View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10344_low_1 (Length: 514)

Name: NF10344_low_1
Description: NF10344
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10344_low_1
NF10344_low_1
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (6-498)||(53383181-53383673)
chr3 (6-498)||(16754864-16755356)
chr3 (6-498)||(6602211-6602703)
chr3 (6-498)||(5423093-5423585)
chr3 (6-498)||(15346408-15346900)
chr3 (6-498)||(12888184-12888676)
chr3 (6-498)||(3687418-3687910)
chr3 (12-498)||(5108774-5109260)
chr3 (12-498)||(20060217-20060703)
chr3 (12-498)||(15587555-15588041)
chr3 (12-498)||(48426928-48427414)
chr3 (29-498)||(16637271-16637740)
chr3 (6-498)||(15400680-15401172)
chr3 (12-498)||(13254171-13254657)
chr3 (12-498)||(16805110-16805596)
chr3 (14-498)||(10007083-10007567)
chr3 (14-498)||(10907693-10908177)
chr3 (15-498)||(16693648-16694131)
chr3 (20-484)||(14874676-14875140)
chr3 (12-425)||(15723170-15723583)
chr3 (12-492)||(17491331-17491811)
chr3 (15-375)||(12499732-12500092)
chr3 (12-492)||(15261111-15261591)
chr3 (6-338)||(15340744-15341076)
chr3 (334-498)||(15357886-15358050)
chr3 (14-492)||(11950066-11950544)
chr3 (14-492)||(12358685-12359163)
chr3 (14-492)||(11959327-11959805)
chr3 (83-492)||(31693343-31693752)
chr3 (83-492)||(31940465-31940874)
chr3 (20-492)||(17187873-17188345)
chr3 (14-492)||(41179015-41179493)
chr3 (14-492)||(16379086-16379564)
chr3 (83-492)||(12179900-12180315)
chr3 (292-492)||(14579577-14579777)
chr3 (14-492)||(13318660-13319138)
chr3 (14-492)||(15013925-15014403)
chr3 (14-492)||(18132504-18132982)
chr3 (14-492)||(44778740-44779218)
chr3 (172-492)||(16826439-16826754)
chr3 (14-492)||(13943517-13943995)
chr3 (377-498)||(24185036-24185157)
chr3 (329-489)||(11888526-11888686)
chr3 (83-492)||(15229165-15229574)
chr3 (83-492)||(15235033-15235442)
chr3 (74-492)||(10418203-10418621)
chr3 (14-495)||(28755811-28756292)
chr3 (14-495)||(47125437-47125918)
chr3 (20-465)||(16834695-16835140)
chr3 (14-492)||(14088166-14088644)
chr3 (283-492)||(14291690-14291899)
chr3 (20-492)||(13970278-13970750)
chr3 (209-492)||(12510641-12510924)
chr3 (273-495)||(10407720-10407942)
chr3 (186-429)||(12269875-12270118)
chr3 (407-498)||(43164551-43164642)
chr3 (144-492)||(16327818-16328166)
chr3 (422-498)||(15714219-15714295)
chr3 (293-492)||(24189076-24189275)
chr3 (74-492)||(30139359-30139777)
chr3 (74-492)||(30148910-30149328)
chr3 (413-492)||(18437022-18437101)
chr3 (308-492)||(8745548-8745732)
chr3 (74-492)||(8272568-8272986)
chr3 (143-318)||(11889623-11889798)
chr3 (74-492)||(15611656-15612074)
chr3 (383-492)||(13965521-13965630)
chr3 (44-240)||(6151274-6151470)
chr3 (383-492)||(15948639-15948748)
chr3 (437-492)||(12272254-12272309)
chr3 (390-492)||(6151022-6151124)
chr3 (461-498)||(26791576-26791613)
chr3 (390-492)||(17200503-17200605)
chr3 (74-136)||(25767871-25767933)
chr3 (14-281)||(10385164-10385431)
chr3 (74-136)||(18915279-18915341)
[»] chr6 (65 HSPs)
chr6 (6-498)||(27189156-27189648)
chr6 (6-498)||(27259592-27260084)
chr6 (6-498)||(28261266-28261758)
chr6 (6-498)||(28284158-28284650)
chr6 (6-498)||(28340015-28340507)
chr6 (6-498)||(2872872-2873364)
chr6 (42-498)||(22828424-22828880)
chr6 (12-498)||(27563902-27564386)
chr6 (12-498)||(24293851-24294337)
chr6 (12-498)||(25114278-25114764)
chr6 (20-498)||(19866421-19866899)
chr6 (20-498)||(22435603-22436081)
chr6 (12-498)||(16925708-16926193)
chr6 (12-498)||(16961551-16962037)
chr6 (12-498)||(25763297-25763783)
chr6 (12-492)||(20634015-20634495)
chr6 (12-498)||(5837288-5837774)
chr6 (12-492)||(22760530-22761010)
chr6 (20-498)||(25607930-25608408)
chr6 (20-432)||(22444001-22444413)
chr6 (12-492)||(18406019-18406499)
chr6 (275-498)||(16573879-16574102)
chr6 (275-498)||(16621278-16621501)
chr6 (12-375)||(23080195-23080558)
chr6 (131-492)||(23085846-23086207)
chr6 (271-492)||(18183442-18183663)
chr6 (14-492)||(25769572-25770050)
chr6 (83-492)||(14377991-14378400)
chr6 (83-492)||(14379541-14379950)
chr6 (14-495)||(15461064-15461545)
chr6 (270-492)||(18963163-18963385)
chr6 (83-475)||(19454821-19455213)
chr6 (355-498)||(21755002-21755145)
chr6 (14-492)||(28280888-28281366)
chr6 (92-492)||(10466924-10467324)
chr6 (14-489)||(19881026-19881501)
chr6 (83-492)||(19436799-19437208)
chr6 (83-484)||(21473398-21473798)
chr6 (50-492)||(18796454-18796896)
chr6 (95-495)||(24366221-24366621)
chr6 (15-276)||(18196024-18196285)
chr6 (14-492)||(34643661-34644139)
chr6 (359-492)||(30679082-30679215)
chr6 (14-492)||(21568066-21568544)
chr6 (308-492)||(24516483-24516667)
chr6 (12-222)||(18965640-18965850)
chr6 (74-492)||(16380448-16380866)
chr6 (383-492)||(23998345-23998454)
chr6 (74-492)||(16648044-16648462)
chr6 (82-321)||(19487528-19487757)
chr6 (389-484)||(8761835-8761930)
chr6 (419-492)||(23080556-23080629)
chr6 (14-485)||(18450231-18450702)
chr6 (390-492)||(1646889-1646991)
chr6 (14-102)||(29590385-29590473)
chr6 (390-492)||(16100119-16100221)
chr6 (410-485)||(14130593-14130668)
chr6 (74-172)||(18577997-18578095)
chr6 (12-69)||(21754940-21754997)
chr6 (48-136)||(14130231-14130319)
chr6 (448-492)||(23025821-23025865)
chr6 (74-129)||(1647252-1647307)
chr6 (74-136)||(16234816-16234878)
chr6 (144-200)||(5295573-5295629)
chr6 (44-136)||(19985847-19985939)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (6-498)||(27666596-27667088)
chr5 (14-498)||(40710576-40711060)
chr5 (12-498)||(27520200-27520686)
chr5 (6-498)||(37289602-37290094)
chr5 (6-498)||(41772630-41773122)
chr5 (29-498)||(16358313-16358782)
chr5 (29-498)||(34568305-34568774)
chr5 (12-498)||(27612148-27612634)
chr5 (6-498)||(14997845-14998337)
chr5 (6-498)||(22349707-22350199)
chr5 (12-498)||(22330993-22331479)
chr5 (12-498)||(18780908-18781394)
chr5 (12-498)||(22136462-22136948)
chr5 (12-498)||(19771754-19772240)
chr5 (12-498)||(29474179-29474665)
chr5 (6-498)||(27683506-27683998)
chr5 (12-490)||(20801191-20801669)
chr5 (12-492)||(25428227-25428707)
chr5 (12-492)||(26736839-26737319)
chr5 (12-492)||(23473021-23473501)
chr5 (12-492)||(21337406-21337889)
chr5 (12-492)||(20466211-20466691)
chr5 (14-492)||(22234032-22234510)
chr5 (152-492)||(21562137-21562476)
chr5 (14-492)||(20344060-20344538)
chr5 (14-492)||(28893054-28893532)
chr5 (14-492)||(28921880-28922358)
chr5 (14-492)||(17267446-17267924)
chr5 (74-492)||(20823291-20823709)
chr5 (14-495)||(14885100-14885581)
chr5 (14-495)||(24796506-24796987)
chr5 (14-492)||(20777691-20778169)
chr5 (14-492)||(22463729-22464207)
chr5 (92-492)||(25849931-25850331)
chr5 (14-492)||(22504457-22504935)
chr5 (92-495)||(37541490-37541893)
chr5 (14-375)||(28914642-28915003)
chr5 (14-375)||(28929910-28930271)
chr5 (22-492)||(21408941-21409408)
chr5 (74-492)||(21935300-21935718)
chr5 (74-492)||(23507522-23507940)
chr5 (14-377)||(21679005-21679368)
chr5 (12-114)||(23442002-23442104)
chr5 (383-492)||(24583357-24583466)
chr5 (74-136)||(23505082-23505144)
chr5 (74-129)||(24583048-24583103)
chr5 (374-492)||(21676946-21677064)
[»] chr8 (62 HSPs)
chr8 (6-498)||(17672390-17672882)
chr8 (12-498)||(19482439-19482917)
chr8 (12-498)||(18858505-18858991)
chr8 (14-498)||(20016630-20017114)
chr8 (12-498)||(30311511-30311997)
chr8 (12-498)||(22041755-22042241)
chr8 (12-498)||(15535311-15535797)
chr8 (12-498)||(32602072-32602559)
chr8 (12-498)||(22118542-22119028)
chr8 (12-498)||(22127326-22127812)
chr8 (12-498)||(22131408-22131894)
chr8 (20-498)||(19979903-19980381)
chr8 (20-498)||(21164905-21165383)
chr8 (12-492)||(21252872-21253352)
chr8 (20-492)||(23651977-23652449)
chr8 (12-492)||(21782793-21783277)
chr8 (12-492)||(22422265-22422745)
chr8 (12-492)||(21392234-21392718)
chr8 (12-492)||(21786728-21787212)
chr8 (20-492)||(19864466-19864939)
chr8 (12-492)||(22246806-22247286)
chr8 (20-492)||(22375826-22376298)
chr8 (15-428)||(21920185-21920598)
chr8 (12-492)||(23886952-23887436)
chr8 (15-492)||(29301799-29302276)
chr8 (12-318)||(22988658-22988964)
chr8 (14-492)||(21323652-21324129)
chr8 (82-492)||(23656925-23657335)
chr8 (86-492)||(31414842-31415248)
chr8 (41-492)||(20394506-20394957)
chr8 (14-492)||(20008294-20008772)
chr8 (14-230)||(19114620-19114836)
chr8 (82-492)||(21927425-21927836)
chr8 (249-492)||(22522711-22522954)
chr8 (14-492)||(31569216-31569693)
chr8 (313-492)||(22989274-22989453)
chr8 (82-489)||(20390097-20390491)
chr8 (14-483)||(19861365-19861834)
chr8 (361-492)||(21781560-21781691)
chr8 (14-492)||(22052793-22053271)
chr8 (95-492)||(16269597-16269994)
chr8 (95-492)||(27356547-27356944)
chr8 (152-495)||(28982979-28983322)
chr8 (152-495)||(28988198-28988541)
chr8 (14-495)||(4983972-4984453)
chr8 (308-492)||(19984404-19984588)
chr8 (14-431)||(6605588-6606005)
chr8 (299-492)||(22061052-22061245)
chr8 (389-492)||(22373173-22373276)
chr8 (74-492)||(16875468-16875886)
chr8 (14-381)||(14567072-14567439)
chr8 (451-498)||(22030470-22030517)
chr8 (143-321)||(22372990-22373168)
chr8 (383-492)||(20650728-20650837)
chr8 (383-492)||(21848710-21848819)
chr8 (390-492)||(23155415-23155517)
chr8 (41-136)||(20651084-20651179)
chr8 (398-492)||(16414405-16414499)
chr8 (272-367)||(19869881-19869976)
chr8 (47-136)||(23155769-23155858)
chr8 (404-484)||(23902484-23902564)
chr8 (398-485)||(24932204-24932291)
[»] chr1 (43 HSPs)
chr1 (6-498)||(33389025-33389517)
chr1 (6-498)||(16348591-16349084)
chr1 (12-498)||(41351664-41352144)
chr1 (12-498)||(21832179-21832665)
chr1 (12-498)||(21233727-21234213)
chr1 (12-498)||(21838827-21839313)
chr1 (20-498)||(51331489-51331967)
chr1 (12-498)||(19108245-19108731)
chr1 (12-498)||(17043011-17043497)
chr1 (12-498)||(24792612-24793098)
chr1 (25-498)||(22503285-22503758)
chr1 (12-492)||(430118-430598)
chr1 (41-492)||(20139989-20140440)
chr1 (12-492)||(22360246-22360726)
chr1 (12-492)||(50618400-50618880)
chr1 (12-492)||(21750817-21751297)
chr1 (75-492)||(21862375-21862792)
chr1 (190-492)||(16378150-16378452)
chr1 (14-492)||(21743554-21744032)
chr1 (20-492)||(19661138-19661610)
chr1 (14-492)||(19856184-19856662)
chr1 (12-239)||(21026050-21026277)
chr1 (14-492)||(20833902-20834380)
chr1 (14-492)||(24097605-24098083)
chr1 (14-492)||(20854762-20855240)
chr1 (83-492)||(20938065-20938474)
chr1 (95-492)||(20296372-20296769)
chr1 (14-495)||(48424783-48425264)
chr1 (14-495)||(52987651-52988132)
chr1 (224-345)||(20944119-20944240)
chr1 (14-495)||(37678959-37679440)
chr1 (272-492)||(41310694-41310914)
chr1 (14-495)||(31537996-31538477)
chr1 (144-492)||(21952918-21953266)
chr1 (14-495)||(38910825-38911306)
chr1 (74-492)||(20829394-20829812)
chr1 (12-149)||(16378019-16378156)
chr1 (82-237)||(41308620-41308775)
chr1 (390-492)||(35930827-35930929)
chr1 (390-492)||(41215858-41215960)
chr1 (383-492)||(20927302-20927411)
chr1 (448-492)||(20527366-20527410)
chr1 (12-99)||(22116790-22116877)
[»] chr2 (46 HSPs)
chr2 (7-498)||(44384034-44384525)
chr2 (6-498)||(10870337-10870829)
chr2 (6-498)||(27219503-27219995)
chr2 (6-498)||(24711521-24712013)
chr2 (14-498)||(16926855-16927339)
chr2 (14-498)||(17000495-17000979)
chr2 (29-498)||(9485726-9486195)
chr2 (6-498)||(21143505-21143997)
chr2 (6-498)||(41606849-41607341)
chr2 (6-498)||(24875214-24875706)
chr2 (6-498)||(27372756-27373248)
chr2 (12-498)||(24263863-24264349)
chr2 (12-480)||(23189412-23189879)
chr2 (20-498)||(24676990-24677468)
chr2 (12-498)||(21323730-21324216)
chr2 (12-498)||(24705946-24706432)
chr2 (143-498)||(9337206-9337561)
chr2 (12-492)||(23073356-23073836)
chr2 (12-492)||(23106198-23106678)
chr2 (12-492)||(22734244-22734724)
chr2 (12-492)||(24818700-24819180)
chr2 (82-492)||(23112299-23112712)
chr2 (12-237)||(22323581-22323806)
chr2 (14-492)||(19650520-19650998)
chr2 (14-492)||(12575848-12576326)
chr2 (14-492)||(27789235-27789713)
chr2 (83-495)||(23278340-23278752)
chr2 (14-492)||(19717487-19717965)
chr2 (14-492)||(23098488-23098966)
chr2 (257-492)||(25255657-25255892)
chr2 (14-495)||(1065246-1065727)
chr2 (92-492)||(30209387-30209787)
chr2 (14-495)||(31832153-31832634)
chr2 (83-432)||(24950154-24950503)
chr2 (20-492)||(30010654-30011126)
chr2 (14-289)||(23295430-23295705)
chr2 (14-332)||(27208802-27209120)
chr2 (14-234)||(25264549-25264769)
chr2 (415-480)||(23611069-23611134)
chr2 (383-492)||(22279969-22280078)
chr2 (38-136)||(12639059-12639157)
chr2 (12-129)||(22279598-22279715)
chr2 (383-492)||(24829658-24829767)
chr2 (390-492)||(25130480-25130582)
chr2 (14-192)||(45534435-45534613)
chr2 (45-136)||(24568494-24568585)
[»] chr4 (45 HSPs)
chr4 (14-498)||(8388276-8388760)
chr4 (14-498)||(8051287-8051771)
chr4 (6-498)||(27713192-27713684)
chr4 (12-498)||(14301643-14302129)
chr4 (5-498)||(12478455-12478948)
chr4 (5-498)||(19776457-19776950)
chr4 (12-498)||(14682429-14682915)
chr4 (6-498)||(40474896-40475388)
chr4 (12-498)||(18225110-18225596)
chr4 (12-498)||(23957609-23958095)
chr4 (12-498)||(15145557-15146035)
chr4 (145-498)||(17092813-17093166)
chr4 (142-498)||(16234656-16235012)
chr4 (12-428)||(16353241-16353658)
chr4 (12-492)||(14849036-14849516)
chr4 (12-492)||(14695975-14696455)
chr4 (14-492)||(15357050-15357528)
chr4 (14-492)||(16153721-16154199)
chr4 (83-492)||(16149644-16150053)
chr4 (12-244)||(18613742-18613974)
chr4 (14-491)||(14161334-14161811)
chr4 (14-492)||(1647207-1647685)
chr4 (245-492)||(16218325-16218572)
chr4 (245-492)||(16221645-16221892)
chr4 (14-492)||(15001295-15001772)
chr4 (14-492)||(51604722-51605200)
chr4 (14-492)||(8707775-8708249)
chr4 (356-492)||(22631910-22632046)
chr4 (14-492)||(27902250-27902728)
chr4 (14-495)||(29451464-29451945)
chr4 (281-492)||(23443237-23443447)
chr4 (14-495)||(3262721-3263202)
chr4 (86-492)||(15072295-15072701)
chr4 (152-495)||(44659793-44660136)
chr4 (152-492)||(11205162-11205502)
chr4 (143-492)||(15257921-15258269)
chr4 (12-181)||(1640321-1640490)
chr4 (14-318)||(15323081-15323385)
chr4 (410-498)||(16251514-16251602)
chr4 (29-139)||(29037427-29037537)
chr4 (448-498)||(16353194-16353244)
chr4 (383-492)||(15291088-15291197)
chr4 (74-136)||(14999239-14999301)
chr4 (392-485)||(12340802-12340895)
chr4 (74-240)||(15291340-15291506)
[»] chr7 (56 HSPs)
chr7 (14-498)||(44789284-44789768)
chr7 (6-498)||(10872535-10873027)
chr7 (6-498)||(18179590-18180082)
chr7 (14-498)||(14334249-14334733)
chr7 (12-498)||(11235146-11235632)
chr7 (6-498)||(11551035-11551527)
chr7 (6-498)||(14956399-14956891)
chr7 (21-498)||(12689362-12689839)
chr7 (6-498)||(15158990-15159482)
chr7 (12-498)||(8709456-8709942)
chr7 (59-498)||(15283-15722)
chr7 (143-498)||(13688023-13688378)
chr7 (12-498)||(15146817-15147304)
chr7 (167-498)||(18588104-18588435)
chr7 (12-492)||(14041546-14042026)
chr7 (12-492)||(14351576-14352056)
chr7 (12-485)||(48813198-48813670)
chr7 (272-498)||(9590479-9590705)
chr7 (12-492)||(15626376-15626856)
chr7 (83-492)||(15100520-15100929)
chr7 (14-492)||(14262162-14262639)
chr7 (15-492)||(12204717-12205194)
chr7 (20-492)||(13675312-13675784)
chr7 (14-492)||(19149065-19149541)
chr7 (15-492)||(14139534-14140011)
chr7 (14-492)||(13966585-13967063)
chr7 (14-492)||(20748464-20748940)
chr7 (83-492)||(16948389-16948798)
chr7 (14-492)||(23503787-23504265)
chr7 (14-484)||(16070222-16070690)
chr7 (92-492)||(13023289-13023689)
chr7 (14-492)||(15342285-15342763)
chr7 (14-492)||(18051870-18052348)
chr7 (95-492)||(12458575-12458972)
chr7 (41-492)||(11386346-11386797)
chr7 (92-495)||(26092712-26093115)
chr7 (12-162)||(14213525-14213675)
chr7 (12-249)||(11770423-11770660)
chr7 (95-495)||(26116504-26116904)
chr7 (14-495)||(49154155-49154636)
chr7 (12-151)||(8200479-8200618)
chr7 (14-492)||(19614529-19615007)
chr7 (92-495)||(11301127-11301530)
chr7 (20-381)||(14284404-14284765)
chr7 (74-492)||(7825813-7826231)
chr7 (402-492)||(11770341-11770431)
chr7 (74-492)||(27105713-27106131)
chr7 (74-492)||(27172194-27172612)
chr7 (6-119)||(13687909-13688022)
chr7 (383-492)||(4442150-4442259)
chr7 (454-498)||(16727316-16727360)
chr7 (454-498)||(17704388-17704432)
chr7 (12-69)||(9597908-9597965)
chr7 (74-136)||(17925563-17925625)
chr7 (392-483)||(13379114-13379205)
chr7 (214-367)||(39210-39363)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (6-498)||(107738-108230)
scaffold0029 (274-492)||(94827-95045)
scaffold0029 (14-492)||(114454-114932)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (12-498)||(8831-9317)
[»] scaffold0080 (6 HSPs)
scaffold0080 (12-498)||(11166-11652)
scaffold0080 (12-498)||(30775-31261)
scaffold0080 (12-498)||(36240-36727)
scaffold0080 (119-492)||(53635-54008)
scaffold0080 (15-288)||(49986-50259)
scaffold0080 (436-498)||(13821-13883)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (12-498)||(40046-40532)
scaffold0109 (12-498)||(14051-14538)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (12-498)||(16051-16537)
scaffold0044 (21-498)||(2322-2801)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (6-498)||(9253-9745)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (12-498)||(57908-58394)
scaffold0017 (20-468)||(195444-195892)
scaffold0017 (12-498)||(17993-18480)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (12-498)||(45044-45530)
scaffold0028 (6-498)||(16823-17315)
scaffold0028 (12-498)||(10367-10853)
scaffold0028 (14-492)||(48447-48925)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (20-498)||(37747-38225)
scaffold0042 (41-492)||(22627-23078)
[»] scaffold0079 (4 HSPs)
scaffold0079 (12-498)||(35388-35875)
scaffold0079 (242-428)||(28222-28408)
scaffold0079 (14-492)||(2611-3089)
scaffold0079 (448-498)||(28405-28455)
[»] scaffold0008 (5 HSPs)
scaffold0008 (12-498)||(85723-86209)
scaffold0008 (47-492)||(85163-85608)
scaffold0008 (383-492)||(132422-132531)
scaffold0008 (44-199)||(132715-132870)
scaffold0008 (398-492)||(26046-26140)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (12-498)||(54918-55404)
scaffold0031 (82-492)||(109593-110003)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (12-404)||(23095-23487)
[»] scaffold0102 (3 HSPs)
scaffold0102 (104-498)||(51272-51666)
scaffold0102 (152-492)||(41729-42069)
scaffold0102 (74-136)||(46702-46764)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (12-492)||(151003-151483)
scaffold0023 (12-492)||(2438-2918)
scaffold0023 (15-442)||(86665-87091)
scaffold0023 (20-96)||(27735-27811)
scaffold0023 (74-136)||(54231-54293)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (12-492)||(20495-20975)
scaffold0081 (12-492)||(35919-36399)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (12-492)||(16533-17014)
scaffold0309 (41-492)||(11715-12167)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (12-495)||(659-1140)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (12-492)||(24878-25358)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (12-433)||(7907-8328)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (12-492)||(7592-8072)
scaffold0647 (12-492)||(2792-3272)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (12-492)||(7913-8393)
scaffold0120 (44-136)||(24101-24193)
scaffold0120 (390-492)||(24447-24549)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (12-492)||(3330-3805)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (12-492)||(7942-8422)
scaffold0358 (12-492)||(17138-17618)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (12-492)||(7020-7500)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (12-492)||(1315-1795)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (12-492)||(8265-8744)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (12-492)||(18274-18754)
scaffold0114 (247-492)||(22002-22247)
scaffold0114 (370-492)||(39307-39429)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (170-498)||(21296-21624)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (12-491)||(1-480)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (21-492)||(13144-13615)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (12-492)||(712-1189)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (12-492)||(20131-20611)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (12-492)||(55648-56128)
scaffold0022 (75-492)||(40588-41005)
scaffold0022 (75-492)||(74308-74725)
scaffold0022 (392-498)||(8753-8859)
scaffold0022 (74-251)||(9000-9177)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (22-489)||(3484-3951)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (12-492)||(7114-7594)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (74-492)||(14-432)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (41-492)||(14412-14863)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (116-461)||(28446-28772)
scaffold0215 (12-222)||(28774-28984)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (12-492)||(17547-18021)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (12-492)||(24466-24946)
scaffold0011 (15-492)||(150465-150942)
scaffold0011 (14-182)||(193947-194115)
scaffold0011 (74-136)||(181879-181941)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (12-492)||(3807-4287)
scaffold0010 (14-495)||(40263-40744)
scaffold0010 (227-492)||(45360-45625)
scaffold0010 (14-199)||(45626-45810)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (12-448)||(30838-31274)
scaffold0026 (14-492)||(50705-51183)
[»] scaffold2004 (1 HSPs)
scaffold2004 (74-492)||(746-1160)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (20-399)||(4095-4474)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (12-492)||(103126-103598)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (12-405)||(6351-6744)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (12-492)||(15154-15634)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (12-492)||(14361-14841)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (12-492)||(10674-11154)
scaffold0018 (12-492)||(24231-24711)
scaffold0018 (12-400)||(16958-17346)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (15-492)||(16773-17249)
scaffold0040 (12-138)||(111775-111901)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (12-492)||(494910-495391)
scaffold0001 (143-492)||(453146-453495)
scaffold0001 (14-492)||(515286-515764)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (12-492)||(217353-217833)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (13-492)||(5006-5484)
scaffold0074 (170-484)||(11172-11486)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (12-492)||(5764-6244)
scaffold0270 (12-492)||(12894-13374)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (242-496)||(29844-30098)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (12-492)||(344-823)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (143-492)||(2623-2972)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (12-492)||(8967-9447)
scaffold0083 (411-492)||(1324-1405)
scaffold0083 (411-492)||(6628-6709)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (15-358)||(407-750)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (12-492)||(5822-6302)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (41-492)||(15911-16361)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (14-489)||(201404-201879)
scaffold0004 (14-484)||(324599-325069)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (292-498)||(15921-16128)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (14-492)||(24109-24587)
scaffold0104 (14-492)||(44350-44828)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (293-498)||(1-206)
scaffold0149 (14-492)||(5284-5761)
scaffold0149 (14-492)||(9715-10192)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (12-274)||(7844-8106)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (74-492)||(10783-11201)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (20-303)||(38070-38353)
scaffold0122 (448-492)||(41438-41482)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (14-492)||(48999-49477)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (240-498)||(1-259)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (14-492)||(1764-2242)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (15-492)||(4645-5122)
scaffold0035 (71-492)||(42040-42461)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (239-467)||(10286-10514)
scaffold0476 (22-474)||(1496-1948)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (20-492)||(33235-33707)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (14-492)||(4071-4552)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (83-486)||(2892-3295)
scaffold0034 (14-492)||(69265-69743)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (14-492)||(19247-19725)
scaffold0244 (44-126)||(25076-25158)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (12-492)||(22119-22598)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (143-498)||(28646-29001)
scaffold0067 (20-492)||(50113-50585)
scaffold0067 (20-492)||(59147-59619)
scaffold0067 (20-492)||(65535-66007)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (14-492)||(2205-2683)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (14-492)||(29218-29696)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (14-492)||(49808-50286)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (14-492)||(250515-250993)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (14-486)||(892-1364)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (14-492)||(9991-10468)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (14-492)||(8956-9434)
scaffold0222 (272-492)||(1422-1642)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (15-492)||(13269-13746)
scaffold0261 (15-492)||(21448-21925)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (74-273)||(44795-44994)
scaffold0130 (359-492)||(4822-4955)
scaffold0130 (14-345)||(8888-9219)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (14-492)||(788-1265)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (14-492)||(42812-43289)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (83-492)||(37612-38021)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (14-492)||(268503-268981)
scaffold0007 (14-492)||(84453-84930)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (14-492)||(1418-1896)
[»] scaffold0266 (3 HSPs)
scaffold0266 (14-492)||(16007-16485)
scaffold0266 (44-180)||(8106-8242)
scaffold0266 (383-492)||(7794-7903)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (146-492)||(19567-19913)
scaffold0077 (74-240)||(26451-26617)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (20-222)||(3556-3758)
[»] scaffold0560 (2 HSPs)
scaffold0560 (345-498)||(8669-8822)
scaffold0560 (290-351)||(10914-10975)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (14-485)||(122-592)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (14-492)||(31252-31730)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (14-492)||(99495-99973)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (82-492)||(176277-176687)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (83-492)||(14164-14579)
scaffold0124 (383-492)||(5739-5848)
scaffold0124 (74-240)||(5993-6159)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (82-492)||(28488-28898)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (176-492)||(557-873)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (20-231)||(953-1164)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (14-492)||(262119-262597)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (83-459)||(6714-7090)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (82-492)||(5022-5432)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (14-492)||(46967-47445)
scaffold0053 (14-492)||(55780-56258)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (20-492)||(79764-80236)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (74-492)||(25068-25486)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (83-492)||(64452-64850)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (308-492)||(114971-115155)
scaffold0037 (44-235)||(115171-115362)
[»] scaffold0076 (4 HSPs)
scaffold0076 (14-492)||(31610-32088)
scaffold0076 (308-492)||(54344-54528)
scaffold0076 (74-492)||(42213-42631)
scaffold0076 (14-291)||(55034-55311)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (14-492)||(52940-53418)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (116-492)||(642-1016)
scaffold0420 (314-492)||(7809-7985)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (14-468)||(10743-11197)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (126-492)||(21127-21493)
scaffold0058 (44-492)||(27181-27628)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (41-374)||(1900-2233)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (14-477)||(782-1245)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (15-492)||(9394-9867)
scaffold0235 (15-492)||(19608-20081)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (14-384)||(42-412)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (14-492)||(20744-21222)
scaffold0090 (14-195)||(24906-25087)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (92-483)||(925-1316)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (395-498)||(11086-11189)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (362-492)||(11201-11331)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (271-492)||(520-741)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (95-492)||(28909-29305)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (20-297)||(895-1172)
[»] scaffold0348 (3 HSPs)
scaffold0348 (20-468)||(9831-10294)
scaffold0348 (308-492)||(18416-18600)
scaffold0348 (436-492)||(5782-5838)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (14-316)||(1219-1521)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (83-375)||(12349-12641)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (8-492)||(33974-34458)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (14-345)||(16229-16560)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (14-321)||(44678-44985)
[»] scaffold0285 (2 HSPs)
scaffold0285 (111-180)||(9217-9286)
scaffold0285 (40-88)||(9169-9217)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (20-162)||(3827-3969)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (74-492)||(25349-25767)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (74-492)||(14863-15281)
scaffold0162 (390-492)||(11107-11209)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (14-348)||(14790-15124)
scaffold0089 (15-285)||(416-686)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (143-492)||(6078-6427)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (15-139)||(6939-7063)
[»] scaffold0180 (3 HSPs)
scaffold0180 (15-285)||(380-650)
scaffold0180 (15-285)||(4700-4970)
scaffold0180 (82-264)||(33914-34096)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (446-498)||(12283-12335)
[»] scaffold0692 (2 HSPs)
scaffold0692 (383-490)||(1819-1926)
scaffold0692 (44-129)||(2171-2256)
[»] scaffold0876 (2 HSPs)
scaffold0876 (390-492)||(879-981)
scaffold0876 (74-239)||(1132-1297)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (86-492)||(178-584)
scaffold0302 (86-492)||(7120-7526)
[»] scaffold0218 (3 HSPs)
scaffold0218 (398-492)||(1885-1979)
scaffold0218 (443-498)||(26651-26706)
scaffold0218 (75-240)||(2137-2302)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (398-492)||(16337-16431)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (383-485)||(7008-7110)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (390-492)||(736-838)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (390-484)||(13566-13660)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (410-492)||(9887-9969)
scaffold0146 (410-492)||(17554-17636)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (390-492)||(89771-89873)
scaffold0021 (38-136)||(7133-7231)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (83-189)||(195204-195310)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (411-492)||(1554-1635)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (383-492)||(7173-7282)
[»] scaffold1486 (1 HSPs)
scaffold1486 (44-136)||(99-191)
[»] scaffold0610 (2 HSPs)
scaffold0610 (44-136)||(7218-7310)
scaffold0610 (446-492)||(4859-4905)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (44-136)||(2189-2281)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (398-492)||(6938-7032)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (448-492)||(2267-2311)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (44-136)||(13113-13205)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (92-288)||(8920-9116)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 473; Significance: 0; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 53383673 - 53383181
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53383673 cggacttaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaataacatggccaaggaaactcacttcatt 53383574  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53383573 caaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacctgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 53383474  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53383473 gagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 53383374  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53383373 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 53383274  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53383273 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 53383181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16755356 - 16754864
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16755356 cggacttaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaataacatggccaaggaaactcacttcatt 16755257  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755256 caaccagaattcacacacaaacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaaaacaatcttcaaatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 16755157  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755156 gagtaaatcaaaatatcgtcaataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 16755057  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755056 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 16754957  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754956 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 16754864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Original strand, 6602211 - 6602703
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6602211 cggacttaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccagaaataacatggccaaggaaactcacttcatt 6602310  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  6602311 caaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcgtcagatgctcagcatgttcttcttcggtcttg 6602410  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6602411 gagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 6602510  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6602511 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttttgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 6602610  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6602611 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 6602703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 5423585 - 5423093
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5423585 cggacttaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaataacatggccaaggaaactcacttcatt 5423486  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  5423485 caacaagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtctta 5423386  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5423385 gagtaaatcaagatatcgtcgatgaacataactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 5423286  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5423285 taacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctaaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacc 5423186  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5423185 tgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 5423093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 15346900 - 15346408
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  15346900 cggacttaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaataacatggcctagaaaactcacttcttt 15346801  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15346800 caaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttg 15346701  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15346700 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 15346601  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15346600 tcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaagctggtgataacc 15346501  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15346500 tgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 15346408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Original strand, 12888184 - 12888676
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  12888184 cggacttaggagtatcccattgcgatactgcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaataacatggccaagtaaactcacttcttt 12888283  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  12888284 caaccagaattcacacttagacaattttgcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcaggtgctcggcatgttcttcttcagtcttg 12888383  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12888384 gagtaaatcaaaatatcatcgatgaacactactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 12888483  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12888484 taacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacc 12888583  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12888584 tgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 12888676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Original strand, 3687418 - 3687910
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||    
T  3687418 cggacttaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaataacatgacctagaaaactcacttcttt 3687517  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  3687518 caaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctctgcatgttcttcttcagtcttg 3687617  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3687618 gagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 3687717  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3687718 taactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacc 3687817  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3687818 tgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgctcccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 3687910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 5109260 - 5108774
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  5109260 taggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccacaacaataccatctccggaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaacca 5109161  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5109160 gaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttttctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 5109061  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5109060 atcaagatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 5108961  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  5108960 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacct 5108861  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5108860 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 5108774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 20060703 - 20060217
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  20060703 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccactgcaattccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaacca 20060604  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  20060603 aaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaa 20060504  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  20060503 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccagaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactc 20060404  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20060403 caaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatct 20060304  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060303 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 20060217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 15588041 - 15587555
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  15588041 taggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaattccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaacca 15587942  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||     
T  15587941 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcaacatgttcttcttcagtcttggagtag 15587842  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15587841 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccagaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 15587742  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15587741 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccatatcgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatct 15587642  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15587641 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 15587555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 48426928 - 48427414
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  48426928 taggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaacca 48427027  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  48427028 gaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtag 48427127  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48427128 atcaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 48427227  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48427228 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatct 48427327  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48427328 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 48427414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 498
Target Start/End: Original strand, 16637271 - 16637740
Alignment:
Q  29 gatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagaca 128  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16637271 gataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagaca 16637370  T
Q  129 atttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgat 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16637371 atttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgat 16637470  T
Q  229 aaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttg 328  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  16637471 aaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaagggcataacttta 16637570  T
Q  329 tattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctga 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16637571 tattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctga 16637670  T
Q  429 aaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16637671 aaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 16637740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 15401172 - 15400680
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15401172 cggacttaggagtctcccatttcgataccgcttcaactttagacggatccacagcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttcttt 15401073  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15401072 caaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacactcgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttg 15400973  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15400972 gagtaaatcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaagtgcattgg 15400873  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15400872 taacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatttggtgataacc 15400773  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15400772 tgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 15400680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 13254171 - 13254657
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  13254171 taggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaattccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaacca 13254270  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  13254271 gaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtag 13254370  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  13254371 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactc 13254470  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13254471 caaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 13254570  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13254571 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagttgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 13254657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16805596 - 16805110
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  16805596 taggagtctcccattgcgataccacttcaactttagacggatccactacaataccatcactagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaacca 16805497  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16805496 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttctccttcagtcttggagtaa 16805397  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16805396 atcaaaatgtcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatgtactccataaacactccaggtgcattggtcacac 16805297  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  16805296 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgtgctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatct 16805197  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16805196 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 16805110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 498
Target Start/End: Original strand, 10007083 - 10007567
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |||    
T  10007083 ggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccgtcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccaga 10007182  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  10007183 attcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagaatgttcttcttcagtcttggagtaaat 10007282  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  10007283 caaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactcca 10007382  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10007383 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctca 10007482  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10007483 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 10007567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 498
Target Start/End: Original strand, 10907693 - 10908177
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |||    
T  10907693 ggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccgtcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccaga 10907792  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  10907793 attcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcaaaatgttcttcttcagtcttggagtaaat 10907892  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  10907893 caaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactcca 10907992  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10907993 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctca 10908092  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908093 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 10908177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 498
Target Start/End: Original strand, 16693648 - 16694131
Alignment:
Q  15 gagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaa 114  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||    
T  16693648 gagtctcccgttgcgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatgaccaagaaaacttacttctttcaaccagaa 16693747  T
Q  115 ttcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatc 214  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16693748 ctcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtatatc 16693847  T
Q  215 aaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccga 314  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16693848 aaaatttcgtctataaacacaactactaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatttactccataaacactccaggtgcattggtcacaccga 16693947  T
Q  315 aaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaa 414  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16693948 atggcataactttatattcatagtgaccatagcgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcacattaatctggtgataacctgatctcaa 16694047  T
Q  415 atcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16694048 atcaatcttgctgaagactttcgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacatattcttgatagt 16694131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 14875140 - 14874676
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  14875140 tcccattgcgataccgcttcgactttagagagatctactgcaataccatcaccagaaataacaaggccaagaaaacttacttctttcaaccagaactcac 14875041  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14875040 acttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 14874941  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14874940 atcatcgataaaaacaaccacgaatcgatccaaaaaggcatgaaagatgcgattcatgtactccatgaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggc 14874841  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  14874840 ataactttgtattcatagtgaccataccgcgttctgaaagatgtcttctgcaaatcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcta 14874741  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatac 484  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14874740 tcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatac 14874676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15723583 - 15723170
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  15723583 taggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaacca 15723484  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15723483 gaattcacacttcgacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 15723384  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15723383 atcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacac 15723284  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15723283 caaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgtgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacct 15723184  T
Q  412 caaatcaatcttgc 425  Q
    ||||||||||||||    
T  15723183 caaatcaatcttgc 15723170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 17491331 - 17491811
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | || |||||||||||||| || |||||||||   || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |    
T  17491331 taggagtctcccattgcgatactacatcaactttagacggatctactgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaacca 17491430  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17491431 gaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaa 17491530  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| || ||||    
T  17491531 attaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgaatgaaagatgcgattcatgtacttcataaatactccaggtgcatttgtaacac 17491630  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
     |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17491631 tgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgttttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 17491730  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17491731 caaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaataatcaattctcggaagtggatacctattctt 17491811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 15 - 375
Target Start/End: Original strand, 12499732 - 12500092
Alignment:
Q  15 gagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaa 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| ||||    
T  12499732 gagtctcccattgcgataccgcttcaactttagaaggatctacagcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaa 12499831  T
Q  115 ttcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatc 214  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12499832 ctcacacttagataatttagcataaagtttcttctctatcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatc 12499931  T
Q  215 aaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccga 314  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  12499932 aaaatatcgtcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatgtactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaa 12500031  T
Q  315 aaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatc 375  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12500032 aaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttatgcatatc 12500092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 15261111 - 15261591
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |    
T  15261111 taggagtctcccattgcgataccgcatcaactttagagggatctactgcaataccattaccagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaacca 15261210  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||     
T  15261211 gaattcacacttttacaatttagcataaagcttcttctccttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggaatat 15261310  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||  | ||||    
T  15261311 atcaaaatatcatcgatgaatacaaccacgaaacgatccaaaaacgcatgaaagatacgattcatgtactccataaacacacctggcgcatttctaacac 15261410  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  15261411 cgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaagccatcttctgcatatcttcatctttcagtttaatctagtgataacccgatct 15261510  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15261511 caaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaattcatcaattctcggaagtggatatctattctt 15261591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 338
Target Start/End: Original strand, 15340744 - 15341076
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15340744 cggacttaggagtctcccatttcgataccgcttcaactttagacggatccacagtaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttcttt 15340843  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15340844 caaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacactcgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttg 15340943  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15340944 gagtaaatcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 15341043  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagt 338  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15341044 taacaccaaaaggcataactttatattcatagt 15341076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 334 - 498
Target Start/End: Original strand, 15357886 - 15358050
Alignment:
Q  334 atagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaact 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  15357886 atagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcatcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaaca 15357985  T
Q  434 cgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357986 cgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 15358050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 11950544 - 11950066
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || ||| |||||   || ||||| |  |||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  11950544 ggagtctcccattgtgatactgcatcaactttcgatggatcaactgcactaccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccaga 11950445  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  11950444 actcacacttcgacaacttagcatacaacttcttctctttcaatacttgcaacacaatcttcaaatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaat 11950345  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || |||||| || |||||||||||||||||   |||||   | |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  11950344 cagaatatcatcaataaacacaaccacgaatttatccaggtaagcatggaaaattcggttcatctactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccg 11950245  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    ||||||||  | |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || ||||    
T  11950244 aaaggcatccccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacctca 11950145  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11950144 agtcaatcttactaaaaacccttgcacccaccaaatgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagtggatacctgttctt 11950066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 12359163 - 12358685
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || | |||||||   || ||||| |  |||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  12359163 ggagtctcccattgtgatactgcatcaactttcgatggatcaactgtaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccaga 12359064  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  12359063 actcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaatacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaat 12358964  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || ||| || || ||||| |||||||| ||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||    
T  12358963 cagaatgtcatcaataaatacaaccactaatttatccaggtaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgctttagtaacaccg 12358864  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| || ||  | || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||    
T  12358863 aaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcttaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctca 12358764  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12358763 agtcattcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctt 12358685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 11959805 - 11959327
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||   ||  |||| |  || || || |||||||||||| | ||| |||    
T  11959805 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgaaggatcaacagcaataccactaccacaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccaga 11959706  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| |   |||| |||||||| ||||| || |||||  ||||||| || ||||| || |||||| ||||||| || ||    
T  11959705 attcacattttgacaactttgcatacaacctcttttctttcaaaacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttggaatagat 11959606  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |||||||| || ||||||||||| |  ||   ||||| ||| |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  11959605 taaaatatcatcaataaacacaactagaaatttatccagaaaagcatggaaaatcctattcatatattccataaacacaccaggcgcattagtaacaccg 11959506  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || ||||  |||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || ||||    
T  11959505 aaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagtcgtcttctgcatatcctcatccttgaccttcatctgatggtaaccagacctca 11959406  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||| ||||| ||   ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11959405 aatcaatcttactgaacacctttgcactcactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctt 11959327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 31693752 - 31693343
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||| |||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  31693752 tggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaaaacttgcaatacaatcttcagatgtt 31693653  T
Q  183 ccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 282  Q
    | ||||| ||||||||||||||  | |||||||  || || || ||||| |||||||||||   ||||| | | |||||||| || |  |||||||||||    
T  31693652 ctgcatgctcttcttcagtctttaaataaatcagtatgtcatcaataaatacaaccacgaatttatccagataagcatggaaaattcagttcatatactc 31693553  T
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatct 382  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||     
T  31693552 cataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcataatgtccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcctcatcc 31693453  T
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    || || || || || || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||    
T  31693452 ttcaccttgatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactggtccatcaagtcgtcaaccctcggaagtggat 31693353  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    |||| |||||    
T  31693352 acctgttctt 31693343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 31940465 - 31940874
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||| |||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  31940465 tggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaaaacttgcaatacaatcttcagatgtt 31940564  T
Q  183 ccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 282  Q
    | ||||| | |||||||||||| || |||||||  || || || ||||| |||||||||||   ||||| | | |||||||| || || |||||||||||    
T  31940565 ctgcatgctattcttcagtctttgaataaatcagtatgtcatcaataaatacaaccacgaatttatccagataagcatggaaaattcggttcatatactc 31940664  T
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatct 382  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||| || || || || |||||||| ||||||||||||||     
T  31940665 cataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcataatgtgcatatcgtgtcctaaaggctgtcttatgcatatcctcatcc 31940764  T
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    || || || || || || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  31940765 ttcaccttgatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactggtccatcaagtcgtcaatcctcggaagtggat 31940864  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    |||| |||||    
T  31940865 acctgttctt 31940874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 492
Target Start/End: Original strand, 17187873 - 17188345
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||   || ||||| |  |||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  17187873 tcccattgtgatactgcatcaacttttgacggatccactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcac 17187972  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    |||| |||||||| ||||| |  || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| | || ||||||| |||    
T  17187973 acttcgacaatttggcatacaactttttctctttcaatacttgcaatacaattttcagatgttctgcatgctcttcctcagtccttgaataaatcagaat 17188072  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
     || || || || |||||||| ||   ||||||| | ||||| || || |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  17188073 gtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaaataggcatgaaaaattctgttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggc 17188172  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    || ||||| ||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  17188173 atcactttatattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatatcctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaa 17188272  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||| || |||||   ||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  17188273 tcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatccatcctcggaagtggatacctgttctt 17188345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 41179015 - 41179493
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||| | | | | |    
T  41179015 ggagtctcccattgtgatactgcatcaactttcgatggatcaaccgctataccatcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaa 41179114  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| |  |||||  |||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||    
T  41179115 actcacatttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaaaacttgcagcacaattctcagatgttctgaatgctcttcttcagtcttcgaataaat 41179214  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || |||||| || ||||| || ||||||||   ||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||    
T  41179215 cagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaaattcgattcatatactccatgaacacaccgggtgcgttagtaacaccg 41179314  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||| || || || || || || |||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||| || ||||    
T  41179315 aaaggcatcactttgtactcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctca 41179414  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  41179415 agtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattctt 41179493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16379564 - 16379086
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| || |  |||||||| || ||||| | ||| ||||||||||| |||||| | | | | |    
T  16379564 ggagtatcccattgcgatactgcatcaacttttgatggatcaactgatataccatcaccagaaataatatgaccaaggaaacttacttcacttagccaaa 16379465  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || |||||  |||||||||| ||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  16379464 actcacattttgacaatttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaacacaattctcagatgttctgcatgctcttcttaagtcttagaataaat 16379365  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || |||||| || ||||| || |||| |||   ||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||||||    
T  16379364 cagaatatcatcaataaataccaccaggaatttatccagaaaggcatgaaaaattcgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccg 16379265  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| || ||||    
T  16379264 aaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatcattcaccttaatttgatggtaacctgacctca 16379165  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||| || |||||   |||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16379164 aatcaatcttactaaaaacctttgcacccactaggtggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatgcctattctt 16379086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 12179900 - 12180315
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||| |    
T  12179900 tggccaagaaaactcacttcaattaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaatatttgcaacacaatcttcagatgct 12179999  T
Q  183 ccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 282  Q
    | ||||| ||||||||||||||  | ||||| | ||| || || ||| |||||||||||||   || ||   | |||||||| || || |||||||||||    
T  12180000 ctgcatgctcttcttcagtcttataataaattagaatgtcatcaatagacacaaccacgaatttattcaggtaggcatggaaaattcggttcatatactc 12180099  T
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcata------gtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcc 376  Q
    ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| || || ||||||||      |||||||||||| || || || || |||||||||||||||    
T  12180100 catgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaagacatcaccttatattcatatatatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcc 12180199  T
Q  377 tcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaa 476  Q
    ||||| || || ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  12180200 tcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaa 12180299  T
Q  477 gtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||| |||||    
T  12180300 gtggatacctgttctt 12180315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 292 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14579777 - 14579577
Alignment:
Q  292 tccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttacttta 391  Q
    |||||||||||| || |||||||| | ||| || || || ||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14579777 tccaggtgcatttgtaacaccgaacgacatcaccttatactcataatgtccataccgcattctaaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcacttta 14579678  T
Q  392 atctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattct 491  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14579677 atctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaattgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctattct 14579578  T
Q  492 t 492  Q
    |    
T  14579577 t 14579577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13319138 - 13318660
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| || | ||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  13319138 ggagtctcccactgcgatactgcgtcaactttcgaaggatcaactgcaataccactaccagaaataacgtagcctagaaaactcacttcacttaaccaga 13319039  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcata-aagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa 212  Q
    | || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||| || | ||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  13319038 actcgcacttcgacaatttagcatacaaatttct-ctctttcaaaatttgcaacataatcttcagatgttctgcatgctcctctttagtcttggaataaa 13318940  T
Q  213 tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacacc 312  Q
    | |||||||| || ||||| || ||||| ||   ||||| ||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  13318939 ttaaaatatcatcaataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacacc 13318840  T
Q  313 gaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctc 412  Q
    ||| ||||| || |||||||| || ||||||||  | || || || || |||||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || |||    
T  13318839 gaatggcatcaccttgtattcgtaatgaccatattgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctc 13318740  T
Q  413 aaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || ||||| || || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  13318739 aagtcaattttactaaaaacttttgcacccaccaactgatccatcaaatcatcaatcctcgggagtggatatctgttctt 13318660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 15014403 - 15013925
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || || ||| |||||||||  |  ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  15014403 ggagtctcccattgcgatactgcatcaaccttagatgggtctacatcaataccattacaagaaataatatggccaagaaaactcacttcgttcaaccaga 15014304  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaat-cttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa 212  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |  |||||||| |||| |||||| || ||||| || || ||| || |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  15014303 attcgcacttcgataacttggcatataacttcttctccttcagcacttgcaaaacaattctaca-atgctcggcatgttcctcctcggtcttagagtata 15014205  T
Q  213 tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacacc 312  Q
    | | |||||| || ||||||||||| || || ||||||||| | ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||    
T  15014204 ttagaatatcatctataaacacaacaacaaatcgatccaaataagcatgaaaaatacgattcatatattccataaacactccaggcgcgttagtaacacc 15014105  T
Q  313 gaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctc 412  Q
    ||||||||| ||    ||||| || || |||||||  || || || |  |||||||| |||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||     
T  15014104 gaaaggcatcaccgaatattcgtaatgtccataacatgtcctaaaggtcgtcttctgaatatcctcatctttcactctgatatggtgatagcccgatctt 15014005  T
Q  413 aaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  15014004 aaatcaatcttactgaacacacgtgcatccactaactaatccatcaaatcgtggatcctcggaagtggatacctattctt 15013925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18132982 - 18132504
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| ||| |||||||| | ||  |||    
T  18132982 ggagtctcacattgtgatactgcatcaactttcgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaagtcacttcacttaatcaga 18132883  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||| || | |||| |||||||||||| | | || ||||||||||| || |||||    
T  18132882 actcgcacttcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacataatcctcagatgttccgtaagctcctcttcagtctttgaataaat 18132783  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |  |||||||| |||||||||||||| ||   |||||   | ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  18132782 taggatatcgtcaataaacacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccg 18132683  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||| || || || || || || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||    
T  18132682 aaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttttgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctca 18132583  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18132582 agtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagtggatacctgttctt 18132504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 44778740 - 44779218
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||| | | | | |    
T  44778740 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaaccgctataccatcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaa 44778839  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || |||| ||| ||||| | |||| | |||||||| ||||| || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  44778840 actcacatttcgacagtttggcatacaatttcctttctttcaaaacttgcaacacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaat 44778939  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || ||| || || ||||| || ||||||||   ||||| ||| ||||| || || ||||||||| ||||||| || || || || || || || ||||||    
T  44778940 cagaatgtcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaaattcgattcataaactccatgaatacaccgggcgcgttagtaacaccg 44779039  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||| || ||||    
T  44779040 aaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctca 44779139  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44779140 agtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaattctcggaagcggatatctattctt 44779218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 172 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16826754 - 16826439
Alignment:
Q  172 cttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcga 271  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||  || |||||||| || || || |||||||||||||| ||   |||||     |||||||| || ||     
T  16826754 cttcagatgctctgcatgctcttcttcagtctcagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatcca-----gcatggaaaattcgg 16826660  T
Q  272 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgca 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| || || || |  ||||||||||    
T  16826659 ttcatatactccataaacacaccagacgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccaaaacgtgtcctaaaggtcgtcttctgca 16826560  T
Q  372 tatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 471  Q
    |||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  16826559 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcgtcaatcct 16826460  T
Q  472 cggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16826459 cggaagtggatacctattctt 16826439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 13943517 - 13943995
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||| | ||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||| | | | | |    
T  13943517 ggagtctcccatcgtgatactgcatcaacttttgatggatcaaccgctataccatcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaa 13943616  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || |||| ||| ||||| |  ||| | |||||||| ||||| |  | |||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  13943617 actcacatttcgacagtttggcatacaacttcctttctttcaaaacttgcagcataattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaat 13943716  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || |||||| || ||||| || ||||||||   ||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||||||    
T  13943717 cagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaaattcgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccg 13943816  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||    
T  13943817 aaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctca 13943916  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  13943917 agtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattctt 13943995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 377 - 498
Target Start/End: Original strand, 24185036 - 24185157
Alignment:
Q  377 tcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaa 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24185036 tcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaa 24185135  T
Q  477 gtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24185136 gtggatacctattcttgatagt 24185157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 329 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 11888686 - 11888526
Alignment:
Q  329 tattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctga 428  Q
    |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11888686 tattcataatgtccataacgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaa 11888587  T
Q  429 aaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 489  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11888586 acacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacctatt 11888526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 15229165 - 15229574
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    |||||||| ||||| |||||| | |||  ||||||||| || |||||  | ||||| |  ||||| |||||||||||||| || | ||| |||||||| |    
T  15229165 tggccaagaaaacttacttcacttaacccgaattcacatttggacaacatggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacataattttcagatgct 15229264  T
Q  183 ccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 282  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||   ||| | | | ||||||||  | | |||||| || ||    
T  15229265 ctgcatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatatcatcaataaacacaaccacaaatttatctagataagcatggaaagttctattcatgtattc 15229364  T
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatct 382  Q
    ||||||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| || || || || || || |||| |||||| ||  |     
T  15229365 cataaacacactaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctacatatcttccccc 15229464  T
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    || || |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15229465 ttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacgcgtgcacccactaactgatcgattaaatcatcaattctcggaagtggat 15229564  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    ||||||||||    
T  15229565 acctattctt 15229574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 15235033 - 15235442
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    |||||||| ||||| |||||| | |||  ||||||||| || |||||  | ||||| |  ||||| |||||||||||||| || | ||| |||||||| |    
T  15235033 tggccaagaaaacttacttcacttaacccgaattcacatttggacaacatggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacataattttcagatgct 15235132  T
Q  183 ccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 282  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||   ||| | | | ||||||||  | | |||||| || ||    
T  15235133 ctgcatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatatcatcaataaacacaaccacaaatttatctagataagcatggaaagttctattcatgtattc 15235232  T
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatct 382  Q
    ||||||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| || || || || || || |||| |||||| ||  |     
T  15235233 cataaacacactaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctacatatcttccccc 15235332  T
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    || || |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15235333 ttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacgcgtgcacccactaactgatcgattaaatcatcaattctcggaagtggat 15235432  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    ||||||||||    
T  15235433 acctattctt 15235442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 74 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 10418621 - 10418203
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||  || ||||| |  ||| |||||||||| | ||| || |||||||    
T  10418621 gaaataacgtggcctagaaaactcacttcatttaaccagaactcgcacttcgacagcttggcatacaacttcctctctttcaatatttgcaacacaatct 10418522  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 273  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||   ||||| ||| |||||||| || || ||    
T  10418521 tcaggtgttcggcgtgttcctcttcagtttttgaatagatcaagatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcggtt 10418422  T
Q  274 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 373  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| || || || || || || ||||||||||||    
T  10418421 catatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcata 10418322  T
Q  374 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 473  Q
    || || || || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || ||||||   ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  10418321 tcttcgtccttcactttaatttgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaaatcatcaatccgcg 10418222  T
Q  474 gaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  10418221 gaagtggatatctattctt 10418203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 495
Target Start/End: Original strand, 28755811 - 28756292
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||||   || ||||| |  || || || ||||| |||||||| ||| |||    
T  28755811 ggagtctcccattgtgataccgcatcaacctttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccaga 28755910  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || || || |||||||| |   |||| || ||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| |||||    
T  28755911 actcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaataaat 28756010  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     || ||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||||||    
T  28756011 taagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacacccggcgcattagtaacaccg 28756110  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  28756111 aaaggcatcactttgtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagacctca 28756210  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgat 495  Q
    |||||||||| || |||| || |  |||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  28756211 aatcaatcttact-aaaaatcttaacaccaaccaattgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgat 28756292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 495
Target Start/End: Original strand, 47125437 - 47125918
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||||   || ||||| |  || || || ||||| |||||||  ||| |||    
T  47125437 ggagtctcccattgtgataccgcatcaacctttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatgtaaccaga 47125536  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || || || |||||||| |   |||| || ||||||||||| || || ||  ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| || ||    
T  47125537 attcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacactattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagat 47125636  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     | |||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  47125637 tagaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccg 47125736  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  47125737 aaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagacctca 47125836  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaa-ctcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgat 495  Q
    |||||||||| || |||| || | ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  47125837 aatcaatcttactaaaaatcttg-gcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgat 47125918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16835140 - 16834695
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||| ||||| || || || || || ||||| || || |||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||| | | | | || ||||    
T  16835140 tcccattgtgataccgcatcaacctttgatggatcaactgctataccatcaccagaaataatatggccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcac 16835041  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    | || |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| |  ||    
T  16835040 attttgacaatttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcctcgtcagtcttagaataaattaggat 16834941  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
     || || ||||| |||||||| |||  ||||| ||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  16834940 gtcatcaataaatacaaccacaaacttatccagaaatgcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggc 16834841  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    || || |||||| | || ||||||||||| || || || || ||||||||||||||  |||| || || ||||| || || ||||| || ||||| ||||    
T  16834840 atcaccttgtatacgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatctccatccttcaccttaatttgatggtaaccagacctcaagtcaa 16834741  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 465  Q
    |||| |||||||    |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  16834740 tcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcatc 16834695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 14088166 - 14088644
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||   || ||||| | ||||||||| |||||||||||| | ||| | |    
T  14088166 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaa 14088265  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | || ||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||  | || || ||    
T  14088266 actcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaatagat 14088365  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    |||||| || || || || |||||||| ||   |||||   | ||||| || || |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  14088366 caaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaattctgttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccg 14088465  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||    
T  14088466 aaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctca 14088565  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | ||||| || || ||||    |||||| || |||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  14088566 agtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattctcggaagcggatatctgttctt 14088644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 283 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14291899 - 14291690
Alignment:
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatct 382  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||| |  || ||||||||||||||| |||| || || || || ||||||||||||||||||||     
T  14291899 cataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaatgcatcatcttatattcatagtgaccaaaacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatcc 14291800  T
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    || || |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  14291799 ttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaattttgctgaacacacaagcacccactaactgatccattaaatcgtcaattctcagaagtggat 14291700  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    |||| |||||    
T  14291699 acctgttctt 14291690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13970750 - 13970278
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||   || ||||| | ||||||||| |||||||||||| | ||| | || || |    
T  13970750 tcccattgtgatactgcatcaacttttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaaactcgc 13970651  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    |||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||| ||||| ||||| |||||  | || || ||||||||    
T  13970650 actttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaaccctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaatagatcaaaat 13970551  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
     || || || || |||||||| ||   |||||   | ||||| || || |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  13970550 gtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaattctgttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggc 13970451  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    || || || ||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  13970450 atcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgatctcaagtcaa 13970351  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | || || |||| || | ||||| || |||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  13970350 ttttact-aaaaatcttcgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaatcctcggaagcggatatctgttctt 13970278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 209 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 12510924 - 12510641
Alignment:
Q  209 taaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtca 308  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||| || || || |    
T  12510924 taaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatacttcataaacacaccaggcgcgttagtaa 12510825  T
Q  309 caccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccga 408  Q
    ||||||||||||| | |||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||  || ||||| ||    
T  12510824 caccgaaaggcatcattttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaatgccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctaatggtaaccaga 12510725  T
Q  409 tctcaaatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
     ||||| |||||||| ||||||| || | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  12510724 cctcaagtcaatcttactgaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaaatcgtcaattctcggaagcggatacctgttctt 12510641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 273 - 495
Target Start/End: Original strand, 10407720 - 10407942
Alignment:
Q  273 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcat 372  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||    
T  10407720 tcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacacagaaaggcattactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcat 10407819  T
Q  373 atcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 471  Q
    ||||||||| || || || ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| || | ||||| || |||||||||||||| || ||||||||    
T  10407820 atcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactgaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 10407918  T
Q  472 cggaagtggatacctattcttgat 495  Q
     ||||| |||||||| ||||||||    
T  10407919 aggaagcggatacctgttcttgat 10407942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 186 - 429
Target Start/End: Original strand, 12269875 - 12270118
Alignment:
Q  186 catgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccat 285  Q
    |||| ||||||||| |||| || |||||||| || || || |||||||||||||| ||   ||| | | | |||||||| || || ||||||||||||||    
T  12269875 catgctcttcttcaatctttgaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatcaagataagcatggaaaattcggttcatatactccat 12269974  T
Q  286 aaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatctttt 385  Q
    ||||||  ||||  |||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || || || || |||||||||||||||||||| ||     
T  12269975 aaacacatcaggaacattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttc 12270074  T
Q  386 actttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaa 429  Q
    || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12270075 accttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctgaa 12270118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 407 - 498
Target Start/End: Original strand, 43164551 - 43164642
Alignment:
Q  407 gatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43164551 gatctcaaaaaaatattgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 43164642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16328166 - 16327818
Alignment:
Q  144 tcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaa 243  Q
    |||||||||||||  |||| || |||||  ||||||| || ||||| || |||||| |||| || || || |||||||| || |||||||| || || ||    
T  16328166 tcttctctttcaaatcttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttagaatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaa 16328067  T
Q  244 ccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgacca 343  Q
    |  ||||  ||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| |  || || |||||||||||||| || ||||| || || ||||||    
T  16328066 cttatccggaaaggcatggaaaattcggttcatgtactccataaacacaccaggcgtgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtactcgtaatgacca 16327967  T
Q  344 taacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgt-gcaccc 442  Q
    || || || || ||||  || ||||||||||||||||  || || |||||||| || ||||| ||  |||| |||||||| || |||| || | |||||     
T  16327966 tatcgtgtcctaaaagtcgttttctgcatatcctcattcttcaccttaatctgatggtaaccagacatcaagtcaatcttact-aaaaatcttagcacca 16327868  T
Q  443 actaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16327867 accaactgatccatcaagtcgtcaattctcgaaagtggatacctgttctt 16327818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 422 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 15714295 - 15714219
Alignment:
Q  422 ttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15714295 ttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 15714219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 293 - 492
Target Start/End: Original strand, 24189076 - 24189275
Alignment:
Q  293 ccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaa 392  Q
    ||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||||||||| || || || |    
T  24189076 ccaggcgcattagtaacaccgaaagacatcactttatattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatatcctcatccttcaccttga 24189175  T
Q  393 tctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||| || ||||| || ||||| |||||||| || |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24189176 tctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctt 24189275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 492
Target Start/End: Original strand, 30139359 - 30139777
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  30139359 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcc 30139458  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 273  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| | | | ||| || || | |||    
T  30139459 tcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctatt 30139558  T
Q  274 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 373  Q
    ||| || |||||||| || || |||||||| |  || || || ||||| ||    || |||||||| ||||| | ||||| ||| || || ||    |||    
T  30139559 catgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatata 30139658  T
Q  374 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 473  Q
    || ||  | |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  30139659 tcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttg 30139758  T
Q  474 gaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  30139759 gaagtggataccgattctt 30139777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 492
Target Start/End: Original strand, 30148910 - 30149328
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  30148910 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcc 30149009  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 273  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| | | | ||| || || | |||    
T  30149010 tcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctatt 30149109  T
Q  274 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 373  Q
    ||| || |||||||| || || |||||||| |  || || || ||||| ||    || |||||||| ||||| | ||||| ||| || || ||    |||    
T  30149110 catgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatata 30149209  T
Q  374 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 473  Q
    || ||  | |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  30149210 tcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttg 30149309  T
Q  474 gaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  30149310 gaagtggataccgattctt 30149328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 413 - 492
Target Start/End: Original strand, 18437022 - 18437101
Alignment:
Q  413 aaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18437022 aaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgggagtggatacatattctt 18437101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 308 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 8745732 - 8745548
Alignment:
Q  308 acaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccg 407  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || || || || |  |||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||| |    
T  8745732 acaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaagggcgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctg 8745633  T
Q  408 atctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
      ||||| |||||||| ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  8745632 tcctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattctt 8745548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 8272986 - 8272568
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || ||  | |  |  ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  8272986 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcgcacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcc 8272887  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 273  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| | | | ||| || || | |||    
T  8272886 tcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctatt 8272787  T
Q  274 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 373  Q
    ||| || |||||||| || || || ||||| |  || || || ||||| ||    || |||||||| ||||| | ||||| ||| || || ||    |||    
T  8272786 catgtattccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatata 8272687  T
Q  374 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 473  Q
    || ||  | |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  8272686 tcttctgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttg 8272587  T
Q  474 gaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  8272586 gaagtggataccgattctt 8272568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11889798 - 11889623
Alignment:
Q  143 ttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacga 242  Q
    |||||||| |||| |||||| || |||||||||| ||| || ||||||||||| | |  ||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  11889798 ttcttctccttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttccttaaacttagagtatatcaaaatatcatcaatgaacacaaccacga 11889699  T
Q  243 accgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaagg 318  Q
    | ||||| ||| | ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||    
T  11889698 agcgatctaaatacgcatgaaaaatacgattcatgtattccatgaacacacctggcgcattagtgacaccgaaagg 11889623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 492
Target Start/End: Original strand, 15611656 - 15612074
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||| ||||||||| || ||| | |     || |||||||| ||||| |||||||||     
T  15611656 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacgcttagacaacttggcacacaaccggttatctttcaaaacttgcaagacaatcc 15611755  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 273  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| | | | ||| || || | |||    
T  15611756 tcaaatgctcagcatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctatt 15611855  T
Q  274 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 373  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||| |  || || || ||||| ||    || |||||||| ||||| | ||||| ||| || || ||    |||    
T  15611856 catatattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatata 15611955  T
Q  374 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 473  Q
    || ||  | || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  15611956 tcttccgccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctcagcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttg 15612055  T
Q  474 gaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  15612056 gaagtggataccgattctt 15612074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 383 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13965630 - 13965521
Alignment:
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    |||||| ||||||| ||||| || |||||| |||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13965630 tttactctaatctgatgatatcctgatctcgaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 13965531  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    ||| ||||||    
T  13965530 accgattctt 13965521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6151470 - 6151274
Alignment:
Q  44 ttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtt 143  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || || ||||||||||| |||||| | |  |    
T  6151470 ttagacggatccacagaaataccacccttagaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcgcacttagacaacttagcacataact 6151371  T
Q  144 tcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccac 240  Q
      ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| || ||||| || || ||||  || || || | ||||||||| || |||||||| |||||    
T  6151370 ggttctccttcaacacttgcaacacaatcgtcagatgctcagcatgctcctcctcagatttcgaatacaccaaaatatcatctataaacaccaccac 6151274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 15948748 - 15948639
Alignment:
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| || || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15948748 tttactctaatctgatgatatcctaatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 15948649  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    ||| ||||||    
T  15948648 accgattctt 15948639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 492
Target Start/End: Original strand, 12272254 - 12272309
Alignment:
Q  437 gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12272254 gcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctt 12272309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 390 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 6151124 - 6151022
Alignment:
Q  390 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 489  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||    
T  6151124 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatatcgatt 6151025  T
Q  490 ctt 492  Q
    |||    
T  6151024 ctt 6151022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 26791613 - 26791576
Alignment:
Q  461 tcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791613 tcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 26791576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 492
Target Start/End: Original strand, 17200503 - 17200605
Alignment:
Q  390 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 489  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||    
T  17200503 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagttgatccatcaaatcatcaatcctcgggagcggataccgatt 17200602  T
Q  490 ctt 492  Q
    |||    
T  17200603 ctt 17200605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 136
Target Start/End: Original strand, 25767871 - 25767933
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagca 136  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||    
T  25767871 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttagca 25767933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 281
Target Start/End: Original strand, 10385164 - 10385431
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||||   || ||||| |  || || || || ||||||||| | ||| |||    
T  10385164 ggagtctcccattgtgataccgcatcaacctttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaagctcacttcacttaaccaga 10385263  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| |   |||| || ||||||||||| || |||||  |||||||  | ||||| ||||| ||  ||||||| |||||    
T  10385264 actcacattttgacaacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgccctgcatgctcttcctcgttcttggaataaat 10385363  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatact 281  Q
    ||| ||||| || || ||||| || || |||  ||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  10385364 caagatatcatcaatgaacaccacaacaaacttatctagaaaagcatggaagattcgattcatgtact 10385431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 136
Target Start/End: Original strand, 18915279 - 18915341
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagca 136  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||||||    
T  18915279 gaaatcacatgaccaaggaaacttacttccttcaaccaaaattcacacttggacaacttagca 18915341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 441; Significance: 0; HSPs: 65)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Original strand, 27189156 - 27189648
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  27189156 cggacttaggggtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaataacatggccaaggaaactcacttcttt 27189255  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27189256 caaccagaattcacacttggacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 27189355  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27189356 gagtaaatcaagatatcgtcgatgaatacaaccacgaaccgatctaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 27189455  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27189456 tcacaccgaaaggcataactttgtattcgtagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttaccttaatctggtgataacc 27189555  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27189556 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 27189648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 27260084 - 27259592
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  27260084 cggacttaggggtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaataacatggccaaggaaactcacttcttt 27259985  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27259984 caaccagaattcacacttggacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 27259885  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27259884 gagtaaatcaagatatcgtcgatgaatacaaccacgaaccgatctaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 27259785  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27259784 tcacaccgaaaggcataactttgtattcgtagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttaccttaatctggtgataacc 27259685  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27259684 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 27259592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 28261758 - 28261266
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  28261758 cggacttaggagtatcccatcgtgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaataacatggccagggaaactcacttcttt 28261659  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  28261658 caaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctctgcatgttcttcttcagtcttg 28261559  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28261558 gagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 28261459  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28261458 tcacaacgaaaggcataactttgtattcatagtgaccatagcgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 28261359  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28261358 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 28261266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Original strand, 28284158 - 28284650
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  28284158 cggacttaggagtatcccatcgtgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaataacatggccagggaaactcacttcttt 28284257  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  28284258 caaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctctgcatgttcttcttcagtcttg 28284357  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28284358 gagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 28284457  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28284458 tcacaacgaaaggcataactttgtattcatagtgaccatagcgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 28284557  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28284558 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 28284650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 28340507 - 28340015
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  28340507 cggacttaggagtatcccatcgtgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaataacatggccagggaaactcacttcttt 28340408  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  28340407 caaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctctgcatgttcttcttcagtcttg 28340308  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28340307 gagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 28340208  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28340207 tcacaacgaaaggcataactttgtattcatagtgaccatagcgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 28340108  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28340107 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 28340015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 2873364 - 2872872
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  2873364 cggacttaggagtatcccattgcgatacaacttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaataacatggccaaggaaactcacttcttt 2873265  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2873264 caaccaaaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctccttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttg 2873165  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2873164 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacataaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 2873065  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2873064 taacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacc 2872965  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872964 cgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 2872872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22828880 - 22828424
Alignment:
Q  42 ctttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaag 141  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22828880 ctttagacggatccacaacaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaag 22828781  T
Q  142 tttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacg 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||    
T  22828780 tttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacgcaactacg 22828681  T
Q  242 aaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgac 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22828680 aaccgatccaaaaatgcatggaagatacgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgac 22828581  T
Q  342 cataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacc 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22828580 cataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatctttatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacc 22828481  T
Q  442 cactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22828480 cactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 22828424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 27564386 - 27563902
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||  ||  |||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  27564386 taggagtctcccattgcgataccgcttcagct--agacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaacca 27564289  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27564288 gaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 27564189  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  27564188 atcaaaatttcatcgatgaacacaaccacgaaccgatctaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactttaggtgcaatggtcacac 27564089  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27564088 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgccttctgcatatcttcatcttttactttaatttggtgataacctgatct 27563989  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27563988 taaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 27563902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 24294337 - 24293851
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  24294337 taggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaattccatcactagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaacca 24294238  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24294237 gaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 24294138  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24294137 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacac 24294038  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||    
T  24294037 caaaaggcataactttatattcatagtgaccataacacgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacct 24293938  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24293937 caaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 24293851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 25114278 - 25114764
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |    
T  25114278 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatccacggcaataccatccccggaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaacca 25114377  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  25114378 gaattcacacttagataatttgacataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtag 25114477  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25114478 atcaaaatatcatcgatgaacaaaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgtattggtaacac 25114577  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| |  |     
T  25114578 caaaaggcataactttatattcacagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcaacctttactttaatctgatgataacctggccc 25114677  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25114678 caaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 25114764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 498
Target Start/End: Original strand, 19866421 - 19866899
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |||| ||||    
T  19866421 tcccattgcgatactgcattaactttagagggatctacaacaatgccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcac 19866520  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
     |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19866521 gcttagatagtttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttctttttcagtcttggagtaaatcaaaat 19866620  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
    ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19866621 atcatcgataaaaacaaccacaaagcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggc 19866720  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  19866721 ataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctcgtgataacctgatcttaaatcaa 19866820  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19866821 tcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 19866899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 498
Target Start/End: Original strand, 22435603 - 22436081
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||||||||| || |||| | |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |||| ||||    
T  22435603 tcccattgcgatactgcatcgagtatagagggatctacagcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcac 22435702  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22435703 acttagataatttaggataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcaacatgttcttctttagtcttggagtaaattaaaat 22435802  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  22435803 atcatcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactctaggtgcattggtaacaccaaaaggc 22435902  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22435903 ataactttgtattcatagtgaccataacacgttttgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaa 22436002  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22436003 tcttgctgaaaacacatgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattattgatagt 22436081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16926193 - 16925708
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| |    
T  16926193 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacgggtctactgcaataccattaccagaaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaacca 16926094  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16926093 gaattcacacttagataacttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 16925994  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16925993 atcaaaatatcatcgatgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgcttcatatactccaaaaacactccaggtgcattggtcacac 16925894  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||    
T  16925893 cgaacggcataacattatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctacatatcttcatctttcactttaatctggtgataaccttacct 16925794  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16925793 caaatcaatcttgctaaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctc-gaagtagatacctattcttgatagt 16925708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16962037 - 16961551
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||  |||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| |    
T  16962037 taggagtctcccattgcgatactgcttcaattttagacgggtctactacaataccattaccagaaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaacca 16961938  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16961937 gaattcacacttagatgacttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 16961838  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16961837 atcaaaatatcgtcaatgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacacttcaggtgcattggtcacac 16961738  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  16961737 cgaacgacataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacct 16961638  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16961637 caaatcaatcttgctaaaaactttcgcaccgactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctattcttgatagt 16961551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 25763783 - 25763297
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| |    
T  25763783 taggagtctcccattgcgataccgctttaactttagacggatctactgcaataccgtcaccagaaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaacca 25763684  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25763683 gaattcacaattagataatttagcatacatttttatctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttctccttcagtcttggagtaa 25763584  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    || ||||| || || ||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  25763583 attaaaatgtcatcaataaagacaaccataaagcgatccaaaaatgcaaggaagatgcgattcatatactccataaacagtccaggtgcatttgtaacac 25763484  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  25763483 cgaaaggcataactttatactcatagtggccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttacttttttctggtgataacctgatct 25763384  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25763383 caaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 25763297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20634495 - 20634015
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||   || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |    
T  20634495 taggagtctcccattgcaataccgcttcaactttagacggatctactgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaacca 20634396  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| || ||||||||||||| || ||||||||||    
T  20634395 gaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttctttagacttggagtaa 20634296  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  20634295 atcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacac 20634196  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20634195 cgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttctactttaatctggtgataaccagatct 20634096  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20634095 caaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 20634015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 5837774 - 5837288
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||  || ||||| || |||||||| ||||| || || |||||| |    
T  5837774 taggagtctcccattacgataccgcttcaactttagacggatcgactgcaataccattaccagaaataacgtggccaagaaaacttacctctttcaacca 5837675  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||    
T  5837674 gaactcacacttagacaacttggcataaagcttcttttctttcaacacttgcaaaacagtcttcagatgctcaacatgttcttcctcagtcttggaataa 5837575  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||| ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5837574 atcagaatgtcgtcaatgaagacaaccacaaagcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacac 5837475  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  5837474 caaaaggcataactttgtactcatagtgaccataacgcgttctgaaagcggtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacct 5837375  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5837374 caaatcaatcttgctgaaaacaaaagcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 5837288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22761010 - 22760530
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||| || |||||||||   ||  |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |    
T  22761010 taggagtctcccattgcgatattgcttcaactttagacagatctactgcaataccactaccacaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaacca 22760911  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || || | ||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22760910 gaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttacaaaaccagcttcaaatgctcagcatgctcttcttcagacttggagtaa 22760811  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  22760810 atcaaaatatcattaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacac 22760711  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22760710 cgaaaggcataactttatactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttgtgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 22760611  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22760610 caaatcaatcttgctgacaacacgtgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 22760530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 20 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 25608408 - 25607930
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||   || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |||||||||    
T  25608408 tcccattgcaataccgcttcaactttagacggatctactgcaataccactaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcac 25608309  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25608308 actttgacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaaaacaatcttcaaatgctcagcatcttcttcttcagacttggagtaaatcaaaat 25608209  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||    
T  25608208 atcatcaataaaaacaactacgaatcgatccaaaaatgcatgaaagatgcaattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaacagc 25608109  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    || || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  25608108 attaccttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatgtcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcta 25608009  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25608008 tcttgctgaaaacacatgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattctttatagt 25607930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 432
Target Start/End: Original strand, 22444001 - 22444413
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||||||||| || |||| | |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |||| ||||    
T  22444001 tcccattgcgatactgcatcgagtatagagggatctacagcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcac 22444100  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22444101 acttagataatttaggataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcaacatgttcttctttagtcttggagtaaattaaaat 22444200  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  22444201 atcatcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactctaggtgcattggtaacaccaaaaggc 22444300  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22444301 ataactttgtattcatagtgaccataacacgttatgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaa 22444400  T
Q  420 tcttgctgaaaac 432  Q
    |||||||||||||    
T  22444401 tcttgctgaaaac 22444413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18406499 - 18406019
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||||   || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |    
T  18406499 taggagtctcccattgcgataccgcatcaactttcgacggatctactgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaacca 18406400  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |  |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18406399 gaattcacacttaaacaatttagcatatagtttcttctctttcaacacttgcaaaaccagtttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 18406300  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  18406299 atcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacaaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacac 18406200  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||| ||||| || || || ||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18406199 cgaacggcatcaccttatactcataatgtccataatacgttctgaaggctgtcttctgcatatcttaatctttcactttaatctggtgatgacccgatct 18406100  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18406099 caaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaggtggatacctattctt 18406019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 275 - 498
Target Start/End: Original strand, 16573879 - 16574102
Alignment:
Q  275 atatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16573879 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatat 16573978  T
Q  375 cctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgg 474  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16573979 cttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcgg 16574078  T
Q  475 aagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16574079 aagtggatacctattcttgatagt 16574102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 275 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16621501 - 16621278
Alignment:
Q  275 atatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621501 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatat 16621402  T
Q  375 cctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgg 474  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16621401 cttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcgg 16621302  T
Q  475 aagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16621301 aagtggatacctattcttgatagt 16621278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 23080195 - 23080558
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| || |||||||||   ||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  23080195 taggagtctcccattgcgatactacatcaactttagagggatctactgcaataccactaccaaaaataacatggccaaggaaactcacctctttcaacca 23080294  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| || ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23080295 gaattcaaactttgataatttagcataaagtttcttctctttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcctcagacttggagtaa 23080394  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  23080395 atcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaaacgatctagaaatgcatgaaaaatgcgattcatgtactccataaacactccaggtgcatttgtaacac 23080494  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatc 375  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  23080495 cgaaagacatcactttatattcataatgtccataacgcgttctaaaatccgtcttctgcatatc 23080558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 131 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23086207 - 23085846
Alignment:
Q  131 ttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataa 230  Q
    ||||||||||| |||||||| | || |||||| || |||||||||| ||| || |||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||| |    
T  23086207 ttagcataaagcttcttctcctccagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcatacttagagtatatcaaaatatcatcgatga 23086108  T
Q  231 acacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgta 330  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||   ||    
T  23086107 acacaaccacgaagcgatccaaatacgcatgaaaaatacgattcatgtactccataaacacacccggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactgaata 23086008  T
Q  331 ttcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaa 430  Q
    |||||| || |||||||| || || || || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||     
T  23086007 ttcataatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctagatatcttcatcttttactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgctaaac 23085908  T
Q  431 actcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  23085907 acacgtgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaattcttggaagggaatacctattctt 23085846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 271 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18183663 - 18183442
Alignment:
Q  271 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgc 370  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||||    
T  18183663 attcatgtacaccataaacacaccaggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgcgtgctaaaagacgtcttctgc 18183564  T
Q  371 atatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 470  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18183563 atatcttcatctttcactttaatctggtgataaccggacctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatgcatcaagtcatcaattc 18183464  T
Q  471 tcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18183463 tcggaagtggatacctattctt 18183442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 25769572 - 25770050
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| ||||| |||||| | ||| |||    
T  25769572 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaga 25769671  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |  ||| | | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||  ||| || |||||    
T  25769672 attcacatttggacaacttagcatacaacttcatttatttcaacacttgcaacacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcatacttagaataaat 25769771  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |  ||||| || |||||||||||||| ||   ||||  | | |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  25769772 taggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccggataagcatggaaaattcggttcatatactccataaatacaccaggcgcattagtaacaccg 25769871  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||| ||| || || || ||||| || ||||| || || || || ||  | ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||    
T  25769872 aaagacatcaccttatactcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccattttctgcatatcctcatcattcaccttaatctgatggtaacctgacctca 25769971  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25769972 aatcaattttgctgaatacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctgttctt 25770050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14378400 - 14377991
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||| | || ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |    
T  14378400 tggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaactcacatttcgacaacttggcatacaactttttctctttcaagacttgcaatacaatcttcagatgct 14378301  T
Q  183 ccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 282  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||||| | |||| || ||||| |||||||| ||   ||||| ||| ||||| || || || |||||||||||    
T  14378300 ctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcagactatcatcaataaatacaaccacaaatttatccagaaaagcatgtaaaattcggttcatatactc 14378201  T
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatct 382  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||||||||||||     
T  14378200 catgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatcc 14378101  T
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    || || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| || ||||||||||    
T  14378100 ttcaccttaatttgatggtaacctgatctcaattcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccaacaagtcataaatcctaggaagtggat 14378001  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    |||| |||||    
T  14378000 acctgttctt 14377991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14379950 - 14379541
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||| | || ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |    
T  14379950 tggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaactcacatttcgacaacttggcatacaactttttctctttcaagacttgcaatacaatcttcagatgct 14379851  T
Q  183 ccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 282  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||||| | |||| || ||||| |||||||| ||   ||||| ||| ||||| || || || |||||||||||    
T  14379850 ctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcagactatcatcaataaatacaaccacaaatttatccagaaaagcatgtaaaattcggttcatatactc 14379751  T
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatct 382  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||||||||||||     
T  14379750 catgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatcc 14379651  T
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    || || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| || ||||||||||    
T  14379650 ttcaccttaatttgatggtaacctgatctcaattcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccaacaagtcataaatcctaggaagtggat 14379551  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    |||| |||||    
T  14379550 acctgttctt 14379541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 495
Target Start/End: Original strand, 15461064 - 15461545
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||  || ||||| || ||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  15461064 ggagtttcccactgagatactgcatcaactttcgaaggatcaaccgctataccattaccagaaataacgtggcctagaaaactcacttcacttaaccaga 15461163  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcata-aagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa 212  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |  || || ||||||||||  ||||| || ||||| |||||||| || || ||||    
T  15461164 aatcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaatcttcaagtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaataaa 15461262  T
Q  213 tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacacc 312  Q
    ||| |||||| || |||||||| ||||| ||   ||| | ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||    
T  15461263 tcagaatatcatctataaacaccaccacaaatttatctagaaaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacacc 15461362  T
Q  313 gaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctc 412  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||| |||    
T  15461363 gaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgttctaaaggccgtcttttgcatatcttcgtctttcactttaatttgatggtaacccgacctc 15461462  T
Q  413 aaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgat 495  Q
    || ||||||||||| ||||||   ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  15461463 aagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaaatcatcaatccgcggaagtggatatctattcttgat 15461545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 270 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18963385 - 18963163
Alignment:
Q  270 gattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctg 369  Q
    ||||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| |||   ||||| || || |||||||| || || ||||  ||||||||    
T  18963385 gattcatgtactccataaatacacctggtgcattagtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaagtcgtcttctg 18963286  T
Q  370 catatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatt 469  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18963285 catatcgtcatctttcactttaatctggtgatagcccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatacatcaaatcatcaatt 18963186  T
Q  470 ctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  18963185 cttggaagtggatacctattctt 18963163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 83 - 475
Target Start/End: Original strand, 19454821 - 19455213
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |    
T  19454821 tggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacactttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaaaacttgcaatactatcttcagatgct 19454920  T
Q  183 ccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 282  Q
    | ||||| ||||||| |||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||   ||||||  | |||||||| || || |||||||||||    
T  19454921 ctgcatgctcttctttagtctttgaataaatcaagatgtcatcaataaatacaaccacaaatttatccaagtaggcatggaaaattcggttcatatactc 19455020  T
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatct 382  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || || || || || ||||||| |||||| |||||     
T  19455021 catgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaagacatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctacatatcttcatcc 19455120  T
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgga 475  Q
    || || |||||||| || ||||| || ||||| | |||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  19455121 ttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtaaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcgga 19455213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 355 - 498
Target Start/End: Original strand, 21755002 - 21755145
Alignment:
Q  355 gaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatcc 454  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  21755002 gaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacaaatgcacccactaactgatcc 21755101  T
Q  455 atcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21755102 atcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattcttgatagt 21755145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 28281366 - 28280888
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| |  || |||||||||||||||||| | | | | |    
T  28281366 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaaccgctataccatcaccagaaataatgtgaccaaggaaactcacttcacttagccaaa 28281267  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || |||| ||| ||||| |  ||| | |||||||| ||||| || |||||  |||||||||| ||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  28281266 attcacatttcgacagtttggcatacaacttcctttctttcaaaacttgcaacacaattctcagatgttctgcatgctctccttcagtcttcgaataaat 28281167  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || ||| || || ||||| || ||||||||   ||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||||||    
T  28281166 cagaatgtcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaaattcgattcatatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacaccg 28281067  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||    
T  28281066 aaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctca 28280967  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| ||||| ||   |||||| || | ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  28280966 agtcaatcttactgaacacctttgcacctaccagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattctt 28280888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 92 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 10467324 - 10466924
Alignment:
Q  92 aaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgtt 191  Q
    |||||||||||  | ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| |   |||| |||||||| ||||| || |||||  ||||||| || ||||| |    
T  10467324 aaactcacttcgcttaaccagaactcacattttgacaactttgcatacaacctcttttctttcaaaacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgct 10467225  T
Q  192 cttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacac 291  Q
    | |||||| ||||||| || || | |||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  10467224 cctcttcattcttggaatagattagaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccataaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacac 10467125  T
Q  292 tccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttacttta 391  Q
     ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  || || || || || || |||||||||||||||||||| || || ||     
T  10467124 accaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgactttatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttt 10467025  T
Q  392 atctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattct 491  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10467024 atctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctgttct 10466925  T
Q  492 t 492  Q
    |    
T  10466924 t 10466924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 489
Target Start/End: Original strand, 19881026 - 19881501
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||||   || ||||| | ||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  19881026 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacctttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaga 19881125  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||  | || || ||    
T  19881126 actcgcactttgacaatttggcatacagtttcttctctttcaatacttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaatagat 19881225  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    |||||| || || || ||||||||||| ||   |||||   | ||||| || || | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  19881226 caaaatgtcatcaatgaacacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaatcctattcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccg 19881325  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || ||||  || |||||||| || || || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||    
T  19881326 aaaggcatcaccttatatttgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatgtcttcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctca 19881425  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 489  Q
    | ||||| || || ||||    |||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  19881426 agtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagcggatatctatt 19881501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 19436799 - 19437208
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    ||||| || |||||||||||| | ||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |  |  |||||||| |  | ||| || ||||||||||||||||    
T  19436799 tggcccagaaaactcacttcacttaagcagaactcacacttcgacaacttagcatacaactctttctcttttagaatttgcaacacaatcttcagatgtt 19436898  T
Q  183 ccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 282  Q
    | ||||| |||||||||||  | || || |||| ||| || || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| ||  | |||||||||||    
T  19436899 ctgcatgctcttcttcagttctagaatagatcagaatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaatttggttcatatactc 19436998  T
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatct 382  Q
    ||| ||||| | ||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| || || ||||| || || || || |||||||||||||||||||||||     
T  19436999 catgaacacactaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcatcc 19437098  T
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    || || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| || |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  19437099 ttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctctgcacccaccaactgatccatcaagtcataaatcctcggaagtggat 19437198  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    |||| |||||    
T  19437199 acctgttctt 19437208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 484
Target Start/End: Original strand, 21473398 - 21473798
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||| |||||||||| || ||||| ||  |||| |  ||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21473398 tggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttgacatacaacttcctttctttcaacacttgcaacacaatcttcagatgtt 21473497  T
Q  183 ccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 282  Q
    | ||||| || |||||| |||| || ||||| |  ||||| |  |||||||||||||| ||   ||||| | | ||||| || || || |||||||||||    
T  21473498 ctgcatgctcctcttcattcttagaataaattaggatatcataaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatgaaaaattcggttcatatactc 21473597  T
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatct 382  Q
    ||||||||| ||||  ||||| || ||| |||||| ||| || || || ||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||||||     
T  21473598 cataaacacaccagc-gcattagtaacatcgaaagacatcaccttatactcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgcatatcctcatcc 21473696  T
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  21473697 ttcactttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgttgaacacacgagcacccactaactgattcattaaatcatcaattctaggaagtcgat 21473796  T
Q  483 ac 484  Q
    ||    
T  21473797 ac 21473798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 492
Target Start/End: Original strand, 18796454 - 18796896
Alignment:
Q  50 ggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttct 149  Q
    |||||||| |||||||||   || ||||| |  |||||| | |||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |  |||||||    
T  18796454 ggatccactgcaataccactaccagaaataatgtggccatgaaaactcacttcatttaaccagaactcacacttcgacaatttggcatacaacttcttct 18796553  T
Q  150 ctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatc 249  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || || |||||||| |  || || || |||||||| ||   |||    
T  18796554 ctttcaatacttgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagttctagaatagatcaaaatgttatcaatgaatacaaccacaaatttatc 18796653  T
Q  250 caaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgc 349  Q
    || | | |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| |||||  |||| || |||| ||||||||| || || ||||| || |||||||| ||     
T  18796654 cagataggcatggaaaattctgttcatatactccatgaacacaccaggcacattagtaacactgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgt 18796753  T
Q  350 gttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaact 449  Q
    || || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| || || || || ||||| ||||| || || ||||    |||||| || ||||    
T  18796754 gtcctaaaggcagtcttctgcatatcctcatccttcaccttgatctgatggtagcctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaact 18796853  T
Q  450 gatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  18796854 gatccatcaagtcgtcaatcctcggaagcggatacctgttctt 18796896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 495
Target Start/End: Original strand, 24366221 - 24366621
Alignment:
Q  95 ctcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttctt 194  Q
    ||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| || ||||||||||| || |||||  |||| || || ||||| || |    
T  24366221 ctcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcaggtgctctgcatgctcct 24366320  T
Q  195 cttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactcc 294  Q
    | ||| ||||||| || || |||||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  24366321 cctcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaatacacc 24366420  T
Q  295 aggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatc 394  Q
     ||  |||| || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || || || |||    
T  24366421 tggcacattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttttgcatatcctcatccttcacctttatc 24366520  T
Q  395 tggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttg 493  Q
    || |||||||| || |||||||||||||| ||||||| || | ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  24366521 tgatgataaccagacctcaaatcaatcttactgaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttg 24366619  T
Q  494 at 495  Q
    ||    
T  24366620 at 24366621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18196285 - 18196024
Alignment:
Q  15 gagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaa 114  Q
    |||| |||||||||||||  || || |||||||| ||||| || ||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||| |||| || |||||| | ||    
T  18196285 gagtctcccattgcgatattgcatcaactttagatggatctaccgcaataccattaccagaaataacatggccaagaaaattcacatctttcaaccaaaa 18196186  T
Q  115 ttcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatc 214  Q
    |||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| |  ||||| |||||||| | ||||||||| |||    
T  18196185 ttcatactttgacaatttagcatatagcttcttctctttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatgcttagcatgctcttcttcggacttggagtatatc 18196086  T
Q  215 aaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcat 276  Q
    |||||||| |  || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  18196085 aaaatatcataaatgaacacaaccacaaaacgatccaaaaacgcatgaaaaatacgattcat 18196024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 34644139 - 34643661
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||||  ||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| | ||| |||    
T  34644139 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacctttgaaggatccactgcaataccacttccagaaataatatggccaaggaaacttacttcacttaaccaga 34644040  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||  | |||||||| ||||| ||||| || ||  | || || ||    
T  34644039 actcacacttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaacacaattcttagatgttctgcatgctcttcctccgttgtcgaatagat 34643940  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    |||||| || || ||  |||||||||| ||   ||||| | | ||||| || || | ||||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||    
T  34643939 caaaatgtcatcaatgtacacaaccacaaatttatccagataagcatgaaaaattctattcatatactccatgaacaccccaggcgcgttagtaacaccg 34643840  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||| || |||||||| || || || || || ||||| || ||||    
T  34643839 aaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatgtcttcatctttcaccttgatttgatggtaacctgacctca 34643740  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaa-ctcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | ||||| || || |||| || | ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  34643739 agtcaattttactaaaaatcttg-gcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctcggaagaggatatctgttctt 34643661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 359 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 30679215 - 30679082
Alignment:
Q  359 gctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatca 458  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  30679215 gctgtcttctgcatatcctcatccgtcactttaatctgatgatagcctgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgtacccactaactgatccatca 30679116  T
Q  459 aatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  30679115 aatcatcaattcttggaagtagatacctattctt 30679082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21568544 - 21568066
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||| ||||||||   || ||||| |  ||||| || ||||| |||||| | | | |||    
T  21568544 ggagtctcccattgcgatactgcatcaactttcgaaggatcaacaacaataccactaccagaaataatgtggccgagaaaacttacttcaattagccaga 21568445  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| || | |||  ||||| ||||||||||  |||| || ||||| ||||| || |||||    
T  21568444 attcacatttcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaaaacctataattcaatcctcagatgttctacatgctcctcttcggtcttagaataaat 21568345  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || |||||| || ||||| |||||||  ||   ||||| ||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||    
T  21568344 cagaatatcatcaataaatacaaccataaatttatccagaaaagcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccg 21568245  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||| | || || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || ||||| || ||||    
T  21568244 aaagacatcactttgtattcgtaatgaccataaagtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatggtaacctgacctca 21568145  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| || ||||    |||||| |  || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  21568144 agtcaatcttactaaaaatctttgcaccaaacaattgatccatcaagtcgtcaatcctcggcagcggatacctgttctt 21568066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 308 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 24516667 - 24516483
Alignment:
Q  308 acaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccg 407  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| |    
T  24516667 acaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctg 24516568  T
Q  408 atctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | ||||| |||||||| || |||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24516567 acctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctt 24516483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18965850 - 18965640
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||| |||||| | || |||||||| ||||| || | ||||||||  || ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  18965850 taggagtctcccattgtgatacaacatcaactttagatggatctactgtaataccattaccagaaataatatggccaaggaaactcacctcattcaacca 18965751  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| || | |||||||||||||| ||| |  ||     
T  18965750 gaattcacactttgacaacttagcatataacttcttctctttcatcacttgaaaaacaatcttcaaatgctcagaatgttcttcttcagacttagcatat 18965651  T
Q  212 atcaaaatatc 222  Q
    |||||||||||    
T  18965650 atcaaaatatc 18965640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16380866 - 16380448
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  16380866 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcc 16380767  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 273  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| | | | ||| || || | |||    
T  16380766 tcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctatt 16380667  T
Q  274 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 373  Q
    ||| || |||||||| || || |||||||| |  || || || ||||| ||    || |||||||| ||||| | ||||| ||| || || ||    |||    
T  16380666 catgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatata 16380567  T
Q  374 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 473  Q
    || ||  | |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  16380566 tcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttg 16380467  T
Q  474 gaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  16380466 gaagtggataccgattctt 16380448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 383 - 492
Target Start/End: Original strand, 23998345 - 23998454
Alignment:
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    |||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23998345 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttgctaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 23998444  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    ||| ||||||    
T  23998445 accgattctt 23998454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16648462 - 16648044
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || ||  | |  |  ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  16648462 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcgcacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcc 16648363  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 273  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| | | | ||| || || | |||    
T  16648362 tcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctatt 16648263  T
Q  274 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 373  Q
    ||| || |||||||| || || || ||||| |  || || || ||||| ||    || |||||||| ||||| | ||||| ||| || || ||    |||    
T  16648262 catgtattccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatata 16648163  T
Q  374 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 473  Q
    || ||  | |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  16648162 tcttctgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctttgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttg 16648063  T
Q  474 gaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  16648062 gaagtggataccgattctt 16648044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19487757 - 19487528
Alignment:
Q  82 atggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgt 181  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | ||| |||||||||| || ||||| || ||||| |  |||||  | ||||||||||| || |||||||| | |||     
T  19487757 atggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttctttaccttcaacacttgcaacacaatctttaaatgc 19487658  T
Q  182 tccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatact 281  Q
    || ||||| |||||||||| ||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||          |||||| ||||    
T  19487657 tctgcatgctcttcttcagacttagaataaatcaagatgtcatcaataaaaacaaccacaaaccgatccaaataagcat----------attcatgtact 19487568  T
Q  282 ccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcat 321  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  19487567 ccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcat 19487528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 389 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 8761930 - 8761835
Alignment:
Q  389 ttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatac 484  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  8761930 ttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaaaactttcgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatac 8761835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 419 - 492
Target Start/End: Original strand, 23080556 - 23080629
Alignment:
Q  419 atcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  23080556 atcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtgaatatctattctt 23080629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 485
Target Start/End: Original strand, 18450231 - 18450702
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||||||| |||| || || || ||||| || || |||||||||||||  || ||||| | ||| ||||| |||||| |||| |||||| |||    
T  18450231 ggagtctcccattgcaataccgcatcaaccttagatgggtctacagcaataccattaccagaaataatatgaccaagaaaactcccttcgttcaaccaga 18450330  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttc-ttcagtcttggagtaaa 212  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |  |||||| | |||| |||||| || |||||  ||| ||| ||  ||||||| || || | | || ||||| |    
T  18450331 attcgcacttcgataacttggcatataacttcttccccttcagcacttgcaaaacaattctcaaatgctcgacatgttcctccttgaat-ttagagtata 18450429  T
Q  213 tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacacc 312  Q
    ||| |||||| || ||||||||||| || || ||||| | | | | ||| || || || || ||||| |||||||| |||||  | ||||| || |||||    
T  18450430 tcagaatatcatctataaacacaacaacaaaacgatctagataagtatgaaaaatacggttaatatattccataaatactcccagcgcattagtaacacc 18450529  T
Q  313 gaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctc 412  Q
    ||||||||| ||    ||||| || |  |  ||||| || || || |  |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||     
T  18450530 gaaaggcatcacaaaatattcgtaatttctgtaacgtgtcctaaaggtcgtcttctgaatatcctcttctttcactttgatctagtgatagcccgagctt 18450629  T
Q  413 aaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 485  Q
    || ||||| || ||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  18450630 aagtcaattttactgaacacaagcgcacccactaattgatccatcaaatcgttgatcctcggaagtggatacc 18450702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 1646991 - 1646889
Alignment:
Q  390 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 489  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  1646991 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctcagcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 1646892  T
Q  490 ctt 492  Q
    |||    
T  1646891 ctt 1646889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 29590473 - 29590385
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttc 102  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  29590473 ggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctaaaaaactcacttc 29590385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 390 - 492
Target Start/End: Original strand, 16100119 - 16100221
Alignment:
Q  390 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 489  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| ||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||    
T  16100119 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagttgatccatcaaatcatcaatccttggtagtggataccgatt 16100218  T
Q  490 ctt 492  Q
    |||    
T  16100219 ctt 16100221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 485
Target Start/End: Original strand, 14130593 - 14130668
Alignment:
Q  410 ctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 485  Q
    ||||||||||||||||| || |||   ||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14130593 ctcaaatcaatcttgctaaacacttccgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 14130668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 172
Target Start/End: Original strand, 18577997 - 18578095
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatc 172  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || ||| |||||||||| |||||| | | ||  ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  18577997 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcatacttagacaacttagcacataattggttctctttcaagacttgcaacacaatc 18578095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Original strand, 21754940 - 21754997
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatc 69  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  21754940 taggagtctcccattgcgatactgcatcgactttagagggacctacagcaataccatc 21754997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 136
Target Start/End: Original strand, 14130231 - 14130319
Alignment:
Q  48 acggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagca 136  Q
    |||||||||||| ||||||| ||   ||||| ||||| |||||||||||||||||   |||| | || |||||||||||||| ||||||    
T  14130231 acggatccacagaaataccacctttagaaatcacatgaccaaggaaactcacttctcacaaccaaaactcacacttagacaacttagca 14130319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23025865 - 23025821
Alignment:
Q  448 ctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  23025865 ctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagcggataccgattctt 23025821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 1647307 - 1647252
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaa 129  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||    
T  1647307 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaa 1647252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 136
Target Start/End: Original strand, 16234816 - 16234878
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagca 136  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  16234816 gaaatcacatgacccaggaaactcccttccttcaaccaaaattcacacttagacaacttagca 16234878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5295629 - 5295573
Alignment:
Q  144 tcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcag 200  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  5295629 tcttttctttcaacacttgcaacacaattttcagatgctctgcatgctcttcttcag 5295573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19985939 - 19985847
Alignment:
Q  44 ttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagca 136  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||    
T  19985939 ttagaaggatccacagaaataccacccttagaaatcacatgaccaagaaaactcgcttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttagca 19985847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 441; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 27667088 - 27666596
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27667088 cggacttaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaataacatggccaaggaaactcacttcatt 27666989  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27666988 caaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttg 27666889  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27666888 gagtaaatcaagatatcgtcgatgaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 27666789  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27666788 tcacaccgaaaggcaaaactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 27666689  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27666688 tgatctcaaatctatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcgaaagtggatacctattcttgatagt 27666596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 498
Target Start/End: Original strand, 40710576 - 40711060
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  40710576 ggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatctccggaaataacatggccaaggaaactcacctctttcaaccaga 40710675  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40710676 attcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagat 40710775  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40710776 caaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 40710875  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  40710876 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctca 40710975  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40710976 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 40711060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 27520200 - 27520686
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  27520200 taggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaattccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaacca 27520299  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27520300 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 27520399  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27520400 attaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 27520499  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  27520500 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgacct 27520599  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27520600 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 27520686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 37290094 - 37289602
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  37290094 cggacttaggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttcttt 37289995  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  37289994 caaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttg 37289895  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37289894 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 37289795  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37289794 taacaccaaaaggcataactttatattcataatgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacc 37289695  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37289694 tgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 37289602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Original strand, 41772630 - 41773122
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  41772630 cggacttaggagtatcccattgcgataccgcttcaactttagacggatccactgcaattccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttcttt 41772729  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  41772730 caaccagaattcacatttagacaatttagcataaaaattcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttg 41772829  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41772830 gagtaaatcaagatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactctaggtgcattgg 41772929  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41772930 taacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacc 41773029  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41773030 tgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 41773122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 498
Target Start/End: Original strand, 16358313 - 16358782
Alignment:
Q  29 gatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagaca 128  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16358313 gataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagaca 16358412  T
Q  129 atttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgat 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16358413 atttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgat 16358512  T
Q  229 aaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttg 328  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  16358513 aaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaagggcataacttta 16358612  T
Q  329 tattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctga 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16358613 tattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctga 16358712  T
Q  429 aaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358713 aaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 16358782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 498
Target Start/End: Original strand, 34568305 - 34568774
Alignment:
Q  29 gatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagaca 128  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  34568305 gataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagaca 34568404  T
Q  129 atttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgat 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34568405 atttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgat 34568504  T
Q  229 aaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttg 328  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  34568505 aaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaagggcataacttta 34568604  T
Q  329 tattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctga 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  34568605 tattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctga 34568704  T
Q  429 aaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34568705 aaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 34568774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 27612148 - 27612634
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  27612148 taggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaattccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaacca 27612247  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27612248 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 27612347  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  27612348 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactc 27612447  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27612448 caaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatct 27612547  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27612548 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctggtccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatttttgatagt 27612634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 14998337 - 14997845
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  14998337 cggacttaggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttcttt 14998238  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  14998237 caaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcctcttcagtcttg 14998138  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14998137 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 14998038  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14998037 taacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacc 14997938  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997937 tgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 14997845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Original strand, 22349707 - 22350199
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22349707 cggacttaggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacgtatccacagcaataccatcaccataaataacatggccaagaaaactcacttcttt 22349806  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22349807 caaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttg 22349906  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22349907 gagtaaatcaaaatatcatcgatgaatacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgtgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 22350006  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350007 taacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 22350106  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22350107 tgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaaatggatacctattcttgatagt 22350199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22331479 - 22330993
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||| |    
T  22331479 taggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatagcctagaaaactcacttctttcaacca 22331380  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22331379 gaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 22331280  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22331279 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacac 22331180  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  22331179 caaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacct 22331080  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22331079 caaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 22330993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 18780908 - 18781394
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||  |    
T  18780908 taggagtctcccattgcgataccgctttaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttccttcaatca 18781007  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18781008 gaattcacacttagacaatttcgcaaaaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 18781107  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18781108 atcaaaatgtcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaaggcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcgttggtcacac 18781207  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  18781208 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatct 18781307  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18781308 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaggtggatacctattcttgatagt 18781394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 22136462 - 22136948
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  22136462 taggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaacca 22136561  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22136562 gaattcacacttagacaatttagcaaaaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 22136661  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  22136662 atcaaaatgtcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatataccccataaacactccaggtgcattagtaacac 22136761  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22136762 caaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgtcctgaaagccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatct 22136861  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136862 caaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 22136948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 19771754 - 19772240
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  19771754 taggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaattccatcaccaaaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaacca 19771853  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19771854 gaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaa 19771953  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19771954 atcaagatatcgtcgatgaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 19772053  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | ||    
T  19772054 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgatatcctcacct 19772153  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19772154 caaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagttgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 19772240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 29474665 - 29474179
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  29474665 taggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaacca 29474566  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  29474565 gaattcacacttcgataatttatcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 29474466  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29474465 atcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaactgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacac 29474366  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  29474365 caaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatctccatcctttactttaatctggtgataacctgacct 29474266  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29474265 caaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 29474179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 27683998 - 27683506
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| || ||||||||||| ||    
T  27683998 cggacttaggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaattccatcaccagagataacatggcctagaaaactcacttcttt 27683899  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  27683898 gaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctctcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcgtcagtcttg 27683799  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27683798 gagtaaatcaaaatattgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccatagacactccaggtgcattgg 27683699  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27683698 taacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacc 27683599  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27683598 tgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 27683506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 490
Target Start/End: Original strand, 20801191 - 20801669
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||| |    
T  20801191 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagaaggatctacaacaataccatcaccagaaatgacatggccaaggaaacttacctctttcaacca 20801290  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  20801291 gaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcagcacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 20801390  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    || |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20801391 attaaaatatcatcgataaagaaaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacac 20801490  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20801491 caaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataccctgatct 20801590  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattc 490  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20801591 caaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatgaaatcatcaattctcggaagaggatacctattc 20801669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 25428227 - 25428707
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||||||||   || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  25428227 taggagtctcccattgcgataccgctttaactttagacggatctactgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaacta 25428326  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |  |||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25428327 gaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagattcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaa 25428426  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||    
T  25428427 atcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaatcggtccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatagtccaggtgcatttgtaacac 25428526  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25428527 cgaaaggcataactttgtattcatagtggccataccgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 25428626  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25428627 cagatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 25428707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26737319 - 26736839
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || || |||||| | ||||| || ||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |    
T  26737319 taggagtctcccattgtgataccgcatcaactttacagggatctactgcaataccattaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaacca 26737220  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||| || | |||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  26737219 gaattcacactttgataatttagcatataacttcttatctttcagcacttgcaaaataatcttcaaatgttcagcatgttcttcttcggacttggagtaa 26737120  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  26737119 atcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaaacgatctaaaaatgcatgaaaaatttgattcatgtactccataaacacaccaggtgcatttgtaacac 26737020  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26737019 cgaaaggcatcactttatattcatattgtccataacgtgttctaaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 26736920  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26736919 caaatcaatcttgctaaatacatgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacatattctt 26736839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 23473021 - 23473501
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23473021 taggagtctcccatcgtgatactgcatcaactttagatggatctactgcaataccaccaccagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaacta 23473120  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| || ||||  || | | | || |||||||||||||||| ||| |||||     
T  23473121 gaactcacactttgacaatttagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaacttttaaacgctcagcatgttcttcttcagactttgagtac 23473220  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||| || || ||||| || ||||    
T  23473221 atcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatacgattcatgtactccatagacacacctggcgcatttgtaacac 23473320  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||    
T  23473321 cgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaagccgtcttctacatatcttcatctttcactttaatttgatgataaaccgatct 23473420  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23473421 caaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctt 23473501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21337889 - 21337406
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaata---ccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaa 108  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||||   |||   || ||||| || ||||| || |||||||| || |||||    
T  21337889 taggagtctcccattgcgatactgcatcaactttcgagggatctactgcaatattaccactaccagaaataacgtggccgagaaaactcacctctttcaa 21337790  T
Q  109 ctagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggag 208  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  || || |||||||||||||||  |||||||    
T  21337789 ccagaattcacactttgataatttagcataaagtttcttctctttcagcacttgcaaaacaatcttcaagtgctcagcatgttcttcttcaaacttggag 21337690  T
Q  209 taaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtca 308  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || ||||| || |    
T  21337689 taaatcaaaatatcgtcgatgaatacaaccactaagctatccaaaaacgcatgaaaaatacgattcatgtattccataaacacacctggcgcattcgtaa 21337590  T
Q  309 caccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccga 408  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21337589 caccgaaaggcatcactttatattcataatatccataacgtgttctaaaagctgtattctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccga 21337490  T
Q  409 tctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
     ||||||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  21337489 cctcaaatcaatcttgctaaacacacatgcacccaataactgatccatcaagtcatcaattcttggaattggatacctattctt 21337406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20466691 - 20466211
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||   || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  20466691 taggagtctcccattgtgatactgcatcaactttagacggatctaccgcaataccactaccagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaacca 20466592  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| |||| |||||| || |||||||||| ||| ||  ||||||||||||||| ||| |||||     
T  20466591 gaactcacactttgacaacttggcatataacttcttctccttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttagagtat 20466492  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||| | ||||| || || |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||    
T  20466491 atcaaaatatcatcgatgatcacaaccacgaagcgatctaaatacgcatgaaaaatacgattcatgtacttcataaacacacccggtgcattagtaacac 20466392  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||| |||   ||||| || || |||||||| || || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20466391 caaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttttgcatatcctcgtctttcactttaatctggtgataacctgatct 20466292  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
     |||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20466291 taaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccagtaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacttattctt 20466211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22234510 - 22234032
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||||||||||||  | || ||||| || ||||| || |||||||||   |  ||||| | ||||||||| ||||| |||||| | ||| |||    
T  22234510 ggagtttcccattgcgatactacatcaactttcgatggatcaactgcaataccactactagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaga 22234411  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || || || ||  |||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  22234410 attcacattttgataacttgacatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaatcttcagatgatctgcatgctcttcttcagtcttagaataaat 22234311  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     || || || || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| ||    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  22234310 taagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattttgttcatatactccacaaacacaccaggcgcattagtaacaccg 22234211  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||  || || || || |||||| |||||||||||||  | || |||||||| || |||||  | ||||    
T  22234210 aaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacatgtcctaaaggccgtcttcggcatatcctcatccatcaccttaatctgatggtaacctaacctca 22234111  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22234110 aatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacctattctt 22234032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 152 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21562476 - 21562137
Alignment:
Q  152 ttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatcca 251  Q
    ||||||||||| || ||||| || | ||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||  || || || ||||||||||| || |||| ||| |    
T  21562476 ttcaacacttgaaacacaatttttaaatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaggatgtcatctataaacacaactacaaaccaatcta 21562377  T
Q  252 aaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgt 351  Q
    || | |||||||| || | |||||| |||||||||||||| ||||  ||||| || |||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  21562376 aataggcatggaaaattctattcatgtactccataaacacaccagacgcattagtaacaccgaaagacatcactttatattcataatgtccatatcgtgt 21562277  T
Q  352 tctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactga 451  Q
     || || || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  21562276 cctaaaggccgttttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtggtaacccgacctcaaatcaatcttgctgaacacgcgtgca-ccactaactga 21562178  T
Q  452 tccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21562177 tccattaaaccatcaattctcggaagtggatacctattctt 21562137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 20344060 - 20344538
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||  || ||||| |  || || || || ||||||||| | ||| |||    
T  20344060 ggagtctcccattgcgatactgcatcaactttcgaaggatccactgcaataccattaccagaaataatgtgacccagaaagctcacttcacttaaccaga 20344159  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| |   ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| || |||||| ||||||| |||||    
T  20344160 actcacattttgacaacttagcatacaacctcttctctttcaaaacttgcaagacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttggaataaat 20344259  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     || ||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | || || ||||||    
T  20344260 taagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaagattcggttcatgtactccataaacacaccaggcacgttagtaacaccg 20344359  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||    
T  20344360 aaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctca 20344459  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | ||||||||||| |||| || | ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  20344460 agtcaatcttgct-aaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttctt 20344538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 28893532 - 28893054
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||  || |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  28893532 ggagtttcccactgagatactgcatcaactttcgaaggatcaaccgcgataccattaccagaaatgacatggcctagaaaactcacttcacttaaccaga 28893433  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcata-aagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa 212  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |  || || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || |    
T  28893432 actcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaatcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaataga 28893334  T
Q  213 tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacacc 312  Q
    |||| ||||| || ||||| || ||||| ||   ||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || || || |||||    
T  28893333 tcaatatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacacc 28893234  T
Q  313 gaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctc 412  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| |||    
T  28893233 gaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacctc 28893134  T
Q  413 aaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || ||||||||||| ||||||   ||||| || ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  28893133 aagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatccgcggaagtggatatctattctt 28893054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 28922358 - 28921880
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||  || |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  28922358 ggagtttcccactgagatactgcatcaactttcgaaggatcaaccgcgataccattaccagaaatgacatggcctagaaaactcacttcacttaaccaga 28922259  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcata-aagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa 212  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |  || || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || |    
T  28922258 actcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaatcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaataga 28922160  T
Q  213 tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacacc 312  Q
    |||| ||||| || ||||| || ||||| ||   ||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || || || |||||    
T  28922159 tcaatatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacacc 28922060  T
Q  313 gaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctc 412  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| |||    
T  28922059 gaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacctc 28921960  T
Q  413 aaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || ||||||||||| ||||||   ||||| || ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  28921959 aagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatccgcggaagtggatatctattctt 28921880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 17267924 - 17267446
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| |||||  | || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||| | | | | |    
T  17267924 ggagtctcccattgtgatacttcatcaacttttgatggatcaaccgctataccatcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaa 17267825  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | | ||| || |||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  17267824 acttacatttcgacaatttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacacaattctcaggtgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaat 17267725  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || |||||| || ||||| || ||||| ||   ||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||||||    
T  17267724 cagaatatcatcaataaataccaccacaaatttatccagaaaggcatgaaaaattcgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccg 17267625  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| || || || || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||    
T  17267624 aaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctca 17267525  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  17267524 agtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattctt 17267446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 492
Target Start/End: Original strand, 20823291 - 20823709
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcata-aagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatc 172  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||| |||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |  || || ||||||    
T  20823291 gaaataacgtggccgaggaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaatc 20823389  T
Q  173 ttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 272  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||   ||||| ||| |||||||| || || |    
T  20823390 ttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagtttttgaatagatcaatatatcatctataaacaccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcggt 20823489  T
Q  273 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcat 372  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  20823490 tcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcat 20823589  T
Q  373 atcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctc 472  Q
    ||| || ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || ||||||   ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |    
T  20823590 atcttcgtctttcactttaatttgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaaatcatcaatccgc 20823689  T
Q  473 ggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  20823690 ggaagtggatatctattctt 20823709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 14885581 - 14885100
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||||   || ||||| |  || || |||||||| |||||||| ||| |||    
T  14885581 ggagtctcccattgtgataccgcatcaacctttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatgtgacccaggaaacttacttcatttaaccaga 14885482  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| |   |||| || ||||||||||| || || ||  ||||||| || || ||||| || ||| ||||||| |||||    
T  14885481 actcacattttgacaacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacactattctcagatgctctgcgtgttcctcctcattcttggaataaat 14885382  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| |||  ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  14885381 taagatatcatcaataaataccaccacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccg 14885282  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  14885281 aaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatcctttacctttatctgatgataaccagacctca 14885182  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaa-ctcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgat 495  Q
    |||||||||| ||||||| || | ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  14885181 aatcaatcttactgaaaatcttg-gcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgat 14885100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 24796987 - 24796506
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||||   || ||||| |  || || || ||||| |||||||  ||| |||    
T  24796987 ggagtctcccattgtgataccgcatcaacctttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatgtaaccaga 24796888  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || || || |||||||| |   |||| || ||||||||||| || || ||  ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| |||||    
T  24796887 attcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacactattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaataaat 24796788  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     | |||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  24796787 tagaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccg 24796688  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||    
T  24796687 aaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatctttcacctttatctgatgataaccagacctca 24796588  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaa-ctcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgat 495  Q
    |||||||||| ||||||| || | ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  24796587 aatcaatcttactgaaaatcttg-gcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgat 24796506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 20777691 - 20778169
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||  || ||| | |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||    
T  20777691 ggagtttcccactgagatactgcatcaactttcgaaggatcaaccgcgataccattaccagaagtaacatggcctaggaaactcacttcacttaaccaga 20777790  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcata-aagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa 212  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |  || || |||||||| || ||||  || ||||| |||||| | || || || |    
T  20777791 actcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaatctttaggtgtttggcgtgttcctcttcaattttagaataga 20777889  T
Q  213 tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacacc 312  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| ||   ||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| || || || |||||    
T  20777890 tcaaaatatcatctataaacaccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaatacaccaggcgcgttagtaacacc 20777989  T
Q  313 gaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctc 412  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||    
T  20777990 gaaaggcatcactttgtattcgtaatgtccatatcgtgttctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatttgatggtaacccgacctc 20778089  T
Q  413 aaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || |||||||| || ||||||   ||||| || ||||| |||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  20778090 aagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcgtcaatccgcgggagtggatacctattctt 20778169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 22463729 - 22464207
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  22463729 ggagtttcccactgagatactgcatcaactttcgaaggatcaaccgcgataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttcacttaaccaga 22463828  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcata-aagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa 212  Q
    | ||  |||| ||||| || ||||| || ||||| ||| ||||| |  || || ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||| || || ||||    
T  22463829 actcgtacttcgacaacttggcatacaactttct-ctccttcaaaatctgcaacacaatcttcaagtgttctgcatgctcctcttcagttttagaataaa 22463927  T
Q  213 tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacacc 312  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||| ||   ||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||| || || || |||||    
T  22463928 tcaaaatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacataccaggcgcgttagtaacacc 22464027  T
Q  313 gaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctc 412  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||||||| |||    
T  22464028 gaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatttgatggtaacccgacctc 22464127  T
Q  413 aaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |  |||||||| || ||||||   ||||| || ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  22464128 aggtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatccgcggaagtggatatctattctt 22464207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 92 - 492
Target Start/End: Original strand, 25849931 - 25850331
Alignment:
Q  92 aaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgtt 191  Q
    |||||||||||| | ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| |   |||| || ||||||||||| || || ||  ||||||| || ||||| |    
T  25849931 aaactcacttcacttaaccagaactcacatttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatactattctcagatgctctgcatgct 25850030  T
Q  192 cttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacac 291  Q
    | |||||| |||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || |||  ||||| ||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||    
T  25850031 cctcttcattcttcgaataaatcaagatatcatcaatgaacactacaacaaacttatccagaaaagcatggaagatttggttcatgtactccataaatac 25850130  T
Q  292 tccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttacttta 391  Q
     ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || ||     
T  25850131 accaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttt 25850230  T
Q  392 atctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattct 491  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||| |   ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  25850231 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaattttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctcggaagcggatatctgttct 25850330  T
Q  492 t 492  Q
    |    
T  25850331 t 25850331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 22504457 - 22504935
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||||   || ||||| |  || || || |||||||||||| | ||| |||    
T  22504457 ggagtctcccattgtgatactgcatcaaccttcgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccaga 22504556  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| |   ||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| || ||||| || |||||  |||| || |||||    
T  22504557 actcacattttgacaactttgcatacaacctcttctctttcaaaacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcgttcttagaataaat 22504656  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     || ||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||  | || || ||||||    
T  22504657 taagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaacacaccaggctcgttagtaacaccg 22504756  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||| || || || || ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||    
T  22504757 aaaggcatcactttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccatcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctca 22504856  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| |||||||  |  ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  22504857 agtcaatcttactgaaaatcctagcaccaaccaactgattcatcaagtcatcaattctatgaagcggatacctgttctt 22504935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 37541893 - 37541490
Alignment:
Q  92 aaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgtt 191  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| ||||| || || || |||||||| |   |||| || ||||||||||| || || ||  ||||||| || || ||||    
T  37541893 aaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacactattctcagatgctctgcgtgtt 37541794  T
Q  192 cttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacac 291  Q
    | || ||| ||||||| || || | |||||| || ||||| || || || |||  ||||| ||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||    
T  37541793 cctcctcattcttggaatagattagaatatcatcaataaataccacaacaaacttatccagaaaggcatggaaaattcgattcatgtattccataaaaac 37541694  T
Q  292 tccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttacttta 391  Q
     ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || ||     
T  37541693 accaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttt 37541594  T
Q  392 atctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattc 490  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||| || | ||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||    
T  37541593 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttact-aaaaatcttagcaccaaccaattgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttc 37541495  T
Q  491 ttgat 495  Q
    |||||    
T  37541494 ttgat 37541490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28915003 - 28914642
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||  || |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  28915003 ggagtttcccactgagatactgcatcaactttcgaaggatcaaccgcgataccattaccagaaatgacatggcctagaaaactcacttcacttaaccaga 28914904  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcata-aagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa 212  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |  || || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || |    
T  28914903 actcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaatcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaataga 28914805  T
Q  213 tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacacc 312  Q
    |||| ||||| || ||||| || ||||| ||   ||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || || || |||||    
T  28914804 tcaatatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacacc 28914705  T
Q  313 gaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatc 375  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  28914704 gaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatc 28914642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28930271 - 28929910
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||  || |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  28930271 ggagtttcccactgagatactgcatcaactttcgaaggatcaaccgcgataccattaccagaaatgacatggcctagaaaactcacttcacttaaccaga 28930172  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcata-aagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa 212  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |  || || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || |    
T  28930171 actcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaatcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaataga 28930073  T
Q  213 tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacacc 312  Q
    |||| ||||| || ||||| || ||||| ||   ||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || || || |||||    
T  28930072 tcaatatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacacc 28929973  T
Q  313 gaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatc 375  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  28929972 gaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatc 28929910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 492
Target Start/End: Original strand, 21408941 - 21409408
Alignment:
Q  22 ccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacac 121  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || || ||| ||||||||   || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  21408941 ccattgcgatactgcatcaaccttagatgggtctacaacaataccactaccagaaataatatgaccaagaaaactcacttcgttcaaccagaattcgcac 21409040  T
Q  122 ttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatat 221  Q
    || || || || ||||| |  |||||||   ||| |||||| || |||||  ||| ||| || |||||||| || |||| ||| |||||  ||| |||||    
T  21409041 ttcgataacttggcatataaattcttct---tcagcacttgcaaaacaattctcaaatgctcggcatgttcctcctcagacttagagtatttcagaatat 21409137  T
Q  222 cgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcat 321  Q
    | || ||||||||||| || || ||||| | | | | ||| || || | ||||||||| |||||||| ||||| || |||||  | ||||||||||||||    
T  21409138 catctataaacacaacaacaaaacgatctagataagtatgaaaaatacaattcatatattccataaatactcctggcgcattaataacaccgaaaggcat 21409237  T
Q  322 aactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatc 421  Q
     ||    ||||| |  || || ||| | || || || || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| |||| || |||||     
T  21409238 cacagaatattcgttatgtccgtaatgtgtcctaaaggccgtcttctgaatatcctcatctttcactttgatatggtgatagccccatcttaagtcaatt 21409337  T
Q  422 ttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || ||||| || || |||||||  ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||||||    
T  21409338 ttactgaacacacgcgcacccatcaactgatccatcaaatcgtcgatcctcggaggtggatatctattctt 21409408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21935718 - 21935300
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  21935718 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcc 21935619  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 273  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| | | | ||| || || | |||    
T  21935618 tcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctatt 21935519  T
Q  274 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 373  Q
    ||| || |||||||| || || |||||||| |  || || || ||||| ||    || |||||||| ||||| |  |||| ||| || || ||    |||    
T  21935518 catgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccataccttgttcggaacgcagttttggatata 21935419  T
Q  374 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 473  Q
    || ||  | |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  21935418 tcttctgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttg 21935319  T
Q  474 gaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  21935318 gaagtggataccgattctt 21935300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 492
Target Start/End: Original strand, 23507522 - 23507940
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || ||| |    |  ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  23507522 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaactttgcacatcactggttctctttcaatacttgcaacacaatcc 23507621  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 273  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| | | | ||| || || | |||    
T  23507622 tcaaatgctcagcatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctatt 23507721  T
Q  274 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 373  Q
    ||| || |||||||| || || |||||||| |  || || || ||||| ||    || |||||||| ||||| | ||||| ||| || || ||    |||    
T  23507722 catgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatata 23507821  T
Q  374 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 473  Q
    || ||  | |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  23507822 tcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttg 23507921  T
Q  474 gaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  23507922 gaagtggataccgattctt 23507940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21679368 - 21679005
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||   || ||||| | ||||||||| |||||||||||| | ||| | |    
T  21679368 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaa 21679269  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | || ||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||| || ||||||| ||||| ||||| |||||  | || || ||    
T  21679268 actcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaatcctcggatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaatagat 21679169  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    |||||| || || || || |||||||| ||   ||| |   |  |||| || || |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  21679168 caaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatctaggtaaacatgaaaaattctgttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccg 21679069  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcct 377  Q
    |||||||| || || ||| | || |||||||| || || || || || ||||||||||| ||||    
T  21679068 aaaggcatcaccttatatccgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatgtcct 21679005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 114
Target Start/End: Original strand, 23442002 - 23442104
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  23442002 taggagtctcccattgtgataccgcttaaacttttgagggatctacagcaataccatcaccagaaatgacatggccaagaaaactcacttctttcaacca 23442101  T
Q  112 gaa 114  Q
    |||    
T  23442102 gaa 23442104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 383 - 492
Target Start/End: Original strand, 24583357 - 24583466
Alignment:
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24583357 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 24583456  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    ||| ||||||    
T  24583457 accgattctt 24583466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 136
Target Start/End: Original strand, 23505082 - 23505144
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagca 136  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||    
T  23505082 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttagca 23505144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 129
Target Start/End: Original strand, 24583048 - 24583103
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaa 129  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||    
T  24583048 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaa 24583103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21677064 - 21676946
Alignment:
Q  374 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 473  Q
    ||||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| ||||| || || ||||    |||||| || |||||||||||||  || ||||||||||    
T  21677064 tcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattctcg 21676965  T
Q  474 gaagtggatacctattctt 492  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  21676964 gaagcggatatctattctt 21676946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 433; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 17672882 - 17672390
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  17672882 cggacttaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaataacatggcctagaaaactcacttcttt 17672783  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17672782 caaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttg 17672683  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672682 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 17672583  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672582 tcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacc 17672483  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672482 tgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 17672390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 19482917 - 19482439
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |    
T  19482917 taggagtatcccattgcgatacagcttcgacttttgacggatccacagcaataccatctccggaaataacatgaccaagaaaactcacttctttcaacca 19482818  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19482817 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttctgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 19482718  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19482717 atcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaactgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatataccccataaacactccaggtgcattggtcacac 19482618  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19482617 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgatct 19482518  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19482517 caaatcaatcttgctgaaaactcgcgcacccactaactgatcca--------tcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 19482439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 18858505 - 18858991
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  18858505 taggagtctcccattgcgataccgcttcgactttagacggatccacagcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaacca 18858604  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18858605 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 18858704  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18858705 atcaaaatgtcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacac 18858804  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18858805 caaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgtcctgaaagccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatct 18858904  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18858905 caaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 18858991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 20017114 - 20016630
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |||    
T  20017114 ggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccaga 20017015  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20017014 attcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 20016915  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016914 caaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 20016815  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  20016814 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttaccttaatctggtgataacctgacctca 20016715  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016714 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 20016630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 30311997 - 30311511
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  30311997 taggagtctcccattgcgacaccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaacca 30311898  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  30311897 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 30311798  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30311797 attaaaatatcgtcaataaacacaacaacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 30311698  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  30311697 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatct 30311598  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30311597 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattatcggaagtggatacctattcttgatagt 30311511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 22041755 - 22042241
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||| |    
T  22041755 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttatttctttcaacca 22041854  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  22041855 gaattctcacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacgcttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtac 22041954  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22041955 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgaattggtcacac 22042054  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22042055 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacacgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 22042154  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22042155 caaatcaatcttgctgaaaactttcgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 22042241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 15535311 - 15535797
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  15535311 taggagtctcccattgtgacaccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaacca 15535410  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15535411 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 15535510  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15535511 atcaaaatgtcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgtgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 15535610  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  15535611 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgataactgttttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatct 15535710  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15535711 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 15535797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 32602072 - 32602559
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||| |    
T  32602072 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccattaccagaaataacatggccaaaaaaacttacttctttcaacca 32602171  T
Q  112 -gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagta 210  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  32602172 agaattcacactttgacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagta 32602271  T
Q  211 aatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcaca 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32602272 aatcaaaatatcatcgataaacacaacaacgaaccgatccaaaaaggcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcaca 32602371  T
Q  311 ccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||    
T  32602372 ccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcaccttaatctggtgataccctgatc 32602471  T
Q  411 tcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32602472 tcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcaccctctaactgatccatcaaatcatcaattctcggtagtggatacctattcttgatagt 32602559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22119028 - 22118542
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || ||| || |    
T  22119028 taggagtctcccaatgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacctctttcgacca 22118929  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22118928 gaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcacgttcttcttcagtcttggagtaa 22118829  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22118828 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacac 22118729  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  22118728 caaaaggcataactttatattcaaagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctacatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacct 22118629  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22118628 caaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 22118542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22127812 - 22127326
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || ||| || |    
T  22127812 taggagtctcccaatgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacctctttcgacca 22127713  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22127712 gaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcacgttcttcttcagtcttggagtaa 22127613  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22127612 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacac 22127513  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  22127512 caaaaggcataactttatattcaaagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctacatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacct 22127413  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22127412 caaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 22127326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22131894 - 22131408
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  22131894 taggagtctcccattgcgataacgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttccttcaacca 22131795  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  22131794 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtag 22131695  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131694 atcaaaatatcatcgataaacacaacaaagaatcgatccaaaaaggcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 22131595  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | |||    
T  22131594 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccgtaatgcgttcttaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgttct 22131495  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131494 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 22131408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 498
Target Start/End: Original strand, 19979903 - 19980381
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |||| |||     
T  19979903 tcccattgcgatactgcatcaactttagagggatctacagcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaaatcat 19980002  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19980003 acttagataatttagcataaaatttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagattctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 19980102  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  19980103 atcgtcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaacactccaggcgcattggtaacaccaaaaggc 19980202  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19980203 ataactttatattcatagtgaccatacagtgttctgaaagttgtcttctacatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaa 19980302  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19980303 tcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 19980381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 21165383 - 21164905
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||||||||  || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |||| ||||    
T  21165383 tcccattgcgatattgcatcaactttagagggatctacagcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcac 21165284  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21165283 acttggataatttagcataaagtttcttctcttttaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaaat 21165184  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
    ||| | |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21165183 atcatagataaaaacaaccacgaatcgatccaagaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaacactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggc 21165084  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21165083 ataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaa 21164984  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21164983 tcttgctgaaaatgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 21164905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 21252872 - 21253352
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || |||||||||   || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |    
T  21252872 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatatactgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaacca 21252971  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |  || | ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21252972 gaattctcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaatacttgcagaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaa 21253071  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  21253072 atcaaaatatcatcgataaaaacaacctcgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacac 21253171  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21253172 cgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 21253271  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21253272 caaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgaaagttgatacctattctt 21253352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 20 - 492
Target Start/End: Original strand, 23651977 - 23652449
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||| ||| || | ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| | |||||||    
T  23651977 tcccattgcgatactgcatcaactttagacgaatctactgtaataccattaccagaaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaaccaaaattcac 23652076  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  23652077 acttagacaatttagcatatagcttcttctctttcaacacttgtaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcctcttcagtcttggagtaaatcaaagt 23652176  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
    ||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  23652177 atcatcaatgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaacacaccaggtgcatttgtaacaccaaaaggc 23652276  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23652277 ataactttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaacctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatcttaaatcaa 23652376  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23652377 tcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcagaagtagatacctattctt 23652449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21783277 - 21782793
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccat---ct-ccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattca 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    || || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  21783277 taggagtctcccattgcgataccgcttcaacttttgacggatccactgcaataccactagctaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttca 21783178  T
Q  108 actagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttgga 207  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| ||  ||||||||||||||| ||||||    
T  21783177 accagaattcgcacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttgga 21783078  T
Q  208 gtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtc 307  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||     
T  21783077 gtaaatcaatatatcatcgataaaaacaaccacgaaccaatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtaatccataaatactccaggtgcattcgta 21782978  T
Q  308 acaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21782977 acaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgctctgaaagttgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctg 21782878  T
Q  408 atctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21782877 atctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatacctattctt 21782793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22422745 - 22422265
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  22422745 taggagtctcccattgcgataccgcatcaactttagagggatctactgcaataccatcaccagaaataacatggccaaggaaactcacctctttcaacca 22422646  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  ||||||||||||| | ||||||||||    
T  22422645 taattcacactttgataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcaaatgttcaacatgttcttcttcggacttggagtaa 22422546  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||    
T  22422545 atcaaaatatcatcaatgaatacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgcgattcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacac 22422446  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22422445 cgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgcgttctgaatgctatcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 22422346  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22422345 caagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgaatacctattctt 22422265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21392718 - 21392234
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccat---ct-ccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattca 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    || || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  21392718 taggagtctcccattgcgataccgcttcaacttttgacggatccactgcaataccactagctaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttca 21392619  T
Q  108 actagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttgga 207  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| ||  ||||||||||||||| ||||||    
T  21392618 accagaattcgcacttagacaattttgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttgga 21392519  T
Q  208 gtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtc 307  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||     
T  21392518 gtaaatcaatatatcatcgataaaaacaaccacgaaccaatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtaatccataaatactccaggtgcattcgta 21392419  T
Q  308 acaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21392418 acaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgctctgaaagttgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctg 21392319  T
Q  408 atctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21392318 atctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatacctattctt 21392234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21787212 - 21786728
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccat---ct-ccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattca 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    || || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  21787212 taggagtctcccattgcgataccgcttcaacttttgacggatccactgcaataccactagctaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttca 21787113  T
Q  108 actagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttgga 207  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| ||  ||||||||||||||| ||||||    
T  21787112 accagaattcgcacttagacaattttgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttgga 21787013  T
Q  208 gtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtc 307  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||     
T  21787012 gtaaatcaatatatcatcgataaaaacaaccacgaaccaatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtaatccataaatactccaggtgcattcgta 21786913  T
Q  308 acaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21786912 acaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgctctgaaagttgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctg 21786813  T
Q  408 atctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21786812 atctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatacctattctt 21786728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 19864939 - 19864466
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||   || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  19864939 tcccattgcgataccacttcaactttagacggatctactgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcgc 19864840  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaaga-caatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaa 218  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |  |||| ||| ||   |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19864839 acttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgtaaaaaccagtttcaaatgctcaatatgttcttcttcagacttagagtaaatcaaaa 19864740  T
Q  219 tatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaagg 318  Q
    |||| || || || ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  19864739 tatcatcaatgaaaacaaccatgaaccaatccaaaaatgcatgaaagatgagattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaagg 19864640  T
Q  319 cataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatca 418  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  19864639 cataactttctactcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatattttactttaatctggtgataacctgatctcaaatct 19864540  T
Q  419 atcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19864539 atcttgctgaaaaatttagcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatacctattctt 19864466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22247286 - 22246806
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | |||||| | || |||||| |    
T  22247286 taggagtctcccatcgtgatactgcatcaactttagagggatctaccgcaataccattaccagaaataacatggccatgaaaactcgcctctttcaacca 22247187  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| || ||||||| || ||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||     
T  22247186 gaattcacactttgaaaatttagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaatctacaaatgctcaacatgttctccttcaatcttggagtat 22247087  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | || || |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||    
T  22247086 atcaaaatatcgtcgatgaacacaaccatgaaacgatccaaaaacgcaggaaaaatacgattcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacac 22246987  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22246986 cgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacttgttctaaaagcggtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 22246887  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22246886 caaatcaatcttgctgaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaagcatcaattcttggaagtggatacccattctt 22246806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22376298 - 22375826
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||| ||||  || || |||||||| ||||| || |||||||||   || ||||| ||||||||||| |||||||  |  |||||| |||||| |     
T  22376298 tcccattgtgatattgcatcaactttagatggatctactgcaataccactaccagaaataacatggccaagaaaactcatctatttcaaccagaatttat 22376199  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    | || |||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22376198 agtttgacaatttagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtatataaaaat 22376099  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |  | |||||||    
T  22376098 atcgtcgatgaacacaaccacaaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatacgattcatgtactccataaacacacctggtgcatttgtaatgctgaaaggc 22375999  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    || ||||| |||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22375998 atcactttatattaataatgtccataacgtgttctaaaagccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctgttgataacccgatctcaaatcaa 22375899  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22375898 tcttgctgaatacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatatctattctt 22375826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 21920598 - 21920185
Alignment:
Q  15 gagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaa 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||   || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||    
T  21920598 gagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatctactgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaa 21920499  T
Q  115 ttcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatc 214  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21920498 ctcacacttagacaatttcgcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaactaacttcaaatgctcagcatattcttcttcagtcttgaagtaaatc 21920399  T
Q  215 aaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccga 314  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||    
T  21920398 aaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcttgaaagatacaattcatgtactccataaatactccatgtgcatttgtaacaccga 21920299  T
Q  315 aaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaa 414  Q
    | | ||| || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21920298 acgacatcaccttatactcataatgtccataacgcgttctaaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaa 21920199  T
Q  415 atcaatcttgctga 428  Q
    ||| ||||||||||    
T  21920198 atctatcttgctga 21920185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 23886952 - 23887436
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaa-tgacatggccaaggaaactcacttcattcaact 110  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23886952 taggagtctcccattgtgataccgcatcaactttagacggatctacaacaatacca-ctacgaaaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaact 23887050  T
Q  111 agaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcat----gttcttcttcagtcttgg 206  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| |||| |||||| || |||||||||| ||| ||  |||    ||||||||| || ||| |    
T  23887051 agaattcacactttgacaacttggcatataacttcttctccttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcaacatacatgttcttctttagacttag 23887150  T
Q  207 agtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 306  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| || ||  ||||||| ||||||||||||||  | || ||||| ||    
T  23887151 agtatatcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaagcgatctaaataagcatgaaaaatatgattcatgtactccataaacacatctggcgcattagt 23887250  T
Q  307 cacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataaccc 406  Q
     |||||||||||||| |||   || || || || |||||||| || || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23887251 aacaccgaaaggcatcactgaatactcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttatgcatatcctcgtctttcactttaatctggtgataaccc 23887350  T
Q  407 gatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
     | ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23887351 aacctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattcttcgaagtggatacctattctt 23887436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 29302276 - 29301799
Alignment:
Q  15 gagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaa 114  Q
    |||| |||||||  || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||   || ||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||    
T  29302276 gagtctcccattcggacacagcttcaacttttgacggatcaactgcaataccactaccagaaataacgtggccaagaaaacttacttcactcaaccagaa 29302177  T
Q  115 ttcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatc 214  Q
    |||||| || ||||| || ||||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  29302176 ttcacattttgacaacttggcatacaacttcctctctttcaacacttgtaacacaatcttcaagtgttctgcatgttattcttcggtcttagagtaaatc 29302077  T
Q  215 aaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccga 314  Q
    | ||| || || ||||| || || || ||| |||| || |||||||| || || |  ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  29302076 agaatgtcatcaataaataccacaacaaactgatctaagaatgcatgaaaaattctgttcatgtactccataaataccccaggtgcatttgtaacaccaa 29301977  T
Q  315 aaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaa 414  Q
    ||||||| || || || ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  29301976 aaggcatcaccttatactcataatgcccataacgtgttctgaatgccgtcttctgcatattctcatctttcaccttaatctagtgataacccgacctcaa 29301877  T
Q  415 atcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  29301876 gtcaattttactgaacacacgtgcacccactaactgatccatcagatcatcaatcctcggaagcggatacctgttctt 29301799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 318
Target Start/End: Original strand, 22988658 - 22988964
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |    
T  22988658 taggagtctcccattgcgataccgcatcaactttagagggatctactgcaataccattaccagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaacca 22988757  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||     
T  22988758 gaattcacactttgacaatttagcataaagcttcttctctttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggaatat 22988857  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||||||| |  || | |||||| ||||    
T  22988858 atcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgtgattcatgtattccataaacacacgtggcgtattggtgacac 22988957  T
Q  312 cgaaagg 318  Q
    |||||||    
T  22988958 cgaaagg 22988964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21324129 - 21323652
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||||||||   || ||||| |  |||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  21324129 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgacgggtcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccaga 21324030  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  21324029 actcacacttcgacaacttagcatacaactt-ttctctttcaaaatttgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaatagat 21323931  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  21323930 cagaatgtcatcgataaacacaaccacgaatttatccaggtaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccg 21323831  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || ||||| || || || ||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| || ||||    
T  21323830 aaaggcatcacattgtactcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctca 21323731  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21323730 agtcaatcttactaaaaacttttgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagtggatacctattctt 21323652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 82 - 492
Target Start/End: Original strand, 23656925 - 23657335
Alignment:
Q  82 atggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgt 181  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | ||| | || |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  23656925 atggccaagaaaacttacttcacttaaccataactcacactttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaatcttcagatgt 23657024  T
Q  182 tccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatact 281  Q
    || ||||| |||||||||||||| || || || | |||||| || ||||| |||||||  ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||||||||    
T  23657025 tctgcatgctcttcttcagtcttagaatatattagaatatcatcaataaatacaaccataaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatact 23657124  T
Q  282 ccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatc 381  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||||||||||||    
T  23657125 ccataaacacgccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatc 23657224  T
Q  382 ttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgga 481  Q
     || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  23657225 cttcactttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaaaacttttgcacctacgaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtgga 23657324  T
Q  482 tacctattctt 492  Q
    ||||| |||||    
T  23657325 tacctgttctt 23657335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 86 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 31415248 - 31414842
Alignment:
Q  86 ccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccg 185  Q
    ||||| ||| |||||||| | ||| |||| | |||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || |    
T  31415248 ccaagaaaattcacttcacttaaccagaacttacactttgacaacttagcatacaacttcttttcttttaacacttgcaatacaatcttcagatgctctg 31415149  T
Q  186 catgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccat 285  Q
    |||| || ||||| ||||| || ||||||| |||||| || |||||||||||||| ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  31415148 catgctcctcttcggtcttagaataaatcagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccat 31415049  T
Q  286 aaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatctttt 385  Q
     ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||     
T  31415048 gaacaccccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttc 31414949  T
Q  386 actttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 485  Q
    || |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  31414948 accttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaacacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacc 31414849  T
Q  486 tattctt 492  Q
    |||||||    
T  31414848 tattctt 31414842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 41 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20394957 - 20394506
Alignment:
Q  41 actttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaa 140  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  20394957 actttagacggatctacaacaataccattaccagaaataatatggccaagaaaactcaccttattcaaccagaattcacactttgacaacttggcatata 20394858  T
Q  141 gtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccac 240  Q
      || |||||||||| |||||| || |||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||    
T  20394857 actttttctctttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcggcatgttcttcttcagacttagagtatatcaaaatatcgtcaatgaacacaacaac 20394758  T
Q  241 gaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtga 340  Q
     || ||||| ||| | ||||| || || |||||||| || |||||||| || || |||||||| ||  |||  |||||||| | |   ||||| || ||     
T  20394757 aaagcgatctaaataagcatgaaaaatacgattcatgtattccataaatacacccggtgcatttgtagcactaaaaggcatcattgattattcgtaatgt 20394658  T
Q  341 ccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcac 440  Q
    || ||||| || || ||||| ||||||| |||||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || || |||||||    
T  20394657 ccgtaacgtgtcctaaaagccgtcttctacatatcttcatccttcagtttaatctgatgatagcccgatctcaaatcaatcttaataaacacacgtgcac 20394558  T
Q  441 ccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||    
T  20394557 ccactaactgatccatcaaatcatcgattcttagaagtggatccctattctt 20394506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20008772 - 20008294
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||  ||||||||   || ||||| | ||||||||| ||||| |||||| | ||| | |    
T  20008772 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatctaccacaataccactaccagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaaa 20008673  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||| ||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  20008672 attcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacagttgcaacacaatcttcatatgctctgcatgctcttcttcattcttagaataaat 20008573  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |  ||||| ||  ||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  20008572 taggatatcatcactaaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctgttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccg 20008473  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || |||||||| || ||||| || || || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||    
T  20008472 aaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatctttcaccttaatctgatggtaacctgagctca 20008373  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20008372 aatcaatcttactgaacacgcgtgcacccactaattgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatatctattctt 20008294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 19114620 - 19114836
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |||    
T  19114620 ggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccaga 19114719  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19114720 attcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcggtcttggagtaaat 19114819  T
Q  214 caaaatatcgtcgataa 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  19114820 caaaatatcgtcgataa 19114836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 82 - 492
Target Start/End: Original strand, 21927425 - 21927836
Alignment:
Q  82 atggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgt 181  Q
    ||||||||| || || |||||| | ||| |||||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  21927425 atggccaagaaatcttacttcacttaaccagaattcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaatcttcagatgc 21927524  T
Q  182 tccgca-tgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatac 280  Q
    || ||| || |||||||||||||| || ||||| || || || || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || |  |||||||||    
T  21927525 tctgcaatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctgttcatatac 21927624  T
Q  281 tccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcat 380  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || |  ||||||||||||| |||||    
T  21927625 tccataaacacaccaggcgcattagtaacactgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggtcgtcttctgcatatgctcat 21927724  T
Q  381 cttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 480  Q
    | || || |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  21927725 ccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactgaacacacgagcacccactaactgatccattaagtcgtcaattctcggaagtgg 21927824  T
Q  481 atacctattctt 492  Q
    ||||||||||||    
T  21927825 atacctattctt 21927836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 249 - 492
Target Start/End: Original strand, 22522711 - 22522954
Alignment:
Q  249 ccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacg 348  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| || | ||||||    
T  22522711 ccaaaaatgcatgaaaaatgcgattcatgtactccataaacactcctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatactcataatgtcgataacg 22522810  T
Q  349 cgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaac 448  Q
     ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||    
T  22522811 tgttctaaaagccgttttctgcatatcttcatctttcactttattctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgagcacccactaac 22522910  T
Q  449 tgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22522911 tgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctgttctt 22522954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 31569693 - 31569216
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||| | | | | |    
T  31569693 ggagtctcccattgcgatactgcatcaacttttgatggatcaaccgctataccatcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaa 31569594  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| |  |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  31569593 actcacatttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaaaacttgcagcacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaat 31569494  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || |||||| || ||||| || ||||||||   ||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||||||    
T  31569493 cagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaaattcgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccg 31569394  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||| | || ||||    
T  31569393 aaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaa-ctgacctca 31569295  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  31569294 agtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattctt 31569216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 313 - 492
Target Start/End: Original strand, 22989274 - 22989453
Alignment:
Q  313 gaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctc 412  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22989274 gaaaggcatcactttatattcataatacccataacgcgttctgaaagctgtattctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctc 22989373  T
Q  413 aaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||| || || | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  22989374 aaatcaatcttgctaaacacacttgcagccactaactgatccatcaagtcatcaattattggaagtggatacctattctt 22989453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 489
Target Start/End: Original strand, 20390097 - 20390491
Alignment:
Q  82 atggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgt 181  Q
    ||||||||| |||||  ||||| | |||||||||||| | || ||||| || ||||| |  || || || ||||||||||| || |||||||| | |||     
T  20390097 atggccaagaaaacttgcttcacttaactagaattcaaatttggacaacttggcatacaactttttttccttcaacacttgcaacacaatctttaaatgc 20390196  T
Q  182 tccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatact 281  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || | ||||||  ||     
T  20390197 tccgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaaccgatccaagaaagcatggaaaattctattcatgcac- 20390295  T
Q  282 ccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatc 381  Q
                ||||  |||| || |||||||||| ||| ||||| ||||  || || ||||| || || || || || || ||||||||||| |||||    
T  20390296 ------------caggcacattagtaacaccgaaagacatcactttatatttgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgcatatcttcatc 20390383  T
Q  382 ttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgga 481  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20390384 ttttactttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgaacccactaactgatccataaaatcatcaattctcggaagtgga 20390483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 483
Target Start/End: Original strand, 19861365 - 19861834
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| | ||||||||| ||||| |||||| | ||| | |    
T  19861365 ggagtctcccattgcgatactgcatcaacttttgatggatcaactgcaataccaataccagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaaa 19861464  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| | |||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| || |||||    
T  19861465 attcacatttggacaacttggcatacaacttcttttatttcaacacttgcaactcaatcttcagatgctctgcatgttcttcttcattcttagaataaat 19861564  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |  ||||| || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || |  |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  19861565 taggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctgttcatatacttcataaacacaccaggcgcattagtaacaccg 19861664  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    || ||||| || || || ||||| || ||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| || ||||    
T  19861665 aagggcattaccttatactcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctca 19861764  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggata 483  Q
    ||| ||| |   |||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19861765 aattaatttacatgaacacacgaccacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtcgata 19861834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 361 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21781691 - 21781560
Alignment:
Q  361 tgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaa 460  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21781691 tgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaa 21781592  T
Q  461 tcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21781591 tcatcaatcctcggaagtggatacctattctt 21781560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 22052793 - 22053271
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || || ||| ||||||||   || ||||| |  |||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  22052793 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgaagggtcaacaacaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccaga 22052892  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| ||  |||| |||||||| |  || ||||||||||  ||||| || |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  22052893 attcacatttcaacaacttagcatacaactttttctctttcagtacttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaat 22052992  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |  ||||| || || || ||| |||| |||  ||||| ||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  22052993 taggatatcatcaatgaatacacccacaaacttatccagaaaggcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccg 22053092  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || | |||||| || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| || ||||    
T  22053093 aaaggcatcacctggtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaaccagacctca 22053192  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | ||||||||  ||||||    |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22053193 agtcaatcttattgaaaatctttgcaccaaccagctgatccatcaagtcatcaattctcggaagcggatacctgttctt 22053271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 95 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16269994 - 16269597
Alignment:
Q  95 ctcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttctt 194  Q
    ||||||||| | ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| |   |||| || ||||||||||| || |||||  |||| || || ||||| || |    
T  16269994 ctcacttcacttaaccagaactcacattttgacaactttgcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcaggtgctctgcatgctcct 16269895  T
Q  195 cttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactcc 294  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||    
T  16269894 cttcattcttggaataaatcaagatatcatcaatgaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaacacacc 16269795  T
Q  295 aggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatc 394  Q
    |||  | || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || || |||    
T  16269794 aggcccgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatc 16269695  T
Q  395 tggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || |||||||  || |||||||||||||| || |||| || | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16269694 tgatgataactagacctcaaatcaatcttact-aaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaaatcgtcaattctcggaagcggatacctgttctt 16269597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 95 - 492
Target Start/End: Original strand, 27356547 - 27356944
Alignment:
Q  95 ctcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttctt 194  Q
    ||||||||| | ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| |   |||||||||| || ||||| || |||||  ||||||| || ||||| || |    
T  27356547 ctcacttcacttaaccagaactcacatttcgacaacttcgcatacaacctcttctcttttaaaacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcct 27356646  T
Q  195 cttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactcc 294  Q
    ||||| ||||||| ||||| || ||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  27356647 cttcattcttggaataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaagattcggttcatgtactccataaacacacc 27356746  T
Q  295 aggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatc 394  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || || || |||    
T  27356747 aggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatc 27356846  T
Q  395 tggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || |  ||||| |||||||| |||||||| || |||| || | ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27356847 tgatagtaaccagatctcaagtcaatcttact-aaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttctt 27356944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 495
Target Start/End: Original strand, 28982979 - 28983322
Alignment:
Q  152 ttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatcca 251  Q
    ||||||||||| || || ||  ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| || || | |||||| || ||||| || ||||| |||  |||||    
T  28982979 ttcaacacttgcaacactattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattagaatatcatcaataaataccaccacaaacttatcca 28983078  T
Q  252 aaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgt 351  Q
     ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||    
T  28983079 gaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgt 28983178  T
Q  352 tctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaa-ctcgtgcacccactaactg 450  Q
     || || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||| || | ||||| || |||||    
T  28983179 cctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagccctcaaatcaatcttactgaaaatcttg-gcaccaaccaactg 28983277  T
Q  451 atccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgat 495  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  28983278 atccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgat 28983322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 495
Target Start/End: Original strand, 28988198 - 28988541
Alignment:
Q  152 ttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatcca 251  Q
    ||||||||||| || || ||  ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| || || | |||||| || ||||| || ||||| |||  |||||    
T  28988198 ttcaacacttgcaacactattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattagaatatcatcaataaataccaccacaaacttatcca 28988297  T
Q  252 aaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgt 351  Q
     ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||    
T  28988298 gaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgt 28988397  T
Q  352 tctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaa-ctcgtgcacccactaactg 450  Q
     || || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||| || | ||||| || |||||    
T  28988398 cctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagccctcaaatcaatcttactgaaaatcttg-gcaccaaccaactg 28988496  T
Q  451 atccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgat 495  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  28988497 atccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgat 28988541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 495
Target Start/End: Original strand, 4983972 - 4984453
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||   || ||||| |  || || || || ||||||||| | ||| |||    
T  4983972 ggagtttcccattgtgataccgcatcaacttttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaagctcacttcacttaaccaga 4984071  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||| ||| |||| | |  |||||| || |||||||| || || ||  ||||||| || ||||| ||||| ||  ||||||| |||||    
T  4984072 actcacattttgacaacttaacatacaatcgcttctcctttaacacttgcaatactattctcagatgctctgcatgctcttcctcgttcttggaataaat 4984171  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    |||  |||| |  || ||||| || || |||  ||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||||    
T  4984172 caaggtatcattaatgaacaccacaacaaacttatctagaaaagcatggaagattcgattcatgtactccataaaaacaccaggcgctttagttacaccg 4984271  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||    
T  4984272 aaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatgataaccagacctca 4984371  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgat 495  Q
    |||||||||| || |||| || | ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||    
T  4984372 aatcaatcttact-aaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacttgttcttgat 4984453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 308 - 492
Target Start/End: Original strand, 19984404 - 19984588
Alignment:
Q  308 acaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccg 407  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| |    
T  19984404 acaccgaaaggcatcaccttttattcataatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctg 19984503  T
Q  408 atctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19984504 acctcaaatcaattttactgaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcagaagtggatacctattctt 19984588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 431
Target Start/End: Original strand, 6605588 - 6606005
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||   || ||||| |  || || || || ||||||||| | ||| |||    
T  6605588 ggagtctcccattgtgataccgcatcaacttttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaagctcacttcacttaaccaga 6605687  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || || || |||||||| |   |||| || |||||||| || || |||||  ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| || ||    
T  6605688 actcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacctgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagat 6605787  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |||||||| || ||||| || || || |||  ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  6605788 taaaatatcatcaataaataccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccg 6605887  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||    
T  6605888 aaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatgataaccagacctca 6605987  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaa 431  Q
    |||||||||| |||||||    
T  6605988 aatcaatcttactgaaaa 6606005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 299 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22061245 - 22061052
Alignment:
Q  299 gcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggt 398  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || || || ||  |||||||||| |||||||| || || |||||||| |    
T  22061245 gcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcataatgaccatatcgtgtcctaaaggccttcttctgcatttcctcatccttcaccttaatctgat 22061146  T
Q  399 gataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  22061145 ggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacttttgcacccaccaactgattcattaagtcatcaatcctgggaagtggatacctgttctt 22061052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 389 - 492
Target Start/End: Original strand, 22373173 - 22373276
Alignment:
Q  389 ttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctat 488  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22373173 ttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaattcttggaagtggatatctat 22373272  T
Q  489 tctt 492  Q
    ||||    
T  22373273 tctt 22373276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16875886 - 16875468
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  16875886 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcc 16875787  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 273  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| | | | ||| || || | |||    
T  16875786 tcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctatt 16875687  T
Q  274 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 373  Q
    ||| || |||||||| || || || ||||| |  || || || ||||| ||    || |||||||| ||||| | ||||| ||| || || ||    |||    
T  16875686 catgtattccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatata 16875587  T
Q  374 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 473  Q
    || ||  | |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  16875586 tcttctgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttg 16875487  T
Q  474 gaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  16875486 gaagtggataccaattctt 16875468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 381
Target Start/End: Original strand, 14567072 - 14567439
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||||   || ||||| |  || || || || ||||||||| | ||| |||    
T  14567072 ggagtttcccattgtgataccgcatcaacctttgagggatccactgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaagctcacttcacttaaccaga 14567171  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| | | |||| || ||||||||||| || || || || || || |  ||||| || || ||| ||||||| |||||    
T  14567172 actcacatttcgacaactttgcatacaatctcttttccttcaacacttgcaacactatttttaggtgctttgcatgctcctcctcattcttggaataaat 14567271  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     || ||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||||    
T  14567272 taagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgccttagtaacaccg 14567371  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatc 381  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || ||||| |||| |||||||||    
T  14567372 aaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttttgcaaatcctcatc 14567439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 451 - 498
Target Start/End: Original strand, 22030470 - 22030517
Alignment:
Q  451 atccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22030470 atccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 22030517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 321
Target Start/End: Original strand, 22372990 - 22373168
Alignment:
Q  143 ttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacga 242  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||| || ||||| |  ||||| ||  ||||||||||||| |    
T  22372990 ttcttttctttcaacacttgcaacacaatcttaagatgctctgcatggtcttcttcattcttagaataaattaggatatcatcagtaaacacaaccacaa 22373089  T
Q  243 accgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcat 321  Q
    |   ||||| | | |||||||| || | |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  22373090 atttatccagataagcatggaaaattcaattcatgtactccatgaacacaccaggcgcattagtaacacccaaaggcat 22373168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 383 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20650837 - 20650728
Alignment:
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20650837 tttactctaatttgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagttgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggat 20650738  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    ||| ||||||    
T  20650737 accgattctt 20650728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 383 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21848819 - 21848710
Alignment:
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  21848819 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaaatggat 21848720  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    ||| ||||||    
T  21848719 accgattctt 21848710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23155517 - 23155415
Alignment:
Q  390 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 489  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || |||  |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||    
T  23155517 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcagaagcggataccgatt 23155418  T
Q  490 ctt 492  Q
    |||    
T  23155417 ctt 23155415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20651179 - 20651084
Alignment:
Q  41 actttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagca 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||||||||| ||||||    
T  20651179 actttagacggatccacagaaataccacccttagaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaatctcacacttagacaacttagca 20651084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 492
Target Start/End: Original strand, 16414405 - 16414499
Alignment:
Q  398 tgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  16414405 tgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattctt 16414499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 367
Target Start/End: Original strand, 19869881 - 19869976
Alignment:
Q  272 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttc 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| || |||||||| |||   || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  19869881 ttcatatactccataaacactcctggcgcgttggacactccaaaaggcatcactgaatactcataatgaccataacgggttctgaaggcagtcttc 19869976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23155858 - 23155769
Alignment:
Q  47 gacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagca 136  Q
    ||||||||| ||| |||||||||    ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||    
T  23155858 gacggatccgcagaaataccatccttagaaatcacatgactaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttagca 23155769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 484
Target Start/End: Original strand, 23902484 - 23902564
Alignment:
Q  404 cccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatac 484  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||   ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  23902484 cccgatctcaaatcaatcttactgaacacttccgcaccaaccagctgatccattaaatcatcaatcctcagaagcggatac 23902564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 24932291 - 24932204
Alignment:
Q  398 tgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 485  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| || | |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  24932291 tgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccgaccagctgatccatcaaatcatcaatcattggaagtggatacc 24932204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 33389517 - 33389025
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  33389517 cggacttaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacagatccacagcaataccatctccggaaataacatggcctagaaaactcacttcttt 33389418  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33389417 caaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttg 33389318  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33389317 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 33389218  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33389217 tcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacc 33389118  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33389117 tgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 33389025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16349084 - 16348591
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||    
T  16349084 cggacttaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaataacatgacctagaaaactcacttcttt 16348985  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16348984 caaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctctgcatgttcttcttcagtcttg 16348885  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348884 gagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 16348785  T
Q  306 tcac-accgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataac 404  Q
    | ||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16348784 taactcccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataac 16348685  T
Q  405 ccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348684 ctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 16348591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 41352144 - 41351664
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |    
T  41352144 taggagtatcccattgcgatacagcttcgacttttgacggatccacagcaataccatctccggaaataacatgaccaagaaaactcacttctttcaacca 41352045  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41352044 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttctgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 41351945  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41351944 atcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaactgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatataccccataaacactccaggtgcattggtcacac 41351845  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41351844 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgatct 41351745  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggataccta-ttcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41351744 caaatcaatcttgctgaaaactcgcgcacccactaactgatccatca-------atttctcggaagtggatacctatttcttgatagt 41351664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 21832179 - 21832665
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  21832179 taggagtctcccattgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaacca 21832278  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21832279 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 21832378  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21832379 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccatgtgcattggtcacac 21832478  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  21832479 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttttgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacct 21832578  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21832579 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctaatcttgatagt 21832665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 21234213 - 21233727
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  21234213 taggagtctcccattgagaaaccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaacca 21234114  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21234113 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgttcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 21234014  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21234013 atcaaaatgtcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactcgaggtgcattgatcacac 21233914  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  21233913 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatct 21233814  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233813 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 21233727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 21838827 - 21839313
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  21838827 taggagtctcccattgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaacca 21838926  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21838927 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 21839026  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21839027 atcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacac 21839126  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  21839127 caaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacct 21839226  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21839227 caaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 21839313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 51331967 - 51331489
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  51331967 tcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcactagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcac 51331868  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51331867 acttagacaatttagcataaaacttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 51331768  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51331767 atcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 51331668  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  51331667 ataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaa 51331568  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51331567 tcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 51331489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 19108245 - 19108731
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  19108245 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatccacagcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaacca 19108344  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19108345 gaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttggaagacaatcttcagatgctcagcatgttctttttcagtcttagagtaa 19108444  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19108445 atcaaaatatcatcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcgtggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacac 19108544  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  19108545 caaaaggcataactttatattcatggtgaccataacgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatcttttacttttatctggtgataacctgacct 19108644  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19108645 caaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 19108731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 17043497 - 17043011
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  17043497 taggagtctcccattgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaacca 17043398  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17043397 gaattcacactttgacaatttagcataaagtttcttctctttcaatacttgcaagacaatcttcatatgctcagcatgttcttctttagtcttggagtaa 17043298  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17043297 atcaaaatatcatcgataaacacaacaacgaaccgatccaaaaaggcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 17043198  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  17043197 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagatgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatct 17043098  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17043097 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggtagtggatacctattcttgatagt 17043011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 24793098 - 24792612
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  24793098 taggagtctcccactgcgataccgcttcaactttagacgaatctactgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaacca 24792999  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24792998 gaactcacacttagataatttagcataaagtttcttttctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcaacatgttcttcttcagtcttggagtaa 24792899  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792898 atcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 24792799  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  24792798 caaaaggcatacctttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacct 24792699  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792698 caaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 24792612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22503758 - 22503285
Alignment:
Q  25 ttgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacactta 124  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| || || |||||| |||| |||||||||    
T  22503758 ttgcgatactgcatcgactttagagggatctacaacaataccatcaccataaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacactta 22503659  T
Q  125 gacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgt 224  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22503658 gatattttagcataaagtttcttctcttttaacacttgcaagacaatcttcagatgctcaacatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcat 22503559  T
Q  225 cgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataac 324  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22503558 cgatgaaaacaaccccgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatttactccataaacactccaggtgcattggtaacaccgaaagacataac 22503459  T
Q  325 tttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttg 424  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22503458 tttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttg 22503359  T
Q  425 ctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22503358 ctgaaaacacgtgcacccactatctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 22503285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 430598 - 430118
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||   || ||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| |    
T  430598 taggagtctctcattgcgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccactaccagaaataacatgcccaagaaagctcacttcttttaacca 430499  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  430498 gaattcacacttagataatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaa 430399  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  430398 atcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcgaatcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacac 430299  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  430298 cgaaaggcataaccttgtactcatagtgagcataccgcgttctgaaggctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatatggtgataacctgatct 430199  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  430198 caaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatccttggaagttgatacctattctt 430118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 41 - 492
Target Start/End: Original strand, 20139989 - 20140440
Alignment:
Q  41 actttagacggatccacagcaataccatctccg-gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataa 139  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  20139989 actttagacggatctactgcaatacca-ctacgagaaataacatggccaagaaagctcacttttttcaaccagaattcacacttagacaatttagcatag 20140087  T
Q  140 agtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaacca 239  Q
    || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||    
T  20140088 agcttcttttctttcaacacttgcaaaacaatcttcaagtgatcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaacca 20140187  T
Q  240 cgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtg 339  Q
      || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | ||| || ||||| ||||| ||    
T  20140188 aaaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtgacaccgaacgacattaccttgtactcataatg 20140287  T
Q  340 accataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgca 439  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20140288 tccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgaactcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgca 20140387  T
Q  440 cccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20140388 cccactaactgatccatcaaatcatcgattctcggaagtggatacctattctt 20140440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22360726 - 22360246
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||   || ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||| |    
T  22360726 taggagtctcccattgcgatactgcatcaactttagacggttctactgcaataccactaccagaaataacatgtccaagatagctcacttccttcaacca 22360627  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||| || || || |  |||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22360626 gaattcacacttagacaatttcgcataaatcatcttctctttcaacacctgcaaaaccagtttcaaatgctcagcaggttcttcttcagacttggagtaa 22360527  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||    
T  22360526 atcaaaatatcatcaataaaaacaacgacgaaccgatcctaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactcaaggtgcatttgtaacac 22360427  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22360426 cgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 22360327  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22360326 caaatctatcttgttgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatatctattctt 22360246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 50618880 - 50618400
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||   || ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||| |    
T  50618880 taggagtctcccattgcgatactgcatcaactttagagggatctactgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaaactcacctctttcaacca 50618781  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  50618780 gaattcacactttgataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacagtcttcaaatgctcaacatgttcttcctcagtcttggagtaa 50618681  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  50618680 atcaaaatgtcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatcaaaaaatgcatgaaaaatgtgattcatgtactccataaacactccaggggcatttgtaacac 50618581  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50618580 cgaaaggcatcactttatactcataatgtccatatcgcgttctaaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 50618481  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50618480 caaatcaatcttgttaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctt 50618400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 21750817 - 21751297
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||  || ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| || ||| |    
T  21750817 taggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatctactgcaataccattgccagaaataacatgtccaagaaaaattacttcttttaacca 21750916  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || || | ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21750917 gaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctttttcaacacttgcaaaaccaacttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaa 21751016  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    || |||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| || ||||    
T  21751017 attaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaagagcattagtaacac 21751116  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| || |||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  21751117 caaaaggcataactttatactcataatgtccataccgcgtcctaaaagttgtcttctacatatcttcatctttcactttaatctggtgatgacccgatct 21751216  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||| |||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21751217 caaatctatcttgttgaaaacacttgcacctactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatacctattctt 21751297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 75 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21862792 - 21862375
Alignment:
Q  75 aaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatctt 174  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||    
T  21862792 aaataacatgtccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagcttcttctctttgaacacttgcaaaaccatctt 21862693  T
Q  175 cagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 274  Q
    || ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  21862692 caaatgctcagcatgttcttcctcagtcttggagtaaattaaaatgtcatcaataaaaacaaccacgaaacggtccaaaaatgcatgaaaaatgcgattc 21862593  T
Q  275 atatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatat 374  Q
    || | |||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21862592 atgtgctccataaacacactaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttatactcataatgtgcataccgcgttctaaaagctgtcttctgcatat 21862493  T
Q  375 cctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgg 474  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  21862492 cttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatgtatcttgctgaacacacgtgcacccaccaactgatccatcaagtcatctattcttgg 21862393  T
Q  475 aagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21862392 aagtggatacctattctt 21862375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 190 - 492
Target Start/End: Original strand, 16378150 - 16378452
Alignment:
Q  190 ttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaac 289  Q
    ||||||||| | |||| |||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| || || |||||||| |||||||| |||    
T  16378150 ttcttcttcggacttgaagtatatcaaaatgtcatcaataaacacaaccacgaaacgatccaaaaacacatgaaaaattcgattcatgtactccatgaac 16378249  T
Q  290 actccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactt 389  Q
    || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16378250 acaccaggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgcgttctaaaagccgtcttctgcatatcctcatctttcactt 16378349  T
Q  390 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 489  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16378350 taatctagtgataacctgatctcaaatcaatcttgttgaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctatt 16378449  T
Q  490 ctt 492  Q
    |||    
T  16378450 ctt 16378452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21744032 - 21743554
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| | ||| |||||| | ||| |||    
T  21744032 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaagacttacttcacttaaccaga 21743933  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  21743932 actcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaat 21743833  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     || || |  || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  21743832 taagatgtgatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctgttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccg 21743733  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||  || || |||||||| || ||||| || ||||    
T  21743732 aaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcattcttcaccttaatctgatggtaacctgacctca 21743633  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21743632 aatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcgtcaattctcggaagtggatacctattctt 21743554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 19661610 - 19661138
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||| | |||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  19661610 tcccattgtgatactgcatcaacttttgaaggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaggaaaactcacttcacttaaccagaactcac 19661511  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| | || |||||||| ||    
T  19661510 acttcgacaacttagcatacaacttcttttcttttaacacttacaatacaatcttcagatgctatgcatgctcttcttcagtccttgaataaatcaagat 19661411  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
     || || |||||||||||||||||   ||| |   | |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  19661410 gtcatcaataaacacaaccacgaatttatctaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggc 19661311  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    || || || |||||||||||||||||||| || ||  | || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  19661310 atcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctagaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaa 19661211  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19661210 tcttactgaaaacatttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaattctcggaagtggatacctgttctt 19661138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 19856184 - 19856662
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||  || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19856184 ggagtctcccattgtgatattgcatcaactttcgaaggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaaggaaactcacttcacttaactaga 19856283  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||| || | ||| || || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||    
T  19856284 actcacactttgacaacttagcatacaacttcttttcttttaatatttgcaatactatcttcagatgttcttcatgctcttcttcagtcttagaataaat 19856383  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    |||||| ||  | |||||||||||||||||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||| ||    
T  19856384 caaaatgtcaccaataaacacaaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccataaacacaccaggcgcatgagtaacaacg 19856483  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || |||||||||| ||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || || |    
T  19856484 aaaggcatcaccttatattcatagtaaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctta 19856583  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19856584 agtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaattgatccattaagtcgtcaattctcggaagtggatacctgttctt 19856662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 239
Target Start/End: Original strand, 21026050 - 21026277
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| |    
T  21026050 taggagtctcccattgcgataccgctttaactttagagggatctacaacaataccatcaccagaaataacatggccaaaaaaactcacttctttcaacca 21026149  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21026150 gaactcacacttagatattttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 21026249  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaacca 239  Q
    || |||||||| ||||| || |||||||    
T  21026250 attaaaatatcatcgatgaaaacaacca 21026277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20834380 - 20833902
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| |||||| |||||   ||| |||    
T  20834380 ggagtctcccattgtgatacagcatcaactttcgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcgcttcacataaccaga 20834281  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| |   | ||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  20834280 actcacacttcgacaacttagcatacaaccttttctctttcaaaatttgcaacacaatcttcaaatgttctgcatgttcttcttcagtctttgaataaat 20834181  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || |||||| || |||||||||||||||||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| || |||||     
T  20834180 cagaatatcatcaataaacacaaccacgaatttatccaggtaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccacgcgcattagtaacacct 20834081  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| || ||||    
T  20834080 aaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctca 20833981  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||| | ||||||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  20833980 agtcaatcatactgaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatatctgttctt 20833902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 24098083 - 24097605
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  || || || |||||||||||| | ||| |||    
T  24098083 ggagtctcccattgtgatactgcatcaactttcgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccaga 24097984  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| || || ||    
T  24097983 actcacactttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaagacttacaatacaatcttcagattttctgcatgctcctcttcagtcttagaatagat 24097884  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || ||| || || ||||| || ||||||||   ||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  24097883 cagaatgtcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatggaaaatttggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccg 24097784  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || |||||||| || ||  |||| || || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||    
T  24097783 aaaggcatcaccttgtattcgtaatgttcatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctca 24097684  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | || ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24097683 agtcgatcttgctgaacacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacctgttctt 24097605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20855240 - 20854762
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  20855240 ggagtttcccactgagatactgcatcaactttcgaaggatcaaccgcgataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttcacttaaccaga 20855141  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcata-aagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa 212  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||| ||||| |  || || ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||| || || ||||    
T  20855140 actcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctccttcaaaatctgcaacacaatcttcaagtgttctgcatgctcctcttcagttttagaataaa 20855042  T
Q  213 tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacacc 312  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||| ||   ||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||    
T  20855041 tcaaaatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacacc 20854942  T
Q  313 gaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctc 412  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| |||    
T  20854941 gaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacctc 20854842  T
Q  413 aaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || |||||||| || ||||||   ||||| || ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  20854841 aagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatccgcggaagtggatatctattctt 20854762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20938474 - 20938065
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| |||||||| || ||  ||||||| |    
T  20938474 tggccaagaaaacttacttcaattaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaatacttgtaatactattctcagatgct 20938375  T
Q  183 ccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 282  Q
    |  |||| |||||||||||||| || ||||||| | | || || |||||||||||||||||   ||||||  | |||||||| || || |||||||||||    
T  20938374 ctacatgctcttcttcagtcttcgaataaatcagactgtcatcaataaacacaaccacgaatttatccaagtaagcatggaaaattcggttcatatactc 20938275  T
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatct 382  Q
    ||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || || |||||||||||||||||     
T  20938274 catgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgcatatcctcatcc 20938175  T
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    || || ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||    
T  20938174 ttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcctaggaagtggat 20938075  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    |||| |||||    
T  20938074 acctgttctt 20938065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 492
Target Start/End: Original strand, 20296372 - 20296769
Alignment:
Q  95 ctcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttctt 194  Q
    ||||||||| | ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| | | |||| || ||||||||||| || |||||  | ||||| || ||||| || |    
T  20296372 ctcacttcacttaaccagaactcacattttgacaactttgcatacaatctcttttccttcaacacttgcaatacaattcttagatgctctgcatgctcct 20296471  T
Q  195 cttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactcc 294  Q
    ||||| |||| || ||||| || ||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||    
T  20296472 cttcattcttagaataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaagattcggttcatgtactccatgaacacacc 20296571  T
Q  295 aggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatc 394  Q
    ||| || || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  20296572 aggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatc 20296671  T
Q  395 tggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| || |||| || | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20296672 tgatggtaaccagacctcaaatcaatcttact-aaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaaatcctcaattctcggaagcggatacctgttctt 20296769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 495
Target Start/End: Original strand, 48424783 - 48425264
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||||   || ||||| |  || || || ||||| |||||||| ||| |||    
T  48424783 ggagtctcccattgtgataccgcatcaacctttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccaga 48424882  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || || || |||||||| |   |||| || ||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| || ||    
T  48424883 actcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagat 48424982  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |||||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  48424983 taaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccg 48425082  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||    
T  48425083 aaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctca 48425182  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgat 495  Q
    |||||||||| || |||| || | ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  48425183 aatcaatcttact-aaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgat 48425264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 495
Target Start/End: Original strand, 52987651 - 52988132
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||||   || ||||| |  || || || ||||| |||||||| ||| |||    
T  52987651 ggagtctcccattgtgataccgcatcaacctttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccaga 52987750  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || || || |||||||| |   |||| || ||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| || ||    
T  52987751 actcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagat 52987850  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |||||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  52987851 taaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccg 52987950  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||    
T  52987951 aaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctca 52988050  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgat 495  Q
    |||||||||| || |||| || | ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  52988051 aatcaatcttact-aaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgat 52988132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Original strand, 20944119 - 20944240
Alignment:
Q  224 tcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataa 323  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20944119 tcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataa 20944218  T
Q  324 ctttgtattcatagtgaccata 345  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  20944219 ctttttattcataatgaccata 20944240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 495
Target Start/End: Original strand, 37678959 - 37679440
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||   || ||||| |  || || |  ||||| ||||||   ||| |||    
T  37678959 ggagtctcccattgtgataccgcatcaacttttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatgtgacccaaaaaacttacttcacctaaccaga 37679058  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || || || |||||||| |   |||| || ||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||| |  || ||| ||||||| || ||    
T  37679059 attcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgcttctcctcattcttggaatagat 37679158  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |||||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  37679159 taaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaagattcgattcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccg 37679258  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||    
T  37679259 aaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatctttcacctttatctgatgataaccagacctca 37679358  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgat 495  Q
    |||||||||| || |||  || | ||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  37679359 aatcaatcttact-aaatatcttagcaccaaccaattgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgat 37679440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 272 - 492
Target Start/End: Original strand, 41310694 - 41310914
Alignment:
Q  272 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgca 371  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||    
T  41310694 ttcatatactccataaacacactaggcgcattagtaacaccgaaagacatcacgttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 41310793  T
Q  372 tatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 471  Q
    |||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||||||| | || |  || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41310794 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccggacctcaaatcagttttacgaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcgtcaattct 41310893  T
Q  472 cggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  41310894 cggaagtggatacctattctt 41310914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 31538477 - 31537996
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||||   || ||||| |  || || || ||||| |||||||| ||| |||    
T  31538477 ggagtctcccattgtgataccgcatcaacctttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccaga 31538378  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || || || |||||||| |   |||| || ||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| || ||    
T  31538377 actcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagat 31538278  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |||||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  31538277 taaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccg 31538178  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  31538177 aaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagacctca 31538078  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgat 495  Q
    |||| ||||| || |||  || | ||||| || |  ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  31538077 aatctatcttact-aaatatcttagcaccaaccagttgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatatctgttcttgat 31537996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 144 - 492
Target Start/End: Original strand, 21952918 - 21953266
Alignment:
Q  144 tcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaa 243  Q
    |||| |||||||| ||||| || |||||  ||||||| || ||||| || |||||  ||||||| ||||| || ||||| || |||||||| || || ||    
T  21952918 tcttttctttcaaaacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcgttcttggaataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaa 21953017  T
Q  244 ccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgacca 343  Q
    |  ||||| ||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  21953018 cttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgacca 21953117  T
Q  344 taacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgt-gcaccc 442  Q
    ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||| || | |||||     
T  21953118 taacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttact-aaaaatcttagcacca 21953216  T
Q  443 actaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  21953217 accaactgatccatcaagtcgtcaattccaggaagcggatacctgttctt 21953266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 38911306 - 38910825
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || || | |||||| |||||||||   || ||||| | ||| || || || ||||||||| | ||| |||    
T  38911306 ggagtctcccattgtgataccgcatcaacctttgaagaatccactgcaataccactaccagaaataatatgacccagaaagctcacttcacttaaccaga 38911207  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||  |||||||| |   |||| || ||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| || ||    
T  38911206 actcacatttcgacagcttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagat 38911107  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |||||||| || ||||| || || || |||  |||||  || |||||||| ||  | ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  38911106 taaaatatcatcaataaataccacaacaaacttatccaggaaagcatggaaaatttggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccg 38911007  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||    
T  38911006 aaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatgataaccagacctca 38910907  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgat 495  Q
    |||||||||| ||||||| || | ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  38910906 aatcaatcttactgaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatatctgttcttgat 38910825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20829812 - 20829394
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  20829812 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcc 20829713  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 273  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| | | | ||| || || | |||    
T  20829712 tcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctatt 20829613  T
Q  274 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 373  Q
    ||| || |||||||| || || |||||||| |  || || || ||||| ||    || |||||||| ||||| | ||||| ||| || || ||    |||    
T  20829612 catgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatata 20829513  T
Q  374 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 473  Q
    || ||  | |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  20829512 tcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttg 20829413  T
Q  474 gaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  20829412 gaagtggataccgattctt 20829394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 149
Target Start/End: Original strand, 16378019 - 16378156
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| |||| || ||||||| ||  || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |    
T  16378019 taggagtctcccattgtgataccgcatcaactttagacagatcaactgcaatactattaccagaaataacatggccaagaaaactaacctctttcaacca 16378118  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttct 149  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  16378119 gaattcacactttgacaatttagcatatagcttcttct 16378156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 237
Target Start/End: Original strand, 41308620 - 41308775
Alignment:
Q  82 atggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgt 181  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | ||| | |||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  41308620 atggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaatcttcagatgc 41308719  T
Q  182 tccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaac 237  Q
    || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || || || |||||||||||    
T  41308720 tctgcatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaac 41308775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 35930929 - 35930827
Alignment:
Q  390 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 489  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  35930929 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctcagcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 35930830  T
Q  490 ctt 492  Q
    |||    
T  35930829 ctt 35930827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 390 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 41215960 - 41215858
Alignment:
Q  390 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 489  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || |||   ||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||    
T  41215960 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttccgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagcggataccgatt 41215861  T
Q  490 ctt 492  Q
    |||    
T  41215860 ctt 41215858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 383 - 492
Target Start/End: Original strand, 20927302 - 20927411
Alignment:
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  20927302 tttactctaatctgatgatatcctgatctcatatcaatcttgctaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctttgaagtggat 20927401  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    | | ||||||    
T  20927402 atcgattctt 20927411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Original strand, 20527366 - 20527410
Alignment:
Q  448 ctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  20527366 ctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattctt 20527410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 22116790 - 22116877
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcac 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||  || |||||||||   || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22116790 taggagtctcccattgcgataccgcatcaactttagatggatttactgcaataccactaccagaaataacatggccaagaaaactcac 22116877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 420; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 44384525 - 44384034
Alignment:
Q  7 ggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattc 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||    
T  44384525 ggacttaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaataacatggcctagaaaactcacttctttc 44384426  T
Q  107 aactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttgg 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  44384425 aaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 44384326  T
Q  207 agtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 306  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384325 agtagatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 44384226  T
Q  307 cacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataaccc 406  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  44384225 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacct 44384126  T
Q  407 gatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384125 aatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 44384034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Original strand, 10870337 - 10870829
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  10870337 cggacttaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaataacatggcctagaaaactcacttcttt 10870436  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10870437 caaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttg 10870536  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10870537 gagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 10870636  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10870637 tcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacc 10870736  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10870737 tgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgctcccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctgttcttgatagt 10870829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Original strand, 27219503 - 27219995
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  27219503 cggacttaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaataacatggcctagaaaactcacttcttt 27219602  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27219603 caaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttg 27219702  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27219703 gagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 27219802  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  27219803 tcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccatatcgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcc 27219902  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27219903 tgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 27219995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Original strand, 24711521 - 24712013
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  24711521 cggacttaggagtctcccactgcgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttcttt 24711620  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24711621 caaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttg 24711720  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24711721 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaaaatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 24711820  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24711821 tcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacc 24711920  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24711921 tgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 24712013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 498
Target Start/End: Original strand, 16926855 - 16927339
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  16926855 ggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcttcggaaataacatggccaaggaaactcacctctttcaaccaga 16926954  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16926955 attcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagat 16927054  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927055 caaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 16927154  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16927155 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatctca 16927254  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927255 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 16927339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 498
Target Start/End: Original strand, 17000495 - 17000979
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  17000495 ggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcttcggaaataacatggccaaggaaactcacctctttcaaccaga 17000594  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17000595 attcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagat 17000694  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17000695 caaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 17000794  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17000795 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatctca 17000894  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17000895 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 17000979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 498
Target Start/End: Original strand, 9485726 - 9486195
Alignment:
Q  29 gatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagaca 128  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9485726 gataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagaca 9485825  T
Q  129 atttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgat 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9485826 atttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgat 9485925  T
Q  229 aaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttg 328  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  9485926 aaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaagggcataacttta 9486025  T
Q  329 tattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctga 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9486026 tattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctga 9486125  T
Q  429 aaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9486126 aaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 9486195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 21143997 - 21143505
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21143997 cggacttaggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacagatccacaacaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttcttt 21143898  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21143897 caaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttg 21143798  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143797 gagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 21143698  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143697 taacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgtatatcttcatcttttactttaatctggtgataacc 21143598  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21143597 tgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagttgatacctattcttgatagt 21143505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 41607341 - 41606849
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  41607341 cggacttaggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcactagaaataacatggcctagaaaactcacttcttt 41607242  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  41607241 caaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttg 41607142  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41607141 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgtgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 41607042  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41607041 taacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacc 41606942  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41606941 tgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 41606849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 24875706 - 24875214
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  24875706 cggacttaggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttcttt 24875607  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24875606 caaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttg 24875507  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24875506 gagtaaatcaaaatatcatcaatgaatacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 24875407  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24875406 taacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctgatgataacc 24875307  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24875306 tgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaatcgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 24875214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Original strand, 27372756 - 27373248
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  27372756 cggacttaggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttcttt 27372855  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27372856 caaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttg 27372955  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27372956 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatattccataaacactccaggtgcattgg 27373055  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  27373056 taacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgatatcc 27373155  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373156 tgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 27373248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 24263863 - 24264349
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  24263863 taggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaattccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaacca 24263962  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24263963 gaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcaacatgttcctcttcagtcttggagtaa 24264062  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24264063 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccaatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacac 24264162  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  24264163 caaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacct 24264262  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264263 caaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 24264349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 480
Target Start/End: Original strand, 23189412 - 23189879
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||  |||||| |    
T  23189412 taggagtctcccattgcgataccgcctcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcccagaaaacttactttcttcaacca 23189511  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23189512 gaat-cacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcctcagtcttggagtaa 23189610  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23189611 atcaaaatatcgtctataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 23189710  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | ||    
T  23189711 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctagtgataacctaacct 23189810  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 480  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23189811 caagtcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaaccgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 23189879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 498
Target Start/End: Original strand, 24676990 - 24677468
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||| |||| ||||    
T  24676990 tcccaatgcgatactgcatcgactttagagggatctacagcaataccatcaccagaaataacatggcccagaaaacttacctctttcaaccagaactcac 24677089  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24677090 acttagataatttagcataaagtttcttctcttttaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaaat 24677189  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
    ||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  24677190 atcatcgatgaaaaaaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactacaggtgcattcgtaacaccgaaaggc 24677289  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24677290 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctatcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaa 24677389  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24677390 tcttgctgaaatcttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 24677468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 21324216 - 21323730
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||  |||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| |    
T  21324216 taggagtatcccattgcgataccgcttaaactttagacggatctacaaaaataccgtcaacagaaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaacca 21324117  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21324116 gaactcacacttagatagtttagcataaagtttcttctccttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 21324017  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  21324016 atcaaaatatcgtcgatgaaaacaactacgaaccaatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaatactccaggtgtattggtaacac 21323917  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21323916 caaaaggcataactttatactcatagtggccataacgtgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttaccttaatctggtgataacccgatct 21323817  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21323816 caaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatatctattcttgatagt 21323730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 24706432 - 24705946
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |    
T  24706432 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatccaccgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaacca 24706333  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24706332 gaactcacatttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 24706233  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || || ||| |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24706232 atcaaaatatcatcaatgaaaacagccacgaaccgatccaaaaatgcgtgaaagatatgattcatgtactccataaacactccaggtacattggtaacac 24706133  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24706132 caaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttctttttttactttaatctggtgataacctgatct 24706033  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24706032 caaatcaatcttgctgaaaactttcgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatttttgatagt 24705946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 143 - 498
Target Start/End: Original strand, 9337206 - 9337561
Alignment:
Q  143 ttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacga 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9337206 ttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaa 9337305  T
Q  243 accgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgacc 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9337306 accgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaagggcataactttatattcatagtgacc 9337405  T
Q  343 ataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcaccc 442  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9337406 ataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcaccc 9337505  T
Q  443 actaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9337506 actagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 9337561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 23073356 - 23073836
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||   || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |    
T  23073356 taggagtctcccattgcgatactgcatcaactttagacggatctactgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaacca 23073455  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| |||    | |||||||||||||| ||||||||||    
T  23073456 gaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttggaaaaccaacttcaaatggctagtatgttcttcttcagacttggagtaa 23073555  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  23073556 atcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaaacattccaaaaatgcatgaaagatgcggttcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacac 23073655  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23073656 cgaaaggcataactttgtattcataatggccatatcgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 23073755  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || ||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23073756 cagatctatcttgctgaaaatacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 23073836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23106678 - 23106198
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||   || ||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| |    
T  23106678 taggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttcttttaacca 23106579  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23106578 taattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaa 23106479  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  23106478 atcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaactgatccaaaaatgcatgaaaaatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacac 23106379  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23106378 cgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgttctaaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 23106279  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23106278 caaatctatcttgctgaaaacttttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattctt 23106198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22734724 - 22734244
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || | |||||||   || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |    
T  22734724 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacgaatctactgaaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaacca 22734625  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22734624 gaatttacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaa 22734525  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||  | ||||    
T  22734524 attaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaattcatgaaagatgcgattcatgtactacataaatactccaggtgcatttataacac 22734425  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22734424 cgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatatggtgataacctgatct 22734325  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||| |||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22734324 caaatctatcttgttgaaaacacttgtacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 22734244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 24819180 - 24818700
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| ||||| || || ||||||   || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  24819180 taggagtctcccattgtgatactacatcaactttagatggatctaccgcgataccactaccagaaataacatggccaagaaaacttacttcattcaacca 24819081  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||     
T  24819080 gagttcacactttgacaacttagcataaagcttcttctccttcagcacttgcaagacaatcctcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttagagtat 24818981  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||| | ||||| || || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||    
T  24818980 atcaaaatatcatcaatgaacacaaccatgaagcgatctaaatacgcatgaaaaatacgattcaagtactccataaacacacctggcgcatttgtaacac 24818881  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||| |||   ||||| || || |||||||| || || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24818880 cgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 24818781  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24818780 caaatcaatcttgctgaatacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcagttcttggaagtggatacctattctt 24818700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 82 - 492
Target Start/End: Original strand, 23112299 - 23112712
Alignment:
Q  82 atggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgt 181  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | ||| |||||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| || ||||||||||| || |||||||| | |||     
T  23112299 atggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttccttcaacacttgcaacacaatctttaaatgc 23112398  T
Q  182 tccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatact 281  Q
    || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| || ||| |||||| | | |||||||| || | |||||| ||||    
T  23112399 tctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaagatatcatcaataaacacaactacaaactgatccagataagcatggaaaattctattcatgtact 23112498  T
Q  282 ccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatc 381  Q
    |||||||||| | ||| ||||| || |||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || |||| |||||| |||||    
T  23112499 ccataaacacactaggcgcattagtaacaccgaaagacatcactttatattcataatgtccatatcgcgtcctaaaggccgttttctacatatcttcatc 23112598  T
Q  382 ttttactttaatctggtgataacccgatctcaa---atcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagt 478  Q
    ||| || |||||||| || |||||||| |||||   ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23112599 tttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcatcaatcttgctgaatatgcgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagt 23112698  T
Q  479 ggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||    
T  23112699 ggatacctattctt 23112712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22323806 - 22323581
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  22323806 taggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaattccatcaccagaaacaacatggcctagaaaactcacttctttcaacca 22323707  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22323706 gaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaa 22323607  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaac 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22323606 atcaagatatcgtcgataaacacaac 22323581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 19650998 - 19650520
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| ||||| |||||| | |||||||    
T  19650998 ggagtctcccattgtgataccgcatcaacttttgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaactaga 19650899  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  19650898 actcacattttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaaaacttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcctcttcggtcttagaataaat 19650799  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     | |||||| || |||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||    
T  19650798 tagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccaaaaaagcatggaaaatttggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtgacaccg 19650699  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || ||||| || || |||||||| || || || || |  |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||  |||    
T  19650698 aaaggcatcaccttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggtcgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacttca 19650599  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19650598 agtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattctt 19650520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 12575848 - 12576326
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||| | | | | |    
T  12575848 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaaccgctataccatcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaa 12575947  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || |||| ||| ||||| |  ||| | |||||||| ||||| || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  12575948 attcacatttcgacagtttggcatacaacttcctttctttcaaaacttgcaacacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaat 12576047  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || ||| || || ||||| || ||||||||   ||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || || || || || || ||||||    
T  12576048 cagaatgtcatcaataaataccaccacgaatttatccaaaaaagcatgaaaaattcgattcatatactccatgaatacaccgggcgcgttagtaacaccg 12576147  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  12576148 aaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatctttcaccttaatttggtggtaacctgacctca 12576247  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  12576248 agtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattctt 12576326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 27789235 - 27789713
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| | || || |||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||| | | | | |    
T  27789235 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggaccaaccgctataccatcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaa 27789334  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| |  |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  27789335 actcacatttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaaaacttgcagcacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaat 27789434  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || |||||| || ||||| || ||||||||   ||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||||||    
T  27789435 cagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaaattcgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccg 27789534  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||    
T  27789535 aaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctca 27789634  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  27789635 agtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattctt 27789713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 83 - 495
Target Start/End: Original strand, 23278340 - 23278752
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    ||||| || |||||||||||| | ||| |||| || ||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||    
T  23278340 tggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaatatttgcaacacaatcttcagatgtt 23278439  T
Q  183 ccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 282  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| || || ||||| |||||||||||   ||||| | | |||||||| || || |||||||||||    
T  23278440 ctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcagaatgtcatcaataaaaacaaccacgaaattatccagataagcatggaaaattcggttcatatactc 23278539  T
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatct 382  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| || || ||||| || || || || |  ||||||||||||||||  ||     
T  23278540 catgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggtcgtcttctgcatatccttgtcc 23278639  T
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    || || ||||| || || ||||| ||  |||| |||||||| || |||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23278640 ttcaccttaatttgatggtaacctgacttcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggat 23278739  T
Q  483 acctattcttgat 495  Q
    |||| ||||||||    
T  23278740 acctgttcttgat 23278752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 19717965 - 19717487
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| |||||  | || ||||| |||||||| || |||||||||   || ||||| |  ||||| || || || |||||| | ||| |||    
T  19717965 ggagtctcccattgtgatactacatcaacttttgacggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggcctagaaatcttacttcacttaaccaga 19717866  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |||||    
T  19717865 actcacacttcgacaacttagcatacagcttcttttctttcaaaacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctgatcttcagtcttagaataaat 19717766  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     | |||||| || ||||||||||||   ||   ||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||    
T  19717765 tagaatatcatcaataaacacaacccaaaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgctttagtaacaccg 19717666  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || ||||| |||||||||||||| || |  || ||||| || ||||| || ||||    
T  19717665 aaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttgtgcatatcctcatccttcaacttgatctgatggtaacctgacctca 19717566  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | ||||||||| | |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  19717565 agtcaatcttgttaaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcagaagtggatatctgttctt 19717487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23098966 - 23098488
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |  ||||| || | ||| ||||||||||||   || ||||| |  ||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  23098966 ggagtctcccattgcgatactgcattaactttcgaagaatcaacagcaataccactaccagaaataatgtggccgagaaaactcacttcacttaaccaga 23098867  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |   | ||||||||||  || ||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  23098866 attcacatttcgacaacttagcatacaacattttctctttcagaacctgtaatacaatcctcagatgctcggcatgctcttcttcagtcttagaataaat 23098767  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| ||| ||||| || || | |||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  23098766 taaaatatcatcaataaacaccaccacgaatctatccagaaaagcatgaaaaatcctattcatatactccataaatacaccaggcgcattagtaacaccg 23098667  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || || || || ||||    
T  23098666 aaaggcatcaccttctattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatggtatcctgacctca 23098567  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| || ||||    |||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  23098566 agtcaatcttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcagaagcggatacctgttctt 23098488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 257 - 492
Target Start/End: Original strand, 25255657 - 25255892
Alignment:
Q  257 gcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctga 356  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || |    
T  25255657 gcatggaaaattcggttcatatactccataaacacaccaagcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 25255756  T
Q  357 aagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccat 456  Q
    | || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25255757 aggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacacgtgcacccactaactgatccat 25255856  T
Q  457 caaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
     || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25255857 taagtcatcaatcctcggaagtggatacctattctt 25255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 495
Target Start/End: Original strand, 1065246 - 1065727
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||||   || ||||| |  || || || ||||| |||||||| ||  |||    
T  1065246 ggagtctcccattgtgataccgcatcaacctttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaatcaga 1065345  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || || || |||||||| |   |||| || ||||||||||| || || ||  ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| || ||    
T  1065346 actcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacactattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagat 1065445  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |||||||| || ||||| || ||||| |||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  1065446 taaaatatcatcaataaataccaccacaaacttatccagaaaagcatggaagattcgattcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccg 1065545  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||    
T  1065546 aaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatgataaccagacctca 1065645  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgat 495  Q
    |||||||||| ||||||| || | ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  1065646 aatcaatcttactgaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgat 1065727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 92 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 30209787 - 30209387
Alignment:
Q  92 aaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgtt 191  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| || || || ||| | |  ||||||||||||| |||||| || |||||  ||| ||||||  ||||||    
T  30209787 aaactcacttcgttcaaccagaattcgcacttcgataacttggcagataacttcttctctttcagcacttgaaaaacaattctcaaatgttcgacatgtt 30209688  T
Q  192 cttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacac 291  Q
    | || || | ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||| | | | ||| || ||  |||||||||| |||||||||||    
T  30209687 cctcctcggacttggagtatatcaaaatatcatctataaacacaacaacaaaacgatccagataagtatgaaaaatatgattcatatattccataaacac 30209588  T
Q  292 tccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttacttta 391  Q
    |||  | ||||| || |||||||||||||| ||    ||||  || || |  ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||| |||||     
T  30209587 tcccagcgcattagtaacaccgaaaggcatcacaaaatatttgtaatgtctgtaacgtgtcctaaaggccgtcttctgaatatcctcatctttcactttg 30209488  T
Q  392 atctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattct 491  Q
    ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||    
T  30209487 atctggtgatagcctgaccttaactcaattttactgaacacacgcgcacccactaactgatccatcaaatcttcgatcctcggaagtggatacttattct 30209388  T
Q  492 t 492  Q
    |    
T  30209387 t 30209387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 495
Target Start/End: Original strand, 31832153 - 31832634
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||||   || ||||| |  || || || ||||| |||||| | ||| |||    
T  31832153 ggagtctcccattgtgataccgcatcaacctttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcacttaaccaga 31832252  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| |   |||| || ||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| |||||    
T  31832253 actcacatttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaataaat 31832352  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     || ||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  31832353 taagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccg 31832452  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||    
T  31832453 aaaggcatcaccttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctca 31832552  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgat 495  Q
    |||||||||| || |||| || | ||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  31832553 aatcaatcttact-aaaaatcttagcaccaaccaattgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgat 31832634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 432
Target Start/End: Original strand, 24950154 - 24950503
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||| | || |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||    
T  24950154 tggccaagaagactcacttcacttaaccataactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaatatttgcaacacaatcttcagatgtt 24950253  T
Q  183 ccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 282  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||| || | ||| |||||| | ||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||    
T  24950254 ctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcagaatatcatcaacaaatacaaccgcaaatttatccaggtaagcatggaaaattcggttcatatactc 24950353  T
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatct 382  Q
    ||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| |||||     
T  24950354 catgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatcc 24950453  T
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaac 432  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||||| || |||||    
T  24950454 tttaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaac 24950503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 30011126 - 30010654
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||| ||||| ||   || ||||| | ||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  30011126 tcccattgcgatactgcatcaaccttagatggatccacaacaatatcactaccagaaataatatgaccgagaaaactcacttcgttcaaccagaattcgc 30011027  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    || | || || || ||||| |  |||||||||| || |||||| || |||||  ||| ||| ||  ||||||| || || | ||||||||| ||||||||    
T  30011026 acatcgataacttggcatataacttcttctcttgcagcacttgcaaaacaattctcaaatgctcgacatgttcctcctcggacttggagtatatcaaaat 30010927  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
    ||| || |||||||| || || || ||||||| | | | ||| || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || |||| |||||||    
T  30010926 atcatctataaacacgacaacaaaacgatccagataagtatgaaaaatacgattcatatatttcataaacactcctggcgcattagtaacactgaaaggc 30010827  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    || ||    ||||| || || || ||||| || || || |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| || || |    
T  30010826 atcacagaatattcgtaatgtccgtaacgtgtcctaaaggtcgtcttctgaatatcctcatctttcactttaatctggtgatagcctaatcttaagtcca 30010727  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | || ||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||    
T  30010726 ttttactgaacacacgcgcacccactaacggatccatcaaatcgtcgatcctcggaagtggatacttattctt 30010654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Original strand, 23295430 - 23295705
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   ||  |||| |  ||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  23295430 ggagtctcccattgtgatactgcatcaactttcgatggatcaactgcaataccactacccaaaataatgtggcccagaaaactcacttcaattaaccaga 23295529  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  23295530 actcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaaaacttgtaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaat 23295629  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaac 289  Q
    ||  || || || |||||||||||||| ||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| |||    
T  23295630 caggatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccaggtaagcatggaaaattcggttcatatactccatnaac 23295705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27209120 - 27208802
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || ||||| || || ||||||   || ||||| || ||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  27209120 ggagtctcccactgcgataccgcatcaactttcgaaggatcaaccgcgataccactaccagaaataacgtggcctagaaaactcacttcacttaaccaga 27209021  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcata-aagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa 212  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |  || || ||||||||||| || || |||||  | ||||||||||| || ||||    
T  27209020 actcgcacttcgacaagttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaatcttcaggtgctctgcatgcacctcttcagtcttagaataaa 27208922  T
Q  213 tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacacc 312  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||   ||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| | ||| || || || |||||    
T  27208921 tcaaaatatcatctataaacaccaccacgaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacactaggcgctttagtaacacc 27208822  T
Q  313 gaaaggcataactttgtatt 332  Q
    ||||| ||| ||||||||||    
T  27208821 gaaagacatcactttgtatt 27208802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Original strand, 25264549 - 25264769
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| ||||| |||||| | ||| |||    
T  25264549 ggagtctcgcattgtgatactgcatcaactttcgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaga 25264648  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  25264649 actcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaat 25264748  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacac 234  Q
    ||| || || || ||||||||    
T  25264749 caagatgtcatcaataaacac 25264769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 415 - 480
Target Start/End: Original strand, 23611069 - 23611134
Alignment:
Q  415 atcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 480  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23611069 atcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaaccgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 23611134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 383 - 492
Target Start/End: Original strand, 22279969 - 22280078
Alignment:
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    |||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22279969 tttactctgatctgatgatatccagatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 22280068  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    ||| ||||||    
T  22280069 accgattctt 22280078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12639157 - 12639059
Alignment:
Q  38 tcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagca 136  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| |    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||    
T  12639157 tcgaccttagacggatccacagaaataccacccttagaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttagca 12639059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Original strand, 22279598 - 22279715
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    |||||| |||||||||| | || || || || |||||||||||||||| |||||||      ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  22279598 taggagaatcccattgcaacaccgcatcaaccttagacggatccacagaaataccacacttagaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaacca 22279697  T
Q  112 gaattcacacttagacaa 129  Q
     |||||||||||||||||    
T  22279698 aaattcacacttagacaa 22279715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 24829767 - 24829658
Alignment:
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    |||||| ||||||| |||||  | |||||| |||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24829767 tttactctaatctgatgatattctgatctctaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 24829668  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    ||| ||||||    
T  24829667 accgattctt 24829658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 492
Target Start/End: Original strand, 25130480 - 25130582
Alignment:
Q  390 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 489  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || |||   ||||| || |  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  25130480 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttccgcaccaaccagttgatccataaaatcatcaatcctcggaagcggataccgatt 25130579  T
Q  490 ctt 492  Q
    |||    
T  25130580 ctt 25130582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 45534435 - 45534613
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||| ||||||||| || || || ||| | ||||||||| ||||||||   || ||||| | ||| || || ||||||||||| |||||| |||    
T  45534435 ggagtctcccgttgcgatactgcatcaaccttaaatggatccacatcaataccactaccagaaataatatgaccgagaaaactcacttcgttcaaccaga 45534534  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttc 192  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |  ||||||||||||| |||||| || |||||  ||| ||| || ||||||||    
T  45534535 attcgcacttcgataacttggcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaattctcaaatgctcggcatgttc 45534613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24568585 - 24568494
Alignment:
Q  45 tagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagca 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |    ||||| ||||| |||||||||||||||||   |||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  24568585 tagacggatccacataaataccacccttagaaatcacatgaccaaggaaactcacttcccgcaactaaaactcacacttagacaacttagca 24568494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 413; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 498
Target Start/End: Original strand, 8388276 - 8388760
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  8388276 ggagtctcccactgtgataccgcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaataacatggccaaggaaactcacctcattcaaccaga 8388375  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8388376 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 8388475  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8388476 taaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 8388575  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  8388576 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgacctca 8388675  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8388676 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 8388760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 8051771 - 8051287
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |||    
T  8051771 ggagtttcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccaga 8051672  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8051671 attcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 8051572  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8051571 caaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 8051472  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  8051471 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgacctca 8051372  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8051371 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 8051287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Original strand, 27713192 - 27713684
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  27713192 cggacttaggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttcttt 27713291  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27713292 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttg 27713391  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27713392 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 27713491  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27713492 tcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacc 27713591  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27713592 tgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgacccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 27713684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 14302129 - 14301643
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  14302129 taggagtctcccattgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaacca 14302030  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14302029 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 14301930  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14301929 atcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacac 14301830  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  14301829 caaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacct 14301730  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14301729 caaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 14301643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 498
Target Start/End: Original strand, 12478455 - 12478948
Alignment:
Q  5 gcggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcat 104  Q
    |||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  12478455 gcggactttggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctt 12478554  T
Q  105 tcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtctt 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  12478555 tcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcggtctt 12478654  T
Q  205 ggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12478655 ggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattg 12478754  T
Q  305 gtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataac 404  Q
    || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12478755 gtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataac 12478854  T
Q  405 ccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12478855 ccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 12478948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 19776950 - 19776457
Alignment:
Q  5 gcggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcat 104  Q
    |||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  19776950 gcggactttggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctt 19776851  T
Q  105 tcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtctt 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  19776850 tcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcggtctt 19776751  T
Q  205 ggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19776750 ggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattg 19776651  T
Q  305 gtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataac 404  Q
    || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19776650 gtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataac 19776551  T
Q  405 ccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19776550 ccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 19776457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 14682429 - 14682915
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  14682429 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaacca 14682528  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14682529 gaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttctttttcagtcttggagtaa 14682628  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14682629 atcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaactctccaggtgcattggtaacac 14682728  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  14682729 caaaaggcataaccttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcgtcatcttttactttaatctggtgataacctgacct 14682828  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682829 cagatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 14682915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Original strand, 40474896 - 40475388
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  40474896 cggacttaggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatccacagcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttcttt 40474995  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40474996 caaccagaattcacacttcgacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttg 40475095  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40475096 gagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 40475195  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40475196 taacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgggttctgaaagctgtcttatgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacc 40475295  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40475296 tgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 40475388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 18225596 - 18225110
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||| |    
T  18225596 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagatggatccactgcaatatcatcaccagaaataacatggccaagaaaaggtacttctttcaacca 18225497  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18225496 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 18225397  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18225396 atcaaaatgtcgtcaataaacacaactacgaaccgatccaaaaaggcatggaagatgcgattcatatactccataaacagtccaggtgcattggtcacac 18225297  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  18225296 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatct 18225197  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225196 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 18225110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 23957609 - 23958095
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  23957609 taggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaattccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaacca 23957708  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23957709 gaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 23957808  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23957809 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacac 23957908  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||    
T  23957909 caaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacct 23958008  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958009 caaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 23958095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 15146035 - 15145557
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |    
T  15146035 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatctacagcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaacca 15145936  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15145935 gaactcacacttagataatttagcataaagtttcctctctttcaacacttgcaagacaatgttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 15145836  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15145835 atcaaaatatcatcgataaagacaaccacgaatcgatccaaaaatgcatgaaagatacgattcatgtactccataaacactccaggtgcattggtaacac 15145736  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15145735 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctagtgataacccgatct 15145636  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15145635 caaatcaatgttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca--------tcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 15145557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 145 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 17093166 - 17092813
Alignment:
Q  145 cttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaac 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17093166 cttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaac 17093067  T
Q  245 cgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccat 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17093066 cgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccat 17092967  T
Q  345 aacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccac 444  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092966 aacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccac 17092867  T
Q  445 taactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092866 tagttgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 17092813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 142 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16235012 - 16234656
Alignment:
Q  142 tttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacg 241  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  16235012 tttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacg 16234913  T
Q  242 aaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgac 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16234912 aaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgtattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgac 16234813  T
Q  342 cataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacc 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234812 cataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacc 16234713  T
Q  442 cactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234712 cactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 16234656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 12 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16353658 - 16353241
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggcca-aggaaactcacttcattcaact 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||| ||||||||| || ||||| || || || |||     
T  16353658 taggagtctcccattgcgatactgcatcgactttagagggatctacaacaataccatcaccagaaataacatggccanagaaaacttacctcttttaacc 16353559  T
Q  111 agaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagta 210  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  16353558 agaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcggtcttggagta 16353459  T
Q  211 aatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcaca 310  Q
    ||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16353458 aattaaaatatcatcgatgagaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaaca 16353359  T
Q  311 ccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatc 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16353358 ccaaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatc 16353259  T
Q  411 tcaaatcaatcttgctga 428  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16353258 tcaaatcaatcttgctga 16353241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14849516 - 14849036
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||   || ||||| || |||||||| ||||| || || |||||| |    
T  14849516 taggagtctcccattgcgatactgcatcaactttagatggatctactgcaataccactaccagaaataacttggccaagaaaacttacctctttcaacca 14849417  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| |||| |||||| || |||||||||| ||| ||  ||||||||||||| | |||||||||     
T  14849416 gaattcacactttgacaatttagcatataacttcttctccttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcaacatgttcttcttcggacttggagtat 14849317  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||    
T  14849316 atcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaagcgatccaaaaatgcatgaaaaatacgattcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacac 14849217  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  14849216 cgaaaggcatctctttatattcataatgtccataacgcgttctaaaagccgtcttctgcatatcttcatctctcactttaatttggtgataacccgatct 14849117  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||| |||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  14849116 caaatcaaccttgctaaatacacgcgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatttttggaagtggatatctattctt 14849036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 14695975 - 14696455
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||   |  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  14695975 taggagtctcccattgcgatactgcatcaactttagatggatctactgcaataccactactagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaacca 14696074  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| || |||||||||||||| | ||| |||||     
T  14696075 gaactcacactttgacaacttagcatataaattcttctctttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcggacttcgagtat 14696174  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| | ||||||| | ||||| || ||    ||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||    
T  14696175 atcaaaatatcatcaatgaacacaaccacgaagcaatccaaatacgcatgaaaaatagagttcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacac 14696274  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||| |||   |||| ||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  14696275 caaaaggcatcactgaatattaataatgtccataacgcgttctaaaggccgtcttctgcatatccttatctttcactttaatttggtgttaacccgatct 14696374  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  14696375 caaatcaatcttgctaaacacacgtacacccactaactgatccataaaatcatcaattcttggaagtagatacatattctt 14696455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 15357528 - 15357050
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| ||||| | |||| | ||| |||    
T  15357528 ggagtctcccattgtgatactgcatcaactttcgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttaattcacttaaccaga 15357429  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  15357428 actcacatttcgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgtaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaat 15357329  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || ||| || || ||||| |||||| |||||  |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  15357328 cagaatgtcatcaataaatacaaccgcgaacttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccg 15357229  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || || |    
T  15357228 aaaggcatcaccttgtattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctta 15357129  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15357128 agtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctt 15357050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 16153721 - 16154199
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| |||||  | || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||| ||| ||||| |||||| | ||| |||    
T  16153721 ggagtctcccattgtgatactacatcaactttcgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggctaagaaaacttacttcacttaaccaga 16153820  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | |||||||| || || |||||||| |  ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||    
T  16153821 actcacacttcgataacttagcatacaacttcttttctttcaatatttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcattgaataaat 16153920  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| ||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  16153921 cagaatatcgtcaataaacacaaccacaaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggtgcattagtaacaccg 16154020  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||    
T  16154021 aaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctggtggtaacctgacctca 16154120  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16154121 agtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctt 16154199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 16149644 - 16150053
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    |||| ||| ||||| |||||| | ||| |||| |||||||| || || |||||||| |  ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||||    
T  16149644 tggcaaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacacttcgataacttagcatacaacttcttttctttcaatatttgcaatacaatcttcagatgtt 16149743  T
Q  183 ccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 282  Q
    | ||||| |||||||||||| | || ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||    
T  16149744 ctgcatgctcttcttcagtcattgaataaatcagaatatcgtcaataaacacaaccacaaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactc 16149843  T
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatct 382  Q
    ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||||||||||||     
T  16149844 catgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatcc 16149943  T
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    || || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  16149944 ttcaccttaatctggtggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggat 16150043  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    |||| |||||    
T  16150044 acctgttctt 16150053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18613974 - 18613742
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||  |||||| |    
T  18613974 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagatataacatggcctagaaaacttacttttttcaacca 18613875  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18613874 gaattcacacttagacaattttgcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 18613775  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaac 244  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  18613774 atcaaaatgtcgtcaataaacacaactacgaac 18613742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 491
Target Start/End: Original strand, 14161334 - 14161811
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||   || || || |  |||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  14161334 ggagtctcccattgtgatactgcatctactttagatggatcaactgcaataccactaccagagataatgtggccaagaaaactcacctcattcaaccaga 14161433  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcata-aagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa 212  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || || ||| || |||||||| ||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||  || ||||    
T  14161434 attcacatttcgacaacttggcatacaacttactt-tccttcaacacctgtagaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttctgtctcagaataaa 14161532  T
Q  213 tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacacc 312  Q
    | |  ||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||| | | ||||| || || |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||    
T  14161533 ttaggatatcatcaataaatacaactacgaacttatccagataagcatgaaaaattctgttcatatactccataaatactccaggtgcattagaaacacc 14161632  T
Q  313 gaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctc 412  Q
    ||||||||| |||    ||||||| || |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14161633 gaaaggcatcactgaaaattcataatgtctgtaacgtgtcctaaaagccgtcttctgtatatcttcattctttactctaatctggtgataacccgatctc 14161732  T
Q  413 aaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattct 491  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14161733 aaatcaatcttgttgaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctattct 14161811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 1647685 - 1647207
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||   || ||||| || |||||||  |||||||||||| | ||| |||    
T  1647685 ggagtctcccattgcgataccgcatcaacttttgaaggatccacagcaataccactaccagaaatcacgtggccaacaaaactcacttcacttaaccaga 1647586  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcata-aagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa 212  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| || |||||| |||||||  |   | || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||    
T  1647585 actcgcacttcgacaacttagcatacaactttctt-tctttcagaatccgcaacacaatcttcaggtgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaa 1647487  T
Q  213 tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacacc 312  Q
    |||||||||| || || || || ||||||||   ||||| ||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  1647486 tcaaaatatcatcaatgaataccaccacgaatttatccagaaaagcatggaaaatcctattcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacacc 1647387  T
Q  313 gaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctc 412  Q
    ||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| || |||    
T  1647386 gaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgagtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatttgatggtaacctgacctc 1647287  T
Q  413 aaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || ||||| || || ||||||  |||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1647286 aagtcaattttactaaaaacttttgcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattctt 1647207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 245 - 492
Target Start/End: Original strand, 16218325 - 16218572
Alignment:
Q  245 cgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccat 344  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || |   |||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  16218325 cgatccaaaaatgcatgaaaaatgcgattcatgtactccataaacacacctgacacatttgtaacaccgaagggcatcactttatattcataatgtccat 16218424  T
Q  345 aacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccac 444  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  16218425 aacgtgttctaaaagctgtcttctgcatatcctcatctttcactttaatctggtgataacccgacctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccac 16218524  T
Q  445 taactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16218525 taactaatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctt 16218572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 245 - 492
Target Start/End: Original strand, 16221645 - 16221892
Alignment:
Q  245 cgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccat 344  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || |   |||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  16221645 cgatccaaaaatgcatgaaaaatgcgattcatgtactccataaacacacctgacacatttgtaacaccgaagggcatcactttatattcataatgtccat 16221744  T
Q  345 aacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccac 444  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  16221745 aacgtgttctaaaagctgtcttctgcatatcctcatctttcactttaatctggtgataacccgacctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccac 16221844  T
Q  445 taactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16221845 taactaatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctt 16221892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 15001772 - 15001295
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| ||||| |||||| | ||| |||    
T  15001772 ggagtctcccattgtgatactgcatctacttttgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaga 15001673  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
     | |||| ||| |||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  15001672 ct-cacatttaaacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacacaatcctcagatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaat 15001574  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    ||| || || || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||  |||||    
T  15001573 caagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcggttcatatactccataaacacaacaggcgcattagtatcaccg 15001474  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||  || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||    
T  15001473 aaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacatgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctca 15001374  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15001373 aatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcgtcaatcctcggaagtggatacctattctt 15001295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 51605200 - 51604722
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||| | | | | |    
T  51605200 ggagtctcccattgcgatactgcatcaacttttgatggatcaaccgctataccatcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaa 51605101  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| |  |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  51605100 actcacatttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaaaacttgcagcacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaat 51605001  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || |||||| || ||||| || ||||||||   ||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||||||    
T  51605000 cagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaaattcgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccg 51604901  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||    
T  51604900 aaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctca 51604801  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  51604800 agtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattctt 51604722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 8707775 - 8708249
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||||||||   || ||||| | ||||||||  ||||| |||||| | ||| | |    
T  8707775 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgacgggtctactgcaataccactaccagaaataatatggccaataaaacttacttcacttaaccaaa 8707874  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| || ||||||||||| || ||||  |||  ||| || ||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  8707875 attcacatttggacaacttggcatacatcttcttttccttcaacacttgcaacacaactttctaatgctctgcatgctcttcttcagacttagaataaat 8707974  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    ||| || || || |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || | |||||| |||||||||||||| ||  | || || || ||||||    
T  8707975 caagatgtcatcaataaacacaaccacaaaccgatccaaataagcatggaaaattctattcatgtactccataaacacaccccgcgcgttagtaacaccg 8708074  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |||   ||||| || || ||||| || || || || || || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  8708075 aaaggcatcactgaatattcgtaatgtccatatcgtgtgctaaaggccgttttctacatatcttcatcttttactttaatatgatggtaacccgacctca 8708174  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||    || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8708175 aatc----ttactaaacacgcgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 8708249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 356 - 492
Target Start/End: Original strand, 22631910 - 22632046
Alignment:
Q  356 aaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatcca 455  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  22631910 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatcca 22632009  T
Q  456 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22632010 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 22632046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 27902250 - 27902728
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  27902250 ggagtctcccactgcgatactgcatcaactttcgaaggatcaaccgcaataccactaccagaaataatgtggcctagaaaactcacttcatttaactaga 27902349  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcata-aagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa 212  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |  || || ||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||    
T  27902350 actcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaatcttcatgtgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaa 27902448  T
Q  213 tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacacc 312  Q
    |||||||||  || ||||| || ||||||||   |||||  || |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||    
T  27902449 tcaaaatatgatcaataaataccaccacgaatttatccaggaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacactccaggcgctttagtaacacc 27902548  T
Q  313 gaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctc 412  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||||| || |||    
T  27902549 gaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatttgatggtaacctgacctc 27902648  T
Q  413 aaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || ||||| || || ||||||  |||||| || |  || |||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  27902649 aagtcaattttactaaaaacttttgcacctaccatttggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatatctgttctt 27902728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 29451945 - 29451464
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||   || ||||| | ||| || || || ||||||||| | ||| |||    
T  29451945 ggagtctcccattgtgataccgcatcaacttttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatatgacccagaaagctcacttcacttaaccaga 29451846  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| | | |||| || ||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| || ||    
T  29451845 actcacatttcgacaactttgcatacaatctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgatctgcatgctcctcctcattcttggaatagat 29451746  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |||||||| || ||||| || || || |||  ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  29451745 taaaatatcatcaataaataccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccg 29451646  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||    
T  29451645 aaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctca 29451546  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgat 495  Q
    |||||||||| ||||||| || | ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  29451545 aatcaatcttactgaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatatctgttcttgat 29451464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 281 - 492
Target Start/End: Original strand, 23443237 - 23443447
Alignment:
Q  281 tccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcat 380  Q
    ||||||||||| || || ||||| || | |||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||    
T  23443237 tccataaacacacctggcgcattcgtaa-accgaaaggcatcactttatactcataatgtccataacgtgttctaaaagttgtcttatgcatatcttcat 23443335  T
Q  381 cttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 480  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23443336 ctttcactttaatctggtgataacccaatctcaaatcaatcttggtaaacacacatgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtgg 23443435  T
Q  481 atacctattctt 492  Q
    |||| |||||||    
T  23443436 atacatattctt 23443447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 3263202 - 3262721
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||||   || ||||| |  || || || ||||| |||||||| ||| |||    
T  3263202 ggagtctcccattgtgataccgcatcaacctttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccaga 3263103  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || || || |||||||| |   |||| || ||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| || ||    
T  3263102 actcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagat 3263003  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |||||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  3263002 taaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccg 3262903  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||    
T  3262902 aaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctca 3262803  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgat 495  Q
    |||||||||| || |||| || | ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  3262802 aatcaatcttact-aaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgat 3262721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 492
Target Start/End: Original strand, 15072295 - 15072701
Alignment:
Q  86 ccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccg 185  Q
    ||||| ||||| |||||| | ||| |||||||||| || ||||| || ||||| |   |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |    
T  15072295 ccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacctcttttctttcaacacttgcaacacaatcttcagatgctctg 15072394  T
Q  186 catgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccat 285  Q
    |||| |||| |||| |||| || ||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| |  | |||||| ||||||||    
T  15072395 catgctcttattcattcttagaataaattaggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaactctattcatgtactccat 15072494  T
Q  286 aaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatctttt 385  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || || || || || || || ||| |||| ||||| ||     
T  15072495 aaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttttgcgtatcttcatccttc 15072594  T
Q  386 actttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 485  Q
    || ||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  15072595 accttaatttgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaattatcggaagtggatatc 15072694  T
Q  486 tattctt 492  Q
    | |||||    
T  15072695 tgttctt 15072701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 44660136 - 44659793
Alignment:
Q  152 ttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatcca 251  Q
    ||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| || || ||||||||||| |||||||| || || |||  |||||    
T  44660136 ttcaacacttgcaacacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaaatatcgtcaataaacaccacaacaaacttatcca 44660037  T
Q  252 aaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgt 351  Q
     ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||    
T  44660036 gaaaagcatggaagattcgattcatgtactccataaatacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgt 44659937  T
Q  352 tctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactg 450  Q
     || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| || | ||||| || |||||    
T  44659936 cctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatgataacctgacctcaaatcaatcttactgaaaa-tcttagcaccaaccaactg 44659838  T
Q  451 atccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgat 495  Q
    ||||||||| || |||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  44659837 atccatcaagtcgtcaattctagggagcggatatctgttcttgat 44659793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 152 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 11205502 - 11205162
Alignment:
Q  152 ttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatcca 251  Q
    ||||||||||| || |||||  |||| ||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||| || ||||| || |||||||| || || |||  |||||    
T  11205502 ttcaacacttgcaatacaattctcaggtgttctgcatgctcctcttcattcttggaataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatcca 11205403  T
Q  252 aaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgt 351  Q
     ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||    
T  11205402 gaaaagcatggaagattcggttcatgtactccataaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgt 11205303  T
Q  352 tctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactg 450  Q
     || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||  || | ||||| || || ||    
T  11205302 cctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaagtcaatcttgct-aaagatcttagcaccaaccaattg 11205204  T
Q  451 atccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  11205203 atccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttctt 11205162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 492
Target Start/End: Original strand, 15257921 - 15258269
Alignment:
Q  143 ttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacga 242  Q
    ||||| |||||| | ||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||| | || |||||||| ||||| || |||||||||||||| |    
T  15257921 ttcttttctttcgatacttgcaatacaatctttagatgctctgcatgctcttcttcggtccttgaataaatcaagatatcatcaataaacacaaccacaa 15258020  T
Q  243 accgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgacc 342  Q
    |   || || | | |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || |||||    
T  15258021 atttattcagataggcatggaaaattcggttcatatattccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgacc 15258120  T
Q  343 ataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcaccc 442  Q
    ||| || || || || || ||||||||||||| |||||| || || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| || || || ||||||    
T  15258121 atatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatattctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctaaacacacgagcaccc 15258220  T
Q  443 actaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  15258221 actaactgatcgat-taatcatcaatcctcgaaagtggatacctgttctt 15258269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 1640490 - 1640321
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||| |||| || ||||| ||||||| ||| ||||| || || |||||| |    
T  1640490 taggagtctcccattgcgataccgcatcaactttagagggatctactgcaatatcatcaccagaaataacatggctaagaaaacttacctctttcaacca 1640391  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgt 181  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  1640390 gaattcacactttgaaaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcaaatgt 1640321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 318
Target Start/End: Original strand, 15323081 - 15323385
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| | ||||||||| ||||| |||||| | ||| |||    
T  15323081 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaga 15323180  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  15323181 attcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacacaattttcagatgctctgcatgctcttcttcactcttagaataaat 15323280  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     | |||||| || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || | |||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  15323281 tacaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctattcatgtattccataaacacaccaggcgcattagtaacaccg 15323380  T
Q  314 aaagg 318  Q
    |||||    
T  15323381 aaagg 15323385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 410 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16251602 - 16251514
Alignment:
Q  410 ctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16251602 ctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatacatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 16251514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 29037537 - 29037427
Alignment:
Q  29 gatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagaca 128  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29037537 gataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagaca 29037438  T
Q  129 atttagcataa 139  Q
    |||||||||||    
T  29037437 atttagcataa 29037427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 448 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16353244 - 16353194
Alignment:
Q  448 ctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16353244 ctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 16353194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 383 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 15291197 - 15291088
Alignment:
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15291197 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 15291098  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    ||| ||||||    
T  15291097 accgattctt 15291088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 136
Target Start/End: Original strand, 14999239 - 14999301
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagca 136  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  14999239 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaattcacacttagacaacttagca 14999301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 12340895 - 12340802
Alignment:
Q  392 atctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 485  Q
    ||||||||||  ||| |||| ||||||||||| ||||| |||  |||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  12340895 atctggtgatctcccaatcttaaatcaatcttactgaacacttctgcaccaaccaattgatccatcaaatcatcaatcctcgggagcggatacc 12340802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15291506 - 15291340
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || ||  | |  |  ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  15291506 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcgcacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcc 15291407  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccac 240  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || || ||||| |||||    
T  15291406 tcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccac 15291340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 44789768 - 44789284
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  44789768 ggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatctccggaaataacatggccaaggaaactcacctctttcaaccaga 44789669  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44789668 attcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagat 44789569  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44789568 caaaatatcgtcgataaacataaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 44789469  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  44789468 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgacaacctgatctca 44789369  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44789368 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 44789284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Original strand, 10872535 - 10873027
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||| ||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  10872535 cggacttaggagtctcccactgtgatatcgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttcttt 10872634  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10872635 caaccagaattcacacttagacaatttaggataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttg 10872734  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10872735 gagtagatcaaaatatcgtcgataaacacgaccacaaaccgatccagaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 10872834  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10872835 tcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacc 10872934  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10872935 tgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 10873027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Original strand, 18179590 - 18180082
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||    
T  18179590 cggacttaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccagaaataacatggccaagaaaactcacctcttt 18179689  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttc-ttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtctt 204  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18179690 caaccagaattcatacttagacaatttggcataaagtgtcnttctctt-caacacttgtaagacaatcttgagatgctcggcatgttcttcttcagtctt 18179788  T
Q  205 ggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattg 304  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18179789 ggagtaaatcaaaatatggtcgataaacacaattacgaaccaatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactctaggtgcattg 18179888  T
Q  305 gtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataac 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18179889 gtcacaccgaaaggcataactttatattcgtagtggccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataac 18179988  T
Q  405 ccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18179989 ctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctctgaagtggatacctattcttgatagt 18180082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 498
Target Start/End: Original strand, 14334249 - 14334733
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |||    
T  14334249 ggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccaga 14334348  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14334349 attcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 14334448  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14334449 caaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 14334548  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  14334549 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttttgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttaccttaatctggtgataacctgacctca 14334648  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14334649 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 14334733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 11235632 - 11235146
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  11235632 taggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaacca 11235533  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  11235532 gaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 11235433  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11235432 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacac 11235333  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  11235332 caaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgtgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacct 11235233  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11235232 caaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 11235146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 11551527 - 11551035
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  11551527 cggacttaggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttcttt 11551428  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  11551427 caaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcaacatgttcttcttcagtcttg 11551328  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11551327 gaataaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 11551228  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11551227 taacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctaaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacc 11551128  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11551127 tgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctattcttgatagt 11551035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Original strand, 14956399 - 14956891
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14956399 cggacttaggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttcttt 14956498  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  14956499 caaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatcttcttcttcagtcttg 14956598  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14956599 gagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 14956698  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14956699 taacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatattttcatcttttactttaatttggtgataacc 14956798  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14956799 tgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 14956891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 498
Target Start/End: Original strand, 12689362 - 12689839
Alignment:
Q  21 cccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcaca 120  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  12689362 cccattgcgataccgcttcaactttagacggatccacagcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcaca 12689461  T
Q  121 cttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaata 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12689462 cttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaata 12689561  T
Q  221 tcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggca 320  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  12689562 tcatcgatgaatacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactctaggtgcattggtaacaccaaaaggca 12689661  T
Q  321 taactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaat 420  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12689662 taactttatattcatagtgaccataacgcgttctcagagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaat 12689761  T
Q  421 cttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12689762 cttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 12689839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 15159482 - 15158990
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  15159482 cggacttaggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacagatccactgcaattccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttcttt 15159383  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  15159382 caaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcgtcagtcttg 15159283  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15159282 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 15159183  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15159182 taacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacc 15159083  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15159082 tgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 15158990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 8709456 - 8709942
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  8709456 taggagtctcccactgtgataccgcttcaactttggacggatccactgcaattccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaacca 8709555  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  8709556 gaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 8709655  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8709656 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccataaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacac 8709755  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  8709756 caaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttaccttaatctggtgatatcctgacct 8709855  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8709856 caaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 8709942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 59 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 15722 - 15283
Alignment:
Q  59 gcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaaca 158  Q
    ||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15722 gcaataccatcaccaaaaataacatggccaagaaaacttacttccttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaaca 15623  T
Q  159 cttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgc 258  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  15622 cttgcaagacaatcatcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacgcaactacgaaccgatccaaaaaggc 15523  T
Q  259 atggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15522 atggaagatgcgattcatatactccataaacactctaggcgcattgtttacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaa 15423  T
Q  359 gctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatca 458  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15422 gctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatca 15323  T
Q  459 aatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15322 aatcctcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 15283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 143 - 498
Target Start/End: Original strand, 13688023 - 13688378
Alignment:
Q  143 ttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacga 242  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13688023 ttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcgtcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaa 13688122  T
Q  243 accgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgacc 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13688123 accgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagggacc 13688222  T
Q  343 ataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcaccc 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13688223 ataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctagtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcaccc 13688322  T
Q  443 actaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13688323 actaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 13688378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 15147304 - 15146817
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |    
T  15147304 taggagtctcccattacgataccgcatcgactttagagggatcaacggcaataccattaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaacca 15147205  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  15147204 gaactcacacttagacaattttgcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtag 15147105  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaa-tgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcaca 310  Q
    || |||||||| || || || | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  15147104 ataaaaatatcatcaatgaaaaaaaccacgaaccgatccaaaaaatgcatggaaaatgcgattcatgtactccataaacacaccaggtgcatttgtaaca 15147005  T
Q  311 ccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatc 410  Q
    || |||||||||||||| || || || || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15147004 ccaaaaggcataactttatactcgtaatgtccatatcgcgttttaaaagccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatc 15146905  T
Q  411 tcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15146904 tcaaatctatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattcttcatagt 15146817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 167 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 18588435 - 18588104
Alignment:
Q  167 acaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaaga 266  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18588435 acaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaaga 18588336  T
Q  267 tgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtctt 366  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18588335 tgcaattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttattttcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtctt 18588236  T
Q  367 ctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatca 466  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18588235 ctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatca 18588136  T
Q  467 attctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18588135 attctcggaagtggatacctattcttgatagt 18588104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 14041546 - 14042026
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||   || | | | ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  14041546 taggagtctcccatttcgatactgcatcaactttagagggatctactgcaataccactaccagtagtaacatgtccaagaaaactcacctctttcaacta 14041645  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  14041646 gaattcacactttgataatttagcataaagtttattctctttcaacacttgcaaaacaatcttcaaatgctcatcatgttcttcctcagtcttggagtaa 14041745  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || || | ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  14041746 atcaaaatatcatcaatgaaaataactacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgtgattcatgtactccataaacacatcaggtgcatttgtaacac 14041845  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14041846 cgaaaggcatcactttgtactcataatgtccataacgcgttctaaaagctgtcttctccatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 14041945  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14041946 caagtcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagttctcaattcttggaagtggacacctattctt 14042026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 14351576 - 14352056
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||   || | | | ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  14351576 taggagtctcccatttcgatactgcatcaactttagagggatctactgcaataccactaccagtagtaacatgtccaagaaaactcacctctttcaacta 14351675  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  14351676 gaattcacactttgataatttagcataaagtttattctctttcaacacttgcaaaacaatcttcaaatgctcatcatgttcttcctcagtcttggagtaa 14351775  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || || | ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  14351776 atcaaaatatcatcaatgaaaataactacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgtgattcatgtactccataaacacatcaggtgcatttgtaacac 14351875  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14351876 cgaaaggcatcactttgtactcataatgtccataacgcgttctaaaagctgtcttctccatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 14351975  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14351976 caagtcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagttctcaattcttggaagtggacacctattctt 14352056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 48813670 - 48813198
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||| ||||  || || |||||||||||||| || |||||||||   || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  48813670 taggagtctcccattgtgatattgcatcaactttagacggatctaccgcaataccactaccagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaacca 48813571  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||| |  |||||||| |||| |||||| || |||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||     
T  48813570 gaattcacactttgacaattg-gcatataacttcttctccttcagcacttgcaacacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttagagtat 48813472  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| || || | |||||| |||||||||||||| |  || ||||| || ||||    
T  48813471 atcaaaatatcatcaatgaacacaaccacgaagcgatctaaataagcatgaaaaatacaattcatgtactccataaacacacttggcgcattagtaacac 48813372  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||| |||   ||||| || || |||||||| || || || | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  48813371 cgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggttgtcttctgcatatcctcgtctttcactttaatttggtgataacctgatct 48813272  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 485  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48813271 caaatcaatcttgctaaacacacgtgcgcccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacc 48813198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 272 - 498
Target Start/End: Original strand, 9590479 - 9590705
Alignment:
Q  272 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9590479 ttcatatactccataaacactccaagtgcattggtcacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgca 9590578  T
Q  372 tatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 471  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9590579 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaaattttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 9590678  T
Q  472 cggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||    
T  9590679 cagaagtggatacctatacttgatagt 9590705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 15626376 - 15626856
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||| ||| | || || ||||||||| |||| ||| ||||||| |  || ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  15626376 taggagtctcccattgtgatcccgcatcaactttagacagatctacaacaataccgttaccagaaataatatggccaaggaaactcacctcattcaacca 15626475  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| |||  ||||     
T  15626476 gaattcacactttgacaacttagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatactcgacatgttcttcttcagacttatagtat 15626575  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    || |||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| ||| | ||||| || || || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||    
T  15626576 attaaaatatcatcgatgaacgcaaccacgaagcgatctaaataagcatgaaaaatacggttcatgtactccataaatacacctggtgcattagtaacac 15626675  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
     ||||||||| ||    ||||| || || |  ||||| || || ||||| ||||||| | |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  15626676 tgaaaggcatcaccgaatattcgtaatgtctgtaacgtgtcctaaaagccgtcttcttcgtatcttcatctttcagtttaatctggtgatagcccgatct 15626775  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15626776 caaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctattctt 15626856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 15100929 - 15100520
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15100929 tggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaagacgatcttcagatgtt 15100830  T
Q  183 ccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 282  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || || |||||||||||||||||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||    
T  15100829 ctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacgaatttatccaggtaagcatggaaaattcggttcatatactc 15100730  T
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatct 382  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||  || |||||||| || || || || |  ||||||||||||||||||||     
T  15100729 cataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatatttgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggtcgtcttctgcatatcctcatcc 15100630  T
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    || || |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  15100629 ttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaatacacgagcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggat 15100530  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    ||||||||||    
T  15100529 acctattctt 15100520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14262639 - 14262162
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   |  ||||| | ||||||||| ||||| |||||| | ||| | |    
T  14262639 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaactgcaataccactactagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaaa 14262540  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | | |||||    
T  14262539 attcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacataatcttcagatgctctgcatgctcttcttcagtctagaa-taaat 14262441  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     || || || || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  14262440 taagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctattcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccg 14262341  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||  | || || || ||  ||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||| || ||||    
T  14262340 aaaggcatcaccttatattcataatgaccatattgtgtcctaaaggccatcttctgcatatcctcatccttcaccttaatatgatggtaacctgacctca 14262241  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14262240 aatcaatcttgctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaaacctcggaagtggatacctattctt 14262162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 12205194 - 12204717
Alignment:
Q  15 gagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaa 114  Q
    |||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| ||||| |||||| | ||| ||||    
T  12205194 gagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaa 12205095  T
Q  115 ttcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatc 214  Q
    |||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||  | |||||     
T  12205094 ttcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacacaattttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttaaaataaatt 12204995  T
Q  215 aaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccga 314  Q
    || ||||| || |||||||| |||||  |   ||||| | | |||||||| || | |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  12204994 aagatatcatcaataaacacgaccacagatttatccagataagcatggaaaattctattcatgtactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccga 12204895  T
Q  315 aaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaa 414  Q
    ||||||| || || |||||||| || ||||| ||  | || || || || ||||||||||| ||||  || || |||||||| || ||||| || |||||    
T  12204894 aaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtatcctaaaggccgttttctgcatatcttcatacttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaa 12204795  T
Q  415 atcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12204794 atcaattttgctgaacacgcatgcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 12204717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 492
Target Start/End: Original strand, 13675312 - 13675784
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  ||||||||  ||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  13675312 tcccattgcgatactgcatcaacttttgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagataactcacttcacttaaccagaactcac 13675411  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    |||| ||||| |||||||| |  || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||    
T  13675412 acttcgacaacttagcatacaactttttctcattcaatacttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcagaat 13675511  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
     || || ||||| |||||||| ||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  13675512 gtcatcaataaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggc 13675611  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    || || |||||||| || || ||||| || || || || || ||||||| |||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  13675612 atcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctccatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaa 13675711  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13675712 tcttgttgaaaacctttgcacccactaactgatccattatgtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctt 13675784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 19149065 - 19149541
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || || | |||||| ||||| || |||||||||   || ||||| | ||||||||| ||||| |||||| | ||| |||    
T  19149065 ggagtctcccattgcgatactgcatcaattttagatggatcaactgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaga 19149164  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || ||||| ||  || | |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  19149165 attcacatttggacaacttgacacacaacttcttttctttcaacacttgcaacacaatcttcagatgctctgcatgctcttcatcagtcttagaataaat 19149264  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     || || || || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  19149265 taagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcaattcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccg 19149364  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||| ||||||||| || || |||||||   | ||||| || ||||    
T  19149365 aaaggcatcaccttatattcatagtgaccgtaacgtgtcctaaaggccgtcttctgca-atcctcatccttcaccttaatct-taggtaacctgacctca 19149462  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||| || || || |  ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19149463 aatcaattttactaaacatacgtgcacccactaaccgatccattaaatcgtcaattcttggaagtggatacctattctt 19149541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 492
Target Start/End: Original strand, 14139534 - 14140011
Alignment:
Q  15 gagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaa 114  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |  |||||||| || ||||| | ||| ||||||||||| |||||| | | | | ||    
T  14139534 gagtttcccattgtgatactgcttcaacttttgatggatcaactgttataccatcaccagaaataatatgaccaaggaaacttacttcacttagccaaaa 14139633  T
Q  115 ttcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatc 214  Q
     ||||| || |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  14139634 ctcacattttgacaatttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaacacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatc 14139733  T
Q  215 aaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccga 314  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||   ||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||    
T  14139734 aaaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaaattcgattcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccga 14139833  T
Q  315 aaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaa 414  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| || |||||    
T  14139834 aaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaa 14139933  T
Q  415 atcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
     ||||| || || |||||   ||||||||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14139934 gtcaatattactaaaaacctttgcacccaccagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattctt 14140011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13967063 - 13966585
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| || | |||||| |||||||||   || ||||| |  || || || || ||||||||| | ||| |||    
T  13967063 ggagtctcccattgcgatactgcatcaactttcgaagtatccactgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaagctcacttcacttaaccaga 13966964  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| |   ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| || |||||| ||||||| |||||    
T  13966963 actcacattttgacaacttagcatacaacctcttctctttcaaaacttgcaagacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttggaataaat 13966864  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     || ||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||    
T  13966863 taagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaagattcggttcatgtactccataaacacaccaggcgcgttagtaacaccg 13966764  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| |||||||    
T  13966763 aaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggtcgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccagatctca 13966664  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||| || |||| |   ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  13966663 aatcaatcttactaaaaattttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttctt 13966585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 20748464 - 20748940
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || || | |||||| ||||| || |||||||||   || ||||| | ||||||||| ||||| |||||| | ||| |||    
T  20748464 ggagtctcccattgcgatactgcatcaattttagatggatcaactgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaga 20748563  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || ||||| ||  || | |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  20748564 attcacatttggacaacttgacacacaacttcttttctttcaacacttgcaacacaatcttcagatgctctgcatgctcttcatcagtcttagaataaat 20748663  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     || || || || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  20748664 taagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctgttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccg 20748763  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||| ||||||||| || || |||||||   | ||||| || ||||    
T  20748764 aaaggcatcaccttatattcatagtgaccgtaacgtgtcctaaaggccgtcttctgca-atcctcatccttcaccttaatct-taggtaacctgacctca 20748861  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||| || || || |  ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20748862 aatcaattttactaaacatacgtgcacccactaaccgatccattaaatcgtcaattcttggaagtggatacctattctt 20748940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16948798 - 16948389
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    ||||| || |||||||||||| | ||| | || |||||||| ||||  |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |    
T  16948798 tggcccagaaaactcacttcacttaaccaaaactcacactttgacagcttagcatacaacttcttttctttcaagacttgcaacacaatcttcagatgct 16948699  T
Q  183 ccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 282  Q
    | || || || |||||  | || || ||||||| |||||| || |||||||||||||| ||   ||||| ||| |||||||| || || |||||||||||    
T  16948698 ctgcgtgctcctcttcgattttagaataaatcagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactc 16948599  T
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatct 382  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || ||||| || || || || || ||||||||||||||||||||     
T  16948598 cataaacacgccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttttattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatcc 16948499  T
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    || || ||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  16948498 ttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaacacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaattctcgggagtggat 16948399  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    ||||||||||    
T  16948398 acctattctt 16948389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23504265 - 23503787
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||| | | | | |    
T  23504265 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcgactgctataccatcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaa 23504166  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || |||| ||| ||||| |  ||| | |||||||| ||||| || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  23504165 actcacatttcgacagtttggcatacaacttcctttctttcaaaacttgcaacacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaat 23504066  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || |||||| || ||||| || ||||||||   ||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||||||    
T  23504065 cagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaaattcgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccg 23503966  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||    
T  23503965 aaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctca 23503866  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  23503865 agtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattctt 23503787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 16070690 - 16070222
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| | ||| || || ||||| |||||| | ||| |||    
T  16070690 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatatgacccagaaaacttacttcacttaaccaga 16070591  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  16070590 actcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaatcttcagatactctgcatgctcttcttcagtcttagaataaat 16070491  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     | |||||| || |||||||||||||| ||   ||||| | |  ||||||| || |  |||||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||    
T  16070490 gagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagatagacatggaaaattctgttcatatactccataaacact--aggcgcattagtaacaccg 16070393  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || |||||||| || ||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||    
T  16070392 aaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctca 16070293  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatac 484  Q
    ||||||| || || |  || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16070292 aatcaattttactaagcacacgagcacccactaactggtccatcaagtcatcaattctcggaagtggatac 16070222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 492
Target Start/End: Original strand, 13023289 - 13023689
Alignment:
Q  92 aaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgtt 191  Q
    |||||||||||| | ||| | || ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || |||||  |||||||||| ||||| |    
T  13023289 aaactcacttcacttaaccacaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaaaacttgcaatacaattctcagatgttctgcatgct 13023388  T
Q  192 cttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacac 291  Q
    | ||||||||||| || ||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||   ||||| ||| |||||||| || || |||||||| | |||||| ||    
T  13023389 cctcttcagtcttagaataaatcaaattatcatcaataaacaccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatataatacataaaaac 13023488  T
Q  292 tccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttacttta 391  Q
     ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || || ||     
T  13023489 accaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatcattcaccttt 13023588  T
Q  392 atctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattct 491  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| || ||    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13023589 atctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttgctaaacaccttcgcacccaccaattgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatatctattct 13023688  T
Q  492 t 492  Q
    |    
T  13023689 t 13023689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 15342285 - 15342763
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| ||||||||   || ||||| |  |||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  15342285 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgaaggatcaacaacaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccaga 15342384  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |  || ||||||||||  ||||| || |||||| |||||||||| ||||| || |||| |||||| || |||||    
T  15342385 attcacatttcgacaacttagcatacaactttttctctttcagtacttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcctctttagtcttagaataaat 15342484  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |  |||||||| || || |||||||| |||  ||||| |||  ||||||| || |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  15342485 taggatatcgtcaatgaatacaaccacaaacttatccagaaagacatggaaaattcagttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccg 15342584  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| || ||||    
T  15342585 aaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaaccagacctca 15342684  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| |||||||    |||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  15342685 agtcaatcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcataaatcctcgaaagcggatacctgttctt 15342763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18052348 - 18051870
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |  |||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||| | | | | |    
T  18052348 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaaccgttataccatcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaa 18052249  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || |||| ||| ||||| |  ||| | |||||||| ||||| || |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  18052248 actcacatttcgacagtttggcatacaacttcctttctttcaaaacttgcaacacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaat 18052149  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || ||| || || ||||| || ||||||||   ||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || || || || || || ||||||    
T  18052148 cagaatgtcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaaattcgattcatatactccatgaatacaccgggcgcgttagtaacaccg 18052049  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||| || ||||    
T  18052048 aaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctca 18051949  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  18051948 agtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattctt 18051870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 95 - 492
Target Start/End: Original strand, 12458575 - 12458972
Alignment:
Q  95 ctcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttctt 194  Q
    ||||||||| | ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || |||||  ||||||| || ||||| || |    
T  12458575 ctcacttcacttaaccagaactcacattttgacaactttgcatacaacttcttttctttcaaaacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcct 12458674  T
Q  195 cttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactcc 294  Q
    ||||| ||||||| || || |||||||| || ||||||||||| |||||   ||||| ||| |||||||||||    |||| ||||||||| ||||| ||    
T  12458675 cttcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaacacaacaacgaaattatccagaaaagcatggaagattatgttcaaatactccatgaacacacc 12458774  T
Q  295 aggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatc 394  Q
    ||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  12458775 aggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgttctaaaggccgtcttctgcatatcctcatctttcacctttatc 12458874  T
Q  395 tggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || || ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||   ||||| |||||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  12458875 tgatggtaaccagacctcaaatcgatcttactgaacactttcgcacctactaactgatccattaggtcatcaatcctcggaagcggatacctgttctt 12458972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 41 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 11386797 - 11386346
Alignment:
Q  41 actttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaa 140  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||   || ||||| |  ||||| || |||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  11386797 actttcgaaggatcaacagcaataccactaccagaaataatgtggccgagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcgacaacttagcataca 11386698  T
Q  141 gtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccac 240  Q
      || ||||||||||  || ||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  11386697 actttttctctttcagaacctgtaatacaatcctcagatgctcggcatgctcttcttcagtcttagaataaattaaaatatcatcaataaacaccaccac 11386598  T
Q  241 gaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtga 340  Q
    ||| | ||||| ||| ||||| || || |  ||| ||||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||||| || |||||||| || |||    
T  11386597 gaatctatccagaaaagcatgaaaaattctgttcttatactccataaatacacctggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatga 11386498  T
Q  341 ccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcac 440  Q
    ||| |||| || || ||  | |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| || ||||    |||||    
T  11386497 ccacaacgtgtcctaaagtccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaatctttgcac 11386398  T
Q  441 ccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  11386397 caaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagcggatacctgttctt 11386346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 92 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 26093115 - 26092712
Alignment:
Q  92 aaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgtt 191  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| ||||| || || || |||||||| |   |||| || ||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||| |    
T  26093115 aaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgct 26093016  T
Q  192 cttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacac 291  Q
    | || ||| ||||||| || || |||||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  26093015 cctcctcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaac 26092916  T
Q  292 tccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttacttta 391  Q
     ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || ||     
T  26092915 accaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttt 26092816  T
Q  392 atctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattc 490  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||| || | ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||    
T  26092815 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttact-aaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttc 26092717  T
Q  491 ttgat 495  Q
    |||||    
T  26092716 ttgat 26092712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 162
Target Start/End: Original strand, 14213525 - 14213675
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  14213525 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaacca 14213624  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttg 162  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14213625 gaattcacactttgacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttg 14213675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11770660 - 11770423
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||   || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |    
T  11770660 taggagtctcccattgcgatactgcatcaactttagatggatctactgcaataccactaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaacca 11770561  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| || ||||||||| | |||| |||||||||     
T  11770560 gaattcacacttagacaatttaacatataacttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttctccctcagacttggagtat 11770461  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatc 249  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  11770460 atcaaaatatcatcgatgaacacaaccacaacccgatc 11770423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 95 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 26116904 - 26116504
Alignment:
Q  95 ctcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttctt 194  Q
    ||||||||| | ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| |   |||| || ||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||| || |    
T  26116904 ctcacttcacttaaccagaactcacatttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacacaattctcagatgctctgcatgctcct 26116805  T
Q  195 cttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactcc 294  Q
    | ||| ||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |  |||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||    
T  26116804 cctcattcttggaatagattaaaatatcgtcaataaacaccacaagaaacttatccagaaaagcatggaagattcgattcatgtactccataaaaacacc 26116705  T
Q  295 aggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatc 394  Q
    ||| || || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| | || || || || |||||||||||||| ||||| || || || |||    
T  26116704 aggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataatgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatc 26116605  T
Q  395 tggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttg 493  Q
    || |||||||| || |||||||||||||| ||||||| || | ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  26116604 tgatgataaccagacctcaaatcaatcttactgaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttg 26116506  T
Q  494 at 495  Q
    ||    
T  26116505 at 26116504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 495
Target Start/End: Original strand, 49154155 - 49154636
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||||   || ||||| |  || || || ||||| |||||||| ||| |||    
T  49154155 ggagtctcccattgtgataccgcatcaacctttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccaga 49154254  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || || || |||||||| |   |||| || ||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| || ||    
T  49154255 actcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagat 49154354  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |||||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  49154355 taaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtaccccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccg 49154454  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||    
T  49154455 aaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctca 49154554  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgat 495  Q
    |||||||||| || |||  || | ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  49154555 aatcaatcttact-aaatatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgat 49154636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 151
Target Start/End: Original strand, 8200479 - 8200618
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  8200479 taggagtatcccattgcgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaacca 8200578  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctct 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8200579 gaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctct 8200618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 19614529 - 19615007
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||   || ||||| | ||||||||| |||||||||||| | ||| | |    
T  19614529 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaa 19614628  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | || ||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||  | || || ||    
T  19614629 actcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaatagat 19614728  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    |||||| || || || || |||||||| ||   |||||   | ||||| || || |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  19614729 caaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaattctgttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccg 19614828  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||    
T  19614829 aaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctca 19614928  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | ||||| || || ||||    |||||| || |||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  19614929 agtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattctcggaagcggatatctgttctt 19615007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 11301530 - 11301127
Alignment:
Q  92 aaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgtt 191  Q
    ||||| |||||||| ||| |||  ||||| || ||||| |||||||| |   |||| || ||||||||||| || || ||  ||||||| || ||||| |    
T  11301530 aaacttacttcatttaaccagatctcacattttgacaacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacactattctcagatgctctgcatgct 11301431  T
Q  192 cttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacac 291  Q
    | || ||| ||||||| ||||| || ||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  11301430 cctcctcattcttggaataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaac 11301331  T
Q  292 tccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttacttta 391  Q
     ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || ||     
T  11301330 accaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttt 11301231  T
Q  392 atctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattc 490  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| || |||  || | ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||    
T  11301230 atctgatggtaaccagacctcaaatcaatcttact-aaatatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatatctgttc 11301132  T
Q  491 ttgat 495  Q
    |||||    
T  11301131 ttgat 11301127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 14284765 - 14284404
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| | ||||||||||   || ||||| |  |||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||    
T  14284765 tcccattgtgatactgcatcaacttttgaaggatcaaaagcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaactagaactcac 14284666  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| || | |||| |||||||||| | ||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  14284665 atttcgacaacttagcatacagcttcttctctttcaatacttgcaatataatcctcagatgttctgtatgctcctcttcagtcttagaataaatcaaaat 14284566  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
     || || || || |||||||| |||  |||||  || ||||| || || |  || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  14284565 gtcatcaatgaatacaaccacaaacttatccaggaaagcatgaaaaatcctgtttatatactccatgaacacgccaggcgcattagtaacaccgaaaggc 14284466  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatc 381  Q
    || || || ||||| || |||| |||||| || || || || |||||||||||||| |||||    
T  14284465 atcaccttatattcgtaatgacaataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatc 14284404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 492
Target Start/End: Original strand, 7825813 - 7826231
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  7825813 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcc 7825912  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 273  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| | | | ||| || || | |||    
T  7825913 tcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctatt 7826012  T
Q  274 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 373  Q
    ||| || |||||||| || || |||||||| |  || || || ||||| ||    || |||||||| ||||| | ||||| ||| || || ||    |||    
T  7826013 catgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatata 7826112  T
Q  374 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 473  Q
    || ||  | |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  7826113 tcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttg 7826212  T
Q  474 gaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  7826213 gaagtggataccgattctt 7826231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 402 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 11770431 - 11770341
Alignment:
Q  402 aacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11770431 aacccgatctcaaattaatcttgctaaacacacgagcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctt 11770341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 27106131 - 27105713
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  27106131 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcc 27106032  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 273  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| | | | ||| || || | |||    
T  27106031 tcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctatt 27105932  T
Q  274 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 373  Q
    ||| || |||||||| || || |||||||| |  || || || ||||| ||    || |||||||| ||||| | ||||| ||| || || ||    |||    
T  27105931 catgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatata 27105832  T
Q  374 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 473  Q
    || ||  | |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  27105831 tcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttg 27105732  T
Q  474 gaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  27105731 gaagtggataccgattctt 27105713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 492
Target Start/End: Original strand, 27172194 - 27172612
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  27172194 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcc 27172293  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 273  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| | | | ||| || || | |||    
T  27172294 tcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctatt 27172393  T
Q  274 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 373  Q
    ||| || |||||||| || || |||||||| |  || || || ||||| ||    || |||||||| ||||| | ||||| ||| || || ||    |||    
T  27172394 catgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatata 27172493  T
Q  374 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 473  Q
    || ||  | |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  27172494 tcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttg 27172593  T
Q  474 gaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  27172594 gaagtggataccgattctt 27172612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 119
Target Start/End: Original strand, 13687909 - 13688022
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  13687909 cggacttaggagtctcccactgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttcttt 13688008  T
Q  106 caactagaattcac 119  Q
    |||| |||||||||    
T  13688009 caaccagaattcac 13688022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 383 - 492
Target Start/End: Original strand, 4442150 - 4442259
Alignment:
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || |||   ||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4442150 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttccgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagcggat 4442249  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    ||| ||||||    
T  4442250 accgattctt 4442259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 454 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16727360 - 16727316
Alignment:
Q  454 catcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16727360 catcaaatcatcaattctcagaagtggatacctattcttgatagt 16727316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 454 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 17704432 - 17704388
Alignment:
Q  454 catcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17704432 catcaaatcatcaattctcagaagtggatacctattcttgatagt 17704388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Original strand, 9597908 - 9597965
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatc 69  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9597908 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatccactacaataccatc 9597965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 136
Target Start/End: Original strand, 17925563 - 17925625
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagca 136  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  17925563 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttcacgcaaccaaaattcacacttagacaacttagca 17925625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 483
Target Start/End: Original strand, 13379114 - 13379205
Alignment:
Q  392 atctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggata 483  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  13379114 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagaggata 13379205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39363 - 39210
Alignment:
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    ||||||||| || || || || || |||||| |||| ||| ||| |||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||     
T  39363 caaaatatcatcaatgaatactacaacgaactgatctaaatatggatggaaaattctgttcatatactccataaaaactcctggcgcgttggacactcca 39264  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttc 367  Q
    |||||||| ||    || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  39263 aaaggcatcaccgaatactcataatgaccataacgggttctgaaggcagtcttc 39210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 108230 - 107738
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  108230 cggacttaggagtatcccattgcgataccgcttcgactttagacggatccagagcaataccatctccagaaataacatggccaagaaaacttacctcttt 108131  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||    
T  108130 caaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcctcttcaatcttg 108031  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108030 gagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaacgcatggaagatgcgactcatatactccataaacactccaggtgcattgg 107931  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107930 tcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctatcttctacatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 107831  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107830 tgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcttgcacccactaactgatccatcaaatcatccattctcggaagtggatacctattcttgatagt 107738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 274 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 95045 - 94827
Alignment:
Q  274 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 373  Q
    |||||||||||| ||||| || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  95045 catatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtagtgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcata 94946  T
Q  374 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 473  Q
    || ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||   ||||| || ||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  94945 tcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatccgcg 94846  T
Q  474 gaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  94845 gaagtggatatctattctt 94827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 114454 - 114932
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||||||  ||||||||   || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  114454 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacctttgaaggatccaccacaataccactaccagaaataatatggccaagaaaactcacttcatttaaccaga 114553  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | || ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||  | || || ||    
T  114554 actcgcacttcgacaatttggcatacaatttcttctctttcaatacttgcaatacaatcatcagatgttctgcatgctcttcctcagttcttgaatagat 114653  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    |||||| || || || || |||||||| ||   |||||   | ||||| || || | ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  114654 caaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaattctattcatatattccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccg 114753  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||| || ||||| || | ||    
T  114754 aaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatgtcttcatctttcaccttgatctgatggtaacctgaccaca 114853  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | ||||| || || ||||    |||||| || |||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  114854 agtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattctcggaagaggatatctgttctt 114932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 8831 - 9317
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  8831 taggagtctcccattgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaacca 8930  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  8931 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 9030  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9031 atcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacac 9130  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  9131 caaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacct 9230  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9231 caaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 9317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 11652 - 11166
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  11652 taggagtctcctattgcgataccacttcgactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttccttcaacca 11553  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  11552 gaattcacacttagacaatttagcataaaatttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 11453  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11452 atcaaaatatcatcgataaacaccaccacgaaccgatccaaaaaggcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 11353  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  11352 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatct 11253  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11252 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 11166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 30775 - 31261
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |    
T  30775 taggagtctcccattgcgatactgcatcgactttagagggatctacaacaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaactgacctctttcaacca 30874  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  30875 gaactcacacttagataatttagcataaagtttcttttcttttaacacctgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 30974  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    || |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||     
T  30975 attaaaatatcttcgatgaaaacaaccacgaactgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattcataacat 31074  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  31075 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttgatctggtgataacctaatct 31174  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31175 caaattaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcatatctcggaagtggatacctattcttgatagt 31261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 36240 - 36727
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaac-tcacttcattcaact 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||| ||||||||||  |||| | || || ||||||     
T  36240 taggagtctcccattgcgatactgcatcgactttagagggatctacaacaataccatcaccagaaataacatggccaacaaaaccttacctctttcaacc 36339  T
Q  111 agaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagta 210  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  36340 agaactcacacttagataatttagcataaagtttcttttcttttaacacctgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagta 36439  T
Q  211 aatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcaca 310  Q
    ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  36440 aataaaaatatcatcaataaaaacaaccacaaaaagatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattcataaca 36539  T
Q  311 ccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatc 410  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  36540 tcgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttgatctggtgataacctaatc 36639  T
Q  411 tcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36640 tcaaattaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaaatctcggaagtggatacctattcttgatagt 36727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 119 - 492
Target Start/End: Original strand, 53635 - 54008
Alignment:
Q  119 cacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaa 218  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53635 cacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaa 53734  T
Q  219 tatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaagg 318  Q
    |||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  53735 tatcatcattgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgtgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaagg 53834  T
Q  319 cataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatca 418  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  53835 cataactttgtactcatagggaccataccgtgttcagaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatct 53934  T
Q  419 atcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53935 atcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatacctattctt 54008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 288
Target Start/End: Original strand, 49986 - 50259
Alignment:
Q  15 gagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccg-gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| || | |||||| |||||| | |    
T  49986 gagtctcccattgcgatatcgcttcaactttagacggatctactgcaatacca-ctacgagaaataacatgtccaagaaagcccacttctttcaaccaaa 50084  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50085 attcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttggagtaaat 50184  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaa 288  Q
    ||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  50185 caaaatatcatcattgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgtgattcatgtactccataaa 50259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 13883 - 13821
Alignment:
Q  436 tgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13883 tgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 13821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 40046 - 40532
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  40046 taggagtcacccattgcgataccgcttcaactttagacgaatccactgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaacca 40145  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  40146 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 40245  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40246 atcaaaatgtcatcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 40345  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || |||||    
T  40346 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttttgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctagtgataccctgatct 40445  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40446 caaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcagttctcggaagtggatacctattcttgatagt 40532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 14538 - 14051
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| | ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||  |    
T  14538 taggagtctgccattgcgataccacttcgaatttagacggatccactacaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttccttcaaaca 14439  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14438 gaattcacacttagaaaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatattcttcttcagtcatggagtaa 14339  T
Q  212 atcaaaa-tatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcaca 310  Q
    || |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14338 ataaaaaatatcatcgataaacaccaccacgaaccgatccaaaaaggcatggaagatgcgattcatatactccataaacattccaggtgcattggtcaca 14239  T
Q  311 ccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatc 410  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  14238 ccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctatcttctgcatatcatcatctttcactttaatctagtgataccccgatc 14139  T
Q  411 tcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14138 tcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 14051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 16051 - 16537
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||| |    
T  16051 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccggaaataacatggccaagaaaacttaattctttcaacca 16150  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16151 gaattcacacttagacaagttagcataaattttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 16250  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16251 atcaaaatatcgtcaataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 16350  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  16351 ggaaaggcataactttatattcatagtgaccacaacgcgttctgaaaactgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacct 16450  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16451 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 16537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 498
Target Start/End: Original strand, 2322 - 2801
Alignment:
Q  21 cccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcaca 120  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  2322 cccattgtgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatcaccggaaataacatggccaagaaaacttaattctttcaaccagaattcaca 2421  T
Q  121 cttagac-aatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2422 cttagaccaagttagcataaaggttattctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 2521  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacacc-gaaagg 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2522 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccggaaagg 2621  T
Q  319 cataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatca 418  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  2622 cataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaaactgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatca 2721  T
Q  419 atcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2722 atcttgctaaaaacacgttcacccactaactaatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 2801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Original strand, 9253 - 9745
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  9253 cggacttaggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagatggatccacagcaataccatcatcagaaataacatggccaagaaaactcacttcttt 9352  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9353 caaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttg 9452  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9453 gagtaaataaaaatatcatcgatgaatacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 9552  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9553 taacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 9652  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9653 tgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgtacccactaactgatccatcagatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 9745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 57908 - 58394
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |    
T  57908 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatccacagcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaacca 58007  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  58008 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttggaagacaatcttcagatgcacagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 58107  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58108 atcaaaatgtcatcgataaacacaactacgaactgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatataatccataaacactccaggtgcattggtcacac 58207  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  58208 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgacct 58307  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58308 caaatcaatcttgctaaaaacttttgcacccactaattgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 58394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 20 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 195892 - 195444
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| |||| ||||    
T  195892 tcccattgccataccgcttcaactttagacggatctacagcaataccgtcaccagaaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcac 195793  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  195792 acttagatagtttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaaccttcagatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaat 195693  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
    ||| |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||    
T  195692 atcatcgataaagacaaccacaaaacgatccagaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaatacttctggtgcattggtaacaccaaaaggc 195593  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  195592 ataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcatcatttatcttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 195493  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaat 468  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  195492 tcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaat 195444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 18480 - 17993
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaac-tcacttcattcaact 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||| ||||||||||  |||| | || || ||||||     
T  18480 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagagggatctacaacaataccatcaccagaaataacatggccaacaaaaccttacctctttcaacc 18381  T
Q  111 agaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttc-agatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagt 209  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||    
T  18380 agaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaattttttagatgttcagcatgttcttcttaatacttggagt 18281  T
Q  210 aaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcac 309  Q
    |||| ||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18280 aaat-aaaatgtcatcaatgaaaacaaccacgaaccgctccaaaaatgcttggaagatgcgattcatgtactacataaacactccaggtgcattggtcac 18182  T
Q  310 accgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgat 409  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  18181 accgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgtactgaaagatatcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacatgat 18082  T
Q  410 ctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18081 ctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggtagtggatacctatttttgatagt 17993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 45044 - 45530
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |    
T  45044 taggagtctcccattgcgataccgcttcgactttagacggatccacagcaataccatcaccggaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaacca 45143  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  45144 gaattcacacttagacaatttggcataaagttttttctctttcaatacttgcaagacaatcttcagatgatcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 45243  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  45244 atcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaatactctaggtgcattggtaacac 45343  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  45344 caaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttaccttaatctggtgataacctgacct 45443  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45444 caaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcgtcaattcttggaagcggatacctattcttgatagt 45530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Original strand, 16823 - 17315
Alignment:
Q  6 cggacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcatt 105  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  16823 cggacttaggaatctcccattgcgatactgcttcaactttagatggatccacagcaataccatcactagaaataacatggccaaggaaactcacttctct 16922  T
Q  106 caactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttg 205  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  16923 caaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttctttttcagtcttg 17022  T
Q  206 gagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17023 gagtaaatcaaaatatcatcgatgaatacaactacgaaccaatccaaaaatgcatggaagatgtgattcatatactccataaacactccaggtgcattgg 17122  T
Q  306 tcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17123 taacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 17222  T
Q  406 cgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17223 tgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtcgatacctattcttgatagt 17315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 10367 - 10853
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  10367 taggagtctcccattgcgataccacttcaactttagatggatccacagcaataccatcactagaaataacatggccaaggaaactcacttctctcaacca 10466  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10467 gaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctttagatgctcagcatgttctttttcagtcttggagtaa 10566  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10567 atcaaaatatcatcgatgaatacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacac 10666  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  10667 caaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagtcgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacctgacct 10766  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  10767 caaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtcgatacctattcttgatagt 10853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 48925 - 48447
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||   || ||||| | ||||||||| |||||||||||| | ||| | |    
T  48925 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaa 48826  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | || ||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||  | || || ||    
T  48825 actcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaatagat 48726  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    |||||| || || || || |||||||| ||   |||||   | ||||| || || |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  48725 caaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaattctgttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccg 48626  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||    
T  48625 aaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtgctaaaggcagtcttctgcatgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctca 48526  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | ||||| || || ||||    |||||| || |||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  48525 agtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattctcggaagcggatatctattctt 48447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 38225 - 37747
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||||||||  || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |||| ||||    
T  38225 tcccattgcgatattgcatctactttagagggatctacagcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcac 38126  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38125 acttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 38026  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  38025 atcatcgatgaaaacaaccgcgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatttatatactccataaacactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggc 37926  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37925 ataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaa 37826  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37825 tcttgctgaaaacatgtgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 37747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 41 - 492
Target Start/End: Original strand, 22627 - 23078
Alignment:
Q  41 actttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaa 140  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||   ||  |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||| |    
T  22627 actttagatggatctaccgcaataccactaccaaaaataacatggccaagaaaacttacctcattcaaccagaactcacactttgacaacttggcatata 22726  T
Q  141 gtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccac 240  Q
      ||||| || |||  |||||| || |||||||||| ||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  22727 acttcttttccttcggcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagtgtgttcttcttcagacttagagtatatcaaaatatcattgatgaacacaaccac 22826  T
Q  241 gaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtga 340  Q
    |||  |||||||| | ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || ||| | || ||| |||||||||| ||    ||||| || ||     
T  22827 gaagtgatccaaatacgcatgaaaaatacgattcatgtactccataaacacacctggcgcagttgtaacaacgaaaggcatcaccgaatattcgtaatgt 22926  T
Q  341 ccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcac 440  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |  | | |||    
T  22927 ccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcgtctttcactttaatctggtggtagcccgatctcaaatcaatcttgctaaacagacattcac 23026  T
Q  441 ccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23027 ccactaactgatccatcaaatcatctattcttggaagtggatacctattctt 23078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 35388 - 35875
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaac-tcacttcattcaact 110  Q
    ||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||| ||||||||||  |||| | || || ||||||     
T  35388 taggagtctcccattgcgatactgcattgactttagagggatctacaacaataccatcaccagaaataacatggccaacaaaaccttacctctttcaacc 35487  T
Q  111 agaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagta 210  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  35488 agaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcggtcttggagta 35587  T
Q  211 aatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcaca 310  Q
    ||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35588 aattaaaatatcatcgatgagaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaaca 35687  T
Q  311 ccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatc 410  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  35688 ccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacc 35787  T
Q  411 tcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35788 tcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 35875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 242 - 428
Target Start/End: Original strand, 28222 - 28408
Alignment:
Q  242 aaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28222 aaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttgtattcatagtgac 28321  T
Q  342 cataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctga 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28322 cataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctga 28408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 2611 - 3089
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| ||||| |||||| | ||| |||    
T  2611 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaga 2710  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  2711 actcacatttagacaacttggcatacaacttcttctctttcaacacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaat 2810  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    ||| || || || |||||||||||||||||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  2811 caagatgtcatcaataaacacaaccacgaatttatccaggtaagcatggaaaattcggttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccg 2910  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |  || || || |  |||||||||||||||||||| ||    |||||||| || ||||| || ||||    
T  2911 aaaggcatcactttatattcgtaatgtccatatcatgtcctaaaggtcgtcttctgcatatcctcatccttcgacttaatctgatggtaacctgacctca 3010  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  3011 aatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcgtcggaagtggatacctgttctt 3089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 448 - 498
Target Start/End: Original strand, 28405 - 28455
Alignment:
Q  448 ctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28405 ctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 28455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 86209 - 85723
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |  || || ||||||||||| ||||| || || |||||| |    
T  86209 taggagtctcccattgcaataccgcttcaactttagagggatctacagcaataccatcgctagatataacatggccaagaaaacttacctctttcaacca 86110  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  86109 gaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctccttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcaatatgttcttcttcagtcttggagtaa 86010  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  86009 atcaaaatgtcatcgatgaaaacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatttactctataaacactccaggtgcattggtaacac 85910  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  85909 caaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 85810  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  85809 caaatcaatcttactgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgtaagtggatacctattcttgatagt 85723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 47 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 85608 - 85163
Alignment:
Q  47 gacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttct 146  Q
    ||||||||||| |||||||||   || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  85608 gacggatccactgcaataccactacctgaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttct 85509  T
Q  147 tctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccg 246  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  85508 tctctttcaacacttgcaaaacaagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggaggaaattaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccg 85409  T
Q  247 atccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataa 346  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  85408 atctaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccatac 85309  T
Q  347 cgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccacta 446  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||    
T  85308 cgtgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataaccttatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgtacccacta 85209  T
Q  447 actgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  85208 actgatccatcaaatcatcaatcctcgtaagtggatacctattctt 85163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 383 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 132531 - 132422
Alignment:
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  132531 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 132432  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    ||| ||||||    
T  132431 accgattctt 132422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 132870 - 132715
Alignment:
Q  44 ttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtt 143  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| |||||| | |  |    
T  132870 ttagaaggatccacagaaataccacccatagaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttagcacataact 132771  T
Q  144 tcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttca 199  Q
      ||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||| || ||||| ||||| |||    
T  132770 ggttctctttcaaaacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttcctca 132715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 492
Target Start/End: Original strand, 26046 - 26140
Alignment:
Q  398 tgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| || |  |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  26046 tgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaacaagatgatacatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattctt 26140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 55404 - 54918
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |  |||||| |    
T  55404 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatctacatcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctttttcaacca 55305  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  55304 gaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttaaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtattggagtaa 55205  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    || |||||||| || | ||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55204 ataaaaatatcatccagaaaaacaaccacaaagggatccaaaaatgcatggaagatgcgattcaattactccataaacactccaggtgcattggtaacac 55105  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  55104 caaaaggcataactttatattcatagtgaccatatcgtgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggttataacctgatct 55005  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  55004 caaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatatctattcttgatagt 54918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 82 - 492
Target Start/End: Original strand, 109593 - 110003
Alignment:
Q  82 atggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgt 181  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | ||| |||| || || || |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  109593 atggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcgcattttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaatcttcagatgt 109692  T
Q  182 tccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatact 281  Q
    || ||||| |||||||||||||| || |||||||  || || || |||||||||||||| ||   ||| | | | |||||||| || || |||||| |||    
T  109693 tctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcacgatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatctagataggcatggaaaattcggttcatagact 109792  T
Q  282 ccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatc 381  Q
    |||||||||| | |||  |||| || |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  109793 ccataaacacactaggcacattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcctcatc 109892  T
Q  382 ttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgga 481  Q
     || || |||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  109893 cttcaccttaatctgatggtaaccagacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcgtcaattctcggaagcgga 109992  T
Q  482 tacctattctt 492  Q
    ||||| |||||    
T  109993 tacctgttctt 110003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 12 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 23487 - 23095
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  23487 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccatctccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaacca 23388  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23387 gaattcacacttagacagtttggcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagttttggagtaa 23288  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23287 atcaaaatgtcgtcgataaacacaactactaaccgatccaaaaatgcatggaagatgtgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacac 23188  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataac 404  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23187 cgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataacgcgttctgaacgctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataac 23095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 3)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 104 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 51666 - 51272
Alignment:
Q  104 ttcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtct 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  51666 ttcaactagaactcacacttagatagtttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatcttcttcttcagtct 51567  T
Q  204 tggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcatt 303  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  51566 tggagtaaatcaaaatgtcatcgatgaaaacaaccacaaagtgatccaaaagtgcatgaaagatgcgattcatatactccataaatactcgaggtgcatt 51467  T
Q  304 ggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataa 403  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  51466 ggtaacaccaaaaggcatgactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttaccttaatctggtgataa 51367  T
Q  404 cccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51366 cccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 51272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 152 - 492
Target Start/End: Original strand, 41729 - 42069
Alignment:
Q  152 ttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatcca 251  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| || ||||| || || || || |||||||||||||| ||   |||||    
T  41729 ttcaacacttgcaacacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcattcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatcca 41828  T
Q  252 aaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgt 351  Q
     | | ||||| || || |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||    
T  41829 tataagcatgcaaaattctgttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaactccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgt 41928  T
Q  352 tctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactga 451  Q
     || || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || || || |||||||||||||||    
T  41929 cctaaaggccgtattctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacacacgagcacccactaactga 42028  T
Q  452 tccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42029 tccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctgttctt 42069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 46764 - 46702
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagca 136  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  46764 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttcccgcaaccaaaattcacacttagacaacttagca 46702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 151003 - 151483
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||   || ||||| ||||| || || || |||||||| |||||| |    
T  151003 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatctactgcaataccactaccagaaattacatgtcctagaaagctcacttctttcaacca 151102  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || | ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  151103 gaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttattctctttcaacacttgcaacaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaa 151202  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  | ||||    
T  151203 attaaaatattatcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaagtgcattcataacac 151302  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  151303 cgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataaccagatct 151402  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  151403 caaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatacctattctt 151483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 2918 - 2438
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||| ||||  || || |||||||| ||||| || |||||||||   |  ||||| ||||||||||| |||||||  || |||||| |    
T  2918 taggagtctcccattgtgatattgcatcaactttagagggatctactgcaataccactactagaaataacatggccaagaaaactcatctctttcaacca 2819  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||| ||| || ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2818 gaattcacactttgataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaactagtcttcaaatgctcagcatgttcttcctcagacttggagtaa 2719  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||| | || || || ||||    
T  2718 atcaaaatatcatcaatgaatacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgcgattcatgtactccataaacacaccaagcgcgtttgtaacac 2619  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |  ||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  2618 cagaaggcatcactttatactcataatgtccataacgcgttctaaaagccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatatggtgataaccggatct 2519  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2518 caaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaattcatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctt 2438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 442
Target Start/End: Original strand, 86665 - 87091
Alignment:
Q  15 gagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaa 114  Q
    |||| |||||||| ||||| || || || ||||| || || ||| ||||||||   || ||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||    
T  86665 gagtctcccattgtgatactgcatcaaccttagatgggtctacatcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaacttacttcgttcaaccagaa 86764  T
Q  115 ttcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatc 214  Q
    ||| ||||| || || |  ||||| |  || ||||| |||| |||||| || ||| |||| | ||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||     
T  86765 ttcgcacttcgataactaggcatataacttattctccttcagcacttgcaaaacattcttaa-atgctcggcatgttcctcctcggtcttagagtatatt 86863  T
Q  215 aaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccga 314  Q
    | ||| || || ||||||| ||| || || |||| |||| | ||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||    
T  86864 agaatctcatctataaacataacaacaaatcgattcaaataagcatgaaaaatatgattcatatattccataaacactccaggggcgttagtaacaccga 86963  T
Q  315 aaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaa 414  Q
    ||||||| |     ||||  || || || ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  86964 aaggcatcatcgaatatttgtaatgtccgtaacgtgtcctaaaggccgtcttctgaatatcctcatctttcactttgatctggtgatagcccgatcttaa 87063  T
Q  415 atcaatcttgctgaaaactcgtgcaccc 442  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||    
T  87064 atcaatcttactgaacacacgtgcaccc 87091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 27811 - 27735
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaact 96  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  27811 tcccattgcgatactgcatcgactttagagggatctaccgcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaact 27735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 54293 - 54231
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagca 136  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||||    
T  54293 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagataacttagca 54231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 20495 - 20975
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| | |    
T  20495 taggagtctcccattgcgataccacatcaactttagagggatctacagcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcatcca 20594  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20595 gaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctcttaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttagagtaa 20694  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    || |||||||| || || || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  20695 attaaaatatcatcaatgaaaacaaccacaaatcgatccaaaaatgcatgaaagatgtgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacac 20794  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20795 cgaaaggcatatctttgtactcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 20894  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20895 caaatctatcttgctgaaaacttttcaacccactaactgatccatcaaatcattaattctcggaagtggatacctattctt 20975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 35919 - 36399
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| | |    
T  35919 taggagtctcccattgcgataccacatcaactttagagggatctacagcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcatcca 36018  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  36019 gaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctattaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttagagtaa 36118  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    || |||||||| || || || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  36119 attaaaatatcatcaatgaaaacaaccacaaatcgatccaaaaatgcatgaaagatgtgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacac 36218  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36219 cgaaaggcataactttatactcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 36318  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36319 caaatctatcttgctgaaaacttttcaacccactaactgatccatcaaatcattaattctcggaagtggatacctattctt 36399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 16533 - 17014
Alignment:
Q  12 taggagtatcccatt-gcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaact 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||   || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||     
T  16533 taggagtctcccatttgcgataccgcttcaactttagacggatctactgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaacc 16632  T
Q  111 agaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagta 210  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || || | ||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  16633 agaattcgcaattagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttacaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagta 16732  T
Q  211 aatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcaca 310  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  16733 aatcaaaatatcatcgataaaaaccaccacgaaccgatccaaaagtgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactcctggtgcatttgtaaca 16832  T
Q  311 ccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatc 410  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16833 ccgaaaggcataactttgtactcataatgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcacctttcactttaatctggtgataacctgatc 16932  T
Q  411 tcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16933 tcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatacctattctt 17014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 492
Target Start/End: Original strand, 11715 - 12167
Alignment:
Q  41 actttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaa 140  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| | ||||||||| ||||| | |||| ||||| |||||||||| || ||||| || ||||| |    
T  11715 acttttgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaacttaattcactcaaccagaattcacatttggacaacttggcataca 11814  T
Q  141 gtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccac 240  Q
      ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| || ||||| |  ||||| || ||||||||||||||    
T  11815 acttcttttctttcaacacttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcattcttagaataaattaggatatcatcaataaacacaaccac 11914  T
Q  241 gaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtga 340  Q
     ||   ||||| | | ||||| || || |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  11915 aaatttatccagataggcatgaaaaattctgttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtga 12014  T
Q  341 ccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaa-tcaatcttgctgaaaactcgtgca 439  Q
    |||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || |||||| ||||| || || || || ||||||    
T  12015 ccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaattcaattttactaaacacacgtgca 12114  T
Q  440 cccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12115 cccactaattgatccattaaatcgtcaattctcggaagtggatacctgttctt 12167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 12 - 495
Target Start/End: Original strand, 659 - 1140
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||   || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |    
T  659 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatctactgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaacca 758  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| || |||||||||||||||| |||| |||||    
T  759 gaattcacccttagacaatttcgcataaaggttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttgaagtaa 858  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  859 atcaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggcgcatttgtaacac 958  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||| ||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  959 cgaacggcatcaccttatactcataatggccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataa--cgatct 1056  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgat 495  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1057 caaatctatcttgctgaaaacttttgcacccaccaactgatccatcaaatcatcaatactcggaagtggatacctattcttgat 1140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 25358 - 24878
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||    || ||||||||| |||| || |||||||||    | ||||| ||||  ||||| ||||||| ||| |||||| |    
T  25358 taggagtctcccattgcgatactagatcaactttagacagatctactgcaataccactaacagaaataacatatccaagaaaactcaattctttcaacca 25259  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||||| ||| || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25258 gaattcacacttagataatttagcataaagtttcttatctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcctcaatcttggagtaa 25159  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  25158 atcaaaatatcgtcaataaaaagaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaacacttcaggtgcatttgtaacac 25059  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25058 cgaaaggcatcactttatattcatattgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcatcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 24959  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24958 caagtcaatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattatcggaagtggatacctattctt 24878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 12 - 433
Target Start/End: Original strand, 7907 - 8328
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||| || || |||||| |    
T  7907 taggagtctcccattgcgatactgcatcaactttagacggatctacagcaataccatcaccagaaataacatggcccataaaacttacctctttcaacca 8006  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||    
T  8007 gaactcacatttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgttcagcatgttcctcctcagttttgaagtaa 8106  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8107 atcaaaatatcgtcgataaacacaacaatgaaccgatccaaaaaggcatggaagatgtgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 8206  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  8207 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataaagcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatatggtgataccctgatct 8306  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaact 433  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8307 caaatcaatcttgctgaaaact 8328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 8072 - 7592
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||   || ||||| ||||| ||||| || |||||| | |||||| |    
T  8072 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatctacttcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcactcctttcaacca 7973  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7972 gaattcatacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttggagtaa 7873  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  7872 atcaaaatatcatcaataaaaacaactatgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacac 7773  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7772 cgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacccgttctgaaagcagtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 7673  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  7672 caaatctatcttgctgaaaacatttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttgaaagtggatacctattctt 7592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 2792 - 3272
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||| ||||  |  || ||||||||||| || | |  ||||||||  || ||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  2792 taggagtctcccattgtgataacgtatcaactttagacgggtctagaaaaataccattaccagaaataatatggccacggaaactcacctcattcaacca 2891  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||| |||||| || | |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| || ||     
T  2892 gaattcacactttgacaattgagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaataatcttcaaatgttcagcatgttcttcttcagacttagattat 2991  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| || || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||    
T  2992 atcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaaacgatccaaataagcatgaaaaatacgattcatgtattccataaatacacccggtgcattagtaacac 3091  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||| |||   ||||  || || || ||||| || || || ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3092 cgaaaggcatcactgaatatttgtaatgtccgtaacgtgtcctaaaggccatcttctgcatatcctcatctttcactttaatctggtgatagcccgatct 3191  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3192 caaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaattgatccatcaaatcatcaattcttggaagtgggtacctattctt 3272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 7913 - 8393
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||   || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |    
T  7913 taggagtctcccattgcgatactgcatcaactttagacggatccactacaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaacca 8012  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| |  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  8013 gaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaactagcttcaaatgcttagcatgttcttcttcagacatggagtaa 8112  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  8113 atcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacaaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacac 8212  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8213 cgaacggcatcaccttatactcataatctccataacgcgttctgaaaactgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 8312  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8313 caaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 8393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Original strand, 24101 - 24193
Alignment:
Q  44 ttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagca 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |    ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||| ||||||    
T  24101 ttagacggatccacagaaataccacccttagaaatcacatgaccaaggaaactcacttcctgcaaccaaaactcacacttagacaacttagca 24193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 492
Target Start/End: Original strand, 24447 - 24549
Alignment:
Q  390 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 489  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || ||   |||||| || |  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||    
T  24447 taatctgatgatatcctgatcttaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagttgatccatcaaatcatcaatccttggaagcggataccgatt 24546  T
Q  490 ctt 492  Q
    |||    
T  24547 ctt 24549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 3330 - 3805
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |     ||||||   || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  3330 taggagtctcccattgcgatacaacatcaactttagacggatcta-----ataccactaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaacca 3424  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || | ||||| ||| || ||||||||||||||||  |||||||||    
T  3425 gaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacaattgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagagttggagtaa 3524  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || ||||    
T  3525 atcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacaaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgaattagtaacac 3624  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3625 cgaaaggcataactttatactcataatgtccatactgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 3724  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3725 cagatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgaaagtggatacctattctt 3805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 7942 - 8422
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||   || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| |    
T  7942 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatctacttcaataccactaccagaaataacatatccaagaaagctcacttctttcaacca 8041  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| ||  ||| |||||| |||  ||||||||||    
T  8042 gaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcaacatattcttcctcaaacttggagtaa 8141  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  8142 atcaaaatatcatcaatgaaaacaagcacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgtgattcatatactccataaatactccaggtgcattcgtaacac 8241  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8242 cgaaaggcataactttgtactcatagtgaccatactgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatct 8341  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8342 caaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaattgatccatcaaatcatcaatcctcgaaagtggatacctattctt 8422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 17138 - 17618
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||   || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| |    
T  17138 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatctacttcaataccactaccagaaataacatatccaagaaagctcacttctttcaacca 17237  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| ||   || |||||| |||  ||||||||||    
T  17238 gaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcaaaatattcttcatcaaacttggagtaa 17337  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || || |||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  17338 atcaaaatatcatcaatgaaaacaagcaagaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgtgattcatatactccataaatactccaggtgcattcgtaacac 17437  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17438 cgaaaggcataactttgtactcatagtgaccatactgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatct 17537  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17538 caaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaattgatccatcaaatcatcaatcctcgaaagtggatacctattctt 17618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 7500 - 7020
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| |||   || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  7500 taggagtctcccattgcgataccgcatcaactttagagggatctactgcaattccactaccagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaacca 7401  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  7400 gaattcacactttgacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacagtcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 7301  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    | |||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  7300 accaaaatgtcatcgatgaatacaaccatgaaacgatccaaaaatgcatgaaagattcgattcatgtactccataaacacaccaggtgcatttgtaacac 7201  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  7200 cgaacgacatcactttatactcataatgtccataacgcgttctaaaagttgtcttctgcatatctccatctttcactttaatctggtgataacctgatct 7101  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7100 caaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcgtcaattcttggaagtggatacctattctt 7020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 1795 - 1315
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||   || ||||| |||||  |||| || |||||||| |||||| |    
T  1795 taggagtctcccattgcgataccgattcaactttagacggatctactacaataccactaccagaaataacatgtacaagaaagctcacttctttcaacca 1696  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1695 gaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttggagtaa 1596  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || || ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  1595 atcaaaatatcatcaatgaaaacaaccatgaaccaatccaaaaatgcatgaaagatgtgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacac 1496  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1495 cgaaaggcataactttgtactcataatggccatactgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatatggtgataacccgatct 1396  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1395 caaagctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccataaaatcatcaatcctcggaagtggataccttttctt 1315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 8265 - 8744
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||   |  ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |    
T  8265 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagatggatctactgcaataccactactagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaacca 8364  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| || || | ||||| ||| || | ||||||||| | || ||||||||||    
T  8365 gaattcgcacttagacaatttcgcataatgcttcttttctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagaatgttcttccttagacttggagtaa 8464  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||    
T  8465 atcaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactacaggtgcattcgtaacac 8564  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8565 cgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataacgcgttatgaaagatgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 8664  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8665 caaatctatcttgctg-aaacttttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtgaatacctattctt 8744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18754 - 18274
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||   ||  |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |    
T  18754 taggagtctcccattgcgataccacttcgactttagacggatctactgcaataccactaccataaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaacca 18655  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| || || | ||||| ||| ||  ||||||||||||||  ||||| ||||    
T  18654 gaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcatctcttttaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcatcatgttcttcttcaaacttggggtaa 18555  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||    
T  18554 atcaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaactgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactctaggtgcattcgtaacac 18455  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  18454 cgaaaggcataactttgtactcatagtgatcataccgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatcttttactataatctagtgataacctgatct 18355  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18354 caaatctatcttgctgaaaacttttgcactcactaactgatccatcaaatcatcaatcctcagaagtggatacctattctt 18274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 247 - 492
Target Start/End: Original strand, 22002 - 22247
Alignment:
Q  247 atccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataa 346  Q
    ||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||     
T  22002 atccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggtgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtactcataatgaccatat 22101  T
Q  347 cgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccacta 446  Q
    || || || || || |||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || ||||||  | ||||||| |    
T  22102 cgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaactttttcacccacca 22201  T
Q  447 actgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  22202 actggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatatctgttctt 22247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 370 - 492
Target Start/End: Original strand, 39307 - 39429
Alignment:
Q  370 catatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatt 469  Q
    |||||| ||||| || || ||||| || || ||||| || ||||| || ||||| || ||||||  ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  39307 catatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcacccaccaactggtccatgaagtcatcaatc 39406  T
Q  470 ctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  39407 ctcggaagtggatacctgttctt 39429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 170 - 498
Target Start/End: Original strand, 21296 - 21624
Alignment:
Q  170 atcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgc 269  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21296 atcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgc 21395  T
Q  270 gattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21396 gattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtaaccataacgcgttctgaaagctgtcttctg 21495  T
Q  370 catatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatt 469  Q
    ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21496 catctctccatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatt 21595  T
Q  470 ctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21596 ctcggaagtggatacctattcttgatagt 21624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 12 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 480 - 1
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||||| |||| || || |||||||| ||||| |  |||||||||   || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  480 taggagtctcccattgcaataccgcatcaactttagagggatctattgcaataccactaccagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaacca 381  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  380 gaattcacactttgacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaacacagtcttcaaatgctcagcatgttcttcctcagtcttggagtaa 281  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  280 atcaaaatgtcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgcgattcatgtactccatcaacacaccaggtgcatttgtaacac 181  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||| ||||| || || || ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  180 cgaacggcatcacgttatactcataatgtccataacacgttctaaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 81  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattct 491  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  80 caagtcaatcttgctgaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 21 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13615 - 13144
Alignment:
Q  21 cccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcaca 120  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||||| ||    
T  13615 cccattgcgataccgcttcaactttagacggatccactgcaataccattaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttcttttaaccagaattcgca 13516  T
Q  121 cttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaata 220  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13515 cttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcatcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaata 13416  T
Q  221 tcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggca 320  Q
    || ||  | ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||||    
T  13415 tcatcttttaaatcaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccacgtgcattcgtaacaccaaaaggca 13316  T
Q  321 taactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaat 420  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  13315 taactttgtactcatagtgaccataccgtgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggagataacccgatctcaaatctat 13216  T
Q  421 cttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
      | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13215 tcttctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacttattctt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 1189 - 712
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| || | |||||||   ||  |||| ||||| ||||| || ||||||||  ||||| |    
T  1189 taggagtctcccattgcgatactgcatcaactttagacggatctactgtaataccactaccaaaaataacatgtccaagaaagctcacttctctcaacca 1090  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| || |||||||||||   || ||||||||||    
T  1089 gaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttc---agacttggagtaa 993  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||    
T  992 atcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactctaggtgcatttgtaacac 893  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||| ||||| || || || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  892 cgaacggcatcaccttatactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 793  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  792 caaatcaatcttgctgaaaacacgttcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctattctt 712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 20131 - 20611
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||  ||||||||   || |||||  |||| ||||| || |||| ||| |||||| |    
T  20131 taggagtctcccattgcgatacaacatcaactttagacggatctactacaataccactaccagaaatagcatgtccaagaaagctcaattctttcaacca 20230  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  20231 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaaccaacttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 20330  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  20331 atcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatatgattcatgtactccataaacactctaggtgcatttgtaacac 20430  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||| ||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  20431 cgaacggcatcaccttatactcataatgtccataccgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctgttgataacctgatct 20530  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20531 caagtcaatcttgctgaaaacactagcacccactaactgatccattaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctt 20611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 55648 - 56128
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||   || ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||| |    
T  55648 taggagtctcccattgcgatactgcatcaactttagagggatctactgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaaactcacctctttcaacca 55747  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  55748 gaattcacactttgataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacagtcttcaaatgctcaacatgttcttcctcagtcttggagtaa 55847  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  55848 atcaaaatgtcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatcaaaaaatgcatgaaaaatgtgattcatgtactccataaacactccaggggcatttgtaacac 55947  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55948 cgaaaggcatcactttatactcataatgtccatatcgcgttctaaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 56047  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56048 caaatcaatcttgttaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctt 56128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 75 - 492
Target Start/End: Original strand, 40588 - 41005
Alignment:
Q  75 aaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatctt 174  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  40588 aaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacagtctt 40687  T
Q  175 cagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 274  Q
    || ||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || | ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  40688 caaatgctcagcatgatcttcctcggtcttggagtaaattaaaatgtcatcaatgaaaaaaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgcgattc 40787  T
Q  275 atatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatat 374  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  40788 atgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatactcataatgtccatatcgcattctaaaagctgtcttctgcatat 40887  T
Q  375 cctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgg 474  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  40888 ctttatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcagttcttgg 40987  T
Q  475 aagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40988 aagtggatacctattctt 41005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 75 - 492
Target Start/End: Original strand, 74308 - 74725
Alignment:
Q  75 aaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatctt 174  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  74308 aaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacagtctt 74407  T
Q  175 cagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 274  Q
    || ||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || | ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  74408 caaatgctcagcatgatcttcctcggtcttggagtaaattaaaatgtcatcaatgaaaaaaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgcgattc 74507  T
Q  275 atatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatat 374  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  74508 atgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatactcataatgtccatatcgcattctaaaagctgtcttctgcatat 74607  T
Q  375 cctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgg 474  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  74608 ctttatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcagttcttgg 74707  T
Q  475 aagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||||||    
T  74708 aagtggatacctattctt 74725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 8859 - 8753
Alignment:
Q  392 atctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattct 491  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  8859 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctcagcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 8760  T
Q  492 tgatagt 498  Q
    | |||||    
T  8759 taatagt 8753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9177 - 9000
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||| || | |  |  ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  9177 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagataacttaacacataactagttctctttcaatacttgcaacacaatcc 9078  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatcca 251  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || || ||||| | ||| || |||||||    
T  9077 tcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccatcacaaaacgatcca 9000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 489
Target Start/End: Original strand, 3484 - 3951
Alignment:
Q  22 ccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacac 121  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||  || ||||| ||||| | ||| |||||||| || |||||| | |||||||||    
T  3484 ccattgcgatactgcatcaactttagacggatctactgcaataccattgccagaaataacatgtctaagaaaactcacctctttcaaccataattcacac 3583  T
Q  122 ttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatat 221  Q
    || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  || ||| |||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  3584 tttgacaatttagcataaaactttttctctttcaacacttccaaaacagtcttcaaatgctcagcatgttcttcctcagtcttggagtaaatcaaaatgt 3683  T
Q  222 cgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcat 321  Q
    | || || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||    
T  3684 catcaatgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgcgattcacgtactccataaacacagcaggtgcatttgtaacaccgaaaggcat 3783  T
Q  322 aactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatc 421  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3784 cactttatattcatagtgtccataacgcgttctaaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatatggtgataacccgatctcaaatctatc 3883  T
Q  422 ttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 489  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3884 ttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctatt 3951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 7114 - 7594
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || |||| ||||||||| || |||||||||   || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||| |    
T  7114 taggagtctcccattgcgatacaacatcaacttaagacggatctactgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaaactcacttcttttaacca 7213  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| ||  |||||||||| || ||||||||||||    
T  7214 gaattcacacttagacaatttcgcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaaccaacttcaaatgctcaacatgttcttcctcggtcttggagtaa 7313  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  7314 atcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatctaaaaatgcatgaaagatacgattcatgtactccataaacactctaggtgcatttgtaacac 7413  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||| | ||| || || || ||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7414 cgaacgacatcaccttatactcataatgtccataccacgttctgaacgctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 7513  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7514 caagtcaatcttgctgaaaacattagcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattctt 7594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 74 - 492
Target Start/End: Original strand, 14 - 432
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||    
T  14 gaaataacatgcccaagaaagctcacttcttttaaccagaattcacacttagataatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagct 113  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 273  Q
    ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  114 tcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcgaat 213  T
Q  274 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 373  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  214 catgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataaccttgtactcatagtgagcataccgcgttctgaaggctgtcttctgcata 313  T
Q  374 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 473  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  314 tcttcatcttttactttaatatggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatccttg 413  T
Q  474 gaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  414 gaagttgatacctattctt 432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 41 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14863 - 14412
Alignment:
Q  41 actttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaa 140  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||   || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  14863 actttagagggatctactgcaataccactaccagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaactagaattcacactttgacaatttagcatata 14764  T
Q  141 gtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccac 240  Q
      ||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14763 acttcttctctttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcaacatgttcttcttcaatcttggagtatatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccac 14664  T
Q  241 gaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtga 340  Q
    ||| | ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||     
T  14663 gaaactatccaaaaatgcatgaaaaatacgattcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgt 14564  T
Q  341 ccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcac 440  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14563 ccataacgtgttctaaaagcagtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaacacacgtgcac 14464  T
Q  441 ccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  14463 ccactaactgatccataaaatcattaattcttggaagtggatatttattctt 14412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 116 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 28772 - 28446
Alignment:
Q  116 tcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatca 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28772 tcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatca 28673  T
Q  216 aaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaa 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
T  28672 aaatatcgtcgataaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggt----------------- 28590  T
Q  316 aggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaa 415  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28589 --gcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaa 28492  T
Q  416 tcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaat 461  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28491 tcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccattaaat 28446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28984 - 28774
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |    
T  28984 taggagtctcccattgcgataccacttcaactttagagggatctacaacaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaacca 28885  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
     || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28884 taacttacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 28785  T
Q  212 atcaaaatatc 222  Q
    |||||||||||    
T  28784 atcaaaatatc 28774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 17547 - 18021
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||   || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  17547 taggagtctcccattgcgatactgcatcaactttagacggatctactgcaataccactaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaacca 17646  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17647 gaattcacacttagataatttagcataaagattcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtattgaagtaa 17746  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||     || ||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  17747 atca-----tcatcattgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacac 17841  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17842 cgaaaggcatcaccttatactcataatgtccataccgcgttctaaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 17941  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17942 caaatctatcttgctgaaaacacgt-cacccaccaactgatccatcaagtcatcaattattggaagtggatacctattctt 18021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 24946 - 24466
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |  |||||||| ||||| || |||||||||   |  ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |    
T  24946 taggagtctcccattgcgatactgcattaactttagatggatctactgcaataccactactagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaacca 24847  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||     
T  24846 gaattcacactttgataatttagcatataacttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttcgagtat 24747  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||    
T  24746 atcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaaacgttccaaaaatgcatgaaaaatacgattcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacac 24647  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24646 cgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgcgttctaaaagccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 24547  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24546 caaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaattgatccattaagtcgtcaattcttggaagtggatacctattctt 24466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 492
Target Start/End: Original strand, 150465 - 150942
Alignment:
Q  15 gagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaa 114  Q
    |||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||  ||| ||||| |  |||||||| ||||| || ||| | ||| ||||    
T  150465 gagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaactgcaataccacttccagaaataatgtggccaagaaaacttacctcacttaaccagaa 150564  T
Q  115 ttcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatc 214  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  150565 ttcacactttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatc 150664  T
Q  215 aaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccga 314  Q
    ||||| || || |||||  |||||| |||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| | ||| ||||| || |||||||    
T  150665 aaaatgtcatcaataaattcaaccatgaatttatccaggtaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacactaggcgcattagtaacaccga 150764  T
Q  315 aaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaa 414  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || |||||    
T  150765 aaggcatcactttatattcatagtgtccatatcatgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaa 150864  T
Q  415 atcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
     |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  150865 gtcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctt 150942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 194115 - 193947
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  194115 ggagtctcccattgtgatactgcatcaactttcgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccaga 194016  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||    ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  194015 actcacacttcgacaacttagcatacgacttcttttctttcaaaacttgtaacacaatcctcagatgtt 193947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 136
Target Start/End: Original strand, 181879 - 181941
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagca 136  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  181879 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaattcacacttagacaacttagca 181941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 3807 - 4287
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||   || ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||| |    
T  3807 taggagtctcccatcgtgatactgcatcaactttagatggatctactgcaataccactaccagaaataacattgccaagaaaactcacctctttcaacca 3906  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  3907 gaattcacactttgacaatttagcatatagcttcttctctttcagcacttgcaatacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtat 4006  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || | ||| || ||||    
T  4007 atcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatacgattcatgtactccataaacacacctggcgtatttgtaacac 4106  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4107 cgaaagacatcactttatattcataatgtctataacgtgttctaaaagccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 4206  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
     |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4207 taaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccacaaaatgatccatcaaatcatcaattcttggaagcggatacctattctt 4287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 40744 - 40263
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||||   || ||||| |  || || || ||||| |||||||| ||| |||    
T  40744 ggagtctcccattgtgataccgcatcaacctttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccaga 40645  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || || || |||||||| |   |||| || ||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| || ||    
T  40644 actcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagat 40545  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |||||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  40544 taaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccg 40445  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  40444 aaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagacctca 40345  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgat 495  Q
    |||||||||| || |||  || | ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  40344 aatcaatcttact-aaatatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgat 40263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 45625 - 45360
Alignment:
Q  227 ataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactt 326  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||  | |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || |    
T  45625 ataaacacaaccacaaatttatccaagtaagcatggaaaatttggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcacct 45526  T
Q  327 tgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgct 426  Q
    | ||||| || |||||||| || || || || ||  ||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||    
T  45525 tttattcttaatgaccatatcgtgtcctaaaggccatcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttact 45426  T
Q  427 gaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
     |||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  45425 aaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattctt 45360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 45810 - 45626
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| ||||| |||||| | ||| |||    
T  45810 ggagtctcccattgtgatactgcatcaactttcaatggatcaactgcaataccacaaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaga 45711  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttca 199  Q
    | |||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  45710 actcacacttcgacaatt-agcatacaacttcttctctttcaaaacttgtaacacaatcttcagatgttttgcatgctcttcttca 45626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 12 - 448
Target Start/End: Original strand, 30838 - 31274
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||| || |||||||||   || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |    
T  30838 taggagtctcccattgcgatactgtatcaactttagacggatctactgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaacca 30937  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| || |||||||||| || || ||||||||||    
T  30938 gaattcacacttagacaatttaacataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttattaagacttggagtaa 31037  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| || ||||    
T  31038 atcaaaatatcatcaataaaaacaaccatgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgcactccataaatactctaggtgcatttgtaacac 31137  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  31138 cgaaaggcataactttatattcatagtggccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataactcgatct 31237  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaac 448  Q
    || ||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  31238 cagatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaac 31274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 50705 - 51183
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatct-ccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactag 112  Q
    ||||| |||||||| |||||  | || |||||||| ||||| || |||||||| ||| || ||||| | ||||||||| ||||| |||||| | ||| ||    
T  50705 ggagtctcccattgtgatactacatcaactttagatggatcaactgcaatacc-tctaccagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaacaag 50803  T
Q  113 aattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa 212  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | || ||||    
T  50804 aattcacatttggacaacttggcatacaacttcttatctttcaacacttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcatagaataaa 50903  T
Q  213 tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacacc 312  Q
    | || || || || |||||||||||||  ||   ||||| | | ||||| || || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  50904 ttaagatgtcatcaataaacacaaccaaaaatttatccagataggcatgaaaaattctattcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacacc 51003  T
Q  313 gaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctc 412  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || || |||||| ||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || |||    
T  51004 gaaaggcatcaccttatattcataatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttcggcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctc 51103  T
Q  413 aaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||| || || || ||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51104 aaatcaattttactaaatacaagagcacccactaactgatccattaaatcttcaattctcgaaagtggatacctattctt 51183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2004 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold2004
Description:

Target: scaffold2004; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 74 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 1160 - 746
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||    
T  1160 gaaataacatgtccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagct 1061  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 273  Q
    ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || || || |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1060 tcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaataccatctatgaaaacaaccacaaactgatccaaaaatgcatgaaagatgcgatt 961  T
Q  274 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 373  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  960 catgtactccataaacactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcatagtgaccataccgcgttctaaaagctgtcttctgcata 861  T
Q  374 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 473  Q
    || |||||||| ||||||||||  ||    | |  ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  860 tcttcatctttcactttaatcttctg----cactttctcaaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattctcg 765  T
Q  474 gaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||||||||    
T  764 gaagtggatacctattctt 746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 399
Target Start/End: Original strand, 4095 - 4474
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |||| ||||    
T  4095 tcccattgcgacactgcatcaactttagagggatctacagcaataccatcaccaaaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcac 4194  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  4195 acttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcattcttgaagtaaatcagaat 4294  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
    ||| || ||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  4295 atcatcaataaaaacaaccacaaagccatccaaaaatgcatggaagatacgattcatatactccataaacactccaagtgcattggtaacaccaaaaggc 4394  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtg 399  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4395 ataactttatattcatagtgaccataacgcgttttgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttaccttaatctggtg 4474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 103126 - 103598
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||   || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||  |    
T  103126 taggagtctcccattgcgatactgcttcaactttagagggatctactgcaataccactaccagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaatca 103225  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  103226 gaattcacactttgataatttagcataaagcttcttctctttcagcacttgcaaaacagtcttcaaatgttcggcatgttcttcctcagacttggagtaa 103325  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| || || ||||| |  ||||    
T  103326 atcaaaatatcatcgatgaatactaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgcgattcatgcactccataaacacacctggcgcatttgcaacac 103425  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  103426 cgaaaggcatcactttatactcatagtgtccataacgcgttctaaaatccatcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgatct 103525  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  103526 caaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaattgatc--------catcaattctcggaagtggatacctattctt 103598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 6744 - 6351
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||   |  | ||| ||||| ||||| || | |||||| |||||| |    
T  6744 taggagtctcccattgcgataccgcttcaactttagacggatctactgcaataccactactagcaataacatgtccaagaaagcacacttctttcaacca 6645  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6644 gaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaa 6545  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  6544 atcaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaacgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacac 6445  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacc 405  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6444 cgaaaggcaaaactttgtactcatagtgaccataccgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacc 6351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 15634 - 15154
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || | |||||||   || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  15634 taggagtctcccattgcgatactgcatcaactttagagggatctactgaaataccactaccagaaattacatggccaagaaaactcacctctttcaacta 15535  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| | |||||| || |||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||     
T  15534 gaattcacactttgacaatttagcatataactttttctcttttagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcttgttcttcttcagtcttggagtat 15435  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |  || || ||||| || ||||    
T  15434 atcaaaatatcgtcgatgaacacaatcacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatacgattcatgtactccataaagatacctggcgcatttgtaacac 15335  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| || | |||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  15334 cgaaaggaatcactttatattcataatgtctataacaagttctaaaagccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatccgatgataacccgatct 15235  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15234 caaagcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtgtatacctattctt 15154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 14361 - 14841
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| |    
T  14361 taggagtctcccattgcgatactgcatcaactttagatggatctactgcaataccattacccgaaataacatggccaagaaaactaacctcattcaacca 14460  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| || ||||| |||||||| | ||| |||||     
T  14461 gaactcacactttgacaatttagaatatagcttcttctctttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgctcttcttcggacttcgagtat 14560  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||     
T  14561 atcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaacgatccaaaaacgcatgaaaaattcgattcatgtattccataaacacaccaggtgcctttgtaacat 14660  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  14661 cgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaagtcgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatcgggtgataacctgatct 14760  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||  || ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14761 caaattgatgttgctaaacacacgtgtacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctt 14841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 11154 - 10674
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| ||||| || || ||||||   || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  11154 taggagtctcccattgtgatactacatcaactttagatggatctaccgcgataccactaccagaaataacatggccaagaaaacttacttcattcaacca 11055  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||     
T  11054 gagttcacactttgacaacttagcataaagcttcttctccttcagcacttgcaagacaatcctcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttagagtat 10955  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||| | ||||| || || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||    
T  10954 atcaaaatatcatcaatgaacacaaccatgaagcgatctaaatacgcatgaaaaatacgattcaagtactccataaacacacctggcgcatttgtaacac 10855  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||| |||   ||||| || || |||||||| || || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10854 cgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 10755  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10754 caaatcaatcttgctgaatacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcagttcttggaagtggatacctattctt 10674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 24711 - 24231
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| |   |||||||||  || ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| |    
T  24711 taggagtctcccattgtgatactgcatcaactttagacggatctatctcaataccattaccagaaataacatggcctagaaaactcacctcattcaacca 24612  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||  |  || |||||||||||||||| |||||     
T  24611 gaattcacattttgacaacttagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatgcgcaacaagttcttcttcagtcttagagtat 24512  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | | | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |  || || || || ||||    
T  24511 atcaaaatgtcgtcgatgaacacaaccacgaaacgatctagatacgcatgaaaaatgcgattcatgtactccataaacacacttggcgcgtttgtaacac 24412  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||| |||   |||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  24411 cgaaaggcatcactgaatatttatagtgtcaataacgtgttctaaaagttgtcttctgcatatcctcgtcttttactttaatctagtgataacccaatct 24312  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24311 caagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctt 24231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 17346 - 16958
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| ||||| || || ||||||   || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  17346 taggagtctcccattgtgatactacatcaactttagatggatctaccgcgataccactaccagaaataacatggccaagaaaacttacttcattcaacca 17247  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||     
T  17246 gagttcacactttgacaacttagcataaagcttcttctccttcagcacttgcaagacaatcctcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttagagtat 17147  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||| | ||||| || || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||    
T  17146 atcaaaatatcatcaatgaacacaaccatgaagcgatctaaatacgcatgaaaaatacgattcaagtactccataaacacacctggcgcatttgtaacac 17047  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtga 400  Q
    |||||||||| |||   ||||| || || |||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17046 cgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtga 16958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 492
Target Start/End: Original strand, 16773 - 17249
Alignment:
Q  15 gagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaa 114  Q
    |||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||| ||   || ||||| |||| |||||  | |||||| || |||||  ||||    
T  16773 gagtctcccattgtgataccgcatcaactttagacggatctactgcaatatcactaccagaaataacattgccaaaaacactcacctctttcaatcagaa 16872  T
Q  115 ttcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatc 214  Q
    || |||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16873 ttgacactttgacaatttggcatataacttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtatatc 16972  T
Q  215 aaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccga 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||    
T  16973 aaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaagcgatctaaatacgcatgaaaaatacgattcatgtactccataaacacacctggcgcattggtaacaccga 17072  T
Q  315 aaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaa 414  Q
    |||| || |||   |||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17073 aagg-atcactgaatattcataatgtccataacgtgttctaaaagttgtcttctgcatatcctcgtctttcactttaatctggtgataacccgatctcaa 17171  T
Q  415 atcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || |||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17172 attaatcttactaaacacacgtgcacccactaattgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctattctt 17249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 111901 - 111775
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||| |    
T  111901 taggagtctcccattgcgatactgcatcaactttagagggatctactgcaataccaccaccagaaataatatggccaagaaaactcacctctttcaacca 111802  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcata 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  111801 gaattcacacttagacaatttagcata 111775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 494910 - 495391
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatga-catggccaaggaaactcacttcattcaact 110  Q
    ||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||   || ||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||     
T  494910 taggagtctcccatcgtgatactgcatcaactttagatggatctaccgcaataccactaccagaaataaacatggccaagaaaactcacctcattcaacc 495009  T
Q  111 agaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagta 210  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||  || |||||||||||||||| ||| |||||    
T  495010 agaactcagactttgacaatttagcatatagcttcttctctttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatactcagcatgttcttcttcagacttcgagta 495109  T
Q  211 aatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcaca 310  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||    
T  495110 tatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacaaaacgatccaaaaacgcatgaaaaatacgattcatgtactcaataaacacacctggcgcatttgtaaca 495209  T
Q  311 ccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatc 410  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  495210 ccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaagccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatcaggtgataaccagatc 495309  T
Q  411 tcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||| ||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  495310 tcaaataaatattgctaaacacacgtgaacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctt 495391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 143 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 453495 - 453146
Alignment:
Q  143 ttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacga 242  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||| || || || |||||||||||||| |    
T  453495 ttcttctctttcaatacttgtaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcaaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaa 453396  T
Q  243 accgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgacc 342  Q
    |   ||||| | | |||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  453395 atttatccagataggcatggaaaattcggttcatatattccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttatattcatagtgtcc 453296  T
Q  343 ataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcaccc 442  Q
    ||| || ||  | || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || |  ||||||    
T  453295 atatcgtgtcttaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaattttgctgaatacactagcaccc 453196  T
Q  443 actaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  453195 actaactgatccattaaatcatcgatcctcggaagtggatacctattctt 453146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 515764 - 515286
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||   || ||||| |  || || || |||||||||||| | ||| |||    
T  515764 ggagtctcccattgtgatactgcatcaactttcgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccaga 515665  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||| |||||| ||||||| |||||    
T  515664 actcacattttgacaactttgcatacaacctcttctctttcaacacttgcaagacaattctcagatgctctgcgtgttcctcttcattcttggaataaat 515565  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     || ||||| || ||||||||||| || |||  ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||||    
T  515564 taagatatcatcaataaacacaacgacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaatacaccaggcgcgttagtaacaccg 515465  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || ||||    
T  515464 aaaggcatcactttgtaatcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatggtaaccagacctca 515365  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| || |||| || | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  515364 agtcaatcttact-aaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcatcaattctaggaagcggatacctattctt 515286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 217833 - 217353
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||||| |||| || || | |||||| ||||| || |||||||||   || ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  217833 taggagtctcccattgcaatactgcatcaaatttagagggatctactgcaataccactaccagaaataacgtggccaagaaaactcacctcattcaacta 217734  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| ||  |||||||||||||   ||| |||||     
T  217733 gaactcacactttgacaatttaacatatagcttcttctctttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcaacatgttcttcttcgaacttcgagtat 217634  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || | |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||    
T  217633 atcaaaatatcatcaatgatcacaaccacgaaacgatcaaaaaacgcatgaaaaatatgattcatgtactccataaacacacctggggcatttgtaacac 217534  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  217533 cgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaggacgtcttctgcatatcctcgtctttcactttaatctggtgataacccgatct 217434  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  217433 caaatcaatcttgcaaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctattctt 217353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 492
Target Start/End: Original strand, 5006 - 5484
Alignment:
Q  13 aggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactag 112  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||    | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  5006 aggagtctcccattgtgatactgcttcaactttagatggatctactgcaataccactagcagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaaccag 5105  T
Q  113 aattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa 212  Q
    || |||||||| ||||| || ||||| |  ||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  5106 aactcacactttgacaactttgcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtata 5205  T
Q  213 tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacacc 312  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| | ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||    
T  5206 tcaaaatatcgtcaatgaacacaaccacaaagcgatccaaatacgcatgaaaaatacgattcatgtactc-atgaacacacctggcgcattcgtaacacc 5304  T
Q  313 gaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctc 412  Q
    ||||||||| |||   ||||||||  | |||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5305 gaaaggcatcactgaatattcataaagcccataacgtgttctaaaggccgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacccaatctc 5404  T
Q  413 aaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5405 aaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccaacaaatcatcaattataggaagtggatacctattctt 5484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 170 - 484
Target Start/End: Original strand, 11172 - 11486
Alignment:
Q  170 atcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgc 269  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| || |    
T  11172 atcttcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaattagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccaaagaagcatggaaaattc 11271  T
Q  270 gattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctg 369  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| || || ||||| || || || || || ||||||||    
T  11272 ggttcatatactccatgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctg 11371  T
Q  370 catatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatt 469  Q
    |||||||| ||| || || |||||| | || ||||| || ||||| |||||||| || |||||   ||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  11372 catatcctaatccttcaccttaatcagatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatc 11471  T
Q  470 ctcggaagtggatac 484  Q
    |||||||||||||||    
T  11472 ctcggaagtggatac 11486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 5764 - 6244
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||||||||   || || |||||||| ||||| || ||||||||| | |  ||||| || |||||||| ||||| || || |||||| |    
T  5764 taggagtctcccattgcgatcttgcatcaactttagatggatctactgcaataccaccactagaaataacgtggccaagaaaacttacctctttcaacca 5863  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||| | ||| |||||     
T  5864 gaatttacactttaacagtttagcatatagcttcttctctttcaacacttgtaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcggacttcgagtat 5963  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |  || |||||||| || ||||||||||| || || ||||| || ||||    
T  5964 atcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaagcgatcaaaaaatgcttgaataatacgattcatgtattccataaacacacctggcgcatttgtaacac 6063  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6064 cgaaagacatcactttatattcataatgtccataacgcattctaaaagtcgtcttctgcatatcctgatctttcactttaatctggtgataacccgatct 6163  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6164 caaatcaatcttgctaaacacacgtgcactcactaactgatccaacaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 12894 - 13374
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||||||||||   || || |||||||| ||||| || ||||||||| | |  ||||| || |||||||| ||||| || || |||||| |    
T  12894 taggagtctcccattgcgatcttgcatcaactttagatggatctactgcaataccaccactagaaataacgtggccaagaaaacttacctctttcaacca 12993  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||| | ||| |||||     
T  12994 gaatttacactttaacagtttagcatatagcttcttctctttcaacacttgtaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcggacttcgagtat 13093  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |  || |||||||| || ||||||||||| || || ||||| || ||||    
T  13094 atcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaagcgatcaaaaaatgcttgaataatacgattcatgtattccataaacacacctggcgcatttgtaacac 13193  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13194 cgaaagacatcactttatattcataatgtccataacgcattctaaaagtcgtcttctgcatatcctgatctttcactttaatctggtgataacccgatct 13293  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13294 caaatcaatcttgctaaacacacgtgcactcactaactgatccaacaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctt 13374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 242 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 30098 - 29844
Alignment:
Q  242 aaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  30098 aaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataattactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgac 29999  T
Q  342 cataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacc 441  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29998 catatcgggttttgaaagctgtcttctacatgtcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacc 29899  T
Q  442 cactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgata 496  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29898 cactatctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgata 29844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Original strand, 344 - 823
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||| |||||||||  | || |||||||| ||||| |  |||||||||   |  ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |    
T  344 taggagtctcccgttgcgatactacatcaactttagatggatctaatgcaataccactacaagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaacca 443  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
     |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| ||   |||||||||||||| ||| ||||||    
T  444 aaattcacagttagataacttcgcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcat-atgttcttcttcagacttagagtaa 542  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||    
T  543 atcaaaatatcataaataaaaacaactacgaactgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatatactccataaatactccaggtgcattagtaaaac 642  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
     ||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  643 tgaaaggcattaccttatactcataatgtccatactgcattctaaaagctgtcttctggacatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 742  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  743 caaatctatcttgcggaaaacacgtgcactcactaactgatccatcaagttatcaattctcggaagtggatacctattctt 823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 143 - 492
Target Start/End: Original strand, 2623 - 2972
Alignment:
Q  143 ttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacga 242  Q
    |||||||| || |||||||| || || | ||||| ||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  2623 ttcttctcctttaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttgcagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaaccacga 2722  T
Q  243 accgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgacc 342  Q
    |  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  2723 aatgattcaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaacactcgaggtgcatttgtaacactgaacggcatcactttttattcatagtgtcc 2822  T
Q  343 ataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcaccc 442  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||    
T  2823 atatcgcgttctaaaaggtgtcttctggatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgatgaaaacacgtgcatcc 2922  T
Q  443 actaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2923 actaactgatccatcaagtcatcaattcatggaagtggatacctattctt 2972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 9447 - 8967
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||| |||| |||||  | || |||||||||||||| || |||||||||   || ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| |    
T  9447 taggagtctcctattgtgataccacatcaactttagacggatctaccgcaataccactaccagaaataacatggccaagaaaactcacctcatccaacca 9348  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||| |  |||||||| |||| |||||| || |||||| ||| ||| ||  ||||||||||||||| ||| |||||     
T  9347 gaattcacactttgacagcttggcatataacttcttctccttcagcacttgcaaaacaatcctcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttagagtat 9248  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||    
T  9247 atcaaaatatcatccatgaacacaaccacgaaacgatctaaatacgcatgaaaaatacgattcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacac 9148  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||| |||   |||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9147 cgaaaggcatcactgaatattcataatgtccataacgtgtcctaaaagccgtcttctccatatccccgtctttcaccttaatctggtgataacccgatct 9048  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  9047 caaatcaatcttgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatctatccttggaagtggatacctattctt 8967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 411 - 492
Target Start/End: Original strand, 1324 - 1405
Alignment:
Q  411 tcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  1324 tcaaatcaatcttgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatctatccttggaagtggatacctattctt 1405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 411 - 492
Target Start/End: Original strand, 6628 - 6709
Alignment:
Q  411 tcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  6628 tcaaatcaatcttgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatctatccttggaagtggatacctattctt 6709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 750 - 407
Alignment:
Q  15 gagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaa 114  Q
    |||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| | ||||    
T  750 gagtctcccattgcgatactacatcaactttagagggatctacaacaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcagccagaa 651  T
Q  115 ttcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatc 214  Q
     |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  650 ctcacactttgataatttagcataaagtttcttctcttttaacacttgcaggacaatcttcaaatgctcagcatgttcttctttagtcttggagtcaatc 551  T
Q  215 aaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccga 314  Q
    ||| |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  550 aaattatcatcgatgaacacaactaagaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccga 451  T
Q  315 aaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaa 358  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||    
T  450 aaggcataactttatattaatagtgaccataccgtgttctgaaa 407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 6302 - 5822
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||  || ||||| ||||| ||||| ||| | || ||||||||| |    
T  6302 taggagtctcccactgtgatactgcatccactttagatggatctaccgcaataccattaccagaaataacatgaccaagaaaaatgacctcattcaacca 6203  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||| || ||||||||||  || || |||||||||||||||| ||| |||||     
T  6202 gaattcacactttgacaacttagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaatcttcaattgctcagcatgttcttcttcagccttagagtat 6103  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | | |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||    
T  6102 atcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaacgatctagatatgcatggaaaatacgattcatgtactccataaacacacctggcgcgtttgtaacac 6003  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
    |||||||||| ||    ||||| || || ||||  || ||||| ||||| ||||| |||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  6002 cgaaaggcatcaccgaatattcctaatgtccatgtcgtgttctaaaagccgtcttttgcatattgtcgtccttcactttaatctggtgataacccgatct 5903  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5902 caagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactggtccatcaagtcgtcaattcttggaagtggatacctattctt 5822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 41 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16361 - 15911
Alignment:
Q  41 actttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaa 140  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||  || ||||| ||| || |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  16361 actttagacggatctaccacaataccattaccagaaataacacggtcaagaaaacttacctcattcaaccagaattcacactttgacaacttagcatata 16262  T
Q  141 gtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccac 240  Q
      |||||||| || |||||||| || | |||||||| ||| || |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||    
T  16261 acttcttctccttgaacacttgcaaaa-aatcttcaaatgctcagcatattcctcttcagtcttagagtatatcaaaatatcatcgatgaatataaccac 16163  T
Q  241 gaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtga 340  Q
    ||| ||||| | | | ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| || || || || || ||||| |||||||| |||   || ||||| ||     
T  16162 gaaacgatctagatacgcatgaaaaatgcgattcatgtactacataaacacacctggcgcgtttgtaacacccaaaggcatcactgaatactcataatgt 16063  T
Q  341 ccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcac 440  Q
    ||||||||  |||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  16062 ccataacgttttctaaaagccatcttctgcatatcctcgtcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaacacatgtgcac 15963  T
Q  441 ccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15962 ccactaactaatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 15911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 201879 - 201404
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||  || || |||||||||   || ||||| | ||||||||| ||| | |||||| | ||| |||    
T  201879 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgacgtgtctactgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaatttacttcacttaaccaga 201780  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || ||| |||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  201779 attcacatttggaccatttggcatacagcttcttttccttcaacacttgcaacacaaccttcaaatgttctgcatgttcttcttcagtcttagagtatat 201680  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || | |||||| |||||||||||||| || || |  || || ||||||    
T  201679 caaaatatcatcaataaacacaaccacaaaccgatccaaataagcatggaaaattctattcatgtactccataaacacacccggcgtgttagtaacaccg 201580  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |||   ||||| || || ||||| || || || || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  201579 aaaggcatcactgaatattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgcatatcttcatcttttactttaatctgatggtaacccgacctca 201480  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 489  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  201479 aatcaatcttgctaaacactcgtgtacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 201404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 484
Target Start/End: Original strand, 324599 - 325069
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||  || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| ||||| |||||| | ||| |||    
T  324599 ggagtctcccattgtgatattgcctcaactttcgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaga 324698  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    |||||||||| ||| | |||||||| |  || ||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| | || || ||    
T  324699 attcacacttcgacgacttagcatacaactttttctctttcaaaatttgcaatacaatcttcagatgttctacatgctcttcttcagtccttgaatagat 324798  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || ||| || || ||||| |||||||||||   ||||| | | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  324799 cagaatgtcatcaataaatacaaccacgaatttatccagataggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccg 324898  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| || || |    
T  324899 aaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctta 324998  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatac 484  Q
    | |||||||| || |||||    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  324999 agtcaatcttactaaaaaccttcgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagtggatac 325069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 292 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16128 - 15921
Alignment:
Q  292 tccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatctttt-acttt 390  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16128 tccaggtgcattggtaacaccaaaacgcataaccttatattcataatgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttttacttt 16029  T
Q  391 aatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattc 490  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16028 aatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattc 15929  T
Q  491 ttgatagt 498  Q
    ||||||||    
T  15928 ttgatagt 15921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 24109 - 24587
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| ||||| |||||| | ||| |||    
T  24109 ggagtctcccattgtgatactgcatcaactttcgatggatcaactgcaataccacaaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaga 24208  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  24209 actcacacttcgacaacttagcatacaacttcttttcttttaatacttgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaat 24308  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || |||||| || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  24309 cagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagagaagcatggaaaattcggttcatatactccataaacaccccaggcgcattagtaacaccg 24408  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||  || ||||    
T  24409 aaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcgtcatccttcaccttaatctggtggtaacttgacctca 24508  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24509 agtcaatcttactgaacacccttgcacccactaactgatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctt 24587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 44828 - 44350
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||   || ||||| |   ||||||| ||||| |||||| | ||| | |    
T  44828 ggagtctcccattgtgatactgcatcaactttagacggatcaactgcaataccactaccagaaataatggggccaagaaaacttacttcacttaaccaaa 44729  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| |  || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||| || |||||    
T  44728 attcacattttgacaacttggcatacaacttattttctttcaatacttgcaatacaatcttcagatgttttgtatgctcttctttagtcttagaataaat 44629  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     || || || || |||||||||||||| ||   ||||| | |||||||||| ||    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  44628 taagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagatatgcatggaaaatttttttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccg 44529  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || || ||||||| |||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||    
T  44528 aaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctccatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacccgacctca 44429  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44428 aatcaattttactgaacacacgagcacccactaactgatccatcaaatcgtcaattctcggaagtggatacctgttctt 44350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 293 - 498
Target Start/End: Original strand, 1 - 206
Alignment:
Q  293 ccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaa 392  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1 ccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatatacatagtgaccataccgtgttctgaaatctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaa 100  T
Q  393 tctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101 tctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacgcgtgcacccacaaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 200  T
Q  493 gatagt 498  Q
    ||||||    
T  201 gatagt 206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 5761 - 5284
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||| | |  |||||||| ||||| |||||| | ||| |||    
T  5761 ggagtctcccattgtgatactgcatcaactttcgatggatcaactgcaataccactaccagaactaatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaga 5662  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  5661 actcacattttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaacacttgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaat 5562  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    ||| || || || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||  ||||| || ||||||    
T  5561 caagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcggttcatatactccataaacacgc-agtcgcattagtaacaccg 5463  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    ||| |||| || || ||||||||||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||    
T  5462 aaatgcatcaccttatattcatagtgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctca 5363  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5362 aatcaatcttgctgaatacacgagcacccactaattgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctt 5284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 10192 - 9715
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||| | |  |||||||| ||||| |||||| | ||| |||    
T  10192 ggagtctcccattgtgatactgcatcaactttcgatggatcaactgcaataccactaccagaactaatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaga 10093  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  10092 actcacattttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaacacttgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaat 9993  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    ||| || || || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||  ||||| || ||||||    
T  9992 caagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcggttcatatactccataaacacgc-agtcgcattagtaacaccg 9894  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    ||| |||| || || ||||||||||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||    
T  9893 aaatgcatcaccttatattcatagtgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctca 9794  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9793 aatcaatcttgctgaatacacgagcacccactaattgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctt 9715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8106 - 7844
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || || |||||| |    
T  8106 taggagtctcccattgggataccgctttaactttagagggatctacagtaataccatcaccagaaataacatgggcaagaaaacttacctctttcaacca 8007  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  8006 gaactcacacttagatagtttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaa 7907  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 274  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7906 atcaaaatatcgtcgacaaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattc 7844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 74 - 492
Target Start/End: Original strand, 10783 - 11201
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||| |||||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  10783 gaaatgatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaatct 10882  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 273  Q
    | | ||| || | ||| |||||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||| || ||  |||||||| | |||||||| || | |||    
T  10883 ttaaatgctctgtatgctcttcttcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaactacaaattgatccaaataagcatggaaaattctatt 10982  T
Q  274 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 373  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || || || ||  | || || || |||||||||    
T  10983 catgtactccataaacacaccaggcgcattggtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgcccgtatcgtgtcttaaaggccgttttctgcata 11082  T
Q  374 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 473  Q
    || |  ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11083 tctttttctttcactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgttgaacacgcgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcg 11182  T
Q  474 gaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11183 gaagtggatacctattctt 11201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 38353 - 38070
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||   || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||||    
T  38353 tcccattgcgatactgcatcaactttagacggatctactgcaataccactaccagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcac 38254  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  38253 acttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttgtagtaaatcaaaat 38154  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcatt 303  Q
    ||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38153 atcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatt 38070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 41482 - 41438
Alignment:
Q  448 ctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41482 ctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 41438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 48999 - 49477
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   ||  |||||| ||||||||| ||||| |||| | | ||| |||    
T  48999 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaactgcaataccactaccataaatgatatggccaagaaaacttacttgacttaaccaga 49098  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  49099 actcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaat 49198  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    ||| || || || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| ||    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||    
T  49199 caagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattttgttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacgccg 49298  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||    
T  49299 aaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctca 49398  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| |||||||||||||| ||||    
T  49399 aatcaattttgctgaatacacgagcacccactaactgatccattaaaccatcgatcctcagaagtggatacctaatctt 49477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 240 - 498
Target Start/End: Original strand, 1 - 259
Alignment:
Q  240 cgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtg 339  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||| || ||||| |||||| || ||||| ||    
T  1 cgaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacactgagaggcaaaactttatactcataatg 100  T
Q  340 accataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgca 439  Q
     ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||    
T  101 tccataccgcgttctaaaagccgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatctagtgataacccgatctcaaatctatcttgttgaaaacacgcgca 200  T
Q  440 cccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  201 cccactaacggatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctttatagt 259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 1764 - 2242
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| | |||| |||| ||||| |||||| | ||| | |    
T  1764 ggagtctcccattgcgatactgcatcaacttttgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatatggtcaagaaaacttacttcacttaaccaaa 1863  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| |  || || |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  1864 attcacatttggacaacttggcatacaacttattttctttcaacacttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaat 1963  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     || || || || |||||||||||||| |    ||||| | | |||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||  |||||    
T  1964 taagatgtcatcaataaacacaaccacaattttatccagataagcatggaaaattctgttcatatactccataaacacactaggcgcattagtagcaccg 2063  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||    
T  2064 aaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccagacctca 2163  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2164 aatcaattttactaaacacacgtgcacccactaattgatccattaaatcgtcaattctcggaagtggatacctattctt 2242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 492
Target Start/End: Original strand, 4645 - 5122
Alignment:
Q  15 gagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaa 114  Q
    |||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| ||||| |||||| | ||| ||||    
T  4645 gagtctcccattgtgatactgcatcaactttcgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactgacttcacttaaccagaa 4744  T
Q  115 ttcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatc 214  Q
     ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  4745 ctcacaattcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaatacttgtaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatc 4844  T
Q  215 aaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccga 314  Q
    | ||| || || ||||||||||| |||||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  4845 agaatgtcatcaataaacacaactacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccga 4944  T
Q  315 aaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaa 414  Q
    ||||||| || || |||||||||| ||||||||| |  || || || |||||| ||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || |||||    
T  4945 aaggcatcaccttatattcatagtaaccataacgtgacctaaaggccgtcttcggcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaa 5044  T
Q  415 atcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
     ||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5045 gtcaattttactaaacacacgtgcacccactaattgatccattaaatcgtcaattctcggaagtggatacctgttctt 5122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 71 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 42461 - 42040
Alignment:
Q  71 ccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaa 170  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| || ||  | ||||| |  |||||||| |||| |||||| || ||||    
T  42461 ccggaaataatatgaccaagaaaactcacttcgttcaaccagaattcgcacttcgataaactggcatataacttcttctccttcagcacttgcaaaacaa 42362  T
Q  171 tcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcg 270  Q
       ||| ||| || |||||||| || || ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||  || || ||||||||| | ||||| || ||  |    
T  42361 atctcaaatgctcggcatgttcctcctcggtcttggagtatatcagaatatcatctataaacacaaaaacaaatcgatccaaataagcatgaaaaatatg 42262  T
Q  271 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgc 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||    ||||| || ||  | ||| | || || || || ||||||||     
T  42261 attcatatattccataaacactccttgcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccgaatattcgtaatgttcgtaatgtgtcctaaaggccgtcttctga 42162  T
Q  371 atatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 470  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||   ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  42161 atatccccatctttcactttgatctggtgatagcctgatcttaagtcaatcttaaagaacacaaatgcacccactaactgatccatcaaatcgtcgatcc 42062  T
Q  471 tcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  42061 tcagaagtggatacctattctt 42040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 239 - 467
Target Start/End: Original strand, 10286 - 10514
Alignment:
Q  239 acgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagt 338  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || ||||| |    
T  10286 acgaaccgatccaaaaatgcttgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcaccttatactcataat 10385  T
Q  339 gaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgc 438  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  10386 gaccatcccgcgttctaaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacacatgc 10485  T
Q  439 acccactaactgatccatcaaatcatcaa 467  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10486 acccactaactgatccatcaagtcatcaa 10514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 1948 - 1496
Alignment:
Q  22 ccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacac 121  Q
    |||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||   || ||||| |  |||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||    
T  1948 ccattgtgatactgcatcaacttttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacac 1849  T
Q  122 ttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatat 221  Q
    || |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | || | ||||| ||| |    
T  1848 ttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttctgtccttgaattaatcagaatgt 1749  T
Q  222 cgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcat 321  Q
    | || || || | |||||| ||   |||||   | ||||| || || |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||| |||||| |||    
T  1748 catcaatgaatagaaccacaaatttatccaggtaggcatgaaaaattctgttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaacgaaagacat 1649  T
Q  322 aactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatc 421  Q
     || || ||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||||| ||| || || || ||||| || || || || ||||| ||||||    
T  1648 caccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatatccttatccttcaccttgatctgatggtagcctgacctcaagtcaatc 1549  T
Q  422 ttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgg 474  Q
    || |||||||| |  |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  1548 ttactgaaaaccctcgcacccactagctgatccatcaagtcatcaatcctcgg 1496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 492
Target Start/End: Original strand, 33235 - 33707
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||    
T  33235 tcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaaccgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaactagaactcac 33334  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    | ||  |||| || ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||    
T  33335 attttaacaacttggcatacaacttcttctctttcaacacctgtaatacaatctttagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaagat 33434  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
     || || || ||||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  33435 gtcatcaatgaacacaaccacgaatttatccaaataggcatggaaaatttggttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggc 33534  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    || || || ||||| || || ||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  33535 atcaccttatattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacattaatctgatggtaacctgacctcaagtcaa 33634  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||| | || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33635 tcttgttaaacacacgtgcacccactaattgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctt 33707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 4071 - 4552
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   ||  |||||| |||||| || ||||| |||||| | ||| | |    
T  4071 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaactgcaataccactaccataaatgatatggcccagaaaacttacttcacttaaccaaa 4170  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  | |||||    
T  4171 attcacattttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaacacttgcaatacaatcttcagatgttatgcatgctcttcttcagtcttataataaat 4270  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    ||| || |  || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  4271 caagatgtgatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaattcggttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccg 4370  T
Q  314 aaaggcataac---tttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatc 410  Q
    |||||||| ||    || |||||||| ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || |    
T  4371 aaaggcatcaccttattatattcataatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctgatggtaaccggacc 4470  T
Q  411 tcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||| || || || ||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4471 tcaaatcaattttactaaacacaggtgcacccacaaactgatccattaaatcgtcaattctcggaagtggatacctgttctt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 83 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 3295 - 2892
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    |||||||| ||||  |||||| | ||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |    
T  3295 tggccaagaaaacaaacttcactaaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaatacttgcaatacaatcttcagatgct 3196  T
Q  183 ccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 282  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||| |  || || || |||||||||||||||||   ||||| | | |||||||| || || |||||||||||    
T  3195 ctgcatgctcttcttcagtctttgaataaattaggatgtcatcaataaacacaaccacgaatttatccagataggcatggaaaattcggttcatatactc 3096  T
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatct 382  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| || || ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||     
T  3095 catgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcctcatcc 2996  T
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    || || |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  2995 ttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggat 2896  T
Q  483 acct 486  Q
    ||||    
T  2895 acct 2892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 69265 - 69743
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| || ||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  69265 ggagtctcccactgcgatactgcatcaacttttgaaggatcaaccgcaataccactaccagaaataacgtggcctagaaaactcacttcacttaacaaga 69364  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcata-aagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa 212  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |  || || ||||||||||   |||| ||||| || ||||||||||| || ||||    
T  69365 actcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaatcttcaagcgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaa 69463  T
Q  213 tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacacc 312  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||||||   ||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||    
T  69464 tcaaaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacacc 69563  T
Q  313 gaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctc 412  Q
    ||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||||| || |||    
T  69564 gaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatttgatggtaacctgacctc 69663  T
Q  413 aaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || ||||| || || ||||||  |||||| || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  69664 aagtcaattttactaaaaacttttgcacctaccaattggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatatctgttctt 69743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 19247 - 19725
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  |||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| ||||| |||||| | ||| |||    
T  19247 ggagtatcccattgtgatactgcatcaacttttgattgatcaactgcaataccaataccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaga 19346  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  19347 attcacattttgacaacttggcatacaacttcttatctttcaacacttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcctcttcggtcttagaataaat 19446  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     || || || || ||||||| |||||| ||   ||| | | | |||||||| ||    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  19447 taagatgtcatcaataaacataaccacaaatttatctagataagcatggaaaattttgtttatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccg 19546  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||    
T  19547 aaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctca 19646  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19647 aatcaatcttgctgaacacacgagcacccactaattgatccattagatcatcaatcctcggaagtggatacctattctt 19725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 25158 - 25076
Alignment:
Q  44 ttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttaga 126  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  25158 ttagaaggatccacagaaataccacccttagaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaattcacacttaga 25076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22598 - 22119
Alignment:
Q  12 taggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaacta 111  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||   || ||||| | ||||||||  |||||||| ||||||||| |    
T  22598 taggagtctcccattgtgatactgcatcaactttagacggatctacagcaataccactaccagaaataatatggccaaaaaaactcacctcattcaacca 22499  T
Q  112 gaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaa 211  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| |   | ||||||| || |||||| || |||||||||| ||| |  || ||||||||||||| ||| |||||     
T  22498 gaattcacactttgacaacttggcatataacgttttctcttgcagcacttgcaaaacaatcttcaaatgcttggcgtgttcttcttcagacttagagtat 22399  T
Q  212 atcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacac 311  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || |  ||||| ||| | |||||  | |||| |||||| || ||| |||| || || |||||||| || ||||    
T  22398 atcaaaatatcatcaatgaacacaacaacaatgcgatctaaataagcatgagaaatgcaattcatgtattccgtaaatacacccggtgcattagtaacac 22299  T
Q  312 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 411  Q
     ||||||||| |||   ||||  || || || ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  22298 -gaaaggcatcactgaatatttgtaatgtccgtaacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctgatgatagctcgatct 22200  T
Q  412 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22199 caaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcgattcttggaagtggataactattctt 22119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 143 - 498
Target Start/End: Original strand, 28646 - 29001
Alignment:
Q  143 ttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacga 242  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || || |||||||||||||| |    
T  28646 ttcttttctttcaacactttcaagacgatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaa 28745  T
Q  243 accgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgacc 342  Q
    |   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || |||||    
T  28746 atttatccaggtaagcatggaaaattcggttcatatactccataagcacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgacc 28845  T
Q  343 ataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcaccc 442  Q
    ||| || || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||| |||| || || ||||||    
T  28846 atatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgttgaatacacgagcaccc 28945  T
Q  443 actaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28946 actaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattcttgatagt 29001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 50585 - 50113
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||  ||  |||| | ||||||||| || || |||||| | |||||||| || |    
T  50585 tcccattgtgataccgcatcaacttttgacggatcaactgctataccattaccaaaaataatatggccaagaaagctaacttcacttaactagaactcgc 50486  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    |||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  50485 acttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaacacttgcaacacaatcttcagatgttccgcatgctcttcttccgtcttagaataaattaaaat 50386  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
    ||| || || || |||||||||||   ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| || || |  || || ||||||||||||    
T  50385 atcatcaatgaatacaaccacgaatttatccaaaaaagcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccgggcgtgttagtaacaccgaaaggc 50286  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    || ||||||||||| || || ||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| || ||||| || |    
T  50285 atcactttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaatgccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcga 50186  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||| || ||||||  ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  50185 tcttactaaaaacttttgcactcaccaactggtccatcaagtcatcaatcctcggtagtggatacctgttctt 50113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 59619 - 59147
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||  ||  |||| | ||||||||| || || |||||| | |||||||| || |    
T  59619 tcccattgtgataccgcatcaacttttgacggatcaactgctataccattaccaaaaataatatggccaagaaagctaacttcacttaactagaactcgc 59520  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    |||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  59519 acttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaacacttgcaacacaatcttcagatgttccgcatgctcttcttccgtcttagaataaattaaaat 59420  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
    ||| || || || |||||||||||   ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| || || |  || || ||||||||||||    
T  59419 atcatcaatgaatacaaccacgaatttatccaaaaaagcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccgggcgtgttagtaacaccgaaaggc 59320  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    || ||||||||||| || || ||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| || ||||| || |    
T  59319 atcactttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcga 59220  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||| || ||||||  ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  59219 tcttactaaaaacttttgcactcaccaactggtccatcaagtcatcaatcctcggtagtggatacctgttctt 59147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 66007 - 65535
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||  ||  |||| | ||||||||| || || |||||| | |||||||| || |    
T  66007 tcccattgtgataccgcatcaacttttgacggatcaactgctataccattaccaaaaataatatggccaagaaagctaacttcacttaactagaactcgc 65908  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    |||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  65907 acttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaacacttgcaacacaatcttcagatgttccgcatgctcttcttccgtcttagaataaattaaaat 65808  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
    ||| || || || |||||||||||   ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| || || |  || || ||||||||||||    
T  65807 atcatcaatgaatacaaccacgaatttatccaaaaaagcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccgggcgtgttagtaacaccgaaaggc 65708  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    || ||||||||||| || || ||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| || ||||| || |    
T  65707 atcactttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaatgccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcga 65608  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||| || ||||||  ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  65607 tcttactaaaaacttttgcactcaccaactggtccatcaagtcatcaatcctcggtagtggatacctgttctt 65535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 2683 - 2205
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   ||  |||| |  |||||||| ||||| |||||| | ||| |||    
T  2683 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaactgcaataccactaccataaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaga 2584  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| |  ||| | ||||| |||||||| || | |||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  2583 attcacatttagacaacttggcatacaacttcctttctttaaacacttgcaacaaaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcattcttagaataaat 2484  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     | |||||| || |||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  2483 tagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccaaataagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccg 2384  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || || || || |  || ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||    
T  2383 aaaggcattactttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggtcgttttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctca 2284  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||| ||| |||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2283 aatcaattttgttgaatacacaagcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctgttctt 2205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 29696 - 29218
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   ||  |||| |  |||||||| ||||| |||||| | ||| |||    
T  29696 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaactgcaataccactaccataaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaga 29597  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| |  ||| | ||||| |||||||| || | |||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  29596 attcacatttagacaacttggcatacaacttcctttctttaaacacttgcaacaaaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcattcttagaataaat 29497  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     | |||||| || |||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  29496 tagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccaaataagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccg 29397  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || || || || |  || ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||    
T  29396 aaaggcattactttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggtcgttttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctca 29297  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||| ||| |||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29296 aatcaattttgttgaatacacaagcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctgttctt 29218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 50286 - 49808
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || | ||| || |||||||||   || ||||| | ||||||||| ||||| |||||| | ||| |||    
T  50286 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatgaatcaactgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaacaaga 50187  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  50186 attcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgaaacacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaat 50087  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     || || || || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||    
T  50086 taagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaattcggttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacatcg 49987  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || |  || ||||||||||||||||| || || |||||||  || ||||| || ||||    
T  49986 aaaggcatcaccttatattcataatgaccatatcgtgtcctaaagggcgtattctgcatatcctcatcattcaccttaatctaatggtaacctgacctca 49887  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  49886 aatcaatcttgcagaacacacgagcacccactaactgatccatgaaatcgtcaattctcgaaagtagatacctgttctt 49808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 250515 - 250993
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  || || || |||||||||||| | ||| |||    
T  250515 ggagtctcccattgtgatactgcatcaactttcgatggatcaactgcaataccactgccagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccaga 250614  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| |   |||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  250615 actcacatttcgacaacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcctcttcagtcttagaataaat 250714  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    ||| || || || ||||||||||| || ||   ||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  250715 caagatgtcatcaataaacacaacaacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacactccaggcgcattagtaacaccg 250814  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||||| |||||| || || |||||||| || ||||| || ||||    
T  250815 aaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatattctcatccttcaccttaatctgatggtaaccagacctca 250914  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||||||||| ||   ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  250915 agtcaatcttgctgaacacctttgcacccaccaattgatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctt 250993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 486
Target Start/End: Original strand, 892 - 1364
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| || || ||| ||||||||   || ||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  892 ggagtctcccattgcgatactacatcaaccttagatgggtctacaacaataccactaccagaaatgatatggccaagaaaagtcacttcgttcaaccaga 991  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |  |||||||| ||||  ||||| || |||||  ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  992 attcacacttcgataatttggcatataacttcttctccttcagtacttgcaaaacaattctcaaatgctccgcatgttcctcttcggtcttagagtatat 1091  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || |||||| || ||||||||||| || ||| |||||||| | ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||    
T  1092 cataatatcatctataaacacaacaacaaactgatccaaataagcatgaaaaatacgattcatatattccataaacactcccggcgcgttagtaacaccg 1191  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| ||    ||||  || || |  ||||| || || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |    
T  1192 aaaggcatcaccgaatatttgtaatgtctgtaacgtgtcctaaaggctgtcttatgaatatcctcatctttcactttgatctggtgatggcccgatctta 1291  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacct 486  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||    
T  1292 aatcaatcttactgaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaattgtcgatcctcggaagtggatacct 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 10468 - 9991
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| | ||||||||| ||||| |||||| | ||| |||    
T  10468 ggagtctcccattgtgatactgcgtcaactttcgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaga 10369  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | |||||||| ||||| ||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  10368 actcacactttgacaacttgacatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaat 10269  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    ||| || || || |||||||||||||||||   ||| |   | |||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||    
T  10268 caagatgtcatcaataaacacaaccacgaatttatctaggtaagcatggaaaattcggttcatatactccataaacacactaggcgcattagtaacaccg 10169  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || ||||| || |||||||| || || |  || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || || || |    
T  10168 aaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcccaaaggccgtcttctgcatatcctcatctttcaccttaatctgatggta-cctgacctta 10070  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10069 agtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaatcctcggaagtggatacctgttctt 9991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 8956 - 9434
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| |||||  | || |||||  ||||||| ||||||||||||   || ||||| |  ||||| || |||||||||||| | |||||||    
T  8956 ggagtctcccattgtgatacttcatcaactttcaacggatcaacagcaataccactaccagaaataatgtggcccagaaaactcacttcacttaactaga 9055  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | |||||||| ||||| |||||| | |  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  9056 actcacacttcgacaacttagcacacaactttttctctttcaaaacttgtaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaat 9155  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     || || || || ||||| |||||||| ||   ||||| | | |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||    
T  9156 taagatgtcatcaataaatacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaatttggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccg 9255  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||| ||| || |||||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  9256 aaagacatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatttgatggtaacctgatctca 9355  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| || |||||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9356 agtcaatcttactaaaaacctttgcatccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctt 9434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 272 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 1642 - 1422
Alignment:
Q  272 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgca 371  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || || || || ||||||| ||    
T  1642 ttcatatcctccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttcttca 1543  T
Q  372 tatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 471  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||||| || ||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  1542 tatcctcatcctttaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacttttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcct 1443  T
Q  472 cggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  1442 cggaagtggatatctgttctt 1422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13746 - 13269
Alignment:
Q  15 gagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaa 114  Q
    |||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| ||||| |||||| | ||| ||||    
T  13746 gagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaa 13647  T
Q  115 ttcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatc 214  Q
     ||||| || |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  13646 ctcacattttgacaattttgcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttctgtcttcgaataaatc 13547  T
Q  215 aaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccga 314  Q
    || || || || |||||||||||||| ||   ||||| | | || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||    
T  13546 aagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcgtggaaaattcggttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaagaccga 13447  T
Q  315 aaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaa 414  Q
    ||||||| || || ||||| || || ||||| |  || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || |||||    
T  13446 aaggcatcaccttatattcgtaatgtccatatcatgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacattaatctgatggtaacctgacctcaa 13347  T
Q  415 atcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13346 atcaatcttgctaaacacacgagcacccactaaatgatccatgaagttatcaatcctcggaagtggatacctgttctt 13269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21925 - 21448
Alignment:
Q  15 gagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaa 114  Q
    |||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| ||||| |||||| | ||| ||||    
T  21925 gagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaa 21826  T
Q  115 ttcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatc 214  Q
     ||||| || ||||| || ||||| |  |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  21825 ctcacattttgacaacttcgcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttctgtcttcgaataaatc 21726  T
Q  215 aaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccga 314  Q
    || || || || |||||||||||||| ||   ||||| | | || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||    
T  21725 aagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcgtggaaaattcggttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaagaccga 21626  T
Q  315 aaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaa 414  Q
    ||||||| || || ||||| || || ||||| |  || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || |||||    
T  21625 aaggcatcaccttatattcgtaatgtccatatcatgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacattaatctgatggtaacctgacctcaa 21526  T
Q  415 atcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21525 atcaatcttgctaaacacacgagcacccactaaatgatccatgaagttatcaatcctcggaagtggatacctgttctt 21448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 74 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 44994 - 44795
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44994 gaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaagtcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacatttgcaagacaatct 44895  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 273  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44894 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtatatcaaaatatcttcgattaattcaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 44795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 359 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 4955 - 4822
Alignment:
Q  359 gctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatca 458  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| | || |||||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  4955 gctgttttctgcatatcttcatccttcaccttaatcagatggtaacctaacctcaaataaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatta 4856  T
Q  459 aatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4855 aatcatcaattctcagaagtggatatctattctt 4822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9219 - 8888
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||||   || ||||| | ||||| ||| |||| |||||||   ||| |||    
T  9219 ggagtctcccattgtgatactgcatcaaccttagatggatcaactgcaataccactaccagaaataatatggcgaagaaaacacacttcacataaccaga 9120  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| || | ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  9119 attcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacataattttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaat 9020  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     || ||||| || |||||||| ||||| ||   ||||| | | |||||||| ||    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  9019 aaagatatcatcaataaacacgaccacaaatttatccagataagcatggaaaattaagttcatgtacttcataaacacaccaggcgcattagtaacaccg 8920  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccata 345  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||    
T  8919 aaaggcatcaccttatattcataatgtccata 8888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 1265 - 788
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || ||| |||||  ||| ||||| |  |||||||| |||||||||||| | ||| | |    
T  1265 ggagtctcccattgtgatactgcatcaactttcgatggatcaactgcattaccacttccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccaaa 1166  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||    
T  1165 attcacacttcgacaacttggcatacaacttcttctcctttaatacttgcaatacaatcttcagatgttctgcattctcttcttcattcttagaataaat 1066  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    ||| || || || |||||| ||||||||||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  1065 caagatgtcatcaataaactcaaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccataaacacgccaggcgcattagtaacaccg 966  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || ||||| || || ||||| || || || || |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||    
T  965 aaaggcatcaccttatattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggtcgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctca 866  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  865 agtcaatcttgctgaaacct-ttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaatcctcggaagtggatacctgttctt 788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 42812 - 43289
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||||   || |||||||  |||||||| || || |||||| | ||| |||    
T  42812 ggagtctcccattgcgatactgcatcaacttttgacggatcaactgcaataccactaccagaaatgatgtggccaagaaagcttacttcacttaaccaga 42911  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  42912 actcacacttcgacaacttagcatacaacttcttctctttcaatatttgcaacacaattttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaatagat 43011  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || |||||| || |||||||||||||| ||   |||||   | |||| ||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  43012 cagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccaggtaagcatagaa-attcggttcatatactcgatgaacacaccaggcgcattagtaacaccg 43110  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || ||  ||||||||||| ||||||| || || ||||| || || ||||| || ||||    
T  43111 aaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccctcttctgcataccctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctca 43210  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  43211 agtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcctcgaaagtggatacctgttctt 43289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 37612 - 38021
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    |||||||| |||||||||| | | ||| | || |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  37612 tggccaagaaaactcactttacttaaccaaaactcacactttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaatacttctaatacaatcttcagatgtt 37711  T
Q  183 ccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 282  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| || || |||||  ||||||| ||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||    
T  37712 ctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcagaatgtcatcaataaattcaaccacaaatttatccaggtaagcatggaaaattcggttcatatactc 37811  T
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatct 382  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  37812 catgaacacaccaggcgcattagtaacaccgtaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccataacgtgttctaaaggccgtcttctgcatatcctcatcc 37911  T
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    || || ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||| ||||||||    
T  37912 ttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaattgatccattaagtcatcaatcctcgaaagtggat 38011  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    |||| |||||    
T  38012 acctgttctt 38021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 268503 - 268981
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||    
T  268503 ggagtttcccactgagatactgcatcaactttcgaaggatcaaccgcgataccattaccagaaataacatggcctaggaaactcacttcacttaaccaga 268602  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcata-aagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaa 212  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |  || || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || ||||    
T  268603 actcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaatcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaataaa 268701  T
Q  213 tcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacacc 312  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||   ||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||    
T  268702 tcaaaatatcatctataaacaccaccacgaatttatccagaaaagcatggaaaatctggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacacc 268801  T
Q  313 gaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctc 412  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||| | || || || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||    
T  268802 gaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccacatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatttgatggtaacccgacctc 268901  T
Q  413 aaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || |||||||| || ||||||   ||||| || ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  268902 aagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatccgcgggagtggatacctattctt 268981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 84930 - 84453
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || || ||||| || |||||| ||||||||    | ||||| | ||| ||||||||||||||||  |||||| |||    
T  84930 ggagtctcccactgcgatactgcatcaaccttagatgggtccacaacaataccactaactgaaataatatgaccaaggaaactcactttgttcaaccaga 84831  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |  ||||||||||||| |||||| || |||||  ||| ||| || ||||| || || |  ||||| ||||| ||    
T  84830 attcgcactttgataacttggcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaattctcaaatgctcggcatgctcctccttggtcttagagtatat 84731  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || |||||| || ||||||||||| || || ||||| | | | | ||| || || ||||||||||| |||||||| ||||   | ||||| || ||||||    
T  84730 cataatatcatctataaacacaacaacaaaacgatctagataagtatgaaaaatacgattcatatattccataaatactctcagcgcattagtaacaccg 84631  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| ||    ||||| || || || ||||| || || || |  |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  84630 aaaggcatcacaaaatattcgtaatgtccgtaacgtgtcctaaaggtcgtcttctgaatatcctcatctttcactttgatccggtgatagcccgatctca 84531  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | ||||| ||  |||| || || ||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  84530 agtcaattttattgaacacacgcgcacccactaact-atccatcaaatcgttaatcctcggaagtcgatacctattctt 84453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 1896 - 1418
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   ||  |||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||| |||    
T  1896 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaactgcaataccactaccataaataatgtggccaagaaaactaacttcatttaaccaga 1797  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  1796 actcacattttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaacacttgcaatacaatcttcagatcttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaat 1697  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    ||| || || || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  1696 caagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaattcggtttatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccg 1597  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    ||||  || || || |||||||||||  |||| || || || ||  | |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||    
T  1596 aaagatatcaccttatattcatagtgttcatatcgtgtcctaaagaccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctca 1497  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||| || ||  | || || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  1496 aatcaattttactatacacacgagcacccactgactgatccattaaatcatcaatcctcggaaatggatacctgttctt 1418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 16007 - 16485
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   ||  |||| | ||||||||| ||||| |||||| | ||| | |    
T  16007 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaactgcaataccactaccataaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaaa 16106  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| |   |||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | || |||||    
T  16107 attcacattttgacaacttggcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaatcttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcgtagaataaat 16206  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     || || || || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  16207 taagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattccgttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccg 16306  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || || |||||||||| ||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||    
T  16307 aaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcaaatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctca 16406  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||| ||| || || || || |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16407 aataaattttactaaacacacaagcacccactaactgatccattaaatcgtcaattctcggaactggatacctgttctt 16485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 8242 - 8106
Alignment:
Q  44 ttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| |    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||||||| |||||| | |  |    
T  8242 ttagacggatccacagcaataccaccattagaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaacacacacttagacaacttagcacataact 8143  T
Q  144 tcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatg 180  Q
      ||||||||||| ||||| || |||||| |||||||    
T  8142 ggttctctttcaaaacttgcaacacaatcctcagatg 8106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 7903 - 7794
Alignment:
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    |||||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||| || || ||   |||||| || |  |||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  7903 tttactctaatctgatgatatcctgacctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagttgatccatcaaatcatcaatccgtggaagtggat 7804  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    | | ||||||    
T  7803 atcgattctt 7794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 146 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 19913 - 19567
Alignment:
Q  146 ttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaacc 245  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||| || || || |||||||||||||||||      
T  19913 ttctctttgaatacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcattcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacgaatt 19814  T
Q  246 gatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccata 345  Q
     ||||||  | |||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||  ||||| || |||| ||||||||| || || ||||| || || |||||    
T  19813 tatccaagtaggcatggaaaattcggttcatatactccataaacacgtcagacgcattagtaacactgaaaggcatcaccttatattcgtaatgtccata 19714  T
Q  346 acgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccact 445  Q
     || || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19713 tcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccact 19614  T
Q  446 aactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  19613 aactgatccattaagtcgtcaatcctcagaagtggatacctgttctt 19567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26617 - 26451
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  26617 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttagcacataactggttctctttcaagacttgcaacacaatcc 26518  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccac 240  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || || ||||| |||||    
T  26517 tcaaatgttcagcatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccac 26451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3758 - 3556
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |||| ||||    
T  3758 tcccattgcgatactgcatcgactttagagggatctacatcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcac 3659  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3658 acttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagataatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 3559  T
Q  220 atc 222  Q
    |||    
T  3558 atc 3556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 345 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 8822 - 8669
Alignment:
Q  345 aacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccac 444  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8822 aacgcgttctgaaagatgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccac 8723  T
Q  445 taactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8722 taactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggattcctattcttgatagt 8669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 290 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 10975 - 10914
Alignment:
Q  290 actccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgt 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10975 actccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatactcatagtgaccataacgcgt 10914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 485
Target Start/End: Original strand, 122 - 592
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||| |||||||   |  ||||| |  |||||||| ||||| || ||| | ||| |||    
T  122 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaacagaaataccactacaagaaataatgtggccaagaaaactaacatcacttaaccaga 221  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  | | |||    
T  222 aatcacactttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcctaaaat-aat 320  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    |||||| || || ||||| ||||||| |||   ||||| | | |||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  321 caaaatgtcatcaataaatacaaccatgaatttatccagataggcatggaaaattcggttcatatacttcataaacacaccaggcgcattagtaacaccg 420  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| | || ||||    
T  421 aaaggcatcactttgtattcttaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaagctgacctca 520  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 485  Q
    | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  521 agtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaatcctcggaagtggatacc 592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 31730 - 31252
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  || || || |||||||||||| | ||| |||    
T  31730 ggagtctcccattgtgatactgcatcaactttcgatggatcaactgcaataccaataccagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccaga 31631  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | |||||||| ||||  || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  31630 actcacactttgacagctttgcatacaacttcttttctttcaagacttgcaatataatcttcagatgctctgcatgctcctcttcagtcttagaataaat 31531  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || |||||| || |||||||| ||||| ||   | ||| ||| |||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||| |    
T  31530 cagaatatcatcaataaacaccaccacaaatttaaccagaaaagcatggaaaattcggttcatatattccataaataccccaggcgcattagtaacactg 31431  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |  |||||||| || || ||||| ||  | || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||    
T  31430 aaaggcatcaacttgtattcgtaatgtccatatcgtctcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatctttcacctttatctgatggtaaccagacctca 31331  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31330 agtcaatcttactgaacacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctt 31252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 99973 - 99495
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||  || |||||||||   || ||||| |  ||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  99973 ggagtctcccattgtgataccgcatcaactttcgatggattaactgcaataccactaccagaaataatgtggcccagaaaactcacttcacttaaccaga 99874  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| |  || |||||||| |  | ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || || ||    
T  99873 actcacacttcgacaacttagcatataactttttctcttttagaatttgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagttctagaatagat 99774  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || ||| || || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  99773 cagaatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaattcgattcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccg 99674  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || ||||    
T  99673 aaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacctca 99574  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| || |||||   ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  99573 attcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctt 99495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 82 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 176687 - 176277
Alignment:
Q  82 atggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgt 181  Q
    ||||||||| ||| | |||||| | ||| |||||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| || ||||||||||  || |||||||| | |||     
T  176687 atggccaagaaaatttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttcattcaacacttacaacacaatctttaaatgc 176588  T
Q  182 tccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatact 281  Q
    || ||||| |||||||||| ||| || |||||||| || || || ||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||| || | |||||| ||||    
T  176587 tctgcatgctcttcttcagacttagaataaatcaagatgtcatcaataaatacaacaacaaaccgatccaaataagcatggaaaattctattcatgtact 176488  T
Q  282 ccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatc 381  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||  || |||   ||||| || || ||||| || || || || |  || || |||||||| |||||    
T  176487 ccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaagatatcactgaatattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggtcgttttatgcatatcttcatc 176388  T
Q  382 ttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgga 481  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  176387 ttttactttaatctaatggtaacccgacctcaaatcaatcatgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaattcgcggaagtgga 176288  T
Q  482 tacctattctt 492  Q
    |||||||||||    
T  176287 tacctattctt 176277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 14164 - 14579
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||| |    
T  14164 tggccaagaaaactcacttcaattaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaatatttgcaacacaatcttcagatgct 14263  T
Q  183 ccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 282  Q
    | ||||| ||||||||||||||  | ||||| | ||| || || ||| |||||||||||||   || ||   | |||||||| || || |||||||||||    
T  14264 ctgcatgctcttcttcagtcttataataaattagaatgtcatcaatagacacaaccacgaatttattcaggtaggcatggaaaattcggttcatatactc 14363  T
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcata------gtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcc 376  Q
    ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| || || ||||||||      |||||||||||| || || || || |||||||||||||||    
T  14364 catgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaagacatcaccttatattcatatatatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcc 14463  T
Q  377 tcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaa 476  Q
    ||||| || || ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  14464 tcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaa 14563  T
Q  477 gtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||| |||||    
T  14564 gtggatacctgttctt 14579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 383 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 5848 - 5739
Alignment:
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5848 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 5749  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    ||| ||||||    
T  5748 accgattctt 5739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6159 - 5993
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  6159 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcc 6060  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccac 240  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || || ||||| |||||    
T  6059 tcaaatgctcagcatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccac 5993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 82 - 492
Target Start/End: Original strand, 28488 - 28898
Alignment:
Q  82 atggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgt 181  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | ||| |||||||||| || ||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||     
T  28488 atggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaatttcttttctttcaacacttgcaacacaatcatcagatgc 28587  T
Q  182 tccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatact 281  Q
    || ||||| | ||||||| || | || ||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || |  ||||||||||    
T  28588 tctgcatgcttttcttcattcctagaataaattaggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaattctgttcatatact 28687  T
Q  282 ccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatc 381  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || || || || |  || |||||||||||||||||    
T  28688 ccataaatacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatactcataatgtccatatcgtgtcctaaaggtcgttttctgcatatcctcatc 28787  T
Q  382 ttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgga 481  Q
     || || |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  28788 cttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactgaacacgcgtgcacccactaactgatctattaaatcatcaattctcggaagtgga 28887  T
Q  482 tacctattctt 492  Q
    || ||||||||    
T  28888 tatctattctt 28898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 176 - 492
Target Start/End: Original strand, 557 - 873
Alignment:
Q  176 agatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattca 275  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||| || ||||| || || || || |||||||||||||| ||   ||| | | | |||||||| || |  ||||    
T  557 agatgtcctgcatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatctagataagcatggaaaattctgttca 656  T
Q  276 tatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatc 375  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || || || |||||||||||||||||    
T  657 tatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaatggcatcaccttatattcataatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatc 756  T
Q  376 ctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgga 475  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||| || |||||| |||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  757 ctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaaccaattttgctaaacacacgagcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgga 856  T
Q  476 agtggatacctattctt 492  Q
    ||| |||||||||||||    
T  857 agttgatacctattctt 873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 953 - 1164
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||||||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |||| ||||    
T  953 tcccattgcgattctgcatcaactttagagggatctacagcaataccatcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcac 1052  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1053 acttagatagtttagcataaagtttcttttctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcagaat 1152  T
Q  220 atcgtcgataaa 231  Q
    ||| || |||||    
T  1153 atcatcaataaa 1164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 262119 - 262597
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| ||||||||   || ||||| |  |||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  262119 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgaaggatcaacaacaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccaga 262218  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |  || ||||||||||  ||||| || |||||| |||||||||| ||||| || |||| |||||| || |||||    
T  262219 attcacatttcgacaacttagcatacaactttttctctttcagtacttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcctctttagtcttagaataaat 262318  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |  |||||||| || || |||||||| |||  ||||| |||  ||||||| || |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  262319 taggatatcgtcaatgaatacaaccacaaacttatccagaaagacatggaaaattcagttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccg 262418  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| || ||||    
T  262419 aaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaaccagacctca 262518  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| |||||||    |||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  262519 agtcaatcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcataaatcctcgaaagcggatacctgttctt 262597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 83 - 459
Target Start/End: Original strand, 6714 - 7090
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| |  |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  6714 tggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaatcttcagatgtt 6813  T
Q  183 ccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 282  Q
    |  |||| ||||| |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||||| ||   |  || ||| ||||| || || || |||||||||||    
T  6814 ctacatgctcttcctcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttaatcagaaaagcatgaaaaattcggttcatatactc 6913  T
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatct 382  Q
     ||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||||||||||||     
T  6914 tataaacacatcaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatcc 7013  T
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaa 459  Q
    || ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||||||| ||||||||||    
T  7014 ttcactttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttacggaatacacgagcacccactaaccgatccatcaa 7090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 5432 - 5022
Alignment:
Q  82 atggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgt 181  Q
    ||||||||| ||||| ||| || | ||| | |||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  5432 atggccaagaaaacttactccacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacacaatcttcagatgc 5333  T
Q  182 tccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatact 281  Q
    || ||||| ||||||||| |||| || ||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || | |||||| ||||    
T  5332 tctgcatgctcttcttcattcttagaataaattaggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctattcatgtact 5233  T
Q  282 ccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatc 381  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||| |  || || ||||| || ||||| || || || || || || ||||||||||| |||||    
T  5232 ccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaagacatcatcttatactcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgcatatcttcatc 5133  T
Q  382 ttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgga 481  Q
     || || ||||| || || ||||| || ||||||||||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5132 cttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaaatcaatttgtctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtgga 5033  T
Q  482 tacctattctt 492  Q
    || ||||||||    
T  5032 tatctattctt 5022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 47445 - 46967
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| | ||||||||| ||||  |||||| | ||| | |    
T  47445 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaacggcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaacctacttcacttaaccaaa 47346  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || |||||  | ||||| |  || || |||||||||||||| || ||||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||  | |||||    
T  47345 attcacattttgacaacgtcgcatacaactttttttctttcaacacttgcaatacaatctgcagatgctctgcatgctcatcttcattcttaaaataaat 47246  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |  ||||| || |||||||||||||| ||   ||| | | | |||||||| ||  | |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  47245 taggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatctagataggcatggaaaatttggttcatatacttcataaacacaccaggcgcattagtaacaccg 47146  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || || ||  ||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || |||     
T  47145 aaaggcatcaccttatattcataatgaccataacgtgtcctaaaggccatcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccggacctcc 47046  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||| || || || || ||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  47045 aatcaattttactaaacacacgtgcacccactagctgatccattaaatcgttaattctcggaagtggatacctattctt 46967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 56258 - 55780
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| ||||||||   || ||||| |  |||| ||| |||||||||||| | ||| |||    
T  56258 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgaaggatcaacaacaataccactaccagaaataatgtggctaagaaaactcacttcacttaaccaga 56159  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |  || ||||||||||  ||||| || |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  56158 attcacatttcgacaacttagcatacaactttttctctttcagtacttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttggaataaat 56059  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |  || || || || || |||||||  |||  ||||| ||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||    
T  56058 taggatgtcatcaatgaatacaaccataaacttatccagaaaagcatgaaaaatacggttcatatactccatgaatacaccaggcgcattagtaacaccg 55959  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| | ||||||||| || ||||||||||| || || || |  |||||||||||||| ||||| || || | ||| || || ||||| || ||||    
T  55958 aaaggcatcaatttgtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggtcgtcttctgcatatcttcatccttcacctgaatttgatggtaacctgacctca 55859  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | ||||||||  ||||||    |||||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  55858 agtcaatcttattgaaaatctttgcaccgaccaactggtccatcaagtcgtcaatcctcggaagcggatatctgttctt 55780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 80236 - 79764
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||  ||  |||| | ||||||||||||||| |||||| | ||| | || || |    
T  80236 tcccattgtgataccgcatcaacttttgacggatcaactgctataccattaccaaaaataatatggccaaggaaacttacttcacttaaccaaaactcgc 80137  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    | || |||||||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||| |  ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||    
T  80136 attttgacaatttagcatacaacttcttttctttcaaaacctgtaatacaatcctcagatgctttgcatgctcctcttcagtcttagaataaattaaaat 80037  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggc 319  Q
    ||| || || || || ||||| |||  |||||  || ||||| || || |  |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| || ||||||||||||    
T  80036 atcatcaatgaatactaccacaaacttatccaggaaagcatgaaaaatcctgttcatatactccatgaacacaccaagcgcattagtaacaccgaaaggc 79937  T
Q  320 ataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaa 419  Q
    || ||||||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| || ||||| ||||    
T  79936 atcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaa 79837  T
Q  420 tcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||| |||||||    |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  79836 tcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcgaaagtggatacctgttctt 79764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 74 - 492
Target Start/End: Original strand, 25068 - 25486
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcata-aagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatc 172  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||| | ||| |||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |  || || ||||||    
T  25068 gaaataacgtggcctagaaaactcacttcagttaaccagaactcccacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaatc 25166  T
Q  173 ttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 272  Q
    ||||  || || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||||||   ||||| ||| |||||||| || || |    
T  25167 ttcaagtgctctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcaaaatatcatctataaataccaccacgaatttatccagaaaggcatggaaaattcggt 25266  T
Q  273 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcat 372  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || ||  | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||  | || || || || |||||||||||    
T  25267 tcatatactccatgaacacgccaggcgcgttaataacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatattgtgtcctaaaggccgtcttctgcat 25366  T
Q  373 atcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctc 472  Q
    ||| |||||||| |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || ||||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  25367 atcttcatctttcactttaatttgatggtaaccagacctcaagtcaattttactaaaaacttttgcacccaccaactggtccatcaagtcatcaaatctc 25466  T
Q  473 ggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  25467 ggaagtggatatctgttctt 25486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 64850 - 64452
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||| |||||||||| || ||||| || ||||| |  ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  64850 tggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacattttgacaacttggcatacaacttcttctttttcaacacttgcaacacaatcttcagatgct 64751  T
Q  183 ccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 282  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||| || || || || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || || |||||||||||    
T  64750 ctgcatgctcttcttcagtctttgaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcggttcatatactc 64651  T
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatct 382  Q
    ||||||||| |||||           | ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| || || || || |  ||||||||||||||||||||     
T  64650 cataaacacaccagg-----------cgccgaacggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggacgtcttctgcatatcctcatcc 64562  T
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| || ||| ||||||| |||| ||||||||    
T  64561 ttcaccttaatctgatggtaaccggacctcaaatcaatcttgctgaacacacgagcatccactaactgatcaattaaaccatcaatcctcgtaagtggat 64462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 101; Significance: 8e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 308 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 115155 - 114971
Alignment:
Q  308 acaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccg 407  Q
    |||||||||||||| |||   ||||| || || |||||||| || || || ||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  115155 acaccgaaaggcatcactcaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccatcttctggatatcctcgtctttcactttaatctggtgataacccg 115056  T
Q  408 atctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  115055 atctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctt 114971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 115362 - 115171
Alignment:
Q  44 ttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtt 143  Q
    ||||||||||| || ||||| |||   || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| || ||||| |  |    
T  115362 ttagacggatctaccgcaatgccactaccagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccaaaattcacactttgacaacttggcatataact 115263  T
Q  144 tcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacaca 235  Q
     |||||| |||| |||||| || |||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  115262 acttctccttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttagagtatatcaaaatatcatcgatgaacaca 115171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 32088 - 31610
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||   || ||||| | ||||||||| |||||||||||| | ||| | |    
T  32088 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaa 31989  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | || ||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||  | || || ||    
T  31988 actcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaatagat 31889  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    |||||| || || || || |||||||| ||   |||||   | ||||| || || |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  31888 caaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaattctgttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccg 31789  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||    
T  31788 aaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctca 31689  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | ||||| || || ||||    |||||| || |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  31688 agtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcatgtcgtcaattctcggaagtggatatcttttctt 31610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 308 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 54528 - 54344
Alignment:
Q  308 acaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccg 407  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || || ||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| |    
T  54528 acaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctg 54429  T
Q  408 atctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | ||||| |||||||| ||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54428 acctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactatctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatatctattctt 54344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 74 - 492
Target Start/End: Original strand, 42213 - 42631
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  42213 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcc 42312  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 273  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| | | | ||| || || | |||    
T  42313 tcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctatt 42412  T
Q  274 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 373  Q
    ||| || |||||||| || ||  | ||||| |  || || || ||||| ||    || |||||||| ||||| | ||||| ||| || || ||    |||    
T  42413 catgtattccataaagacacctagcgcattagatactccaaatggcatcacaaaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatata 42512  T
Q  374 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 473  Q
    || ||  | |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  42513 tcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctatgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttg 42612  T
Q  474 gaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  42613 gaagtggataccgattctt 42631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 55311 - 55034
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| ||||| |||||| | ||| | |    
T  55311 ggagtctcccattgtgatattgcttcaacttttgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaaa 55212  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||  | || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || ||    
T  55211 actcttatttcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaaaacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaatagat 55112  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacac 291  Q
     | |||||| || ||||| || ||||||||   | | | ||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  55111 tagaatatcatcaataaataccaccacgaatttaactagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacac 55034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 52940 - 53418
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || |||||||||   || ||||| |  ||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  52940 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgacgggtcaactgcaataccactaccagaaataatgtggcccagaaaactcacttcacttaaccaga 53039  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | |||||||| ||||| ||| |||| |  || ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  53040 actcacacttcgacaacttaacatacaactttttctctttcaatatttgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaat 53139  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || |||||| || ||||| |||||||| ||   |||||   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||  |||||  |||| || ||| ||    
T  53140 cagaatatcatcaataaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatggaaaatccggttcatatactccatgaacaaaccaggcacattagtaacatcg 53239  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    ||||| || || ||||| || || || ||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| || ||||    
T  53240 aaaggtatcaccttgtactcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctca 53339  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||| || |||||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||    
T  53340 agtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaattgatccatcaagtcatcaatcctagaaagtggatatctgttctt 53418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 116 - 492
Target Start/End: Original strand, 642 - 1016
Alignment:
Q  116 tcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatca 215  Q
    ||||| || |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  642 tcacatttcgacaatttagcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatta 741  T
Q  216 aaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaa 315  Q
     ||| || || |||||||| ||||| ||   ||||| ||| |||||||| || || |||||||||| ||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  742 gaatgtcatcaataaacaccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactacatgaacacacccggcgcattagtaacaccgaa 841  T
Q  316 aggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaa 415  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| || |||||     
T  842 aggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaag 941  T
Q  416 tcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||| || || ||||    ||  | ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  942 tcaatattactaaaaaactttg--ctcaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctt 1016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 492
Target Start/End: Original strand, 7809 - 7985
Alignment:
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| || ||||    
T  7809 aaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctca 7908  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | ||||| || || ||||    ||| |  || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7909 agtcaatattactaaaaaactttgctc--accaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctt 7985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 11197 - 10743
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || |||||||| || || |||||||  || ||||| | ||| ||||||||||| |||||| | | | | |    
T  11197 ggagtctcccattgtgataccgcatcaacctttgacggatcaactgctataccattaccagaaataatatgaccaaggaaacttacttcacttagccaaa 11098  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  11097 actcacattttgacaatttggcatacaacttcttctctttaaatacttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaat 10998  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |||||||| || ||||| || || |||||   |||||  || ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||    
T  10997 taaaatatcatcaataaataccactacgaatttatccaggaaagcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccg 10898  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || ||||| || ||||    
T  10897 aaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatggtaaccagacctca 10798  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaat 468  Q
    | || ||||| || ||||    |||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  10797 agtcgatcttactaaaaatatttgcaccaaccaactgatccatcaagtcatcaat 10743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 126 - 492
Target Start/End: Original strand, 21127 - 21493
Alignment:
Q  126 acaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtc 225  Q
    ||||||||||||| |  || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||| ||    
T  21127 acaatttagcatacaacttattttctttcaaaacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaattagaatatcatc 21226  T
Q  226 gataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataact 325  Q
     | ||| ||||| || ||   ||||| ||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||     
T  21227 aagaaatacaactacaaatttatccagaaaagcatgaaaaattcggttcatatactccatgaatacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggtatcacc 21326  T
Q  326 ttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgc 425  Q
    || |||||||| ||||| |  || || || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| || ||||| |||||||| |    
T  21327 ttctattcataatgaccgtgtcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttac 21426  T
Q  426 tgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | ||||||  ||||||||| |  ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21427 taaaaacttttgcacccaccacttgatccaccaagtcgtcaatcctcggaagtggatacctgttctt 21493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 27628 - 27181
Alignment:
Q  44 ttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtt 143  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||   || ||||| | ||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| || || || ||||| |  |    
T  27628 ttagatggatccacaacaataccactaccagaaataatatgaccaagaaaactcact-cgttcaaccagaattctcactttgataacttggcatataact 27530  T
Q  144 tcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaa 243  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||  ||| ||| || |||||||| || |||| ||| ||||| ||||  ||||| || ||||||||||| || ||    
T  27529 tcttctctttcagcacttgcaaaacaattctcaaatgctcggcatgttcctcctcagacttagagtatatcaggatatcatctataaacacaacaacaaa 27430  T
Q  244 ccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgacca 343  Q
     ||||| | | | | ||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||    |||||||| |  ||     
T  27429 acgatctagataagtatgaaaaatacgattcatatattccacaaatactcccggcgcattagtaacaccgaaaggcatcacagaatattcataatttccg 27330  T
Q  344 taacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcaccca 443  Q
    |||||  | || ||  |  ||||||| || ||||||||||| | ||| ||| ||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||    
T  27329 taacgtatcctaaagtccatcttctgaatgtcctcatctttcagtttgatccggtgatagcccgatcttaagtcaattttactgaacacacgtgcaccca 27230  T
Q  444 ctaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  27229 ctaactgatacatcaaatcattgatcctcggaagtggatacctattctt 27181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2233 - 1900
Alignment:
Q  41 actttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaa 140  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||   || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||  |    
T  2233 actttagacgaatctaccgcaataccactaccagaaataacatgaccaagaaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaacttggcattta 2134  T
Q  141 gtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccac 240  Q
      |||||||| |||| |||||| || |||||||||| ||| ||  |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||     
T  2133 acttcttctccttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcaacatgttcttcttgagacttagagtatatcaaaatatcatcaatgaacacaaccat 2034  T
Q  241 gaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtga 340  Q
    ||| ||||| ||| | ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||||| ||| |||   ||||| || ||     
T  2033 gaagcgatctaaatacgcatgaaaaatacgattcatgtactccataaacacacccggcgcattagtaacaccgaaagccatcactgcatattcgtaatgt 1934  T
Q  341 ccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatat 374  Q
    |||||||| || || || || |||||||||||||    
T  1933 ccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatat 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 1245 - 782
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| | ||| || || |||||||||||| | ||| |||    
T  1245 ggagtctcccattgtgataccgcatcaactttcgatggatctactgcaataccactaccagaaataatatgacccagaaaactcacttcacttaaccaga 1146  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| |   |||| |||||||| ||||| || |||||  ||||||| || ||||| || |||||| ||||||| || ||    
T  1145 actcacattttgacaactttgcatacaacctcttttctttcaaaacttgcaacacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttggaatagat 1046  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     ||||||||||| || || ||||| || ||   ||||| |||  ||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||    
T  1045 taaaatatcgtcaatgaatacaacaacaaatttatccagaaaatcatggaaaatttggttcatatactccataaacacaccaggcgcgttagtaacaccg 946  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || ||||    
T  945 aaaggcatcactttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatggtaaccagacctca 846  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaag 477  Q
    | |||||||| || |||| || | ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  845 agtcaatcttact-aaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaag 782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 9867 - 9394
Alignment:
Q  15 gagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaa 114  Q
    |||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| || || |||||| | ||| ||||    
T  9867 gagtctcccattgtgatactgcatctacttttgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaatcttacttcacttaaccagaa 9768  T
Q  115 ttcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatc 214  Q
     |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||| | ||| || ||||||||| | |  ||||||    
T  9767 ctcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaaaatttgcaacacaatcttcaaatgttctgtatgctcctcttcagtcctagcttaaatc 9668  T
Q  215 aaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccga 314  Q
    | |||||| || |||||||||||||| ||    |  |   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||    
T  9667 agaatatcatcaataaacacaaccacaaa----tttaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccga 9572  T
Q  315 aaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaa 414  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| || |||||    
T  9571 aaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaa 9472  T
Q  415 atcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
     ||||| |  |  |||||   ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  9471 gtcaatttaacaaaaaacctttgcacccactagctgatccgtcaagtcatcaatcctcagaagtggatacctgttctt 9394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20081 - 19608
Alignment:
Q  15 gagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaa 114  Q
    |||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| || || |||||| | ||| ||||    
T  20081 gagtctcccattgtgatactgcatccacttttgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaagcttacttcacttaaccagaa 19982  T
Q  115 ttcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatc 214  Q
     |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||| | ||| || ||||||||| | |  ||||||    
T  19981 ctcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaaaatttgcaacacaatcttcaaatgttctgtatgctcctcttcagtcctagcttaaatc 19882  T
Q  215 aaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccga 314  Q
    | |||||| || |||||||||||||| ||    |  |   | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||    
T  19881 agaatatcatcaataaacacaaccacaaa----tttaggtaggcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccga 19786  T
Q  315 aaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaa 414  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| || |||||    
T  19785 aaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaa 19686  T
Q  415 atcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
     ||||| |  |  |||||   ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  19685 gtcaatttaacaaaaaacctttgcacccactagctgatccgtcaagtcatcaatcctcagaagtggatacctgttctt 19608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 412 - 42
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| |||||||||  ||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| | ||| |||    
T  412 ggagtctcccattgtgatactgcttcaacctttgaaggatccactgcaataccacttccagaaataatatggccaaggaaacttacttcacttaaccaga 313  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||| ||||| ||||| || ||  | || || ||    
T  312 actcacacttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaacacaattctcagatgttctgcatgctcttcctccgttgtcgaatagat 213  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    |||||| || || ||  |||| ||||| ||   ||||| | | ||||| || || | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  212 caaaatgtcatcaatgtacactaccacaaatttatccagataagcatgaaaaattctattcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccg 113  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttt 384  Q
    |||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||||||||    
T  112 aaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatgtcttcatcttt 42  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 492
Target Start/End: Original strand, 20744 - 21222
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||   || ||||| | ||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  20744 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgaagggtccactgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaga 20843  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| | || ||||| || ||| || |||||||||| ||||| ||||| ||| |  | || || ||    
T  20844 actcacacttcgacaatttggcatacaacttcttctctatgaatacttgcaatacagtcctcagatgttctgcatgctcttcctcatttctagaatagat 20943  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    |||||| || || || || || ||||| ||   |||||   | ||||| || || |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  20944 caaaatgtcatcaatgaataccaccacaaatttatccaggtaggcatgaaaaattctgttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccg 21043  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 413  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||  || ||||| || ||||    
T  21044 aaaagcatcaccttatattcgtagtgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatgtcctcatctttcaccttaatctaatggtaacctgacctca 21143  T
Q  414 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | ||||| || || ||||    |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  21144 agtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactggtccatcaagtcatcaattctcggaagcggatatctgttctt 21222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 24906 - 25087
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||   || ||||| | ||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  24906 ggagtctcccattgtgatactgcatcaacttttgaagggtccactgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaga 25005  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttc 195  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| | || ||||| || ||| || |||||||||| ||||| |||||    
T  25006 actcacacttcgacaatttggcatacaacttcttctctatgaatacttgcaatacagtcctcagatgttctgcatgctcttc 25087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 483
Target Start/End: Original strand, 925 - 1316
Alignment:
Q  92 aaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgtt 191  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||  || ||||| | | |||| |||||||| ||||| || |||||  ||||||| || ||||| |    
T  925 aaactcacttcacttaactagaactcacattttgacagctttgcatacaatctcttttctttcaaaacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgct 1024  T
Q  192 cttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacac 291  Q
    | |||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||    |||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  1025 cctcttcattcttagaataaattaaaatatcatcaataaatacaacaacaaatttgtccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacac 1124  T
Q  292 tccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttacttta 391  Q
     ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| ||||||||||| || || |||    
T  1125 accaggcgcgttagtaacaccgaaaggcattactttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgaatatcctcatccttcacctta 1224  T
Q  392 atctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgt-gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggata 483  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || ||||| || |||| || | ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  1225 atctgatggtaaccagacctcaagtcgatcttact-aaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagcggata 1316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 395 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 11189 - 11086
Alignment:
Q  395 tggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttga 494  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  11189 tggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacatgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctgttcttaa 11090  T
Q  495 tagt 498  Q
    ||||    
T  11089 tagt 11086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 362 - 492
Target Start/End: Original strand, 11201 - 11331
Alignment:
Q  362 gtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaat 461  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  11201 gtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaat 11300  T
Q  462 catcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11301 cgtcaattctcggaagtggatacctattctt 11331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 271 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 741 - 520
Alignment:
Q  271 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgc 370  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || |||||||||    
T  741 attcatatactccatgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgc 642  T
Q  371 atatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 470  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |  || |||||||| ||||| |||||||| || ||||||  |||||| || |||||||||||||  || ||| |||    
T  641 atatcttcatctttcactttaatttcatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaacttttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcagttc 542  T
Q  471 tcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||| ||||| || |||||    
T  541 tcggaagcggatatctgttctt 520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 492
Target Start/End: Original strand, 28909 - 29305
Alignment:
Q  95 ctcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttctt 194  Q
    ||||||||| | ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| |   |||| |||||||| ||||| || |||||  |||| || || ||||| |||     
T  28909 ctcacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttcgcatacaacctcttttctttcaaaacttgcaacacaattctcaggtgctctgcatgctct- 29007  T
Q  195 cttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactcc 294  Q
    ||||| |||| || || || || ||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| ||||||||| ||    
T  29008 cttcattcttagaatagattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattaggttcatatactacataaacacacc 29107  T
Q  295 aggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatc 394  Q
    ||| || || || |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| || || || || ||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  29108 aggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccatcttctgcatatcctcatccttcacttttatc 29207  T
Q  395 tggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || || |||||  | ||||| |||||||| |||||||  |  ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  29208 tgatggtaaccaaacctcaagtcaatcttactgaaaatcctagcaccaaccaattgatccatcaaatcgtcaattctcggaagcggatacctgttctt 29305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 297
Target Start/End: Original strand, 895 - 1172
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| |  |||||||||   || ||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  895 tcccattgtgatactgcatcaacttttgatggatcaattgcaataccactaccagaaataatatggccaagaaaacttacttcatttaactagaactcac 994  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    | || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||    
T  995 attttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatattcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcaagat 1094  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccagg 297  Q
     || || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||    
T  1095 gtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctgttcatatactccataaacacaccagg 1172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 10294 - 9831
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| |||| ||| || || |||||||  || ||||| | ||||||||||||||| |||||| | ||| | || ||||    
T  10294 tcccattgtgataccgcatcaacttttgacgaatcaactgctataccattaccagaaataatatggccaaggaaacttacttcacttaaccaaaactcac 10195  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 219  Q
    | || |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| ||  |||| |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || ||    
T  10194 attttgacaatttggcatacaacttcttttctttcaaaacacgtaacacaatcctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaattaacat 10095  T
Q  220 atcgtcgataaacacaaccacgaac----------cgat-----ccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattg 304  Q
    ||| || ||||| || ||||||||           |||      ||| ||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||     
T  10094 atcatcaataaataccaccacgaatttaaccagaacgaatttaaccagaaaagcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacacctggcgcatta 9995  T
Q  305 gtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataac 404  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  9994 gtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaac 9895  T
Q  405 ccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaat 468  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  9894 ctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcacccaccaactggtccatcaagtcatcaat 9831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 308 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18600 - 18416
Alignment:
Q  308 acaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccg 407  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| |    
T  18600 acaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgttctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctg 18501  T
Q  408 atctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    | ||||| || ||||| || ||||||  ||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  18500 acctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcacccaccaattggtccatcaagtcatcaatcctcggatgtggatacctgttctt 18416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 5838 - 5782
Alignment:
Q  436 tgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5838 tgcacccaccaactggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctt 5782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 1219 - 1521
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || ||||| || ||||  ||||| |||||||  || ||||| | ||||||||||||||| |||||| | ||| | |    
T  1219 ggagtctcccattgcgataccgtatcaacttttgatggattaacagctataccattaccagaaataatatggccaaggaaacttacttcacttaaccaaa 1318  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | || || || |||||||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  1319 actcgcattttgacaatttagcatacaacttcttttctttcaaaacctgtaatacaatcctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaat 1418  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |||||||| || || || || ||||||||   ||||| ||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||    
T  1419 taaaatatcatcaatgaatactaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccg 1518  T
Q  314 aaa 316  Q
    |||    
T  1519 aaa 1521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12641 - 12349
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    ||||| || |||||||||||| |  || |||| | |||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||    
T  12641 tggcccagaaaactcacttcactttaccagaacttacactttgacaacttagcatacaactttttctctttcaataattgcaacacaatcttcagatgtt 12542  T
Q  183 ccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 282  Q
    | ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||  || ||||| |||||||| ||    |||||  | |||||||| || || ||| |||||||    
T  12541 ctgcatgctcttcttcagtctttgaatagatcagaatattatcaataaatacaaccacaaatttttccaagtaagcatggaaaattcggttcgtatactc 12442  T
Q  283 cataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatc 375  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||  | || || || || ||||||||||||||    
T  12441 catgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatattgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatc 12349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 492
Target Start/End: Original strand, 33974 - 34458
Alignment:
Q  8 gacgtaggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattca 107  Q
    |||||||||| |||||||||| | || || || || |||||||||||||||| ||||||| |    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||    
T  33974 gacgtaggagaatcccattgcaacaccgcatcaaccttagacggatccacagaaataccacccttagaaatcacatgaccaaggaaacttacttcctcca 34073  T
Q  108 actagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttgga 207  Q
    || | ||||||||||||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||| || ||||| ||||| |||| ||| ||    
T  34074 accaaaattcacacttagacaactttgcacataactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttcctcagacttcga 34173  T
Q  208 gtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtc 307  Q
     || | ||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| | | | ||| || || | ||||||||||||||| || || || || |||||||      
T  34174 atacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctattcatatactccatgaagacacctggcgcattggat 34273  T
Q  308 acaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccg 407  Q
    || || || ||||| ||    || |||||||| ||||| | |||||  || || || ||  | ||||| ||  | |||||| ||||||| ||||| || |    
T  34274 actccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcgaaacgcggttttgggtatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctg 34373  T
Q  408 atctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||||||| || || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  34374 atctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccgaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtgcataccgattctt 34458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16560 - 16229
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||||   || ||||| |  |||||||| ||||| |||||| | ||| |||    
T  16560 ggagtctcccattgtgatactgcatcaactttcgatggatcaactgcaataccactaccagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaga 16461  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| || ||||| | ||| || || ||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||| || |||||    
T  16460 actcacacttcgacaacttagcatacaacttcttttccttcaatatttgcaatactatcttcagatgttctacatgcactttttcagtctttgaataaat 16361  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    || |||||| || |||||||||||||||||   |||||   | |||||||| || || ||||||||||| |  ||||| ||||| || || || ||||||    
T  16360 cagaatatcatcaataaacacaaccacgaatttatccaggtaagcatggaaaattcggttcatatactctaggaacacaccaggcgcgttagtaacaccg 16261  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccata 345  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  16260 aaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccata 16229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 321
Target Start/End: Original strand, 44678 - 44985
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || ||||||||||  || ||||| |  || || || |||||||||||| | ||| |||    
T  44678 ggagtctcccattgtgatactgcatcaactttcgatggatcaactgcaataccattaccagaaataatgtgacctagaaaactcacttcacttaaccaga 44777  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||  |||||||| |   |||| || ||||||||||| || | |||  |||||||||  ||||| || |||||| ||||||| |||||    
T  44778 actcacattttgacagcttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatataattctcagatgttttgcatgctcctcttcattcttggaataaat 44877  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
    ||| || || || |||||||||||||| ||   ||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  44878 caagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacactccaggcgcattagtaacaccg 44977  T
Q  314 aaaggcat 321  Q
    ||||||||    
T  44978 aaaggcat 44985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 180
Target Start/End: Original strand, 9217 - 9286
Alignment:
Q  111 agaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatg 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9217 agaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatg 9286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 88
Target Start/End: Original strand, 9169 - 9217
Alignment:
Q  40 gactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggcca 88  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||||    
T  9169 gactttagacggatccactgcaataccatcaccagaaataacatcgcca 9217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 162
Target Start/End: Original strand, 3827 - 3969
Alignment:
Q  20 tcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcac 119  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||   ||  |||| ||||| | ||| ||||| ||||| || ||| |||||||||    
T  3827 tcccattgcgatagtgcttcaactttagacggatctactgcaataccactaccaaaaataacatgtctaagaaaacttacttcttttaaccagaattcac 3926  T
Q  120 acttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttg 162  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3927 acatagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttg 3969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 492
Target Start/End: Original strand, 25349 - 25767
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  25349 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcc 25448  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 273  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| | | | ||| || || | |||    
T  25449 tcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctatt 25548  T
Q  274 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 373  Q
    ||| || |||||||| || || |||||||| |  || || || ||||| ||    || |||||||| ||||| | ||||| ||| || || ||    |||    
T  25549 catgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatata 25648  T
Q  374 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 473  Q
    || ||  | |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  25649 tcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttg 25748  T
Q  474 gaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  25749 gaagtggataccgattctt 25767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 492
Target Start/End: Original strand, 14863 - 15281
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  14863 gaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcc 14962  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 273  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || || ||||| ||||| || || |||| | | | ||| || || | |||    
T  14963 tcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctatt 15062  T
Q  274 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 373  Q
    ||| || |||||||| || || |||||||| |  || || || ||||| ||    || |||||||| ||||| | ||||| ||| || || ||    |||    
T  15063 catgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatata 15162  T
Q  374 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 473  Q
    || ||  | |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  15163 tcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttg 15262  T
Q  474 gaagtggatacctattctt 492  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  15263 gaagtggataccgattctt 15281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 390 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 11209 - 11107
Alignment:
Q  390 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 489  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||   || ||| || |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  11209 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactgaacacctctgaaccaaccagttgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 11110  T
Q  490 ctt 492  Q
    |||    
T  11109 ctt 11107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15124 - 14790
Alignment:
Q  14 ggagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||||   || ||||| |  || || || || ||||||||| | |||||||    
T  15124 ggagtctcccattgtgataccgcatcaacctttgaaggatccactgcaataccactaccagaaataatgtgacccagaaagctcacttcacttaactaga 15025  T
Q  114 attcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaat 213  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| |   |||| || ||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| || ||    
T  15024 actcacatttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagat 14925  T
Q  214 caaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccg 313  Q
     |||||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||||    
T  14924 taaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaagattagattcatgtactccataaaaacaccaggcgcgttagtaacaccg 14825  T
Q  314 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacg 348  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  14824 aaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacg 14790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 686 - 416
Alignment:
Q  15 gagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaa 114  Q
    |||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || |||||||||   ||  |||| |  |||||||| |||||||||||| | ||| ||||    
T  686 gagtgtcccattgtgatactgcatcaacttttgacggatcaactgcaataccactaccataaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaa 587  T
Q  115 ttcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatc 214  Q
     |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| |  || || ||||||||||||||||| | ||| | |||||||||| | || || |||    
T  586 ctcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaaaatctgcaacacaatcttcagatgttctgaatgctattcttcagtccttgaatagatc 487  T
Q  215 aaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccat 285  Q
    | ||| || || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || || ||||||||||||||    
T  486 agaatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcggttcatatactccat 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 6427 - 6078
Alignment:
Q  143 ttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacga 242  Q
    ||||| |||||||| || || || |||||  |||||||||| ||||| || |||||| ||||||| || || |||||||| || ||||| || |||| ||    
T  6427 ttcttttctttcaaaacgtgcaatacaattctcagatgttctgcatgctcctcttcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaataccaccatga 6328  T
Q  243 accgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgacc 342  Q
    |   |||||  || |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||| | || || || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  6327 atttatccaggaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccatgcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgacc 6228  T
Q  343 ataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcaccc 442  Q
    ||  || || || || || ||||||||||| || ||||| ||  | || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| || ||||    ||||||     
T  6227 atttcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatgtcttcatccttcccctttatctgatggtaaccagacctcaagtcgatcttactaaaaatctttgcacca 6128  T
Q  443 actaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  6127 accaactgatccatcaagtcgtcaatcctcagaagcggatacctgttctt 6078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 7063 - 6939
Alignment:
Q  15 gagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaa 114  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||  || ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| || ||| ||||    
T  7063 gagtctcccattgcgatacagcatcaactttagacggatctactgcaataccattgccagaaataacatgtccaagaaaaattacttcttttaaccagaa 6964  T
Q  115 ttcacacttagacaatttagcataa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6963 ttcacacttagacaatttagcataa 6939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 650 - 380
Alignment:
Q  15 gagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaa 114  Q
    |||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || |||||||||   ||  |||| |  |||||||| |||||||||||| | ||| ||||    
T  650 gagtgtcccattgtgatactgcatcaacttttgacggatcaactgcaataccactaccataaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaa 551  T
Q  115 ttcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatc 214  Q
     |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| |  || || ||||||||||||||||| | ||| | |||||||||| | || || |||    
T  550 ctcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaaaatctgcaacacaatcttcagatgttctgaatgctattcttcagtccttgaatagatc 451  T
Q  215 aaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccat 285  Q
    | ||| || || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || || ||||||||||||||    
T  450 agaatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcggttcatatactccat 380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 4970 - 4700
Alignment:
Q  15 gagtatcccattgcgatacagcttcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaa 114  Q
    |||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || |||||||||   ||  |||| |  |||||||| |||||||||||| | ||| ||||    
T  4970 gagtgtcccattgtgatactgcatcaacttttgacggatcaactgcaataccactaccataaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaa 4871  T
Q  115 ttcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatc 214  Q
     |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| |  || || ||||||||||||||||| | ||| | |||||||||| | || || |||    
T  4870 ctcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaaaatctgcaacacaatcttcagatgttctgaatgctattcttcagtccttgaatagatc 4771  T
Q  215 aaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccat 285  Q
    | ||| || || |||||||||||||| ||   ||||| | | |||||||| || || ||||||||||||||    
T  4770 agaatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcggttcatatactccat 4700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34096 - 33914
Alignment:
Q  82 atggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgt 181  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | ||| |||||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| || || |||||||| || | |||||| | |||     
T  34096 atggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacatcttcttttcctttaacacttgcaacataatctttaaatgc 33997  T
Q  182 tccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaa 264  Q
    || ||||| |||||||||| | | || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  33996 tctgcatgctcttcttcagacctagaataaatcaaaatgtcatcaataaatacaaccacgaaccaatccaaataagcatggaa 33914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 12335 - 12283
Alignment:
Q  446 aactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12335 aactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 12283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 383 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 1926 - 1819
Alignment:
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    |||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||   |||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1926 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttgctaaacacctctgcaccaaccaactgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 1827  T
Q  483 acctattc 490  Q
    ||| ||||    
T  1826 accgattc 1819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 2256 - 2171
Alignment:
Q  44 ttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaa 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |    ||||| ||||| |||||||||||||||||   |||| | || ||||||||||||||    
T  2256 ttagacggatccacagaaataccacccttagaaatcacatgaccaaggaaactcacttcccgcaaccaaaactcacacttagacaa 2171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 981 - 879
Alignment:
Q  390 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 489  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||  |||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  981 taatctgatgatatcccgatctcaaatcaatcttactaaacacttctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagcggataccgatt 882  T
Q  490 ctt 492  Q
    |||    
T  881 ctt 879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1297 - 1132
Alignment:
Q  74 gaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 173  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||  | |||||| || |||||||| |||||||||||| | | ||  ||||| ||||| ||||| || ||||||     
T  1297 gaaatcacatgacaaaggaaactcactttctgcaactaaaactcacacttcgacaatttagcacataattggttctccttcaagacttgcaacacaatcc 1198  T
Q  174 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaacca 239  Q
    ||| ||| || ||||| || || |||| ||| || || | ||||||||| || |||||||| ||||    
T  1197 tcaaatgctcagcatgctcctcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctataaacaccacca 1132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 492
Target Start/End: Original strand, 178 - 584
Alignment:
Q  86 ccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccg 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || |||||| | |  |  ||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||| || |    
T  178 ccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagaaaacttagcacataactggttctctttcaaaacttgcaacacaatcctcaaatgctcag 277  T
Q  186 catgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccat 285  Q
    |||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || |||||||| ||||| || || |||| | | | ||| || || | |||||| || |||||    
T  278 catgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctataaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctattcatgtattccat 377  T
Q  286 aaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatctttt 385  Q
    ||| || || || ||||| |  || || || | ||| ||    || |||||||| ||||| | ||||| ||| || || ||    ||||| ||  | |||    
T  378 aaaaacacctggcgcattagatactccaaatgacatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcggttttggatatatcttccgccttt 477  T
Q  386 actttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 485  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| || | | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  478 actctaatctggtgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagcagatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacc 577  T
Q  486 tattctt 492  Q
     ||||||    
T  578 gattctt 584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 492
Target Start/End: Original strand, 7120 - 7526
Alignment:
Q  86 ccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccg 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||| || |    
T  7120 ccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttagcacataactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcag 7219  T
Q  186 catgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccat 285  Q
    |||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || |||||||| ||||| || || |||| | | | ||| || || | |||||| || |||||    
T  7220 catgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctataaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctattcatgtattccat 7319  T
Q  286 aaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatctttt 385  Q
    ||| || || || ||||| |  || || || | ||| ||    || |||||||| ||||| | ||||| ||| || || ||    ||||| ||  | |||    
T  7320 aaaaacacctggcgcattagatactccaaatgacatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcggttttggatatatcttccgccttt 7419  T
Q  386 actttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacc 485  Q
    ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| || | ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  7420 actctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctatgcaccaaccagctgatccatcatatcatcaatccttggaagtggatacc 7519  T
Q  486 tattctt 492  Q
     ||||||    
T  7520 gattctt 7526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 398 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 1979 - 1885
Alignment:
Q  398 tgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || |||  |||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  1979 tgatatcccgatctcaaatcaatcttactaaacacttctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattctt 1885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 498
Target Start/End: Original strand, 26651 - 26706
Alignment:
Q  443 actaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 498  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  26651 actaactgatccatcaaataatcaatcctcggaagcggataccaattctttatagt 26706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2302 - 2137
Alignment:
Q  75 aaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatctt 174  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| || || || | |||| |    
T  2302 aaatcacatgaccaaggaaactcacttcctccaaccaaaactcacacttagacaacttagcacataactggttctctttcaagacctgcaacataatcct 2203  T
Q  175 cagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccac 240  Q
    || ||| || ||||| ||||| |||| ||| || || | ||||||||| || || ||||| |||||    
T  2202 caaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctattaacaccaccac 2137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 492
Target Start/End: Original strand, 16337 - 16431
Alignment:
Q  398 tgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || || |||   ||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16337 tgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttccgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggataccgattctt 16431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 383 - 485
Target Start/End: Original strand, 7008 - 7110
Alignment:
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7008 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctctgaagtggat 7107  T
Q  483 acc 485  Q
    |||    
T  7108 acc 7110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 390 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 838 - 736
Alignment:
Q  390 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 489  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || | |   ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||    
T  838 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacatttccgcaccaaccaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaatcggataccgatt 739  T
Q  490 ctt 492  Q
    |||    
T  738 ctt 736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 390 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 13660 - 13566
Alignment:
Q  390 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatac 484  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13660 taatctgatgatatcctgatctcaattcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatac 13566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 410 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 9969 - 9887
Alignment:
Q  410 ctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||| |||||||| || || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9969 ctcaagtcaatcttactaaacacacgagcacccactaagtgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctt 9887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 410 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 17636 - 17554
Alignment:
Q  410 ctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||| |||||||| || || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17636 ctcaagtcaatcttactaaacacacgagcacccactaagtgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctt 17554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 390 - 492
Target Start/End: Original strand, 89771 - 89873
Alignment:
Q  390 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 489  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || |||   ||||| || | ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  89771 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttccgcaccaaccagctgatccatgaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 89870  T
Q  490 ctt 492  Q
    |||    
T  89871 ctt 89873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 7133 - 7231
Alignment:
Q  38 tcgactttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagca 136  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||| |    ||||| ||||| || |||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||| ||||||    
T  7133 tcgaccttagacggatccacataaataccacccttagaaatcacatgacccaggaaactcacttcctgcaaccaaaactcacacttagacaacttagca 7231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 189
Target Start/End: Original strand, 195204 - 195310
Alignment:
Q  83 tggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgtt 182  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||| |||||||| |  || ||||||||||  ||||| || |||||| |||||||||    
T  195204 tggccaagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcgacaacttagcatacaactttttctctttcagtacttgcaatacaatcctcagatgtt 195303  T
Q  183 ccgcatg 189  Q
    | |||||    
T  195304 ctgcatg 195310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 1635 - 1554
Alignment:
Q  411 tcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||| || || ||   |||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  1635 tcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccaactgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattctt 1554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 383 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 7282 - 7173
Alignment:
Q  383 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 482  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || ||   |||||| || | ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  7282 tttactctaatctgatgatatcctgatcttaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcataaatccttggaagcggat 7183  T
Q  483 acctattctt 492  Q
    ||| ||||||    
T  7182 accgattctt 7173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1486 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1486
Description:

Target: scaffold1486; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Original strand, 99 - 191
Alignment:
Q  44 ttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagca 136  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||   ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||||    
T  99 ttagaaggatccacataaataccacctttagaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagataacttagca 191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 7310 - 7218
Alignment:
Q  44 ttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagca 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |    ||||| | ||| ||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||| ||||||    
T  7310 ttagacggatccacagaaataccacccttagaaatcatatgaccaaggaaactcacttcctgcaaccaaaactcacacttagacaacttagca 7218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 446 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 4905 - 4859
Alignment:
Q  446 aactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||    
T  4905 aactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagcagataccgattctt 4859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Original strand, 2189 - 2281
Alignment:
Q  44 ttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagca 136  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||    
T  2189 ttagaaggatccacagaaataccacccttagaaataacatgaccaagaaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttagca 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 7032 - 6938
Alignment:
Q  398 tgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || || |||   ||||| || | || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  7032 tgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttccgcaccaaccagctaatccatcaaaccatcaatcctcggaagcggataccgattctt 6938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Original strand, 2267 - 2311
Alignment:
Q  448 ctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 492  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  2267 ctgatccatcaaatcatcaatccttgggagtggataccgattctt 2311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13205 - 13113
Alignment:
Q  44 ttagacggatccacagcaataccatctccggaaatgacatggccaaggaaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagca 136  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |    ||||| ||||| |||||||||||||||||   |||| | || |||||||||||||| ||||||    
T  13205 ttagaaggatccacagaaataccaccctaagaaatcacatgaccaaggaaactcacttcccgcaaccaaaactcacacttagacaacttagca 13113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9116 - 8920
Alignment:
Q  92 aaactcacttcattcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgttccgcatgtt 191  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| ||||| || || || |||||||| |   |||| || ||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||| |    
T  9116 aaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgct 9017  T
Q  192 cttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaa 288  Q
    | || ||| ||||||| || || || ||||| || |||||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||    
T  9016 cctcctcattcttggaatatattaatatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaatttggttcatgtactccataaa 8920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University