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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10350_low_1 (Length: 1216)

Name: NF10350_low_1
Description: NF10350
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10350_low_1
NF10350_low_1
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (12-1202)||(43365300-43366494)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 1137; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 1137; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 1202
Target Start/End: Original strand, 43365300 - 43366494
Alignment:
Q  12 catcaacacaacaataactagcatgttggacacctaacttacaatgttggaaccacaaattttattaataaaattgaggcacacaattttgatgaaagct 111  Q
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T  43365300 catcaacacaacaataactagcatgttggacacctaacttacaatgttggaaccacaaattttattaataaaattgaggcacacaattttgatgaaagct 43365399  T
Q  112 tccaattagggacctttaatgaaacacttacacgtttcttgatcagcactggtaaaacacgaccctcgtagcatttgggggtgcatttccttggaacacg 211  Q
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T  43365400 tccaattagggacctttaattaaacacttacacgtttcttgatcagcactggtaaaacacgaccctcgtagcatttgggggtgcatttccttggaacacg 43365499  T
Q  212 cactgtatatggagtcgcaaatttctctcccatatttggtagttgctttacaactcttatgtcattccggagggatgttataaaccaatcggcatcaaat 311  Q
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T  43365500 cactgtatatggagtcgcaaatttctctcccatatttggtagttgctttacaactcttatgtcattccggagggatgttataaaccaatcggcatcaaat 43365599  T
Q  312 aattgagaaaaattgctgcaagaaaataataatcaaatattacttacaaattaaggggtacaatgaaaatgtgttctgctaccaaagaaaatattatatg 411  Q
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T  43365600 aattgagaaaaattgctgcaagaaaataataatcaaatattacttacaaattaaggggtacaatgaaaatgtgttctgctaccaaagaaaatattatatg 43365699  T
Q  412 tgatttaagagacattcttcctgatatgatagaagtaaattgtaaacacagacctgttgtctttccagaaagatgtatgatccaatgctggaataacaag 511  Q
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T  43365700 tgatttaagagacattcttcctgatatgatagaagtaaattgtaaacacagacctgttgtctttccagaaagatgtatgatccaatgctggaataacaag 43365799  T
Q  512 agtagcattcaaaagataggcagccacaacagcatcaattatctgcacccacaaacaatctgtattttttcaataccagaaatattgcatccacataaca 611  Q
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T  43365800 agtagcattcaaaagataggcagccacaacagcatcaattatctgcacccacaaacaatctgtattttttcaataccagaaatattgcatccacataaca 43365899  T
Q  612 ttatttatcattcatatttgtatcaccaatcattcatcaaattcgattgagaaaatcctaattgagnnnnnnnagccgaacggcacatacaaaatctgta 711  Q
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T  43365900 ttatttatcattcatatttgtatcaccaatcattcatcaaattcgattgagaaaatcctaattgagtttttttagccgaacggcacatacaaaatctgta 43365999  T
Q  712 tatcaatcaccaatttgtgcagacctataattattgggtagaaatttcatcctatacttttttgcaaatgaccacggtcccactctatgaaataaagtta 811  Q
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T  43366000 tatcgatcaccaatttgtgcagacctataattattgggtagaaatttcatcctatacttttttgcaaatgaccagggtcccactctatgaaataaagtta 43366099  T
Q  812 tagcatattacatattacatgttttagattgcagcatagttatattagtactcagaatgcaattatgtctactaatgaaatggaagaactattcatgctt 911  Q
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T  43366100 tagcatattacatattacatgttttagattgcagcatagttatattagtactcagaatgcaattatgtctactaatgaaatggaagaactattcatgctt 43366199  T
Q  912 aaataaaacaatttggttacataaagaaagatatacatattccaagtaatactttaacctcactgaactccttccttta----tatttatttgatcaaaa 1007  Q
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T  43366200 aaataaaaaaaattggttacataaagaaagatatacatattccaagtaatactttaacctcactgaactccttcctttatatttatttatttgatcaaaa 43366299  T
Q  1008 ggattgcaaaaacaaacaaatgccacagttcattaataaagaagcttagcttacccctgttctctgttgatttaagcctccactggttgcgattaacaag 1107  Q
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T  43366300 ggattgcaaaaacaaacaaatgccacagttcattaataaagaagcttagcttacccctgttctctgttgatttaagcctccactggttgcgattaacaag 43366399  T
Q  1108 tatcggtccggatgagttttgctattagcctctgcaacaattagaaatataaataaatacactcaatcaaaattaaattgatgagatgaaaaaag 1202  Q
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T  43366400 tatcggtccggatgagttttgctattagcctctgcaacaattagaaatataaataaatacactcaatcaaaattaaattgatgagatgaaaaaag 43366494  T

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