View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10365_high_13 (Length: 359)

Name: NF10365_high_13
Description: NF10365
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10365_high_13
NF10365_high_13
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (115-359)||(25175571-25175815)
chr6 (115-359)||(27653983-27654227)
chr6 (115-359)||(16825752-16825998)
chr6 (28-356)||(23153458-23153787)
chr6 (30-356)||(14626045-14626370)
chr6 (24-356)||(1650016-1650345)
chr6 (103-356)||(1657748-1657999)
chr6 (103-356)||(35009439-35009691)
chr6 (103-356)||(15862484-15862734)
chr6 (28-98)||(23148266-23148336)
chr6 (103-299)||(29665941-29666137)
chr6 (103-188)||(27751603-27751688)
chr6 (26-61)||(23995247-23995282)
chr6 (28-61)||(18002394-18002427)
chr6 (28-61)||(26090059-26090092)
chr6 (119-203)||(29605612-29605696)
chr6 (30-61)||(4991396-4991427)
chr6 (28-59)||(15742119-15742150)
chr6 (26-61)||(27751742-27751777)
chr6 (26-61)||(32276656-32276691)
chr6 (27-61)||(1657659-1657693)
chr6 (27-61)||(15862789-15862823)
chr6 (28-61)||(18823282-18823315)
chr6 (28-61)||(18839137-18839170)
chr6 (29-61)||(19983192-19983224)
chr6 (29-61)||(35015057-35015089)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (115-359)||(25426636-25426880)
chr5 (115-359)||(12382-12626)
chr5 (115-359)||(22366481-22366725)
chr5 (140-359)||(18778017-18778236)
chr5 (115-359)||(19499907-19500151)
chr5 (115-359)||(21073595-21073839)
chr5 (26-356)||(23506976-23507305)
chr5 (140-359)||(43443420-43443639)
chr5 (28-356)||(27182470-27182799)
chr5 (140-357)||(4200010-4200227)
chr5 (140-359)||(27009849-27010068)
chr5 (26-356)||(22053750-22054085)
chr5 (26-356)||(18530985-18531319)
chr5 (103-356)||(34939289-34939540)
chr5 (115-315)||(29188284-29188483)
chr5 (103-250)||(20623085-20623232)
chr5 (103-250)||(21233528-21233675)
chr5 (105-249)||(25900408-25900552)
chr5 (103-250)||(16536313-16536460)
chr5 (103-250)||(37052860-37053007)
chr5 (24-61)||(20623286-20623323)
chr5 (24-61)||(21233437-21233474)
chr5 (24-61)||(25900315-25900352)
chr5 (24-61)||(37053061-37053098)
chr5 (27-61)||(16105967-16106001)
chr5 (24-61)||(16536514-16536551)
chr5 (26-61)||(108725-108760)
chr5 (28-61)||(9730277-9730310)
chr5 (24-61)||(21651018-21651055)
chr5 (323-356)||(29190482-29190515)
chr5 (119-203)||(29918127-29918212)
chr5 (110-199)||(32950862-32950951)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (115-359)||(19886661-19886905)
chr2 (26-356)||(462749-463078)
chr2 (26-356)||(8891253-8891584)
chr2 (29-356)||(20627238-20627565)
chr2 (26-356)||(36982361-36982693)
chr2 (29-359)||(19794629-19794959)
chr2 (103-359)||(17396653-17396908)
chr2 (29-356)||(43642881-43643209)
chr2 (26-356)||(24341306-24341641)
chr2 (153-359)||(7507894-7508099)
chr2 (103-250)||(25265390-25265537)
chr2 (26-125)||(22863169-22863270)
chr2 (103-250)||(19689401-19689548)
chr2 (103-250)||(23820187-23820334)
chr2 (103-250)||(14906440-14906587)
chr2 (103-250)||(20015127-20015274)
chr2 (24-61)||(9652791-9652828)
chr2 (24-61)||(14906349-14906386)
chr2 (24-61)||(23820388-23820425)
chr2 (24-61)||(17396562-17396599)
chr2 (24-61)||(19689310-19689347)
chr2 (24-61)||(20015328-20015365)
chr2 (29-61)||(22284278-22284310)
chr2 (30-61)||(25213372-25213403)
chr2 (120-201)||(68156-68238)
chr2 (28-61)||(7507756-7507789)
chr2 (24-61)||(12641554-12641591)
chr2 (28-61)||(28031133-28031166)
chr2 (28-95)||(31146072-31146138)
chr2 (28-61)||(33128372-33128405)
chr2 (29-61)||(22275045-22275077)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (26-359)||(3505-3837)
scaffold0266 (26-356)||(1135-1465)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (115-359)||(47357662-47357906)
chr4 (26-356)||(13246441-13246772)
chr4 (29-356)||(54118168-54118496)
chr4 (26-267)||(121989-122229)
chr4 (140-359)||(10644227-10644446)
chr4 (103-359)||(13048221-13048477)
chr4 (26-356)||(15675006-15675341)
chr4 (26-299)||(10104167-10104445)
chr4 (130-356)||(31115640-31115865)
chr4 (103-359)||(26680209-26680463)
chr4 (26-166)||(33240900-33241046)
chr4 (103-250)||(10488678-10488825)
chr4 (103-250)||(16327926-16328073)
chr4 (271-356)||(111406-111491)
chr4 (26-135)||(31132545-31132660)
chr4 (119-201)||(40885570-40885652)
chr4 (24-61)||(16609008-16609045)
chr4 (24-61)||(26680517-26680554)
chr4 (26-61)||(15135904-15135939)
chr4 (26-61)||(15272208-15272243)
chr4 (27-61)||(14952085-14952119)
chr4 (24-61)||(16327835-16327872)
chr4 (21-60)||(22738577-22738616)
chr4 (120-201)||(15044992-15045074)
chr4 (26-60)||(55376491-55376525)
chr4 (28-61)||(8045272-8045305)
chr4 (28-61)||(16523146-16523179)
chr4 (22-59)||(18248527-18248564)
chr4 (21-61)||(8378493-8378533)
[»] chr3 (45 HSPs)
chr3 (27-359)||(14842485-14842816)
chr3 (24-356)||(13838905-13839237)
chr3 (115-359)||(55316227-55316471)
chr3 (26-356)||(2049821-2050150)
chr3 (26-356)||(12030070-12030399)
chr3 (115-359)||(41270083-41270327)
chr3 (140-359)||(16821147-16821366)
chr3 (103-359)||(13975722-13975977)
chr3 (103-359)||(45860813-45861068)
chr3 (93-356)||(51158008-51158270)
chr3 (66-356)||(15858986-15859276)
chr3 (103-359)||(13954890-13955145)
chr3 (110-359)||(15936634-15936882)
chr3 (29-250)||(16744041-16744262)
chr3 (110-359)||(15938476-15938724)
chr3 (24-356)||(15614845-15615174)
chr3 (26-149)||(19260746-19260869)
chr3 (103-356)||(17912483-17912733)
chr3 (29-166)||(19231981-19232121)
chr3 (103-250)||(2449238-2449385)
chr3 (24-61)||(2449147-2449184)
chr3 (24-61)||(23492696-23492733)
chr3 (24-61)||(38168237-38168274)
chr3 (119-203)||(4145814-4145898)
chr3 (26-61)||(16261777-16261812)
chr3 (26-61)||(17912395-17912430)
chr3 (26-61)||(53771365-53771400)
chr3 (22-199)||(54651625-54651803)
chr3 (24-61)||(13954799-13954836)
chr3 (28-61)||(16933868-16933901)
chr3 (24-61)||(30153265-30153302)
chr3 (24-61)||(33342204-33342241)
chr3 (24-61)||(45861122-45861159)
chr3 (29-61)||(17955884-17955916)
chr3 (26-61)||(11986077-11986112)
chr3 (26-61)||(14285289-14285324)
chr3 (29-64)||(15857163-15857198)
chr3 (26-61)||(51961028-51961063)
chr3 (110-199)||(11986173-11986262)
chr3 (119-160)||(14080715-14080756)
chr3 (28-61)||(19947026-19947059)
chr3 (29-61)||(2844514-2844546)
chr3 (29-61)||(3992873-3992905)
chr3 (29-61)||(54038024-54038056)
chr3 (29-61)||(55513193-55513225)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (26-356)||(20931356-20931685)
chr1 (29-359)||(41394230-41394559)
chr1 (26-356)||(20913048-20913370)
chr1 (140-359)||(18601143-18601362)
chr1 (115-359)||(5072388-5072632)
chr1 (28-355)||(20893550-20893877)
chr1 (26-356)||(37844371-37844703)
chr1 (26-356)||(20445690-20446022)
chr1 (26-356)||(20531455-20531786)
chr1 (153-359)||(22227817-22228022)
chr1 (153-359)||(22232514-22232719)
chr1 (140-356)||(2116265-2116481)
chr1 (24-301)||(45051489-45051763)
chr1 (103-250)||(51452608-51452755)
chr1 (24-61)||(51452809-51452846)
chr1 (30-61)||(15861327-15861358)
chr1 (29-61)||(21860334-21860366)
chr1 (29-61)||(44034871-44034903)
[»] chr8 (32 HSPs)
chr8 (26-356)||(16193640-16193968)
chr8 (26-356)||(43373389-43373720)
chr8 (115-355)||(30120734-30120974)
chr8 (177-359)||(222753-222935)
chr8 (177-359)||(736376-736558)
chr8 (177-359)||(860271-860453)
chr8 (26-356)||(24928713-24929043)
chr8 (115-359)||(16674392-16674636)
chr8 (140-355)||(21844597-21844812)
chr8 (140-355)||(21851990-21852205)
chr8 (29-356)||(16404900-16405224)
chr8 (115-356)||(6774258-6774498)
chr8 (115-356)||(24548993-24549233)
chr8 (103-356)||(17345581-17345832)
chr8 (103-359)||(22907214-22907468)
chr8 (103-250)||(5238203-5238350)
chr8 (103-250)||(24661248-24661395)
chr8 (103-250)||(43685662-43685809)
chr8 (177-239)||(691908-691970)
chr8 (24-61)||(5238404-5238441)
chr8 (24-61)||(22907123-22907160)
chr8 (24-61)||(24385647-24385684)
chr8 (24-61)||(24661157-24661194)
chr8 (24-61)||(43685863-43685900)
chr8 (29-61)||(24716762-24716794)
chr8 (28-61)||(2545265-2545298)
chr8 (28-61)||(3431175-3431208)
chr8 (28-61)||(22886654-22886687)
chr8 (29-61)||(274766-274798)
chr8 (29-61)||(641051-641083)
chr8 (29-61)||(826857-826889)
chr8 (120-160)||(38533855-38533895)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (26-359)||(5987-6318)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (27-359)||(880-1210)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (28-356)||(48609-48936)
scaffold0023 (140-359)||(36101-36320)
scaffold0023 (28-61)||(61121-61154)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (115-359)||(10989418-10989661)
chr7 (24-356)||(16211777-16212108)
chr7 (140-359)||(2437465-2437684)
chr7 (30-356)||(3059977-3060302)
chr7 (26-356)||(13036935-13037266)
chr7 (26-356)||(11580658-11580991)
chr7 (26-356)||(36052678-36053006)
chr7 (140-359)||(13911049-13911269)
chr7 (140-359)||(13572684-13572903)
chr7 (103-359)||(25292338-25292593)
chr7 (110-359)||(18253842-18254090)
chr7 (103-356)||(47481031-47481283)
chr7 (140-359)||(16478987-16479205)
chr7 (103-359)||(7293025-7293279)
chr7 (103-250)||(11516343-11516490)
chr7 (103-250)||(15441564-15441711)
chr7 (103-250)||(30262129-30262276)
chr7 (104-356)||(13321025-13321278)
chr7 (31-224)||(295893-296087)
chr7 (24-61)||(7293333-7293370)
chr7 (24-61)||(11516544-11516581)
chr7 (24-61)||(14113898-14113935)
chr7 (24-61)||(15441473-15441510)
chr7 (24-61)||(30262038-30262075)
chr7 (26-135)||(36024372-36024488)
chr7 (26-61)||(2029244-2029279)
chr7 (26-98)||(15709428-15709504)
chr7 (26-61)||(42056185-42056220)
chr7 (24-60)||(25292247-25292283)
chr7 (26-61)||(3049905-3049940)
chr7 (21-60)||(10000279-10000318)
chr7 (26-61)||(13321334-13321369)
chr7 (26-61)||(25124450-25124485)
chr7 (26-61)||(47480941-47480976)
chr7 (120-201)||(13377693-13377775)
chr7 (28-61)||(371417-371450)
chr7 (24-61)||(14423549-14423585)
chr7 (29-61)||(126738-126770)
chr7 (33-61)||(15516765-15516793)
chr7 (29-61)||(32493946-32493978)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (26-356)||(8889-9218)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (26-359)||(12123-12453)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (26-356)||(171916-172245)
scaffold0001 (26-356)||(177619-177948)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (24-352)||(26335-26663)
scaffold0162 (103-250)||(8180-8327)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (26-356)||(247363-247694)
scaffold0012 (24-61)||(34070-34107)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (39-356)||(4996-5313)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (26-356)||(41740-42069)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (140-359)||(43005-43224)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (26-356)||(128092-128420)
scaffold0008 (140-359)||(31700-31920)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (29-356)||(36837-37165)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (26-356)||(272036-272365)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (32-356)||(19217-19543)
scaffold0195 (103-356)||(21301-21553)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (110-343)||(5552-5785)
scaffold0772 (24-61)||(5846-5883)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (28-356)||(123086-123416)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (140-356)||(46-262)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (171-359)||(64584-64772)
scaffold0026 (110-359)||(107755-108003)
scaffold0026 (118-160)||(89863-89905)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (26-249)||(51105-51328)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (110-359)||(48195-48443)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (140-359)||(21141-21359)
scaffold0139 (140-359)||(14086-14304)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (77-356)||(148732-149012)
scaffold0025 (26-356)||(8860-9195)
scaffold0025 (26-124)||(146843-146941)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (26-249)||(89375-89600)
scaffold0028 (26-154)||(107705-107835)
scaffold0028 (30-61)||(130880-130911)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (153-359)||(5254-5458)
[»] scaffold0215 (4 HSPs)
scaffold0215 (140-356)||(9374-9589)
scaffold0215 (140-356)||(16272-16487)
scaffold0215 (21-61)||(9257-9297)
scaffold0215 (21-61)||(16155-16195)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (153-359)||(3730-3936)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (115-261)||(1304-1450)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (103-354)||(534-784)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (103-359)||(34460-34716)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (103-236)||(13636-13769)
scaffold0132 (26-61)||(13824-13859)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (114-356)||(2973-3215)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (140-269)||(13350-13478)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (103-356)||(41659-41911)
scaffold0125 (28-69)||(41957-41998)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (103-359)||(37066-37320)
scaffold0078 (24-61)||(36975-37012)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (103-250)||(26911-27058)
scaffold0141 (110-250)||(22656-22796)
scaffold0141 (24-61)||(22857-22894)
scaffold0141 (24-61)||(27112-27149)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (103-250)||(1582-1729)
scaffold0124 (24-61)||(1491-1528)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (261-359)||(9-107)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (261-359)||(48522-48620)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (271-356)||(9393-9478)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (103-196)||(3360-3453)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (24-61)||(873-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (24-61)||(9877-9914)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (24-61)||(108070-108107)
scaffold0032 (26-61)||(55904-55939)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (26-61)||(6440-6475)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (26-61)||(13282-13317)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (110-266)||(56106-56262)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (26-61)||(57389-57424)
scaffold0058 (119-160)||(70307-70348)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (26-72)||(18015-18061)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (24-61)||(193392-193429)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (25-61)||(17300-17336)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (29-61)||(80187-80219)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (21-60)||(12036-12075)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (119-201)||(8174-8257)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (26-61)||(34305-34340)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (26-61)||(45338-45373)
scaffold0066 (153-199)||(45198-45244)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (26-61)||(12415-12450)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (22-199)||(10249-10427)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (27-61)||(17207-17241)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (120-201)||(2317-2399)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (26-60)||(339-373)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (26-60)||(25532-25566)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (28-61)||(5475-5508)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (28-61)||(4345-4378)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (28-61)||(5549-5582)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 115 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25175815 - 25175571
Alignment:
Q  115 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 214  Q
    |||||||||||| |||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175815 tgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25175716  T
Q  215 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175715 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25175616  T
Q  315 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175615 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 25175571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 115 - 359
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654227
Alignment:
Q  115 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 214  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  215 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttga 27654182  T
Q  315 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654183 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 27654227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 115 - 359
Target Start/End: Original strand, 16825752 - 16825998
Alignment:
Q  115 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgta--taattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 212  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825752 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 16825851  T
Q  213 atgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttattt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16825852 atgataagttatgaagattgtgctaaattggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatct 16825951  T
Q  313 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16825952 gatattatgattgatgaataattgctttgttatgcatattcatggat 16825998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23153787 - 23153458
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 125  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| |||||||||    
T  23153787 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcg 23153688  T
Q  126 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 225  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  23153687 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 23153588  T
Q  226 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 325  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||| || || |||    
T  23153587 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttg 23153489  T
Q  326 atgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  23153488 atgaatcattacttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 30 - 356
Target Start/End: Original strand, 14626045 - 14626370
Alignment:
Q  30 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  14626045 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgct 14626144  T
Q  130 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 229  Q
    |   || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14626145 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaa 14626244  T
Q  230 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 329  Q
    |||||   ||  |||||| || | |||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||    
T  14626245 ttgtgtgcaattggtgaa-ttatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatga 14626343  T
Q  330 ataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  14626344 atcattgcttgggtatgcatattcatg 14626370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 356
Target Start/End: Original strand, 1650016 - 1650345
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaat 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||    
T  1650016 tcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagat 1650112  T
Q  123 tcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 222  Q
    |||| |||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  1650113 tcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagtt 1650212  T
Q  223 atgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 322  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | |||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |      
T  1650213 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttg 1650311  T
Q  323 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1650312 ttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1650345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 103 - 356
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1657999
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 302  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaat-tgagttatgattcttgttcagttgatgttatt 1657945  T
Q  303 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1657946 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 356
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009691
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 302  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||||| |  |  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 35009637  T
Q  303 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35009638 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 35009691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862484
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 302  Q
     |||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||| | | |||||||     
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaat-tgagttatgattcttgttc-atttatgttatt 15862538  T
Q  303 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
      || || ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15862537 gctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 23148336 - 23148266
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23148336 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29666137 - 29665941
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttca 201  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||| | || || |||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  29666137 atggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttca 29666038  T
Q  202 ta-tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 299  Q
     | |||||| |||||  |||||||||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  29666037 aagtatgcataaatgtcaagttatgaa-attgtactcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751603
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtga 188  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| ||| || | || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 23995282 - 23995247
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995282 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23995247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 61
Target Start/End: Original strand, 18002394 - 18002427
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002394 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 18002427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 26090092 - 26090059
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090092 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26090059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29605696 - 29605612
Alignment:
Q  119 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 203  Q
    |||||||| ||| || |||| || |||||||| |||||||||||  || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29605696 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 29605612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 4991427 - 4991396
Alignment:
Q  30 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991427 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 59
Target Start/End: Original strand, 15742119 - 15742150
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742119 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 15742150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 27751777 - 27751742
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27751777 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 27751742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Original strand, 32276656 - 32276691
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32276656 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 32276691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 61
Target Start/End: Original strand, 1657659 - 1657693
Alignment:
Q  27 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1657659 tctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 1657693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 15862823 - 15862789
Alignment:
Q  27 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15862823 tctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 15862789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 61
Target Start/End: Original strand, 18823282 - 18823315
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18823282 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18823315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 61
Target Start/End: Original strand, 18839137 - 18839170
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18839137 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18839170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 61
Target Start/End: Original strand, 19983192 - 19983224
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19983192 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 19983224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 61
Target Start/End: Original strand, 35015057 - 35015089
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35015057 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 35015089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 115 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426636
Alignment:
Q  115 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 214  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  215 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25426681  T
Q  315 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426680 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 25426636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 115 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12382
Alignment:
Q  115 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 214  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  215 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 12427  T
Q  315 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12426 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 12382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 115 - 359
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366725
Alignment:
Q  115 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 214  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  215 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 22366680  T
Q  315 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366681 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 22366725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 140 - 359
Target Start/End: Original strand, 18778017 - 18778236
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778017 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 18778116  T
Q  240 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 339  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778117 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatattatgattgatgaataattgctt 18778216  T
Q  340 gggtatgcatattcatggat 359  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18778217 gggtatgcatattcatggat 18778236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 115 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19499907
Alignment:
Q  115 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 214  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  215 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19499952  T
Q  315 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19499951 tattatgattgattaataattgctttggtatgcatattcatggat 19499907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 115 - 359
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073839
Alignment:
Q  115 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 214  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  215 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttga 21073794  T
Q  315 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073795 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 21073839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23507305 - 23506976
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  23507305 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcg 23507206  T
Q  126 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 225  Q
    | |||||  | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  23507205 tgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 23507106  T
Q  226 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 325  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  23507105 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttg 23507007  T
Q  326 atgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507006 atgaataattgcttgggtatgcatattcatg 23506976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 140 - 359
Target Start/End: Original strand, 43443420 - 43443639
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  43443420 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 43443519  T
Q  240 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 339  Q
      ||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443520 ttggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 43443619  T
Q  340 gggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  43443620 gggtttgcatattcatggat 43443639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 356
Target Start/End: Original strand, 27182470 - 27182799
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 125  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||     
T  27182470 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattca 27182569  T
Q  126 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 225  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  27182570 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 27182669  T
Q  226 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 325  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  27182670 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttg 27182768  T
Q  326 atgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27182769 atgaatcattgcttgagtatgcatattcatg 27182799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 140 - 357
Target Start/End: Original strand, 4200010 - 4200227
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4200010 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaa 4200109  T
Q  240 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 339  Q
      |||||||||||| || ||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4200110 ttggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaatgattgctt 4200209  T
Q  340 gggtatgcatattcatgg 357  Q
    |||| |||||||||||||    
T  4200210 gggtttgcatattcatgg 4200227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 140 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27010068 - 27009849
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  27010068 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtactcaa 27009969  T
Q  240 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 339  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27009968 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgctt 27009869  T
Q  340 gggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  27009868 gggtttgcatattcatggat 27009849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Original strand, 22053750 - 22054085
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgcta 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| ||||||||||    
T  22053750 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgcta 22053849  T
Q  120 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataa 219  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||    
T  22053850 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaa 22053949  T
Q  220 gttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatta 319  Q
    ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||     
T  22053950 gttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttg 22054048  T
Q  320 tgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |  ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  22054049 ttgttgatgaatcattgcttgggtctacatattcatg 22054085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Original strand, 18530985 - 18531319
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatc---atcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaat-tttgattat-ggatgattgttgctaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| || || |||| |||||||||||    
T  18530985 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcgtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaa 18531084  T
Q  121 attcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataag 220  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||    
T  18531085 attcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaag 18531184  T
Q  221 ttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattat 320  Q
    || |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |    
T  18531185 ttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgt 18531283  T
Q  321 gattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
      ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  18531284 tgttgatgaatcattgctcgggtatacatattcatg 18531319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939289
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 302  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||  |||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagtcattgtgaat-tgagttatgattcttgttcagttgatgttatt 34939343  T
Q  303 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34939342 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 115 - 315
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188483
Alignment:
Q  115 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 214  Q
    ||||| |||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  215 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 314  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 29188482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623085
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20623085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233675
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 21233675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 249
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900552
Alignment:
Q  105 ggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatat 204  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||   ||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  205 atgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatt 249  Q
    |||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt 25900552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536313
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16536313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052860
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
    |||||   |||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 37052860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 20623323 - 20623286
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623323 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 20623286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 21233437 - 21233474
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233437 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 21233474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 25900315 - 25900352
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900315 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25900352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 37053098 - 37053061
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053098 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 16106001 - 16105967
Alignment:
Q  27 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16106001 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 16536551 - 16536514
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16536551 tcatctaagataagggggttagtctttatcataatcat 16536514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Original strand, 108725 - 108760
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  108725 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 108760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 61
Target Start/End: Original strand, 9730277 - 9730310
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9730277 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 9730310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 21651055 - 21651018
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21651055 tcatctaaggtaagggggttaatatttatcataatcat 21651018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 356
Target Start/End: Original strand, 29190482 - 29190515
Alignment:
Q  323 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29190482 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 29190515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29918212 - 29918127
Alignment:
Q  119 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 203  Q
    |||||||| |||||| |||| || |||||||| || |||||| |||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  29918212 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 29918127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32950951 - 32950862
Alignment:
Q  110 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 199  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||| || || || |||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  32950951 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 32950862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 115 - 359
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886905
Alignment:
Q  115 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 214  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  215 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19886860  T
Q  315 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886861 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 19886905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 463078 - 462749
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  463078 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcg 462979  T
Q  126 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 225  Q
    | |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  462978 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 462879  T
Q  226 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 325  Q
    || |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||    
T  462878 aaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattg 462780  T
Q  326 atgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  462779 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 462749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8891584 - 8891253
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatt 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  8891584 atctaaggtaaaggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaatt 8891485  T
Q  124 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 223  Q
    ||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||     
T  8891484 cgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttg 8891385  T
Q  224 tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 323  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || |    
T  8891384 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggt 8891286  T
Q  324 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8891285 tgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 8891253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 356
Target Start/End: Original strand, 20627238 - 20627565
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgta 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  20627238 taaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaattttcaaatattgtatgaattatgattatggataattgttgttaaattcgtg 20627337  T
Q  128 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 227  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||    
T  20627338 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaa 20627437  T
Q  228 gattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 327  Q
     |||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| |||| |||||  ||||| ||| | || || |||||    
T  20627438 aattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatggttgttaattggtgttgtggttgat 20627536  T
Q  328 gaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20627537 gaatcattgcttgggtatggatattcatg 20627565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Original strand, 36982361 - 36982693
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||    
T  36982361 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaat 36982460  T
Q  123 tcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 222  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36982461 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagtt 36982560  T
Q  223 atgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 322  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | | ||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |      
T  36982561 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttg 36982659  T
Q  323 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  36982660 ttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatg 36982693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 359
Target Start/End: Original strand, 19794629 - 19794959
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| ||||| | |||||||||    
T  19794629 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtaaattt-caaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtcgttaaattcgt 19794727  T
Q  127 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 226  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  19794728 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 19794827  T
Q  227 agattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 326  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||||    |||| ||||| ||||  ||||    
T  19794828 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgttatagttga 19794926  T
Q  327 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19794927 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatggat 19794959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 103 - 359
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396908
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 302  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 17396851  T
Q  303 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17396852 aatgttatttgatattatgattaatggataattgcttgggtttgcatattcatggat 17396908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 356
Target Start/End: Original strand, 43642881 - 43643209
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 126  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||| ||    
T  43642881 taagggaaggaggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcatagtggataattgttgctaaatttgt 43642980  T
Q  127 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 226  Q
     |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||| |||    
T  43642981 gctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtga 43643080  T
Q  227 agattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 326  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | || ||||||| ||||| |||| | |||||||||||||| ||||| |||   ||||| ||||| || |  ||||    
T  43643081 aaattgtgctcaattggtgaattt-ttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttga 43643179  T
Q  327 tgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43643180 tgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 43643209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Original strand, 24341306 - 24341641
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgcta 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| ||||||||||    
T  24341306 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgcta 24341405  T
Q  120 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataa 219  Q
    ||||| | || ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||  ||    
T  24341406 aattcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaa 24341505  T
Q  220 gttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatta 319  Q
    ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||     
T  24341506 gttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttc 24341604  T
Q  320 tgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
       ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24341605 ctgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatg 24341641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 153 - 359
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508099
Alignment:
Q  153 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttct 252  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||  |||||||||      
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-g 7507992  T
Q  253 cctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 351  Q
     |||||||||||||||| |||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7507993 gctaagttgttgttaat-tgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatat 7508091  T
Q  352 tcatggat 359  Q
    ||||||||    
T  7508092 tcatggat 7508099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265537
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 25265537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 22863270 - 22863169
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  22863270 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaatt 22863171  T
Q  124 cg 125  Q
    ||    
T  22863170 cg 22863169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689548
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 19689548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820187
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 23820187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906587
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 14906587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015127
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||  || |||| | ||||||||| ||||||||||||       
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20015127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 9652791 - 9652828
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652791 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9652828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 14906349 - 14906386
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906349 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14906386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 23820425 - 23820388
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820425 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23820388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 17396562 - 17396599
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17396562 tcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 17396599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 19689310 - 19689347
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689310 tcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19689347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 20015365 - 20015328
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20015365 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcatgatcat 20015328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 22284310 - 22284278
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284310 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 25213403 - 25213372
Alignment:
Q  30 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213403 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 68238 - 68156
Alignment:
Q  120 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 201  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  68238 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 68156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 61
Target Start/End: Original strand, 7507756 - 7507789
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7507756 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 7507789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 12641554 - 12641591
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12641554 tcatctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 12641591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 61
Target Start/End: Original strand, 28031133 - 28031166
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28031133 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 28031166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Original strand, 31146072 - 31146138
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaa-tgttgtatgaat 95  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31146072 ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcatctt--ttgtgtaaattttcaaattgttgtatgaat 31146138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 33128405 - 33128372
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33128405 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 33128372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 22275077 - 22275045
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22275077 taaggtaagggggttagcctttatcataatcat 22275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Original strand, 3505 - 3837
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3505 atctaaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcg 3604  T
Q  126 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 225  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  3605 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 3704  T
Q  226 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 325  Q
    || |||||||| ||  ||| ||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||    
T  3705 aaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattg 3803  T
Q  326 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3804 aggaataattgcttgggtatgcatattgatggat 3837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1465 - 1135
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattc 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  1465 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattc 1366  T
Q  125 gtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 224  Q
    || |||||||| || || |||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  1365 gtgctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgt 1266  T
Q  225 gaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 324  Q
    ||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || ||    
T  1265 gaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggtt 1167  T
Q  325 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1166 gatgaataattgcttgggtgtgcatattcatg 1135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 115 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357662
Alignment:
Q  115 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 214  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  215 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 47357707  T
Q  315 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  47357706 tattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggat 47357662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13246772 - 13246441
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| ||||||    
T  13246772 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaatt 13246673  T
Q  124 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 223  Q
    ||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||     
T  13246672 cgtgctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttg 13246573  T
Q  224 tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 323  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |    
T  13246572 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggt 13246474  T
Q  324 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13246473 tgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 13246441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 29 - 356
Target Start/End: Original strand, 54118168 - 54118496
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  54118168 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 54118267  T
Q  127 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 226  Q
     |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||    
T  54118268 gctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtga 54118367  T
Q  227 agattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 326  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   | |||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||| || || ||||    
T  54118368 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaattgatgttgtggttga 54118466  T
Q  327 tgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54118467 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 54118496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 122229 - 121989
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  122229 atctaaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttg 122130  T
Q  126 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 225  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  122129 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 122030  T
Q  226 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgtta 267  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  122029 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtta 121989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 140 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10644446 - 10644227
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  10644446 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaa 10644347  T
Q  240 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 339  Q
      ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644346 ttggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 10644247  T
Q  340 gggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  10644246 gggtttgcatattcatggat 10644227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 103 - 359
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048477
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||    || ||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 302  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13048420  T
Q  303 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13048421 aatgttattagataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 13048477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Original strand, 15675006 - 15675341
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgcta 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| ||||||||||    
T  15675006 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgcta 15675105  T
Q  120 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataa 219  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||    
T  15675106 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaa 15675205  T
Q  220 gttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatta 319  Q
    ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||     
T  15675206 gttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttg 15675304  T
Q  320 tgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15675305 ttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatg 15675341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 299
Target Start/End: Original strand, 10104167 - 10104445
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgcta 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||  || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| ||||||||||    
T  10104167 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgcta 10104266  T
Q  120 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataa 219  Q
    ||| ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||    
T  10104267 aatccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaa 10104366  T
Q  220 gttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 299  Q
    ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  10104367 gttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115640
Alignment:
Q  130 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 229  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||  ||||| |||| |    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  230 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 329  Q
    || |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatga 31115667  T
Q  330 ataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  31115666 atcattgcttgggtatacatattcatg 31115640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680209
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 302  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| |  |||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 26680266  T
Q  303 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  26680265 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggat 26680209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 33241046 - 33240900
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgcta 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| ||||||||||    
T  33241046 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgcta 33240947  T
Q  120 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatg 166  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  33240946 aattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatg 33240900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488678
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 10488678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328073
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16328073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 271 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 111491 - 111406
Alignment:
Q  271 tgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  111491 tgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 111406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 31132660 - 31132545
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgcta 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| ||||||||||    
T  31132660 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataattatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgcta 31132561  T
Q  120 aattcgtactccaact 135  Q
    ||||||| ||||||||    
T  31132560 aattcgtgctccaact 31132545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 201
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885652
Alignment:
Q  119 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 201  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttca 40885652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 16609008 - 16609045
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16609008 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16609045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 26680554 - 26680517
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680554 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26680517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Original strand, 15135904 - 15135939
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135904 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15135939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Original strand, 15272208 - 15272243
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272208 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15272243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 14952119 - 14952085
Alignment:
Q  27 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952119 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 16327835 - 16327872
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327835 tcatataaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16327872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 22738616 - 22738577
Alignment:
Q  21 acatcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22738616 acatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatca 22738577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15045074 - 15044992
Alignment:
Q  120 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 201  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15045074 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 15044992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 60
Target Start/End: Original strand, 55376491 - 55376525
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 60  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55376491 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 55376525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 8045305 - 8045272
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8045305 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 8045272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 16523179 - 16523146
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16523179 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 16523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 18248564 - 18248527
Alignment:
Q  22 catcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18248564 catcatctaaggtaagggggttagttattatcataatc 18248527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 8378533 - 8378493
Alignment:
Q  21 acatcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  8378533 acatcatctaaggtaaggggattagttattatcataatcat 8378493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 27 - 359
Target Start/End: Original strand, 14842485 - 14842816
Alignment:
Q  27 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14842485 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgt 14842584  T
Q  127 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 226  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  14842585 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatga 14842684  T
Q  227 agattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 326  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  14842685 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattga 14842783  T
Q  327 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14842784 tgaataattgattgggtttgcatattcatggat 14842816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 24 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13839237 - 13838905
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  13839237 tcatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaat 13839138  T
Q  123 tcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 222  Q
    |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||    
T  13839137 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagtt 13839038  T
Q  223 atgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 322  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||| |||    |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || ||     
T  13839037 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgg 13838939  T
Q  323 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13838938 ttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 115 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316227
Alignment:
Q  115 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 214  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  215 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 314  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 55316272  T
Q  315 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55316271 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 55316227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2050150 - 2049821
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2050150 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcg 2050051  T
Q  126 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 225  Q
    | |||||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||    
T  2050050 tgctccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtg 2049951  T
Q  226 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 325  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || |||    
T  2049950 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttg 2049852  T
Q  326 atgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2049851 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 2049821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Original strand, 12030070 - 12030399
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 125  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12030070 atctaaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcg 12030169  T
Q  126 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 225  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||    
T  12030170 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtg 12030269  T
Q  226 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 325  Q
    ||  ||||||| ||  ||||||||| | ||||||| |||||||| |||  | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| |||    
T  12030270 aaagttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttg 12030368  T
Q  326 atgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12030369 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 12030399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 115 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270083
Alignment:
Q  115 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 214  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  215 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 314  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 41270128  T
Q  315 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41270127 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 41270083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 140 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16821366 - 16821147
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  16821366 tgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaaa 16821267  T
Q  240 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 339  Q
      ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821266 ttggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 16821167  T
Q  340 gggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  16821166 gggtttgcatattcatggat 16821147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 103 - 359
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975977
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 302  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13975920  T
Q  303 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13975921 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 13975977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 103 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860813
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 302  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 45860870  T
Q  303 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45860869 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 45860813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 93 - 356
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158270
Alignment:
Q  93 aattttgattatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaatt 192  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  193 acatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaa 292  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||     
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaat 51158206  T
Q  293 tgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51158207 tgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 51158270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 66 - 356
Target Start/End: Original strand, 15858986 - 15859276
Alignment:
Q  66 attttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattg 163  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15858986 attttgtaaattt-caattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattg 15859084  T
Q  164 atgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgtt 263  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||    
T  15859085 atgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtt 15859183  T
Q  264 gttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    ||| |  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15859184 gttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 15859276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 103 - 359
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955145
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 302  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13955088  T
Q  303 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13955089 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 13955145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 110 - 359
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936882
Alignment:
Q  110 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 209  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  210 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 309  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 15936832  T
Q  310 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15936833 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggat 15936882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 250
Target Start/End: Original strand, 16744041 - 16744262
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 128  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  16744041 taaggtaacgaggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgttaaattcgtgc 16744140  T
Q  129 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 228  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||     
T  16744141 tccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 16744240  T
Q  229 attgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
    ||||||| ||| || |||||||    
T  16744241 attgtgcaaaatggatgaattt 16744262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 110 - 359
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938724
Alignment:
Q  110 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 209  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  210 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 309  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 15938674  T
Q  310 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15938675 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggat 15938724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15615174 - 15614845
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaat 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||    
T  15615174 tcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagat 15615078  T
Q  123 tcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 222  Q
    | || |||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15615077 ttgtgctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagtt 15614978  T
Q  223 atgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 322  Q
     |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| |||||||| || | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |      
T  15614977 gtgaatatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtag 15614879  T
Q  323 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15614878 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 15614845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 19260746 - 19260869
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  19260746 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcg 19260845  T
Q  126 tactccaactatgttgttatgttt 149  Q
    | ||| || |||| || |||||||    
T  19260846 tgctctaattatgatgatatgttt 19260869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 103 - 356
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912733
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaact-tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 302  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||  | ||||||  |  || ||||| ||| |  |||| | |||||| |||||||  ||||||||     
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatt--tgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttatt 17912679  T
Q  303 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17912680 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17912733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19232121 - 19231981
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  19232121 taaggtaagggggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 19232022  T
Q  126 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatg 166  Q
    | |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||    
T  19232021 tgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgatg 19231981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449385
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 2449385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 2449147 - 2449184
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449147 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2449184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 23492733 - 23492696
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492733 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23492696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 38168274 - 38168237
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168274 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 38168237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 203
Target Start/End: Original strand, 4145814 - 4145898
Alignment:
Q  119 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 203  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||| || || ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  4145814 aaattcgtactccaattatggtgatatgtttgaatacatgaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattacatgttcata 4145898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 16261812 - 16261777
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261812 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16261777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Original strand, 17912395 - 17912430
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912395 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17912430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 53771400 - 53771365
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771400 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 53771365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 54651803 - 54651625
Alignment:
Q  22 catcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |  | ||||  ||||||||||||  | | || ||| || |||||||||||    
T  54651803 catcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaa 54651704  T
Q  121 attcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 199  Q
    |||||| |||   || || || ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  54651703 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgtt 54651625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 13954799 - 13954836
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13954799 tcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 13954836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 61
Target Start/End: Original strand, 16933868 - 16933901
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933868 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 30153302 - 30153265
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30153302 tcatctaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 30153265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 33342241 - 33342204
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33342241 tcatctaaggtaagagggttagtctttatcataatcat 33342204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 45861159 - 45861122
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45861159 tcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 45861122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 61
Target Start/End: Original strand, 17955884 - 17955916
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955884 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Original strand, 11986077 - 11986112
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11986077 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 11986112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 14285324 - 14285289
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14285324 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 14285289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 64
Target Start/End: Original strand, 15857163 - 15857198
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcat 64  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15857163 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Original strand, 51961028 - 51961063
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51961028 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 51961063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 199
Target Start/End: Original strand, 11986173 - 11986262
Alignment:
Q  110 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 199  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||| || || ||||||| || ||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  11986173 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 11986262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080715
Alignment:
Q  119 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 160  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 14080715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 19947059 - 19947026
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19947059 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 19947026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 2844546 - 2844514
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2844546 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 2844514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 3992905 - 3992873
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3992905 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3992873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 61
Target Start/End: Original strand, 54038024 - 54038056
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54038024 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 54038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 55513225 - 55513193
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55513225 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 55513193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20931685 - 20931356
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  20931685 atctaaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcg 20931586  T
Q  126 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 225  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20931585 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatg 20931486  T
Q  226 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 325  Q
    || |||||||||||  ||||||||| | |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  20931485 aaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttg 20931387  T
Q  326 atgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20931386 atgaataatttcttgggtatgcatattcatg 20931356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41394559 - 41394230
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41394559 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 41394460  T
Q  129 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 228  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  41394459 tccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 41394360  T
Q  229 attgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 328  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||   |||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||    
T  41394359 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatg 41394261  T
Q  329 aataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    ||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  41394260 aatcactgattgggtatgcatattcatggat 41394230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20913370 - 20913048
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  20913370 atctaaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcg 20913271  T
Q  126 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 225  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20913270 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatg 20913171  T
Q  226 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 325  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | | |||||||||||||       | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  20913170 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttaa-------tttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttg 20913079  T
Q  326 atgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20913078 atgaataattgcttgggtatgcatattcatg 20913048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 140 - 359
Target Start/End: Original strand, 18601143 - 18601362
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18601143 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 18601242  T
Q  240 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 339  Q
      |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18601243 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgctt 18601342  T
Q  340 gggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  18601343 gggtttgcatattcatggat 18601362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 115 - 359
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072632
Alignment:
Q  115 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 214  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  215 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 314  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 5072587  T
Q  315 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5072588 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 5072632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 355
Target Start/End: Original strand, 20893550 - 20893877
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 125  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||     
T  20893550 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaa-ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattct 20893648  T
Q  126 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 225  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  20893649 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 20893748  T
Q  226 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 325  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||    
T  20893749 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttg 20893847  T
Q  326 atgaataattgcttgggtatgcatattcat 355  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20893848 atgaatcattgtttgggtatgcatattcat 20893877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Original strand, 37844371 - 37844703
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  37844371 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaatt 37844470  T
Q  124 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 223  Q
    | | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||  ||    
T  37844471 catgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaata 37844570  T
Q  224 -tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 322  Q
     |||| |||||||| ||    ||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || ||     
T  37844571 gtgaaaattgtgctcaattaatgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtgg 37844669  T
Q  323 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37844670 ttgatgagtcattgcttgggtatgcatattcatg 37844703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20446022 - 20445690
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaat 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||    
T  20446022 atctaaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaat 20445923  T
Q  123 tcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 222  Q
    |||| |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||     
T  20445922 tcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtg 20445823  T
Q  223 atgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 322  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  || ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |      
T  20445822 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtag 20445724  T
Q  323 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20445723 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 20445690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20531786 - 20531455
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatt 123  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  20531786 atctaaggtaaggaaattagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaatt 20531687  T
Q  124 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 223  Q
    ||| |||||| | || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||      
T  20531686 cgtgctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtgg 20531587  T
Q  224 tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 323  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  || ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |    
T  20531586 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagt 20531488  T
Q  324 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20531487 tgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 20531455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 153 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22228022 - 22227817
Alignment:
Q  153 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttct 252  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||  | ||||||| |    
T  22228022 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-t 22227924  T
Q  253 cctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 352  Q
     |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22227923 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatatt 22227824  T
Q  353 catggat 359  Q
    |||||||    
T  22227823 catggat 22227817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 153 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22232719 - 22232514
Alignment:
Q  153 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttct 252  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||  | ||||||| |    
T  22232719 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-t 22232621  T
Q  253 cctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 352  Q
     |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22232620 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatatt 22232521  T
Q  353 catggat 359  Q
    |||||||    
T  22232520 catggat 22232514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 140 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2116481 - 2116265
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  2116481 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 2116382  T
Q  240 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtga-gttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 338  Q
      ||||||||| | ||||||| |||||||| |||  || ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||    
T  2116381 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgct 2116283  T
Q  339 tgggtatgcatattcatg 356  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2116282 tgggtatgcatattcatg 2116265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 45051763 - 45051489
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaat 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||    
T  45051763 tcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-tgattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagat 45051667  T
Q  123 tcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 222  Q
    ||||  ||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45051666 tcgtgttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagtt 45051567  T
Q  223 atgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 301  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | |||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  45051566 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 45051489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452608
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 51452608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 51452846 - 51452809
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51452846 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcttaatcat 51452809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 61
Target Start/End: Original strand, 15861327 - 15861358
Alignment:
Q  30 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861327 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 21860366 - 21860334
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21860366 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 21860334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 61
Target Start/End: Original strand, 44034871 - 44034903
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44034871 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 44034903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 32)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Original strand, 16193640 - 16193968
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16193640 atctaaggtaagggg-ttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcg 16193738  T
Q  126 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 225  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  16193739 tgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 16193838  T
Q  226 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 325  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | | || ||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  16193839 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttg 16193937  T
Q  326 atgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16193938 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 16193968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Original strand, 43373389 - 43373720
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||  |||||||||    
T  43373389 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaatt 43373488  T
Q  124 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 223  Q
    ||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  43373489 cgtgctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttg 43373588  T
Q  224 tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 323  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || |    
T  43373589 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggt 43373687  T
Q  324 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43373688 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 43373720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 115 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120734
Alignment:
Q  115 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 214  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  215 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 314  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 30120775  T
Q  315 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30120774 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcat 30120734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 177 - 359
Target Start/End: Original strand, 222753 - 222935
Alignment:
Q  177 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagtt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  222753 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 222852  T
Q  277 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222853 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 222935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 177 - 359
Target Start/End: Original strand, 736376 - 736558
Alignment:
Q  177 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagtt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  736376 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 736475  T
Q  277 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736476 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 736558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 177 - 359
Target Start/End: Original strand, 860271 - 860453
Alignment:
Q  177 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagtt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  860271 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 860370  T
Q  277 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860371 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 860453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Original strand, 24928713 - 24929043
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattc 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24928713 atctaaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattc 24928812  T
Q  125 gtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 224  Q
    || |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |    
T  24928813 gtgctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 24928912  T
Q  225 gaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 324  Q
    ||| |||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| |||    |||||| ||  |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || |||||    
T  24928913 gaaaattgtgctcaattggtgaatttc-gctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgatt 24929011  T
Q  325 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24929012 gatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 115 - 359
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674636
Alignment:
Q  115 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 214  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  215 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 314  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 16674591  T
Q  315 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16674592 taatatgattaatgaataattgcttgagtttgcatattcatggat 16674636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 140 - 355
Target Start/End: Original strand, 21844597 - 21844812
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21844597 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 21844696  T
Q  240 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 339  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844697 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 21844796  T
Q  340 gggtatgcatattcat 355  Q
    |||| |||||||||||    
T  21844797 gggtttgcatattcat 21844812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 140 - 355
Target Start/End: Original strand, 21851990 - 21852205
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21851990 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 21852089  T
Q  240 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 339  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21852090 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 21852189  T
Q  340 gggtatgcatattcat 355  Q
    |||| |||||||||||    
T  21852190 gggtttgcatattcat 21852205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 356
Target Start/End: Original strand, 16404900 - 16405224
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||    
T  16404900 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattt-gtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcatgatggataattattgctaaattcgt 16404998  T
Q  127 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 226  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||| |||    
T  16404999 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtga 16405098  T
Q  227 agattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 326  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||   ||||||||  |||  | |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||    
T  16405099 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttttagttga 16405194  T
Q  327 tgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    ||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  16405195 tgaatcactgcttgggtatgcaaattcatg 16405224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 115 - 356
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774498
Alignment:
Q  115 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 214  Q
    ||||| |||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  215 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 314  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttga 6774456  T
Q  315 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    | || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6774457 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 6774498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 115 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24548993
Alignment:
Q  115 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 214  Q
    ||||| |||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  215 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 314  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| |||||||| || | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 24549035  T
Q  315 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24549034 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 24548993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 103 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345581
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 302  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||  |||| ||||     
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaat-tgagttatgattcttgttcagttgatattatt 17345635  T
Q  303 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17345634 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 359
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907468
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 302  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||| ||| |  |||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 22907411  T
Q  303 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22907412 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggat 22907468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238203
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 5238203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661395
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 24661395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685662
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 43685662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 239
Target Start/End: Original strand, 691908 - 691970
Alignment:
Q  177 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691908 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 691970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 5238441 - 5238404
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238441 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 5238404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 22907123 - 22907160
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907123 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 24385647 - 24385684
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385647 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24385684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 24661157 - 24661194
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661157 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24661194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 43685900 - 43685863
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685900 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43685863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 61
Target Start/End: Original strand, 24716762 - 24716794
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716762 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 2545298 - 2545265
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2545298 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 2545265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 61
Target Start/End: Original strand, 3431175 - 3431208
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3431175 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 3431208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 22886687 - 22886654
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22886687 ctaaggtaagggggttagtcttaatcataatcat 22886654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 274798 - 274766
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  274798 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 274766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 61
Target Start/End: Original strand, 641051 - 641083
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  641051 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 61
Target Start/End: Original strand, 826857 - 826889
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  826857 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 826889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 38533895 - 38533855
Alignment:
Q  120 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 160  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  38533895 aattcgtactccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 38533855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Original strand, 5987 - 6318
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5987 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcg 6086  T
Q  126 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 225  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |     
T  6087 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgta 6186  T
Q  226 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 325  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  | |||||||||    
T  6187 aaaattgtgctgaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaat-tgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattg 6284  T
Q  326 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6285 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 6318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 27 - 359
Target Start/End: Original strand, 880 - 1210
Alignment:
Q  27 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  880 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgt 979  T
Q  127 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 226  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||    
T  980 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtga 1079  T
Q  227 agattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 326  Q
    | |||||||| ||  | ||||||| | |||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  1080 aaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaat-tgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattga 1177  T
Q  327 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1178 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 1210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 48936 - 48609
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgta 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  48936 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtg 48837  T
Q  128 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 227  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  48836 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaa 48737  T
Q  228 gattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 327  Q
     |||||||| |   ||||||||| | ||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || |||||    
T  48736 aattgtgctcagttggtgaattt-tgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgat 48638  T
Q  328 gaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48637 gaatcattgcttgggtatgcatattcatg 48609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 140 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 36320 - 36101
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36320 tgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 36221  T
Q  240 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 339  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36220 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattgctt 36121  T
Q  340 gggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  36120 gggtttgcatattcatggat 36101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 61
Target Start/End: Original strand, 61121 - 61154
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  61121 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 61154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989418
Alignment:
Q  115 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 214  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  215 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 314  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 10989463  T
Q  315 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10989462 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 10989418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16212108 - 16211777
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  16212108 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaatt 16212009  T
Q  124 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 223  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  16212008 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttg 16211909  T
Q  224 tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 323  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| || || |    
T  16211908 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggt 16211810  T
Q  324 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16211809 tgatgattcattgcttgggtatgcatattcatg 16211777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 140 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 2437684 - 2437465
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  2437684 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgttcaa 2437585  T
Q  240 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 339  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437584 ttggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 2437485  T
Q  340 gggtatgcatattcatggat 359  Q
    | || |||||||||||||||    
T  2437484 gagtttgcatattcatggat 2437465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3060302 - 3059977
Alignment:
Q  30 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  3060302 aaggtaagggggtaagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttatatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgct 3060203  T
Q  130 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 229  Q
    |||||| || |  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| |    
T  3060202 ccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaa 3060103  T
Q  230 ttgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 329  Q
    || |||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  3060102 ttatgctcaaatggtgaattt-tgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatga 3060004  T
Q  330 ataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  3060003 atcattgcttgggtatgcatattcatg 3059977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Original strand, 13036935 - 13037266
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  13036935 atctaaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaatt 13037034  T
Q  124 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 223  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| | | ||||||||||||     
T  13037035 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttg 13037134  T
Q  224 tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 323  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| || || |    
T  13037135 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggt 13037233  T
Q  324 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13037234 tgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 13037266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Original strand, 11580658 - 11580991
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg---attatggatgattgttgctaaa 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||| ||||||||    
T  11580658 atctaaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaa 11580757  T
Q  122 ttcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagt 221  Q
    ||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||    
T  11580758 ttcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagt 11580857  T
Q  222 tatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatg 321  Q
    | |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || ||    
T  11580858 tgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtg 11580956  T
Q  322 attgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11580957 gttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatg 11580991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36053006 - 36052678
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  36053006 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatt 36052907  T
Q  124 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 223  Q
      |||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  36052906 tatactccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttg 36052807  T
Q  224 tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 323  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||   ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| || || |    
T  36052806 tgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggt 36052711  T
Q  324 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36052710 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 36052678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 140 - 359
Target Start/End: Original strand, 13911049 - 13911269
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  13911049 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaa 13911148  T
Q  240 agggtgaatttctcct-aagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 338  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13911149 ttggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatttct 13911248  T
Q  339 tgggtatgcatattcatggat 359  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  13911249 tgggtttgcatattcatggat 13911269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 140 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13572903 - 13572684
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  13572903 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 13572804  T
Q  240 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 339  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13572803 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgctt 13572704  T
Q  340 gggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  13572703 gggtttgcatattcatggat 13572684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 103 - 359
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292593
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||| |||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 302  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||  |||||||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgctcaattggtgaatt-ctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 25292536  T
Q  303 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25292537 aatgttatttgatattatgactaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 25292593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 110 - 359
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18254090
Alignment:
Q  110 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 209  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  210 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 309  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 18254040  T
Q  310 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18254041 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggat 18254090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 103 - 356
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481283
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 302  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatc 47481229  T
Q  303 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
      | ||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47481230 gctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 47481283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 140 - 359
Target Start/End: Original strand, 16478987 - 16479205
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  16478987 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaa 16479086  T
Q  240 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 339  Q
      ||||||||| |  |||||| || ||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||    
T  16479087 ttggtgaattt-tgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgctt 16479185  T
Q  340 gggtatgcatattcatggat 359  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16479186 gggtatgcatattcatggat 16479205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7293025
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 302  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||||||| |  |||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 7293082  T
Q  303 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7293081 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggat 7293025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516343
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 11516343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441711
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 15441711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262276
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 30262276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13321025
Alignment:
Q  104 tggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttcat 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaa 13321179  T
Q  203 a-tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttg-ttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 300  Q
    | |||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||| ||||| |  |||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  13321178 agtatgtataaatgtcaagttatgaa-attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtta 13321081  T
Q  301 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  ||||||| |||| |||||||    
T  13321080 ttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatg 13321025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 224
Target Start/End: Original strand, 295893 - 296087
Alignment:
Q  31 aggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttg-attatggatgattgttgctaaattcgtac 128  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||||      
T  295893 aggtaagggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaactttgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgt 295991  T
Q  129 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 224  Q
    || || |  | |||||||||||| ||||||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||| |||||||    
T  295992 tctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttat 296087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 7293370 - 7293333
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293370 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 7293333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 11516581 - 11516544
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516581 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 11516544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 14113898 - 14113935
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113898 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14113935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 15441473 - 15441510
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441473 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15441510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 30262038 - 30262075
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262038 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 30262075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 36024488 - 36024372
Alignment:
Q  26 atctaaggtaaggggg-ttagtctttatcataatcatcatca----ttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgct 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    ||||  || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||| ||    
T  36024488 atctaaggtaaggggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgtttct 36024389  T
Q  119 aaattcgtactccaact 135  Q
    |||||||| ||||||||    
T  36024388 aaattcgtgctccaact 36024372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 2029279 - 2029244
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029279 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2029244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 15709504 - 15709428
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatc----attttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 98  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    |||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15709504 atctaaggtaagaggattagtcttcatcataatcatcatcatcaattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttt 15709428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Original strand, 42056185 - 42056220
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056185 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 42056220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 60
Target Start/End: Original strand, 25292247 - 25292283
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 60  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25292247 tcatctaagataagggggttagtctttatcataatca 25292283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 3049940 - 3049905
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3049940 atctaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3049905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 60
Target Start/End: Original strand, 10000279 - 10000318
Alignment:
Q  21 acatcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10000279 acatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatca 10000318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 13321369 - 13321334
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13321369 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 13321334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 25124485 - 25124450
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25124485 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 25124450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Original strand, 47480941 - 47480976
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47480941 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 47480976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13377775 - 13377693
Alignment:
Q  120 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 201  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  13377775 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 13377693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 371450 - 371417
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  371450 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 371417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 14423549 - 14423585
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14423549 tcatctaaggtaagggggttagtc-ttatcataatcat 14423585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 126770 - 126738
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  126770 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 126738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 61
Target Start/End: Original strand, 15516765 - 15516793
Alignment:
Q  33 gtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516765 gtaagggggttagtctttatcataatcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 61
Target Start/End: Original strand, 32493946 - 32493978
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32493946 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 32493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9218 - 8889
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  9218 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcg 9119  T
Q  126 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 225  Q
    | |||||  | || |||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| ||    
T  9118 tgctccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtg 9019  T
Q  226 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 325  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||    
T  9018 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattg 8920  T
Q  326 atgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8919 atgaataattgcttgggtatgcatattcatg 8889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12453 - 12123
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaattc 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12453 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgtaacttt-caaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattc 12355  T
Q  125 gtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 224  Q
    || ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| | || || |||||||||||||| |    
T  12354 gtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgt 12255  T
Q  225 gaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 324  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||| |  |||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12254 gaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgttaagttgttg-taat-tgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgatt 12158  T
Q  325 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12157 catgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 12123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 172245 - 171916
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  172245 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacg 172146  T
Q  126 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 225  Q
    | |||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  172145 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 172046  T
Q  226 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 325  Q
    || |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| |  ||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  172045 aaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttg 171947  T
Q  326 atgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  171946 atgaatcattgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 177948 - 177619
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  177948 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacg 177849  T
Q  126 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 225  Q
    | |||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  177848 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 177749  T
Q  226 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 325  Q
    || |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| |  ||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  177748 aaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttg 177650  T
Q  326 atgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  177649 atgaatcattgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 24 - 352
Target Start/End: Original strand, 26335 - 26663
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||||||||||||    
T  26335 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaat 26434  T
Q  123 tcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 222  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26435 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagtt 26534  T
Q  223 atgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 322  Q
     |||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||    
T  26535 gtgaaaattgttctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtga 26633  T
Q  323 ttgatgaataattgcttgggtatgcatatt 352  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26634 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatatt 26663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8327
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Original strand, 247363 - 247694
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  247363 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaatt 247462  T
Q  124 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 223  Q
    ||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||| | | ||||||||||||     
T  247463 cgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttg 247562  T
Q  224 tgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 323  Q
    |||| |||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |    
T  247563 tgaaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggt 247661  T
Q  324 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  247662 tgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 34070 - 34107
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34070 tcatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 34107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 39 - 356
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5313
Alignment:
Q  39 gggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtactccaactat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  138 gttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgcta 237  Q
    |  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 5195  T
Q  238 aaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 337  Q
    ||  ||||||||| | | ||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||| |||||    
T  5196 aattggtgaattt-tgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgc 5294  T
Q  338 ttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5295 ttgggtatgcatattcatg 5313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42069 - 41740
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42069 atctaaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcg 41970  T
Q  126 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 225  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||    
T  41969 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtg 41870  T
Q  226 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 325  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||| | || |   ||    
T  41869 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatg 41771  T
Q  326 atgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  41770 atgaatcattggttgggtatgcatattcatg 41740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 140 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 43224 - 43005
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43224 tgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgctaaa 43125  T
Q  240 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 339  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43124 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 43025  T
Q  340 gggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  43024 gggtttgcatattcatggat 43005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Original strand, 128092 - 128420
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  128092 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcg 128191  T
Q  126 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 225  Q
    | || ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| || || |||  || |||||| ||    
T  128192 tgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtg 128291  T
Q  226 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 325  Q
    || |||||||| ||  || |||||| |  || |||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||||    
T  128292 aaaattgtgctcaattggcgaattt-tgttaggttgttgttaat-tgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattg 128389  T
Q  326 atgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  128390 atgaataattgattgggtatgcatattcatg 128420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 140 - 359
Target Start/End: Original strand, 31700 - 31920
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  31700 tgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaa 31799  T
Q  240 agggtgaatttctcct-aagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 338  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31800 ttggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataattgct 31899  T
Q  339 tgggtatgcatattcatggat 359  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  31900 tgggtttgcatattcatggat 31920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 356
Target Start/End: Original strand, 36837 - 37165
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||||||    
T  36837 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgt 36936  T
Q  127 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 226  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  36937 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 37036  T
Q  227 agattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 326  Q
    | |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||    |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  37037 aaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttga 37135  T
Q  327 tgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37136 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 37165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 272365 - 272036
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||    
T  272365 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacg 272266  T
Q  126 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 225  Q
    |||||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  272265 tactccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 272166  T
Q  226 aagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 325  Q
    || |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||    |||||| |||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||| || || |||    
T  272165 aaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttg 272067  T
Q  326 atgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  272066 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 272036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19543 - 19217
Alignment:
Q  32 ggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtac 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||| |    
T  19543 ggtaagggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgc 19444  T
Q  129 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 228  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  19443 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 19344  T
Q  229 attgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 328  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||    
T  19343 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatg 19245  T
Q  329 aataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19244 aatcattgcttgggtatgcatattcatg 19217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 103 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21301
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 302  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||| |||||||||     
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttatt 21355  T
Q  303 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21354 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 21301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 110 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5552
Alignment:
Q  110 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  210 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 309  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5685 aaaatgataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 5586  T
Q  310 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggt 343  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5585 tttgataatatgattaatgaataattgcttgggt 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 5883 - 5846
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5883 tcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 356
Target Start/End: Original strand, 123086 - 123416
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattc 124  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||    
T  123086 ctaaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattc 123185  T
Q  125 gtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 224  Q
    || |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |    
T  123186 gtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 123285  T
Q  225 gaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 324  Q
    ||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||   | |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||    
T  123286 gaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggtt 123384  T
Q  325 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  123385 gatgaataatggcttgggtatgcatattcatg 123416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 140 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 262 - 46
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  262 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgctcaa 163  T
Q  240 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 339  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  162 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgctt 63  T
Q  340 gggtatgcatattcatg 356  Q
    |||| ||||||||||||    
T  62 gggtttgcatattcatg 46  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 171 - 359
Target Start/End: Original strand, 64584 - 64772
Alignment:
Q  171 ttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatg 270  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  64584 ttgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatt 64683  T
Q  271 tgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  64684 tgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 64772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 110 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107755
Alignment:
Q  110 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 209  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  210 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 309  Q
    ||||||||||||| | || |||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 107805  T
Q  310 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  107804 attgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 107755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 160
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  118 taaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 160  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 249
Target Start/End: Original strand, 51105 - 51328
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcg 125  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  51105 atcttaggtaaggagattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcg 51204  T
Q  126 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 225  Q
    | |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||    
T  51205 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtg 51304  T
Q  226 aagattgtgctaaaagggtgaatt 249  Q
    || |||||||| ||  ||||||||    
T  51305 aaaattgtgctcaattggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 110 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48195
Alignment:
Q  110 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  210 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 309  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgtta 48245  T
Q  310 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48244 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggat 48195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 140 - 359
Target Start/End: Original strand, 21141 - 21359
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21141 tgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgagctcaa 21240  T
Q  240 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 339  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21241 ttggtgaattt-tcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttgatgttatgattgatgaataattgctt 21339  T
Q  340 gggtatgcatattcatggat 359  Q
    | || |||||||||||||||    
T  21340 gagtttgcatattcatggat 21359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 140 - 359
Target Start/End: Original strand, 14086 - 14304
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14086 tgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgctcaa 14185  T
Q  240 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 339  Q
      ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14186 ttggtgaattt-tcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgctt 14284  T
Q  340 gggtatgcatattcatggat 359  Q
    | || |||||||||||||||    
T  14285 gagtttgcatattcatggat 14304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 77 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 149012 - 148732
Alignment:
Q  77 tttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgt 174  Q
    ||||||||||||||||||||||   || || ||| ||||||| |||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  149012 tttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 148913  T
Q  175 ataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgag 274  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  148912 aagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgag 148814  T
Q  275 ttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||  || || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  148813 atttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatg 148732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9195 - 8860
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgcta 119  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| ||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||    
T  9195 atctaaggtaagtgtgttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgcta 9096  T
Q  120 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataa 219  Q
    ||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||    
T  9095 aattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaa 8996  T
Q  220 gttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatta 319  Q
    ||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||  ||||||| |||||||||   | ||| ||||| ||     
T  8995 gttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttg 8897  T
Q  320 tgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  8896 ttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatg 8860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 146941 - 146843
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattc 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  146941 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaattc 146843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 249
Target Start/End: Original strand, 89375 - 89600
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  89375 atctaaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaatt 89474  T
Q  124 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 223  Q
    ||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||     
T  89475 cgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttg 89574  T
Q  224 tgaagattgtgctaaaagggtgaatt 249  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||    
T  89575 tgaaaattgtgctcaattggtgaatt 89600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 107705 - 107835
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| ||||||||||    
T  107705 atctaaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaatt 107804  T
Q  124 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatg 154  Q
    ||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  107805 cgtgctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 130911 - 130880
Alignment:
Q  30 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130911 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 153 - 359
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5458
Alignment:
Q  153 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttct 252  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||| |    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-t 5352  T
Q  253 cctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 352  Q
     || ||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5353 gctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatatt 5451  T
Q  353 catggat 359  Q
    |||||||    
T  5452 catggat 5458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 4)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 140 - 356
Target Start/End: Original strand, 9374 - 9589
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  9374 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 9473  T
Q  240 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 339  Q
      ||||||||| | ||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  9474 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 9572  T
Q  340 gggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||||||||||||||    
T  9573 gggtatgcatattcatg 9589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 140 - 356
Target Start/End: Original strand, 16272 - 16487
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  16272 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 16371  T
Q  240 agggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 339  Q
      ||||||||| | ||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  16372 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 16470  T
Q  340 gggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||||||||||||||    
T  16471 gggtatgcatattcatg 16487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 61
Target Start/End: Original strand, 9257 - 9297
Alignment:
Q  21 acatcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  9257 acatcatctaaggtaagggggttagttattatcacaatcat 9297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 61
Target Start/End: Original strand, 16155 - 16195
Alignment:
Q  21 acatcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  16155 acatcatctaaggtaagggggttagttattatcacaatcat 16195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 153 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3730
Alignment:
Q  153 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa-tgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttc 251  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||   ||  |||||||||     
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaattt- 3838  T
Q  252 tcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 351  Q
    | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3837 tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatat 3738  T
Q  352 tcatggat 359  Q
    ||||||||    
T  3737 tcatggat 3730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 115 - 261
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1450
Alignment:
Q  115 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 214  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  215 gataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttg 261  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttg 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 103 - 354
Target Start/End: Original strand, 534 - 784
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 302  Q
    ||| | | ||||||| |||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | |||||||  |||||   | |||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattt-tgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatg 732  T
Q  303 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattca 354  Q
      || || ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  733 gctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattca 784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 359
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34716
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttat 301  Q
     | || ||||||   ||||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| || || || |||||||||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttat 34658  T
Q  302 gaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
       ||||||||||| || |  ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  34659 tgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggat 34716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13636
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 236  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 13636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 13859 - 13824
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13859 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 13824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 2973
Alignment:
Q  114 ttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 213  Q
    ||||||||||||| |||   || || |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  214 tgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttattt 312  Q
    ||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttattt 3017  T
Q  313 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    ||| || |  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  3016 gatgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatg 2973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 269
Target Start/End: Original strand, 13350 - 13478
Alignment:
Q  140 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  13350 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 13449  T
Q  240 agggtgaatttctcctaagttgttgttaat 269  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  13450 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaat 13478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 103 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41659
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 302  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||| ||||||||| |  |  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 41713  T
Q  303 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
      |||||  |||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41712 gttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 41659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 41998 - 41957
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattt 69  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  41998 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcattt 41957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 103 - 359
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37320
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 302  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||| |||    |||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 37263  T
Q  303 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  37264 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggat 37320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 36975 - 37012
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36975 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26911
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 26911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22656
Alignment:
Q  110 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||      
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  210 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 22656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 22894 - 22857
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 27149 - 27112
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27149 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 27112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1729
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  203 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaattt 250  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 1491 - 1528
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1491 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 261 - 359
Target Start/End: Original strand, 9 - 107
Alignment:
Q  261 gttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9 gttgttaatttgatatttgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 261 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 48620 - 48522
Alignment:
Q  261 gttgttaatgtgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 359  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48620 gttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 48522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 271 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9478 - 9393
Alignment:
Q  271 tgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 356  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9478 tgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 9393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3360
Alignment:
Q  103 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 196  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||| | || || ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 873 - 910
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  873 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 9877 - 9914
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9877 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 108070 - 108107
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108070 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 108107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 55939 - 55904
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55939 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 55904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Original strand, 6440 - 6475
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6440 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 6475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Original strand, 13282 - 13317
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13282 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 13317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 266
Target Start/End: Original strand, 56106 - 56262
Alignment:
Q  110 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg--ttcatatatg 207  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||| || || ||||||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||  || |  ||||    
T  56106 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatg 56205  T
Q  208 caaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaagggtgaatttctcctaagttgttgtt 266  Q
     | |||||  |||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  56206 tataaatgtcaagttatgaa-attgtgctcaaatggtgaattt-tgctaagttgttgtt 56262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Original strand, 57389 - 57424
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57389 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 160
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70348
Alignment:
Q  119 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 160  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 70348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 18061 - 18015
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  18061 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcataattattttgt 18015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Original strand, 193392 - 193429
Alignment:
Q  24 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193392 tcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 193429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 61
Target Start/End: Original strand, 17300 - 17336
Alignment:
Q  25 catctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17300 catctaaggtaagcgggttagtctttatcataatcat 17336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 80219 - 80187
Alignment:
Q  29 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80219 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 60
Target Start/End: Original strand, 12036 - 12075
Alignment:
Q  21 acatcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12036 acatcatctaaggtaagggggttagttattatcataatca 12075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8174
Alignment:
Q  119 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 201  Q
    |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||  ||||||||||| || ||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttca 8174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Original strand, 34305 - 34340
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34305 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 34340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 45373 - 45338
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45373 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 45338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 45244 - 45198
Alignment:
Q  153 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 199  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45244 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtt 45198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Original strand, 12415 - 12450
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12415 atctaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 199
Target Start/End: Original strand, 10249 - 10427
Alignment:
Q  22 catcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||| ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| || |||||||||||    
T  10249 catcatctaaggtaagggggtttgtcttcttcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaa 10348  T
Q  121 attcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 199  Q
    |||||| |||   || || || ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  10349 attcgtgctcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 61
Target Start/End: Original strand, 17207 - 17241
Alignment:
Q  27 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17207 tctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 17241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 201
Target Start/End: Original strand, 2317 - 2399
Alignment:
Q  120 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 201  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  2317 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 2399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 373 - 339
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 60  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  373 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 25566 - 25532
Alignment:
Q  26 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 60  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25566 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 25532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 61
Target Start/End: Original strand, 5475 - 5508
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5475 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 61
Target Start/End: Original strand, 4345 - 4378
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4345 ctaaggtaagggggttagactttatcataatcat 4378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 5582 - 5549
Alignment:
Q  28 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5582 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University