View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10366_high_18 (Length: 321)

Name: NF10366_high_18
Description: NF10366
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10366_high_18
NF10366_high_18
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (1-316)||(22145253-22145568)
chr8 (1-304)||(22059269-22059572)
chr8 (1-302)||(17614857-17615157)
chr8 (1-304)||(28853888-28854191)
chr8 (1-302)||(24707688-24707989)
chr8 (16-302)||(10829334-10829619)
chr8 (1-302)||(17795334-17795639)
chr8 (1-316)||(363889-364209)
chr8 (4-302)||(44431965-44432268)
chr8 (1-94)||(7301164-7301258)
chr8 (1-94)||(45135010-45135104)
chr8 (3-79)||(6608372-6608449)
[»] chr7 (13 HSPs)
chr7 (1-316)||(13395331-13395646)
chr7 (1-316)||(48785251-48785566)
chr7 (1-304)||(4993423-4993726)
chr7 (40-302)||(124073-124329)
chr7 (1-302)||(35366164-35366465)
chr7 (1-302)||(13733416-13733714)
chr7 (1-302)||(21065042-21065340)
chr7 (1-80)||(38828169-38828249)
chr7 (4-94)||(16006343-16006434)
chr7 (1-94)||(8776285-8776379)
chr7 (3-79)||(21743403-21743480)
chr7 (6-79)||(17505886-17505960)
chr7 (6-79)||(17547254-17547328)
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (1-316)||(16102281-16102596)
chr6 (1-304)||(12595895-12596198)
chr6 (1-302)||(16812716-16813016)
chr6 (1-302)||(16829736-16830036)
chr6 (4-302)||(29492696-29492993)
chr6 (1-94)||(8522854-8522948)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (1-316)||(287028-287343)
chr4 (1-316)||(47126692-47127007)
chr4 (1-304)||(28382762-28383065)
chr4 (1-302)||(10313653-10313953)
chr4 (40-302)||(31116934-31117190)
chr4 (40-302)||(55502629-55502885)
chr4 (1-302)||(15279966-15280264)
chr4 (1-302)||(16359442-16359743)
chr4 (1-165)||(33848844-33849011)
chr4 (1-316)||(56115467-56115787)
chr4 (104-302)||(43251208-43251410)
chr4 (1-94)||(41791594-41791688)
chr4 (3-79)||(4170950-4171027)
chr4 (3-79)||(14698642-14698719)
chr4 (6-79)||(53387819-53387893)
[»] chr3 (17 HSPs)
chr3 (1-316)||(2034850-2035165)
chr3 (1-316)||(2038357-2038672)
chr3 (1-316)||(2042098-2042413)
chr3 (1-316)||(14041583-14041898)
chr3 (1-316)||(14038115-14038430)
chr3 (1-316)||(39230663-39230978)
chr3 (1-304)||(18958834-18959136)
chr3 (3-302)||(54046655-54046953)
chr3 (1-302)||(15010037-15010337)
chr3 (1-302)||(603520-603827)
chr3 (1-165)||(10989585-10989753)
chr3 (1-94)||(54973308-54973402)
chr3 (1-94)||(54975918-54976012)
chr3 (1-94)||(54978528-54978622)
chr3 (1-79)||(10554358-10554437)
chr3 (1-130)||(55292471-55292602)
chr3 (255-316)||(16800006-16800068)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (1-316)||(44620866-44621181)
chr2 (1-316)||(41684629-41684944)
chr2 (1-302)||(12627771-12628071)
chr2 (40-302)||(31755900-31756156)
chr2 (1-302)||(23339045-23339350)
chr2 (1-302)||(28349008-28349315)
chr2 (3-79)||(31503524-31503601)
chr2 (3-79)||(31506090-31506167)
chr2 (1-94)||(21239210-21239304)
chr2 (1-94)||(21241760-21241854)
chr2 (3-94)||(24504627-24504719)
chr2 (1-31)||(20591253-20591283)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (1-316)||(20631254-20631569)
chr1 (1-316)||(36181513-36181828)
chr1 (1-316)||(14432220-14432535)
chr1 (1-304)||(45307227-45307530)
chr1 (1-302)||(22900133-22900433)
chr1 (1-302)||(24087357-24087656)
chr1 (1-302)||(37358410-37358708)
chr1 (1-302)||(296457-296762)
chr1 (1-316)||(294136-294457)
chr1 (1-96)||(2333058-2333154)
chr1 (1-94)||(20579385-20579479)
[»] scaffold0525 (2 HSPs)
scaffold0525 (1-316)||(10741-11056)
scaffold0525 (1-94)||(9093-9187)
[»] chr5 (14 HSPs)
chr5 (1-302)||(16255815-16256115)
chr5 (1-302)||(22589612-22589912)
chr5 (1-302)||(22593167-22593467)
chr5 (1-302)||(22596722-22597022)
chr5 (1-302)||(16259448-16259748)
chr5 (1-304)||(23693396-23693699)
chr5 (40-302)||(22880190-22880446)
chr5 (1-302)||(4397647-4397947)
chr5 (1-302)||(26360965-26361263)
chr5 (40-302)||(43121139-43121401)
chr5 (40-302)||(43124672-43124934)
chr5 (1-207)||(22758633-22758842)
chr5 (1-94)||(26495808-26495902)
chr5 (1-94)||(29325325-29325419)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (40-302)||(33129-33385)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (40-302)||(81427-81683)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (1-302)||(133851-134149)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (1-302)||(8373-8679)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (1-207)||(162385-162594)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (1-79)||(1638-1716)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-165)||(2440-2608)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-165)||(137876-138044)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (104-302)||(22775-22976)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22145568 - 22145253
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22145568 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 22145469  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22145468 attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 22145369  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22145368 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 22145269  T
301 tctccaggatcaactc 316  Q
    |||| ||| |||||||    
22145268 tctcaaggttcaactc 22145253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22059572 - 22059269
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22059572 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaactaacacattgtacaatctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 22059473  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22059472 attaacaatcatgatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 22059373  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
22059372 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttgccctaaccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatcttttattgcta 22059273  T
301 tctc 304  Q
    ||||    
22059272 tctc 22059269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 17614857 - 17615157
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
17614857 acctatgactccgttacttagaatgacagctcgccacttacaactcgaaccaacacattgttcattctaattgaatgcagttaagtataaatcagcgatc 17614956  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
17614957 attaaccatcataatcaatcaacggcaacacaacagtatacgacagcatgatataacaatatcttatacaattcaatgatgtctagcattttcacataat 17615056  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
17615057 ccaagtattacttatacaa-ttttatcacattaataacctcaatttgccatgaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacgtctttcattgtta 17615155  T
301 tc 302  Q
    ||    
17615156 tc 17615157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 28853888 - 28854191
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaa-cgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
28853888 acctatgactccgttacttagaaacgacaacccgccacttacaacttgaaccaacacattgtacattctaactgaatgcaattaagtataaaccagcgat 28853987  T
100 cattaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28853988 cattaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacgtcagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataa 28854087  T
200 tccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgct 299  Q
     ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
28854088 accaagtattacttatacga-tcttatcacattaataacctcaatttgccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatcttccattgct 28854186  T
300 atctc 304  Q
    |||||    
28854187 atctc 28854191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24707989 - 24707688
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
24707989 acctatgactccgttacttataatgacaactcacaacttacaacccgaaccaacacattgtatattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcattc 24707890  T
101 attaacaatcataa-tcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataa 199  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
24707889 atcaacaatcataattcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcgtgatataacagtatcttatgcaattcaacgatgtctaacattttcacataa 24707790  T
200 tccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgct 299  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  | || | |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |    
24707789 tccaagtaatacttatacaa-ttttatcatattaataacctcaatttgtcataacaagcttctcagatcatcatttatatcctatacatctttcattgtt 24707691  T
300 atc 302  Q
    |||    
24707690 atc 24707688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 10829619 - 10829334
Alignment:
16 acttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcattaacaatcataat 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||    
10829619 acttagaacgacaactcgcaacttacaactcgaaccaacaccttgtatattctaattgtttgtagttatgcataaaccagcaatcatcaacaatcataat 10829520  T
116 caatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatccaagtattacttat 215  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||    
10829519 caatcaacagcaacacaacagtatacaacaacgtgatataacaatatcttatgcaattcaacgatgtctagcatttgcacatgatctaagtaatacttat 10829420  T
216 acaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc 302  Q
    |||| |||||| | | ||||||||||||||   | || |||| ||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
10829419 acaa-ttttattatactaataacctcaattcctcataaccagtttcacatattatcatttatatcatatacatctttcatcgctatc 10829334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 17795334 - 17795639
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaa-cgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
17795334 acctatgactccgttacttagaaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtagaaaccagcgat 17795433  T
100 cattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatataca-acagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||  | |||| ||||  |||||    
17795434 cattaacaatcataatcaatcaacagcaacacaaacagtatacagacagcgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaacattcccacat 17795532  T
198 aatccaagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttca 294  Q
    |||||||||| | | ||| ||| || ||||| |||   ||||||||||||| | |  |  ||||||||||  ||||| || | |||||||||| ||||||    
17795533 aatccaagtaatgcgtatgcaa-ttatatcatattaaaaataacctcaattcatcacaatcagcttcacacatcatccttaatatcctatacaactttca 17795631  T
295 ttgctatc 302  Q
    ||||||||    
17795632 ttgctatc 17795639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 363889 - 364209
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccactt--acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcga 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |    
363889 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacttttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaaacataaactagcaa 363988  T
99 tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatataca-acagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcaca 196  Q
    |||  |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||| ||||  | |||| ||||  ||||    
363989 tcagcaacaatcatactcaatcaacagcaacacaaacagtatacagacaacgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaacattcccaca 364087  T
197 taatccaagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttc 293  Q
    ||||||||||| | | ||| ||| || ||||| |||   ||||||||||||| | |  |  ||||||||||| ||||| || | |||||||||| |||||    
364088 taatccaagtaatgcgtatgcaa-ttatatcatattaaaaataacctcaattcatcacaatcagcttcacagatcatccttaatatcctatacaactttc 364186  T
294 attgctatctccaggatcaactc 316  Q
    ||||||||| | ||| |||||||    
364187 attgctatcccaaggttcaactc 364209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 44431965 - 44432268
Alignment:
4 tatgactccgttacttagaacgacaactcgccactt--acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatca 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | ||||    
44431965 tatgactccgttatttagaacgacaacttgcaacttttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgtagttaaacataaaccatcaatca 44432064  T
102 ttaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatataca-acagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataa 199  Q
      |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||  | |||| ||||  |||||||    
44432065 gcaacaatcatactcaatcaacaacaacacaaacaatatacagacagcgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaacattcccacataa 44432163  T
200 tccaagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcatt 296  Q
    |||||||| | | ||| ||| || ||||| |||   ||||||||||||| | |  |  ||||||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||||    
44432164 tccaagtaatgcgtatgcaa-ttatatcatattaaaaataacctcaattcatcacaatcagcttcacagatcatccttaatatcctatacaactttcatt 44432262  T
297 gctatc 302  Q
    ||||||    
44432263 gctatc 44432268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 7301258 - 7301164
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||| ||||  ||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||    
7301258 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaactaacatcttgtataatctaattgaatgcatttatgcataaacca 7301164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 45135104 - 45135010
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||| |||||||||  ||||| | |  ||||||||||| ||| | ||||||||    
45135104 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttaccacttgaaccaacatcttgtataattcaattgaatgcatttatgcataaacca 45135010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 6608449 - 6608372
Alignment:
3 ctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
6608449 ctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 6608372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 13)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13395646 - 13395331
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13395646 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 13395547  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13395546 attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 13395447  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13395446 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 13395347  T
301 tctccaggatcaactc 316  Q
    |||| ||| |||||||    
13395346 tctcaaggttcaactc 13395331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 48785251 - 48785566
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48785251 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 48785350  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48785351 attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 48785450  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48785451 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 48785550  T
301 tctccaggatcaactc 316  Q
    |||| ||| |||||||    
48785551 tctcaaggttcaactc 48785566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 4993423 - 4993726
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaa-cgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
4993423 acctatgactccgttacttagaaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccatcgat 4993522  T
100 cattaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
4993523 cattaacaatcataatcaatcaacagcaacataacagtatacgtcagcttgatatgataatattttatacaatccaacgatgtctagcattatcacataa 4993622  T
200 tccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgct 299  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
4993623 accaagtattacttatacaa-ttttatcacattaataacctcaatttgccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatctttcattgct 4993721  T
300 atctc 304  Q
    |||||    
4993722 atctc 4993726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 40 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 124329 - 124073
Alignment:
40 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||    
124329 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcaattaaatataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaca-----acaacagtat 124235  T
140 acaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacc 239  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
124234 acgtcagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattataacataaaccaagtattacttgtacaa-ttttatcacattaataacc 124136  T
240 tcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc 302  Q
    ||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
124135 tcaattggccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatctctcattgctatc 124073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 35366164 - 35366465
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
35366164 acctatgactccgttacttagaacgacaactcaaaacttacaactcgaaccaacaccttgtatattctaattgaatgcaattaagcataaaccagcaatc 35366263  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||  ||||    
35366264 atcaacaatcatattcaatcaacagcaacacaacaatatacaacagcgtgatataacaatatcttatgcaattcaacgatgtctaacatttccatgtaat 35366363  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacatt-aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgct 299  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||| || |||||||||| | | || ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
35366364 ccaagtaatacgtatacaa-ttttatcatattaaacaacctcaattcatcataaccaacttcacagatcatcattaatatcctatacatctttcattgct 35366462  T
300 atc 302  Q
    |||    
35366463 atc 35366465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13733714 - 13733416
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
13733714 acctatgactccgttacttataacgacaactcacaacttacaac-cgaaccaacacattgtatattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcattc 13733616  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
13733615 atcaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacaacgtgatataacagtatcttatgcaattcaacgatgtctaacattttctcataat 13733516  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
     |||||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||   | || |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
13733515 -caagtaatacttatacaa-gtttatcatgttaataacctcaattcgtcataaccagcttctcatatcatcatttatatcctatacatctttcattgtta 13733418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21065340 - 21065042
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccactt--acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcga 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||||| | ||| |||| |    
21065340 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacttttacaacgcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaagcacaaatcagcaa 21065241  T
99 tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaa-caatatacaa-cagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcaca 196  Q
    |||   ||||       |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| || |    
21065240 tca---acaa-------caatcaacagcaacacaaacaatatacaaacaacatgatataacaatatcttatgcaattcaacaatgtctaacatttccata 21065151  T
197 taatccaagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaa-atcctatacatcttt 292  Q
    ||||||||||| | | ||||| |||| || || |||   ||||||||||||| | | ||  ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| ||||    
21065150 taatccaagtaatgcgtatac-atttataacatattaaaaataacctcaattcatcataatcagcttcacagattatcaattaatatcctatacaacttt 21065052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 38828169 - 38828249
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccac-ttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcag 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
38828169 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaactttacaactcgaacccacaccttgtatattctaattgaatgcag 38828249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 94
Target Start/End: Original strand, 16006343 - 16006434
Alignment:
4 tatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || ||||||||||| ||| | ||||||||    
16006343 tatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 16006434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 8776285 - 8776379
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||| |||||||||  ||||| | |  ||||||||||| ||| | ||||||||    
8776285 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttaccacttgaaccaacatcttgtataattcaattgaatgcatttatgcataaacca 8776379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 21743480 - 21743403
Alignment:
3 ctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
21743480 ctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 21743403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 17505960 - 17505886
Alignment:
6 tgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
17505960 tgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 17505886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 79
Target Start/End: Original strand, 17547254 - 17547328
Alignment:
6 tgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
17547254 tgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 17547328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 16102281 - 16102596
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16102281 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 16102380  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16102381 attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 16102480  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16102481 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 16102580  T
301 tctccaggatcaactc 316  Q
    |||| ||| |||||||    
16102581 tctcaaggttcaactc 16102596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 12595895 - 12596198
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12595895 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacagctcggaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 12595994  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12595995 attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacaacatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 12596094  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12596095 ccaagtattacttatacgatttttatcgcattaataacctcaatttgccctaaccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 12596194  T
301 tctc 304  Q
    ||||    
12596195 tctc 12596198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 16812716 - 16813016
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||    
16812716 acctatgactccgttacttataacgacaactcacaacttacaacccgaaccaacaccttgtatattctaattgaatacagttaagtataaaccaacattc 16812815  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
16812816 atcaacaatcataatcaatcaacaacaacacaacagtatacaacagcgtgatataacagtatcttatgcaattcaacgatgtctaacattttcacataat 16812915  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
16812916 ccaagtaatacttatacaa-ttttatcatattaataacctcaatttgtcataaccagcttctcagatcatcatttatatcctatacatctttcattgtta 16813014  T
301 tc 302  Q
    ||    
16813015 tc 16813016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 16829736 - 16830036
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
16829736 acctatgactctgttacttataacgacaactaacaacttacaacccgaaccaacaccttgtatattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcattc 16829835  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
16829836 atcaacaatcataatcaatcaacatcaacacaacagtatacaacagcgtgatataacagtatcttatgcaattcaacgatgtctaacattttcacataat 16829935  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
16829936 ccaagtaatacttatacaa-ttttatcatattaataacctcaatttgtcataaccagcttctcagatcatcatttatatcctatacatctttcattgtta 16830034  T
301 tc 302  Q
    ||    
16830035 tc 16830036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 29492696 - 29492993
Alignment:
4 tatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcatt 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||     
29492696 tatgactccgttacttataacgacatctcacaacttacaacccgaacccacaccttgtatattctaattgaatgcggttaagtataggccagcattcatc 29492795  T
104 aacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatcca 203  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
29492796 aacaatcacaatcaatcaacaacaacacaacagtatacaacagcgtgatataacagtagcttatgcaattcaacgatgtctaacattttcacataatcca 29492895  T
204 agtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc 302  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
29492896 agtaatacttatacaa-ttttatcacattaataacctcaatttgccatgaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacgtctttcattgttatc 29492993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 8522854 - 8522948
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || ||||||||||| ||| | ||||||||    
8522854 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 8522948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 287028 - 287343
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
287028 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 287127  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
287128 attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 287227  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
287228 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 287327  T
301 tctccaggatcaactc 316  Q
    |||| ||| |||||||    
287328 tctcaaggttcaactc 287343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 47127007 - 47126692
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47127007 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 47126908  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47126907 attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 47126808  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47126807 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagattcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 47126708  T
301 tctccaggatcaactc 316  Q
    |||| ||| |||||||    
47126707 tctcaaggttcaactc 47126692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 28382762 - 28383065
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28382762 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 28382861  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28382862 attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 28382961  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28382962 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttgccctaaccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 28383061  T
301 tctc 304  Q
    ||||    
28383062 tctc 28383065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 10313653 - 10313953
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10313653 acctatgacttcgttgcttagaacgacaactcaccacttacaattagaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 10313752  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
10313753 attaacaaacataatcaatcaacagcaacacaacagtatacgacagtatgatgtaacaatatcttatacaattcatcgatgtctagcattttcacataat 10313852  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
10313853 ccaagtaatacttatacaa-ttttatcatattaataacctcaattttccataaccagcttcacagatcatcatttatatcctatacatctttcattgcta 10313951  T
301 tc 302  Q
    ||    
10313952 tc 10313953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 40 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 31117190 - 31116934
Alignment:
40 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||    
31117190 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcaattaaatataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaca-----acaacagtat 31117096  T
140 acaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacc 239  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
31117095 acgtcagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattataacataaaccaagtattacttgtacaa-ttttatcacattaataacc 31116997  T
240 tcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc 302  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
31116996 tcaatttgccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatctctcattgctatc 31116934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 40 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 55502885 - 55502629
Alignment:
40 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||    
55502885 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcaattaaatataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaca-----acaacagtat 55502791  T
140 acaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacc 239  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
55502790 acgtcagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattataacataaaccaagtattacttgtacaa-ttttatcacattaataacc 55502692  T
240 tcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc 302  Q
    ||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
55502691 tcaattggccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatctctcattgctatc 55502629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 15280264 - 15279966
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
15280264 acctatgactccattacttataacgacaactcacaacttacaac-cgaaccaacacattgtatattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcattc 15280166  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| || |||    
15280165 atcaacaatcataatcaatcaacagcaacacagcagtatacaacagcgtgatataacagtatcttatgcaattcaacgatgtctaacattttctcacaat 15280066  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
     |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||   | || |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
15280065 -caagtaatacttatacaa-gtttatcatattaataacctcaattcgtcataaccagcttctcatatcatcatttatatcctatacatctttcattgtta 15279968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 16359442 - 16359743
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacaca--ttgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcga 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |      
16359442 acctatgactccgttacttataacgacaactcacaacttacaac-cgaaccaacacacctggtatattctaattgaatgcagttaagtataagccatcat 16359540  T
99 tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacata 198  Q
    |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||  |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| || |    
16359541 tcatcaataatcataatcaattaacagcaacacaatagtatacaacagtgtgatataacagtatcttatgcaattcaacgatgtctaacattttctcaca 16359640  T
199 atccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgc 298  Q
    ||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||   | || |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||     
16359641 atccaagtaatactcatacaa-gtttatcatattaataacctcaattcgtcatagccagcttctcatatcatcatttatatcctatacatctttcattgt 16359739  T
299 tatc 302  Q
    ||||    
16359740 tatc 16359743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 33848844 - 33849011
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaa-cgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
33848844 acctatgactccgttacttagaaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccaacgat 33848943  T
100 cattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatataca-acagcatgatataacaatatctt 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
33848944 cattaacaatcataatcaataaacagcaacacaaacagtatacagacagcgtgatataacaatatctt 33849011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 56115787 - 56115467
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccactt--acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcga 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |    
56115787 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacttttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaaacataaactagcaa 56115688  T
99 tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatataca-acagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcaca 196  Q
    |||  |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||| ||||  | |||| ||||  ||||    
56115687 tcagcaacaatcatactcaatcaacagcaacacaaacagtatacagacaacgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaacattcccaca 56115589  T
197 taatccaagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttc 293  Q
    ||||||||||| | | ||| ||| || ||||| |||   ||||||||||||| | |  |  ||||||||||| ||||| || | |||||||||| |||||    
56115588 taatccaagtaatgcgtatgcaa-ttatatcatattaaaaataacctcaattcatcgcaatcagcttcacagatcatccttaatatcctatacaactttc 56115490  T
294 attgctatctccaggatcaactc 316  Q
    ||||||||| | ||| |||||||    
56115489 attgctatcccaaggttcaactc 56115467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 43251410 - 43251208
Alignment:
104 aacaatcataatcaatcaaccgcaacacaa-caatatacaa-cagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatc 201  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| || ||||||    
43251410 aacaatcatattcaatcaacagcaacacaaacggtatacaaacagcgttatataccaatatcttatgcaattcaacaatgtctaacatttccatataatc 43251311  T
202 caagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgc 298  Q
    ||| || | | ||||||| || ||||| |||   ||||||||||||| | | ||  ||||||||||| |||||||| | ||| |||||| |||||||||     
43251310 caaataatgcgtatacaa-ttatatcatattaaaaataacctcaattcatcataatcagcttcacagatcatcattaatatcatatacaactttcattgt 43251212  T
299 tatc 302  Q
    ||||    
43251211 tatc 43251208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 41791594 - 41791688
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || ||||||||||| ||| | ||||||||    
41791594 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 41791688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 79
Target Start/End: Original strand, 4170950 - 4171027
Alignment:
3 ctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
4170950 ctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 4171027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 79
Target Start/End: Original strand, 14698642 - 14698719
Alignment:
3 ctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
14698642 ctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 14698719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 53387893 - 53387819
Alignment:
6 tgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
53387893 tgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 53387819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 17)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2035165 - 2034850
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2035165 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 2035066  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2035065 attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 2034966  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2034965 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 2034866  T
301 tctccaggatcaactc 316  Q
    |||| ||| |||||||    
2034865 tctcaaggttcaactc 2034850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2038672 - 2038357
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2038672 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 2038573  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2038572 attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 2038473  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2038472 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 2038373  T
301 tctccaggatcaactc 316  Q
    |||| ||| |||||||    
2038372 tctcaaggttcaactc 2038357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2042413 - 2042098
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2042413 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 2042314  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2042313 attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 2042214  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2042213 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 2042114  T
301 tctccaggatcaactc 316  Q
    |||| ||| |||||||    
2042113 tctcaaggttcaactc 2042098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 14041583 - 14041898
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14041583 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 14041682  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14041683 attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 14041782  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14041783 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 14041882  T
301 tctccaggatcaactc 316  Q
    |||| ||| |||||||    
14041883 tctcaaggttcaactc 14041898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 14038115 - 14038430
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14038115 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 14038214  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14038215 attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 14038314  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14038315 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttgccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 14038414  T
301 tctccaggatcaactc 316  Q
    |||| ||| |||||||    
14038415 tctcaaggttcaactc 14038430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 39230663 - 39230978
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
39230663 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcggtc 39230762  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39230763 attaacaatcataatcaatcaacaacaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 39230862  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39230863 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 39230962  T
301 tctccaggatcaactc 316  Q
    |||| ||| |||||||    
39230963 tctcaaggttcaactc 39230978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 18958834 - 18959136
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
18958834 acctataactacgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacatattgtacattctaattgaatgcaattaagtataatccagcgatc 18958933  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
18958934 atcaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacatcagcatgatataacaatatcttatacaattcaacgatgtctagcattttcacataat 18959033  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  | || ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
18959034 ccaggtattacttatacaa-ttttatcacattaataacctcaatttgccatgactagattcacagttcatcgtttatatcctatacgtctttcattgcta 18959132  T
301 tctc 304  Q
    ||||    
18959133 tctc 18959136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 302
Target Start/End: Original strand, 54046655 - 54046953
Alignment:
3 ctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    
54046655 ctatgactccgttacttagaacgacaactcgcaacttacaactcgaaccaacaccttgtatattctaattgaatgcagttaagcataaaccaacaatcat 54046754  T
103 taacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatcc 202  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||     
54046755 caacaatcataatcaatcaacaacaacacaaaagtatacaacagagtgatataacaatatcttatgcaattcaacgatgtctagcatttgcacatgatct 54046854  T
203 aagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc 302  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||   | || |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
54046855 aagtaatacttatacaa-ttttattatataaataacctcaattcctcataaccagcttcacatatcatcatttatatcctatacatctttcatcgctatc 54046953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 15010337 - 15010037
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
15010337 acctatgactccgttacttagaacgacaactctcaacttacaactcgaaccaacaccttgtatattctaattgaatgcagttaagcataaaccatcaatc 15010238  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||    
15010237 atcaacaatcataatcaatcaacaacaacacaacagtatacaacagcgtgatataacaatatcttatgcaattcaatgatgtctagcatttgcacatgat 15010138  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||   |  | ||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
15010137 ctaagtaatacttatacaa-ttttattatattaataacctcaattcctcaaaaccagcttcatagatcatcttttatatcctatacatctttcatcgcta 15010039  T
301 tc 302  Q
    ||    
15010038 tc 15010037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 603827 - 603520
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
603827 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcaacttacaactcgaaccaacaccttatatattctaattgaatgcagttaagcataaacctgcaatc 603728  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacaca-------acaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttc 193  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |    
603727 atcaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaatatacaacatcgtgatataacaatatcttatgcaattcaacgatgtctagcatttgc 603628  T
194 acataatccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttc 293  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||   | || |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
603627 acatgatctaagtaatacttatacaa-ttttattatattaataacctcaattcctcataaccagcttcacatatcatcatttatatcctatacatctttc 603529  T
294 attgctatc 302  Q
    || ||||||    
603528 atcgctatc 603520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10989753 - 10989585
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccactt--acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcga 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||||  ||||| || | |    
10989753 acctatgactcctttacttagaacgacaacttgcaacttttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaaacataaatcaacaa 10989654  T
99 tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatataca-acagcatgatataacaatatctt 165  Q
    |||  |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
10989653 tcagcaacaatcatactcaatcaacagcaacacaaacagtatacagacagcgtgatataacaatatctt 10989585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 54973308 - 54973402
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || ||||||||||| ||| | ||||||||    
54973308 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 54973402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 54975918 - 54976012
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || ||||||||||| ||| | ||||||||    
54975918 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 54976012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 54978528 - 54978622
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || ||||||||||| ||| | ||||||||    
54978528 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 54978622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 10554358 - 10554437
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
10554358 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 10554437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 55292602 - 55292471
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgat 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || ||||||||||| ||| | |||||||| | ||    
55292602 acctatgactccgttacttggaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaat 55292503  T
100 cattaac-aatcataatcaatcaaccgcaaca 130  Q
    ||  | | ||||||| ||||||||| ||||||    
55292502 cagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 55292471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 316
Target Start/End: Original strand, 16800006 - 16800068
Alignment:
255 cagcttcacagttcatcatttaa-atcctatacatctttcattgctatctccaggatcaactc 316  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||    
16800006 cagcttcacagatcatcaattaatatcctatacaactttcattgctatcccaaggttcaactc 16800068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 44620866 - 44621181
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44620866 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 44620965  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44620966 attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 44621065  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44621066 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 44621165  T
301 tctccaggatcaactc 316  Q
    |||| ||| |||||||    
44621166 tctcaaggttcaactc 44621181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41684944 - 41684629
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
41684944 acctatgactccgttacctagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgtagttaagtataaaccagcgatc 41684845  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41684844 attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 41684745  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
41684744 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcgtttaaatcctatacatctttcattgcta 41684645  T
301 tctccaggatcaactc 316  Q
    |||| ||| |||||||    
41684644 tctcaaggttcaactc 41684629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12628071 - 12627771
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
12628071 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcaacttacaactcgaaccaacaccttgtatgttctaattgaatgcagttaagcataaaccagcaatc 12627972  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
12627971 atcaacaatcataatcaatcaacaacaacacaacagtatacaacagcgtgatataacaatatcttatgcaattcaacgatgtctagcatttgcacatgat 12627872  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||   | || |||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
12627871 ctaagtaatacttatacaa-ttttattatactaataacctcaattcctcataaccagtttcacagatcatcatttatatcatatacatctttcatcgcta 12627773  T
301 tc 302  Q
    ||    
12627772 tc 12627771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 40 - 302
Target Start/End: Original strand, 31755900 - 31756156
Alignment:
40 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||    
31755900 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcaattaaatataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaca-----acaacagtat 31755994  T
140 acaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacc 239  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
31755995 acgtcagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattataacataaaccaagtattacttgtacaa-ttttatcacattaataacc 31756093  T
240 tcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc 302  Q
    ||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
31756094 tcaattggccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatctctcattgctatc 31756156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23339350 - 23339045
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaa-cgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
23339350 acctatgactccgttacttagaaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccaacgat 23339251  T
100 cattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatataca-acagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacat 197  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||  | ||||  |||  |||||    
23339250 cattaacaatcataatcaataaacagcaacacaaacagtatacagacagcgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaaaattcccacat 23339152  T
198 aatccaagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttca 294  Q
    |||||||||| | | ||| ||| || ||||| |||   ||||||||||||| | |  |  ||||||||||  ||||| || | |||||||||| ||||||    
23339151 aatccaagtaatgcgtatgcaa-ttatatcatattaaaaataacctcaattcatcacaatcagcttcacacatcatccttaatatcctatacaactttca 23339053  T
295 ttgctatc 302  Q
    ||||||||    
23339052 ttgctatc 23339045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 28349008 - 28349315
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccactt--acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcga 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
28349008 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacttctacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaagcataaaccagcaa 28349107  T
99 tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatatac-aacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcaca 196  Q
    |||  |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| || |    
28349108 tcagcaacaatcatattcaatcaacagcaacacaaacagtatacaaacagcgtgatataacaatatcttatgcaattcaacaatgtctaacatttccata 28349207  T
197 taatccaagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttc 293  Q
    ||||||||||| | | ||||||| || ||||| |||   ||||||||||||| | | ||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||    
28349208 taatccaagtaatgcgtatacaa-ttatatcatattagaaataacctcaattcatcataatcagcttcacagatcatcattaatatcctatacaactttc 28349306  T
294 attgctatc 302  Q
    |||||||||    
28349307 attgctatc 28349315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 79
Target Start/End: Original strand, 31503524 - 31503601
Alignment:
3 ctatgactccgttacttagaacgacaactcgccac-ttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31503524 ctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 31503601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 79
Target Start/End: Original strand, 31506090 - 31506167
Alignment:
3 ctatgactccgttacttagaacgacaactcgccac-ttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31506090 ctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 31506167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21239304 - 21239210
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || ||||||||||| ||| | ||||||||    
21239304 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 21239210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21241854 - 21241760
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || ||||||||||| ||| | ||||||||    
21241854 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 21241760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Original strand, 24504627 - 24504719
Alignment:
3 ctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || ||||||||||| ||| | ||||||||    
24504627 ctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 24504719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 20591283 - 20591253
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaact 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
20591283 acctatgactccgttacttagaacgacaact 20591253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 20631254 - 20631569
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20631254 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 20631353  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20631354 attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 20631453  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20631454 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 20631553  T
301 tctccaggatcaactc 316  Q
    |||| ||| |||||||    
20631554 tctcaaggttcaactc 20631569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 36181513 - 36181828
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36181513 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 36181612  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36181613 attaacaatcataatcaatcaacaacaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 36181712  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36181713 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 36181812  T
301 tctccaggatcaactc 316  Q
    |||| ||| |||||||    
36181813 tctcaaggttcaactc 36181828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14432535 - 14432220
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14432535 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaactaacacattgaacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 14432436  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14432435 attaacaatcacaatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacggcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 14432336  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14432335 ccaagtattacttatacaatttttatcacgttaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 14432236  T
301 tctccaggatcaactc 316  Q
    |||| ||| |||||||    
14432235 tctcaaggttcaactc 14432220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 45307227 - 45307530
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaa-cgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgat 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45307227 acctatgactccgttacttggaaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgat 45307326  T
100 cattaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
45307327 cattaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacgtcagcatgatatgataatattttatacaatccaacgatgtctagcattatcacataa 45307426  T
200 tccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgct 299  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
45307427 accaagtattacttatacaa-ttttatcacattaataacctcaatttgccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatctttcattgct 45307525  T
300 atctc 304  Q
    |||||    
45307526 atctc 45307530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22900433 - 22900133
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22900433 acctatgactccgttacttggaacgacagctcgccacttacaactcgaaccaacacattgttcattctaattgaatgcagttaagtataaatcagcgatc 22900334  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
22900333 attaacaatcataatcaatcaacggcaacacaacagtatacgacagcatgatataacaatatcttatacaattcaatgatgtctagcattttcacataat 22900234  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
22900233 ctaagtattacttatacaa-ttttatcacattaataacctcaatttgccatgaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacgtctttcattgtta 22900135  T
301 tc 302  Q
    ||    
22900134 tc 22900133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 24087357 - 24087656
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |      
24087357 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcaacttacaactcga-ccaacaccttgtatattctaattgaatgtagttaagcataaaccagcaaaa 24087455  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
24087456 atcaacaatcataattaatcaacagcaacacaacaatatacaacagcgtgatataacaatatcttatgcaattcaacgatgtctagcatttgcacatgat 24087555  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||   | || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
24087556 ctaagtaatacttatacaa-ttttattatattaatcacctcaattcctcataaccagcttcacagatcatcatttatatcctatacatctttcatcgcta 24087654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 37358410 - 37358708
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
37358410 acctatgactccgttacttataacgacaactcacaacttacaac-cgaaccaacacattgtatattctaactgaatgcagttaagtataaaccagcattc 37358508  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| || |||    
37358509 atcaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacatcgtgatataacagtatcttatgcaattcaacgatgtctaacattttctcacaat 37358608  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
     |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||   | || |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
37358609 -caagtaatacttatacaa-gtttatcatattaataacctcaattcgtcataaccagcttctcatatcatcatttatatcctatacatctttcattgtta 37358706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 296457 - 296762
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaa-cgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
296457 acctatgactccgttacttagaaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccaacgat 296556  T
100 cattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatataca-acagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacat 197  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||  | |||| ||||  |||||    
296557 cattaacaattataatcaataaacaacaacacaaacagtatacagacagcgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaacattcccacat 296655  T
198 aatccaagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttca 294  Q
    |||||||||| | | ||| ||| || ||||| |||   ||||||||||||| | |  |  ||||||||||  ||||| || | |||||||||| ||||||    
296656 aatccaagtaatgcgtatgcaa-ttatatcatattaaaaataacctcaattcatcacaatcagcttcacacatcatccttaatatcctatacaactttca 296754  T
295 ttgctatc 302  Q
    ||||||||    
296755 ttgctatc 296762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 294136 - 294457
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccactt--acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcga 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||  |||| ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |    
294136 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacttctacaactcgaacttacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaagcataaactagcaa 294235  T
99 tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatatac-aacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcaca 196  Q
    |||  |||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| || |    
294236 tcagcaacaatcatattcaattaacagcaacacaaacagtatacaaacagcgagatataacaatatcttatgcaattcaacaatgtctaacatttccata 294335  T
197 taatccaagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttc 293  Q
    ||||||||||| | | ||||||| || ||||| |||   ||||||||||||| | | ||  |||| |||||| |||||||| | |||||||||| |||||    
294336 taatccaagtaattcgtatacaa-ttatatcatattaaaaataacctcaattcatcataatcagcatcacagatcatcattaatatcctatacaactttc 294434  T
294 attgctatctccaggatcaactc 316  Q
    ||||||||| | ||| |||||||    
294435 attgctatcccaaggttcaactc 294457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 2333154 - 2333058
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccactt-acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagc 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||    
2333154 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaactttacaactcgaactcacaccttgtatattctaattgaatgcagttatgcacaaaccagc 2333058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 20579385 - 20579479
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 94  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||  ||||| | || ||||||||||| ||| | ||||||||    
20579385 acctatggctccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacccgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 20579479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 2)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11056 - 10741
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11056 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 10957  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10956 attaacaatcataatcaatcaacagtaacacaatagtatacaacaacatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 10857  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10856 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 10757  T
301 tctccaggatcaactc 316  Q
    |||| ||| |||||||    
10756 tctcaaggttcaactc 10741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 9093 - 9187
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 94  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || ||||||||||| ||| | ||||||||    
9093 acctatgactcagttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 9187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 14)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16256115 - 16255815
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
16256115 acctatgactccgttacttggaacgacagctcgccacttacaactcgaaccaacacattgttcattctaattgaatgcagttaagtataaatcagcgatc 16256016  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
16256015 attaacaatcataatcaatcaacggcaacacaacagtatacgacagcatgatataacaatatcttatacaattcaatgatgtctagcattttcacataat 16255916  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
16255915 ctaagtattacttatacaa-ttttatcacattaataacctcaatttgccatgaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacgtctttcattgtta 16255817  T
301 tc 302  Q
    ||    
16255816 tc 16255815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22589912 - 22589612
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22589912 acctatgactccgttacttggaacgacagctcgccacttacaactcgaaccaacacattgttcattctaattgaatgcagttaagtataaatcagcgatc 22589813  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
22589812 attaacaatcataatcaatcaacggcaacacaacagtatacgacagcatgatataacaatatcttatacaattcaatgatgtctagcattttcacataat 22589713  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
22589712 ctaagtattacttatacaa-ttttatcacattaataacctcaatttgccatgaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacgtctttcattgtta 22589614  T
301 tc 302  Q
    ||    
22589613 tc 22589612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22593467 - 22593167
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22593467 acctatgactccgttacttggaacgacagctcgccacttacaactcgaaccaacacattgttcattctaattgaatgcagttaagtataaatcagcgatc 22593368  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
22593367 attaacaatcataatcaatcaacggcaacacaacagtatacgacagcatgatataacaatatcttatacaattcaatgatgtctagcattttcacataat 22593268  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
22593267 ctaagtattacttatacaa-ttttatcacattaataacctcaatttgccatgaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacgtctttcattgtta 22593169  T
301 tc 302  Q
    ||    
22593168 tc 22593167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22597022 - 22596722
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22597022 acctatgactccgttacttggaacgacagctcgccacttacaactcgaaccaacacattgttcattctaattgaatgcagttaagtataaatcagcgatc 22596923  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
22596922 attaacaatcataatcaatcaacggcaacacaacagtatacgacagcatgatataacaatatcttatacaattcaatgatgtctagcattttcacataat 22596823  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
22596822 ctaagtattacttatacaa-ttttatcacattaataacctcaatttgccatgaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacgtctttcattgtta 22596724  T
301 tc 302  Q
    ||    
22596723 tc 22596722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16259748 - 16259448
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
16259748 acctatgactccgttacttggaacaacagctcgccacttacaactcgaaccaacacattgttcattctaattgaatgcagttaagtataaatcagcgatc 16259649  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
16259648 attaacaatcataatcaatcaacggcaacacaacagtatacgacagcatgatataacaatatcttatacaattcaatgatgtctagcattttcacataat 16259549  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
16259548 ctaagtattacttatacaa-ttttatcacattaataacctcaatttgccatgaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacgtctttcattgtta 16259450  T
301 tc 302  Q
    ||    
16259449 tc 16259448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 23693396 - 23693699
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
23693396 acctatgactttgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgcacattctaatggaatgccgttaagtataaaccagcgatc 23693495  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23693496 attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacgacatcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 23693595  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccc-tatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   | || ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
23693596 ccaagtattacttatacaatttt-atcacattaatcacctcaattttgtcataaccagcttcacagttcttcatttatatcttatacatctttcattgct 23693694  T
300 atctc 304  Q
    |||||    
23693695 atctc 23693699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 40 - 302
Target Start/End: Original strand, 22880190 - 22880446
Alignment:
40 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||    
22880190 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcaattaaatataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaca-----acaacagtat 22880284  T
140 acaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacc 239  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
22880285 acgtcagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattataacataaaccaagtattacttgtacaa-ttttatcacattaataccc 22880383  T
240 tcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc 302  Q
    ||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
22880384 tcaattggccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatctctcattgctatc 22880446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 4397647 - 4397947
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
4397647 acctatgactccgtttcttataacgacaactcacaacttacaacccgaaccaacaccttgtatattcgaattgaatgcagttaagtataaaccagcattc 4397746  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
4397747 atcaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacaacgtgatataacagtatcttatgcaattcaacgatgtctaacattttcacataat 4397846  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||   | || | |||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
4397847 ccaagtaatacttatacaa-tttgatcatattaataacctcaattcgtcataactagcttctcagatcattatttatatcctatacatctttcattgtta 4397945  T
301 tc 302  Q
    ||    
4397946 tc 4397947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26361263 - 26360965
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
26361263 acctatgactccgtttcttataacgacaactcacaacttacaac-cgaaccaacacattgtatattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcattc 26361165  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| || |||    
26361164 atcaacaatcataatcaatcaacagcaacgcaacagtatacaacagcgtgatataacagtatcttatgcaattcaacgatgtctaacattttctcacaat 26361065  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
     |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||   | || |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
26361064 -caagtaatacttatacaa-gtttatcatattaataacctcaattcgtcataaccagcttctcatatcatcatttatatcctatacatctttcattgtta 26360967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 302
Target Start/End: Original strand, 43121139 - 43121401
Alignment:
40 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaata 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
43121139 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcaattaaatataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaacagcaacacaaacagta 43121238  T
139 taca-acagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatccaagtattacttatacaatttttatcacattaataa 237  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||  | |||| |||| | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
43121239 tacagacagcgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaacattataacataaaccaagtattacttgtacaa-ttttatcacattaataa 43121336  T
238 cctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc 302  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
43121337 cctcaatttgccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatctctcattgctatc 43121401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 302
Target Start/End: Original strand, 43124672 - 43124934
Alignment:
40 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaata 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
43124672 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcaattaaatataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaacagcaacacaaacagta 43124771  T
139 taca-acagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatccaagtattacttatacaatttttatcacattaataa 237  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||  | |||| |||| | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
43124772 tacagacagcgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaacattataacataaaccaagtattacttgtacaa-ttttatcacattaataa 43124869  T
238 cctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc 302  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
43124870 cctcaatttgccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatctctcattgctatc 43124934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22758842 - 22758633
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccactt--acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcga 98  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||||  |||||||||| |    
22758842 acctttgactccattacttagaacgacaacttgcaacttttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaaacataaaccagcaa 22758743  T
99 tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatatac-aacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcaca 196  Q
    |||  |||||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||  | |||| ||||  ||||    
22758742 tcagcaacaatcatactcaatcaatagcaacacaaacagtatacggacagcgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaacattcccaca 22758644  T
197 taatccaagta 207  Q
    |||||||||||    
22758643 taatccaagta 22758633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 26495808 - 26495902
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || ||||||||||| ||| | ||||||||    
26495808 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 26495902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 29325419 - 29325325
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||  ||||| | || ||||||||||| ||| | ||||||||    
29325419 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 29325325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 40 - 302
Target Start/End: Original strand, 33129 - 33385
Alignment:
40 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||    
33129 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcaattaaatataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaca-----acaacagtat 33223  T
140 acaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacc 239  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
33224 acgtcagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattataacataaaccaagtattacttgtacaa-ttttatcacattaataacc 33322  T
240 tcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc 302  Q
    ||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
33323 tcaattggccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatctctcattgctatc 33385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 40 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 81683 - 81427
Alignment:
40 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||    
81683 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcaattaaatataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaca-----acaacagtat 81589  T
140 acaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacc 239  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
81588 acgtcagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattataacataaaccaagtattacttgtacaa-ttttatcacattaataacc 81490  T
240 tcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc 302  Q
    ||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
81489 tcaattggccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatctctcattgctatc 81427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 134149 - 133851
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
134149 acctatgactccgtttcttataacgacaactcacaacttacaac-cgaaccaacacattgtatattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcattc 134051  T
101 attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat 200  Q
    || ||||||||||||||||||||  | ||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| || |||    
134050 atcaacaatcataatcaatcaacatccacacaatggtatacaacagcgtgatataacagtatcttatgcaattcaacgatgtctaacattttctcacaat 133951  T
201 ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta 300  Q
     |||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||   | || |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
133950 -caagtgatacttatacaa-gtttatcatattaataacctcaattcgtcataaccagcttctcatatcatcatttatatcctatacatctttcattgtta 133853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8679 - 8373
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccactt--acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcga 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
8679 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacttttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaagcataaaccagcaa 8580  T
99 tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatatac-aacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcaca 196  Q
    |||  |||||||||| |||||||||  |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||  | |||| ||||  ||||    
8579 tcagcaacaatcatattcaatcaacaacaacacaaacagtatacaaacagcgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaacattcccaca 8481  T
197 taatccaagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttc 293  Q
    ||||||||||| | | ||| ||| || ||||| |||   |||||||| |||| | | ||  ||||||||||| |||||||| | |  ||||||| |||||    
8480 taatccaagtaatgcgtatgcaa-ttatatcatattaaaaataaccttaattcatcataatcagcttcacagatcatcattaatactctatacaactttc 8382  T
294 attgctatc 302  Q
    |||||||||    
8381 attgctatc 8373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 162385 - 162594
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccactt--acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcga 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |    
162385 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacttttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaaacataaactagcaa 162484  T
99 tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatatac-aacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcaca 196  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||  | |||| ||||  ||||    
162485 tcagcaacaatcataatcaatcaacagcaacgcaaacagtatacaaacagcgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaccattcccaca 162583  T
197 taatccaagta 207  Q
    |||||||||||    
162584 taatccaagta 162594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 1638 - 1716
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 79  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1638 acctaagactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 1716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 2440 - 2608
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccactt--acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcga 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||| ||||||  |||||||||| |    
2440 acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacttttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgtagttaaacataaaccagcaa 2539  T
99 tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatataca-acagcatgatataacaatatctt 165  Q
    |||  |||||||||| ||||||||| ||||| | |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
2540 tcagcaacaatcatactcaatcaacagcaacgcaaacagtatacagacagcgtgatataacaatatctt 2608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 137876 - 138044
Alignment:
1 acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccactt--acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcga 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||  |||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||| ||||||  |||||||||| |    
137876 acctatgactccattacttagaacgacaacttgcaaattttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgaagttaaacataaaccagcaa 137975  T
99 tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatataca-acagcatgatataacaatatctt 165  Q
    |||  |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
137976 tcagcaacaatcatactcaatcaacagcaacacaaacagtatacagacagcgtgatataacaatatctt 138044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 302
Target Start/End: Original strand, 22775 - 22976
Alignment:
104 aacaatcataatcaatcaaccgcaacacaa-caatataca-acagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatc 201  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||  | |||| ||||  |||||||||    
22775 aacaatcatactcaatcaacagcaacacaaacagtatacagacagcgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaacattcccacataatc 22873  T
202 caagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgc 298  Q
    |||||| | | ||| ||| || ||||| |||   ||||||||||||| | |  |  ||||||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||    
22874 caagtaatgcgtatgcaa-ttatatcatattaaaaataacctcaattcatcacaatcagcttcacagatcatccttaatatcctatacaactttcattgc 22972  T
299 tatc 302  Q
    ||||    
22973 tatc 22976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University