View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF10366_high_18 (Length: 321)
Name: NF10366_high_18
Description: NF10366
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF10366_high_18 |
 |  |
|
| [»] scaffold0525 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0141 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0049 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0021 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0395 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0023 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0131 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0109 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0003 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0077 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22145568 - 22145253
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22145568 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
22145469 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22145468 |
attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
22145369 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22145368 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
22145269 |
T |
 |
| Q |
301 |
tctccaggatcaactc |
316 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
22145268 |
tctcaaggttcaactc |
22145253 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22059572 - 22059269
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22059572 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaactaacacattgtacaatctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
22059473 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22059472 |
attaacaatcatgatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
22059373 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22059372 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttgccctaaccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatcttttattgcta |
22059273 |
T |
 |
| Q |
301 |
tctc |
304 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
22059272 |
tctc |
22059269 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 17614857 - 17615157
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17614857 |
acctatgactccgttacttagaatgacagctcgccacttacaactcgaaccaacacattgttcattctaattgaatgcagttaagtataaatcagcgatc |
17614956 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17614957 |
attaaccatcataatcaatcaacggcaacacaacagtatacgacagcatgatataacaatatcttatacaattcaatgatgtctagcattttcacataat |
17615056 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
17615057 |
ccaagtattacttatacaa-ttttatcacattaataacctcaatttgccatgaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacgtctttcattgtta |
17615155 |
T |
 |
| Q |
301 |
tc |
302 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
17615156 |
tc |
17615157 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 28853888 - 28854191
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaa-cgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgat |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28853888 |
acctatgactccgttacttagaaacgacaacccgccacttacaacttgaaccaacacattgtacattctaactgaatgcaattaagtataaaccagcgat |
28853987 |
T |
 |
| Q |
100 |
cattaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataa |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28853988 |
cattaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacgtcagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataa |
28854087 |
T |
 |
| Q |
200 |
tccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgct |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28854088 |
accaagtattacttatacga-tcttatcacattaataacctcaatttgccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatcttccattgct |
28854186 |
T |
 |
| Q |
300 |
atctc |
304 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
28854187 |
atctc |
28854191 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24707989 - 24707688
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
24707989 |
acctatgactccgttacttataatgacaactcacaacttacaacccgaaccaacacattgtatattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcattc |
24707890 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataa-tcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataa |
199 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24707889 |
atcaacaatcataattcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcgtgatataacagtatcttatgcaattcaacgatgtctaacattttcacataa |
24707790 |
T |
 |
| Q |
200 |
tccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgct |
299 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | || | |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
24707789 |
tccaagtaatacttatacaa-ttttatcatattaataacctcaatttgtcataacaagcttctcagatcatcatttatatcctatacatctttcattgtt |
24707691 |
T |
 |
| Q |
300 |
atc |
302 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
24707690 |
atc |
24707688 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 10829619 - 10829334
Alignment:
| Q |
16 |
acttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcattaacaatcataat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10829619 |
acttagaacgacaactcgcaacttacaactcgaaccaacaccttgtatattctaattgtttgtagttatgcataaaccagcaatcatcaacaatcataat |
10829520 |
T |
 |
| Q |
116 |
caatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatccaagtattacttat |
215 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
10829519 |
caatcaacagcaacacaacagtatacaacaacgtgatataacaatatcttatgcaattcaacgatgtctagcatttgcacatgatctaagtaatacttat |
10829420 |
T |
 |
| Q |
216 |
acaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc |
302 |
Q |
| |
|
|||| |||||| | | |||||||||||||| | || |||| |||||| | |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10829419 |
acaa-ttttattatactaataacctcaattcctcataaccagtttcacatattatcatttatatcatatacatctttcatcgctatc |
10829334 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 17795334 - 17795639
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaa-cgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgat |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17795334 |
acctatgactccgttacttagaaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtagaaaccagcgat |
17795433 |
T |
 |
| Q |
100 |
cattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatataca-acagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacat |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| | |||| |||| ||||| |
|
|
| T |
17795434 |
cattaacaatcataatcaatcaacagcaacacaaacagtatacagacagcgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaacattcccacat |
17795532 |
T |
 |
| Q |
198 |
aatccaagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttca |
294 |
Q |
| |
|
|||||||||| | | ||| ||| || ||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||| ||||| || | |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17795533 |
aatccaagtaatgcgtatgcaa-ttatatcatattaaaaataacctcaattcatcacaatcagcttcacacatcatccttaatatcctatacaactttca |
17795631 |
T |
 |
| Q |
295 |
ttgctatc |
302 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
17795632 |
ttgctatc |
17795639 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 363889 - 364209
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccactt--acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcga |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||| | |
|
|
| T |
363889 |
acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacttttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaaacataaactagcaa |
363988 |
T |
 |
| Q |
99 |
tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatataca-acagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcaca |
196 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||| |||| | |||| |||| |||| |
|
|
| T |
363989 |
tcagcaacaatcatactcaatcaacagcaacacaaacagtatacagacaacgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaacattcccaca |
364087 |
T |
 |
| Q |
197 |
taatccaagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttc |
293 |
Q |
| |
|
||||||||||| | | ||| ||| || ||||| ||| ||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||| || | |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
364088 |
taatccaagtaatgcgtatgcaa-ttatatcatattaaaaataacctcaattcatcacaatcagcttcacagatcatccttaatatcctatacaactttc |
364186 |
T |
 |
| Q |
294 |
attgctatctccaggatcaactc |
316 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||||||| |
|
|
| T |
364187 |
attgctatcccaaggttcaactc |
364209 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 44431965 - 44432268
Alignment:
| Q |
4 |
tatgactccgttacttagaacgacaactcgccactt--acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatca |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||| |
|
|
| T |
44431965 |
tatgactccgttatttagaacgacaacttgcaacttttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgtagttaaacataaaccatcaatca |
44432064 |
T |
 |
| Q |
102 |
ttaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatataca-acagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataa |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| | |||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
44432065 |
gcaacaatcatactcaatcaacaacaacacaaacaatatacagacagcgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaacattcccacataa |
44432163 |
T |
 |
| Q |
200 |
tccaagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcatt |
296 |
Q |
| |
|
|||||||| | | ||| ||| || ||||| ||| ||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||| || | |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
44432164 |
tccaagtaatgcgtatgcaa-ttatatcatattaaaaataacctcaattcatcacaatcagcttcacagatcatccttaatatcctatacaactttcatt |
44432262 |
T |
 |
| Q |
297 |
gctatc |
302 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
44432263 |
gctatc |
44432268 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 7301258 - 7301164
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
7301258 |
acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaactaacatcttgtataatctaattgaatgcatttatgcataaacca |
7301164 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 45135104 - 45135010
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||| ||||| | | ||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
45135104 |
acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttaccacttgaaccaacatcttgtataattcaattgaatgcatttatgcataaacca |
45135010 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 6608449 - 6608372
Alignment:
| Q |
3 |
ctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca |
79 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
6608449 |
ctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca |
6608372 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 13)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13395646 - 13395331
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13395646 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
13395547 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13395546 |
attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
13395447 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13395446 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
13395347 |
T |
 |
| Q |
301 |
tctccaggatcaactc |
316 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
13395346 |
tctcaaggttcaactc |
13395331 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 48785251 - 48785566
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48785251 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
48785350 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48785351 |
attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
48785450 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48785451 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
48785550 |
T |
 |
| Q |
301 |
tctccaggatcaactc |
316 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
48785551 |
tctcaaggttcaactc |
48785566 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 4993423 - 4993726
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaa-cgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgat |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4993423 |
acctatgactccgttacttagaaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccatcgat |
4993522 |
T |
 |
| Q |
100 |
cattaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataa |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4993523 |
cattaacaatcataatcaatcaacagcaacataacagtatacgtcagcttgatatgataatattttatacaatccaacgatgtctagcattatcacataa |
4993622 |
T |
 |
| Q |
200 |
tccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgct |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4993623 |
accaagtattacttatacaa-ttttatcacattaataacctcaatttgccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatctttcattgct |
4993721 |
T |
 |
| Q |
300 |
atctc |
304 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
4993722 |
atctc |
4993726 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 40 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 124329 - 124073
Alignment:
| Q |
40 |
acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatat |
139 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
124329 |
acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcaattaaatataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaca-----acaacagtat |
124235 |
T |
 |
| Q |
140 |
acaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacc |
239 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
124234 |
acgtcagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattataacataaaccaagtattacttgtacaa-ttttatcacattaataacc |
124136 |
T |
 |
| Q |
240 |
tcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc |
302 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
124135 |
tcaattggccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatctctcattgctatc |
124073 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 35366164 - 35366465
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
35366164 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcaaaacttacaactcgaaccaacaccttgtatattctaattgaatgcaattaagcataaaccagcaatc |
35366263 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
35366264 |
atcaacaatcatattcaatcaacagcaacacaacaatatacaacagcgtgatataacaatatcttatgcaattcaacgatgtctaacatttccatgtaat |
35366363 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacatt-aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgct |
299 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||| |||||||| ||| || |||||||||| | | || ||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35366364 |
ccaagtaatacgtatacaa-ttttatcatattaaacaacctcaattcatcataaccaacttcacagatcatcattaatatcctatacatctttcattgct |
35366462 |
T |
 |
| Q |
300 |
atc |
302 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
35366463 |
atc |
35366465 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13733714 - 13733416
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
13733714 |
acctatgactccgttacttataacgacaactcacaacttacaac-cgaaccaacacattgtatattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcattc |
13733616 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
13733615 |
atcaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacaacgtgatataacagtatcttatgcaattcaacgatgtctaacattttctcataat |
13733516 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
13733515 |
-caagtaatacttatacaa-gtttatcatgttaataacctcaattcgtcataaccagcttctcatatcatcatttatatcctatacatctttcattgtta |
13733418 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21065340 - 21065042
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccactt--acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcga |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||| |||| | |
|
|
| T |
21065340 |
acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacttttacaacgcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaagcacaaatcagcaa |
21065241 |
T |
 |
| Q |
99 |
tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaa-caatatacaa-cagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcaca |
196 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
21065240 |
tca---acaa-------caatcaacagcaacacaaacaatatacaaacaacatgatataacaatatcttatgcaattcaacaatgtctaacatttccata |
21065151 |
T |
 |
| Q |
197 |
taatccaagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaa-atcctatacatcttt |
292 |
Q |
| |
|
||||||||||| | | ||||| |||| || || ||| ||||||||||||| | | || ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
21065150 |
taatccaagtaatgcgtatac-atttataacatattaaaaataacctcaattcatcataatcagcttcacagattatcaattaatatcctatacaacttt |
21065052 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 38828169 - 38828249
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccac-ttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcag |
80 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38828169 |
acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaactttacaactcgaacccacaccttgtatattctaattgaatgcag |
38828249 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 94
Target Start/End: Original strand, 16006343 - 16006434
Alignment:
| Q |
4 |
tatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca |
94 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
16006343 |
tatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca |
16006434 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 8776285 - 8776379
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||| ||||| | | ||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
8776285 |
acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttaccacttgaaccaacatcttgtataattcaattgaatgcatttatgcataaacca |
8776379 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 21743480 - 21743403
Alignment:
| Q |
3 |
ctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca |
79 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
21743480 |
ctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca |
21743403 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 17505960 - 17505886
Alignment:
| Q |
6 |
tgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca |
79 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
17505960 |
tgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca |
17505886 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 79
Target Start/End: Original strand, 17547254 - 17547328
Alignment:
| Q |
6 |
tgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca |
79 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
17547254 |
tgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca |
17547328 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 16102281 - 16102596
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16102281 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
16102380 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16102381 |
attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
16102480 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16102481 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
16102580 |
T |
 |
| Q |
301 |
tctccaggatcaactc |
316 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
16102581 |
tctcaaggttcaactc |
16102596 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 12595895 - 12596198
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12595895 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacagctcggaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
12595994 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12595995 |
attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacaacatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
12596094 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12596095 |
ccaagtattacttatacgatttttatcgcattaataacctcaatttgccctaaccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
12596194 |
T |
 |
| Q |
301 |
tctc |
304 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
12596195 |
tctc |
12596198 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 16812716 - 16813016
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
16812716 |
acctatgactccgttacttataacgacaactcacaacttacaacccgaaccaacaccttgtatattctaattgaatacagttaagtataaaccaacattc |
16812815 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16812816 |
atcaacaatcataatcaatcaacaacaacacaacagtatacaacagcgtgatataacagtatcttatgcaattcaacgatgtctaacattttcacataat |
16812915 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |
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| T |
16812916 |
ccaagtaatacttatacaa-ttttatcatattaataacctcaatttgtcataaccagcttctcagatcatcatttatatcctatacatctttcattgtta |
16813014 |
T |
 |
| Q |
301 |
tc |
302 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
16813015 |
tc |
16813016 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 16829736 - 16830036
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
16829736 |
acctatgactctgttacttataacgacaactaacaacttacaacccgaaccaacaccttgtatattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcattc |
16829835 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16829836 |
atcaacaatcataatcaatcaacatcaacacaacagtatacaacagcgtgatataacagtatcttatgcaattcaacgatgtctaacattttcacataat |
16829935 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |
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|
| T |
16829936 |
ccaagtaatacttatacaa-ttttatcatattaataacctcaatttgtcataaccagcttctcagatcatcatttatatcctatacatctttcattgtta |
16830034 |
T |
 |
| Q |
301 |
tc |
302 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
16830035 |
tc |
16830036 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 29492696 - 29492993
Alignment:
| Q |
4 |
tatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcatt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |
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|
| T |
29492696 |
tatgactccgttacttataacgacatctcacaacttacaacccgaacccacaccttgtatattctaattgaatgcggttaagtataggccagcattcatc |
29492795 |
T |
 |
| Q |
104 |
aacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatcca |
203 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29492796 |
aacaatcacaatcaatcaacaacaacacaacagtatacaacagcgtgatataacagtagcttatgcaattcaacgatgtctaacattttcacataatcca |
29492895 |
T |
 |
| Q |
204 |
agtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc |
302 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
29492896 |
agtaatacttatacaa-ttttatcacattaataacctcaatttgccatgaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacgtctttcattgttatc |
29492993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 8522854 - 8522948
Alignment:
| Q |
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94 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8522854 |
acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca |
8522948 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 287028 - 287343
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
287028 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
287127 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
287128 |
attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
287227 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
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| T |
287228 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
287327 |
T |
 |
| Q |
301 |
tctccaggatcaactc |
316 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| |
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| T |
287328 |
tctcaaggttcaactc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 47127007 - 47126692
Alignment:
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47127007 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
47126908 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47126907 |
attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
47126808 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47126807 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagattcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
47126708 |
T |
 |
| Q |
301 |
tctccaggatcaactc |
316 |
Q |
| |
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|||| ||| ||||||| |
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|
| T |
47126707 |
tctcaaggttcaactc |
47126692 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 28382762 - 28383065
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28382762 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
28382861 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28382862 |
attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
28382961 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28382962 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttgccctaaccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
28383061 |
T |
 |
| Q |
301 |
tctc |
304 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
28383062 |
tctc |
28383065 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 10313653 - 10313953
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10313653 |
acctatgacttcgttgcttagaacgacaactcaccacttacaattagaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
10313752 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10313753 |
attaacaaacataatcaatcaacagcaacacaacagtatacgacagtatgatgtaacaatatcttatacaattcatcgatgtctagcattttcacataat |
10313852 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10313853 |
ccaagtaatacttatacaa-ttttatcatattaataacctcaattttccataaccagcttcacagatcatcatttatatcctatacatctttcattgcta |
10313951 |
T |
 |
| Q |
301 |
tc |
302 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
10313952 |
tc |
10313953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 40 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 31117190 - 31116934
Alignment:
| Q |
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139 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
31117190 |
acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcaattaaatataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaca-----acaacagtat |
31117096 |
T |
 |
| Q |
140 |
acaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacc |
239 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31117095 |
acgtcagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattataacataaaccaagtattacttgtacaa-ttttatcacattaataacc |
31116997 |
T |
 |
| Q |
240 |
tcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc |
302 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31116996 |
tcaatttgccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatctctcattgctatc |
31116934 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 40 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 55502885 - 55502629
Alignment:
| Q |
40 |
acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatat |
139 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
55502885 |
acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcaattaaatataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaca-----acaacagtat |
55502791 |
T |
 |
| Q |
140 |
acaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacc |
239 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55502790 |
acgtcagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattataacataaaccaagtattacttgtacaa-ttttatcacattaataacc |
55502692 |
T |
 |
| Q |
240 |
tcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc |
302 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
55502691 |
tcaattggccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatctctcattgctatc |
55502629 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 15280264 - 15279966
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
15280264 |
acctatgactccattacttataacgacaactcacaacttacaac-cgaaccaacacattgtatattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcattc |
15280166 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||| |
|
|
| T |
15280165 |
atcaacaatcataatcaatcaacagcaacacagcagtatacaacagcgtgatataacagtatcttatgcaattcaacgatgtctaacattttctcacaat |
15280066 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
15280065 |
-caagtaatacttatacaa-gtttatcatattaataacctcaattcgtcataaccagcttctcatatcatcatttatatcctatacatctttcattgtta |
15279968 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 16359442 - 16359743
Alignment:
| Q |
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98 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
16359442 |
acctatgactccgttacttataacgacaactcacaacttacaac-cgaaccaacacacctggtatattctaattgaatgcagttaagtataagccatcat |
16359540 |
T |
 |
| Q |
99 |
tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacata |
198 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| || | |
|
|
| T |
16359541 |
tcatcaataatcataatcaattaacagcaacacaatagtatacaacagtgtgatataacagtatcttatgcaattcaacgatgtctaacattttctcaca |
16359640 |
T |
 |
| Q |
199 |
atccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgc |
298 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16359641 |
atccaagtaatactcatacaa-gtttatcatattaataacctcaattcgtcatagccagcttctcatatcatcatttatatcctatacatctttcattgt |
16359739 |
T |
 |
| Q |
299 |
tatc |
302 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
16359740 |
tatc |
16359743 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 33848844 - 33849011
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaa-cgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgat |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
33848844 |
acctatgactccgttacttagaaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccaacgat |
33848943 |
T |
 |
| Q |
100 |
cattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatataca-acagcatgatataacaatatctt |
165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33848944 |
cattaacaatcataatcaataaacagcaacacaaacagtatacagacagcgtgatataacaatatctt |
33849011 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 56115787 - 56115467
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccactt--acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcga |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||| | |
|
|
| T |
56115787 |
acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacttttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaaacataaactagcaa |
56115688 |
T |
 |
| Q |
99 |
tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatataca-acagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcaca |
196 |
Q |
| |
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||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||| |||| | |||| |||| |||| |
|
|
| T |
56115687 |
tcagcaacaatcatactcaatcaacagcaacacaaacagtatacagacaacgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaacattcccaca |
56115589 |
T |
 |
| Q |
197 |
taatccaagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttc |
293 |
Q |
| |
|
||||||||||| | | ||| ||| || ||||| ||| ||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||| || | |||||||||| ||||| |
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|
| T |
56115588 |
taatccaagtaatgcgtatgcaa-ttatatcatattaaaaataacctcaattcatcgcaatcagcttcacagatcatccttaatatcctatacaactttc |
56115490 |
T |
 |
| Q |
294 |
attgctatctccaggatcaactc |
316 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||||||| |
|
|
| T |
56115489 |
attgctatcccaaggttcaactc |
56115467 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 43251410 - 43251208
Alignment:
| Q |
104 |
aacaatcataatcaatcaaccgcaacacaa-caatatacaa-cagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatc |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| || |||||| |
|
|
| T |
43251410 |
aacaatcatattcaatcaacagcaacacaaacggtatacaaacagcgttatataccaatatcttatgcaattcaacaatgtctaacatttccatataatc |
43251311 |
T |
 |
| Q |
202 |
caagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgc |
298 |
Q |
| |
|
||| || | | ||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| | | || ||||||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43251310 |
caaataatgcgtatacaa-ttatatcatattaaaaataacctcaattcatcataatcagcttcacagatcatcattaatatcatatacaactttcattgt |
43251212 |
T |
 |
| Q |
299 |
tatc |
302 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
43251211 |
tatc |
43251208 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 41791594 - 41791688
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
41791594 |
acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca |
41791688 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 79
Target Start/End: Original strand, 4170950 - 4171027
Alignment:
| Q |
3 |
ctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca |
79 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
4170950 |
ctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca |
4171027 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 79
Target Start/End: Original strand, 14698642 - 14698719
Alignment:
| Q |
3 |
ctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca |
79 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
14698642 |
ctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca |
14698719 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 53387893 - 53387819
Alignment:
| Q |
6 |
tgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca |
79 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
53387893 |
tgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca |
53387819 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 17)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2035165 - 2034850
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2035165 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
2035066 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2035065 |
attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
2034966 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2034965 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
2034866 |
T |
 |
| Q |
301 |
tctccaggatcaactc |
316 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
2034865 |
tctcaaggttcaactc |
2034850 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2038672 - 2038357
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2038672 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
2038573 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2038572 |
attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
2038473 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2038472 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
2038373 |
T |
 |
| Q |
301 |
tctccaggatcaactc |
316 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
2038372 |
tctcaaggttcaactc |
2038357 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2042413 - 2042098
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2042413 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
2042314 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2042313 |
attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
2042214 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2042213 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
2042114 |
T |
 |
| Q |
301 |
tctccaggatcaactc |
316 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
2042113 |
tctcaaggttcaactc |
2042098 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 14041583 - 14041898
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14041583 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
14041682 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14041683 |
attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
14041782 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14041783 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
14041882 |
T |
 |
| Q |
301 |
tctccaggatcaactc |
316 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
14041883 |
tctcaaggttcaactc |
14041898 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 14038115 - 14038430
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14038115 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
14038214 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14038215 |
attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
14038314 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14038315 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttgccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
14038414 |
T |
 |
| Q |
301 |
tctccaggatcaactc |
316 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
14038415 |
tctcaaggttcaactc |
14038430 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 39230663 - 39230978
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
39230663 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcggtc |
39230762 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39230763 |
attaacaatcataatcaatcaacaacaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
39230862 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39230863 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
39230962 |
T |
 |
| Q |
301 |
tctccaggatcaactc |
316 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
39230963 |
tctcaaggttcaactc |
39230978 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 18958834 - 18959136
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18958834 |
acctataactacgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacatattgtacattctaattgaatgcaattaagtataatccagcgatc |
18958933 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18958934 |
atcaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacatcagcatgatataacaatatcttatacaattcaacgatgtctagcattttcacataat |
18959033 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | || ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18959034 |
ccaggtattacttatacaa-ttttatcacattaataacctcaatttgccatgactagattcacagttcatcgtttatatcctatacgtctttcattgcta |
18959132 |
T |
 |
| Q |
301 |
tctc |
304 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
18959133 |
tctc |
18959136 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 302
Target Start/End: Original strand, 54046655 - 54046953
Alignment:
| Q |
3 |
ctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcat |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |
|
|
| T |
54046655 |
ctatgactccgttacttagaacgacaactcgcaacttacaactcgaaccaacaccttgtatattctaattgaatgcagttaagcataaaccaacaatcat |
54046754 |
T |
 |
| Q |
103 |
taacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatcc |
202 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
54046755 |
caacaatcataatcaatcaacaacaacacaaaagtatacaacagagtgatataacaatatcttatgcaattcaacgatgtctagcatttgcacatgatct |
54046854 |
T |
 |
| Q |
203 |
aagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc |
302 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||| | || ||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
54046855 |
aagtaatacttatacaa-ttttattatataaataacctcaattcctcataaccagcttcacatatcatcatttatatcctatacatctttcatcgctatc |
54046953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 15010337 - 15010037
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |
|
|
| T |
15010337 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactctcaacttacaactcgaaccaacaccttgtatattctaattgaatgcagttaagcataaaccatcaatc |
15010238 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
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|| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| || |
|
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| T |
15010237 |
atcaacaatcataatcaatcaacaacaacacaacagtatacaacagcgtgatataacaatatcttatgcaattcaatgatgtctagcatttgcacatgat |
15010138 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15010137 |
ctaagtaatacttatacaa-ttttattatattaataacctcaattcctcaaaaccagcttcatagatcatcttttatatcctatacatctttcatcgcta |
15010039 |
T |
 |
| Q |
301 |
tc |
302 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
15010038 |
tc |
15010037 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 603827 - 603520
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |
|
|
| T |
603827 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcaacttacaactcgaaccaacaccttatatattctaattgaatgcagttaagcataaacctgcaatc |
603728 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacaca-------acaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttc |
193 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
603727 |
atcaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaatatacaacatcgtgatataacaatatcttatgcaattcaacgatgtctagcatttgc |
603628 |
T |
 |
| Q |
194 |
acataatccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttc |
293 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
603627 |
acatgatctaagtaatacttatacaa-ttttattatattaataacctcaattcctcataaccagcttcacatatcatcatttatatcctatacatctttc |
603529 |
T |
 |
| Q |
294 |
attgctatc |
302 |
Q |
| |
|
|| |||||| |
|
|
| T |
603528 |
atcgctatc |
603520 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10989753 - 10989585
Alignment:
| Q |
1 |
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98 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| || | | |
|
|
| T |
10989753 |
acctatgactcctttacttagaacgacaacttgcaacttttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaaacataaatcaacaa |
10989654 |
T |
 |
| Q |
99 |
tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatataca-acagcatgatataacaatatctt |
165 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10989653 |
tcagcaacaatcatactcaatcaacagcaacacaaacagtatacagacagcgtgatataacaatatctt |
10989585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 54973308 - 54973402
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
54973308 |
acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca |
54973402 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 54975918 - 54976012
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
54975918 |
acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca |
54976012 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 54978528 - 54978622
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
54978528 |
acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca |
54978622 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 10554358 - 10554437
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca |
79 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
10554358 |
acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca |
10554437 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 55292602 - 55292471
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgat |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||| | |||||||| | || |
|
|
| T |
55292602 |
acctatgactccgttacttggaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaat |
55292503 |
T |
 |
| Q |
100 |
cattaac-aatcataatcaatcaaccgcaaca |
130 |
Q |
| |
|
|| | | ||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
55292502 |
cagcagcaaatcatattcaatcaacagcaaca |
55292471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 316
Target Start/End: Original strand, 16800006 - 16800068
Alignment:
| Q |
255 |
cagcttcacagttcatcatttaa-atcctatacatctttcattgctatctccaggatcaactc |
316 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| |
|
|
| T |
16800006 |
cagcttcacagatcatcaattaatatcctatacaactttcattgctatcccaaggttcaactc |
16800068 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 44620866 - 44621181
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44620866 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
44620965 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44620966 |
attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
44621065 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44621066 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
44621165 |
T |
 |
| Q |
301 |
tctccaggatcaactc |
316 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
44621166 |
tctcaaggttcaactc |
44621181 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41684944 - 41684629
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41684944 |
acctatgactccgttacctagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgtagttaagtataaaccagcgatc |
41684845 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41684844 |
attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
41684745 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41684744 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcgtttaaatcctatacatctttcattgcta |
41684645 |
T |
 |
| Q |
301 |
tctccaggatcaactc |
316 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
41684644 |
tctcaaggttcaactc |
41684629 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12628071 - 12627771
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
12628071 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcaacttacaactcgaaccaacaccttgtatgttctaattgaatgcagttaagcataaaccagcaatc |
12627972 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
12627971 |
atcaacaatcataatcaatcaacaacaacacaacagtatacaacagcgtgatataacaatatcttatgcaattcaacgatgtctagcatttgcacatgat |
12627872 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||||| | || |||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12627871 |
ctaagtaatacttatacaa-ttttattatactaataacctcaattcctcataaccagtttcacagatcatcatttatatcatatacatctttcatcgcta |
12627773 |
T |
 |
| Q |
301 |
tc |
302 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
12627772 |
tc |
12627771 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 40 - 302
Target Start/End: Original strand, 31755900 - 31756156
Alignment:
| Q |
40 |
acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatat |
139 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
31755900 |
acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcaattaaatataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaca-----acaacagtat |
31755994 |
T |
 |
| Q |
140 |
acaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacc |
239 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31755995 |
acgtcagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattataacataaaccaagtattacttgtacaa-ttttatcacattaataacc |
31756093 |
T |
 |
| Q |
240 |
tcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc |
302 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31756094 |
tcaattggccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatctctcattgctatc |
31756156 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23339350 - 23339045
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaa-cgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgat |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
23339350 |
acctatgactccgttacttagaaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccaacgat |
23339251 |
T |
 |
| Q |
100 |
cattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatataca-acagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacat |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| | |||| ||| ||||| |
|
|
| T |
23339250 |
cattaacaatcataatcaataaacagcaacacaaacagtatacagacagcgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaaaattcccacat |
23339152 |
T |
 |
| Q |
198 |
aatccaagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttca |
294 |
Q |
| |
|
|||||||||| | | ||| ||| || ||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||| ||||| || | |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23339151 |
aatccaagtaatgcgtatgcaa-ttatatcatattaaaaataacctcaattcatcacaatcagcttcacacatcatccttaatatcctatacaactttca |
23339053 |
T |
 |
| Q |
295 |
ttgctatc |
302 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
23339052 |
ttgctatc |
23339045 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 28349008 - 28349315
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccactt--acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcga |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
28349008 |
acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacttctacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaagcataaaccagcaa |
28349107 |
T |
 |
| Q |
99 |
tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatatac-aacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcaca |
196 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
28349108 |
tcagcaacaatcatattcaatcaacagcaacacaaacagtatacaaacagcgtgatataacaatatcttatgcaattcaacaatgtctaacatttccata |
28349207 |
T |
 |
| Q |
197 |
taatccaagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttc |
293 |
Q |
| |
|
||||||||||| | | ||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| | | || ||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28349208 |
taatccaagtaatgcgtatacaa-ttatatcatattagaaataacctcaattcatcataatcagcttcacagatcatcattaatatcctatacaactttc |
28349306 |
T |
 |
| Q |
294 |
attgctatc |
302 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
28349307 |
attgctatc |
28349315 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 79
Target Start/End: Original strand, 31503524 - 31503601
Alignment:
| Q |
3 |
ctatgactccgttacttagaacgacaactcgccac-ttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca |
79 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31503524 |
ctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca |
31503601 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 79
Target Start/End: Original strand, 31506090 - 31506167
Alignment:
| Q |
3 |
ctatgactccgttacttagaacgacaactcgccac-ttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca |
79 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
31506090 |
ctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca |
31506167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21239304 - 21239210
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
21239304 |
acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca |
21239210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21241854 - 21241760
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
21241854 |
acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca |
21241760 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Original strand, 24504627 - 24504719
Alignment:
| Q |
3 |
ctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
24504627 |
ctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca |
24504719 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 20591283 - 20591253
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaact |
31 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20591283 |
acctatgactccgttacttagaacgacaact |
20591253 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 20631254 - 20631569
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20631254 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
20631353 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20631354 |
attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
20631453 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20631454 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
20631553 |
T |
 |
| Q |
301 |
tctccaggatcaactc |
316 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
20631554 |
tctcaaggttcaactc |
20631569 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 36181513 - 36181828
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36181513 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
36181612 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36181613 |
attaacaatcataatcaatcaacaacaacacaacagtatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
36181712 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36181713 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
36181812 |
T |
 |
| Q |
301 |
tctccaggatcaactc |
316 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
36181813 |
tctcaaggttcaactc |
36181828 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14432535 - 14432220
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14432535 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaactaacacattgaacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
14432436 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14432435 |
attaacaatcacaatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacggcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
14432336 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14432335 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacgttaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
14432236 |
T |
 |
| Q |
301 |
tctccaggatcaactc |
316 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
14432235 |
tctcaaggttcaactc |
14432220 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 45307227 - 45307530
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaa-cgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgat |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45307227 |
acctatgactccgttacttggaaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgat |
45307326 |
T |
 |
| Q |
100 |
cattaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataa |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
45307327 |
cattaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacgtcagcatgatatgataatattttatacaatccaacgatgtctagcattatcacataa |
45307426 |
T |
 |
| Q |
200 |
tccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgct |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45307427 |
accaagtattacttatacaa-ttttatcacattaataacctcaatttgccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatctttcattgct |
45307525 |
T |
 |
| Q |
300 |
atctc |
304 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
45307526 |
atctc |
45307530 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22900433 - 22900133
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22900433 |
acctatgactccgttacttggaacgacagctcgccacttacaactcgaaccaacacattgttcattctaattgaatgcagttaagtataaatcagcgatc |
22900334 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22900333 |
attaacaatcataatcaatcaacggcaacacaacagtatacgacagcatgatataacaatatcttatacaattcaatgatgtctagcattttcacataat |
22900234 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
22900233 |
ctaagtattacttatacaa-ttttatcacattaataacctcaatttgccatgaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacgtctttcattgtta |
22900135 |
T |
 |
| Q |
301 |
tc |
302 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
22900134 |
tc |
22900133 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 24087357 - 24087656
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
24087357 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcaacttacaactcga-ccaacaccttgtatattctaattgaatgtagttaagcataaaccagcaaaa |
24087455 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
24087456 |
atcaacaatcataattaatcaacagcaacacaacaatatacaacagcgtgatataacaatatcttatgcaattcaacgatgtctagcatttgcacatgat |
24087555 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
24087556 |
ctaagtaatacttatacaa-ttttattatattaatcacctcaattcctcataaccagcttcacagatcatcatttatatcctatacatctttcatcgcta |
24087654 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 37358410 - 37358708
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
37358410 |
acctatgactccgttacttataacgacaactcacaacttacaac-cgaaccaacacattgtatattctaactgaatgcagttaagtataaaccagcattc |
37358508 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||| |
|
|
| T |
37358509 |
atcaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacatcgtgatataacagtatcttatgcaattcaacgatgtctaacattttctcacaat |
37358608 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
37358609 |
-caagtaatacttatacaa-gtttatcatattaataacctcaattcgtcataaccagcttctcatatcatcatttatatcctatacatctttcattgtta |
37358706 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 296457 - 296762
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaa-cgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgat |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
296457 |
acctatgactccgttacttagaaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccaacgat |
296556 |
T |
 |
| Q |
100 |
cattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatataca-acagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacat |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| | |||| |||| ||||| |
|
|
| T |
296557 |
cattaacaattataatcaataaacaacaacacaaacagtatacagacagcgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaacattcccacat |
296655 |
T |
 |
| Q |
198 |
aatccaagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttca |
294 |
Q |
| |
|
|||||||||| | | ||| ||| || ||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||| ||||| || | |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
296656 |
aatccaagtaatgcgtatgcaa-ttatatcatattaaaaataacctcaattcatcacaatcagcttcacacatcatccttaatatcctatacaactttca |
296754 |
T |
 |
| Q |
295 |
ttgctatc |
302 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
296755 |
ttgctatc |
296762 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 294136 - 294457
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccactt--acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcga |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | |
|
|
| T |
294136 |
acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacttctacaactcgaacttacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaagcataaactagcaa |
294235 |
T |
 |
| Q |
99 |
tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatatac-aacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcaca |
196 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
294236 |
tcagcaacaatcatattcaattaacagcaacacaaacagtatacaaacagcgagatataacaatatcttatgcaattcaacaatgtctaacatttccata |
294335 |
T |
 |
| Q |
197 |
taatccaagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttc |
293 |
Q |
| |
|
||||||||||| | | ||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| | | || |||| |||||| |||||||| | |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
294336 |
taatccaagtaattcgtatacaa-ttatatcatattaaaaataacctcaattcatcataatcagcatcacagatcatcattaatatcctatacaactttc |
294434 |
T |
 |
| Q |
294 |
attgctatctccaggatcaactc |
316 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||||||| |
|
|
| T |
294435 |
attgctatcccaaggttcaactc |
294457 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 2333154 - 2333058
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccactt-acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagc |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||| |
|
|
| T |
2333154 |
acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaactttacaactcgaactcacaccttgtatattctaattgaatgcagttatgcacaaaccagc |
2333058 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 20579385 - 20579479
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1 |
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| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
20579385 |
acctatggctccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacccgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca |
20579479 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0525 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 2)
Name: scaffold0525
Description:
Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11056 - 10741
Alignment:
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1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11056 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
10957 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10956 |
attaacaatcataatcaatcaacagtaacacaatagtatacaacaacatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
10857 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10856 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
10757 |
T |
 |
| Q |
301 |
tctccaggatcaactc |
316 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
10756 |
tctcaaggttcaactc |
10741 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 9093 - 9187
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
9093 |
acctatgactcagttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca |
9187 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 14)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16256115 - 16255815
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16256115 |
acctatgactccgttacttggaacgacagctcgccacttacaactcgaaccaacacattgttcattctaattgaatgcagttaagtataaatcagcgatc |
16256016 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16256015 |
attaacaatcataatcaatcaacggcaacacaacagtatacgacagcatgatataacaatatcttatacaattcaatgatgtctagcattttcacataat |
16255916 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
16255915 |
ctaagtattacttatacaa-ttttatcacattaataacctcaatttgccatgaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacgtctttcattgtta |
16255817 |
T |
 |
| Q |
301 |
tc |
302 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
16255816 |
tc |
16255815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22589912 - 22589612
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22589912 |
acctatgactccgttacttggaacgacagctcgccacttacaactcgaaccaacacattgttcattctaattgaatgcagttaagtataaatcagcgatc |
22589813 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22589812 |
attaacaatcataatcaatcaacggcaacacaacagtatacgacagcatgatataacaatatcttatacaattcaatgatgtctagcattttcacataat |
22589713 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
22589712 |
ctaagtattacttatacaa-ttttatcacattaataacctcaatttgccatgaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacgtctttcattgtta |
22589614 |
T |
 |
| Q |
301 |
tc |
302 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
22589613 |
tc |
22589612 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22593467 - 22593167
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22593467 |
acctatgactccgttacttggaacgacagctcgccacttacaactcgaaccaacacattgttcattctaattgaatgcagttaagtataaatcagcgatc |
22593368 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22593367 |
attaacaatcataatcaatcaacggcaacacaacagtatacgacagcatgatataacaatatcttatacaattcaatgatgtctagcattttcacataat |
22593268 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
22593267 |
ctaagtattacttatacaa-ttttatcacattaataacctcaatttgccatgaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacgtctttcattgtta |
22593169 |
T |
 |
| Q |
301 |
tc |
302 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
22593168 |
tc |
22593167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22597022 - 22596722
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22597022 |
acctatgactccgttacttggaacgacagctcgccacttacaactcgaaccaacacattgttcattctaattgaatgcagttaagtataaatcagcgatc |
22596923 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22596922 |
attaacaatcataatcaatcaacggcaacacaacagtatacgacagcatgatataacaatatcttatacaattcaatgatgtctagcattttcacataat |
22596823 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
22596822 |
ctaagtattacttatacaa-ttttatcacattaataacctcaatttgccatgaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacgtctttcattgtta |
22596724 |
T |
 |
| Q |
301 |
tc |
302 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
22596723 |
tc |
22596722 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16259748 - 16259448
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16259748 |
acctatgactccgttacttggaacaacagctcgccacttacaactcgaaccaacacattgttcattctaattgaatgcagttaagtataaatcagcgatc |
16259649 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16259648 |
attaacaatcataatcaatcaacggcaacacaacagtatacgacagcatgatataacaatatcttatacaattcaatgatgtctagcattttcacataat |
16259549 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
16259548 |
ctaagtattacttatacaa-ttttatcacattaataacctcaatttgccatgaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacgtctttcattgtta |
16259450 |
T |
 |
| Q |
301 |
tc |
302 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
16259449 |
tc |
16259448 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 23693396 - 23693699
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23693396 |
acctatgactttgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgcacattctaatggaatgccgttaagtataaaccagcgatc |
23693495 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23693496 |
attaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacgacatcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
23693595 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccc-tatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgct |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23693596 |
ccaagtattacttatacaatttt-atcacattaatcacctcaattttgtcataaccagcttcacagttcttcatttatatcttatacatctttcattgct |
23693694 |
T |
 |
| Q |
300 |
atctc |
304 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
23693695 |
atctc |
23693699 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 40 - 302
Target Start/End: Original strand, 22880190 - 22880446
Alignment:
| Q |
40 |
acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatat |
139 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
22880190 |
acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcaattaaatataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaca-----acaacagtat |
22880284 |
T |
 |
| Q |
140 |
acaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacc |
239 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |
|
|
| T |
22880285 |
acgtcagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattataacataaaccaagtattacttgtacaa-ttttatcacattaataccc |
22880383 |
T |
 |
| Q |
240 |
tcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc |
302 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22880384 |
tcaattggccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatctctcattgctatc |
22880446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 4397647 - 4397947
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
4397647 |
acctatgactccgtttcttataacgacaactcacaacttacaacccgaaccaacaccttgtatattcgaattgaatgcagttaagtataaaccagcattc |
4397746 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4397747 |
atcaacaatcataatcaatcaacagcaacacaacagtatacaacaacgtgatataacagtatcttatgcaattcaacgatgtctaacattttcacataat |
4397846 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| | || | |||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
4397847 |
ccaagtaatacttatacaa-tttgatcatattaataacctcaattcgtcataactagcttctcagatcattatttatatcctatacatctttcattgtta |
4397945 |
T |
 |
| Q |
301 |
tc |
302 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
4397946 |
tc |
4397947 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26361263 - 26360965
Alignment:
| Q |
1 |
acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
26361263 |
acctatgactccgtttcttataacgacaactcacaacttacaac-cgaaccaacacattgtatattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcattc |
26361165 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||| |
|
|
| T |
26361164 |
atcaacaatcataatcaatcaacagcaacgcaacagtatacaacagcgtgatataacagtatcttatgcaattcaacgatgtctaacattttctcacaat |
26361065 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
26361064 |
-caagtaatacttatacaa-gtttatcatattaataacctcaattcgtcataaccagcttctcatatcatcatttatatcctatacatctttcattgtta |
26360967 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 302
Target Start/End: Original strand, 43121139 - 43121401
Alignment:
| Q |
40 |
acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaata |
138 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |
|
|
| T |
43121139 |
acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcaattaaatataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaacagcaacacaaacagta |
43121238 |
T |
 |
| Q |
139 |
taca-acagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatccaagtattacttatacaatttttatcacattaataa |
237 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| | |||| |||| | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43121239 |
tacagacagcgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaacattataacataaaccaagtattacttgtacaa-ttttatcacattaataa |
43121336 |
T |
 |
| Q |
238 |
cctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc |
302 |
Q |
| |
|
||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
43121337 |
cctcaatttgccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatctctcattgctatc |
43121401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 302
Target Start/End: Original strand, 43124672 - 43124934
Alignment:
| Q |
40 |
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138 |
Q |
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| T |
43124672 |
acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcaattaaatataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaacagcaacacaaacagta |
43124771 |
T |
 |
| Q |
139 |
taca-acagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatccaagtattacttatacaatttttatcacattaataa |
237 |
Q |
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| T |
43124772 |
tacagacagcgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaacattataacataaaccaagtattacttgtacaa-ttttatcacattaataa |
43124869 |
T |
 |
| Q |
238 |
cctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc |
302 |
Q |
| |
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| T |
43124870 |
cctcaatttgccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatctctcattgctatc |
43124934 |
T |
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Target: chr5; HSP #12
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Target Start/End: Complemental strand, 22758842 - 22758633
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Q |
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| T |
22758842 |
acctttgactccattacttagaacgacaacttgcaacttttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaaacataaaccagcaa |
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T |
 |
| Q |
99 |
tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatatac-aacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcaca |
196 |
Q |
| |
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| T |
22758742 |
tcagcaacaatcatactcaatcaatagcaacacaaacagtatacggacagcgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaacattcccaca |
22758644 |
T |
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| Q |
197 |
taatccaagta |
207 |
Q |
| |
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||||||||||| |
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|
| T |
22758643 |
taatccaagta |
22758633 |
T |
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Target: chr5; HSP #13
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94 |
Q |
| |
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|
| T |
26495808 |
acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca |
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T |
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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
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Q |
| |
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| T |
29325419 |
acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca |
29325325 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
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Target: scaffold0141; HSP #1
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| |
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| T |
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acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcaattaaatataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaca-----acaacagtat |
33223 |
T |
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| Q |
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239 |
Q |
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| T |
33224 |
acgtcagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattataacataaaccaagtattacttgtacaa-ttttatcacattaataacc |
33322 |
T |
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| Q |
240 |
tcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc |
302 |
Q |
| |
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| T |
33323 |
tcaattggccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatctctcattgctatc |
33385 |
T |
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Target: scaffold0049 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold0049; HSP #1
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139 |
Q |
| |
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| T |
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acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcaattaaatataaaccagcgatcattaacaatcataatcaatcaaca-----acaacagtat |
81589 |
T |
 |
| Q |
140 |
acaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataatccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacc |
239 |
Q |
| |
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| T |
81588 |
acgtcagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattataacataaaccaagtattacttgtacaa-ttttatcacattaataacc |
81490 |
T |
 |
| Q |
240 |
tcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgctatc |
302 |
Q |
| |
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| T |
81489 |
tcaattggccataaccagcttcacagttcatcatttatatcctatacatctctcattgctatc |
81427 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:
Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 134149 - 133851
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Q |
| |
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| T |
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acctatgactccgtttcttataacgacaactcacaacttacaac-cgaaccaacacattgtatattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcattc |
134051 |
T |
 |
| Q |
101 |
attaacaatcataatcaatcaaccgcaacacaacaatatacaacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcacataat |
200 |
Q |
| |
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| T |
134050 |
atcaacaatcataatcaatcaacatccacacaatggtatacaacagcgtgatataacagtatcttatgcaattcaacgatgtctaacattttctcacaat |
133951 |
T |
 |
| Q |
201 |
ccaagtattacttatacaatttttatcacattaataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgcta |
300 |
Q |
| |
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| T |
133950 |
-caagtgatacttatacaa-gtttatcatattaataacctcaattcgtcataaccagcttctcatatcatcatttatatcctatacatctttcattgtta |
133853 |
T |
 |
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Target: scaffold0395 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:
Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8679 - 8373
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Q |
| |
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|
|
| T |
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acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacttttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaagcataaaccagcaa |
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T |
 |
| Q |
99 |
tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatatac-aacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcaca |
196 |
Q |
| |
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| T |
8579 |
tcagcaacaatcatattcaatcaacaacaacacaaacagtatacaaacagcgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaacattcccaca |
8481 |
T |
 |
| Q |
197 |
taatccaagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttc |
293 |
Q |
| |
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| T |
8480 |
taatccaagtaatgcgtatgcaa-ttatatcatattaaaaataaccttaattcatcataatcagcttcacagatcatcattaatactctatacaactttc |
8382 |
T |
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| Q |
294 |
attgctatc |
302 |
Q |
| |
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||||||||| |
|
|
| T |
8381 |
attgctatc |
8373 |
T |
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Target: scaffold0023 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
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Target: scaffold0023; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 162385 - 162594
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Q |
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|
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||| | |
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acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacttttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaaacataaactagcaa |
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T |
 |
| Q |
99 |
tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatatac-aacagcatgatataacaatatcttatacaatccaacgatgtctagcattttcaca |
196 |
Q |
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| T |
162485 |
tcagcaacaatcataatcaatcaacagcaacgcaaacagtatacaaacagcgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaccattcccaca |
162583 |
T |
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| Q |
197 |
taatccaagta |
207 |
Q |
| |
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||||||||||| |
|
|
| T |
162584 |
taatccaagta |
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T |
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Target: scaffold0131 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
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Target: scaffold0131; HSP #1
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Q |
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|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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1638 |
acctaagactccgttacttagaacgacaactcgccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca |
1716 |
T |
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Target: scaffold0109 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
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Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
2440 |
acctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacttttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgtagttaaacataaaccagcaa |
2539 |
T |
 |
| Q |
99 |
tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatataca-acagcatgatataacaatatctt |
165 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||||||| ||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
2540 |
tcagcaacaatcatactcaatcaacagcaacgcaaacagtatacagacagcgtgatataacaatatctt |
2608 |
T |
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Target: scaffold0003 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
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Target: scaffold0003; HSP #1
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acctatgactccgttacttagaacgacaactcgccactt--acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcga |
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Q |
| |
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|||||||||||| |||||||||||||||||| || | || |||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
137876 |
acctatgactccattacttagaacgacaacttgcaaattttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgaagttaaacataaaccagcaa |
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T |
 |
| Q |
99 |
tcattaacaatcataatcaatcaaccgcaacac-aacaatataca-acagcatgatataacaatatctt |
165 |
Q |
| |
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||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
137976 |
tcagcaacaatcatactcaatcaacagcaacacaaacagtatacagacagcgtgatataacaatatctt |
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T |
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Target: scaffold0077 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
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Target: scaffold0077; HSP #1
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Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| | |||| |||| ||||||||| |
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|
| T |
22775 |
aacaatcatactcaatcaacagcaacacaaacagtatacagacagcgtgatataacaatatctt-tgcaattcaacactatctaacattcccacataatc |
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T |
 |
| Q |
202 |
caagtattacttatacaatttttatcacatt---aataacctcaatttaccctatccagcttcacagttcatcatttaaatcctatacatctttcattgc |
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Q |
| |
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|||||| | | ||| ||| || ||||| ||| ||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||| || | |||||||||| |||||||||| |
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| T |
22874 |
caagtaatgcgtatgcaa-ttatatcatattaaaaataacctcaattcatcacaatcagcttcacagatcatccttaatatcctatacaactttcattgc |
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T |
 |
| Q |
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tatc |
302 |
Q |
| |
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| T |
22973 |
tatc |
22976 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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