View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1037_low_9 (Length: 274)

Name: NF1037_low_9
Description: NF1037
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1037_low_9
NF1037_low_9
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (35-247)||(27498803-27499015)
chr6 (26-247)||(34812643-34812864)
chr6 (26-247)||(3666526-3666747)
chr6 (26-247)||(9117972-9118193)
chr6 (26-247)||(12722316-12722537)
chr6 (26-247)||(12860031-12860252)
chr6 (26-247)||(13918346-13918567)
chr6 (26-247)||(25792814-25793035)
chr6 (26-247)||(26030520-26030741)
chr6 (26-247)||(26869902-26870123)
chr6 (26-247)||(27346845-27347066)
chr6 (26-247)||(27407585-27407806)
chr6 (26-247)||(32967426-32967647)
chr6 (35-247)||(4636026-4636238)
chr6 (35-247)||(32306535-32306747)
chr6 (26-247)||(27377893-27378114)
chr6 (26-247)||(27468250-27468471)
chr6 (26-247)||(16954108-16954329)
chr6 (26-247)||(20035405-20035626)
chr6 (26-247)||(18920984-18921205)
chr6 (26-247)||(26038716-26038937)
chr6 (26-247)||(18829790-18830011)
chr6 (35-247)||(17052549-17052761)
chr6 (26-247)||(11248860-11249081)
chr6 (35-247)||(1655880-1656092)
chr6 (35-236)||(22381145-22381346)
chr6 (39-221)||(22810201-22810384)
chr6 (37-247)||(14064986-14065196)
chr6 (37-238)||(16881281-16881482)
chr6 (37-238)||(20138383-20138584)
chr6 (37-238)||(22194285-22194486)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (26-247)||(18757964-18758185)
chr4 (26-247)||(22001577-22001798)
chr4 (26-247)||(455722-455943)
chr4 (26-247)||(10295831-10296052)
chr4 (26-247)||(10746072-10746293)
chr4 (26-247)||(10959841-10960062)
chr4 (26-247)||(16261025-16261246)
chr4 (26-247)||(27193059-27193280)
chr4 (26-247)||(36023451-36023672)
chr4 (26-247)||(49512696-49512917)
chr4 (35-247)||(24645491-24645703)
chr4 (35-247)||(27661772-27661984)
chr4 (35-247)||(55750735-55750947)
chr4 (26-247)||(16310272-16310493)
chr4 (26-247)||(17923258-17923479)
chr4 (26-247)||(19949869-19950090)
chr4 (26-247)||(27820405-27820626)
chr4 (26-247)||(30931964-30932185)
chr4 (35-247)||(40462228-40462440)
chr4 (26-247)||(14841556-14841777)
chr4 (39-247)||(4993282-4993490)
chr4 (26-247)||(27171223-27171448)
chr4 (26-247)||(14845420-14845639)
chr4 (26-247)||(5017297-5017518)
chr4 (26-247)||(15202277-15202498)
chr4 (37-247)||(16849151-16849361)
chr4 (37-247)||(14908534-14908744)
chr4 (35-247)||(15467806-15468020)
chr4 (26-241)||(19606370-19606585)
chr4 (96-247)||(24023013-24023164)
chr4 (37-221)||(17242620-17242804)
chr4 (39-247)||(15009455-15009661)
chr4 (96-221)||(15876046-15876171)
chr4 (76-247)||(11453021-11453191)
chr4 (76-247)||(11533583-11533753)
chr4 (102-212)||(22125908-22126018)
chr4 (81-156)||(40271274-40271349)
chr4 (26-69)||(1273048-1273091)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (26-247)||(10632293-10632514)
chr3 (26-247)||(13378137-13378358)
chr3 (26-247)||(13388731-13388952)
chr3 (26-247)||(509640-509861)
chr3 (26-247)||(5542491-5542712)
chr3 (26-247)||(5622866-5623087)
chr3 (26-247)||(5871166-5871387)
chr3 (26-247)||(6215531-6215752)
chr3 (26-247)||(8779809-8780030)
chr3 (26-247)||(12291659-12291880)
chr3 (26-247)||(19783568-19783789)
chr3 (26-247)||(24388988-24389209)
chr3 (26-247)||(29466675-29466896)
chr3 (35-247)||(28319717-28319929)
chr3 (35-247)||(38199798-38200010)
chr3 (35-247)||(39377230-39377442)
chr3 (26-247)||(4748865-4749086)
chr3 (26-247)||(9386053-9386274)
chr3 (26-247)||(14470767-14470988)
chr3 (26-247)||(20678667-20678888)
chr3 (26-247)||(23762440-23762661)
chr3 (26-247)||(24665016-24665237)
chr3 (35-247)||(11277864-11278076)
chr3 (26-240)||(17901559-17901773)
chr3 (26-247)||(5515819-5516040)
chr3 (26-247)||(6495812-6496033)
chr3 (26-247)||(12243029-12243250)
chr3 (26-247)||(13126837-13127058)
chr3 (26-247)||(41688795-41689016)
chr3 (26-247)||(1058726-1058947)
chr3 (26-247)||(37871607-37871828)
chr3 (26-247)||(37880125-37880346)
chr3 (35-247)||(11211573-11211785)
chr3 (26-247)||(1789342-1789562)
chr3 (26-247)||(15656511-15656732)
chr3 (35-246)||(13267137-13267348)
chr3 (37-247)||(9987368-9987578)
chr3 (26-247)||(9001259-9001480)
chr3 (26-247)||(29939024-29939245)
chr3 (26-247)||(29988178-29988399)
chr3 (60-247)||(4409437-4409624)
chr3 (26-247)||(17964831-17965052)
chr3 (35-247)||(13144280-13144492)
chr3 (37-247)||(5198247-5198457)
chr3 (37-196)||(18127202-18127361)
chr3 (118-247)||(16424719-16424848)
chr3 (53-168)||(17011332-17011447)
chr3 (37-241)||(17250242-17250446)
chr3 (26-142)||(16439806-16439922)
chr3 (35-153)||(15838462-15838580)
chr3 (81-194)||(12751451-12751564)
chr3 (178-247)||(15838388-15838457)
chr3 (37-147)||(18704026-18704136)
chr3 (111-147)||(18695535-18695571)
chr3 (111-147)||(18711054-18711090)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (26-247)||(22939147-22939368)
chr2 (26-247)||(9768253-9768474)
chr2 (26-247)||(9903063-9903284)
chr2 (26-247)||(10272088-10272309)
chr2 (26-247)||(11400662-11400883)
chr2 (26-247)||(19307909-19308130)
chr2 (26-247)||(21126432-21126653)
chr2 (26-247)||(34795707-34795928)
chr2 (26-247)||(39175584-39175805)
chr2 (26-247)||(40245710-40245931)
chr2 (26-247)||(43087799-43088020)
chr2 (35-247)||(27226540-27226752)
chr2 (35-247)||(35258106-35258318)
chr2 (35-247)||(35268731-35268943)
chr2 (26-247)||(21167437-21167658)
chr2 (26-247)||(29249322-29249543)
chr2 (26-247)||(43350504-43350725)
chr2 (26-247)||(4214997-4215218)
chr2 (26-247)||(24333239-24333460)
chr2 (26-247)||(26872068-26872289)
chr2 (35-247)||(24420444-24420656)
chr2 (26-247)||(28726807-28727028)
chr2 (39-247)||(24809877-24810085)
chr2 (37-241)||(18944184-18944388)
chr2 (37-247)||(24720438-24720637)
chr2 (64-120)||(28706716-28706772)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (26-247)||(7694987-7695208)
chr1 (35-247)||(5838292-5838504)
chr1 (26-247)||(7512362-7512583)
chr1 (26-247)||(12618668-12618889)
chr1 (26-247)||(12735616-12735837)
chr1 (26-247)||(21868751-21868972)
chr1 (26-247)||(36241946-36242167)
chr1 (26-247)||(38100173-38100394)
chr1 (26-247)||(47613448-47613669)
chr1 (26-247)||(51651389-51651610)
chr1 (35-247)||(3176689-3176901)
chr1 (26-247)||(5645220-5645441)
chr1 (26-247)||(4172390-4172611)
chr1 (26-247)||(7684236-7684457)
chr1 (26-247)||(35643554-35643775)
chr1 (26-247)||(149187-149412)
chr1 (37-247)||(22452323-22452533)
chr1 (37-247)||(22447089-22447299)
chr1 (35-247)||(19165176-19165388)
chr1 (37-241)||(21129830-21130034)
chr1 (37-247)||(22126578-22126788)
chr1 (37-247)||(20934303-20934513)
chr1 (105-247)||(17720623-17720765)
chr1 (82-247)||(23390011-23390176)
chr1 (37-135)||(21211250-21211348)
chr1 (179-247)||(21211346-21211414)
chr1 (36-101)||(23979089-23979154)
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (35-247)||(35221105-35221317)
chr5 (26-247)||(6981398-6981619)
chr5 (26-247)||(9341548-9341769)
chr5 (26-247)||(14035635-14035856)
chr5 (26-247)||(14452059-14452280)
chr5 (26-247)||(14563100-14563321)
chr5 (26-247)||(22152109-22152330)
chr5 (26-247)||(22681709-22681930)
chr5 (26-247)||(23483249-23483470)
chr5 (26-247)||(23702373-23702594)
chr5 (26-247)||(24572665-24572886)
chr5 (26-247)||(24821923-24822144)
chr5 (26-247)||(27047284-27047505)
chr5 (26-247)||(27465755-27465976)
chr5 (26-247)||(27617219-27617440)
chr5 (26-247)||(30232473-30232694)
chr5 (26-247)||(31839073-31839294)
chr5 (26-247)||(34777489-34777710)
chr5 (26-247)||(39358089-39358310)
chr5 (26-247)||(39495934-39496155)
chr5 (26-247)||(40395955-40396176)
chr5 (26-247)||(42048373-42048594)
chr5 (35-247)||(15745571-15745783)
chr5 (35-247)||(17612664-17612876)
chr5 (35-247)||(17724520-17724732)
chr5 (35-247)||(31354136-31354348)
chr5 (35-247)||(37735014-37735226)
chr5 (26-247)||(15998343-15998564)
chr5 (26-247)||(19469565-19469786)
chr5 (26-247)||(23301870-23302091)
chr5 (26-247)||(23367529-23367750)
chr5 (26-247)||(24813506-24813727)
chr5 (26-247)||(36587564-36587785)
chr5 (35-247)||(36693300-36693512)
chr5 (26-247)||(1116349-1116570)
chr5 (26-247)||(5295589-5295810)
chr5 (26-247)||(17451759-17451980)
chr5 (26-247)||(20557340-20557561)
chr5 (26-247)||(20785638-20785859)
chr5 (26-247)||(24934700-24934921)
chr5 (26-247)||(23401504-23401725)
chr5 (26-247)||(34057526-34057747)
chr5 (26-247)||(13528359-13528580)
chr5 (38-247)||(21671457-21671666)
chr5 (83-221)||(12860514-12860652)
chr5 (67-157)||(18030958-18031048)
[»] scaffold0382 (3 HSPs)
scaffold0382 (26-247)||(6796-7017)
scaffold0382 (35-247)||(1500-1712)
scaffold0382 (35-79)||(12063-12107)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (26-247)||(4291-4512)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (26-247)||(36262-36483)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (26-247)||(42465-42686)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (26-247)||(3354140-3354361)
chr8 (26-247)||(6156213-6156434)
chr8 (26-247)||(9346245-9346466)
chr8 (26-247)||(25679493-25679714)
chr8 (26-247)||(29081538-29081759)
chr8 (26-247)||(32083201-32083422)
chr8 (26-247)||(36298073-36298294)
chr8 (35-247)||(36083068-36083280)
chr8 (26-247)||(13694075-13694296)
chr8 (26-247)||(15786215-15786436)
chr8 (26-247)||(19133827-19134048)
chr8 (35-247)||(44486261-44486473)
chr8 (26-247)||(246955-247176)
chr8 (26-247)||(810075-810296)
chr8 (26-247)||(19229925-19230146)
chr8 (26-247)||(19423472-19423693)
chr8 (26-247)||(16741819-16742040)
chr8 (26-247)||(30320210-30320431)
chr8 (56-247)||(21293451-21293642)
chr8 (26-247)||(22151794-22152015)
chr8 (37-236)||(20377328-20377527)
chr8 (37-247)||(24650045-24650254)
chr8 (37-238)||(19934275-19934476)
chr8 (37-247)||(22466659-22466868)
chr8 (37-247)||(22668206-22668415)
chr8 (41-247)||(17293712-17293916)
chr8 (89-184)||(14977291-14977386)
chr8 (94-221)||(15080689-15080815)
chr8 (94-221)||(15165433-15165559)
chr8 (88-158)||(12798971-12799041)
chr8 (78-164)||(24588604-24588690)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (26-247)||(462540-462761)
chr7 (26-247)||(1992684-1992905)
chr7 (26-247)||(9090362-9090583)
chr7 (26-247)||(22094269-22094490)
chr7 (26-247)||(24739229-24739450)
chr7 (26-247)||(26395648-26395869)
chr7 (26-247)||(40047658-40047879)
chr7 (35-247)||(8007629-8007841)
chr7 (35-247)||(11010315-11010527)
chr7 (26-246)||(20984386-20984606)
chr7 (35-247)||(42870976-42871188)
chr7 (26-247)||(4217136-4217357)
chr7 (26-247)||(8622491-8622712)
chr7 (26-247)||(9164692-9164913)
chr7 (26-247)||(20998973-20999194)
chr7 (26-246)||(26691296-26691516)
chr7 (26-247)||(172018-172239)
chr7 (26-247)||(2711167-2711388)
chr7 (26-247)||(6872784-6873005)
chr7 (26-247)||(17955668-17955889)
chr7 (26-247)||(15883377-15883597)
chr7 (39-247)||(9438392-9438600)
chr7 (26-247)||(18433651-18433872)
chr7 (35-246)||(4417557-4417768)
chr7 (37-247)||(14138775-14138985)
chr7 (37-247)||(10651966-10652176)
chr7 (37-218)||(13661623-13661804)
chr7 (37-236)||(4824212-4824400)
chr7 (41-221)||(16158785-16158958)
chr7 (155-246)||(4420520-4420611)
chr7 (96-238)||(20540822-20540964)
chr7 (73-182)||(5169778-5169887)
chr7 (36-162)||(16158665-16158784)
[»] scaffold0047 (3 HSPs)
scaffold0047 (26-247)||(38390-38611)
scaffold0047 (26-247)||(42255-42474)
scaffold0047 (37-236)||(3561-3760)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (26-247)||(48448-48669)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (39-247)||(1821-2029)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (37-246)||(161111-161320)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (35-247)||(33255-33467)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (26-247)||(14233-14454)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (35-247)||(160484-160696)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (37-247)||(3286-3496)
scaffold0004 (35-241)||(7283-7489)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (37-247)||(14229-14439)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (35-247)||(4889-5101)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (37-241)||(4053-4257)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (37-241)||(12258-12462)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (37-247)||(7479-7689)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (37-235)||(21705-21903)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (41-236)||(11881-12076)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (35-247)||(25572-25780)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (37-247)||(10482-10692)
[»] scaffold1365 (1 HSPs)
scaffold1365 (37-246)||(154-363)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (82-247)||(48814-48979)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (37-240)||(73544-73747)
scaffold0037 (37-240)||(85734-85937)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (37-247)||(3555-3765)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (37-247)||(30304-30514)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (37-247)||(3552-3762)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (37-247)||(130158-130368)
[»] scaffold0594 (1 HSPs)
scaffold0594 (37-241)||(1652-1856)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (59-247)||(14775-14963)
[»] scaffold0863 (1 HSPs)
scaffold0863 (37-247)||(2959-3169)
[»] scaffold1835 (1 HSPs)
scaffold1835 (37-221)||(611-794)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (53-247)||(7898-8092)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (37-186)||(6183-6332)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (37-189)||(2510-2662)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (37-154)||(10101-10218)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (37-169)||(38507-38637)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (26-247)||(7710-7945)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (56-241)||(74064-74249)
[»] scaffold1578 (1 HSPs)
scaffold1578 (37-108)||(530-601)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (174-241)||(42944-43011)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27499015 - 27498803
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27499015 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 27498916  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27498915 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 27498816  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  27498815 ttctgtgatgctg 27498803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 34812643 - 34812864
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34812643 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 34812742  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  34812743 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 34812842  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  34812843 ttgattggattctgtgatgctg 34812864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3666747 - 3666526
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3666747 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 3666648  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  3666647 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 3666548  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  3666547 ttgattggattctgtgatgctg 3666526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 9117972 - 9118193
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9117972 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 9118071  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9118072 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 9118171  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  9118172 ttgattggattctgtgatgctg 9118193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 12722316 - 12722537
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12722316 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 12722415  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  12722416 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 12722515  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  12722516 ttgattggattctgtgatgctg 12722537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12860252 - 12860031
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12860252 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 12860153  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  12860152 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 12860053  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  12860052 ttgattggattctgtgatgctg 12860031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13918567 - 13918346
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13918567 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 13918468  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13918467 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 13918368  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  13918367 ttgattggattctgtgatgctg 13918346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25793035 - 25792814
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25793035 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 25792936  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  25792935 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 25792836  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  25792835 ttgattggattctgtgatgctg 25792814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26030741 - 26030520
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26030741 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 26030642  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  26030641 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 26030542  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  26030541 ttgattggattctgtgatgctg 26030520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26870123 - 26869902
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26870123 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 26870024  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  26870023 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 26869924  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  26869923 ttgattggattctgtgatgctg 26869902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27347066 - 27346845
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27347066 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 27346967  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27346966 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 27346867  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  27346866 ttgattggattctgtgatgctg 27346845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27407806 - 27407585
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27407806 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 27407707  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27407706 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 27407607  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  27407606 ttgattggattctgtgatgctg 27407585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 32967426 - 32967647
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32967426 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 32967525  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  32967526 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 32967625  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  32967626 ttgattggattctgtgatgctg 32967647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4636238 - 4636026
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4636238 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 4636139  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4636138 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattgga 4636039  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  4636038 ttctgtgatgctg 4636026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 32306535 - 32306747
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32306535 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 32306634  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32306635 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattgga 32306734  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  32306735 ttctgtgatgctg 32306747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27378114 - 27377893
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27378114 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 27378015  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27378014 tcctagagaatctcattaaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 27377915  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  27377914 ttgattggattctgtgatgctg 27377893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27468471 - 27468250
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27468471 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 27468372  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27468371 tcctagagaatctcattaaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 27468272  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  27468271 ttgattggattctgtgatgctg 27468250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16954329 - 16954108
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16954329 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcttctagacgtgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 16954230  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16954229 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 16954130  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  16954129 ttgattggattctgtgatgctg 16954108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 20035405 - 20035626
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20035405 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcaatgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 20035504  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20035505 tcctagagaatctcatttaactacagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 20035604  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  20035605 ttgattggattctgtgatgctg 20035626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 18920984 - 18921205
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18920984 agaagctatacagaggtatgattggctctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 18921083  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18921084 tcctagagaatctcatttaactacagttaaaagaatcttcagatatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattacaag 18921183  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18921184 ttgattggattctgtgatgctg 18921205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26038937 - 26038716
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26038937 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtatatgcctgtgtgcaagatttcaatcaga 26038838  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  26038837 tcctagagaatctcaattaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcttgtataggaaatccctagattataag 26038738  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  26038737 ttgattggattctgtgatgctg 26038716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 18829790 - 18830011
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18829790 agaagctatacagaggtacgattggttctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 18829889  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||    
T  18829890 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaaaaactaatcttggactcctgtataggaaatctctagattatcag 18829989  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  18829990 ttggttggattctgtgatgctg 18830011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17052761 - 17052549
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  17052761 acagaggtatgattggttctctgttatatctcactgcatctagacgtgatattttatttagtgtatgcttgtgtgcaagataccagtcagatcctagaga 17052662  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  17052661 atctcatttaactgctattaagagaatcttcaggtatatgaaaggaacaactaatcttagactcctttataggaaatccctagattatcagttggttgga 17052562  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  17052561 ttctgtgatgctg 17052549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11249081 - 11248860
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11249081 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacatcattgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttatgtgcaagatttcagtcaga 11248982  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  11248981 tcctagagaatctcatttaactgtagttaagagaatcttcaggtatctgaaggaaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattatcag 11248882  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  11248881 ttggttggattctgtgatgctg 11248860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1656092 - 1655880
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1656092 acagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcagatcctagaga 1655993  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||| |||||    
T  1655992 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctaaaggggacaactaatcttggactcctttatagaaaatccttaaattatcagttggttgga 1655893  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    || |||| |||||    
T  1655892 ttttgtgatgctg 1655880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22381346 - 22381145
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  22381346 acagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctagaccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcatgatttcagtcagatcctagaaa 22381247  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  22381246 acctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacgactaatcttggactcctttataggaaatccttagattataagttggttgga 22381147  T
Q  235 tt 236  Q
    ||    
T  22381146 tt 22381145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22810384 - 22810201
Alignment:
Q  39 aggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcct-agagaatc 137  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||    
T  22810384 aggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcaaatcctaaaagaatc 22810285  T
Q  138 tcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagatta 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  22810284 tcatttaactgttgttaagagaatcttcatgtatttgaagggaacaactaatcttggactgctctatacgaaatccctagatta 22810201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Original strand, 14064986 - 14065196
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14064986 agaggtatgattggttctttgttatatttcactgcatctagaccatatattttgttcagtgtgtgtctgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 14065085  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| | |||||  |||||| ||||||    
T  14065086 ctcacttaactgctgttaaaagaatctttaggtgtttgaaaggaacaactattcttggactcctctataagaaatccattgattatcagttgactggatt 14065185  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
    ||||| |||||    
T  14065186 ctgtgatgctg 14065196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16881482 - 16881281
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16881482 agagttatgattggttctttgttatacctcactacatctagactagatattttagtcagtgtatgcttttgtgcaagatttcagtcagatcttagagaat 16881383  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  16881382 ctcatttaactattgtttagagaatcttcatgtatttgaagggaacaactaatcttggacttctctatgggaaatccctagattatcagttggttggatt 16881283  T
Q  237 ct 238  Q
    ||    
T  16881282 ct 16881281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Original strand, 20138383 - 20138584
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    |||||||| || ||| | ||||||| ||| ||| |||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||||||    
T  20138383 agaggtataataggttcactgttattcctaactacatctacacctaatattttatttattgtatgcttgtgttcaacgtttcaatcatattctagagaat 20138482  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    || || |||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  20138483 ctaatgtaacagttgttaagagaatctttagatatttgaaaggaacaactaatcttgtacttctttataacaaatccttagattataagttggttggatt 20138582  T
Q  237 ct 238  Q
    ||    
T  20138583 ct 20138584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22194486 - 22194285
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    |||||||| || ||| | ||||||| ||| ||| |||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||||||    
T  22194486 agaggtataataggttcactgttattcctaactacatctacacctaatattttatttattgtatgcttgtgttcaacgtttcaatcatattctagagaat 22194387  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    || || |||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  22194386 ctaatgtaacagttgttaagagaatctttagatatttgaaaggaacaactaatcttgtacttctttataacaaatccttagattataagttggttggatt 22194287  T
Q  237 ct 238  Q
    ||    
T  22194286 ct 22194285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 18757964 - 18758185
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18757964 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 18758063  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18758064 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 18758163  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  18758164 ttgattgaattctgtgatgctg 18758185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22001798 - 22001577
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001798 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 22001699  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22001698 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 22001599  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  22001598 ttgattggattctgtgatgctg 22001577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 455943 - 455722
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455943 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 455844  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  455843 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 455744  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  455743 ttgattggattctgtgatgctg 455722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10296052 - 10295831
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10296052 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 10295953  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  10295952 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 10295853  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  10295852 ttgattggattctgtgatgctg 10295831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 10746072 - 10746293
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10746072 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 10746171  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  10746172 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 10746271  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  10746272 ttgattggattctgtgatgctg 10746293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 10959841 - 10960062
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10959841 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 10959940  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  10959941 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 10960040  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  10960041 ttgattggattctgtgatgctg 10960062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16261246 - 16261025
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261246 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 16261147  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16261146 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 16261047  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  16261046 ttgattggattctgtgatgctg 16261025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27193280 - 27193059
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27193280 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 27193181  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27193180 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 27193081  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  27193080 ttgattggattctgtgatgctg 27193059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 36023672 - 36023451
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36023672 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 36023573  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  36023572 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 36023473  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  36023472 ttgattggattctgtgatgctg 36023451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 49512917 - 49512696
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49512917 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 49512818  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  49512817 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 49512718  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  49512717 ttgattggattctgtgatgctg 49512696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24645703 - 24645491
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24645703 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 24645604  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24645603 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattgga 24645504  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  24645503 ttctgtgatgctg 24645491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27661984 - 27661772
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27661984 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 27661885  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27661884 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattgga 27661785  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  27661784 ttctgtgatgctg 27661772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 55750735 - 55750947
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55750735 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 55750834  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55750835 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattgga 55750934  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  55750935 ttctgtgatgctg 55750947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16310493 - 16310272
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16310493 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagcgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 16310394  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16310393 tcctagagaatctcatttaactgcagttaaaagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattacaag 16310294  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  16310293 ttgattggattctgtgatgctg 16310272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17923479 - 17923258
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17923479 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaagcaga 17923380  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17923379 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 17923280  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  17923279 ttgattggattctgtgatgctg 17923258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 19949869 - 19950090
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19949869 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcgctgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 19949968  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  19949969 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 19950068  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  19950069 ttgattggattctgtgatgctg 19950090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 27820405 - 27820626
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27820405 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 27820504  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27820505 tcatagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 27820604  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  27820605 ttgattggattctgtgatgctg 27820626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 30931964 - 30932185
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30931964 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 30932063  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  30932064 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 30932163  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  30932164 ttgattgaattctgtgatgctg 30932185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 40462228 - 40462440
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40462228 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtgtgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 40462327  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40462328 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattgga 40462427  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  40462428 ttctgtgatgctg 40462440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 14841556 - 14841777
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14841556 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 14841655  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  14841656 tcctagagaatctcatttaaatgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatacctagattataag 14841755  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  14841756 ttggttggattctgtgatgctg 14841777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 39 - 247
Target Start/End: Original strand, 4993282 - 4993490
Alignment:
Q  39 aggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatct 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4993282 aggtatgattggttctctgttataccttactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatct 4993381  T
Q  139 catttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggattct 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4993382 catttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatctctagattataagttgattggattct 4993481  T
Q  239 gtggtgctg 247  Q
    ||| |||||    
T  4993482 gtgatgctg 4993490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27171448 - 27171223
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgta----tgcttgtgtgcaagatttcaat 121  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  27171448 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtacgtatgcttgtgtgcaagatttcaat 27171349  T
Q  122 cagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagatta 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27171348 cagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagatta 27171249  T
Q  222 caagttgattggattctgtggtgctg 247  Q
     ||||||||||||||||||| |||||    
T  27171248 taagttgattggattctgtgatgctg 27171223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 14845420 - 14845639
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  14845420 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtg--caaaatttcaatcaga 14845517  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14845518 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 14845617  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  14845618 ttgattggattctgtgatgctg 14845639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5017518 - 5017297
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5017518 agaagctatacataggtatgattggttctctattataccttactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 5017419  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  5017418 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatctctagattataag 5017319  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  5017318 ttgattggattctgtgatgctg 5017297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 15202277 - 15202498
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202277 agaagctatacagaggtatgattggttgtctgttatacctcactgcatctagacctgatattttatttagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 15202376  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15202377 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcctcaggcatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 15202476  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  15202477 ttgattggattctgtgatgctg 15202498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16849361 - 16849151
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16849361 agaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcagatcctagagaat 16849262  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  16849261 ctcatttaactgctattaagagaatcttcatgtatctgaagggaacaactaatcttagactcctttataggaaatcgctagattatcagttggttggatt 16849162  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
     |||| |||||    
T  16849161 ttgtgatgctg 16849151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Original strand, 14908534 - 14908744
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14908534 agaggtatgattggttctttgttatatctcactgcatctaggccaaatattttattcagtgtatgattgtgtgcaagatttcagtcagatcctagagaat 14908633  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  14908634 ctcatttaactactattaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctcaataggaaatccctagattatcagttggttggatt 14908733  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
     |||| |||||    
T  14908734 ttgtgatgctg 14908744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 15467806 - 15468020
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtat--gcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctaga 132  Q
    ||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15467806 acagaggtatgattggttctcttttgtatctcactgcatccagatcagatattttattcagtgtatatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctaga 15467905  T
Q  133 gaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||    
T  15467906 gaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactgatcttggactcctgtataggaaatccttagattatcagttggttg 15468005  T
Q  233 gattctgtggtgctg 247  Q
    ||||||||| |||||    
T  15468006 gattctgtgatgctg 15468020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 19606370 - 19606585
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||||| | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  19606370 agaagcaatatagcggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgtttgtgcgcaagattccagtcaga 19606469  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  19606470 tcctagagaatctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggtatttggaaggaacaactaatcttggattcctttataggaaatctctagattatcag 19606569  T
Q  226 ttgattggattctgtg 241  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  19606570 ttggttggattttgtg 19606585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 96 - 247
Target Start/End: Original strand, 24023013 - 24023164
Alignment:
Q  96 tgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttgga 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24023013 tgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttgga 24023112  T
Q  196 ctcctttataggaaatccctagattacaagttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24023113 ctcctgtataggaaatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 24023164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17242804 - 17242620
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17242804 agaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctagaccaaatattttattgagtgtttgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 17242705  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagatta 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  17242704 ctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggcagttgaagagaacaactaatcttgggctcctctataagaaatccctagatta 17242620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 39 - 247
Target Start/End: Original strand, 15009455 - 15009661
Alignment:
Q  39 aggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatct 138  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15009455 aggtatgattggttctttgttatacctcactacatctagacaggatattttattcagt--atgcttgtgtgcaagattctaatcagatcctagagaatct 15009552  T
Q  139 catttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggattct 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||| ||||||| |    
T  15009553 catttaactcctgttaagagaatctgcagatatctgaaaggatcaactaatcttggactcctctacaggaaatccctagattatcaattggttggatttt 15009652  T
Q  239 gtggtgctg 247  Q
    ||| |||||    
T  15009653 gtgatgctg 15009661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 96 - 221
Target Start/End: Original strand, 15876046 - 15876171
Alignment:
Q  96 tgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttgga 195  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15876046 tgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaatctcatttaactggttttaagagaatctttaggtatctgaaaggaacaactaatcttgga 15876145  T
Q  196 ctcctttataggaaatccctagatta 221  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||    
T  15876146 ctcatctataggaaatccctagatta 15876171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 247
Target Start/End: Original strand, 11453021 - 11453191
Alignment:
Q  76 agacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttga 175  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  11453021 agacctgatattttatttagtgtctgtctgtgtgcaagattgcg-tcagatcctagataatctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggtatctga 11453119  T
Q  176 aaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| | |||||||||| |  |||||||||||| |||||    
T  11453120 aaggaacaactaatcttggattgctttataagaaatctcaagattacaagctagttggattctgtgatgctg 11453191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11533753 - 11533583
Alignment:
Q  76 agacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttga 175  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  11533753 agacctgatattttatttagtgtctgtctgtgtgcaagattgcg-tcagatcctagataatctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggtatctga 11533655  T
Q  176 aaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| | |||||||||| |  ||||||| |||| |||||    
T  11533654 aaggaacaactaatcttggattgctttataagaaatctcaagattacaagctagttggattgtgtgatgctg 11533583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22126018 - 22125908
Alignment:
Q  102 cttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctt 201  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| || |  |||||    
T  22126018 cttgtgtgctaggtttcaatcaaatcctaaagaaactcacttaactgttgttaagagaatctttagatatatgaaaggaactactaatatttgtttcctt 22125919  T
Q  202 tataggaaatc 212  Q
    |||| ||||||    
T  22125918 tataagaaatc 22125908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40271349 - 40271274
Alignment:
Q  81 tgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaag 156  Q
    |||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  40271349 tgatattttgtttagtatatgcttgtgtgtaagatttcaaatagatcatagagaatcacatttaactgttgttaag 40271274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 69
Target Start/End: Original strand, 1273048 - 1273091
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcact 69  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1273048 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcact 1273091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 10632293 - 10632514
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10632293 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 10632392  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  10632393 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgataggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 10632492  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  10632493 ttgattggattctgtgatgctg 10632514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 13378137 - 13378358
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13378137 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 13378236  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13378237 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 13378336  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  13378337 ttgattggattctgtgatgctg 13378358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 13388731 - 13388952
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13388731 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 13388830  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13388831 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 13388930  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  13388931 ttgattggattctgtgatgctg 13388952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 509640 - 509861
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  509640 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 509739  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  509740 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 509839  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  509840 ttgattggattctgtgatgctg 509861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 5542491 - 5542712
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542491 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 5542590  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  5542591 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 5542690  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  5542691 ttgattggattctgtgatgctg 5542712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 5622866 - 5623087
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5622866 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 5622965  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  5622966 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 5623065  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  5623066 ttgattggattctgtgatgctg 5623087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 5871166 - 5871387
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5871166 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 5871265  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  5871266 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 5871365  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  5871366 ttgattggattctgtgatgctg 5871387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 6215531 - 6215752
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6215531 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 6215630  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  6215631 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 6215730  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  6215731 ttgattggattctgtgatgctg 6215752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8780030 - 8779809
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8780030 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 8779931  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8779930 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 8779831  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  8779830 ttgattggattctgtgatgctg 8779809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 12291659 - 12291880
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12291659 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 12291758  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  12291759 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 12291858  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  12291859 ttgattggattctgtgatgctg 12291880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19783789 - 19783568
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19783789 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 19783690  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  19783689 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 19783590  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  19783589 ttgattggattctgtgatgctg 19783568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 24388988 - 24389209
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24388988 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 24389087  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24389088 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 24389187  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  24389188 ttgattggattctgtgatgctg 24389209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 29466675 - 29466896
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29466675 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 29466774  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  29466775 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 29466874  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  29466875 ttgattggattctgtgatgctg 29466896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 28319717 - 28319929
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28319717 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 28319816  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28319817 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattgga 28319916  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  28319917 ttctgtgatgctg 28319929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38200010 - 38199798
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38200010 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 38199911  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38199910 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattgga 38199811  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  38199810 ttctgtgatgctg 38199798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39377442 - 39377230
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39377442 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 39377343  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39377342 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattgga 39377243  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  39377242 ttctgtgatgctg 39377230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4749086 - 4748865
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4749086 agaagctatacagaggtatgattggttctctgtcatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 4748987  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  4748986 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 4748887  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  4748886 ttgattggattctgtgatgctg 4748865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 9386053 - 9386274
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9386053 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagcgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 9386152  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9386153 tcctagataatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattacaag 9386252  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  9386253 ttggttggattctgtgatgctg 9386274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14470988 - 14470767
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14470988 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcctgtgtgcaagatttcaatcaga 14470889  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14470888 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 14470789  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  14470788 ttgattggattctgtgatgctg 14470767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 20678667 - 20678888
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20678667 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 20678766  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20678767 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 20678866  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
     ||||||||||||||| |||||    
T  20678867 ctgattggattctgtgatgctg 20678888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23762661 - 23762440
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23762661 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatatagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 23762562  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23762561 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 23762462  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  23762461 ttgattggattctgtgatgctg 23762440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24665237 - 24665016
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24665237 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 24665138  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24665137 ttctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 24665038  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  24665037 ttgattggattctgtgatgctg 24665016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 11277864 - 11278076
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11277864 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 11277963  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  11277964 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattaga 11278063  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  11278064 ttctgtgatgctg 11278076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 17901559 - 17901773
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17901559 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 17901658  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17901659 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 17901758  T
Q  226 ttgattggattctgt 240  Q
    |||||| ||||||||    
T  17901759 ttgatttgattctgt 17901773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5516040 - 5515819
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  5516040 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcctgtgtgtaagatttcaatcaga 5515941  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  5515940 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 5515841  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  5515840 ttgattggattctgtgatgctg 5515819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 6495812 - 6496033
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6495812 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttataccttactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 6495911  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  6495912 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatctctagattataag 6496011  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  6496012 ttgattggattctgtgatgctg 6496033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 12243029 - 12243250
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12243029 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttataccttactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 12243128  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  12243129 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatatgaaatccctagattataag 12243228  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  12243229 ttgattggattctgtgatgctg 12243250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13127058 - 13126837
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  13127058 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcctgtgtgcaagatttcaatcagt 13126959  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13126958 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 13126859  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  13126858 ttgattggattctgtgatgctg 13126837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 41689016 - 41688795
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41689016 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttctgtgcaagatttcaatcaga 41688917  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  41688916 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactagtcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 41688817  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  41688816 ttgattggattctgtgatgctg 41688795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1058947 - 1058726
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1058947 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactacatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 1058848  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  1058847 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattaccag 1058748  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  1058747 ttggttggattctgtgatgctg 1058726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 37871828 - 37871607
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37871828 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 37871729  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  37871728 tcctagagaatctcatttaactgtagttaagagaatcttcaagtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggagatccctagattataag 37871629  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  37871628 ttgattggattctgtgatgctg 37871607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 37880346 - 37880125
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37880346 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 37880247  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  37880246 tcctagagaatctcatttaactgtagttaagagaatcttcaagtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggagatccctagattataag 37880147  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  37880146 ttgattggattctgtgatgctg 37880125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 11211573 - 11211785
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11211573 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttatgtgcaagatttcaatcagatcctagata 11211672  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11211673 atctcatttaactacagttaagagaatcttcaggtatatgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattacaagttggttgga 11211772  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  11211773 ttctgtgatgctg 11211785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 1789342 - 1789562
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1789342 agaagctatacagaggtataattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatat-ttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 1789440  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  1789441 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 1789540  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| ||| |||||||| |||||    
T  1789541 ttggttgtattctgtgatgctg 1789562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 15656511 - 15656732
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15656511 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttataactcactgcatctagaccagatattttatttagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaaacaga 15656610  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  15656611 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaagggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattatcag 15656710  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  15656711 ttggttggattctgtgatgctg 15656732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 246
Target Start/End: Original strand, 13267137 - 13267348
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13267137 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatccaaacctgatattttattctgtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 13267236  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13267237 atctcatttaactgcagttaagagaattttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcatgtataggaaatccctagattacaagttggttgga 13267336  T
Q  235 ttctgtggtgct 246  Q
    ||||||| ||||    
T  13267337 ttctgtgatgct 13267348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Original strand, 9987368 - 9987578
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987368 agaggtatgattggttctctgttataccttactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 9987467  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9987468 ctcatttaactgcagttaagagaatcttcagatctctgaaagaaacaactaatcttggactcctgtataggaaatctctagattataagttgattggatt 9987567  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
    ||||| |||||    
T  9987568 ctgtgatgctg 9987578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 9001259 - 9001480
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9001259 agaagctatacagaggtatgattgattctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcggtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 9001358  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |    
T  9001359 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattatctg 9001458  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  9001459 ttggttggattctgtgatgctg 9001480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 29939024 - 29939245
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29939024 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttgttcagcgtatgcttgtgtgcaagattccaatcaga 29939123  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  29939124 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactccattataggaaatccctagattatcag 29939223  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| ||||||||| || |||||    
T  29939224 ttggttggattctttgatgctg 29939245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 29988178 - 29988399
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29988178 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttgttcagcgtatgcttgtgtgcaagattccaatcaga 29988277  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  29988278 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactccattataggaaatccctagattatcag 29988377  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| ||||||||| || |||||    
T  29988378 ttggttggattctttgatgctg 29988399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 60 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4409624 - 4409437
Alignment:
Q  60 atacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagaga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4409624 atacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaaaaga 4409525  T
Q  160 atcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4409524 atcttcaggtatctgaaaggaacaactaattttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattggattctgtgatgctg 4409437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17965052 - 17964831
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17965052 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatatctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccaatcaga 17964953  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||    
T  17964952 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatttgggactcctgtataggaaatctctagattatcag 17964853  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  17964852 ttggttggattctgtgatgctg 17964831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13144492 - 13144280
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  13144492 acagagctatgatttgttctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcatgatttcagtcagatcctaaaga 13144393  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  13144392 atctcatttaactactgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccttagattatcagttggttgga 13144293  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  13144292 ttctgtgatgctg 13144280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5198457 - 5198247
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5198457 agaggtatgattggttctttgttatacttcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcagatcctagagaat 5198358  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  5198357 ctcatttaactgttgttaagataatctttagatatctgaagggaacaacaaatcttggactcctctatatgaaatccctagattatcagttggttggatt 5198258  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
    ||||| |||||    
T  5198257 ctgtgatgctg 5198247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 196
Target Start/End: Original strand, 18127202 - 18127361
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  18127202 agaggtatgattggttctttgttgtacctcattgcatctaaaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccaatcagatccatgagaat 18127301  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggac 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18127302 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcagatatttgaaaggaacaacaaatcttggac 18127361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 247
Target Start/End: Original strand, 16424719 - 16424848
Alignment:
Q  118 caatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16424719 caatcagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctag 16424818  T
Q  218 attacaagttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16424819 attataagttgattggattctgtgatgctg 16424848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 53 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17011447 - 17011332
Alignment:
Q  53 ctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgt 152  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17011447 ctctgttatacctcactgcatcaagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgt 17011348  T
Q  153 taagagaatcttcagg 168  Q
    ||||||||||||||||    
T  17011347 taagagaatcttcagg 17011332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 241
Target Start/End: Original strand, 17250242 - 17250446
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||  |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17250242 agaggtatgattggttgtttgttatacctcattgcatctaggacatatattttattcagtgtatgcttttgtgcaagattccagtcagatcctagagaat 17250341  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  17250342 ctcatttaactactattaaaagaatctttagatatctaaaagaaacaactaatcttggactcctctatcggaaatccctagattatcagttggttggatt 17250441  T
Q  237 ctgtg 241  Q
     ||||    
T  17250442 ttgtg 17250446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 142
Target Start/End: Original strand, 16439806 - 16439922
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16439806 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttaaatcaga 16439905  T
Q  126 tcctagagaatctcatt 142  Q
    ||| |||||||||||||    
T  16439906 tccaagagaatctcatt 16439922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15838580 - 15838462
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15838580 acagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcagaccctagaga 15838481  T
Q  135 atctcatttaactgctgtt 153  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  15838480 atctcatttaacagctgtt 15838462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 81 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12751564 - 12751451
Alignment:
Q  81 tgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaagga 180  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | ||| | |||||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  12751564 tgatattttatttagtgtttgcttgtgtgcaagattacaatcagatcttagagaatttcactaaaccgttgttaagataatcttcaggtatatgaaagaa 12751465  T
Q  181 acaactaatcttgg 194  Q
    || |||||||||||    
T  12751464 acgactaatcttgg 12751451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15838457 - 15838388
Alignment:
Q  178 ggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  15838457 ggaacaactaatcttggactcctttataggaagtccttagattatcagttggttggattctgtgatgctg 15838388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 147
Target Start/End: Original strand, 18704026 - 18704136
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||| ||| ||  |||||| |||||  |||||||||  |||||  |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18704026 agaggtatgataggttcttggttatatctcacaacatctagactagatattatattcaattaatgcttgtgtgtaagatttcaatcagatcctaaagaat 18704125  T
Q  137 ctcatttaact 147  Q
    |||| ||||||    
T  18704126 ctcacttaact 18704136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 147
Target Start/End: Original strand, 18695535 - 18695571
Alignment:
Q  111 aagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaact 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18695535 aagatttcaatcagatcctaaagaatctcacttaact 18695571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 147
Target Start/End: Original strand, 18711054 - 18711090
Alignment:
Q  111 aagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaact 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18711054 aagatttcaatcagatcctaaagaatctcacttaact 18711090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 22939147 - 22939368
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22939147 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 22939246  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22939247 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 22939346  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  22939347 ttgattggattctgtgatgctg 22939368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 9768253 - 9768474
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9768253 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 9768352  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9768353 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 9768452  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  9768453 ttgattggattctgtgatgctg 9768474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 9903063 - 9903284
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9903063 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 9903162  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9903163 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 9903262  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  9903263 ttgattggattctgtgatgctg 9903284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10272309 - 10272088
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10272309 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 10272210  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  10272209 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 10272110  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  10272109 ttgattggattctgtgatgctg 10272088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 11400662 - 11400883
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11400662 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 11400761  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  11400762 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 11400861  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  11400862 ttgattggattctgtgatgctg 11400883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 19307909 - 19308130
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19307909 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 19308008  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  19308009 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 19308108  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  19308109 ttgattggattctgtgatgctg 19308130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 21126432 - 21126653
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21126432 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 21126531  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21126532 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 21126631  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  21126632 ttgattggattctgtgatgctg 21126653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 34795707 - 34795928
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34795707 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 34795806  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  34795807 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 34795906  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  34795907 ttgattggattctgtgatgctg 34795928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 39175584 - 39175805
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39175584 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 39175683  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  39175684 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 39175783  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  39175784 ttgattggattctgtgatgctg 39175805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 40245931 - 40245710
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40245931 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 40245832  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  40245831 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 40245732  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  40245731 ttgattggattctgtgatgctg 40245710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 43088020 - 43087799
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43088020 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 43087921  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  43087920 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 43087821  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  43087820 ttgattggattctgtgatgctg 43087799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27226752 - 27226540
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27226752 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 27226653  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27226652 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattgga 27226553  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  27226552 ttctgtgatgctg 27226540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 35258318 - 35258106
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35258318 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 35258219  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35258218 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattgga 35258119  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  35258118 ttctgtgatgctg 35258106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 35268943 - 35268731
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35268943 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 35268844  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35268843 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattgga 35268744  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  35268743 ttctgtgatgctg 35268731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 21167437 - 21167658
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21167437 agaagctatacagaggtatgattgattctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 21167536  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21167537 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctatataggaaatccctagattataag 21167636  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  21167637 ttgattggattctgtgatgctg 21167658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29249543 - 29249322
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29249543 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 29249444  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  29249443 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaattaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 29249344  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  29249343 ttgattggattctgtgatgctg 29249322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 43350725 - 43350504
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43350725 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcttctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 43350626  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  43350625 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 43350526  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  43350525 ttgattggattctgtgatgctg 43350504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4215218 - 4214997
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4215218 agaagctatacagaagtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcaatgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 4215119  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  4215118 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 4215019  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  4215018 ttgattggattctgtgatgctg 4214997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 24333239 - 24333460
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24333239 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 24333338  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24333339 ttctagagaatctcatttaattgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 24333438  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  24333439 ttgattggattctgtgatgctg 24333460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26872289 - 26872068
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26872289 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgcgtgcaagatttcaatcaga 26872190  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26872189 tcctagagaatctcatttaactacagttaaaagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattacaag 26872090  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  26872089 ttggttggattctgtgatgctg 26872068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 24420444 - 24420656
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24420444 acagaggtatgatgggttcttcgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 24420543  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  24420544 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagataataagttggttgga 24420643  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  24420644 ttctgtgatgctg 24420656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 28726807 - 28727028
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28726807 agaagctatacaaaggtatgattggttctctattatacatcactgcatctagacctgatattttattcagtgtacgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 28726906  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  28726907 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaattcctagattataag 28727006  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  28727007 ttaattggattctgtgatgctg 28727028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 39 - 247
Target Start/End: Original strand, 24809877 - 24810085
Alignment:
Q  39 aggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatct 138  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24809877 aggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcagatcctagagaatct 24809976  T
Q  139 catttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggattct 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  24809977 catttaactgctgttaagagaatcttcagctatctgaagggaacaactaatcatggactcctttataggaaatccttagattatcagttggttggattct 24810076  T
Q  239 gtggtgctg 247  Q
    ||| |||||    
T  24810077 gtgatgctg 24810085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18944388 - 18944184
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18944388 agagatatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggtcagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccaatcagatcatagagaat 18944289  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  18944288 ctcatttaactattgttaagagaatcttcagatatttgaaaggaacaattaatcttggacttctctataggaaatccctggattatcagttggttggatt 18944189  T
Q  237 ctgtg 241  Q
     ||||    
T  18944188 ttgtg 18944184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24720637 - 24720438
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||  |||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24720637 agaggtgtgattggttctttgttataccttactgcatctaggccaaatattttcttcagtttatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaat 24720538  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||           |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||||||    
T  24720537 ctcatttaactgctgttaaaagaatcttc-----------aggaacaactaatcttggactcctctataggaaatccttagattatcagttggttggatt 24720449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 120
Target Start/End: Original strand, 28706716 - 28706772
Alignment:
Q  64 ctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28706716 ctcactgcatctagaccagatattttatttagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaa 28706772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 7694987 - 7695208
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7694987 agaagctatacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 7695086  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  7695087 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 7695186  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  7695187 ttgattggattctgtgatgctg 7695208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5838504 - 5838292
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5838504 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 5838405  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5838404 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattataagttgattgga 5838305  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  5838304 ttctgtgatgctg 5838292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7512583 - 7512362
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7512583 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 7512484  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  7512483 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 7512384  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  7512383 ttgattggattctgtgatgctg 7512362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 12618668 - 12618889
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12618668 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 12618767  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  12618768 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 12618867  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  12618868 ttgattggattctgtgatgctg 12618889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12735837 - 12735616
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12735837 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 12735738  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  12735737 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 12735638  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  12735637 ttgattggattctgtgatgctg 12735616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21868972 - 21868751
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21868972 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 21868873  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21868872 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 21868773  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  21868772 ttgattggattctgtgatgctg 21868751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 36241946 - 36242167
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36241946 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 36242045  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  36242046 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 36242145  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  36242146 ttgattggattctgtgatgctg 36242167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38100394 - 38100173
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38100394 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 38100295  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  38100294 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 38100195  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  38100194 ttgattggattctgtgatgctg 38100173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 47613448 - 47613669
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47613448 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 47613547  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  47613548 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 47613647  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  47613648 ttgattggattctgtgatgctg 47613669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 51651389 - 51651610
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51651389 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 51651488  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  51651489 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 51651588  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  51651589 ttgattggattctgtgatgctg 51651610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3176901 - 3176689
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3176901 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 3176802  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3176801 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattgga 3176702  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  3176701 ttctgtgatgctg 3176689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 5645220 - 5645441
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5645220 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 5645319  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  5645320 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 5645419  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  5645420 ttgattggattctatgatgctg 5645441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4172611 - 4172390
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4172611 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagcgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 4172512  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  4172511 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcttgtataggaaatccctagattataag 4172412  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  4172411 ttgattggattctgtgatgctg 4172390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7684457 - 7684236
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7684457 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 7684358  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  7684357 tcctagagaatctcatttaattgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctatataggaaatctctagattataag 7684258  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  7684257 ttgattggattctgtgatgctg 7684236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 35643554 - 35643775
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35643554 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcttctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 35643653  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  35643654 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 35643753  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  35643754 ttgattggattctatgatgctg 35643775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 149187 - 149412
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgta----tgcttgtgtgcaagatttcaat 121  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  149187 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtacgtatgcttgtgtgcaagatttcaat 149286  T
Q  122 cagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagatta 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  149287 cagatcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatattggactcctgtataggaaatccctagatta 149386  T
Q  222 caagttgattggattctgtggtgctg 247  Q
     ||||||||||||||||||| |||||    
T  149387 taagttgattggattctgtgatgctg 149412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Original strand, 22452323 - 22452533
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22452323 agaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcagatcctagagaat 22452422  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  22452423 ctcatttaactactgttaagagaatcttcaggtatttgaagggaacaactaatcttggactcctctataggaaatccctagattatcagttggttggatt 22452522  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
     |||| |||||    
T  22452523 ttgtgatgctg 22452533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Original strand, 22447089 - 22447299
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22447089 agaggtatgattggttctctattatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcagatcctagagaat 22447188  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  22447189 ctcatttaactactgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatcttggactcctctataggaaatccctagattatcagttggttggatt 22447288  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
     |||| |||||    
T  22447289 ttgtgatgctg 22447299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 19165176 - 19165388
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19165176 acagaggtatggttggttctttgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagaga 19165275  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  19165276 attttatttaacagctgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatcttggactcctttattggaaatccttagattatcagttggttgga 19165375  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  19165376 ttctgtgatgctg 19165388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 241
Target Start/End: Original strand, 21129830 - 21130034
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21129830 agaggtatgattggttctttgttgtacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcagatcctagagaat 21129929  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||  ||||||  || || |||||||    
T  21129930 ctcatttaactgctgttaagagaatctttagatatctgaagggaacaactattcttagactcctctataggaaatcctgagattatcagctggttggatt 21130029  T
Q  237 ctgtg 241  Q
    |||||    
T  21130030 ctgtg 21130034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22126788 - 22126578
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||| ||||||    
T  22126788 agaggtaagattggttctttgttatatctcactgcatctaggccaaatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattctagttagatcctggagaat 22126689  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22126688 ctcatttaactgctgttaaaagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctctgtaggaaatccctaaattaccagttggttggatt 22126589  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
     |||| |||||    
T  22126588 ttgtgatgctg 22126578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20934513 - 20934303
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20934513 agaggtatgattggttctttgctataccgcactgcatctaggccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccaatcagatcctagagaat 20934414  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||||||    
T  20934413 ctcatttaactattgttaagagaatcatcaggtatctgaaatgatcaactagttttggaatcctctataggaaatccttagattatcagttggttggatt 20934314  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
     |||| |||||    
T  20934313 atgtgatgctg 20934303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 105 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17720765 - 17720623
Alignment:
Q  105 gtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttat 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17720765 gtgtgcaagattccaatcagatcctagagaatctcatttaacagctgttaagagaatctttagatatttaaaaggaacaactaatcttggactcctttat 17720666  T
Q  205 aggaaatccctagattacaagttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| |||| |||||    
T  17720665 aggaaatccttagattataagttggttgaattttgtgatgctg 17720623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23390176 - 23390011
Alignment:
Q  82 gatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaa 181  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23390176 gatatgttattcagtgtatgcatgtttgcaagatttcagtcagatcctagataatctcatctaacagttgttaagagaatctttaggtatctgaaaggaa 23390077  T
Q  182 caactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||||| |||||| | | ||||||| ||||||   |||||| ||| |  |||||||||||| |||||    
T  23390076 caactcatcttgaaattctttataagaaatctaaagattataagctagttggattctgtgatgctg 23390011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 135
Target Start/End: Original strand, 21211250 - 21211348
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaa 135  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21211250 agaggtatgattggttctttgttgtacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtatgcaagatttcagtcagatcctagagaa 21211348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 247
Target Start/End: Original strand, 21211346 - 21211414
Alignment:
Q  179 gaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  21211346 gaacaactaatcttggactcctctataggaaatccttagattatcagttggttggattctgtgatgctg 21211414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 101
Target Start/End: Original strand, 23979089 - 23979154
Alignment:
Q  36 cagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatg 101  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  23979089 cagaggtatgataggttcactgttatacctaactgcatctagacttgatattttatttagtgtatg 23979154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 35221105 - 35221317
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35221105 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 35221204  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35221205 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattataagttgattgga 35221304  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  35221305 ttctgtgatgctg 35221317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 6981398 - 6981619
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6981398 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 6981497  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  6981498 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 6981597  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  6981598 ttgattggattctgtgatgctg 6981619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 9341548 - 9341769
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9341548 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 9341647  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9341648 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 9341747  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  9341748 ttgattggattctgtgatgctg 9341769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 14035635 - 14035856
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14035635 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 14035734  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14035735 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 14035834  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  14035835 ttgattggattctgtgatgctg 14035856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14452280 - 14452059
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14452280 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 14452181  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14452180 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 14452081  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  14452080 ttgattggattctgtgatgctg 14452059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14563321 - 14563100
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14563321 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 14563222  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14563221 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 14563122  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  14563121 ttgattggattctgtgatgctg 14563100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 22152109 - 22152330
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22152109 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 22152208  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22152209 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 22152308  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  22152309 ttgattggattctgtgatgctg 22152330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 22681709 - 22681930
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22681709 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 22681808  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22681809 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 22681908  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  22681909 ttgattggattctgtgatgctg 22681930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23483470 - 23483249
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23483470 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 23483371  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23483370 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 23483271  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  23483270 ttgattggattctgtgatgctg 23483249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 23702373 - 23702594
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23702373 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 23702472  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23702473 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 23702572  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  23702573 ttgattggattctgtgatgctg 23702594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 24572665 - 24572886
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24572665 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 24572764  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24572765 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 24572864  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  24572865 ttgattggattctgtgatgctg 24572886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24822144 - 24821923
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24822144 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 24822045  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24822044 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 24821945  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  24821944 ttgattggattctgtgatgctg 24821923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27047505 - 27047284
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27047505 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 27047406  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27047405 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 27047306  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  27047305 ttgattggattctgtgatgctg 27047284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 27465755 - 27465976
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27465755 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 27465854  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27465855 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 27465954  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  27465955 ttgattggattctgtgatgctg 27465976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27617440 - 27617219
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27617440 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 27617341  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27617340 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 27617241  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  27617240 ttgattggattctgtgatgctg 27617219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30232694 - 30232473
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30232694 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 30232595  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  30232594 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 30232495  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  30232494 ttgattggattctgtgatgctg 30232473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 31839073 - 31839294
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31839073 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 31839172  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  31839173 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 31839272  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  31839273 ttgattggattctgtgatgctg 31839294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 34777489 - 34777710
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34777489 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 34777588  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  34777589 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 34777688  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  34777689 ttgattggattctgtgatgctg 34777710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 39358089 - 39358310
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39358089 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 39358188  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  39358189 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 39358288  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  39358289 ttgattggattctgtgatgctg 39358310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39496155 - 39495934
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39496155 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 39496056  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  39496055 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 39495956  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  39495955 ttgattggattctgtgatgctg 39495934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 40395955 - 40396176
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40395955 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 40396054  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  40396055 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 40396154  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  40396155 ttgattggattctgtgatgctg 40396176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 42048373 - 42048594
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42048373 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 42048472  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  42048473 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 42048572  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  42048573 ttgattggattctgtgatgctg 42048594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 15745571 - 15745783
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15745571 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 15745670  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15745671 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattgga 15745770  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  15745771 ttctgtgatgctg 15745783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 17612664 - 17612876
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17612664 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 17612763  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17612764 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattgga 17612863  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  17612864 ttctgtgatgctg 17612876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 17724520 - 17724732
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17724520 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 17724619  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17724620 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattgga 17724719  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  17724720 ttctgtgatgctg 17724732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 31354136 - 31354348
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31354136 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 31354235  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31354236 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattgga 31354335  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  31354336 ttctgtgatgctg 31354348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 37735226 - 37735014
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37735226 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 37735127  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37735126 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattgga 37735027  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  37735026 ttctgtgatgctg 37735014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15998564 - 15998343
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15998564 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 15998465  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15998464 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacagctaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 15998365  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  15998364 ttgattggattctgtgatgctg 15998343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 19469565 - 19469786
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19469565 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatagctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 19469664  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19469665 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattacaag 19469764  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  19469765 ttggttggattctgtgatgctg 19469786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 23301870 - 23302091
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23301870 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactacatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 23301969  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23301970 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 23302069  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  23302070 ttgattggattctgtgatgctg 23302091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 23367529 - 23367750
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23367529 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcctgtgtgcaagatttcaatcaga 23367628  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23367629 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 23367728  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  23367729 ttgattggattctgtgatgctg 23367750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 24813506 - 24813727
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24813506 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcttctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 24813605  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24813606 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 24813705  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  24813706 ttgattggattctgtgatgctg 24813727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 36587785 - 36587564
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36587785 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcttctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 36587686  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  36587685 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 36587586  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  36587585 ttgattggattctgtgatgctg 36587564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 36693300 - 36693512
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36693300 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 36693399  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  36693400 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgactgga 36693499  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  36693500 ttctgtgatgctg 36693512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1116570 - 1116349
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1116570 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 1116471  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  1116470 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaagcaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 1116371  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  1116370 ttggttggattctgtgatgctg 1116349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5295810 - 5295589
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5295810 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 5295711  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  5295710 tcttagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccccagattataag 5295611  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  5295610 ttgattggattctgtgatgctg 5295589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17451980 - 17451759
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17451980 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 17451881  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17451880 tcctagagaatctcatttaactgcagttaaaagaatcatcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 17451781  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  17451780 ttgattggattctgtgatgctg 17451759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 20557340 - 20557561
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20557340 agaagctatacagaggtatgattggttttctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 20557439  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20557440 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 20557539  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  20557540 ttaattggattctgtgatgctg 20557561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 20785638 - 20785859
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20785638 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 20785737  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20785738 tcctagagaatctcatttaactgtagttaagagaatcttcaggtatcttaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 20785837  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  20785838 ttgattggattctgtgatgctg 20785859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24934921 - 24934700
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24934921 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 24934822  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  24934821 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttgtactcctgtataggaaatccctagactataag 24934722  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  24934721 ttgattggattctgtgatgctg 24934700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 23401504 - 23401725
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23401504 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaattaga 23401603  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23401604 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaagtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 23401703  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  23401704 ttgattgaattctgtgatgctg 23401725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 34057526 - 34057747
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34057526 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 34057625  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  34057626 tcctagagaatctcatttaactgcagttaaaagaatcttcaggtatctgaaaggaacaacaaatattggactcctgtataggaaatccctagattataag 34057725  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  34057726 ttgattggattctgtgatgctg 34057747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13528580 - 13528359
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  13528580 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattcaagtcaga 13528481  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  13528480 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaagtatctgaagggaacaactaattttggactcctgtataggaaatccctagattatcag 13528381  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  13528380 ttggttggattctgtgatgctg 13528359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 38 - 247
Target Start/End: Original strand, 21671457 - 21671666
Alignment:
Q  38 gaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatc 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21671457 gaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatttagaccagatattttattcaatgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctggagaatc 21671556  T
Q  138 tcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggattc 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  21671557 tcatttaactgttgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattatcaattggttggattc 21671656  T
Q  238 tgtggtgctg 247  Q
    |||| |||||    
T  21671657 tgtgatgctg 21671666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12860652 - 12860514
Alignment:
Q  83 atatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaac 182  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  12860652 atattttatttagtgtatgcttgtgtgcaaggttccaattagatcctaaagaatcttatttaactgttgttaagataatctttagatatttgaaatgaac 12860553  T
Q  183 aactaatcttggactcctttataggaaatccctagatta 221  Q
      ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  12860552 ggctaatcttggacttctttataagaaatccttagatta 12860514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 157
Target Start/End: Original strand, 18030958 - 18031048
Alignment:
Q  67 actgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaaga 157  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||  |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18030958 actgcttcaagacctgatattttatttagtatatgtttatgtgttagattctaatcagatcctccagaatctcatttaactgctcttaaga 18031048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 6796 - 7017
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6796 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 6895  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  6896 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 6995  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  6996 ttgattggattctgtgatgctg 7017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 1500 - 1712
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1500 acagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctagactagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcagatcctagaga 1599  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  1600 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgagggcaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattatcagttggttgga 1699  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  1700 ttctgtgatgctg 1712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 79
Target Start/End: Original strand, 12063 - 12107
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagac 79  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12063 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagac 12107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 4291 - 4512
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4291 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 4390  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  4391 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 4490  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  4491 ttgattggattctgtgatgctg 4512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 36483 - 36262
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36483 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 36384  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  36383 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 36284  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  36283 ttgattggattctgtgatgctg 36262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 42465 - 42686
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42465 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 42564  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  42565 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 42664  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  42665 ttgattggattctgtgatgctg 42686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 3354140 - 3354361
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3354140 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 3354239  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  3354240 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 3354339  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  3354340 ttgattggattctgtgatgctg 3354361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6156434 - 6156213
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6156434 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 6156335  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  6156334 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 6156235  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  6156234 ttgattggattctgtgatgctg 6156213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9346466 - 9346245
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9346466 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 9346367  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9346366 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 9346267  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  9346266 ttgattggattctgtgatgctg 9346245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 25679493 - 25679714
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25679493 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 25679592  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  25679593 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 25679692  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  25679693 ttgattggattctgtgatgctg 25679714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29081759 - 29081538
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29081759 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 29081660  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  29081659 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 29081560  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  29081559 ttgattggattctgtgatgctg 29081538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 32083201 - 32083422
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32083201 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 32083300  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  32083301 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 32083400  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  32083401 ttgattggattctgtgatgctg 32083422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 36298294 - 36298073
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36298294 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 36298195  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  36298194 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 36298095  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  36298094 ttgattggattctgtgatgctg 36298073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 36083280 - 36083068
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36083280 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 36083181  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36083180 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattgga 36083081  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  36083080 ttctgtgatgctg 36083068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 13694075 - 13694296
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13694075 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 13694174  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13694175 tcctagagaatctcatttaactgcagtcaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 13694274  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  13694275 ttgattggattctgtgatgctg 13694296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 15786215 - 15786436
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15786215 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 15786314  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15786315 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagataatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctatataggaaatccctagattataag 15786414  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  15786415 ttaattggattctgtgatgctg 15786436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19134048 - 19133827
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19134048 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctaaacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 19133949  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  19133948 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 19133849  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  19133848 ttgattggattctgtgatgctg 19133827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 44486473 - 44486261
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44486473 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 44486374  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  44486373 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgactgga 44486274  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  44486273 ttctgtgatgctg 44486261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 247176 - 246955
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247176 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 247077  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  247076 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctaaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 246977  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  246976 tttattggattctgtgatgctg 246955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 810296 - 810075
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  810296 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 810197  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  810196 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctaaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 810097  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  810096 tttattggattctgtgatgctg 810075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19230146 - 19229925
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  19230146 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaactaga 19230047  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  19230046 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 19229947  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  19229946 ttgattggattctgtgatgctg 19229925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19423693 - 19423472
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19423693 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacatgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 19423594  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  19423593 tcctagagaatctcatttaactacagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 19423494  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  19423493 ttgattggattctgtgatgctg 19423472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16742040 - 16741819
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16742040 agaagctatacagaggtatgattggctctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 16741941  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  16741940 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtatagaaaatccctagattataag 16741841  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  16741840 ttggttggattctgtgatgctg 16741819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 30320210 - 30320431
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30320210 agaagctatacataggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 30320309  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  30320310 tcctcgagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatctctagattataag 30320409  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  30320410 ttggttggattctgtgatgctg 30320431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 56 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21293642 - 21293451
Alignment:
Q  56 tgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaa 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21293642 tgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaa 21293543  T
Q  156 gagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||||    
T  21293542 gagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattatcagttggttggattttgtgatgctg 21293451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 22151794 - 22152015
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22151794 agaagctatacagaggtatgattggttctctattataccctactgcatctagagcagatattttgttcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcaga 22151893  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  22151894 tcctagagaatctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggtatttgaagggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattatcag 22151993  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  22151994 ttggttggattctgtgatgctg 22152015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Original strand, 20377328 - 20377527
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  20377328 agaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatgtaggctagatattttattcagtgtatgcatgtgtgcaagattccagtcagatcctatagaat 20377427  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20377428 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatatgaaaggaaaaactaatcttggactcctctataggaaatccctagattaccagttggttggatt 20377527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24650254 - 24650045
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  24650254 agaggtatgattggtctt-tgttatacttcactgcatctaggccagctattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctaaagaat 24650156  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||  |||||||    
T  24650155 ctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctctataggaaatccttagattatcagttagttggatt 24650056  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
     |||| |||||    
T  24650055 ttgtgatgctg 24650045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19934476 - 19934275
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  19934476 agaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctataccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatcttagtcagatcctagagaat 19934377  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||    
T  19934376 ctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggtatctgaatggaacaactaatctttgactcatctataggaaatcccaagattatcagttggttggatt 19934277  T
Q  237 ct 238  Q
    ||    
T  19934276 ct 19934275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Original strand, 22466659 - 22466868
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22466659 agaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggtcagatatttaattcagtgtatgcttgtgtgcaagattcca-tcagatcctagagaat 22466757  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  22466758 ctcatttaattgttgttaagagaatcttcaagtatctgaaaggaacaactaatcttggacttacctataggaaatctctagattatcagttggttggatt 22466857  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
     ||||||||||    
T  22466858 ttgtggtgctg 22466868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22668415 - 22668206
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22668415 agaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggccagatatttaattcagtgtatgcttgtgtgcaagattcca-tcagatcctagagaat 22668317  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  22668316 ctcatttaattgttgtaaagagaatcttcaagtatctgaaaggaacaactaatcttggacttctctatagaaaatctctagattatcagttggttggatt 22668217  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
     ||| ||||||    
T  22668216 ttgtcgtgctg 22668206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 247
Target Start/End: Original strand, 17293712 - 17293916
Alignment:
Q  41 gtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctca 140  Q
    ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  17293712 gtatgattggttccttgttatacatcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcagatccaagaaaatctca 17293811  T
Q  141 tttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggattctgt 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||    
T  17293812 tttaactgctgttaacagaattttcaggtatttgaagggaacaactaatcttagactcc--tctaggaaatccctagattatcagttggttgaattttgt 17293909  T
Q  241 ggtgctg 247  Q
    | |||||    
T  17293910 gatgctg 17293916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14977386 - 14977291
Alignment:
Q  89 tattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaa 184  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14977386 tattcagtgtctgtttgtctgcaagatttcaatcatatccttgagaatctcacttaactgttgttaagaaaatcttcagatatctgaaaggaacaa 14977291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 221
Target Start/End: Original strand, 15080689 - 15080815
Alignment:
Q  94 agtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttg 193  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  15080689 agtgtatgtttgtgtgcaaaattccaatcaggtcctagataatctcatttaattgttgttaagataatcttca-gtatctaaaaggaacaactaatcttg 15080787  T
Q  194 gactcctttataggaaatccctagatta 221  Q
    |  | ||||||| | |||||| ||||||    
T  15080788 gcttactttatacggaatcccaagatta 15080815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15165559 - 15165433
Alignment:
Q  94 agtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttg 193  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||    
T  15165559 agtgtatgtttgtgtgcaaaattccaatcaggtcctagagaatctcatttaattgttgttaagataatcttca-gtatctaaaaggaacaattaatcttg 15165461  T
Q  194 gactcctttataggaaatccctagatta 221  Q
    |  | ||||||| | |||||| ||||||    
T  15165460 gcttactttatacggaatcccaagatta 15165433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12799041 - 12798971
Alignment:
Q  88 ttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagag 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  12799041 ttatttagtgtatgcttgtgtgcaagattccaatcagatcctagagaatcacacttaactgttcttaagag 12798971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 24588690 - 24588604
Alignment:
Q  78 acctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatctt 164  Q
    |||||||||  |||||| ||||| ||| || |||||| | |||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24588690 acctgatattctattcattgtatacttatgcgcaagactccaatcatatcctaaagaatctcatttaaatgttgttaagagaatctt 24588604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 462540 - 462761
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  462540 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 462639  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  462640 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 462739  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  462740 ttgattggattctgtgatgctg 462761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1992905 - 1992684
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1992905 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 1992806  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1992805 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaattttggactcctttataggaaatccctagattataag 1992706  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  1992705 ttgattggattctgtgatgctg 1992684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9090583 - 9090362
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9090583 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 9090484  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9090483 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 9090384  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  9090383 ttgattggattctgtgatgctg 9090362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22094490 - 22094269
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22094490 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 22094391  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22094390 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 22094291  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  22094290 ttgattggattctgtgatgctg 22094269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24739450 - 24739229
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24739450 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 24739351  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24739350 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 24739251  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  24739250 ttgattggattctgtgatgctg 24739229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 26395648 - 26395869
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26395648 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 26395747  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  26395748 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 26395847  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  26395848 ttgattggattctgtgatgctg 26395869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 40047658 - 40047879
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40047658 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 40047757  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  40047758 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 40047857  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  40047858 ttgattggattctgtgatgctg 40047879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 8007629 - 8007841
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8007629 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 8007728  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8007729 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattgga 8007828  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  8007829 ttctgtgatgctg 8007841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11010527 - 11010315
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11010527 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 11010428  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11010427 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattgga 11010328  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  11010327 ttctgtgatgctg 11010315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 26 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20984606 - 20984386
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20984606 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 20984507  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20984506 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 20984407  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgct 246  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  20984406 ttgattggattctgtgatgct 20984386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 42871188 - 42870976
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42871188 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 42871089  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42871088 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataagttgattgga 42870989  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  42870988 ttctgtgatgctg 42870976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4217357 - 4217136
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4217357 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 4217258  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  4217257 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatctttgactcctgtataggaaatccctagattataag 4217158  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  4217157 ttgattggattctgtgatgctg 4217136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8622712 - 8622491
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8622712 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgctattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 8622613  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8622612 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 8622513  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  8622512 ttgattggattctgtgatgctg 8622491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9164913 - 9164692
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9164913 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 9164814  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9164813 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagaaaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 9164714  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  9164713 ttgattggattctgtgatgctg 9164692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 20998973 - 20999194
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20998973 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 20999072  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  20999073 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcttgtataggaaatccctagattataag 20999172  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  20999173 ttgattggattctgtgatgctg 20999194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 246
Target Start/End: Original strand, 26691296 - 26691516
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26691296 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcttctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 26691395  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  26691396 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 26691495  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgct 246  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  26691496 ttgattggattctgtgatgct 26691516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 172239 - 172018
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172239 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagatctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 172140  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  172139 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagataatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 172040  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  172039 ttgattggattctgtgatgctg 172018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 2711167 - 2711388
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2711167 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 2711266  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  2711267 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctaaaaggaacaactaatcttggactcatgtataggaaatccctagattataag 2711366  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  2711367 ttgattggattctgtgatgctg 2711388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 6872784 - 6873005
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6872784 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagatctgatattttatttagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 6872883  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  6872884 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 6872983  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  6872984 ttgattggattctgtgatgctg 6873005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 17955668 - 17955889
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17955668 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacttgatattttattcagtgtatgcttgtgtggaagatttcaatcaga 17955767  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17955768 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 17955867  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  17955868 ttgattggattctgtgatgctg 17955889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 15883377 - 15883597
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15883377 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatat-ttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 15883475  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  15883476 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatctctagattataag 15883575  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  15883576 ttggttggattctgtgatgctg 15883597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 39 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9438600 - 9438392
Alignment:
Q  39 aggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatct 138  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9438600 aggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatct 9438501  T
Q  139 catttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggattct 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9438500 catttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcatgtatgggaaatccctagattataagttgattggattct 9438401  T
Q  239 gtggtgctg 247  Q
    ||| |||||    
T  9438400 gtgatgctg 9438392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18433872 - 18433651
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18433872 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaattaga 18433773  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  18433772 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattattag 18433673  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  18433672 ttggttggattctgtgatgctg 18433651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 35 - 246
Target Start/End: Original strand, 4417557 - 4417768
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4417557 acagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcatggtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 4417656  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  4417657 atctcatttaactgctgttgagagaatcttcaggtatctgaatggaacaactaatcttggacttctttatagaaaatccctagattatcagttgattgga 4417756  T
Q  235 ttctgtggtgct 246  Q
    ||||||| ||||    
T  4417757 ttctgtgatgct 4417768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14138985 - 14138775
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14138985 agaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaaatcctagagaat 14138886  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  14138885 ctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggtatttgaagggaacaactaatcttggactcctctataggaaatccctagattatcagttggttggatt 14138786  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
     |||| |||||    
T  14138785 ttgtgatgctg 14138775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10652176 - 10651966
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | |||||    
T  10652176 agaggtatgattagttctttgttatacctcactgcatctaggccagatattttattcagtgtatgcttgtatgcaagattccagtcagatcccaaagaat 10652077  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||  ||||| ||| |||    
T  10652076 ctcatttaactgctgttaagagaagcttcaggtatttgaaaggaacaattaatcttggactcctctatagaaaatccttagattattagttggttgaatt 10651977  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
     |||| |||||    
T  10651976 ttgtgatgctg 10651966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13661804 - 13661623
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  13661804 agagatatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcttagagaat 13661705  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctaga 218  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13661704 ctcatttaactgctgtaaagaaagtctttaggtatctgaaaggatcaactaatcttggactcctctataggaaatccctaga 13661623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4824400 - 4824212
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||           || ||||||||||||    
T  4824400 agagttatgattggttctttgttatacctcactgcatccagactggatattttattcaacgtatgcttgtgtgc-----------caaatcctagagaat 4824312  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  4824311 ctcatttaactgatgttaagagaatcttcaggtatttaaagggaacaacttatcttggactcctgtataggaaatccctatattatcagttggttggatt 4824212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Original strand, 16158785 - 16158958
Alignment:
Q  41 gtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctca 140  Q
    ||||||| ||| || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||       | ||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16158785 gtatgataggttctttgttatacctgattgcatctagacctgatattttatttagtgtatg-------gaaaggttttaatcagatcttagagaatctca 16158877  T
Q  141 tttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagatta 221  Q
     ||||||  | ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16158878 cttaactcttcttaagagaatctttagatatttgaaaggaacaataaatctaggactcctttataagaaatccttagatta 16158958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 155 - 246
Target Start/End: Original strand, 4420520 - 4420611
Alignment:
Q  155 agagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggattctgtggtgct 246  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  4420520 agagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatcttggacttctttatagaaaatccctagattatcagttgattggattctgtgatgct 4420611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20540964 - 20540822
Alignment:
Q  96 tgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttgga 195  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| || || | |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  20540964 tgtatgcctgtgtgtaagatttcaatcagatcacagagaatctcacttgacagatgttaagagaatttttaggtatctgaaaggaacaactaatctagga 20540865  T
Q  196 ctcctttataggaaatccctagattacaagttgattggattct 238  Q
     | |||||||  ||||| | |||||| |||||| |||||||||    
T  20540864 attctttataacaaatctcaagattataagttggttggattct 20540822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Original strand, 5169778 - 5169887
Alignment:
Q  73 tctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatt 172  Q
    ||||||| |||||| || ||  ||||||| | |||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  5169778 tctagacttgatattttgtttggtgtatggtagtgtgcaagaatccaatcaaatcctagagaaactcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatc 5169877  T
Q  173 tgaaaggaac 182  Q
    ||||||||||    
T  5169878 tgaaaggaac 5169887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 162
Target Start/End: Original strand, 16158665 - 16158784
Alignment:
Q  36 cagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaa 135  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||       | ||| ||| ||||||||| |||||||    
T  16158665 cagaggtatgataggttctttgttatacctgattgcatctagacctgatattttatttagtgtatg-------gaaaggttttaatcagatcttagagaa 16158757  T
Q  136 tctcatttaactgctgttaagagaatc 162  Q
    ||||| ||||||  | |||||||||||    
T  16158758 tctcacttaactcttcttaagagaatc 16158784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 38390 - 38611
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38390 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 38489  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  38490 tcctagagaatctcatttaaatgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatacctagattataag 38589  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  38590 ttggttggattctgtgatgctg 38611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 42255 - 42474
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  42255 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagacctgatattttattcagtgtatgcttgtg--caaaatttcaatcaga 42352  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  42353 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 42452  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  42453 ttgattggattctgtgatgctg 42474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3760 - 3561
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||| |||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||| || |||||    
T  3760 agaggtacgattggttctttgttatacatcactgtatctaggccaaatattttattcagtgtatgcttgtgcggaagattccagccagatcatatagaat 3661  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    |||||||||| | | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  3660 ctcatttaacagttattaatagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctctataggaaatccctatattatcagttggttggatt 3561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 48448 - 48669
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48448 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactacatctatacctgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 48547  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  48548 tcctagagaatctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaattaatcttggactcctgtataggaaatccctagattataag 48647  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  48648 ttgattggattctgtgatgctg 48669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 39 - 247
Target Start/End: Original strand, 1821 - 2029
Alignment:
Q  39 aggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatct 138  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1821 aggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcagatcctagagaatct 1920  T
Q  139 catttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggattct 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  1921 catttaactgctgttaagagaatcttcagctatctgaagggaacaactaatcatggactcctttataggaaatccttagattatcagttggttggattct 2020  T
Q  239 gtggtgctg 247  Q
    ||| |||||    
T  2021 gtgatgctg 2029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 37 - 246
Target Start/End: Original strand, 161111 - 161320
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  161111 agaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctagaccagatatcttatttagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcagatcctagagaat 161210  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  161211 ctcctttaactgttgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacagctaatcttggactcctttataggaaatccctagattatcagttggttggatt 161310  T
Q  237 ctgtggtgct 246  Q
    ||||| ||||    
T  161311 ctgtgatgct 161320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 33255 - 33467
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  33255 acagaggtatgattggttctttgttacacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttgagtcagatcctagaaa 33354  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  33355 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccttagattattagttggttgga 33454  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  33455 ttctgtgatgctg 33467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14454 - 14233
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcaga 125  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14454 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcattcaga 14355  T
Q  126 tcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaag 225  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||  ||    
T  14354 tcctagagaatctcatttaacctctgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatcttagacttctgtataggaaatccatagattatcag 14255  T
Q  226 ttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  14254 ttggttggattctgtgatgctg 14233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 160484 - 160696
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  160484 acagagctatgatttgttctctgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcatgatttcagtcagatcctaaaga 160583  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  160584 atctcatttaactactgttaagagaatcttcaggtatctgaagggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccttagattatcagttggttgga 160683  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    ||||||| |||||    
T  160684 ttctgtgatgctg 160696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3496 - 3286
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3496 agaggtatgattggttctttgttataccttactgcatctagggatgatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaat 3397  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  3396 ctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctctataggaaatccctagattatcagttggttggatt 3297  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
     |||| |||||    
T  3296 ttgtgatgctg 3286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 241
Target Start/End: Original strand, 7283 - 7489
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  7283 acagaggtatgattggttctttgttatacctaactgcatctaggcaagatattttattcagtgtatgcttgtgtgctagattccagtcagatcctagaga 7382  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    |||| ||||||||  |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  7383 atcttatttaacttatgttaagaaaatcttcagatatctgaaaggaacaactaatcttggactcctctatagtaaatccctagattatcagttggttgga 7482  T
Q  235 ttctgtg 241  Q
    || ||||    
T  7483 ttttgtg 7489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Original strand, 14229 - 14439
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  14229 agaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgaaagattacaatcagatcctagagaat 14328  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||    
T  14329 ctcatttaactactgttaagagaatcttcatgtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctctataggaaatcccaagattattagttggttgaatt 14428  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
     |||| |||||    
T  14429 ttgtgatgctg 14439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Original strand, 4889 - 5101
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4889 acagaggtatgattggttctctattatacctcactgcatctagaccagatattttatttagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagaga 4988  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  | ||| |||||    
T  4989 atctcatttaactgcagttaagagaatcttcaggtatttgaagggaacaactaatcttggactcatgtataggaaatcccgagattatcaattggttgga 5088  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    || |||| |||||    
T  5089 ttatgtgatgctg 5101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4257 - 4053
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4257 agaggtatgattgattctttgttatacctcactgcatctagaccggatattttattcagtgtatgcttgtgcgcaagatttcagtcagatcctagagaat 4158  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  4157 ctcatttaactgttgttaagagaatcttcagatatctgaagggaacaacaaatcttggactcctctataggaaatccctagattatcagttggttggatt 4058  T
Q  237 ctgtg 241  Q
    |||||    
T  4057 ctgtg 4053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12462 - 12258
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12462 agaggtatgattggttctttgttgtacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 12363  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| | || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  12362 ctcatttaactgttgttaagagaatctttagatatcttaagggaacatctaatcttggactcctctataggaaatccctagattatcagttggttggatt 12263  T
Q  237 ctgtg 241  Q
    |||||    
T  12262 ctgtg 12258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Original strand, 7479 - 7689
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7479 agaggtatgattggttctttgttatacctcactacatctaggtcagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccaataagatcctagagaat 7578  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||  ||||| |||||||    
T  7579 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggacttctctataggaaatcattagattatcagttggttggatt 7678  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
     |||| |||||    
T  7679 ttgtgatgctg 7689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 21705 - 21903
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21705 agaggtatgattggttctttgttatacctcactacatctaggccagatattttatttagtgtatgcatgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 21804  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggat 235  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  21805 cttatttaactgctattaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctctataggaaatccatagattatcagttggttggat 21903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12076 - 11881
Alignment:
Q  41 gtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctca 140  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12076 gtatgattggttcattgttatacctcactgcatctatgccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttgagtcagatcctagagaatctca 11977  T
Q  141 tttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  11976 tttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggactcctctataggaaatacctagattatcagttggttggatt 11881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25780 - 25572
Alignment:
Q  35 acagaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagaga 134  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25780 acagaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctagaccagatattttattcagtgtatg----tgtgcaagatttcagtcagatcctagaga 25685  T
Q  135 atctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattgga 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  25684 atctcatttaactgctgttaagagaatctttagatatctgaagggaacaacaaatcttggactcctttataggaaatccctagattatcagttggttgga 25585  T
Q  235 ttctgtggtgctg 247  Q
    |||| || |||||    
T  25584 ttctatgatgctg 25572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Original strand, 10482 - 10692
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10482 agaggtatgattggttctttgttgtacctcactgtatctagaccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcagatcttagagaat 10581  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  10582 atcatttaactgttgttaagagaatctttagatatctgaagggaacaacaaatcttggactcctttataggaaatccctagattatcagttggttggatt 10681  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
    ||||| |||||    
T  10682 ctgtgatgctg 10692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1365 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold1365
Description:

Target: scaffold1365; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 246
Target Start/End: Original strand, 154 - 363
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  154 agaggtatgattggttctttactatacctcactgcatctaggccaaatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaat 253  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||    
T  254 ctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggtatatgaaaggaacaactaatcttggactcctgtataggaaatccctagattatcagttggttggttt 353  T
Q  237 ctgtggtgct 246  Q
     |||| ||||    
T  354 ttgtgatgct 363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 82 - 247
Target Start/End: Original strand, 48814 - 48979
Alignment:
Q  82 gatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaa 181  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48814 gatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaa 48913  T
Q  182 caactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  48914 caactaatcttggactcctttattggaaatccctagattatcagttggttggattctgtgatgctg 48979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 73747 - 73544
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  73747 agaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcttagagaat 73648  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| || ||||    
T  73647 ctcatttaacaactgttaagaaaatcttcaggtatctgaaaggaacaacaaatcttggactcctttacaggaaatccttagattataagttggttagatt 73548  T
Q  237 ctgt 240  Q
    ||||    
T  73547 ctgt 73544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 85937 - 85734
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  85937 agaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggccagatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcttagagaat 85838  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| || ||||    
T  85837 ctcatttaacaactgttaagaaaatcttcaggtatctgaaaggaacaacaaatcttggactcctttacaggaaatccttagattataagttggttagatt 85738  T
Q  237 ctgt 240  Q
    ||||    
T  85737 ctgt 85734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3765 - 3555
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  3765 agaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccaatcagatcctagagaaa 3666  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    || ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||||||    
T  3665 ctgatttaactgttgttaagagaattttcaggtatctgaaaggatcaactagtcttggactcctctataggaaatccttagattatcagttggttggatt 3566  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
    ||||| |||||    
T  3565 ctgtgatgctg 3555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Original strand, 30304 - 30514
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30304 agaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctagaccagatattttattctatgtatgcttacgtgcaagatttcagtcagatcctagagaat 30403  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||| |||||||    
T  30404 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcagatatctgaagggaacaacaaatcttggacttctctataggaaatccctagattatcaattggttggatt 30503  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
    || || |||||    
T  30504 ctatgatgctg 30514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3762 - 3552
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3762 agaggcatgattggtactttgttgtacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgtttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaat 3663  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  3662 ctcatttaaccgctgttaagagaatcttcaggtatgtgaaaggaacaactaatcttggacttctttacagaaaaaccctagattatcagttggttggatt 3563  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
    ||||| |||||    
T  3562 ctgtgatgctg 3552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Original strand, 130158 - 130368
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  130158 agaggtatgattggttctttattatacctcactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcagatcctagagaat 130257  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  130258 ctcatttaactgctattaagagaatctttagatatctgaagggaacaaaaaatcttggactcctctataggaaattcctagattatcagttggttggatt 130357  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
    ||||| |||||    
T  130358 ctgtgatgctg 130368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0594 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0594
Description:

Target: scaffold0594; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 241
Target Start/End: Original strand, 1652 - 1856
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  1652 agaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggccagatattttattaaatatatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctaaagaat 1751  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||  ||||| |||||||    
T  1752 ctcatttaactattgttaagagaatcttcaggtatctgaaaggaacaactaatcttggaatcctcaataggaagtccctagattattagttggttggatt 1851  T
Q  237 ctgtg 241  Q
    |||||    
T  1852 ctgtg 1856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 59 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14963 - 14775
Alignment:
Q  59 tatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaagag 158  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14963 tatacctaactgcatctaggccatatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcagtcagatcctagagaatctcatttaactgttgttaagag 14864  T
Q  159 aatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| |||| |||||    
T  14863 aatattcaggtatctaaaaggaacaactaatctttgactcctctataggaaatcccaagattatcagttggttggattttgtgatgctg 14775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0863 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0863
Description:

Target: scaffold0863; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Original strand, 2959 - 3169
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    |||| |||||||||| || |||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  2959 agagctatgattggttctttgttttacctcattgcatctaggccagatattttattcagtgtatgcttatgtgcaagattccagtcagatcctggagaat 3058  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggatt 236  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  3059 ctcatttcactattgttaagagaatcttcaagtatctgaaaggagcaactaatcttggactcctctataggaaatccctagattatcagttggttggatt 3158  T
Q  237 ctgtggtgctg 247  Q
     |||| |||||    
T  3159 ttgtgatgctg 3169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1835 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1835
Description:

Target: scaffold1835; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 794 - 611
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||||||||    
T  794 agaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctag-ccagatattttattcagagtatgcttctgtgcaatattccagtctgatcctagagaat 696  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagatta 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  695 ctcatttaagtgctgttaagagaatattcaagtatttgaaaggaacaaccaatattggactcctctataggaaatccttagatta 611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 53 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8092 - 7898
Alignment:
Q  53 ctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgt 152  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  8092 ctctattatacctcactgcatctaagccaaatattttattcagtgtatgtttgtgtgcaaaattctagtcagatcctggagaatctcatttaactgccgt 7993  T
Q  153 taagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggattctgtggtgctg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||||    
T  7992 taagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactcatcttggacttgtctataggaaatccctagattattagttggttggattttgtgatgctg 7898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Original strand, 6183 - 6332
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  6183 agaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggccagatattctattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatccaagagaat 6282  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaact 186  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6283 ctcatttaactgctgttatgagaatcttcaggtatctgaaaggaacaact 6332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2662 - 2510
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  2662 agaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggccaaatattttattcagcgtatgcttgtgtgcaagattccaggcagatcctagagaat 2563  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaat 189  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2562 ctcattcaactgctgttaagagaatcttcaggtatttgaaaggaacaattaat 2510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 10218 - 10101
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10218 agaggtatgattggttctttgttatacctcactacatctaggccaaatattttattcagtgtatgcttgtgtgcaagattccaatcagatcctagagaat 10119  T
Q  137 ctcatttaactgctgtta 154  Q
    |||||||||||| |||||    
T  10118 ctcatttaactgttgtta 10101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 38637 - 38507
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaat 136  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||   |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38637 agaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctg--ctagatattttatttagtgtatgcttgtgtgcaagattccagtcagatcctagagaat 38540  T
Q  137 ctcatttaactgctgttaagagaatcttcaggt 169  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38539 ctcatttaactgttgttaagagaatcttcaggt 38507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Original strand, 7710 - 7945
Alignment:
Q  26 agaagcaacacagaggtatgattggtcctctgttatacc-tcactgcatctagacct-gatatctt-attcagtgtat-gcttgtgt-gcaagattt-ca 119  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  7710 agaagctatacagaggtatgattggttctctgttataccctcactgcatctagaccttgatatttttattcagtgtattgcttgtgtagcaagattttca 7809  T
Q  120 atcagat-cctagagaat-ctcatttaa-ctgctgtt-aagagaat-cttcaggtatttgaaagg-aacaactaa-tcttggactcctttataggaaatc 212  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  7810 atcagattcctagagaattctcatttaaactgcagtttaagagaattcttcaggtatctgaaaggtaacaactaaatcttgtactcctgtataggaaatc 7909  T
Q  213 cctagattacaagttgattgga-ttctgtggtgctg 247  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||| |||||    
T  7910 cctagactataagttgattggacttctgtgatgctg 7945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 74249 - 74064
Alignment:
Q  56 tgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgtgcaagatttcaatcagatcctagagaatctcatttaactgctgttaa 155  Q
    |||||| ||| ||| |||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||||| || ||||   ||||||    
T  74249 tgttattcctaactacatctacacctaatattttatttattgtatgcttgtgtgcaacgtttcaatcatattctaaagaatctaatgtaacaattgttaa 74150  T
Q  156 gagaatcttcaggtatttgaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggattctgtg 241  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||| | ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  74149 gagaatctttagatatttgaaaggaacaactaatcttgaacttctttataacaaatacttagattataagttggttggattctgtg 74064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1578 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1578
Description:

Target: scaffold1578; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 601 - 530
Alignment:
Q  37 agaggtatgattggtcctctgttatacctcactgcatctagacctgatatcttattcagtgtatgcttgtgt 108  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  601 agaggtatgattggttctttgttatacctcactgcatctaggtcagatattttatttagtgtatgcttgtgt 530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 43011 - 42944
Alignment:
Q  174 gaaaggaacaactaatcttggactcctttataggaaatccctagattacaagttgattggattctgtg 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  43011 gaaaggaacaactaatcttagactcctctatagaaaatccctagattatcagttggttggattttgtg 42944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University