View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10380_low_7 (Length: 375)

Name: NF10380_low_7
Description: NF10380
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10380_low_7
NF10380_low_7
[»] chr4 (77 HSPs)
chr4 (4-257)||(5046640-5046893)
chr4 (4-221)||(5156999-5157216)
chr4 (4-241)||(13211796-13212033)
chr4 (1-257)||(30820485-30820742)
chr4 (4-257)||(14202869-14203123)
chr4 (4-217)||(42807910-42808124)
chr4 (4-242)||(7630037-7630276)
chr4 (4-257)||(48559963-48560216)
chr4 (4-257)||(6213948-6214202)
chr4 (1-178)||(3818788-3818967)
chr4 (4-241)||(50182156-50182391)
chr4 (4-220)||(12584285-12584502)
chr4 (5-220)||(41172412-41172627)
chr4 (4-220)||(17377495-17377712)
chr4 (4-203)||(17745167-17745364)
chr4 (4-167)||(10216251-10216414)
chr4 (4-242)||(17180930-17181171)
chr4 (4-203)||(49970614-49970812)
chr4 (4-220)||(13621100-13621316)
chr4 (4-257)||(13371183-13371429)
chr4 (4-257)||(13381384-13381630)
chr4 (4-257)||(578756-579012)
chr4 (4-220)||(34683047-34683264)
chr4 (6-201)||(51783970-51784167)
chr4 (71-257)||(13621381-13621566)
chr4 (4-223)||(21519730-21519950)
chr4 (4-220)||(26958541-26958755)
chr4 (4-164)||(30258126-30258286)
chr4 (71-241)||(10981368-10981538)
chr4 (80-220)||(18470259-18470399)
chr4 (4-203)||(52437436-52437635)
chr4 (5-235)||(9744146-9744373)
chr4 (5-220)||(26335726-26335938)
chr4 (5-189)||(40496156-40496339)
chr4 (22-224)||(4712638-4712838)
chr4 (5-220)||(16553410-16553622)
chr4 (102-257)||(45801769-45801927)
chr4 (85-254)||(6946596-6946763)
chr4 (5-220)||(52306753-52306965)
chr4 (85-220)||(6137592-6137725)
chr4 (4-202)||(47382181-47382370)
chr4 (5-220)||(46106659-46106871)
chr4 (12-189)||(4490680-4490856)
chr4 (85-220)||(14862958-14863090)
chr4 (5-220)||(33105897-33106109)
chr4 (5-175)||(15725208-15725376)
chr4 (112-203)||(6137499-6137589)
chr4 (108-223)||(43638959-43639072)
chr4 (102-220)||(6193066-6193182)
chr4 (5-164)||(20458846-20459004)
chr4 (85-219)||(38425745-38425877)
chr4 (5-176)||(49425774-49425943)
chr4 (71-189)||(29102000-29102117)
chr4 (85-235)||(33811015-33811163)
chr4 (5-220)||(45875744-45875956)
chr4 (102-220)||(54742433-54742549)
chr4 (138-203)||(56532591-56532655)
chr4 (5-136)||(23383940-23384067)
chr4 (5-166)||(11777510-11777669)
chr4 (85-174)||(36955387-36955475)
chr4 (85-134)||(43639068-43639117)
chr4 (102-183)||(49606040-49606120)
chr4 (5-130)||(142692-142816)
chr4 (102-189)||(578707-578793)
chr4 (5-202)||(14948126-14948319)
chr4 (102-189)||(14202820-14202906)
chr4 (154-201)||(30258349-30258396)
chr4 (123-157)||(30258289-30258323)
chr4 (112-149)||(6946766-6946803)
chr4 (103-184)||(11777460-11777541)
chr4 (112-149)||(14863093-14863130)
chr4 (103-184)||(23383890-23383971)
chr4 (112-149)||(26335862-26335899)
chr4 (5-62)||(38425573-38425630)
chr4 (103-184)||(52306934-52307015)
chr4 (103-183)||(26335908-26335988)
chr4 (113-149)||(49425813-49425849)
[»] chr3 (78 HSPs)
chr3 (4-257)||(6748651-6748904)
chr3 (4-241)||(11460106-11460343)
chr3 (4-255)||(7848469-7848720)
chr3 (11-241)||(37504497-37504727)
chr3 (4-217)||(6114761-6114975)
chr3 (4-257)||(21727585-21727839)
chr3 (4-241)||(47461650-47461888)
chr3 (4-257)||(12896578-12896831)
chr3 (4-257)||(8815272-8815524)
chr3 (4-220)||(995029-995246)
chr3 (4-241)||(6109165-6109403)
chr3 (4-241)||(7521314-7521552)
chr3 (25-258)||(26158254-26158488)
chr3 (4-241)||(45059533-45059771)
chr3 (4-217)||(994723-994937)
chr3 (4-257)||(4043568-4043829)
chr3 (4-203)||(51148013-51148212)
chr3 (4-241)||(27728147-27728387)
chr3 (4-203)||(17065720-17065919)
chr3 (4-257)||(38797916-38798173)
chr3 (4-257)||(26152198-26152453)
chr3 (4-176)||(51952222-51952396)
chr3 (113-221)||(27800440-27800548)
chr3 (102-241)||(17226274-17226413)
chr3 (70-220)||(2868231-2868381)
chr3 (71-220)||(3544265-3544415)
chr3 (131-257)||(21408611-21408737)
chr3 (5-249)||(53581503-53581744)
chr3 (5-259)||(13349069-13349320)
chr3 (5-220)||(33837816-33838033)
chr3 (5-220)||(53467358-53467570)
chr3 (4-125)||(52654387-52654508)
chr3 (5-220)||(1376004-1376217)
chr3 (85-241)||(31039643-31039797)
chr3 (4-118)||(26152511-26152626)
chr3 (5-177)||(50801589-50801759)
chr3 (5-177)||(50874121-50874291)
chr3 (5-203)||(27317629-27317825)
chr3 (85-223)||(34277567-34277703)
chr3 (133-220)||(48649313-48649400)
chr3 (5-220)||(27359970-27360180)
chr3 (5-171)||(12127562-12127726)
chr3 (102-220)||(3800169-3800286)
chr3 (85-220)||(50913086-50913219)
chr3 (4-99)||(3269234-3269329)
chr3 (4-62)||(17226203-17226261)
chr3 (4-62)||(30347775-30347833)
chr3 (114-203)||(26103730-26103817)
chr3 (5-220)||(36823928-36824140)
chr3 (4-60)||(27800584-27800640)
chr3 (92-220)||(48765306-48765432)
chr3 (102-203)||(8814768-8814867)
chr3 (85-220)||(32203127-32203259)
chr3 (5-220)||(3269342-3269555)
chr3 (155-257)||(17604868-17604969)
chr3 (103-184)||(50912957-50913038)
chr3 (1-55)||(3544430-3544484)
chr3 (85-151)||(17605513-17605579)
chr3 (112-149)||(3800306-3800343)
chr3 (5-132)||(22894554-22894679)
chr3 (102-181)||(53455514-53455589)
chr3 (5-62)||(54244749-54244806)
chr3 (125-217)||(22894875-22894965)
chr3 (103-187)||(50801725-50801809)
chr3 (103-187)||(50874071-50874155)
chr3 (102-189)||(3269185-3269271)
chr3 (102-189)||(6114938-6115024)
chr3 (102-189)||(7521515-7521601)
chr3 (102-189)||(17226154-17226240)
chr3 (102-189)||(26152462-26152548)
chr3 (4-62)||(48649428-48649487)
chr3 (112-149)||(12127650-12127687)
chr3 (103-184)||(12127695-12127776)
chr3 (112-149)||(29950657-29950694)
chr3 (112-149)||(29999811-29999848)
chr3 (101-189)||(994673-994760)
chr3 (101-189)||(7848683-7848770)
chr3 (104-184)||(17605627-17605707)
[»] chr2 (56 HSPs)
chr2 (4-257)||(39906280-39906533)
chr2 (4-241)||(7682016-7682252)
chr2 (4-241)||(44542807-44543044)
chr2 (4-218)||(9689386-9689601)
chr2 (4-217)||(6332287-6332500)
chr2 (4-217)||(33173481-33173693)
chr2 (4-220)||(20939721-20939937)
chr2 (4-203)||(4293215-4293414)
chr2 (4-217)||(2586363-2586576)
chr2 (4-217)||(22711044-22711257)
chr2 (4-217)||(30406472-30406685)
chr2 (4-257)||(44257400-44257655)
chr2 (6-241)||(9690171-9690406)
chr2 (4-235)||(15554033-15554264)
chr2 (4-200)||(39904653-39904850)
chr2 (4-241)||(38986919-38987155)
chr2 (4-216)||(22301989-22302201)
chr2 (71-214)||(324966-325109)
chr2 (102-220)||(3769433-3769551)
chr2 (5-220)||(34082566-34082778)
chr2 (102-257)||(18370327-18370480)
chr2 (5-203)||(11675151-11675347)
chr2 (85-258)||(13001967-13002138)
chr2 (92-184)||(17265356-17265447)
chr2 (1-164)||(1297598-1297746)
chr2 (85-235)||(29512043-29512193)
chr2 (5-220)||(1750172-1750383)
chr2 (6-224)||(16075024-16075237)
chr2 (5-257)||(16513020-16513266)
chr2 (5-186)||(23664747-23664927)
chr2 (5-151)||(33739546-33739691)
chr2 (121-220)||(8741623-8741722)
chr2 (4-111)||(3769653-3769760)
chr2 (121-217)||(23234034-23234130)
chr2 (85-224)||(42850094-42850231)
chr2 (85-224)||(8386777-8386915)
chr2 (5-184)||(23387144-23387322)
chr2 (102-220)||(29403928-29404044)
chr2 (5-189)||(37169556-37169737)
chr2 (5-178)||(1576652-1576823)
chr2 (4-62)||(19630763-19630821)
chr2 (4-62)||(19827664-19827722)
chr2 (85-178)||(768568-768660)
chr2 (85-149)||(24755157-24755220)
chr2 (102-181)||(43660829-43660908)
chr2 (5-62)||(29511965-29512022)
chr2 (5-41)||(324757-324793)
chr2 (119-189)||(12537296-12537365)
chr2 (105-187)||(41528057-41528139)
chr2 (103-184)||(11675101-11675182)
chr2 (103-184)||(16513235-16513316)
chr2 (112-149)||(33739585-33739622)
chr2 (103-184)||(34082516-34082597)
chr2 (154-187)||(45629737-45629770)
chr2 (95-166)||(41527931-41528002)
chr2 (122-163)||(43660694-43660737)
[»] chr7 (74 HSPs)
chr7 (4-220)||(12080682-12080898)
chr7 (4-220)||(15230048-15230264)
chr7 (13-220)||(14777910-14778117)
chr7 (1-217)||(20516906-20517123)
chr7 (4-218)||(11327581-11327796)
chr7 (4-172)||(32852888-32853056)
chr7 (4-257)||(38876165-38876419)
chr7 (4-241)||(27811904-27812141)
chr7 (4-217)||(8047971-8048180)
chr7 (4-203)||(24720261-24720460)
chr7 (4-257)||(48454542-48454796)
chr7 (4-257)||(14718992-14719244)
chr7 (4-220)||(34986509-34986725)
chr7 (4-200)||(45225396-45225593)
chr7 (4-220)||(28605425-28605640)
chr7 (4-234)||(26380073-26380304)
chr7 (4-217)||(22479193-22479405)
chr7 (4-241)||(4655007-4655249)
chr7 (6-217)||(7437798-7438010)
chr7 (1-174)||(18123076-18123250)
chr7 (4-241)||(27596982-27597232)
chr7 (4-220)||(14770057-14770274)
chr7 (4-220)||(15220508-15220725)
chr7 (79-241)||(45225222-45225384)
chr7 (4-217)||(43711898-43712113)
chr7 (4-157)||(37138933-37139087)
chr7 (71-201)||(48193155-48193285)
chr7 (4-241)||(18199530-18199772)
chr7 (106-241)||(33889044-33889179)
chr7 (5-255)||(25818433-25818681)
chr7 (5-257)||(938842-939091)
chr7 (111-217)||(1325335-1325441)
chr7 (11-257)||(41407289-41407532)
chr7 (5-220)||(18352315-18352528)
chr7 (85-257)||(2936587-2936757)
chr7 (5-220)||(38367856-38368068)
chr7 (5-220)||(19069380-19069592)
chr7 (6-220)||(27168254-27168465)
chr7 (5-184)||(28912101-28912278)
chr7 (5-221)||(2362735-2362946)
chr7 (25-235)||(41037327-41037535)
chr7 (5-203)||(454105-454300)
chr7 (5-189)||(9401656-9401838)
chr7 (5-203)||(15957214-15957409)
chr7 (257-363)||(31029415-31029516)
chr7 (5-235)||(2509321-2509547)
chr7 (102-203)||(32577505-32577607)
chr7 (4-62)||(18829839-18829897)
chr7 (85-218)||(38796903-38797035)
chr7 (5-175)||(11766149-11766317)
chr7 (4-60)||(32577713-32577769)
chr7 (4-113)||(33889847-33889956)
chr7 (27-131)||(32577615-32577719)
chr7 (115-177)||(18829697-18829759)
chr7 (85-220)||(6736589-6736723)
chr7 (85-180)||(23740061-23740156)
chr7 (102-220)||(6559341-6559457)
chr7 (19-62)||(17317400-17317443)
chr7 (85-189)||(2633972-2634072)
chr7 (113-217)||(3512711-3512813)
chr7 (85-149)||(27168292-27168356)
chr7 (4-48)||(48193343-48193387)
chr7 (102-189)||(7437746-7437833)
chr7 (103-184)||(9401606-9401687)
chr7 (103-187)||(454266-454350)
chr7 (102-189)||(4655212-4655298)
chr7 (91-165)||(14780074-14780148)
chr7 (112-150)||(38367894-38367932)
chr7 (4-49)||(3407151-3407196)
chr7 (128-189)||(7835347-7835407)
chr7 (103-184)||(28912247-28912328)
chr7 (154-187)||(38796824-38796857)
chr7 (102-183)||(45225562-45225642)
chr7 (104-184)||(939060-939140)
[»] chr5 (82 HSPs)
chr5 (4-241)||(4736744-4736978)
chr5 (4-220)||(30687914-30688131)
chr5 (1-204)||(1951430-1951633)
chr5 (4-241)||(29302104-29302342)
chr5 (4-203)||(3960638-3960837)
chr5 (13-217)||(15808944-15809149)
chr5 (4-257)||(17604975-17605227)
chr5 (12-217)||(33026201-33026406)
chr5 (4-217)||(11448706-11448920)
chr5 (4-224)||(26905864-26906081)
chr5 (16-217)||(17209888-17210086)
chr5 (4-220)||(1921431-1921647)
chr5 (4-241)||(33282206-33282442)
chr5 (79-217)||(27005155-27005293)
chr5 (38-220)||(33833087-33833270)
chr5 (12-220)||(37282153-37282357)
chr5 (105-220)||(14795662-14795777)
chr5 (11-220)||(30667588-30667794)
chr5 (102-241)||(7014475-7014614)
chr5 (102-241)||(30486059-30486198)
chr5 (27-235)||(31240268-31240473)
chr5 (4-235)||(2528720-2528950)
chr5 (105-183)||(1797420-1797498)
chr5 (5-220)||(25912044-25912256)
chr5 (4-141)||(37249351-37249489)
chr5 (5-241)||(4737879-4738112)
chr5 (5-220)||(14369735-14369947)
chr5 (5-218)||(28747732-28747943)
chr5 (4-115)||(17559224-17559335)
chr5 (5-220)||(12910024-12910236)
chr5 (4-220)||(37468513-37468720)
chr5 (5-220)||(7944255-7944467)
chr5 (5-220)||(4083706-4083918)
chr5 (5-218)||(13711033-13711245)
chr5 (92-184)||(17421697-17421788)
chr5 (11-203)||(39038504-39038694)
chr5 (85-220)||(39548921-39549054)
chr5 (5-189)||(33696051-33696233)
chr5 (5-220)||(2695098-2695309)
chr5 (85-257)||(6436354-6436524)
chr5 (5-175)||(31752128-31752296)
chr5 (85-220)||(3038855-3038988)
chr5 (85-222)||(17233353-17233488)
chr5 (102-257)||(22701842-22701995)
chr5 (32-127)||(38661242-38661337)
chr5 (5-178)||(6260993-6261164)
chr5 (5-178)||(22800642-22800814)
chr5 (70-220)||(8410684-8410832)
chr5 (4-62)||(22282212-22282270)
chr5 (11-62)||(7014631-7014682)
chr5 (5-184)||(9124705-9124884)
chr5 (4-62)||(1807520-1807578)
chr5 (11-234)||(10951009-10951229)
chr5 (5-149)||(17232918-17233061)
chr5 (5-146)||(857928-858070)
chr5 (105-173)||(4150976-4151045)
chr5 (5-62)||(11351820-11351877)
chr5 (5-60)||(4151093-4151148)
chr5 (102-177)||(38952198-38952272)
chr5 (5-175)||(33832728-33832898)
chr5 (103-184)||(17232868-17232949)
chr5 (112-149)||(17421798-17421835)
chr5 (5-62)||(32736383-32736440)
chr5 (108-184)||(13676229-13676303)
chr5 (141-257)||(40234211-40234325)
chr5 (154-257)||(31752377-31752479)
chr5 (94-149)||(32736347-32736401)
chr5 (102-189)||(37249452-37249538)
chr5 (169-220)||(38661192-38661243)
chr5 (154-184)||(6260994-6261024)
chr5 (103-189)||(29302056-29302141)
chr5 (103-189)||(30687866-30687951)
chr5 (112-149)||(2695137-2695174)
chr5 (103-184)||(4083887-4083968)
chr5 (103-184)||(4738081-4738162)
chr5 (107-184)||(6436572-6436649)
chr5 (102-175)||(8318124-8318197)
chr5 (112-149)||(14369871-14369908)
chr5 (103-184)||(17421843-17421924)
chr5 (112-149)||(25912083-25912120)
chr5 (154-242)||(22213127-22213215)
chr5 (101-189)||(33282405-33282492)
[»] chr1 (84 HSPs)
chr1 (5-220)||(39424267-39424482)
chr1 (4-257)||(20411194-20411448)
chr1 (5-203)||(16960281-16960479)
chr1 (4-220)||(36817647-36817864)
chr1 (1-257)||(1804922-1805178)
chr1 (4-220)||(13385703-13385922)
chr1 (4-257)||(14494366-14494620)
chr1 (4-257)||(12864226-12864478)
chr1 (4-198)||(47130907-47131102)
chr1 (4-220)||(32374511-32374727)
chr1 (11-204)||(27389474-27389670)
chr1 (4-241)||(32716356-32716589)
chr1 (4-220)||(27255649-27255866)
chr1 (4-217)||(51464996-51465208)
chr1 (5-243)||(10764556-10764794)
chr1 (77-203)||(14387471-14387597)
chr1 (4-254)||(43236151-43236410)
chr1 (102-257)||(13943358-13943513)
chr1 (4-175)||(52772243-52772415)
chr1 (5-220)||(13157557-13157772)
chr1 (5-220)||(16005547-16005760)
chr1 (5-220)||(26842998-26843210)
chr1 (85-220)||(463392-463525)
chr1 (4-217)||(28094405-28094605)
chr1 (4-149)||(20201739-20201885)
chr1 (85-217)||(27787880-27788010)
chr1 (102-249)||(32155937-32156082)
chr1 (85-220)||(34515210-34515343)
chr1 (5-225)||(6192424-6192643)
chr1 (11-184)||(158420-158592)
chr1 (5-178)||(36389459-36389630)
chr1 (5-220)||(51431828-51432042)
chr1 (85-203)||(5491681-5491797)
chr1 (93-220)||(24770717-24770842)
chr1 (5-217)||(28454691-28454900)
chr1 (85-203)||(13264531-13264647)
chr1 (5-203)||(16073438-16073635)
chr1 (5-189)||(34306440-34306626)
chr1 (102-203)||(42199853-42199952)
chr1 (102-203)||(42208721-42208820)
chr1 (85-189)||(3979457-3979560)
chr1 (4-189)||(27348128-27348309)
chr1 (4-180)||(24190751-24190927)
chr1 (85-220)||(8642979-8643112)
chr1 (4-62)||(28646759-28646817)
chr1 (5-184)||(45818799-45818976)
chr1 (144-201)||(12010512-12010569)
chr1 (102-203)||(47130805-47130905)
chr1 (5-257)||(23413584-23413830)
chr1 (5-130)||(33676084-33676209)
chr1 (96-220)||(41146233-41146355)
chr1 (85-257)||(50559329-50559499)
chr1 (11-62)||(3099574-3099625)
chr1 (85-220)||(32994250-32994383)
chr1 (77-130)||(32151996-32152049)
chr1 (85-149)||(32151945-32152009)
chr1 (85-132)||(32144130-32144177)
chr1 (5-164)||(3273370-3273528)
chr1 (13-189)||(4158116-4158290)
chr1 (123-189)||(33675834-33675899)
chr1 (103-184)||(462968-463049)
chr1 (4-62)||(12010605-12010665)
chr1 (103-184)||(28704514-28704595)
chr1 (92-224)||(14387341-14387470)
chr1 (102-189)||(20411145-20411231)
chr1 (102-189)||(27255600-27255686)
chr1 (111-178)||(28764654-28764720)
chr1 (102-149)||(32144088-32144135)
chr1 (95-145)||(25378604-25378654)
chr1 (4-41)||(2965334-2965371)
chr1 (154-187)||(3977973-3978006)
chr1 (103-184)||(10558162-10558243)
chr1 (85-134)||(13157362-13157411)
chr1 (112-149)||(13157596-13157633)
chr1 (103-180)||(16005733-16005810)
chr1 (103-184)||(16073388-16073469)
chr1 (112-149)||(24770669-24770706)
chr1 (102-179)||(28182156-28182232)
chr1 (112-149)||(36389498-36389535)
chr1 (5-62)||(50559250-50559307)
chr1 (5-57)||(20201700-20201752)
chr1 (102-189)||(28646710-28646796)
chr1 (103-183)||(42200018-42200098)
chr1 (103-183)||(42208886-42208966)
[»] chr8 (83 HSPs)
chr8 (4-257)||(9483649-9483902)
chr8 (4-257)||(14826237-14826488)
chr8 (4-217)||(19971415-19971628)
chr8 (4-217)||(21021185-21021398)
chr8 (4-257)||(21442128-21442381)
chr8 (4-241)||(41942859-41943093)
chr8 (4-220)||(31071554-31071769)
chr8 (4-175)||(1783002-1783173)
chr8 (4-217)||(30577868-30578082)
chr8 (11-257)||(5642465-5642702)
chr8 (11-257)||(5644406-5644643)
chr8 (5-203)||(13269233-13269429)
chr8 (5-235)||(35550559-35550786)
chr8 (107-217)||(25281053-25281163)
chr8 (5-220)||(27545762-27545974)
chr8 (5-224)||(25127871-25128089)
chr8 (111-203)||(42556441-42556532)
chr8 (5-184)||(13468318-13468496)
chr8 (5-220)||(1201671-1201883)
chr8 (5-220)||(2823584-2823796)
chr8 (85-220)||(8258304-8258437)
chr8 (5-218)||(10616293-10616503)
chr8 (85-156)||(21442395-21442466)
chr8 (127-257)||(2178651-2178780)
chr8 (5-217)||(26042926-26043135)
chr8 (5-224)||(30633043-30633259)
chr8 (5-235)||(30207169-30207396)
chr8 (11-220)||(3369720-3369925)
chr8 (93-220)||(25123467-25123592)
chr8 (5-220)||(32069024-32069234)
chr8 (85-183)||(32486945-32487042)
chr8 (5-203)||(184108-184304)
chr8 (140-241)||(3154067-3154168)
chr8 (5-203)||(5946786-5946981)
chr8 (5-221)||(10776977-10777188)
chr8 (26-217)||(29125695-29125883)
chr8 (5-151)||(23544841-23544987)
chr8 (11-189)||(26867935-26868112)
chr8 (85-217)||(1281869-1281999)
chr8 (4-62)||(3154209-3154267)
chr8 (4-62)||(4018675-4018733)
chr8 (5-183)||(9483938-9484115)
chr8 (1-62)||(25280993-25281054)
chr8 (85-193)||(39934409-39934516)
chr8 (4-62)||(1775535-1775593)
chr8 (4-62)||(14819307-14819365)
chr8 (104-189)||(44874146-44874230)
chr8 (5-151)||(36899739-36899886)
chr8 (4-62)||(18804322-18804380)
chr8 (102-184)||(18804887-18804968)
chr8 (114-220)||(23161301-23161405)
chr8 (5-257)||(34103002-34103251)
chr8 (5-135)||(26630031-26630161)
chr8 (103-187)||(30633225-30633309)
chr8 (102-189)||(13290594-13290680)
chr8 (13-149)||(45299639-45299774)
chr8 (136-181)||(9869596-9869641)
chr8 (85-234)||(32512114-32512261)
chr8 (155-220)||(36901237-36901301)
chr8 (85-220)||(9413889-9414022)
chr8 (5-126)||(17691217-17691337)
chr8 (102-225)||(42556760-42556881)
chr8 (154-220)||(29377864-29377929)
chr8 (5-62)||(7089968-7090025)
chr8 (103-184)||(17691167-17691248)
chr8 (105-178)||(21352256-21352328)
chr8 (112-149)||(26043059-26043096)
chr8 (104-149)||(45299698-45299743)
chr8 (154-234)||(17952598-17952677)
chr8 (102-189)||(3154230-3154316)
chr8 (154-241)||(23053811-23053897)
chr8 (5-60)||(42556684-42556739)
chr8 (114-180)||(29377534-29377600)
chr8 (112-149)||(184147-184184)
chr8 (112-149)||(1201710-1201747)
chr8 (112-149)||(10616332-10616369)
chr8 (154-187)||(13468462-13468495)
chr8 (112-149)||(17691256-17691293)
chr8 (112-149)||(26630070-26630107)
chr8 (103-184)||(27545712-27545793)
chr8 (136-181)||(30400528-30400572)
chr8 (103-183)||(1201621-1201701)
chr8 (101-189)||(19971591-19971678)
[»] chr6 (51 HSPs)
chr6 (4-241)||(1369899-1370136)
chr6 (4-220)||(31132876-31133093)
chr6 (4-257)||(29646159-29646413)
chr6 (4-220)||(11100380-11100597)
chr6 (4-220)||(10777943-10778160)
chr6 (4-257)||(15962737-15962992)
chr6 (4-220)||(9955795-9956012)
chr6 (4-257)||(4184261-4184514)
chr6 (4-257)||(5187770-5188022)
chr6 (4-241)||(27828307-27828549)
chr6 (4-241)||(8171836-8172073)
chr6 (4-220)||(16599069-16599286)
chr6 (71-248)||(20755423-20755600)
chr6 (4-164)||(26667865-26668026)
chr6 (5-220)||(33730501-33730710)
chr6 (5-257)||(4898447-4898696)
chr6 (107-220)||(10315306-10315420)
chr6 (5-177)||(14488320-14488490)
chr6 (85-257)||(18154487-18154657)
chr6 (85-241)||(30525434-30525588)
chr6 (102-213)||(21969991-21970100)
chr6 (4-99)||(11210297-11210392)
chr6 (139-257)||(15882021-15882139)
chr6 (5-220)||(18102668-18102881)
chr6 (85-220)||(15718188-15718321)
chr6 (4-96)||(15881926-15882018)
chr6 (4-62)||(24022877-24022935)
chr6 (5-177)||(25061676-25061845)
chr6 (102-203)||(26211376-26211475)
chr6 (102-220)||(3438090-3438206)
chr6 (4-62)||(10196604-10196662)
chr6 (4-62)||(35002025-35002083)
chr6 (101-183)||(32889635-32889715)
chr6 (5-220)||(4838255-4838473)
chr6 (85-180)||(4898207-4898302)
chr6 (11-62)||(33311672-33311723)
chr6 (5-217)||(11742305-11742514)
chr6 (85-166)||(9406615-9406695)
chr6 (4-62)||(8062115-8062173)
chr6 (85-174)||(11100081-11100170)
chr6 (154-187)||(3881411-3881444)
chr6 (70-150)||(30525393-30525473)
chr6 (154-235)||(32194180-32194260)
chr6 (102-189)||(9955746-9955832)
chr6 (126-220)||(228020-228111)
chr6 (112-149)||(4838397-4838434)
chr6 (103-184)||(5703803-5703884)
chr6 (112-149)||(11742438-11742475)
chr6 (112-149)||(25061770-25061807)
chr6 (104-189)||(31132829-31132913)
chr6 (103-203)||(11742465-11742564)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (1-241)||(452363-452603)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (4-257)||(57839-58093)
scaffold0068 (102-189)||(58056-58142)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (4-257)||(26051-26305)
[»] scaffold0119 (2 HSPs)
scaffold0119 (4-164)||(2767-2928)
scaffold0119 (4-164)||(14822-14983)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (5-217)||(20620-20830)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (5-220)||(9733-9946)
[»] scaffold0418 (2 HSPs)
scaffold0418 (5-189)||(5696-5878)
scaffold0418 (113-149)||(5803-5839)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (5-220)||(4043-4254)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (12-220)||(22624-22830)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (5-220)||(6522-6734)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (4-62)||(82742-82800)
[»] scaffold1808 (2 HSPs)
scaffold1808 (85-189)||(577-680)
scaffold1808 (103-187)||(725-809)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (4-60)||(14872-14928)
[»] scaffold0778 (2 HSPs)
scaffold0778 (4-46)||(6271-6313)
scaffold0778 (102-189)||(6222-6308)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 77)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 5046640 - 5046893
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  5046640 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacat 5046739  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5046740 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaaatggttaaatacaccttaaggtgtaactttgctaaaaca 5046839  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
     |  |||||||||||||||||  || |||||| ||||||  ||||| |||||||    
T  5046840 ctcccacataaaaactaatgggtgtgttctagcaaaccttatatatatatatat 5046893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5157216 - 5156999
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        || || ||||||| |||||||||||||||   |    
T  5157216 ttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaaatgggtgtgttctagcaaatcctataggcct 5157117  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5157116 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 5157017  T
Q  204 ttttcacataaaaactaa 221  Q
     |||||||||||||||||    
T  5157016 ctttcacataaaaactaa 5156999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13212033 - 13211796
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  13212033 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 13211934  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  13211933 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtcaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaagca 13211834  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
     |  ||||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  13211833 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 13211796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 30820485 - 30820742
Alignment:
Q  1 aaattataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctataga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||| |  |||| || |||||||||||||||     
T  30820485 aaattataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataaattggtgtattctagcaaatcctatagg 30820584  T
Q  101 aatttgctagaatacacccacttatttt-ttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaa 199  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  30820585 catttgctagaagacacccacttatttttttagaaggagtattttaccaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaa 30820684  T
Q  200 aacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    |||| || ||||||||||||| |||  || |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  30820685 aacacttccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccccatatatatatatat 30820742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 14202869 - 14203123
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  14202869 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgagtgtgttctagcaaatcctataggca 14202968  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14202969 tttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtggataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 14203068  T
Q  203 attttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    | |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  14203069 actcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccccatatatatatatat 14203123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 42807910 - 42808124
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-taagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  42807910 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 42808009  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  42808010 tttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 42808109  T
Q  203 attttcacataaaaa 217  Q
    | || ||||||||||    
T  42808110 acttccacataaaaa 42808124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 7630276 - 7630037
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  7630276 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatattgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 7630177  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7630176 tttgctaggatacacccacttagattttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 7630077  T
Q  203 attttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacct 242  Q
    | | |||||||||||||| |||  || |||||| ||||||    
T  7630076 actctcacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacct 7630037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 48560216 - 48559963
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  48560216 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgttttaacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 48560117  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  48560116 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaatttaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 48560017  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
     |  |||||||||| || |||  || |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  48560016 ctcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaaccccatatatatatatat 48559963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6214202 - 6213948
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  6214202 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccctctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 6214103  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  6214102 tttgctaggatacacccacttagtttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaac 6214003  T
Q  203 attttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    | | |||||||||||||| |||| || |||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  6214002 actctcacataaaaactagtggatgtgttctagcaaactccatatatatatatat 6213948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3818967 - 3818788
Alignment:
Q  1 aaattataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn--taagtgagtgtgttatagcaaatcctata 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3818967 aaattataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacatcttctaaaaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctata 3818868  T
Q  99 gaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 178  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3818867 aacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 3818788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 50182391 - 50182156
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| ||||||||  |||||  ||    
T  50182391 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaagttgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaat--tataggcat 50182294  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  50182293 ttgttagaatacactcacttattttttagaagcagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaata 50182194  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
     ||||||||||||| ||||||  || |||||| |||||    
T  50182193 ctttcacataaaaattaatgggtgtgttctagcaaacc 50182156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 12584285 - 12584502
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| || |||| |||||||| ||||||  |    
T  12584285 ttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtatgttctagcaaattctataggca 12584384  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  12584385 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctagaac 12584484  T
Q  203 attttcacataaaaacta 220  Q
    | |  |||||||||||||    
T  12584485 actcccacataaaaacta 12584502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 41172627 - 41172412
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||       ||| || ||||||| ||||||||| |||||  |||    
T  41172627 tataactaaaaagttaataaatacattttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataaatgggtgtgttctagcaaatcttataggcatt 41172528  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||     
T  41172527 tgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacactttaaggtgtagctttgctaaagcac 41172428  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  41172427 tcccacataaaaacta 41172412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17377712 - 17377495
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||       
T  17377712 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggct 17377613  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17377612 tttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaaatagtttaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 17377513  T
Q  203 attttcacataaaaacta 220  Q
    | |  | |||||||||||    
T  17377512 actcccgcataaaaacta 17377495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17745364 - 17745167
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||        |||||  |||||| |||||||||||||||  ||    
T  17745364 ttataactaaaaagttaataaatacaccttcaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtggatgtgttctagcaaatcctataggcat 17745265  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17745264 --gctagaatacacccacctattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaaatggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 17745167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Original strand, 10216251 - 10216414
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  10216251 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 10216350  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10216351 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 10216414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17181171 - 17180930
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaa---gtgagtgtgttatagcaaatcctataga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||        ||   ||| ||| ||| |||||||||||||||     
T  17181171 ttataactaaaaagttaataaatacaacttaaggtgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaaaacaagtgggtgcgttctagcaaatcctatagg 17181072  T
Q  101 aatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaa 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17181071 catttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtatttttgcaatttaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaa 17180972  T
Q  201 acattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacct 242  Q
    ||| |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||||||    
T  17180971 acactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacct 17180930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 49970812 - 49970614
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||        ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  49970812 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacctactaaaaaaacaagtgggtgtgtt-tagcaaatcctataggcat 49970714  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||  ||||||||||||    
T  49970713 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagaaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccctaatgtgtagatttgctaaaaca 49970614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13621316 - 13621100
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  13621316 ttataactaaaaagttaataaatactccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 13621217  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||    
T  13621216 tttgctaggatacacc-acttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaatttttagctttgctaaaac 13621118  T
Q  203 attttcacataaaaacta 220  Q
    | |  |||||||||||||    
T  13621117 actcccacataaaaacta 13621100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13371429 - 13371183
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  13371429 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 13371330  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||      || |||| |||||||||||||    
T  13371329 ttgctagaatacaaccacttatgttttagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggtaaaatac------aggtgtagctttgctaaaaca 13371236  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
     |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  13371235 ctcccacataaaaactagtgg-tgtgttctagcaaaccccatatatatatatat 13371183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13381630 - 13381384
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  13381630 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 13381531  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||      || |||| |||||||||||||    
T  13381530 ttgctagaatacaaccacttatgttttagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggtaaaatac------aggtgtagctttgctaaaaca 13381437  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
     |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  13381436 ctcccacataaaaactagtgg-tgtgttctagcaaaccccatatatatatatat 13381384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 578756 - 579012
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctata--acacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctataga 100  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||         || || |||| || |||||||||||||||     
T  578756 ttataactaaaaagtgaataaatacaccttaaggtgtatgttgctatataacacaccttctagaaaaagcaaatgggtgtattctagcaaatcctatagg 578855  T
Q  101 aatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaa 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  578856 catttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaa 578955  T
Q  201 acattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    ||| |   |||||||||||| |||  || |||||  ||||| | ||||| |||||||    
T  578956 acactcatacataaaaactagtgggtgtattctaacaaaccccatatatatatatat 579012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 34683047 - 34683264
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| ||||||||| |||||  |    
T  34683047 ttataactaaaaagttaacaaatacagcttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcatataggca 34683146  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34683147 tttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaattaaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtaactctgctaaaac 34683246  T
Q  203 attttcacataaaaacta 220  Q
    | |  ||| |||||||||    
T  34683247 actcccacgtaaaaacta 34683264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Original strand, 51783970 - 51784167
Alignment:
Q  6 ataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaattt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  51783970 ataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaataaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcattt 51784069  T
Q  106 gctagaatacaccc-acttattttttagaagg-agtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  51784070 gctagaatacaccctacttattttttagaagggagtattttagtaaataaataactaaaaagtgattaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaa 51784167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 71 - 257
Target Start/End: Original strand, 13621381 - 13621566
Alignment:
Q  71 aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 170  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13621381 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 13621480  T
Q  171 aaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| || ||||||  |||| ||||||| |||||||    
T  13621481 aaatacaccacaagatgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttctagcgaacc-cgtatatatatatat 13621566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21519950 - 21519730
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |         ||||| ||||||| ||| |||||||||||  |    
T  21519950 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttttaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagtaaatcctataggca 21519851  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| |||||||    
T  21519850 tttgctagaatacacccacttattttttagaagaagtattttagcaaatcaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggagtagctttactaaaac 21519751  T
Q  203 attttcacataaaaactaatg 223  Q
    | |  |||||||||| |||||    
T  21519750 actcccacataaaaattaatg 21519730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26958755 - 26958541
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||    
T  26958755 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcatataggcat 26958656  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  26958655 ttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaaat-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 26958558  T
Q  204 ttttcacataaaaacta 220  Q
     |  |||||||||||||    
T  26958557 ctcccacataaaaacta 26958541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 30258126 - 30258286
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||        ||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  30258126 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacgcattctaaaaaaacaagtgagtgtgttctagcaaatcctataggcat 30258225  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30258226 ttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaatgaataactaaaaa 30258286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 71 - 241
Target Start/End: Original strand, 10981368 - 10981538
Alignment:
Q  71 aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 170  Q
    ||||| ||||||| || |||||  |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10981368 aagtgggtgtgttctaacaaattttataggcatttgctagaatacatccacttattttctagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 10981467  T
Q  171 aaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  10981468 aaatacacattaaggtgtagctttgctaaaacactctcacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 10981538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18470399 - 18470259
Alignment:
Q  80 tgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacc 179  Q
    |||| ||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18470399 tgttctagtaaattctatagccatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacc 18470300  T
Q  180 ttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
    ||||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  18470299 ttaaggtgtagttttgctaaaacactcccacataaaaacta 18470259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Original strand, 52437436 - 52437635
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaa--gtgagtgtgttatagcaaatcctatagaa 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||        ||  ||| ||||||| |||||| |||||||||     
T  52437436 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaagttgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaaaaaagtgggtgtgttctagcaactcctatagac 52437535  T
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  52437536 atttgttaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgt-agtttgctaaaa 52437633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 9744146 - 9744373
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  9744146 tataactaaaaagttgttagatacaccttaaggtgaatgttgctacaacacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtatattagcaactcctataggcatt 9744244  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |     
T  9744245 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataaataaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaac-ttgctaaaatac 9744342  T
Q  205 tttcacataaaaactaatggacgtcttctag 235  Q
    | |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  9744343 tctcacataaaaactagtggatgtgttctag 9744373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26335938 - 26335726
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  26335938 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 26335840  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     
T  26335839 tgttaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 26335742  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  26335741 tcccacataaaaacta 26335726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 189
Target Start/End: Original strand, 40496156 - 40496339
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| ||||    |||||| ||||||||| |||    
T  40496156 tataactaaaaagttgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtaagttagcaactcctatagacatt 40496255  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  40496256 tgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatataccttaaggtgta 40496339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4712838 - 4712638
Alignment:
Q  22 taaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccac 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||       |||||| ||||    |||||| ||||||||  ||| |||| |||||||||||    
T  4712838 taaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaatacaccttctaaaaaaataagtgggtgtaagttagcaactcctataggcattcgctaaaatacacccac 4712739  T
Q  122 ttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaa 221  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  4712738 ttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaaccaa 4712641  T
Q  222 tgg 224  Q
    |||    
T  4712640 tgg 4712638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16553622 - 16553410
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||  |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  16553622 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaata-taagtaggtgtatgttagcaactcctataggcatt 16553524  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||||||||||     
T  16553523 tgctagaatacatccacttattttttagaaagtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 16553426  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    || |||||||||||||    
T  16553425 ttccacataaaaacta 16553410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 45801927 - 45801769
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataac---taaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgcta 198  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||| ||    
T  45801927 atttgttagaatacatccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaataaaaagtggttaaatacactctaatgtgtagctttgtta 45801828  T
Q  199 aaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    ||||| |  ||||||||||||||| || || |||| | | ||||| ||||| |||||||    
T  45801827 aaacactcccacataaaaactaatagatgtgttcttgcagacctcatatatatatatat 45801769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6946763 - 6946596
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6946763 tagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacactttaag 6946665  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtata 254  Q
     |||| | ||||||||||| | |||||||||||||| |||  || |||||| ||| ||| ||||| ||||    
T  6946664 gtgtagc-ttgctaaaacactctcacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaatctcatatatatata 6946596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 52306965 - 52306753
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |       |||||| |||| |  |||||| ||||||||| |||    
T  52306965 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttataaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 52306867  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || || ||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||     
T  52306866 tgctaggatacacctacttattttttagaaggtgtgttataacaact-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgt-aggttgctaaaacac 52306769  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    | || |||||||||||    
T  52306768 tctcccataaaaacta 52306753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 220
Target Start/End: Original strand, 6137592 - 6137725
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6137592 tagcaactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagtaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaag 6137690  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
     | || | ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  6137691 gtatagc-ttgctaaaacactcccacataaaaacta 6137725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 47382370 - 47382181
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnta--agtgagtgtgttatagcaaatcctatagaa 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||        |  ||||  |||||| || ||||||||||||      
T  47382370 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtttgttgatataacacaccttctaaaaaaaaacaagtggatgtgttctaacaaatcctataggc 47382271  T
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    || ||||| ||||           ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  47382270 atatgctaaaata-----------tttttagaaagagtattttagcaagtgaataaccaaaaagtgattaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaa 47382182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 46106871 - 46106659
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||       |||||| |||| |  |||||| ||| ||||  |||    
T  46106871 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacctcctaaaata-taagtgggtgtatgttagcaactccaataggcatt 46106773  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | | |||||||||||     
T  46106772 tgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttgaatacaccttaaggtggagc-ttgctaaaacac 46106675  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  46106674 tcccacataaaaacta 46106659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4490856 - 4490680
Alignment:
Q  12 aaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctaga 111  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||| |||||||| |    
T  4490856 aaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaattaagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgctata 4490757  T
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||||||||||||||  || ||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  4490756 atacacccacttatttcctaaaatatgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacgctaagatgta 4490680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14863090 - 14862958
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14863090 tagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaa-gtgtgttttagcaagt-tataattaaaaagtagttaaatacaccttaag 14862993  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
     |||| | ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  14862992 gtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaacta 14862958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33106109 - 33105897
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||| |||    
T  33106109 tataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 33106011  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||  ||||  ||||| | ||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |     
T  33106010 tgctaggatacgcccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataatcaaaaaatagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaatac 33105913  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  33105912 tcccacataaaaacta 33105897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15725376 - 15725208
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||| |||||| || ||||||||||||       ||||||||||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  15725376 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-taagtgagtgtatgttagcaactcctataggcatt 15725278  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 175  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  15725277 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagtaagt-tataactaaaaaatagttaaata 15725208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 112 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6137589 - 6137499
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | || |||||||||||||    
T  6137589 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaag-gtataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtatatctttgctaaaaca 6137499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 43639072 - 43638959
Alignment:
Q  108 tagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacatttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||| | ||     
T  43639072 tagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataactaaaaagcagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaatacttc 43638975  T
Q  208 cacataaaaactaatg 223  Q
    |||||||||| |||||    
T  43638974 cacataaaaattaatg 43638959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Original strand, 6193066 - 6193182
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||||||||    
T  6193066 atttgctagaatacactcacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataacaaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtagc-ttgctaaaa 6193163  T
Q  202 cattttcacataaaaacta 220  Q
    || |   ||||||||||||    
T  6193164 cactccaacataaaaacta 6193182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 164
Target Start/End: Original strand, 20458846 - 20459004
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||| || ||||| ||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  20458846 tatagttaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacactccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 20458945  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||  |||||||||||    
T  20458946 tgctagaatatacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataactaaaaa 20459004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 219
Target Start/End: Original strand, 38425745 - 38425877
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  38425745 tagcaactcctataggcatttgctagaacacacccatttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaacttaag 38425843  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaact 219  Q
     |||| | ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  38425844 gtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaact 38425877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 49425774 - 49425943
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| ||||    |||||| | ||||||  |||    
T  49425774 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtacgttagcaacttctataggcatt 49425872  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 176  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  49425873 tgctaggatacacctacttattttttagaaggtgtgttttagcaact-tataactaaaaagtagttaaatac 49425943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29102117 - 29102000
Alignment:
Q  71 aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 170  Q
    |||||||||| |  || ||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||  |||| |||||||| |||    
T  29102117 aagtgagtgtatgttaacaactcctataaacatttgctaggatacacccacttattttttataagatgtgttttagcaagt-tataattaaaaagtagtt 29102019  T
Q  171 aaatacaccttaagatgta 189  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  29102018 aaatacacattaagatgta 29102000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33811163 - 33811015
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33811163 tagcaactcctacaggcatttgctataatacacccacttaatttttagaaagtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaag 33811065  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctag 235  Q
     | || | ||| ||||||| |  ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  33811064 gtatagc-ttgttaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttctag 33811015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45875956 - 45875744
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| || |       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  45875956 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacatt-ttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 45875858  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||| |  ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| | ||| |||||||     
T  45875857 tgctaggatacacccacttatttttttgaatgtgtgttttagcaaat-tataactaaaaagtagtgaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgttaaaacac 45875760  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  45875759 tcccacataaaaacta 45875744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 54742549 - 54742433
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||    
T  54742549 atttgctaaaatacacccacttatattttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactagaaagtagttaaatgcactttaaggtgtagc-ttgctaaaa 54742452  T
Q  202 cattttcacataaaaacta 220  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  54742451 cattcccacataaaaacta 54742433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Original strand, 56532591 - 56532655
Alignment:
Q  138 gtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||    
T  56532591 gtattttagcaagtgaataactaaaaaatggttaaataca-tttaagatgtagcttttctaaaaca 56532655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Original strand, 23383940 - 23384067
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||          |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  23383940 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacct----aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 23384035  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaagg 136  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23384036 tgctaggatacacccacttattttttagaagg 23384067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 166
Target Start/End: Original strand, 11777510 - 11777669
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||       ||| || |||| |  |||||| |||||||   |||    
T  11777510 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacatattctaaaaaa-taattgggtgtatgttagcaactcctataagcatt 11777608  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagt 166  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||||    
T  11777609 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagtaagt-tataactaaaaagt 11777669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36955475 - 36955387
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaat 174  Q
    |||||| || |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| || | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  36955475 tagcaactcatataggcatttgctagaatacactcacttattttttataatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaat 36955387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 43639117 - 43639068
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaa 134  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43639117 tagcaactcctatagacatttgttagaatacacccacttattttttagaa 43639068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 49606120 - 49606040
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 183  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  49606120 atttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgcgttttagcaagt-tatagataaaaagtagttaaatacactttaa 49606040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 142816 - 142692
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| || |||| ||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  142816 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaagacactttctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 142718  T
Q  105 tgctagaatacacccacttatttttt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  142717 tgctaggatacacccacttatttttt 142692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Original strand, 578707 - 578793
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  578707 atttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagtta-taactaaaaagtgaataaatacaccttaaggtgta 578793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14948319 - 14948126
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| | ||||       |||||| |||| |  |||||| || | |||| |||    
T  14948319 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacgcattctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcatttagacatt 14948221  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    || ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||  |||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14948220 tgttaggattcacccacttattttttaaaaggtgtgttttaataagtta-taactaaaa-gtagttaaatacaccttaagatgtagc-ttgctaaaac 14948126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Original strand, 14202820 - 14202906
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||| ||||||| ||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  14202820 atttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcgagtta-taactaaaaagttaataaatacaccttaagatgta 14202906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30258396 - 30258349
Alignment:
Q  154 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||    
T  30258396 ataactaaaaagtggttaaatacatcctaaggtgtagctttgctaaaa 30258349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 30258323 - 30258289
Alignment:
Q  123 tattttttagaaggagtattttagcaagtgaataa 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30258323 tattttttagaaggagtattttagcaaatgaataa 30258289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Original strand, 6946766 - 6946803
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  6946766 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 6946803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Original strand, 11777460 - 11777541
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   ||||  | |||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11777460 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtatgttttagcaaaggtataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 11777541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Original strand, 14863093 - 14863130
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14863093 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 14863130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Original strand, 23383890 - 23383971
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   |||| || |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23383890 tttgctaggatacacccactggtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 23383971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Original strand, 26335862 - 26335899
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  26335862 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 26335899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 62
Target Start/End: Original strand, 38425573 - 38425630
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
T  38425573 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct 38425630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 52307015 - 52306934
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||   |||| || ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52307015 tttgctaggatacactcactagtttttattaaggtgtgttttagcaaatatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 52306934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 26335988 - 26335908
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 183  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   |||| ||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26335988 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtattttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaa 26335908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 49425849 - 49425813
Alignment:
Q  113 tacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  49425849 tacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 49425813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 78)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 6748651 - 6748904
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| ||||||||||||||   ||    
T  6748651 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataagcat 6748750  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6748751 ttgctagaatacacccacttcttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtaactttgctaaaaca 6748850  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
     || ||||||||||||| |||  || |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  6748851 cttccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccccatatatatatatat 6748904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11460343 - 11460106
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| | |||||||||||||||  ||    
T  11460343 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgagtgtgctctagcaaatcctataggcat 11460244  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11460243 ttgctagaatgcacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 11460144  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
     |  ||||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  11460143 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagtaaacc 11460106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7848720 - 7848469
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  7848720 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtacgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 7848621  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7848620 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 7848521  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatat 255  Q
     |   |||||||||||| |||  || |||||| ||||| | ||||| |||||    
T  7848520 ctcctacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccccatatatatatat 7848469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 37504727 - 37504497
Alignment:
Q  11 taaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  37504727 taaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgttag 37504628  T
Q  111 aatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcac 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || |||    
T  37504627 aatacacccacttattttttagaaggagtattttagaaagtgaataactaaaaagtggttaaacacaccttaaggtgtagctttgctaaaacacttccac 37504528  T
Q  211 ataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
    |||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  37504527 ataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 37504497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6114975 - 6114761
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  6114975 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagaca 6114876  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  6114875 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtaaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 6114776  T
Q  203 attttcacataaaaa 217  Q
    | |  ||||||||||    
T  6114775 actcccacataaaaa 6114761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21727839 - 21727585
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |         ||||| ||||||| |||||||||||| ||  |    
T  21727839 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttataaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctacaggca 21727740  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21727739 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtaaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 21727640  T
Q  203 attttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    | |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  21727639 actcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccccatatatatatatat 21727585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 47461888 - 47461650
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       | ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  47461888 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctattaaaattaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 47461789  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  47461788 tttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 47461689  T
Q  203 attttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
    | |  ||||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  47461688 actcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 47461650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12896831 - 12896578
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  12896831 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 12896732  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12896731 tttgctaggatacacccacttaatttttggaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 12896632  T
Q  203 attttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    | |  ||||||||||||| |||   | |||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  12896631 actcccacataaaaactagtgggtttgttctagcaaacc-cgtatatatatatat 12896578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8815524 - 8815272
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  8815524 ttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttttagcaaatcctataggcat 8815425  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8815424 ttgctagaatacacctacttattttt-agaaggagtattttcgcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 8815326  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
     |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  8815325 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccccatatatatatatat 8815272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 995029 - 995246
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||        ||||| || |||| |||||||||||||||  ||    
T  995029 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctgtaacacaccttctaaaaaaacaagtgggtatgttctagcaaatcctataggcat 995128  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttatttt-ttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  995129 ttgctagaatacaaccacttatttttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccataaggtgtagctttgctaaaac 995228  T
Q  203 attttcacataaaaacta 220  Q
    |||  |||||||||||||    
T  995229 attcccacataaaaacta 995246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 6109165 - 6109403
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| ||||||||| |||||  |    
T  6109165 ttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcatataggca 6109264  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  6109265 tttgctagaatacacccatttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagcgttgctaaaac 6109364  T
Q  203 attttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
    | |  ||||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  6109365 actcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 6109403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7521552 - 7521314
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| |||| || |||||||||||||||  |    
T  7521552 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtattctagcaaatcctataggca 7521453  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7521452 tttgttagaatacacccacttattttttagaaagaatattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 7521353  T
Q  203 attttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
    |    ||||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  7521352 aaacccacataaaaactagtgggtgtattctagcaaacc 7521314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 258
Target Start/End: Original strand, 26158254 - 26158488
Alignment:
Q  25 atacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccactt 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  26158254 atacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctactt 26158353  T
Q  124 attttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |  ||||||||||||| ||    
T  26158354 attttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagatttgctaaaacactcccacataaaaactagtg 26158453  T
Q  224 gacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatatt 258  Q
    |  || |||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  26158454 ggtgtgttctagcaaaccccatatatatatatatt 26158488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 45059533 - 45059771
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-taagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||        |||||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  45059533 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgttataacacacattctaacaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctatagaca 45059632  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  45059633 tttgctaggatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacactttaaggtgtagctttgctaaaac 45059732  T
Q  203 attttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
    | |  || |||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  45059733 actcccaaataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 45059771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 994723 - 994937
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||        || || ||||||| || ||||||||||||  ||    
T  994723 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgctgctataacacaccttctaaaaaaacaattgggtgtgttctaccaaatcctataggcat 994822  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac-cttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | | |||| ||||||||||||    
T  994823 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacactctaagggtgtagctttgctaaaac 994922  T
Q  203 attttcacataaaaa 217  Q
    |||  ||||||||||    
T  994923 attcccacataaaaa 994937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4043829 - 4043568
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagc-------aaatcct 95  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| || |       |||||||    
T  4043829 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctaacttctaacaaatcct 4043730  T
Q  96 atagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttg 195  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  4043729 ataggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagatttg 4043630  T
Q  196 ctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  4043629 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccccatatatatatatat 4043568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Original strand, 51148013 - 51148212
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  51148013 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacactttctaaaagaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagaa- 51148111  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  51148112 tttgctagaacgcacccacttattttttagaatgagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaacttaaggtgtagctttgctaaaac 51148211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27728387 - 27728147
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacac--cttctnnnnnnn-taagtgagtgtgttatagcaaatcctataga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||        |||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  27728387 ttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttgctataacacacaccttctaacaaaaataagtgggtgtgttttagcaaatcctatagg 27728288  T
Q  101 aatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaa 200  Q
     |||||||   ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27728287 catttgcttagatacacccacttagtttttagaaggaatattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaa 27728188  T
Q  201 acattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
    ||| |  ||||||| ||||| |||  || |||||| |||||    
T  27728187 acactcccacataataactagtgggtgtgttctagcaaacc 27728147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17065919 - 17065720
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  17065919 ttataactaagaagttaataaatacgtcttaaggtgtatgttattataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacat 17065820  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  17065819 ttgctagaatgtacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaaatggttaaatacacccgaagatgtagctttgctaaaaca 17065720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 38798173 - 38797916
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnta--agtgagtgtgttatagcaaatcctatagaa 101  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |  |||| ||||||| |||||||||||||||      
T  38798173 ttataactaaaaaattaataaatacaccttaaagtgtatgttgcgataacacaccttctaaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggc 38798074  T
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||| |||||    
T  38798073 atttgctaaaatacatccacttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacattaaggtatagctttgttaaaa 38797974  T
Q  202 ca--ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    ||   | |||||||||||||| ||   || |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  38797973 cactctctcacataaaaactagtgagtgtgttctagcaaaccccatatatatatatat 38797916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 26152198 - 26152453
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||         |||   ||||||| || ||||||||||||  |    
T  26152198 ttataactaaaaagttaataaatataccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagcaggtgtgttctatcaaatcctataggca 26152297  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaac-tttgctaaaa 201  Q
    |||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||    
T  26152298 tttggtaagatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagcttttactaaaa 26152397  T
Q  202 cattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    || |  ||||||||||||| |||   | |||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  26152398 cactcccacataaaaactagtgggtatgttctagcaaacctcatatatatatatat 26152453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 51952396 - 51952222
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-taagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  51952396 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 51952297  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttatt-ttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  51952296 tttgctagaatacacccacttatttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaataggttaaatac 51952222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 113 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27800548 - 27800440
Alignment:
Q  113 tacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacat 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27800548 tacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacacttccacat 27800449  T
Q  213 aaaaactaa 221  Q
    |||||||||    
T  27800448 aaaaactaa 27800440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 241
Target Start/End: Original strand, 17226274 - 17226413
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  17226274 atttgctagaatacacccacttattttttagaagaaatattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaa 17226373  T
Q  202 cattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
    || |  |||||||||||||||||  || |||||| |||||    
T  17226374 cactcccacataaaaactaatgggtgtgttctagcaaacc 17226413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 220
Target Start/End: Original strand, 2868231 - 2868381
Alignment:
Q  70 taagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggt 169  Q
    |||||| |||| || ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2868231 taagtgggtgttttctagcaaatcatataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgagtgttttagcaagtgaataaataaaaagtggt 2868330  T
Q  170 taaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  2868331 taaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacacttcaacataaaaacta 2868381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 71 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3544415 - 3544265
Alignment:
Q  71 aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttatttttt-agaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggt 169  Q
    ||||| |||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3544415 aagtgggtgtattctagcaaatcttataggcatttgctagaatacacccacttatttttttagaaggagtattttagcaagtgaagaattaaaaagtggt 3544316  T
Q  170 taaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
    |||||||||| |||| |||| |||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  3544315 taaatacaccctaaggtgtagctttactaaaacactcccacataaaaacta 3544265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 257
Target Start/End: Original strand, 21408611 - 21408737
Alignment:
Q  131 agaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtct 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||  || |    
T  21408611 agaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgt 21408710  T
Q  231 tctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    ||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  21408711 tctagcaaaccccatatatatatatat 21408737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 53581744 - 53581503
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||| |||    
T  53581744 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 53581646  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | |||||||||||     
T  53581645 tgctaagatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 53581548  T
Q  205 tttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatat 249  Q
    |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||| ||| |||||    
T  53581547 tcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaatctcatatat 53581503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13349320 - 13349069
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||| ||||  |||    
T  13349320 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaata-taagtgggtgtatgttagcaactccaataggcatt 13349222  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || | | |||||||||||     
T  13349221 tgctaggatacacccacttattttttagaaggcgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtggagc-ttgctaaaacac 13349124  T
Q  205 tttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatatta 259  Q
    |  ||||||||||| | |||  || |||||| ||| | | ||||| |||||||||    
T  13349123 tcccacataaaaaccagtgggtgtgttctagcaaatcccatatatatatatatta 13349069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 33837816 - 33838033
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||| |||    
T  33837816 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 33837915  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaag---tgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||   | | ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  33837916 tgctaggatacactcacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaa 33838014  T
Q  202 cattttcacataaaaacta 220  Q
    || |   ||||||||||||    
T  33838015 cactcctacataaaaacta 33838033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 53467358 - 53467570
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||       |||||  |||| |  |||||| || | |||  |||    
T  53467358 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtggatgttgctaaaacacacattctaaaata-taagttggtgtatgttagcaactcatgtaggcatt 53467456  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||     
T  53467457 tgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtataac-ttgttaaaacac 53467554  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  53467555 tcccacataaaaacta 53467570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 52654508 - 52654387
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||    
T  52654508 ttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgagtgtgttctagcaaattctataggcat 52654409  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttat 125  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  52654408 ttgctaaaatacacccacttat 52654387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 1376004 - 1376217
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  1376004 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 1376103  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||| | | |||||||||     
T  1376104 tgctaggatacatccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatatacctgaaggtgtagc-tagctaaaacac 1376201  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  1376202 tcccacataaaaacta 1376217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 241
Target Start/End: Original strand, 31039643 - 31039797
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31039643 tagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaag 31039741  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
     |||| | ||||||||||| |   |||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  31039742 gtgtagc-ttgctaaaacactcctacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 31039797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 118
Target Start/End: Original strand, 26152511 - 26152626
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct-nnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  26152511 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 26152610  T
Q  103 tttgctagaatacacc 118  Q
    ||||||||||||||||    
T  26152611 tttgctagaatacacc 26152626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 50801759 - 50801589
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||       ||| ||||||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  50801759 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaacttctataaaa-taaatgagtgtatgttagcaactcctataggcatt 50801661  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  50801660 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaataca 50801589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Original strand, 50874121 - 50874291
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||       ||| ||||||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  50874121 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaacttctataaaa-taaatgagtgtatgttagcaactcctataggcatt 50874219  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  50874220 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaataca 50874291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 27317825 - 27317629
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataaca-caccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| || | ||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  ||    
T  27317825 tataactaaaaatttattaaatacaccttagagtgaatgttgctaaaaaaacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 27317727  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||    
T  27317726 ttgctagaatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 27317629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 223
Target Start/End: Original strand, 34277567 - 34277703
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataact-aaaaagtggttaaatacaccttaa 183  Q
    |||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||  |||    
T  34277567 tagcaactcctatagacgtttg-tagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaacg-ataactaaaaaaatggttaaatacactctaa 34277664  T
Q  184 gatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatg 223  Q
    | ||| | ||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  34277665 ggtgt-agtttgctaaaacattcatacataaaaactaatg 34277703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 48649400 - 48649313
Alignment:
Q  133 aaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||    
T  48649400 aaggagtattttagcaagtaaataactaaaaagtggtcaaatacaccttatgatgtagctttgctaaaatactcccacataaaaacta 48649313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27360180 - 27359970
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| |||||||| | ||    
T  27360180 tataactaaaaagttattaaatacaccttagagtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctatagca-tt 27360083  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||  |||||| |||||| |||||||  |||||||| | || | |||||||||||     
T  27360082 tgctagaatacatccacttattttttataaggtgtgttttagcaagt-tataact-aaaagtagttaaatgtaccttaaggtatagc-ttgctaaaacac 27359986  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  27359985 tcccacataaaaacta 27359970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 12127726 - 12127562
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  12127726 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 12127628  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtta 171  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  12127627 ttctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcatgt-tataactaaaaagtagtta 12127562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3800286 - 3800169
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaagga-gtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaa 200  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  3800286 attttctaggatacacccacttattttttagaaggttgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaa 3800189  T
Q  201 acattttcacataaaaacta 220  Q
    ||| |  |||||||||||||    
T  3800188 acactcccacataaaaacta 3800169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 220
Target Start/End: Original strand, 50913086 - 50913219
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||  |||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  50913086 tagcaactcctacaggcatttgctagaatacacccacttaatttttagaaggtgtgttttagggagt-tataactaaaaagtagttaaatgtaccttaag 50913184  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
    ||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  50913185 atgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaacta 50913219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 99
Target Start/End: Original strand, 3269234 - 3269329
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatag 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3269234 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatag 3269329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Original strand, 17226203 - 17226261
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17226203 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 17226261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Original strand, 30347775 - 30347833
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30347775 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 30347833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 203
Target Start/End: Original strand, 26103730 - 26103817
Alignment:
Q  114 acacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26103730 acacccacttattttttagaaggtgtcttttagcaagt-tataactaaaaaatagttaaatacaccttaagatgtagc-ttgctaaaaca 26103817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36824140 - 36823928
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||  || |||||| || ||||||| ||||       |||||| |||| |  ||| || ||| ||||  |||    
T  36824140 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgttaaaacacacattctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagtaactccaataggcatt 36824042  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    ||||||||||||   |||| |||||||||||| || |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     
T  36824041 tgctagaatacaagaacttgttttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 36823944  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  36823943 tcccacataaaaacta 36823928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 27800640 - 27800584
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacacctt 60  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27800640 ttataactaaaaagttaataaatacatcttaaagtgtatgttgctataacacacctt 27800584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 220
Target Start/End: Original strand, 48765306 - 48765432
Alignment:
Q  92 tcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaac 191  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |    
T  48765306 tcctatggatatttgctaaaatacacccatttattttttagaaggtgtgttttagtaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc 48765404  T
Q  192 tttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
     ||||||||| | |  |||||||||||||    
T  48765405 -ttgctaaaatactcacacataaaaacta 48765432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8814867 - 8814768
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  || | |||||||| ||| ||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  8814867 atttgctagaatacacccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaagt-tatgattaaaaagtagttcaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaa 8814770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32203259 - 32203127
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| || ||||||    
T  32203259 tagcaactcttataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactagaaagtagttaaatgca-cttaag 32203162  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
     |||| | ||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  32203161 gtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaacacta 32203127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3269555 - 3269342
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||  |||| |  || ||| |||||||   |||    
T  3269555 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagttggtgtatgttaccaactcctatatgcatt 3269457  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataact-aaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |  | |||||||| ||  |||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || | | |||||||||||    
T  3269456 tgctaggatacacacacttattttttagaatgtctgttttagcatgt-tataactaaaaaaatagttaaatacactttaaggtgcagc-ttgctaaaaca 3269359  T
Q  204 ttttcacataaaaacta 220  Q
     || |||||||||||||    
T  3269358 cttccacataaaaacta 3269342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17604969 - 17604868
Alignment:
Q  155 taactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtata 254  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||| ||| ||| ||||| ||||    
T  17604969 taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttctagcaaatctcatatatatata 17604871  T
Q  255 tat 257  Q
    |||    
T  17604870 tat 17604868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Original strand, 50912957 - 50913038
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||  |  |||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50912957 tttgctaggatacacccactaatttttatgtgggagtattttagcaaaaatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 50913038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 3544484 - 3544430
Alignment:
Q  1 aaattataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacac 55  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  3544484 aaattataactaaaaagataataaatacatcttaaggtgtatgttgatataacac 3544430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 17605579 - 17605513
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 151  Q
    |||||| |||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  17605579 tagcaactcctatatgcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtttgttttagcaagt 17605513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Original strand, 3800306 - 3800343
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3800306 atacacccacttattttttagaaggtgtattttagcaa 3800343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 132
Target Start/End: Original strand, 22894554 - 22894679
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||       |||||| |||| |  |||||| ||||||| | |||    
T  22894554 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacacat-ctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatt 22894651  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttag 132  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22894652 tgctaggatacacccacttattttttag 22894679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 181
Target Start/End: Original strand, 53455514 - 53455589
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacctt 181  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  53455514 atttgctagcgtacatccacttattttttag---gagtatttgagcaagttaa-aactaaaaagtggttacatacacctt 53455589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 54244806 - 54244749
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  54244806 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct 54244749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 217
Target Start/End: Original strand, 22894875 - 22894965
Alignment:
Q  125 ttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaa 217  Q
    |||| ||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |  ||||||||||    
T  22894875 ttttatagaaggtgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaa 22894965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 50801809 - 50801725
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatg 187  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   |||| || |||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50801809 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatg 50801725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 187
Target Start/End: Original strand, 50874071 - 50874155
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatg 187  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   |||| || |||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50874071 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatg 50874155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Original strand, 3269185 - 3269271
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||  |  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  3269185 atttgctagaacacacctactaatttttatgtgggagtgttttagcaagtta-taactaaaaagttaataaatacaccttaagatgta 3269271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6115024 - 6114938
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  6115024 atttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 6114938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7521601 - 7521515
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||||||||| |||||  |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  7521601 atttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtattttaacaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 7521515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Original strand, 17226154 - 17226240
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  17226154 atttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 17226240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Original strand, 26152462 - 26152548
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  26152462 atttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 26152548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 48649487 - 48649428
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaag-tgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| ||||    
T  48649487 ttataactaaaaagttaataaatacatctttgaggtgtatgttgctataacacacattct 48649428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Original strand, 12127650 - 12127687
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12127650 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 12127687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 12127776 - 12127695
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||   |||| || |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12127776 tttgttaggatacacccactgatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 12127695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Original strand, 29950657 - 29950694
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  29950657 atacacccacttattttttagaagaagtgttttagcaa 29950694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Original strand, 29999811 - 29999848
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  29999811 atacacccacttattttttagaagaagtgttttagcaa 29999848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 189
Target Start/End: Original strand, 994673 - 994760
Alignment:
Q  101 aatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||| ||||| |||||  |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  994673 aatttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttaacaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 994760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7848770 - 7848683
Alignment:
Q  101 aatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||  |  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  7848770 aatttgctagaacacacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagtta-taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 7848683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17605707 - 17605627
Alignment:
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||   |||| || |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17605707 ttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 17605627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 56)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 39906280 - 39906533
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  39906280 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 39906379  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  39906380 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 39906479  T
Q  203 attttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    | |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  39906480 actcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacctc-tatatatatatat 39906533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 7682016 - 7682252
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||        ||||| |||| || |||||||||||||||  ||    
T  7682016 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacactttctaaaaaaagaagtgggtgtattttagcaaatcctataggcat 7682115  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7682116 ttgctagaatacacccactt-ttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 7682214  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
     |  ||||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  7682215 ctcccacataaaaactagtggatgtgttctagaaaacc 7682252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 44543044 - 44542807
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  44543044 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 44542945  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  44542944 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtaaataactaaggagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 44542845  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
     |  ||||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  44542844 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 44542807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 9689386 - 9689601
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||| || |||||||||||||||  |    
T  9689386 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgagtgtattctagcaaatcctataggca 9689485  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9689486 tttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaattactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 9689585  T
Q  203 attttcacataaaaac 218  Q
    | |  |||||||||||    
T  9689586 actcccacataaaaac 9689601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 6332287 - 6332500
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  6332287 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtaagttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacat 6332386  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  6332387 ttgctagaatacacccacttattttttaaaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaaca 6332486  T
Q  204 ttttcacataaaaa 217  Q
     |  ||||||||||    
T  6332487 ctcccacataaaaa 6332500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33173693 - 33173481
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  33173693 ttataactaaaaagttaataaataaaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttc-caaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacat 33173595  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||    
T  33173594 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccctaatgtgtagctttgctaaaaca 33173495  T
Q  204 ttttcacataaaaa 217  Q
     |  ||||||||||    
T  33173494 ctcccacataaaaa 33173481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 20939721 - 20939937
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  20939721 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgcatgttgctataacacactttctaaataaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 20939820  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  20939821 ttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacatcttaaggtgtagctttgctaaaaca 20939920  T
Q  204 ttttcacataaaaacta 220  Q
     |   ||||||||||||    
T  20939921 ctcctacataaaaacta 20939937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Original strand, 4293215 - 4293414
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||        ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||    
T  4293215 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattctaaaaaaacaagtgggtgtgttatagcaaattatataggtat 4293314  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4293315 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaagtgattaaatacaccctaagatgtagctttgctaaaaca 4293414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2586576 - 2586363
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||  ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  2586576 ttataactaaaaaactaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagttggtgtgttctagcaaatcctataggcat 2586477  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  2586476 ttgctagaatacacctacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataacaaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaaca 2586377  T
Q  204 ttttcacataaaaa 217  Q
     |  ||||||||||    
T  2586376 ctcccacataaaaa 2586363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 22711044 - 22711257
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||       ||| || |||||||||| ||||||||||||  ||    
T  22711044 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctgtaacacaccttctaaaaaaataaatgggtgtgttataacaaatcctataggcat 22711143  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  22711144 ttgctagaatacatccacttattttttagaaggagtattttagtaaataaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgttaaaaca 22711243  T
Q  204 ttttcacataaaaa 217  Q
     |  ||||||||||    
T  22711244 ctcccacataaaaa 22711257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 30406472 - 30406685
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||  |     
T  30406472 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcttaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcac 30406571  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  30406572 ttgctacaatacacccacttattttttagatggagtattttagcaaatcaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaaca 30406671  T
Q  204 ttttcacataaaaa 217  Q
     |  ||||||||||    
T  30406672 ctcccacataaaaa 30406685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44257655 - 44257400
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt--aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaa 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||          ||||| ||||||| || |||||| |||||      
T  44257655 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaaaaaaaagcaagtgggtgtgttctaacaaatcttataggc 44257556  T
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  44257555 atttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaaatggttcaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaa 44257456  T
Q  202 cattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    || |  |||||||||||||||||   | || ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  44257455 cactcccacataaaaactaatgggtttattttagcaaacctcatatatatatatat 44257400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Original strand, 9690171 - 9690406
Alignment:
Q  6 ataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaattt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||    
T  9690171 ataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcttaaaaaacaagtgagtgtgttctagcaaatcttataggcattt 9690270  T
Q  106 gctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacatt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||| ||||| | |    
T  9690271 gctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaaatcaataactaaaaagtggttaaatacatcctaaggtgtagctttgttaaaatact 9690370  T
Q  206 ttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
      ||||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  9690371 cccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 9690406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Original strand, 15554033 - 15554264
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||        || || ||||||| ||||||||||||| || ||    
T  15554033 ttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttcctataacacacattctaaaaaaacaaatgggtgtgttctagcaaatcctattgacat 15554132  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15554133 ttgttagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaatgaataactaaaaagttattaaatacaccttaaagtgtaactttgctaaaaca 15554232  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctag 235  Q
     |  |||||||||||||||||| || ||||||    
T  15554233 ctcccacataaaaactaatggatgtgttctag 15554264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 39904850 - 39904653
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  39904850 ttataactaaaaagttaataaatacactttaagatgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 39904751  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  39904750 tttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataattaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaa 39904653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38987155 - 38986919
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  38987155 ttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctacaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 38987056  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  38987055 tttgctagaatacatccacttacattttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaattggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 38986956  T
Q  203 attttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
    |   |||||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  38986955 a--ctcacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 38986919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 22301989 - 22302201
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  22301989 ttataactaaaaagttaataaatacacct-aaggtgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 22302087  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  22302088 tttgctagaatacacccacttattgtttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaac 22302187  T
Q  203 attttcacataaaa 216  Q
    | |  |||||||||    
T  22302188 actcccacataaaa 22302201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 214
Target Start/End: Original strand, 324966 - 325109
Alignment:
Q  71 aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 170  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  324966 aagtgagtgtgttctagcaaattttataggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttaacaaatgaataactaaaaagtggtt 325065  T
Q  171 aaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataa 214  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  325066 aaatacaccataaggtgtagctttgctaaaacactctcacataa 325109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3769551 - 3769433
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  3769551 atttgctagaacacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaag 3769452  T
Q  202 cattttcacataaaaacta 220  Q
    || |  |||||||||||||    
T  3769451 cactcccacataaaaacta 3769433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 34082566 - 34082778
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  34082566 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 34082664  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     
T  34082665 tgctaggatacacccatttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 34082762  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  34082763 taccacataaaaacta 34082778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 257
Target Start/End: Original strand, 18370327 - 18370480
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18370327 atttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaac-ttgctaaaa 18370424  T
Q  202 cattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    || |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||| ||| ||||| |||||||    
T  18370425 cactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaatctcatatatatatatat 18370480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Original strand, 11675151 - 11675347
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  11675151 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacacaccttctaaaata-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 11675249  T
Q  105 tgctagaatacacccactta-ttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  11675250 tgctaggatacacccacttatttttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 11675347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13002138 - 13001967
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13002138 tagcaactcctataggcatttgctaaaatacaccctcttattttttagaaggagtgttttagcaagtg-ataactaaaaagtggttaaatacaccctaag 13002040  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatatt 258  Q
     |||| |  |||||||||| |  |||||||||| || | |  || |||||| ||| ||| ||||| ||||||||    
T  13002039 gtgtagc-atgctaaaacactcccacataaaaattagtcggtgtgttctagcaaatctcatatatatatatatt 13001967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 184
Target Start/End: Original strand, 17265356 - 17265447
Alignment:
Q  92 tcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  17265356 tcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatg-ataactaagaagtagttaagtacaccttaag 17265447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 1297598 - 1297746
Alignment:
Q  1 aaattataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctataga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||||||           
T  1297598 aaattataactaaaaagttaataaataaaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgagtgtgttctagcaaatc------- 1297690  T
Q  101 aatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 164  Q
         ||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1297691 -----gctagaatacaaccacttatttttt---aggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 1297746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29512193 - 29512043
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttatttttt--agaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacctta 182  Q
    |||||| | ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  29512193 tagcaacttctatagacatttactaggatacacccacttattttttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtggttaaatacacttta 29512095  T
Q  183 agatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctag 235  Q
    || |||| | ||||||||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  29512094 aggtgtagc-ttgctaaaacacttccacataaaaactagtggatgtgttctag 29512043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1750383 - 1750172
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||        |||||| |||| |  |||||| ||||| |   |||    
T  1750383 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttc-caaaaaataagtg-gtgtatgttagcaactcctacatgcatt 1750286  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||     
T  1750285 tgctagaatacacccacttaatttttagaaggtgtgttttagtaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 1750188  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    | |||| |||||||||    
T  1750187 tctcacctaaaaacta 1750172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16075237 - 16075024
Alignment:
Q  6 ataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaattt 105  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||       |||||  |||| |  |||||| |||| |||  ||||    
T  16075237 ataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaa-taagttggtgtatgttagcaactcctgtaggcattt 16075139  T
Q  106 gctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacatt 205  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||  |    
T  16075138 actaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaaatagttaaatacacattaaggtgtagc-ttgctaaaac--t 16075043  T
Q  206 ttcacataaaaactaatgg 224  Q
     | ||||||||||||||||    
T  16075042 cttacataaaaactaatgg 16075024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16513266 - 16513020
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  16513266 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacgcaccttctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 16513168  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||   | |||| ||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     
T  16513167 tgctaggatacacccacttattttttag---gtgtatgttagcaaatta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 16513073  T
Q  205 tttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    |  ||| ||||||||| |||  || |||||| ||| | | ||||| |||||||    
T  16513072 tcccacgtaaaaactagtgggtgtgttctagcaaatcccatatatatatatat 16513020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Original strand, 23664747 - 23664927
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||  |||| ||| |||||| || ||||||||||||       ||| ||||||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  23664747 tataattaaaaaattgttaaatacattttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaaataaatgagtgtatgttagcaactcctataggcatt 23664846  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagat 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23664847 tgctagaatacacccacttatattttagaaggtgtgttttaacaaat-tataactaaaaagtagttaaatacactttaagat 23664927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Original strand, 33739546 - 33739691
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  33739546 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 33739644  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 151  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  33739645 tgctagaatacatccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt 33739691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 220
Target Start/End: Original strand, 8741623 - 8741722
Alignment:
Q  121 cttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||| |   ||||||||||||    
T  8741623 cttaatttttaagaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatatactttaaggtgtagctttgctaaaacactcctacataaaaacta 8741722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 3769760 - 3769653
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  3769760 ttataactaaaatgttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 3769661  T
Q  104 ttgctaga 111  Q
    ||||||||    
T  3769660 ttgctaga 3769653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23234130 - 23234034
Alignment:
Q  121 cttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaa 217  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | || |||| ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  23234130 cttattttttagaaggggtactttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacatcctgaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaa 23234034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Original strand, 42850094 - 42850231
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  42850094 tagcaattcctataggcatttgctagaatacatccacttattttttaaaaagtgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccctaaa 42850192  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatgg 224  Q
     |||| | ||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  42850193 gtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaactaatgg 42850231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Original strand, 8386777 - 8386915
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttatttttt-agaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 183  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| | |||   | ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  8386777 tagcaactcctatatgcatttgctagaatacacccacttatttttttacaagatatgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccctaa 8386875  T
Q  184 gatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatgg 224  Q
    |||||| | ||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  8386876 gatgtagc-ttgataaaacactcccacataaaaactaatgg 8386915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23387322 - 23387144
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| || ||| || ||||||| ||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||| |||    
T  23387322 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatcttgttaaaacacacattctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 23387224  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac-accttaag 184  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23387223 tgttaggatacacctacttattttttagaaggtgtatcttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacgaccttaag 23387144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29404044 - 29403928
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||| |||| |||| | |||||||||    
T  29404044 atttgctaaaatacacccacttattttttagaatgagtgttttagcaaatg-ataactaaaaaatggttcaatgcaccctaaggtgtagc-ttgctaaaa 29403947  T
Q  202 cattttcacataaaaacta 220  Q
     | |  |||||||||||||    
T  29403946 tactcccacataaaaacta 29403928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 189
Target Start/End: Original strand, 37169556 - 37169737
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |       |||||| |||| |  ||||||  | |||||  |||    
T  37169556 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtggatgttgctaaaacactccttttaaaaa--taagtgggtgtatgttagcaacccatataggcatt 37169653  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  37169654 tgctagaatacaccctcttattttttaaaaggtgcgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgta 37169737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 178
Target Start/End: Original strand, 1576652 - 1576823
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| |||||||   |||    
T  1576652 tataactaaaaagttgttgaatacaccttaaggtgaatgttgataaaacacaccttctgaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataatcatt 1576750  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 178  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| | || |||||| || |  ||||||||||||| |||||||||||    
T  1576751 tgctaggatgcacccacttattttttagaatgtgtgttttaggaaat-tataactaaaaagtagttaaatacac 1576823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Original strand, 19630763 - 19630821
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19630763 ttataactaaaaaattaataaatacacattaaggtatatgttgctataacacaccttct 19630821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Original strand, 19827664 - 19827722
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19827664 ttataactaaaaaattaataaatacacattaaggtatatgttgctataacacaccttct 19827722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 768660 - 768568
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 178  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  768660 tagcaactcctataggcatttgctacgatacaccaacttattttttagaaggtgcgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacac 768568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 24755220 - 24755157
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    |||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24755220 tagcaagtcctataaatatttgctaaaatacacccacttat-ttttagaaagagtattttagcaa 24755157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 43660908 - 43660829
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacctt 181  Q
    ||||||||  ||||||||| || |||||||  ||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43660908 atttgctaagatacacccaattgttttttatgaggagtattttaggaaagatataactaaaaagtggttaaatacacctt 43660829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 62
Target Start/End: Original strand, 29511965 - 29512022
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    ||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  29511965 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttct 29512022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 41
Target Start/End: Original strand, 324757 - 324793
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgta 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  324757 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 324793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 189
Target Start/End: Original strand, 12537296 - 12537365
Alignment:
Q  119 cacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||    
T  12537296 cacttattatttaaaaggagtattctagcatgtga-taactaaaaagtgattaaatactctttaaggtgta 12537365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41528139 - 41528057
Alignment:
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatg 187  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   |||| || ||||| |||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41528139 tgctaggatacacccactaatttttattaaggtgtgttttaacaaaaatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatg 41528057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Original strand, 11675101 - 11675182
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   |||| || |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11675101 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 11675182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16513316 - 16513235
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   |||| || |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16513316 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 16513235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 33739622 - 33739585
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  33739622 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 33739585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Original strand, 34082516 - 34082597
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   |||| || |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34082516 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 34082597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 187
Target Start/End: Original strand, 45629737 - 45629770
Alignment:
Q  154 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatg 187  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45629737 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatg 45629770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 41528002 - 41527931
Alignment:
Q  95 tatagaaatttgctagaatacacccactta-ttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagt 166  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | || ||||| |||||  |||||||||||||    
T  41528002 tatagacatttgctataatacacccacttacttttttagaatgtgtgttttaacaagt-tataactaaaaagt 41527931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 43660737 - 43660694
Alignment:
Q  122 ttattttttagaaggagtattttagcaagtga--ataactaaaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  43660737 ttattttttagaaggagtattttagcatgtgatgataactaaaa 43660694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 74)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12080898 - 12080682
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  12080898 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 12080799  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  12080798 ttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaacacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 12080699  T
Q  204 ttttcacataaaaacta 220  Q
     |  |||||||||||||    
T  12080698 ctcccacataaaaacta 12080682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15230264 - 15230048
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  15230264 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataatacaccttctaaacaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacat 15230165  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15230164 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaacacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 15230065  T
Q  204 ttttcacataaaaacta 220  Q
     |  |||||||||||||    
T  15230064 ctcccacataaaaacta 15230048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14778117 - 14777910
Alignment:
Q  13 aaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14778117 aaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataatacaccttctaaacaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaa 14778018  T
Q  113 tacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |  |||||    
T  14778017 tacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaacacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacat 14777918  T
Q  213 aaaaacta 220  Q
    ||||||||    
T  14777917 aaaaacta 14777910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20517123 - 20516906
Alignment:
Q  1 aaattataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatag 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20517123 aaattataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatag 20517024  T
Q  100 aaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaa 199  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20517023 gcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaa 20516924  T
Q  200 aacattttcacataaaaa 217  Q
    |||| |  ||||||||||    
T  20516923 aacactcccacataaaaa 20516906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11327796 - 11327581
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-taagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  11327796 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 11327697  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  11327696 tttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtatagctttgctaaaac 11327597  T
Q  203 attttcacataaaaac 218  Q
    | || |||||||||||    
T  11327596 acttccacataaaaac 11327581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 32853056 - 32852888
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  32853056 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttatagcaaatcctatagacat 32852957  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32852956 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 32852888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 38876165 - 38876419
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  38876165 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 38876264  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||    
T  38876265 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacatcttaaggtgtagctttgttaaaac 38876364  T
Q  203 attttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    | |  || ||||||| || ||   || |||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  38876365 actcccatataaaaattagtgagtgtgttctagcaaacctcatatatatatatat 38876419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27812141 - 27811904
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||        ||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||    
T  27812141 ttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataatacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctgtaggcat 27812042  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27812041 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 27811942  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
     |  ||||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  27811941 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 27811904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 8047971 - 8048180
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8047971 ttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttttaaaa----aaataagtgtgttatagcaaatcctacagacat 8048066  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  8048067 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaaca 8048166  T
Q  204 ttttcacataaaaa 217  Q
     |  ||||||||||    
T  8048167 ctcccacataaaaa 8048180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24720460 - 24720261
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||       ||| || ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  24720460 ttataactaaaaagttaataaatacaccattaggtgtatgttgctataacgcaccttctaaaaaaataaatgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 24720361  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24720360 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaataaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 24720261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 48454542 - 48454796
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  48454542 ttataactaaaaagataataaatacaccttaaggtatatgttgatataacacaccttctaaaataaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagaca 48454641  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||    
T  48454642 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaagaactaaaaagtggttaaatgcaccctaaggtgtagctttgctaaaac 48454741  T
Q  203 attttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    | |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||| | | ||||| |||||||    
T  48454742 actcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaatcccatatatatatatat 48454796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 14718992 - 14719244
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| |||||  |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  14718992 ttataactaaaattttaataaatacatcttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 14719091  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  14719092 ttgctggaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag-tgtagctttgctaaaaga 14719190  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
     |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  14719191 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccccatatatatatatat 14719244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34986725 - 34986509
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-taagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |        ||||||| |||||| ||||||||| |||||  |    
T  34986725 ttataattaaaaagataataaatacaccttaaggtgtatgttgatataacacaccttataaaataaataagtgaatgtgttctagcaaatcttataggca 34986626  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  34986625 tttgctagaatacacccacttattttttagaaagagtattttagcaagtgaagaactaaaaagtggttaaatacacctaaag-cgtaactttgctaaaac 34986527  T
Q  203 attttcacataaaaacta 220  Q
    | | ||||||||||||||    
T  34986526 actctcacataaaaacta 34986509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 45225593 - 45225396
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||| ||||||  |    
T  45225593 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaattctataggca 45225494  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  45225493 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagttaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaa 45225396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28605640 - 28605425
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||        ||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||    
T  28605640 ttataactaaaatgttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacataccttctaaaaaac-aagtgggtgtgttttagcaaattctataggtat 28605542  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  28605541 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaacacaccttaaggtgtagctttactaaagca 28605442  T
Q  204 ttttcacataaaaacta 220  Q
     |  |||||||||||||    
T  28605441 ctcccacataaaaacta 28605425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 26380073 - 26380304
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||         |||||| |||||| |||||||||||||||  |    
T  26380073 ttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtatatgtttctataacacaccttctaacaaaaacaagtgaatgtgttctagcaaatcctataggca 26380172  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26380173 tttgctaggatacacccgcttagtttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaacttaaggtgtaactttgctaaaac 26380272  T
Q  203 attttcacataaaaactaatggacgtcttcta 234  Q
    | |  |||||||||||||||||| || |||||    
T  26380273 actcccacataaaaactaatggatgtgttcta 26380304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22479405 - 22479193
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||         ||||| ||||||| || ||||||||||| | ||    
T  22479405 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataggacaccttcgaaaaaaacaagtgggtgtgttctatcaaatcctatatacat 22479306  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||    
T  22479305 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaattcaccctaag-tgtagctttgctaaaaca 22479207  T
Q  204 ttttcacataaaaa 217  Q
     || ||||||||||    
T  22479206 cttccacataaaaa 22479193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4655249 - 4655007
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataa----cacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctata 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||         ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4655249 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataagtaacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctata 4655150  T
Q  99 gaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgcta 198  Q
       |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  4655149 agcatttgctaaaatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacatcttaaggtgtagctttgcta 4655050  T
Q  199 aaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
    ||||| |  ||||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  4655049 aaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 4655007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 217
Target Start/End: Original strand, 7437798 - 7438010
Alignment:
Q  6 ataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||          ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||    
T  7437798 ataactaaaaagttaataaatacacattaaggtgtatgttgctataacacaccttccaaaaaaaacaagtgggtgtgttatagtaaatcctataggcatt 7437897  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||     
T  7437898 tgctagaatacacccaattattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaacccaccttaaggtgtagctttgctaaaacac 7437997  T
Q  205 tttcacataaaaa 217  Q
    |  ||||||||||    
T  7437998 tcccacataaaaa 7438010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 18123076 - 18123250
Alignment:
Q  1 aaattataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18123076 aaattataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctgacaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctatag 18123175  T
Q  100 aaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaat 174  Q
      ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18123176 gcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggttaaat 18123250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27597232 - 27596982
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatag---- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||        
T  27597232 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 27597133  T
Q  100 ---------aaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaa 190  Q
             | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27597132 ttcctatagacatttgctagaatacatccacttattttttagaatgagtattttagcaaataaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtag 27597033  T
Q  191 ctttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  27597032 ctttgctaaaacactataacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 27596982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14770274 - 14770057
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  14770274 ttataactaaaaagttaataagtacaccttaaggtgtatgtttctataacacaccttctaaaaaaacaagtgagtgtgttatagcaaatcctataggcat 14770175  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtg-aataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| ||||  ||||||||||     
T  14770174 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttcgcaagtgaaataattaaaaggtgattaaatgcaccctaaggtgtagttttgctaaaat 14770075  T
Q  203 attttcacataaaaacta 220  Q
    | |  |||||||||||||    
T  14770074 actcccacataaaaacta 14770057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15220725 - 15220508
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15220725 ttataactaaaaagttaataagtacaccttaaggtgtatgtttctataacacaccttctaaaaaaacaagtgagtgtgttatagcaaatcctataggcat 15220626  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtg-aataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| ||||  ||||||||||     
T  15220625 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttcgcaagtgaaataattaaaaggtgattaaatgcaccctaaggtgtagttttgctaaaat 15220526  T
Q  203 attttcacataaaaacta 220  Q
    | |  |||||||||||||    
T  15220525 actcccacataaaaacta 15220508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 79 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45225384 - 45225222
Alignment:
Q  79 gtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 178  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45225384 gtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagttaataactaaaaagtggttaaatacac 45225285  T
Q  179 cttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  45225284 cttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 45225222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 43712113 - 43711898
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaag-ttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||| ||||| | |    
T  43712113 ttataattaaaaaaattaataaatatagtttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatactatataca 43712014  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttatttttt-agaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  ||||||||||    
T  43712013 tttgctagaatatacccacttatttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacactttaaagtgtagttttgctaaaa 43711914  T
Q  202 cattttcacataaaaa 217  Q
    || |  ||||||||||    
T  43711913 cactcccacataaaaa 43711898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Original strand, 37138933 - 37139087
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-taagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||        |||||| ||||||| || ||||||||||||| |    
T  37138933 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaaataagtgggtgtgttctaacaaatcctatagaca 37139032  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataa 157  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37139033 tttgctaaaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataa 37139087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 48193285 - 48193155
Alignment:
Q  71 aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 170  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  48193285 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaaatgaataactaaaaagtggtt 48193186  T
Q  171 aaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  48193185 aaatacaccccaagatgtagctttgctaaaa 48193155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18199772 - 18199530
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||         ||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  18199772 ttataactacaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaacttctataaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagact 18199673  T
Q  103 tttgctagaatac----acccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgcta 198  Q
      ||   |  | |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18199672 agtgggtgtgttctataacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgcta 18199573  T
Q  199 aaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
    ||||| |  ||||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  18199572 aaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 18199530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33889179 - 33889044
Alignment:
Q  106 gctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacatt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  33889179 gctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaaggggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacact 33889080  T
Q  206 ttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
       |||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  33889079 ccgacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 33889044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25818681 - 25818433
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  25818681 tataactaaaaagttgtttaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 25818582  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||     
T  25818581 tgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagcagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 25818484  T
Q  205 tttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatat 255  Q
    |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  25818483 tcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaatctcatatatatatat 25818433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 939091 - 938842
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  939091 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaag-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 938993  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     
T  938992 tgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 938895  T
Q  205 tttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||| | | ||||| |||||||    
T  938894 tcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaatcccatatatatatatat 938842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 217
Target Start/End: Original strand, 1325335 - 1325441
Alignment:
Q  111 aatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcac 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |  |||    
T  1325335 aatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtagttaaatgcacgttaagatgtagctttgctaaaacactcccac 1325434  T
Q  211 ataaaaa 217  Q
    |||||||    
T  1325435 ataaaaa 1325441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 41407532 - 41407289
Alignment:
Q  11 taaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctag 110  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||||||||    
T  41407532 taaaaagttgttatatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaata-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctag 41407434  T
Q  111 aatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcac 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| | ||||||||||| |  |||    
T  41407433 aatacacccacttattttttagaaagtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaatgtgtagc-ttgctaaaacactcccac 41407336  T
Q  211 ataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    |||||||||||| |  || |||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  41407335 ataaaaactaataggtgtgttctagcaaacctcatatatatatatat 41407289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 18352315 - 18352528
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  18352315 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 18352414  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||| |||||||     
T  18352415 tgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgttaaaacac 18352512  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  18352513 tcccacataaaaacta 18352528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2936757 - 2936587
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| |||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2936757 tagcaactcctattggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaag 2936659  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
     |||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||||  || |||||| ||| ||| ||||| |||||||    
T  2936658 gtgtaac-ttgctaaaacactcaaacataaaaactaatgggtgtgttctagcaaatctcatatatatatatat 2936587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 38367856 - 38368068
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |  ||| ||||||||  |||    
T  38367856 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatcttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtatgttgacaactcctataggcatt 38367954  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  38367955 tgctagaatacagccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaac-ttgctaaaacac 38368052  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  38368053 tcccacataaaaacta 38368068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19069592 - 19069380
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| || | |  |||||| ||||||||  |||    
T  19069592 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaata-taagtgggtttatgttagcaactcctatagctatt 19069494  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     
T  19069493 tgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataattaaaaactagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 19069396  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    | | ||||||||||||    
T  19069395 tcttacataaaaacta 19069380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 220
Target Start/End: Original strand, 27168254 - 27168465
Alignment:
Q  6 ataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaat-cctatagaaatt 104  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  || ||||| ||||||| | ||    
T  27168254 ataattaaaaagttcttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtatcctaccaaatgcctataggagtt 27168352  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     
T  27168353 -gctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 27168449  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  27168450 tcacacataaaaacta 27168465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28912278 - 28912101
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||       |||||| |||| |  |||||| |||||| |  |||    
T  28912278 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctatgggcatt 28912180  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28912179 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaag 28912101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2362946 - 2362735
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||       ||||||  ||| |  |||||| ||||||||| |||    
T  2362946 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacataccttctaaaaaaataagtggatgtatgttagcaactcctatagacatt 2362847  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   ||| || |||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||     
T  2362846 tgctaggatacacccacttatttttt---aggtgtgttttagcaagt-tatcactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtataac-ttgctaaaacac 2362752  T
Q  205 tttcacataaaaactaa 221  Q
    |  ||||||||||||||    
T  2362751 tcccacataaaaactaa 2362735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41037535 - 41037327
Alignment:
Q  25 atacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccactta 124  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||       |||||||||||    |||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| |||    
T  41037535 atacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaaataagtgagtgtaagttagcaactcctataggcatttgctaaaatacacccagtta 41037436  T
Q  125 ttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatgg 224  Q
    | ||| |||| | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  41037435 tatttaagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacattcccacataaaaactagtgg 41037338  T
Q  225 acgtcttctag 235  Q
    | || ||||||    
T  41037337 atgtgttctag 41037327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 454300 - 454105
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||  || |||||| || ||||||| ||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  454300 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgttaaaacacacattctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 454202  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  454201 tgttaggatacacccacttattttttagaaggtgtattttagcaagt-tttaactaaaaagtagttaattacaccttaagatgtagc-ttgctaaaaca 454105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 189
Target Start/End: Original strand, 9401656 - 9401838
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  9401656 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtagctaaaacacaccttctaaaata-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 9401754  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  9401755 tgctagaatacacccacttattttttagatggtgtgttttagcatgt-tataattaaaaagtagttaaatataccttaaggtgta 9401838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Original strand, 15957214 - 15957409
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  || ||| ||||||||| |||    
T  15957214 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaacgttgctaaaacacaccttctaaaaa--taagtgggtgtatgttaacaactcctatagacatt 15957311  T
Q  105 tgctagaatacacccactta-ttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | |||||||||||    
T  15957312 tgctaggatacaccaacttatttttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 15957409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 257 - 363
Target Start/End: Original strand, 31029415 - 31029516
Alignment:
Q  257 ttaatgatgattaatcatcgttaaacataagtaaaacttgatattaataatatgatnnnnnnnnnnnngaagaagctagtattgggcatatgtggggttg 356  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31029415 ttaatgatgatcaatcatcgttaaacataagtaaaacttcatattaataatatgat-----aaaaaaagaagaagctagtattgggcatatgtggggttg 31029509  T
Q  357 atgatgg 363  Q
    |||||||    
T  31029510 atgatgg 31029516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 2509321 - 2509547
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||       |||||| |||| |  || ||| |||||||   |||    
T  2509321 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaagaa-taagtgggtgtatgttaacaactcctatatgcatt 2509419  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||||||     
T  2509420 tgctagaatacacccactta-tttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtggttaaatgtaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 2509516  T
Q  205 tttcacataaaaactaatggacgtcttctag 235  Q
    |  ||||| ||||||| |||| || ||||||    
T  2509517 tcccacatcaaaactagtggatgtgttctag 2509547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 32577607 - 32577505
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttatttttt-agaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaa 200  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| | |||| |||| ||||||||||    
T  32577607 atttgctagaacacacccatttgtttttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaagttgttaaatacatcctaaggtgtagctttgctaaa 32577508  T
Q  201 aca 203  Q
    |||    
T  32577507 aca 32577505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 18829897 - 18829839
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18829897 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 18829839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 218
Target Start/End: Original strand, 38796903 - 38797035
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataact-aaaaagtggttaaatacaccttaa 183  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||||  |||||| ||||| | ||||| |||||| |||    
T  38796903 tagcaactcctatagacatttgctagaatacacccgcttattttttaaaaggtgtgttttaacaagt-tataactaaaaaaatagttaattacaccctaa 38797001  T
Q  184 gatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaac 218  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  38797002 ggtgtaac-ttgctaaaacacttccacataaaaac 38797035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11766317 - 11766149
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||       ||||||   || |  |||||| || ||||   |||    
T  11766317 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaa-taagtggacgtatgttagcaactcttatatgcatt 11766219  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 175  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  11766218 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaata 11766149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 32577769 - 32577713
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacacctt 60  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32577769 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacctt 32577713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 33889956 - 33889847
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||        ||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||    
T  33889956 ttataactaaaaagttaataaatacacattaaggtgtatgttgctataacgcaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcatataggcat 33889857  T
Q  104 ttgctagaat 113  Q
    ||||||||||    
T  33889856 ttgctagaat 33889847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 32577719 - 32577615
Alignment:
Q  27 acaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttatt 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||         ||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  32577719 acaccttaaggtgtatgttgctataacacgccttccaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataagcatttgctagaatacacccacttatt 32577620  T
Q  127 tttta 131  Q
    |||||    
T  32577619 tttta 32577615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18829759 - 18829697
Alignment:
Q  115 cacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 177  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18829759 cacccacttatttttttaaaagagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 18829697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 220
Target Start/End: Original strand, 6736589 - 6736723
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccactta-ttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 183  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| ||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6736589 tagcaactcctataggcatttgctagaatacacctacttatttttttagaaggtgtgttttaacaaat-tataactaaaaagtagttaagtacaccttaa 6736687  T
Q  184 gatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
    | |||| | || |||||||| |  |||||||||||||    
T  6736688 ggtgtagc-ttactaaaacactcccacataaaaacta 6736723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23740156 - 23740061
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttatttttt-agaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacct 180  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23740156 tagcaactcctataggcatttgttagaatacacctacttatttttttagaaggtgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtggttaaatacacct 23740061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6559457 - 6559341
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |  | ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  6559457 atttgctataatacacccgcttattttatagaatgtatgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaa 6559360  T
Q  202 cattttcacataaaaacta 220  Q
    || |  ||||| |||||||    
T  6559359 cactcccacatcaaaacta 6559341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 17317443 - 17317400
Alignment:
Q  19 taataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17317443 taataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 17317400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 189
Target Start/End: Original strand, 2633972 - 2634072
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||   ||| || |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  2633972 tagcaactcctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt---aggtgtgttttagcaagt-tataaccaaaaagtagttaaatgcaccttaag 2634067  T
Q  185 atgta 189  Q
     ||||    
T  2634068 gtgta 2634072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 217
Target Start/End: Original strand, 3512711 - 3512813
Alignment:
Q  113 tacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||  ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |  |||||    
T  3512711 tacacccacttattttttagaagatgtgttttagtaagt-tataactaaaaagtagtgaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacat 3512808  T
Q  213 aaaaa 217  Q
    |||||    
T  3512809 aaaaa 3512813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 27168356 - 27168292
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27168356 tagcaactcctataggcatttggtaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 27168292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 48193387 - 48193343
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgct 48  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48193387 ttataaataaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgct 48193343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Original strand, 7437746 - 7437833
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||    
T  7437746 atttgctagaacacacccactagtttttatgtgggagtattttagtaagtgaataactaaaaagttaataaatacacattaaggtgta 7437833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Original strand, 9401606 - 9401687
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||   |||| || |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9401606 tttgctaggatacacccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 9401687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 454350 - 454266
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatg 187  Q
    |||||||| || ||||||||  |||||   |||| || ||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  454350 tttgctaggattcacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaatatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatg 454266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4655298 - 4655212
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  4655298 atttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 4655212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 14780148 - 14780074
Alignment:
Q  91 atcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaag 165  Q
    |||||||| | ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  14780148 atcctataaacatttgatagaaaacaccctctttttttttagagagagttttttagcgagtgaataactcaaaag 14780074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 38367932 - 38367894
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaag 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  38367932 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaag 38367894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 3407196 - 3407151
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgcta 49  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3407196 ttataactaaaaagtgaataaatacaccttgaagtgtgtgttgcta 3407151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 189
Target Start/End: Original strand, 7835347 - 7835407
Alignment:
Q  128 tttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||||||| || ||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  7835347 tttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaaatagttaaatacaccttaaggtgta 7835407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28912328 - 28912247
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   |||| || |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28912328 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 28912247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 187
Target Start/End: Original strand, 38796824 - 38796857
Alignment:
Q  154 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatg 187  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38796824 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatg 38796857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 45225642 - 45225562
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 183  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  45225642 atttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaa 45225562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 939140 - 939060
Alignment:
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||   |||| || |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  939140 ttgctaggatacacccactactttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 939060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 82)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4736978 - 4736744
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||        ||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  4736978 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattctaaaaaaacaagtgggtgtgttatagcaaatcctataggcat 4736879  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4736878 ttgctagaatacatccacttattttttag---gagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtagctttgctaaaaca 4736782  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
     |  |||||||||||||||||  || |||||| |||||    
T  4736781 ctcccacataaaaactaatgggtgtgttctagcaaacc 4736744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 30687914 - 30688131
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  30687914 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 30688013  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  30688014 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 30688113  T
Q  203 attttcacataaaaacta 220  Q
    | |  |||||||||||||    
T  30688114 actcccacataaaaacta 30688131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 1951430 - 1951633
Alignment:
Q  1 aaattataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctataga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  1951430 aaattataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaagaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagg 1951529  T
Q  101 aatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaa 200  Q
     || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1951530 catatgttagaatacacccacttattttttaaaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaa 1951629  T
Q  201 acat 204  Q
    ||||    
T  1951630 acat 1951633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 29302104 - 29302342
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  29302104 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgagtgtgttctagcaaatcctataggca 29302203  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  29302204 tttgctagaatacacccgcttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaggtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 29302303  T
Q  203 attttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
    | |  ||||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  29302304 actcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 29302342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Original strand, 3960638 - 3960837
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||| ||||| | |||||||||||| |   ||    
T  3960638 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgctctagcaaatcctacatgcat 3960737  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  3960738 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaaca 3960837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15809149 - 15808944
Alignment:
Q  13 aaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctaga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  15809149 aaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaga 15809050  T
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcaca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |  ||||    
T  15809049 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaattaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaacactcccaca 15808950  T
Q  212 taaaaa 217  Q
    ||||||    
T  15808949 taaaaa 15808944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17605227 - 17604975
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  17605227 ttataactaaaaatttaataaatacatcttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 17605128  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  17605127 ttgctggaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaagtaaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag-tgtagctttgctaaaaga 17605029  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
     |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  17605028 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccccatatatatatatat 17604975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33026406 - 33026201
Alignment:
Q  12 aaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctaga 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||  ||||||||||||||  ||||||||||    
T  33026406 aaaaagttaataaatacatcttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttcaagcaaatcctataggcatttgctaga 33026307  T
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcaca 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |  ||||    
T  33026306 atacaccgacttattttttagaaggagtattttagcaaattaataactaaaaagtggttaaatacaccctaagatgtagttttgctaaaacactcccaca 33026207  T
Q  212 taaaaa 217  Q
    ||||||    
T  33026206 taaaaa 33026201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11448920 - 11448706
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  11448920 ttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgttataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 11448821  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11448820 tttgctaggatacatccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaatatctaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 11448721  T
Q  203 attttcacataaaaa 217  Q
    | |  ||||||||||    
T  11448720 actcccacataaaaa 11448706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26906081 - 26905864
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  26906081 ttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaac-aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 26905983  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  26905982 ttgctagaatacagccacttattttttt--aggagtattttagcaaatgaataactaaaaagttgttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaaca 26905885  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatgg 224  Q
     |  |||||||||| ||||||    
T  26905884 ctcccacataaaaattaatgg 26905864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Original strand, 17209888 - 17210086
Alignment:
Q  16 agttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatac 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||| |||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17209888 agttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgttcaagcaaatcctataggcatttgctagaatac 17209987  T
Q  116 acccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaa 215  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||    
T  17209988 acccacttattttttag---gagtattttagcaaatcaataactaaaaaatggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaa 17210084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1921647 - 1921431
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-taagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||        |||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  1921647 ttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatattgttataacacatcttctaacaaaaataagtgagtgtgttctagcaaatcctataggca 1921548  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  1921547 tttgctcggatacacccacttagtttttaaaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaac 1921449  T
Q  203 attttcacataaaaacta 220  Q
    | |  |||||||||||||    
T  1921448 actcccacataaaaacta 1921431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33282442 - 33282206
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||| ||||  ||    
T  33282442 ttataactaaaaagttaataaatacactttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatccaataggcat 33282343  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| | || ||||||||| |||    
T  33282342 ttgctagaatgcacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtagttaaata-aacttaaggtatagctttgctaagaca 33282244  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
     |  ||||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  33282243 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 33282206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 217
Target Start/End: Original strand, 27005155 - 27005293
Alignment:
Q  79 gtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 178  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27005155 gtgttctagcaaatcctttagacatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatagac 27005254  T
Q  179 cttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaa 217  Q
    |||||| |||| ||||||||||| | | |||||||||||    
T  27005255 cttaaggtgtagctttgctaaaatactctcacataaaaa 27005293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Original strand, 33833087 - 33833270
Alignment:
Q  38 tgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaagg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  33833087 tgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctaacaaatcctatatacatttgctaggatacacccacttagtttttagaagg 33833186  T
Q  137 agtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  33833187 agtattttagttagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaacta 33833270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37282357 - 37282153
Alignment:
Q  12 aaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctaga 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||| |    
T  37282357 aaaaagttaacaaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaaa 37282258  T
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcaca 211  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||| ||||| ||||||| |  || |    
T  37282257 atacactcacttattttttag---gagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt-aatagacttcaagatgtagctttggtaaaacactcccata 37282162  T
Q  212 taaaaacta 220  Q
    |||||||||    
T  37282161 taaaaacta 37282153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14795777 - 14795662
Alignment:
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||     
T  14795777 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataaaccttaaggtgtagctttgctaaaacac 14795678  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  14795677 tcccacataaaaacta 14795662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Original strand, 30667588 - 30667794
Alignment:
Q  11 taaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctag 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||    
T  30667588 taaaaagttaataaatacaccataagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-aagtgagtgtgttctagcaaattctataggcatttgctag 30667686  T
Q  111 aatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcac 210  Q
    ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||  |||| ||||||||||||| |   ||    
T  30667687 aatacacaca--tattttttagaatgagtattttagcaagtgaaaaattaaaaagtgattaaatacactttaacgtgtagctttgctaaaacactcctac 30667784  T
Q  211 ataaaaacta 220  Q
    ||||||||||    
T  30667785 ataaaaacta 30667794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7014614 - 7014475
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  7014614 atttgctagaacacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaatgaataactaaaaaatggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaa 7014515  T
Q  202 cattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
    || |  |||||||||| ||||||  || |||||| |||||    
T  7014514 cactcccacataaaaattaatgggtgtgttctagcaaacc 7014475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30486198 - 30486059
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  30486198 atttgctaggatacatccacttagtttttagaatgagtattttagcaattgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaa 30486099  T
Q  202 cattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
    || |  ||||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  30486098 cactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 30486059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Original strand, 31240268 - 31240473
Alignment:
Q  27 acaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttatt 126  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| || |||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  31240268 acaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaata-taagtgggtgtatgttagcaactcttataggcatttgctaggatacacccacttatt 31240366  T
Q  127 ttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggac 226  Q
    |||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||| ||||     
T  31240367 ttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagc-ttgctaaaacactctcacataaaaactagtggat 31240464  T
Q  227 gtcttctag 235  Q
    || ||||||    
T  31240465 gtgttctag 31240473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2528950 - 2528720
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||| ||    
T  2528950 ttataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 2528851  T
Q  104 ttgctagaatacacccactta-ttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||| | | || ||||||||||    
T  2528850 ttgctagaatacatccacttatttttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactgaaaagtagttaaatgcaccttaaggtat-accttgctaaaac 2528753  T
Q  203 attttcacataaaaactaatggacgtcttctag 235  Q
    | |  ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  2528752 actcccacataaaaactagtggatgtgttctag 2528720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1797498 - 1797420
Alignment:
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1797498 tgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 1797420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 25912044 - 25912256
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  25912044 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaaggttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 25912142  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  25912143 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgtaac-ttgctaaaacac 25912240  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  25912241 tcccacataaaaacta 25912256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 37249489 - 37249351
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct-nnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  37249489 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 37249390  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtat 141  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  37249389 tttgctagaatacacccatttattttttaaaaggagtat 37249351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4738112 - 4737879
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| || ||| |  |||    
T  4738112 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaata-taagtgggtgtatgttagcaactcatatgggcatt 4738014  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     
T  4738013 tgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 4737916  T
Q  205 tttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
    |  ||||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  4737915 tcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 4737879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14369947 - 14369735
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  14369947 tataactaaaaagttgttaactacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 14369849  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     
T  14369848 tgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 14369751  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  ||||| |||||||    
T  14369750 tcccacatgaaaacta 14369735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28747943 - 28747732
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||||| | ||| ||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||| |||    
T  28747943 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaagcactccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 28747844  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||| |||| | |||||||||||     
T  28747843 tgctagaatacacccacttaatttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaaatagttaaatacaccctaaggtgtagc-ttgctaaaacac 28747746  T
Q  205 tttcacataaaaac 218  Q
    | ||||||||||||    
T  28747745 tctcacataaaaac 28747732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 115
Target Start/End: Original strand, 17559224 - 17559335
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  17559224 ttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttatagcaaatcctatagacat 17559323  T
Q  104 ttgctagaatac 115  Q
    ||||||||||||    
T  17559324 ttgctagaatac 17559335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 12910024 - 12910236
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| ||||| ||| |||||| || ||||||| ||||       ||||||||||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  12910024 tataattaaaaaattgttaaatacatcttaaggtgaatgttgttaaaacacacattctaaaata-taagtgagtgtatgttagcaactcctataggcatt 12910122  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     
T  12910123 tgctagaatacacccacttattttttagaatgtatgttttagcatgt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 12910220  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  12910221 tcccacataaaaacta 12910236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37468720 - 37468513
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||       |||||| |||| |  ||||||||||||||| |||    
T  37468720 ttataactaaaaagttgataaatacaccttgagttgtatgtttctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaaatcctataggaat 37468621  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtga-ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    ||||||||||||||||     |||||    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||| |||| | ||||||||||    
T  37468620 ttgctagaatacaccc-----ttttt----aggagtattttagcaagtgataacactaaaaagtggttaaatgcaccctaaggtgtagc-ttgctaaaac 37468531  T
Q  203 attttcacataaaaacta 220  Q
    | |  |||||||||||||    
T  37468530 actcccacataaaaacta 37468513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7944467 - 7944255
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  7944467 tataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacctcctaaaaa--taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 7944370  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagt-ggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  7944369 tgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtaagttaaatacaccttaaagtgtaac-ttgctaaaaca 7944272  T
Q  204 ttttcacataaaaacta 220  Q
     |  |||||||||||||    
T  7944271 ctcccacataaaaacta 7944255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4083918 - 4083706
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||       |||||| ||||    |||||| ||||||||  |||    
T  4083918 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtcgctaaaacacaccttctaaaata-taagtgggtgtacgttagcaactcctataggcatt 4083820  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| | ||| |||||||     
T  4083819 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaagtgtagc-ttgttaaaacac 4083722  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  4083721 tcccacataaaaacta 4083706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Original strand, 13711033 - 13711245
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||  | ||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  13711033 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacattcattctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 13711132  T
Q  105 tgctagaatacacccac-ttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  13711133 tgctagaatacacccactttttttttttgaatgagtgttttagcaagt-tataatcaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 13711230  T
Q  204 ttttcacataaaaac 218  Q
     | ||||||||||||    
T  13711231 ctctcacataaaaac 13711245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17421788 - 17421697
Alignment:
Q  92 tcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17421788 tcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccataag 17421697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 39038694 - 39038504
Alignment:
Q  11 taaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctag 110  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||       |||||| || | |  |||||| |||||||   |||||||||    
T  39038694 taaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacatcttctaaaaaaataagtgggtctatgttagcaactcctatatgcatttgctag 39038595  T
Q  111 aatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  39038594 gatatacccacttattttttagaaggtgtgttttaacaaat-tataactaaaaagtagttaaataaaccttaaggtgtaac-ttgctaaaaca 39038504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 220
Target Start/End: Original strand, 39548921 - 39549054
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| | ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  39548921 tagcaacttctatagccatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatataccttaag 39549019  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
    ||||| | ||||||||||| |   ||||||||||||    
T  39549020 atgtagc-ttgctaaaacactcctacataaaaacta 39549054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33696233 - 33696051
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  33696233 tataactaaaaagttgttaaatacaccttatggtgaatgtagctaaaacacaccttctaaaata-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 33696135  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  33696134 tgctagaatacacccacttattttttagaagttatgttttagcatgt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 33696051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 2695098 - 2695309
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  2695098 tataactaaaatgttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 2695196  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||| |||||||||  |||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||    
T  2695197 tgctaggata-acccacttacattttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaatat 2695293  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  2695294 tcccacataaaaacta 2695309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6436524 - 6436354
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6436524 tagcaactcctataggcatttgctaggattcacctacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tacaactaaaaagtagttaaatacatcttaag 6436426  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
     |||| | ||||||||||| |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||| ||| ||||| |||||||    
T  6436425 gtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaatctcatatatatatatat 6436354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 31752296 - 31752128
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||  |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  31752296 tataactaaaaagttgttaaatacacattaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagtaggtgtatgttagcaactcctataggcatt 31752198  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  31752197 tgctagaatacacccatttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaata 31752128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3038988 - 3038855
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3038988 tagcaactcctataggcatttgttaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacatcttaag 3038890  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
     |||| | ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  3038889 gtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaacta 3038855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 222
Target Start/End: Original strand, 17233353 - 17233488
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||| ||| |  |||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  17233353 tagcaactcctataggcatttgctagaacacactcacttattttttagaagttgtgttttaccaaat-tataattaaaaagtagttaaatactccttaag 17233451  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaat 222  Q
     |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17233452 gtgtaac-ttgctaaaacacttccacataaaaactaat 17233488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 257
Target Start/End: Original strand, 22701842 - 22701995
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  22701842 atttgctagaatacacccactta-tttttggaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtaac-ttgctaaaa 22701938  T
Q  202 cattttcacataaaa-actaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    || |  ||||||||| |||| |||  || |||||| ||| ||| ||||| |||||||    
T  22701939 cactcccacataaaacactagtgggtgtgttctagcaaatctcatatatatatatat 22701995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 38661337 - 38661242
Alignment:
Q  32 ttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattt 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  38661337 ttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattt 38661242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 178
Target Start/End: Original strand, 6260993 - 6261164
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| ||||||||   |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| |       |||||| |||| |  |||||| ||||||||| |||    
T  6260993 tataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacacctt-ttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 6261091  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 178  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||| |||||| | |||||||||||    
T  6261092 tgctaggatatacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataattaaaaaatagttaaatacac 6261164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 178
Target Start/End: Original strand, 22800642 - 22800814
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |        ||||| |||| |  |||||| ||||| ||| |||    
T  22800642 tataattaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctacaacactccttttaaaaaaagaagtgggtgtatgttagcaactcctacagacatt 22800741  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| |  ||||||||||||| | |||||||||    
T  22800742 tgctagaatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttaacaaat-tataactaaaaagtagctaaatacac 22800814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 220
Target Start/End: Original strand, 8410684 - 8410832
Alignment:
Q  70 taagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggt 169  Q
    ||||||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  8410684 taagtgagtgtatcctagcaactcctataaacatttgctaggatacatcaacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagt 8410782  T
Q  170 taaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
    |||| | || ||||| |||| | ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  8410783 taaacatacattaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaacta 8410832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Original strand, 22282212 - 22282270
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22282212 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgctgctataacacaccttct 22282270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 7014682 - 7014631
Alignment:
Q  11 taaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7014682 taaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattct 7014631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 9124884 - 9124705
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||       |||||| |||| |  || ||| | ||||||  |||    
T  9124884 tataactaaaaatttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaataagtgggtgtatgttaacaacttctataggcatt 9124785  T
Q  105 tgctagaatacacccacttatt-ttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| | || |||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  9124784 tgctagaatacatccacttatttttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaaatatttaaatacaccttaag 9124705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 1807578 - 1807520
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1807578 ttataactaaaaagttaataaatatatcttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 1807520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10951229 - 10951009
Alignment:
Q  11 taaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctag 110  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||        |||||| |||| |  |||||| ||||||||  ||||| ||     
T  10951229 taaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtttctaaaacacacattc-gaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgatat 10951131  T
Q  111 aatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcac 210  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||| | ||||||||||| |  |||    
T  10951130 aatacacctacttattttttataaggtgtgttttagcaagt-tatatctaaaaagtagctaaatacatcttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccac 10951033  T
Q  211 ataaaaactaatggacgtcttcta 234  Q
    || ||||||| |||| || |||||    
T  10951032 attaaaactagtggatgtgttcta 10951009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Original strand, 17232918 - 17233061
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||       ||| ||| ||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  17232918 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaagcacaccttctaaaaaa-taaatgaatgtatgttagcaactcctataggcatt 17233016  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17233017 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 17233061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 858070 - 857928
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctata-gaaat 103  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||| | | |    
T  858070 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct-agaaaataagtgggtgtctgttagcaactcctatatgcatt 857972  T
Q  104 ttgctagaatacacccactta-ttttttagaaggagtattttag 146  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||    
T  857971 ttgctagaatacacccacttacttttttaaaaggtgtgttttag 857928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4151045 - 4150976
Alignment:
Q  105 tgctagaatacacccacttatttttt-agaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaa 173  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4151045 tgctagaatactccaacttatttttttaaaaagagtattttaacaagtgaataactaaaaagtgattaaa 4150976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 62
Target Start/End: Original strand, 11351820 - 11351877
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11351820 tataattaaaaagttattgaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct 11351877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 4151148 - 4151093
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacacctt 60  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4151148 tataactaaaaaattaataaatacatcttgaggtgtatgttgctataacacacctt 4151093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38952272 - 38952198
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 177  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||| | ||||||||    
T  38952272 atttgctaaaatacacccacttattttttataaggagtgttttggcatgt-cataactaaaaagtagctaaataca 38952198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 33832898 - 33832728
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||| | ||| ||| ||||||||||||       ||| ||||||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  33832898 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaacgtttctaaaacacaccttctaaaaaaataaatgagtgtatgttagcaactcctataggcatt 33832799  T
Q  105 tgctagaatacacccacttatt-ttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 175  Q
    || |||||  |||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  33832798 tgttagaacgcacccacttattgttttggaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtaattaaata 33832728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Original strand, 17232868 - 17232949
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||   |||| ||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17232868 tttgctaggatacacctactaatttttattaaggtgtattttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 17232949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Original strand, 17421798 - 17421835
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17421798 atacacccacttattttttagaatgagtattttagcaa 17421835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 32736440 - 32736383
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  32736440 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct 32736383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 184
Target Start/End: Original strand, 13676229 - 13676303
Alignment:
Q  108 tagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||| | |||||||| ||||||    
T  13676229 tagaattcacacacttattttttaaaaggagtattttagcatgtg-ataact-aaaagttgctaaatacatcttaag 13676303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 257
Target Start/End: Original strand, 40234211 - 40234325
Alignment:
Q  141 ttttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaac 240  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||| |  ||||||||||||| |||  || |||||| |||     
T  40234211 ttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacactttaaggtgt-agtttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaat 40234308  T
Q  241 ctcgtatatgtatatat 257  Q
    | | ||||| |||||||    
T  40234309 cccatatatatatatat 40234325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31752479 - 31752377
Alignment:
Q  154 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtat 253  Q
    ||||||||||| | |||||||  |||||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||| ||| ||||| |||    
T  31752479 ataactaaaaactagttaaatgtaccttaagatgtag-tttgctaaaacactcccacataaaaactagtggttgtgttctagcaaatctcatatatatat 31752381  T
Q  254 atat 257  Q
    ||||    
T  31752380 atat 31752377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 149
Target Start/End: Original strand, 32736347 - 32736401
Alignment:
Q  94 ctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  32736347 ctatagaaatt-gctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 32736401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 37249538 - 37249452
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  37249538 atttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 37249452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38661243 - 38661192
Alignment:
Q  169 ttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  38661243 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaacta 38661192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 184
Target Start/End: Original strand, 6260994 - 6261024
Alignment:
Q  154 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6260994 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 6261024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 189
Target Start/End: Original strand, 29302056 - 29302141
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  29302056 tttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 29302141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 189
Target Start/End: Original strand, 30687866 - 30687951
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  30687866 tttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 30687951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 2695174 - 2695137
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  2695174 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 2695137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4083968 - 4083887
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   |||| || |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4083968 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 4083887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4738162 - 4738081
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   |||| || |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4738162 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 4738081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6436649 - 6436572
Alignment:
Q  107 ctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||| |||||||||||  |||||   |||| ||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6436649 ctaggatacacccactagtttttattaaggtgtattttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 6436572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 8318197 - 8318124
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 175  Q
    ||||||||  |||||||| |||  |||||| ||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  8318197 atttgctatgatacacccgcttggtttttataagaagtattttagcaaagatataactaaaaagtggttaaata 8318124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Original strand, 14369871 - 14369908
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14369871 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 14369908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17421924 - 17421843
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||   |||| || ||||| ||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  17421924 tttgctaggatacacccactaatttttattaaggtgtgttttaacaaatatataactaaaaagttgtttaatacaccttaag 17421843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 25912120 - 25912083
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25912120 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 25912083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 242
Target Start/End: Original strand, 22213127 - 22213215
Alignment:
Q  154 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacct 242  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| ||||||| | |||| |||||| || |||  || |||||| ||||||    
T  22213127 ataattaaaaagtggttaaatacaccctaaattgtagctttgttaaaacactctcacttaaaaattagtgggtgtgttctagcaaacct 22213215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33282492 - 33282405
Alignment:
Q  101 aatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||  |  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  33282492 aatttgctagaacatacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagtta-taactaaaaagttaataaatacactttaagatgta 33282405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 84)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 39424267 - 39424482
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||    
T  39424267 tataattaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 39424366  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |     
T  39424367 tgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaagtac 39424466  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    || |||||||||||||    
T  39424467 ttccacataaaaacta 39424482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 20411194 - 20411448
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  20411194 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagtca 20411293  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20411294 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtatcttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 20411393  T
Q  203 attttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    | |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  20411394 actcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccccatatatatatatat 20411448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Original strand, 16960281 - 16960479
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||    
T  16960281 tataactaaaaatttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttatagcaaatcatataggcatt 16960380  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16960381 tgctagaatacactcacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 16960479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 36817647 - 36817864
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  36817647 ttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctacaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggaa 36817746  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  36817747 tttgctagaatacacacacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaattcaccttaaggtgtagctttgctaaaac 36817846  T
Q  203 attttcacataaaaacta 220  Q
    | | ||||||||||||||    
T  36817847 actctcacataaaaacta 36817864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1805178 - 1804922
Alignment:
Q  1 aaattataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctataga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |        ||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  1805178 aaattataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtaagttgctataacacaccttttaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagg 1805079  T
Q  101 aatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||    
T  1805078 catttgctagaatacacccacttatcttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaagtggttaaatacatcctaaggtgtagctttgctaaa 1804979  T
Q  201 acattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    ||| |  |||||||||| ||||||  || |||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  1804978 acactcccacataaaaattaatgggtgtgttctagcaaacctcatatatatatatat 1804922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13385922 - 13385703
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-taagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  13385922 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 13385823  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaacttt--gctaaa 200  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  13385822 tttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaattgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtaactttgcgctaaa 13385723  T
Q  201 acattttcacataaaaacta 220  Q
    ||| |  |||||||||||||    
T  13385722 acactcccacataaaaacta 13385703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 14494366 - 14494620
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  14494366 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 14494465  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  14494466 tttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataaaccttaaggtgtagctttgctaaaac 14494565  T
Q  203 attttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    | |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  14494566 actcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccccatatatatatatat 14494620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12864478 - 12864226
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||           ||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||    
T  12864478 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtttgttgctataacacacctaaaaaaaaac-aagtgggtgtgttctagcaaatcatataggcat 12864380  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  12864379 ttgctagaatacacccacttattttttaaaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 12864280  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
     |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  12864279 ctcccacataaaaactactgggtgtgttctagcaaaccccatatatatatatat 12864226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 47131102 - 47130907
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  47131102 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 47131003  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttatttttt-agaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgcta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  47131002 ttgctagaatacacccacttatttttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctttgcta 47130907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32374727 - 32374511
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||         ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  32374727 ttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaacaaaaacaagtgggtgtgttatagcaaatcctatagaca 32374628  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||| ||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  32374627 tttgttacgatacacccacttagtttgtagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtaac-ttgctaaaac 32374529  T
Q  203 attttcacataaaaacta 220  Q
    | || |||||||||||||    
T  32374528 acttccacataaaaacta 32374511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27389670 - 27389474
Alignment:
Q  11 taaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatc----ctatagaaatttg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||    ||||||  |||||    
T  27389670 taaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaac-aagtgggtgtgttctagcaaatcaatcctataggcatttg 27389572  T
Q  107 ctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27389571 ctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaacacaccttaaggtgtagctttgctaaaacat 27389474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32716589 - 32716356
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |    ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||    
T  32716589 ttataactaaaaagttaataaatacatat----gtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcttataggcat 32716494  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32716493 ttgctagaatacacccacttatttttaagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 32716394  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
     |  |||||||||||||||||  || |||||| |||||    
T  32716393 ctcccacataaaaactaatgggtgtgttctagcaaacc 32716356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 27255649 - 27255866
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |         ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  27255649 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttactataacacaccttttagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 27255748  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27255749 tttgctagaatacaccctcttattttttaaaaggagtattttaggaagtaaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 27255848  T
Q  203 attttcacataaaaacta 220  Q
    | |  |||||||||||||    
T  27255849 actcccacataaaaacta 27255866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 51465208 - 51464996
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||||  |||||||||||||||| || ||  |     
T  51465208 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaagtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtggatgtgttatagcaaatcttacaggcaa 51465109  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  51465108 ttgctagaatacacc-acttattttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaaatggttaaatacagcctaaggtgtaactttgctaaaaca 51465010  T
Q  204 ttttcacataaaaa 217  Q
     |  ||||||||||    
T  51465009 ctcccacataaaaa 51464996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10764794 - 10764556
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| || |||||| |||    
T  10764794 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcttatagacatt 10764695  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||     
T  10764694 ttctagaatacacccactcattttttagaaggtgtgttatagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctttgttaaaacac 10764595  T
Q  205 tttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctc 243  Q
    | |||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||    
T  10764594 tctcacataaaaactagtgggtgtcttctagcaaacctc 10764556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 77 - 203
Target Start/End: Original strand, 14387471 - 14387597
Alignment:
Q  77 gtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14387471 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttggcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 14387570  T
Q  177 accttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||    
T  14387571 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 14387597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 43236151 - 43236410
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-taagtgagtgtgttatag--------caaatcc 94  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||||  || ||| |||        |||||||    
T  43236151 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtggatgcgttctaggcttctagcaaatcc 43236250  T
Q  95 tatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaacttt 194  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||    
T  43236251 tataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaagaagtattttagcaagtggataactaaaaagtggttaaatacaccttaatgtgttgcttt 43236350  T
Q  195 gctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtata 254  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||||| | ||||| ||||    
T  43236351 gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccccatatatatata 43236410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 257
Target Start/End: Original strand, 13943358 - 13943513
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  13943358 atttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgttaaaa 13943457  T
Q  202 cattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    || |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  13943458 cactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccccatatatatatatat 13943513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Original strand, 52772243 - 52772415
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnta--agtgagtgtgttatagcaaatcctatagaa 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||        |  |||| ||||||| ||||||||| |||||      
T  52772243 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttg-tataacacatcttctaaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcttataggc 52772341  T
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52772342 atttgctagaatacacccacttatttttcagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 52772415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 13157557 - 13157772
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaa---atcctatagaa 101  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  ||||||   ||||||||||     
T  13157557 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactgatcctatagac 13157655  T
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  13157656 atttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaa 13157753  T
Q  202 cattttcacataaaaacta 220  Q
    || |  |||||||||||||    
T  13157754 cactcccacataaaaacta 13157772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16005760 - 16005547
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||| ||  || ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  16005760 tataactaaaaagttgttaaatacacctcaagctgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 16005661  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||     
T  16005660 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagc-ttgttaaaacac 16005563  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    ||  ||||||||||||    
T  16005562 ttctacataaaaacta 16005547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 26842998 - 26843210
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||       |||||| ||||||  |||||| ||||||||  |||    
T  26842998 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacacacattctaataaa-taagtgggtgtgtgttagcaactcctataggcatt 26843096  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     
T  26843097 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaagttgtagc-ttgctaaaacac 26843194  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  26843195 tcacacataaaaacta 26843210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 220
Target Start/End: Original strand, 463392 - 463525
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  463392 tagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaag 463490  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
     |||| | ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  463491 gtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaacta 463525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 28094605 - 28094405
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct-nnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||         |||||  |||||| |||||||||||||||       
T  28094605 ttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaaacaagtggatgtgttctagcaaatcctatag--- 28094509  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
                ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  28094508 -----------gcacccacttatttttaagaaggagtattttagtaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaac 28094420  T
Q  203 attttcacataaaaa 217  Q
    | |  ||||||||||    
T  28094419 actcccacataaaaa 28094405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 20201885 - 20201739
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  20201885 ttataactaaaaagttaataaatagaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagaca 20201786  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || | || |||||||||    
T  20201785 tttgctataatacacccacttattttttataatgtgtgttttagcaa 20201739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 217
Target Start/End: Original strand, 27787880 - 27788010
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27787880 tagcaactcttataggaatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaag 27787978  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaa 217  Q
     |||| | ||||||||||| |  ||||||||||    
T  27787979 gtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaa 27788010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32156082 - 32155937
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||| | |||| |||| | |||||||||    
T  32156082 atttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtgttttagcaagt-tataaataaaaagtagttaaatacatcctaaggtgtagc-ttgctaaaa 32155985  T
Q  202 cattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatat 249  Q
    ||||  |||||||||||||||||  || |||||| ||| ||| |||||    
T  32155984 cattcacacataaaaactaatgggtgtgttctagcaaatctcttatat 32155937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 220
Target Start/End: Original strand, 34515210 - 34515343
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34515210 tagcaactcctataggcatttgttagaatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaag 34515308  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
     |||| | ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  34515309 gtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaacta 34515343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 6192424 - 6192643
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgt--atgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||| |||||       |||||| ||||||  |||||| |||||||   |    
T  6192424 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggggtgaatgttgctaaaacacatcttctaaaaaa-taagtgggtgtgtgttagcaactcctatatgca 6192522  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||     
T  6192523 tttgctagaatacacccacttatattttagaaggtgtgtttcagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaat 6192620  T
Q  203 attttcacataaaaactaatgga 225  Q
    | | | |||||||||||| ||||    
T  6192621 actatgacataaaaactagtgga 6192643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 184
Target Start/End: Original strand, 158420 - 158592
Alignment:
Q  11 taaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctag 110  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       ||| ||  ||| |  |||||| |||||||| |||||||||     
T  158420 taaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaattaaatggatgtatgttagcaactcctataggaatttgctat 158519  T
Q  111 aatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  158520 aattcacccacttattttctagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagctaaatacaccttaag 158592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 178
Target Start/End: Original strand, 36389459 - 36389630
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  36389459 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 36389557  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 178  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  36389558 tgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacac 36389630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 51432042 - 51431828
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  ||| || ||||||||| |||    
T  51432042 tataactaaaaagttgttaaatacactttaaggttaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggtgtatgttaggaactcctatagacatt 51431943  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataact-aaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  |||||| |||||   ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  51431942 tgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaaat-tataactaaaaaaacagttaaatgcaccttaaggtgtaac-ttgctaaaaca 51431845  T
Q  204 ttttcacataaaaacta 220  Q
     |   ||||||||||||    
T  51431844 ctccaacataaaaacta 51431828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Original strand, 5491681 - 5491797
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5491681 tagcaactcctatagacatttactagaatacactcacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccctaag 5491779  T
Q  185 atgtaactttgctaaaaca 203  Q
     |||| | |||||||||||    
T  5491780 gtgtatc-ttgctaaaaca 5491797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Original strand, 24770717 - 24770842
Alignment:
Q  93 cctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaact 192  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |     
T  24770717 cctataggcatttgctaggatacacccacttattcttttgaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagtgaaatgcaccttaagatgtagc- 24770814  T
Q  193 ttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24770815 ttgctaaaacactctcacataaaaacta 24770842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 28454900 - 28454691
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||        ||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  28454900 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaagctgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaa-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 28454802  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||| ||| |||||||| | |||||| |||| | |||||||||||     
T  28454801 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaacagtagttaaatataacttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 28454704  T
Q  205 tttcacataaaaa 217  Q
    |  ||||||||||    
T  28454703 tcccacataaaaa 28454691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13264647 - 13264531
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13264647 tagcaactcatataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaag 13264549  T
Q  185 atgtaactttgctaaaaca 203  Q
     |||| | |||||||||||    
T  13264548 gtgtagc-ttgctaaaaca 13264531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Original strand, 16073438 - 16073635
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-taagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||        |||||| |||| |  |||||| ||||| ||  ||    
T  16073438 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacctcctaaaaaaaataagtgggtgtttgttagcaactcctacaggcat 16073537  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  16073538 ttgttatgatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacgttaaggtgtaac-ttgctaaaaca 16073635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 189
Target Start/End: Original strand, 34306440 - 34306626
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| || |||||| ||||| | ||||       ||||||||||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  34306440 tataattaaaaagttgctaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacactcattctaaaaaa-taagtgagtgtatgttagcaactcctataggcatt 34306538  T
Q  105 tgctagaatacac----ccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||  ||  |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  34306539 tgctagaatacactcacccacttattttttagaagttgtgctttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 34306626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 42199952 - 42199853
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  42199952 atttgctagaatacacacacttaatttttagaaggtgtattttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaa 42199855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 42208820 - 42208721
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  42208820 atttgctagaatacacacacttaatttttagaaggtgtattttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaa 42208723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 189
Target Start/End: Original strand, 3979457 - 3979560
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  3979457 tagcaactcctatagacatttgctataatacacccacttattttttagaaggtgtgctttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaaaacatcttaag 3979555  T
Q  185 atgta 189  Q
    |||||    
T  3979556 atgta 3979560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Original strand, 27348128 - 27348309
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |       ||| || || |||  |||||| || ||||| | |    
T  27348128 ttataactaaaaagttgataaatacaccttaaggtgtat-ttgctataacacaccttataaaaaa-taaatgggtatgtgttagcaactcttatagca-t 27348224  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||    
T  27348225 ttgttagaatacaccaacttattttttagaagaagtattttagcaaatg-ataactaaaaaatagttaagtacatcttaagttgta 27348309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24190927 - 24190751
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||| |  |||||  | |||||   ||    
T  24190927 ttataattaagaagttcataaatacaccttgaggtgtatgttgctataacacaccttct-aaaaaataagtaagtgtatattagcatcttctatatgcat 24190829  T
Q  104 ttgctagaatacacccact--tattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacct 180  Q
    ||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| |||||    
T  24190828 ttgctagaatagaacgacttatattttttagaaggagtattttatcaagtgaa-aactaaaaaatgattaaatgcacct 24190751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8643112 - 8642979
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| |||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| | |||||||    
T  8643112 tagcaactcctatacgcatttgctataatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataaccaaaaagtagttaaatgcgccttaag 8643014  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
    ||||| | ||||||||||| |  || ||||||||||    
T  8643013 atgtagc-ttgctaaaacactcccatataaaaacta 8642979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Original strand, 28646759 - 28646817
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28646759 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacgcaccttct 28646817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 45818976 - 45818799
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| || |||||| |||    
T  45818976 tataactaaaatgttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtg-gtgtatgttagcaactcatatagacatt 45818878  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| || |  ||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  45818877 tgctataatacacccacttattttttagaagttgtgctttagaaaat-tataactaaaaagaagttaaaaacaccttaag 45818799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12010569 - 12010512
Alignment:
Q  144 tagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12010569 tagcaagtaaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaa 12010512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 203
Target Start/End: Original strand, 47130805 - 47130905
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |  |||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  47130805 atttgctaggatacacccacttattttttaaaatgtgcgttttagcaggtta-taactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaa 47130903  T
Q  202 ca 203  Q
    ||    
T  47130904 ca 47130905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23413830 - 23413584
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||        ||||| |||| |  |||||| ||||||  | |||    
T  23413830 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaatac-aagtgggtgtatgttagcaactcctatgaacatt 23413732  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   ||| ||  ||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     
T  23413731 tgctagaatacatccacttattttttt--aggtgtgctttaggaattta-taactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 23413636  T
Q  205 tttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
       ||||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||    
T  23413635 ccccacataaaaactagtgggtgtcttctagcaaa-ctcatatatatatatat 23413584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 33676209 - 33676084
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||| |||    
T  33676209 tataattaataagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgctagcaactcctatagacatt 33676110  T
Q  105 tgctagaatacacccacttatttttt 130  Q
    || ||| |||||||||||||||||||    
T  33676109 tgttaggatacacccacttatttttt 33676084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 41146355 - 41146233
Alignment:
Q  96 atagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttg 195  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| | |||    
T  41146355 atagacatttgctaggatatacccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagtgaaatgcaccttaaggtgtagc-ttg 41146258  T
Q  196 ctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
    |||||||| |  || ||||||||||    
T  41146257 ctaaaacactcccatataaaaacta 41146233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 257
Target Start/End: Original strand, 50559329 - 50559499
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  50559329 tagcaactcctataggcatttgttaggatacgcccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagtgaaatgcaccttaag 50559427  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
     | || | ||||||||||| |   |||||||||||| |||  || |||||| ||| | | ||||| |||||||    
T  50559428 gtttagc-ttgctaaaacactcctacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaatcccatatatatatatat 50559499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 62
Target Start/End: Original strand, 3099574 - 3099625
Alignment:
Q  11 taaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3099574 taaaaagttgataaatacaccttaaaatgtatgttgctataacacacattct 3099625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 220
Target Start/End: Original strand, 32994250 - 32994383
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| || |||||||||||||   || |||||||||||  |||| |||||||| ||||||| || ||||||    
T  32994250 tagcaaatcatatggccatttgctagaatacactcatttattttttagaatatgtgttttagcaagt-tataattaaaaagtagttaaatgcatcttaag 32994348  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
     |||| | ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  32994349 gtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaacta 32994383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 130
Target Start/End: Original strand, 32151996 - 32152049
Alignment:
Q  77 gtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttatttttt 130  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32151996 gtgtgttttagcaactcctatagacatttgctaggatacacccacttatttttt 32152049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Original strand, 32151945 - 32152009
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    |||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  32151945 tagcaactcctatatgcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 32152009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 132
Target Start/End: Original strand, 32144130 - 32144177
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttag 132  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32144130 tagcaactcctatagacatttgctaggatacacccacttattttttag 32144177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3273528 - 3273370
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| | ||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  3273528 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtggatgttgctaaagcactcattctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 3273429  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 164  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||  |||||||||||    
T  3273428 tgttagaatgcacccacttattttttaaaaggtgtgttttagtaagt-tataactaaaaa 3273370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Original strand, 4158116 - 4158290
Alignment:
Q  13 aaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaa 112  Q
    |||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||       ||||||  ||| |  |||||| |||||||   ||||| ||| |    
T  4158116 aaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagtggatgtatgttagcaactcctataagcatttgttagga 4158214  T
Q  113 tacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
     |||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||  ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  4158215 aacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaggt-tataactaaaaaataattaaatacaccttaaggtgta 4158290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33675899 - 33675834
Alignment:
Q  123 tattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  33675899 tattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgta 33675834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Original strand, 462968 - 463049
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   |||| ||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  462968 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtattttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 463049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 12010665 - 12010605
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtg--tatgttgctataacacaccttct 62  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  12010665 ttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatatgttgttataacacaccttct 12010605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28704595 - 28704514
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||| || |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28704595 tttgctatgatacatccatttattctttagaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 28704514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 224
Target Start/End: Original strand, 14387341 - 14387470
Alignment:
Q  92 tcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaac 191  Q
    ||||||||  |||| |||||||||| ||| |||||||| |||||| || ||||| ||||| | |||||||||| | ||||||| ||||||||| |||| |    
T  14387341 tcctatagccatttactagaatacatccatttattttt-agaaggtgtgttttaacaagtta-taactaaaaaatagttaaatgcaccttaaggtgtagc 14387438  T
Q  192 tttgctaaaacattttcacataaaaactaatgg 224  Q
     ||||||| ||| |  ||||||| |||||||||    
T  14387439 -ttgctaacacactcccacataagaactaatgg 14387470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Original strand, 20411145 - 20411231
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  20411145 atttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 20411231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Original strand, 27255600 - 27255686
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  27255600 atttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 27255686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 178
Target Start/End: Original strand, 28764654 - 28764720
Alignment:
Q  111 aatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  28764654 aatacatccacttattttttagaatgattgttttagcaagt-cataactaaaaagtggctaaacacac 28764720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 149
Target Start/End: Original strand, 32144088 - 32144135
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  32144088 atttgctgggatacacccacttattttttagaaggtgtaatttagcaa 32144135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 25378654 - 25378604
Alignment:
Q  95 tatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtatttta 145  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  25378654 tatagagatttgctaacatacacccacttattttttaaaatgagtatttta 25378604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 2965371 - 2965334
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgta 41  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2965371 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 2965334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 187
Target Start/End: Original strand, 3977973 - 3978006
Alignment:
Q  154 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatg 187  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3977973 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatg 3978006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Original strand, 10558162 - 10558243
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   |||| || |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10558162 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 10558243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 134
Target Start/End: Original strand, 13157362 - 13157411
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaa 134  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13157362 tagcaactcctataggcatttgctataattcacccacttattttttagaa 13157411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 13157633 - 13157596
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13157633 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 13157596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16005810 - 16005733
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacct 180  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||   |||| || |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16005810 tttgctaggatacacccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacacct 16005733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Original strand, 16073388 - 16073469
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   |||| || |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16073388 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 16073469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 24770706 - 24770669
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24770706 atacacccacttattttttagaaggtttattttagcaa 24770669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 28182232 - 28182156
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacc 179  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| || ||  ||||||||||||| |||||| |||||    
T  28182232 atttgctaaaatacaccaacttatttttttgaaagagtgttttaacatgt-cataactaaaaagtagttaaacacacc 28182156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 36389535 - 36389498
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  36389535 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 36389498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 62
Target Start/End: Original strand, 50559250 - 50559307
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  50559250 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 50559307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 20201700 - 20201752
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacac 57  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  20201700 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacac 20201752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Original strand, 28646710 - 28646796
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttatttttta-gaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  28646710 atttgttagaacacaccca-ttagtttttatgtaggagtattttagcaagtta-taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 28646796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 42200098 - 42200018
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 183  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||    |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42200098 tttgttaggatacacccactaatttttaagtgggagtgttttagcaaaaatataagtaaaaagttgttaaatacaccttaa 42200018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 42208966 - 42208886
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 183  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||    |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42208966 tttgttaggatacacccactaatttttaagtgggagtgttttagcaaaaatataagtaaaaagttgttaaatacaccttaa 42208886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 83)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 9483649 - 9483902
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  9483649 ttataactaaaaagttaataaatagacattaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 9483748  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  9483749 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaata 9483848  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
     |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  9483849 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccccatatatatatatat 9483902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14826488 - 14826237
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||  ||||||| ||||||||||||||   ||    
T  14826488 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtaggtgtgttctagcaaatcctataagcat 14826389  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14826388 ttgctagaatacacccacttattttttagaatgaatatttttgcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 14826289  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
     |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  14826288 ctcccacataaaaactagtgg--gtgttctagcaaaccccttatatatatatat 14826237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19971628 - 19971415
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||       |||||| ||||||| || ||||||||||||  ||    
T  19971628 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgttctaacaaatcctataggcat 19971529  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  19971528 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaaatggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaaca 19971429  T
Q  204 ttttcacataaaaa 217  Q
     |  ||||||||||    
T  19971428 ctcccacataaaaa 19971415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 21021185 - 21021398
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||       |||||| ||||||| || ||||||||||||  ||    
T  21021185 ttataaataaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgttctaacaaatcctataggcat 21021284  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  21021285 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaaatggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaaca 21021384  T
Q  204 ttttcacataaaaa 217  Q
     |  ||||||||||    
T  21021385 ctcccacataaaaa 21021398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 21442128 - 21442381
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  21442128 ttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 21442227  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  21442228 tttgctagaatacacc-acttgttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagatttgctaaaac 21442326  T
Q  203 attttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    | |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  21442327 actcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccccatatatatatatat 21442381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 41942859 - 41943093
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||        ||||| | ||||| |||||||||||||||  ||    
T  41942859 ttataactaaaaagttaataaatacaccctaaggtgtatcttgctataacacaccttctaaaaaac-aagtggg-gtgttctagcaaatcctataggcat 41942956  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  41942957 t-gctagaatacacccacttattttttaggaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacactttaaggtgtaactttgctaaaaca 41943055  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
     |  |||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  41943056 ctcccacataaaaactaatggatgtgttctagcaaacc 41943093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 31071554 - 31071769
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  31071554 ttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgtcgctataacacaccttctaaaaaac-aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 31071652  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  31071653 ttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaaca 31071752  T
Q  204 ttttcacataaaaacta 220  Q
     |  |||||||||||||    
T  31071753 ctcccacataaaaacta 31071769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Original strand, 1783002 - 1783173
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  1783002 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 1783101  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1783102 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtgttttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 1783173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 30577868 - 30578082
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-taagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        || ||| ||||||| |||||||| ||||||  |    
T  30577868 ttataactgaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataggtgggtgtgttctagcaaattctataggca 30577967  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  30577968 tttgctaggatacacccgcttattttttagaatgagtattttagcaggtgaataactaaaaagtggttaaatacaccataaggtgtagctttgctaaaac 30578067  T
Q  203 attttcacataaaaa 217  Q
    | |  ||||||||||    
T  30578068 actcccacataaaaa 30578082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 5642702 - 5642465
Alignment:
Q  11 taaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||        ||||| ||||     ||||||||||||||  |||||||||    
T  5642702 taaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaataacaagtgggtgt-----agcaaatcctataggcatttgctag 5642608  T
Q  111 aatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcac 210  Q
    ||||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||| |  |||    
T  5642607 aatacacccactttttttgtag---gagtattttagcaagtgaataattaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctagaacactcccac 5642511  T
Q  211 ataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    |||||||||| |||  || |||||  ||||| ||||||| |||||||    
T  5642510 ataaaaactagtgggtgtgttctaacaaacc-cgtatatatatatat 5642465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 5644643 - 5644406
Alignment:
Q  11 taaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||        ||||| ||||     ||||||||||||||  |||||||||    
T  5644643 taaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaataacaagtgggtgt-----agcaaatcctataggcatttgctag 5644549  T
Q  111 aatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcac 210  Q
    ||||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||| |  |||    
T  5644548 aatacacccactttttttgtag---gagtattttagcaagtgaataattaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctagaacactcccac 5644452  T
Q  211 ataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    |||||||||| |||  || |||||  ||||| ||||||| |||||||    
T  5644451 ataaaaactagtgggtgtgttctaacaaacc-cgtatatatatatat 5644406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13269429 - 13269233
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||| | |||    
T  13269429 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatt 13269330  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13269329 tgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtaac-ttgctaaaaca 13269233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35550786 - 35550559
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  35550786 tataagtaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacactttctaaaata-taagtgggtgtatattagcaactcctataggcatt 35550688  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     
T  35550687 tgctaggatacactcacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 35550590  T
Q  205 tttcacataaaaactaatggacgtcttctag 235  Q
    |  ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  35550589 tcccacataaaaactagtggatgtgttctag 35550559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 217
Target Start/End: Original strand, 25281053 - 25281163
Alignment:
Q  107 ctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |     
T  25281053 ctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaataaataactaaaaagtgcttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactc 25281152  T
Q  207 tcacataaaaa 217  Q
     ||||||||||    
T  25281153 acacataaaaa 25281163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 27545762 - 27545974
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| |||||||   |||    
T  27545762 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaata-taagtgggtgtatgttagcaactcctataagcatt 27545860  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||     
T  27545861 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgt-agattgctaaaacac 27545958  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  27545959 taccacataaaaacta 27545974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Original strand, 25127871 - 25128089
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-taagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||        |||||| |||| |  |||||| ||||| ||| ||    
T  25127871 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacaaaccttctaaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctacagacat 25127970  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||    
T  25127971 ttgctagaatactctcacttaatttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 25128068  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatgg 224  Q
     |  |||||||||||||||||    
T  25128069 ctcccacataaaaactaatgg 25128089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 203
Target Start/End: Original strand, 42556441 - 42556532
Alignment:
Q  111 aatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||    
T  42556441 aatacacctacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacatcttaaggtgtatc-ttgctaaaaca 42556532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13468496 - 13468318
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  13468496 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 13468397  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  13468396 tgctataatacacccacttattttttagaaggtgtgctttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatactccttaag 13468318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 1201671 - 1201883
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  1201671 tataactaaaaagttgtaaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 1201769  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||     
T  1201770 tgctaggatacacccacttatattttagaaggtgtgttttaacaaat-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgttaaaacac 1201867  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  1201868 tcccacataaaaacta 1201883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2823796 - 2823584
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||       ||| || |||| |  |||||| ||||||||| |||    
T  2823796 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaa-taattgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 2823698  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | || | |||||||||||     
T  2823697 tgctaggatacatccacttattttttagaaagtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtatagc-ttgctaaaacac 2823600  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    || |||||||||||||    
T  2823599 ttccacataaaaacta 2823584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8258437 - 8258304
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  8258437 tagcaactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaagaagtgttttagcaaat-tataaccaaaaagtagttaaatacaccttaag 8258339  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
     |||| | ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  8258338 gtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaacta 8258304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Original strand, 10616293 - 10616503
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||| || |||| ||| || |||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  10616293 tataactaaaaagttgttaaatatacattaaggtgaatattgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 10616391  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||     
T  10616392 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaaatagttaaatacaccttaaggtgt-agtttgctaaaacac 10616489  T
Q  205 tttcacataaaaac 218  Q
    |  |||||||||||    
T  10616490 tcccacataaaaac 10616503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21442466 - 21442395
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaata 156  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21442466 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaata 21442395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 127 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2178780 - 2178651
Alignment:
Q  127 ttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggac 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |  || |||||||| | ||||     
T  2178780 ttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag-tgtaggtttgctaaaacactcccatataaaaaccagtggat 2178682  T
Q  227 gtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    ||||||||| ||| | | ||||| |||||||    
T  2178681 gtcttctagcaaatcccatatatatatatat 2178651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26043135 - 26042926
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| || |||||| || |||||||||       |||||| |||| |  || ||| ||||||||  |||    
T  26043135 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaatacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtatgttaacaactcctataggcatt 26043037  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     
T  26043036 tgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 26042939  T
Q  205 tttcacataaaaa 217  Q
    |  ||||||||||    
T  26042938 tcccacataaaaa 26042926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30633259 - 30633043
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| | ||| |   |||    
T  30633259 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtttgttagcaacttctacatgcatt 30633161  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | || ||||||||     
T  30633160 tgctagaatacacccatttaatttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttactaaaacac 30633063  T
Q  205 tttcacataaaaactaatgg 224  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  30633062 tctcacataaaaactaatgg 30633043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 30207169 - 30207396
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  30207169 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccatctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 30207267  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||| |  |||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||     
T  30207268 tgctagaatacacccacttattttttaaagagtgtgttttagcaaat-tataattaaaaagtagttaaatgcacattaaggtgtaac-ttgctaaaacac 30207365  T
Q  205 tttcacataaaaactaatggacgtcttctag 235  Q
    |  ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  30207366 tcccacataaaaactagtggatgtgttctag 30207396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Original strand, 3369720 - 3369925
Alignment:
Q  11 taaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctag 110  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||||||||    
T  3369720 taaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaata-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctag 3369818  T
Q  111 aatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcac 210  Q
     ||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | ||||||||||| |  |||    
T  3369819 gatacacccactta-tttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatataccttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccac 3369915  T
Q  211 ataaaaacta 220  Q
    ||||||||||    
T  3369916 ataaaaacta 3369925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Original strand, 25123467 - 25123592
Alignment:
Q  93 cctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaact 192  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| |     
T  25123467 cctatagacatttgctagaatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcacctgaagacgtagc- 25123564  T
Q  193 ttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25123565 ttgctaaaacactctcacataaaaacta 25123592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 32069024 - 32069234
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  32069024 tataactaaaaagttgttaaataaaccttaaggtgaatgttgctaaaacacactttctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 32069122  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     
T  32069123 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataact--aaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 32069218  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  ||||| |||||||    
T  32069219 tcacacatgaaaacta 32069234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 32487042 - 32486945
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 183  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32487042 tagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaagtgtattttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaa 32486945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Original strand, 184108 - 184304
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  ||||||  | |||||| |||    
T  184108 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaacccatatagacatt 184206  T
Q  105 tgctagaatacacccactta-ttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| | || |||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  184207 tgctaggatacacccacttatttttttagaatgtgtgttttaataagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 184304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3154168 - 3154067
Alignment:
Q  140 attttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |  ||||||||||||| |||  || |||||| |||    
T  3154168 attttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagttttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 3154069  T
Q  240 cc 241  Q
    ||    
T  3154068 cc 3154067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5946981 - 5946786
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| |||||| |  |||    
T  5946981 tataactaaaaagttgttaaataaaccttaaggtgaatgttgttgaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatcggcatt 5946882  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  5946881 tgctaggatacacc-acttattttttagaagatgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagc-ttgctaaaaca 5946786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 10776977 - 10777188
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       |||||| |||| |  |||||| |||||||   |||    
T  10776977 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataagcatt 10777076  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||   ||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||| |     
T  10777077 tgctaagatacatccacttatttttt---aggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaagtgt-agtttgctaaaatac 10777171  T
Q  205 tttcacataaaaactaa 221  Q
    || ||||||||||||||    
T  10777172 ttccacataaaaactaa 10777188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29125883 - 29125695
Alignment:
Q  26 tacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttat 125  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||    
T  29125883 tacaccttaaggtgaatgttactaaaacacaccttctaagaaa-taagtgggtgtatcttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacctat 29125785  T
Q  126 tttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaa 217  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |  ||||||||||    
T  29125784 tttttggaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaa 29125695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23544987 - 23544841
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||| |||    
T  23544987 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 23544888  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 151  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  23544887 tgttagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagtaagt 23544841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26868112 - 26867935
Alignment:
Q  11 taaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctag 110  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||| |||     
T  26868112 taaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgccaaaacacaccttcttaaaaattaagtgcgtgtatgttagcaactcctataggcatttactat 26868013  T
Q  111 aatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  26868012 aacacacccacttattttctagaaggtgtgttttagcaagt-tatatctaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgta 26867935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1281999 - 1281869
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| | ||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  1281999 tagcaacttctataggcatttggtagaatacatccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaatgtagttaaatacactttaag 1281901  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaa 217  Q
     |||||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  1281900 gtgtaac-ttgctaaaacactcccacataaaaa 1281869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 3154267 - 3154209
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3154267 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 3154209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 4018733 - 4018675
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4018733 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 4018675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 9484115 - 9483938
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||       |||||| |||| |  |||||| |||||||   |||    
T  9484115 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacactttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataagcatt 9484016  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 183  Q
    || ||  ||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  9484015 tgttaagatatacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataactaaaaaatagttaaatacaccttaa 9483938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 25280993 - 25281054
Alignment:
Q  1 aaattataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25280993 aaattataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtaagttgctataacacaccttct 25281054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39934516 - 39934409
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  39934516 tagcaactcctacaggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaaggtgtgttttaacaagt-tataactaaaaggtagttaaatacaccctaag 39934418  T
Q  185 atgtaactt 193  Q
     ||||||||    
T  39934417 gtgtaactt 39934409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 1775593 - 1775535
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1775593 ttataactaaaatgttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 1775535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Original strand, 14819307 - 14819365
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14819307 ttataactaaaaagttaataaacacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 14819365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 44874230 - 44874146
Alignment:
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| | ||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44874230 ttgctagaatacacccacttattttttagaaagtgtgtttcaccaactta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgta 44874146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Original strand, 36899739 - 36899886
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacac--cttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| |||||||   |    
T  36899739 tataactaaaaagttgttaaatacacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaata-taagtgggtgtatgttagcaactcctatacgca 36899837  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagt 151  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  36899838 tttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt 36899886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Original strand, 18804322 - 18804380
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  18804322 ttataattaaaaagttgataaatacaccttgaggtgtatgttgctataagacaccttct 18804380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 184
Target Start/End: Original strand, 18804887 - 18804968
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18804887 atttgttagaataaacccacatattttttagaaggactattttaacaaatg-ataactaaaaagtagttaagtacaccttaag 18804968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23161405 - 23161301
Alignment:
Q  114 acacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacata 213  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||| |  |||||     
T  23161405 acacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacatg 23161308  T
Q  214 aaaacta 220  Q
    |||||||    
T  23161307 aaaacta 23161301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 257
Target Start/End: Original strand, 34103002 - 34103251
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||       |||||| |||| |  |||||| | ||||||   ||    
T  34103002 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaacttctataggcttt 34103100  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||  ||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||| | |||||||||||     
T  34103101 tgctatgatacatccatttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaaatagttaaatacactttaacgtgtagc-ttgctaaaacaa 34103198  T
Q  205 tttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    |  ||||| ||||||| |||  || |||||| ||| | | ||||| |||||||    
T  34103199 tcccacatgaaaactagtgggtgtgttctagcaaatcccatatatatatatat 34103251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 26630031 - 26630161
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||| |||    
T  26630031 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 26630129  T
Q  105 t-gctagaatacacccacttattttttagaag 135  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26630130 tagctaggatacacccacttatttttttgaag 26630161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30633309 - 30633225
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatg 187  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30633309 tttgctaggatacacccactaatttttaagtgggagtgttttagcaaaaatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatg 30633225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Original strand, 13290594 - 13290680
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  13290594 atttgttagaatacatccacttaatttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcactttaaggtgta 13290680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 45299774 - 45299639
Alignment:
Q  13 aaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaa 112  Q
    |||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| || |||||  ||||||||| |    
T  45299774 aaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtatgctagcaactcttataggcatttgctagga 45299676  T
Q  113 tacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  45299675 tacacccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaa 45299639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9869641 - 9869596
Alignment:
Q  136 gagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacctt 181  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9869641 gagtattttagcatgtaaataactaaaaagtggttaaatacacctt 9869596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 234
Target Start/End: Original strand, 32512114 - 32512261
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| || |||||  |||||||| ||||||   | ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| |||||| | |||||||||| |||||     
T  32512114 tagcaactcttataggcatttgctataatacatttatttattttttagaatgagtgttttagcaaatga-taaataaaaaatagttaaatacatcttaaa 32512212  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttcta 234  Q
     |||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| |||| || |||||    
T  32512213 gtgtagctt-gctaaaacactctcacataaaaactagtggatgtgttcta 32512261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 220
Target Start/End: Original strand, 36901237 - 36901301
Alignment:
Q  155 taactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  36901237 taactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaacta 36901301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 220
Target Start/End: Original strand, 9413889 - 9414022
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||  | |||||||||||  |||| |||||||| | | |||| | ||||||    
T  9413889 tagcaactcctatagacatttgctagaatacatctacttattttttaaaaggtatgttttagcaagt-tataattaaaaagtcggtgaatataacttaag 9413987  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
     |||| | ||||||||||| |   ||||||||||||    
T  9413988 gtgtagc-ttgctaaaacactcctacataaaaacta 9414022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 17691217 - 17691337
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| | ||||||| |||    
T  17691217 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagtgggtgtatgttagcaacttctatagacatt 17691315  T
Q  105 tgctagaatacacccacttatt 126  Q
    || || ||||||||||||||||    
T  17691316 tgttataatacacccacttatt 17691337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Original strand, 42556760 - 42556881
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||| | || |||||||||||  ||||||||||||  || ||||  |||||||| |||| | |||||||||    
T  42556760 atttgctaggatacactcacttatttttttgaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagcagtgaaatgtaccttaaggtgtagc-ttgctaaaa 42556857  T
Q  202 cattttcacataaaaactaatgga 225  Q
    || | | |||||||||||| ||||    
T  42556858 cactcttacataaaaactagtgga 42556881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29377929 - 29377864
Alignment:
Q  154 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  29377929 ataactgaaaagttgttaaatacaccttaaggtgtaac-ttgctaaaacactcccacataaaaacta 29377864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 7090025 - 7089968
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7090025 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct 7089968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Original strand, 17691167 - 17691248
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||   |||| || |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17691167 tttgctaggatacacccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaaaatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 17691248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21352328 - 21352256
Alignment:
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||| |||||| | ||||| |||||    
T  21352328 tgctataatacacccacttattttttagaaggggtattttaacaaatg-ataattaaaaaatagttaagtacac 21352256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Original strand, 26043059 - 26043096
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26043059 atacacccacttattttttagaaggtgtattttagcaa 26043096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 149
Target Start/End: Original strand, 45299698 - 45299743
Alignment:
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  45299698 ttgctagcatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 45299743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17952677 - 17952598
Alignment:
Q  154 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttcta 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||    
T  17952677 ataactaaaaagtagttaaatacaccctaaaatgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttcta 17952598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3154316 - 3154230
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  3154316 atttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 3154230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23053897 - 23053811
Alignment:
Q  154 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | || | ||||||||||| |  ||||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  23053897 ataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtatagc-ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 23053811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 60
Target Start/End: Original strand, 42556684 - 42556739
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacacctt 60  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  42556684 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacctt 42556739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 180
Target Start/End: Original strand, 29377534 - 29377600
Alignment:
Q  114 acacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacct 180  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29377534 acactcacttgttttttagaataagtattttagcaaaaatataattaaaaagtggttaaatacacct 29377600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 184184 - 184147
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  184184 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 184147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 1201747 - 1201710
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1201747 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 1201710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 10616369 - 10616332
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10616369 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 10616332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13468495 - 13468462
Alignment:
Q  154 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatg 187  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13468495 ataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatg 13468462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 17691293 - 17691256
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17691293 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 17691256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 26630107 - 26630070
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  26630107 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 26630070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Original strand, 27545712 - 27545793
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   |||| || |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27545712 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggcgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 27545793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 181
Target Start/End: Original strand, 30400528 - 30400572
Alignment:
Q  136 gagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacctt 181  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30400528 gagtattttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacctt 30400572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 183
Target Start/End: Original strand, 1201621 - 1201701
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 183  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||   |||| || |||||||||    ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1201621 tttgctaggatacacccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgtaaaatacaccttaa 1201701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19971678 - 19971591
Alignment:
Q  101 aatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||  |  ||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  19971678 aatttgctagaacacacccactagtttttatgttggagtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 19971591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 51)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 1369899 - 1370136
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||        ||||| ||||||| || ||||||||||||| ||    
T  1369899 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctaacaaatcctatagacat 1369998  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1369999 ttgctagaatacatccatttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 1370098  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
     | |||||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  1370099 ctctcacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 1370136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 31132876 - 31133093
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  31132876 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatattgctatagcacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 31132975  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  31132976 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 31133075  T
Q  203 attttcacataaaaacta 220  Q
    | |  |||||||||||||    
T  31133076 actcccacataaaaacta 31133093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29646413 - 29646159
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  29646413 ttataactaaaaa-ttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 29646315  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  29646314 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgttaaaac 29646215  T
Q  203 attttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctc-gtatatgtatatat 257  Q
    | |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  29646214 actcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacccctatatatgtatatat 29646159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 11100380 - 11100597
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  11100380 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 11100479  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11100480 tttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 11100579  T
Q  203 attttcacataaaaacta 220  Q
    | |  |||||||||||||    
T  11100580 actcccacataaaaacta 11100597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 10777943 - 10778160
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| || ||||||||||||| |    
T  10777943 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctaacaaatcctatagaca 10778042  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10778043 tttgctaggatacacccacttggtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgtttaaatacaccttaagatgtagctttgctaaaac 10778142  T
Q  203 attttcacataaaaacta 220  Q
    | |  |||||||||||||    
T  10778143 actcccacataaaaacta 10778160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 15962737 - 15962992
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||| ||||||  |    
T  15962737 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaattctataggca 15962836  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15962837 ttttctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgtataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 15962936  T
Q  203 attttcacat-aaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    | |  ||||| |||||||| |||  || |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  15962937 actcccacataaaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccccatatatatatatat 15962992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 9955795 - 9956012
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  9955795 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtacgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 9955894  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9955895 tttgctagaatacacccacttattttttagaaagagtattttaacaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 9955994  T
Q  203 attttcacataaaaacta 220  Q
    | |   ||||||||||||    
T  9955995 actcctacataaaaacta 9956012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 4184261 - 4184514
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | |||| |||||| ||||||||         ||||| ||||||| |||||||||||||||  |    
T  4184261 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggt--acgttgttataacgcaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 4184358  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4184359 tttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 4184458  T
Q  203 attttcacataaaaa-ctaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    | |  |||||||||| ||| |||| || |||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  4184459 actcccacataaaaacctagtggatgtgttctagcaaacctcatatatatatatat 4184514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 5187770 - 5188022
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |       |||||| ||||||| ||||||| |||| ||  ||    
T  5187770 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttttaaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaaacctacaggcat 5187869  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  5187870 ttgctagaatacacccacttattttttagattgagtattttaacaaatgaataactaaaaagtgattaaatacacc-taagatgtagatttgctaaaaca 5187968  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
     || |||||||||| ||||||  || |||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  5187969 cttccacataaaaattaatgggtgtgttctagtaaactccatatatatatatat 5188022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 27828307 - 27828549
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataa----cacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctata 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||         ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27828307 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataagtaacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctata 27828406  T
Q  99 gaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgcta 198  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  27828407 ggcatttgttagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgcta 27828506  T
Q  199 aaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
    ||||| |  ||||||||| ||| |||  || |||||| |||||    
T  27828507 aaacactcccacataaaagctagtgggtgtgttctagcaaacc 27828549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8172073 - 8171836
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaat 103  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||        ||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||    
T  8172073 ttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacactttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcttataggcat 8171974  T
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaaca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  8171973 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaataaataactaaacagtggttaaatacactctaagttatagctttgctaaaaca 8171874  T
Q  204 ttttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
     |  |||||||||| || |||| || |||||| |||||    
T  8171873 ctcccacataaaaattagtggatgtgttctagcaaacc 8171836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 16599069 - 16599286
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||  ||||||| |||  ||||||||||  |    
T  16599069 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagttggtgtgttttagtgaatcctataggca 16599168  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  16599169 tttactagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtagctttggtaaaac 16599268  T
Q  203 attttcacataaaaacta 220  Q
    | |  |||||||||||||    
T  16599269 actcccacataaaaacta 16599286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 71 - 248
Target Start/End: Original strand, 20755423 - 20755600
Alignment:
Q  71 aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 170  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20755423 aagtgaatgtgttctagcaaatcctatagacgtttgctagaatacacgcacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 20755522  T
Q  171 aaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtata 248  Q
    |||||||||||||| | ||  ||| |||||||| |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||||| ||||||    
T  20755523 aaatacaccttaaggtatattttttctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccccgtata 20755600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 26667865 - 26668026
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||| ||||||  |    
T  26667865 ttataactaaaaagttaataaatacatcttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaattctataggca 26667964  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 164  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26667965 tttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgtataactaaaaa 26668026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33730710 - 33730501
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       ||||  ||| |||||  |||| ||||||||  |||    
T  33730710 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataag--agtatgtta--gcaactcctataggcatt 33730615  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||     
T  33730614 tgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 33730517  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  33730516 tcccacataaaaacta 33730501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 257
Target Start/End: Original strand, 4898447 - 4898696
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||| |       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  4898447 tataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacctt-ttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 4898545  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||||||||||     
T  4898546 tgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 4898643  T
Q  205 tttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    |   ||||||||| || |||| || |||||| ||| ||  ||||| |||||||    
T  4898644 tcatacataaaaattagtggatgtgttctagtaaatcttatatatatatatat 4898696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 220
Target Start/End: Original strand, 10315306 - 10315420
Alignment:
Q  107 ctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtg-aataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacatt 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| |    
T  10315306 ctagaatacactcacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaaataactaaaaggttgttaaatacaccctaatgtgtagctttgctaaaacact 10315405  T
Q  206 ttcacataaaaacta 220  Q
      |||||||||||||    
T  10315406 cccacataaaaacta 10315420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14488490 - 14488320
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| |||||| || ||||| | ||||       ||||||||||| |  |||||| || |||||  |||    
T  14488490 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacactcattctaaaaaa-taagtgagtgtatgttagcaactcatataggcatt 14488392  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  14488391 tgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaataca 14488320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18154657 - 18154487
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  18154657 tagcaactcctatagacatttgttaggatacacccacttattttatagacggtgtgttttagcaagt-tataacaaaaaaatagttaaatacaccttaag 18154559  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
     |||| | ||||||||||| |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||| ||| ||||| |||||||    
T  18154558 gtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaatctcatatatatatatat 18154487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 241
Target Start/End: Original strand, 30525434 - 30525588
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30525434 tagcaactcctataggcatttgctagaatacactcacttattttttagaaagtatgttttagcaaat-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaag 30525532  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
     || | | ||||||||||| |  |||||||||||||||||  || |||||| |||||    
T  30525533 gtgcagc-ttgctaaaacactcccacataaaaactaatgggtgtgttctagcaaacc 30525588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 213
Target Start/End: Original strand, 21969991 - 21970100
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21969991 atttgctagaatacatctacttattttttataaggtgtattttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagc-ttgctaaaa 21970088  T
Q  202 cattttcacata 213  Q
    || || ||||||    
T  21970089 cacttccacata 21970100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 99
Target Start/End: Original strand, 11210297 - 11210392
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatag 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  11210297 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgcgttctagcaaatcctatag 11210392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 257
Target Start/End: Original strand, 15882021 - 15882139
Alignment:
Q  139 tattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaa 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||| ||||||| |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||    
T  15882021 tattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacatcataaggtgtagctttgttaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaa 15882120  T
Q  239 acctcgtatatgtatatat 257  Q
    ||| | ||||| |||||||    
T  15882121 accccatatatatatatat 15882139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18102881 - 18102668
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| |       |||||  |||| |   ||||| | ||||||  |||    
T  18102881 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgttaaaacacaccttttaaaaaaataagttggtgtatgtcagcaacttctataggcatt 18102782  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| | |||||||||||     
T  18102781 tgctatgatacacccacttattttttagaatgtgtattttagcaagt-tataactaaagagtagttaaatacaccttcaggtgtagc-ttgctaaaacac 18102684  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |  |||||||||||||    
T  18102683 tcccacataaaaacta 18102668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15718321 - 15718188
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||| ||| | | |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15718321 tagcaactcctataggcatttgttagaatacatccacttatattttagaaggtgtgttttaacaaatta-taactaaaaagtagttaaatgcaccttaag 15718223  T
Q  185 atgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
     |||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  15718222 gtgtagc-ttgctaaaacattcccacataaaaacta 15718188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 96
Target Start/End: Original strand, 15881926 - 15882018
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatccta 96  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15881926 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatccta 15882018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 24022935 - 24022877
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24022935 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 24022877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25061845 - 25061676
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  25061845 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaa-gtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 25061748  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 177  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  25061747 tgctaggatacaccaacttatttgttagaaggtgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaataca 25061676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 203
Target Start/End: Original strand, 26211376 - 26211475
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||| || || ||||||||||| |||| | |||||||||    
T  26211376 atttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaaatg-ataattaaaaagtagtcaagtacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaa 26211473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Original strand, 3438090 - 3438206
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaa 201  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | || ||||||    
T  3438090 atttgcaaggatatacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttactaaaa 3438187  T
Q  202 cattttcacataaaaacta 220  Q
    || || |||||||||||||    
T  3438188 cacttccacataaaaacta 3438206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 10196662 - 10196604
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  10196662 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttct 10196604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 35002083 - 35002025
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  35002083 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattct 35002025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 183
Target Start/End: Original strand, 32889635 - 32889715
Alignment:
Q  101 aatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32889635 aatttgctagaatacacccacttattttttaaaagaagtattttaacaaagatataact--aaagtggttaaatacaccttaa 32889715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4838473 - 4838255
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  4838473 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 4838375  T
Q  105 tgc------tagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgcta 198  Q
    | |      ||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||| |  ||| |||||||||||| |||| | ||||||    
T  4838374 tactaggaataggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaaatacttagatacaccttaaggtgtagc-ttgcta 4838277  T
Q  199 aaacattttcacataaaaacta 220  Q
    ||||| |  |||||||||||||    
T  4838276 aaacactcccacataaaaacta 4838255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 180
Target Start/End: Original strand, 4898207 - 4898302
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttatttttta-gaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacct 180  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||    
T  4898207 tagcaactcctataggcatttgctagaatacactcacttattttttattaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaaattgttaaatacacct 4898302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 62
Target Start/End: Original strand, 33311672 - 33311723
Alignment:
Q  11 taaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33311672 taaaaaattaataaatacaccttaaagtatatgttgctataacacatcttct 33311723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11742514 - 11742305
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  11742514 tataactaaaaagttgttaaatacattttaaggtgtattttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 11742416  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||  |||| || |||||||| || | |||||||||| | || |||| ||||||||| |||| | |||||||||||     
T  11742415 tgctaggatacacccatttaattttttaaaggtgtgttttagcaggtta-taactaaaaaatagtgaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 11742318  T
Q  205 tttcacataaaaa 217  Q
    || | ||||||||    
T  11742317 ttcctcataaaaa 11742305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 9406695 - 9406615
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagt 166  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  9406695 tagcaattcctatatgcatttgctagaatacacccacttattgtttacaatgagtgtttcagcaagtgaa-aactaaaaagt 9406615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Original strand, 8062115 - 8062173
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| |||| |||||||    
T  8062115 ttataattaaaaagtgaataaatacactttcacgtgtatgttgctaaaacaaaccttct 8062173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11100170 - 11100081
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttatt-ttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaat 174  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  11100170 tagcaactcctatatgcatttgctagaatgcacccacttatttttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaat 11100081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3881444 - 3881411
Alignment:
Q  154 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3881444 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatg 3881411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 30525473 - 30525393
Alignment:
Q  70 taagtgagtgtgttatagcaaat-cctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaag 150  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||| | || ||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  30525473 taagtgagtgtattctagcaaatgcctataggagtt-gctaacatacacccacttatattttagaaggtgtattttagcaag 30525393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32194260 - 32194180
Alignment:
Q  154 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaactaatggacgtcttctag 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || |||||||| || ||||| ||||||| |||| || ||||||    
T  32194260 ataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttactaaaacacttccacatgaaaactagtggatgtgttctag 32194180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Original strand, 9955746 - 9955832
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  9955746 atttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 9955832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 220
Target Start/End: Original strand, 228020 - 228111
Alignment:
Q  126 tttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcacataaaaacta 220  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  228020 tttttagaaggtatgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatataccttaa-atgtagc-ttgctaaaacacttccacatgaaaacta 228111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Original strand, 4838397 - 4838434
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4838397 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 4838434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 184
Target Start/End: Original strand, 5703803 - 5703884
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||||| || ||||||||  |||||   ||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5703803 tttgctaggattcacccactagtttttattaaggagttttttaacaaatatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag 5703884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Original strand, 11742438 - 11742475
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  11742438 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 11742475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Original strand, 25061770 - 25061807
Alignment:
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25061770 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 25061807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 189
Target Start/End: Original strand, 31132829 - 31132913
Alignment:
Q  104 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  31132829 ttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 31132913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11742564 - 11742465
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||   |||| ||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||    
T  11742564 tttgctaggatacacccattaatttttattaaggtgtattttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacattttaaggtgt-attttgctaaaac 11742466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 452363 - 452603
Alignment:
Q  1 aaattataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctataga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||| ||||||| ||||||||| |||||     
T  452363 aaattataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgcgtgtgttctagcaaatcgtatagg 452462  T
Q  101 aatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaa 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  452463 catttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtatataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaa 452562  T
Q  201 acattttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacc 241  Q
    ||| |  ||||||||||||| |||  || |||||| |||||    
T  452563 acactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 452603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 58093 - 57839
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||  |||| || |||||||||||||||  |    
T  58093 ttataactaaaaagtgaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagttggtgttttctagcaaatcctataggca 57994  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  57993 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaaatggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 57894  T
Q  203 attttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    | |  ||||||||||||| |||  || |||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  57893 actcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccccatatatatatatat 57839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 58142 - 58056
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  58142 atttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagtta-taactaaaaagtgaataaatacaccttaaggtgta 58056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 26051 - 26305
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||||| ||||||||| |||||  |    
T  26051 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcttataggca 26150  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaac 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26151 tttgctagaatacacccacttatattttagaatgagtattttagcaaataaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac 26250  T
Q  203 attttcacataaaaactaatggacgtcttctaggaaacctcgtatatgtatatat 257  Q
    | |  ||||||||||||| |||  || ||||||  |||| | ||||| |||||||    
T  26251 actcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcgaaccccatatatatatatat 26305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 2928 - 2767
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||| ||||||  |    
T  2928 ttataactaaaaagttaataaatacatcttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaattctataggca 2829  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 164  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2828 tttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgtataactaaaaa 2767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 14983 - 14822
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnt-aagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||         ||||| ||||||| |||||||| ||||||  |    
T  14983 ttataactaaaaagttaataaatacatcttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaattctataggca 14884  T
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 164  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14883 tttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgtataactaaaaa 14822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Original strand, 20620 - 20830
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||       |||||| |||| |  |||||| ||||||||  |||    
T  20620 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 20719  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     
T  20720 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtatgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtatc-ttgctaaaacac 20817  T
Q  205 tttcacataaaaa 217  Q
    |  ||||||||||    
T  20818 tcccacataaaaa 20830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 9733 - 9946
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| | || |  |||||| ||||||||  |||    
T  9733 tataactaaaaagttgttaaatacacctcaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggcgtatgttagcaactcctataggcatt 9832  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     
T  9833 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 9930  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |   ||||||||||||    
T  9931 tcctacataaaaacta 9946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5878 - 5696
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       |||||| ||||    |||||| ||||||||| |||    
T  5878 tataactaaaaagttgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagtgggtgtaagttagcaactcctatagacatt 5780  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  5779 tgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatataccttaaggtgta 5696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 149
Target Start/End: Original strand, 5803 - 5839
Alignment:
Q  113 tacacccacttattttttagaaggagtattttagcaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5803 tacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa 5839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4254 - 4043
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       ||||||  ||| |  |||||| |||||||   |||    
T  4254 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taagtggatgtatgttagcaactcctataagcatt 4156  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  4155 tgcta-aatacacccacttattttttagaaggtgtgtttgagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaac-ttgctaaaacac 4059  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    |   ||||||||||||    
T  4058 tcctacataaaaacta 4043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 22624 - 22830
Alignment:
Q  12 aaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatttgctaga 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |        ||||| |||| |  |||||| |  ||||    |||| ||||    
T  22624 aaaaagttaataaatacaccttgaggtgtatgttgctataacacacttt-tgaaaaaacaagtgggtgtatgttagcaagttttatatgtgtttgttaga 22722  T
Q  112 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacattttcaca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||| || ||||    
T  22723 atacacccacttattttttagaaggagtcatttggtaagtgaataattaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagc-ttgctaaaacacttccaca 22821  T
Q  212 taaaaacta 220  Q
    || ||||||    
T  22822 tagaaacta 22830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6734 - 6522
Alignment:
Q  5 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnntaagtgagtgtgttatagcaaatcctatagaaatt 104  Q
    ||||| |||||||||  |||||| || || | ||| ||||||||| ||||||||||||       ||| || ||||||  |||||| ||||||||  |||    
T  6734 tataactaaaaagttgttaaatatactttgaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taattgggtgtgtgttagcaactcctataggcatt 6636  T
Q  105 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacat 204  Q
    |||||| ||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||||||||||     
T  6635 tgctaggatacatctatttattttttagaaggtgtattttagcaagt-tataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacac 6538  T
Q  205 tttcacataaaaacta 220  Q
    || |||||||||||||    
T  6537 ttccacataaaaacta 6522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Original strand, 82742 - 82800
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  82742 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 82800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 680 - 577
Alignment:
Q  85 tagcaaatcctatagaaatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 184  Q
    |||||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||   ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  680 tagcaactcctataggcattttctaggatacacccacttatttttcagaaggtatgttttagcaag-ctataactaaaaagtagttaaaaacaccttaag 582  T
Q  185 atgta 189  Q
     ||||    
T  581 gtgta 577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 809 - 725
Alignment:
Q  103 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatg 187  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||   |||| || |||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  809 tttgctagaatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaattacaccttaagatg 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 14928 - 14872
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacacctt 60  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14928 ttataactaaaaagttattaaacacaccttactgtgtatgttgctataacacacctt 14872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0778 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0778
Description:

Target: scaffold0778; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Original strand, 6271 - 6313
Alignment:
Q  4 ttataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttg 46  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6271 ttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttg 6313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0778; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Original strand, 6222 - 6308
Alignment:
Q  102 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgta 189  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  6222 atttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 6308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University