View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10383_low_4 (Length: 394)

Name: NF10383_low_4
Description: NF10383
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10383_low_4
NF10383_low_4
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (17-384)||(20346328-20346694)
chr7 (179-384)||(4477311-4477515)
chr7 (176-384)||(6394750-6394957)
chr7 (178-384)||(5280861-5281066)
chr7 (176-384)||(12097580-12097787)
chr7 (176-384)||(24792322-24792529)
chr7 (176-384)||(30181014-30181221)
chr7 (176-384)||(43067963-43068170)
chr7 (176-384)||(42204153-42204361)
chr7 (176-384)||(12101168-12101375)
chr7 (176-384)||(33359080-33359287)
chr7 (176-384)||(42964986-42965193)
chr7 (178-382)||(3511324-3511527)
chr7 (176-384)||(22649684-22649891)
chr7 (177-384)||(7164184-7164390)
chr7 (176-384)||(15655911-15656118)
chr7 (176-384)||(933284-933491)
chr7 (180-384)||(1803029-1803232)
chr7 (182-382)||(43156718-43156917)
chr7 (176-383)||(36890821-36891026)
chr7 (178-384)||(9452591-9452796)
chr7 (179-384)||(42673467-42673667)
chr7 (176-384)||(25748486-25748693)
chr7 (176-384)||(33846519-33846721)
chr7 (175-384)||(8630664-8630872)
chr7 (176-384)||(4347272-4347478)
chr7 (176-384)||(32041541-32041748)
chr7 (171-384)||(38866538-38866750)
chr7 (177-384)||(46134294-46134500)
chr7 (177-384)||(17753600-17753806)
chr7 (178-384)||(46891329-46891535)
chr7 (176-384)||(43021570-43021773)
chr7 (212-382)||(48865665-48865837)
chr7 (176-384)||(16894497-16894694)
chr7 (176-323)||(19828269-19828415)
chr7 (176-273)||(37704979-37705075)
chr7 (179-328)||(37005857-37006005)
chr7 (168-287)||(43405010-43405129)
chr7 (182-267)||(27691433-27691517)
chr7 (176-232)||(30075369-30075425)
chr7 (176-311)||(36849600-36849734)
chr7 (180-240)||(15655545-15655605)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (170-384)||(39206580-39206793)
chr8 (176-383)||(39218777-39218983)
chr8 (176-384)||(14422703-14422910)
chr8 (175-384)||(34842365-34842573)
chr8 (176-384)||(18594537-18594744)
chr8 (180-382)||(2042526-2042727)
chr8 (176-384)||(24113166-24113373)
chr8 (176-384)||(29938061-29938268)
chr8 (173-384)||(13110401-13110611)
chr8 (179-384)||(144397-144601)
chr8 (180-384)||(10836755-10836958)
chr8 (176-384)||(22260630-22260837)
chr8 (176-384)||(33278400-33278607)
chr8 (176-384)||(35118031-35118238)
chr8 (177-384)||(7791412-7791618)
chr8 (176-384)||(6144273-6144480)
chr8 (180-384)||(7774768-7774971)
chr8 (179-383)||(41575516-41575719)
chr8 (181-384)||(34679457-34679659)
chr8 (176-383)||(4035847-4036053)
chr8 (178-384)||(34998896-34999101)
chr8 (176-384)||(5320564-5320771)
chr8 (176-384)||(7811995-7812202)
chr8 (176-380)||(38167159-38167362)
chr8 (182-383)||(44804945-44805145)
chr8 (179-383)||(66180-66384)
chr8 (176-384)||(36491157-36491364)
chr8 (178-384)||(8021721-8021918)
chr8 (180-384)||(42571598-42571798)
chr8 (176-333)||(40117903-40118059)
chr8 (178-381)||(28639280-28639484)
chr8 (176-333)||(33287076-33287232)
chr8 (180-316)||(26783801-26783936)
chr8 (256-381)||(9807339-9807464)
chr8 (176-328)||(2322068-2322219)
chr8 (181-273)||(5005171-5005262)
chr8 (178-264)||(9806875-9806960)
chr8 (178-273)||(39220258-39220352)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (176-384)||(27679169-27679376)
chr5 (176-384)||(9008057-9008264)
chr5 (176-381)||(1579037-1579241)
chr5 (176-381)||(1605574-1605778)
chr5 (176-384)||(33491196-33491403)
chr5 (181-384)||(3386486-3386688)
chr5 (178-384)||(16069356-16069561)
chr5 (179-384)||(24105671-24105875)
chr5 (180-384)||(16737447-16737650)
chr5 (176-380)||(27420859-27421062)
chr5 (179-384)||(31883148-31883352)
chr5 (176-383)||(5202973-5203179)
chr5 (176-384)||(4120938-4121145)
chr5 (176-384)||(8374339-8374545)
chr5 (176-384)||(19358527-19358734)
chr5 (176-384)||(38598450-38598657)
chr5 (176-384)||(35782644-35782851)
chr5 (176-384)||(20992146-20992353)
chr5 (176-384)||(33991141-33991348)
chr5 (182-381)||(1165604-1165802)
chr5 (178-384)||(3921584-3921789)
chr5 (180-381)||(31410481-31410681)
chr5 (176-384)||(26602942-26603139)
chr5 (220-384)||(27025001-27025164)
chr5 (176-311)||(20992354-20992492)
chr5 (183-317)||(33284642-33284775)
chr5 (326-384)||(35420424-35420482)
chr5 (181-230)||(12425685-12425733)
chr5 (187-311)||(31638157-31638280)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (176-379)||(22956-23158)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (167-384)||(1168492-1168708)
chr1 (176-384)||(52753147-52753354)
chr1 (178-383)||(8079710-8079914)
chr1 (176-384)||(25897372-25897579)
chr1 (176-384)||(39260346-39260553)
chr1 (177-384)||(26663257-26663463)
chr1 (181-383)||(29078519-29078720)
chr1 (176-384)||(20089469-20089676)
chr1 (176-384)||(33510482-33510689)
chr1 (176-384)||(970524-970733)
chr1 (176-383)||(16052094-16052300)
chr1 (176-384)||(29288147-29288352)
chr1 (176-384)||(26580270-26580477)
chr1 (176-384)||(32671577-32671784)
chr1 (179-384)||(46409436-46409642)
chr1 (176-384)||(52696789-52696996)
chr1 (181-384)||(38829072-38829274)
chr1 (178-384)||(19715161-19715366)
chr1 (176-384)||(1940747-1940954)
chr1 (176-384)||(41928495-41928702)
chr1 (176-384)||(42370795-42371002)
chr1 (177-384)||(5215384-5215590)
chr1 (176-381)||(1170447-1170651)
chr1 (179-384)||(8120870-8121074)
chr1 (176-384)||(2347654-2347862)
chr1 (179-384)||(43905655-43905859)
chr1 (178-383)||(46760966-46761170)
chr1 (176-384)||(12682818-12683025)
chr1 (176-384)||(17591689-17591893)
chr1 (176-384)||(15203110-15203317)
chr1 (178-381)||(2473722-2473924)
chr1 (176-384)||(51359217-51359423)
chr1 (178-384)||(7145207-7145412)
chr1 (176-384)||(13996723-13996930)
chr1 (179-384)||(49146173-49146377)
chr1 (176-384)||(40092489-40092696)
chr1 (177-379)||(6765458-6765659)
chr1 (176-384)||(23498458-23498665)
chr1 (176-384)||(15554152-15554351)
chr1 (194-384)||(17587505-17587694)
chr1 (180-381)||(15717787-15717986)
chr1 (212-384)||(40149497-40149668)
chr1 (176-345)||(29695673-29695842)
chr1 (179-383)||(38171833-38172023)
chr1 (170-301)||(52086259-52086389)
chr1 (191-311)||(23322913-23323032)
chr1 (176-249)||(5675103-5675176)
chr1 (180-231)||(5217935-5217986)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (176-384)||(26946876-26947083)
chr6 (176-384)||(2837545-2837752)
chr6 (176-384)||(6086599-6086806)
chr6 (179-384)||(34887292-34887496)
chr6 (176-384)||(3347523-3347730)
chr6 (176-384)||(26704339-26704546)
chr6 (180-384)||(30691855-30692058)
chr6 (169-384)||(17261073-17261287)
chr6 (176-384)||(9459563-9459770)
chr6 (176-384)||(20726791-20726994)
chr6 (176-384)||(21893455-21893662)
chr6 (177-384)||(3955769-3955972)
chr6 (176-384)||(11167240-11167447)
chr6 (176-384)||(18613538-18613745)
chr6 (176-383)||(35198284-35198489)
chr6 (178-384)||(28199508-28199714)
chr6 (186-384)||(1153603-1153800)
chr6 (176-377)||(16307015-16307215)
chr6 (176-340)||(52836-52999)
chr6 (180-379)||(30698934-30699132)
chr6 (249-384)||(33464401-33464536)
chr6 (270-384)||(53001-53115)
chr6 (178-250)||(33463703-33463775)
[»] chr4 (61 HSPs)
chr4 (176-384)||(54189543-54189750)
chr4 (177-384)||(1756752-1756958)
chr4 (176-384)||(19913618-19913825)
chr4 (176-382)||(23776449-23776654)
chr4 (167-384)||(53717452-53717668)
chr4 (176-384)||(28032700-28032907)
chr4 (176-384)||(38055155-38055362)
chr4 (176-383)||(37968746-37968952)
chr4 (176-375)||(50055098-50055296)
chr4 (177-384)||(54412627-54412833)
chr4 (170-384)||(2481396-2481609)
chr4 (174-384)||(11639566-11639775)
chr4 (178-383)||(20877047-20877251)
chr4 (179-384)||(53875658-53875862)
chr4 (180-384)||(15241016-15241219)
chr4 (176-384)||(27488636-27488843)
chr4 (176-384)||(45424522-45424729)
chr4 (178-384)||(1617084-1617289)
chr4 (178-384)||(35490761-35490966)
chr4 (175-384)||(40428708-40428916)
chr4 (176-384)||(6611348-6611555)
chr4 (176-384)||(37464719-37464926)
chr4 (176-384)||(44784905-44785112)
chr4 (176-384)||(50353799-50354006)
chr4 (178-381)||(30423556-30423757)
chr4 (176-382)||(48909844-48910049)
chr4 (179-384)||(16700782-16700986)
chr4 (176-384)||(47632032-47632240)
chr4 (176-384)||(14987790-14987997)
chr4 (178-384)||(31969681-31969886)
chr4 (179-381)||(43289951-43290152)
chr4 (176-384)||(6688615-6688816)
chr4 (176-381)||(23704200-23704404)
chr4 (179-384)||(19164961-19165164)
chr4 (176-385)||(8932165-8932373)
chr4 (170-384)||(27536092-27536301)
chr4 (176-384)||(15669181-15669388)
chr4 (178-381)||(52139203-52139405)
chr4 (178-384)||(8591080-8591285)
chr4 (179-384)||(30171581-30171785)
chr4 (187-384)||(33703850-33704046)
chr4 (176-383)||(53353053-53353267)
chr4 (176-384)||(44379175-44379382)
chr4 (171-384)||(27583620-27583832)
chr4 (176-384)||(55344813-55345020)
chr4 (181-350)||(28360433-28360602)
chr4 (187-384)||(38071314-38071504)
chr4 (182-384)||(40680026-40680227)
chr4 (177-375)||(44375844-44376041)
chr4 (176-328)||(50053441-50053592)
chr4 (256-384)||(23269034-23269162)
chr4 (200-381)||(16703843-16704023)
chr4 (178-264)||(23265865-23265950)
chr4 (297-384)||(53408137-53408225)
chr4 (321-384)||(23261874-23261937)
chr4 (176-249)||(44548263-44548337)
chr4 (331-384)||(9595890-9595943)
chr4 (176-231)||(9595975-9596029)
chr4 (318-384)||(48748197-48748263)
chr4 (335-384)||(50055301-50055350)
chr4 (252-327)||(51780763-51780838)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (176-384)||(37698129-37698336)
chr3 (176-384)||(15520128-15520335)
chr3 (176-384)||(22174976-22175183)
chr3 (176-384)||(25999383-25999590)
chr3 (176-384)||(54534314-54534519)
chr3 (176-383)||(42307892-42308098)
chr3 (176-384)||(8042602-8042809)
chr3 (176-384)||(50528924-50529131)
chr3 (177-384)||(38856089-38856295)
chr3 (176-384)||(20842334-20842541)
chr3 (176-383)||(46452149-46452355)
chr3 (178-379)||(32244117-32244317)
chr3 (176-384)||(25494271-25494478)
chr3 (176-384)||(38933941-38934147)
chr3 (176-383)||(15520631-15520837)
chr3 (176-383)||(20699144-20699350)
chr3 (181-384)||(21581042-21581244)
chr3 (170-383)||(24835686-24835898)
chr3 (176-384)||(29445483-29445690)
chr3 (176-384)||(54870160-54870367)
chr3 (176-384)||(12117644-12117851)
chr3 (176-384)||(35226442-35226649)
chr3 (181-384)||(44609319-44609521)
chr3 (178-384)||(32359256-32359461)
chr3 (176-384)||(2895180-2895391)
chr3 (176-383)||(26122809-26123015)
chr3 (185-384)||(42104957-42105155)
chr3 (181-384)||(48924989-48925189)
chr3 (176-384)||(34700336-34700543)
chr3 (176-384)||(53028220-53028419)
chr3 (176-383)||(44688761-44688961)
chr3 (174-334)||(35643210-35643369)
chr3 (214-384)||(16354379-16354548)
chr3 (181-304)||(50529839-50529961)
chr3 (204-381)||(12915930-12916105)
chr3 (296-383)||(24366143-24366230)
chr3 (176-310)||(49128044-49128177)
chr3 (306-384)||(13696917-13696995)
chr3 (176-231)||(24366087-24366142)
chr3 (336-384)||(50528868-50528916)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (176-384)||(36703-36910)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (180-384)||(3873244-3873447)
chr2 (176-384)||(18806884-18807091)
chr2 (176-384)||(31517215-31517422)
chr2 (176-384)||(6174828-6175035)
chr2 (176-384)||(33906047-33906254)
chr2 (176-384)||(26323186-26323393)
chr2 (176-363)||(1108278-1108463)
chr2 (176-383)||(39635450-39635656)
chr2 (178-384)||(4016039-4016244)
chr2 (179-384)||(42937720-42937925)
chr2 (179-384)||(1482903-1483106)
chr2 (172-384)||(28329839-28330048)
chr2 (176-384)||(4232142-4232349)
chr2 (176-384)||(5733397-5733604)
chr2 (178-384)||(850997-851202)
chr2 (176-384)||(2178769-2178976)
chr2 (176-379)||(19901143-19901344)
chr2 (192-381)||(19383938-19384126)
chr2 (176-384)||(30270679-30270886)
chr2 (179-384)||(16588776-16588980)
chr2 (182-376)||(16066302-16066495)
chr2 (177-382)||(30420181-30420373)
chr2 (166-384)||(44947549-44947759)
chr2 (179-380)||(429817-430017)
chr2 (176-328)||(42446625-42446776)
chr2 (179-328)||(3585291-3585439)
chr2 (176-321)||(22101210-22101353)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (174-384)||(3706-3915)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (176-384)||(10236-10443)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (177-384)||(295-501)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (176-384)||(6-213)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (178-383)||(145246-145450)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (178-384)||(6-212)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 384
Target Start/End: Original strand, 20346328 - 20346694
Alignment:
Q  17 atatgtatatagcactttctcaatcaaatgatccatttaaaattacaagccaaacaaaaattaagtgtgaaaatagaaacatcgacacagtgcaataaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20346328 atatgtatatagcactttctcaatcaaatgatccatttaaaattacaagccaaacaaaaattaagtgtgaaaatagaaacatcgacacagtgcaataaaa 20346427  T
Q  117 tttatatatagtcatccaaagcaaatatttatgttaagttcctcactaaccataattaagccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggctta 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20346428 tttatatatagtcaaccaaagcaaatatttatgttaagttcctcactaaccataattaagccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggctta 20346527  T
Q  217 tctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20346528 tctactctcataagcctttttaaaggtgttt-gggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaa 20346626  T
Q  317 attttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctctctg 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  20346627 attttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgaaacctccttcgattctctctg 20346694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 179 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4477515 - 4477311
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  4477515 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttcaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcatgg 4477417  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattc 378  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4477416 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 4477317  T
Q  379 tctctg 384  Q
    ||||||    
T  4477316 tctctg 4477311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 6394750 - 6394957
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  6394750 gccccgtttagattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgga-taaataaataaaaatagtttatca 6394848  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6394849 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 6394948  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  6394949 ttctctctg 6394957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 178 - 384
Target Start/End: Original strand, 5280861 - 5281066
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  5280861 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattcacataagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatcata 5280959  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  5280960 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 5281059  T
Q  378 ctctctg 384  Q
    |||||||    
T  5281060 ctctctg 5281066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12097787 - 12097580
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12097787 gccccatttggattggcttaagttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagattatca 12097689  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12097688 tagtttcataagctacttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 12097589  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  12097588 ttctctctg 12097580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24792529 - 24792322
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24792529 gccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 24792431  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24792430 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 24792331  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  24792330 ttctctctg 24792322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30181221 - 30181014
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30181221 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 30181123  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||    
T  30181122 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacccccttcga 30181023  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  30181022 ttctctctg 30181014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43068170 - 43067963
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  43068170 gccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 43068072  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  43068071 tagtttcataagcttcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 43067972  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  43067971 ttctctctg 43067963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 42204153 - 42204361
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagccttttt-aaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  42204153 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagtcttttttaaaggtgtttggg-taaataagtaaaaatagcttatc 42204251  T
Q  275 attgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcg 374  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  42204252 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcg 42204351  T
Q  375 attctctctg 384  Q
    ||||||||||    
T  42204352 attctctctg 42204361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12101375 - 12101168
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12101375 gccccatttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 12101277  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12101276 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctatggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 12101177  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  12101176 ttctctctg 12101168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33359287 - 33359080
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33359287 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttgaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 33359189  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  33359188 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 33359089  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  33359088 ttctctctg 33359080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 42965193 - 42964986
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  42965193 gccccttttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 42965095  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  42965094 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 42964995  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  42964994 ttctctctg 42964986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 178 - 382
Target Start/End: Original strand, 3511324 - 3511527
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||     
T  3511324 cccgtttggattgtcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaatagataaaaatagcttatcata 3511422  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3511423 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 3511522  T
Q  378 ctctc 382  Q
    |||||    
T  3511523 ctctc 3511527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22649891 - 22649684
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22649891 gccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatca 22649793  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  22649792 taatttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcga 22649693  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    || ||||||    
T  22649692 ttttctctg 22649684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 177 - 384
Target Start/End: Original strand, 7164184 - 7164390
Alignment:
Q  177 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7164184 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcat 7164282  T
Q  277 tgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgat 376  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  7164283 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgat 7164382  T
Q  377 tctctctg 384  Q
    ||| ||||    
T  7164383 tctatctg 7164390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 15655911 - 15656118
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  15655911 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctcgcataagcctttttgaaggtgtttggg-taaataaacaaaaacagcttatca 15656009  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15656010 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcga 15656109  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  15656110 ttctctctg 15656118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 933284 - 933491
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  933284 gccctgtttgaattggcttattttgagctcatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatca 933382  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  933383 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 933482  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
     ||||||||    
T  933483 atctctctg 933491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 180 - 384
Target Start/End: Original strand, 1803029 - 1803232
Alignment:
Q  180 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgt 279  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1803029 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttggg-taaataaataaaaatagcttatcatagt 1803127  T
Q  280 ttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattct 379  Q
    |||||||||| ||||| | |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1803128 ttcataagctgcttatacgatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 1803227  T
Q  380 ctctg 384  Q
    |||||    
T  1803228 ctctg 1803232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 182 - 382
Target Start/End: Original strand, 43156718 - 43156917
Alignment:
Q  182 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgttt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43156718 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcatagttt 43156816  T
Q  282 cataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctct 381  Q
    ||||||||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  43156817 cataagctgtttatggcaaatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagaacttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 43156916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 176 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 36891026 - 36890821
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  36891026 gccccgtttggattgacttattt-gagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 36890929  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  36890928 tagtttcataagttgcttatgccatatttcaataagcctaagttttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 36890829  T
Q  376 ttctctct 383  Q
    ||||||||    
T  36890828 ttctctct 36890821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 178 - 384
Target Start/End: Original strand, 9452591 - 9452796
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||     
T  9452591 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctattctcataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataagtaaaaatagtttatcata 9452689  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    ||||||||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9452690 gtttcataagctgtctatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 9452789  T
Q  378 ctctctg 384  Q
    |||||||    
T  9452790 ctctctg 9452796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 179 - 384
Target Start/End: Original strand, 42673467 - 42673667
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||| || ||||||| |    
T  42673467 ccgtttggattgacttatttggagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttggg-----taaataaaaacagcttatcatag 42673561  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattc 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  42673562 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 42673661  T
Q  379 tctctg 384  Q
    ||||||    
T  42673662 tctctg 42673667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 25748486 - 25748693
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25748486 gccccgtttggattggcttaagttgagcttatattagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 25748584  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25748585 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 25748684  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    || ||||||    
T  25748685 ttatctctg 25748693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33846721 - 33846519
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  33846721 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgttt-gggtaaataaataaaaatagcttatca 33846623  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | ||||||||| || |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  33846622 tagtttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta-----gggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 33846528  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  33846527 ttctctctg 33846519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 175 - 384
Target Start/End: Original strand, 8630664 - 8630872
Alignment:
Q  175 agccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatc 274  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8630664 agccccgtttggatttgtttattttgaggttatgtgggttgatctactcccataagcctttttaaaggtgttcggg-taaataaataaaaatagtttatc 8630762  T
Q  275 attgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcg 374  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||    
T  8630763 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaatccccttcg 8630862  T
Q  375 attctctctg 384  Q
    ||||||||||    
T  8630863 attctctctg 8630872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 4347272 - 4347478
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  4347272 gccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgggcttatctactcccataaacttttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttacca 4347370  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  4347371 tagtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctcgagcttaacaaggagcttatgaatttatgt-aaccccttcta 4347469  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  4347470 ttctctctg 4347478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 32041541 - 32041748
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  32041541 gccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 32041639  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||||    
T  32041640 tagtttcataagctgcttatgtcatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttataaatttatgtaaccttattcga 32041739  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  32041740 ttctctctg 32041748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 171 - 384
Target Start/End: Original strand, 38866538 - 38866750
Alignment:
Q  171 attaagccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagat 270  Q
    |||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  38866538 attaaggctcgtttggatcgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataattttttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtt 38866636  T
Q  271 tatcattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactcc 370  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  38866637 tatcatagtttcataagctgtttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 38866736  T
Q  371 ttcgattctctctg 384  Q
    ||||||| ||||||    
T  38866737 ttcgattatctctg 38866750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 177 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 46134500 - 46134294
Alignment:
Q  177 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcat 276  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  46134500 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcctataactctttttaaagatgtttggg-taaataaataaaaatagtttattat 46134402  T
Q  277 tgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgat 376  Q
     ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||    
T  46134401 agtttcataagctgtttacgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttattaatttatgtaacctcattcgat 46134302  T
Q  377 tctctctg 384  Q
    ||||||||    
T  46134301 tctctctg 46134294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 177 - 384
Target Start/End: Original strand, 17753600 - 17753806
Alignment:
Q  177 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcat 276  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  17753600 ccccgtttggattagcttattttgagcttatacaagcttatctactcctataagccttttagaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttaacat 17753698  T
Q  277 tgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgat 376  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17753699 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttacccttcaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgat 17753798  T
Q  377 tctctctg 384  Q
    ||||||||    
T  17753799 tctctctg 17753806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 178 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 46891535 - 46891329
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagccttttt-aaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  46891535 cccgtttggattggcttattttgagcttatataggcttatctactcctataaaccttttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttgtcat 46891437  T
Q  277 tgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgat 376  Q
     |||| ||||||| |||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  46891436 agttttataagctgcttatgtcatattttaattagcctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctccttcgat 46891337  T
Q  377 tctctctg 384  Q
    | ||||||    
T  46891336 tgtctctg 46891329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43021773 - 43021570
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||   ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||| |    
T  43021773 gccccatttggattggcttattttaagtttatgtggacttatctacttcaataagtctttttaaagatgttt-gggtaaataaataaaaataacttatta 43021675  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||     ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  43021674 tagtttcataagctgcttatggcatatttc----ggtctaaattttcagcttactctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 43021579  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  43021578 ttctctctg 43021570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 212 - 382
Target Start/End: Original strand, 48865665 - 48865837
Alignment:
Q  212 gcttatctactctcataagccttttt---aaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtttcataagctacttatgccatatttcaat 308  Q
    |||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  48865665 gcttatctacttccataagccttttttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaat 48865763  T
Q  309 aagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctctc 382  Q
    ||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  48865764 aagcctaaattttcagcttaacatcaggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 48865837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16894694 - 16894497
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  16894694 gccccgtttggattggcttattttgagcttat----------ctactcccataagcttttttaaaggtatttggg-taaacaaataaaaatagtttatca 16894606  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  16894605 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcaacttaacagggagcttatgaatttatgtaacatccttcga 16894506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 176 - 323
Target Start/End: Original strand, 19828269 - 19828415
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  19828269 gccccgtttgaattggcttattttgagtttatgttggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgttt-ggctaaataaataaaaatagcttatca 19828367  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttca 323  Q
    | |||||||||  | |||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  19828368 tagtttcataaattgcttatgccatattttaataagccaaaattttca 19828415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 176 - 273
Target Start/End: Original strand, 37704979 - 37705075
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattat 273  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  37704979 gccccgtttgggttgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgttt-gggtaaataaataaaaatagcttat 37705075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 179 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37006005 - 37005857
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||   |||||  |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||| |      
T  37006005 ccgtttggattggcttattttaagcttatgtgagtttatctacttctataagtttttttaaaggcgttt-gggtaaatcagtaaaaatagcttatcgtaa 37005907  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagctta 328  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||    
T  37005906 tttcataagctgcttatgctatattttaataaggctaattttttagctta 37005857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 287
Target Start/End: Original strand, 43405010 - 43405129
Alignment:
Q  168 ataattaag-ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaat 266  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  43405010 ataattaaggccccgtttgaattgacttattttaagcttatgttggcttatctactcctataagtctttttaaaggcgttt-gggtaaatcaataaaaat 43405108  T
Q  267 agattatcattgtttcataag 287  Q
    || ||||| |  |||||||||    
T  43405109 agcttatcgtaatttcataag 43405129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27691517 - 27691433
Alignment:
Q  182 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaata 267  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27691517 tttgaattggtttattttgaatttatatgggcttatctactcccataaatctttttaaagatgttt-gggtaaataaataaaaata 27691433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30075425 - 30075369
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcc 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||  ||||||||    
T  30075425 gccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgagtttatctactaacataagcc 30075369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36849734 - 36849600
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||||| || ||||||  |||| |  ||||||||||||||| || ||||| |||||||  || ||||||    
T  36849734 gccccgtttggattgacttattcgaagcttatgtgggtttgtctactaacatatgtttttttaaaggtgttt-ggataaatcaataaaatcagcttatca 36849636  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataag 311  Q
       |||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||    
T  36849635 caatttcataaactgtttatgtcatattttaataag 36849600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15655605 - 15655545
Alignment:
Q  180 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaa 240  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||| |||| ||||||  |||||| |||||||||    
T  15655605 cgtttggattggcttattctaaacttatgtgagcttgtctactaacataagtctttttaaa 15655545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 170 - 384
Target Start/End: Original strand, 39206580 - 39206793
Alignment:
Q  170 aattaagccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaataga 269  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  39206580 aattaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagc 39206678  T
Q  270 ttatcattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactc 369  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  39206679 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 39206778  T
Q  370 cttcgattctctctg 384  Q
    |||||||||||||||    
T  39206779 cttcgattctctctg 39206793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 176 - 383
Target Start/End: Original strand, 39218777 - 39218983
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  39218777 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatggtttatca 39218875  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  39218876 tagcttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctgatgaatttatgtgacctccttcga 39218975  T
Q  376 ttctctct 383  Q
    ||||||||    
T  39218976 ttctctct 39218983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 14422703 - 14422910
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14422703 gccccgtttggattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 14422801  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14422802 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 14422901  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  14422902 ttctctctg 14422910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 175 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34842573 - 34842365
Alignment:
Q  175 agccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34842573 agccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatc 34842475  T
Q  275 attgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcg 374  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34842474 atagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaatttccagcttacccaccgtcttaacaaggagcttattaatttatgtgacctccttcg 34842375  T
Q  375 attctctctg 384  Q
    ||||||||||    
T  34842374 attctctctg 34842365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 18594537 - 18594744
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18594537 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 18594635  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18594636 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 18594735  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  18594736 ttctctctg 18594744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 180 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 2042727 - 2042526
Alignment:
Q  180 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||    
T  2042727 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaacagcttatcatagt 2042629  T
Q  280 ttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattct 379  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  2042628 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 2042529  T
Q  380 ctc 382  Q
    |||    
T  2042528 ctc 2042526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24113373 - 24113166
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24113373 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaccctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaacagattatca 24113275  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24113274 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 24113175  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  24113174 ttctctctg 24113166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 29938061 - 29938268
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  29938061 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataagtaaaaatagcttatca 29938159  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29938160 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 29938259  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  29938260 ttctctctg 29938268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 173 - 384
Target Start/End: Original strand, 13110401 - 13110611
Alignment:
Q  173 taagccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagatta 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  13110401 taaggcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatatgcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagctta 13110499  T
Q  273 tcattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactcctt 372  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  13110500 tcatagtttaataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctcctt 13110599  T
Q  373 cgattctctctg 384  Q
    ||||||||||||    
T  13110600 cgattctctctg 13110611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 179 - 384
Target Start/End: Original strand, 144397 - 144601
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  144397 ccgtttggattgacttattttgagcatatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taagtaaataaaaatagtttatcatag 144495  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattc 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  144496 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 144595  T
Q  379 tctctg 384  Q
    ||||||    
T  144596 tctctg 144601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 180 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10836958 - 10836755
Alignment:
Q  180 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10836958 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatcatagt 10836860  T
Q  280 ttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattct 379  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  10836859 ttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattat 10836760  T
Q  380 ctctg 384  Q
    |||||    
T  10836759 ctctg 10836755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22260837 - 22260630
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  22260837 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagtctttttaaaggcgtttggg-taaatcaataaaaatagcttatcc 22260739  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22260738 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 22260639  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  22260638 ttctctctg 22260630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 33278400 - 33278607
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  33278400 gccccgtttggattggcttattttgagtttatatggacttatctactttcataagtctttttaaaggtgtttgga-taaataaataaaaatagtttatca 33278498  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  33278499 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 33278598  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  33278599 ttctctctg 33278607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 35118238 - 35118031
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  35118238 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagccttttgaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 35118140  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  35118139 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcattcga 35118040  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  35118039 ttctctctg 35118031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 177 - 384
Target Start/End: Original strand, 7791412 - 7791618
Alignment:
Q  177 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7791412 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagattatcat 7791510  T
Q  277 tgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgat 376  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7791511 agtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 7791610  T
Q  377 tctctctg 384  Q
    ||||||||    
T  7791611 tctctctg 7791618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6144480 - 6144273
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6144480 gccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccatatgcctttttaacagtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 6144382  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6144381 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 6144282  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  6144281 ttctctctg 6144273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 180 - 384
Target Start/End: Original strand, 7774768 - 7774971
Alignment:
Q  180 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgt 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7774768 cgtttagattggcttattttgagcttatgcgggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagattatcatagt 7774866  T
Q  280 ttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattct 379  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  7774867 ttcataagctgcttatgtcatattttattaagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 7774966  T
Q  380 ctctg 384  Q
    |||||    
T  7774967 ctctg 7774971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 179 - 383
Target Start/End: Original strand, 41575516 - 41575719
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |    
T  41575516 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtagacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgga-taaataaataaaaattgcttatcatag 41575614  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattc 378  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  41575615 tttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattc 41575714  T
Q  379 tctct 383  Q
    |||||    
T  41575715 tctct 41575719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 181 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34679659 - 34679457
Alignment:
Q  181 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtt 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  34679659 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgaa-taaataaataaaaatagtttatcatagtt 34679561  T
Q  281 tcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctc 380  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  34679560 tcataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctt 34679461  T
Q  381 tctg 384  Q
    ||||    
T  34679460 tctg 34679457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 176 - 383
Target Start/End: Original strand, 4035847 - 4036053
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  4035847 gccccgtttggattggtttatttttagcttatatgggcttatctactcccataagttttattaaaggtgtttggg-taaacaaataaaaatagcttatca 4035945  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  4035946 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 4036045  T
Q  376 ttctctct 383  Q
    ||||||||    
T  4036046 ttctctct 4036053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 178 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34999101 - 34998896
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |     
T  34999101 cccgtatggattggcttattttgagcttatacgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatctta 34999003  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  34999002 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttgccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatttaatctccttcgatt 34998903  T
Q  378 ctctctg 384  Q
    |||||||    
T  34998902 ctctctg 34998896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 5320564 - 5320771
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||||    
T  5320564 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaagttgttttgg-taaataaataaaaataatttatca 5320662  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||| | |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5320663 tagtttcataagttgcttatgtcatgtttcaataagcctaaattttcaacttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 5320762  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  5320763 ttctctctg 5320771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 7811995 - 7812202
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||  ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7811995 gccccgttttgattggcttattttgagtttatgtgagtttatctacttccattagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagattatca 7812093  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  7812094 tagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcga 7812193  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  7812194 ttctctctg 7812202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 176 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 38167362 - 38167159
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  38167362 gccctgtttggattggcctattttgagtttatgtgggcttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaactagtttatca 38167264  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  38167263 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcga 38167164  T
Q  376 ttctc 380  Q
    |||||    
T  38167163 ttctc 38167159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 182 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 44805145 - 44804945
Alignment:
Q  182 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgttt 281  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  44805145 tttgaattggcttattttgagcttatgtaggtttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttaga-taaataaataaaaatagcttatcatagttt 44805047  T
Q  282 cataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctct 381  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  44805046 cataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 44804947  T
Q  382 ct 383  Q
    ||    
T  44804946 ct 44804945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 179 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 66384 - 66180
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| || |||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |    
T  66384 ccgtttagattggcttattttgagtttctgtaggcttatctattcccatatgtctttttaaaagtgtttggg-taaataaataaaaataacttataatag 66286  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccc-tccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  66285 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagtttaaattttcagcttaccctttcggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctccttcgatt 66186  T
Q  378 ctctct 383  Q
    ||||||    
T  66185 ctctct 66180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 36491157 - 36491364
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  36491157 gccccatttggattggcttattttaagcttatgtgggattatctaatcgcataagtctttttgaaggtgtttggg-taaataaataaaaacagcttatca 36491255  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||  |  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  36491256 tagtttcataacttgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctctttcga 36491355  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  36491356 ttctctctg 36491364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 178 - 384
Target Start/End: Original strand, 8021721 - 8021918
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  8021721 cccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgttt-gggtaaataaataaaaatagtttatcata 8021819  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||        |||||||||||||||||||||||| ||||| | | || ||||||||    
T  8021820 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttca--------tccggcttaacaaggagcttatgagtttatataacctacttcgatt 8021911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 180 - 384
Target Start/End: Original strand, 42571598 - 42571798
Alignment:
Q  180 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  42571598 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaagtgttt-gggtaaat-aataaaaatagcttatcatagt 42571695  T
Q  280 ttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattct 379  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||    
T  42571696 ttcataagctgcttatgtcatatttcaat--gcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaaggaacttatgaatttatgcaacctctttcgattct 42571793  T
Q  380 ctctg 384  Q
    |||||    
T  42571794 ctctg 42571798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 176 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 40118059 - 40117903
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  40118059 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgttt-gggtaaataaataaaaatagcttatca 40117961  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctc 333  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  40117960 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagcttaccctc 40117903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 178 - 381
Target Start/End: Original strand, 28639280 - 28639484
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcata----agcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattat 273  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||    ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  28639280 cccgtttgaattggcttattttaagcttatgtgagcttatctactcctatatacaagcttttttaaaggtgttttgg-taaataaataaaaatagtttat 28639378  T
Q  274 cattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttc 373  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | |||||||    
T  28639379 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacatagagcttatga--ttatgtaacctccttc 28639476  T
Q  374 gattctct 381  Q
    ||||||||    
T  28639477 gattctct 28639484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 176 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 33287232 - 33287076
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  33287232 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccatatgcttttttaaaggtgtttgga-taaataaataaaaatagtttatca 33287134  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctc 333  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33287133 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc 33287076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 180 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26783936 - 26783801
Alignment:
Q  180 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  26783936 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgttt-gggtaaataaataaatatagcttatcatagt 26783838  T
Q  280 ttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaa 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  26783837 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 26783801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 256 - 381
Target Start/End: Original strand, 9807339 - 9807464
Alignment:
Q  256 taaataaaaatagattatcattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 355  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9807339 taaataaaaatagcttatcatagcttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatga 9807438  T
Q  356 atttatgtgaactccttcgattctct 381  Q
    |||||||  | |||||||| ||||||    
T  9807439 atttatgaaacctccttcgtttctct 9807464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 176 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 2322219 - 2322068
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||  |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  2322219 gccccgtttggattggcttattcggagcttatatggatttatctactaacataagcttttttaaaggtgttt-gggtaaatcaataaaaacagcttatca 2322121  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagctta 328  Q
       ||||||||||| |||||  |||||||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  2322120 caatttcataagctgcttatatcatattttgataagcctaaattttaagctta 2322068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 273
Target Start/End: Original strand, 5005171 - 5005262
Alignment:
Q  181 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattat 273  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  5005171 gtttggattggcttatcttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggcgttt-gggtaaatcaataaaaatagcttat 5005262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 178 - 264
Target Start/End: Original strand, 9806875 - 9806960
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaa 264  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9806875 cccgtttggattgacttattttgagtttatatgtgcttatctactcccatatgcctttttaaatgtgttt-gggtaaataaataaaa 9806960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 273
Target Start/End: Original strand, 39220258 - 39220352
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattat 273  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||  |||||||||   |||| | |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  39220258 cccgtttgaattgacttattttgagcttatatgaacttatctacatccatatgtctttttaaaggtgttt-gagtaaatcaataaaaatagcttat 39220352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27679376 - 27679169
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27679376 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 27679278  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27679277 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcga 27679178  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  27679177 ttctctctg 27679169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9008264 - 9008057
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9008264 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 9008166  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  9008165 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcga 9008066  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  9008065 ttctctctg 9008057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 176 - 381
Target Start/End: Original strand, 1579037 - 1579241
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1579037 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatca 1579135  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1579136 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 1579235  T
Q  376 ttctct 381  Q
    ||||||    
T  1579236 ttctct 1579241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 176 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 1605778 - 1605574
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1605778 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatca 1605680  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1605679 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 1605580  T
Q  376 ttctct 381  Q
    ||||||    
T  1605579 ttctct 1605574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33491403 - 33491196
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33491403 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 33491305  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  33491304 tagtttcataagctgcttttgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 33491205  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  33491204 ttctctctg 33491196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 181 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3386688 - 3386486
Alignment:
Q  181 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtt 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  3386688 gtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcatagtt 3386590  T
Q  281 tcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctc 380  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  3386589 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcctatgaatttatgtaacctccttcgattatc 3386490  T
Q  381 tctg 384  Q
    ||||    
T  3386489 tctg 3386486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 178 - 384
Target Start/End: Original strand, 16069356 - 16069561
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||     
T  16069356 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgag-taaataaataaaaatagcttatcata 16069454  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16069455 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 16069554  T
Q  378 ctctctg 384  Q
    |||||||    
T  16069555 ctctctg 16069561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 179 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24105875 - 24105671
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  24105875 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcatag 24105777  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattc 378  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24105776 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattatcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 24105677  T
Q  379 tctctg 384  Q
    ||||||    
T  24105676 tctctg 24105671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 180 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16737650 - 16737447
Alignment:
Q  180 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgt 279  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16737650 cgtttgaattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcatagt 16737552  T
Q  280 ttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattct 379  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16737551 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 16737452  T
Q  380 ctctg 384  Q
    |||||    
T  16737451 ctctg 16737447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 176 - 380
Target Start/End: Original strand, 27420859 - 27421062
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  27420859 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgag-taaataaataaaaatagtttatca 27420957  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  27420958 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcga 27421057  T
Q  376 ttctc 380  Q
    |||||    
T  27421058 ttctc 27421062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 179 - 384
Target Start/End: Original strand, 31883148 - 31883352
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  31883148 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatcatag 31883246  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattc 378  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31883247 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 31883346  T
Q  379 tctctg 384  Q
    ||||||    
T  31883347 tctctg 31883352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 176 - 383
Target Start/End: Original strand, 5202973 - 5203179
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5202973 gccccgtttggattgacttattttgagtttatgttggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatca 5203071  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  5203072 tagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtcaccttcttcga 5203171  T
Q  376 ttctctct 383  Q
    ||||||||    
T  5203172 ttctctct 5203179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 4120938 - 4121145
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||    
T  4120938 gccccgtttggaatggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcccttttaaaggtgtttggg-taaataagtaaaaataatttatca 4121036  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  4121037 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttga 4121136  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  4121137 ttctctctg 4121145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 8374545 - 8374339
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  8374545 gccccgtttggattgccttattttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatca 8374447  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  8374446 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatg-atttatgtaacctccttcga 8374348  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  8374347 ttctctctg 8374339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 19358527 - 19358734
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19358527 gccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaagtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 19358625  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19358626 tagtttcataagctgcttatgccatattttagtaagcctaaattttcagcttaccctccaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcga 19358725  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  19358726 ttctctctg 19358734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 38598657 - 38598450
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  38598657 gcccggtttggattggcttactttgaacttatgtgagcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttggg-taaataagtaaaaatagcttatca 38598559  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  38598558 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcga 38598459  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  38598458 ttctctctg 38598450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 35782851 - 35782644
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  35782851 gccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 35782753  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccg-gcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcg 374  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  35782752 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcctaccctccgtgctta-caaggagcttatgaatttatgtaacctcattcg 35782654  T
Q  375 attctctctg 384  Q
    ||||||||||    
T  35782653 attctctctg 35782644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20992353 - 20992146
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  20992353 gccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtggtcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcatatca 20992255  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  20992254 tagtttcataagctgattatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcga 20992155  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  20992154 ttctctctg 20992146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 33991141 - 33991348
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33991141 gccccgtttgaattgacttattttgagtttatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 33991239  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  33991240 tagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcga 33991339  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  33991340 ttctctctg 33991348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 182 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 1165802 - 1165604
Alignment:
Q  182 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgttt 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1165802 tttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcatagttt 1165704  T
Q  282 cataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctct 381  Q
    |||||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1165703 cataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 1165604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 178 - 384
Target Start/End: Original strand, 3921584 - 3921789
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||     
T  3921584 cccgtttggattgatttattttgagtttatatgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgga-taaataaataaaaatagcttatcata 3921682  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3921683 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaaaaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 3921782  T
Q  378 ctctctg 384  Q
    |||||||    
T  3921783 ctctctg 3921789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 180 - 381
Target Start/End: Original strand, 31410481 - 31410681
Alignment:
Q  180 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgt 279  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  31410481 cgtttggattgatttattttgagtttatatgggtttatctacccccataagtctttttaaaggtgtttgag-taaacaaataaaaatagcttatcatagt 31410579  T
Q  280 ttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattct 379  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31410580 tttataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtgacctccttcgattct 31410679  T
Q  380 ct 381  Q
    ||    
T  31410680 ct 31410681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26603139 - 26602942
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26603139 gccccgtttggattggcttattttgagcttat----------ctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 26603051  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  26603050 tagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcataatttttcagtttactctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcga 26602951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Original strand, 27025001 - 27025164
Alignment:
Q  220 actctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaatt 319  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  27025001 actcccataagactttttaaagatgttcggg-taaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccattttttaataagcctaaatt 27025099  T
Q  320 ttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctctctg 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27025100 ttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttataaatttatgtaacctccttcgattctctctg 27025164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 176 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20992492 - 20992354
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgt----gggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagatt 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  20992492 gccctgtttggattggcttattttgagcttatgtacatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcat 20992394  T
Q  272 atcattgtttcataagctacttatgccatatttcaataag 311  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20992393 atcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataag 20992354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 183 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33284775 - 33284642
Alignment:
Q  183 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtttc 282  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  33284775 ttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgttt-aagtaaataaataaaaatagcttatcatagtttt 33284677  T
Q  283 ataagctacttatgccatatttcaataagtctaaa 317  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33284676 ataaactgcttataccatatttcaataagcctaaa 33284642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 326 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 35420482 - 35420424
Alignment:
Q  326 ttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctctctg 384  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  35420482 ttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 35420424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12425733 - 12425685
Alignment:
Q  181 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataag 230  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||    
T  12425733 gtttggattggcttattttga-cttatttgagcttatctactgtcataag 12425685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 311
Target Start/End: Original strand, 31638157 - 31638280
Alignment:
Q  187 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtttcataa 286  Q
    |||| ||||||||  | ||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||| |||||| || |||||  |||||||||  ||||||   ||| ||||    
T  31638157 attgacttattttatgtttatgtgagcttacctactaacataagcctttgtaaaagtgttt-ggataaatcgataaaaataacttatcacaattttataa 31638255  T
Q  287 gctacttatgccatatttcaataag 311  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||    
T  31638256 gcttcttatgtcatattttaataag 31638280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 176 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23158 - 22956
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23158 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 23060  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23059 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 22960  T
Q  376 ttct 379  Q
    ||||    
T  22959 ttct 22956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 167 - 384
Target Start/End: Original strand, 1168492 - 1168708
Alignment:
Q  167 cataattaagccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaat 266  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1168492 cataattaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaat 1168590  T
Q  267 agattatcattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaa 366  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  1168591 agcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaat 1168690  T
Q  367 ctccttcgattctctctg 384  Q
    |||||| |||||||||||    
T  1168691 ctcctttgattctctctg 1168708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 52753354 - 52753147
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  52753354 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 52753256  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  52753255 tagtttcataagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 52753156  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  52753155 ttctctctg 52753147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 178 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 8079914 - 8079710
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  8079914 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcata 8079816  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||    
T  8079815 gtttcataagctacttatgccatattttaataagcctaagttttcagcttaccctctggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcctttgatt 8079716  T
Q  378 ctctct 383  Q
    ||||||    
T  8079715 ctctct 8079710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 25897372 - 25897579
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25897372 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcatatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 25897470  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25897471 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 25897570  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  25897571 ttctctctg 25897579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 39260553 - 39260346
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  39260553 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 39260455  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  39260454 tagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 39260355  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  39260354 ttctctctg 39260346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 177 - 384
Target Start/End: Original strand, 26663257 - 26663463
Alignment:
Q  177 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  26663257 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgga-taaataaataaaaatagcttatcat 26663355  T
Q  277 tgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgat 376  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26663356 agtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 26663455  T
Q  377 tctctctg 384  Q
    ||||||||    
T  26663456 tctctctg 26663463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 181 - 383
Target Start/End: Original strand, 29078519 - 29078720
Alignment:
Q  181 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtt 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  29078519 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcatagtt 29078617  T
Q  281 tcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctc 380  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  29078618 tcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 29078717  T
Q  381 tct 383  Q
    |||    
T  29078718 tct 29078720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 20089469 - 20089676
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  20089469 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttagg-taaataaataaaaatagcttatca 20089567  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20089568 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 20089667  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  20089668 ttctctctg 20089676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 33510482 - 33510689
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  33510482 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgga-taaataaataaaaatagtttatca 33510580  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  33510581 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 33510680  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  33510681 ttctctctg 33510689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 970733 - 970524
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  970733 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagattatca 970635  T
Q  276 tt--gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttc 373  Q
    |   |||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  970634 tatagtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttc 970535  T
Q  374 gattctctctg 384  Q
    |||||||||||    
T  970534 gattctctctg 970524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 176 - 383
Target Start/End: Original strand, 16052094 - 16052300
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16052094 gccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 16052192  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16052193 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 16052292  T
Q  376 ttctctct 383  Q
    ||||||||    
T  16052293 ttctctct 16052300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 29288147 - 29288352
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29288147 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatca 29288245  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||    
T  29288246 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaa--tatgtaacctccttcga 29288343  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  29288344 ttctctctg 29288352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26580477 - 26580270
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  26580477 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taagtaaataaaaatagcttatca 26580379  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26580378 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 26580279  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    || ||||||    
T  26580278 ttatctctg 26580270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 32671577 - 32671784
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  32671577 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctactcccataagcctttttaaagatgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 32671675  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  32671676 tagtttcataagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcga 32671775  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  32671776 ttctctctg 32671784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 179 - 384
Target Start/End: Original strand, 46409436 - 46409642
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  46409436 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctaatctcataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcatag 46409534  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggc--ttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgat 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46409535 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttacccttcgacaattaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgat 46409634  T
Q  377 tctctctg 384  Q
    ||||||||    
T  46409635 tctctctg 46409642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 52696789 - 52696996
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  52696789 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggg-taaataaacaaaaacagcttatca 52696887  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  52696888 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 52696987  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    || ||||||    
T  52696988 ttatctctg 52696996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 181 - 384
Target Start/End: Original strand, 38829072 - 38829274
Alignment:
Q  181 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtt 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  38829072 gtttggattggcttattttgagcttatgtcggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcatagtt 38829170  T
Q  281 tcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctc 380  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  38829171 tcataagctgcttgtgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccatcgattctc 38829270  T
Q  381 tctg 384  Q
    ||||    
T  38829271 tctg 38829274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 178 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19715366 - 19715161
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19715366 cccgtttggattggtttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgga-taaataaataaaaatagcttatcatt 19715268  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19715267 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 19715168  T
Q  378 ctctctg 384  Q
    |||||||    
T  19715167 ctctctg 19715161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1940954 - 1940747
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1940954 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 1940856  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||| |  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  1940855 tagtttcataagttgtttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcaa 1940756  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  1940755 ttctctctg 1940747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 41928702 - 41928495
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41928702 gccccgtttggattggcttattttgaacttatgtggacttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatca 41928604  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  41928603 tagtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcga 41928504  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  41928503 ttctctctg 41928495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 42371002 - 42370795
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  42371002 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaaaaacttatca 42370904  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| ||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  42370903 tagtttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 42370804  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  42370803 ttctctctg 42370795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 177 - 384
Target Start/End: Original strand, 5215384 - 5215590
Alignment:
Q  177 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  5215384 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactttcataagcctttttaaagatgtttggg-taaataagtaaaaatagcttatcat 5215482  T
Q  277 tgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgat 376  Q
     |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  5215483 agtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaacttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 5215582  T
Q  377 tctctctg 384  Q
    | ||||||    
T  5215583 tatctctg 5215590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 176 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 1170651 - 1170447
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  1170651 gccccgtttggattggcttattttgagcttttgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaacagcttatca 1170553  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  1170552 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcga 1170453  T
Q  376 ttctct 381  Q
    ||||||    
T  1170452 ttctct 1170447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 179 - 384
Target Start/End: Original strand, 8120870 - 8121074
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |    
T  8120870 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaacagtttatcatag 8120968  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattc 378  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8120969 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagtttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 8121068  T
Q  379 tctctg 384  Q
    ||||||    
T  8121069 tctctg 8121074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 2347654 - 2347862
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  2347654 gccccgtttggatttgtttattttgagtttatgcgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatca 2347752  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttc-aataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcg 374  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  2347753 tagtttcataagctgcttatgtcatatttttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcg 2347852  T
Q  375 attctctctg 384  Q
    ||||||||||    
T  2347853 attctctctg 2347862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 179 - 384
Target Start/End: Original strand, 43905655 - 43905859
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  43905655 ccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcatag 43905753  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattc 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||     
T  43905754 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttacgtaacctccttcgattg 43905853  T
Q  379 tctctg 384  Q
    ||||||    
T  43905854 tctctg 43905859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 178 - 383
Target Start/End: Original strand, 46760966 - 46761170
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  46760966 cccgtttggattgacttattttgaacttatatgagcttatctacttgcataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcata 46761064  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  46761065 gtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacttccttcgatt 46761164  T
Q  378 ctctct 383  Q
    ||||||    
T  46761165 ctctct 46761170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 12682818 - 12683025
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12682818 gccctgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 12682916  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12682917 tagtttcataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatctttagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcga 12683016  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  12683017 ttctctctg 12683025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 17591689 - 17591893
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  17591689 gccccgtttggattggcttatt--gagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttggg-taaataaataaaaacagcttatca 17591784  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17591785 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttccagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 17591884  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  17591885 ttctctctg 17591893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 15203110 - 15203317
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15203110 gccccgtttgaattgacttattttaagcttttgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgttaggg-taaataaataaaaatagcttatca 15203208  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  15203209 tagtttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagccaaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcga 15203308  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  15203309 ttctctctg 15203317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 178 - 381
Target Start/End: Original strand, 2473722 - 2473924
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||     
T  2473722 cccgtttggatcggtttattttgagcttatgtgggcttatctacgcccataagcttttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttattata 2473820  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  2473821 gtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctcctacttaacaaggagcttatgaatttatgttacctccttcgagt 2473920  T
Q  378 ctct 381  Q
    ||||    
T  2473921 ctct 2473924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 51359423 - 51359217
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  51359423 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatttactgccataagccttcttaaaggtttt--gggtaaataattaaaaatagcttatca 51359326  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  51359325 tagtttcataaggtgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcga 51359226  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  51359225 ttctctctg 51359217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 178 - 384
Target Start/End: Original strand, 7145207 - 7145412
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttatttt-gagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcat 276  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7145207 cccgtttggattgacttatttttgagcttatgtgtatttatctactcccataagcctttttaaaagtgtt--gggtaaataaacaaaaatagtttatcat 7145304  T
Q  277 tgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgat 376  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7145305 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 7145404  T
Q  377 tctctctg 384  Q
    ||||||||    
T  7145405 tctctctg 7145412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13996930 - 13996723
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| |    
T  13996930 gccctgtttggattggcttattttgaaattatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgga-taaataaataaaaatagcttataa 13996832  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||    
T  13996831 tggtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctcattcga 13996732  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  13996731 ttctctctg 13996723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 179 - 384
Target Start/End: Original strand, 49146173 - 49146377
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  49146173 ccgtttggattggtttattttgagcttatgtggatttatatactcccataagtttttttaaaggtgtttgga-taaataaataaaaatagcttatcatag 49146271  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattc 378  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || ||||||||    
T  49146272 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcatcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacgtcattcgattc 49146371  T
Q  379 tctctg 384  Q
    ||||||    
T  49146372 tctctg 49146377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 40092489 - 40092696
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  40092489 gccctgtttggattgacttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatatcttatca 40092587  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||    
T  40092588 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctttttcga 40092687  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    || ||||||    
T  40092688 ttttctctg 40092696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 177 - 379
Target Start/End: Original strand, 6765458 - 6765659
Alignment:
Q  177 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  6765458 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgaatttatctacttttataagcctttttaaaagtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatcat 6765556  T
Q  277 tgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgat 376  Q
      |||||| |||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  6765557 attttcatgagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctccttcgat 6765656  T
Q  377 tct 379  Q
    |||    
T  6765657 tct 6765659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 23498458 - 23498665
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  23498458 gccctgtttgaattggcttattttaagcttatgtgggcttatctacttccacaagcctttttcaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagttcatca 23498556  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||| | |||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  23498557 tagtttcataagttgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcga 23498656  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  23498657 ttctctctg 23498665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15554351 - 15554152
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     ||    
T  15554351 gccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatag-----ca 15554258  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    ||   |||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15554257 tt---tcataaactgctgatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 15554161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 194 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 17587694 - 17587505
Alignment:
Q  194 tattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtttcataagctactt 293  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||    
T  17587694 tattttgagcttatgtgagcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttggc-taaataaataaaaacagcttatcatattttcataagctgctt 17587596  T
Q  294 atgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctctctg 384  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  17587595 atgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctttctg 17587505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 180 - 381
Target Start/End: Original strand, 15717787 - 15717986
Alignment:
Q  180 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgt 279  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||| ||    
T  15717787 cgtttggattgacttattttgagtttatgttggcctatctaatttcataagcctttttaaaggtgtttgag-taaataaataaaaatagctt-tcatagt 15717884  T
Q  280 ttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattct 379  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||    
T  15717885 ttcataagctgcttatgccataatttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgattttatgtaacctccttcaattct 15717984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 212 - 384
Target Start/End: Original strand, 40149497 - 40149668
Alignment:
Q  212 gcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtttcataagctacttatgccatatttcaataag 311  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  40149497 gcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaataatttatcatagttttataagctgcttatgtcatattttaataag 40149595  T
Q  312 tctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctctctg 384  Q
     |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40149596 cctaaattttcagtttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 40149668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 176 - 345
Target Start/End: Original strand, 29695673 - 29695842
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataa-gcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatc 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||    
T  29695673 gccctgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcccataatttttttttaaaggtgttt-ggataaataaataaaaataatttatc 29695771  T
Q  275 attgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaag 345  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29695772 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaag 29695842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 179 - 383
Target Start/End: Original strand, 38171833 - 38172023
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||| |    
T  38171833 ccgtttgcattgacttattttgaatttatgtgaacttatctactcacataaacctttttaaaggtgttt-ggataaataaataaaaacagtttatcatag 38171931  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattc 378  Q
    ||||||||||| ||||||              | |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  38171932 tttcataagctgcttatg-------------tgcctaaattttcagcttatcctccggcttaagaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 38172018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 170 - 301
Target Start/End: Original strand, 52086259 - 52086389
Alignment:
Q  170 aattaagccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaataga 269  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||      
T  52086259 aattaggccctgtttggattgacttattttaagcttatgtgggtttatctgctcccataaacctttttaaaggtgttt-gggtaaatcagtaaaaataac 52086357  T
Q  270 ttatcattgtttcataagctacttatgccata 301  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  52086358 ttatcataatttcataagctgcttatgccata 52086389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23323032 - 23322913
Alignment:
Q  191 gcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtttcataagcta 290  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | ||||| |||| |||| |  ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||     
T  23323032 gcttattttgagcttatataggcttatctactcccataaactttttttaaggcgttt-gaataaatcaataaaaatagtttatcataatttcataagctg 23322934  T
Q  291 cttatgccatatttcaataag 311  Q
    |||||| |||| || ||||||    
T  23322933 cttatgtcatactttaataag 23322913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 249
Target Start/End: Original strand, 5675103 - 5675176
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||    
T  5675103 gccccgtttggattggcttattttaagcttatgttagcttatctactaacataagctttttgaaagatgtttgg 5675176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5217986 - 5217935
Alignment:
Q  180 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagc 231  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||    
T  5217986 cgtttggattggcttattttaagcttatgagagcttatctactaacataagc 5217935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26947083 - 26946876
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26947083 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 26946985  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26946984 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 26946885  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  26946884 ttctctctg 26946876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 2837545 - 2837752
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  2837545 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 2837643  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | ||||||| |||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  2837644 tagtttcatgagctgctcatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 2837743  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  2837744 ttctctctg 2837752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6086806 - 6086599
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6086806 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 6086708  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6086707 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 6086608  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  6086607 ttctctctg 6086599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 179 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34887496 - 34887292
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  34887496 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctcctcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcatag 34887398  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattc 378  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34887397 tttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctaatgaatttatgtgacctccttcgattc 34887298  T
Q  379 tctctg 384  Q
    ||||||    
T  34887297 tctctg 34887292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3347730 - 3347523
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||    
T  3347730 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgga-taaataaataaaaacagcttatca 3347632  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3347631 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 3347532  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  3347531 ttctctctg 3347523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26704546 - 26704339
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26704546 gccccgtttggattggtttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 26704448  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26704447 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 26704348  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  26704347 ttctctctg 26704339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 180 - 384
Target Start/End: Original strand, 30691855 - 30692058
Alignment:
Q  180 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  30691855 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcatagt 30691953  T
Q  280 ttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattct 379  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  30691954 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 30692053  T
Q  380 ctctg 384  Q
    |||||    
T  30692054 ctctg 30692058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 169 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 17261287 - 17261073
Alignment:
Q  169 taattaagccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatag 268  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17261287 taattaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttctaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatag 17261189  T
Q  269 attatcattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaact 368  Q
     |||| ||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  17261188 cttataatattttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacct 17261089  T
Q  369 ccttcgattctctctg 384  Q
    ||||||||||||||||    
T  17261088 ccttcgattctctctg 17261073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 9459563 - 9459770
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9459563 gccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagcttatctatttccataagcctttttaaaggtatttggg-taaataaataaaaatagcttatca 9459661  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  9459662 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtatcctccttcga 9459761  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  9459762 ttctctctg 9459770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 20726791 - 20726994
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||  ||||||    
T  20726791 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-----taaataaaaataacttatca 20726885  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20726886 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 20726985  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  20726986 ttctctctg 20726994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 21893455 - 21893662
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  21893455 gccccgtttggatcgatttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaatatataaaaatagcttatca 21893553  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21893554 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 21893653  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  21893654 ttctctctg 21893662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 177 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3955972 - 3955769
Alignment:
Q  177 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3955972 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcat 3955874  T
Q  277 tgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgat 376  Q
     ||||||||| || ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||    
T  3955873 agtttcataaactgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa---ccttcgat 3955777  T
Q  377 tctctctg 384  Q
    ||||||||    
T  3955776 tctctctg 3955769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 11167240 - 11167447
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11167240 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgtgcttatttattttcataagtttttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 11167338  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  11167339 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccaccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 11167438  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  11167439 ttctctctg 11167447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 18613538 - 18613745
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  18613538 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgcggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaacagcttatca 18613636  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | ||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18613637 tagttccataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 18613736  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  18613737 ttctctctg 18613745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 176 - 383
Target Start/End: Original strand, 35198284 - 35198489
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  35198284 gccccgtttgaattggcttattttgaacttatgtgggcttatctacttccataagc-tttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 35198381  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  35198382 tagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttactctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtgatctcattcga 35198481  T
Q  376 ttctctct 383  Q
    ||||||||    
T  35198482 ttctctct 35198489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 178 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28199714 - 28199508
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatc---tactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatc 274  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28199714 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactc-cataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatc 28199617  T
Q  275 attgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcg 374  Q
    || |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  28199616 atagtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 28199518  T
Q  375 attctctctg 384  Q
    ||||||||||    
T  28199517 attctctctg 28199508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 186 - 384
Target Start/End: Original strand, 1153603 - 1153800
Alignment:
Q  186 gattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtttcata 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1153603 gattggcttattttaagcttatgttggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataagtaaaaatagattatcatagtttcata 1153701  T
Q  286 agctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctctctg 384  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||    
T  1153702 agctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggtgcttatgtatttatgtaacctccttcgtttctctctg 1153800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 176 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16307215 - 16307015
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||    
T  16307215 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgga-taaataaataaaaacagcttatca 16307117  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  16307116 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcga 16307017  T
Q  376 tt 377  Q
    ||    
T  16307016 tt 16307015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 176 - 340
Target Start/End: Original strand, 52836 - 52999
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  52836 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcatttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 52934  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggctta 340  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52935 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggctta 52999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 180 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30699132 - 30698934
Alignment:
Q  180 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgt 279  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||| || |   ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  30699132 cgtttggattgacttattatgagtttatgtgagcttatttatttctataagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcatagt 30699034  T
Q  280 ttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattct 379  Q
    || || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  30699033 tttattagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 30698934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 249 - 384
Target Start/End: Original strand, 33464401 - 33464536
Alignment:
Q  249 gggtaaataaataaaaatagattatcattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggag 348  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33464401 gggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggag 33464500  T
Q  349 cttatgaatttatgtgaactccttcgattctctctg 384  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  33464501 cttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 33464536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 270 - 384
Target Start/End: Original strand, 53001 - 53115
Alignment:
Q  270 ttatcattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactc 369  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  53001 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 53100  T
Q  370 cttcgattctctctg 384  Q
    |||||||||||||||    
T  53101 cttcgattctctctg 53115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 250
Target Start/End: Original strand, 33463703 - 33463775
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33463703 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg 33463775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 54189543 - 54189750
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  54189543 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 54189641  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  54189642 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 54189741  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  54189742 ttctctctg 54189750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 177 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1756958 - 1756752
Alignment:
Q  177 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1756958 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagattatcat 1756860  T
Q  277 tgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgat 376  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  1756859 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgat 1756760  T
Q  377 tctctctg 384  Q
    ||||||||    
T  1756759 tctctctg 1756752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19913825 - 19913618
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  19913825 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaattaaaacagcttatca 19913727  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19913726 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 19913627  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  19913626 ttctctctg 19913618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 176 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23776654 - 23776449
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23776654 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 23776556  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||    
T  23776555 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggatcttatgaatttatgtaaccttcttcga 23776456  T
Q  376 ttctctc 382  Q
    |||||||    
T  23776455 ttctctc 23776449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 167 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 53717668 - 53717452
Alignment:
Q  167 cataattaagccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaat 266  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  53717668 catatttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttggg-taaataaataaaaat 53717570  T
Q  267 agattatcattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaa 366  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  53717569 agcttatcatagtttcataagctgcttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaac 53717470  T
Q  367 ctccttcgattctctctg 384  Q
    ||||||||||||||||||    
T  53717469 ctccttcgattctctctg 53717452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28032907 - 28032700
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28032907 gccctgtttagattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 28032809  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  28032808 tagtatcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 28032709  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    || ||||||    
T  28032708 ttatctctg 28032700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 38055155 - 38055362
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  38055155 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatattttatca 38055253  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  38055254 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccatcga 38055353  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  38055354 ttctctctg 38055362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 176 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 37968952 - 37968746
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37968952 gccccatttagattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 37968854  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37968853 tagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 37968754  T
Q  376 ttctctct 383  Q
    ||||||||    
T  37968753 ttctctct 37968746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 176 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 50055296 - 50055098
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||    
T  50055296 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgga-taaataaatgaaaatagcttatca 50055198  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  50055197 tggtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 50055098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 177 - 384
Target Start/End: Original strand, 54412627 - 54412833
Alignment:
Q  177 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  54412627 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgga-taaataaataaaaatagcttatcat 54412725  T
Q  277 tgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgat 376  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  54412726 agtttcataagctgcttatgtcatattctaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctccttcgat 54412825  T
Q  377 tctctctg 384  Q
    ||||||||    
T  54412826 tctctctg 54412833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 170 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2481609 - 2481396
Alignment:
Q  170 aattaagccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaataga 269  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||     
T  2481609 aattaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggg-taaataaacaaaaacagc 2481511  T
Q  270 ttatcattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactc 369  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  2481510 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagccaaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 2481411  T
Q  370 cttcgattctctctg 384  Q
    |||||||||||||||    
T  2481410 cttcgattctctctg 2481396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 174 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 11639775 - 11639566
Alignment:
Q  174 aagccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattat 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11639775 aagccccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttggg-taaataaataaaaatagcttat 11639677  T
Q  274 cattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttc 373  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||     
T  11639676 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttt 11639577  T
Q  374 gattctctctg 384  Q
    |||||||||||    
T  11639576 gattctctctg 11639566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 178 - 383
Target Start/End: Original strand, 20877047 - 20877251
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  20877047 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatcata 20877145  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||    
T  20877146 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttacgtaacctccttagatt 20877245  T
Q  378 ctctct 383  Q
    ||||||    
T  20877246 ctctct 20877251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 179 - 384
Target Start/End: Original strand, 53875658 - 53875862
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  53875658 ccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatatactctcataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcatag 53875756  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattc 378  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  53875757 ttttataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattc 53875856  T
Q  379 tctctg 384  Q
    ||||||    
T  53875857 tctctg 53875862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 180 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15241219 - 15241016
Alignment:
Q  180 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||    
T  15241219 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaacagtttatcatagt 15241121  T
Q  280 ttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattct 379  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15241120 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 15241021  T
Q  380 ctctg 384  Q
    |||||    
T  15241020 ctctg 15241016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27488843 - 27488636
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27488843 gccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 27488745  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27488744 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcga 27488645  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  27488644 ttctctctg 27488636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 45424729 - 45424522
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  45424729 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatca 45424631  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  45424630 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 45424531  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||| ||||    
T  45424530 ttctttctg 45424522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 178 - 384
Target Start/End: Original strand, 1617084 - 1617289
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||     
T  1617084 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaataacttatcata 1617182  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1617183 gtttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 1617282  T
Q  378 ctctctg 384  Q
    |||||||    
T  1617283 ctctctg 1617289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 178 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 35490966 - 35490761
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||     
T  35490966 cccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatccactctcataagcttttttaaaggtgtttgga-taaataaataaaaatagcttatcata 35490868  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  35490867 gtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccaccttcgatt 35490768  T
Q  378 ctctctg 384  Q
    |||||||    
T  35490767 ctctctg 35490761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 175 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 40428916 - 40428708
Alignment:
Q  175 agccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatc 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40428916 agccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatc 40428818  T
Q  275 attgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcg 374  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  40428817 atagtttcataagctgcttataccatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 40428718  T
Q  375 attctctctg 384  Q
    ||||||||||    
T  40428717 attctctctg 40428708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6611555 - 6611348
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6611555 gccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 6611457  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | ||||||||||||  ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6611456 tagtttcataagctgtttatgtcatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcga 6611357  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  6611356 ttctctctg 6611348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 37464719 - 37464926
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  37464719 gccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaacagtttatca 37464817  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  37464818 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttaccctccggtttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcga 37464917  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  37464918 ttctctctg 37464926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 44785112 - 44784905
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  44785112 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttgtaaaagtgtttggg-taaacaaataaaaatagcttatca 44785014  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  44785013 tagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaactttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcga 44784914  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  44784913 ttctctctg 44784905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 50353799 - 50354006
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  50353799 gccccgtttggattggcttattttgagcttctgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatga 50353897  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  50353898 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 50353997  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    || ||||||    
T  50353998 ttatctctg 50354006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 178 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 30423757 - 30423556
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  30423757 cccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcata 30423659  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  30423658 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcataaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagctta-gaatttatgtaacctccttcgatt 30423560  T
Q  378 ctct 381  Q
    ||||    
T  30423559 ctct 30423556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 176 - 382
Target Start/End: Original strand, 48909844 - 48910049
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  48909844 gccctgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgga-taaataaataaaaatagcttatca 48909942  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  48909943 tagtttcataagctgcttatgccatattttaacaaacctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcga 48910042  T
Q  376 ttctctc 382  Q
    |||||||    
T  48910043 ttctctc 48910049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 179 - 384
Target Start/End: Original strand, 16700782 - 16700986
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |    
T  16700782 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaacagcttatcatag 16700880  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattc 378  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  16700881 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctagcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctccttcgattc 16700980  T
Q  379 tctctg 384  Q
    ||||||    
T  16700981 tctctg 16700986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 47632032 - 47632240
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaa-ggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  47632032 gccccgtttggattggcttattttgagtttatgtggacttatctactctcataaacctttttaaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttctc 47632130  T
Q  275 attgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcg 374  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||     
T  47632131 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttca 47632230  T
Q  375 attctctctg 384  Q
    ||||||||||    
T  47632231 attctctctg 47632240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 14987790 - 14987997
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14987790 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagccattttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 14987888  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14987889 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcttgcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcga 14987988  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||| ||||    
T  14987989 ttctttctg 14987997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 178 - 384
Target Start/End: Original strand, 31969681 - 31969886
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  31969681 cccgtttgaattgatttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttggg-taaataaataaaaatagtttatcata 31969779  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31969780 gtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 31969879  T
Q  378 ctctctg 384  Q
    |||||||    
T  31969880 ctctctg 31969886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 179 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 43290152 - 43289951
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  43290152 ccgtttggattggcttattttgagcttttatgtgcttatctactcacataagcctttttaaaggtgtttgag-taaataaataaaaatagcttatcatag 43290054  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattc 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  43290053 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 43289954  T
Q  379 tct 381  Q
    |||    
T  43289953 tct 43289951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6688816 - 6688615
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6688816 gccccgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgttt-gggtaaataaataaaaatagcttatca 6688718  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | ||||      || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6688717 tagttt------ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 6688624  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  6688623 ttctctctg 6688615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 176 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23704404 - 23704200
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23704404 gccctgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcacataagccttttgaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatca 23704306  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||    
T  23704305 tagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcatttga 23704206  T
Q  376 ttctct 381  Q
    ||||||    
T  23704205 ttctct 23704200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 179 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19165164 - 19164961
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataag-cctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  19165164 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttttaaaggtgttt-gggtaaataaataaaaatagtttatcata 19165066  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  19165065 gtttcataagctgcttatgccatattt-aataagcctaaattttcagcttaccct-cggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgttt 19164968  T
Q  378 ctctctg 384  Q
     ||||||    
T  19164967 ttctctg 19164961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 176 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 8932373 - 8932165
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |     
T  8932373 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgag-taaataaataaaaatagcttaacg 8932275  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  8932274 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctccttcga 8932175  T
Q  376 ttctctctgc 385  Q
    ||||||||||    
T  8932174 ttctctctgc 8932165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 170 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27536301 - 27536092
Alignment:
Q  170 aattaagccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaataga 269  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  27536301 aattaggccccgtttggattggcttattttgagcttatacgggctta----ctcccataagccttcttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagt 27536207  T
Q  270 ttatcattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactc 369  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27536206 ttatcatagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 27536107  T
Q  370 cttcgattctctctg 384  Q
    |||||||||||||||    
T  27536106 cttcgattctctctg 27536092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 15669181 - 15669388
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  15669181 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctaatcacataagactttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaacagcttatca 15669279  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  15669280 tagtttcataagctgcttatgtcatactttaataagcctaaattttcagcttaccgtccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcca 15669379  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  15669380 ttctctctg 15669388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 178 - 381
Target Start/End: Original strand, 52139203 - 52139405
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |   ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  52139203 cccgtttggattggcttattttgaacttatgtgggtttatctatttctataagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcata 52139301  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  52139302 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 52139401  T
Q  378 ctct 381  Q
    ||||    
T  52139402 ctct 52139405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 178 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 8591285 - 8591080
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  8591285 cccgtttgacttggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttctataagcctttttaaagatgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcata 8591187  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  8591186 gtttcataagctgcttatgccatatgttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcggtt 8591087  T
Q  378 ctctctg 384  Q
    |||||||    
T  8591086 ctctctg 8591080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 179 - 384
Target Start/End: Original strand, 30171581 - 30171785
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  30171581 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatcttattccataagcttttttaaaggtgtttgga-taaataaatgaaaatagcttatcatag 30171679  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattc 378  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  30171680 tttcataagctgcttataccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccttccggtttaacaaggagcttatgaatttatttaacctccttcgattc 30171779  T
Q  379 tctctg 384  Q
    ||||||    
T  30171780 tctctg 30171785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 187 - 384
Target Start/End: Original strand, 33703850 - 33704046
Alignment:
Q  187 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtttcataa 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||    
T  33703850 attgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaacaacttatcatagtttcataa 33703948  T
Q  287 gctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctctctg 384  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  33703949 gctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 33704046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 176 - 383
Target Start/End: Original strand, 53353053 - 53353267
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagctta----tgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagatt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  53353053 gccccgtttggattggcttattttgagcttaattatatgggcttatctactcccatatgtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagctt 53353151  T
Q  272 atcattgtttcataagctacttatgccatatttcaata----agtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaac 367  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  53353152 atcatagtttcataagctgcttatgccatattttaatatataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttatgtaacc 53353251  T
Q  368 tccttcgattctctct 383  Q
    ||||||||||||||||    
T  53353252 tccttcgattctctct 53353267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 44379382 - 44379175
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  44379382 gccctgtttggattgacttattttgagtttatataggcttatctacttccataaacctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatca 44379284  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  44379283 tagtttcataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcga 44379184  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  44379183 ttctctctg 44379175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 171 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27583832 - 27583620
Alignment:
Q  171 attaagccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagat 270  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  |    
T  27583832 attaaggcccatttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaagatgtttgga-taaataaataaaaataact 27583734  T
Q  271 tatcattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactcc 370  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  27583733 tatcatagttgcataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcc 27583634  T
Q  371 ttcgattctctctg 384  Q
    ||| ||||||||||    
T  27583633 ttcaattctctctg 27583620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 55345020 - 55344813
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  55345020 gccccgtttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaagatgttt-gggtaaataaataaaaatagcttatca 55344922  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    |  || ||| || |  |||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  55344921 tatttgcatgagttgtttataccatattttaataagccaaaattttcagcttaccatccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttga 55344822  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  55344821 ttctctctg 55344813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 181 - 350
Target Start/End: Original strand, 28360433 - 28360602
Alignment:
Q  181 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtt 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  28360433 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttttctactcccataagcctttttaaaggtgttt-gggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 28360531  T
Q  281 tcataagctacttatgcca-tatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagct 350  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360532 ttataagctgcttatgccattatttttataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagct 28360602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 187 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 38071504 - 38071314
Alignment:
Q  187 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtttcataa 286  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  38071504 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataatcctttttaaaggtgttt-gggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataa 38071406  T
Q  287 gctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctctctg 384  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  38071405 gctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagtttac---ggggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa---ccttcgattctctctg 38071314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 182 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 40680227 - 40680026
Alignment:
Q  182 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgttt 281  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  40680227 tttggattgacttattttgaatttatgtgagcttatctacttccataagtctttttaaaggtatttgga-taaataaataaaaatagcttatcatagttt 40680129  T
Q  282 cataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctct 381  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  40680128 cataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctct 40680029  T
Q  382 ctg 384  Q
    |||    
T  40680028 ctg 40680026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 177 - 375
Target Start/End: Original strand, 44375844 - 44376041
Alignment:
Q  177 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||  | |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  44375844 ccccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatctattccaatagccatttttataggtgttcggg-taaataaataaaaatagtttatcat 44375942  T
Q  277 tgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
     ||||||||| || |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  44375943 agtttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaaaaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcga 44376041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 176 - 328
Target Start/End: Original strand, 50053441 - 50053592
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  50053441 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatggacttatctactcccataagcctttttaaatgtgttt-gggcaaataaataaaaatagcttatca 50053539  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagctta 328  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  50053540 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcatctta 50053592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 256 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23269162 - 23269034
Alignment:
Q  256 taaataaaaatagattatcattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 355  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23269162 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 23269063  T
Q  356 atttatgtgaactccttcgattctctctg 384  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23269062 atttatgtaatctccttcgattctctctg 23269034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 200 - 381
Target Start/End: Original strand, 16703843 - 16704023
Alignment:
Q  200 gagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtttcataagctacttatgcca 299  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16703843 gagcttatgtgaacttatctacttccataagcttttttaaagttgtttgaa-taaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgcca 16703941  T
Q  300 tatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctct 381  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||||    
T  16703942 tattttaataagcctaaattttcagtttatcctccggcttaacaaggagcctataaatttatgtaacccccttcgattctct 16704023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 178 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 23265950 - 23265865
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23265950 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcggataagcctttttaaaggtgttt-gggtaaataaataaaa 23265865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 297 - 384
Target Start/End: Original strand, 53408137 - 53408225
Alignment:
Q  297 ccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccct-ccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctctctg 384  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  53408137 ccatattttattaagcctaaattttcagcttacccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 53408225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23261937 - 23261874
Alignment:
Q  321 tcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctctctg 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23261937 tcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 23261874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 176 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44548337 - 44548263
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggc-ttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgg 249  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  44548337 gccccgtttgaattggccttatttggagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttgg 44548263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 331 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9595943 - 9595890
Alignment:
Q  331 ctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctctctg 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9595943 ctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 9595890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9596029 - 9595975
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596029 gccccgtttggattggcttattt-gagtttatgtgggcttatctactctcataagc 9595975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 384
Target Start/End: Original strand, 48748197 - 48748263
Alignment:
Q  318 ttttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctctctg 384  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  48748197 ttttcagcataccctccgtcttaataaggagcttatgaatttatgtaatctccttcaattctctctg 48748263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 335 - 384
Target Start/End: Original strand, 50055301 - 50055350
Alignment:
Q  335 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctctctg 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50055301 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 50055350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 51780838 - 51780763
Alignment:
Q  252 taaataaataaaaatagattatcattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagctt 327  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  51780838 taaatcaataaaaatagcttatcataatttcataagctgcttatgccatattttaataagcccaaattttaagctt 51780763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 37698336 - 37698129
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37698336 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 37698238  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  37698237 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 37698138  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  37698137 ttctctctg 37698129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15520335 - 15520128
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  15520335 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaataacttatca 15520237  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  15520236 tcgtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcga 15520137  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  15520136 ttctctctg 15520128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22175183 - 22174976
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  22175183 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggg-taaataaataaaaacagcttatca 22175085  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22175084 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 22174985  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  22174984 ttctctctg 22174976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 25999383 - 25999590
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25999383 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 25999481  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  25999482 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcga 25999581  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  25999582 ttctctctg 25999590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 54534519 - 54534314
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  54534519 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 54534421  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54534420 tggttt-ataagctgcttatgccatatt-caataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 54534323  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  54534322 ttctctctg 54534314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 176 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 42308098 - 42307892
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  42308098 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggcgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 42308000  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  42307999 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcga 42307900  T
Q  376 ttctctct 383  Q
    ||||||||    
T  42307899 ttctctct 42307892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 8042602 - 8042809
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  8042602 gccccgtttggatgggcttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataagtaaaaatagtttatca 8042700  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8042701 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 8042800  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  8042801 ttctctctg 8042809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 50528924 - 50529131
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  50528924 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggg-taaataaataaaaacagcttatca 50529022  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  50529023 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcga 50529122  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  50529123 ttctctctg 50529131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 177 - 384
Target Start/End: Original strand, 38856089 - 38856295
Alignment:
Q  177 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38856089 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcat 38856187  T
Q  277 tgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgat 376  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  38856188 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgat 38856287  T
Q  377 tctctctg 384  Q
    | ||||||    
T  38856288 tatctctg 38856295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20842541 - 20842334
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  20842541 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaacaacttatca 20842443  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20842442 tagtttcataagctgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 20842343  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  20842342 ttctctctg 20842334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 176 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 46452355 - 46452149
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  46452355 gccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatca 46452257  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  46452256 tagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctcaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 46452157  T
Q  376 ttctctct 383  Q
    ||||||||    
T  46452156 ttctctct 46452149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 178 - 379
Target Start/End: Original strand, 32244117 - 32244317
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  32244117 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatcata 32244215  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  32244216 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 32244315  T
Q  378 ct 379  Q
    ||    
T  32244316 ct 32244317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25494478 - 25494271
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25494478 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 25494380  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  25494379 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcga 25494280  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  25494279 ttctctctg 25494271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 38933941 - 38934147
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  38933941 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttggg-taaataaataaaaacagcttatca 38934038  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  38934039 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagtctaaatttccagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 38934138  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  38934139 ttctctctg 38934147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 176 - 383
Target Start/End: Original strand, 15520631 - 15520837
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  15520631 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggg-taaataaacaaaaacagcttatca 15520729  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  15520730 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttttgtaacctccttcga 15520829  T
Q  376 ttctctct 383  Q
    ||||||||    
T  15520830 ttctctct 15520837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 176 - 383
Target Start/End: Original strand, 20699144 - 20699350
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  20699144 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggg-taaataaacaaaaacagcttatca 20699242  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||    
T  20699243 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttaggaatttttgtaacctccttcga 20699342  T
Q  376 ttctctct 383  Q
    ||||||||    
T  20699343 ttctctct 20699350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 181 - 384
Target Start/End: Original strand, 21581042 - 21581244
Alignment:
Q  181 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtt 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  21581042 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaataacttatcatagtt 21581140  T
Q  281 tcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctc 380  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  21581141 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatccttcgattctc 21581240  T
Q  381 tctg 384  Q
    ||||    
T  21581241 tctg 21581244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 170 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 24835898 - 24835686
Alignment:
Q  170 aattaagccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaataga 269  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| | | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  24835898 aattaggccccgtttggattgatttattttgagcttatatagacttatcaactcccataagcctttttaaaggtgtttgga-taaataaataaaaatagc 24835800  T
Q  270 ttatcattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactc 369  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24835799 ttattatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaactc 24835700  T
Q  370 cttcgattctctct 383  Q
    |||||||| |||||    
T  24835699 cttcgattatctct 24835686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 29445483 - 29445690
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29445483 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 29445581  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  29445582 tagtttcataagctgtttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcca 29445681  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||| ||||    
T  29445682 ttctatctg 29445690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 54870367 - 54870160
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  54870367 gccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 54870269  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  54870268 tcgtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 54870169  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||| ||||    
T  54870168 ttctttctg 54870160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12117851 - 12117644
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  12117851 gccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgga-taaataaataaaaatagtttatca 12117753  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  12117752 tagtttcataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcga 12117653  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  12117652 ttctctctg 12117644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 35226442 - 35226649
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||    
T  35226442 gccctgtttggattggcctattttgagcttatgtgggcttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaatcagcttatca 35226540  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  35226541 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcctaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 35226640  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  35226641 ttctctctg 35226649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 181 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 44609521 - 44609319
Alignment:
Q  181 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtt 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||    
T  44609521 gtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctacttgcataagcctttttgaaggtgtttggg-taaataaataaaaacagcttatcatagtt 44609423  T
Q  281 tcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctc 380  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  44609422 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctctttcgattctc 44609323  T
Q  381 tctg 384  Q
    ||||    
T  44609322 tctg 44609319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 178 - 384
Target Start/End: Original strand, 32359256 - 32359461
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||     
T  32359256 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctatttccataagcttttataaaggtgtttgag-taaataaataaaaatagtttatcata 32359354  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  32359355 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 32359454  T
Q  378 ctctctg 384  Q
    |||||||    
T  32359455 ctctctg 32359461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 2895180 - 2895391
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  2895180 gccccatttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaaaaaattatca 2895278  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagct----tatgaatttatgtgaactcct 371  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||| | | |||||    
T  2895279 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatatatgaatttatataacctcct 2895378  T
Q  372 tcgattctctctg 384  Q
    |||||||||||||    
T  2895379 tcgattctctctg 2895391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 176 - 383
Target Start/End: Original strand, 26122809 - 26123015
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  26122809 gcccagtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctattcccatgagcctttttaaaggtgtttgga-taaataaataaaaatagcttatca 26122907  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |  | ||||||    
T  26122908 tagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagtagcttatgaatttacgtaacattcttcga 26123007  T
Q  376 ttctctct 383  Q
    ||||||||    
T  26123008 ttctctct 26123015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 42105155 - 42104957
Alignment:
Q  185 ggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtttcat 284  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  42105155 ggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacatttttaaaggtgtttgga-taaaaaaataaaaatagtttatcatagtttcat 42105057  T
Q  285 aagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctctctg 384  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  42105056 aagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcatgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattccctctg 42104957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 181 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 48925189 - 48924989
Alignment:
Q  181 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtt 280  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||| || |   |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  48925189 gtttggattggcttatttagagtttatatgggtttatctacttccataagcttttttaaaagttt---gggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 48925093  T
Q  281 tcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctc 380  Q
    |||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  48925092 tcataagctgtttatgtcatattttaataagtctaaatttttagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 48924993  T
Q  381 tctg 384  Q
    ||||    
T  48924992 tctg 48924989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 34700336 - 34700543
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  34700336 gccccgtttagattggtttattttgagcttatgtgggtttatttacttccataagcctttttaaaggtgtttgag-taaataaataaaaatagcttatca 34700434  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | | |||||| ||    
T  34700435 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaagaagcttatgaatttatataacctcctttga 34700534  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    || ||||||    
T  34700535 ttatctctg 34700543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 53028220 - 53028419
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||         |||||||||||||||| ||||||    
T  53028220 gccctgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagtctttttagaggt---------aaataaataaaaatagcttatca 53028310  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    |  |||||||| || |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  53028311 tattttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 53028410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 176 - 383
Target Start/End: Original strand, 44688761 - 44688961
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||| ||||||||||     ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  44688761 gccccgtttgaattggcttat-----gcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaagatgtttgga-taaataaataaaaatagcttatca 44688854  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||    
T  44688855 tagtttcataagctgcttatgc-atattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgcaacctccttcga 44688953  T
Q  376 ttctctct 383  Q
    ||||||||    
T  44688954 ttctctct 44688961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 174 - 334
Target Start/End: Original strand, 35643210 - 35643369
Alignment:
Q  174 aagccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattat 273  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  35643210 aagccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctacttccataagcctttttaaaggtgcttggg-taaataaataaaaatagcttat 35643308  T
Q  274 cattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctcc 334  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  35643309 catagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttgagcttaccctcc 35643369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 214 - 384
Target Start/End: Original strand, 16354379 - 16354548
Alignment:
Q  214 ttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtc 313  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || ||||||| ||| |||||| |    
T  16354379 ttatctacactcataagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaataacttatcatagtttcataagctgctaatgccatgttttaataagcc 16354477  T
Q  314 taaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctctctg 384  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  16354478 taaattttcagcttatcctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctgcgattatctctg 16354548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 181 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 50529961 - 50529839
Alignment:
Q  181 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtt 280  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  50529961 gtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgttt-gggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 50529863  T
Q  281 tcataagctacttatgccatattt 304  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  50529862 tcataagctgcttatgccatattt 50529839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 204 - 381
Target Start/End: Original strand, 12915930 - 12916105
Alignment:
Q  204 ttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtttcataagctacttatgccatatt 303  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||||||| || |||||| ||||||    
T  12915930 ttatgtgggcttatttactc-cataaatctttttaaaggtgtttgga-taaataaataaaaatagtttatcataatttcataaactgcttatgtcatatt 12916027  T
Q  304 tcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctct 381  Q
    | ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  12916028 taaataagcttaagttttcagcttaccctccggtttaagaaagagtttatgaatttatgtaacccccttcgattctct 12916105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 296 - 383
Target Start/End: Original strand, 24366143 - 24366230
Alignment:
Q  296 gccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctctct 383  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  24366143 gccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttagattctctct 24366230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 176 - 310
Target Start/End: Original strand, 49128044 - 49128177
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||||     
T  49128044 gccccgtttggattgacttattttaaacttatgtgggcttatctactcctataagtctttttaaagatgttt-gggtaaatcaataaaaataacttatcg 49128142  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataa 310  Q
    |  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  49128143 taatttcataagctgcttatgctatattttaataa 49128177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 306 - 384
Target Start/End: Original strand, 13696917 - 13696995
Alignment:
Q  306 aataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctctctg 384  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||    
T  13696917 aataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttgtgtaacctcctttgattctctctg 13696995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 231
Target Start/End: Original strand, 24366087 - 24366142
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagc 231  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24366087 gccccttttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagc 24366142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 50528916 - 50528868
Alignment:
Q  336 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctctctg 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||    
T  50528916 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctatctg 50528868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 36703 - 36910
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  36703 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 36801  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  36802 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 36901  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  36902 ttctctctg 36910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 180 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3873447 - 3873244
Alignment:
Q  180 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  3873447 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaatatagcttatcatagt 3873349  T
Q  280 ttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattct 379  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||    
T  3873348 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatataacctcattcgattct 3873249  T
Q  380 ctctg 384  Q
    |||||    
T  3873248 ctctg 3873244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18807091 - 18806884
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18807091 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 18806993  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18806992 tagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 18806893  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  18806892 ttctctctg 18806884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31517422 - 31517215
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31517422 gccccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 31517324  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  31517323 tagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 31517224  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  31517223 ttctctctg 31517215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6175035 - 6174828
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  6175035 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatattttatca 6174937  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6174936 tagtttcataagctgcttatgtcatatttcattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctccttcga 6174837  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  6174836 ttctctctg 6174828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33906254 - 33906047
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33906254 gccctgtttggattgacttattttgaacttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 33906156  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  33906155 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 33906056  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    || ||||||    
T  33906055 ttatctctg 33906047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26323393 - 26323186
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  26323393 gccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagtctttttaaagatgtttgga-taaataaataaaaatagcttatca 26323295  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  26323294 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcga 26323195  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  26323194 ttctctctg 26323186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 176 - 363
Target Start/End: Original strand, 1108278 - 1108463
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1108278 gccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatca 1108375  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 363  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1108376 tagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgt 1108463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 176 - 383
Target Start/End: Original strand, 39635450 - 39635656
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  39635450 gccccgtttggattagcttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaatatagcttatca 39635548  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  39635549 tagtttcataagctgcttatgtcatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaacgagcttatcaatttatgtaacctccttcga 39635648  T
Q  376 ttctctct 383  Q
    ||||||||    
T  39635649 ttctctct 39635656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 178 - 384
Target Start/End: Original strand, 4016039 - 4016244
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||     
T  4016039 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-tgaataaataaaaataacgtatcata 4016137  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4016138 gtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 4016237  T
Q  378 ctctctg 384  Q
    |||||||    
T  4016238 ctctctg 4016244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 179 - 384
Target Start/End: Original strand, 42937720 - 42937925
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  42937720 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatcatag 42937818  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataa-gtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42937819 tttcataagctgcttatgccatattttaataaagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 42937918  T
Q  378 ctctctg 384  Q
    |||||||    
T  42937919 ctctctg 42937925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 179 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1483106 - 1482903
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1483106 ccgttttgattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactc-cataagcttttttaaaagtgtttggg-taaataaataaaaatagcttattattg 1483009  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattc 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  1483008 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttacccttcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatccttcgattc 1482909  T
Q  379 tctctg 384  Q
    ||||||    
T  1482908 tctctg 1482903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 172 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28330048 - 28329839
Alignment:
Q  172 ttaagccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagatt 271  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  28330048 ttaagtcccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacacccataagcctttttaaaggtgttt-gggtaaataaataaaaatagctt 28329950  T
Q  272 atcattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactcct 371  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  28329949 atcatagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct--agcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctcct 28329852  T
Q  372 tcgattctctctg 384  Q
    |||||||| ||||    
T  28329851 tcgattctttctg 28329839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4232349 - 4232142
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4232349 gccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 4232251  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  4232250 tagtttcataagctgcttatgccatattttcacaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcattcga 4232151  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    || ||||||    
T  4232150 ttatctctg 4232142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 5733397 - 5733604
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||    
T  5733397 gccccatttagattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatcagcctttttaaaggtgtttggg-tgaataaataaaaacaacttatca 5733495  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  5733496 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcga 5733595  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  5733596 ttctctctg 5733604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 178 - 384
Target Start/End: Original strand, 850997 - 851202
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | || |||||||     
T  850997 cccgtttggatttgcttattttaagcttatgtaggcttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttggg-taaataaataaatagagcttatcata 851095  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  851096 attttataagctgcttatgccatattttaataagcttaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 851195  T
Q  378 ctctctg 384  Q
    |||||||    
T  851196 ctctctg 851202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2178976 - 2178769
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  2178976 gccccgtttggattgatttattttaagtttatgtggacttatctattcgcataagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaacagcttatca 2178878  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  2178877 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 2178778  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  2178777 ttctctctg 2178769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 176 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19901344 - 19901143
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  19901344 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttctctacttccataagcctttttaaaagtgtttggg-taaataa-taaaaatagcttatca 19901247  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  19901246 tagtttcataaactgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcccacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcga 19901147  T
Q  376 ttct 379  Q
    ||||    
T  19901146 ttct 19901143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 192 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 19384126 - 19383938
Alignment:
Q  192 cttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgtttcataagctac 291  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |      
T  19384126 cttattttgagtttatatgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgt 19384028  T
Q  292 ttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattctct 381  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19384027 ttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 19383938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30270886 - 30270679
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||    
T  30270886 gccccgtttggattggcttattttaagcttatatgagtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgga-taaataaaataaaatagtttatca 30270788  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  30270787 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcga 30270688  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    || ||||||    
T  30270687 ttatctctg 30270679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 179 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16588980 - 16588776
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| || |    
T  16588980 ccgtttggattggcttattttgtgtttatgtgggcttatctactttcataagtctttttaaagaagtttggg-taaataaataaaaatagcttattatag 16588882  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattc 378  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||| ||||||     
T  16588881 tttcataagctgcttatgccatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaattaatgtaacctccgtcgatta 16588782  T
Q  379 tctctg 384  Q
    ||||||    
T  16588781 tctctg 16588776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 182 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16066495 - 16066302
Alignment:
Q  182 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattgttt 281  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16066495 tttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctttcataagtcttttttaaagtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcatagttt 16066397  T
Q  282 cataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgat 376  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16066396 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgatttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 16066302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 177 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 30420373 - 30420181
Alignment:
Q  177 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30420373 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgttt-gggtaaataaataaaaatagcttatcat 30420275  T
Q  277 tgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgat 376  Q
     | |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  30420274 aggttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca------------gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcgat 30420187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 166 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 44947759 - 44947549
Alignment:
Q  166 ccataattaagccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaa 265  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  44947759 ccatatttaagccccatttgtattggcttattttgatcttatgtgagtttatctagtgccataagcatttttaaaagtgtttgga-taaataaataaaaa 44947661  T
Q  266 tagattatcattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtga 365  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  44947660 tagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattt-------gctaaattttcagtttaccctccggcttaacaagaagtttatgaatttatgtaa 44947568  T
Q  366 actccttcgattctctctg 384  Q
     ||||||||||||||||||    
T  44947567 cctccttcgattctctctg 44947549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 380
Target Start/End: Original strand, 429817 - 430017
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    ||||||| |||  ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||      
T  429817 ccgtttgaattcccttattttgaatttatgtggatttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcataa 429915  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgattc 378  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  429916 tttcataagttgcttatgcgatattttaataagcctaaattttcaacttacaattcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattc 430015  T
Q  379 tc 380  Q
    ||    
T  430016 tc 430017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 42446776 - 42446625
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |  ||||||    
T  42446776 gccccgtttggattggcttattcggagtttatgcgaacttatctactaacataagcctttttaaaggtgttt-aggtaaatcaataaaaacaacttatca 42446678  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagctta 328  Q
       ||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||| ||||||    
T  42446677 caatttcataagctgcttatgccatattttaataagatcaaattttaagctta 42446625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 328
Target Start/End: Original strand, 3585291 - 3585439
Alignment:
Q  179 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcattg 278  Q
    |||||||||| ||||||||   |||||||||||  ||||| |||  ||||| |||| ||||| |||||| || ||||| |||||||| |  ||||||       
T  3585291 ccgtttggatcggcttattcaaagcttatgtggatttatccactaacataaaccttattaaatgtgttttgg-taaattaataaaaacaatttatcacaa 3585389  T
Q  279 tttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagctta 328  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||| | ||||||    
T  3585390 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattatgagctta 3585439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22101353 - 22101210
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||| ||||| |||||  ||  ||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||| |  ||||||    
T  22101353 gccccgtttgaattgggttattcagaatttatgtggt-ttatctactaacataagcctttttaaaggtatttgta-taaatcaataaaaacaacttatca 22101256  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaatttt 321  Q
       ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | |||||||    
T  22101255 caatttcataagctgcttatgtcatattttaataagcccaaatttt 22101210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 174 - 384
Target Start/End: Original strand, 3706 - 3915
Alignment:
Q  174 aagccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattat 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3706 aagccccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttggg-taaataaataaaaatagcttat 3804  T
Q  274 cattgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttc 373  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||     
T  3805 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttt 3904  T
Q  374 gattctctctg 384  Q
    |||||||||||    
T  3905 gattctctctg 3915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 10236 - 10443
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10236 gccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggtttatctactctcataagccttcttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagtttatca 10334  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  10335 tagtttcataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 10434  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  10435 ttctctctg 10443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 177 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 501 - 295
Alignment:
Q  177 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  501 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagattatcat 403  T
Q  277 tgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgat 376  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  402 agtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 303  T
Q  377 tctctctg 384  Q
    ||||||||    
T  302 tctctctg 295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 213 - 6
Alignment:
Q  176 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatca 275  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  213 gccccgtttgtattggcttaagttgagtttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatca 115  T
Q  276 ttgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcga 375  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  114 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataatcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 15  T
Q  376 ttctctctg 384  Q
    |||||||||    
T  14 ttctctctg 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 178 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 145450 - 145246
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatcatt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  145450 cccgtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatcata 145352  T
Q  278 gtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcgatt 377  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  145351 gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctccttcgatt 145252  T
Q  378 ctctct 383  Q
    ||||||    
T  145251 ctctct 145246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 178 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 212 - 6
Alignment:
Q  178 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatc---tactctcataagcctttttaaaggtgtttggggtaaataaataaaaatagattatc 274  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  212 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactc-cataagcctttttaaaggtgtttggg-taaataaataaaaatagcttatc 115  T
Q  275 attgtttcataagctacttatgccatatttcaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgaactccttcg 374  Q
    || |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  114 atagtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 16  T
Q  375 attctctctg 384  Q
    ||||||||||    
T  15 attctctctg 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University