View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10434_low_5 (Length: 447)

Name: NF10434_low_5
Description: NF10434
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10434_low_5
NF10434_low_5
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (16-436)||(28786817-28787237)
chr6 (16-436)||(28792938-28793358)
chr6 (16-436)||(27603887-27604307)
chr6 (16-436)||(27717682-27718102)
chr6 (16-436)||(27610303-27610723)
chr6 (16-436)||(28781680-28782100)
chr6 (16-436)||(27592204-27592624)
chr6 (16-436)||(27676803-27677223)
chr6 (16-436)||(27530484-27530904)
chr6 (16-436)||(27426795-27427215)
chr6 (16-436)||(26803025-26803445)
chr6 (16-436)||(27705587-27706007)
chr6 (16-436)||(27679529-27679949)
chr6 (16-374)||(26656606-26656964)
chr6 (16-374)||(26762577-26762935)
chr6 (16-425)||(31285149-31285558)
chr6 (18-436)||(26647058-26647476)
chr6 (18-436)||(26753026-26753444)
chr6 (16-373)||(27337278-27337635)
chr6 (16-373)||(27398018-27398375)
chr6 (16-436)||(27697769-27698189)
chr6 (16-374)||(26884711-26885069)
chr6 (19-425)||(26623861-26624267)
chr6 (19-425)||(26729838-26730244)
chr6 (16-365)||(26862230-26862579)
chr6 (16-370)||(26143513-26143867)
chr6 (136-374)||(25492622-25492860)
chr6 (16-365)||(26056572-26056921)
chr6 (16-365)||(26076542-26076891)
chr6 (162-374)||(26824460-26824672)
chr6 (16-370)||(25539188-25539542)
chr6 (16-365)||(25580372-25580721)
chr6 (169-365)||(25483709-25483905)
chr6 (16-436)||(27215031-27215451)
chr6 (16-256)||(25511651-25511891)
chr6 (172-255)||(28140295-28140378)
chr6 (186-313)||(29843340-29843467)
chr6 (201-254)||(26937790-26937843)
chr6 (172-247)||(26950511-26950586)
chr6 (186-260)||(29826741-29826815)
chr6 (313-365)||(25511588-25511640)
chr6 (199-263)||(26849464-26849528)
chr6 (199-247)||(28097809-28097857)
chr6 (16-46)||(25492502-25492532)
chr6 (199-256)||(26975710-26975767)
chr6 (186-247)||(28243563-28243624)
chr6 (199-235)||(25074647-25074683)
chr6 (220-300)||(29845851-29845931)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (16-436)||(3895-4315)
scaffold0277 (16-436)||(12858-13278)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (19-436)||(18678742-18679159)
chr4 (16-436)||(18698579-18698999)
chr4 (16-436)||(18730683-18731103)
chr4 (19-436)||(18654659-18655076)
chr4 (16-436)||(18723264-18723684)
chr4 (16-436)||(18074340-18074760)
chr4 (199-272)||(5090319-5090392)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (16-436)||(8066-8486)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (16-436)||(2722-3142)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (18-436)||(267525-267943)
chr1 (75-375)||(28126917-28127217)
chr1 (19-374)||(28163562-28163916)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (16-436)||(60148-60568)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (15-436)||(29273020-29273441)
chr8 (325-374)||(16440694-16440743)
chr8 (334-374)||(16449533-16449573)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (163-263)||(3280411-3280511)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (186-263)||(16691619-16691696)
chr5 (13-61)||(16691821-16691869)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (186-247)||(43725-43786)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (220-300)||(2056-2136)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 28787237 - 28786817
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  28787237 tcaacatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagttgaa 28787138  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28787137 gtgtttttaaaaggagcacctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcaga 28787038  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28787037 aataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgcggactccatcatcagatccttcatcaaga 28786938  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |    
T  28786937 agcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatat 28786838  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28786837 ctccaataaacttgtattcat 28786817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 28793358 - 28792938
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  28793358 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagttgaa 28793259  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28793258 gtgtttttaaaaggagcacctcctggagatgtttcaatctatttgaagctgaactctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcaga 28793159  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28793158 aataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgcggactccatcatcagatccttcatcaaga 28793059  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |    
T  28793058 agcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatat 28792959  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28792958 ctccaataaacttgtattcat 28792938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Original strand, 27603887 - 27604307
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||    
T  27603887 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattgaatgcagcctttcctttatatgagaaattccctcactaacacctcctaacttaatttcaagttgaa 27603986  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603987 gtgtttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 27604086  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27604087 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaaga 27604186  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |  |||||||    
T  27604187 agagatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaataggataattggcaacatgtaagggctgacgactgatcttgttggagatttctttcactatct 27604286  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
     |||||||| || ||||||||    
T  27604287 ttccaataagctcgtattcat 27604307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Original strand, 27717682 - 27718102
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  | |||||    
T  27717682 tcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaacttaatttcaagttgaa 27717781  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27717782 gtgtttttaaaaggagctccttctgaagatgtttcaatttatttgaagttgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 27717881  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27717882 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaaga 27717981  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||    
T  27717982 agcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgacgactggtcttgttggagatgtatttgactatct 27718081  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  27718082 ctccaataaactcgtattcat 27718102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Original strand, 27610303 - 27610723
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  | |||||    
T  27610303 tcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaacttaatttcaagttgaa 27610402  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610403 gtgtttttaaaaggagctcctcctgaagatgtttcaatttatttgaagttgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 27610502  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610503 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaaga 27610602  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  27610603 agcgatttcacttcttgtacttgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatct 27610702  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  27610703 ctccagtaaactcgtattcat 27610723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 28782100 - 28781680
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  28782100 tcaacatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagttgaa 28782001  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28782000 gtgcttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 28781901  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    ||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||    
T  28781900 aattaagttataaactgcttttacaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatcctgactccattatcatatccttcaccaaga 28781801  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |    
T  28781800 agcgatttcacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtaattggcaacatgtaagtgctgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatat 28781701  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  28781700 cgccaataaacttgtattcat 28781680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Original strand, 27592204 - 27592624
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||| || ||||||| |||||||| |||||  | |||||    
T  27592204 tcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttccatgtagcctttcctttattttaggaattccttcgctaacacttcctaacttaatttcaagttgaa 27592303  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27592304 gtgtttttaaaaggagctcctgctggagatttttcaagttatttgaagctgaactctctttcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 27592403  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||| ||| |||||  |||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  27592404 aataaagttataaattgctttcgcaagtgttgattttcccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatgatcagatccttcatcaaga 27592503  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  27592504 agcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatttaagggctgtcgactgatcttgttggagatgtatttgactatct 27592603  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  27592604 ttccaataagcttgtattcat 27592624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Original strand, 27676803 - 27677223
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||| || ||||||| |||||||| |||||  | |||||    
T  27676803 tcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttccatgtagcctttcctttattttaggaattccttcgctaacacttcctaacttaatttcaagttgaa 27676902  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27676903 gtgtttttaaaaggagctcctgctggagatttttcaagttatttgaagctgaactctctttcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 27677002  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||| ||| |||||  |||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  27677003 aataaaattataaattgctttcgcaagtgttgattttcccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatgatcagatccttcatcaaga 27677102  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  27677103 agcgatttcatttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaagggttgttgactgatcttgttggagatgtatttgactatct 27677202  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  27677203 ttccaataagcttgtattcat 27677223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Original strand, 27530484 - 27530904
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||||| ||  ||    | |||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||  ||    
T  27530484 tcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttgcttaatgattggaattccctgactaacacctcctaacttaatgtccaatctaa 27530583  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
     |||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||| ||||||||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||    
T  27530584 ctgtttttaaaaggagtttctcttggagatgtttcaagttatctgaagtcgaattcactctcacattttctagaaaacataaaacttcaaattgatcagc 27530683  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  27530684 aatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacctatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtggacctcatcatcagatttttcatcaaga 27530783  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
     ||  |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||  || |||||||    
T  27530784 tgccctttcacatgttgtactcgggactgtaatccaacaggatatttggcaacatctaagggctcacgactaatcctgttggaaatgtcttcgactatct 27530883  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
     ||||||||||| ||||||||    
T  27530884 ttccaataaactcgtattcat 27530904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Original strand, 27426795 - 27427215
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |   | |||||||| |||    || ||||||||||| ||| || |||||| |||||||| |||||    
T  27426795 tcaacgtcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacaacctttcctttatgattgagattccctcactgacatctgctaacttaattttcagttgaa 27426894  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
    |||| |||  |||||||  |||||||| | |||||||  ||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  27426895 gtgtctttgaaaggagcatctcctggaaacgtttcaagctatttgaagctgaattctctctgacttgttcaagaaaacataaaccttcaaattgatcagc 27426994  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||| ||| |||||  |||| |||||||||| ||  |||||||||    
T  27426995 aacaaaattatagattgctcttgcaagtgttgatttacctgagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaaga 27427094  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  27427095 agcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaaggactgtcgactgatcttgttggagatgtatttgactatct 27427194  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
     |||||||| || ||||||||    
T  27427195 ttccaataagctcgtattcat 27427215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 26803445 - 26803025
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |   || ||||||| ||||   | ||| ||||||| ||||    ||||||  |||||||||  |     
T  26803445 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttatttctacacagtctttcctttataattggaatcccctcacaaacatgatctaacttgattttcaatccag 26803346  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
     |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||  | |||||||||| | | |||||||||||||||    
T  26803345 ttgtttttagaagaagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagc 26803246  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||  | ||||||| ||| |||||  |||| |||||||||| ||  |||||||||    
T  26803245 aacaaaattatagattgctcttgcaagtgctgatttacccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaaga 26803146  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  26803145 agcgatttcacttcttgtactcgagagtgcaatccaacagggtaattagcaacatgtaagggctgacgattgatcttgttggagatgtatttgactatct 26803046  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  26803045 ctccaatcaacttgtattcat 26803025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Original strand, 27705587 - 27706007
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||| |||  | | ||| ||||||| ||||    ||||||  |||||| ||  |     
T  27705587 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacagcctttcctttatgaatggaatcccctcacaaacatgatctaactttattttcgatccag 27705686  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
     |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| | ||||  |||||| |||||||||||||  | |||||||||| | | |||||||||||||||    
T  27705687 ttgtttttagaagaagcttctcttggagatgtttcaagtcattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagc 27705786  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  | ||| ||| ||| |||||  |||| |||||||||| ||  |||||||||    
T  27705787 aacaaaattataaattgctcttgcaagtgttgatttacccaagcctccaatgccaaaaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaaga 27705886  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  27705887 agtgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaagggatgtcgactgatcttgttggagatgtatttgactatct 27705986  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  27705987 ttccaataagcttgtattcat 27706007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 27679949 - 27679529
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||  ||||||| |||    | ||||||||||||||||    |||||| ||||| |||         
T  27679949 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacataatctttcctttatgactggaattccctcactaacatggtctaacttaatttccaaacctg 27679850  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
     |||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||||||||||  | |||||||||||| | ||| |||||||| ||    
T  27679849 ttgtttttaaaaggagcttctcttggagatatttcaagttattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacatgaaccttcgaattgatctgc 27679750  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    || ||||||||| |||  | |||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||| ||| |||||  |||| |||||||| ||||  |||||||||    
T  27679749 aacaaaattatagatttgtcttgcaagtgttgatttccccaaacctccaatgccataaattccaaccatatggaccccatcatcggatccctcatcaaga 27679650  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  27679649 agcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaagggctgtcgactgatcttgttggagatgtatttgactatct 27679550  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  27679549 ttccaataagcttgtattcat 27679529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26656964 - 26656606
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||| |||    | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |  ||    
T  26656964 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggaattccctcactaacatctcctaacttaatattcactctaa 26656865  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
      ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||| |||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||    
T  26656864 cagtttttgaaaggagctcctcctggagatgtttcaaattattatgagctgaattctctctgacattgtgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagc 26656765  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  | ||  |||| | |||||  | |||||||    
T  26656764 gacaaaattataaattgctttggcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgagaacctcatccttagatcccttatcaaga 26656665  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaa 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26656664 agcaatttcacttgttgtactcgagactctaatccaacagggtatttggcaacatgtaa 26656606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26762935 - 26762577
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||| |||    | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |  ||    
T  26762935 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggaattccctcactaacatctcctaacttaatattcactctaa 26762836  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
      ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||| |||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||    
T  26762835 cagtttttgaaaggagctcctcctggagatgtttcaaattattatgagctgaattctctctgacattgtgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagc 26762736  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  | ||  |||| | |||||  | |||||||    
T  26762735 gacaaaattataaattgctttggcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgagaacctcatccttagatcccttatcaaga 26762636  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaa 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26762635 agcaatttcacttgttgtactcgagactctaatccaacagggtatttggcaacatgtaa 26762577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31285558 - 31285149
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||  ||    | ||||||||||||||||    |||||| ||||| ||||  ||    
T  31285558 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccctcactaacatggtctaacttaatttccaatccaa 31285459  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
     |||||| | |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||  | |||||||||| | |  |||||||||||| |    
T  31285458 ttgttttcaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttatttttagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataatccgtcaaattgatcacc 31285359  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||  | || || | || || |   | |||||||    
T  31285358 aataaaattatagattgctcttgcaagtgttgatttacccaagcctcctatcccataaagtcctaccatgtgtacccctttattagtttccttatcaaga 31285259  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| |  ||||| |    
T  31285258 agcaatttcacttgttgtattcgaaacttaaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggcacacgattgatcttgttggagatgtatttgactatgt 31285159  T
Q  416 ctccaataaa 425  Q
    ||||||||||    
T  31285158 ctccaataaa 31285149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 26647476 - 26647058
Alignment:
Q  18 aacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaagt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||  ||    | ||||||||||| || |  ||| |||| ||| |||| || || |    
T  26647476 aacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccctcacaaatatgtccaaacttaatgttcactttaact 26647377  T
Q  118 gtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaa 217  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||   |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||   | |||||||||||||||||    
T  26647376 gtttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagttattatgagctgaattctctctgacattatgaagaaagcatacaccttcaaattgatcagcaa 26647277  T
Q  218 taaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaag 317  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||  || |||||||||    
T  26647276 caaaattataaatcgctttggcaagtgttgatttacccaaacctccagtaccataaagtcctaccatatggaccccttcatcagattctttatcaagaag 26647177  T
Q  318 caatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatctct 417  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||      |||| | ||||||||||||||||  || |||||||      
T  26647176 caatttcacttgttctaatcgggactctaatccaacagggtatttggctacatgtaaaatgacacgattgatcttgttggagatgtcttcgactatcttc 26647077  T
Q  418 ccaataaacttgtattcat 436  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26647076 ccaataaacttgtattcat 26647058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 26753444 - 26753026
Alignment:
Q  18 aacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaagt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||  ||    | ||||||||||| || |  ||| |||| ||| |||| || || |    
T  26753444 aacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccctcacaaatatgtccaaacttaatgttcactttaact 26753345  T
Q  118 gtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaa 217  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||   |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||   | |||||||||||||||||    
T  26753344 gtttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagttattatgagctgaattctctctgacattatgaagaaagcatacaccttcaaattgatcagcaa 26753245  T
Q  218 taaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaag 317  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||  || |||||||||    
T  26753244 caaaattataaatcgctttggcaagtgttgatttacccaaacctccagtaccataaagtcctaccatatggaccccttcatcagattctttatcaagaag 26753145  T
Q  318 caatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatctct 417  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||      |||| | ||||||||||||||||  || |||||||      
T  26753144 caatttcacttgttctaatcgggactctaatccaacagggtatttggctacatgtaaaatgacacgattgatcttgttggagatgtcttcgactatcttc 26753045  T
Q  418 ccaataaacttgtattcat 436  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26753044 ccaataaacttgtattcat 26753026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 27337278 - 27337635
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||  ||    | ||||||||||  |||| ||| ||||| ||| |||| |||||    
T  27337278 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcttcctacatagcctttccttaatgattggaattccctcagaaacatctcttaacttaatgttcagttgaa 27337377  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
     |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| || ||   |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||   | |||||||||||||||    
T  27337378 ctgtttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagtttttacgagctgaattctctctaacattatgaagaaagcatactccttcaaattgatcagc 27337477  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||   ||| || |||||||||   |||||||||    
T  27337478 aatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgattttcccaagcctctagtaccataaagtcctaccatgttgaccccttcatcagattcctcatcaaga 27337577  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgta 373  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  27337578 agcaattttacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtatttggcaacgtgta 27337635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 27398018 - 27398375
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||  ||    | ||||||||||  |||| ||| ||||| ||| |||| |||||    
T  27398018 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcttcctacatagcctttccttaatgattggaattccctcagaaacatctcttaacttaatgttcagttgaa 27398117  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
     |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| || ||   |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||   | |||||||||||||||    
T  27398118 ctgtttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagtttttacgagctgaattctctctaacattatgaagaaagcatactccttcaaattgatcagc 27398217  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||   ||| || |||||||||   |||||||||    
T  27398218 aatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgattttcccaagcctctagtaccataaagtcctaccatgttgaccccttcatcagattcctcatcaaga 27398317  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgta 373  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  27398318 agcaattttacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtatttggcaacgtgta 27398375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Original strand, 27697769 - 27698189
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||  ||    | |||||| |||||||||    |||| | ||||| | ||  |     
T  27697769 tcaacatcgtcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccgtcactaacatggtctaaattaatttccgatccag 27697868  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
     |||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||  |||||| |||  ||||||||| | |||||||||| | | |||||||||||||||    
T  27697869 ttgttttaaaaaggagcttctcttggagatgttccaagttatttttagctgaattcattctcacattatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagc 27697968  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    ||  |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||  | ||| ||| ||| |||||  |||| |||||||||||||  | |||||||    
T  27697969 aaccaaattatagattgctcttgcaagtgttgattttcccaagcctccaatcccaaaaattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaaga 27698068  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    |   ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  27698069 attgatttcactctttgtacttgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatct 27698168  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  27698169 cttcaataaacttgtattcat 27698189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26885069 - 26884711
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||    | |||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||| ||    
T  26885069 tcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctatgtagtctttcctttatgagtggaattccctcactaacatctcctaacttaatgtttaatttaa 26884970  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
     |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||   || ||| ||||| || || || |  |||||||||   |||||||||||||||||    
T  26884969 ttgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaagttattatgagttgaattctccctgactttatgcagaaaacatacacattcaaattgatcagc 26884870  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  | || || || | ||||   | |||||||    
T  26884869 aacataattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaattcctaccatgtgtaccccttcgttagattccttatcaaga 26884770  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaa 374  Q
    |||||||| | ||||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  26884769 agcaattttaattgttgtactcggtactgtaatccaacagggtatttggctacatgtaa 26884711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 26624267 - 26623861
Alignment:
Q  19 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaagtg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||  ||    ||||||||||||||||||    | |||| ||||| ||||  |  ||    
T  26624267 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattgaaattccctcactaacatggtccaacttaatttccaatccagttg 26624168  T
Q  119 tttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 218  Q
    |||| | |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||  | |||||||||| | | |||||||||||||||||     
T  26624167 ttttaaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaac 26624068  T
Q  219 aaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaagc 318  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| | ||| |||||  |||| |||||||||||||  | |||||||||     
T  26624067 aaagttatagattgctcttgcaagtgttgatttgcccaagcctccaatcccatacattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaagt 26623968  T
Q  319 aatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatctctc 418  Q
     ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| |  ||||||| |     
T  26623967 gatttcacttgttgtagttgagactgtaatccaacagggtatttagcaacatgtaagggcacacgattgatcttgttggagatgtatttgactatctttt 26623868  T
Q  419 caataaa 425  Q
    |||||||    
T  26623867 caataaa 26623861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 26730244 - 26729838
Alignment:
Q  19 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaagtg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||  ||    ||||||||||||||||||    | |||| ||||| ||||  |  ||    
T  26730244 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattgaaattccctcactaacatggtccaacttaatttccaatccagttg 26730145  T
Q  119 tttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 218  Q
    |||| | |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||  | |||||||||| | | |||||||||||||||||     
T  26730144 ttttaaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaac 26730045  T
Q  219 aaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaagc 318  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| | ||| |||||  |||| |||||||||||||  | |||||||||     
T  26730044 aaagttatagattgctcttgcaagtgttgatttgcccaagcctccaatcccatacattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaagt 26729945  T
Q  319 aatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatctctc 418  Q
     ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| |  ||||||| |     
T  26729944 gatttcacttgttgtagttgagactgtaatccaacagggtatttagcaacatgtaagggcacacgattgatcttgttggagatgtatttgactatctttt 26729845  T
Q  419 caataaa 425  Q
    |||||||    
T  26729844 caataaa 26729838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26862579 - 26862230
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||| ||||||| ||||   | ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| ||    
T  26862579 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaa 26862480  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
     |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  ||||   || ||| |||||||| || || | ||||||||||   | |||||||||||| ||    
T  26862479 ctgtttttaaaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggc 26862380  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||  | || || |||||||||     |||||||    
T  26862379 aacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatcaaga 26862280  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggc 365  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||| || |||||    
T  26862279 agcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggc 26862230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26143867 - 26143513
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  ||| |||||||  ||    |||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||| ||    
T  26143867 tcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaa 26143768  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
     |||| ||| |||||| || ||||||||||||||||  |||||   |  ||| |||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||    
T  26143767 ctgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagc 26143668  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||| |||||  |||| ||||| |     ||||||    
T  26143667 aacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccaaaaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaaga 26143568  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacat 370  Q
    ||||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  26143567 agcaatttcacttcttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 26143513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 374
Target Start/End: Original strand, 25492622 - 25492860
Alignment:
Q  136 tcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgctt 235  Q
    |||||||||| |||||| ||  ||| || ||| ||||||||||||| | | ||||||||| | | |||||||||||||||||| || ||||| |||| ||    
T  25492622 tcctggagatctttcaagtttcttggagttgaattctctctcacatctcctagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaatgaagttatagattgatt 25492721  T
Q  236 ttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtac 335  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||   |||| ||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25492722 ttgcaagtgttgatttacctaagcctccagtaccataaagtcctaccatgtggaactcatcctcagatacctcatctagaagcaatttcacgtgttgtac 25492821  T
Q  336 tcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaa 374  Q
    ||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25492822 tcgggattgtaatccaacagggtatttggcaacatgtaa 25492860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26056921 - 26056572
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||| ||||   |  ||||||||||||||| || |||||| |   |  |||| ||    
T  26056921 tcaacatcgtcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttataattggtattccctcactaacatcttctaactgaccgtcaaatttaa 26056822  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
     | |||||  |||||||| || ||||||||||||||| || ||   || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||    
T  26056821 ctatttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagc 26056722  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||  |||  ||||| |     ||||||    
T  26056721 aatagaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccggtaccaaaaattcctaccatgcggacctcattctcagagcccatgtcaaga 26056622  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggc 365  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  26056621 agcaatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggc 26056572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26076891 - 26076542
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||| ||||   |  ||||||||||||||| || ||| || |   |  |||| ||    
T  26076891 tcaacatcgtcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttataattggtattccctcactaacatcttctatctgaccgtcaaatttaa 26076792  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
     | |||||  |||||||| || ||||||||||||||| || ||   || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||    
T  26076791 ctatttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagc 26076692  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||  |||  ||||| |     ||||||    
T  26076691 aatagaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccggtaccaaaaattcctaccatgcggacctcattctcagagcccatgtcaaga 26076592  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggc 365  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  26076591 agcaatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggc 26076542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 162 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26824672 - 26824460
Alignment:
Q  162 agctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcct 261  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||  |   |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  26824672 agctgaattctctctcacgttctcaagaaaacaaaaaacttcaaatttatcagcaatagaattaaaagttgcttttgcaagtgttgatttacctaaacct 26824573  T
Q  262 ccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataat 361  Q
    ||  |||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||||   | |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |    
T  26824572 ccaataccgtaaagtcctaccatatggaccacatcatcagattcgttatcaagaagagatttcacttgttgtactcgggactgtaatccaaccgggtatt 26824473  T
Q  362 tggcaacatgtaa 374  Q
    |||||||||||||    
T  26824472 tggcaacatgtaa 26824460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25539542 - 25539188
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||| |||    |  ||||||||||||||| || |||||| |   |  |||| ||    
T  25539542 tcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttttagatagtctttcctttatgattgttattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaa 25539443  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
     | |||||  |||||||| ||  |||||||||||||| |||||   |  ||| |||||||| ||||| | ||||||||||     |||||||||||||||    
T  25539442 ctatttttgaaaggagcttcttttggagatgtttcaagttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaacttcaaattgatcagc 25539343  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |     ||||||    
T  25539342 aacaaaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccaagtcaaga 25539243  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacat 370  Q
    |||||||||||||||| || | | ||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  25539242 agcaatttcacttgttctattggggactgtaatccaacagggtatttggccacat 25539188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 25580721 - 25580372
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||  |  ||| |||||||  ||    |||||||||||||||||| || |||||| ||  |  |||| ||    
T  25580721 tcaacatcatcaaaaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctactaacttaaagtaaaatttaa 25580622  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
     | || ||| |||||| |  |  |||||||||||||| |||||   |  |||  ||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||    
T  25580621 ctattattaaaaggagataataatggagatgtttcaagttattaagaattgaaatctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagc 25580522  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||  |||| ||||| |     ||||||    
T  25580521 aacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtggaccacatcctcagagcccatgtcaaga 25580422  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggc 365  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  25580421 agcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggc 25580372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 169 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 25483905 - 25483709
Alignment:
Q  169 ttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtac 268  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  25483905 ttctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaagaaaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtac 25483806  T
Q  269 cataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggc 365  Q
    || ||||||||||||| |||||  |||| ||||| |     |||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  25483805 caaaaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggc 25483709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 27215451 - 27215031
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||| |||  | ||| |  | ||| |||||||||||||||||||||| |   |  |||  ||    
T  27215451 tcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttcttttgacatagcattttttttatctttgtaatcccctcactaacacctcctaacttatcgtctaatctaa 27215352  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
      ||||| | ||||| ||  ||||| || |||||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||| ||| |||||| |||| | |||||| ||||||||    
T  27215351 ccgttttcataaggatcttttcctgcaggtgtttcaagttatttaaagttgaattctctttcacatcttctagaaaatatgaaccttcaaactgatcagc 27215252  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  |||| ||||||||||||  ||||  | || | |||||  |  ||||||    
T  27215251 aatgaaattaaaaattgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagctccatgaagtcctaccatgtggacctcttccttagatcccttgtcaaga 27215152  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    |||||||| |||||||||| | | |  || ||||||||||| |  ||||||||||||||    | |||| |  ||||||| |||||||  || |||||||    
T  27215151 agcaattttacttgttgtatttgggtatgtaatccaacagggtgtttggcaacatgtaaaaaatcacgattcgtcttgtttgagatgtcttcaactatct 27215052  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
       ||||||||||||||||||    
T  27215051 tctcaataaacttgtattcat 27215031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25511891 - 25511651
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||| ||||   |  ||||||||||||||| || ||| || |   |  |||| ||    
T  25511891 tcaacatcgtcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttataattggtattccctcactaacatcttctatctgaccgtcaaatttaa 25511792  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
     | |||||  |||||||| || ||||||||||||||| || ||   || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||    
T  25511791 ctatttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagc 25511692  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttaccca 256  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25511691 aatagaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttaccca 25511651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28140378 - 28140295
Alignment:
Q  172 tctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttaccc 255  Q
    ||||||||||| | |||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28140378 tctctcacattatgaagaaaacacaaacattcaaattgatcggcaataaaattataaattgcttgtgcaagtgttgttttaccc 28140295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 313
Target Start/End: Original strand, 29843340 - 29843467
Alignment:
Q  186 aagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatc 285  Q
    |||||||||  | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||  | |||||||  || ||||||    
T  29843340 aagaaaacacaaacattcaaatttatcagcaatcaaattataaattgctcgagcaagtgttgttttacccaatccaccaattccataaatccccaccatc 29843439  T
Q  286 cggactccatcatcagatctttcatcaa 313  Q
     |||||| ||||||| || || ||||||    
T  29843440 tggactcgatcatcaaattttgcatcaa 29843467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26937843 - 26937790
Alignment:
Q  201 ttcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacc 254  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26937843 ttcaaattgatcaccaatcaaattataaattgctcgtgcaagtgttgatttacc 26937790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26950586 - 26950511
Alignment:
Q  172 tctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttg 247  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||  ||||||||||    
T  26950586 tctctcacattgtgaagaaaacatttgcattcaaattgattagcaatcaagttataaactgcttgagcaagtgttg 26950511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29826815 - 29826741
Alignment:
Q  186 aagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcc 260  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  29826815 aagaaaacacaagcattcaaatttatcaccaatcatattataaattgctcgagcaagtgttgttttacccaatcc 29826741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 25511640 - 25511588
Alignment:
Q  313 agaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggc 365  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  25511640 agaagcaatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggc 25511588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26849528 - 26849464
Alignment:
Q  199 cattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctcc 263  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||| ||| |||| ||||||    
T  26849528 cattcaaattgatcagcaatcgaattataaactgcttgagcaagtgttgtttttcccattcctcc 26849464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 247
Target Start/End: Original strand, 28097809 - 28097857
Alignment:
Q  199 cattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttg 247  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28097809 cattcaaattgaccagcaatgaaattataaaccgcttttgcaagtgttg 28097857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 25492502 - 25492532
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttct 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25492502 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttct 25492532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26975767 - 26975710
Alignment:
Q  199 cattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttaccca 256  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||    
T  26975767 cattcaaattgattagcaatcaaattataaactgcttgagcaagtgttgtcttaccca 26975710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28243624 - 28243563
Alignment:
Q  186 aagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttg 247  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28243624 aagaaaacataaacaatcaaattgatcagctatggaattataaactgctcttgcaagtgttg 28243563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25074683 - 25074647
Alignment:
Q  199 cattcaaattgatcagcaataaaattataaattgctt 235  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25074683 cattcaaattgattagcaatcaaattataaattgctt 25074647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 300
Target Start/End: Original strand, 29845851 - 29845931
Alignment:
Q  220 aaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatca 300  Q
    |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||  | |||||||  || |||||| |||||| |||||||    
T  29845851 aaattataaattgctcgagcaagtgttgttttacccaatccaccaattccataaatccccaccatctggactcgatcatca 29845931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Original strand, 3895 - 4315
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||    
T  3895 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgcagcctttcctttatatgagaaattccctcactaacacctcctaacttaatttcaagttgaa 3994  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3995 gtgtttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattcatcagc 4094  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||    
T  4095 aataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgtgggctccatgatcagatccttcatcaaga 4194  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||  |||||||    
T  4195 agcgatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgatgactgatcttgttggagatgttcttgactatct 4294  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4295 ctccaataaacttgtattcat 4315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Original strand, 12858 - 13278
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||  |||||    
T  12858 tcaacatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacttcctaacttagttttctgttgaa 12957  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12958 gtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcaga 13057  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13058 aataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatccttcatcaaga 13157  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |    
T  13158 agcgatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatat 13257  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  13258 cgccaataaacttgtattcat 13278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 19 - 436
Target Start/End: Original strand, 18678742 - 18679159
Alignment:
Q  19 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaagtg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||    
T  18678742 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgaaagtg 18678841  T
Q  119 tttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 218  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18678842 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 18678941  T
Q  219 aaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaagc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18678942 aaaattataaattgcttttgcaagtgttaatttacccatgcctccaatgccataaagtcctaccatgcggactccatcataagatcattcatcaagaagc 18679041  T
Q  319 aatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatctctc 418  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| |  ||||||||||    
T  18679042 gatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgccgactgatcttgttagagacgtatttgactatctctc 18679141  T
Q  419 caataaacttgtattcat 436  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18679142 caataaacttgtattcat 18679159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Original strand, 18698579 - 18698999
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   |    
T  18698579 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgcta 18698678  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18698679 gtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 18698778  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18698779 aataaaattataaattgctttcgcaagtgttgatttacccatgcctccaatgccataaagtcctaacatgcggactccatcatcagatcctttatcaaga 18698878  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||| |    
T  18698879 agcgctttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgacgactgatcttgttggagacgtatttgactatat 18698978  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18698979 ctccaataaacttgtattcat 18698999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Original strand, 18730683 - 18731103
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   |    
T  18730683 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatatagggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgcta 18730782  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18730783 gtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 18730882  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||    
T  18730883 aataaaattataaattactttagcaagtgttgattttcccatgcctccaataccataaagtcctatcatgcggactccaccataagatcctttatcaaga 18730982  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |  |||||||    
T  18730983 agcgatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggtaaatggcaacatgtaagggctgacgactgatcttgttggagacatatttgactatct 18731082  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
     | ||||||||||||||||||    
T  18731083 tttcaataaacttgtattcat 18731103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 19 - 436
Target Start/End: Original strand, 18654659 - 18655076
Alignment:
Q  19 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaagtg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||    
T  18654659 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgaaagtg 18654758  T
Q  119 tttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 218  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18654759 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagatgaattttctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 18654858  T
Q  219 aaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaagc 318  Q
    | |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  18654859 acaattattaattgattttgcaagtgttgattttcccatgcctccaataccataaagtcctatcatgcggactccaccatcagatcctttatcaagaagc 18654958  T
Q  319 aatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatctctc 418  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |  ||||||| ||    
T  18654959 gatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggtaactggcagcatgtaagggctgacgactgatcttgttggagacatatttgactatctttc 18655058  T
Q  419 caataaacttgtattcat 436  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18655059 caataaacttgtattcat 18655076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Original strand, 18723264 - 18723684
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |  ||    
T  18723264 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagccttttctttatataaggaattctctcactaacacctcctaagttaattttcagtgaaa 18723363  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18723364 gtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacgttttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 18723463  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||    
T  18723464 aataaaattataaattccttttgcaagtgttgattttcccatgcctccaataccataaagtcctatcatgcggactccaccattagatcctttatcaaga 18723563  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  || |  |||||||    
T  18723564 agcgatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggtaagtggcaacatgtaagggctgacgactgatcttgttgttgacatatttgactatct 18723663  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  18723664 ttccaataaacttgtattcat 18723684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 18074760 - 18074340
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |   | |||||||| |||    || ||||||||||| ||| || |||||| |||||||| |||||    
T  18074760 tcaacgtcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacaacctttcctttatgattgagattccctcactgacatctgctaacttaattttcagttgaa 18074661  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
    |||| |||  |||||||  |||||||| | |||||||  ||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  18074660 gtgtctttgaaaggagcatctcctggaaacgtttcaagctatttgaagctgaattctctctgacttgttcaagaaaacataaaccttcaaattgatcagc 18074561  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||| ||| |||||  |||| |||||||||| ||  |||||||||    
T  18074560 aacaaaattatagattgctcttgcaagtgttgatttacctgagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaaga 18074461  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  18074460 agcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaaggactgtcgactgatcttgttggagatgtatttgactatct 18074361  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
     |||||||| || ||||||||    
T  18074360 ttccaataagctcgtattcat 18074340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 272
Target Start/End: Original strand, 5090319 - 5090392
Alignment:
Q  199 cattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccata 272  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| || |||||    
T  5090319 cattcaaattgatgagcaatgaaattgtaaattgcttttccaagtgtggttttacccattcctccagtcccata 5090392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 8486 - 8066
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||  |||||    
T  8486 tcaacatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacttcctaacttagttttctgttgaa 8387  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8386 gtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcaga 8287  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8286 aataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatccttcatcaaga 8187  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |    
T  8186 agcgatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatat 8087  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  8086 cgccaataaacttgtattcat 8066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Original strand, 2722 - 3142
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  | |||||    
T  2722 tcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaacttaatttcaagttgaa 2821  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2822 gtgtttttaaaaggagctccaactgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 2921  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2922 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaaga 3021  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||    
T  3022 agcgatttcacttgttgtactcgagacttcattccaacagggtaattggcaacatgtaagggttgacgactggtcttgttggagatgtatttgactatct 3121  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  3122 ctccaataaactcgtattcat 3142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 436
Target Start/End: Original strand, 267525 - 267943
Alignment:
Q  18 aacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaagt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||  ||    | ||| ||||||||||||    |||||| ||||| ||||  |  |    
T  267525 aacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaatgccctcactaacatggtctaacttaatttccaatccagtt 267624  T
Q  118 gtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaa 217  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||  |||||| || ||||||||||  | |||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  267625 gtttttaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttacttatagctgaattttctctcacatcatgaagaaaacataatccttcaaattgatcagcaa 267724  T
Q  218 taaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaag 317  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  | ||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  267725 taaaattatagattgctcttgcaagggttgatttacccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaag 267824  T
Q  318 caatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatctct 417  Q
    ||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  267825 caatttcacttgttgtacttgagaccataatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctcacgactgatcttgttggagatgtatttgactatctct 267924  T
Q  418 ccaataaacttgtattcat 436  Q
    |||||||||||||||||||    
T  267925 ccaataaacttgtattcat 267943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 75 - 375
Target Start/End: Original strand, 28126917 - 28127217
Alignment:
Q  75 aattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaagtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctct 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  || |||||| | ||||||||  || |||||||||||||| |||| || || |||  |||||    
T  28126917 aattccctcactaacacctcctaacttaatgtccaatccaactgttttcaaaaggagcttttcttggagatgtttcaaattatatggagttgaaatctct 28127016  T
Q  175 ctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaa 274  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  28127017 ctcacatcttctagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaagcctccaataccataaa 28127116  T
Q  275 gtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaa 374  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| |||  | ||| |||||||| ||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28127117 gtcctaccatgtggacctcatcatcatatcccttatcgagaagcaaattcacttgttgtacttggtcctgtaatccaacaggatatttggcaacatgtaa 28127216  T
Q  375 g 375  Q
    |    
T  28127217 g 28127217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 374
Target Start/End: Original strand, 28163562 - 28163916
Alignment:
Q  19 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaagtg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||  | |||    | |||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||  || ||    
T  28163562 acatcatcaagaatcaaaagaattttatttctatgtagcctttgttttatgattgtaattccctcactaacacctcctaacttaatgtccgatctaactg 28163661  T
Q  119 tttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 218  Q
    |||  | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||   || || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  28163662 tttcaaaaag-agctcttcctggagatgtttcaagttggatggagttgaattctctctcacatcttctagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaat 28163760  T
Q  219 aaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaagc 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||  | ||| ||||||    
T  28163761 gaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaagcctccagtatcataaagtcctaccatgtggacctcatcatcatatcccttatcgagaagc 28163860  T
Q  319 aatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaa 374  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  28163861 aatttcacttgttgtacttgagattgtaatccaacaggatattttgcaacatgtaa 28163916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 60568 - 60148
Alignment:
Q  16 tcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattgaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |   | |||||||| |||    || ||||||||||| ||| || |||||| |||||||| |||||    
T  60568 tcaacgtcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacaacctttcctttatgattgagattccctcactgacatctgctaacttaattttcagttgaa 60469  T
Q  116 gtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagc 215  Q
    |||| |||  |||||||  |||||||| | |||||||  ||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  60468 gtgtctttgaaaggagcatctcctggaaacgtttcaagctatttgaagctgaattctctctgacttgttcaagaaaacataaaccttcaaattgatcagc 60369  T
Q  216 aataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaaga 315  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||| ||| |||||  |||| |||||||||| ||  |||||||||    
T  60368 aacaaaattatagattgctcttgcaagtgttgatttacctgagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaaga 60269  T
Q  316 agcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatct 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  60268 agcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaaggactgtcgactgatcttgttggagatgtatttgactatct 60169  T
Q  416 ctccaataaacttgtattcat 436  Q
     |||||||| || ||||||||    
T  60168 ttccaataagctcgtattcat 60148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 436
Target Start/End: Original strand, 29273020 - 29273441
Alignment:
Q  15 atcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagcctttcctctatataagaaattccctcactaacacctcctaactcaattttcaattga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |||||| |||| ||||   | ||| ||||||||||||    |||||| ||||| ||||  |    
T  29273020 atcaacatcatcgagaatcaaaagaattttctttctacttagcctctcctttataattggaatcccctcactaacatgatctaacttaatttccaatcca 29273119  T
Q  115 agtgtttttagaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcag 214  Q
      |||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||  | |||||||||| |   ||||||||||||||    
T  29273120 gttgtttttaaaaggagtttctcttggagatgtttcaagttatttttagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaatcttcaaattgatcag 29273219  T
Q  215 caataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaag 314  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| || ||  | ||||||| ||| |||||  |||  |||||||||||||  | ||||||    
T  29273220 caaaaaaattatagattgctcttgcaagggttgatttacccaagccaccaatcccataaattccaaccatatggatcccatcatcagatccattatcaag 29273319  T
Q  315 aagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatc 414  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||| |  ||||||    
T  29273320 aagcgatttgacttgttgtacttgagactgtaatccaacagggtatttggcaacatgtaagggcacgcggctgatcttgttggagatgtatttgactatc 29273419  T
Q  415 tctccaataaacttgtattcat 436  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  29273420 tctccgataaacttgtattcat 29273441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16440743 - 16440694
Alignment:
Q  325 acttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaa 374  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16440743 acttggtgcactcgagactccaatccaacagggtaattagcaacatgtaa 16440694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16449573 - 16449533
Alignment:
Q  334 actcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaa 374  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16449573 actcgagactccaatccaactggataattcgcaacatgtaa 16449533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3280511 - 3280411
Alignment:
Q  163 gctgagttctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctc 262  Q
    ||||| || ||||||||||| | ||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||  ||||||| |||||    
T  3280511 gctgaattttctctcacattgtgaagaaaacatacacattcaaattgattagcaatgaaattataaactgctcttgcaagagttgtcttacccattcctc 3280412  T
Q  263 c 263  Q
    |    
T  3280411 c 3280411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16691696 - 16691619
Alignment:
Q  186 aagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctcc 263  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||| | ||||||    
T  16691696 aagaaaacacaaacattcaaattgatcagcaatcaaattataaattgctcgagcaagtgttgttttaccgattcctcc 16691619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 16691869 - 16691821
Alignment:
Q  13 tcatcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgtagccttt 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||||||    
T  16691869 tcatcaacatcatcgagaatcaaaagaacctttttttgttgtagccttt 16691821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 43786 - 43725
Alignment:
Q  186 aagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttg 247  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  43786 aagaaaacataaacaatcaaattgatcagctatggaattataaactgctcttgcaagtgttg 43725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 300
Target Start/End: Original strand, 2056 - 2136
Alignment:
Q  220 aaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccggtaccataaagtcctaccatccggactccatcatca 300  Q
    |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||  | |||||||  || |||||| |||||| |||||||    
T  2056 aaattataaattgctcgagcaagtgttgttttacccaatccaccaattccataaatccccaccatctggactcgatcatca 2136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University