View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1043_low_3 (Length: 603)

Name: NF1043_low_3
Description: NF1043
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1043_low_3
NF1043_low_3
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (112-594)||(24206349-24206833)
chr2 (112-594)||(6784106-6784581)
chr2 (175-583)||(14387923-14388331)
chr2 (146-590)||(2767799-2768235)
chr2 (175-590)||(6798420-6798827)
chr2 (178-590)||(17697124-17697528)
chr2 (193-585)||(34401010-34401394)
chr2 (249-590)||(44708644-44708977)
chr2 (175-476)||(16763860-16764153)
chr2 (315-582)||(42518258-42518525)
chr2 (193-480)||(39456091-39456370)
chr2 (179-384)||(19907308-19907504)
chr2 (119-349)||(40561083-40561305)
chr2 (312-434)||(4047377-4047499)
chr2 (310-434)||(20941733-20941856)
chr2 (120-233)||(37021388-37021501)
chr2 (482-590)||(39663887-39663995)
chr2 (312-434)||(26581545-26581667)
chr2 (312-434)||(161432-161554)
chr2 (364-431)||(38149339-38149406)
chr2 (356-427)||(7744707-7744778)
chr2 (287-350)||(19581960-19582023)
chr2 (491-536)||(11022125-11022170)
chr2 (491-536)||(28247629-28247674)
chr2 (312-386)||(11313399-11313473)
chr2 (548-590)||(19581912-19581954)
chr2 (491-536)||(38149490-38149535)
chr2 (496-536)||(10715876-10715916)
chr2 (406-434)||(11022252-11022280)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (112-594)||(15307124-15307598)
chr8 (112-594)||(15487493-15487967)
chr8 (112-594)||(27404962-27405435)
chr8 (117-594)||(29238031-29238500)
chr8 (175-590)||(41041407-41041813)
chr8 (175-590)||(40338495-40338909)
chr8 (175-480)||(5037331-5037628)
chr8 (119-427)||(27692005-27692305)
chr8 (175-427)||(33707795-33708039)
chr8 (186-435)||(13485114-13485351)
chr8 (241-458)||(3152485-3152702)
chr8 (175-349)||(22273154-22273328)
chr8 (119-349)||(42942633-42942855)
chr8 (450-590)||(9672123-9672263)
chr8 (310-434)||(11720354-11720478)
chr8 (117-220)||(600809-600912)
chr8 (117-221)||(33761642-33761746)
chr8 (312-431)||(12515887-12516006)
chr8 (117-221)||(35510253-35510357)
chr8 (175-350)||(7744193-7744360)
chr8 (544-591)||(7744143-7744190)
chr8 (544-591)||(26239454-26239501)
chr8 (364-431)||(28432939-28433006)
chr8 (364-434)||(25371236-25371306)
chr8 (544-590)||(41824684-41824730)
chr8 (175-350)||(26239504-26239671)
chr8 (241-350)||(41824733-41824834)
chr8 (215-287)||(9672292-9672364)
chr8 (312-395)||(24285797-24285880)
chr8 (491-536)||(28432810-28432855)
chr8 (491-536)||(40019748-40019793)
chr8 (392-434)||(10770940-10770982)
chr8 (119-204)||(8609007-8609092)
chr8 (356-428)||(44620116-44620188)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (112-594)||(42472301-42472775)
chr5 (175-594)||(21841896-21842308)
chr5 (250-590)||(28821364-28821696)
chr5 (119-590)||(2180613-2181073)
chr5 (333-594)||(17577011-17577273)
chr5 (333-594)||(17574980-17575242)
chr5 (333-594)||(17575700-17575962)
chr5 (329-590)||(18624137-18624398)
chr5 (119-427)||(2853253-2853553)
chr5 (175-384)||(12800823-12801023)
chr5 (119-370)||(30464679-30464922)
chr5 (175-384)||(12738000-12738200)
chr5 (175-349)||(8540566-8540732)
chr5 (175-349)||(32134897-32135063)
chr5 (473-591)||(34328108-34328226)
chr5 (120-233)||(40781430-40781543)
chr5 (312-431)||(1344229-1344348)
chr5 (120-232)||(29620912-29621024)
chr5 (312-434)||(28036377-28036499)
chr5 (314-431)||(1343744-1343861)
chr5 (365-427)||(18341213-18341275)
chr5 (175-232)||(28821275-28821332)
chr5 (356-428)||(27349967-27350039)
chr5 (255-291)||(41494555-41494591)
chr5 (491-536)||(42619875-42619920)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (175-594)||(26224363-26224782)
chr1 (175-594)||(27088183-27088592)
chr1 (175-594)||(33599961-33600381)
chr1 (175-590)||(50554925-50555331)
chr1 (119-480)||(25277299-25277660)
chr1 (175-590)||(15105341-15105748)
chr1 (175-464)||(6817664-6817945)
chr1 (175-480)||(45045435-45045732)
chr1 (175-480)||(37345231-37345528)
chr1 (375-590)||(37087316-37087531)
chr1 (119-427)||(46582573-46582873)
chr1 (175-349)||(3012516-3012682)
chr1 (119-370)||(31237556-31237791)
chr1 (175-349)||(51895228-51895394)
chr1 (175-291)||(2870494-2870610)
chr1 (120-233)||(9120813-9120926)
chr1 (117-221)||(8168514-8168618)
chr1 (128-233)||(1443408-1443513)
chr1 (120-233)||(47012213-47012326)
chr1 (365-434)||(42558848-42558917)
chr1 (312-434)||(3369967-3370089)
chr1 (544-590)||(52642649-52642695)
chr1 (175-350)||(52642698-52642865)
chr1 (356-428)||(51122987-51123059)
chr1 (491-536)||(5784321-5784366)
chr1 (119-204)||(34777337-34777422)
chr1 (547-590)||(6817623-6817666)
chr1 (491-536)||(11153136-11153181)
chr1 (365-434)||(32086004-32086073)
chr1 (406-434)||(5784211-5784239)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (119-594)||(18644112-18644587)
chr6 (175-594)||(32437900-32438309)
chr6 (175-590)||(7371806-7372212)
chr6 (199-590)||(11356119-11356497)
chr6 (175-480)||(32517766-32518063)
chr6 (307-590)||(9399137-9399420)
chr6 (119-427)||(20524226-20524526)
chr6 (255-481)||(33267809-33268027)
chr6 (448-585)||(20524587-20524724)
chr6 (128-233)||(32455022-32455127)
chr6 (255-350)||(10569375-10569462)
chr6 (175-350)||(7050654-7050821)
chr6 (366-434)||(17935548-17935616)
chr6 (215-291)||(6902085-6902161)
chr6 (544-587)||(7050824-7050867)
chr6 (544-590)||(10569465-10569511)
chr6 (544-589)||(6902215-6902260)
chr6 (491-536)||(34344779-34344824)
chr6 (491-532)||(17951156-17951197)
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (175-594)||(51012822-51013233)
chr4 (175-590)||(11254753-11255159)
chr4 (175-590)||(35402493-35402897)
chr4 (119-502)||(41760637-41761012)
chr4 (175-481)||(49524027-49524325)
chr4 (255-533)||(2692165-2692435)
chr4 (112-371)||(834096-834347)
chr4 (175-427)||(43520333-43520577)
chr4 (311-590)||(11641112-11641391)
chr4 (373-590)||(41760422-41760638)
chr4 (112-371)||(5438616-5438863)
chr4 (175-411)||(42981515-42981743)
chr4 (476-594)||(5438863-5438984)
chr4 (476-594)||(833975-834096)
chr4 (439-590)||(42981746-42981897)
chr4 (117-221)||(319845-319949)
chr4 (117-221)||(4172685-4172789)
chr4 (117-221)||(33265422-33265526)
chr4 (117-221)||(43508065-43508169)
chr4 (175-350)||(48645809-48645976)
chr4 (364-431)||(32652934-32653001)
chr4 (312-434)||(28101484-28101606)
chr4 (364-434)||(4614585-4614655)
chr4 (321-434)||(7150446-7150559)
chr4 (215-350)||(54387076-54387203)
chr4 (544-590)||(54387206-54387252)
chr4 (544-590)||(48645760-48645806)
chr4 (491-535)||(44993401-44993445)
chr4 (379-434)||(27385571-27385626)
chr4 (377-431)||(13449570-13449624)
chr4 (491-536)||(32653085-32653130)
chr4 (491-536)||(39190273-39190318)
chr4 (491-536)||(39922461-39922506)
chr4 (491-536)||(42879876-42879921)
chr4 (491-536)||(43778979-43779024)
chr4 (356-418)||(10544170-10544232)
chr4 (241-291)||(11641016-11641066)
chr4 (175-221)||(41782417-41782463)
chr4 (491-536)||(5485506-5485551)
chr4 (491-536)||(39084606-39084651)
chr4 (190-219)||(43507646-43507675)
chr4 (491-531)||(10544259-10544299)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (175-594)||(53188518-53188929)
chr3 (121-590)||(27897937-27898397)
chr3 (119-590)||(30599030-30599492)
chr3 (175-590)||(46198634-46199041)
chr3 (175-586)||(21349609-21350012)
chr3 (175-585)||(44275045-44275445)
chr3 (119-525)||(17516169-17516565)
chr3 (175-585)||(43766036-43766438)
chr3 (175-476)||(54899348-54899649)
chr3 (119-590)||(2377855-2378311)
chr3 (311-594)||(35904567-35904850)
chr3 (119-411)||(2225165-2225457)
chr3 (119-427)||(2661073-2661373)
chr3 (119-427)||(44795058-44795358)
chr3 (215-458)||(610549-610784)
chr3 (215-458)||(46113422-46113657)
chr3 (175-349)||(23292232-23292398)
chr3 (119-280)||(35904849-35905010)
chr3 (314-433)||(13466205-13466324)
chr3 (117-221)||(38192456-38192560)
chr3 (117-221)||(53093196-53093300)
chr3 (117-218)||(46609724-46609825)
chr3 (117-221)||(46309848-46309952)
chr3 (366-434)||(32843436-32843504)
chr3 (367-434)||(23876220-23876287)
chr3 (364-431)||(41945412-41945479)
chr3 (328-434)||(35862440-35862546)
chr3 (255-350)||(48829886-48829973)
chr3 (215-350)||(51685546-51685673)
chr3 (453-590)||(13466364-13466507)
chr3 (544-590)||(42281798-42281844)
chr3 (544-590)||(48829837-48829883)
chr3 (364-417)||(2976359-2976412)
chr3 (215-291)||(42280443-42280519)
chr3 (544-586)||(51685676-51685718)
chr3 (356-428)||(49495067-49495139)
chr3 (491-536)||(37886367-37886412)
chr3 (492-532)||(2976210-2976250)
chr3 (364-428)||(33050905-33050969)
chr3 (119-204)||(41978587-41978672)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (119-591)||(38472946-38473409)
chr7 (121-590)||(22154741-22155202)
chr7 (121-590)||(22210656-22211117)
chr7 (119-594)||(35692168-35692635)
chr7 (146-590)||(45360203-45360638)
chr7 (119-590)||(46438331-46438795)
chr7 (119-587)||(34775788-34776246)
chr7 (175-590)||(47385029-47385444)
chr7 (175-590)||(24227243-24227650)
chr7 (175-464)||(6604420-6604701)
chr7 (175-432)||(23905232-23905481)
chr7 (296-486)||(69132-69322)
chr7 (175-427)||(27665031-27665275)
chr7 (175-427)||(29995501-29995745)
chr7 (287-533)||(48310947-48311194)
chr7 (179-384)||(39858271-39858467)
chr7 (175-349)||(37114591-37114757)
chr7 (119-291)||(13168922-13169094)
chr7 (491-594)||(77260-77363)
chr7 (448-590)||(48851293-48851435)
chr7 (312-434)||(11683621-11683743)
chr7 (120-233)||(20478921-20479034)
chr7 (312-435)||(32840488-32840610)
chr7 (364-431)||(4321800-4321867)
chr7 (312-419)||(7402914-7403021)
chr7 (314-417)||(23168648-23168751)
chr7 (117-221)||(35402544-35402647)
chr7 (356-428)||(34784575-34784647)
chr7 (364-431)||(34691871-34691938)
chr7 (119-213)||(69040-69134)
chr7 (357-434)||(40360951-40361028)
chr7 (356-422)||(13035927-13035993)
chr7 (544-590)||(38550267-38550313)
chr7 (255-350)||(38550316-38550419)
chr7 (367-431)||(48302873-48302936)
chr7 (433-480)||(23905122-23905169)
chr7 (241-288)||(37792150-37792197)
chr7 (491-536)||(30109185-30109230)
chr7 (547-590)||(6604699-6604742)
chr7 (345-384)||(13169123-13169162)
chr7 (491-536)||(48302744-48302789)
chr7 (356-428)||(1547112-1547184)
chr7 (364-404)||(27956815-27956855)
chr7 (492-536)||(34692023-34692067)
[»] scaffold0345 (1 HSPs)
scaffold0345 (199-590)||(472-858)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (175-479)||(9164-9460)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (175-590)||(107409-107814)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (287-531)||(1401-1643)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (175-263)||(4199-4287)
scaffold0058 (175-263)||(5371-5459)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 24206833 - 24206349
Alignment:
Q  112 atgtccaaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnn--actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24206833 atgtccaaaggatcaaattgatttctgttataataattcaaggaccaatttgatgatttttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatat 24206734  T
Q  210 aattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  24206733 aattcaaggaccaatgtgattgaatatttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacaacattacatggactta 24206634  T
Q  310 gcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatcca 409  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24206633 gaacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacataatcaactttatcca 24206534  T
Q  410 tcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcc 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24206533 tcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattttttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcc 24206434  T
Q  510 taattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24206433 taattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaaattacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 24206349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 6784581 - 6784106
Alignment:
Q  112 atgtccaaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnn-actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatata 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||         |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6784581 atgtccaaaggatccaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatgtttttttttactaatttaaagatcgaaatgatggatatgaatata 6784482  T
Q  211 attcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttgg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||    
T  6784481 attcaaggaccaatgtgattgaatttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta--------catggacttgg 6784390  T
Q  311 cacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccat 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6784389 cacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagttcacttcctaaacaatcaactttatccat 6784290  T
Q  411 caaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcct 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6784289 caaccttgccctccaaacctcttctttgcccctatcatttggcttctcgatcaactttgcatttcttccatgaccaacatcattgtttttaaaatagcct 6784190  T
Q  511 aattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 594  Q
    |||||||||||||||||||||||  |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6784189 aattcttcagcttcatcaacccaaccaaaaaaattacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 6784106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 175 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 14388331 - 14387923
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388331 actaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaagtttttttacataaaggtttgattcattcattgacaacctc 14388232  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14388231 ttttcattacaacattacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 14388132  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14388131 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttagcttctccatcaaccttgcattt 14388032  T
Q  475 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 574  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14388031 cttccattaccagcaccattgtttttaaaatagcctaattcctcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcacaatcatcctgtacaatca 14387932  T
Q  575 aaagacaaa 583  Q
    |||||||||    
T  14387931 aaagacaaa 14387923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 146 - 590
Target Start/End: Original strand, 2767799 - 2768235
Alignment:
Q  146 aattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacag 245  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       ||||     
T  2767799 aattcaaggaccaatttgatggtattttcactaaattgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaatttttttgacat 2767898  T
Q  246 aaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaa 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2767899 aaaggttttattcattcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatgggtttggcacaatacaatagcattttaaacaacttaatcaaa 2767990  T
Q  346 caaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctat 445  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2767991 caaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagcttacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctat 2768090  T
Q  446 catttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnntt 545  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||    
T  2768091 cctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaattt 2768190  T
Q  546 acaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2768191 acaattttcaccatcatcctatataatcaaaagacaaaaccagta 2768235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 175 - 590
Target Start/End: Original strand, 6798420 - 6798827
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6798420 actaatttgaggatcgatttgatgaatatgtatacaattgaaggaccaatttgattgaatttttttgacagaaaggtttgactcattcattgacaacctc 6798519  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6798520 ttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 6798611  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  6798612 cctaagctcacttcctacacaatcaactttattcatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatctcttggcttctccgtcaaccttgcattt 6798711  T
Q  475 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 574  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6798712 cttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctagttcgtcagcttcatcaacctacacaaaatatttacaattttcaccatcatcctatacaatca 6798811  T
Q  575 aaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||||||    
T  6798812 aaagacaaaatcagta 6798827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 178 - 590
Target Start/End: Original strand, 17697124 - 17697528
Alignment:
Q  178 aatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttt 277  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17697124 aattttaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccagtttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcgttgacaacctcttt 17697223  T
Q  278 tcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacct 377  Q
    |||| ||||||        ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  17697224 tcataacaaca--------ttacatggacttggcataatacaatagcattttaaacaattcaatcaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaactt 17697315  T
Q  378 aagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttctt 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17697316 aagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttctt 17697415  T
Q  478 ccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaa 577  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  17697416 ccatgaccaacaccattgtttttaaaataacctagttcttcagcttcatcaacctacacaaaaaatctacaattttcacaaatatattatacaatcaaaa 17697515  T
Q  578 gacaaaatcagta 590  Q
    |||||||||||||    
T  17697516 gacaaaatcagta 17697528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 193 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 34401394 - 34401010
Alignment:
Q  193 atgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattag 292  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34401394 atgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttaacaaaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta- 34401296  T
Q  293 aacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctac 392  Q
           |||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34401295 -------catgaacttggcacaatgcaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaataatcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctac 34401203  T
Q  393 acaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatca 492  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  34401202 tcaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttctatttcttccatgaccagcacca 34401103  T
Q  493 ttgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaat 585  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34401102 ttatttttaaaatagcctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaactttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaat 34401010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 249 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 44708977 - 44708644
Alignment:
Q  249 ggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaa 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44708977 ggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta--------catggacttggcgcaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaa 44708886  T
Q  349 aatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcat 448  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  44708885 aatactcctatcaatatcttaatcaacctaagcccacttcctacacaattaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcct 44708786  T
Q  449 ttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttaca 548  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  44708785 ttggcttctccatcaaccttgcatgtgttccatgaccagcaccattatttttaaaataacctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttaca 44708686  T
Q  549 attttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44708685 attttcaccatcatcatatacaatcaaaagacaaaataagta 44708644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 175 - 476
Target Start/End: Original strand, 16763860 - 16764153
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16763860 actaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaatttttttgacataaaggtttgattcattcattgacaacctc 16763959  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16763960 ttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 16764051  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16764052 cctaagttcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctctaaacctcttctctgcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcattt 16764151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 315 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 42518525 - 42518258
Alignment:
Q  315 atacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaac 414  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42518525 atacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaataaacctaagatcacttcttacacaatcaactttatccatcaac 42518426  T
Q  415 cttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaatt 514  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  42518425 cttgccctccaaacttcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgatcagcaccattgtttttaaaatagcctagtt 42518326  T
Q  515 cttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaa 582  Q
    ||| ||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42518325 ctttagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaa 42518258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 193 - 480
Target Start/End: Original strand, 39456091 - 39456370
Alignment:
Q  193 atgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattag 292  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||       |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  39456091 atgatgaatatgcatataattcaatgaccaatttgattgaatttttttgacaaaagggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaaca---- 39456186  T
Q  293 aacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctac 392  Q
        ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39456187 ----ttacatggacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcttatcaatatcttaattaacctaagctcacttcctac 39456282  T
Q  393 acaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttcca 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39456283 acaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcctttggcttttccatcaaccttgcatttcttcca 39456370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 179 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19907504 - 19907308
Alignment:
Q  179 atttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 278  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19907504 atttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacagaatggtttgattcattcattgataacctctttt 19907405  T
Q  279 cattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaaccta 378  Q
    |||||||||||||        |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19907404 cattacaacatta--------catggacttggcacaat-caataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaaccta 19907314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 119 - 349
Target Start/End: Original strand, 40561083 - 40561305
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| |||||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  40561083 aaggatcacattgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatgtgcatataatttaagg 40561182  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 318  Q
    |||||| | ||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||    
T  40561183 accaatttaattgaaattttttaacaaaaaggtttgattcattcattgacaacatcttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaatac 40561274  T
Q  319 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40561275 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 40561305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 312 - 434
Target Start/End: Original strand, 4047377 - 4047499
Alignment:
Q  312 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  4047377 acaatacaatagcatgttaaacaactcaaacaagcaaattatgactatcaaatacttaatcaacctaagctcacttcctacacagtcaactttgtccatt 4047476  T
Q  412 aaccttgccctccaaacctcttc 434  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  4047477 aactttgccctccaaacctcttc 4047499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 310 - 434
Target Start/End: Original strand, 20941733 - 20941856
Alignment:
Q  310 gcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatcca 409  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| |||| ||   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20941733 gcacaatacagtaacatgttaaacaactcaaacaagcaaattatgactatcaaatacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttgtcca 20941832  T
Q  410 tcaaccttgccctccaaacctcttc 434  Q
    ||||||||| | |||||||||||||    
T  20941833 tcaaccttg-catccaaacctcttc 20941856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 233
Target Start/End: Original strand, 37021388 - 37021501
Alignment:
Q  120 aggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagga 219  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       | |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37021388 aggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggttttttcattaatttgaggatcaaaatgatggatatgattataattcaagga 37021487  T
Q  220 ccaatgtgattgaa 233  Q
    ||||||||||||||    
T  37021488 ccaatgtgattgaa 37021501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 482 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 39663995 - 39663887
Alignment:
Q  482 gaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagaca 581  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39663995 gaccaacaccattgttttcaaaataacctagttcttcagcttcatcaacccacataaaaaatttacaattttcactatcatcctatacaatcaaaagaca 39663896  T
Q  582 aaatcagta 590  Q
    |||||||||    
T  39663895 aaatcagta 39663887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 26581667 - 26581545
Alignment:
Q  312 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 411  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||| ||   ||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26581667 acaatacagtagcatgttaaacaacccaaacaagcaaactatgactaacacatacttaatcaacctaagctcacttcatacacaatcaactttgtccatc 26581568  T
Q  412 aaccttgccctccaaacctcttc 434  Q
    |||||| ||||| ||||||||||    
T  26581567 aaccttcccctctaaacctcttc 26581545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 434
Target Start/End: Original strand, 161432 - 161554
Alignment:
Q  312 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 411  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||   |||||||  |||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||| ||||||    
T  161432 acaatagagtagcatgttaaacaactcaaacaagcaaattatgactatcaaatacttaatcaaccaaacctcactttctacatagtcaactttgtccatc 161531  T
Q  412 aaccttgccctccaaacctcttc 434  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  161532 aaccttgccctctaaacctcttc 161554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 431
Target Start/End: Original strand, 38149339 - 38149406
Alignment:
Q  364 aacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 431  Q
    |||||||||| || || |||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38149339 aacttaatcaccccaatctcactttttatacaatcaactttgtccatcaaccttgccctccaaacctc 38149406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 427
Target Start/End: Original strand, 7744707 - 7744778
Alignment:
Q  356 ctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 427  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  7744707 ctatcaaaaacttaataaacctaagctcaattcctaaagtatcaactttgtccatcaacctcaccctccaaa 7744778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19582023 - 19581960
Alignment:
Q  287 cattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 350  Q
    ||||| |||||||||  || ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19582023 cattacaacattacagagacttgacacaatacaataacattttaaacaattcaatcaaacaaaa 19581960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 491 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 11022170 - 11022125
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 536  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11022170 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 11022125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 491 - 536
Target Start/End: Original strand, 28247629 - 28247674
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 536  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28247629 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 28247674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11313473 - 11313399
Alignment:
Q  312 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcact 386  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11313473 acaatacagtagcatgttaaaaaactcaaacaagcaaattataattatcaaaaacttaatcaacctaagctcact 11313399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 548 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 19581954 - 19581912
Alignment:
Q  548 aattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19581954 aattttcaccatcatcctacacaattaaaagacaaaatcagta 19581912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 491 - 536
Target Start/End: Original strand, 38149490 - 38149535
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 536  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  38149490 cattgtttttaaagtaacctagttcttcaacttcatcaacccacac 38149535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 496 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 10715916 - 10715876
Alignment:
Q  496 tttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 536  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10715916 tttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 10715876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 406 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 11022280 - 11022252
Alignment:
Q  406 tccatcaaccttgccctccaaacctcttc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11022280 tccatcaaccttgccctccaaacctcttc 11022252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 594
Target Start/End: Original strand, 15307124 - 15307598
Alignment:
Q  112 atgtccaaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 211  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15307124 atgtacaaatgatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 15307223  T
Q  212 ttcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||    
T  15307224 ttcaaggaccaatgtgattgaatttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttggc 15307315  T
Q  312 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 411  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15307316 acaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 15307415  T
Q  412 aaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagccta 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15307416 aaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagccta 15307515  T
Q  512 attcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 594  Q
    ||||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15307516 attcttcagcttcatcaacccacgcaaaaaaattacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 15307598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 594
Target Start/End: Original strand, 15487493 - 15487967
Alignment:
Q  112 atgtccaaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 211  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15487493 atgtacaaatgatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 15487592  T
Q  212 ttcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||    
T  15487593 ttcaaggaccaatgtgattgaatttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttggc 15487684  T
Q  312 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 411  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15487685 acaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 15487784  T
Q  412 aaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagccta 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15487785 aaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagccta 15487884  T
Q  512 attcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 594  Q
    ||||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15487885 attcttcagcttcatcaacccacgcaaaaaaattacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 15487967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 27405435 - 27404962
Alignment:
Q  112 atgtccaaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27405435 atgtccaaaggatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatgttttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 27405336  T
Q  212 ttcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||||| |||||    
T  27405335 ttcaaggaccaatgtgattgaatatttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaaccttttttcattacaacatta--------catggacttggc 27405244  T
Q  312 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27405243 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagttcacttcctagacaatcaactttatccatc 27405144  T
Q  412 aaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagccta 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27405143 aaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttggcttcttgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcct- 27405045  T
Q  512 attcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27405044 attcttcagcttcatcaacccacacaaaaaaattacagttttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 27404962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 117 - 594
Target Start/End: Original strand, 29238031 - 29238500
Alignment:
Q  117 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 216  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29238031 caaatgatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgacggatatgaatataattcaa 29238130  T
Q  217 ggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaat 316  Q
    |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||| ||||||    
T  29238131 ggaccaatgtgattgaatttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttgacacaat 29238222  T
Q  317 acaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaacct 416  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29238223 acaatagcattttaaataactcaaccaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagcttacttcctacacaatcaactttatccaccaacct 29238322  T
Q  417 tgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattct 516  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29238323 tgcccttcaaacctcttctctgcccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagcctaattct 29238422  T
Q  517 tcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 594  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29238423 tcagcttcatcaacccacacaaaaaaattacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 29238500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 175 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 41041813 - 41041407
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41041813 actaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaatttttg-gacagaaatgtttgattcattcattgacaacctc 41041715  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    |||||||||||||||||        |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41041714 ttttcattacaacatta--------catggacttggcaaaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 41041623  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  41041622 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgcccttcaaacctcttctctccccctatcctttgccttctccatcaaccttgcattt 41041523  T
Q  475 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 574  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41041522 cttccatgaccaacaccattgtttttaaaataacatagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaattttacaattttcaccgtcatcctatacaatca 41041423  T
Q  575 aaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||||||    
T  41041422 aaagacaaaatcagta 41041407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 175 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 40338909 - 40338495
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40338909 actaatttgaggatcgatacgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 40338810  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    ||||||||||||||||| |         ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  40338809 ttttcattacaacattaca---------ggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcag 40338719  T
Q  375 cctaagctcacttccta--------cacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaacc 466  Q
    |||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||| |||||||    
T  40338718 cctaagctcacttcctaacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccgtatcctctggcttctccatcaacc 40338619  T
Q  467 ttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatccta 566  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||       |||||||||| || |||||||||    
T  40338618 ttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagtctagttcttcagcttcatcaactcacacaaaaaaattacaatttttaccatcatccta 40338519  T
Q  567 tacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  40338518 tacaatcaaaagacaaaatcagta 40338495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 175 - 480
Target Start/End: Original strand, 5037331 - 5037628
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5037331 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaatttctttgacataagggtttgattcattcattgacaacctc 5037430  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5037431 ttttcattacaaca--------ttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 5037522  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5037523 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatcgatcaaccttgccttccaaacctcttctcttcccctatcatttggcttatccatcaaccttgcattt 5037622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 119 - 427
Target Start/End: Original strand, 27692005 - 27692305
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  27692005 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaagg 27692104  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 318  Q
    |||||| ||||||||       |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||    
T  27692105 accaatttgattgaaatattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaatac 27692196  T
Q  319 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 418  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27692197 aatatcatttttaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 27692296  T
Q  419 ccctccaaa 427  Q
     ||||||||    
T  27692297 tcctccaaa 27692305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 175 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 33708039 - 33707795
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||       |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33708039 actaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaatgaccaatttgattgaaatattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctc 33707940  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    |||||||||||||||||        ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  33707939 ttttcattacaacatta--------catagacttggcacaatacaatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatacttctatcaatatcttaatcaa 33707848  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33707847 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaa 33707795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 186 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13485351 - 13485114
Alignment:
Q  186 gatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattaca 285  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13485351 gatcgatatgatggatatgtacataattcaaggaccaatttgatt----ttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattaca 13485256  T
Q  286 acattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcac 385  Q
    ||||||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||| |||| || |    
T  13485255 acatta--------catggacttggtacaatacaatagcattttaaacaactcaatcgaataaaatactcatatcaatatcttaatcaacataagttcgc 13485164  T
Q  386 ttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13485163 ttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaaccttttct 13485114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 241 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 3152702 - 3152485
Alignment:
Q  241 gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaa 340  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||   | ||| ||||||| |||| |||||||||| ||| ||    
T  3152702 gacagaagggttgaattcattcattgacaacttcttttcattataacattacaacattacacacacttgacacaataaaataacattttaaacgacttaa 3152603  T
Q  341 tcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacc 440  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  3152602 tcaaacaaattactcctatcaatattttaatcaacctaagctcacttcctatacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaagcctcttctctaac 3152503  T
Q  441 cctatcatttggcttctc 458  Q
     ||||| |||||||||||    
T  3152502 actatcctttggcttctc 3152485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 175 - 349
Target Start/End: Original strand, 22273154 - 22273328
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| | |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22273154 actaatttgatgatcgatacgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgatagaaaggtttgattcatttattgacaacctc 22273253  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22273254 ttttcattacaacattacaacattacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 22273328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 119 - 349
Target Start/End: Original strand, 42942633 - 42942855
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       | |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  42942633 aaggatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcaataatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaagg 42942732  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 318  Q
    |||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||| ||||||||||||    
T  42942733 accaatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattac--------aacattacatggacttggcacaatac 42942824  T
Q  319 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 349  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42942825 aataacattttaaacaactcaatcaaacaaa 42942855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 450 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 9672263 - 9672123
Alignment:
Q  450 tggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaa 549  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  9672263 tggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgatcagcaccattgtttttaaaataacttagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaa 9672164  T
Q  550 ttttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9672163 ttttcaccatcatcttatacaatcaaaagacaaaatcagta 9672123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 310 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 11720478 - 11720354
Alignment:
Q  310 gcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatcca 409  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11720478 gcacaatacagtagcatgttaaacaacttaaacaaacaaattactcctattaaatacttaatcaacctaagctcacttcctacacagtcaactttgtcca 11720379  T
Q  410 tcaaccttgccctccaaacctcttc 434  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||    
T  11720378 tcaaccttgtccttcaaacctcttc 11720354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 117 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 600912 - 600809
Alignment:
Q  117 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  600912 caaaggatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgacggatatgaatataattcaa 600813  T
Q  217 ggac 220  Q
    ||||    
T  600812 ggac 600809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33761746 - 33761642
Alignment:
Q  117 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 216  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33761746 caaaggatcacattgatatctgttatgataattcaatgaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 33761647  T
Q  217 ggacc 221  Q
    |||||    
T  33761646 ggacc 33761642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 312 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12516006 - 12515887
Alignment:
Q  312 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||   |||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  12516006 acaatacaatagcatgttaaaaaactcaaacaagcaaattatgactattaaaaacttaatcaacctaagctcacttcccatacaatcaactttgtccatc 12515907  T
Q  412 aaccttgccctccaaacctc 431  Q
    ||| || |||||||||||||    
T  12515906 aacatttccctccaaacctc 12515887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Original strand, 35510253 - 35510357
Alignment:
Q  117 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 216  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35510253 caaaggaccacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataatttaa 35510352  T
Q  217 ggacc 221  Q
    |||||    
T  35510353 ggacc 35510357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7744360 - 7744193
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||   ||| |||  ||| |||||| ||||||||       ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||    
T  7744360 actaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaagaaccaatttgattgaaattttttgacagaagggttaaattcattcattgacagcctc 7744261  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 350  Q
    |||||||||||||||||      ||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7744260 ttttcattacaacatta------taca--gacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcacacaaaa 7744193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 544 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 7744190 - 7744143
Alignment:
Q  544 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtat 591  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7744190 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtat 7744143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 544 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 26239501 - 26239454
Alignment:
Q  544 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtat 591  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26239501 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtat 26239454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 364 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28433006 - 28432939
Alignment:
Q  364 aacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 431  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28433006 aacttaatcaccctcagctcacttcttatacaatcaactttgcccatcaaccttgccctccaaacctc 28432939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 25371306 - 25371236
Alignment:
Q  364 aacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 434  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  25371306 aacttattcaacctaagttcacttcctacacactcaactttgtccatcaatcttgctctccaaacatcttc 25371236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 544 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 41824730 - 41824684
Alignment:
Q  544 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41824730 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 41824684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26239671 - 26239504
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||   ||| |||  ||||||||||  |||||||       ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  26239671 actaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaattggattgaaattttttgacagaagggttaaattcattcattgacaacctc 26239572  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 350  Q
    |||||||||||||        ||||||  || |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26239571 ttttcattacaac--------attacacagacttgatacaatacaataacattttaaacaactcaatcacacaaaa 26239504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 41824834 - 41824733
Alignment:
Q  241 gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaa 340  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41824834 gacagaagggttaaattcattcattggcaacctcttttcattacaacatta--------cacaggcttggcacaatacaataacattttaaacaactcaa 41824743  T
Q  341 tcaaacaaaa 350  Q
    ||| ||||||    
T  41824742 tcacacaaaa 41824733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9672364 - 9672292
Alignment:
Q  215 aaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaac 287  Q
    |||||||||| ||||||||       ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9672364 aaggaccaatttgattgaattttttcgacagaagggttggattcattcattgacaacatcttttcattacaac 9672292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 395
Target Start/End: Original strand, 24285797 - 24285880
Alignment:
Q  312 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacaca 395  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||   |||||||  | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24285797 acaatacaatagcatgttaaacaactcaaacaagcaaattatgactatcaaatatttaatcaacttaatctcacttcctacaca 24285880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 491 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 28432855 - 28432810
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 536  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28432855 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 28432810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 491 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 40019793 - 40019748
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 536  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40019793 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 40019748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 392 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 10770982 - 10770940
Alignment:
Q  392 cacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 434  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10770982 cacagtcaactttgtccatcaaccttgccttccaaacctcttc 10770940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8609092 - 8609007
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatg 204  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8609092 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatg 8609007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 356 - 428
Target Start/End: Original strand, 44620116 - 44620188
Alignment:
Q  356 ctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 428  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||| ||| || ||||||||  ||||||||||    
T  44620116 ctatcaaaaacttaatcaacctaagctcaactcctaaagtatcaattttgtctatcaacctcaccctccaaac 44620188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 42472775 - 42472301
Alignment:
Q  112 atgtccaaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42472775 atgtccaaaggatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatgttttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 42472676  T
Q  212 ttcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||||| |||||    
T  42472675 ttcaaggaccaatgtgattgaatatttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaaccttttttcattacaacatta--------catggacttggc 42472584  T
Q  312 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42472583 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctagacaatcaactttatccatc 42472484  T
Q  412 aaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagccta 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42472483 aaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagccta 42472384  T
Q  512 attcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42472383 attcttcagcttcatcaacccacacaaaaatattacagttttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 42472301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 175 - 594
Target Start/End: Original strand, 21841896 - 21842308
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21841896 actaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaatttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 21841995  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21841996 ttttcattacaaca--------ttacatggacttgccacaatacaataacattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttagtcaa 21842087  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21842088 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaacctcttctctgcccctagcatttgacttctccatcaaccttgcattt 21842187  T
Q  475 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac-nnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatc 573  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21842188 cttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaaatttacaattttcacagttatcctatacaatc 21842287  T
Q  574 aaaagacaaaatcagtataat 594  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  21842288 aaaagataaaatcagtataat 21842308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 250 - 590
Target Start/End: Original strand, 28821364 - 28821696
Alignment:
Q  250 gtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28821364 gtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattaga--------tggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 28821455  T
Q  350 atactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatt 449  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | || ||||| ||    
T  28821456 atactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaacctttccctccaaacctcttatatccctctatcctt 28821555  T
Q  450 tggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaa 549  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  28821556 tggtttctccatcaaccttgcatttcttccttgaccaacaccattgtttttaaaatagcctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaa 28821655  T
Q  550 ttttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  28821656 ttttcaccatcatcctatgcaatcaatagacaaaatcagta 28821696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 119 - 590
Target Start/End: Original strand, 2180613 - 2181073
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  2180613 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaagg 2180712  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 318  Q
    |||||| ||||||||       |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| |||||||||| |    
T  2180713 accaatttgattgaaattttttgacacaagggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta--------catggacttggcacaat-c 2180803  T
Q  319 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 418  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2180804 aataacattttaaa--actcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatcgatcaaccttg 2180901  T
Q  419 ccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttc 518  Q
     |||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2180902 tcctccaaacctcttctttgcccctgtcctttgacttctccattaaccttgcatttctttcatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttcttc 2181001  T
Q  519 agcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    | |||||||||||||||        ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2181002 aacttcatcaacccacataaaaaatttacaattttcaccatcatcttatgcaatcaaaagacaaaatcagta 2181073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 333 - 594
Target Start/End: Original strand, 17577011 - 17577273
Alignment:
Q  333 caactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcactt-cctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17577011 caactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcactttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 17577110  T
Q  432 ttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacc 531  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17577111 ttctctgcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacc 17577210  T
Q  532 cacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 594  Q
    |||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17577211 cacacaaaaaatttacaattttcacaatcatcatatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 17577273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 333 - 594
Target Start/End: Original strand, 17574980 - 17575242
Alignment:
Q  333 caactcaatcaaacaaaatactcctatcaata-acttaatcaacctaagctcactt-cctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacct 430  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17574980 caactcagtcaaacaaa-tactcctatcaatatacttaatcaacctaagctcactttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacct 17575078  T
Q  431 cttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaac 530  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575079 cttctctgcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaac 17575178  T
Q  531 ccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 594  Q
    ||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575179 ccacacaaaaaatttacaattttcacaatcatcatatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 17575242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 333 - 594
Target Start/End: Original strand, 17575700 - 17575962
Alignment:
Q  333 caactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcactt-cctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575700 caactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcactttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 17575799  T
Q  432 ttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgttttt-aaaatagcctaattcttcagcttcatcaac 530  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575800 ttctctgcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaaatagcctaattcttcagcttcatcaac 17575899  T
Q  531 ccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 594  Q
    ||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575900 ccacac-aaaaatttacaattttcacaatcatcatatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 17575962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 329 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 18624398 - 18624137
Alignment:
Q  329 taaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 428  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  18624398 taaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaacttcatccatcaaccttgtcatccaaac 18624299  T
Q  429 ctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatca 528  Q
    |||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  18624298 ctcttctctgacactatcctttggattctctatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttctttagcttcatca 18624199  T
Q  529 acccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    |||||||        ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18624198 acccacataaaaaatttacaattttcactatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 18624137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 119 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 2853553 - 2853253
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||||||        |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  2853553 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaagacctatttgatgatatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaagg 2853454  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 318  Q
    |||||| | ||||||       |||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||        |||||| |||||||| |||    
T  2853453 accaatttcattgaaatattttgacataaaggtttggttcattcattgacaatctattttcattacaacatta--------catggacttggcacattac 2853362  T
Q  319 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 418  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2853361 aatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatattcatatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcttacacaatcaactttatccatcaaccttg 2853262  T
Q  419 ccctccaaa 427  Q
     ||||||||    
T  2853261 tcctccaaa 2853253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 175 - 384
Target Start/End: Original strand, 12800823 - 12801023
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12800823 actaatttgatgatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacagaatggtttgattcattcattgacaacctc 12800922  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    |||||||||||||||||        |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12800923 ttttcattacaacatta--------catggacttggcacaat-caatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 12801013  T
Q  375 cctaagctca 384  Q
    ||||||||||    
T  12801014 cctaagctca 12801023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 119 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 30464922 - 30464679
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  30464922 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattatcactaattttaggatcgatatgatggatatgcatataattcaagg 30464823  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 318  Q
    |||||| ||||||||       ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||    
T  30464822 accaatttgattgaaattttttgacagaagggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaac--------attacatggacttggcacaatac 30464731  T
Q  319 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaa 370  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  30464730 aatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatgaatatcttaa 30464679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 175 - 384
Target Start/End: Original strand, 12738000 - 12738200
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  12738000 actaatttgatgatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacagaatggtttgattcattcatcgacaacctc 12738099  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    |||| ||||||||||||        |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12738100 tttttattacaacatta--------catggacttggcacaat-caatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 12738190  T
Q  375 cctaagctca 384  Q
    ||||||||||    
T  12738191 cctaagctca 12738200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 175 - 349
Target Start/End: Original strand, 8540566 - 8540732
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8540566 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggatcaatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaaccta 8540665  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 349  Q
    ||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8540666 ttttcattac--------aacattacatggatttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 8540732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 175 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 32135063 - 32134897
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32135063 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 32134964  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 349  Q
    |||||||||||||        ||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32134963 ttttcattacaac--------attacatcgacttgacacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaa 32134897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 473 - 591
Target Start/End: Original strand, 34328108 - 34328226
Alignment:
Q  473 ttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaat 572  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34328108 ttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttcctcagcttcatcaacccacacaaaatatttacaattttcaccatcatcctatacaat 34328207  T
Q  573 caaaagacaaaatcagtat 591  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34328208 caaaagacaaaatcagtat 34328226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 233
Target Start/End: Original strand, 40781430 - 40781543
Alignment:
Q  120 aggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagga 219  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40781430 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgatggatatgattataattcaagga 40781529  T
Q  220 ccaatgtgattgaa 233  Q
    ||||||||||||||    
T  40781530 ccaatgtgattgaa 40781543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 312 - 431
Target Start/End: Original strand, 1344229 - 1344348
Alignment:
Q  312 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 411  Q
    ||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||   |||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1344229 acaatacagcagcatgttaaaaaactcaaacaagcaaattatgactatgaaaaacttaatcagcctaagctcacttcctatacaatcaactttgtccatc 1344328  T
Q  412 aaccttgccctccaaacctc 431  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1344329 aaccttgccctccaaacctc 1344348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29621024 - 29620912
Alignment:
Q  120 aggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagga 219  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       | |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29621024 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcaaaatgatggatatgattgtaattcaagga 29620925  T
Q  220 ccaatgtgattga 232  Q
    |||||||||||||    
T  29620924 ccaatgtgattga 29620912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28036499 - 28036377
Alignment:
Q  312 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 411  Q
    |||||||| || ||| ||||| ||||||| ||| |||| ||   |||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28036499 acaatacagtaacatgttaaataactcaaacaagcaaattatgactatcaaatacataatcaatctaagctcacttcctacacaatcaattttgtccatc 28036400  T
Q  412 aaccttgccctccaaacctcttc 434  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  28036399 aaccttgccctccaaacttcttc 28036377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 314 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 1343861 - 1343744
Alignment:
Q  314 aatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaa 413  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||   ||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  1343861 aatacagtagcatgttaaaaaactcaaacaagcaaattatgactatcaaaaacttaatcagcataagctcactttctatacaatcaactttgtccatcaa 1343762  T
Q  414 ccttgccctccaaacctc 431  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  1343761 ccttgtccttcaaacctc 1343744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 365 - 427
Target Start/End: Original strand, 18341213 - 18341275
Alignment:
Q  365 acttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 427  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18341213 acttaatcaatttaagctcacttcctacacaatcaactttgtccatcaacattgccctccaaa 18341275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 232
Target Start/End: Original strand, 28821275 - 28821332
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattga 232  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  28821275 actaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattga 28821332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 428
Target Start/End: Original strand, 27349967 - 27350039
Alignment:
Q  356 ctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  27349967 ctatcaaaaacttaatcaacctaagctcaattcctaaagtatcaactttgtccatcaacctcaccctccaaac 27350039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41494591 - 41494555
Alignment:
Q  255 attcattcattgacaacctcttttcattacaacatta 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41494591 attcattcattgacaacctcttttcattactacatta 41494555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 491 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 42619920 - 42619875
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 536  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42619920 cattgtttttaaagtaacctagttcttcaacttcatcaacccacac 42619875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 175 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 26224782 - 26224363
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224782 actaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaatttttttgacataaaggtttgattcattcattgacaacctc 26224683  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26224682 ttttcagtacaacattacaacattacatggacttggcacaatacaataacattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 26224583  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  26224582 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgcccttcaaacctcttctcttcccctatcttttgtcttctccatcaaccttgcattt 26224483  T
Q  475 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 574  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26224482 cttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcataattatcctatacaatca 26224383  T
Q  575 aaagacaaaatcagtataat 594  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26224382 aaagacaaaatcagtataat 26224363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 175 - 594
Target Start/End: Original strand, 27088183 - 27088592
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27088183 actaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaattttt--gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 27088280  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27088281 ttttcattacaaca--------ttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 27088372  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27088373 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaacctcttctctgcccctaacatttggcttctccatcaaccttgcattt 27088472  T
Q  475 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 574  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27088473 cttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcacaattatcttatacaatca 27088572  T
Q  575 aaagacaaaatcagtataat 594  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27088573 aaagacaaaatcagtataat 27088592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 175 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 33600381 - 33599961
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnn-gacagaaaggtttgattcattcattgacaacct 273  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||        |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33600381 actaatttgaggatcgaaaggatggatatgcatataattcaaggaccgatttgattgaattttttttgacagaaaggtt-gattcattcattgacaacct 33600283  T
Q  274 cttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatca 373  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33600282 cttttcattacaactttacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatca 33600183  T
Q  374 acctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatt 473  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33600182 acctaagctgccttcctagacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttccctgcccctatcatttgccttctctatcaaccttgcatt 33600083  T
Q  474 tcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac-nnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaat 572  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33600082 tcttccatgaccatcaccattgtttttaaaatagcctagttcttcagattcatcaacccacacaaaaaaatttacaattttcacaatcatcctatacaat 33599983  T
Q  573 caaaagacaaaatcagtataat 594  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33599982 caaaagacaaaatcagtataat 33599961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 175 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 50555331 - 50554925
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  50555331 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacagaatgatttgattcattcattgacaacctc 50555232  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    |||||||||||||||||        |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50555231 ttttcattacaacatta--------catggacttggcacaat-caataacattttaaacaactccatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 50555141  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  50555140 cctaaactcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcctttggcttctccatcaatcttgcattt 50555041  T
Q  475 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 574  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50555040 cttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttcttcagtttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatca 50554941  T
Q  575 aaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||||||    
T  50554940 aaagacaaaatcagta 50554925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 119 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 25277660 - 25277299
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  25277660 aaggatcacagtgatgtctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaagg 25277561  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 318  Q
    |||||| ||||||||       |||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  25277560 accaatttgattgaatttttttgacataagggtttggttcagtcattgacaacctcttttcattacaacattacaacattacatggacttgacacaatac 25277461  T
Q  319 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25277460 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 25277361  T
Q  419 ccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttcca 480  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25277360 ccctccaaacctcttctttgcccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttcca 25277299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 175 - 590
Target Start/End: Original strand, 15105341 - 15105748
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||   ||| |||  |||||||||| ||||||||        |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15105341 actaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaaatttcttaacagaatggttggattcattcattgacaacctc 15105440  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    |||||||||||||||||        ||  || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15105441 ttttcattacaacatta--------cacagacttgacacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaatatcttaatcaa 15105532  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15105533 cctaagctcatttcctacacaatcaacttcatccatcaaccttgtcatccaaacctcttctctgacactatcatttggcttctccatcaaccttgcattt 15105632  T
Q  475 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 574  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15105633 cttccatgaccaacaccattgtttttaaaataacctaattcttcagcttcatcaacccacataaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatca 15105732  T
Q  575 aaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||| ||||||||||    
T  15105733 aaagaaaaaatcagta 15105748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 175 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 6817945 - 6817664
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6817945 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaatttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 6817846  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    ||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6817845 ttttcattacaacattata--------tgtacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaa 6817754  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaa 464  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  6817753 cctaagctcacttcttacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcctttggcttctccatcaa 6817664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 175 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 45045732 - 45045435
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||       |||| || |||||| |||||||||||||||| ||    
T  45045732 actaatttgaagatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaatttttttgacataagggtttggttcattcattgacaacttc 45045633  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    |||||||||||||||||        |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45045632 ttttcattacaacatta--------catggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 45045541  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  45045540 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaagcttgccctccaaacctcttctttgcccctatcctttggcttctccatcaaccttgcattt 45045441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 175 - 480
Target Start/End: Original strand, 37345231 - 37345528
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||       |||| || |||||| |||| ||||||||||||||    
T  37345231 actaatttgaggatcggtatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaatttttttgacataagggtttggttcagtcattgacaacctc 37345330  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  37345331 ttttcattacaaca--------ttacatggacttgacacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaa 37345422  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  37345423 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctttgcccatatcctttggcttctccatcaaccttgcattt 37345522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 375 - 590
Target Start/End: Original strand, 37087316 - 37087531
Alignment:
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37087316 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcatttggcttctccatcaaccttgcattt 37087415  T
Q  475 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 574  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37087416 cttccatgaccagcaccattgttattaaaatagcctcattcctcaacttcatcaacccacacaaaatatttacaattttcaccatcatcctatacaatca 37087515  T
Q  575 aaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||||||    
T  37087516 aaagacaaaatcagta 37087531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 119 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 46582873 - 46582573
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  46582873 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaagg 46582774  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 318  Q
    |||||| ||||||||       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        |||||| ||||||||||||    
T  46582773 accaatttgattgaaatattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaacaata--------catggacttggcacaatac 46582682  T
Q  319 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 418  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  46582681 aatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacaaaatcaagtttatccatcaaccttg 46582582  T
Q  419 ccctccaaa 427  Q
     ||||||||    
T  46582581 tcctccaaa 46582573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 175 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 3012682 - 3012516
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3012682 actaatttgaggatcaatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaaccta 3012583  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 349  Q
    ||||||| ||        ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3012582 ttttcatcac--------aacattacatggacttggcacaatacaataacattttaaataactcaatcaaacaaa 3012516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31237791 - 31237556
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  31237791 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattatcactaatttgaggatcgatataatggatatgcatataattcaagg 31237692  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 318  Q
    |||||| ||||||||       || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||| |||| |||||||    
T  31237691 accaatttgattgaaattttttgatagaagggtttgattcattcattgacaacctctttt----------------cattacatggacttggtacaatac 31237608  T
Q  319 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaa 370  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31237607 aatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaa 31237556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 175 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 51895394 - 51895228
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51895394 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaagggccaatttgattgaatttttttgacataaaggtttgattcattcattgacaacctc 51895295  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 349  Q
    |||||||||||||        ||||||||||  || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51895294 ttttcattacaac--------attacatggacatgacataatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaa 51895228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 175 - 291
Target Start/End: Original strand, 2870494 - 2870610
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2870494 actaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaatattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctc 2870593  T
Q  275 ttttcattacaacatta 291  Q
    ||||| |||||||||||    
T  2870594 ttttcgttacaacatta 2870610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9120926 - 9120813
Alignment:
Q  120 aggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagga 219  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9120926 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgatggatatgattataattcaagga 9120827  T
Q  220 ccaatgtgattgaa 233  Q
    ||||||||||||||    
T  9120826 ccaatgtgattgaa 9120813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8168618 - 8168514
Alignment:
Q  117 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 216  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8168618 caaaggatcacattgatatctgttatgataattcaatgaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 8168519  T
Q  217 ggacc 221  Q
    |||||    
T  8168518 ggacc 8168514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 1443408 - 1443513
Alignment:
Q  128 attgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtg 227  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1443408 attgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgatggatatgattataattcaaggaccaatgtg 1443507  T
Q  228 attgaa 233  Q
    ||||||    
T  1443508 attgaa 1443513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 47012326 - 47012213
Alignment:
Q  120 aggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagga 219  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       | |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  47012326 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgattgatatgattataattcaagga 47012227  T
Q  220 ccaatgtgattgaa 233  Q
    ||||||||||||||    
T  47012226 ccaatgtgattgaa 47012213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 365 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 42558917 - 42558848
Alignment:
Q  365 acttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42558917 acttaatcaacctaagctcacttcctacacagtcaactttgtccatcaaccatgccctccaaacctcttc 42558848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 3370089 - 3369967
Alignment:
Q  312 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 411  Q
    |||||||| ||||| |  ||||||||||| ||| |||| ||   ||| |||  |||||||||||| ||||||||| |||||  | |||||||| ||||||    
T  3370089 acaatacagtagcaatggaaacaactcaaacaagcaaattatgactaacaaatacttaatcaaccaaagctcactccctacgtagtcaactttgtccatc 3369990  T
Q  412 aaccttgccctccaaacctcttc 434  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  3369989 aaccttgtcctccaaacctcttc 3369967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 544 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 52642695 - 52642649
Alignment:
Q  544 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52642695 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 52642649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 52642865 - 52642698
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||   ||  |||  || ||||||| ||||||||       ||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  52642865 actaatttagggatcgatatgatggatagacatgcaatagaaagaccaatttgattgaaattttttgacagaagggttaaattcattcattggcaacctc 52642766  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 350  Q
    |||||||||||||||||        ||  || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  52642765 ttttcattacaacatta--------cacagacttggcacaatgcaataacattttaaacaactcaatcacacaaaa 52642698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 428
Target Start/End: Original strand, 51122987 - 51123059
Alignment:
Q  356 ctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  51122987 ctatcaaaaacttaatcaacctaagctcagttcctaaagtatcaactttgtccatctacctcaccctccaaac 51123059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 491 - 536
Target Start/End: Original strand, 5784321 - 5784366
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 536  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5784321 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 5784366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34777422 - 34777337
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatg 204  Q
    |||||||| | |||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34777422 aaggatcacagtgatatctgttatgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatg 34777337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 547 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 6817666 - 6817623
Alignment:
Q  547 caattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6817666 caattttcaccatcatcatatacaatcaaaagacaaaattagta 6817623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 491 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 11153181 - 11153136
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 536  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11153181 cattgtttttaaagtaacctagttcttcaacttcatcaacccacac 11153136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 434
Target Start/End: Original strand, 32086004 - 32086073
Alignment:
Q  365 acttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 434  Q
    |||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| || || |||||| ||||||    
T  32086004 acttgatcaatctaaactcacttactaaacaatcaactttgtccatcaacatttccttccaaaactcttc 32086073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 406 - 434
Target Start/End: Original strand, 5784211 - 5784239
Alignment:
Q  406 tccatcaaccttgccctccaaacctcttc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5784211 tccatcaaccttgccctccaaacctcttc 5784239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 119 - 594
Target Start/End: Original strand, 18644112 - 18644587
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18644112 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgatgatcgaaataatggatatgcatataattcaagg 18644211  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 318  Q
    |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||    
T  18644212 accaatgtgattgaatttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaatctcttttcattacaacattacaacattacacagacttggcacaatac 18644311  T
Q  319 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 418  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18644312 aatagcattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagttcacttcctactcaatcaactttatccatcaaccttg 18644411  T
Q  419 ccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttc 518  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18644412 ccctccaaacctcttctctgcccctagcatttgacttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctaattcttc 18644511  T
Q  519 agcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 594  Q
    |||||||||||||| |||       |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18644512 agcttcatcaaccctcacaaaaaaattacaattttcacaattatcttatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 18644587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 175 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 32438309 - 32437900
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32438309 actaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattaaaggaccaatatgattgaatttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaatctc 32438210  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    |||||||||||||||||        |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32438209 ttttcattacaacatta--------catggacttggcacaatgcaatagcattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 32438118  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32438117 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacc-cttctttgcccctagcattt-gcttctccatcaaccttgcattt 32438020  T
Q  475 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 574  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32438019 cttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaaaattatcctatacaatca 32437920  T
Q  575 aaagacaaaatcagtataat 594  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  32437919 aaagacaaaatcagtataat 32437900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 175 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 7372212 - 7371806
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372212 actaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgatattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 7372113  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    |||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7372112 ttttcattacaacatta--------catggacttggcacaatacaataccattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 7372021  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7372020 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccttatcctttggcttctccatcaaccttgcattt 7371921  T
Q  475 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 574  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7371920 cttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttcctcaacttcatcaacccacac-aaaatattacaattttcaccatcattctatacaatca 7371822  T
Q  575 aaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||||||    
T  7371821 aaagacaaaatcagta 7371806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 199 - 590
Target Start/End: Original strand, 11356119 - 11356497
Alignment:
Q  199 gatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacatt 298  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11356119 gatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaactttttgacataagggtttgattcattcattgaccacctcttttcattacaacattacaacatt 11356218  T
Q  299 acatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatc 398  Q
    ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||       
T  11356219 acatgaacttggcacaatagaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatacttctatcaatatcgtaatcaacctaagctgacttcctacaca--- 11356315  T
Q  399 aactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgttt 498  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11356316 ----------atcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttcttctatgaccagcaccattgttt 11356405  T
Q  499 ttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||       ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11356406 ttaaaataacctagttcttcagcttcatcaactcacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcatatacaatcaaaagacaaaataagta 11356497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 175 - 480
Target Start/End: Original strand, 32517766 - 32518063
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||       |||| || |||||| |||| ||||||||||||||    
T  32517766 actaatttgaggatcggtatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaatttttttgacataagggtttggttcagtcattgacaacctc 32517865  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  32517866 ttttcattacaaca--------ttacatggacttgacacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaa 32517957  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  32517958 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctttgcccatatcctttggcttctccatcaaccttgcattt 32518057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 307 - 590
Target Start/End: Original strand, 9399137 - 9399420
Alignment:
Q  307 ttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttat 406  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9399137 ttggcacaataaaataacattctaaacaactcaaacaaacaaatcactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcatttcctacacaatcaactttat 9399236  T
Q  407 ccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaata 506  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9399237 ccatcaactttgccttccaaacctcttctctgccactatcctttggcttctccatcaaccttgcttttctaccatgaccagcacccttgtttttaaaata 9399336  T
Q  507 gcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9399337 acctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaagatttataattttcaccatcgtcctatacaatcaaaagacaaaattagta 9399420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 119 - 427
Target Start/End: Original strand, 20524226 - 20524526
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| ||||||||||   |||||||||||||    
T  20524226 aaggatcatagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatacatatataattcaagg 20524325  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 318  Q
    |||||| ||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| | ||||||||||||    
T  20524326 accaatttgattgaattttttttacataaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatgaacttggcacaatac 20524417  T
Q  319 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20524418 aatagcattttaaacaactcaataaaacaaaatactcatatcaatatcataatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 20524517  T
Q  419 ccctccaaa 427  Q
    |||||||||    
T  20524518 ccctccaaa 20524526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 255 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 33268027 - 33267809
Alignment:
Q  255 attcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatact 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       || |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  33268027 attcattcattgacaacctcttttcattacaacattacaaca-------gacttggcacaatacaataacattttaaacagctcattcaaacaaattact 33267935  T
Q  355 cctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggct 454  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||| || ||||| |||| ||    
T  33267934 cctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgacc-ccaaacctatactctgccactatcctttgcct 33267836  T
Q  455 tctcgatcaaccttgcatttcttccat 481  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  33267835 tcttcatcaaccttgcatttcttccat 33267809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 448 - 585
Target Start/End: Original strand, 20524587 - 20524724
Alignment:
Q  448 tttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttac 547  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  20524587 tttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgacgagcaccgttgtttttaaaatagcatagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttac 20524686  T
Q  548 aattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaat 585  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  20524687 aattttcaccatcatcctatacaagcagaagacaaaat 20524724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32455127 - 32455022
Alignment:
Q  128 attgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtg 227  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  32455127 attgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgatggatatgattataattcaaggaccaatgta 32455028  T
Q  228 attgaa 233  Q
    ||||||    
T  32455027 attgaa 32455022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 255 - 350
Target Start/End: Original strand, 10569375 - 10569462
Alignment:
Q  255 attcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10569375 attcattcattgacaacctcttttcattacaacatta--------catagacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaa 10569462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 350
Target Start/End: Original strand, 7050654 - 7050821
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||   ||| |||  |||||||||| ||||||||       |||| || ||||  |||||| |||||||||||||    
T  7050654 actaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaatttttttgacaaaagggttaaattcatccattgacaacctc 7050753  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 350  Q
    |||||||||||||||||        ||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7050754 ttttcattacaacatta--------cacagacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaa 7050821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 366 - 434
Target Start/End: Original strand, 17935548 - 17935616
Alignment:
Q  366 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 434  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  17935548 cttaatcaacctaagctcacatcctactcagtcaactttgtccctcaaccttaccctccaaaactcttc 17935616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 291
Target Start/End: Original strand, 6902085 - 6902161
Alignment:
Q  215 aaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta 291  Q
    |||||||||| ||||||||       ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6902085 aaggaccaatttgattgaatttttttgacagaagggttaaattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta 6902161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 544 - 587
Target Start/End: Original strand, 7050824 - 7050867
Alignment:
Q  544 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatca 587  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7050824 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatca 7050867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 544 - 590
Target Start/End: Original strand, 10569465 - 10569511
Alignment:
Q  544 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10569465 ttacaattttcaccatcatcctgtacaatcaaaagacaaaatcagta 10569511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 544 - 589
Target Start/End: Original strand, 6902215 - 6902260
Alignment:
Q  544 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagt 589  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6902215 ttacaaatttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagt 6902260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 491 - 536
Target Start/End: Original strand, 34344779 - 34344824
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 536  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34344779 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 34344824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 491 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 17951197 - 17951156
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaaccc 532  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  17951197 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaaccc 17951156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 175 - 594
Target Start/End: Original strand, 51012822 - 51013233
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51012822 actaatttgaggattgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaatttttttgatagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 51012921  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51012922 ttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaacccagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 51013013  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51013014 cctaagcttacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcattt 51013113  T
Q  475 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 574  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51013114 cttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcattaacccacacaaaaaatttacaattttcacaatcatcctatacaatca 51013213  T
Q  575 aaagacaaaatcagtataat 594  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  51013214 aaagacaaaatcagtataat 51013233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 175 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 11255159 - 11254753
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11255159 actaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaacgatcaatttgattgaaattttttgacataaaggtttgattcattcattgacaacctc 11255060  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    |||||||||||||||||        |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11255059 ttttcattacaacatta--------catggacttggcacaatataatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 11254968  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11254967 cctaagctcacttcctacacaattaactttatccaacaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcattt 11254868  T
Q  475 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 574  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11254867 cttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagcatagttcttcggcttcatcaacc-acacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatca 11254769  T
Q  575 aaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||||||    
T  11254768 aaagacaaaatcagta 11254753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 175 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 35402897 - 35402493
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||       |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  35402897 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaagaaccaatttgattgaaattttttgacataagggtttgattcattcattgacaacctc 35402798  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    |||||||||||||||||        || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35402797 ttttcattacaacatta--------cacggacttggcacagtacaatagcattttaaacaactcaatcaaaaaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 35402706  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  35402705 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcctttgccttctccatcaaccttgcattt 35402606  T
Q  475 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 574  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||   ||||    
T  35402605 cttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctat---atca 35402509  T
Q  575 aaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||||||    
T  35402508 aaagacaaaatcagta 35402493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 119 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 41761012 - 41760637
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| | |||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  41761012 aaggatcacagtgatatctggtatgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaagg 41760913  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 318  Q
    |||||| ||||||||       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||||||||||    
T  41760912 accaatttgattgaaattttttgccagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta--------catggacttggcacaatac 41760821  T
Q  319 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 418  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41760820 aatagcattttcaacaactcaatcaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 41760721  T
Q  419 ccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaa 502  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41760720 ccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaa 41760637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 175 - 481
Target Start/End: Original strand, 49524027 - 49524325
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49524027 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaatgaccaatttgattgaaatattttgacagaagggtttgattcattcattgacaacctc 49524126  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    ||||||||||||||        ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49524127 ttttcattacaaca--------ttacatgaacttggcacaatacaataatattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 49524218  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  49524219 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcctttggcttctccatcaaccttgcattt 49524318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 255 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 2692435 - 2692165
Alignment:
Q  255 attcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatact 354  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||        ||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2692435 attcattcgttgacaacctcttttaattacaac--------attacagagacttggcacaatacaataacattttaaacaacttaatcaaacaaattact 2692344  T
Q  355 cctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggct 454  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||    
T  2692343 cctatcaatatcttaatcaacctaagctgacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgccactatcctttagct 2692244  T
Q  455 tctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaaccca 533  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2692243 tctccatcaaccttgcatttcttccatgacctgcatcattgtttttaaaataacctagttcttcagcttcatcaaccca 2692165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 112 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 834347 - 834096
Alignment:
Q  112 atgtccaaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  834347 atgtccaaaggatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatgttttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 834248  T
Q  212 ttcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||| |||||    
T  834247 ttcaaggaccaatgtgattgaatatttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaaccttttttcattac--------aacattacatggacttggc 834156  T
Q  312 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaat 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  834155 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaat 834096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 175 - 427
Target Start/End: Original strand, 43520333 - 43520577
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43520333 actaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaatattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctc 43520432  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43520433 ttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaatacaatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 43520524  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  43520525 cctaagctcacttcctacacaatcaactttattcatcaaccttgtcctccaaa 43520577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 311 - 590
Target Start/End: Original strand, 11641112 - 11641391
Alignment:
Q  311 cacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccat 410  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11641112 cacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaacatcttaatcaacctaagttcacttcctacacaatcaactttatccat 11641211  T
Q  411 caaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcct 510  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |   |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  11641212 caaccttgccctccaatcctcttctttgctagtatcctttgacttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccatcaccattgtttttaaaataacct 11641311  T
Q  511 aattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    | || |||||||||||||||||| ||       | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  11641312 agttattcagcttcatcaacccagacaaaaaattgacaattttcaccatcatcctatacaaagaaaattcaaaatcagta 11641391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 373 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 41760638 - 41760422
Alignment:
Q  373 aacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcat 472  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41760638 aacctaagctcacttcctacccaatcaactttatgcatcaaccttgccctccaaacctcttctct-cccctatcctttggcttctccatcaaccttgcat 41760540  T
Q  473 ttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaat 572  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41760539 ttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagctcagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaat 41760440  T
Q  573 caaaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41760439 caaaagacaaaatcagta 41760422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 112 - 371
Target Start/End: Original strand, 5438616 - 5438863
Alignment:
Q  112 atgtccaaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    |||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5438616 atgtccaaaggatcaaattgatttctgttatgataattcaagga----tttgatgttttttttactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataa 5438711  T
Q  212 ttcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||| |||||    
T  5438712 ttcaaggaccaatgtgattgaatatttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaaccttttttcattac--------aacattacatggacttggc 5438803  T
Q  312 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaat 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5438804 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaat 5438863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 42981515 - 42981743
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42981515 actaatttaaggatcgatatgatagatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcatcgacaacctc 42981614  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    |||||||||||||| ||        |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42981615 ttttcattacaacaata--------catgaacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatgaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 42981706  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 411  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42981707 tctaagctcatttcctacacaatcaactttatccatc 42981743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 476 - 594
Target Start/End: Original strand, 5438863 - 5438984
Alignment:
Q  476 ttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctataca---at 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||   ||    
T  5438863 ttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaaattacagttttcacaatcatcctatacaatcat 5438962  T
Q  573 caaaagacaaaatcagtataat 594  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5438963 caaaagacaaaatcagtataat 5438984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 476 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 834096 - 833975
Alignment:
Q  476 ttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctataca---at 572  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||   ||    
T  834096 ttccatgaccatcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaaattacagttttcacaatcatcctatacaatcat 833997  T
Q  573 caaaagacaaaatcagtataat 594  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  833996 caaaagacaaaatcagtataat 833975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 439 - 590
Target Start/End: Original strand, 42981746 - 42981897
Alignment:
Q  439 cccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnn 538  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||      
T  42981746 cccctatcctttggcttctccatcaacattggatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagcctagttcttcaacttcatcaagccacacaa 42981845  T
Q  539 nnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
         |||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  42981846 aaaatttacaatttttaccttcatcctgtacaatcaaaaggcaaaatcagta 42981897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 319949 - 319845
Alignment:
Q  117 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 216  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  319949 caaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 319850  T
Q  217 ggacc 221  Q
    |||||    
T  319849 ggacc 319845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4172789 - 4172685
Alignment:
Q  117 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 216  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4172789 caaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 4172690  T
Q  217 ggacc 221  Q
    |||||    
T  4172689 ggacc 4172685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Original strand, 33265422 - 33265526
Alignment:
Q  117 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 216  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33265422 caaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 33265521  T
Q  217 ggacc 221  Q
    |||||    
T  33265522 ggacc 33265526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Original strand, 43508065 - 43508169
Alignment:
Q  117 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 216  Q
    |||||||||| |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43508065 caaaggatcacattgatatttgttatgataattcaaggaccaatttgatggtatcttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 43508164  T
Q  217 ggacc 221  Q
    |||||    
T  43508165 ggacc 43508169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 48645976 - 48645809
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||   ||| |||  |||||||||| ||||||||       ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||    
T  48645976 actaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaaattttttgacagaagggttaaattcatttattgacaacctc 48645877  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 350  Q
    |||||||||||||||||        ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48645876 ttttcattacaacatta--------catagacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaa 48645809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 364 - 431
Target Start/End: Original strand, 32652934 - 32653001
Alignment:
Q  364 aacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 431  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32652934 aacttaatcaccctaagctcacttcctatacaatcaactttttccatcaaccttgccctccaaacctc 32653001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28101606 - 28101484
Alignment:
Q  312 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || | | | ||   |||||||  |||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||    
T  28101606 acaatacaatagcatgttaaacaactcaaacagatatattatgactatcaaatacttaatcaacctaagttcattttctacacagtcaactttgtccatc 28101507  T
Q  412 aaccttgccctccaaacctcttc 434  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  28101506 gaccttgccctccaaacctcttc 28101484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 364 - 434
Target Start/End: Original strand, 4614585 - 4614655
Alignment:
Q  364 aacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 434  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4614585 aacttaatcaacttaagctcacttcctacatagtcaactttgtccatcaaccatgccctccaaacctcttc 4614655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 321 - 434
Target Start/End: Original strand, 7150446 - 7150559
Alignment:
Q  321 tagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgcc 420  Q
    |||||| |||||||||||||  || |||| ||   |||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  7150446 tagcatgttaaacaactcaaaaaaccaaattatgactatcaaatacttaatcaacctaacctcacttcttacatagtcaactttgtccatcaaccttgcc 7150545  T
Q  421 ctccaaacctcttc 434  Q
    ||| ||||||||||    
T  7150546 ctctaaacctcttc 7150559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 350
Target Start/End: Original strand, 54387076 - 54387203
Alignment:
Q  215 aaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcaca 314  Q
    |||||||||| ||||||||       ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||  || ||||||||    
T  54387076 aaggaccaatttgattgaaattttttgacagaagggttaaattcattcattgacaacctcttttcattac--------aacattacacagacttggcaca 54387167  T
Q  315 atacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 350  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  54387168 atacaataacattttaaacaactcaatcacacaaaa 54387203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 544 - 590
Target Start/End: Original strand, 54387206 - 54387252
Alignment:
Q  544 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54387206 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 54387252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 544 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 48645806 - 48645760
Alignment:
Q  544 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48645806 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaaggcaaaatcagta 48645760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 44993445 - 44993401
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccaca 535  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44993445 cattgtttttaaagtaacctaattcttcagcttcatcaacccaca 44993401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 379 - 434
Target Start/End: Original strand, 27385571 - 27385626
Alignment:
Q  379 agctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 434  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27385571 agctcagttcctatacaatcaactttgtccatcaaccttgtcttccaaacctcttc 27385626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13449624 - 13449570
Alignment:
Q  377 taagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 431  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13449624 taagctcacttcatatgcaatcaactttgtccatcaactttgccctccaaacctc 13449570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 491 - 536
Target Start/End: Original strand, 32653085 - 32653130
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 536  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32653085 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 32653130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 491 - 536
Target Start/End: Original strand, 39190273 - 39190318
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 536  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39190273 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 39190318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 491 - 536
Target Start/End: Original strand, 39922461 - 39922506
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 536  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39922461 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 39922506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 491 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 42879921 - 42879876
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 536  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42879921 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 42879876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 491 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 43779024 - 43778979
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 536  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43779024 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 43778979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 356 - 418
Target Start/End: Original strand, 10544170 - 10544232
Alignment:
Q  356 ctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 418  Q
    |||||||  ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10544170 ctatcaaatacttaatgaatctaagctcactatctacacaatcaactttctccatcaatcttg 10544232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 291
Target Start/End: Original strand, 11641016 - 11641066
Alignment:
Q  241 gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta 291  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11641016 gacagaatggttgaattcattcattgacaacatcttttctttacaacatta 11641066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 221
Target Start/End: Original strand, 41782417 - 41782463
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggacc 221  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41782417 actaatttgaggattgatatgatggatatgcatataattcaaggacc 41782463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 491 - 536
Target Start/End: Original strand, 5485506 - 5485551
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 536  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5485506 cattgtttttaaagtaacctagttcatcagcttcatcaacccacac 5485551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 491 - 536
Target Start/End: Original strand, 39084606 - 39084651
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 536  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  39084606 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagtttcatcaacccacac 39084651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 219
Target Start/End: Original strand, 43507646 - 43507675
Alignment:
Q  190 gaaatgatggatatgaatataattcaagga 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43507646 gaaatgatggatatgaatataattcaagga 43507675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 491 - 531
Target Start/End: Original strand, 10544259 - 10544299
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacc 531  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  10544259 cattgtttttaaagtatcctaattctccagcttcatcaacc 10544299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 175 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 53188929 - 53188518
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  53188929 actaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaatttttttgacagaaaggtttcattcattcattgacaaccta 53188830  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    |||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53188829 ttttcattacaacatta--------catggacttggcacaatacaataacattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 53188738  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53188737 tctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaactttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcattt 53188638  T
Q  475 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 574  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53188637 cttccatgaccaacaccgttgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcacaatcatcctatacaatca 53188538  T
Q  575 aaagacaaaatcagtataat 594  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  53188537 aaagacaaaatcagtataat 53188518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 121 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 27898397 - 27897937
Alignment:
Q  121 ggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggac 220  Q
    |||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27898397 ggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggac 27898298  T
Q  221 caatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaa 320  Q
    |||  ||||||||       |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| |||||||||| |||    
T  27898297 caacttgattgaatttttttgacaaaagggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta--------catggacttggcacaat-caa 27898207  T
Q  321 tagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgcc 420  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27898206 tagcattttaaacaacttaatcaaacaaaatactcctatcaatatattaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgcc 27898107  T
Q  421 ctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcag 520  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||     
T  27898106 ctccaaacctcttctctgcccctatcatttgccttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttcttcaa 27898007  T
Q  521 cttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27898006 cttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 27897937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 119 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 30599492 - 30599030
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||| | |||||| ||||| |||||||||||||    
T  30599492 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcaatatgatgaatatgtatataattcaagg 30599393  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 318  Q
    |||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||||||||||    
T  30599392 accaatttgattgaaattttt-gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta--------catggacttggcacaatac 30599302  T
Q  319 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 418  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30599301 aataacattttaaacaactcaatgaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 30599202  T
Q  419 ccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttc 518  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  30599201 ccctccaaacctcttctctccccctatcctttgacttctccatcaatcttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaatagtctagttcttc 30599102  T
Q  519 agcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    | ||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30599101 aacttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcttatacaatcaaaagacaaaataagta 30599030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 175 - 590
Target Start/End: Original strand, 46198634 - 46199041
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46198634 actaatttgaggatcgatatgatagatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacataaatgtttgattcattcattgacaacctc 46198733  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46198734 ttttcattacaaca--------ttacatggacttgacacaatataataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 46198825  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  46198826 cctaagtccacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttgacttctccatcaaccttgcattt 46198925  T
Q  475 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 574  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  46198926 cttccatgaccagaaccattgtttttaaaataggctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatta 46199025  T
Q  575 aaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||||||    
T  46199026 aaagacaaaatcagta 46199041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 175 - 586
Target Start/End: Original strand, 21349609 - 21350012
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21349609 actaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaatgaccaatttgattgatttttttttacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 21349708  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  21349709 ttttcattacaaca--------ttacatggacttggcgcaatagaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcatatcaatgtcttaatcaa 21349800  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21349801 cataagctcacttcctacacaatcaactttattcatcaaccttgccctcaaaacttcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcattt 21349900  T
Q  475 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 574  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21349901 cttccatgaccatcaccattgtttttaaaatagcctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatca 21350000  T
Q  575 aaagacaaaatc 586  Q
    ||||||||||||    
T  21350001 aaagacaaaatc 21350012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 175 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 44275445 - 44275045
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44275445 actaatttgaggatcgatatgatggatatgtgtataattcaaggaccaatttgattgaaatttttt--cagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 44275348  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    |||||||||||||||||        |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44275347 ttttcattacaacatta--------catgaacttggcacaatacaataccattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 44275256  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44275255 cctaagctcccttccttcacaatcaaatttatccatcaaccttgccctccaaacgtcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttccattt 44275156  T
Q  475 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 574  Q
    |||| |||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44275155 cttcgatgaccagaaccattgtttgtaaaatagcctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatca 44275056  T
Q  575 aaagacaaaat 585  Q
    |||||||||||    
T  44275055 aaagacaaaat 44275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 119 - 525
Target Start/End: Original strand, 17516169 - 17516565
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17516169 aaggatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttttactaatttgagtatcgatatgatggatatga-tataattcaagg 17516267  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 318  Q
    |||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||    
T  17516268 accaatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatggaattggcacaatac 17516359  T
Q  319 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516360 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatacttctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 17516459  T
Q  419 ccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttc 518  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17516460 ccctccaaacctcttctct-cccccatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcctagttcttc 17516558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 175 - 585
Target Start/End: Original strand, 43766036 - 43766438
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43766036 actaatttgatgatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgatagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 43766135  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    ||||||||||||  |||        |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43766136 ttttcattacaatgtta--------catgaacttgacacaataaaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatattaatcaa 43766227  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  43766228 tctaagctcacttcctacacaatcagctttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaatcttgcattt 43766327  T
Q  475 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 574  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  43766328 catccatgaccagcaccattgtttttaaaattgcctagttcttcaacttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaataa 43766427  T
Q  575 aaagacaaaat 585  Q
    |||||||||||    
T  43766428 aaagacaaaat 43766438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 175 - 476
Target Start/End: Original strand, 54899348 - 54899649
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54899348 actaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccgatgtgattgaatttttttgacggaaaggtttgattcattcattgacaacctc 54899447  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54899448 ttttcattacaacattacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 54899547  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  54899548 cctaagctcacttcctacacaatcaactttacccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccttatcatttggcttctccatcaaccttgtattt 54899647  T
Q  475 ct 476  Q
    ||    
T  54899648 ct 54899649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 119 - 590
Target Start/End: Original strand, 2377855 - 2378311
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  2377855 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgttatgatggatatgcatataattcaagg 2377954  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 318  Q
    |||||| ||||||||        ||| || |||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||        |||||| |||||||||| |    
T  2377955 accaatttgattgaaattttttaacataagggtttgattcatt-----acaacctcttttcattacaacatta--------catggacttggcacaat-c 2378040  T
Q  319 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 418  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2378041 aataacattttaaacaactcaatcaaa-aaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcatttcctacgcaatcaactttatccatcaaccttg 2378139  T
Q  419 ccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttc 518  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2378140 ctctccaaacctcttctctgcccctatcctttgacttatccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttcttc 2378239  T
Q  519 agcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378240 agcttcatcaacccacacaaaaattttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 2378311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 311 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 35904850 - 35904567
Alignment:
Q  311 cacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccat 410  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35904850 cacaatacaataacattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaaactcacttcctacacaatcaactttatccat 35904751  T
Q  411 caaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcct 510  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  35904750 caaccttgccctccaaacctgttctctgcccctatcgtttgccttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccattgtttttaaaatagcct 35904651  T
Q  511 aattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35904650 aattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcacaatcatcctatacaataaaaagacaaaatcagtataat 35904567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 119 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 2225457 - 2225165
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2225457 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgtatataattcaagg 2225358  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 318  Q
    ||||||| || ||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2225357 accaatgcgaatgaatttttttgacagaaatgtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacaacattacatggacttggcacaatac 2225258  T
Q  319 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 411  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2225257 aataacattttaaacaactcagtcaagcaaaatactcctatcaatatattaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 2225165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 119 - 427
Target Start/End: Original strand, 2661073 - 2661373
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       || ||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  2661073 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaaccaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaagg 2661172  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 318  Q
    |||||| ||||| ||       |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||  |||||||||||    
T  2661173 accaatttgattaaaatattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatggacatggcacaatac 2661264  T
Q  319 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 418  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2661265 aatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatacccctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 2661364  T
Q  419 ccctccaaa 427  Q
     ||||||||    
T  2661365 tcctccaaa 2661373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 119 - 427
Target Start/End: Original strand, 44795058 - 44795358
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  44795058 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatggatataattcaaga 44795157  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 318  Q
    |||||| ||||||||       |||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||| |||||    
T  44795158 accaatttgattgaaatattttgacataatggtttggttcattcatcgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttggcataatac 44795249  T
Q  319 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 418  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44795250 aatattattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 44795349  T
Q  419 ccctccaaa 427  Q
     ||||||||    
T  44795350 tcctccaaa 44795358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 215 - 458
Target Start/End: Original strand, 610549 - 610784
Alignment:
Q  215 aaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcaca 314  Q
    |||||||||| ||||||||       ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      |||  | ||||||||    
T  610549 aaggaccaatttgattgaatttttttgacagaagggttgaattcattcattgacaacctcttttcattacaacattaca------cat--acttggcaca 610640  T
Q  315 atacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaac 414  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  610641 atacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaatatcttaataaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaac 610740  T
Q  415 cttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctc 458  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||||    
T  610741 cttgccctccaagccttttctctaacactatcttttggcttctc 610784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 215 - 458
Target Start/End: Original strand, 46113422 - 46113657
Alignment:
Q  215 aaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcaca 314  Q
    |||||||||| ||||||||       ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||  || ||| ||||    
T  46113422 aaggaccaatttgattgaaattttttgacagaagggttggattcattccttgacaacctcttttcattacaacatta--------cacagacttgacaca 46113513  T
Q  315 atacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaac 414  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  46113514 atacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcccgcacaatcaactttatccatcagc 46113613  T
Q  415 cttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctc 458  Q
    |||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||    
T  46113614 cttgccctccaagcctcttctcgaacactatcatttgtcttctc 46113657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 175 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23292398 - 23292232
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  23292398 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggatcaatttgattgaaattttttgacagaaaagtttgattcattcattgacaaccta 23292299  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 349  Q
    |||||||||||||        |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23292298 ttttcattacaac--------attatatggacttgtcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 23292232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 35905010 - 35904849
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35905010 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaatgacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaagg 35904911  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttca 280  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35904910 accaatgtgattgaatttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttca 35904849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 314 - 433
Target Start/End: Original strand, 13466205 - 13466324
Alignment:
Q  314 aatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaa 413  Q
    |||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13466205 aatacagtagcatgttaaacaatccaatcaaacaaattacacctatcaaatatttaatcaacctaaactcacttcctacacaatcaactttgtccatcaa 13466304  T
Q  414 ccttgccctccaaacctctt 433  Q
    |||| |||||||| ||||||    
T  13466305 cctttccctccaatcctctt 13466324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38192560 - 38192456
Alignment:
Q  117 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 216  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38192560 caaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 38192461  T
Q  217 ggacc 221  Q
    |||||    
T  38192460 ggacc 38192456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 53093300 - 53093196
Alignment:
Q  117 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 216  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53093300 caaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 53093201  T
Q  217 ggacc 221  Q
    |||||    
T  53093200 ggacc 53093196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 46609825 - 46609724
Alignment:
Q  117 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 216  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46609825 caaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 46609726  T
Q  217 gg 218  Q
    ||    
T  46609725 gg 46609724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Original strand, 46309848 - 46309952
Alignment:
Q  117 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 216  Q
    |||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46309848 caaatgatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcat 46309947  T
Q  217 ggacc 221  Q
    |||||    
T  46309948 ggacc 46309952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 366 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 32843504 - 32843436
Alignment:
Q  366 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 434  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  32843504 cttaatcaacctaagctcacatcctacacagtcaactttgtcgatcaaccttgccctccaaaactcttc 32843436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 367 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 23876287 - 23876220
Alignment:
Q  367 ttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 434  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23876287 ttaatcaacctaaactcacttcatacagagtcaactttgtccatcaaccttgccctccaaacctcttc 23876220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 364 - 431
Target Start/End: Original strand, 41945412 - 41945479
Alignment:
Q  364 aacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 431  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  41945412 aacttaatcaccctaagctcacttcctatacaatcaactttgtccatcaaccttgtcctctaaacctc 41945479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 328 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 35862546 - 35862440
Alignment:
Q  328 ttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 427  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||    ||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||    
T  35862546 ttaaacaactcaaacaagcaaattatgattatcaaatacttaatcaacttaagctcgcttcctacacaatcaactttgttcatcaaccttgccatgcaaa 35862447  T
Q  428 cctcttc 434  Q
    |||||||    
T  35862446 cctcttc 35862440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 255 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 48829973 - 48829886
Alignment:
Q  255 attcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 350  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48829973 attcattcattgacaaccacttttcattacaacatta--------cacagacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaa 48829886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 350
Target Start/End: Original strand, 51685546 - 51685673
Alignment:
Q  215 aaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcaca 314  Q
    |||||||||| ||||||||       ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||  || ||| ||||    
T  51685546 aaggaccaatttgattgaaattttttgacagaaaggttaaattcattcattgacaacctcttttcattac--------aacattacacagacttgacaca 51685637  T
Q  315 atacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 350  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51685638 atacaataacatttcaaacaactcaatcacacaaaa 51685673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 453 - 590
Target Start/End: Original strand, 13466364 - 13466507
Alignment:
Q  453 cttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagca------tcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnntta 546  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||       |||    
T  13466364 cttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaccacaaattccattgtttttaaaataacctagctcttcagcttcatcaacccagacaaaaaattta 13466463  T
Q  547 caattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
     | ||||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  13466464 tagttttcaccatcatcctatacaaagaaaattcaaaatcagta 13466507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 544 - 590
Target Start/End: Original strand, 42281798 - 42281844
Alignment:
Q  544 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42281798 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 42281844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 544 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 48829883 - 48829837
Alignment:
Q  544 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48829883 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 48829837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2976412 - 2976359
Alignment:
Q  364 aacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaacctt 417  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  2976412 aacttaatcaacctaagctcaattcctacacactcaactttgtccatcaacctt 2976359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 291
Target Start/End: Original strand, 42280443 - 42280519
Alignment:
Q  215 aaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta 291  Q
    |||||||||| ||||||||       ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42280443 aaggaccaatttgattgaaattttttgacagaagggttaaattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta 42280519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 544 - 586
Target Start/End: Original strand, 51685676 - 51685718
Alignment:
Q  544 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatc 586  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51685676 ttacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatc 51685718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 49495139 - 49495067
Alignment:
Q  356 ctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  49495139 ctatcaaaaacttaatcaacctaagctcagttcctaaaatatcaactttgtccatctacctcaccctccaaac 49495067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 491 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 37886412 - 37886367
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 536  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37886412 cattgtttttaaagtaatctagttcttcagcttcatcaacccacac 37886367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 492 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 2976250 - 2976210
Alignment:
Q  492 attgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaaccc 532  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  2976250 attgtttttaaagtatcctaattcttcagcttcattaaccc 2976210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 364 - 428
Target Start/End: Original strand, 33050905 - 33050969
Alignment:
Q  364 aacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 428  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  33050905 aactcaatcaacctacgctcaattcctaaagtatcaactttgtccatcaatctcgccctccaaac 33050969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 204
Target Start/End: Original strand, 41978587 - 41978672
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatg 204  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41978587 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatg 41978672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 119 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 38473409 - 38472946
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| ||||||  |||| |||||||||||||    
T  38473409 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatgagtatgtatataattcaagg 38473310  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 318  Q
    |||||| ||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| |||||| |||||    
T  38473309 accaatttgattgaaattttttgacaaaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta--------catggacttggcaaaatac 38473218  T
Q  319 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38473217 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagttcacttcctacacaatcaactttatccatcaactttg 38473118  T
Q  419 ccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttc 518  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||    
T  38473117 ccctccaaacctcttctctccccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaattgcctagttattc 38473018  T
Q  519 agcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtat 591  Q
    ||||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473017 agcttcatcaacccacac-aaaaaattacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtat 38472946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 121 - 590
Target Start/End: Original strand, 22154741 - 22155202
Alignment:
Q  121 ggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggac 220  Q
    |||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22154741 ggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggac 22154840  T
Q  221 caatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaa 320  Q
    |||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||    
T  22154841 caatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaatacaa 22154932  T
Q  321 tagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgcc 420  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  22154933 taacattttaaacaattcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacgatcaactttatccatcaaccttgtc 22155032  T
Q  421 ctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcag 520  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  22155033 ctccaaacctcttctctgcccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacatcattgtttttaaaataacctagttcttcaa 22155132  T
Q  521 cttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    |||||||||||||||        ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22155133 cttcatcaacccacaaaaaaatattacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaggacaaattcagta 22155202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 121 - 590
Target Start/End: Original strand, 22210656 - 22211117
Alignment:
Q  121 ggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggac 220  Q
    |||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22210656 ggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggac 22210755  T
Q  221 caatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaa 320  Q
    |||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||    
T  22210756 caatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaatacaa 22210847  T
Q  321 tagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgcc 420  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  22210848 taacattttaaacaattcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacgatcaactttatccatcaaccttgtc 22210947  T
Q  421 ctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcag 520  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  22210948 ctccaaacctcttctctgcccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacatcattgtttttaaaataacctagttcttcaa 22211047  T
Q  521 cttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    |||||||||||||||        ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22211048 cttcatcaacccacaaaaaaatattacaattttcaccatcatcctatacaatcaaaggacaaattcagta 22211117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 119 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 35692635 - 35692168
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  35692635 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaatgacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaagg 35692536  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 318  Q
    |||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||||||||||    
T  35692535 accaatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta--------catggacttggcacaatac 35692444  T
Q  319 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 418  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35692443 aatagcattt-aaacaacacaatcaaacaaaatacttttatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccaccaaccttg 35692345  T
Q  419 ccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgttttt-aaaatagcctaattctt 517  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  35692344 ccctccaaacctcttctctgtccccatcatttgacttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccaacaccgttgtttttaaaaatagtctagttctt 35692245  T
Q  518 cagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagtataat 594  Q
    |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35692244 cagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcacaatcatcttatacaatcaaaagacaaaatcaatataat 35692168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 146 - 590
Target Start/End: Original strand, 45360203 - 45360638
Alignment:
Q  146 aattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacag 245  Q
    |||||||||||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       ||||     
T  45360203 aattcaaagacctatttgatggtattttcactaattttaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacat 45360302  T
Q  246 aaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaa 345  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  45360303 aagggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta--------catggacttggcacaat-cattagcattttaaacaactcaatccaa 45360393  T
Q  346 caaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctat 445  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  45360394 caaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaaactcacttcctatacaatcaactttttccatcaaccttgccctccaaacctcttctccgcccctat 45360493  T
Q  446 catttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnntt 545  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||       ||    
T  45360494 cctttgacttctccatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagtttttcagcttcatccacccacacaaaaaattt 45360593  T
Q  546 acaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45360594 acaattttcaccatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 45360638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 119 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 46438795 - 46438331
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||||| |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       ||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  46438795 aaggatcaaagtgatatctgttgtgaaaattcaatgacctatttgatggtattttcacttatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaagg 46438696  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 318  Q
    |||||| ||||||||       |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||        |||||| ||||||||||||    
T  46438695 accaatttgattgaaattttttgacatataggtttgattcattcgttgacaacctcttttcagtacaacatta--------catggacttggcacaatac 46438604  T
Q  319 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 418  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46438603 aatagcattttaaacaactcaaccaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacagtcaactttatccatcaaccttg 46438504  T
Q  419 ccctccaaacctcttctct-acccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattctt 517  Q
     ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  46438503 tcctccaaacttcttctctcccccctatcctttggcttctctatcaaccttgcatttcttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttctt 46438404  T
Q  518 cagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    || ||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  46438403 caacttcatcaacccacacaaaaaaattacaattttcaccatcatccaatgcaatcaaaagacaaattcagta 46438331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 119 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 34776246 - 34775788
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| | |||| |||| | ||| |||||||||| | |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  34776246 aaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaagatctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaagg 34776147  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatac 318  Q
    |||||| ||||| ||       |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| |||| ||||| |    
T  34776146 accaatttgattaaaaaaatttgacagaagagtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta--------catggacttgggacaat-c 34776056  T
Q  319 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34776055 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatacacctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttattcatcaaccttg 34775956  T
Q  419 ccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttc 518  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  34775955 ccctccaaacctcttctttgcccctatcatttggcttctccatcaaccttacatttcttccatgactagtaccattatttttaaaataacctagttcttc 34775856  T
Q  519 agcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatca 587  Q
    ||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34775855 agcttcatcaacccacac-aaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaaccaaaagacaaaatca 34775788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 175 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 47385444 - 47385029
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||   |||||||  |||||||||| ||||||||       ||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  47385444 actaatttggggatcgatatgatggatagacatataatagaaggaccaatttgattgaatttttttgacagaaaggttgaattcattcattgacaaccac 47385345  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||  || ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  47385344 tgttcattacaacattacagcattacacagacttggcacaataaaataaaattctaaacaactcaatcaaacaaatcactcctatcaatatcttaatcaa 47385245  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  47385244 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccttccaaacctcttctctgccactatcctttggcttctccatcaaccttgcattt 47385145  T
Q  475 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 574  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  47385144 cttccatgaccagcaccattgtttttaaaataacctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaagatttacaattttcaccattatcctgtacaatca 47385045  T
Q  575 aaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||||||    
T  47385044 aaagacaaaatcagta 47385029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 175 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 24227650 - 24227243
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||  || ||||||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24227650 actaatttgaggattgatatgatggatgtgtatataatttaaggacatatttgattgaaattttttgacaacaaggtttgattcattcattgacaacctc 24227551  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    |||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24227550 ttttcattgcaacatta--------catggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatgaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 24227459  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||    
T  24227458 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacttcttctctccccttatcgtttgacttctccatcaaacttgcattt 24227359  T
Q  475 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 574  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       | ||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  24227358 cttccatgactagtaccattgtttttaaaatagcctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaattcacaatttccaccgtcatcctatacaatca 24227259  T
Q  575 aaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||||||    
T  24227258 aaagacaaaatcagta 24227243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 175 - 464
Target Start/End: Original strand, 6604420 - 6604701
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6604420 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 6604519  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    ||||||||||||||        ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  6604520 ttttcattacaaca--------ttacatgaacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctcaatcaa 6604611  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaa 464  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||    
T  6604612 cctaagctcacttcctatacaatcaactttatccatcaaccttgcccttcaaacctcttctttgcccctatcctttggcttctccatcaa 6604701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 175 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23905481 - 23905232
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||       ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23905481 actaatttgaggatcgatatgattgatatgcatataattcaatgaccaatttgatttaaattttttgacagaagggtttgattcattcattgacaacctc 23905382  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    |||||||||||||||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23905381 ttttcattacaacatta--------catggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactgaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 23905290  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctct 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23905289 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaacctct 23905232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 296 - 486
Target Start/End: Original strand, 69132 - 69322
Alignment:
Q  296 attacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacaca 395  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69132 attacatggacttggcacagtacaatagtatttaaaacaactcaatcaaacaaaatactcatattaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacaca 69231  T
Q  396 atcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgacca 486  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  69232 atgaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttcttccatgacca 69322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 175 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27665275 - 27665031
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27665275 actaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattaaaatattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctc 27665176  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    |||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27665175 ttttcattacaacatta--------catggacttggcacaatacaatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 27665084  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 427  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27665083 cctaagctcacttcctacacagttaattttatccatcaaccttgtcctccaaa 27665031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 175 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 29995745 - 29995501
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||       |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  29995745 actaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataatttaaggatcaatttgattgaaatattttgacagaaatgtttggttcattcattgaaaacctc 29995646  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    | |||||||||||||||        ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29995645 tgttcattacaacatta--------catagacttggcacaatacaatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 29995554  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 427  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29995553 cctaagctcacttcctacacagtcaactttatccatcaaccttgtcctccaaa 29995501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 287 - 533
Target Start/End: Original strand, 48310947 - 48311194
Alignment:
Q  287 cattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcact 386  Q
    ||||| |||||||||  || ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  48310947 cattacaacattacacagacttgacataatataatagcattttaaacaattcaatcaaacaaattactcatgtcaatatcttaatcaacctaagttcact 48311046  T
Q  387 tcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgacca 486  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||  || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  48311047 tcctacacaatcgactttatccatcaacattgccctccaaacctcttctccgccactattcttaggcttctccattaaccttgcattccttccatgacca 48311146  T
Q  487 gcatcattgttt-ttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaaccca 533  Q
    ||| |||||||| | |||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  48311147 gcaccattgtttataaaaataacatagttcttcagcttcatcaaccca 48311194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 179 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 39858467 - 39858271
Alignment:
Q  179 atttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 278  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39858467 atttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacagaatggtttgattcattcattgacaacctctttt 39858368  T
Q  279 cattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaaccta 378  Q
    |||||||||||||        |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39858367 cattacaacatta--------catggacttggcacaat-caataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaaccta 39858277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 175 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 37114757 - 37114591
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37114757 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttgacaaaaagatttgattcattcattgacaacctc 37114658  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 349  Q
    |||||| |||        ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37114657 ttttcaatac--------aacattacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 37114591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 13168922 - 13169094
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 218  Q
    |||||||| |||||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13168922 aaggatcacattgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatgttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaagg 13169021  T
Q  219 accaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta 291  Q
    |||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13169022 accaatttgattgaaattttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta 13169094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 491 - 594
Target Start/End: Original strand, 77260 - 77363
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77260 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 77359  T
Q  591 taat 594  Q
    ||||    
T  77360 taat 77363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 448 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 48851435 - 48851293
Alignment:
Q  448 tttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttac 547  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  48851435 tttggtttctccatcaaccttgcatttcttccattaccagcaccattgtttttgaaataatctagttcttcagcttcatcaacccacacaaaaaatttac 48851336  T
Q  548 aattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48851335 aattttcaccatcatcttatacaatcaaaagacaaaatcagta 48851293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 312 - 434
Target Start/End: Original strand, 11683621 - 11683743
Alignment:
Q  312 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||| ||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  11683621 acaatacaatagcatgttaaaaaactcaaacaagtaaattatgactatcaaaaacttaatcaacctaagctcacttcctatacactcaactttgtccatc 11683720  T
Q  412 aaccttgccctccaaacctcttc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11683721 aaccttgccctccaaacctcttc 11683743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 233
Target Start/End: Original strand, 20478921 - 20479034
Alignment:
Q  120 aggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagga 219  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||       | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20478921 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgatggatatgattataattcaagga 20479020  T
Q  220 ccaatgtgattgaa 233  Q
    ||||||||||||||    
T  20479021 ccaatgtgattgaa 20479034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 435
Target Start/End: Original strand, 32840488 - 32840610
Alignment:
Q  312 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 411  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || |||| ||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32840488 acaatacaataacatgttaaaaaattcaaacaagcaaattatgcctatcaaatacttaatcatc-taagttcacttcctacacaatcaactttgtccatc 32840586  T
Q  412 aaccttgccctccaaacctcttct 435  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  32840587 aaccttgccctccaaacctattct 32840610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 364 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 4321867 - 4321800
Alignment:
Q  364 aacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 431  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4321867 aacttaatcaccctaagcttacttcctatacaatcaactttgtccatcaaccttgccctccaaacctc 4321800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 419
Target Start/End: Original strand, 7402914 - 7403021
Alignment:
Q  312 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 411  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||   |||||||  ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||    
T  7402914 acaatacagtagcatgttaaacaacccaaacaaacaaattatgactatcaaatacttaatcaacctaatcttacatcctacacaatcaactttgtccatc 7403013  T
Q  412 aaccttgc 419  Q
    ||||||||    
T  7403014 aaccttgc 7403021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 314 - 417
Target Start/End: Original strand, 23168648 - 23168751
Alignment:
Q  314 aatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaa 413  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| || |||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23168648 aatacaataacatgttaaacaatccaatcaaacgaattacttctatcaaatacttaatcaatctaaactcacttcgtacacaatcaactttatccgtcaa 23168747  T
Q  414 cctt 417  Q
    ||||    
T  23168748 cctt 23168751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35402647 - 35402544
Alignment:
Q  117 caaaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaa 216  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||        |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35402647 caaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatgatattttcactaatttgaggatcgaaatgatggat-tgaatataattcaa 35402549  T
Q  217 ggacc 221  Q
    |||||    
T  35402548 ggacc 35402544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 356 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 34784647 - 34784575
Alignment:
Q  356 ctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  34784647 ctatcaaaaacttaatcaacctaagctcacttcttatacaatcaactttgtccatcaacattgcccttcaaac 34784575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 364 - 431
Target Start/End: Original strand, 34691871 - 34691938
Alignment:
Q  364 aacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 431  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  34691871 aacttaatcaacctaagttcacttcatatacaatcaactttgtccatcaacgttgccctccaaacctc 34691938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 213
Target Start/End: Original strand, 69040 - 69134
Alignment:
Q  119 aaggatcaaattgatttctgatatgataattcaaagaccaatttgatggnnnnnnnactaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataatt 213  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  69040 aaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataatt 69134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Original strand, 40360951 - 40361028
Alignment:
Q  357 tatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 434  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  40360951 tatcaattactttatcaatctaagctcactttctaaacaatcaactttgtccatcaaccttgctctccaaacttcttc 40361028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 356 - 422
Target Start/End: Original strand, 13035927 - 13035993
Alignment:
Q  356 ctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccct 422  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  13035927 ctatcaaatacttaatcaacctaatctcacttcctacatagtcaactttctccatcaaccttcccct 13035993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 544 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 38550313 - 38550267
Alignment:
Q  544 ttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38550313 ttacaattttcaccatcatcctataaaatcaaaagacaaaatcagta 38550267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 255 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 38550419 - 38550316
Alignment:
Q  255 attcattcattgacaacctcttttcattacaacat--------tagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaac 346  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||        || |||||||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  38550419 attcatttattgacaacctcttttcattacaacataacaactttacaacattacacagactttgcacaatacaataacattttaaacaactcaataacac 38550320  T
Q  347 aaaa 350  Q
    ||||    
T  38550319 aaaa 38550316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 48302936 - 48302873
Alignment:
Q  367 ttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 431  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  48302936 ttaatcaccctaagctcacttcctgtacaatcaactttgtccatcaacgttg-cctccaaacctc 48302873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 433 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 23905169 - 23905122
Alignment:
Q  433 tctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttcca 480  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23905169 tctctgcccctatcctttggcttctccatcaaccttgcatttcttcca 23905122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 37792197 - 37792150
Alignment:
Q  241 gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaaca 288  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37792197 gacagaagggttgaattcattcattgacaacctcttttcattacaaca 37792150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 491 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 30109230 - 30109185
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 536  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30109230 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 30109185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 547 - 590
Target Start/End: Original strand, 6604699 - 6604742
Alignment:
Q  547 caattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6604699 caattttcaccatcatcctatacaatcaaaagataaaataagta 6604742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 384
Target Start/End: Original strand, 13169123 - 13169162
Alignment:
Q  345 acaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctca 384  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13169123 acaaaatattcctatcaatatcttaatcaacctaagctca 13169162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 491 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 48302789 - 48302744
Alignment:
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 536  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  48302789 cattgtttttaaagtaacctagttcttcagctttatcaacccacac 48302744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 356 - 428
Target Start/End: Original strand, 1547112 - 1547184
Alignment:
Q  356 ctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |  || |||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  1547112 ctatcaaaaacttaatcaacctaagctaaattcttaaagtataaactttgtccatcaacctcaccctccaaac 1547184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 364 - 404
Target Start/End: Original strand, 27956815 - 27956855
Alignment:
Q  364 aacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaacttt 404  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27956815 aacttaatcaacataagctcacttcctacacgctcaacttt 27956855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 492 - 536
Target Start/End: Original strand, 34692023 - 34692067
Alignment:
Q  492 attgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacac 536  Q
    |||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34692023 attgttttgaaagtaacctagttcttcagcttcatcaacccacac 34692067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 199 - 590
Target Start/End: Original strand, 472 - 858
Alignment:
Q  199 gatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattagaacatt 298  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  472 gatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaactttttgacataagggtttgattcattcattgaccacctcttttcattacaacattacaacatt 571  T
Q  299 aca--------tggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcacttcct 390  Q
    |||        || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  572 acaacattacatgaacttggcacaatagaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatacttctatcaatatcgtaatcaacctaagctgacttcct 671  T
Q  391 acacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgaccagcat 490  Q
    |||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  672 acacaatca-------------accttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctccatcaaccttgcatttcttctatgaccagcac 758  T
Q  491 cattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatcaaaagacaaaatcagta 590  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||       ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  759 cattgtttttaaaataacctagttcttcagcttcatcaactcacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcatatacaatcaaaagacaaaataagta 858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 175 - 479
Target Start/End: Original strand, 9164 - 9460
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||       |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  9164 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggactaatttgattgaatttttttgacataagggtttgattcattcattgacaacctc 9263  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    ||||||||||||||        ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9264 ttttcattacaaca--------ttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 9355  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9356 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatcgatcaaccttgccctccaaacctcttctctgctcctatcatttggcttctccatcaaccttacattt 9455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 175 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 107814 - 107409
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 274  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||   ||| |||  || ||||||| ||||||||       ||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  107814 actaatttagggatcgatatgatggatagacatacaatagaatgaccaatttgattgaaattttttgacagaagggtt-gattcattcattgacaacctt 107716  T
Q  275 ttttcattacaacattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaa 374  Q
    |||||||||| |||||| |  |        | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  107715 ttttcattactacattacacaa--------acttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaatatcttaatcaa 107624  T
Q  375 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcattt 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  107623 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctcaaaacctcttcgctgacactatcctttggcttcttcatcaaccttgcattt 107524  T
Q  475 cttccatgaccagcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacccacacnnnnnnnttacaattttcacaatcatcctatacaatca 574  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  107523 cttccatgaccagcaccattg-ttttaaactaacctagttcttcaacttcatcaacccacacaaaaaatttacaattttcaccatcatcctatacaatca 107425  T
Q  575 aaagacaaaatcagta 590  Q
    ||||||||||||||||    
T  107424 aaagacaaaatcagta 107409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 287 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 1643 - 1401
Alignment:
Q  287 cattagaacattacatggatttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcact 386  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||  |||||    
T  1643 cattacaacattacatagacttggcataatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaacatcttaatcagcctaaattcact 1544  T
Q  387 tcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttggcttctcgatcaaccttgcatttcttccatgacca 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |   |||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  1543 tcctacacaatcaactttatccat--accttgccctccaaacctcttctttgcaagtatcctttgacttctgcatcaaccttgcatttcttccatgctca 1446  T
Q  487 gcatcattgtttttaaaatagcctaattcttcagcttcatcaacc 531  Q
     || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1445 tcaccattgtttttaaaataacctagttcttcagcttcatcaacc 1401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 263
Target Start/End: Original strand, 4199 - 4287
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattca 263  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||| ||||||||    
T  4199 actaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaatattttgacagaaaggtttggttcattca 4287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 263
Target Start/End: Original strand, 5371 - 5459
Alignment:
Q  175 actaatttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaannnnnnngacagaaaggtttgattcattca 263  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||| ||||||||    
T  5371 actaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaatattttgacagaaaggtttggttcattca 5459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University