View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10441_low_2 (Length: 606)

Name: NF10441_low_2
Description: NF10441
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10441_low_2
NF10441_low_2
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (42-473)||(116298-116754)
scaffold0019 (42-116)||(169138-169212)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (42-459)||(6172516-6172947)
chr7 (42-459)||(10346035-10346478)
chr7 (42-459)||(8107618-8108061)
chr7 (42-459)||(31158006-31158449)
chr7 (42-459)||(12090190-12090633)
chr7 (42-459)||(31878590-31879031)
chr7 (42-459)||(2631385-2631828)
chr7 (42-459)||(12183855-12184296)
chr7 (44-450)||(2797295-2797727)
chr7 (42-459)||(12190832-12191273)
chr7 (42-458)||(23795084-23795526)
chr7 (42-448)||(22909118-22909549)
chr7 (42-371)||(19471920-19472263)
chr7 (42-459)||(22321531-22321973)
chr7 (44-459)||(45500443-45500883)
chr7 (116-459)||(31664305-31664667)
chr7 (42-448)||(1274588-1275019)
chr7 (42-475)||(3544608-3545067)
chr7 (42-459)||(2477647-2478092)
chr7 (158-475)||(22818386-22818721)
chr7 (42-453)||(1953952-1954359)
chr7 (42-475)||(24482718-24483177)
chr7 (148-448)||(29032624-29032945)
chr7 (313-459)||(19472279-19472436)
chr7 (42-169)||(22820403-22820536)
chr7 (384-459)||(33160171-33160246)
chr7 (42-145)||(31882433-31882542)
chr7 (364-448)||(19063514-19063597)
chr7 (536-573)||(6172404-6172441)
chr7 (536-573)||(33160059-33160096)
chr7 (534-578)||(12090710-12090754)
chr7 (224-299)||(1948318-1948394)
chr7 (224-299)||(19090269-19090345)
chr7 (224-299)||(26602373-26602449)
chr7 (224-299)||(36876006-36876082)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (42-459)||(52618503-52618934)
chr4 (42-459)||(5273292-5273724)
chr4 (42-475)||(19247558-19248016)
chr4 (42-475)||(1187938-1188396)
chr4 (42-459)||(4838866-4839309)
chr4 (44-475)||(26069698-26070157)
chr4 (42-475)||(42532616-42533075)
chr4 (42-459)||(35416426-35416856)
chr4 (42-459)||(22047670-22048113)
chr4 (42-459)||(323427-323870)
chr4 (42-459)||(40995277-40995722)
chr4 (42-459)||(26373361-26373802)
chr4 (42-452)||(21677397-21677833)
chr4 (42-459)||(46691767-46692209)
chr4 (42-457)||(55326765-55327204)
chr4 (42-459)||(30218117-30218564)
chr4 (42-450)||(53895377-53895810)
chr4 (42-450)||(33110432-33110867)
chr4 (44-458)||(20948735-20949175)
chr4 (42-244)||(9417163-9417372)
chr4 (313-458)||(44432069-44432225)
chr4 (42-108)||(21668635-21668701)
chr4 (266-462)||(6639963-6640178)
chr4 (364-450)||(8894929-8895015)
chr4 (536-578)||(26373869-26373911)
chr4 (536-578)||(52618386-52618428)
chr4 (536-578)||(1187835-1187877)
chr4 (224-299)||(7780787-7780863)
chr4 (228-299)||(30238694-30238766)
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (42-475)||(11738528-11738986)
chr1 (42-459)||(38121662-38122105)
chr1 (42-459)||(39000911-39001354)
chr1 (42-459)||(33491928-33492371)
chr1 (42-475)||(9667426-9667883)
chr1 (42-459)||(16832513-16832955)
chr1 (42-459)||(12167946-12168389)
chr1 (42-459)||(44504998-44505443)
chr1 (42-457)||(432071-432511)
chr1 (42-459)||(40999834-41000276)
chr1 (47-462)||(13217784-13218221)
chr1 (42-459)||(49249061-49249496)
chr1 (42-448)||(8995992-8996423)
chr1 (42-369)||(36083848-36084190)
chr1 (42-282)||(15161612-15161859)
chr1 (42-275)||(16130706-16130937)
chr1 (278-459)||(16129648-16129848)
chr1 (278-429)||(16130232-16130402)
chr1 (220-367)||(39454195-39454354)
chr1 (47-346)||(9268748-9269063)
chr1 (240-369)||(13830377-13830515)
chr1 (321-450)||(15161101-15161240)
chr1 (181-299)||(6244363-6244482)
chr1 (361-457)||(6244192-6244288)
chr1 (390-450)||(36080218-36080277)
chr1 (364-457)||(7612368-7612460)
chr1 (536-573)||(11739046-11739083)
chr1 (181-300)||(13249135-13249254)
chr1 (256-304)||(30660334-30660382)
chr1 (236-275)||(16130156-16130195)
chr1 (181-299)||(31473678-31473796)
chr1 (224-299)||(1175067-1175143)
chr1 (224-299)||(26621931-26622007)
chr1 (224-299)||(31072779-31072855)
chr1 (231-299)||(41305205-41305273)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (42-459)||(22180590-22181033)
chr8 (42-459)||(3298791-3299233)
chr8 (42-459)||(34006503-34006933)
chr8 (42-459)||(8743013-8743456)
chr8 (42-459)||(9067897-9068340)
chr8 (42-459)||(28925873-28926316)
chr8 (42-459)||(27348015-27348458)
chr8 (42-459)||(28370082-28370525)
chr8 (42-459)||(41577061-41577504)
chr8 (42-450)||(11308717-11309151)
chr8 (46-450)||(4861685-4862114)
chr8 (45-448)||(22242976-22243406)
chr8 (42-448)||(13509964-13510395)
chr8 (42-448)||(13599494-13599925)
chr8 (149-458)||(16580075-16580404)
chr8 (42-474)||(12538131-12538595)
chr8 (42-475)||(16958525-16958984)
chr8 (42-448)||(22233580-22234012)
chr8 (42-448)||(22222405-22222828)
chr8 (42-448)||(22228747-22229170)
chr8 (46-247)||(17993087-17993294)
chr8 (245-459)||(24040705-24040937)
chr8 (277-450)||(17992892-17993085)
chr8 (42-244)||(21692669-21692878)
chr8 (42-256)||(13849059-13849278)
chr8 (160-457)||(1607276-1607594)
chr8 (42-218)||(36736936-36737117)
chr8 (42-101)||(22227238-22227297)
chr8 (411-462)||(36737110-36737163)
chr8 (364-457)||(21692158-21692250)
chr8 (536-573)||(34007007-34007044)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (42-459)||(43991520-43991957)
chr2 (42-459)||(29223704-29224146)
chr2 (42-459)||(29337003-29337445)
chr2 (42-471)||(36667599-36668054)
chr2 (42-459)||(23924762-23925204)
chr2 (42-459)||(36039992-36040435)
chr2 (42-458)||(27257375-27257816)
chr2 (42-475)||(13230072-13230527)
chr2 (42-459)||(32522918-32523360)
chr2 (42-371)||(21160053-21160397)
chr2 (42-475)||(28457607-28458065)
chr2 (42-314)||(41977748-41978026)
chr2 (42-459)||(14700630-14701075)
chr2 (42-282)||(42700703-42700949)
chr2 (42-371)||(9786834-9787180)
chr2 (274-475)||(42702175-42702395)
chr2 (313-459)||(5784540-5784697)
chr2 (42-459)||(24662859-24663304)
chr2 (250-459)||(36557465-36557695)
chr2 (50-233)||(40200173-40200363)
chr2 (42-244)||(31758500-31758709)
chr2 (42-216)||(36557292-36557473)
chr2 (381-475)||(8687768-8687860)
chr2 (258-313)||(11651893-11651948)
chr2 (390-450)||(492737-492796)
chr2 (370-453)||(11651811-11651894)
chr2 (536-578)||(13230587-13230629)
chr2 (536-578)||(14700512-14700554)
chr2 (536-578)||(28458127-28458169)
chr2 (536-578)||(43991402-43991444)
chr2 (364-457)||(31758265-31758357)
chr2 (536-578)||(23925278-23925320)
chr2 (536-578)||(42702456-42702498)
chr2 (536-573)||(36040514-36040551)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (42-459)||(27166828-27167270)
chr5 (42-459)||(11766744-11767186)
chr5 (42-459)||(9404413-9404856)
chr5 (42-459)||(11723006-11723449)
chr5 (42-459)||(16904339-16904782)
chr5 (42-459)||(31845969-31846411)
chr5 (42-459)||(33434592-33435034)
chr5 (42-459)||(34456286-34456727)
chr5 (42-475)||(34869476-34869934)
chr5 (42-459)||(30606806-30607249)
chr5 (42-459)||(14344458-14344893)
chr5 (118-459)||(7314954-7315315)
chr5 (42-459)||(6269879-6270322)
chr5 (42-459)||(24835724-24836154)
chr5 (42-371)||(37251635-37251979)
chr5 (42-313)||(7315358-7315636)
chr5 (42-215)||(32226911-32227090)
chr5 (181-369)||(39655911-39656110)
chr5 (42-182)||(519315-519461)
chr5 (366-448)||(32226833-32226914)
chr5 (536-578)||(27167344-27167386)
chr5 (364-450)||(39656116-39656201)
chr5 (224-299)||(42151280-42151356)
chr5 (256-300)||(42747579-42747623)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (42-459)||(22097656-22098098)
chr3 (43-459)||(48167925-48168366)
chr3 (42-459)||(9989385-9989827)
chr3 (42-459)||(10385800-10386243)
chr3 (42-450)||(45527645-45528079)
chr3 (42-459)||(7652952-7653395)
chr3 (42-460)||(37471417-37471860)
chr3 (42-459)||(27850281-27850722)
chr3 (42-459)||(3588389-3588832)
chr3 (42-475)||(20837068-20837525)
chr3 (42-459)||(36469166-36469607)
chr3 (42-459)||(52307815-52308258)
chr3 (42-421)||(4742733-4743135)
chr3 (42-371)||(1232221-1232565)
chr3 (46-450)||(23193921-23194347)
chr3 (155-459)||(8615492-8615816)
chr3 (42-459)||(26335106-26335540)
chr3 (42-289)||(37022867-37023122)
chr3 (42-475)||(33247962-33248421)
chr3 (42-369)||(49434186-49434529)
chr3 (42-250)||(20962986-20963200)
chr3 (42-448)||(2357161-2357592)
chr3 (242-459)||(23385385-23385622)
chr3 (313-459)||(27030699-27030856)
chr3 (364-475)||(20963731-20963842)
chr3 (42-208)||(23411748-23411909)
chr3 (42-160)||(8625931-8626055)
chr3 (274-312)||(20963676-20963714)
chr3 (42-79)||(22098375-22098412)
chr3 (418-459)||(23411666-23411707)
chr3 (394-450)||(49434095-49434150)
chr3 (224-286)||(17405038-17405101)
chr3 (536-573)||(22097544-22097581)
chr3 (536-573)||(27850796-27850833)
chr3 (536-578)||(48168442-48168484)
chr3 (364-457)||(17405138-17405231)
chr3 (536-573)||(20963902-20963939)
chr3 (224-299)||(4311171-4311247)
chr3 (224-299)||(10940989-10941065)
chr3 (42-78)||(27104386-27104422)
[»] chr6 (34 HSPs)
chr6 (42-459)||(24160986-24161428)
chr6 (42-459)||(3539036-3539479)
chr6 (42-459)||(26515158-26515601)
chr6 (42-459)||(9932535-9932978)
chr6 (42-459)||(34006491-34006934)
chr6 (42-459)||(32806493-32806935)
chr6 (42-475)||(21596258-21596719)
chr6 (42-459)||(24878854-24879297)
chr6 (42-448)||(25976950-25977381)
chr6 (42-450)||(14270670-14271104)
chr6 (42-314)||(13173554-13173832)
chr6 (42-314)||(13182087-13182365)
chr6 (42-314)||(34913842-34914120)
chr6 (43-475)||(5988733-5989191)
chr6 (42-291)||(16698086-16698341)
chr6 (42-448)||(1454796-1455223)
chr6 (42-448)||(1466488-1466915)
chr6 (42-450)||(21631178-21631615)
chr6 (313-475)||(14479533-14479706)
chr6 (149-367)||(32821893-32822119)
chr6 (366-459)||(26510392-26510485)
chr6 (220-457)||(26604330-26604587)
chr6 (42-369)||(15642506-15642850)
chr6 (181-369)||(9518317-9518516)
chr6 (263-314)||(6868010-6868061)
chr6 (236-316)||(25541250-25541330)
chr6 (536-597)||(32807013-32807074)
chr6 (364-448)||(34913449-34913532)
chr6 (340-371)||(13173859-13173890)
chr6 (340-371)||(13182392-13182423)
chr6 (365-475)||(6868132-6868240)
chr6 (42-108)||(9518176-9518242)
chr6 (536-578)||(21596779-21596821)
chr6 (224-299)||(21262259-21262335)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (42-459)||(8731-9174)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (42-459)||(28629-29072)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (42-455)||(76182-76620)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (42-459)||(25380-25823)
[»] scaffold0147 (1 HSPs)
scaffold0147 (42-457)||(6723-7163)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (42-448)||(11934-12363)
scaffold0298 (42-448)||(15704-16133)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (42-448)||(12195-12626)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (42-450)||(714-1147)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (42-314)||(12218-12489)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (42-369)||(14274-14617)
scaffold0091 (390-448)||(14185-14242)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (42-459)||(16203-16646)
[»] scaffold1494 (1 HSPs)
scaffold1494 (313-459)||(1553-1710)
[»] scaffold0447 (4 HSPs)
scaffold0447 (189-314)||(7216-7341)
scaffold0447 (189-314)||(11830-11955)
scaffold0447 (116-160)||(7340-7384)
scaffold0447 (116-160)||(11954-11998)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (189-314)||(9825-9950)
scaffold0383 (116-160)||(9949-9993)
[»] scaffold1832 (1 HSPs)
scaffold1832 (328-457)||(1-141)
[»] scaffold0458 (1 HSPs)
scaffold0458 (220-367)||(9364-9523)
[»] scaffold0160 (3 HSPs)
scaffold0160 (42-182)||(35053-35196)
scaffold0160 (236-314)||(35212-35291)
scaffold0160 (391-447)||(35388-35443)


Alignment Details
Target: scaffold0019 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 473
Target Start/End: Original strand, 116298 - 116754
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  116298 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 116397  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116398 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 116497  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtt--------tgaaaaccacaagagta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||    
T  116498 caagaataacaacaatattgaattaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttaaatacctcaaaaccacaagagta 116597  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa-----------gattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  116598 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaggattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 116697  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccctaacctctct 473  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  116698 ctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaatgccctaacctctct 116754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 116
Target Start/End: Original strand, 169138 - 169212
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga 116  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  169138 atcaaaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctaga 169212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 6172947 - 6172516
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctagagt------gattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |      |||||||||||| ||||    
T  6172947 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacctaaaagcattaagtcctagattaaaactgattatcaaatattaac 6172848  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  6172847 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattaaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaacg 6172748  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||    
T  6172747 caagaataacagcaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagta 6172648  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 427  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6172647 gatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagattccatgacaggatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 6172548  T
Q  428 taccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6172547 taccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 6172516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 10346035 - 10346478
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  10346035 atcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 10346134  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  10346135 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 10346234  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  10346235 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 10346334  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10346335 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 10346434  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10346435 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 10346478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 8107618 - 8108061
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  8107618 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 8107717  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      
T  8107718 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatgaaaa 8107817  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaaaacc--------acaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||        ||||||||    
T  8107818 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaattacaagagt 8107917  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8107918 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 8108017  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8108018 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 8108061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 31158006 - 31158449
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  31158006 atcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 31158105  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  31158106 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 31158205  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  31158206 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaaggttacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 31158305  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31158306 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacatgatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 31158405  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31158406 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 31158449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 12090190 - 12090633
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  12090190 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 12090289  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  12090290 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctagttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 12090389  T
Q  236 caagaataacaac-aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||        |||||||||||| |    
T  12090390 caataataacaacaaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaatattacatattagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagatt 12090489  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12090490 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 12090589  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12090590 tttactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 12090633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 31879031 - 31878590
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  31879031 atcacaaaatcgattggatagattaatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatactaac 31878932  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  31878931 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattatatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaactg 31878832  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  31878831 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagta 31878732  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatc 417  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||          |||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||    
T  31878731 gatgtagctacatatgtctttgatagttttgcaaaggatgaaaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatc 31878632  T
Q  418 tactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31878631 tactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 31878590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 2631828 - 2631385
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  2631828 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 2631729  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      
T  2631728 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatgaaaa 2631629  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  2631628 caagaataacaataatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 2631529  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2631528 agatgtagctacatatgtttatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 2631429  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2631428 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 2631385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 12184296 - 12183855
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||      |||||||||||||  ||||    
T  12184296 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaactgattaaattacccaaaagcattaagtcgtagattaaaagtgattatcaaattttaac 12184197  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  12184196 atccatgtatagagtgataactcaagatagattgttattctatctctagattcaaaagtatgtatccatatcattt-gaatctcaataaaacattaaatg 12184098  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||    
T  12184097 caagaataacaacaatattgaacaaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaaaagta 12183998  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12183997 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 12183898  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12183897 ctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 12183855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 44 - 450
Target Start/End: Original strand, 2797295 - 2797727
Alignment:
Q  44 cacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaacat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||||    
T  2797295 cacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacat 2797394  T
Q  138 tcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattca 237  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||    
T  2797395 ccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacaataaaagca 2797494  T
Q  238 agaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagagtag 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||| ||||    
T  2797495 agaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtag 2797594  T
Q  329 atgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatc 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||    
T  2797595 atgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatc 2797694  T
Q  418 tactcctaactaccttgttttgtgtttctctct 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2797695 tactcctaactaccttgttttgtgtttctctct 2797727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 12191273 - 12190832
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || || || | || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||  ||||    
T  12191273 atcacaaagtcgattggatagttaaatagaagaattacaaaacgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaattttaac 12191174  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  12191173 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattt-gaatctcaataaaacattaaatg 12191075  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  12191074 caagaataacaacaatattgaataaatatccagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagta 12190975  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12190974 gatgtaaatacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 12190875  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12190874 ctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 12190832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 42 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 23795526 - 23795084
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  23795526 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcccaatcgactaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 23795427  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  23795426 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatatgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaa 23795327  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  23795326 caagaataacaacaattttgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 23795227  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23795226 agatggagctacatatgtctataatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 23795127  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaa 458  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23795126 tctactcctaactaccttgctttgagtttctctctctagaaaa 23795084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 42 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22909549 - 22909118
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  22909549 atcacaaagtcgattggataatttaatcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 22909450  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22909449 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatg 22909350  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagagt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||         ||| ||||||||||    
T  22909349 caagaataacaacaatattgaatatatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagagt 22909250  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  22909249 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgactagatccatgatgtctcaacaaatcttagattgaa 22909150  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 448  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22909149 tctactcctaac-accttgctttgtgtttctct 22909118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 42 - 371
Target Start/End: Original strand, 19471920 - 19472263
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  19471920 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 19472019  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  19472020 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 19472119  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||    
T  19472120 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagta 19472219  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19472220 gatgtagctacatatgtctatgatagctttacaaaggatgaaga 19472263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 22321531 - 22321973
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  22321531 atcaaaaagtcaattgggtagtctaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 22321630  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  22321631 atccatgtctagagtgataacttaagatatattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 22321730  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  22321731 caagaataacaacaata-tgaataaataagctagaaccatatattaaaggatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 22321829  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgc-----------aaaggatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22321830 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaggatgaagattcaatgaaaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 22321929  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22321930 tctactcctaactaacttgctttgtatttctctctctagaaaag 22321973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 44 - 459
Target Start/End: Original strand, 45500443 - 45500883
Alignment:
Q  44 cacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaacat 137  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| | |||||      |||||||||||||| ||||||    
T  45500443 cacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacat 45500542  T
Q  138 tcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattca 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||  ||    
T  45500543 tcatgtctagagtgataacttaagatacattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaacaataaaagca 45500642  T
Q  238 agaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagtaga 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  45500643 agaataacaacaatattgaataaataactataaccatatattaaatggtcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagtaga 45500742  T
Q  330 tgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg-----------atgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatct 418  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||||||| |           |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45500743 tataactacatatgtctgtgatagctttgcaaatgatgaagaagaaatgaagattcaatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatct 45500842  T
Q  419 actcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45500843 actcataactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 45500883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 116 - 459
Target Start/End: Original strand, 31664305 - 31664667
Alignment:
Q  116 agtgattatcaaatagtaacattcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaa 215  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31664305 agtgattatcaaatactaacatccatgtctagattgataacttaagatagattgttattctagttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaa 31664404  T
Q  216 tctcaataaaacattaaattcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtt----- 310  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         
T  31664405 tctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcctgttcgaat 31664504  T
Q  311 ---tgaaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtct 396  Q
       | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31664505 acctcaaaaccacaagagtagatgtagctagatatgtttatgatagctttgtaaaggattaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtct 31664604  T
Q  397 caacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31664605 caacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 31664667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 42 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1275019 - 1274588
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  1275019 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaatcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 1274920  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1274919 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtctatatcattttgaatctcaataaaacattaaatg 1274820  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagagt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||         ||| ||| ||| ||    
T  1274819 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataataacttgtttgaatacctcaaaacccagaagggt 1274720  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||           ||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||  || ||    
T  1274719 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagataaagattcaatgccgagatccatgatgtctcaacaaatcttgagttaaa 1274620  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 448  Q
    ||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  1274619 tctactcataac-accttactttgtgtttctct 1274588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 42 - 475
Target Start/End: Original strand, 3544608 - 3545067
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  3544608 atcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 3544707  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3544708 atctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttcttaaatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 3544807  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaaga 324  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||         ||| |||||||     
T  3544808 acaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagtaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagg 3544907  T
Q  325 gtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttg 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  3544908 gtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatggagaagagatgaagatttaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttg 3545007  T
Q  414 aatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccctaacctctctct 475  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  3545008 aatctactcctaactacctttctttttgtttctctctctagaaatg--cctaacctctctct 3545067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 2478092 - 2477647
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||  | ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  2478092 atcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcctaacctattaaacgacccaaaagcattaagttctagatgaaaagtgattatcaaatattaac 2477993  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2477992 atttatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagccttaaat 2477893  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaaga 324  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||         ||| |||||||     
T  2477892 agaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagg 2477793  T
Q  325 gtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttg 413  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  2477792 gtagatggagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttg 2477693  T
Q  414 aatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2477692 aatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 2477647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 158 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 22818721 - 22818386
Alignment:
Q  158 taagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaagaataacaacaatattgaa 257  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22818721 taagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 22818622  T
Q  258 taaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatg 349  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22818621 taaatagctagaaccatacattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagaatggatgtagctacatatgtctatg 22818522  T
Q  350 atagctttgc-----------aaaggatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgtttt 438  Q
    ||||||||||           ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22818521 atagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgcctt 22818422  T
Q  439 gtgtttctctctctagaaaaggccctaacctctctct 475  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22818421 gtatttctctctctag-aaatgccctaacctctctct 22818386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 1954359 - 1953952
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctagagtgattatcaaatagtaacattcat 141  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||    || |  ||| ||        
T  1954359 atcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcctaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagagtgat----aact--taaaat---- 1954270  T
Q  142 gtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaagaa 241  Q
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||            
T  1954269 ----agagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaagcaataaa-------- 1954182  T
Q  242 taacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtt--------tgaaaaccacaagagtagatgta 333  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||||| ||||||| ||    
T  1954181 -agcaagaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttaaatacctcaaaaccacaatagtagatata 1954083  T
Q  334 gctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactc 422  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||           ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1954082 gctacatatgtctatgatagcttttcaaaggatgaagaagaattgaagattcaatgacaagatccatgatgtcttaacaaatcttggcttgaatctactc 1953983  T
Q  423 ctaactaccttgttttgtgtttctctctcta 453  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1953982 ctaactacattgctttgtgtttctctctcta 1953952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 42 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 24483177 - 24482718
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctagagt------gattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| || |||| |      |||||||||||| ||||    
T  24483177 atcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatt-ctcaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtc-tagattaaaaatgattatcaaatattaac 24483080  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| |||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24483079 atctatgtctagagtgataacttaagataaattattattctagttcttagacccaaaagtaattgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaac 24482980  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg----------aaaaccacaag 323  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||          ||| |||||||    
T  24482979 acaagaataacaacaatattgaataaataaactagaaccatattttaaaagatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctctaaaatccacaag 24482880  T
Q  324 agtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggctt 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  24482879 ggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgtctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggtt 24482780  T
Q  413 gaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccctaacctctctct 475  Q
      |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  24482779 tgatctactcataactcccttgctttgtgtttctctctctag-aaatgcactaacctctctct 24482718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 148 - 448
Target Start/End: Original strand, 29032624 - 29032945
Alignment:
Q  148 agtgataacttaagatagattgctattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaagaataaca 246  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29032624 agtgataacttaagatatatttttattctatttcttagattcaaaagtatttgtcaatatcattttgaatttcaataaagcattaaatacaagaataaca 29032723  T
Q  247 acaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagagtagatgtagct 336  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||         ||| |||||||  |||||||||||    
T  29032724 acaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaaggttagatgtagct 29032823  T
Q  337 acatatgtctatgatagctttgca-----------aaggatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactccta 425  Q
    |||||||||||||  ||||| |||           || ||||||||||||||| | |||  || |||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  29032824 acatatgtctatgcaagcttggcaaatgatgaaagaaagatgaagattccatgtctagactcatgatgtctcaacaaatcttgaatagaatctactccta 29032923  T
Q  426 actaccttgttttgtgtttctct 448  Q
    || |||||  |||||||||||||    
T  29032924 ac-accttactttgtgtttctct 29032945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 313 - 459
Target Start/End: Original strand, 19472279 - 19472436
Alignment:
Q  313 aaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaaca 401  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19472279 aaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttacaaaggatgcagaaaggatgaagattccaagacaagatccatgatgtctcaaca 19472378  T
Q  402 aatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19472379 aatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 19472436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22820536 - 22820403
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctag------agtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||      | ||||||||||||| ||||    
T  22820536 atcacgaagtcgattggataatttaatcgacgatttcccaaccgattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaattgattatcaaatattaac 22820437  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattg 169  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22820436 atccatgtctagagtgataacttaagatagattg 22820403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 33160246 - 33160171
Alignment:
Q  384 atccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33160246 atccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 33160171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31882542 - 31882433
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctag------agtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||      ||||||||||||||| ||||    
T  31882542 atcacaaattcgattggatagtttaatcaatgatttcccaaccgattaaatcacccaaaagtattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 31882443  T
Q  136 attcatgtct 145  Q
    || |||||||    
T  31882442 atccatgtct 31882433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 19063597 - 19063514
Alignment:
Q  364 gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 448  Q
    ||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  19063597 gatgaagattcaatgcttagatccatgatgtctcaacaaattttaggttgaatctactcctaac-accttactttgtgtttctct 19063514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 536 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 6172441 - 6172404
Alignment:
Q  536 atttatatgggccacttctgcaaaatttcgctaatagc 573  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6172441 atttatatgggccacttctgcagaatttcgctaatagc 6172404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 536 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 33160096 - 33160059
Alignment:
Q  536 atttatatgggccacttctgcaaaatttcgctaatagc 573  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33160096 atttatatgggccacttctgcagaatttcgctaatagc 33160059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 534 - 578
Target Start/End: Original strand, 12090710 - 12090754
Alignment:
Q  534 ccatttatatgggccacttctgcaaaatttcgctaatagcgaaat 578  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12090710 ccatttatatgagccacttctgcgaaatttcgctaatagctaaat 12090754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1948394 - 1948318
Alignment:
Q  224 aaacattaaatt-caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 299  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  1948394 aaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 1948318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Original strand, 19090269 - 19090345
Alignment:
Q  224 aaacattaaatt-caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 299  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  19090269 aaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 19090345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Original strand, 26602373 - 26602449
Alignment:
Q  224 aaacattaaatt-caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 299  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  26602373 aaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 26602449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Original strand, 36876006 - 36876082
Alignment:
Q  224 aaacattaaatt-caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 299  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  36876006 aaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 36876082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 52618934 - 52618503
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  52618934 atcacaaagtcgattggatagtttaattgacgatttcccgatcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 52618835  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  52618834 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtttgtgtccatatcattttgaatctcaataaatcattaaatg 52618735  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||    
T  52618734 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaatagta 52618635  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  52618634 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaac 52618535  T
Q  428 taccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52618534 taccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 52618503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 5273292 - 5273724
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  5273292 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 5273391  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  5273392 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaa 5273491  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  5273492 caagaataacaacaattttgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 5273591  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaa 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273592 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaatccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaa 5273691  T
Q  427 ctaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5273692 ctaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 5273724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 42 - 475
Target Start/End: Original strand, 19247558 - 19248016
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  19247558 atcacaaagttgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 19247657  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  19247658 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtctatatcattttgaagctcaataaaacattaaatg 19247757  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||    
T  19247758 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaaccacaagagta 19247857  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  19247858 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatattggtttgaat 19247957  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccctaacctctctct 475  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19247958 ctactcccaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaatgccctaacctctctct 19248016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 42 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 1188396 - 1187938
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  1188396 atcacaaagtcgattggatagtttattcgacgatttcccaaccgattaaatcacccaaaagcatcaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 1188297  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1188296 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 1188197  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  1188196 caataataacaacaatattaaataaataactagaatcatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagta 1188097  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||           |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  1188096 gatgtagctacatatgcctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttgacttgaat 1187997  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccctaacctctctct 475  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1187996 ctactcctaactaccttgctttgtgtttctctgtctagaaaatgccctaacctctctct 1187938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 4838866 - 4839309
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  4838866 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 4838965  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  4838966 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 4839065  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  4839066 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 4839165  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4839166 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 4839265  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4839266 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 4839309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 44 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 26070157 - 26069698
Alignment:
Q  44 cacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaacat 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||||    
T  26070157 cacaaagtcgattagatagtttaatcgacgatttcccaatcgattaaattacccaaaagcattaagttctagactaaaagtgattatcaaatattaacat 26070058  T
Q  138 tcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattca 237  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  26070057 acatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtctgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagca 26069958  T
Q  238 agaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagagtag 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| ||||||| ||||    
T  26069957 agaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtag 26069858  T
Q  329 --atgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26069857 atatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagttgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 26069758  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccctaacctctctct 475  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26069757 tctacttctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaatgccctaacctctctct 26069698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 42 - 475
Target Start/End: Original strand, 42532616 - 42533075
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  42532616 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 42532715  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaa-gtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  42532716 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctagttctagattcaaaaagtatgtgtccatatcattttgaatcttaataaaacaataaaa 42532815  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaa-ccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagag 325  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  42532816 gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagag 42532915  T
Q  326 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgc-----------aaaggatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttga 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  42532916 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgacgtctcaacaaatctaggcttga 42533015  T
Q  415 atctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccctaacctctctct 475  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42533016 atctactcctaaccaccttgctttgtgtttctctctctag-aaatgccctaacctctctct 42533075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 35416426 - 35416856
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  35416426 atcataaagtcgattggatagtttaattgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 35416525  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||      
T  35416526 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatctttttgaatctcaataaaacaataaaag 35416625  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtt-------tgaaaaccacaagagtag 328  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||||||||||||    
T  35416626 caagaatatcaataatattgaataaattgctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgttgaatacatcaaaaccacaagagtag 35416725  T
Q  329 atgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaact 428  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35416726 atgtaactacatatgtctatgatagttgtgcaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaact 35416825  T
Q  429 accttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    | |||  |||||||||||||||||| |||||    
T  35416826 atctttctttgtgtttctctctctaaaaaag 35416856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 22048113 - 22047670
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  22048113 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 22048014  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||      
T  22048013 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattctgaatctcaataaaacaataaaaa 22047914  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  22047913 caaaaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 22047814  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22047813 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccataatgtctcaacaaatcttggcttgaa 22047714  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22047713 tcttctcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 22047670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 323870 - 323427
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||      |||||||||||||| ||||    
T  323870 atcacaacgttgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaac 323771  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  323770 atccatgtctagcgtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccgtatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 323671  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  323670 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacatcaaaactacaagagt 323571  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  323570 agatgtagctacatatgtttatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 323471  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  323470 tctactcctaactatcttgctttgtgtttctctctctagaaaag 323427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 40995277 - 40995722
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  40995277 atcacaaagtcgattggttcatttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgactcaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 40995376  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||      
T  40995377 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataagacaataaaag 40995476  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccata---tattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||    
T  40995477 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattattaaatgatcaaaagattacataatagcttttttgaatacctcaaaaccacaaga 40995576  T
Q  325 gtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttg 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40995577 gtagatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttg 40995676  T
Q  414 aatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40995677 aatctactcctaactaccttgatttgtgtttctctctctagaaaag 40995722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 26373361 - 26373802
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |  ||||      |||||||||||||| ||||    
T  26373361 atcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttctcaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaac 26373460  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||      
T  26373461 attcatgtctagagtgataacttaaggtagattgttattctatttatagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaaca-taaaag 26373559  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||      
T  26373560 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacatgaggt 26373659  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg-----------atgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||           |||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26373660 gatatagctatatatgtctatgatagctttgcaaaggataaagaagaaatgaagattcaatgataagatccatgatatctcaacaaatattggcttgaat 26373759  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26373760 ctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 26373802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 42 - 452
Target Start/End: Original strand, 21677397 - 21677833
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||      |||||||||||||| ||||    
T  21677397 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacctaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaac 21677496  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  21677497 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaatcaaacattaaatg 21677596  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||    
T  21677597 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaaccacaagagt 21677696  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||  ||| | |||| || ||||||||||  |||||||| |||||    
T  21677697 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattttatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaa 21677796  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctct 452  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21677797 tctattcctaactactttgctttgtgtttctctctct 21677833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 46691767 - 46692209
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | | | ||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  46691767 atcacaaagttgattggatcgtttaatcgatgatttcccaaccgattaattgacctaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 46691866  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||      
T  46691867 atcaatgtttagagggataacttaagatagattgttattctatttctagatttaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaacaataaaag 46691966  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  46691967 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagta 46692066  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg-----------atgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  46692067 gatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaagaaatgaagattcaatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 46692166  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  46692167 ctactcctaactaccttgctttgtgtttctatctctagaaaag 46692209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 42 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 55327204 - 55326765
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||| |||||| ||||||   |||||      |||||||||||||| ||||    
T  55327204 atcacaaagtcgattggatagtttaaccgacgatttccc----gattaaattacccaaaaacattaagctctagattaaaagtgattatcaaatattaac 55327109  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  55327108 atccatgtctaaagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaagcattaaaca 55327009  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||        ||||||||||| ||    
T  55327008 caagaataacaacaattttgaataaataagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattgcataatagcttgcttgaatacctcaaaaccacaagggt 55326909  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttg-----------caaaggatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttga- 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| |||||||||| |||| | |||| || ||||||||||  |||||||| ||||     
T  55326908 agatgtagctacatatgtctatgatagctttggaatggatgaagaaaagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaa 55326809  T
Q  415 -atctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaa 457  Q
     ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  55326808 tatctactcctaactatcttgctatgtgtttctctctctagaaa 55326765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 30218117 - 30218564
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |  ||||      |||||||||||||| ||||    
T  30218117 atcacaaagtcgattggatc-tttaatcgatgatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaagttttagattaaaagtgattatcaaatattaac 30218215  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30218216 atctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttcttagaacaaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaat 30218315  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaat----agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccaca 321  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||         ||| |||||    
T  30218316 acaagaatagcaacaatattgaataaataataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccaca 30218415  T
Q  322 agagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgc-----------aaaggatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggc 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| ||||||||||||||| | |||  || || |||||||||||||||||     
T  30218416 agggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgctaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagactcatgacgtctcaacaaatcttggg 30218515  T
Q  411 ttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30218516 ttgaatctactcttaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 30218564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 53895810 - 53895377
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||  | |||||| ||||||   |||||      |||||||||||||| ||||    
T  53895810 atcacaaagtcgattggatcgtttaatagacgatttcccaacctattaaacgacccaaaaacattaaggtctagattaaaagtgattatcaaatattaac 53895711  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||  ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  53895710 atctatgtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaac 53895611  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaaga 324  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||         ||| ||| |||     
T  53895610 acaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa--at-aagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccagaagg 53895514  T
Q  325 gtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttg 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| |||||| | |||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  53895513 gtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagactccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggttg 53895414  T
Q  414 aatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctct 450  Q
    ||||||||  ||||||| |||| |||  |||||||||    
T  53895413 aatctacttttaactacattgtcttgaatttctctct 53895377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 450
Target Start/End: Original strand, 33110432 - 33110867
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||| |  ||||      |||||||||||||| ||||    
T  33110432 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccctgaacattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaac 33110531  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||  | || |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| | ||||||     
T  33110532 atctatgtctagaatgataacttaagatagactcttatgtttttcctagattcaaaagtatttgtcaatatcatttcaaatctcaataaagctttaaata 33110631  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagag 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||         ||| ||||||| |    
T  33110632 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagtttacataatggcttgtgtgaatacctcaaaacccacaaggg 33110731  T
Q  326 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttga 414  Q
    || || || ||||||||||||| |||||||||||||||           |||||||||  |||| | | || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  33110732 tatatataactacatatgtctacgatagctttgcaaaggatgaaaaaaagatgaagatgtcatgcctaaattcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 33110831  T
Q  415 atctactcctaactaccttgttttgtgtttctctct 450  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  33110832 atctactcttaactaccttgccttgtgtttctctct 33110867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 44 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 20949175 - 20948735
Alignment:
Q  44 cacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaacat 137  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| | ||||| | | |||||| |||||| | |||||      |||||||||||| | ||||||    
T  20949175 cacaaagtcgattggatcatttaatcgatgattttccaatctattaattgatccaaaaacattaaattctagattaaaagtgattatcaaagattaacat 20949076  T
Q  138 tcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattca 237  Q
      |||||| || ||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |  ||||| ||    
T  20949075 ctatgtctggaatgaaaactta-gatagattgttattctattcctagatccaaaagtatttgtcaatatcatttcaaatctcaataaagctataaataca 20948977  T
Q  238 agaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagagta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||         ||| |||||||  ||    
T  20948976 agaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaatatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggata 20948877  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||  |||||           ||||||||||||||| | |||| || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20948876 gatgtagctacatatatttatgatagcttgacaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcgacaaatcttgggttgaat 20948777  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaa 458  Q
    |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20948776 ctacttttaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaa 20948735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 244
Target Start/End: Original strand, 9417163 - 9417372
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| | |||||      |||||| | ||||| ||||    
T  9417163 atcacaaagtcgattggatcatttaatcgacgatttcccaacctattaaacaaaccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattgtaaaatattaac 9417262  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||  ||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  9417263 atctatgtctagaatgaaaacttacgatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaac 9417362  T
Q  235 tcaagaataa 244  Q
     |||||||||    
T  9417363 acaagaataa 9417372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 313 - 458
Target Start/End: Original strand, 44432069 - 44432225
Alignment:
Q  313 aaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa-----------gattccatgacaagatccacgatgtctcaaca 401  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||           ||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  44432069 aaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgtaaaggatgaagaaagggtgaagattccatggcaagatccatgatgtctcaaga 44432168  T
Q  402 aatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaa 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  44432169 aatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgagtttctctctctagaaaa 44432225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 108
Target Start/End: Original strand, 21668635 - 21668701
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21668635 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacctaaaagcattaa 21668701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 6640178 - 6639963
Alignment:
Q  266 tagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaaaacc---------acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctt 356  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6640178 tagaaccttatattaaatgatcaaa-gattccataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgaaagctt 6640080  T
Q  357 tgcaaaggat-----------gaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttc 445  Q
    || ||| |||           ||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  6640079 tggaaaagatagaagaaagatgaagattacatgctaagattcaagatgtctcaacaaattttgggaagaatctactcctaacacccttgctttgtgtttc 6639980  T
Q  446 tctctctagaaaaggcc 462  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  6639979 tctcactagaaatggcc 6639963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 8895015 - 8894929
Alignment:
Q  364 gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctct 450  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||   ||||||||| |||||  |||||  ||||||||||||||    
T  8895015 gatgaagatttcatgacaagattcatgatttctctacaaatcttgggaagaatctacttctaacacccttgcattgtgtttctctct 8894929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 536 - 578
Target Start/End: Original strand, 26373869 - 26373911
Alignment:
Q  536 atttatatgggccacttctgcaaaatttcgctaatagcgaaat 578  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26373869 atttatatgggccacttctgcgaaatttcgctaatagccaaat 26373911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 536 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 52618428 - 52618386
Alignment:
Q  536 atttatatgggccacttctgcaaaatttcgctaatagcgaaat 578  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  52618428 atttatatgggccacttctgcgaaatttcgctaatagccaaat 52618386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 536 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 1187877 - 1187835
Alignment:
Q  536 atttatatgggccacttctgcaaaatttcgctaatagcgaaat 578  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1187877 atttatatgtgccatttctgcaaaatttcgctaatagccaaat 1187835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Original strand, 7780787 - 7780863
Alignment:
Q  224 aaacattaaatt-caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 299  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  7780787 aaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 7780863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 299
Target Start/End: Original strand, 30238694 - 30238766
Alignment:
Q  228 attaaatt-caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 299  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  30238694 attaaattgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 30238766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 42 - 475
Target Start/End: Original strand, 11738528 - 11738986
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  11738528 atcacaaagtcgattggatagtttagtcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 11738627  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  11738628 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaattatgtgtccatatcattttgaatctcagtaaaacattaaatg 11738727  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  11738728 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattgcataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagta 11738827  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11738828 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtgtcaacaaatcttggcttgaat 11738927  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccctaacctctctct 475  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11738928 ttactcctaactaccttgctttgtgtttctctctatagaaaatgccctaacctctctct 11738986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 38121662 - 38122105
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  38121662 atcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 38121761  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  38121762 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 38121861  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  38121862 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 38121961  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38121962 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 38122061  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38122062 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 38122105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 39000911 - 39001354
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| | ||    
T  39000911 atcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattgac 39001010  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  39001011 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 39001110  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  39001111 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaataccttaaaactacaagagt 39001210  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39001211 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 39001310  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39001311 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 39001354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 33491928 - 33492371
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  33491928 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 33492027  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      
T  33492028 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatgaaaa 33492127  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaa--------aaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||    
T  33492128 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcagaactacaagagt 33492227  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33492228 agatgtggctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 33492327  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33492328 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 33492371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 42 - 475
Target Start/End: Original strand, 9667426 - 9667883
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  9667426 atcacgaagtcgattggataatttaatcgacgatttaccaaccgattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 9667525  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  9667526 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 9667625  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| |     
T  9667626 caagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagaatg 9667725  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9667726 tatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 9667825  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccctaacctctctct 475  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9667826 ctactcctaactaccttgccttgtatttctctctctag-aaatgccctaacctctctct 9667883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 16832513 - 16832955
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  16832513 atcacaaagtcgattggataatttaatcgacgatttcctaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 16832612  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||     
T  16832613 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaaatatgtgtccatatcattttgaatctaaataacatattaaatg 16832712  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  16832713 caagaatagcaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagta 16832812  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||           |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16832813 gatatagctacatatatctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 16832912  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16832913 ctactcctaactaccttactttgtgtttctctctctagaaaag 16832955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 12167946 - 12168389
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  12167946 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 12168045  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||      
T  12168046 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtcaatattattttgaatctcaataaaacaataaaag 12168145  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  12168146 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 12168245  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12168246 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaatggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 12168345  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12168346 tctacacctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 12168389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 44504998 - 44505443
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  44504998 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 44505097  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  44505098 atccatgtctagagtgataatttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 44505197  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaa-ccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgttt----------gaaaaccacaaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||     
T  44505198 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaacccatatattaaataatcaaaagattacataatagcttgttttgaatacctcaaaaaccacaagt 44505297  T
Q  325 gtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttg 413  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  44505298 ttagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacatgatccatgatgtctcaacaaattttggcttg 44505397  T
Q  414 aatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44505398 aatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 44505443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 42 - 457
Target Start/End: Original strand, 432071 - 432511
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  432071 atcacgaagtcgattggataatttaatcgacgatttcccaaccgattaattcacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 432170  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  432171 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 432270  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| |     
T  432271 caagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagaatg 432370  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  432371 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggcttgagt 432470  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaa 457  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  432471 ctactcctaactaccttgccttgtatttctctctctagaaa 432511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 40999834 - 41000276
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  40999834 atcacaaagccttttggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 40999933  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||      
T  40999934 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaagaataaaag 41000033  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  41000034 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagta 41000133  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg-----------atgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||           |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41000134 gatataactacatatgtctatgatagatttgcaaaggatgaggaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 41000233  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41000234 ctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 41000276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 47 - 462
Target Start/End: Original strand, 13217784 - 13218221
Alignment:
Q  47 aaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaacattca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||      |||||||||||||| |||||||||    
T  13217784 aaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccagctaattaaattatccaaaagtattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacattca 13217883  T
Q  141 tgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaaga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |   |    
T  13217884 tgtctagagtgataacttaagataaattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatcttaataaaacattaaaggc---a 13217980  T
Q  241 ataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagtagatgt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||    
T  13217981 ataacaacaatattgaataaatagctagaaccgtatattaaattatcaaaagattacataatatcttgtttgaatgcctcaaaaccacaagagtagatgt 13218080  T
Q  333 agctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctact 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13218081 agctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagttccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctact 13218180  T
Q  422 cctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggcc 462  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  13218181 cctaaccaccttgctttgtgtttctctctctaaaaaaggcc 13218221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 49249496 - 49249061
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  49249496 atcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattactcaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 49249397  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||      
T  49249396 atccatttctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatataattttgaatctcaataaaacaataaaag 49249297  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  49249296 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatatt--------aaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 49249205  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49249204 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 49249105  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  49249104 tctactcctaactaccttactttgtgtttctctctttagaaaag 49249061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 42 - 448
Target Start/End: Original strand, 8995992 - 8996423
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||      |||||||||||||| || |    
T  8995992 atcacaaagtcgattggatagcttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaatttttagattaaaagtgattatcaaatattagc 8996091  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  8996092 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaaggatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatg 8996191  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||         ||| ||||||| ||    
T  8996192 caataataacaacaatattgaataaatagctagaatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacatcaaaacccacaagggt 8996291  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| ||| | ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  8996292 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtcgcaacaaatcttgggttgaa 8996391  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 448  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8996392 tctactcctaac-accttgctttgtgtttctct 8996423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 42 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 36084190 - 36083848
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  36084190 atcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaatgcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 36084091  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||  ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36084090 atctatgtctagaatgaaaacttaagatagattgttattatatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaac 36083991  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaaaaccacaaga--------g 325  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||| ||| ||| |        |    
T  36083990 acaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagat-aagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagg 36083892  T
Q  326 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 369  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||||||||    
T  36083891 tagatgtaactacatatgtctatgcaagcttgacaaaggatgaa 36083848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15161859 - 15161612
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||| |      |||||||||||||| ||||    
T  15161859 atcacaaagtcgattgaaccgtttaatcgactatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctatattaaaagtgattatcaaatattaac 15161760  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaat 234  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || ||| ||||||||| |||  ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  15161759 atctatgtctagagtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgttaatatccttttcaatctcaaataaagcattaaat 15161660  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaa 282  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15161659 gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaa 15161612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16130937 - 16130706
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||| |||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  16130937 atcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgattccctaaccgattaaatgacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 16130838  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||             
T  16130837 atctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattttatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaa--------g 16130746  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccata 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16130745 caagaataacaacaatattgaataaatggctagaatcata 16130706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 278 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 16129848 - 16129648
Alignment:
Q  278 ttaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaa--------aaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16129848 ttaaatgatcaaaagattacataatagattgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaa 16129749  T
Q  370 ga-----------ttccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaa 458  Q
    ||           ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16129748 gaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactatcttgctttgtgtttctctctctataaaa 16129649  T
Q  459 g 459  Q
    |    
T  16129648 g 16129648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16130402 - 16130232
Alignment:
Q  278 ttaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaaaacc--------acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16130402 ttaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaatcacaagagtagatatagctacatatgtctatgataactttgcaaatgatgaa 16130303  T
Q  370 ga-----------ttccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaacta 429  Q
    ||           ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16130302 gaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttgacttgaatctactcctaacta 16130232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39454354 - 39454195
Alignment:
Q  220 aataaaacattaaattcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattaca---taatagcttgtttg--- 312  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||       
T  39454354 aataaagcattaaactcaagaataataacaatattgaataaataagctagaaccttaaattaaatgatc-aaagattacaaattaatagcttgtttgaat 39454256  T
Q  313 ------aaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg 367  Q
          ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  39454255 accttaaaaaccacaagcgtagatgtagctacatatgtctatgataactttgcaaaagatg 39454195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9269063 - 9268748
Alignment:
Q  47 aaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga-------gtgattatcaaatagtaacattc 139  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  | | |||||||||||   || ||       |||||||||||| | ||| ||||    
T  9269063 aaagccgattggatcgtttaatcgacgatttcccaatcaattaaacgacctaaaagcattaagctcttgatttcaaggtgattatcaaagattaa-attc 9268965  T
Q  140 -atgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaattca 237  Q
     ||||||||| |||  ||||| ||||||||  ||||||  | |||||| ||||||||| |||| |||  ||||  |||||||| |||| | ||| || ||    
T  9268964 tatgtctagaatgaacactta-gatagattattattctgatcctagatccaaaagtatttgtcaataaaatttcaaatctcaaataaagctttagatgca 9268866  T
Q  238 agaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagagtag 328  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||         ||| ||||||| ||||    
T  9268865 agaataataacaatattgaataaatagctagaaacatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttggttgaatacctcaaaacccacaagggtag 9268766  T
Q  329 atgtagctacatatgtct 346  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9268765 atgtagctacatatgtct 9268748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 240 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13830515 - 13830377
Alignment:
Q  240 aataacaacaatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagagtaga 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||         ||| ||||||| ||| |    
T  13830515 aataataacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaatgatc-aagtaatacataatagcttgtttgaatacctaaaaacccacaagggtaaa 13830417  T
Q  330 tgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 369  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13830416 tgtagctacatatgtctatgaaaactttgcaaaggatgaa 13830377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15161240 - 15161101
Alignment:
Q  321 aagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg-----------atgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttgg 409  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15161240 aagagtagatgtaactacatatgtctatgatagctttgcagaggatgaagaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgg 15161141  T
Q  410 cttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctct 450  Q
       |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  15161140 gaagaatctactcctaa-tatcttgctttgtgtttctctct 15161101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6244482 - 6244363
Alignment:
Q  181 ctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaagaataacaacaatattgaat-aaatagctagaaccatatatt 279  Q
    |||||||||||||||  | || ||| ||||| |||||| ||  ||||||||||  ||||||| | ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  6244482 ctagattcaaaagtacctttcaataacatttcgaatctaaaataaacattaaacacaagaatgataacaatattgaataaaagagctggaaccatatatt 6244383  T
Q  280 aaatgatcaaaagattacat 299  Q
    |||||||||| || ||||||    
T  6244382 aaatgatcaagagtttacat 6244363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 361 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 6244288 - 6244192
Alignment:
Q  361 aaggatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaa 457  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||||||     |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6244288 aaggatgaagattccatgacaatattcatgatatctctacaaatctttagaagaatctactcctaacacccttgctttgtgtttctctcactagaaa 6244192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 36080277 - 36080218
Alignment:
Q  390 gatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctct 450  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36080277 gatgtctcaacaagtcttggatagaatctactcctaac-accttgctttgtgtttctctct 36080218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 364 - 457
Target Start/End: Original strand, 7612368 - 7612460
Alignment:
Q  364 gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaa 457  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||   |||| ||  ||||||||||||||||||    
T  7612368 gatgaagattc-atgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggaaagaatccacttctaacactcttgcttcatgtttctctctctagaaa 7612460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 536 - 573
Target Start/End: Original strand, 11739046 - 11739083
Alignment:
Q  536 atttatatgggccacttctgcaaaatttcgctaatagc 573  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11739046 atttatatgggccacttctgcgaaatttcgctaatagc 11739083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 300
Target Start/End: Original strand, 13249135 - 13249254
Alignment:
Q  181 ctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaata-aaacattaaattcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatatt 279  Q
    |||||||||||||||| | || ||| |||||| ||||  |||| |||||| || | |||||||||   ||||||  |||||| |||||||| ||||||||    
T  13249135 ctagattcaaaagtatttttcaataacattttaaatca-aatataaacatgaattacaagaataatctcaatatcaaataaagagctagaatcatatatt 13249233  T
Q  280 aaatgatcaaaagattacata 300  Q
    ||| || ||||||||||||||    
T  13249234 aaaagaacaaaagattacata 13249254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 304
Target Start/End: Original strand, 30660334 - 30660382
Alignment:
Q  256 aataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatag 304  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  30660334 aataaagagctagaatcatatattaaaggatcaaaagattacacaatag 30660382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16130195 - 16130156
Alignment:
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccata 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16130195 caagaataacaacaatattgaataaatggctagaatcata 16130156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 299
Target Start/End: Original strand, 31473678 - 31473796
Alignment:
Q  181 ctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatatta 280  Q
    |||||||||||||||| | || ||| |||||| ||||  |   |||||| || | |||||||||   ||||||  |||||| |||||||| ||||||||     
T  31473678 ctagattcaaaagtatttttcaataacattttaaatcaaacataaacatgaattgcaagaataatctcaatatcaaataaaaagctagaatcatatattt 31473777  T
Q  281 aatgatcaaaagattacat 299  Q
    || ||||||||||||||||    
T  31473778 aaggatcaaaagattacat 31473796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Original strand, 1175067 - 1175143
Alignment:
Q  224 aaacattaaatt-caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 299  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  1175067 aaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 1175143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Original strand, 26621931 - 26622007
Alignment:
Q  224 aaacattaaatt-caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 299  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  26621931 aaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 26622007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Original strand, 31072779 - 31072855
Alignment:
Q  224 aaacattaaatt-caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 299  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  31072779 aaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 31072855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 41305273 - 41305205
Alignment:
Q  231 aaattcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 299  Q
    |||| ||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  41305273 aaatgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 41305205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 22181033 - 22180590
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  22181033 atcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 22180934  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  22180933 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 22180834  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagagt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| ||||||||||    
T  22180833 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagagt 22180734  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgc-----------aaaggatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22180733 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaggatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 22180634  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22180633 tctactcctaactaccttgctttttgtttctctctctagaaaag 22180590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 3299233 - 3298791
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  3299233 atcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 3299134  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  3299133 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 3299034  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||    
T  3299033 caagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagta 3298934  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgc-----------aaaggatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3298933 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaatggatgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 3298834  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3298833 ctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 3298791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 34006503 - 34006933
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||| |||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  34006503 atcacaaagtagataagataatttaaacgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 34006602  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||      
T  34006603 atcaatgtatagagtgataacttaagatagattgttattctatttatagattcaaaattatgtgtccatatcattttgaatctcaat-aaacaataaaag 34006701  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||    
T  34006702 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagta 34006801  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34006802 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggctttaatctactcctaac 34006901  T
Q  428 taccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34006902 taccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 34006933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 8743013 - 8743456
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  8743013 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 8743112  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  8743113 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaa 8743212  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  8743213 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 8743312  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8743313 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 8743412  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8743413 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 8743456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 9067897 - 9068340
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  9067897 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 9067996  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  9067997 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 9068096  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  9068097 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 9068196  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9068197 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 9068296  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9068297 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 9068340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 28925873 - 28926316
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  28925873 atcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 28925972  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||      
T  28925973 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatctttttgaatctcaataaaacaataaaag 28926072  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  28926073 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 28926172  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28926173 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 28926272  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28926273 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 28926316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 27348458 - 27348015
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  27348458 atcacaaagttgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 27348359  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  27348358 atccatgtctagagtgataacttaagatggattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 27348259  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaaaacc--------acaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||        ||||||||    
T  27348258 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaagactacaagagt 27348159  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27348158 agatgtagctacatatgtctatgataactttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 27348059  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27348058 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 27348015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 28370525 - 28370082
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  28370525 atcacgaagtcgattggataatttaatcgacgatttcccaaccgattaatttacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 28370426  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  28370425 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattttatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 28370326  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  28370325 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 28370226  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28370225 aaatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 28370126  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28370125 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 28370082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 41577061 - 41577504
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| |||     
T  41577061 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaag 41577160  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  41577161 atccatgtttagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtacgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaa 41577260  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaaaacc--------acaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||        ||||||||    
T  41577261 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaagctacaagagt 41577360  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41577361 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 41577460  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41577461 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 41577504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 42 - 450
Target Start/End: Original strand, 11308717 - 11309151
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  11308717 atcacaaagtcgtttgggcagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 11308816  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  11308817 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacagtaaaag 11308916  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  11308917 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 11309016  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatga-----------agattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11309017 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtggagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 11309116  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctct 450  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11309117 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctct 11309151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 46 - 450
Target Start/End: Original strand, 4861685 - 4862114
Alignment:
Q  46 caaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaacattc 139  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| |||||| |    
T  4861685 caaagtcgatcggatcatttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatcc 4861784  T
Q  140 atgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  4861785 atgtctagagtgataacttaagataaattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaag 4861884  T
Q  240 aataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagtagatg 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||    
T  4861885 aataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagatg 4861984  T
Q  332 tagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctac 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  4861985 tagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctac 4862084  T
Q  421 tcctaactaccttgttttgtgtttctctct 450  Q
    || ||||||||||   ||||||||||||||    
T  4862085 tcttaactaccttaccttgtgtttctctct 4862114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 45 - 448
Target Start/End: Original strand, 22242976 - 22243406
Alignment:
Q  45 acaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaacatt 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||||     
T  22242976 acaaagtcgattggatagttcaatcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatc 22243075  T
Q  139 catgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaa 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22243076 catgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacatttaattcaa 22243175  T
Q  239 gaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagagtag 328  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||         ||| ||||||  ||||    
T  22243176 gaataacaataatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaaggtag 22243275  T
Q  329 atgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatc 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22243276 atgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatc 22243375  T
Q  418 tactcctaactaccttgttttgtgtttctct 448  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22243376 tacttctaactaccttgttttgtgtttctct 22243406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 42 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13510395 - 13509964
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  13510395 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 13510296  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13510295 atccatgtctagagtgataacttaagatatattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatg 13510196  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagagt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||         ||| ||||||| ||    
T  13510195 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 13510096  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  13510095 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttaggttgaa 13509996  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 448  Q
    |||||| ||||| | |||| |||||||||||||    
T  13509995 tctacttctaac-atcttgctttgtgtttctct 13509964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 42 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13599925 - 13599494
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  13599925 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 13599826  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13599825 atccatgtctagagtgataacttaagatatattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatg 13599726  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagagt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||         ||| ||||||| ||    
T  13599725 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 13599626  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  13599625 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttaggttgaa 13599526  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 448  Q
    |||||| ||||| | |||| |||||||||||||    
T  13599525 tctacttctaac-atcttgctttgtgtttctct 13599494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 149 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 16580404 - 16580075
Alignment:
Q  149 gtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaagaataacaac 248  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  16580404 gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac 16580305  T
Q  249 aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagtagatgtagctaca 339  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16580304 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagtagatgtagctaca 16580205  T
Q  340 tatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaact 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16580204 tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaact 16580105  T
Q  429 accttgttttgtgtttctctctctagaaaa 458  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16580104 accttgctttgtgtttctctctctagaaaa 16580075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 42 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 12538595 - 12538131
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||| | |||||| |||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  12538595 atcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgattttctaatcgattaaatgacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 12538496  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttga------atctcaataaaacat 229  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      |||||||||||| |     
T  12538495 atccatatctagagtgataacttaagataaattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaattttaaatctcaataaaataa 12538396  T
Q  230 taaattcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccac 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         ||| ||||    
T  12538395 taaaatcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaaaattacataatagtttgtttgaatacctcaaaacccac 12538296  T
Q  321 aagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaa-----------ggatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttgg 409  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||            ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | |    
T  12538295 aagggtagatgtacctacatatgtctaagatagctttgcaaatgatgaagaagagatgaagattcaatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcatag 12538196  T
Q  410 cttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccctaacctctctc 474  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12538195 cttgaatctaatcctaactaccttgatttgtgtttctctctctagaaaatgccctaacctctctc 12538131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 42 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 16958984 - 16958525
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| |||||| | |||||      |||||||||||||| |||     
T  16958984 atcacagagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcccaacctattaaacgacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaaa 16958885  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16958884 atctatgtctaaagtgataacttaaaatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 16958785  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaaga 324  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||         ||| |||||||     
T  16958784 acaagaataacaacaatagtgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagaaattaaataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagg 16958685  T
Q  325 gtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttg 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||| | |||  || |||||||||||||||||||| |||    
T  16958684 gtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttg 16958585  T
Q  414 aatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccctaacctctctct 475  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  16958584 aatctactcttaactaccttgctttgtgtttctctctct--aaaaagccctagcctctctct 16958525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 42 - 448
Target Start/End: Original strand, 22233580 - 22234012
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  22233580 atcacaaagtcgactggatcgtttaatcgacgatttcccaacagattaaatgacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 22233679  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22233680 atctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttcttaaatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaac 22233779  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagag 325  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||         ||| ||||||| |    
T  22233780 acaagaataacaacaatattgaataaacagctagaatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggg 22233879  T
Q  326 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttga 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||| | ||    
T  22233880 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtaga 22233979  T
Q  415 atctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 448  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22233980 atctactcctaac-accttgctttgtgtttctct 22234012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 42 - 448
Target Start/End: Original strand, 22222405 - 22222828
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  22222405 atcacaaagtcgactggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 22222504  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22222505 atctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttcttaaatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaac 22222604  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagag 325  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           ||| ||||||||| |||||||||         ||| ||||||| |    
T  22222605 acaagaataacaacaatattgaataaatagctagaatcatatat-----------aagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggg 22222693  T
Q  326 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-------------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggctt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||| |     
T  22222694 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggta 22222793  T
Q  413 gaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 448  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22222794 gaatctactcctaac-accttgctttgtgtttctct 22222828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 42 - 448
Target Start/End: Original strand, 22228747 - 22229170
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctag------agtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||      | ||||||||||||| ||||    
T  22228747 atcacaaagtcgactggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagtttaaaaatgattatcaaatattaac 22228846  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22228847 atctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttcttaaatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaac 22228946  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagag 325  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           ||| ||||||||| |||||||||         ||| ||||||| |    
T  22228947 acaagaataacaacaatattgaataaatagctagaatcatatat-----------aagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggg 22229035  T
Q  326 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-------------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggctt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||| |     
T  22229036 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggta 22229135  T
Q  413 gaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 448  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22229136 gaatctactcctaac-accttgctttgtgtttctct 22229170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 46 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17993294 - 17993087
Alignment:
Q  46 caaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaacattc 139  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| |||||| |    
T  17993294 caaagtcgatcggatcgtttaatcgacgattttccaagcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatcc 17993195  T
Q  140 atgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaag 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17993194 atgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaag 17993095  T
Q  240 aataacaa 247  Q
    ||||||||    
T  17993094 aataacaa 17993087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 245 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 24040937 - 24040705
Alignment:
Q  245 caacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaa--------aaccacaagagtagatgtagct 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||| |||||    
T  24040937 caacaatattgaataaatagctaaaaccatatattaaat-atcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccataagagtagatatagct 24040839  T
Q  337 acatatgtctatgatagctttgcaaaggatga-----------agattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactccta 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24040838 acatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctacttcta 24040739  T
Q  426 actaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24040738 actacattgatttatgtttctctctctagaaaag 24040705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 277 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 17993085 - 17992892
Alignment:
Q  277 attaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaaaacc---------acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17993085 attaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg 17992986  T
Q  368 aaga-----------ttccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctct 450  Q
    ||||           |||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  17992985 aagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttggattgaatctactcttaactaccttgccttgtgtttctctct 17992892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21692878 - 21692669
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||  | ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  21692878 atcacaaagtcgattggatcgtttaatcaaaaatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaac 21692779  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||  ||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||| | ||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  21692778 atctatgtctagaatgaaaatttaaaatagattgttattctatttcttggatccaaaagcatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaac 21692679  T
Q  235 tcaagaataa 244  Q
     |||||||||    
T  21692678 acaagaataa 21692669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 13849059 - 13849278
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||| | | | ||||||||||| | |||||      |||||||||||| | ||||    
T  13849059 atcacaaaatcgattggatcatttaatcgatgatttcccaatctattaattgatctaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaagattaac 13849158  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    ||  |||| |||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| | ||||||     
T  13849159 atctatgtatagaatgaaaactta-gatagattgttattctactcctagattcaaaagtatttgtcaatatcatttcaaatctcaataaagctttaaata 13849257  T
Q  236 caagaataacaacaatattga 256  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  13849258 caagaataataacaatattga 13849278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 1607594 - 1607276
Alignment:
Q  160 agatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaattcaagaataacaacaatattgaat 258  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||| ||||| ||| | || ||| |||||  ||||| || |||| |||||| | ||||||||| ||||||||| |||    
T  1607594 agatagattattattctaactctagatccaaaattatttttcaataacatttcaaatcttaaataaagcattaagtacaagaataataacaatatttaat 1607495  T
Q  259 aaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaaaacc---------acaagagtagatgtagctacatatgtctat 348  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||| |||         ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1607494 aaataaggtagaaccatatattaaataaataaa-gattacataatagtttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtagctacatatgcctat 1607396  T
Q  349 gatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttt 437  Q
    || ||||||||||||||           |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| |   |||| ||||| ||||  ||||| ||    
T  1607395 gaaagctttgcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttaggaagaatatactcttaacacccttgctt 1607296  T
Q  438 tgtgtttctctctctagaaa 457  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  1607295 tgtgtttctctatctagaaa 1607276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 218
Target Start/End: Original strand, 36736936 - 36737117
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| | ||||||| |  ||||||| | || | |||||      |||||||||||| | |||     
T  36736936 atcacaaagtcgattgcatcatttaatcgatgatttcccaatctattaaatgactcaaaagcttcaagttctagattaatagtgattatcaaagattaaa 36737035  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatct 218  Q
    ||  ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  36737036 atctatgtctagagtgaaaactta-gatagattattattctattcctagattcaaaagtatttgtcaatatcattttgaatct 36737117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 101
Target Start/End: Original strand, 22227238 - 22227297
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaa 101  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  22227238 atcacaaagtcgactggatcgtttaatcgacgatttcccaacagattaaatgacccaaaa 22227297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 411 - 462
Target Start/End: Original strand, 36737110 - 36737163
Alignment:
Q  411 ttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtt--tctctctctagaaaaggcc 462  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36737110 ttgaatctactcctaactatcttgctttgtgtttctctctctctagaaaaggcc 36737163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 364 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 21692250 - 21692158
Alignment:
Q  364 gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaa 457  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||   |||| ||  ||||||||||||||||||    
T  21692250 gatgaagattc-atgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggaaagaatccacttctaacactcttgcttcatgtttctctctctagaaa 21692158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 536 - 573
Target Start/End: Original strand, 34007007 - 34007044
Alignment:
Q  536 atttatatgggccacttctgcaaaatttcgctaatagc 573  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34007007 atttatatgggccacttctacaagatttcgctaatagc 34007044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 43991957 - 43991520
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  43991957 atcacaaagtcgattagatagttttatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattacgtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 43991858  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctattt-ctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43991857 atccatgtctacagtgataacttaagatagattgttattctattttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 43991758  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||    
T  43991757 gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagcaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagt 43991658  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----aagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctact 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43991657 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctact 43991558  T
Q  422 cctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  43991557 cctaactaccttgccttgtgtttctatctctagaaaag 43991520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 29224146 - 29223704
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  29224146 atcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 29224047  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  29224046 atccatgtctaaagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 29223947  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttga-------aaaccacaagagta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||    
T  29223946 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaactacaagagta 29223847  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29223846 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 29223747  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29223746 ctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 29223704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 29337445 - 29337003
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  29337445 atcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 29337346  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  29337345 atccatgtctaaagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 29337246  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttga-------aaaccacaagagta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||    
T  29337245 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaactacaagagta 29337146  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29337145 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 29337046  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29337045 ctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 29337003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 42 - 471
Target Start/End: Original strand, 36667599 - 36668054
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  36667599 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaacggattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 36667698  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||      
T  36667699 atccatgcctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacaataaaag 36667798  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagagt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| ||||||| ||    
T  36667799 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 36667898  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  36667899 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttaag 36667998  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccctaacctct 471  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  36667999 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctaaaaaatgccctaacctct 36668054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 23924762 - 23925204
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||      |||||||||||| | ||||    
T  23924762 atcacaaagtcgattggataatttaattgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaaaacctagattaaaagtgattatcaaaaattaac 23924861  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23924862 atccatgtctagagtgataacttaagatagattattattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatg 23924961  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||    
T  23924962 caagaataacaacaatattgaataaatagctataaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacaacaagagta 23925061  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23925062 gatgtagatacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacatgatccatgatgtctcaacaaatcttcgcttgaat 23925161  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23925162 ctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 23925204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 36039992 - 36040435
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  36039992 atcaaaaagtcgataggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaaacatcaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 36040091  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaat-aaaacattaaat 234  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||     
T  36040092 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttatagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaaaaaataaaa 36040191  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  36040192 gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 36040291  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36040292 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 36040391  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  36040392 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctacaaaag 36040435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 42 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 27257816 - 27257375
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  27257816 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 27257717  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27257716 atccatgtctagagtgataatttaagatagattgttattctatttctagatttaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 27257617  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  27257616 taagaataacaacaatattgaataaatagctagaactatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagta 27257517  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||| | |||| || ||||||||||  |||||||| || |||    
T  27257516 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttaaat 27257417  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaa 458  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27257416 ctcctccaaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaa 27257375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 42 - 475
Target Start/End: Original strand, 13230072 - 13230527
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  13230072 atcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgaactaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 13230171  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||      
T  13230172 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaacaataaaag 13230271  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaa--------aaccacaagagta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  13230272 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcagaaccacaagagta 13230371  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| ||||||    
T  13230372 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgtaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaat 13230471  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccctaacctctctct 475  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13230472 ctactcataactaccttgctttgtgtt--tctctctagaaaa-gccctagcctctctct 13230527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 32523360 - 32522918
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |  ||||      |||||||||||||| ||||    
T  32523360 atcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttctcaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttttagattaaaagtgattatcaaatattaac 32523261  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||      
T  32523260 atccatgtttagagtgataacttaagatggattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaacaataaaag 32523161  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| |||    
T  32523160 taagaataacaacactattgaataaatcgctataaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagggta 32523061  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg-----------atgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||           |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  32523060 gaaatagctacatatgtccatgatagctttgcaaaggacgaagaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaataaatcttggcttgaat 32522961  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32522960 ctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 32522918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 42 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21160397 - 21160053
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  21160397 atcacaaagtcgattgaatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 21160298  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21160297 atccatgtctagagtgataacttaagatatattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatattattttgaatctcaataaaacattaaatg 21160198  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||         ||| ||||||| ||    
T  21160197 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaatcatatattgaatgatcaagaaattacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 21160098  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21160097 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaagatgaaga 21160053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 475
Target Start/End: Original strand, 28457607 - 28458065
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||      || ||||||||||| ||||    
T  28457607 atcacaaagttgattggatcatttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaaattctagattaaatgtaattatcaaatattaac 28457706  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  28457707 atctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttcttaaacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaca- 28457805  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaaga 324  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||         ||| |||||||     
T  28457806 -caagaataacaacaatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagg 28457904  T
Q  325 gtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttg 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||           ||||||||||| ||| | ||||||| ||||||| |||||||||||  |||    
T  28457905 gtagatgtagctacatatgtctatgatagcattgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtcttaacaaatcttgagttg 28458004  T
Q  414 aatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccctaacctctctct 475  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28458005 aatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctag-aaatgccctaacctctctct 28458065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 42 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41978026 - 41977748
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  41978026 atcacaaagtcgattggatagcttaatcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 41977927  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  41977926 atccatgtctagagtgataacttaagataaattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatg 41977827  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  41977826 caagaataacaacaatattgaataaatagctaaaatcgtatattaaaatatcaaaagtttacataatggcttgtttgaa 41977748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 14701075 - 14700630
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||  ||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  14701075 atcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcccaacctattaaacgacctaaaaatattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 14700976  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14700975 atctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttctcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaat 14700876  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaaga 324  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||         ||| |||||||     
T  14700875 acaagaacaacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagtttacataatagttagtttgaatacctcaaaacccacaagg 14700776  T
Q  325 gtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga-----------ttccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttg 413  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| || | |||  || |||||||||||||||||||| |||    
T  14700775 gtagatgtaactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagtttccttgcctagactcaagatgtctcaacaaatcttgggttg 14700676  T
Q  414 aatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  14700675 aatctactcttaactaccttgctttgtgtttttctctctataaaag 14700630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 42 - 282
Target Start/End: Original strand, 42700703 - 42700949
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  42700703 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaccaaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 42700802  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
     | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  42700803 ttccatgtctagagtgataacttaatatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgttcatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 42700902  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaa 282  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  42700903 caagaataacaacaatattaaacaaatagctagaaccatatattaaa 42700949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 42 - 371
Target Start/End: Original strand, 9786834 - 9787180
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | ||      |||||||||||||| | ||    
T  9786834 atcacaaagtcgattgaatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgac 9786933  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9786934 atctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgttaatatcatattgaatctcaataaagcattaaat 9787033  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaaga 324  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||         ||| ||||||      
T  9787034 acaagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaatg 9787133  T
Q  325 gtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 371  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9787134 gtagatatacttacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 9787180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 274 - 475
Target Start/End: Original strand, 42702175 - 42702395
Alignment:
Q  274 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaa--------aaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42702175 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttatttgaatacctcaaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 42702274  T
Q  366 -----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctag 454  Q
               ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42702275 ggaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctag 42702374  T
Q  455 aaaaggccctaacctctctct 475  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  42702375 aaaatgccctaacctctctct 42702395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 313 - 459
Target Start/End: Original strand, 5784540 - 5784697
Alignment:
Q  313 aaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa-----------gattccatgacaagatccacgatgtctcaaca 401  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5784540 aaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaaca 5784639  T
Q  402 aatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5784640 aatcttggcttgaatctactcctaacttccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 5784697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 24662859 - 24663304
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga-------gtgattatcaaatagtaa 134  Q
    ||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||||||| | || ||       |||||||||||| | |||    
T  24662859 atcacaatgttgattggatcatttaatcgacgatttcccaacctattaaacgaccaaaaagcattaagttcttgattacaaagtgattatcaaagattaa 24662958  T
Q  135 cattc-atgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaa 232  Q
     || | ||||||||| ||| |||||| ||||||||  |||| || |  ||||| ||||||||| |||| ||| |||||  ||||| || |||| | ||||    
T  24662959 -atcctatgtctagaatgaaaactta-gatagattattattttaatcttagatccaaaagtatttgtcaataacatttcaaatcttaaataaagctttaa 24663056  T
Q  233 attcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaaaac---------cacaa 322  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||         |||||    
T  24663057 atgcaagaataataacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacgtaatagcttgtttgaatacctcaaaactcacaa 24663156  T
Q  323 gagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggct 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||           ||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||||      
T  24663157 gcgtagatgtagctacatatgtctatgcaagcttcgcaaaggatgaaagaaagatgaagattcaatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttggta 24663256  T
Q  412 tgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24663257 tgaaactactcctaacaaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 24663304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 250 - 459
Target Start/End: Original strand, 36557465 - 36557695
Alignment:
Q  250 atattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaaaacc---------acaagagtagatgtagctaca 339  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||         ||||| ||||||||| |||||    
T  36557465 atattgaataaataagttagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtacctaca 36557564  T
Q  340 tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga-----------ttccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaact 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36557565 tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattaaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaact 36557664  T
Q  429 accttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  36557665 accttgctatgtgtttctctctctagaaaag 36557695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40200363 - 40200173
Alignment:
Q  50 gtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaacattcatgt 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||||  ||||    
T  40200363 gtcgattggatcgtttaatcgacgatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgt 40200264  T
Q  144 ctagagtgataacttaagatagattgctattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaa 233  Q
    || || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40200263 ctggaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaa 40200173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31758709 - 31758500
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  31758709 atcacaaagtcgattggatcgtttaatcaacgatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaac 31758610  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||| |||||| || ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  31758609 atttatgtctggaatgaaaacttaagatagcttgttattctatttcttagatccaaaagcattggtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaac 31758510  T
Q  235 tcaagaataa 244  Q
     |||||||||    
T  31758509 acaagaataa 31758500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 216
Target Start/End: Original strand, 36557292 - 36557473
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  36557292 atcacaaagtcgattgcattgtataatcgacgatttcccagccgtttgaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 36557391  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaat 216  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  36557392 atctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttcttagattcaaaagtatttgtcaatatcatattgaat 36557473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 381 - 475
Target Start/End: Original strand, 8687768 - 8687860
Alignment:
Q  381 aagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccctaacctctctct 475  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8687768 aagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtt--tctctctagaaaatgccctaacctctctct 8687860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11651948 - 11651893
Alignment:
Q  258 taaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 313  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651948 taaatagctagaatcatatattagatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 11651893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 390 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 492796 - 492737
Alignment:
Q  390 gatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctct 450  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  492796 gatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-accttgatttgtgtttctctct 492737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 370 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 11651894 - 11651811
Alignment:
Q  370 gattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctcta 453  Q
    ||||||| |||||||| || ||| |||| |||||||||||   |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  11651894 gattccacgacaagattcatgatttctctacaaatcttgggaagaatctactcataacacccttgctttgtgtttctctctcta 11651811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 536 - 578
Target Start/End: Original strand, 13230587 - 13230629
Alignment:
Q  536 atttatatgggccacttctgcaaaatttcgctaatagcgaaat 578  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13230587 atttatatgggccacttctgcgaaatttcgctaatagccaaat 13230629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 536 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 14700554 - 14700512
Alignment:
Q  536 atttatatgggccacttctgcaaaatttcgctaatagcgaaat 578  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14700554 atttatatgggtcacttctgcaaaatttcgctaatagccaaat 14700512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 536 - 578
Target Start/End: Original strand, 28458127 - 28458169
Alignment:
Q  536 atttatatgggccacttctgcaaaatttcgctaatagcgaaat 578  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28458127 atttatatgggccacttctgcgaaatttcgctaatagccaaat 28458169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 536 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 43991444 - 43991402
Alignment:
Q  536 atttatatgggccacttctgcaaaatttcgctaatagcgaaat 578  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  43991444 atttatatgggccacttctgcgaaatttcgctaatagctaaat 43991402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 364 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 31758357 - 31758265
Alignment:
Q  364 gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaa 457  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||   |||| ||  ||||||||||||||||||    
T  31758357 gatgaagattc-atgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggaaagaatccacttctaacactcttgcttcatgtttctctctctagaaa 31758265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 536 - 578
Target Start/End: Original strand, 23925278 - 23925320
Alignment:
Q  536 atttatatgggccacttctgcaaaatttcgctaatagcgaaat 578  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23925278 atttatatgggctacttctgcgaaatttcgctaatagctaaat 23925320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 536 - 578
Target Start/End: Original strand, 42702456 - 42702498
Alignment:
Q  536 atttatatgggccacttctgcaaaatttcgctaatagcgaaat 578  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  42702456 atttatatgggccacttctgcgaaatttcactaatagctaaat 42702498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 536 - 573
Target Start/End: Original strand, 36040514 - 36040551
Alignment:
Q  536 atttatatgggccacttctgcaaaatttcgctaatagc 573  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  36040514 atttatatgggccacttctgcaagatttcactaatagc 36040551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 27166828 - 27167270
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  27166828 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 27166927  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27166928 atccatgtctagagtgataacttaagataaattgttattctatttctagattcaaaaatatatgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatg 27167027  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||    
T  27167028 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaaccacaagagta 27167127  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27167128 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtcccaacaaatcttggcttgaat 27167227  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27167228 ctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 27167270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 11767186 - 11766744
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  11767186 atcacaaaatcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 11767087  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  11767086 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaataataaaag 11766987  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||    
T  11766986 caagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagta 11766887  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11766886 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 11766787  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11766786 ctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 11766744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 9404856 - 9404413
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  9404856 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 9404757  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  9404756 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaa 9404657  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  9404656 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 9404557  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9404556 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 9404457  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9404456 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 9404413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 11723006 - 11723449
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  11723006 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 11723105  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  11723106 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 11723205  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  11723206 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 11723305  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11723306 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 11723405  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11723406 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 11723449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 16904339 - 16904782
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  16904339 atcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 16904438  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  16904439 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 16904538  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  16904539 caagaataacaacaatattgaataaataggctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 16904638  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16904639 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 16904738  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16904739 tctacccctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 16904782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 31846411 - 31845969
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  31846411 atcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 31846312  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  31846311 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 31846212  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||| ||    
T  31846211 caagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagatta 31846112  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31846111 aatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 31846012  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31846011 ctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 31845969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 33435034 - 33434592
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  33435034 atcacaaagtcgattgggtagtttaatcgtcgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 33434935  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  33434934 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 33434835  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |    
T  33434834 caagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgagtacctcaaaactacaagagga 33434735  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33434734 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 33434635  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33434634 ctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 33434592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 34456727 - 34456286
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  34456727 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 34456628  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  34456627 atccatgtc--gagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaa 34456530  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  34456529 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 34456430  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34456429 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 34456330  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34456329 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 34456286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 42 - 475
Target Start/End: Original strand, 34869476 - 34869934
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  34869476 atcacaaagtcgattggataatttaatcgaggatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 34869575  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||     
T  34869576 atccatgtctagagtgataacttaagaaagattgttattttatttctagattcaaaagtacgtgtccatatcattttaaatctcaatagaacattatatg 34869675  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagagt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||         ||| ||||||| ||    
T  34869676 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcgaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 34869775  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34869776 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagaatgaataagagatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 34869875  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccctaacctctctct 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  34869876 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctag-aaatgccctaacctctctct 34869934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 30606806 - 30607249
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  30606806 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 30606905  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  30606906 atccatgtctagagtgataacttaagatagattattattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaa 30607005  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  30607006 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 30607105  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30607106 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatattggcttgaa 30607205  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30607206 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 30607249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 14344893 - 14344458
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  14344893 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 14344794  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  14344793 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaa 14344694  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  14344693 caagaataacaacaatattgaataaataagttagaaccatatatt--------aaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 14344602  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14344601 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 14344502  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14344501 tctactcctaactaccttgctttgagtttctctctctagaaaag 14344458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 118 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 7315315 - 7314954
Alignment:
Q  118 tgattatcaaatagtaacattcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatc 217  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7315315 tgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatc 7315216  T
Q  218 tcaataaaacattaaattcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---- 312  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        
T  7315215 tcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaata 7315116  T
Q  313 ----aaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctc 397  Q
        ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7315115 cctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctc 7315016  T
Q  398 aacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7315015 aacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 7314954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 6270322 - 6269879
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttccc-aaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||      |||||||||||||| |||    
T  6270322 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttccccaaccgattaaattaccaaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaa 6270223  T
Q  135 cattcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  6270222 catccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtacatgtccatatcattttgagtctcaataaaacaataaag 6270123  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||    
T  6270122 acaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaatatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagt 6270023  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg-----------atgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  6270022 agatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagattccttgacaagatccatgttgtcacaacaaatcttggcttgaa 6269923  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6269922 tctactcataactacatttctttgtgtttctctctctagaaaag 6269879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 24836154 - 24835724
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  24836154 atcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 24836055  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || |||||             ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  24836054 atccatgt-------------ttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 24835968  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  24835967 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 24835868  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  24835867 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcctgacttgaa 24835768  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24835767 tctactcctaactaccttgatttgtgtttctctctctagaaaag 24835724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 42 - 371
Target Start/End: Original strand, 37251635 - 37251979
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  37251635 atcacaaagtcgattggatagcttaatcgacgatttcccaaacgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 37251734  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  37251735 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatttcaataaaacattaaatg 37251834  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagagt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||         ||| ||||||| ||    
T  37251835 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 37251934  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 371  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37251935 agatgtagctacatatatctatgatagctttgcaaaggatgaaga 37251979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 42 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7315636 - 7315358
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  7315636 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 7315537  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  7315536 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaa 7315437  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7315436 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttga 7315358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32227090 - 32226911
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||      |||||||||||||| | ||    
T  32227090 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcactaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattgac 32226991  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32226990 attcatgtctagagtgataacttaagacagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaa 32226911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 369
Target Start/End: Original strand, 39655911 - 39656110
Alignment:
Q  181 ctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaattcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaaccatatat 278  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||  |||||||| |||| | |||||| ||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  39655911 ctagattcaaaagtatttgtcaataacatttcaaatctcaaataaagctttaaatgcaagaataataagaagattgaataaataagctagaaccatatat 39656010  T
Q  279 taaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 369  Q
    |||| |||||| || |||||||||  ||||||||         ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||    
T  39656011 taaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctttgcaagcttgacaaaggatgaa 39656110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 519461 - 519315
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  519461 atcacaaagttgatttgatcgtttaatcgacaatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaac 519362  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttct 182  Q
    ||  || | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  519361 atctatatttagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttct 519315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 366 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 32226914 - 32226833
Alignment:
Q  366 tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 448  Q
    ||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  32226914 tgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaattttaggttgaatctactcctaac-accttgctttgtgtttctct 32226833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 536 - 578
Target Start/End: Original strand, 27167344 - 27167386
Alignment:
Q  536 atttatatgggccacttctgcaaaatttcgctaatagcgaaat 578  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27167344 atttatatgagccacttctgcgaaatttcgctaatagctaaat 27167386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 450
Target Start/End: Original strand, 39656116 - 39656201
Alignment:
Q  364 gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctct 450  Q
    |||||||||| |||| | |||| || ||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||    
T  39656116 gatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttttgtagaatctactcctaac-accttacgttgtgtttctctct 39656201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Original strand, 42151280 - 42151356
Alignment:
Q  224 aaacattaaatt-caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 299  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  42151280 aaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 42151356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 300
Target Start/End: Original strand, 42747579 - 42747623
Alignment:
Q  256 aataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacata 300  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  42747579 aataaagagctagaatcatatattcaaagatcaaaagattacata 42747623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 22098098 - 22097656
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  22098098 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 22097999  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  22097998 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 22097899  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||    
T  22097898 taagaataacaacaatattgaataaatggctagaaccatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagta 22097799  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22097798 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 22097699  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22097698 ctactcctaactaccttactttgtgtttctctctctagaaaag 22097656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 43 - 459
Target Start/End: Original strand, 48167925 - 48168366
Alignment:
Q  43 tcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaaca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| |||||    
T  48167925 tcacaaattcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaaca 48168024  T
Q  137 ttcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattc 236  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48168025 tccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatgtcattttgaatctcaataaaacattaaatgc 48168124  T
Q  237 aagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagtag 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||    
T  48168125 aagaataacaacaatattgaataaatagctaaaacaatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagtag 48168224  T
Q  329 atgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatga-----------agattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatc 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48168225 atgtagctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagtgaagatgcagattccatgataagatccctgatgtctcaacaaatcttggcttgaatc 48168324  T
Q  418 tactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  48168325 tactcctaactaccttgcttcgtgtttctctctctagaaaag 48168366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 9989827 - 9989385
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  9989827 atcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 9989728  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  9989727 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 9989628  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||    
T  9989627 caagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagta 9989528  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgc-----------aaaggatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9989527 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggttgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 9989428  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9989427 ctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 9989385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 10385800 - 10386243
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  10385800 atcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 10385899  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |      
T  10385900 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatacaag 10385999  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  10386000 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaggattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 10386099  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  10386100 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggctcgaa 10386199  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10386200 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 10386243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 42 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 45528079 - 45527645
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  45528079 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaaacatcaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 45527980  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacatt-aaat 234  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45527979 atccatgtctagagtgataacttaagatagatttttattttatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaaat 45527880  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||    
T  45527879 gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatgtattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagt 45527780  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45527779 agatgtagctagatatgtctatgatagctttgcaaaggatgatgaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 45527680  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctct 450  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45527679 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctct 45527645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 7652952 - 7653395
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  7652952 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 7653051  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      
T  7653052 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatgaaaa 7653151  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  7653152 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 7653251  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7653252 agatgtagctacatatgtctaagatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 7653351  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7653352 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 7653395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 42 - 460
Target Start/End: Original strand, 37471417 - 37471860
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  37471417 atcacaaagtcgattggataatttaatcgacgatttctcaactgattaaattatccaaaagaattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 37471516  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  37471517 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 37471616  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  37471617 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacatcaaaaccacaagagta 37471716  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  37471717 gatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgtcgtctcaacaaattttggcttgaat 37471816  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaagg 460  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37471817 ctactcctaactactttgctttgtgtttctctctctagaaaagg 37471860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 27850281 - 27850722
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  27850281 atcacaaagttgattggatagtttaatcgacgatttctcaaccgattaaattagccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 27850380  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  27850381 atccatgtctagagtgataacttacgatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 27850480  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtt--------tgaaaaccacaagagta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        | |||||||||||| |     
T  27850481 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaaaattacataatagcttgtttaaatacctcaaaaccacaagattg 27850580  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27850581 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaatgatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 27850680  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27850681 ctactcctaactaccttg-cttgtgtttctctctctagaaaag 27850722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 3588832 - 3588389
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  3588832 atcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgactaaatgacccaaaagcattaagtcctagattataagtgattatcaaatattaac 3588733  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  3588732 atctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatctctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaataataaaag 3588633  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  3588632 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 3588533  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3588532 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 3588433  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3588432 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 3588389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 42 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 20837525 - 20837068
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| |||     
T  20837525 atcacgaagtcgattggataatttaatcgatgatttcccaaccgattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaat 20837426  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  20837425 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 20837326  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| |     
T  20837325 caagaataacaataatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagaatg 20837226  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20837225 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 20837126  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccctaacctctctct 475  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  20837125 ctactcctaactaccttgccttgtatttctctctctag-aaatgccctaacccctctct 20837068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 36469166 - 36469607
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  36469166 atcacaaagtcgtttagatattttaaccgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 36469265  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||     
T  36469266 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatgtctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaacaataaaatg 36469365  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  36469366 caagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatgtattaaaagatctaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagta 36469465  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36469466 gttgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 36469565  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  36469566 ctactcctaactaccttg-cttgtgtttctctctctagaaaag 36469607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 52307815 - 52308258
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  52307815 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcaacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 52307914  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  52307915 atccatgtctagagtgataacttaagatagattattattctatttatagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaa 52308014  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  52308015 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatgtattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 52308114  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||    
T  52308115 agatgtagctacatatgtctaagatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctaaacaaatattggctagaa 52308214  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52308215 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 52308258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 42 - 421
Target Start/End: Original strand, 4742733 - 4743135
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||| ||||| ||||    
T  4742733 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacaatttccaaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattattaaatattaac 4742832  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||      
T  4742833 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaat-aaacaataaaag 4742931  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||    
T  4742932 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatatt-aatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagta 4743030  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgc-----------aaaggatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4743031 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaacgatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatctctcaacaaatcttggcttgaat 4743130  T
Q  417 ctact 421  Q
    |||||    
T  4743131 ctact 4743135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 42 - 371
Target Start/End: Original strand, 1232221 - 1232565
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  1232221 atcacaaagtcgattgaatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 1232320  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  1232321 atccatgtctatagtgataacttaagatatattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatg 1232420  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagagt 326  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||         ||| ||||||| ||    
T  1232421 aaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagaaattacataatggtttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 1232520  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 371  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1232521 agatgtagctacatatgtctataatagctttgcaaaggatgaaga 1232565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 46 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 23194347 - 23193921
Alignment:
Q  46 caaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaacattc 139  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      ||| |||||||||| |||||| |    
T  23194347 caaagtcgatcggatcgtttaatcgacgatttcctaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgtttatcaaatattaacatcc 23194248  T
Q  140 atgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaag 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23194247 atgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatattattttgaatctcaataaaacattaaatgcaag 23194148  T
Q  240 aataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagagtagat 330  Q
    ||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||         ||| ||||||| ||||||    
T  23194147 aata---acaatattgaataaatagatagaaccatatattaaatgatcaaaagattacgtaatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagat 23194051  T
Q  331 gtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatcta 419  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||           |||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  23194050 gtagctacatatgtctctgatag-tttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatcta 23193952  T
Q  420 ctcctaactaccttgttttgtgtttctctct 450  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  23193951 ctcttaactaccttgccttgtgtttctctct 23193921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 155 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 8615816 - 8615492
Alignment:
Q  155 acttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaagaataacaacaatatt 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  8615816 acttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 8615717  T
Q  255 gaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtc 345  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8615716 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtc 8615617  T
Q  346 tatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 434  Q
    ||||||||||||||||||||           |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8615616 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 8615517  T
Q  435 ttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  8615516 ctttgtgtttctctctctagaaaag 8615492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 26335540 - 26335106
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||| ||||||  | ||| ||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  26335540 atcacaaagtcgattggatcatttaattgacgatttccaaacctattaaacgacccataagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaac 26335441  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||  || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  26335440 atctatatctagagttataacttaagatagattgttattctattttttagatccaaaagtatttgtcaatatcgttttgaatctcaataaagcaataaat 26335341  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaaga 324  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||         ||| |||||||     
T  26335340 acaagaataacaacaatattgaataaataagctaaaatcatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagg 26335241  T
Q  325 gtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcct 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  26335240 gtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagatttcatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactctt 26335141  T
Q  425 aactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26335140 aactaccttgctttgtgtttttctctctagaaaag 26335106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 37023122 - 37022867
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctagag--------tgattatcaaatagta 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||        |||||||||||||  |    
T  37023122 atcacaaagtcgattggatagttttatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaaatcatatagattaaaagtgattatcaaatatca 37023023  T
Q  134 acattcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaa 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37023022 acatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaaatatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaa 37022923  T
Q  234 ttcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaa 289  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37022922 tgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaa 37022867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 42 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 33248421 - 33247962
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||      |||||||||||||| ||||    
T  33248421 atcacaaagttgattggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttcgagataaaaagtgattatcaaatattaac 33248322  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  33248321 atctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctagttcttagacccaaaaatattggtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaac 33248222  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaa-tagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaaga 324  Q
      ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||         ||| |||||||     
T  33248221 ataag-ataacaacaatattgaataaattagctagaatcatatattaaaatatcgaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagg 33248123  T
Q  325 gtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttg 413  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| ||| | | || || |||||||||||||||||||| |||    
T  33248122 gtagatgcagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaaaagagatgaagattcaatgcctaaattcatgatgtctcaacaaatcttgggttg 33248023  T
Q  414 aatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccctaacctctctct 475  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  33248022 aatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctcta-aaaatgccccaacctctctct 33247962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 49434529 - 49434186
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  49434529 atcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 49434430  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||  ||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  49434429 atctatgtctagaatgtaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttaaatctcaataaaacattaaac 49434330  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaaaac---------cacaaga 324  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| ||         |||||||    
T  49434329 acaagaataacaacaatattaaataaataagttagaactatatattaaaagatgaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacgcacaaga 49434230  T
Q  325 gtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 369  Q
     || |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  49434229 -taaatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaa 49434186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 250
Target Start/End: Original strand, 20962986 - 20963200
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  20962986 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgatgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattgagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 20963085  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  20963086 atccatgtctagagtgataccttaagatatattgttattctatttctagattcaaaagtatatgttcatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 20963185  T
Q  236 caagaataacaacaa 250  Q
    ||| |||||||||||    
T  20963186 caataataacaacaa 20963200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 2357592 - 2357161
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| | ||||| | | ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  2357592 atcacaaagtcgattggttcatttaatcgatgatttcccaatcaattaattgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 2357493  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||   |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2357492 atc--tgtctagagtgataacttaatatagattattattctatttcttagattcaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaat 2357395  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaaga 324  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| || |||||| || | |||||||         ||| ||||||      
T  2357394 gcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattagaagatcaagagtttacatcatggtttgtttgaatacctcaaaacccacaatg 2357295  T
Q  325 gtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttg 413  Q
     |||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||           |||||||||| |||| | |||  || |||||||||||||||||||| |||    
T  2357294 ttagatgtagctacatatgtctatacaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttg 2357195  T
Q  414 aatctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 448  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  2357194 aatctactcctaac-atcttgctttgtgtttctct 2357161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 242 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 23385622 - 23385385
Alignment:
Q  242 taacaacaatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaaaacc--------acaagagtagatgt 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||        |||||| |||||||    
T  23385622 taacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaaaattacataatagcttgtttgaatacctaaaaactacaagaatagatgt 23385523  T
Q  333 agctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga-----------ttccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctact 421  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23385522 agctaaatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgtagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctact 23385423  T
Q  422 cctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23385422 cctaactaccttgctttttgtttctctctctagaaaag 23385385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 313 - 459
Target Start/End: Original strand, 27030699 - 27030856
Alignment:
Q  313 aaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa-----------gattccatgacaagatccacgatgtctcaaca 401  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27030699 aaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaaca 27030798  T
Q  402 aatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27030799 aatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 27030856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 364 - 475
Target Start/End: Original strand, 20963731 - 20963842
Alignment:
Q  364 gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccc 463  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20963731 gatgaagattccacgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaatgccc 20963830  T
Q  464 taacctctctct 475  Q
    ||||||||||||    
T  20963831 taacctctctct 20963842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23411909 - 23411748
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| | |||||      ||||||||||||           
T  23411909 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgaataaattacccaaaagaattaagttctagattaaaagtgattatcaaa------- 23411817  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatca 208  Q
        |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23411816 ----atgtctagagtgataacttaagatagatcgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatca 23411748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 8626055 - 8625931
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctag------agtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||      ||||||||||||||| ||||    
T  8626055 atcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaatcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 8625956  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaa 160  Q
    || ||||||||||||||||| ||||    
T  8625955 atccatgtctagagtgataaattaa 8625931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 312
Target Start/End: Original strand, 20963676 - 20963714
Alignment:
Q  274 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20963676 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg 20963714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 22098412 - 22098375
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22098412 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcc 22098375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 418 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 23411707 - 23411666
Alignment:
Q  418 tactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23411707 tactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 23411666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 49434150 - 49434095
Alignment:
Q  394 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctct 450  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  49434150 tctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-accttgctttgtgtttctctct 49434095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 286
Target Start/End: Original strand, 17405038 - 17405101
Alignment:
Q  224 aaacattaaattcaagaataacaacaatattgaat-aaatagctagaaccatatattaaatgat 286  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17405038 aaacattaaacacaagaataataacaatattgaataaaagatctagaaccatatattaaatgat 17405101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 536 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 22097581 - 22097544
Alignment:
Q  536 atttatatgggccacttctgcaaaatttcgctaatagc 573  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22097581 atttatatgggccacttctgcaagatttcgctaatagc 22097544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 536 - 573
Target Start/End: Original strand, 27850796 - 27850833
Alignment:
Q  536 atttatatgggccacttctgcaaaatttcgctaatagc 573  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27850796 atttatatgggccacttctgcaaactttcgctaatagc 27850833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 536 - 578
Target Start/End: Original strand, 48168442 - 48168484
Alignment:
Q  536 atttatatgggccacttctgcaaaatttcgctaatagcgaaat 578  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  48168442 atttatatgggccacttctgcgaaattttgctaatagctaaat 48168484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 457
Target Start/End: Original strand, 17405138 - 17405231
Alignment:
Q  364 gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaa 457  Q
    |||||| ||| |||| |||||  || ||| |||| ||||||||||    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17405138 gatgaatattacatgtcaagactcatgatatctctacaaatcttgaaaagaatctactcctaacacccttgctttgtgtttctctctcttgaaa 17405231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 536 - 573
Target Start/End: Original strand, 20963902 - 20963939
Alignment:
Q  536 atttatatgggccacttctgcaaaatttcgctaatagc 573  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20963902 atttatatgggccacttctgcgaaattttgctaatagc 20963939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4311247 - 4311171
Alignment:
Q  224 aaacattaaatt-caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 299  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  4311247 aaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 4311171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10941065 - 10940989
Alignment:
Q  224 aaacattaaatt-caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 299  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  10941065 aaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 10940989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 27104422 - 27104386
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttc 78  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27104422 atcacaaagtcgattggatcatttaatcgacgatttc 27104386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 34)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 24160986 - 24161428
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||      |||||||||||||| ||||    
T  24160986 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtccttgattaaaagtgattatcaaatattaac 24161085  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24161086 atccatgtcgagagtgataacttaagatagattattattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatg 24161185  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  24161186 caagaataacaacaatattgaataaataactagaaccatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagta 24161285  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgc-----------aaaggatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  24161286 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgccaagaatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatctttgcttgaat 24161385  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24161386 ctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 24161428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 3539479 - 3539036
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  3539479 atcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 3539380  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  3539379 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 3539280  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  3539279 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 3539180  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3539179 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 3539080  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3539079 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 3539036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 26515158 - 26515601
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  26515158 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 26515257  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  26515258 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 26515357  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  26515358 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 26515457  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26515458 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 26515557  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26515558 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 26515601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 9932535 - 9932978
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  9932535 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 9932634  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  9932635 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 9932734  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  9932735 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 9932834  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  9932835 agatgtagctacatatgtatatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttgccttgaa 9932934  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9932935 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 9932978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 34006934 - 34006491
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  34006934 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 34006835  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  34006834 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaa 34006735  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  34006734 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 34006635  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34006634 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggtttgaa 34006535  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  34006534 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctttctagaaaag 34006491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 32806493 - 32806935
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||| ||||| ||||    
T  32806493 atcacaacgtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattattaaatattaac 32806592  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||      
T  32806593 atccatgtctagagtgataacttaagatagatttttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaccaataaaag 32806692  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  32806693 caagaataacaacaatattgaataaatagctataaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagta 32806792  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32806793 ggtgtagatacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 32806892  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32806893 ctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctaggaaag 32806935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 42 - 475
Target Start/End: Original strand, 21596258 - 21596719
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||      |||||||||||||| ||||    
T  21596258 atcaaaaagtcgattggatattttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaaggtctagattaaaagtgattatcaaatattaac 21596357  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  21596358 atccatgtctagagtgataacttaagatagtttgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 21596457  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||  ||    
T  21596458 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagttta 21596557  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattc----catgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggctt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21596558 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttggctt 21596657  T
Q  413 gaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccctaacctctctct 475  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21596658 gaatctactcctaactaccatgctttgtgtttctctctctag-aaatgccctaacctctctct 21596719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 24879297 - 24878854
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  24879297 atcacaaagtcgattggataatttaatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 24879198  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  24879197 atccatgtctaaagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgtatctcaataaaacattaaaca 24879098  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  24879097 caagaataacaacaatattgaataaataagctatagccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 24878998  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||| | |||| || ||||||||||  |||||||| |||||    
T  24878997 atatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaa 24878898  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24878897 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 24878854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 42 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 25977381 - 25976950
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  25977381 atcacaaagtcgattggttagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 25977282  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  25977281 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaatcattaaata 25977182  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaa-tagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagag 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||         ||| ||||||| |    
T  25977181 caaaaataacaacaatattgaataaacaagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaaggg 25977082  T
Q  326 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||    
T  25977081 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagatgaagaaaagatgaagattccataacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaa 25976982  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 448  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25976981 tctactcctaac-accttgctttgtgtttctct 25976950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 42 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 14271104 - 14270670
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  14271104 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 14271005  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  14271004 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaaca 14270905  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagag 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||||||         ||| ||||||| |    
T  14270904 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaaaatcaagaaattacataattgcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggg 14270805  T
Q  326 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgc-----------aaaggatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttga 414  Q
    || || |||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||||||||  || | ||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  14270804 tatatatagctacatatgtctatgatagttttgcaaaagatgaagaaaagatgaagattcactgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttgggttga 14270705  T
Q  415 atctactcctaactaccttgttttgtgtttctctct 450  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14270704 atctactcctaac-accttgctttgtgtttctctct 14270670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 42 - 314
Target Start/End: Original strand, 13173554 - 13173832
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  13173554 atcacaaagtcgattggatagttcaatcgaagatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 13173653  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13173654 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatg 13173753  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13173754 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaatcatatattaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaa 13173832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 42 - 314
Target Start/End: Original strand, 13182087 - 13182365
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  13182087 atcacaaagtcgattggatagttcaatcgacgattttccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtactagattaaaagtgattatcaaatattaac 13182186  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  13182187 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaaaa 13182286  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13182287 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaatcatatattaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaa 13182365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 42 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34914120 - 34913842
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  34914120 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaactgattaaattacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 34914021  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34914020 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatg 34913921  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaa 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||    
T  34913920 caagaataacagcaatattgaataaatagatagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatgacttgtttgaa 34913842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 43 - 475
Target Start/End: Original strand, 5988733 - 5989191
Alignment:
Q  43 tcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaaca 136  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | ||| |      |||||||||||||| |||||    
T  5988733 tcacaacgtcgattggatcgtttaattgacgatttccctaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctaaattaaaagtgattatcaaatattaaca 5988832  T
Q  137 ttcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    |  ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  5988833 tctatgtctagaatgaaaacttaagatagattgttat-ctagttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaaca 5988931  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagag 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         ||| ||||||| |    
T  5988932 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggg 5989031  T
Q  326 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgc----------aaaggatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||          ||| ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5989032 taaatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaaaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaa 5989131  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccctaacctctctct 475  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||    
T  5989132 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaatgccatattctctctct 5989191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16698341 - 16698086
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  16698341 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttccaaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 16698242  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||      
T  16698241 atccatgtctagagtgataacttaagataggttgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatttcaataaaacaataaaag 16698142  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaa 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16698141 caagaataacaacaatattgaataaatagttagaaccatatattaaatgatcaaaa 16698086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 42 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1455223 - 1454796
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  1455223 atcacaaagtcgattggatagtttaatcaacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 1455124  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  1455123 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgtaattctat-----gattcaaaagtatttgtcaacatcattttgaatctcaataaaacatcaaata 1455029  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaa-tagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagag 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||         ||| ||||||| |    
T  1455028 caagaataacaacaatattgaataaacaagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggg 1454929  T
Q  326 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttga 414  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||           ||||||||||||||| | |||  || |||||||||||||||||||| | ||    
T  1454928 tagatgtagttacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggtaga 1454829  T
Q  415 atctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 448  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  1454828 atctactcctaac-accttgctttgtgtttctct 1454796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 42 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1466915 - 1466488
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  1466915 atcacaaagtcgattggatagtttaatcaacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 1466816  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  1466815 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgtaattctat-----gattcaaaagtatttgtcaacatcattttgaatctcaataaaacatcaaata 1466721  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaa-tagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagag 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||         ||| ||||||| |    
T  1466720 caagaataacaacaatattgaataaacaagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggg 1466621  T
Q  326 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttga 414  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||           ||||||||||||||| | |||  || |||||||||||||||||||| | ||    
T  1466620 tagatgtagttacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggtaga 1466521  T
Q  415 atctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 448  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  1466520 atctactcctaac-accttgctttgtgtttctct 1466488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21631615 - 21631178
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||  | |||||| |||||| | |||||      |||||||||||| | ||||    
T  21631615 atcacaaagtcgattagatcgtttaatcgacgatttctcaatctattaaacgacccaaaaacattaagttctagattataagtgattatcaaagattaac 21631516  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21631515 atctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttcttagattcaaaagcatttttcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaat 21631416  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagag 325  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||        ||| |||||||||    
T  21631415 acaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatgtattaaaagatcaagagtttacgtaatagcttgtttgaatacctcaaatccacaagag 21631316  T
Q  326 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-------------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggctt 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||             ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  21631315 tagatgtaactacatatgtctatgatagctttacaaaggatgaagaaaagagatgaagattctatgtctagatccatgatgtctcaacaaatcttgtgtt 21631216  T
Q  413 gaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctct 450  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21631215 aaatctactcttaactaccttgctttatgtttctctct 21631178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 313 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 14479706 - 14479533
Alignment:
Q  313 aaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga-----------ttccatgacaagatccacgatgtctcaaca 401  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14479706 aaaaccacaagagtagatatagctacatatgtctatgatagatttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaaca 14479607  T
Q  402 aatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccctaacctctctct 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14479606 aatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaatgccataacctctctct 14479533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 149 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32822119 - 32821893
Alignment:
Q  149 gtgataacttaagatagattgctattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaagaataacaa 247  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32822119 gtgataacttatgatatattgttattctagttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacagtaaatacaagaataacaa 32822020  T
Q  248 caatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaaaaccacaa-------gagtagatgtagctaca 339  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||| |||        ||||||||||||||||    
T  32822019 caatattgaataaataagctagaaccatatattaaa-aatctaaagattacataattgcttatttgaatacctcaaaacccacaagtagatgtagctaca 32821921  T
Q  340 tatgtctatgatagctttgcaaaggatg 367  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||    
T  32821920 tttgtctatgatagcttttaaaaggatg 32821893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 366 - 459
Target Start/End: Original strand, 26510392 - 26510485
Alignment:
Q  366 tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26510392 tgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 26510485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 220 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 26604587 - 26604330
Alignment:
Q  220 aataaaacattaaattcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaa---- 314  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||        
T  26604587 aataaagcattaaaaacaagaataataacaatattgaataaataagctagaatcttatattaaatgatc-aaagattacataatagcttttttgaatacc 26604489  T
Q  315 -----aaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgca-----------aaggatgaagattccatgacaagatccacgatgtctca 398  Q
         | |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||           || |||||||||||||||  ||||| || |||||||||    
T  26604488 tcaatacccacaaggatagatgtagctacatatgtctatgaaagctttgcaaaagatggaagaaagatgaagattccatgctaagattcatgatgtctca 26604389  T
Q  399 acaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaa 457  Q
    |||||||||||   ||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26604388 acaaatcttgggaagaatctacttctaacacccttgctttgtgtttctctctctagaaa 26604330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15642850 - 15642506
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga-------gtgattatcaaatagtaa 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||  | ||||||||||||| | || ||       |||||||| ||| | |||    
T  15642850 atcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcctaacctattaaacgatccaaaagcattaagttcttgattacaaagtgattatgaaagattaa 15642751  T
Q  135 cattc-atgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaa 232  Q
     || | ||||||||| ||| ||| || ||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||| |||| ||| |||||  ||||| || |||| | ||||    
T  15642750 -atactatgtctagaatgaaaacata-gatagattattattctaatcctagatccaaaagtatttgtcaataacatttcaaatcttaaataaagctttaa 15642653  T
Q  233 attcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaa 322  Q
    |  ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||         ||| ||||||    
T  15642652 aggcaagaataataacaatattcaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttatttgaatacctcaaaacccacaa 15642553  T
Q  323 gagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 369  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  15642552 gggtagatttagctacatatgtctatgcaagcttagcaaaggatgaa 15642506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 181 - 369
Target Start/End: Original strand, 9518317 - 9518516
Alignment:
Q  181 ctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaattcaagaataacaacaatattgaataaatag-ctagaaccatatat 278  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||  |||||||| |||| | |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  9518317 ctagattcaaaagtatttgtcaataacatttcaaatctcaaataaagctttaaatgcaagaataataacaattatgaataaataaactagaaccatatat 9518416  T
Q  279 taaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 369  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |||||||||         ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||    
T  9518417 taaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgcaaacttggcaaaggatgaa 9518516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 263 - 314
Target Start/End: Original strand, 6868010 - 6868061
Alignment:
Q  263 agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6868010 agctagaaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaa 6868061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 236 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25541330 - 25541250
Alignment:
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaaaa 316  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  25541330 caagaataataacaatatttaataaataagctagaaccttatatgaaatgatcaaa-gattacataatagcttgttttaaaa 25541250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 536 - 597
Target Start/End: Original strand, 32807013 - 32807074
Alignment:
Q  536 atttatatgggccacttctgcaaaatttcgctaatagcgaaatgggtgaaatatgtctctgc 597  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  32807013 atttatatgggccacttctgcgaaatttcgctattagcgaaatgtgtgaaatatgcctctgc 32807074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 364 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 34913532 - 34913449
Alignment:
Q  364 gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 448  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34913532 gatgaagattcaatgcctaaatccataatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac-accttgctttgtgtttctct 34913449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 371
Target Start/End: Original strand, 13173859 - 13173890
Alignment:
Q  340 tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13173859 tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 13173890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 371
Target Start/End: Original strand, 13182392 - 13182423
Alignment:
Q  340 tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13182392 tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 13182423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 365 - 475
Target Start/End: Original strand, 6868132 - 6868240
Alignment:
Q  365 atgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaaggccct 464  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||| | || ||| |||||||   ||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| | ||| |||||    
T  6868132 atgaagactccatgacaagattcatgatat-tctacatatcttgggaggaatctacttctaacacccttgttttgtgtttctcactcttg-aaatgccct 6868229  T
Q  465 aacctctctct 475  Q
    || ||||||||    
T  6868230 aatctctctct 6868240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 108
Target Start/End: Original strand, 9518176 - 9518242
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaa 108  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||  | ||||||| |||||    
T  9518176 atcacaaagtcgatcggatcgtttaatcgacgatttctcaatctattaaacgacccaaaagtattaa 9518242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 536 - 578
Target Start/End: Original strand, 21596779 - 21596821
Alignment:
Q  536 atttatatgggccacttctgcaaaatttcgctaatagcgaaat 578  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21596779 atttatatgggctacttctgcgaaatttcgctaatagctaaat 21596821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21262335 - 21262259
Alignment:
Q  224 aaacattaaatt-caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacat 299  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  21262335 aaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagattacat 21262259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 9174 - 8731
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  9174 atcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 9075  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  9074 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 8975  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  8974 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 8875  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8874 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 8775  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8774 tctactcctaactaccttgccttgtgtttctctctctagaaaag 8731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 28629 - 29072
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  28629 atcacaaagtcgtttgggtagtttaatcgacgattttccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 28728  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  28729 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 28828  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  28829 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 28928  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28929 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 29028  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29029 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 29072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 42 - 455
Target Start/End: Original strand, 76182 - 76620
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||      |||||||||||||| ||||    
T  76182 atcacaaagtcgattgaatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcgtagattaaaagtgattatcaaatattaac 76281  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  76282 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattttatttctagattcaaaagtatgtgttcatatcattttgaatctcaataaaacattaaatg 76381  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||| ||||||||||    
T  76382 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatacattaaatgatcaaaagattacataataacttgtttgaatacctcaaaatcacaagagta 76481  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  76482 gatgtatctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaattgttgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 76581  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctaga 455  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  76582 ctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctaga 76620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 25380 - 25823
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  25380 atcacgaagtcgattggataatttaatcgacgatttccaaaccgattaatttacccaaaagcattaagtactagattaaaagtgattatcaaatattaac 25479  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  25480 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaag 25579  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||    
T  25580 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagt 25679  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25680 agatgtagctacatatatctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 25779  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25780 tctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 25823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0147 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0147
Description:

Target: scaffold0147; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 42 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 7163 - 6723
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||    
T  7163 atcacaaagtcgattggataacttaatcgacgattttccaaccaattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaac 7064  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||      
T  7063 atccatgtctagagtgataacttaaaatatattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgttcatatcattttgaatctcaagaaaacaataaaag 6964  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg--------aaaaccacaagagta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        |||||||||||| |     
T  6963 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagaatg 6864  T
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6863 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 6764  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaa 457  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  6763 ctactcctaactaccttgccttgtatttctctctctagaaa 6723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 42 - 448
Target Start/End: Original strand, 11934 - 12363
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      || ||||||||||| ||||    
T  11934 atcacaaagtagattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaac 12033  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12034 atccatttctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatg 12133  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaaaac---------cacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||         |||||| ||    
T  12134 caagaataacaacaatattgaataaatagctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacacacaagggt 12233  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| ||| | |||| || |||||||||| ||||||||| |||||    
T  12234 agatgcagct--atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaa 12331  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 448  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12332 tctactcctaac-accttgctttgtgtttctct 12363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 42 - 448
Target Start/End: Original strand, 15704 - 16133
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      || ||||||||||| ||||    
T  15704 atcacaaagttgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaac 15803  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15804 atccatttctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatg 15903  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaaaac---------cacaagagt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||         |||||| ||    
T  15904 caagaataacaacaatattgaataaatagctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacacacaagggt 16003  T
Q  327 agatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 415  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| ||| | |||| || |||||||||| ||||||||| |||||    
T  16004 agatgcagct--atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaa 16101  T
Q  416 tctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 448  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16102 tctactcctaac-accttgctttgtgtttctct 16133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 42 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12195
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      || ||||||||||| ||||    
T  12626 atcacaaagttgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaac 12527  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaac-attaaat 234  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12526 atccatttctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaattaaat 12427  T
Q  235 tcaagaat-aacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaaaac---------cacaaga 324  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||         ||||||     
T  12426 gcaagaataaacaacaatattgaataaatagctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacacacaagg 12327  T
Q  325 gtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttg 413  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| ||| | |||| || |||||||||| ||||||||| |||    
T  12326 gtagatgcagct--atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttg 12229  T
Q  414 aatctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 448  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12228 aatctactcctaac-accttgctttgtgtttctct 12195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 42 - 450
Target Start/End: Original strand, 714 - 1147
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  714 atcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaatcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 813  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  814 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatattattttgaatctcaataaaacattaaatg 913  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaagag 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||         ||| ||||||  |    
T  914 caagaataacaacaatattgaataaataagcta-caccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaaagg 1012  T
Q  326 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg-----------atgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttga 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||           ||||| |||||||| | |||  || |||||||||||||||||||| | ||    
T  1013 tagatgtagctacatatgtctgtgataactttgcaaaggacgaagaagatatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttggataga 1112  T
Q  415 atctactcctaactaccttgttttgtgtttctctct 450  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  1113 atctactcctaac-accttactttgtgtttctctct 1147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 180; Significance: 7e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 42 - 314
Target Start/End: Original strand, 12218 - 12489
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||      |||||||||||||| ||||    
T  12218 atcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaac 12317  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  12318 atccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaa--------g 12409  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12410 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaa 12489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 42 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14617 - 14274
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctaga------gtgattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||  | |||||||||||||   || ||      |||||||||||||| ||||    
T  14617 atcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgattttccaatctattaaacgatccaaaagcattaagctcttgatttaaagtgattatcaaatattaac 14518  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaat 234  Q
    ||  ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  14517 atctatgtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttatatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaac 14418  T
Q  235 tcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg---------aaaaccacaaga 324  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| || |||| |||| |||||||||         ||| |||||||     
T  14417 acaagaataacaactatattgaataaataaactagaaccatatattaaaagatcaagagtttac-taatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagg 14319  T
Q  325 gtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14318 gtagatgtagctacatatgtatatgatagctttgcaaaggatgaa 14274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14242 - 14185
Alignment:
Q  390 gatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctct 448  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  14242 gatgtctcaacaaatcttgagttgaatctactcctaac-accttgctttgtgtctctct 14185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 459
Target Start/End: Original strand, 16203 - 16646
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctagagt------gattatcaaatagtaac 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||   | ||||||||||||| | ||||| |      |||||||||| | ||||    
T  16203 atcacaaagtcgattggatcgtttaatcgatgatttcccaatctattaatcgatccaaaagcattaagttctagattaaaaatgattatcaaagattaac 16302  T
Q  136 attcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatt 235  Q
    ||  ||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||   ||| |||||| |||||||||  ||  |||||||||  |||||||||||| | ||||||     
T  16303 atctatgtctagaatgaaaactta-gatagattgttatataattcctagatccaaaagtattagttaatatcatttcaaatctcaataaagccttaaata 16401  T
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgttt---------gaaaaccacaagag 325  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| |||          ||| ||||||| |    
T  16402 caagaataacaaccatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagggtttacataatagcttatttaaatacctcaaaacccacaaggg 16501  T
Q  326 tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttga 414  Q
    || |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||           |||||||||| |||| | |||| || |||||||||||||||||||| | ||    
T  16502 tatatgtagatacatatgtctaagatagcttggcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtaga 16601  T
Q  415 atctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16602 atctactcttaactaccttactttgtgtttctctctctagaaaag 16646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1494 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1494
Description:

Target: scaffold1494; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 313 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 1710 - 1553
Alignment:
Q  313 aaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga-----------ttccatgacaagatccacgatgtctcaaca 401  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1710 aaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgataagatccatgatgtctcaaca 1611  T
Q  402 aatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaaag 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1610 aatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctctagaaaag 1553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7341 - 7216
Alignment:
Q  189 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatca 288  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341 aaaagtatgtgtccataacattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagatagctagaaccatatattaaatgatca 7242  T
Q  289 aaagattacataatagcttgtttgaa 314  Q
    | || ||||||||| |||||||||||    
T  7241 agagtttacataatggcttgtttgaa 7216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11955 - 11830
Alignment:
Q  189 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatca 288  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11955 aaaagtatgtgtccataacattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagatagctagaaccatatattaaatgatca 11856  T
Q  289 aaagattacataatagcttgtttgaa 314  Q
    | || ||||||||| |||||||||||    
T  11855 agagtttacataatggcttgtttgaa 11830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7384 - 7340
Alignment:
Q  116 agtgattatcaaatagtaacattcatgtctagagtgataacttaa 160  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7384 agtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 7340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 11998 - 11954
Alignment:
Q  116 agtgattatcaaatagtaacattcatgtctagagtgataacttaa 160  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11998 agtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 11954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9950 - 9825
Alignment:
Q  189 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatca 288  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9950 aaaagtatgtgtccataacattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagatagctagaaccatatattaaatgatca 9851  T
Q  289 aaagattacataatagcttgtttgaa 314  Q
    | || ||||||||| |||||||||||    
T  9850 agagtttacataatggcttgtttgaa 9825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9993 - 9949
Alignment:
Q  116 agtgattatcaaatagtaacattcatgtctagagtgataacttaa 160  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9993 agtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 9949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1832 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1832
Description:

Target: scaffold1832; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 328 - 457
Target Start/End: Original strand, 1 - 141
Alignment:
Q  328 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga-----------ttccatgacaagatccacgatgtctcaacaaatcttggcttgaat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  1 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagaggaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgtgttgaat 100  T
Q  417 ctactcctaactaccttgttttgtgtttctctctctagaaa 457  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  101 ctactcccaactaccttgctttgtctttctctctctagaaa 141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0458 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0458
Description:

Target: scaffold0458; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 367
Target Start/End: Original strand, 9364 - 9523
Alignment:
Q  220 aataaaacattaaattcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattaca---taatagcttgtttg--- 312  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||       
T  9364 aataaagcattaaactcaagaataataacaatattgaataaataagctagaaccttaaattaaatgatc-aaagattacaaattaatagcttgtttgaat 9462  T
Q  313 ------aaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg 367  Q
          ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9463 accttaaaaaccacaagcgtagatgtagctacatatgtctatgataactttgcaaaagatg 9523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 182
Target Start/End: Original strand, 35053 - 35196
Alignment:
Q  42 atcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaattcctag-------agtgattatcaaatagtaa 134  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| | ||||       ||||||||||||||| |||    
T  35053 atcacaaagtcgatcggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgaccaaaaagcattaagttctagatttaaaagtgattatcaaatattaa 35152  T
Q  135 cattcatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttct 182  Q
        ||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  35153 ----catctatagagtgataacttaaggtagattgttattctatttct 35196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 314
Target Start/End: Original strand, 35212 - 35291
Alignment:
Q  236 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  35212 caagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaaaaatcaagaaattacataatggcttgtttgaa 35291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 447
Target Start/End: Original strand, 35388 - 35443
Alignment:
Q  391 atgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgttttgtgtttctc 447  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35388 atgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-accttgctttgtgtttctc 35443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University