View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10450_low_16 (Length: 227)

Name: NF10450_low_16
Description: NF10450
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10450_low_16
NF10450_low_16
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (1-227)||(38119912-38120139)
chr1 (1-227)||(11196939-11197162)
chr1 (34-227)||(45828652-45828845)
chr1 (60-227)||(47660949-47661116)
chr1 (63-227)||(23273217-23273381)
chr1 (35-227)||(22527071-22527269)
chr1 (43-227)||(51336981-51337165)
chr1 (43-227)||(47505417-47505607)
chr1 (58-227)||(13636805-13636980)
chr1 (51-227)||(35256210-35256386)
chr1 (58-227)||(19522092-19522258)
chr1 (64-227)||(26878786-26878955)
chr1 (58-227)||(19159097-19159272)
chr1 (64-227)||(3729154-3729323)
chr1 (64-227)||(21144006-21144175)
chr1 (58-227)||(52804944-52805119)
chr1 (61-165)||(94916-95020)
chr1 (58-227)||(50617697-50617873)
chr1 (58-227)||(31780472-31780641)
chr1 (63-142)||(8548257-8548336)
chr1 (58-117)||(470574-470633)
chr1 (55-130)||(49854822-49854897)
chr1 (49-126)||(16269590-16269667)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (1-227)||(38971118-38971344)
chr5 (1-223)||(42538874-42539089)
chr5 (34-227)||(511409-511603)
chr5 (34-227)||(5199837-5200036)
chr5 (58-227)||(42937467-42937636)
chr5 (58-227)||(8468-8643)
chr5 (58-227)||(8577344-8577519)
chr5 (64-227)||(28238544-28238713)
chr5 (64-227)||(38407662-38407831)
chr5 (34-204)||(40622792-40622962)
chr5 (66-227)||(30708124-30708291)
chr5 (1-227)||(15939721-15939944)
chr5 (58-227)||(19037968-19038143)
chr5 (66-227)||(7761620-7761787)
chr5 (58-227)||(28879675-28879850)
chr5 (1-61)||(36503425-36503485)
chr5 (60-95)||(8699237-8699272)
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (1-227)||(37343327-37343553)
chr7 (1-227)||(41734805-41735031)
chr7 (57-227)||(16680536-16680706)
chr7 (57-227)||(17654772-17654942)
chr7 (43-227)||(47521767-47521957)
chr7 (43-225)||(16488452-16488634)
chr7 (64-227)||(19801577-19801740)
chr7 (64-227)||(48406435-48406604)
chr7 (64-227)||(34741798-34741958)
chr7 (64-227)||(9368213-9368382)
chr7 (64-227)||(35607202-35607371)
chr7 (64-227)||(41883617-41883786)
chr7 (58-227)||(5538356-5538531)
chr7 (58-227)||(15071088-15071263)
chr7 (58-227)||(17838030-17838205)
chr7 (64-227)||(17460073-17460242)
chr7 (64-227)||(17592972-17593141)
chr7 (43-190)||(36980660-36980807)
chr7 (43-227)||(27450481-27450667)
chr7 (97-193)||(11630143-11630239)
chr7 (64-227)||(10521907-10522076)
chr7 (107-227)||(42504788-42504914)
chr7 (49-130)||(9491787-9491868)
chr7 (63-227)||(13323111-13323280)
chr7 (43-130)||(47669996-47670083)
[»] chr3 (33 HSPs)
chr3 (1-227)||(11380786-11381012)
chr3 (1-193)||(42759754-42759946)
chr3 (43-227)||(20353618-20353802)
chr3 (34-227)||(6928202-6928395)
chr3 (49-227)||(44232788-44232966)
chr3 (43-218)||(16861562-16861743)
chr3 (55-227)||(48891594-48891766)
chr3 (58-227)||(2648377-2648552)
chr3 (64-227)||(34048502-34048671)
chr3 (64-227)||(42900967-42901136)
chr3 (64-227)||(50477584-50477753)
chr3 (64-227)||(54389202-54389371)
chr3 (34-167)||(48565957-48566090)
chr3 (49-165)||(41615394-41615510)
chr3 (58-227)||(46401782-46401957)
chr3 (64-227)||(46698122-46698291)
chr3 (58-227)||(16646572-16646747)
chr3 (86-227)||(17562171-17562319)
chr3 (65-224)||(49266177-49266342)
chr3 (58-165)||(52388414-52388521)
chr3 (58-227)||(2271857-2272032)
chr3 (58-165)||(4005215-4005322)
chr3 (87-227)||(599944-600081)
chr3 (58-204)||(47070987-47071140)
chr3 (58-165)||(9473421-9473528)
chr3 (64-193)||(49141337-49141472)
chr3 (58-165)||(36130615-36130722)
chr3 (64-227)||(50213974-50214143)
chr3 (43-118)||(42804750-42804825)
chr3 (60-130)||(30252898-30252968)
chr3 (12-128)||(18751920-18752036)
chr3 (67-119)||(26334789-26334841)
chr3 (1-61)||(12373946-12374006)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (34-227)||(34819397-34819590)
chr8 (34-227)||(40075487-40075680)
chr8 (43-227)||(30761068-30761252)
chr8 (1-195)||(5301073-5301267)
chr8 (34-227)||(35554665-35554858)
chr8 (54-227)||(20859090-20859263)
chr8 (60-227)||(12716091-12716257)
chr8 (58-227)||(15033570-15033745)
chr8 (64-227)||(1055603-1055772)
chr8 (64-227)||(23019098-23019267)
chr8 (64-227)||(26662524-26662693)
chr8 (64-227)||(42482317-42482486)
chr8 (64-227)||(22307-22476)
chr8 (68-227)||(486548-486713)
chr8 (43-226)||(39831541-39831730)
chr8 (66-225)||(52161-52320)
chr8 (3-132)||(45132908-45133037)
chr8 (58-155)||(41239359-41239456)
chr8 (58-165)||(34367429-34367536)
chr8 (149-227)||(41242986-41243064)
chr8 (159-227)||(43214461-43214529)
chr8 (1-130)||(21176093-21176219)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (30-227)||(24885416-24885613)
chr6 (12-224)||(2405816-2406027)
chr6 (1-192)||(2407336-2407521)
chr6 (33-227)||(26172994-26173187)
chr6 (58-227)||(22304307-22304482)
chr6 (64-227)||(6204226-6204395)
chr6 (64-227)||(11691193-11691362)
chr6 (64-227)||(30826429-30826598)
chr6 (43-227)||(18001601-18001785)
chr6 (58-227)||(27638825-27639000)
chr6 (58-227)||(31771144-31771308)
chr6 (64-227)||(3384505-3384667)
chr6 (55-227)||(3502051-3502237)
chr6 (63-130)||(32641674-32641741)
chr6 (43-130)||(32643068-32643155)
chr6 (43-130)||(24085617-24085704)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (1-227)||(51686191-51686411)
chr4 (49-227)||(50020500-50020678)
chr4 (49-227)||(50196407-50196585)
chr4 (34-227)||(46439097-46439283)
chr4 (34-227)||(8110228-8110421)
chr4 (34-227)||(10729781-10729974)
chr4 (34-227)||(10943550-10943743)
chr4 (55-227)||(14317686-14317858)
chr4 (58-227)||(21018397-21018572)
chr4 (58-227)||(30723546-30723721)
chr4 (1-132)||(41930813-41930944)
chr4 (64-227)||(1305945-1306114)
chr4 (64-227)||(6178615-6178784)
chr4 (58-227)||(41795844-41796019)
chr4 (58-227)||(49168588-49168763)
chr4 (54-227)||(21535045-21535218)
chr4 (58-227)||(40355223-40355397)
chr4 (64-227)||(31424817-31424986)
chr4 (64-227)||(49093499-49093668)
chr4 (58-172)||(50278271-50278385)
chr4 (54-227)||(72014-72187)
chr4 (3-190)||(50904435-50904622)
chr4 (58-165)||(37016409-37016516)
chr4 (64-197)||(44674656-44674795)
chr4 (91-227)||(11081483-11081619)
chr4 (57-119)||(12892091-12892153)
chr4 (73-224)||(55278613-55278761)
chr4 (72-131)||(40886456-40886515)
chr4 (49-119)||(13624332-13624402)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (30-172)||(6637866-6638011)
chr2 (1-130)||(7416959-7417088)
chr2 (64-227)||(30493772-30493941)
chr2 (54-227)||(39950565-39950744)
chr2 (64-227)||(15834333-15834502)
chr2 (60-227)||(36653303-36653476)
chr2 (64-227)||(43981598-43981767)
chr2 (37-227)||(28471605-28471803)
chr2 (64-227)||(5355048-5355217)
chr2 (64-227)||(43536515-43536684)
chr2 (37-227)||(29398389-29398585)
chr2 (3-130)||(25514813-25514931)
chr2 (43-130)||(40538702-40538789)
chr2 (58-165)||(17423599-17423706)
chr2 (67-165)||(10825732-10825830)
chr2 (64-125)||(3938350-3938411)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (54-119)||(12538-12603)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 38119912 - 38120139
Alignment:
Q  1 accaagtcatgaaaatatatcctaaa-cataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  38119912 accaagtcatgaaaatatatcctaaaacataaaatattactactcctgatcctactgatgctgccggtgcctcctcctcggcctttggcctagcctcctg 38120011  T
Q  100 gtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtagg 199  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  38120012 gtcaagatcggcacgatctggtccctaacatgggtcatcgtctgaaaccactgctgagggctcatgacctcctcttgacctatctgcgcatcagtgtagg 38120111  T
Q  200 caacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38120112 caacaacgacactaaccatgtcataggt 38120139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11197162 - 11196939
Alignment:
Q  1 accaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||| |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |    
T  11197162 accaagtcatgaaaatatatcctaaacattaaatactact---cctggtcctgctgatgttgttggtgcctcctcttcggcctctggcctcgcctcctag 11197066  T
Q  101 tcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggc 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||    
T  11197065 tcaagatcggcgcgatctgctcctcaacatggatcatggcctgaaaccactgttgagggctcatgacctcctcctgacctaactgcacattagcgtaggc 11196966  T
Q  201 aacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11196965 aacagcggcactaactatgtcataggt 11196939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 45828845 - 45828652
Alignment:
Q  34 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 133  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45828845 tactgctactcctggtcctgctgatgctgctggtgccttctccttggcctctagcctcgcctcctggtcaagatcggcgcgatctgctccctaacatggg 45828746  T
Q  134 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  45828745 tcatggcctgaaaccactgttgagggctcatgacctcaccttgacctatctgcgcatcagcgtaggcaacatcggcactaaccatgtcataggt 45828652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 47661116 - 47660949
Alignment:
Q  60 ctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg 159  Q
    |||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  47661116 ctgctggtgcctcctcatcgacccatggcctcgcctcctggtcaagatcggcgcgatctgctccctaacatgggtcatggcctgaaaccgctgttgaggg 47661017  T
Q  160 ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47661016 ctcatgacctcctcctgacctatatgcgcatcagcataggcaacaacgacactaaccatgtcataggt 47660949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Original strand, 23273217 - 23273381
Alignment:
Q  63 ctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctc 162  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23273217 ctggtgccacctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagattgacgcgatctgctccataacatgggtcatggcctgaaaccactgttgagggctc 23273316  T
Q  163 atgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  23273317 atgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggctacaacggcactaaccatgtcataggt 23273381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22527269 - 22527071
Alignment:
Q  35 actactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggt 134  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  22527269 actactactactggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagataggcgcgatctgctccttaagatggct 22527170  T
Q  135 catcgcctgaaaccactgttgagg------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||| |||| |||| |||| |||||      |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22527169 catggcctcaaacgactgctgaggggtcatgctcatgacctccttctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 22527071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 51337165 - 51336981
Alignment:
Q  43 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 142  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||    
T  51337165 tcctgttcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcagcctctggcctcgcctcctggccaatatcggcgcgatctgctctctaacatggctcatggcct 51337066  T
Q  143 gaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  51337065 gaaaccattgatgagggctcatgacctcctcctggccaatctatgcatcagcgtaggcaacagcgccgctaaccatgtcataggt 51336981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 43 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 47505607 - 47505417
Alignment:
Q  43 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 142  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||| |||||| || |||| |||| |||| ||||    
T  47505607 tcctggtcctgctgatgctgttggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcatggtcaagataggcgtgatctgctctctaatatggctcatggcct 47505508  T
Q  143 gaaaccactgttgagg------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||||||||||||||||      |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47505507 gaaaccactgttgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 47505417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 13636805 - 13636980
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  13636805 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgtgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 13636904  T
Q  158 g------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |      |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13636905 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 13636980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 51 - 227
Target Start/End: Original strand, 35256210 - 35256386
Alignment:
Q  51 ctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccac 150  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||||||||| || ||||||| | |||| || ||||||||     
T  35256210 ctactgctgctgttggtgtctcctcctcggcctctggcctcgcctccttgccaatatcggcgcgatctgctctctaacatagctcatggcttgaaaccat 35256309  T
Q  151 tgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || || || |||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  35256310 tgttgagggctcatgacctcctcctggccaatatgtgcatcaatgtaggcaacagcgctgctaaccatgtcataggt 35256386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 19522092 - 19522258
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| | |||  |||| |||||||||||||||||||    
T  19522092 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcttggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgactcatggcctgaaaccactgttgag 19522191  T
Q  158 ggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||||||||   |||| ||| || ||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19522192 ggctcatg---tcctcctggcccatctgtgcatcagcataggcaacaacggcactaaccatgtcataggt 19522258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26878955 - 26878786
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||         
T  26878955 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 26878856  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26878855 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 26878786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19159272 - 19159097
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  19159272 tgctgatggtgcctcctcctgggcctctgggctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 19159173  T
Q  158 g------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |      |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19159172 gggtcatgctcatgacctcctcctagcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcaccactaaccatgtcataggt 19159097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 3729154 - 3729323
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 159  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  3729154 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaattggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 3729253  T
Q  160 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3729254 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 3729323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21144175 - 21144006
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||  |||||         
T  21144175 tggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaaaatcagcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactactgaggggtcg 21144076  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  21144075 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccacaaaccatgtcataggt 21144006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 52805119 - 52804944
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| | |||| || | |||||||||||||  ||||    
T  52805119 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaaaattggcgcggtctgctccctcatatggctcgtggcctgaaaccactactgag 52805020  T
Q  158 g------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |      |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  52805019 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccacaaaccatgtcataggt 52804944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 165
Target Start/End: Original strand, 94916 - 95020
Alignment:
Q  61 tgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggc 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  94916 tgctggtgcctcctcctcggcctctagcctcgcctcctggtcaagataggcgcgatctgctccctaagatggctcatggcctgaaaccactgttgagggg 95015  T
Q  161 tcatg 165  Q
    |||||    
T  95016 tcatg 95020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 50617697 - 50617873
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||| | ||||    
T  50617697 tgctgatgatgcatcctcctcggcctctagcctcgcctcctggtcaaaatcggtgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccacagctgag 50617796  T
Q  158 gg-------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||       ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  50617797 ggggtcatgctcatgacctcctcctgacctaactgcgcagcagcgtaggcaacagcgccacaaaccatgtcataggt 50617873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 31780472 - 31780641
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||| |||||||||  |||    
T  31780472 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctaggctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgttccctcatatggctcatggcctaaaaccactgccgag 31780571  T
Q  158 ggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    || |||||  ||||| ||| |||| |||| |||||| |||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  31780572 gggtcatgctctcctcctggcctaactgcacatcagcgtaggcaacaacaccataaaccatgtcataggt 31780641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 8548336 - 8548257
Alignment:
Q  63 ctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  8548336 ctggtgcctcctcctcggcctttgggctctcctcctggtcaaaatcgacgcgatctgctccctcatatgggtcatggcct 8548257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 470633 - 470574
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatc 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  470633 tgctgatgctgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatc 470574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 130
Target Start/End: Original strand, 49854822 - 49854897
Alignment:
Q  55 tgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacat 130  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| | ||||||| ||||||| | ||||||||    
T  49854822 tgatgttgttggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcttggtaatgatcggcacgatctgctgcctaacat 49854897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 126
Target Start/End: Original strand, 16269590 - 16269667
Alignment:
Q  49 tcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatcccta 126  Q
    ||||| |||||||| || |||| ||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16269590 tcctattgatgctgttgttgccgcctgctcgacctctggcctcgcgtcctggtcaagatcggcacgatctgctcccta 16269667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38971344 - 38971118
Alignment:
Q  1 accaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactgg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  38971344 accaagacatgaaaatatatcctaaacataaaatattactactcctggtcctgctgatgctgctcgtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctcttgg 38971245  T
Q  101 tcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggc 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  38971244 tcaagatcggcgcgatctgctccctaacatgggtcatggcctgaaaccactgttgagggctcatggcctcctcctgacctatctgcgcatcagcgtaggc 38971145  T
Q  201 aacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||| || |||||||||||||||||||    
T  38971144 aacaacggcactaaccatgtcataggt 38971118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 42539089 - 42538874
Alignment:
Q  1 accaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactgg 100  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||       ||||| ||||    
T  42539089 accaagtcctaaaaatctatcctaaacataaaatactactactcttagtcctgttgatgctgctggtgcctcctcctcgacct-------cgcctcctgg 42538997  T
Q  101 tcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggc 200  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42538996 tcaaaatcggcgcgatctgctccttaacatgggtcatggcctgaaaccactgttgagggctcatgacctcctcctgacctatttgcgcatcagcgtaggc 42538897  T
Q  201 aacagcgacactaaccatgtcat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  42538896 aacagcgacactaaccatgtcat 42538874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Original strand, 511409 - 511603
Alignment:
Q  34 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 133  Q
    |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |    
T  511409 tactgctactcctggttctgctgatgctgctggtgccacctcctcggcctttggcctcgcctcctggtcaagatcggtgcgatctactccctaacatgag 511508  T
Q  134 tcatcgcctgaaaccactg-ttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  511509 tcatggcctgaaaccactgcttgaaggctcatgacctcctcctggcctatctgcgcattagtgtaggcaacaacggcactaaccatgtcataggt 511603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 5200036 - 5199837
Alignment:
Q  34 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 133  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  5200036 tactactggtcctggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcttcgcctcctggtcaagatcggcgcgatctgctccctaagatggc 5199937  T
Q  134 tcatcgcctgaaaccactgttgagggct------catgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||      ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  5199936 tcatgacctgaaaccactgctgagggctcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtagacaacggcgccactaaccatgtcataggt 5199837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 42937467 - 42937636
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |  || |||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  42937467 tgctgatggtgcctcctcctcagcctctggcctcgcctccttgctaatatcggcgcaatctgctccctaacatggctcatggcctgataccactgttgag 42937566  T
Q  158 ggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42937567 ggctcatgccctcctcctggcctatctgtgcattagcgtaggcaacagcggcactaaccatgtcataggt 42937636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 8468 - 8643
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8468 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgttgag 8567  T
Q  158 g------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |      |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  8568 gggtcatgctcataacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcacaggt 8643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 8577344 - 8577519
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8577344 tgctgatggtgcctcctcctcggcctttgggctcgcctcctggtcaaaatcggcacgatttgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgttgag 8577443  T
Q  158 g------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |      |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8577444 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccactaaccatgtcataggt 8577519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 28238544 - 28238713
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| |||||         
T  28238544 tggtgcctcctccccggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgagggctca 28238643  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28238644 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 28238713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 38407662 - 38407831
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||| |||||         
T  38407662 tggtgcctcctcctcggcctatggcctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactgctgaggggtca 38407761  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     ||||||||||||||  || |||| ||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  38407762 tgctcatgacctcctcttggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccacaaaccatgtcataggt 38407831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 204
Target Start/End: Original strand, 40622792 - 40622962
Alignment:
Q  34 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 133  Q
    |||| ||| ||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||| |||| ||||||||| || |||||||||     
T  40622792 tactgctagtcctggtcctgctgatgttgttggtgcctcctcctcggcctctggccttgcctcctggccaatatcgccgcgatctgctctctaacatggc 40622891  T
Q  134 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaaca 204  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |  |||||||||    
T  40622892 tcatggcctgaaaccattgttgagggctcatgacctccgtctgacccatctgcacatctgcataggcaaca 40622962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30708291 - 30708124
Alignment:
Q  66 gtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg------g 159  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| |||||      |    
T  30708291 gtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtcatg 30708192  T
Q  160 ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30708191 ctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcataggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 30708124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15939944 - 15939721
Alignment:
Q  1 accaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactgg 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||     
T  15939944 accaagtcctaaaaatatatcctaaacataagatactactactcctggtgttgctgatgttgctggtgccgcctcctcggcctctggcctcgcctcctga 15939845  T
Q  101 tcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggc 200  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |  ||| || | ||||||||| |||||   |||||| | || | |||||   |||||    
T  15939844 ccaatatcggcgcgatctgctccctaacatggcgcatggcctcagtccattgctcagggctcatcacctc---ctgacccaactactcatcaacataggc 15939748  T
Q  201 aacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||| || | |||||||||||||||||    
T  15939747 aacaacgcctctaaccatgtcataggt 15939721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 19037968 - 19038143
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||||  |||||| ||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19037968 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcacgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgttgag 19038067  T
Q  158 g------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |      ||||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19038068 gggtcatgctcatgacctcctcttggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 19038143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7761787 - 7761620
Alignment:
Q  66 gtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg------g 159  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| | | |||| |||| |||||||||||||| |||||      |    
T  7761787 gtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaaaatcggtgcgatctgctccttcatatggctcatggcctgaaaccactgctgaggggtcatg 7761688  T
Q  160 ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  7761687 ctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcaccataaaccatgtcataggt 7761620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28879850 - 28879675
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  28879850 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggatcatggcctcaaaccactgctgag 28879751  T
Q  158 g------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |      |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||| |||||    
T  28879750 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggtaacaacgccactaaccatgtcgtaggt 28879675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 36503425 - 36503485
Alignment:
Q  1 accaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgct 61  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  36503425 accaagttatgaaaatatatcttaaacataaaatactactactcttgatcctgctggtgct 36503485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 95
Target Start/End: Original strand, 8699237 - 8699272
Alignment:
Q  60 ctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcct 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8699237 ctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcct 8699272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37343553 - 37343327
Alignment:
Q  1 accaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| || |    
T  37343553 accaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcatggtcttgctgatgctactggtgcctcctcatcggcttctggcctcgcctcctag 37343454  T
Q  101 tcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggc 200  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  37343453 tcaagatcggcgcgatctgcttcctaacatgggtcatggtctgaaaccactgttgagggctcatgacctcctcctgacctatctgcgcatcagcgtaggc 37343354  T
Q  201 aacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  37343353 aacaacgacactaaccatgtcataggt 37343327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41735031 - 41734805
Alignment:
Q  1 accaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactgg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||||| ||||    
T  41735031 accaagtcatgaaactatatcctaaacataaaatactactactcctggtcctgctgatgctgctggtgcctcctccttgacctatgaactcgcctcctgg 41734932  T
Q  101 tcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggc 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  41734931 tcaagatcggcgcgatctgttccctaacatgggtcatggcctgaaaccactgctgaaggctcatgacctcctcctgacctatatgcgcatcagcgtaggc 41734832  T
Q  201 aacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  41734831 aacaacgacactaaccatgtcataggt 41734805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16680706 - 16680536
Alignment:
Q  57 atgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttga 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16680706 atgctgctggtgcctcctcctcggcctctgacctcgcctcctgatcaagatcggcgcgatctactccctaagatggctcatggcctgaaaccactgttga 16680607  T
Q  157 gggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||||||||||||||| ||| |  || || ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16680606 gggctcatgacctcctcctggctcatttgtgcatcagcgtagacaacagcggcactaaccatgtcataggt 16680536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17654942 - 17654772
Alignment:
Q  57 atgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttga 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17654942 atgctgctggtgcctcctcctcggcctctgacctcgcctcctgatcaagatcggcgcgatctactccctaagatggctcatggcctgaaaccactgttga 17654843  T
Q  157 gggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||||||||||||||| ||| |  || || ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17654842 gggctcatgacctcctcctggctcatttgtgcatcagcgtagacaacagcggcactaaccatgtcataggt 17654772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 43 - 227
Target Start/End: Original strand, 47521767 - 47521957
Alignment:
Q  43 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 142  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||    
T  47521767 tcctggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagacaggcgcgatctgctccctaagatggctcatggcct 47521866  T
Q  143 gaaaccactgttgagg------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||||      |||| ||||||||| ||| |||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47521867 aaaaccactgttgaggggtcatgctcgtgacctcctcctggcctaactgctcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 47521957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16488634 - 16488452
Alignment:
Q  43 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 142  Q
    ||||| |||| ||||||||| || |||| |||  |||||| |||||||||||| || ||||||||| ||| |||| | |||||||||||| |||| ||||    
T  16488634 tcctggtcctgctgatgctgttgttgccgccttgtcggcccttggcctcgcctcctagtcaagatcagcgtgatcggctccctaacatggctcatggcct 16488535  T
Q  143 gaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcatag 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16488534 gaaaccactgttgagggctcatgacctcctcttgacccatctgtgcatcagcgtaggcaacaacgacactaaccatgtcatag 16488452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19801740 - 19801577
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctca 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||    
T  19801740 tggtgcctcctcctcggcctctggccttgccccctggtcaagatcgacgcaatctgctccctaagatggttcatgacctgaaaccactactgagggctca 19801641  T
Q  164 tgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||||||||| |||  | ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19801640 tgacctcctcctggaccatctgtgcatcagcgtaggcaacagtgacactaaccatgtcataggt 19801577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 48406604 - 48406435
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| |||||         
T  48406604 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 48406505  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48406504 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 48406435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34741958 - 34741798
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctca 163  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  34741958 tggtgcctccttctcggcccctggcctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactgctgagggctca 34741859  T
Q  164 tgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||||||   ||| || ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34741858 tgacctc---ctggcccatctgtgcatcaacgtaggcaacaacgacactaaccatgtcataggt 34741798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 9368213 - 9368382
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||         
T  9368213 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 9368312  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9368313 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 9368382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 35607202 - 35607371
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||         
T  35607202 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 35607301  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35607302 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 35607371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41883786 - 41883617
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||         
T  41883786 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 41883687  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41883686 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 41883617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 5538356 - 5538531
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  5538356 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactgctgag 5538455  T
Q  158 g------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |      |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  5538456 gggtcatgctcatgacctcctcctagcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacaccacaaaccatgtcataggt 5538531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 15071088 - 15071263
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||   ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  15071088 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcttatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 15071187  T
Q  158 g------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |      |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15071188 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagctccactaaccatgtcataggt 15071263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17838205 - 17838030
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  17838205 tgctgatggtgccccctcctcggcctttgggctcgccttctggtcaaaatcagcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactgctgag 17838106  T
Q  158 g------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |      |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17838105 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaagtgcgcatcagcgtagacaacagcgccactaaccatgtcataggt 17838030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 17460073 - 17460242
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| |||||         
T  17460073 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtaaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 17460172  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17460173 tgctcatgacctcctcctggcctaactgctcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 17460242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17593141 - 17592972
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| |||||         
T  17593141 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtaaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 17593042  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17593041 tgctcatgacctcctcctggcctaactgctcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 17592972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36980807 - 36980660
Alignment:
Q  43 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 142  Q
    ||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||    
T  36980807 tcctggtcctgctgatgctgttcgtgcctcctcctcggcctctggtctcgcctcctggccaatatcggcgcgatcttctctctaacatggctcatggcct 36980708  T
Q  143 gaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcat 190  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  36980707 aaaaccattgttgagggctcatgacctcctcctggcccatctgtgcat 36980660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 227
Target Start/End: Original strand, 27450481 - 27450667
Alignment:
Q  43 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 142  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||    
T  27450481 tcctggtcctgctgatgctgttggtgcctc---ctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagataggcgcgatctgctccctaagatgactcatggcct 27450577  T
Q  143 gaaaccactgttgagg------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||||||||| |||||      |||||||||||||| ||| |||| |||| ||| ||  ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27450578 gaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgctcataagcttaggcaacaacg-cactaaccatgtcataggt 27450667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 193
Target Start/End: Original strand, 11630143 - 11630239
Alignment:
Q  97 ctggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcag 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  11630143 ctggtgaagatcggcgcgatctgctccctaacatgggtcctgacctgaaaccactgctgagggctcatgacctccttctggcctaactgtgcatcag 11630239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10522076 - 10521907
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | |||| |||| |||| ||||||||  |||||         
T  10522076 tggtgcctcctcctcggcctatgggcttgcctcctggtcaaaattggcgcgatctggtccctcatatggctcatggcctcaaaccacttctgaggggtca 10521977  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| | ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  10521976 tgctcatgacctcctcctggcctaaccgcgcatcagcgtaggcaacaacgctactaaccatgtcataggt 10521907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 42504788 - 42504914
Alignment:
Q  107 tcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggc 200  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||      ||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  42504788 tcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaattgcgcatcagcgtaggc 42504887  T
Q  201 aacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||| || |||||||||||||||||||    
T  42504888 aacaacgccactaaccatgtcataggt 42504914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 130
Target Start/End: Original strand, 9491787 - 9491868
Alignment:
Q  49 tcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacat 130  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  9491787 tcctgctggtgctggtggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctcctggtaatgatcggcgcgatctgctgcctaacat 9491868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13323280 - 13323111
Alignment:
Q  63 ctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg---- 158  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||  || ||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||  |||||        
T  13323280 ctggtgcctcctcctcggtctctatcctcgcctcctggtcataattggcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactactgaggggtc 13323181  T
Q  159 --gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
      |||||||||||||| |||  | | ||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||    
T  13323180 atgctcatgacctcctcctggtc-aactgcgcatcagcgtaggtaacagcgccaaaaaccatgtcataggt 13323111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 130
Target Start/End: Original strand, 47669996 - 47670083
Alignment:
Q  43 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacat 130  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |  |||||||||||||| | ||||||||    
T  47669996 tcctggtcctgctgatgctactggtgcctcctcctcggcctctggcatcgcctcctggtaattatcggcgcgatctggtgcctaacat 47670083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 33)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 11380786 - 11381012
Alignment:
Q  1 accaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactgg 100  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  11380786 accaagtcctaaaaatctatcctaaacataaaatactactactcctggtcctgttgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcttcctag 11380885  T
Q  101 tcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggc 200  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11380886 tcaagatcgccgcgatctgctccctaacatgggtcatgacctgaaaccactgctgaggactcatgacctcctcctgtcctatctgcgcatcagcgtaggc 11380985  T
Q  201 aacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||| || |||||||||||||||||||    
T  11380986 aacaacggcactaaccatgtcataggt 11381012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 42759946 - 42759754
Alignment:
Q  1 accaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  42759946 accaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcatggtcctgctaatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcttgg 42759847  T
Q  101 tcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcag 193  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42759846 tcaagatcggcgcgatgtgctcccttacatgggtcatggcctgaaaccactgctgagggttcatgacctcctcctgacctatctgcgcatcag 42759754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 43 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20353802 - 20353618
Alignment:
Q  43 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 142  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||    
T  20353802 tcctggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgtctcctggtcatgatcggcgcgatctgctccccaagatgggtcatggcct 20353703  T
Q  143 gaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20353702 gaaaccactgatgagggctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaagcaacaacgacactaaccatgtcataggt 20353618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6928395 - 6928202
Alignment:
Q  34 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 133  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  6928395 tactgctactcctggtcctgctgatggtgctggtgcatcctccttggcatctggcctcgcctcctggtcaagatcggcgcgatctgctccctaacacgag 6928296  T
Q  134 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  6928295 tcatggcctgaaaccactgctgagggatcatgacatcctcctgacctatctgcgcatcagcgtaggcaactacgacactaaccatgccataggt 6928202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44232966 - 44232788
Alignment:
Q  49 tcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaacc 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| | || ||||||||||    
T  44232966 tcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcgacctatgggctcgcctcctggtcaagatcggcgcgttctgctccctaagatggcttatggcctgaaacc 44232867  T
Q  149 actgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  44232866 actgttgagggctcatgacctcctcctggcctaattgcacatcagcgtaggcaacaacggcactaaccatgtcataggt 44232788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 218
Target Start/End: Original strand, 16861562 - 16861743
Alignment:
Q  43 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 142  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||| |||| |||| ||||    
T  16861562 tcctggtcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctgttcaagatcagcgcaatctgctctctaagatggctcatggcct 16861661  T
Q  143 gaaaccactgttgagg------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccat 218  Q
    |||||||||| |||||      |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16861662 gaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgtgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccat 16861743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 48891766 - 48891594
Alignment:
Q  55 tgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgtt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||  ||| |||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |    
T  48891766 tgatgctgctggtgcctcctcctcagcctctggccttgccttctgaccaatatcgacgcgatctgctctctaacatggctcatggcctgaaaccattgct 48891667  T
Q  155 gagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  48891666 gagggctcatgacctccttctggctcatctgtgcatcagcgtaggcaacaacgccgctaaccatgtcataggt 48891594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 2648377 - 2648552
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| | ||    
T  2648377 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctaag 2648476  T
Q  158 g------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |      |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2648477 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 2648552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34048671 - 34048502
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||         
T  34048671 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 34048572  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34048571 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 34048502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 42900967 - 42901136
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||         
T  42900967 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 42901066  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42901067 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 42901136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 50477584 - 50477753
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 159  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  50477584 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcagcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 50477683  T
Q  160 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50477684 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 50477753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 54389371 - 54389202
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||         
T  54389371 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 54389272  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54389271 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcataggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 54389202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 48566090 - 48565957
Alignment:
Q  34 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 133  Q
    |||| ||||||||| || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48566090 tactgctactcctggtcttgttgatgttgttggtgcctcctcctcggcctctggcctaccctcctggtcaagatcggcgcgatctgctccctaacatggg 48565991  T
Q  134 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgac 167  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  48565990 tcatggcctgcaaccactgctgagggctcatgac 48565957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 41615510 - 41615394
Alignment:
Q  49 tcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaacc 148  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  41615510 tcctgctgatgttgttggtgcctcctcctcggcctctggcctcacctcctggtcaagatcggcgcaatctgctccctaagatggctcatggcctgaaacc 41615411  T
Q  149 actgttgagggctcatg 165  Q
    |||||||||||||||||    
T  41615410 actgttgagggctcatg 41615394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 46401957 - 46401782
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||  || ||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  46401957 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggttctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgttgag 46401858  T
Q  158 g------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |      ||||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46401857 ggatcatgctcatgacctcctcttggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 46401782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 46698122 - 46698291
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||         
T  46698122 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 46698221  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  46698222 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtatgcaatagcgccactaaccatgtcataggt 46698291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16646747 - 16646572
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16646747 tgctgatggtgcctcctcctcgacctctggcctcgcctcctggtcaaaatcggcacgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactgttgag 16646648  T
Q  158 g------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |      |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| |||| |  ||  |||||||||||||||    
T  16646647 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaattgcgcatcagtgtaggaaacaacaccataaaccatgtcataggt 16646572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 227
Target Start/End: Original strand, 17562171 - 17562319
Alignment:
Q  86 ggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg-------ctcatgacctccttctgac 178  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||| || ||||||       ||||||||||||| ||| |    
T  17562171 ggcctcgcctcctggtcaagataggcgcgatctgctccctaagatggctcatggcctgaaaccattgctgagggggtcatgctcatgacctcctcctggc 17562270  T
Q  179 ctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17562271 ctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccactaaccatgtcataggt 17562319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 224
Target Start/End: Original strand, 49266177 - 49266342
Alignment:
Q  65 ggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg------ 158  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||| | |||          
T  49266177 ggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagacaggcgcaatctgctccctaagatggctgatggcctgaaaccactgctaaggggtcat 49266276  T
Q  159 gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcata 224  Q
    ||||||||||||||  || |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  49266277 gctcatgacctcctcatggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacatcgccactaaccatgtcata 49266342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 165
Target Start/End: Original strand, 52388414 - 52388521
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  52388414 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagattggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctgaaaccactgctaag 52388513  T
Q  158 ggctcatg 165  Q
    || |||||    
T  52388514 gggtcatg 52388521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 2271857 - 2272032
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| || |||| |||||| | ||| | |||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  2271857 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctcgcctcctagtcaaaattggcgtgatctgcttcctcatatggctcatggcctcaaaccactgctgag 2271956  T
Q  158 gg------ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||      ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2271957 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcataggcaacagcgccactaatcatgtcataggt 2272032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 165
Target Start/End: Original strand, 4005215 - 4005322
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4005215 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctggccttgcctcttggtcaagatcggcacgatctgctccctcatatgggtcatggcctgaaaccactgctgag 4005314  T
Q  158 ggctcatg 165  Q
    || |||||    
T  4005315 gggtcatg 4005322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 600081 - 599944
Alignment:
Q  87 gcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgc 186  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    ||  | | |||     
T  600081 gcctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactgctgggggctcatgacctc---ttgggccaactgt 599985  T
Q  187 gcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  599984 gcatcagtgtaggcaacagcggcactaaccatgtcgtaggt 599944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 204
Target Start/End: Original strand, 47070987 - 47071140
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctg-aaaccactgttga 156  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||||| ||||||||| |||    
T  47070987 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcatcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaaccactgctga 47071086  T
Q  157 gg------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaaca 204  Q
    ||      |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | ||||||||    
T  47071087 ggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgcaggcaaca 47071140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9473528 - 9473421
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||    
T  9473528 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgacctcgcctcctagtcaagatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctgaaactactgctaag 9473429  T
Q  158 ggctcatg 165  Q
    || |||||    
T  9473428 gggtcatg 9473421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 193
Target Start/End: Original strand, 49141337 - 49141472
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||         
T  49141337 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 49141436  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcag 193  Q
     |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  49141437 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcag 49141472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 36130722 - 36130615
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| | |||||||||||| ||||    
T  36130722 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctggccttgcatcttggtcaagatcggcgcgatctgctccctcatatgcgtcatggactgaaaccactgctgag 36130623  T
Q  158 ggctcatg 165  Q
    || |||||    
T  36130622 gggtcatg 36130615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 50213974 - 50214143
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || | |||| |||| |||||||||||| | ||| |         
T  50213974 tggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctagtcaaaatcggcgcgatctgctctcttatatggctcatggcctgaaaccacagctgatgggtaa 50214073  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     ||| ||||||| || ||| |||| ||||||||||  |||||||||| || ||| | |||||||||||||    
T  50214074 tgcttatgaccttctcctggcctaactgcgcatcaacgtaggcaacaacgccacaatccatgtcataggt 50214143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 118
Target Start/End: Original strand, 42804750 - 42804825
Alignment:
Q  43 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatct 118  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  42804750 tcctggtcctactgatgctgttggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtaatgattggcgcgatct 42804825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 130
Target Start/End: Original strand, 30252898 - 30252968
Alignment:
Q  60 ctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  30252898 ctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctccaggtaatgatcggcgcgatctgctgcctaacat 30252968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18752036 - 18751920
Alignment:
Q  12 aaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggc 111  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || || | |||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||| |||||||    
T  18752036 aaaatctatcctaaatagaaaatattactactcttggtcttgctgatgttggtgttgcctcctcctcggcctctggccccgtttcctggtcatgatcggc 18751937  T
Q  112 gcgatctgatccctaac 128  Q
    |||||||| | ||||||    
T  18751936 gcgatctgcttcctaac 18751920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 119
Target Start/End: Original strand, 26334789 - 26334841
Alignment:
Q  67 tgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctg 119  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  26334789 tgccgcctcctcggcctctggcctcgtctcctggtcaatatcggcgcgatctg 26334841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 12374006 - 12373946
Alignment:
Q  1 accaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgct 61  Q
    |||||||| | ||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  12374006 accaagtcctaaaaatctgtccgaaacataaaatactcctactgctgatcctactcatgct 12373946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Original strand, 34819397 - 34819590
Alignment:
Q  34 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 133  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34819397 tactgctactcctggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagatcggcgcgatctgctccctaacatggg 34819496  T
Q  134 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  34819497 ttatggcctgaaaccactgctgagggctcatgacctcctcctgacctatctgcgtatcagcgtaggcaacaacggcactaaccatgtcataggt 34819590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Original strand, 40075487 - 40075680
Alignment:
Q  34 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 133  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40075487 tactgctactcctggtcctgctgatgttgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcatggtcaagatcggcgcgatctgctccctaacatggg 40075586  T
Q  134 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  40075587 tcatggcctgaaaccactgctgagggctcatgacctcctcctggcctatctgcgcattagcgtaggcaacagtagcactaaccatgtcataggt 40075680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 227
Target Start/End: Original strand, 30761068 - 30761252
Alignment:
Q  43 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 142  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  30761068 tcctggtcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggccaatatcggcgcgatctgctccctaacatggctcatggcct 30761167  T
Q  143 gaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30761168 gaaaccactgttgagggctcatgacctcctcctggcacatctgtgcatcagcgtaggcaacagcggcactaaccatgtcataggt 30761252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 5301073 - 5301267
Alignment:
Q  1 accaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactgg 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  5301073 accaagtcctaaaaatatatcctaaacataaaatactactggtcttggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctag 5301172  T
Q  101 tcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtg 195  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  5301173 tcaagatcggcgcgatctactccctaacatggatcatggcctgaaaccactgctgagggctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagtg 5301267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35554858 - 35554665
Alignment:
Q  34 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 133  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  35554858 tactgctactcctggtcctgctgatggtgctggtgcctcctcctcggcctctgtcctcgcctcctggtcaaaatcggcacgatctgctccctaacatggg 35554759  T
Q  134 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  35554758 tcatggcctgaaaccattgctgagggctcatgaactcctcctgacctatttgcgcatcagcgtaggcaacaacggcactaaccatgtcataggt 35554665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20859263 - 20859090
Alignment:
Q  54 ctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| ||||||||||||||     
T  20859263 ctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcttggtcaagatcggcgcgatttgctccctaagatggctcatggcctgaaaccactgc 20859164  T
Q  154 tgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20859163 tgagggctcatgacctcctcctggcccatctgtgcatcagtgtaggcaacaacggcactaaccatgtcataggt 20859090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 227
Target Start/End: Original strand, 12716091 - 12716257
Alignment:
Q  60 ctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg 159  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||      
T  12716091 ctgctgttgccgcctcctcggcctctggcctcgcctccta-tcaatatcggcgcgatctgctccctaacatggctcatggcttgaaaccattgttgagaa 12716189  T
Q  160 ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  12716190 ctcatgacctcctcctgacccatctgcgcatcagcataggcaatagcggcactaaccatgtcataggt 12716257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 15033570 - 15033745
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  15033570 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactactgag 15033669  T
Q  158 g------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |      |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15033670 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaattgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 15033745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1055772 - 1055603
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||         
T  1055772 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 1055673  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1055672 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 1055603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 23019098 - 23019267
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||         
T  23019098 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 23019197  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23019198 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 23019267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26662693 - 26662524
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||         
T  26662693 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 26662594  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26662593 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 26662524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 42482317 - 42482486
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| |||||         
T  42482317 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 42482416  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42482417 tgctcatgacctcctcctggcataactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 42482486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 22307 - 22476
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||         
T  22307 tggtgcctcctcctcggcctttgggctctcctccaggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 22406  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| |   |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22407 tgctcatgacctcctccccgcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 22476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 227
Target Start/End: Original strand, 486548 - 486713
Alignment:
Q  68 gcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg------ct 161  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| || |||      ||    
T  486548 gcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgtggggtcatgct 486647  T
Q  162 catgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  486648 catgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 486713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 226
Target Start/End: Original strand, 39831541 - 39831730
Alignment:
Q  43 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 142  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| | || ||||    
T  39831541 tcctggtcctgctgatgctgctgttgcatcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagataggcgcgatctgctcccaaagatggcttatggcct 39831640  T
Q  143 gaaaccactgttgagg------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcatagg 226  Q
    | |||||||| |||||      ||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  39831641 ggaaccactgctgaggggtcatgctcatggcctcctcctggcctaactgctcatcagcataggcaacaacgccactaaccatgtcatagg 39831730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 52320 - 52161
Alignment:
Q  66 gtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatg 165  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  52320 gtgccccctcctcggcatgtggcctcgcctcctggccaatatcggcgtgatctgctctttaacatggctcatggcctgaaaccattgctgagggctcatg 52221  T
Q  166 acctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcatag 225  Q
    ||||||| | | || ||||| ||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||    
T  52220 acctcctccaggcccatctgtgcatcagagtaggcaacaacgccgctaaccatgtcatag 52161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 45133037 - 45132908
Alignment:
Q  3 caagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtc 102  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||| |    
T  45133037 caagtcctaaaaatatatcctaaacataaaatactactactcatggtcttgttgatgctgctggtgccgcctcctcggcctctggcctctcctcctggcc 45132938  T
Q  103 aagatcggcgcgatctgatccctaacatgg 132  Q
    || ||||||| |||||| || || ||||||    
T  45132937 aatatcggcgtgatctgctctcttacatgg 45132908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 155
Target Start/End: Original strand, 41239359 - 41239456
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttg 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||||||    
T  41239359 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaaaatcggcacgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactgttg 41239456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 165
Target Start/End: Original strand, 34367429 - 34367536
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  34367429 tgctgatgctgcctcctcctcggcccctggcctcgcctcctggtcaaaatcagcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactgctgag 34367528  T
Q  158 ggctcatg 165  Q
    || |||||    
T  34367529 gggtcatg 34367536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 149 - 227
Target Start/End: Original strand, 41242986 - 41243064
Alignment:
Q  149 actgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41242986 actgttgagggcttatgacctcctcctggcccatctgtgcatcagggtaggcaacagcggcactaaccatgtcataggt 41243064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43214529 - 43214461
Alignment:
Q  159 gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43214529 gctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 43214461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 21176093 - 21176219
Alignment:
Q  1 accaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactgg 100  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||     ||||| |||||| || || ||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  21176093 accaagtcctaaaaatctatcctaaacagaaaatactactacgt---atcctgctgatgttgttgttgcctccaccttggcctctagcctcgcctcctgg 21176189  T
Q  101 tcaagatcggcgcgatctgatccctaacat 130  Q
    ||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  21176190 tcatgaacggcgcgatctgctccctaacat 21176219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 227
Target Start/End: Original strand, 24885416 - 24885613
Alignment:
Q  30 aaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaaca 129  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||||    
T  24885416 aaaatattactactcctggtcctgctgatgctgctggtgcctccttctcggcctctggcctcgcctcctgctcaagatcggtgcgatccgctccctaaca 24885515  T
Q  130 tgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24885516 tgggtcatggcctgaaacaactgctgagggctcatgacctcctcctgacctatctgcgcatcatcgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 24885613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 2405816 - 2406027
Alignment:
Q  12 aaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  2405816 aaaatctatcctaaacataaaatactactggtcctggtcctgctgatgttgctggtgcctcctcctcggcctctagcctcgcctcctggtcaagatcggc 2405915  T
Q  112 gcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacac 211  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||  || || ||||||| |||    
T  2405916 gcgatctgctccgtaacatgggtcatggcctgaaaccactactgagggctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcaacgttgg-aacagcggcac 2406014  T
Q  212 taaccatgtcata 224  Q
    |||||||||||||    
T  2406015 taaccatgtcata 2406027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2407521 - 2407336
Alignment:
Q  1 accaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactgg 100  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||      ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  2407521 accaagtcctaaaaatctatcctaaacataaaatactactggtcctg------ctgatgctgctagtgcctcctcctcggactctggcctcgcctcctgg 2407428  T
Q  101 tcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatca 192  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  2407427 tcaagatcgacgcgatctgctctctaacatgggtcatggtctgaaaccaccggtgagggctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatca 2407336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26173187 - 26172994
Alignment:
Q  33 atactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgg 132  Q
    ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  26173187 atactactggtcctggtcctattgatgctgctggtgccttctcctcggcctctagcctcgcctcatgatcaagatcggcgcgatctgctcc-taagatgg 26173089  T
Q  133 gtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26173088 ctcatggcctaaaaccactgctgagggctcatgaccttctcctggccaatctgtgcatcagcgtaggcaacaacggcactaaccatgtcataggt 26172994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22304482 - 22304307
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  22304482 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 22304383  T
Q  158 g------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |      |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22304382 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 22304307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6204395 - 6204226
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||         
T  6204395 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 6204296  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6204295 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 6204226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11691362 - 11691193
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||         
T  11691362 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 11691263  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11691262 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 11691193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 30826429 - 30826598
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||         
T  30826429 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 30826528  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30826529 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 30826598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 227
Target Start/End: Original strand, 18001601 - 18001785
Alignment:
Q  43 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcct 142  Q
    ||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| || ||||||||||| || ||||||||| |||| ||||    
T  18001601 tcctggtcctgctgatgttgttggtgcctcctcctcggcctctaacctcgcctcctggccaatattggcgcgatctgctctctaacatggctcatggcct 18001700  T
Q  143 gaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||| |||||||||| || |  ||||||||||||||||    
T  18001701 gaaaccattgatgagggctcatgacctcttcctggcccatctgtgcatcagcgtaggcaacatcgccgttaaccatgtcataggt 18001785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27639000 - 27638825
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  27639000 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 27638901  T
Q  158 g------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |      |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  27638900 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccactgaccatgtcataggt 27638825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31771308 - 31771144
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  31771308 tgctgatgttgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaaaatcggcgtgatctgctccctaatatggctcatggcctgaaaccactgctgag 31771209  T
Q  158 ggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    || |||||     || ||| |||| ||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  31771208 gggtcatg-----ctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccacaaaccatgtcataggt 31771144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3384667 - 3384505
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctca 163  Q
    |||| |||| |||| ||||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  3384667 tggtacctcatcctaggcctctggcctcgcctctaagtcaagatcggggcgatttgctccctaacatggctcatggcctgaaaccactactgagggctca 3384568  T
Q  164 tgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  3384567 tgacctcctcctgacctatttgtgcatcagcg-aggcaacaacaacactaaccatgtcataggt 3384505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3502237 - 3502051
Alignment:
Q  55 tgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaa-------- 146  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||            
T  3502237 tgatgttgttggtgcttcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagataggcgtgatctgctccctaagatggctcatggcctgaaaccacgaaa 3502138  T
Q  147 ccactgttgagg------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||||| |||||      |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3502137 ccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctagcctaactgcgcatcagtgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 3502051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 130
Target Start/End: Original strand, 32641674 - 32641741
Alignment:
Q  63 ctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacat 130  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  32641674 ctggtgcctcctcctcggtctctggcctcgcctcctggtaatgatcggcgcgatctgctgcctaacat 32641741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 32643155 - 32643068
Alignment:
Q  43 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacat 130  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||  |||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  32643155 tcctggtcctgctggtgctgctggtgcctcctcctcagcctctagcctcgcctcatggtaatgatcggcgcgatctgctgcctaacat 32643068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 130
Target Start/End: Original strand, 24085617 - 24085704
Alignment:
Q  43 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacat 130  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  || | ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  24085617 tcctggtcctgctgatgttgctggtggctcctcctcggcctctggcctcgcctccaagtaatgatcggcgcaatctgctgcctaacat 24085704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 51686411 - 51686191
Alignment:
Q  1 accaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactgg 100  Q
    |||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||      |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  51686411 accaagtcctaaaaatctatcataaacataaaatactactggtcctg------ctgatgttgttggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcatgg 51686318  T
Q  101 tcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggc 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  51686317 tcaagatcggcgcgatctgctccctaacatgggtcatggcctaaaaccactgttgagggcttatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggc 51686218  T
Q  201 aacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  51686217 aacagcggcactaaccatgtcataggt 51686191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 227
Target Start/End: Original strand, 50020500 - 50020678
Alignment:
Q  49 tcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaacc 148  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||| |||| |||| ||||||||||    
T  50020500 tcctgctgatgcttctggtgcctcctcctcagcctttggcctcgcctcctggtcaagatcggcgcgatttgctccataagatggctcatggcctgaaacc 50020599  T
Q  149 actgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||  ||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50020600 actactgagggcccatgacctcctcctggcccatctgtgcatcagtgtaggcaacagcggcactaaccatgtcataggt 50020678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 50196585 - 50196407
Alignment:
Q  49 tcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaacc 148  Q
    |||| |||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  50196585 tcctgctgatgttgttgatgcctcctcctcggcctctggcctcacctcctggtcaagatcggtgcgatctgctccctaagatggctcatggcctgaaacc 50196486  T
Q  149 actgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50196485 actgttaagggctcatgacctcctcctggcccatctgtgcatcagcgtaggcaacagcggcactaaccatgtcataggt 50196407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 46439283 - 46439097
Alignment:
Q  34 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 133  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||       ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  46439283 tactgctactcctggtcctgctgatactgctggtgcctcctcctcggtct-------cgcctcctggtcaagatcgacgcgatctgctccctaacatggg 46439191  T
Q  134 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46439190 tcatggcctgaaaccactgttcagggctcatgacctcctcctgatctatatgcgcatcaacgcaggcaacaacgacactaaccatgtcataggt 46439097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8110421 - 8110228
Alignment:
Q  34 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 133  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  8110421 tactactggtcctggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcccctcctggccaatatcggcgcgatctgctccctaacatggc 8110322  T
Q  134 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| || ||||| |||||||  |||||||||||| ||| ||  |||||||||||    
T  8110321 tcatggcctgaaaccactactgagagctcatgacctcctcctggcccatctgtgcatcagcataggcaacagcggcacgaaatatgtcataggt 8110228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Original strand, 10729781 - 10729974
Alignment:
Q  34 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||  | || || |||| |||||||||||| ||||||| |||  ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| |     
T  10729781 tactactactcctgatcctactgtagttgttgttgccgcctcctcggcctctggcctcacctcttggccaatatcggcgtgatctggtccctaacatagc 10729880  T
Q  134 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  10729881 tcatggcctgaaaccattgttgagggctcatgacctccgcctggcccatctgcgcatcagcgtaggcaacaacgccgctaaccatgtcataggt 10729974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Original strand, 10943550 - 10943743
Alignment:
Q  34 tactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatggg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||  | || || |||| |||||||||||| ||||||| |||  ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| |     
T  10943550 tactactactcctgatcctactgtagttgttgttgccgcctcctcggcctctggcctcacctcttggccaatatcggcgtgatctggtccctaacatagc 10943649  T
Q  134 tcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  10943650 tcatggcctgaaaccattgttgagggctcatgacctccgcctggcccatctgcgcatcagcgtaggcaacaacgccgctaaccatgtcataggt 10943743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14317858 - 14317686
Alignment:
Q  55 tgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgtt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  14317858 tgatgctgctggtgcctcctcctcgtcctctggcctcgcctcctggccaacatcggcgcgatctgctctctaacatggctcatggcttgaaaccattgtt 14317759  T
Q  155 gagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||| |||| ||||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  14317758 gagggctcatgacctccgcctggcccatctgcgcgtcagcgtaggcaacagcaccgctaacaatgtcataggt 14317686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 21018397 - 21018572
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  21018397 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 21018496  T
Q  158 g------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |      |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21018497 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccattaaccatgtcataggt 21018572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 30723546 - 30723721
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  30723546 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 30723645  T
Q  158 g------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |      |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30723646 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 30723721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 41930813 - 41930944
Alignment:
Q  1 accaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||    
T  41930813 accaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactattactcctggtcctgctgatgctgctggtgccgcctccttgacctctggcctcgcctcctgg 41930912  T
Q  101 tcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgg 132  Q
     ||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41930913 ccaatatcagcgcgatctgctccctaacatgg 41930944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 1305945 - 1306114
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||         
T  1305945 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 1306044  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1306045 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 1306114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 6178615 - 6178784
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||         
T  6178615 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 6178714  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6178715 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 6178784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 41795844 - 41796019
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  41795844 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgttgag 41795943  T
Q  158 g------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |      ||||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41795944 gggtcatgctcatgacctcctcttggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 41796019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 49168763 - 49168588
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  49168763 tgctgatggtgcctcctcctcggcctatgggctctcctcctggtcaaaatcgacgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 49168664  T
Q  158 g------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |      |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  49168663 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgccataggt 49168588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 227
Target Start/End: Original strand, 21535045 - 21535218
Alignment:
Q  54 ctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactg-gtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactg 152  Q
    |||||| || || |||| |||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| || ||    
T  21535045 ctgatgttgttgttgccgcctcctcggcctctggccttgcct-ctgtgtcaatatcgacgcgatctgctccctaacatggctcatggcctgaaatcattg 21535143  T
Q  153 ttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     ||||||||||||||||||| || ||| || || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21535144 ctgagggctcatgacctcctcctaacccatttgtgcatcagcgtaggcaacagcggcactaaccatgtcataggt 21535218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 40355223 - 40355397
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  40355223 tgctgatggtgcctcctcctcggcctatgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgct-cctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 40355321  T
Q  158 g------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |      |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40355322 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccactaaccatgtcataggt 40355397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31424986 - 31424817
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||         
T  31424986 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgtgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 31424887  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31424886 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcacaggt 31424817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 49093668 - 49093499
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 159  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  49093668 tggtgcctcctcctcagcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 49093569  T
Q  160 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49093568 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 49093499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 50278385 - 50278271
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  50278385 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctggccccgcctcctggtcaaaatcggctcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactgtagag 50278286  T
Q  158 ggctcatgacctcct 172  Q
    |||||||||||||||    
T  50278285 ggctcatgacctcct 50278271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 72187 - 72014
Alignment:
Q  54 ctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgt 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| |||| |||| ||| |||||| ||||||  || ||||||||| |||| ||||||||||| ||     
T  72187 ctgatgctgctagtgcctcctcctcagcctctagccttgccttctggccaatatcggcacgatctactctctaacatggctcatggcctgaaaccattgc 72088  T
Q  154 tgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||||||||||||||| || |||  | ||||| |||||||  ||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  72087 tgagggctcatgacctactcctgggccatctgtgcatcagcataggcaacaacgccgctaaccatgtcataggt 72014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 50904622 - 50904435
Alignment:
Q  3 caagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtc 102  Q
    |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||      
T  50904622 caagtcctaaaaatttatcctaaaaataaaatactactagtcctggtctcggtcctgctgatggtgcctcctcctcggtctttggcgttgcctcctggct 50904523  T
Q  103 aagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcat 190  Q
    || ||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  50904522 aatatcggcgcgatatgctccctaacatggctcatggcctgataccactgctgagggcccatgacctcctcctggcccatctgtgcat 50904435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 165
Target Start/End: Original strand, 37016409 - 37016516
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| | || | |||| |||||||||||||| ||||    
T  37016409 tgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcgccttctagtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatattgctcatggcctgaaaccactgctgag 37016508  T
Q  158 ggctcatg 165  Q
    || |||||    
T  37016509 gggtcatg 37016516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 197
Target Start/End: Original strand, 44674656 - 44674795
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||   ||||         
T  44674656 tggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctagtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactaccgaggggtca 44674755  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgta 197  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||    
T  44674756 tgctcatgacctcctcctggcctaactgagcatcagtgta 44674795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 227
Target Start/End: Original strand, 11081483 - 11081619
Alignment:
Q  91 cgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctccttctgacctatctgcgcat 190  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||| |||| ||||   ||||||| || |||||||    
T  11081483 cgcctcctggtcaatatcggcgtgatcttctccctaacatgggtcatggcctgaaaccattactcaggggtcataacctttgtctgacccatatgcgcat 11081582  T
Q  191 cagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||  |||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  11081583 caacgtaggcaacatcgccactaaccatgtcacaggt 11081619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12892153 - 12892091
Alignment:
Q  57 atgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctg 119  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  12892153 atgctgctgttgccgcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaatatcggcacgatctg 12892091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 224
Target Start/End: Original strand, 55278613 - 55278761
Alignment:
Q  73 ctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctcct 172  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||| | ||| || ||||||| ||||  ||| |||| |||||| || | |||| |||| |||||      
T  55278613 ctcctcggcctccggcctcgcctcttggtcaatatcggtgtgatatgctccctaatatggtgcatggcctcaaaccattgctcagggttcatcacctc-- 55278710  T
Q  173 tctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcata 224  Q
     |||||| |||||| ||||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  55278711 -ctgacccatctgctcatcagcataggcaacaacaccactaaccatgtcata 55278761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 131
Target Start/End: Original strand, 40886456 - 40886515
Alignment:
Q  72 cctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatg 131  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  40886456 cctcctcggcctctgggctcgcctcctggtcaatatcggtgcaatctgctccctaacatg 40886515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 119
Target Start/End: Original strand, 13624332 - 13624402
Alignment:
Q  49 tcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctg 119  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||    
T  13624332 tcctgctggtgctgttggtgcctcctcctcggcatctggcctcgcctcctggtaatgatcgacgcaatctg 13624402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 172
Target Start/End: Original strand, 6637866 - 6638011
Alignment:
Q  30 aaaatactactact---cctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatcccta 126  Q
    ||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6637866 aaaatactactactggtcctggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggtctcccctcctggtcaatatcggcgcgatctgctcccta 6637965  T
Q  127 acatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatgacctcct 172  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6637966 acatggctcatggcctgaaaccactgttgagggctcatgacctcct 6638011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 7417088 - 7416959
Alignment:
Q  1 accaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  7417088 accaagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctggtcctactgatgttgttggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctga 7416989  T
Q  101 tcaagatcggcgcgatctgatccctaacat 130  Q
    | | |||||||||||| || | ||||||||    
T  7416988 taatgatcggcgcgatttgctgcctaacat 7416959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 30493772 - 30493941
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||         
T  30493772 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 30493871  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30493872 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 30493941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 39950744 - 39950565
Alignment:
Q  54 ctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgt 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||| |||||     
T  39950744 ctgatcctgctggtgcctcctcctcggcctctgggttcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaatcactgc 39950645  T
Q  154 tgagg------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    |||||      |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39950644 tgaggggtcatgctcatgacctcctcctagcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccactaaccatgtcataggt 39950565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15834502 - 15834333
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 159  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| || |||| |||| |||| ||||||        
T  15834502 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggttatggcctcaaacgactgctgaggggtca 15834403  T
Q  160 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15834402 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 15834333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 227
Target Start/End: Original strand, 36653303 - 36653476
Alignment:
Q  60 ctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| || |||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  36653303 ctgctggtgcctcctcctcggcctctagcctcgcctcctggtcaagatcagcgagatctgctcccaaagatggctcatggcctgaaaccactgctgaggg 36653402  T
Q  160 ctcatga------cctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     ||||||       |||||  || |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36653403 gtcatgatcatgttctcctcttggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 36653476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43981767 - 43981598
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 159  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  43981767 tggtgtctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 43981668  T
Q  160 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43981667 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 43981598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28471803 - 28471605
Alignment:
Q  37 tactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctac--tggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggt 134  Q
    ||||||| ||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  | ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  28471803 tactactactggtcctaatcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctcgcctccctttgtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggt 28471704  T
Q  135 catcgcctgaaaccactgttgagg------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||      |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28471703 catggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcaacgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 28471605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 5355217 - 5355048
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgaggg---- 159  Q
    ||||||||| |||||||||| | | ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| ||||||        
T  5355217 tggtgcctcatcctcggcctctaggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctcccttatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 5355118  T
Q  160 --ctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
      ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5355117 tgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggt 5355048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 43536515 - 43536684
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagg----- 158  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||         
T  43536515 tggtgcctcctcctcagcctctggactctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcataccactgctgaggggtca 43536614  T
Q  159 -gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
     ||||||||||||||  || |||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  43536615 tgctcatgacctcctcatggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccactaaccatgtcataggt 43536684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 227
Target Start/End: Original strand, 29398389 - 29398585
Alignment:
Q  37 tactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtca 136  Q
    ||||||| ||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||  ||| || ||||| | |||| |||    
T  29398389 tactactactgatcctggtcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcacctcctggtcaaaatcggcatgatatgctccctcatatggctca 29398488  T
Q  137 tcgcctgaaaccactgttgagg------gctcatgacctccttctgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggt 227  Q
    | ||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  29398489 tggcctgaaaccactgttgaggggtcatgctcatgacctcctcctagcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccgtaaaccatgtcataggt 29398585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 130
Target Start/End: Original strand, 25514813 - 25514931
Alignment:
Q  3 caagtcatgaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtc 102  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||         |||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  25514813 caagtcctaaaaatatatcctaaacataaaatactactactcctggtcctgctgatgctg---------cctcctcggcctctggcctcgcctcctggcc 25514903  T
Q  103 aagatcggcgcgatctgatccctaacat 130  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||    
T  25514904 aatatcggcgcgatctgctccataacat 25514931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 40538789 - 40538702
Alignment:
Q  43 tcctgatcctactgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacat 130  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||| | ||||||||    
T  40538789 tcctggtcctgcttatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctactggtaatgatcggtgcgatctgctgcctaacat 40538702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17423706 - 17423599
Alignment:
Q  58 tgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgag 157  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  17423706 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 17423607  T
Q  158 ggctcatg 165  Q
    || |||||    
T  17423606 gggtcatg 17423599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Original strand, 10825732 - 10825830
Alignment:
Q  67 tgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccctaacatgggtcatcgcctgaaaccactgttgagggctcatg 165  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  10825732 tgcctcctcctcggcctctggtctcgcctcctggtcaaaatcaacgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactgctgaggggtcatg 10825830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Original strand, 3938350 - 3938411
Alignment:
Q  64 tggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctgatccct 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3938350 tggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccct 3938411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12603 - 12538
Alignment:
Q  54 ctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctactggtcaagatcggcgcgatctg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| | |||||||||||||||    
T  12603 ctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctgccctcgcctcttggtaatgatcggcgcgatctg 12538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University