View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10457_low_2 (Length: 470)

Name: NF10457_low_2
Description: NF10457
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10457_low_2
NF10457_low_2
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (3-452)||(34217935-34218390)
chr7 (191-371)||(30244260-30244438)
chr7 (190-350)||(45754705-45754862)
chr7 (191-352)||(7517570-7517729)
chr7 (196-368)||(6054555-6054725)
chr7 (189-365)||(40094770-40094944)
chr7 (191-371)||(30245067-30245241)
chr7 (191-384)||(1085593-1085784)
chr7 (191-359)||(45433231-45433397)
chr7 (191-370)||(23368-23545)
chr7 (191-371)||(22567029-22567206)
chr7 (191-384)||(47129085-47129275)
chr7 (190-372)||(11845182-11845360)
chr7 (191-328)||(7554015-7554150)
chr7 (209-351)||(19122740-19122879)
chr7 (191-372)||(30032557-30032736)
chr7 (207-371)||(37533354-37533516)
chr7 (190-340)||(24838722-24838871)
chr7 (207-370)||(37533002-37533162)
chr7 (191-364)||(9901635-9901804)
chr7 (191-359)||(24177425-24177591)
chr7 (191-351)||(45434626-45434784)
chr7 (191-310)||(22566713-22566830)
chr7 (192-353)||(36939741-36939900)
chr7 (207-358)||(29157571-29157720)
chr7 (191-321)||(16569186-16569314)
chr7 (191-321)||(16596348-16596476)
chr7 (194-351)||(8128451-8128606)
chr7 (211-358)||(14681520-14681663)
chr7 (274-374)||(37167852-37167952)
chr7 (191-359)||(118301-118469)
chr7 (258-371)||(30253547-30253656)
chr7 (196-321)||(40230331-40230454)
chr7 (190-352)||(36534795-36534953)
chr7 (191-298)||(41910657-41910762)
chr7 (191-359)||(36622950-36623116)
chr7 (189-321)||(43241483-43241613)
chr7 (190-358)||(20599303-20599471)
chr7 (291-371)||(37532741-37532821)
chr7 (288-384)||(47129454-47129549)
chr7 (192-259)||(36109017-36109084)
chr7 (194-291)||(28301613-28301708)
chr7 (191-321)||(1085288-1085417)
chr7 (274-362)||(28300252-28300340)
chr7 (191-259)||(30244691-30244759)
chr7 (191-259)||(30245484-30245552)
chr7 (191-259)||(30255329-30255397)
chr7 (191-243)||(36967345-36967397)
chr7 (304-359)||(30244453-30244508)
chr7 (207-308)||(44361517-44361615)
chr7 (304-386)||(30253671-30253753)
chr7 (274-335)||(21619071-21619132)
chr7 (288-355)||(28300574-28300642)
chr7 (304-359)||(30245256-30245311)
chr7 (256-322)||(21416180-21416246)
chr7 (191-359)||(41854625-41854790)
chr7 (274-320)||(23569043-23569089)
chr7 (256-310)||(48071439-48071493)
chr7 (258-335)||(4124114-4124191)
chr7 (194-251)||(40094502-40094559)
chr7 (256-310)||(27598038-27598092)
chr7 (295-348)||(45755019-45755072)
[»] chr1 (67 HSPs)
chr1 (191-359)||(26661524-26661690)
chr1 (193-371)||(17294569-17294746)
chr1 (207-372)||(44290447-44290610)
chr1 (207-374)||(44290811-44290977)
chr1 (193-371)||(3875321-3875497)
chr1 (191-352)||(37556101-37556260)
chr1 (191-372)||(41142362-41142542)
chr1 (193-359)||(41157367-41157531)
chr1 (191-371)||(26661888-26662066)
chr1 (191-364)||(11977270-11977441)
chr1 (191-372)||(34364497-34364676)
chr1 (190-359)||(41156980-41157147)
chr1 (194-354)||(24600321-24600479)
chr1 (191-359)||(34649428-34649594)
chr1 (207-367)||(3550726-3550881)
chr1 (193-359)||(5319967-5320131)
chr1 (192-374)||(40082398-40082577)
chr1 (211-359)||(3537601-3537747)
chr1 (207-359)||(41759489-41759639)
chr1 (191-326)||(34364915-34365048)
chr1 (194-359)||(22077497-22077660)
chr1 (191-383)||(37850579-37850768)
chr1 (213-374)||(45493962-45494124)
chr1 (190-384)||(31767138-31767330)
chr1 (190-359)||(29798188-29798355)
chr1 (193-346)||(38804370-38804521)
chr1 (207-371)||(50052014-50052175)
chr1 (193-384)||(66449-66638)
chr1 (192-352)||(37555721-37555878)
chr1 (207-321)||(32594756-32594868)
chr1 (209-364)||(14318875-14319028)
chr1 (190-297)||(41184489-41184594)
chr1 (207-358)||(48588491-48588640)
chr1 (191-372)||(39066190-39066368)
chr1 (197-359)||(45084378-45084532)
chr1 (211-321)||(5528794-5528902)
chr1 (194-371)||(66079-66254)
chr1 (207-351)||(9955913-9956057)
chr1 (228-359)||(32168700-32168823)
chr1 (196-371)||(22077819-22077991)
chr1 (238-321)||(44043812-44043893)
chr1 (270-369)||(11977011-11977110)
chr1 (226-359)||(22077112-22077243)
chr1 (194-355)||(24131994-24132150)
chr1 (206-322)||(5575109-5575223)
chr1 (274-371)||(50051679-50051775)
chr1 (207-282)||(3537226-3537299)
chr1 (194-352)||(19283464-19283620)
chr1 (194-335)||(1188614-1188753)
chr1 (194-351)||(30630648-30630803)
chr1 (193-355)||(22793270-22793431)
chr1 (190-351)||(45839616-45839779)
chr1 (258-352)||(24448332-24448426)
chr1 (270-352)||(47380176-47380258)
chr1 (191-248)||(35154150-35154207)
chr1 (201-253)||(4266888-4266940)
chr1 (190-284)||(21378118-21378210)
chr1 (258-340)||(883596-883678)
chr1 (216-359)||(44091909-44092050)
chr1 (257-304)||(10554983-10555030)
chr1 (258-328)||(10351215-10351285)
chr1 (194-310)||(44685449-44685563)
chr1 (196-359)||(1187365-1187527)
chr1 (276-321)||(9956213-9956258)
chr1 (194-259)||(50469181-50469246)
chr1 (194-269)||(4878796-4878869)
chr1 (258-318)||(35154046-35154106)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (191-385)||(16454897-16455089)
chr6 (190-372)||(2377743-2377923)
chr6 (190-352)||(16107667-16107827)
chr6 (207-384)||(29518509-29518684)
chr6 (207-384)||(29518926-29519101)
chr6 (207-384)||(32741185-32741360)
chr6 (191-371)||(16454565-16454743)
chr6 (191-386)||(2578418-2578610)
chr6 (190-385)||(2843543-2843737)
chr6 (190-384)||(2579850-2580041)
chr6 (207-367)||(2378132-2378290)
chr6 (194-359)||(10073993-10074156)
chr6 (207-359)||(35210210-35210360)
chr6 (207-372)||(1846754-1846917)
chr6 (190-371)||(593697-593878)
chr6 (207-351)||(3409265-3409407)
chr6 (194-353)||(10074371-10074528)
chr6 (191-384)||(2579087-2579273)
chr6 (211-359)||(3058236-3058382)
chr6 (207-372)||(14748331-14748490)
chr6 (207-371)||(3415464-3415628)
chr6 (207-359)||(3409666-3409816)
chr6 (194-360)||(10073617-10073779)
chr6 (191-359)||(5832029-5832194)
chr6 (191-358)||(6999799-6999964)
chr6 (190-321)||(9062390-9062518)
chr6 (207-310)||(32460631-32460732)
chr6 (207-352)||(1127366-1127509)
chr6 (191-372)||(16108053-16108221)
chr6 (194-359)||(2578837-2578999)
chr6 (207-372)||(26544055-26544218)
chr6 (190-362)||(5958606-5958772)
chr6 (207-353)||(2579500-2579644)
chr6 (194-357)||(10911558-10911720)
chr6 (191-346)||(1950200-1950353)
chr6 (193-335)||(6071124-6071264)
chr6 (268-359)||(12071693-12071784)
chr6 (268-358)||(12085037-12085127)
chr6 (193-321)||(8481919-8482044)
chr6 (207-359)||(17135071-17135221)
chr6 (194-328)||(12092515-12092647)
chr6 (255-358)||(31714722-31714823)
chr6 (295-338)||(10902453-10902496)
chr6 (274-321)||(11637761-11637808)
chr6 (274-315)||(22605301-22605342)
chr6 (216-319)||(2975567-2975668)
chr6 (257-301)||(20117208-20117252)
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (191-368)||(37990632-37990807)
chr3 (190-371)||(29644892-29645071)
chr3 (191-364)||(43346788-43346959)
chr3 (191-359)||(37990979-37991145)
chr3 (190-360)||(15772843-15773011)
chr3 (191-371)||(32462890-32463069)
chr3 (191-371)||(25755384-25755562)
chr3 (191-370)||(42342081-42342258)
chr3 (194-359)||(33803254-33803417)
chr3 (194-359)||(35946515-35946678)
chr3 (191-359)||(42342390-42342556)
chr3 (193-372)||(54017805-54017982)
chr3 (190-359)||(12114564-12114731)
chr3 (191-385)||(15773182-15773376)
chr3 (189-372)||(52634664-52634844)
chr3 (191-359)||(29644583-29644749)
chr3 (191-359)||(53117977-53118142)
chr3 (191-359)||(3135456-3135629)
chr3 (190-385)||(32589693-32589885)
chr3 (207-372)||(22304575-22304738)
chr3 (191-372)||(41359753-41359929)
chr3 (191-359)||(25739427-25739593)
chr3 (191-359)||(54018200-54018366)
chr3 (210-353)||(39934963-39935104)
chr3 (194-359)||(21832347-21832508)
chr3 (193-358)||(45395656-45395819)
chr3 (189-371)||(1634305-1634485)
chr3 (190-321)||(49336727-49336856)
chr3 (191-359)||(45901703-45901870)
chr3 (191-355)||(31190007-31190161)
chr3 (193-328)||(3135106-3135237)
chr3 (191-353)||(22303963-22304116)
chr3 (207-319)||(39389076-39389186)
chr3 (190-350)||(39914241-39914399)
chr3 (207-369)||(11661957-11662117)
chr3 (190-369)||(53577353-53577530)
chr3 (194-355)||(47964921-47965080)
chr3 (207-359)||(50612449-50612604)
chr3 (194-371)||(33175649-33175829)
chr3 (194-322)||(8327897-8328023)
chr3 (191-385)||(32462535-32462727)
chr3 (207-317)||(4823661-4823769)
chr3 (194-335)||(47964544-47964683)
chr3 (207-371)||(37726510-37726664)
chr3 (261-358)||(22303662-22303759)
chr3 (211-319)||(42584864-42584970)
chr3 (193-359)||(44160549-44160710)
chr3 (194-354)||(9240142-9240300)
chr3 (209-295)||(7767380-7767464)
chr3 (270-328)||(39336003-39336061)
chr3 (191-257)||(43346640-43346706)
chr3 (207-286)||(51886567-51886644)
chr3 (288-359)||(41359493-41359564)
chr3 (195-327)||(33362327-33362460)
chr3 (207-256)||(22304252-22304301)
chr3 (274-319)||(54017590-54017635)
chr3 (191-259)||(11661525-11661593)
chr3 (264-335)||(25317219-25317290)
chr3 (283-370)||(43978856-43978947)
chr3 (256-322)||(53596013-53596079)
chr3 (256-322)||(53596328-53596394)
chr3 (327-384)||(9239937-9239994)
chr3 (312-372)||(22304302-22304362)
chr3 (274-322)||(53596546-53596594)
chr3 (288-322)||(11661605-11661639)
chr3 (274-315)||(17731950-17731991)
chr3 (256-309)||(17735043-17735096)
chr3 (274-315)||(19033181-19033222)
chr3 (256-309)||(19036312-19036365)
chr3 (288-359)||(7766785-7766854)
chr3 (307-359)||(8328374-8328426)
chr3 (193-233)||(12747878-12747918)
chr3 (207-322)||(25991409-25991522)
chr3 (274-310)||(46546376-46546412)
chr3 (266-310)||(52635003-52635047)
[»] chr8 (78 HSPs)
chr8 (190-370)||(3038281-3038459)
chr8 (191-353)||(34834866-34835026)
chr8 (191-372)||(9309345-9309523)
chr8 (207-371)||(3669693-3669855)
chr8 (190-321)||(30359260-30359389)
chr8 (191-372)||(6876851-6877031)
chr8 (190-359)||(25561817-25561985)
chr8 (191-357)||(30359599-30359763)
chr8 (207-354)||(30441087-30441236)
chr8 (196-351)||(45122067-45122220)
chr8 (191-372)||(34835199-34835378)
chr8 (190-358)||(70277-70442)
chr8 (226-357)||(9483191-9483320)
chr8 (193-373)||(40518061-40518241)
chr8 (207-357)||(3670066-3670214)
chr8 (191-321)||(8794101-8794229)
chr8 (196-370)||(40518577-40518749)
chr8 (225-359)||(45122648-45122780)
chr8 (192-393)||(5915863-5916056)
chr8 (191-357)||(9482608-9482770)
chr8 (191-359)||(33113369-33113535)
chr8 (213-372)||(5420663-5420820)
chr8 (191-355)||(37544496-37544658)
chr8 (207-359)||(45121912-45122062)
chr8 (196-359)||(1513917-1514078)
chr8 (194-372)||(41972151-41972330)
chr8 (194-372)||(9308970-9309150)
chr8 (194-356)||(9608738-9608898)
chr8 (191-372)||(34835464-34835644)
chr8 (191-372)||(34835730-34835910)
chr8 (207-328)||(147457-147576)
chr8 (193-354)||(9507769-9507933)
chr8 (191-359)||(8918766-8918932)
chr8 (207-371)||(40579496-40579658)
chr8 (214-385)||(20870549-20870718)
chr8 (207-372)||(1014233-1014397)
chr8 (207-371)||(32640521-32640679)
chr8 (190-316)||(43274824-43274948)
chr8 (211-384)||(18371970-18372142)
chr8 (191-359)||(45122996-45123162)
chr8 (191-354)||(45121663-45121823)
chr8 (191-372)||(147819-147989)
chr8 (207-353)||(1013879-1014023)
chr8 (194-371)||(9620668-9620841)
chr8 (195-352)||(12283867-12284021)
chr8 (281-359)||(41129066-41129144)
chr8 (278-371)||(40579259-40579352)
chr8 (208-357)||(18371665-18371807)
chr8 (214-293)||(3037776-3037853)
chr8 (208-359)||(6651510-6651650)
chr8 (207-259)||(18372356-18372408)
chr8 (194-320)||(4154707-4154831)
chr8 (288-359)||(8919146-8919217)
chr8 (191-307)||(18372988-18373098)
chr8 (207-308)||(20130455-20130553)
chr8 (256-310)||(12156709-12156763)
chr8 (193-352)||(4154290-4154446)
chr8 (207-353)||(6731910-6732045)
chr8 (207-259)||(18372799-18372851)
chr8 (211-259)||(25561744-25561792)
chr8 (199-310)||(18372657-18372762)
chr8 (208-259)||(41416271-41416322)
chr8 (314-372)||(3037958-3038016)
chr8 (207-319)||(18380059-18380169)
chr8 (297-370)||(43274626-43274699)
chr8 (207-335)||(2467508-2467632)
chr8 (224-338)||(9609108-9609220)
chr8 (280-335)||(20995442-20995497)
chr8 (257-328)||(27856185-27856256)
chr8 (207-306)||(43398123-43398223)
chr8 (194-258)||(20995502-20995566)
chr8 (227-310)||(32305503-32305584)
chr8 (194-233)||(18645713-18645752)
chr8 (303-371)||(18372273-18372342)
chr8 (340-372)||(3038041-3038073)
chr8 (207-243)||(18372487-18372523)
chr8 (191-227)||(43274699-43274735)
chr8 (217-280)||(44358151-44358212)
[»] chr2 (66 HSPs)
chr2 (191-371)||(6421375-6421553)
chr2 (191-369)||(15880253-15880429)
chr2 (194-372)||(962591-962767)
chr2 (207-384)||(5542602-5542777)
chr2 (207-370)||(36178596-36178757)
chr2 (191-372)||(15511485-15511661)
chr2 (207-371)||(37105930-37106092)
chr2 (207-365)||(37106194-37106350)
chr2 (207-372)||(14745656-14745819)
chr2 (196-359)||(35580726-35580886)
chr2 (191-364)||(6712966-6713138)
chr2 (207-384)||(5542975-5543150)
chr2 (191-359)||(40733507-40733673)
chr2 (190-372)||(36005869-36006048)
chr2 (194-371)||(42514642-42514817)
chr2 (190-359)||(38796620-38796789)
chr2 (191-359)||(40733873-40734038)
chr2 (207-359)||(41283477-41283627)
chr2 (207-362)||(33731654-33731807)
chr2 (198-372)||(1769889-1770061)
chr2 (223-371)||(36178161-36178307)
chr2 (194-358)||(40679632-40679794)
chr2 (217-359)||(6422126-6422266)
chr2 (266-371)||(6421794-6421899)
chr2 (191-331)||(16542439-16542577)
chr2 (191-322)||(28254276-28254405)
chr2 (207-310)||(36178320-36178421)
chr2 (214-386)||(23346250-23346419)
chr2 (194-361)||(28531314-28531479)
chr2 (209-359)||(29676543-29676685)
chr2 (191-359)||(29676893-29677064)
chr2 (198-356)||(7598606-7598754)
chr2 (212-372)||(40163361-40163520)
chr2 (191-310)||(31468801-31468914)
chr2 (194-356)||(37632602-37632762)
chr2 (198-359)||(7598225-7598384)
chr2 (207-354)||(14745300-14745446)
chr2 (193-335)||(30313170-30313309)
chr2 (191-259)||(38796318-38796386)
chr2 (266-357)||(6421689-6421780)
chr2 (194-347)||(5367448-5367599)
chr2 (194-331)||(33561481-33561616)
chr2 (258-348)||(36784273-36784363)
chr2 (191-291)||(31899496-31899594)
chr2 (190-319)||(31259658-31259788)
chr2 (191-258)||(36785664-36785731)
chr2 (275-357)||(3672773-3672855)
chr2 (193-385)||(29873513-29873703)
chr2 (194-310)||(33953822-33953936)
chr2 (192-351)||(12529038-12529195)
chr2 (209-315)||(37895107-37895211)
chr2 (258-372)||(3673123-3673237)
chr2 (191-249)||(6421294-6421352)
chr2 (209-314)||(12910236-12910339)
chr2 (197-310)||(29874074-29874185)
chr2 (194-371)||(16590881-16591051)
chr2 (217-308)||(28254165-28254254)
chr2 (196-322)||(37894731-37894855)
chr2 (194-333)||(41678396-41678534)
chr2 (256-322)||(28226708-28226773)
chr2 (193-320)||(30323456-30323581)
chr2 (258-334)||(31385792-31385868)
chr2 (256-322)||(28226390-28226456)
chr2 (261-371)||(35580428-35580540)
chr2 (293-385)||(31899079-31899170)
chr2 (191-236)||(3673075-3673120)
[»] chr4 (88 HSPs)
chr4 (190-358)||(25483325-25483491)
chr4 (191-359)||(36572009-36572175)
chr4 (191-371)||(36608649-36608827)
chr4 (189-371)||(39792848-39793028)
chr4 (190-359)||(34646649-34646816)
chr4 (194-359)||(36629230-36629393)
chr4 (196-384)||(39404013-39404200)
chr4 (207-364)||(41370363-41370518)
chr4 (191-364)||(50002416-50002587)
chr4 (191-371)||(10245910-10246087)
chr4 (191-359)||(22183264-22183430)
chr4 (191-383)||(39404388-39404577)
chr4 (190-359)||(1731647-1731814)
chr4 (190-359)||(50459710-50459877)
chr4 (208-371)||(50630743-50630904)
chr4 (207-370)||(55933113-55933274)
chr4 (194-352)||(3244458-3244614)
chr4 (196-372)||(3340802-3340976)
chr4 (189-321)||(4955355-4955485)
chr4 (191-372)||(54936190-54936364)
chr4 (198-372)||(54017582-54017754)
chr4 (193-322)||(41707502-41707628)
chr4 (210-359)||(44621011-44621158)
chr4 (191-359)||(22027961-22028127)
chr4 (191-359)||(45489332-45489497)
chr4 (194-371)||(2740693-2740866)
chr4 (190-371)||(16889524-16889704)
chr4 (194-351)||(52884688-52884844)
chr4 (211-367)||(54343000-54343147)
chr4 (194-359)||(20825829-20825992)
chr4 (194-354)||(32941128-32941286)
chr4 (191-322)||(52884877-52885007)
chr4 (191-359)||(22028369-22028537)
chr4 (195-382)||(44620654-44620838)
chr4 (207-355)||(49302910-49303058)
chr4 (216-351)||(54108928-54109060)
chr4 (192-358)||(51768061-51768225)
chr4 (210-359)||(44620362-44620509)
chr4 (193-358)||(3700357-3700512)
chr4 (258-359)||(23817681-23817782)
chr4 (194-322)||(54741215-54741341)
chr4 (203-326)||(6975489-6975610)
chr4 (224-367)||(18932741-18932882)
chr4 (191-357)||(43174496-43174661)
chr4 (194-363)||(20826210-20826377)
chr4 (191-371)||(49076439-49076614)
chr4 (190-370)||(49076820-49076997)
chr4 (216-328)||(45496820-45496930)
chr4 (185-310)||(54017751-54017876)
chr4 (207-321)||(49880166-49880278)
chr4 (189-358)||(4390102-4390269)
chr4 (191-386)||(16888789-16888983)
chr4 (258-372)||(31691207-31691323)
chr4 (295-372)||(43174233-43174310)
chr4 (219-372)||(3271802-3271959)
chr4 (191-310)||(3341118-3341235)
chr4 (258-372)||(18879861-18879975)
chr4 (196-369)||(34004575-34004744)
chr4 (194-310)||(2741064-2741178)
chr4 (190-349)||(19504694-19504842)
chr4 (260-344)||(15841383-15841467)
chr4 (191-259)||(44620286-44620354)
chr4 (216-352)||(54108551-54108686)
chr4 (195-331)||(15841013-15841146)
chr4 (201-352)||(45489721-45489870)
chr4 (194-284)||(10246340-10246428)
chr4 (227-364)||(48111693-48111828)
chr4 (266-367)||(43827503-43827603)
chr4 (256-322)||(11197279-11197345)
chr4 (258-335)||(34544161-34544239)
chr4 (194-322)||(28034222-28034348)
chr4 (199-338)||(40067041-40067179)
chr4 (193-249)||(45050593-45050649)
chr4 (289-384)||(39698919-39699014)
chr4 (256-315)||(51681591-51681650)
chr4 (256-322)||(10396184-10396250)
chr4 (292-362)||(11348261-11348330)
chr4 (258-335)||(760244-760320)
chr4 (263-352)||(11783560-11783649)
chr4 (191-259)||(44620934-44621003)
chr4 (330-370)||(20695925-20695965)
chr4 (195-259)||(44621420-44621484)
chr4 (274-321)||(922489-922536)
chr4 (256-310)||(1868104-1868158)
chr4 (256-322)||(10396469-10396535)
chr4 (211-253)||(50788087-50788129)
chr4 (256-301)||(45484772-45484817)
chr4 (190-242)||(11706636-11706688)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (190-372)||(503-683)
scaffold0702 (207-367)||(141-294)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (191-372)||(1095-1274)
scaffold0391 (258-322)||(1730-1794)
scaffold0391 (191-252)||(3092-3153)
[»] chr5 (67 HSPs)
chr5 (191-359)||(40296317-40296483)
chr5 (191-374)||(42405585-42405764)
chr5 (190-372)||(15370088-15370268)
chr5 (190-359)||(36492219-36492386)
chr5 (191-371)||(25327925-25328103)
chr5 (207-385)||(18603096-18603272)
chr5 (191-357)||(34753029-34753193)
chr5 (191-352)||(26074602-26074761)
chr5 (190-354)||(26075168-26075331)
chr5 (207-359)||(6500457-6500606)
chr5 (194-371)||(36568559-36568732)
chr5 (207-375)||(32487400-32487565)
chr5 (207-359)||(41170640-41170790)
chr5 (194-352)||(26074155-26074311)
chr5 (207-385)||(27502012-27502188)
chr5 (207-372)||(624202-624365)
chr5 (194-371)||(1028507-1028682)
chr5 (194-359)||(41632775-41632938)
chr5 (196-359)||(35150002-35150162)
chr5 (197-383)||(3294993-3295176)
chr5 (193-359)||(3295347-3295509)
chr5 (191-371)||(299479-299658)
chr5 (190-359)||(12662654-12662821)
chr5 (194-347)||(13415774-13415925)
chr5 (191-359)||(6224186-6224352)
chr5 (203-371)||(9498645-9498810)
chr5 (191-321)||(26074821-26074950)
chr5 (207-359)||(6500829-6500978)
chr5 (227-371)||(15370428-15370570)
chr5 (191-359)||(11416979-11417143)
chr5 (190-335)||(41635217-41635360)
chr5 (207-371)||(38427554-38427715)
chr5 (207-369)||(623824-623984)
chr5 (190-359)||(35167840-35168007)
chr5 (207-328)||(36522270-36522389)
chr5 (190-371)||(300948-301119)
chr5 (193-323)||(31509615-31509744)
chr5 (191-359)||(35914839-35915005)
chr5 (207-338)||(5723814-5723943)
chr5 (213-357)||(33747783-33747925)
chr5 (289-372)||(26900006-26900089)
chr5 (207-340)||(29549276-29549407)
chr5 (215-335)||(31509745-31509864)
chr5 (193-298)||(42508604-42508707)
chr5 (207-371)||(2411013-2411175)
chr5 (194-259)||(39309677-39309742)
chr5 (194-359)||(24489208-24489369)
chr5 (194-310)||(36521947-36522061)
chr5 (238-353)||(26590918-26591031)
chr5 (203-338)||(39003543-39003676)
chr5 (256-322)||(13042592-13042658)
chr5 (256-322)||(13112590-13112656)
chr5 (190-240)||(26900089-26900139)
chr5 (191-249)||(35150737-35150795)
chr5 (191-249)||(35151028-35151086)
chr5 (201-298)||(42524717-42524811)
chr5 (275-359)||(13785634-13785718)
chr5 (290-370)||(38427306-38427386)
chr5 (194-359)||(13786003-13786166)
chr5 (261-328)||(32445943-32446010)
chr5 (260-338)||(36527118-36527196)
chr5 (256-315)||(34103607-34103666)
chr5 (288-338)||(795255-795305)
chr5 (209-259)||(6225052-6225102)
chr5 (207-283)||(26074324-26074398)
chr5 (207-259)||(7768856-7768908)
chr5 (193-233)||(36527209-36527249)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (190-352)||(5385-5546)
scaffold0734 (191-352)||(5767-5931)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (193-321)||(5349-5475)
scaffold0078 (189-354)||(4970-5133)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (190-359)||(47349-47516)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (191-319)||(17496-17624)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (191-280)||(10192-10279)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (193-233)||(39830-39870)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 405; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 34218390 - 34217935
Alignment:
Q  3 gactcaagatttgaccatgatgggagcatcagtctaacctccaccagtatgtatggttagctcggaataaaccatatgatatacactttctactccatag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34218390 gactcaagatttgaccatgatgggagcatcagtctaacctccaccagtatgtatggttagctcggaataaaccatatgatatacactttctactccatag 34218291  T
Q  103 atactaatcctcaaatcttggttacgacacattgcctacaaggtgcatcatacatacagttcttagcaagaatatttggccccatcgttgttgttgtgta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34218290 atactaatcctcaaatcttggttacgacacattgcctacaaggtgcatcatacatacagttcttagcaagaatatttggccccatcgttgttgttgtgta 34218191  T
Q  203 caaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34218190 caaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacacct--tataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggt 34218093  T
Q  303 aagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaacaatcgtggggctgcaataa 402  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34218092 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaacaatcgtggggctgcaataa 34217993  T
Q  403 agatgtttcccctgccac------atg--ataacaccatcgagacgacggtccgagtt 452  Q
    ||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34217992 agatgtttcccctgccacaccataatggcataacaccatcgagacgacggtccgagtt 34217935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 191 - 371
Target Start/End: Original strand, 30244260 - 30244438
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  30244260 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaagaccttata--agtaagaggactcataaacccattgcctt 30244357  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30244358 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccccgagctcccc 30244438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 190 - 350
Target Start/End: Original strand, 45754705 - 45754862
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| | ||    
T  45754705 ttgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtc-cacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttata--agtaagatgactcataaacccatagcct 45754801  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45754802 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 45754862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 191 - 352
Target Start/End: Original strand, 7517570 - 7517729
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  7517570 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattgcctt 7517667  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgg 352  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7517668 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctgtctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 7517729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 196 - 368
Target Start/End: Original strand, 6054555 - 6054725
Alignment:
Q  196 ttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggt 295  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  6054555 ttgtggacaagtgttagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacacattgccttaaggt 6054652  T
Q  296 tttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctc 368  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6054653 tttgggtaagagtgtggtgtctctcctacttgtatggttgttctagccttgatgtggacggtcccccgagctc 6054725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 40094944 - 40094770
Alignment:
Q  189 gttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtc 288  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  40094944 gttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttata--agtaagaggacccataaacccatcgtc 40094847  T
Q  289 ttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgag 365  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  40094846 ttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtggtcggtcccccgag 40094770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 371
Target Start/End: Original strand, 30245067 - 30245241
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||| ||||| |||    
T  30245067 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacct--tataagtaagacgacccataaactcattgcctt 30245164  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30245165 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccccgagctcccc 30245241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 191 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1085784 - 1085593
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  1085784 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttata--agtaagaggacccataaacccattgcctt 1085687  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaaca 384  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| | ||||||    
T  1085686 aaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccctcatgacccaaca 1085593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Original strand, 45433231 - 45433397
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| |||| |||    
T  45433231 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgatccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtaagagaactcataaacctattgcctt 45433328  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  45433329 aagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggtcggtcc 45433397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 191 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23545 - 23368
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| |||| |||    
T  23545 tgttgttgtgtgcaattgtgagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacctattgcctt 23448  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccc 370  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||  |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23447 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcatgtgcggttgttctagcctcgatttggacggtcccccgagctccc 23368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 191 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22567206 - 22567029
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||| |||    
T  22567206 tgttgttgtatgcaagtgtgagtaatatgtc-cacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaactcattgcctt 22567110  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22567109 aaggtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcgggcctcgatgtggatggtcccccgagctcccc 22567029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 384
Target Start/End: Original strand, 47129085 - 47129275
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |  ||    
T  47129085 tgttgttgtgcacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttata--agtaagaggacccataaacccatcgcttt 47129182  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaaca 384  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |  || ||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  47129183 aaggttttgggtaggagtgtggtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcc-ccgagctcccctcatgatccaaca 47129275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 190 - 372
Target Start/End: Original strand, 11845182 - 11845360
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||| ||    
T  11845182 ttgttgttgtgcacaa--gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaatccattgcct 11845277  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  11845278 taaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgtagacggtcccccgtgctccccc 11845360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 191 - 328
Target Start/End: Original strand, 7554015 - 7554150
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||| | |||    
T  7554015 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct--tataagtaagaggatccataaacccatagcctt 7554112  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7554113 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgt 7554150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 209 - 351
Target Start/End: Original strand, 19122740 - 19122879
Alignment:
Q  209 tgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagt 308  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19122740 tgagttatatgtc-cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggactcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagt 19122836  T
Q  309 gtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtg 351  Q
    || |||||| ||| |||||| ||||||||| || |||||||||    
T  19122837 gtggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 19122879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 191 - 372
Target Start/End: Original strand, 30032557 - 30032736
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |  |||||||| || | |||    
T  30032557 tgttgttgcgtacatgtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaagtgttgaacacct--tataagtaagagtatccataaacctatagcctt 30032654  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30032655 aaggttttgggtaagagtgtgacatctctcttgcttgtgcggttgttctatcctcgatgtggacggtcccccgagctccccc 30032736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 207 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 37533516 - 37533354
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||   |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  37533516 tgtgagttatatgttctacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggtaaga 37533419  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||| |||||||| | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  37533418 gtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 37533354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 190 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24838871 - 24838722
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgaga-ggactcataaacccattgtc 288  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| |||  ||||||||| |||||    
T  24838871 ttgttgttgtgtataagtgtaagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaaggatccataaacccgttgtc 24838774  T
Q  289 ttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaa 340  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||    
T  24838773 ttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctctcttgcttgtgtggttgttcaa 24838722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 207 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 37533162 - 37533002
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  37533162 tgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacacct--tataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa-a 37533066  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccc 370  Q
    |||| |||||||||| ||||||  | |||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  37533065 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcgcttgttctaacctcgatgtggacggtcccccgcgctccc 37533002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 191 - 364
Target Start/End: Original strand, 9901635 - 9901804
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||   || ||||||  ||||||| |||||||||    
T  9901635 tgttattgtgtataagtgtgagttatatgtc-cacatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttatac--gt-agaggatccataaactcattgtctt 9901730  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccga 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  9901731 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgcggttgttctagcctcggtgtggactgtcctccga 9901804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Original strand, 24177425 - 24177591
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||| |||    
T  24177425 tgttgttgtgtgcaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacacct--tataagtaagcggacccataaacccattgcctt 24177522  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    || ||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||   |||||||| |||||||||||    
T  24177523 aaagtttttggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgtcttagcctcgacgtggacggtcc 24177591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 191 - 351
Target Start/End: Original strand, 45434626 - 45434784
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||  | || |||    
T  45434626 tgttgttgtgtacaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacct--tataagtaagaggacccataaacttactgcctt 45434723  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtg 351  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||   ||||||| ||||||||||||    
T  45434724 aaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtggagttgttctagcctcgatgtg 45434784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 191 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22566830 - 22566713
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  22566830 tgttgttgtatgcaagtgtgagtaatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacct--tataagtaagaggacccataaacccattgcctt 22566733  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22566732 aaggttttgggtaagagtgt 22566713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36939900 - 36939741
Alignment:
Q  192 gttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctta 291  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||| ||||    
T  36939900 gttgttctgtgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttata--agtaagaggacccataaatccattgcctta 36939803  T
Q  292 aggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgga 353  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||    
T  36939802 aggttttgggtaaaagtgtggtgtttctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtgga 36939741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 358
Target Start/End: Original strand, 29157571 - 29157720
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  29157571 tgtgagttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagacgacccataaatccattgccttaaggttttgggtaaga 29157668  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtc 358  Q
    |||| |||||||||| ||| || | |||| || || || |||||||||||||    
T  29157669 gtgtggtgtctctcttgctcgtgtagttgctctagtcttgatgtggacggtc 29157720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Original strand, 16569186 - 16569314
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  16569186 tgttgttgtatgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaatacct--tataagtaagaggacccataaacccattgcctt 16569283  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctct 321  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  16569284 aaggtttttggtaagagtgcggtgtctctct 16569314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16596476 - 16596348
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  16596476 tgttgttgtatgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaatacct--tataagtaagaggacccataaacccattgcctt 16596379  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctct 321  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  16596378 aaggtttttggtaagagtgcggtgtctctct 16596348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 194 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 8128606 - 8128451
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||| || | |||| ||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||   ||||||    
T  8128606 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatat--gtaagaggacccataaacccataaccttaag 8128509  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtg 351  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||    
T  8128508 gttttggttaagagtgtggtgtcactctcgcttatgtggttgttctagcatcgatgtg 8128451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 211 - 358
Target Start/End: Original strand, 14681520 - 14681663
Alignment:
Q  211 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 310  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14681520 agttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgta--agtaagagggcccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 14681617  T
Q  311 agtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtc 358  Q
     ||||||||| |   |||  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14681618 ggtgtctctcacaagtgt--ggttgttctagccttgatgtggacggtc 14681663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 274 - 374
Target Start/End: Original strand, 37167852 - 37167952
Alignment:
Q  274 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccccc 373  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37167852 cataaatccattgacttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgcgctcccccc 37167951  T
Q  374 a 374  Q
    |    
T  37167952 a 37167952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 118469 - 118301
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||| |||||||||||   |||||| ||||||  ||||||||||||  | |    
T  118469 tgttgttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacct--aataagtaagaggatccataaacccattaccgt 118372  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtc--tctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||||||||||||||||||| | |||  ||||| |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  118371 aaggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtgtggttgttctagctttgatgtggacggtcc 118301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 258 - 371
Target Start/End: Original strand, 30253547 - 30253656
Alignment:
Q  258 tataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggt 357  Q
    ||||||| |||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  30253547 tataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggt 30253642  T
Q  358 cctccgagctcccc 371  Q
    || |||||||||||    
T  30253643 cccccgagctcccc 30253656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 196 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40230454 - 40230331
Alignment:
Q  196 ttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggt 295  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40230454 ttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttata--agtaagaggacccataaacccatagtcttaaggt 40230357  T
Q  296 tttgggtaagagtgtagtgtctctct 321  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||    
T  40230356 tttgggtaaaagtctggtgtctctct 40230331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 190 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 36534953 - 36534795
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| |  ||||    
T  36534953 ttgttgttgtgtgcaagtgtaacttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacctaaagtct 36534856  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgg 352  Q
    ||||||||||||||||||||| | |  |||||| |  || ||||||||| |||||||||||||    
T  36534855 taaggttttgggtaagagtgtggcg--tctctcacaagtgtggttgttccagcctcgatgtgg 36534795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 191 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 41910762 - 41910657
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  41910762 tgttgttgtgtgtaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaatacct--tataactgagaggacccataaacccattggctt 41910665  T
Q  291 aaggtttt 298  Q
    ||| ||||    
T  41910664 aagatttt 41910657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Original strand, 36622950 - 36623116
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||  || |||||||  |||||  |||||| |||||| |||    
T  36622950 tgttattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaaca--ttttataagtaggaggatccataaatccattgcctt 36623047  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||||| |||| | ||| ||||||  ||||| || ||||||   ||| ||||||||||||||    
T  36623048 aaggttttgggtaggagtatggtgcctctcttacttgtgtgattgttctgaccttgatgtggacggtcc 36623116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Original strand, 43241483 - 43241613
Alignment:
Q  189 gttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtc 288  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||||||  |||| |    
T  43241483 gttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacacct--tataagtaaaaggactcataaacttattgac 43241580  T
Q  289 ttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctct 321  Q
    |||||||||| ||||| ||| |  |||||||||    
T  43241581 ttaaggttttaggtaaaagtatgatgtctctct 43241613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 358
Target Start/End: Original strand, 20599303 - 20599471
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | | |||||  | ||||| | |||||||  |||||| ||||| ||    
T  20599303 ttgttgttgtctataagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaaaagtaaaggataaacac--tttataaataagaggacatataaactcattgcct 20599400  T
Q  290 taaggttttgggta--agagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtc 358  Q
    ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||    
T  20599401 taacgttttgggtaagagagtgtggtgtctctcttgcttgtatggttgttttaaccttgatgtgaacggtc 20599471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 291 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 37532821 - 37532741
Alignment:
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37532821 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctagcttgtgctgttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgcgctcccc 37532741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 288 - 384
Target Start/End: Original strand, 47129454 - 47129549
Alignment:
Q  288 cttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaaca 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||    
T  47129454 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtggacggtcc-ccgagctcccctcatgacccaaca 47129549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 36109084 - 36109017
Alignment:
Q  192 gttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttata 259  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36109084 gttgttgtgtgcaagtgtgagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttata 36109017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 28301708 - 28301613
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctta 291  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28301708 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacacct--tataagtaagaggacccataaacccattgcctta 28301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 1085417 - 1085288
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttat-atgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| || |||  ||| |||| || ||||||| ||||| ||    
T  1085417 tgttgttgtgtgcaagtgtgagtttttatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacaactcata--agtaagagaacccataaactcattgcct 1085320  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctct 321  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1085319 taaggttttgggtaagagtgtggtgtttctct 1085288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28300340 - 28300252
Alignment:
Q  274 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctcc 362  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28300340 cataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttcgggcctcgatgtggacggtcctcc 28300252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 259
Target Start/End: Original strand, 30244691 - 30244759
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttata 259  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30244691 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttata 30244759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 259
Target Start/End: Original strand, 30245484 - 30245552
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttata 259  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30245484 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttata 30245552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 259
Target Start/End: Original strand, 30255329 - 30255397
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttata 259  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30255329 tgttgttgtgtgcaagtgtgcgttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttata 30255397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 36967397 - 36967345
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaa 243  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36967397 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaa 36967345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 359
Target Start/End: Original strand, 30244453 - 30244508
Alignment:
Q  304 agagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30244453 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 30244508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 44361615 - 44361517
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||| ||  |||||||||||   |||| |||||| |||||||    
T  44361615 tgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt---taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaaga 44361519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 386
Target Start/End: Original strand, 30253671 - 30253753
Alignment:
Q  304 agagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaacaat 386  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||| | ||||||||    
T  30253671 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggactgtcccccaggctcccctcatgacccaacaat 30253753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21619132 - 21619071
Alignment:
Q  274 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||||||||||    
T  21619132 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaaaagtgtggtgtatctttcacttgtatggttg 21619071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 28300642 - 28300574
Alignment:
Q  288 cttaaggttttggg-taagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacg 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28300642 cttaaggttttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtggacg 28300574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 359
Target Start/End: Original strand, 30245256 - 30245311
Alignment:
Q  304 agagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30245256 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcaatgtggacggtcc 30245311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21416246 - 21416180
Alignment:
Q  256 tatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctc 322  Q
    |||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21416246 tatataagagaggagacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctctc 21416180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Original strand, 41854625 - 41854790
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    |||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||| |||  |||||   | || |||    
T  41854625 tgtttttgtgtgcaagtatgagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacacct--tataagcaagatgacctataaatataatgcctt 41854721  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| |||  |||||  |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  41854722 aaggttttgggtaagagtgtgacgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcaatgtagacggtcc 41854790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23569089 - 23569043
Alignment:
Q  274 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctc 320  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23569089 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc 23569043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 310
Target Start/End: Original strand, 48071439 - 48071493
Alignment:
Q  256 tatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 310  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  48071439 tatataagagagggaactcataaacctattgtcttaaggttttggataagagtgt 48071493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4124191 - 4124114
Alignment:
Q  258 tataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttg 335  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||    
T  4124191 tataagtgagaggaccaataaactcattgcattaaggttttggataaaagtgtggtgtctctctcacttttttggttg 4124114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 40094559 - 40094502
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaac 251  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  40094559 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatcagataaaagagtaaaggttgaac 40094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 310
Target Start/End: Original strand, 27598038 - 27598092
Alignment:
Q  256 tatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 310  Q
    |||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27598038 tatataagagaggagacccataaacccattgtcttagggttttgcgtaagagtgt 27598092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 348
Target Start/End: Original strand, 45755019 - 45755072
Alignment:
Q  295 ttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgat 348  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  45755019 ttttgggtaaaagtgtggtgtctcccttacttgtgtggttgttcaagcctcgat 45755072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 67)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26661690 - 26661524
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  26661690 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtgagaggacccataaactcattgcctt 26661593  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26661592 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggttgttcaagcctcgatatggacggtcc 26661524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 371
Target Start/End: Original strand, 17294569 - 17294746
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17294569 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttata--agtaagaggacccataaacccattgccttaa 17294666  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgt-atggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17294667 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttatgcaggttgctctagcctcgatgtggacggtcgcccgagctcccc 17294746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 207 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 44290610 - 44290447
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44290610 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttata--agtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 44290513  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    || | |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44290512 gtatggtgtctttcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccc 44290447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 207 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 44290977 - 44290811
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaa-g 305  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  44290977 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaag 44290880  T
Q  306 agtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccccca 374  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44290879 agtgtggtgtatctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccccca 44290811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 193 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 3875497 - 3875321
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    ||||||||| |||  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  3875497 ttgttgtgtgcaagagtcagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttata--agtaagaggactcataaacccattgccttaa 3875400  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||||| ||||||| ||| | ||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3875399 ggttttaggtaagaatgtggagtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 3875321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 352
Target Start/End: Original strand, 37556101 - 37556260
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaag-agtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| | ||    
T  37556101 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaaatagtaaaggttgaacatcttata--agtaagaggac-cataaacccatagcct 37556197  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgg 352  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37556198 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37556260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 372
Target Start/End: Original strand, 41142362 - 41142542
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||| |||    
T  41142362 tgttgttctgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacacct--tataagtaaaaggacccataaacccattgcctt 41142459  T
Q  291 aaggttttgggt-aagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    |||||||| ||| |||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41142460 aaggtttttggtaaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagttccccc 41142542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 193 - 359
Target Start/End: Original strand, 41157367 - 41157531
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  41157367 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattgccttta 41157464  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41157465 ggttttgagtaagagtgtggtgtctgtcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcc 41157531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 191 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26662066 - 26661888
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| |||| |||    
T  26662066 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatatcccatatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtgagaagacccataaaccgattgcctt 26661969  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||||  || ||||||||    
T  26661968 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaatccttgatgcggatggtctccctagctcccc 26661888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 364
Target Start/End: Original strand, 11977270 - 11977441
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| | || |||    
T  11977270 tgttgctgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttata--agtaagagcactcataaacctaatgcctt 11977367  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccga 364  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11977368 aaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcaagtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccga 11977441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 372
Target Start/End: Original strand, 34364497 - 34364676
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||  | ||||||||| | |||    
T  34364497 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct--tataagtaagaggatccgtaaacccatagcctt 34364594  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||| | | ||||||||||    
T  34364595 aaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggatggttccctgagctccccc 34364676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 190 - 359
Target Start/End: Original strand, 41156980 - 41157147
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| |||||  |    
T  41156980 ttgttgttgtgtgcaagtgtgaattatatgtcccataacggataaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaactcattgctt 41157077  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41157078 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcc 41157147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 194 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 24600479 - 24600321
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||  |||||  ||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24600479 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattata--agtaagagaactcataaactcattgtcttaag 24600382  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggac 354  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24600381 gttttgtgtaagagtgtggtgtctctctcgctagtatggttgttctagcctcgatgtggac 24600321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Original strand, 34649428 - 34649594
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  || || |||||||| | || |||    
T  34649428 tgttgttgtatacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacct--tataagtgcaagaacccataaacctaatgcctt 34649525  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34649526 aaggttttgggtaagagtgaggcgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 34649594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 207 - 367
Target Start/End: Original strand, 3550726 - 3550881
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3550726 tgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggactcataaacccattgccttaaagttttgggtaaga 3550823  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagct 367  Q
    |||| |||||||||| ||   || |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3550824 gtgtggtgtctctcttgc---tacggttgttctagcctcgatgtggacggttttccgagct 3550881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 193 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5320131 - 5319967
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||  ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| | |||||    
T  5320131 ttgttgtatgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttata--agtgagaggacccataaactcatagccttaa 5320034  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  5320033 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcc 5319967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 374
Target Start/End: Original strand, 40082398 - 40082577
Alignment:
Q  192 gttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctta 291  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||  ||||| ||||    
T  40082398 gttgttgtgcgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagagga-tcataaattcattgcctta 40082494  T
Q  292 aggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccccca 374  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  40082495 aggttttgggtaagagtgtggtatctctcttgcttgtgcgtttgttctagcctcgatgtggatagtcctccgagctcccccca 40082577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 211 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3537747 - 3537601
Alignment:
Q  211 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3537747 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatg--agtaagaggacctataaacccattggcttaaggttttgggtaagagtgt 3537650  T
Q  311 agtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
     | |||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3537649 ggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3537601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 41759489 - 41759639
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  41759489 tgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttata--agtaagatgatccataaatccattgccttaaggttttgggtaaga 41759586  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41759587 gtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagccttgatgtggacggtcc 41759639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 326
Target Start/End: Original strand, 34364915 - 34365048
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| | |||    
T  34364915 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaataataaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccatagcctt 34365012  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgctt 326  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34365013 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgctt 34365048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22077660 - 22077497
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | | | ||||||    
T  22077660 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaactcgtagccttaag 22077563  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22077562 gttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgttcaagcatcgatatggacggtcc 22077497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 191 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 37850768 - 37850579
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||  ||| |||| || |||||||| | ||| ||    
T  37850768 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttata--agtaagagaacccataaacctaatgtttt 37850671  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaac 383  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  37850670 aaggtttcggataagagtgtggtgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtcc-cctagctcccctcatgatccaac 37850579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 213 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 45494124 - 45493962
Alignment:
Q  213 ttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatata--agtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||| ||| ||  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  45494124 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatatatataagtaagatgatccataaacccattgccttaaagttttggataagagtgt 45494025  T
Q  311 agtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccccca 374  Q
     ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  45494024 ggtgtctctcttccttatgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc-cccagctcccccca 45493962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 190 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31767330 - 31767138
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||| |||| | || ||    
T  31767330 ttgttgttgtgtgcaagtgtgggttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccattaacctaatgcct 31767233  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaaca 384  Q
    |||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||| | ||||||    
T  31767232 taaggttttgggtaagagtgtgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctagactcgatgtggacggtcccccaagcttccctcatgacccaaca 31767138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 190 - 359
Target Start/End: Original strand, 29798188 - 29798355
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  29798188 ttgttgttgtatgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggactcataaacccattgcct 29798285  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  || ||||||||| | ||||||| | ||||||||    
T  29798286 taaggtcttggataagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctaacctcgatatagacggtcc 29798355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 193 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 38804521 - 38804370
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||  |||||||||||   |||||    
T  38804521 ttgttgtttacaagtgtgagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattata--agtaagaggatccataaacccataaccttaa 38804424  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||    
T  38804423 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 38804370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 207 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 50052175 - 50052014
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  50052175 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttata--agtaagaggacccataaacctattttcttaaagttttgggtaaga 50052078  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||| |||||||||| | || | | ||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  50052077 gtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctaacctcgatgtggacagtcccccgagctcccc 50052014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 193 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 66638 - 66449
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||  || |||||||| || |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||  |||||||  || | |||||    
T  66638 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggatccataaacatatggccttaa 66541  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaaca 384  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||| | ||||||    
T  66540 ggttttgggtaagagtatagcgtctctctcgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggttatccaagctcccctcatgacccaaca 66449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 352
Target Start/End: Original strand, 37555721 - 37555878
Alignment:
Q  192 gttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctta 291  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| || |||||| || |||||  ||| ||||||| | |||| || | | ||||    
T  37555721 gttgttgtgtaaaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtgaaggttgaatacattata--agtaagaggac-cttaaatccttagcctta 37555817  T
Q  292 aggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgg 352  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37555818 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37555878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 207 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 32594868 - 32594756
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32594868 tgtgagttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtaaga 32594771  T
Q  307 gtgtagtgtctctct 321  Q
    |||| ||||||||||    
T  32594770 gtgtggtgtctctct 32594756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 209 - 364
Target Start/End: Original strand, 14318875 - 14319028
Alignment:
Q  209 tgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagt 308  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  14318875 tgagttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaagacccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagt 14318972  T
Q  309 gtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccga 364  Q
    || ||||||||||   ||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  14318973 gtggtgtctctcttatttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccga 14319028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41184594 - 41184489
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  41184594 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacac--tttataagtaagaggacccataaacccattgcct 41184497  T
Q  290 taaggttt 297  Q
    ||||||||    
T  41184496 taaggttt 41184489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 207 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 48588640 - 48588491
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  48588640 tgtgagttctatgtccgacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaagacccgtaaattcattgccttaaggttttgggtaaga 48588543  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtc 358  Q
    |||  ||||||||||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  48588542 gtgcggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 48588491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 191 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 39066368 - 39066190
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |  ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  | | ||| ||| ||||||  |||||||||    
T  39066368 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatattccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttata--actaagatgacccataaaatcattgtctt 39066271  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || | |||||||    
T  39066270 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttacttatgtggttgttctagccttgatgt-gacggtcccccaaactccccc 39066190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 197 - 359
Target Start/End: Original strand, 45084378 - 45084532
Alignment:
Q  197 tgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggtt 296  Q
    ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||       |||||||||||    
T  45084378 tgtgtgcaagtgtgagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataac------gtcttaaggtt 45084469  T
Q  297 ttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||| |||||||||    
T  45084470 ttgggtaagagagtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgcggacggtcc 45084532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 211 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5528902 - 5528794
Alignment:
Q  211 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  5528902 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatct--tataaataagaggactcataaactcattttcttaaggttttgggtaaatgtgt 5528805  T
Q  311 agtgtctctct 321  Q
     | ||||||||    
T  5528804 ggcgtctctct 5528794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 194 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 66254 - 66079
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttat-atgtctcacatcggataaaagagtaaatgtt-gaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctta 291  Q
    |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| || | ||||    
T  66254 tgttgtgtgcaagtgtgagtaatcatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggtttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacctatggcctta 66157  T
Q  292 aggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    ||||||||||||||||||| | |   ||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||  ||| |||||||||||    
T  66156 aggttttgggtaagagtgtggcg--cctctcacttgtatggttgttctggcctcgatgtagacaatcccccgagctcccc 66079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 351
Target Start/End: Original strand, 9955913 - 9956057
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaaga-gtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcat-aaacccattgtcttaaggttttgggtaa 304  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9955913 tgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattata--agtaagaggacccattaaaccaattgccttaaggttttgggtaa 9956010  T
Q  305 gagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtg 351  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||    
T  9956011 gagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtg 9956057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32168823 - 32168700
Alignment:
Q  228 cggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttg 327  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||        ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  32168823 cggataaaatagtaaaggttgaacacctta--------agaggacccataaacccattgccttgaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttg 32168732  T
Q  328 tatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  32168731 tgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcc 32168700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22077991 - 22077819
Alignment:
Q  196 ttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggt 295  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| | | |||||||| || | |||| |||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||| ||| | || |||||    
T  22077991 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgttttaaatcggatagaaaaataaaggttgaacatcttata--agtaagaggacccataaactcatagcct-aaggt 22077895  T
Q  296 tttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    || |||||||||||| | |||||| || ||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  22077894 ttggggtaagagtgtggcgtctctttcacttatgcggttgttcaagcatcgatgtggacggtcctccaggctcccc 22077819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 44043893 - 44043812
Alignment:
Q  238 agtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  44043893 agtaaatgttgaacaccttata--agtaagatgacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctct 44043812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 270 - 369
Target Start/End: Original strand, 11977011 - 11977110
Alignment:
Q  270 gactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcc 369  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11977011 gactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcc 11977110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 226 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22077243 - 22077112
Alignment:
Q  226 atcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgct 325  Q
    |||||||| || |||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||   ||||| ||| ||    
T  22077243 atcggatagaaaagtaaaggttgaataccttata--agtaagaggacccataaactcattgccctaaggttttggataagagtgtgacgtctccctcact 22077146  T
Q  326 tgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077145 tatgcggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 22077112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24132150 - 24131994
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||| | ||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |  | || |||  ||||||| ||||| ||||||    
T  24132150 tgttgtatgcaactgtgagttatatgtccctcatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaa--taaggggatccataaactcattgccttaag 24132053  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacg 355  Q
    |||| ||||||| |||  ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24132052 gttt-gggtaagtgtg--gtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtagacg 24131994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 206 - 322
Target Start/End: Original strand, 5575109 - 5575223
Alignment:
Q  206 atgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaag 305  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||  ||||| |||| |  |||||||||||| ||||    
T  5575109 atgtgaattatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacacct--tataagtaagaggacctataaatccatagctttaaggttttggataag 5575206  T
Q  306 agtgtagtgtctctctc 322  Q
    ||||| | |||||||||    
T  5575207 agtgtggcgtctctctc 5575223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 50051775 - 50051679
Alignment:
Q  274 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | || | | ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  50051775 cataaacccattatcttaaggttttgcgtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctagcatcgatgtggacggtccccctagctcccc 50051679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3537299 - 3537226
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaaccc 282  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  3537299 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct--tataagtaagaggacccataaaccc 3537226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 19283620 - 19283464
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| || |||  | ||||| ||| || || |  ||||||||| ||||||| ||| | ||||||    
T  19283620 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggatagaaaagtggaggttgagcactttgtaaa--tgagaggacacataaactcatcgccttaag 19283523  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgg 352  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||  ||||| || ||||| |||||||    
T  19283522 gttttggataagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctggatgtgg 19283464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1188753 - 1188614
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||  || |||||||| || |||  | |||||| |  || ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||    
T  1188753 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtggaggttgaata--ttttataagtgagaagactcataaactcattgctttaag 1188656  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttg 335  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| | ||||||    
T  1188655 gttttgggtaaaagtgtggcgtctctctcacttatgtggttg 1188614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30630803 - 30630648
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||  |||| |||||  ||| |||| || ||||||| ||||| |||||     
T  30630803 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaaaattaaaggtttgacactttata--agtaagagaacccataaacacattgccttaaa 30630706  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtg 351  Q
    ||||||||||||||||  | ||| || || ||| | |||||||||  |||||||||||    
T  30630705 gttttgggtaagagtggggcgtccctatcacttatgtggttgttctggcctcgatgtg 30630648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 355
Target Start/End: Original strand, 22793270 - 22793431
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaaccca-ttgtctta 291  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||| || |||| | |||||| ||  | ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||    
T  22793270 ttgttgtgagcaagtgtgagttatatgtcccacatcgtatagaaaagtagaggttgaaaac--tttataagtgagaggatccataaacccatttgcctta 22793367  T
Q  292 aggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacg 355  Q
     ||||||| ||||||||||   ||||||||  ||||| |||||||||  ||||| || ||||||    
T  22793368 cggttttgagtaagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttgttctggcctcaatatggacg 22793431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 351
Target Start/End: Original strand, 45839616 - 45839779
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgtt-----gaacaccttatataagtgagaggactcataaacccat 284  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| || | |||| |||     ||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||   |     
T  45839616 ttgttgttgtgtacaagtatgagttatatgtcccacatcggatagaa-aataaaggttgaatcgaacacct--tataagtaagaagacccataaatgtaa 45839712  T
Q  285 tgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtg 351  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  | ||||||  |||||||||||    
T  45839713 tgccttaaggttttgggtaagattgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctggcctcgatgtg 45839779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 352
Target Start/End: Original strand, 24448332 - 24448426
Alignment:
Q  258 tataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgg 352  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| | || |||||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||    
T  24448332 tataagtgagagggctcataaactcattgtcttaagattttggataaaagtgtggcgtgtctctcacttatgaggttgttcaggcctagatgtgg 24448426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 270 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 47380258 - 47380176
Alignment:
Q  270 gactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgg 352  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  47380258 gactcataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtgacatctctctcacttgtctggttgctcaagcctagatgtgg 47380176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 35154207 - 35154150
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttg 248  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  35154207 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttg 35154150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4266940 - 4266888
Alignment:
Q  201 tacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacac 253  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4266940 tacaaatgtgagttatatgtcctacattagataaaagagtaaatgttgaacac 4266888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21378210 - 21378118
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccat 284  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||| | ||  ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21378210 ttgttgttgtgtgcaagtgtcagttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatct--tataagtaagaggacccataaacccat 21378118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 883678 - 883596
Alignment:
Q  258 tataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaa 340  Q
    ||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||| |||| || |||||    
T  883678 tataagtgagaggactcattaacttaatgtcttaaggttttaggttaaagtgtagtgtctttctcacttatatgattattcaa 883596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 359
Target Start/End: Original strand, 44091909 - 44092050
Alignment:
Q  216 tatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgt 315  Q
    |||||| |||||| |||  || |||||| ||||||||| |||||  |||||||| || |||||| | | | | ||||| || ||||||||||||| | ||    
T  44091909 tatgtcacacatcagatgtaaaagtaaaggttgaacactttata--agtgagagaacccataaatctaatattttaagattgtgggtaagagtgtggcgt 44092006  T
Q  316 ctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    || |||| ||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  44092007 ctttctcacttgttttgttgttctggcctcgatgtagacggtcc 44092050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 304
Target Start/End: Original strand, 10554983 - 10555030
Alignment:
Q  257 atataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaa 304  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  10554983 atataaatgagagcactcataaactcattgtcttaaggtttagggtaa 10555030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 328
Target Start/End: Original strand, 10351215 - 10351285
Alignment:
Q  258 tataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgt 328  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  10351215 tataagtgagagaacccataaacacattactttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgt 10351285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 310
Target Start/End: Original strand, 44685449 - 44685563
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatg-ttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||| || |||||| | ||||| ||||  ||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||    
T  44685449 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggtttgaaaacct--tataagtaagaggaccaataaactcattgccttaa 44685546  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgt 310  Q
     | ||||||||| |||||    
T  44685547 tg-tttgggtaacagtgt 44685563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1187527 - 1187365
Alignment:
Q  196 ttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggt 295  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  | ||| ||||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||| |    
T  1187527 ttgtgtgcaagtgtgaattatatgtctcacatcgaatataaaagtggaggttaaaca--ttttataagtgagaagacccataaactcattaccttaagat 1187430  T
Q  296 tttgggtaagagtgtagtgtctctctcgc-ttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||| |||| |||||   ||||||||| | || ||| |||||||   ||| ||||||||||||||    
T  1187429 tttgagtaaaagtgtgacgtctctctcactttttatagttgttctgacctagatgtggacggtcc 1187365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9956258 - 9956213
Alignment:
Q  276 taaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctct 321  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  9956258 taaacacattgtcttaatgttttgggtaagagtgtgatgtctctct 9956213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 50469246 - 50469181
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttata 259  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||    
T  50469246 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataataaagtaaaggttgaacactttata 50469181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 269
Target Start/End: Original strand, 4878796 - 4878869
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagag 269  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||  |||||||  || ||||||||||||    
T  4878796 tgttgtgtgcaattgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtgaagcttgaaca--ttttataagtgagag 4878869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 35154106 - 35154046
Alignment:
Q  258 tataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctc 318  Q
    ||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  35154106 tataagtaagagggcccataaactgattgtcttaaggtttttggcaagagtgtggtgtctc 35154046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 191 - 385
Target Start/End: Original strand, 16454897 - 16455089
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | ||||| |||||||| |||| |||    
T  16454897 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtaataggacccataaacctattgcctt 16454994  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16454995 aaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcataatccaacaa 16455089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 190 - 372
Target Start/End: Original strand, 2377743 - 2377923
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  2377743 ttgttgttgtgcacaagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattgcct 2377840  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  2377841 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccccgagcttcccc 2377923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 190 - 352
Target Start/End: Original strand, 16107667 - 16107827
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16107667 ttgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtgtcacatcggataaaaaagtaaaggttaaacaccttata--agtaagaggactcataaacccattgcct 16107764  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgg 352  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  16107765 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgg 16107827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 207 - 384
Target Start/End: Original strand, 29518509 - 29518684
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29518509 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaaga 29518606  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaaca 384  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||    
T  29518607 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataacccaaca 29518684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 207 - 384
Target Start/End: Original strand, 29518926 - 29519101
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29518926 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaaga 29519023  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaaca 384  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||    
T  29519024 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataacccaaca 29519101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 207 - 384
Target Start/End: Original strand, 32741185 - 32741360
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  32741185 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaaga 32741282  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaaca 384  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||    
T  32741283 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataacccaaca 32741360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 191 - 371
Target Start/End: Original strand, 16454565 - 16454743
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  16454565 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattgcctt 16454662  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    ||| |||||| ||||||||| | |||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16454663 aagattttggataagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 16454743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 191 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 2578610 - 2578418
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||| | |||    
T  2578610 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccaca-cggataaaagagtaaaggttgaacactttata--agtaagaggacccataaacccatagcctt 2578514  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaacaat 386  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||| ||| | ||||||||    
T  2578513 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagcccccctcatgacccaacaat 2578418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 190 - 385
Target Start/End: Original strand, 2843543 - 2843737
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactc-ataaacccattgtc 288  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| | |||||| ||||| |    
T  2843543 ttgttgttgtgcacaattgtgagttatatgtttcacatcggataaaataataaaagttgaacaccttata--agtaagaggaccccataaactcattgcc 2843640  T
Q  289 ttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||| |||||||||    
T  2843641 ttaaggttttgggtaagagtgtggtatctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctaactcccctcatgatccaacaa 2843737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 190 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2580041 - 2579850
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||  | ||    
T  2580041 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattata--agtaagaggacccataaacccacagcct 2579944  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaaca 384  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||||    
T  2579943 taaggttttgggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggaaggtcc-ccaagctcccctcattacccaaca 2579850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 207 - 367
Target Start/End: Original strand, 2378132 - 2378290
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  2378132 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttaggtaaga 2378229  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagct 367  Q
     ||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2378230 atgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagct 2378290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 194 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10074156 - 10073993
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10074156 tgttgtgtgcaagggtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaacgttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattgccttaag 10074059  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10074058 gttttgggtaaaagtgtggtgtctctctcgcttatttggttgttctagcctcgacgtggacggtcc 10073993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 35210210 - 35210360
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  35210210 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaaaccattgccttaaggttttgggtaaga 35210307  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||| |||| ||| | ||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  35210308 gtgtggtgtttcttttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtcc 35210360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 207 - 372
Target Start/End: Original strand, 1846754 - 1846917
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| |||| || |||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  1846754 tgtgaattctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagagcacccataaatccattgccttaaggttttggataaga 1846851  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    |||| |||||||| | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1846852 gtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagcttcccc 1846917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 190 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 593878 - 593697
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||| || || ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | || ||    
T  593878 ttgttgctgagtgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacct--tataagtaagaggactcataaaccgactgcct 593781  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctc--gcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||   |||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  593780 taaggttttgggtaatagtgtggtatctctctcttacttgtacggttgttctaggctcgatgttgacggtcccccgagctcccc 593697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 207 - 351
Target Start/End: Original strand, 3409265 - 3409407
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3409265 tgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaaga 3409362  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtg 351  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  3409363 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 3409407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 194 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 10074528 - 10074371
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  10074528 tgttgtgtgcaagtgtgagttagaggtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaactcattgccttaag 10074431  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgga 353  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||    
T  10074430 gttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtgga 10074371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 191 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2579273 - 2579087
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      ||||||  |||||||||||    ||    
T  2579273 tgttgttgtgtacaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttata------agaggaaccataaacccataacttt 2579180  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaaca 384  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | ||||||    
T  2579179 aaggctttggctaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtcc-ccgagctcccctcatgacccaaca 2579087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 211 - 359
Target Start/End: Original strand, 3058236 - 3058382
Alignment:
Q  211 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||  |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3058236 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtatgaggatccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 3058333  T
Q  311 agtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
     |||||||||| ||||||| ||| |||| | ||||||||||||| ||||    
T  3058334 ggtgtctctcttgcttgtagggtggttctaacctcgatgtggaccgtcc 3058382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 207 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 14748490 - 14748331
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| | ||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  14748490 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct--tataaataagaggacccataaactcattgcgttaaggttttgggtaaga 14748393  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    |||| |    ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14748392 gtgtgg----tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctccccc 14748331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 207 - 371
Target Start/End: Original strand, 3415464 - 3415628
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3415464 tgtgagttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacacc--atataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaaga 3415561  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgt--tcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||| |||||||||| ||||||  ||||||  || |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  3415562 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctctagcctcgatgtggaaggtcccccaagctcccc 3415628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 3409666 - 3409816
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  3409666 tgtgagttatatgtaccacatcagataaaatagtaaaagttgaacatcttata--agtaagaggacccataaacccattgcctttattttttgggtaaga 3409763  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3409764 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3409816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 194 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 10073779 - 10073617
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  10073779 tgttgtgtgcaagtgttagttatatgtcccacatcggagaaaag--taaaggttgaacaccttata--agtaagaggatccataaactcattggcttaag 10073684  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcct 360  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10073683 attttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtcct 10073617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5832194 - 5832029
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||    |||    
T  5832194 tgttgttgtgcacaagtgtaagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacacct--tataagtaagaggacccataaagcca-cccctt 5832098  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5832097 aagattttgggtaaaagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtagacggtcc 5832029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 6999964 - 6999799
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  || ||||||  ||||||| || || |||    
T  6999964 tgttattgtgtataagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatat--gtaagaggatccataaactcactgcctt 6999867  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtc 358  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||| |||  | ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6999866 aaggttttggataagagtgtggcgtctctcttgctaatgtggttgttctagtctcgatgtggacggtc 6999799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9062518 - 9062390
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9062518 ttgttattgtgtataaatgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatct--tataagtaagaggactcataaactcattgtct 9062421  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctct 321  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  9062420 taa-gttttgggtaaaagtgtggtatctctct 9062390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32460732 - 32460631
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32460732 tgtgagttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 32460635  T
Q  307 gtgt 310  Q
    ||||    
T  32460634 gtgt 32460631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 352
Target Start/End: Original strand, 1127366 - 1127509
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1127366 tgtgagttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggactcataaacccattaccttaaggttttgggtaaga 1127463  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgg 352  Q
    |||| | ||||||||  ||| | |||||| || | |||||||||||    
T  1127464 gtgtggcgtctctcttacttatgtggttgctctaacctcgatgtgg 1127509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 191 - 372
Target Start/End: Original strand, 16108053 - 16108221
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  16108053 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcagataaaagagtaaatgttgaacacct--tataagtaagaggacccataaacccattgcctt 16108150  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggt-cctccgagctccccc 372  Q
    ||||            |||| |||||||||| ||||||  |||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16108151 aagg------------gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttataacctcgatgtggacggtccctccgagctccccc 16108221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 194 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 2578999 - 2578837
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||  ||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  | ||||||  ||||||| ||||  ||||||    
T  2578999 tgttgtgagcaagtgtgatttatatgtccctcatcggataaaa-agtaaatgttgaataccttataaa--taagaggatccataaactcattaccttaag 2578903  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  2578902 gttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctgacctcgatgtggacggtcc 2578837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 207 - 372
Target Start/End: Original strand, 26544055 - 26544218
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||  | |||||||||||| ||||||    
T  26544055 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttata--agtaagaggacccataaacccaccgccttaaggttttgagtaaga 26544152  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    ||||  ||||||||| ||||||  | |||||| |||||| ||||| |  |||| ||||||| ||||    
T  26544153 gtgtgatgtctctcttgcttgtgcgattgttctagcctcaatgtgaagagtcccccgagcttcccc 26544218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 190 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5958772 - 5958606
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| | |||| |||||||||| ||||||||    
T  5958772 ttgttgtggtgtgcaattgtgagttatatgtgttacatcggataaaacagtaaaggttgaacacct--tataaataagagaactcataaactcattgtct 5958675  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctcc 362  Q
    ||| ||||||||  |||||||  |||||||    ||||| || |||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  5958674 taaagttttgggatagagtgtgatgtctct----cttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacgctcctcc 5958606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 207 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2579644 - 2579500
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| || | | ||||||||  ||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  2579644 tgtgagttatatgtcccacatcggacaaaaaagtaaaggtcggataccttata--agtaagagggcccataaactcattgccttaaggttttgggtaaaa 2579547  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgga 353  Q
    || | |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  2579546 gtatggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtgga 2579500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 194 - 357
Target Start/End: Original strand, 10911558 - 10911720
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaaga-gtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10911558 tgttgtatgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggactcataaactcattgccttaa 10911655  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggt 357  Q
     ||||||  |||||||||  |||||||||  ||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10911656 agttttgaataagagtgtgatgtctctcttactaatgttgttgttcaagcctcgatgtggacggt 10911720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 191 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1950353 - 1950200
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||  |||||| | | || |||    
T  1950353 tgttgttgcgtataagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacct--tacaagtaagaggagccataaatctaatgcctt 1950256  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcg 346  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||  |||||  |||||||| |||||||    
T  1950255 aaggttttgagtaagagtgtgacgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcg 1950200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 335
Target Start/End: Original strand, 6071124 - 6071264
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||| || |||  | ||||||||| |||||  ||||||| ||  ||||||| ||||| |||||    
T  6071124 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtggaggttgaacactttata--agtgagatgatccataaactcattgccttaa 6071221  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttg 335  Q
    | |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6071222 gattttggataagagtgtggcgtctctctcgcttgtatggttg 6071264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 268 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12071784 - 12071693
Alignment:
Q  268 aggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  12071784 aggactcataaacctatgaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtcc 12071693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 268 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12085127 - 12085037
Alignment:
Q  268 aggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtc 358  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  12085127 aggactcataaaaccatggccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgcgaacggtc 12085037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 321
Target Start/End: Original strand, 8481919 - 8482044
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||| || |||  | ||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  8481919 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtc-cacatcagatataaaagtggaggttgaacactttataaa--tgagatgactcataaactcattgccttaa 8482015  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctct 321  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8482016 gattttgggtaagagtgtggtgtctctct 8482044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17135221 - 17135071
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| || ||||  ||||||  |||||| |||||||| ||||||   || ||||||| |||||    
T  17135221 tgtgagttatatgtctcacatcggatagagaagtaaatgtttaatacct--tataagcaagaggattcataaactcattgttagaaagttttggataaga 17135124  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||   | |||| ||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  17135123 gtgtgacggctctttcgcttgtgcggttgttccggccttgatgtggacggtcc 17135071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 12092647 - 12092515
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| |||  ||| |||| ||||| ||||||||||| || |||  | ||||| ||| |||||  ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  12092647 tgttgtgtgcaagggtgtgttagatgtcccacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttata--agtgagaggatccataaactcattgccttaag 12092550  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgt 328  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  12092549 gttttgagtaagactgtggtgtctctctcacttgt 12092515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 358
Target Start/End: Original strand, 31714722 - 31714823
Alignment:
Q  255 ttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggac 354  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||| | || | | |||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  31714722 ttatataa-tgagaggacccattaactcattgccttaaggttttgagtaagagtgtggcgt-tttttcgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggac 31714819  T
Q  355 ggtc 358  Q
    ||||    
T  31714820 ggtc 31714823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10902496 - 10902453
Alignment:
Q  295 ttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttc 338  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10902496 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtatggttgttc 10902453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 11637808 - 11637761
Alignment:
Q  274 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctct 321  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11637808 cataaacccattgtcttaagattttggataagagtgtggtgtctctct 11637761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22605342 - 22605301
Alignment:
Q  274 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgt 315  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22605342 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgt 22605301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 319
Target Start/End: Original strand, 2975567 - 2975668
Alignment:
Q  216 tatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgt 315  Q
    |||||| ||||||  ||| || ||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||| |||||| || ||||||||| ||||||  |||||||||  |||    
T  2975567 tatgtcccacatcaaatagaaaagtaaatgttgaacacct--tataagcaagatgacccataaatcctttgtcttaaagttttgaataagagtgtgatgt 2975664  T
Q  316 ctct 319  Q
    ||||    
T  2975665 ctct 2975668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 257 - 301
Target Start/End: Original strand, 20117208 - 20117252
Alignment:
Q  257 atataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttggg 301  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  20117208 atataagtgagagtactcataaattcaatgtcttaaggttttggg 20117252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 37990807 - 37990632
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  37990807 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttata--agtaagaggactcataaactcattgcctt 37990710  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctc 368  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37990709 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctc 37990632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 190 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29645071 - 29644892
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  29645071 ttgttgttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattgtct 29644974  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |  |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29644973 taaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccc 29644892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 191 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 43346959 - 43346788
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| |||| || ||||||| ||||| |||    
T  43346959 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagagaacccataaactcattgcctt 43346862  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccga 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  43346861 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctctatgtggacggtcctccga 43346788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 37991145 - 37990979
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| |||||||  |||||| ||| | |||    
T  37991145 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacctataaactcatcgcctt 37991048  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37991047 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37990979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 190 - 360
Target Start/End: Original strand, 15772843 - 15773011
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| |||||  |    
T  15772843 ttgttgtcgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttata--agtaagaggacccataaactcattgctt 15772940  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcct 360  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15772941 taaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacggtcct 15773011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 32463069 - 32462890
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatg-ttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  32463069 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttata--agtaagaagactcataaacccattgcct 32462972  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  32462971 taaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgtacggtcttccaagctcccc 32462890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 191 - 371
Target Start/End: Original strand, 25755384 - 25755562
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  25755384 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttata--agtaagaggactcataaatccattgtcct 25755481  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    || ||| ||||||| ||||| | |||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  25755482 aaagttgtgggtaaaagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccccgaactcccc 25755562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 191 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 42342258 - 42342081
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  42342258 tgttgttgtgtgcaagtgtgattcatatgttccacatcggataaaagagtaaatgttcaatgccttata--agtaagaggactcataaactcattgcctt 42342161  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccc 370  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42342160 aaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgaactccc 42342081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33803417 - 33803254
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||    
T  33803417 tgttgtgtgcaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacc--atataagtaagaggacccataaacccattgcattaag 33803320  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    || |||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33803319 gtattgggtaagagtgtggcgtctccctctcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 33803254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 359
Target Start/End: Original strand, 35946515 - 35946678
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  35946515 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacacct--tataagtaagaggacccataaacccgttgccttaag 35946612  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  35946613 gttttgggtaaaagtgtggtgtctctcttgcttgtgcaattgttctagcctcgatgtggacggtcc 35946678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 42342556 - 42342390
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  42342556 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttata--agtaagaggacccataaatccattgtctt 42342459  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  42342458 aaggttttgggtaagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 42342390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 193 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 54017982 - 54017805
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |  | |||||    
T  54017982 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggactcataaacctaacgccttaa 54017885  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||    
T  54017884 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcttcgatgtgggcggtccccctggctccccc 54017805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 190 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12114731 - 12114564
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12114731 ttgttgttgtgtgcaagtgtaagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattgtct 12114634  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  12114633 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagccacgatgtggtcggtcc 12114564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 385
Target Start/End: Original strand, 15773182 - 15773376
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| | ||||| |||    
T  15773182 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaaagttgaacatct--tataagtaagaggactcataagctcattgcctt 15773279  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctct--ctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaacaa 385  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||  || |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||| | |||||| ||| |||||||||    
T  15773280 aaagttttgggtaagagtgtgatgtctcttgcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacgatcctcctaactcccctcatgatccaacaa 15773376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 189 - 372
Target Start/End: Original strand, 52634664 - 52634844
Alignment:
Q  189 gttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtc 288  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |    
T  52634664 gttgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgcct--tataagtaaga-gacccataaacccattgcc 52634760  T
Q  289 ttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||   ||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  52634761 ttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagccttgatgtagactgtcccccgagctccccc 52634844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 29644749 - 29644583
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| || |||||||||||||||||    
T  29644749 tgtttttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtaagagaacccataaacccattgtctt 29644652  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |  |||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  29644651 aaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcttcgatgtggatggtcc 29644583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 53118142 - 53117977
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  53118142 tgttgttgtgggcaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtgagaggattca-aaacccattgcctt 53118046  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  53118045 aagattttgggtaagagtgtagtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcatcgatgtgaacggtcc 53117977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3135629 - 3135456
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttat---ataagtgagaggactc--ataaacccatt 285  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||   || ||| ||||||| |  |||||||||||    
T  3135629 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacctcagataaaagagtaaaagttgaacaccttattatattagtaagaggacccccataaacccatt 3135530  T
Q  286 gtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    | ||||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3135529 gccttaaggttttagataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3135456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 190 - 385
Target Start/End: Original strand, 32589693 - 32589885
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||  ||||||| | |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  32589693 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagt-atatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattgcct 32589789  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaacaa 385  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||  ||| |||||||||    
T  32589790 taaggttttgggtaagagtgcgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctaggctcgatgtggacggtccccctcgctcccttcatgatccaacaa 32589885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 207 - 372
Target Start/End: Original strand, 22304575 - 22304738
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22304575 tgtgagctatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttata--agtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaaga 22304672  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||||||| || |||||||||||| |||| || |||| ||||    
T  22304673 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacagtccccctagcttcccc 22304738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 191 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 41359929 - 41359753
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||    | ||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  41359929 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttat----cccacatcggatacaatagtaaaggttgaataccttata--agtaagaggacccataaacccattgcctt 41359836  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggt-cctccgagctccccc 372  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  41359835 aaggttttgggtaagaatgtggcgtctctctcgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccccccgagctccccc 41359753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25739593 - 25739427
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |  |||||||| ||||||| ||||||| |||||  ||    
T  25739593 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatc--atataagtaagaggacccataaactcattgcttt 25739496  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
     |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  25739495 taggttttgggtaagagtgtgacgtctctctagcttgtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcc 25739427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 54018366 - 54018200
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| |  | |||    
T  54018366 tgttgttatgtgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttata--agtaagaggacccataaacctaacgcctt 54018269  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  54018268 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcatgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcc 54018200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 210 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 39935104 - 39934963
Alignment:
Q  210 gagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtg 309  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  39935104 gagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggatccataaacccattgccttaaagttttgagtaagagtg 39935007  T
Q  310 tagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgga 353  Q
    |  ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  39935006 tgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 39934963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21832508 - 21832347
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  21832508 tgttatgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggactcataaactcatagccttaag 21832411  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21832410 gttttgggtaagagtg--gcgtctctcttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacagtcc 21832347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 193 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 45395819 - 45395656
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  45395819 ttgttgtgtgcaagtgtaagttatatatcccacatcgaataaaagagtaaaggttaaacacgttata--agtaagaggatccataaacccattgtcttaa 45395722  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtc 358  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  45395721 tgttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgctctagcctcgatgtggagggtc 45395656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 189 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1634485 - 1634305
Alignment:
Q  189 gttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggata-aaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgt 287  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  ||| ||| ||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  1634485 gttgttgctgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaaggttaaacacat--tataagtaagaggacccataaacccattgg 1634388  T
Q  288 cttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1634387 cttaaggttttgggtaagagtgcggtatctctctcac-tatatggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccc 1634305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 190 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 49336856 - 49336727
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  49336856 ttgttgttgtgtacaagtgtgagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccacct--tataagtaagaggacccataaacccatagtct 49336759  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctct 321  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  49336758 taaagttctgggtaagagtgtggtgtctctct 49336727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Original strand, 45901703 - 45901870
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatg-ttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||| | ||    
T  45901703 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagaaaaaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacgcataaactcatggcct 45901800  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||| | | ||||||||||||||||    
T  45901801 taaagtttttggtaagagtgtggtgtctctcttacttatagggttgttctaacttcgatgtggacggtcc 45901870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 355
Target Start/End: Original strand, 31190007 - 31190161
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||        |||||| | |||    
T  31190007 tgttgttgtgtgcaagtgtgagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacct--tataagttagagg--------acccatagcctt 31190096  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacg 355  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||||||    
T  31190097 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtcgggttgttctagcctcgatttggacg 31190161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 193 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3135237 - 3135106
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| | || || |||||||||| || | |||    
T  3135237 ttgttgtgtacaa--gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaatgttgaacacct--tataagtaaaagaacccataaacccactgccataa 3135142  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgt 328  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3135141 ggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 3135106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 191 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22304116 - 22303963
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||       ||||||  ||| || |||| ||||||||||||| |||    
T  22304116 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggt-------cttata--agtaagcggacccataaacccattgcctt 22304026  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgga 353  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  22304025 aaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtgga 22303963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 319
Target Start/End: Original strand, 39389076 - 39389186
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |  | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39389076 tgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaa--actaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 39389173  T
Q  307 gtgtagtgtctct 319  Q
    |||| ||||||||    
T  39389174 gtgtggtgtctct 39389186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 350
Target Start/End: Original strand, 39914241 - 39914399
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||  ||||| | ||||||| |||||||| | || ||    
T  39914241 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacacct--tataaataagaggacccataaacctaatgcct 39914338  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgt 350  Q
    |||  |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||    
T  39914339 taatattttggataagagtgtggtgtctctctcacttatgcggttgttctagcctcgatgt 39914399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 207 - 369
Target Start/End: Original strand, 11661957 - 11662117
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaagg-ttttgggtaag 305  Q
    ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  11661957 tgtgagttaaatgccccacattggataaaagagtaaaggttgaacacct--taaaagtgagaggcctcataaaccaattgccttaaggtttttgggtaag 11662054  T
Q  306 agtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcc 369  Q
    ||||  |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||    
T  11662055 agtgaggtgtctctctc-attgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacagtcccacgagctcc 11662117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 369
Target Start/End: Original strand, 53577353 - 53577530
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||  || || | || |||  |||||||  |||| ||    
T  53577353 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaacatct--taaaaataagtggatccataaacatattgcct 53577450  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcc 369  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  || ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||||    
T  53577451 taaggtcttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcggtgtggatggtcccccgaactcc 53577530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 194 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 47965080 - 47964921
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||| || |||  | ||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  47965080 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttttacatcggatagaaaagtggaggttaaaca--ttatataagtgagagggctcataagcccattgccttaag 47964983  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacg 355  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||  |||| ||||||||||    
T  47964982 attttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttatatgattgttctggcctagatgtggacg 47964921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 50612604 - 50612449
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcata-----aacccattgtcttaaggttttggg 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||     |||  ||| |||||||||||||||    
T  50612604 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacacct--tataagtaagaggactcataaatctaacatattatcttaaggttttggg 50612507  T
Q  302 taagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  50612506 taagagtgtgatgtctctcttgcttgagtggttgttccatcctcgacgtggacggtcc 50612449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 194 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 33175829 - 33175649
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataa---acccattgtctt 290  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||  ||| |||| || |||||   || ||| | |||    
T  33175829 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttata--agtaagagaacccataataaactcatagcctt 33175732  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtg---tctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||| | |||| |||||||||||    
T  33175731 aaggttttgggtaagagtgt-gtgacgtctctctcacttgtgtgattgttctagcctcggtgtgggcagtcccccgagctcccc 33175649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 194 - 322
Target Start/End: Original strand, 8327897 - 8328023
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| | ||  ||||||| |||| || |||||||  | || ||||||    
T  8327897 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatct--tataagtaagagaacccataaacgtaatgccttaag 8327994  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctc 322  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8327995 gttttgggtaagagtgtggtgtctctctc 8328023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 191 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 32462727 - 32462535
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagt-aaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||| ||  |||||||| ||||  |    
T  32462727 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaatgaaagagtaaaaggttgaacacct--tataagtaagatgatccataaacctattgctt 32462630  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaacaa 385  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||| | ||||  | |||||  ||||||||||| ||||| || || | |||||| ||| |||||||||    
T  32462629 taaggttttggataagagtgtggggtctctcttgtttgtgggattgttttagcctcgatgtagacgg-cccccaaactcccctcatgatccaacaa 32462535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 317
Target Start/End: Original strand, 4823661 - 4823769
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  4823661 tgtgagttataagtctcacatcggataaaatagtaaaagttaaacacct--tataagtaggaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaaga 4823758  T
Q  307 gtgtagtgtct 317  Q
    |||| ||||||    
T  4823759 gtgtggtgtct 4823769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 194 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 47964683 - 47964544
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||  ||  | ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  47964683 tgttgtgtgcaagtgtgagttgtatgtcccgcatcggatagaaatgtggaggttgaacgc--tatataagtgagaggacccataaacctattgccttaag 47964586  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttg 335  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||    
T  47964585 gttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttg 47964544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 371
Target Start/End: Original strand, 37726510 - 37726664
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| |||||        | |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  37726510 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaatacct--tataagtaagagg--------atccattgcctttaggttttggataaga 37726599  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    ||||   || | |||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37726600 gtgtgacgtttatcttacttgtatagttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgaactcccc 37726664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22303759 - 22303662
Alignment:
Q  261 aagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtc 358  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||  | |||||| ||||||||||| |||||||    
T  22303759 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttacttgtgcgattgttctagcctcgatgtagacggtc 22303662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 42584970 - 42584864
Alignment:
Q  211 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  42584970 agttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacacct--tataagtaagaggatccataaaccaattgtcttaagattttgagaaagagtgt 42584873  T
Q  311 agtgtctct 319  Q
     ||||||||    
T  42584872 ggtgtctct 42584864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 44160710 - 44160549
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||||||| ||| || |||||||| | |||| ||||||||||||||| |  | ||||||  |||||||||||||||||||    
T  44160710 ttgttgtatgcaagtgtcagttatatgtttcatattggataaaacaataaaggttgaacaccttataaa--taagaggatccataaacccattgtcttaa 44160613  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||||| ||||||| ||| | ||||||||  ||||   | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  44160612 ggtttt-ggtaagaatgtggcgtctctcttacttg--cgattgttctagcctcgatgtggacggtcc 44160549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 354
Target Start/End: Original strand, 9240142 - 9240300
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||| | |||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||    
T  9240142 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagagaagtaaaagctgaacacct--tataagtaagaggacccataaatccattaccttaag 9240239  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggac 354  Q
     ||| || ||||| ||| |||||||||||  | ||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  9240240 atttcggataagaatgtggtgtctctctcaatagtgcggttattctagcctcgatgtggac 9240300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7767464 - 7767380
Alignment:
Q  209 tgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggt 295  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||| |||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7767464 tgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttata--actaagaggactcataaacccattgtcttaaggt 7767380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 39336061 - 39336003
Alignment:
Q  270 gactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgt 328  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39336061 gactcataaaatcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgt 39336003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 257
Target Start/End: Original strand, 43346640 - 43346706
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacacctta 257  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43346640 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 43346706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 286
Target Start/End: Original strand, 51886567 - 51886644
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  | |||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  51886567 tgtgagttatatgtctcacatcgaataaaatagtaaaggttgaaca--tcatataagtaagaggacccataaactcattg 51886644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41359564 - 41359493
Alignment:
Q  288 cttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  41359564 cttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 41359493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 33362460 - 33362327
Alignment:
Q  195 gttgtgtacaaatgtgagttatatg---tctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctta 291  Q
    |||||||| || |||||||||||||   |||||  |||||||||| | |||| |||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||  ||||    
T  33362460 gttgtgtataagtgtgagttatatgatatctcatgtcggataaaataataaaggttgaataccttata--agtaagaggacccataaacccatttcctta 33362363  T
Q  292 aggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttg 327  Q
    || ||||||||||| |||  || ||||||| |||||    
T  33362362 agattttgggtaagtgtggcgtctctctcttgcttg 33362327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 256
Target Start/End: Original strand, 22304252 - 22304301
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacacctt 256  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  22304252 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 22304301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 54017635 - 54017590
Alignment:
Q  274 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctct 319  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54017635 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 54017590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 259
Target Start/End: Original strand, 11661525 - 11661593
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttata 259  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||| |||| ||||||    
T  11661525 tgttggtgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttata 11661593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 335
Target Start/End: Original strand, 25317219 - 25317290
Alignment:
Q  264 tgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttg 335  Q
    ||||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  25317219 tgagaggacccataaacttgttgccttaaggttttgggtaaaagtgtagtgtgtctctcacttgtgtggttg 25317290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 43978947 - 43978856
Alignment:
Q  283 attgtcttaaggttttgggtaag----agtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccc 370  Q
    |||| ||||||||||||||||||    ||||| | ||||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43978947 attgccttaaggttttgggtaagctagagtgtggcgtctctctcacttgtgtgtttgttctaacctcgatgtggactgtcccccgagctccc 43978856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 322
Target Start/End: Original strand, 53596013 - 53596079
Alignment:
Q  256 tatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctc 322  Q
    |||||||| |||  ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53596013 tatataagagaggagacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctc 53596079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 322
Target Start/End: Original strand, 53596328 - 53596394
Alignment:
Q  256 tatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctc 322  Q
    |||||||| |||  ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53596328 tatataagagaggagacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctc 53596394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 384
Target Start/End: Original strand, 9239937 - 9239994
Alignment:
Q  327 gtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaaca 384  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||    
T  9239937 gtatggtttttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctcatgatccaaca 9239994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 372
Target Start/End: Original strand, 22304302 - 22304362
Alignment:
Q  312 gtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  22304302 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagcttcccc 22304362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 322
Target Start/End: Original strand, 53596546 - 53596594
Alignment:
Q  274 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctc 322  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  53596546 cataaacccattgacttaagattttaggtaagagtgtggtgtctctctc 53596594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 322
Target Start/End: Original strand, 11661605 - 11661639
Alignment:
Q  288 cttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11661605 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctc 11661639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17731991 - 17731950
Alignment:
Q  274 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgt 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17731991 cataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 17731950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 17735096 - 17735043
Alignment:
Q  256 tatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtg 309  Q
    |||||||| ||| | || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17735096 tatataagagagggaacccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtg 17735043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19033222 - 19033181
Alignment:
Q  274 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgt 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19033222 cataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 19033181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19036365 - 19036312
Alignment:
Q  256 tatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtg 309  Q
    |||||||| ||| | || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19036365 tatataagagagggaacccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtg 19036312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7766854 - 7766785
Alignment:
Q  288 cttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  7766854 cttaaggttttaggtaagattgtggcgtctctcac--ttgtatggttgttctagcctcgatgtagatggtcc 7766785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 359
Target Start/End: Original strand, 8328374 - 8328426
Alignment:
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8328374 gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttttagcctcgatgtggacggtcc 8328426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12747918 - 12747878
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggata 233  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12747918 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 12747878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Original strand, 25991409 - 25991522
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  |||||  ||| |||||| ||||  || |||||||||||| ||  ||||||| | || ||||||||||||||| | |    
T  25991409 tgtgagtaatatgtcccacatcaaataaacaagttaatgttaaaca--ttttataagtgagagaacctataaacctaatgccttaaggttttgggttaaa 25991506  T
Q  307 gtgtagtgtctctctc 322  Q
    |||| || ||||||||    
T  25991507 gtgtggtctctctctc 25991522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 46546412 - 46546376
Alignment:
Q  274 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 310  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  46546412 cataaacccattgccttaaggttttgtgtaagagtgt 46546376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 310
Target Start/End: Original strand, 52635003 - 52635047
Alignment:
Q  266 agaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 310  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  52635003 agaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgt 52635047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 78)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 190 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 3038459 - 3038281
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||  ||| | ||||| ||||||||||||| ||    
T  3038459 ttgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttata--agtaaaaggacccataaacccattgcct 3038362  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccc 370  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038361 taaggttttgggtaagagtgtggcatctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgagctccc 3038281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 191 - 353
Target Start/End: Original strand, 34834866 - 34835026
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||| |||    
T  34834866 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttata--agtaagatgactcataaactcattgcctt 34834963  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgga 353  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  34834964 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 34835026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 372
Target Start/End: Original strand, 9309345 - 9309523
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||    
T  9309345 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacacct--tataagtaagaggacccttaaactcattgcctt 9309442  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    ||||| | |||||||||||| |||||||||||   | | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9309443 aaggtgtcgggtaagagtgtggtgtctctctc-agtatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccc 9309523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 207 - 371
Target Start/End: Original strand, 3669693 - 3669855
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3669693 tgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaaga 3669790  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  3669791 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccccctagctcccc 3669855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 190 - 321
Target Start/End: Original strand, 30359260 - 30359389
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  30359260 ttgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacacct--tataagcaagaggacccataaacccatagcct 30359357  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctct 321  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30359358 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 30359389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 191 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6877031 - 6876851
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatat-gtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  | ||| ||| |||| || ||||||||    
T  6877031 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatagtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaa--taagatgacccatacactcattgtct 6876934  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    || |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6876933 tagggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgtttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccc 6876851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 190 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25561985 - 25561817
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  25561985 ttgttgttgtctacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacacct--tataagtaagaggacccataaactcattgtct 25561888  T
Q  290 taaggtttt-gggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||    ||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  25561887 taaggttttggggtaagagtgtgacatctctcttgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggaaggtcc 25561817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 191 - 357
Target Start/End: Original strand, 30359599 - 30359763
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||   |||    
T  30359599 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaagttgaacacct--tataagtaagaggactcataaacccataacctt 30359696  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggt 357  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| |  |||||||| | | ||||||||||||||    
T  30359697 aagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttatgcggttgttctaacttcgatgtggacggt 30359763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 207 - 354
Target Start/End: Original strand, 30441087 - 30441236
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacacctta--tataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaa 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30441087 tgtgagttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagagggcccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 30441186  T
Q  305 gagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggac 354  Q
    |||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  30441187 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 30441236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 196 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 45122220 - 45122067
Alignment:
Q  196 ttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggt 295  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| |||| || ||||||| |||| |||||||||    
T  45122220 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagagaacccataaactcattttcttaaggt 45122123  T
Q  296 tttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtg 351  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||    
T  45122122 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtg 45122067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 191 - 372
Target Start/End: Original strand, 34835199 - 34835378
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||| |||    
T  34835199 tgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaactcattgcctt 34835296  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||    
T  34835297 aaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctccccc 34835378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 190 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 70442 - 70277
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||| || ||    
T  70442 ttgttgttgtgtacaaa-gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatct--tataagtaagaggacccataaacccactgcct 70346  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtc 358  Q
    ||||||||| |||||||||||   |||| ||| |||||| ||||||||| | |||| ||| ||||||||    
T  70345 taaggttttaggtaagagtgtgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctaacctcaatgcggacggtc 70277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 226 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9483320 - 9483191
Alignment:
Q  226 atcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgct 325  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  9483320 atcggataaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgct 9483223  T
Q  326 tgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggt 357  Q
     ||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  9483222 cgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 9483191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 373
Target Start/End: Original strand, 40518061 - 40518241
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaaga--gtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||  ||| |  |||| |||||||||| || |||    
T  40518061 ttgttgtgttcaagtgtgagttatatgttccacattggataaaaaaaagtaaaggttgaacaccttata--agtaaatggacccataaacccaatgcctt 40518158  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccccc 373  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  40518159 aaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccccgagctcccccc 40518241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 207 - 357
Target Start/End: Original strand, 3670066 - 3670214
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||  |||  |||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  3670066 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtttaacaccttata--agtatgaggacccataaacctatttccttaaggttttgggtaaga 3670163  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggt 357  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3670164 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 3670214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Original strand, 8794101 - 8794229
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| | | ||||    
T  8794101 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatct--tataagtaagaggactcataaacctaatatctt 8794198  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctct 321  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  8794199 aaggttttgggtgagagtgcggtgtctctct 8794229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 196 - 370
Target Start/End: Original strand, 40518577 - 40518749
Alignment:
Q  196 ttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggt 295  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| |  | ||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  40518577 ttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaa--taagaggacccataaacccaatgacttaaggt 40518674  T
Q  296 tttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccc 370  Q
    |||||||||||||||   ||| |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  40518675 tttgggtaagagtgtgacgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcctctgagctccc 40518749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 225 - 359
Target Start/End: Original strand, 45122648 - 45122780
Alignment:
Q  225 catcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgc 324  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||    
T  45122648 catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggcgtctctcttgc 45122745  T
Q  325 ttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45122746 ttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaaggtcc 45122780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 393
Target Start/End: Original strand, 5915863 - 5916056
Alignment:
Q  192 gttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctta 291  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| ||||||||  ||||| ||| ||||| |||||      ||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  5915863 gttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaaatgtaaa-gtttaacactttata------agaggacccataaactcattgcctta 5915955  T
Q  292 aggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaacaatcgtgg 391  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||||    
T  5915956 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc-ccgaactcccccaatgatccaacaatagtgg 5916054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 191 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9482770 - 9482608
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||     
T  9482770 tgttgttgtgtacaa--gtgagttatatgttccacatgggataaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattgccta 9482675  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggt 357  Q
    ||| |||||  ||||||||| || ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  9482674 aagattttgtataagagtgtggtatctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 9482608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33113535 - 33113369
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||| |||    
T  33113535 tgttgttgtgtacaagtttgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttata--agtaagaggacccataaactcattgcctt 33113438  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| || ||| ||| |||||||||    
T  33113437 aagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctaggctcaatgcggacggtcc 33113369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 213 - 372
Target Start/End: Original strand, 5420663 - 5420820
Alignment:
Q  213 ttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtag 312  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||      
T  5420663 ttatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttata--agtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttttgtaagagtgtga 5420760  T
Q  313 tgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
     ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||    
T  5420761 cgtctccctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaccgtccgcggaactccccc 5420820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 37544658 - 37544496
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||  ||  ||||||| |||||| |||||   ||    
T  37544658 tgttgttgtgcacaagtgtgagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattata--agaaagaggacccataaatccattacttt 37544561  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacg 355  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  37544560 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacg 37544496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 45122062 - 45121912
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |    
T  45122062 tgtgagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttata--agtaagaggactcataaactcattgccttaagattttgggtaaca 45121965  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||| | |||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  45121964 gtgtggcgtctcttttgctcgtgtggttattcaagcctcgatgtggaaggtcc 45121912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 196 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1514078 - 1513917
Alignment:
Q  196 ttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggt 295  Q
    |||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||   ||||||||    
T  1514078 ttgtgtacaagtatgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacct--tataagtaagaggacccttaaacccataaccttaaggt 1513981  T
Q  296 tttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||  | |||  |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1513980 tttgggtaaaagtgtggtatctctcttacatgtggggttattctagcctcgatgtggacggtcc 1513917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 194 - 372
Target Start/End: Original strand, 41972151 - 41972330
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||     
T  41972151 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacacct--tataagtgataggacccataaacccattgccataaa 41972248  T
Q  294 gtt---ttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    |||   |||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||||||  |||| |||||||    
T  41972249 gttttgttgggtaagagtgtggcgtcactcttgcttgtgtggttgttccagcctcaatatggacggtctcccgaactccccc 41972330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 194 - 372
Target Start/End: Original strand, 9308970 - 9309150
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtct--cacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctta 291  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| ||||||| ||||||||||||| || |    
T  9308970 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacacatcagataaaagagtaaaagttgaacatgttata--agtaagaggacccataaacccattgcctaa 9309067  T
Q  292 aggttttgggtaagagt---gtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    |||||||||| ||||||   || ||||||||||| ||  | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9309068 aggttttgggcaagagtagtgtggtgtctctctcacta-tgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccc 9309150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 194 - 356
Target Start/End: Original strand, 9608738 - 9608898
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||   ||||||    
T  9608738 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttata--agtaagatgacccataaacccatcaccttaag 9608835  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacgg 356  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  9608836 gttttgggtatgagtgtggcgtctctcttgctagtgaggttgttctagcctcgatgtggacgg 9608898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 191 - 372
Target Start/End: Original strand, 34835464 - 34835644
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcg-gataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||| ||    
T  34835464 tgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttata--agtaagaggacccataaactcattgcct 34835561  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||    
T  34835562 taaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctccccc 34835644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 191 - 372
Target Start/End: Original strand, 34835730 - 34835910
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcg-gataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||| ||    
T  34835730 tgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttata--agtaagaggacccataaactcattgcct 34835827  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||    
T  34835828 taaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctccccc 34835910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 328
Target Start/End: Original strand, 147457 - 147576
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| | ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  147457 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacct--tataaataagaggacccataaacctattgccttaaagttttgggtaaga 147554  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgt 328  Q
    |||| | |||||||| ||||||    
T  147555 gtgtggcgtctctcttgcttgt 147576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 193 - 354
Target Start/End: Original strand, 9507769 - 9507933
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtct--cacatcggataaaag---agtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgt 287  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||   || || |||||||||   |||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||      
T  9507769 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatctcctccatattggataaaagtacagtaaaggttgaataccttata--agtaagaggactcataaacccattac 9507866  T
Q  288 cttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggac 354  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9507867 cttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctatctcttatatggttgttcaagcctcgatgtggac 9507933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8918932 - 8918766
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||| |||| |||    
T  8918932 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttacatgtcccacatcagatagcagagtaaaggttgaacactttata--agtaagaggacccataaacctattgactt 8918835  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| ||| || ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  8918834 aaggttttgggtaagagtgtgacgtctttcttgcgtgtgtggttgttttaacctcgatgtggacggtcc 8918766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 40579658 - 40579496
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||| |||||||| ||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||  ||||  |||||||||| |||||||    
T  40579658 tgtgaattatatgtttcatattggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacttattgctttaaggttttaggtaaga 40579561  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||| |||||||| | ||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  40579560 gtgtggtgtctctattgcttgtacggttgttctatcctcgatgtggacgatcctccatgctcccc 40579496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 214 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 20870718 - 20870549
Alignment:
Q  214 tatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagt 313  Q
    |||||||  |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||| || |||||| |||||| ||||||||| ||    
T  20870718 tatatgttccacatcagataaaatagtaaaggttgaacatcttata--agtaagaggacccataaacccactgccttaagattttggataagagtgtggt 20870621  T
Q  314 gtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaacaa 385  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||    
T  20870620 gtctctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatatggacggtcctcctggctcccctcatgacccaacaa 20870549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 207 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 1014397 - 1014233
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||| | ||  ||||| |||||||||||||    
T  1014397 tgtgagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccgtaaactcgttaccttaaagttttgggtaaga 1014300  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacgg-tcctccgagctccccc 372  Q
    |||| |||||||||  ||||||  |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  1014299 gtgtggtgtctctcctgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggttcccccgagctccccc 1014233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 207 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 32640679 - 32640521
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||       || || |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32640679 tgtgagttatctgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaaca-------taggtaagaggaccgataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 32640587  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctcc-gagctcccc 371  Q
    |||| | |||||||| |||| | || |||||| ||||||||||||  |||||| || |||||||||    
T  32640586 gtgttgcgtctctcttgcttttgtgattgttctagcctcgatgtgagcggtccgccagagctcccc 32640521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43274948 - 43274824
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |  |  ||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  43274948 ttgttgttgtgtataagtgtgagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaata--tattataagtaagaggacccataaacctattgtct 43274851  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtc 316  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  43274850 taaggttttgagtaagagtgtggtgtc 43274824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 211 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18372142 - 18371970
Alignment:
Q  211 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 310  Q
    ||||||||||  ||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18372142 agttatatgtaccacatccaataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggatccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgt 18372045  T
Q  311 agtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacgg-tcctccgagctccccccataatccaaca 384  Q
     |||| ||||||||||||  ||||| || |||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||    
T  18372044 ggtgtttctctcgcttgtgcggttgctctagcctcaatgtgaacggttcccccgagctcccctcatgacccaaca 18371970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Original strand, 45122996 - 45123162
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||    ||||| ||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  45122996 tgttgctgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacacct----taagtaagatgacccataaacctattttctt 45123091  T
Q  291 aaggttttgggta--agagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||   ||||  |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  45123092 aaggttttgggtaagagagtgtggtgtctctcttatttgtggggttgttctaatctcgatgtggacggtcc 45123162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 191 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 45121823 - 45121663
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||  |||||||| |  | |||    
T  45121823 tgttgttgtgtacaagtgtgagttgt-tgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgatcacct--tataagtaagaggatccataaacctacagcctt 45121727  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggac 354  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||||  ||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  45121726 aaggttttgagtaagagtgtgatatctctcttacttatggggttgttctagcctcgatgtggac 45121663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 191 - 372
Target Start/End: Original strand, 147819 - 147989
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||           || |||||||| |||| |||    
T  147819 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaaaagtaaatgttgaacaacatata-----------acccataaacctattgcctt 147907  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||   ||||||| |||||| |||||  ||||||||  |||||||||    
T  147908 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcagttgttctagcctcaatgtgagcggtcctcatagctccccc 147989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1014023 - 1013879
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||  |||||||||||| ||||  |||||| ||||||    
T  1014023 tgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccctata--agtaagaggaccaataaacccattgccttagagttttgagtaaga 1013926  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgga 353  Q
    ||||  ||||||| |  |||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  1013925 gtgtgttgtctcttttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1013879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 194 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 9620841 - 9620668
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||| || |||| | ||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  9620841 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacaacagatagaaaagtagaagttgatcactttata--agtgagaggacccataaactcattgccttaag 9620744  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
     ||||   ||||||| |  |||||||||| ||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  9620743 atttta--taagagtttgatgtctctctcacttgtgtggttgctcaggcctggatgtggacggtcccccgggctcccc 9620668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 352
Target Start/End: Original strand, 12283867 - 12284021
Alignment:
Q  195 gttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaagg 294  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| | |||| |  ||| | | ||| ||||||| ||  |||||||||    
T  12283867 gttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacgtcagataaaaaagtaaatgttgaatatcttaaa--agtaaaatgacacataaactcaa-gtcttaagg 12283963  T
Q  295 ttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgg 352  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  12283964 ttttggataagagtgtagtgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctctatgtgg 12284021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 281 - 359
Target Start/End: Original strand, 41129066 - 41129144
Alignment:
Q  281 ccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41129066 ccattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcaaacctcgatgtggacggtcc 41129144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 278 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 40579352 - 40579259
Alignment:
Q  278 aacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  40579352 aacccattgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccccgagctcccc 40579259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18371807 - 18371665
Alignment:
Q  208 gtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagag 307  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||       ||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18371807 gtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaacat------taagtaagaagacccataaacccat-gccttaaggttttgggtaagag 18371715  T
Q  308 tgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggt 357  Q
    ||| |||| ||||||  ||||  ||||| || ||| ||||||||||||||    
T  18371714 tgtggtgtgtctctcatttgtgcggttgctctagcttcgatgtggacggt 18371665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 3037853 - 3037776
Alignment:
Q  214 tatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3037853 tatatgttccacatcggatgaaatagtaaatgttgaacaccttata--agtaagaggactcataaacccattgtcttaag 3037776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 208 - 359
Target Start/End: Original strand, 6651510 - 6651650
Alignment:
Q  208 gtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagag 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |           | |||| || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6651510 gtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaaaa-----------taagagaacccataaattcattgccttaaggttttgggtaagag 6651598  T
Q  308 tgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||| |||||||||| ||||||  | |||||| | |||||||||||| |||||    
T  6651599 tgtggtgtctctcttgcttgtgcgattgttctaacctcgatgtggatggtcc 6651650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18372408 - 18372356
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttata 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18372408 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata 18372356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 4154831 - 4154707
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||| || |||  | ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||| ||||| |  |||    
T  4154831 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttata--agtgaaaggacccataaactcattgccccaag 4154734  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctc 320  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||    
T  4154733 gttttgggtaagagtgtggcgtctctc 4154707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8919217 - 8919146
Alignment:
Q  288 cttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8919217 cttaaggttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtggacggtcc 8919146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18373098 - 18372988
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||| |      
T  18373098 tgttgttgtgtacag-tgtgatttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggttgaacacct--tataaataagaggactcataaactcattgcc-- 18373004  T
Q  291 aaggttttgggtaagag 307  Q
     ||||||||||||||||    
T  18373003 -aggttttgggtaagag 18372988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 308
Target Start/End: Original strand, 20130455 - 20130553
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||| ||  |||||||||||   |||| |||||| |||||||    
T  20130455 tgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt---taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaaga 20130551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12156763 - 12156709
Alignment:
Q  256 tatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 310  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12156763 tatataagagaaagaactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 12156709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 4154446 - 4154290
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| || |||  | |||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||    
T  4154446 ttgttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtggaggttgaacac--tttataagtgaga-gacccataaactcattgccttaa 4154350  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgg 352  Q
      ||||||||||| ||||  ||||||||||  |||| |||||| ||  |||| |||||||    
T  4154349 tattttgggtaagtgtgtgatgtctctctcaattgtttggttgctctggcctagatgtgg 4154290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 353
Target Start/End: Original strand, 6731910 - 6732045
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||           ||| |||| || ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  6731910 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaa-----------agtaagagaacccataaattcattgccttaaggttttgagtaaga 6731998  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgga 353  Q
    |||| |||||||||| |||| |  |||||||| | ||||||||||||    
T  6731999 gtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctaacctcgatgtgga 6732045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18372851 - 18372799
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttata 259  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18372851 tgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata 18372799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25561792 - 25561744
Alignment:
Q  211 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttata 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25561792 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttata 25561744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18372762 - 18372657
Alignment:
Q  199 tgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggtttt 298  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  ||  |||||||||| |||||| ||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||||||| |   |||||||    
T  18372762 tgtacaagtgtgatttatatgttccatttcggataaaatagtaaaggttgaacactt---ataagtaagaggactcataaacccattgcc---aggtttt 18372669  T
Q  299 gggtaagagtgt 310  Q
    ||||||||||||    
T  18372668 gggtaagagtgt 18372657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 41416322 - 41416271
Alignment:
Q  208 gtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttata 259  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  41416322 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata 41416271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 314 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3038016 - 3037958
Alignment:
Q  314 gtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3038016 gtctctctatcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccc 3037958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18380169 - 18380059
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||  ||| || || |  ||||||||| |  |||||||||||| ||||||    
T  18380169 tgtgagttatatatcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagggggcctataaacccactaccttaaggttttgagtaaga 18380072  T
Q  307 gtgtagtgtctct 319  Q
    |||| ||| ||||    
T  18380071 gtgtggtgcctct 18380059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 43274699 - 43274626
Alignment:
Q  297 ttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccc 370  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||  ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43274699 ttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttatggggttgttccagcctcgatgtggacggtcccccgagctccc 43274626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 335
Target Start/End: Original strand, 2467508 - 2467632
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || | || | |||||||||    |||| |||||||  | ||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |    
T  2467508 tgtgagttatatgtctcacgtcggatagaaaattagaagttgaacac----tatatgtgagagagcacataaactcgttgtcttaaagtttttggtaaaa 2467603  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttg 335  Q
    ||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  2467604 gtgtgacgtctctctcacttgtatggttg 2467632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 338
Target Start/End: Original strand, 9609108 - 9609220
Alignment:
Q  224 acatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcg 323  Q
    ||||| |||| || |||||| |||||||| ||||||  ||| ||| ||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| |    
T  9609108 acatcagatagaaaagtaaaggttgaacatcttata--agtaagatgacccataaacccatcgccttaatgttttcggtaagagtgtggcgtctctcttg 9609205  T
Q  324 cttgtatggttgttc 338  Q
    || || |||||||||    
T  9609206 ctagtgtggttgttc 9609220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20995497 - 20995442
Alignment:
Q  280 cccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttg 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  20995497 cccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcacttgtgtggttg 20995442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 328
Target Start/End: Original strand, 27856185 - 27856256
Alignment:
Q  257 atataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgt 328  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27856185 atataagatagaggactcataaacccactgccttaagattttggataaaagtgttgtgtctctctcacttgt 27856256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 43398223 - 43398123
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttat--ataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaa 304  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||| |||    
T  43398223 tgtgagttatatatctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagag-gaggacccataaattcattgccttaaagttttggataa 43398125  T
Q  305 ga 306  Q
    ||    
T  43398124 ga 43398123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20995566 - 20995502
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttat 258  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||| ||||    
T  20995566 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaaaagtggaggttgaacactttat 20995502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 310
Target Start/End: Original strand, 32305503 - 32305584
Alignment:
Q  227 tcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 310  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||  |||||||||||  |||||| |||||| |||||||||    
T  32305503 tcggataaaatagtaaaggttgaacacct--tataagtaagaagacctataaacccattaccttaagattttggataagagtgt 32305584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18645752 - 18645713
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggata 233  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18645752 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggata 18645713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18372342 - 18372273
Alignment:
Q  303 aagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacgg-tcctccgagctcccc 371  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||| |  || |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18372342 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtgcggttgctttagtctcgatgtggacggttcccccgagctcccc 18372273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3038073 - 3038041
Alignment:
Q  340 agcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3038073 agcctcgatgtggacggtcccccgagctccccc 3038041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 207 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18372523 - 18372487
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaa 243  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18372523 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 18372487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43274735 - 43274699
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacat 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  43274735 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatatctcacat 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 44358212 - 44358151
Alignment:
Q  217 atgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaac 280  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||  || ||||||||||| |||||||||||    
T  44358212 atgtctcacatcagataaaaaagtgaatgttgacca--ttttataagtgagatgactcataaac 44358151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 66)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 191 - 371
Target Start/End: Original strand, 6421375 - 6421553
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  6421375 tgttgttgtgcacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggactcataaactcattgcctt 6421472  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6421473 gaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 6421553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 191 - 369
Target Start/End: Original strand, 15880253 - 15880429
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  15880253 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattgcctt 15880350  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcc 369  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15880351 aaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtggacgttcctccgagctcc 15880429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 194 - 372
Target Start/End: Original strand, 962591 - 962767
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  962591 tgttgtatgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttata--agtgagaggacccataaacccattgtcttaag 962688  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  962689 gttttgggtaagagtgtgttgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctcccgaactccccc 962767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 207 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5542777 - 5542602
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  5542777 tgtgagttatatgtcccatatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacctattgccttaaggtttttggtaaga 5542680  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaaca 384  Q
    |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  5542679 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcaagtctcgatgtggacggtcccccgagctccccccatgatccaaca 5542602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 207 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 36178757 - 36178596
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36178757 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 36178660  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccc 370  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  36178659 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctctatgtggacgatcccccgcgctccc 36178596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 191 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15511661 - 15511485
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15511661 tgttgttgtgtgcaa--gtgagttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttata--agtaagaggacccataaacccattgtctt 15511566  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15511565 aagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtggacgatcc-ccgagctccccc 15511485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 207 - 371
Target Start/End: Original strand, 37105930 - 37106092
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||  ||| || |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  37105930 tgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaaggggacccataaactcattgccttaagattttgggtaaga 37106027  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37106028 gtgtggtgtctctcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 37106092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 207 - 365
Target Start/End: Original strand, 37106194 - 37106350
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37106194 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccatttccttaaggttttgggtaaga 37106291  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgag 365  Q
    |||| |||| ||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37106292 gtgtggtgtttctcttgcttgtgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcctccgag 37106350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 207 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 14745819 - 14745656
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14745819 tgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 14745722  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    |||| | |||||||| ||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14745721 gtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccccgagctccccc 14745656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 196 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 35580886 - 35580726
Alignment:
Q  196 ttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggt 295  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  35580886 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttata--agtgagaggac-cataaacccattgccttaaggt 35580790  T
Q  296 tttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35580789 tttgggtaagagtgcggcgtctctcttgtttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 35580726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 191 - 364
Target Start/End: Original strand, 6712966 - 6713138
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| ||||  ||    
T  6712966 tgttgttgtatacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacacct--tataagtaagaggacccataaacctattgcttt 6713063  T
Q  291 aagg-ttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccga 364  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |  | |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6713064 aaggtttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttatgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccccga 6713138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 207 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5543150 - 5542975
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||  |||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  5543150 tgtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggatccataaacctattgccttaagattttgggtaaga 5543053  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaaca 384  Q
    |||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||    
T  5543052 gtgtggtgtctctattgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtggacggtaccttgagctccccccatgatccaaca 5542975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Original strand, 40733507 - 40733673
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| |    |||    
T  40733507 tgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacacct--tataagtaagaggacccataaacctacaacctt 40733604  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  40733605 aaagttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggtagttcaagtctcgatgtggatggtcc 40733673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 190 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 36006048 - 36005869
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||| ||    
T  36006048 ttgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaa-agtaaaagttgaacaccttata--agtaagaggacccataaactcattgcct 36005952  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||||||    
T  36005951 taaggttttgggtaaaagtgtggcgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacagtctctcgagctccccc 36005869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 371
Target Start/End: Original strand, 42514642 - 42514817
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||  ||||| |||| || |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  42514642 tgttgtatgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccatcgccttaag 42514739  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42514740 attttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 42514817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 190 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 38796789 - 38796620
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||| |||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| | || ||    
T  38796789 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacacct--tataagtaagaggacccataaacctaatgcct 38796692  T
Q  290 taaggttttgggtaagag--tgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38796691 taaggttttgggtaagagtatgtggcgtctctattgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtcgacggtcc 38796620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Original strand, 40733873 - 40734038
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  || |||||||||||  ||| ||||| ||||||| || |  | |||    
T  40733873 tgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaagatttaacaccttata--agtaagagggctcataa-cctacagcctt 40733969  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40733970 aaagttttgggtaagagtgtggtgtctgtctcgcttgtgtggttgttcaagtctcgatgtggacggtcc 40734038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41283627 - 41283477
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  41283627 tgtgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttaggtaaga 41283530  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||| | |||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41283529 gtgtggcgtctctcttgtttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcc 41283477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 207 - 362
Target Start/End: Original strand, 33731654 - 33731807
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33731654 tgtgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttata--agtaagaggatccataaacctattgccttaaggttttgggtaaga 33731751  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctcc 362  Q
    || | |||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  33731752 gtatggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtaaacggtcctcc 33731807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 198 - 372
Target Start/End: Original strand, 1769889 - 1770061
Alignment:
Q  198 gtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttt 297  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| |  || | | ||    
T  1769889 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacacct--tataagtaagaggactcataaactcatagctttgaagctt 1769986  T
Q  298 tgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    ||  ||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  1769987 tgaataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtgaacgatcctcctagctccccc 1770061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 223 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 36178307 - 36178161
Alignment:
Q  223 cacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctc 322  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| || | || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||     
T  36178307 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgcctctctt 36178210  T
Q  323 gcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  36178209 gcttgtgtggttgttatagcctcgatgtagacggtcccccgcgctcccc 36178161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 194 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 40679794 - 40679632
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||  |||||||||||||||  ||| |||| || ||||||||||| | ||||||    
T  40679794 tgttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaagggttgaacaccttata--agtaagagaacccataaacccatcgccttaag 40679697  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtc 358  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||  |||||  |||||||| || ||||||||||||||||    
T  40679696 attttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagtctcgatgtggacggtc 40679632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 217 - 359
Target Start/End: Original strand, 6422126 - 6422266
Alignment:
Q  217 atgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtc 316  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  | | ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6422126 atgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacacattata--attaagaggacccataaacccatagccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtc 6422223  T
Q  317 tctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6422224 tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggactgtcc 6422266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 371
Target Start/End: Original strand, 6421794 - 6421899
Alignment:
Q  266 agaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgag 365  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  6421794 agaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttctggcctcgatgtggacggtcccccgag 6421893  T
Q  366 ctcccc 371  Q
    ||||||    
T  6421894 ctcccc 6421899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 191 - 331
Target Start/End: Original strand, 16542439 - 16542577
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| | |||||||| |||||| ||||| |||    
T  16542439 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct--tataaataagaggacttataaactcattgcctt 16542536  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatg 331  Q
    ||| ||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  16542537 aagattttgagtaagagtgtagcatctctctcacttgtatg 16542577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 191 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 28254405 - 28254276
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||| |||    
T  28254405 tgttgttgtgtgccagtgtgacttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttata--agtaagaggacccataaactcattgcctt 28254308  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctc 322  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28254307 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctc 28254276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 207 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 36178421 - 36178320
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178421 tgtgagttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggtggaacaccttata--agtaaggggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 36178324  T
Q  307 gtgt 310  Q
    ||||    
T  36178323 gtgt 36178320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 214 - 386
Target Start/End: Original strand, 23346250 - 23346419
Alignment:
Q  214 tatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagt 313  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||| ||| |||||||||||  |   ||||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||  |    
T  23346250 tatatgtctcacatcgtatagaaaagtaaaggttaaacaccttataata---agagggcccataaacccatagccttaaggttttcggtaagagtgtgat 23346346  T
Q  314 gtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaacaat 386  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  23346347 gtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctagatgtggacggtcgcccgagctcccctcatgacccaacaat 23346419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 194 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 28531479 - 28531314
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||    
T  28531479 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagcaaaggttgaacacct--tataagtaagaggtcccataaactcattgccttaag 28531382  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctc 361  Q
     |||||||||||||||| ||| |||||||  || |   |||| || |||||||||||||| |||||||    
T  28531381 attttgggtaagagtgtggtgactctctcagttatgcagttgctctagcctcgatgtggatggtcctc 28531314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 209 - 359
Target Start/End: Original strand, 29676543 - 29676685
Alignment:
Q  209 tgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagt 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||  |||||||| || ||||||| ||||| |||      ||||||||||||    
T  29676543 tgagttatatgtctcacattggataaaagagtaaagattgaacacattata--agtgagagaacccataaactcattgcctt------ttgggtaagagt 29676634  T
Q  309 gtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    || |||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29676635 gtggtgtctctcttgcttgtggggttattcaaacctcgatgtggacggtcc 29676685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Original strand, 29676893 - 29677064
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttata--taag-tgagaggactcataaacccattgt 287  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | ||  |||| ||| |||||||||||||     
T  29676893 tgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtttaacaccttataggtgagaggagaagacccataaacccattgc 29676992  T
Q  288 cttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||| |||  |||||||||| ||||||||||   ||||  |||||||| | |||||||||||| |||||    
T  29676993 cttaaggctttaagtaagagtgtggtgtctctcttaattgtggggttgttccaacctcgatgtggatggtcc 29677064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 198 - 356
Target Start/End: Original strand, 7598606 - 7598754
Alignment:
Q  198 gtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttt 297  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |        |||| ||||    
T  7598606 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataacc--------ttaacgttt 7598695  T
Q  298 tgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacgg 356  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7598696 ttggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcatcgatgtggacgg 7598754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 40163520 - 40163361
Alignment:
Q  212 gttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt-aaggttttgggtaagagtgt 310  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||| ||| |||| | |||||| |||||||||||||| |||||    
T  40163520 gttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttata--agtaagatgacccattaacctagtgtctttaaggttttgggtaaaagtgt 40163423  T
Q  311 agtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||| || ||||  | ||||||||||    
T  40163422 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtagatggtctcctgagctccccc 40163361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 191 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31468914 - 31468801
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||      ||||||| ||||||| ||||| |||    
T  31468914 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaatatcttata------agaggacccataaactcattgcctt 31468821  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31468820 aaggttttgggtaagagtgt 31468801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 194 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37632762 - 37632602
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||  |||  || ||||||| ||||||| |||||||||||    |||||    
T  37632762 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgaca--ttttataagtaagaggacccataaacccataactttaag 37632665  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacgg 356  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||  |  || || |||||| |||||||||||||||||    
T  37632664 gttttgggtaagagtgtggtgtatctcttacaagtgtgattgttctagcctcgatgtggacgg 37632602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 359
Target Start/End: Original strand, 7598225 - 7598384
Alignment:
Q  198 gtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttt 297  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||   |||||| ||| || |||||| ||| ||||||||||| |  | ||||||| ||||||| ||| | ||||||||||    
T  7598225 gtgtgcaagtgtgaattatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaa--taagaggacccataaactcatagccttaaggttt 7598322  T
Q  298 tgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||| | | ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7598323 tgggtaagaatatggtgtctctctcacttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcc 7598384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 14745446 - 14745300
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||| ||| ||  |||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14745446 tgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatggttgaacatcttgta--agtatgaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 14745349  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgt-atggttgttcaagcctcgatgtggac 354  Q
    |||| | |||||||| |   ||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  14745348 gtgtggcgtctctcttgtaagtggtggttgttctagcctcgatgtggac 14745300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 335
Target Start/End: Original strand, 30313170 - 30313309
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    ||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||| || |||  | ||||||||| |   |||||||||||||| || |||| ||||| |||||    
T  30313170 ttgttgtgtgcaagcgtgtgttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgaacactt---ataagtgagaggacccaaaaactcattgccttaa 30313266  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttg 335  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||    
T  30313267 gattttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttg 30313309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 191 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 38796386 - 38796318
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttata 259  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38796386 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttata 38796318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 357
Target Start/End: Original strand, 6421689 - 6421780
Alignment:
Q  266 agaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggt 357  Q
    ||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  6421689 agaggacccataaacctattgactaaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttccggcctcgatgtggacggt 6421780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 347
Target Start/End: Original strand, 5367448 - 5367599
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||| ||| ||  ||| ||| |||   ||||||    
T  5367448 tgttgtgtacaagtgtgatatatatgtcccagatcggataaaagagcaaaggttgaacaccttata--agtaagatgatccatgaacacataaccttaag 5367545  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcga 347  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||||| ||||||||    
T  5367546 gttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcga 5367599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33561616 - 33561481
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||| || |||  | ||| ||||| |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  33561616 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcagatagaaaagtggaggttaaacactttata--agtgagaggacccataaactcattgtcttaag 33561519  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatg 331  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| ||| ||||    
T  33561518 gttttgggtaagagtgtgatatctctctcacttttatg 33561481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 258 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 36784363 - 36784273
Alignment:
Q  258 tataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgat 348  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  36784363 tataagtaagatgacccataaaccctttgtcttaaggttttggataaaagtgttgtgtctctcttgcttgtgtggttattcaagcctcgat 36784273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 31899594 - 31899496
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||    
T  31899594 tgttgttgtgtgaaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacacct--tataagtaagaggacccataaactcattgcctt 31899497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 190 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 31259788 - 31259658
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatc---ggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattg 286  Q
    ||||||||||||  || || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||| ||| |||||||| ||      
T  31259788 ttgttgttgtgtgtaagtgcgagttatatgtctcacatcatcggataaaagagtaaaggttcaacacct--tataagtaagatgacccataaacctatca 31259691  T
Q  287 tcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctct 319  Q
     ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  31259690 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtatctct 31259658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 36785731 - 36785664
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttat 258  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  36785731 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 36785664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 357
Target Start/End: Original strand, 3672773 - 3672855
Alignment:
Q  275 ataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggt 357  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  3672773 ataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttaattgtgtggttgttctagtctcgatgtggacggt 3672855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 29873703 - 29873513
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    ||||||||| |||  ||| |||| ||||| |||||| |||| || |||  | ||||||||  || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  29873703 ttgttgtgtgcaagggtgtgttacatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaaca--ttttataagtgggaggactcataaactcattgccttaa 29873606  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaacaa 385  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||| |||||| ||  | || ||||| | |||||||||  ||||||| | ||| |||||||    
T  29873605 ggttttgagtaagagtgtgacgtctctctcacttgtgtggttgctctggtctggatgtaggcggtcctcctggctcccctcgtaacccaacaa 29873513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 33953936 - 33953822
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||  | |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||     
T  33953936 tgttgtgtgcaaatgtgagttataagtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacac--tatataagtgagaggacccataaacctgttgccttaaa 33953839  T
Q  294 gttttgggtaagagtgt 310  Q
     ||||||||||||||||    
T  33953838 attttgggtaagagtgt 33953822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 12529195 - 12529038
Alignment:
Q  192 gttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctta 291  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||  ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12529195 gttgttgtatgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaaataaaacagtaaagattgaacaccgtata--agtaagaggactcataaactcattgcctta 12529098  T
Q  292 aggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtg 351  Q
    | ||||| | |||||  ||||||||||||| | ||||  |||||||| | |||| |||||    
T  12529097 aagttttagataagaacgtagtgtctctcttgtttgtgcggttgttctaacctcaatgtg 12529038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 37895211 - 37895107
Alignment:
Q  209 tgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagt 308  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || | |||| |||||| |||||| |  ||| | || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37895211 tgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaagttgaaaaccttaaa--agtaaaagaacacataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 37895114  T
Q  309 gtagtgt 315  Q
    || ||||    
T  37895113 gtggtgt 37895107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 372
Target Start/End: Original strand, 3673123 - 3673237
Alignment:
Q  258 tataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggt 357  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| |||||  ||||| |||||| |||||||||  |||||||||  || || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3673123 tataagtaagaggatccataaactcattgctttaagattttggctaagagtgtgatgtctctcttactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 3673222  T
Q  358 cctccgagctccccc 372  Q
    || ||  ||||||||    
T  3673223 ccccctggctccccc 3673237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 249
Target Start/End: Original strand, 6421294 - 6421352
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttga 249  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6421294 tgttgttgtgtacaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttga 6421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 314
Target Start/End: Original strand, 12910236 - 12910339
Alignment:
Q  209 tgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagt 308  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  || |||| | ||||||| |||||||  ||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12910236 tgagttatatgttccacatcggatggaaaagtacaggttgaaccccttata--agtgaaatgacttataaattcattgtcttaaggttttgggtaagagt 12910333  T
Q  309 gtagtg 314  Q
    ||||||    
T  12910334 gtagtg 12910339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29874185 - 29874074
Alignment:
Q  197 tgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggtt 296  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||| || |||  | ||||||||| |||||  | || |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  29874185 tgtgtacaagtgtgtgttatatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttata--attgggaggacccataaacccattgccttaaggtt 29874088  T
Q  297 ttgggtaagagtgt 310  Q
    |||| |||||||||    
T  29874087 ttggataagagtgt 29874074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 371
Target Start/End: Original strand, 16590881 - 16591051
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaaga-gtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||        |||| ||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  16590881 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaaagtaaaggttgaaca--------aagtaagaggacccataaacacattgccttaa 16590972  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    ||||||  |||||| | || |||||||||  |||||  |||||||| |||||| |||||||| |||  |||||||||||    
T  16590973 ggttttaagtaagaatctaatgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcaatgtggacagtctcccgagctcccc 16591051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 28254254 - 28254165
Alignment:
Q  217 atgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagt 308  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  28254254 atgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacactttata--agtaagaggactcataaacactttgccttaaagtttagggtaagagt 28254165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 37894855 - 37894731
Alignment:
Q  196 ttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggt 295  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||| || |||||| | | || ||||  ||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| |    
T  37894855 ttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtaaaggctaaaaacct--tataagtaagaagactcataaatccattgccttaagat 37894758  T
Q  296 tttgggtaagagtgtagtgtctctctc 322  Q
    ||||| ||| ||||| |||| ||||||    
T  37894757 tttggttaaaagtgtggtgtgtctctc 37894731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41678534 - 41678396
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagtt--atatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctta 291  Q
    |||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||| |||| || ||   | ||| |||||  | ||||||||||||||| |||||| || ||| ||||    
T  41678534 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatatgtctcacatcagatagaaaaggggaggttaaacac--tttataagtgagaggacccataaa-cctttgcctta 41678438  T
Q  292 aggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggt 333  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  41678437 aggttttgagtaagagtgtaacgtctctctcacttgtatggt 41678396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 322
Target Start/End: Original strand, 28226708 - 28226773
Alignment:
Q  256 tatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctc 322  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28226708 tatataagagaggagactcataaacccattgtctt-aggtttttggtaagagtgtggtgtctctctc 28226773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 320
Target Start/End: Original strand, 30323456 - 30323581
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||| || ||| |||| || | |  | ||||||||| ||| |  |||||||||||  |||||| ||||| |||||    
T  30323456 ttgttgtgtgcaagtgtgtgttatatgtcccaaatcagatagaaaattggaggttgaacactttaga--agtgagaggacctataaactcattgccttaa 30323553  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctc 320  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||    
T  30323554 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctc 30323581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 334
Target Start/End: Original strand, 31385792 - 31385868
Alignment:
Q  258 tataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggtt 334  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  31385792 tataagtgaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggaataagtgtggtgtctctttcacttgtgtggtt 31385868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 322
Target Start/End: Original strand, 28226390 - 28226456
Alignment:
Q  256 tatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctc 322  Q
    |||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28226390 tatataagagaggagacccataaacacattgtcttagggttttaggtaagagtgtggtgtctctctc 28226456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 35580540 - 35580428
Alignment:
Q  261 aagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagag--tgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacgg-t 357  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||  | || |||||  ||||||||||||||||| |    
T  35580540 aagtgtgaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagagtgtggcgtctctctcccta-tgtgattgttttagcctcgatgtggacggtt 35580442  T
Q  358 cctccgagctcccc 371  Q
    || |||||||||||    
T  35580441 cccccgagctcccc 35580428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 31899170 - 31899079
Alignment:
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaacaa 385  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| ||||||  |||| ||| | |||||||||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||||    
T  31899170 ggttttgggtaagagtgaggtatctctcttgcttgtggggttcttctaacctcgatgtgaacggtcc-ccaagctcccctcatgatccaacaa 31899079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 236
Target Start/End: Original strand, 3673075 - 3673120
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaa 236  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3673075 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaa 3673120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 88)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 190 - 358
Target Start/End: Original strand, 25483325 - 25483491
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||  ||||||||||||| ||    
T  25483325 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttata--agtaagaggatccataaacccattgcct 25483422  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtc 358  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25483423 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 25483491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Original strand, 36572009 - 36572175
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||| |||    
T  36572009 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttata--agtaagaagacccataaatccattgcctt 36572106  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36572107 aaggttttgggttagagtatggtgtctctctcgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcc 36572175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 36608827 - 36608649
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| ||||||  |||||| ||||||||||    
T  36608827 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcata--agtaagaggatccataaatccattgtctt 36608730  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36608729 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccc 36608649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 189 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 39793028 - 39792848
Alignment:
Q  189 gttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtc 288  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||  | ||||| ||||| |    
T  39793028 gttgctgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttata--agaaagaggaaccgtaaactcattgcc 39792931  T
Q  289 ttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39792930 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctctgagctcccc 39792848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 190 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34646816 - 34646649
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||    
T  34646816 ttgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacacct--tataactaagaggactcataaactcattgcct 34646719  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  34646718 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctggtctgtgtggttgttctagccttgttgtggacggtcc 34646649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 194 - 359
Target Start/End: Original strand, 36629230 - 36629393
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  36629230 tgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttaaacaccttata--agtaagaggacccataaactcattgccttaag 36629327  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36629328 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 36629393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 196 - 384
Target Start/End: Original strand, 39404013 - 39404200
Alignment:
Q  196 ttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggt 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||    
T  39404013 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttata--agtaagaggactcataaactcatagcattaaggt 39404110  T
Q  296 tttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccccca-taatccaaca 384  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  39404111 tttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcactaatccaaca 39404200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 207 - 364
Target Start/End: Original strand, 41370363 - 41370518
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41370363 tgtgagttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttata--agtaagaggacccataaacccattgccttaaagttttgggtaaga 41370460  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccga 364  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  41370461 gtgtagtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccga 41370518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 364
Target Start/End: Original strand, 50002416 - 50002587
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  50002416 tgttgttgtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacacttttta--agtaagaggacccataaatccattgtctt 50002513  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccga 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  50002514 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccccga 50002587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 191 - 371
Target Start/End: Original strand, 10245910 - 10246087
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||  | |||    
T  10245910 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggac-cataaacccaaagcctt 10246006  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  10246007 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctcccttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacgctcccccaagctcccc 10246087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22183430 - 22183264
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| | ||||| ||||||||||||| |||    
T  22183430 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttata--agtaaaaggacccataaacccattgcctt 22183333  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22183332 aaggttttggataagagtgtggcgtctctctcacttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 22183264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 383
Target Start/End: Original strand, 39404388 - 39404577
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| || | |||    
T  39404388 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggtggaacaccttata--agtaagaggacccataaacctatagcctt 39404485  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccccca-taatccaac 383  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  39404486 aaggttttgggcaagaatgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtc--ccgagctcccctcactaatccaac 39404577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 190 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1731814 - 1731647
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| |||||||| |||| ||    
T  1731814 ttgttgttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaa--taagaggacccataaaccaattgcct 1731717  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  1731716 taaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 1731647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 190 - 359
Target Start/End: Original strand, 50459710 - 50459877
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  50459710 ttgttgtagtgcataagtgtgagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttata--agtaagaggactcataaacccattatct 50459807  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  50459808 taaggttttaggtaagagcgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtcc 50459877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 208 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 50630904 - 50630743
Alignment:
Q  208 gtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagag 307  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50630904 gtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattata--agtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 50630807  T
Q  308 tgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    ||| |||||||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  50630806 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtgggcggtccgcctagctcccc 50630743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 207 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 55933274 - 55933113
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  55933274 tgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattgccttaaagttttgggtaaga 55933177  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccc 370  Q
    |||| ||||||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  55933176 gtgtggtgtctctcttacttgtacagttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctccc 55933113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 194 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 3244614 - 3244458
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||     
T  3244614 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttata--agtaagaggacccataaactcattgtcttaaa 3244517  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgg 352  Q
    ||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3244516 gttttgggtaagaatgtgtcgtctctctcacttgtatggttgttccagcctcgatgtgg 3244458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 196 - 372
Target Start/End: Original strand, 3340802 - 3340976
Alignment:
Q  196 ttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggt 295  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  3340802 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttata--agtaagaggacccataaacccactgccttaaggt 3340899  T
Q  296 tttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  3340900 tttgggtaagagtgtggtgtctttcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtctcctgagctccccc 3340976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 4955485 - 4955355
Alignment:
Q  189 gttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtc 288  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  4955485 gttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttata--agtaagaggactcataaacccattgcc 4955388  T
Q  289 ttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctct 321  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4955387 ttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctct 4955355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 372
Target Start/End: Original strand, 54936190 - 54936364
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    | |||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  54936190 tgttgttgtgtacaagtgtgagttat----cccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgta--agtaagaggacccataaacccattgcctt 54936283  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | | | ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  54936284 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccccgagctccccc 54936364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 198 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 54017754 - 54017582
Alignment:
Q  198 gtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttt 297  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  54017754 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttata--agtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 54017657  T
Q  298 tgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    | |||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  54017656 taggtaagagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctccctagctccccc 54017582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 193 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 41707628 - 41707502
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | || || ||||||| |||||||||||    
T  41707628 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacc--atataagtaaaagaacccataaactcattgtcttaa 41707531  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctctc 322  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  41707530 ggtttt-ggtaagagtgtggtgtctctctc 41707502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Original strand, 44621011 - 44621158
Alignment:
Q  210 gagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtg 309  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44621011 gagttgtatgacccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttata--agtaagagggcacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtg 44621108  T
Q  310 tagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    | |||| ||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  44621109 tggtgtttctcttgcttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcc 44621158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22028127 - 22027961
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||  |||| |||    
T  22028127 tgttgttgtgtgcaagtgtgacttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacatattgcctt 22028030  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||| ||||    
T  22028029 aaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcgcttatgtggttgttttagtctcgatgtggacagtcc 22027961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 45489497 - 45489332
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||| |||||| | ||| ||    
T  45489497 tgttgttgtgtacaagtgtgaattatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacacc--atataagtaagagaactcttaaacctactgt-tt 45489401  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||| |||| |||||||||||  ||||||| | ||| || || |||||| |||||||||||||| |||||    
T  45489400 aagatttttggtaagagtgtgatgtctcttttgctagtgtgattgttctagcctcgatgtggatggtcc 45489332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 194 - 371
Target Start/End: Original strand, 2740693 - 2740866
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||  | ||||||    
T  2740693 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacacct--tataagtaagaggacctataaacccagagccttaag 2740790  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  2740791 gttttacgtaagagtgtggcgtctctctcacttg--tggttgttctagcctcgatatggatggtcccccgagctcccc 2740866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 190 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16889704 - 16889524
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgta-caaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtc 288  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||| | || |    
T  16889704 ttgttgttgtgtggcaagtgtgagttatatgtctcaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttata--agtaagaggattcataaacctactgcc 16889607  T
Q  289 ttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| || |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16889606 ttaaagttttgggtaagagtatggtgtctctcttccttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacggtccctcgagctcccc 16889524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 194 - 351
Target Start/End: Original strand, 52884688 - 52884844
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||   |||||||||||| ||||||    
T  52884688 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagatgatcgataaacccattgccttaag 52884785  T
Q  294 gttttggg-taagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtg 351  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||    
T  52884786 gttttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtg 52884844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 54343147 - 54343000
Alignment:
Q  211 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| |||||||       ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54343147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggac-------cccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 54343057  T
Q  311 agtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagct 367  Q
     |||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  54343056 ggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccccgagct 54343000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 194 - 359
Target Start/End: Original strand, 20825829 - 20825992
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| | |||| || ||||||||  | | ||||||    
T  20825829 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacct--tataaataagagcacccataaacctttagccttaag 20825926  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||  ||| |  |||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  20825927 gttttgggtaagagtgtggtgtttctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacagtcc 20825992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 194 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 32941286 - 32941128
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| | || |||||| ||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  32941286 tgttgtctgcaagtgtgagttatatgtcttacatcggaaagaacagtaaaggttgaacaccttataaa--taagagggctcataaactcattgccttaag 32941189  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggac 354  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  32941188 gttttgggtaagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 32941128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 322
Target Start/End: Original strand, 52884877 - 52885007
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||    
T  52884877 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct--tataagtaagaggatccataaacccattgcctt 52884974  T
Q  291 aaggtttt-gggtaagagtgtagtgtctctctc 322  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  52884975 aaggttttggggtaagaatgtggtgtctctctc 52885007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22028537 - 22028369
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagag--taaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtc 288  Q
    ||||||||||| ||| ||| | |||||||||  ||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  22028537 tgttgttgtgtgcaagtgttacttatatgtcctacatcggataaaaaaaaataaaggttgaacaccttatt--agtaagaggacccataaactcattgtc 22028440  T
Q  289 ttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22028439 ttaatgttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 22028369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 382
Target Start/End: Original strand, 44620654 - 44620838
Alignment:
Q  195 gttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaagg 294  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||| ||   |||||||    
T  44620654 gttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatgaaatagtagaggttgaacactttata--agtaagaggacccataaacc-ataaccttaagg 44620750  T
Q  295 ttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaa 382  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||  |||||||  | |||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||    
T  44620751 ttttgggtaagagtgtggtttctctcttgcttgtgcggttgttatatcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctcatgatccaa 44620838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Original strand, 49302910 - 49303058
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49302910 tgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 49303009  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacg 355  Q
    |||| |||| |||||  ||| |  | |||||| | ||||||||||||||    
T  49303010 gtgtggtgtatctcttacttatgcgattgttctatcctcgatgtggacg 49303058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 216 - 351
Target Start/End: Original strand, 54108928 - 54109060
Alignment:
Q  216 tatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgt 315  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  54108928 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattgccttaag-ttttgggtaagagtgtggtgt 54109024  T
Q  316 ctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtg 351  Q
    |||||| ||||||  |||||||| ||| ||||||||    
T  54109025 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcttcgatgtg 54109060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 51768225 - 51768061
Alignment:
Q  192 gttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctta 291  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  51768225 gttgttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcctatatcgaatataagagtaaatgttgaacacct--tataaataagaggactcataaactcattgtctta 51768128  T
Q  292 aggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtc 358  Q
    ||||||||||||| |||    |||||||||  ||| |  | |||||| | |||||||||||||||||    
T  51768127 aggttttgggtaaaagtacgatgtctctcttacttatgggattgttctaacctcgatgtggacggtc 51768061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Original strand, 44620362 - 44620509
Alignment:
Q  210 gagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtg 309  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |   |||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44620362 gagttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagag--cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 44620459  T
Q  310 tagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |  ||| ||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  44620460 tgatgtttctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatgtggacggtcc 44620509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 193 - 358
Target Start/End: Original strand, 3700357 - 3700512
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||        ||||| |||||    
T  3700357 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacacct--tataagtaaaaggact--------cattgccttaa 3700446  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtc 358  Q
    |||||||| ||||||| |  ||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3700447 ggttttggataagagtatgatgtctctctcatttgtgtggttattcaagcctcgatgtggacggtc 3700512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23817782 - 23817681
Alignment:
Q  258 tataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggt 357  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23817782 tataagtaagaggattcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 23817683  T
Q  358 cc 359  Q
    ||    
T  23817682 cc 23817681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 194 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 54741341 - 54741215
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| |||| ||  |||||||||||    
T  54741341 tgttgtgtgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacacct--tataagtaagaggacccatacacagattgtcttaag 54741244  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctc 322  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  54741243 gttttggataagagtgtagtctctctctc 54741215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 203 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6975610 - 6975489
Alignment:
Q  203 caaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| | ||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  6975610 caaatgtgagttatatgtctcacatccgataaaatagtaaaggttgaatatcttata--agtaagaggactcataaatccattatcttaagattttgggt 6975513  T
Q  303 aagagtgtagtgtctctctcgctt 326  Q
    |||||||| | |||||||| ||||    
T  6975512 aagagtgtggcgtctctcttgctt 6975489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 224 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18932882 - 18932741
Alignment:
Q  224 acatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcg 323  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |  | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||      
T  18932882 acatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataaa--taagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctctta 18932785  T
Q  324 cttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagct 367  Q
    ||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18932784 cttgagtggttgttatagcctcgatgtgtacggtcccccgagct 18932741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 191 - 357
Target Start/End: Original strand, 43174496 - 43174661
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaa-gagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| ||   ||    
T  43174496 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacacataaacctatgacct 43174593  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggt 357  Q
    ||| || |||||||||||||| | |||||||| | || ||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  43174594 taaagtgttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtttatatggttgttgtagccttgatgtggacggt 43174661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 194 - 363
Target Start/End: Original strand, 20826210 - 20826377
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||| |||| || ||||||||||| | |||||     
T  20826210 tgttatgtagaaatgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacacgt--tataagtaagagaacccataaacccatagccttaac 20826307  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccg 363  Q
     |||| |||||||||||  |||||||||  ||| |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20826308 attttaggtaagagtgtgatgtctctcttccttatgcgattgttctagcctcgatgtggacggccctccg 20826377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 191 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 49076614 - 49076439
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||  || ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  49076614 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtaccatatcggataaaacagtaaaggttgaacacct--tataagtaagaggacctataaacccattgtctt 49076517  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    || | |||||||||| | |  |||||| |||||||| |  | |||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49076516 aaag-tttgggtaagggcg--gtgtctgtctcgcttatgcgattgttatagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 49076439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 49076997 - 49076820
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||  || || || ||||| |||||| |||||||||||||||   || |||| || |||||||||||   ||    
T  49076997 ttgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccatattggctaaaatagtaaaggttgaacaccttata---gtaagagaacccataaacccataacct 49076901  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccc 370  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  49076900 taaggttttgggttagagtgtggtgtctttcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccctgagctccc 49076820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 216 - 328
Target Start/End: Original strand, 45496820 - 45496930
Alignment:
Q  216 tatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgt 315  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45496820 tatgtcccacatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 45496917  T
Q  316 ctctctcgcttgt 328  Q
    |||||| ||||||    
T  45496918 ctctcttgcttgt 45496930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 54017876 - 54017751
Alignment:
Q  185 catcgttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctc--acatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaaccc 282  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||  |||    
T  54017876 catctttgttgttgtgtgcaaatgtgagttatatatatcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccatattccc 54017779  T
Q  283 attgtcttaaggttttgggtaagagtgt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  54017778 attgtcttaaggttttaggtaagagtgt 54017751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 207 - 321
Target Start/End: Original strand, 49880166 - 49880278
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  49880166 tgtgagttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttgggtaaga 49880263  T
Q  307 gtgtagtgtctctct 321  Q
    | || ||||||||||    
T  49880264 gcgtggtgtctctct 49880278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4390269 - 4390102
Alignment:
Q  189 gttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtc 288  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| || || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||  | | | | |||||      
T  4390269 gttgttgttgtgtgcaagtgtgagttacatatcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggatcctttagcacattgcg 4390172  T
Q  289 ttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtc 358  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4390171 ttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgcggacggtc 4390102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 191 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 16888983 - 16888789
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgta-caaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||  ||| |||| ||  |||||| ||||||||    
T  16888983 tgttgttgtgtggcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttata--agtaagagaacctataaactcattgtct 16888886  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaacaat 386  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||  | |||||| ||  ||||||| |||||||| |  |||||||||  | ||||||||||    
T  16888885 tacggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgtttgtgcgattgttctagtttcgatgtagacggtcccctaagctcccccgctgatccaacaat 16888789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 258 - 372
Target Start/End: Original strand, 31691207 - 31691323
Alignment:
Q  258 tataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtc--tctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacg 355  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||  ||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  31691207 tataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtacgattgttctagcctcgatgtggacg 31691306  T
Q  356 gtcctccgagctccccc 372  Q
     |||| |||||||||||    
T  31691307 atccttcgagctccccc 31691323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 295 - 372
Target Start/End: Original strand, 43174233 - 43174310
Alignment:
Q  295 ttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  43174233 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagccttgatgtggacggtcccccgagctccccc 43174310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 372
Target Start/End: Original strand, 3271802 - 3271959
Alignment:
Q  219 gtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttat-ataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtct 317  Q
    |||||||||| |||| || |||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3271802 gtctcacatcagatagaaaagtaaaagttaaacaccttattataagtaagagaacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgt-gtgtct 3271900  T
Q  318 ctctcg---cttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggt-cctccgagctccccc 372  Q
    ||||||    || | ||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  3271901 ctctcgtttattatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtccccccgagctccccc 3271959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 191 - 310
Target Start/End: Original strand, 3341118 - 3341235
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | ||||||| ||||||| |||||   |||||| ||    
T  3341118 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacac--tttataagtaagaggacccataacatcattgtttt 3341215  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgt 310  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  3341216 aagattttgggtaagagtgt 3341235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 258 - 372
Target Start/End: Original strand, 18879861 - 18879975
Alignment:
Q  258 tataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggt 357  Q
    ||||||| ||| |||  ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||   |||||| | | |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18879861 tataagtaagatgacctataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctcttttggttgtgtggttgttctagcttcgatgtggacggt 18879960  T
Q  358 cctccgagctccccc 372  Q
    |||||||||||||||    
T  18879961 cctccgagctccccc 18879975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34004744 - 34004575
Alignment:
Q  196 ttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggt 295  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||| |||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||||    
T  34004744 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatatgataaaa-actaaaggttgaacaacttata--agtaagaggacccataaactcattc-cttaaggt 34004649  T
Q  296 tttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcc 369  Q
    ||| | |||||||||   ||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  34004648 tttcgataagagtgtgccgtctctctcccttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacggtctcccgagctcc 34004575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 194 - 310
Target Start/End: Original strand, 2741064 - 2741178
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  2741064 tgttatgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaatagtaaaggttgaataccttata--agtaagaggacccataactccattgccttaag 2741161  T
Q  294 gttttgggtaagagtgt 310  Q
    |||||||||||||||||    
T  2741162 gttttgggtaagagtgt 2741178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 349
Target Start/End: Original strand, 19504694 - 19504842
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||            ||||||| |||||| | |||| ||    
T  19504694 ttgttgttgtgtacaagtatgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacac-----------aagaggacccataaatctattgcct 19504782  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatg 349  Q
    ||| ||||||||||||||||| | |||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19504783 taaagttttgggtaagagtgtggcgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 19504842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15841467 - 15841383
Alignment:
Q  260 taagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcct 344  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| || |||||    
T  15841467 taagtgagaggattcataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcacttgtgtggttgctctagcct 15841383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 259
Target Start/End: Original strand, 44620286 - 44620354
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttata 259  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  44620286 tgttgttgtgtacaaatatgagttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttata 44620354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 352
Target Start/End: Original strand, 54108551 - 54108686
Alignment:
Q  216 tatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacc-cattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtg 314  Q
    |||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  54108551 tatgtcccatataggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaaaaggacccataaaattcattgccttaaggttttggctaagagtgtggtg 54108648  T
Q  315 tctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgg 352  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  54108649 tctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtgg 54108686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15841146 - 15841013
Alignment:
Q  195 gttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaagg 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||| || |||  | | ||||||  || ||||||||||||||   ||||||||||||  |||||     
T  15841146 gttgtgtacaaatgtgaattatatgtcccatatcagatagaaaagtggaggctgaaca--ttttataagtgagaggatctataaacccattgctttaag- 15841050  T
Q  295 ttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatg 331  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15841049 ttttgggtaagagtgtattgtctctctcacttgtatg 15841013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 201 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 45489870 - 45489721
Alignment:
Q  201 tacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaaccc-attgtcttaaggttttg 299  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| | |  |||||||| ||| ||  | ||||||  |  || |||||||||||    
T  45489870 tacaattgtgagttatatgtatcacattggataaaagagtaaagattgaatatc--atataagtaagatgatccttaaaccttaaagt-ttaaggttttg 45489774  T
Q  300 ggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgg 352  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  45489773 ggtaatagtgtggtgtctctctcgcttgcatggttgttctagtctcgatgtgg 45489721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 284
Target Start/End: Original strand, 10246340 - 10246428
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccat 284  Q
    |||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10246340 tgttgtgtgcaagtgtctgttatatgtctcaaatcggataaaagagtaaaggttgaacatct--tataagttagaggacccataaacccat 10246428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 48111828 - 48111693
Alignment:
Q  227 tcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgctt 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| | |||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |      
T  48111828 tcggataaaagagtaaaggttgaacacattata--agtaaaaggacttataaatccattaccttaaggttttaggtatgagtgtggtgtctctctcacaa 48111731  T
Q  327 gtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccga 364  Q
     | ||||| ||| | |||| ||||||||||||| ||||    
T  48111730 atgtggtttttctaacctcaatgtggacggtcccccga 48111693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 367
Target Start/End: Original strand, 43827503 - 43827603
Alignment:
Q  266 agaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgag 365  Q
    ||||||| ||||||  ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  43827503 agaggacccataaattcattgccttaaggttt-ggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctaacctcgatgtggacggtcccccgag 43827601  T
Q  366 ct 367  Q
    ||    
T  43827602 ct 43827603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 322
Target Start/End: Original strand, 11197279 - 11197345
Alignment:
Q  256 tatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctc 322  Q
    |||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11197279 tatataagagaggagacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctctc 11197345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 335
Target Start/End: Original strand, 34544161 - 34544239
Alignment:
Q  258 tataagtgagaggactcataaacccattgtcttaagg-ttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttg 335  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||    
T  34544161 tataaatgagaggacccataaactcattgccttaaggtttttgggtaagagtgtggtatctctctcacttgtacggttg 34544239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 322
Target Start/End: Original strand, 28034222 - 28034348
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||||| || |||  | ||||||||| |||||  |||||||| || |||||||  ||||  |||||    
T  28034222 tgttgtgtgcaagtgtgaattatatgtcccgcatcggatagaaaagtggaggttgaacactttata--agtgagagaacccataaacttattgctttaag 28034319  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctc 322  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  28034320 gttttaggtaagagtgtggcgtctctctc 28034348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 338
Target Start/End: Original strand, 40067041 - 40067179
Alignment:
Q  199 tgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagt-aaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttt 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| || ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||| |||| | ||| |  |||||| |||    
T  40067041 tgtacaagtgtgagttatatgttctacatcggataaaagtgtaaaaagttgaacacat--tataagtaagaggacacatagatccactaccttaagattt 40067138  T
Q  298 tgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttc 338  Q
    ||||||| |||||  ||||||||| |||| | |||||||||    
T  40067139 tgggtaaaagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttc 40067179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 249
Target Start/End: Original strand, 45050593 - 45050649
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttga 249  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  45050593 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcaaataaaagagtaaaggttga 45050649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 289 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 39699014 - 39698919
Alignment:
Q  289 ttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaaca 384  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  |||| ||| || |||||||||||| |||||  |||||| || ||| ||||||||    
T  39699014 ttaaggttttgagtaagagtgtagcatctctcttgcttgtgcggttattctagtctcgatgtggacagtcctatgagctctcctcatcatccaaca 39698919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 315
Target Start/End: Original strand, 51681591 - 51681650
Alignment:
Q  256 tatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgt 315  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  51681591 tatataagagaggggactcatatacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgt 51681650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 322
Target Start/End: Original strand, 10396184 - 10396250
Alignment:
Q  256 tatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctc 322  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  10396184 tatataagagagaagacccataaacccattgccttagggttttaggtaagagggtggtgtctctctc 10396250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11348330 - 11348261
Alignment:
Q  292 aggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctcc 362  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  11348330 aggtttttggtaagagtgt-gtgtctctctcacttatgtggttgttcaagtctcgatgtgaaaggtcctcc 11348261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 335
Target Start/End: Original strand, 760244 - 760320
Alignment:
Q  258 tataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttg 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||    
T  760244 tataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt-ggtaaaagtgtggtgtctctctcatttgtgtggttg 760320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 263 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 11783649 - 11783560
Alignment:
Q  263 gtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgg 352  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  11783649 gtgagaggacccatacacctattgccataaagttttgggtaagagtgtgtcgtttctctcgcttgtatagttgctctagcctagatgtgg 11783560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 259
Target Start/End: Original strand, 44620934 - 44621003
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctca-catcggataaaagagtaaatgttgaacaccttata 259  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  44620934 tgttgttgtggacaagtgtgagttagatgtcccaacatcggataaaactgtaaaggttgaacaccttata 44621003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Original strand, 20695925 - 20695965
Alignment:
Q  330 tggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20695925 tggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccccgagctccc 20695965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 259
Target Start/End: Original strand, 44621420 - 44621484
Alignment:
Q  195 gttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttata 259  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  44621420 gttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatgggataaaacagtaaaggttaaacaccttata 44621484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 321
Target Start/End: Original strand, 922489 - 922536
Alignment:
Q  274 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctct 321  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  922489 cataaacccattgtcttaggggtttggataagagtgtggtgtctctct 922536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 310
Target Start/End: Original strand, 1868104 - 1868158
Alignment:
Q  256 tatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 310  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1868104 tatataagagagggaacccataaacccattgccttaaagttttgggtaagagtgt 1868158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 322
Target Start/End: Original strand, 10396469 - 10396535
Alignment:
Q  256 tatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctc 322  Q
    |||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  10396469 tatataagagaggagacccataaacccattgccttagggttttggataagagtgtggtctctctctc 10396535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 50788129 - 50788087
Alignment:
Q  211 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacac 253  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  50788129 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 50788087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 301
Target Start/End: Original strand, 45484772 - 45484817
Alignment:
Q  256 tatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttggg 301  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||    
T  45484772 tatataagtgagagaacccataaacccaatgccttaaggttttggg 45484817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11706688 - 11706636
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaa 242  Q
    |||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  11706688 ttgttgttgtgtgcaagggtgagttgtatgtcccacatcggataaaaaagtaa 11706636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 190 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 683 - 503
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  683 ttgttgttgtgcacaagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattgcct 586  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  585 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccccgagcttcccc 503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 207 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 294 - 141
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| ||||   ||| ||| ||| |||||||    
T  294 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct--tataagtaagaggac-cataaa-ccat--actttagg-tttaggtaaga 202  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagct 367  Q
     ||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  201 atgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagct 141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 191 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 1274 - 1095
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||  | ||||||||||||||||||| |||    
T  1274 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttata--agaaaaaggactcataaacccattgcctt 1177  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| | || | ||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  1176 aaggttttgggtaagagtatggtgtctctcttgtttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggttccccaagctccccc 1095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1794 - 1730
Alignment:
Q  258 tataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctc 322  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1794 tataagtgagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctctc 1730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 3153 - 3092
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaaca 252  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3153 tgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaaca 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 67)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 40296483 - 40296317
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  40296483 tgttggtgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattgcctt 40296386  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40296385 gaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 40296317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 191 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 42405764 - 42405585
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | |||||||||||||| | || |||    
T  42405764 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct--tacaagtaaaaggactcataaacctaatgcctt 42405667  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccccca 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42405666 aaggttttgggtaagagtgtggtg--tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccccca 42405585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 190 - 372
Target Start/End: Original strand, 15370088 - 15370268
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||| |||  | ||    
T  15370088 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttata--agtaagaggacccataaatccacagcct 15370185  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15370186 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccc 15370268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 190 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 36492386 - 36492219
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||  |||||| ||||  ||    
T  36492386 ttgttgttgtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggaccaataaacacattacct 36492289  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36492288 ttaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 36492219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 191 - 371
Target Start/End: Original strand, 25327925 - 25328103
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| | || |||    
T  25327925 tgttgttgtgtctaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacctaatgcctt 25328022  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  || ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  25328023 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccgagctcccc 25328103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 207 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18603272 - 18603096
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18603272 tgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 18603175  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaacaa 385  Q
    |||| |  ||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||| |||||||    
T  18603174 gtgtggcatctctcttgcttgtgtggtagttctagcctcgatgtggacggttctcctggctcccctcgtaacccaacaa 18603096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 191 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34753193 - 34753029
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||| |||| |||    
T  34753193 tgttgttgtgtacaaatgtaagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttata--agtaagaagacccataaaccgattgcctt 34753096  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggt 357  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  34753095 aaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 34753029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 352
Target Start/End: Original strand, 26074602 - 26074761
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  26074602 tgtttttgtgtacaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattgcctt 26074699  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgg 352  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| || | |||||||||||    
T  26074700 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgg 26074761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 190 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 26075331 - 26075168
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  26075331 ttgttgttgtgtacaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacacct--tataagtaagaggacccataaacccattgcct 26075234  T
Q  290 taaggttttgggt-aagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggac 354  Q
    ||||||||||||| ||||||||   |||||||| ||  || ||||||||  |||||||||||||||    
T  26075233 taaggttttgggtaaagagtgtgtcgtctctcttgcaagtgtggttgttttagcctcgatgtggac 26075168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 6500457 - 6500606
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6500457 tgtgagttatatgtc-cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacctttaaacccattgccttaaggttttgggtaaga 6500553  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6500554 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 6500606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 194 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 36568732 - 36568559
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||    
T  36568732 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacacct--tataagtgagatgacccgtaaacccattgccttaag 36568635  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36568634 gtttttggtaagagtgtggcgtctctct--cttgtgtggttgttctatcctcgatgtggaaggtcccccgagctcccc 36568559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 207 - 375
Target Start/End: Original strand, 32487400 - 32487565
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32487400 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct---ataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 32487496  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccat 375  Q
    ||||   || ||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  32487497 gtgtgacgtatctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccccaagcttcccccat 32487565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 41170640 - 41170790
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41170640 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttata--agtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 41170737  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||| |||| | ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  41170738 gtgtggtgtttttcttgcttgtgtggttgttctagcctcggtgtagacggtcc 41170790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26074311 - 26074155
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  || ||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  26074311 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatat--gtaagaggacccatgaacccattgccttaag 26074214  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgg 352  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| || | |||||||||||    
T  26074213 gttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgg 26074155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 207 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 27502188 - 27502012
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||| |    
T  27502188 tgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttata--agtaagaggacccataaacctattgccttaagatttttggtaaaa 27502091  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaacaa 385  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||    
T  27502090 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctatcctcgatgtggacggtccccctagctcccctcatgacccaacaa 27502012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 207 - 372
Target Start/End: Original strand, 624202 - 624365
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||| ||||||||| |||||  ||| ||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  624202 tgtgagttatatgtcccacattgtataaaatagtaaaggttgaacacgttata--agtaagatgacccataaacccatagccttgaggttttgggtaaga 624299  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    |||| ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  624300 gtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggttccccgagctccccc 624365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1028682 - 1028507
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||| ||   ||||||    
T  1028682 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttata--agtaagaggacccataaacctataaccttaag 1028585  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1028584 gtttttggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccc 1028507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 359
Target Start/End: Original strand, 41632775 - 41632938
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||  |||||    
T  41632775 tgttgtgtgcaagtgtaagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccaatgctttaag 41632872  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||  || |||||||||||||||||    
T  41632873 attttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagtctcgatgtggacggtcc 41632938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 196 - 359
Target Start/End: Original strand, 35150002 - 35150162
Alignment:
Q  196 ttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggt 295  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||| |||| || |||||| |||||||||||||||    
T  35150002 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttata--agtaagag-acccataaatccattgtcttaaggt 35150098  T
Q  296 tttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||| | |||| |||||||| ||||    
T  35150099 tttgggtaaaagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcaatgtggaccgtcc 35150162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 197 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 3295176 - 3294993
Alignment:
Q  197 tgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggtt 296  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  3295176 tgtgtgcaagtgtgagt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaagacccataaacccattgccttgaggtt 3295080  T
Q  297 ttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaac 383  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||| |||||||    
T  3295079 ttgggtatgagtgtggtgtctctcttggttgtgtggttgttgtagcctcgatgtggacagtccccctcgctcccctcatgatccaac 3294993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 193 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3295509 - 3295347
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    |||||||||  || ||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| |||| |||||    
T  3295509 ttgttgtgtggaagtgtgagt-atatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaaccaattgccttaa 3295413  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3295412 ggttttgg-taagagtgtgttgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3295347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 191 - 371
Target Start/End: Original strand, 299479 - 299658
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||| ||| | |||    
T  299479 tgttgttgtgcgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacacct--tataagtaagatgacccataaactcatagcctt 299576  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctcc-gagctcccc 371  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| | ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| || |||||||||    
T  299577 aaggttttgtgtaagagtgtggcgtctctattgcttgtacggttgttctagcatcgatgtggacagtcccccggagctcccc 299658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 190 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12662821 - 12662654
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||  || ||||||| |||  || |||||| |||||||||    
T  12662821 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca--ttttataagtaagaaaacccataaatccattgtct 12662724  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  12662723 taagtttttgggtaagagtgtggtgcctttcttgcttgtggggttcttctagcctcgatgtggtcggtcc 12662654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 194 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13415925 - 13415774
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| |||  ||||||    
T  13415925 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaattagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacctattaccttaag 13415828  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcga 347  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  |||||||| ||||||||    
T  13415827 gttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcga 13415774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Original strand, 6224186 - 6224352
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||    
T  6224186 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaaggttgaacacct--tataagtaagaggacccataaactcatcgcctt 6224283  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||  | ||||||  ||||| || |||||| || ||||||||||    
T  6224284 aaggtttttggtaagagtgtggtgcctcagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatatggacggtcc 6224352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 203 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 9498810 - 9498645
Alignment:
Q  203 caaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9498810 caaatgtgagttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattgccttaagattttgggt 9498713  T
Q  303 aagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||||||| |||||||||| | || | | | || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  9498712 aagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gctggtctagcctcaatgtggacggtccccctagctcccc 9498645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26074950 - 26074821
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||    
T  26074950 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacac--aatataagtaggaggacccataaacctattgtctt 26074853  T
Q  291 aaggttttgggt-aagagtgtagtgtctctct 321  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  26074852 aaggttttgggtaaagagtgtggcgtctctct 26074821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 6500829 - 6500978
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  | | ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  6500829 tgtgagttatatgtc-cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaa--taaaaggacccataaactcattgccttaaggttttggataaga 6500925  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    |||| ||||||||||  |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  6500926 gtgtggtgtctctcttacttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcc 6500978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 371
Target Start/End: Original strand, 15370428 - 15370570
Alignment:
Q  227 tcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgctt 326  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||||| | ||    
T  15370428 tcggatgaaacagtaaatgttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtggcgtctctcttgttt 15370525  T
Q  327 gtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15370526 gtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccatgctcccc 15370570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11417143 - 11416979
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||| |||    
T  11417143 tgttgttgtgtgcaa--gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggatccataaacccattgcctt 11417048  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  11417047 aaggttttgtgtaagagtgtgatctctctcttgcttgtgggattgttctagcttcgatgtggatggtcc 11416979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 41635360 - 41635217
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||  |||||| |||||||||    
T  41635360 ttgttgttgtgtataagtatgagttatatgtttcccatcagataaaagagtaaatgttgaacacct--tataaataagaggatccataaatccattgtct 41635263  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttg 335  Q
    |||  |||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  41635262 taaaattttaggtaagagtgtagtatctcttttacttgtatggttg 41635217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 371
Target Start/End: Original strand, 38427554 - 38427715
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  38427554 tgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacatcttata--agt-agaggacccattaatccattgtcttaaggttttgtgtaaga 38427650  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    ||||   ||||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||| | || ||||||||||||    
T  38427651 gtgtgacgtctctctcacttgtgcggttgttctaacctcgatgtggatgatcttccgagctcccc 38427715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 207 - 369
Target Start/End: Original strand, 623824 - 623984
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| |  ||| ||  ||  |||||||  || | |||||||||||| ||||||    
T  623824 tgtgagttatatgtctcacatcggatataatagtaaaggttgaacactttaca--agtaagttgagccataaacttatagccttaaggttttgagtaaga 623921  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcc 369  Q
    |||| ||||||||||| |||||  |||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  623922 gtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcaatgtagacggtcccccgagctcc 623984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 190 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 35168007 - 35167840
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||  || ||| |||||| | |||| ||    
T  35168007 ttgttgttgtgtacaagtatgagttatgtatctcacatcagataaaagagtaaaggttgaacacct--tataagtaggatgacccataaatctattgcct 35167910  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    | | ||||| |||||||||||  |||||||| | || || ||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  35167909 tgatgtttttggtaagagtgtgatgtctctcacactagtgtggttgttctagcatcgatgtggactgtcc 35167840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 207 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 36522389 - 36522270
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || | |  | ||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36522389 tgtgagttatatgtctcacattggatagaaaaatggaagttgaaca--ttttataagtgagaggaccaataaacccattatcttaaggttttgggtaaga 36522292  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgt 328  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  36522291 gtgtggtgtctctctcacttgt 36522270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 371
Target Start/End: Original strand, 300948 - 301119
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||  ||| ||||        || |||||| ||    
T  300948 ttgtttttgtgtacaagtgtgggttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttata--agtaagag--------aatccattgcct 301037  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  301038 taagatttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggctgttcaagtctcgacgtgaacggtcctccgaactcccc 301119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 193 - 323
Target Start/End: Original strand, 31509615 - 31509744
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| |||  | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  31509615 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcac--tttataagtgagaggactcataaactcattgccttga 31509712  T
Q  293 gg-ttttgggtaagagtgtagtgtctctctcg 323  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  31509713 ggttttttggtaagaatgtagtgtctctctcg 31509744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Original strand, 35914839 - 35915005
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||| ||| | |||| |||||| | |    
T  35914839 tgttgttgtgtataagtatgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaggttgaaca--ttttataagtaagaagacccgtaaatccattgccct 35914936  T
Q  291 aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||  | |||| ||||| ||| || ||||||| |||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||    
T  35914937 aaattattggataagaatgtggtatctctcttgcttatatgattggtcaaacctcaatgtggacggtcc 35915005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5723943 - 5723814
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||  || |||| || ||| ||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  5723943 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaataataaaagttgaacacattatat--gtaagagaacccattaatttattgtcttaaggttttgggaaaga 5723846  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttc 338  Q
    || |||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  5723845 gtatagtgtctctcttgcttgtgcggttgttc 5723814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 357
Target Start/End: Original strand, 33747783 - 33747925
Alignment:
Q  213 ttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtag 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || |||||  ||| ||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| |    
T  33747783 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaatactttata--agtaagaggatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtgg 33747880  T
Q  313 tgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggt 357  Q
    |||||||||  ||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33747881 tgtctctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacggt 33747925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 289 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26900089 - 26900006
Alignment:
Q  289 ttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccc 372  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  26900089 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggtttgttctagccttgatgtggacggtcccccaagctccccc 26900006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29549407 - 29549276
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    ||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||| | ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||| |||||    
T  29549407 tgtgagttatatgttccatatcagataaaatagtaaaggatgaacacc--atataagtaagaagacccataaacacattaccttaaggttttggataaga 29549310  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaa 340  Q
    |||| | |||||||| |||| | |||||||||||    
T  29549309 gtgtggcgtctctcttgcttatgtggttgttcaa 29549276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 335
Target Start/End: Original strand, 31509745 - 31509864
Alignment:
Q  215 atatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaagg-ttttgggtaagagtgtagt 313  Q
    ||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||| ||| ||    
T  31509745 atatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttata--agtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtggt 31509842  T
Q  314 gtctctctcgcttgtatggttg 335  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  31509843 gtctctctcgcttgtacggttg 31509864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 298
Target Start/End: Original strand, 42508604 - 42508707
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| || |||||| ||| |||| || |||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  42508604 ttgttgtgtacaagtgtgaattatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaata--agtaagaggactcataaacccattgccttaa 42508701  T
Q  293 ggtttt 298  Q
    ||||||    
T  42508702 ggtttt 42508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 371
Target Start/End: Original strand, 2411013 - 2411175
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaaga 306  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| |  |||||| |||||||| ||| ||  ||| |||| || |||||||  |||| |||||||||||| ||||||    
T  2411013 tgtgagttatatgtcctacattggatagagaagtaaaagttgaacatcttgta--agtaagagaacccataaacttattgccttaaggttttgagtaaga 2411110  T
Q  307 gtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccc 371  Q
    ||||||| ||||| |  |||| ||| |||||| | ||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  2411111 gtgtagtttctctattacttgaatgattgttctaacctcgatatggacggtcccccaagctcccc 2411175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 259
Target Start/End: Original strand, 39309677 - 39309742
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttata 259  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  39309677 tgttgtgtacaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagggtaaatgttgaacacattata 39309742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24489369 - 24489208
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||| || || ||| ||| ||||||||||   ||| |||  || ||||||||||||| ||||||    
T  24489369 tgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagaaaaggttaaacaccttatt--agtaaga--acccataaacccattgccttaag 24489274  T
Q  294 gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
     ||||| |||||||||| | |||||| |  |||||  |||||||| || |||||||||| ||||||    
T  24489273 attttgcgtaagagtgtggcgtctcttttacttgtgcggttgttctagtctcgatgtgggcggtcc 24489208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 36522061 - 36521947
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaag 293  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| |||| || |||  | |||||||||  | | ||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  36522061 tgttgtgcgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttgaacac--tctttaaatgagaggacccataaaccaattgccttaag 36521964  T
Q  294 gttttgggtaagagtgt 310  Q
    |||||||||||||||||    
T  36521963 gttttgggtaagagtgt 36521947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26591031 - 26590918
Alignment:
Q  238 agtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgtt 337  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||  || || |||||||||||| |||||||||| | ||||||||| || || ||||||||    
T  26591031 agtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggatccataaattcaatgccttaaggttttgagtaagagtgtggcgtctctctcactagtgtggttgtt 26590934  T
Q  338 caagcctcgatgtgga 353  Q
    | | ||||||||||||    
T  26590933 ctaacctcgatgtgga 26590918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 338
Target Start/End: Original strand, 39003543 - 39003676
Alignment:
Q  203 caaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggt 302  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||  |||| | ||||||||| ||||| ||    
T  39003543 caaatgtgagtaatatgtctgacatcggatgaaaatgtaaatgttgaaca--ttatataagtgagatgacccaataacctaatgtcttaagattttgagt 39003640  T
Q  303 aagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttc 338  Q
     | | ||| |||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  39003641 taaaatgtggtgtttctctcacttatatgattgttc 39003676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 322
Target Start/End: Original strand, 13042592 - 13042658
Alignment:
Q  256 tatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctc 322  Q
    |||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13042592 tatataagagaggagacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctctc 13042658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 322
Target Start/End: Original strand, 13112590 - 13112656
Alignment:
Q  256 tatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctc 322  Q
    |||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  13112590 tatataagagaggagacccataaacccattgtcttaaggttttggataagagtgtggtgtctttctc 13112656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26900139 - 26900089
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagt 240  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  26900139 ttgttgttgtgtacaaatttgagttatatgtcccacatcagataaaagagt 26900089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 249
Target Start/End: Original strand, 35150737 - 35150795
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttga 249  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  35150737 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatattga 35150795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 249
Target Start/End: Original strand, 35151028 - 35151086
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttga 249  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  35151028 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatattga 35151086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 298
Target Start/End: Original strand, 42524717 - 42524811
Alignment:
Q  201 tacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggtttt 298  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||  |  | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42524717 tacaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaa-gttgaacatcttatgaa--taagaggactcataaatccattgtctgaaggtttt 42524811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13785718 - 13785634
Alignment:
Q  275 ataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||||||||||   |||||||||||  |||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  13785718 ataaacccataaccttaaggttttaagtaaaagtgtggtgtttctctcgtttgtatggttgttctaacttcgatgtggacggtcc 13785634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 370
Target Start/End: Original strand, 38427306 - 38427386
Alignment:
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccc 370  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||  |||||||| | ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  38427306 taagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgttggcggtcccccgagctccc 38427386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13786166 - 13786003
Alignment:
Q  194 tgttgtgtacaaatgtgagttat-atgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    ||||||| |||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||| |||||  ||| ||| ||| | |||| | ||||||||||    
T  13786166 tgttgtgcacaagtgtgagtaattatgtttcacatcggataaaa-agtgatggttgaacactttata--agtaagatgacccgtaaatctattgtcttaa 13786070  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    | |||||| |||||||||  |||||||||| ||  |||| ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  13786069 gattttggataagagtgtgatgtctctctcactattatgattgttctggcctcgttgtcgacggtcc 13786003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 328
Target Start/End: Original strand, 32445943 - 32446010
Alignment:
Q  261 aagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgt 328  Q
    |||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||    
T  32445943 aagtgagaggacccataaacccaacgccttaaggttttgggttaaagtgtggtgtctctctcacttgt 32446010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36527196 - 36527118
Alignment:
Q  260 taagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttc 338  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||  |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  36527196 taagtgagaggatccataaacgcattgccttaagattttggataagagtgtgctgtctctctcacttgtgtggctgttc 36527118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 315
Target Start/End: Original strand, 34103607 - 34103666
Alignment:
Q  256 tatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtagtgt 315  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  34103607 tatataagagagagaactcataaactcattgccttaaggttttgaataagagtgtggtgt 34103666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 795305 - 795255
Alignment:
Q  288 cttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttc 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||    
T  795305 cttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttc 795255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 259
Target Start/End: Original strand, 6225052 - 6225102
Alignment:
Q  209 tgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttata 259  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6225052 tgagttatatatcccacatcagataaaagaataaaggttgaacaccttata 6225102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 283
Target Start/End: Original strand, 26074324 - 26074398
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaaccca 283  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| || | ||||  ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26074324 tgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaactaaagattgaacacct--tataagtaagaggacccataaaccca 26074398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 7768856 - 7768908
Alignment:
Q  207 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttata 259  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  7768856 tgtgagttatatatcctacatcggataaaataataaaggttgaacaccttata 7768908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 36527249 - 36527209
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggata 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36527249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagata 36527209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 190 - 352
Target Start/End: Original strand, 5385 - 5546
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||  |||||||    
T  5385 ttgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct--tataagtaagagggcccataaacatattgtct 5482  T
Q  290 t-aaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgg 352  Q
    | ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5483 taaagtttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcaagcctcgatgtgg 5546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 191 - 352
Target Start/End: Original strand, 5767 - 5931
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  5767 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct--tataagtaagaggacccataaacccattgcctt 5864  T
Q  291 aag-----gttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgg 352  Q
    |||      ||||| |||||||||| |||||||| |  |||||  |||||||||| | |||||||||    
T  5865 aagattaaattttgagtaagagtgtggtgtctcttttacttgtggggttgttcaaacttcgatgtgg 5931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 193 - 321
Target Start/End: Original strand, 5349 - 5475
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 292  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5349 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttata--agtaagaggacccataaacccattgccttaa 5446  T
Q  293 ggttttgggtaagagtgtagtgtctctct 321  Q
    | |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5447 gattttggataagagtgtggtgtctctct 5475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 354
Target Start/End: Original strand, 4970 - 5133
Alignment:
Q  189 gttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtc 288  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| ||| || | ||||||  ||| | | ||| ||||||| ||||| |    
T  4970 gttgttgttgtgtgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttata--agtaaaaagacccataaactcattgcc 5067  T
Q  289 ttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggac 354  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||||    
T  5068 ttatggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggac 5133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 359
Target Start/End: Original strand, 47349 - 47516
Alignment:
Q  190 ttgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtct 289  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||  ||| |||| |  ||||||||||||| ||    
T  47349 ttgttgatgtgtgcaagtgtgaattaaatgtctcacatccgataaaatagtaaagtttgaacaccttata--agtaagagaatccataaacccattgcct 47446  T
Q  290 taaggttttgggtaagagtgtagtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 359  Q
    ||| ||||||||||| | ||| |||||||||| |||||   |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  47447 taaagttttgggtaaaaatgtggtgtctctcttgcttgcgcggttgttctaacctcgatgtggacggtcc 47516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 191 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 17624 - 17496
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaacccattgtctt 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||  | ||||| ||||||| ||||||||||| | |||    
T  17624 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaacacct--tgtaagtaagaggacccataaacccatagcctt 17527  T
Q  291 aagg--ttttgggtaagagtgtagtgtctct 319  Q
    ||||  |||||||||||||| | ||||||||    
T  17526 aaggttttttgggtaagagtatggtgtctct 17496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 10279 - 10192
Alignment:
Q  191 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttatataagtgagaggactcataaac 280  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||    
T  10279 tgttgttgtgcacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacacct--tataagtaagaggacccataaac 10192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 233
Target Start/End: Original strand, 39830 - 39870
Alignment:
Q  193 ttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggata 233  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  39830 ttgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 39870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University