View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10470_low_16 (Length: 314)

Name: NF10470_low_16
Description: NF10470
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10470_low_16
NF10470_low_16
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (1-312)||(33965-34276)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (1-312)||(7341235-7341546)
chr8 (1-312)||(32377502-32377813)
chr8 (1-312)||(32431459-32431770)
chr8 (1-312)||(8422450-8422761)
chr8 (1-304)||(30304204-30304507)
chr8 (1-304)||(35965339-35965642)
chr8 (1-304)||(43688765-43689068)
chr8 (1-304)||(43370931-43371234)
chr8 (1-300)||(2145593-2145897)
chr8 (1-302)||(45455542-45455843)
chr8 (1-304)||(7169064-7169358)
chr8 (132-304)||(1115936-1116108)
chr8 (1-235)||(22581061-22581295)
chr8 (151-304)||(39751772-39751925)
chr8 (1-133)||(45116582-45116714)
chr8 (1-133)||(44321173-44321305)
chr8 (9-167)||(14401375-14401532)
chr8 (22-138)||(17316787-17316903)
chr8 (29-112)||(13781580-13781663)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (1-312)||(43622729-43623040)
chr7 (1-312)||(30787695-30788006)
chr7 (1-312)||(45764535-45764846)
chr7 (1-312)||(617343-617654)
chr7 (1-304)||(18106552-18106855)
chr7 (1-304)||(42500571-42500874)
chr7 (1-304)||(47062047-47062350)
chr7 (1-304)||(43827200-43827503)
chr7 (1-195)||(15067162-15067356)
chr7 (48-304)||(8400750-8401006)
chr7 (191-304)||(15060777-15060890)
chr7 (21-133)||(1297321-1297433)
chr7 (1-76)||(12116963-12117038)
chr7 (1-158)||(16795690-16795847)
chr7 (1-133)||(16794207-16794339)
chr7 (1-133)||(40445159-40445291)
chr7 (21-133)||(43378922-43379034)
chr7 (1-133)||(47867093-47867225)
chr7 (1-133)||(45172503-45172635)
chr7 (21-133)||(46791660-46791772)
chr7 (30-146)||(8193903-8194019)
chr7 (1-133)||(40794258-40794390)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (1-312)||(49565058-49565369)
chr4 (1-304)||(19072251-19072554)
chr4 (1-304)||(3404954-3405257)
chr4 (1-304)||(9891186-9891489)
chr4 (1-304)||(41024363-41024666)
chr4 (1-304)||(4769298-4769601)
chr4 (1-304)||(4976919-4977222)
chr4 (1-304)||(38463431-38463734)
chr4 (1-304)||(44049774-44050077)
chr4 (1-304)||(11502670-11502973)
chr4 (1-304)||(4978552-4978851)
chr4 (1-304)||(21471958-21472261)
chr4 (120-304)||(51643211-51643395)
chr4 (1-271)||(6182875-6183145)
chr4 (193-304)||(18580117-18580225)
chr4 (1-133)||(32716628-32716760)
chr4 (1-133)||(1591168-1591300)
chr4 (21-106)||(4617919-4618004)
chr4 (21-133)||(17916521-17916633)
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (1-312)||(3949899-3950210)
chr3 (1-312)||(8159577-8159888)
chr3 (1-304)||(6742051-6742354)
chr3 (1-312)||(30946236-30946547)
chr3 (1-304)||(13746315-13746618)
chr3 (1-304)||(16445784-16446087)
chr3 (1-304)||(36816110-36816413)
chr3 (1-304)||(14399719-14400023)
chr3 (1-302)||(46991840-46992141)
chr3 (1-304)||(7841610-7841912)
chr3 (19-304)||(48249479-48249764)
chr3 (84-304)||(9428510-9428730)
chr3 (1-304)||(6504549-6504852)
chr3 (1-302)||(77614-77915)
chr3 (1-304)||(21954833-21955135)
chr3 (1-304)||(7838760-7839063)
chr3 (1-260)||(29949193-29949451)
chr3 (1-260)||(29998347-29998605)
chr3 (13-260)||(29908027-29908273)
chr3 (21-109)||(28610533-28610621)
chr3 (1-126)||(9556358-9556483)
chr3 (256-304)||(29930532-29930580)
chr3 (256-304)||(29979686-29979734)
chr3 (21-133)||(2284671-2284783)
chr3 (1-133)||(40467802-40467934)
chr3 (45-133)||(4120432-4120520)
chr3 (21-133)||(12491422-12491534)
chr3 (1-133)||(33940190-33940322)
chr3 (21-133)||(51548147-51548259)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (1-312)||(212035-212346)
chr2 (1-312)||(5348323-5348634)
chr2 (1-312)||(41561168-41561479)
chr2 (1-312)||(10623048-10623359)
chr2 (1-304)||(27274954-27275257)
chr2 (1-306)||(38946925-38947230)
chr2 (1-304)||(39795134-39795437)
chr2 (1-304)||(3802160-3802463)
chr2 (1-304)||(24750822-24751126)
chr2 (1-304)||(1098420-1098723)
chr2 (5-302)||(45476524-45476820)
chr2 (12-304)||(24604694-24604986)
chr2 (1-304)||(12907086-12907389)
chr2 (1-304)||(43948876-43949179)
chr2 (1-304)||(41007574-41007877)
chr2 (1-304)||(34920376-34920679)
chr2 (1-304)||(436475-436779)
chr2 (1-304)||(9655320-9655623)
chr2 (54-304)||(28354549-28354799)
chr2 (1-219)||(7264229-7264447)
chr2 (58-304)||(11692466-11692712)
chr2 (1-304)||(17996766-17997069)
chr2 (12-111)||(24941255-24941354)
chr2 (5-158)||(28423072-28423225)
chr2 (20-111)||(3353894-3353985)
chr2 (9-150)||(21535507-21535642)
chr2 (1-44)||(11692424-11692467)
chr2 (266-304)||(7264196-7264234)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (1-312)||(3947055-3947366)
chr1 (1-312)||(3984269-3984580)
chr1 (1-312)||(44466738-44467049)
chr1 (1-312)||(20350612-20350923)
chr1 (1-312)||(38774709-38775020)
chr1 (1-304)||(29355282-29355585)
chr1 (1-304)||(5079099-5079402)
chr1 (1-304)||(13630580-13630883)
chr1 (1-304)||(41455001-41455304)
chr1 (1-304)||(37016078-37016381)
chr1 (1-304)||(50116357-50116660)
chr1 (1-304)||(12649173-12649476)
chr1 (1-304)||(38691533-38691836)
chr1 (1-304)||(46974328-46974631)
chr1 (1-304)||(13174945-13175248)
chr1 (1-304)||(51663422-51663725)
chr1 (20-304)||(21942977-21943261)
chr1 (1-221)||(19498058-19498277)
chr1 (18-297)||(32106265-32106533)
chr1 (209-304)||(44619905-44620000)
chr1 (143-297)||(26466006-26466160)
chr1 (1-133)||(36360114-36360246)
chr1 (1-133)||(28863225-28863357)
chr1 (263-304)||(7980068-7980109)
chr1 (1-133)||(45472687-45472819)
chr1 (38-133)||(7403953-7404048)
chr1 (21-106)||(20240037-20240122)
chr1 (1-133)||(18887388-18887520)
chr1 (115-212)||(25231558-25231655)
chr1 (1-106)||(27283402-27283507)
chr1 (18-131)||(31445866-31445979)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (1-304)||(2045-2348)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (1-312)||(1611345-1611656)
chr6 (1-304)||(31147486-31147789)
chr6 (1-304)||(29287547-29287845)
chr6 (1-229)||(28357557-28357785)
chr6 (1-304)||(18607160-18607463)
chr6 (1-304)||(21357944-21358244)
chr6 (1-304)||(23961926-23962226)
chr6 (230-304)||(28251060-28251134)
chr6 (228-304)||(24220332-24220408)
chr6 (1-133)||(9095463-9095595)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (1-304)||(37819471-37819774)
chr5 (1-304)||(28885002-28885305)
chr5 (1-304)||(7020474-7020777)
chr5 (1-304)||(11032046-11032349)
chr5 (1-304)||(38858784-38859087)
chr5 (1-304)||(34078944-34079247)
chr5 (1-304)||(27866439-27866742)
chr5 (3-304)||(7799602-7799903)
chr5 (1-304)||(18536930-18537233)
chr5 (1-304)||(4202533-4202836)
chr5 (1-304)||(1036515-1036818)
chr5 (1-304)||(25895691-25895998)
chr5 (1-304)||(13566701-13566988)
chr5 (1-297)||(20287439-20287736)
chr5 (66-297)||(20286180-20286410)
chr5 (21-133)||(11819551-11819663)
chr5 (1-133)||(27013263-27013395)
chr5 (1-133)||(42343826-42343957)
chr5 (1-133)||(43295549-43295681)
chr5 (53-158)||(25053043-25053148)
chr5 (1-133)||(6553124-6553256)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (1-304)||(15951-16254)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (1-304)||(17233-17536)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (151-304)||(12426-12580)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (1-64)||(25540-25603)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (1-57)||(44-100)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-133)||(28480-28612)


Alignment Details
Target: scaffold0101 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34276 - 33965
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34276 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 34177  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34176 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 34077  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34076 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 33977  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    ||||||| ||||    
T  33976 gtctctggttct 33965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 7341546 - 7341235
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341546 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 7341447  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341446 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 7341347  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341346 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 7341247  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    ||||||| ||||    
T  7341246 gtctctggttct 7341235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 32377502 - 32377813
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377502 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 32377601  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377602 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 32377701  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377702 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 32377801  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    ||||||| ||||    
T  32377802 gtctctggttct 32377813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 32431459 - 32431770
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431459 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 32431558  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431559 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 32431658  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431659 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 32431758  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    ||||||| ||||    
T  32431759 gtctctggttct 32431770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 8422450 - 8422761
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422450 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 8422549  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422550 aaacaatataatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 8422649  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422650 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 8422749  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    ||||||| ||||    
T  8422750 gtctctggttct 8422761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 30304204 - 30304507
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304204 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 30304303  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304304 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 30304403  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304404 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 30304503  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  30304504 gtct 30304507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 35965339 - 35965642
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965339 tcaaatcggtcgaagggaccccaactacctcaaatattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 35965438  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965439 aaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcaactgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 35965538  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965539 ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 35965638  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  35965639 gtct 35965642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 43688765 - 43689068
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43688765 tcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 43688864  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||  || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43688865 aaacaacttaacggattttggatgagcccaaaagatatcttcgattatagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcccccaac 43688964  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43688965 ttcgaaattagaaattgcaacggcttcttatcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 43689064  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  43689065 gtct 43689068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43371234 - 43370931
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43371234 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacgttgacatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 43371135  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43371134 aaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagctgtgctcctccaac 43371035  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43371034 ttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcagctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 43370935  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  43370934 gtct 43370931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 2145593 - 2145897
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2145593 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 2145692  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2145693 aaacaacttaacgaatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 2145792  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccc-----tatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgca 295  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2145793 ttcgagattagatattgcaacaacttcttgtcacctctattatatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgca 2145892  T
Q  296 atgtg 300  Q
    |||||    
T  2145893 atgtg 2145897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 45455843 - 45455542
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  45455843 tcaaatcgatcgaagtgatcccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggttttgttggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaaatttt 45455744  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || ||  ||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45455743 aaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaaaatatatttgattgtggtactttcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaac 45455644  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45455643 ttcgagattagatattgcaacggctttttgtcacctctatttgcctttcatatttgttgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatatg 45455544  T
Q  301 gt 302  Q
    ||    
T  45455543 gt 45455542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7169358 - 7169064
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7169358 tcaaatcggtcaaagtgaccctaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagttcataaccaaaatcgttggaaaattgtt 7169259  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7169258 aaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcatccaac 7169159  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    || ||||||| | |||||||||         |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7169158 tttgagattatatattgcaacg---------cacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatggaatgtg 7169068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 132 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1116108 - 1115936
Alignment:
Q  132 aaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgt 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1116108 aaaacatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgt 1116009  T
Q  232 cacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1116008 cacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacatttgtttcacatttgtcatgcaatgtggtct 1115936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22581295 - 22581061
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22581295 tcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgcaggtggagtccataaccaaaaccgttagaaaattgtt 22581196  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22581195 aaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatattttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 22581096  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacc 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22581095 ttcgagattagatattgcaacggattcttgtcacc 22581061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 151 - 304
Target Start/End: Original strand, 39751772 - 39751925
Alignment:
Q  151 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 250  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39751772 tactttcactttgtgttcttgagtaataagtgaagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaatggtttcttgtcacctctatttgccttcca 39751871  T
Q  251 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39751872 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 39751925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 45116714 - 45116582
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| |||||| || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || |||||||||||    
T  45116714 tcaaataggttgaggtaactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaattgtt 45116615  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  45116614 aaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 45116582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 44321305 - 44321173
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| |||||| || || |||||||  ||||||| |  ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || | |||| ||||    
T  44321305 tcaaataggttgaggtaactccaactatttcaaacaataacattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcgaaaaagtgtt 44321206  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  44321205 aaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 44321173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 14401375 - 14401532
Alignment:
Q  9 gttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatt 108  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| || || ||| |||| || | ||||||  | | |||||| |||||||| |    
T  14401375 gttgaggtgaccccaactatctcaaacaatgacatcctatacgtgttggttttataggtgaagtcgatgaacaaaactatcgaaaaattattaaacaact 14401474  T
Q  109 taatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgtt 167  Q
    |||  |||   |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||  |||||||    
T  14401475 taacagattcaggatgagcccaaaatatatcatgaatagta-tactttcacattgtgtt 14401532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 17316903 - 17316787
Alignment:
Q  22 caactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgg 121  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||| ||| | | ||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||||  |||  |||    
T  17316903 caactatctcaaacaatggcatcatgtacaagttggttttgtatgtgaaattcatgatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaacttaaatgattgtgg 17316804  T
Q  122 atgagcccaaaaaatat 138  Q
     ||||| ||||||||||    
T  17316803 gtgagctcaaaaaatat 17316787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 112
Target Start/End: Original strand, 13781580 - 13781663
Alignment:
Q  29 ctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaat 112  Q
    ||||||||  ||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||| | |||||||||    
T  13781580 ctcaaacaacggcattcgatagatgttggttttgtaagtggagtccatgaccaaaacggtcggaaaagtgttgagcaatttaat 13781663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 43622729 - 43623040
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622729 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 43622828  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622829 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 43622928  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622929 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 43623028  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    ||||||| ||||    
T  43623029 gtctctggttct 43623040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30788006 - 30787695
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30788006 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 30787907  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787906 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 30787807  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787806 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgctttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 30787707  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    || |||| ||||    
T  30787706 gtatctggttct 30787695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 45764846 - 45764535
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764846 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgctggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 45764747  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764746 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 45764647  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45764646 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcgcatttgtcatgcaatgtg 45764547  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    ||||||| ||||    
T  45764546 gtctctggttct 45764535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 617343 - 617654
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  617343 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaatcgttggaaaattgtt 617442  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617443 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 617542  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617543 ttcgagattagaaattgcaacggtttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 617642  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    ||||||| ||||    
T  617643 gtctctggttct 617654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18106855 - 18106552
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106855 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattagcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 18106756  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106755 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 18106656  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106655 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 18106556  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  18106555 gtct 18106552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 42500874 - 42500571
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500874 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 42500775  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500774 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 42500675  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500674 ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 42500575  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  42500574 gtct 42500571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 47062350 - 47062047
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  47062350 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacattttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaatttttt 47062251  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47062250 aaacaacttaacggatgttggatgagcccgaaagatatcttcaattgtagtactttcactttgtgtt-ttgagtaataagtatagttgtgctcttccaac 47062152  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtc-acccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47062151 ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcaacctctatttgccttccatatttgttgacgttcatcgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgt 47062052  T
Q  300 ggtct 304  Q
    |||||    
T  47062051 ggtct 47062047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 43827200 - 43827503
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaa-gtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgt 99  Q
    |||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43827200 tcaaatcggtcgaaagtgacccaaactacctcaaacattggcatcttgtacacgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccattggaaaattgt 43827299  T
Q  100 taaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaa 199  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||    
T  43827300 taaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatattttcaattgtagtactttcactttgtgttcttgtgaaataagtatagttgtgctcattcaa 43827399  T
Q  200 cttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgt 299  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  43827400 cttcgaga-tagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgctgacgttcattgtacacttgcttgatatttgtcatgcaatgt 43827498  T
Q  300 ggtct 304  Q
    |||||    
T  43827499 ggtct 43827503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15067356 - 15067162
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067356 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtatgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 15067257  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcct 195  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067256 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcct 15067162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 48 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 8401006 - 8400750
Alignment:
Q  48 tacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatag 147  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  8401006 tacatgttggttttgtaggtgaaatccataaccaaaaccgttagaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaaaatatctttaattg 8400907  T
Q  148 tattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcctt 247  Q
    || ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  8400906 tagtactttcactttgtgttcttgagaaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgccgtcttgtcacctctatttgcctt 8400807  T
Q  248 ccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 304  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  8400806 ccatatttgttgacgttcaatgtacacttgcttgatatttgtcatccaatgtggtct 8400750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 191 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15060890 - 15060777
Alignment:
Q  191 ctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtc 290  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15060890 ctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtc 15060791  T
Q  291 atgcaatgtggtct 304  Q
    ||||||||||||||    
T  15060790 atgcaatgtggtct 15060777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1297433 - 1297321
Alignment:
Q  21 ccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttg 120  Q
    |||||||  ||||| | |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||    
T  1297433 ccaactatttcaaaaaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagttggaaaaatgttaaacaactttatcgatgttg 1297334  T
Q  121 gatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| ||||||    
T  1297333 gatgagtccaaaa 1297321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 12116963 - 12117038
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccat 76  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12116963 tcaaatcggccgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccat 12117038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 16795690 - 16795847
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| ||||||||| |   ||||||  ||||||| ||||||| | |||| ||| || |||||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  16795690 tcaaataggttgaagtgagttcaactatttcaaacaatggcatcatgtacaagtttgttttgtacatggaatccattatcaaaacagttggaaaattgtt 16795789  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttca 158  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| |||||| |  |||| || ||| |||||||||    
T  16795790 aaacaattttaccgatgttggatgagtccaaaataagtcttgaacagttttactttca 16795847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 16794207 - 16794339
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| |||||| || || |||||||  ||||||| ||||||| | |||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||| || |||||||||||    
T  16794207 tcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcatcatgtacaagtttgttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaattgtt 16794306  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| || |  |||||| |||||| ||||||    
T  16794307 aaacaactttactgatgtttgatgagtccaaaa 16794339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 40445159 - 40445291
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| |||||| || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||| |||| ||||| | |||||| ||  ||||| ||||    
T  40445159 tcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacatggaatccattatcaaaacagtcagaaaagtgtt 40445258  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  40445259 aaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 40445291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Original strand, 43378922 - 43379034
Alignment:
Q  21 ccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttg 120  Q
    |||||||  ||||||| | | |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||| || |  |||||||    
T  43378922 ccaactatttcaaacaatagaatcctatacaagttggttttgtatgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgatgttg 43379021  T
Q  121 gatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| ||||||    
T  43379022 gatgagtccaaaa 43379034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 47867093 - 47867225
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| |||||| || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| | |||| | ||  ||||| ||||    
T  47867093 tcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttgattttgtacgtggagtccattatcaaagcagtcagaaaagtgtt 47867192  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  47867193 aaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 47867225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 45172503 - 45172635
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| ||| ||||| || | |||||  ||||| | |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| || || | |||||| || |||||| ||||    
T  45172503 tcaaataggtcgaagtgactcaaactatttcaaataatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatcaattatcaaaacagtcggaaaagtgtt 45172602  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  45172603 aaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 45172635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 46791772 - 46791660
Alignment:
Q  21 ccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttg 120  Q
    |||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||| || |||||| ||||||| || || |  |||||||    
T  46791772 ccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttagttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaataactttactgatgttg 46791673  T
Q  121 gatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| ||||||    
T  46791672 gatgagtccaaaa 46791660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Original strand, 8193903 - 8194019
Alignment:
Q  30 tcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagccc 129  Q
    ||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||| | |||||| || |||||||| |||||||| || |   |||||||||||| ||    
T  8193903 tcaaacaatggcatcatgtacaagttggttttgtacgtggaatgcattatcaaaacagtcggaaaattattaaacaactttaccaatgttggatgagtcc 8194002  T
Q  130 aaaaaatatcttcaata 146  Q
    |||| || |||| ||||    
T  8194003 aaaatatgtcttgaata 8194019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 40794390 - 40794258
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| |||||| || || |||||||  | ||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||| |||||   |||||  || |||||| ||||    
T  40794390 tcaaataggttgaggtgactccaactatttaaaacaatggcattctatacaagttgattttgtacgtggaatccattctcaaaatagtcggaaaagtgtt 40794291  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  40794290 aaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 40794258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 49565058 - 49565369
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565058 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 49565157  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565158 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 49565257  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565258 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 49565357  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    ||||||| ||||    
T  49565358 gtctctggttct 49565369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 19072251 - 19072554
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072251 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 19072350  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072351 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 19072450  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072451 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 19072550  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  19072551 gtct 19072554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3405257 - 3404954
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3405257 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgtttgaaaattgtt 3405158  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405157 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 3405058  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3405057 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttatcatgcaatgtg 3404958  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  3404957 gtct 3404954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9891489 - 9891186
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891489 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 9891390  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891389 aaacaacttaatggatgttggatgagtccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 9891290  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891289 ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 9891190  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  9891189 gtct 9891186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 41024666 - 41024363
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024666 tcaaatcggttgaagtgaccccaaccacctcaaacattggcctcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 41024567  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024566 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 41024467  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024466 ttcgagattagaaattgcaacgactttttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 41024367  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  41024366 gtct 41024363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4769601 - 4769298
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4769601 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 4769502  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4769501 aaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 4769402  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4769401 ttcgaaatcagaaattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgtagacattcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 4769302  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  4769301 gtct 4769298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4977222 - 4976919
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4977222 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 4977123  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4977122 aaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgctctttagtaataagtatagttgtgctcctccaac 4977023  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    || ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4977022 tttgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatttgcattccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 4976923  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  4976922 gtct 4976919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 38463431 - 38463734
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38463431 tcaaatcggtcgaagtgactccaactacctcaaacattagcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 38463530  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38463531 aaacaacttaacgaatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 38463630  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38463631 ttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatttgccttccgtatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcagtgtg 38463730  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  38463731 gtct 38463734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 44050077 - 44049774
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44050077 tcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 44049978  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  44049977 aaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtagtttcactttgtgttattgagtaataagtatagctgcgctcctccaac 44049878  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44049877 ttcgagattagatattgcaacagcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcgttgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 44049778  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  44049777 gtct 44049774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11502973 - 11502670
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11502973 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 11502874  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11502873 aaacaacttaacggatgtttgatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttctctttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcttccaac 11502774  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11502773 ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgtcttccatatttgttgacgttcattgtttacttgcttcacatttatcatgcaatgtg 11502674  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  11502673 gtct 11502670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 4978552 - 4978851
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4978552 tcaaatcgatcgaagtgaccctaactacctcaaacattgacatcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttcgaaaattgtt 4978651  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| ||||  || |||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4978652 aaacaacttaacagacgttggaagagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 4978751  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4978752 tttgagattagatattgcaacggcttcttgtcacc----tttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 4978847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 21472261 - 21471958
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtctt-gtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgt 99  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21472261 tcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggtgtttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgt 21472162  T
Q  100 taaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaa 199  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||  || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21472161 taaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatctttgattttagtactttcactttgtgttcttaagtaataagtatagttgtgctcctccaa 21472062  T
Q  200 cttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgt 299  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  21472061 cttcgagattaaatattgcaacgacttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacattt-ttatccaatgt 21471963  T
Q  300 ggtct 304  Q
    |||||    
T  21471962 ggtct 21471958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 304
Target Start/End: Original strand, 51643211 - 51643395
Alignment:
Q  120 ggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgca 219  Q
    |||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51643211 ggatgagcccaaaagatatctttgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgca 51643310  T
Q  220 acggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 304  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51643311 acggcgtcttgtcaactctatttgccttccatatttgttgacgttcatcgtacacttgctttacatttgtcatgcaatgtggtct 51643395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6183145 - 6182875
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6183145 tcaaatcggtcgagatgaccccaactatctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtagatggagttcataatcaaaactgttggaaaattgtt 6183046  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | | | |||||  ||||||||| ||||||||     
T  6183045 aaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaatatgtcttgaatagtagtactttcaatttgtgttatggtgaaataaacatagttgtgttcctccaat 6182946  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgta 271  Q
    || ||||||||| |||||| |  | |||||||||| || |||| |||  |||||| |||| ||||||||||    
T  6182945 tttgagattagatattgcatcaccgtcttgtcacctctgtttgacttgaatattttttgatgttcattgta 6182875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 193 - 304
Target Start/End: Original strand, 18580117 - 18580225
Alignment:
Q  193 cctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcat 292  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18580117 cctcaaacttcgagattaaatattgcaacggcttcttgtcacctctatttg---tccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcat 18580213  T
Q  293 gcaatgtggtct 304  Q
    |||||| |||||    
T  18580214 gcaatgaggtct 18580225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 32716760 - 32716628
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| |||||| || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || |||||| ||||    
T  32716760 tcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaagtgtt 32716661  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  32716660 aaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 32716628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1591300 - 1591168
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| |||||| || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||| | |||||| || | |||||||||    
T  1591300 tcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttctacgtggaatccattatcaaaacagtcgaaaaattgtt 1591201  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  1591200 aaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 1591168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 4618004 - 4617919
Alignment:
Q  21 ccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaa 106  Q
    |||||||  ||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||||||    
T  4618004 ccaactatttcaaacaatggcgtcctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaa 4617919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17916633 - 17916521
Alignment:
Q  21 ccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttg 120  Q
    |||||||  ||||||| |||||| |||||||   |||| ||||||||| | ||||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  |||||||    
T  17916633 ccaactatttcaaacaatggcattctatacaaaatggttttgtacgtgaaatccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttg 17916534  T
Q  121 gatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| ||||||    
T  17916533 gatgagtccaaaa 17916521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3950210 - 3949899
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950210 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 3950111  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950110 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 3950011  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950010 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 3949911  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    ||||||| ||||    
T  3949910 gtctctggttct 3949899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 8159577 - 8159888
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159577 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 8159676  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159677 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 8159776  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159777 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 8159876  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    ||||||| ||||    
T  8159877 gtctctggttct 8159888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 6742354 - 6742051
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742354 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 6742255  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742254 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 6742155  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742154 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 6742055  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  6742054 gtct 6742051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 30946236 - 30946547
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946236 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 30946335  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946336 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 30946435  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946436 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgactttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 30946535  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    ||||||| ||||    
T  30946536 gtctctggttct 30946547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 13746315 - 13746618
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746315 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 13746414  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746415 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 13746514  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746515 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 13746614  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  13746615 gtct 13746618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16446087 - 16445784
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446087 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 16445988  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16445987 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaatatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaac 16445888  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445887 ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 16445788  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  16445787 gtct 16445784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 36816110 - 36816413
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816110 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 36816209  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816210 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtattactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 36816309  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816310 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 36816409  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  36816410 gtct 36816413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 14400023 - 14399719
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcacccc-aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgt 99  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14400023 tcaaatcggtcgaagtgacccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgt 14399924  T
Q  100 taaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaa 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14399923 taaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaa 14399824  T
Q  200 cttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgt 299  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14399823 attcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgt 14399724  T
Q  300 ggtct 304  Q
    |||||    
T  14399723 ggtct 14399719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 46991840 - 46992141
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46991840 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 46991939  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46991940 aaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 46992039  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
     |  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46992040 ataaagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgtcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcatatttgtcatgcaatgtg 46992139  T
Q  301 gt 302  Q
    ||    
T  46992140 gt 46992141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 7841610 - 7841912
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7841610 tcaaatcggtctaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctctacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 7841709  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7841710 aaacaacttaacggatgttggatgaacccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagt-tagttgtgctcctccaac 7841808  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7841809 ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 7841908  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  7841909 gtct 7841912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 304
Target Start/End: Original strand, 48249479 - 48249764
Alignment:
Q  19 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  48249479 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgt 48249578  T
Q  119 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 218  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||    
T  48249579 tggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtgataagtatagttgtgctcatccaacatagagattagatattgc 48249678  T
Q  219 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 304  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249679 aacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 48249764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 84 - 304
Target Start/End: Original strand, 9428510 - 9428730
Alignment:
Q  84 accgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtat 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428510 accgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtat 9428609  T
Q  184 agttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428610 agttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcac 9428709  T
Q  284 atttgtcatgcaatgtggtct 304  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9428710 atttgtcatgcaatgtggtct 9428730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 6504549 - 6504852
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6504549 tcaaatcggtcgaagtgacctcaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggttatgtaggtggagtccataaccaaaacggttggaaaattgtt 6504648  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6504649 aaaaaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaac 6504748  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6504749 ttcgaggttagatattgcaacggcttcttgtcacctctatgtgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 6504848  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  6504849 gtct 6504852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 77614 - 77915
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  77614 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttgaaaaattgtt 77713  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77714 aaacaacttaacaaatgttggatgagcccaaaagatatcttcgatggtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 77813  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77814 ttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatttgcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 77913  T
Q  301 gt 302  Q
    ||    
T  77914 gt 77915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 21954833 - 21955135
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21954833 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaatattggcatcctgtacatgttcgttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 21954932  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||  ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  21954933 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaggtatcttcgattgtggtactttcactttgttttcttgagaaataagtatagttgtggtcctccaac 21955032  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21955033 ttcgagatta-atattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 21955131  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  21955132 gtct 21955135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7839063 - 7838760
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7839063 tcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccatgaccaaaaccgttggaaaattgtt 7838964  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7838963 aaacaacttaacagatgtcggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttatgttcttaagtaataagtatagttgtgctcctccaac 7838864  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7838863 ttcaagattagatattgcaacggcttcttgccacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 7838764  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  7838763 gtct 7838760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29949451 - 29949193
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29949451 tcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 29949352  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  29949351 aaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtactactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgct-ctctaac 29949253  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttga 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29949252 ttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctttatttgccttccatatttgttga 29949193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29998605 - 29998347
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29998605 tcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 29998506  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  29998505 aaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtactactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgct-ctctaac 29998407  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttga 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29998406 ttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctttatttgccttccatatttgttga 29998347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29908273 - 29908027
Alignment:
Q  13 aagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaat 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  29908273 aagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaac 29908174  T
Q  113 ggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattaga 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29908173 ggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtactactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgct-ctctaacttcgagattaga 29908075  T
Q  213 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttga 260  Q
     ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29908074 tattgcaacgacttcttgtcacctttatttgccttccatatttgttga 29908027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 109
Target Start/End: Original strand, 28610533 - 28610621
Alignment:
Q  21 ccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaattt 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28610533 ccaactacctcaaacattgacatcttctacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaaccattt 28610621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 9556358 - 9556483
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| |||||| || || |||||||  ||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||| | ||||| | |||||| || |||||||||||    
T  9556358 tcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacatcctgtacaagttggttttgtacgtgaaatccattatcaaaacagtcggaaaattgtt 9556457  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgag 126  Q
    |||||| || | ||||||||||||||    
T  9556458 aaacaactttacggatgttggatgag 9556483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29930580 - 29930532
Alignment:
Q  256 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 304  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29930580 gttgacgttcattgtacatttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 29930532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29979734 - 29979686
Alignment:
Q  256 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 304  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29979734 gttgacgttcattgtacatttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 29979686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Original strand, 2284671 - 2284783
Alignment:
Q  21 ccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttg 120  Q
    |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||  || |||||| |||||||||| || |  |||||||    
T  2284671 ccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaatagtcggaaaagtgttaaacaactttactgatgttg 2284770  T
Q  121 gatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| ||||||    
T  2284771 gatgagtccaaaa 2284783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 40467802 - 40467934
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| |||||| || || |||||||  ||||||| || |||  |||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || |||||| ||||    
T  40467802 tcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattttatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaagtgtt 40467901  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  40467902 aaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 40467934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 133
Target Start/End: Original strand, 4120432 - 4120520
Alignment:
Q  45 ctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  4120432 ctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacggtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 4120520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 12491534 - 12491422
Alignment:
Q  21 ccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttg 120  Q
    |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||| | ||||||| ||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| || |  |||||||    
T  12491534 ccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttgattttgtacgcggaatccattatcaaaacagttggaaaagtgttaaacaactttactgatgttg 12491435  T
Q  121 gatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| ||||||    
T  12491434 gatgagtccaaaa 12491422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 33940322 - 33940190
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| |||||| || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || |  ||| ||||    
T  33940322 tcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcgagaaagtgtt 33940223  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    |||| | || |  ||||||||||||| ||||||    
T  33940222 aaacgactttaccgatgttggatgagtccaaaa 33940190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Original strand, 51548147 - 51548259
Alignment:
Q  21 ccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttg 120  Q
    |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || | |||| |||||||||| || |  |||||||    
T  51548147 ccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgatgttg 51548246  T
Q  121 gatgagcccaaaa 133  Q
    ||| || ||||||    
T  51548247 gataagtccaaaa 51548259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 212035 - 212346
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212035 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 212134  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212135 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 212234  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212235 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 212334  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    ||||||| ||||    
T  212335 gtctctggttct 212346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5348634 - 5348323
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348634 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 5348535  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348534 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 5348435  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348434 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 5348335  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    ||||||| ||||    
T  5348334 gtctctggttct 5348323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 41561479 - 41561168
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561479 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 41561380  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561379 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 41561280  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561279 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 41561180  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    ||||||| ||||    
T  41561179 gtctctggttct 41561168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 10623048 - 10623359
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623048 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 10623147  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623148 aaacaatttaatggatgttagatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 10623247  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623248 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 10623347  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    ||||||| ||||    
T  10623348 gtctctggttct 10623359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 27274954 - 27275257
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27274954 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 27275053  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275054 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 27275153  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275154 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 27275253  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  27275254 gtct 27275257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38947230 - 38946925
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947230 tcaaatcagttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcttatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 38947131  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947130 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 38947031  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38947030 ttcgagattagaaattgcaacggtttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgaaatgtg 38946931  T
Q  301 gtctct 306  Q
    ||||||    
T  38946930 gtctct 38946925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 39795437 - 39795134
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795437 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 39795338  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39795337 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactatcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaac 39795238  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795237 ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 39795138  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  39795137 gtct 39795134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 3802160 - 3802463
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaa-cattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgt 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802160 tcaagtcggttgaagtcaccc-aactacctcaaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgt 3802258  T
Q  100 taaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaa 199  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3802259 taaacaacttaatggaagttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctccttcaa 3802358  T
Q  200 cttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802359 cttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgaagttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgt 3802458  T
Q  300 ggtct 304  Q
    |||||    
T  3802459 ggtct 3802463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 24751126 - 24750822
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctata-catgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgt 99  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24751126 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctataacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgt 24751027  T
Q  100 taaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaa 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24751026 taaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatctttgatcgtattactttcactttgtattcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaa 24750927  T
Q  200 cttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24750926 cttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgt 24750827  T
Q  300 ggtct 304  Q
    |||||    
T  24750826 ggtct 24750822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 1098420 - 1098723
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098420 tcaaatcggtcgatgtgaccccaactacctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 1098519  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1098520 aaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcggttgtagtactttcactttgtgttcttgaataataagtatagttgtgctcctccaac 1098619  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098620 ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 1098719  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  1098720 gtct 1098723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 45476820 - 45476524
Alignment:
Q  5 atcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaac 104  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45476820 atcgtttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaac 45476721  T
Q  105 aatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcg 204  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45476720 aacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcg 45476621  T
Q  205 agattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 302  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45476620 agattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccata-ttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 45476524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 304
Target Start/End: Original strand, 24604694 - 24604986
Alignment:
Q  12 gaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaa 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24604694 gaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaa 24604793  T
Q  112 tggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattag 211  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24604794 cagatgttggatgagcccaaaagatatctttgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattag 24604893  T
Q  212 aaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 304  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24604894 atattgcaacggcttcttgtcacctctatttgtcttccctatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 24604986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 12907086 - 12907389
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12907086 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtgaagtccataaccaaatccgttggaaaattgtt 12907185  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12907186 aaacaacttaacggatgttggatgagtccaaaagatattttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 12907285  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12907286 ttcgaaatttgaaattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgactttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 12907385  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  12907386 gtct 12907389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 43948876 - 43949179
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43948876 tcaaatcagtagaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 43948975  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43948976 aaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctctaac 43949075  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43949076 ttcgagattagataacgcaacggcttcttgtcacctatatttgtcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 43949175  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  43949176 gtct 43949179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 41007574 - 41007877
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  41007574 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttagttttgtaggtggagtccataatcaaaaccgttgagaaattgtt 41007673  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41007674 aaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 41007773  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41007774 ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttacatatttgttgacgttcattttagacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 41007873  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  41007874 gtct 41007877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 34920376 - 34920679
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34920376 tcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaatattgtt 34920475  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34920476 aaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtataagtgtgctcctccaac 34920575  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34920576 ttcgaaattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgaatttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 34920675  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  34920676 gtct 34920679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 436779 - 436475
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaac-attggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgt 99  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  436779 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaaccattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataatcaaaaccgttggaaaattgt 436680  T
Q  100 taaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaa 199  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  436679 taaacaacttaaaagatgttagatgagcccaaaagatatcttagattgtagtactttcactatgtgttcttgaataataagtatagatgtgctcctccaa 436580  T
Q  200 cttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  436579 cttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacaattgcttcacatttgtcatgcaatgt 436480  T
Q  300 ggtct 304  Q
    |||||    
T  436479 ggtct 436475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9655623 - 9655320
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9655623 tcaaatcggtcgaaatgaccccaactacctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataatcaaaaccgttggaaaattgtt 9655524  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9655523 aaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataaatatagttgtgctccttcaac 9655424  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9655423 ttcgacattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttacttcacatttttcatgcaatgtg 9655324  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  9655323 gtct 9655320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 304
Target Start/End: Original strand, 28354549 - 28354799
Alignment:
Q  54 ttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattac 153  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||    
T  28354549 ttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtac 28354648  T
Q  154 tttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatat 253  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  28354649 tttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctatatttgacttccatat 28354748  T
Q  254 ttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28354749 ttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgaaatgtggtct 28354799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7264447 - 7264229
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7264447 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacatcaaacattggcatcctatacatgttaattttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 7264348  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7264347 taactacttaatggatgttggatgagcctaaaaaatatcttcaatggtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 7264248  T
Q  201 ttcgagattagaaattgca 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7264247 ttcgagattagaaattgca 7264229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 58 - 304
Target Start/End: Original strand, 11692466 - 11692712
Alignment:
Q  58 tcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttc 157  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| || ||||    
T  11692466 tcttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattcttaaacaacttaacggatgttggatgggcccaaaatatatcttctattgtagtaatttc 11692565  T
Q  158 aagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgt 257  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  11692566 actttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaatttcgagattaaatattgcaacggcttcttgtcaactctatttgccttccatatttgt 11692665  T
Q  258 tgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692666 tgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 11692712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 17996766 - 17997069
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  17996766 tcaaatcggtcgaggtgaccccaactatctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccattggaatattgtt 17996865  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||    
T  17996866 aaacaacgtaacggatgttggatgagcctaaaagatatcttcaatagtagtactttcactttgtgttcttgagaaataaacacagttgtgctcctccaac 17996965  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    || ||||||||||| | ||||  | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||     
T  17996966 tttgagattagaaactacaacatcgtcttgtcacctctatttgacttccatatttgttgacgttcattgtatacttgcttgatatttggcatgcaatgtt 17997065  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  17997066 gtct 17997069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 111
Target Start/End: Original strand, 24941255 - 24941354
Alignment:
Q  12 gaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaa 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24941255 gaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaa 24941354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 158
Target Start/End: Original strand, 28423072 - 28423225
Alignment:
Q  5 atcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaac 104  Q
    ||||||||| || || |||||||  ||||||| ||||||| | |||| |||||| |||||||||||  |||| | |||||| || || ||||||||||||    
T  28423072 atcggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcatcatgtacaagttggttttgtacgtggaacccattatcaaaacagtcgggaaattgttaaac 28423171  T
Q  105 aatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttca 158  Q
    || || |  ||||||||||||| |||||| || |||| |||||| | |||||||    
T  28423172 aactttaccgatgttggatgagtccaaaatatgtcttgaatagtttgactttca 28423225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 111
Target Start/End: Original strand, 3353894 - 3353985
Alignment:
Q  20 cccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaa 111  Q
    |||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||||| || || ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  3353894 cccaactatctcaaacaataacatcctgtacatgttggttttataggtggagtccatgatcaaaacagtcgaaaaattgttaaacaatttaa 3353985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 21535642 - 21535507
Alignment:
Q  9 gttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatt 108  Q
    ||||| || |||||||||| |||||| | ||||||| | ||||||||||| || ||      ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||      
T  21535642 gttgaggtgaccccaactatctcaaatagtggcatcatgtacatgttggttttata------gtccataaccaaaactgttggaaaattgttaaccaacc 21535549  T
Q  109 taatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtat 150  Q
    |||  |||   |||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  21535548 taactgattgaggatgagcccaaaatatgtcttgaatagtat 21535507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 11692424 - 11692467
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatc 44  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11692424 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattggcatc 11692467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7264234 - 7264196
Alignment:
Q  266 attgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 304  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7264234 attgcacacttgcttcacaattgtcatgcaatgtggtct 7264196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 3947055 - 3947366
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947055 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 3947154  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947155 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 3947254  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947255 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 3947354  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    ||||||| ||||    
T  3947355 gtctctggttct 3947366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3984580 - 3984269
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984580 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 3984481  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984480 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 3984381  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984380 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 3984281  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    ||||||| ||||    
T  3984280 gtctctggttct 3984269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 44467049 - 44466738
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467049 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 44466950  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466949 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 44466850  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466849 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 44466750  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    ||||||| ||||    
T  44466749 gtctctggttct 44466738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20350923 - 20350612
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350923 tcaaatcggttgaagtcacccaaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 20350824  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350823 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 20350724  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350723 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 20350624  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    ||||||| ||||    
T  20350623 gtctctggttct 20350612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 38774709 - 38775020
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774709 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 38774808  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774809 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 38774908  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774909 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccatatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 38775008  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    ||||||| ||||    
T  38775009 gtctctggttct 38775020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 29355282 - 29355585
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355282 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 29355381  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355382 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 29355481  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355482 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 29355581  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  29355582 gtct 29355585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5079402 - 5079099
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  5079402 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccgtaaccaaaaccgtttgaaaattgtt 5079303  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079302 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 5079203  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079202 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatctgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 5079103  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  5079102 gtct 5079099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13630883 - 13630580
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630883 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 13630784  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13630783 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaatatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaac 13630684  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630683 ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 13630584  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  13630583 gtct 13630580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 41455304 - 41455001
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455304 tcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctttacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 41455205  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455204 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaatatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 41455105  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455104 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 41455005  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  41455004 gtct 41455001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 37016381 - 37016078
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016381 tcaaatcggtcgaaatgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 37016282  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016281 aaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 37016182  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016181 ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 37016082  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  37016081 gtct 37016078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 50116357 - 50116660
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50116357 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 50116456  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50116457 aaacaacttaacggatgttagatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 50116556  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50116557 ttcgacattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 50116656  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  50116657 gtct 50116660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 12649173 - 12649476
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649173 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 12649272  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649273 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 12649372  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
     | || |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649373 atagatattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatttgtcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 12649472  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  12649473 gtct 12649476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 38691533 - 38691836
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38691533 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttgaaaaattgtt 38691632  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38691633 aaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 38691732  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38691733 atcgagattagatattgcaacggcttcttgtcatctctatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 38691832  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  38691833 gtct 38691836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 46974631 - 46974328
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46974631 tcaaatcgattgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacctgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaagattgtt 46974532  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46974531 aaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 46974432  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46974431 tttgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctttatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgtttcacatttgtcatgcaatgtg 46974332  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  46974331 gtct 46974328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13175248 - 13174945
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13175248 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgatggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgctggaaatttgtt 13175149  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13175148 aaacaacttagcggatgttggatgagcacaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 13175049  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13175048 tttgaaattagaaattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgattttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 13174949  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  13174948 gtct 13174945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 51663725 - 51663422
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51663725 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacactggcattttatacatgttggttttgtaggtagagtccataatcaaaaccgttggaaaattgtt 51663626  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51663625 aaacaacttaaaggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgactaataagtatagttgtgctcctccaac 51663526  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51663525 ttcgagattagatattgcaacgacttattgtcacctctatttgccttccatttttgttgacgttcaatgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 51663426  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  51663425 gtct 51663422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 304
Target Start/End: Original strand, 21942977 - 21943261
Alignment:
Q  20 cccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgtt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| | ||| |    
T  21942977 cccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggaatccataaccaaaaccgttgaaaatttgttaaacaacttaacgaatgat 21943076  T
Q  120 ggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgca 219  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21943077 ggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgtttttgagaaataagcatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgca 21943176  T
Q  220 acggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 304  Q
    || | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21943177 acagtttcttgtcgcctctatttgccttccatatttgttgacgtttattgtacacttgtttgacatttgtcatgcaatgtggtct 21943261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 19498058 - 19498277
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498058 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgtttgttttgtgggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 19498157  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19498158 aaacaacttaacggatgttggatgagccc-aaaagtatctttgattgtagtactttcactttgtgttttttagaaataagtatagttgtgctcctccaac 19498256  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaac 221  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  19498257 ttcgagattagatattgcaac 19498277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Original strand, 32106265 - 32106533
Alignment:
Q  18 accccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatg 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||           ||||||||||| ||||||||||    
T  32106265 accccaactatctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaa-----------ttgttaaacaacttaatggatg 32106353  T
Q  118 ttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattg 217  Q
    ||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||  ||||||||| | | |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||    
T  32106354 ttggatgagcttaaaatatgtcttcaatagtagtactttcactttgtgttctggtgaaataaacatagttgtgctcctccaactttgagattatataatg 32106453  T
Q  218 caacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaat 297  Q
    || |  | |||||||||| || || | |||||||||||||||| ||| |||| | |||||||| | ||||||| ||||||    
T  32106454 catcatcgtcttgtcacctctgttcgacttccatatttgttgatgttaattgcatacttgcttgatatttgtcttgcaat 32106533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 209 - 304
Target Start/End: Original strand, 44619905 - 44620000
Alignment:
Q  209 tagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 304  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44619905 tagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgcacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 44620000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 143 - 297
Target Start/End: Original strand, 26466006 - 26466160
Alignment:
Q  143 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 242  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  | | || | ||| || | |    
T  26466006 aatagtagtactttcattttgtgttcttgagaaataaacatagttgtgctccttcaactttgagattagaaactgcaacaccgttttttaacctctgtat 26466105  T
Q  243 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaat 297  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  26466106 gacttccatatttattgacgttcattgtatacttgcttgatatttgtcatgcaat 26466160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 36360114 - 36360246
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| |||||| || || | |||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  36360114 tcaaataggttgaggtgactcaaactatttcaaacagtgacattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagttggaaaattgtt 36360213  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  36360214 aaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 36360246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 28863357 - 28863225
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| |||||| || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||| | |||||| || | |||| ||||    
T  28863357 tcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtagaatccattatcaaaacagtcgaaaaagtgtt 28863258  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| ||||||    
T  28863257 aaacaattttacgaatgttggatgagtccaaaa 28863225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 263 - 304
Target Start/End: Original strand, 7980068 - 7980109
Alignment:
Q  263 ttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7980068 ttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 7980109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 45472819 - 45472687
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| |||||| || || |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||  ||||| | |||||| || |||||| ||||    
T  45472819 tcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggttttgtacgtgggatccattatcaaaacagtcggaaaagtgtt 45472720  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  45472719 aaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 45472687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 7404048 - 7403953
Alignment:
Q  38 tggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  7404048 tggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 7403953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 20240122 - 20240037
Alignment:
Q  21 ccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaa 106  Q
    |||||||  ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||| | ||  ||||||||||||||||    
T  20240122 ccaactatttcaaacaatgacatcctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaagcagtcagaaaattgttaaacaa 20240037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 18887388 - 18887520
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| |||||| || || |||||||  ||||||| || |||| |||||| ||| ||  |||||||||| ||||| | |||||   | |||||||||||    
T  18887388 tcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacatcttatacaagttagttctgtacgtggaatccattatcaaaaaaatcggaaaattgtt 18887487  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  18887488 aaacaactttaccgatgttggatgagaccaaaa 18887520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25231655 - 25231558
Alignment:
Q  115 atgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattaga 212  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||| ||||||||  || |||| | | | |||||  |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25231655 atgttggatgaacccaaaatatgtctttaattgtagtactttcactttttgttatggtgaaataaacatagttgtgctcctccaattttgagattaga 25231558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 27283507 - 27283402
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| |||||| || || |||||||  | ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||  |  ||||| || |||||||||||    
T  27283507 tcaaataggttgaggtgactccaactattttaaataatggcatcctatacaagttggttttgtgcgtggaatccaatattaaaacagtcggaaaattgtt 27283408  T
Q  101 aaacaa 106  Q
    ||||||    
T  27283407 aaacaa 27283402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 31445979 - 31445866
Alignment:
Q  18 accccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatg 117  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||| | |||||  ||||| || | ||||||||| || | |||||| |||| |||| |||||||||| || || |||     
T  31445979 accctaactaccttaaacaatgacattcaatacacattggttttatgcgtggagtctatgatcaaaactgttgaaaaagtgttaaacaactttatagatt 31445880  T
Q  118 ttggatgagcccaa 131  Q
    ||||||||||||||    
T  31445879 ttggatgagcccaa 31445866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2348 - 2045
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2348 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 2249  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2248 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 2149  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2148 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 2049  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  2048 gtct 2045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 1611345 - 1611656
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611345 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctataaatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 1611444  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611445 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 1611544  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611545 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 1611644  T
Q  301 gtctctgcttct 312  Q
    ||||||| ||||    
T  1611645 gtctctggttct 1611656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31147789 - 31147486
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31147789 tcaaatcggtcgaagtgaacacaactacctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 31147690  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31147689 aaacaacttaacggatgttgtatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 31147590  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  31147589 ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcaaatttatcatgcaatgtg 31147490  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  31147489 gtct 31147486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 29287547 - 29287845
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29287547 tcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaatt-tt 29287645  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29287646 aaacaaattaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 29287745  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||| ||||||    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29287746 ttcgatattaga----gcaacgacttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttttcatgcaatgtg 29287841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28357785 - 28357557
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28357785 tcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacatttgcatcctatacatgttggtcttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 28357686  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28357685 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcaattgtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 28357586  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttctt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28357585 ttcgagattagaaattgcaacggcttctt 28357557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18607463 - 18607160
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607463 tcaaatctgtcgaagtgaccccaactacttcaaatattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 18607364  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18607363 aaacaacttaacgaatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtattgttgtgctcctccaac 18607264  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||  | |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607263 ttaaaaattagatattgcaacggcttcttatcacctctatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 18607164  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  18607163 gtct 18607160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 21357944 - 21358244
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21357944 tcaaatcggtcgaagtgacccgaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 21358043  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  21358044 aaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaatatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgacaaataagtatagttgtgctcctcgaac 21358143  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |  ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  21358144 ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgt---ctatcattttacgcttgcttgacctttgtcatgcaatgtg 21358240  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  21358241 gtct 21358244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 23961926 - 23962226
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23961926 tcaaatcggtcgaagtgacccgaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 23962025  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  23962026 aaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaatatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgacaaataagtatagttgtgctcctcgaac 23962125  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |  ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  23962126 ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgt---ctatcattttacgcttgcttgacctttgtcatgcaatgtg 23962222  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  23962223 gtct 23962226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 28251134 - 28251060
Alignment:
Q  230 gtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 304  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251134 gtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 28251060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 24220408 - 24220332
Alignment:
Q  228 ttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 304  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  24220408 ttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgtttattttacacttacttgatatttgtcatgcaatgtggtct 24220332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 9095595 - 9095463
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| |||||| || || |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||  ||||||||||| ||||| | |||||| || |||||| ||||    
T  9095595 tcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggctttgtacgtggaatccatgatcaaaacagtcggaaaagtgtt 9095496  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  9095495 aaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 9095463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 37819471 - 37819774
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819471 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 37819570  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819571 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 37819670  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819671 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 37819770  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  37819771 gtct 37819774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 28885002 - 28885305
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885002 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatccaatacatgttggtttcgtacgtggaatccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 28885101  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885102 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 28885201  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885202 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 28885301  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  28885302 gtct 28885305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 7020474 - 7020777
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020474 tcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 7020573  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7020574 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagatgtgctcctccaac 7020673  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020674 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 7020773  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  7020774 gtct 7020777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 11032046 - 11032349
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032046 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 11032145  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11032146 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaac 11032245  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032246 ttcgagattagatattgcaacggtttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 11032345  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  11032346 gtct 11032349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 38858784 - 38859087
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858784 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatatatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 38858883  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38858884 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaac 38858983  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858984 ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 38859083  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  38859084 gtct 38859087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34079247 - 34078944
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34079247 tcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 34079148  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34079147 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcaattgtattactttcacgttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 34079048  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34079047 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 34078948  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  34078947 gtct 34078944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 27866439 - 27866742
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866439 tcaaatcggttgaagtgaccccaaccacctcaaacattggcctcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 27866538  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866539 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcaattgtattactttcacgttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 27866638  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866639 ttcgagattagaaattgcaaaggtttcttgtcacctctattttccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 27866738  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  27866739 gtct 27866742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 304
Target Start/End: Original strand, 7799602 - 7799903
Alignment:
Q  3 aaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaa 102  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7799602 aaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccttaaccaaaaccgttggaaaattgttaa 7799701  T
Q  103 acaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactt 202  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7799702 acaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactt 7799801  T
Q  203 cgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 302  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7799802 cgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattttccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 7799901  T
Q  303 ct 304  Q
    ||    
T  7799902 ct 7799903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 18536930 - 18537233
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18536930 tcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattagcatcttgtacatgttagttttgtaggtggagtccataaccaaaaccattggaaaattgtt 18537029  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537030 aaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 18537129  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537130 ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 18537229  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  18537230 gtct 18537233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 4202533 - 4202836
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4202533 tcaaatcggtcgaagtgacctcaactacctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaactgttggaaaattgtt 4202632  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4202633 aaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 4202732  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4202733 ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttatcatgcaatgtg 4202832  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  4202833 gtct 4202836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1036818 - 1036515
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1036818 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttgattttgtaggttgagtccgtaaccaaaaccgttggaaaattgtt 1036719  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1036718 aaacaacttaatggatgttagatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 1036619  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1036618 ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattttccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgtgtcacatttgtcatgcaatgtg 1036519  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  1036518 gtct 1036515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 25895691 - 25895998
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25895691 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaagcattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 25895790  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25895791 aaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactctcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 25895890  T
Q  201 ----ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaa 296  Q
         | || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25895891 atatatagatattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaa 25895990  T
Q  297 tgtggtct 304  Q
    ||||||||    
T  25895991 tgtggtct 25895998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 13566701 - 13566988
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||                  
T  13566701 tcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctagacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaacc-------------- 13566786  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
      |||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566787 --acaacttaatggatgttgaatgatcccaaaagatatcttcaattgtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 13566884  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566885 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 13566984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20287736 - 20287439
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||| || || |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20287736 tcaaatcggtcgaggtgaccccaactatctcaaacataggcatcttgtacatgttggtttggtaggtggagtccataaccagaaccgttggaaaattgtt 20287637  T
Q  101 -aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaa 199  Q
     ||| || |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||| |   | |||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  20287636 aaaaaaacttaacggatgttggatgagcgcaaaatatgtcttcaatagtagtactttgaccatttgttcttgagaaataaacataattgtgctcctccaa 20287537  T
Q  200 cttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaat 297  Q
    ||| ||||||||||| || |||  | |||||||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||    
T  20287536 ctttgagattagaaactggaaccccgtcttgtcacctctgtttgactttcatatttattgacgttcattatatacttgcttgatatttgtcatacaat 20287439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20286410 - 20286180
Alignment:
Q  66 gtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtg 165  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| | |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||  |||||    
T  20286410 gtggagtccataaccaaaactgttggaaaattcataa-caactaagcggatgttggatgagcccaaaatatgtcttcaatagtagtactttcattttgtg 20286312  T
Q  166 ttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttc 265  Q
    || ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    |||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||    
T  20286311 ttattgagaaataaagataattgtgctcctccaactttgagattagaaactgcaccacagtcttgtcacctctgtttgacttccatatttgttgatgttc 20286212  T
Q  266 attgtacacttgcttcacatttgtcatgcaat 297  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  20286211 attgtatacttgcttgatatttgtcatgcaat 20286180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 11819663 - 11819551
Alignment:
Q  21 ccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttg 120  Q
    |||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||| || |  ||| |||    
T  11819663 ccaactatttcaaacaatagcatcctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgattttg 11819564  T
Q  121 gatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| ||||||    
T  11819563 gatgagtccaaaa 11819551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 27013263 - 27013395
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| |||||| || || |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| || || | |||||| || |||||||||||    
T  27013263 tcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggttttgtacgtggaatctattatcaaaacagtcggaaaattgtt 27013362  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  27013363 aaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 27013395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 42343957 - 42343826
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| |||||| || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || |||||| ||||    
T  42343957 tcaaataggttgaggttactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtatgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaagtgtt 42343858  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    ||||||| || | ||||||||||||| ||||||    
T  42343857 aaacaatatact-gatgttggatgagtccaaaa 42343826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 43295681 - 43295549
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| |||||| || || |||||||  ||||| | || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || | |||| ||||    
T  43295681 tcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaataatgacattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcgaaaaagtgtt 43295582  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  43295581 aaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 43295549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 25053148 - 25053043
Alignment:
Q  53 gttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtatta 152  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |  ||||||||||||||||  || || ||| ||||||||| |||||| || |||| |||||| | |    
T  25053148 gttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagccggaaaattgttaaacagctttatcgatattggatgagtccaaaatatgtcttgaatagtttga 25053049  T
Q  153 ctttca 158  Q
    ||||||    
T  25053048 ctttca 25053043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 6553256 - 6553124
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| |||||| || || || ||||  ||||||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || | |||| ||||    
T  6553256 tcaaataggttgaggtgactcccactatttcaaacaatggcattctatacaaattggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcgaaaaagtgtt 6553157  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    |||||| || |  || |||||||||| ||||||    
T  6553156 aaacaactttaccgaagttggatgagtccaaaa 6553124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 15951 - 16254
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15951 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 16050  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16051 aaacaacttaatggaagttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 16150  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16151 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcgttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 16250  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  16251 gtct 16254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 17536 - 17233
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17536 tcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 17437  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 200  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17436 aaacaacttaacagatgttggatgagcctaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 17337  T
Q  201 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17336 ttcgagattagatatttcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttttcatgcaatgtg 17237  T
Q  301 gtct 304  Q
    ||||    
T  17236 gtct 17233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 151 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 12580 - 12426
Alignment:
Q  151 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcc-ttcc 249  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||     
T  12580 tactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacagcttcttgtcacctctatttgcctttcg 12481  T
Q  250 atatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12480 atatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 12426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 25540 - 25603
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgta 64  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25540 tcaaattggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgta 25603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 44 - 100
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttgg 57  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  44 tcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatcttgg 100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 28480 - 28612
Alignment:
Q  1 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 100  Q
    |||||| |||||| || || |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||| || || || || ||||| | |||||| || |||||| ||||    
T  28480 tcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggttttttatgtagaatccattatcaaaacagtcggaaaagtgtt 28579  T
Q  101 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 133  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  28580 aaacaattttaccgatgttggatgagtccaaaa 28612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University