View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10473_high_1 (Length: 938)

Name: NF10473_high_1
Description: NF10473
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10473_high_1
NF10473_high_1
[»] chr1 (235 HSPs)
chr1 (377-920)||(45647767-45648307)
chr1 (12-378)||(1210663-1211029)
chr1 (12-378)||(30202128-30202494)
chr1 (12-379)||(34792346-34792713)
chr1 (12-376)||(49347393-49347757)
chr1 (12-378)||(8671838-8672202)
chr1 (12-379)||(9592652-9593019)
chr1 (12-378)||(22090012-22090380)
chr1 (12-377)||(51440764-51441129)
chr1 (19-378)||(51601983-51602340)
chr1 (15-378)||(32230959-32231315)
chr1 (12-375)||(43240380-43240745)
chr1 (16-379)||(696191-696555)
chr1 (17-378)||(4001453-4001814)
chr1 (84-378)||(4029112-4029406)
chr1 (16-378)||(15085856-15086206)
chr1 (464-920)||(45642830-45643288)
chr1 (16-378)||(32082754-32083105)
chr1 (16-378)||(8391694-8392056)
chr1 (19-378)||(38807669-38808031)
chr1 (112-378)||(25979229-25979495)
chr1 (16-374)||(37462878-37463231)
chr1 (12-341)||(9509236-9509565)
chr1 (178-378)||(37311753-37311953)
chr1 (12-361)||(9599409-9599758)
chr1 (157-378)||(39318193-39318412)
chr1 (211-376)||(52921197-52921362)
chr1 (25-378)||(27847798-27848155)
chr1 (15-373)||(39140434-39140794)
chr1 (16-376)||(18469082-18469440)
chr1 (124-375)||(52561590-52561841)
chr1 (17-378)||(32404525-32404890)
chr1 (95-378)||(48431397-48431687)
chr1 (82-376)||(2544587-2544875)
chr1 (258-378)||(4707219-4707338)
chr1 (244-377)||(32079176-32079307)
chr1 (70-378)||(38868858-38869166)
chr1 (218-378)||(41560353-41560513)
chr1 (266-378)||(24020265-24020377)
chr1 (58-377)||(36623884-36624184)
chr1 (15-378)||(6025526-6025889)
chr1 (82-378)||(3818854-3819150)
chr1 (201-379)||(4415455-4415634)
chr1 (287-378)||(44751677-44751768)
chr1 (294-379)||(29577452-29577537)
chr1 (287-379)||(44941773-44941865)
chr1 (97-378)||(5338727-5338997)
chr1 (82-372)||(40416359-40416649)
chr1 (22-241)||(43423645-43423866)
chr1 (287-376)||(42337749-42337838)
chr1 (16-275)||(34827205-34827462)
chr1 (258-376)||(46423216-46423331)
chr1 (12-378)||(26016355-26016721)
chr1 (124-377)||(8796239-8796492)
chr1 (241-378)||(10200304-10200441)
chr1 (109-378)||(478695-478965)
chr1 (284-378)||(28090692-28090786)
chr1 (230-375)||(29128919-29129065)
chr1 (275-376)||(40568410-40568511)
chr1 (247-378)||(52532614-52532745)
chr1 (12-163)||(1661344-1661499)
chr1 (277-378)||(34444539-34444640)
chr1 (301-376)||(28533674-28533749)
chr1 (37-144)||(52561843-52561950)
chr1 (224-378)||(11941578-11941732)
chr1 (82-376)||(36339804-36340097)
chr1 (277-378)||(6084158-6084259)
chr1 (12-349)||(40419557-40419893)
chr1 (124-368)||(7762445-7762689)
chr1 (44-371)||(19908040-19908371)
chr1 (246-378)||(19936612-19936744)
chr1 (217-378)||(28511795-28511960)
chr1 (304-376)||(38877343-38877415)
chr1 (291-378)||(5113940-5114027)
chr1 (277-376)||(25715326-25715425)
chr1 (57-376)||(35828562-35828869)
chr1 (190-376)||(50806765-50806949)
chr1 (308-378)||(3777258-3777328)
chr1 (286-376)||(21769711-21769801)
chr1 (124-353)||(28528385-28528614)
chr1 (297-378)||(32111987-32112068)
chr1 (265-378)||(43375596-43375709)
chr1 (41-194)||(51812472-51812625)
chr1 (217-375)||(8342885-8343040)
chr1 (95-287)||(37263332-37263523)
chr1 (314-378)||(41165502-41165566)
chr1 (315-378)||(4318843-4318906)
chr1 (12-158)||(14226047-14226191)
chr1 (124-378)||(16272820-16273073)
chr1 (277-378)||(7133300-7133401)
chr1 (303-375)||(4590533-4590605)
chr1 (129-373)||(42501143-42501387)
chr1 (86-378)||(52832037-52832329)
chr1 (32-249)||(39894722-39894934)
chr1 (323-378)||(43481796-43481851)
chr1 (308-378)||(2914121-2914191)
chr1 (196-378)||(26299187-26299352)
chr1 (277-379)||(45510830-45510932)
chr1 (16-162)||(4379927-4380081)
chr1 (290-375)||(22175341-22175426)
chr1 (309-378)||(37430418-37430487)
chr1 (250-378)||(42539210-42539339)
chr1 (291-376)||(50257767-50257852)
chr1 (277-368)||(109002-109092)
chr1 (303-374)||(15437130-15437201)
chr1 (217-372)||(19908388-19908543)
chr1 (217-372)||(29577147-29577301)
chr1 (288-374)||(1290033-1290119)
chr1 (224-341)||(8676897-8677017)
chr1 (16-151)||(19936444-19936571)
chr1 (96-287)||(27637720-27637913)
chr1 (222-360)||(29807984-29808122)
chr1 (301-378)||(17268987-17269064)
chr1 (291-372)||(27072491-27072572)
chr1 (329-378)||(38758018-38758067)
chr1 (301-378)||(50846769-50846846)
chr1 (301-374)||(52073050-52073123)
chr1 (242-375)||(52292188-52292320)
chr1 (301-369)||(2429636-2429704)
chr1 (95-247)||(13827699-13827851)
chr1 (19-163)||(18793201-18793345)
chr1 (301-377)||(30396728-30396804)
chr1 (278-378)||(31274399-31274499)
chr1 (308-376)||(43028808-43028876)
chr1 (238-337)||(16142019-16142118)
chr1 (300-378)||(27704156-27704235)
chr1 (217-375)||(44008702-44008859)
chr1 (279-378)||(50636266-50636365)
chr1 (303-378)||(51584953-51585028)
chr1 (214-312)||(8628150-8628248)
chr1 (124-270)||(9002382-9002528)
chr1 (216-378)||(12930309-12930471)
chr1 (21-159)||(17815402-17815537)
chr1 (296-378)||(26113437-26113519)
chr1 (207-350)||(27520233-27520378)
chr1 (94-312)||(41611806-41612024)
chr1 (324-378)||(52814292-52814346)
chr1 (301-378)||(1704834-1704911)
chr1 (321-378)||(10569069-10569126)
chr1 (277-378)||(11584180-11584281)
chr1 (249-378)||(44905354-44905483)
chr1 (301-370)||(49377508-49377577)
chr1 (220-372)||(8203138-8203290)
chr1 (328-376)||(12231592-12231640)
chr1 (301-373)||(16943362-16943434)
chr1 (139-371)||(30833982-30834214)
chr1 (302-378)||(39525973-39526049)
chr1 (12-92)||(52442788-52442868)
chr1 (103-373)||(990469-990732)
chr1 (94-368)||(10272259-10272530)
chr1 (303-378)||(14224294-14224368)
chr1 (301-372)||(14225840-14225911)
chr1 (153-376)||(33560858-33561081)
chr1 (322-376)||(4380188-4380241)
chr1 (265-373)||(15438800-15438904)
chr1 (277-378)||(40920526-40920628)
chr1 (139-376)||(50771555-50771792)
chr1 (86-163)||(52073675-52073753)
chr1 (313-375)||(52815094-52815155)
chr1 (337-378)||(8809499-8809540)
chr1 (281-378)||(15706969-15707066)
chr1 (325-378)||(49051174-49051227)
chr1 (328-373)||(50830637-50830682)
chr1 (326-378)||(7082536-7082588)
chr1 (95-163)||(8343071-8343139)
chr1 (99-163)||(13827930-13827994)
chr1 (25-160)||(17275137-17275262)
chr1 (278-378)||(35672869-35672969)
chr1 (305-373)||(39797212-39797280)
chr1 (19-91)||(40920822-40920894)
chr1 (324-376)||(43898439-43898491)
chr1 (302-374)||(43934332-43934404)
chr1 (265-353)||(48865730-48865818)
chr1 (332-375)||(853782-853825)
chr1 (301-364)||(7083097-7083160)
chr1 (314-373)||(7210930-7210989)
chr1 (277-352)||(14557751-14557826)
chr1 (16-163)||(16943097-16943243)
chr1 (337-376)||(29975442-29975481)
chr1 (301-356)||(37294128-37294183)
chr1 (20-103)||(41611098-41611181)
chr1 (216-347)||(52878328-52878459)
chr1 (265-336)||(52900682-52900753)
chr1 (312-378)||(2728847-2728913)
chr1 (277-335)||(39776936-39776994)
chr1 (291-373)||(52981410-52981492)
chr1 (337-378)||(6757462-6757503)
chr1 (324-378)||(7601361-7601411)
chr1 (336-373)||(8725812-8725849)
chr1 (19-88)||(16142172-16142241)
chr1 (19-163)||(16822235-16822376)
chr1 (337-378)||(21519167-21519208)
chr1 (301-378)||(39123367-39123443)
chr1 (277-378)||(39515866-39515967)
chr1 (325-370)||(49062469-49062514)
chr1 (17-89)||(51234537-51234610)
chr1 (337-378)||(52901039-52901080)
chr1 (277-361)||(7124324-7124408)
chr1 (324-376)||(14732334-14732386)
chr1 (305-377)||(17640066-17640138)
chr1 (226-371)||(17815611-17815753)
chr1 (301-369)||(37429906-37429974)
chr1 (277-378)||(48861373-48861476)
chr1 (277-377)||(51812692-51812792)
chr1 (301-372)||(2694423-2694494)
chr1 (335-378)||(3059554-3059597)
chr1 (343-378)||(7913781-7913816)
chr1 (343-378)||(7922074-7922109)
chr1 (230-333)||(11331247-11331350)
chr1 (230-333)||(11489268-11489371)
chr1 (331-378)||(22319837-22319884)
chr1 (343-378)||(22930642-22930677)
chr1 (343-378)||(30985306-30985341)
chr1 (120-155)||(31274578-31274613)
chr1 (337-376)||(37831616-37831655)
chr1 (19-210)||(39422209-39422398)
chr1 (105-160)||(44905548-44905603)
chr1 (331-374)||(46388612-46388654)
chr1 (21-87)||(4590813-4590879)
chr1 (102-160)||(7921843-7921901)
chr1 (154-236)||(9602204-9602286)
chr1 (28-171)||(19908573-19908718)
chr1 (302-376)||(34863648-34863722)
chr1 (328-378)||(37099760-37099810)
chr1 (303-368)||(37263566-37263632)
chr1 (296-378)||(41017215-41017296)
chr1 (309-374)||(43598923-43598989)
chr1 (110-188)||(46388392-46388470)
chr1 (343-376)||(4298323-4298356)
chr1 (131-180)||(10569263-10569312)
chr1 (349-378)||(11572405-11572434)
chr1 (303-364)||(30445314-30445375)
chr1 (337-374)||(45168483-45168520)
chr1 (331-372)||(46395056-46395096)
chr1 (343-376)||(51173925-51173958)
[»] chr4 (250 HSPs)
chr4 (12-376)||(31959814-31960178)
chr4 (12-378)||(436147-436513)
chr4 (12-378)||(52569513-52569879)
chr4 (12-378)||(48174091-48174457)
chr4 (12-378)||(4440773-4441137)
chr4 (12-378)||(33227127-33227493)
chr4 (12-377)||(56375208-56375573)
chr4 (12-379)||(33190845-33191212)
chr4 (12-376)||(48622543-48622905)
chr4 (12-377)||(1777016-1777379)
chr4 (12-378)||(53707712-53708078)
chr4 (12-378)||(43433836-43434208)
chr4 (12-376)||(23906297-23906665)
chr4 (12-378)||(46582824-46583188)
chr4 (12-378)||(28236103-28236466)
chr4 (25-378)||(37797783-37798135)
chr4 (12-378)||(47265193-47265566)
chr4 (16-378)||(39100534-39100893)
chr4 (16-376)||(27450180-27450533)
chr4 (12-350)||(50286889-50287217)
chr4 (73-369)||(39708412-39708708)
chr4 (16-377)||(27983122-27983476)
chr4 (118-378)||(8286455-8286723)
chr4 (15-359)||(37773468-37773811)
chr4 (86-373)||(20192025-20192311)
chr4 (82-375)||(26037506-26037799)
chr4 (113-377)||(32479057-32479321)
chr4 (16-373)||(1793382-1793741)
chr4 (190-378)||(21236954-21237142)
chr4 (16-378)||(45204838-45205208)
chr4 (28-377)||(51421666-51422013)
chr4 (14-376)||(20591306-20591662)
chr4 (222-378)||(6957726-6957882)
chr4 (19-312)||(41009414-41009707)
chr4 (222-378)||(12494791-12494947)
chr4 (19-377)||(20601651-20602003)
chr4 (19-378)||(1211390-1211747)
chr4 (12-138)||(12494668-12494794)
chr4 (145-326)||(50679556-50679736)
chr4 (16-378)||(35690226-35690555)
chr4 (15-372)||(54470128-54470485)
chr4 (222-378)||(21528416-21528572)
chr4 (125-375)||(53518325-53518571)
chr4 (222-371)||(7947065-7947214)
chr4 (24-374)||(16002857-16003206)
chr4 (12-162)||(31458946-31459098)
chr4 (266-378)||(19154861-19154973)
chr4 (212-375)||(4548140-4548303)
chr4 (271-378)||(19969358-19969465)
chr4 (139-378)||(31961264-31961503)
chr4 (128-378)||(20821002-20821255)
chr4 (152-377)||(28351617-28351842)
chr4 (12-378)||(56224983-56225352)
chr4 (78-376)||(46372008-46372306)
chr4 (15-376)||(42639020-42639381)
chr4 (146-378)||(2589124-2589356)
chr4 (78-376)||(31897428-31897724)
chr4 (82-378)||(35555648-35555941)
chr4 (12-153)||(49987346-49987487)
chr4 (215-371)||(50862764-50862908)
chr4 (296-378)||(19061933-19062015)
chr4 (12-377)||(7092218-7092583)
chr4 (33-378)||(10208977-10209318)
chr4 (212-376)||(51811280-51811442)
chr4 (12-194)||(33709837-33710024)
chr4 (18-338)||(21106908-21107236)
chr4 (15-156)||(44047568-44047709)
chr4 (265-378)||(55007917-55008030)
chr4 (78-373)||(31339521-31339803)
chr4 (181-378)||(31459093-31459278)
chr4 (303-377)||(49939733-49939807)
chr4 (58-203)||(28497452-28497598)
chr4 (131-378)||(13805263-13805510)
chr4 (267-378)||(34208267-34208378)
chr4 (223-378)||(37488220-37488375)
chr4 (104-378)||(42285701-42285972)
chr4 (16-369)||(34233031-34233393)
chr4 (312-378)||(50238613-50238679)
chr4 (312-378)||(50238699-50238765)
chr4 (217-377)||(2557670-2557831)
chr4 (277-378)||(25575007-25575108)
chr4 (101-286)||(26356626-26356811)
chr4 (16-378)||(29398741-29399088)
chr4 (16-203)||(50662311-50662497)
chr4 (217-378)||(53540413-53540574)
chr4 (262-378)||(5306464-5306580)
chr4 (12-163)||(17900398-17900549)
chr4 (303-378)||(32633404-32633479)
chr4 (12-202)||(51252635-51252823)
chr4 (238-375)||(26024851-26024988)
chr4 (301-378)||(45209203-45209280)
chr4 (12-235)||(25257722-25257943)
chr4 (23-176)||(41192763-41192918)
chr4 (315-378)||(30634104-30634167)
chr4 (223-378)||(31043201-31043356)
chr4 (25-377)||(44360014-44360369)
chr4 (59-307)||(50680704-50680953)
chr4 (19-358)||(55578956-55579295)
chr4 (247-376)||(28550455-28550584)
chr4 (278-378)||(20105516-20105616)
chr4 (282-378)||(25427860-25427956)
chr4 (23-163)||(38570960-38571099)
chr4 (306-378)||(50869878-50869950)
chr4 (303-378)||(7066497-7066571)
chr4 (291-378)||(12443292-12443379)
chr4 (14-376)||(25755237-25755598)
chr4 (12-160)||(31403234-31403384)
chr4 (303-374)||(34585691-34585762)
chr4 (242-373)||(37042667-37042798)
chr4 (119-358)||(47372676-47372915)
chr4 (217-376)||(49987531-49987690)
chr4 (125-373)||(17666053-17666294)
chr4 (18-224)||(2588905-2589120)
chr4 (309-378)||(15661870-15661939)
chr4 (301-378)||(32339766-32339843)
chr4 (295-372)||(36255526-36255603)
chr4 (301-378)||(40932922-40932999)
chr4 (277-378)||(51438628-51438729)
chr4 (277-374)||(55388213-55388310)
chr4 (282-374)||(1095633-1095725)
chr4 (12-144)||(10775654-10775786)
chr4 (317-377)||(15665324-15665384)
chr4 (277-377)||(41192244-41192344)
chr4 (326-378)||(46153940-46153992)
chr4 (71-194)||(1427466-1427589)
chr4 (301-380)||(3979127-3979206)
chr4 (301-376)||(8284346-8284421)
chr4 (277-376)||(29209175-29209274)
chr4 (12-87)||(43070053-43070128)
chr4 (301-376)||(49738550-49738625)
chr4 (227-373)||(13296566-13296712)
chr4 (328-378)||(56130404-56130454)
chr4 (97-377)||(22420716-22420993)
chr4 (277-374)||(22873601-22873698)
chr4 (305-378)||(44719359-44719432)
chr4 (218-291)||(55809075-55809148)
chr4 (79-171)||(30621409-30621501)
chr4 (324-376)||(38017319-38017371)
chr4 (323-378)||(1328612-1328667)
chr4 (323-378)||(4879107-4879162)
chr4 (20-91)||(25967552-25967623)
chr4 (82-376)||(40018189-40018477)
chr4 (16-171)||(45175930-45176083)
chr4 (313-376)||(46236708-46236771)
chr4 (301-372)||(49686900-49686971)
chr4 (304-378)||(6958237-6958310)
chr4 (308-374)||(21359227-21359293)
chr4 (168-377)||(21945644-21945846)
chr4 (234-312)||(41009283-41009361)
chr4 (65-163)||(46715585-46715678)
chr4 (233-378)||(56439568-56439714)
chr4 (301-370)||(7544537-7544605)
chr4 (227-360)||(8598957-8599090)
chr4 (275-332)||(41729494-41729551)
chr4 (19-163)||(50471453-50471595)
chr4 (296-377)||(50967027-50967108)
chr4 (324-376)||(28348287-28348339)
chr4 (224-376)||(31403034-31403186)
chr4 (15-82)||(18966474-18966541)
chr4 (223-378)||(20999129-20999284)
chr4 (303-378)||(35622674-35622749)
chr4 (303-378)||(36556758-36556833)
chr4 (303-378)||(39446908-39446983)
chr4 (324-379)||(44047367-44047422)
chr4 (216-374)||(45184135-45184291)
chr4 (305-376)||(47372915-47372986)
chr4 (108-163)||(47611741-47611796)
chr4 (336-378)||(8327143-8327185)
chr4 (303-373)||(13262421-13262491)
chr4 (58-160)||(36557246-36557347)
chr4 (323-376)||(813147-813200)
chr4 (301-370)||(1965639-1965708)
chr4 (332-377)||(6478662-6478706)
chr4 (305-374)||(17900691-17900760)
chr4 (307-376)||(32613643-32613712)
chr4 (323-376)||(54529647-54529700)
chr4 (101-208)||(20131167-20131274)
chr4 (314-378)||(26275014-26275078)
chr4 (296-376)||(36799657-36799737)
chr4 (314-378)||(38585249-38585313)
chr4 (59-171)||(38903925-38904036)
chr4 (108-188)||(45185215-45185295)
chr4 (336-376)||(49416949-49416989)
chr4 (324-376)||(50471757-50471809)
chr4 (301-378)||(56200153-56200234)
chr4 (303-378)||(883358-883433)
chr4 (343-378)||(26772535-26772570)
chr4 (82-209)||(38266134-38266261)
chr4 (217-371)||(47147496-47147648)
chr4 (343-378)||(49454477-49454512)
chr4 (220-331)||(50287988-50288099)
chr4 (291-378)||(54963648-54963734)
chr4 (324-374)||(8598898-8598948)
chr4 (138-204)||(20605241-20605307)
chr4 (17-160)||(45423542-45423681)
chr4 (296-378)||(54935351-54935433)
chr4 (18-163)||(934649-934793)
chr4 (23-160)||(1380296-1380433)
chr4 (314-363)||(14623243-14623292)
chr4 (343-376)||(26357008-26357041)
chr4 (265-358)||(28486092-28486185)
chr4 (328-373)||(32630495-32630540)
chr4 (277-374)||(34379586-34379682)
chr4 (343-376)||(38789623-38789656)
chr4 (321-378)||(42293263-42293320)
chr4 (341-378)||(48451071-48451108)
chr4 (323-372)||(52359963-52360012)
chr4 (79-160)||(55768717-55768798)
chr4 (79-160)||(55832973-55833054)
chr4 (330-374)||(20047670-20047714)
chr4 (322-378)||(25959225-25959281)
chr4 (337-373)||(32745831-32745867)
chr4 (110-162)||(44860862-44860914)
chr4 (95-163)||(49738817-49738885)
chr4 (343-378)||(3601417-3601452)
chr4 (324-375)||(4136744-4136795)
chr4 (327-374)||(8459056-8459103)
chr4 (335-370)||(10536580-10536615)
chr4 (12-245)||(11389638-11389875)
chr4 (314-376)||(11400444-11400507)
chr4 (314-376)||(11410171-11410234)
chr4 (335-378)||(23294023-23294066)
chr4 (301-376)||(27338387-27338462)
chr4 (305-356)||(28467649-28467700)
chr4 (343-378)||(35585854-35585889)
chr4 (335-378)||(43774098-43774141)
chr4 (323-378)||(46539109-46539164)
chr4 (343-378)||(49370043-49370078)
chr4 (343-378)||(51051453-51051488)
chr4 (303-374)||(51550251-51550322)
chr4 (335-378)||(52357924-52357967)
chr4 (324-362)||(1380600-1380638)
chr4 (296-378)||(1989785-1989867)
chr4 (318-376)||(6931722-6931780)
chr4 (332-374)||(10775473-10775515)
chr4 (324-378)||(20654868-20654922)
chr4 (246-336)||(30621241-30621331)
chr4 (97-155)||(42293470-42293528)
chr4 (336-378)||(44940738-44940780)
chr4 (344-378)||(49416204-49416238)
chr4 (304-378)||(51176784-51176858)
chr4 (346-380)||(51879747-51879781)
chr4 (344-378)||(53413941-53413975)
chr4 (314-372)||(53517725-53517783)
chr4 (265-378)||(26510559-26510671)
chr4 (331-376)||(28764374-28764419)
chr4 (17-74)||(40933198-40933255)
chr4 (301-378)||(51841196-51841273)
chr4 (275-376)||(55768500-55768600)
chr4 (275-376)||(55832756-55832856)
[»] chr3 (199 HSPs)
chr3 (12-378)||(52138718-52139084)
chr3 (12-378)||(28245355-28245721)
chr3 (12-378)||(54278938-54279303)
chr3 (12-378)||(51447715-51448073)
chr3 (16-378)||(21995-22356)
chr3 (16-378)||(5168750-5169116)
chr3 (17-376)||(47233596-47233955)
chr3 (12-376)||(25191297-25191659)
chr3 (77-376)||(35033129-35033428)
chr3 (12-377)||(54128296-54128662)
chr3 (12-277)||(33272122-33272392)
chr3 (127-378)||(48508268-48508519)
chr3 (19-378)||(53519511-53519864)
chr3 (82-376)||(38850108-38850403)
chr3 (206-378)||(12096703-12096875)
chr3 (14-378)||(43694769-43695127)
chr3 (19-378)||(19676079-19676447)
chr3 (36-376)||(45289091-45289434)
chr3 (33-378)||(49503566-49503897)
chr3 (41-374)||(39600683-39601016)
chr3 (12-268)||(45728064-45728324)
chr3 (95-377)||(50960636-50960914)
chr3 (58-370)||(38430807-38431129)
chr3 (233-378)||(52156082-52156227)
chr3 (28-376)||(48734147-48734481)
chr3 (16-366)||(19736918-19737255)
chr3 (24-366)||(19757829-19758158)
chr3 (82-243)||(38060419-38060580)
chr3 (101-341)||(48953454-48953697)
chr3 (110-367)||(39235154-39235409)
chr3 (16-375)||(26490239-26490596)
chr3 (98-378)||(42510014-42510292)
chr3 (12-312)||(27917490-27917788)
chr3 (238-376)||(38060858-38060996)
chr3 (272-378)||(47555330-47555436)
chr3 (248-378)||(53262295-53262425)
chr3 (32-299)||(3186707-3186973)
chr3 (64-377)||(31454224-31454537)
chr3 (84-376)||(54364976-54365268)
chr3 (82-374)||(30294125-30294418)
chr3 (239-376)||(49042081-49042219)
chr3 (58-376)||(54424959-54425289)
chr3 (265-378)||(311307-311420)
chr3 (287-378)||(7895878-7895969)
chr3 (70-334)||(52678892-52679154)
chr3 (263-378)||(2133610-2133725)
chr3 (228-364)||(17022684-17022820)
chr3 (288-378)||(48532151-48532242)
chr3 (247-376)||(15296060-15296189)
chr3 (12-373)||(49841529-49841895)
chr3 (119-314)||(19162650-19162842)
chr3 (303-376)||(31566161-31566234)
chr3 (16-376)||(2340717-2341074)
chr3 (303-378)||(40273203-40273278)
chr3 (105-359)||(37351418-37351672)
chr3 (281-376)||(30797822-30797917)
chr3 (277-376)||(40106620-40106719)
chr3 (311-378)||(45834598-45834665)
chr3 (228-377)||(45486848-45487000)
chr3 (16-236)||(50249303-50249529)
chr3 (22-159)||(344928-345065)
chr3 (265-378)||(29601063-29601176)
chr3 (109-376)||(36303994-36304248)
chr3 (277-378)||(39208791-39208892)
chr3 (308-373)||(41529975-41530040)
chr3 (218-378)||(27893213-27893373)
chr3 (12-163)||(36820174-36820323)
chr3 (301-377)||(46148235-46148311)
chr3 (95-335)||(21200551-21200787)
chr3 (287-378)||(33271908-33271999)
chr3 (12-91)||(38850012-38850091)
chr3 (283-378)||(45374475-45374570)
chr3 (288-378)||(52927846-52927936)
chr3 (58-171)||(3987011-3987124)
chr3 (303-376)||(24778609-24778682)
chr3 (265-366)||(40116348-40116449)
chr3 (80-209)||(41842678-41842806)
chr3 (110-374)||(659541-659805)
chr3 (301-377)||(37083291-37083367)
chr3 (16-371)||(46431684-46432031)
chr3 (277-376)||(14415260-14415358)
chr3 (16-371)||(23534576-23534929)
chr3 (277-376)||(40991614-40991713)
chr3 (221-376)||(11284120-11284270)
chr3 (287-365)||(24541343-24541421)
chr3 (278-376)||(48712075-48712173)
chr3 (82-259)||(11581432-11581609)
chr3 (95-376)||(42026536-42026817)
chr3 (217-376)||(29475811-29475968)
chr3 (217-378)||(41482141-41482298)
chr3 (305-376)||(7278675-7278746)
chr3 (304-375)||(21862742-21862813)
chr3 (16-151)||(31337751-31337884)
chr3 (314-376)||(52882662-52882724)
chr3 (301-378)||(388260-388337)
chr3 (58-162)||(29600863-29600968)
chr3 (301-378)||(31146907-31146983)
chr3 (328-377)||(39512777-39512826)
chr3 (284-377)||(39781917-39782009)
chr3 (314-375)||(45468795-45468856)
chr3 (281-373)||(32170592-32170684)
chr3 (16-88)||(45236778-45236850)
chr3 (303-378)||(3987543-3987618)
chr3 (303-378)||(20208207-20208282)
chr3 (12-155)||(29817422-29817565)
chr3 (16-91)||(30345445-30345520)
chr3 (282-378)||(35420455-35420552)
chr3 (282-373)||(49045023-49045114)
chr3 (256-376)||(54422837-54422963)
chr3 (312-374)||(31452963-31453025)
chr3 (225-339)||(40116505-40116619)
chr3 (324-378)||(50249607-50249661)
chr3 (12-57)||(47542031-47542076)
chr3 (217-373)||(45493695-45493851)
chr3 (301-373)||(46367390-46367462)
chr3 (316-376)||(53214871-53214931)
chr3 (282-377)||(4472386-4472481)
chr3 (303-378)||(30332558-30332633)
chr3 (12-91)||(46568034-46568113)
chr3 (316-374)||(21427586-21427644)
chr3 (337-379)||(48259947-48259989)
chr3 (16-78)||(48953694-48953756)
chr3 (218-287)||(26990337-26990406)
chr3 (302-379)||(31260964-31261040)
chr3 (309-374)||(35481143-35481208)
chr3 (301-378)||(39535399-39535475)
chr3 (330-379)||(44102953-44103002)
chr3 (309-374)||(49888402-49888467)
chr3 (314-378)||(344770-344834)
chr3 (72-163)||(31453151-31453242)
chr3 (228-379)||(34844569-34844721)
chr3 (338-378)||(35701093-35701133)
chr3 (17-89)||(38054624-38054696)
chr3 (324-380)||(49933436-49933492)
chr3 (301-376)||(7120790-7120865)
chr3 (343-378)||(23610930-23610965)
chr3 (337-376)||(27192466-27192505)
chr3 (331-378)||(35032764-35032811)
chr3 (277-371)||(36049309-36049401)
chr3 (314-377)||(37102807-37102870)
chr3 (314-377)||(40672366-40672429)
chr3 (228-379)||(43308696-43308847)
chr3 (343-378)||(43529295-43529330)
chr3 (336-378)||(237294-237336)
chr3 (305-371)||(6988113-6988179)
chr3 (305-375)||(21427995-21428065)
chr3 (27-153)||(26388414-26388540)
chr3 (301-375)||(34719081-34719155)
chr3 (99-153)||(37534429-37534483)
chr3 (101-163)||(39535653-39535715)
chr3 (296-378)||(53266893-53266975)
chr3 (341-378)||(829149-829186)
chr3 (122-171)||(3870649-3870698)
chr3 (331-372)||(8566670-8566711)
chr3 (324-373)||(26990442-26990491)
chr3 (291-360)||(27795996-27796065)
chr3 (190-376)||(31337560-31337741)
chr3 (35-115)||(33307087-33307165)
chr3 (323-372)||(34253689-34253738)
chr3 (323-376)||(35465758-35465811)
chr3 (269-370)||(41842529-41842630)
chr3 (304-373)||(46140617-46140686)
chr3 (324-373)||(54485767-54485816)
chr3 (304-364)||(7942864-7942924)
chr3 (330-378)||(24084320-24084368)
chr3 (336-376)||(43396082-43396122)
chr3 (336-372)||(52077473-52077509)
chr3 (323-378)||(7446274-7446329)
chr3 (323-378)||(7454416-7454471)
chr3 (343-378)||(21000720-21000755)
chr3 (343-378)||(36764934-36764969)
chr3 (325-376)||(40122645-40122696)
chr3 (343-378)||(41230513-41230548)
chr3 (95-162)||(44134044-44134111)
chr3 (331-374)||(44443208-44443250)
chr3 (346-377)||(48328200-48328231)
chr3 (303-378)||(50631879-50631954)
chr3 (277-377)||(55244461-55244565)
chr3 (333-367)||(944467-944501)
chr3 (332-378)||(4660165-4660211)
chr3 (343-377)||(21506270-21506304)
chr3 (332-378)||(34067137-34067183)
chr3 (97-163)||(36868437-36868503)
chr3 (301-374)||(37598171-37598245)
chr3 (12-54)||(42510333-42510375)
chr3 (302-376)||(44133845-44133918)
chr3 (295-365)||(53951956-53952026)
chr3 (348-377)||(21513070-21513099)
chr3 (320-357)||(24103420-24103457)
chr3 (348-377)||(26874857-26874886)
chr3 (299-376)||(32052395-32052472)
chr3 (325-378)||(34812775-34812828)
chr3 (332-369)||(37102989-37103026)
chr3 (335-376)||(41965819-41965860)
chr3 (301-370)||(41971277-41971345)
chr3 (301-374)||(47804666-47804738)
chr3 (335-376)||(49090632-49090673)
chr3 (16-89)||(50621647-50621720)
chr3 (325-378)||(53266818-53266871)
[»] chr7 (218 HSPs)
chr7 (12-379)||(37617862-37618230)
chr7 (12-378)||(11593878-11594244)
chr7 (15-376)||(34869341-34869702)
chr7 (12-378)||(12841273-12841639)
chr7 (12-378)||(49029194-49029559)
chr7 (12-369)||(35906208-35906565)
chr7 (16-378)||(39906370-39906730)
chr7 (12-378)||(33349804-33350170)
chr7 (12-378)||(44855172-44855536)
chr7 (12-374)||(46355858-46356219)
chr7 (16-378)||(45836480-45836840)
chr7 (12-323)||(13859061-13859372)
chr7 (59-378)||(6374833-6375152)
chr7 (14-378)||(36651914-36652276)
chr7 (18-378)||(43281600-43281958)
chr7 (12-378)||(31005141-31005489)
chr7 (17-375)||(35558994-35559353)
chr7 (94-378)||(31682600-31682884)
chr7 (59-378)||(29650349-29650668)
chr7 (16-378)||(43491230-43491592)
chr7 (16-378)||(38606927-38607276)
chr7 (80-378)||(2885720-2886018)
chr7 (97-378)||(22349623-22349904)
chr7 (95-378)||(36869235-36869525)
chr7 (12-250)||(33072872-33073108)
chr7 (19-375)||(23404343-23404697)
chr7 (17-376)||(36136687-36137046)
chr7 (207-378)||(38900070-38900240)
chr7 (104-378)||(15682184-15682458)
chr7 (25-373)||(28627936-28628284)
chr7 (211-376)||(40979928-40980093)
chr7 (133-378)||(32631615-32631848)
chr7 (167-374)||(31681022-31681226)
chr7 (145-377)||(7273151-7273383)
chr7 (16-333)||(47848596-47848912)
chr7 (152-378)||(24598186-24598411)
chr7 (229-376)||(48919247-48919394)
chr7 (251-377)||(27648937-27649063)
chr7 (29-376)||(8492236-8492580)
chr7 (245-377)||(21078068-21078200)
chr7 (16-206)||(7272961-7273151)
chr7 (216-378)||(9210702-9210864)
chr7 (150-377)||(1011103-1011329)
chr7 (112-378)||(38135211-38135476)
chr7 (16-136)||(32630517-32630636)
chr7 (270-377)||(33073105-33073212)
chr7 (97-378)||(12966025-12966300)
chr7 (281-378)||(28208326-28208423)
chr7 (266-375)||(34035155-34035264)
chr7 (12-212)||(36514371-36514569)
chr7 (16-248)||(25579205-25579431)
chr7 (12-378)||(36101775-36102129)
chr7 (19-259)||(43282330-43282574)
chr7 (217-373)||(45601599-45601755)
chr7 (58-198)||(46014359-46014498)
chr7 (16-299)||(7189296-7189593)
chr7 (19-378)||(48735899-48736256)
chr7 (58-378)||(26741892-26742215)
chr7 (12-370)||(5335840-5336193)
chr7 (19-203)||(39811882-39812066)
chr7 (224-378)||(42187572-42187725)
chr7 (272-373)||(47852265-47852366)
chr7 (12-91)||(36869574-36869653)
chr7 (241-375)||(14057625-14057759)
chr7 (241-375)||(14367653-14367787)
chr7 (303-377)||(31869101-31869175)
chr7 (16-161)||(42187393-42187537)
chr7 (16-201)||(19262609-19262791)
chr7 (229-375)||(34745882-34746028)
chr7 (266-378)||(42969870-42969982)
chr7 (269-377)||(47652722-47652830)
chr7 (13-109)||(24598409-24598509)
chr7 (299-374)||(24777166-24777241)
chr7 (12-378)||(14593679-14594036)
chr7 (281-375)||(24177628-24177721)
chr7 (12-163)||(30200176-30200323)
chr7 (312-378)||(40630652-40630718)
chr7 (13-162)||(28020883-28021032)
chr7 (82-162)||(27021906-27021986)
chr7 (251-378)||(28355322-28355450)
chr7 (277-376)||(33732017-33732114)
chr7 (95-203)||(40169650-40169758)
chr7 (141-348)||(1569063-1569270)
chr7 (238-373)||(40149016-40149150)
chr7 (268-378)||(33103100-33103210)
chr7 (265-378)||(27893561-27893674)
chr7 (309-378)||(28708596-28708665)
chr7 (306-379)||(31840442-31840515)
chr7 (227-376)||(37976368-37976517)
chr7 (214-378)||(44951274-44951439)
chr7 (129-378)||(48202701-48202949)
chr7 (277-376)||(34341395-34341494)
chr7 (256-376)||(40415169-40415295)
chr7 (12-163)||(16013202-16013357)
chr7 (191-377)||(19119423-19119608)
chr7 (296-378)||(25891090-25891172)
chr7 (12-202)||(1740715-1740909)
chr7 (301-378)||(4604754-4604831)
chr7 (238-339)||(36239833-36239934)
chr7 (301-378)||(48515482-48515559)
chr7 (314-378)||(5418294-5418358)
chr7 (314-374)||(6263479-6263539)
chr7 (303-375)||(34029677-34029749)
chr7 (280-360)||(34926538-34926618)
chr7 (227-375)||(38103616-38103762)
chr7 (100-377)||(7220750-7221039)
chr7 (265-376)||(8519046-8519157)
chr7 (303-378)||(16013484-16013559)
chr7 (12-379)||(24549686-24550051)
chr7 (281-376)||(30814125-30814220)
chr7 (95-166)||(38920795-38920866)
chr7 (150-377)||(1531372-1531587)
chr7 (117-251)||(6420615-6420749)
chr7 (304-378)||(33281097-33281170)
chr7 (277-378)||(2882734-2882835)
chr7 (301-378)||(41483694-41483771)
chr7 (58-163)||(41948480-41948585)
chr7 (304-376)||(20158671-20158743)
chr7 (265-376)||(28541943-28542055)
chr7 (314-378)||(29312209-29312273)
chr7 (318-378)||(29318793-29318853)
chr7 (314-378)||(47700054-47700117)
chr7 (323-378)||(20525050-20525105)
chr7 (227-378)||(47796150-47796301)
chr7 (95-285)||(18605237-18605427)
chr7 (331-377)||(21244282-21244328)
chr7 (148-378)||(33139208-33139437)
chr7 (95-193)||(35713696-35713794)
chr7 (12-163)||(40830146-40830292)
chr7 (296-373)||(36245259-36245336)
chr7 (303-376)||(45558539-45558611)
chr7 (304-364)||(17759483-17759543)
chr7 (314-374)||(30144975-30145035)
chr7 (303-376)||(38921086-38921161)
chr7 (301-373)||(39812145-39812217)
chr7 (13-171)||(40139124-40139279)
chr7 (84-160)||(45558352-45558428)
chr7 (307-378)||(1523856-1523927)
chr7 (303-378)||(6807700-6807775)
chr7 (227-330)||(21517426-21517529)
chr7 (303-378)||(35865912-35865987)
chr7 (324-375)||(39738446-39738497)
chr7 (301-376)||(40138948-40139023)
chr7 (302-377)||(41461318-41461393)
chr7 (221-356)||(43281958-43282092)
chr7 (41-153)||(47796359-47796473)
chr7 (25-91)||(1523747-1523813)
chr7 (95-285)||(18637563-18637753)
chr7 (95-285)||(18650997-18651187)
chr7 (296-374)||(24376025-24376103)
chr7 (296-378)||(48515373-48515455)
chr7 (317-378)||(17907722-17907783)
chr7 (265-378)||(25731472-25731585)
chr7 (305-378)||(28021146-28021219)
chr7 (301-378)||(40008429-40008506)
chr7 (86-209)||(5418071-5418195)
chr7 (324-368)||(6682583-6682627)
chr7 (334-378)||(20899411-20899455)
chr7 (19-91)||(27021991-27022063)
chr7 (95-299)||(28562443-28562647)
chr7 (326-378)||(30199965-30200017)
chr7 (277-376)||(32879192-32879292)
chr7 (338-378)||(43423989-43424029)
chr7 (278-337)||(6807388-6807447)
chr7 (217-348)||(22174123-22174254)
chr7 (265-336)||(31859046-31859117)
chr7 (343-378)||(35725569-35725604)
chr7 (247-354)||(40391845-40391952)
chr7 (223-374)||(40830331-40830481)
chr7 (217-339)||(44401164-44401284)
chr7 (301-368)||(45054311-45054378)
chr7 (24-151)||(45841206-45841332)
chr7 (343-378)||(47413713-47413748)
chr7 (277-379)||(3457544-3457645)
chr7 (148-226)||(26925264-26925342)
chr7 (112-202)||(30144793-30144883)
chr7 (301-375)||(30914503-30914577)
chr7 (343-377)||(33650869-33650903)
chr7 (301-371)||(33871479-33871549)
chr7 (324-378)||(45840994-45841048)
chr7 (333-378)||(12241684-12241728)
chr7 (303-376)||(25578069-25578142)
chr7 (323-376)||(25579103-25579156)
chr7 (84-161)||(30632958-30633035)
chr7 (306-378)||(475987-476059)
chr7 (97-201)||(3457368-3457471)
chr7 (342-378)||(3928344-3928380)
chr7 (301-377)||(19262457-19262533)
chr7 (324-380)||(26847836-26847892)
chr7 (306-378)||(27021723-27021795)
chr7 (336-376)||(35734691-35734731)
chr7 (336-376)||(41157897-41157937)
chr7 (217-377)||(42177018-42177177)
chr7 (124-171)||(9797909-9797956)
chr7 (96-155)||(27893769-27893828)
chr7 (95-170)||(30914674-30914749)
chr7 (32-91)||(35713617-35713676)
chr7 (248-371)||(35922407-35922530)
chr7 (70-137)||(37439580-37439647)
chr7 (337-375)||(635309-635347)
chr7 (343-377)||(5577498-5577532)
chr7 (12-86)||(29653844-29653918)
chr7 (343-373)||(30188512-30188542)
chr7 (316-378)||(35066744-35066805)
chr7 (335-377)||(38504695-38504737)
chr7 (16-157)||(40008636-40008777)
chr7 (323-377)||(41948724-41948778)
chr7 (336-374)||(48735683-48735721)
chr7 (95-163)||(6429156-6429225)
chr7 (82-151)||(23720829-23720898)
chr7 (33-90)||(25731639-25731696)
chr7 (58-163)||(25826683-25826788)
chr7 (309-350)||(37595891-37595932)
chr7 (63-136)||(42177255-42177328)
chr7 (341-374)||(43653184-43653217)
chr7 (343-372)||(44930960-44930989)
chr7 (324-365)||(47155183-47155224)
chr7 (300-377)||(47185807-47185883)
[»] chr8 (194 HSPs)
chr8 (12-379)||(36565238-36565605)
chr8 (12-378)||(36545065-36545433)
chr8 (12-375)||(36394949-36395314)
chr8 (60-378)||(11523721-11524040)
chr8 (12-378)||(40813240-40813608)
chr8 (12-378)||(39946775-39947132)
chr8 (16-378)||(42854002-42854364)
chr8 (96-373)||(12491141-12491418)
chr8 (12-375)||(2796473-2796838)
chr8 (16-377)||(18125097-18125454)
chr8 (41-378)||(21121105-21121429)
chr8 (11-376)||(45419156-45419517)
chr8 (16-378)||(37077687-37078033)
chr8 (168-378)||(42469725-42469935)
chr8 (66-373)||(8932676-8932982)
chr8 (17-376)||(29520583-29520931)
chr8 (16-376)||(8879446-8879800)
chr8 (195-378)||(2027631-2027814)
chr8 (244-377)||(25473402-25473535)
chr8 (26-378)||(32043522-32043871)
chr8 (114-376)||(26904908-26905168)
chr8 (221-378)||(14742080-14742234)
chr8 (16-254)||(18751998-18752233)
chr8 (12-377)||(39953263-39953628)
chr8 (265-376)||(44529396-44529507)
chr8 (267-378)||(44047530-44047641)
chr8 (97-341)||(43904700-43904947)
chr8 (119-378)||(30559718-30559982)
chr8 (103-378)||(32930970-32931244)
chr8 (86-352)||(29700268-29700534)
chr8 (256-378)||(15215410-15215532)
chr8 (265-378)||(490506-490619)
chr8 (17-288)||(10079995-10080264)
chr8 (184-375)||(35362651-35362842)
chr8 (12-374)||(16917102-16917462)
chr8 (105-378)||(35643606-35643872)
chr8 (152-372)||(12025847-12026058)
chr8 (246-377)||(45041315-45041445)
chr8 (14-160)||(13171865-13172011)
chr8 (16-370)||(16351312-16351653)
chr8 (222-378)||(23492163-23492318)
chr8 (242-375)||(25288912-25289045)
chr8 (242-375)||(25300247-25300380)
chr8 (12-197)||(30748377-30748560)
chr8 (223-376)||(35914601-35914754)
chr8 (16-312)||(45512558-45512856)
chr8 (217-376)||(2216411-2216568)
chr8 (18-188)||(6510616-6510784)
chr8 (16-378)||(5908564-5908930)
chr8 (45-194)||(7046285-7046434)
chr8 (217-378)||(43733330-43733490)
chr8 (287-379)||(10668494-10668586)
chr8 (12-88)||(12492130-12492206)
chr8 (304-379)||(1928584-1928659)
chr8 (216-378)||(28169514-28169675)
chr8 (130-378)||(42584407-42584642)
chr8 (178-374)||(7531646-7531842)
chr8 (125-318)||(9904940-9905132)
chr8 (217-378)||(30198264-30198425)
chr8 (217-378)||(30812814-30812975)
chr8 (302-378)||(32276893-32276969)
chr8 (298-378)||(32569708-32569788)
chr8 (277-373)||(44699649-44699745)
chr8 (46-161)||(9695583-9695698)
chr8 (266-378)||(31715992-31716106)
chr8 (12-232)||(39760572-39760788)
chr8 (28-163)||(44681252-44681387)
chr8 (63-164)||(12796912-12797011)
chr8 (266-376)||(26363660-26363768)
chr8 (232-378)||(39967497-39967643)
chr8 (18-171)||(2518597-2518749)
chr8 (10-91)||(15215556-15215637)
chr8 (301-378)||(27556300-27556377)
chr8 (16-157)||(30113416-30113557)
chr8 (12-108)||(25288820-25288916)
chr8 (12-108)||(25300155-25300251)
chr8 (216-375)||(3801995-3802154)
chr8 (301-376)||(12611704-12611779)
chr8 (287-378)||(8255529-8255622)
chr8 (242-375)||(14459043-14459177)
chr8 (277-378)||(3473753-3473854)
chr8 (82-377)||(13589474-13589762)
chr8 (314-379)||(35323993-35324058)
chr8 (324-372)||(26055651-26055699)
chr8 (12-209)||(36143287-36143480)
chr8 (291-375)||(36143538-36143622)
chr8 (12-147)||(30456441-30456575)
chr8 (301-376)||(35646930-35647005)
chr8 (223-350)||(38391919-38392046)
chr8 (323-378)||(41031418-41031473)
chr8 (323-378)||(41031524-41031579)
chr8 (12-146)||(42493536-42493668)
chr8 (191-305)||(5266027-5266140)
chr8 (99-209)||(10824331-10824441)
chr8 (329-378)||(1064955-1065004)
chr8 (277-378)||(21425229-21425330)
chr8 (301-378)||(30689942-30690019)
chr8 (16-377)||(30783041-30783400)
chr8 (314-379)||(39651025-39651090)
chr8 (301-373)||(1313771-1313843)
chr8 (16-136)||(13986416-13986536)
chr8 (222-378)||(14903689-14903845)
chr8 (17-157)||(39051065-39051205)
chr8 (301-378)||(41212068-41212147)
chr8 (277-379)||(43350728-43350827)
chr8 (303-378)||(36042407-36042482)
chr8 (303-378)||(38901817-38901892)
chr8 (82-163)||(2776442-2776524)
chr8 (97-163)||(18474173-18474239)
chr8 (35-244)||(25985462-25985668)
chr8 (214-296)||(28269759-28269840)
chr8 (305-370)||(18741843-18741908)
chr8 (305-370)||(18746807-18746872)
chr8 (266-375)||(36069774-36069883)
chr8 (219-378)||(39388907-39389070)
chr8 (217-378)||(41444337-41444501)
chr8 (325-377)||(4558207-4558259)
chr8 (218-378)||(16994442-16994602)
chr8 (225-341)||(17491689-17491805)
chr8 (303-375)||(18473973-18474045)
chr8 (223-378)||(79156-79310)
chr8 (323-378)||(12985919-12985974)
chr8 (220-376)||(23023351-23023509)
chr8 (324-379)||(31309583-31309638)
chr8 (327-378)||(35085135-35085186)
chr8 (323-378)||(40982894-40982949)
chr8 (58-209)||(44373740-44373891)
chr8 (314-377)||(45512443-45512506)
chr8 (42-163)||(78988-79112)
chr8 (277-379)||(10824186-10824288)
chr8 (281-359)||(16035744-16035822)
chr8 (337-378)||(24837934-24837975)
chr8 (335-376)||(30980058-30980099)
chr8 (328-376)||(4061897-4061945)
chr8 (324-376)||(9695815-9695867)
chr8 (326-378)||(16921451-16921503)
chr8 (95-163)||(25985813-25985880)
chr8 (95-155)||(41444547-41444607)
chr8 (16-163)||(41971991-41972134)
chr8 (303-374)||(2518400-2518471)
chr8 (272-375)||(3464172-3464274)
chr8 (324-379)||(5057596-5057651)
chr8 (335-378)||(9842361-9842404)
chr8 (306-377)||(12692239-12692310)
chr8 (324-367)||(14742847-14742890)
chr8 (343-378)||(16918494-16918529)
chr8 (240-299)||(25439471-25439530)
chr8 (335-378)||(32978115-32978158)
chr8 (324-378)||(1549389-1549443)
chr8 (238-376)||(4955335-4955473)
chr8 (19-89)||(16252860-16252930)
chr8 (200-378)||(24399788-24399965)
chr8 (277-379)||(30748646-30748748)
chr8 (157-259)||(38178377-38178479)
chr8 (128-373)||(3079609-3079850)
chr8 (341-374)||(5030418-5030451)
chr8 (58-149)||(33666726-33666814)
chr8 (304-377)||(35320399-35320472)
chr8 (303-372)||(39702163-39702232)
chr8 (305-378)||(42493428-42493501)
chr8 (314-378)||(1070279-1070343)
chr8 (324-376)||(3638335-3638387)
chr8 (301-377)||(5810277-5810353)
chr8 (324-376)||(16971772-16971824)
chr8 (277-365)||(18742034-18742122)
chr8 (277-365)||(18746998-18747086)
chr8 (16-91)||(29735728-29735804)
chr8 (17-317)||(33827816-33828116)
chr8 (21-89)||(36069570-36069638)
chr8 (323-374)||(1335555-1335606)
chr8 (82-161)||(6483245-6483324)
chr8 (98-137)||(7103274-7103313)
chr8 (58-209)||(11733711-11733862)
chr8 (343-378)||(16008393-16008428)
chr8 (301-372)||(16715480-16715551)
chr8 (220-375)||(27037761-27037915)
chr8 (86-157)||(34196064-34196135)
chr8 (332-378)||(4011484-4011530)
chr8 (301-378)||(5127299-5127377)
chr8 (332-374)||(5205413-5205455)
chr8 (335-376)||(14744522-14744564)
chr8 (21-87)||(25439394-25439460)
chr8 (301-371)||(26639233-26639303)
chr8 (101-163)||(29645044-29645106)
chr8 (303-341)||(30456329-30456367)
chr8 (332-378)||(39049825-39049871)
chr8 (343-376)||(2938342-2938375)
chr8 (82-163)||(23023231-23023312)
chr8 (343-376)||(25439552-25439585)
chr8 (335-376)||(27449183-27449224)
chr8 (343-376)||(32838891-32838924)
chr8 (265-378)||(33076295-33076408)
chr8 (335-376)||(40640609-40640650)
chr8 (336-377)||(41604656-41604697)
[»] chr6 (106 HSPs)
chr6 (12-378)||(28085294-28085660)
chr6 (12-378)||(32755837-32756205)
chr6 (16-373)||(30031178-30031535)
chr6 (20-378)||(5258146-5258506)
chr6 (16-376)||(35043441-35043801)
chr6 (16-375)||(608081-608442)
chr6 (16-376)||(9706698-9707052)
chr6 (16-378)||(20427634-20427996)
chr6 (66-378)||(12890556-12890859)
chr6 (16-377)||(9593709-9594072)
chr6 (17-336)||(5631741-5632064)
chr6 (12-378)||(14030724-14031079)
chr6 (40-376)||(21351837-21352171)
chr6 (16-248)||(10099987-10100217)
chr6 (105-378)||(30679417-30679680)
chr6 (217-378)||(34143763-34143924)
chr6 (217-378)||(34156379-34156540)
chr6 (96-333)||(33496963-33497198)
chr6 (12-378)||(28026827-28027189)
chr6 (264-376)||(34934830-34934942)
chr6 (262-378)||(31818999-31819115)
chr6 (216-376)||(5095956-5096116)
chr6 (23-341)||(6055806-6056123)
chr6 (143-271)||(7133795-7133923)
chr6 (143-271)||(7136718-7136846)
chr6 (166-337)||(5080912-5081083)
chr6 (257-378)||(3206457-3206578)
chr6 (217-378)||(34503-34664)
chr6 (100-376)||(2689646-2689915)
chr6 (16-127)||(5080777-5080888)
chr6 (245-378)||(10098894-10099025)
chr6 (95-376)||(31818533-31818813)
chr6 (15-378)||(10617232-10617586)
chr6 (12-163)||(33083976-33084127)
chr6 (16-232)||(26291700-26291917)
chr6 (102-341)||(24665818-24666058)
chr6 (303-374)||(30789076-30789147)
chr6 (256-378)||(5897619-5897741)
chr6 (22-182)||(9568588-9568750)
chr6 (298-376)||(1615223-1615301)
chr6 (217-377)||(8364679-8364839)
chr6 (141-378)||(579465-579702)
chr6 (84-378)||(7513387-7513683)
chr6 (256-374)||(7492551-7492669)
chr6 (282-378)||(4245870-4245966)
chr6 (305-376)||(12119642-12119714)
chr6 (277-377)||(12133901-12134001)
chr6 (12-92)||(33998288-33998368)
chr6 (303-378)||(38980-39055)
chr6 (16-254)||(25493972-25494210)
chr6 (70-188)||(2079317-2079434)
chr6 (102-378)||(6293390-6293660)
chr6 (304-373)||(21886314-21886383)
chr6 (305-378)||(30642980-30643053)
chr6 (323-376)||(33730194-33730247)
chr6 (97-157)||(8364575-8364635)
chr6 (301-373)||(21089604-21089676)
chr6 (303-378)||(1008050-1008124)
chr6 (279-378)||(9568884-9568982)
chr6 (305-376)||(18130814-18130885)
chr6 (217-375)||(33997545-33997703)
chr6 (21-157)||(6641628-6641764)
chr6 (301-377)||(32945455-32945531)
chr6 (16-104)||(33496106-33496194)
chr6 (15-90)||(5129123-5129198)
chr6 (277-368)||(5983814-5983905)
chr6 (301-377)||(7337192-7337270)
chr6 (305-376)||(23888478-23888549)
chr6 (336-379)||(24698854-24698897)
chr6 (309-368)||(32068635-32068694)
chr6 (301-379)||(9109506-9109584)
chr6 (12-162)||(12134115-12134265)
chr6 (323-377)||(29900275-29900329)
chr6 (301-378)||(586057-586134)
chr6 (237-378)||(1747944-1748084)
chr6 (16-110)||(2065018-2065116)
chr6 (318-375)||(5053750-5053807)
chr6 (37-134)||(5095816-5095913)
chr6 (86-150)||(21870299-21870363)
chr6 (303-366)||(10453272-10453335)
chr6 (326-377)||(29931068-29931119)
chr6 (301-356)||(32080676-32080731)
chr6 (301-368)||(32097944-32098011)
chr6 (102-379)||(43049-43326)
chr6 (291-337)||(1911577-1911623)
chr6 (323-376)||(6692696-6692749)
chr6 (12-171)||(7150526-7150682)
chr6 (324-373)||(21870069-21870118)
chr6 (330-371)||(29354741-29354782)
chr6 (303-360)||(33084138-33084195)
chr6 (16-80)||(2689578-2689642)
chr6 (342-378)||(3127274-3127310)
chr6 (291-350)||(413280-413339)
chr6 (323-378)||(2307854-2307909)
chr6 (343-378)||(4878295-4878330)
chr6 (12-55)||(6293690-6293733)
chr6 (325-376)||(7150311-7150362)
chr6 (291-358)||(7513008-7513075)
chr6 (96-378)||(31831857-31832139)
chr6 (336-378)||(451947-451989)
chr6 (301-371)||(2079488-2079558)
chr6 (265-335)||(14389202-14389272)
chr6 (344-378)||(21531802-21531836)
chr6 (336-378)||(27840048-27840090)
chr6 (343-377)||(31434441-31434475)
chr6 (184-245)||(3963889-3963950)
[»] chr5 (175 HSPs)
chr5 (12-378)||(12492382-12492751)
chr5 (20-378)||(4496308-4496668)
chr5 (12-377)||(24178428-24178793)
chr5 (12-377)||(1287578-1287953)
chr5 (12-378)||(28976857-28977221)
chr5 (12-374)||(2075475-2075838)
chr5 (12-378)||(10639215-10639586)
chr5 (12-378)||(1275183-1275548)
chr5 (59-369)||(38684932-38685242)
chr5 (16-376)||(3301766-3302126)
chr5 (16-376)||(16347380-16347738)
chr5 (97-375)||(20456776-20457054)
chr5 (42-378)||(14665658-14665996)
chr5 (12-378)||(34272940-34273297)
chr5 (152-378)||(2915494-2915719)
chr5 (25-378)||(26884687-26885040)
chr5 (225-378)||(29816513-29816666)
chr5 (183-379)||(13561383-13561579)
chr5 (126-372)||(38501422-38501668)
chr5 (190-374)||(14911268-14911452)
chr5 (58-329)||(14749271-14749542)
chr5 (238-376)||(16913882-16914021)
chr5 (16-377)||(27816-28165)
chr5 (274-378)||(30213755-30213859)
chr5 (82-378)||(79501-79797)
chr5 (12-336)||(36215418-36215730)
chr5 (58-379)||(7359258-7359577)
chr5 (58-378)||(6859345-6859665)
chr5 (86-371)||(2712936-2713213)
chr5 (267-377)||(5558314-5558424)
chr5 (32-367)||(6888931-6889267)
chr5 (82-378)||(14667751-14668055)
chr5 (41-287)||(31636009-31636253)
chr5 (16-344)||(32516480-32516805)
chr5 (247-378)||(28276391-28276522)
chr5 (15-312)||(17340500-17340798)
chr5 (72-376)||(43557833-43558133)
chr5 (265-378)||(418032-418145)
chr5 (16-377)||(7678402-7678760)
chr5 (12-373)||(11002424-11002785)
chr5 (97-378)||(43475243-43475523)
chr5 (101-376)||(1525651-1525923)
chr5 (223-378)||(11675658-11675814)
chr5 (305-380)||(408490-408565)
chr5 (105-359)||(30588460-30588712)
chr5 (217-364)||(9235172-9235316)
chr5 (12-374)||(10082747-10083102)
chr5 (25-157)||(15168721-15168855)
chr5 (17-245)||(21952274-21952508)
chr5 (288-377)||(38132531-38132619)
chr5 (237-377)||(2090556-2090696)
chr5 (285-377)||(18855798-18855890)
chr5 (298-378)||(42576214-42576294)
chr5 (303-378)||(28411885-28411960)
chr5 (219-378)||(29922409-29922568)
chr5 (255-378)||(39040917-39041040)
chr5 (256-378)||(2393039-2393160)
chr5 (291-373)||(7640510-7640592)
chr5 (217-375)||(12576861-12577019)
chr5 (218-367)||(15588399-15588546)
chr5 (277-378)||(32442124-32442224)
chr5 (291-379)||(9400708-9400796)
chr5 (79-259)||(15489609-15489789)
chr5 (262-378)||(20367061-20367177)
chr5 (85-377)||(38684471-38684763)
chr5 (303-374)||(3442873-3442944)
chr5 (244-314)||(2552932-2553002)
chr5 (49-254)||(42199243-42199446)
chr5 (12-101)||(20318905-20318989)
chr5 (304-377)||(42272687-42272760)
chr5 (43-171)||(418190-418318)
chr5 (131-378)||(9917458-9917695)
chr5 (308-376)||(27386554-27386622)
chr5 (95-163)||(33667217-33667285)
chr5 (296-378)||(5860036-5860118)
chr5 (296-378)||(11069160-11069242)
chr5 (232-377)||(5303582-5303730)
chr5 (95-378)||(18350900-18351189)
chr5 (95-259)||(28676596-28676760)
chr5 (302-378)||(32366186-32366262)
chr5 (278-378)||(38830504-38830603)
chr5 (301-376)||(28186782-28186857)
chr5 (279-377)||(2645175-2645273)
chr5 (14-88)||(28186956-28187030)
chr5 (323-377)||(36551375-36551429)
chr5 (265-378)||(41894237-41894357)
chr5 (230-376)||(42504247-42504393)
chr5 (12-137)||(219692-219817)
chr5 (307-376)||(9121078-9121147)
chr5 (121-234)||(15986879-15986992)
chr5 (221-374)||(33667562-33667715)
chr5 (301-378)||(36123180-36123257)
chr5 (301-378)||(41200344-41200421)
chr5 (124-359)||(23979976-23980209)
chr5 (220-376)||(27998567-27998723)
chr5 (303-371)||(28985292-28985360)
chr5 (105-358)||(29938126-29938374)
chr5 (314-378)||(39322077-39322141)
chr5 (216-375)||(25938091-25938250)
chr5 (303-374)||(27800037-27800108)
chr5 (314-376)||(218052-218114)
chr5 (196-310)||(15168873-15168987)
chr5 (121-247)||(36200769-36200894)
chr5 (323-376)||(3000968-3001021)
chr5 (323-376)||(9234115-9234168)
chr5 (25-162)||(31906592-31906729)
chr5 (302-376)||(41108727-41108803)
chr5 (23-91)||(5305545-5305613)
chr5 (217-377)||(6788190-6788349)
chr5 (131-235)||(11675547-11675651)
chr5 (308-380)||(43423492-43423563)
chr5 (323-374)||(10668569-10668620)
chr5 (114-209)||(21093772-21093867)
chr5 (308-378)||(32006161-32006232)
chr5 (150-289)||(33157918-33158057)
chr5 (17-116)||(34039960-34040059)
chr5 (152-335)||(43035039-43035222)
chr5 (323-372)||(8081967-8082017)
chr5 (280-378)||(21193650-21193748)
chr5 (305-375)||(30639717-30639787)
chr5 (14-76)||(36200702-36200764)
chr5 (281-378)||(683699-683796)
chr5 (309-378)||(4026326-4026395)
chr5 (335-376)||(10989085-10989126)
chr5 (337-378)||(13606995-13607036)
chr5 (280-365)||(15252755-15252840)
chr5 (328-376)||(7367172-7367220)
chr5 (216-312)||(14725640-14725736)
chr5 (98-162)||(37065533-37065597)
chr5 (277-369)||(41808105-41808197)
chr5 (323-378)||(4653481-4653536)
chr5 (337-376)||(10124388-10124427)
chr5 (328-375)||(16014485-16014532)
chr5 (343-378)||(29929303-29929338)
chr5 (257-376)||(31220546-31220664)
chr5 (318-377)||(35118321-35118380)
chr5 (58-113)||(42504446-42504501)
chr5 (303-365)||(1935402-1935464)
chr5 (320-378)||(24391022-24391080)
chr5 (14-56)||(27998343-27998385)
chr5 (304-373)||(2049271-2049339)
chr5 (323-376)||(19137907-19137960)
chr5 (343-376)||(32489295-32489328)
chr5 (333-378)||(34119859-34119904)
chr5 (250-378)||(37065632-37065761)
chr5 (95-272)||(38578625-38578802)
chr5 (337-378)||(42408698-42408739)
chr5 (296-368)||(12534414-12534486)
chr5 (332-376)||(21952600-21952644)
chr5 (143-247)||(27799892-27799996)
chr5 (292-376)||(39012776-39012860)
chr5 (86-163)||(41833795-41833874)
chr5 (343-378)||(3563413-3563448)
chr5 (331-378)||(3775072-3775119)
chr5 (22-89)||(34194783-34194850)
chr5 (296-378)||(1104706-1104787)
chr5 (84-182)||(4026529-4026627)
chr5 (19-81)||(6368220-6368282)
chr5 (338-376)||(15584252-15584290)
chr5 (324-374)||(30639301-30639351)
chr5 (336-378)||(32925105-32925147)
chr5 (343-373)||(34190971-34191001)
chr5 (295-378)||(39668904-39668991)
chr5 (291-377)||(41833656-41833742)
chr5 (324-365)||(3448776-3448817)
chr5 (12-49)||(5848403-5848440)
chr5 (337-378)||(7090314-7090355)
chr5 (337-374)||(10668648-10668685)
chr5 (337-370)||(18741227-18741260)
chr5 (105-162)||(27553842-27553899)
chr5 (345-378)||(31635927-31635960)
chr5 (95-152)||(38341641-38341698)
chr5 (301-374)||(39128269-39128342)
chr5 (314-375)||(39766741-39766802)
chr5 (18-55)||(43558135-43558172)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (12-378)||(31386-31752)
scaffold0018 (86-163)||(44081-44158)
[»] chr2 (176 HSPs)
chr2 (12-374)||(8180698-8181060)
chr2 (12-378)||(3865990-3866356)
chr2 (12-376)||(36183369-36183733)
chr2 (12-376)||(38452686-38453053)
chr2 (12-375)||(3243654-3244015)
chr2 (12-378)||(4807510-4807879)
chr2 (16-378)||(38429806-38430167)
chr2 (16-378)||(12734623-12734984)
chr2 (82-378)||(2610576-2610872)
chr2 (16-378)||(41197225-41197588)
chr2 (16-376)||(11992108-11992466)
chr2 (16-376)||(41763043-41763401)
chr2 (65-378)||(25834650-25834962)
chr2 (115-378)||(451646-451909)
chr2 (16-378)||(45367623-45367984)
chr2 (136-378)||(7326158-7326400)
chr2 (23-376)||(18424378-18424728)
chr2 (166-377)||(28508750-28508961)
chr2 (101-377)||(24583630-24583907)
chr2 (16-350)||(23997539-23997858)
chr2 (16-376)||(38434873-38435234)
chr2 (211-378)||(35643065-35643232)
chr2 (20-378)||(9556367-9556724)
chr2 (95-378)||(12141545-12141828)
chr2 (198-376)||(31959625-31959803)
chr2 (151-374)||(39029638-39029867)
chr2 (20-378)||(6237751-6238110)
chr2 (263-378)||(227358-227473)
chr2 (256-378)||(30306194-30306316)
chr2 (95-375)||(18958908-18959192)
chr2 (79-378)||(43751945-43752244)
chr2 (256-378)||(38328368-38328488)
chr2 (214-375)||(45543074-45543234)
chr2 (218-378)||(43573128-43573287)
chr2 (103-378)||(44437719-44437994)
chr2 (274-378)||(3635321-3635425)
chr2 (12-369)||(4598569-4598928)
chr2 (99-378)||(12882043-12882317)
chr2 (236-376)||(9996623-9996766)
chr2 (133-378)||(42543274-42543519)
chr2 (16-163)||(16097199-16097350)
chr2 (265-378)||(9496037-9496150)
chr2 (63-375)||(37481618-37481930)
chr2 (294-376)||(12474927-12475009)
chr2 (191-374)||(35755247-35755434)
chr2 (82-374)||(13149319-13149612)
chr2 (12-209)||(7825276-7825475)
chr2 (70-376)||(11412697-11412992)
chr2 (13-359)||(41545325-41545670)
chr2 (306-378)||(17670680-17670752)
chr2 (265-373)||(19336896-19337004)
chr2 (279-375)||(39709202-39709298)
chr2 (95-378)||(6218968-6219249)
chr2 (190-377)||(13443907-13444094)
chr2 (12-253)||(23714384-23714622)
chr2 (12-253)||(24102056-24102294)
chr2 (288-378)||(9531598-9531688)
chr2 (296-378)||(12520060-12520142)
chr2 (229-378)||(12489800-12489949)
chr2 (90-163)||(43238306-43238379)
chr2 (217-372)||(33504346-33504502)
chr2 (12-91)||(2610446-2610525)
chr2 (12-373)||(42092437-42092796)
chr2 (95-378)||(3481145-3481438)
chr2 (82-378)||(43832087-43832382)
chr2 (220-363)||(37470146-37470289)
chr2 (277-378)||(8197539-8197640)
chr2 (277-378)||(8202299-8202400)
chr2 (184-372)||(19234988-19235176)
chr2 (184-376)||(5758995-5759187)
chr2 (306-378)||(17626284-17626356)
chr2 (222-378)||(33287549-33287705)
chr2 (223-378)||(7431887-7432042)
chr2 (303-378)||(15025703-15025778)
chr2 (251-377)||(30743686-30743812)
chr2 (58-376)||(13240763-13241063)
chr2 (296-377)||(19863436-19863517)
chr2 (296-377)||(19867768-19867849)
chr2 (296-377)||(19872669-19872750)
chr2 (305-378)||(25384680-25384753)
chr2 (217-374)||(26670891-26671048)
chr2 (16-209)||(45077670-45077870)
chr2 (294-378)||(42549835-42549919)
chr2 (301-376)||(10516749-10516824)
chr2 (217-376)||(19855585-19855744)
chr2 (16-147)||(30743545-30743675)
chr2 (16-161)||(19337069-19337209)
chr2 (44-173)||(40759049-40759179)
chr2 (310-374)||(522445-522509)
chr2 (281-365)||(3720426-3720510)
chr2 (296-376)||(17429252-17429332)
chr2 (16-263)||(13592411-13592656)
chr2 (124-366)||(26784350-26784592)
chr2 (303-375)||(887065-887138)
chr2 (323-376)||(16521007-16521060)
chr2 (280-373)||(45077915-45078008)
chr2 (12-68)||(451930-451986)
chr2 (314-378)||(14444889-14444953)
chr2 (238-377)||(28960210-28960350)
chr2 (277-377)||(32402683-32402783)
chr2 (97-241)||(32443668-32443812)
chr2 (311-378)||(12470895-12470962)
chr2 (302-377)||(14397957-14398032)
chr2 (323-378)||(15775843-15775898)
chr2 (294-377)||(21281462-21281545)
chr2 (267-377)||(9394629-9394739)
chr2 (12-163)||(9647822-9647969)
chr2 (296-374)||(34931634-34931712)
chr2 (79-132)||(227307-227360)
chr2 (64-153)||(19024150-19024239)
chr2 (323-372)||(45482989-45483038)
chr2 (303-375)||(624687-624759)
chr2 (306-378)||(3305807-3305879)
chr2 (24-163)||(9578916-9579053)
chr2 (178-346)||(21834638-21834806)
chr2 (79-163)||(38860158-38860242)
chr2 (335-378)||(10403891-10403934)
chr2 (303-378)||(15015154-15015229)
chr2 (324-379)||(33971534-33971589)
chr2 (301-376)||(36993742-36993816)
chr2 (96-202)||(11017316-11017422)
chr2 (102-171)||(14197367-14197437)
chr2 (305-363)||(29968624-29968682)
chr2 (324-378)||(33393339-33393393)
chr2 (336-378)||(38429651-38429693)
chr2 (335-376)||(2073307-2073348)
chr2 (279-376)||(3030864-3030960)
chr2 (303-368)||(19024387-19024452)
chr2 (301-373)||(19224988-19225061)
chr2 (296-361)||(23915708-23915773)
chr2 (337-378)||(37520689-37520730)
chr2 (330-378)||(8560804-8560852)
chr2 (321-377)||(15222472-15222528)
chr2 (178-378)||(17581543-17581743)
chr2 (298-374)||(32364923-32364999)
chr2 (107-163)||(41858744-41858800)
chr2 (278-373)||(186135-186230)
chr2 (124-171)||(907710-907757)
chr2 (343-378)||(1648113-1648148)
chr2 (305-376)||(2515171-2515242)
chr2 (296-375)||(7615471-7615550)
chr2 (301-376)||(9647611-9647686)
chr2 (319-374)||(12026014-12026069)
chr2 (343-378)||(13188391-13188426)
chr2 (277-376)||(13474214-13474313)
chr2 (303-354)||(19334174-19334225)
chr2 (331-378)||(26566292-26566339)
chr2 (278-376)||(26850419-26850517)
chr2 (251-377)||(18790105-18790231)
chr2 (12-78)||(24583904-24583970)
chr2 (324-378)||(36819406-36819459)
chr2 (217-378)||(45436965-45437124)
chr2 (301-378)||(335710-335787)
chr2 (323-376)||(32706472-32706525)
chr2 (277-374)||(36366819-36366916)
chr2 (302-366)||(440924-440988)
chr2 (309-376)||(2901960-2902028)
chr2 (318-378)||(24214010-24214070)
chr2 (309-376)||(32443851-32443919)
chr2 (96-160)||(41330131-41330195)
chr2 (324-376)||(44415853-44415905)
chr2 (334-373)||(11414571-11414610)
chr2 (343-378)||(14530529-14530564)
chr2 (320-378)||(23354105-23354164)
chr2 (335-378)||(25284954-25284997)
chr2 (319-378)||(32395594-32395653)
chr2 (334-373)||(43970020-43970059)
chr2 (321-375)||(9078804-9078858)
chr2 (348-378)||(14520948-14520978)
chr2 (17-162)||(18188706-18188848)
chr2 (323-369)||(44877440-44877486)
chr2 (18-111)||(17581392-17581485)
chr2 (301-370)||(19015946-19016015)
chr2 (309-378)||(32541792-32541861)
chr2 (277-374)||(36650625-36650721)
chr2 (129-202)||(43260439-43260512)
[»] scaffold0570 (2 HSPs)
scaffold0570 (51-378)||(946-1271)
scaffold0570 (12-49)||(2597-2634)
[»] scaffold0024 (3 HSPs)
scaffold0024 (16-376)||(82643-83000)
scaffold0024 (285-373)||(48119-48207)
scaffold0024 (314-371)||(18943-19000)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (14-378)||(4278-4634)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (16-378)||(86607-86967)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (222-378)||(25530-25686)
scaffold0157 (12-138)||(25683-25809)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (203-376)||(16687-16860)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (136-378)||(11547-11787)
scaffold0113 (12-162)||(11810-11962)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (166-378)||(4708-4920)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (244-377)||(481-614)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (84-374)||(7431-7720)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (233-378)||(14722-14867)
scaffold0199 (109-162)||(14626-14678)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (286-378)||(28887-28979)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (217-378)||(58224-58385)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (238-375)||(160325-160462)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (265-376)||(25443-25554)
[»] scaffold1259 (1 HSPs)
scaffold1259 (230-378)||(1520-1665)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (291-377)||(6771-6857)
[»] scaffold0245 (1 HSPs)
scaffold0245 (288-374)||(16438-16524)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (305-370)||(3648-3713)
scaffold0491 (277-365)||(3839-3927)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (305-378)||(99284-99357)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (98-162)||(11802-11866)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (256-336)||(39481-39561)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (314-363)||(194086-194135)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (326-378)||(19149-19201)
[»] scaffold0179 (1 HSPs)
scaffold0179 (323-374)||(26049-26100)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (303-378)||(163192-163267)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (325-378)||(40610-40663)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 488; Significance: 0; HSPs: 235)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 488; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 377 - 920
Target Start/End: Original strand, 45647767 - 45648307
Alignment:
Q  377 tgcaccattggtggaaaagtgttttacacttaaaaacaaattagaacccaccgacataacaaataattgtgtaacttccnnnnnnnnaaaaccgtcaaac 476  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||    
T  45647767 tgcaccgttggtggaaaagtgttttacacttaaaaacaaattagaacccaccgacataacaaataattgtgtaacttccttttttt--aaaccgtcaaac 45647864  T
Q  477 atgattcgcaagattgaagatttgtgattggttcattggatgtcagtgtaaaataactttacagttacggtgcatattccattaatctcataacttacat 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45647865 atgattcgcaagattgaagatttgtgattggttcattggatgtcagtgtaaaataactttacagttacggtgcatattccattaatctcataacttacat 45647964  T
Q  577 tgaaccacctttttatgcatattttgtcggataagttgcttgtatttttatttttgaaaagagaatgcggcattctagttattagtactccttcaaaatg 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45647965 tgaaccacctttttatgcatattttgtaggataagttgcttgtatttttatttttgaaaagagaatgcggcattctagttattagtactccttcaaaatg 45648064  T
Q  677 gagagtacaatgtgaattgcctaagtaaactaatattgtcccttgttgcaggtgcccacggctcaaacgacttgttctgccggcttggaacagaattaaa 776  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45648065 gagagtacaatgtgaattgcctaagt-aactaatcttgtcccttgttgcaggtgcccacggctcaaacgccttgttctgccggcttggaacagaattaaa 45648163  T
Q  777 agtacaggaatgtgcaaggcaatccgttcctggaaagagctggagtctttgacaatgcctactatagaaaacgcgccatattttctagatgaaattgcaa 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45648164 agtacaggaatgtgcaaggcaatccgttcctggaaagagctggagtctttgacaatgcctactatagaaaacgcgccatattttctagatgaaattgcaa 45648263  T
Q  877 caaactgcaagaacttcagtgaactcaagattatggggccatgt 920  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45648264 caaactgcaagaacttcagtgaactcaagattatggggccatgt 45648307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 1210663 - 1211029
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1210663 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 1210762  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1210763 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 1210862  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1210863 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 1210962  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1210963 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 1211029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30202494 - 30202128
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30202494 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 30202395  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30202394 gaaaggttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggacgagagtcaag 30202295  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30202294 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 30202195  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30202194 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 30202128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 12 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34792713 - 34792346
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34792713 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgaaaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 34792614  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34792613 gaaaagttggtagaaagtaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 34792514  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34792513 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaac 34792414  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34792413 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgc 34792346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 12 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 49347757 - 49347393
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  49347757 agcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattggagagagagtaggggtagcatctatagta 49347658  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49347657 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgcagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 49347558  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49347557 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 49347458  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49347457 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49347393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 8671838 - 8672202
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  8671838 agcagagataaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagta 8671935  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8671936 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 8672035  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8672036 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 8672135  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8672136 actatagcgtcatttgatccatatagccaaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttg 8672202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 12 - 379
Target Start/End: Original strand, 9592652 - 9593019
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9592652 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 9592751  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9592752 gaaaagtttgtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 9592851  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  9592852 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaacctattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttagatttaaatttggtgtatgatagaac 9592951  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9592952 actatagcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgc 9593019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 22090012 - 22090380
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatag 109  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  22090012 agcagagatgaggatgctgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattatgaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatag 22090111  T
Q  110 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22090112 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagggagaagacccgtagatgccgtggtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtca 22090211  T
Q  210 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22090212 agttaaaaggggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 22090311  T
Q  310 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22090312 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccactaagtgggataaggcttggttgttgttgttg 22090380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 12 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 51441129 - 51440764
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  51441129 agcagagatgaggatgttgcattggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagta 51441030  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  51441029 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccggagatgccgtggtaagaagagtagagcaaatggaggagagtcaag 51440930  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51440929 ttaaaggaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 51440830  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51440829 actacggcgtcatttgattcatgtaaccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 51440764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 19 - 378
Target Start/End: Original strand, 51601983 - 51602340
Alignment:
Q  19 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  51601983 atgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagag--tgagggtagcacctatagtagaaaagt 51602080  T
Q  119 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51602081 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 51602180  T
Q  219 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  51602181 aggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaagggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacatcatgg 51602280  T
Q  319 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51602281 cgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 51602340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32231315 - 32230959
Alignment:
Q  15 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 114  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32231315 agagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaa 32231216  T
Q  115 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 214  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32231215 aaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtta 32231116  T
Q  215 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32231115 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaagttggtctatgatagaacact 32231016  T
Q  315 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagt-gggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| || |||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32231015 atggtgtaatttgatccat--------ccccacttagtggggataaggcttggttgttgttgttg 32230959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43240745 - 43240380
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatag 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  43240745 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacgccattagagagagagagtgggggtagcacctatag 43240646  T
Q  110 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  43240645 tagaaaaattgatagaaaataggcttagatagtttgagcatgtagagagaagacccgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtta 43240546  T
Q  210 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 309  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43240545 agttaaaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttatatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 43240446  T
Q  310 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43240445 acactatggcgtcatttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttagttgttgttg 43240380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 16 - 379
Target Start/End: Original strand, 696191 - 696555
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  696191 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 696290  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  696291 agttggtagaaaataggcttagatggcttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcatatggaggagagtcaggttaa 696390  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  696391 aagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacacta 696490  T
Q  316 -tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  696491 ttggcgtcatttgatcaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 696555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4001814 - 4001453
Alignment:
Q  17 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 116  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4001814 agatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacaaaataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 4001715  T
Q  117 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4001714 gttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaa 4001615  T
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||    
T  4001614 agaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaccctat 4001515  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    | | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4001514 gacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 4001453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 84 - 378
Target Start/End: Original strand, 4029112 - 4029406
Alignment:
Q  84 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaaga 183  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  4029112 agagagagtgggggtagcacctagagtagacaagttggtagaaaataggcttagaaggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 4029211  T
Q  184 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagt 283  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4029212 agaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagt 4029311  T
Q  284 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4029312 tggatccaaatttggtgtatgatataacactatggcgacatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 4029406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Original strand, 15085856 - 15086206
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15085856 gagatgaggatgttgcgctggacgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 15085955  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  15085956 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcagattaa 15086055  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    |||||||||||||||||||| ||            |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||    
T  15086056 aagaggtagaggaagacctaaga------------aaaccattagataggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacacta 15086143  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15086144 tgacgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 15086206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 464 - 920
Target Start/End: Original strand, 45642830 - 45643288
Alignment:
Q  464 aaaaccgtcaaacatgattcgcaagattgaagatttgtgattggttcattggatgtcagtgtaaaataactttacagttacggtgcatattccattaatc 563  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||     
T  45642830 aaaaccatcaaacatgattcgctagattgaagaattgtaatcggttcattggatgtcagtataaaataactttactcttacaatgcatattcaattaatt 45642929  T
Q  564 tcataacttacattgaaccacctttttatgc-atattttgtcggataagttgcttgtatttttatttttgaaaagagaatgcggcattc-----tagtta 657  Q
    || ||||||  ||||||||||||||| ||   || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||    
T  45642930 tcctaacttgaattgaaccaccttttcataagatgtttggtaggataagttgcttgtatttttatttttgaaaagagaatgcggcactccttgctagtta 45643029  T
Q  658 ttagtactccttcaaaatggagagtacaatgtgaattgcctaagtaaactaatattgtcccttgttgcaggtgcccacggctcaaacgacttgttctgcc 757  Q
    |||  |||   || ||||||||| | ||| ||| ||| | ||| ||| ||||| | | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  45643030 ttaacact---tccaaatggagattgcaacgtggattacttaaataa-ctaatctcgccccttgttgtaggtgcccacatctcaaacgactggttctgcc 45643125  T
Q  758 ggcttggaacagaattaaaagtacaggaatgtgcaaggcaatccgttcctggaaagagctggagtctttgacaatgcctactatagaaaacgcgccatat 857  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  45643126 ggcttggaacagaattaaaagaacaggaatgtgcaaggcaatccgttgctggaaagagctagagtctctaacaatgcctagtatagcaaacccgccatat 45643225  T
Q  858 tttctagatgaaattgcaacaaactgcaagaacttcagtgaactcaagattatggggccatgt 920  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45643226 tttctagaggaaattgcaacaaactgcaagaacttcagtgaactcaagattatggggccatgt 45643288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32083105 - 32082754
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32083105 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacagggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 32083006  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  32083005 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgcagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 32082906  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    |||||||||||||||||||| ||            |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||    
T  32082905 aagaggtagaggaagacctaaga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacacta 32082818  T
Q  316 tggc-gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  32082817 cggcagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttagtttttgttgttg 32082754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Original strand, 8391694 - 8392056
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8391694 gagatgaagatgttgtgttggatgagtggtaagactacacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 8391793  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  8391794 agttggtagaaaataggtttagattgtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcatgttaa 8391893  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    | |||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | | |||||||| ||||    
T  8391894 aggaggtatatgaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttttgatagaatacta 8391993  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||    
T  8391994 tggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtaggaaaagacttagtcgttgttgttg 8392056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 38808031 - 38807669
Alignment:
Q  19 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----tgtgggtagcacctatagtagaa 114  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||    
T  38808031 atgaggatgttgtgttggat-agtggtaagaccagacgggatagaattagaaatgacaccattagagagagagagaatgggggtagcacctatagtagaa 38807933  T
Q  115 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 214  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||   ||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | |    
T  38807932 aagttggtagaaaatagacttagatggtttaggcatgtaaagagaagacccttagatgccgtcgtaagaagagtagaccagatggaggagagtcagatca 38807833  T
Q  215 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 314  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  38807832 aaagagctaggggaagacctaagaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgatagaacact 38807733  T
Q  315 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38807732 atggcgtaatttgttccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 38807669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 112 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25979495 - 25979229
Alignment:
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  25979495 gaaaagttagtagaaactaggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgctgttgtaaggagagtagatcgaatggaggagagtcagg 25979396  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25979395 ttaaaagaggtagaggaagacccatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaac 25979296  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25979295 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 25979229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37463231 - 37462878
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||    
T  37463231 gagatgaggatgtttcattggatgagtggtaagactagacaggttaggattaggaatgacaccattagag--agagttggggtagcacctatagtagaaa 37463134  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc-aagtta 214  Q
    ||   ||||||||||||||||| ||||||||||   || |||| ||||  |||||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||  |   |    
T  37463133 agacagtagaaaataggcttaggtggtttgggc---tatagagtagacatgtagatgccgtagtacgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcaa 37463037  T
Q  215 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 314  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||| |    
T  37463036 aaagaggtagaggattacctagaaaaactataagagaaacgatcaggaatgatttagaggttaatgagtttgat-caaatatggtttatcatagaacatt 37462938  T
Q  315 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37462937 atggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 37462878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 9509236 - 9509565
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9509236 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtgataagactagacaggatatgattagaaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagta 9509335  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| | |||   ||||| ||||| ||||||||||||||      
T  9509336 gaaaagatggtaaaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagaccggtatatgctttagtacttagagtagatcagatggaggagagtcata 9509435  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || |||||| ||   |||||||| || |||||| |||| |||||| ||||    
T  9509436 ttagaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagatttacagcctaatgagttagagccaaatatggtttatgattgaac 9509535  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccga 341  Q
    | |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9509536 attatggcgtaattcgatccatgtagccga 9509565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37311953 - 37311753
Alignment:
Q  178 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 277  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37311953 gtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggtagacctaggaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 37311854  T
Q  278 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37311853 atgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgtt 37311754  T
Q  378 g 378  Q
    |    
T  37311753 g 37311753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 9599758 - 9599409
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  9599758 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacatcattagagagagagttggagtaacacctatagta 9599659  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | ||| |||  | ||||| | | |||  |||||| ||||| ||||||||||||||      
T  9599658 gaaaagatggtagaaaataggcttaggtggttcgggcatataaatagatgacctgcagatgttatagtacaaagagtagatcagatggaggagagtcaga 9599559  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||  |||||||| | |||||||| |||||| || |||| |||||||||||    
T  9599558 tcataagaggtagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaatatttagagtttaatgagtttgatccagatatggtttatgatagaac 9599459  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagg 361  Q
      |||||||| |||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||    
T  9599458 gttatggcgtaatttgatccatgtagctgaccttacttagtgggaaaagg 9599409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 157 - 378
Target Start/End: Original strand, 39318193 - 39318412
Alignment:
Q  157 agaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaa 256  Q
    |||||||  |||||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  39318193 agaagacccgtagatgc-gtcgtaagaagagcagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaacca 39318291  T
Q  257 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39318292 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccga-cccgcttagtggga 39318390  T
Q  357 taaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  39318391 taaggcttgtttgttgttgttg 39318412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 211 - 376
Target Start/End: Original strand, 52921197 - 52921362
Alignment:
Q  211 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  52921197 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaa 52921296  T
Q  311 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52921297 cactattgcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 52921362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27848155 - 27847798
Alignment:
Q  25 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 124  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  27848155 atgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggat-aggaataacaccattagagagagagttgtggtagcacctgtggtagaaaagatggtag 27848057  T
Q  125 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 224  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||||||  | | |||||||||    
T  27848056 aaaataagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctgtagtatgaagagtatatcagatggaggagagtcagctcagaagaggtag 27847957  T
Q  225 aggaagacc-taggaaaactattagagaaacaatta-gaaag---gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 319  Q
    ||||||||| | | |||| ||| |||||||| | ||  ||||   ||||||||||| |||||||| | |  |||| |||| |||||| ||||| |||| |    
T  27847956 aggaagacctttgaaaaattataagagaaactactaccaaagatagatttagaggttaatgagtttggttgaaatatggtttatgatggaacattatgcc 27847857  T
Q  320 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27847856 gtaattttatccatgtagccgatctcacttagtgggataaggcttggtcattgttgttg 27847798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 39140434 - 39140794
Alignment:
Q  15 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa-------gattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  | |||||||||||    
T  39140434 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaactggtaagactagatgagataggattaggaatgaaaccattacagagagagttggcgtagcacctat 39140533  T
Q  108 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 207  Q
    |||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  39140534 agtagaaaagatggcaaaaaattggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccgatacatgttgtagtacgaagagtagatcagatggatgagagt 39140633  T
Q  208 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 307  Q
    ||  ||| ||||||||||||||   |||  |||  |||  ||||||| ||||| ||  |||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |  ||||    
T  39140634 cagattagaagaggtagaggaa---ctaaaaaagttat--gagaaactattaggaaaaatttagaggttaattagttggatccaaatatggtttcagata 39140728  T
Q  308 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39140729 gaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgt 39140794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18469440 - 18469082
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |  ||||| ||||||||||||| |    
T  18469440 gagatgacgatgctgcgttgtatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacacaattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaga 18469343  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    || || ||||||||||| |||| | |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||  |||| |||||| ||||||   | ||    
T  18469342 agatgatagaaaataggattaggtagtttggacatatagtgagaagactggtagatgttgtagtacgaagagtaaatcagatggagaagagtcggatcaa 18469243  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||  |||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||| ||    
T  18469242 aagaggtagatgaagacttagaaaaattataagagaaacttttaggaaatattaagaggtcaatgagttggatacaaatatagtttatgatcgaacatta 18469143  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||| || ||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  18469142 tggtgtaatttggttcatgtagacgaccccacttagtgggataatgctttgatgttgttgt 18469082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 124 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 52561841 - 52561590
Alignment:
Q  124 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 223  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||| ||||||||    
T  52561841 gaaaataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagaccgatagatgttgcagtacgaagagtagatcagatggaggagagttagattagaagaggta 52561742  T
Q  224 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 323  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |  | ||||||| |||||||  |    
T  52561741 gaggaagacttagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttcgggtagaacattatggcgaaa 52561642  T
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52561641 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52561590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32404890 - 32404525
Alignment:
Q  17 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacat----gataggat--taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagt 110  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||     |||  |||  ||| || |||| |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  32404890 agatgaggatgttgcgttagatgcgtggtaagaatagacagctaagattagatattagaaacgacaacattcgagagtgagt-tgggtaacacctatagt 32404792  T
Q  111 agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 210  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  |||||| || | ||||| ||||| ||  | |||||||| |||||     
T  32404791 aaaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggatatgtagagagaagacctgtagattctatagtaaggagagtagagaagatggaggatagtcat 32404692  T
Q  211 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 310  Q
     | | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||  |||||||  |||| ||||||| ||    
T  32404691 atcacaagaggtagaggaagacctacaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttaaatccaaacatggtttatgatataa 32404592  T
Q  311 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32404591 cataatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc-tggttgttgttgttg 32404525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 95 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 48431687 - 48431397
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||  ||||| |||||    
T  48431687 gggtagcccctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaagagagttgatca 48431588  T
Q  195 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggt-------caatgagttgga 287  Q
     |||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||| |        |||||||||||    
T  48431587 gatggaggatagtcggattacaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagatttatgaataatgagttgga 48431488  T
Q  288 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| |||| | ||||| ||||  ||||| | ||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48431487 tccaaatatggtttgtgataaaacatcatggcttaatttgatccttgtagctgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttg 48431397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 82 - 376
Target Start/End: Original strand, 2544587 - 2544875
Alignment:
Q  82 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 181  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||| || | ||||    
T  2544587 agagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaacagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctatagtaa 2544686  T
Q  182 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 281  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||     ||| ||  |||||||    
T  2544687 ggagagtagatcagatggaggatagtcaaac-actagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactataaga-----tttggaaatcaatga 2544780  T
Q  282 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||| | |||| |||| ||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2544781 gttggagcgaaatatggtttataatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtggtaaaaggcttggttgttgttgt 2544875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 258 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4707338 - 4707219
Alignment:
Q  258 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggat 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4707338 tagaaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccgaccccacttagtgggat 4707240  T
Q  358 aaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4707239 aaggcttggttgttgttgttg 4707219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 244 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 32079307 - 32079176
Alignment:
Q  244 attagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatc 343  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  32079307 attagagaaaccatcagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatctggtttatgatagaacac--tggcgtcatttgatcgatgtagccgacc 32079210  T
Q  344 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32079209 ccacttggtgggataaggcttggttgttgttgtt 32079176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 378
Target Start/End: Original strand, 38868858 - 38869166
Alignment:
Q  70 aatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtag 169  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||  | |||||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38868858 aatgacaacattaaagagagggttggagtagcacctatcatagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaacactagtag 38868957  T
Q  170 atgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggattt 269  Q
    || || | |  || ||||| ||| | |||||||  |||||| | |  ||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||  || ||| |    
T  38868958 attctctagcgaggagagtagattagatggagggtagtcaaatcattagaggcagaagaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatct 38869057  T
Q  270 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 369  Q
    || | | |||| |||||||  | || |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  38869058 agcgattaatgggttggatagatatatggtatatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaatgcttggttg 38869157  T
Q  370 ttgttgttg 378  Q
     ||||||||    
T  38869158 ctgttgttg 38869166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 218 - 378
Target Start/End: Original strand, 41560353 - 41560513
Alignment:
Q  218 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 317  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |   |||||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  41560353 gaggtagaagaagacctagaaaagctataagagaaactattaggatacatttagagattaatgagttggatccaaatatgggttatgatagaacattatg 41560452  T
Q  318 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41560453 gcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 41560513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 266 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24020377 - 24020265
Alignment:
Q  266 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  24020377 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgcagccaaccccactttgtgggataaggcttg 24020278  T
Q  366 gttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||    
T  24020277 gttgttgttgttg 24020265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 36624184 - 36623884
Alignment:
Q  58 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |  |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  36624184 gatagaattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagtacttgcagtagaaaagattgtagaaaataggcttaggtggttt-ggcatgtcgaga 36624086  T
Q  158 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 257  Q
    ||||||| |||     ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||   | | ||||||||||||||||||            ||||||||| ||    
T  36624085 gaagactggta-----tgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcagaagaggtagaggaagacc------------tagagaaactat 36624003  T
Q  258 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc-gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 356  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||| |||||| || |  |||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  36624002 tagaaaagatttagaggctaatgagttggatccaaatatggtttaggatcgaacattatggctgtaa--tgatccatgtagtcgaccctacttagtggga 36623905  T
Q  357 taaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||| ||||| ||||||    
T  36623904 taaggctttgttgtcgttgtt 36623884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 378
Target Start/End: Original strand, 6025526 - 6025889
Alignment:
Q  15 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 114  Q
    ||||| |||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||  |||| |||||| ||||| | ||||| ||||| |||  || |||||||||||||| ||    
T  6025526 agagacgaggatgttttgctggatgtttggcaagactagactggataagattagaaatgatagcattaaagagatagttgggttagcacctatagtaaaa 6025625  T
Q  115 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 214  Q
    | | |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||   | ||| ||    |||| ||||| ||||| ||| |||  |||||| | |    
T  6025626 acgatggttgaaactaggcttagatgacttgggcatgtacagagaacacctatggatactccaataaggagagtagatcagatgtagggtagtcaaatca 6025725  T
Q  215 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 314  Q
      ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || | || ||| ||| ||||| | ||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||      
T  6025726 ctagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagatactagtaaaaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatctgatagaacatg 6025825  T
Q  315 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  6025826 atggcgtcatttgatccatgtagccgattccacttagtgggataatacttggttgtttttgttg 6025889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3819150 - 3818854
Alignment:
Q  82 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 181  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||||||| |||| | || ||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||| || | ||||    
T  3819150 agagagagagttgaggtagcacctatggtagaaaagatggtggtaactagacttaagtggtttgggcatgtagaaagaagacttgtggattctctagtaa 3819051  T
Q  182 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 281  Q
      ||||| ||||| |||||||  | ||||   |  ||||  |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||| | |||||    
T  3819050 agagagtagatcagatggagggtaatcaaaccactagagaaagaggaagaccttgaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagattaatga 3818951  T
Q  282 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| ||  |||| |||| |||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3818950 gttgaatagaaatatggtttatgatggaacattatgtcgccatttgatccatgtagccgactgcacttagtgggataaggcttggtcgttgttgttg 3818854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 201 - 379
Target Start/End: Original strand, 4415455 - 4415634
Alignment:
Q  201 ggagagtcaagttaaaaga-ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 299  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  4415455 ggagagtcaggttaaaaaaaggtagaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgat 4415554  T
Q  300 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
     | | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  4415555 tttttatagaacattatggcatcatttgatccatgtagccgactccatttagtggaaaaagacttggttgttgttgttgc 4415634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 287 - 378
Target Start/End: Original strand, 44751677 - 44751768
Alignment:
Q  287 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44751677 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 44751768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Original strand, 29577452 - 29577537
Alignment:
Q  294 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29577452 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 29577537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 287 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 44941865 - 44941773
Alignment:
Q  287 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44941865 atccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 44941773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 378
Target Start/End: Original strand, 5338727 - 5338997
Alignment:
Q  97 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||| ||||| |    
T  5338727 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactgagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagagtagatcaga 5338826  T
Q  197 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 296  Q
    ||||||| | |||  | |  ||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||           ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |    
T  5338827 tggaggatattcagatcactagaggcagaagtagacctagaaaaactataagagaaa-----------gatctagagattaatgagttggatcgaaatgt 5338915  T
Q  297 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    | | ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5338916 gatttattatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgagataaggctcggttgttgttgttg 5338997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 372
Target Start/End: Original strand, 40416359 - 40416649
Alignment:
Q  82 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 181  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||||||  ||| ||||    
T  40416359 agagagagagttggagtagcacctatagtagaaaagatggtggaaacgaggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagaactgtagattttgtagtaa 40416458  T
Q  182 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 281  Q
    | ||||| ||||| ||| |||| |||||  | |  | ||  ||| |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||  || ||| || || | |||||    
T  40416459 ggagagtagatcagatgcaggatagtcagatcaccaaagacagaagaagacctagaaaaactataagacaaactattaagaaagatctatagattaatga 40416558  T
Q  282 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||| || || |||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  40416559 gttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatgtgatccctttagccgaccccacttagtgggttaaggtttggctgttg 40416649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 241
Target Start/End: Original strand, 43423645 - 43423866
Alignment:
Q  22 aggatgttgcgttggatgagtggt--aagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagtt 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||   |||| |||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |    
T  43423645 aggatgttgcgttggatgtgtgggggaagactagacaggataggattagaaatgaccacattagagagagagttggggtaacacctatagtagaaaagat 43423744  T
Q  120 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga 219  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||  | |||||    |||||| | |  |||    
T  43423745 ggtggaaactaggcttaggtggtttggccatgtagagagaagacttgtagattatgtagtaagtagagtagactagatggatagtagtcaaatcactaga 43423844  T
Q  220 ggtagaggaagacctaggaaaa 241  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  43423845 ggtagaggaagacctagaaaaa 43423866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 287 - 376
Target Start/End: Original strand, 42337749 - 42337838
Alignment:
Q  287 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42337749 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 42337838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 34827462 - 34827205
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||   ||| |||||| ||||||   ||||   |||||||  ||||||| | ||||| || ||    
T  34827462 gagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgatataagattagaaatgact--attatgtagagagttggggtagcgcatatagaagtaa 34827365  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    || |||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||   |||||||| | ||||||| ||| ||| | |||||||||||| | ||||     
T  34827364 agatggtagaaaataggcttctttggtttggacatgtaaagagaagaccgatagatgctctagtaagaaaagtagattagatggaggagagtaaggttag 34827265  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggt 275  Q
    || |  || |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  34827264 aaaaaataaaggaagacctagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt 34827205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 46423331 - 46423216
Alignment:
Q  258 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggat 357  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46423331 tagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgattgaaca---tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggat 46423235  T
Q  358 aaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  46423234 aaggctcggttgttgttgt 46423216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 26016355 - 26016721
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||  ||| |   |||||||||||||||  ||||| ||||||||  |    
T  26016355 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacaggatataattataaataatggcattagagagagagttggggtaacacctatatga 26016454  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||| ||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||   |  || |||| | ||| ||| | ||||| ||| ||| ||||||      
T  26016455 gaaaagatggtagaaactagatttaggtggtttgggtatgtagaaagaagacctatgcattctgtagcaaggagattagatcagatgaaggggagtcaga 26016554  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    | |  |||||||   | |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||   |||  |||| | || ||||||    
T  26016555 tcactagaggtaagagtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaatgatctagagataaatgagttagagaaaaacatggtttttggtagaac 26016654  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    | | ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||    
T  26016655 attgtggcgtcgtttgatacatgtagctgagcccacttagtggggtaagacttagttgttcttgttg 26016721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 377
Target Start/End: Original strand, 8796239 - 8796492
Alignment:
Q  124 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 223  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||| |   || ||||| |||||  |||  |||||||| |||||  | |  ||||| |    
T  8796239 gaaaataggtttaggtggtttggacatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcggatggaggatagtcagatcactagaggca 8796338  T
Q  224 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 323  Q
    |||||||||| |  |||||| | |||||||| ||||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| |    
T  8796339 gaggaagaccaataaaaactttaagagaaactattaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaa 8796438  T
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8796439 tttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 8796492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 241 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10200441 - 10200304
Alignment:
Q  241 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 340  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  10200441 actatgagagagactattagaaaagatttagagatcgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatcatggtgtaatttgatccatgtagccg 10200342  T
Q  341 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    | | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10200341 acctcacttaatgggataatgcttggttgttgttgttg 10200304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 378
Target Start/End: Original strand, 478695 - 478965
Alignment:
Q  109 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 208  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||  ||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||     
T  478695 gtagaaaagttggtagaaaaaag-cttaggtggtttggacattcagatagaa-acttgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcagatgaaagagagtt 478792  T
Q  209 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 308  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||||  || | |||| ||||||||    
T  478793 aggtcaaaagagttagaggaagacctacaaaatctataagagaaactattaggaaagttttagaggttaatgagttggatggaagtatggt-tatgatag 478891  T
Q  309 aacactatggc-----gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    || |||||| |      | |||||||| || ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  478892 aatactatgacataatttgatttgatctatttagccaat-ccacttagtgggataaagtttggttgttgttgttg 478965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 284 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28090786 - 28090692
Alignment:
Q  284 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28090786 tggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 28090692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 230 - 375
Target Start/End: Original strand, 29128919 - 29129065
Alignment:
Q  230 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 329  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || || ||||    
T  29128919 gacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaacaagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatatgat 29129018  T
Q  330 -ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29129019 cccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggtttttgttg 29129065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40568511 - 40568410
Alignment:
Q  275 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40568511 tcaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaaaactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 40568412  T
Q  375 gt 376  Q
    ||    
T  40568411 gt 40568410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 247 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 52532745 - 52532614
Alignment:
Q  247 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 346  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  52532745 agagaaactattaggaaagatttagaaattaatgagttggaacaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgacccca 52532646  T
Q  347 cttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  52532645 cttagtgggaaaaggcttggttgttgtggttg 52532614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 1661344 - 1661499
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattag----gaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctat 107  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||  || ||||| ||||  ||||||||||||    ||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  1661344 agcagagatgaagatgttgtgttgaatgtctgataagactagatgtgataggattagaaatgaatgacaatatttgagagagagttggggtagcacctat 1661443  T
Q  108 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1661444 agtagaaaagatggtggaaaataggctcagatggtttgagcatgtagagagaagac 1661499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 277 - 378
Target Start/End: Original strand, 34444539 - 34444640
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34444539 aatgagttggatccaaatatggtttataataaaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 34444638  T
Q  377 tg 378  Q
    ||    
T  34444639 tg 34444640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 301 - 376
Target Start/End: Original strand, 28533674 - 28533749
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28533674 tatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 28533749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 52561950 - 52561843
Alignment:
Q  37 atgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 136  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||    
T  52561950 atgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctttagtagaaatgatgatagaaaataggctta 52561851  T
Q  137 gatggttt 144  Q
    | ||||||    
T  52561850 ggtggttt 52561843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 224 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11941732 - 11941578
Alignment:
Q  224 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 323  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||| ||||||||| | | |||||||||||  | | |||| ||||||| |||| ||||||||      
T  11941732 gaggaagacctagaaaaacaataagagaagctattagaaaagatttagagattattgagttggatcggagtatggtttatgataaaacattatggcgtat 11941633  T
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11941632 tttgatccatgtagtcggcctcacttagtgggatacggcttggttgttgttgttg 11941578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 36340097 - 36339804
Alignment:
Q  82 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 181  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| |||||| | |||| |||||||||||   |||||  ||| ||||    
T  36340097 agagagagagttggtgtagcacctatattagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttagacatggagagagaagacctatagattttgtagtaa 36339998  T
Q  182 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 281  Q
    |  | || ||||| |||||||| |   |  | |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||    
T  36339997 ggcgggttgatcagatggaggatacctagatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagattt-gaaattaatga 36339899  T
Q  282 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||   |||  ||||  |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36339898 gttggacagaaacatggttaatgataaaacattatgaagtaatttgatccatgtagctgactccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgt 36339804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 277 - 378
Target Start/End: Original strand, 6084158 - 6084259
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6084158 aatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtaatttgatccatgtatttgatctcacttagtgggataaggcttggttgttattgt 6084257  T
Q  377 tg 378  Q
    ||    
T  6084258 tg 6084259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 349
Target Start/End: Original strand, 40419557 - 40419893
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| | ||||   ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| || |||||||    
T  40419557 agcagagatgaggatggtgcgttgaatgtatggtaaaactagatgagatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagaacttatagta 40419656  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||| || |||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  || |||  ||| | ||| ||||| | ||| ||||||| |||| |      
T  40419657 gaatagatggtagtaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagacatgtggattatgtagcaaggagagtagttcagatggaggggagttaga 40419756  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    | |  |||||||| || |||| ||| ||| ||||   |||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | ||||||| |    
T  40419757 taactagaggtaggggtagacatagaaaatctatacaagaaactattatgaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatagatc 40419856  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 349  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||    
T  40419857 actatggcgtcgttt-attcatgtagccgaccccactt 40419893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 7762689 - 7762445
Alignment:
Q  124 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 223  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | | ||| ||| |||  |||| ||| | ||| || |  | ||||||| ||    
T  7762689 gaaaatatgattagatggtttgggcatgtagagagaagaattgtagatgttatagtatgaaaagtaaatcatatgaaagagtgttagatcaaaagagata 7762590  T
Q  224 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 323  Q
     |    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| ||||| || |    
T  7762589 aaaagggacctagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagatgttaatgagttggatctaaatatggtttataatagaacattatggtgtaa 7762490  T
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 368  Q
    ||||||  ||||| ||| |  |||||| | |||||||||||||||    
T  7762489 tttgatttatgtaaccgtttacacttaataggataaggcttggtt 7762445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19908371 - 19908040
Alignment:
Q  44 gtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtt 143  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||| |||||||  |||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||  ||||  | | |||| || ||    
T  19908371 gtaagactagacatgacagggttagaaatgacaaaattaaagagagagttgtggtagcacctatagtaaaaaagatgggggaaaccaagtttaggtgatt 19908272  T
Q  144 tgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa--- 240  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||  ||| ||||| ||||   |||| |||||| | || ||  | |  | ||||||||| |||| ||| |||       
T  19908271 tgggcatgtagagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagcaaatcagatggag-atagccagatcagtaaaggtagaggtagacttagaaaatta 19908173  T
Q  241 --actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 338  Q
      ||||| ||||| || |||||||    ||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||||    
T  19908172 taactataagagacacgattagaatttttttagagattaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacattattgcgtaattttatccatgtagc 19908073  T
Q  339 cgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 371  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19908072 cgaccccacttagtgggataaggcttgattgtt 19908040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 246 - 378
Target Start/End: Original strand, 19936612 - 19936744
Alignment:
Q  246 tagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccc 345  Q
    |||| |||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  19936612 tagaaaaactattaggaaagatttagatgttaatgagttagatccaaatatggttaatgatagaacattacggcgtaatttgatccatgtagccgactcc 19936711  T
Q  346 acttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19936712 gcttagtgggataagacttgattgttgttgttg 19936744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 217 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28511960 - 28511795
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  | ||| || || || ||| | ||||||||||| | |||  |||| |||||||||||| |||    
T  28511960 agaggcagagaaagacctagaaaaactattagagaaattactaggaaagacttggagattaatgagttggaccaaaacatggtttatgatagaacattat 28511861  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg----ataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||    
T  28511860 ggcgtaatttgatcaatgtagccgaccccacttagtgggatacataagacttggttgttgttgttg 28511795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 304 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38877415 - 38877343
Alignment:
Q  304 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38877415 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaacccacttagtgggataaggcttggttgtggttgt 38877343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 291 - 378
Target Start/End: Original strand, 5113940 - 5114027
Alignment:
Q  291 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5113940 aaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgacctcaattagtgggataacgtttggttgttgttgttg 5114027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 277 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 25715425 - 25715326
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||| | | |||| |||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25715425 aatgagttgaaccgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25715326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 35828869 - 35828562
Alignment:
Q  57 tgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagag 156  Q
    ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  35828869 tgataagattagaaatgacaatattagagagagagtttgagtagcacctatggtagaaaagatggtggaaaatagggttaggtggtttggacgtgtagag 35828770  T
Q  157 agaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaa 256  Q
    |||||||   |||||  ||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||  |    ||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||  |    
T  35828769 agaagacctatagattatgtagtaaggagagaagatcatatggaggatagtcagatccctagaggcagaggaagatctggaaaaactattag-gaaa-ga 35828672  T
Q  257 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 356  Q
    || || |  |||        ||||||||||||  |||| |||| || ||||||||| ||||||   |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  35828671 tttgata--att--------aatgagttggatggaaatatggtttacgatagaacattatggcaatatttgatccatgtaaccgaccccgcttagtggga 35828582  T
Q  357 taaggcttggttgttgttgt 376  Q
     ||| |||||||||||||||    
T  35828581 aaagacttggttgttgttgt 35828562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 190 - 376
Target Start/End: Original strand, 50806765 - 50806949
Alignment:
Q  190 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 289  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |  ||| ||||| |||||||||| ||||| || |||||||| || |  ||||||  |||| | |||| |||||||     
T  50806765 gatcaaatggaggggagtcaaatcactagaagtagatgaagacctagaaaaacaataagagaaactatcaagaaggat--agagattaatgcgttggata 50806862  T
Q  290 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
     |||| |||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50806863 aaaatatggtttatgataaaacactatggcgttgtttgattcatgtaaccgaccccatttagtggaataaggcttggttgttgttgt 50806949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 308 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3777328 - 3777258
Alignment:
Q  308 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3777328 gaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtaggataatgcttggttgttgttgttg 3777258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 286 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21769801 - 21769711
Alignment:
Q  286 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||| |||| |||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21769801 gatctaaatatggtttgtgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgt 21769711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 353
Target Start/End: Original strand, 28528385 - 28528614
Alignment:
Q  124 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 223  Q
    |||| ||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||| || ||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |    ||| |||    
T  28528385 gaaactagacttaggtggtttcggcatgtcgggagaagacttgtggattctgtagtaaggacagtagatcaaatggaggggagtcaaatccctagaagta 28528484  T
Q  224 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 323  Q
    | ||||||||||  |||||||| | |||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | ||||||| ||||||||||||     
T  28528485 ggggaagacctaaaaaaactataacagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaccactatggcgtcg 28528584  T
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtg 353  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28528585 tttgattcatgtagccgaccccacttagtg 28528614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 297 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32112068 - 32111987
Alignment:
Q  297 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  32112068 ggtgtatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagccgaacccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgttg 32111987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 43375709 - 43375596
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||| ||||  ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  43375709 gatttagagattaatgagttggaccgaaatatggttcatgatagaacattatgacataatttgatccatgtagccaatcccacttagtgggataaagatt 43375610  T
Q  365 ggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||    
T  43375609 ggttgttgttgttg 43375596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 194
Target Start/End: Original strand, 51812472 - 51812625
Alignment:
Q  41 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg 140  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  | |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||    
T  51812472 gtggtaagattagacacgataagattagaaatgactactttagagagagagttggggtaacaactatagtagaaaagatggtggaaactaggcttatgtg 51812571  T
Q  141 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
     ||||||||||||||||||| | | ||||||  ||| ||||||| ||| |||||    
T  51812572 atttgggcatgtagagagaaaaattgtagattttgtagtaagaaaagtagatca 51812625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 217 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8343040 - 8342885
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  |||| | || | |||| ||||| |||    
T  8343040 agagatagaggaagacctagaaaaactataagagaaacaattaataaagatctagagattaatgagttggatagaaatatagtatttgatggaacattat 8342941  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    | |||   |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8342940 gacgt---ttgatcaatgtatctgatcccacttagtgggataaggcttgattgttgttg 8342885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 287
Target Start/End: Original strand, 37263332 - 37263523
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||| ||| || |||| || |||||| |||||  ||||    
T  37263332 gggtagcacctatagtagaaaagatagtagaaactagacttcagtggtttgggcatgtagagagaaaacttgtggatgttgcggtaaggagagtaaatca 37263431  T
Q  195 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 287  Q
     ||||||| | ||||| | |  |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || | | | ||| ||||| |||||||||||||    
T  37263432 gatggaggggtgtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaatactattagtgaaactatca-agaagatctagagatcaatgagttgga 37263523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Original strand, 41165502 - 41165566
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41165502 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 41165566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 315 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4318906 - 4318843
Alignment:
Q  315 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4318906 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 4318843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14226191 - 14226047
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||| | |||||| ||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||  |    |||||||||||  ||    
T  14226191 agcagatacgaggattttgtgttggatgtgtggtaaggctagacatgataggattagaaatggcaacattggagagag--ttgcagtagcacctatcata 14226094  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 158  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14226093 gaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagag 14226047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16273073 - 16272820
Alignment:
Q  124 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 223  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| ||| |||||| || | |||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||    
T  16273073 gaaaataggtttaggtggtttgtacatttagagagaaaacttgtagattctatagtaagaagagtggatcaaatagaggataatcatattacaagaggta 16272974  T
Q  224 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 323  Q
     || | ||||||| | ||||||||||||||  ||||  ||  ||||| || | ||||||| | ||| || | |||| |||||||||||| |||| | |      
T  16272973 tagaacgacctagaagaactattagagaaattattatgaaatatttatagattaatgagtagtatctaattatggtttatgatagaacaatatgacatat 16272874  T
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||  | || |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||    
T  16272873 tttgatccatgtaatcaat-ccacttagtgggataatgtctggatgttgttgttg 16272820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 277 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7133401 - 7133300
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||| | ||||  |||| ||||||||||| | |||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7133401 aatgagttggaccgaaatacggtgaatgatagaacattttggcctaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 7133302  T
Q  377 tg 378  Q
    ||    
T  7133301 tg 7133300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4590605 - 4590533
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4590605 tgatagaacaatatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 4590533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 373
Target Start/End: Original strand, 42501143 - 42501387
Alignment:
Q  129 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 228  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||  ||||  || ||| |||| | ||| ||||| | ||| |||||||  |||||| | |  ||||||||||||    
T  42501143 taggcttgggtggtttggacatgtagagaagagacccgtggattctgtagaaaggagagtagttcagatggagggtagtcaaatcattagaggtagagga 42501242  T
Q  229 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 328  Q
    | |||||| |||||||| |||||||  ||||  || ||| || || | ||||||||||||  |||| |||  |||||||||||| ||  ||||| ||| |    
T  42501243 aaacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctatagattaatgagttggatagaaatatggaatatgatagaacattacagcgtcgtttaa 42501342  T
Q  329 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||| ||||    
T  42501343 tccatgtagccgaccctacttagtgggataaagtttggttattgt 42501387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 378
Target Start/End: Original strand, 52832037 - 52832329
Alignment:
Q  86 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaag 185  Q
    |||||||  |||||| | ||| |||||||||| || || ||||||   |||| ||||||||||||||  |||||||||   |||||| ||| |||   ||    
T  52832037 agagagttggggtagtagctacagtagaaaagatgatacaaaataaatttaggtggtttgggcatgttaagagaagaccgatagatgttgttgtacagag 52832136  T
Q  186 agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 285  Q
    ||| ||| | |||||||||||||   ||| || ||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||  |||||||| |||||||||||  || |||||    
T  52832137 agtagataagatggaggagagtcgtattagaataggtagaggaatacctagaaaaaccaaaagagaaagtattagaaaagatttagaggttgataagttg 52832236  T
Q  286 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
     || ||||| | || |  ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||  ||| | | ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  52832237 aatacaaatattgtttcagatagaacattatgacgtaatttgatccatatagttgattcaatttagtaggataagatttggttgttgttgttg 52832329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 249
Target Start/End: Original strand, 39894722 - 39894934
Alignment:
Q  32 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 131  Q
    ||||||| ||||| |||||||||   |||||||||| |||| |||| || | ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  39894722 gttggataagtggcaagattagatgagataggattaagaataacactatcatagagagaat-tgggtagcccctatagtagaaaagatggga-aaaatag 39894819  T
Q  132 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 231  Q
       ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  || | ||   ||||||||   | |||||| ||||||||| |    
T  39894820 atctaggtggtttgggcatgtacggagaagacttgtagatgttgtggtacgaagagtaaattagat---ggagagtccgatcaaaagatgtagaggaaaa 39894916  T
Q  232 cctaggaaaactattaga 249  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  39894917 cctagaaaaactattaga 39894934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 323 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 43481851 - 43481796
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43481851 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 43481796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 308 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2914191 - 2914121
Alignment:
Q  308 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2914191 gaacattatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 2914121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 378
Target Start/End: Original strand, 26299187 - 26299352
Alignment:
Q  196 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 295  Q
    |||||||| |||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||| ||||| |     
T  26299187 atggaggatagtcagattaccagaggtagaggaaaacctaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttgggtccaactg 26299286  T
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
                     ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26299287 -----------------ctatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgctgttgttg 26299352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 277 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 45510932 - 45510830
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  45510932 aatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggctgatgttgt 45510833  T
Q  377 tgc 379  Q
    |||    
T  45510832 tgc 45510830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Original strand, 4379927 - 4380081
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--------gggtagcacctat 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||        |||||||| ||||    
T  4379927 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagaaaagatatgattagaaatgacaacattagagagagagagtgagtgttggggtagcaactat 4380026  T
Q  108 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 162  Q
    |||||||||| |||| |||| || | |||| ||||||   |||||||||||||||    
T  4380027 agtagaaaagatggtggaaactaaggttaggtggtttatacatgtagagagaaga 4380081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 290 - 375
Target Start/End: Original strand, 22175341 - 22175426
Alignment:
Q  290 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22175341 caaatatggtttatgatagaacattatggtagaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttggtgttg 22175426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 309 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37430487 - 37430418
Alignment:
Q  309 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37430487 aacattatggcgtagtttgatccatatagccgatcccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttg 37430418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 42539339 - 42539210
Alignment:
Q  250 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat-ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 348  Q
    ||||||||||| ||  | || ||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||  || || || ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42539339 gaaacaattaggaaaaacttggagatcaatgagttggaccaaaatttagtttatgatagaacatcattggtgtaatttgatccatgtagacgaccccact 42539240  T
Q  349 tagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42539239 tagtgggaaaaggcttggttattgttgttg 42539210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 291 - 376
Target Start/End: Original strand, 50257767 - 50257852
Alignment:
Q  291 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  50257767 aaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaggcttcgttgttgttgt 50257852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 277 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 109092 - 109002
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 368  Q
    ||||||||||||  | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  109092 aatgagttggataaatatatgatgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagcctgtcccac-tagtgggataaagcttggtt 109002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 303 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15437201 - 15437130
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15437201 tgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccaaccccacatagtgggataaggcttggttgttgtt 15437130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 217 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 19908543 - 19908388
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| |   ||||||| ||||||||| | || ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||   |||    
T  19908543 agaggcagaggtagacctagaaaaactttaagagacattgttagaaaagatttagagattaacgagttggattcaaatatggtttataatagaatcttat 19908444  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
     ||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19908443 tgcgtagtttgatccatgtacctgaccccacttagtgggataaggcttggtcgttg 19908388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 217 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 29577301 - 29577147
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  | | |||| ||||  || ||| ||||| | |||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| |||    
T  29577301 agaggtagaggaagacctagaaaaactacaacataaactattaagaaagatctagagattaatgagctggatcaaaatatggt-tatgatagaacattat 29577203  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    ||| | ||||  | ||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29577202 ggcataatttatttcatgtagccaaccccacttagtgggatagtgcttggttgttg 29577147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 288 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1290119 - 1290033
Alignment:
Q  288 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  1290119 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 1290033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 224 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8677017 - 8676897
Alignment:
Q  224 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg---tatgatagaacactatggcg 320  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||||| | |||| |||||   |||||||||| | ||||||     
T  8677017 gaggaaaacctaggaaatctataagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtggtctatgatagaatattatggca 8676918  T
Q  321 tcatttgatccatgtagccga 341  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  8676917 taatttgatccatgtagccga 8676897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 151
Target Start/End: Original strand, 19936444 - 19936571
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||        ||||||  ||||||||||||||| | |||    
T  19936444 gagatgagaatgttgtgttggatgagtggtaagactagatgggataggaataggaatgacacc--------gagagttagggtagcacctatagcaaaaa 19936535  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatg 151  Q
    || |||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  19936536 agatggtagaaaataggtttatgtggtttgggcatg 19936571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27637913 - 27637720
Alignment:
Q  96 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc-- 193  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||| |||||  || |||| ||| ||||| ||||| ||||      
T  27637913 ggtagcacctatagcagaaaagatgatagaaactagacttaggtgttttgggcatgtagagaaaagacatgtggatgttgtagtaaggagagtagatcat 27637814  T
Q  194 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 287  Q
    | ||||||  ||| ||| | |  |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| || |  |||||| ||| | |||||||||||||    
T  27637813 atatggagtggaggcaaatcactagaggtaggggaagacctaaaaaaacttttagagaaactatcaagaaggatctagtgatcaatgagttgga 27637720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 360
Target Start/End: Original strand, 29807984 - 29808122
Alignment:
Q  222 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 321  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |  |||||| || |  | || |||||| ||  |||| |||| | ||||| ||||||||||||     
T  29807984 tagaagaagacctagaaaaactataagagaaacgatcaagaaggatctaaatattaacgagttgaataaaaatatggtttttgataaaacactatggcga 29808083  T
Q  322 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataag 360  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29808084 catttgattcatgtagccgattccacttagtgggataag 29808122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17269064 - 17268987
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||  ||||||||    
T  17269064 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggaaaagtcttggttagtgttgttg 17268987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 291 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 27072572 - 27072491
Alignment:
Q  291 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||    
T  27072572 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccatgcttagtgggaaaaggcttggttgttg 27072491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 329 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 38758067 - 38758018
Alignment:
Q  329 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38758067 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 38758018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Original strand, 50846769 - 50846846
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  50846769 tatgatagaacattatggcataatttgatctatgtagccgacaccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgttg 50846846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 52073123 - 52073050
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  52073123 tatgatagaacattatggcggcgattgatccatgtagccgaccccacttggtgggataaggcttgattgttgtt 52073050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 375
Target Start/End: Original strand, 52292188 - 52292320
Alignment:
Q  242 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 341  Q
    |||| |||||||| ||||| || || || ||| | ||||||||||| |||| | | || |||||||||| | ||| | || |||||||||||||| || |    
T  52292188 ctataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgagttgga-ccaattattgtttatgatagaaaattattgagtaatttgatccatgtaaccaa 52292286  T
Q  342 tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52292287 ccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52292320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2429704 - 2429636
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 369  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  2429704 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggacaaagcttggttg 2429636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13827851 - 13827699
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||| | || |||||||| |||||||||||||||   |||||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  13827851 gggtagtacctatagtagaaaagacggtggaaactagggtaaggtggtttggacatgtagagagaagaagtgtagattctgtagtaaggagagtagatca 13827752  T
Q  195 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 247  Q
     |||||  | |||||  | |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13827751 tatggaacatagtcagatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatta 13827699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18793345 - 18793201
Alignment:
Q  19 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 118  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| | ||  ||||||  ||||| |||||| ||  |||||| || ||| |||||||||     
T  18793345 atgatgatgttgcgttggatgtgtggaaagactagacaggatagaactaaaaatgacgacattaaagagagggttggggtaggacttattgtagaaaaga 18793246  T
Q  119 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    ||||||||| ||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||    
T  18793245 tggtagaaactagacttagttgattttggcatgcagagagaagac 18793201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 30396804 - 30396728
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||||| ||||| | | |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30396804 tatgatagaacattatggtggcgtttgatccgtgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtttttgtt 30396728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31274499 - 31274399
Alignment:
Q  278 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||| |||  |||| |||| ||||||| |||  |||||||| ||||||||  |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31274499 atgagttagattgaaatatggtttatgatataacgttatggcgtaatttgatctgtgtagctgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgtt 31274400  T
Q  378 g 378  Q
    |    
T  31274399 g 31274399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 308 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 43028876 - 43028808
Alignment:
Q  308 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43028876 gaacactatggtgtcgtttgattcatgtaagcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 43028808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16142118 - 16142019
Alignment:
Q  238 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 337  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||| |||| ||||||| | |||| |||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  16142118 aaaactataagagaaaccattagaaaagatttagagtttaataagttagatccaattatggtttatgatcgaacaatatgacgtaatttgatccatgtag 16142019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 378
Target Start/End: Original strand, 27704156 - 27704235
Alignment:
Q  300 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg-ataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| |||| ||||||||||||    
T  27704156 gtatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttagtgggaaaaagacttgtttgttgttgttg 27704235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 375
Target Start/End: Original strand, 44008702 - 44008859
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||| ||  |||||| || ||||| ||||||||||||||    |||| ||||||| ||||||  ||    
T  44008702 agaggcagaggaagacctagaaaaaatctaagagaaactatcgagaaag-atctagagatcaatgagttggatagggattttgtgtatggtagaacgtta 44008800  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    || || |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  44008801 tg-cgccatttgatccatttagccgaacctacttagtgagatacggcttggttgttgttg 44008859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 378
Target Start/End: Original strand, 50636266 - 50636365
Alignment:
Q  279 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||  |||| |||| ||||||||| || |||| | |||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  50636266 tgagttggataaaaatatggtatatgatagagcattatgacatcatttgatcaatgtagtcgattctacttagcgggataaggcttgattgttgttgttg 50636365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Original strand, 51584953 - 51585028
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||| | |  |||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51584953 tgatagaacactatgacattgtttgattcatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttg 51585028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 312
Target Start/End: Original strand, 8628150 - 8628248
Alignment:
Q  214 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |||| |||| | || || |||||||||    
T  8628150 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaatttgatcaaaatatagtttacgatagaaca 8628248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 270
Target Start/End: Original strand, 9002382 - 9002528
Alignment:
Q  124 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 223  Q
    ||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||    
T  9002382 gaaaataggtttaggtagtttggacatgtagagaaaaaacttgtagattttgtagtaagaagagtagatcaaatagaggataatcatattagaagaggta 9002481  T
Q  224 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggattta 270  Q
     || |||||||||  ||||||| ||| |||| ||| |||| ||||||    
T  9002482 tagaaagacctagagaaactatcagaaaaactatttgaaaagattta 9002528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12930471 - 12930309
Alignment:
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    |||||||||||  || |||||||||| ||| |||||||  ||||  ||  ||||| || | | |||||||||||||||| || | |||||||||| | ||    
T  12930471 aagaggtagagagaggcctaggaaaattataagagaaattattatgaaaaatttaaagattagtgagttggatccaaatatgatttatgatagaagatta 12930372  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    || ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||    |||||| ||||||||||||||||    
T  12930371 tgacgtaatttgatccgtgtagccaaccccacttagcaaaataaggattggttgttgttgttg 12930309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 159
Target Start/End: Original strand, 17815402 - 17815537
Alignment:
Q  21 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttg 120  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| || |||||  ||||| ||||| |||||||  |||||||||||| || || ||| || |||| | |||||| ||    
T  17815402 gaggatgttgtgttggatgtgtggta-gactagacgggatagcattagaaatgacaatattagagagaga-tgagg-taggacttataatggaaaagatg 17815498  T
Q  121 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga 159  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17815499 gtggaaactaggcttagttggtttgggcatgtagagaga 17815537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26113519 - 26113437
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  26113519 tggtttatgatagaacattatggcttaatttgatccatgtagccgagctcacttagtgggataagactacattgttgttgttg 26113437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27520378 - 27520233
Alignment:
Q  207 tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaa--ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 304  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||  |||| |||||||| ||||||||  |||||||| | |||||| ||||||||||| || | ||||    
T  27520378 tcaagtcaaaagaggtaaaggaagacatataaaaaaactataagagaaactattagaaaaaatttagagattaatgagctggatccaaatatgatttatg 27520279  T
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 350  Q
    |||||||| ||||  || ||||||| ||||||| ||| | ||||||    
T  27520278 atagaacattatgatgtaatttgattcatgtagtcgacctcactta 27520233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 312
Target Start/End: Original strand, 41611806 - 41612024
Alignment:
Q  94 tgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 193  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||||   ||||||| ||| ||| ||| ||| |||     
T  41611806 tgggtagcacttatattagaaaagatggtagaaaataggtttatgtggtttgagaatgtagagagaagatatgtagatgatgtagtacgaaaagtagatt 41611905  T
Q  194 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 293  Q
    |||| ||||   ||||    || ||||||||||||| | |||  |||| ||| ||||| |   ||||||| |||||||| || ||||||||| || ||||    
T  41611906 aaatagaggtttgtcagagcaagagaggtagaggaaaatctataaaaaatataagagatattgttagaaaagatttagatgttaatgagttgaattcaaa 41612005  T
Q  294 tttggtgtatgatagaaca 312  Q
    | |||| ||| ||||||||    
T  41612006 tatggtttatcatagaaca 41612024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 52814346 - 52814292
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  52814346 tttgatccatgtagcctatcccacttagtgggttaaggcttggttgtttttgttg 52814292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Original strand, 1704834 - 1704911
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1704834 tatgatagaacatcatggcataatttgatccatgttgctgaccccacttagtgtgataagacttggttgttgttgttg 1704911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10569126 - 10569069
Alignment:
Q  321 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10569126 tcatttgatccatgtagccggttccacttaaagggataaggcttggttgttgttgttg 10569069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 378
Target Start/End: Original strand, 11584180 - 11584281
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11584180 aatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 11584279  T
Q  377 tg 378  Q
    ||    
T  11584280 tg 11584281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 44905483 - 44905354
Alignment:
Q  249 agaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 348  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | |||||| | || | || || || | |    
T  44905483 agaaactataagaaatgatttataggttaatgagtttgatccaaatatggtttatcatagaacactatggcataatttgacctatttggctgaccctatt 44905384  T
Q  349 tagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  44905383 taataggataaggtttggttgttgttgttg 44905354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 370
Target Start/End: Original strand, 49377508 - 49377577
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 370  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  49377508 tatgatagaacattatggcggtgtttgatccatgtagccgactccagttagtgggataaggcttggttgt 49377577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 220 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 8203290 - 8203138
Alignment:
Q  220 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 319  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||| | |||||||||||   |  | || |  | ||||||||| ||||||    
T  8203290 ggtagaagaagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaagatctagagattaatgagttggacggaggtatgatagaagatagaacattatggc 8203191  T
Q  320 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    ||   || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  8203190 gttgatttatccatgtagccgaccccacttagtgtgataagatttggttgttg 8203138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 328 - 376
Target Start/End: Original strand, 12231592 - 12231640
Alignment:
Q  328 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12231592 atccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 12231640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 373
Target Start/End: Original strand, 16943362 - 16943434
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  16943362 tatgatagaacattatggcggcgtttgatccatgtagtcgaccccacctagtgagataatgcttggttgttgt 16943434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 30834214 - 30833982
Alignment:
Q  139 tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagga 238  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| | |||| || |  |||| ||||| ||||| ||||| |  |||||| |  | ||||| |||||||||||||| |    
T  30834214 tggtttggtcgtgtagagagaagacttgcagattctataataaggagagtagatcagatggaaggtagtcaaatcgatagagggagaggaagacctagaa 30834115  T
Q  239 aaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 338  Q
    || |||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  |||| | || | |||  ||||| | ||||||||||| | |||||||||    
T  30834114 aagctataagagaaactattacgaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatagtatttgacggaacattgtggcgtcatttaaaccatgtagc 30834015  T
Q  339 cgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 371  Q
     || | || || | ||||||||||||| |||||    
T  30834014 ggacctcattttgagggataaggcttgattgtt 30833982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 302 - 378
Target Start/End: Original strand, 39525973 - 39526049
Alignment:
Q  302 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| || || | |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39525973 atgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagctgaccctatttagtgggaccaggcttggttgttgttgttg 39526049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 52442868 - 52442788
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt 92  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| | |||| ||||||||||    
T  52442868 agcagacatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaagataagattagaaatgagaacattggagagagagt 52442788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 990732 - 990469
Alignment:
Q  103 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 202  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||   ||||| |||| | ||| ||||| ||| | |||||      
T  990732 cctatagtagaaaagatggtaggaaataggctcaggtggtttaggtatgtaaagagaagacatatagattctgtagcaaggagagtagattagatggaat 990633  T
Q  203 agagtcaagttaaaagaggtagaggaag-acctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg 300  Q
    | |||||  | |    ||| |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||| | ||||||||||||| | || ||||     
T  990632 atagtcagatcactgtaggcagaggaagcacattggaaaactattagagaaactattgagata-gatctagagattaatgagttggatcaacatatggtt 990534  T
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    ||||||||||||        | ||||||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  990533 tatgatagaaca--------ttatttgattcatgtagccgacaccacttaacgggataaggcttggttgttgt 990469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 368
Target Start/End: Original strand, 10272259 - 10272530
Alignment:
Q  94 tgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 193  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || |  |||||| ||||||||||||||||||  || ||| | || | ||| ||||  ||||    
T  10272259 tgggttgcacctgtagtagaaaagatggtagaaactagactaaagtggttttggcatgtagagagaagacctgtggattc-gtaggaaggagaggagatc 10272357  T
Q  194 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 293  Q
    | ||||| | ||||||| | |  |||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||  |||||| ||||  | ||| ||| |||   | |    
T  10272358 agatggatgggagtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaacttataagagaaactattaagaaggatctagaaattaataagtaggagaaaca 10272457  T
Q  294 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 368  Q
      |||| | |||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  10272458 cctggtttttgatagaacac--cggtgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggaataaggtttggtt 10272530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Original strand, 14224294 - 14224368
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14224294 tgatagaccactatggcgtcattt-attcatgcagccgaccctacttagtgggacaaggattggttgttgttgttg 14224368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 14225911 - 14225840
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  14225911 tatgatagaacagtatggtgtcgtttgatccatgtagccggccccacttagtgggatatgaattggttgttg 14225840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 33561081 - 33560858
Alignment:
Q  153 agagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaa 252  Q
    |||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||| |||   |||||||  |||||| | |  ||||| |||||||| ||||| |||||| | || |||    
T  33561081 agagagaagacctgtagattctgtagtaaggagagtagatatgatggagggtagtcaaatcactagaggcagaggaagtcctagaaaaactgtaagggaa 33560982  T
Q  253 acaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagt 352  Q
    || ||||   | ||| ||||| | |  |||||||||  |||| |||| ||| | |||||| |||| | |  |||||||||||||||| | || |||||||    
T  33560981 actattaagtaagatctagagattagcgagttggatataaatatggtatatcagagaacattatgacattgtttgatccatgtagccaaccctacttagt 33560882  T
Q  353 gggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  33560881 gggataaggcttggctgttgttgt 33560858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 376
Target Start/End: Original strand, 4380188 - 4380241
Alignment:
Q  322 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4380188 cattttatccatgtagccga-cccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 4380241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15438904 - 15438800
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| |||| |||| |||||||||| |   || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  15438904 gatttagagattaatgagttagatcaaaatatggtttatgatagaaaa---tgacgttatttgatgcatgtagccgaccccacttagt-agataaggctt 15438809  T
Q  365 ggttgttgt 373  Q
    |||||||||    
T  15438808 ggttgttgt 15438800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40920628 - 40920526
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga-tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  40920628 aatgagttggatagaaatatggtatatgatagaatattatggtgtcttttgattcatgtagtcgacccccacttagtgggatcaggtttggttgttcttg 40920529  T
Q  376 ttg 378  Q
    |||    
T  40920528 ttg 40920526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 50771792 - 50771555
Alignment:
Q  139 tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagga 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | |||  ||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| | |  |||||||| ||||||||||| |    
T  50771792 tggtttgggc-tgtagagagaagacccatggattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggggagtcaaatgactagaggtaggggaagacctagaa 50771694  T
Q  239 aaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgg-tgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 337  Q
    ||||||| || ||||| ||||  |||||  ||||| | ||| |||||||   | |  ||| | | | ||||||||| ||||| || || ||| |||| ||    
T  50771693 aaactataagcgaaactattaagaaggacctagagattaataagttggagaaagacatggttttttaatagaacaccatggcatcgttcgattcatgcag 50771594  T
Q  338 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    || |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50771593 ccaactccacttagtgagataaggcttggttgttgttgt 50771555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 52073753 - 52073675
Alignment:
Q  86 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  52073753 agagagttggggtagcacctattgtagaaaagatggtaaaaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 52073675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 375
Target Start/End: Original strand, 52815094 - 52815155
Alignment:
Q  313 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  52815094 ctatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttag-aggataaggcttggttgttgttg 52815155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 337 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8809540 - 8809499
Alignment:
Q  337 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8809540 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 8809499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 281 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15707066 - 15706969
Alignment:
Q  281 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||  |||| |||||| |||| ||||| |||| || | ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15707066 agttggatagaaatatggtgtttgattgaacattatgacgccgtttgatccacgcagccgtccccacttagtgggataaggctttgttgttattgttg 15706969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 325 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 49051227 - 49051174
Alignment:
Q  325 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  49051227 ttgatacatgtagccgatcccacttagtgggataaggttttgttgtcgttgttg 49051174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 50830682 - 50830637
Alignment:
Q  328 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50830682 atccatgtagccgaccccacttagtggggtaaggcttggttgttgt 50830637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 378
Target Start/End: Original strand, 7082536 - 7082588
Alignment:
Q  326 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  7082536 tgatccatgtagccgaccccacttagtgggatatggctgggttgtggttgttg 7082588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 8343139 - 8343071
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  8343139 gggtaacacctttagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggactgggcatgtagagagaagac 8343071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13827994 - 13827930
Alignment:
Q  99 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  13827994 agcacctatagtagaaaagatggtggaaactagggttaggtggtttgaacatgtagagagaagac 13827930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 160
Target Start/End: Original strand, 17275137 - 17275262
Alignment:
Q  25 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |          ||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||| | || |    
T  17275137 atgttgcgttggatgtgtggtaagactacacatgataggataa----------cattagagagagatttggggtagcttctatagtagaaaagattgtgg 17275226  T
Q  125 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 160  Q
    ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17275227 aaacttggcttaggtggtttgtgcatgtagagagaa 17275262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 378
Target Start/End: Original strand, 35672869 - 35672969
Alignment:
Q  278 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||| ||| ||||| | || ||||||||||   ||||| || |||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  35672869 atgagtttgatacaaatatagtttatgatagaatgttatggtgtaatttgatcgatgtagctgatctcgcttagtgggataagacttggttgatgttgtt 35672968  T
Q  378 g 378  Q
    |    
T  35672969 g 35672969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 373
Target Start/End: Original strand, 39797212 - 39797280
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  39797212 atagaacattatggcgtcatttgattcatgtaatcaattccacttagtggaataaggcttgattgttgt 39797280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 40920894 - 40920822
Alignment:
Q  19 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 91  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  40920894 atgaagatgttgcattggatgtgtggtaagattagacgagataggattagaaattacaatattagagagagag 40920822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 376
Target Start/End: Original strand, 43898439 - 43898491
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43898439 tttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 43898491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 43934404 - 43934332
Alignment:
Q  302 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43934404 atgatagaacattatggcggcgtttgttccatgtagctaaccccacttagtgggataaggtttggttgctgtt 43934332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 48865818 - 48865730
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtg 353  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| || |||| |||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  48865818 gatttagaggttaatgaattagatccagatatggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccactcagtg 48865730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 853825 - 853782
Alignment:
Q  332 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  853825 atgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttg 853782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 364
Target Start/End: Original strand, 7083097 - 7083160
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||    
T  7083097 tatgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagctgaccccgcttagtgggttaaagctt 7083160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 7210989 - 7210930
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  7210989 tatggcataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataagcctcggttgttgt 7210930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 277 - 352
Target Start/End: Original strand, 14557751 - 14557826
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagt 352  Q
    ||||||||||| | |||| | || |||||||||||| ||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14557751 aatgagttggaccgaaatgtagtttatgatagaacattatggcgtattttgatccacgtggccgatcccacttagt 14557826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 163
Target Start/End: Original strand, 16943097 - 16943243
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||| || ||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||  |||||  || |||  ||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  16943097 gagatgagaatattgtgttggatgcgtgataagactagacgagataaaattagacattacaatattagggagagagttggggtagtacctatagtagaaa 16943196  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    || |||| |||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  16943197 agatggtggaaactagatttag-tggtttgggcgtgtagggagaagac 16943243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 337 - 376
Target Start/End: Original strand, 29975442 - 29975481
Alignment:
Q  337 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29975442 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 29975481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37294183 - 37294128
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 356  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  37294183 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccatttagtggga 37294128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 103
Target Start/End: Original strand, 41611098 - 41611181
Alignment:
Q  20 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcac 103  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| | |||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||    
T  41611098 tgagaatgttgcgttggatgagtagtaagaatggacgggatatgattaggaatgacgctattagagagagtgttggggtagcac 41611181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 52878459 - 52878328
Alignment:
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||| |||| ||  |||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |  | | |||||||||||  ||    
T  52878459 aagaggtataggaagacttaggaaaattataagagtaattattataaaagatttagaggttaatgagttgaatccaactacgatttatgatagaacttta 52878360  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccac 347  Q
    | | || ||||||| |||||| ||||| ||||    
T  52878359 tagtgtaatttgattcatgtaaccgataccac 52878328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 265 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 52900753 - 52900682
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 336  Q
    ||||||||| | |||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  52900753 gatttagagattaatgagttggactgaaatatggtttatgatagaacactatggcggaatttgatccatgta 52900682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 378
Target Start/End: Original strand, 2728847 - 2728913
Alignment:
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| || ||| |||||||||||    
T  2728847 actattgcgtcatttgattcatgtagccgaccccacttactaggataatgcctggatgttgttgttg 2728913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 39776994 - 39776936
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 335  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  39776994 aatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacacaatggcgtaatttgatcaatgt 39776936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 52981492 - 52981410
Alignment:
Q  291 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||||| || ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  52981492 aaatatggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatccttgtagccaaccccacttggtgggataacgattggttgttgt 52981410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 378
Target Start/End: Original strand, 6757462 - 6757503
Alignment:
Q  337 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6757462 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgatgttgttg 6757503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 7601361 - 7601411
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7601361 tttgatccatgtagccgacccca----gtgggataaggcttggttgttgttgttg 7601411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8725849 - 8725812
Alignment:
Q  336 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8725849 agccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 8725812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 16142241 - 16142172
Alignment:
Q  19 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 88  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16142241 atgaagatgttatgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcaggaatgccaccattagagaga 16142172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16822376 - 16822235
Alignment:
Q  19 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 118  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||  |||||  ||||  |  || ||| || ||  ||||| |||     
T  16822376 atgaggatgttgtgttggatgtgtggtaatactagataagataggattagaaatgacagtattagtaagag--ttaggatagaacttac-gtagacaaga 16822280  T
Q  119 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16822279 tggtagaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 16822235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 378
Target Start/End: Original strand, 21519167 - 21519208
Alignment:
Q  337 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21519167 gccgaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttg 21519208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #193
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39123443 - 39123367
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||| || | ||||||||||||    
T  39123443 tatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccga-cccccttagtggtgtaagactcgattgttgttgttg 39123367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #194
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39515967 - 39515866
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||| |||||| |  ||||||| |||||||  | | || |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39515967 aatgagttggatcaaaatatggattatggtagaacattatggcattgtttgatctatgtagctaaccacaattagtgagataagacttggttgttgttgt 39515868  T
Q  377 tg 378  Q
    ||    
T  39515867 tg 39515866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #195
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 49062514 - 49062469
Alignment:
Q  325 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 370  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  49062514 ttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggtttgattgt 49062469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #196
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Original strand, 51234537 - 51234610
Alignment:
Q  17 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattaga-catgataggattaggaatgacaccattagagagag 89  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  51234537 agatgaggatgttgtgttggacgtgtggtaagactaaaacatgataggattagaaattacaacattagagagag 51234610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #197
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 378
Target Start/End: Original strand, 52901039 - 52901080
Alignment:
Q  337 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52901039 gccgaccccacttagtgggataaggcttggtggttgttgttg 52901080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #198
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 361
Target Start/End: Original strand, 7124324 - 7124408
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagg 361  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| || |||||| || ||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  7124324 aatgaattggatagaaatatggtataggatagagcattatggtgtcgtttgatccatgtagctgacctcacttagtgggataagg 7124408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #199
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 14732386 - 14732334
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14732386 tttgattcatgtggcccatcccacttagtgggatacggcttggttgctgttgt 14732334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #200
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 305 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17640138 - 17640066
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||| | | |||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  17640138 atagaacattatggcgtcgtttgattcatgttgtcaatccaacttagtgggataagacttagttgttattgtt 17640066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #201
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 371
Target Start/End: Original strand, 17815611 - 17815753
Alignment:
Q  226 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 324  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||||| || ||| | |  ||||||| |||  |||| |||| ||||||||| || | ||| ||| |    
T  17815611 ggaagacctagaaaaattataagagaaactatttagaaag-atctagtgattgatgagttagatagaaatatggtatatgatagagcattttggtgtcgt 17815709  T
Q  325 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 371  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17815710 ttgatccatgtag---atctcacttagtgagataaggcttggttgtt 17815753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37429974 - 37429906
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 369  Q
    |||||||| ||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||    
T  37429974 tatgatagcacattgtggtgtaatttgatccatgtagccgaccccatttaatgggataagggttggttg 37429906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 48861476 - 48861373
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtat--gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||  |||||| || |||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || ||    
T  48861476 aatgagttggatagaaatatggtatatttgatagagcattatgacgtcgtttgattcatgtcgccgaccccacttagtgggataagacttcgtttttttt 48861377  T
Q  375 gttg 378  Q
    ||||    
T  48861376 gttg 48861373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 377
Target Start/End: Original strand, 51812692 - 51812792
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||| |||| |||| |||| |||||||||| | |||| ||| |||| ||  || ||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  51812692 aatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaatattatgccgtaatttaatatatatatacgaccccactaagtgggataaggcttggtttttgttgt 51812791  T
Q  377 t 377  Q
    |    
T  51812792 t 51812792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #205
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2694494 - 2694423
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    |||||||||||| |||||  |  |||||||||| |||| || |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2694494 tatgatagaacattatggtatagtttgatccatttagcagaccccacttagtgggatacggtttggttgttg 2694423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #206
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 378
Target Start/End: Original strand, 3059554 - 3059597
Alignment:
Q  335 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3059554 tagccgactccacttggtgggataaggcttggttgttgttgttg 3059597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #207
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7913816 - 7913781
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7913816 cccacttagtgggataaggtttggttgttgttgttg 7913781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #208
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Original strand, 7922074 - 7922109
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7922074 cccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 7922109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #209
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 11331350 - 11331247
Alignment:
Q  230 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 329  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||| ||||||  |||| ||||  || |||||||    
T  11331350 gacctagaaaaagtataagagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgat 11331251  T
Q  330 ccat 333  Q
    ||||    
T  11331250 ccat 11331247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #210
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 11489371 - 11489268
Alignment:
Q  230 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 329  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||| ||||||  |||| ||||  || |||||||    
T  11489371 gacctagaaaaagtataagagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgat 11489272  T
Q  330 ccat 333  Q
    ||||    
T  11489271 ccat 11489268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #211
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22319884 - 22319837
Alignment:
Q  331 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  22319884 catgcagccgatcccacttagtgggataaagtttgtttgttgttgttg 22319837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #212
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Original strand, 22930642 - 22930677
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22930642 cccacttagtgggataatgcttggttgttgttgttg 22930677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #213
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30985341 - 30985306
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30985341 cccacttagtgggataaggcttgtttgttgttgttg 30985306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #214
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 31274613 - 31274578
Alignment:
Q  120 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31274613 ggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaga 31274578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #215
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 376
Target Start/End: Original strand, 37831616 - 37831655
Alignment:
Q  337 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37831616 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttttgt 37831655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #216
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39422398 - 39422209
Alignment:
Q  19 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 118  Q
    ||||| |||||| ||| |||| |||||| ||||| |   ||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||  | ||| ||| |||||||||||||     
T  39422398 atgagaatgttgtgttagatgtgtggtaggattatatgagatagaattagaaatgacaatattaga-agagagttggagtaacacatatagtagaaaaga 39422300  T
Q  119 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 210  Q
    | ||||||| ||| ||||| || || || ||||||||||||||||  ||||||  ||| || || ||| | ||||| ||||||| |||||||    
T  39422299 tagtagaaactagacttaggtgctt-ggacatgtagagagaagacatgtagattatgtagttaggagaatagatcatatggaggggagtcaa 39422209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #217
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 44905603 - 44905548
Alignment:
Q  105 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 160  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  44905603 tatagtagaaaagacggtagaaaatatgcttaggtggtttggacatgtaaagagaa 44905548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #218
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 374
Target Start/End: Original strand, 46388612 - 46388654
Alignment:
Q  331 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46388612 catgtagctgatcccactta-tgggataaggcttggttgttgtt 46388654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #219
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 4590879 - 4590813
Alignment:
Q  21 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagag 87  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  4590879 gaggatgttgcgttgaatgtgcggtgagactagacaagataggattagaaatgacaatattagagag 4590813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #220
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 160
Target Start/End: Original strand, 7921843 - 7921901
Alignment:
Q  102 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 160  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  7921843 acctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttatgtggtttggacatgtagagagaa 7921901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #221
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 9602204 - 9602286
Alignment:
Q  154 gagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctag 236  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||| || ||||  |||||| ||  |||||| ||||||||||||||    
T  9602204 gagagaagactagtagattgtgtagtaagaagagaagatcagatagagggtagtcaaattgcaagaggcagaggaagacctag 9602286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #222
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 19908718 - 19908573
Alignment:
Q  28 ttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattag--agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 125  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||  |||||||||  ||| | |||||| || |||||||   || ||    
T  19908718 ttgcgttggatgtgttgtaagactagacatgatatgatttgtaatgacaacattagaaagagagagttcgggcaacacctaaagaagaaaagagagtgga 19908619  T
Q  126 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 171  Q
    ||  || ||||  ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||    
T  19908618 aaccagacttaagtggtttgagcatgtatagagaaaacttgtagat 19908573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #223
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 302 - 376
Target Start/End: Original strand, 34863648 - 34863722
Alignment:
Q  302 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||| | ||| | |||||  |||||| ||||||||||||||    
T  34863648 atgatagaacattatggtatcatttcatccatgtagccaaccccgcctagtgaaataaggattggttgttgttgt 34863722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #224
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 328 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37099810 - 37099760
Alignment:
Q  328 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37099810 atccatgtagccggccccacttggtgggaaaaggcttggttattgttgttg 37099760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #225
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 303 - 368
Target Start/End: Original strand, 37263566 - 37263632
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttga-tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 368  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  37263566 tgatagaacactatggcgtcgtttaaattcacgtagccagccccacttagtgggataaggcttggtt 37263632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #226
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41017296 - 41017215
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| |||||||||||| ||| || | ||||| || ||||||| ||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41017296 tggtttatgatagaacattatagcataatttggtcgatgtagc-gactccacttagtggaataagacttggttgttgttgttg 41017215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #227
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 309 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 43598989 - 43598923
Alignment:
Q  309 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc-ttggttgttgtt 374  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  43598989 aacattatggcgtagtttgatccatgtagcagaccctacttactgggataaggctttggttgttgtt 43598923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #228
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 188
Target Start/End: Original strand, 46388392 - 46388470
Alignment:
Q  110 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagt 188  Q
    |||||||| |||| |||| | ||||||| | |||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||    
T  46388392 tagaaaagatggtggaaactcggcttaggtagtttgcacatgtagagagaagacttgtagattctgtagtaaggagagt 46388470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #229
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 376
Target Start/End: Original strand, 4298323 - 4298356
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4298323 cccacttagtgggataaggcctggttgttgttgt 4298356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #230
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10569312 - 10569263
Alignment:
Q  131 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggta 180  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||    
T  10569312 ggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagattctgtagta 10569263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #231
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 378
Target Start/End: Original strand, 11572405 - 11572434
Alignment:
Q  349 tagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11572405 tagtgggataaggcttggttgttgttgttg 11572434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #232
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 364
Target Start/End: Original strand, 30445314 - 30445375
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  30445314 tgatagaacaccatgacgtcgtttgattcatgtagccaactccacttagtgggataaagctt 30445375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #233
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 337 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 45168520 - 45168483
Alignment:
Q  337 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45168520 gccgatctcacttagtgggataaggcttgtttgttgtt 45168483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #234
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 331 - 372
Target Start/End: Original strand, 46395056 - 46395096
Alignment:
Q  331 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46395056 catgtagctgatcccactta-tgggataaggcttggttgttg 46395096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #235
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 376
Target Start/End: Original strand, 51173925 - 51173958
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51173925 cccacttagcgggataaggcttggttgttgttgt 51173958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 250)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31960178 - 31959814
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31960178 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 31960079  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31960078 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 31959979  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31959978 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 31959879  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31959878 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31959814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 436147 - 436513
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  436147 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtcgtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 436246  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  436247 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 436346  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  436347 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccactagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaac 436446  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  436447 actatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 436513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 52569879 - 52569513
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52569879 agcagagatcaggatgttgtgttggatgaggggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 52569780  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52569779 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 52569680  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52569679 ttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 52569580  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52569579 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 52569513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 48174457 - 48174091
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  48174457 agcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagta 48174358  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48174357 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 48174258  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48174257 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaac 48174158  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48174157 attatggcgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 48174091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 4440773 - 4441137
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  4440773 agcagagattaggatgttgcgttcgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatggcaccattagagagag--tgggggcagcacctatagta 4440870  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4440871 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatctagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 4440970  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4440971 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 4441070  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  4441071 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgtcgtcgttgttg 4441137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 33227127 - 33227493
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33227127 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 33227226  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33227227 gaaaagttggtagaaaataggcttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaagagagtcaag 33227326  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33227327 ttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 33227426  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  33227427 actatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacctagtggaataaggcttggttgtttttgttg 33227493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 12 - 377
Target Start/End: Original strand, 56375208 - 56375573
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  56375208 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataagattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctataata 56375307  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  56375308 gaaaagttggtagaaaacaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaag 56375407  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56375408 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtgaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 56375507  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56375508 actatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 56375573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 12 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33191212 - 33190845
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33191212 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagattagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 33191113  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  33191112 gaaaagttggtagaaaatagacttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagggtagatcaaatggagaagagtcaag 33191013  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33191012 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaac 33190913  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33190912 actatgacgtcatttgacccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgtttttgttgc 33190845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 12 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 48622905 - 48622543
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  48622905 agcagagatgaggatgttgctttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacccatagta 48622808  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  48622807 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaaaagaagatcaaatggaggagagtcaag 48622708  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48622707 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatcattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaac 48622608  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48622607 actatggcgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 48622543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1777379 - 1777016
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    ||||||||||||||    
T  1777379 agcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tggaaatagcacctatagta 1777282  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1777281 aaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatctagagagaagactcatagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 1777182  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1777181 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 1777082  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1777081 agtatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgtt 1777016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 53707712 - 53708078
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  53707712 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagactagacatgataggactaggaatgacaccattagaaagagagtggaggtagcacctatagta 53707811  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  53707812 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggatagtcaag 53707911  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53707912 ttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 53708011  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53708012 actatgacgtcatttgatccatttagtcgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 53708078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 43433836 - 43434208
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag------agagagtgtgggtagcacct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||    
T  43433836 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacct 43433935  T
Q  106 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggaga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43433936 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaaatcaaatggaggaga 43434035  T
Q  206 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  43434036 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattgaaaatgatttagaggtcaatgagtcggatccaaatttgatgtagga 43434135  T
Q  306 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43434136 tagaacactacggcgtcatttgatccatgtagtcgagcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 43434208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23906665 - 23906297
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag------tgtgggtagcacct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      || |||||||||||    
T  23906665 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacct 23906566  T
Q  106 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggaga 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23906565 atagtagaaaagtttgtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaagac--gtagatgccgtggtaagaagagtagattaaatggaggaga 23906468  T
Q  206 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 305  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23906467 gtcaagttaaaaaaggtaaatgaagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 23906368  T
Q  306 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23906367 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 23906297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 46583188 - 46582824
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  46583188 agcagagatgaggatgttgcattagagaagtggtaagactagacagcataggattaggaatgacaccattcgagagagagtggggatagcacctatagta 46583089  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacta-gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46583088 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagaga--agaccccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaa 46582991  T
Q  211 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46582990 gttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattggaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 46582891  T
Q  311 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46582890 ccctatggcgtcatttgatccatgtagccta-cccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttg 46582824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 28236103 - 28236466
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||| | |||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  28236103 agcagagattatgatgctgcattggatgaatggtaagattagatatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagta 28236200  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  28236201 gaaaagttggtggaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgtcgtcgtaagaagagttgatcaaatggcggagaatcaag 28236300  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  28236301 ttaaaat-ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatctttataaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaat 28236399  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28236400 attatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 28236466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 378
Target Start/End: Original strand, 37797783 - 37798135
Alignment:
Q  25 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 124  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37797783 atgttgcgttggatgagtgataagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtag 37797882  T
Q  125 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 224  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||    
T  37797883 aaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagattcgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggatgagagtcaggttaaaaga-ttag 37797981  T
Q  225 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 324  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  37797982 aggaagatctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaagtcaatgagttgaatccaaatatggtttatgatagaacaatatgacgtcat 37798081  T
Q  325 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37798082 ttgatcaatgtagccgactccatttagtgggataaggcttggttattgttgttg 37798135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 47265566 - 47265193
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  47265566 agcaaagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataagattatgaatgacaccattatagagagagtgggggtaacacctatagta 47265467  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac---tagt----agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 204  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||    |||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  47265466 gaaaaggtagtagaaaataggtttagatgatttgggcatgtagagagaagacacgtagtccgtagatgccgtcgtaagaagagtagactaaatggaggag 47265367  T
Q  205 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 304  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  47265366 attctagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatctatg 47265267  T
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47265266 atagaacactatagtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttattgttgttg 47265193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39100893 - 39100534
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||    
T  39100893 gagatgaggatgttgcgccaaatgagtggtaagactagaaatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagaagaaa 39100796  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  39100795 agttgatagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagatccgtagatgc-gttgtaagaagagtagatcagatggaagatagtcaggttaa 39100697  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||| ||    
T  39100696 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccaaatattgtttatcatagaacatta 39100597  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39100596 tggcgtaatataatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 39100534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27450533 - 27450180
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  27450533 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatagaat----aatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaa 27450440  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||    
T  27450439 agttggtagaaaataggcttagatggttttgacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggagtagaatcaggttaa 27450340  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||    
T  27450339 aagaggtaaaggaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattggaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgat-tttgatagaacacta 27450241  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27450240 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgctgttgt 27450180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 50286889 - 50287217
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||    ||||||||||    
T  50286889 agcagagatgaggaagttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag-----ggg----acctatagta 50286979  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  50286980 gaaaagttggtagaaaatagacttggatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcgaatggaggagagtcaag 50287079  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  50287080 ttaaaagaggtagaagaagacctatgaaaactattagagtaatcattataaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttgatgtatgatagaac 50287179  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 350  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  50287180 actatgg-gccatttgatccatgtagtcgaccccactta 50287217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 73 - 369
Target Start/End: Original strand, 39708412 - 39708708
Alignment:
Q  73 gacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatg 172  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||    
T  39708412 gacaccattagggagagagtgagggtagctcctgtagtataaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtatagagaagacacatagatg 39708511  T
Q  173 ctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttaga 272  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  39708512 ccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttaga 39708611  T
Q  273 ggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 369  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  39708612 ggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatgtcgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataagacttggttg 39708708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 377
Target Start/End: Original strand, 27983122 - 27983476
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27983122 gagatgaggatattgtgctagatgagtggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaa 27983221  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    |||||||||       ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  27983222 agttggtag-------gcttagatggtttgaacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaggttaa 27983314  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||  | | |||||||||||    
T  27983315 aagaggtagaggaagacataagaaaaccattcgataaacctttagaaaagatttagagttcaatgaattggatcaaaatatggatttttatagaacacta 27983414  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27983415 tgacgtcatttgatccatgtagccgatcccaattaatgggataaggtttggttgttgttgtt 27983476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 118 - 378
Target Start/End: Original strand, 8286455 - 8286723
Alignment:
Q  118 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  8286455 ttggtagaaaataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatgaaatggaggagagtcaagttagaa 8286554  T
Q  218 ga--------ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 309  Q
    ||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8286555 gaggacaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataga 8286654  T
Q  310 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286655 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 8286723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 37773811 - 37773468
Alignment:
Q  15 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 114  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  37773811 agagatgagaatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatagaattatgaatgataccattagagagagtaag-gggtagcacctatagtagaa 37773713  T
Q  115 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 214  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||   || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  37773712 aagtcggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagatagacgacccgtaaatatcgttgtaagtagagtagatcaaatggatgagagtcaattta 37773613  T
Q  215 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 314  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37773612 aaagaggtagatgaatacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccagatttggtttatgatagaacact 37773513  T
Q  315 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 359  Q
    ||| | | |||||||| || ||||||| ||| |||| || |||||    
T  37773512 atgacataatttgatctatatagccgaccccgcttaatgagataa 37773468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 86 - 373
Target Start/End: Original strand, 20192025 - 20192311
Alignment:
Q  86 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaag 185  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20192025 agagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttgatagaaaataagcttagatagtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaag 20192124  T
Q  186 agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 285  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  20192125 agtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagtggaagacctgaaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgggttg 20192224  T
Q  286 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20192225 gatccaaatttgatgtatgatagaacattatgacgttatttgat-caagtagccgaccctacttagtgggataaagcttggttgttgt 20192311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 82 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26037799 - 26037506
Alignment:
Q  82 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||  ||| |||| || ||||    
T  26037799 agagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgatattatagagagaagacctgtaaatgccgtcgtaa 26037700  T
Q  182 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 281  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||    
T  26037699 gaagagtagatcagatggaggagagtcaggttaaaagaggcagaggaaaacctaggaaaaccataagagaaactattaggaaagatttagaggtgaatga 26037600  T
Q  282 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26037599 gttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattggatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 26037506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 113 - 377
Target Start/End: Original strand, 32479057 - 32479321
Alignment:
Q  113 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  32479057 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacctgtagaggccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaggt 32479156  T
Q  213 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 312  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||    
T  32479157 tgaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcaaaatatggtttttgatagaaca 32479256  T
Q  313 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32479257 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggaaaaaggcttggttgttgttgtt 32479321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 1793382 - 1793741
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |  ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  1793382 gagatgaggatgttgtgttggatgaacggtaagacttaacgggataagattaggaatgacaccattagggagagagcgggggtagcacctatagtaaaaa 1793481  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||| ||| ||||| |||||||||  ||   | ||    
T  1793482 agttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttgttgatgtcgtcgtaagaatagtagatcagatggaggag--tcgtatcaa 1793579  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac----aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |    
T  1793580 aagaggtagagaaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagc 1793679  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1793680 actatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 1793741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 190 - 378
Target Start/End: Original strand, 21236954 - 21237142
Alignment:
Q  190 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21236954 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 21237053  T
Q  290 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21237054 caaatttggtatatgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggattggttgttgttgttg 21237142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45205208 - 45204838
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt-gtgggtagcacctatagtagaa 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  45205208 gagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattaacgagagagttgggggtagtgcctatagtagaa 45205109  T
Q  115 aagttggtagaaaataggctt--agatggtttgggcatgtagagagaagac---tagt----agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggaga 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||  || ||||||| ||| |||||||||||||   ||||    ||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  45205108 aagatggtagaaaatagacttttaggtggtttgtgcacgtagagagaagacctgtagtctgtagatgatgttgtacgaagagtagatcagatggaggaga 45205009  T
Q  206 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 305  Q
    | ||  | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  45205008 g-cagatcaaaagaggtggaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagtttaataagttggatccaaatatggtttatga 45204910  T
Q  306 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45204909 tagaacatta-ggcgtaatttgatctatgtagcccacccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 45204838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 51421666 - 51422013
Alignment:
Q  28 ttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 127  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |  |  ||||||||| |||||||||  || || ||||||    
T  51421666 ttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattatgaatgacaccattagagagtg--ttggggtagcacatatagtagattagatgatagaaa 51421763  T
Q  128 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 227  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||  ||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||   ||||  | ||||||||||||||    
T  51421764 ataggcttaggtggtttgggcatatacagagaagaccggtagatgttgtaatacgaagagtagatcaaatggaggtttgtcagatcaaaagaggtagagg 51421863  T
Q  228 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 327  Q
    ||||  ||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||| |||||    
T  51421864 aagatttagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaaaatggtttatgatagaacattatgacgtaatttg 51421963  T
Q  328 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51421964 atccatgtagccaatctcacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 51422013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20591662 - 20591306
Alignment:
Q  14 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 113  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||| | |||||| |||||   ||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20591662 cagatatgaggatgttgtgctggatgaatagtaagactagacggaattagattgagaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacttatagtaga 20591563  T
Q  114 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 213  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  || |||||||||||  |||| |||||||||||||||||     
T  20591562 aaagttggtagaaaataagattagatggtttgggcatgtagagagaagactcatagatgtcgt-gtaagaagagtatatcagatggaggagagtcaagt- 20591465  T
Q  214 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 313  Q
       ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  20591464 ---agaggtagaggaagacctaagaaaactataagagaccccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggt-tatgatagaacac 20591369  T
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
     ||| ||| ||||||| ||| ||  ||| ||   ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20591368 aatgacgtaatttgattcatatattcgaccctttttagtgggataagacttgattgttgttgt 20591306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 222 - 378
Target Start/End: Original strand, 6957726 - 6957882
Alignment:
Q  222 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6957726 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatgacgt 6957825  T
Q  322 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6957826 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 6957882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 41009707 - 41009414
Alignment:
Q  19 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  41009707 atgaggatgttgcgttggatgatcggtaagactagacatggtaggattagaaatgacatcattagggagataatgggggtagcacctatagtagaaaagt 41009608  T
Q  119 tggt-agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 217  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||||| || ||||||| | | ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  41009607 tggtaaaaaaatagacttagatggtttgtgcatgtagaaagaagacatgttgatgcagtcgtaagaaaaatagatcagatggaggagagtcaggtcaaaa 41009508  T
Q  218 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 312  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||    
T  41009507 gtggtagaggaagacct-ggaaaactataagagaaactattagaaatgatttagaagtcaatgagatggattcaaatatggtttatgatataaca 41009414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 222 - 378
Target Start/End: Original strand, 12494791 - 12494947
Alignment:
Q  222 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12494791 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 12494890  T
Q  322 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12494891 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12494947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20602003 - 20601651
Alignment:
Q  19 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||  | ||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||||||  | || ||| ||||||||||||||    
T  20602003 atgaggatgttgcgctggatgagcgctaagacaatacatgatagaattgagaatgacaccactagggagagagtggagataacacttatagtagaaaagt 20601904  T
Q  119 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 218  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||  || | |||||||||||||| || |||||    
T  20601903 tggtagaaaataggattagatggtttgtgcatgtagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaagagtatataagatggaggagagtcaggtcaaaag 20601804  T
Q  219 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 318  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||       ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||     
T  20601803 aggtagaagaagacct-tgaaaactataagagaaaccattagaaag-----tcaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaacattatga 20601710  T
Q  319 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||| ||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  20601709 cgtaatttgattcatgtaactgaacccacttagtgggataagagttaattgttgttgtt 20601651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1211747 - 1211390
Alignment:
Q  19 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| | | ||||||||||||| | ||||    
T  1211747 atgaggatgttgcactggatgagtggtaaaactagacatgatatgattaggaatgacaccatt--cgagagagtgggagcagcacctatagtaaacaagt 1211650  T
Q  119 tggtag--aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 216  Q
    ||||||  || ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||   | |||    
T  1211649 tggtaggaaatatatgcttaaatggtttgggaatgtagagagaagacctatagatattgtcgtaagaagagtagatcagatggagtagagtcggatcaaa 1211550  T
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||     
T  1211549 agagatagaggaagacataggagaactataagataaattattagaaa-aaattagaggtcaatgagttggatcc--atttggtttctcatagaacactaa 1211453  T
Q  317 ggcgt-catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1211452 ggcgtaaatttgattcatgtagccgaccccacttaatgggataagacttggttgttgttgttg 1211390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 138
Target Start/End: Original strand, 12494668 - 12494794
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12494668 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 12494767  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttaga 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12494768 gaaaagttggtagaaaataggcttaga 12494794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 145 - 326
Target Start/End: Original strand, 50679556 - 50679736
Alignment:
Q  145 gggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaacta 244  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||   | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50679556 gggcatgtagaaagaaga-tcgtagatgtcatcgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaacta 50679654  T
Q  245 ttagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||    
T  50679655 ttagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataaaatactatgacgtcattt 50679736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Original strand, 35690226 - 35690555
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||       
T  35690226 gagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattaggaatgacacctttaaagagagagttggggtagcacctatagtag--- 35690322  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
             ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||                     |||||||||| | |||||||| |||||  | ||    
T  35690323 ---------aaaataggcttaggtggtttgggcatgtagatagaag---------------------aagagtggattagatggaggaaagtcagatcaa 35690392  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||  |||||||||| |||||||| |||||||    ||| |||||||||||| ||    
T  35690393 aagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattacgaaaaatttagaggttaatgagtttgatccaatcagggtttatgatagaacatta 35690492  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  35690493 tggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggtttttgttgttg 35690555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Original strand, 54470128 - 54470485
Alignment:
Q  15 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||   |||| |||| | ||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  54470128 agagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgggatatgatttgaaataacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaa 54470227  T
Q  115 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 214  Q
    ||| |||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||| ||||| |||||  |||||||||||   |||||| |||    
T  54470228 aagatggtggaaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagacatgtaaattatgtagtaaggagagtaaatcaaatggagagtagtcaaatta 54470327  T
Q  215 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 314  Q
      ||||| | | ||||||| || |||||||| |||||| | ||||  || | | ||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||||  || || |    
T  54470328 ctagaggcaaaagaagaccaagaaaaactataagagaatctattaataaagttctagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgactgagcatt 54470427  T
Q  315 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54470428 attgcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggattaggcttggttgttg 54470485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 222 - 378
Target Start/End: Original strand, 21528416 - 21528572
Alignment:
Q  222 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 321  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||| |     
T  21528416 tagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactatggtgg 21528515  T
Q  322 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21528516 catttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 21528572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 53518571 - 53518325
Alignment:
Q  125 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  || |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||   |||||| | | |||||||||    
T  53518571 aaaataggcttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctgtggatgctgtagtacgaagagtagatcagatggag---agtcaaatcagaagaggtag 53518475  T
Q  225 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 324  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| |||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  53518474 aggaaggcctagaaaaactatgagaaaaactaataggaaagatttagaggttaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaat 53518375  T
Q  325 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  53518374 ttgatccatgcag-cgaccccacttagtgggataggactcggttgttgttg 53518325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 222 - 371
Target Start/End: Original strand, 7947065 - 7947214
Alignment:
Q  222 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 321  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||    
T  7947065 tagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccatttgaaaggatttagaggtcaatcagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatcatgt 7947164  T
Q  322 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 371  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7947165 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 7947214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 374
Target Start/End: Original strand, 16002857 - 16003206
Alignment:
Q  24 gatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggta 123  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | |||||||| ||| |||||||| ||    
T  16002857 gatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgaaataggattaggaatgacaccattatagagtgagtgaggatggcacctatggtataaaagttgata 16002956  T
Q  124 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 223  Q
    |||||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||||  |||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| || ||| | || ||||||  ||    
T  16002957 gaaaatagtcttagatgg-ttgaacatttagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagggtaaatcagatggatgaaagttatgtcaaaagaaata 16003055  T
Q  224 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 323  Q
    |||||| |||    |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||| ||||||||| ||| |    
T  16003056 gaggaataccgtaaaaaactataagagaaaccattagaaaaaatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgatttatgataaaacactatgacgtaa 16003155  T
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||| |||||| ||  |||||||| ||| | |||||   |||||||||||||    
T  16003156 tttaatccatataagcgatcccatttaataggatataacttggttgttgtt 16003206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 162
Target Start/End: Original strand, 31458946 - 31459098
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagag--agagtgtgggtagcacctatag 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||   ||||||||||||||    
T  31458946 agcacagatgaggatgttgcgttggttgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgataccattagagagacagagtcgaggtagcacctatag 31459045  T
Q  110 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 162  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31459046 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaga 31459098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 266 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19154973 - 19154861
Alignment:
Q  266 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19154973 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgttatttgatccatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttg 19154874  T
Q  366 gttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||    
T  19154873 gttgttgttgttg 19154861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 212 - 375
Target Start/End: Original strand, 4548140 - 4548303
Alignment:
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4548140 ttaaaaaaggcagaggaggacctacgaaaactattagagaaatcattagaaatattttagaggtcaataagttggatctaaatttggtttatgatagaac 4548239  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4548240 actaaggcgtaatttgatccatgtagccaacccaacttagtgggataatgcttggttgttgttg 4548303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 271 - 378
Target Start/End: Original strand, 19969358 - 19969465
Alignment:
Q  271 gaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19969358 gaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgt 19969457  T
Q  371 tgttgttg 378  Q
    ||||||||    
T  19969458 tgttgttg 19969465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 139 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31961503 - 31961264
Alignment:
Q  139 tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| || || ||||||||| | ||||||  ||||||| | |  |||||||| || |||||||| |    
T  31961503 tggtttgggcatgtagagagaagacttgtggattctgtagttaggagagtggattagatggagaggagtcaaatcactagaggtaggggtagacctagaa 31961404  T
Q  239 aaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 338  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||||||   | |  ||||   ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  31961403 aaactataagagaaactattaggaaagatctagagataaatgagttggagaaagacatggttgttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagc 31961304  T
Q  339 cgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31961303 cgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 31961264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 128 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20821255 - 20821002
Alignment:
Q  128 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  |  ||| || ||| ||| | |||||| ||| |||  | |||||||||||| |    
T  20821255 ataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacctgtagatgccttcataacaaaagtagattagatggagcagaatcagatcaaaagaggtagatg 20821156  T
Q  228 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac----actatggcgtca 323  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    |||||  | | |    
T  20821155 aagacctaggaaaactataagagaaaca-ttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaacgaacactatatcataa 20821057  T
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    || |||||||||||| ||||  |||||||  ||||||| |||||| |||||||||    
T  20821056 ttcgatccatgtagctgatcttacttagtaagataaggtttggttattgttgttg 20821002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 152 - 377
Target Start/End: Original strand, 28351617 - 28351842
Alignment:
Q  152 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 251  Q
    ||||||||||||  |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  28351617 tagagagaagacctgtagactctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattacaagaggtagagaaagacctagaaaaactataagaga 28351716  T
Q  252 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttag 351  Q
    ||| ||||  || ||||||||| | | |||||||||||||||| | || |||  ||||||  |||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28351717 aactattacgaaagatttagagattattgagttggatccaaatatagtttatagtagaaccttatggaattatttgatccatgtagccgaccccacttag 28351816  T
Q  352 tgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||    
T  28351817 tggggtaaggcttggctgttgttgtt 28351842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 56224983 - 56225352
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga---ttagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctata 108  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  |  || ||  |||||||    
T  56224983 agcagagatgatgatgttgtggtggatgagtggtaagacactaagacatgatatgattaggaatgacaccataagagaaag--ttgggataatacctata 56225080  T
Q  109 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 208  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||     |||||| ||| ||| | |||||  |||| |||||||||||||    
T  56225081 gtataaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgagtatgtagagagaaggaacatagatgttgtagtacgtagagtatatcatatggaggagagtc 56225180  T
Q  209 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaa--aactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgat 306  Q
     | | || | || ||||| |||| |||  ||  |||||| || | ||| ||||  || | ||||||||| ||| | || ||||||||| |||| | | ||    
T  56225181 taatcaagaaagttagagaaagatctaaaaagaaactataaggggaactattatgaaagttttagaggttaataaatttgatccaaatatggtattttat 56225280  T
Q  307 agaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  56225281 agaacactatgatgtaatttgatccatgtggtcgaccccacttagtgggataaggatcggttgttgttgttg 56225352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 376
Target Start/End: Original strand, 46372008 - 46372306
Alignment:
Q  78 cattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtg 177  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||     
T  46372008 cattagagatagagttggggtagcacctatagtcgaaaatattgtagaaactagacttaggtggtttgtgcatgtagagagaagacatgtggattctgta 46372107  T
Q  178 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 277  Q
     |||||||||  ||||| || |||| ||| ||  | |  |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| | |    
T  46372108 ctaagaagagcagatcagatagaggggagccagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataa 46372207  T
Q  278 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||   | |  |||| | |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  46372208 atgagttggagaaagacatggtttttgatagaacaccgtagcgtcctttgattcatgtagctgaccccacttagttgggtaaggcttggttgttgttgt 46372306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42639381 - 42639020
Alignment:
Q  15 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 114  Q
    ||||||||| |||||  ||| ||||  |||||| | |||||  ||||||||||  |||  || | |||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  42639381 agagatgagaatgttatgtttgatgtatggtaacactagacgggataggattataaatagcaaccttagagagagagttagggttgcacctatagtagaa 42639282  T
Q  115 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 214  Q
    ||| |||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||  | ||  || | ||||||| ||||||| | |    
T  42639281 aagatggtggaaaccaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttatggattctgtggtaaggggggtaaattagatggaggggagtcaaatca 42639182  T
Q  215 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 314  Q
      ||||||||||||| | |||| ||||||   |||||||| ||||  || ||| ||| | | ||||||||||||  |||| |||| | |||||||||| |    
T  42639181 ctagaggtagaggaatatctagaaaaactgcaagagaaactattaagaaagatctagcgattaatgagttggatagaaatatggtatttgatagaacatt 42639082  T
Q  315 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||| | | || ||||||||| | ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  42639081 atggcgtcgtgtaattcatgtagccaaccccgcttagtgggataaggcatgcttgttgttgt 42639020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 378
Target Start/End: Original strand, 2589124 - 2589356
Alignment:
Q  146 ggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactat 245  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||| |||| || || ||||| ||||||||||||| |||| || |||  |||||||||| | ||||||| ||||  ||    
T  2589124 ggcatgtagagagaaaacttgtggattctgtagttaggagagtagatcaaatggaggggagttaaattactagaggtagagcacgacctagaaaaagcat 2589223  T
Q  246 tagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccc 345  Q
     |||||||| || |  | |||| ||||| | ||||||||||||  |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | |||    
T  2589224 aagagaaactatcaagatggatctagagattaatgagttggatgaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagctaacccc 2589323  T
Q  346 acttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2589324 agttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 2589356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31897724 - 31897428
Alignment:
Q  78 cattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtg 177  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||| ||||  || ||| ||||     
T  31897724 cattagagagatagttggggtagcaccta--gtagaaaagatggtagaaactagacttgggtggtttgcgcatgtagagagcagacctgtggattctgta 31897627  T
Q  178 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 277  Q
    || || ||||| ||| | ||||||| ||||||  | |  |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| | |    
T  31897626 gttaggagagtcgattagatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataa 31897527  T
Q  278 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||   | |  ||||   ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31897526 atgagttggagaaagacatggttgttgatagaacactatgacgccgtttgattcatgtagccaacctcacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 31897428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35555941 - 35555648
Alignment:
Q  82 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 181  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  || ||| |||| || |    
T  35555941 agagagagagttcgggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatttagagagaagacctgtggattctgtagtta 35555842  T
Q  182 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 281  Q
    | ||||| ||| | || |||||||||   || |  |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||   |||  | ||||| | |||||    
T  35555841 ggagagtagattagatagaggagagttgggtcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactatt---aagagtctagagataaatga 35555745  T
Q  282 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||   | |  |||| | |||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35555744 gttggagaaagacatggtttttgatagtacagtatggcgtcgtttgattcatgtagccgactccatttagtgggacaaggcttggttgtttttgttg 35555648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 153
Target Start/End: Original strand, 49987346 - 49987487
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  49987346 agcagagatgaggatgttgtgttgaatgtttagtaagactagacatgataggattagaaatgacaacattagatagagagtctgggtcacacctatagta 49987445  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgta 153  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  49987446 gaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggtcatgta 49987487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 215 - 371
Target Start/End: Original strand, 50862764 - 50862908
Alignment:
Q  215 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga-gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  50862764 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt-------------t 50862850  T
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 371  Q
    || || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50862851 taaggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 50862908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 296 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19062015 - 19061933
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19062015 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgttgttgttg 19061933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7092583 - 7092218
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||   |||| |||||| |||||||  |||||||| |||||  |  ||||||||||||||    
T  7092583 agcagagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagtctagaagggatatgattag-aatgacatgattagagacagagttggaatagcacctatagta 7092485  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||  || ||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | | ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||      
T  7092484 gaaaatatgatagaaaataggtttaagtggtttgggcatatagagagaagacatgtagatgttatagtatgaagagtagatcagatggatgagagtcaga 7092385  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg--ataga 309  Q
      | ||||||| |||||||||||| || || ||| || ||||  ||||  || ||||||||||| |||| ||| |||| |||| || | ||||  |||||    
T  7092384 acataagaggtggaggaagaccta-gagaaatataagtgaaattattatgaaagatttagaggttaatgcgttagatctaaatatgatttatgatataga 7092286  T
Q  310 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    | | ||| || | | || |||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||||| | ||||||||    
T  7092285 atattatagcataaattaatccatgtaaacgaccccacttagtagcataaggcttggatattgttgtt 7092218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 378
Target Start/End: Original strand, 10208977 - 10209318
Alignment:
Q  33 ttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagg 132  Q
    ||||||| ||||||||| ||||   ||||| ||||| ||||||| ||||||||||    |  |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||      
T  10208977 ttggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacaacattagagag----ttggggtagaacctatagtagaaaagatggcagaaactaaa 10209072  T
Q  133 cttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta--gaggaag 230  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||  ||  | | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | |  || ||||  | || ||    
T  10209073 cttagttggtttgggcatgtagcgagaagacctgtgaattttttagtaaggagagtagatcagatggaggagagtcatatgactagtggtagggggggag 10209172  T
Q  231 acctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatc 330  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | |||||||||||  ||||||| ||||||     
T  10209173 acctagaaaaactataagagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacac--tggcgtcgtttgatt 10209270  T
Q  331 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10209271 caagtagccgaccccacttagtgggataaggcgtggttgttgctgttg 10209318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 212 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 51811442 - 51811280
Alignment:
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||  ||||||  ||||||||   ||| ||| |||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  51811442 ttaaaagaagtagatgaagacctaagaaaatcatccgagaaatcattagaaaaagtttcgagctcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaac 51811343  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51811342 actatgacgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggctt-gttgttgttgt 51811280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Original strand, 33709837 - 33710024
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggat-----taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcaccta 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     ||| |||| || |||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  33709837 agcagagatgatgatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgataggataggattagaaatggcaacattagagagagagttggggtaacaccta 33709936  T
Q  107 tagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||| ||||||| |||||||||   || ||| |||| ||||  |||||||||||    
T  33709937 tagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttaggcatgtggagagaagaactgtggattctgtagtaaagagagtggatca 33710024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 338
Target Start/End: Original strand, 21106908 - 21107236
Alignment:
Q  18 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattaga----gagagagtgtgggtagcacctatagtaga 113  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||| |    ||||||||   ||||| | ||||||||||    
T  21106908 gatgaggatgttgggttcgatgtgtggtaagactagacgtgatagaattagaaatgacaacattatatatagagagagttgaggtagtatctatagtaga 21107007  T
Q  114 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa---gactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa-atggaggagagtca 209  Q
    || | | || |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||   |||| ||||||  ||| ||||| |||||||||||| |||||||  |||||    
T  21107008 aaggatagttgaaaataggcttaggtagtttgggcatctagagagaagacgacttgtagattatgtagtaaggagagtggatcaagatggagggtagtca 21107107  T
Q  210 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 309  Q
      | |   || | || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | ||||| | | ||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21107108 gatcactggatgcagcggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagttttagtgattaattagttggatccaaatatggtttatgataga 21107207  T
Q  310 acactatggcgtcatttgatccatgtagc 338  Q
    ||  |||||| |  ||||||| |||||||    
T  21107208 actttatggcttagtttgatctatgtagc 21107236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 44047709 - 44047568
Alignment:
Q  15 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 114  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44047709 agagacgaggatgttgcattgaatgcgtggtaggattaggcgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaa 44047610  T
Q  115 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagag 156  Q
    ||| ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  44047609 aaggtggtagaatctaggcttaggtggtttggacatgtagag 44047568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 265 - 378
Target Start/End: Original strand, 55007917 - 55008030
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55007917 gatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagatcattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 55008016  T
Q  365 ggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||    
T  55008017 ggttgttgttgttg 55008030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 78 - 373
Target Start/End: Original strand, 31339521 - 31339803
Alignment:
Q  78 cattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtg 177  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||| | ||| |||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||     
T  31339521 cattagagagagagttggggtagaacctatggtagaaaaat-ggtcgaaactaagcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacttgtagattatgta 31339619  T
Q  178 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 277  Q
    ||||| | ||| ||||||||| ||   |||||| | |  ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||    |||       | ||||| | |    
T  31339620 gtaaggatagtagatcaaatgaagagtagtcaa-tcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatatgagaa----tta-------tctagagatta 31339707  T
Q  278 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31339708 atgagttggatcgaaatatggtacatgatagaacattatgacgtcgtttggtccatgtatccgaccccacttagtgggataaggcttgcttgttgt 31339803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 378
Target Start/End: Original strand, 31459093 - 31459278
Alignment:
Q  181 agaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatg 280  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||  | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||           ||||| |||||||| | ||||    
T  31459093 agaagagtagatcatatgtaggagagtcagatcaaaagaggtaaaggaagacctagaaaaactattag-----------gaaag-atttagagattaatg 31459180  T
Q  281 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||  | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31459181 agttggatcccaatatggtgtgtgattgaacattatggcggaacttgatccatgtacccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtcgttg 31459278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 49939807 - 49939733
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49939807 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgtt 49939733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 203
Target Start/End: Original strand, 28497452 - 28497598
Alignment:
Q  58 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 155  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28497452 gataggattagaaatgacaacatcagagagagagagttggggtagcacctttagtagaaaagattgtggaaaa-aggcttaggtggtttgggcatgtaga 28497550  T
Q  156 gagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 203  Q
    ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28497551 gagaagacttgtagattatgtagtaaggagagtagatcagatggagga 28497598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13805510 - 13805263
Alignment:
Q  131 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 230  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||  ||| | ||| ||| | ||||| ||||||||  ||||  | |  ||||| |||||||     
T  13805510 ggcttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctttagattttgtagcaaggagactagatcacatggaggattgtcagatcactagaggcagaggaaa 13805411  T
Q  231 acctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatc 330  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || |  || ||||| |||   ||| |||||||   |||| |||| |||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  13805410 acctagaaaaactataagagaaactatgaagaaagattttgagagtaataagttggacggaaatatggtttatgatagaacattatgggataatttgatc 13805311  T
Q  331 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13805310 catgtagccaaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttgttg 13805263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 267 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 34208378 - 34208267
Alignment:
Q  267 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 366  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  34208378 tttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgcaatttgatccatgtactcgaccccccttattgggataaggcttgg 34208279  T
Q  367 ttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||    
T  34208278 ttgttgttgttg 34208267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 223 - 378
Target Start/End: Original strand, 37488220 - 37488375
Alignment:
Q  223 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 322  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||  | ||| |||| |||| |||| ||||  |||||||| || ||||||||     
T  37488220 agaggtagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaataagtttgatcaaaatatggttaatgatagagcattatggcgta 37488319  T
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37488320 atttgatccatgtagccagccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 37488375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 42285972 - 42285701
Alignment:
Q  104 ctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||| || |||||||  |||| | ||||||     
T  42285972 ctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtatagagaagacctgtggattctgtagtcagaagagcagatc-agtggaggg 42285874  T
Q  204 gagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtat 303  Q
    ||||||  | |  |||||| | || |||||||| ||| ||||   |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | |    
T  42285873 gagtcagatcactagaggtgggggtagacctagaaaagctat--aagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggttttt 42285776  T
Q  304 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  42285775 gatagaatactatggcattgtttgattcatgtagccaaccccacttagttggataagacttggttgttgttgttg 42285701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34233393 - 34233031
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtaga 113  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| |||| || ||  ||||||||||||||||    
T  34233393 gagatgatgatgttgtgttggatgtgtgataagactagatgtgataggattagaaacgacaacattagagatagagagttgggatagcacctatagtaga 34233294  T
Q  114 aaa-gttggtagaaaataggcttaga-------tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggaga 205  Q
    ||| |||||  |||||| |||||||        |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||  ||| ||||| ||||| ||| | ||||||||      
T  34233293 aaaagttggg-gaaaattggcttaggacttgggtggtttggacatgtagagagagaacatgtagattatgtagtaaggagagtagatgagatggaggatc 34233195  T
Q  206 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 305  Q
    ||||  | |  ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||   || ||  ||||| | |||||||| |||| ||||  ||| |||||    
T  34233194 gtcagatcactagaggcagaggaaaacctagaaaaactatcagagaaactattcataaagacctagagattaatgagttagatcaaaataaggtttatga 34233095  T
Q  306 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 369  Q
    ||||||| | | |||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||    
T  34233094 tagaacattgtagcgtaatttgatccatgtagccgacgccactcagtgggacaatgcttggttg 34233031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 312 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 50238679 - 50238613
Alignment:
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50238679 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 50238613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 312 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 50238765 - 50238699
Alignment:
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50238765 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 50238699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 217 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2557831 - 2557670
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||| ||||  |||||| |  || | || |||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||    
T  2557831 agaggtagaggaagatctagaaaaactgtaagagaaactattaagaaggatctgaagattaacgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattat 2557732  T
Q  317 -ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
     || || ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2557731 tggtgtaatttgatccatgtagccaactccatttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 2557670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 277 - 378
Target Start/End: Original strand, 25575007 - 25575108
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25575007 aatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgtagcagaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25575106  T
Q  377 tg 378  Q
    ||    
T  25575107 tg 25575108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 286
Target Start/End: Original strand, 26356626 - 26356811
Alignment:
Q  101 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgga 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||| ||||  |||||    
T  26356626 cacctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttaggtggtttgggcacttagagagaagacatgtgggtattgtagtaaggagagtagatcggatgga 26356725  T
Q  201 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgg 286  Q
    || ||||||| | |  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||  |||||| ||||| | ||||||||||    
T  26356726 ggggagtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactataagagaaactgttatgaaggatctagagattaatgagttgg 26356811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Original strand, 29398741 - 29399088
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    || ||||||  |||||||  ||||| || |||||   | |||||||||| |||||||    
T  29398741 gagatgaggatgttgc-ttggatttgtggtaagattagatggaattggattacaaatgacaatattagggaaagagttgcgatagcacctatggtagaaa 29398839  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    || |||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| || || ||||| || |  || ||||| |||||| | |     
T  29398840 agatggtggaaaatatgcttatgtggtttgggcatgtagagagaagacctatagattctgtagtgaggagagtagaccggatagaggatagtcaaatcac 29398939  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||  |||           |||| | ||| ||  | || |||||||| | ||||  ||| |||||||||||| ||    
T  29398940 tagaggcagaggaagacctagaaaaact--tag-----------gaaatgtttt-gaaattaacgagttggaacgaaataaggtttatgatagaacatta 29399025  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29399026 tggcgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 29399088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Original strand, 50662311 - 50662497
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||| |||||||||| || ||||| ||||||||| || |   ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  | |||| | |||||||||||||||    
T  50662311 gagacgaggatgttgtgtaggatgtgtggtaagactatatgagataggattggaaatgacagcattagagagag--tttgggcaacacctatagtagaaa 50662408  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatgg-tttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 203  Q
    || |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||| ||||| |||| |||| ||||    
T  50662409 agatggtggaaagtaggcttaggtggttttgggcatgtagagagaagacttgtagattctattgtaaggagagtagatctaatgaagga 50662497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 217 - 378
Target Start/End: Original strand, 53540413 - 53540574
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || || || ||| | |||||||||||   |||| |||| |||||||||||| |||    
T  53540413 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagacttggagattaatgagttggacaaaaatatggtttatgatagaacattat 53540512  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||| | ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  53540513 ggcataatttgatccatatagccaaccccactgagtgggataagacttggttgttattgttg 53540574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 262 - 378
Target Start/End: Original strand, 5306464 - 5306580
Alignment:
Q  262 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagg 361  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||||||    
T  5306464 aaggatctagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatggcgtaatttgatccatatagctaaccccacttggtgggataagg 5306563  T
Q  362 cttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  5306564 cttggttgttgttgttg 5306580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 17900398 - 17900549
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||  ||||| ||||||  |||||||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  17900398 agcagaaatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataaaattagaaatgacgacattagagacggagttggggtagcacctatagta 17900497  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    ||||||  |||||||| ||| || |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  17900498 gaaaagacggtagaaactagactcatgtggtttgggcacgtagagagaagac 17900549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32633479 - 32633404
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32633479 tgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 32633404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 51252823 - 51252635
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||| || |||||| ||| ||| |||| || |||||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||  |  ||||||||||| |||||    
T  51252823 agcagggaggaggattttgtgttagatgtgtcgtaagactagacgagataggattagaaatgactacattagagagag--ttggggtagcacctctagta 51252726  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 202  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  || ||| || ||| ||| ||||| | |||||||||||    
T  51252725 gaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtatgggcatgtagagagaagacatgtggattctatggcaaggagagtaggtcaaatggagg 51252635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26024988 - 26024851
Alignment:
Q  238 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 337  Q
    ||||||||  ||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| | |  |||| |||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  26024988 aaaactatatgagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgagacatggtttatgatagaacattatggtgtaattttatccatgtag 26024889  T
Q  338 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26024888 ccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttg 26024851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45209280 - 45209203
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45209280 tatgatagaatattatggcgtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 45209203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25257943 - 25257722
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |   |||| |||||| | ||    
T  25257943 agcaaagatgagcttgttgtgttggatgtgtagtaagactagacatgatagaattagaaatgacaacattagagagag--ttgaggtaacacctacaata 25257846  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
     ||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||  |||     
T  25257845 taaaagatggtagaagctagacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtgaatgctgttgtaaggagagtagatcagatggaggggacacaaa 25257746  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagaccta 235  Q
    | |  |||||||| ||||||||||    
T  25257745 tcactagaggtaggggaagaccta 25257722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 176
Target Start/End: Original strand, 41192763 - 41192918
Alignment:
Q  23 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttg 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||  ||||||| | ||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||| ||    
T  41192763 ggatgttgcgttggatgtgtggtatgattagacaggatacaattataaatgacagcgttagagagagagagttggggtagcacctacagtagaaaagatg 41192862  T
Q  121 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgt 176  Q
    || |||| ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  41192863 gtggaaactagacttaggtgatttgtgcatgtagagagaagacctgtagattctgt 41192918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 315 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30634167 - 30634104
Alignment:
Q  315 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30634167 atggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 30634104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 223 - 378
Target Start/End: Original strand, 31043201 - 31043356
Alignment:
Q  223 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 322  Q
    ||||||||||| ||  ||||||  |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| || |     
T  31043201 agaggaagacccagataaactaaaagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacactattgcata 31043300  T
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||| || ||| || |||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||    
T  31043301 atttgatccttgcagctgaccccacttagtgcaataaagcttagttattgttgttg 31043356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 377
Target Start/End: Original strand, 44360014 - 44360369
Alignment:
Q  25 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattaga----gagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttg 120  Q
    |||||| |||||||| |||||| || ||| |  ||||| ||||| |||||||  ||||||    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  44360014 atgttgtgttggatgtgtggtaggactaggcgagatagaattagaaatgacaatattagatggagagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatg 44360113  T
Q  121 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 220  Q
    ||||||| |||  |||| | |||||||||||||||||||||||  || || | ||| ||||| | | | ||||| ||||||| ||| ||| | |  || |    
T  44360114 gtagaaactaga-ttaggttgtttgggcatgtagagagaagacatgtggacgatgtagtaaggataatagatcatatggaggggaggcaaatcactagtg 44360212  T
Q  221 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 320  Q
       |  |||||| ||| |||||||||||||||||  | |  |||||| | |||| ||||||||||||   | |   ||| | ||||||||||||||| ||    
T  44360213 cctggagaagacttagaaaaactattagagaaactgtcaagaaggatcttgaggccaatgagttggagaaagacacggtttttgatagaacactatgacg 44360312  T
Q  321 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    || |||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||    
T  44360313 tcgtttgattcatgtagccgaccccacttaataggataaggcttgtttattgttgtt 44360369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 59 - 307
Target Start/End: Original strand, 50680704 - 50680953
Alignment:
Q  59 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt-gggcatgtagaga 157  Q
    |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||  ||| | |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  50680704 ataggattggaaataacaacattagagagagagttagggcaacacctatagttgaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttatggcatgtagaga 50680803  T
Q  158 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaa-caa 256  Q
    |||| || |||||| | || ||||| ||||| |||| |||| |||| ||| |  | |  | ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||  |     
T  50680804 gaaggcttgtagattccgtagtaaggagagtagatccaatgaaggatagttagatcactataggcagaggtagacctagaaaaactataagagaaattat 50680903  T
Q  257 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 307  Q
    ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||  ||| |||| |||||||    
T  50680904 ttagaaa-gatctagagattaatgagttggatcggaatatggtttatgata 50680953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 358
Target Start/End: Original strand, 55578956 - 55579295
Alignment:
Q  19 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaa 116  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||  | ||  |||| ||||| ||||||||| |||  | |||||| || ||  || |||||||||| |||||    
T  55578956 atgaggatgttgtgttgaataagtggtaagaggaaacgagataagattatgaatgacactattttatagagagagttggaataacacctatagt-gaaaa 55579054  T
Q  117 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 216  Q
      |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||    || ||| ||| ||| |||||||  ||   ||||||||||||||| | |||    
T  55579055 aatggtagaaaatatgcttaggtggttcgggcatgtaaagagaagatatataaatgttgtagtatgaagagtaaatttgatggaggagagtcaaatcaaa 55579154  T
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| | | |||| |||   || |||||| ||||  |||||||||||  |||   ||| ||||||| |||| |||    
T  55579155 agaggtagaagaagacctagaaaaactataaaataaactattttgaaagatttaaaggttcatgagttggatttaaacaaggtttatgata-aacattat 55579253  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 358  Q
    |   | ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  55579254 gatataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgtgata 55579295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 247 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 28550584 - 28550455
Alignment:
Q  247 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 346  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | ||||||||  |||||   | |||||||| ||||||| || ||||    
T  28550584 agagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaaagctatgttataatttgatcaatgtagctgacccca 28550485  T
Q  347 cttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28550484 cttattgggataaggtttggttgttgttgt 28550455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 278 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20105616 - 20105516
Alignment:
Q  278 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||||   |||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  20105616 atgagttggactgaaatatggtatatgataggacattatggcgtcatttgatccatgtagccaatctcacttagtaggacaaggcttggtggttgttgtt 20105517  T
Q  378 g 378  Q
    |    
T  20105516 g 20105516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 282 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25427956 - 25427860
Alignment:
Q  282 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  25427956 gttggatctaaatttggtctatgattgaacactacggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttaatgagataagacttggttgttgttgttg 25427860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 38571099 - 38570960
Alignment:
Q  23 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 122  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  | |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||| | ||    
T  38571099 ggatgttgtgttggatgtgtggtac-actagacaagataggattggaaatgacaacatttgagagagagctggggaagcacctatagtacaaaagatagt 38571001  T
Q  123 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38571000 ggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagaaagaagac 38570960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 306 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 50869950 - 50869878
Alignment:
Q  306 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50869950 tagaacactatggcgtcgtttgattcatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 50869878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7066571 - 7066497
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7066571 tgatagaacactatg-cgtcatttgattcatgtagctgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 7066497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 378
Target Start/End: Original strand, 12443292 - 12443379
Alignment:
Q  291 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||    
T  12443292 aaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgatcccaaatcgtaggataaggcttggttgttgttgttg 12443379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Original strand, 25755237 - 25755598
Alignment:
Q  14 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 113  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| | || |||| | |||||  |||||||||||||  ||||    
T  25755237 cagagatgagaatgttgtgttagatgtgtggtaagactagacatgatatgattggaaatgaaaacaataga-aaagagttggggtagcacctatcttaga 25755335  T
Q  114 aaag-ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 212  Q
    ||||   ||| |||||| ||| |||||||||||| || |||||| ||||||   |||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||    |||| |    
T  25755336 aaagaaaggtggaaaatcggcatagatggtttggacacgtagagcgaagacctatagattatgttgtaagtagagtagatcaaatggagggtgatcaaat 25755435  T
Q  213 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 312  Q
        ||||| | |||||||| || |||||| || |||||||| ||||   | || || | | | ||||||||||||    || || | ||| ||||||||    
T  25755436 cgttagaggcaaaggaagacgta-gaaaaccataagagaaactattaagtaagacttggggattaatgagttggatagggatatgatatatcatagaaca 25755534  T
Q  313 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
     ||| | ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  25755535 ttatagtgtcatttgatccatgaagtcgatcccatttaatgggataaggcttggttgtttttgt 25755598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 31403384 - 31403234
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga----gtgtgggtagcacctat 107  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    ||  |||||||||||||    
T  31403384 agcagagatgatgatgttgagttgaatgtgtggtgagattagacgggataggattagaaatgacaacattagagacagatagagttggggtagcacctat 31403285  T
Q  108 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 160  Q
    |||||||||  |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  31403284 agtagaaaa-atggtggaaactaggcttaggtgg-ttgggcatgtaaagagaa 31403234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 303 - 374
Target Start/End: Original strand, 34585691 - 34585762
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34585691 tgataaaacattatggcgtcatttgatccatgtagcttaacccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 34585762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 242 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37042798 - 37042667
Alignment:
Q  242 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 341  Q
    |||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | | ||||||||||  ||||  ||| | |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37042798 ctataagagaaactattaagaaagatctagagattattgagttggatagaaatacggtatttgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgtagccga 37042699  T
Q  342 tcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37042698 cccgacttagtgggataaggcttggttgttgt 37042667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 358
Target Start/End: Original strand, 47372676 - 47372915
Alignment:
Q  119 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 218  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||  || |||  ||| | ||||||||| ||| | | |||||  |||||| | |  ||    
T  47372676 tggtggaaactagacttcgatggtttaggcatgtagagcgaagacccgtggattttgtaggaagaagagtagattagacggagggtagtcaaatcactag 47372775  T
Q  219 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 318  Q
    ||| ||||| |||| |  ||||||||| |||||||| | ||  || |||  |||| | ||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  47372776 aggcagaggtagacttgagaaaactataagagaaactactaataaagatccagagattaatgagttggatagaaatatggtatattatagaacattatgg 47372875  T
Q  319 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 358  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47372876 agtcgtttgatccatgtagcccatcccacttagtgggata 47372915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 217 - 376
Target Start/End: Original strand, 49987531 - 49987690
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || || || ||| | |||||| ||||||||| | ||||  |||||||| || |||    
T  49987531 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagacttggagataaatgagatggatccaactatggttcatgatagagcattat 49987630  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||| |||| |||| | |||  || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  49987631 ggcgtaattttatccttctagttgaccccacttagttggataaggtttggttgttgttgt 49987690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 17666294 - 17666053
Alignment:
Q  125 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 224  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||  ||| ||||||||||| ||| |||| ||| | |||||  ||| ||||| ||     
T  17666294 aaaataggtttaggtggtttggacatgtagagggaaaacatgtagattatgtagtaagaagagtagatgaaatagagaatagtcatattacaagagatat 17666195  T
Q  225 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 324  Q
    | |||||| ||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||| || | |||||||| |||  |||       |||||||||||| |||| |||  |    
T  17666194 atgaagacttagaaaaaatataagagaaactattagaaaagatttatagattaatgagttagatgaaaa-------tatgatagaacaatatgacgtatt 17666102  T
Q  325 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  17666101 tcgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataatgtttggttattgt 17666053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 2588905 - 2589120
Alignment:
Q  18 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg----------tagcacctat 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| | |||          ||| ||||||    
T  2588905 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagaagggataggattagaaatgacaacattagggagggagggagggagggttggggtagtacctat 2589004  T
Q  108 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 207  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || ||| |||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  2589005 agt-gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttaggcatgtagagagaaaacttgtggattctgtagttaggagagtagatcagatggaggggagt 2589103  T
Q  208 caagttaaaagaggtag 224  Q
     || |||  ||||||||    
T  2589104 taaattactagaggtag 2589120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 309 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15661939 - 15661870
Alignment:
Q  309 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15661939 aacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgtcgttg 15661870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Original strand, 32339766 - 32339843
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339766 tatgatagaaaattatggcgtcgtttgatccatgtagtctattctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 32339843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 36255603 - 36255526
Alignment:
Q  295 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36255603 ttggtgaatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttg 36255526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40932999 - 40932922
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40932999 tatgatagaacattatggcggcgtttgatgcatgtagccgaccccacttggtgggataaggcttgattgttgttgttg 40932922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 277 - 378
Target Start/End: Original strand, 51438628 - 51438729
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||   |||| |||| ||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51438628 aatgagttggaatgaaatatggtttataatataacattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgt 51438727  T
Q  377 tg 378  Q
    ||    
T  51438728 tg 51438729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 277 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 55388310 - 55388213
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||||| |||| |||| || | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55388310 aatgagttagatcgaaatatgatttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgttgtcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 55388213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 282 - 374
Target Start/End: Original strand, 1095633 - 1095725
Alignment:
Q  282 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1095633 gttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgttatttgatcgatgtacccgaccccgtttagtgggataaggcttggttgttgtt 1095725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10775786 - 10775654
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||  ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  10775786 agcagagatgatgatgttgtgttggatgcgtggcaggaccagacaggaaagaattagaaatgacaacattagagagagtgttggggtaacacctatagta 10775687  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt 144  Q
    |||||| ||||||||| ||| | ||| ||||||    
T  10775686 gaaaagatggtagaaactagacataggtggttt 10775654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 317 - 377
Target Start/End: Original strand, 15665324 - 15665384
Alignment:
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15665324 ggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 15665384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 277 - 377
Target Start/End: Original strand, 41192244 - 41192344
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||| |||||| || || ||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  41192244 aatgagttggatagaaatatggtatatggtagaacattatggcttcgttcgatccatgtagccgacccgacatagttggataaggcttggttgttgttgt 41192343  T
Q  377 t 377  Q
    |    
T  41192344 t 41192344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 326 - 378
Target Start/End: Original strand, 46153940 - 46153992
Alignment:
Q  326 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46153940 tgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 46153992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1427589 - 1427466
Alignment:
Q  71 atgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtaga 170  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || ||    
T  1427589 atgacaacattagagagagagccagggtagaacatatagtagaaaacatggtggaaactaggcttagatggtttgagcatgtagagagaggacctgtgga 1427490  T
Q  171 tgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
    |  ||||||||| ||||| |||||    
T  1427489 ttttgtggtaaggagagtagatca 1427466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 301 - 380
Target Start/End: Original strand, 3979127 - 3979206
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgca 380  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3979127 tatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcctactccacatagtgggataaggcttggttgttgttggtgca 3979206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 301 - 376
Target Start/End: Original strand, 8284346 - 8284421
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  8284346 tatgatagatcattatggcgtcatttgatccatatagccgatcctacttagtgggattaggcttgattgatgttgt 8284421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 277 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 29209274 - 29209175
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||||||||| || ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  29209274 aatgagttggatagaaatatggtatatgatagagcattatggcgttgtttgatcaatgtagccgaccccacttaatgggataagacttggttgtttttgt 29209175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 43070128 - 43070053
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagag 87  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43070128 agcagagatgatcatgttgggttggatgtgtggtaagattagacaggataggattagaaatgacaacattagagag 43070053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 301 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 49738625 - 49738550
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49738625 tatgacagaacattatggcggtgtttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49738550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 373
Target Start/End: Original strand, 13296566 - 13296712
Alignment:
Q  227 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 326  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||||| ||  | ||||||||||| | ||||  |||||||| |  |||| ||| |||| ||||    
T  13296566 gaagacctaggaaagctattagagatactattagacaagatttggaaattaatgagttggaccgaaatacggtgtatggttaaacattatagcgtaattt 13296665  T
Q  327 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    ||| |||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  13296666 gatgcatgcagccgacctcacttagtgggaaaatgcttggttgttgt 13296712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 328 - 378
Target Start/End: Original strand, 56130404 - 56130454
Alignment:
Q  328 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56130404 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 56130454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22420993 - 22420716
Alignment:
Q  97 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 196  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| |||  ||||||||| || ||||| |||||||||||||||   | ||||  |||  |||||||||| ||| | |    
T  22420993 gtagcaactgtagtggaaaagatggtggaagctaggcttaggtgatttggacatgtagagagaagatctgaagattttgtaataagaagagtagataaga 22420894  T
Q  197 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 296  Q
    ||||| | | |||| | |  ||||| |  ||||||  ||| |||||||| |||  ||| || |||||| || ||||| | ||||||||||||  | || |    
T  22420893 tggagaatattcaaatcactagaggcaagggaagatttagaaaaactataaga--aactataagaaag-atctagagattaatgagttggatagagatat 22420797  T
Q  297 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||  |||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22420796 ggtaaatgatagagcattatggcgttgtttgatctatgtagttgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 22420716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22873698 - 22873601
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||| |||  ||| |||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22873698 aatgagttggttccaaatatgggttatgatagaacattataacgtaatttaatccatgtagccaaccccatttagtgggataaggcttggtagttgtt 22873601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 305 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 44719432 - 44719359
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44719432 atagagcattatggtgtcgtttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 44719359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 55809148 - 55809075
Alignment:
Q  218 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcca 291  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  55809148 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatcca 55809075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 30621501 - 30621409
Alignment:
Q  79 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 171  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  30621501 attagagagggagttggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtgatttgggcacgtagagagaagatttgtagat 30621409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 376
Target Start/End: Original strand, 38017319 - 38017371
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38017319 tttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggcttgggtgttgttgt 38017371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1328667 - 1328612
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1328667 atttgatccatgtatccgatcctacctagtgggataaggcttggttgttgttgttg 1328612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4879162 - 4879107
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4879162 atttgatccatgtagccgacctcacttactgggataaggcttggttgttgttgttg 4879107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 25967623 - 25967552
Alignment:
Q  20 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 91  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  25967623 tgaggatgttgcgatggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgactacattagagagagag 25967552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40018477 - 40018189
Alignment:
Q  82 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 181  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||     
T  40018477 agagagagaattggggtagcacctatcgtaaaaaagatggtagaaacttggcttatgtggtttgggcatgccgagagaagacttgtatattctatagta- 40018379  T
Q  182 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 281  Q
         || ||||| ||| |||  |||||| | |  ||||| | |  ||||| ||| |||||||| ||| ||||  |||  || ||| ||||| |||||||    
T  40018378 -----gtagatcagatgaagggtagtcaaatcactagaggcaaataaagacttagaaaaactataagaaaaactgttaagaaagatctagagatcaatga 40018284  T
Q  282 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||    || || | |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||    
T  40018283 gttggatagggatatgatatatgatagaacattacggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtggaataaaacttgtttgctgttgt 40018189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 171
Target Start/End: Original strand, 45175930 - 45176083
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||  | |||||| ||||  ||||| |||||||   ||| |||||||||  ||||||  ||||| |||||||    
T  45175930 gagatgaggatgttgtcttggatgtgtggtagtactagacaagataatattagaaatgacaatgtta-agagagagttggggtagtgcctattgtagaaa 45176028  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 171  Q
    || |  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45176029 agattcta-aaaattggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagat 45176083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 376
Target Start/End: Original strand, 46236708 - 46236771
Alignment:
Q  313 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  46236708 ctatggcgtactttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggtggttgttgt 46236771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 372
Target Start/End: Original strand, 49686900 - 49686971
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    |||||| ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49686900 tatgatggaatattatggcgtcgtttgaaccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttg 49686971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6958310 - 6958237
Alignment:
Q  304 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  6958310 gatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccctacttagtgggataa-cattggttgttgttgttg 6958237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21359293 - 21359227
Alignment:
Q  308 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21359293 gaacattatggcgtaatttgattcatgcagccgaccccacttagtgggataaggctttgttgttgtt 21359227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 168 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21945846 - 21945644
Alignment:
Q  168 agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggat 267  Q
    |||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | |  |||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || |||    
T  21945846 agattctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcacatcactagaggctgaggaagacctagaaaaactatcatagaaactattaggaaagat 21945747  T
Q  268 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggt 367  Q
    || ||  | |||||||||||   |||| |||| |||||||||||   |||||||  |||||||||||||||| | |||    ||||||| || |||||||    
T  21945746 ttggaaattaatgagttggactgaaatatggtttatgatagaac---atggcgtattttgatccatgtagccaacccc----agtgggaaaaagcttggt 21945654  T
Q  368 tgttgttgtt 377  Q
    ||||||||||    
T  21945653 tgttgttgtt 21945644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 41009361 - 41009283
Alignment:
Q  234 taggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 312  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||    
T  41009361 taggtaaactataagagaaacaattagaaatgatttagaagtcaatgagttggattcaaatatgttttatgatataaca 41009283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 46715678 - 46715585
Alignment:
Q  65 ttaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |     ||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  46715678 ttagaaatgacaacattagagagagagag-----agcacctattgtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtgtgggcatgtagagagaagac 46715585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 233 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 56439714 - 56439568
Alignment:
Q  233 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 332  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||  | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||| |||| |||| |||||    
T  56439714 ctagaaaaactatcagagaaactattatgaaagatttggaaattaattagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatagcgtaatttaatcca 56439615  T
Q  333 tgtagccgatcccacttagtgggataaggc-ttggttgttgttgttg 378  Q
    | ||||| | ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||    
T  56439614 tatagccaaccccacttagtgcgaaaaggctttgcttgttgttgttg 56439568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 7544605 - 7544537
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 370  Q
    |||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  7544605 tatgatagaacattatagcga-atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagccttggttgt 7544537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8599090 - 8598957
Alignment:
Q  227 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 326  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| || | || |||||||| ||   ||||  ||| | |||||||||| ||||||||| |||    
T  8599090 gaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctaaatgttaatgagttagaaagaaataaggtatttgatagaacattatggcgtcgttt 8598991  T
Q  327 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataag 360  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8598990 gattcatgtagccgacgccacttagtgggataag 8598957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41729551 - 41729494
Alignment:
Q  275 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41729551 tcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtagtttgatcca 41729494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Original strand, 50471453 - 50471595
Alignment:
Q  19 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 118  Q
    ||||| |||||| ||||||||  || ||||| | ||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||   |  |||||||||  ||||||||||||     
T  50471453 atgagaatgttgtgttggatgtttgctaagacttgacgtaataggattagagatgacaacattagagagac--tcggggtagcactaatagtagaaaaga 50471550  T
Q  119 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    |||| |||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  50471551 tggtggaaactaggtttaagtggtttgggcatgtagagagaagac 50471595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 50967108 - 50967027
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||| ||||| |||| | |||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  50967108 tggtatatgaaagaaaattatgtcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtggaataaagcttggttgttgttgtt 50967027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 376
Target Start/End: Original strand, 28348287 - 28348339
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28348287 tttgaaccatgtagccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28348339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 224 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31403186 - 31403034
Alignment:
Q  224 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 323  Q
    |||||||| ||||  ||||||| ||| |||| ||||  || ||| ||||| | ||| ||||||||  |||| |||| ||||||||| || ||||| ||      
T  31403186 gaggaagatctagagaaactataagaaaaactattatgaaagatctagagattaattagttggatagaaatgtggtatatgatagagcattatggtgttg 31403087  T
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  31403086 cttgatccatgtagacgaccccacttagtaggataaaacttggttgttgttgt 31403034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 82
Target Start/End: Original strand, 18966474 - 18966541
Alignment:
Q  15 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatta 82  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||    
T  18966474 agagatgaagatgttgcgttggatgtgtggtaagattagacaaaataggattataaatgacaacatta 18966541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 378
Target Start/End: Original strand, 20999129 - 20999284
Alignment:
Q  223 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 322  Q
    |||||||||||||| |||||||| | | |||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||| ||  | || |||  |||| |||| || |||| ||||    
T  20999129 agaggaagacctagaaaaactataatataaactattaagaaagatctagagtttaatgagttgaataaatatatggcatatggtagagcattatgacgtc 20999228  T
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
     |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  20999229 gtttgatccttgtagccgaccccactcagtgggataaagcttgattgttattgttg 20999284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35622749 - 35622674
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||| ||| ||| || |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35622749 tgatagaacgctagggcatcgtttgattcaggtagctgaccccacttagtgggataaggcttggtcgttgttgttg 35622674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 36556833 - 36556758
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||| | |||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36556833 tgataggacactatggcgttgtttgattcgtgtacccgaccccactttgtgggataagacttggttgttgttgttg 36556758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39446983 - 39446908
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  39446983 tgattgaacactatggcgttgtttaattcatgtaaccgaccccacttaatgggataaggcttggttgtggttgttg 39446908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 44047422 - 44047367
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44047422 tttgattcatgtagccaaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttgttgc 44047367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 45184291 - 45184135
Alignment:
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||||  || |||  |||| | ||||||||| ||  |    |||| ||| ||| |||| ||    
T  45184291 aagaggtagaggaagacctagaaaaactataaga--aactattatgaaagataaagagattaatgagttgaatttactcatggtttataataaaacatta 45184194  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    || ||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45184193 tgacgtaattcgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgtt 45184135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 376
Target Start/End: Original strand, 47372915 - 47372986
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||| |||| | || | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47372915 atagaacattatgacatcgtctgatccatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 47372986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 163
Target Start/End: Original strand, 47611741 - 47611796
Alignment:
Q  108 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47611741 agtagaaaagatgatggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 47611796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 378
Target Start/End: Original strand, 8327143 - 8327185
Alignment:
Q  336 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8327143 agccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 8327185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 373
Target Start/End: Original strand, 13262421 - 13262491
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13262421 tgatagaaaactatgacgtcgtttgattcatgtagccgactccacttagtgtgataaggcttagttgttgt 13262491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 36557347 - 36557246
Alignment:
Q  58 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 157  Q
    ||||| ||||| ||||||   ||| ||||||||||  ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  36557347 gatagaattagaaatgacgatattggagagagagttggggcagcacccatagtagaaaagatggtagaaactagacttag-tggtttgggaatgtagaga 36557249  T
Q  158 gaa 160  Q
    |||    
T  36557248 gaa 36557246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 376
Target Start/End: Original strand, 813147 - 813200
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  813147 atttgatccatgtagcagaccccgcttagtggaataaggcttggttgttgttgt 813200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 301 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1965708 - 1965639
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 370  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  1965708 tatgatagaataatatggcgtaatttgatccacgtagccgatcccatttagtgggaaaagatttggttgt 1965639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 6478706 - 6478662
Alignment:
Q  332 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6478706 atgtagccga-cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 6478662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 374
Target Start/End: Original strand, 17900691 - 17900760
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17900691 atagagcactatggcgttgtttgattcatttagctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgtt 17900760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 307 - 376
Target Start/End: Original strand, 32613643 - 32613712
Alignment:
Q  307 agaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  32613643 agaacattatgacgtcgtttgatccatgtagccaatcacacttaatgggatatggcttgattgttgttgt 32613712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 376
Target Start/End: Original strand, 54529647 - 54529700
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54529647 atttgatccatgtagccggacccatttagtgggataagacttggttgttgttgt 54529700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20131274 - 20131167
Alignment:
Q  101 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgg-gcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgg 199  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||   ||||||| |||||||||| ||||| |   | ||| ||||||| ||||||||||    
T  20131274 cacctatagtagaaaaat-ggtagaaaatagacttagatgtttttttgcatgtaaagagaagactcgtagaagtcatagtatgaagagtagatcaaatgg 20131176  T
Q  200 aggagagtc 208  Q
    |||||||||    
T  20131175 aggagagtc 20131167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26275078 - 26275014
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  26275078 tatggcctaatttgatccatgtatccgaccccatttagttggaaaaggcttggttgttgttgttg 26275014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 36799737 - 36799657
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||| |||||| ||||| ||| || | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  36799737 tggtttatgattgaacaatatcgcataatttgatccatgtagacgaccccacttagtgggataaagcttaattgttgttgt 36799657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 38585313 - 38585249
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  38585313 tatggcgtaatttgatccatttagctgagcccacttagtggaataaggcttagttgttattgttg 38585249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 38904036 - 38903925
Alignment:
Q  59 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 158  Q
    |||||||||||||| |||  ||||  |||||| | ||||||||||| ||  |||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  38904036 ataggattaggaat-acaatattaccgagagactctgggtagcaccgatcatagaaaagatggtggaaactcggcttagttggtttgagcatgtggagag 38903938  T
Q  159 aagactagtagat 171  Q
    |||||| ||||||    
T  38903937 aagacttgtagat 38903925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 45185295 - 45185215
Alignment:
Q  108 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagt 188  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||    
T  45185295 agtagaaaagatggtggataataggcttaggtgatttgggcatatagagacaagacttgtagattttgtagtaagaagagt 45185215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 376
Target Start/End: Original strand, 49416949 - 49416989
Alignment:
Q  336 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49416949 agccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49416989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 376
Target Start/End: Original strand, 50471757 - 50471809
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50471757 tttgatccatgtaatcgaccccacttagtgggataacgcttggttgttgttgt 50471809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Original strand, 56200153 - 56200234
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatcc----atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||    |||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  56200153 tatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatccatgtagccgaacccaatcaatgggataaggcttgtttgttgttgttg 56200234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 883433 - 883358
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| || |  |||| |||||||| |||||||||    
T  883433 tgatagaacactatgacatcatttaatccatgtagccgaccccactcagggatataatgcttggttattgttgttg 883358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26772570 - 26772535
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772570 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 26772535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Original strand, 38266134 - 38266261
Alignment:
Q  82 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 181  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||| | | |||| |||| || |||||| |||||||  ||||| |||| ||| || |||||||| ||| |||    
T  38266134 agagagagagttagggtagcacctataatagagaggatggtggaaactaagcttaggtggtttgaccatgttgagataagtcttgtagatgccgtgataa 38266233  T
Q  182 gaagagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
    | ||||| ||||  |||||||| |||||    
T  38266234 ggagagtagatcgtatggaggatagtca 38266261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 217 - 371
Target Start/End: Original strand, 47147496 - 47147648
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  | || || | |||||||||||| |||    
T  47147496 agaggcagaggaagacctagaaaaactatagaagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggat--agatatgatatatgatagaacattat 47147593  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 371  Q
    ||| |  ||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||  |||||||    
T  47147594 ggcattgtttgatccatgtaaccatccccaattagtgggataaggcccggttgtt 47147648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 49454512 - 49454477
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49454512 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 49454477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 220 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 50288099 - 50287988
Alignment:
Q  220 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 319  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||  |||| ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| || | ||||||| || |||||| |    
T  50288099 ggtagaggaagacttagaaaaactataagataaattattaaaaaagatttagaggtcaatgaattgaatgcaaatatgttttatgatataatactatgtc 50288000  T
Q  320 gtcatttgatcc 331  Q
    || |||| ||||    
T  50287999 gtaatttaatcc 50287988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 291 - 378
Target Start/End: Original strand, 54963648 - 54963734
Alignment:
Q  291 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  54963648 aaatatggtatatgatagaaca-tatggcctaattttatccatgtacctgacccaacttagtgggataagacttagttgttgttgttg 54963734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8598948 - 8598898
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  8598948 tttgattcatgtagccgatcccacttaatgggataagactttgttgttgtt 8598898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 204
Target Start/End: Original strand, 20605241 - 20605307
Alignment:
Q  138 atggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||||||    
T  20605241 atggtttgggcatgtagagagaagagctgtagattctgtggtaaggagagtatatcaagtggaggag 20605307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Original strand, 45423542 - 45423681
Alignment:
Q  17 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||| ||||    | |||||   ||||||||||||| |||||||    
T  45423542 agatgaggatgttgtgttggttgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacatt----atagagttgaggtagcacctataatagaaaa 45423637  T
Q  117 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 160  Q
    | ||||||||| | | ||||  |||||| | |||||||| ||||    
T  45423638 gatggtagaaacttgacttacgtggttttgacatgtagaaagaa 45423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 378
Target Start/End: Original strand, 54935351 - 54935433
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| |||||||||||| |||  | | ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||    
T  54935351 tggtttatgatagaacattataacataatttgatccatgtagcctaccccacttggtgggacagggcttggttgttattgttg 54935433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 934793 - 934649
Alignment:
Q  18 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaag 117  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||| || |||  ||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| ||  ||||| |||||||  | ||||||    
T  934793 gatgaggttgttgcgttggctgtgtggtatgactaggtatgatagaattagaaatgataatattagagagagggttggggtatcacctatcat-gaaaag 934695  T
Q  118 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
     ||||||||| |   ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  934694 atggtagaaactcatcttaggtggtttgggcaagtagagaggagac 934649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 160
Target Start/End: Original strand, 1380296 - 1380433
Alignment:
Q  23 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 122  Q
    ||||||||| ||||||| || || |||   |||| ||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||  || || ||||||  ||||||||  || |    
T  1380296 ggatgttgcattggatgtgttgttagacctgacacgatagaattagaatggacaacattagagagagagttgggataacacctaccgtagaaaacatgat 1380395  T
Q  123 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 160  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1380396 agaaactcggcttaggtggtttgggcacgtagagagaa 1380433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14623292 - 14623243
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggct 363  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  14623292 tatggtgtcatttgatccatgtagccaatcccacctagtggaataaggct 14623243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 376
Target Start/End: Original strand, 26357008 - 26357041
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26357008 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 26357041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 358
Target Start/End: Original strand, 28486092 - 28486185
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 358  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||  || ||||| |||||||| |||||||||||||||| || | |  |||||||||||    
T  28486092 gatttagagattaatgagttggatccaaatatgatttacaattgaacaatatggcgtaatttgatccatgtagctgacctcggttagtgggata 28486185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32630540 - 32630495
Alignment:
Q  328 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32630540 atccatgtagctgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgt 32630495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 374
Target Start/End: Original strand, 34379586 - 34379682
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | |||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| || ||| ||||| |||||| ||||    
T  34379586 aatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaacttgat-catgtagccgaccccactttgttggaaaaggcgtggttgctgtt 34379682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38789656 - 38789623
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38789656 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38789623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 42293320 - 42293263
Alignment:
Q  321 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  42293320 tcatttaatctatgtagccggccccacttagtggaataaggcctggttgttgttgttg 42293263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 48451108 - 48451071
Alignment:
Q  341 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48451108 atcccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttg 48451071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 52360012 - 52359963
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  52360012 atttgatccatgtagcagaccccactttgtggggtaaggcttggttgttg 52359963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 55768798 - 55768717
Alignment:
Q  79 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 160  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||    
T  55768798 attagagagatagtaggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55768717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 55833054 - 55832973
Alignment:
Q  79 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 160  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||    
T  55833054 attagagagatagtaggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55832973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 330 - 374
Target Start/End: Original strand, 20047670 - 20047714
Alignment:
Q  330 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20047670 ccatgtagccggccccacttagtgggataagacttggttgttgtt 20047714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25959281 - 25959225
Alignment:
Q  322 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||| ||||||| | | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25959281 catttgatccttgtagccaacctcacctagtgggataagacttggttgttgttgttg 25959225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 373
Target Start/End: Original strand, 32745831 - 32745867
Alignment:
Q  337 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32745831 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 32745867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #213
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 162
Target Start/End: Original strand, 44860862 - 44860914
Alignment:
Q  110 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 162  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44860862 tagaaaagatggtggaaaccaggcttagatggtttgggcatgtatagagaaga 44860914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #214
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 49738885 - 49738817
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| || |||| || |||| |||||||||    
T  49738885 gggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtgatttgagcgtgtaaagagaagac 49738817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #215
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3601452 - 3601417
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3601452 cccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgttg 3601417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #216
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4136795 - 4136744
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  4136795 tttgatccatgtagccgaccctacttagtgagataaaacttggttgttgttg 4136744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #217
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8459103 - 8459056
Alignment:
Q  327 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8459103 gatccatgtagccaaccccatttagtgggataagacttggttgttgtt 8459056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #218
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 370
Target Start/End: Original strand, 10536580 - 10536615
Alignment:
Q  335 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 370  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10536580 tagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgt 10536615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #219
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 11389638 - 11389875
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatg--ataggattaggaatgacaccattaga--gagagagtgtgggtagcacctat 107  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| | |||||  |  |||||||||| ||||||| | |||||  ||||||||  |||||||||||||    
T  11389638 agcagagatgaggatgttggattggatgtgtggtaaaactagacgggatataggattagaaatgacaactttagagcgagagagttagggtagcacctat 11389737  T
Q  108 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 207  Q
      ||| |||  |||| |||| |  |||||| |||| ||| || || |||||||   | |||||| |||| ||||| ||||| ||| | |||||    |||    
T  11389738 tctagtaaatatggtggaaactctgcttaggtggtctggccacgtggagagaatctttgtagattctgtagtaaggagagtagataagatggaaagtagt 11389837  T
Q  208 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactat 245  Q
    ||| | |  |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  11389838 caaatcactagaggtagaggaagacgtagaaaaactat 11389875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #220
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11400507 - 11400444
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc-ttggttgttgttgt 376  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11400507 tatggtgtaatttcatccatgtagccgacccaacttagtgggataaggctttggttgtcgttgt 11400444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #221
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11410234 - 11410171
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc-ttggttgttgttgt 376  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11410234 tatggtgtaatttcatccatgtagccgacccaacttagtgggataaggctttggttgtcgttgt 11410171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #222
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 378
Target Start/End: Original strand, 23294023 - 23294066
Alignment:
Q  335 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23294023 tagccgaccctacttagtgggataaggcgtggttgttgttgttg 23294066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #223
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27338462 - 27338387
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  27338462 tatgatagaacattatgacgtagttggatccatgtagccgaccctccttagtgggatgagactttgttgttgttgt 27338387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #224
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 356
Target Start/End: Original strand, 28467649 - 28467700
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 356  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  28467649 atagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcggaccccgcttagtggga 28467700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #225
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Original strand, 35585854 - 35585889
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35585854 cccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 35585889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #226
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 378
Target Start/End: Original strand, 43774098 - 43774141
Alignment:
Q  335 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43774098 tagccgaccccatttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 43774141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #227
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 46539164 - 46539109
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  46539164 atttgattcatgtaggcaaccccacttagtgggataaggtttgcttgttgttgttg 46539109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #228
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Original strand, 49370043 - 49370078
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49370043 cccacttagtgggatatggcttggttgttgttgttg 49370078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #229
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 51051488 - 51051453
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51051488 cccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 51051453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #230
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 51550322 - 51550251
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||   |||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51550322 tgatagaacattatgtcgtcatttgatttttgtagctgactgcacttagtgggataaggcttagttgttgtt 51550251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #231
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 378
Target Start/End: Original strand, 52357924 - 52357967
Alignment:
Q  335 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52357924 tagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgctgttgttg 52357967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #232
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 362
Target Start/End: Original strand, 1380600 - 1380638
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc 362  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1380600 tttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggc 1380638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #233
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 378
Target Start/End: Original strand, 1989785 - 1989867
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| ||||||| |||| | |||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  1989785 tggtttatgataaaacattttggcgtaatttgattcatgcaatcgaccccacttattgcgataaggcttggtggttgttgttg 1989867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #234
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 318 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6931780 - 6931722
Alignment:
Q  318 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  6931780 gcgtcgtttgatccttgtagatgatcccgcttagtgggataaagcttcgttgttgttgt 6931722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #235
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 332 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 10775515 - 10775473
Alignment:
Q  332 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10775515 atgtcgccgaccccacatagtgggataaggcttggttgttgtt 10775473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #236
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 20654868 - 20654922
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  20654868 tttgattcatgtatccgaccccacttagtgagataagacttagttgttgttgttg 20654922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #237
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30621331 - 30621241
Alignment:
Q  246 tagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 336  Q
    ||||||||| ||||  || ||||||||| | |||| |||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||| | | ||||||||||||    
T  30621331 tagagaaactattaagaaagatttagagattaatgtgttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcttaacttgatccatgta 30621241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #238
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 42293528 - 42293470
Alignment:
Q  97 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 155  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||| ||||||||| |||||||    
T  42293528 gtagcacctatagtagaaaagatgatggaaactcggcttaggtggtttgggtatgtaga 42293470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #239
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 336 - 378
Target Start/End: Original strand, 44940738 - 44940780
Alignment:
Q  336 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44940738 agccgaccccacttagtgggataagtcttggttgttgtggttg 44940780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #240
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 378
Target Start/End: Original strand, 49416204 - 49416238
Alignment:
Q  344 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49416204 ccacgtagtgggataaggcttggttgttgttgttg 49416238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #241
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 304 - 378
Target Start/End: Original strand, 51176784 - 51176858
Alignment:
Q  304 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||| || | ||||||||||   |||||||||| || |||||||    
T  51176784 gatagaacattatggcataatttgatccatgtagcggaccacacttagtggtgaaaggcttggtggtggttgttg 51176858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #242
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 346 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 51879781 - 51879747
Alignment:
Q  346 acttagtgggataaggcttggttgttgttgttgca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51879781 acttagtgggataaggcttggtttttgttgttgca 51879747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #243
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 378
Target Start/End: Original strand, 53413941 - 53413975
Alignment:
Q  344 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53413941 ccacttagtgggataaggtttggttgttgttgttg 53413975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #244
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 372
Target Start/End: Original strand, 53517725 - 53517783
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  53517725 tatggtgtcgtttaatccatgtagccgaccctacttagtggaataagacttggttgttg 53517783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #245
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 378
Target Start/End: Original strand, 26510559 - 26510671
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |  ||||||||| ||||| || | | |||| |||||| ||| || ||| | ||||||||| |||    
T  26510559 gatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgcgatagaacattatggtgtaagtagatcaatgtagtcga-cctactgaatgggataagactt 26510657  T
Q  365 ggttgttgttgttg 378  Q
      ||||||||||||    
T  26510658 cattgttgttgttg 26510671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #246
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 331 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 28764419 - 28764374
Alignment:
Q  331 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28764419 catgtagccgacctcatttggtgggataaggcttggttgttgttgt 28764374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #247
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 40933255 - 40933198
Alignment:
Q  17 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatga 74  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||| ||||| |||||    
T  40933255 agatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagacaatacatgatagaattagaaatga 40933198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #248
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 51841273 - 51841196
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| |||| |||||||   |||||||||| |||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  51841273 tatgatacaacattatggcggtgtttgatccatatagctgaccccgcttagtgggatgaagcttggttgttgctgttg 51841196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #249
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 55768600 - 55768500
Alignment:
Q  275 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| |||  |||| ||| | || || ||| || ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  55768600 tcaatgagttggatcaaagtatggtgtatgatagaacattatagcgcaatttaatcaacgtggctgataccgctt-gtgggacaatgcttggttgttgtt 55768502  T
Q  375 gt 376  Q
    ||    
T  55768501 gt 55768500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #250
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 55832856 - 55832756
Alignment:
Q  275 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| |||  |||| ||| | || || ||| || ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  55832856 tcaatgagttggatcaaagtatggtgtatgatagaacattatagcggaatttaatcaacgtggctgataccgctt-gtgggacaatgcttggttgttgtt 55832758  T
Q  375 gt 376  Q
    ||    
T  55832757 gt 55832756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 319; Significance: 1e-179; HSPs: 199)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 52138718 - 52139084
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52138718 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 52138817  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  52138818 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagaatagattaaatggaggagagtcaag 52138917  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52138918 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 52139017  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139018 actatgacgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 52139084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 28245355 - 28245721
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28245355 agcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagcctggataggattaggaatgacatcattagagagagagtgggggtagcacctatagta 28245454  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28245455 gaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaaaacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaag 28245554  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28245555 ttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaacgattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataatagaac 28245654  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  28245655 actatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgagataaggcttgattgctgttgttg 28245721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 54278938 - 54279303
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54278938 agcagagatgaggatgttgcgttggataagtggtaagactagacaagatagaattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctatagta 54279037  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54279038 gaaaagttggtagaaaataggcttagacggtttgggcacgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaaaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 54279137  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54279138 ttaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 54279237  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||||    
T  54279238 actatggcgtcatttgatcaatgtagccgatcccacttaataagataagacttggtt-ttgttgttg 54279303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 51448073 - 51447715
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  51448073 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagta-gggtagcacctatagta 51447975  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51447974 gaaaagttggtagaaaataggcttagatagtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 51447875  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51447874 ttaaaaga-------gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 51447782  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51447781 actatggcgtcatttgattcatgtagccggccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 51447715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Original strand, 21995 - 22356
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21995 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 22094  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||    
T  22095 agttggtagaaa-taggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcgggttaa 22193  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  22194 aagaggtagaggaagacttaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 22293  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22294 tggcgtcatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttg 22356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Original strand, 5168750 - 5169116
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag----agagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||| |||    
T  5168750 gagatgaggatgttgcgctggatgataggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatggta 5168849  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  5168850 gaaaagttggtagaaaatacgcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtctag 5168949  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  5168950 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 5169049  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5169050 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 5169116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 47233955 - 47233596
Alignment:
Q  17 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  47233955 agatgaggatattgcgttggatgagtggtaagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagaatggaggtagcacctatagtagaaaa 47233856  T
Q  117 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  47233855 gttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaa 47233756  T
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  47233755 agatgttgaagaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggaattagaggtcaatgaattagatccaaatatggtttttgatagaacactat 47233656  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47233655 ggcgtcatttgattcatgtagccgaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgt 47233596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 376
Target Start/End: Original strand, 25191297 - 25191659
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  25191297 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatatgattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 25191394  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||  ||||||||||||||||| |  |    
T  25191395 gaaaaattggaagaaaatagacttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggaggagagcccgg 25191494  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| |||| | |||||||||    
T  25191495 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaatcatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgaattagatcaaaatatggtttttgatagaac 25191594  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25191595 actatggcgtcatttgatccatgtagctgatcccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 25191659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 77 - 376
Target Start/End: Original strand, 35033129 - 35033428
Alignment:
Q  77 ccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgt 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  |    
T  35033129 ccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttatatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccat 35033228  T
Q  177 ggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtc 276  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  35033229 tgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtc 35033328  T
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35033329 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccgacctcatctagtgggataaggcttggttgttgttgt 35033428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 12 - 377
Target Start/End: Original strand, 54128296 - 54128662
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  54128296 agcagagatgaggatgttgcgtttgatgagtggtaaaactagacgcgataggattatgaatgacaccattagagagagtgttggggtagcacctatagta 54128395  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||  ||| | ||||| ||||| |||||||  |||||      
T  54128396 gaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagaaaagacctgtagatgatgcagtacgtagagtagatcagatggaggttagtcaga 54128495  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatt-agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 310  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  54128496 tcgaaagaggtagaggaagacctagaaaaactattaagagaaactataaggaaagatttagaggtcaatgagttggacccaaatatggtttatgatagaa 54128595  T
Q  311 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54128596 cattatggcataatttgatccatgtaggcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 54128662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33272392 - 33272122
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctata- 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||     
T  33272392 agcagagatgaggatgttgcattggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatat 33272293  T
Q  109 ---gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggaga 205  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  33272292 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagact-gtagatgccgtggtaagaagtgtatatcaaatggaggaga 33272194  T
Q  206 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33272193 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtca 33272122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 127 - 378
Target Start/End: Original strand, 48508268 - 48508519
Alignment:
Q  127 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  48508268 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag 48508367  T
Q  227 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 326  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  48508368 gaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattt 48508467  T
Q  327 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48508468 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 48508519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 378
Target Start/End: Original strand, 53519511 - 53519864
Alignment:
Q  19 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctata------gtag 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||      ||||    
T  53519511 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaatactagacaggataggattaagaatgacaccattagacagagagtgggggtagcacctatatatatagtag 53519610  T
Q  113 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||   |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  53519611 aaaagttggtagaaaataggcttagatgttttggacatgaatagagaagaaccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgt 53519710  T
Q  213 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||            |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||    
T  53519711 taaaagaggtagaggaagacctaaga------------aaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaataaggtttttgatagaaca 53519798  T
Q  313 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53519799 ctatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttg 53519864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 82 - 376
Target Start/End: Original strand, 38850108 - 38850403
Alignment:
Q  82 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 181  Q
    |||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |  || ||||    
T  38850108 agagagagagagagagtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaagatcagtagaggtcgtcgtaa 38850207  T
Q  182 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattag-aaaggatttagaggtcaatg 280  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||    
T  38850208 gaagagtagatcgaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaattattagataaaccattagaaaaggatctagaagtcaatg 38850307  T
Q  281 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    | ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||||||||||    
T  38850308 aattgaattcaaatttggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaaacttagttgttgttgt 38850403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 206 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12096875 - 12096703
Alignment:
Q  206 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12096875 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 12096776  T
Q  306 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12096775 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12096703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 43695127 - 43694769
Alignment:
Q  14 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatga-----taggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg-tagcacctat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||     |||||||||||||||||      ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  43695127 cagagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagaccagacatgacatgataggattaggaatgaca------gagagagagtggggggtagcacctat 43695034  T
Q  108 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||| | ||||||||| ||||        
T  43695033 agtagaaaagttggtagaaaatttgcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgtcgtcgtaagaagattagatcaaatgaagga---- 43694938  T
Q  208 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 307  Q
      |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| | ||| |||||||    
T  43694937 --agttaaaagaggtagaggaaaatctaggaaaactattagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatggattggatctaaactaggtttatgata 43694840  T
Q  308 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| || | |||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43694839 gaacaatacgacgtcatttgatctatgtagtcgaccccatttagtgggataaagctgggttgttgttgttg 43694769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19676447 - 19676079
Alignment:
Q  19 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag--------tgt--gggtagcacctata 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||   |||| |||||||| ||||||||||||||||||||        |||  ||||||||||||||    
T  19676447 atgaggatgttgcattggatgagcggtaagactagatgggataagattaggagtgacaccattagagagagagagagagagtgttggggtagcacctata 19676348  T
Q  109 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 208  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||  ||||| || ||||||||||    
T  19676347 gtacaaaagatgatagaaaattggcttaggtggtattggcatgtagagagaagacctgtagatgctgtagtacaaagagaagatcagatagaggagagtc 19676248  T
Q  209 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 308  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19676247 agatcaaaagaggta-aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatgctgtatgatag 19676149  T
Q  309 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    | || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19676148 agcattatggcgtgatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttattgttg 19676079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 36 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 45289434 - 45289091
Alignment:
Q  36 gatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctat--agtagaaaagttggtagaaaatag 131  Q
    |||| ||| ||||| |||||  |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||    
T  45289434 gatgtgtgataagactagacgggataagattagaaatgacac-attagagagagagagttggggtagcacctattcagtagaaaagatggtggaaaatag 45289336  T
Q  132 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 231  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |  ||| ||||| ||||||||||    
T  45289335 gcttaggtggtttgggcacgtagagagaacacttgtagattttgtagtaagaagagtagatcagatggaggatagttagattacaagagatagaggaaga 45289236  T
Q  232 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 331  Q
     ||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| || | |||||||||    
T  45289235 tctatgaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatcc 45289136  T
Q  332 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45289135 atgtcgccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45289091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 33 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 49503897 - 49503566
Alignment:
Q  33 ttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagg 132  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49503897 ttggatgagtggtaagactagacgagataggattgggaatgacaccattagagagagagttcaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaatagg 49503798  T
Q  133 cttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  ||  || ||| ||||| ||||||| |||||   ||| |||| ||||||||||||    
T  49503797 cttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccaatagatgttgtaatacaaacagtagatcagatggaggggagtctgattagaagatgtagaggaagac 49503698  T
Q  233 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 332  Q
    ||||  |||||||||| ||||           ||||||  ||| |||||||||| ||||||| |||| |  |||| || | |||||||| ||||||||||    
T  49503697 ctag--aaactattag-gaaa-----------gatttaacggttaatgagttgggtccaaatatggttttggatataatattatggcgtaatttgatcca 49503612  T
Q  333 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49503611 tgtagccgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 49503566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 39601016 - 39600683
Alignment:
Q  41 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg 140  Q
    ||||||||| ||||   |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | |||||| ||    
T  39601016 gtggtaagactagatgggataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacaagcttaggtg 39600917  T
Q  141 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 240  Q
    |||| |||||||| |||||||||  |||||| |||| |  || ||||| ||||| || ||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  39600916 gttttggcatgtaaagagaagacctgtagattctgtagcgaggagagtagatcagatcgaggatagtcagattgcaagaggtagaggaagacctagaaaa 39600817  T
Q  241 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 340  Q
    ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||     
T  39600816 actataagagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatctggtttacgatagaacattatggtgtaatttgatccatctaacca 39600717  T
Q  341 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  39600716 accccactttgtgggataagacttggtttttgtt 39600683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 45728064 - 45728324
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt-agagagagagtgtgggtagcacctatagt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||   |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  45728064 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagacgagacgaaataggattagaaatgacatcatttagagagagagtgggggtagcacatatagt 45728163  T
Q  111 agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag-aagactagtagatgctgtggtaagaagag--tggatcaaatggaggagagt 207  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||| | ||||||||||| || ||   ||||||  || ||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  45728164 agaaaagttggtagaaagtaggatcagatggttttgacatgtagagagaaaaacccatagatgtcgttgtaagaagagtatatatcaaatggaggagagt 45728263  T
Q  208 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatt 268  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45728264 catgttaaaagagatagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatt 45728324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 95 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 50960914 - 50960636
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      ||| ||| | ||||||||| |||||    
T  50960914 gggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacct----atgttgtagaaagaagagtagatca 50960819  T
Q  195 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 294  Q
     |||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||| || | ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50960818 gatggaggagagtcggatcgaaagagggagaggaagacctagaaaaaatttaagagaaactattaggaaaggtttagagattaatgagttggatccaaat 50960719  T
Q  295 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
     |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50960718 atggtgtatcatagaccattatggtgtaatttgatccatttagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgctgtt 50960636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 370
Target Start/End: Original strand, 38430807 - 38431129
Alignment:
Q  58 gataggattaggaatgacaccattagag-----agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  38430807 gataggattaggaatgacaccattagagcgtttagagcgttgaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggttgattgggcatgt 38430906  T
Q  153 agagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaa 252  Q
    ||||||| |||  | ||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||    
T  38430907 agagagacgacctgcagatgttgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaagacttagaaaaactacaagagaa 38431006  T
Q  253 acaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca-----ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 346  Q
    || |||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||      || ||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  38431007 actattgtggaagg-tttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattacgttacggcgtaatttgatccatgtagtcgacccca 38431105  T
Q  347 cttagtgggataaggcttggttgt 370  Q
    || ||| |||| ||||||||||||    
T  38431106 ctaagtaggatgaggcttggttgt 38431129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 233 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 52156227 - 52156082
Alignment:
Q  233 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 332  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52156227 ctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatctgatcca 52156128  T
Q  333 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52156127 tgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttg 52156082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 48734481 - 48734147
Alignment:
Q  28 ttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 127  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |  |||| ||||| ||||||||||||||||||| |  |  ||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  48734481 ttgcgttggatgagtggtaaaactaggcgggataagattatgaatgacaccattagagagtg--ttggggtagcgcgtatagtagaacagatggtagaaa 48734384  T
Q  128 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||   ||| |  | ||||||||||||||    
T  48734383 ataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaactgtagaggctgtagtacgaagagtagatcagatggagattagttagatcaaaagaggtagagg 48734284  T
Q  228 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 327  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||            |||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||||||| | |||    
T  48734283 aaggccttgaaaaactattagagaa------------gatttaaaggtcaacgagttgggtccaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaagttg 48734196  T
Q  328 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48734195 atccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 48734147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 366
Target Start/End: Original strand, 19736918 - 19737255
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt-gtgggtagcacctatagtagaa 114  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  19736918 gagatgatgatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaa 19737017  T
Q  115 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 214  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  || |     
T  19737018 aagatggtagaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagt-tagatc 19737116  T
Q  215 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 314  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||            |||||||| | |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||| |    
T  19737117 aaaaaggttgaggaagacctagaaaaactattag-gaaa-----------tatttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgataaaacatt 19737204  T
Q  315 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 366  Q
    ||||  | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19737205 atggtataatttgatccatgtag-cgaccccacttagtgggataaggcttgg 19737255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 366
Target Start/End: Original strand, 19757829 - 19758158
Alignment:
Q  24 gatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt-gtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||  |||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19757829 gatgttgtgttggatgagtggtaagactacacgagatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaaaagatggt 19757928  T
Q  123 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggt 222  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  || | ||| ||||    
T  19757929 agaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagt-tagatcaaaaaggt 19758027  T
Q  223 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 322  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||            |||||||| | |||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| |||||  |     
T  19758028 agaggaagacctagaaaaactattag-gaaa-----------tatttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgatagaacattatggtata 19758115  T
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 366  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19758116 atttgatccatgtag-cgaccccacttagtgggataaggcttgg 19758158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 38060419 - 38060580
Alignment:
Q  82 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||    
T  38060419 agagagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgccgtcgtaa 38060518  T
Q  182 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaact 243  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  38060519 gaagagtagattaaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagagggagacctaggaaaact 38060580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 48953697 - 48953454
Alignment:
Q  101 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa-gactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||| |||  | ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  48953697 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataaacttagatgatttgggcatgtaaagagaaagacccgcagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatgg 48953598  T
Q  200 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagga--tttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 297  Q
    |||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| |  | || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  48953597 aggagagtcgggtcaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactataagagaaatcattaaaaagaacttataaaggtcaatgagttggatccaaatatg 48953498  T
Q  298 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 341  Q
     | ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  48953497 atttatgatagaacactatgacgtaatttaatccatgtagccga 48953454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Original strand, 39235154 - 39235409
Alignment:
Q  110 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  39235154 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatggaggaaagtca 39235253  T
Q  210 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 309  Q
      | |||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  39235254 gatcaaaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataggataaactattaggaaagatttagaagttaatgagttggatctaaatatggtttacgataga 39235353  T
Q  310 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggt 367  Q
    ||| |||| ||| | ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  39235354 acattatgtcgtga-ttgatccatgtagccga-ccctcttagtaggataaggcttggt 39235409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 375
Target Start/End: Original strand, 26490239 - 26490596
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||||| ||||||  ||||||| ||||  |   ||||||||||||||||||||    
T  26490239 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacaagacgggatatgattagcaatgacgtcattagacagag--ttgaggtagcacctatagtagaaa 26490336  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||   | |||| ||| ||| ||||||| ||||| || ||||||| |||  |||     
T  26490337 agatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagataaaagaccgttggatgttgtagtacgaagagtagatcagatagaggagaatcatattag 26490436  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    | |||| || ||||||  ||| |||||||  |||||||| |||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||| || | |   |||||| | ||    
T  26490437 atgaggcagtggaagatatagaaaaactagaagagaaactattagaaaagatttagagactaatgagtttgatccaaatgtgatttcatatagaatatta 26490536  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||    
T  26490537 tggcgtaatttgatccatatagtcgatcccacttagtaagataagacttgattgttgttg 26490596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 98 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 42510292 - 42510014
Alignment:
Q  98 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaat 197  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||   |||||  ||||||||| ||||| ||||| ||    
T  42510292 tagcacctatagtagaaaagatagtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagaga--agacctatagattttgtggtaaggagagtagatcagat 42510195  T
Q  198 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 297  Q
    |||||| |||||  | |  ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | ||||||||||| | |||| ||    
T  42510194 ggaggatagtcagatcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactatcagagaaaccattaggaaagatttggaaataaatgagttggaccaaaatatg 42510095  T
Q  298 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    || |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  42510094 gtttatgattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagagggaaaaggcttggctgttgttgttg 42510014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 312
Target Start/End: Original strand, 27917490 - 27917788
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||  ||||||||||||| |||||||||| ||  |  |||||||||||||||||    
T  27917490 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagcctagacgagatttgattaggaatgaccccattagagaaag--ttggggtagcacctatagta 27917587  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  |||| | |||||||||||||| | |||      
T  27917588 gaaaagatggtaggaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacttgtagatgttgtattagaaagaatagatcaaatggaggacaatcaga 27917687  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    | | || ||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| |||||| |||||  |||| |||   ||||||| |||| |||| || ||||||||    
T  27917688 tcataataggtagacgaagacctataaaaactataagagagacaactagaaaagattttaaggttaattcattggatctaaatatggtttacgatagaac 27917787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 238 - 376
Target Start/End: Original strand, 38060858 - 38060996
Alignment:
Q  238 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 337  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38060858 aaaactattagagaaaccattagaaaggttttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaccatggcgtaatttgatccatgtag 38060957  T
Q  338 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  38060958 ccgaccccacttagtgggataagaattggttgttgttgt 38060996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 272 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 47555436 - 47555330
Alignment:
Q  272 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47555436 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 47555337  T
Q  372 gttgttg 378  Q
    |||||||    
T  47555336 gttgttg 47555330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 248 - 378
Target Start/End: Original strand, 53262295 - 53262425
Alignment:
Q  248 gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccac 347  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  53262295 gagaaaccattagaagagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccac 53262394  T
Q  348 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53262395 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 53262425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 299
Target Start/End: Original strand, 3186707 - 3186973
Alignment:
Q  32 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 131  Q
    |||||||||| ||||||| | | |  |||| ||||||||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3186707 gttggatgagcggtaagacttggcgggataagattaggaatgacaccattatggaaagagtggtggtagcacctatagtgggaaagttggtagaaaatag 3186806  T
Q  132 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 231  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||   | ||||||| | | ||||| || ||| | ||||| || ||||||||| ||| || |    
T  3186807 gc-tagatgatttgggcatgtagagagaagatttgtagatgtcattgtaagaaaaatagatcagattgagaaaagtcaggtcaaaagaggtggagaaata 3186905  T
Q  232 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 299  Q
    |||| ||||||||| ||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3186906 cctaagaaaactataagaaaaatcattagaaagaatttaaaggtcaatgagttagatccaaatatggt 3186973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31454537 - 31454224
Alignment:
Q  64 attaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||     
T  31454537 attagaaatgacaacattagagagagtgt-tggttagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttgg-tggtttgtgcatgtagagagaagaa 31454440  T
Q  164 tagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt--taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattaga 261  Q
      |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||| |  | | ||| |||| ||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||      
T  31454439 atgcggattctgtagttaggagagtagatcagatggaggggagtcaaatctttagagatgtaggggatgacctagaaaaactataagggaaactattaat 31454340  T
Q  262 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagg 361  Q
     ||||| ||||  | ||||| |||||   | |  |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  31454339 taggatctagatattaatgaattggagaaagacatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatttagccgaccccacttagtgggataagg 31454240  T
Q  362 cttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||||||||||    
T  31454239 cttggttgttgttgtt 31454224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 54365268 - 54364976
Alignment:
Q  84 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga--agactagtagatgctgtggtaa 181  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  | ||  |||||| || |  |||    
T  54365268 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggcggaaaatag-cttaggtggtttgggcatgtagagagagaatacctgtagattctattataa 54365170  T
Q  182 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 281  Q
    | ||||| ||||||||| |||| |||||    |  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||| | ||||     
T  54365169 ggagagtagatcaaatgaaggatagtcagaccacgagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgt 54365070  T
Q  282 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||| || | |||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  54365069 gttagaccaaaatatggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccacac-tagtgggataaggcttggctgttgttgt 54364976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 82 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30294418 - 30294125
Alignment:
Q  82 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat---gtagagagaagactagtagatgctgtgg 178  Q
    |||||||||| | | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||    |    
T  30294418 agagagagagagagagtagcacatatactaaaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgagcatattgtagagagaagacttgtagatgccaccg 30294319  T
Q  179 taagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaa 278  Q
    ||||||||||  || | ||  |||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  30294318 taagaagagtaaattagattaaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctagaagaactataagataaactattaaaaaagatttataggtcaa 30294219  T
Q  279 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||||||| || | || | ||||||| |||||||||||   ||||| || ||||| || | |  ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30294218 tgagttggatctaagtatgatttatgataaaacactatggc--aatttgttctatgtaaccaaccttacttagtgggataaaacttggttgttgtt 30294125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 239 - 376
Target Start/End: Original strand, 49042081 - 49042219
Alignment:
Q  239 aaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt-atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 337  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49042081 aaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggttttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtag 49042180  T
Q  338 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  49042181 ccgaccccacttggtgagataaggcttggttgttgttgt 49042219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 54425289 - 54424959
Alignment:
Q  58 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 157  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| || || || ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||| ||    
T  54425289 gataggattatgaatgacaccattaggaagagagtgagg-tatcatctataatagaaaagtttgtagaaaatagacttagaagatttgaacatgtaggga 54425191  T
Q  158 gaagactagtagatgctgtggtaagaag-------agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 250  Q
    ||||||  | |||||| || ||||| ||       ||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  54425190 gaagacctgcagatgccgttgtaagtaggatttagagtagatcagatggaggagattcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaagaaagctataagag 54425091  T
Q  251 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt------catttgatccatgtagccgatcc 344  Q
      || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| | |       ||||||||||| |||| || ||    
T  54425090 ggaccattaaaaaggatttagaggtcaatgggttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgacataatttcaatttgatccatctagctgaccc 54424991  T
Q  345 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||| | ||||| || |||||||    
T  54424990 cacttagtgggatgatgcttgattattgttgt 54424959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 265 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 311420 - 311307
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  311420 gatttagaggtcaattagttggatccagatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 311321  T
Q  365 ggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||    
T  311320 ggttgttgttgttg 311307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 287 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7895969 - 7895878
Alignment:
Q  287 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7895969 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 7895878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 52679154 - 52678892
Alignment:
Q  70 aatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagt 167  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||   ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  52679154 aatgacaccattagaaagagagagtggaaatagcatctatagcagaaaagttggaagaaaataggctctggtgatttggacatgtagagagaagacttgt 52679055  T
Q  168 agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggat 267  Q
    |||||   ||||||||| | | ||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||  || |||    
T  52679054 agatg--ttggtaagaaaaatagatcggatggaggagagtcgggttaaaagatgtagaagaagacctaggaaaacta--agagaaactattatgaaagat 52678959  T
Q  268 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatg 334  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| || |  |||||| || | ||| |||| ||||||||||||    
T  52678958 ttagaggttaatgagttgaattcaaatatgattcatgatataatattatagcgtaatttgatccatg 52678892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 263 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2133725 - 2133610
Alignment:
Q  263 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc 362  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  2133725 aggatgtagaggtcaatgagttgaatccaaatatagtttatgatagaacactatggcgtgatttgatccatgtactcgaccccacttagtgggataaggc 2133626  T
Q  363 ttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||    
T  2133625 ttggttgttgttgttg 2133610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 228 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17022820 - 17022684
Alignment:
Q  228 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | ||||| |||||||     
T  17022820 aagacctaggaaagctattagagaaaccattaaaaaggaattagaggtcaatgagttggatccaattttagtttatgatagaatattatggtgtcattta 17022721  T
Q  328 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    || ||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  17022720 attcatgtagccgacctcatttagtgggataaggctt 17022684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 288 - 378
Target Start/End: Original strand, 48532151 - 48532242
Alignment:
Q  288 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca-tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48532151 tccaaattttgtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 48532242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 247 - 376
Target Start/End: Original strand, 15296060 - 15296189
Alignment:
Q  247 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 346  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| || | |  ||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  15296060 agagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaatatgatttcggatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgacccca 15296159  T
Q  347 cttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15296160 cttagtgggataaggcttggttgttgttgt 15296189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 373
Target Start/End: Original strand, 49841529 - 49841895
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--------tagcac 103  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||  | || |||||| ||||||| |||||| ||||||| || ||        ||||||    
T  49841529 agcatagatgaggatgttgtgttggatgtgtagtaagactagacgaggtaagattagaaatgacaacattagtgagagagagttggggtagccgtagcac 49841628  T
Q  104 ctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 203  Q
    ||||| |||||||| |||| |||| ||| || || |||||||||| |||||||||||||| | |   | || | ||||| |||||  |||| ||| |||     
T  49841629 ctatattagaaaagatggtggaaactagactaaggtggtttgggcgtgtagagagaagac-attgacttctttagtaaggagagtaaatcagatgaaggg 49841727  T
Q  204 gagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtat 303  Q
     |||||| |||  |||||||||||||||||   |||||  || |||||||| ||||  || ||| || || | ||||||||||||| |||| |||| |||    
T  49841728 tagtcaaattactagaggtagaggaagacca--gaaaaaaataagagaaactattaacaaagatctaaagattaatgagttggatcgaaatatggtatat 49841825  T
Q  304 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||| | | |||||||||||||||||    
T  49841826 gatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccacatagcgaggtaaggcttggttgttgt 49841895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19162842 - 19162650
Alignment:
Q  119 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 218  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| || | ||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  19162842 tggtagaaaaaag-cttaggtggtttggacacgcagatagaa-acttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatgaaggagagtcaggtcaaaag 19162745  T
Q  219 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 314  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||  |||||||||||||    
T  19162744 agttagaggaagacctaggaaatctataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatgcaagtatggt-aatgatagaacact 19162650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 303 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31566234 - 31566161
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31566234 tgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31566161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2341074 - 2340717
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| | ||  ||||||||||  | |||||||    
T  2341074 gagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagacatgatagaattagaaatgaaaacattagagagggtgttggggtagcaccattcgtagaaa 2340975  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga-ctagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 214  Q
    || |||| ||||||   ||||  ||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||  ||| ||    ||||| || ||||| ||||  |||||| | |    
T  2340974 agatggtggaaaatcatcttacgtggtttgagcatgtagagaaaagatcta-tagattatgtagt---gagagtagagcaaatagagggtagtcaaatca 2340879  T
Q  215 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 314  Q
      | || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||| |||        || | |||||||||||| |    
T  2340878 ctaaagctagagaaagacctaggaaaactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagtcggagagggtaatgatatatgatagaacatt 2340779  T
Q  315 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| | |||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  2340778 atggcgttgtttgatccatgaagccaaccccacttagttgtataaggattggttgttgttgt 2340717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40273278 - 40273203
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  40273278 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggtttggttgttgttgttg 40273203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 359
Target Start/End: Original strand, 37351418 - 37351672
Alignment:
Q  105 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||   |||||||||||||| |||||||| |  ||  |||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |    
T  37351418 tatagtagaaaagatggtagaaactagacttgagtggtttgggcatgtggagagaagtcatgtgaatgcggtagtaaggagagtagatcagatggaaggg 37351517  T
Q  205 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 304  Q
    || ||| | |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || ||| ||||| | |||||| ||||   | || |||| | ||    
T  37351518 aggcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactattagagaaacaatcaagaaagatctagagattaatgagatggagaaagatatggtttttg 37351617  T
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 359  Q
     |||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37351618 ttagaacactacgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggaataa 37351672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 281 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 30797917 - 30797822
Alignment:
Q  281 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30797917 agttggatccaaatttagtttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgtaaccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgt 30797822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 277 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40106719 - 40106620
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40106719 aatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacataatttgatcaatgtagtggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40106620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 311 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45834665 - 45834598
Alignment:
Q  311 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45834665 cactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 45834598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 228 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 45487000 - 45486848
Alignment:
Q  228 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt---tggtgtatgatagaacactatggcgtcat 324  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || || || ||| | ||||| ||||| ||||||    |||| |||||||||||| |||||| | ||    
T  45487000 aagacctagaaaaactataagagaaactattatgaaagactttgagattaatgacttggaaccaaataatatggtttatgatagaacattatggcataat 45486901  T
Q  325 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45486900 ttgatccatgtagccggccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 45486848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 236
Target Start/End: Original strand, 50249303 - 50249529
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggat---taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtag 112  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||  ||||||||   ||| ||||| | |||||||||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  50249303 gagatgatgatgtttcgttggatgtgtggtaggactagacgagataggatgattagaaatgataacattagagagagagttggggtagcgcgtatagtag 50249402  T
Q  113 aaaagttggtagaaaataggctta---gatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
    ||||| |||| |||| ||| ||||   | |||||||||||||||||| ||||||  |||||| || | ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  50249403 aaaagatggtggaaactagacttaggtggtggtttgggcatgtagagtgaagacatgtagattctttagtaaggagagtagatcagatgggggatagtca 50249502  T
Q  210 agttaaaagaggtagaggaagacctag 236  Q
      | |  ||||||||||||||||||||    
T  50249503 tatcaccagaggtagaggaagacctag 50249529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 345065 - 344928
Alignment:
Q  22 aggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttgg 121  Q
    ||||||||  |||||||  ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||     
T  345065 aggatgttatgttggatttgtggtaagactagacgagataggattagaaatgatgacattagagagagagttggggtagcacttatagtagaaaagatgt 344966  T
Q  122 tagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga 159  Q
    |||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  344965 tagaaaataggcttaagtagtttggtcatgtagagaga 344928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 378
Target Start/End: Original strand, 29601063 - 29601176
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||| | || |||||||||||| ||||  || |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  29601063 gatttagagattaatgagttggattcaaatatagtttatgatagaacattatgatgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggatacggctt 29601162  T
Q  365 ggttgttgttgttg 378  Q
    |||| |||||||||    
T  29601163 ggttcttgttgttg 29601176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 376
Target Start/End: Original strand, 36303994 - 36304248
Alignment:
Q  109 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 208  Q
    ||||||||| |||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||| | ||||| || ||||  ||||    
T  36303994 gtagaaaagatggtggaaactagg-ttagatgggttgggcatgtagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagaatagatcagatagagggtagtc 36304092  T
Q  209 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 308  Q
    |  |||  ||||| ||  | |||||||| ||||||||||           |||||| || ||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  36304093 agattactagaggcagttgtagacctagtaaaactatta-----------agaaag-atctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatag 36304180  T
Q  309 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | || || |||||| ||||||||||||    
T  36304181 gacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactcaatgtgacaaggctcggttgttgttgt 36304248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 277 - 378
Target Start/End: Original strand, 39208791 - 39208892
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||  || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39208791 aatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagaggaccccagttagtgggatatggcttggttgttgttgt 39208890  T
Q  377 tg 378  Q
    ||    
T  39208891 tg 39208892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 308 - 373
Target Start/End: Original strand, 41529975 - 41530040
Alignment:
Q  308 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41529975 gaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 41530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 218 - 378
Target Start/End: Original strand, 27893213 - 27893373
Alignment:
Q  218 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 317  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||  ||||| | |||||||||||   | |  || | | ||| |||||||||||    
T  27893213 gaggtagaggaagacctagaaagactataagagaaactattaaaaaggacctagagattaatgagttggagaaagacatgatttttgaaagaacactatg 27893312  T
Q  318 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  27893313 gcattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggctttgttgatgctgttg 27893373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 36820323 - 36820174
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||  |||||  |||||||||||||| ||    
T  36820323 agcaaagataaggttgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgagataggattagaaatgacgacattagag--agagttggggtagcacctatatta 36820226  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    | |||| |||| |||| ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||    
T  36820225 gcaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttagacatgtaaagagaagac 36820174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 301 - 377
Target Start/End: Original strand, 46148235 - 46148311
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  46148235 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggtcaaggcttggttgttgttgtt 46148311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 335
Target Start/End: Original strand, 21200551 - 21200787
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||| ||||| |||||    
T  21200551 gggtagcaccta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgcagtaaggagagtagatca 21200648  T
Q  195 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac-aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 293  Q
     ||||||   |||||| | |  || || |||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||  | ||||||||||||  |||    
T  21200649 catggagagtagtcaaatcactagggggagaggaagacctagaaaaactattagacaaactatttagaaa-gatctagatattaatgagttggatagaaa 21200747  T
Q  294 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 335  Q
    | ||  |||| ||||| || ||||||||| |||||| |||||    
T  21200748 tatg--gtattatagagcattatggcgtcgtttgatgcatgt 21200787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 287 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 33271999 - 33271908
Alignment:
Q  287 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||| |  ||||| |||| |||||||||||||    
T  33271999 atccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatctatgtagccaaccccacttaataagataaagcttagttgttgttgttg 33271908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 91
Target Start/End: Original strand, 38850012 - 38850091
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 91  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38850012 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtagtaagactagacatgatatgattaggaatgacatcatgagagagagag 38850091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 283 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45374570 - 45374475
Alignment:
Q  283 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||| | |||| |  ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45374570 ttggatccaactatggtttcggatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 45374475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 288 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 52927936 - 52927846
Alignment:
Q  288 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| |||| || || |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52927936 tccaaatatggtttacgacagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgatgttg 52927846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 171
Target Start/End: Original strand, 3987011 - 3987124
Alignment:
Q  58 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 157  Q
    ||||| ||||| ||||||   ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  3987011 gatagaattagaaatgacgatattggagagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagaga 3987110  T
Q  158 gaagactagtagat 171  Q
    ||||||| ||||||    
T  3987111 gaagactggtagat 3987124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 303 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24778682 - 24778609
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24778682 tgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggctgttgttgt 24778609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 265 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 40116449 - 40116348
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  40116449 gatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgacctcgcttagtgggataaggctt 40116350  T
Q  365 gg 366  Q
    ||    
T  40116349 gg 40116348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41842806 - 41842678
Alignment:
Q  80 ttagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggt 179  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||| ||    
T  41842806 ttagagagaaagt-tgggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaccagtcttaggtggtttgggtatgtagagagaagagcggtagattctgtagt 41842708  T
Q  180 aagaagagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
    ||  ||||| |||||||||||||| |||||    
T  41842707 aatgagagtagatcaaatggaggatagtca 41842678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 374
Target Start/End: Original strand, 659541 - 659805
Alignment:
Q  110 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
    |||||||| | ||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||||| || || | ||||   ||| |    
T  659541 tagaaaagatagtagaaacttagcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaatttgtagattctgtagtaagcagagttgaccagagggagagtagtga 659640  T
Q  210 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 309  Q
    | | |  ||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||| || |  | | ||||| || | ||||||||||||    || |  | |||||||||    
T  659641 aatcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactgtaagagaaaccatcaagatgtatttacagattaatgagttggatagggatattatatatgataga 659740  T
Q  310 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||| ||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  659741 acattatggcagtgtttgatccatgtagccgaccccacttagtggggtaaggcttggttgttgtt 659805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 301 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 37083367 - 37083291
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37083367 tatgatcgaacattatggcgtaatttggtccttgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 37083291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 46432031 - 46431684
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||  ||| ||| |||   |  ||||||| | | | |||||||    
T  46432031 gagatggggatgttgcattggatgtgtggtaagactagacaggatagggttagaaatgactacatcagatagac--ttggggtagcgcttcttgtagaaa 46431934  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||    | |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||  ||   |||||| |||| ||||| ||||| ||| | |||||||| | |||| | |     
T  46431933 agacaatggaaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagag--gatctgtagattctgtagtaaggagagtagataagatggaggatactcaaatcac 46431836  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
     ||||| |||| |    |||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||| | ||||||||||||  | || |  | |||||| ||||| |     
T  46431835 tagaggcagagaa----ctagaaaaactataagagaaactattaaaaaagatctagagattaatgagttggatagagatattatatatgatggaacattg 46431740  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 371  Q
     |||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431739 aggcgtcgtttgatccatgtcgccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 46431684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 277 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 14415358 - 14415260
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||| ||| || |||| ||||||| |||| |||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14415358 aatgagttggacccacatatggtttatgatataacattatggcataatttgatc-atgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 14415260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 23534929 - 23534576
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  || ||| | ||||   |||| |||||| |||||||  |||||||||||  || ||||||||  ||||||| |||    
T  23534929 gagaagaggatgttgcgttagatgtttgataaaactagatcagataagattagaaatgacaatattagagagagt-tgggggtagcatttatagtaaaaa 23534831  T
Q  116 agttggtagaaaatag--gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 213  Q
    || ||||||| ||||   |||||||||||||||  |||||||||  ||||  || | |  ||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||| |  |     
T  23534830 agatggtagataatataagcttagatggtttggatatgtagaga--agacccgtgggttatgtagtaaggagagtagatcagatggatgatagttagatc 23534733  T
Q  214 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 313  Q
    |  ||||||||||||||||| |  |||| ||| | |||||| ||||| || || |||||| | |||||||||||    ||| || | ||||||||||||     
T  23534732 actagaggtagaggaagacccaaaaaaattataacagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggactgtaatatgatttatgatagaacat 23534633  T
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 371  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  23534632 tatggcgtaatttgatccatgtagtcgacctcactttgt-ggataaggcttggttgtt 23534576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 277 - 376
Target Start/End: Original strand, 40991614 - 40991713
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  40991614 aatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataagacttggctgttgttgt 40991713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 376
Target Start/End: Original strand, 11284120 - 11284270
Alignment:
Q  221 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||     ||| ||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||| ||| ||     
T  11284120 gtagaggaagacctag-aaaactataagagaaactattaa----gatgtagagattaatgagttggatataaatatggtatatgattgaacattattgca 11284214  T
Q  321 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    || |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11284215 tcgtttgatccatgtagccaaccccgcttagtgagataaggcttgcttgttgttgt 11284270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 287 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24541421 - 24541343
Alignment:
Q  287 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 365  Q
    |||||||| |||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24541421 atccaaatatggtttaggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccacttagtgggataaggcttg 24541343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 48712173 - 48712075
Alignment:
Q  278 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| |||| | | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48712173 atgagttggattcaaatatggtttatgatataacattatgacattatttcatccatgtagttgatcccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 48712075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 259
Target Start/End: Original strand, 11581432 - 11581609
Alignment:
Q  82 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 181  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||  ||  ||| ||||    
T  11581432 agagagagagttagggtagaacctacaatagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggtatgtagagagaagacatgtgaattatgtagtaa 11581531  T
Q  182 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta 259  Q
    |||||||  |||| ||| ||| ||||||| | |  |||||||   |||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  11581532 gaagagtacatcagatgtaggtgagtcaaatcactagaggtatgagaagacctagaaaaactataagagaaactatta 11581609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42026817 - 42026536
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
    |||||||||  | ||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||  | | ||||| ||||| |||||    
T  42026817 gggtagcactcacagtagaaaagagggtggaaactaggcttaggtggtttgagcttgtagagagaaaacttgtagattatttagtaaggagagtagatca 42026718  T
Q  195 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 294  Q
     | |||||| | |||  |    ||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||||| ||||  |  ||| ||| | | |||||||| |||  ||||    
T  42026717 gacggaggataatcacatccctagaggcagaggaagaccaatcaaagctataagagaaactattaagattgatatagggattaatgagttagatagaaat 42026618  T
Q  295 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
     |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||||| ||||||| |||||||    
T  42026617 atggtatatgatagaacattatggcgttatttgattcatttagccgaccccacatactgtgataagacttggttcttgttgt 42026536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 217 - 376
Target Start/End: Original strand, 29475811 - 29475968
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||  ||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  |||| | || |||||||||| |||||    
T  29475811 agaggcagaggaagacctagaaaagctataaga--aactattaagaaagatctagagattaatgagttggattgaaatattgtttatgatagaaaactat 29475908  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| |  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29475909 ggcgtaatttgacccatctagccaactccagttagtgggataaggtttggttgttgttgt 29475968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 217 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41482298 - 41482141
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactatta-gagaaacaattagaaagga-tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 314  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| ||| | ||||||||| | | |||| |||| |||||||||||| |    
T  41482298 agaggcagaggaagacctagaaaaacttttaagagaaactattaggaaagactttggagattaatgagttgaaccaaaatctggtttatgatagaacatt 41482199  T
Q  315 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| ||||||||      ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41482198 atggcgtaatttgatc------gccaaccccacttggtgggataaggcttggttgttgttgttg 41482141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 305 - 376
Target Start/End: Original strand, 7278675 - 7278746
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  7278675 atagaacattataacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttagttgttgttgt 7278746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 304 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21862813 - 21862742
Alignment:
Q  304 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21862813 gatagaagaatatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgcttgttgttg 21862742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 31337884 - 31337751
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||   ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31337884 gagataaggatcttgtgttggatgtgtgataagactagatgggataggattaa-aatgacagcattagagagaaagt-tgggtagcacctatagtagaaa 31337787  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatg 151  Q
    || |||| |||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  31337786 agatggttgaaactaggcttaagtggtttgagcatg 31337751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 52882724 - 52882662
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52882724 tatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggagaaggcttggttgttgttgt 52882662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 388337 - 388260
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  388337 tatgatagagcattatgacgtaatttgatcaatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtcgttgttg 388260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 162
Target Start/End: Original strand, 29600863 - 29600968
Alignment:
Q  58 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctt-agatggtttgggcatgtagag 156  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    ||| | | ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29600863 gatatgattagaaatgacaacattagagagagagttgtcgtaacgcttatagtaaaaaagatggtagaaaataggttttagatggtttgggcatgtagag 29600962  T
Q  157 agaaga 162  Q
    ||||||    
T  29600963 agaaga 29600968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Original strand, 31146907 - 31146983
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31146907 tatgataaaaca-tatggtgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttg 31146983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 377
Target Start/End: Original strand, 39512777 - 39512826
Alignment:
Q  328 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39512777 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 39512826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 284 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 39782009 - 39781917
Alignment:
Q  284 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| || |||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39782009 tggatccaaatacggtttatgataga-cattatggcgtaatttgatcaatgtggccgaccccactcagtgggataaggcttgggtgttgttgtt 39781917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 314 - 375
Target Start/End: Original strand, 45468795 - 45468856
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45468795 tatggcgtcgtttgatctatgtaaccgatcccacttagtggaataaggcttggttgttgttg 45468856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 373
Target Start/End: Original strand, 32170592 - 32170684
Alignment:
Q  281 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    ||||||||  |||| |||| ||||||| |||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32170592 agttggatagaaatatggtctatgatataacattatgacataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaagcttggttgttgt 32170684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Original strand, 45236778 - 45236850
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 88  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  45236778 gagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacaccattagagaga 45236850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Original strand, 3987543 - 3987618
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3987543 tgataggacactatggcgttgtttgattcatgtacccgaccccactttgtgggataagacttggttgttgttgttg 3987618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Original strand, 20208207 - 20208282
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  20208207 tgatagaactttatggcatcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataacgcttggttaatgttgttg 20208282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 155
Target Start/End: Original strand, 29817422 - 29817565
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||  || | | |||||||||  ||||||||||||||   |||| | ||| |  | |||||||||||||||    
T  29817422 agcaaagatgaggatgttgcgttggataagtgacaaaactggacatgatataattaggaatgacactgatagaaatagaattggtgtagcacctatagta 29817521  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 155  Q
    |||||| | ||||||| || | |||| |||||||| ||||||||    
T  29817522 gaaaagattgtagaaagtaagtttaggtggtttggacatgtaga 29817565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 91
Target Start/End: Original strand, 30345445 - 30345520
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 91  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  30345445 gagatgaggatgttgtgttggatgagcggtaagattggacatgatagaattatgaatgacactatttaagagagag 30345520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 378
Target Start/End: Original strand, 35420455 - 35420552
Alignment:
Q  282 gttggatccaaatttggtgt--atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| |||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35420455 gttggatcgaaatatggtgtgcacgatagaacattatggcgtaatttggtccatgtagc-gaccccatttagtgggataaggcttggttgttattgttg 35420552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 373
Target Start/End: Original strand, 49045023 - 49045114
Alignment:
Q  282 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||| ||||||   |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  49045023 gttggatccaaatatagtttatgacagaacattatggccgaatttaatccatgtagccgaccccactcagtgggacaaggcttggttgttgt 49045114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 54422963 - 54422837
Alignment:
Q  256 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt------catttgatccatgtagccgatcccactt 349  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| | |       ||||||||||| |||| || |||||||    
T  54422963 attaaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgacataatttcaatttgatccatctagctgaccccactt 54422864  T
Q  350 agtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||| | ||||| || |||||||    
T  54422863 agtgggatgatgcttgattattgttgt 54422837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31453025 - 31452963
Alignment:
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31453025 actatggcgtcgtttgattcatgtagcagaccccacttagtggaataaggcttggttgttgtt 31452963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 40116619 - 40116505
Alignment:
Q  225 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 324  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| | |||||| ||    
T  40116619 aggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggatagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattgtggcgtaat 40116520  T
Q  325 ttgatccatgtagcc 339  Q
    | |||| | ||||||    
T  40116519 tcgatctacgtagcc 40116505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 50249607 - 50249661
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50249607 tttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggatacggcttggttgttgttgttg 50249661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 47542076 - 47542031
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47542076 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacat 47542031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 217 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 45493851 - 45493695
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    ||||| ||||| | ||||||  ||||||| | |||||| ||||  || |||  |||||| |||||| |||||  |||  |||| ||||||||| || |||    
T  45493851 agaggcagagggatacctagataaactataaaagaaactattaagaaagatccagaggttaatgagctggatagaaacatggtatatgatagagcattat 45493752  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||| ||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  45493751 ggcgccattcaatccatgtagccgaccccacttagtaggataaagcgtggttgttgt 45493695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 46367462 - 46367390
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  46367462 tatgatagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagcctaccccacttaattggataaagcttggttgttgt 46367390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 53214931 - 53214871
Alignment:
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53214931 tggcgtaatttgatccatgcagccgaccccatttagtcggataaggcttggttgttgttgt 53214871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 282 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 4472481 - 4472386
Alignment:
Q  282 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||   ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  4472481 gttggattcaaatatgatttataatagaacactatggtgtaacttgatccatgtagccgactacacttagttcgataaagcttggttgttgttgtt 4472386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30332633 - 30332558
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||| | |||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30332633 tgatagaacattatggcataatttgatccaggcagcctaccccacctagtgggatacggcttggttgttgttgttg 30332558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 91
Target Start/End: Original strand, 46568034 - 46568113
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 91  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  46568034 agcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtgttaagactagaccagattgaattagaaatgacaacattagagagagag 46568113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21427644 - 21427586
Alignment:
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21427644 tggcgtcgtttgatccatgtagtcaatcctacttagtgggataagacttggttgttgtt 21427586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 379
Target Start/End: Original strand, 48259947 - 48259989
Alignment:
Q  337 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48259947 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 48259989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 48953756 - 48953694
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacacc 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||    
T  48953756 gagatgaggatgttgcgttggatgagcggtaagattggatgagataggattaagaatgacacc 48953694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 287
Target Start/End: Original strand, 26990337 - 26990406
Alignment:
Q  218 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 287  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  26990337 gaggtaggggaagacctagaaaaactattagagaaactatcaagaaggatctagagatcaatgagttgga 26990406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31261040 - 31260964
Alignment:
Q  302 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31261040 atgatagaacactgtgacatcatttgattcatgc-gccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgtttttgttgc 31260964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 374
Target Start/End: Original strand, 35481143 - 35481208
Alignment:
Q  309 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35481143 aacattatgacgtaatttgattcatttagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgtt 35481208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39535475 - 39535399
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| ||||| | | ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39535475 tatgatagaacattatggtggcgtttgatccatgtaaccgg-cccacttagtgggataaagcatggttgttgttgttg 39535399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 44103002 - 44102953
Alignment:
Q  330 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44103002 ccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttattgc 44102953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 374
Target Start/End: Original strand, 49888402 - 49888467
Alignment:
Q  309 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  49888402 aacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagttggaaaaggtttggttgttgtt 49888467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 344834 - 344770
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| || |||| ||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  344834 tatggtgtaatttcatcgatgtagccgacccaacttagtaggataaggcttggttgttgttgttg 344770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 31453242 - 31453151
Alignment:
Q  72 tgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta-gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  31453242 tgacaacattaga-agagagttggggcagcacctatagtaagaaaagatggtagaaactagacttaggttgttttggcatgtagagagaagac 31453151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34844721 - 34844569
Alignment:
Q  228 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 327  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  | || ||| | |||||| |||| |  |||   || |||||||||||| |||||  | || ||    
T  34844721 aagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaaacttggagattaatgaggtggaccagaatactgtttatgatagaacattatggtataatatg 34844622  T
Q  328 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc-ttggttgttgttgttgc 379  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  34844621 atccatgtagccgaccccactaagtaggataaggctttggttgttattgttgc 34844569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 378
Target Start/End: Original strand, 35701093 - 35701133
Alignment:
Q  338 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35701093 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 35701133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 38054696 - 38054624
Alignment:
Q  17 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 89  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  38054696 agatgagaatgttgcgttgaatgggtggtaagactagacgggataggattagaaatgataacattagagagag 38054624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 49933492 - 49933436
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgca 380  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  49933492 tttggtccatgtagccgacctcacttagtgggataaagcttgattgttgttgttgca 49933436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 376
Target Start/End: Original strand, 7120790 - 7120865
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||| || | |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7120790 tatgataaaatattatgacgtaatttgatccatataaccgataccacttagtgggatatggcctggttgttgttgt 7120865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23610965 - 23610930
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23610965 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 23610930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 337 - 376
Target Start/End: Original strand, 27192466 - 27192505
Alignment:
Q  337 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27192466 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 27192505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35032811 - 35032764
Alignment:
Q  331 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  35032811 catgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttattgatgttg 35032764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 277 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 36049401 - 36049309
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 371  Q
    ||||| ||||||| |||| |||  ||||||  |||||||| |||| |||||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36049401 aatgaattggatcaaaatatggcctatgattaaacactatagcgtaatttgat--atgtagccggccccacttagtgggatagggcttggttgtt 36049309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 37102870 - 37102807
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  37102870 tatggtgtaatttgatccatgtagcctaccccacttcgtgggataaggcatgtttgttgttgtt 37102807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40672429 - 40672366
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||| | |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  40672429 tatggcataatttgatccatgtagctgacctcacttagtgggataaggcttggttatagttgtt 40672366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 228 - 379
Target Start/End: Original strand, 43308696 - 43308847
Alignment:
Q  228 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 327  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| ||||  ||  || ||||| | ||| ||||||||  | || || | ||||||||||||  || ||| |  |||    
T  43308696 aagacctagaaaaactacaagagaaactattaagaaaaatctagagattaatcagttggatagagatatgatatatgatagaacataattgcgccggttg 43308795  T
Q  328 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43308796 atccatgtagccaaccccactttgtgggatgaggcttggtttttgttgttgc 43308847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Original strand, 43529295 - 43529330
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43529295 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 43529330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 237336 - 237294
Alignment:
Q  336 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  237336 agccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 237294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 371
Target Start/End: Original strand, 6988113 - 6988179
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 371  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  6988113 atagatcattatggcgtcatttgatcaatgtagccgactccttttagtgggataaggcttagttgtt 6988179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21428065 - 21427995
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  21428065 atagaacattatggcgtaatttgatccatgtagtcgactccatttattgggataaggattggtagttgttg 21427995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 153
Target Start/End: Original strand, 26388414 - 26388540
Alignment:
Q  27 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 126  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||    ||| |||||| ||| | ||||||||| | |||||   | | ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26388414 gttgcgttggatgtgtggttagactagattatatatgattagaaattaaaccattagacatagagttgagatggcacctataatagaaaagatggtagaa 26388513  T
Q  127 aataggcttagatggtttgggcatgta 153  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||    
T  26388514 aataggtttaggtgatttgggcatgta 26388540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34719155 - 34719081
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    ||||||||| || |||||| || |||||| | ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34719155 tatgatagagcattatggcttcgtttgattcttgtggctgaccccacttagggggataaggcttggttgttgttg 34719081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 37534483 - 37534429
Alignment:
Q  99 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgta 153  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37534483 agcaccgatagtagaaaagatggtggaaaataggcttacctggtttgggcatgta 37534429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 39535715 - 39535653
Alignment:
Q  101 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  39535715 cacctatagtagaaaagatggtagaaacccggcttaggtggtttaggcaagtagagagaagac 39535653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 378
Target Start/End: Original strand, 53266893 - 53266975
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| ||||||||||   ||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  53266893 tggtttatgatagaatgttatggtgtaatttaatccatgtagccgatctcacttagtgagataagggttggtggttattgttg 53266975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 378
Target Start/End: Original strand, 829149 - 829186
Alignment:
Q  341 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  829149 atcccacttagttggataaggcttggttgttgttgttg 829186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3870698 - 3870649
Alignment:
Q  122 tagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 171  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3870698 tagaaacttggcttagatggttttggcatgtagagagaagacttgtagat 3870649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 372
Target Start/End: Original strand, 8566670 - 8566711
Alignment:
Q  331 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8566670 catgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggttgttg 8566711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 373
Target Start/End: Original strand, 26990442 - 26990491
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26990442 tttgattcacgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgt 26990491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27796065 - 27795996
Alignment:
Q  291 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataag 360  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||||||| | |||||||    
T  27796065 aaatttggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatctatgtacccaaccccacttattaggataag 27795996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31337741 - 31337560
Alignment:
Q  190 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 289  Q
    ||||||||| |||  |||||||| |  ||||  ||||||| |||||| |||||||| | |||||| || |||||| || |||||    |||||||||||     
T  31337741 gatcaaatgaagggcagtcaagtgactagagtcagaggaaaacctagaaaaactataacagaaactataagaaag-atctagag----atgagttggata 31337647  T
Q  290 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
     |||| |||| | |||||||||| |||| | |  ||||||| || || |||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31337646 gaaatatggtatttgatagaacattatgacattgtttgatctatttaaccgacctcacttagtggtataaagcttggttgttgttgt 31337560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 115
Target Start/End: Original strand, 33307087 - 33307165
Alignment:
Q  35 ggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||||| || |||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33307087 ggatgtgtggtaagactaaacatgataagattagaaacgacaacatt--agagagagttggggtagcacctatagtagaaa 33307165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 372
Target Start/End: Original strand, 34253689 - 34253738
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  34253689 atttgatccatgtagccgaccccatttagtgggacagggcttggttgttg 34253738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 376
Target Start/End: Original strand, 35465758 - 35465811
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  35465758 atttgatccatgtagctgacctcacttaatgggataaggattggttgttgttgt 35465811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 41842630 - 41842529
Alignment:
Q  269 tagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 368  Q
    ||||||| |||||||| |||  |||| |||| | |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | | | || |||||| | ||||||||||||    
T  41842630 tagaggttaatgagttagattgaaatatggtttttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagtcaacctcatttagtgagctaaggcttggtt 41842531  T
Q  369 gt 370  Q
    ||    
T  41842530 gt 41842529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 373
Target Start/End: Original strand, 46140617 - 46140686
Alignment:
Q  304 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  46140617 gatagaacattatggagttgtttgatccatgtagtcgaccccactttgtgagataaggtttggttgttgt 46140686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 373
Target Start/End: Original strand, 54485767 - 54485816
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  54485767 tttgatctatgtagccgatcccgcctagtcggataaggcttggttgttgt 54485816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 364
Target Start/End: Original strand, 7942864 - 7942924
Alignment:
Q  304 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    ||||||||| ||||| ||  || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  7942864 gatagaacattatggtgttgttcgatccatgtagtcgataccacttagtgggataaggctt 7942924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 330 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24084368 - 24084320
Alignment:
Q  330 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24084368 ccatgtaaccgactccacttagtgggataaggtttggttgttgttgttg 24084320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 43396122 - 43396082
Alignment:
Q  336 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43396122 agccgaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 43396082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 52077509 - 52077473
Alignment:
Q  336 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52077509 agccgatcccacttagtgggacaaggcttggttgttg 52077473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 378
Target Start/End: Original strand, 7446274 - 7446329
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  7446274 atttgatccatgtagctgactccacttagtgggaaaaggctcggttgctgttgttg 7446329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 378
Target Start/End: Original strand, 7454416 - 7454471
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  7454416 atttgatccatgtagctgactccacttagtgggaaaaggctcggttgctgttgttg 7454471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Original strand, 21000720 - 21000755
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21000720 cccacttagtgggataaggtttggttgttgttgttg 21000755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Original strand, 36764934 - 36764969
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36764934 cccacttagtggtataaggcttggttgttgttgttg 36764969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 376
Target Start/End: Original strand, 40122645 - 40122696
Alignment:
Q  325 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  40122645 ttgatccatgtagccgaccccacttagttggataaaacttggttgtcgttgt 40122696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41230548 - 41230513
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41230548 cccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 41230513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 44134111 - 44134044
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 162  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||    
T  44134111 gggtagcgcctctagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttggacatctagatagaaga 44134044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 44443250 - 44443208
Alignment:
Q  331 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44443250 catgtagctgatcccactta-tgggataaggcttggttgttgtt 44443208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 48328231 - 48328200
Alignment:
Q  346 acttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48328231 acttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 48328200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 50631954 - 50631879
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||| |||| | |  |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  50631954 tgatagaacattatgccattgtttgattcatgcagccaaccccacttagtgggataaagattggttgttgttgttg 50631879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 377
Target Start/End: Original strand, 55244461 - 55244565
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag----ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||    || | ||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  55244461 aatgagttggatagaaatatggtatatgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgaagctgaccaaccccgcttagtgggataagacttggctgttg 55244560  T
Q  373 ttgtt 377  Q
     ||||    
T  55244561 ctgtt 55244565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 333 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 944501 - 944467
Alignment:
Q  333 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggt 367  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  944501 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggt 944467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 332 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4660211 - 4660165
Alignment:
Q  332 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4660211 atgtagccgactccaattagtggaataaggcttggttgttgttgttg 4660165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 377
Target Start/End: Original strand, 21506270 - 21506304
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21506270 cccacttagtgggatatggcttggttgttgttgtt 21506304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 332 - 378
Target Start/End: Original strand, 34067137 - 34067183
Alignment:
Q  332 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34067137 atgtagccaaccccacgtagtggaataaggcttggttgttgttgttg 34067183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 36868503 - 36868437
Alignment:
Q  97 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||| || | |||||||    
T  36868503 gtagcacctatggtagagaagatggtggaaagtaggcttaggtggtttgggcatatataaagaagac 36868437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37598245 - 37598171
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcc-cacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| | | || || |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37598245 tatgatagaacattatggcgtcatttgactcatgtagtcaaccctcatttagtgggataaagcttgattgttgtt 37598171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 42510375 - 42510333
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattaga 54  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  42510375 agcagagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactaga 42510333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 302 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 44133918 - 44133845
Alignment:
Q  302 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  44133918 atgatagagcattatggcgt-atttgatccatgtagtcgatcttatttagtggtataaagtttggttgttgttgt 44133845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 365
Target Start/End: Original strand, 53951956 - 53952026
Alignment:
Q  295 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 365  Q
    ||||| |||||||||| | || || | | |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  53951956 ttggtatatgatagaatattacggtgccgtttgatccatatagccgaccccacatagtgggataaggcttg 53952026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21513099 - 21513070
Alignment:
Q  348 ttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21513099 ttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 21513070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24103457 - 24103420
Alignment:
Q  320 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggat 357  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24103457 gtcatttgatccatgtaaccgatcccacttagagggat 24103420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 26874886 - 26874857
Alignment:
Q  348 ttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26874886 ttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 26874857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 32052472 - 32052395
Alignment:
Q  299 tgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||   | |||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||    
T  32052472 tgtatgatagaacattattgcgtcatttggtccatgtagttcaccccacttagcaggacaagacttggttggtgttgt 32052395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 378
Target Start/End: Original strand, 34812775 - 34812828
Alignment:
Q  325 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34812775 ttgatccatgtaactgactccacttagtgggataaagcttggttggtgttgttg 34812828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37103026 - 37102989
Alignment:
Q  332 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  37103026 atgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttg 37102989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 376
Target Start/End: Original strand, 41965819 - 41965860
Alignment:
Q  335 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41965819 tagccgactccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 41965860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 41971345 - 41971277
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 370  Q
    |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41971345 tatgatagaacattatgacgttgtttgatccatgtagccaactccacttagt-ggataaggctttgttgt 41971277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 47804738 - 47804666
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||| |||| ||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  47804738 tatgatagaacattatggcattgtttcatccttgttgccgatcccactttgtaggataa-gcttggttgttgtt 47804666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 376
Target Start/End: Original strand, 49090632 - 49090673
Alignment:
Q  335 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  49090632 tagccgaccccacttaatgggaaaaggcttggttgttgttgt 49090673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 50621720 - 50621647
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 89  Q
    |||||||| ||||||| || |||  ||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  50621720 gagatgagaatgttgcatttgatatgtggtaagactatgaatgataggattagaaatgacaacattagagagag 50621647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 53266871 - 53266818
Alignment:
Q  325 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||    
T  53266871 ttgatccatgtagccggtctcacttagtgagatgaggcttggtggttattgttg 53266818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 218)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 12 - 379
Target Start/End: Original strand, 37617862 - 37618230
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37617862 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 37617961  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaa-taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37617962 gaaaagttggtagaaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaa 37618061  T
Q  211 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37618062 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 37618161  T
Q  311 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37618162 cactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 37618230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 11593878 - 11594244
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11593878 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcacctatagta 11593977  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11593978 gaaaagttggtagaaaatacggttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 11594077  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11594078 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 11594177  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11594178 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 11594244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Original strand, 34869341 - 34869702
Alignment:
Q  15 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34869341 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaa 34869440  T
Q  115 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  34869441 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatccaatggtggagagtcaagtta 34869540  T
Q  215 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34869541 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 34869640  T
Q  315 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34869641 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccctaattagtgggataaggcttggttgttgttgt 34869702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12841639 - 12841273
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12841639 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaaaactagacatgataggattaggaatgaccccattagagagagagtggaggtagcacctatagta 12841540  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12841539 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 12841440  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12841439 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtatccaaatttggtttatgatagaac 12841340  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12841339 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12841273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 49029194 - 49029559
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49029194 agcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 49029293  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  49029294 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagacgaatagatcaaatggaggagagtcaag 49029393  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49029394 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 49029493  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  49029494 actatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggatacggc-tggttgttgttgttg 49029559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 35906565 - 35906208
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35906565 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagta 35906466  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  35906465 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcatatggaggagagtcaag 35906366  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35906365 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttcgaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 35906266  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35906265 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttg 35906208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39906730 - 39906370
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39906730 gagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaa 39906631  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  39906630 agttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccatagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggag--tcaagttaa 39906533  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39906532 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgacttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 39906433  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39906432 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 39906370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 33350170 - 33349804
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  33350170 agcagagatgaggatgttgccttggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagta 33350071  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33350070 gaaaagttgctagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 33349971  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  33349970 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatagtagaac 33349871  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33349870 actatagcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 33349804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 44855536 - 44855172
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  44855536 agcagagatcaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggatagtacctatagta 44855437  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44855436 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 44855337  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  44855336 ttaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgat--aac 44855239  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44855238 actatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 44855172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 46356219 - 46355858
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  46356219 agcagagatg-ggatgttgcgttgaatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatcagagagagaatgggggtagcacctatagta 46356121  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46356120 gaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 46356021  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46356020 ttaaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatctggtgtatgatagaac 46355921  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46355920 actatgccatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgtt 46355858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45836840 - 45836480
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45836840 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagagtagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 45836741  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||      
T  45836740 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagttaggtt-- 45836643  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  45836642 atgaggtagagggagacctaggacaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacacta 45836543  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45836542 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttg 45836480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 12 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13859372 - 13859061
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13859372 agcagagatgaggatgttgcgttggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 13859273  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13859272 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 13859173  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13859172 ttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggccaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaac 13859073  T
Q  312 actatggcgtca 323  Q
    ||||||||||||    
T  13859072 actatggcgtca 13859061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 59 - 378
Target Start/End: Original strand, 6374833 - 6375152
Alignment:
Q  59 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6374833 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagag 6374932  T
Q  159 aagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt 258  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  6374933 aagaccagtagatgctgtggtaagaagggtagatcaaatgtaggagaatcaagttaaaagaggtagaggaagatctaggaaaactattagagaaaccatt 6375032  T
Q  259 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 358  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6375033 agaaagaatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 6375132  T
Q  359 aggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  6375133 aggcttggttgttgtcgttg 6375152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 14 - 378
Target Start/End: Original strand, 36651914 - 36652276
Alignment:
Q  14 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |  |||| ||| | ||||||||    
T  36651914 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagaggg--taggggtggcatccatagtaga 36652011  T
Q  114 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  36652012 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttcagcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatagaggatagtcaagtt 36652111  T
Q  214 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 313  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36652112 aaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggattcagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacac 36652211  T
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  36652212 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgctgttgttg 36652276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 43281600 - 43281958
Alignment:
Q  18 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaag 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  43281600 gatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaatataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaag 43281697  T
Q  118 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  43281698 ttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaa 43281797  T
Q  218 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  43281798 gaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 43281897  T
Q  318 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43281898 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgttg 43281958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 31005141 - 31005489
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31005141 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaataacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 31005240  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31005241 gaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 31005340  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||              
T  31005341 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatttgaaaggattcagagatcaatgagttggatccaaatttggtgt---------- 31005430  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
            |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31005431 --------gtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 31005489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35559353 - 35558994
Alignment:
Q  17 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacct-atagtagaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35559353 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagatcagatttgataggattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcaccttatagtagaaa 35559254  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||   ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35559253 agttggtagaaaataggcttagatgatttggacatttagtgagaagacccctagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaa 35559154  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||    
T  35559153 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttagtttatggtagaacatta 35559054  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    | || |||||||||||||||||| || | || |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  35559053 tagcatcatttgatccatgtagcggacctcatttagtaagataaggcttagttgttgttg 35558994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 94 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31682884 - 31682600
Alignment:
Q  94 tgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 193  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  31682884 tgggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggtatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatc 31682785  T
Q  194 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  31682784 aaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccata 31682685  T
Q  294 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31682684 tttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 31682600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 59 - 378
Target Start/End: Original strand, 29650349 - 29650668
Alignment:
Q  59 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29650349 ataggattaggaatgacaccattcgagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagag 29650448  T
Q  159 aagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt 258  Q
    |||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||    
T  29650449 aagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtaaaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccatt 29650548  T
Q  259 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 358  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29650549 agaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactaaggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 29650648  T
Q  359 aggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29650649 aggcttggttgttgttgttg 29650668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Original strand, 43491230 - 43491592
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||| |||    
T  43491230 gagatgaggatgttgtgctggatgagcggtaagattagatgggatatgattaggaatgacaccattggggagagagtaggggtaacacctatagtataaa 43491329  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  43491330 aattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagagtcaggtcaa 43491429  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  43491430 aagaggtagaggaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaacacta 43491529  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||  || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43491530 tgatgtaatttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 43491592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Original strand, 38606927 - 38607276
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38606927 gagatgataatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaacatta-agagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 38607025  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  38607026 ggttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcacgttag 38607125  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    |||||| ||||||||||||| ||            |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  38607126 aagagggagaggaagacctaaga------------aaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 38607213  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38607214 tggcgtcgtttgatccatgtagccgactccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgttg 38607276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 80 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2886018 - 2885720
Alignment:
Q  80 ttagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggt 179  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||    
T  2886018 ttagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgttgt 2885919  T
Q  180 aagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaat 279  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  2885918 acgaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaatgatttagtggtcaat 2885819  T
Q  280 gagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2885818 gagttggacccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 2885720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 97 - 378
Target Start/End: Original strand, 22349623 - 22349904
Alignment:
Q  97 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  ||   ||||||||||||| |||||||    
T  22349623 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttggcatgtagagagaagacccgtaattgtcatggtaagaagagtagatcaaa 22349722  T
Q  197 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22349723 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaactaggaaaactattagagaaaccattaaaaaggatttaaaggtcaataagttggatccaaattt 22349822  T
Q  297 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22349823 ggtatatgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 22349904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 95 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 36869525 - 36869235
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||| |||||    
T  36869525 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcagaagaagagtagatca 36869426  T
Q  195 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 294  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  36869425 aatggaggagagtcaagttagaataggtagaggaagacctgggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagatgtcaatgagttagattcaaat 36869326  T
Q  295 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatc-------catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36869325 ttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 36869235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 33072872 - 33073108
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  33072872 agcagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagta 33072969  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33072970 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaag 33073069  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33073070 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatcagag 33073108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 375
Target Start/End: Original strand, 23404343 - 23404697
Alignment:
Q  19 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  23404343 atgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagggagagagtgggggtaacacttatagtagaaaagt 23404442  T
Q  119 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 218  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||||| |||||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  23404443 tgggagaaaataggcttagacagttt-ggcatgtagattgaagactcgtagatgtcgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggtcaaaag 23404541  T
Q  219 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 318  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||   ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23404542 aggtagaagaagacctaggaaaattataaaagaaaccattacaattaatttatagatcaatgagtttgatccaaatatggtgtatgatagaacattatgg 23404641  T
Q  319 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
     || |||| |||| | ||||||| |||||||  | |||||||| || ||||||||||    
T  23404642 tgtaattttatccgtatagccga-cccacttgataggataaggtttagttgttgttg 23404697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 36136687 - 36137046
Alignment:
Q  17 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 116  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36136687 agatgagaatgttgtgttggatgggtggtaagactagaagggataggtttaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaa 36136786  T
Q  117 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 216  Q
    | ||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||| ||   |||||| ||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||  | | |    
T  36136787 gatggtagaaaatagtcttaggttgtttgggcatatagagagaatacctatagatgttgtagtacgaagagcagatcagatggaggagagtcagatcaga 36136886  T
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  36136887 agaagtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatttggaaagatttagatgttaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaacattat 36136986  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
     | || |||||||  || || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36136987 agggtaatttgatttatttaaccgatcgcgcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36137046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 207 - 378
Target Start/End: Original strand, 38900070 - 38900240
Alignment:
Q  207 tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38900070 tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgat 38900169  T
Q  307 agaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38900170 tgaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 38900240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 104 - 378
Target Start/End: Original strand, 15682184 - 15682458
Alignment:
Q  104 ctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  15682184 ctatagtagaaaagttggtaggaaataggcttagatggtttaggcaggtagagagaagatccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaattgagga 15682283  T
Q  204 gagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtat 303  Q
     |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||    
T  15682284 aagtcaagtcaaaagaggtggagaaaaacctaggaaaactataagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttat 15682383  T
Q  304 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  15682384 gatagaacactatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaagcttggtagttgttgttg 15682458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28628284 - 28627936
Alignment:
Q  25 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 124  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||  | ||  ||| ||||||| ||| ||| |||||||||| ||||  | |||||||||| |||||||| | |||| |    
T  28628284 atgttgccttggatgtatggtaagaccatacgggatgggattagaaattacaacattagagagggagttggagtagcacctagagtagaaatgatggtgg 28628185  T
Q  125 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 224  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||  ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||| | | |||||||||    
T  28628184 aaaattggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagtagatccgatggaggatagtcaaatcacaagaggtag 28628085  T
Q  225 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 324  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  28628084 aggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatgcaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaat 28627985  T
Q  325 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28627984 ttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggcttagttgttgt 28627936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 211 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40980093 - 40979928
Alignment:
Q  211 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40980093 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaa 40979994  T
Q  311 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40979993 cactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40979928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 133 - 378
Target Start/End: Original strand, 32631615 - 32631848
Alignment:
Q  133 cttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 232  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32631615 cttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggatagtcaggttaaaagaggtagaggaagac 32631714  T
Q  233 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 332  Q
    ||| |||||| |||||| ||            |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  32631715 ctaagaaaaccattagaaaa------------gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacgctatggcgtcatttgatcta 32631802  T
Q  333 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32631803 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 32631848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 167 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31681226 - 31681022
Alignment:
Q  167 tagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagga 266  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  31681226 tagatgccgtcgtaagaagagttgatcaaatggaagagagtcagtttaaaacaggtagagggagacctaggaaaa---ttagagaaaccattagaaagga 31681130  T
Q  267 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 366  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31681129 tttaagggtcaatgagttggatccaaatatggcttatgatagaatactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttgg 31681030  T
Q  367 ttgttgtt 374  Q
    ||||||||    
T  31681029 ttgttgtt 31681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 145 - 377
Target Start/End: Original strand, 7273151 - 7273383
Alignment:
Q  145 gggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaacta 244  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||| || ||| | ||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7273151 gggcatgtagagagaagatccgtaggtgccgtcgtatgtagagtagattggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctatgaaaacta 7273250  T
Q  245 ttagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcc 344  Q
    | |||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  7273251 taagagaaaccattagaaaatattcagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatatagcactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccc 7273350  T
Q  345 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7273351 cacttagtgggataaggcttgattgttgttgtt 7273383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 333
Target Start/End: Original strand, 47848596 - 47848912
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| || | ||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  47848596 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcagaagtgataacattagagagagagttggggtagcgcctatagtagaaa 47848695  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||  |||| ||||| ||||| |||||||| ||||   | |     
T  47848696 agatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtcgagagaagacttgtaaattctgtactaaggagagtagatcagatggaggatagtctgatcac 47848795  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
     ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| | | | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  47848796 tagaggcagaggaagaactagaaaaactataagagaaactattggaaa-gatttggggattaatgagctggatccaaatatggtttatgatagaacatta 47848894  T
Q  316 tggcgtcatttgatccat 333  Q
    |||  | |||||||||||    
T  47848895 tggtttaatttgatccat 47848912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 152 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24598411 - 24598186
Alignment:
Q  152 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 251  Q
    ||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||    
T  24598411 tagagagcagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaatcattcgaga 24598312  T
Q  252 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttag 351  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||| | || |||     
T  24598311 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaatattttggcatcatttgatccatgtagccga-ctcatttaa 24598213  T
Q  352 tgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24598212 tgggataagacttggttgttgttgttg 24598186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 229 - 376
Target Start/End: Original strand, 48919247 - 48919394
Alignment:
Q  229 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 328  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  48919247 agacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttatgataaaccactatggcgtcatttga 48919346  T
Q  329 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48919347 tccatgtagtcgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 48919394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 251 - 377
Target Start/End: Original strand, 27648937 - 27649063
Alignment:
Q  251 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 350  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27648937 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactgtggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 27649036  T
Q  351 gtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27649037 gtgggataaggcttggttgttgttgtt 27649063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8492580 - 8492236
Alignment:
Q  29 tgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 128  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  8492580 tgcgttggatgagtggcaagactagacgggataggattacgaatgacaccattagggagagatttggggtaacacctatagtaaaaatgatggtagaaaa 8492481  T
Q  129 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 228  Q
    |||||| || |||||||  | |||||||| |||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||| ||||||||| || |  ||| ||||||||||| |    
T  8492480 taggctaaggtggtttgaacttgtagagaaaagacttgtagatgttgtagtacaaagagtagatcagatggaggagggtgagattagaagaggtagagaa 8492381  T
Q  229 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 328  Q
    ||||| | |||||  |||| |  |||  |||| || ||||||||||| || |||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||| | ||||||    
T  8492380 agacc-acgaaaa--attataataactgttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttga 8492284  T
Q  329 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    || ||||| |  | ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||    
T  8492283 tcaatgtaactaaccccacttagtgagataaggctcgactgttgttgt 8492236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 377
Target Start/End: Original strand, 21078068 - 21078200
Alignment:
Q  245 ttagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcc 344  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       
T  21078068 ttagagaaaccattagtaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgactt 21078167  T
Q  345 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21078168 catttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 21078200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 7272961 - 7273151
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||  | | ||| |||||||||||||||    
T  7272961 gagatgaggatgttgtgctggatgagcggtaagactacacgggataggattaggaatgacacctttagggagagaacgggagtatcacctatagtagaaa 7273060  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagag 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |  ||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  7273061 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtacagagaagacctgtagatgccgccgtatgaagagtagatcagatggaggagag 7273151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 216 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9210864 - 9210702
Alignment:
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||    
T  9210864 aagaggttgaggaagacctaggaaaactataagagaaacttttaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatacaacatta 9210765  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9210764 tggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttgttg 9210702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 150 - 377
Target Start/End: Original strand, 1011103 - 1011329
Alignment:
Q  150 tgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga 249  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  1011103 tgtagagagaagacatctagatgttgtagtacgaagagtagatcagataaaggagagtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaattatgaga 1011202  T
Q  250 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 349  Q
    ||||  ||||| ||  ||||| |||| ||||| |||||||||| | |||| || ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||    
T  1011203 gaaattattaggaaatatttaaaggttaatgatttggatccaa-tatggtttaggatagaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccactt 1011301  T
Q  350 agtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1011302 agtgggataaggcttggttgttgttgtt 1011329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 112 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 38135476 - 38135211
Alignment:
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||      
T  38135476 gaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagacagaagaccagtagattttgtagtaaggaga-tagatcagatggaggatagtcaga 38135378  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    | |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||||| | |||| |||  ||||||||||     
T  38135377 tcattagaggcagatgaagacctagaaaaagtataagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatgggttatgatagaat 38135278  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38135277 attatggcgtaatttgatccatctagctgaccccacttggtgggacaaggcttggttgttattgttg 38135211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 136
Target Start/End: Original strand, 32630517 - 32630636
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32630517 gagatgaggatgttgagctggatgagtggtaagactagacatgataggattagga-tgataccattggagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 32630615  T
Q  116 agttggtagaaaataggctta 136  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32630616 agttggtagaaaataggctta 32630636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 270 - 377
Target Start/End: Original strand, 33073105 - 33073212
Alignment:
Q  270 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33073105 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataataaaacaatatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 33073204  T
Q  370 ttgttgtt 377  Q
    || |||||    
T  33073205 ttattgtt 33073212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 378
Target Start/End: Original strand, 12966025 - 12966300
Alignment:
Q  97 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 196  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||| ||||||     
T  12966025 gtagcacctatagaagaaaagatggtggaaactatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaattctgtagtaaggagagtagatcaag 12966124  T
Q  197 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 296  Q
    || ||   |||||| | |       ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||  |||||||| | ||||| ||||||  |||| |    
T  12966125 tgaagactagtcaaatcac------tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaatatttagagattaatgatttggatagaaatat 12966218  T
Q  297 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||| ||||||| | || |||| | |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12966219 ggtatatgataaatcattatgccattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12966300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 281 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28208423 - 28208326
Alignment:
Q  281 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28208423 agttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 28208326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 266 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34035264 - 34035155
Alignment:
Q  266 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 365  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  34035264 atttagagatcaatgagttggatccaaatatggttcatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggattaggcttg 34035165  T
Q  366 gttgttgttg 375  Q
    ||||||||||    
T  34035164 gttgttgttg 34035155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36514569 - 36514371
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||| ||||| || |||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  36514569 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaaacgggatagaattagaaaggacaacattagagagag--ttggggtagcacctatagta 36514472  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||| | ||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  36514471 gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagacgacttgtggattctgtagtatggagagtagatcagatagaggggagtcaag 36514372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25579431 - 25579205
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||     ||||||||| ||||||  |||||||||||| | | | |||||||| |||| |||||    
T  25579431 gagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaatactaga-----taggattagaaatgaccacattagagagagtggg-gagtagcacccatagcagaaa 25579338  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    |  |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| | |     
T  25579337 aaatggtggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacatgtagattctgtggtaagaagagtagattagatggaggatagtcaaatcac 25579238  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattag 248  Q
    ||||| || | |||||||||| |||||||||||    
T  25579237 aagagttaaatgaagacctagaaaaactattag 25579205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 36102129 - 36101775
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||| ||||   |||  |||||| ||||||| |||| |||  ||||||  ||||||||||||| ||    
T  36102129 agcagagatgaaaatgttgagttcgatgtgtggtaagactagatgggatgagattagaaatgacaacatttgaggaagagtgaaggtagcacctataata 36102030  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||| || | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||  |||   | | ||||| ||||| |||||| | |||||      
T  36102029 gaaaagatgttggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacctatagattttgtaacagggagagtagatcatatggagaatagtcaga 36101930  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    | |  ||||| |||||||||||||| |||| |||||            ||||| ||||| || | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  36101929 tcactagaggcagaggaagacctagaaaaattattat-----------gaaag-atttatagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaac 36101842  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36101841 attatgacgtaatttgatccatgtagttgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 36101775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 43282330 - 43282574
Alignment:
Q  19 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt---agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||||   |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43282330 atgaggatgttgcgttagatgtgtggtaagtctagacatgatatgattagaaatgacaacatttagagagagagagttggggtagcacctatagtagaaa 43282429  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||| ||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||| ||||| ||| | |||||||| |||||  | |     
T  43282430 agtcggtggaaactaggcttaggtgaattgggcatgtagagagaagacttgcagattctgtaggaaggagagtagat-agatggaggatagtcagatcac 43282528  T
Q  216 aagag--gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta 259  Q
    |||||  |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  43282529 aagaggtgtagaggatgacctagaaaaactataagagaaactatta 43282574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 217 - 373
Target Start/End: Original strand, 45601599 - 45601755
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||    
T  45601599 agaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaacactat 45601698  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    || || |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45601699 ggtgtaatttgatccatgtagctgaactcacttagtgggataaggcttggttgttgt 45601755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 58 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 46014498 - 46014359
Alignment:
Q  58 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 157  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  46014498 gataagattagaaatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgg-ttggacatgtagaga 46014400  T
Q  158 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatg 198  Q
    ||||||   ||||||| ||  |||||||||| |||||||||    
T  46014399 gaagacccatagatgccgtcctaagaagagtagatcaaatg 46014359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7189593 - 7189296
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga--------gtgtgggtagcacctat 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||        ||  |||| ||||||||    
T  7189593 gagatgaggatgttgtgttgaatgaccggtaagattagacgagataggat-atgaatgacaccattagagagagaaagagagagttggggtcgcacctat 7189495  T
Q  108 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat------gctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 201  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    |||||      | ||| ||| ||||||| ||||| ||||||    
T  7189494 agtagaaaagatggtagaaaataagcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaatcgatagatgttgtagttgtagtatgaagagtagatcagatggag 7189395  T
Q  202 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac-aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 299  Q
    ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||| ||  |||||||||    
T  7189394 gagagtcatattagaagatgtagaggaagacctagaaaaactataagggaagctaattagaaaagatttagaggttaaggagttgaatataaatttggt 7189296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 48736256 - 48735899
Alignment:
Q  19 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||   ||||  ||||| ||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||     
T  48736256 atgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagactagatgagataaaattagaaatgacgacattatagagagagttggggtagcacctacagtagaaaaga 48736157  T
Q  119 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 218  Q
    ||| ||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||  || |||  ||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||  | |  ||    
T  48736156 tgggagaaactagacttaggtggtttgctcatgtagagcgaagacctgtggattatgtagttaggagagtagatcaaatggagg-gagtcagatcactag 48736058  T
Q  219 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 318  Q
    |||||| |  |||||| | |||||||| |||||  | ||||| | || | ||||| | |||||||| ||   | |  |||| ||||| |||| |||||||    
T  48736057 aggtagggctagaccttgaaaaactataagagaggctattagtagggttctagagataaatgagtttgagaaagacatggtttatga-agaatactatgg 48735959  T
Q  319 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48735958 cgtcgtttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttgttg 48735899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 58 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26742215 - 26741892
Alignment:
Q  58 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt-gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagag 156  Q
    ||||||||||| ||||| |  || |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||  |||||||||    
T  26742215 gataggattagaaatgataatatcagagagtgagagttgggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggattaggtggtttgaacatgtagag 26742116  T
Q  157 agaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga--aac 254  Q
    | | |||   |||||  ||||||||| ||||| ||||| || ||| | |||||  | |  ||||| |||||||||| ||| |||||||| | |||  |||    
T  26742115 aaacgacctatagattttgtggtaaggagagtagatcagatagagaatagtcagatcactagaggcagaggaagacgtagaaaaactatcaaagataaac 26742016  T
Q  255 aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgg 354  Q
     ||||| ||  |||| ||  | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||     
T  26742015 tattaggaaatatttggaaataaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtaaccaatcccacttagtgc 26741916  T
Q  355 gataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
     | || ||||||||||||||||||    
T  26741915 aaaaatgcttggttgttgttgttg 26741892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 370
Target Start/End: Original strand, 5335840 - 5336193
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||   ||||| ||||| | ||||  |||||||||  |||||||| ||||||||    
T  5335840 agcagagatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagactagacagaatgcaattagaaatgataacatt--agagagagttggggtagcatctatagta 5335937  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    | |||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||   || ||| |||| || || ||||| ||| | ||||||| |||||||     
T  5335938 ggaaagatggtcgaaactagacttaggtggtttgggcatatagagagaagaactgtggattctgtagttaggagagtagattagatggaggggagtcaaa 5336037  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    | |   ||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| || ||||  || ||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | |||| |||     
T  5336038 tcactcgaggtaggggaaaaccttgaaaaactat--gagatactattaagaatgatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgattgaat 5336135  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 370  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  5336136 actatggcgtcgtttgattcatgtagccga-cccacatagtgggataagacttggttgt 5336193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 39811882 - 39812066
Alignment:
Q  19 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||      
T  39811882 atgaggatgttgctttggatgtgtggtaagactagacgtgataggattagaaatgacaacattagagagagagttggggcagcacctatcatagaaaaaa 39811981  T
Q  119 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 203  Q
    ||||  ||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||   |||||| || | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  39811982 tggtgaaaactcggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagagatgtagattctatagtaaggagagtagatcagatggagga 39812066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 224 - 378
Target Start/End: Original strand, 42187572 - 42187725
Alignment:
Q  224 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact-atggcgtc 322  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||||||| ||||| ||  |||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||     
T  42187572 gaggaagacctaa-aaaattataagagaaactattaggaaatatttagagattaattagttggatccaaatt-ggtttatgatagaacatttatggcgta 42187669  T
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42187670 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctttgttgttgttgttg 42187725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 272 - 373
Target Start/End: Original strand, 47852265 - 47852366
Alignment:
Q  272 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 371  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  47852265 aggttaatgagttggatccaaatgtggtgtatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagggggataaggcttggctgtt 47852364  T
Q  372 gt 373  Q
    ||    
T  47852365 gt 47852366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 36869653 - 36869574
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 91  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36869653 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactggacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 36869574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 241 - 375
Target Start/End: Original strand, 14057625 - 14057759
Alignment:
Q  241 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 340  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  14057625 actataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagcca 14057724  T
Q  341 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14057725 accccacttagtaggataaggcttagttgttgttg 14057759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 241 - 375
Target Start/End: Original strand, 14367653 - 14367787
Alignment:
Q  241 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 340  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  14367653 actataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagcca 14367752  T
Q  341 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14367753 accccacttagtaggataaggcttagttgttgttg 14367787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31869175 - 31869101
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31869175 tgatagaacactctggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 31869101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 161
Target Start/End: Original strand, 42187393 - 42187537
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||  ||||  ||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  42187393 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtagtaagactagacgggatat-attagaaatggcagcattagaaagagagtcggggtagcacctataatagaaa 42187491  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 161  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42187492 agatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaag 42187537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19262791 - 19262609
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||||||||| |||  |||  ||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||    
T  19262791 gagatgaggatgttacgtgtgatatgtggtaatactagacatgatagagttagaaatgacaatattagagagag--ttggggtagcacctattgtagaaa 19262694  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 201  Q
    || ||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  19262693 agatggtagaaacttggcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtagat-ttgtagtaagaagagtagatcagatggag 19262609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 229 - 375
Target Start/End: Original strand, 34745882 - 34746028
Alignment:
Q  229 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 328  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| || || | |||||||||||   |||  |||| | ||||||||| |||||||||  |||||    
T  34745882 agacctagaaaaaccataagagaaactattaggaaggatctaaagataaatgagttggagaaaaacatggtttttgatagaacgctatggcgttgtttga 34745981  T
Q  329 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34745982 ttcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 34746028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 378
Target Start/End: Original strand, 42969870 - 42969982
Alignment:
Q  266 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 365  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  42969870 atttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgattgaacattatcgtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttt 42969969  T
Q  366 gttgttgttgttg 378  Q
    ||| ||| |||||    
T  42969970 gttattgatgttg 42969982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 269 - 377
Target Start/End: Original strand, 47652722 - 47652830
Alignment:
Q  269 tagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 368  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||| |||| |  ||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47652722 tagaggttaataagtttgatccaaatatggtttcggatagaacattatggcgtaacttgatccctgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 47652821  T
Q  369 gttgttgtt 377  Q
    |||||||||    
T  47652822 gttgttgtt 47652830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 24598509 - 24598409
Alignment:
Q  13 gcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt----agagagagagtgtgggtagcacctata 108  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  24598509 gcagagacgaggatgttgtgttggatgagtggtaagtttagacatgataggattaggaatgacaccattatagaaagagagagtgggggtatcacctata 24598410  T
Q  109 g 109  Q
    |    
T  24598409 g 24598409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Original strand, 24777166 - 24777241
Alignment:
Q  299 tgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24777166 tgtatgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgatcctacttagtgggataaagcttggttgttgtt 24777241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 14593679 - 14594036
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtg----ggtagcacctat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |  | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |    |||  |||||||    
T  14593679 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacggaaccgaattagaaatgacaacattagagagagagtgagctggggtgacacctat 14593778  T
Q  108 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 207  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||       | ||| ||||| || |||  ||||    
T  14593779 agtagaaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagacctgtggattctgtat-----atagtagatcagatagagaggagt 14593873  T
Q  208 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 307  Q
    ||| | |  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||| |  ||||| |    |||  |||  ||    |||| | |||||    
T  14593874 caaatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaagaacctagagattg--gagaagga--ca----tggtttttgata 14593965  T
Q  308 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| || ||| | | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14593966 gaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 14594036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 281 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24177721 - 24177628
Alignment:
Q  281 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24177721 agttgggtccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatt-gatccatgtagccaaccccacttagtaggataaagcttggttgttgttg 24177628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 30200323 - 30200176
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   |||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||    |||| |||||||||||    
T  30200323 agcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagatgggatatgattagaaatgacaacattagagagttag----ggtaacacctatagta 30200228  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||| || ||| |||||||| | |||||||    
T  30200227 gaaaagatggtggaaactaggcttaggtgattttggcatgtaaatagaagac 30200176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 312 - 378
Target Start/End: Original strand, 40630652 - 40630718
Alignment:
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40630652 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 40630718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Original strand, 28020883 - 28021032
Alignment:
Q  13 gcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtag 112  Q
    ||||||| || |||||||| || |||| ||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||| | ||||||||| |||||  ||||||||| ||| ||||    
T  28020883 gcagagaggaagatgttgcattagatgtgtgataagactggacatgatatgattcgaaatgataacattagagaaagagttggggtagcacttatcgtag 28020982  T
Q  113 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 162  Q
    ||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28020983 aaaagatggtggaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 28021032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 27021986 - 27021906
Alignment:
Q  82 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 162  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27021986 agagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagttggtgaaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 27021906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 251 - 378
Target Start/End: Original strand, 28355322 - 28355450
Alignment:
Q  251 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc-gatcccactt 349  Q
    |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||| | || |||||||    
T  28355322 aaactattaggaaagatttataggttaatgaggtggatcaaaatatggtttatgataaaacattatggcggaatttgatccacgtagtctgaccccactt 28355421  T
Q  350 agtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355422 agtgggataaggcttggttgttgttgttg 28355450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 277 - 376
Target Start/End: Original strand, 33732017 - 33732114
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||  |||| |||| |||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33732017 aatgagtgagatcgaaatatggtttatgatagaacattatggca--atttgatccatgtagccggtcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33732114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 203
Target Start/End: Original strand, 40169650 - 40169758
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||||  ||| ||||| |||||    
T  40169650 gggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagataagacacgtagattttgtgtgaaggagagtagatca 40169749  T
Q  195 aatggagga 203  Q
    |||||||||    
T  40169750 aatggagga 40169758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 141 - 348
Target Start/End: Original strand, 1569063 - 1569270
Alignment:
Q  141 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 240  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||| | ||| ||||| ||||| |||||||| |||||  ||   ||||| ||||| || ||||| |||    
T  1569063 gtttgagcatgtagagagaagtcgtgtagatgttgtagaaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattgctagaggcagaggtagtcctagaaaa 1569162  T
Q  241 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 340  Q
    ||||| |||| ||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||    
T  1569163 actataagagtaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatcgatgtagtcg 1569262  T
Q  341 atcccact 348  Q
    | ||||||    
T  1569263 accccact 1569270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 238 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40149150 - 40149016
Alignment:
Q  238 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 337  Q
    |||||||| |||||||| | ||| || || || |||  |||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||    
T  40149150 aaaactataagagaaactactaggaaagacttggagagcaatgagttggaccaaaatatggt-tatgatagaacattatggcgcaatttgatctatgtag 40149052  T
Q  338 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40149051 ccgaatccacttagtgggataaggcttggttgttgt 40149016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 268 - 378
Target Start/End: Original strand, 33103100 - 33103210
Alignment:
Q  268 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggt 367  Q
    |||||| | ||||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  33103100 ttagagattaatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggc 33103199  T
Q  368 tgttgttgttg 378  Q
    || ||||||||    
T  33103200 tgatgttgttg 33103210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 265 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27893674 - 27893561
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    ||||||||| | |||||| |||| | |||| || | |||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  27893674 gatttagagattaatgagctggaccgaaatatgttttatgatagaacattatggcataatttgattcatgtagccgaccctacttagtgcgataaggctt 27893575  T
Q  365 ggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||    
T  27893574 ggttgttgttgttg 27893561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 309 - 378
Target Start/End: Original strand, 28708596 - 28708665
Alignment:
Q  309 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28708596 aacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgatgttgttg 28708665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 306 - 379
Target Start/End: Original strand, 31840442 - 31840515
Alignment:
Q  306 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31840442 tagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagcctaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 31840515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 376
Target Start/End: Original strand, 37976368 - 37976517
Alignment:
Q  227 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 326  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| | ||  || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||   |||     
T  37976368 gaagacctagaaaaactataagtgaaactaatatgaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggctaaatta 37976467  T
Q  327 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  37976468 gatccatgtagccaaccccgcttagcaagataaggtttggttgttgttgt 37976517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 214 - 378
Target Start/End: Original strand, 44951274 - 44951439
Alignment:
Q  214 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta-gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||  |||||||  ||||| | |||||| | || ||| ||||| |  | ||||||||||||    
T  44951274 aaaagaggtagaggaagatctaggaaaattacaaagagaaacctttagaaaatatttaaaagtcaattacttagattcaaatattatttatgatagaaca 44951373  T
Q  313 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  44951374 ctatgacgtaatttgatccatgtagccgacaatacttagtggtataaggtttggttgttgttgttg 44951439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 48202949 - 48202701
Alignment:
Q  129 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 228  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||| | |  | ||| ||||||    
T  48202949 taggcttaggtggtttgcgcatgtagagagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagatcatatggtggatagtcaaatcattataggcagagga 48202850  T
Q  229 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 328  Q
    || ||||| |||||||| ||||| |   |||  || | | ||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||| | ||| |  ||||||    
T  48202849 aggcctagaaaaactataagagagatcgttaagaaagttgtagagtttaatgagttggattgaaatatggtttatgttagaacattgtggtgcaatttga 48202750  T
Q  329 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| || | | ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  48202749 tccatgcagtc-aacccccttggttggataaggtttggttgttgttgttg 48202701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 277 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34341494 - 34341395
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34341494 aatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaccaatgtagccgaccccatttagtggaataaggcttgtttgttgttgt 34341395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 376
Target Start/End: Original strand, 40415169 - 40415295
Alignment:
Q  256 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccc------actt 349  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| || | |||||| |||| |||| || | ||||||||||||||||||| |||      ||||    
T  40415169 attaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatgttttatgattgaaccctatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttatactt 40415268  T
Q  350 agtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  40415269 agtgggataaggcttggttgttgttgt 40415295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 16013202 - 16013357
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtg----tgggtagcacctat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |    ||||| ||||||| ||||||||||||||||     ||||  |||||||    
T  16013202 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacggaaccaaattagaaatgacaacattagagagagagtgagctggggtgacacctat 16013301  T
Q  108 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    |||| ||||  ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  16013302 agtacaaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagac 16013357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19119608 - 19119423
Alignment:
Q  191 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc 290  Q
    |||| ||||||||||||||| | |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |  | |||| ||||| |||||||||| ||       
T  19119608 atcagatggaggagagtcaaatcactagaggtagtggaagacctag-aaaactattagagaaactatcaagatggatctagagatcaatgagtttgagaa 19119510  T
Q  291 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    | |  |||  | ||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  19119509 agacatggcttttgatacaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaaaatttgttgttgttgtt 19119423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 296 - 378
Target Start/End: Original strand, 25891090 - 25891172
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25891090 tggtttataatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtacgataaggcttggttgttgttgttg 25891172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Original strand, 1740715 - 1740909
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt----agagagagagtgtgggtagcacctat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    | || |||||| ||||| | ||||    ||||||||||| ||||||||| |||     
T  1740715 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtagtaagactaggtggggtaagattagaaatgagaacattagagagagagagagtttgggtagcatctac 1740814  T
Q  108 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 202  Q
    |||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| | || |||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  1740815 agtagaaaatatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtatgtagataggagaattgtggattttgtagtaaggagagtagatcagatggagg 1740909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Original strand, 4604754 - 4604831
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4604754 tatgatagaacattatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataagacttggttcttgttgttg 4604831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 36239934 - 36239833
Alignment:
Q  238 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 337  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||| | || ||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  36239934 aaaactataagagaaactattaggaaaaatttagagattaacgagttggatccaaatatgctttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtag 36239835  T
Q  338 cc 339  Q
    ||    
T  36239834 cc 36239833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Original strand, 48515482 - 48515559
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  48515482 tatgatagtacactatgacgtaatttgatccgtgtagccgaccccacttagtgggataagacttggtttttgttgttg 48515559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Original strand, 5418294 - 5418358
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5418294 tatggcgtaatttgatccatgtagtcgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 5418358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 314 - 374
Target Start/End: Original strand, 6263479 - 6263539
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6263479 tatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 6263539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34029749 - 34029677
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34029749 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccaccaagtgggataaggcttggttgttgttg 34029677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 280 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 34926618 - 34926538
Alignment:
Q  280 gagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataag 360  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34926618 gagttggatcgaaatatggtttatgatagaacttaatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagcgggataag 34926538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38103762 - 38103616
Alignment:
Q  227 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 326  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||| | || ||||||| |||| ||||| || ||||    
T  38103762 gaaggcctagaaaaactataagagagactattaggaaatactaagagattaatgagttggatccaaatattgtttatgata-aacattatggtgtaattt 38103664  T
Q  327 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38103663 gatcc-tgtagccgaccccagttagtgggataagacttggttgttgttg 38103616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 377
Target Start/End: Original strand, 7220750 - 7221039
Alignment:
Q  100 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac------tagtagatgctgtggtaaga------agag 187  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||      | |||||| |||| |||  |      ||||    
T  7220750 gcacctattgtagaaaagatgatagaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacgtgtacttgtagattctgtagtattagtatggagag 7220849  T
Q  188 tggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 287  Q
    | ||| | |||||||| |||||| |||  ||||| |||| ||||||||  ||||| || || ||||  ||||  || ||||||||| | |||| ||||||    
T  7220850 tagattagatggaggatagtcaaattactagaggcagagtaagacctataaaaaccataagtgaaattattaacaaagatttagagattaatgtgttgga 7220949  T
Q  288 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |  | || |  | | |||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7220950 taaagatataatatgtgatagaaaattatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtggtgtaaggcttggttgttgttgtt 7221039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8519157 - 8519046
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||| |  | ||||||||||| |||||||||     
T  8519157 gatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttgatcaatgtaactaaccccacttagtgagataaggctc 8519058  T
Q  365 ggttgttgttgt 376  Q
    | ||||||||||    
T  8519057 gattgttgttgt 8519046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Original strand, 16013484 - 16013559
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||| || ||| | | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16013484 tgatagaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 16013559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24550051 - 24549686
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| |  ||| |||||| ||||| | |||||||| ||||     |||| ||||||||       
T  24550051 agcagagatgaggatgttgtgttggatgtgttgtaagactagatagaatatgattagaaatgataacattagagtgagatctatggtatcacctata--- 24549955  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtaga-tgctgt--gg--taagaagagtggatcaaatggaggagag 206  Q
       ||| || | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || || |  |||  ||  |||| |||||   ||| ||||||| ||     
T  24549954 ---aagatgatggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtggactattgttaggactaaggagagtaagtcagatggaggggat 24549858  T
Q  207 tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgat 306  Q
    |||| | |  ||||||||| ||||||||   | |||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  |||| |||| | ||||    
T  24549857 tcaaatcactagaggtagaagaagacctgaaagaactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggattgaaatatggtatttgat 24549758  T
Q  307 agaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    ||||   ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  24549757 agaatcttattgcgtcgttt-atccatgtagcagatcccacttagtaggattaggcatggttgttgttgttgc 24549686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 30814220 - 30814125
Alignment:
Q  281 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||| |||| || | |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  30814220 agttggatcgaaatatgttttatgatagaacattatcacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaagaggcttggtagttgttgt 30814125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 166
Target Start/End: Original strand, 38920795 - 38920866
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactag 166  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38920795 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagagagatgactag 38920866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 150 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1531587 - 1531372
Alignment:
Q  150 tgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga 249  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||| ||| ||| ||| ||||| ||  ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||     
T  1531587 tgtagagagaagacctctagatgttgtagtacgaatagtagatcagataaaggagagccagatcaaaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagc 1531488  T
Q  250 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 349  Q
     |||  ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |  ||||||||| ||||| |            ||||||||| |||||||    
T  1531487 aaaattattaggaaaaatttagaggttaatgagttggacccaaatatggtttgggatagaacattatggtg------------tgtagccgaccccactt 1531400  T
Q  350 agtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1531399 agtgggattaggcttggttgttgttgtt 1531372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6420749 - 6420615
Alignment:
Q  117 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 216  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||| | || |||||  | |      
T  6420749 gttggtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatactgtagtaaggagagtagatcagatgaatgatagtcagatcact 6420650  T
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 251  Q
    ||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  6420649 agaggcagaggtagacctataaaaactataagaga 6420615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 304 - 378
Target Start/End: Original strand, 33281097 - 33281170
Alignment:
Q  304 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33281097 gatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccggacc-acttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 33281170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2882835 - 2882734
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||| || | ||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  2882835 aatgagttggatcgaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatctatttagctgacctcacttagtgagaaaaggcttggtggttgttgt 2882736  T
Q  377 tg 378  Q
    ||    
T  2882735 tg 2882734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Original strand, 41483694 - 41483771
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41483694 tatggtagaactttatggtgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagatttggttgttgttgttg 41483771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 163
Target Start/End: Original strand, 41948480 - 41948585
Alignment:
Q  58 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 157  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||  | ||||||| || | |||||||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41948480 gatacgattagaaatgacaacattagagtgagagttggcgtagcacttacaatagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagaga 41948579  T
Q  158 gaagac 163  Q
    ||||||    
T  41948580 gaagac 41948585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20158743 - 20158671
Alignment:
Q  304 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20158743 gatagaacactatcaagtaatttgatccatgtagctgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 20158671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 28542055 - 28541943
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccc-acttagtgggataaggct 363  Q
    ||||||||| | ||||||||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||| |  |||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  28542055 gatttagagattaatgagttggattgaactatggtttatgatagaacatcatggcatagtttgatccgtgtagccgacccccacttagttggataaggct 28541956  T
Q  364 tggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||    
T  28541955 tggttgttgttgt 28541943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Original strand, 29312209 - 29312273
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29312209 tatggcgtaatttgatccatgaagccgacccagcttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 29312273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 29318853 - 29318793
Alignment:
Q  318 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29318853 gcgtaatttgatccatgtagccgacccagcttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 29318793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 47700117 - 47700054
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  47700117 tatggcgtaatttgatccatgtagccga-cccacttggtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 47700054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20525105 - 20525050
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20525105 atttgatccatgtagccgaccccacttagcgggataaggctcggttgttgttgttg 20525050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 47796301 - 47796150
Alignment:
Q  227 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 326  Q
    ||||||| || |||| ||| |||||| | ||||| || ||||||||  | ||| |||||||   |||| |||| |||||||||| | |||||||| ||||    
T  47796301 gaagaccgagaaaaattataagagaacctattaggaaagatttagaaattaataagttggactgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaattt 47796202  T
Q  327 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||  ||||||||||||    
T  47796201 gatccatgcagccgatcccgcttagtcggaaaagccttctttgttgttgttg 47796150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18605427 - 18605237
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||  | | || || ||| | |||||    
T  18605427 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattatatagttaggagattagatca 18605328  T
Q  195 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 285  Q
     || |||||||||||| | |  ||| |||  || |||||||| |||||||  |||||||| ||||  |||||||||||  | |||||||||    
T  18605327 gatcgaggagagtcaaatcactagatgtatgggtagacctagaaaaactacaagagaaactattatgaaggatttagaaataaatgagttg 18605237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21244328 - 21244282
Alignment:
Q  331 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21244328 catgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 21244282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 378
Target Start/End: Original strand, 33139208 - 33139437
Alignment:
Q  148 catgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 247  Q
    ||||||||||||||||  | |||||| || ||||||| |||  | || |||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| |  |    
T  33139208 catgtagagagaagacccgcagatgccgttgtaagaaaagtataacagatggagaagagttaagtcaaaagagatagagtaagacataggaaaaccacaa 33139307  T
Q  248 gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccac 347  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||  || |  ||||| | || ||||||| | || ||||  || |||||||||||||| | |||||||     
T  33139308 gagaaacacttaaaaatgatttcgaggttaatgaactgaagtcaaatatagtttatgatacaccattatgatgtaatttgatccatgtaactgatcccat 33139407  T
Q  348 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
      |||||||||| | || |||||||||||||    
T  33139408 gaagtgggataa-gatttgttgttgttgttg 33139437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 193
Target Start/End: Original strand, 35713696 - 35713794
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 193  Q
    |||||| || |||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||| ||||    
T  35713696 gggtaggacatatagttgaaaaaatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtacattttgtagtaaggagagtagatc 35713794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 40830146 - 40830292
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||  || ||| | |||||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||    |||||||||||||| | |    
T  40830146 agcagagataaggatgttgtgttgaatg--tgctaaaagtagacatgatagaattagaaatgacaatattagaaagagt---tgggtagcacctattgaa 40830240  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    |||||| ||||||||| |   ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  40830241 gaaaagatggtagaaactctacttaggtggtttgggcatgaagagagaagac 40830292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36245336 - 36245259
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  36245336 tggtatatgatagaacattatgacgtcgtttgatccacgtagtcgatcccacatagttggataaggcttgtttgttgt 36245259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 376
Target Start/End: Original strand, 45558539 - 45558611
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  45558539 tgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagttgaccccgcttagt-ggataaggtttggttgttgttgt 45558611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 304 - 364
Target Start/End: Original strand, 17759483 - 17759543
Alignment:
Q  304 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17759483 gatagaacactatggtgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 17759543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 374
Target Start/End: Original strand, 30144975 - 30145035
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  30144975 tatggtgtcatttgatccatgcagccaatcccacttagtgtgataaggcttggttgctgtt 30145035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 303 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38921161 - 38921086
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag--ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  38921161 tgatagaaggctatggcgtcatttgattcatgtaggaccgaccccacttagggggaaaaggcttggttgttgttgt 38921086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 373
Target Start/End: Original strand, 39812145 - 39812217
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812145 tatgatagaacattatgatgtcgtttgatccatgtagttggccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 39812217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 40139279 - 40139124
Alignment:
Q  13 gcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtag 112  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| || |||| ||||||||||||     ||||  ||||||||||||    
T  40139279 gcagagacgaggatgttgtgtgggatgtgtggtaagactagacgggataagattagaaaagacaacattagagagagtc---gggtttcacctatagtag 40139183  T
Q  113 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 171  Q
    ||||  |||| |||| | ||||||| || | ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  40139182 aaaatatggtggaaactgggcttaggtgatctgggcatgtagggagaagatttgtagat 40139124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 160
Target Start/End: Original strand, 45558352 - 45558428
Alignment:
Q  84 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 160  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  45558352 agagagagttggggtaccacctatagtagaaaagttggtagaaactcgacttaggtggtttgtgcacgtagagagaa 45558428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 378
Target Start/End: Original strand, 1523856 - 1523927
Alignment:
Q  307 agaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1523856 agaacactatgacgtaatttgattcatgtagccaacctcacttagggagataaggcttggttgttgttgttg 1523927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Original strand, 6807700 - 6807775
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||| |||||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6807700 tgatagaacattatggcgtcgtatgattcatgtaggtgaccccacttagtgggataagatttggttgttgttgttg 6807775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21517529 - 21517426
Alignment:
Q  227 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 326  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||  |||||||| | ||| |||||||||||||| || | ||||||| |||| |||| ||| ||||    
T  21517529 gaagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaatatttagagattaataagttggatccaaatatgatttatgatataacattatgacgtaattt 21517430  T
Q  327 gatc 330  Q
    ||||    
T  21517429 gatc 21517426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Original strand, 35865912 - 35865987
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  35865912 tgataaaacactatggcgtcgtttggttcatgtagccaaccccacttagtgggacagggcttgcttgttgttgttg 35865987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39738497 - 39738446
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39738497 tttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 39738446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40139023 - 40138948
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||    
T  40139023 tatgatagaatattatgacgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgcgataagacttggctgttattgt 40138948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 377
Target Start/End: Original strand, 41461318 - 41461393
Alignment:
Q  302 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||| || |||||||||  |||||||||| |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41461318 atgatagaccattatggcgtcggttgatccatgcagccaaccccggttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 41461393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 356
Target Start/End: Original strand, 43281958 - 43282092
Alignment:
Q  221 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 320  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||   | ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||| | |||| |||||||    
T  43281958 gtagaggatgacctagaaaaaccgtaagagaaacaattaagtaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgacaaaaca-tatggcg 43282056  T
Q  321 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 356  Q
    | |||||||| || ||||||| | ||||||||||||    
T  43282057 taatttgatctatctagccgacctcacttagtggga 43282092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 47796473 - 47796359
Alignment:
Q  41 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 138  Q
    ||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||  |||||| |||||| || ||  || || |||||||||||||| |||| |||||||||| |||     
T  47796473 gtggtaagactagatgggataggattagaaatgacaatattagatagagagagttggagtaccaactatagtagaaaaggtggttgaaaataggcgtagg 47796374  T
Q  139 tggtttgggcatgta 153  Q
    |||||||||||||||    
T  47796373 tggtttgggcatgta 47796359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Original strand, 1523747 - 1523813
Alignment:
Q  25 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 91  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1523747 atgttgcgttgcatgagtgacaagactagacgtgataggattattaatgacaccattagagagagag 1523813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 285
Target Start/End: Original strand, 18637563 - 18637753
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||  | | || || ||| | |||||    
T  18637563 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattatatagttaggagattagatca 18637662  T
Q  195 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 285  Q
     || |||||||||||| | |  ||| |||  || |||||||| |||| ||  |||||||| ||||  |||||||||||  | |||||||||    
T  18637663 gatcgaggagagtcaaatcactagatgtatgggtagacctagaaaaaatacaagagaaactattatgaaggatttagaaataaatgagttg 18637753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 285
Target Start/End: Original strand, 18650997 - 18651187
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||  | | || || ||| | |||||    
T  18650997 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattatatagttaggagattagatca 18651096  T
Q  195 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 285  Q
     || |||||||||||| | |  ||| |||  || |||||||| |||| ||  |||||||| ||||  |||||||||||  | |||||||||    
T  18651097 gatcgaggagagtcaaatcactagatgtatgggtagacctagaaaaaatacaagagaaactattatgaaggatttagaaataaatgagttg 18651187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24376103 - 24376025
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||| || |||||||||    
T  24376103 tggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcgcttagtgggacaaggttttgttgttgtt 24376025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 378
Target Start/End: Original strand, 48515373 - 48515455
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  48515373 tggtttatgatagaacattatggcgtaattttattcatgtagccgccccaacttagtgggataaggctcggtggttattgttg 48515455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 317 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17907783 - 17907722
Alignment:
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  17907783 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccccatttagcaggataagacttggttgttgttgttg 17907722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 265 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25731585 - 25731472
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    |||||| |||| ||| | |||||||||||| |||| |   |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || | |  ||| ||||||||| |||    
T  25731585 gatttacaggttaataaattggatccaaatatggtttcgaatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagcagacctcgtttaatgggataagactt 25731486  T
Q  365 ggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||    
T  25731485 ggttgttgttgttg 25731472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 378
Target Start/End: Original strand, 28021146 - 28021219
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28021146 atagaacattatgaggtcgtttgacccatgtagcctactccacttggtgggataaggcttggttgttgttgttg 28021219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40008506 - 40008429
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| || | |||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  40008506 tatgatagaacattatgtcgttgtttgatccatgtagctgacctcacttaatgagataagacttggttgttgttgttg 40008429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 209
Target Start/End: Original strand, 5418071 - 5418195
Alignment:
Q  86 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc-ttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaa 184  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||  || ||| |||| ||||| |    
T  5418071 agagagttggggtagcacctcttgtagaaaatatggtggaaaataggctttagattgtttgtgcatgtagaaagaagacctgttgattctgtagtaagta 5418170  T
Q  185 gagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
    |||| |||||  ||||||| |||||    
T  5418171 gagtagatcaggtggaggatagtca 5418195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 368
Target Start/End: Original strand, 6682583 - 6682627
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 368  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6682583 tttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 6682627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 378
Target Start/End: Original strand, 20899411 - 20899455
Alignment:
Q  334 gtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20899411 gtagccggccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 20899455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 27022063 - 27021991
Alignment:
Q  19 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 91  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  27022063 atgagaatgttgcattggatgtgtgataagactagacaggataggattaaaaatgacaacattagagagagag 27021991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28562647 - 28562443
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
    |||||||| || ||||| |||||   || |||||||| ||||| |||| || ||||  |||||||||||  | ||||  ||| ||||||||| | |||||    
T  28562647 gggtagcatctctagtaaaaaagaatgtggaaaatagacttaggtggtatgcgcatacagagagaagacatgcagattttgtagtaagaagattagatca 28562548  T
Q  195 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 294  Q
     || ||| | ||| |  ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||  || ||||||||| | || ||||||||||| |||    
T  28562547 gatagagaatagttagattacaagaggtagaggatgacctagaaaaaatataagagaaactattatgaaagatttagagattaacgagttggatcctaat 28562448  T
Q  295 ttggt 299  Q
     ||||    
T  28562447 atggt 28562443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30200017 - 30199965
Alignment:
Q  326 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30200017 tgatctatgtagccggccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 30199965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 32879292 - 32879192
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtat-gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |  ||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32879292 aatgagttggatccaaatatggttaaaagatggaacattagggcgtaatttgatccttgtagccgaccctgcttagttggataaggcttggttggtgttg 32879193  T
Q  376 t 376  Q
    |    
T  32879192 t 32879192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 43424029 - 43423989
Alignment:
Q  338 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43424029 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 43423989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 278 - 337
Target Start/End: Original strand, 6807388 - 6807447
Alignment:
Q  278 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 337  Q
    ||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6807388 atgagttagatagaaatatggtgtatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgtag 6807447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 217 - 348
Target Start/End: Original strand, 22174123 - 22174254
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    ||||| ||||||| || ||| |||||||| |||||||| || |  || ||| ||||| | ||||| || |||  |||| |||| | |||||||||| |||    
T  22174123 agaggcagaggaaaacgtagaaaaactataagagaaactataaacaaagatctagagattaatgaattagatagaaatatggtatgtgatagaacattat 22174222  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 348  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  22174223 ggcgttgtttgatccatgtagccgaccccact 22174254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 265 - 336
Target Start/End: Original strand, 31859046 - 31859117
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| | | ||||||| ||||||    
T  31859046 gatttagaagtcaatgagttggatccaaatttaatttataatagaacactatgacataatttgattcatgta 31859117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35725604 - 35725569
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35725604 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 35725569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 247 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 40391952 - 40391845
Alignment:
Q  247 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 346  Q
    |||||||| | ||| || ||||||||  | ||| ||||||| | |||| |||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||    
T  40391952 agagaaactagtaggaatgatttagaaattaataagttggaccgaaatatggcttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctaaccgacccca 40391853  T
Q  347 cttagtgg 354  Q
    ||||||||    
T  40391852 cttagtgg 40391845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 223 - 374
Target Start/End: Original strand, 40830331 - 40830481
Alignment:
Q  223 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 322  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||||| ||||  | ||||||||| ||   | | || | |||||||||||| || || | |    
T  40830331 agaggaagacctagaaaatctataagagaaactattaagaaggatctagaaattaatgagttgtatatga-tatgatatatgatagaacattacggaggc 40830429  T
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
     |||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40830430 gtttgatccatgtagccaacccctcctagtgggataaggcttgattgttgtt 40830481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 217 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 44401284 - 44401164
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||  || ||||||||| | || |||||  ||| |||| || | |||||||||||| |||    
T  44401284 agaggtggaggatgacctagaaaaattataagagaaactattaagaaagatttagagattaacgagtt--atcaaaatatgttttatgatagaacattat 44401187  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagcc 339  Q
    | ||| |||||||||||||||||    
T  44401186 gacgtaatttgatccatgtagcc 44401164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 45054378 - 45054311
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 368  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||    
T  45054378 tatgatagaatattatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccacttggttggataatgcttggtt 45054311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 45841332 - 45841206
Alignment:
Q  24 gatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggta 123  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| |||||   |||| | |||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||||||||  |||     
T  45841332 gatgttgtgttgaatgtgtggtaagcttagaagagatacggttagaaatgacaacattagatagagagt-tgagtaacacctataatagaaaagacggtg 45841234  T
Q  124 gaaaataggcttagatggtttgggcatg 151  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||    
T  45841233 gaaactaggtttagttggtttgggcatg 45841206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 47413748 - 47413713
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47413748 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 47413713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 379
Target Start/End: Original strand, 3457544 - 3457645
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||| |||| | || ||||||| |||| |||||| | |||||||| ||||   ||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  3457544 aatgagttggatcaaaatattgtttatgataaaacattatggcataatttgatcaatgtgagcga-cctacttagtgggataaggctttgttgttgctgt 3457642  T
Q  377 tgc 379  Q
    |||    
T  3457643 tgc 3457645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 226
Target Start/End: Original strand, 26925264 - 26925342
Alignment:
Q  148 catgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 226  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| | || ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  26925264 catgcagagagaagactcgtagatgatgtagtaagaagagtagattagatagaggatagtcgaattaaaagaggtagag 26925342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 202
Target Start/End: Original strand, 30144793 - 30144883
Alignment:
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 202  Q
    |||||| |||||||||   ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  30144793 gaaaagatggtagaaatccggcttaggtagtttgggcaggtagagagaagacttgtagattctatagtacgaagagtagatcagatggagg 30144883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30914577 - 30914503
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||||||||||  ||||||  | |||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30914577 tatgatagaactttatggcagcgtttgatccatattgccaaccccacttagtgggataaggcttggttattgttg 30914503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 33650903 - 33650869
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33650903 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 33650869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 371
Target Start/End: Original strand, 33871479 - 33871549
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 371  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||   || |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  33871479 tatgatagaacattatggcgtaatttcatccatgtaattgagcccagttagtgggataagacttggttgtt 33871549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45841048 - 45840994
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45841048 tttgatccatgtagctgaccccaattagtggtataagacttggttgttgttgttg 45840994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12241728 - 12241684
Alignment:
Q  333 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12241728 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt-ttgttgttg 12241684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 376
Target Start/End: Original strand, 25578069 - 25578142
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||| |||||||||||||  || ||| | ||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25578069 tgataaaacactatggcgttgttagattcgtgtagccaaacctacttagtgggataaggattggttgttgttgt 25578142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 25579156 - 25579103
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25579156 atttgatccatgtcgccgaccccactcagtggtataaggcttagttgttgttgt 25579103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 161
Target Start/End: Original strand, 30632958 - 30633035
Alignment:
Q  84 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 161  Q
    |||||||||  |||||||||||||  || ||||  |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30632958 agagagagtcggggtagcacctatcataaaaaaaatggtggaagctcggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 30633035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 378
Target Start/End: Original strand, 475987 - 476059
Alignment:
Q  306 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| |||||||   ||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  475987 tagaacattatggcgctgtttgatccaagtagtggattctacttagtgggataaggcttggttgtttttgttg 476059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 3457368 - 3457471
Alignment:
Q  97 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 196  Q
    ||||||| |||||||||||||   || |||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||| ||||  ||||||||||| |    
T  3457368 gtagcacttatagtagaaaagactgt-gaaactaggtttaggtggtttgggcattcagagagaagacatgtagatgttgtagtaatgagagtggatcaga 3457466  T
Q  197 tggag 201  Q
    |||||    
T  3457467 tggag 3457471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3928380 - 3928344
Alignment:
Q  342 tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3928380 tcccacttagtgggataaggcttggatgttgttgttg 3928344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19262533 - 19262457
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||||| |||||||   |||||| |||||| ||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19262533 tatgatagaacattatggcggtgtttgattcatgtaaccgacgccacttggtgggatatggcttagttgttgttgtt 19262457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 380
Target Start/End: Original strand, 26847836 - 26847892
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgca 380  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  26847836 tttgatccacgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggctgttttcgttgca 26847892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27021795 - 27021723
Alignment:
Q  306 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||| | ||||||    
T  27021795 tagaacattatggcacaatttgatccatgttgccgaccccacttagtgggataggacttggttgatattgttg 27021723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 35734731 - 35734691
Alignment:
Q  336 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35734731 agccgaccccacttagcgggataaggcttggttgttgttgt 35734691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 376
Target Start/End: Original strand, 41157897 - 41157937
Alignment:
Q  336 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41157897 agccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 41157937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 42177177 - 42177018
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||| |||| |||||| | ||||  || ||| ||||| | ||||||||  ||  |||| |||| |||||| ||||| |||    
T  42177177 agaggtggaggaagacgtagaaaacctataagagaatctattaagaaagatctagagataaatgagtttcataaaaatatggtatatgattgaacattat 42177078  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    | |||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  42177077 gacgtcgtttgatctatgtaatcga-cccacttagtgggatatagtttgattgttgttgtt 42177018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 9797956 - 9797909
Alignment:
Q  124 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 171  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9797956 gaaaattggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttgtagat 9797909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27893828 - 27893769
Alignment:
Q  96 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 155  Q
    |||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  27893828 ggtaacacctatagtagaatagatggtggaaaataggcttaggtggtttgaacatgtaga 27893769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 30914749 - 30914674
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtaga 170  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||| | ||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  30914749 gggtagtacctattgtagaaaaaatggtagaaactcggctttggtggtttgggcatgtaacgagaagacttgtaga 30914674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #197
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 91
Target Start/End: Original strand, 35713617 - 35713676
Alignment:
Q  32 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 91  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  35713617 gttggatgtgtggtaaggttagatatgataggattagaaatgaaaatattagagagagag 35713676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #198
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 371
Target Start/End: Original strand, 35922407 - 35922530
Alignment:
Q  248 gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccac 347  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||| ||| |||| || | |||||||||||| |||| | | ||||||||||| || ||  ||| |     
T  35922407 gagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacattatgacctaatttgatccatataaccattcctat 35922506  T
Q  348 ttagtgggataaggcttggttgtt 371  Q
    ||||||||||| |  |||||||||    
T  35922507 ttagtgggatatgatttggttgtt 35922530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #199
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 37439647 - 37439580
Alignment:
Q  70 aatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttag 137  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| || |  |||||||||||||    
T  37439647 aatgacaacattagagagagagttggagtagcacctatggtagaaaagatgatgtaaaataggcttag 37439580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #200
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 337 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 635347 - 635309
Alignment:
Q  337 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  635347 gccgaccccacttagtgggataaggcttggatgttgttg 635309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #201
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5577532 - 5577498
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5577532 cccacttagtcggataaggcttggttgttgttgtt 5577498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #202
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 29653918 - 29653844
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagaga 86  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  29653918 agcagagatacggctgttgcgttggatgtgtggtaacactagacgggatagaattagaaatgacatcattagaga 29653844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #203
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 373
Target Start/End: Original strand, 30188512 - 30188542
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30188512 cccacttagtgggataaggcttggttgttgt 30188542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #204
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35066805 - 35066744
Alignment:
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  35066805 tggcgtaatttgatccatgttgccaaccacacttagtgagataaggcttggtt-ttgttgttg 35066744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #205
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 335 - 377
Target Start/End: Original strand, 38504695 - 38504737
Alignment:
Q  335 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  38504695 tagccgaccccacttagcgggataaggcttggctgttgttgtt 38504737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #206
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 40008777 - 40008636
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggt-agcacctatagtagaa 114  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| | ||||||  | || ||||| ||||||| ||||||||||||  || || | | |||||||   ||||    
T  40008777 gagatgaagatgttgcgtaggatgtgtggtaaaactagacaaaaaagaattagaaatgacaacattagagagag-ttggggataaacacctatcaaagaa 40008679  T
Q  115 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 157  Q
    ||| |||| |||| | || |||| |||||||||||||||||||    
T  40008678 aagatggtggaaactcggattaggtggtttgggcatgtagaga 40008636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #207
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 323 - 377
Target Start/End: Original strand, 41948724 - 41948778
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  41948724 atttcatccatgtagccaaccccacttagtggggtaatgtttggttgttgttgtt 41948778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #208
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 336 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 48735721 - 48735683
Alignment:
Q  336 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48735721 agccgaccccacttagtggcataaggcttggttgttgtt 48735683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #209
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 6429225 - 6429156
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagtt-ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||  |||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  6429225 gggtagcacctatagtagaaaaggcaggtgaaaaataggtttaggtggtttgggcatgccgagagaagac 6429156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #210
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 151
Target Start/End: Original strand, 23720829 - 23720898
Alignment:
Q  82 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatg 151  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||  || | ||| ||||| |||||||||||||    
T  23720829 agagagagagttagggttgcacctatagtagaaaagatggcggagactagccttaggtggtttgggcatg 23720898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #211
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 25731696 - 25731639
Alignment:
Q  33 ttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga 90  Q
    |||||||| |||||||| |||||  || ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25731696 ttggatgaatggtaagactagacgagaaaggattaagaatgacacctttagagagaga 25731639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #212
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 25826788 - 25826683
Alignment:
Q  58 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 157  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||   ||| | | |||| ||||||||| ||||||||| | ||||| | ||||||| | |||| ||||    
T  25826788 gataggattagaaatgaaaacattagagagggagttgcggttgaaactattgtagaaaagatggtagaaactcggcttgggtggtttgcgaatgtggaga 25826689  T
Q  158 gaagac 163  Q
    ||||||    
T  25826688 gaagac 25826683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #213
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 350
Target Start/End: Original strand, 37595891 - 37595932
Alignment:
Q  309 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 350  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  37595891 aacattatggcgtcatttgatccatgtagtcgatcctactta 37595932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #214
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 42177328 - 42177255
Alignment:
Q  63 gattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 136  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  42177328 gattagaaatgacaatattagagagagagttgaggtatcacctatagtagaaaagatggtgaaaactaggctta 42177255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #215
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 43653217 - 43653184
Alignment:
Q  341 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43653217 atcccacttagtgggataaggcttgattgttgtt 43653184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #216
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 372
Target Start/End: Original strand, 44930960 - 44930989
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44930960 cccacttagtgggataaggcttggttgttg 44930989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #217
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 47155224 - 47155183
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 365  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  47155224 tttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttg 47155183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #218
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 47185883 - 47185807
Alignment:
Q  300 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||||||| |||| | |  ||||||| || ||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  47185883 gtatgatagaacattatgacattgtttgatctat-tagccgaccccacttaatgagataagacttggttgttgttgtt 47185807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 312; Significance: 1e-175; HSPs: 194)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 12 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 36565605 - 36565238
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36565605 agcagagatgaggatgatgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 36565506  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36565505 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaatacccgtagatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaag 36565406  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36565405 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 36565306  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36565305 actatggcgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttgc 36565238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 36545065 - 36545433
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatag 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  36545065 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtaacacctatag 36545164  T
Q  110 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  36545165 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtca 36545264  T
Q  210 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 309  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36545265 agttaaaagacgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 36545364  T
Q  310 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36545365 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 36545433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36395314 - 36394949
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36395314 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 36395215  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggctt-agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36395214 gaaaagttggtagaaaataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggaaagtcaa 36395115  T
Q  211 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 310  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36395114 gttaaaagaggtataggaagacctaggaaaactatttgagaaaccgttagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatttggtgtatgatagaa 36395015  T
Q  311 cactatggcgtca-tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||||| | | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36395014 cactattgtggcattttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttg 36394949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 60 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11524040 - 11523721
Alignment:
Q  60 taggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctt-agatggtttgggcatgtagagag 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11524040 taggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagttaataggctttagatggtttgggcatgtagagag 11523941  T
Q  159 aagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt 258  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11523940 aagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 11523841  T
Q  259 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11523840 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 11523741  T
Q  359 aggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11523740 aggcttggttgttgttgttg 11523721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 40813240 - 40813608
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatag 109  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  40813240 agcagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacataataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatag 40813339  T
Q  110 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40813340 tagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtca 40813439  T
Q  210 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40813440 agttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttggtgtgtgataga 40813539  T
Q  310 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  40813540 acactatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaaacttcgttgttgttgttg 40813608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 39946775 - 39947132
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39946775 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattatagaaagagtgggggtagcacctatagta 39946874  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  39946875 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacctgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagactcaag 39946974  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  39946975 ttagaagaggtagaggacgacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtttatgatagaac 39947074  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
     |||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39947075 gctatggcgtcatttg--------agccga-cccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 39947132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 42854364 - 42854002
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |    
T  42854364 gagatgacgatgttgcgctggataagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccatcagagagagagtgggggtaacacctatagcagaga 42854265  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  42854264 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 42854165  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||    
T  42854164 aagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataacacta 42854065  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42854064 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggtttggtggttgttgttg 42854002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 96 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12491418 - 12491141
Alignment:
Q  96 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12491418 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaa 12491319  T
Q  196 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 295  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12491318 atgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 12491219  T
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12491218 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgt 12491141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 2796473 - 2796838
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagatta--gacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatag 109  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  2796473 agcaaagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactatagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcgcctatag 2796572  T
Q  110 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||  | |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2796573 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga---ct-gtagatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtca 2796668  T
Q  210 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| | |||||||    
T  2796669 tgttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaattagttgaactcaaatttggtttttgataga 2796768  T
Q  310 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa----ggcttggttgttgttg 375  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  2796769 acagtatggcgtaatttgattcatgtagacgaccccacttagtgggataaggatggcttggttgttgttg 2796838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 377
Target Start/End: Original strand, 18125097 - 18125454
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  18125097 gagatgagcatgttgcgctggatgagtgacaagacgagacatgataggattagaaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaa 18125194  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| |    
T  18125195 agttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcgggtt-a 18125293  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||    
T  18125294 aagaggtagagggagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttaaaagtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaatacta 18125393  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||| || |||||||| |||||| | | || ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18125394 tggtgt-atttgatcaatgtagtcaacccgacttagtgggataaaacttggttgttgttgtt 18125454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 41 - 378
Target Start/End: Original strand, 21121105 - 21121429
Alignment:
Q  41 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg 140  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||            |||| |||||||    
T  21121105 gtggtaagactagacgggataggattagaaatggcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtacaaaa------------taggtttagatg 21121192  T
Q  141 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 240  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21121193 gtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggacgagagttaggttaaaagaggtagagggagacctaagaaa 21121292  T
Q  241 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 340  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21121293 tctattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatcctaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccg 21121391  T
Q  341 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21121392 accccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 21121429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 45419156 - 45419517
Alignment:
Q  11 aagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagt 110  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  45419156 aagcggagatgaagatgttgcgttggattagtggtaagactagaagggataagattaggaatgacaccattagagaga-attg-gggtagcacctatagt 45419253  T
Q  111 agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 210  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||  | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  45419254 agaaaagatggtataaaatagacttaggtggtttgggcatgtagagataagacctgtagaggc--tagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcag 45419351  T
Q  211 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 310  Q
     |   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||| |    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  45419352 atctgaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttaaatcataatgagtttgatccaaatttggtttatgatagaa 45419451  T
Q  311 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45419452 cattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45419517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Original strand, 37077687 - 37078033
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||            |||    
T  37077687 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaaaactagacgagataggattaggaatgacaccattcggaagagagtgagggtag------------aaa 37077774  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||    
T  37077775 agttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagag--gacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcgggtcaa 37077872  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || | ||||||||||      
T  37077873 aataggtagatgaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatactttggaagatagaacac-- 37077970  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    || ||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  37077971 tgacgtaatttgatccatgcagccgaccccacttaatgggataaaacttggttgttgttgttg 37078033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 168 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 42469935 - 42469725
Alignment:
Q  168 agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggat 267  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||    
T  42469935 agatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagat 42469836  T
Q  268 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  42469835 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttattgggataaggcttggt 42469736  T
Q  368 tgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||    
T  42469735 tgttgttgttg 42469725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 66 - 373
Target Start/End: Original strand, 8932676 - 8932982
Alignment:
Q  66 taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||       
T  8932676 taggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacatacagtagaaaagttggtagaaaatagatttagatggtttggacatgtagaaagaagatcc 8932773  T
Q  166 gt-agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaag 264  Q
    || | ||||  | |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||     
T  8932774 gttaaatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaa 8932873  T
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||| |||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||| ||||    
T  8932874 gatttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggcttttgataaaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgaaataaagctt 8932973  T
Q  365 ggttgttgt 373  Q
    |||||||||    
T  8932974 ggttgttgt 8932982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 29520583 - 29520931
Alignment:
Q  17 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa- 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||     
T  29520583 agatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataggattagaaatgataccattagagagagagttggggtggcatctatagtagaaat 29520682  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    |  |||| ||||           |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | |     
T  29520683 aaatggtggaaa-----------tggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaaatcac 29520771  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  29520772 aagaggtagaggaag-cctagaaaaactataagagaaactgttaggaacgatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatta 29520870  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29520871 tggcgtaatttgatccatgtagcccaccccatttagtgggataatgcttggttgttgttgt 29520931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8879800 - 8879446
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||| |||||||  | ||| |||||||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  8879800 gagatgagaatgttgcacttgataagtggtaagactggactagataggattaggaatgacacaattagagagagaatgggggaagcacctatagtagaaa 8879701  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||  |    ||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| |||  ||  |    
T  8879700 agttggtagaaaatagacttagatgatttgggtatgtagagagaagacccg----tgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagggtcgggtcca 8879605  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    ||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||      
T  8879604 aagagcttgagggagacgtaggaaaactataagagaaaccattaaaaatgatttagaagtcaataagttgaatccaaatatggtttatgatataacac-- 8879507  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  8879506 tgacgtaatttaatccatgtagccgactccacttattaggataaagcttggttgttgttgt 8879446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 195 - 378
Target Start/End: Original strand, 2027631 - 2027814
Alignment:
Q  195 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||    
T  2027631 aatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttatattcaaat 2027730  T
Q  295 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga-tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
     |||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2027731 atggtttatgatagaacactatgacgccatttgatcc-tgtagccaacccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 2027814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 244 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25473535 - 25473402
Alignment:
Q  244 attagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatc 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  25473535 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgacc 25473436  T
Q  344 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25473435 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 25473402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 378
Target Start/End: Original strand, 32043522 - 32043871
Alignment:
Q  26 tgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  32043522 tgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtatcacctatagtacaaaagatggtaga 32043621  T
Q  126 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 225  Q
    || ||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||| ||||| ||| | ||||| ||||||| | ||||| | |  ||||||||     
T  32043622 aactagactttggtggtttggccatgtagagagaagacctgtggatgttgtagtaaggagaatagatcagatggaggggtgtcaaatcactagaggtagg 32043721  T
Q  226 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatt 325  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| || |  |||||| || || |||||||||||||   | |  |||| | |||||||||||||||||  | ||    
T  32043722 ggaagacctaaaaaaactattagagaaactatcaagaaggatctaaagatcaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggc--cgtt 32043819  T
Q  326 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32043820 tgattcatgta-ctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 32043871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 114 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26905168 - 26904908
Alignment:
Q  114 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||  || |||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |     
T  26905168 aaagttggtagaaaataggcttagatgatttagatatgtagagagaaaactcatacatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaagagagtcagata 26905069  T
Q  214 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 313  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||| ||| |||||    
T  26905068 aaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaataagttgga-ccaaatatagtttataataaaacac 26904970  T
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||  ||| ||| |||||| |||| |||||||||    
T  26904969 tatgtcgtaatttgatccatatagtcgaccccgtttaatggaataaggtttgg-tgttgttgt 26904908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 221 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14742234 - 14742080
Alignment:
Q  221 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 320  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |   ||||||||||||||||||    
T  14742234 gtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaagtcaatgagttggatccaaatatttt---tgatagaacactatggcg 14742138  T
Q  321 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742137 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 14742080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18752233 - 18751998
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18752233 gagatgagaatgttgcgctgaatgagtgttaagactagacataataggattagggatgacaccattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaa 18752136  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    ||||||| || || | ||||||||||||||||||  | ||| |  ||||    
T  18752135 agttggtagaaaata-gcttagatggtttggacatgtagagagaggatccatagatgccgttgttaaaagagtggatcaaatggaaaatagttagattaa 18752037  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac 254  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||    
T  18752036 aagaggtagaggaatacctaaaaaaaccattagcgaaac 18751998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 39953628 - 39953263
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| ||| |   |||||||||||||||  || |||||||||||  |    
T  39953628 agcagagatgagaatgttgcgttggatgtgtggtaagattaaacatgatataattagaaataatgacattagagagagagttgggatagcacctatatga 39953529  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||| ||||||||| |||  |||| |||||| |||||||||||||  |||   | |||  ||| ||||| ||||| ||||| ||| ||| || |||      
T  39953528 gaaaagatggtagaaactagatttaggtggtttaggcatgtagagaggtgacctatggattatgtagtaaggagagtagatcagatgaaggcgaatcaga 39953429  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    | |  |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||| ||   |||  |||| | |||| | ||    
T  39953428 tcactagaggtaggggtagacctaggaaaactaaaagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttagagaaaaacatggtttttgatgggac 39953329  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39953328 actatggagttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 39953263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 265 - 376
Target Start/End: Original strand, 44529396 - 44529507
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44529396 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 44529495  T
Q  365 ggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||    
T  44529496 ggttgttgttgt 44529507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 267 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 44047641 - 44047530
Alignment:
Q  267 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  44047641 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgg 44047542  T
Q  367 ttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||    
T  44047541 ttgttgttgttg 44047530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 43904947 - 43904700
Alignment:
Q  97 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag---gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 193  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  |||||||    |||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  43904947 gtagcatctatagtagaaaagatggaggaaaataataagcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagatgttgtagtaagaagaatagatc 43904848  T
Q  194 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 293  Q
    | |||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||  |||  |  ||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  43904847 agatggaggatagtcaaattacaagaggtacaggaagacctagaaatactataagagaaacggttatgagagatttagagattaatgagttggatctaaa 43904748  T
Q  294 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 341  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43904747 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 43904700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 378
Target Start/End: Original strand, 30559718 - 30559982
Alignment:
Q  119 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 218  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||||   | |  ||    
T  30559718 tggtcgaaaataggcttaggtggtttgggcatttagagagaagacatgtagattttgtagtaaggacagtggatcagatggaggatagtcggatcactag 30559817  T
Q  219 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 318  Q
    || |||| |||||| ||  |||||||| |||||||| || || || ||||||||| | ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||     
T  30559818 agatagatgaagacttaaaaaaactataagagaaactatcaggaaagatttagagattaatgagttggatccatatatggtttatgatagaacattatga 30559917  T
Q  319 cgtcatttgatcc-----atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||| |||||||||     |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30559918 cgtaatttgatccatgtaatgtagccgaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 30559982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 103 - 378
Target Start/End: Original strand, 32930970 - 32931244
Alignment:
Q  103 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga-ctagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 201  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | |||||| || ||||| |||||||| |||| | ||| ||||| |||| ||||| ||| | ||||| ||||||    
T  32930970 cctatagtagaaaaggtggcagaaaacatgcttaggtgatttggacatgtagaaagaaaatcta-tagattctgtagtaaggagactagatcagatggag 32931068  T
Q  202 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt 301  Q
    || |||||  | |  ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | ||||||||||| | |||| ||||||    
T  32931069 gatagtcatatcactagaggcagaggaagacctaaaaaaactatcagagaaactattaggaaagattttgaaattaatgagttgga-cgaaatatggtgt 32931167  T
Q  302 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  32931168 atgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaagccttggttgttgatgttg 32931244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 352
Target Start/End: Original strand, 29700268 - 29700534
Alignment:
Q  86 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaag 185  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| | | ||| |||| ||||| ||    
T  29700268 agagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggaggaaagttggcttaggtggtttgggcatatagagaaaagaccattggattctgtagtaaggag 29700367  T
Q  186 agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 285  Q
    ||| ||| | |||||||| |||||  | |  |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | ||| || || || ||| | ||||||| |    
T  29700368 agtagattagatggaggatagtcatatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactaaaagagaaactaataggaaagacttggagataaatgagtcg 29700467  T
Q  286 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagt 352  Q
    || | |||||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29700468 gaccaaaattttgtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgactccacttagt 29700534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 256 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15215532 - 15215410
Alignment:
Q  256 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg 355  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  15215532 attagaaaagatttagagatcaatgagtttgatccaaatatggtttttaatagaacactatgacgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagtagg 15215433  T
Q  356 ataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15215432 ataaggcttggttgttgttgttg 15215410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 265 - 378
Target Start/End: Original strand, 490506 - 490619
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  490506 gatttagagattgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 490605  T
Q  365 ggttgttgttgttg 378  Q
    | ||||||||||||    
T  490606 gtttgttgttgttg 490619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10080264 - 10079995
Alignment:
Q  17 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 116  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||    
T  10080264 agatgatgatgttgcgttgggtgtttggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagagagttgaggtagcatcta-agtagaaaa 10080166  T
Q  117 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 216  Q
    | |||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |  |||  ||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| | |      
T  10080165 gatggtggaaactaggcct-gatggtttgggcatgtagagagaagacctgaggattttgtagtaaggagagtagatcaaatgaaggggagtcaaatcact 10080067  T
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat 288  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||  |||  || ||| ||||| | ||||||||||||    
T  10080066 agaggtagaggaagacctagagaaactataagaaaaactgttaagaaagatctagagattaatgagttggat 10079995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 184 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35362842 - 35362651
Alignment:
Q  184 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagt 283  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |    | ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||    
T  35362842 agagtagatcaaatggaggatagtcaaatccctataggcagaggaagacctagaaaaactatcggagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagt 35362743  T
Q  284 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    ||||   |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35362742 tggactgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 35362651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Original strand, 16917102 - 16917462
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |  ||||||||| | | |  ||||||||||  ||||||| |||||| || | |||  |||||| ||| | ||||    
T  16917102 agcagagatgagaatgttgcgttgactttgtggtaagactcggctggataggattaaaaatgacaacattagtgataaagttggggtagtaccgaaagta 16917201  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||     
T  16917202 gaaaagatggtgcaaactaggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaggcttgtagat-ttgtagtaaggagagtagatcagattgaggatagtcaaa 16917300  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    | |  | ||||||| |||||||||| ||| ||||  | ||||| || |   | ||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  16917301 tcactacaggtagaagaagacctagaaaagctataggtgaaactatcaaggaagatttagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgatagaac 16917400  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    | | || |  | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16917401 a-tttgactgcttttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataagacttggttattgtt 16917462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35643872 - 35643606
Alignment:
Q  105 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa----tgga 200  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||         |||| ||| | ||||||     ||||    
T  35643872 tatagtagaaaagatggtggaaaatatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtag---------taaggagaatagatcaatcagctgga 35643782  T
Q  201 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg 300  Q
    ||| |||||  |||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| ||||     
T  35643781 ggatagtcagattactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtt 35643682  T
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||  | | |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35643681 tatgatagaacact--gccatattttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgttg 35643606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 372
Target Start/End: Original strand, 12025847 - 12026058
Alignment:
Q  152 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 251  Q
    |||||||||||   |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||| |    
T  12025847 tagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagagaagagtcaggttaaaagaggtaaatgaagacctaagaaaaccattagaaa 12025946  T
Q  252 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat---ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 348  Q
    |            ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||   | |||||||||||||||||| |||| || |||    
T  12025947 a------------gatttagaggtcaataagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcgtcatttgatccatgtaaccgaccctact 12026034  T
Q  349 tagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    |||||| |||||| ||||||||||    
T  12026035 tagtggaataaggtttggttgttg 12026058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 246 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 45041445 - 45041315
Alignment:
Q  246 tagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccc 345  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||  || |||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  45041445 tagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaa-tatggtttatgatagcgcattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccc 45041347  T
Q  346 acttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45041346 acttagtgggataaggcttggttgttgatgtt 45041315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13172011 - 13171865
Alignment:
Q  14 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 113  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || |||||| |||||  ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  13172011 cagagatgagaatgttgcattggatgtgtagtaagactagacgggataggattagaaatgacaagattagagagagagttggggaagcacctatagtaga 13171912  T
Q  114 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 160  Q
    |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||    
T  13171911 aaagatggtggaaaatatgcttaggtggtttgggcatataaagagaa 13171865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 16351312 - 16351653
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||   ||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  16351312 gagatgaagatgttgcgttggatatgtggtaagactagacggaatagagttagaaatgacaacattagagagagaattagggtagcacctatagtagaaa 16351411  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
                 ||| ||| | |||||| ||||||||||||||| |||  | |||  ||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |     
T  16351412 c------------tagacttgggtggtttaggcatgtagagagaaaacttttggatcatgtagtaaggagagtagatcagatggaggggagtcaagtcac 16351499  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
      ||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||| ||   | |  |||| | | |||||||||||    
T  16351500 ttgagataggagaagacctagaaaaactattagagaaactattaagaaggatctagagattaatgagtt-gagaaagacatggtttttaatagaacacta 16351598  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 370  Q
    |||| || |||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16351599 tggcatcgtttgattcatgtagacgaccccacttagtggaataaggcttggttgt 16351653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 222 - 378
Target Start/End: Original strand, 23492163 - 23492318
Alignment:
Q  222 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 320  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||| || ||| | | ||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||| |    
T  23492163 tagaggaagacctag-aaaactattagagaaactactcagaaag-atgtagcgattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaacactatggtg 23492260  T
Q  321 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23492261 tcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgtttgttgttgttg 23492318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 375
Target Start/End: Original strand, 25288912 - 25289045
Alignment:
Q  242 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 341  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| | | |||||||| || |||| ||    
T  25288912 ctataagagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataactctatgacataatttgatctatttagctga 25289011  T
Q  342 tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
     ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25289012 ccccacctagtggtataaggcttggttgttgttg 25289045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 375
Target Start/End: Original strand, 25300247 - 25300380
Alignment:
Q  242 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 341  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| | | |||||||| ||||||| ||    
T  25300247 ctataagagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataacactatgacataatttgatctatgtagctga 25300346  T
Q  342 tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
     ||||| |||||| | |||||||||| |||||||    
T  25300347 ccccacctagtggaacaaggcttggtggttgttg 25300380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 197
Target Start/End: Original strand, 30748377 - 30748560
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||| ||| |||||  |||||    
T  30748377 agcagatatgaggatgtttcgttggatgtgtggttagattagacatgataggattagaaatgacaacattacagagag-ttgt-ggtcgcaccagtagta 30748474  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaat 197  Q
    |||||| |||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||| | ||| ||||||||    
T  30748475 gaaaagatggtggaatcaaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagattctatagtaagcaaagtagatcaaat 30748560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 223 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 35914754 - 35914601
Alignment:
Q  223 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 322  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||  || | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||     
T  35914754 agaggaagacatagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttgaagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgta 35914655  T
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35914654 atttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataagacttggttgttgttgt 35914601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 45512856 - 45512558
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagtaga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| | | |||| |||| ||||| |  |||| |||||| | ||  |||||||||||||||||||    
T  45512856 gagatgagaatgtttcgttggatgtgtggtaagactagatagg-tagggttagaaatgaaaatattaaagagagggagttggggtagcacctatagtaga 45512758  T
Q  114 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 213  Q
    |||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    ||||| | || ||||| ||||| ||| | ||||  || |||||| |     
T  45512757 aaagatgatggaaaataagcttagatggtttgggcatataaagagaagatctctagattcggtagtaagcagagtagattagatggcagatagtcaaatc 45512658  T
Q  214 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaaca 312  Q
    |  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||| | |||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  45512657 actagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgagttcgatccaaaatatggtttatgatagaaca 45512558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 217 - 376
Target Start/End: Original strand, 2216411 - 2216568
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || | |||||||||||| |||    
T  2216411 agaggtagaggaagacctagaaaaaacataagagaaactattaagaag-atttagagatcaatgagttggatcctaatatgtt-tatgatagaacattat 2216508  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
     | || ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2216509 agtgtaatttgatccatgtagccgaccccactcagtgagataaggcttggtggttgttgt 2216568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6510784 - 6510616
Alignment:
Q  18 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaag 117  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||   |||| |||||| ||||||||||||  |||||||| | |  ||||||||||| ||||||||    
T  6510784 gatgatgatgttgtgttggataagtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaccattgaagagagagagcg--tagcacctataatagaaaag 6510687  T
Q  118 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagt 188  Q
    ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||||||||    
T  6510686 ttggtagaaaacaaatttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtcgtaagaagagt 6510616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Original strand, 5908564 - 5908930
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||| || ||| ||||||| ||   |||| |||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  5908564 gagatgaggctgctgccttggatgtgtttcaagactagacgggataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagaacctatagtagaaa 5908663  T
Q  116 agttggtagaaaa------taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
    || |||| ||||       ||| ||||| ||||||||  || ||||||||||||  ||||||  ||| ||||| ||||| |||||  |||||||  ||||    
T  5908664 agatggttgaaatggaaactagacttagttggtttgg--atatagagagaagacctgtagattttgtagtaaggagagtagatcaggtggaggatggtca 5908761  T
Q  210 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 309  Q
      | |  ||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||  |  | | ||||||||||||| |||| || | |||||||||    
T  5908762 gatcactagagacataggaagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaagatccaaggattaatgagttggatcaaaatatgatttatgataga 5908861  T
Q  310 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||  ||| |||| ||| |||||||||||  |  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5908862 accttattgcgtaattggatccatgtagttggacccaattagtggaataaggcttggttgttgttgttg 5908930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 194
Target Start/End: Original strand, 7046285 - 7046434
Alignment:
Q  45 taagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt 144  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| |||| |||  | ||||||| ||||||    
T  7046285 taagactagacatgataggattagaaatgacaacattagagagagaggctgggtagcaccaatcgtagaaaagatggtggaacctcggcttagctggttt 7046384  T
Q  145 gggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| | |||| ||||| ||||| |||||    
T  7046385 gggcatgtagagagaaaacacgtagcttctgtagtaaggagagtagatca 7046434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 378
Target Start/End: Original strand, 43733330 - 43733490
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||    |||||| ||||| | ||||||||||||  |||| || | |  |||||||||||||    
T  43733330 agaggtagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactatcgagaaggatctagagattaatgagttggataaaaatgtgttttg-gatagaacactat 43733428  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  43733429 ggcgtcgtttcattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtggctgttgttg 43733490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 287 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10668586 - 10668494
Alignment:
Q  287 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10668586 atccatatttggtgtacgatagaacactatgaggtcatttgatcgatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 10668494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 12492206 - 12492130
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 88  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12492206 agcagatatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattagagaga 12492130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 304 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1928659 - 1928584
Alignment:
Q  304 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1928659 gatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 1928584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 216 - 378
Target Start/End: Original strand, 28169514 - 28169675
Alignment:
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||| || | ||    
T  28169514 aagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagagaaactattaggaaagattttgagattaatgagttggattcaaatatggtttatgataaaatatta 28169613  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||| || |||| |||||| || || | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28169614 tggtgtaattttatccatataaccaaccccacttagt-ggataaggcttggttgatgttgttg 28169675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 378
Target Start/End: Original strand, 42584407 - 42584642
Alignment:
Q  130 aggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaa 229  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||| |||   ||||  | ||||||||||||  ||    
T  42584407 aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatgaaggtttgtcagatcaaaagaggtagataaa 42584506  T
Q  230 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 329  Q
    ||||||| |||||||| ||           ||||| || || |||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  42584507 gacctagaaaaactataag-----------gaaag-atctataggttaatgatttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat 42584594  T
Q  330 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  42584595 ct-tgtagccgaccccacttagtgggataagacttgattgttgttgttg 42584642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 7531842 - 7531646
Alignment:
Q  178 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 277  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||  | |  |||||||  || |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||| | |    
T  7531842 gtaaggagagtagatcagatggaggggagtcagatcactagaggtaagggtagacctagaaaaactatacgagaaactattaggaaggatctagagataa 7531743  T
Q  278 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||||||   | |  |||| | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7531742 atgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaactcacttagtaggataaggcttggttgttgtt 7531646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9905132 - 9904940
Alignment:
Q  125 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 224  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || | | |||||   | ||||||||||| | |||||||||||    
T  9905132 aaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgttgtagtaaaaaaa-tagatcacgggaaggagagtcaaatcaaaagaggtag 9905034  T
Q  225 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 318  Q
    | |||||||||| |||||||  |||||||| ||||  || ||||||||  | ||||| ||||||| ||||  ||| ||||||| |||| |||||    
T  9905033 atgaagacctagaaaaactacaagagaaactattaataaagatttagaaattaatgatttggatcaaaataaggtttatgataaaacattatgg 9904940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 217 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30198425 - 30198264
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||  ||||  || ||| | ||| | |||||||||||||  ||| |||| |||||||||| | |||    
T  30198425 agaggcagaggtagacttagaaaaactataagagaaattattaagaaagatattgagattaatgagttggatcggaatatggtttatgatagaatattat 30198326  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    || ||  ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30198325 ggtgtagtttgatctatgttgccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 30198264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 217 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30812975 - 30812814
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||   ||||||  |||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | ||||||||||||||    
T  30812975 agaggtaggggtagacctagaaaaactatacaagaaactgttaggaaggatctagagataaatgagttggaaaaagacatggtttttgatagaacactat 30812876  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    || ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30812875 ggtgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggtggttgttgttg 30812814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 302 - 378
Target Start/End: Original strand, 32276893 - 32276969
Alignment:
Q  302 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32276893 atgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagacgaacccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttg 32276969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32569788 - 32569708
Alignment:
Q  298 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32569788 gtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatttatgtagccgaccccatttagtgggataagacttggttgttgttgttg 32569708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 277 - 373
Target Start/End: Original strand, 44699649 - 44699745
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||| || | |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44699649 aatgagttagaccgaaatatggtgcatgatagaacactatggcgtaatttgatccctgtagcagaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgt 44699745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 161
Target Start/End: Original strand, 9695583 - 9695698
Alignment:
Q  46 aagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttg 145  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||    
T  9695583 aagactagacaggatagaattagaaatgacaacattatagagatatttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttg 9695682  T
Q  146 ggcatgtagagagaag 161  Q
    ||||||||||||||||    
T  9695683 ggcatgtagagagaag 9695698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 378
Target Start/End: Original strand, 31715992 - 31716106
Alignment:
Q  266 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc--cgatcccacttagtgggataaggct 363  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |    ||||||||||||||||||||    
T  31715992 atttagagattaattagttggatccaaatatggtttaagatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcgtcaccaccacttagtgggataaggct 31716091  T
Q  364 tggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||    
T  31716092 tggttgttgttgttg 31716106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39760788 - 39760572
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||  || |||||||||| |||    
T  39760788 agcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaggattagacaagataggagtagaaatgataacattagagacagagttgggttagcacctatcgta 39760689  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||   || |||| |    |||| |||||||||||| |||||| |||| | |||||| | ||  |||| ||||| ||||| |||||||  ||||||     
T  39760688 gaaaagaatgtggaaact----ttaggtggtttgggcatatagagaaaagagttgtagattccgtaataaggagagtagatcatatggagggtagtcaaa 39760593  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagac 232  Q
    |    ||||||||||||||||    
T  39760592 tcgctagaggtagaggaagac 39760572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 44681387 - 44681252
Alignment:
Q  28 ttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 127  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  44681387 ttgcattggatgtgtggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagacagttgtggtagcacctataatagaaaagatggtggaaa 44681288  T
Q  128 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    ||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  44681287 ataagcttagaaggtttggaaatctagagagaagac 44681252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12797011 - 12796912
Alignment:
Q  63 gattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||  ||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  12797011 gattaggaataacaccattagaaagag--tggaggtaacacctatagaagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttaggcatgcagagagaaga 12796914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 376
Target Start/End: Original strand, 26363660 - 26363768
Alignment:
Q  266 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  26363660 atttagaggtcaa-gagttggatctaaatatggtttatgatagaacact-tagtgtaatttgatccatgtagtcgaccccactcagtgggataagacttg 26363757  T
Q  366 gttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||    
T  26363758 gttgttgttgt 26363768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 232 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39967643 - 39967497
Alignment:
Q  232 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 331  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||| | | ||||||||||||  | || | || |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  39967643 cctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagcgattaatgagttggattgagatatagtttatgttagaacattatggcgtagtttgatcc 39967544  T
Q  332 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  39967543 atgtagccgatcccacttattgtgataatgcttggttgttgttgttg 39967497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 2518749 - 2518597
Alignment:
Q  18 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaag 117  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | |  |||||||||||  ||||||||||    
T  2518749 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcacctcaagtagaaaag 2518651  T
Q  118 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 171  Q
     |||| ||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  2518650 atggtggaaaataggtttaggtggtttgattatgtagagagaagacttgtagat 2518597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 15215637 - 15215556
Alignment:
Q  10 gaagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 91  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15215637 gaagcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactatacaggataggattagaaatgacaccattagagagagag 15215556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27556377 - 27556300
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27556377 tatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggttaaagcttggttgttgttgttg 27556300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 30113557 - 30113416
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||| |||||| | | ||||  || ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||    
T  30113557 gagatgagaatgttgtgctagatgtttgttaagaatagatatgataagattatgaatgacattattagagagagagtcggggtaacacatatagtagaaa 30113458  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 157  Q
    || |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  30113457 agatggtagaaaataggtttaattggtttgggcatatagaga 30113416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Original strand, 25288820 - 25288916
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctata 108  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25288820 agcagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagagagtgtgggggtagcacctata 25288916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Original strand, 25300155 - 25300251
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctata 108  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25300155 agcagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagagagtgtgggggtagcacctata 25300251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 375
Target Start/End: Original strand, 3801995 - 3802154
Alignment:
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    |||| |||||||||||| ||  ||||| |  ||||| || ||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||    
T  3801995 aagatgtagaggaagacatacaaaaacaacaagagagactattatgaaagatttaaaggttaatgagttggattcaaacatggtatatgatcgaacacta 3802094  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    ||| || |||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3802095 tggagtaatttgattaatgtagtcgaacccatttagtgggataaggctttgttgttgttg 3802154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 301 - 376
Target Start/End: Original strand, 12611704 - 12611779
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611704 tatgttagaactttatggtgtcgtttgatccatgtagccgatcccaattagtgggataaggcttggttgttgttgt 12611779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 287 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8255622 - 8255529
Alignment:
Q  287 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc--gatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8255622 atccaaatatggtttatgatagaccaatatggcgtaatttgatccatgtagccgagacaccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttg 8255529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 375
Target Start/End: Original strand, 14459043 - 14459177
Alignment:
Q  242 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 341  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| || | |||| |||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  14459043 ctataagagaaactattaggaaagatttggagattaatgagttagaccaaaatatggtttatgatggaacattatggtgtaatttgatccatgtagccga 14459142  T
Q  342 -tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
      ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14459143 cccccactttgtgggataagccttggttgttgttg 14459177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 277 - 378
Target Start/End: Original strand, 3473753 - 3473854
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||| |  |||||||| |||||| ||| | |||||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3473753 aatgagttggaccggaatttggtttatgattgaatattatggcgaaatttaatccatttagccgaccccacttagtgggataaggctttgttgttgttgt 3473852  T
Q  377 tg 378  Q
    ||    
T  3473853 tg 3473854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 377
Target Start/End: Original strand, 13589474 - 13589762
Alignment:
Q  82 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 181  Q
    |||||||||||   |||||| |||||| |||||||  |||||||||||| | |||| |||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||| |||     
T  13589474 agagagagagttgaggtagcgcctataatagaaaatatggtagaaaatatgattaggtggtttgaacatgttgagagaagaccgatagatgttgtagtac 13589573  T
Q  182 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 281  Q
    ||||||| ||| | |||||||| | |        |||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||| || | |||||    
T  13589574 gaagagtagattatatggaggacaat-------gaagaggtagatgaagacttagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttaaagattaatga 13589666  T
Q  282 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||| ||| |||| || | |   |||||||| |||||||  |||||||| |||||||| | || || |  || |||||| |||| |||||||||||    
T  13589667 gttgaatcaaaatatgattttaaatagaacaatatggcgcaatttgatctatgtagccaaccctacattatgagataagacttgattgttgttgtt 13589762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 314 - 379
Target Start/End: Original strand, 35323993 - 35324058
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35323993 tatgacgtaatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 35324058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 324 - 372
Target Start/End: Original strand, 26055651 - 26055699
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26055651 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 26055699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 209
Target Start/End: Original strand, 36143287 - 36143480
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||   ||||||||||| || || |  |||||||||    |   |||||||||||||| |    
T  36143287 agcagagatgaggatgttgtgttggtcgtgtggtaagactagatgagataggattagaaaggaaaagattagagag----tcgaggtagcacctatagca 36143382  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
    ||| || |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||   ||||| |||| ||| | ||||| |||||||||||||| |||||    
T  36143383 gaatagatggtggaaaatagacttaggtggtttgggcatttagagaaaagacctatagattctgtagtatggagagtagatcaaatggaggatagtca 36143480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 291 - 375
Target Start/End: Original strand, 36143538 - 36143622
Alignment:
Q  291 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  36143538 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtcatctgatccatgtagccgaccccacctagtcggaaaaggcttggttgttgttg 36143622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 30456575 - 30456441
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |   ||||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||  | || ||||||||||||    
T  30456575 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagacca-atgggatagaattagaaatgacgacattagagagatagttcgagttgcacctatagta 30456477  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggg 147  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||  |||||||||    
T  30456476 gaaaagatggtagaaactagacttatgtggtttggg 30456441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 301 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 35647005 - 35646930
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  35647005 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccgaccccacttagtgtaacaaggcttggttgttgttgt 35646930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 38392046 - 38391919
Alignment:
Q  223 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 322  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||  || ||| || || | ||||||| ||||| |||| |||| |||||||||| | ||||||||     
T  38392046 agaggaagacctagaaaaactatatgagaaaccattaagaaagatctacagattaatgagtgggatcgaaatatggtatatgatagaatattatggcgta 38391947  T
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccactta 350  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38391946 atttcatccatgtggccgatcccactta 38391919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 323 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41031473 - 41031418
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41031473 atttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 41031418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 323 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41031579 - 41031524
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41031579 atttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 41031524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 42493668 - 42493536
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||| |||||   ||||||| ||||   ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  42493668 agcaaagatgaggatgttgcgttggttgtgtggtaagattagtcaagattggattgtaaatgacaacatt--ggagagagttggggtaacacctatagta 42493571  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgg 146  Q
    |||||| | || |||| ||||||||| ||||||||    
T  42493570 gaaaagattgtggaaactaggcttaggtggtttgg 42493536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 305
Target Start/End: Original strand, 5266027 - 5266140
Alignment:
Q  191 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc 290  Q
    |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||  |||| || |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5266027 atcaaacggaggagagt-aagtcagaagaggtagagaaagacctagaaaaactatcatagaaatcattataatggatttggaggtcaatgagttgaatcc 5266125  T
Q  291 aaatttggtgtatga 305  Q
    |||||| || |||||    
T  5266126 aaatttagtttatga 5266140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10824441 - 10824331
Alignment:
Q  99 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatg 198  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||  |||||  ||| ||| | ||||| |||||||||    
T  10824441 agcacctaaagtagaaaagatggtcgaaaataggcttaggtggtttgggtatttagagaaaagactcatagattttgtagtatggagagtagatcaaatg 10824342  T
Q  199 gaggagagtca 209  Q
    ||||| |||||    
T  10824341 gaggatagtca 10824331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 329 - 378
Target Start/End: Original strand, 1064955 - 1065004
Alignment:
Q  329 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1064955 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 1065004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 378
Target Start/End: Original strand, 21425229 - 21425330
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||| |||| || | ||||||||| || |||||| | |||||||||||||||| || || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  21425229 aatgagttggatcgaaatatgatttatgatagaccattatggcataatttgatccatgtagcagaccctacttagtggaatatggcttggttattgttgt 21425328  T
Q  377 tg 378  Q
    ||    
T  21425329 tg 21425330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Original strand, 30689942 - 30690019
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  30689942 tatgatataacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttggtttttattgttg 30690019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 30783400 - 30783041
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag-----agagagtgtgggtagca-cctatag 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||     |||||||  || ||||| |||||||    
T  30783400 gagatgaggatcttgcgttggatctgtggcaagactagataggataggattagaaatgacaacattagaggggagagagagttgggatagcaacctatag 30783301  T
Q  110 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
    ||||||| | ||| ||||   ||||||| | |||||||| |||||||| |||||  ||||||  ||| ||||  ||||| |||     |||||| |||||    
T  30783300 tagaaaaat-ggtggaaac--ggcttaggttgtttgggcttgtagagaaaagacatgtagattttgtagtaaagagagtagat-----ggaggatagtca 30783209  T
Q  210 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 308  Q
      | |  ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||| |||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||| ||| |||     
T  30783208 gatcactagaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaag-atctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataataa 30783110  T
Q  309 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||| ||||  ||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||  ||||||||||    
T  30783109 aacattatgaggtagtttgatccatgtagccgaccccatctagtgggataaaacttgactgttgttgtt 30783041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 314 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 39651090 - 39651025
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39651090 tatggtgtaatttgatccatatacccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 39651025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 373
Target Start/End: Original strand, 1313771 - 1313843
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1313771 tatgatagaacattatggcgtaattttatccatgtagttgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgt 1313843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 136
Target Start/End: Original strand, 13986416 - 13986536
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||| | |||||  ||||  ||||||||||||| ||||| |||| || |  ||||||||||||||||| |||    
T  13986416 gagatgaggatgttacactggatgagtggtaatactagacgagatataattaggaatgacatcattaaagagggatttggggtagcacctatagtacaaa 13986515  T
Q  116 agttggtagaaaataggctta 136  Q
    |  ||||||||||||| ||||    
T  13986516 atatggtagaaaatagactta 13986536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 378
Target Start/End: Original strand, 14903689 - 14903845
Alignment:
Q  222 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 321  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||  |||||||    |||||||| || | ||||  ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  14903689 tagaggaagacctagaaaaactataagagagactattgggaaatatttagaaagtaatgagttagaccaaaataaggtttatgataggacattatggcgt 14903788  T
Q  322 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  14903789 aatttgatccatgtagcttaccccacttagtggggaaaaacttggttgttgttgttg 14903845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Original strand, 39051065 - 39051205
Alignment:
Q  17 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 116  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||  || || |||||||  | |||||    
T  39051065 agatgaggatgttgtgttagatgtgtggtaagacaagacatgatagaattagaaatgacaatattcgagagagagttgggataacacctatcattgaaaa 39051164  T
Q  117 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 157  Q
    | ||| ||||| | || |||| ||||||||| |||||||||    
T  39051165 gatggcagaaactcggtttaggtggtttgggtatgtagaga 39051205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Original strand, 41212068 - 41212147
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta--gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  41212068 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctatagccgaccccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgttg 41212147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 43350827 - 43350728
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||    ||| || |||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  43350827 aatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaact---tggtgtaatttgatccaagtagccgaccccgctaagtgggataaggcttggttgttgttgt 43350731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Original strand, 36042407 - 36042482
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| |||  ||||||||||||||||    
T  36042407 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagcggaccccaattaatgggaaaagatttggttgttgttgttg 36042482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 38901892 - 38901817
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38901892 tgatataacactatggcggcatttgattcatgtagcggaccccatatagtgggataaggcttgattgttgttgttg 38901817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2776524 - 2776442
Alignment:
Q  82 agagagagag-tgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2776524 agagagagagctgggggtagcacctatcgtagaaatgatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcatgttgagagaagac 2776442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18474239 - 18474173
Alignment:
Q  97 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18474239 gtagcacctatagtagaaatgatggtggaaactaggcttagttggtttgagcatgtagagagaagac 18474173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 244
Target Start/End: Original strand, 25985462 - 25985668
Alignment:
Q  35 ggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggct 134  Q
    ||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  25985462 ggatgtgtggtaagacaagacaggatagaattagaaacgacaacattagagagag--ttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagact 25985559  T
Q  135 tagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacct 234  Q
    |   || ||| ||||||| ||||||||||  ||  ||  ||  ||||| ||| | ||||| ||| ||| ||||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  25985560 tgcgtgattttggcatgt-gagagaagacatgtgaattttgaagtaaggagactagatcagatgtaggggagtcaaatcactagaggtagaggaagacct 25985658  T
Q  235 aggaaaacta 244  Q
    || |||||||    
T  25985659 agaaaaacta 25985668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28269840 - 28269759
Alignment:
Q  214 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 296  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28269840 aaaagaggtatatgaagacctagaaaaattataagagaaactattagcaag-atttagaggttaatgagttggatccaaattt 28269759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 370
Target Start/End: Original strand, 18741843 - 18741908
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 370  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18741843 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgt 18741908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 370
Target Start/End: Original strand, 18746807 - 18746872
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 370  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18746807 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgt 18746872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 375
Target Start/End: Original strand, 36069774 - 36069883
Alignment:
Q  266 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 365  Q
    |||||||| | |||||||||| |  |||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| ||| |||| |||||    
T  36069774 atttagagattaatgagttgggtagaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatccatatagccaaacccacttactggaataatgcttg 36069873  T
Q  366 gttgttgttg 375  Q
     |||||||||    
T  36069874 attgttgttg 36069883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 378
Target Start/End: Original strand, 39388907 - 39389070
Alignment:
Q  219 aggtagaggaagacctaggaaaactatta-gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgg---tgtatgatagaacact 314  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||| ||||| | ||||||||||||  ||||  |    | | || ||||| | |    
T  39388907 aggtagaggaggacctagaaaaactataaagagaaactattaggaaagatctagagattaatgagttggatagaaataagaaactatttggtagaagatt 39389006  T
Q  315 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  39389007 atggcgtcgtttgatccatgtggccaaccccacttagtgggataaagcttggtttttgttgttg 39389070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41444501 - 41444337
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctag--gaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 313  Q
    ||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||| | |||| ||| |||| |||| |||| ||||||| ||||     
T  41444501 agaggcagaggaagacctagaaaaaaactataagagaaactattaagaaaaggtttagagattaatgggtttgatcaaaatatggtttatgatataacat 41444402  T
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||   ||| |||||| |||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  41444401 tacaacgtaatttgaaccatgtagccaaacccacttaatggaataatgcttggtcgttgttgttg 41444337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 4558259 - 4558207
Alignment:
Q  325 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4558259 ttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 4558207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 218 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16994602 - 16994442
Alignment:
Q  218 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 317  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||  || ||||||||| | | ||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||    
T  16994602 gaggaagaggaagacctagaaaaactatatgagaaactattaagaatgatttagagattattgagttggattgagatatgatgtataatagaacgttatg 16994503  T
Q  318 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
      ||  |||| | ||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||    
T  16994502 atgttgtttggtacatgtagccgaacccacttagtcagataaagcttggttgtcgttgttg 16994442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17491805 - 17491689
Alignment:
Q  225 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 324  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||  || || || ||| | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||       
T  17491805 aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaagaaagacttggagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtatg 17491706  T
Q  325 ttgatccatgtagccga 341  Q
    |||||||||||||||||    
T  17491705 ttgatccatgtagccga 17491689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18474045 - 18473973
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||||||||| |||| | || |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18474045 tgatagaacattatgacttcgtttgattcatgtagccgacaccacttagtgggataagacttggttgttgttg 18473973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 378
Target Start/End: Original strand, 79156 - 79310
Alignment:
Q  223 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 322  Q
    |||||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | |||||| |||||  |||| |||  | ||||||||||  ||||||||    
T  79156 agaggaaggcttagaaacactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagctggatagaaatatggcctgtgatagaacataatggcgtc 79255  T
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  79256 gtttgatccatgtacccgaccccacttagtgtactaaggctt-gttgttgttgttg 79310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 378
Target Start/End: Original strand, 12985919 - 12985974
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12985919 atttgatccatgaagccgagcccatttagcgggataaggcttggttgttgttgttg 12985974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 376
Target Start/End: Original strand, 23023351 - 23023509
Alignment:
Q  220 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||  || ||| || || | ||||||||||||   ||  || | |||||||||| | |||| |    
T  23023351 ggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactactaagaaagatctacagattaatgagttggataggaacatgatatatgatagaatattatgac 23023450  T
Q  320 gtcatttgatccatgtagccgatcccact--tagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| || ||||||| ||||||    
T  23023451 gtcgtttgatccatgtaaccgaccccacttatagtgggatatggtttggttgatgttgt 23023509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 31309583 - 31309638
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31309583 tttgattcatgtagccgacaccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgc 31309638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 327 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35085186 - 35085135
Alignment:
Q  327 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  35085186 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataagggttagttgttgttgttg 35085135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40982949 - 40982894
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40982949 atttgatccatgttgccgaccccatttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 40982894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 209
Target Start/End: Original strand, 44373740 - 44373891
Alignment:
Q  58 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 157  Q
    ||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||     
T  44373740 gataggattagaaatgaaaatattagagtgagagttggagtagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggcttgagtggtttgagcatgtagagt 44373839  T
Q  158 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
     |||||   |||||  ||| ||||  ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  44373840 aaagacctatagattttgtagtaaagagagtagatcaaatagaggatagtca 44373891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 45512506 - 45512443
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  45512506 tatggcataatttgatccatgtagcctaccccacttagtgggatgaggcttggttgttgctgtt 45512443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 163
Target Start/End: Original strand, 78988 - 79112
Alignment:
Q  42 tggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaata---ggcttaga 138  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||  |  ||||| |||||| |||||||| | ||||||||| ||   |||||||     
T  78988 tggtaagactagacgggataggattagaaacaacaacattagagagagcattcgggtaacacctacagtagaaatgatggtagaaattactaggcttagg 79087  T
Q  139 tggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  79088 tggtttgggcatgtatagagaagac 79112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10824288 - 10824186
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||| ||||| | |||| |||| | |||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10824288 aatgaattggaccaaaatatggtttttgatagaacattatgaagtaagttgatccatgtagccgaccccgcctagtcggaaaaggcttggttgttgttgt 10824189  T
Q  377 tgc 379  Q
    |||    
T  10824188 tgc 10824186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16035822 - 16035744
Alignment:
Q  281 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 359  Q
    ||||||||| |||| |||| |||| ||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  16035822 agttggatcgaaatatggtttatggtagaacattatgacgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggataa 16035744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 337 - 378
Target Start/End: Original strand, 24837934 - 24837975
Alignment:
Q  337 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24837934 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 24837975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 376
Target Start/End: Original strand, 30980058 - 30980099
Alignment:
Q  335 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30980058 tagccgatcccacttagtgggatgaggcttggttgttgttgt 30980099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 376
Target Start/End: Original strand, 4061897 - 4061945
Alignment:
Q  328 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4061897 atccatgtagccgaccccacttagtggaaaaaggcttggttgttgttgt 4061945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 376
Target Start/End: Original strand, 9695815 - 9695867
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9695815 tttgatccatgtaaccgaccccgcttagtgggataaggcttgattgttgttgt 9695867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 378
Target Start/End: Original strand, 16921451 - 16921503
Alignment:
Q  326 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16921451 tgatccatgtagccgaccgtacttagtgggataaagcttggttgttgttgttg 16921503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 25985880 - 25985813
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||| |||| ||||||||||||    
T  25985880 gggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaactagactta-ttggtttgtgcatttagagagaagac 25985813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 41444607 - 41444547
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||||| ||||||||    
T  41444607 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttggacatgtaga 41444547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 41972134 - 41971991
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||   | ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||  |  ||||| |||||| ||||||||    
T  41972134 gagatgaggatgttgtattggatgtgtgataagattaatga-gatagaattagaaatgagaatattagagagag--ttagggtaacaccta-agtagaaa 41972039  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    || |||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  41972038 agatggtggaaaataagtttaggtggtttggacatgtagagagaagac 41971991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 303 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2518471 - 2518400
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  2518471 tgatagaacattatggcataatttgatccttgtagctgaccccacttagtaagataaggtttggttgttgtt 2518400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3464274 - 3464172
Alignment:
Q  272 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 371  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  | |||||||||||| |||||  |  |||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  3464274 aggtcaatgagttgga-ccaaatataatttatgatagaacattatggtatagtttgatccatatagtcgattccacttaatgggataagacttgattgtt 3464176  T
Q  372 gttg 375  Q
    ||||    
T  3464175 gttg 3464172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 5057596 - 5057651
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5057596 tttgatccatgtaactgatcctacttagtgggataaggcttgattgttattgttgc 5057651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 335 - 378
Target Start/End: Original strand, 9842361 - 9842404
Alignment:
Q  335 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9842361 tagccgaccccacttagtggcataaggcttggttgttgttgttg 9842404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 306 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12692310 - 12692239
Alignment:
Q  306 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||| |||| |||| ||| ||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12692310 tagaacattatgccgtcgtttaatccacgcagccgattccaattagtgggataaggcttggttgtttttgtt 12692239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14742890 - 14742847
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggt 367  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  14742890 tttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggt 14742847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16918529 - 16918494
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16918529 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 16918494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 240 - 299
Target Start/End: Original strand, 25439471 - 25439530
Alignment:
Q  240 aactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 299  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  25439471 aactataagagaaaccattcgaaaggatttagagatcaatgagttggattcaaatatggt 25439530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 335 - 378
Target Start/End: Original strand, 32978115 - 32978158
Alignment:
Q  335 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32978115 tagccgacccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 32978158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1549443 - 1549389
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1549443 tttgatccatgtaacggaccccacttagtgggatatggcttggtggttgttgttg 1549389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 376
Target Start/End: Original strand, 4955335 - 4955473
Alignment:
Q  238 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 337  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||| || |||||  | |||||||| |||  |||| || | ||| ||| |||| || | ||| |||||||  ||||||    
T  4955335 aaaattattagagaaactattaaaaaagacttagaaattaatgagtttgatttaaatatgatttataataaaacattacgacgtaatttgatttatgtag 4955434  T
Q  338 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4955435 tcgatctcacttagtgagataaggtttggttgttgttgt 4955473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 16252860 - 16252930
Alignment:
Q  19 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 89  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16252860 atgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagatgagataaaattagaaatgacaacattagagagag 16252930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24399965 - 24399788
Alignment:
Q  200 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 299  Q
    |||| |||||| |||  ||||| |||| || || ||| |||| ||| |||||||| ||||  |||||| | ||| | ||||||||||||  |||| ||||    
T  24399965 aggatagtcaaattactagaggcagagcaaaacttagaaaaattataagagaaactattaagaaggatctcgagattaatgagttggattgaaatatggt 24399866  T
Q  300 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
     |||||||||| | ||||  |||||||| || |||||||| | | |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||    
T  24399865 ttatgatagaatattatgatgtcatttgttctatgtagccaaccacacttagtggaataa-gtttggttgttgtagttg 24399788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 379
Target Start/End: Original strand, 30748646 - 30748748
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||  |||| || | ||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||| || ||| |||| ||| |||||||||||    
T  30748646 aatgagttggatagaaatatgatatataattgaacattatgatgtcatttgatccatgtagctgaccccactaagcgggttaagacttagttgttgttgt 30748745  T
Q  377 tgc 379  Q
    |||    
T  30748746 tgc 30748748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 38178479 - 38178377
Alignment:
Q  157 agaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaa 256  Q
    |||||||  ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  38178479 agaagacctgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaaatcgctagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaacta 38178380  T
Q  257 tta 259  Q
    |||    
T  38178379 tta 38178377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3079850 - 3079609
Alignment:
Q  128 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 227  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   | |||  |||| |||| | ||| ||||| ||| ||| |||| || | |  ||||||| |||    
T  3079850 ataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagacctat-gattttgtgataaggaaagtagatcagatgaaggggagtgaaatcactagaggtaaagg 3079752  T
Q  228 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 327  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||| ||||  || ||| | | | |  ||||||||||| || || |||| | ||||||| || ||||  ||  ||||    
T  3079751 aagacctag-ataactataagagaaactattaagaaagatctggggattgatgagttggatacacatatggtatttgataga-cattatgaagtggtttg 3079654  T
Q  328 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  3079653 atccatgtagccga-cccacttaatgggacatggcttggttgttgt 3079609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5030451 - 5030418
Alignment:
Q  341 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5030451 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 5030418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 33666814 - 33666726
Alignment:
Q  58 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggca 149  Q
    |||||||||| ||||||||   | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||    
T  33666814 gataggattaagaatgaca---taagagagagagttggggtagcacctatcgtagaaaagatggtagaaactctacttaaatggtttgggca 33666726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35320472 - 35320399
Alignment:
Q  304 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||| |||||| | |||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35320472 gatagaacattatggcttaatttaattaatgtagctgaccccacttagtgggataaagcttggttattgttgtt 35320399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 372
Target Start/End: Original strand, 39702163 - 39702232
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||  |||||||||||    
T  39702163 tgatagaacattatggtatcatttgatctatgtagccgaccacatttagtgggataaaacttggttgttg 39702232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 42493501 - 42493428
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| |||||||| || ||||||| |||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  42493501 atagaaaactatggcatcgtttgatctatgtagccaaccccatttagtaggacaaggcttggttgttggtgttg 42493428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Original strand, 1070279 - 1070343
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1070279 tatggcatcatttgatccatgtagctaatctcacctggtgggataagacttgattgttgttgttg 1070343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3638387 - 3638335
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3638387 tttgttccatggagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgatgttgt 3638335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5810353 - 5810277
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||||  |||| | || || ||||||||||||| | | |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5810353 tatgatagaactttatgtcatcgttcgatccatgtagccaacctcacttaatgggatgaggcttggttgttgttgtt 5810277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16971824 - 16971772
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16971824 tttgatccatgtagccgacccaatttagtgggattaggcttcgttgttgttgt 16971772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18742122 - 18742034
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 365  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  18742122 aatgagttggattaaaatatggtttatgattgaacattaaggcttaatttgatcaatgtagtcgaccccaattagtgggatatggcttg 18742034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18747086 - 18746998
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 365  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  18747086 aatgagttggattaaaatatggtttatgattgaacattaaggcttaatttgatcaatgtagtcgaccccaattagtgggatatggcttg 18746998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 91
Target Start/End: Original strand, 29735728 - 29735804
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacacca-ttagagagagag 91  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||  || || |||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  29735728 gagatgaggatgttgtgttggatgaatggtaagactagacgagaaagaattaagaataacaccatttagagagagag 29735804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33828116 - 33827816
Alignment:
Q  17 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | |||| | |||| | |||| || ||| ||||||| ||||| ||||| |||  ||||| || ||||||||  |||    
T  33828116 agatgaggatgttgtgttggatgtctagtaaaactagataagataagactagaaatgacaacattatagagatagttggggtaacaactatagtattaaa 33828017  T
Q  117 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 216  Q
      | || ||||| | |||||| || |||| |||| |||||| |||||  ||||||    | |||||| |||| |||||||| || || |   |  ||| |    
T  33828016 tattgtggaaaacatgcttaggtgatttgagcatatagagataagacgtgtagatttcatagtaagatgagtagatcaaatagaagataaaaagattaca 33827917  T
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    |||||||  ||||||| ||  |||||||| |||||||| |||| |||  ||||| || | ||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||| |||    
T  33827916 agaggtacgggaagacgtataaaaactataagagaaactattaaaaaatatttatagattaatgaattggatctaaatatggtttatgatagaacaatat 33827817  T
Q  317 g 317  Q
    |    
T  33827816 g 33827816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 89
Target Start/End: Original strand, 36069570 - 36069638
Alignment:
Q  21 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 89  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  36069570 gaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataagattagaaacgacaacattagagagag 36069638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 374
Target Start/End: Original strand, 1335555 - 1335606
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  1335555 atttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataggacttagttgttgtt 1335606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 161
Target Start/End: Original strand, 6483245 - 6483324
Alignment:
Q  82 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 161  Q
    |||||||||||  |||||||   |||||||||||||  ||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6483245 agagagagagttggggtagctggtatagtagaaaagagggtggaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagggaag 6483324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 137
Target Start/End: Original strand, 7103274 - 7103313
Alignment:
Q  98 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttag 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  7103274 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactaggcttag 7103313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 209
Target Start/End: Original strand, 11733711 - 11733862
Alignment:
Q  58 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 157  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  || || |||||||  ||||| || |||| |||| |||  |||  |||||||  | ||| ||||    
T  11733711 gataggattagaaatgacaacattagagaaagagttgggataacacctatgatagaatagatggtggaaactagagttaagtggtttgatcttgttgaga 11733810  T
Q  158 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
    ||||| | ||||||| ||| ||||| ||||| |||||  ||||||| |||||    
T  11733811 gaagatttgtagatgttgtagtaaggagagtagatcacgtggaggatagtca 11733862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16008428 - 16008393
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16008428 cccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 16008393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 372
Target Start/End: Original strand, 16715480 - 16715551
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16715480 tatgatagaacattatggcggtgtttgatccacgtagccgaccctgcttagtgggattaggcttgattgttg 16715551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 375
Target Start/End: Original strand, 27037761 - 27037915
Alignment:
Q  220 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 319  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  || |||| ||||| || ||| || || | ||||||||||||  |||| |||| | |||||||| | ||||||    
T  27037761 ggtagagaaagacctagtaaaactatacgataaactattaggaaagatataaagattaatgagttggatagaaatatggtatttgatagaatattatggc 27037860  T
Q  320 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    ||  |||||||||||  | |   ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  27037861 gttttttgatccatg-ggacagccccacttagtgagatagggctttgttgttgttg 27037915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 157
Target Start/End: Original strand, 34196064 - 34196135
Alignment:
Q  86 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 157  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  34196064 agagagttggggtagcacctatagtagaaaaaacagtagaaactagacttatgtggtttgggcatgtagaga 34196135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 332 - 378
Target Start/End: Original strand, 4011484 - 4011530
Alignment:
Q  332 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4011484 atgtagccgaccccactaagtgggataaggcttagttgtttttgttg 4011530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5127377 - 5127299
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc-ttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |  | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5127377 tatgatagaacattacggcgtaatttgacccatgtaactaaccccacttggtgggataaggctttggtggttgttgttg 5127299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 332 - 374
Target Start/End: Original strand, 5205413 - 5205455
Alignment:
Q  332 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5205413 atgtaggcgaccccacttagtgggataagacttggttgttgtt 5205455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 335 - 376
Target Start/End: Original strand, 14744522 - 14744564
Alignment:
Q  335 tagccgatcccactt-agtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14744522 tagccgaccccactttagtgggataaggcttggttgttgttgt 14744564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 87
Target Start/End: Original strand, 25439394 - 25439460
Alignment:
Q  21 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagag 87  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||   ||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  25439394 gaggatgttgcgctggattagtggtaagactagatgagataggaataggaacgataccattagagag 25439460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 371
Target Start/End: Original strand, 26639233 - 26639303
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 371  Q
    ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| |||| || |||||||| |||| | ||||||||||    
T  26639233 tatgatagatcattatggtgtcgtttgatccatgtatccgacccaacttagtgagatatgacttggttgtt 26639303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 163
Target Start/End: Original strand, 29645044 - 29645106
Alignment:
Q  101 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  29645044 cacctatagtataaaagatggtggaaaataggtttaattggtttggacatgtaaagagaagac 29645106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #185
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 303 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 30456367 - 30456329
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 341  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  30456367 tgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccga 30456329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #186
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 332 - 378
Target Start/End: Original strand, 39049825 - 39049871
Alignment:
Q  332 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  39049825 atgtagccgaccccacttagtgggataaagctttattgttgttgttg 39049871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 376
Target Start/End: Original strand, 2938342 - 2938375
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2938342 cccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgt 2938375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 163
Target Start/End: Original strand, 23023231 - 23023312
Alignment:
Q  82 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| |||  |||| ||||||||| | |||||   |||||||||||||||    
T  23023231 agagagagagttcgggtagcacttattgtagaaaagatgggggaaactaggcttaggtagtttgattatgtagagagaagac 23023312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 376
Target Start/End: Original strand, 25439552 - 25439585
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25439552 cccacttagtgggatatggcttggttgttgttgt 25439585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27449224 - 27449183
Alignment:
Q  335 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27449224 tagccgaccccacttagtgggataaagcttggctgttgttgt 27449183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 32838924 - 32838891
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32838924 cccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 32838891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 378
Target Start/End: Original strand, 33076295 - 33076408
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    ||||||||| | ||||||||| | | |||| |||| ||| |||||| | ||||  || |||||||||||||||     ||||||||||||||||||  ||    
T  33076295 gatttagagattaatgagttgtaccaaaatatggtttataatagaatattatgatgtaatttgatccatgtagttatccccacttagtgggataagattt 33076394  T
Q  365 ggttgttgttgttg 378  Q
    | ||||||||||||    
T  33076395 gattgttgttgttg 33076408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40640650 - 40640609
Alignment:
Q  335 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40640650 tagccgagcccacttagttggataagtcttggttgttgttgt 40640609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 41604697 - 41604656
Alignment:
Q  336 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41604697 agccgaccccgcttagtggggtaaggcttggttgttgttgtt 41604656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 307; Significance: 1e-172; HSPs: 106)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 28085294 - 28085660
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28085294 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattacgaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 28085393  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28085394 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtaaataaagtggtaagaagagtagatcaaatggagtagagtcaag 28085493  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28085494 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 28085593  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28085594 actatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 28085660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 32755837 - 32756205
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatag 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  32755837 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataatattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatag 32755936  T
Q  110 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | |||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32755937 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagggaagacccgaagatgtcgtaataagaagagtagatcaaatggaggagagtca 32756036  T
Q  210 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32756037 agttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 32756136  T
Q  310 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  32756137 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggggtaagacttggatgttgttgttg 32756205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 30031178 - 30031535
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30031178 gagatgaggttgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgtcaccattagagagggagtgggggtagcacctatagtagaaa 30031277  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  30031278 agttggtagaaaataggcttagatgagttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 30031377  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||    
T  30031378 aagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtttatgatagaacacta 30031477  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30031478 tggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgt 30031535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 20 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5258506 - 5258146
Alignment:
Q  20 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaag 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  5258506 tgagaatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattatgaatgacaccgttagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 5258407  T
Q  118 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5258406 ttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagattccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgttaaaa 5258307  T
Q  218 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 317  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | ||||  |||||||||    
T  5258306 gaggtagagaaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagacaagatttagaggtcaatgagctagatccaaatatggtttttgattaaacactatg 5258207  T
Q  318 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5258206 gcgtcatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataagtcttggttgttgttgttg 5258146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 16 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 35043801 - 35043441
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  35043801 gagatgaagatgttgcgctggatgattggtaagattagacatgataggattatgaatgacaccattagagggagagtgagggtagtacctaaagtagaaa 35043702  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  35043701 agttggttgaaaataggcttagattgtttggacatgtagagagaatacccgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggacgagagtcaggttaa 35043602  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  35043601 aagaagtagatgaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgtgttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 35043502  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    || |||||||||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  35043501 tgacgtcatttgatcaatgtagctgatcccacttaaagagataaggcttggttgttgttgt 35043441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 375
Target Start/End: Original strand, 608081 - 608442
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  608081 gagatgaggatgttccgttggatgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagag--tgagggtatcacctatagtagaaa 608178  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  608179 agttgatagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgcctttgtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcagattaa 608278  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctag----gaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||| || |||||||||     |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||     
T  608279 aagaggttgatgaagacctaattaagaaaactattcgagaaaccattagaaaagatttagagttcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaat 608378  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  608379 actatgacgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttg 608442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 376
Target Start/End: Original strand, 9706698 - 9707052
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  9706698 gagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctattgtagaaa 9706797  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||   |||| || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  9706798 agttggtagaaaataggcttagatggtttg------tagagagaagacccatagaagccgttgttagaagagtagatcaaatggagaagagtcaggttaa 9706891  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    ||||||||  |||||  ||| | |||| |||||| ||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  9706892 aagaggtacgggaagggctaagtaaaccattagataaaccgttaggaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 9706991  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9706992 tggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 9707052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20427996 - 20427634
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20427996 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaggacaagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 20427897  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||| || |||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||     
T  20427896 agttggtagaaaataggcttagatggtttgaacgtgtatagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtaaatcaaatagaggggagtcaggttac 20427797  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||||    
T  20427796 aagaggttgaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaa-aatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaatacta 20427698  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggat-aaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20427697 tggcgacatttaatcaatgtagccgacccgacttagtgggataaagacttggttgttgttgttg 20427634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 66 - 378
Target Start/End: Original strand, 12890556 - 12890859
Alignment:
Q  66 taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacta 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |            
T  12890556 taggaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttacatggtttgggcatgtaccca-------- 12890647  T
Q  166 gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagg 265  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12890648 -tagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaaggtcaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaagg 12890746  T
Q  266 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 365  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12890747 atttagacgtcaatgagttagatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttg 12890846  T
Q  366 gttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||    
T  12890847 gttgttgttgttg 12890859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 9594072 - 9593709
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtg------ggtagcacctatag 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |      |||||||||  |||    
T  9594072 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattagagagagagagggagttggggtagcaccattag 9593973  T
Q  110 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9593972 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagatgctgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagtca 9593873  T
Q  210 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 309  Q
    | |   ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || || |||||| | |||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  9593872 aat--caagaggtagaggaagacctagaaaaattataagagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggatcccaatatggtttatgataga 9593775  T
Q  310 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||| ||||  || ||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9593774 acattatg--gtaatttgatccatatagctgaccacacttagtggcataaggcttggttgttgttgtt 9593709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 336
Target Start/End: Original strand, 5631741 - 5632064
Alignment:
Q  17 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag----agagagtgtgggtagcacctatagtag 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5631741 agatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagaccggatatgattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtaacacctatagtag 5631840  T
Q  113 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |    
T  5631841 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccttcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcagat 5631940  T
Q  213 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 312  Q
    ||||||||  | |||||||| || |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  5631941 taaaagagacaaaggaagacttaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataaca 5632040  T
Q  313 ctatggcgtcatttgatccatgta 336  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  5632041 ctatgacgtcatttgatccatgta 5632064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 14030724 - 14031079
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggt-aagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14030724 agcagagatgaggatgttgcgatggatgagtggttaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagatagtgggggtagcacctatagt 14030823  T
Q  111 agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||| |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||      
T  14030824 agaaaagttggtagataataggcttaaatggtttggacatgtatagagaagacatgtaaatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagtggagagtcgg 14030923  T
Q  211 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 310  Q
     ||||||||||||||||||||||||           ||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| || | | ||||||||    
T  14030924 attaaaagaggtagaggaagaccta-----------agaaaaac-attagaaaagatttagaggtcaatgggttagatccaaatatgatttttgatagaa 14031011  T
Q  311 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
     |||||  ||||||||||||||| || |||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14031012 tactataacgtcatttgatccatataaccgaccctatttagtgggataaagtttggttgttgttgttg 14031079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21352171 - 21351837
Alignment:
Q  40 agtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagat 139  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21352171 agtggtaagactagatatgataggattaggaataacatcgttagagagag--tggaggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagat 21352074  T
Q  140 ggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaa 239  Q
    | ||||| ||||||||||||||||  || |||||  | || |||||| | || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21352073 gatttggacatgtagagagaagacctgtcgatgccattgttagaagaatagaacaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaa 21351974  T
Q  240 aactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc 339  Q
    ||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  21351973 aaccaatagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgttaattgatccatgtagcc 21351874  T
Q  340 gatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    || | || |||||| |||||| ||| || ||||||||    
T  21351873 gacctcagttagtgagataagacttcgtcgttgttgt 21351837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10100217 - 10099987
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| |||||||||||    
T  10100217 gagatgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacaatatatgattagaaatgacaccattagagagag--tgggggtcgcacatatagtagaaa 10100120  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||    
T  10100119 agttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcagtttaa 10100020  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattag 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10100019 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattag 10099987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 105 - 378
Target Start/End: Original strand, 30679417 - 30679680
Alignment:
Q  105 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||  || ||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  30679417 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagaggagacccgtagatgtcgtcgtaagaatagtagatcaaatggagtag 30679516  T
Q  205 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 304  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||          |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  30679517 agtcaagttataagaggtataggaagac----------tattagagaaaccattaaaaaggatttagaagtcaataagttggatccaaattcggtctatg 30679606  T
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  30679607 atagaacattataacgtcatttgatctatgtagccgatcccacttaatgggataagacttggttgttgttgttg 30679680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 217 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 34143924 - 34143763
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34143924 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34143825  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34143824 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgttg 34143763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 217 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 34156540 - 34156379
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34156540 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34156441  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34156440 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgttg 34156379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Original strand, 33496963 - 33497198
Alignment:
Q  96 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||  |||||    
T  33496963 ggtagcacctatggtagaaaagttagtagaaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacc-gtaaacgctgtcgtaagaagagaagatca 33497061  T
Q  195 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 294  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33497062 aatgaaggag--tcaagttaaaagaggtagagggagatctagaaaaactattagagaaacctttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaat 33497159  T
Q  295 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccat 333  Q
     || | ||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  33497160 atgatttatgatataacactatagcgtaatttgatccat 33497198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28027189 - 28026827
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||  | ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  28027189 agcagagacgaggatgttatgttggatgagtggtaagactagatggcataggattaggaatgacgtcgttagatagagaatg-gggtagcacctatagta 28027091  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || ||  |||||||| || ||| |||||||  |||| ||||||||||||||      
T  28027090 gaaaatgtggtagaaaataggcttgg-tggtttggacatgtagagataacacctgtagatgcggtagtacgaagagtatatcagatggaggagagtcaga 28026992  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||  || |||||| |||| ||||| ||| || ||||| |||| ||||||  |||    
T  28026991 ttagaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagaaaaaccattatgaaagatttacaggttaatgatttgtattcaaatatggtttatgat--aac 28026894  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagt-gggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    | || ||||| |||||| | |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28026893 attacggcgtaatttga-caatgtagccgaccccacttattgggggtaaggcttgcttgttgttgttg 28026827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 264 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34934942 - 34934830
Alignment:
Q  264 ggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34934942 ggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcctcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggct 34934843  T
Q  364 tggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||    
T  34934842 tggttgttgttgt 34934830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 378
Target Start/End: Original strand, 31818999 - 31819115
Alignment:
Q  262 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagg 361  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  31818999 aagggtttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatg 31819098  T
Q  362 cttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||| |||||||    
T  31819099 cttggttgtggttgttg 31819115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 216 - 376
Target Start/End: Original strand, 5095956 - 5096116
Alignment:
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||| || ||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||    
T  5095956 aagaggtagaggaagacctagaaaaactagaagagaaactcttaggaaagatttagtggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacatta 5096055  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5096056 tggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataaggtttggttgttgttgt 5096116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6056123 - 6055806
Alignment:
Q  23 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt-tgg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||   |      
T  6056123 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaaaaatta 6056026  T
Q  122 tagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagagg 221  Q
    ||| ||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||   || ||| ||||| ||||| ||||||||| | |||| |||    
T  6056025 taggaaataggttttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtgcaaatagtagatcagatggaagagagtcaaataaaaaaagg 6055926  T
Q  222 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 321  Q
    ||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | |||    
T  6055925 tagaggaagacctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgt 6055826  T
Q  322 catttgatccatgtagccga 341  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  6055825 aatttgatgcatgtagccga 6055806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 271
Target Start/End: Original strand, 7133795 - 7133923
Alignment:
Q  143 ttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 242  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7133795 ttgggcatgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaac 7133894  T
Q  243 tattagagaaacaattagaaaggatttag 271  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7133895 tattagagaaaccattagaaatgatttag 7133923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 271
Target Start/End: Original strand, 7136718 - 7136846
Alignment:
Q  143 ttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 242  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7136718 ttgggcatgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaac 7136817  T
Q  243 tattagagaaacaattagaaaggatttag 271  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7136818 tattagagaaaccattagaaatgatttag 7136846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 337
Target Start/End: Original strand, 5080912 - 5081083
Alignment:
Q  166 gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagg 265  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||  |||      
T  5080912 gtagatgctgtcgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtctcgttaaaagagatagatgaagacctaggaaaactattagagaaatcattcaaaatt 5081011  T
Q  266 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5081012 atttagaggtcaatgagttggatacaaatatgatttatgatagaacactataacgtcatttgatccatgtag 5081083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 257 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3206578 - 3206457
Alignment:
Q  257 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3206578 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 3206479  T
Q  357 taaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| ||||||| |||||||||    
T  3206478 taagacttggttattgttgttg 3206457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 217 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 34664 - 34503
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| || || | ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||    
T  34664 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctaaagattaatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattat 34565  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34564 ggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 34503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 376
Target Start/End: Original strand, 2689646 - 2689915
Alignment:
Q  100 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgg 199  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||| || |    
T  2689646 gcacctatagttgaaaagtttgtagaaaataggcttagatgatttgagcatgtagagagaagacatgtagatgccgtcataagaagagtagatcagatag 2689745  T
Q  200 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 299  Q
    || ||||||| || |||||||||      |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||| ||||| | ||    
T  2689746 agtagagtcatgtcaaaagaggt------agacctagaaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcagcgaattggatgcaaatattgt 2689839  T
Q  300 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
     ||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||  ||| |  |||||||  ||||| | ||||||||||||||    
T  2689840 ttat-atagaatactatgacgtaatttgattcatataatcgaccttacttagtatgataatgtttggttgttgttgt 2689915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 127
Target Start/End: Original strand, 5080777 - 5080888
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5080777 gagatgaggatgttgcgctggataactggtaagattagacataataagattaggaatgacaccattagagaacgagtgggggtatcacctatagtagaaa 5080876  T
Q  116 agttggtagaaa 127  Q
    ||||||||||||    
T  5080877 agttggtagaaa 5080888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 245 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10099025 - 10098894
Alignment:
Q  245 ttagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcc 344  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||| ||    
T  10099025 ttagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtgtatgatagaacacta--acgtcatttgatccatgtaatcgaccc 10098928  T
Q  345 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10098927 cacttagtgggataagacttgattgttgttgttg 10098894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 95 - 376
Target Start/End: Original strand, 31818533 - 31818813
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| ||||| |||||| | ||||  ||||||||||  || ||| |||  ||||| | ||| |||||    
T  31818533 gggtagcacctatagtacaaaaaatggtggaaaatagacttaggtggttttg-catgatgagagaagacctgttgattctgcagtaaggaaagtagatca 31818631  T
Q  195 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 294  Q
     |||||||  ||| |  | |  | ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | ||| ||| | ||||||||||||| || |    
T  31818632 tatggagggtagtgagatcactaaaggtaggagaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttggagattaatgagttggatcaaagt 31818731  T
Q  295 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
     |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  31818732 atggtttatgatagaacattatgtcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagcgggaaaaagcttggttgttgttgt 31818813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10617586 - 10617232
Alignment:
Q  15 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||   |||| ||||| |||||||     |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  10617586 agagatgaggat-ttgcgttggatgtgtgttaagactagacgaaatagaattagaaatgaca-----agagcgagagttggggtagcacttatagtagaa 10617493  T
Q  115 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 214  Q
    |||  | |||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||  || | | |||   |||| |||||  |||||||||||| ||||||| | |    
T  10617492 aagacg-tagaaactagacttaggtggtttgagcatgtagaaagaagacctgtggtttctgcattaaggagagt--atcaaatggaggggagtcaaatca 10617396  T
Q  215 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 314  Q
      ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | ||||||||||||    
T  10617395 ctagaggtagaagaaaacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacact 10617296  T
Q  315 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  10617295 ttggcgttgtttgatttatgtagccggccccacttagtgggatccggcttggtggttgttgttg 10617232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 33083976 - 33084127
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||   ||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  33083976 agcagaaatgaggatgctgcgttggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacgatattagagagagagttggggtagcacctatggta 33084075  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  33084076 gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagac 33084127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 26291700 - 26291917
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtag-cacctatagtag 112  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||  |||||| |||||||| |||    
T  26291700 gagatgatgatgttgtgttgaatgtgtggtaagtctagacttgatagtattaggaatgatactattagagatagagagttagggtagacacctataatag 26291799  T
Q  113 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 212  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||  |||||| |||| ||||| ||||||||||||    |    
T  26291800 aaaatatggtagaaaatagacttaggtggttt--gcatgtagagagaagacttatagatgttgcagtaagatgagtagatcagatggaggagagtgtgat 26291897  T
Q  213 taaaagaggtagaggaagac 232  Q
     |||||| ||||||||||||    
T  26291898 caaaagacgtagaggaagac 26291917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 341
Target Start/End: Original strand, 24665818 - 24666058
Alignment:
Q  102 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtaga-tgctgtggtaagaagagtggatcaaatgga 200  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| |  ||| ||||| ||||| ||||| ||| |    
T  24665818 acctatagtagaaaatatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtagatttttgtagtaaggagagtagatcagatgaa 24665917  T
Q  201 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg 300  Q
    | | ||||   | |  ||||| |||||||| | ||| | |||||  |||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  24665918 gcatagtcggatcaccagaggcagaggaagtcatagaataactacaagagaaactattaagaaatatttagaggtcaatgagttggatcgaaatatggtt 24666017  T
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 341  Q
    |||||||||||| |||| | | ||||||||  |||||||||    
T  24666018 tatgatagaacattatgacttaatttgatctgtgtagccga 24666058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 303 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30789147 - 30789076
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30789147 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggcttggttgttgtt 30789076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 256 - 378
Target Start/End: Original strand, 5897619 - 5897741
Alignment:
Q  256 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg 355  Q
    |||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||| |||| |||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5897619 attagaaaagatttagatattaatgtgttggatcaaaatatggtatatggtagaatattatgacgtaatttgatccatgtagcggatcccacttagtggg 5897718  T
Q  356 ataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  5897719 ataaggcttgattgttgttgttg 5897741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 182
Target Start/End: Original strand, 9568588 - 9568750
Alignment:
Q  22 aggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagtagaaaagtt 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| |  |||||   |||||||| ||||||||||||| |    
T  9568588 aggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgatagaattataaatgacaacattagagcgccagtgttgaggtagcacttatagtagaaaagat 9568687  T
Q  120 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaag 182  Q
    | | |||||| | |||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||  |||||||||    
T  9568688 gatggaaaatggacttagatggtttgggcaactagagggaagacatgtagattatgtggtaag 9568750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 298 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1615301 - 1615223
Alignment:
Q  298 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1615301 gtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcatttagtgggataagacttggttgttgttgt 1615223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 217 - 377
Target Start/End: Original strand, 8364679 - 8364839
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||  | ||| |||||||   |||  |||| |||||||||||| |||    
T  8364679 agaggaagatgaagacctaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaaattaataagttggactgaaacatggtttatgatagaacattat 8364778  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  8364779 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttagtgggaaaaggctttattgttgttgtt 8364839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 378
Target Start/End: Original strand, 579465 - 579702
Alignment:
Q  141 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 240  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  | | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||   | |  ||||| |||| |||||||   |||    
T  579465 gtttgagcatgtagagagaaggcttgtagattatatagtaaggagagttgatcagatggaggatagtctgatcactagaggcagagaaagacctcaaaaa 579564  T
Q  241 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 340  Q
    ||| | |||||||| ||||  || ||| ||||  | | ||| ||| ||| |||| |||| | |||  ||| | |||||||| |||||||| |||||||||    
T  579565 actgtaagagaaactattaagaaagatatagaaattagtgacttgaatcaaaatatggtttctgaaggaaaattatggcgtaatttgatctatgtagccg 579664  T
Q  341 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  579665 atcccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttg 579702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7513683 - 7513387
Alignment:
Q  84 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga-ctagtagatgctgtggtaag 182  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| | |||||| | |  || |||  ||| |||||    
T  7513683 agagagagttcggggagcacctataatagaaaagatggtagaacctagacttaggtggtttgggcatgcaaagagaaaaacccgtggattatgtagtaag 7513584  T
Q  183 aagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg-aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 281  Q
    ||||||  |||| || |||| ||||||| | |  ||||| || || ||||||| |  ||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||| | |||||    
T  7513583 aagagtcaatcagattgaggggagtcaaatcactagaggcagggggaagacctggataaactataagagaaacttttaggaaggatctagagatgaatga 7513484  T
Q  282 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||   | |  |||| | |||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||| |  ||| |||||||||||||| ||||||    
T  7513483 gttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagctgatctcacttggcaggacaaggcttggttgtttttgttg 7513387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 374
Target Start/End: Original strand, 7492551 - 7492669
Alignment:
Q  256 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg 355  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |  ||||||||| ||| |||| |||||  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  7492551 attaggaaagatttagaggttaatgagttttatccaaatatggtttcggatagaacattatagcgttatttgtaccaagtagccgaccccacttagtggg 7492650  T
Q  356 ataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  7492651 ataaggattggttgttgtt 7492669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 282 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4245966 - 4245870
Alignment:
Q  282 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||  |||| |||| | |||||||||| |||| | || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4245966 gttggataaaaatatggtatttgatagaacattatgacatcgtttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttttgttg 4245870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 305 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12119714 - 12119642
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccc-acttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12119714 atagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttattgt 12119642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 277 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12134001 - 12133901
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||| |||| || |  || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12134001 aatgagttggatcgaaatgtgattcataatagaacattatggcataatctgatccatgtagccgaccccacttagtgagaaaaggcttggttgttgttgt 12133902  T
Q  377 t 377  Q
    |    
T  12133901 t 12133901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 33998368 - 33998288
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt 92  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  33998368 agcagagatgaagatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataggattagaaatgactacattagagagagagt 33998288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Original strand, 38980 - 39055
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38980 tgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgagtccactaagtgggataaggctcggttgttgttgttg 39055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25494210 - 25493972
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggt-aagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   |||| |||||| |||| || ||||  || || |||  ||||||||||||||||| ||    
T  25494210 gagatggggatgttgcgttggatgtgtggtgaatattagatgggataagattagaaatggcaacattgtagggatagttggggtagcacctatagtataa 25494111  T
Q  115 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 214  Q
    |  || || ||||||| | |||| |||||||| |||||| |||||| ||  |||||| || | |||| | |||| |||||||| ||||| |||||  |||    
T  25494110 atatt-gtggaaaataagtttaggtggtttggacatgtatagagaaaacatgtagattctatagtaaaacgagtagatcaaatagaggatagtcatatta 25494012  T
Q  215 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac 254  Q
     |||||||| | |||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25494011 caagaggtacaagaagacctagaagaactataagagaaac 25493972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 188
Target Start/End: Original strand, 2079317 - 2079434
Alignment:
Q  70 aatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtag 169  Q
    |||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||| || |||||||||||||| | ||||    
T  2079317 aatgacaatattagagagggagt-tgggtagcatctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttaggtatgtagagagaagatttgtag 2079415  T
Q  170 atgctgtggtaagaagagt 188  Q
    ||  ||| ||||| |||||    
T  2079416 attatgtagtaaggagagt 2079434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6293660 - 6293390
Alignment:
Q  102 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 201  Q
    |||||||||| ||||  |||| |||| |||| | || |||||||||||||||||||||| ||  ||||||  |||  |||| |||||  |||| ||| ||    
T  6293660 acctatagtacaaaatatggtggaaactaggttcaggtggtttgggcatgtagagagaacacctgtagattatgtaataaggagagtaaatcagatgaag 6293561  T
Q  202 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt 301  Q
    || |||||| | |       |||||||||| |||| |||||||  | |||||| ||||| ||  || ||||  | |||||||| |||  |||| |||| |    
T  6293560 gatagtcaaatcac------tagaggaagatctagaaaaactaaaatagaaactattaggaaatatctagatattaatgagttagatagaaatatggtat 6293467  T
Q  302 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| || ||||||  | |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6293466 atgatagagcattatggcaacgtttggtcaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgcggttgttg 6293390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 373
Target Start/End: Original strand, 21886314 - 21886383
Alignment:
Q  304 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21886314 gatagaacacaatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtggtataaggcttagttgttgt 21886383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 305 - 378
Target Start/End: Original strand, 30642980 - 30643053
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30642980 atagaacattatggagtaatttgatctatgtagccgaccccacttagcgggttaaggcttggttgttgttgttg 30643053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 376
Target Start/End: Original strand, 33730194 - 33730247
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33730194 atttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33730247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 8364575 - 8364635
Alignment:
Q  97 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 157  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8364575 gtagcaactatagtagaaaaggtggttgaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagaga 8364635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 373
Target Start/End: Original strand, 21089604 - 21089676
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21089604 tatgatagaacattatggcattgtttgatccatgtagctgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 21089676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1008124 - 1008050
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1008124 tgatagaacattatggcgtaatttgatccaggtagca-accccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 1008050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 378
Target Start/End: Original strand, 9568884 - 9568982
Alignment:
Q  279 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  9568884 tgagttggatccaaatatggtttatgatagaccgttatggcgtaatttgatccatatagcc-aacccacttaatgggatagagcttgtttgttgttgttg 9568982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18130885 - 18130814
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  18130885 atagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacctaatgggataaggcttagttgttgttgt 18130814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 33997703 - 33997545
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta-gaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||| |  | |||| | ||||||||||||  |||| ||||  ||||| ||||| ||    
T  33997703 agaggcagaggaagaccttggaaaactataagagaaactattaagaaaagcct-agagattaatgagttggatagaaatatggtacatgattgaacatta 33997605  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||| |||   || | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  33997604 tggcgtcatttgatctatgcgaccaaccacacttagtgggataatgcttgattgttgttg 33997545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 6641764 - 6641628
Alignment:
Q  21 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttg 120  Q
    |||||||||||||| ||||  | |||||| ||||   |||| |||| | |||||||  |||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6641764 gaggatgttgcgttcgatgttttgtaagactagatgggataagattggaaatgacaatattagagatagagttggggtatcacctatagtagaaaagatg 6641665  T
Q  121 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 157  Q
    ||||||| ||| ||| | | |||||||||| ||||||    
T  6641664 gtagaaactagacttgggttgtttgggcatctagaga 6641628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 377
Target Start/End: Original strand, 32945455 - 32945531
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  32945455 tatgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgtagccgacatcacttagttgaataaggcttggttgtcgttgtt 32945531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 104
Target Start/End: Original strand, 33496106 - 33496194
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacc 104  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | | |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||    
T  33496106 gagatgatgatgttgcattggatgaatggtaagattaaataggataagattagaaatgacaccattacagagatagtaggggtagcacc 33496194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 5129198 - 5129123
Alignment:
Q  15 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga 90  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  5129198 agagatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagattcgatgtgatcggattagaaatgacaatattagagagaga 5129123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 368
Target Start/End: Original strand, 5983814 - 5983905
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 368  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| |  |||||||||  || |||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5983814 aatgaattggatcgaaatatggtttgcgatagaacatgatagcgtaatttgatccacgtagccgaccccactcagtgggataaggcttggtt 5983905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7337270 - 7337192
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt--agtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||| |||||||||||||||||    
T  7337270 tatgatagaatattatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccacttagagggggataaagcttggttgttgttgtt 7337192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23888549 - 23888478
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  23888549 atagaacattatggtgtaatttgatccatgtagcagaccccacctaatgggataaggcttagttgttgttgt 23888478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 336 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24698897 - 24698854
Alignment:
Q  336 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24698897 agccgatcccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 24698854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 368
Target Start/End: Original strand, 32068635 - 32068694
Alignment:
Q  309 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 368  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  32068635 aacattatggcgtaatttgatacatgtagccgatcccacttagtgggataaagtttggtt 32068694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9109584 - 9109506
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    |||||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  9109584 tatgatagaatactatgaagtagtttgatccatgtagccgaccccagttagtgagataatgcttagttgttgttgttgc 9109506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12134265 - 12134115
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||  |||    |||| ||||| |||||||  |||||||||||| |   ||||  ||||||||||    
T  12134265 agcagagatgagaatgttgtgttggatgtgtggcaagacaagatgatatagaattagaaatgacaatattagagagagaattgaggtacgacctatagta 12134166  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 162  Q
    |||||| |||| |||||||||||||   ||||| |||| ||||||| ||||    
T  12134165 gaaaagatggtggaaaataggcttacggggtttcggcacgtagagaaaaga 12134115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 377
Target Start/End: Original strand, 29900275 - 29900329
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  29900275 atttgatccatgtagccgacccctcttagtgggataaggattggttcttgttgtt 29900329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Original strand, 586057 - 586134
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||    
T  586057 tatgatagaacattatgacgtcatttgattcatggagccgacctcacttaatgggataaaccttgattgttgttgttg 586134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1748084 - 1747944
Alignment:
Q  237 gaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 336  Q
    |||||||||||||||||| | ||  ||  |||||||| | ||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||| |||||||||||||    
T  1748084 gaaaactattagagaaactactaagaaaaatttagagattaatgagttggatagaaatatagtatatgatagaacattacgacgtcgtttgatccatgta 1747985  T
Q  337 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |  || || |||| ||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  1747984 gttga-cctacttggtgcgataagacttggttgctgttgttg 1747944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 2065116 - 2065018
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattag----agagagagtgtgggtagcacctatagt 110  Q
    |||||||||||| | |  |||||||| ||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2065116 gagatgaggatgctaccctggatgagcggtaagactacatatgataggattagtaatgacaccattagaaaaagagagagtgggggaagcacctatagt 2065018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Original strand, 5053750 - 5053807
Alignment:
Q  318 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5053750 gcgtcgtttgatcaatgtagccgaccccatttagtaggataaggcttggttgttgttg 5053807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 134
Target Start/End: Original strand, 5095816 - 5095913
Alignment:
Q  37 atgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggct 134  Q
    ||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||  || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5095816 atgagtggtaagactggaagggataggattaggaatgactacattagagggagtgttgggatatcacctatagtagaatagatggtagaaaataggct 5095913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 21870363 - 21870299
Alignment:
Q  86 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat 150  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  21870363 agagagttggggtagcacctgtagtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcat 21870299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 303 - 366
Target Start/End: Original strand, 10453272 - 10453335
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 366  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |   |||| |||||||||||||||    
T  10453272 tgatagaacactatggcgtcttttgattcatgtagccgaccatgcttactgggataaggcttgg 10453335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 326 - 377
Target Start/End: Original strand, 29931068 - 29931119
Alignment:
Q  326 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  29931068 tgatccatgtagccgaccccgcttagtaggataaggcttggttcttgttgtt 29931119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 356
Target Start/End: Original strand, 32080676 - 32080731
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 356  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32080676 tatgatataacattatggcgtaatttgatacatgtagtcgatcccacttagtggga 32080731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 368
Target Start/End: Original strand, 32097944 - 32098011
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 368  Q
    ||||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  32097944 tatgatataacattatggcgtaaattgatacatgtagccgattccacttagtgggataaagtttggtt 32098011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 43326 - 43049
Alignment:
Q  102 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 201  Q
    ||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |  |||||  ||| |  |||||||| |||||  || ||    
T  43326 acctataatagaaaaaatggtggaaactaggcttaggtggtctggccatgtagagagaagatttatagattttgtagcgagaagagtagatcaggtg-ag 43228  T
Q  202 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta-gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg 300  Q
    || |||||  |    ||||| || ||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||||  || ||| |||||   ||||||||||||| |||| | ||     
T  43227 gatagtcagatctctagaggcagcggaagacctagaacaacttttaagagaaactattaataaagatctagagagtaatgagttggatcaaaatatagtt 43128  T
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    |||||||||  | ||||| || |||| ||||||||| ||   | |||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  43127 tatgatagagtattatggtgtaattttatccatgtatccagcctcacttagtgggataagacttggtttttattgttgc 43049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 337
Target Start/End: Original strand, 1911577 - 1911623
Alignment:
Q  291 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 337  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1911577 aaatatggtgtatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtag 1911623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6692749 - 6692696
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  6692749 atttgattcatgtagtcgaccccacttggtgggaaaaggcttggttgttgttgt 6692696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 7150682 - 7150526
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||| || | ||||||||||||    |||||| | |||||  ||    
T  7150682 agcagagatgctaatgttgctttggatgtgtggtaagactagacgagataggatttggaacgaaaacattagagagagt---tgggtaactcctatcata 7150586  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 171  Q
     ||||  |||| |||| | || |||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  7150585 aaaaatatggtggaaactcggattaggtggtttgggcatggggagagaagacttgtagat 7150526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21870118 - 21870069
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21870118 tttgatccatgcagccgacctcacttagtgggataaggtttggttgttgt 21870069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29354782 - 29354741
Alignment:
Q  330 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 371  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29354782 ccatgtagcctatctcacttagtgggataaggcttggttgtt 29354741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 360
Target Start/End: Original strand, 33084138 - 33084195
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataag 360  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  33084138 tgatagaatactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccctacttagtgcgataag 33084195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 80
Target Start/End: Original strand, 2689578 - 2689642
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccat 80  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  |||||| || | | |||||||||||||||||||||||    
T  2689578 gagatgaggatgttgtgatggatgagcagtaagactaaataggataggattaggaatgacaccat 2689642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3127310 - 3127274
Alignment:
Q  342 tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3127310 tcccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgttg 3127274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 350
Target Start/End: Original strand, 413280 - 413339
Alignment:
Q  291 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 350  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  413280 aaatatggtatatgatagaagattatagtgtcatttgatcaatgtagccgatcccactta 413339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 378
Target Start/End: Original strand, 2307854 - 2307909
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  2307854 atttgatcaatatagccgatcccacttaatggaataagactttgttgttgttgttg 2307909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4878330 - 4878295
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4878330 cccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgttg 4878295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 6293733 - 6293690
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagac 55  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  6293733 agcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaaaattagac 6293690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7150362 - 7150311
Alignment:
Q  325 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7150362 ttgatccatgtagccgagcctatgtagtgggattaggcttggttgttgttgt 7150311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 7513075 - 7513008
Alignment:
Q  291 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 358  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  7513075 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgtagttgaccccacttagtgggata 7513008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31832139 - 31831857
Alignment:
Q  96 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa 195  Q
    |||||||||||||||| || || |||| |  | ||||||||  |||||||| ||||||||||||||    | ||||  | | | ||| ||||| |||||     
T  31832139 ggtagcacctatagtaaaatagatggtgggtattaggcttaagtggtttggacatgtagagagaaggtccggagattatatagcaagtagagtagatcag 31832040  T
Q  196 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 295  Q
    |||||||| |||||  | |  |||  ||||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | | |||||||||||||||      
T  31832039 atggaggatagtcagatcatcagaaatagaggaaagcctagaaaaactatcagagaaactattaagaaagatctagagattactgagttggatccaaaca 31831940  T
Q  296 tgg-tgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||| | |||||||||||| | | | |  ||||||| |||| || ||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  31831939 tggttttatgatagaacattgtaggggaatttgattcatgcagtcgaccctacttagtgagataagg-ttggttgtttttgttg 31831857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 336 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 451989 - 451947
Alignment:
Q  336 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  451989 agccgaccccacttggtgggataaggcttggttgttgtcgttg 451947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 371
Target Start/End: Original strand, 2079488 - 2079558
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 371  Q
    ||||||||| || ||| |||| |||| ||||||||||||||  | |||||||||| ||||| |||||||||    
T  2079488 tatgatagagcattatagcgtaatttaatccatgtagccgactcgacttagtggggtaaggtttggttgtt 2079558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 265 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14389272 - 14389202
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 335  Q
    ||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||||||||    
T  14389272 gatttagagattaataagttagatccaaatatggtttatgatataacattagggcgtaatttgatccatgt 14389202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 378
Target Start/End: Original strand, 21531802 - 21531836
Alignment:
Q  344 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21531802 ccacttagtgggataaggcttggttgttattgttg 21531836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 336 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27840090 - 27840048
Alignment:
Q  336 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27840090 agccgaccccacttagtgggtcaaggcttggttgttgttgttg 27840048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31434475 - 31434441
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31434475 cccacttagtgggataagtcttggttgttgttgtt 31434441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 245
Target Start/End: Original strand, 3963889 - 3963950
Alignment:
Q  184 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactat 245  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3963889 agagtggatcagaaggaggggagtcaaatcaccagaggtagaggaagacctagaaaaactat 3963950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 304; Significance: 1e-170; HSPs: 175)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12492751 - 12492382
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcaccta---ta 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||    
T  12492751 agcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctactata 12492652  T
Q  109 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12492651 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaggagagtc 12492552  T
Q  209 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12492551 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 12492452  T
Q  309 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12492451 aacactatggcgtcatttgatgcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12492382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 20 - 378
Target Start/End: Original strand, 4496308 - 4496668
Alignment:
Q  20 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacat--gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaag 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4496308 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacacaggataggattaggaatgacacctttagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 4496407  T
Q  118 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4496408 ctggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 4496507  T
Q  218 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4496508 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 4496607  T
Q  318 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4496608 gcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 4496668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 12 - 377
Target Start/End: Original strand, 24178428 - 24178793
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24178428 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactatacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 24178527  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24178528 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtggagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 24178627  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24178628 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagttcaatgagttggatccaaatttagtgtatgatagaac 24178727  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  24178728 actatggcatcatttgatctatgtagccgaccccacttaatgaaataaggcttggttgttgttgtt 24178793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 12 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1287953 - 1287578
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----------tgtgggtagc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||          || |||||||    
T  1287953 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacatcattagagagagagagagagagagtgggggtagc 1287854  T
Q  102 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1287853 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggag 1287754  T
Q  202 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1287753 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt 1287654  T
Q  302 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1287653 atgatagtacactatggcgtcagttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttattgatgtt 1287578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28977221 - 28976857
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  28977221 agcagagatgagtatgttgtgttggatgagtggtaaaactagaaatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagta 28977124  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28977123 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtatatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaag 28977024  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28977023 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 28976924  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28976923 actatggcgtcatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 28976857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2075838 - 2075475
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  2075838 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagttgtaagactagacaagataggattaggaatgacaacattagagagagagtgggggtaacacctacagta 2075739  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2075738 gaaaagttggtagacaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 2075639  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattag-aaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2075638 ttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagagaaaccattagaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 2075539  T
Q  311 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2075538 tactatggcgtcatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttgattgttgtt 2075475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 10639215 - 10639586
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatag-- 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||      
T  10639215 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggctagcacctatagac 10639314  T
Q  110 -----tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 204  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10639315 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgaattgggcatgtagagagaagacctgtagatgccatggtaagaagagtagaacaaatggaggag 10639414  T
Q  205 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 304  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10639415 --tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 10639512  T
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10639513 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactttgtgggataaggcttggttgttgttgttg 10639586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 1275183 - 1275548
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1275183 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtg-gggtagcacctatagta 1275281  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1275282 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 1275381  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1275382 ttaacaggggtagaggaagacctagaaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggttaatcagttgaatccaaatttggtgtttgatagaac 1275481  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1275482 attatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatagttgttgttgttg 1275548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 59 - 369
Target Start/End: Original strand, 38684932 - 38685242
Alignment:
Q  59 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38684932 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagag 38685031  T
Q  159 aagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt 258  Q
    |||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38685032 aagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 38685131  T
Q  259 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38685132 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 38685231  T
Q  359 aggcttggttg 369  Q
    |||||||||||    
T  38685232 aggcttggttg 38685242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 376
Target Start/End: Original strand, 3301766 - 3302126
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3301766 gagatggggatgttgcgcttgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgagggtagcccctatagtagaaa 3301865  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  3301866 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagaatgaatcaaatggaggagagtcaggttaa 3301965  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  3301966 aagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattataaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 3302065  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3302066 cggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 3302126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16347738 - 16347380
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||  ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16347738 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaatatatgattaaaaatgaaaccattagagagagagcgggggtagcacctatagtagaaa 16347639  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16347638 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcctttgcaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 16347539  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||      
T  16347538 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgatttggatacaaatatggtttatgatagaacac-- 16347441  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16347440 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgt 16347380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 97 - 375
Target Start/End: Original strand, 20456776 - 20457054
Alignment:
Q  97 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20456776 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaa 20456875  T
Q  197 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  20456876 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttgaatctaaattt 20456975  T
Q  297 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20456976 gatgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttg 20457054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Original strand, 14665658 - 14665996
Alignment:
Q  42 tggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag----agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttag 137  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14665658 tggtaagcctagacatgataggattagaaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagagaagttgatagaaaataggcttag 14665757  T
Q  138 atggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagg 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14665758 atggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggagcagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctagg 14665857  T
Q  238 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||    
T  14665858 aaaactattagagaaaccattaggaagaatttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgataga--actctggcgtaatttgatctatgtag 14665955  T
Q  338 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665956 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 14665996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 34272940 - 34273297
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----------tgtgggtagc 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||          || |||||||    
T  34272940 agcagagatgaggatgttgcattggatgagtggtaagactagaca-----ggattaggaatgacaccattagagagagagagagagagagtgggggtagc 34273034  T
Q  102 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||                  
T  34273035 acctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgcagatgtcgtggtaagaagag-------------- 34273120  T
Q  202 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34273121 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt 34273220  T
Q  302 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  34273221 atgatagaacactatgacgtcattcgatccatgtagccaacctcacttagtgagataaggcttagttgttgttgttg 34273297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 152 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2915719 - 2915494
Alignment:
Q  152 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 251  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2915719 tagagagaagacccgtagatgccttggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagaga 2915620  T
Q  252 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttag 351  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2915619 aaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt-tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttag 2915521  T
Q  352 tgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2915520 tgggataaggcttggttattgttgttg 2915494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26885040 - 26884687
Alignment:
Q  25 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtag-aaaagttggta 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26885040 atgttgcgttggatgagtggtaaaactagacgggataggattaggaataacaccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggta 26884941  T
Q  124 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 223  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  26884940 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagataagatttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggta 26884841  T
Q  224 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 322  Q
    ||||| || ||||||||||||  ||| |||| ||||| || ||||||||||| |||| || |||||| |||| || | ||||||||||||||| | ||      
T  26884840 gaggatgagctaggaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttagaggttaatgggtcggatccaaaatatgatttatgatagaacactacgacgca 26884743  T
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26884742 atttgatccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttgattgttgttgttg 26884687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 225 - 378
Target Start/End: Original strand, 29816513 - 29816666
Alignment:
Q  225 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29816513 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 29816612  T
Q  325 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29816613 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 29816666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 183 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13561579 - 13561383
Alignment:
Q  183 aagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgag 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13561579 aagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 13561480  T
Q  283 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    |||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13561479 ttggatccaactatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgtttgttgttgttgc 13561383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 126 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 38501668 - 38501422
Alignment:
Q  126 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 225  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||||||   | ||||||| | ||    
T  38501668 aaataggtttagatggtttggacatgtaaagagaagacttgtagatgccgtcgtaagaagagtagattagatggaggagagtcggatcaaaagagatgga 38501569  T
Q  226 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatt 325  Q
     |||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| ||||| | || ||     
T  38501568 tgaagacctaggagaactataaaagaaactattagaaagtatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaaaactatagtgtaata 38501469  T
Q  326 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38501468 tgatcgatgtagccgatcccacttagtgggataagacttggttgttg 38501422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 190 - 374
Target Start/End: Original strand, 14911268 - 14911452
Alignment:
Q  190 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 289  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14911268 gatcaaatgaaggagagtcgggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggttaatgagttggatc 14911367  T
Q  290 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  14911368 caaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggtttggttgttgtt 14911452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 329
Target Start/End: Original strand, 14749271 - 14749542
Alignment:
Q  58 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 157  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14749271 gataggattagaaatgaaaacattagagagagagttggtgtagcacctatagtagaaaaattggtagaaactagacttagatggtttggacatgtagaga 14749370  T
Q  158 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 257  Q
    ||||||  || ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| | |  | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  14749371 gaagacctgtggattctgttgtaaggagagtcgatcagatggaggggagtcaaatcactaaaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactat 14749470  T
Q  258 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 329  Q
     |  |||||| ||||| | || |||||||||  |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14749471 caagaaggatctagagattaacgagttggatagaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 14749542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 238 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16914021 - 16913882
Alignment:
Q  238 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16914021 aaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttacgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtag 16913922  T
Q  338 ccga-tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16913921 ccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 16913882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 377
Target Start/End: Original strand, 27816 - 28165
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| | || ||| |||| ||||| ||||||||||||| || | |||||  |||||||||||||||||||||    
T  27816 gagatgaggatgttgcattagatgagtggtaaaacta-acaagatatgattatgaatgacaccatttgaaaaagagttagggtagcacctatagtagaaa 27914  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    || || | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||  || ||| | ||||         || ||||||| ||||| |||   ||||||||  | ||    
T  27915 agatgatggaaaataggcttaggtggtttgagc--gtaggtaggagatttgtag---------tacgaagagtagatcagatgcgtgagagtcagatcaa 28003  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||| || | | |||||||||||||    
T  28004 aagaggttgaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaataagttggatccaaatatgatttctgatagaacacta 28103  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||| | ||||||| |||||||| || |||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  28104 tggcataatttgatacatgtagctgaccccatttagttagataagacttggtttttgttgtt 28165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 274 - 378
Target Start/End: Original strand, 30213755 - 30213859
Alignment:
Q  274 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30213755 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttt 30213854  T
Q  374 tgttg 378  Q
    |||||    
T  30213855 tgttg 30213859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 378
Target Start/End: Original strand, 79501 - 79797
Alignment:
Q  82 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 181  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |   |||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||| ||||    
T  79501 agagagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacataattaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagtaa 79600  T
Q  182 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 281  Q
    | ||||| ||||||||||||||  |||   | | ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||    
T  79601 ggagagtcgatcaaatggaggatggtcggatcacaagaggctgaggaagacctagaaaaactatcagataaactattaggaatgatttggaaattaatga 79700  T
Q  282 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    | |||| | |||| ||||| |||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  79701 gctggaccgaaatatggtgcatgatagaccattatggcgtgatttcatccatgtagctggccccacttagtgggaaaaggcttggtggttgttgttg 79797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 336
Target Start/End: Original strand, 36215418 - 36215730
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||  |||| | |||| |||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  36215418 agcagagatgagtatgttgcgctagatgagcagtaaaactagatatgatatgattatgaatgac--cattagggagagagtggaggtagcatctatagta 36215515  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||| |||  || | ||||||||| ||||  |||||||||||||| |    
T  36215516 gaaaagttggtaggaaatatgcttagatggtttcggcacgtagaaagaaaactcgtatatgtcgttgaaagaagagtagatcggatggaggagagtcagg 36215615  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    | |||||||||||          ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | ||| |||||||  ||   |||||||||||    
T  36215616 tcaaaagaggtag----------aggaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaattaattgaatccaaacatgacttatgatagaac 36215705  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgta 336  Q
    ||||||  || ||||||| ||||||    
T  36215706 actatgatgtgatttgattcatgta 36215730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 7359577 - 7359258
Alignment:
Q  58 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 157  Q
    ||||| ||||| |||||||   |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  7359577 gatagaattagaaatgacaatgttagagagagagttcaggtaacacctatagtagaaaatatggtggaaaataggtttaggtggtttgg-catgtagaga 7359479  T
Q  158 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 257  Q
    |||||   |||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | |  ||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  7359478 gaagatatgtagattctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcatatcactagaggcagaggaaagcctagaaaaaccataagagaaactat 7359379  T
Q  258 t-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 356  Q
    | |||||  || ||||| | ||| ||||||||| |||| |||| || |||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7359378 ttagaaaa-atctagagattaataagttggatcgaaatatggtttacgata-aacattatgacgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtggga 7359281  T
Q  357 taaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  7359280 caagacttggttgttgttgttgc 7359258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 58 - 378
Target Start/End: Original strand, 6859345 - 6859665
Alignment:
Q  58 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 157  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||  | ||| |||| ||||| |||| ||| |||||||| || |||||||    
T  6859345 gatatgattagaaatgacaatattagacagagagttggggtagcacctatagtgaagaagatggtggaaaacaggcataggtggtttggacacgtagaga 6859444  T
Q  158 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 257  Q
    ||||||| || ||| |||| |||||  || |  || | |||||||| ||||||   |  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  6859445 gaagacttgtggattctgtagtaaggggaataaattagatggaggatagtcaaaccactagaggaagaggaagacctagaaaaactataagagaaactat 6859544  T
Q  258 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggat 357  Q
    ||| || |||||| || | | | | ||||  | |||| |||| |||||||||||| |||||| | |||| |||||||| || || |||||||||||||||    
T  6859545 taggaaagatttacagattagttacttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcataattttatccatgttgctgaccccacttagtgggat 6859644  T
Q  358 aaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  6859645 aaggcttggtagttgttgttg 6859665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 371
Target Start/End: Original strand, 2712936 - 2713213
Alignment:
Q  86 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaag 185  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||   ||| ||    
T  2712936 agagagttggggtagcacctatagtctaaaagatggtagagactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtggattctgtatgaaggag 2713035  T
Q  186 agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 285  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| | |  ||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||    
T  2713036 agtagatcagatggaggagagtcaaatcactagagtcaggggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaggatctagagatgaatgagttg 2713135  T
Q  286 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 371  Q
    ||   |||      |   |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2713136 ga--gaaa------gacagatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgagcccacttagtgggataaggcttggttgtt 2713213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 267 - 377
Target Start/End: Original strand, 5558314 - 5558424
Alignment:
Q  267 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5558314 tttagaggtcaatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgg 5558413  T
Q  367 ttgttgttgtt 377  Q
    |||| ||||||    
T  5558414 ttgtcgttgtt 5558424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 367
Target Start/End: Original strand, 6888931 - 6889267
Alignment:
Q  32 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 131  Q
    |||||||| ||||||||| ||||   |||| |||||| |||||||  |||| ||| |||||  ||||||||| |||||  |||||| |||| ||||||||    
T  6888931 gttggatgtgtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaatattacagaaagagttggggtagcacgtatagaggaaaagatggtggaaaatag 6889030  T
Q  132 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 231  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||||| | | |  || | |||||||| ||||||   |   |||| ||||||||     
T  6889031 gcttaagtggtttggacatgtagagagaagacttgtggattatgtggtaaggacaataaattagatggaggatagtcaaaccacttgaggaagaggaagg 6889130  T
Q  232 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 331  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||| ||||||  | |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  6889131 cctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaattagttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcc 6889230  T
Q  332 atgtagccgatcccactt-agtgggataaggcttggt 367  Q
    ||||||| || | || || |||||||||| |||||||    
T  6889231 atgtagctgaactcatttaagtgggataaagcttggt 6889267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 378
Target Start/End: Original strand, 14667751 - 14668055
Alignment:
Q  82 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggg--------catgtagagagaagactagtagatgc 173  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||        ||||||||||||||||  ||| ||      
T  14667751 agagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttggggctttgggcatgtagagagaagacatgtacatta 14667850  T
Q  174 tgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagag 273  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||| |  | |  ||||| || ||||  ||||| |||||||| |||||| | | ||  || ||| |||||    
T  14667851 tgtagtaaggagagtagatcagatggattatagttatatcactagaggcagcggaaatcctagaaaaactataagagaagctactaagaaagatctagag 14667950  T
Q  274 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
     | |||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  14667951 attaatgagttggatccaagtatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataagacttggttgtagt 14668050  T
Q  374 tgttg 378  Q
    |||||    
T  14668051 tgttg 14668055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31636253 - 31636009
Alignment:
Q  41 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg 140  Q
    ||||||||| |||||  ||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||    
T  31636253 gtggtaagactagactggatagaattataaatgacagcattagagaaag--ttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtg 31636156  T
Q  141 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||||| ||||| ||| | |||| || ||||||| | |  |||| ||| |||||| |||| |||    
T  31636155 gtttgggcatgtagagagaagacccgtggatgttgtagtaaggagagtagattagatggtggggagtcaaatcactagagataggggaagatctagaaaa 31636056  T
Q  241 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 287  Q
    |||||||||||||| || |  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  31636055 actattagagaaactatcaagaaggatatagagatcaatgagttgga 31636009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 344
Target Start/End: Original strand, 32516480 - 32516805
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||||||  |  | ||| ||| |||||||||||    
T  32516480 gagatgatgatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaggatagacttagaaatgacaacattagagagag--ttggagtaacacttatagtagaaa 32516577  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||| | | |||| ||| || ||  |||||| |||| ||| | ||||| ||||  ||| |||| | |||  |||     
T  32516578 agatggtggaaaataggcttaggtggtttagacttgtaaagaaaatacatgtagattctgtagtatggagagtagatcggatgaaggataatcagattac 32516677  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||   ||||||||| | ||  |||||||| ||||| |||| |||||||||| | ||    
T  32516678 aagaggtagaggaagaccta-aaaaactataagagaaactattagagcagatttagagattaacaagttggattcaaatatggtttatgatagaatatta 32516776  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcc 344  Q
    || ||| |||||||| || || |||||||    
T  32516777 tgacgtaatttgatcgatataaccgatcc 32516805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 247 - 378
Target Start/End: Original strand, 28276391 - 28276522
Alignment:
Q  247 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 346  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |  |||    
T  28276391 agagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggattcaaatattgtttatgatagaaaactatggtgtaatttgatccatgtagccaactcca 28276490  T
Q  347 cttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28276491 cttagcgggataaggcttggttgttgttgttg 28276522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17340798 - 17340500
Alignment:
Q  15 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacct-atagtaga 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||   | || ||| | ||||||||    
T  17340798 agagataaggatgttgcgttggatgagtggtaaaactagaagaaatgtgattaggaatgacaccattagagagagggttgagataacactttatagtaga 17340699  T
Q  114 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 213  Q
    ||  ||  |||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| ||| | ||||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  17340698 aacattattagaaaataggcttaggtggttttgacatgttaagagaaaactcgcagatgatgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcaggtc 17340599  T
Q  214 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 312  Q
    ||||  |||||| |||||| ||| |||| ||| |  | ||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  17340598 aaaaagggtagatgaagacttagaaaaattataattgtaactattaagaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttatgatataaca 17340500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 43558133 - 43557833
Alignment:
Q  72 tgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtag 169  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||| |||| |||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43558133 tgacaacattagagagagagagttagggtagcatctataatagaaaagatggtggaaactaagcttaggtggtttgggcatatagagagaagacttgtag 43558034  T
Q  170 atgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggattt 269  Q
    ||||||  ||||||||||| ||| | ||  | ||  ||||  | |  |||  | || || ||||||| |||||||| ||||||||     | || |||||    
T  43558033 atgctgcagtaagaagagtagattagataaatgatggtcatatcactaga--tggatgatgacctagaaaaactataagagaaac----cgtaaagattt 43557940  T
Q  270 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 369  Q
     ||| | | ||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| | | | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  43557939 ggagattattgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacttaagttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcctggttg 43557840  T
Q  370 ttgttgt 376  Q
    |||||||    
T  43557839 ttgttgt 43557833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 265 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 418145 - 418032
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  418145 gatttagagattaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttggtgggatatggctt 418046  T
Q  365 ggttgttgttgttg 378  Q
    |  |||||||||||    
T  418045 gaatgttgttgttg 418032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 377
Target Start/End: Original strand, 7678402 - 7678760
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag-----agagagtgtgggtagca-cctatag 109  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||     |||||||  || ||||| |||||||    
T  7678402 gagatgaggatgttgcgttggatctgtggcaagactagataggataggattagaaatgacaacattagaggggagagagagttgggatagcaacctatag 7678501  T
Q  110 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
    ||||||| | ||| ||||   ||||||| | |||||||| |||||||| |||||  |||||| |||| ||||| ||||| |||     |||||| |||||    
T  7678502 tagaaaaat-ggtggaaac--ggcttaggttgtttgggcttgtagagaaaagacatgtagattctgtagtaaggagagtagat-----ggaggatagtca 7678593  T
Q  210 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 308  Q
      | |  ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||| |||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||| ||| |||     
T  7678594 gatcactagaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaag-atctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataata- 7678691  T
Q  309 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||| ||||  ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7678692 aacattatgaggtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaaacttggttgttgttgtt 7678760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 11002785 - 11002424
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||   ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||| ||||    
T  11002785 agcagagatgaggatgttgcgctggatgtgtggtaagacgagatgggatagaattagaaatgacaacattagagagag--ttcgggtagcacctacagta 11002688  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtgg--taagaagagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
    |||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||   || ||  |||| |  | ||  |||| ||||| ||| ||| ||||||    
T  11002687 gaaaacatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtaggtagaagatctgtggactctgtagttttaggggagtagatcagatgtaggggagtca 11002588  T
Q  210 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 309  Q
      | |  |||||| | || |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || ||| ||||| | |||||||||||   |    | || | |||||||    
T  11002587 gatcactagaggttggggtagacctagaaaaactataagacaaactattagtaacgatctagagataaatgagttggagaaaggcatagtttttgataga 11002488  T
Q  310 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||||| |  |||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11002487 acactatggcattgtttgattcatgtagtcgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgt 11002424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 378
Target Start/End: Original strand, 43475243 - 43475523
Alignment:
Q  97 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |    
T  43475243 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtattcagagagaagacctgtagatgttgtagtaaggagagtagatcaga 43475342  T
Q  197 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 296  Q
    ||||||| |||||  | |  | ||| | | | | || ||| |||||| | |||||||| ||||  || |||  |||| | ||||||||||||| |||| |    
T  43475343 tggaggatagtcagatcactataggaaaaagtaaacatagaaaaact-taagagaaactattaagaaagatccagagattaatgagttggatcgaaatat 43475441  T
Q  297 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    | | |||| ||||||  ||||| || |||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43475442 gatttatggtagaacgttatggtgtaatttgatccacgtagccaactccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 43475523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 376
Target Start/End: Original strand, 1525651 - 1525923
Alignment:
Q  101 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgga 200  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||  || |||  || || ||||| ||||| |||||    
T  1525651 cacctattgtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggcttggacatgtagagagaagacccgtgaattctgcagttaggagagtagatcagatgga 1525750  T
Q  201 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg 300  Q
    |||||||||  | |  |||||||| || |||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||  |||| | |||||||||||   | |  ||||     
T  1525751 ggagagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaggatccagagataaatgagttggagaaagacatggtt 1525850  T
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    | ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1525851 tttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccga--cca-ttagtgagataaggcttggttgttgttgt 1525923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 223 - 378
Target Start/End: Original strand, 11675658 - 11675814
Alignment:
Q  223 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 321  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| | ||||||||||||   |||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  11675658 agaggaagacctgtaaaaactataagagaaactattaggacagatttagagattaatgagttggattttaaatatggtttatgatagaacattatggcgt 11675757  T
Q  322 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
      ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11675758 agtttaatccatgtagccgaccccacttagttggataaggcttggttgttgttgttg 11675814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 305 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 408565 - 408490
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgca 380  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  408565 atagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgca 408490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 359
Target Start/End: Original strand, 30588460 - 30588712
Alignment:
Q  105 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 204  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||| |   ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||  |||||||||     
T  30588460 tataatagaaaagatggtggaaaataggtttaagtggtttgggcatattcggagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagat--aatggaggat 30588557  T
Q  205 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 304  Q
    ||||| || |  ||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||   |||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||     
T  30588558 agtcaggtcacgagagacataggaagacctagaaaaactataagagaaattgttaagaaagatctagagatgaatgagttggatcgaaatatggtttata 30588657  T
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 359  Q
    |||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30588658 atagaacattatgacgtgatatgatccatgtagccgactccacttagtgggataa 30588712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 364
Target Start/End: Original strand, 9235172 - 9235316
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||  || ||| ||||| | |||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| |||    
T  9235172 agaggcagaggaagacctagaaaaacta--agagaaactattaagaaagatatagagattaatgagctggatcgaaatatggtttatgatagaacattat 9235269  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9235270 ggcataatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggctt 9235316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 10083102 - 10082747
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||| | |||||| |||||  |  ||||| |||||||||||    
T  10083102 agcagggatgaggatgttgctttg-atgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgagaacattagggagagcattggggtatcacctatagta 10083004  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||  ||||| |||      |||| |||||||     
T  10083003 gaaaagatggtagaaactagacttaagtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtagtaaagagagtagat------gaggggagtcaaa 10082910  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    | |  |||| ||| | ||||||||| |||||||| |||||||| | ||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | || ||  ||    
T  10082909 tcaccagagatagggtaagacctagaaaaactataagagaaactagtaacaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgttaacac 10082810  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||| |||| | |||| |||||||| || ||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  10082809 actatgacgtcgtctgattcatgtagctgaccctgcttattgtgataaggcttggttgttgtt 10082747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 157
Target Start/End: Original strand, 15168721 - 15168855
Alignment:
Q  25 atgttgcgttggatgagtggta--agattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 122  Q
    |||||||||| ||||||||| |  |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15168721 atgttgcgttagatgagtggcacaagattagacgagataggattaagaatgacaccattagagggagttggggggtagcacctatagtagaaaagatggt 15168820  T
Q  123 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 157  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  15168821 agaaaataggctaaggtggtttggacatgttgaga 15168855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 245
Target Start/End: Original strand, 21952274 - 21952508
Alignment:
Q  17 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcac----ctatagt 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||  ||||| |||    |||||||    
T  21952274 agatgaggatgttgcgttgcatgtgtggtaagactagacgagataagattagaaatgacagcattaaagagagagggttggggtaacacacacctatagt 21952373  T
Q  111 agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 210  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||| |  || ||| || | ||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||    
T  21952374 agaaaagatggcagaaactagactcaggtggtttggacatgtagagagaagtcctgtggattctatagtaaggagaatagatcagatggaggggagtcaa 21952473  T
Q  211 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactat 245  Q
     | |  |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21952474 atcactagaggtaggggaagacctagaaaaactat 21952508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 288 - 377
Target Start/End: Original strand, 38132531 - 38132619
Alignment:
Q  288 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38132531 tccaaatgtggt-tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 38132619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 237 - 377
Target Start/End: Original strand, 2090556 - 2090696
Alignment:
Q  237 gaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 336  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||| | || ||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2090556 gaaaactataagagaaaatattaggaaagatttagaggttaatgagcttgatccaaatatagtttatgatccaacattatggcgtaatttgatccatgta 2090655  T
Q  337 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
     |||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2090656 cccgaccccattgagtgggataaggctttgttgttgttgtt 2090696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 285 - 377
Target Start/End: Original strand, 18855798 - 18855890
Alignment:
Q  285 ggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18855798 ggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 18855890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 298 - 378
Target Start/End: Original strand, 42576214 - 42576294
Alignment:
Q  298 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42576214 gtgtatgatagaacataatggcgtaatttgatccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 42576294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Original strand, 28411885 - 28411960
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28411885 tgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 28411960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 378
Target Start/End: Original strand, 29922409 - 29922568
Alignment:
Q  219 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 318  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||| | ||  |||||||   |||  |||| || ||||||||| |||||    
T  29922409 aggtagaggaagatctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagattaacaagttggactgaaacctggtttacgatagaacattatgg 29922508  T
Q  319 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||| ||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  29922509 cgtaatttgatccatgtagccaacctcacttggtgggataagccttggttgttgttgttg 29922568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 255 - 378
Target Start/End: Original strand, 39040917 - 39041040
Alignment:
Q  255 aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgg 354  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| | ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  39040917 aattagaaaagatttagaggtcaataagttgcatctaaatatggtttttgatataacaccatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgg 39041016  T
Q  355 gataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||    
T  39041017 gataagacttgattgttgtagttg 39041040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 378
Target Start/End: Original strand, 2393039 - 2393160
Alignment:
Q  256 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg 355  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| | || | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2393039 attagaaaagatttagaggtcaatgaattagacccaaatatagtttctaatagaatactatggtatcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggg 2393138  T
Q  356 ataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| |||| |||||||||||||    
T  2393139 ataaagctt-gttgttgttgttg 2393160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 291 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 7640592 - 7640510
Alignment:
Q  291 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7640592 aaatatggtttatgatagaacactacggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggaataaggctcggttgttgt 7640510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 217 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12577019 - 12576861
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||| ||  |||| |||| ||||||||| || |||    
T  12577019 agaggcagaggaagacctagaaaaactacaagataaactattaagaaagatctagagattaatgagttgaatagaaatatggtatatgatagaccattat 12576920  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    || ||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12576919 ggtgtcattttatacatgtagccgaccccaattagtgggataaagcttggttgttgttg 12576861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 218 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15588546 - 15588399
Alignment:
Q  218 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 317  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||   ||||||||||||  |||  |||| ||||| |||||| ||||    
T  15588546 gaggcagaggacgacctagaaaaactataagagaaactattataa--gatttagagagaaatgagttggataaaaacatggtatatgacagaacattatg 15588449  T
Q  318 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggt 367  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15588448 gcgtcgtttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttggt 15588399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 277 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32442224 - 32442124
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||| |||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32442224 aatgagttggatccaaatatggttttggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataa-gcttggttattgttgt 32442126  T
Q  377 tg 378  Q
    ||    
T  32442125 tg 32442124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 291 - 379
Target Start/End: Original strand, 9400708 - 9400796
Alignment:
Q  291 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9400708 aaatttggtttatgatataatactatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccatttagtgggattaggcttggttattgttgttgc 9400796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15489789 - 15489609
Alignment:
Q  79 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtgg 178  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||      
T  15489789 attagagagagagttggggtagtacctattgtagaaaagatggttgaaactcagcttagatggtttgggcatgtagagagaagatttgtagattttgtat 15489690  T
Q  179 taagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta 259  Q
    |||| ||||| ||| | |||||||| |||  | | |  ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  15489689 taaggagagtagattagatggaggatagttgaatcactagaggcagaggaagacctagaaaaacaataagagaaactatta 15489609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 378
Target Start/End: Original strand, 20367061 - 20367177
Alignment:
Q  262 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagg 361  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||| || ||||||||    
T  20367061 aaggatctagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatgacgtaatttgatccatatagccaaccccacttggtaggataagg 20367160  T
Q  362 cttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  20367161 cttggttgttgttgttg 20367177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 377
Target Start/End: Original strand, 38684471 - 38684763
Alignment:
Q  85 gagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaa 184  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||| |||| ||  |||| |||||||  |||||||||||||||||  ||  || || | ||||| |    
T  38684471 gagagagtcagggtagcacctatagtataatagatggtggaaactaaacttaaatggtttcagcatgtagagagaagacctgtgtattctatagtaagga 38684570  T
Q  185 gagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagtt 284  Q
    ||||  || | ||||||| || || | | |  ||| ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||  |||  || ||| ||||| | ||| ||||    
T  38684571 gagtatattagatggaggggattccaatcactagatgtaaaggaagacctagaaaaactacaagagaaacttttaagaaagatctagagattaattagtt 38684670  T
Q  285 ggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||  |||| ||||   |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  38684671 ggatagaaatatggtacttgatagaacattatggcgttatttgattcatgtagttgaccccacttagtggaataaagcttggttgttgttgtt 38684763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 303 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3442944 - 3442873
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3442944 tgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggcataaggcttggttgttgtt 3442873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 244 - 314
Target Start/End: Original strand, 2552932 - 2553002
Alignment:
Q  244 attagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 314  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2552932 attagagaaagcattaaaaaggatttagatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 2553002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 254
Target Start/End: Original strand, 42199243 - 42199446
Alignment:
Q  49 attagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggc 148  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||  | ||| ||||||| |  ||||||||| ||  ||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||    
T  42199243 attagacgggataggattagaaatgacgacgttacagagagaattggggtagcactta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggc 42199340  T
Q  149 atgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattag 248  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||   |||||| | |  || || |||| ||||||||| |||||||||||    
T  42199341 atgtagagagaagacatgtagattctgtagtaaggagagtagatcacatggagagtagtcaaatcactagggggagagaaagacctagaaaaactattag 42199440  T
Q  249 agaaac 254  Q
    | ||||    
T  42199441 acaaac 42199446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 101
Target Start/End: Original strand, 20318905 - 20318989
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20318905 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggta-----agactggataggattaggaatgacaccattagagaaagagtgggggtagc 20318989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 304 - 377
Target Start/End: Original strand, 42272687 - 42272760
Alignment:
Q  304 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42272687 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggctaagttgttgttgtt 42272760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 418318 - 418190
Alignment:
Q  43 ggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga--tg 140  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||||  ||    
T  418318 ggtaagacgagacatgatagaattagaaatgacaacattagagagag--ttggggtagcacctatggtagaaaagatggcagaaatttggcttagacctg 418221  T
Q  141 gtttgggcatgtagagagaagactagtagat 171  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  418220 gtttgggcatgtagagagaatacttgtagat 418190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9917695 - 9917458
Alignment:
Q  131 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 230  Q
    ||||||| ||||||| || |||| |||||||||  || |||  ||| ||||  ||||| ||||| |||||||| |||||| | | |||||  |||||| |    
T  9917695 ggcttagttggtttgtgcgtgtaaagagaagacatgttgattttgtagtaaagagagtcgatcagatggaggatagtcaaatcacaagagacagaggatg 9917596  T
Q  231 acctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 329  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | |       |||||||||||| |||  | || |||||     
T  9917595 acctagaaaaactattagagaaactatttagaaag-atatagagatcaatgagttggatagaga-------tatgatagaacagtataacatcgtttga- 9917505  T
Q  330 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
      |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9917504 --atgtagccgaccccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgttg 9917458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 308 - 376
Target Start/End: Original strand, 27386554 - 27386622
Alignment:
Q  308 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27386554 gaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatggttgttgttgt 27386622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 163
Target Start/End: Original strand, 33667217 - 33667285
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33667217 gggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 33667285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 296 - 378
Target Start/End: Original strand, 5860036 - 5860118
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5860036 tggtttatgatagaccattatggcgtaatttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 5860118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 296 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11069242 - 11069160
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11069242 tggtatatgatagaacattatggcgtaatttgatccatatagctgaccccacatagtgggatatggcttggttgttgttgttg 11069160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 232 - 377
Target Start/End: Original strand, 5303582 - 5303730
Alignment:
Q  232 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt--ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga- 328  Q
    ||||| |||||| | |||||||| |||  ||| ||||||||| | ||||||||||||  |||| |  ||| |||||||||| | ||||||||  ||| |     
T  5303582 cctagaaaaactgtaagagaaactattgaaaaagatttagagtttaatgagttggatagaaatatatggtatatgatagaatattatggcgttgttttaa 5303681  T
Q  329 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5303682 tccatgtagccgatcccacttagtgggataagtcctggttgttgttgtt 5303730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18351189 - 18350900
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggca-tgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 193  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||   |||| ||||| ||||    
T  18351189 gggtagcacctatagtagaaaatatggtagaaactaggcttaggtggtttgggcattgtagagagaagacctgtagattatgcaataaggagagtagatc 18351090  T
Q  194 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaa------aggatttagaggtcaatgagttgg 286  Q
    ||| |||||  | |||| | |  ||||| ||||||| | ||| |||| |||| |||||||| ||| ||||      ||  | ||||| | ||||||||||    
T  18351089 aaaaggagggtaatcaaatcactagagg-agaggaacatcta-gaaagctataagagaaactattaagaaaaatctagactatagagattaatgagttgg 18350992  T
Q  287 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||  |||| |||| | || ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  18350991 atagaaatatggtatttgttagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagccgacctcacatggtgggatgagacttggatgttgttgttg 18350900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 259
Target Start/End: Original strand, 28676596 - 28676760
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||   || ||  ||| ||||| | | |  || |    
T  28676596 gggtagcagctatagtagaaaagatggtggaaaatagtcttaggtggtttcggcatgtagagagaagacctttaaattatgtcgtaaggataatatatta 28676695  T
Q  195 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta 259  Q
     ||||||||  ||||  ||| |||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  28676696 gatggaggattgtcagattacaagaggtagaagaagacctataaaaactataagagaaacaatta 28676760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 302 - 378
Target Start/End: Original strand, 32366186 - 32366262
Alignment:
Q  302 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32366186 atgatagaacattatgacgtcatttgatccatgtggccaaccccatgtagtgggataaggcttggttgttgttgttg 32366262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 378
Target Start/End: Original strand, 38830504 - 38830603
Alignment:
Q  278 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||| | |||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  38830504 atgagttggaccgaaatatgatgtatgatagaacattatagcgtaatt-gatccatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggtttggttgttgttgtt 38830602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 301 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 28186857 - 28186782
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  28186857 tatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgcagccgaccctactcaatgggataaggcttggttgttgttgt 28186782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 377
Target Start/End: Original strand, 2645175 - 2645273
Alignment:
Q  279 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||||  |||| |||| | ||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2645175 tgagttggatagaaatgtggtatttgataaaacattatagcatcgtttgatccatgtagccggccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 2645273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 28187030 - 28186956
Alignment:
Q  14 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 88  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28187030 cagagatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgacaacattagagaga 28186956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 323 - 377
Target Start/End: Original strand, 36551375 - 36551429
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36551375 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgtt 36551429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 378
Target Start/End: Original strand, 41894237 - 41894357
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga-------tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggat 357  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||       || |||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  41894237 gatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgaattatgatacaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggat 41894336  T
Q  358 aaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  41894337 aagactttgttgttgttgttg 41894357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42504393 - 42504247
Alignment:
Q  230 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 329  Q
    ||||||| |||||||| ||||||   | || |||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  42504393 gacctagaaaaactataagagaagtcaataaaaaggatttagatgtcaatgagttatatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat 42504294  T
Q  330 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    | | ||||  |||  ||| ||||||  || |||||||||||||||||    
T  42504293 caacgtagttgatttcacctagtggtctagggcttggttgttgttgt 42504247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 219817 - 219692
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||  |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||     
T  219817 agcaaagatgagaatgttgcgttggatgcgtgttaagacaagacgagataagattacgaatgacaacattggagagagagttggggtagcacctatcgtt 219718  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttag 137  Q
    |||||| |||| |||| | |||||||    
T  219717 gaaaaggtggtggaaacttggcttag 219692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 307 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 9121147 - 9121078
Alignment:
Q  307 agaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9121147 agaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgtcgttgt 9121078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15986992 - 15986879
Alignment:
Q  121 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 220  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||   |||||| || | ||||| |||||||||||||||||||| |||||  | | |||||    
T  15986992 gtagaaaataggtttaggtggtttgggcgtgtagagagaagatatgtagattctatagtaaggagagtggatcaaatggaggatagtcagatcacaagag 15986893  T
Q  221 gtagaggaagacct 234  Q
    ||| | ||||||||    
T  15986892 gtaaatgaagacct 15986879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 374
Target Start/End: Original strand, 33667562 - 33667715
Alignment:
Q  221 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 320  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||   ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | |||||||||||| |||||    
T  33667562 gtaggggaagacctagaaaaactataagagaagttattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactttggcg 33667661  T
Q  321 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |  |||||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33667662 ttgtttgattcgtgtagccaaccccacttattgggataaggcttggttgttgtt 33667715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 36123257 - 36123180
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| ||||| | | |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36123257 tatgatagaacattatggtggcgtttgatccatgtaatcggtcccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 36123180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41200421 - 41200344
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  41200421 tatgatagaacgttatggcatcatttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataaggccttgctgttgttgttg 41200344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 359
Target Start/End: Original strand, 23979976 - 23980209
Alignment:
Q  124 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 223  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||  |  |||||| || | ||||||||||| ||||| || ||  | |||||  ||| ||||||||    
T  23979976 gaaaataggtttaggtggtttggacatgtagagagaaaccctgtagattctatagtaagaagagtagatcagataga--aaagtcatattacaagaggta 23980073  T
Q  224 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 323  Q
     ||| |||||||| | ||| || |||||||| |||   || |||||| || | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| | |      
T  23980074 taggcagacctagaagaacaataagagaaactattgagaatgatttatagattaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacaatatgacatat 23980173  T
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 359  Q
    ||  |||||||||  | | |||||||||||||||||    
T  23980174 ttcaatccatgtaatcaaccccacttagtgggataa 23980209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 376
Target Start/End: Original strand, 27998567 - 27998723
Alignment:
Q  220 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||  || ||| || || | |||||||| |||   ||  || | |||||||||| | |||| |    
T  27998567 ggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactactaagaaagatctacagattaatgagttagataggaacatgatatatgatagaatattatgac 27998666  T
Q  320 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  27998667 gtcgtttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggatatggtttggttgatgttgt 27998723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 303 - 371
Target Start/End: Original strand, 28985292 - 28985360
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 371  Q
    |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28985292 tgatagaacattatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgtt 28985360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 358
Target Start/End: Original strand, 29938126 - 29938374
Alignment:
Q  105 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 204  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||  |||||| | |||||||| | ||| |||   ||| ||||     
T  29938126 tataatagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttaagcctatagagagaagacctgtagattcggtggtaaggacagtagattggatgaaggat 29938225  T
Q  205 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 304  Q
    |||||  | | ||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||||| || ||||||  | | ||||||||||||  |||| || | ||||    
T  29938226 agtcagatcacaagaggtagaggaagacctagaaaaact----gagaaactattaggaatgatttaatgattaatgagttggattgaaatatgatttatg 29938321  T
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 358  Q
     ||||||| | ||| || | ||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  29938322 -tagaacattttggtgtaagttggtccatgtagccgaccccactcagttggata 29938374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39322141 - 39322077
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||    
T  39322141 tatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagactggctagttgttgttg 39322077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 375
Target Start/End: Original strand, 25938091 - 25938250
Alignment:
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    |||||||| ||||| ||||||   |||||| |||||||| ||||||||   ||||||| ||| ||||||| || ||||| | || ||||| | |||||||    
T  25938091 aagaggtaaaggaatacctagactaactataagagaaactattagaaattttttagagatcactgagttgaattcaaatatagtttatgacataacacta 25938190  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
     |  || ||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25938191 cgttgtaatttgattcatgtagccgactccacatagtgagataagacttggttgttgttg 25938250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 374
Target Start/End: Original strand, 27800037 - 27800108
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27800037 tgatagaacattatggtataatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 27800108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 218114 - 218052
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  218114 tatggcgtcattagatccatgtagccgaccccacctagtgggataagacttggttgttattgt 218052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 310
Target Start/End: Original strand, 15168873 - 15168987
Alignment:
Q  196 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 295  Q
    |||||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||  |||| ||  |||||||||| ||| ||||||||||| ||     
T  15168873 atggaggagagtgagattagaagaggtagaggacaacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaaaatttagaggttaataagttggatccagata 15168972  T
Q  296 tggtgtatgatagaa 310  Q
    |||| ||||||||||    
T  15168973 tggtttatgatagaa 15168987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 247
Target Start/End: Original strand, 36200769 - 36200894
Alignment:
Q  121 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 220  Q
    |||||||||| | |||| ||||||  |||||||||||||| || |||| ||| ||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||  | ||||     
T  36200769 gtagaaaatatgattaggtggttttagcatgtagagagaaaaccagtaaatgatgtagtatgaagagtagatcagatagaggagagtaaag-aagaagat 36200867  T
Q  221 gtagaggaagacctaggaaaactatta 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  36200868 gtagaggaagacctagaaaaactatta 36200894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 376
Target Start/End: Original strand, 3000968 - 3001021
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3000968 atttgatggatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 3001021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 376
Target Start/End: Original strand, 9234115 - 9234168
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9234115 atttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 9234168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 162
Target Start/End: Original strand, 31906592 - 31906729
Alignment:
Q  25 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 124  Q
    |||||||||| |||||  ||||| | |||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||  |||||| | ||||||||||||| |    
T  31906592 atgttgcgttcgatgaacggtaaaactagacggaataggattaggaatgacatcattagggagagagtgagagtgacacctacaatagaaaagttggtcg 31906691  T
Q  125 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 162  Q
     |||||  ||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  31906692 gaaatattcttagatagtttagacatgtagatagaaga 31906729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 41108803 - 41108727
Alignment:
Q  302 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta--gtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  41108803 atgatagtacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgtgggataaggcttgattgttgttgt 41108727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 91
Target Start/End: Original strand, 5305545 - 5305613
Alignment:
Q  23 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 91  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  5305545 ggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacaagatagaattagaaataacaacattagagagagag 5305613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 217 - 377
Target Start/End: Original strand, 6788190 - 6788349
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||| || || || ||  | |||||||||||   |||| || | |||||||||||| |||    
T  6788190 agaggcagaggaagacctagaaaaactatcaaaggaactattaggaaagacttggaaattaatgagttggactgaaatatgatttatgatagaacattat 6788289  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
     |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| ||| |||||| |||||||||    
T  6788290 agcgtaatttgattcatgtagccgacctcacttagtagga-aagacttggtggttgttgtt 6788349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 235
Target Start/End: Original strand, 11675547 - 11675651
Alignment:
Q  131 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 230  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||| |||| ||||| ||||| ||||| | |||||| |||||  | |||||| ||||||||||    
T  11675547 ggcttaggtggtttgggcatgttgagagaaggcctgtagattctgtagtaaggagagtagatcatagggaggatagtcagatcaaaagatgtagaggaag 11675646  T
Q  231 accta 235  Q
    |||||    
T  11675647 accta 11675651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 308 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 43423563 - 43423492
Alignment:
Q  308 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgca 380  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43423563 gaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccttttagtgggataaggctt-gttgttgttgttgca 43423492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 374
Target Start/End: Original strand, 10668569 - 10668620
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10668569 atttgatcaatgtagccgaccccacttattgggataaggcttggttgttgtt 10668620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 209
Target Start/End: Original strand, 21093772 - 21093867
Alignment:
Q  114 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  21093772 aaagttggtggaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagggaagacttggagattttgtagtaaagagagtagatcagatggaggatagtca 21093867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32006232 - 32006161
Alignment:
Q  308 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt-agtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32006232 gaacattaaggcgtaatttgatccatgtagccaaacccagttcagtgggataaggcttggttgttgttgttg 32006161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33158057 - 33157918
Alignment:
Q  150 tgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga 249  Q
    ||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||| |||| |||    
T  33158057 tgtagagagaaaacatgtagattctgtagtaagaagagtagatcaaatataagatagtcatgttacaagaggtataagaagacctagaaaacctataaga 33157958  T
Q  250 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 289  Q
    ||||| | || |||  ||||| || | |||||||||||||    
T  33157957 gaaactactaaaaaatatttatagattaatgagttggatc 33157918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Original strand, 34039960 - 34040059
Alignment:
Q  17 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||   ||||||  ||||||||||||    
T  34039960 agatgaggatgtcgcgttggatgaatgataaaactagatatgataggattaaaaattacaccattagagagagaatgaatgtagcatgtatagtagaaaa 34040059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Original strand, 43035039 - 43035222
Alignment:
Q  152 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 251  Q
    ||||||||||||   ||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||| |||||| | |  ||||| ||||||||| |||| ||||| ||  ||||    
T  43035039 tagagagaagacgtctagattctgtagtagggagagtagatcaaatcgaggatagtcaactcactagaggcagaggaagaactagaaaaaccatctgaga 43035138  T
Q  252 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 335  Q
    ||| ||||| ||  |||| ||  |  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||    
T  43035139 aactattaggaaaaatttggaaatttatgagttggaccgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgttttttaatccatgt 43035222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 8082017 - 8081967
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatccc-acttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8082017 atttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttg 8081967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21193748 - 21193650
Alignment:
Q  280 gagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||  |||| |||| ||||||||| || |||| | | ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21193748 gagttggatagaaatatggtttatgatagatcattatgacataatttgattcatgtatccgaccccacgtagtggaataaggcttggttattgttgttg 21193650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30639787 - 30639717
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30639787 atagaacattgtggtgtaatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggattggtagttgttg 30639717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Original strand, 36200702 - 36200764
Alignment:
Q  14 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgaca 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | | |||| ||||||||||||||    
T  36200702 cagagatgaggatgttgcgttggatgagcggtaagactaaataggataagattaggaatgaca 36200764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 281 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 683796 - 683699
Alignment:
Q  281 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| ||| |||| |||| |||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  683796 agttgtatcaaaatatggtttatgatagaacattatgttgtagtttgatccatgtagccaaccccacttagcgggataagactttgtttttgttgttg 683699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4026395 - 4026326
Alignment:
Q  309 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4026395 aacattatgacgtcgtttgatccatgtagccgagttcactttgtgggatcaggcttggttgttgttgttg 4026326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10989126 - 10989085
Alignment:
Q  335 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989126 tagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 10989085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 337 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13607036 - 13606995
Alignment:
Q  337 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13607036 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 13606995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 280 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15252840 - 15252755
Alignment:
Q  280 gagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 365  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||| ||||  ||  ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15252840 gagttggatcgaaatagggtttatgatagaacattatgatgtagtttaattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttg 15252755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7367220 - 7367172
Alignment:
Q  328 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7367220 atccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttattgt 7367172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 312
Target Start/End: Original strand, 14725640 - 14725736
Alignment:
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 312  Q
    |||||||||||||| | |||| |||| ||| ||| |||| |||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||    
T  14725640 aagaggtagaggaaaagctagaaaaattataagataaactattataaaagatttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatcgaaca 14725736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 162
Target Start/End: Original strand, 37065533 - 37065597
Alignment:
Q  98 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 162  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  37065533 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttgggtcatttgggcatgtagagagaaga 37065597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 369
Target Start/End: Original strand, 41808105 - 41808197
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 369  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||||||||||| |||| | || |||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| | ||||||||    
T  41808105 aatgagttggatataaatatgatgtatgatagaacattatgacatcgtttgatccatgtagtcgatctgacttagtaggataggacttggttg 41808197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 323 - 378
Target Start/End: Original strand, 4653481 - 4653536
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4653481 atttgattcatgtatccgaccccacttagtgagataagacttggttgttgttgttg 4653536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 337 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10124427 - 10124388
Alignment:
Q  337 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10124427 gccgaacccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 10124388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 328 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16014532 - 16014485
Alignment:
Q  328 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16014532 atccatgtagccgaccccacttagtgggaaaagggttggttgttgttg 16014485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Original strand, 29929303 - 29929338
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29929303 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 29929338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 257 - 376
Target Start/End: Original strand, 31220546 - 31220664
Alignment:
Q  257 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 356  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | | |||||||  | ||||  |||||||||||||| ||| |||||| | ||| || ||    
T  31220546 ttagaaaagattttgagatcaatgagttggatctaaatatgatttttgatagat-attatgatgtcatttgatccatatagtcgatcctatttaatgaga 31220644  T
Q  357 taaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  31220645 taaggtttggttgttgttgt 31220664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 318 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35118380 - 35118321
Alignment:
Q  318 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35118380 gcgtaatttgatccatgtacccgacctcatttagtgggataaggcttgattgttgttgtt 35118321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 58 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 42504501 - 42504446
Alignment:
Q  58 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42504501 gatatgattaggaatgacatcatcagagagagagtgggggtagcacttatagtaga 42504446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 365
Target Start/End: Original strand, 1935402 - 1935464
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 365  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1935402 tgatagaacactctggcgttgtttgattcatatagccgaccccacttagtggaataaggcttg 1935464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24391080 - 24391022
Alignment:
Q  320 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24391080 gtcatttaatccaagtagcagaccccacttagtgggataaggcttgcttgctgttgttg 24391022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 56
Target Start/End: Original strand, 27998343 - 27998385
Alignment:
Q  14 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagaca 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27998343 cagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagaca 27998385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 373
Target Start/End: Original strand, 2049271 - 2049339
Alignment:
Q  304 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||| || |||||| | |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2049271 gatagaccattatggcatgatttgatccatgtagccgactgcactta-tgggataaggcttggttgttgt 2049339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19137960 - 19137907
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19137960 atttgatccatgcagccaaccccacttagtgggataagggttggttgtcgttgt 19137907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 376
Target Start/End: Original strand, 32489295 - 32489328
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32489295 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 32489328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 378
Target Start/End: Original strand, 34119859 - 34119904
Alignment:
Q  333 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  34119859 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgatttttgttgttg 34119904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 378
Target Start/End: Original strand, 37065632 - 37065761
Alignment:
Q  250 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca-ct 348  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | ||||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  37065632 gaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatagagcactatgaagtcgtttgattcatgtagccgaccccagct 37065731  T
Q  349 tagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  37065732 tagtgggataagactaggtcgttgttgttg 37065761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38578802 - 38578625
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||  | | || || ||| | |||||    
T  38578802 gggtagcacctctattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtaaagagaagacatgtagattatatagttagcagattagatca 38578703  T
Q  195 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttaga 272  Q
     || |||||||||||| | |  ||| |||| || |||||||| |||||||  |||||||| ||||  |||||| ||||    
T  38578702 gatcgaggagagtcaaatcactagatgtaggggtagacctagaaaaactacaagagaaactattatgaaggatctaga 38578625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 42408739 - 42408698
Alignment:
Q  337 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42408739 gccgatcctacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 42408698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 368
Target Start/End: Original strand, 12534414 - 12534486
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 368  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||  || |||| ||||||||||| |||||||||    
T  12534414 tggtttataatagaacattatggcgtaatttgatccatttagttgaccccagttagtgggatacggcttggtt 12534486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 332 - 376
Target Start/End: Original strand, 21952600 - 21952644
Alignment:
Q  332 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21952600 atgtagccgaccccacttagtgggaaaaggctcggttgttgttgt 21952644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 247
Target Start/End: Original strand, 27799892 - 27799996
Alignment:
Q  143 ttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 242  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||   | |  ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  27799892 ttgggcatgtagagagaagagatgtagatgttgtagtaagaagattagatcatatggaggatagtcggatcactagaggcagagtaagacctagaaaaac 27799991  T
Q  243 tatta 247  Q
    |||||    
T  27799992 tatta 27799996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 376
Target Start/End: Original strand, 39012776 - 39012860
Alignment:
Q  292 aatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |  ||||||| ||| | ||||| | |||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  39012776 aatttagtttatgatagaacactatggtgcaatttgattcatattgccgacctcacttagtgaaataagggttggttgttgttgt 39012860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 41833874 - 41833795
Alignment:
Q  86 agagagtgtgggtagcacctatagta--gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||  |||||| |||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  41833874 agagagttggggtagcacctatggtatagaaaagatggtggaacatatgcttaggtggtttgggcatgtagagacaagac 41833795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3563448 - 3563413
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3563448 cccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 3563413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3775119 - 3775072
Alignment:
Q  331 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  3775119 catgtagccgaccccacttagtgggataaagcctgattgttgttgttg 3775072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 34194850 - 34194783
Alignment:
Q  22 aggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 89  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  34194850 aggatgttgtgttggatgtgtggtaaaactagacaggataggattagaaatgtaaacattagagagag 34194783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1104787 - 1104706
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| || ||| ||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  1104787 tggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcaatg-agtcgaccccacttagtggattaaggctagattgttgttgttg 1104706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4026627 - 4026529
Alignment:
Q  84 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaag 182  Q
    |||||||||  ||||| ||| || |||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||    
T  4026627 agagagagttggggtaacacgtaaagtaaaaaagatggtggaaactagtcttaggtggtttggacatgtagagaggagacctgtagattctgtagtaag 4026529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 6368282 - 6368220
Alignment:
Q  19 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt 81  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  6368282 atgaggatgttgcgttagatgtgtggtaagaatagacgagatagaattagaaatgacaacatt 6368220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 338 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15584290 - 15584252
Alignment:
Q  338 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15584290 ccgatcccacttggtggtataaggcttggttgttgttgt 15584252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30639351 - 30639301
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||||||||||| | | || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30639351 tttgatccatgtagtcaaccctacttagtgggataagacttggttgttgtt 30639301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 336 - 378
Target Start/End: Original strand, 32925105 - 32925147
Alignment:
Q  336 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32925105 agccgaccccgcttagtgggacaaggcttggttgttgttgttg 32925147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34191001 - 34190971
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34191001 cccacttagtgggataaggcttggttgttgt 34190971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 39668904 - 39668991
Alignment:
Q  295 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc----atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    |||||| | | ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39668904 ttggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtatgtagactaccccgcatagtgggataatgcttggttgtttttgttg 39668991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 291 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 41833742 - 41833656
Alignment:
Q  291 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||| |||| |||||||||||| | ||| || |||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  41833742 aaatatggtttatgatagaacattttggtgtaatttaatccatgtagctgaccccgcttagtgggattatgcctggttattgttgtt 41833656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3448817 - 3448776
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 365  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3448817 tttgatccatgttgccgaccccactgagtgggataaggcttg 3448776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 5848440 - 5848403
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga 49  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5848440 agcagagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaaga 5848403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 337 - 378
Target Start/End: Original strand, 7090314 - 7090355
Alignment:
Q  337 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7090314 gccgaccccacttagtgggatagggcttggttgtcgttgttg 7090355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 337 - 374
Target Start/End: Original strand, 10668648 - 10668685
Alignment:
Q  337 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10668648 gccgaccccacttattgggataaggcttggttgttgtt 10668685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 337 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18741260 - 18741227
Alignment:
Q  337 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18741260 gccgatcccacttagtgggataagacttggttgt 18741227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 27553842 - 27553899
Alignment:
Q  105 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 162  Q
    ||||||||||||  || || |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27553842 tatagtagaaaatatgatataaaataagcttaggtggtttgagcatgtagagagaaga 27553899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31635960 - 31635927
Alignment:
Q  345 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31635960 cacttggtgggataaggcttggttgttgttgttg 31635927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 38341698 - 38341641
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgt 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  38341698 gggtagcagctatagtagaaaagacagtggaaaataggcttaggtggtttgggtatgt 38341641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 374
Target Start/End: Original strand, 39128269 - 39128342
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  39128269 tatgatacaacattatggcgccgtttgatacatgtagccgacctaacttagtgggatatggtttgattgttgtt 39128342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 375
Target Start/End: Original strand, 39766741 - 39766802
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || || |||| |||||||||||||    
T  39766741 tatggcgtaattttatccatgtagccgacctcacttactgagaaaagggttggttgttgttg 39766802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 43558172 - 43558135
Alignment:
Q  18 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagac 55  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43558172 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagac 43558135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 299; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 31386 - 31752
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31386 agcagagattaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 31485  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31486 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 31585  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31586 ttaaaagatgtagaggaagacccaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 31685  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31686 actgtgaagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 31752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 44158 - 44081
Alignment:
Q  86 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44158 agagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggcggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 44081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 176)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Original strand, 8180698 - 8181060
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8180698 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 8180797  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8180798 gaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtggatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 8180897  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8180898 ttaaaagcggtagaggaagacataggaaaactattagataaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 8180997  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8180998 actatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgtt 8181060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 3865990 - 3866356
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3865990 agcagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattggagagagagtgggggtagcacctatagta 3866089  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  3866090 aaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaaa 3866189  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3866190 ttaaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 3866289  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3866290 actatgacatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttg 3866356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 12 - 376
Target Start/End: Original strand, 36183369 - 36183733
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36183369 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacacaattagagagagagtaggggtagcacctatagta 36183468  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  36183469 gaaaagttggtagaaaataatcttagttggtttcggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaag 36183568  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36183569 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaac 36183668  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36183669 actatggtgccatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 36183733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 12 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38453053 - 38452686
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----tgtgggtagcacctat 107  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||    
T  38453053 agcagacatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatcataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcatctat 38452954  T
Q  108 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  38452953 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaaga-tagatcaaatggaggaaagt 38452855  T
Q  208 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38452854 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 38452755  T
Q  308 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38452754 aaacactatggtgtcattcgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38452686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3244015 - 3243654
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  3244015 agcagagataaggatgttgcgttggatgagtagtaagactacacatgataggattatgaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagta 3243918  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3243917 aaaaagttgatggaaaataggcttagatggtttgggaatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagaatagatcaaatggaggagagtcaag 3243818  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3243817 ttaaaagaggcagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaagtttggtgtatgatagaac 3243718  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3243717 actatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 3243654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 378
Target Start/End: Original strand, 4807510 - 4807879
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----tgtgggtagcacctat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||||    
T  4807510 agcagagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagaatagacatgataggattatgaatgacatcattagagagagagagagtgggggtagcacctat 4807609  T
Q  108 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4807610 agtagaaaagttggtagaaa-taggcttagatagtttcggcatatagagagaagactcgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagt 4807708  T
Q  208 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4807709 caagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagtatttagaggtcaatgagttggatccaaattcggtgtacgata 4807808  T
Q  308 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4807809 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 4807879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Original strand, 38429806 - 38430167
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  38429806 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggcagcacctatagtagaaa 38429905  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  38429906 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtatatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 38430005  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  38430006 aagaagtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 38430105  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  38430106 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgg-tgttgttgttg 38430167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Original strand, 12734623 - 12734984
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  12734623 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaa 12734720  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12734721 aattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 12734820  T
Q  216 aagagg-tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 314  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12734821 aagagggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacact 12734920  T
Q  315 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12734921 atggtgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12734984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 82 - 378
Target Start/End: Original strand, 2610576 - 2610872
Alignment:
Q  82 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||    
T  2610576 agagagagagtgggggtagcacctatagtggaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgtcgtggtaa 2610675  T
Q  182 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 281  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2610676 gaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatga 2610775  T
Q  282 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2610776 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttg 2610872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41197588 - 41197225
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41197588 gagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagatagagtgagggtagcacctataatagaaa 41197489  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt-a 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  41197488 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 41197389  T
Q  215 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 314  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||| |    
T  41197388 aaaaaggtagagaaagacctaagaaaaccatttgagaaaccattataaaagatttagaggtcaacgagttggatcccaatatggtttttgatagaacatt 41197289  T
Q  315 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  41197288 atggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttgatgggataaggcttggttgttgttgttg 41197225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11992466 - 11992108
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  11992466 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaatactagacatgataagattaggaatgacaccattagagagag--tgagggtagcacctatagtagaaa 11992369  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  11992368 agttggtagaaaataagcttagatggtttggacatatagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggagagtcgggttaa 11992269  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | | |||||||||| ||    
T  11992268 aagaggtaaaggaagacctaagaaaaccattagggaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatatgatttttgatagaacatta 11992169  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11992168 tggcgttatttgatccatgtagctgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgt 11992108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 41763401 - 41763043
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  41763401 gagatgaggatgttgcgatggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtg-gggtaacacctatagtagaaa 41763303  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  |||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  41763302 agttggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgcagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 41763203  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| || | | |||||||||||      
T  41763202 aaaaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaaaattta-aggtcaattagttggatccaaatatgttttttgatagaacaccc 41763104  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41763103 gggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 41763043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 65 - 378
Target Start/End: Original strand, 25834650 - 25834962
Alignment:
Q  65 ttaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25834650 ttaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaaga 25834749  T
Q  163 ctagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaa 262  Q
    |  || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  25834750 cctgtggatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggag--ttaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaact-ttaaagaaaccattagaa 25834846  T
Q  263 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25834847 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactgtggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc 25834946  T
Q  363 ttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||    
T  25834947 ttggttgttgttgttg 25834962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 115 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 451909 - 451646
Alignment:
Q  115 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  451909 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaaaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtta 451810  T
Q  215 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  451809 aaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacact 451710  T
Q  315 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  451709 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgttg 451646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45367984 - 45367623
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  45367984 gagatgatgatgttgcgctggatgaatggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtggg-gggtagcacctatagtagaaa 45367886  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  45367885 agttggtagaaaataaccttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagggtagatcaaatggaggagagtctagttaa 45367786  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | | |||||||||||||    
T  45367785 aagaggtagaggaagactcaagaaaaccattagagaaatcattagaaaggatttagaggtaaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacacta 45367686  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  45367685 tgacgtcatttgatccatgtcgccgaccccacttagtgggataaaacttgtttgttgttgttg 45367623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 136 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7326400 - 7326158
Alignment:
Q  136 agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccta 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7326400 agatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacata 7326301  T
Q  236 ggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7326300 ggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 7326201  T
Q  336 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7326200 agccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 7326158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18424728 - 18424378
Alignment:
Q  23 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  18424728 ggatgttacgtcggatgagtggtaagactagatatgatatgattaagaatgataccattagagagagtgggtg--tagcatctatagtagaaaagttggt 18424631  T
Q  123 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||| |  ||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  18424630 agaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagacgacccgtagatgccgacgtaagaagattagatcaattggatgagagtcaggttaaaagaggt 18424531  T
Q  223 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 322  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18424530 agaggaagacataggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagagatcaataagtttgatccgaatatggtttatgatagaacactatgacgtc 18424431  T
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18424430 atttgatccatgta-ccgtccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 18424378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 166 - 377
Target Start/End: Original strand, 28508750 - 28508961
Alignment:
Q  166 gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagg 265  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28508750 gtagatgccgtggtaataagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagg 28508849  T
Q  266 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28508850 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttg 28508949  T
Q  366 gttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||||||    
T  28508950 gttgttgttgtt 28508961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 101 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24583907 - 24583630
Alignment:
Q  101 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgga 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24583907 cacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatgga 24583808  T
Q  201 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgg-- 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||  |  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       
T  24583807 ggagagtcaagttaaaagagatagatgaagacaaaaaaaaactaatagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc-aaatttgagt 24583709  T
Q  299 tgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    | | |||||| |||||||| ||| |||| ||| |||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24583708 tttgtgatagcacactatgacgtaatttaatcaatgttgccgaccccacttaatgagataaggcttggttgttgttgtt 24583630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 350
Target Start/End: Original strand, 23997539 - 23997858
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||   |||    
T  23997539 gagatgaagatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatcggattaggaatgacaccattagagatagagtgggtgtagcacctatag---aaa 23997635  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||  |||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23997636 atttggtagaaaatagccttagatggttttgacatgtagaaagaagacccgtagatgtcgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 23997735  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    ||||||| || ||||||||| ||            |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||    
T  23997736 aagaggtggaagaagacctaaga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataaaacacta 23997823  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 350  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  23997824 tggcgttatttgattcatgtatccgaccccactta 23997858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 376
Target Start/End: Original strand, 38434873 - 38435234
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||  || | |||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  38434873 gagatgaggatgttgcattggatgcgtggtaaaactagacgagagaagattagaaatgacaacattagagagagaattggggtagcacctatagtagaaa 38434972  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttaga-tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 214  Q
    || |||| |||| ||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | |    
T  38434973 agatggtggaaactagactttgggtggtttgggcatgtaaagagaagacttgtagatgctttagtaaggagagtagatcatatggaggatagtcagatca 38435072  T
Q  215 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 314  Q
      ||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||  || ||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||| |    
T  38435073 ctagaggcagaggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgtgttggatcgaaatttggtttatgattgaacatt 38435172  T
Q  315 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38435173 atggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggcataaggcttggttgttgttgt 38435234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 211 - 378
Target Start/End: Original strand, 35643065 - 35643232
Alignment:
Q  211 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35643065 gttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 35643164  T
Q  311 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35643165 cactatgacatcatttaatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 35643232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9556724 - 9556367
Alignment:
Q  20 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagtt 119  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||| |     
T  9556724 tgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagacgggatatgattagaaatgacaacattagagagaaagttggggtaacacttatagtagaaaaat- 9556626  T
Q  120 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga 219  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||  |||| |||||||| ||||||  ||  |||    
T  9556625 ggtggaaaataggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagacaagtagattctgtagtaagaaaagtatatcagatggaggatagtcaaactactaga 9556526  T
Q  220 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 319  Q
    || | |||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||  || ||| ||| | | ||||||||||||| | || |||| |||||||||||| || ||     
T  9556525 ggcaaaggaagaccttgaaaaactataagataaactattaagaaagatctagtgattaatgagttggatcaagatatggtttatgatagaacattagggt 9556426  T
Q  320 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    || ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9556425 gtaatttgatacatgtagccgactccacttagtgggatgaggcttggttgttgttgttg 9556367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 95 - 378
Target Start/End: Original strand, 12141545 - 12141828
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||| || | ||||| ||||| |||||    
T  12141545 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaagaggcttaggtggtttgggcacgtagaaagaagacctgtagattctctagtaaggagagtagatca 12141644  T
Q  195 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 294  Q
     || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||| || || |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  12141645 gattgaggatagtcaaattacaagaggtagaggaagacctagaaaagctataggagaaactattaggaaagacttagagattaatgacttggatccaaat 12141744  T
Q  295 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
     |||| |||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12141745 atggtatatgatagaacattatggcatgatttgatcgatgtagccaaccccatttagtggggtaaggcttgattgttgttgttg 12141828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 198 - 376
Target Start/End: Original strand, 31959625 - 31959803
Alignment:
Q  198 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 297  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31959625 ggaggagagtcaggtcaaaagagttaggcgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 31959724  T
Q  298 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31959725 gtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 31959803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 151 - 374
Target Start/End: Original strand, 39029638 - 39029867
Alignment:
Q  151 gtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 250  Q
    |||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||    
T  39029638 gtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaattggaggaaagtcaggtaaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaacattcgag 39029737  T
Q  251 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca------tgtagccgatcc 344  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||      ||||||||| ||    
T  39029738 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtaggtgtagccgaccc 39029837  T
Q  345 cacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39029838 cacttagtgggataaggcttggttgttgtt 39029867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6238110 - 6237751
Alignment:
Q  20 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta--gaaaag 117  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||    ||||||||| |  |  || |||    
T  6238110 tgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactagacatgatagaattaggaatgacaccaatgg-gagagagtggacatagcacctaaaaaaaagataag 6238012  T
Q  118 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 217  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| | |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  6238011 ttggtagaaaacatgcttagatggtttggacatgtagagagtagacccgtaaacgtcgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagacatgtcaaaa 6237912  T
Q  218 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 317  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||    
T  6237911 gaggtagagtaagacctagaaaaactagaagataaaccattagaaatgatttagaggtcaatcagttggattcaaatatagtttatgatagaacactatg 6237812  T
Q  318 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |  | |||||||| || ||| ||| |||||||| ||| | || ||||  ||||||||||||    
T  6237811 ggatgatttgatctatatagtcgaccccacttaatggaagaaagcttaattgttgttgttg 6237751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 263 - 378
Target Start/End: Original strand, 227358 - 227473
Alignment:
Q  263 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  227358 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc 227457  T
Q  363 ttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||    
T  227458 ttggttgttgttgttg 227473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 256 - 378
Target Start/End: Original strand, 30306194 - 30306316
Alignment:
Q  256 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg 355  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30306194 attagaaaggatttagaggtcattgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 30306293  T
Q  356 ataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30306294 ataaggcttggttgttgttgttg 30306316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 375
Target Start/End: Original strand, 18958908 - 18959192
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgg----gcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtgg 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||  | || |  ||| ||||| ||||| |    
T  18958908 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggttgggcatgcagagagaagacctgcagcttttgtagtaaggagagtag 18959007  T
Q  191 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc 290  Q
    |||| |||||||| |||||  | |  ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| || || || || || ||| | |||||||||||||     
T  18959008 atcagatggaggatagtcagatcatcagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactataaggaaagacttggagattaatgagttggatca 18959107  T
Q  291 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18959108 aaatatggtctatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttattgttg 18959192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 79 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 43752244 - 43751945
Alignment:
Q  79 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtgg 178  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||   |||||  ||| |    
T  43752244 attagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaaaataggcttaggtgatttggacatgtagagagaagacctatagattatgtag 43752145  T
Q  179 taagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaa 278  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| | |||  | |   |||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | ||    
T  43752144 tagggagagtagatcagatggaggatactcagatcactggaggcataggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagatttggaaattaa 43752045  T
Q  279 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||    
T  43752044 tgagttggaccgaaagatggtgtatgatagaacactatgttgtaatttgatccatgtggccgacctcacttagttggaaaaggctcagttgttgttgttg 43751945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 256 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 38328488 - 38328368
Alignment:
Q  256 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38328488 attagaaaggatttagaggtcaatgaa--ggatccaaatttggtgcatgatagaacactatggcttcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 38328391  T
Q  356 ataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  38328390 ataaggcttggttgttgttgttg 38328368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 214 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45543234 - 45543074
Alignment:
Q  214 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 313  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||     
T  45543234 aaaagaggtagaggaagacctggaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt-aatgagttcgatccaaatatggtttatgatagaacat 45543136  T
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45543135 tatggcgtactttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttgcttgttgttg 45543074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 218 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 43573287 - 43573128
Alignment:
Q  218 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 317  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||  ||||    
T  43573287 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagaaaaacaactaggaaagattta-aggttaatgagttggatccaaatatgatttatgatcgaacgttatg 43573189  T
Q  318 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43573188 gcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 43573128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 44437994 - 44437719
Alignment:
Q  103 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||  |||| ||  | ||| | |||||||    
T  44437994 cctatagtagaaaagatggtagaaactagacataggtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtaataaggagtatagatgagatggagg 44437895  T
Q  203 agagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgta 302  Q
     ||||||  | |  |||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   |||  |||| |     
T  44437894 ggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactatatgagaaactattaagaaggatctagagataaatgagttggagaaaaacatggtttt 44437795  T
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44437794 tgatagaacactatggcgttgtttaattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 44437719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 274 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3635425 - 3635321
Alignment:
Q  274 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3635425 gtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 3635326  T
Q  374 tgttg 378  Q
    |||||    
T  3635325 tgttg 3635321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 4598928 - 4598569
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatag 109  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||   ||||||  |||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  4598928 agcagaaatgatgatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattcaaaatgacgacattagagagagagagttggggtagcacctatag 4598829  T
Q  110 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
    ||| |||| ||||||||| ||| ||| | |||||||| ||| |||| |||||||| ||  ||  ||| ||||| | |   ||| ||||||||| ||||||    
T  4598828 tagtaaagatggtagaaactagactttggtggtttggacatatagaaagaagacttgtgaattttgtagtaagtataacagataaaatggaggggagtca 4598729  T
Q  210 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 309  Q
     || |  |||||||| || | |||||| ||||||||  ||||| | ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  | |  | |||||||    
T  4598728 ggtcactagaggtagtggtaaacctagaaaaactatacgagaagctattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatagattttgataga 4598629  T
Q  310 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 369  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4598628 acactatggcgtcatttgattcatgtaaccgattccacttagcgggataaggcttggttg 4598569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12882317 - 12882043
Alignment:
Q  99 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga---gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa 195  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||   | |||   ||||||||||| ||  ||||||| |||||     
T  12882317 agcacctatactagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggca-gaggagacctgtagat--gtagatgctgtcgttcgaagagtagatcag 12882221  T
Q  196 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 295  Q
    |||||||||| || |  ||||||   | ||||||||||||  ||| |||| |||||||| | ||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  12882220 atggaggagattcta--taaaag---ttgaggaagacctataaaagctataagagaaactactaggaaatatttagaggttaatgagttggatccaaata 12882126  T
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| | |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12882125 tggtttgtgatagaacattttggcgtaatttgatccatgtagcctacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12882043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 236 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 9996766 - 9996623
Alignment:
Q  236 ggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 335  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||||||    
T  9996766 ggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgattaaacactatggcataatttgatccatgt 9996667  T
Q  336 agccgatcccactt---agtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||| |||||||   || ||||||||||||||||||||||||    
T  9996666 agccgaccccacttagaagagggataaggcttggttgttgttgt 9996623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 133 - 378
Target Start/End: Original strand, 42543274 - 42543519
Alignment:
Q  133 cttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 232  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||  | |  |||||||| || ||||    
T  42543274 cttaggtggtttgggcatgtacagagaagacctgtggattctgtagttaggagagtagatcaaatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagac 42543373  T
Q  233 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 332  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  || | | ||||||||| |||||||||  |||||| ||    
T  42543374 ctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacgtgctttttgatagaacgctatggcgttgtttgattca 42543473  T
Q  333 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42543474 tgtagccggccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 42543519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16097350 - 16097199
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag----agtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||   |||| |||||| ||||||||| ||||||||||    |||| |||||||||||||| ||    
T  16097350 gagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagatgggatatgattagaaatgacaccgttagagagagttagagtgggggtagcacctataata 16097251  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16097250 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttggacatgtagagagaagac 16097199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 265 - 378
Target Start/End: Original strand, 9496037 - 9496150
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  9496037 gatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggacaaggctt 9496136  T
Q  365 ggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||    
T  9496137 ggttgttgttgttg 9496150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37481930 - 37481618
Alignment:
Q  63 gattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 162  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  37481930 gattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagttcctatagtaaaaaagatggttgaacctaggcttaggtggtttgagcatgtagagagaaga 37481831  T
Q  163 ctagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaa 262  Q
    || ||  ||  ||| || || ||||| ||||| ||||||| |||| |  | |   |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||  |    
T  37481830 cttgtgaattttgtagttaggagagtagatcagatggaggggagttagatcactggaggtagatgaagaccaagaaaaactattagagaaactattaaga 37481731  T
Q  263 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc 362  Q
    | ||| ||| | | ||||||||||||  |||| |||| | |||||||| | ||||| ||| |||||| ||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||    
T  37481730 aagatctagcgataaatgagttggataaaaatatggtatttgatagaaaattatggtgtcttttgattcatctagtcgaccccacgtagtcggataaggc 37481631  T
Q  363 ttggttgttgttg 375  Q
     ||||||||||||    
T  37481630 gtggttgttgttg 37481618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 294 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12475009 - 12474927
Alignment:
Q  294 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12475009 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12474927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 191 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 35755434 - 35755247
Alignment:
Q  191 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga----gttgg 286  Q
    |||| |||||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||| ||| |    |||||    
T  35755434 atcagatggaggaaagtcatatcaaaagagggagaggaaggcctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaattaatgggttgg 35755335  T
Q  287 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| | || ||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35755334 atccaaatatggtttatgatagaacattgtgccgtaatttgatccatgcagccgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgtt 35755247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 374
Target Start/End: Original strand, 13149319 - 13149612
Alignment:
Q  82 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 181  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||   |||||| || |||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |       
T  13149319 agagagtgagttggggtagcacctataaacgaaaagatgatagaaaatagacttcggtggtctggccatgtagagagaagacatgtaaatgatgtagctc 13149418  T
Q  182 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggt-agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatg 280  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||  | | |||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| ||||    
T  13149419 gaagagtagataagatggaggaaagtcagatcagaagatgttagaggaagacttaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatg 13149518  T
Q  281 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||| | |||||||| | ||  ||||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||| || ||| || |||||| |||||||||||||    
T  13149519 agtagaatccaaatatcgttgatgatagaacattatgacataatttgatccatatagccgatctcaattaatgagataagacttggttgttgtt 13149612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 209
Target Start/End: Original strand, 7825276 - 7825475
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatag 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  7825276 agcagagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacactattagagagagagtgttggagtagcacctatag 7825375  T
Q  110 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 209  Q
    | | |||  ||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||| || | || || ||||| ||| | |||||||| |||||    
T  7825376 ttgtaaatatggtgaaaaataagcttagttggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattctatagtcaggagagtagatgagatggaggatagtca 7825475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 376
Target Start/End: Original strand, 11412697 - 11412992
Alignment:
Q  70 aatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtag 169  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||   ||||    
T  11412697 aatgacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggtggaaaataggcttaggttgtttgggcatttagagataagaactgtag 11412796  T
Q  170 atgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag-agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatt 268  Q
    || |||| |||   ||||| ||||| ||||||| | |||||  | |  ||||  ||||||| |||||| |||||||||||           |||||   |    
T  11412797 attctgtagtag--agagtagatcagatggaggggtagtcagatcactagagccagaggaaaacctagaaaaactattag-----------gaaaga--t 11412881  T
Q  269 tagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag---aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 365  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||   |||| ||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  11412882 tagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagtagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaactcacttagtaggataaggcttg 11412981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Original strand, 41545325 - 41545670
Alignment:
Q  13 gcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagt-a 111  Q
    ||||||||  |||||||  |||||||||  |||| |||||||   | |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| | |    
T  41545325 gcagagatcgggatgttatgttggatgaacggtatgattagatgaggtaggattaagaatgacaccattagggagagagcgagggtaacacctataataa 41545424  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagact-agtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 210  Q
     |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||| ||  |||||||  || ||   ||||||  |||| ||||||||  |||||    
T  41545425 aaaaagttggtagaaaatatgcttaaatagtttgagcatgtagaaagaagtctctgtagatgtcgttgt---aagagtatatcagatggaggattgtcaa 41545521  T
Q  211 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 310  Q
    |  |||||||     |||||| | || |||||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  41545522 gccaaaagagacgacggaagagcaagaaaaactataagagaaaccattataaaagatgtagaggtccatgagttgaattcaaatatggtttatgatagaa 41545621  T
Q  311 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 359  Q
    ||||||| | | |||||||  || ||||||||| |||||| || |||||    
T  41545622 cactatgacttaatttgatttatttagccgatctcacttaatgagataa 41545670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 306 - 378
Target Start/End: Original strand, 17670680 - 17670752
Alignment:
Q  306 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17670680 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 17670752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 265 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19337004 - 19336896
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19337004 gatttagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaatcccacttattgggataaagctt 19336905  T
Q  365 ggttgttgt 373  Q
    |||||||||    
T  19336904 ggttgttgt 19336896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 279 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39709298 - 39709202
Alignment:
Q  279 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39709298 tgagttggatcaaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttg 39709202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 378
Target Start/End: Original strand, 6218968 - 6219249
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||   ||||||  ||| ||||| ||||  |||||    
T  6218968 gggtagcacttatagtagaaaagatagtggataataggcttaggtggtttggacatgtagagaggagatatgtagattatgtagtaaggagaggtgatca 6219067  T
Q  195 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 294  Q
    ||||||||| |||    | |   |||| |||| |||||||  |||| |||| | | ||||| |||| || ||||||||| | | ||||||||| | ||||    
T  6219068 aatggaggatagtgggatcactggaggcagagaaagaccttagaaa-ctataatataaaca-ttaggaaagatttagagattagtgagttggaccgaaat 6219165  T
Q  295 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
     |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  6219166 atggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacctagttggataaggcttggttgttattgttg 6219249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 190 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 13444094 - 13443907
Alignment:
Q  190 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 289  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||| |||| |||||||  |||  |||   ||||||  | |||||| |||  |    
T  13444094 gatcagatggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaaaacttagaaaatctatgagagaaattattgaaaaaattttagatattaatgagatgggcc 13443995  T
Q  290 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13443994 caaatatggtttattatagaacattatggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttagttattgttgtt 13443907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23714622 - 23714384
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||  ||||||| ||||    |||||||||| |||||||    
T  23714622 agcagagattagaatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacattagatagagt---tgggtagcacatatagta 23714526  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||| |||| |||| ||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||| || |||  ||| ||||| ||||| |||||||||| || |||||||     
T  23714525 gaaaagatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagacttgtggattatgtagtaaggagagtagatcaaatggtggggagtcaaa 23714426  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaa 253  Q
    | |  ||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  23714425 tcactagacgtagatgaagacttagaaaaactataagagaaa 23714384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24102294 - 24102056
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||  ||||||| ||||    |||||||||| |||||||    
T  24102294 agcagagattagaatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacattagatagagt---tgggtagcacatatagta 24102198  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||| |||| |||| ||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||| || |||  ||| ||||| ||||| |||||||||| || |||||||     
T  24102197 gaaaagatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagacttgtggattatgtagtaaggagagtagatcaaatggtggggagtcaaa 24102098  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaa 253  Q
    | |  ||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  24102097 tcactagacgtagatgaagacttagaaaaactataagagaaa 24102056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 288 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9531688 - 9531598
Alignment:
Q  288 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9531688 tccaaatatggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 9531598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 296 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12520142 - 12520060
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12520142 tggtttatgataaaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12520060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 229 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12489949 - 12489800
Alignment:
Q  229 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 328  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | ||||| |||||| ||||||| |||||    
T  12489949 agacctagaaaaactatatgagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatataacactttggcgtcgtttga 12489850  T
Q  329 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12489849 ttcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12489800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 43238379 - 43238306
Alignment:
Q  90 agtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43238379 agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaaagagaagac 43238306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 372
Target Start/End: Original strand, 33504346 - 33504502
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtc-aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    ||||| |||| || |||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| |  ||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||    
T  33504346 agaggcagagaaaaacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagagatttaataagttggattgaaatatggtatatgatagaacatta 33504445  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33504446 tggcgtaatttgatccatctagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 33504502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 91
Target Start/End: Original strand, 2610446 - 2610525
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 91  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2610446 agcagagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggacaggattaggaatgacaccattagagagagag 2610525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 373
Target Start/End: Original strand, 42092437 - 42092796
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||| |||||  |||| |||||| |||||||  ||   |||||||||  ||||||| |||||| ||    
T  42092437 agcagagatgatgatgttgcattggatgtgtagtaagactagacgggatatgattagaaatgaca--atgttagagagagttggggtagcgcctatacta 42092534  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 211  Q
    |||||| ||||||||| || | |||| || | |||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||| ||||| ||| | |||||||  ||||||     
T  42092535 gaaaagatggtagaaactaagattaggtgatctgggcatgtagagagaaggcttgtagattttgtagtaaggagagtagattagatggagggtagtcaat 42092634  T
Q  212 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 311  Q
    | |  | ||  | ||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| ||| ||||| | ||| ||||||||    ||  | | |||||||||      
T  42092635 tcactatagagacaggtagacctagaaaaactataggagaaactattaaaaaagatgtagagattaattagttggatagtgatacgatatatgatagagg 42092734  T
Q  312 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    | | ||||||  ||||||||||||||| || || ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  42092735 attgtggcgttgtttgatccatgtagctgaccctacttagtaggattaggcttggttgttgt 42092796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 378
Target Start/End: Original strand, 3481145 - 3481438
Alignment:
Q  95 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 194  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||| | ||| ||||| |||||    
T  3481145 gggtagcacctatagta---aagatggtggaaaacaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagcaaggagagtagatca 3481241  T
Q  195 aatggaggagagtca-------agttaaa-----agaggtagaggaagacctaggaaaactatt-agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 281  Q
     |||||||| |||||       ||| | |     ||||| |||||||||||||| ||||  | | |||||||| ||||| || ||||| ||  | ||  |    
T  3481242 gatggaggatagtcagatggacagtcagatcactagaggaagaggaagacctagaaaaaaaaatcagagaaactattaggaaagatttggaaattaacaa 3481341  T
Q  282 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||   |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3481342 gttggacagaaatatggtctatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgttg 3481438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 378
Target Start/End: Original strand, 43832087 - 43832382
Alignment:
Q  82 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 181  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||  || | |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||  || |||  ||| || |    
T  43832087 agagagagagttggggtatcacctatagtaaaaaatatg-tggaaactaggcttaggtgatttgggcatgtacagagaaaacatgtggattatgtagtta 43832185  T
Q  182 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 281  Q
    | ||||| ||||| ||||||   | |||| | |  ||| | |||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||    
T  43832186 ggagagtagatcagatggagagtaatcaaatcagtagacgcagaggaagacctaaacaaactataagagaaactattaagaaggatctagagattaatga 43832285  T
Q  282 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||    || || ||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||| || || |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43832286 gttggataaggatatgatgtattatagaacattatgacggcatttgatccatgtagctgacccaacttagtttgataaggcttggttgttgttgttg 43832382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 37470289 - 37470146
Alignment:
Q  220 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 319  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||| |  ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||     
T  37470289 ggtagaggaagacctgaaaaaactataagagaaactattaggacagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggcatatgatagaacattatggt 37470190  T
Q  320 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggct 363  Q
    ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37470189 gtagtttgatccatgtagctaatcccacttagtgggataaggct 37470146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 277 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8197640 - 8197539
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||  |||| || | |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8197640 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 8197541  T
Q  377 tg 378  Q
    ||    
T  8197540 tg 8197539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 277 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8202400 - 8202299
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||  |||| || | |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8202400 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 8202301  T
Q  377 tg 378  Q
    ||    
T  8202300 tg 8202299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 184 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 19235176 - 19234988
Alignment:
Q  184 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgag 282  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||| | |  |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||| || ||||| | |||||     
T  19235176 agagtagatcagatggaggggagtcaaatcactagagatagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattgagaaag-atctagagattaatgat 19235078  T
Q  283 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    ||||||  |||| |||| | |||||||||| | || |||| ||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19235077 ttggatagaaatatggtatttgatagaacattctgtcgtcgtttaatccatgtagccaactccacttagtgggataaggcttagttgttg 19234988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 5759187 - 5758995
Alignment:
Q  184 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagt 283  Q
    ||||| ||||| ||||||| || |||| | |  |||||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |  |  |||||| ||||| |||||||||    
T  5759187 agagtagatcagatggaggggaatcaaatcactagaggtagggaaatacctagaaaaactattagagaaactaccaagaaggatctagagatcaatgagt 5759088  T
Q  284 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||   | |  |||| | |||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5759087 tggagaaagacatggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcaggtagctgaccccacttagttggataaggcttggttgttgttgt 5758995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 306 - 378
Target Start/End: Original strand, 17626284 - 17626356
Alignment:
Q  306 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17626284 tagaacactatggcgtcatttgttccatgtagccgaaccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgttg 17626356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 222 - 378
Target Start/End: Original strand, 33287549 - 33287705
Alignment:
Q  222 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 321  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||  | |||||||| |||| |||| |||| |||||||||||| |||| | |    
T  33287549 tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacat 33287648  T
Q  322 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
      |||||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33287649 agtttgatccttgtagccaactccacttagtgggacaagacttggttgttgttgttg 33287705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 223 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7432042 - 7431887
Alignment:
Q  223 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 322  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||| ||||| | ||||||||| ||  |||| |||| ||| ||||| ||  |||| |||    
T  7432042 agaggaaaacctagaaaaactattggagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttgaataaaaatatggtatataatagatcataatggtgtc 7431943  T
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7431942 atttgatccatgcaaccgacctcacttagtgggataaagcttagttgttgttgttg 7431887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Original strand, 15025703 - 15025778
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15025703 tgatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgatgcaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 15025778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 251 - 377
Target Start/End: Original strand, 30743686 - 30743812
Alignment:
Q  251 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 350  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||| |||| | | ||||||||| || || ||| | ||||||    
T  30743686 aaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttataatagaacaatatgtcataatttgatccttgcagtcgaactcactta 30743785  T
Q  351 gtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30743786 gtgagataaggctttgttgttgttgtt 30743812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13241063 - 13240763
Alignment:
Q  58 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 157  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  | ||||||  |||  |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13241063 gataggattagaaatgacaacattagagagagaattggagtagcaagtatgttagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagaga 13240964  T
Q  158 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 257  Q
    ||||||  |||||| || | ||||| ||||| ||||      | || || || || |  ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||        
T  13240963 gaagacatgtagattctttagtaaggagagtagatc------atgatagccaggtcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatta-agaaa---- 13240875  T
Q  258 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggat 357  Q
           ||| ||||| | || |||||| ||| ||||||||| ||||||| | || |||| |||  |||||||| ||| ||||| ||  |||||||||||    
T  13240874 -------gatctagagattaacgagttgaatcgaaatttggtttatgataaaccattatgccgttgtttgatccgtgtcgccgacccagcttagtgggat 13240782  T
Q  358 aaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  13240781 aaggcttggttattgttgt 13240763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 296 - 377
Target Start/End: Original strand, 19863436 - 19863517
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19863436 tggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19863517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 296 - 377
Target Start/End: Original strand, 19867768 - 19867849
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19867768 tggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19867849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 296 - 377
Target Start/End: Original strand, 19872669 - 19872750
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19872669 tggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19872750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 305 - 378
Target Start/End: Original strand, 25384680 - 25384753
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25384680 atagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgggataaggcttggtggttgttgttg 25384753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 217 - 374
Target Start/End: Original strand, 26670891 - 26671048
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||  || ||||||||| | ||||||||||| | |||| || | |||||||||| |  ||    
T  26670891 agaggtagaggaagacctacaaaaactataaaagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttggaccaaaatatgatttatgatagaatataat 26670990  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    || || |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26670991 ggtgtaatttgatccatgtagccgacactgcttagtgggataagacttggttattgtt 26671048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 45077670 - 45077870
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag----agagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||  | | ||||||    ||||||| || |||||| ||||||||    
T  45077670 gagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactagatagaattagaaatgtgaactttagagggagagagagtttgagtagcatctatagta 45077769  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggctt---agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 208  Q
    |||||| |||| || | ||| |||   || |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  45077770 gaaaagatggtggagagtagacttgggaggtggttttggcatgtagagagaaaacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtc 45077869  T
Q  209 a 209  Q
    |    
T  45077870 a 45077870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 42549919 - 42549835
Alignment:
Q  294 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42549919 tttggtttatgatagaacatcatggcgtaatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttg 42549835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 301 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10516824 - 10516749
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||| || | |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10516824 tatgataaaatattatggcgtaatttgatccatgtagctgatctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 10516749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 217 - 376
Target Start/End: Original strand, 19855585 - 19855744
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||  || |||  |||||| |||||| |||||  |||  |||| ||||||||| || |||    
T  19855585 agaggcagaggaagacctagataaactataaaagaaactattaagaaagatccagaggttaatgagctggatagaaacatggtatatgatagagcattat 19855684  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||| ||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  19855685 ggcgccattcaatccatgtagccgaccccacttagtaggataaagcgtggttgttgttgt 19855744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 147
Target Start/End: Original strand, 30743545 - 30743675
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  30743545 gagatgaggatgttgcgcatgatgagtgctaagactagacgggataggattgggaatgtcaccgttaggaagagagtg-gggtagcacttatggtagaaa 30743643  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttggg 147  Q
    | |||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  30743644 aattggtagaaattagaattagatggtttggg 30743675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19337209 - 19337069
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga-ttagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 114  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||  ||||| | ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |    
T  19337209 gagatgaggatgttacgttggatgtgtggtaagacttaggcaggataggattataaatgagaacattagagagag--ttggggtagcacctatagtagta 19337112  T
Q  115 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 161  Q
    ||| |||| ||||||| |||||    | |||||||||||||||||||    
T  19337111 aagatggtggaaaataagctta----ggttgggcatgtagagagaag 19337069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 173
Target Start/End: Original strand, 40759049 - 40759179
Alignment:
Q  44 gtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggt-agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggt 142  Q
    |||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||  |||| |||| |||  |||| ||||    
T  40759049 gtaagactagacaagataagattagaaatgacaacattagagagagaggttgggttagcacttatagtagaaaaaatggtggaaactagagttaggtggt 40759148  T
Q  143 ttgggcatgtagagagaagactagtagatgc 173  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  40759149 ttgtgcatgtagagagaagacttttagatgc 40759179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 310 - 374
Target Start/End: Original strand, 522445 - 522509
Alignment:
Q  310 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  522445 acactatggcgtcatttgatccatgtagcagatcacacttaatgggataaggctttgttgttgtt 522509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3720510 - 3720426
Alignment:
Q  281 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 365  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3720510 agttggatcgaaaaatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggagaaggcttg 3720426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 296 - 376
Target Start/End: Original strand, 17429252 - 17429332
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||| |||||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17429252 tggtatatgatagaacattatgacataatttgattcatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgt 17429332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13592656 - 13592411
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||   |||| |||||| |||| || ||||  || || |||  ||||||||||||||||| |||    
T  13592656 gagatggggatgttgtgttggatgtgtggtgatattagatgggataagattagaaatggcaacattgtagggatagttggggtagcacctatagtataaa 13592557  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
      ||| | ||||||||  |||| |||||||| |||||| |||||| ||  ||||||  | | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||      
T  13592556 tattg-tggaaaatagt-ttaggtggtttggacatgtatagagaaaacatgtagatattatagtaagaagagtagatcaaatagaggatagtcatatttc 13592459  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaa 263  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| || |||||    
T  13592458 aagaggtataggaagacctagaagaactataagagaaactatcagaaa 13592411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 26784592 - 26784350
Alignment:
Q  124 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 223  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||   || |||  ||| ||||| || || ||| | |||||||  |||||| | |  ||||| |    
T  26784592 gaaactaggcttaggttgtttgtgcatttagagagaagatatgtggattttgtagtaaggagggtagataagatggagggtagtcaaatcactagaggca 26784493  T
Q  224 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 323  Q
    ||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||| ||  |||| |||| ||||||| |||| | |||  | |    
T  26784492 gagaaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatatagagattaatgagttgaatagaaatatggtatatgataaaacattttggtttaa 26784393  T
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 366  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||    
T  26784392 tttgatccatgtagccaatctcacttagtaggataagacttgg 26784350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 887138 - 887065
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa-ggcttggttgttgttg 375  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  887138 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttggtgggataatggcttggttgttgttg 887065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16521060 - 16521007
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16521060 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 16521007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 373
Target Start/End: Original strand, 45077915 - 45078008
Alignment:
Q  280 gagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||||| |||| | || ||||||||||||  ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45077915 gagttggatcgaaatatagtttatgatagaacataatggcataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataaagcttggttgttgt 45078008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 451986 - 451930
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattag 68  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  451986 agcagagatgagtatgttgcgttagatgagtggtaagactagacatgataggattag 451930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 314 - 378
Target Start/End: Original strand, 14444889 - 14444953
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14444889 tatggcgtactttgatccatgtagccatccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 14444953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 28960350 - 28960210
Alignment:
Q  238 aaaactatta-gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 336  Q
    |||||||||| |||||||  |||  |||||| ||||| | |||||||||||   | || |||| | ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  28960350 aaaactattaagagaaactgttaagaaggatctagagataaatgagttggagaaagatatggtttttgatagagcactatggtgtcgtttgattcatgta 28960251  T
Q  337 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28960250 gtcgactccatttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 28960210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 377
Target Start/End: Original strand, 32402683 - 32402783
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||  ||||  ||| |||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32402683 aatgagttggatagaaataaggtatatgatagaacattatggtttcatttgatccacgtagacgatcctgcttagtgggataagacttggctgttgttgt 32402782  T
Q  377 t 377  Q
    |    
T  32402783 t 32402783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 241
Target Start/End: Original strand, 32443668 - 32443812
Alignment:
Q  97 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 196  Q
    ||||||||||||  || |||  || ||||||||| |||| | |||||||   |||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| | |    
T  32443668 gtagcacctataaaaggaaatatgatagaaaatatgctttggtggtttgaaaatgtagagagaaaacttgtagatgttgtagtacgaagagtggataaga 32443767  T
Q  197 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaa 241  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  32443768 tggaggatagtcagattaaaagaggtagtggaagatctagaaaaa 32443812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12470962 - 12470895
Alignment:
Q  311 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12470962 cactatggcgtcgtttgcttcatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggtggttgttgttg 12470895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 14398032 - 14397957
Alignment:
Q  302 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14398032 atgatagaacattatggtgtcatttgttccacatagctgatcctacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 14397957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15775898 - 15775843
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15775898 atttggtccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgttg 15775843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21281545 - 21281462
Alignment:
Q  294 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||| || ||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21281545 tttggtttacgatagaacattatggcttaatttgatccatgcagccaaccccaattagtgggataaggcttggtagttgttgtt 21281462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 9394739 - 9394629
Alignment:
Q  267 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 366  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| || |||||| | |||| |||||||||||| | ||||||| || ||||||| ||| |    
T  9394739 tttaaaggttaatgagttggatccgaatatggtttataatagagcattatggcttaattttatccatgtagccaaccccacttggtaggataagactttg 9394640  T
Q  367 ttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||||    
T  9394639 ttgttgttgtt 9394629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 9647969 - 9647822
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||| |||| || ||||    | |||||  ||| || ||||||||||    
T  9647969 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataagattagaaatgtcaacatt----atagagttggggcagtacctatagta 9647874  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    |||| | |||| |||| |||  |||| |||||||| |||||| | |||||||    
T  9647873 gaaatgatggtggaaactagctttaggtggtttggacatgtaaaaagaagac 9647822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 374
Target Start/End: Original strand, 34931634 - 34931712
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34931634 tggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatatagccgaccgtacttagtgggacaaggcttggttgttgtt 34931712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 132
Target Start/End: Original strand, 227307 - 227360
Alignment:
Q  79 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagg 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  227307 attagagagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagtttgtagaaaatagg 227360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 153
Target Start/End: Original strand, 19024150 - 19024239
Alignment:
Q  64 attaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgta 153  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| |||| |||| || |||||| |||||||| ||||||    
T  19024150 attagaaatgacaacattagagagagggtttgggtagcacctatatttgaaaagatggtggaaagtaagcttaggtggtttggacatgta 19024239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 45483038 - 45482989
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 372  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45483038 atttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 45482989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 624759 - 624687
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    ||||||||| ||||||  |  |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  624759 tgatagaacgctatggtatagtttgattcatgtagccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttg 624687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 306 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3305879 - 3305807
Alignment:
Q  306 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  3305879 tagaacattatggcgtcgtttgatccatatagtggatcccactttgtgggataaggcttggttattgatgttg 3305807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 9579053 - 9578916
Alignment:
Q  24 gatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggta 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||  ||   |||||||||  ||||  ||| |||||||| |||| || |     
T  9579053 gatgttgcgttggatgtgtggtaagaatagatatgatagaattaaaaatgaca--atgttagagagagttggggtgacacatatagtagtaaagatgatg 9578956  T
Q  124 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
     ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9578955 taaaatagacttaggtggtttggacatgtagagagaagac 9578916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 346
Target Start/End: Original strand, 21834638 - 21834806
Alignment:
Q  178 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 277  Q
    |||||||||||  ||||||| || || || ||  ||| |||||||| || |||| |||| |||||||| ||| |||| ||||| ||  ||||| || | |    
T  21834638 gtaagaagagtaaatcaaatagaagatagacatattacaagaggtatagaaagatctagaaaaactataagataaactattaggaaatatttatagatta 21834737  T
Q  278 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 346  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | |  |||| ||||||||| ||| ||||    
T  21834738 atgagttggatctaaatttggtttatgatagaacaatatgacatattttggtccatgtagtcgacccca 21834806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 163
Target Start/End: Original strand, 38860158 - 38860242
Alignment:
Q  79 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||    
T  38860158 attagatagagagtgggggcagcacccatagtagaaaagattgtggaaaataggcttaggtggtttaggcatttagaaagaagac 38860242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10403934 - 10403891
Alignment:
Q  335 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10403934 tagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 10403891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Original strand, 15015154 - 15015229
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15015154 tgatagaacactctggtttcgtttgattcatgtagccgacgcaacttagtgggataaggcttggttgctgttgttg 15015229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 33971534 - 33971589
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 379  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33971534 tttgatccatgtagccgaccccacctagtgggatatggcatggttgttgttgttgc 33971589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 376
Target Start/End: Original strand, 36993742 - 36993816
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||  ||| |||| ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36993742 tatgatatcacattatgacgtaatttgatccatgtagccta-ccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36993816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 202
Target Start/End: Original strand, 11017316 - 11017422
Alignment:
Q  96 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa 195  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||| | ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||  ||| || ||||| || ||||||    
T  11017316 ggtagcacctatagtagaaaagatcgtggaaactcggcttaagtggtttgggtatgtggagagaagacccgtagattttgtagttagaagggtagatcaa 11017415  T
Q  196 atggagg 202  Q
    |||||||    
T  11017416 atggagg 11017422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 14197437 - 14197367
Alignment:
Q  102 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggctt-agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 171  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14197437 acctatagtagaaaagatggtggaaactaggctttaggtggtttgggcatgtagagtgaagacttgtagat 14197367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 29968682 - 29968624
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggct 363  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29968682 atagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgactccacttagtgggataaggct 29968624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 33393339 - 33393393
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33393339 tttgatccatgtaaccgaccccacttactgggataaagcttggttgttgttgttg 33393393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 378
Target Start/End: Original strand, 38429651 - 38429693
Alignment:
Q  336 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38429651 agccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 38429693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2073348 - 2073307
Alignment:
Q  335 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2073348 tagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2073307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 279 - 376
Target Start/End: Original strand, 3030864 - 3030960
Alignment:
Q  279 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||| ||| | |  ||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3030864 tgagttggatcccaatatagattatgatacaacattatggcataattttatccatgtagc-gaccccacttagtgggataagccttggtcgttgttgt 3030960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 303 - 368
Target Start/End: Original strand, 19024387 - 19024452
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 368  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19024387 tgatagaactttatggcgtcgtttgatctatatagccgaccccactcagtgggataaggcttggtt 19024452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 301 - 373
Target Start/End: Original strand, 19224988 - 19225061
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagt-gggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||    
T  19224988 tatgatagaacactatgatgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtcggaaaaaggctcggttgttgt 19225061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23915773 - 23915708
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagg 361  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| | || ||||||||    
T  23915773 tggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgcagccgaccccacatggtcggataagg 23915708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 337 - 378
Target Start/End: Original strand, 37520689 - 37520730
Alignment:
Q  337 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37520689 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 37520730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8560852 - 8560804
Alignment:
Q  330 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8560852 ccatgtagccgacccaacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 8560804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 377
Target Start/End: Original strand, 15222472 - 15222528
Alignment:
Q  321 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15222472 tcatttgatccatgtagccaaccccacctagtaggataagacttggttgttgttgtt 15222528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 17581543 - 17581743
Alignment:
Q  178 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 277  Q
    ||||||| |||  ||||||| ||||| |||||  ||  |||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| || ||||  || |||||| |  |      
T  17581543 gtaagaaaagtatatcaaatagaggatagtcatattttaagaggtatagaaagacctagaaaaactataagagagactattacgaaagatttacatattt 17581642  T
Q  278 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||| ||| |||| || | |||||||||||| |||| | |  || | || |||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||    
T  17581643 atgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacaatatgacatatttcggtctatgtagtcgatcccacttagtaggataaagtttggtggttgttgtt 17581742  T
Q  378 g 378  Q
    |    
T  17581743 g 17581743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 32364999 - 32364923
Alignment:
Q  298 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||| || | |||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  32364999 gtgtatgatagaacattatggtgtaatttgatcaatgtagctgacctcacttaataggaaaaggcttggttgttgtt 32364923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 163
Target Start/End: Original strand, 41858744 - 41858800
Alignment:
Q  107 tagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 163  Q
    ||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41858744 tagtagaaaagatggtggaaactgggcttagatggtttggacatgtagagagaagac 41858800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 278 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 186230 - 186135
Alignment:
Q  278 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||   || || |||||||||  ||| | | ||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  186230 atgagttggatccaaataaagtttaagatagaacatcatgtcataatttgattcatgtggccgacctcacttagtgggataaagcttggttgttgt 186135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 171
Target Start/End: Original strand, 907710 - 907757
Alignment:
Q  124 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 171  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  907710 gaaaatagccttagatggtttgggcatgtagagagaagagttgtagat 907757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Original strand, 1648113 - 1648148
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1648113 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 1648148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 305 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2515242 - 2515171
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2515242 atagaatattatggcgtactttgatctatctagccgaccccacttagtgggataaggcttgtttgtcgttgt 2515171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 375
Target Start/End: Original strand, 7615471 - 7615550
Alignment:
Q  296 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  7615471 tggtatatgataaaacattatgtcgtcatttgatccgtctatccgataccaattagtgggataaggcctgattgttgttg 7615550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 9647686 - 9647611
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||| ||||| |||||| || |||||| |||| | ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9647686 tatgatggaacattatggcatcgtttgattcatgcaaccgatcccatttaatgagataaggcttggttgttgttgt 9647611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 319 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12026069 - 12026014
Alignment:
Q  319 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12026069 cgtcgtttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaagtttggttgttgtt 12026014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Original strand, 13188391 - 13188426
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13188391 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 13188426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 277 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13474313 - 13474214
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||  ||| |||| |||||||  ||| |||||| | |||||||| ||  || |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13474313 aatgagttggatcggaatatggtttatgataatacattatggcataatttgatctattgagtcgactccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 13474214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 303 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 19334225 - 19334174
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgg 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  19334225 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgactccacttagtgg 19334174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 378
Target Start/End: Original strand, 26566292 - 26566339
Alignment:
Q  331 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26566292 catgtagccaaccccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgttg 26566339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 278 - 376
Target Start/End: Original strand, 26850419 - 26850517
Alignment:
Q  278 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt-agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||| | |||| |||| ||||||| |||| |||||||| ||||| || |||| |||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26850419 atgagttgga-cgaaatatggtttatgataaaacattatggcgtaatttgttcgatgttagccaaccccacttagtgggaaaaggtttggttgttgttgt 26850517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18790231 - 18790105
Alignment:
Q  251 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 350  Q
    |||| ||||||| ||||| | ||||||||||  | ||||||||| || | ||||||| | ||  ||| |||  ||| |||||||| ||||| |||| |||    
T  18790231 aaaccattagaatggattcataggtcaatgaaatagatccaaatatgatttatgatataccatcatgtcgtactttcatccatgtcgccgaccccattta 18790132  T
Q  351 gtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18790131 gtgggagaaggcttagttgttgttgtt 18790105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 24583970 - 24583904
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacacc 78  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  24583970 agcagagatgaagatgttgtgcgggatgagtggtaagactaaacatgatatgattaagaatgacacc 24583904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 378
Target Start/End: Original strand, 36819406 - 36819459
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  36819406 tttgatccatatagccga-cccacttagtgggataaagcttggttattgttgttg 36819459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 378
Target Start/End: Original strand, 45436965 - 45437124
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    ||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||| | |  || || ||||||||| | ||||  |||||||||||| |||| | |||||||||| ||     
T  45436965 agaggcagaggaagacctataaaaattataagagaatctagcaggaaagatttagagattaatgcattggatccaaatatggtatttgatagaacattac 45437064  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    || || |||||||| |||||||| | | |||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  45437065 ggtgtaatttgatctatgtagccaacctcactcagtggg--aaggcatggttgctgttgttg 45437124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 335787 - 335710
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  335787 tatgatagaacattacggcataatttgatccatatagcaggccccacttagtaggatatagcttggttgttgttgttg 335710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 376
Target Start/End: Original strand, 32706472 - 32706525
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||  |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32706472 atttgatggatgtagtcgattccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 32706525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 374
Target Start/End: Original strand, 36366819 - 36366916
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||||||| | |||| |||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || | |||| ||||||| |  | ||||||||||||||    
T  36366819 aatgagttggaccgaaatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgatccatgtatccaaccccatttagtggtaataagcttggttgttgtt 36366916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 366
Target Start/End: Original strand, 440924 - 440988
Alignment:
Q  302 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 366  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||| |||||    
T  440924 atgatacaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgactccacttagagggataagacttgg 440988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2902028 - 2901960
Alignment:
Q  309 aacactatggcgtcatttgatccatgtagcc-gatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||| ||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2902028 aacattatggtgtaatttgatccttgtagcccgaccccacttagtggaaaaaggcttggttgttgttgt 2901960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 378
Target Start/End: Original strand, 24214010 - 24214070
Alignment:
Q  318 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24214010 gcgtaatttaatccatgtagccgaccccaccttgtgggataagatttggttgttgttgttg 24214070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 376
Target Start/End: Original strand, 32443851 - 32443919
Alignment:
Q  309 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagt-gggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  32443851 aacattatggcataatttgatccatgtagccgactccacttagtggggataagacttagttgttgttgt 32443919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 160
Target Start/End: Original strand, 41330131 - 41330195
Alignment:
Q  96 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 160  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41330131 ggtaacacctttagtagaaaagatgatcaaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaa 41330195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 376
Target Start/End: Original strand, 44415853 - 44415905
Alignment:
Q  324 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44415853 tttgatccatgttgccaaccctgcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 44415905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 373
Target Start/End: Original strand, 11414571 - 11414610
Alignment:
Q  334 gtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11414571 gtagccgacaccacttagtgggataaggcttggttgttgt 11414610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 378
Target Start/End: Original strand, 14530529 - 14530564
Alignment:
Q  343 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14530529 cccacttagtgggataatgcttggttgttgttgttg 14530564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 378
Target Start/End: Original strand, 23354105 - 23354164
Alignment:
Q  320 gtcatttgatccatgtagccga-tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||    
T  23354105 gtcatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaagattgattgttggtgttg 23354164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25284997 - 25284954
Alignment:
Q  335 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25284997 tagccgactccacttactgggataaggcttggttgttgttgttg 25284954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 378
Target Start/End: Original strand, 32395594 - 32395653
Alignment:
Q  319 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  32395594 cgtcgtttgatgcatgtagccgaccccatttagttggataaagtttggttgttgttgttg 32395653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 373
Target Start/End: Original strand, 43970020 - 43970059
Alignment:
Q  334 gtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43970020 gtagccgatctcacttagttggataaggcttggttgttgt 43970059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 375
Target Start/End: Original strand, 9078804 - 9078858
Alignment:
Q  321 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||    
T  9078804 tcatatgatccatgtagccgagcccacttagtgggattagatttggttgtcgttg 9078858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 348 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14520978 - 14520948
Alignment:
Q  348 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14520978 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 14520948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Original strand, 18188706 - 18188848
Alignment:
Q  17 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||  |||| ||| || ||||||| |||| |||||||  |  ||||||||||| |  |||||||    
T  18188706 agatgaggatgttgtgttggatgtgtg-taaggctagacgggatatgatcagaaatgacaacattggagagag--ttggggtagcacctcttctagaaaa 18188802  T
Q  117 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 162  Q
    | |||| |||  | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18188803 gatggtggaagctcgacttaggtggtttgggcatgtaaagagaaga 18188848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 323 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 44877486 - 44877440
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 369  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  44877486 atttggtccatgtagccgaccccacttcgtgggataaggcttagttg 44877440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 111
Target Start/End: Original strand, 17581392 - 17581485
Alignment:
Q  18 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    |||| |||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||| ||||  ||||| |||   ||||||||||||||||    
T  17581392 gatggggatgttttgttggatgtgtggtaagactagatatgataagattaaaaatgacaacattgtagagatagttaaggtagcacctatagta 17581485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 370
Target Start/End: Original strand, 19015946 - 19016015
Alignment:
Q  301 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 370  Q
    |||||| ||||| |||| | || |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||||    
T  19015946 tatgattgaacaatatgacatcgtttgatccatgtagccgacctcacttagcgggataaaacttggttgt 19016015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32541861 - 32541792
Alignment:
Q  309 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||  ||| ||||||||||||    
T  32541861 aacactatggggtcgtttgattcatgtagccgaccccacttaataagataagaattgattgttgttgttg 32541792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 374
Target Start/End: Original strand, 36650625 - 36650721
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||  ||| ||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  36650625 aatgagttagatcaaaatatagtttatgatagaacactataacgtaatttgatccgtgtagctgactccatttagt-ggataagacttggtttttgtt 36650721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 202
Target Start/End: Original strand, 43260439 - 43260512
Alignment:
Q  129 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||| |||||| || | ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  43260439 taggcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctatagtaaggagagtagatcagatggagg 43260512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1271 - 946
Alignment:
Q  51 tagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat 150  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1271 tagacaggataggattatgaatgacaccattagagagag--tgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccat 1174  T
Q  151 gtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 250  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1173 gtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaaattaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 1074  T
Q  251 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 350  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  1073 aaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccattta 974  T
Q  351 gtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  973 gtgggataaggcttggttgttgttgttg 946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 2634 - 2597
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga 49  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2634 agcagagatgaggatgtttcattggatgagtggtaaga 2597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 3)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 376
Target Start/End: Original strand, 82643 - 83000
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  82643 gagatgaggatgttgcactggatgagtagtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 82742  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||    ||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||   |||||    
T  82743 agttggtagaaaatgggcttagatgatttggacatatagagagaagatccatagatgcagtcgtaagaagggtatatcaaatggaggagagt--ggttaa 82840  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  82841 gagaggtagaggaagacctaggaaaacta-tagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaacacta 82939  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  82940 tgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggcttggttgttgttgt 83000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 285 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48207 - 48119
Alignment:
Q  285 ggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 373  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  48207 ggattcaaatatggtgtatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtaggattaggcttagttgttgt 48119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19000 - 18943
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 371  Q
    ||||| ||| |||||||||| || ||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  19000 tatggtgtcgtttgatccatataaccgatgccaactagtgggataaggcttggttgtt 18943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4634 - 4278
Alignment:
Q  14 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg-tagcacctatagtag 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  4634 cagatatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagactagacatgataggattataaatgacaccattagagagagagagtggggtggcacctatagtag 4535  T
Q  113 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4534 aaaagttggtaaaaaataggcttagatagtttgggcatgtagaaagaagactcgtagaagctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagaatcaagt 4435  T
Q  213 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 312  Q
    |||||||||||          ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  4434 taaaagaggta----------taggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttggtttataatagaaca 4345  T
Q  313 ctatggcgtcatttgatccatgtagccga-tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4344 ctatgacgttatttgatccatgtaggcgacccccatttaatgggataaggcttggttcttgttgttg 4278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 86967 - 86607
Alignment:
Q  16 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | | | || |   | ||||||||    
T  86967 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagaccagaaaggataagattagaaatgacaccattagagagagagagagag-ag-agagagagtagaaa 86870  T
Q  116 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  86869 agttggtagaaaatagtcttagatagtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 86770  T
Q  216 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 315  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  86769 aagaggtagatggagacctaggaaaactgttagagaaaccactagaaaggatttagaggtcgacaggttggatccaaatatgatgtatgatagaacacta 86670  T
Q  316 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  86669 tgacgtaatttgatccatgtagtcggctccacttagtgggatacgacttgtttgttgttgttg 86607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 137; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 222 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25686 - 25530
Alignment:
Q  222 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25686 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 25587  T
Q  322 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25586 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 25530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 25809 - 25683
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 111  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25809 agcagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 25710  T
Q  112 gaaaagttggtagaaaataggcttaga 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  25709 gaaaagttggtagaaaataggcttaga 25683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 126; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 203 - 376
Target Start/End: Original strand, 16687 - 16860
Alignment:
Q  203 agagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgta 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |     
T  16687 agagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttt 16786  T
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16787 tgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgactccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 16860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 124; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11787 - 11547
Alignment:
Q  136 agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccta 235  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  11787 agatgatttgggcatgtagagcgaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttagaagaggtagacgaataccta 11688  T
Q  236 ggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  11687 ggaaaactattagagaaatcgttagaaagaatttagaagtcaattggttggatccaaatttg--gtttgatagagtactatgacgtcatttgatccatgt 11590  T
Q  336 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  11589 agccgaccccacttagtaggataaggtttggttgctgttgttg 11547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11962 - 11810
Alignment:
Q  12 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga--gtgtgggtagcacctatag 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  11962 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactagacataataggattaggaatgacaccatcagagagagatagtgggggtagcacctatag 11863  T
Q  110 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11862 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagacagaaga 11810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 121; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 166 - 378
Target Start/End: Original strand, 4708 - 4920
Alignment:
Q  166 gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagg 265  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| |||| | ||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  4708 gtagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaagattaaaagaggtagatgaaggcgtaggaaaaccataagagaaaccattagaaagg 4807  T
Q  266 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 365  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  4808 atttagacgtcaatgagttaaatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccgtgtagccgaccccactttgtgggataacgcttg 4907  T
Q  366 gttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||    
T  4908 gttgttgttgttg 4920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 114; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 244 - 377
Target Start/End: Original strand, 481 - 614
Alignment:
Q  244 attagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatc 343  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  481 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtacccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacc 580  T
Q  344 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  581 ccacttagtgggataaggcttgattgttgttgtt 614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 100; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 84 - 374
Target Start/End: Original strand, 7431 - 7720
Alignment:
Q  84 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaaga 183  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||| ||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||   |  |||||    
T  7431 agagagagtctgggtagcacgtaaagtacaaaagtttgtagaaaacacgcttagttggtttgggcatgtagagagaaggcatgtagatgtcttcataaga 7530  T
Q  184 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagt 283  Q
    |||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||| |  |  ||||| || ||||||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||| | |||    
T  7531 agagtatatcagatggaggagagtgaagtcaaaagag-tgtatcaagacataagaaaactataagataaactattagaaaagattcagaggtcatttagt 7629  T
Q  284 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatc-ccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||| ||||| ||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7630 tggattcaaatatggttcacgatagaacactatggcgtaatttgatccatgcagcc-atctccacttagtgggataaagcttggttgttgtt 7720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 90; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 233 - 378
Target Start/End: Original strand, 14722 - 14867
Alignment:
Q  233 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 332  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14722 ctaggaaaactttaagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatcca 14821  T
Q  333 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14822 tgtagccaaccccacgtagtgggataaatcttggttgttgttgttg 14867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 162
Target Start/End: Original strand, 14626 - 14678
Alignment:
Q  109 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  14626 gtagaaaagtaggtagaaaata-gcttagatggtcggggtatgtagagagaaga 14678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 286 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28979 - 28887
Alignment:
Q  286 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28979 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 62; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 217 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 58385 - 58224
Alignment:
Q  217 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 316  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| ||  | || ||| ||||||||||||| | | || |||| |||||||||||| |||    
T  58385 agaggcagaggaagacctagaaaaacgataagagaaactgttaggaaaaacttggagatcaatgagttggaccaagatatggtttatgatagaacattat 58286  T
Q  317 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  58285 gtcgtaatttgatccatgtagccgacccaacttagtgggataaggcttcattattgttgttg 58224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 54; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 160462 - 160325
Alignment:
Q  238 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 337  Q
    |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||  | |||||||| || | |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  160462 aaaactacaagagaaactattaggaaagattaagaaattaatgagttcgaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaatcatgtag 160363  T
Q  338 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 375  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  160362 ccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 160325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 25554 - 25443
Alignment:
Q  265 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 364  Q
    ||||||||| | ||||||||||||  ||||  | | ||||||| |||| |||||| || ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  25554 gatttagagattaatgagttggatagaaataagttatatgataaaacattatggcttcgtttgatctatgtagtcaatcccactttgtgggataaggctt 25455  T
Q  365 ggttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||    
T  25454 ggttgttgttgt 25443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1259 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1259
Description:

Target: scaffold1259; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1665 - 1520
Alignment:
Q  230 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 329  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||  |   |||| |  ||||||||| |||| ||| |||||||    
T  1665 gacctagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttaaaggttaatgagttagatctga---tggtatgagatagaacattatgacgtaatttgat 1569  T
Q  330 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    | ||||||| || |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  1568 caatgtagctgaccccacttattaagataaagcttggttgttgttgttg 1520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 291 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 6857 - 6771
Alignment:
Q  291 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 377  Q
    |||| |||| ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  6857 aaatatggtatatgatataacattatggcataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggctgttattgtt 6771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0245
Description:

Target: scaffold0245; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 288 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16438
Alignment:
Q  288 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  16524 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 16438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 370
Target Start/End: Original strand, 3648 - 3713
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 370  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  3648 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgt 3713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3927 - 3839
Alignment:
Q  277 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 365  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  3927 aatgagttggattaaaatatggtttatgattgaacattaaggcttaatttgatcaatgtagtcgaccccaattagtgggatatggcttg 3839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 99357 - 99284
Alignment:
Q  305 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  99357 atagaacgctatggtgtcgtttgaatcatgtagccgacaccacatagtgggataaggcttggttgttgttgttg 99284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 162
Target Start/End: Original strand, 11802 - 11866
Alignment:
Q  98 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 162  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11802 tagcacctattgtagaaaagatggtaggaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 11866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 336
Target Start/End: Original strand, 39481 - 39561
Alignment:
Q  256 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 336  Q
    ||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  39481 attaggaaagatttagatggtaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacatgatggcgtaatttaatccatgta 39561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 363
Target Start/End: Original strand, 194086 - 194135
Alignment:
Q  314 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggct 363  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  194086 tatggtgtcatttgatccatgtagccaatcccacctagtggaataaggct 194135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 378
Target Start/End: Original strand, 19149 - 19201
Alignment:
Q  326 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  19149 tgatccacgtagccgaccccacttagtgagataaagtttggttgttgttgttg 19201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0179 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0179
Description:

Target: scaffold0179; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 374
Target Start/End: Original strand, 26049 - 26100
Alignment:
Q  323 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 374  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  26049 atttgagccatgtagccgaccccacttagtacgataaggcttgcttgttgtt 26100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 163267 - 163192
Alignment:
Q  303 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||  ||| ||||||| ||||  |||| ||||||||||||    
T  163267 tgatagaacactatgacgtcgtttgattcatatagccgactccatttagtggaataaaacttgattgttgttgttg 163192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40663 - 40610
Alignment:
Q  325 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 378  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  40663 ttgattcatgtagccgatctcatttagtgggataatgtttggttgtcgttgttg 40610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University