View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10481A_low_21 (Length: 468)

Name: NF10481A_low_21
Description: NF10481A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10481A_low_21
NF10481A_low_21
[»] chr3 (79 HSPs)
chr3 (8-466)||(11960269-11960727)
chr3 (11-466)||(16328760-16329215)
chr3 (11-466)||(16337612-16338067)
chr3 (8-466)||(47124515-47124973)
chr3 (8-466)||(28754889-28755347)
chr3 (8-466)||(13319602-13320060)
chr3 (8-466)||(17493201-17493659)
chr3 (18-435)||(14574504-14574921)
chr3 (18-466)||(31694286-31694734)
chr3 (18-466)||(31939484-31939932)
chr3 (8-459)||(18133453-18133904)
chr3 (8-466)||(12359627-12360100)
chr3 (8-385)||(11302954-11303331)
chr3 (74-441)||(16827328-16827695)
chr3 (8-435)||(16380059-16380486)
chr3 (8-206)||(10384539-10384737)
chr3 (8-435)||(13942595-13943022)
chr3 (12-435)||(16835641-16836064)
chr3 (8-435)||(44777818-44778245)
chr3 (8-435)||(41178093-41178520)
chr3 (8-466)||(14087244-14087702)
chr3 (18-466)||(13971220-13971668)
chr3 (8-385)||(4679009-4679386)
chr3 (12-435)||(10419176-10419599)
chr3 (235-466)||(17187172-17187403)
chr3 (12-433)||(15228224-15228645)
chr3 (9-435)||(5424072-5424498)
chr3 (24-199)||(13299889-13300064)
chr3 (24-199)||(13310547-13310722)
chr3 (61-433)||(15234141-15234513)
chr3 (9-435)||(15401659-15402085)
chr3 (9-441)||(10906772-10907204)
chr3 (8-435)||(14580084-14580511)
chr3 (11-441)||(15588528-15588958)
chr3 (9-435)||(15724076-15724502)
chr3 (11-441)||(16636337-16636767)
chr3 (11-441)||(43163661-43164091)
chr3 (9-435)||(15339831-15340257)
chr3 (9-441)||(13253252-13253684)
chr3 (11-441)||(20061190-20061620)
chr3 (11-441)||(48426011-48426441)
chr3 (9-441)||(10006162-10006594)
chr3 (8-232)||(8758416-8758640)
chr3 (245-435)||(15260428-15260618)
chr3 (333-466)||(12179234-12179367)
chr3 (9-427)||(15347395-15347813)
chr3 (9-466)||(16411393-16411850)
chr3 (237-457)||(14125714-14125935)
chr3 (277-435)||(16692994-16693152)
chr3 (11-435)||(53384160-53384584)
chr3 (303-466)||(16491292-16491455)
chr3 (275-466)||(16806058-16806249)
chr3 (11-435)||(6601300-6601724)
chr3 (9-145)||(26791831-26791967)
chr3 (11-466)||(14875610-14876064)
chr3 (11-435)||(12498812-12499236)
chr3 (8-169)||(15248708-15248869)
chr3 (11-143)||(17490414-17490546)
chr3 (302-421)||(18750809-18750928)
chr3 (302-421)||(25767183-25767302)
chr3 (11-145)||(16756017-16756151)
chr3 (302-466)||(6151964-6152128)
chr3 (302-466)||(15610968-15611132)
chr3 (303-435)||(17490706-17490838)
chr3 (302-466)||(30138671-30138835)
chr3 (302-466)||(30148222-30148386)
chr3 (302-421)||(6711567-6711686)
chr3 (252-439)||(15014894-15015081)
chr3 (11-78)||(15062308-15062375)
chr3 (11-169)||(16371976-16372134)
chr3 (281-466)||(8273510-8273695)
chr3 (302-466)||(13966455-13966619)
chr3 (11-111)||(16491647-16491747)
chr3 (302-421)||(16741859-16741978)
chr3 (8-78)||(15209452-15209522)
chr3 (302-403)||(16258009-16258110)
chr3 (302-466)||(17193959-17194123)
chr3 (11-78)||(9523283-9523350)
chr3 (245-397)||(16755765-16755917)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (11-466)||(20891927-20892382)
chr4 (8-462)||(11206107-11206561)
chr4 (8-466)||(3263666-3264124)
chr4 (8-466)||(29452409-29452867)
chr4 (8-463)||(44660741-44661196)
chr4 (8-466)||(33223865-33224323)
chr4 (8-466)||(15357992-15358450)
chr4 (8-462)||(16148653-16149107)
chr4 (8-462)||(16152799-16153253)
chr4 (12-435)||(15246870-15247293)
chr4 (8-441)||(15002261-15002694)
chr4 (8-435)||(27901328-27901755)
chr4 (8-462)||(1648153-1648607)
chr4 (12-433)||(15413931-15414352)
chr4 (12-433)||(8706864-8707287)
chr4 (11-435)||(14695058-14695482)
chr4 (9-433)||(14850011-14850435)
chr4 (12-348)||(15078581-15078917)
chr4 (74-441)||(15320158-15320511)
chr4 (131-435)||(51605695-51605999)
chr4 (9-441)||(19777430-19777862)
chr4 (9-427)||(23956690-23957108)
chr4 (9-466)||(40473983-40474440)
chr4 (9-441)||(14681510-14681942)
chr4 (11-441)||(12477545-12477975)
chr4 (8-466)||(14160412-14160870)
chr4 (11-441)||(29038041-29038471)
chr4 (9-441)||(8387355-8387787)
chr4 (9-435)||(8052266-8052692)
chr4 (8-435)||(14302621-14303048)
chr4 (9-466)||(12524619-12525076)
chr4 (18-435)||(18226089-18226506)
chr4 (308-466)||(15071601-15071759)
chr4 (9-441)||(18298148-18298580)
chr4 (277-457)||(18614445-18614625)
chr4 (9-427)||(27712279-27712697)
chr4 (245-435)||(16354088-16354278)
chr4 (11-435)||(15146528-15146952)
chr4 (297-431)||(9292066-9292200)
chr4 (302-466)||(14998552-14998716)
chr4 (302-403)||(13248881-13248982)
chr4 (8-136)||(1639367-1639495)
chr4 (302-421)||(15292075-15292194)
chr4 (11-76)||(16354447-16354512)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (8-466)||(12457572-12458030)
chr7 (8-466)||(13022289-13022747)
chr7 (8-466)||(13967527-13967985)
chr7 (8-466)||(265-724)
chr7 (8-466)||(26117464-26117922)
chr7 (8-466)||(11305122-11305580)
chr7 (8-466)||(16949331-16949789)
chr7 (8-466)||(49153233-49153691)
chr7 (8-466)||(15101462-15101920)
chr7 (8-466)||(13666469-13666927)
chr7 (8-466)||(14285235-14285693)
chr7 (8-318)||(12456634-12456944)
chr7 (8-435)||(15341363-15341790)
chr7 (8-441)||(16071179-16071611)
chr7 (74-433)||(14263136-14263495)
chr7 (12-433)||(19148147-19148568)
chr7 (12-433)||(20747546-20747967)
chr7 (12-466)||(11387287-11387741)
chr7 (8-385)||(14434623-14435000)
chr7 (8-466)||(19613607-19614065)
chr7 (8-435)||(23504760-23505187)
chr7 (8-435)||(18052843-18053270)
chr7 (8-435)||(15204550-15204977)
chr7 (8-433)||(11771155-11771580)
chr7 (19-433)||(12205692-12206106)
chr7 (8-425)||(15625483-15625902)
chr7 (9-435)||(10871927-10872353)
chr7 (9-441)||(44790257-44790689)
chr7 (9-435)||(11236125-11236551)
chr7 (9-434)||(12688433-12688857)
chr7 (9-466)||(14955490-14955943)
chr7 (9-435)||(8708537-8708963)
chr7 (9-466)||(9596989-9597446)
chr7 (9-435)||(15159969-15160395)
chr7 (11-435)||(8199562-8199986)
chr7 (8-435)||(320949-321376)
chr7 (9-435)||(14333328-14333754)
chr7 (245-435)||(16230-16420)
chr7 (9-435)||(23202525-23202951)
chr7 (9-435)||(23508652-23509078)
chr7 (9-107)||(8211346-8211444)
chr7 (9-435)||(13686996-13687422)
chr7 (9-435)||(18178674-18179100)
chr7 (9-435)||(18550670-18551096)
chr7 (8-406)||(14040626-14041024)
chr7 (8-406)||(14350656-14351054)
chr7 (10-466)||(11551983-11552439)
chr7 (9-435)||(14212606-14213032)
chr7 (8-105)||(14130805-14130902)
chr7 (302-421)||(13455972-13456091)
chr7 (302-421)||(14937572-14937691)
chr7 (302-421)||(15365165-15365284)
chr7 (11-169)||(15153835-15153993)
chr7 (302-466)||(7825125-7825289)
chr7 (302-466)||(27106655-27106819)
chr7 (302-466)||(27171506-27171670)
chr7 (245-412)||(15147820-15147987)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (8-466)||(16270539-16270997)
chr8 (8-466)||(29302741-29303199)
chr8 (8-466)||(12305766-12306224)
chr8 (8-466)||(14566150-14566608)
chr8 (8-466)||(6604666-6605124)
chr8 (8-466)||(31415786-31416247)
chr8 (8-466)||(27355556-27356002)
chr8 (8-431)||(6680119-6680542)
chr8 (8-435)||(23655935-23656362)
chr8 (8-390)||(803064-803446)
chr8 (8-435)||(1267246-1267673)
chr8 (8-435)||(22051871-22052298)
chr8 (8-466)||(20974971-20975424)
chr8 (12-433)||(20984895-20985316)
chr8 (12-441)||(21841429-21841858)
chr8 (12-466)||(19852423-19852877)
chr8 (12-466)||(19858459-19858913)
chr8 (8-431)||(20009271-20009693)
chr8 (8-435)||(31570188-31570615)
chr8 (251-435)||(21324615-21324798)
chr8 (12-466)||(22371952-22372397)
chr8 (12-433)||(20389111-20389532)
chr8 (11-466)||(21165853-21166308)
chr8 (8-435)||(19483410-19483837)
chr8 (8-435)||(20395478-20395905)
chr8 (8-435)||(22376800-22377227)
chr8 (8-435)||(22382975-22383402)
chr8 (11-435)||(19978978-19979402)
chr8 (9-435)||(22128304-22128730)
chr8 (61-435)||(23886085-23886459)
chr8 (9-435)||(18857586-18858012)
chr8 (9-435)||(17673369-17673795)
chr8 (8-332)||(22247866-22248190)
chr8 (9-435)||(22040868-22041294)
chr8 (9-435)||(22119520-22119946)
chr8 (11-435)||(19113701-19114125)
chr8 (11-316)||(22988207-22988512)
chr8 (9-435)||(15534392-15534818)
chr8 (9-435)||(30312490-30312916)
chr8 (245-435)||(20017609-20017799)
chr8 (247-442)||(21252191-21252386)
chr8 (8-110)||(23949927-23950029)
chr8 (277-466)||(32601421-32601610)
chr8 (15-145)||(21921372-21921502)
chr8 (9-442)||(21043454-21043887)
chr8 (9-442)||(22132380-22132813)
chr8 (11-435)||(23651052-23651476)
chr8 (11-322)||(16407504-16407815)
chr8 (302-421)||(21195862-21195981)
chr8 (302-421)||(22435605-22435724)
chr8 (302-466)||(16876410-16876574)
chr8 (19-466)||(21393180-21393627)
chr8 (19-466)||(21787674-21788121)
chr8 (302-403)||(20651711-20651812)
chr8 (345-418)||(22623399-22623472)
chr8 (25-145)||(21251969-21252089)
chr8 (302-421)||(21849697-21849816)
chr8 (355-441)||(22247773-22247859)
chr8 (302-403)||(23156390-23156491)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (8-466)||(20343138-20343596)
chr5 (8-466)||(22503535-22503993)
chr5 (8-466)||(23079143-23079601)
chr5 (8-466)||(25848931-25849389)
chr5 (8-466)||(14886045-14886503)
chr5 (8-466)||(24797451-24797909)
chr5 (8-466)||(37542435-37542893)
chr5 (8-466)||(24619349-24619807)
chr5 (8-466)||(24715580-24716038)
chr5 (8-466)||(24748608-24749066)
chr5 (8-466)||(22234974-22235432)
chr5 (8-435)||(17268419-17268846)
chr5 (8-466)||(21679832-21680290)
chr5 (8-346)||(21889933-21890271)
chr5 (12-435)||(22462812-22463234)
chr5 (18-466)||(28893996-28894444)
chr5 (18-466)||(28915467-28915915)
chr5 (18-466)||(28922822-28923270)
chr5 (12-435)||(20822313-20822736)
chr5 (12-397)||(21830884-21831269)
chr5 (12-433)||(21563060-21563481)
chr5 (18-429)||(20774625-20775036)
chr5 (11-433)||(26737814-26738236)
chr5 (9-435)||(22331972-22332398)
chr5 (9-435)||(27667575-27668001)
chr5 (11-441)||(16357379-16357809)
chr5 (11-441)||(27519284-27519713)
chr5 (255-466)||(28930735-28930946)
chr5 (9-435)||(29475158-29475584)
chr5 (11-441)||(34567371-34567801)
chr5 (9-435)||(27684485-27684911)
chr5 (9-435)||(22135543-22135969)
chr5 (8-435)||(20467183-20467609)
chr5 (9-435)||(27611229-27611655)
chr5 (9-435)||(14998824-14999250)
chr5 (12-177)||(21496933-21497098)
chr5 (64-441)||(23472159-23472535)
chr5 (18-466)||(21881833-21882281)
chr5 (9-441)||(40709655-40710087)
chr5 (277-435)||(18776939-18777097)
chr5 (9-435)||(23441085-23441511)
chr5 (11-435)||(23574614-23575030)
chr5 (9-427)||(19770835-19771253)
chr5 (9-435)||(41771717-41772143)
chr5 (275-435)||(21408279-21408439)
chr5 (11-373)||(23517403-23517765)
chr5 (11-169)||(20800325-20800483)
chr5 (245-466)||(37290550-37290771)
chr5 (302-466)||(21936242-21936406)
chr5 (302-466)||(27012234-27012398)
chr5 (9-120)||(22349298-22349409)
chr5 (8-433)||(21338384-21338809)
chr5 (11-163)||(25424066-25424217)
chr5 (344-441)||(21872129-21872226)
chr5 (344-441)||(21876409-21876506)
chr5 (281-466)||(24582339-24582524)
chr5 (369-433)||(21497159-21497223)
chr5 (284-435)||(25427583-25427734)
chr5 (387-435)||(874-922)
chr5 (8-134)||(37290882-37291008)
chr5 (9-78)||(18776645-18776714)
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (8-466)||(10467866-10468324)
chr6 (8-466)||(24365218-24365676)
chr6 (8-466)||(19454226-19454684)
chr6 (8-466)||(8761950-8762408)
chr6 (8-466)||(5296223-5296681)
chr6 (8-462)||(19435808-19436262)
chr6 (8-466)||(14380484-14380942)
chr6 (20-466)||(14378934-14379380)
chr6 (8-466)||(21472407-21472865)
chr6 (8-466)||(18795496-18795954)
chr6 (12-441)||(21563174-21563603)
chr6 (12-441)||(21569033-21569462)
chr6 (8-435)||(28281861-28282288)
chr6 (18-463)||(19880114-19880559)
chr6 (12-466)||(15460146-15460600)
chr6 (9-364)||(25768998-25769353)
chr6 (8-435)||(15896900-15897327)
chr6 (12-433)||(19488322-19488743)
chr6 (15-463)||(34644606-34645054)
chr6 (8-361)||(18966414-18966767)
chr6 (8-427)||(1542140-1542559)
chr6 (9-435)||(16625765-16626191)
chr6 (8-333)||(18196875-18197200)
chr6 (9-435)||(25113359-25113785)
chr6 (9-441)||(29590962-29591394)
chr6 (18-435)||(19865503-19865920)
chr6 (11-441)||(23079278-23079708)
chr6 (8-412)||(5838290-5838694)
chr6 (9-435)||(2873851-2874277)
chr6 (11-433)||(22761505-22761927)
chr6 (19-435)||(22434686-22435102)
chr6 (19-435)||(22443084-22443500)
chr6 (18-435)||(16926688-16927105)
chr6 (9-435)||(24312216-24312642)
chr6 (11-435)||(25608909-25609333)
chr6 (245-466)||(27564838-27565059)
chr6 (11-442)||(20636342-20636773)
chr6 (11-435)||(28262245-28262669)
chr6 (11-435)||(28340994-28341418)
chr6 (275-435)||(18449583-18449743)
chr6 (11-147)||(22078026-22078162)
chr6 (8-435)||(27188242-27188669)
chr6 (8-435)||(27260571-27260998)
chr6 (302-466)||(16381390-16381554)
chr6 (302-466)||(16648986-16649150)
chr6 (302-421)||(18836970-18837089)
chr6 (302-421)||(21928305-21928424)
chr6 (302-421)||(35275148-35275267)
chr6 (18-435)||(16962493-16962910)
chr6 (275-379)||(18407048-18407152)
chr6 (302-466)||(23997348-23997512)
chr6 (302-421)||(1647876-1647995)
chr6 (302-397)||(23026802-23026897)
chr6 (11-145)||(18407280-18407414)
chr6 (302-421)||(18572751-18572872)
chr6 (11-109)||(27330807-27330905)
chr6 (11-109)||(27391547-27391645)
chr6 (302-403)||(16099150-16099251)
chr6 (9-78)||(27566385-27566454)
chr6 (302-421)||(14129569-14129688)
chr6 (302-403)||(14624437-14624538)
chr6 (8-85)||(18436415-18436492)
chr6 (302-466)||(16234128-16234292)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (8-466)||(21951866-21952324)
chr1 (11-466)||(20295372-20295827)
chr1 (8-466)||(24098547-24099005)
chr1 (8-466)||(37678037-37678495)
chr1 (8-466)||(31538941-31539399)
chr1 (8-466)||(19855262-19855720)
chr1 (74-466)||(23197190-23197582)
chr1 (8-466)||(20939007-20939465)
chr1 (8-466)||(19662081-19662539)
chr1 (89-466)||(20834844-20835221)
chr1 (12-435)||(20855735-20856158)
chr1 (8-435)||(16373486-16373914)
chr1 (9-435)||(22109980-22110406)
chr1 (9-435)||(22113829-22114255)
chr1 (8-435)||(41352637-41353064)
chr1 (9-441)||(51332462-51332894)
chr1 (9-435)||(21831261-21831687)
chr1 (9-427)||(33390012-33390430)
chr1 (9-435)||(19759848-19760274)
chr1 (8-349)||(50619305-50619646)
chr1 (219-466)||(20060896-20061143)
chr1 (9-466)||(19107326-19107783)
chr1 (9-435)||(21837908-21838334)
chr1 (245-435)||(16077631-16077821)
chr1 (11-442)||(21749901-21750331)
chr1 (303-466)||(431060-431223)
chr1 (277-435)||(21234706-21234864)
chr1 (11-435)||(21025133-21025557)
chr1 (11-406)||(22361248-22361643)
chr1 (9-466)||(17043959-17044416)
chr1 (339-441)||(21744521-21744623)
chr1 (11-441)||(16349565-16349998)
chr1 (302-466)||(20830336-20830500)
chr1 (8-111)||(20139787-20139890)
chr1 (11-145)||(20250761-20250895)
chr1 (302-421)||(22134546-22134665)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (8-466)||(41208-41666)
scaffold0010 (8-466)||(46274-46732)
scaffold0010 (8-435)||(2887-3314)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (8-466)||(249586-250044)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (8-466)||(7020-7478)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (8-466)||(43756-44214)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (78-466)||(1-393)
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (8-466)||(1064324-1064782)
chr2 (8-466)||(20828832-20829290)
chr2 (8-466)||(31831231-31831689)
chr2 (8-466)||(23277349-23277807)
chr2 (8-466)||(23294508-23294966)
chr2 (8-466)||(19651462-19651922)
chr2 (8-466)||(24949162-24949621)
chr2 (83-441)||(23099455-23099813)
chr2 (8-435)||(27788314-27788740)
chr2 (8-435)||(12574926-12575353)
chr2 (12-435)||(27209615-27210038)
chr2 (8-180)||(20833558-20833730)
chr2 (74-433)||(23111375-23111734)
chr2 (9-435)||(27371843-27372269)
chr2 (11-441)||(16923465-16923895)
chr2 (11-441)||(16982728-16983158)
chr2 (11-441)||(17064293-17064723)
chr2 (9-466)||(24876161-24876618)
chr2 (9-435)||(41607828-41608254)
chr2 (9-441)||(16925934-16926366)
chr2 (9-441)||(16999574-17000006)
chr2 (9-433)||(21324711-21325135)
chr2 (11-441)||(10869426-10869856)
chr2 (9-435)||(24710608-24711034)
chr2 (11-436)||(24676065-24676490)
chr2 (9-457)||(21144462-21144910)
chr2 (9-435)||(44385012-44385438)
chr2 (11-441)||(27218592-27219022)
chr2 (9-435)||(24262944-24263370)
chr2 (8-168)||(27364789-27364949)
chr2 (9-435)||(22324299-22324725)
chr2 (252-435)||(45533162-45533345)
chr2 (9-435)||(24706925-24707351)
chr2 (8-435)||(30210361-30210787)
chr2 (11-145)||(9610712-9610846)
chr2 (12-106)||(11357646-11357740)
chr2 (11-145)||(17067951-17068085)
chr2 (11-147)||(23107461-23107597)
chr2 (11-169)||(22756174-22756332)
chr2 (8-224)||(24819340-24819556)
chr2 (252-435)||(30011627-30011808)
chr2 (18-412)||(23066974-23067368)
chr2 (302-466)||(12639645-12639809)
chr2 (303-435)||(23107173-23107305)
chr2 (302-466)||(24830600-24830764)
chr2 (302-421)||(22278972-22279091)
chr2 (302-397)||(24569149-24569244)
chr2 (8-87)||(45530084-45530163)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (8-466)||(15588-16046)
scaffold0089 (84-431)||(10486-10833)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (28-466)||(27926-28364)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (8-466)||(55775-56233)
scaffold0076 (8-466)||(32552-33010)
scaffold0076 (302-466)||(41525-41689)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (11-462)||(32198-32649)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (8-435)||(20367-20794)
scaffold0104 (8-435)||(23187-23614)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (8-346)||(27234-27572)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (8-466)||(149543-150000)
scaffold0011 (8-466)||(194579-195037)
scaffold0011 (8-435)||(25439-25866)
scaffold0011 (302-421)||(181191-181310)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (8-441)||(90023-90456)
scaffold0001 (8-441)||(89345-89778)
scaffold0001 (8-49)||(390492-390533)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (8-466)||(3724-4180)
scaffold0035 (302-435)||(43013-43146)
scaffold0035 (275-373)||(38396-38494)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (12-466)||(32388-32842)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (8-435)||(5723-6150)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (8-466)||(2561-3019)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (8-466)||(41890-42348)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (9-466)||(3828-4285)
scaffold0034 (8-466)||(12783-13234)
scaffold0034 (8-435)||(68343-68770)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (8-435)||(20093-20520)
scaffold0058 (387-435)||(58097-58145)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (8-463)||(2233-2688)
scaffold0222 (8-466)||(8033-8491)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (8-466)||(427-884)
scaffold0120 (11-442)||(13034-13465)
scaffold0120 (15-442)||(7000-7427)
scaffold0120 (302-403)||(23443-23544)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (9-466)||(28191-28648)
scaffold0139 (9-466)||(34444-34901)
scaffold0139 (61-397)||(102-429)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (39-466)||(5-432)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (8-466)||(10932-11390)
scaffold0298 (8-466)||(14702-15160)
scaffold0298 (8-466)||(20956-21414)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (8-435)||(80738-81165)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (9-466)||(13173-13631)
scaffold0124 (302-421)||(6728-6847)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (8-435)||(297-724)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (8-435)||(45490-45917)
scaffold0114 (8-435)||(20873-21287)
scaffold0114 (11-442)||(19240-19671)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (24-466)||(6113-6555)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (8-466)||(10332-10790)
scaffold0235 (8-466)||(20546-21004)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (8-466)||(323677-324135)
scaffold0004 (12-433)||(202376-202797)
scaffold0004 (279-435)||(118470-118626)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (8-462)||(24755-25198)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (8-466)||(2205-2663)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (12-466)||(2360-2814)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (74-466)||(1729-2121)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (8-435)||(6186-6613)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (8-435)||(4358-4785)
[»] scaffold0067 (5 HSPs)
scaffold0067 (9-435)||(51086-51512)
scaffold0067 (9-435)||(60120-60546)
scaffold0067 (9-435)||(66508-66934)
scaffold0067 (126-466)||(27716-28055)
scaffold0067 (27-130)||(26392-26495)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (8-466)||(13174-13632)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (27-435)||(48096-48504)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (8-466)||(100437-100885)
scaffold0020 (11-391)||(181175-181555)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (12-466)||(563-1015)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (8-435)||(5242-5669)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (8-466)||(3149-3607)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (8-421)||(11706-12119)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (8-435)||(11692-12119)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (74-441)||(5469-5836)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (74-441)||(47934-48301)
scaffold0053 (9-466)||(56722-57179)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (12-441)||(10770-11199)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (18-342)||(28208-28532)
scaffold0156 (344-462)||(35422-35540)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (12-441)||(29034-29463)
scaffold0026 (15-435)||(29925-30345)
scaffold0026 (393-441)||(50168-50216)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (8-435)||(18322-18749)
scaffold0244 (302-421)||(25697-25816)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (8-466)||(50750-51196)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (8-379)||(48168-48539)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (8-435)||(261281-261708)
scaffold0005 (11-435)||(277736-278160)
[»] scaffold2112 (1 HSPs)
scaffold2112 (61-466)||(4-409)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (245-466)||(1709-1930)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (118-435)||(40781-41098)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (74-441)||(4815-5182)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (12-441)||(873-1301)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (8-466)||(19822-20280)
scaffold0090 (8-466)||(23984-24442)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (74-435)||(908-1269)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (8-435)||(856-1283)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (12-433)||(27501-27922)
[»] scaffold0077 (4 HSPs)
scaffold0077 (8-315)||(20467-20774)
scaffold0077 (302-421)||(16484-16603)
scaffold0077 (315-403)||(25820-25908)
scaffold0077 (302-421)||(27186-27305)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (208-441)||(15285-15518)
scaffold0266 (302-421)||(8781-8900)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (12-435)||(139-563)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (8-466)||(49389-49847)
scaffold0028 (8-427)||(44127-44543)
scaffold0028 (9-466)||(9448-9905)
scaffold0028 (9-466)||(15910-16367)
scaffold0028 (302-412)||(105502-105612)
scaffold0028 (8-145)||(812-949)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (254-466)||(12402-12614)
scaffold0180 (11-435)||(31659-32083)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (12-288)||(3768-4044)
scaffold0403 (303-466)||(7640-7803)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (18-466)||(113542-113990)
scaffold0029 (9-435)||(108717-109143)
scaffold0029 (12-295)||(95048-95331)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (171-406)||(6265-6500)
scaffold0149 (171-406)||(10696-10931)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (12-397)||(6-391)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (108-433)||(3180-3505)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (108-433)||(30193-30518)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (51-463)||(6563-6975)
scaffold0117 (302-421)||(344-463)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (8-435)||(16883-17310)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (12-441)||(9708-10137)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (9-421)||(5005-5417)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (8-435)||(218323-218750)
scaffold0012 (8-169)||(230016-230177)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (8-441)||(18115-18548)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (112-433)||(5997-6320)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (8-435)||(4844-5271)
scaffold0270 (8-435)||(11974-12401)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (11-433)||(6799-7221)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (12-406)||(39694-40088)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (18-433)||(23987-24395)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (8-435)||(15850-16277)
scaffold0040 (11-433)||(112396-112818)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (8-435)||(1881-2308)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (8-435)||(115811-116238)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (264-466)||(108859-109061)
scaffold0031 (18-435)||(62937-63354)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (11-455)||(4239-4683)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (8-198)||(14340-14530)
scaffold0261 (8-198)||(22519-22709)
scaffold0261 (304-466)||(14175-14336)
scaffold0261 (304-466)||(22354-22515)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (9-435)||(13442-13868)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (11-364)||(17657-18009)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (11-435)||(102209-102633)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (9-435)||(7913-8339)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (213-435)||(96342-96564)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (228-433)||(177170-177375)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (11-435)||(3170-3594)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (8-435)||(9922-10349)
[»] scaffold0081 (4 HSPs)
scaffold0081 (11-466)||(19578-20033)
scaffold0081 (11-466)||(35002-35457)
scaffold0081 (11-412)||(50408-50809)
scaffold0081 (302-466)||(273-437)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (8-435)||(13987-14412)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (245-466)||(1628-1849)
scaffold0044 (245-466)||(15368-15589)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (9-466)||(8340-8797)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (8-435)||(9943-10369)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (61-435)||(66431-66805)
scaffold0042 (11-435)||(38726-39150)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (64-433)||(7995-8364)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (90-435)||(15388-15733)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (8-412)||(25873-26277)
scaffold0243 (302-421)||(749-868)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (9-441)||(8371-8803)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (99-435)||(29477-29813)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (275-435)||(85425-85585)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (11-373)||(1035-1397)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (247-442)||(7552-7747)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (210-385)||(16455-16630)
scaffold0348 (369-435)||(10795-10861)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (9-435)||(56991-57417)
scaffold0017 (11-435)||(196384-196808)
scaffold0017 (13-457)||(18951-19395)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (245-433)||(23093-23281)
scaffold0100 (90-169)||(24879-24958)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (11-466)||(6990-7445)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (11-466)||(14086-14541)
scaffold0324 (11-145)||(19198-19332)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (277-435)||(39621-39779)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (245-435)||(26184-26374)
scaffold0079 (11-76)||(25950-26015)
[»] scaffold0023 (6 HSPs)
scaffold0023 (11-412)||(3385-3787)
scaffold0023 (11-169)||(28544-28702)
scaffold0023 (342-435)||(60060-60153)
scaffold0023 (303-406)||(131374-131477)
scaffold0023 (342-466)||(28243-28367)
scaffold0023 (11-145)||(131083-131217)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (9-435)||(3311-3737)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (302-421)||(729-848)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (9-435)||(9570-9996)
scaffold0109 (9-435)||(32479-32905)
[»] scaffold0358 (3 HSPs)
scaffold0358 (63-412)||(3538-3887)
scaffold0358 (303-442)||(7317-7456)
scaffold0358 (11-111)||(7025-7125)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (245-435)||(24677-24867)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (8-258)||(1649-1899)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (302-421)||(19314-19433)
[»] scaffold0540 (2 HSPs)
scaffold0540 (284-442)||(7230-7388)
scaffold0540 (11-145)||(7527-7661)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (11-169)||(2986-3144)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (302-403)||(10561-10662)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (11-435)||(16631-17054)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (8-169)||(669-830)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (302-403)||(8532-8633)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (302-403)||(133427-133528)
scaffold0008 (302-466)||(25093-25257)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (302-466)||(2750-2914)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (8-435)||(1866-2293)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (302-466)||(6441-6605)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (302-466)||(24661-24825)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (19-159)||(5-145)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (302-466)||(14175-14339)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (275-435)||(79400-79560)
scaffold0022 (11-111)||(79724-79824)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (8-224)||(11314-11530)
scaffold0018 (8-224)||(17506-17722)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (287-466)||(8424-8603)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (302-421)||(25229-25348)
scaffold0021 (336-421)||(32333-32418)
scaffold0021 (302-403)||(72456-72557)
scaffold0021 (309-421)||(15705-15817)
[»] scaffold0719 (1 HSPs)
scaffold0719 (11-129)||(146-264)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (390-435)||(1-46)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (8-125)||(34161-34278)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (15-111)||(3354-3450)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (26-145)||(39099-39218)
scaffold0122 (309-435)||(38854-38980)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (302-412)||(13743-13853)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (9-78)||(1388-1457)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (357-466)||(12867-12976)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (315-403)||(3824-3912)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (61-169)||(4166-4274)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (8-111)||(837-940)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (302-373)||(4560-4631)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (247-442)||(2648-2843)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (9-78)||(22841-22910)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (302-403)||(2890-2991)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (302-390)||(45612-45700)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 79)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 11960727 - 11960269
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11960727 caaatcatggtacatctttatagcccctgggtgaatactcaaactactatcgtgactctcttcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaata 11960628  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11960627 caaaatcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 11960528  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11960527 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaatcctcatcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 11960428  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11960427 gtccctaaactgctctagcaactcaaattcctttaccatcaaagcagacatatgcaatgttttcctcctcaatgcatcagcaaccacattggccttacta 11960328  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11960327 ggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcagtagttctaacaatctcctctgcct 11960269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16329215 - 16328760
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16329215 atcatggtacatctttgtagaccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcatcattgtcaggaatacaa 16329116  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  16329115 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactgtcctcagtgtcactaccagtagtcatcaaatcaacaaatttcaaatctg 16329016  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtc 310  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16329015 ctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaatcttcattatccccaactgtatactctgagatgacagttcacagacaagactcaagtc 16328916  T
Q  311 tctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagga 410  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16328915 tctaaactgttccaacaactcaaattcttttaccattaaagcagacatatgtaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagga 16328816  T
Q  411 tggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  16328815 tggtaattcaagccaaaatcgtaatccttcagtaactctaaccatctcctgtgcct 16328760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16338067 - 16337612
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16338067 atcatggtacatctttgtagcccccaggtgaatactcaacctactcttatgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 16337968  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16337967 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactattctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcaaaaata 16337868  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtc 310  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16337867 cctgctgagcttctctgatactgttcaagaaatcactatcaatcctcaacattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacataccagactcaagtc 16337768  T
Q  311 tctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagga 410  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16337767 tctaaactgttctaacaattcgaattccttcaccatcaaagcagacatatgtaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacatcggccttaccagga 16337668  T
Q  411 tggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16337667 tggtaattcaagccaaaatcataatccttcagtaactctaaccatctcctctgcct 16337612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 47124515 - 47124973
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||     
T  47124515 caaatcatggtacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcctcattgtcaggaatg 47124614  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47124615 caaactctacctctgaacctcaacacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 47124714  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  47124715 cttctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaattcacagacaagactcat 47124814  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47124815 atctctgaactgttctaacaactcaaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggccttacca 47124914  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  47124915 ggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactctaaccacctcctctgcct 47124973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 28754889 - 28755347
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  28754889 caaatcatggtacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaata 28754988  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28754989 caaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 28755088  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  28755089 cctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaatcttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaattcacagacaagactcat 28755188  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28755189 atctctgaactgttctaacaactcaaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactcaaagcatccgcaaccacattggccttacca 28755288  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  28755289 ggatggtaattcaaaccaaaatcaaaatccttcagtaactctaaccacctcctctgcct 28755347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13320060 - 13319602
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| || || | |||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  13320060 caaatcatggtacattttcgtagctcccgggtgaatactcaatctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaaccatcatcatcaggaata 13319961  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||| ||||| | |||| ||||||||||| || | ||    
T  13319960 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcactattctcagtttcataaccagcaatcattaaatcaacaaattttacat 13319861  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13319860 ctacctgctgagcttcacggatactattcaagaaatcactgttaatcttcaacatccccgactgaatactttgaggtgacaattcacaaacaaggctcaa 13319761  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||||||| || || ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||    
T  13319760 gtctttaaactgttctagcaaatcaaattctcttaccatcagtgcagacatatgtaaggtcttcctgctcaacgcattcgcaaccacattggctttacca 13319661  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  13319660 ggatggtaattcaaaccaaagtcataatccttcaacagctctaaccatctcctctgcct 13319602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 17493201 - 17493659
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| ||  |||||||| |||| || || | ||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  17493201 caaatcatgatacattttcgtagctccagaatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaactcgtcattatcaggaata 17493300  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  17493301 caaattcttcctctaaacctcaacacaccctgatcatcaacctttaagtcactatcttcagtgtcactaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacat 17493400  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17493401 ccacttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaaatgtacactctgaggtgtcaattcacagacacgactcaa 17493500  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||     
T  17493501 gtctctaaactgttctagcaaatcaaattctctcaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcctcctcaaggcatctgcaaccacgttggctttaccc 17493600  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||  || | ||||||||| ||||||||    
T  17493601 ggatggtaactcaaaccaaaatcataatccttcaacagctttaaccatcttctctgcct 17493659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 435
Target Start/End: Original strand, 14574504 - 14574921
Alignment:
Q  18 tacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 117  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||    
T  14574504 tacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcttctagaatcaactttttcaactcatcactatcaggaatgcaaattcttc 14574603  T
Q  118 ctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctg 217  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  14574604 ctctgaacctcaacacaccatgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccacttgctg 14574703  T
Q  218 agcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaac 317  Q
     ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  14574704 tgcttctcggatactactcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgcacactctgaggtgacaactcgcaaacaagactcaagtctctaaac 14574803  T
Q  318 tgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaat 417  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  14574804 tgctctagcaaatcaaattcatttaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaat 14574903  T
Q  418 tcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||||||||||||    
T  14574904 tcaaaccaaaatcataat 14574921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 31694734 - 31694286
Alignment:
Q  18 tacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 117  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| || || | ||||||||||||||| || ||||  |||||||| |||| |||||    
T  31694734 tacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaattcgtcatcatcaggaatgcaaattcttc 31694635  T
Q  118 ctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctg 217  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  31694634 ctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccattaagtcaacaaacttcacatccacttgctg 31694535  T
Q  218 agcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaac 317  Q
     |||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31694534 tgcttctcgaatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaattcacagacaaggttcaagtctctaaac 31694435  T
Q  318 tgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaat 417  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  31694434 tgttctagcaaatcaaattctttcaccatcaaagcagacatatgcagcgttttcctactcaaagcatctgcaactacattggctttaccaggatgttaat 31694335  T
Q  418 tcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||  || || ||||| |||||||||||    
T  31694334 tcaaaccaaagtcataatccttcaacagctccaaccacctcctctgcct 31694286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 18 - 466
Target Start/End: Original strand, 31939484 - 31939932
Alignment:
Q  18 tacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 117  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||| |||| |||| || || | ||||||||||||||| || ||||  |||||||| |||| |||||    
T  31939484 tacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacccttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaattcgtcatcatcaggaatgcaaattcttc 31939583  T
Q  118 ctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctg 217  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  31939584 ctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccattaagtcaacaaacttcacatccacttgctg 31939683  T
Q  218 agcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaac 317  Q
     |||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  31939684 tgcttctcgaatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaattcacaggcaaggctcgagtctctaaac 31939783  T
Q  318 tgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaat 417  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31939784 tgttctagcaaatcaaattctttcaccatcaaagcagacatatgcagcgttttcctactcaaagcatctgcaactacattggctttaccaggatggtaat 31939883  T
Q  418 tcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||  || || ||||| |||||||||||    
T  31939884 tcaaaccaaagtcataatccttcaacagctccaaccacctcctctgcct 31939932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 18133904 - 18133453
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||  |||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  18133904 caaatcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctactcttgtgactttcttccaaaattaactttttcaactcgtcattatcaggaata 18133805  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    | || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  18133804 ctaattcttcctctgaaccttaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtttcattaccaacaatcatcaaatgaacaaacttcacat 18133705  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| | |||||| |||||| ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| || |||||    
T  18133704 ctacttgctgcgcttctcggatattattcaagaaatcactgttaatctttagcatcgccaactgaacactatgaggtgtcaattcacagacgaggctcaa 18133605  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || | ||  ||||||||||| || |||||     
T  18133604 gtctctaaacggctctaacaaatcaaattcttttaccatcaaagcagacatatgcaacgttttcctacttaaggtatatgcaaccacattagctttaccc 18133505  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcc 459  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||    
T  18133504 ggatggtaattcatgccaaaatcataatccttcaacagctctaaccacctcc 18133453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12360100 - 12359627
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  12360100 caaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcatcatcaggaaca 12360001  T
Q  108 ---------------caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaat 192  Q
                   |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |  ||| ||||    
T  12360000 tcatcatcaggaatgcaaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccaacaaccattaaat 12359901  T
Q  193 caacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattc 292  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12359900 caacaaacttcacatctacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgtacactctgaggtgtcaattc 12359801  T
Q  293 acagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaacc 392  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| | ||| ||||||    
T  12359800 acagacaaggctcaagtctctaaactgctctaacaaatcaaattatttcaccatcaaagcagacatatgcaacgtctttctactcaaggaatctgcaacc 12359701  T
Q  393 acattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||| |||||| ||||||||    
T  12359700 acattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacagctctatccatcttctctgcct 12359627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 11303331 - 11302954
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||  |||||||| | || || || | | ||||| |||| ||||||||||| ||||||||     
T  11303331 caaatcatgatacattttcgtagctcccagatgaatactcaagctactcttgtgcctttcctctaaactcaaccttttgaaatcatcattatcaggaatg 11303232  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||| | ||    
T  11303231 caaattcttcctctgaaccttaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccattaaccatcaaatcaacaaacttaacat 11303132  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11303131 ctacttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaactgtacactctgaggtgtcaattcacagacaagactcaa 11303032  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatc 385  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  11303031 atctctaaactgctctagcagatcaaattctttcaccatcaaagcagagatatgcaatgtcttgctgctcaacgcatc 11302954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 74 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 16827695 - 16827328
Alignment:
Q  74 aatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtca 173  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||    
T  16827695 aatcaactttttcaaatcatcattatcatgaatacaaatttttcctctgaacctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcattatcttcagtttca 16827596  T
Q  174 ttaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgta 273  Q
    |||| || |  |||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16827595 ttactagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatcaacttgatgtgcttctctgatactgttcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgta 16827496  T
Q  274 tactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcct 373  Q
     || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||| || |||||    
T  16827495 caccctgaggtgacaactcacagataagactcaagtctctaaaatggtctagcaactcaaactcttttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcct 16827396  T
Q  374 gctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    |||||| ||||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  16827395 gctcaaagcatctgcaaacacattagctttacccggatggtaattcaaactaaaatcataatccttca 16827328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16380486 - 16380059
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| || || | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16380486 caaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaattcttcattgtcaggaata 16380387  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||| | ||    
T  16380386 caaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtgccattaccagtaacaatcaaatcaaccaacttgacat 16380287  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | || || || ||||||||||||||  |||  |||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||     
T  16380286 ccacctgttgtgcttctcggatactactcagaaaatcactgttaatctttagcatgcccaactgtatgctttgaggcgacaactcacataccaaactcat 16380187  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || || || || | |    
T  16380186 gtctctaaactgttccagcaaatcaaattcttttatcatcatagcagacatatgcagtgtcttcctgctcaatgcatcagcaactacgttagctttgcta 16380087  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16380086 ggatggtaattcaaaccaaaatcataat 16380059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 206
Target Start/End: Original strand, 10384539 - 10384737
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  10384539 caaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaata 10384638  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaa 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10384639 caaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaatcaacaaacttcaaa 10384737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 13942595 - 13943022
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||  |||||||  |||| || || || || ||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  13942595 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaata 13942694  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||| |  ||| | |||||| | ||| | ||    
T  13942695 caaattctacctctgaatcttagcacaccctgatcatcaacctggaagtcactatcttcaatgccattaccagcaaccattagatcaaccagcttgacat 13942794  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| |||| ||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||  || ||||  ||||| ||||| || | |||||     
T  13942795 ccacttgttgtgcttcccggatactattcaggaaatcactgttaatctttagcatccccaactgtacgctttgagacgacaactcacataccaaactcat 13942894  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| || || ||     
T  13942895 gtctctaaactgttccagcaaatcgaattcttttatcatcatagcagacatatgcagtgtcttcctgctcaatgcatcagcgactacattagcttttccc 13942994  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13942995 ggatggtaattcaacccaaaatcataat 13943022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16836064 - 16835641
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||  |||||||| |||| || || | ||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||    
T  16836064 tcatgatacatcttcgtagctccgggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaacttttttgattcttcattgtcaggaatacaaa 16835965  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||| |||||||| || |  || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||| |   |||| |||||| ||||| | ||| ||    
T  16835964 ttctacctctgaatcttaatactccctgatcatcaactttgaagtcactatcttcagtgccattaccagcaacaatcagatcaaccaacttgacatccac 16835865  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
     ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||| |||| ||| |||||||| | |||||  |||| ||| ||||| |||||||||| ||||    
T  16835864 ctgctgtgcttctcggatactactcaagaaatcactgttaattttcaacatacccaactgaacactcttcggtgtcaactcacacacaagactcatgtct 16835765  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| || ||| |||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||    
T  16835764 ctaaactgttccagcaaatcaaattctcttaccattaatgcagacatgtgcaaagtctttctgctcaacgcatccgcaactacattggctttatcaggat 16835665  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  16835664 ggtaattcaaaccaaaatcataat 16835641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 44777818 - 44778245
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||  |||||||  |||| || || || || ||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  44777818 caaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaata 44777917  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |  ||||||||| |  ||| | |||||| ||||| | ||    
T  44777918 caaattctacctctgaatcttagcacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcgataccattaccagcaaccattagatcaaccaacttgacat 44778017  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || | |||||     
T  44778018 ccacttgctgcgcttcccggatactattcaggaaatcactgttaatctttagcatccccaactgtatgctctgaggcgacaactcacacaccaaactcat 44778117  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||     
T  44778118 gtctctaaactgttccagtaaatcaaattctttcatcatcatagcagacatatgcagtgtcttcctactcaatgcatcagcgactacattagctttgccc 44778217  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  44778218 ggatggtaattcaacccaaaatcataat 44778245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 41178093 - 41178520
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||  |||||||  |||| || || || |||||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  41178093 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggatcaactttttcatttcttcattatcaggaata 41178192  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||  |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||| |  ||||| |||||| ||||| | ||    
T  41178193 caaattctacctctgattctcaacacaccctgttcatcaaccttgaagtcactatcttcaacgccattaccagcaaccatcagatcaaccaacttgacat 41178292  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| ||||||||||||||  |||  |||| ||| | |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || | |||||     
T  41178293 ccacttgctgtgcttctcggatactactcagaaaatcactgttaatctttagcatccccaactgtacactttgaggcgacaactcacaaaccaaactcat 41178392  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || |  || ||||||||||| | ||||| |||| ||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||     
T  41178393 gtctctaaactgttccaataaatcaaattctttcatcatcatagcagacatatggagtgtcttcctactcaacgcatccgcgactacattagcttttccc 41178492  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  41178493 ggatggtaattcaacccaaaatcataat 41178520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 14087244 - 14087702
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||| |||| ||||| | ||||||| ||||||  ||||| ||||| |||||     
T  14087244 caaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttcttccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgtctggaatg 14087343  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||| || || |||||||||||||  | ||||| | ||   || ||||| |||||||| | ||    
T  14087344 caaattctgcctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagcttgattactattaactattaaatccacaaacttgacat 14087443  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | || || || ||||||| |||||| |||||||| | |||||  || |||| ||| |||||||    |||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  14087444 caacctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttcatcatacccaacttctcactctggggtgacaattcgcaaacaagactcaa 14087543  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  ||  |||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  14087544 gtctctaaactgttcaagcaactcgaattcctttaccatcatggccgacatgtgtaatgtcttcctactcaaagcatctgcaactacattggctttaccc 14087643  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| || || || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14087644 ggatgatagtttaacccaaaatcataatccttcaatagctctaaccatctcctctgcct 14087702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13971668 - 13971220
Alignment:
Q  18 tacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 117  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||| |||| ||||| | ||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||| |||| ||| |    
T  13971668 tacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttcttccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgtcgggaatgcaaattctgc 13971569  T
Q  118 ctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctg 217  Q
    |||||||| ||| |||||| || |||||||| || || |||||||||||||  | ||||| | ||   || ||||| |||||||  | ||| || || ||    
T  13971568 ctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagcttgattactattaactattaaatccacaaactcgacatcaacctgttg 13971469  T
Q  218 agcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaac 317  Q
     |||| |  |||||| |||||||| | |||||  || || | ||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13971468 cgcttatttgatactattcaagaattcactattgatttttaacatacccaactgcacactctggggtgacaattcgcaaacaagactcaagtctctaaac 13971369  T
Q  318 tgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaat 417  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||  ||  |||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |    
T  13971368 tgttcaagcaactcaaattcctttaccatcatggccgacatgtgtaacgtcttcctactcaaggcatctgcaactacattggctttacccggatgatagt 13971269  T
Q  418 tcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13971268 tcaacccaaagtcataatccttcaatagctctaaccatctcctctgcct 13971220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 385
Target Start/End: Original strand, 4679009 - 4679386
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||  |||||||  |||| || || || || ||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  4679009 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaata 4679108  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||| |  ||||| |||||| ||||| | ||    
T  4679109 caaattctacctctgaatctcaacacaccctgttcatcaaccttgaagtcactatcttcaacgccattaccagcaaccatcagatcaaccaacttgacat 4679208  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| ||||||||||||||  |||  |||| ||| | |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || | |||||     
T  4679209 ccacttgctgtgcttctcggatactactcagaaaatcactgttaatctttagcatccccaactgtacactttgaggcgacaactcacaaaccaaactcat 4679308  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatc 385  Q
    |||||||||||| || |  || ||||||||||| | ||||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||    
T  4679309 gtctctaaactgttccaataaatcaaattctttcatcatcatagcagacatatggagtgtcttcctactcaatgcatc 4679386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 10419599 - 10419176
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||  |||| ||||| | ||||||||| ||||| || |||||||| |||| |||||    
T  10419599 tcatgatacattttcgtagctcctggatgaatactcaaattactcttatgactttcttctaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcgggaacacaaa 10419500  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||| ||||| || ||||  ||||| || |||||||| || || |||| ||||||||  | ||||| |  |  ||| ||||| |||||||| | ||| ||    
T  10419499 ttctgcctctaaatctcaatacaccttgttcatcaactttgaaatcaccatcctcagcttgattactatcaaccattaaatccacaaacttgacatcaac 10419400  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    | | || ||||||| |||||| |||||||| | |||||  ||||||| ||| |||||||| | ||| |||| ||| |||||||| || |||||||||||     
T  10419399 tcgttgtgcttctctgatactattcaagaagtcactattgatcttcaacatacccaactgcacactttgagatgataattcacacactagactcaagtcc 10419300  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  10419299 ctaaactgttcaagcaactcgaactcctttaccatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaactacattagctttacccggat 10419200  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    | || ||||| |||||||||||||    
T  10419199 gatagttcaaaccaaaatcataat 10419176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 235 - 466
Target Start/End: Original strand, 17187172 - 17187403
Alignment:
Q  235 tcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaa 334  Q
    ||||||||| ||| | ||| |||| ||| |||||||| | |||||||||||  |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  17187172 tcaagaaatcactgttaattttcaacatacccaactgcacactctgaggtgttaattcacaaaccagactcaagtctctgaactgttcaagcaactcaaa 17187271  T
Q  335 ttcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataa 434  Q
    ||| |||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| | ||||||||||    
T  17187272 ttcctttaccatcatagccgacatatgcaatgccttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacccgggtgatagttcaaactaaaatcataa 17187371  T
Q  435 ttcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17187372 tccttcaatagctctaaccatctcctctgcct 17187403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 433
Target Start/End: Original strand, 15228224 - 15228645
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||| ||  ||||  || |||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  15228224 tcatgatacatctttatagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaacgttttcaactcatcattatcaggaatagaaa 15228323  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     |||| ||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||    || |||||| |||||||| | ||| ||    
T  15228324 ttcttactcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttggttactagccaccaacaaatccacaaacttaacatcaac 15228423  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
     | ||| ||||||   ||||| |||||||| | ||| |  ||||||| ||| ||||| |  | ||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||    
T  15228424 cttctgtgcttctttaatactattcaagaactcactgttgatcttcaacatacccaatttcacactttgagttgacaactcacaaactagactcaagtct 15228523  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||  |||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  15228524 ctaaattgctcaagcaactcaaaatctttaactatcatagctgacatatgcaaagtcttcctgctgaaagcatctgcaacaacattggctttacccggat 15228623  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
    | ||||| || | |||||||||    
T  15228624 gataatttaaactaaaatcata 15228645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 5424498 - 5424072
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  5424498 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 5424399  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  5424398 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 5424299  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||| | ||||||| || | ||||||    
T  5424298 aactttctgtgcttccttgatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccaatttcacactctgaggtgtccattcacaaaccaaactcaa 5424200  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  5424199 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 5424100  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  5424099 ggatgataattcaagccaaagtcataat 5424072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13300064 - 13299889
Alignment:
Q  24 ttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctga 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| || || | |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  13300064 ttcgtagctcccgggtgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaaccatcatcatcaggaatacaaattcttcctctga 13299965  T
Q  124 acctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaa 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||| ||||| | |||| |||||||||||    
T  13299964 acctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcactattctcagtttcataaccagcaatcattaaatcaacaaa 13299889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13310722 - 13310547
Alignment:
Q  24 ttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctga 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| || || | |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  13310722 ttcgtagctcccgggtgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaaccatcatcatcaggaatacaaattcttcctctga 13310623  T
Q  124 acctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaa 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||| ||||| | |||| |||||||||||    
T  13310622 acctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcactattctcagtttcataaccagcaatcattaaatcaacaaa 13310547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 433
Target Start/End: Original strand, 15234141 - 15234513
Alignment:
Q  61 gactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcact 160  Q
    |||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||| ||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15234141 gactttcttctaaaatcaacgttttcaactcatcattatcaggaatagaaattcttactcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcact 15234240  T
Q  161 atcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagc 260  Q
    ||| ||||| |  |||| ||    || |||||| |||||||| | ||| || | ||| ||||||   ||||| |||||||| | ||| |  ||||||| |    
T  15234241 atcttcagtttggttactagccaccaacaaatccacaaacttaacatcaaccttctgtgcttctttaatactattcaagaactcactgttgatcttcaac 15234340  T
Q  261 atccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatat 360  Q
    || ||||| |  | ||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||  ||||||    
T  15234341 atacccaatttcacactttgagttgacaactcacaaactagactcaagtctctaaattgctcaagcaactcaaaatctttaactatcatagctgacatat 15234440  T
Q  361 gcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
    |||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || | |||||||||    
T  15234441 gcaaagtcttcctgctgaaagcatctgcaacaacattggctttacccggatgataatttaaactaaaatcata 15234513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15402085 - 15401659
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  15402085 aaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 15401986  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  15401985 aaattcttccttggaatctcaacacaccttgatcatcaattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 15401886  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     |||  ||| |||||   |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||      
T  15401885 aactctctgtgcttccttgatacttttcaggaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcata 15401786  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||| || || || || || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  15401785 tctctaaactgttcaagaaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctg 15401686  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  15401685 gatgataattcaaaccaaagtcataat 15401659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 441
Target Start/End: Original strand, 10906772 - 10907204
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  10906772 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 10906871  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  10906872 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 10906971  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | || ||     
T  10906972 aactttctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaacacat 10907070  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  10907071 atctctaaactgttctagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 10907170  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||||| |||||||| || || ||||||| |||||    
T  10907171 ggatgataattcaaaccgaagtcataatccttca 10907204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 14580511 - 14580084
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||  || ||||||| |||||||||| ||| || |  || |||| ||| ||||||    
T  14580511 caaatcatgatacattttcgtagctcctgggtgaatactcaagctacttctgtgactctcctcaagaatcatcttcttaatctcttcatcgtctggaata 14580412  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||  ||||| |  ||||| |||||||| | ||| || |||||||| ||| | | ||||| ||||  || |||||| |||||||| | ||    
T  14580411 caaattctacctcgaaaccttaatacaccttgatcatcgatcttgaaatcactatcttcaatctgattactagtaaccaacaaatccacaaacttgacat 14580312  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||| ||| |||||    ||||| ||||| || | | |||||||||||| ||| || | ||  | |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  14580311 caactttctgtgcttccttaatacttttcaaaaattcattatcaatcttcaacattcctagcttaacactctgagatgacatttcacagactaaactcaa 14580212  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||  |||| || ||  | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  14580211 atctctgaactgttcaagcaactcgaactcttttaccatcatagcggacatgtgtaaattcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 14580112  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14580111 ggatgataattcaaaccaaaatcataat 14580084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 15588958 - 15588528
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||||    
T  15588958 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaa 15588859  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  15588858 attcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtctacaaactttacatcaa 15588759  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| |||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||  |    
T  15588758 ctttctgtgcttccttgatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatat 15588660  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  15588659 ctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 15588560  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  15588559 atgataattcaaaccaaagtcataatccttca 15588528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15724502 - 15724076
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  15724502 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 15724403  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    | | |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| |||||    
T  15724402 agattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtctacaaacttgaaatc 15724303  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  15724302 aactttctgcgcttccttgatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 15724204  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| || |||||     
T  15724203 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctacaacaacattagctttacct 15724104  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  15724103 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 15724076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 441
Target Start/End: Original strand, 16636337 - 16636767
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||||    
T  16636337 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaa 16636436  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || | ||| ||| || |||||||| | ||| |    
T  16636437 attcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaa 16636536  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| |||||   |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||  |    
T  16636537 ctttctgtgcttccttgatacctttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatat 16636635  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  16636636 ctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 16636735  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  16636736 atgataattcaaaccaaagtcataatccttca 16636767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 441
Target Start/End: Original strand, 43163661 - 43164091
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||||    
T  43163661 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaa 43163760  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || | ||| ||| || |||||||| | ||| |    
T  43163761 attcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaa 43163860  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| |||||   |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||  |    
T  43163861 ctttctgtgcttccttgatacctttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatat 43163959  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  43163960 ctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 43164059  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  43164060 atgataattcaaaccaaagtcataatccttca 43164091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 15339831 - 15340257
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  15339831 aaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 15339930  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||| | || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  15339931 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcattgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 15340030  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     |||  ||| |||||   |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||      
T  15340031 aactctctgtgcttccttgatacttttcaggaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcata 15340130  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||| || ||||| |    
T  15340131 tctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacagcattagctttacctg 15340230  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  15340231 gatgataattcaaaccaaagtcataat 15340257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 441
Target Start/End: Original strand, 13253252 - 13253684
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  13253252 aaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 13253351  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || | ||| ||| || |||||||| | |||    
T  13253352 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatc 13253451  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || ||   |||||     
T  13253452 aactttctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcactatcaaccttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccgaactcat 13253550  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  13253551 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 13253650  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    || || |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  13253651 gggtgataattcaaaccaaagtcataatccttca 13253684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 20061620 - 20061190
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||| |||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||||    
T  20061620 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcctcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaa 20061521  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  20061520 attcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaa 20061421  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| |||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||  |    
T  20061420 ctttctgtgcttccttgatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatat 20061322  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  20061321 ctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 20061222  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  20061221 atgataattcaaaccaaagtcataatccttca 20061190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 441
Target Start/End: Original strand, 48426011 - 48426441
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||||    
T  48426011 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaa 48426110  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  48426111 attcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaa 48426210  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtc 310  Q
    ||| ||| |||||   |||| | ||||| || | |||||||||||| ||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||  ||    
T  48426211 ctttctgtgcttccttgatatttttcaaaaattcactatcaatcttgagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatc 48426310  T
Q  311 tctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagga 410  Q
    ||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||    
T  48426311 tctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgga 48426410  T
Q  411 tggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    || |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  48426411 tgataattcaaaccaaagtcataatccttca 48426441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 441
Target Start/End: Original strand, 10006162 - 10006594
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||| ||| || ||||    
T  10006162 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcatcgtctgggatac 10006261  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  10006262 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 10006361  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  10006362 aactttctgtgcttccttgatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 10006460  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  10006461 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 10006560  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||||| |||||||| || || ||||||| |||||    
T  10006561 ggatgataattcaaaccgaagtcataatccttca 10006594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8758640 - 8758416
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||  |||||||  |||| || || || || ||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  8758640 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaata 8758541  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||  | ||||||||| |  ||||| |||||| ||||| | ||    
T  8758540 caaattctacctctgaatctcaacacaccctgttcatcaaccttgaagtcactattttcaacgccattaccagcaaccatcagatcaactaacttgacat 8758441  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatact 232  Q
    | |||||||| ||||||||||||||    
T  8758440 ccacttgctgtgcttctcggatact 8758416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 245 - 435
Target Start/End: Original strand, 15260428 - 15260618
Alignment:
Q  245 actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttacc 344  Q
    |||||||||||||||||| || | ||  | ||| |||| |||||| || || || | |||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  15260428 actatcaatcttcagcattcctagcttcacactttgagatgacaactcgcaaactaaactcaaatctctaaactgttcaagcaactcaaactcttttacc 15260527  T
Q  345 atcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15260528 atcatagcggacatatgcaaagttttcctacttaaggcatctgcaacaacattagccttacccggatggtaattcaactcaaaatcataat 15260618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 333 - 466
Target Start/End: Original strand, 12179234 - 12179367
Alignment:
Q  333 aattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcat 432  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||    
T  12179234 aattctttcaccatcatagcagacatatgcaacgttttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttgcccggctggtaattcaaaccaaaatcat 12179333  T
Q  433 aattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||| |||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  12179334 aatccttcaacagctctaaccatcttctctgcct 12179367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 15347813 - 15347395
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||| ||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  15347813 aaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcgagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 15347714  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||  || |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  15347713 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 15347614  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| || | |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| ||||||| || | ||||||    
T  15347613 aactttctgtgcttccttgatacttttta-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcaa 15347515  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || || ||||| || ||| | |||||||  ||  ||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  15347514 atctctaaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatttcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttaccc 15347415  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaa 427  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  15347414 ggatgataattcaaaccaaa 15347395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16411850 - 16411393
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| |||||||    
T  16411850 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaacctcttcattgtctggaatac 16411751  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||  | ||  | || |  || ||| || |||||||| |||||    
T  16411750 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagactgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttaaatc 16411651  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  |  |||||||||||| |||| || || | |||||     
T  16411650 aactttctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacgctctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 16411552  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     || || ||||| || || ||||| || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  16411551 atccctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacct 16411452  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
     |||| |||||||| ||||| || ||||  ||||| | ||||| |||||| ||||||||    
T  16411451 agatgataattcaaaccaaagtcgtaatctttcagcaattctagccatcttctctgcct 16411393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 14125935 - 14125714
Alignment:
Q  237 aagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaat 335  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| ||||||| || | |||||  ||||||||| | || || || || ||     
T  14125935 aagaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcatatctctaaacggttcaagtaattcgaac 14125836  T
Q  336 tcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  14125835 tctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctgctcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataat 14125736  T
Q  436 tcttcagtagttctaaccatct 457  Q
      ||||| | ||||| ||||||    
T  14125735 ctttcagcaattctagccatct 14125714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 277 - 435
Target Start/End: Original strand, 16692994 - 16693152
Alignment:
Q  277 tctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgct 376  Q
    ||||||||||| |||| || || | |||||||||||| ||||| || || ||||| || ||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16692994 tctgaggtgaccattcgcaaactaaactcaagtctctgaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcaaggcagacatatgcaatgtcttcctgct 16693093  T
Q  377 caatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  16693094 caacgcatctgcaacaacattagctttacctgggtgataattcaaaccaaagtcataat 16693152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 53384584 - 53384160
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || || | ||| |||||||||    
T  53384584 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcgtcgtctggaatacaa 53384485  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||| |||| ||| |||| ||| || |||||||| |  ||||| ||||| || ||||  | ||  | || |  || |||||| |||||||||| |||      
T  53384484 attctccctcggaatctcaacacgccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagcctgatctctagcaaccaacaaatccacaaacttcacatcat 53384385  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    |   ||| ||||||  ||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| ||||||| || | |||||  |    
T  53384384 ccctctgtgcttctttgatgcttttca-gaaattcactatccatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcatat 53384286  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||  ||||| || || |||||||| ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || ||||| ||    
T  53384285 ctcggaactgttcaagtaactcaaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaataacattagctttacccgg 53384186  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  53384185 atgttaattcaaaccaaagtcataat 53384160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 303 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16491455 - 16491292
Alignment:
Q  303 ctcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcct 402  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||| |||||  |||| ||||| || |    
T  16491455 ctcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcttttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatcttcaacaacattagctt 16491356  T
Q  403 taccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||| ||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||| | ||||| |||||| | ||||||    
T  16491355 tacccggatgatagctcaacccaaaatcataatccttcagcaattctagccatctacgctgcct 16491292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16806249 - 16806058
Alignment:
Q  275 actctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctg 374  Q
    ||||||||||||| ||||||| || | |||||| || || ||||| || || ||||| || ||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  16806249 actctgaggtgaccattcacaaactaaactcaaatccctgaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctg 16806150  T
Q  375 ctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||  |||| |||||||  ||||| | ||||| |||||| | ||||||    
T  16806149 ctcaaagcatctgcaacaacattagctttacctagatgataattcaaagcaaagtcataatctttcagcaattctatccatctacgctgcct 16806058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 6601300 - 6601724
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| ||||| |||    
T  6601300 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtcgggaatgcaa 6601399  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||| |||| ||| |||| ||| || | |||||| |  ||||| ||||| || ||||  | ||  |  | |  || |||||| |||||||| | ||| |    
T  6601400 attctccctcggaatctcaacacgccttcatcatcgattttaaaatcactgtcttcagcctgatctctggcaaccagcaaatccacaaactttacatcaa 6601499  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||  ||| ||||||  |||  | |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||| | ||||||| || | |||||  |    
T  6601500 ctctctgtgcttctttgatgtttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgtccattcacaaaccaaactcatat 6601598  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||  ||||| || || ||||| || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  6601599 ctcggaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccgg 6601698  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  6601699 atgataattcaaaccaaagtcataat 6601724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 26791967 - 26791831
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  26791967 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 26791868  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatc 145  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||||||    
T  26791867 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 26791831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14876064 - 14875610
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |   ||||| |||||||||||  || ||||  || ||||  ||||||||||||    
T  14876064 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctataactcttttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaa 14875965  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||  |||| ||| |||| |||||| || ||||| ||||||| ||||| ||| ||||| | |||||  | |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  14875964 attcaacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaa-gtcaccatcttcagtctgattacttgcaaccaacaagtctacaaacttgatatcaa 14875866  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtc 310  Q
    |||  || || |||   ||||| ||||| || | ||||||||| |||||||| ||||  |  | ||||||||||||| | ||||| || |  ||||  ||    
T  14875865 ctttttgtgcctctttaatacttttcaaaaattcactatcaattttcagcattcccagtttcacactctgaggtgaccactcacaaactaagctcatatc 14875766  T
Q  311 tctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagga 410  Q
    ||||||||  || |||||||| || ||| | || |||| ||   ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||    
T  14875765 tctaaactattcaagcaactcgaactctctaactatcatagtggacatatgcaatgtcttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacctgga 14875666  T
Q  411 tggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || ||||||||  |||| |||||||  ||||| | ||||| |||||| | ||||||    
T  14875665 tgataattcaaatcaaagtcataatctttcagcaattctagccatctacgctgcct 14875610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 12498812 - 12499236
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  ||||||| ||||||||||  || ||||  || |||| ||||||||| |||    
T  12498812 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcctcaagaatcattttcttcatctcttcatcgtcaggaatgcaa 12498911  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    |  |  |||| ||| |||| |||||| || ||||| || |||||||||| | | ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  12498912 atccgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccaacttcagtctaattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaa 12499011  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
     || ||| || |||   ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||  |  | ||| ||||||||| | ||||| || | |||||  |    
T  12499012 atttctgtgcctctttaatacttttc-agaaattcactatcaatcttcaacattcccagtttcacactttgaggtgaccactcacaaaccaaactcatat 12499110  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || || || || || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||| || || || |||||  |    
T  12499111 ctctaaactgttcaagtaaatcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaagccatctgcaacgacgttagctttacctag 12499210  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  12499211 atgataattcaaaccaaagtcataat 12499236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 169
Target Start/End: Original strand, 15248708 - 15248869
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||| | ||||||||||    
T  15248708 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactttcttcaagaatcatcttcttcatctcatcgtcgtcaggaata 15248807  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagt 169  Q
    |||| ||| ||||  || | || ||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||    
T  15248808 caaattctgcctcgaaaacgcaacactccctgatcatcgattttaaaatcactatcttcagt 15248869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 143
Target Start/End: Original strand, 17490414 - 17490546
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| ||| |||||||||    
T  17490414 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaa 17490513  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatca 143  Q
    |  || ||||  ||||||| |||||| ||||||    
T  17490514 atcctacctcgaaacctcaacacaccttgatca 17490546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Original strand, 18750809 - 18750928
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  18750809 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagcc 18750908  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || || ||||| ||| ||||    
T  18750909 ttccctggatgataactcaa 18750928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Original strand, 25767183 - 25767302
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  25767183 actcaaatctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagcc 25767282  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || |||||||| ||| ||||    
T  25767283 ttcccaggatgataactcaa 25767302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16756151 - 16756017
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| ||||| |||    
T  16756151 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatgcaa 16756052  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatc 145  Q
    | ||| |||| ||| |||| ||| || ||||||||    
T  16756051 attctccctcggaatctcaacacgccttgatcatc 16756017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 6152128 - 6151964
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||| |  || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  6152128 actcaagtctagaaactgctcaatcaatttcaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagcc 6152029  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  6152028 ttcccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatctcctctgcct 6151964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Original strand, 15610968 - 15611132
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| ||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  15610968 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaaatcttcctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 15611067  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| | | ||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  15611068 tttccgggatgataactcaactgaaaatcaaagtccttaagatattccaaccatctcctctgcct 15611132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 435
Target Start/End: Original strand, 17490706 - 17490838
Alignment:
Q  303 ctcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcct 402  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |  |||||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  17490706 ctcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactactttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctt 17490805  T
Q  403 taccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||| ||  ||||  ||||||||||||    
T  17490806 taccaggatgatagctcaactcaaaatcataat 17490838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Original strand, 30138671 - 30138835
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  30138671 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 30138770  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||| ||||||||    
T  30138771 tttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatcttctctgcct 30138835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Original strand, 30148222 - 30148386
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  30148222 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 30148321  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||| ||||||||    
T  30148322 tttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatcttctctgcct 30148386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 6711686 - 6711567
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||| ||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||| |   |||| ||||| ||||| || |||||||| |||    
T  6711686 actcaaatctcgaaactgctcaatcaactccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaacggcatcctactcaaagcatctgccaccacattcgcc 6711587  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || || ||||||||| ||||    
T  6711586 ttcccgggatggtaactcaa 6711567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 15015081 - 15014894
Alignment:
Q  252 atcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaag 351  Q
    |||||||||||||| || |  | ||||||  | |||| |||||| || | |||||||||| | ||||| || ||||| |  || ||| | ||||||| ||    
T  15015081 atcttcagcatccctaatttcacactctgctgcgacacttcacaaactaaactcaagtctttgaactgttcaagcaaatgcaactctctaaccatcatag 15014982  T
Q  352 caaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattctt 439  Q
    || ||||||| ||||||||||| || || ||||  | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  15014981 cagacatatgtaatgttttcctacttaaagcatttgtaacaacattagccttacccggatggtaattcaacctgaaatcataattctt 15014894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 78
Target Start/End: Original strand, 15062308 - 15062375
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatca 78  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||||||||||    
T  15062308 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctactcctatgactctcttcaagaatca 15062375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Original strand, 16371976 - 16372134
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || | ||  ||||||||||||    
T  16371976 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctctttatcatcaggaatacaa 16372075  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagt 169  Q
    | ||   ||| ||| |||| |||||| || ||||| ||||||||| ||| ||| |||||    
T  16372076 attcgggctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagccaccatcttcagt 16372134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 8273695 - 8273510
Alignment:
Q  281 aggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaat 380  Q
    ||||| ||| |||| ||| | |||||| |||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || |||||     
T  8273695 aggtgtcaactcactgaccaaactcaaatctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaa 8273596  T
Q  381 gcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||| ||||||||    
T  8273595 gcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatcttctctgcct 8273510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13966619 - 13966455
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||| ||||| ||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  13966619 actcaaatctcgaaacttctcaatcaattcaaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 13966520  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||| ||||||||    
T  13966519 tttccgggatgataactcaactaaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatcttctctgcct 13966455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 16491747 - 16491647
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  |   |||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||| |||||||||    
T  16491747 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttttatggtactcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaa 16491648  T
Q  111 a 111  Q
    |    
T  16491647 a 16491647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16741978 - 16741859
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| || |||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  16741978 actcaagtctcgaagctgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 16741879  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || || ||||| ||| ||||    
T  16741878 tttccgggatgataactcaa 16741859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 78
Target Start/End: Original strand, 15209452 - 15209522
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatca 78  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||    
T  15209452 caaatcatgatacatcttcgtagcacccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 15209522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 403
Target Start/End: Original strand, 16258009 - 16258110
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  16258009 actcaagtctcgaaattgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 16258108  T
Q  402 tt 403  Q
    ||    
T  16258109 tt 16258110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Original strand, 17193959 - 17194123
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||| ||| ||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| |||||| |||| ||| | |||    
T  17193959 actcaaatctcgaaattgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcatcaacaacaatagcc 17194058  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||||||| ||   ||| |||||||| ||||||||    
T  17194059 ttcccgggatgataactcaactgaaaatcaaaattcttaagatattccaaccatcttctctgcct 17194123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 78
Target Start/End: Original strand, 9523283 - 9523350
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatca 78  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||    
T  9523283 atcatgatacatcttcgtagctcccgaatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatca 9523350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 16755917 - 16755765
Alignment:
Q  245 actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttacc 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||| | ||||||| || | |||||  ||||  ||||| || || ||||| || ||| | |||    
T  16755917 actatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgtccattcacaaaccaaactcatatctcggaactgttcaagtaactcgaactctctgacc 16755818  T
Q  345 atcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacatt 397  Q
    ||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16755817 atcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacatt 16755765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 466
Target Start/End: Original strand, 20891927 - 20892382
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20891927 atcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcttcaagaatcaacttcttcaaatcatcgttgtcagaaatacaa 20892026  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  20892027 actctttctctgaacctcaggaaaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagcgtcactaccagtagtcatcaaatcaacaaatttcaaatctg 20892126  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtc 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20892127 ctttctgagcttctcggatactgttcaagaaattactaacaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagaccagactcaagtc 20892226  T
Q  311 tctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagga 410  Q
    ||||||||| || | ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20892227 tctaaactgttccaacaattcaaattcttttaccattaaagcagacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagga 20892326  T
Q  411 tggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20892327 tggtaattcaagccaaaatcgtaatccttcagtaactctaaccatctcctctgcct 20892382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 8 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 11206561 - 11206107
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11206561 caaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactattgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaata 11206462  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11206461 caaacccttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcggtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaactttaaat 11206362  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  11206361 ccactttctgagcttctcagatactgttcaagaaatcactatcaatcttcaacatccccaactgtatactctgagatgacaattcacagacaagactcat 11206262  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11206261 gtctctgaactgttctaacaattcaaattctttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctgctcaaagcatcagcaacaacattggccttacca 11206162  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctct 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||    
T  11206161 ggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcagtaactctaaccacctcctct 11206107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 3264124 - 3263666
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  3264124 caaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaata 3264025  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3264024 caaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 3263925  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  3263924 cttctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaattcacagacaagactcat 3263825  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3263824 atctctgaactgttctaacaactcaaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggccttacca 3263725  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  3263724 ggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactctaaccacctcctctgcct 3263666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 29452867 - 29452409
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29452867 caaatcatgatacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaata 29452768  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  29452767 caaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcattatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 29452668  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  29452667 cttctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaattcacagacaagactcat 29452568  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||| || || |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29452567 atctctgaactgttctaacaactcaaactccttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggccttacca 29452468  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  29452467 ggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactctaaccacctcctctgcct 29452409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 8 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 44661196 - 44660741
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  44661196 caaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattatcaggaata 44661097  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44661096 caaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcggtatcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 44660997  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  44660996 ccactttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcgctatcaattttcaacattcccaactgtatactctgagatgacaattcacagacaagactcat 44660897  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  44660896 gtctctgaactgttctaacaattcaaattcctttaccattaaagcagacatatgcaaagttttcttgctcaaagcatcagcaacaacgttggccttacca 44660797  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctg 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  44660796 ggatggtaattcaagccaaaatcataatctttcagtaactctaaccacctcctctg 44660741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 33223865 - 33224323
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33223865 caaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttatgactctcttctagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaata 33223964  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33223965 caaattcttcctctgaaccacagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcgttatcctcagtgtcattactagtagtcatcaaatcaacaaacttcaagt 33224064  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||    
T  33224065 ctacttgctgagcttctcgggtactattcaagaaatcactattaatcctcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaactcacaaacaaggctcaa 33224164  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||| |||||||| |||| ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  33224165 gtccctaaactgttctaacaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatatgtaatgtcttcctgctcaacgcatcagcaaccacattggctttacca 33224264  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||| || ||||||||    
T  33224265 ggatggtaattcaagccaaaatcataatctttcaacagctctaaccaccttctctgcct 33224323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15358450 - 15357992
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||| |  || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  15358450 caaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttactctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatg 15358351  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  15358350 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacat 15358251  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15358250 ctacttgctgtgcttctcggatactattcaagaagtcactattaatcttcagcatccctaactgtacactatgaggtgtcaattcacagacaagactcaa 15358151  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||| ||||| ||  || |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  15358150 gtctctaagctgctatattaaatcaaattcctttaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttaccc 15358051  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || ||| ||||||| ||||||||    
T  15358050 ggatggtaattcaagccaaaatcataatctttcaacagctctcaccatcttctctgcct 15357992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 462
Target Start/End: Original strand, 16148653 - 16149107
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||| |||| || || ||| |||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  16148653 caaatcgtgatacattttcgtagctcccggatggatacttaagctgctcttgtgactttcctccagagtcaactttttcaacccttcattgtcaggaata 16148752  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  16148753 caaattcttcctatgaacctcaacacaccctgatcatcgactttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacat 16148852  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16148853 ctacttgctgagtttctcgtatactgttcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaa 16148952  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||    
T  16148953 gtctctaaactgctctaacaaatcgaattcttttaccatcaaggcggacatatgcaatgtcttcctgctcaacgtatctgcaaccacattggctttacca 16149052  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctct 462  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||  |  ||||||||||||||||    
T  16149053 ggatggtaattcaaaccaaaatcatagtccttcaacaactctaaccatctcctct 16149107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 462
Target Start/End: Original strand, 16152799 - 16153253
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||| |||| || || ||| |||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  16152799 caaatcgtgatacattttcgtagctcccggatggatacttaagctgctcttgtgactttcctccagagtcaactttttcaacccttcattgtcaggaata 16152898  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  16152899 caaattcttcctatgaacctcaacacaccctgatcatcgactttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacat 16152998  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16152999 ctacttgctgagtttctcgtatactgttcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaa 16153098  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||    
T  16153099 gtctctaaactgctctaacaaatcgaattcttttaccatcaaggcggacatatgcaatgtcttcctgctcaacgtatctgcaaccacattggctttacca 16153198  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctct 462  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||  |  ||||||||||||||||    
T  16153199 ggatggtaattcaaaccaaaatcatagtccttcaacaactctaaccatctcctct 16153253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 435
Target Start/End: Original strand, 15246870 - 15247293
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  15246870 tcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctccagaatcaactttttcaactcgtcattatcaggaatacaaa 15246969  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| ||    
T  15246970 ttcttcccctgaacctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtgtcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccac 15247069  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  15247070 ttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgtacactctgaagtgtcaactcatagacaagactcaagtct 15247169  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| | ||    
T  15247170 ctaaactgctctagcaaatcaaattcttttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaaacatctgcaaccacattagctttacccgaat 15247269  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  15247270 ggtaattcaaaccaaagtcataat 15247293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 8 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 15002694 - 15002261
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15002694 caaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgactttcttctagaatcaattttttcaaatcatcattatcaggaata 15002595  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| || |  ||| ||||| |||||||| | ||    
T  15002594 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcattatcttcagtttcattactagcaaccattaaatccacaaacttgacat 15002495  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |  |||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  15002494 catcttgttgtgcttctctgatactgttcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgtacactctgaggtgacaactcacagacaagactaaa 15002395  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||     
T  15002394 gtctctaaactgctatagcaactcaaactcttttaccatcatagccgacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttaccc 15002295  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15002294 ggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 15002261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 27901328 - 27901755
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||| | ||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  27901328 caaatcatgatacatttttgtagcttccggatgaatactcaagttactcttatgactttcttctaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcaggaata 27901427  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||| || |||| |||||| || ||||||||||| || || ||||||||||  | ||||| ||||  ||| ||||| ||||||||   ||    
T  27901428 caaattctgcctctaaatctcaacacaccttgttcatcaaccttgaaatctctatcctcagcttgattactagtaaccattaaatccacaaactttgcat 27901527  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || |||||||  ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27901528 caacttgttgtgcttctcttatactattcaagaaatcactattgatcttcagcatacccaactttacactttgaggtgacaattcacaaacgagactcaa 27901627  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||  ||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  27901628 gtctctaaactgttcaagtaattcgaattcctttaccatcatggccgacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaactacattagctttaccc 27901727  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27901728 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 27901755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 1648607 - 1648153
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||| || || ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  1648607 caaatcatggtacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctagaattaaccttttcaactcatcattatcaggaata 1648508  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| | |||||| |||| |||||| || ||||||||||| || |||| || |||||| |||||||||| | |||| ||||||||||| || | ||    
T  1648507 caaattctgcttctgaatctcaacacaccttgttcatcaaccttgaaatcaccattctcagtttcattaccagcaatcattaaatcaacaaattttacat 1648408  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | || || ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||| ||||| || | ||| ||    
T  1648407 ccacctgttgagcttctcggatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatcccaaatttaatactttgaggtgacaactcacaaactaaacttaa 1648308  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||| ||| || ||||| || ||||| ||||||||||  ||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||  |    
T  1648307 gtctctaagctgttcaagcaattcgaattcctttaccatcatggccgacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatccgccacaacattagccttatta 1648208  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctct 462  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||| |  ||||  || ||||||||||||||||    
T  1648207 gggtggtaattcaaaccaaagtcatagtctttcaacagctctaaccatctcctct 1648153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 15414352 - 15413931
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||  ||||  || |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  15414352 tcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaaactacttctgtgactttcttccaaaatcaactttttcaactcatcattatgaggaatacaaa 15414253  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     |||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||| || ||||| || ||||| | ||||| |  |  || |||||| |||||||| | ||| ||    
T  15414252 ttcttcctcagaatctcaacacaccctgatcatgaaccttgaaatcactttcttcagtttgattactaacaaccaacaaatccacaaacttaatatcaac 15414153  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
     | ||| ||||||   ||||| |||||||| | |||||  ||||||| ||| |||||||  | ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  15414152 cttctgtgcttctttaatactattcaagaactcactattgatcttcaacatacccaacttcacactttgaggtgacaactcacaaactagactcaagtct 15414053  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  15414052 ctaaaatgctccagcaactcaaattctttaaccatcatagctgacatatgcaatgtcttcctgcttaaagcatctgcaacaacattggctttacccggat 15413953  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
    | |||||||| |||||||||||    
T  15413952 gataattcaaaccaaaatcata 15413931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 433
Target Start/End: Original strand, 8706864 - 8707287
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8706864 tcatgatacatctttgtagctctcggatgaatacttaagttacttttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatacaaa 8706963  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||| |||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| ||    
T  8706964 ttctgcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaac 8707063  T
Q  212 ttgctgagc--ttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    || ||| ||  ||||   ||| |||||||||| | ||| |  ||||||||||| |||||||  | ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  8707064 tttctgcgcgcttctttaatattgttcaagaactcactgttgatcttcagcatacccaacttcacactatgaggcgacaactcacaaactagactcaagt 8707163  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  8707164 ctctaaactgttcaagcaactcaaactctctaaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacctgg 8707263  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  8707264 atgataattcaaaccaaaatcata 8707287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 14695058 - 14695482
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  14695058 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgagtactcaagctacttatatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaa 14695157  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | |||||    
T  14695158 attctgcctcggaatctcaacactccctgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtttaattactagaaaccaacaagtccacaaacttaacatcta 14695257  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtc 310  Q
     || ||  ||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||  | |||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||    
T  14695258 ttttctacgcttctttgatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcccagcttcacactctgaggtgacaattcgcagactaaactcaaatc 14695357  T
Q  311 tctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagga 410  Q
    |||||| |  |  ||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||  | ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||    
T  14695358 tctaaattttttaagcaactcaaactcttttaacatcatagcggacatatgcaacttcttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacctgga 14695457  T
Q  411 tggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  14695458 tgataattcaacccaaaatcataat 14695482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 14850435 - 14850011
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||  |  || |||||||||||||||  || ||||  ||||||| |||||||||||    
T  14850435 aaatcatgatacatcttcatagctcccggatgaatactcaagctacttctatgaatctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcaggaatac 14850336  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| ||| |||| ||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | | ||||| || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  14850335 aaattctgcctcggaatctcaacacgccttgatcatcgaccttaaagtctctatcttcaatctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttaacatc 14850236  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     |||| ||| ||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| | ||  | || ||||||||||||||| || ||||| |  ||||      
T  14850235 aactttctgcgcttctttgatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcacagttttacactctgaggtgacaactcgcagactaacctcaga 14850136  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||| | || ||||| |    
T  14850135 tctctaaactgctcaagcaactcaaactcttttaccatcacagcggacatatgcaacgtcttcctacttaaagcatctgcaacaacagtagctttacctg 14850036  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
    |||| ||||| || |||||||||||    
T  14850035 gatgataattaaacccaaaatcata 14850011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 348
Target Start/End: Original strand, 15078581 - 15078917
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||  ||||  |  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||    
T  15078581 tcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctatgactttcttccagaatcaactttttcaactcatcactatcaagaatgcaaa 15078680  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || ||    || ||||| | ||||| || |  ||| ||||| |||||||| | ||| |     
T  15078681 ttcttcctctgaaccttaacacaccctgctcatcgaccttgaaatcttcctcttcagtttgattactagcatccattaaatccacaaacttgacatcaat 15078780  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    || ||| ||||| | |||||| |||||||| | |||||  ||||||| ||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15078781 tttctgtgcttccctgatactattcaagaattcactattgatcttcaacatacccaactgcacactttgaggtgacaactcacaaacaagactcaagtct 15078880  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatca 348  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  15078881 ctaaactgttcaagcaactcaaactcttttaccatca 15078917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 74 - 441
Target Start/End: Original strand, 15320158 - 15320511
Alignment:
Q  74 aatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtca 173  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| | |    
T  15320158 aatcaactttttcaactcatcattatcaggaatgtaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaggtcaccatcttcagtttaa 15320257  T
Q  174 ttaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgta 273  Q
    ||||  |||   || ||||| |||||| | | ||| | || |||||||||   |||               |||||  ||||||| ||| |||||||  |    
T  15320258 ttacgggtaactattaaatccacaaacctgacatcaattttctgagcttccttgatc--------------actattgatcttcaacatacccaactaca 15320343  T
Q  274 tactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcct 373  Q
     ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||    
T  15320344 cactctgaggtgacaactcataaactagactcaagtctctaaactgctcaagcaactcaaaatcctttaccatcaaagcagacatgtgcaacgtcttcct 15320443  T
Q  374 gctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    |||||| ||||| |||| |||||| || ||||| || || |||||||  ||||||||||||| |||||    
T  15320444 gctcaaagcatctgcaatcacattagctttacctgggtgataattcataccaaaatcataatccttca 15320511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 131 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 51605999 - 51605695
Alignment:
Q  131 cacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggata 230  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |   ||||||||||  ||| | |||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||| |||    
T  51605999 cacactctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaatactattaccagtaaccattagatcaaccaacttgacatccacttgctgtgcttctcgaata 51605900  T
Q  231 ctgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaact 330  Q
    || |||| |||||  || | |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | ||||| |||||||||||| || |  || |    
T  51605899 ctattcaggaaatcgctgttaatctttagcatccccaactgtatgctttgaggcgacaactcacacaccaaactcatgtctctaaactgttccaataaat 51605800  T
Q  331 caaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatc 430  Q
    |||||||||| | ||||| |||| ||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||    
T  51605799 caaattctttcatcatcatagcagacatatggagtgtcttcctactcaacgcatccgcgactacattagcttttcccggatggtaattcaacccaaaatc 51605700  T
Q  431 ataat 435  Q
    |||||    
T  51605699 ataat 51605695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19777862 - 19777430
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  19777862 aaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 19777763  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  19777762 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 19777663  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  19777662 aactttctgtgcttccttgatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 19777564  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  19777563 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 19777464  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  19777463 ggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 19777430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 427
Target Start/End: Original strand, 23956690 - 23957108
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || ||||||||  | ||||    
T  23956690 aaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtcctggatac 23956789  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  23956790 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 23956889  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| || | |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| ||||||| || | ||||||    
T  23956890 aactttctgtgcttccttgatacttttta-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcaa 23956988  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  23956989 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttaccc 23957088  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaa 427  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  23957089 ggatgataattcaaaccaaa 23957108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 466
Target Start/End: Original strand, 40473983 - 40474440
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  40473983 aaatcatgatacatcttcatagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 40474082  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  40474083 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgattactagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 40474182  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
      |||  || |||||   |||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||| || |  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  40474183 agctttatgtgcttccttgatacttttca-gaaattcactatcaattttcagcatacctagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 40474281  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||     
T  40474282 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctttgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctacttaaggcatctgcaaccacattagctttacct 40474381  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||  |||| |||||| | ||||||    
T  40474382 ggatgataattcaaaccaaagtcataatctttcagtaagtctagccatctacgctgcct 40474440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 441
Target Start/End: Original strand, 14681510 - 14681942
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| |||||||    
T  14681510 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatac 14681609  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| ||||||||  || |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |   | ||| || |||||||| | |||    
T  14681610 aaattcttcctcgaaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagaaactaacaagtccacaaactttacatc 14681709  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  14681710 aactttctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 14681808  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| || || ||||| || ||| | ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  14681809 atctctgaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcaaaacggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 14681908  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  14681909 ggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 14681942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 441
Target Start/End: Original strand, 12477545 - 12477975
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||||    
T  12477545 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaa 12477644  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  12477645 attcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaa 12477744  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| |||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||  |    
T  12477745 ctttctgtgcttccttgatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatat 12477843  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  12477844 ctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 12477943  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  12477944 atgataattcaaaccaaagtcataatccttca 12477975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 14160412 - 14160870
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||    | |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||||    
T  14160412 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactccgatggctctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcattgtctggaata 14160511  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| || | ||| |||| ||| || || |||||||| |||||||||||||| || |  | |||| ||| |  || ||| || ||||| || | ||    
T  14160512 caaattctaccgcggaatctcaacactccttggtcatcaactttaaagtcactatcttctgactgattatcagcaaccaacaagtccacaaatttaacat 14160611  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 306  Q
    |  ||| ||| |||||    ||||| || | |||||| | |||||||||||||||| || |||| || ||||||||  |||||||| ||||| | |||||    
T  14160612 catctttctgtgcttccttaatactcttta-gaaattcattatcaatcttcagcattcctaactttacactctgagacgacaattcgcagaccaaactca 14160710  T
Q  307 agtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacc 406  Q
    | |||||||| |  |||||||| ||||| || || ||||||| |||  |||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || |||||    
T  14160711 aatctctaaattattctagcaattcaaactccttaaccatcatagcggacatatgcaaggtctttctacttaaggcatcagctacgacattcgctttacc 14160810  T
Q  407 aggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
     ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  || | |||||| ||||||||    
T  14160811 cggatgataattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactcaagccatcttctctgcct 14160870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 29038471 - 29038041
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||||    
T  29038471 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaa 29038372  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || | ||| ||| || |||||||| | ||| |    
T  29038371 attcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaa 29038272  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| |||||   |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||  |    
T  29038271 ctttctgtgcttccttgatacctttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatat 29038173  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  29038172 ctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 29038073  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  29038072 atgataattcaaaccaaagtcataatccttca 29038041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 441
Target Start/End: Original strand, 8387355 - 8387787
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  8387355 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 8387454  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || | ||| ||| || |||||||| | |||    
T  8387455 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatc 8387554  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||   ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  8387555 aactttctgtgcttccttgatacctctca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 8387653  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  8387654 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 8387753  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  8387754 ggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 8387787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8052692 - 8052266
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  || ||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  8052692 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgaatctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 8052593  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||  || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  8052592 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcaccgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 8052493  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  8052492 aactttctgtgcttccttgatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccaatttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 8052394  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  8052393 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 8052294  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  8052293 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 8052266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 14303048 - 14302621
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || || || | |||||| || |||    
T  14303048 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaaactctttattgtctgggata 14302949  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||| || ||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | ||    
T  14302948 caaattcttcctcggaatctcaacacaccttggtcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacat 14302849  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||| ||| ||| |   |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  14302848 caactttctgtgctcccttgatacttttcaggaattcactatcaatcttcagcatacccaatttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 14302749  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || || || || || ||| | ||||||| |||  ||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  14302748 atctctaaactgttcaagaaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatatcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 14302649  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    | ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  14302648 gaatgataattcaaaccaaagtcataat 14302621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 466
Target Start/End: Original strand, 12524619 - 12525076
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||| || ||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||  || |||||||||||||||||| ||  || |  ||  ||| ||| |||||||    
T  12524619 aaatcgtgatacatcttcgtagcttccggatggatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcatctccttaatctctccatcgtctggaatac 12524718  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| | |||||| |  ||||| ||||| || | ||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  12524719 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttcatcatcgattttaaaatcactgtctttagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 12524818  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  12524819 aactttctgtgcttccttgatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 12524917  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| || || ||||| || ||| | ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  12524918 atctctgaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcatagcgaacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 12525017  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| | ||| | |||||| ||||||||    
T  12525018 ggatgataattcaaaccaaagtcataatccttcagcaattcaagccatcttctctgcct 12525076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18226506 - 18226089
Alignment:
Q  18 tacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 117  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || |||| |||  ||| ||||||||| ||||  |  |    
T  18226506 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatatctgcatcgtcaggaatgcaaatccgac 18226407  T
Q  118 ctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctg 217  Q
    ||| ||| |||| |||||| || || || || ||||||||||  || ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| | ||  ||    
T  18226406 ctcggaatctcaacacaccgtgctcgtcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaaatttatg 18226307  T
Q  218 agcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaa 316  Q
     || |||   ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||| ||    
T  18226306 tgcctctttaatactcttca-gaaattcactatcaatcttcagcattcccaatttcacactctgaggtgaccattcacaaactaaactcaaatctctgaa 18226208  T
Q  317 ctgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaa 416  Q
    | | || || |||||||| | | | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||    
T  18226207 ccgttcaagtaactcaaactttctaaccatcaaagctgacatatgcaatgtcttcctgctcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataa 18226108  T
Q  417 ttcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| ||| | |||||||    
T  18226107 ttcaaaccatagtcataat 18226089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 308 - 466
Target Start/End: Original strand, 15071601 - 15071759
Alignment:
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  15071601 gtctctaaactgttcaagcaactcaaactcttttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaactacattagctttaccc 15071700  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| | ||||| || ||| | |||||| ||||||||    
T  15071701 ggatggtaatttaaactaaaatcatagtccttcaataattcaagccatcttctctgcct 15071759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 441
Target Start/End: Original strand, 18298148 - 18298580
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  18298148 aaatcgtgatacatctttgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 18298247  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| || | |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || || || | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  18298248 aaattcttcctcggaatctaaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttccgtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 18298347  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  |  |||||||||||| ||||||| || | |||||     
T  18298348 aactttctgtgcttccttgatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacgctctgaggtgaccattcacaaaccaaactcat 18298446  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||  ||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  18298447 atctcggaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 18298546  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  18298547 ggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 18298580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 277 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 18614625 - 18614445
Alignment:
Q  277 tctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgct 376  Q
    ||||||||||| ||||||| |  | |||||| ||||| || || || || |||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||    
T  18614625 tctgaggtgaccattcacaaattaaactcaaatctctgaattgttcaagtaactcaaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttcatgct 18614526  T
Q  377 caatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatct 457  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||    
T  18614525 caaggcatcagcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttcaacagttctatccatct 18614445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 427
Target Start/End: Original strand, 27712279 - 27712697
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  27712279 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 27712378  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||  || |  ||||| ||||| || ||||  | ||  | || |  || |||||| |||||||| | |||    
T  27712379 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagcctgatctctagcaaccaacaaatccacaaactttacatc 27712478  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| ||||||  ||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  |  |||||||||| | ||||||| || | |||||     
T  27712479 aactttctgtgcttctttgatgcttttc-agaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacgctctgaggtgtccattcacaaaccaaactcat 27712577  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| || || ||||| || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  27712578 atctctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatccgcaacaacattagctttaccc 27712677  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaa 427  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  27712678 ggatgataattcaaaccaaa 27712697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16354278 - 16354088
Alignment:
Q  245 actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttacc 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| | ||||| || |  ||||  |||||||||||||  || ||||| || ||| | |||    
T  16354278 actatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgaggtgaccactcacaaactaagctcatatctctaaactgcttaagtaactcgaactctctaacc 16354179  T
Q  345 atcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  16354178 atcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataat 16354088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15146952 - 15146528
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || ||||  |||||||||||     
T  15146952 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacat 15146853  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||  |||| ||| |||| |||||| || | ||| |||||||| ||||  || ||||| | ||||| ||    ||  || || |||||||| | ||| |    
T  15146852 attcgacctcggaatctcaacacaccatgtttatcgaccttaaattcaccttcttcagtctgattactagctaccaataagtctacaaacttgacatcaa 15146753  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| |||||    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| || |  |  | |||||||| |||| | ||||| || |  ||||| |    
T  15146752 ctttctgtgcttccttcatacttttca-gaaattcactatcaatcttcaacattcctagtttcacactctgagatgaccactcacaaactaagctcaaat 15146654  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||||||||| || ||||| ||| | |||||  |||| ||||| || ||||| ||    
T  15146653 ctctaaactgttcaagcaactcaaactctttaaccatcatagcggacatatgcaacgtcttcctactcgaggcatctacaacaacattagctttacctgg 15146554  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  15146553 atgataattcaaaccaaagtcataat 15146528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 431
Target Start/End: Original strand, 9292066 - 9292200
Alignment:
Q  297 acaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacat 396  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||    
T  9292066 acaaaactcaagtctcgaaactgctcaaccaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacat 9292165  T
Q  397 tggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatca 431  Q
    | ||| | |||||||| ||| |||||  |||||||    
T  9292166 tagccctcccaggatgataactcaagtgaaaatca 9292200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Original strand, 14998552 - 14998716
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||||| || ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  14998552 actcaagtatcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagcc 14998651  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||| ||||||||    
T  14998652 ttcccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatcttctctgcct 14998716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 403
Target Start/End: Original strand, 13248881 - 13248982
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  13248881 actcaagtctcgaaactactcaaacaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagcc 13248980  T
Q  402 tt 403  Q
    ||    
T  13248981 tt 13248982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1639495 - 1639367
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||  || |  || |||||||| | ||||    
T  1639495 caaatcatgatacatcttcgtagctctcgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatctccttaatctcttcattgtctgaaata 1639396  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacacc 136  Q
    |||| ||| ||||  ||||||| ||||||    
T  1639395 caaattctacctcgaaacctcaacacacc 1639367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 15292194 - 15292075
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||| ||||| ||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  15292194 actcaaatctcgaaacttctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 15292095  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || || ||||| ||| ||||    
T  15292094 tttccgggatgataactcaa 15292075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 16354512 - 16354447
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaat 76  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||    
T  16354512 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 16354447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 12457572 - 12458030
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12457572 caaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatcatcgttgtcaggaata 12457671  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||    
T  12457672 caaactcttcctctaaacctcagcacaccttggtcatcaaccttaaaatcactatcctcagtgtcattacccgtatttatcaaatccacaaacttcaaat 12457771  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12457772 ctacttgctgagcttctcgaatactgttcaagaaatcactatcaatcttcagcatccccaactatatactctgaggtgacaattcacggacaagactcaa 12457871  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12457872 gtctctaaattgctccagcaactcaaattcttttatcatcaaagcagacatatgcaatgtttttctgctcaaagcatcagcaactacattggccttacca 12457971  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  12457972 ggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcagtaactctaaccatctcctttgcct 12458030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 13022289 - 13022747
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13022289 caaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcttcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaata 13022388  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| | |  ||| |||||||||||||| | ||    
T  13022389 caaactcttcctctgaacctcagaacaccctgatcataaaccttgaagtcactatcctctgtctcattacccgcaaccattaaatcaacaaactttacat 13022488  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13022489 ccacttgctgcgcttctcggatactattcaagaaattactattaatcttcagcatccccaattgtatactctgaggtgacaattcacaaacaaggctcaa 13022588  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13022589 gtctctaaactgttctagcaaatcaaattctcttaccatcaaagcagacatatgtaatgttttcctgctcaacgcatcagcaaccacattggctttacca 13022688  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  13022689 gggtggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatctcctctgcct 13022747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13967985 - 13967527
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||||| |||||    
T  13967985 caaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcgagaatcaaattcttcaaatcatcactgtcaagaata 13967886  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13967885 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttaaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 13967786  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  13967785 ccgctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctaaggtgacaattcacagacaagactcat 13967686  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13967685 gtctctgaactgttctaacaattcaaattctttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttccgggttaaagcatcagcaacaacattggccttacca 13967586  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| |||||||||||    
T  13967585 ggatggtaatttaagccaaaatcataatccttcaataactctaaccacctcctctgcct 13967527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 724 - 265
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  724 caaatcatggtacatctttgttgctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaata 625  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| | ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  624 caaatttttcttctgaacctcataacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgtcattacccgtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 525  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  524 ctacttgctgagcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgaatactctgaggtgtcaactcatagacaagactcaa 425  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgca-tcagcaaccacattggccttacc 406  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |||||| |||||||| |||||    
T  424 gtctctaaactgttctagcaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctgcgcaacgcatttagcaacaacattggctttacc 325  T
Q  407 aggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  324 aggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacagttctaaccatcttctctgcct 265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 26117922 - 26117464
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  26117922 caaatcatggtacattttagtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattatcaggaata 26117823  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26117822 caaactttacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 26117723  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||     
T  26117722 ccactttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaattttcaacattcccaaatgtatactctggaatgacaattcacagacaagactcat 26117623  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| | |||     
T  26117622 gtctctgaaatgttctagcaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctgctcaaagcatcagccacaacattggcttaaccc 26117523  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26117522 ggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcagtaactctaaccatctcctctgcct 26117464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 11305580 - 11305122
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  11305580 caaatcatgatacatttttgtagcccctgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaata 11305481  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11305480 caaactctacctctgaacctcagtacaccttgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcgttaccagaagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 11305381  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  11305380 cttctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaattcacagacaagactcat 11305281  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||| ||||| |||| ||| ||||| || || |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11305280 gtctctgaactgttctaacaattcaaactccttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctactcaaagcatcagcaaccacattagccttacca 11305181  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  11305180 ggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactctaaccacctcctctgcct 11305122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16949789 - 16949331
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16949789 caaatcgtggtacatctttgtagctcccgggtgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgttaggaata 16949690  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  16949689 caaattcttcctctaaatctcaaaacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgtcattaccaataatcattaaatcaacaaacttcaaat 16949590  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||||||||||| |||||| ||| |||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16949589 ccacttgctgagcttctcagatactattctagaagtcactattaatcctcagcatccccaactgtatactctgaggtgtcaattcacagacaagactcaa 16949490  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  16949489 gtccctaaactgttctagcaattcaaattccttcaccatcagagcagacatatgcaatgtcttcctgctcaacgcatcagcaaccacattggttttacca 16949390  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| || ||||||||    
T  16949389 ggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacagctctaaccaccttctctgcct 16949331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 49153233 - 49153691
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  49153233 caaatcatgatacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaata 49153332  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  49153333 caaactctacctctgaacctcagaacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcaacaaatcaacaaacttcaaat 49153432  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||     
T  49153433 cctctttctgagcttctcggatactgttcaaaaagttactatcaattttcaacattcccaactgaatactctggggtgaccattcacagacaaggctcat 49153532  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  49153533 gtctctgaactgttctagcaattcgaactccttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctactcaaagcgtccgcaaccacattggccttacca 49153632  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||| |||||||||||    
T  49153633 ggatggtaattcaagccaaaatcaaaatctttcagtaactctaaccacctcctctgcct 49153691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15101920 - 15101462
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||| || || | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  15101920 caaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcgttatcaggaata 15101821  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||| |||||| | ||    
T  15101820 caaattcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtgtcattaccaacaaccatcaaatcaataaacttgacat 15101721  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15101720 ccacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactgttaatcttcaacatacccaactgtacactctgaggtgacaactcacagacaagactcaa 15101621  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||||||||| || |||||     
T  15101620 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcctgctcagagcatctgcaaccacattagctttaccc 15101521  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || |||| |||||| ||||||||    
T  15101520 ggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacagctctagccatcttctctgcct 15101462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 13666469 - 13666927
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||| || || | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13666469 caaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaatcatcattatcaggaata 13666568  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||    
T  13666569 caaattcttcctctgaacctcaacacatcctgatcatcaaccttaaagtcactatccttagtgccattaccagcaaccattaaatcaacaaacttcacat 13666668  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    ||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  13666669 ctacttgttgtgcttctcggatgctattcaagaaataactgttaatcttcagcatccccaactgaacactttgaggtgtcaattcacagacaaagctcaa 13666768  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| |||| |    
T  13666769 gtctctaaactgctctaacaaatcaaattattttaccatcaaagcagacatatgcaacgttttcctactcaaggcatttgcaaccacgttggctttacta 13666868  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||  || |||||||| |||||||||||    
T  13666869 ggatggtaattcaaactaaaatcataatccttcaacagctctaaccacctcctctgcct 13666927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14285693 - 14285235
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||  |||||||| |||| || || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14285693 caaatcatggtacatttttgtagctccaggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaata 14285594  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    ||||  || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||| | ||| | ||    
T  14285593 caaatcctccctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtgccattaccagcaatcatcaaatcaaccagcttgacat 14285494  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | | |||||| |||||||| |||||   |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||     
T  14285493 ccagttgctgtgcttctcgaatactacccaagaaatcactattaatcttcagcatgcccaactgtatactctgaggcgacaactcacataccaggctcat 14285394  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||    
T  14285393 gtctctaaactgttccagcaaatcaaattcttttaccatcatagcagacatatgcagtgtcttcctgctcaacgcatcagcaactacgttagctttacca 14285294  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  || |  || ||||||||||||||||||||    
T  14285293 ggatggtaattcaacccaaaatcataatcttttaacagctctaaccatctcctctgcct 14285235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 318
Target Start/End: Original strand, 12456634 - 12456944
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12456634 caaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaata 12456733  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12456734 caaattcttcctctgaaccttagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcaatgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcgaat 12456833  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||    
T  12456834 ccacttgccgagcttctcggatactattcaagaaatcattattaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaactcacaaacaaggctcaa 12456933  T
Q  308 gtctctaaact 318  Q
    |||||||||||    
T  12456934 gtctctaaact 12456944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 15341363 - 15341790
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| || | ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15341363 caaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgaatttcttctaaaattaactttttcaattcttcattgtcaggaata 15341462  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||  || ||||||||| | ||||||||||||| | ||| | ||    
T  15341463 caaattctacctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactattttctttgccattaccagcaatcatcaaatcaaccagcttgacat 15341562  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||     
T  15341563 ccacttgctttgcttctcggatactactcaagaaatcactattaatcttcagcatgcccaactgtatactctgagtcgacaactcacataccagactcat 15341662  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  15341663 gtccctaaactgttccagcaaatcaaattcttttatcatcatagcagacatatgcagcgtcttcctgctcaatgcatcagcaactacattagctttacca 15341762  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15341763 ggatggtaattcaaaccaaaataataat 15341790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 16071611 - 16071179
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||||  |  | || || || | |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  16071611 caaatcatggtatatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctatggctttcctctaaaatcaacttttt-aaatcatcattatcatgaata 16071513  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||  | ||||| || |  ||| |||||||||||||| | ||    
T  16071512 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcaccatcttcagcttgattactagcaaccattaaatcaacaaacttgacat 16071413  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | | |||  | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16071412 ccatttgacgtgcttctcggatactattcaagaaattactattaatcttcagcatacccaactgtacactctgaggtgacaactcacaaacaagactcaa 16071313  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||    
T  16071312 gtctctaaactgttctagtaactcaaactcctttaccatcatagcagacatgtgcaatgtcttcctgctcaaagcatctacaaccacattagctttacca 16071213  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16071212 gaatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 16071179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 74 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 14263495 - 14263136
Alignment:
Q  74 aatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtca 173  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  14263495 aatcaactttttcaaatcatcactatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttca 14263396  T
Q  174 ttaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgta 273  Q
    |||| ||||  ||| |||||||| ||||| | ||| ||||| || ||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14263395 ttactagtaaccattaaatcaacgaacttgacatcaacttgttgtgcttctctgatactactcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgta 14263296  T
Q  274 tactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcct 373  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| || |||||||| | || | |||| || || || |||||    
T  14263295 aactctgaggtgacaactcacaaacaagacttaagtctctaaactgttcaagtaactcaaactcctttaccattatagtagacatgtgtaacgtcttcct 14263196  T
Q  374 gctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14263195 gctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaacccaaaatcata 14263136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 433
Target Start/End: Original strand, 19148147 - 19148568
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||  || |  || |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19148147 tcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctatttatgtgactttcttctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaa 19148246  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| | ||||| || |  ||| ||| | |||||||| | ||| ||    
T  19148247 ttcttcctctgaacctcaacataccctgatcatcaaccttgaaatcaccatcttcagtttgattactagcaaccattaaacccacaaacttgacatcaac 19148346  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  19148347 ttgctgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaattttcagcatacccatctgtacactctgaggtgacaactcacaaacaagacccaagtct 19148446  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  19148447 ctaaactgttcaagcaactcaaattcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggat 19148546  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
    | |||||||| |||||||||||    
T  19148547 gataattcaatccaaaatcata 19148568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 433
Target Start/End: Original strand, 20747546 - 20747967
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||  || |  || |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20747546 tcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctatttatgtgactttcttctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaa 20747645  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| | ||||| || |  ||| ||| | |||||||| | ||| ||    
T  20747646 ttcttcctctgaacctcaacataccctgatcatcaaccttgaaatcaccatcttcagtttgattactagcaaccattaaacccacaaacttgacatcaac 20747745  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  20747746 ttgctgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaattttcagcatacccatctgtacactctgaggtgacaactcacaaacaagacccaagtct 20747845  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  20747846 ctaaactgttcaagcaactcaaattcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggat 20747945  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
    | |||||||| |||||||||||    
T  20747946 gataattcaatccaaaatcata 20747967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 11387741 - 11387287
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| || | || || || | ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11387741 tcatgatacatcttcgtagctcccggatggatacttaagttactcctgtggctttcctctaaaattaactttttcaactcatcattatcaggaatacaaa 11387642  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||| ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| || |||||||||||||  | ||||| ||||  ||| ||||| |||||||| | ||| ||    
T  11387641 ttctgcctctgaacctcaacacgccttgttcatcaaccttgaaatcactatcctcagcttgattactagtaaccattaaatccacaaacttgacatcaac 11387542  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    ||| || ||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11387541 ttgttgcgcttctctgatactattcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaacttcacactctgaggtgacaattcacaaacaagactcaagtct 11387442  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||  |||| ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| ||||| || ||||| ||||    
T  11387441 ctaaactgttcaagcaactcaaattcctttaccatcatagccgacatgtgcaacgtcttcctactcaaagcatctacaactacattagctttacccggat 11387342  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | ||| || ||||||||    
T  11387341 ggtaattcaatccaaaatcataatccttcaataattcaagccaccttctctgcct 11387287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 385
Target Start/End: Original strand, 14434623 - 14435000
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| || || | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14434623 caaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaattcttcattgtcaggaata 14434722  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |   |||| |||||| ||||| | ||    
T  14434723 caaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtgccattaccagcaacaatcagatcaaccaacttgacat 14434822  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | || ||||| ||||||||||||||  ||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||     
T  14434823 ccacctgctgtgcttctcggatactactcaggaaatcactgttaatcttcagcatgcccaactgtatgctttgaggcgacaactcacataccaaactcat 14434922  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatc 385  Q
    |||||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  14434923 gtctctaaactattccagcaaatcaaattcttttatcatcatagcagacatatgcagtgtcttcctgctcaacgcatc 14435000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 19613607 - 19614065
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||| |||| ||||| | ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||     
T  19613607 caaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttcttccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgtcaggaatg 19613706  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||| || || |||||||||||||  | ||||| | ||   || ||||| |||||||| | ||    
T  19613707 caaattctgcctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagcttgattactattaactattaaatccacaaacttgacat 19613806  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | || || || ||||||| |||||| |||||||| | |||||  || |||| ||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  19613807 caacctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttcatcatacccaactgcacactctggggtgacaattcgcaaacaagactcaa 19613906  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||  |||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  19613907 gtctctaaactgttcaagcaactcaaattcctttaccatcatggccgacatgtgtaacgtcttcctactcaaagcatctgcaactacattggctttaccc 19614006  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19614007 ggatgatagttcaacccaaaatcataatccttcaatagctctaaccatctcctctgcct 19614065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23505187 - 23504760
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||  |||||||  |||| || || || || ||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  23505187 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaata 23505088  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |  ||||||||| |  ||| | |||||| ||||| | ||    
T  23505087 caaattctacctctgaatcttagcacaccctgatcatcaaccttgaagtcattatcttcaataccattaccagcaaccattagatcaaccaacttgacat 23504988  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || |||||||||||||| |||| |||||  || | |||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| || | |||||     
T  23504987 ccacttgttgtgcttctcggatactattcaggaaatcgctgttaatctttagcatccccaactgtacgctttgaggcgacaactcacataccaaactcat 23504888  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||     
T  23504887 gtctctaaactgttccagtaaatcaaattcttttatcatcatagcagacatatgcagcgtcttcctactcaatgcatcagcgactacattagctttgccc 23504788  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23504787 ggatggtaattcaacccaaaatcataat 23504760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18053270 - 18052843
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||  |||||||  |||| || || |  || ||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  18053270 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaagattaactttttcatttcttcattatcaggaata 18053171  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||| |  ||||| |||||| ||||| | ||    
T  18053170 caaattctacctctgaatctcaacacaccctgttcatcaaccttgaagtcactatcttcaacgccattaccagcaaccatcagatcaaccaacttgacat 18053071  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| ||||||||||||||  |||  |||| ||| | |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || | |||||     
T  18053070 ccacttgctgtgcttctcggatactactcagaaaatcactgttaatctttagcatccccaactgtacactttgaggcgacaactcacaaaccaaactcat 18052971  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || |  || ||||||||||| | ||||| |||| ||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||     
T  18052970 gtctctaaactgttccaataaatcaaattctttcatcatcatagcagacatatggagtgtcttcctactcaaagcatccgcgactacattagctttgccc 18052871  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18052870 ggatggtaattcaacccaaaatcataat 18052843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 15204550 - 15204977
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||| ||| || |  || |||| ||||||||||    
T  15204550 caaatcatgatacatcttcgtagcttccggatgaatactcaagctacttttgtgactctcttcaagaatcatcttctttatctcttcatcgtcaggaata 15204649  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||| ||| |||| ||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||| || |  || |||  | |||||||| | ||    
T  15204650 caaattctgcctcggaatctcaacattccctgatcatcgaccttgaagtcactatcttcagtctaattactagcaaccaacaagcccacaaacttaacat 15204749  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||  || ||||||   |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | || |||||| ||||| |||| ||| ||||| | |||||     
T  15204750 caactttatgcgcttctttaatactgttcaagaattcactatcaatcttcagcattcctagctttatactatgaggcgacagttcgcagactaaactcag 15204849  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||  || |||| ||| || ||||| ||||||| |||| ||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || || |||||     
T  15204850 gtctctaaactattcgagcagctccaactctttaaccatcatagcagacatatgtaaagttttcctacttaaggcatctgcaacaacgttagctttacct 15204949  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15204950 ggatgataattcaacccaaaatcataat 15204977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 11771580 - 11771155
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  11771580 caaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtcaggaata 11771481  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||  || |||| ||| || |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| | ||||| || | ||| ||| || |||||||| | ||    
T  11771480 caaattctgcctcgaaatctcaccacgccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgattactagcaatcaacaagtccacaaacttaacat 11771381  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 306  Q
    | | || ||| ||||||   ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||||| || ||||| |  ||||    
T  11771380 caattttctgcgcttctttaatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgaggtgacaactcgcagactaagctca 11771282  T
Q  307 agtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacc 406  Q
    | |||||||| || || ||||| |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||  | ||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  11771281 aatctctaaattgttcaagcaattcaatttcttttaccatcatagcggacatatgcaacatcttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacc 11771182  T
Q  407 aggatggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||    
T  11771181 tggatgatagttcaacccaaaatcata 11771155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 12206106 - 12205692
Alignment:
Q  19 acatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcc 118  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||||| ||  ||||  || |||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12206106 acatctttatagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaaccttttcaactcatcattatcaggaatacaaattcttcc 12206007  T
Q  119 tctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctga 218  Q
    || ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || | ||    || |||||| |||||||| | ||| || | |||     
T  12206006 tcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttggttgctagccaccaacaaatccacaaacttaacatcaacctcctgt 12205907  T
Q  219 gcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaact 318  Q
    ||||||   ||||| ||||| || | ||| |  ||||||| ||| ||||| |  | ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  12205906 gcttctttaatactattcaaaaactcactgttgatcttcaacatacccaatttcacactttgaggtgacaactcacaaactagactcaagtctctaaact 12205807  T
Q  319 gctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaatt 418  Q
    |  | ||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  12205806 gaccaagcaactcaaattctttaaccatcatagctgatatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattggctttacccggatgataatt 12205707  T
Q  419 caagccaaaatcata 433  Q
     || | |||||||||    
T  12205706 taaactaaaatcata 12205692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 425
Target Start/End: Original strand, 15625483 - 15625902
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||  || |||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  15625483 caaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactttcttcaagaatcatcttcttcatctcatcattgtcaggaata 15625582  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatca--accttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaa 205  Q
    |||| ||| ||||  || | || ||| |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| | ||| |||  | |    ||||| |||||||| |     
T  15625583 caaattctgcctcgaaatcgcaacactccctgatcatctcgaccttaaagtcactatcttcagtctgatttccaccaatatataaatctacaaactttac 15625682  T
Q  206 atctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagact 304  Q
    ||| ||||  || ||||||   ||||| || | |||||| |||||||||||||||||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15625683 atccactttttgcgcttctttaatactattga-gaaattcactatcaatcttcagcattcctaacttcacaatctgaggtgacaattcacagactagact 15625781  T
Q  305 caagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcctta 404  Q
    ||  ||||||||||| || |||| ||| || ||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| || || ||||| ||||| |||||  | |||    
T  15625782 cagatctctaaactgttcgagcagctccaactctttaaccatcatagcagacatatgtagagttttcctacttaaagcatctgcaacaacattatcttta 15625881  T
Q  405 ccaggatggtaattcaagcca 425  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  15625882 cctggatgataattcaagcca 15625902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 10871927 - 10872353
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  10871927 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 10872026  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || | ||| ||| || |||||||| | |||    
T  10872027 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatc 10872126  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||| |  | ||||||||||| | ||||||| || | ||||||    
T  10872127 aactttctgtgcttccttgatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatatccaatttcacactctgaggtgtccattcacaaaccaaactcaa 10872225  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  10872226 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 10872325  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||    
T  10872326 ggatgataatccaacccaaagtcataat 10872353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 44790689 - 44790257
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  44790689 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 44790590  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  44790589 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 44790490  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||| ||||||||| |||| || || | |||||     
T  44790489 aactttctgtgcttccttgatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactttgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 44790391  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  44790390 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctttgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 44790291  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  44790290 ggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 44790257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 11236551 - 11236125
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  11236551 aaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 11236452  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  11236451 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatc 11236352  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     ||   ||| |||||   |||||| |||| ||| | ||||||||| |||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||      
T  11236351 aaccctctgcgcttccttgatacttttcaggaattcactatcaattttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcata 11236252  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  11236251 tctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctg 11236152  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  11236151 gatgataattcaaaccaaagtcataat 11236125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 434
Target Start/End: Original strand, 12688433 - 12688857
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| ||| || |  || |||| |||  ||||||    
T  12688433 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctgtgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcat-gtctagaatac 12688531  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||| | || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| |||||    
T  12688532 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcaatgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttaaatc 12688631  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  12688632 aactttctgtgcttccttgatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 12688730  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| || || ||||| || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  12688731 atctctgaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 12688830  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataa 434  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  12688831 ggatgataattcaaaccaaagtcataa 12688857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 466
Target Start/End: Original strand, 14955490 - 14955943
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| |     |||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| |||||||    
T  14955490 aaatcatgatacatcttcgtagctca----tgaatactcaagctactcctgtgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatac 14955585  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  14955586 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 14955685  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||| ||||||| |||| || || | |||||     
T  14955686 aactttctgtgcttccttgatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacactctaaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 14955784  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| || || ||||| || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  14955785 atctctgaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 14955884  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||  | ||| | ||| |||||||||||    
T  14955885 ggatgataattcaacccaaaatcataatccttcaacaattcaagccacctcctctgcct 14955943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 8708537 - 8708963
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  8708537 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 8708636  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  8708637 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 8708736  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||| | |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  8708737 aactttctgtgcttccttgatatttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 8708835  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||||  ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  8708836 atctctaaactgttcaagcaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaacgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 8708935  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  8708936 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 8708963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 466
Target Start/End: Original strand, 9596989 - 9597446
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| ||||  ||  ||| ||||||||| |    
T  9596989 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctctgcatcgtcaggaatgc 9597088  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    |||  |  |||| ||| |||| |||||| || ||||| |  ||||||||||  || ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  9597089 aaatccgacctcggaatctcaacacaccttggtcatcgattttaaagtcaccgtcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatc 9597188  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
      |||  || || |||   ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| ||||||| || | |||||     
T  9597189 agctttttgtgcctctttaatactcttca-gaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcat 9597287  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || || || || || ||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  9597288 atctctaaactgttcaagtaattcgaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttcatgctcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 9597387  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  9597388 ggatgataattcaaaccaaagtcataatctttcagtagttctagccatctacgctgcct 9597446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15160395 - 15159969
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||| |  ||||||||||||||||||  || || |  || |||||||| || ||||    
T  15160395 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactaaatatactcctatgactctcttcaagaatcattttcttaatctcttcattgtctgggatac 15160296  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||  || |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  15160295 aaattcttcctcggaatctcagcacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaacttgacatc 15160196  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     |||| ||| |||||   |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||     | ||||||||||||| |||| || || | |||||      
T  15160195 aactttctgcgcttccttgatacttttcaggaattcactatcaatcttcagcatacccagtctcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcata 15160096  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  15160095 tctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctg 15159996  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||    
T  15159995 gatgataattcaagccaaagtcataat 15159969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 8199562 - 8199986
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||||    
T  8199562 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaa 8199661  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  8199662 attcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtctacaaactttacatcaa 8199761  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| |||||   |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||  |    
T  8199762 ctttctgtgcttccttgatacctttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatat 8199860  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  8199861 ctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 8199960  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  8199961 atgataattcaaaccaaagtcataat 8199986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 321376 - 320949
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  ||||  |   ||| |||||||||||||  || ||||  ||||||| ||| ||||||    
T  321376 caaatcatgatacatcttcgtagctcctggatggatactcaagctacttctatcactttcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaata 321277  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||  ||| ||| |||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||| || ||||| | ||||| || |  || ||| || |||| ||| | ||    
T  321276 caaattctatctcggaatctcaacacaccttgatcatcaattttaaaatcactgtcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaagcttaacat 321177  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||  || ||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| || |||||||| ||| || | ||||||    
T  321176 caactttttgtgcttctttaatactcttcaagaaatcactatcaatcttcagcatccctaacttcacactcttagatgacaattaacataccaaactcaa 321077  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| |||| ||| |||||||| || || || ||||||| |||  |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  321076 atctctgaactactccagcaactcgaactccttcaccatcatagcggacatatgcaaagtcttcctacttaaggcatccgcaacaacattagctttaccc 320977  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| ||  ||||  ||||||||||||    
T  320976 ggatgatagctcaattcaaaatcataat 320949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 14333328 - 14333754
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||| | || ||||    
T  14333328 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgcctgggatac 14333427  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| ||||||  ||||||| |  ||||| ||||  || ||||| | ||  | || |  || ||| || ||| |||| | |||    
T  14333428 aaattcttcctcggaatctcaacacacctagatcatcgattttaaaatcaccgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacacactttacatc 14333527  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  14333528 aactttctgtgcttccttgatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccaatttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 14333626  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  14333627 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 14333726  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  14333727 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 14333754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16420 - 16230
Alignment:
Q  245 actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttacc 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |  |  |||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||| | |||    
T  16420 actatcaatcttcagcattcccagtttcactctctgaggtgaccattcacaaactaaactcaaatctctgaactgttcaagtaactcaaactctctaacc 16321  T
Q  345 atcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  16320 atcaaagcggacatatgcaatgtcttcctgctcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataat 16230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23202951 - 23202525
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| ||||| |    
T  23202951 aaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatgc 23202852  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    | | |||||||| ||| |||| |||||| ||||||||     |||| |||||||| ||||| | ||  | || |  |  | | || |||||||||| |||    
T  23202851 atattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcggttctaaaatcactatcttcagtctgatctctagcaaccgacgagtccacaaacttcacatc 23202752  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    ||||| ||| |||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  23202751 tactttctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 23202653  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| || || ||||| || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||| || |||||     
T  23202652 atctctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacatcattagctttaccc 23202553  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| | |||||| ||||| |||||||    
T  23202552 ggatgatgattcaaaccaaagtcataat 23202525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23509078 - 23508652
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| ||||| |    
T  23509078 aaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatgc 23508979  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    | | |||||||| ||| |||| |||||| ||||||||     |||| |||||||| ||||| | ||  | || |  |  | | || |||||||||| |||    
T  23508978 atattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcggttctaaaatcactatcttcagtctgatctctagcaaccgacgagtccacaaacttcacatc 23508879  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    ||||| ||| |||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  23508878 tactttctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 23508780  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| || || ||||| || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||| || |||||     
T  23508779 atctctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacatcattagctttaccc 23508680  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| | |||||| ||||| |||||||    
T  23508679 ggatgatgattcaaaccaaagtcataat 23508652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 8211444 - 8211346
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  8211444 aaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctccagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaata 8211346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 13686996 - 13687422
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || || |  || |||||||| || ||||    
T  13686996 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttaatctcttcattgtctgggatac 13687095  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||  || |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  13687096 aaattcttcctcggaatctcagcacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaacttgacatc 13687195  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||     | |||||||||||||  ||| || || | |||||     
T  13687196 aactttctgcgcttccttgatact-ttttagaaattcactatcaatcttcagcatacccagtctcacactctgaggtgacctttcgcaaaccaaactcat 13687294  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || |||||     
T  13687295 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatatgcaacaacattagctttacct 13687394  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13687395 ggatgataattcaagccaaagtcataat 13687422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 18178674 - 18179100
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||| ||||||||||||| ||| || |  || |||||||| ||||| |    
T  18178674 aaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactttcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatgc 18178773  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |   |||| ||||| || | ||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  18178774 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattctaaaatcactgtctttagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 18178873  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  |  |||||||||||| ||||||| || | |||||     
T  18178874 aactttctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacgctctgaggtgaccattcacaaaccaaactcat 18178972  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| || || || || || || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  18178973 atctctgaaatgttcaagtaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 18179072  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  18179073 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 18179100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18551096 - 18550670
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||| | ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  18551096 aaattatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaattatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 18550997  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||  || |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  18550996 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 18550897  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||| | |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  18550896 aactttctgtgcttccttgatatttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 18550798  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||||  ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  18550797 atctctaaactgttcaagcaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaacgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 18550698  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  18550697 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 18550670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Original strand, 14040626 - 14041024
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||| |||  || ||||  ||||||  ||| ||||||    
T  14040626 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaaactacttctatgactctcttcaagattcattttcttcatctcatcagcgtctggaata 14040725  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| | ||||| |  |  || |||||| |||||||| | ||    
T  14040726 caaattctacctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgattactaacaaccaacaaatctacaaacttaacat 14040825  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 306  Q
    | | || ||  ||||||   ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || | ||  | ||||| || |||||| ||||| || | ||| |    
T  14040826 caaatttctctgcttctttaatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcattcctagcttcacactctaagatgacaactcacatactaaactta 14040924  T
Q  307 agtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacc 406  Q
    | ||| ||||||| || | |||||| || ||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||| || || |||||  |||| ||||| || |||||    
T  14040925 aatctgtaaactgttccaacaactcgaactcttttaccatcatagcgggcatatgcaatgtcttcctacttaaggcatctacaacaacattagctttacc 14041024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Original strand, 14350656 - 14351054
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||| |||  || ||||  ||||||  ||| ||||||    
T  14350656 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaaactacttctatgactctcttcaagattcattttcttcatctcatcagcgtctggaata 14350755  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| | ||||| |  |  || |||||| |||||||| | ||    
T  14350756 caaattctacctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgattactaacaaccaacaaatctacaaacttaacat 14350855  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 306  Q
    | | || ||  ||||||   ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || | ||  | ||||| || |||||| ||||| || | ||| |    
T  14350856 caaatttctctgcttctttaatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcattcctagcttcacactctaagatgacaactcacatactaaactta 14350954  T
Q  307 agtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacc 406  Q
    | ||| ||||||| || | |||||| || ||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||| || || |||||  |||| ||||| || |||||    
T  14350955 aatctgtaaactgttccaacaactcgaactcttttaccatcatagcgggcatatgcaatgtcttcctacttaaggcatctacaacaacattagctttacc 14351054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 11552439 - 11551983
Alignment:
Q  10 aatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaataca 109  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| || ||||||| |||||||||| ||| || |  || |||||||  ||||||||    
T  11552439 aatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctgtgactctcctcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtatggaataca 11552340  T
Q  110 aactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatct 209  Q
    || |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || || || | ||  | || |  || ||| || |||||||| | ||      
T  11552339 aattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcggtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatga 11552240  T
Q  210 acttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
    |||| ||| |||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||| ||||||| |||  || || | |||||      
T  11552239 actttctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcattcccaatttcacactctaaggtgaccatttgcaaaccaaactcata 11552141  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    | ||| ||||| || |  ||||| || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||      
T  11552140 tatctgaactgttcaactaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtctttttactcaaggcatctgcaacaacattagctttaccta 11552041  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||| |||||||| ||||| | ||||| |||||| | ||| | |||||| ||||||||    
T  11552040 gatgataattcaaaccaaagttataatccttcagcaattcaagccatcttctctgcct 11551983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 14212606 - 14213032
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||     ||||||||||||||||||  || ||||  ||  ||| ||| |||||||    
T  14212606 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctacttcgatgactctcttcaagaatcattttcttcatttctgcatcgtcgggaatac 14212705  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    |||  |  |||| ||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||  || ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  14212706 aaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcatcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatc 14212805  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| || |||   ||||| || | |||||| | |||||||||||||||| ||||  |  |   ||||||||||| ||||||| || |  |||||    
T  14212806 aactttctgtgcctctttaatactcttta-gaaattcattatcaatcttcagcattcccagtttcactttctgaggtgaccattcacaaaccaagctcaa 14212904  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| || || || || |||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||| || |||||     
T  14212905 atctctgaattgttcaagtaactcaaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctgctcaaagcatctgcaacaaaattagctttacct 14213004  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  14213005 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 14213032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 105
Target Start/End: Original strand, 14130805 - 14130902
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| || || | ||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  14130805 caaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaattcttcattgtcaggaa 14130902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Original strand, 13455972 - 13456091
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||    
T  13455972 actcaaatctctaaactgctcaatcaactccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtcttcctactcaaagcatcaacaacaacattcgcc 13456071  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || || ||||| ||| ||||    
T  13456072 tttccgggatgataactcaa 13456091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Original strand, 14937572 - 14937691
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||||| || || || ||||| |||||| |||| ||||| |||    
T  14937572 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaattctttaaccatcaaagcagacatttgcaaagtctttctactcaaagcatcaacaacaacattcgcc 14937671  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || |||||||| ||| ||||    
T  14937672 tttccaggatgataactcaa 14937691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Original strand, 15365165 - 15365284
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||||| || || || ||||| |||||| |||| ||||| |||    
T  15365165 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaattctttaaccatcaaagcagacatttgcaaagtctttctactcaaagcatcaacaacaacattcgcc 15365264  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || |||||||| ||| ||||    
T  15365265 tttccaggatgataactcaa 15365284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15153993 - 15153835
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||||||  ||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| ||| |||||||||    
T  15153993 atcatgatacatcttcatagctcccggatggatactcaagctactcctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaa 15153894  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagt 169  Q
    |  || ||||  ||||||| |||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||    
T  15153893 atcctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagt 15153835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Original strand, 7825125 - 7825289
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  7825125 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 7825224  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||| ||||||||    
T  7825225 tttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatcttctctgcct 7825289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 27106819 - 27106655
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  27106819 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 27106720  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||| ||||||||    
T  27106719 tttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatcttctctgcct 27106655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Original strand, 27171506 - 27171670
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  27171506 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 27171605  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||| ||||||||    
T  27171606 tttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatcttctctgcct 27171670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15147987 - 15147820
Alignment:
Q  245 actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttacc 344  Q
    |||||||||||||||||| || |  |  | ||||||||||||| ||||||| || |  ||||| || |||||||| || |||||||| || ||  | |||    
T  15147987 actatcaatcttcagcattcctagtttcacactctgaggtgaccattcacaaactaagctcaaatcactaaactgttcaagcaactcgaactccctaacc 15147888  T
Q  345 atcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatg 412  Q
    |||| |||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  15147887 atcatagcagacatatgcaaagtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatg 15147820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16270997 - 16270539
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16270997 caaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaata 16270898  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| || |||| ||    
T  16270897 catactcttcctctgaacctcagtacaccctgatcatcaaccttaaaatcacggtcctcggtgtcactaccagttgtcatcaaatcaaccaatttcacat 16270798  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16270797 ccgctttctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacagttcacagacaagactcaa 16270698  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16270697 gtctctaaactgttctaacaactcgaattcttttaccattaaagcagacatgtgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 16270598  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  16270597 ggatggtaattcaagccaaaatcataatcctttagtaactctaaccatctcctctgcct 16270539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 29303199 - 29302741
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  29303199 caaatcatgatacatctttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctctacaagaatcaatttcttcaaatcatcattgtcaggaata 29303100  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29303099 caaactcttcatctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattgccagatgtcatcaaatcaacaaacttcaaat 29303000  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29302999 ctatttgctgagcttctcggatactgtttaagaaatcactatcaatcttcagcatccccaaccgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 29302900  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || | ||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29302899 gtctctaaactgttccaacaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatatgcaatgttttcctgcttaacgcatctgcaaccacattagccttacca 29302800  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  29302799 ggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatctcctctgcct 29302741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 12305766 - 12306224
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  12305766 caaatcatggtacattttagtagcccccgggtgaatactcaacctactcttatgactctcttcaagaattaacttcttcaactcatcattgtcaggaatg 12305865  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  12305866 catactcttcatctgaacctcaaaacaccctgatcatcaaccttaaaatcactgtcctcagtgtcactaccagtagtcatcaaatcaaccaatttcaaat 12305965  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12305966 ctgctttctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcaacatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagactagactcaa 12306065  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12306066 gtctctaaactgttctaacaactcgaattcttttaccattaaagcagacatatgcaatgttttacagctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 12306165  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||||    
T  12306166 ggatggtaattcaagccaaaatcataatcctttagtaactataaccatctcctctgcct 12306224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 14566150 - 14566608
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  14566150 caaatcatgatacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctacttttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaata 14566249  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14566250 caaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttaaaatcactatcctcagtgtcgttaccagaagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 14566349  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  14566350 cttctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaattcacagacaagactcat 14566449  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||| ||||| |||| ||| ||||| || || |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14566450 gtctctgaactgttctaacaattcaaactccttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggccttacca 14566549  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  14566550 ggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactctaaccacctcctctgcct 14566608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 6604666 - 6605124
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6604666 caaatcatgatacatttttgtagcttccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaata 6604765  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6604766 cagactctacccctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcaccaaatcaacaaacttcaaat 6604865  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |  | |  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  6604866 cctccttttgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaatcttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaattcacagacaagactcat 6604965  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||| ||||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6604966 gtctctgaactgttctaacaactcgaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggccttacca 6605065  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  6605066 ggatggtaattcaagccaaaatcaaaatctttcagtaactctaaccatcttctctgcct 6605124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 31416247 - 31415786
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31416247 caaatcatggtacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaata 31416148  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  31416147 caaattcttcctctgaatctcaatacgccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgtcattaccagtaatcattaaatcaacaaacttcaaat 31416048  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  31416047 ccacttgctgagcttctcggatactattcaagaattcactattaatcttcagcatccccaactgcacactctgaggtgtcaactcactgacaagactcaa 31415948  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaa---agcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcctta 404  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  31415947 gtccctaaactgttctagcaattcaaattccttcaccatcaaagcagcagacatatgcaatgtcttcctgctcaacgcgtcagcaaccacattggcttta 31415848  T
Q  405 ccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  31415847 ccagaatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacagttctaaccatcttctctgcct 31415786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 27355556 - 27356002
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||  || ||| |||||  |||||||||||    
T  27355556 caaatcatgatacatctttgtagcccccgggtgtatactcaatctactcttgtgactatcttcaagaatcaaccctt-caactcatcgctgtcaggaata 27355654  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27355655 caaactctccctctgaatctcagtacaccctgatcatcaaccttaaagtcactgtcctcagcgtcactaccagtagtcattaaatcaacaaatttcaaat 27355754  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  27355755 ctgctttctgagcttctcggatactattcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacagttcacagacaagactcag 27355854  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||    
T  27355855 gtctctaaactgttctaacaactcgaattctttcaccattaaagcagacatgtgcaatgttttcctgct-----------caaccacattggccttacca 27355943  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  27355944 ggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatcttctctgcct 27356002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 8 - 431
Target Start/End: Original strand, 6680119 - 6680542
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6680119 caaatcatgatacatttttgtagcttccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaata 6680218  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6680219 cagactctacccctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcaccaaatcaacaaacttcaaat 6680318  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |  | |  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  6680319 cctccttttgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaattcacagacaagactcat 6680418  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||| ||||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6680419 gtctctgaactgttctaacaactcgaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggccttacca 6680518  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6680519 ggatggtaattcaagccaaaatca 6680542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 23655935 - 23656362
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23655935 caaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgaccttcttccagaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatg 23656034  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  23656035 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacat 23656134  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23656135 ccacttgttgtgcttctcggatactactcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgtatactctgaggtgacaactcacagacaagactcaa 23656234  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  23656235 gtctctaaactgttctagcaaatcaaattcttttaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttaccc 23656334  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  23656335 ggatagtaattcaaaccaaaatcataat 23656362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 803446 - 803064
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  803446 caaatcatggtacatctttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctctagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaata 803347  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  803346 caaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcgttaccagaagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 803247  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  803246 cttctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaattcacagacaagactcat 803147  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaa 390  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  803146 atctctgaactgttctaacaactcaaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctactcaaagcatcagcaa 803064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 1267246 - 1267673
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1267246 caaatcatggtacatctttgtagctcctggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaata 1267345  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | ||| | ||    
T  1267346 caaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagcaaccatcaaatcaaccagcttgacat 1267445  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  1267446 ccacttgatgtgcttctcggatactgctcaagaaatcactgttaatcttcagcatccctaattgtatactttgaggtgataactcacagactagactcaa 1267545  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||     
T  1267546 atctctaaactgctctagcaaatcaaattcttttatcatcatagcagatatatgcagtgtcttcctcctcaacgcatctgcaaccacattgactttaccc 1267645  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1267646 agatggtaattcaaaccaaaatcataat 1267673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 22051871 - 22052298
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| || || | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22051871 caaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaacctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaattcttcattgtcaggaata 22051970  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || | |||| |||||||| | ||| | ||    
T  22051971 caaattctacctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctccgtgccattactagcaatcattaaatcaaccagcttgacat 22052070  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| ||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||     
T  22052071 ccacttgctgtgcttctcggatactacccaagaaatcactattaatcttcagcatgcccaactatatgctttgaggcgacaactcacataccagactcat 22052170  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  22052171 gtctctaaactgttccagcaaatcaaattcttttaccatcatagcagacatatgcagtgtcttcctgctcaatgcatcagcaactacgttagctttacca 22052270  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22052271 ggatggtaattcaaaccaaaatcataat 22052298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 20975424 - 20974971
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||  |||||||| |||| || || | |||||||||||||||| ||||||  ||||||||     
T  20975424 caaatcatgatacattttcgtagctcccgtatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaaccatcatcatcaggaatg 20975325  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||    
T  20975324 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccattaaatcaacaaacttcacat 20975225  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| |  |||||||  ||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20975224 ccacttgttttgcttctcttatactattcaagaaatcacttttaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaa 20975125  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| ||||| || |  |||||||| |||     |||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20975124 ctctctaaactgttctagaaaatggaattctttcacc-----agcagacatatgcagcgttttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttacca 20975030  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||| |||||||| || | |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  20975029 ggatggtaattcaaaccaaaatcgtagtccttcaacagctctaaccatctcctctgcct 20974971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 20985316 - 20984895
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||  ||||  || |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  20985316 tcatgatacatctttgtagctctcgggtgaatacttaagatacttctgtgactttcttccaaaatcaactttttcaactcatcatttttaggaatacaaa 20985217  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| ||||   || |||||||||||||| | ||| ||    
T  20985216 ttcttcctctaaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttcattactagtaactattaaatcaacaaacttgacatcaac 20985117  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20985116 tttctgtgcttctctgatactgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaactgcacactctgaggtgacaactcacaaacaagactcaagtct 20985017  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||| |||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  20985016 ctaaactgctatagcaactcaaactcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtctttctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacccggat 20984917  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  20984916 ggtaattcaacccaaaatcata 20984895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 441
Target Start/End: Original strand, 21841429 - 21841858
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||  ||||  || |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21841429 tcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaa 21841528  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| | ||||| || |  ||| ||||| |||||||| | ||| ||    
T  21841529 tccttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcaccctcttcagtttaattactagcaaccattaaatccacaaacttgacatcaac 21841628  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    ||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  21841629 ttgttgtgcttctctgatactgttcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgtacactctgaggtgacaactcacaaacaagacttaagtct 21841728  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||| |  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  21841729 ctaaactgctctagcaactcaaactcctttaccatcatagcagacatgtttaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggat 21841828  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    |||||||||| |  |||||||||| |||||    
T  21841829 ggtaattcaaacagaaatcataatccttca 21841858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 466
Target Start/End: Original strand, 19852423 - 19852877
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||  ||||  || |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  19852423 tcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatgcaaa 19852522  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||| | | ||| || | |||| ||||| |||||||| | ||| |     
T  19852523 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcatccttgaaatcaccatcttcagtttgaatactagcaatcattaaatccacaaacttgacatcaat 19852622  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    || ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  19852623 tttctgcgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaattgtacactctgaggtgacaactcacaaactagactcaagtct 19852722  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  19852723 ctaaactgctcaagcaactcaaactcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttaccggggt 19852822  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    | |||||||| ||||||||||| | |||||  | ||| | |||||| ||||||||    
T  19852823 gataattcaaaccaaaatcatagtccttcaacaattcaagccatcttctctgcct 19852877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 466
Target Start/End: Original strand, 19858459 - 19858913
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||  ||||  || |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  19858459 tcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatgcaaa 19858558  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||| | | ||| || | |||| ||||| |||||||| | ||| |     
T  19858559 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcatccttgaaatcaccatcttcagtttgaatactagcaatcattaaatccacaaacttgacatcaat 19858658  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    || ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  19858659 tttctgcgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaattgtacactctgaggtgacaactcacaaactagactcaagtct 19858758  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    || |||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  19858759 ctgaactgctcaagcaactcaaactcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttaccggggt 19858858  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    | |||||||| ||||||||||| | |||||  | ||| | |||||| ||||||||    
T  19858859 gataattcaaaccaaaatcatagtccttcaacaattcaagccatcttctctgcct 19858913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20009693 - 20009271
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| ||  ||||  || |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  20009693 caaatcatgatacatatttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaagaata 20009594  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||   ||||| ||||  ||| ||||| |||| ||| | ||    
T  20009593 caaattcttcctctgaacctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcaccctcttcagttcgattactagtaaccattaaatccacaagcttgacat 20009494  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | | || ||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  20009493 caattttctgcgcttctatgatattgttcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaattgcacactctgaggtgacaactcacaaactagactcaa 20009394  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||     
T  20009393 gtctctgaactgttcaagcaactcaaactcttttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattag-tttaccg 20009295  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatca 431  Q
    || || |||||||| |||||||||    
T  20009294 gggtgataattcaaaccaaaatca 20009271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 31570615 - 31570188
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||  |||||||  |||| || || || || ||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  31570615 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaata 31570516  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |   ||||||||||  ||| | |||||| ||||| | ||    
T  31570515 caaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaatactattaccagtaaccattagatcaaccaacttgacat 31570416  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||  || | |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||     
T  31570415 ccacttgctgtgcttctcgaatactattcaggaaatcgctgttaatctttagcatccccaactgtatgctttgaggcgacaactcacacaccaaactcat 31570316  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||| | ||||| |||| ||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||     
T  31570315 gtctctaaactgttccagtaaatcaaattctttcatcatcatagcagacatatgaagtgtcttcctactcaacgcatccgcgactacattagcttttccc 31570216  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31570215 ggatggtaattcaacccaaaatcataat 31570188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 251 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21324798 - 21324615
Alignment:
Q  251 aatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaa 350  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  21324798 aatcttcagcatccccaactaaacactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaagtctctaaactgctctagcaaatcaaattctttcaccatc-aa 21324700  T
Q  351 gcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||| ||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21324699 gcagacacatgcaacgttttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcgtaat 21324615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 466
Target Start/End: Original strand, 22371952 - 22372397
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| ||  ||||  || |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| | ||||||||  | |    
T  22371952 tcatgatacatctttgtagctcccaggtgaatacttaagctacttctgtgactttcttctataatcaactttttcaactcatcactatcaggaatgaata 22372051  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| || ||||  |  || || | ||||| || |  ||| ||||| ||||||         |     
T  22372052 ttcttcctctgaacctcaacacacacagatcatcaaccttgaaatcacccttttcggtttgattactagcaaccattaaatccacaaac---------ag 22372142  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    || ||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||| | |||||||| ||||||   ||| |||||||||| ||||    
T  22372143 tttctgcgcttctctgatactgtttaagaaatcactattgatcttcaacatacccaactgcacactctgagatgacaacaaacaaacaagactcaggtct 22372242  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  22372243 ctaaactgttcaagcaactcaaactcttttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaactacattagctttacccggat 22372342  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||| || | ||||||||| | ||||| || ||| | |||||| ||||||||    
T  22372343 ggtaatttaaactaaaatcatagtccttcaataattcaagccatcttctctgcct 22372397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 433
Target Start/End: Original strand, 20389111 - 20389532
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  |||   || |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20389111 tcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacgtatgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatacaaa 20389210  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||| |||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||| || |  || ||| || |||||||| | ||| ||    
T  20389211 ttctgcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttgaatactagcaaccaacaagtcgacaaacttaatatcaac 20389310  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
     | ||  ||||||  |||| |||||||||| | ||| |  ||||||| ||| | |||||  | ||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||     
T  20389311 cttctatgcttctttgatattgttcaagaactcactgttgatcttcaacatactcaacttcacactctgaggcgacaactcacaaactaggctcaagtcc 20389410  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| ||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  20389411 ctaaactgttcaagcaaataaaactctttaaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcctgctcaaagaatctgcaacaacattagctttacctggat 20389510  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
    | |||||||| |||||||||||    
T  20389511 gataattcaaaccaaaatcata 20389532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21166308 - 21165853
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || |||| ||  |||||||||    
T  21166308 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcgttgggaatacaa 21166209  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||  |||| ||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  21166208 attcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtctccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaa 21166109  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    |||  || ||||||  |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| | ||||| || |  ||||  |    
T  21166108 ctttatgtgcttctttgatactcttca-gaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgaggtgaccactcacacactaagctcatat 21166010  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  21166009 ctctaaactgttcaagcaactcgaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 21165910  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||| | ||||||    
T  21165909 atgataattcaaaccaaagtcataatccttcagcaattctagccatctacgctgcct 21165853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 19483837 - 19483410
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| ||||||    
T  19483837 caaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaata 19483738  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    ||||  ||||||| ||| |||| |||||| |||||||| | |||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || |||||| |||||||| | ||    
T  19483737 caaatccttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgatcttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaaatccacaaactttacat 19483638  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||| ||| ||||||  ||| ||  |||  |||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| ||||||| || | |||||     
T  19483637 caactttctgtgcttctttgatgcttctcagaaaatcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcat 19483538  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||  ||||| || || |||||||| ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  19483537 atctcggaactgttcaagtaactcaaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttaccc 19483438  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19483437 ggatggtaattcaacccaaagtcataat 19483410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20395905 - 20395478
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||  || |||| ||||||||||||| ||| || |  ||||||||||| ||||||    
T  20395905 caaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactttcttcaagaatcatcttctttatctcatcattgtcgggaata 20395806  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
     ||| ||| ||||  || | || ||  |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | ||| |||  | |||   |||| |||||||| | ||    
T  20395805 taaattctgcctcgaaatcgcaacaatccctgatcatcaacttttaagtcaccatcctcagtctgattcccaccaatcaaataatctacaaactttacat 20395706  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||| ||| |||||    ||||| ||||| || | ||||| |||||||| ||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| || | |||||     
T  20395705 ccactttctgtgcttccttaatactattcaaaaattcactattaatcttcaacattcccaacttcacactctgaggtgacaattcacaaactaaactcag 20395606  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || |||| ||| || ||||| ||||||| | |  ||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  20395605 gtctctaaactgttcgagcagctccaactctttaaccatcataactgacatatgtaaagttttcctacttaaagcatctgcaacaacattagctttacct 20395506  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20395505 ggatgataattcaacccaaaatcataat 20395478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22377227 - 22376800
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||  || |  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| || |||||||    
T  22377227 caaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctatttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgttaggaata 22377128  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||| ||| |||| ||| ||| ||||||| |  ||||| |||||||| ||||| | ||||| || |  || ||| |  |||||||| | ||    
T  22377127 caaattctgcctcagaatctcaacactcccagatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgattactagaaaccaacaagtgcacaaacttaacat 22377028  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | | || ||| ||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| | || ||  | ||||||||||||||||||||| || | |||||     
T  22377027 caattttctgcgcttctttgatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcacagcttcacactctgaggtgacaattcacaaactaaactcag 22376928  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||  | || || || || ||||| ||||| ||||| || ||||      
T  22376927 atctctaaactgttcaagcaactcaaactcttttaccatcatagcggacatatgcaacatctttctacttaaggcatctgcaacaacattagctttactt 22376828  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
     |||  |||||||| |||||||||||||    
T  22376827 agataataattcaacccaaaatcataat 22376800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22383402 - 22382975
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||  || |  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| || |||||||    
T  22383402 caaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctatttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgttaggaata 22383303  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||| ||| |||| ||| ||| ||||||| |  ||||| |||||||| ||||| | ||||| || |  || ||| |  |||||||| | ||    
T  22383302 caaattctgcctcagaatctcaacactccccgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgattactagaaaccaacaagtgcacaaacttaacat 22383203  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | | || ||| ||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| | || ||  | ||||||||||||||||||||| || | |||||     
T  22383202 caattttctgcgcttctttgatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcacagcttcacactctgaggtgacaattcacaaactaaactcag 22383103  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||  | || || || || ||||| ||||| ||||| || ||||      
T  22383102 atctctaaactgttcaagcaactcaaactcttttaccatcatagcggacatatgcaacatctttctacttaaggcatctgcaacaacattagctttactt 22383003  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
     |||  |||||||| |||||||||||||    
T  22383002 agataataattcaacccaaaatcataat 22382975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 19978978 - 19979402
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || ||||||||| ||||||||    
T  19978978 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcattgtcaagaatacaa 19979077  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||  |||| ||| ||||  ||||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||||  | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  19979078 attcgacctcggaatctcaatacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagcctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaa 19979177  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtc 310  Q
    ||| ||| ||||||  |||||| ||||| || | ||||||||| |||||||| ||||  |  | ||||||||||||| | ||||| || |  ||||  ||    
T  19979178 ctttctgtgcttctttgatactcttcaaaaattcactatcaattttcagcattcccagtttcacactctgaggtgaccactcacaaactaagctcatatc 19979277  T
Q  311 tctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagga 410  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||    
T  19979278 tctaaactgttcaagcaactcaaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtctttatactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgga 19979377  T
Q  411 tggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    || |||||||| ||||| |||||||    
T  19979378 tgataattcaaaccaaagtcataat 19979402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22128730 - 22128304
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||||| || ||||    
T  22128730 aaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaaactacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatatcttcattgtctgggatac 22128631  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || |||||| |||||||| | |||    
T  22128630 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaaatctacaaacttgacatc 22128531  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||  ||| |||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  22128530 aactctctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 22128432  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||||| |||  |||||||||| || ||||| |||||  |||| ||||| ||||| || |||||     
T  22128431 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaacgtcttcctactcaagacatctgcaacaacattagctttacct 22128332  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  22128331 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 22128304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 435
Target Start/End: Original strand, 23886085 - 23886459
Alignment:
Q  61 gactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||   || ||| |||| |||||| |||||| |||||||    
T  23886085 gactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcattgtcaggaatacaaattctgcctcggaattgcaacactccctaatcatcgaccttagagtcact 23886184  T
Q  161 atcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcag 259  Q
    ||| ||||| | ||| |||  | | |  ||||| |||||||| | ||| ||||  || || |||   ||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  23886185 atcttcagtctgatttccaccaataaataaatctacaaactttacatccacttcatgcgcctctttaatactattca-gaaattcactatcaatcttcag 23886283  T
Q  260 catccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacata 359  Q
    ||| || ||||  | |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| || || |||| ||| || ||||| | |||||  ||  ||||     
T  23886284 cattcctaacttcacactctgaggtgacaattcacagactaaactcaaatctctaaattgttcaagcagctccaactctttgatcatcatggcggacatg 23886383  T
Q  360 tgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    || |  |||||||| || || ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23886384 tgtagagttttcctacttaaagcatctgcaacaacattagttttaccaggatgataattcaacccaaaatcataat 23886459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 18857586 - 18858012
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||| ||||||| ||| || |  || |||||||| |||||||    
T  18857586 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttctagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatac 18857685  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    |||  ||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || |||||   ||||| || |  || |||||| |||||||| | |||    
T  18857686 aaatccttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactttcttcagtccgattactagcaaccaacaaatctacaaacttgacatc 18857785  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     |||  ||| |||||    ||||| ||||  || | |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||      
T  18857786 aactctctgtgcttccttaatacttttcataaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcata 18857885  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||||| |||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  18857886 tctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaaagtcttcctactcaaggcatctgcaacgacattagctttacctg 18857985  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  18857986 gatgataattcaaaccaaagtcataat 18858012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 17673795 - 17673369
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  17673795 aaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 17673696  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||  || |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  17673695 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 17673596  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| ||||  | || | |||||     
T  17673595 aactttctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcggaaaccaaactcat 17673497  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || || || || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  17673496 atctctaaactgttcaagtaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 17673397  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17673396 ggatgataattcaagccaaagtcataat 17673369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22248190 - 22247866
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || ||| |||||||||||    
T  22248190 caaatcatgatacatcctcgtagctcccggatgaatacacaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcgtcaatgtcaggaata 22248091  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||  ||| |||| ||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||| | ||||| || | ||| ||| || |||||||| | ||    
T  22248090 caaattctgccttggaatctcaacactccctgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgattactagcaatcaacaagtccacaaacttaacat 22247991  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | | || |||  |||||  ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || | ||  | |||||||||||||||||  | ||| | ||||||    
T  22247990 caattttctgcacttctttgatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcctagcttcacactctgaggtgacaatttgccgactaaactcaa 22247891  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactca 332  Q
     ||||||||||| || |||||||||    
T  22247890 atctctaaactgttcaagcaactca 22247866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 22040868 - 22041294
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || |||| ||   ||| ||||||||| |    
T  22040868 aaatcgtgatacatcttcgtagctcctagatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatatttgcatcgtcaggaatgc 22040967  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    |||  |  |||| ||| |||| |||||| |||||||| || |||||||||   || || || | ||||| || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  22040968 aaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcatcgactttaaagtcatcgtcttccgtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatc 22041067  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| || |||   ||||| |||| |||||| ||||||||||||||| || ||||  |  | ||||||||||||| ||||||| || | ||||||    
T  22041068 aactttctgtgcctctttaatacttttca-gaaattcactatcaatcttcaggattcccagtttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcaa 22041166  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     || || ||||| || || |||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  22041167 atcactgaactgttcaagtaactcaaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctgctcaaggcatccgcaacaacattggctttacct 22041266  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  22041267 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 22041294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22119946 - 22119520
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||  |  |||||| ||||||||||| ||| || | ||| |||||||| || ||||    
T  22119946 aaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagcaacttctatgactctattcaagaatcatcttcttaatatcttcattgtctgggatac 22119847  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| || ||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || |||||| |||||||| | |||    
T  22119846 aaattcttcctcggaatctcaacataccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaaatctacaaacttgacatc 22119747  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||  ||| |||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  22119746 aactctctgcgcttccttgatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 22119648  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||| ||||||| || ||||| || || ||| | ||||||| |||  |||||||||| || ||||| |||||  |||| ||||| ||||| || |||||     
T  22119647 atctttaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaacgtcttcctactcaagccatctgcaacaacattagctttacct 22119548  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  22119547 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 22119520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 19113701 - 19114125
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||||    
T  19113701 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaa 19113800  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||| |||| ||| |  ||||| ||||| || | ||| | ||  | || | ||| ||| || |||||||| | ||| |    
T  19113801 attcttcctcggaatctcaacacaccttgattatcgattttaaaatcactgtctttagtctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaa 19113900  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| |||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||  |    
T  19113901 ctttctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatat 19113999  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||  ||||| || || || || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  19114000 ctcggaactgttcaagtaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 19114099  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  19114100 atgataattcaaaccaaagtcataat 19114125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 316
Target Start/End: Original strand, 22988207 - 22988512
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| || ||||||| ||    
T  22988207 atcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtaaggaatagaa 22988306  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||| |||| ||| |||| ||| || |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| | ||||| || | ||| ||| || |||||||| | ||| |    
T  22988307 attctgcctcggaatctcaacacgccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgattactagaaatcaacaattccacaaacttaacatcaa 22988406  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtc 310  Q
     ||  || ||||||   ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||| ||||| | |||||| ||    
T  22988407 ttttatgcgcttctttaatactcttcaggaattcactatcaatcttcagcattcctaactttacactctgagatgacaattcgcagactaaactcaaatc 22988506  T
Q  311 tctaaa 316  Q
    ||||||    
T  22988507 tctaaa 22988512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 15534392 - 15534818
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  ||  |||  ||| |||| |    
T  15534392 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttctttatttctgcatcatcatgaatgc 15534491  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    |||  |  |||| ||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||  || ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  15534492 aaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcatcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatc 15534591  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    ||||| ||| || |||   ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  |   ||||||||||| |||| || || | ||||||    
T  15534592 tactttctgtgcctctataatactcttca-gaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcactttctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcaa 15534690  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     |||||||| || || || ||||| || ||| | |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  15534691 atctctaaattgttcaagtaactcgaactctctaaccatcaaagcggacatgtgcaatgtcttcctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacct 15534790  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  15534791 ggatcataattcaaaccaaagtcataat 15534818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 30312916 - 30312490
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||  ||| ||||||||| |    
T  30312916 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgc 30312817  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    |||  |  |||| ||| |||| |||||| ||||| || || ||||||||||  || ||||| | ||||| || |   | |||||| |||||||| | |||    
T  30312816 aaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgattactagcaactaacaaatctacaaacttgacatc 30312717  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     ||||  || || |||   ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||  |  |   ||||||||||| ||||||| || | ||||||    
T  30312716 aactttatgtgcctctttaatactcttca-gaaattcactattaatcttcagcattcccagtttcactttctgaggtgaccattcacaaactaaactcaa 30312618  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| || || ||||| || ||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  30312617 atctctgaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacct 30312518  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  30312517 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 30312490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20017799 - 20017609
Alignment:
Q  245 actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttacc 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||  ||||||||||| || ||||| || || ||| | |||    
T  20017799 actatcaatcttcagcatacccaatttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgacc 20017700  T
Q  345 atcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  20017699 atcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataat 20017609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 247 - 442
Target Start/End: Original strand, 21252191 - 21252386
Alignment:
Q  247 tatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccat 346  Q
    |||||||||||||||| || | || || ||| | || ||||| |||||| || |  ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  21252191 tatcaatcttcagcattcctagctttacactttcagatgacatttcacacactaagctcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcttttaccat 21252290  T
Q  347 caaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcag 442  Q
    || |||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||||  |||||||||||| ||||||    
T  21252291 catagcagacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagctcaactcaaaatcataatccttcag 21252386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 110
Target Start/End: Original strand, 23949927 - 23950029
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  23949927 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttatgtgactctcttcaagaatcgtcttcttcatctcatcattgtcaggaata 23950026  T
Q  108 caa 110  Q
    |||    
T  23950027 caa 23950029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 277 - 466
Target Start/End: Original strand, 32601421 - 32601610
Alignment:
Q  277 tctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgct 376  Q
    ||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||| || || || || ||||| || ||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  32601421 tctgaggtgaccattcacaaaccaaactcaaatctctgaattgttcaagtaactcgaactctataaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctgct 32601520  T
Q  377 caatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||| ||||| || |||| |||||  | ||||| |||||| | ||||||    
T  32601521 caaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgatgattcaaaccaaagtcgtaatccttcaacaattctagccatctacgctgcct 32601610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21921502 - 21921372
Alignment:
Q  15 tggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||  || || |  ||||||| |||  |||||||||  |    
T  21921502 tggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttactcctatgactctcttcaagaatcattttctttatctcatcatcgtcttgaatacaaatcc 21921403  T
Q  115 ttcctctgaacctcagcacaccctgatcatc 145  Q
    | ||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  21921402 tacctcgaaacctcagcacaccttgatcatc 21921372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 442
Target Start/End: Original strand, 21043454 - 21043887
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||  |  | ||||||||||||||||  || ||||  ||||||| ||| |||||||    
T  21043454 aaatcatgatacatcttcgtagctctcggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatac 21043553  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    |||  || ||||  ||||||||||| |  |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | |||||  | |  || ||| || |||||||| | |||    
T  21043554 aaatcctacctcgaaacctcagcactctttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgattacttgcaaccaacaagtccacaaacttaacatc 21043653  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| || |||   ||||| ||| ||||||| | |||||||||||| ||| || | ||  | ||| | || ||||| |||||| || |  ||||     
T  21043654 aactttctgtgcctctttaatactcttc-agaaattcattatcaatcttcatcattcctagcttcacactttcagatgacatttcacacactaagctcag 21043752  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  21043753 atctctgaactgttcaagcaactcgaactctttcaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctactcagagcatctgcaacaacattagctttacct 21043852  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcag 442  Q
    ||||| ||  ||||  |||||||||| | ||||||    
T  21043853 ggatgatagctcaactcaaaatcatagtccttcag 21043887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22132813 - 22132380
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||     ||||||| ||||||||||  || ||||  ||  ||| ||| ||||| |    
T  22132813 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttcaatgactctcctcaagaatcattttcttcatctctgcatcgtcgggaatgc 22132714  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    |||  |  |||| ||| |||| |||||| ||||| || || ||||||||||  || ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  22132713 aaatccgacctcagaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatc 22132614  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| || |||   ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  |   ||| ||||||| |||||||||| | ||||||    
T  22132613 aactttctgtgcctctttaatactcttca-gaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcactttctaaggtgaccattcacagactaaactcaa 22132515  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||  | || || |||||||| ||| | ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||   |||  |||| || |||||     
T  22132514 atctctgaatggttcaagtaactcaaactctctaaccatgaaagcggacatatgcaatgtcttcctgctcaacgcatctataacatcattagctttacct 22132415  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcag 442  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  22132414 ggatgataattcaaaccaaagtcataatccttcag 22132380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 23651052 - 23651476
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || |||| |||   |||||||    
T  23651052 atcatgatacatcttcgtagctcccagatgaatactcaagatacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcgtctaaaatacaa 23651151  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    |  || ||||  ||||||| |||||  |||||||| | |||||| ||||| || | ||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  23651152 atcctacctcgaaacctcaacacacattgatcatcgatcttaaaatcactgtctttagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaa 23651251  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| ||||||   ||| | |||| |||||| |||||||| ||||||||| || |  |  | ||||||||||||| ||||||| || |  ||||| |    
T  23651252 ctttctgtgcttctttaatatttttca-gaaattcactatcaagcttcagcattcctagtttcacactctgaggtgaccattcacaaactaagctcaaat 23651350  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || | |||||| || ||  | ||||||| |||| |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  23651351 ctctaaactgttccaacaactcgaactccctaaccatcatagcagacatatgcaaagtcttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 23651450  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||| ||  ||||  ||||||||||||    
T  23651451 atgatagctcaactcaaaatcataat 23651476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16407815 - 16407504
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || |||| ||||||||| |||    
T  16407815 atcatgatacatcttcgtagctcctgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttattcatctcttcatcgtcaggaatgcaa 16407716  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    |  |  |||| ||| |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  16407715 atccgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaa 16407616  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    |||  || ||||||   ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||  |  | |||||||| |||| ||||||| || |  ||||  |    
T  16407615 ctttttgtgcttctttaatactcttc-agaaattcactattaatcttcagcattcccagtttcacactctgagatgaccattcacaaaccaagctcatat 16407517  T
Q  310 ctctaaactgctc 322  Q
    |||||||||||||    
T  16407516 ctctaaactgctc 16407504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 21195981 - 21195862
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||| ||||||||| | ||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  21195981 actcaaatctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccataaaagcaaacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattcgcc 21195882  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || || ||||| ||| ||||    
T  21195881 ttcccgggatgataactcaa 21195862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Original strand, 22435605 - 22435724
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||| |||| |||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  22435605 actcaaatctcgaaacggctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtttttctactcaaagcatctgcaacaacattagcc 22435704  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || |||||||| ||| ||||    
T  22435705 ttcccaggatgataactcaa 22435724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16876574 - 16876410
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  16876574 actcaaatctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 16876475  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||| ||||||||    
T  16876474 tttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatcttctctgcct 16876410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21393627 - 21393180
Alignment:
Q  19 acatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcc 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  |  | ||||||||||||||||  |  ||||  ||||||| ||||||||||||||  |  ||    
T  21393627 acatcttcgtagctcctggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaatcatttccttcatctcatcatcgtcaggaatacaaatccgacc 21393528  T
Q  119 tctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctga 218  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||| | || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||  ||| |||     
T  21393527 tcgaaacctcagcacaccttgatcatcgattttaaaatcattgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcagctttctgt 21393428  T
Q  219 gcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaact 318  Q
    || |||   ||||| ||||  || | | |||||||||||||||| || | ||  | ||| | || ||||| |||||| || |  ||||| ||||| ||||    
T  21393427 gcctctttaatacttttcagaaactcattatcaatcttcagcattcctagcttcacactttcagatgacatttcacacactaagctcaaatctctgaact 21393328  T
Q  319 gctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaatt 418  Q
    | || |||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||  |    
T  21393327 gttcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcatactcaaagcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagct 21393228  T
Q  419 caagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||  |||||||| |||  ||||| | ||||| |||||| | ||||||    
T  21393227 caactcaaaatcagaatctttcagcaattctagccatctacgctgcct 21393180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21788121 - 21787674
Alignment:
Q  19 acatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcc 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  |  | ||||||||||||||||  |  ||||  ||||||| ||||||||||||||  |  ||    
T  21788121 acatcttcgtagctcctggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaatcatttccttcatctcatcatcgtcaggaatacaaatccgacc 21788022  T
Q  119 tctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctga 218  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||| | || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||  ||| |||     
T  21788021 tcgaaacctcagcacaccttgatcatcgattttaaaatcattgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcagctttctgt 21787922  T
Q  219 gcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaact 318  Q
    || |||   ||||| ||||  || | | |||||||||||||||| || | ||  | ||| | || ||||| |||||| || |  ||||| ||||| ||||    
T  21787921 gcctctttaatacttttcagaaactcattatcaatcttcagcattcctagcttcacactttcagatgacatttcacacactaagctcaaatctctgaact 21787822  T
Q  319 gctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaatt 418  Q
    | || |||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||  |    
T  21787821 gttcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcatactcaaagcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagct 21787722  T
Q  419 caagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||  |||||||| |||  ||||| | ||||| |||||| | ||||||    
T  21787721 caactcaaaatcagaatctttcagcaattctagccatctacgctgcct 21787674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 20651812 - 20651711
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||| ||||||||| | ||| || || ||||| ||||| |||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  20651812 actcaaatctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccattaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagcc 20651713  T
Q  402 tt 403  Q
    ||    
T  20651712 tt 20651711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 22623472 - 22623399
Alignment:
Q  345 atcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaatt 418  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22623472 atcatagcagacatatgtaatgttttcctacttaaagcatctgcaacaacattagccttacccggatggtaatt 22623399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 145
Target Start/End: Original strand, 21251969 - 21252089
Alignment:
Q  25 tcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaa 124  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  |||||  || | ||||||||||||||||  || ||||  ||||||| ||| ||||||||||  |  ||||  ||    
T  21251969 tcgtagctcccggatgaatactcaggttacttctgtggctctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaaatccgacctcgaaa 21252068  T
Q  125 cctcagcacaccctgatcatc 145  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  21252069 cctcagcacaccttgatcatc 21252089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 21849816 - 21849697
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | ||| || || ||||| ||||||||| || |||||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  21849816 actcaagtctcgaaattgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaatcagacatatgcaaagtcgtcctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 21849717  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || || ||||| ||| ||||    
T  21849716 tttccgggatgataactcaa 21849697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22247859 - 22247773
Alignment:
Q  355 acatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22247859 acatatgcaacgtcttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacttggatgataattcaacccaaaatcataatccttca 22247773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 23156491 - 23156390
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| |  | |||||| |||||||||| | |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  23156491 actcaagtctcaaaactgctcaatcaatttcagttctttaaccatcaaagtagacatatgcaaagtctttctactcaaggcatctgcaacaacattagcc 23156392  T
Q  402 tt 403  Q
    ||    
T  23156391 tt 23156390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 20343138 - 20343596
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20343138 caaatcatggtatatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaata 20343237  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20343238 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 20343337  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  20343338 ccactttctgagcttctcgaatactgttcaagaaatcactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgagatgacaattcatagacaagactcat 20343437  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20343438 gtctctgaactgttctaacaattcaaattctttcatcatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctgctcaaagcatcagcaaccacattggccttacca 20343537  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  20343538 ggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcagtaactctaaccacctcctatgcct 20343596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 22503535 - 22503993
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22503535 caaatcatggtacattttagtagccccgggctgaatactcaacctactcttatgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcatcattgtcaggaata 22503634  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22503635 catactcttcctctgaacctcagaacaccctgatcatcaaccttaaaatcattgtcctcagtgtcactaccagtagtcatcaaatcaaccaatttcaaat 22503734  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22503735 ctgctttctaagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaactcacagactagactcaa 22503834  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22503835 gtctctaaactgttctaacaactcgaattcttttaccattaaagcagacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 22503934  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| || |||||    
T  22503935 ggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatcttctttgcct 22503993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23079601 - 23079143
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23079601 caaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactacttttgtgactctcttcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaata 23079502  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23079501 caaactcttcctctgaacctcagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcattatcctccgtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 23079402  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  23079401 ctacttgttgagcttctcagatactattcaagaaattactgttaatcttcaacatccccaactatatactctgaagtgacaattcacaaacaaggctcaa 23079302  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23079301 gtctctaaactgttctagcaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatatgtaatgttttcctgctcaacgcattagcaaccacattggctttacca 23079202  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||||||||||||    
T  23079201 ggatggtaattcaagccaaaatcataatcattcaacagctctaaccatctcctctgcct 23079143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 25848931 - 25849389
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  25848931 caaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttatgactatcatcaagaatcaacttcttcaactcatcattgtcaggaata 25849030  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  25849031 catactcttcctctgaacctcagaacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaataaacttcaaat 25849130  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  25849131 ccactttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaatctttagcatccccaactgtatactctgagatgacaattcacagacaagactcat 25849230  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25849231 gtctctgaactattctagcaattcaaattctttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctgctcaaagcatcagcaaccacattggccttacca 25849330  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25849331 ggatggtaattcaagccaaaatcataatctttcagtaactctaaccatctcctctgcct 25849389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14886503 - 14886045
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  14886503 caaatcatgatacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaata 14886404  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  14886403 caaactctacctctgaacctcagcaccccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaatcaacaaatttcaaat 14886304  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  14886303 cttctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaattcacagacaagactcat 14886204  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14886203 atctctgaactgttctaacaactcaaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggccttacca 14886104  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  14886103 ggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactctaaccacctcctctgcct 14886045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24797909 - 24797451
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||     
T  24797909 caaatcatggtacatttttgtagctcccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaatg 24797810  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24797809 caaactctacctctgaacctcaaaacaccttgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 24797710  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  24797709 cttctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatccctatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaattcacagacaagactcat 24797610  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24797609 atctctgaactgttctaacaactcaaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttacca 24797510  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  24797509 ggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactctaaccacctcctctgcct 24797451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 37542893 - 37542435
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||    
T  37542893 caaatcatggtacattttcgtagctcctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaatttcttcaactcttcgttgtcaggaata 37542794  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37542793 caaactctacctctgaacctcagtacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 37542694  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  37542693 cctctttctgagcttctcggatactgtttaagaagttactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaattcacagacaagactcat 37542594  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||| ||||| |||| ||| ||||| || || |||||||||||| |||  ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||    
T  37542593 gtctctgaactgttctaacaattcaaactccttcaccatcaaagcagacacgtgcaaagttttcctacttaaagcgtcagcaaccacattggccttacca 37542494  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||||||| |||||||||||    
T  37542493 ggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcaataactctaaccacctcctctgcct 37542435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24619807 - 24619349
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24619807 caaatcatggtacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaata 24619708  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  24619707 caaattcttcctctgaacctcagaacaccctgaacatcaaccttgaaatcgctatcctcagtgtcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacat 24619608  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||  |||| |||||    
T  24619607 cgacttgctaagcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgccaactcacaaccaaggctcaa 24619508  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || || || || ||||| |||||||||| |||| |||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  24619507 gtctctaaactgttccagtaattcgaattcctttaccatcatagcagacatgtgtaacgttttcctgctcaaagcatctgcaaccacattggctttaccc 24619408  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  24619407 ggatggtaattcaagtcaaaatcataatccttcaacagctctaaccatcttctctgcct 24619349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24716038 - 24715580
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24716038 caaatcatggtacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaata 24715939  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  24715938 caaattcttcctctgaacctcagaacaccctgaacatcaaccttgaaatcgctatcctcagtgtcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacat 24715839  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||  |||| |||||    
T  24715838 cgacttgctaagcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgccaactcacaaccaaggctcaa 24715739  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || || || || ||||| |||||||||| |||| |||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  24715738 gtctctaaactgttccagtaattcgaattcctttaccatcatagcagacatgtgtaacgttttcctgctcaaagcatctgcaaccacattggctttaccc 24715639  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  24715638 ggatggtaattcaagtcaaaatcataatccttcaacagctctaaccatcttctctgcct 24715580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24749066 - 24748608
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24749066 caaatcatggtacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaata 24748967  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  24748966 caaattcttcctctgaacctcagaacaccctgaacatcaaccttgaaatcgctatcctcagtgtcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacat 24748867  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||  |||| |||||    
T  24748866 cgacttgctaagcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgccaactcacaaccaaggctcaa 24748767  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || || || || ||||| |||||||||| |||| |||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  24748766 gtctctaaactgttccagtaattcgaattcctttaccatcatagcagacatgtgtaacgttttcctgctcaaagcatctgcaaccacattggctttaccc 24748667  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  24748666 ggatggtaattcaagtcaaaatcataatccttcaacagctctaaccatcttctctgcct 24748608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22235432 - 22234974
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| ||  |||||||| |||| || || | ||| ||||||||||| || ||||| ||| |||||    
T  22235432 caaatcatggtacatctttgtagctcccagatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaactcttcattatcatgaata 22235333  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||  |  |||||||||||||||||||| ||    
T  22235332 caaattcttcctctgaacctcaacacatcctgatcatcgaccttaaagtcactatcctcagcttcattaccaacaaccatcaaatcaacaaacttcacat 22235233  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22235232 ctacctgctgcgcttctcggatattattcaagaaatcactgttaatctttagcatccccaactgaatactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaa 22235133  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22235132 gtctctaaactgctctaacaaatcaaattctttcaccatcaaagcagacatatgcaacgttttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttacca 22235033  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| | |||||  || || |||||||||||||||||    
T  22235032 agatggtaattcaagccaaattcatagtccttcaacagctccaaccatctcctctgcct 22234974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 17268846 - 17268419
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||| |||| || || || || ||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  17268846 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgctcaagctactcttgtgactttcctctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaata 17268747  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||| |  ||||| |||||||||||| | ||    
T  17268746 caaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaatgccattaccagcaaccatcagatcaacaaacttgacat 17268647  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | || ||||| ||||||||||||||  |||  |||| ||| | |||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| || | |||||     
T  17268646 ccacctgctgtgcttctcggatactactcagaaaatcactgttaatctttagcatccccaactgtacgctttgaggcgacaactcacataccaaactcat 17268547  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||     
T  17268546 gtctctaaactgttccagcaaatcgaattcttttatcatcatagcagacatatgcagtgtcttcctactcaatgcatcagcgactacattagcttttccc 17268447  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17268446 ggatggtaattcaacccaaaatcataat 17268419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21680290 - 21679832
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||| |||| ||||| | ||||||| |||| |  ||||| |||||||||||     
T  21680290 caaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttcttccaaaatcaacctttttatctcatcgttgtcaggaatg 21680191  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||| || || |||||||||||||  | ||||| | ||   || ||||| |||||||| | ||    
T  21680190 caaattctgcctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagcttgattactattaactattaaatccacaaacttgacat 21680091  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | || || || ||||||| |||||| |||||||| | |||||  || |||| ||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  21680090 caacctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttcatcatacccaactgcacactctggggtgacaattcgcaaacaagactcaa 21679991  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  ||  |||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  21679990 gtctctaaactgttcaagcaactcgaattcctttaccatcatggccgacatgtgtaacgtcttcctactcaaagcatctgcaactacattggctttaccc 21679891  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21679890 ggatgatagttcaacccaaaatcataatccttcaatagctctaaccatctcctctgcct 21679832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21890271 - 21889933
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||| | || ||||| | | ||||||||||||| |||||| | ||||||||     
T  21890271 caaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactaaagctacttttgtggctttcttccaaactcaactttttcaactcatcactatcaggaatg 21890172  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||| | ||||| || |  ||| ||||| |||||||| | ||    
T  21890171 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcaccaaccttgaagtcactatatttagtttgattactagcaaccattaaatcgacaaacttgacat 21890072  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  21890071 caacttgttgtgcttctctgatactgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaactgtacactctgaggtgacaactcataaacaagactcaa 21889972  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccat 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  21889971 gtctctaaacttctctagcaactcaaactcctttaccat 21889933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 435
Target Start/End: Original strand, 22462812 - 22463234
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||  |||| ||||| | ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  22462812 tcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaagttgctcttatgactttcttccaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcaggaatacaaa 22462911  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||| ||||| || |||| |||||| || | ||||||||| || ||||||| ||| |  | |||||||| |  ||| ||||| |||||||| | ||| ||    
T  22462912 ttctgcctctaaatctcaacacaccttgtt-atcaaccttgaaatcactattctctgcttgattaccagcaaccattaaatccacaaacttaacatcaac 22463010  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    ||| || ||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| | ||| |||| |||||||||||| || ||||| || ||     
T  22463011 ttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattgatcttcagcatacccaactgcacactttgagatgacaattcacacacgagacttaaatcc 22463110  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || ||  |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||| ||||    
T  22463111 ctaaactgttcgagcaattcaaactcctttaccattaaggccgacatgtgcaacgtcttcctactcaacgcatctgcaactacattaactttacccggat 22463210  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22463211 ggtaattcaagccaaaatcataat 22463234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 28894444 - 28893996
Alignment:
Q  18 tacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 117  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||  ||||| | ||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||| ||| |    
T  28894444 tacatttttgtagctcccgggtgaatactcaagttgctcttatgaccttcttctaaaatcaacttcttcagttcctcattgtcagggatacaaattctgc 28894345  T
Q  118 ctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctg 217  Q
    |||| || |||| |||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |  | ||||||   |  ||||||||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  28894344 ctctaaatctcaacacaccttgctcatcaaccttgaaatcactctcctcggcttgattacccacaaccatcaaatccacgaacttaacatcaacttgttg 28894245  T
Q  218 agcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaac 317  Q
     ||||||| || ||| | |||||||  |||||  ||||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  28894244 tgcttctctgacactatccaagaaaccactattgatcttcaacatacccaactgtacactttgagatgataattcacacactagactcaagtccctaaac 28894145  T
Q  318 tgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaat 417  Q
    || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  28894144 tgttcaagcaactcgaattcctttaccatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacctggatggtagt 28894045  T
Q  418 tcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | ||  || | |||||||||||||||    
T  28894044 tcaaaccaaaatcataatcctttaataactcaagccatctcctctgcct 28893996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 28915915 - 28915467
Alignment:
Q  18 tacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 117  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||  ||||| | ||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||| ||| |    
T  28915915 tacatttttgtagctcccgggtgaatactcaagttgctcttatgaccttcttctaaaatcaacttcttcagttcctcattgtcagggatacaaattctgc 28915816  T
Q  118 ctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctg 217  Q
    |||| || |||| |||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |  | ||||||   |  ||||||||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  28915815 ctctaaatctcaacacaccttgctcatcaaccttgaaatcactctcctcggcttgattacccacaaccatcaaatccacgaacttaacatcaacttgttg 28915716  T
Q  218 agcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaac 317  Q
     ||||||| || ||| | |||||||  |||||  ||||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  28915715 tgcttctctgacactatccaagaaaccactattgatcttcaacatacccaactgtacactttgagatgataattcacacactagactcaagtccctaaac 28915616  T
Q  318 tgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaat 417  Q
    || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  28915615 tgttcaagcaactcgaattcctttaccatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacctggatggtagt 28915516  T
Q  418 tcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | ||  || | |||||||||||||||    
T  28915515 tcaaaccaaaatcataatcctttaataactcaagccatctcctctgcct 28915467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 28923270 - 28922822
Alignment:
Q  18 tacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 117  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||  ||||| | ||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||| ||| |    
T  28923270 tacatttttgtagctcccgggtgaatactcaagttgctcttatgaccttcttctaaaatcaacttcttcagttcctcattgtcagggatacaaattctgc 28923171  T
Q  118 ctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctg 217  Q
    |||| || |||| |||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |  | ||||||   |  ||||||||| || ||||| | ||| ||||| ||    
T  28923170 ctctaaatctcaacacaccttgctcatcaaccttgaaatcactctcctcggcttgattacccacaaccatcaaatccacgaacttaacatcaacttgttg 28923071  T
Q  218 agcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaac 317  Q
     ||||||| || ||| | |||||||  |||||  ||||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  28923070 tgcttctctgacactatccaagaaaccactattgatcttcaacatacccaactgtacactttgagatgataattcacacactagactcaagtccctaaac 28922971  T
Q  318 tgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaat 417  Q
    || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  28922970 tgttcaagcaactcgaattcctttaccatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacctggatggtagt 28922871  T
Q  418 tcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | ||  || | |||||||||||||||    
T  28922870 tcaaaccaaaatcataatcctttaataactcaagccatctcctctgcct 28922822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 435
Target Start/End: Original strand, 20822313 - 20822736
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||| | ||||||||| ||||| || |||||||| |||| |||||    
T  20822313 tcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaaattactcttatgactttcttctaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcgggaacacaaa 20822412  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||| ||||| || ||||  ||||| || |||||||| || || |||| ||| ||||  | ||||| ||     |||||||| |||||||| | ||| ||    
T  20822413 ttctgcctctaaatctcaatacaccttgttcatcaactttgaaatcaccatcttcagcttgattactagcgactatcaaatctacaaacttaacatcaac 20822512  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    ||| || ||||||| |||||| ||||||||||  ||||  ||||||| ||| |||||||| | ||| |||| ||| || ||||| || ||||| ||||||    
T  20822513 ttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcgctattgatcttcaacatacccaactgcacactttgagatgataactcacacactagacttaagtct 20822612  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  20822613 ctaaactgttcaagcaattcgaattcctttaccatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaactacattagctttacccggat 20822712  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20822713 ggtaattcaagccaaaatcataat 20822736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 21831269 - 21830884
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||| |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  21831269 tcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaaactacttttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcagggatacaaa 21831170  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||| |||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||| | ||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| ||    
T  21831169 ttctgcctcagaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcaccatctttagtttgattactagcaaccaacaattctacaaacttaacatcaac 21831070  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    || ||| ||||||   ||| |||||||||| | ||| |  ||||||| ||| |||||||  | ||||| ||| ||||| ||||| || ||||||| ||||    
T  21831069 tttctgcgcttctttaatattgttcaagaactcactgttgatcttcaacatacccaacttcacactcttaggcgacaactcacaaacgagactcaggtct 21830970  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacatt 397  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  21830969 ctaaactgttcaagcaactcaaactctttaaccatcatagcaaacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaacaacatt 21830884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21563481 - 21563060
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||  ||||  || |||| ||||| | ||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  21563481 tcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcataattataaggaatacaaa 21563382  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     | |   || ||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| ||    
T  21563381 ttatgtgtcggaatctcaacacacgttgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaac 21563282  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    || ||| ||||||  ||||||||||||||| | ||| |  ||||||| ||| |||||||  | ||||| ||| ||||| ||||| || ||||||| ||||    
T  21563281 tttctgtgcttctttgatactgttcaagaactcactgttgatcttcaacatacccaacttcacactctaaggcgacaactcacaaacgagactcaggtct 21563182  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  21563181 ctaaactgttcaagcaactcaaactctttaaccatcatagcatacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacctggat 21563082  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
    | |||||||| | |||||||||    
T  21563081 gataattcaaactaaaatcata 21563060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 20774625 - 20775036
Alignment:
Q  18 tacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 117  Q
    ||||| || ||||| ||| ||||||||||||| || |||||  |||  ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||| |    
T  20774625 tacatttttgtagctcccaggtgaatactcaagttgctcttatgaccttcttctaaaatcaacttcttcaattcctcattgtcagggatacaaattctgc 20774724  T
Q  118 ctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctg 217  Q
    |||| || |||| |||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |  | |||||    |  ||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||    
T  20774725 ctctaaatctcaacacaccttgctcatcaaccttgaaatcactctcctcggcttgattactcacaaccattaaatccacaaacttaacatcaacttgttg 20774824  T
Q  218 agcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaac 317  Q
     ||||||| ||||||   |||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||| | ||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  20774825 tgcttctctgatactacccaagaaatcactattgatcttcaacatacccaactgcacactttgagatgataattcacacacgagactcaagtccctaaac 20774924  T
Q  318 tgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaat 417  Q
    || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||| | |||||||| |    
T  20774925 tgttcaagcaactcgaattcctttaccatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaactactttagctttatctggatggtagt 20775024  T
Q  418 tcaagccaaaat 429  Q
    ||||||||||||    
T  20775025 tcaagccaaaat 20775036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 26738236 - 26737814
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  26738236 atcatgatacattttcgtagctccctgatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaa 26738137  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||||||||  || |||| | |||| |||||||| |  ||||| |||| ||| ||||| | ||||| || | ||| ||| || |||||||| | ||| |    
T  26738136 attcttcctcgaaatctcaacgcaccatgatcatcgattttaaaatcaccatcttcagtctgattactagcaatcaacaagtccacaaacttaacatcaa 26738037  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    |||  ||   ||||   ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||| ||||| | |||||| |    
T  26738036 ctttatgtctttctttaatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcattcccagcttcacactctgaggtgacaattcgcagactaaactcaaat 26737938  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    ||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||  ||    
T  26737937 ctctaaactgctccaacaactcgaactcttttaccatcatagcggacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacttgg 26737838  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
    ||| |||||||| | |||||||||    
T  26737837 atgataattcaaactaaaatcata 26737814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22332398 - 22331972
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  22332398 aaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 22332299  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  22332298 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 22332199  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     |||| ||| |||||   |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||      
T  22332198 aactttctgtgcttccttgatacttttcaggaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcata 22332099  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  22332098 tctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctg 22331999  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  22331998 gatgataattcaaaccaaagtcataat 22331972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27668001 - 27667575
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| ||||| |    
T  27668001 aaatcatgatacatcttcgtagatcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatgc 27667902  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| ||||||||  || |||| ||| || |||||||| |  ||||| ||||| || ||||  | ||  | || |  || |||||| |||||||| | |||    
T  27667901 aaattcttcctcgaaatctcaacacgccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagcctgatctctagcaaccaacaaatccacaaactttacatc 27667802  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| ||||||  ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||| | ||||||| || | ||||||    
T  27667801 aactttctgtgcttctttgatgcttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccaatttcacactctgaggtgtccattcacaaaccaaactcaa 27667703  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  27667702 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 27667603  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27667602 ggatgataattcaagccaaagtcataat 27667575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 441
Target Start/End: Original strand, 16357379 - 16357809
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||||    
T  16357379 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaa 16357478  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || | ||| ||| || |||||||| | ||| |    
T  16357479 attcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaa 16357578  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| |||||   |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||  |    
T  16357579 ctttctgtgcttccttgatacctttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatat 16357677  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  16357678 ctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 16357777  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  16357778 atgataattcaaaccaaagtcataatccttca 16357809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 441
Target Start/End: Original strand, 27519284 - 27519713
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||||    
T  27519284 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaa 27519383  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || | ||| ||| || |||||||| | ||| |    
T  27519384 attcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaa 27519483  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| |||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| | |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||  |    
T  27519484 ctttctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcataccc-agttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatat 27519581  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  27519582 ctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 27519681  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  27519682 atgataattcaaaccaaagtcataatccttca 27519713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 255 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 28930946 - 28930735
Alignment:
Q  255 ttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaa 354  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||      
T  28930946 ttcaacatacccaactgtacactttgagatgataattcacacactagactcaagtccctaaactgttcaagcaactcgaattcctttaccatcaaggccg 28930847  T
Q  355 acatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaacca 454  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||  || | |||    
T  28930846 acatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacctggatggtagttcaaaccaaaatcataatcctttaataactcaagcca 28930747  T
Q  455 tctcctctgcct 466  Q
    ||||||||||||    
T  28930746 tctcctctgcct 28930735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 29475584 - 29475158
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  29475584 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 29475485  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  29475484 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatc 29475385  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  29475384 aactttctgcgcttccttgatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 29475286  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||| ||| || ||||| || || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  29475285 atctctaatctgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 29475186  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  29475185 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 29475158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 441
Target Start/End: Original strand, 34567371 - 34567801
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||||    
T  34567371 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaa 34567470  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || | ||| ||| || |||||||| | ||| |    
T  34567471 attcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaa 34567570  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| |||||   |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||  |    
T  34567571 ctttctgtgcttccttgatacctttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatat 34567669  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  34567670 ctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 34567769  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  34567770 atgataattcaaaccaaagtcataatccttca 34567801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27684911 - 27684485
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || ||||||||  | ||||    
T  27684911 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctaggatac 27684812  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||  || |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  27684811 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaacttgacatc 27684712  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     |||| ||| |||||   |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||      
T  27684711 aactttctgcgcttccttgatacttttcaggaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcata 27684612  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  27684611 tctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctg 27684512  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||    
T  27684511 gatgataattcaagccaaagtcataat 27684485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 22135543 - 22135969
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||| ||||||| ||| || |  || |||||||| |||||||    
T  22135543 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttctagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatac 22135642  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    |||  ||| ||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||||| || |  || |||||| |||||||| | |||    
T  22135643 aaatcctttctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactttcttcagtctgattactagcaaccaacaaatctacaaacttgacatc 22135742  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||| ||||||| |||| || || | |||||     
T  22135743 aactttctgtgcttccttgatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctaaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 22135841  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| |  || |||   ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  22135842 atctctaaactgttcaagcaatttgaactctccgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 22135941  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  22135942 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 22135969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20467609 - 20467183
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  ||  ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||  |||||||||    
T  20467609 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgttactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcatcaggaata 20467510  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| | | ||||  || | || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| |||  | | |  ||||| |||||||| | ||    
T  20467509 caaattttgcctcgaaatcgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcactatcttcagtctgatttccaccaataaataaatctacaaactttacat 20467410  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 306  Q
    | |||| |||  ||| |   |||||  || ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||  |  |||||||||||||| ||||| || | |||||    
T  20467409 ccactttctg-ccttttttaatactagtc-agaaattcactatcaatctttagcattcctaacttcacgctctgaggtgacaactcacaaactaaactca 20467312  T
Q  307 agtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacc 406  Q
     |||||||||||| || |||| ||| || ||||| | ||||| |||  ||||||| |  |||||||  || || ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  20467311 ggtctctaaactgttcgagcagctctaactctttgatcatcatagcggacatatgtagagttttccgacttaaagcatctgcaacaacattagctttacc 20467212  T
Q  407 aggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20467211 tggatgataattcaacccaaaatcataat 20467183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 27611229 - 27611655
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  27611229 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 27611328  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||| ||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || | ||| ||| || |||||||| | |||    
T  27611329 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatc 27611428  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  27611429 aactttctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcgctatcaatcttcagcatacccaatttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 27611527  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || || |  || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  27611528 atctctaaactgttcaagtagttcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 27611627  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  27611628 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 27611655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 14999250 - 14998824
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  14999250 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 14999151  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||  ||||  || |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  14999150 aaattcttcctcggaatctcaacacactttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaacttgacatc 14999051  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     |||| ||| |||||   |||||| |||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||      
T  14999050 aactttctgcgcttccttgatacttttcaggaattcactatgaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcata 14998951  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  14998950 tctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctg 14998851  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  14998850 gatgataattcaaaccaaagtcataat 14998824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 177
Target Start/End: Original strand, 21496933 - 21497098
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||  ||||  || |||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  21496933 tcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaaatcatccttattaggaatgcaaa 21497032  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattac 177  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  21497033 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttcattac 21497098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 441
Target Start/End: Original strand, 23472159 - 23472535
Alignment:
Q  64 tctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatc 163  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||| ||||  || | || ||| |||  |||||| |  ||||| ||| ||||    
T  23472159 tctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaattctgcctcgaaaacgcaacactcccaaatcatcgattttaaaatcattatc 23472258  T
Q  164 ctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatc 263  Q
     ||||  | ||||| ||||  || ||| || |||||||| | |||   || ||| ||||||  |||| || ||||||| ||| |||||||||| |||||     
T  23472259 ttcagcctaattactagtatccaacaagtccacaaacttaacatcagttttctgtgcttctttgatattgctcaagaattta-tatcaatctttagcatt 23472357  T
Q  264 cccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgca 363  Q
    |||| ||  | |||||||||||||| ||| ||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||    
T  23472358 cccagcttcacactctgaggtgacatttcgcagactaaactcaaatctctaaactgttcaagcaactcgaactcttttaccatcatagcggacatatgca 23472457  T
Q  364 atgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    | || ||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||| || ||||||||||||| |||||    
T  23472458 acgtcttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacctagatgataatttaacccaaaatcataatccttca 23472535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 466
Target Start/End: Original strand, 21881833 - 21882281
Alignment:
Q  18 tacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 117  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||  |  |||||| |||||||||||  || ||||  ||  |||  |||||||||||||  |  |    
T  21881833 tacatcttcgtagctctcgggtgaatactcaagctacttctatgactctattcaagaatcattttcttcatctctacataatcaggaatacaaatacgac 21881932  T
Q  118 ctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctg 217  Q
    ||| ||| |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||| ||||| | ||||| || |  || ||| |  |||||||| | ||| |||| |||    
T  21881933 ctcggaaactcaacacaccatggtcatcgacattaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtatacaaacttgacatcaactttctg 21882032  T
Q  218 agcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaa 316  Q
     ||||||  |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | ||  |  | ||||||||||||| | ||||| || || ||||  ||| ||||    
T  21882033 tgcttctttgatactcttca-gaaattcactatcaatcttcagcattcacagtttcacactctgaggtgaccactcacaaactaggctcatatctgtaaa 21882131  T
Q  317 ctgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaa 416  Q
    ||| || ||||||||||| ||| | ||||||| |||  |||||| |||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||| || |||||  |||| |||    
T  21882132 ctgttcaagcaactcaaactctctaaccatcatagcggacatattcaatgtcttcctactcaaggcatcaacaacaacattagctttacctagatgataa 21882231  T
Q  417 ttcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| ||||| |||||||  ||||| | ||||| |||||| | ||||||    
T  21882232 ttcaaaccaaagtcataatctttcagcaattctagccatctacgctgcct 21882281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 441
Target Start/End: Original strand, 40709655 - 40710087
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  40709655 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 40709754  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || || || | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  40709755 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttccgtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 40709854  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||  |  |  |||||||||||| ||||||| || | |||||     
T  40709855 aactttctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcactatcaatcttcaacatacccagtttcacgctctgaggtgaccattcacaaaccaaactcat 40709953  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||  ||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  40709954 atctcggaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 40710053  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  40710054 ggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 40710087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 277 - 435
Target Start/End: Original strand, 18776939 - 18777097
Alignment:
Q  277 tctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgct 376  Q
    ||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18776939 tctgaggtgaccattcacaaactaaactcaaatctctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctgct 18777038  T
Q  377 caatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || |||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  18777039 caaagcatctgcaacaacattagctttacctagatgataattcaaaccaaaatcataat 18777097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 23441085 - 23441511
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||| ||||||||||  || ||||  || |||| |||| |||| |    
T  23441085 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcctcaagaatcattttcttcatctcttcatcgtcacgaatgc 23441184  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    |||  |  |||| ||| |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  23441185 aaatccgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatc 23441284  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     ||||  || || |||   ||||| ||||  || | |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||| | ||||||| || | ||||||     
T  23441285 aactttttgtgcctctttaatactcttcataaattcactatcaatcttcagcattcccactttcacactctgaggtgtccattcacaaactaaactcaaa 23441384  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||| || || || || || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||| |    
T  23441385 tctctaaactgttcaagtaattcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagttttacctg 23441484  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  23441485 gatgataattcaaaccaaagtcataat 23441511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 23574614 - 23575030
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||| || ||   |||||   |||||||   |||||||||||    
T  23574614 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaataaaca---ttttct--tcatcat---caggaatacaa 23574705  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||  |||| ||| |||| |||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||| | | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  23574706 attcggcctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaaatcaccatcctcaatctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaa 23574805  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtc 310  Q
     ||  || ||||||  |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| | ||||| || |  ||||  ||    
T  23574806 ttttttgtgcttctttgatactcttcaggaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgaggtgaccactcacaaactaagctcatatc 23574905  T
Q  311 tctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagga 410  Q
    ||||||||| || ||||| || || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||    
T  23574906 tctaaactgttcaagcaattcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgccttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgga 23575005  T
Q  411 tggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    || |||||||| ||||| |||||||    
T  23575006 tgataattcaaaccaaagtcataat 23575030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 427
Target Start/End: Original strand, 19770835 - 19771253
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  19770835 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 19770934  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||  || |  ||||| ||||| || ||||  | ||  | || |  || |||||| |||||||| | |||    
T  19770935 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagcctgatctctagcaaccaacaaatccacaaactttacatc 19771034  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| ||||||  ||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  |  |||||||||| | ||||||| || | |||||     
T  19771035 aactttctgtgcttctttgatgcttttc-agaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacgctctgaggtgtccattcacaaaccaaactcat 19771133  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| || || ||||| || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  19771134 atctctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatccgcaacaacattagctttaccc 19771233  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaa 427  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  19771234 ggatgataattcaaaccaaa 19771253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 41771717 - 41772143
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  41771717 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 41771816  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  41771817 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 41771916  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     |||| ||| |||||   |||| | ||||| || | |||||||||||| ||||| || |  |  |  |||||||||||| ||||| | || | |||||      
T  41771917 aactttctgtgcttcctagatatttttcaaaaattcactatcaatcttgagcatacctagtttcacgctctgaggtgaccattcataaaccaaactcata 41772016  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||  ||||| || || ||||| || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  41772017 tctcggaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctg 41772116  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  41772117 gatgataattcaaaccaaagtcataat 41772143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 21408279 - 21408439
Alignment:
Q  275 actctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctg 374  Q
    |||||| || |||| |||||| || | |||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||     
T  21408279 actctgcggcgacacttcacaaaccaaactcaagtctctgaactgttcaagcaactccaactctttaaccatcatagcagacatatgtaatgttttccta 21408378  T
Q  375 ctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    || || | ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  21408379 cttaaagtatctgcaacaacattagccttacccggatggtaattcaatccgaattcataat 21408439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 373
Target Start/End: Original strand, 23517403 - 23517765
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || ||||  | ||||||||||    
T  23517403 atcatgatacatcttcatagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatctttaggaatacaa 23517502  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||  |||| ||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||||| ||| || || | ||||| || |  ||  || || |||||||| | ||| |    
T  23517503 attcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttctgtctgattactagcaaccaataagtctacaaacttgacatcaa 23517602  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    |||  || ||||||  |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||  | ||||| || |  ||||  |    
T  23517603 ctttatgtgcttctttgatactcttc-agaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgaggtgatcactcacaaactaagctcatat 23517701  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcct 373  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| |||||    
T  23517702 ctctaaactgttcaagcaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcct 23517765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Original strand, 20800325 - 20800483
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || |||| |||||||||||||    
T  20800325 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaggttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcgtcaggaatacaa 20800424  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagt 169  Q
    | ||  |||| ||| |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  20800425 attcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagt 20800483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 37290771 - 37290550
Alignment:
Q  245 actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttacc 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||| || |||| ||||||| || | |||||  ||||||||||| || ||||| || |||||| | |||    
T  37290771 actatcaatcttcagcatacccagtttcacactctaagatgaccattcacaaaccaaactcatatctctaaactgttcaagcaattcgaattctctgacc 37290672  T
Q  345 atcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagta 444  Q
    |||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||| ||||| || |||| |||||  |    
T  37290671 atcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgggtgataattcaaaccaaagtcgtaatccttcaaca 37290572  T
Q  445 gttctaaccatctcctctgcct 466  Q
     ||||| |||||| | ||||||    
T  37290571 attctagccatctgcgctgcct 37290550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21936406 - 21936242
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  21936406 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 21936307  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  21936306 tttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatctcctctgcct 21936242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Original strand, 27012234 - 27012398
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  27012234 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 27012333  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  27012334 tttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatctcctctgcct 27012398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 120
Target Start/End: Original strand, 22349298 - 22349409
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||  | |||||||||||||||||| ||| || |  || ||||||||  ||||||    
T  22349298 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcccgtgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctagaatac 22349397  T
Q  109 aaactcttcctc 120  Q
    ||| ||||||||    
T  22349398 aaattcttcctc 22349409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21338809 - 21338384
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| |||  |||||    
T  21338809 caaatcatgatacattttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctagaata 21338710  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||| ||| ||||  || ||||||||||| |  ||||| ||| | |  ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||    
T  21338709 caaattctacctcggaatctcaatactccctgatcatcgattttaaaatcattgttttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttaacat 21338610  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 306  Q
    | |||| ||| ||||||   ||||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||| || | ||  | | |||||| |||||  |  || || | |||||    
T  21338609 caactttctgcgcttctttaatacttttc-agaaattcattatcaatcttctgcattcctagcttcacattctgagatgacatcttgcaaactaaactca 21338511  T
Q  307 agtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacc 406  Q
    | ||| ||||||| || |||||||| |  ||||| ||||||| |||  |||||||||   | ||||||||||| ||||  ||||| ||||| || |||||    
T  21338510 aatctttaaactgttccagcaactcgagctctttaaccatcatagctgacatatgcagcatcttcctgctcaaagcatttgcaacaacattagctttacc 21338411  T
Q  407 aggatggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||    
T  21338410 tggatgatagttcaacccaaaatcata 21338384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 163
Target Start/End: Original strand, 25424066 - 25424217
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| ||| |||||||||    
T  25424066 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaa-ttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaa 25424164  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatc 163  Q
    |  || ||||  ||||||| |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  25424165 atcctacctcgaaacctcaacacacgttgatcatcgattttaaaatcactatc 25424217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21872226 - 21872129
Alignment:
Q  344 catcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||||| |||| |||| ||||| || || | |||||| ||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  21872226 catcatagcagacatgtgcaacgtctttcagctcaaagcatctgcaaccacattagctttactcggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 21872129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21876506 - 21876409
Alignment:
Q  344 catcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||||| |||| |||| ||||| || || | |||||| ||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  21876506 catcatagcagacatgtgcaacgtctttcagctcaaagcatctgcaaccacattagctttactcggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 21876409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Original strand, 24582339 - 24582524
Alignment:
Q  281 aggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaat 380  Q
    ||||| ||| |||| ||| | |||||| |||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || |||||     
T  24582339 aggtgtcaactcactgaccaaactcaaatctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaa 24582438  T
Q  381 gcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||| ||||||||    
T  24582439 gcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatcttctctgcct 24582524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 433
Target Start/End: Original strand, 21497159 - 21497223
Alignment:
Q  369 ttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  21497159 ttcctgctcaaagcatctgcaactacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcata 21497223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 435
Target Start/End: Original strand, 25427583 - 25427734
Alignment:
Q  284 tgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgca 383  Q
    ||||| |||||| || | |||||| | ||| ||||| || |||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  25427583 tgacatttcacaaactaaactcaaatttctgaactgttcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctactcaaagca 25427682  T
Q  384 tcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    || ||||| ||||| || ||||  ||||| ||  ||||  ||||||||||||    
T  25427683 tctgcaacaacattagctttacacggatgatagctcaactcaaaatcataat 25427734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 922 - 874
Alignment:
Q  387 gcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  922 gcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataat 874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 37291008 - 37290882
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| |||  | |  || ||| |||| || |||    
T  37291008 caaatcatgatacatcttcgtggctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcctaatctcttcaatgtctgggata 37290909  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcaca 134  Q
    |||| |||||||| ||| |||| ||||    
T  37290908 caaattcttcctcggaatctcaacaca 37290882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Original strand, 18776645 - 18776714
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatca 78  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||    
T  18776645 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 18776714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 10468324 - 10467866
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10468324 caaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcttctagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaata 10468225  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| | |  ||| |||||||||||||| | ||    
T  10468224 caaactcttcctctgaacctcaaaacaccctgatcatcaactttgaagtcactatcctctgtctcattacccgcaaccattaaatcaacaaactttacat 10468125  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10468124 ccacttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattctcagacaagactcaa 10468025  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10468024 gtctctaaattgctccagcaactcaaattcttttatcatcaaagcagacatatgcaatgtttttctgctcaaagcatcagcaaccacattggccttacca 10467925  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10467924 ggatggtaattcaagccaaaatcataatcattcagtaactctaaccatctcctctgcct 10467866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 24365218 - 24365676
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  24365218 caaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactattgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattatcaggaata 24365317  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24365318 caaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcggtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 24365417  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  24365418 ccactttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctgagatgacaattcacagacaagactaat 24365517  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  24365518 gtctctgaactgttctaacaattcaaattcttttaccattaaagcagacatgtgcaaggttttcctgctcaaagcatcagcaacaacgttggccttacca 24365617  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24365618 ggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcagtaactctaaccatctcctctgcct 24365676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 19454226 - 19454684
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||| || || | |||||| |||||||| || ||||  |||||||||    
T  19454226 caaatcatgttacattttcgtagctcccggatgaatacttaagttactcttgtgactttcctcgaaaatcaattttttcaactcgtcatcatcaggaata 19454325  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  19454326 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacat 19454425  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || ||||||| |||| | |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19454426 ccacttgttgtgcttctctgatattattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaactgcacactctgaggtgtcaattcacagacaagactcaa 19454525  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  19454526 atctctaaattgctctagcaaatcaaattctttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttaccc 19454625  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || |||||||| |||||||||||    
T  19454626 ggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacagctctaaccacctcctctgcct 19454684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 8762408 - 8761950
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||| | ||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8762408 caaatcatggtacatttttgtagctcccgggtgaatactcaagctacttttgtgactttattctaaaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaata 8762309  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | |  ||| |||||||||||||| | ||    
T  8762308 caaattctacctctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttcattacccgcaaccattaaatcaacaaactttacat 8762209  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| | |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8762208 ccacttgctgcggttctcggatactattcaggaaatcactattaattttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaa 8762109  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8762108 gtctctaaactgttctagcaaatcgaattctttcaccattaaagcagacatatgcagcgttttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttacca 8762009  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  8762008 ggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatctcctctgcct 8761950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 5296681 - 5296223
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5296681 caaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaagctactcttgtaactttcttctaaaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaata 5296582  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | |  ||| |||||||||||||| | ||    
T  5296581 caaattctacctctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttcattacccgcaaacattaaatcaacaaactttacat 5296482  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | | ||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  5296481 ccagttgttgcgcttctcggatactattcaagaaatcactgttaattctcagcatccccaattgtatactctgaggtgataactcacaaacaaggctcaa 5296382  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||     
T  5296381 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaacgcatcaacaaccacattagctttaccc 5296282  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| || |||||    
T  5296281 ggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatcttctttgcct 5296223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 8 - 462
Target Start/End: Original strand, 19435808 - 19436262
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19435808 caaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttattctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaata 19435907  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||    
T  19435908 caaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatccaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccagcaactatcaaatcaacaaacttcacat 19436007  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||  || || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19436008 ccacttgctgagcttctcagatactattcaagaaatcactatgaattttcagcatcctgaattgaacactctgaggtgtcaattcacagacaagactcaa 19436107  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||| | |||||||||||||| || ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||| |    
T  19436108 atctttgaactgctctagcaaatcgaattcctccaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttccggctcaacgcattagcaaccacattggctttacta 19436207  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctct 462  Q
    |||||||||||||| |||||||| || | |||||  || ||||||||| ||||||    
T  19436208 ggatggtaattcaaaccaaaatcgtagtccttcaacagctctaaccatatcctct 19436262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14380942 - 14380484
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||  |||||||| |||| || || | ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  14380942 caaatcatggtacatctttgtagctcccggatgaacactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaactcatcattgtcacgaata 14380843  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||    
T  14380842 caaattcttcctctgaacctcaatacaccctgatcatccaccatgaagtcactttcctcagtgccattaccagcaactatcaaatcaacaaacttcacat 14380743  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14380742 ccacttgctgcgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatctttagcatccccaattgaacactctgaggtgtcaattcacagacaagactcaa 14380643  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||||||||  |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14380642 atctctgaactactctagcaaatcgaattctttcaccattaaggcagacatatgcagcgttttcctacttaaggcatctgcaaccacattggctttacca 14380543  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||  || |||||||| |||||||||||    
T  14380542 ggatggtaattcaaaccaaaatcatagtccttcaacagctctaaccacctcctctgcct 14380484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14379380 - 14378934
Alignment:
Q  20 catcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcct 119  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| ||||||  |||||||| |||| || || | ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14379380 catctttgtagctcccggatgaacactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaactcatcattgtcacgaatacaaattcttcct 14379281  T
Q  120 ctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgag 219  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  14379280 ctgaacctcaatacaccctgatcatccaccatgaagtcactttcctcagtgccattaccagcaactatcaaatcaacaaacttcacatccacttgctgcg 14379181  T
Q  220 cttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactg 319  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  14379180 cttctctgatactattcaagaaatcactattaatctttagcatccccaattgaacactctgaggtgtcaattcacagacaagactcaaatctctgaacta 14379081  T
Q  320 ctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattc 419  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||||||||  |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14379080 ctctagcaaatcgaattctttcaccattaaggcagacatatgcagcgttttcctacttaaggcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattc 14378981  T
Q  420 aagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || ||||||||||| | |||||  || |||||||| |||||||||||    
T  14378980 aaaccaaaatcatagtccttcaacagctctaaccacctcctctgcct 14378934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 21472407 - 21472865
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  | ||  || |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| | ||||||||     
T  21472407 caaatcatggtacatctttgtagctcccgggtgaatacttaagctgcttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcactatcaggaatg 21472506  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| || |  ||||||||| |||||||| | ||    
T  21472507 caaattattcctctgaacctcaacacgccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttgattactagcaaccatcaaatccacaaacttgacat 21472606  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | | || ||| ||||| |  |||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| ||| || || |||||||||||    
T  21472607 caattttctgcgcttccctaatactgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaactgcacactctgaggtggcaactcgcaaacaagactcaa 21472706  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||     
T  21472707 gtctctaaattgttcaaggaactcaaactcttttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttaccc 21472806  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||  | ||| | |||||| ||||||||    
T  21472807 ggatggtaattcaaaccaaaatcatagtccttcaacaattcaagccatcttctctgcct 21472865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 18795496 - 18795954
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||| |||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18795496 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactcttgtgactttcttccaagatcaactttttcaactcatcattgtccggaata 18795595  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| || || |||||||| ||||  | ||||| |  |  ||| ||||| |||||||| | ||    
T  18795596 caaattctacctctgaacctcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcttcagattgattactataaaacattaaatccacaaacttgacat 18795695  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | || || || ||||||| |||||| |||||||| | |||||  || |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18795696 caacctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctgaggtgacaattcacaaacaagactcaa 18795795  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||  |||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  18795796 gtctctaaactattcaagcaactcaaattcctttaccattaaagccgacatgtgtaacgtcttcctactcaaagcatctgcaactacattggctttaccc 18795895  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  18795896 ggatgatagttcaaaccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatctcctctgcct 18795954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21563603 - 21563174
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || || || || |||||| || | || || || | ||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21563603 tcatgatacatcttcgtagctcccggatggatgcttaagttactcctgtggctttcctctaaaattaactgtttcaactcatcattatcaggaatacaaa 21563504  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||| ||||| || |||| ||| || || ||||||||||| || |||||| ||||||  | ||||| ||||  ||  | ||| |||||||| | ||| ||    
T  21563503 ttctgcctctaaatctcaacacgccttgttcatcaaccttgaaatcactagcctcagcttgattactagtaaccaatatatccacaaacttgacatcaac 21563404  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    ||| || ||||||| |||||| |||||||||| |||||  || |||| ||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21563403 ttgttgcgcttctctgatacttttcaagaaatcactattgattttcaacatacccagctgcacactctgaggtgacaattcacaaacaagactcaagtct 21563304  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||  |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  21563303 ctaaactgttcaagcaactcaaattcctttaccatcatagccgacatgtgcaacgtcttcctactcaaagcatctgcaactacattagctttacccggat 21563204  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21563203 ggtaattcaagccaaaatcataatccttca 21563174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21569462 - 21569033
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || || || || |||||| || | || || || | ||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21569462 tcatgatacatcttcgtagctcccggatggatgcttaagttactcctgtggctttcctctaaaattaactgtttcaactcatcattatcaggaatacaaa 21569363  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||| ||||| || |||| ||| || || ||||||||||| || |||||| ||||||  | ||||| ||||  ||  | ||| |||||||| | ||| ||    
T  21569362 ttctgcctctaaatctcaacacgccttgttcatcaaccttgaaatcactagcctcagcttgattactagtaaccaatacatccacaaacttgacatcaac 21569263  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    ||| || ||||||| |||||| |||||||||| |||||  || |||| ||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21569262 ttgttgcgcttctctgatacttttcaagaaatcactattgattttcaacatacccagctgcacactctgaggtgacaattcacaaacaagactcaagtct 21569163  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||  |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  21569162 ctaaactgttcaagcaactcaaattcctttaccatcatagccgacatgtgcaacgtcttcctactcaaagcatctgcaactacattagctttacccggat 21569063  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21569062 ggtaattcaagccaaaatcataatccttca 21569033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 28282288 - 28281861
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||  |||||||  |||| || || || || ||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  28282288 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaata 28282189  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||  ||| | |||||| ||||| | ||    
T  28282188 caaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcaatactattaccagtaaccattagatcaaccaacttgacat 28282089  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||  || | |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||     
T  28282088 ccacttgctgtgcttctcgaatactattcaggaaatcgctgttaatctttagcatccccaactgtatgctttgaggcgacaactcacacaccaaactcat 28281989  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || |  || ||||||||||| | ||||| |||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||     
T  28281988 gtctctaaactgttccaataaatcaaattctttcatcatcatagcagacatatggagtgtcttcctactcaatgcatccgcgactacatttgcttttccc 28281889  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28281888 ggatggtaattcaacccaaaatcataat 28281861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 463
Target Start/End: Original strand, 19880114 - 19880559
Alignment:
Q  18 tacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 117  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||| | || ||||| | ||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||| |    
T  19880114 tacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactcttgtggctttcttccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgttaggaatacaaattctgc 19880213  T
Q  118 ctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctg 217  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| | ||||| |  |  ||| ||||| |||||||| | ||| || || ||    
T  19880214 ctctgaacctcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcttcagtctgattactatcaaccattaaatccacaaacttgacatcaacctgttg 19880313  T
Q  218 agcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaac 317  Q
     ||||||| ||||||  ||||||| | | |||  || |||| ||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19880314 tgcttctctgatactactcaagaattcattattgattttcaacatgcccaactgcacactctggggtgacaattcacaaacaaggctcaagtctctaaac 19880413  T
Q  318 tgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaat 417  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||  ||  |||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |    
T  19880414 tgttcaagcaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgcaacgtctttctactcaaagcatctgcaactacgttggctttacccggatgatagt 19880513  T
Q  418 tcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctg 463  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19880514 tcaacccaaaatcataatccttcaatagctctaaccatctcctctg 19880559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 466
Target Start/End: Original strand, 15460146 - 15460600
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||  |||| ||||| | ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  15460146 tcatgatacattttcgtagctcctggatgaatactcaaattgctcttatgactttcttctaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcgggaatacaaa 15460245  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||| ||||| || ||||  ||||| || |||||||| || || |||| ||||||||  | ||||| |  |  ||| ||||| |||||||| | ||| ||    
T  15460246 ttctgcctctaaatctcaatacaccttgttcatcaactttgaaatcaccatcctcagcttgattactatcaaccattaaatccacaaacttgacatcaac 15460345  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    | | || ||||||||||||||  ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| || | ||| || | |||||||||||| || ||||||||||||    
T  15460346 tcgttgtgcttctcggatactactcaagaaatcactattgatcttcagcatacccaaatgcacactttgcgatgacaattcacacactagactcaagtct 15460445  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    |||||||| || ||||| || || || ||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  15460446 ctaaactgttcaagcaattcgaactcctttaccatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaactacattagctttacccggat 15460545  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    | || ||||| ||||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  15460546 gatagttcaaaccaaaatcataatcctttaataattctagccatctcctctgcct 15460600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 364
Target Start/End: Original strand, 25768998 - 25769353
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||||  || |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  25768998 aaatcatggtacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttccaaaatcaactttttcaactcatcactatcaggaatac 25769097  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | | ||||| || |  ||| ||||| |||||||| | |||    
T  25769098 aaattcttcctctaaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcattttgattactagcaaccattaaatccacaaacttgacatc 25769197  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     | || ||| ||||| | |||| |||| ||||||| |||||  ||||||| ||| ||| |||| | |||||||||||| || ||||| | ||||||||||    
T  25769198 aattttctgcgcttccctgatattgtttaagaaatcactattgatcttcaacataccctactgcacactctgaggtgataactcacaaagaagactcaag 25769297  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaa 364  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  25769298 tctctaaattgttcaagaaactcaaactcttttaccatcatagcagacatgtgcaa 25769353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 15896900 - 15897327
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  ||||  || ||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  15896900 caaatcatgatacatctttgtagctcctggatggatactcaagatacttgtgtgactctctttaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtcaggaata 15896999  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    | || ||| ||||  || | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||  |   |  ||||| |||||||| | ||    
T  15897000 cgaattctgcctcgtaatcgcaacactccctgatcatcaaccttaaagtcactatcttcagtctgatttccaccaacaagtaaatctacaaactttacat 15897099  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||  || ||||||   |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||||||||||||| ||||||||| |  |||||    
T  15897100 caactttttgtgcttctttaatactgttcaagaattcactatcaatcttcagcattcctaacttcacactctgaggtgacacttcacagactaagctcaa 15897199  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||||||| |  |||||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  15897200 atctctaaactgttcaagcaactcaaattctttgatcatcatcgcggacatatgtagagttttcctacttaaagcatctgcaacaacattagctttacct 15897299  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15897300 ggatgataattcaacccaaaatcataat 15897327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 19488743 - 19488322
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||||  || |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  19488743 tcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatacgaa 19488644  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||| |||| ||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| ||    
T  19488643 ttctgcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaacctggaagtcaccatcttcagtttgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaac 19488544  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    || ||| ||||||   ||||| |||||||| |  ||    ||||||| ||| || ||||  | ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  19488543 tttctgcgcttctttaatactattcaagaactctctgctgatcttcaacatacctaacttcacactttgaggcgacaactcacaaactagactcaagtct 19488444  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||  ||||    
T  19488443 ctaaactgttcaagcaactcaaactctttaaccatcatagcagacatattcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacttggat 19488344  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
    | |||||||| |||||||||||    
T  19488343 gataattcaaaccaaaatcata 19488322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 34645054 - 34644606
Alignment:
Q  15 tggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||||||  ||||||  ||||| || |||||||| |||| ||    
T  34645054 tggtacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttatcaggaatgcaaattc 34644955  T
Q  115 ttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttg 214  Q
    | |||||||| |||| |||||| || ||||||||||| || |||| ||| ||||| | ||| | |  | |||| ||||| |||||||| |  || ||| |    
T  34644954 tgcctctgaatctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcaccatcttcagtttgattgctatcaatcattaaatccacaaacttgacgtccactag 34644855  T
Q  215 ctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctcta 314  Q
     || |||||||  ||||| | |||||| | |||||  || |||| ||| |||||||| | |||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||    
T  34644854 ttgcgcttctctaatactatccaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaactcgcaaacaaggctcaaatctcta 34644755  T
Q  315 aactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggt 414  Q
    ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||  |||| || || || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |    
T  34644754 aactgttcaagcaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtctttctactcaaggcatctgcaactacattagctttacccggatgat 34644655  T
Q  415 aattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctg 463  Q
    | ||||| ||||| ||||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  34644654 agttcaacccaaactcataatccttcaataactctagccatctcctctg 34644606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18966767 - 18966414
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||    
T  18966767 caaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcatcttcctcatctcatcattgtcaggaata 18966668  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||  || | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||  | | |  ||||| |||||||| | ||    
T  18966667 caaattctacctcgaaatcacaacactccctgatcatcaaccttaaagtcactatctttagtctgatttccaccaataaataaatctacaaactttacat 18966568  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 306  Q
      |||| ||| ||||||   ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  18966567 tcactttctgcgcttctttaatactatt-gagaaattcactatcaatcttcagcattcctaacttcacactctgaggtgacaattcatagactaaactca 18966469  T
Q  307 agtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatg 361  Q
     |||||||||||| || |||| ||| || |||||  |||||| |||| |||||||    
T  18966468 ggtctctaaactgttcgagcagctccaactctttagccatcatagcagacatatg 18966414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 1542559 - 1542140
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| ||||||    
T  1542559 caaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaata 1542460  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||  ||| ||| |||| || ||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| |  | || || |  || ||| || |||||||| | ||    
T  1542459 caaattctctctcggaatctcaacagaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctggtcactagcaaccaacaagtccacaaacttgacat 1542360  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||| ||| |||||   |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| ||||||| || | |||||     
T  1542359 caactttctgtgcttccttgatactcttcaggaactcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcat 1542260  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || || ||||| || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  1542259 atctctaaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtcttccgactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 1542160  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaa 427  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  1542159 ggatggtaattcaaaccaaa 1542140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16626191 - 16625765
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  16626191 aaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 16626092  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  16626091 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 16625992  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||| | |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  16625991 aactttctgtgcttccttgatatttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 16625893  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  16625892 atctctaaactgttcaagcaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 16625793  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  16625792 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 16625765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 18197200 - 18196875
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| | ||| ||||||    
T  18197200 caaatcatgatacatcttggtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcgtcgtctggaata 18197101  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||  || |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |  || ||| || |||||||| |  |    
T  18197100 caaattctacctcgaaatctcaacacaccttgatcatcgaccttaaagtcactatccttagtgtgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacgt 18197001  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||| ||| |||||    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || | ||  | |||||||| ||||||||| || || | ||||||    
T  18197000 caactttctgcgcttcaataatacttttcaagaaatcactatcaatcttcagcattcctagcttcacactctgagatgacaattcgcaaactaaactcaa 18196901  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaa 333  Q
     ||||||| ||| || || |||||||    
T  18196900 atctctaacctgttcaagtaactcaa 18196875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 25113359 - 25113785
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| |||||||    
T  25113359 aaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatac 25113458  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || ||||| || | |||    
T  25113459 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgaatttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaattttacatc 25113558  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   ||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  |||||||||||| |||| || || | |||||     
T  25113559 gactttctgtgcttccttgatacttctc-agaaattcactatcaatcttcagcatacccagttttacgctctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 25113657  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| || || ||||| || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  25113658 atctctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 25113757  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  25113758 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 25113785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 29591394 - 29590962
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  29591394 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 29591295  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||| ||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || | ||| ||| || |||||||| | |||    
T  29591294 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatc 29591195  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  29591194 aactttctgtgcttccttgatacctttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 29591096  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  29591095 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 29590996  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  29590995 ggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 29590962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 435
Target Start/End: Original strand, 19865503 - 19865920
Alignment:
Q  18 tacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 117  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||  || ||||  ||||||||||||| ||       
T  19865503 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattcgaa 19865602  T
Q  118 ctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctg 217  Q
    |||  || |||| |||||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||||| | ||||| || |  || ||| || | |||||| | ||| |||| |||    
T  19865603 ctcgaaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctataaacttgacatcaactttctg 19865702  T
Q  218 agcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaa 316  Q
     |||||   |||||| || | |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||| |||| |||| | ||||| || |  ||||  ||||||||    
T  19865703 tgcttccttgatacttttta-gaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacactttgagatgaccagtcacaaactaagctcatatctctaaa 19865801  T
Q  317 ctgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaa 416  Q
    ||| || |||| ||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||    
T  19865802 ctgttcaagcagctcgaactctttaaccatcatagcagacatatgcaacgttttcctactcaaggcatcagcaacaacattagctttacctggatgataa 19865901  T
Q  417 ttcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| ||||| |||||||    
T  19865902 ttcaaaccaaagtcataat 19865920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 441
Target Start/End: Original strand, 23079278 - 23079708
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||| ||    
T  23079278 atcatgatacattttcgtagctcccggatggatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtcaggaatagaa 23079377  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||| |||| ||| |||| ||| || |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| | ||||| || |  || |||||| |||||| | | ||| |    
T  23079378 attctccctcggaatctcaacactccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgattactagcaaccaacaaatctacaaacctaacatcaa 23079477  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    |||  || ||||||   ||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||| || | |   | |||||||| |||||| || ||||| | |||||| |    
T  23079478 ctttatgcgcttctttaatacttttca-gaaattcactatcaattttcagcattcctagcctcacactctgagatgacaactcgcagactaaactcaaat 23079576  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || || || | ||| ||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  23079577 ctctaaactgttccagaaaattaaactcttttaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 23079676  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||| || || || | ||||||||||| |||||    
T  23079677 atgatagtttaaactaaaatcataatccttca 23079708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 5838694 - 5838290
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  ||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||||| |||    
T  5838694 caaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcctcgagaatcattttcttcatctcttcattgtcagggata 5838595  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |   |||  ||| || | |||||| || ||||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||     | |||||| |||||||| | ||    
T  5838594 caaatttgaccttggaatcttaacacaccatggtcatcgaccttaaaatcaccatcttcagtctgattactagcgactaacaaatccacaaacttgacat 5838495  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||| ||| |||||   |||||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||| ||||||||| ||||||| || | |||||     
T  5838494 caactttctgtgcttccttgatactattcagaaaatcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactatgaggtgaccattcacaaaccaaactcat 5838395  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     |||||||||||||| || ||||| || ||| | ||||||| |||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  5838394 atctctaaactgctcaagtaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaaagtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 5838295  T
Q  408 ggatg 412  Q
    |||||    
T  5838294 ggatg 5838290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 2874277 - 2873851
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  ||  ||||||| || ||||    
T  2874277 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctctccattgtctgggatac 2874178  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||| | || ||||| | ||  | || |  || ||| ||  ||||||| | |||    
T  2874177 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcattgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtcctcaaactttacatc 2874078  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     |||| ||| |||||   |||| | ||||  || | |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||      
T  2874077 aactttctgtgcttccttgatatttttcagaaactcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcata 2873978  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| |    
T  2873977 tctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcgacaacattagctttacctg 2873878  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  2873877 gatgataattcaaaccaaagtcataat 2873851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22761927 - 22761505
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| ||| |||||||||    
T  22761927 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaa 22761828  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    |  || ||||  ||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||| || ||||| | || || || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  22761827 atcctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaagtcactgtcttcagtctgatcactagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaa 22761728  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtc 310  Q
    |||  || ||||||   ||||| |||| ||| | | |||||||||||||||| || | ||  | ||| | || | ||| |||||| || | |||||| ||    
T  22761727 ctttttgcgcttctttaatactcttcaggaattcattatcaatcttcagcattcctagcttcacactttcagataacatttcacaaactaaactcaaatc 22761628  T
Q  311 tctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagga 410  Q
    ||| || || || |||||||| || || ||||||||||  ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||    
T  22761627 tctgaattgttcaagcaactcgaactcctttaccatcatggcagacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacctgga 22761528  T
Q  411 tggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
    || ||  ||||  ||||||||||    
T  22761527 tgatagctcaactcaaaatcata 22761505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 22434686 - 22435102
Alignment:
Q  19 acatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcc 118  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || ||||   |||||||||||| ||   |    
T  22434686 acatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatttcttcatcaacaggaatacaaattcgatc 22434785  T
Q  119 tctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctga 218  Q
    || ||| |||| |||||| || ||||| ||||| ||||||| ||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| |||  |||     
T  22434786 tcggaatctcaacacaccgtggtcatcgaccttgaagtcaccatcttcagtctaattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactctctgt 22434885  T
Q  219 gcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaac 317  Q
    ||||||  |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| | ||||| || |  ||||| |||||||||    
T  22434886 gcttctttgatactcttca-gaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgaggtgaccactcacaaactaagctcaaatctctaaac 22434984  T
Q  318 tgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaat 417  Q
    || || |||||||| || ||| | || |||| |||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || |    
T  22434985 tgttcaagcaactcgaactctctaactatcatagcggacatatgcaacgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagt 22435084  T
Q  418 tcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  22435085 tcaaaccaaagtcataat 22435102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 22443084 - 22443500
Alignment:
Q  19 acatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcc 118  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || ||||   |||||||||||| ||   |    
T  22443084 acatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatttcttcatcaacaggaatacaaattcgatc 22443183  T
Q  119 tctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctga 218  Q
    || ||| |||| |||||| || ||||| ||||| ||||||| ||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| |||  |||     
T  22443184 tcggaatctcaacacaccgtggtcatcgaccttgaagtcaccatcttcagtctaattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactatctgt 22443283  T
Q  219 gcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaac 317  Q
    ||||||  |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| | ||||| || |  ||||| |||||||||    
T  22443284 gcttctttgatactcttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccactcacaaactaagctcaaatctctaaac 22443382  T
Q  318 tgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaat 417  Q
    || || |||||||| || ||| | || |||| |||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || |    
T  22443383 tgttcaagcaactcgaactctctaactatcatagcggacatatgcaacgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagt 22443482  T
Q  418 tcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  22443483 tcaaaccaaagtcataat 22443500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16927105 - 16926688
Alignment:
Q  18 tacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||||||||||  ||  |||  ||  ||| ||||||||| ||||  |  |    
T  16927105 tacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcattttcctcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgac 16927006  T
Q  118 ctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctg 217  Q
    ||| ||| |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| |||| |||    
T  16927005 ctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagtctaattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctg 16926906  T
Q  218 agcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaa 316  Q
     || |||   ||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||  |  | | |||||||| ||  |||||| || | |||||  ||||||||    
T  16926905 tgcctctttaatactcttca-gaaattcactatcaatcttccgcattcccagtttcacattctgaggtaaccgttcacaaaccaaactcatatctctaaa 16926807  T
Q  317 ctgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaa 416  Q
    ||| || || ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||     
T  16926806 ctgttccagtaactcgaactcttttaccatcatagcggacatgtgcaatgacttcctactcaatgcatctgcaacaacattagctttacctggatgatag 16926707  T
Q  417 ttcaagccaaaatcataat 435  Q
     ||||  ||||||||||||    
T  16926706 ctcaactcaaaatcataat 16926688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24312642 - 24312216
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  24312642 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 24312543  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||  || |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  24312542 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 24312443  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     |||| ||| |||||   ||| || ||||| || | |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||      
T  24312442 aactttctgtgcttccttgatgcttttcaaaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcata 24312343  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||| | || ||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| | ||| | ||| ||||| || ||||| |    
T  24312342 tctctaaactgttcaagcaattcgaactctctaacaatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggaatctgaaacaacattagctttacctg 24312243  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  24312242 gatgataattcaaaccaaagtcataat 24312216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 25609333 - 25608909
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| ||||  || |||| ||| |||||||||    
T  25609333 atcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcttcatcgtctggaatacaa 25609234  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    |  || ||||  |||||||  ||||| || ||||| | |||||| ||||  || ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  25609233 atcctacctcgaaacctcaatacaccttggtcatcgatcttaaaatcaccgtcttcagtctgattactagcaaccaacaagtccacaaacttgacatcaa 25609134  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||  ||||||   ||| |  ||| |||||| |||||||||||||||||| || | || || | ||||||||||| ||||||| || | |||||| |    
T  25609133 ctttctatgcttctttaatatttctca-gaaattcactatcaatcttcagcattcctagctttacaatctgaggtgaccattcacaaactaaactcaaat 25609035  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || | |||||| || ||| | ||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  25609034 ctctaaactgttccaacaactcgaactctctaaccatcatagcagacatatgcaaagtcttcctactcaaggcgtctgcaacaacattagctttacctgg 25608935  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||| ||  ||||  ||||||||||||    
T  25608934 atgatagctcaactcaaaatcataat 25608909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 245 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 27565059 - 27564838
Alignment:
Q  245 actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttacc 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| ||||||| || |  ||||  ||||||||||| || || || || || | | | |||    
T  27565059 actatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgaggtgactattcacaaaccaagctcatatctctaaactgttcaagtaattcgaactttctaacc 27564960  T
Q  345 atcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagta 444  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |    
T  27564959 atcaaagcggacatatgcaatgtcttcctgctcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttcagca 27564860  T
Q  445 gttctaaccatctcctctgcct 466  Q
     ||||| |||||| | ||||||    
T  27564859 attctagccatcttcgctgcct 27564838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20636773 - 20636342
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| ||| |||||| ||    
T  20636773 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaataaaa 20636674  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    |  || ||||  ||||||| |||||| |||||||| |  ||||| |||||  | ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  20636673 atcctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgccttcagtctgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaa 20636574  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    | |  || ||||||   ||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| || | ||  | ||| | || ||||| |||||| || | |||||| |    
T  20636573 ccttttgcgcttctttaatactcttc-agaaattcattatcaatcttcagcattcctagcttcacactttcagatgacatttcacaaactaaactcaaat 20636475  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||| ||||| || |||||||| || || |||||||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  20636474 ctctgaactgttcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcgaacatatgtaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacccgg 20636375  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataattcttcag 442  Q
    ||| ||  ||||  |||||||||| | ||||||    
T  20636374 atgatagctcaactcaaaatcatagtccttcag 20636342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 28262669 - 28262245
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || || | ||| |||||||||    
T  28262669 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcgtcgtctggaatacaa 28262570  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||| |||| ||| |||| ||| || |||||||| |  ||||| |||||  | | ||  | ||  | || |  || |||||| || ||||||| ||| |    
T  28262569 attctccctcggaatctcaacacgccttgatcatcgattttaaaatcactgccttgagcctgatctctagcaaccaacaaatccacgaacttcacatcaa 28262470  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| ||||||  ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||| ||| ||||||| || | |||||  |    
T  28262469 ctttctgtgcttctttgatgcttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggcgaccattcacaaaccaaactcatat 28262371  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||| ||||| || || ||||| || ||| | |||||||  ||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  28262370 ctctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatggcagacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 28262271  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
     || ||||| || ||||| |||||||    
T  28262270 gtgataatttaaaccaaagtcataat 28262245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 28341418 - 28340994
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || || | ||| |||||||||    
T  28341418 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcgtcgtctggaatacaa 28341319  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||| |||| ||| |||| ||| || |||||||| |  ||||| |||||  | | ||  | ||  | || |  || |||||| || ||||||| ||| |    
T  28341318 attctccctcggaatctcaacacgccttgatcatcgattttaaaatcactgccttgagcctgatctctagcaaccaacaaatccacgaacttcacatcaa 28341219  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| ||||||  ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||| ||| ||||||| || | |||||  |    
T  28341218 ctttctgtgcttctttgatgcttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggcgaccattcacaaaccaaactcatat 28341120  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||| ||||| || || ||||| || ||| | |||||||  ||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  28341119 ctctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatggcagacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 28341020  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
     || ||||| || ||||| |||||||    
T  28341019 gtgataatttaaaccaaagtcataat 28340994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 18449583 - 18449743
Alignment:
Q  275 actctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctg 374  Q
    |||||| || |||| |||||| || | |||||||||| | |||||  | |||||||| || ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||     
T  18449583 actctgcggcgacacttcacaaaccaaactcaagtctttgaactgtgcaagcaactccaactctttaaccatcatagcagacatatgtaatgttttccta 18449682  T
Q  375 ctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    || || ||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||| |||||    
T  18449683 cttaaagcatatgcaacaacattagccttacccggatggtaattcaacccgaaattataat 18449743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22078162 - 22078026
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| |||  || |||||    
T  22078162 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtctagagtacaa 22078063  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaa 147  Q
    | ||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||    
T  22078062 attcttcctcgaaacctcaacataccttgatcatcaa 22078026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 27188242 - 27188669
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| |||||     
T  27188242 caaatcatgatacattttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatg 27188341  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||| ||| |||| ||| || | |||||| |   |||| || || || ||||  | ||  | || |  ||  ||||| |||||||| | ||    
T  27188342 caaattcttcctcggaatctcaacacgccttcatcatcgattctaaaatcgctgtcttcagcctgatctctagcaaccaataaatccacaaactttacat 27188441  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 306  Q
    | |||   || ||||||  ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||| ||||||| || | |||||    
T  27188442 caactctttgtgcttctttgatgcttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccaatttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactca 27188540  T
Q  307 agtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacc 406  Q
      ||||  ||||| || || | |||||| ||| | |||||||  ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  27188541 tatctcggaactgttcaagtagctcaaactctctgaccatcatggcggacatatgcaacgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacc 27188640  T
Q  407 aggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
     ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  27188641 cggatgataattcaaaccaaagtcataat 27188669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27260998 - 27260571
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| |||||     
T  27260998 caaatcatgatacattttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatg 27260899  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||| ||| |||| ||| || | |||||| |   |||| || || || ||||  | ||  | || |  ||  ||||| |||||||| | ||    
T  27260898 caaattcttcctcggaatctcaacacgccttcatcatcgattctaaaatcgctgtcttcagcctgatctctagcaaccaataaatccacaaactttacat 27260799  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 306  Q
    | |||   || ||||||  ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||| ||||||| || | |||||    
T  27260798 caactctttgtgcttctttgatgcttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccaatttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactca 27260700  T
Q  307 agtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacc 406  Q
      ||||  ||||| || || | |||||| ||| | |||||||  ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  27260699 tatctcggaactgttcaagtagctcaaactctctgaccatcatggcggacatatgcaacgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacc 27260600  T
Q  407 aggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
     ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  27260599 cggatgataattcaaaccaaagtcataat 27260571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16381554 - 16381390
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  16381554 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 16381455  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||| ||||||||    
T  16381454 tttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatcttctctgcct 16381390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16649150 - 16648986
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  16649150 actcaaatctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 16649051  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  16649050 tttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatctcctctgcct 16648986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 18837089 - 18836970
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  18837089 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 18836990  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || || ||||| ||| ||||    
T  18836989 ttcccgggatgataactcaa 18836970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Original strand, 21928305 - 21928424
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| || || ||||| ||||| |||    
T  21928305 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattcaaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcgtcggcaacaacatttgcc 21928404  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || || ||||| ||| ||||    
T  21928405 ttcccgggatgataactcaa 21928424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 35275267 - 35275148
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||||||||| |||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  35275267 actcaaatctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcaaacataagcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagcc 35275168  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || | |||||| ||| ||||    
T  35275167 ttcctaggatgataactcaa 35275148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16962910 - 16962493
Alignment:
Q  18 tacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 117  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  ||  |||  ||  ||| ||||||||| ||||  |  |    
T  16962910 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcctcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgac 16962811  T
Q  118 ctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctg 217  Q
    ||| ||| |||| ||| || || ||||| || |||||||||| ||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| ||||  ||    
T  16962810 ctcggaatctcaacacgccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttatg 16962711  T
Q  218 agcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaa 316  Q
     || | |   ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||| || ||  |||||| || | |||||  ||||||||    
T  16962710 tgcctttttaatactcttc-agaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgacgtaaccgttcacaaaccaaactcatatctctaaa 16962612  T
Q  317 ctgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaa 416  Q
    ||| || || ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||  ||||| |||||||||||  |||| ||||| || ||||| ||||| ||     
T  16962611 ctgttccagtaactcgaactcttttaccatcatagcggacatgtgcaatgacttcctactcaatgcatctccaacaacattagctttacctggatgatag 16962512  T
Q  417 ttcaagccaaaatcataat 435  Q
     ||||  ||||||||||||    
T  16962511 ctcaactcaaaatcataat 16962493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18407152 - 18407048
Alignment:
Q  275 actctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctg 374  Q
    ||||| || ||||| |||||| || | |||||| ||||| ||||| || |||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||| || ||||||    
T  18407152 actctcagatgacatttcacaaactaaactcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctg 18407053  T
Q  375 ctcaa 379  Q
    |||||    
T  18407052 ctcaa 18407048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Original strand, 23997348 - 23997512
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  23997348 actcaagtctcgaaattgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 23997447  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| | | ||   ||| |||||||||||||||||    
T  23997448 tttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccgtaagatattccaaccatctcctctgcct 23997512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 1647995 - 1647876
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| ||| |||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  1647995 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacacatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 1647896  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || || ||||| ||| ||||    
T  1647895 tttcctggatgataactcaa 1647876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 23026897 - 23026802
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacatt 397  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| |||||| |||| |||||    
T  23026897 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcaaacatatgcaaagtctttatactcaaagcatcaacaacaacatt 23026802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18407414 - 18407280
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || ||||  || |||||||||    
T  18407414 atcatgatacatcttcgtagctcccagatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatctggaatacaa 18407315  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatc 145  Q
    |  || ||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  18407314 atcctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatc 18407280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Original strand, 18572751 - 18572872
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaa--ttcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattgg 399  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || ||   ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |    
T  18572751 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctctttaaccatcaaagcagacatatgcaaggtctttctactcaaagcatcagcaacaacattag 18572850  T
Q  400 ccttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    |||| || ||||| ||| ||||    
T  18572851 ccttcccgggatgataactcaa 18572872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27330905 - 27330807
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaataca 109  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||| ||| ||||||||    
T  27330905 atcatgttacatcttcgcagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcgagaatcatcttcttcatctcatcatcgtctggaataca 27330807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27391645 - 27391547
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaataca 109  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||| ||| ||||||||    
T  27391645 atcatgttacatcttcgcagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcgagaatcatcttcttcatctcatcatcgtctggaataca 27391547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 403
Target Start/End: Original strand, 16099150 - 16099251
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| ||| |||||||| |||||||||| || || || ||||| |||||| |||| ||||| |||    
T  16099150 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccttcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcaacaacaacattagcc 16099249  T
Q  402 tt 403  Q
    ||    
T  16099250 tt 16099251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 27566454 - 27566385
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatca 78  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||    
T  27566454 aaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttttatgactctcttcaagaatca 27566385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Original strand, 14129569 - 14129688
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || | ||| |||||| |||| ||||| |||    
T  14129569 actcaagtctcgaaagtgctcaatcaatttaaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctacacaaagcatcaacaacaacattagcc 14129668  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || || ||||| ||| ||||    
T  14129669 ttcccgggatgataactcaa 14129688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14624538 - 14624437
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||| ||||||||| |  || || |||||||| |||||||||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  14624538 actcaaatctcgaaactgctcaattaattccaattctttaaccatcaaagcagaaatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 14624439  T
Q  402 tt 403  Q
    ||    
T  14624438 tt 14624437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 85
Target Start/End: Original strand, 18436415 - 18436492
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaacttttt 85  Q
    ||||||||| ||||| || ||||  ||||| ||||||||||| |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||    
T  18436415 caaatcatgatacatttttgtaggtcccggatgaatactcaaattacttctgtgactttcttccagaatcaacttttt 18436492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Original strand, 16234128 - 16234292
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||  | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || | ||| |||||  |||| ||||| |||    
T  16234128 actcaagtctcgaaactgctaaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctacacaaagcatccacaacaacattagcc 16234227  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   |||||||||||| || |||||    
T  16234228 ttcccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattctaaccatcttctttgcct 16234292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 21951866 - 21952324
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21951866 caaatcatgaaacatatttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcttcaaggatcaacttcttcaaatcatcattgttaggaata 21951965  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  21951966 caaactcttcctctgaatctcagtacaccctgatcatccaccttaaaatcactgtcctcagtgtcactaccagtagtcatcaaatcaaccaatttcaaat 21952065  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    || ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  21952066 ctgctttctgggcttctcgaatactgttcaaaaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgagatgacagttcacagacaaggctcaa 21952165  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21952166 gtctctaaactgttctaacaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctgctcaacgcatcagcaaccacattggccttacca 21952265  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21952266 ggatggtaattcaagccaaaatcgtaatccttcagtaactctaaccatctcctctgcct 21952324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 466
Target Start/End: Original strand, 20295372 - 20295827
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20295372 atcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcttcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 20295471  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||| || |||| |||      
T  20295472 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactgtcctcggtgtcactaccagtcgtcatccaatcaaccaatttcacatccg 20295571  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtc 310  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20295572 ctttctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgaatactctgaggtgacaattcacagaccaaactcaagtc 20295671  T
Q  311 tctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagga 410  Q
    ||||||||  |||| ||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  20295672 tctaaactattctaacaattcaaattctttcgccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctgctcaaagcatcagcaactacattggccttaccaggg 20295771  T
Q  411 tggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  20295772 tggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatcttctctgcct 20295827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24099005 - 24098547
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24099005 caaatcatggtacatctttgtagctcccgggtgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaacccatcattgtcaggaata 24098906  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24098905 caaattcttcctctgaacctcaaaacaccctgatcgtcaaccttgaagtcactatcctcagtgtcattaccagtaatcatcaaatcaacaaacttcaaat 24098806  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  24098805 ccacttgctgagcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaactcacagacaaggctcaa 24098706  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24098705 gtctctaaactgttctagcaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctgctcaacgcatcagcaaccacattggctttacca 24098606  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  24098605 ggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaaaagatctaaccatcttctctgcct 24098547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 37678037 - 37678495
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  37678037 caaatcatgatacatttttgtagcccctgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaata 37678136  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  37678137 caaactctacctctgaacctcagtacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccggaagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 37678236  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37678237 cttctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaatcttcaacattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcat 37678336  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37678337 atctctgaactgttctaacaactcaaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactcaaagcatcaacaaccacattggccttacca 37678436  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  37678437 ggatggtaattcaaaccaaaatcaaaatccttcagtaactctaaccacctcctctgcct 37678495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 31539399 - 31538941
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  31539399 caaatcatgatacattttcgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctccagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaata 31539300  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31539299 caaactctacctgtgaacctcagcacaccctgatcatcaattttgaaatcactatccccagtgtcattaccagaagtcaccaaatcaacaaacttcaaat 31539200  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31539199 cttctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcat 31539100  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||  |||  ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31539099 atctctgaactgttctaacaactcaaactctttcaccatcaaagctgacacgtgcaacgttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggccttacca 31539000  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  31538999 ggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactctaaccacctcctctgcct 31538941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 19855262 - 19855720
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||| ||  || ||||| |||| || || | ||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  19855262 caaatcatgatacattttcgtagctcccagatgaatacttaagctattcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaactcgtcattatcaggaata 19855361  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||| | ||    
T  19855362 caaatccttcctctgaacctcaatacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaacaatcaaatcaacaaacttaacat 19855461  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19855462 ccacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgtacactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaa 19855561  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  19855562 gtctctaaactgctctagtaaatcaaattctttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttaccc 19855661  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  19855662 ggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatctcctctgcct 19855720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 74 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23197582 - 23197190
Alignment:
Q  74 aatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtca 173  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  23197582 aatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaactttaaagtcactatcttcagtttca 23197483  T
Q  174 ttaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgta 273  Q
     |||||| |  ||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23197482 ctaccagcaaccatcaaatccacaaacttaacatccacttgctgtgcttcacggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgta 23197383  T
Q  274 tactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcct 373  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || |||||    
T  23197382 cactctgaggtgtcaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcct 23197283  T
Q  374 gctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  23197282 gctcaacgcatcagcaaccacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatcttctctgcct 23197190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 20939465 - 20939007
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||     
T  20939465 caaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaattaacttttttaaatcatcatcatcaggaatg 20939366  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||| ||||| ||    
T  20939365 caaattcttcttctgaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccattaaatcaacaaccttcacat 20939266  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20939265 ccacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaattactattaattttcagcatccccaattgtacactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaa 20939166  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20939165 gtctctaaactgctataacaaatcaaattcttttaccatcaaagcagacatatgcaacattttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttacca 20939066  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  20939065 ggatggtaatttaagccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatctcctctgcct 20939007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 19662539 - 19662081
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  ||||  ||||||| ||  |||||||| |||| || || | ||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  19662539 caaatcatgatacattttcgtagcttccggacgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaactcgtcattatcaggaata 19662440  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||| | ||| | ||    
T  19662439 caaattcttcctctgaacctcaatacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatccttagtgccattaccagcaaccatcaaatcaaccagcttgacat 19662340  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||| ||| |||||||||||||| |||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  19662339 ccacttcctgtgcttctcggatactattcaagaaatcattgttaatcttcagcatccccaactgtacactctggggtgtcaattcacaaacaagactcaa 19662240  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||     
T  19662239 atctctaaactgctctagcaaatcaaattctttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacct 19662140  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||  || |||||||| |||||||||||    
T  19662139 ggatgataattcaaaccaaaatcataatccttcaacagctctaaccacctcctctgcct 19662081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 89 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 20835221 - 20834844
Alignment:
Q  89 atcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatc 188  Q
    ||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  |||     
T  20835221 atcatcatcatcgggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagtgccattaccagcaaccatt 20835122  T
Q  189 aaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgaca 288  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| | || |||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |    
T  20835121 aaatcaacaaacttcacatccactagttgtgcttctcggatactattcaagaaatcattattaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtta 20835022  T
Q  289 attcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagc 388  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||    
T  20835021 attcacagacaaggctcaagtctctaaactgttctagcaaatcgaattctttcaccattaaagcagacatatgcagcgttttcctactcaaggcatctgc 20834922  T
Q  389 aaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  || |||||||||||||||||    
T  20834921 aaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacaactccaaccatctcctctgcct 20834844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20856158 - 20855735
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||  |||| ||||| | ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  20856158 tcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaagttgctcttatgactttcttctaaaatcaacttcttcaattcctcattgtcaggaatacaaa 20856059  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||| ||||| || |||| |||||| || ||||||||||| || ||||||| ||| |    ||||| ||    ||||||||| |||||||| | ||| ||    
T  20856058 ttctgcctcttaatctcaacacaccttgctcatcaaccttgaaatcactattctccgctagattactagcgaccatcaaatccacaaacttaacatcaac 20855959  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    ||| || ||||||| |||||| | |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| | ||| |||| |||||||||||| || ||||| || ||     
T  20855958 ttgttgcgcttctctgatactatccaagaaatcactattgatcttcagcatacccaactgcacactttgagatgacaattcacacacgagacttaaatcc 20855859  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    |||||||| || ||||| | ||| || |||||||| || ||  |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||| ||||    
T  20855858 ctaaactgttcgagcaattaaaactcctttaccattaaggccgacatgtgcaacgtcttcctactcaacgcatctgcaactacattaactttacccggat 20855759  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20855758 ggtaattcaagccaaaatcataat 20855735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 16373486 - 16373914
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||| ||||||    
T  16373486 caaatcatgatacatcttcgcagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtctggaata 16373585  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||  || |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||    
T  16373586 caaattctacctcgaaatctcaacacaccttgatcatcgaccttaaagtcactgtcttcagtctgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacat 16373685  T
Q  208 ctacttgctgag-cttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 306  Q
    | |||| ||| | ||| |   ||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||| ||||||| || | |||||    
T  16373686 caactttctgcgtcttttttaatacttttcaagaattcactatcaatcttcagcattcccagcttcacactctgaggtgaccattcacaaactaaactca 16373785  T
Q  307 agtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacc 406  Q
      ||||||||||| || |||||||| || || || ||||||| |||| |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  16373786 gatctctaaactgttcaagcaactcgaactccttaaccatcatagcagacatatgcaaagtcttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacc 16373885  T
Q  407 aggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16373886 tggatgataattcaaaccaaaatcataat 16373914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 22109980 - 22110406
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| ||| |||||||    
T  22109980 aaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatac 22110079  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| ||| |||| ||| |||| ||| || || ||||| | |||||| |||||||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  22110080 aaattctgcctcggaatctcaacactccttggtcatcgatcttaaaatcactatcttcagtctgattactaggaaccaacaagtccacaaacttaacatc 22110179  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     | ||  || ||||||   |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||  | ||||||| |||||| ||| || || | ||||||     
T  22110180 gattttatgcgcttctttaatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcccagcttcacactctgatgtgacatttcgcatactaaactcaaa 22110279  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |  || || ||||| |    
T  22110280 tctctaaactattcaagcaactcaaactcttttaccatcatagaggacatatgcaacgtcttcctacttaaggcatctgcaacaaatttagctttacctg 22110379  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||    
T  22110380 gatgataattcaacccaaaatcataat 22110406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 22113829 - 22114255
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| ||| |||||||    
T  22113829 aaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatac 22113928  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| ||| |||| ||| |||| ||| || || ||||| | |||||| |||||||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  22113929 aaattctgcctcggaatctcaacactccttggtcatcgatcttaaaatcactatcttcagtctgattactaggaaccaacaagtccacaaacttaacatc 22114028  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     | ||  || ||||||   |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||  | ||||||| |||||| ||| || || | ||||||     
T  22114029 gattttatgcgcttctttaatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcccagcttcacactctgatgtgacatttcgcatactaaactcaaa 22114128  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |  || || ||||| |    
T  22114129 tctctaaactattcaagcaactcaaactcttttaccatcatagaggacatatgcaacgtcttcctacttaaggcatctgcaacaaatttagctttacctg 22114228  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||    
T  22114229 gatgataattcaacccaaaatcataat 22114255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 41353064 - 41352637
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| ||||||    
T  41353064 caaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaata 41352965  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    ||||  ||||||| ||| |||| |||||| |||||||| | |||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || |||||| |||||||| | ||    
T  41352964 caaatccttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgatcttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaaatccacaaactttacat 41352865  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||| ||| ||||||  ||| ||  |||  |||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| ||||||| || | |||||     
T  41352864 caactttctgtgcttctttgatgcttctcagaaaatcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcat 41352765  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||  ||||| || || |||||||| ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  41352764 atctcggaactgttcaagtaactcaaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttaccc 41352665  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  41352664 ggatggtaattcaacccaaagtcataat 41352637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 51332894 - 51332462
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  51332894 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 51332795  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || || || | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  51332794 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttccgtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 51332695  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     |||| ||| |||||   |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||| ||||||| || | |||||      
T  51332694 aactttctgtgcttccttgatacttttcaggaattcactatcaatcttcagcatacccaatttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcata 51332595  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||| |||  ||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  51332594 tctctaaactgttcaagcaattcgaactctttgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctaatcaaggcatctgcaacaacattagctttacctg 51332495  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  51332494 gatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 51332462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 21831261 - 21831687
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || ||||||||  | ||||    
T  21831261 aaatcatgataaatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctaggatac 21831360  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  21831361 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 21831460  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     |||  ||| |||||   |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||      
T  21831461 aactctctgtgcttccttgatacttttcaggaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcata 21831560  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  21831561 tctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctg 21831660  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  21831661 gatgataattcaaaccaaagtcataat 21831687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 33390430 - 33390012
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||| ||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  33390430 aaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcgagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 33390331  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||  || |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  33390330 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 33390231  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| || | |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| ||||||| || | ||||||    
T  33390230 aactttctgtgcttccttgatacttttta-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcaa 33390132  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  33390131 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttaccc 33390032  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaa 427  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  33390031 ggatgataattcaaaccaaa 33390012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 19760274 - 19759848
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| ||||||||  |||| || || || ||||||||  ||||  || |||||||||||||||||| |||| |||  ||||| | |||||||||||    
T  19760274 aaatcatgatacatctttatagctcctggatggatactcaagctacttatgtgactctcttcaagaatcatctttctcatctcatcgtcgtcaggaatac 19760175  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| ||| |||| ||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | | | ||   | | |  ||||| |||||||| | |||    
T  19760174 aaattctacctcggaatcgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcactatcttcagtctgagtccctccaataaataaatctacaaactttacatc 19760075  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
      | | ||| ||||||   ||||| ||||  || | ||||||||||||||||||  | ||||  | |||||||||||||| ||||||||| | ||||||     
T  19760074 agccttctgtgcttcttttatactattcataaattcactatcaatcttcagcatttctaacttcacactctgaggtgacacttcacagactaaactcaaa 19759975  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||| || |||| ||| |||||||  | ||||| |||  ||||||| |  |||||||| || || ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  19759974 tctctaaactgttcaagcagctccaattcttagatcatcatagcggacatatgtagagttttcctacttaacgcatctgcaacaacattagcttttcctg 19759875  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||    
T  19759874 gatgataattcaacccaaaatcataat 19759848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 50619646 - 50619305
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||||||  ||||||    
T  50619646 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttttatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcattgtatggaata 50619547  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||  ||||||| |||||| |||||||| |  ||||| |  || || ||||| | ||||| ||||  || ||| || |||||||| | ||    
T  50619546 caaattctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatatctgtcttcagtctgattactagtaaccaacaagtctacaaacttaacat 50619447  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 306  Q
    | |||| ||  |||||    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |  | ||  | ||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  50619446 caactttctctgcttccttaatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcattcttagcttcacactctgaggtgacaattcacatactaaactca 50619348  T
Q  307 agtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaa 349  Q
    | ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||    
T  50619347 aatctctaaactgttccaaccactcaaattcttttaccatcaa 50619305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 219 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 20061143 - 20060896
Alignment:
Q  219 gcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaact 318  Q
    ||||||| |||||| |||||||| | |||||  || |||| ||| |||||||| | |||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  20061143 gcttctctgatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtaacaaatcacaaacaaggctcaaatctctaaaat 20061044  T
Q  319 gctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaatt 418  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||  ||  |||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||| ||    
T  20061043 gctcaagcaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtcttcctactcaacgcatctgcaactacattagctttacccgaatggtagtt 20060944  T
Q  419 caagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||||||||||||| ||| | || ||| |  ||||||||||||||    
T  20060943 caagccaaaatcataatcctttaataattcaagtcatctcctctgcct 20060896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 466
Target Start/End: Original strand, 19107326 - 19107783
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| || | |||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| |||||||    
T  19107326 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctgtggctctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatac 19107425  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || | ||| |  |  | || |   | ||| || |||||||| | ||     
T  19107426 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtctttagtctgttctctagcaactaacaagtccacaaactttacatt 19107525  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | |||||||| |||| |||| || || | |||||     
T  19107526 aactttctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgagatgaccattcgcaaaccaaactcat 19107624  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| || || ||||| || ||| | ||||||| |||  |||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  19107625 atctctgaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatacaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 19107724  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||  | ||| | ||| |||||||||||    
T  19107725 ggatgataattcaaaccaaagtcataatccttcaacaattcaagccacctcctctgcct 19107783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 21837908 - 21838334
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  21837908 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttattaatctcttcattgtctgggatac 21838007  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||  || |  ||||| ||| | || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  21838008 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcattgtcttcagtctgatctctagaaaccaacaagtccacaaactttacatc 21838107  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||| | |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  21838108 aactttctgtgcttccttgatatttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 21838206  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  21838207 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 21838306  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  21838307 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 21838334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 245 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16077821 - 16077631
Alignment:
Q  245 actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttacc 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||| | |||    
T  16077821 actatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgaggtgaccattcacaaactaaactcaaatctctgaactgttcaagtaactcaaactctctaacc 16077722  T
Q  345 atcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  16077721 atcaaagcggacatatgcaatgtcttcctcctcaaggcatctgcaacaacattaactttacctggatgataattcaaaccaaagtcataat 16077631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 442
Target Start/End: Original strand, 21749901 - 21750331
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  |||| ||  || |||||||||    
T  21749901 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcat-atcatctggaatacaa 21749999  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    |  || ||||  || |||| |||||| |||||||| |  ||||| || || || ||||| | || || ||    || ||| || |||||||| | ||| |    
T  21750000 atcctacctcgaaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatctctgtcttcagtctaatcactagccaccaacaagtccacaaacttaacatcaa 21750099  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    |||  || ||||||   ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||  | ||||| || ||||| |||||| || | |||||| |    
T  21750100 ctttttgtgcttctttaatactcttca-gaaattcattatcaatcttcagcatccctaacttcacactctcagatgacatttcacatactaaactcaaat 21750198  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  21750199 ctctgaactgttcaagcaactcgaactcttttaccatcatggccgacatatgcaatgtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacccgg 21750298  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataattcttcag 442  Q
    ||| ||  ||||  |||||||||| ||||||||    
T  21750299 atgatagctcaactcaaaatcatagttcttcag 21750331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 303 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 431223 - 431060
Alignment:
Q  303 ctcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcct 402  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  431223 ctcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaattcttttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctt 431124  T
Q  403 taccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||| ||||| ||  ||||  |||||||||||| |||||| | ||||| |||||| | ||||||    
T  431123 tacccggatgatagctcaactcaaaatcataatccttcagcaattctagccatctacgctgcct 431060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 277 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21234864 - 21234706
Alignment:
Q  277 tctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgct 376  Q
    ||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||| | |||||||||||  |||||||||| || ||||||||    
T  21234864 tctgaggtgaccattcacaaactaaactcaaatctctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcaaagcggacatatgcaacgtcttcctgct 21234765  T
Q  377 caatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  21234764 caaagcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataat 21234706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 21025133 - 21025557
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||| |||||||||||  || |||    | ||||  ||||||||||||    
T  21025133 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactcttttcaagaatcattttcttcctcccttcatcatcaggaatacaa 21025232  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||  |||| ||| |||| |||||| || ||||  ||||||||||||| ||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  21025233 attcggcctcggaatctcaacacaccatggtcattgaccttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaa 21025332  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
     || ||| || |||   ||||| || | |||||| ||||||||| |||||||| ||||  |  | ||||||||||||| | ||||| || |  ||||  |    
T  21025333 ttttctgtgcctctttaatacttttta-gaaattcactatcaattttcagcattcccagtttcacactctgaggtgaccactcacaaactaagctcatat 21025431  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||| || ||||| ||    
T  21025432 ctctaaactgttcaagcaattcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaccattagctttacctgg 21025531  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  21025532 atgataattcaaaccaaattcataat 21025557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22361643 - 22361248
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| ||  |||||||||    
T  22361643 atcatgatagatcttcgtagctcccggatgaatactcaagtttcttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtttggaatacaa 22361544  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    |  || ||||  |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||  || ||||| | || || || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  22361543 atcctacctcgaaacctcagcacaccttgatcatcgattttaaaatcaccgtcttcagtctgatcactagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaa 22361444  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtc 310  Q
    |||  |  ||||||   ||||| ||||| || | | |||||||||||||||| || | ||  | ||| | || ||||| |||||| || | |||||| ||    
T  22361443 ctttttatgcttctttaatactcttcaaaaattcattatcaatcttcagcattcctagcttcacactttaagatgacatttcacaaactaaactcaaatc 22361344  T
Q  311 tctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacc 406  Q
    ||| ||||| || |||||||| || | ||||||||||| |||| | |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  22361343 tctgaactgttcaagcaactcgaactattttaccatcatagcagatatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacc 22361248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 17044416 - 17043959
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||  ||| ||| |||||||    
T  17044416 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtggatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctctgcatcgtcgggaatac 17044317  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    |||  |  |||| ||| |||| ||   | |||||||| || ||||||||||  || ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  17044316 aaatccgacctcggaatctcaacatgtcgtgatcatcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatc 17044217  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| || |||   ||||| || | |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  |   ||||||||||| ||||| | || | ||||||    
T  17044216 aactttctgtgcctctttaatacttttta-gaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcactttctgaggtgaccattcataaaccaaactcaa 17044118  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| || || || || ||||| || ||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||     
T  17044117 atctctgaattgttcaagtaactcgaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctgctcaaggcatctgcaacaacgttagctttacct 17044018  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| |||||||| ||||| || |||| |||||  | ||||| |||||| | ||||||    
T  17044017 ggatgataattcaaaccaaagtcgtaatccttcaacaattctagccatctacgctgcct 17043959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21744623 - 21744521
Alignment:
Q  339 tttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattct 438  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  21744623 tttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctactcaaagcatctgcaaccacattagctttactcggatggtaattcaacccaaaatcataatcct 21744524  T
Q  439 tca 441  Q
    |||    
T  21744523 tca 21744521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 16349998 - 16349565
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||||    
T  16349998 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaa 16349899  T
Q  111 act-cttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatct 209  Q
    | | ||||||| ||| |||| |||||| |||| ||| |  ||||| ||||| || || || | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||     
T  16349898 attacttcctcggaatctcaacacaccttgattatcgattttaaaatcactgtcttccgtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatca 16349799  T
Q  210 acttgctgagctt--ctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 306  Q
    |||| ||| ||||  || |  |||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||  |  |  |||||||||||| ||||||| || | |||||    
T  16349798 actttctgtgctttccttgattacttttca-gaaattcactatcaatcttcaacatacccagtttcacgctctgaggtgaccattcacaaaccaaactca 16349700  T
Q  307 agtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacc 406  Q
      ||||  ||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  16349699 tatctcggaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacc 16349600  T
Q  407 aggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
     ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  16349599 tggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 16349565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 20830500 - 20830336
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  20830500 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 20830401  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||| ||||||||    
T  20830400 tttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatcttctctgcct 20830336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 111
Target Start/End: Original strand, 20139787 - 20139890
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| ||||  || |||| ||| ||||||    
T  20139787 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatttcttcatagtctggaata 20139886  T
Q  108 caaa 111  Q
    ||||    
T  20139887 caaa 20139890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Original strand, 20250761 - 20250895
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| ||| |||||||||    
T  20250761 atcatgatacatcttcgtagctcccgaatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaa 20250860  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatc 145  Q
    |  || ||||  ||||||| || ||| ||||||||    
T  20250861 atcctacctcaaaacctcaacataccttgatcatc 20250895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 22134665 - 22134546
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||| ||||||||| | ||| || || | ||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  22134665 actcaaatctcgaaactgctcaatcaattccaactatttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagcc 22134566  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || || ||||| ||| ||||    
T  22134565 ttcccgggatgataactcaa 22134546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 41666 - 41208
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  41666 caaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaata 41567  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41566 caaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 41467  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  41466 cttctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaattcacagacaagactcat 41367  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41366 atctctgaactgttctaacaactcaaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggccttacca 41267  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  41266 ggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactctaaccacctcctctgcct 41208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 46732 - 46274
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| | ||| || ||||| || || |||||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46732 caaatcatgattcatttttgtagctcctggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaattaactttttcaaatcatcattatcaggaata 46633  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||    
T  46632 cagattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagcttcattactagcaaccatcaaatcaacaaacttcacat 46533  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  46532 ctacttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaattcacagacaaggatcaa 46433  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||    
T  46432 gtctctaaactgctctaacaaatcaaattcttttaccatcaaagcagacatatgcaacgttttcctactcaaggcatgtgcaactacattggctttacca 46333  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||    
T  46332 ggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacagctccaaccatctcctctgcct 46274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 2887 - 3314
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  |||||||  | |||||||    
T  2887 caaatcatgatacatctttgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcattaggaata 2986  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||| | ||||| ||||  || ||| || |||||||| | ||    
T  2987 caaattctgcctcagaatctcaacaccccctgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgattactagtaaccaacaagtccacaaacttaacat 3086  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |   || ||| ||||||  |||||| || ||||| | |||||||||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  3087 cggttttctgcgcttctttgatactatttaagaattcactatcaatctttagcattcccaacttcacactctgaggtgacaattcgcagactaaactcaa 3186  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| | ||| || |||||     
T  3187 atctctaaattgttcaagcaactcaaactcttttaccatcaatgcggacatatgcaacgtcttcctacttaaggcatctgcaacaaaattagctttacct 3286  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||  |||||||| ||| |||||||||    
T  3287 ggataataattcaacccacaatcataat 3314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 249586 - 250044
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  249586 caaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgacttttttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaata 249685  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  249686 caaattcttcctctgaacctcagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcaccaaatcaacaaacttcaaat 249785  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||    
T  249786 ccacttgctgagcttctcggatgctattcaagaaatcattattaatcttcagcatccgcaactgaacactctgaggtgtcaactcacaaacaaggctcaa 249885  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  249886 gtctctaaactgttctagcaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatatgtaatgttttcctgctcaacgcatcagcaaccacattggctttacca 249985  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  249986 ggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcagcagctctaaccatcttctctgcct 250044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 7478 - 7020
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7478 caaatcatgatacatctttgtagccctcgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcttcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaata 7379  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| | |  ||| |||||||||||||| | ||    
T  7378 caaactcttcctctgaacctcagaacaccctgatcataaaccttgaagtcactatcctctgtctcattacccgcaaccattaaatcaacaaactttacat 7279  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  7278 ccacttgctgcgcttctcggatactattcaaaaaattactgttaatcttcaacatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacaaacaaggctcag 7179  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7178 gtctctaaactgttctagcaaatccaattctcttaccattaaagcagacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggctttacca 7079  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  7078 ggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacatctctaaccatctcctctgcct 7020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 43756 - 44214
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  43756 caaatcattgtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcttctagaattaacttcttcaactcatcattgtcaggaata 43855  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43856 caaattcttcctctgaacctcaaaacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgtcattaccagcagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 43955  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||    
T  43956 ctacttgctgagcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaactcacaaacaaggctcaa 44055  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44056 gtctctaaaatgttctagcaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctactcaacgcattagcaaccacattggctttacca 44155  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  44156 ggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaaaagctctaaccatcttctctgcct 44214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 78 - 466
Target Start/End: Original strand, 1 - 393
Alignment:
Q  78 aactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattac 177  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1 aacttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccataaagtcactatcctcagtgtcattac 100  T
Q  178 cagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatact 277  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  101 ctgaagtcatcaaatcaacaaacttcaaatccactttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcacaataaatcttcagcatccccaactgtatact 200  T
Q  278 ctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaac----atatgcaatgttttcct 373  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| || |||||||||||| ||    |||||||||||||||||    
T  201 ctgaggtgacagttcacagacaagactcaagtctctaaactgttatagcaattcgaattccttcaccatcaaagcagacatatatatgcaatgttttcct 300  T
Q  374 gctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  301 gctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcagtaactctaaccacctcctctgcct 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 1064324 - 1064782
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||    
T  1064324 caaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgttaggaata 1064423  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1064424 caaactctacctctgaacctcagtacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 1064523  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  1064524 cctctttctgagcttctcgaatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaattcacagacaagactcat 1064623  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1064624 atctctgaactgttctaacaactcaaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggccttacca 1064723  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  1064724 ggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactctaaccacctcctctgcct 1064782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 20828832 - 20829290
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  20828832 caaatcatggtacatctttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaata 20828931  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20828932 caaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcgttaccagaagtcatcagatcaacaaacttcaaat 20829031  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  20829032 cttctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaattcacagacaagactcat 20829131  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20829132 atctctgaactgttctaacaactcaaactctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggcctcacca 20829231  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  20829232 ggatggtaattcaagccaaaatcaaaatctttcagtaactctaaccatcttctctgcct 20829290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 31831231 - 31831689
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||||    
T  31831231 caaatcatggtacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttctttaactcctcattgtcaggaata 31831330  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31831331 caaactctacctctgaacctcaacacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 31831430  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  31831431 cttctttctgagctcctcggatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaattcacagacaagactcat 31831530  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||| ||||| |||| ||| ||||| || || |||||||||||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31831531 gtctctgaactgttctaacaattcaaactccttcaccatcaaagcagacatgtgtaaagttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggccttacca 31831630  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  31831631 ggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactctaaccacctcctctgcct 31831689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 23277349 - 23277807
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| || || | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23277349 caaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaatcatcattatcaggaata 23277448  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||  |  |||||||||||| ||||||| ||    
T  23277449 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcactatcttcagtttcattaccaacaaccatcaaatcaacgaacttcacat 23277548  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| | ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23277549 ctacttgctgcgcttctcggatactattcaagaagtcactgttaatcttcagaatccccaactgaacactctgaggtgtcaactcacagacaagactcaa 23277648  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23277649 gtctctaaactgctatagcagatcaaattcttttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctactcaacgcatctgcaaccacattggctttacca 23277748  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  23277749 ggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatctcctctgcct 23277807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 23294508 - 23294966
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| ||||  |||||||| |||| || || ||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||     
T  23294508 caaatcatgatacattttcgttgctcccggatgaatattcaagctactcttgtgactttcctctagaattaactttttcaaattatcatcatcaggaatg 23294607  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |  ||| ||||| |||||||||| ||    
T  23294608 caaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagcttcattaccagcaaccattaaatccacaaacttcacat 23294707  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  23294708 ccacttactgagcttctcggatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaacttaatactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaa 23294807  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||||    
T  23294808 gtctctaaactgctataacaaatcaaattcttttaccattaaagcagacatatgcaacgtcttcctgctcaacgcatctgccaccaaattggctttacca 23294907  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||    
T  23294908 ggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacagctccaaccatctcctctgcct 23294966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 19651922 - 19651462
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  19651922 caaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatattcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatg 19651823  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcac--tatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaa 205  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||| || ||||||||| |   |||||||||||||||||||     
T  19651822 caaattcttcctctgaatctcaatacaccccgatcatccaccttgaagtcacactatcctcaatgccattaccagcaactatcaaatcaacaaacttcac 19651723  T
Q  206 atctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactc 305  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19651722 atccacttgctgcgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaattgaacactctgaggtgtcaattcacagacaagactc 19651623  T
Q  306 aagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttac 405  Q
    || ||||| ||||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||| |||||||||  |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |    
T  19651622 aaatctctgaactgctatagcaaatcgaattctttcaccattgaagcagacatatgcagcgttttcctacttaaggcatctgcaaccacattagctttcc 19651523  T
Q  406 caggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||  || ||||||||||||||||||||    
T  19651522 taggatggtaattcaaaccaaaatcatagtctttcaacagctctaaccatctcctctgcct 19651462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 24949162 - 24949621
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||| ||  |||||||| |||| || || | |||||||||||||||| ||||||  | ||||||     
T  24949162 caaatcatgatacattttcgtagctcccagatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaaccatcatcatgaggaatg 24949261  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccc-tgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaa 206  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| |  | | |||| |||| |||||| |    
T  24949262 caaattcttcctctgaatctcatcacaaccatgatcatcaaccttgaagtcacgatccttagtgccattaccagcaacccttaaattaacatacttcaca 24949361  T
Q  207 tctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 306  Q
    || |||| ||| |||||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  24949362 tccactttctgtgcttctcggatactatctaagaaatcactgataatcttcagcatccccaactgaacactctgaagtgtcaattcacagacaaggctca 24949461  T
Q  307 agtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacc 406  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  24949462 agtctctaaactgttctaacaaatcaaattctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttacc 24949561  T
Q  407 aggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24949562 agaatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaatagctctaaccatctcctctgcct 24949621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 83 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 23099813 - 23099455
Alignment:
Q  83 tttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagta 182  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| || |||||| ||||||  | ||||| ||||    
T  23099813 tttcaactcatcattatcaggaatacaaattctgcctctgaacctcaacacgccttgttcatcaaccttgaaatcactagcctcagcttgattactagta 23099714  T
Q  183 gtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgag 282  Q
      ||  ||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||||| |||||  || |||| ||| |||| ||| | ||||||||    
T  23099713 accaataaatccacaaacttgacatcaacttgttgcgcttctctgatacttttcaagaaatcactattgattttcaacatacccagctgcacactctgag 23099614  T
Q  283 gtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgc 382  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||  |||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  23099613 gtgacaattcacaaaccagactcaagtctctaaactgttcaagcaactcaaattcctttaccatcatagccgacatgtgcaacgtcttcctactcaaagc 23099514  T
Q  383 atcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23099513 atctgcaactacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatccttca 23099455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 27788314 - 27788740
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||  |||||||  |||| || || || || ||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  27788314 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaata 27788413  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |   ||||||||||  ||| | |||||| ||||| | ||    
T  27788414 caaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaatactattaccagtaaccattagatcaaccaacttgacat 27788513  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||  || | |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||     
T  27788514 ccacttgctgtgcttctcgaatactattcaggaaatcgctgttaatctttagcatccccaactgtatgctttgaggcgacaactcacacaccaaactcat 27788613  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || |  || ||||||||||| | ||||| |||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||     
T  27788614 gtctctaaactgttccaataaatcaaattctttcatcatcatagcagacatatg-agtgtcttcctactcaatgcatcagcgactacattagcttttccc 27788712  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27788713 ggatggtaattcaacccaaaatcataat 27788740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 12574926 - 12575353
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||  |||||||  |||| || || || || ||||||||||  || ||||| ||||| |||    
T  12574926 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttcttcattatcagggata 12575025  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  || |||||| |  ||| | |||||| ||||| | ||    
T  12575026 caaactctacctctgaatctaagcacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaataccactaccagcaaccattagatcaactaacttgacat 12575125  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || ||||||||||| || |||| ||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| || | |||||     
T  12575126 ccacttgttgtgcttctcggattctattcaggaaatcactgttaatctttagcatccccaactgtacgctttgaggcgacaactcacataccaaactcat 12575225  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || |  || ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||     
T  12575226 gtctctaaactgttccaataaatcaaattctttcatcatcatagcagacatatgcagtgtcttcctactcaatgcatccgcgactacattagctttgccc 12575325  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12575326 ggatggtaattcaacccaaaatcataat 12575353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27210038 - 27209615
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||  |||| ||||| |  |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |    
T  27210038 tcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagttgctcttatgactttcttctaatatcaacttcttcaattctttattgtcaggaatacaga 27209939  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     | | ||||| || |||| |||||| || ||||||| ||| || ||||||| |||||  | ||||| ||||  ||| ||||| |||||||| | ||| ||    
T  27209938 ttttgcctctaaatctcaacacaccttgctcatcaatcttgaaatcactattctcagcctgattactagtaaccataaaatccacaaacttgacatcaac 27209839  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    ||| || ||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||||    
T  27209838 ttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattgatcttcagcatacccaactgcacactttgagatgataattcacatacgagactcaagtct 27209739  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    |||||||  || ||||| || ||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||    
T  27209738 ctaaactattcgagcaattcgaattcctttaccatcaaggcggacatgtgcaatgtctttctactcaacgcatctgcgactacattagctttacccggat 27209639  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27209638 ggtaattcaagccaaaatcataat 27209615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 20833558 - 20833730
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  20833558 caaatcatggtacatctttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaata 20833657  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccag 180  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  20833658 caaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcgttaccag 20833730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 74 - 433
Target Start/End: Original strand, 23111375 - 23111734
Alignment:
Q  74 aatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtca 173  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  ||| ||| |||| ||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||   ||| | |    
T  23111375 aatcaactttttcaactcatcactgtcaagaatgaaaattctgcctcagaatctcaacataccctgatcatcaaccttgaagtcaccatctctagtttga 23111474  T
Q  174 ttaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgta 273  Q
    |||| || |  || |||||| |||||||| | ||| | || ||| ||||||   |||||||||||||| | ||| |  ||||||| ||| |||||||  |    
T  23111475 ttactagcaaccaacaaatccacaaacttaacatcaaatttctgtgcttctttaatactgttcaagaattcactgttgatcttcaacatacccaacttca 23111574  T
Q  274 tactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcct 373  Q
     | ||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||  || ||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||    
T  23111575 caatctgaggtgacaactcacaaacaagactcagatctctaaactcttcaagcaactaaaactcttttaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcct 23111674  T
Q  374 gctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
     ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||| | |||||||||    
T  23111675 actcaaagcatctgcaacaacattggctttacttggatgataattcaaactaaaatcata 23111734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 27371843 - 27372269
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  27371843 aaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 27371942  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  27371943 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 27372042  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||| | |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  27372043 aactttctgtgcttccttgatatttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 27372141  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  27372142 atctctaaactgttcaagcaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 27372241  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  27372242 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 27372269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 441
Target Start/End: Original strand, 16923465 - 16923895
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||||    
T  16923465 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaa 16923564  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || | ||| ||| || |||||||| | ||| |    
T  16923565 attcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaa 16923664  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| |||||   |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||  |    
T  16923665 cttcctgtgcttccttgatacctttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatat 16923763  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  16923764 ctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 16923863  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  16923864 atgataattcaaaccaaagtcataatccttca 16923895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 441
Target Start/End: Original strand, 16982728 - 16983158
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||||    
T  16982728 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaa 16982827  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || | ||| ||| || |||||||| | ||| |    
T  16982828 attcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaa 16982927  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| |||||   |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||  |    
T  16982928 cttcctgtgcttccttgatacctttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatat 16983026  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  16983027 ctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 16983126  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  16983127 atgataattcaaaccaaagtcataatccttca 16983158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 441
Target Start/End: Original strand, 17064293 - 17064723
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||||    
T  17064293 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaa 17064392  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || | ||| ||| || |||||||| | ||| |    
T  17064393 attcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaa 17064492  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| |||||   |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||  |    
T  17064493 cttcctgtgcttccttgatacctttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatat 17064591  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  17064592 ctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 17064691  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  17064692 atgataattcaaaccaaagtcataatccttca 17064723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24876618 - 24876161
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| |||||||    
T  24876618 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctgtgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatac 24876519  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| |||||||| || ||   ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  24876518 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcggtccgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 24876419  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||  |||| || || | |||||     
T  24876418 aactttctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgatcattcgcaaaccaaactcat 24876320  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| || || || || || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||      
T  24876319 atctctgaactgttcaagtaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttactt 24876220  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| | ||||| |||||| | ||||||    
T  24876219 ggatgataattcaaaccaaagtcataatctttcagcaattctagccatctacgctgcct 24876161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 41608254 - 41607828
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  41608254 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 41608155  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||  || |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  41608154 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaacttgacatc 41608055  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     |||| ||| |||||   |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||      
T  41608054 aactttctgcgcttccttgatacttttcaggaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcata 41607955  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  41607954 tctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctg 41607855  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  41607854 gatgataattcaaaccaaagtcataat 41607828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 441
Target Start/End: Original strand, 16925934 - 16926366
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  16925934 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 16926033  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  16926034 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 16926133  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||| ||||||||| |||| || || | |||||     
T  16926134 aactttctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactttgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 16926232  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  16926233 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 16926332  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  16926333 ggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 16926366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 441
Target Start/End: Original strand, 16999574 - 17000006
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  16999574 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 16999673  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  16999674 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 16999773  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||| ||||||||| |||| || || | |||||     
T  16999774 aactttctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactttgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 16999872  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  16999873 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 16999972  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  16999973 ggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 17000006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21325135 - 21324711
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || ||||  ||||||||||    
T  21325135 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatac 21325036  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| ||  |||| ||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||||| | ||||| || | ||| ||| || |||||||| | |||    
T  21325035 aaattcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaatcaacaagtctacaaacttgacatc 21324936  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| || |||   ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| | || || || | |||||     
T  21324935 aactttctgtgcctctttaatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgaggtgaccactcgcaaaccaaactcat 21324837  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || || ||||| || ||| | ||||||| |||  |||||||||| || ||||| ||||| || ||  |||| ||||| ||||||||     
T  21324836 atctctaaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaaagtcttcctactcaaggcgtctacaacaacattagccttacct 21324737  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  21324736 ggatgataattcaaaccaaagtcata 21324711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 441
Target Start/End: Original strand, 10869426 - 10869856
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||| ||| || ||||||    
T  10869426 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcatcgtctgggatacaa 10869525  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  10869526 attcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtctacaaactttacatcaa 10869625  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| |||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  |  |||||||||||| |||| || || | |||||  |    
T  10869626 ctttctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcactctctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatat 10869724  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  10869725 ctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 10869824  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  10869825 atggtaattcagaccaaagtcataatccttca 10869856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 24710608 - 24711034
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  24710608 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 24710707  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||  || |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  24710708 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 24710807  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     ||||  || |||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| ||||||| || | ||||||    
T  24710808 aactttttgtgcttccttgatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcaa 24710906  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  24710907 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 24711006  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  24711007 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 24711034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 436
Target Start/End: Original strand, 24676065 - 24676490
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || ||||  ||||||||||||    
T  24676065 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaggctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaa 24676164  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||  |||| ||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  24676165 attcggcctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaa 24676264  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| || |||   ||||| || | |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| | ||||| || |  ||||  |    
T  24676265 ctttctgtgcctctttaatacttttta-gaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgaggtgaccactcacaaaccaagctcatat 24676363  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  24676364 ctctaaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 24676463  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataatt 436  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  24676464 atgataattcaaaccaaagtcataatt 24676490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 21144910 - 21144462
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| |||||||    
T  21144910 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcctcattgtctggaatac 21144811  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| ||| |||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  ||  || || |||||||| | |||    
T  21144810 aaattctccctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaataagtccacaaactttacatc 21144711  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatta-ctatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  21144710 aactttctgtgcttccttgatacttttca-gaaattcgctatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 21144612  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| || || ||||| || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  21144611 atctctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 21144512  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatct 457  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| | ||||| ||||||    
T  21144511 ggatgataattcaaaccaaagtcataatctttcagcaattctagccatct 21144462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 44385438 - 44385012
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  44385438 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 44385339  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| |||  ||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  44385338 aaattcttcctcggaatttcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 44385239  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||| | |||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  44385238 aactttctgtgcttccttgatatttttca-gaaattcactatcaatctttagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 44385140  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  44385139 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 44385040  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  44385039 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 44385012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 441
Target Start/End: Original strand, 27218592 - 27219022
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||||    
T  27218592 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaa 27218691  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || || || | ||  | || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  27218692 attcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttccgtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaa 27218791  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| |||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||  |  |  |||||||||||| |||| || || | |||||  |    
T  27218792 ctttctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcactatcaatcttcaacatacccagtttcacgctctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcatat 27218890  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||  || ||||| || || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  27218891 ctctaaactattcaagcaattcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 27218990  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  27218991 atgataattcaaaccaaagtcataatccttca 27219022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 24262944 - 24263370
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||| |||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||    
T  24262944 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgaccctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatac 24263043  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||  || |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  24263044 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 24263143  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||| ||||||| |||| || || | |||||     
T  24263144 aactttctgtgcttccttgatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccaatttcacactctaaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 24263242  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||| || || ||| |   ||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  24263243 atctctaaactgttcaagcaattcgaactctctggtcatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 24263342  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    || || |||||||| ||||| |||||||    
T  24263343 gggtgataattcaaaccaaagtcataat 24263370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27364949 - 27364789
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||| |||| ||||| | ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||     
T  27364949 caaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttcttccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgtcaggaatg 27364850  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcag 168  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||| || || |||||||||||||    
T  27364849 caaattctgcctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcag 27364789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22324725 - 22324299
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || ||||| || || | ||    
T  22324725 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaaactacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctgggacac 22324626  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||  || |  ||||| ||||| || ||||  | ||  | || |  || |||||| |||||||| | |||    
T  22324625 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagcctgatctctagcaaccaacaaatccacaaactttacatc 22324526  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |  |  |  |||||||||||| ||||||| || | |||||     
T  22324525 aactttctgcgcttccttgatactgttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacctagtttcacgctctgaggtgaccattcacaaaccaaactcat 22324427  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||  ||||| || || ||||| || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  22324426 atctcggaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttaccc 22324327  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  22324326 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 22324299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Original strand, 45533162 - 45533345
Alignment:
Q  252 atcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaag 351  Q
    ||||||| ||||||||| |  | |||||| || |||| |||||| || | |||||||||||| ||||  || |||||||| || ||| | ||||||| ||    
T  45533162 atcttcaacatccccaatttcacactctgtggcgacacttcacaaaccaaactcaagtctctgaactattcaagcaactccaactctctaaccatcatag 45533261  T
Q  352 caaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    || ||||||  ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  45533262 cagacatatttaatgttttcctacttaaagcatctgcaacaacattagccttacccggatggtaattcaacccgaaatcataat 45533345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24707351 - 24706925
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||| ||  || ||||     ||||  ||||||||||    
T  24707351 aaatcatgatacatcttcgtagatcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaaccattttcttcatcaattcatcatcaggaatac 24707252  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| ||  |||| ||| |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||| ||||| | ||||| |  |   | ||||| || |||||| | |||    
T  24707251 aaattcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagtctgattactaacaactaacaaataaaaaaacttgacatc 24707152  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     ||||  || || |||   ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| | ||||| || |  ||||     
T  24707151 aactttatgtgcctctttaatactcttca-gaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgaggtgaccactcacaaaccaagctcat 24707053  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || || ||||| || ||| | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||      
T  24707052 atctctaaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcaatgcggacatatgcaatgtcttcctgctcaaggcatctgcaaaaacattagccttactt 24706953  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  24706952 ggataataattcaaaccaaagtcataat 24706925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 30210787 - 30210361
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||| ||||||||  ||   ||  |||||||||    
T  30210787 caaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaaattacttttgtgactttcttctagaatcatctttttcatttctgtatcatcaggaata 30210688  T
Q  108 caaactcttcctctgaa-cctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaa 206  Q
    |||| |||  | ||||| || || ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||     |  ||| ||||| || ||||||| |    
T  30210687 caaattctatc-ctgaaaccgcaacactccttgatcatcaactttaaaatcactatcttcagtctgattattgccaaccatgaaatctaccaacttcaca 30210589  T
Q  207 tctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 306  Q
    || || | |||||| |||  |||||| | ||| || ||  | |  ||||||| ||||||||| |  | |||||| || |||| |||||| || | |||||    
T  30210588 tccaccttctgagcctctttgatactatccaaaaatttgttgttgatcttcaacatccccaatttcacactctgtggcgacacttcacaaaccaaactca 30210489  T
Q  307 agtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacc 406  Q
    ||||||| ||||| |  |||||||| || ||| | ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| ||||    
T  30210488 agtctctgaactgttaaagcaactccaactctctaaccatcatagcagacatatgta-tgttttcctacttaaagcatctgtaacaacattagccatacc 30210390  T
Q  407 aggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||    
T  30210389 cggatggtaattcaacccgaaatcataat 30210361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Original strand, 9610712 - 9610846
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||||    
T  9610712 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaa 9610811  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatc 145  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||| ||||||||    
T  9610812 attcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 9610846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 11357740 - 11357646
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaat 106  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  11357740 tcatgatacatttttgtagcccctgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcaatgtcaggaat 11357646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Original strand, 17067951 - 17068085
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| || ||||||    
T  17067951 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaa 17068050  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatc 145  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||| ||||||||    
T  17068051 attcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 17068085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23107597 - 23107461
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||  |  | ||||||||| ||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||    
T  23107597 atcatgatacatcttcgtagctcccggattaatactcaagttacttctatggctctcttcaggaatcattttcttcatctcatcattgtcaggaatacaa 23107498  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaa 147  Q
    |  |  ||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  23107497 atccgacctcgaaacctcagcacaccttgatcatcaa 23107461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22756332 - 22756174
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||| |  || ||||  || ||||  ||||||||||||    
T  22756332 atcatgatacatcttcgtagctcccggttgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaattattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaa 22756233  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagt 169  Q
    | ||  |||| ||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  22756232 attcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagt 22756174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24819556 - 24819340
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| || ||||||||  ||||  || ||||||||| |||| ||| ||| ||||  ||||||| ||| ||||||    
T  24819556 caaataatgatacatctttctagctcccggatggatactcaagctacttctgtgactctctttaagagtcatcttcttcatctcatcatcgtctggaata 24819457  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||| ||| |||| ||| || |||||||| || || ||||||||||| |||||   ||||| || |  || |||||| |||||||| | ||    
T  24819456 caaattctacctcagaatctcaacactccttgatcatcgactttgaagtcactatcttcagtcggattactagcaaccaacaaatccacaaacttaacat 24819357  T
Q  208 ctacttgctgagcttct 224  Q
    |||||| ||| ||||||    
T  24819356 ctactttctgcgcttct 24819340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 30011808 - 30011627
Alignment:
Q  252 atcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaag 351  Q
    ||||||| ||||||||| |  | |||||| || |||| |||||| || | |||||||||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||||||| ||    
T  30011808 atcttcaacatccccaatttcacactctgtggcgacacttcacaaaccaaactcaagtctctgaactgttcaagcaactccaactctctaaccatcatag 30011709  T
Q  352 caaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    || ||  ||| ||||||||||| || ||  |||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| || || ||||||||||    
T  30011708 cagac--atgtaatgttttcctacttaaaacatctgcaacaacattagccttactcggatggtaatttaacccgaaatcataat 30011627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 412
Target Start/End: Original strand, 23066974 - 23067368
Alignment:
Q  18 tacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| ||| ||||||||||  || |    
T  23066974 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcctac 23067073  T
Q  118 ctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctg 217  Q
    |||  |||| || |||||| |||||||| |  ||||| ||||  || ||||| | || || || |  || ||| || |||||||| | ||| |||| | |    
T  23067074 ctcgaaaccgcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcaccgtcttcagtctgatcactagaaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactttccg 23067173  T
Q  218 agcttctcggatactgttcaagaaattact-atcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaa 316  Q
     ||||||   ||||| || | ||||||  | ||||||||||||||| || | ||  | ||||| |  ||||| |||||| || | |||||| ||||| ||    
T  23067174 tgcttctttaatactcttta-gaaattcgttatcaatcttcagcattcctagcttcacactctcaaatgacatttcacaaactaaactcaaatctctgaa 23067272  T
Q  317 ctgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatg 412  Q
    ||| || |||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||| || || || ||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  23067273 ctgttcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcagacatatgcaaggtctttctactcaaagcgtctgcaacaacattagctttacccggatg 23067368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12639809 - 12639645
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||| |||||| || | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  12639809 actcaaatctcgaaactgttcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatctgcaacaacattagcc 12639710  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||| ||||||||    
T  12639709 tttccgggatgataactcaattgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatcttctctgcct 12639645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23107305 - 23107173
Alignment:
Q  303 ctcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcct 402  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| | ||| ||||| || |    
T  23107305 ctcaaatctctgaactgttcaagtaactcgaactcttttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgtaacaacattagctt 23107206  T
Q  403 taccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||  ||||| ||  ||||  ||||||||||||    
T  23107205 tacgcggatgatagctcaactcaaaatcataat 23107173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24830764 - 24830600
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| | ||| ||||| |||    
T  24830764 actcaagtctcgaaattgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgtaacaacattagcc 24830665  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || ||  |||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  24830664 tttccgagatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatctcctctgcct 24830600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Original strand, 22278972 - 22279091
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||| ||||||||| | ||| || || || || ||||| |||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  22278972 actcaaatctcgaaactgctcaatcaattccaagtccttaaccattaaagcatacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagcc 22279071  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || || ||||| ||| ||||    
T  22279072 ttcccgggatgataactcaa 22279091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 24569244 - 24569149
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacatt 397  Q
    |||||| |||| ||||| ||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  24569244 actcaaatctcaaaactactcaatcaattctaactctttcaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacatt 24569149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 87
Target Start/End: Original strand, 45530084 - 45530163
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttca 87  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||  || |||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  45530084 caaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaaattacttctgtgactttcttctagaatcatctttttca 45530163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16046 - 15588
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  16046 caaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattatcaggaata 15947  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15946 caaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatccttggtatcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 15847  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||  ||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  15846 ccactttttgagcttctcggatactattcaagaagtcattatcaattttcaaccttcccaactatatactctgagatgacaattcacagacaagactcat 15747  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15746 gtctctgaactgttctaacaattcaaattcttttaccattaaagcagacatatgcaaagtcttcctgctcaaagcatcagcaacaacattggccttacca 15647  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  15646 ggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcagtaactctaaccacctcctctgcct 15588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 431
Target Start/End: Original strand, 10486 - 10833
Alignment:
Q  84 ttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtag 183  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| |||| | | |||| |||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||| || |     
T  10486 ttcaactcatgattatcagggatacaaattctgcctcggtatctcaacacaccttcatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttgattactagcaa 10585  T
Q  184 tcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgagg 283  Q
     || ||| || |||||||| | ||| |||| ||| ||||||   |||||||||||||| | ||| |  ||||||| ||| | |||||  | |||||||||    
T  10586 ccaacaagtccacaaacttaacatcaactttctgcgcttctttaatactgttcaagaattcactgttgatcttcaacatacacaacttcacactctgagg 10685  T
Q  284 tgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgca 383  Q
     ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| |||| ||||||   |    
T  10686 cgacaactcacaaactagactcaagtctctaaactgttcaagcaactcaaattctttaaccatcatagctgacatatgcaatgtcttcccgctcaaaata 10785  T
Q  384 tcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatca 431  Q
    || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  10786 tctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaaatca 10833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Original strand, 27926 - 28364
Alignment:
Q  28 tagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacct 127  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27926 tagcccccgggtgaatactcaatctactcttgtgactctcttcaagaatcaacttcctcaattcatcgttgtcaggaatacaaactcttcctctgaatct 28025  T
Q  128 cagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcgg 227  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||| || ||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||    
T  28026 cagtacaccctaatcatcaatcttgaaatcactgttctcagcgtcactaccagtagtcatcaaatcaaccaatttcaaatctaccttctgagcttctcgg 28125  T
Q  228 atactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagca 327  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  28126 atattgtccaagaaattactatcaattttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaacttttctaaca 28225  T
Q  328 actcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaa 427  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28226 attcaaattctttcaccattaaagcagacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcaacaaccacattggccttaccatgatggtaattcaagccaaa 28325  T
Q  428 atcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||| |||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  28326 atcataatccttcaacagctctaaccatcttctctgcct 28364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 56233 - 55775
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  56233 caaatcatggtacatctttgtagctctcggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaata 56134  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||  ||    
T  56133 caaattcttcctctgaatctcaatacaccctgatcatccaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccagcaattatcaaatcaacaaacttcccat 56034  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  56033 ccaattgctgagcttctcggatactattcaagaaattactattaattttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaactcacaaacaagactcaa 55934  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  55933 gtctctaaactgttctagcaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacca 55834  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  55833 ggatggtaattgaagccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatctcctctgcct 55775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 33010 - 32552
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||| |||| ||||| | ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||     
T  33010 caaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttcttccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgtcaggaatg 32911  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||| || || |||||||||||||  | ||||| | ||   || ||||| |||||||| | ||    
T  32910 caaattctgcctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagcttgattactattaactattaaatccacaaacttgacat 32811  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | || || || ||||||| |||||| |||||||| | |||||  || |||| ||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  32810 caacctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttcatcatacccaactgcacactctggggtgacaattcgcaaacaagactcaa 32711  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  ||  |||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  32710 gtctctaaactgttcaagcaactcgaattcctttaccatcatggccgacatgtgtaacgtcttcctactcaaagcatctgcaactacattggctttaccc 32611  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  32610 ggatgatagttcaacccaaaatcataatccttcaatagctctaaccatctcctctgcct 32552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Original strand, 41525 - 41689
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  41525 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 41624  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||| ||||||||    
T  41625 tttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatcttctctgcct 41689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 32649 - 32198
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32649 atcacggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcttctagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 32550  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32549 attcttcctctgaacctcattacaccctgatcatctaccttgaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 32450  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtc 310  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||    
T  32449 cctgctgagcgtctcggatactgttcaagaaatcactattaatccgcaacatccccaactgaacactctgaggtgtcaactcacaaacaaggctcaagtc 32350  T
Q  311 tctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagga 410  Q
    |||| |||  |||| ||| || ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  32349 tctagactattctaacaattcgaattccttcaccatcaaagcagacatatgtaatgttttgctgctcaacgcatcagcaaccacattggctttaccaaga 32250  T
Q  411 tggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctct 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||    
T  32249 tggtaattcaagccaaaatcataatccttcagcagctctaaccatcttctct 32198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 20367 - 20794
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20367 caaatcatggtacatttttgtagcccctgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcttctagaatcaacttcttcaaatcatcattctcaggaata 20466  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20467 caaattcttcctatgaacctcagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcgttatcctcagtgtcattactagtagtcatcaaatcaacaaacttcaagt 20566  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||    
T  20567 ctacttgctgagcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcctcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaactcacaaacaaggcttaa 20666  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20667 gtctctaaactgttctaacaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatatgtaatgtcttcctgctcaacgcatcaacaaccacattggctttacca 20766  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20767 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 20794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 23187 - 23614
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23187 caaatcatggtacatttttgtagcccctgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcttctagaatcaacttcttcaaatcatcattctcaggaata 23286  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23287 caaattcttcctatgaacctcagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcgttatcctcagtgtcattactagtagtcatcaaatcaacaaacttcaagt 23386  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||    
T  23387 ctacttgctgagcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcctcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaactcacaaacaaggcttaa 23486  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  23487 gtctctaaactgttctaacaattcaaattccttcaccatcaaagcagacatatgtaatgtcttcctgctcaacgcatcatcaaccacattggctttacca 23586  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23587 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 23614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 346
Target Start/End: Original strand, 27234 - 27572
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  27234 caaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatcatcatgatcaggaata 27333  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27334 caaactcttcctttgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcactaccaatagtcatcaaatcaacaaatttcaaat 27433  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  27434 ctattttctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgagatgacaattcacagacaagactcag 27533  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccat 346  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||    
T  27534 gtctctaaactgttccaacaattcaaattctttcaccat 27572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 149543 - 150000
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  149543 caaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctccagaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatg 149642  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  |||||| || |||||||| | ||    
T  149643 caaatttttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactttcctcagtttcattaccagcaaccatcaagtccacaaacttgacat 149742  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||| | || |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  149743 ccactagttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaactcacagacaagactcaa 149842  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||     
T  149843 gtctctaaactgctctagcaaatcaaattctttcaccatcaaagcagacatattcaatgtcttcctgctcaacgcatctgcaaccacatt-gctttaccc 149941  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  149942 ggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatctcctctgcct 150000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 195037 - 194579
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||| || || | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||     
T  195037 caaatcgtgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaatcatcatcatcaggaatg 194938  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |  ||| |||||||||||||||| ||    
T  194937 caaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccaacaaccattaaatcaacaaacttcacat 194838  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| || |||||||||||    
T  194837 ccacttgttgtgcttctcgaatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaactgtacactcagaggtgtcaattcgcaaacaagactcaa 194738  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||  |||||||||||| ||||||    
T  194737 gtatctaaactactctagcaactcaaattctttcaccatcaaagcagacatatgcaacgtcttcctactcaaggcatcaataaccacattggctttacca 194638  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  || |||||||||||||||||    
T  194637 ggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacacctccaaccatctcctctgcct 194579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 25866 - 25439
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||    
T  25866 caaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcattgtcaggaata 25767  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||  || | || ||| |||| |||||| |  ||||| || ||||| ||||| | ||||| || | ||| ||| || |||||||| | ||    
T  25766 caaattctccctcgaaaacgcaacactccctaatcatcgattttaaaatcgctatcttcagtctgattactagcaatcaacaagtccacaaacttaacat 25667  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | | || ||| |||| |   |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| || |  |  | |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||    
T  25666 caattttctgcgcttttttaatactgttcaggaattcactatcaatctttagcattccaagtttcacactctgaggtgacatttcgcagactaaactcaa 25567  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| || ||||| || |  ||||| ||||| |||||  | |||||     
T  25566 atctctaaactgttcaagcaactcaaactcttttaccatcatagcggacatatgcaacgtcttcctacttagggcatctgcaacaacattaactttacct 25467  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25466 ggatgataattcaacccaaaatcataat 25439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Original strand, 181191 - 181310
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| | ||||| |||    
T  181191 actcaagtctcaaaactgctcaaccaattccaactctttaacaatcaaagcagacatatgcaaagtttttctactcaaagcatcagcaccaacattagcc 181290  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || || ||||| ||| ||||    
T  181291 ttcccgggatgataactcaa 181310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 8 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 90456 - 90023
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||  |  |||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  90456 caaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactttagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatg 90357  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||| | ||    
T  90356 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcattactagcaaccatcaaatcaacaaacttgacat 90257  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  90256 ccacttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaactgtacactctgaggtgataactcacagacaagactcaa 90157  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||     
T  90156 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttaccc 90057  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  90056 ggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 90023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 89778 - 89345
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||  |  |||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  89778 caaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactttagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatg 89679  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||| | ||    
T  89678 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcattactagcaaccatcaaatcaacaaacttgacat 89579  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  89578 ccacttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaactgtacactctgaggtgataactcacagacaagactcaa 89479  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||     
T  89478 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcgtttaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttaccc 89379  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  89378 ggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 89345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 390533 - 390492
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaa 49  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  390533 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaa 390492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 3724 - 4180
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||  |||||||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  3724 caaatcatgatacattttcgtagctcctggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatg 3823  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  3824 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcaatgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacat 3923  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3924 ctacttgctgtgcttcttggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcattcccaactg--tactctgaggtgacaactcacagacaagactcaa 4021  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  4022 gtctctaaactgctctagcaaattgaattcttttaccatcatagcagacatatgcaacgccttcatgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacct 4121  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |  ||||||||||| ||||||||    
T  4122 ggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacaactctaaccatcttctctgcct 4180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 43146 - 43013
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||||| | || ||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||     
T  43146 actcaagtctctgaactgttcaagaaactccaactctttaaccatcataacagacatatgtaatgttttcctacttaaagcatctgcaacgacattagct 43047  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  43046 ttacctggatgataattcaaaccaaagtcataat 43013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 38494 - 38396
Alignment:
Q  275 actctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcct 373  Q
    |||||| ||||||| |||||| || | |||||||||||| |||||  | |||||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  38494 actctgtggtgacacttcacaaaccaaactcaagtctctgaactgtacaagcaactccaactctttaaccatcataacaaacatatgtaatgttttcct 38396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 12 - 466
Target Start/End: Original strand, 32388 - 32842
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  32388 tcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctccagaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaa 32487  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| ||    
T  32488 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccac 32587  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    ||| || |||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32588 ttgttgcgcttcttggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgtacactctgaggtgacaattcacagacaagactcaaatct 32687  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  32688 ctaaaccgcgctagcaactcaaattcttttaccatcatagcagacatatgcaacgttttcctgctcagagtatccgcaaccacattagctttacccggat 32787  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||  || |||| |||||| ||||||||    
T  32788 ggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacagctctagccatcttctctgcct 32842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 5723 - 6150
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5723 caaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcttccagaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaata 5822  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  5823 caaattcttcctctgaacctcaacataccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaatttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacat 5922  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5923 caacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaactgtacactctgaggtgacaactcatagacaagactcaa 6022  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||     
T  6023 gtctctaaactgctctagcaactcaaactcctttaccatcataacaaacatgtgcaacgttttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttaccc 6122  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  6123 ggatggtaattcaaaccaaaatcataat 6150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 2561 - 3019
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| | ||  |||||||| |||| || || | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  2561 caaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaataattaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaattttttcaaatcatcattatcaggaatg 2660  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||| ||||||| | ||    
T  2661 caaattcttcctctgaaccttaacacaccctaatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcatcaaacttaagat 2760  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2761 ctacttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgtacactctgaggtgtcaattcacagacaagactcaa 2860  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||| |||| ||||||||||  | ||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||     
T  2861 gtctctaaactactctagcaaatcgaattctttcaccatcatagcagacatatgcaacatcttcctgctcagcgcatctgcaaccatattggctttaccc 2960  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  2961 agatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatcttctctgcct 3019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 41890 - 42348
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||| || || | ||||||||||||||| || ||||| | |||||||    
T  41890 caaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaactcgtcattattaggaata 41989  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |  ||  | |||||||||||||| ||    
T  41990 caaattcttcctctggacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctatgccattaccagcaaccaatatatcaacaaacttcacat 42089  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  42090 ccacttgctgagcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaa 42189  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  42190 gtctctaaactgttctagcaaatcgaattctttcaccattaaagcagacatatgcagcgttttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttacct 42289  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  42290 ggatggtaattcaaaccaaaatcatagtccttcaacagctctaaccatctcctctgcct 42348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 9 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 4285 - 3828
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||  |||||||| |||| || || | ||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4285 aaatcatgatacatctttgtagctcccgaatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaaccttttgaaatcatcattatcaggaatac 4186  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||    
T  4185 aaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatccaccttaaactcactatcctcagtgccattaccagcaaccattaaatcaacaaacttcacatc 4086  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
    |||| | || |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4085 tactagttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaactgtacactctaaggtgtcaattcacaaacaagactcaag 3986  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  3985 tctctaaaatgctctagcaactcaaattctttcaccatcaaagcagacatatgcaacgtcttgctactcaaggcatctgcaaccacattagctttacccg 3886  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  3885 ggtggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatctcctctgcct 3828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13234 - 12783
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13234 caaatcatggtacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatg 13135  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||| | ||    
T  13134 caaattcttcctctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattacccgcaaccatcaaatcaacaaacttgacat 13035  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         
T  13034 ccacttgttgtgcttctcgtatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgtatactctgaggtgacaactcacagacaaga----- 12940  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
      |||||||| | |||||||| |||||||  || |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12939 --ctctaaacagttctagcaattcaaattgcttcaccatcaaaggagacatatgcaatgtcttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacca 12842  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  12841 tgatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaatagctccaaccatctcctctgcct 12783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 68343 - 68770
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||| | ||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  68343 caaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaagttactcttatgactttcttctaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcaggaata 68442  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||| || |||| |||||| || ||||||||||| || || ||||||||||  | ||||| ||||  ||| ||||| ||||||||   ||    
T  68443 caaattctgcctctaaatctcaacacaccttgttcatcaaccttgaaatctctatcctcagcttgattactagtaaccattaaatccacaaacttagcat 68542  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || ||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  68543 caacttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattgatcttcagcatacccaactgtacactctgaggtgacaattcacaaacgagactcaa 68642  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||  ||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  68643 gtctctaaactgttcaagaaattcgaattcctttaccatcatggccgacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaactacattagctttaccc 68742  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  68743 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 68770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 20093 - 20520
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||  || ||||| || || |||||||||||  |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20093 caaatcatgatacaaattagtagctccaggatgaatactcaagctactcttgtgactctcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaata 20192  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||    
T  20193 caaattcttcctctgaatctcaatacaccctgatcatcaactttgaagtcaatatcttcagcttcattaccagtaaccatcaaatcaacaaacttaacat 20292  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20293 ccacttgttgcgcttctcggatactgttcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgaatactctgaggtgtcaattcacaaacaagactcaa 20392  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20393 gtctctaaattgttctagtaaatcgaattccttcaccatcaacgcagacatatgcaatgtcttcctgctcaacgcatccgcaaccacattggctttacca 20492  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20493 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 20520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 387 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 58145 - 58097
Alignment:
Q  387 gcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  58145 gcaacaacattagccttacccggatggtaattcaacccgaaatcataat 58097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 8 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 2688 - 2233
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2688 caaatcatgatacattttcgtagctcctggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaata 2589  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    ||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||  |  ||| |||||||||||||||| ||    
T  2588 caaatccttcctctgaaccttaacacaccctgatcatcgaccttgaagtcactatcctctgtttcattaccaacaaccattaaatcaacaaacttcacat 2489  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  2488 ctacttgttgcgcttctcggatactgttcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaactcacacacaagactcaa 2389  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  2388 gtctctaaattgctctagcaaatcgaattcttttaccatcatagtagacatatgcaacgttttcctacgcaaggcatctgcaactacattggctttacca 2289  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctg 463  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||    
T  2288 ggatggtaattcaaaccaaaatcataatctttcaacagctctaaccatctcctctg 2233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 8033 - 8491
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||  |||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||| ||||||  ||||||||     
T  8033 caaatcatgatacattttcgtagctcccagatgaatactcaagctactcttgtgactctcctctaaaattaactttttcaaaccatcatcatcaggaatg 8132  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
     ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  8133 aaaattcttcctctaaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgcccttaccagtaaccatcaaatcaacaaacttcacat 8232  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8233 ctacatgctgcgcttctcgaatactattcaagaagtcactgttaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaa 8332  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||| | |||||||||| || |||||  ||||  |||| |||||||||||||| ||||||    
T  8333 gtctctaaactgttctagcaaatcgaattctttcaccattaaagtagacatatgcaacgtcttcctattcaagacatctgcaaccacattggctttacca 8432  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||    
T  8433 agatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacagctccaaccatctcctctgcct 8491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 884 - 427
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||| |||| || || | ||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  884 caaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaactc-tcattatcaggaata 786  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| | ||| | ||    
T  785 caaattcttcctctgaacctcaatacaccttgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcaaccagcttgacat 686  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  685 ccacttgttgtgcttcccggatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaactgtacactctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaa 586  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  585 gtctctaaactgctctaacaaatcaaattctttcaccatcatagcagacatgtgcaacgttttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttaccc 486  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||||||||    
T  485 ggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacagctctaagcatctcctctgcct 427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 442
Target Start/End: Original strand, 13034 - 13465
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  13034 atcatgatacatcttcgtagctccagggtgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcattgtctggaatacaa 13133  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    |  || ||||  || |||| |||||| |||||||| | |||||| ||||| || ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  13134 atcctacctcgaaatctcaacacaccttgatcatcgatcttaaaatcactgtcttcagtctgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaa 13233  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| ||||||   ||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| || | ||  | ||||| || ||||| |||||| || |  ||||| |    
T  13234 ctttctgtgcttctttaatactcttc-agaaattcattatcaatcttcagcattcctagcttcacactctcagatgacatttcacacactaagctcaaat 13332  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||  ||| || ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| ||    
T  13333 ctctgaactgttcaagtaactcgaactcctttaccatcatggcagacttatgcaaagtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagcttgacccgg 13432  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataattcttcag 442  Q
    ||| ||  ||||  |||||||||| | ||||||    
T  13433 atgatagctcaactcaaaatcatagtccttcag 13465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 442
Target Start/End: Original strand, 7000 - 7427
Alignment:
Q  15 tggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| ||| ||||||||||  |    
T  7000 tggtacatcttcgtagctcctggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcc 7099  T
Q  115 ttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttg 214  Q
    | ||||| ||||| | |||| | |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | || || || |  || ||| ||||||||||| | ||| ||||     
T  7100 tacctctaaaccttaacacagcttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatcactagcaaccaacaagtcaacaaacttaacatcgacttt 7199  T
Q  215 ctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctct 313  Q
    ||| ||||||   ||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| || | ||  | ||| | || ||||| |||||| || | |||||| |||||    
T  7200 ctgtgcttctttaatactcttc-agaaattcattatcaatcttcagcattcctagcttcacactttcagatgacatttcacaaactaaactcaaatctct 7298  T
Q  314 aaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatgg 413  Q
     ||||| || |||||||| || || |||||||||| |||  |||||||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||     
T  7299 gaactgttcaagcaactcgaactcatttaccatcatagcggacatatgcaaagtcttcctactcaaagcgtctgcaacaacattagctttacccggatga 7398  T
Q  414 taattcaagccaaaatcataattcttcag 442  Q
    ||  ||||  |||||||||| | ||||||    
T  7399 tagctcaactcaaaatcatagtccttcag 7427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 403
Target Start/End: Original strand, 23443 - 23544
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||| ||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  23443 actcaaatctcgaaactgctcaatcaactccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagcc 23542  T
Q  402 tt 403  Q
    ||    
T  23543 tt 23544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 466
Target Start/End: Original strand, 28191 - 28648
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| ||||| |||||||  ||| | |||||||| ||  |||||||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  28191 aaatcatgatacattttcgtagatcccagatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattattagaaatac 28290  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||| | |||    
T  28291 aaattcttcctccgaacctcaacacaccctgaaaatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaagcttgacatc 28390  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     ||||| || |||||||||||||| |||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  28391 cacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcattgttaatcttcagcatccccaactgtacactctgaggtgtcaattcacaaacaagactcaaa 28490  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  28491 tctctaaactactctagcaaatcaaattatttcaccatcaaagcacatatatgcagtgtcttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacccg 28590  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  28591 gatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatctcctctgcct 28648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 466
Target Start/End: Original strand, 34444 - 34901
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| ||||| |||||||  ||| | |||||||| ||  |||||||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  34444 aaatcatgatacattttcgtagatcccagatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattattagaaatac 34543  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||| | |||    
T  34544 aaattcttcctccgaacctcaacacaccctgaaaatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaagcttgacatc 34643  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     ||||| || |||||||||||||| |||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  34644 cacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcattgttaatcttcagcatccccaactgtacactctgaggtgtcaattcacaaacaagactcaaa 34743  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  34744 tctctaaactactctagcaaatcaaattatttcaccatcaaagcacatatatgcagtgtcttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacccg 34843  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  34844 gatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatctcctctgcct 34901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 429 - 102
Alignment:
Q  61 gactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcact 160  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||     
T  429 gactttcttcgaaaatcaactttttcaactcatcactatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctaatcgtcaaccttgaagtcacg 330  T
Q  161 atcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagc 260  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||  ||| ||||| ||| |||| | ||| || | ||| |||||||  ||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  329 atcttcagtttcattactagtaaccattaaatccacacacttgacatcaacattctgggcttctctaatactattcaagaaatcactattaatctttagc 230  T
Q  261 atccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatat 360  Q
    || |||||         |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| | |  || || ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |    
T  229 atacccaa---------ctgaggtggcagctcacaaacaagactcaagtctttgagttgttcaagcaactcaaactcctttaccatcatagcaaacatgt 139  T
Q  361 gcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacatt 397  Q
    |||| || |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  138 gcaacgtcttcctgcttaaagcatctgcaaccacatt 102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 39 - 466
Target Start/End: Original strand, 5 - 432
Alignment:
Q  39 tgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccct 138  Q
    |||||||| ||  |||||||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5 tgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccct 104  T
Q  139 gatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaa 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |   ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  105 gatcatcaaccttaaagtcactatcctcaataacattaccagcaacaatcaaatcaacaaacttaacatctacttgctgtgcttctcggatactattcag 204  T
Q  239 gaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattct 338  Q
    ||||| ||||| ||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  205 gaaatcactattaattttcaacatcccaaactgaacactctgaggtgtcaactcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaaatcgaattct 304  T
Q  339 tttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattct 438  Q
    || ||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  305 ttaaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcctgctcaacgcatctgctaccacattggctttacctggatggtaattcaaacaaaaatcataatcct 404  T
Q  439 tcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||    
T  405 tcaacagctctaaccatctcctctgcct 432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 11390 - 10932
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| | || || || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  11390 caaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtggctttcctccaaaatcaactttttcacatcatcattatcaggaatg 11291  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||    
T  11290 caaattcttcctttgaatctcaacacaccttgatcatcaaccttaaagtcactatcttcagtttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttcacat 11191  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| | | | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  11190 ctacttgctgcgcttctcgaatactattcaagaaatcaatgttaatcttcagcattcccaactgaacactctgaggtgtcaactcacagacaagactcaa 11091  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||     
T  11090 gtctctaaactgctctagcaaatcaaattcttttaccatcgtagcagacatgtgcaacgtcttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacct 10991  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  10990 ggatgataattcaagccaaaatcataatctttcaacagctctaaccatcttctctgcct 10932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15160 - 14702
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| | || || || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  15160 caaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtggctttcctccaaaatcaactttttcacatcatcattatcaggaatg 15061  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||    
T  15060 caaattcttcctttgaatctcaacacaccttgatcatcaaccttaaagtcactatcttcagtttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttcacat 14961  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| | | | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14960 ctacttgctgcgcttctcgaatactattcaagaaatcaatgttaatcttcagcattcccaactgaacactctgaggtgtcaactcacagacaagactcaa 14861  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||     
T  14860 gtctctaaactgctctagcaaatcaaattcttttaccatcttagcagacatgtgcaacgtcttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacct 14761  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  14760 ggatgataattcaagccaaaatcataatctttcaacagctctaaccatcttctctgcct 14702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 20956 - 21414
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20956 caaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaata 21055  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    ||||  |||||| ||||| |||  | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  21056 caaatccttcctgtgaacttcaatataccctgatcattaaccttgaagtcactatcttcaatttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacat 21155  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | | | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21156 ccacttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcaatgttaatcttcagcattcccaactgaacactctgaggtgtcaactcacagacaagactcaa 21255  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||  || ||||||  ||||  |  ||||| ||||| || ||     
T  21256 ttctctaaatggctctagcaaatcaaattctttcaccatcatagcagacatatgcaacgtcctcttgctcatcgcatttgacaccacgttggctttcccc 21355  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
      |||||||||||| |||||||||||||  ||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  21356 aaatggtaattcaaaccaaaatcataatctttcaacagctctaaccatcttctctgcct 21414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 81165 - 80738
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  81165 caaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcttcaagaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaata 81066  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||| | ||||| ||||||| | ||| | ||    
T  81065 caaattctacctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactgtcctctgtttcattaccagcaatcatcgaatcaaccagcttgacat 80966  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| ||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| || |||||  |||| ||||| || |||||||     
T  80965 ccacttgctgtgcttctcggatactacccaagaaatcactattaatcttcagcatgcccaactttattctttgaggctacaactcacataccagactcat 80866  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  80865 gtctctaaactgttccagcaaatcaaattcttttaccatcatagcagacatatgtagtgtcttcctgctcaacgcatcagcaaccacattggctttacca 80766  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  80765 ggatggtaattcaaaccaaaatcataat 80738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 466
Target Start/End: Original strand, 13173 - 13631
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcc-cccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||| ||  |||||||| |||| || || | ||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  13173 aaatcatgatacattttcgtagcttcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaaccttttgaaatcatcattatcaggaata 13272  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||    
T  13273 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatccaccttaaactcactatcctcagtgccattaccagcaaccattaaatcaacaaacttcacat 13372  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    ||||| | || |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13373 ctactagttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaactgtacactctaaggtgtcaactcacagacaagactcaa 13472  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||     
T  13473 gtctctaaactgctctagcaaatcaaattctttcaccatcgtagcagacatgtgcaacgtcttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacct 13572  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  13573 ggatgataattcaagccaaaatcataatctttcaacagctctaaccatcttctctgcct 13631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 6847 - 6728
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| ||||||||||||  ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  6847 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagtcatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 6748  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || || ||||| ||| ||||    
T  6747 tttccgggatgataactcaa 6728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 297 - 724
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  297 caaatcatggtacatttttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcttcattttcaggaata 396  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
     ||| ||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | |  ||| |||||||||||||| | ||    
T  397 taaattctacctctgaatctcaatacaccctggtcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttcattacccgcaaccattaaatcaacaaactttacat 496  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  497 ccacttgctgcgcttcttggatactattcaagaaatcactattaattctcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaactcacaaacaaggctcaa 596  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  597 gtctctaaactgttctagcaaatcaaattcttttaccatcaacgcagacatatgtaaggtcttcctgctcaacgcatccgcaaccacattggctttacca 696  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||    
T  697 gggtggtaattcaaaccaaaatcataat 724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 45490 - 45917
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| || ||    
T  45490 caaatcatggtacatttttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcttcattgtcaagatta 45589  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| | |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | | |  ||| |||||||||||||| | ||    
T  45590 caaattctacatctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttcattatccgcaaccattaaatcaacaaactttacat 45689  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  45690 ccacttgctgcgcttctcggatactattcaagaaattactgttaatcttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacaaacaaggctcaa 45789  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |  || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45790 gtctctaaactgttctagcaaatcaaattctcttaccatcaacgcagacatatgtagggtcttcctgcttaacgcatccgcaaccacattggctttacca 45889  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  45890 ggatggtaattcaaaccaaaatcataat 45917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 20873 - 21287
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || ||||  ||||| ||||||||||   |||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  20873 caaatcatgatacatttttgtaggtcccggatgaatactcatgctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcttcattgtaaggaata 20972  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | |  ||| |||||||||| ||| | ||    
T  20973 caaattctacctctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttcattacccgcaaccattaaatcaacaatctttacat 21072  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||             ||||||||| ||| | ||||| |||||    
T  21073 ccacttgttgcgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatcccca-------------aggtgacaactcagaaacaaggctcaa 21159  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| |    
T  21160 gtctctaaactgttctagaagatcaaattctcttaccatcaacgcagacatatgtaaggtcttcctgctcaacgcatccgcaaccacattagctttacta 21259  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21260 ggatggtaattcaaaccaaaatcataat 21287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19671 - 19240
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||   |  | ||||||||||||||||  || ||||  ||||||| ||| |||||||||    
T  19671 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacatctatggctctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaa 19572  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    |  |  ||||  |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | || || || |  || ||| || |||||||| | |||      
T  19571 atccgacctcgaaacctcagtacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatcactagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcag 19472  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtc 310  Q
    ||| ||| || |||   ||||| ||||| || | | |||||||||||||||| || | ||  | ||| | || ||||| |||||| || |  || || ||    
T  19471 ctttctgtgcctctttaatactcttcaaaaattcattatcaatcttcagcattcctagcttcacactttcagatgacatttcacacactaatcttaaatc 19372  T
Q  311 tctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagga 410  Q
    | | ||||| || |||||||  || ||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||    
T  19371 tttgaactgttcaagcaacttgaactcttttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacccgga 19272  T
Q  411 tggtaattcaagccaaaatcataattcttcag 442  Q
    || ||  ||||  |||||||||| | ||||||    
T  19271 tgatagctcaacacaaaatcatagtccttcag 19240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 24 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 6555 - 6113
Alignment:
Q  24 ttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctga 123  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| || || | ||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| |    
T  6555 ttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaatcatcatcatcaggaatgcaaattcttcctctaa 6456  T
Q  124 acctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttc 223  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| |||||||| ||||||| | | |||||||  |||||    
T  6455 atctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccattaaatcaactaacttcacagccacttgctttgcttc 6356  T
Q  224 tcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctct 323  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  6355 tcggatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaactgtacactcagaggtgtcaattcacatacaaggcttaagtctctaaactgctct 6256  T
Q  324 agcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagc 423  Q
    | ||| | ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6255 aacaaataaaattctttcaccattaaagcagacatatgcaacattttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagc 6156  T
Q  424 caaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||| |||||  |  ||||||||||| ||||||||    
T  6155 caaaatcataatccttcaacatctctaaccatcttctctgcct 6113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 10790 - 10332
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||| || || | ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||     
T  10790 caaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaaccatcatcattaggaatg 10691  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||    
T  10690 caaattctccctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccaataaccatcaaatcaacaaacttctcat 10591  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||  || |||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||| || | | ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10590 ccacttattgcgcttctcggatactatttaagaaatcactattaatcttcagcatccccaattgaacaatctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaa 10491  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||  |||||  |||||||||  |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||    
T  10490 gtctctaaactgttctagcaaattgaattctttcaccactaaagcggacatatgcagcgttttcctactcaaggcatctgtaaccacattggctttacca 10391  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||    
T  10390 ggatggtaattcaacccaaaatcataatccttcaacagctccaaccatctcctctgcct 10332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21004 - 20546
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||| || || | ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||     
T  21004 caaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaaccatcatcattaggaatg 20905  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||    
T  20904 caaattctccctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccaataaccatcaaatcaacaaacttctcat 20805  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||  || |||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||| || | | ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20804 ccacttattgcgcttctcggatactatttaagaaatcactattaatcttcagcatccccaattgaacaatctgaggtgtcaattcacagacaaggctcaa 20705  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||  |||||  |||||||||  |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||    
T  20704 gtctctaaactgttctagcaaattgaattctttcaccactaaagcggacatatgcagcgttttcctactcaaggcatctgtaaccacattggctttacca 20605  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||    
T  20604 ggatggtaattcaacccaaaatcataatccttcaacagctccaaccatctcctctgcct 20546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 323677 - 324135
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| || || | ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||     
T  323677 caaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctccaaaattaactttttcaaatcatcatcatcaagaatg 323776  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |  ||| |||||||||||||||| |     
T  323777 caaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcattgccattaccagcaaccattaaatcaacaaacttcacac 323876  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || |||||||||||||| |||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  323877 ccacttgttgtgcttctcggatactcttcaagaaatcattgttaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaattcacaaacaaggctcaa 323976  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  323977 gtctctaaactgctctaacaaatcaaattatttcaccattaaagcagacatgtgcaacgtcttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttacta 324076  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  324077 ggatggtaattcaaaccaaaatcatagtccttcaacagctctaaccatctcctctgcct 324135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 202797 - 202376
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||| ||  ||||  || |||| ||||| | |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  202797 tcatgatacatctttgtagctccctgatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaacttttttaactcatcattatcaggaatacaaa 202698  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||| || | ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | |||   || |  || ||| || |||||||| | ||| ||    
T  202697 ttctaccgcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttgatttttagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaac 202598  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    || |||  |||||   ||| |||||||||| | ||| |  ||||||| ||| |||||||  | ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  202597 tttctgcacttctttaatattgttcaagaactcactgttgatcttcaacatacccaacttcacactctgaggcgacaactcacaaactagactcaagtct 202498  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  202497 ctaaaatgttcaagcaactcaaactctttaaccatcatagctgacatatgcaatgtcttcctgctcaaagcatctgcaacaacatttgctttacctggat 202398  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
    | |||||||| |||||||||||    
T  202397 gataattcaaaccaaaatcata 202376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 435
Target Start/End: Original strand, 118470 - 118626
Alignment:
Q  279 tgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctca 378  Q
    |||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||| || |||| ||| || ||||| | ||||| | |  ||||||| |  |||||||| || |    
T  118470 tgagatgacaattcacaaataaaactcaagtctctaaactgttcgagcagctccaactctttgatcatcataacggacatatgtagagttttcctactta 118569  T
Q  379 atgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    | ||||| ||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  118570 aagcatctgcaacaacgttagctttacctggatgataattcaacccaaaatcataat 118626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 25198 - 24755
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||| || || | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25198 caaatcaggatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaatcatcattatcaggaata 25099  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  25098 caaattcttcctctgaacct-----------gatcatcaaccttaaagtcactatccttagtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacat 25010  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  25009 ctacttgatgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatccccaactgtacactctcaggtgtcaattcacagacaagacacaa 24910  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  24909 atctctaaactgctctagcaaatcgaattctttcaccatcaaagcaaacatatgcaacgtctttctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttaccc 24810  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctct 462  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |  ||||||||||| ||||    
T  24809 ggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacaactctaaccatcttctct 24755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 2663 - 2205
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  2663 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaactttttcaacccatcattgtcagggata 2564  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |   |||| |||||| ||||| | ||    
T  2563 caaattctgcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtgccattaccagcaacaatcagatcaaccaacttgacat 2464  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||| | ||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  2463 ccacttgctgtgcttctcggatactactcaagaattcactgttaattttcaacatacccaactgcacactctgaggtgtcaattcacaaaccagactcaa 2364  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  2363 gtctctgaactgctcaagcaactcaaattctttcaccatcaacgccgacatatgcaatgccttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttaccc 2264  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  2263 ggatgatagttcaaactaaaatcataatccttcaacagctctaaccatctcctctgcct 2205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 2814 - 2360
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||| || || | |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  2814 tcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaaatttttcaactcatcattatcaggaatgcaaa 2715  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| |     
T  2714 ttctttctccgaacctcaacacaccctcatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccag 2615  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2614 ttgctgtgcttctcggatactattcaagaaattacaattaatcttcaacatacccaactgtacactctaaggtgagaactcacagacaagactcaagtct 2515  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| ||||    
T  2514 ctaaactgctctagcaactcaaactcttttaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagcttcacccggat 2415  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||  |  |||| |||||| ||||||||    
T  2414 ggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacaactctagccatcttctctgcct 2360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 74 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 2121 - 1729
Alignment:
Q  74 aatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtca 173  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  2121 aatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatacaaattcttcctcggaacctcaacacaccctgatcattaaccttgaagtcactatcttcagtttca 2022  T
Q  174 ttaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgta 273  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  2021 ttactagcaatcatcaaatcaacaaacttgacatcaacttgttgtgcttctctgatattgttcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaacttta 1922  T
Q  274 tactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcct 373  Q
     ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || | |||| ||||| || |||||    
T  1921 cactctgaggtgtcaactcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaactcctttaccatcatagtagacatgtgcaacgtcttcct 1822  T
Q  374 gctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |  || | |||||||||||||||    
T  1821 actcaaggcatctgcaaccacatttgctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacaactcaagccatctcctctgcct 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 6186 - 6613
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| || || | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6186 caaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaattcttcattgtcaggaata 6285  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||  ||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||| | ||| | ||    
T  6286 caaattctatctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtgccattaccagcaatcatcaaatcaaccagcttgacat 6385  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| ||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||     
T  6386 ccacttgctgtgcttctcggatactacccaagaaatcactattaatcttcagcatgcccaactgtatgctctgaggcgacaactcacataccagactcat 6485  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  6486 gtctctaaactgttccagcaaatcaaattcttttaccatcatagcatacatatgaagtgtcttcctgctcaatgcatcagcaactacgttagctttacca 6585  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  6586 ggatggtaattcaaaccaaaatcataat 6613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 4785 - 4358
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||  |||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4785 caaatcatggtacattttcgtagcttccggatgaatactcaagctactcttatgactttcttctaaaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaata 4686  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| | |  ||| |||||||||||||| | ||    
T  4685 caaattctacctctgaatctcaatacaccctaatcatcaaccttgaagtcattatcctctgtttcattacccgcaaccattaaatcaacaaactttacat 4586  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| |||||||| ||| | |||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  4585 ccacttgctgcgcttctcgaatattattcaagaaatcactattaattctcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaactcacaaacaaggctcaa 4486  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4485 gtctctaaactattctagtaaatcaaattcttttaccatcaatgcagacatatgtaaggtcttcctgctcaacgcatccgcaaccacattggctttacca 4386  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4385 ggatggtaattcaaaccaaaatcataat 4358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 5)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 51512 - 51086
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  51512 aaatcatgatacattttcgtagctcgcggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcgtcattgtcaggaatac 51413  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||    
T  51412 aaattctatctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcggtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttcacatc 51313  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     ||||| || ||||| |||||| | |||| ||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  51312 cacttgttgtgcttcacggatattattcaggaaatcactattaattctcaacatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacaaacaaggctcaag 51213  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || || |||||| |||| ||||| ||| |||||||| | |||| ||    
T  51212 tctctaaactgttctagcaaatcaaattctctcaccatcaacgcagacatatgtaaggtcttcctgatcaacgcatccgcagccacattgcctttactag 51113  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  51112 gatggtaattcaaaccaaaatcataat 51086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 60546 - 60120
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  60546 aaatcatgatacattttcgtagctcgcggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcgtcattgtcaggaatac 60447  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||    
T  60446 aaattctatctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcggtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttcacatc 60347  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     ||||| || ||||| |||||| | |||| ||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  60346 cacttgttgtgcttcacggatattattcaggaaatcactattaattctcaacatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacaaacaaggctcaag 60247  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || || |||||| |||| ||||| ||| |||||||| | |||| ||    
T  60246 tctctaaactgttctagcaaatcaaattctctcaccatcaacgcagacatatgtaaggtcttcctgatcaacgcatccgcagccacattgcctttactag 60147  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  60146 gatggtaattcaaaccaaaatcataat 60120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 66934 - 66508
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  66934 aaatcatgatacattttcgtagctcgcggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcgtcattgtcaggaatac 66835  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||    
T  66834 aaattctatctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcggtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttcacatc 66735  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     ||||| || ||||| |||||| | |||| ||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  66734 cacttgttgtgcttcacggatattattcaggaaatcactattaattctcaacatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacaaacaaggctcaag 66635  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || || |||||| |||| ||||| ||| |||||||| | |||| ||    
T  66634 tctctaaactgttctagcaaatcaaattctctcaccatcaacgcagacatatgtaaggtcttcctgatcaacgcatccgcagccacattgcctttactag 66535  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  66534 gatggtaattcaaaccaaaatcataat 66508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 126 - 466
Target Start/End: Original strand, 27716 - 28055
Alignment:
Q  126 ctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctc 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||    
T  27716 ctcagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcattatcttcagtgtcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccacttgctgtgcttctc 27815  T
Q  226 ggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctag 325  Q
    ||||||| |||||||||| | | | |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27816 ggatactattcaagaaatcattgttaatcttcaacatacccaactgtacactctaaggtgacaactcgcaaacaagactcaagtctttaaactgctctag 27915  T
Q  326 caactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagcca 425  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| || || |||||||  |||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||    
T  27916 caactcaaattcttttaccatcatagcagacatatccaacgtctt-ctgctcagagcatctacaaccacattagctttacctggatggtaattcaaacca 28014  T
Q  426 aaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||| |||||  || |||| |||||| ||||||||    
T  28015 aaatcataatccttcaacagctctagccatcttctctgcct 28055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 130
Target Start/End: Original strand, 26392 - 26495
Alignment:
Q  27 gtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacc 126  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||| || || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26392 gtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcgttatcaggaatacaaattcttcctctaaacc 26491  T
Q  127 tcag 130  Q
    ||||    
T  26492 tcag 26495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13632 - 13174
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||| ||  |||||||| |||| || || ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||     
T  13632 caaatcatgatacatttttgtagctcctagatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctagaattaactttttcaaatcatcatcatcaagaatg 13533  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |  ||| |||||||||||||||| ||    
T  13532 caaattcttcctctgaatctcaacacacccttttcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattactagcaaccattaaatcaacaaacttcacat 13433  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13432 ccacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaattacttttaattttcagcatccccaactgaacactctaaggtgtcaattcacagacaaggctcaa 13333  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  13332 gtctctaaattgttctagcaaatcgaattctttcaccattaaagcaaacatatgcagcgttttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttatca 13233  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||| |||||||| || | |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  13232 ggatggtaattcaaaccaaaatcgtagtccttcaacagctctaaccatctcctctgcct 13174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 27 - 435
Target Start/End: Original strand, 48096 - 48504
Alignment:
Q  27 gtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacc 126  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48096 gtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgactttcttccagaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatacaaattcttcctctgaacc 48195  T
Q  127 tcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcg 226  Q
    ||| |||||| | |||||||||||| || |||| ||| ||||| | ||||| || |  ||| |||||||||||||| | ||| || || || |||||||     
T  48196 tcaacacaccttcatcatcaaccttgaaatcaccatcttcagtttgattactagcaaccattaaatcaacaaacttgacatcaacctgatgtgcttctct 48295  T
Q  227 gatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagc 326  Q
    ||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48296 gatactactcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgtacactctgaggtgataactcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagc 48395  T
Q  327 aactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaa 426  Q
    |||||||| || |||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  48396 aactcaaaatcctttaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaa 48495  T
Q  427 aatcataat 435  Q
    |||||||||    
T  48496 aatcataat 48504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 100885 - 100437
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaata---ctcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcagga 104  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||   || ||  |||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  100885 caaatcatgatacatctttgtagctcccagatgaataatacttaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgttagga 100786  T
Q  105 atacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttca 204  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||             |||||||||||| |||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  100785 atacaaattcttcctctgaatctcaacacaccttga-------------agtcactatccttagtgccattaccagcaactatcaaatcaacaaacttca 100699  T
Q  205 aatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagact 304  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  100698 catccacttgctgagcttctcggatactattcaagaaatcactattaattttcagcatccccaattgaatactctaaggtgtcaattcacagacaagact 100599  T
Q  305 caagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcctta 404  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  100598 caaatctctgaactgctctagcaaatcgaattccttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctgctcaatgcatctgcaaccacattggcttta 100499  T
Q  405 ccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||  || | ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  100498 ccatgatggtaattcaaaccaaaattgtagtccttcaatagctctaaccatctcctctgcct 100437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 391
Target Start/End: Original strand, 181175 - 181555
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || |||| |||||||||||||    
T  181175 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcgtcaggaatacaa 181274  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||  |||| |||  ||| |||||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||||| | ||||  || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  181275 attcggcctcggaatttcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgattattagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaa 181374  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| |||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |  | |||||||| |||| ||||||| || |  ||||| |    
T  181375 ctttctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcactatcaatctttagcattcccagtttcacactctgagatgaccattcacaaactaagctcaaat 181473  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaac 391  Q
    |||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||| |||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  181474 ctctcaactgttcaagcaactcgaactctttaaccatcatagcggacatatgcaacgtcttcctactcaaggcatctgcaac 181555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 1015 - 563
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||||    
T  1015 tcatgatacatttttgtagctcccgggtgaatactctagctactcttgtgactttcttctagaatcaacttttccaactcatcactatcaggaatgcaaa 916  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| || || ||||||  || |  |||||||||||||||||| | ||| ||    
T  915 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaactttgaagtcaatatcttccgtttcattattagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccac 816  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  815 ttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcac-attaatcttcatcatccccaactgtacagtctgaggtgtcaactcacagacaagactcaagtct 717  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| || |  ||||| ||||||||||| || |||||  |||    
T  716 ctaaactgctctagcaaatcaaattcttttaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcctacttatggcatctgcaaccacatttgctttacc-cgat 618  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||  || |||| |||||||||||||||    
T  617 ggtaattcaaaccaaaatcataatctttcaacagctctagccatctcctctgcct 563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 5669 - 5242
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5669 caaatcgtggtacatttttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaata 5570  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| ||||  || |||| ||||||||| || |||||||||||||  || ||| |||    |  ||| |||||||||||||| | ||    
T  5569 caaattctacctctgaatctcaatactccctaatcatcaactttgaagtcactatcctgtgtttcactacatacaaccattaaatcaacaaactttacat 5470  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5469 ccacttgctgcgcttctcggatactattcaagaaattactgttaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacaaacaagactcaa 5370  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| | ||| ||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  5369 gtctctaaactgttctagcaaatcaaattctcataccatctacgcagacatatgtaaggtcttcctcctcaacgcatccgcaactacattggctttacca 5270  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5269 agatggtaatccaaaccaaaatcataat 5242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 3149 - 3607
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||| |||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3149 caaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgacattcttccagaatcatctttttcaactcatcattatcaggaata 3248  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || |||| ||| ||||| | ||||| || |  ||| ||||||||||||||   ||    
T  3249 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctcaccatcaaccttgaaatcaccatcttcagtttgattactagcaaccattaaatcaacaaacttggcat 3348  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3349 caacttgctgtgcttctctgatactgttcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactatacactcttaggtgacaactcacagacaagactcaa 3448  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||     
T  3449 gtctctaaaatgctctagcaactcaaactcctttaccataatagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttaccc 3548  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||| || |  || | |||||||||||||||    
T  3549 ggatggtaatttaaaccaaaatcataatcctttagcaactcaagccatctcctctgcct 3607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 421
Target Start/End: Original strand, 11706 - 12119
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| ||  |||||||  |||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  11706 caaatcatgatacatttttgtagctcctggatgaatacttaagctactcttatgactttcttctaagatcaactttttcaattcttcattgtcaggaata 11805  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |  ||| |||||||||||||| | ||    
T  11806 caaattctacctatgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttcattaccagcaaccattaaatcaacaaactttacat 11905  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11906 ccacttgttgcgcttctcggatactattcaagaaatcactattaattctcaacatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacaaacaaggctcaa 12005  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12006 gtcactaaactgttctagcaaatcaaattcttttaccatcaacgtagacatatgtaaggtcttcctactcaacgcatctgcaaccacattggctttacca 12105  T
Q  408 ggatggtaattcaa 421  Q
    ||||||||||||||    
T  12106 ggatggtaattcaa 12119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12119 - 11692
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| || || | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12119 caaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcatctaaaattaactttttcaattcttcattgtcaggaata 12020  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||| | ||| | ||    
T  12019 caaattctacctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtgccattaccagcaatcatcaaatcaaccagcttgacat 11920  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| |  ||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||  ||||| || | |||||     
T  11919 ccacttgatatgcttctcggatactacccaagaaatcactattaatcttcagcatgcccaaccgtatgctctgaggcgacagctcacataccacactcat 11820  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||| |    
T  11819 gtctctaaactgttccagcatatcaaattcttttaccatcatagcagacatatgcagtgtcttcctgctcaatgcatcagcaactacgttagctttacta 11720  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11719 ggatggtaattcaaaccaaaatcataat 11692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 74 - 441
Target Start/End: Original strand, 5469 - 5836
Alignment:
Q  74 aatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtca 173  Q
    |||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||    
T  5469 aatcgactttttcaactcatcactatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttca 5568  T
Q  174 ttaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgta 273  Q
    |||| ||||  ||| ||||| ||| |||| | ||| ||||  || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5569 ttactagtaaccattaaatccacacacttgacatcaactttttgtgcttctctgatactgttcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgta 5668  T
Q  274 tactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcct 373  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||| ||||| || |||||    
T  5669 cactctgaggtgacaactcacaaacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaactcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcct 5768  T
Q  374 gctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5769 tctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 5836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 74 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 48301 - 47934
Alignment:
Q  74 aatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtca 173  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | |    
T  48301 aatcaactttttcaactcatcattatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcactatcttcagtttga 48202  T
Q  174 ttaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgta 273  Q
    |||| || |  ||| |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||  || |||| ||| ||||||| ||    
T  48201 ttactagcaaccattaaatcaacaaacttgacatcaacttgctgtgcttctctgataatgttcaagaaatcactattgattttcaacatacccaactata 48102  T
Q  274 tactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcct 373  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||| |||| ||||| || |||||    
T  48101 cactctgaggtgacaactcacagacaagactcaagtctctaaactgctctaacaactcaaactcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcct 48002  T
Q  374 gctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    |||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  48001 gctcaaagcatctgcgaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 47934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 57179 - 56722
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| || || | ||| ||||||||||||   ||||  |||||||| |    
T  57179 aaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaactgtcatcatcaggaatgc 57080  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||  |  |||||||||||||||||||| |||    
T  57079 aaattcttcccctgaacctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaatgccattaccaacaaccatcaaatcaacaaacttcacatc 56980  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||     
T  56979 cacttgttgcgcttctcggatactattcaagaaatcactattaattctcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaactcacaaacaaggctcaac 56880  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  ||| | |||||||| |||| |||| ||||  || ||| ||||||| ||||||||||| || || || ||||| |    
T  56879 tctctaaactgttctagcaaatcatgttcctataccatcatagcagacatgtgcagcgtcttcttgctcaacgcatcagcaactacgttagctttacccg 56780  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  || ||||||||||||||||||||    
T  56779 gatggtaattcaaaccaaaatcataatcctttaacagctctaaccatctcctctgcct 56722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 441
Target Start/End: Original strand, 10770 - 11199
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |   ||||  || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  10770 tcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaggctacttctgtgactttcttctagaatcaactttttcaaatcatcattatcaagaatgcaaa 10869  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| | || |  ||| |||||||||||||| | ||  ||    
T  10870 tccttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccattttcagtttcattgctagcaaccattaaatcaacaaactttacataaac 10969  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    ||  || ||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10970 tttatgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaactgcacactctgaggcgacaactcacaaacaagactcaagtct 11069  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  11070 ctaaactgctctagcaactcaaactcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggat 11169  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11170 ggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 11199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Original strand, 28208 - 28532
Alignment:
Q  18 tacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 117  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28208 tacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctccagaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatacaaattcttc 28307  T
Q  118 ctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctg 217  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |   ||||  ||||||||||| | ||| ||||| ||    
T  28308 ctctgaaccttaacacaccctgatcatcaaccttatagtcactatcctcagtttcattaccagcaactatcaggtcaacaaacttgacatccacttgttg 28407  T
Q  218 agcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaac 317  Q
     |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28408 tgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgtacactctgaggtgtcaactcacagacaagactcaagtctctaaac 28507  T
Q  318 tgctctagcaactcaaattctttta 342  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  28508 tgctctagcaaatcaaattctttta 28532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 462
Target Start/End: Original strand, 35422 - 35540
Alignment:
Q  344 catcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagt 443  Q
    ||||| |||| |||| |||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||      
T  35422 catcatagcagacatgtgcaacatcttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaac 35521  T
Q  444 agttctaaccatctcctct 462  Q
    || ||||||||||| ||||    
T  35522 agctctaaccatcttctct 35540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 441
Target Start/End: Original strand, 29034 - 29463
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||  ||||  || | || ||||| | ||||||||||||||| |||||| | ||||||||  |||    
T  29034 tcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtggctttcttccaaaatcaactttttcaactcatcactatcaggaatgaaaa 29133  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| ||||  ||| ||||| ||| |||| | ||| ||    
T  29134 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttcattactagtaaccattaaatccacacacttgacatcaac 29233  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    |||||| ||||||| |||| | |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||    
T  29234 ttgctgtgcttctctgatattattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaactgtacactctgaggtgacaactcacaaacaagaatcaactct 29333  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  29334 ctaaactgctctagcaactcaaacttctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggat 29433  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29434 ggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 29463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 435
Target Start/End: Original strand, 29925 - 30345
Alignment:
Q  15 tggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| ||  ||||||||||  |    
T  29925 tggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtttggaatacaaatcc 30024  T
Q  115 ttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttg 214  Q
    | ||||  ||||||| |||||  |||||||| | |||||| ||||| || ||||| | || || || |  || |||||  |||||||| | ||| ||||     
T  30025 tacctcgaaacctcaacacacgttgatcatcgatcttaaaatcactgtcttcagtctgatcactagaaaccaacaaatgtacaaacttaacatcaacttt 30124  T
Q  215 ctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctct 313  Q
     || || |||   ||||| ||  |||||||   |||||||||||||||| || | ||  | ||| | || ||||| |||||| || | |||||| |||||    
T  30125 ttgtgcctcttttatactctt-tagaaattcgttatcaatcttcagcattcctagcttcacactttcagatgacatttcacaaactaaactcaaatctct 30223  T
Q  314 aaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatgg 413  Q
     ||||| || | |||||| || || |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || ||||| |||||     
T  30224 gaactgttcaaccaactcgaactcctttaccatcatagcagacatatgcaatgtcttcctactcaaagcatctgcaaaaacattagctttacctggatga 30323  T
Q  414 taattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||  ||||  ||||||||||||    
T  30324 tagctcaactcaaaatcataat 30345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 393 - 441
Target Start/End: Original strand, 50168 - 50216
Alignment:
Q  393 acattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  50168 acattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 50216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 18322 - 18749
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  |||| |||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||     
T  18322 caaatgatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgttactttcttccagaatcaactttttcaactcatcactatcatgaatg 18421  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| || |  ||| |||||||||||||| | ||    
T  18422 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttgattactagcaaccattaaatcaacaaacttgacat 18521  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18522 caacttgctgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaaccttcagcatacccaactgtacactttgaagtgacaactcacagacaagactcaa 18621  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| |||| | || || ||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||| || |||||     
T  18622 gtctctaaaatattctagcaactcaaactcttttaccatcatagcagagatgtgaaatgtcttcctgctcaaagcatctacaacgacattagctttaccc 18721  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||    
T  18722 ggatggtaattaaaaccaaaatcataat 18749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 25816 - 25697
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||| |||| || || |||    
T  25816 actcaaatctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaatgtctttctactcaaagcatcaacaacaacgttagcc 25717  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || || ||||| ||| ||||    
T  25716 ttcccgggatgataactcaa 25697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 51196 - 50750
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||| || |||||  || |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  51196 caaatcatgatacatctttgtagctcctagatgaatacttaagttacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaaatcatcactatcaggaatg 51097  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| || |  |||             || | ||    
T  51096 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatctccagtttcattactagaaaccatt------------ttgacat 51009  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || |||||||  ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51008 caacttgatgtgcttctctaatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatagccaactgtacactctgaggtgacaactcacagacaagactcaa 50909  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| || |||||     
T  50908 gtctctaaactgttctagcaactcaaactcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgttttcctgctcaaagcatctacaaccacattagctttaccc 50809  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| | |||||| ||||||||    
T  50808 ggatggtaattcaacccaaaatcataatccttcaacagttcaagccatcttctctgcct 50750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 48539 - 48168
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||||||  |||| || || | ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  48539 caaatcgtggtacatttttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttatgactttcctctaaaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaata 48440  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| | ||| | ||    
T  48439 caaattctacctctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctctgtttcattaccagcaatcatcaaatcaaccagcttgacat 48340  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || || |||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  48339 ccacttgttgtgcctctcggatactacccaagaaatcactattaatcttcagcatgcctaactgtatactctgaggcgacaactcacataccagactcaa 48240  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaa 379  Q
    |||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  48239 gtctctaaaccgttccagcaaatcaaattcttttaccatcatagcagacatatgcagtgtcttcctgctcaa 48168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 261281 - 261708
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||  ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||| ||| |    
T  261281 caaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgaccttcttctaaaattaactttttcaattcttcattgtcaagaaca 261380  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||  |||  ||  || ||||||||| | ||||||||||||| | ||| | ||    
T  261381 caaattctacctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtctttattttctttgccattaccagcaatcatcaaatcaaccagcttgacat 261480  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||  ||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||     
T  261481 ccacttgctttgcttctcggatactacccaagaaatcactattaatcttcagcatgcccaactgtatactctgagtcgacaactcacataccagactcat 261580  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || || || |||||     
T  261581 gtccctaaactgttccagcaaatcaaattcttttaccatcatagcagacatatgcagtgtcttcctgctcaacgcatcagcaactacgttagctttacct 261680  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||    
T  261681 ggatggtaattcaaacaaaaatcataat 261708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 278160 - 277736
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || ||||  ||||||||||||    
T  278160 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaacctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaa 278061  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||  |||| ||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||||| | ||||| || |  ||   | || ||||  || | ||| |    
T  278060 attcggcctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccaaagagtctacaattttgacatcaa 277961  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| || |||   ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||  | || ||||||||||||| | ||||| || | ||||| ||    
T  277960 ctttctgtgcctctttaatactcttca-gaaattcactatcaatcttaagcattcccagttttacactctgaggtgaccactcacaaaccaaactcatgt 277862  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  277861 ctctaaactgttcaagtaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 277762  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  277761 atgataattcaaaccaaagtcataat 277736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 61 - 466
Target Start/End: Original strand, 4 - 409
Alignment:
Q  61 gactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcact 160  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||     
T  4 gactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcgttatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacaccccctgatcatcaaccttgaaatcacc 103  T
Q  161 atcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagc 260  Q
     || ||||| | ||||| || |  ||| |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  104 ctcttcagtttgattactagcaaccattaaatcaacaaacttgacatcaacttgctgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttcagc 203  T
Q  261 atccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatat 360  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||| |||| || |||||||||| |||| ||||||    
T  204 atacccaactgtacactctgaggtgacaactcacaaacaaggctcaagtctctgaactattcaagcaacacaaactcctttaccatcatagcagacatat 303  T
Q  361 gcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcct 460  Q
    |||| || ||||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | ||| | |||||| ||    
T  304 gcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccatattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacaattcaagccatcttct 403  T
Q  461 ctgcct 466  Q
    ||||||    
T  404 ctgcct 409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 245 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 1930 - 1709
Alignment:
Q  245 actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttacc 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |    
T  1930 actatcaatcttcagcatccccaactatatactctgaggtgacagttcacagacaagactcaagtctctaaactgttctaacaattcgaattcttttatc 1831  T
Q  345 atcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagta 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1830 attaaagcagacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcgtaatccttcagta 1731  T
Q  445 gttctaaccatctcctctgcct 466  Q
      | ||||||||||||||||||    
T  1730 actataaccatctcctctgcct 1709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 118 - 435
Target Start/End: Original strand, 40781 - 41098
Alignment:
Q  118 ctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctg 217  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||   ||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||| ||    
T  40781 ctctgaatctcaacacaccctgataatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttcattgttagtaaccatcaaatcaacaaacttgatatccacttgatg 40880  T
Q  218 agcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaac 317  Q
     |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40881 tgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaactgtacactctgaggtgacaactcacagacaagactcaagtctctaaac 40980  T
Q  318 tgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaat 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  40981 tgctctagcaactcaaattcttttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatgataat 41080  T
Q  418 tcaagccaaaatcataat 435  Q
      || |||||||||||||    
T  41081 caaaaccaaaatcataat 41098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 74 - 441
Target Start/End: Original strand, 4815 - 5182
Alignment:
Q  74 aatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtca 173  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  || || || | |    
T  4815 aatcaactttatcaaatcatcattattaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccctcttcggtttga 4914  T
Q  174 ttaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgta 273  Q
    |||| || |  ||| |||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  4915 ttactagcaaccattaaatcaacaaacttgacatcaacttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatactcaactgta 5014  T
Q  274 tactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcct 373  Q
     ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||| | || ||||| || ||| |    
T  5015 cactttgaggtgacaactcacaaacaagactcaagtctctaaactgctccagcaactcaaactcctttaccatcatagcagaaatgtgcaacgtcttctt 5114  T
Q  374 gctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  5115 gctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaatttaaaccaaaatcataatccttca 5182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 1301 - 873
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||| ||  ||||  || |||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1301 tcatgatacatctttgtagctcctagatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaacattttcaactcatcattgtcaggaatgcaaa 1202  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||| || |  ||| |||||||||||||| | |||  |    
T  1201 ttcttcctctgaacctcaacactccttgatcatcaaccttgaaatcactatcttcagtc-cattactagcaaccattaaatcaacaaacttgacatcggc 1103  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||    
T  1102 ttgctgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgtacactctgaggtttcaactcacaaacaagactcaagtct 1003  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| || | ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||| | | ||    
T  1002 ctaaactgctctagcaactcaaagtcatttaccatcatagcagacttgtgcaacgtcttcctgcttaaagcatctgcaaccacattagctttaaccgaat 903  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  902 ggtaatttaaaccaaaatcataatccttca 873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 19822 - 20280
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||| |||| || || | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||     
T  19822 caaatcatgatacatcttcgtagctcccgaatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcatctcatcattgtcaggaatg 19921  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| || || |||||||| ||||  | ||||||| ||  ||| ||||| |||||||| | ||    
T  19922 caaattctgcctctgaacctcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcttcagcttgattaccattaaccattaaatccacaaacttgacat 20021  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | || || || ||||||| |||||| |||||||| | |||||  || |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  20022 caacctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttcagcatacccaactgcacactctggggtgacaattcgcaaaccagactcaa 20121  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||  |||| || || || ||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||     
T  20122 gtctctaaactgttcaagcaactcaaattcctttaccatcatagccgacatgtgtaacgtcttcctgctcaaagcatctgtaactacattggctttaccc 20221  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  20222 ggatgatagttcaacccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatctcctctgcct 20280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Original strand, 23984 - 24442
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||| |||| || || | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||     
T  23984 caaatcatgatacatcttcgtagctcccgaatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcatctcatcattgtcaggaatg 24083  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| || || |||||||| ||||  | ||||| |  |  ||| ||||| |||||||| | ||    
T  24084 caaattctgcctctgaacctcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcttcagattgattacaataaaacattaaatccacaaacttgacat 24183  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | || || || ||||||| |||||| |||||||| | |||||  || |||| ||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  24184 caacctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaattcgcaaacaagactcaa 24283  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||  |||| || || || ||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||     
T  24284 gtctctaaactgttcaagcaactcaaattcctttaccatcatagccgacatgtgtaacgtcttcctgctcaaagcatctgtaactacattggctttaccc 24383  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  24384 ggatgatagttcaacccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatctcctctgcct 24442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 74 - 435
Target Start/End: Original strand, 908 - 1269
Alignment:
Q  74 aatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtca 173  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| |||    
T  908 aatcaactttttcaaatcattgttatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcaccatcttcagtttca 1007  T
Q  174 ttaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgta 273  Q
    |||| || |  ||| |||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  1008 ttactagcaaccattaaatcaacaaacttgacatcaacttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaattgta 1107  T
Q  274 tactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcct 373  Q
     ||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||| || |||||||||| || | |||| || || || |||||    
T  1108 cactctaaggcgacaactcacaaacaagactcaagtctctttactattctagaaactcaaactcctttaccatcatagtagacatgtgtaacgtcttcct 1207  T
Q  374 gctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1208 gctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataat 1269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 856 - 1283
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||  |||| ||||| | ||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  856 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttgctcttatgactttcttctaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcaggaata 955  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||| || |||| |||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||  | ||||| ||||  ||| ||||| |||||||| | ||    
T  956 caaattctgcctctaaatctcaacacaccttgttcatcaaccttgaaatcactattctcagcttgattactagtaaccataaaatccacaaacttgacat 1055  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||| || ||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||||  || |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1056 caacttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattgatcttcaatatacccaactgcacactttgaggtgacaattcacaaacgagactcaa 1155  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||  ||  |||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  1156 gtctctaaactgttcaagcaattcgaattccttcaccatcatggccgacatgtgcaatgtctttctactcaacgcatctgcaactacattagctttaccc 1255  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1256 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 1283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 433
Target Start/End: Original strand, 27501 - 27922
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||||  || |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  27501 tcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttccaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatgcaaa 27600  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||| | ||||| || |  ||| ||||| |||||||| | ||| |     
T  27601 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaacattgaagtcatcattttcagtttgattactagcaaccattaaatccacaaacttgacatcaat 27700  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  27701 tttctgcgcttctctgatactgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaactgcacactctgaggtgacaactcacaaacaagactgaagtct 27800  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
    ||||| || || || | |||||| ||||||||||||| |||| |||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  27801 ctaaattgttcaagtagctcaaactcttttaccatcatagcagacatgtgaaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaactacattagctttacccggat 27900  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  27901 ggtaattcaaaccaaaatcata 27922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 4)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20774 - 20467
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||| | ||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  20774 caaatcaagatagatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgacttttttctaaaatcaactttttcaaatcatcatcatcaggaatg 20675  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |  ||||||||| |||||||| | ||    
T  20674 caaattcttcctctgaatctcaacacaccatgatcatcaaccttaaagtcactatcctgagtgccactaccagcaaccatcaaatcgacaaacttgacat 20575  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20574 ccacttgctgtgcttcccggatactattcaagaaatcactgttaaacttcagcatccctaactgtacactctgaggtgtcaattcgcagacaagactcaa 20475  T
Q  308 gtctctaa 315  Q
    ||||||||    
T  20474 gtctctaa 20467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16603 - 16484
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  16603 actcaagtcttgaaactgctcaatcaactcaaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagcc 16504  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || |||||||| ||| ||||    
T  16503 ttcccaggatgataactcaa 16484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 25908 - 25820
Alignment:
Q  315 aactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcctt 403  Q
    |||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||  ||||||||||| ||||| |||||    
T  25908 aactgctcaatcaattccaattctttaaccatcaaagcaaacatatgcaaagtctttctactcagagcatcagcaacaacattagcctt 25820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 27305 - 27186
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| |||||| |||| ||||| |||    
T  27305 actcaaatctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcaacaacaacattagcc 27206  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || || ||||| ||| ||||    
T  27205 ttcccgggatgataactcaa 27186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 208 - 441
Target Start/End: Original strand, 15285 - 15518
Alignment:
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    ||||||| || ||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15285 ctacttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgtacactctgaggtgacaactcacagacaagactcaa 15384  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||     
T  15385 gtctctaaactgttctagcaactcaaactcctttaccatcatagcagacatatgcaacctcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttaccc 15484  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15485 agatggtaattcaacccaaaatcataatccttca 15518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 8900 - 8781
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||| ||||||||| | |||||| || ||||| ||  |||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  8900 actcaaatctcgaaactgctcaatcaactctaactctttaacattcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagcc 8801  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || || ||||| ||| ||||    
T  8800 ttcccgggatgataactcaa 8781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 563 - 139
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttc-aagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||  |||| ||||| || ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  563 tcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaagttgctcttatgactttcttctaaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcaggaatacaa 464  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||| ||||| || |||| |||||| || ||||||||||| || ||||||| ||| |  | ||||| ||||  ||| ||||| |||||||| | ||| |    
T  463 attctgcctctaaatctcaacacaccttgttcatcaaccttgaaatcactattctccgcttgattactagtaaccattaaatccacaaacttaacatcaa 364  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtc 310  Q
    |||| || ||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||| || ||||| |||||    
T  363 cttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattgatcttcagcatacccaactgcacactctgagatgacaattcacacacgagacttaagtc 264  T
Q  311 tctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagga 410  Q
     |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||| | |||    
T  263 cctaaactgttcgagcaattcaaactcctttaccatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaactactttagctttatctgga 164  T
Q  411 tggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  163 tggtatttcaagccaaaatcataat 139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 49847 - 49389
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||| |||| ||||| | ||||||| ||||||  ||||| || ||||||||     
T  49847 caaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttcttccaaaatcaaccttttcatctcatcgttatcaggaatg 49748  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| | ||||||| ||| |||||| || |||||||| || || |||||||||||||  ||||||| | ||   || ||||| |||||||| | ||    
T  49747 caaattctgcatctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagcttcattactattaactattaaatccacaaacttgacat 49648  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | || || || ||||||| |||||| |||||||| | |||||  || |||  ||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  49647 caacctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttctacatacccaactgcacactctggggtgacaattcgcaaacaagactcaa 49548  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||  |||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  49547 gtctctaaactgttcaagcaactcaaattcctttaccatcatggccgacatgtgtaacgtcttcctactcaaagcatctgcaactacattggctttaccc 49448  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    | ||| || ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  49447 gaatgatagttcaacccaaaatcataatccttcaatagctctaaccatctcctctgcct 49389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 427
Target Start/End: Original strand, 44127 - 44543
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| | ||||    
T  44127 caaatcgtgatacatcttcgtagctcccgagtgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgtaata 44226  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||  ||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| |  | || || |   | ||| || |||||||| | ||    
T  44227 caaattctctctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctggtcactagca---accaagtccacaaacttgacat 44323  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||| ||| |||||   |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| ||||||| || | |||||     
T  44324 caactttctgtgcttccttgatactcttcaggaactcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcacaaaccaaactcat 44423  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| || || ||||| || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  44424 atctctgaactgttcgagtaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtcttccgactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 44523  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaa 427  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  44524 ggatggtaattcaaaccaaa 44543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 466
Target Start/End: Original strand, 9448 - 9905
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| |||||||    
T  9448 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactcctgtgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatac 9547  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  || || ||| | || |||||   || || || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  9548 aaattcttcctcggaatctcaccacaccttgatcatcgattttcaaatcattgtcttcagtccgatcactagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 9647  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || |  |  | ||||| ||||||| |||| || || | |||||     
T  9648 aactttctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcatacctagtttcacactctcaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 9746  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| || || || || || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||| | || |||||     
T  9747 atctctgaactgttcaagtaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctacttaaggcatctgcaacaacactagctttacct 9846  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| | ||||| |||||| | ||||||    
T  9847 ggatgataattcaaaccaaagtcataatctttcagcaattctagccatctacgctgcct 9905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 466
Target Start/End: Original strand, 15910 - 16367
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| ||| || |  || | |||||| |||||||    
T  15910 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactcctgtgactctcttcaagaatcatcttcttaatctctttattgtctggaatac 16009  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||| | || |||||   ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  16010 aaattcttcctcggaatctcaccacaccttgatcatcgattttaaaatcattgtcttcagtccgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 16109  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| || |  |  | ||||| ||||||| |||| || || | ||||      
T  16110 aactttctgtgcttccttgatact-tttaagaaattcactatcaatcttcagcatacctagtttcacactctcaggtgaccattcgcaaaccaaactctt 16208  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| || || || || || ||| | ||||||| || | ||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  16209 atctctgaactgttcaagtaattcgaactctctgaccatcatagaagacatatgcaatgtcttccaactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 16308  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| | ||||| |||||| | ||||||    
T  16309 ggatgataattcaaaccaaagtcataatctttcagcaattctagccatctacgctgcct 16367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 105612 - 105502
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  105612 actcaagtctcgaaactgctcaaccaaatccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagcc 105513  T
Q  402 ttaccaggatg 412  Q
    || || |||||    
T  105512 ttcccgggatg 105502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 949 - 812
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||| |||||||||| ||||||| ||| || |  || |||| |||  |||||    
T  949 caaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaagctacttttgtgactctcttccagaatcatcttctttatctcttcatcgtctagaata 850  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatc 145  Q
    |||| ||| ||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  849 caaattctacctcgaaacctcaatacaccatgatcatc 812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 254 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12614 - 12402
Alignment:
Q  254 cttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagca 353  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||  |||||    
T  12614 cttcagcatccccaactgaatactctgaggtgtcaattcacagacaagactcaagtctctaaactgttctagcaaatcgaattctttcaccattcaagca 12515  T
Q  354 aacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaacc 453  Q
     |||||||||  || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||    
T  12514 gacatatgcagcgtcttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcatagtccttcaacagttctaacc 12415  T
Q  454 atctcctctgcct 466  Q
    |||||||||||||    
T  12414 atctcctctgcct 12402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 32083 - 31659
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||  |  |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  32083 atcatgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaa 31984  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||| |||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| | ||||| || |   | ||| || |||||||| | ||| |    
T  31983 attctacctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgattactagcaactaacaagtctacaaacttgacatcaa 31884  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| ||||||   ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||| |||| ||  | ||| | || |||||| |  ||||| | |||||| |    
T  31883 ctttctgcgcttctttaatacttttc-agaaattcattatcaatctttagcattcccagcttcacactttaagatgacaacttgcagactaaactcaaat 31785  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  31784 ctctaaactgttcaagcaactcgaactcttttaccatcatagcggacatatgcaacgtcttcctacttaaggcatctgcaaccacattagctttacctgg 31685  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||| || || || | |||||||||||    
T  31684 atgatagtttaaactaaaatcataat 31659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Original strand, 3768 - 4044
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  3768 tcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcttccagaataaactttttcaactcatcattatctggaatgcaaa 3867  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| ||    
T  3868 ttctccctctgaacctcaacacaccctgaacatcaaccttgaagtcactctcttcagtttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccac 3967  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgaca 288  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  3968 ttgctgcgcttctcggatactattcaagaaatcgctattaatcttcaacatacccaattgtacactctgaggtgaca 4044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 303 - 466
Target Start/End: Original strand, 7640 - 7803
Alignment:
Q  303 ctcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcct 402  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  7640 ctcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcttttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctt 7739  T
Q  403 taccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||| ||||| ||  ||||  ||||||||||||  ||||| | ||||| |||||| | ||||||    
T  7740 tacccggatgatagctcaactcaaaatcataatctttcagcaattctagccatctacgctgcct 7803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 466
Target Start/End: Original strand, 113542 - 113990
Alignment:
Q  18 tacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 117  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||  || ||||| |||| ||||| | ||||| | ||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||| |    
T  113542 tacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctattcttgtgactttcttccaaaatcagccttttcatctcatcgttgtcaagaatacaaattctgc 113641  T
Q  118 ctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctg 217  Q
    ||| ||| |||| |||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| | ||||| | ||  ||| ||||| |||| ||| | ||| || || ||    
T  113642 ctccgaatctcaacacaccgtgttcatcaaccttgcaatcactatcttcagtttgattactattaaccattaaatccacaagcttgacatcaacctgttg 113741  T
Q  218 agcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaac 317  Q
     ||||||| |||||| |||||||| | | |||  || |||| ||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  113742 cgcttctctgatactattcaagaattcattattgattttcaacatgcccaactgcacactctggggtgacaattcacaaacaaggctcaaatctctaaac 113841  T
Q  318 tgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaat 417  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||  ||  |||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |    
T  113842 tgttcaagcaactcaaattccttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtcttcctactcaaagcatctgcaactacattggcgttacccggatgatagt 113941  T
Q  418 tcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  113942 tcaacccaaaatcataatccttcaatagctctaaccatctcctctgcct 113990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 109143 - 108717
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| ||||||     
T  109143 aaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatat 109044  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  109043 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 108944  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  |  |||||||||||| |||| || || | |||||     
T  108943 aactttctgtgcttccttgatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacgctctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 108845  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| || || ||||| || ||| | ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  108844 atctctgaactgttcaagtaactcgaactctctgaccatcatagcagacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 108745  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  108744 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 108717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 95331 - 95048
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||  |||| ||||| | ||| ||||| || || || |||||||| |||| |||||    
T  95331 tcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaaattgctcttatgactttcttctaaaattaacttctttaattcttcattgtcgggaacacaaa 95232  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||| ||||| || ||||  ||||| || |||||||| || || |||| ||| ||||  | ||||| |  |  ||| ||||| |||||||| |  || ||    
T  95231 ttctacctctaaatctcaatacaccttgctcatcaactttgaaatcaccatcttcagcttgattactatcaaccattaaatccacaaacttgatgtcaac 95132  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcaca 295  Q
    ||| || ||||||| ||| || |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||    
T  95131 ttgttgtgcttctctgatgctattcaagaaatcactattgatcttcagcatacccaactgtacactttgcgatgacaattcaca 95048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 171 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 6500 - 6265
Alignment:
Q  171 tcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaact 270  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  6500 tcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatcaacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattattcttcaacatacccaact 6401  T
Q  271 gtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgtttt 370  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| |||| |||||||||| || ||    
T  6400 ggacactctgaggtgacaactcacagacaagactcaagtctctaaactgttctaggaactcaaactcctttaccatcatagcagacatatgcaacgtctt 6301  T
Q  371 cctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacc 406  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  6300 cctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacc 6265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 171 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 10931 - 10696
Alignment:
Q  171 tcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaact 270  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  10931 tcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatcaacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattattcttcaacatacccaact 10832  T
Q  271 gtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgtttt 370  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| |||| |||||||||| || ||    
T  10831 ggacactctgaggtgacaactcacagacaagactcaagtctctaaactgttctaggaactcaaactcctttaccatcatagcagacatatgcaacgtctt 10732  T
Q  371 cctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacc 406  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  10731 cctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacc 10696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 391 - 6
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||||  |  |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||     
T  391 tcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctatgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcactatcaagaatgcaag 292  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||  || ||||| | ||||| || |  ||| ||||| |||||| | | ||| |     
T  291 ttcttcctctgaacctcaacacaccttgatcatcaaccttgaaatcaccctcttcagtttgattactagcaaccattaaatccacaaacatgacatcaat 192  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    ||  || ||||||| |||| |||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||| ||| ||||    
T  191 tttatgtgcttctctgatattgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaactgcacactctgaggtgacaactcacaaactagagtcacgtct 92  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacatt 397  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  91 ctaaactgctcaagcaactcaaactcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacatt 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 108 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 3505 - 3180
Alignment:
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  ||| ||||| | ||||| || |  ||||||||| |||||||| | ||    
T  3505 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgatgtcaacatcttcagtttgattactagcaaccatcaaatccacaaacttgacat 3406  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | | || ||| |||||   ||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3405 ccattttctgcgcttccttgatactgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaattgcacactctgaggtgacaactcacaaacaagactcaa 3306  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||| || || || |||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| |  ||||||    
T  3305 gtctctaaattgttcaagaaactcaaactctttcactatcaaagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatccgcgactacattagttttacca 3206  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
     ||||||||||||| |||||||||||    
T  3205 agatggtaattcaaaccaaaatcata 3180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 108 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 30518 - 30193
Alignment:
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  ||| ||||| | ||||| || |  ||||||||| |||||||| | ||    
T  30518 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgatgtcaacatcttcagtttgattactagcaaccatcaaatccacaaacttgacat 30419  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | | || ||| |||||   ||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30418 ccattttctgcgcttccttgatactgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaattgcacactctgaggtgacaactcacaaacaagactcaa 30319  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    ||||||||| || || || |||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| |  ||||||    
T  30318 gtctctaaattgttcaagaaactcaaactctttcactatcaaagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatccgcgactacattagttttacca 30219  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
     ||||||||||||| |||||||||||    
T  30218 agatggtaattcaaaccaaaatcata 30193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 51 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 6975 - 6563
Alignment:
Q  51 ttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaacct 150  Q
    ||||||||| |||| ||||| | ||||| | ||||||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  6975 ttactcttgtgactttcttctaaaatcagccttttcatctcatcattgtcaggaacacaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaacct 6876  T
Q  151 taaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatc 250  Q
    | || |||||||| ||||| | ||||| | ||  | | ||||| |||| ||| | ||| || || || ||||||| |||||| |||||||| | | |||     
T  6875 tgaaatcactatcttcagtttgattactattaacccttaaatccacaagcttgacatcaacctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcattatt 6776  T
Q  251 aatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaa 350  Q
     || |||| ||| |||||||| | |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||      
T  6775 gattttcaacatacccaactgcacactctggggcgacaactcacaaacaagactcaaatctctaaactgttcaagcaactcaaattccttcaccatcatg 6676  T
Q  351 gcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttcta 450  Q
    ||  |||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |    
T  6675 gccgacatgtgtaacgtcttcctactcaaagcatccgcaactacattggctttacccggatgatagttcaacccaaaatcataatccttcaatagctcca 6576  T
Q  451 accatctcctctg 463  Q
    |||||||||||||    
T  6575 accatctcctctg 6563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 463 - 344
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||  |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  463 actcaaatctcgaaactgctcaatcaattcgaactctttaaccatcaaagcggacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagcc 364  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || || ||||| ||| ||||    
T  363 ttcccgggatgataactcaa 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 17310 - 16883
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||  ||| |||||    
T  17310 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttttgtgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcttcaagaata 17211  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||| ||| | || |||  |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||    
T  17210 caaattctgcctcagaatcgcaacacctcctgatcatcaaccttgaagtcattatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacat 17111  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||  || ||||||   ||| |||||||||| | | |||||||||||||||| || ||||  | |||||||||||||| ||||||||| |  |||||    
T  17110 caactttttgcgcttctttaatattgttcaagaattcattatcaatcttcagcattcctaacttcacactctgaggtgacacttcacagactaagctcaa 17011  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||| |||  ||||||| |  |||||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  17010 atctctaaactgttcaagtaactcaaattccttgaccatcatagcggacatatgtagagttttcctacttaaagcatctgcaacaacattagctttacct 16911  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    || || ||||||||  ||||||||||||    
T  16910 ggttgataattcaactcaaaatcataat 16883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 10137 - 9708
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||| | |||||||| ||  ||||  || |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  10137 tcatgatacatctttttagctccctgatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcagaaatacaaa 10038  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||   ||||| |  |  || |||||| |||||||| | ||| ||    
T  10037 ttcttcctcggaatctcaacacacccagatcatcaaccttgaagtcactatctttagttggattactaccaaccaacaaatccacaaacttaacatcaac 9938  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
     | ||| |||||||  ||||| | |||||| | ||| |  ||||||| ||| |||||||  | ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  9937 cttctgtgcttctctaatactatccaagaactcactgttgatcttcaacatacccaacttcacactttgaggtgacaactcacaaactagactcaagtct 9838  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggat 411  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| ||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  9837 ttaaactgctcaagcaactcaaattctttaaccatcatagctgacaaatgcaatgtcttcctgcttaaagcatctgcaacaacattggctttacccggat 9738  T
Q  412 ggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    | ||||| || | ||||||| ||| |||||    
T  9737 gataatttaaactaaaatcacaatccttca 9708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 421
Target Start/End: Original strand, 5005 - 5417
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||| |||||||    
T  5005 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgattactcaagctacttttatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtctggaatac 5104  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| ||| ||||  || | || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||  | |  || ||| || |||||||| | |||    
T  5105 aaattctgcctcgaaaacgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcactatcttcagtctgattacttgcaaccaacaagtctacaaacttaacatc 5204  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     | || ||| ||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| | || ||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  5205 aattttctgcgcttctttgatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattctcagcttcacactctgaggtgacaattcacagactaaactcaaa 5304  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| |||  ||||||| || || ||||| || || ||||| ||||| | ||| || ||||| |    
T  5305 tccctaaactgttcaagcaactcaaactctcttaccatcatagcggacatatgtaacgtcttcctacttaaggcatctgcaacaaaattagctttacctg 5404  T
Q  409 gatggtaattcaa 421  Q
    |||| ||||||||    
T  5405 gatgataattcaa 5417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 218750 - 218323
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||||||    
T  218750 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcattatcaggaata 218651  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||| ||| |||| ||  ||||||||||  |  ||||| ||| | || ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||    
T  218650 caaattctgcctcggaatctcaacaatccctgatcattgattttaaaatcattgtcttcagtctgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacat 218551  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | | || ||| ||||||  |||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||  | ||||||||||||||||||  |||| | ||||||    
T  218550 caattttctgcgcttctttgatattgttcaagaattcactatcaatctttagcattcccaacttcacactctgaggtgacaattcgtagactaaactcaa 218451  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| | ||| || |||||     
T  218450 atctctaaactgctcaagcaactcaaactcttttaccatcatagtggacatatgcaacgtcttcctacttaaggcatctgcaacaaaattagctttacct 218351  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||  || ||||| |||||||||||||    
T  218350 ggattatagttcaacccaaaatcataat 218323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 169
Target Start/End: Original strand, 230016 - 230177
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||| ||||||    
T  230016 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactttcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtctggaata 230115  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagt 169  Q
     ||| ||| |||| ||| |||| |||||| |||||||| | |||||| |||| ||| |||||    
T  230116 taaattctacctcggaatctcaacacaccttgatcatcgatcttaaaatcaccatcttcagt 230177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 18548 - 18115
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| ||||||||||    
T  18548 caaatcatgatacatcttcgtagctcccaggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcaggaata 18449  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||   ||  || | || ||| ||||||||||| |  ||||| |||| ||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||    
T  18448 caaattctgaatcgaaaacgcaacactccctgatcatcgattttaaaatcacaatcttcagtctgattactagaaaccaacaagtccacaaacttaacat 18349  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | | || ||| |||| |  |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||  | |||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  18348 caattttctgcgcttttgtgatactattcaagaattcactatcaatctttagcattcccagcttcacactctgaggtgacaattcgcagactaaactcaa 18249  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  18248 atctctaaactgttcaagcaactcaaactcttttaccatcatagcggacatatgcaacgtcttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacct 18149  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    | ||| |||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  18148 gaatgataattcaacccaaaatcacaatccttca 18115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 112 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 6320 - 5997
Alignment:
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||  ||| ||||| ||||||||   ||| |     
T  6320 ctcttcctctgaaccttaacacaccttgatcatcaactttgaagtcaccatcttcagtttgattactagtaaccattaaatccacaaacttggcatcgat 6221  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    || ||| | |||   ||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  6220 tttctgtgtttccttgatactgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaactgcacactctgaggtgacaactcacaaactagactcaagtct 6121  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaacc--acattggccttaccagg 409  Q
    ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||  ||||| || ||||| ||    
T  6120 ctaaactgctcaagcaactccaactcctttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctactcaaagcatctgcaaccgtacattagctttaccggg 6021  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
     || |||||||| |||||||||||    
T  6020 gtgataattcaaaccaaaatcata 5997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 4844 - 5271
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||| ||||||    
T  4844 caaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtctggaata 4943  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||  ||| ||| |||| ||| || |||||||| |  |||||||||||||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||    
T  4944 caaattctggctcggaatctcaacactccttgatcatcgattttaaagtcactatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttaacat 5043  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 306  Q
    | |||| ||| ||||||   ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| ||  | |||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  5044 caactttctgcgcttctttaatacttttca-gaaattcactatcaatcttcatcattcccagcttcacactctgaggtgacaattcgcagactaaactca 5142  T
Q  307 agtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacc 406  Q
    | |||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||| ||   |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||     
T  5143 aatctctaaattgttcaagcaactcaaacttttttaccatcatagtggacatatgcaacgtcttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttact 5242  T
Q  407 aggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5243 tggatgataattcaacccaaaatcataat 5271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 11974 - 12401
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||| ||||||    
T  11974 caaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtctggaata 12073  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||  ||| ||| |||| ||| || |||||||| |  |||||||||||||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||    
T  12074 caaattctggctcggaatctcaacactccttgatcatcgattttaaagtcactatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttaacat 12173  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 306  Q
    | |||| ||| ||||||   ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| ||  | |||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  12174 caactttctgcgcttctttaatacttttca-gaaattcactatcaatcttcatcattcccagcttcacactctgaggtgacaattcgcagactaaactca 12272  T
Q  307 agtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacc 406  Q
    | |||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||| ||   |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||     
T  12273 aatctctaaattgttcaagcaactcaaacttttttaccatcatagtggacatatgcaacgtcttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttact 12372  T
Q  407 aggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12373 tggatgataattcaacccaaaatcataat 12401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 7221 - 6799
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| || ||||||||||    
T  7221 atcatgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcatcttcttcatttcatcatcgtaaggaatacaa 7122  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||| ||||  || | || ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| | || || || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  7121 attctacctcaaaaacgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcattatcttcagtctgatcactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaa 7022  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtc 310  Q
    ||| ||| ||||||   |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| || ||||  | ||||| |||||||| ||| ||||| |  ||||||||    
T  7021 ctttctgcgcttctttaatactgttcaagaattcactaacaatcttcatcattcctaacttcacactctaaggtgacacttcgcagactaagctcaagtc 6922  T
Q  311 tctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagga 410  Q
    ||||||||| || |||| ||| || ||||| | ||||| |||  ||||||| |  || ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  6921 tctaaactgttcaagcagctccaactctttgatcatcatagcggacatatgtagagtcttcctacttaatgcatctgcaaccacattagctttacctgga 6822  T
Q  411 tggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  6821 tgataattcaacccaaaatcata 6799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 40088 - 39694
Alignment:
Q  12 tcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||||  || || | ||||| | ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  40088 tcatgataaatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgaatatcttctaaaatcaactttttcaattcatcattataaggaatacaaa 39989  T
Q  112 ctcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctac 211  Q
     ||||||||  || |||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| ||    
T  39988 ttcttcctcgaaatctcaacacgccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttaatatcaac 39889  T
Q  212 ttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtct 311  Q
    ||  || ||||||  ||||||||||||||| | | | |  ||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  39888 tttttgtgcttctttgatactgttcaagaactcattgttgatcttcaacatacccaacttcatactctgaggcgacaactcacaaactagactcaagtct 39789  T
Q  312 ctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacc 406  Q
    ||||| || || ||||||||||| || || ||||||| |||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  39788 ctaaattgttcaagcaactcaaactccttaaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcatgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacc 39694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24395 - 23987
Alignment:
Q  18 tacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 117  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||| |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  24395 tacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatacaaattctgc 24296  T
Q  118 ctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctg 217  Q
    ||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| |||| |||    
T  24295 ctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaactttctg 24196  T
Q  218 agcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaac 317  Q
     ||||||   ||| |||||||||| | ||| |  ||||||| ||| | |||||  | |||||||||  |||  ||||| || ||||||||||||||||||    
T  24195 cgcttctttaatattgttcaagaactcactgttgatcttcaacatactcaacttcacactctgaggctacatctcacaaactagactcaagtctctaaac 24096  T
Q  318 tgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaat 417  Q
    || || ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||        ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||    
T  24095 tgttcaagcaactcaaactctttaaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcctactca-------tgcaacaacattagctttacctggatgataat 24003  T
Q  418 tcaagccaaaatcata 433  Q
    |||| |||||||||||    
T  24002 tcaaaccaaaatcata 23987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 15850 - 16277
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||  || ||||||||||||||||||  || ||||  ||||| | ||||||||||    
T  15850 caaatcatgatacatcttagtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcgtcgtcaggaata 15949  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| | |  |||  || |||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || | |||||  | |  || ||| || |||||||| | ||    
T  15950 caaattatatctcgaaatctcaacacaccctgatcatcgactttgaagtcactatcttccgtctgattacttgcaaccaacaagtccacaaacttaacat 16049  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 306  Q
    |  ||| ||| |||||  | ||||| || | |||||| |||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||| || ||||| | |||||    
T  16050 cctctttctgcgcttcatgaatactcttta-gaaattcactatcaatcttcagcattcccagctttacactctgaggtgacaactcgcagactaaactca 16148  T
Q  307 agtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacc 406  Q
    | ||||||||||| || |||| |||||| || || ||||||| |||| |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  16149 aatctctaaactgttcaagcagctcaaactccttaaccatcatagcagacatatgcaaagtcttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacc 16248  T
Q  407 aggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16249 tggatgataattcaacccaaaatcataat 16277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 112818 - 112396
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| ||||  || |||| ||| |||||||||    
T  112818 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcctcatcgtctggaatacaa 112719  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||| |||| ||| |||| ||||||  ||||||| |  ||||| |||| ||| ||||| | ||||| || ||  | ||| || |||||||| | ||| |    
T  112718 attctacctcggaatctcaacacacctcgatcatcgattttaaaatcaccatcttcagtatgattactagcagctaacaagtctacaaacttaacatcga 112619  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    | | ||| ||||||   ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || | ||  | ||||| || ||||| ||||||||| | |||||| |    
T  112618 ccttctgtgcttctttaatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcattcctagcttcacactcttagatgacatttcacagactaaactcaaat 112520  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || | |||||| || |||||||||||||  |   ||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| || ||||| ||    
T  112519 ctctaaactgttccaacaactcgaactcttttaccatcatggtcgacatatgcaatgtcttcctacttaaagcatctgctacaacattagctttacctgg 112420  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
    ||| ||  ||||  ||||||||||    
T  112419 atgatagctcaactcaaaatcata 112396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 1881 - 2308
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||  ||||  || |||||||||| ||||||| ||| || |  |||||||||||| |||||    
T  1881 caaatcatgatacatctttatagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactctcttcgagaatcatcttctttatctcatcattgtcaagaata 1980  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||  || | || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||  | |||  ||||| |||||||| | ||    
T  1981 caaattctgcctcgaaatcgcaacactccctgatcatcaactttaaagtcactatcctcagtctgatttccaccaatcaataaatctacaaactttagat 2080  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    |   || ||| ||||||   ||||||||||| || | ||||| |||||||| ||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||     
T  2081 ccgttttctgtgcttctttaatactgttcaaaaattcactattaatcttcaacattcccaacttgacactctgaggtgacaattcacaaacaaaactcag 2180  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||  ||||||| ||  ||| ||| || | ||| ||||||| |||| ||||||| || |||||||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||     
T  2181 gtcaataaactgttcgtgcagctccaactttttaaccatcatagcagacatatgtaaagttttcctacttaaagcatctgcaagaacattagctttacct 2280  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||  || ||||||||||    
T  2281 ggatgataattcagcccgaaatcataat 2308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 116238 - 115811
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  116238 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcattgtcaggaata 116139  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||  || | || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| |||  | | |   |||| |||||||| | ||    
T  116138 caaattctgcctcgaaatcgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcactatcttcagtctgatttccaccaataaatgaatctacaaactttacat 116039  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | ||||  ||  | |||   ||||   |||  || | |||||||||| ||||||| || ||||  | |||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  116038 caactttatgcacctctttaataccaatcataaattcactatcaatcatcagcattcctaacttcacactctgaggtgacaattcacagactaaactcag 115939  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
    |||||||||||| || |||| ||| |  ||||| | ||||| |||  ||||||| |  |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||||||     
T  115938 gtctctaaactgttcgagcagctccagctctttgatcatcatagcggacatatgtagagttttcctacttaaagcatctgcaacaacgttagccttacct 115839  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  115838 ggatgataattcaatccaaaatcataat 115811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 264 - 466
Target Start/End: Original strand, 108859 - 109061
Alignment:
Q  264 cccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgca 363  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||| |||| |||| ||||    
T  108859 cccaactgtacgctctgaggtgacaactcacagacaagactcaagtctctaaactaatctagaaactcaaaatcatttaccatcatagcagacatgtgca 108958  T
Q  364 atgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctg 463  Q
    | || ||||||||||| |||||  |||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||  || || | |||||| |||||    
T  108959 acgtcttcctgctcaaagcatctacaaccacattagctttacccggatgttaattcaaaccaaaatcataatccttcaacagctcaagccatcttctctg 109058  T
Q  464 cct 466  Q
    |||    
T  109059 cct 109061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 63354 - 62937
Alignment:
Q  18 tacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || |||| ||||||||| |||| ||  |    
T  63354 tacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcgtcaggaattcaaattcgac 63255  T
Q  118 ctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctg 217  Q
    |||  || |||| |||||| || |  || || ||||||||||  || ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| |||| |||    
T  63254 ctcgtaatctcaacacaccttgtttttcgactttaaagtcaccttcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctg 63155  T
Q  218 agcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaa 316  Q
     |||||   |||||| | || |||||| |||||||||||||||||| ||||  | || |||||||  |||  | ||||| || |  ||||| ||||||||    
T  63154 tgcttccttgatactttgca-gaaattcactatcaatcttcagcattcccagttttacactctgatatgagcactcacaaactaagctcaaatctctaaa 63056  T
Q  317 ctgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaa 416  Q
    ||| || |||||||| ||  |||| ||||||| |||  |||||||||| || ||||| |||||  |||| ||||| ||| | || ||||| ||||| |||    
T  63055 ctgttcaagcaactcgaacactttaaccatcatagcggacatatgcaacgtcttcctactcaagacatctgcaacaacagtagctttacctggatgataa 62956  T
Q  417 ttcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| ||||| |||||||    
T  62955 ttcaaaccaaagtcataat 62937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 4683 - 4239
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  ||| ||||||||||||||   | ||||  || |||| ||||||||| |||    
T  4683 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgaccctcttcaagaatcattatcttcatctcttcatcgtcaggaatgcaa 4584  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||  |||| ||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||| || |  || ||| || | |||||| | ||| |    
T  4583 attcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcaaccttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctaaaaacttgacatcaa 4484  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| ||||||  |||||| || | |||||| |||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||| | ||||| || |  ||||  |    
T  4483 ctttctgtgcttctttgatactcttta-gaaattcactatcaatcttcagcattcccagcttcacactctgaggtgaccactcacaaactaagctcatat 4385  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| |  |||||||| || ||| | |||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  4384 ctctaaactgtttaagcaactcgaactctctaaccatcaaagcggacatattcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 4285  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccat 455  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||    
T  4284 atgataattcaaaccaaagtcataatccttcagcaattctagccat 4239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14530 - 14340
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  || | ||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14530 caaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctagttttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaata 14431  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaa 198  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || |  ||||||||||||||    
T  14430 caaatccttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcattactagcaaccatcaaatcaacaa 14340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22709 - 22519
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  || | ||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22709 caaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctagttttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaata 22610  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaa 198  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || |  ||||||||||||||    
T  22609 caaatccttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcattactagcaaccatcaaatcaacaa 22519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 304 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14336 - 14175
Alignment:
Q  304 tcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcctt 403  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||    
T  14336 tcaagtctctaaaatggtctagcaactcaaattcttttaccatcagagcagacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattgtcttt 14237  T
Q  404 accaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    | | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || | || |||||| ||||||||    
T  14236 a-ctggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacagctgtagccatcttctctgcct 14175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 304 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22515 - 22354
Alignment:
Q  304 tcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcctt 403  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||    
T  22515 tcaagtctctaaaatggtctagcaactcaaattcttttaccatcagagcagacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattgtcttt 22416  T
Q  404 accaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    | | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || | || |||||| ||||||||    
T  22415 a-ctggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacagctgtagccatcttctctgcct 22354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 13442 - 13868
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||  ||| ||||||||| |    
T  13442 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgc 13541  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    |||  |  |||| ||| |||| ||| || || ||||| || ||||||||||  ||  |||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||     
T  13542 aaatccgacctcggaatctcaacacgccgtggtcatcgactttaaagtcaccgtctccagtctgattactagcatccaacaagtccacaaacttaacatt 13641  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     | || ||| ||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || | ||  | |||||||||||||||||| ||||| | ||||||     
T  13642 aattttctgcgcttctttgatactgttcaagaattcactatcgatctttagcattcctagcttcacactctgaggtgacaattcgcagactaaactcaaa 13741  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |  ||||| |    
T  13742 tctctaaactgttcaagcaactcaaactcttttaccatcatggcggacatatgcaaagttttcctgcttaaggcatctgcgacaacattagttttacctg 13841  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||    
T  13842 gatgataattcaacccaaaatcataat 13868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 17657 - 18009
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  17657 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatacttaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaa 17756  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||| |  ||||| ||| |||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  17757 attctgcctcagaatctcaacactccctgatcatcgattttaaaatcattatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaa 17856  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtc 310  Q
     || ||| ||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || | ||  | ||| |||||||||||||  || || | |||||| ||    
T  17857 ttttctgcgcttctttgatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcctagcttcacactatgaggtgacaatt-gcatactaaactcaaatc 17955  T
Q  311 tctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaa 364  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  17956 tctaaactgttcaagcaactcaaactcttttaccatcatagcggacatatgcaa 18009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 102209 - 102633
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || |||| |||||||||||||    
T  102209 atcatgatacattttcgtagctcccggatggatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcctcatcgtcaggaatacaa 102308  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||| |||| ||| |||| |||||| || ||||| |  ||||| |||||||  ||||| ||||||| |  |  || |||||| |||||||| | ||| |    
T  102309 attctacctcggaatctcaacacaccttggtcatcgattttaaaatcactattttcagtctcattactatcaaccaacaaatctacaaacttaacatcga 102408  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  | | ||  | |||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |    
T  102409 ctttctgcgcttctttaatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatttctagcttcacactctgagatgacaattcacagactaagctcaaat 102507  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    || ||||||| || |||||||| || |||||||||||||  ||   ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| || ||||| ||    
T  102508 ctataaactgttcaagcaactcgaactcttttaccatcatggcgggcatatgcaaagtcttcctactcaatgcatctgcaacaaaattagctttacctgg 102607  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||    
T  102608 atgatagttcaaaccaaaatcataat 102633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 7913 - 8339
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || ||||||||  | ||||    
T  7913 aaatcatgataaatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctaggatac 8012  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  8013 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 8112  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     |||  ||| |||||   |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||      
T  8113 aactctctgtgcttccttgatacttttcaggaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcata 8212  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  8213 tctctaaactgttcaagcaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctg 8312  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  8313 gatgataattcaaaccaaagtcataat 8339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 213 - 435
Target Start/End: Original strand, 96342 - 96564
Alignment:
Q  213 tgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctc 312  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||  |||| ||| | |||||| ||||||||||||||||   | ||||  ||||| ||||| || | ||||| |||||    
T  96342 tgctgtgcttctcggatactactcagaaaatcactgttaatctttagcatccccaactgtacgatttgagacgacaactcacaaaccaaactcatgtctc 96441  T
Q  313 taaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatg 412  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| || || || |||||    
T  96442 taaactgttccagaaaatcaaattcttttatcatcatagcagacatatgcagtgtcttcctgctcaatgcatcagcgactacattagcttttcccggatg 96541  T
Q  413 gtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  96542 gtaattcaacccaaaatcataat 96564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 228 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 177375 - 177170
Alignment:
Q  228 atactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagca 327  Q
    |||||||||||||| | |||||  ||||||| ||| |||||||  | ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  177375 atactgttcaagaattcactattgatcttcaacatacccaacttcacactctgaggcgacaactcacaaactagactcaagtctctaaactgttctagca 177276  T
Q  328 actcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaa 427  Q
    | || |||||||| ||||||| |||| ||||||| || || |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  177275 attctaattctttaaccatcatagcagacatatgtaacgtcttcctgcttaaagcttctgcaacgacattagccttacctggatgataattcaaaccaaa 177176  T
Q  428 atcata 433  Q
     |||||    
T  177175 gtcata 177170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 3170 - 3594
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || ||||  ||||||||||||    
T  3170 atcatgatacatcttcgtagctcccaggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaa 3269  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | |   |||| ||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||||| | |||||  | |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  3270 attaaacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgattactggcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaa 3369  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtc 310  Q
    ||| ||| |||||   |||| | ||||  || |||||||||||||||||||| ||||  |  | |||||||| |||||| ||||| || |  ||||| ||    
T  3370 ctttctgtgcttccttgatagttttcagaaatttactatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgagatgacaactcacaaactaagctcaaatc 3469  T
Q  311 tctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagga 410  Q
    ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||| |||  |||||||||| || ||||| ||| | ||||| | ||| ||||| || ||||| |||    
T  3470 tctaaactgttcaagcaactcgaactctttaaccatcatagcggacatatgcaacgtcttcctactcgaggcatctgtaacaacattagctttacctgga 3569  T
Q  411 tggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    || |||||||| ||||| |||||||    
T  3570 tgataattcaaaccaaagtcataat 3594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 10349 - 9922
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||  ||||  || ||||||||||||||||||  || ||||  ||||| | ||||||||||    
T  10349 caaatcatgatacatctttgtagctcccggatgtatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcattttcttcatgtcatcgtcgtcaggaata 10250  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| | || ||| | || ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |  || |||  | | |  ||||| |||||||| | ||    
T  10249 caaattctgcttcggaatcgcaacactccctgatcgtcgaccttaaagtcactatcttcagtctggtttccaccaataaataaatctacaaactttacat 10150  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 306  Q
    |  |||  || ||||||   ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||  | |||||  ||||||| ||||||||| | |||||    
T  10149 ccgctttttgcgcttctttaatactattca-gaaattcactatcaatcttcagcattcctaacttcacactctagggtgacacttcacagactaaactca 10051  T
Q  307 agtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacc 406  Q
    | |||| |||||| || |||| ||| |||||||| | ||||| |||  ||||||| |  |||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||  ||||    
T  10050 aatctcaaaactgttcaagcagctccaattctttgatcatcatagcggacatatgtagagttttcctacttaattcatctgcaacaacattggctatacc 9951  T
Q  407 aggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  9950 tggatgataattcaacccaaaatcataat 9922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 466
Target Start/End: Original strand, 19578 - 20033
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |   ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || |||| |||||||||||||    
T  19578 atcatgatacatcttcgtagctgccgggtgaatacttaggctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcgtcaggaatacaa 19677  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||  |||| ||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||||| | ||||| || |  |  ||| || |||||||| | ||| |    
T  19678 attcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccgacaagtctacaaacttaacatcaa 19777  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| ||||||  |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | | |||||||| || | ||||| || |  ||||  |    
T  19778 ctttctgtgcttctttgatactcttca-gaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacattctgaggtaaccactcacaaactaagctcatat 19876  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| || ||||| ||    
T  19877 ctctaaactgttcaagcaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctacaacaacattagctttacctgg 19976  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| | ||||| |||||| | ||||||    
T  19977 atgataattcaaaccaaagtcataatctttcagcaattctagccatctacgctgcct 20033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 466
Target Start/End: Original strand, 35002 - 35457
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |   ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || ||||  ||||||||||||    
T  35002 atcatgatacatcttcgtagctgccgggtgaatacttaggctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaa 35101  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||  |||| ||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||||| | ||||| || |  |  ||| || |||||||| | ||| |    
T  35102 attcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccgacaagtctacaaacttaacatcaa 35201  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| ||||||  |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | | |||||||| || | ||||| || |  ||||  |    
T  35202 ctttctgtgcttctttgatactcttca-gaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcacattctgaggtaaccactcacaaactaagctcatat 35300  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| || ||||| ||    
T  35301 ctctaaactgttcaagcaactcgaactctctaaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctacaacaacattagctttacctgg 35400  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| | ||||| |||||| | ||||||    
T  35401 atgataattcaaaccaaagtcataatctttcagcaattctagccatctacgctgcct 35457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 412
Target Start/End: Original strand, 50408 - 50809
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  |||||||  || |||||||||    
T  50408 atcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcttctggaatacaa 50507  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||| ||||  |||||||  ||||| ||||||||||  ||||| ||||| || ||||| | ||||| ||||  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  50508 attctacctcgaaacctcaatacaccttgatcatcaattttaaaatcactgtcttcagtctgattactagtaaccaacaagtctacaaacttaacatcaa 50607  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaat-tactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    |||  || ||||||   ||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||| || | ||  | ||||| || |||||  ||||| || |  ||||| |    
T  50608 ctttttgcgcttctttaatactcttc-agaaatacactatcaatcttcagcatacctagcttcacactcttagatgacatctcacaaactaagctcaaat 50706  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    || | ||||| || |||||||| || || |||||||||| |||  |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  50707 ctttgaactgttcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcggacatgtgcaaagtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacctgg 50806  T
Q  410 atg 412  Q
    |||    
T  50807 atg 50809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Original strand, 273 - 437
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||||||| |||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  273 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcaaacaaatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 372  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   |||||||||||| || |||||    
T  373 ttcccgggatgataaatcaactgaaaatcaaaatccttaagatattctaaccatcttctttgcct 437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 14412 - 13987
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  14412 caaatcatgatacatcttcgtagctccctgatgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatagtcaggaata 14313  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||  |||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| ||   |   || ||||| |||||||| | ||    
T  14312 caaattctgcctcgaaaccgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcactatcttcagtctgattcccccaacaaat-aaatctacaaactttacat 14214  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 306  Q
    | |||| ||| ||||||   ||||   | |||||||| ||||||||||||| |||| || ||||  | |||||  |||||||| ||||| || | |||||    
T  14213 cgactttctgcgcttctttaatac--attaagaaattcactatcaatcttctgcattcctaacttcacactctatggtgacaactcacaaactaaactca 14116  T
Q  307 agtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacc 406  Q
     |||| ||||||| || |||| ||| || ||||| | ||||| |||  ||||||| |  |||||||| || || ||||| ||||| || || || ||||     
T  14115 ggtctttaaactgttcgagcagctccaactctttgatcatcatagcggacatatgtagagttttcctacttaaagcatctgcaacaacgttagctttact 14016  T
Q  407 aggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  14015 aggatgataattcaacccaaaaccataat 13987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 245 - 466
Target Start/End: Original strand, 1628 - 1849
Alignment:
Q  245 actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttacc 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||| | |||    
T  1628 actatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgaggtgaccattcacaaactaaactcaaatctctgaactgttcaagtaactcaaactctctaacc 1727  T
Q  345 atcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagta 444  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |    
T  1728 atcaaagcggacatatgcaatgtcttcctgctcaaggcatcaacaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttcagca 1827  T
Q  445 gttctaaccatctcctctgcct 466  Q
     ||||| |||||| | ||||||    
T  1828 attctagccatctacgctgcct 1849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 245 - 466
Target Start/End: Original strand, 15368 - 15589
Alignment:
Q  245 actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttacc 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||| | |||    
T  15368 actatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgaggtgaccattcacaaactaaactcaaatctctgaactgttcaagtaactcaaactctctaacc 15467  T
Q  345 atcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagta 444  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |    
T  15468 atcaaagcggacatatgcaatgtcttcctgctcaaggcatcaacaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttcagca 15567  T
Q  445 gttctaaccatctcctctgcct 466  Q
     ||||| |||||| | ||||||    
T  15568 attctagccatctacgctgcct 15589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 466
Target Start/End: Original strand, 8340 - 8797
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| |||||||    
T  8340 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctgtgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatac 8439  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||| | || |||||   ||  |  | |   | ||| || |||||||| | |||    
T  8440 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcattgtcttcagtccgatctcttgcaactaacaagtccacaaactttacatc 8539  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| |||||   |||||| ||| |||| || |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||| ||||||| |||| || || | |||||     
T  8540 aactttctgcgcttccttgatacttttc-agaatttcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctaaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 8638  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || || || || || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  8639 atctctaaactgttcaagtaattcgaactctctgaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 8738  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| | ||||| |||||| | ||||||    
T  8739 ggatgataattcaaaccaaagtcataatctttcagcaattctagccatctacgctgcct 8797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 9943 - 10369
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| |||| |||||    
T  9943 caaatcatgatacatcttcgtagctcctggatgaatgctcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtcatgaata 10042  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||| |  || | ||||| || |  || ||| |  |||||||| | ||    
T  10043 caaattcttcctcagaatctcaacacaccttggtcatcgaccttaaagtcattatcttttgtctgattactagcaaccaacaagtacacaaacttaacat 10142  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||| ||| |||| |   ||| | ||||  || |  ||||  ||||| |||||||| | ||  | ||||||||||||||  |||||||| | ||||||    
T  10143 caactttctgcgcttatataata-ttttcagaaactcgctattgatctttagcatccctagcttcacactctgaggtgacacctcacagactaaactcaa 10241  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     |||||||| || || |||||||| || || || ||||||| |||| ||||||| || || ||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  10242 atctctaaattgttcaagcaactcgaactccttaaccatcatagcagacatatgtaaagtcttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacct 10341  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10342 ggatgataattcaaaccaaaatcataat 10369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 435
Target Start/End: Original strand, 66431 - 66805
Alignment:
Q  61 gactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcact 160  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||  ||  ||| ||||||||| ||||  |  |||| ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  66431 gactctcttcaagaatcattttcttcatctctacatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcatcaactttaaagtcacc 66530  T
Q  161 atcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcag 259  Q
     || |||||   ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| |||| ||| || |||  |||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  66531 gtcttcagtccgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcctctttgatactcttca-gaaattcactatcaatcttcag 66629  T
Q  260 catccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacata 359  Q
    ||| |||| ||  |  |||| ||||||| ||||||| || | |||||| ||||| ||||| |  || ||||| || ||| | |||||||||||  |||||    
T  66630 cattcccagcttcactctctaaggtgaccattcacaaactaaactcaaatctctgaactgtttaagtaactcgaactctctgaccatcaaagcggacata 66729  T
Q  360 tgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  66730 tgcaatgtcttcttgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatggtaattcaaaccaaagtcataat 66805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 39150 - 38726
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||  |  || |||||||||||||||  || ||||  || |||| |||||||||||||    
T  39150 atcatgatacatctttgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgagtctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcgtcaggaatacaa 39051  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||   ||| ||| |||| |||||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||||| | ||||| || |  || ||| || | ||| || | ||| |    
T  39050 attcgatctcggaatctcaacacaccatggtcatcaagcttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctaaaaaattgacatcaa 38951  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| || |||   ||||| || | |||||| ||||||||||||||| || ||||  |  | ||||||||||||| | ||||| || |  ||||  |    
T  38950 ctttctgtgcctctttaatacttttta-gaaattcactatcaatcttcagaattcccagtttcacactctgaggtgaccactcacacactaagctcatat 38852  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  38851 ctctaaactgttcaagcaactcgaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctacacaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 38752  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  38751 atgataattcaaaccaaagtcataat 38726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 8364 - 7995
Alignment:
Q  64 tctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatc 163  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  8364 tctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtcatgaatacaaattctacctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaactcactgtc 8265  T
Q  164 ctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcat 262  Q
     ||||| | ||||| || |  || ||| |  |||||||| | ||| |||| ||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8264 ttcagtctgattactagcaaccaacaagtatacaaacttaacatcaactttctgtgcttctttaatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcat 8166  T
Q  263 ccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgc 362  Q
      | | ||  | |||||||| |||||||||||| || | |||||| ||||||||||| || | |||||| || ||| |||||||||  ||  ||||||||    
T  8165 ttctagcttcacactctgagatgacaattcacatactaaactcaaatctctaaactgttcaaacaactcgaactctcttaccatcatggccgacatatgc 8066  T
Q  363 aatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||||  ||||||||||    
T  8065 aatgttttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgatagctcaactcaaaatcata 7995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15733 - 15388
Alignment:
Q  90 tcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatca 189  Q
    ||||||| | |||| ||||||| ||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||| |  ||||| |||| ||| ||||| | ||||| || |  || ||    
T  15733 tcatcatcgccagggatacaaattctgcctcggaatctcaacactccctgatcatcgattttaaaatcaccatcttcagtctgattactagcaaccaaca 15634  T
Q  190 aatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaa 289  Q
    | || |||||||| | ||| | ||  || ||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| | ||||| |||||||  | ||||||||| |||||    
T  15633 agtccacaaacttaacatcaattttatgcgcttctttgatactgttcaagaattcactatcaatccttagcattcccaacttcacactctgaggggacaa 15534  T
Q  290 ttcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagca 389  Q
     || || || | |||||| ||||||||| | || || |||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||| || ||||| || || ||||| |||    
T  15533 atcgcaaactaaactcaaatctctaaaccgttcaagtaactcaaactcttttaccatcatagtggacatatgcaacgtcttcctacttaaggcatctgca 15434  T
Q  390 accacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    || ||||| || ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15433 acaacattagctttacatggatgataattcaacccaaaatcataat 15388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 26277 - 25873
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  || |  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| ||| ||||||    
T  26277 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctatttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaata 26178  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| ||||  || |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||||| || |   | ||| || |||||||| | ||    
T  26177 caaattctacctcgaaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgattactagcaactaacaagtctacaaacttaacat 26078  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
    | |||| ||| ||||||   |||||  | |  || | |||||||||||||| ||| || | ||  | ||||| || ||||| ||||||||| | ||||||    
T  26077 caactttctgtgcttctttaatacttcttagaaactcactatcaatcttcaacattcctagcttcacactcttagatgacatttcacagactaaactcaa 25978  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||||||||| || | |||||| || |||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  25977 atctctaaactgttccaacaactcgaactcttttaccatcatggccgacatatgcaatgtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacct 25878  T
Q  408 ggatg 412  Q
    |||||    
T  25877 ggatg 25873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Original strand, 749 - 868
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||| ||| ||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| |||||| |||| ||||| |||    
T  749 actcaaatctcgaaaatgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcaacaacaacattagcc 848  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || || ||||| ||| ||||    
T  849 ttcccgggatgataactcaa 868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 441
Target Start/End: Original strand, 8371 - 8803
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||| |||  | |  ||  ||||||| |||||||    
T  8371 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcatcttcgtaatctctccattgtctggaatac 8470  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    ||| |||||||  ||| |||| |||||| ||| |||| |  ||||| ||| | || ||||| | ||  | || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  8471 aaattcttccttggaatctcaacacaccttgaccatcgattttaaaatcattgtcttcagtctgatctctagcaaccaacaagtccacaaactttacatc 8570  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||  |||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| |||| || || | |||||     
T  8571 aactttctttgcttccttgatacttttca-gaaattcactatcaatcttcagcatacccagtttcacactctgaggtgaccattcgcaaaccaaactcat 8669  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| || || ||||| || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  8670 atctctgaactgttcaagtaactcgaactctctcaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacct 8769  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  8770 ggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 8803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 29813 - 29477
Alignment:
Q  99 tcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaa 198  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||| || | |||||| || ||||| ||| ||||||||| ||| ||||| | ||||| || |  || ||| || ||||    
T  29813 tcaggaatacaaattcgacctcggaatcttaacacaccatggtcatcgaccataaagtcaccatcttcagtctgattacaagcaaccaacaagtctacaa 29714  T
Q  199 acttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 298  Q
    |||| | ||| |||| ||| |||||   |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||  |||  |  | |||||||| |||| | ||||| ||    
T  29713 acttgacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcaaaaattcactatcaatcttcagcatttccagtttcacactctgagatgaccactcacaaac 29614  T
Q  299 aagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattg 398  Q
     |  ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||| |||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||     
T  29613 taagctcaaatctctaaactgttcaagcaactcgaactctttaaccatcatagcggacatatgcaacgtcttcctactcaaagcatctgcaacaacatta 29514  T
Q  399 gccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  29513 gctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataat 29477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 85585 - 85425
Alignment:
Q  275 actctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctg 374  Q
    |||||| || |||| |||||| || | |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||||| |||||||||||     
T  85585 actctgcggcgacacttcacaaaccaaactcaagtctctaaactgttcaagcaactcaaactctctaaccatcatagcagacatatgtaatgttttccta 85486  T
Q  375 ctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    || || ||||| ||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  85485 cttaaagcatctgcaataacattagtcttacccggatggtaattcaacccgaaatcataat 85425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1397 - 1035
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| |  ||||||||||||  ||||  || ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  1397 atcatgatatatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctatgactctcttcaaatatcattttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaa 1298  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||| |||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || ||||| | ||||| || |  ||  || || |||||||| | ||| |    
T  1297 attctacctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgattactagcaaccaaaaagtctacaaacttaacatcaa 1198  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| ||||||   ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || | ||  | |||||||| |||||| || ||||  | |||||| |    
T  1197 ctttctgtgcttctttaatacttttc-agaaattcactatcaatcttcagcattcctagcttcacactctgagatgacaactctcagaataaactcaaat 1099  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcct 373  Q
    |||||||||| || | ||| || || |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||    
T  1098 ctctaaactgttcgaacaattcgaactcttttaccatcatggccgacatatgcaatgtcttcct 1035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 247 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 7747 - 7552
Alignment:
Q  247 tatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccat 346  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  | ||||| || ||||| |||||| || | |||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  7747 tatcaatcttcagcatccctaacttcacactctcagatgacatttcacatactaaactcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcttttaccat 7648  T
Q  347 caaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcag 442  Q
    ||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||||  |||||||||| ||||||||    
T  7647 catggccgacatatgcaatgtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagctcaactcaaaatcatagttcttcag 7552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 210 - 385
Target Start/End: Original strand, 16455 - 16630
Alignment:
Q  210 acttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||||| || ||||||| || ||| |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| | ||| |||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  16455 acttgttgtgcttctctgagactattcaagaaatcactattgatcttcagcatacccaactgcacactttgagatgacaattcacacacgagactcaagt 16554  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatc 385  Q
    |||||||||| || ||||| || |||||  |||||||||| ||  |||| |||||||| || || ||||| |||||    
T  16555 ctctaaactgttcgagcaattccaattcccttaccatcaaggccgacatgtgcaatgtctttctactcaaggcatc 16630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 10861 - 10795
Alignment:
Q  369 ttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  10861 ttcctgcttaacgcatccgcaaccacattggctttaccaagatggtaattcaaaccaaaatcataat 10795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 56991 - 57417
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||  ||| |||||||||      
T  56991 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtggatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgt 57090  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    |||  |  |||| ||| |||| |||||| ||||| || || ||||||||||  || ||||| | ||||| || |  || |||||| |||||||| | |||    
T  57091 aaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgattactagcaaccaacaaatctacaaacttgacatc 57190  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaag 308  Q
     |||| ||  || |||   ||||| ||||  || | |||||||||||||||||| ||||  |  |   ||||||||||| ||||||| || | ||||||     
T  57191 aactttctttgcctctttaatactcttcataaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcactttctgaggtgaccattcacaaaccaaactcaaa 57290  T
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||| ||||| || || ||||| || ||| | ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||| || ||||| |    
T  57291 tctctgaactgttcaagaaactcgaactctctgaccataaaagcggacatatgcaatgtcttcctgctcaaagcatctacaacaacattagctttacctg 57390  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  57391 gatgataattcaaaccaaagtcataat 57417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 196808 - 196384
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  | ||||| ||||||||||  || ||||  ||  ||| ||||||||| |||    
T  196808 atcatgatacatcttcgtagctcccggttgaatactcaagctacttctatggctctcctcaagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaa 196709  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    |  |  |||| ||| |||| |||||  || |||||||| |||||||||| ||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  196708 atacgacctcggaatctcaacacacgatggtcatcaactttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaa 196609  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| |||  |  ||   ||||| |||| |||||| |||| ||||||||| ||| ||||  |  | ||||||||||||| | ||||| || | |||||  |    
T  196608 ctttctgtacccctttaatacttttca-gaaattcactaccaatcttcaacattcccagtttcacactctgaggtgaccactcacaaactaaactcatat 196510  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    ||||||| || || |||||||| || ||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| || || || || ||||| || ||||| ||    
T  196509 ctctaaattgttcaagcaactcgaactctctaaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcgtccgcgacaacattagctttacctgg 196410  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  196409 atgataattcaaaccaaagtcataat 196384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 19395 - 18951
Alignment:
Q  13 catggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaac 112  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||| |||||||||||  || ||||  ||  ||| ||||||||| ||||     
T  19395 catgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttatatgactctattcaagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaat 19296  T
Q  113 tcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctact 212  Q
     |  |||| |||||||| | |||| || |||||||| |||||||||| ||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||  | ||| |||    
T  19295 ccgacctcggaacctcaacgcaccatggtcatcaactttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaactggacatcaact 19196  T
Q  213 tgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctc 312  Q
    |  || || ||    ||||| ||||| || | ||||||||||||||| || ||||  |  | ||||||||||||| | ||||| || |  ||||  ||||    
T  19195 ttttgtgcctcattaatactcttcaaaaattcactatcaatcttcagtattcccagtttcacactctgaggtgaccactcacaaaccaagctcatatctc 19096  T
Q  313 taaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatg 412  Q
    ||||| | || || || || || ||| |  |||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  19095 taaaccgttcaaggaattcgaactctctacccatcaaagtggacatatgcaatgtattcctgctcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatg 18996  T
Q  413 gtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatct 457  Q
     |||||||| ||||| |||||||  ||||| | ||||| ||||||    
T  18995 ataattcaaaccaaagtcataatctttcagcaattctagccatct 18951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 23281 - 23093
Alignment:
Q  245 actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttacc 344  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||  || |||| ||| || ||||| |||    
T  23281 actattaatcttcaacattcccaacttcacactctgaggtgacaattcacaaactaaactcaagtgtctaaactattcgagcagctccaactctttaacc 23182  T
Q  345 atcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcata 433  Q
    |||| || | ||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23181 atcataggagacatatgtaaaattttcctacttaaggcatctgcaaccacattaactttacctggatgataattcaacccaaaatcata 23093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 24958 - 24879
Alignment:
Q  90 tcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagt 169  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||  || | || ||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  24958 tcatcattgttaggaatacaaattctgcctcgaaatcgcaacactccctgattatcaacttttaagtcactatcctcagt 24879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 466
Target Start/End: Original strand, 6990 - 7445
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || ||||  ||||||||||||    
T  6990 atcatgatacatcttcatagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaa 7089  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||  |||| ||| |||| ||||||  | ||||| || ||||| |||| ||| ||||| | ||| | || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  7090 attcgacctcggaatctcaacacaccaaggtcatcgactttaaaatcaccatcttcagtttgattgctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaa 7189  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtc 310  Q
    |||  || || |||   ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||| | ||||| || |  ||||  ||    
T  7190 ctttttgtgcctctttaatacttttcaaaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcagactctgaggtgaccactcacaaactaagctcatatc 7289  T
Q  311 tctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagga 410  Q
    ||||||||| || || ||||| || ||| | ||||||| ||   ||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||    
T  7290 tctaaactgatcaagtaactcgaactctctaaccatcatagaggacatatgcaatgtcttactactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgga 7389  T
Q  411 tggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || |||||||| ||||| ||||||| |||||  | ||| | ||| |||||||||||    
T  7390 tgataattcaaaccaaagtcataatccttcaacaattcaagccacctcctctgcct 7445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14541 - 14086
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |  | ||||||||||||||||  || ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  14541 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaa 14442  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    |  |  ||||  |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||| | || ||||| | || || || |  || ||| || |||||||| | |||      
T  14441 atccgacctcgaaacctcagcacaccttgatcatcgattttaaattcattgtcttcagtttgatcactagcaaccaacaagtccacaaactttacatcag 14342  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtc 310  Q
    ||| ||| || |||   ||||| ||||  || | | |||||||||||||||| || | ||  | ||  | |  ||||| |||||| || |  ||||| ||    
T  14341 ctttctgtgcctctttaatacttttcagaaactcattatcaatcttcagcattcctagcttcacacgttcatatgacatttcacacactaagctcaaatc 14242  T
Q  311 tctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagga 410  Q
    ||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||  || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||    
T  14241 tctgaactgttcaagcaactcgaactcttttaccatcatagcagacatatgcatggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacccgga 14142  T
Q  411 tggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || ||  ||||  |||||||||||| |||||| | ||||| |||||| | ||||||    
T  14141 tgatagctcaactcaaaatcataatccttcagcaattctagccatctaccctgcct 14086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 19332 - 19198
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |  | ||||||||||||||||  || ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  19332 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaa 19233  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatc 145  Q
    |  |  ||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  19232 atccgacctcgaaacctcagcacaccttgatcatc 19198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 277 - 435
Target Start/End: Original strand, 39621 - 39779
Alignment:
Q  277 tctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgct 376  Q
    ||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||| ||||| || || |||| ||| ||| | |||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  39621 tctgaggtgaccattcacaaactaaactcaaatctctgaactgttcaagtaacttaaactctctgaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttactgct 39720  T
Q  377 caatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  39721 caaagcatcaacaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataat 39779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 435
Target Start/End: Original strand, 26184 - 26374
Alignment:
Q  245 actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttacc 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |  | | ||||||||||| | ||||| |||| |||||  ||||||||||| |  || ||||| || ||| | |||    
T  26184 actatcaatcttcagcattcccagtttcacaatctgaggtgaccaatcacaaacaaaactcatatctctaaactgataaagtaactcgaactctctaacc 26283  T
Q  345 atcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  26284 atcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataat 26374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 25950 - 26015
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaat 76  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||    
T  25950 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 26015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 3787 - 3385
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||||||    
T  3787 atcatgatacattttcgtagctcccagatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatctttttcatctcatcaccgtcaggaatacaa 3688  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||| |||| ||| |||| | |||| ||| |||| |  ||||| |||||| | ||||| | ||||  || |  || ||| || |||||||| | ||| |    
T  3687 attctacctcggaatctcaacgcaccttgagcatcgattttaaaatcactaccttcagtctgattattagcaaccaccaagtctacaaacttaacatcaa 3588  T
Q  211 cttgctgagc-ttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||  || ||||   ||||| || | ||| ||| |||||||||| ||||| |||| ||  | |||||  | ||| ||||| ||||| | |||||| |    
T  3587 ctttctatgctttctttaatactttttaggaatttattatcaatctttagcattcccagcttcacactctatgatgaaaattcgcagactaaactcaaat 3488  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || ||||| | ||| ||||| ||||||| || | |||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  3487 ctctaaactgttcaagcaattaaaactctttaaccatcatagaagacatatgcaaagttttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacctgg 3388  T
Q  410 atg 412  Q
    |||    
T  3387 atg 3385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28702 - 28544
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||| ||  ||| || ||||||||||    
T  28702 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcaactctacatcgtaaggaatacaa 28603  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagt 169  Q
    |  |  |||| ||| |||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  28602 atccgacctcggaaactcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagt 28544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 435
Target Start/End: Original strand, 60060 - 60153
Alignment:
Q  342 accatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||  | || ||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  60060 accatcatatcaaacatatgtaatgttttcctatttaaagcatctgcaacaacattacccttacccggatggtaattcaatccgaaatcataat 60153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 406
Target Start/End: Original strand, 131374 - 131477
Alignment:
Q  303 ctcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcct 402  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||  ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  131374 ctcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcttttaccatcatggcagacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctt 131473  T
Q  403 tacc 406  Q
    ||||    
T  131474 tacc 131477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 28367 - 28243
Alignment:
Q  342 accatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttca 441  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| ||||  ||||| | ||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||    
T  28367 accatcatagcggacatatgcaatgtcttccaactcaaggaatctgcaacaacattagctttacctggatgataattgaaaccaaagtcataatccttca 28268  T
Q  442 gtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    | | ||||| |||||| | ||||||    
T  28267 gcaattctagccatctacgctgcct 28243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Original strand, 131083 - 131217
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  || ||||  ||||||| ||| |||||||||    
T  131083 atcatgatacctcttcgtagctcccggatgaatactcaagttgcttctatggctctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaa 131182  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatc 145  Q
    |  |  ||||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  131183 atccgacctcgaaacctcagtacaccttgatcatc 131217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 3737 - 3311
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||| | |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||  ||| ||||||||| |    
T  3737 aaatcgtgatacatcttcgtagcacccagatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctctacatcgtcaggaatgc 3638  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    |||  |  |||| ||| |||| |||||| ||||| || || ||||| ||||  || ||| | | ||||| || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  3637 aaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaattcaccgtcttcattctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatc 3538  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| || |||   ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  |   ||| ||||||  ||||||| || | ||||||    
T  3537 aactttctgtgcctctttaatactcttca-gaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcactttctaaggtgatcattcacaaacgaaactcaa 3439  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| ||  | ||||| || ||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||     
T  3438 ttctctgaactgttcaggtaactcgaactctctgaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctgctcaaagcatcggcaaccacattagctttacct 3339  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||    
T  3338 ggatgataattcaaaccgaagtcataat 3311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Original strand, 729 - 848
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  729 actcaagtctcgaaactgctcaaacaaatcaaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagcc 828  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || || ||||| ||| ||||    
T  829 ttcccgggatgataactcaa 848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 9570 - 9996
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||| | |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||  ||| ||||||||| |    
T  9570 aaatcgtgatacatcttcgtagcacccagatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctctacatcgtcaggaatgc 9669  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    |||  |  |||| ||| |||| |||||| ||||| || || ||||| ||||  || ||| | | ||||| || |  || ||| || |||||||| | |||    
T  9670 aaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaattcaccgtcttcattctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatc 9769  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     |||| ||| || |||   ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  |   ||| ||||||  ||||||| || | ||||||    
T  9770 aactttctgtgcctctttaatactcttca-gaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcactttctaaggtgatcattcacaaacgaaactcaa 9868  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| ||||| ||  | ||||| || ||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||     
T  9869 ttctctgaactgttcaggtaactcgaactctctgaccatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctgctcaaagcatcggcaaccacattagctttacct 9968  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||    
T  9969 ggatgataattcaaaccgaagtcataat 9996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 32905 - 32479
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatac 108  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||| ||||||||||  || ||||  ||  ||| ||||||||| |    
T  32905 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcctcaagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgc 32806  T
Q  109 aaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatc 208  Q
    |||  |  |||| ||| |||| |||||| ||||| || || ||||||||||  || ||||| | ||||| || |  || ||| || | |||||| | |||    
T  32805 aaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctagaaacttgacatc 32706  T
Q  209 tacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaa 307  Q
     ||||  || || |||   ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |  |   ||||||||||| ||||||| || | ||||||    
T  32705 aactttttgtgcctctttaatactcttca-gaaattcactatcaatcttcagcattcccagtttcactttctgaggtgaccattcacaaaccaaactcaa 32607  T
Q  308 gtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacca 407  Q
     ||||| || || ||  | ||||| || ||||| ||||||||||   |||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  32606 atctctgaattgttccggtaactcgaactctttgaccatcaaagtggacatatgcaacgtctttctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacct 32507  T
Q  408 ggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  32506 ggatgataattcaaaccaaagtcataat 32479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 3887 - 3538
Alignment:
Q  63 ctctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactat 162  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||| |||||||| |  ||||  || || |    
T  3887 ctctcttcaagaatcatcttgttcatctcatcatcgtctggaatacaaattctacctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaatatcgctgt 3788  T
Q  163 cctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagca 261  Q
    | || || | |||||  | |  ||  || ||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||   ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||    
T  3787 cttcggtttgattacttgcaaccaagaagtcaacaaacttaacatcaactttctgcgcttctttaatacttttca-gaaatacactatcaatcttcagca 3689  T
Q  262 tccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatg 361  Q
    | || | ||  | ||||| || ||||| |||||| || | |||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| || |||||||||| |||  |||||||    
T  3688 ttcctagcttcacactcttagatgacatttcacataccaaactcaaatctctgaactgttctaacaattcaaactcctttaccatcatagcggacatatg 3589  T
Q  362 caatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatg 412  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  3588 caaagtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatg 3538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 303 - 442
Target Start/End: Original strand, 7317 - 7456
Alignment:
Q  303 ctcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcct 402  Q
    ||||| ||||| ||||  || |||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  7317 ctcaaatctctgaactattcaagcaactcgaactcttttaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctt 7416  T
Q  403 taccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcag 442  Q
    |||| ||||| ||  ||||  |||||||||||| ||||||    
T  7417 tacccggatgatagctcaactcaaaatcataatccttcag 7456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Original strand, 7025 - 7125
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |  | |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||| |||||||||    
T  7025 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaa 7124  T
Q  111 a 111  Q
    |    
T  7125 a 7125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 435
Target Start/End: Original strand, 24677 - 24867
Alignment:
Q  245 actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttacc 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |  | |||||||| |||| | ||||| || |  ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||    
T  24677 actatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgagatgaccactcacaaactaagctcaaatctctaaactgttcaagcaactcgaactctttaacc 24776  T
Q  345 atcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||||||  ||||||| |  || ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  24777 atcaaagcggacatatgtagagtcttcctacttaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataat 24867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 1649 - 1899
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||     |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| |||  |||||    
T  1649 caaatcatggtgcatcttcgtagctcccggatgaatactcaaactacttcaatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtctagaata 1748  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    ||||  |||||||| || |||| |||||| ||||| || |  ||||| ||||| || ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | ||    
T  1749 caaatccttcctctaaatctcaacacaccttgatcgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacat 1848  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttca 258  Q
    | |||| ||| ||||||   ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1849 caactttctgtgcttctttaatactcttc-agaaattcactatcaatcttca 1899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Original strand, 19314 - 19433
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||||||||| ||||| |||    
T  19314 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcaaacatatgcaaagtctttctactaaaagcatcagcaacaacattagcc 19413  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || || ||||| ||| ||||    
T  19414 ttcccgggatgataactcaa 19433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 7388 - 7230
Alignment:
Q  284 tgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgca 383  Q
    ||||| |||||| || | |||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||| || ||||| ||||| ||     
T  7388 tgacatttcacacactaaactcaaatctctgaactgttcaagcaactcgaactcttttaccatcatagcagacaaatgcaaggtcttcctactcaaagcg 7289  T
Q  384 tcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcag 442  Q
    || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||||  |||||||||||| ||||||    
T  7288 tctgcaacaacattagctttacccggatgatagctcaactcaaaatcataatccttcag 7230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7661 - 7527
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |  | ||||||||||||||||  || ||||  ||||||| ||| |||||||||    
T  7661 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaa 7562  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatc 145  Q
    |  || ||||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  7561 atcctacctcgaaacctcagtacaccttgatcatc 7527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3144 - 2986
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||  ||| |||||||||||||    
T  3144 atcatgatacattttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctctacatcgtcaggaatacaa 3045  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagt 169  Q
    |  |  |||| |||||||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  3044 atccgacctcggaacctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagt 2986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 403
Target Start/End: Original strand, 10561 - 10662
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  10561 actcaagtctcaaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtcttcctactcaaagcatcggcaacaacattagcc 10660  T
Q  402 tt 403  Q
    ||    
T  10661 tt 10662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 16631 - 17054
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||| ||| ||| ||||| |||    
T  16631 atcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctca-catcgtctggaatgcaa 16729  T
Q  111 actcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatcta 210  Q
    | ||| ||||  |||||||  ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| || || | ||||| || |  || ||| || |||| ||| | ||| |    
T  16730 attctacctcgaaacctcaagacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttctgtctgattactagcaaccaacaagtctacaaccttaacatcaa 16829  T
Q  211 cttgctgagcttctcggatactgttcaagaaat-tactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagt 309  Q
    ||| ||| ||||||   ||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||| || |  |  | ||||| || ||||| ||| || || |  ||||| |    
T  16830 ctttctgtgcttctttaatacttttc-agaaatacactatcaatcttcagcattcctaggttcacactcttagatgacatttcgcaaactaacctcaaat 16928  T
Q  310 ctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccagg 409  Q
    |||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||    
T  16929 ctctaaactgttccaataattcaaactcttttaccatcatggccgacatatgcaatgtcttcctactcaaagcatctgctacaacattagctttacccgg 17028  T
Q  410 atggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||| ||  ||||  ||||||||||||    
T  17029 atgatagctcaactcaaaatcataat 17054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 169
Target Start/End: Original strand, 669 - 830
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||| | ||| ||||||    
T  669 caaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaataatcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcgtcgtctggaata 768  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagt 169  Q
     |||  || ||||  ||||||| |||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  769 gaaatcctacctcgaaacctcaacacagcttgatcatcgattttaaaatcactatcctcagt 830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 403
Target Start/End: Original strand, 8532 - 8633
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  8532 actcaagtctcaaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtcttcctactcaaagcatcggcaacaacattagcc 8631  T
Q  402 tt 403  Q
    ||    
T  8632 tt 8633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 133528 - 133427
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | ||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  133528 actcaagtctcgaaacttctcaatcaattctaattctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagcc 133429  T
Q  402 tt 403  Q
    ||    
T  133428 tt 133427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Original strand, 25093 - 25257
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| |||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||  |     
T  25093 actcaaatctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattcact 25192  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  25193 ttcccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatctcctctgcct 25257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 2914 - 2750
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  2914 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 2815  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||| ||||||||    
T  2814 tttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatcttctctgcct 2750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 1866 - 2293
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||  ||||||| ||| ||||  || |||| |||  |||||    
T  1866 caaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctttgagaatcatcttcttcatctcctcatcgtctagaata 1965  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||| ||| || | |||||| |||||||| |  ||||| ||| | || ||||| | ||||| || |   | ||| || |||||||| | ||    
T  1966 caaattctacctcggaatctgaacacaccttgatcatcgattttaaaatcattgtcttcagtctgattactagcaactaccaagtctacaaacttaacat 2065  T
Q  208 ctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatt-actatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 306  Q
    | |||| ||| ||||||   ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||| || |  |  | |||||||| |||||||||||| || | |||||    
T  2066 caactttctgcgcttctttaatacttttca-gaaattcattatcaatcttcagcatacctagtttcacactctgagatgacaattcacatactaaactca 2164  T
Q  307 agtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttacc 406  Q
      ||||| ||| | || | ||| ||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||    
T  2165 tatctctcaaccgttccaacaattcaaactcttttaccatcatggccgacatatgcaatgtcttcctactcaaagcatctgctacaacattagctttacc 2264  T
Q  407 aggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
      |||| ||  ||||  ||||||||||||    
T  2265 tagatgatagctcaactcaaaatcataat 2293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Original strand, 6441 - 6605
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || || || |||||||||||| |||||||||| |  || || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  6441 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactcattaaccatcaaagcagacatatgcaaagactttctactcaaagcatcagcaacaacattagcc 6540  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || |||||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||| ||||||||    
T  6541 ttcccaggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatcttctctgcct 6605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Original strand, 24661 - 24825
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  24661 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 24760  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||| ||||||||    
T  24761 tttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatcttctctgcct 24825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 145 - 5
Alignment:
Q  19 acatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcc 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||| |  || ||||  || |||| |||||||||||||| ||  ||    
T  145 acatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaattattttcttcatctcttcatcgtcaggaatacaaattcgacc 46  T
Q  119 tctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcac 159  Q
    || ||| |||| |||||| || ||| | |||||||||||||    
T  45 tcggaatctcaacacaccatggtcaacgaccttaaagtcac 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Original strand, 14175 - 14339
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  14175 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcc 14274  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    || || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||   ||| |||||||| ||||||||    
T  14275 tttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaagatattccaaccatcttctctgcct 14339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 79560 - 79400
Alignment:
Q  275 actctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctg 374  Q
    ||||||||||||| | ||||| || |  ||||  |||||||||||||| || ||||| || ||| | |||||||  ||  ||||||||||||| || ||     
T  79560 actctgaggtgaccactcacaaactaagctcatatctctaaactgctcaagtaactcgaactctctaaccatcatggcggacatatgcaatgtctttcta 79461  T
Q  375 ctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  79460 ctcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataat 79400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 79824 - 79724
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || ||||  ||||||||||||    
T  79824 atcatgatacatcttcgtagctcccggttgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaa 79725  T
Q  111 a 111  Q
    |    
T  79724 a 79724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11530 - 11314
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| || ||||||||  ||||  || ||||||||| |||| ||| ||| ||||  ||||||| ||| ||||||    
T  11530 caaataatgatacatctttctagctcccggatggatactcaagctacttctgtgactctctttaagagtcatcttcttcatctcatcatcgtctggaata 11431  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||| ||| |||| ||| || |||||||| || || ||||||||||| |||||   ||||| || |  || |||||| |||||||| | ||    
T  11430 caaattctacctcagaatctcaacactccttgatcatcgactttgaagtcactatcttcagtcggattactagcaaccaacaaatccacaaacttaacat 11331  T
Q  208 ctacttgctgagcttct 224  Q
    |||||| ||| ||||||    
T  11330 ctactttctgcgcttct 11314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17722 - 17506
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| || ||||||||  ||||  || ||||||||| |||| ||| ||| ||||  ||||||| ||| ||||||    
T  17722 caaataatgatacatctttctagctcccggatggatactcaagctacttctgtgactctctttaagagtcatcttcttcatctcatcatcgtctggaata 17623  T
Q  108 caaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaat 207  Q
    |||| ||| |||| ||| |||| ||| || |||||||| || || ||||||||||| |||||   ||||| || |  || |||||| |||||||| | ||    
T  17622 caaattctacctcagaatctcaacactccttgatcatcgactttgaagtcactatcttcagtcggattactagcaaccaacaaatccacaaacttaacat 17523  T
Q  208 ctacttgctgagcttct 224  Q
    |||||| ||| ||||||    
T  17522 ctactttctgcgcttct 17506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 466
Target Start/End: Original strand, 8424 - 8603
Alignment:
Q  287 caattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatca 386  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||| | |||||||||| || ||| | ||||| ||||||    
T  8424 caattcactaacaaaactcaggtctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaaggagacatatgcaaagtcttcatactcaaagcatca 8523  T
Q  387 gcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatctcctctgcct 466  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   ||||||| ||| ||| ||    |||||||| |||||||||||    
T  8524 gcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaaggtactctaaccaactcctctgcct 8603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Original strand, 25229 - 25348
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| || || |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| |||||| |||| ||||| |||    
T  25229 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattcaaactcattaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcaacaacgacattagcc 25328  T
Q  402 ttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    || ||| |||| ||| ||||    
T  25329 ttcccaagatgataactcaa 25348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 32418 - 32333
Alignment:
Q  336 tcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaa 421  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| ||||    
T  32418 tctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagccttcccgggatgataactcaa 32333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 403
Target Start/End: Original strand, 72456 - 72557
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || || || |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| |||||| |||| ||||| |||    
T  72456 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactccttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcaacaacaacattagcc 72555  T
Q  402 tt 403  Q
    ||    
T  72556 tt 72557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 421
Target Start/End: Original strand, 15705 - 15817
Alignment:
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    |||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||     
T  15705 tctcgaaactgctcaatcaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcaacaacgacattagccttcccaa 15804  T
Q  409 gatggtaattcaa 421  Q
    |||| ||| ||||    
T  15805 gatgataactcaa 15817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0719 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0719
Description:

Target: scaffold0719; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 264 - 146
Alignment:
Q  11 atcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||| || |  || || ||||| |||||||||    
T  264 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcgttgtctggaatacaa 165  T
Q  111 actcttcctctgaacctca 129  Q
    | ||| |||| ||| ||||    
T  164 attctccctcggaatctca 146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 435
Target Start/End: Original strand, 1 - 46
Alignment:
Q  390 accacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1 accacattggccttactaggatggtaattcaaaccaaaatcataat 46  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 125
Target Start/End: Original strand, 34161 - 34278
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||| |||| ||||| | ||||||| |||| |  ||||| |||||||||||     
T  34161 caaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttcttccaaaatcaacctttttatctcatcgttgtcaggaatg 34260  T
Q  108 caaactcttcctctgaac 125  Q
    |||| ||| |||||||||    
T  34261 caaattctgcctctgaac 34278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 111
Target Start/End: Original strand, 3354 - 3450
Alignment:
Q  15 tggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaa 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||  || ||||  || |||| ||| ||||||||||    
T  3354 tggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcctcatcgtctggaatacaaa 3450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 39218 - 39099
Alignment:
Q  26 cgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaac 125  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| ||| ||||||||||  || ||||  |||    
T  39218 cgtagctcccggatgaatactcaagttactcctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcctacctcgaaac 39119  T
Q  126 ctcagcacaccctgatcatc 145  Q
    |||| ||| || ||||||||    
T  39118 ctcatcactccttgatcatc 39099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 38980 - 38854
Alignment:
Q  309 tctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccag 408  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || || |||||||||| |||| |||||| ||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| |    
T  38980 tctctgaactgttcaagcaactcgaactcctttaccatcatagcagacatatccaaggtcttcctactcaaagcgtctgcaacaacattagctttacccg 38881  T
Q  409 gatggtaattcaagccaaaatcataat 435  Q
    |||| ||  ||||  ||||||||||||    
T  38880 gatgatagctcaactcaaaatcataat 38854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 13853 - 13743
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    |||||| ||||  |||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || || || || ||||||||||| ||||| |||    
T  13853 actcaaatctcgtaactgctcaatcaattccaattctttaaccatcaaagcaaacttatgcaaagtctttctacttaaagcatcagcaacaacattagcc 13754  T
Q  402 ttaccaggatg 412  Q
    || || |||||    
T  13753 ttcccgggatg 13743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Original strand, 1388 - 1457
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatca 78  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||    
T  1388 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 1457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12976 - 12867
Alignment:
Q  357 atatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcagtagttctaaccatc 456  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |  ||||||| || || |||||    
T  12976 atatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcatattctttcagtatttttagccatc 12877  T
Q  457 tcctctgcct 466  Q
    | | ||||||    
T  12876 tacgctgcct 12867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 403
Target Start/End: Original strand, 3824 - 3912
Alignment:
Q  315 aactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcctt 403  Q
    |||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||  ||| ||||| |||||    
T  3824 aactgctcaatcaattccaattctttaaccatcaaagcaaacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcaataacaacattagcctt 3912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 169
Target Start/End: Original strand, 4166 - 4274
Alignment:
Q  61 gactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcact 160  Q
    |||||||||| | ||||| ||| || |  ||||||| |||| ||||||||| ||  ||||  || ||||||||||| || ||||||||  ||||||||||    
T  4166 gactctcttccaaaatcatcttcttaatctcatcatcgtcatgaatacaaattcggcctcgaaatctcagcacaccttggtcatcaactctaaagtcact 4265  T
Q  161 atcctcagt 169  Q
    |||||||||    
T  4266 atcctcagt 4274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 111
Target Start/End: Original strand, 837 - 940
Alignment:
Q  8 caaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaata 107  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| || || | ||  |||||||||||| || |||  ||||||||     
T  837 caaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaactaactttttcaaaccaacatcatcaggaatg 936  T
Q  108 caaa 111  Q
    ||||    
T  937 caaa 940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4631 - 4560
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcct 373  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  4631 actcaagtctctgaactgttcaagcaactccaactctctaaccatcatagcagacatatgtaatgttttcct 4560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 442
Target Start/End: Original strand, 2648 - 2843
Alignment:
Q  247 tatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccat 346  Q
    |||||||||||||||| || | ||  | ||||| || ||||| |||||| || | |||||| ||| | ||||| || || ||||| || || ||||||||    
T  2648 tatcaatcttcagcattcctagcttcacactctcagatgacatttcacatactaaactcaaatctttgaactgttcaagtaactcgaactcctttaccat 2747  T
Q  347 caaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataattcttcag 442  Q
    || |||| ||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||| ||||| ||  ||||  |||||||||| | ||||||    
T  2748 catagcagacatatgtaaagtcttcctactcaaagcatccgcaacaacattaactttacctggatgatagctcaactcaaaatcatagtccttcag 2843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Original strand, 22841 - 22910
Alignment:
Q  9 aaatcatggtacatcttcgtagcccccgggtgaatactcaacttactcttgcgactctcttcaagaatca 78  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||    
T  22841 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttatatgactctcttcaagaatca 22910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 2991 - 2890
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggcc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || ||||| |||||||||||| ||||||| || || || || ||||| |||||| |||  ||||| |||    
T  2991 actcaagtctcgaaactgctcaaccaattccaactctttaaccatcaaagcagacatatgtaaagtctttctactcaaagcatcaacaaatacattagcc 2892  T
Q  402 tt 403  Q
    ||    
T  2891 tt 2890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 390
Target Start/End: Original strand, 45612 - 45700
Alignment:
Q  302 actcaagtctctaaactgctctagcaactcaaattcttttaccatcaaagcaaacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaa 390  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| || || || || |||||||||||| |||||||||| || ||  | ||||| ||||||||||    
T  45612 actcaagtctcgaaactgctcaatcaattccaactccttaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttttactcaaagcatcagcaa 45700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University