View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10481A_low_24 (Length: 457)

Name: NF10481A_low_24
Description: NF10481A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10481A_low_24
NF10481A_low_24
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (77-439)||(20774166-20774528)
chr5 (74-439)||(22462356-22462721)
chr5 (77-439)||(28894541-28894903)
chr5 (77-439)||(28916012-28916374)
chr5 (77-439)||(28923367-28923729)
chr5 (77-439)||(20821860-20822222)
chr5 (77-439)||(22235519-22235881)
chr5 (80-438)||(21890359-21890717)
chr5 (77-438)||(17268934-17269294)
chr5 (77-420)||(21563591-21563934)
chr5 (77-438)||(24716126-24716487)
chr5 (77-438)||(24619895-24620256)
chr5 (77-438)||(22503086-22503447)
chr5 (77-438)||(25848482-25848843)
chr5 (77-438)||(24749154-24749515)
chr5 (77-438)||(14886591-14886952)
chr5 (79-439)||(21831360-21831720)
chr5 (77-439)||(20342689-20343051)
chr5 (74-438)||(24797997-24798361)
chr5 (77-439)||(23079688-23080050)
chr5 (77-378)||(22381606-22381907)
chr5 (77-393)||(19770385-19770701)
chr5 (77-393)||(27668135-27668451)
chr5 (82-396)||(25423619-25423933)
chr5 (77-438)||(23471654-23472015)
chr5 (77-393)||(14999384-14999700)
chr5 (77-393)||(34566919-34567235)
chr5 (77-393)||(37291141-37291457)
chr5 (74-396)||(20467739-20468060)
chr5 (77-393)||(16356927-16357243)
chr5 (77-405)||(22332520-22332848)
chr5 (77-393)||(22348848-22349164)
chr5 (77-393)||(27610779-27611095)
chr5 (77-393)||(27685045-27685361)
chr5 (77-393)||(40709205-40709521)
chr5 (77-278)||(21339046-21339247)
chr5 (201-438)||(37542981-37543218)
chr5 (77-393)||(41771267-41771583)
chr5 (77-393)||(27518832-27519148)
chr5 (77-393)||(29475718-29476034)
chr5 (77-393)||(22135093-22135409)
chr5 (77-405)||(23574167-23574490)
chr5 (77-303)||(21497772-21497997)
chr5 (81-272)||(21496569-21496760)
chr5 (165-405)||(26738360-26738600)
chr5 (80-278)||(18776198-18776396)
chr5 (77-225)||(23516966-23517114)
chr5 (157-423)||(21407643-21407909)
chr5 (77-206)||(20799185-20799314)
chr5 (77-189)||(23440650-23440762)
chr5 (380-439)||(21680377-21680436)
chr5 (77-206)||(37545328-37545457)
chr5 (77-144)||(922-989)
chr5 (341-405)||(23440899-23440963)
chr5 (77-132)||(26738611-26738666)
chr5 (203-405)||(20799999-20800201)
chr5 (342-393)||(21338942-21338993)
chr5 (341-396)||(23517215-23517270)
chr5 (362-396)||(21936830-21936864)
chr5 (362-396)||(24581902-24581936)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (74-439)||(654-1019)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (74-439)||(20856250-20856615)
chr1 (77-439)||(20835377-20835739)
chr1 (77-439)||(22432605-22432967)
chr1 (77-439)||(19662626-19662992)
chr1 (77-439)||(20939552-20939914)
chr1 (77-438)||(19854821-19855174)
chr1 (77-438)||(31539487-31539848)
chr1 (77-438)||(24099093-24099454)
chr1 (77-438)||(37677588-37677949)
chr1 (77-438)||(20294920-20295281)
chr1 (77-405)||(21749449-21749777)
chr1 (73-405)||(50619767-50620099)
chr1 (77-393)||(16350134-16350450)
chr1 (77-405)||(22361767-22362095)
chr1 (77-393)||(51333028-51333344)
chr1 (77-393)||(21837458-21837774)
chr1 (77-393)||(33390564-33390880)
chr1 (77-393)||(21830811-21831127)
chr1 (77-393)||(17044550-17044866)
chr1 (77-303)||(16369805-16370031)
chr1 (77-225)||(19106875-19107023)
chr1 (140-396)||(20139401-20139657)
chr1 (73-405)||(19760389-19760721)
chr1 (338-438)||(21951678-21951778)
chr1 (146-405)||(20250379-20250638)
chr1 (77-189)||(16078391-16078503)
chr1 (77-189)||(41354208-41354320)
chr1 (77-150)||(41308333-41308406)
chr1 (362-396)||(20830924-20830958)
chr1 (341-393)||(16078191-16078243)
chr1 (341-393)||(20937686-20937738)
chr1 (341-393)||(41353197-41353249)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (74-439)||(95422-95787)
scaffold0029 (81-439)||(113087-113445)
scaffold0029 (77-393)||(109277-109593)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (77-438)||(27900879-27901240)
chr4 (77-438)||(15002782-15003143)
chr4 (77-438)||(15246417-15246778)
chr4 (77-438)||(1648695-1649056)
chr4 (79-439)||(15078130-15078490)
chr4 (77-439)||(8706411-8706773)
chr4 (77-409)||(15358537-15358869)
chr4 (77-437)||(15319644-15320004)
chr4 (77-438)||(3264212-3264573)
chr4 (77-439)||(33223416-33223778)
chr4 (77-438)||(11206649-11207010)
chr4 (77-438)||(29452955-29453316)
chr4 (73-439)||(14691391-14691757)
chr4 (77-438)||(20891475-20891836)
chr4 (79-438)||(44661284-44661643)
chr4 (77-439)||(15414443-15414805)
chr4 (73-438)||(14850524-14850889)
chr4 (80-393)||(16251648-16251961)
chr4 (77-393)||(8052826-8053142)
chr4 (77-393)||(8386905-8387221)
chr4 (77-393)||(12477093-12477409)
chr4 (77-393)||(14681060-14681376)
chr4 (77-393)||(27711829-27712145)
chr4 (77-393)||(29038607-29038923)
chr4 (73-401)||(1639620-1639948)
chr4 (77-405)||(7090925-7091253)
chr4 (77-393)||(12524169-12524485)
chr4 (77-405)||(15147076-15147403)
chr4 (77-393)||(40473533-40473849)
chr4 (77-393)||(18297698-18298014)
chr4 (77-393)||(19777996-19778312)
chr4 (77-393)||(23956240-23956556)
chr4 (77-393)||(14303181-14303497)
chr4 (77-410)||(16354631-16354964)
chr4 (80-393)||(18226649-18226962)
chr4 (84-401)||(14159970-14160287)
chr4 (146-222)||(18549694-18549770)
chr4 (362-396)||(15292618-15292652)
chr4 (79-117)||(16146409-16146447)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (80-438)||(67897-68255)
scaffold0034 (77-439)||(4373-4735)
scaffold0034 (77-438)||(13322-13683)
[»] chr6 (56 HSPs)
chr6 (77-439)||(15459693-15460055)
chr6 (77-439)||(34645148-34645510)
chr6 (77-439)||(21563694-21564056)
chr6 (77-439)||(21569553-21569915)
chr6 (77-438)||(25768548-25768909)
chr6 (77-439)||(19453777-19454139)
chr6 (81-439)||(21471962-21472320)
chr6 (77-438)||(8762496-8762857)
chr6 (77-439)||(14381029-14381391)
chr6 (77-438)||(5296769-5297130)
chr6 (79-416)||(17415845-17416182)
chr6 (77-439)||(27560179-27560541)
chr6 (77-438)||(22796195-22796556)
chr6 (77-438)||(18795047-18795408)
chr6 (77-429)||(28282385-28282737)
chr6 (80-439)||(19879658-19880017)
chr6 (77-439)||(10468411-10468773)
chr6 (77-438)||(24364769-24365130)
chr6 (77-393)||(1542692-1543008)
chr6 (77-405)||(18407538-18407866)
chr6 (77-393)||(24312776-24313092)
chr6 (77-410)||(5838810-5839143)
chr6 (73-405)||(15896447-15896779)
chr6 (77-405)||(19865044-19865372)
chr6 (77-408)||(28262790-28263121)
chr6 (77-408)||(28341539-28341870)
chr6 (77-393)||(16626325-16626641)
chr6 (77-393)||(29591528-29591844)
chr6 (140-393)||(20636909-20637162)
chr6 (77-393)||(2874411-2874727)
chr6 (77-405)||(22762051-22762379)
chr6 (81-408)||(28291965-28292292)
chr6 (84-405)||(27391769-27392090)
chr6 (77-405)||(25112909-25113237)
chr6 (84-405)||(27331029-27331350)
chr6 (77-405)||(22078286-22078614)
chr6 (74-393)||(25609469-25609788)
chr6 (77-405)||(16927236-16927564)
chr6 (77-405)||(23078826-23079154)
chr6 (77-393)||(27187793-27188109)
chr6 (77-393)||(27261131-27261447)
chr6 (77-396)||(22434226-22434545)
chr6 (80-345)||(11280161-11280426)
chr6 (74-213)||(17032737-17032876)
chr6 (140-438)||(18197291-18197589)
chr6 (77-160)||(1641129-1641212)
chr6 (77-220)||(16963148-16963291)
chr6 (371-439)||(19435653-19435721)
chr6 (164-396)||(22442711-22442943)
chr6 (77-224)||(27559765-27559912)
chr6 (140-225)||(21836973-21837058)
chr6 (362-396)||(1648419-1648453)
chr6 (173-303)||(18966984-18967114)
chr6 (365-396)||(23996893-23996924)
chr6 (362-396)||(16381978-16382012)
chr6 (380-430)||(19488843-19488893)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (77-438)||(6708-7069)
[»] chr3 (70 HSPs)
chr3 (77-439)||(10419690-10420052)
chr3 (77-438)||(13322298-13322659)
chr3 (77-439)||(14086795-14087157)
chr3 (77-439)||(13971765-13972127)
chr3 (77-439)||(17492752-17493114)
chr3 (77-439)||(18133991-18134353)
chr3 (77-430)||(12360196-12360549)
chr3 (77-438)||(16827849-16828209)
chr3 (77-438)||(16836156-16836517)
chr3 (77-439)||(13942146-13942508)
chr3 (80-438)||(14574054-14574406)
chr3 (77-429)||(8758737-8759089)
chr3 (77-429)||(41177644-41177996)
chr3 (77-438)||(11303419-11303780)
chr3 (77-438)||(28754440-28754801)
chr3 (77-438)||(47124066-47124427)
chr3 (77-429)||(4678560-4678912)
chr3 (77-439)||(44777369-44777731)
chr3 (77-381)||(15952671-15952975)
chr3 (77-438)||(10384091-10384451)
chr3 (77-430)||(16380582-16380935)
chr3 (77-438)||(16338158-16338519)
chr3 (77-392)||(15227771-15228086)
chr3 (77-438)||(9522831-9523192)
chr3 (77-420)||(16329324-16329668)
chr3 (77-410)||(12498360-12498693)
chr3 (77-410)||(16491866-16492199)
chr3 (77-393)||(10005712-10006028)
chr3 (77-405)||(17489962-17490290)
chr3 (77-408)||(6600848-6601179)
chr3 (290-439)||(11960814-11960963)
chr3 (77-393)||(5424632-5424948)
chr3 (77-393)||(10906322-10906638)
chr3 (77-393)||(13252802-13253118)
chr3 (77-393)||(16635885-16636201)
chr3 (77-393)||(43163209-43163525)
chr3 (77-408)||(53384705-53385036)
chr3 (77-393)||(48425559-48425875)
chr3 (78-225)||(14126464-14126611)
chr3 (77-393)||(15347947-15348263)
chr3 (77-393)||(20061756-20062072)
chr3 (74-405)||(16371522-16371853)
chr3 (77-259)||(12850104-12850286)
chr3 (80-393)||(16411984-16412297)
chr3 (74-405)||(14876188-14876520)
chr3 (77-393)||(15589094-15589410)
chr3 (80-408)||(16756272-16756600)
chr3 (74-372)||(15061865-15062163)
chr3 (79-393)||(15339383-15339697)
chr3 (80-393)||(26792101-26792414)
chr3 (77-393)||(15402212-15402528)
chr3 (77-393)||(16806628-16806944)
chr3 (80-405)||(15209006-15209331)
chr3 (80-393)||(15724636-15724949)
chr3 (77-303)||(16692272-16692502)
chr3 (81-405)||(15248263-15248587)
chr3 (77-225)||(11564551-11564699)
chr3 (89-278)||(15015573-15015762)
chr3 (74-132)||(11960986-11961044)
chr3 (38-74)||(14685174-14685210)
chr3 (383-439)||(31694831-31694887)
chr3 (383-439)||(31939331-31939387)
chr3 (77-116)||(26008961-26009000)
chr3 (362-396)||(8274098-8274132)
chr3 (362-396)||(13967039-13967073)
chr3 (362-396)||(30138213-30138247)
chr3 (362-396)||(30147764-30147798)
chr3 (362-439)||(16742359-16742436)
chr3 (38-74)||(10790579-10790615)
chr3 (86-250)||(18748796-18748960)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (138-438)||(468-768)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (77-439)||(20975511-20975873)
chr8 (77-438)||(1266797-1267158)
chr8 (77-430)||(21840976-21841329)
chr8 (77-438)||(31416335-31416696)
chr8 (80-438)||(23655489-23655847)
chr8 (79-439)||(22061293-22061653)
chr8 (77-439)||(20388658-20389020)
chr8 (77-439)||(22371499-22371861)
chr8 (77-438)||(19851970-19852331)
chr8 (77-438)||(19858006-19858367)
chr8 (77-438)||(803534-803895)
chr8 (77-438)||(6679670-6680031)
chr8 (77-429)||(31570712-31571064)
chr8 (77-438)||(16271085-16271446)
chr8 (77-438)||(22051422-22051783)
chr8 (77-438)||(6604217-6604578)
chr8 (77-438)||(27355107-27355468)
chr8 (77-439)||(29303286-29303648)
chr8 (74-438)||(14565698-14566062)
chr8 (77-438)||(12305317-12305678)
chr8 (73-438)||(20395986-20396351)
chr8 (73-438)||(22377315-22377680)
chr8 (73-438)||(22383490-22383855)
chr8 (75-395)||(23949476-23949796)
chr8 (77-393)||(19113249-19113565)
chr8 (77-396)||(16407949-16408267)
chr8 (77-395)||(21393769-21394087)
chr8 (77-395)||(21788263-21788581)
chr8 (77-410)||(21251500-21251833)
chr8 (77-393)||(32600703-32601019)
chr8 (77-438)||(20009780-20010122)
chr8 (79-405)||(21921630-21921955)
chr8 (77-393)||(17673929-17674245)
chr8 (77-393)||(18857136-18857452)
chr8 (77-405)||(21166432-21166759)
chr8 (81-405)||(22040422-22040746)
chr8 (81-393)||(30313050-30313362)
chr8 (77-405)||(23650600-23650928)
chr8 (77-405)||(19978526-19978854)
chr8 (77-225)||(22046932-22047080)
chr8 (81-222)||(15533943-15534084)
chr8 (80-393)||(22164098-22164411)
chr8 (81-393)||(22120080-22120392)
chr8 (77-393)||(22132947-22133263)
chr8 (74-396)||(22987757-22988074)
chr8 (77-184)||(20017865-20017972)
chr8 (77-189)||(19484980-19485092)
chr8 (359-438)||(22248278-22248357)
chr8 (146-222)||(19863684-19863760)
chr8 (146-222)||(19868321-19868397)
chr8 (362-395)||(21850241-21850274)
chr8 (341-405)||(21043268-21043332)
chr8 (107-222)||(22129017-22129132)
chr8 (362-396)||(16876998-16877032)
chr8 (42-74)||(1733390-1733422)
chr8 (341-393)||(19483970-19484022)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (77-439)||(33097-33459)
scaffold0076 (239-439)||(56320-56520)
scaffold0076 (362-396)||(41067-41101)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (77-439)||(49934-50296)
scaffold0028 (77-393)||(43678-43994)
scaffold0028 (77-393)||(8998-9314)
scaffold0028 (77-225)||(15460-15608)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (77-439)||(6658-7020)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (77-439)||(51600-51962)
scaffold0067 (77-439)||(60634-60996)
scaffold0067 (77-439)||(67022-67384)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (77-439)||(118092-118454)
scaffold0004 (77-427)||(323228-323578)
scaffold0004 (77-439)||(202888-203250)
scaffold0004 (77-278)||(386343-386544)
scaffold0004 (74-303)||(112542-112771)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (77-439)||(27365036-27365398)
chr2 (77-439)||(19652009-19652371)
chr2 (77-438)||(24641866-24642227)
chr2 (230-438)||(27210130-27210338)
chr2 (77-439)||(23276900-23277262)
chr2 (77-439)||(24948713-24949075)
chr2 (77-429)||(12574477-12574829)
chr2 (77-438)||(1063875-1064236)
chr2 (77-438)||(20828383-20828744)
chr2 (77-438)||(20833109-20833470)
chr2 (77-425)||(21125130-21125476)
chr2 (77-429)||(27787865-27788217)
chr2 (77-438)||(31830782-31831143)
chr2 (77-309)||(23294082-23294314)
chr2 (125-439)||(23110907-23111221)
chr2 (77-438)||(11357832-11358193)
chr2 (77-405)||(24675613-24675941)
chr2 (80-393)||(27371396-27371709)
chr2 (77-393)||(9610260-9610576)
chr2 (77-405)||(21325257-21325585)
chr2 (77-393)||(27218140-27218456)
chr2 (77-393)||(16923013-16923329)
chr2 (77-393)||(16982276-16982592)
chr2 (77-393)||(17063841-17064157)
chr2 (77-393)||(17067499-17067815)
chr2 (77-393)||(22324859-22325175)
chr2 (77-393)||(24707485-24707801)
chr2 (140-405)||(23107721-23107986)
chr2 (80-393)||(24262497-24262810)
chr2 (77-393)||(10868974-10869290)
chr2 (77-393)||(16925484-16925800)
chr2 (77-393)||(16999124-16999440)
chr2 (77-405)||(22756456-22756784)
chr2 (77-303)||(23064201-23064427)
chr2 (80-393)||(21145044-21145357)
chr2 (77-390)||(41608391-41608704)
chr2 (77-393)||(24876752-24877068)
chr2 (333-439)||(23294315-23294421)
chr2 (77-225)||(24710157-24710305)
chr2 (77-225)||(44385740-44385888)
chr2 (79-225)||(20442684-20442830)
chr2 (77-225)||(23189131-23189279)
chr2 (86-439)||(45529644-45529997)
chr2 (77-276)||(30211037-30211236)
chr2 (217-438)||(24819644-24819865)
chr2 (73-206)||(24825472-24825605)
chr2 (239-405)||(21890709-21890875)
chr2 (362-393)||(22276687-22276718)
chr2 (334-393)||(24710415-24710474)
chr2 (338-393)||(44385572-44385627)
chr2 (362-395)||(12640234-12640267)
chr2 (98-251)||(25128792-25128945)
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (79-439)||(14285780-14286140)
chr7 (80-439)||(13666023-13666382)
chr7 (77-439)||(6413994-6414356)
chr7 (77-438)||(13021840-13022201)
chr7 (77-438)||(19147694-19148055)
chr7 (77-438)||(20747093-20747454)
chr7 (77-438)||(15102008-15102369)
chr7 (74-438)||(11305668-11306032)
chr7 (77-429)||(18053367-18053719)
chr7 (77-439)||(14130356-14130718)
chr7 (77-439)||(23505274-23505636)
chr7 (77-439)||(14434174-14434536)
chr7 (77-438)||(14263649-14264010)
chr7 (77-438)||(49152784-49153145)
chr7 (80-438)||(16071699-16072057)
chr7 (209-439)||(19613290-19613520)
chr7 (77-438)||(16949876-16950237)
chr7 (77-439)||(11387832-11388194)
chr7 (74-439)||(15340911-15341276)
chr7 (77-439)||(12206204-12206566)
chr7 (73-396)||(15625030-15625353)
chr7 (77-438)||(8211533-8211894)
chr7 (75-438)||(812-1175)
chr7 (77-438)||(12456185-12456546)
chr7 (77-438)||(13968073-13968434)
chr7 (75-429)||(11771677-11772031)
chr7 (77-438)||(26118010-26118371)
chr7 (77-393)||(12687983-12688299)
chr7 (254-439)||(12457300-12457485)
chr7 (77-393)||(9596539-9596855)
chr7 (77-393)||(18551230-18551546)
chr7 (77-393)||(8199110-8199426)
chr7 (77-393)||(44790823-44791139)
chr7 (77-404)||(14040178-14040504)
chr7 (77-404)||(14350208-14350534)
chr7 (77-393)||(11236685-11237001)
chr7 (77-393)||(8708087-8708403)
chr7 (77-393)||(10871477-10871793)
chr7 (77-393)||(11552574-11552890)
chr7 (77-393)||(13686546-13686862)
chr7 (77-393)||(14332879-14333195)
chr7 (77-393)||(15160529-15160845)
chr7 (73-405)||(15154117-15154449)
chr7 (77-393)||(18178224-18178540)
chr7 (81-393)||(16788-17100)
chr7 (86-420)||(21662452-21662786)
chr7 (77-250)||(14955102-14955275)
chr7 (110-393)||(23203085-23203368)
chr7 (110-393)||(23509212-23509495)
chr7 (264-396)||(321506-321638)
chr7 (86-250)||(4440419-4440583)
chr7 (77-135)||(23199451-23199509)
chr7 (362-396)||(27107243-27107277)
chr7 (77-113)||(12457262-12457298)
chr7 (38-70)||(14325743-14325775)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (77-439)||(19644-20006)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (77-438)||(27749-28110)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (77-439)||(41443-41803)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (77-439)||(21091-21453)
scaffold0235 (153-439)||(10877-11163)
[»] scaffold0298 (5 HSPs)
scaffold0298 (77-438)||(20507-20868)
scaffold0298 (77-355)||(12865-13143)
scaffold0298 (77-355)||(16635-16913)
scaffold0298 (351-439)||(11477-11565)
scaffold0298 (351-439)||(15247-15335)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (77-430)||(40262-40615)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (84-439)||(25285-25640)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (77-439)||(48627-48989)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (77-439)||(46819-47181)
scaffold0010 (77-438)||(41754-42115)
scaffold0010 (77-438)||(2445-2806)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (77-438)||(10317-10678)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (77-438)||(27048-27409)
scaffold0192 (77-255)||(26666-26844)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (79-438)||(17958-18317)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (79-438)||(3277-3636)
scaffold0035 (146-222)||(12833-12909)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (84-439)||(195124-195479)
scaffold0011 (74-438)||(149091-149455)
scaffold0011 (75-427)||(25965-26317)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (77-439)||(4872-5234)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (170-438)||(5830-6098)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (77-437)||(5757-6117)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (80-439)||(100972-101331)
scaffold0020 (79-405)||(180725-181051)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (77-439)||(944-1306)
scaffold0120 (77-393)||(6547-6863)
scaffold0120 (341-393)||(12846-12898)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (77-420)||(114704-115052)
scaffold0001 (77-278)||(90513-90714)
scaffold0001 (73-396)||(390663-390986)
scaffold0001 (138-278)||(89835-89975)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (77-435)||(6660-7019)
scaffold0149 (77-435)||(11091-11450)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (77-439)||(44029-44391)
scaffold0114 (77-439)||(45041-45403)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (80-438)||(47651-48009)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (77-439)||(6456-6818)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (153-438)||(2188-2473)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (77-438)||(51284-51645)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (98-439)||(81252-81593)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (74-430)||(12215-12570)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (179-439)||(13719-13979)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (77-439)||(11293-11655)
[»] scaffold0053 (3 HSPs)
scaffold0053 (220-438)||(57268-57486)
scaffold0053 (74-438)||(48455-48819)
scaffold0053 (77-135)||(57541-57599)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (77-438)||(1393-1754)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (77-438)||(4954-5315)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (77-438)||(393-754)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (77-438)||(5274-5635)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (77-438)||(570-931)
scaffold0139 (77-204)||(28043-28170)
scaffold0139 (77-204)||(34296-34423)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (74-439)||(260829-261194)
scaffold0005 (77-393)||(278296-278612)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (153-439)||(7660-7946)
scaffold0222 (77-439)||(2775-3137)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (77-419)||(31934-32276)
scaffold0106 (77-410)||(14563-14896)
scaffold0106 (77-225)||(17965-18113)
scaffold0106 (157-393)||(18321-18557)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (81-420)||(28207-28546)
scaffold0064 (81-420)||(40198-40537)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (77-438)||(2318-2679)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (77-438)||(3315-3676)
scaffold0403 (77-410)||(6896-7229)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (77-400)||(2336-2657)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (80-438)||(249140-249498)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (77-430)||(43307-43660)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (79-439)||(19375-19735)
scaffold0090 (79-439)||(23537-23897)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (77-355)||(11412-11690)
scaffold0124 (77-258)||(5-186)
scaffold0124 (351-439)||(12996-13084)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (217-439)||(528-750)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (77-439)||(24492-24853)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (77-438)||(16134-16495)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (230-439)||(5-210)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (189-438)||(14618-14867)
scaffold0261 (189-438)||(22797-23046)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (77-438)||(17883-18233)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (77-439)||(32739-33101)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (77-438)||(26785-27146)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (218-390)||(49437-49609)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (140-439)||(12081-12380)
scaffold0483 (77-160)||(9782-9865)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (73-438)||(1428-1793)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (77-405)||(19126-19454)
scaffold0081 (77-278)||(50017-50218)
scaffold0081 (140-405)||(34613-34878)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (73-420)||(25158-25505)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (79-438)||(218838-219197)
scaffold0012 (73-405)||(229563-229895)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (77-438)||(4555-4916)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (78-410)||(19451-19783)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (77-405)||(32207-32534)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (77-410)||(6573-6906)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (73-438)||(3660-4025)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (77-396)||(1991-2310)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (77-416)||(15859-16198)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (255-438)||(20096-20279)
scaffold0104 (255-438)||(22916-23099)
scaffold0104 (77-258)||(1052-1233)
scaffold0104 (158-258)||(12582-12682)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (75-392)||(3872-4189)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (75-392)||(9118-9435)
scaffold0109 (75-393)||(33039-33357)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (73-429)||(9490-9846)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (77-393)||(160-476)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (77-405)||(14884-15212)
scaffold0044 (77-393)||(1144-1460)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (214-430)||(28718-28934)
scaffold0026 (77-219)||(37726-37868)
scaffold0026 (187-405)||(29578-29797)
[»] scaffold0600 (2 HSPs)
scaffold0600 (77-251)||(4399-4573)
scaffold0600 (358-439)||(4581-4662)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (140-405)||(39465-39730)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (77-405)||(277-605)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (77-405)||(63485-63813)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (77-416)||(14522-14861)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (81-405)||(3911-4232)
scaffold0023 (77-254)||(130672-130849)
scaffold0023 (77-276)||(28963-29161)
scaffold0023 (86-212)||(59287-59413)
scaffold0023 (341-405)||(28826-28890)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (77-438)||(15401-15762)
scaffold0040 (80-393)||(112953-113266)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (77-405)||(3268-3596)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (77-277)||(13011-13211)
scaffold0293 (341-393)||(13256-13308)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (77-405)||(220-548)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (77-393)||(7921-8237)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (77-405)||(4553-4881)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (77-393)||(7463-7779)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (77-405)||(16179-16507)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (77-303)||(18761-18987)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (77-410)||(25498-25831)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (287-439)||(482-633)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (77-253)||(622-798)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (93-405)||(2914-3226)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (350-438)||(7566-7654)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (77-393)||(7890-8206)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (77-393)||(22391-22707)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (153-405)||(8541-8793)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (81-393)||(65933-66245)
scaffold0042 (77-405)||(39274-39601)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (77-251)||(68199-68373)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (107-404)||(4425-4722)
scaffold0270 (107-404)||(11555-11852)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (77-393)||(938-1254)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (74-405)||(1197-1528)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (73-396)||(116368-116691)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (77-396)||(196941-197260)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (77-405)||(6538-6866)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (77-393)||(8314-8630)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (77-396)||(5745-6064)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (77-278)||(80075-80276)
scaffold0022 (73-105)||(126953-126985)
[»] scaffold0379 (2 HSPs)
scaffold0379 (217-405)||(7345-7533)
scaffold0379 (73-189)||(12647-12763)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (362-438)||(20862-20938)
scaffold0077 (362-396)||(27729-27763)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (77-224)||(844-991)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (233-439)||(10228-10434)
scaffold0130 (77-171)||(10428-10522)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (77-393)||(7797-8110)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (86-420)||(5031-5364)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (77-303)||(9867-10093)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (80-204)||(4953-5077)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (153-405)||(24098-24350)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (79-405)||(1791-2117)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (77-216)||(1523-1662)
scaffold0413 (341-405)||(1681-1745)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (339-438)||(17467-17566)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (380-439)||(34015-34074)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (217-438)||(11618-11839)
scaffold0018 (217-438)||(17810-18031)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (156-439)||(85938-86213)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (362-403)||(880-921)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (241-312)||(17524-17595)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (164-251)||(71830-71917)
scaffold0021 (98-251)||(33021-33174)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (362-396)||(3338-3372)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (362-396)||(3967-4001)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (362-396)||(24203-24237)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (362-412)||(3391-3441)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (362-396)||(44347-44381)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (86-251)||(182-347)
[»] scaffold1701 (1 HSPs)
scaffold1701 (38-70)||(28-60)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (77-117)||(195-235)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 20774166 - 20774528
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20774166 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaaccttg 20774265  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20774266 ggtctctgtctgacactatactcgacggaaccccatgcaatttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 20774365  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20774366 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgtcctctcgaagtattaggtaaacttgacacaaaatccatagaa 20774465  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20774466 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgt 20774528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 74 - 439
Target Start/End: Original strand, 22462356 - 22462721
Alignment:
Q  74 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 173  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22462356 ctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacc 22462455  T
Q  174 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462456 ttgggtctctatctgacactatacttgacggaactccatgcaacttaacaatattctaaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 22462555  T
Q  274 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 373  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462556 aatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 22462655  T
Q  374 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462656 gaaatgatatcccatttccactctggtacctccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 22462721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 28894903 - 28894541
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28894903 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacacatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttg 28894804  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28894803 ggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaactgagctactggataactgatattaat 28894704  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28894703 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccatatcgaatcatgtcctctcggagtattaggcaaacttgtcacaaaatccatagaa 28894604  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28894603 atactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgt 28894541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 28916374 - 28916012
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28916374 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttg 28916275  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28916274 ggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaactgagctactggataactgatattaat 28916175  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28916174 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccatatcgaatcatgtcctctcggagtattaggcaaacttgtcacaaaatccatagaa 28916075  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28916074 atactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgt 28916012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 28923729 - 28923367
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28923729 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttg 28923630  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28923629 ggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaactgagctactggataactgatattaat 28923530  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28923529 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccatatcgaatcatgtcctctcggagtattaggcaaacttgtcacaaaatccatagaa 28923430  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28923429 atactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgt 28923367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 20821860 - 20822222
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20821860 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaacctcg 20821959  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20821960 ggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaactgagctactggataacttatattaat 20822059  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20822060 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaactacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacgaaatccatagaa 20822159  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20822160 atactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaatcccgcaggcctctgatgt 20822222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 22235881 - 22235519
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| ||||| ||||| |||||||    
T  22235881 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccttg 22235782  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||    
T  22235781 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactaagctaccgaataactaatattaat 22235682  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22235681 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaaccaatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 22235582  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  22235581 atgctatctcacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctacaggcttctgatgt 22235519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21890717 - 21890359
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| || |    
T  21890717 gactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggat 21890618  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||     
T  21890617 ctctatccgacacaatactcgatggaactccatggaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgatcgg 21890518  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 379  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||| |  || |||||||| || | ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21890517 aataaagtgtgtcgacttcgtcaacctatagacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattttgtaaactcgtcacaaaatccatggaaatg 21890418  T
Q  380 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
     | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  21890417 ttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaacccttcaggcttctgatg 21890359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 17269294 - 17268934
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | | ||||||| |||||||   | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  17269294 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaatt-agtctcaatttcgaacccagagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 17269196  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17269195 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 17269096  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17269095 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 17268996  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  17268995 atgctatcccatttccactctggtacatccaacggtgtcaacaatcctgcaggtttctgatg 17268934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 77 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 21563934 - 21563591
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21563934 tccgactgaccatatgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21563835  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  21563834 gatctctatccgacacaatgctcgatggaacaccatgcagcttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaat 21563735  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || | ||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  21563734 cggaataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggcatcgtgccctcttggagtattcggtaaacttgtcacaaaatccatggat 21563635  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21563634 atgctatcccatttccactccggcacatccaatggtgtcaacaa 21563591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24716487 - 24716126
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||| |    
T  24716487 tccgactgaccatctgtctgaggatgctaagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcg 24716388  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
      |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24716387 aatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccatattatgaatgtaaatctctgccaactctgctaccggataactaatatttat 24716288  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||| || ||||||||||||||||  || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  24716287 tggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttgctaaactcgtcacgaaatccatagaa 24716188  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  24716187 ataatgtcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatg 24716126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24620256 - 24619895
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||| |    
T  24620256 tccgactgaccatctgtctgaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcg 24620157  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
      |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24620156 aatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccatattatgaatgtaaatctctgccaactctgctaccggataactaatatttat 24620057  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||| || ||||||||||||||||  || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  24620056 tggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttgctaaactcgtcacgaaatccatagaa 24619957  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  24619956 ataatgtcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatg 24619895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 22503086 - 22503447
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  22503086 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 22503185  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22503186 gatccctatccgacacaatgctcgatggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattaat 22503285  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22503286 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctttcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 22503385  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  22503386 atactgtcccacttccactccgatacatccaacggtgacaacaaccctgcaggcttctgatg 22503447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 25848482 - 25848843
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || |||||| |  |||| || || ||||| ||||| |    
T  25848482 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaattcttccagaacctagaagtgaacctcg 25848581  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  25848582 gatctctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctactggataactgatattgat 25848681  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| ||||| ||||||||| |||||| ||| || |||||||| || |  |||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  25848682 aggaataaagtgtgccgacttcatcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgctctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 25848781  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25848782 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 25848843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24749515 - 24749154
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||| |    
T  24749515 tccgactgaccatctgtctaaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcg 24749416  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
      |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24749415 aatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccatattatgaatgtaaatctctgccaactctgctaccggataactaatatttat 24749316  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||| || ||||||||||||||||  || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  24749315 tggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttgctaaactcgtcacgaaatccatagaa 24749216  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  24749215 ataatgtcccatttccactccagtacatccaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatg 24749154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14886952 - 14886591
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  14886952 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 14886853  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14886852 gatctctatctgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaat 14886753  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || | |||||| ||  ||| ||| || |||||||| || ||||||||||| ||     
T  14886752 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcatcatgtcctttcgaagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggag 14886653  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14886652 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 14886591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 79 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21831720 - 21831360
Alignment:
Q  79 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 178  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| |     
T  21831720 cgactgaccatgtgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttcga 21831621  T
Q  179 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 278  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||| |  |||| |||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| || |    
T  21831620 tctctatctgacacaatgctcgacagaacacggtgcagcttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattgattg 21831521  T
Q  279 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 378  Q
     ||| |||||||||||||||| ||| || || || || ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  | ||    
T  21831520 gaataaagtgcgccgacttcgacaatctatcaacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaatcttgttacaaaatccatgcatat 21831421  T
Q  379 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||| ||||||||    
T  21831420 gctatctcattttcactccggcacatctaacggtgtcaacaacccagtaggcttctgatgt 21831360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 20342689 - 20343051
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  20342689 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 20342788  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  20342789 gatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattgat 20342888  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| ||||||||| |||||| ||| || || ||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  20342889 aggaatgaagtgtgccgacttcctcaaccggtcgacaacgacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 20342988  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20342989 atactgtcccacttccactccggtacgtccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 20343051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 74 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24798361 - 24797997
Alignment:
Q  74 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 173  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||    
T  24798361 ctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcagtttcgaccccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 24798262  T
Q  174 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 273  Q
    | || || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24798261 tcggatccctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatatt 24798162  T
Q  274 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 373  Q
    ||| | |||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || | |||||| ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||||||     
T  24798161 aataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcatcatgtcctttcgaagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatg 24798062  T
Q  374 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24798061 gagatactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 24797997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 23080050 - 23079688
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  23080050 tccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcaaacccaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 23079951  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
      || ||||| || || ||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23079950 aatccctatccgatacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatgctatgaacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattaat 23079851  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
       |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23079850 atgaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 23079751  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||  | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23079750 atattgtccgacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 23079688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 77 - 378
Target Start/End: Original strand, 22381606 - 22381907
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  22381606 tccgactgaccatctgcctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 22381705  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || ||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22381706 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatgttttgaacataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 22381805  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22381806 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctatcaaccagaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 22381905  T
Q  377 at 378  Q
    ||    
T  22381906 at 22381907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 19770385 - 19770701
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19770385 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 19770484  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  19770485 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 19770584  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  19770585 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtatttggcaaacttgtcacaaaatccatggat 19770684  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  19770685 atactatcccatttcca 19770701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 27668451 - 27668135
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27668451 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27668352  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27668351 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 27668252  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27668251 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 27668152  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  27668151 atactatcccatttcca 27668135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 396
Target Start/End: Original strand, 25423619 - 25423933
Alignment:
Q  82 ctgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtct 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  25423619 ctgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaccttggatct 25423718  T
Q  182 ctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaa 281  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||| || ||||| ||||| ||||  || ||| |||| |||||||||| ||    
T  25423719 ctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatatctcgaatataaatctctgccaattgagaaacaggaaaactaatattaatcggaa 25423818  T
Q  282 tgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgct 381  Q
      || || ||| |||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  25423819 gaaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatact 25423918  T
Q  382 atcccatttccactc 396  Q
    |||||||||||||||    
T  25423919 atcccatttccactc 25423933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 23471654 - 23472015
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||  |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  23471654 tccgactgaccatctgtctacggatgatacgcctaactaaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 23471753  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||  ||||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  23471754 gatctctatctgatacaatgcttgaaggaaaaccatgtagcttcacaatattgcgaatgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatattaat 23471853  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| || || |||||||||||||| || || || |  || || ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  23471854 cggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaattacacaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 23471953  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  |||||||    
T  23471954 atgctatcccatttccactatggtatatctaaaggtgttatcaaccctgcaggtttctgatg 23472015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 14999700 - 14999384
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||  |||| || |||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14999700 tccgactgaccatatgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14999601  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  14999600 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 14999501  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  14999500 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 14999401  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  14999400 atactatcccatttcca 14999384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 34566919 - 34567235
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  34566919 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 34567018  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  34567019 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 34567118  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  34567119 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 34567218  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  34567219 atactatcccatttcca 34567235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 37291457 - 37291141
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  37291457 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 37291358  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  37291357 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 37291258  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||     
T  37291257 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtgtttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 37291158  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  37291157 atactatcccatttcca 37291141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20468060 - 20467739
Alignment:
Q  74 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 173  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  20468060 ctttcagactggccatctgtctgcggataatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacc 20467961  T
Q  174 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 273  Q
    | || ||||||||||| || || || ||| |||| ||||| | |||||||||||   | ||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  20467960 tcggatctctatctgatacaatgcttgacagaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaatctccgtcaactgagatacaggacaactgatatt 20467861  T
Q  274 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 373  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| |||  | |||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  20467860 aatcggaatgaa-tgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatg 20467762  T
Q  374 gaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    || || |||||||||||||||||    
T  20467761 gatatactatcccatttccactc 20467739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 16356927 - 16357243
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16356927 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16357026  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16357027 gatccctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16357126  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16357127 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 16357226  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  16357227 atactatcccatttcca 16357243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22332848 - 22332520
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22332848 tccgactgaccatctttctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22332749  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || |||||||||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  22332748 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctccgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 22332649  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22332648 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22332549  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22332548 atactatcccacttccattccggcacatc 22332520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 22348848 - 22349164
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22348848 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctctgcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22348947  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  22348948 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 22349047  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || ||||||||||||||||| || || | |||||  || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22349048 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaataaccctaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 22349147  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  22349148 atactatcccatttcca 22349164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 27610779 - 27611095
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27610779 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacaccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27610878  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27610879 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27610978  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || ||||| |||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27610979 aggtagaaaatgagctgactttgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27611078  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  27611079 atactatcccatttcca 27611095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 27685361 - 27685045
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27685361 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27685262  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27685261 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 27685162  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27685161 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 27685062  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  27685061 atactatcccatttcca 27685045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 40709205 - 40709521
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  40709205 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 40709304  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  | || ||||||||    
T  40709305 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttaacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaagctaatattaat 40709404  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  40709405 cggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 40709504  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  40709505 atactatcccatttcca 40709521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21339247 - 21339046
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || || ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  21339247 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 21339148  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  21339147 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcgaatataaatctccgccaactgagacacaggaaaactgatattaat 21339048  T
Q  277 cg 278  Q
    ||    
T  21339047 cg 21339046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 201 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 37543218 - 37542981
Alignment:
Q  201 acggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgt 300  Q
    ||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||    
T  37543218 acggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgactttgt 37543119  T
Q  301 caacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggt 400  Q
    ||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| |||    
T  37543118 caaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagataatgtcccacttccactctggt 37543019  T
Q  401 acatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  37543018 acatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 37542981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 41771267 - 41771583
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  41771267 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctgaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 41771366  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||| ||||    
T  41771367 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatactaat 41771466  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  41771467 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 41771566  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  41771567 atactatcccatttcca 41771583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 27518832 - 27519148
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27518832 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgtcgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27518931  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27518932 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27519031  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27519032 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27519131  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  27519132 atactatcccatttcca 27519148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 29476034 - 29475718
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || |||||| |  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  29476034 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttcgaaccccaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 29475935  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | || ||| || ||||| ||||| || || || ||  |||| ||||||||    
T  29475934 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttaatataaatctctgccaattgggcaacagggaaactaatattaat 29475835  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  29475834 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 29475735  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  29475734 atactatcccatttcca 29475718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 22135093 - 22135409
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22135093 tccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22135192  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  22135193 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 22135292  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || ||||| |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22135293 cggtagaaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 22135392  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  22135393 atactatcccatttcca 22135409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Original strand, 23574167 - 23574490
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  23574167 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 23574266  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||  ||  ||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  23574267 gatcaataaatgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttccttaatatagatctctgccaactgggcaaccggaaaactaatattaat 23574366  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||     || || |  |||||  | |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  23574367 cggtagaaaatgagccgacttcgtca-----tcaacaatcacccaatttgtgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 23574461  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  23574462 atactatcccatttccactctggcacatc 23574490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21497997 - 21497772
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| ||| || |||||||||  |||||||| ||||    
T  21497997 tccggctgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaaattttccaaaatccagaagtaaatcttg 21497898  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  21497897 gatctctatctgacacaatgctcga-agaacaccatgcaacttcacaatatcatgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 21497799  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 303  Q
    || ||  || || ||||||||||||||    
T  21497798 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaa 21497772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 272
Target Start/End: Original strand, 21496569 - 21496760
Alignment:
Q  81 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 180  Q
    ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||  | || || |||||||   ||| ||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  21496569 actgaccatctatttgcgaatgataagccgaactcaaccttaacttagaacccagggcattttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatc 21496668  T
Q  181 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 272  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  21496669 tctatccgacacaatacttgatggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatataaatatccgccaactgagctaccggaaaactaatat 21496760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 26738600 - 26738360
Alignment:
Q  165 aagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggata 264  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||| ||||  || ||| |    
T  26738600 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcgaatgtaaatttccgccaattgagaaacaggaaa 26738501  T
Q  265 actgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcaca 364  Q
    | ||||||||||   || ||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||    
T  26738500 attgatattaattagaaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcaca 26738401  T
Q  365 aaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26738400 aaatccatggatatgctatcacatttccactctggtacatc 26738360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 278
Target Start/End: Original strand, 18776198 - 18776396
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  18776198 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaggcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggat 18776297  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 278  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||| ||| | ||  || || ||||||||||| || || || ||| |||| ||||||||||    
T  18776298 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcataatctccttgatttaaatctccgccaattgggcaacaggaaaactaatattaatcg 18776396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 225
Target Start/End: Original strand, 23516966 - 23517114
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||    
T  23516966 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaaccctcttgcaaactctttcaaaatctagaagtaaatcttg 23517065  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 225  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  |||||||    
T  23517066 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatctcacaat 23517114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 423
Target Start/End: Original strand, 21407643 - 21407909
Alignment:
Q  157 aaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagct 256  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |   | || || |||||||||||||||| |    
T  21407643 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgtagcttcacaatctcacggatataaatctccgccaactgagat 21407742  T
Q  257 actggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaac 356  Q
    || ||| ||||||| ||||||| ||| || || ||||||||||| |   | || || |  ||||| |||| || ||| ||  | |||||||| || ||||    
T  21407743 acaggaaaactgatgttaatcggaataaaatgggccgacttcgttagtgtatccacaattacccaaatcgcataatgtccttttggagtattcggaaaac 21407842  T
Q  357 ttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacc 423  Q
    | |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||||||||    
T  21407843 tcgtcacaaaatccatggatatattatcccacttccactctggaatatctaaaggtgtcaacaaacc 21407909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 206
Target Start/End: Original strand, 20799185 - 20799314
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| |||| || |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  20799185 tccgactgaccatctgtccgcggataataagccaaactcaatctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaacttttccaaaatctaaaagtaaatcttg 20799284  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaa 206  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  20799285 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 20799314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 189
Target Start/End: Original strand, 23440650 - 23440762
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  23440650 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttg 23440749  T
Q  177 ggtctctatctga 189  Q
    | |||||||||||    
T  23440750 gatctctatctga 23440762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21680436 - 21680377
Alignment:
Q  380 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  21680436 ctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggtttctgatgt 21680377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37545457 - 37545328
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | || |||||| || |||| || || ||||| ||||| |    
T  37545457 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaaattttccagaacctagaagtgaacctcg 37545358  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaa 206  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||    
T  37545357 gatctctatccgacacaatgctagacggaa 37545328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 989 - 922
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttg 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||    
T  989 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttg 922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 405
Target Start/End: Original strand, 23440899 - 23440963
Alignment:
Q  341 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  23440899 ggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 23440963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26738666 - 26738611
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacc 132  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  26738666 tccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttagaacc 26738611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 405
Target Start/End: Original strand, 20799999 - 20800201
Alignment:
Q  203 ggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtca 302  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| | || ||||||||||  |  || || |||||||| ||||    
T  20799999 ggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaacctaatattaatcggtagaaaatgagccgactttgtca 20800098  T
Q  303 acctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtac 402  Q
    | || || |  | |||||| || |  |||| ||| || |||||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||    
T  20800099 atctatcaataataacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggtaaacgcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcac 20800198  T
Q  403 atc 405  Q
    |||    
T  20800199 atc 20800201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21338993 - 21338942
Alignment:
Q  342 gagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 393  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21338993 gagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttcca 21338942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 396
Target Start/End: Original strand, 23517215 - 23517270
Alignment:
Q  341 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  23517215 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactc 23517270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21936864 - 21936830
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21936864 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 21936830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 396
Target Start/End: Original strand, 24581902 - 24581936
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24581902 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 24581936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 74 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 1019 - 654
Alignment:
Q  74 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 173  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||     
T  1019 ctttccgaatgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttcaagtaaact 920  T
Q  174 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 273  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  919 ttgggtctctatttgacactatactcgacggaaccccatgcaatttcacaatattctgaatgtagatctccgctaactgagctactggataactgatatt 820  T
Q  274 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 373  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  819 aatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 720  T
Q  374 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  719 gaaatgttatcccatttccactctggtacttccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 74 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 20856615 - 20856250
Alignment:
Q  74 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 173  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20856615 ctttccgactgaccatatgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacc 20856516  T
Q  174 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856515 ttgggtctctatctgacactatacttgacggaacaccatgcaacttaacaatattctaaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 20856416  T
Q  274 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 373  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856415 aatcagaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 20856316  T
Q  374 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856315 gaaatgatatcccatttccactctggtacctccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 20856250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 20835739 - 20835377
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||| | ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  20835739 tccgattgaccgtctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtcagctcttccagaatctagaagtgaacctcg 20835640  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20835639 gatccctatccgacacaattctcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 20835540  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| || |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20835539 cggaataaaatgcgtcgactttgtcaacatgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 20835440  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20835439 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 20835377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 22432967 - 22432605
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || ||  |||| ||||| |    
T  22432967 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctataagtgaacctcg 22432868  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22432867 gatccctatccgacacaatactcgaaggaacttcatgcagcttcacaattttctgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 22432768  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22432767 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaattatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 22432668  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22432667 atgctatcccatttccactctggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 22432605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 19662992 - 19662626
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||||||  |||||||||| || || ||||| |    
T  19662992 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcg 19662893  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19662892 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 19662793  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||    
T  19662792 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccacatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccataaaa 19662693  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggt----acatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||| ||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  19662692 atgctataccacttccactccggccggcacatccaacggtgtcaacaactctgcaggcttctgatgt 19662626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 20939914 - 20939552
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    |||| ||  ||||||| || ||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  20939914 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcggcctcaacttctaacccaaaacgtcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 20939815  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  20939814 gatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcattatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccgaataattgatattaat 20939715  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20939714 cgaaataaagtgcgtcgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagcgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 20939615  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||   |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20939614 ataaaatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 20939552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 19854821 - 19855174
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  19854821 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 19854920  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  19854921 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcaccatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgat 19855020  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||||||||||||        |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19855021 cggaataaagtgcgccgactt--------tgtcaaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 19855112  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  19855113 atgctatcccacttccactctggcacatccaacggtgtcaacaaccccgcaggcttctgatg 19855174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31539848 - 31539487
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  31539848 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacttcattttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 31539749  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31539748 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 31539649  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||     
T  31539648 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggcaaactcgtcacaaaatccatagag 31539549  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31539548 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 31539487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24099454 - 24099093
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||  ||||||| |||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  24099454 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 24099355  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || || || | ||||||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  24099354 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaatgttatgaacataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattgat 24099255  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24099254 tggaatgaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatagcatcatgccctctcgtagtgttcggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 24099155  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24099154 atactgtcccatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 24099093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 37677588 - 37677949
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  37677588 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 37677687  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37677688 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaat 37677787  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||     
T  37677788 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactagttacaaaatccatagag 37677887  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  37677888 atactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 37677949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 20294920 - 20295281
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || |||| |||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  20294920 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtagactcttccagaacctagaagtgaacctcg 20295019  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  20295020 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccgagtaactgatattaat 20295119  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || | |||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||     
T  20295120 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaataacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagag 20295219  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20295220 ataatgtcccacttccagtccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20295281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Original strand, 21749449 - 21749777
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21749449 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21749548  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  21749549 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 21749648  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  21749649 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggat 21749748  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  21749749 atactatcccatttccactctggcacatc 21749777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 50620099 - 50619767
Alignment:
Q  73 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||     
T  50620099 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaat 50620000  T
Q  173 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 272  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    ||| || ||||| ||||||||||  ||  || |||||||||    
T  50619999 cttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatttcacaatatcacaaatataaatctctgccaactgagaaacaagaaaactgatat 50619900  T
Q  273 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 372  Q
    ||||||  ||||| || ||| |||||||||| || || || |  ||||| ||||  ||||  || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  50619899 taatcgggatgaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcatttcctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 50619800  T
Q  373 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
     || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  50619799 ggatatactatcccatttccactctggtacatc 50619767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16350450 - 16350134
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16350450 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16350351  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  | || ||||||||    
T  16350350 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaagctaatattaat 16350251  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  16350250 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 16350151  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  16350150 atactatcccatttcca 16350134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22362095 - 22361767
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||  |||| || || |  ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22362095 tccgactgaccatatgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagatcttaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22361996  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||| |   || ||| |||| ||||||||    
T  22361995 ggtctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatataaatctccgccaactaataaacaggaaaactaatattaat 22361896  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  || | |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22361895 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcgttccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22361796  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  22361795 atactatcccatttccactctggcacatc 22361767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 51333344 - 51333028
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  51333344 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 51333245  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  51333244 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 51333145  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  51333144 cggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 51333045  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  51333044 atactatcccatttcca 51333028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 21837458 - 21837774
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21837458 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21837557  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  21837558 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 21837657  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  21837658 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctgggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21837757  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  21837758 atactatcccatttcca 21837774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 33390880 - 33390564
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  33390880 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 33390781  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  33390780 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 33390681  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||     
T  33390680 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctaggagtattcgacaaactcgtcacaaaatccatggat 33390581  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  33390580 atactatcccatttcca 33390564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 21830811 - 21831127
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21830811 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21830910  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| ||||| || || || ||  |||| ||||||||    
T  21830911 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaattgggcaacagggaaactaatattaat 21831010  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    |   |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  21831011 ctgtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatccatggat 21831110  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  21831111 atactatcccatttcca 21831127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 17044866 - 17044550
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  17044866 tccgactgaccatctgtctgcagatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttg 17044767  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| ||||| || || || ||| |||| ||||||||    
T  17044766 gatctctgtctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaattgggcaacaggaaaactaatattaat 17044667  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || ||| |||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | ||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  17044666 cggtagaaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccctctctgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 17044567  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  17044566 atactatcccatttcca 17044550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 303
Target Start/End: Original strand, 16369805 - 16370031
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||  | || ||  | ||||| ||||   |||||||||| |||||||| || |    
T  16369805 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttatagcctaaagcctcttgcaaacccttccaaaatctagaagtaaatctcg 16369904  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   |||| || ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  16369905 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactgagctataggaaaactgatattaat 16370004  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 303  Q
    || |||||| || ||||||||||||||    
T  16370005 cggaatgaaatgagccgacttcgtcaa 16370031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 225
Target Start/End: Original strand, 19106875 - 19107023
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||  |||    
T  19106875 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatattg 19106974  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 225  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19106975 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 19107023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 396
Target Start/End: Original strand, 20139401 - 20139657
Alignment:
Q  140 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 239  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| |    
T  20139401 tcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcccaaatgtaaa 20139500  T
Q  240 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 339  Q
    | || |||||| |||  || ||  |||| |||||||||| ||  || || || ||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| ||    
T  20139501 tttctgccaaccgagaaacagggaaactaatattaatcggaagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgtgtcattccctct 20139600  T
Q  340 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  20139601 aggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactc 20139657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 19760721 - 19760389
Alignment:
Q  73 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||  | ||||| |||||  || ||||||| || ||||||    
T  19760721 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacttcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactcttctaaaatctagaggtaaac 19760622  T
Q  173 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 272  Q
    || || | |||||| || || ||  |||| ||||| ||||| | |||||||||||     ||||| |||||||| |||| || |||  || |||||||||    
T  19760621 ctcggatttctatccgatacaatgttcgatggaacaccatgtagcttcacaatatcgcagatgtaaatctccgctaactaagatacatgaaaactgatat 19760522  T
Q  273 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 372  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||| || || || |  ||||| || |  ||||  ||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  19760521 taatcgaaattaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatagcgtcatttcctttcggagtactcggcaaacttgtcacaaaatccat 19760422  T
Q  373 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
     || || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  19760421 ggatatactatctcatttccactctggcacatc 19760389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 438
Target Start/End: Original strand, 21951678 - 21951778
Alignment:
Q  338 ctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgat 437  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21951678 ctcggagtgttcggcaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgat 21951777  T
Q  438 g 438  Q
    |    
T  21951778 g 21951778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 146 - 405
Target Start/End: Original strand, 20250379 - 20250638
Alignment:
Q  146 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccg 245  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||| | ||||||||||   |||| || ||||| |    
T  20250379 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatttctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgccaattcacaatatcacgaatataaatctctg 20250478  T
Q  246 ccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagt 345  Q
    |||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  | || |||  | |||||    
T  20250479 ccaactgagaaacaggaaaactgatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtaattccctttaggagt 20250578  T
Q  346 attaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| || |||||    
T  20250579 attcggaaaactcgtcacaaaatccatgtatatactatcccatttccactctggcacatc 20250638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16078503 - 16078391
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  16078503 tccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaagccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 16078404  T
Q  177 ggtctctatctga 189  Q
    | |||||||||||    
T  16078403 gatctctatctga 16078391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 41354320 - 41354208
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  41354320 tccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 41354221  T
Q  177 ggtctctatctga 189  Q
    | |||||||||||    
T  41354220 gatctctatctga 41354208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 150
Target Start/End: Original strand, 41308333 - 41308406
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaact 150  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| |||||    
T  41308333 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaact 41308406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20830958 - 20830924
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20830958 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 20830924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16078243 - 16078191
Alignment:
Q  341 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 393  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  16078243 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 16078191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 393
Target Start/End: Original strand, 20937686 - 20937738
Alignment:
Q  341 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 393  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  20937686 ggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 20937738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 41353249 - 41353197
Alignment:
Q  341 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 393  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  41353249 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 41353197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 74 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 95787 - 95422
Alignment:
Q  74 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 173  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  95787 ctttccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaacc 95688  T
Q  174 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  95687 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatattctggatgtagatttccgccaactgagctactgggtaacttatatt 95588  T
Q  274 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 373  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  95587 aatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccatatagaatcgtgtcctctcggggtattgggtaaacttgtcacgaaatccata 95488  T
Q  374 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  95487 gaaatactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgt 95422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 81 - 439
Target Start/End: Original strand, 113087 - 113445
Alignment:
Q  81 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 180  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| |  ||    
T  113087 actgaccatctttctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcgaatc 113186  T
Q  181 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 280  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||| || ||||| |||||||| || || | | |||||||||| || | |    
T  113187 tctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcagcttcacaatgtcccgaatataaatctctgccaactgcgccaccgtaaaactgatatttattgga 113286  T
Q  281 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 380  Q
    || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||| |    
T  113287 ataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgactacaacccatattgaatcatgtcctctcggagtgtttggtagactcgtcacgaaatccatagaaatac 113386  T
Q  381 tatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  113387 tatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 113445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 109593 - 109277
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  109593 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 109494  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  109493 gttctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 109394  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||     
T  109393 aggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaattccatcgat 109294  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  109293 atactatcccatttcca 109277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 27900879 - 27901240
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |    
T  27900879 tccgactgaccatctgtctacggatgataagctgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccccg 27900978  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27900979 ggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaactgagctactggataactgatattaat 27901078  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27901079 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 27901178  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27901179 atgctgtcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatg 27901240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15003143 - 15002782
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  15003143 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 15003044  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||    
T  15003043 ggtctctttccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaaccgagctaccggataactaacattgat 15002944  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  15002943 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 15002844  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||| | ||||| |||| ||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  15002843 atgatctcccacttccgctctggcacatctaacggtgtcaacaacactgcaggcttctgatg 15002782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 15246417 - 15246778
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  15246417 tccgactgaccatctgtctggggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 15246516  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
      |||||||| || || |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  15246517 aatctctatccgatacaatactcgacgaaactccatgtaacttcacaatattgtgaatataaatctctgccaactgagctattggataactaatattgat 15246616  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  15246617 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaa 15246716  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15246717 atgctatcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 15246778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1649056 - 1648695
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  || ||||||| ||||| ||||| |    
T  1649056 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttctaaaatctggaagtgaacctcg 1648957  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| | |||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  1648956 gatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgaagcttcacaatatgatgaatataaatctcagccaactgagctaccgaataactaatattaat 1648857  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1648856 aggaatgaaatgtgccgacttagtcaacctatcgaccacaacccatatagaattatgccctctcggagtattaggtaaactcgttacaaaatccatagaa 1648757  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1648756 atgctgtcccatttccactccagtatatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatg 1648695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 79 - 439
Target Start/End: Original strand, 15078130 - 15078490
Alignment:
Q  79 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 178  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||     
T  15078130 cgactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcgga 15078229  T
Q  179 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 278  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  15078230 tctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctccaccaactaagctaccggaaaactaatattgatcg 15078329  T
Q  279 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 378  Q
     ||| || |||||||||||| ||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||    
T  15078330 gaataaaatgcgccgacttcatcaacctttcaacaacaacccaaatggtatcatgccctctcggagtattcgataaactcgtcacaaaatccatggaaat 15078429  T
Q  379 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    | | ||||| |||||||| || ||||| || |||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  15078430 gttgtcccacttccactctggcacatctaatggtgtcattaaccctgcaggcttctgatgt 15078490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 8706411 - 8706773
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || |||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8706411 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaactcaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8706510  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||    
T  8706511 gatctctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcagcttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattgat 8706610  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  8706611 tggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggat 8706710  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  8706711 atgctatctcatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaacccagcaggcttctgatgt 8706773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 77 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 15358869 - 15358537
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| | |||  ||| |||||||||||| ||||| |    
T  15358869 tccgactgaccatctctctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttcccaaatcttgaagtgaacctcg 15358770  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15358769 gatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 15358670  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||    
T  15358669 tggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcagaaaatccatagaa 15358570  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaac 409  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15358569 atactgtcccatttccactccggcacatccaac 15358537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 77 - 437
Target Start/End: Original strand, 15319644 - 15320004
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  15319644 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 15319743  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  15319744 gatctctatctgacacaatgctcgatgggacaccatgcaacttcacaatattatgaatataaatttccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 15319843  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  || || ||| |||| ||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  15319844 cgggataaaatgccccgagttcgtcaacctatcaacaacaacccaaatggtatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggag 15319943  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgat 437  Q
    ||| | ||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15319944 atgttgtcccacttccactctcgcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgat 15320004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 3264573 - 3264212
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  3264573 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 3264474  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3264473 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 3264374  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  3264373 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 3264274  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3264273 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 3264212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 33223416 - 33223778
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||| ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  33223416 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 33223515  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||  | ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  33223516 gatctctatccgacacaatactcgacgggacaccatgtagcttcacaatgctatgaacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgat 33223615  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||| ||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  33223616 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaatccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 33223715  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33223716 atactgtcccacttccattccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 33223778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 11207010 - 11206649
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  || | || || ||||| |||||      
T  11207010 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttcaagaacctagaagtgaacctca 11206911  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11206910 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtatatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaat 11206811  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  11206810 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaatcggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 11206711  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11206710 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 11206649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 29453316 - 29452955
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  29453316 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 29453217  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  29453216 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatgttaat 29453117  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  29453116 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 29453017  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  29453016 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 29452955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 73 - 439
Target Start/End: Original strand, 14691391 - 14691757
Alignment:
Q  73 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  14691391 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 14691490  T
Q  173 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 272  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  14691491 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcgggaatgtaaatctccaccaactgaggtacaggaaaactgatat 14691590  T
Q  273 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 372  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| |  ||||| ||||  |||| |||  ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  14691591 tactcgaaatgaaatgagccgacttcgtcaatccatctacaatcacccaaatcgcgtcattccctttcgaagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 14691690  T
Q  373 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  14691691 ggatatgctatcccatttccactctggtacatctaacggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatgt 14691757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 20891475 - 20891836
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  |||| ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  20891475 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 20891574  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||| |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||| | ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  20891575 gatctttatccgacacaatacttgacggtacaccgtgcaacttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgat 20891674  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||     
T  20891675 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacgaaatccatagag 20891774  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  20891775 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcatcaaccctgtaggcttctgatg 20891836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 79 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 44661643 - 44661284
Alignment:
Q  79 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 178  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| ||     
T  44661643 cgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcgga 44661544  T
Q  179 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 278  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||| || |    
T  44661543 tctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataattgatattgatag 44661444  T
Q  279 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 378  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  44661443 gaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagat 44661344  T
Q  379 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  44661343 actatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccccgcaggcttctgatg 44661284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 15414805 - 15414443
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||    
T  15414805 tccgactggctatctgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagatgtaaatcttg 15414706  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||| ||||| |||||||  || || | | |||| ||||||||    
T  15414705 gatctctatccgacacaatacttgacggaacaccatgcagcttcacaatatcacgaatgtaaatctctgccaactatgccaccgaaaaactaatattaat 15414606  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||| || |||||||| || || || || || | |||||| | ||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||     
T  15414605 cggaataaagtgtgctgacttcgttaatctatcaacaaccagccatatggcatcatgccctctcgaagtattcagtaaacttgttacaaagtccatggat 15414506  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||| ||| || |||||| ||||||||    
T  15414505 atgctatcccatttccactctggcacatctaatggtttcagcaacccagcaggcttctgatgt 15414443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14850889 - 14850524
Alignment:
Q  73 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  14850889 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 14850790  T
Q  173 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 272  Q
    ||  | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| ||  ||||||||||||  || ||| |||| ||||    
T  14850789 ctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatcgcgaatgtaaattcccgccaactgagaaacaggaaaactcatat 14850690  T
Q  273 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 372  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||  |||| |||  || ||||||| || |||||  ||||||||| |||    
T  14850689 taatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatctacaatcacccaaatcgcgtcattccctttctgagtattcggaaaactcatcacaaaatacat 14850590  T
Q  373 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
     || ||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  14850589 ggatatgttatcccatttccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 14850524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16251961 - 16251648
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  16251961 gactgaccatctgtctgcgaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 16251862  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||     
T  16251861 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcgg 16251762  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 379  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||     
T  16251761 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccccctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgaatata 16251662  T
Q  380 ctatcccatttcca 393  Q
    ||||||||||||||    
T  16251661 ctatcccatttcca 16251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 8053142 - 8052826
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8053142 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8053043  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| || ||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  8053042 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgctaactgggcaacagggaaactaatattaat 8052943  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || ||||||||||||||||| || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8052942 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctgtcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 8052843  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  8052842 atactatcccatttcca 8052826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 8386905 - 8387221
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8386905 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8387004  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  8387005 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 8387104  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8387105 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 8387204  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  8387205 atactatcccatttcca 8387221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 12477093 - 12477409
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  12477093 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 12477192  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  12477193 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 12477292  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  12477293 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 12477392  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  12477393 atactatcccatttcca 12477409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 14681060 - 14681376
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14681060 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14681159  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| || || || ||||| ||||  ||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  14681160 gatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctccgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 14681259  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  14681260 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 14681359  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||| ||||||    
T  14681360 atactatcccttttcca 14681376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 27711829 - 27712145
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27711829 tccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27711928  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27711929 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27712028  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27712029 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgtgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27712128  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  27712129 atactatcccatttcca 27712145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 29038923 - 29038607
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  29038923 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 29038824  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  29038823 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 29038724  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  29038723 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 29038624  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  29038623 atactatcccatttcca 29038607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1639948 - 1639620
Alignment:
Q  73 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 172  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |  |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||     
T  1639948 tctttccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccaaactccacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaat 1639849  T
Q  173 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattct-gaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgata 271  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||| | || || ||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  1639848 cttggatctctatctgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaat-ttctcggatataaatctctgtcaactgagctacgggaaaactgata 1639750  T
Q  272 ttaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatcca 371  Q
    ||||||| ||  || || |||| ||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  1639749 ttaatcggaagaaaatgagccgtcttcgtcaatctatcgacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatcca 1639650  T
Q  372 tagaaatgctatcccatttccactccggta 401  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  1639649 tggatatgctatcccacttccactctggta 1639620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Original strand, 7090925 - 7091253
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| || ||||||| ||||||||  |||    
T  7090925 tccgactgactatctgtctgcggatgatatgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttctaaaatctagaagtaaattttg 7091024  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattct-gaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaa 275  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||  || ||| |||| |||||||    
T  7091025 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat-ttctcgaatatagatctctgccaactgagaaacaggaaaactaatattaa 7091123  T
Q  276 tcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccataga 375  Q
    ||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||  ||||  |||| |||  | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||    
T  7091124 tcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcaccctaatcgcgtcattccctttaggagtattcgacaaacttgtcacaaaatccatgga 7091223  T
Q  376 aatgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
     || ||||||||||||||||| || |||||    
T  7091224 tatactatcccatttccactctggcacatc 7091253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 12524169 - 12524485
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| || |    
T  12524169 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcg 12524268  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| || ||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  12524269 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgctaactgggcaacaggaaaactaatattaat 12524368  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  12524369 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 12524468  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  12524469 atactatcccatttcca 12524485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 15147403 - 15147076
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  ||||||||||  ||||||| ||||    
T  15147403 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtaaatcttg 15147304  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||  ||||||  || |  ||| |||||||||||||    
T  15147303 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttccttaatatagatctctaccaactaggcaataggaaaactgatattaat 15147204  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||     
T  15147203 cg-tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaactatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcgacaaactcgtcacaaaatccatggat 15147105  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  15147104 atactatcccatttccactctggcacatc 15147076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 40473533 - 40473849
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| ||  |||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  40473533 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 40473632  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||  |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  40473633 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctttgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 40473732  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  40473733 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 40473832  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  40473833 atactatcccatttcca 40473849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 18297698 - 18298014
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  18297698 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccgaaatctagaagtaaatcttg 18297797  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  18297798 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 18297897  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||     
T  18297898 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaattcatggat 18297997  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  18297998 atactatcccatttcca 18298014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 19778312 - 19777996
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19778312 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 19778213  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||   | || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  19778212 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttggtataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 19778113  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  19778112 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 19778013  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  19778012 atactatcccatttcca 19777996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 23956240 - 23956556
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23956240 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaacttaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 23956339  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  23956340 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 23956439  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  23956440 aggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 23956539  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  23956540 atactatcccatttcca 23956556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 14303497 - 14303181
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14303497 tccgactaaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14303398  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  14303397 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 14303298  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  14303297 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 14303198  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  14303197 atactatcccatttcca 14303181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16354964 - 16354631
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  16354964 tccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 16354865  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | | ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  | ||| || ||||  |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  16354864 gatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaatctctttaatataaatctttgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 16354765  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  |||| ||| |   ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16354764 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcattccctccatgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16354665  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 410  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  16354664 atactatcccatttccattctggcacatctaacg 16354631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 18226962 - 18226649
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  18226962 gactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcctccaaaatctagaagtaaatcttggat 18226863  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    ||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||  || || ||| |||||||||||||||     
T  18226862 ctcgatctgatacaatgctcgaaggcacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactaggcaacaggaaaactgatattaatcgg 18226763  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 379  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  18226762 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatata 18226663  T
Q  380 ctatcccatttcca 393  Q
    ||||||||||||||    
T  18226662 ctatcccatttcca 18226649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 401
Target Start/End: Original strand, 14159970 - 14160287
Alignment:
Q  84 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 183  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14159970 gaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctct 14160069  T
Q  184 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 283  Q
     ||| | || ||  | || ||||| |||||||||||||||||||   |||| || || || ||||||||||  || ||| |||| |||||||| | || |    
T  14160070 gtctaatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatttctgccaactgagacacaggaaaactaatattaattggaagg 14160169  T
Q  284 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 383  Q
    || || |||||||| ||||  || |  || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||| | |||||||||||||| || |||||||    
T  14160170 aaatgagccgacttagtcagtctatagacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtattcggcaaaatcgtcacaaaatccatggatatgctat 14160269  T
Q  384 cccatttccactccggta 401  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  14160270 cccatttccactctggta 14160287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18549770 - 18549694
Alignment:
Q  146 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 222  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18549770 aaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 18549694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 15292652 - 15292618
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15292652 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 15292618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 117
Target Start/End: Original strand, 16146409 - 16146447
Alignment:
Q  79 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaa 117  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16146409 cgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaa 16146447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 80 - 438
Target Start/End: Original strand, 67897 - 68255
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  67897 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcgggt 67996  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  67997 ctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaactgagctactggataactgatattaatcgg 68096  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  68097 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaagtccatagaaatg 68196  T
Q  380 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  68197 ttgtcccatttccactccagtacatccaacggtgtcaacaaccctgtaggcctctgatg 68255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 4735 - 4373
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||| |||||  |||| ||||| |    
T  4735 tccgactgaccatctgtctgaggacgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctaaaagtgaacctcg 4636  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  4635 gatccctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagctttacaatattatgaatataaatctccgccaactgagccaccggataactaatattaat 4536  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4535 cggaataaagtgcgccgactttgtcaacttgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 4436  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  4435 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttttgatgt 4373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13683 - 13322
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||      
T  13683 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctct 13584  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |  ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13583 gattcctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgactataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 13484  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13483 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcaacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaacttgttacaaaatccatagaa 13384  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  13383 atattgtcccacttccactccggcacatctaacggcgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 13322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 56)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 15459693 - 15460055
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15459693 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacttcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttg 15459792  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15459793 ggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacgatattatgaatgtaaatctctgccagctgagctactggataacttatattaat 15459892  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15459893 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccatatagaatcgtgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 15459992  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15459993 atgctatcccatttccactccggtatatccaacggtgtcaacaatcctgcaggcttctgatgt 15460055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 34645510 - 34645148
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34645510 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttg 34645411  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | || || ||||| ||||| || || || ||| |||||||||| ||    
T  34645410 gatccctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccggatataaatctctgccaattgcgccaccggaaaactgatatttat 34645311  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34645310 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgactacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 34645211  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34645210 atactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatgt 34645148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21564056 - 21563694
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  21564056 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 21563957  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
      ||||||||  |||| ||||||||| | || ||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  21563956 aatctctatcctacacaatactcgaccgtacaccatgaagcttaacaatattatgaatatatatctccgccaactgagctacctgataactgatattgat 21563857  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21563856 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 21563757  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  21563756 atgttatcccatttccactccggcacatccaacgatgtcaacaaccctgcaagcttctgatgt 21563694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21569915 - 21569553
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  21569915 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 21569816  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
      ||||||||  |||| ||||||||| | || ||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  21569815 aatctctatcctacacaatactcgaccgtacaccatgaagcttaacaatattatgaatatatatctccgccaactgagctaccagataactgatattgat 21569716  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21569715 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 21569616  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  21569615 atgttatcccatttccactccggcacatccaacgatgtcaacaaccctgcaagcttctgatgt 21569553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 25768548 - 25768909
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| |    
T  25768548 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttggaaactcttccaaaatcttgaattaaacctcg 25768647  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  25768648 gatctctatcggacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaatattataaatgtaaatctccgccaactgagctactggaaaactaatattgat 25768747  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| | || || |||||||| || | |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  25768748 cgaaataaaatgcgccgacttcgtcaacgtatcgacgacaacccaaatggcatcatgtcccctcgaagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 25768847  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25768848 atactgtcccacttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 25768909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 19453777 - 19454139
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| || || ||||| |    
T  19453777 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcg 19453876  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19453877 gatccctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 19453976  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19453977 cggaataaagtgcgctgactttgtcaacctgtcaaccacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 19454076  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  19454077 atgatatcccaattccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagacttctgatgt 19454139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 81 - 439
Target Start/End: Original strand, 21471962 - 21472320
Alignment:
Q  81 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 180  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  21471962 actgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatc 21472061  T
Q  181 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 280  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||      
T  21472062 tctatccgacacaatactcgatggaactccatgaaacttcacaataatatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgatcggg 21472161  T
Q  281 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 380  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| ||| |||||| ||| || || |    
T  21472162 ataaaatgcgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaactcgtcgcaaaattcatggagatac 21472261  T
Q  381 tatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21472262 tgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 21472320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 8762857 - 8762496
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  8762857 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaacctcg 8762758  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  8762757 gatctctatccgacacaatactcgacggtacgccatgtagcttcacaatatcatgaatatagatctccgccaactgagctaccggataattgatatcaat 8762658  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  8762657 cagaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatggcatcatgccctctctgagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatataa 8762558  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    |||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  8762557 atgtcgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 8762496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 14381391 - 14381029
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  14381391 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagctgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 14381292  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  14381291 gatctctattcgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctcccccaactgagctaccaggtaactaatattaat 14381192  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14381191 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 14381092  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14381091 atgctatctcacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaatcctgcaggcctctgatgt 14381029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 5297130 - 5296769
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  5297130 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaacccaacctcaatttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 5297031  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||||    
T  5297030 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatgttttgaatataaatctcagccaactgagctacccgataattgatgttaat 5296931  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||  || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5296930 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactagtcacaaaatccatagaa 5296831  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5296830 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 5296769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 79 - 416
Target Start/End: Original strand, 17415845 - 17416182
Alignment:
Q  79 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 178  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| ||     
T  17415845 cgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacttaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcgga 17415944  T
Q  179 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 278  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  17415945 tccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaattg 17416044  T
Q  279 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 378  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | |||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||    
T  17416045 gaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgactactacccaaatggcatcatgtcctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaaat 17416144  T
Q  379 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 416  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17416145 gttatcccacttccactccggcacatccaacggtgtca 17416182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 27560541 - 27560179
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  27560541 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 27560442  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  27560441 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgat 27560342  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27560341 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccaccacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 27560242  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27560241 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggcgtcaacaatcctgcaggcttctgatgt 27560179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22796556 - 22796195
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  22796556 tccgactgaccatatgtttgcgaatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 22796457  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  22796456 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactaataatgat 22796357  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||| | |||||| |||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |     
T  22796356 cggaataaagtgtgtcgactttgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatgtat 22796257  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||| | | ||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  22796256 atgttgttccacttccactttggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 22796195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 18795047 - 18795408
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||  ||||||| ||||   |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  18795047 tccgattgaccatccgtatgaggatgataagccaaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaacgcttccataatctagaagtgaacctcg 18795146  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |   | || || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  18795147 gatctctatctgacacagtactcgacggaacaccatgcatcttcacaatgtcacggatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactgatatttat 18795246  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18795247 cggaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaaattgtcacaaaatccatagaa 18795346  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  18795347 atgttgtcccacttccactctggaacatctaatggtatcaacaaccctgcaggcttctgatg 18795408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 77 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 28282737 - 28282385
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  28282737 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 28282638  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  28282637 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 28282538  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28282537 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 28282438  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28282437 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 28282385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 80 - 439
Target Start/End: Original strand, 19879658 - 19880017
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| || |    
T  19879658 gactgtccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggat 19879757  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |   || || |||||||||||||| || |  ||| |||||||||| ||||     
T  19879758 ctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccagatataaatctccgccaactgcgccatcggaaaactgatatttatcgg 19879857  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 379  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  19879858 aataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatattgaatcatatcccctcggagtgtttggtagactcgtcacgaaatccatagaaatg 19879957  T
Q  380 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19879958 ctatcccatttccactctggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 19880017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 10468773 - 10468411
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| ||||||||  ||||||| || || || ||||| |    
T  10468773 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccaaaacctagaggtgaacctcg 10468674  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||||| || |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  10468673 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatattatggacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgat 10468574  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||     
T  10468573 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaattgcttcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacgaaatctatagag 10468474  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10468473 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 10468411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 24364769 - 24365130
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  24364769 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 24364868  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||| | |||||| ||||||| ||    
T  24364869 gatctctattcgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctgccggataattgatattgat 24364968  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  24364969 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagat 24365068  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24365069 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 24365130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1543008 - 1542692
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  1543008 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 1542909  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  1542908 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 1542809  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || ||||||||||||||||| || || | |||||| || | ||  | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  1542808 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcatatttccctctgggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 1542709  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  1542708 atactatcccatttcca 1542692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 18407866 - 18407538
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  18407866 tccgactgaccctctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagacgtaaaccttg 18407767  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||| |||  || ||| |||||||||||||    
T  18407766 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaaatctctgccaacagagaaacaggaaaactgatattaat 18407667  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||  || || | |||||||||||| || || || |  ||| | ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18407666 cggaagaaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcaccaaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 18407567  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  18407566 atactatcccatttccactctggcacatc 18407538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24313092 - 24312776
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  24313092 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 24312993  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||    
T  24312992 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactgatattaat 24312893  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  24312892 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 24312793  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  24312792 atactatcccatttcca 24312776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 77 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 5839143 - 5838810
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  5839143 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 5839044  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||| |||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || |||||  |||||||||  || ||| |||| ||||| ||    
T  5839043 gatctctaactgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttccttgatataaatctctaccaactgagaaacaggaaaactaatatttat 5838944  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||||||||| || | |||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  5838943 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactagtcacaaaatccatggat 5838844  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 410  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5838843 atactatcccatttccattccggcacatctaacg 5838810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 405
Target Start/End: Original strand, 15896447 - 15896779
Alignment:
Q  73 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 172  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |   | ||||| |||||  |||||||| | |||||| ||    
T  15896447 tctttccgactgattatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacttcaacttagaacctacagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtatac 15896546  T
Q  173 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 272  Q
    ||    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | |||||||||||   | ||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  15896547 ctcacatctctatctgatacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatat 15896646  T
Q  273 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 372  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||| || || |  ||||| ||     ||| |||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15896647 taatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaatcacccaaataacgccattccctttcggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccat 15896746  T
Q  373 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
     || || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  15896747 ggatatactatcccatttccactttggtacatc 15896779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Original strand, 19865044 - 19865372
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  19865044 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 19865143  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || ||  || |||||||||||||    
T  19865144 gatctctatctgatacaatgctcgtaggaacaccatgaaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacacgaaaactgatattaat 19865243  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  19865244 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 19865343  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  19865344 atactatcccatttccactctggcacatc 19865372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 77 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 28263121 - 28262790
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  28263121 tccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 28263022  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  28263021 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcaaaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 28262922  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  | ||| || || ||||| ||||| || || || | |||||| || | |||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  28262921 aggtaggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 28262822  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 408  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28262821 atactatcccatttccattccggcacatccaa 28262790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 77 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 28341870 - 28341539
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  28341870 tccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 28341771  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  28341770 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcaaaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 28341671  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  | ||| || || ||||| ||||| || || || | |||||| || | |||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  28341670 aggtaggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 28341571  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 408  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28341570 atactatcccatttccattccggcacatccaa 28341539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16626641 - 16626325
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16626641 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcatctttgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16626542  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  16626541 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 16626442  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16626441 aggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctcagagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16626342  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  16626341 atactatcccatttcca 16626325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 29591844 - 29591528
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| | |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  29591844 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcactctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 29591745  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  29591744 gatctctatctgacacaatgctcgaagggacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 29591645  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  | ||| || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  29591644 cggtaggaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 29591545  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  29591544 atactatcccatttcca 29591528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 140 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20637162 - 20636909
Alignment:
Q  140 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 239  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||    
T  20637162 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataga 20637063  T
Q  240 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 339  Q
    |||| ||||||||||  || |||||||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  |    
T  20637062 tctctgccaactgagaaacaggataactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattcccttt 20636963  T
Q  340 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 393  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  20636962 aggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 20636909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 2874727 - 2874411
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  2874727 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 2874628  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||  || || ||||| |||||||  || || ||  |||| ||||||||    
T  2874627 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaagttcacaatctccttgatataaatctctgccaactaggcaacagggaaactaatattaat 2874528  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  2874527 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 2874428  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  2874427 atactatcccatttcca 2874411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22762379 - 22762051
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||| | |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22762379 tccgactaaccatcagtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctctggcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22762280  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  22762279 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 22762180  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    |  ||  || || |||||||| ||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22762179 cataagaaaatgagccgacttagtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22762080  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  22762079 atactatcccatttccactctggcacatc 22762051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 81 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 28292292 - 28291965
Alignment:
Q  81 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 180  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28292292 actgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 28292193  T
Q  181 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 280  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||| |      
T  28292192 tctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggt 28292093  T
Q  281 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 380  Q
    | ||| || || ||||| ||||| || || || | |||||| || | |||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  28292092 aggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatac 28291993  T
Q  381 tatcccatttccactccggtacatccaa 408  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28291992 tatcccatttccattccggcacatccaa 28291965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 27392090 - 27391769
Alignment:
Q  84 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 183  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||| |||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  27392090 gaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 27391991  T
Q  184 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 283  Q
    |||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| | ||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||      
T  27391990 atctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgtcaactgagaaacaggaaaacttatattaatcggaaga 27391891  T
Q  284 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 383  Q
    || || |||||||||||||| || || || |  ||||| |||   |||| |||    |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  27391890 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcacgtcattcccttaaggagtatttggcaagcttgtcacaaaatccatggatatgctat 27391791  T
Q  384 cccatttccactccggtacatc 405  Q
    |||||||| |||| || |||||    
T  27391790 cccatttctactctggcacatc 27391769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Original strand, 25112909 - 25113237
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  25112909 tccgactgaccatctgtctgtggatgataggccgaacttaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 25113008  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  25113009 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 25113108  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||     
T  25113109 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacgaaatccatcgat 25113208  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||    
T  25113209 atactatcccatttccattctggtacatc 25113237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 27331350 - 27331029
Alignment:
Q  84 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 183  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||| |||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  27331350 gaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 27331251  T
Q  184 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 283  Q
    |||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| | ||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||      
T  27331250 atctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgtcaactgagaaacaggaaaacttatattaatcggaaga 27331151  T
Q  284 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 383  Q
    || || |||||||||||||| || || || |  ||||| |||   |||| |||    |||||||  || || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  27331150 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcacgtcattcccttaaggagtatagggcaagcttgtcacaaaatccatggatatgctat 27331051  T
Q  384 cccatttccactccggtacatc 405  Q
    |||||||| |||| || |||||    
T  27331050 cccatttctactctggcacatc 27331029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22078614 - 22078286
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || || || ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22078614 tccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagagcctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22078515  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||   |||| |||||||| | ||||||||  || ||| ||||||||||||     
T  22078514 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatatctcgaatatagatctctgtcaactgagaaacaggaaaactgatattaac 22078415  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||  || ||||||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  || | |||  | |||||||| || |||||  ||||||||||||  ||     
T  22078414 cggaagaaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcgttccctttaggagtattcggcaaactcatcacaaaatccacggat 22078315  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || |||||||| |||||||| || |||||    
T  22078314 atactatcccacttccactctggcacatc 22078286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 25609788 - 25609469
Alignment:
Q  74 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 173  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  25609788 ctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 25609689  T
Q  174 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 273  Q
    |||| ||||||||||| || ||  |||| ||||| |||||||||||||| || |  | ||  || ||||| ||||| ||||  || ||| |||||||| |    
T  25609688 ttggatctctatctgatacaatggtcgaaggaacaccatgcaacttcacgatctctttaacataaatctctgccaattgagaaacaggaaaactgatact 25609589  T
Q  274 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 373  Q
    |||||  |  || || || ||||||||||| ||||| || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||| | || ||||| ||||| ||||||||     
T  25609588 aatcgccagaaaatgtgctgacttcgtcaatctgtcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtaatcggcaaactcgtcacgaaatccatg 25609489  T
Q  374 gaaatgctatcccatttcca 393  Q
    || || ||||||||||||||    
T  25609488 gatatactatcccatttcca 25609469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16927564 - 16927236
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || | ||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| || |    
T  16927564 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcg 16927465  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    ||||||||| ||| || || ||||| ||||  ||||||||||||||||| |  | ||| || | ||| |||||||  || || ||| ||||||| |||||    
T  16927464 ggtctctatttgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctctttaatataaacctctgccaactatgcaacaggaaaactgatgttaat 16927365  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || || ||||||||||| ||||| || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16927364 cggtagaaaatgtgctgacttcgtcaatctgtcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16927265  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  16927264 atactatcccatttccactctggcacatc 16927236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Original strand, 23078826 - 23079154
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||    |||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||    
T  23078826 tccgactgaccatctctctgcggacgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagactcttgtaaactcttcaaaaatctagaagtaaatcttg 23078925  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   |||| || || |||||||||||||  ||  || |||||||||||||    
T  23078926 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatctcgaatataaatttccgccaactgagacacatgaaaactgatattaat 23079025  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || |||||| || ||| |||||||||| || ||||| |  ||||| ||||  |||| | |  | ||||||||    ||||| |||||||||||||| ||     
T  23079026 cggaatgaaatgagccaacttcgtcaatctatctacaatcacccaaatcgcgtcattcactttaggagtattctaaaaactcgtcacaaaatccatggat 23079125  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23079126 atactatctcatttccactctggtacatc 23079154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 27187793 - 27188109
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27187793 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27187892  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27187893 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27187992  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || || |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27187993 aggtagaaaatgagctgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggtgtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27188092  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  27188093 atactatcccatttcca 27188109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 27261447 - 27261131
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27261447 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27261348  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27261347 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27261248  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || || |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27261247 aggtagaaaatgagctgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggtgtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27261148  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  27261147 atactatcccatttcca 27261131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 396
Target Start/End: Original strand, 22434226 - 22434545
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||  |||||||| ||||    
T  22434226 tccgactaatcatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatccagaagtaaatcttg 22434325  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || | |  ||| || ||||| | |||||| || || ||| |||||||||||||    
T  22434326 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttccataatataaatctctgtcaactgggcaacaggaaaactgatattaat 22434425  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    |   |  || || ||||||||||||||  | || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22434426 cagtagaaaatgagccgacttcgtcaatatatcgacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22434525  T
Q  377 atgctatcccatttccactc 396  Q
    || |||||||||||||||||    
T  22434526 atactatcccatttccactc 22434545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11280426 - 11280161
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| || |    
T  11280426 gactggccatcggtctgaggatggtaagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggat 11280327  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    |||||||||| || |||||||| | ||  ||||||||||||||||| | | | || || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||| ||||     
T  11280326 ctctatctgatacaatactcgatgtaataccatgcaacttcacaatttcccggatataaatctctgccaactgtgccaccggaaaactgatatttatcgg 11280227  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagt 345  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |  || || |||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  11280226 aataaagtgcgccaacttcgtcaatccatcgactacaaccaatattgaatcatgtcccctcggagt 11280161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 213
Target Start/End: Original strand, 17032737 - 17032876
Alignment:
Q  74 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 173  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  17032737 ctttccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 17032836  T
Q  174 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatg 213  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||    
T  17032837 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 17032876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 18197589 - 18197291
Alignment:
Q  140 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 239  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   | ||||| |    
T  18197589 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgatggaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaa 18197490  T
Q  240 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 339  Q
    |||| || ||||||| |||   | ||||||| ||||||| |||||| ||  | |||||||||||  | || || |  ||||| || |  || | |||  |    
T  18197489 tctctgctaactgagatacaaaaaaactgatgttaatcggaatgaaatgatctgacttcgtcaatttatccacaatcacccaaatagcgtcgttcccttt 18197390  T
Q  340 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  18197389 aggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgcatatgctatcccatttccactctggtatatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 18197291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 160
Target Start/End: Original strand, 1641129 - 1641212
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaat 160  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||    
T  1641129 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaat 1641212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16963291 - 16963148
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || | ||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| || |    
T  16963291 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcg 16963192  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttc 220  Q
    ||||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16963191 ggtctctatctgatataatgctcgaaggaacaccatgcaacttc 16963148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 371 - 439
Target Start/End: Original strand, 19435653 - 19435721
Alignment:
Q  371 atagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19435653 atagaaatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 19435721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 396
Target Start/End: Original strand, 22442711 - 22442943
Alignment:
Q  164 gaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggat 263  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || | |  ||| || ||||| | |||||| || || |||     
T  22442711 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttccataatataaatctctgtcaactgggcaacaggaa 22442810  T
Q  264 aactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac 363  Q
    ||||||||||||||   |  || || ||||||||||||||  | || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||    
T  22442811 aactgatattaatcagtagaaaatgagccgacttcgtcaatatatcgacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcac 22442910  T
Q  364 aaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  22442911 aaaatccatggatatactatcccatttccactc 22442943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27559912 - 27559765
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  27559912 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 27559813  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaa 224  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||    
T  27559812 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 27559765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21837058 - 21836973
Alignment:
Q  140 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 225  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21837058 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21836973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1648453 - 1648419
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1648453 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 1648419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18967114 - 18966984
Alignment:
Q  173 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 272  Q
    ||||| |||||||||||||  ||  |||||  ||| ||||| | |||||||||||   | ||||| |||||||||||||||| |||  || ||||||| |    
T  18967114 cttggatctctatctgacataatgatcgacaaaacaccatgtaccttcacaatatcgcggatgtaaatctccgccaactgagatacaagaaaactgatgt 18967015  T
Q  273 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 303  Q
    |||||| |||||| || |||||| |||||||    
T  18967014 taatcggaatgaaatgagccgacgtcgtcaa 18966984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 396
Target Start/End: Original strand, 23996893 - 23996924
Alignment:
Q  365 aaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23996893 aaatccatagaaatgctatcccatttccactc 23996924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16382012 - 16381978
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16382012 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 16381978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 380 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 19488893 - 19488843
Alignment:
Q  380 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 430  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  19488893 ctatcccatttccactccggcacatctaatggtgtcaacaacccagcaggc 19488843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 6708 - 7069
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||    
T  6708 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtgaactcttccaaaatctagaagtgaaccttg 6807  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6808 ggtctctatcggacactatactcgaggggataccatgcaacttcacaatgttatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 6907  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6908 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatggaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 7007  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||    
T  7008 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaactttcctgcaggcctctgatg 7069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 10420052 - 10419690
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10420052 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttg 10419953  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10419952 ggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacgatattatgaatgtaaatctccgccagctgagctactggataacttatattaat 10419853  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10419852 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccatatagaatcgtgtcctctcggggtattgggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 10419753  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  10419752 atgctatcccatttccactccggtatatccaacggtgtcaacaatcccgcaggcttctgatgt 10419690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13322659 - 13322298
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||  | |||||||| |||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||      
T  13322659 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacctcgaacccaaaacatcttgcaaactcttccagaatctagaagtaaacctca 13322560  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13322559 gatccctatctgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctctgccaactgagctaccggataactgatattaat 13322460  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13322459 cgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaactcgtcacaaaatccatagag 13322360  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  13322359 atgctgtcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcagacctccgatg 13322298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 14086795 - 14087157
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  14086795 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 14086894  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  14086895 gatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 14086994  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14086995 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 14087094  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  14087095 atactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggtttctgatgt 14087157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 13972127 - 13971765
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  13972127 tccgactgaccatctgtctggggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 13972028  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | || || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  13972027 gatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccggatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 13971928  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13971927 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 13971828  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13971827 atactatcccatttccactccggtatatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 13971765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 17492752 - 17493114
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  17492752 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaagttcgaccccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 17492851  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| || || | || | ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17492852 gatctctatccgaaacaacacacaacggaacaccatgcaacttcacaatgttatgaatgtagatctccgccaactgagctaccggataattgatattaat 17492951  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| || ||||||||||||||||| || || || | ||||||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  17492952 tggaataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcgacaataacccatatggcatcatgccctcttggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 17493051  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17493052 atgctatcccacttcaactctggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 17493114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 18134353 - 18133991
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || ||||||||    || || |||||  |||| |||||  |||| ||||| |    
T  18134353 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaaagtgtcctgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcg 18134254  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18134253 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtaaccttacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 18134154  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  18134153 cggaataaagtgcgccgaattcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccattgaa 18134054  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  18134053 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctaatgt 18133991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 77 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 12360549 - 12360196
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||| ||  |||| ||||| || || ||||| |    
T  12360549 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaatctcttccataatctagatgtgaacctcg 12360450  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| | ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||    
T  12360449 gatccctatccgacacaatactctacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatgtaaatctccgccaactgagctatcggatatttgatattaat 12360350  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12360349 cggaataaagtgcgccaactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 12360250  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 430  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12360249 atgttatcccacttccactccggcacatccaactgtgtcaacaaccctgcaggc 12360196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16828209 - 16827849
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| ||| |  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  16828209 tccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaattcttccaaaatctagaagtgaacctcg 16828110  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  16828109 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgat 16828010  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||| || | ||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  16828009 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcca-cacaacccaaatggcatcatgccctctcagagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 16827911  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16827910 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 16827849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16836517 - 16836156
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| ||||| || || ||||| |    
T  16836517 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcg 16836418  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16836417 gatctctatccgatgcaatactcgacggaactccatgaagcttcacaacattatgaatgtaaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 16836318  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16836317 aggaatgaagtgcgccgactttgtcaacttgtcgaccacaacccaaatagaatcatgtcctcttggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 16836218  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16836217 atgctatcccatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 16836156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 13942146 - 13942508
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  13942146 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 13942245  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| | | | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  13942246 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcaccacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 13942345  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13942346 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 13942445  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  13942446 atgctatcccatttccactccggtacatccaatgatgtcaacaatcctgcaggtttctgatgt 13942508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 80 - 438
Target Start/End: Original strand, 14574054 - 14574406
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||    |    
T  14574054 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctgaaat 14574153  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||         
T  14574154 ctctatctgacacaatactcgacgaaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactg--atta----g 14574247  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 379  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14574248 aataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatg 14574347  T
Q  380 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14574348 ctatcccacttccactctggcacatctaacgatgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 14574406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 77 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 8759089 - 8758737
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  8759089 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 8758990  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  8758989 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 8758890  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8758889 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 8758790  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8758789 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 8758737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 77 - 429
Target Start/End: Original strand, 41177644 - 41177996
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  41177644 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 41177743  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  41177744 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 41177843  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41177844 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 41177943  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41177944 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 41177996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 11303780 - 11303419
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  | || || |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  11303780 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaggcgtcctgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 11303681  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  11303680 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccagataactaatattgat 11303581  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  11303580 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacgacgacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaa 11303481  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||    
T  11303480 atgttgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctacaagcttctgatg 11303419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 28754440 - 28754801
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||||||||| |    
T  28754440 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcg 28754539  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28754540 gatctctatctgacacaatactagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaat 28754639  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||     
T  28754640 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggggtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagag 28754739  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  28754740 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 28754801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 47124066 - 47124427
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  47124066 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 47124165  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |  ||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  47124166 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgcgctaccgggtaactgatattaat 47124265  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || |  ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  47124266 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatagcgtcatgcctcctcggagtgttcggtaaacttgtcacaaaatccatagag 47124365  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  47124366 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 47124427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 77 - 429
Target Start/End: Original strand, 4678560 - 4678912
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  4678560 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 4678659  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| || | | | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  4678660 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagctttaccacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 4678759  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4678760 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccaccacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 4678859  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4678860 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 4678912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 44777369 - 44777731
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || || |||||  |||| ||||||||  |||| || || ||||||||||| |    
T  44777369 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcg 44777468  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||||| | | || || || || || |||||||||||||| |||||| |||| || ||    
T  44777469 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgtagcttcacaacactatgtatataaatttcagccaactgagctaccggataattgatgttgat 44777568  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  44777569 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccaccacccaaatcgaatcatgtcccttcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 44777668  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  44777669 atgctatcccatttccactctggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcgggcttctgatgt 44777731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 77 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 15952975 - 15952671
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  15952975 tccgactgaccatatgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 15952876  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||    
T  15952875 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataagcaatattgat 15952776  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||| |||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||    
T  15952775 cggaataaagtgtgccgacttcgtcagcctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggaa 15952676  T
Q  377 atgct 381  Q
    |||||    
T  15952675 atgct 15952671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 10384091 - 10384451
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||| | |||| || || ||||| ||||| |    
T  10384091 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgcaaacatttccagaacctagaagtgaacctcg 10384190  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  10384191 gatctctatccgacacaatacta-acggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattgat 10384289  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  10384290 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 10384389  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10384390 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 10384451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 77 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 16380935 - 16380582
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || || ||| | |    
T  16380935 tccgactgaccatctgtctgagaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacatcg 16380836  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16380835 gatccctatccgacacaatacttgaaggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 16380736  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| || || |||||||| | ||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16380735 aggaataaaatgtgccgactttgacaatctatcaaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaagcttgtcacgaaatccatagaa 16380636  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 430  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16380635 atgctatcccatttccactctggtacatccaacggcgtcaacaatcctgcaggc 16380582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16338519 - 16338158
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||| | ||||| |    
T  16338519 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaactgaacctcg 16338420  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| |||||||||| | ||||  || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16338419 gatccctatccgacacaatacttgacggtacaccgtgcagcttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccgggtaactgatattaat 16338320  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||     
T  16338319 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcgtcatgccctcttggagtgttcggtaaactcgtcacgaaatccatagag 16338220  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  16338219 atattgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtgaacaaccctgcaggcttctgatg 16338158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 77 - 392
Target Start/End: Original strand, 15227771 - 15228086
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||    
T  15227771 tccgactgaccaattgtttgcggatgataagctgaactccacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagatgtaaatcttg 15227870  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||    |||||| ||||| |||||||| || ||  || |||| ||||||||    
T  15227871 gatctctatccgatacaatactcgatggaacaccatgcagcttcgcaatatcacaaatgtaaatctctgccaactgtgccaccagaaaactaatattaat 15227970  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||| || ||||||||||| || || || || |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  15227971 cggaataaagtgtgctgacttcgtcaatctatcaacaactacccatatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaacttgttacaaagtccatggat 15228070  T
Q  377 atgctatcccatttcc 392  Q
    ||||||||||||||||    
T  15228071 atgctatcccatttcc 15228086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 9522831 - 9523192
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  9522831 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 9522930  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||| ||  |  ||| |||||||||||||    
T  9522931 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactaagaaataggaaaactgatattaat 9523030  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  9523031 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaattacccaaatcgggtcattccctttaggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggat 9523130  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||| || ||| |||||  |||||||    
T  9523131 atactatcccatttccactctggcacatctaatggtatcatcataccagcaggtttctgatg 9523192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 77 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 16329668 - 16329324
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | |||||||||||  |||| || || ||| | ||||| |    
T  16329668 tccgactaaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaactcttccagaacctagaaatgaacctcg 16329569  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||| | ||||  || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  16329568 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccgggtaactgatattgat 16329469  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| || ||||||||||||| ||  || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||     
T  16329468 aggaatgaagtgtgctgacttcgtcaaccggttgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgtttggtagactcgtcacgaaatccatagag 16329369  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatcc-aacggtgtcaacaa 420  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16329368 atactgtcccacttccactccggtacatcctaacggtgtcaacaa 16329324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 410
Target Start/End: Original strand, 12498360 - 12498693
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  12498360 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 12498459  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  12498460 gatctctatttgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 12498559  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || ||||||||| |||| || || || | |||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  12498560 cggtagaaaatgagccgacttcatcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcattccctctaggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatagat 12498659  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 410  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  12498660 atactatcccatttccattctggcacatctaacg 12498693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16492199 - 16491866
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||    
T  16492199 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacaccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccataatctagaagtaaatcttg 16492100  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  16492099 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 16492000  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||  || ||| | |||||||||||||| ||     
T  16491999 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtatgcggaaaaatcgtcacaaaatccatggat 16491900  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 410  Q
    ||  |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  16491899 atattatcccatttccactctggcacatctaacg 16491866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 10005712 - 10006028
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10005712 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 10005811  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  10005812 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 10005911  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  10005912 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 10006011  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  10006012 atactatcccatttcca 10006028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Original strand, 17489962 - 17490290
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  17489962 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 17490061  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  17490062 gatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatatagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 17490161  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || |  |  ||||| || |  |||| |||  |  ||||||| || ||||| | |||||||||||| ||     
T  17490162 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaataatcacccaaattgcgtcattccctttaagagtattcggcaaactcgacacaaaatccatggat 17490261  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  17490262 atgctatctcatttccactctggcacatc 17490290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 77 - 408
Target Start/End: Original strand, 6600848 - 6601179
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  6600848 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 6600947  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  6600948 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 6601047  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  | ||| || || ||||||||||| || || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  6601048 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcgctccctctcggagtattcggaaaacttgtcacaaaatccatcgat 6601147  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 408  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6601148 atactatcccatttccattccggcacatccaa 6601179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 290 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 11960963 - 11960814
Alignment:
Q  290 gccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatt 389  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  11960963 gccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtgtttggaaaactcgtcacaaaatccatagaaatactgtctcatt 11960864  T
Q  390 tccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11960863 tccactccggtacatccaacggtgtcaacaatcctgcaggcttctgatgt 11960814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 5424948 - 5424632
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  5424948 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 5424849  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  5424848 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaactttacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 5424749  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  5424748 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatcgat 5424649  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  5424648 atactatcccatttcca 5424632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 10906322 - 10906638
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10906322 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 10906421  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  10906422 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 10906521  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  10906522 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 10906621  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  10906622 atactatcccatttcca 10906638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 13252802 - 13253118
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  13252802 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 13252901  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| || |||||    
T  13252902 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatgttaat 13253001  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  13253002 cggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 13253101  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  13253102 atactatcccatttcca 13253118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 16635885 - 16636201
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16635885 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16635984  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16635985 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16636084  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16636085 aggcaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 16636184  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  16636185 atactatcccatttcca 16636201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 43163209 - 43163525
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  43163209 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 43163308  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  43163309 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 43163408  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  43163409 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 43163508  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  43163509 atactatcccatttcca 43163525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 53385036 - 53384705
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  53385036 tccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 53384937  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatat-tctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaa 275  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||| ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||    
T  53384936 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctctg-atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaa 53384838  T
Q  276 tcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccataga 375  Q
    | |  | ||| || || ||||| ||||| || || || | |||||| || | |||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  53384837 taggtaggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcga 53384738  T
Q  376 aatgctatcccatttccactccggtacatccaa 408  Q
     || |||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  53384737 tatactatcccatttccattccgacacatccaa 53384705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 48425559 - 48425875
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  48425559 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 48425658  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  48425659 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 48425758  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  | ||| || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  48425759 aggtaggaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctttaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 48425858  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  48425859 atactatcccatttcca 48425875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14126611 - 14126464
Alignment:
Q  78 ccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgg 177  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  14126611 ccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgaaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 14126512  T
Q  178 gtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 225  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14126511 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14126464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15348263 - 15347947
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15348263 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15348164  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  15348163 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 15348064  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  15348063 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 15347964  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  15347963 atactatcccatttcca 15347947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20062072 - 20061756
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  20062072 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 20061973  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  20061972 gatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 20061873  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  20061872 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 20061773  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  20061772 atactatcccatttcca 20061756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 74 - 405
Target Start/End: Original strand, 16371522 - 16371853
Alignment:
Q  74 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 173  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  16371522 ctttccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 16371621  T
Q  174 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 273  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | || ||| || || || | |||||| || ||  || |||| |||||    
T  16371622 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatttccttaatataaatatctggcaactgggcaacatgaaaactaatatt 16371721  T
Q  274 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 373  Q
    |||||  |  || || || ||||||||||| || || || |  ||||| |||   |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||     
T  16371722 aatcggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcacgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatg 16371821  T
Q  374 gaaatgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  16371822 gatatactatcccatttccactctggcacatc 16371853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12850286 - 12850104
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||  |||| |||||| ||||  | |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||      
T  12850286 tccgactgaccatctgtctacggattataagccgaactcaacctcaactttgaatccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctca 12850187  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctact 259  Q
    | |||||||| ||||| || || || || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12850186 gatctctatccgacacaatgcttgatgggacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctact 12850104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16412297 - 16411984
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||||||||| || || || |||||  ||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  16412297 gactgaccatctgtttgtggttgatactccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 16412198  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||||     
T  16412197 ctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaatcgg 16412098  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 379  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  16412097 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatccatggatata 16411998  T
Q  380 ctatcccatttcca 393  Q
    ||||||||||||||    
T  16411997 ctatcccatttcca 16411984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 14876520 - 14876188
Alignment:
Q  74 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 173  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  14876520 ctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 14876421  T
Q  174 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataact-gatat 272  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||  || || ||||| ||| |||| || || ||| ||||  ||||    
T  14876420 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgatataaatctctgcctactgggcaacaggaaaactaaatat 14876321  T
Q  273 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 372  Q
    ||||||  |  || || |||| ||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || ||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  14876320 taatcggtagaaaatgagccggcttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcattccctctaggagtattctgcaaactcgtcacaaaatccat 14876221  T
Q  373 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
     || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  14876220 ggatatactatcccatttccactctggcacatc 14876188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15589410 - 15589094
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15589410 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15589311  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  15589310 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 15589211  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  15589210 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 15589111  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  15589110 atactatcccatttcca 15589094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 80 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16756600 - 16756272
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  16756600 gactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 16756501  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||| |     
T  16756500 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaatagg 16756401  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 379  Q
     |  || || || ||||||||||| || || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  16756400 tagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatata 16756301  T
Q  380 ctatcccatttccactccggtacatccaa 408  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  16756300 ctatcccatttccattccagcacatccaa 16756272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 372
Target Start/End: Original strand, 15061865 - 15062163
Alignment:
Q  74 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 173  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| |    
T  15061865 ctttccgactgaccatctgtctgcgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactattccaaaatctagaagtaaatc 15061964  T
Q  174 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 273  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | || ||| || || || ||||| || || || ||| |||| |||||    
T  15061965 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatttccttaatataaatatctgccaattgggcaacaggaaaactaatatt 15062064  T
Q  274 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 372  Q
    |||||  |  || || || ||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  15062065 aatcggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 15062163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 393
Target Start/End: Original strand, 15339383 - 15339697
Alignment:
Q  79 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 178  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| |||  |  ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||     
T  15339383 cgactgaccatctgtctgtcgatgatacgccgaactcaatctcagctacgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 15339482  T
Q  179 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 278  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || |   |||| ||||||||||    
T  15339483 tctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagtgaaactaatattaatcg 15339582  T
Q  279 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 378  Q
      |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  15339583 gtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatat 15339682  T
Q  379 gctatcccatttcca 393  Q
     ||||||||||||||    
T  15339683 actatcccatttcca 15339697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 26792414 - 26792101
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  26792414 gactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 26792315  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    ||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| ||||| || || || ||  |||| |||||||| |     
T  26792314 ctctatctgacacaatgctggaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaaatgggcaacggggaaactaatattaattgg 26792215  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 379  Q
     || || || ||| |||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  26792214 tataaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgatata 26792115  T
Q  380 ctatcccatttcca 393  Q
    ||||||||||||||    
T  26792114 ctatcccatttcca 26792101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15402528 - 15402212
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||| |||  || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15402528 tccgactgaccagctgtctatggatgatacgccgaactcaatctcagcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15402429  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  || | ||||||||    
T  15402428 gatctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaagtaatattaat 15402329  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || | ||| |||||||||||||| ||     
T  15402328 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcatactcgtcacaaaatccatggat 15402229  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  15402228 atactatcccatttcca 15402212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16806944 - 16806628
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||  ||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  16806944 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcctcttgctaacttttccaaaacctagaagtaaatcttg 16806845  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  16806844 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 16806745  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||| | || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||     
T  16806744 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacctaaattgtgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaagtccatggat 16806645  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  16806644 atactatcccatttcca 16806628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 405
Target Start/End: Original strand, 15209006 - 15209331
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||| || ||||| |  || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||| ||    |    
T  15209006 gactgaccatctgtctgcggatgatacgccgagctcaacctcaacttagaacctacaacctcttgcaaaatcttccaaaatctagaagtaaatctcatat 15209105  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||   || || || || || ||||||| ||  || ||| |||||||||||||||     
T  15209106 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaataacgtggatataaatttctgccaactaagacacaggaaaactgatattaatcgg 15209205  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 379  Q
    |||||| |  |||||||| ||||| || || || |  | ||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||    
T  15209206 aatgaaataagccgactttgtcaatctatcaacaatcatccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatg 15209305  T
Q  380 ctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15209306 ctatcccatttccactctggtacatc 15209331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15724949 - 15724636
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  15724949 gactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctacaagtaaatcttggat 15724850  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    ||||||||||||| || |  || ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||| ||||||     
T  15724849 ctctatctgacacaatgcctgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaataataatcgg 15724750  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 379  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  15724749 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatata 15724650  T
Q  380 ctatcccatttcca 393  Q
    ||||||||||||||    
T  15724649 ctatcccatttcca 15724636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 303
Target Start/End: Original strand, 16692272 - 16692502
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatct----tgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 172  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  | |||    || |||||| |||||||||| ||||||||     
T  16692272 tccgactgaccatccgtctgtggatgataagctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctctagcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaat 16692371  T
Q  173 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 272  Q
    ||| | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| | ||  || || ||||||||||| || || || ||| |||| ||||    
T  16692372 cttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttgatataaatctccgccaattgggcaacaggaaaactaatat 16692471  T
Q  273 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 303  Q
    ||||||  | ||| || ||||||||||||||    
T  16692472 taatcggtaggaaatgagccgacttcgtcaa 16692502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 405
Target Start/End: Original strand, 15248263 - 15248587
Alignment:
Q  81 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 180  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||    ||    
T  15248263 actgaccatctgtctgctgatgatacgccgagctcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatctcatatc 15248362  T
Q  181 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 280  Q
    ||||||||| || || ||| | ||||| |||||||||||||||||||   | || || || |||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| |    
T  15248363 tctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcggatataaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaatcgga 15248462  T
Q  281 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 380  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || || || |  ||||| ||||  | || |||  | |||||||  || ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  15248463 atgaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgttattccctttaggagtatacggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgc 15248562  T
Q  381 tatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    | ||||||||||||||  |||||||    
T  15248563 tgtcccatttccactctagtacatc 15248587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11564699 - 11564551
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||  ||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  11564699 tccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatttcaacttcgaacccaaagcctcttgctaacttttccaaaatctagaagaaaatcttg 11564600  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 225  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  11564599 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 11564551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 89 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15015762 - 15015573
Alignment:
Q  89 tccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctg 188  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||| | || || |||||  ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  15015762 tccgactgcggatgatatgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttcctaaatctagaagtaaatcttggatctctatctg 15015663  T
Q  189 acactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 278  Q
    | || |||||||||||||| ||||| | | ||| ||| |   |||| || || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  15015662 atacaatactcgacggaacaccatgtagcctcaaaatctcacgaatataaatttccgccaactgagatacaggaaaactgatattaatcg 15015573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11961044 - 11960986
Alignment:
Q  74 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacc 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  11961044 ctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacc 11960986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 14685210 - 14685174
Alignment:
Q  38 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagcggtc 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14685210 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagcggtc 14685174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 383 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 31694887 - 31694831
Alignment:
Q  383 tcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31694887 tcccacttccactccggcacatttaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 31694831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 383 - 439
Target Start/End: Original strand, 31939331 - 31939387
Alignment:
Q  383 tcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  31939331 tcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgaaggcttctgatgt 31939387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 26009000 - 26008961
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactca 116  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26009000 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactca 26008961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8274132 - 8274098
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8274132 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 8274098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13967073 - 13967039
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13967073 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 13967039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 396
Target Start/End: Original strand, 30138213 - 30138247
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30138213 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 30138247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 396
Target Start/End: Original strand, 30147764 - 30147798
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30147764 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 30147798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 16742436 - 16742359
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||  || ||||||||  || |||||||||    
T  16742436 acaaaatccatagaaatgctattccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacctgacggtctctgatgt 16742359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Original strand, 10790579 - 10790615
Alignment:
Q  38 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagcggtc 74  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10790579 ttgatagctgtacacaccataggggcttccagcggtc 10790615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 250
Target Start/End: Original strand, 18748796 - 18748960
Alignment:
Q  86 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 185  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |  |||||  || |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||| || ||   ||    
T  18748796 ccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcctgat 18748895  T
Q  186 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaac 250  Q
    ||||||| ||||| || ||||   |||||||| | ||||| | || |||||||||||| ||||||    
T  18748896 ctgacacaatactagaaggaatatcatgcaacctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaac 18748960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 138 - 438
Target Start/End: Original strand, 468 - 768
Alignment:
Q  138 catcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgta 237  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  468 catcttgtaaactctttcaaaatcttgaagtaaacctcgggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaatattatgaatgta 567  T
Q  238 gatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgcccc 337  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  568 aatctctgccaactgagctactggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgatttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccct 667  T
Q  338 ctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgat 437  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  668 cttggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccatttccactccggtacatccaacggcgtcaacaatcctgcaggcctctgat 767  T
Q  438 g 438  Q
    |    
T  768 g 768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 20975873 - 20975511
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||| || |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  20975873 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcatgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 20975774  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20975773 gatctccatctgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctatcggataactgatattaat 20975674  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  20975673 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtatgtggtaaattcgtcacaaaatccatagaa 20975574  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  20975573 atgctatcccatttccactccggcacatccaacggtgtcaacaacactgcaggcttctgatgt 20975511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 1266797 - 1267158
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  1266797 tccgaccgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcatcttgcaagctcttccataatctagaagtgaacctcg 1266896  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| || |||||||| || ||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1266897 gatctctatccgacacaatgctcgacggtacaccatgcagcttaacaatgttatgaatgtaaatctccgccaactgtgctacaggataactgatattaat 1266996  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1266997 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcgtgtcctctaagagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 1267096  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1267097 atgctatcccatttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 1267158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 77 - 430
Target Start/End: Original strand, 21840976 - 21841329
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||| ||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  21840976 tccgactgaccatttgtttgcagatgatgagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttttaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 21841075  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  21841076 gatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgctaactgagctactggaaaactaatattgat 21841175  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||    
T  21841176 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgaccaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggaa 21841275  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 430  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21841276 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggc 21841329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31416696 - 31416335
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  31416696 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 31416597  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || | ||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31416596 gatccctatccgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaatgttataaacataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 31416497  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31416496 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgctcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 31416397  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31416396 atgctatcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 31416335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 438
Target Start/End: Original strand, 23655489 - 23655847
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |  ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| || |    
T  23655489 gactgaccatctgtctgcggatgataacccgaactcaacctcaactccgaacccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggat 23655588  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |    
T  23655589 ctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgcaacttcacaatattgtgaatataaatctccgccaactaagctaccggataactaatattaatcaa 23655688  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 379  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  23655689 aatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaactacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggaaatg 23655788  T
Q  380 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||| |||||||    
T  23655789 ttgtcccacttccactccggcacatctaacggtgttaataaccctgcaggcttctgatg 23655847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 79 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 22061653 - 22061293
Alignment:
Q  79 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 178  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || | |||  |||| || || ||||| ||||||||     
T  22061653 cgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcagactcttccagaacctagaagtgaaccttgga 22061554  T
Q  179 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 278  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |    
T  22061553 tccctatccgacacaatactcgacggaactccatgtagtttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggatacttgatgttaatag 22061454  T
Q  279 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 378  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| || ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22061453 gaatgaagtgcgccgactttctcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcgtgtcctctcgtagtgtttggtaaactcatcacaaaatccatagaaat 22061354  T
Q  379 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  22061353 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaataaccctgcaggcttctgatgt 22061293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 20388658 - 20389020
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| | ||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  20388658 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttacaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 20388757  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||    
T  20388758 gatctctatctgatacaattatcgacggaacaccatgcaactttacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccactggaaaactaatattgat 20388857  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||     
T  20388858 tggaataaagtgtgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaacttgtcacacaatccatggat 20388957  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  20388958 atgctatcccatttccactccggcacatctaatggtgtcaacaacccagcaggcttctgatgt 20389020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 22371499 - 22371861
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| |    
T  22371499 tccgactcaccatctgtttgcggattataagccgaacccaacctcaactttgaacccaacgcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcg 22371598  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  22371599 gatctctattcgacacaatactcgatggaagcccatgaaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgtcaaatgagctaccggaaaactaatattgat 22371698  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  22371699 cggaataaaatgcgccgacttcgtcaacctatcaacaactacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 22371798  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22371799 atgttgtcccacttccactcaggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 22371861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 19851970 - 19852331
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||  ||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  19851970 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 19852069  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||    
T  19852070 gatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcccaatattatgaatgtaaatttctgccaactgtgctaccggaaaactaatattgat 19852169  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    |||||| || ||  ||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||    
T  19852170 cgaaataaaatgtaccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggcaaactcgtctcaaaatccatggaa 19852269  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  19852270 atgctgtcccacttccactctggcacatcgaacggtgtcaacaaccctgcatgcttctgatg 19852331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 19858006 - 19858367
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||  ||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  19858006 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 19858105  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||    
T  19858106 gatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcccaatattatgaatgtaaatttctgccaactgtgctaccggaaaactaatattgat 19858205  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    |||||| || ||  ||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||    
T  19858206 cgaaataaaatgtaccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggcaaactcgtctcaaaatccatggaa 19858305  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  19858306 atgctgtcccacttccactctggcacatcgaacggtgtcaacaaccctgcatgcttctgatg 19858367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 803895 - 803534
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  803895 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccaaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 803796  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  803795 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactatgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 803696  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||     
T  803695 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccgtagag 803596  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  803595 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 803534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 6679670 - 6680031
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  6679670 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 6679769  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6679770 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 6679869  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  6679870 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 6679969  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  6679970 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcatgcttctgatg 6680031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 77 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 31571064 - 31570712
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  31571064 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 31570965  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| | |||||| || || ||    
T  31570964 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccgaataactaatgttgat 31570865  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31570864 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 31570765  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31570764 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 31570712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16271446 - 16271085
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  16271446 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccataacctagaagtgaacctcg 16271347  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| | |||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16271346 gatccctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcaccacattgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccgggtaactgatattaat 16271247  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  16271246 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 16271147  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  16271146 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccttgcaggcttctgatg 16271085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 22051422 - 22051783
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  22051422 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttggaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 22051521  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  22051522 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatttagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgat 22051621  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| || || |||||||| |||||||| ||  |||||||||| || |||||||| |  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22051622 aggaataaaatgtgccgactttgtcaacctatcacccacaacccaaatagaatcatgtcttctcggagtgtttagtaaacttgtcacaaaatccatagaa 22051721  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  22051722 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggcgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 22051783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 6604217 - 6604578
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  6604217 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 6604316  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  6604317 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattgat 6604416  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  6604417 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 6604516  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  6604517 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcatgcttctgatg 6604578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 27355107 - 27355468
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  27355107 tccgactgaccatccgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 27355206  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||    
T  27355207 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccacactatgaatgtaaatctctgccaactgttctaccggataactgatattgat 27355306  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| | |||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||||||     
T  27355307 gggaatgaagtgtgtcgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaattcgtcacaaaatccatagag 27355406  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  27355407 atactgtcccacttccactccagtacatctaacggtgtcaaaaaccctgcaggcttctgatg 27355468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 29303648 - 29303286
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  29303648 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 29303549  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| || | ||  || ||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  29303548 gatccctatccgacacaatactcgaaggaaccccatgtagcttcacaatgttataaacataaatctctgccaattgtgctaccgaataactgatattaat 29303449  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||||||| |||| ||| || |||||| | ||||| |||||||||||     
T  29303448 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcgaagtgtttggtaaattcgtcacgaaatccatagag 29303349  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  29303348 atactatcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 29303286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 74 - 438
Target Start/End: Original strand, 14565698 - 14566062
Alignment:
Q  74 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 173  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||    
T  14565698 ctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 14565797  T
Q  174 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 273  Q
    | || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14565798 tcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatatt 14565897  T
Q  274 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 373  Q
    ||| | |||||| || ||||||||||||||||  || || || ||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  14565898 aataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaactacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccata 14565997  T
Q  374 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14565998 gagatactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 14566062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 12305317 - 12305678
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    || ||||||||  |||| ||  | ||||| ||||| |    
T  12305317 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgtgtcctgtaaactcttccagaacatagaagtgaacctcg 12305416  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12305417 gatccctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattaat 12305516  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || ||||| || || |  |||| ||| |||||||| || |||||  | ||||| |||||||||||     
T  12305517 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaactcaaatagtgtcataccctctcggagtgttcggtaaggtcgtcacgaaatccatagag 12305616  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12305617 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 12305678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20396351 - 20395986
Alignment:
Q  73 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||   ||  || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  20396351 tctttccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaaccacagcttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 20396252  T
Q  173 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 272  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||| | | || ||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  20396251 cttggatctctatctgacacaatgctcggcaggacaccatgcaacttcacaatctggcgaatgtaaatctccgccaactgagatagaggaaaactgatat 20396152  T
Q  273 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 372  Q
    ||| || |||||| || || |||||||| || || || || |  ||||| || |   ||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  20396151 taaccggaatgaaatgagctgacttcgttaatctatccacaatcacccaaatagcggcatgccctcttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 20396052  T
Q  373 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
     || || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  20396051 ggatatactatcccattttcactctggcacatctaacggtgtcaacaacccagcaggtttctgatg 20395986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22377680 - 22377315
Alignment:
Q  73 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  22377680 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 22377581  T
Q  173 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 272  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   ||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  22377580 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcacgaatgtaaatttccgccaactgagatacaggaaaactgatat 22377481  T
Q  273 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 372  Q
    |||||  |||  | || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | | ||||||  | ||||| |||||||||| |||    
T  22377480 taatcagaatagaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttagaagtattcagcaaactcgtcacaaaattcat 22377381  T
Q  373 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
     || ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  22377380 ggatatgctatcccattcccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 22377315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22383855 - 22383490
Alignment:
Q  73 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  22383855 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 22383756  T
Q  173 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 272  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   ||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  22383755 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcacgaatgtaaatttccgccaactgagatacaggaaaactgatat 22383656  T
Q  273 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 372  Q
    |||||  |||  | || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | | ||||||  | ||||| |||||||||| |||    
T  22383655 taatcagaatagaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttagaagtattcagcaaactcgtcacaaaattcat 22383556  T
Q  373 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
     || ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  22383555 ggatatgctatcccattcccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 22383490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 395
Target Start/End: Original strand, 23949476 - 23949796
Alignment:
Q  75 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 174  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || || | ||| | |||  |||||||||| |||||||||||    
T  23949476 tttccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaacctattgcatactcttccaaaatctagaagtaaacct 23949575  T
Q  175 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 274  Q
     || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | ||||||| |||   | ||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||    
T  23949576 cggatctctatctgatacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacagtatcgcggatgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatgtta 23949675  T
Q  275 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 374  Q
    |||| |||||| || ||| |||||||||| || ||||| |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  23949676 atcggaatgaaatgagccaacttcgtcaatctatctacaatcacccaaatagcgtcattccctcttggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatgg 23949775  T
Q  375 aaatgctatcccatttccact 395  Q
    | ||  |||||||||||||||    
T  23949776 atatattatcccatttccact 23949796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 19113249 - 19113565
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19113249 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 19113348  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  | || ||||||||    
T  19113349 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaagctaatattaat 19113448  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  19113449 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 19113548  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  19113549 atactatcccatttcca 19113565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 77 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16408267 - 16407949
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  16408267 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctataagtaaatcttg 16408168  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||| |||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||| ||    
T  16408167 ggtctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttc-caatctccttaatataaatctctgccaactgggccacaggaaaactaatatttat 16408069  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || |  | |||||| || |  | || ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16408068 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaattataacccaaattgcgtaattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16407969  T
Q  377 atgctatcccatttccactc 396  Q
    || |||||||||||||||||    
T  16407968 atactatcccatttccactc 16407949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 77 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 21394087 - 21393769
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21394087 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctggaagtaaatcttg 21393988  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||  ||||  || ||| || | ||||||||    
T  21393987 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatataaatctctgccagttgagaaacaggaaaattaatattaat 21393888  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  21393887 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21393788  T
Q  377 atgctatcccatttccact 395  Q
    || ||||||||||||||||    
T  21393787 atactatcccatttccact 21393769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 77 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 21788581 - 21788263
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21788581 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctggaagtaaatcttg 21788482  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||  ||||  || ||| || | ||||||||    
T  21788481 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatataaatctctgccagttgagaaacaggaaaattaatattaat 21788382  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  21788381 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21788282  T
Q  377 atgctatcccatttccact 395  Q
    || ||||||||||||||||    
T  21788281 atactatcccatttccact 21788263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 77 - 410
Target Start/End: Original strand, 21251500 - 21251833
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| |||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21251500 tccgactgactatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21251599  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||| ||||  || ||| |||| ||||||||    
T  21251600 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacaaatgtaaatctccgccaattgagaaacaggaaaactaatattaat 21251699  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  21251700 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21251799  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 410  Q
    || | |||||||||||| || || ||||| ||||    
T  21251800 atacgatcccatttccaatctggcacatctaacg 21251833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 32600703 - 32601019
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  32600703 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttg 32600802  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  32600803 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 32600902  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  32600903 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 32601002  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||| ||||||||    
T  32601003 atactatctcatttcca 32601019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20010122 - 20009780
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||   | || |||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||      
T  20010122 tccgaatgaccatctgcctgcggatgataagccgaactcacccttaactttgaacccaaggcatcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctga 20010023  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
      | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |                
T  20010022 aatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgggctaccggaaa------------ 20009935  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
           || |||| ||| ||||||||||  || || |||||||| || | ||||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||    
T  20009934 -------aaatgcgtcgaattcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcattccctcttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggaa 20009842  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20009841 atgttgtcccacttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20009780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 21921955 - 21921630
Alignment:
Q  79 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 178  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||     
T  21921955 cgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 21921856  T
Q  179 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 278  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||  || ||| |||||||||||||||    
T  21921855 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctcttccaattgagaaacaggaaaactgatattaatcg 21921756  T
Q  279 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 378  Q
     ||  || || |||||||||| ||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||   | ||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  21921755 gaagaaaatgagccgacttcgacaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccgtttaggagt-ttcggcaaactcgtcacaaaatccatggatat 21921657  T
Q  379 gctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
      |||||||||||||||| || |||||    
T  21921656 attatcccatttccactctggcacatc 21921630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 17674245 - 17673929
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  17674245 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 17674146  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||   | || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  17674145 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttggtataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 17674046  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  17674045 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 17673946  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  17673945 atactatcccatttcca 17673929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 18857136 - 18857452
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  18857136 tccgactgaccatctgtctgcgggtgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 18857235  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| || |||||    
T  18857236 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatgttaat 18857335  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  18857336 aggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggat 18857435  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  18857436 atactatcccatttcca 18857452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 21166759 - 21166432
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21166759 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21166660  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | || ||| || ||||| || ||||  || || ||| |||||||||||||    
T  21166659 gatctctatctgata-aatgctcgaaggaacaccatgcaactttacaatctccttaatataaatctctgctaactaggcaacaggaaaactgatattaat 21166561  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  21166560 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21166461  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    ||  ||||||| |||||||| || |||||    
T  21166460 atattatcccacttccactctggcacatc 21166432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 81 - 405
Target Start/End: Original strand, 22040422 - 22040746
Alignment:
Q  81 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 180  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||| ||    
T  22040422 actgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatgttggatc 22040521  T
Q  181 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 280  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||| ||| || || ||| |||| ||||||||||      
T  22040522 tctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccagctgggcaacaggaaaactaatattaatcggt 22040621  T
Q  281 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 380  Q
    |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  22040622 agaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatac 22040721  T
Q  381 tatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||    
T  22040722 tatcccatttccattccggcacatc 22040746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 81 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 30313362 - 30313050
Alignment:
Q  81 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 180  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  30313362 actgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 30313263  T
Q  181 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 280  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || |||||| ||||||| || || ||| |||| ||||||||||      
T  30313262 tctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctccaccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggt 30313163  T
Q  281 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 380  Q
    |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  30313162 agaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatac 30313063  T
Q  381 tatcccatttcca 393  Q
    |||||||||||||    
T  30313062 tatcccatttcca 30313050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Original strand, 23650600 - 23650928
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23650600 tccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 23650699  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||| ||||  ||  || || | ||||||||    
T  23650700 gatctctatctgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaaatgagaaacaagaaaaataatattaat 23650799  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    |  ||  || || ||||| |||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||   ||     
T  23650800 cagaagaaaatgagccgaattcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatcctgggat 23650899  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  23650900 atactatcccatttccactctggcacatc 23650928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Original strand, 19978526 - 19978854
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||  | || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  19978526 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgagctcaatctcaacttagaacccaaagcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 19978625  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||| ||  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  || || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||    
T  19978626 gatctctatttgttacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttcattgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaat 19978725  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || ||    ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||| ||     
T  19978726 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacagtcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcatcacaaaatccatggat 19978825  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  19978826 atactatcccatttccactctggcacatc 19978854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 225
Target Start/End: Original strand, 22046932 - 22047080
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  22046932 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 22047031  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 225  Q
    | ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  22047032 gatctctatctgatatgatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaat 22047080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 222
Target Start/End: Original strand, 15533943 - 15534084
Alignment:
Q  81 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 180  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15533943 actgaccatctttctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 15534042  T
Q  181 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 222  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  15534043 tctatctgatacaatactcgaaggaacaccatgtaacctcac 15534084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22164411 - 22164098
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  22164411 gactgaccatatgtctgcggatgacacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 22164312  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    |||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||  | || || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||     
T  22164311 ctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatcttacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcgg 22164212  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 379  Q
     | ||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  22164211 taggaattgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggatata 22164112  T
Q  380 ctatcccatttcca 393  Q
    ||||||||||||||    
T  22164111 ctatcccatttcca 22164098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22120392 - 22120080
Alignment:
Q  81 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 180  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  22120392 actgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatc 22120293  T
Q  181 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 280  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  | || ||||||||||      
T  22120292 tctatctgacacaatgctcgaaggaataccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaagctaatattaatcggt 22120193  T
Q  281 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 380  Q
    |  || || |||||||| ||||| || || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  22120192 agaaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatac 22120093  T
Q  381 tatcccatttcca 393  Q
    | |||||||||||    
T  22120092 tgtcccatttcca 22120080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22133263 - 22132947
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22133263 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22133164  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||  | || || | ||  || || |||||   |||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  22133163 gatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatcttacgatctccttgatataaatctctttcaactgggcaacaggaaaactaatattaat 22133064  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  | ||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||| ||     
T  22133063 cggtaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgtgtcgttccctctaggagtattcggaaaactcatcacaaaatccatggat 22132964  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  22132963 atactatcccatttcca 22132947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 396
Target Start/End: Original strand, 22987757 - 22988074
Alignment:
Q  74 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 173  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| || ||||| ||  | ||||  |||||  ||||||||||     |||| |    
T  22987757 ctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgcaacctcaacttagaacctaaagcctcttacaaactcttccaaaatct-----taaatc 22987851  T
Q  174 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 273  Q
    | |  ||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || || |||||||||||||  || ||| ||||||||||    
T  22987852 tcgaatctctatctcatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcgaatataaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatatt 22987951  T
Q  274 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 373  Q
    |||||  || || ||  ||||||| ||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||     
T  22987952 aatcggtataaaatgatccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatg 22988051  T
Q  374 gaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    || ||| ||||||||||| ||||    
T  22988052 gatatgttatcccatttctactc 22988074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20017972 - 20017865
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  20017972 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 20017873  T
Q  177 ggtctcta 184  Q
    | ||||||    
T  20017872 gatctcta 20017865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19485092 - 19484980
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19485092 tccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 19484993  T
Q  177 ggtctctatctga 189  Q
    | |||||||||||    
T  19484992 gatctctatctga 19484980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22248357 - 22248278
Alignment:
Q  359 gtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||||||  |||||||    
T  22248357 gtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtacatctaaaggtgttatcaaccctgcaggtttctgatg 22248278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 222
Target Start/End: Original strand, 19863684 - 19863760
Alignment:
Q  146 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 222  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19863684 aaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 19863760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 222
Target Start/End: Original strand, 19868321 - 19868397
Alignment:
Q  146 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 222  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19868321 aaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 19868397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 21850274 - 21850241
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccact 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850274 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccact 21850241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 405
Target Start/End: Original strand, 21043268 - 21043332
Alignment:
Q  341 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  21043268 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 21043332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22129132 - 22129017
Alignment:
Q  107 gccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaa 206  Q
    |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  22129132 gccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaa 22129033  T
Q  207 ccccatgcaacttcac 222  Q
      ||||||||| ||||    
T  22129032 taccatgcaacctcac 22129017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16877032 - 16876998
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16877032 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 16876998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 74
Target Start/End: Original strand, 1733390 - 1733422
Alignment:
Q  42 tagccgtacacaccatatgggcttccagcggtc 74  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1733390 tagctgtacacaccatatgggcttccagcggtc 1733422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 19484022 - 19483970
Alignment:
Q  341 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 393  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  19484022 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 19483970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 33459 - 33097
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  33459 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 33360  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  33359 gatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 33260  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33259 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 33160  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  33159 atactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggtttctgatgt 33097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 239 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 56520 - 56320
Alignment:
Q  239 atctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccc 338  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| |    
T  56520 atctccgccaactgtgctaccggataactaatattaataggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcataccctc 56421  T
Q  339 tcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||| ||| || |||||||||| | | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  56420 tcgaagtgtttggtaaacttggctccaaatccatagaaatgctatctcacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 56321  T
Q  439 t 439  Q
    |    
T  56320 t 56320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 396
Target Start/End: Original strand, 41067 - 41101
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41067 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 41101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 50296 - 49934
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  50296 tccgactgaccatccgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttggaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 50197  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  50196 gatctctatttgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 50097  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50096 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattatgtaaacttgtcacaaaatccatagaa 49997  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  49996 atactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 49934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 43678 - 43994
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  43678 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 43777  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  43778 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 43877  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || ||||||||||||||||| || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  43878 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctgggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 43977  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  43978 atactatcccatttcca 43994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 8998 - 9314
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8998 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 9097  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || |  ||  |||| ||||||||    
T  9098 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaatagggaaactaatattaat 9197  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || ||||| |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  9198 cggtagaaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 9297  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  9298 atactatcccatttcca 9314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 225
Target Start/End: Original strand, 15460 - 15608
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || || |||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15460 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgatcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15559  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 225  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15560 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 15608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 7020 - 6658
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||   |||| || ||||||||  | ||||| |||||  | || ||||| ||||| ||||| |    
T  7020 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactctttcagaatctagaagtgaacctcg 6921  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6920 gatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatgtagatttccgccaactgagctaccggataactgatattaat 6821  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6820 cagaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 6721  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6720 atgctatcccacttccactccggtacatccagcggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 6658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 51962 - 51600
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  51962 tccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 51863  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  51862 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattctgaatatatatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 51763  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  51762 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 51663  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  51662 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 51600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 60996 - 60634
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  60996 tccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 60897  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  60896 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattctgaatatatatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 60797  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  60796 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 60697  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  60696 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 60634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 67384 - 67022
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  67384 tccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 67285  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  67284 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattctgaatatatatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 67185  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  67184 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 67085  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  67084 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 67022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 118092 - 118454
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  118092 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 118191  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  118192 gatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgcgctaccggataactgatattaat 118291  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  118292 cggaataaagtgcgccgacttcatcaacatgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 118391  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||   |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  118392 ataaaatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 118454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 77 - 427
Target Start/End: Original strand, 323228 - 323578
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||   |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  323228 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccaaactcagcctcaacttcgaacccaaggcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 323327  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  323328 gatccctatccgacaaaatactcgacggtacaccatgcaacttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 323427  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  323428 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacttgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 323527  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgca 427  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  323528 atgttatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgca 323578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 203250 - 202888
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  203250 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctacaagtaaatcttg 203151  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||   |||| || || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||    
T  203150 gatctctatttgacacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaatatcacgaatataaatttctgccaactgagccactggaaaactaatattgat 203051  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  203050 tggaataaagtgtgccgacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatggtatcatgccctctcggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggat 202951  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||||    
T  202950 atgctatcctatttccactccggcacatctaacgatgtcaacaacccagcaggcttctgatgt 202888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 77 - 278
Target Start/End: Original strand, 386343 - 386544
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  386343 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 386442  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  386443 gatctctatccgacacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatgtaattctccgctaactgagctaccggaaaactaatattgat 386542  T
Q  277 cg 278  Q
    ||    
T  386543 cg 386544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 303
Target Start/End: Original strand, 112542 - 112771
Alignment:
Q  74 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 173  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  112542 cttttcgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacttcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacc 112641  T
Q  174 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 273  Q
    |  | ||||||||||| || || || | |||||| ||||| | |||||||||||  || ||||| || ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  112642 tcagatctctatctgatacaatgcttggcggaacaccatgtagcttcacaatatcgtggatgtaaatatccgccaactgagatataggaaaactgatatt 112741  T
Q  274 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 303  Q
    ||||| |||||| || ||| ||||||||||    
T  112742 aatcggaatgaaatgagcccacttcgtcaa 112771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 27365398 - 27365036
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  27365398 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 27365299  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | || || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  27365298 gatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccggatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 27365199  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27365198 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 27365099  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27365098 atactatcccatttccactccggtatatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 27365036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 19652371 - 19652009
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  19652371 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 19652272  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||  |||| ||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19652271 gatccttatccgacacaatactcgacggtactccatataacttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 19652172  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19652171 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtctacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtatacttgtcactaaatccatagaa 19652072  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19652071 atactgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatgt 19652009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 24641866 - 24642227
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  24641866 tccgactaaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaagtcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 24641965  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    |  ||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24641966 gacctctatccgacataatactcgacggtacaccatgtaacttcacaatattgtgaatatgaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 24642065  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24642066 tggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 24642165  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  24642166 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgccaacaaccctgcaggcttctgatg 24642227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 230 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 27210338 - 27210130
Alignment:
Q  230 tgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaat 329  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27210338 tgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatagaat 27210239  T
Q  330 catgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27210238 catgccccctcggagtattaggtaaacttatcacaaaatccatataaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaatcctgcagg 27210139  T
Q  430 cctctgatg 438  Q
    |||||||||    
T  27210138 cctctgatg 27210130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 23276900 - 23277262
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || || ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  23276900 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 23276999  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
      || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23277000 aatcactatccgacacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgcgctaccggataactgatattaat 23277099  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| || |||||| | ||||||||||||||||||    
T  23277100 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctcttggagtgttcggtaaaatcgtcacaaaatccatagaa 23277199  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23277200 atgctatcccacttccattccggcacatctaacagtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 23277262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 24948713 - 24949075
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||  | ||| ||||  ||||||| |||||  |||| |||||  |||| ||||| |    
T  24948713 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacatcgaaaccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcg 24948812  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || |||||||| || ||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24948813 gatccctatctgatacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 24948912  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24948913 cggaataaagtgcgccaacttcatcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 24949012  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  24949013 atcctatcccatttcaactccggcacatccaacgatatcaacaaccctgcaggcttctgatgt 24949075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 77 - 429
Target Start/End: Original strand, 12574477 - 12574829
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  12574477 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 12574576  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  12574577 gatctctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 12574676  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12574677 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccactacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 12574776  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12574777 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 12574829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 1063875 - 1064236
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  1063875 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaatttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 1063974  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  1063975 gatctctatccgacacaatactagacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattgat 1064074  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  1064075 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 1064174  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1064175 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 1064236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 20828383 - 20828744
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  20828383 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 20828482  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20828483 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 20828582  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  20828583 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 20828682  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20828683 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20828744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 20833109 - 20833470
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  20833109 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 20833208  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20833209 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 20833308  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  20833309 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 20833408  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20833409 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20833470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 77 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 21125476 - 21125130
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  21125476 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 21125377  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  21125376 gatctctatctgacacaatactcgatggaaccccatgtaacttcacgat--tatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 21125279  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||| || | | |||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  21125278 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgaaaacaacccaaatggcaccatgtcctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 21125179  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctg 425  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  21125178 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctg 21125130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 77 - 429
Target Start/End: Original strand, 27787865 - 27788217
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  27787865 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 27787964  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  27787965 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 27788064  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27788065 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacgacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 27788164  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27788165 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 27788217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 31830782 - 31831143
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  31830782 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 31830881  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |  ||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  31830882 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgcgctaccgggtaactgatattaat 31830981  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||     
T  31830982 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggag 31831081  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31831082 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 31831143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 77 - 309
Target Start/End: Original strand, 23294082 - 23294314
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  23294082 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaagctcttccagaatctagaagtgaacctcg 23294181  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23294182 gatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgattttaat 23294281  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtc 309  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23294282 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtc 23294314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 125 - 439
Target Start/End: Original strand, 23110907 - 23111221
Alignment:
Q  125 tttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaa 224  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23110907 tttgaacccaatgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacacaatgcaacttcacaa 23111006  T
Q  225 tattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatat 324  Q
    |||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||  || || |||||  |||||||||| || || || || ||||| ||    
T  23111007 tatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaatcgggataaaatgcgctaacttcgtcaatctatcgacaactacccaaat 23111106  T
Q  325 cgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacct 424  Q
     | ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||     
T  23111107 agcatcatgccctcttggagtattgggtaaacttgttacaaaatccatggatatgttatcccatttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccca 23111206  T
Q  425 gcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||| ||||||||    
T  23111207 gcaggcttctgatgt 23111221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 11358193 - 11357832
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  11358193 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 11358094  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |  || || | | |  |||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  11358093 gatccctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagttttaccacactgcgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataattgatattaat 11357994  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  11357993 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 11357894  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  11357893 atactatcccacttccactccggtacatctaacggtgccaacaaccctgcaggcttctgatg 11357832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Original strand, 24675613 - 24675941
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  24675613 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 24675712  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||| ||| || || |||||  |||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||  || || ||| |||||||||||||    
T  24675713 gatctctatatgatacaatgctcgaaagaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactaggcaacaggaaaactgatattaat 24675812  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  24675813 cggtagaaaatgggccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 24675912  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||    
T  24675913 atgctattccatttccactctggcacatc 24675941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Original strand, 27371396 - 27371709
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  27371396 gactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 27371495  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| |||||||| |     
T  27371496 ctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaatagg 27371595  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 379  Q
     |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  27371596 tagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatata 27371695  T
Q  380 ctatcccatttcca 393  Q
    ||||||||||||||    
T  27371696 ctatcccatttcca 27371709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 9610260 - 9610576
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  9610260 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 9610359  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  9610360 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 9610459  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  9610460 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 9610559  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  9610560 atactatcccatttcca 9610576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 21325585 - 21325257
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21325585 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccggactcaatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21325486  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  21325485 gatctctatctgatataatgctcgacagaacaccatgcaacttcacaatttccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 21325386  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| ||||| || |  ||||| |||   ||||  || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||     
T  21325385 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctgtcaacaatcacccaaatctcgtcatatcctctaggagtattcggaaaactcgtcacgaaatccatggat 21325286  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  21325285 atactatcccatttccactctggcacatc 21325257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 27218140 - 27218456
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27218140 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27218239  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27218240 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27218339  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27218340 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27218439  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  27218440 atactatcccatttcca 27218456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 16923013 - 16923329
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16923013 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16923112  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16923113 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16923212  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16923213 aggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16923312  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  16923313 atactatcccatttcca 16923329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 16982276 - 16982592
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16982276 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16982375  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16982376 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16982475  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16982476 aggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16982575  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  16982576 atactatcccatttcca 16982592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 17063841 - 17064157
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  17063841 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 17063940  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  17063941 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 17064040  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  17064041 aggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 17064140  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  17064141 atactatcccatttcca 17064157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 17067499 - 17067815
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  17067499 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 17067598  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  17067599 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 17067698  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  17067699 aggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 17067798  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  17067799 atactatcccatttcca 17067815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22325175 - 22324859
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22325175 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22325076  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || |  ||  |||| ||||||||    
T  22325075 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaatagggaaactaatattaat 22324976  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22324975 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22324876  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  22324875 atactatcccatttcca 22324859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24707801 - 24707485
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  ||||||||||  ||||||| ||||    
T  24707801 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtaaatcttg 24707702  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  24707701 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatttccttaatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 24707602  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| ||||| || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  24707601 cgctagaaaatgagccgacttcgtcaatctgtcaacgattacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 24707502  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  24707501 atactatcccatttcca 24707485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 140 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 23107986 - 23107721
Alignment:
Q  140 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 239  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||    
T  23107986 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaga 23107887  T
Q  240 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 339  Q
    |||| ||||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  ||||  ||  |    
T  23107886 tctcggccaactgaggaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcatttccttt 23107787  T
Q  340 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  23107786 aggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 23107721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Original strand, 24262497 - 24262810
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  24262497 gactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 24262596  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||||     
T  24262597 ctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaatcgg 24262696  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 379  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  24262697 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatata 24262796  T
Q  380 ctatcccatttcca 393  Q
    ||||||||||||||    
T  24262797 ctatcccatttcca 24262810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 10868974 - 10869290
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10868974 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 10869073  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  10869074 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 10869173  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| ||||  ||   ||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||     
T  10869174 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaatcgcgtcgctccctctcggagtactcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 10869273  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  10869274 atactatcccatttcca 10869290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 16925484 - 16925800
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16925484 tccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16925583  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16925584 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16925683  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |      
T  16925684 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgtt 16925783  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  16925784 atactatcccatttcca 16925800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 16999124 - 16999440
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16999124 tccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16999223  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16999224 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16999323  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |      
T  16999324 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgtt 16999423  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  16999424 atactatcccatttcca 16999440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22756784 - 22756456
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| || ||||| ||||    
T  22756784 tccgactgaccatctgtctgtgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgaaaactcttccaaaatctagaggtaaatcttg 22756685  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||    
T  22756684 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaat 22756585  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||| ||||| || || |  |  |||||  |||  |||| ||| || |||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||     
T  22756584 cggtagaaaatgagccgactttgtcaatctatcaaaaatcacccaagtcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcgcaaaatccatggat 22756485  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  22756484 atactatcccatttccactctggcacatc 22756456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 303
Target Start/End: Original strand, 23064201 - 23064427
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23064201 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaacttg 23064300  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||   |||| || ||||| ||||| ||||  || ||| |||| ||||||||    
T  23064301 gatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcactatatctcgaatataaatctctgccaattgagaaacaggaaaactaatattaat 23064400  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 303  Q
    || ||  || || ||||||||||||||    
T  23064401 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaa 23064427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21145357 - 21145044
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  21145357 gactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 21145258  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||| || || |||||||  || || ||  |||| ||||| ||||     
T  21145257 ctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatttctgccaacttggcaacagggaaactaatattgatcgg 21145158  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 379  Q
     |  || || ||||| |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||     
T  21145157 tagaaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacgaaatccatcgatata 21145058  T
Q  380 ctatcccatttcca 393  Q
    ||||||||||||||    
T  21145057 ctatcccatttcca 21145044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 41608704 - 41608391
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  41608704 tccgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 41608605  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||   ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  41608604 gatctctgtctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatccccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 41608505  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  41608504 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 41608405  T
Q  377 atgctatcccattt 390  Q
    || |||||||||||    
T  41608404 atactatcccattt 41608391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24877068 - 24876752
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||| | |||||||| ||||    
T  24877068 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatgtagaagtaaatcttg 24876969  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  24876968 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 24876869  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  | ||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||     
T  24876868 cggtaggaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaacaacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacgaaatccatcgat 24876769  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  24876768 atactatcccatttcca 24876752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 333 - 439
Target Start/End: Original strand, 23294315 - 23294421
Alignment:
Q  333 gccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcct 432  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  23294315 gccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccactttcactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggctt 23294414  T
Q  433 ctgatgt 439  Q
    |||||||    
T  23294415 ctgatgt 23294421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 225
Target Start/End: Original strand, 24710157 - 24710305
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  24710157 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 24710256  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 225  Q
    | |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||    
T  24710257 gatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 24710305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44385888 - 44385740
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  44385888 tccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 44385789  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 225  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  44385788 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 44385740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20442830 - 20442684
Alignment:
Q  79 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 178  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||     
T  20442830 cgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 20442731  T
Q  179 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 225  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  20442730 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacatcacaat 20442684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 225
Target Start/End: Original strand, 23189131 - 23189279
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23189131 tccgactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 23189230  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 225  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  23189231 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaat 23189279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 439
Target Start/End: Original strand, 45529644 - 45529997
Alignment:
Q  86 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 185  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||| | || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  45529644 ccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctat 45529743  T
Q  186 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaa 285  Q
    |||| || |||||||| | ||| ||||| | ||||||||| |   | || || |||||   ||||||||  || ||| ||||||| |||||   ||| ||    
T  45529744 ctgatacaatactcgatgcaacaccatgtagcttcacaatctctcggatataaatctctatcaactgagacacaggaaaactgatgttaattagaataaa 45529843  T
Q  286 gtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcc 385  Q
     || |||||||||||||  || || || |  ||||| |||| |||||| ||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  45529844 atgagccgacttcgtcagtctatccacaattacccaaatcgcatcatgtccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggacatactatcc 45529943  T
Q  386 catttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || ||||||||  | ||||| || ||||||||||| || |||||  ||||||||    
T  45529944 cacttccactctagaacatctaaaggtgtcaacaacccagcaggtttctgatgt 45529997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 30211236 - 30211037
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||| || ||||||||| | || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  30211236 tccgtctgtccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 30211137  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| |   | || || |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  30211136 gatccctatctgatacaatactcgatggaacaccatgtagcttcacaatctcacggatataaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatgttaat 30211037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24819865 - 24819644
Alignment:
Q  217 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 316  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||  | |  || |      
T  24819865 cttcacaatatcgcggatgtaaatctccgcccactgagatataggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgagttcgtcaatatatgaacaatc 24819766  T
Q  317 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 416  Q
    ||||  || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  24819765 accccaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggcacatctaaaggtgtca 24819666  T
Q  417 acaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
     ||| ||||||||  |||||||    
T  24819665 tcaaccctgcaggtttctgatg 24819644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24825605 - 24825472
Alignment:
Q  73 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 172  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  24825605 tctttccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 24825506  T
Q  173 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaa 206  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  24825505 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 24825472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 21890875 - 21890709
Alignment:
Q  239 atctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccc 338  Q
    ||||| ||||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| |||| ||||| |||      
T  21890875 atctctgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcatcattccctt 21890776  T
Q  339 tcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    | ||| |||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||| || |||||    
T  21890775 taggattattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccttttccactctggcacatc 21890709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 393
Target Start/End: Original strand, 22276687 - 22276718
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22276687 acaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 22276718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 393
Target Start/End: Original strand, 24710415 - 24710474
Alignment:
Q  334 ccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 393  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  24710415 ccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 24710474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 44385627 - 44385572
Alignment:
Q  338 ctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 393  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  44385627 ctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 44385572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 12640267 - 12640234
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccact 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12640267 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccact 12640234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 251
Target Start/End: Original strand, 25128792 - 25128945
Alignment:
Q  98 ggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatac 197  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| || |  |||||  ||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||| || || | ||||||||| ||||    
T  25128792 ggatgataagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatac 25128891  T
Q  198 tcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 251  Q
    | || ||||  ||||||||| | ||||| |  | |||||||||| | |||||||    
T  25128892 tagaaggaataccatgcaacctaacaatctgttcaatgtagatcccagccaact 25128945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 79 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 14286140 - 14285780
Alignment:
Q  79 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 178  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| || ||  ||| |||||| || || ||||| ||     
T  14286140 cgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaaagcatcttgcaagctcttccgaaatctagatgtgaacctcgga 14286041  T
Q  179 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 278  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  14286040 tctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatgtagatctccgctaactgtgctaccggataactgatgttaatcg 14285941  T
Q  279 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 378  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14285940 gaatgaagtgcgtcgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgttacaaaatccatagaaat 14285841  T
Q  379 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
     || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14285840 actgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 14285780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 80 - 439
Target Start/End: Original strand, 13666023 - 13666382
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  13666023 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaagctcttccagaatctagaagtgaacctcggat 13666122  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||  || ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  13666123 ccctatccgacacaatactcgacgatacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccaccaactgagctaccggataactgatattgatcgg 13666222  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 379  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13666223 aataaagtgcgccgactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaaatg 13666322  T
Q  380 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13666323 ctatcccacttccactccggcacatccatcggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 13666382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 6413994 - 6414356
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||      
T  6413994 tccgactgaccttctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctca 6414093  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  6414094 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctctgctaactgagctatcggataactgatattgat 6414193  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6414194 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 6414293  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6414294 atactatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 6414356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 13021840 - 13022201
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||| |||| || || || || ||||| |    
T  13021840 tccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaacttttccagaacctagaggtgaacctcg 13021939  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || |||||||| || ||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13021940 gatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatgctatgaacataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 13022039  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | |||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  13022040 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgccccctcggagtgtttggttaactcgtcacgaaatccatagaa 13022139  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  13022140 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 13022201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 19147694 - 19148055
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||  |||  || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||      
T  19147694 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctca 19147793  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  19147794 gatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 19147893  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  19147894 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcataccctctaggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 19147993  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  19147994 atgctatcccacttccattctggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 19148055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 20747093 - 20747454
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||  |||  || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||      
T  20747093 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctca 20747192  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  20747193 gatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 20747292  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  20747293 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcataccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 20747392  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20747393 atgctatcccacttccattctggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20747454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15102369 - 15102008
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  15102369 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 15102270  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| ||| |||| || |  ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15102269 gatctctatccgacacaatattcgatggtaaaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgat 15102170  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || | ||||||||  |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15102169 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaatctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccgtctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 15102070  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15102069 atgttgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 15102008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 74 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 11306032 - 11305668
Alignment:
Q  74 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 173  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||||||||| ||||| ||||    
T  11306032 ctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccaaaatctagaagtgaacc 11305933  T
Q  174 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 273  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11305932 tcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatatt 11305833  T
Q  274 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 373  Q
    ||| | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  11305832 aataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccata 11305733  T
Q  374 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11305732 gagatactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 11305668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 77 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18053719 - 18053367
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  18053719 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 18053620  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  18053619 gatccctatctgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 18053520  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||    
T  18053519 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaattcgtcacaaaatccatagaa 18053420  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18053419 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 18053367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 14130356 - 14130718
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  14130356 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 14130455  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  14130456 gatccctatccgacacaatacttgaaggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgat 14130555  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14130556 aggaataaaatgtgccgactttgtcaacctatcaaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 14130655  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14130656 atgctatcccatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 14130718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 23505636 - 23505274
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  23505636 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 23505537  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||| | |||||| | | | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  23505536 gatccctatccgacacaatacacgaaggaactccatgtagcttcaccacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 23505437  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23505436 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 23505337  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||    
T  23505336 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggcgtcaacaatcctgcaggtttctgatgt 23505274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 14434174 - 14434536
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  14434174 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 14434273  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  14434274 gatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgat 14434373  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14434374 aggaataaaatgtgccgactttgtcaacctatcaaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 14434473  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14434474 atgctatcccatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 14434536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14264010 - 14263649
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  14264010 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 14263911  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  14263910 gatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 14263811  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || | ||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| ||| |||    
T  14263810 cggaataaagtgtgccgacttcgttaacctatcgacaacaacgcaaatggcatcatgccctctcggagtattcgataaactcgtcacaaaattcatggaa 14263711  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  14263710 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccacgcaggcttctgatg 14263649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 49152784 - 49153145
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  49152784 tccgactgaccatccgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 49152883  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  49152884 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaat 49152983  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||     
T  49152984 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagag 49153083  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  49153084 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 49153145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 80 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16072057 - 16071699
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||| || |    
T  16072057 gactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaactgaacctcggat 16071958  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||     
T  16071957 ctctatccgacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgatcgg 16071858  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 379  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||  |||| || | |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16071857 aagaaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctttgagtgttcgataaactcgtcacaaaatccatggaaatg 16071758  T
Q  380 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
     | ||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16071757 ttgtcccacttccactctagcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 16071699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 209 - 439
Target Start/End: Original strand, 19613290 - 19613520
Alignment:
Q  209 ccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgt 308  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| || | | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || |    
T  19613290 ccatgcaacttcacaatgtcccgaatataaatctccgccaactgagccaccgaaaaactgatatttatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctat 19613389  T
Q  309 ctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaa 408  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19613390 caaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaa 19613489  T
Q  409 cggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19613490 tggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 19613520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16950237 - 16949876
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  16950237 tccgactgaccatctgtctgaggatgataatccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 16950138  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
      |||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| | ||||||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16950137 aatctctatccgacacaatactcgacagtactccatgtagcttcacaatgttatgaacataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 16950038  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| ||||||||  | |||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  16950037 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgctcggtagactcgtcacgaaatccatagaa 16949938  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  16949937 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgttaacaaccctgcaggcttctgatg 16949876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 11388194 - 11387832
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  11388194 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 11388095  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||     | ||||| |||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| ||    
T  11388094 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatggcacggatgtaaatctccgccagctgaggtaccggaaaactgatatttat 11387995  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||| || || | |||||| || | |||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||    
T  11387994 cggaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatccacaaaaacccaaatagcatcatgccctatcggagtattcggtaaactcgtcataaaatccgtagaa 11387895  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11387894 atgttgtcccacttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 11387832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 74 - 439
Target Start/End: Original strand, 15340911 - 15341276
Alignment:
Q  74 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 173  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || || ||||    
T  15340911 ctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcatcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagatgtgaacc 15341010  T
Q  174 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 273  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| | ||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  15341011 tcggatccctatccgacacaatactagaaggaactctatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgtt 15341110  T
Q  274 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 373  Q
     || | ||| ||||| ||| |||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||||||||||    
T  15341111 gataggaataaagtgtgccaactttgtcaacctatcgactacaacccatatagaatcatgtcctctcggggtgtttggtaaactcgtcataaaatccata 15341210  T
Q  374 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15341211 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 15341276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 12206566 - 12206204
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||    
T  12206566 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctcgatgtaaatcttg 12206467  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||    
T  12206466 gatctctatccaacacaatactcgacggaacaccatgcagcttcacaatatcacgaatgtaaatctctgccaactgtgccactggaaaactaatattaat 12206367  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| ||||| || |||||| |||| || || || || | ||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  12206366 tggaataaagtgtgctgacttcttcaatctatcaacaaccatccatatgacatcatgccctctcagagtatttggtaaacttgttacaaagtccatggat 12206267  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  12206266 atgctatcccatttccattctggaacatctaatggtgtcaacaacccagcaggcttctgatgt 12206204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 73 - 396
Target Start/End: Original strand, 15625030 - 15625353
Alignment:
Q  73 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 172  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| || |||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  15625030 tctttccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 15625129  T
Q  173 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 272  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||    
T  15625130 cttggatctctatctgacacaatgctcggcggaacaccatgtagcttcacaatatcgcgaatgtagatctccgccaactgagacacaggaaaactgatat 15625229  T
Q  273 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 372  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || || |||| |||  | |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15625230 taatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagagtcattcccttttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccat 15625329  T
Q  373 agaaatgctatcccatttccactc 396  Q
     || ||  ||||||||||||||||    
T  15625330 ggatatagtatcccatttccactc 15625353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 8211894 - 8211533
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | |||||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  8211894 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 8211795  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||    
T  8211794 gatctctatctgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaattgcgctaccggataactgatattgat 8211695  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| || |  |||||||| |||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||     
T  8211694 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacaaaatccatagag 8211595  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  8211594 atactgtctcacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccatgcaggcttctgatg 8211533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1175 - 812
Alignment:
Q  75 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 174  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| |||||    
T  1175 tttccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacct 1076  T
Q  175 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 274  Q
    ||  || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||  || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||     
T  1075 tgtatccctatccgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaatgttatgaacataaatctccgccaactgtgctaccagataactgatattg 976  T
Q  275 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 374  Q
    |||| |||||| || || ||||||||||||||||| || |  ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||    
T  975 atcggaatgaaatgtgctgacttcgtcaacctgtcgacaatgacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaacttggcacgaaatccatag 876  T
Q  375 aaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  875 aaatattgtcccacttccactccggcacatctaacgatgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 12456185 - 12456546
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||| || || |||||  ||||||||||| |  |||| || || ||||| ||||| |    
T  12456185 tccgactgaccatctgtctggggatgataagccgagctcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgtaaattcttccagaacctagaagtgaacctcg 12456284  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || || || | |||||||||  | | ||  || |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  12456285 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaatgctataaacataaatctctaccaactgtgctaccggataactgatattgat 12456384  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12456385 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcgtagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 12456484  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  12456485 atattgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccatgcaggcttctgatg 12456546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13968434 - 13968073
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  13968434 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 13968335  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  13968334 gatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataacttatattaat 13968235  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  13968234 aggaataaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagag 13968135  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  13968134 atactgtcccacttccagtccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 13968073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 75 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 11772031 - 11771677
Alignment:
Q  75 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 174  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11772031 tttccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcctccaaaatctagaagtaaacct 11771932  T
Q  175 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 274  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||   | ||||| || |||||||||||||  ||  || ||||||||||     
T  11771931 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatatcgcggatgtaaatttccgccaactgagacacaagaaaactgatattt 11771832  T
Q  275 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 374  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  11771831 atcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 11771732  T
Q  375 aaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 429  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  11771731 atatgctatcccatttccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcagg 11771677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 26118371 - 26118010
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || |||||||   |||| || || ||||| ||||| |    
T  26118371 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacgcttccagaacctagaagtgaacctcg 26118272  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || || || || ||||| ||||| |||||| ||||||| ||    
T  26118271 gatctctatccgacacaatactcgccggaacaccatgaagtttcactacactgtgaatataaatttctgctaactgcgctaccggataattgatattgat 26118172  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  26118171 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 26118072  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  26118071 atactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccccgcaggcttctgatg 26118010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 12687983 - 12688299
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  12687983 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 12688082  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| || || || ||||| ||||  ||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  12688083 gatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctccgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 12688182  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  12688183 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccccctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 12688282  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  12688283 atactatcccatttcca 12688299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 254 - 439
Target Start/End: Original strand, 12457300 - 12457485
Alignment:
Q  254 gctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggta 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||| | || | ||||||||| |||||||| ||  |||    
T  12457300 gctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtctacaacaacctaaatagcatcatgccctctcggagtgttccgta 12457399  T
Q  354 aacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12457400 aactcgtcacgaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 12457485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 9596539 - 9596855
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  9596539 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 9596638  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| || || ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  9596639 gatctctatctgatacaatgctcgaagggacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 9596738  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | ||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||     
T  9596739 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccctctaggagtattcggcaaacttgtcacaaagtccatggat 9596838  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  9596839 atactatcccatttcca 9596855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 18551546 - 18551230
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  18551546 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 18551447  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  18551446 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 18551347  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  18551346 aggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 18551247  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  18551246 atactatcccatttcca 18551230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 8199110 - 8199426
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8199110 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8199209  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  8199210 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 8199309  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8199310 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 8199409  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  8199410 atactatcccatttcca 8199426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 44791139 - 44790823
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  44791139 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 44791040  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  44791039 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 44790940  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  44790939 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 44790840  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  44790839 atactatcccatttcca 44790823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 404
Target Start/End: Original strand, 14040178 - 14040504
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| |   | ||||| ||| || |||||||| | |||||||| ||||    
T  14040178 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttg 14040277  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  14040278 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatatagatttctgccaactgaaacacaggaaaactgatattaat 14040377  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||| |||| || ||||| ||||||| |||||| ||     
T  14040378 cggaataaagtgagccgacttcgtcaatctatc-acaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggaatattcggcaaactcgtcacaacatccatggat 14040476  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacat 404  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||    
T  14040477 atactatcccatttccactctggtacat 14040504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 404
Target Start/End: Original strand, 14350208 - 14350534
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| |   | ||||| ||| || |||||||| | |||||||| ||||    
T  14350208 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttg 14350307  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  14350308 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatatagatttctgccaactgaaacacaggaaaactgatattaat 14350407  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||| |||| || ||||| ||||||| |||||| ||     
T  14350408 cggaataaagtgagccgacttcgtcaatctatc-acaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggaatattcggcaaactcgtcacaacatccatggat 14350506  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacat 404  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||    
T  14350507 atactatcccatttccactctggtacat 14350534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 11237001 - 11236685
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  11237001 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 11236902  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  11236901 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 11236802  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||     
T  11236801 cggcagaaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattttgcaaactcgtcacaaaatccatggat 11236702  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  11236701 atactatcccatttcca 11236685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 8708087 - 8708403
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8708087 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8708186  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  8708187 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 8708286  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || |  ||||| |||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8708287 aggtagaaaatgagttgactttgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 8708386  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  8708387 atactatcccatttcca 8708403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 10871477 - 10871793
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10871477 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 10871576  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  10871577 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 10871676  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  10871677 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 10871776  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  10871777 atactatcccatttcca 10871793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 11552890 - 11552574
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  11552890 tccgactgtccatctatctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaaggaaatcttg 11552791  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  11552790 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 11552691  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  11552690 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccattgat 11552591  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  11552590 atactatcccatttcca 11552574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 13686546 - 13686862
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  13686546 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 13686645  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || |||||  ||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  13686646 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctaccaactgggcaacggggaaactaatattaat 13686745  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  13686746 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 13686845  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  13686846 atactatcccatttcca 13686862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 14332879 - 14333195
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14332879 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14332978  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||  | ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  14332979 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgataaaaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 14333078  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  14333079 aggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaagagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 14333178  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  14333179 atactatcccatttcca 14333195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15160845 - 15160529
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15160845 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15160746  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  15160745 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 15160646  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||     
T  15160645 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcaaaaaatccatggat 15160546  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  15160545 atactatcccatttcca 15160529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 15154449 - 15154117
Alignment:
Q  73 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | |  || |||||| |||||||||| ||||| ||     
T  15154449 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctgctgcaaacttttccaaaatctagaagtgaat 15154350  T
Q  173 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 272  Q
    ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| || ||||||    
T  15154349 cttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttcacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaattgatat 15154250  T
Q  273 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 372  Q
    |||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||| |||| |||  | |||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  15154249 taatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaattacccaaatcgagtcattccctttaggagtattcggcaaactcgttaaaaaatccat 15154150  T
Q  373 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
     || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  15154149 ggatatactatcccatttccactctggcacatc 15154117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 18178224 - 18178540
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  18178224 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctaaaagtaaatcttg 18178323  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || ||  |||| ||||| ||||| | ||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  18178324 gatctctatctgatacaatgttcgaaggaacaccatgtagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 18178423  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  18178424 aggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatagat 18178523  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  18178524 atactatcccatttcca 18178540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 17100 - 16788
Alignment:
Q  81 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 180  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  17100 actgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 17001  T
Q  181 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 280  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | | ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||      
T  17000 tctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggt 16901  T
Q  281 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 380  Q
    |  || || |||||||||| ||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  16900 agaaaatgagccgacttcgacaatctatcaacgatgacccaaattgtgtcgttccctctaggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggatatac 16801  T
Q  381 tatcccatttcca 393  Q
    |||||||||||||    
T  16800 tatcccatttcca 16788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 420
Target Start/End: Original strand, 21662452 - 21662786
Alignment:
Q  86 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 185  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||| || ||||||||| | || |  |||||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  21662452 ccatctgtctgcggatgatacgcctaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctacaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctat 21662551  T
Q  186 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaa 285  Q
    || | || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |   | || || ||||   ||||||||| ||| ||| || |||| ||||||| ||| ||    
T  21662552 ctaatacaatactcgatggaacaccatgtaacttcacaatctcacggatataaatcttttccaactgagatacaggaaaattgatgttaatcggaataaa 21662651  T
Q  286 gtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcc 385  Q
     || |||||||||||||  || || || |  ||||| |||| |||||| ||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  21662652 atgagccgacttcgtcagtctatccacaattacccaaatcgcatcatgtccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcc 21662751  T
Q  386 catttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 420  Q
    ||  ||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  21662752 cacgtccactctggaacatctaaaggtgtcaacaa 21662786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 250
Target Start/End: Original strand, 14955102 - 14955275
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | | ||| |||||| |  |||  || |||||||| ||||    
T  14955102 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctgttgcaaacttttgaaaatcctagaagtaaatcttg 14955201  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaac 250  Q
    | ||||||||  | || || ||||| ||||  ||||||||| ||||||| | || |||||| ||||||||||||    
T  14955202 gatctctatccaatacaatgctcgaaggaataccatgcaacgtcacaatctccttaatgtaaatctccgccaac 14955275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 23203368 - 23203085
Alignment:
Q  110 gaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccc 209  Q
    ||||||||| |||| || || |||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |    
T  23203368 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23203269  T
Q  210 catgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtc 309  Q
    |||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| ||||| |  || || ||  |||| |||||||| |  |  || || || ||||||||||| || ||    
T  23203268 catgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaatttggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatc 23203169  T
Q  310 taccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 393  Q
     || | |||||| || |  || | ||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  23203168 aacaataacccaaattgcgtcgttccctctcgtagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 23203085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 23509495 - 23509212
Alignment:
Q  110 gaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccc 209  Q
    ||||||||| |||| || || |||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |    
T  23509495 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23509396  T
Q  210 catgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtc 309  Q
    |||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| ||||| |  || || ||  |||| |||||||| |  |  || || || ||||||||||| || ||    
T  23509395 catgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaatttggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatc 23509296  T
Q  310 taccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 393  Q
     || | |||||| || |  || | ||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  23509295 aacaataacccaaattgcgtcgttccctctcgtagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 23509212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 321638 - 321506
Alignment:
Q  264 aactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac 363  Q
    |||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || |||||||||||    
T  321638 aactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaacttgtcac 321539  T
Q  364 aaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  321538 aaaatccatggatatactatcccatttccactc 321506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 250
Target Start/End: Original strand, 4440419 - 4440583
Alignment:
Q  86 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 185  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||| || |  |||||  || |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||| || || | ||    
T  4440419 ccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 4440518  T
Q  186 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaac 250  Q
    ||||||| ||||| || ||||  ||||||||| ||||||| | || |||||||||||| ||||||    
T  4440519 ctgacacaatactagaaggaataccatgcaacctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaac 4440583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 23199509 - 23199451
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaa 135  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||    
T  23199509 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaa 23199451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 27107277 - 27107243
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27107277 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 27107243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 113
Target Start/End: Original strand, 12457262 - 12457298
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaac 113  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12457262 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaac 12457298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 14325775 - 14325743
Alignment:
Q  38 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagc 70  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14325775 ttgatagccgtacacaccgtatgggcttccagc 14325743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 19644 - 20006
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  19644 tccgactgaccatctgtctgaggatcataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 19743  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19744 gatccctatcagacacaatactcgacggaactccatgtagcttcacaatgttctgaatataaatctccgccaactgagctacgagataactgatattaat 19843  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19844 aggaatgaagtgcgccgactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctttcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 19943  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19944 atgctatcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 20006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 27749 - 28110
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  27749 tccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 27848  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27849 gatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaactgagctaacggataactgatattaat 27948  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | |||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27949 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgtcctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 28048  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  28049 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccgtgcaggcttctgatg 28110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 41443 - 41803
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||  |    
T  41443 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaac--aacctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccccg 41540  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41541 gatctctattcgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 41640  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  41641 cggaataaagtgcgccgacttcatcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 41740  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  41741 atgctatcccacttccactccggcatatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 41803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21453 - 21091
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  21453 tccgactgaccgtctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaacctcg 21354  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21353 gatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 21254  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21253 cgaaataaagtgcgccaactttgtcaatttgtcgaccacaacccatatcgcatcatgccctctcggagtgttaggtagactcgtcacaaaatccatagaa 21154  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21153 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatgt 21091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 153 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 11163 - 10877
Alignment:
Q  153 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 252  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  11163 tccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactg 11064  T
Q  253 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 352  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  11063 agctaccggataactgatattaatcgaaataaagtgcgccaactttgtcaatttgtcgaccacaacccatatcgcatcatgccctctcggagtgttaggt 10964  T
Q  353 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10963 agactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatgt 10877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 5)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 20507 - 20868
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  20507 tccgactaaacatctgtctgcggatgataaaccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 20606  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20607 gatcgctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattgtgaatataaatctccacaaactgagctaccgggtaactgatattaat 20706  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||    
T  20707 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccaaatggaatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcataaaatccatagaa 20806  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  20807 atgttgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcatcaaccctgtaggcttctgatg 20868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 77 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13143 - 12865
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||| |    
T  13143 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcg 13044  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13043 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattattaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 12944  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaa 355  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| | |||||||    
T  12943 cgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctaggagtgtaaggtaaa 12865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 77 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16913 - 16635
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||| |    
T  16913 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcg 16814  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16813 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattattaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 16714  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaa 355  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| | |||||||    
T  16713 cgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctaggagtgtaaggtaaa 16635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 351 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 11565 - 11477
Alignment:
Q  351 gtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11565 gtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 11477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 351 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 15335 - 15247
Alignment:
Q  351 gtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15335 gtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 15247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 77 - 430
Target Start/End: Original strand, 40262 - 40615
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  40262 tccgactgaccatctctttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 40361  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  40362 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgat 40461  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  40462 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 40561  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 430  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40562 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggc 40615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 84 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 25640 - 25285
Alignment:
Q  84 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 183  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  25640 gaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaatctcttccataatctagaagtgaacctcggatctct 25541  T
Q  184 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 283  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||     
T  25540 atccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcataaaattatgaatgtagatctccgccaactgagctaccggataactgataataattggaata 25441  T
Q  284 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 383  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  25440 aagtgcgctgacttcgtcaacctgtcaaccacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgtttt 25341  T
Q  384 cccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||    
T  25340 cccacttccactccggcacatccaacggtgtcaaaaaccctgcagacttctgatgt 25285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 48989 - 48627
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  48989 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 48890  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  48889 gattcctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagctttacaatattatgaatataaatctcagccaactgagctaccagataactgatgttaat 48790  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  48789 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaacttgtcactaaatccatagaa 48690  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  48689 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccatgcaggcttctgatgt 48627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 47181 - 46819
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||| || || ||||| |||||||    
T  47181 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaaccttg 47082  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||    
T  47081 gatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgcagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactaagctatcggataattgatattaat 46982  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  46981 cggaataaaatgcgccgacttcgtcaacctgttgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 46882  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  46881 atgttatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaacccttcaggcttctgatgt 46819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 42115 - 41754
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  42115 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 42016  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42015 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 41916  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  41915 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 41816  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  41815 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 41754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 2445 - 2806
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||||| | |||  |||||||||| || |||||||| |    
T  2445 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttacaacctaaagcctcttgcacactcttccaaaatctagaggtaaacctcg 2544  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| ||  | ||||| ||||| ||||| | ||||| |||||   |||| || || | |||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  2545 gatctctatctgatacattgctcgaaggaacaccatgtagcttcataatatcgcgaatataaattttcgccaactgagacacaggaaaactgatattaat 2644  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || |||||| || |||||||||||||| || || || |  | ||| || |   ||| |||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||  ||     
T  2645 cggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcagccaaattgcgccattccctttaggagtattcgacaaactcgtcacaaaatccacggat 2744  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  2745 atgctatcccatttccattctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 2806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 10317 - 10678
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  10317 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgaaaactcttccaaaatcttgaagtgaaccttg 10416  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  10417 gatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctcctccaactgagctaccggaaaactaatattgat 10516  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||   ||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||    
T  10517 tggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatgacatcatgccctctcggactattcggtaaactcgtcacaaaatccatgaaa 10616  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10617 atgctatcccacttccactctggcatatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 10678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 27048 - 27409
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  27048 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttg 27147  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  27148 gatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatcttctccaactgagctaccggaaaactaatattgat 27247  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  27248 cggaataaaatgcgctgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 27347  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27348 atgctatcccacttccactctggcacatctaacagtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 27409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 77 - 255
Target Start/End: Original strand, 26666 - 26844
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  26666 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttg 26765  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagc 255  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||    
T  26766 gatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatcttctccaactgagc 26844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 79 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 18317 - 17958
Alignment:
Q  79 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 178  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||     
T  18317 cgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaaccttgga 18218  T
Q  179 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 278  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18217 tctctatacgacacaatactcgacggaactccatgaaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctactggataactaatattgatcg 18118  T
Q  279 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 378  Q
     ||| ||||| |||||||| |||||| |||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||    
T  18117 gaataaagtgtgccgactttgtcaacttgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacgaaatccatggaaat 18018  T
Q  379 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18017 gctgtcccactttcactctgccacatctaacggtgtcaacaatcctgcaggcttctgatg 17958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 79 - 438
Target Start/End: Original strand, 3277 - 3636
Alignment:
Q  79 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 178  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||| ||| | |||  |||||||||| ||||| |||||  |     
T  3277 cgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcattttgcagactcttccaaaatctagaagtgaacctcaga 3376  T
Q  179 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 278  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  3377 tcactatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgttatgaatgtagatctccgccaactgagctaccggataactgatattaattg 3476  T
Q  279 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 378  Q
     ||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3477 gaataaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcagagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaat 3576  T
Q  379 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  3577 gctgtcccacttccattccgccacatccaacggtgtcaacaaccctgcagtcttctgatg 3636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12909 - 12833
Alignment:
Q  146 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 222  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  12909 aaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatacacgaaggaacaccatgcaacttcac 12833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 84 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 195479 - 195124
Alignment:
Q  84 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 183  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  195479 gaccatctgtctgaggatggtaagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatgttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctct 195380  T
Q  184 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 283  Q
    ||| ||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| || | ||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||     
T  195379 atccgacacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaatgttatgaatataaacctctgctaactgagctaccggataaatgatattaatcggaata 195280  T
Q  284 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 383  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  195279 aagtgcgccgactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcagagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctat 195180  T
Q  384 cccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  195179 ccaacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgtaggcttctgatgt 195124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 74 - 438
Target Start/End: Original strand, 149091 - 149455
Alignment:
Q  74 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 173  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||  ||||||| | |||  |||||||||| ||||| ||||    
T  149091 ctttccgactgaccatctttctgaggatgataagccgaactcaactccaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttccaaaatctagaagtgaacc 149190  T
Q  174 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 273  Q
    | || || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| | ||||| ||| || | ||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  149191 tcggatccctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagcttcaaaatgttatcaatataaatctcctccaactgagctaccggataactgatatt 149290  T
Q  274 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 373  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  149291 aatcggaatgaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatggaatcatgccctctcggagtgttcagtaaactcgtcacaaaatccata 149390  T
Q  374 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  149391 gaaatgctgtcccaattacactccagcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 149455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 75 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26317 - 25965
Alignment:
Q  75 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  26317 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 26218  T
Q  175 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 274  Q
     || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||   | ||||| || ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  26217 cggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatatcgcggatgtaaatttccgccaactgggatacaggaaaactgatatta 26118  T
Q  275 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 374  Q
    |||| ||| || || |||||||||||||| || || |  |  ||||| ||||  |||| |||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  26117 atcggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaataatcacccaaatcgcgtcattccctttcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 26018  T
Q  375 aaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgca 427  Q
    | ||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  26017 atatgctatgccatttccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgca 25965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 5234 - 4872
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||| || |||||  |||| || || ||||| |||||      
T  5234 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacatcctgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctca 5135  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
      || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5134 aatccctatccgacacaatactcgaaagaactccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 5035  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5034 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaatccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 4935  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4934 atgttatcccatttccactccgatacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 4872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 170 - 438
Target Start/End: Original strand, 5830 - 6098
Alignment:
Q  170 aaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactga 269  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  5830 aaccttggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaatattatgaatgtaaatctcagccaactgagctacaggataactaa 5929  T
Q  270 tattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatc 369  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  5930 tgttaataggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatc 6029  T
Q  370 catagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6030 catagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcttctgatg 6098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 77 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 6117 - 5757
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| |||||      
T  6117 tccgactgaccatctatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcatccagaacctagaagtgaacctca 6018  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6017 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattatgaatataaatcttagccaactgagctaccggataactgatgttaat 5918  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| | |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5917 aggaatgaagtgtgtcgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 5818  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgat 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  5817 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgtaggcttctgat 5757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 80 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 101331 - 100972
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| || |    
T  101331 gactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggat 101232  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  || |||| ||||| ||||     
T  101231 ccctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccagaaaactaatatttatcgg 101132  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 379  Q
     || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||     
T  101131 gataaaatgtgccgacttcgtcaacctatctaccacgacccaaatggcatcatgccctcttggagtgtttggcaaactcgtcacaaaatccatagaaata 101032  T
Q  380 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  101031 ttgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 100972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 405
Target Start/End: Original strand, 180725 - 181051
Alignment:
Q  79 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 178  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||     
T  180725 cgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactgttccaaaatctagaagtaaatcttgga 180824  T
Q  179 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 278  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || |  ||| |||||||||||||||    
T  180825 tctctatccgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaagaggaaaactgatattaatcg 180924  T
Q  279 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 378  Q
      |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  180925 gtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatat 181024  T
Q  379 gctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
     ||||||||||||||||| || |||||    
T  181025 actatcccatttccactctggcacatc 181051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 1306 - 944
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  1306 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccacaacttcgaacccaaagcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcg 1207  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || || || ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1206 gatccctgtccgacacgatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttataaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 1107  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1106 cggaatatagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 1007  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1006 attaggtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 6547 - 6863
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||| ||  | || || |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6547 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcatgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaccttg 6646  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  6647 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 6746  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||||||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||     
T  6747 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccatatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgttacaaaatccatggat 6846  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  6847 atactatcccatttcca 6863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 393
Target Start/End: Original strand, 12846 - 12898
Alignment:
Q  341 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 393  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  12846 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 12898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 77 - 420
Target Start/End: Original strand, 114704 - 115052
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  114704 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcg 114803  T
Q  177 ggtct-----ctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgata 271  Q
    | ||      |||||  |||| ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  114804 gatcggatccctatccaacacaatactcgacggtacaccatgcagctttacaatattatgactgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgata 114903  T
Q  272 ttaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatcca 371  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  114904 ttaatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctgtcaaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatcca 115003  T
Q  372 tagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 420  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  115004 tagaaatgctattccacttccactccagcacatccaacggtgtcaacaa 115052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 77 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 90714 - 90513
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||   ||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  90714 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcacacccaagccatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 90615  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  90614 gatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctctgccaactgagctactagataactaatattgat 90515  T
Q  277 cg 278  Q
    ||    
T  90514 cg 90513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 390986 - 390663
Alignment:
Q  73 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||     
T  390986 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaat 390887  T
Q  173 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 272  Q
    ||||| ||| ||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  |  ||| |||||||||    
T  390886 cttggatctttatctgatacaatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctcagccaactgagaaataggaaaactgatat 390787  T
Q  273 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 372  Q
    |||||| ||| || || | | |||||||||| || || || || ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  390786 taatcggaataaaatgagtcaacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatcgcgtcatcccctttaggagtattcagcaaactcgtcacaaaatccat 390687  T
Q  373 agaaatgctatcccatttccactc 396  Q
     || || |||||||||||||||||    
T  390686 ggatatactatcccatttccactc 390663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 89975 - 89835
Alignment:
Q  138 catcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgta 237  Q
    ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  89975 catcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatata 89876  T
Q  238 gatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 278  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  89875 aatctctgccaactgagctactagataactaatattgatcg 89835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 77 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 7019 - 6660
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||      
T  7019 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctca 6920  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||    
T  6919 gatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaacattgat 6820  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac-aaaatccataga 375  Q
    |  ||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  6819 cagaataaagtgcgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaaatccatgga 6720  T
Q  376 aatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctg 435  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  6719 aatgctgtcccacttccactccggcacatctaatggtgtcaacaaccttgcaggcttctg 6660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 77 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11091
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||      
T  11450 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctca 11351  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||    
T  11350 gatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaacattgat 11251  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac-aaaatccataga 375  Q
    |  ||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  11250 cagaataaagtgcgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaaatccatgga 11151  T
Q  376 aatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctg 435  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  11150 aatgctgtcccacttccactccggcacatctaatggtgtcaacaaccttgcaggcttctg 11091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 44029 - 44391
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  44029 tccgactgaccatgtatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 44128  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  44129 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactcatgttaat 44228  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  ||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  44229 agggatgaagtgttccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgttacaaaatccatagaa 44328  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  44329 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 44391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 45041 - 45403
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  45041 tccgactgaccatgtatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 45140  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  45141 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactcatgttaat 45240  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  ||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  45241 agggatgaagtgttccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgttacaaaatccatagaa 45340  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  45341 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 45403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 438
Target Start/End: Original strand, 47651 - 48009
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  47651 gactgaccatttgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcgggt 47750  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||     
T  47751 ctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctcccccaactgagctaccggataactaatattgatcgg 47850  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 379  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| || | |||| | || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47851 aataaagtgtgccgacttagtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcagggcctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatg 47950  T
Q  380 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
     | ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||||    
T  47951 ttgtcccacttccactctggcacatctaacggggtcaacaaccctgtaggcttctgatg 48009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 6818 - 6456
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||      
T  6818 tccgactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctca 6719  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  6718 gatctctatccgacacaatgttcgatggaaccccatgtaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 6619  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  6618 cgggataaaatgcgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggtatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggag 6519  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||| ||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  6518 atgctgtcccacttccactctggaaaatctaacggtgtcaacaatcctgcaggcttctcatgt 6456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 438
Target Start/End: Original strand, 2188 - 2473
Alignment:
Q  153 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 252  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2188 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatttgaaacaatactcgacgggactccatgcaacttcacaatattatgaatgtagatctccgccaactg 2287  T
Q  253 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 352  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||    
T  2288 agctaccggataactgatattaatcggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggt 2387  T
Q  353 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||  ||||| |||||||    
T  2388 aaacttgtcacaaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggcacatcaaacggtgtcaaaaacccaacaggcttctgatg 2473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 51645 - 51284
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||  |||| |||||      
T  51645 tccgactaaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtgaacctca 51546  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  51545 gatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 51446  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  51445 cggaataaagtgtgacgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccttctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 51346  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  51345 atgctgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 51284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 98 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 81593 - 81252
Alignment:
Q  98 ggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatac 197  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || || ||  |||||||||| || || ||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  81593 ggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaagctcttccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatac 81494  T
Q  198 tcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgactt 297  Q
    ||||||| || ||||| | ||||| |||||| ||||| || ||||  | |||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  81493 tcgacggtacaccatgtagcttcaaaatattatgaatataaatctaagtcaactgagctaccggataactgatgttaataggaatgaagtgtgccgactt 81394  T
Q  298 cgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactcc 397  Q
     |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81393 tgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcgtagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactcc 81294  T
Q  398 ggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  81293 ggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 81252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 74 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 12570 - 12215
Alignment:
Q  74 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 173  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||||||||| || || ||||    
T  12570 ctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccaaaatctagatgtgaacc 12471  T
Q  174 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 273  Q
    | || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  12470 tcggatccctatccgacacaatactcgacggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataattgatgtt 12371  T
Q  274 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 373  Q
     ||   ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||| | ||||| |||||||||    
T  12370 gataccaatgaagtgcgtcgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaaatcgtcacgaaatccata 12271  T
Q  374 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 430  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12270 gaaatgctatcccatttccactctggtacatccaacgg-gtcaacaaccctgcaggc 12215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 179 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 13979 - 13719
Alignment:
Q  179 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 278  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13979 tctctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatgttaatcg 13880  T
Q  279 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 378  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13879 gaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaat 13780  T
Q  379 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  13779 gctatcccacttccactctggtacatccaacggtgtcaacaaccttgcaggcttctgatgt 13719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Original strand, 11293 - 11655
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  11293 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactgaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctcgaagtgaacctcg 11392  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11393 gatctccatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatgttttgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 11492  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||||||  ||||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11493 aggaatgaagtgtaccgactttgtcaacctatcgaccacaaaccatatagaatcaaaccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 11592  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11593 atgttatcccatttccactccgatacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 11655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 220 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 57486 - 57268
Alignment:
Q  220 cacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacc 319  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  57486 cacaatattatgaatgtaaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaataggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacc 57387  T
Q  320 catatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaaca 419  Q
    || || |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57386 caaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaaca 57287  T
Q  420 aacctgcaggcctctgatg 438  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  57286 accctgcaggcttctgatg 57268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 74 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 48819 - 48455
Alignment:
Q  74 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 173  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || ||||||||  ||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  48819 ctttccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaacatcttgaagtgaacc 48720  T
Q  174 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 273  Q
    | || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||    
T  48719 tcggatctttatccgacacaatactcgacggaaccccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctatcggaaaactaatatt 48620  T
Q  274 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 373  Q
     |||| ||  ||||  ||||||||||||||||| || || |||| ||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||     
T  48619 gatcggaagaaagtttgccgacttcgtcaacctatcgacaacaatccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatcaatg 48520  T
Q  374 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    |||||| | ||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  48519 gaaatgttgtcccacttccactctggcatatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 48455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 57599 - 57541
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaa 135  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||    
T  57599 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaa 57541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1754 - 1393
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||| |||||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  1754 tccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacttcaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaacctcgaagtgaacctcg 1655  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||  ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||    
T  1654 gatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgcaacttaaaaatatgatgaatataaatctccgccaactaagctaccggaaaactaatattgat 1555  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| || || ||| ||||||||||||| || ||  ||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||    
T  1554 cggaataaaatgtgcctacttcgtcaacctatcgacagcaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcataaaatccatggaa 1455  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1454 atgctatcccacttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 1393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 4954 - 5315
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || |||||| |   |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| |    
T  4954 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccgaggaatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcg 5053  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
      |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| ||    
T  5054 aatctctatccgacacgatgctcgatggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctatcggaaaactaatattgat 5153  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  5154 cggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggag 5253  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||| | ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5254 atgttgtcccacttccactatggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 5315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 393 - 754
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  393 tccgactgaccatctgtttgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 492  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  493 gatctctatccgacacaatactcgatggtacatcatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 592  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||||||| || || | | |||| || | ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  593 cggaataaagtgtgtcgacttcgtcaacctatcgacaaaatcccaaatggcatcatgccctctcagagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 692  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||| | ||||| |||||||  || | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  693 atgttgtcccacttccactttggcaaatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 5274 - 5635
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  5274 tccgactgaccatctgtctgcagatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcg 5373  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
      |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5374 aatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaatgttatgaatataaatctccgctaactgagctaccggataactgatattaat 5473  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||| | |||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  5474 aggaatgaagtgtgccaacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcgtattattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 5573  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||| | ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5574 atgttgtcccacttccagtctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 5635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 931 - 570
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  931 tccgactgaccatctgtttgcggacgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 832  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||  || |||| ||||| ||    
T  831 gatctctatccgacacaatactcgatgaaacaccatgtaacttcataatattatgaatataaatctcagccaattgagctaccagaaaactaatattgat 732  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||    
T  731 cggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcagtaaactcgtcacaaaatccatggaa 632  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  631 atgctatcccactttcactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 204
Target Start/End: Original strand, 28043 - 28170
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || || |||||  | ||||| |||||  ||||||||||  |||| ||||| |    
T  28043 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtgaacctcg 28142  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacgg 204  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  28143 gatctctatctgacacaatacttgacgg 28170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 204
Target Start/End: Original strand, 34296 - 34423
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || || |||||  | ||||| |||||  ||||||||||  |||| ||||| |    
T  34296 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtgaacctcg 34395  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacgg 204  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  34396 gatctctatctgacacaatacttgacgg 34423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 74 - 439
Target Start/End: Original strand, 260829 - 261194
Alignment:
Q  74 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 173  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || || ||||    
T  260829 ctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacc 260928  T
Q  174 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 273  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||    
T  260929 tcggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaattgagctatcggataactgatgtt 261028  T
Q  274 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 373  Q
     || | ||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  261029 gataggaataaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcagagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccata 261128  T
Q  374 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  261129 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggcgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 261194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 278612 - 278296
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||| |||||  ||||||| || |||||||| ||||    
T  278612 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaatttagaaccgaaggcctcttgcaaactcttccaaaacctagaagtaaatcttg 278513  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| ||| || | || || ||| |||||||||||||    
T  278512 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgcctacagggcgacaggaaaactgatattaat 278413  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||     || || |||||||||||||| || || || |  | ||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  278412 cggtggaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcatccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 278313  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  278312 atactatcccatttcca 278296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 153 - 439
Target Start/End: Original strand, 7660 - 7946
Alignment:
Q  153 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 252  Q
    |||| ||||| ||||| ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||| | | |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||    
T  7660 tccagaatctagaagtgaacatcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccacgtagcttcacaatattatgaatataaatctccaccaactg 7759  T
Q  253 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 352  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||    
T  7760 agctaccagataactgatattaatcggaataaagtgcgccgacttcatcaacttgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgtttggt 7859  T
Q  353 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7860 aaactcgtcacaaaatccagagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 7946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 3137 - 2775
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| |||||  |||| ||||| |    
T  3137 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcatgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcg 3038  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||| || || ||||  || |||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  3037 gatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcactatgttatgaacataaatctccgccaactatgctaccagataactgatattaat 2938  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||| | ||| ||||| || ||||| || | || ||| |||||||||| |||||||    
T  2937 aggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgataacaacctatatagcatcgtgccctcttggagtgtttgctatactcgtcacaaaattcatagaa 2838  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  2837 atactatcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttcttatgt 2775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 77 - 419
Target Start/End: Original strand, 31934 - 32276
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||   ||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  31934 tccgactgacaatctgtttgcggatgataagctgaactcaaccccaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 32033  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  32034 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaattgagctaccggataactgatattgat 32133  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| ||| || ||||||| || ||||| || |  |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  32134 tggaataaagagcaccgactttgttaacctatcaaaaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 32233  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaaca 419  Q
    ||| | ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32234 atgttgtcccacttccactcctgcacatccaacggtgtcaaca 32276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 77 - 410
Target Start/End: Original strand, 14563 - 14896
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||| || ||| | ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14563 tccgactgagcatctgtttgcggctgatacgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14662  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  14663 gatctctatctgacacaatgctcgaatgaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 14762  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||  || || ||||||||||||||||| || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||     
T  14763 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtattaggcaaactcttcacaaaatccatggat 14862  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 410  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  14863 atactatcccatttccactctggcacatctaacg 14896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 225
Target Start/End: Original strand, 17965 - 18113
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  17965 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 18064  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 225  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| || || ||| |||||||    
T  18065 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccgtgtaacctcacaat 18113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 157 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 18557 - 18321
Alignment:
Q  157 aaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagct 256  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| || || || || ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||      
T  18557 aaatctagaagtaaatcttggatctctatatgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaaatttccgccaactgagaa 18458  T
Q  257 actggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaac 356  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||   ||| |||  | |||||||| | |||||    
T  18457 acaggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcggcattccctttaggagtattcgttaaac 18358  T
Q  357 ttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 393  Q
    | |||||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  18357 tcgtcacaaaatacatggatatactatcccatttcca 18321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 81 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 28546 - 28207
Alignment:
Q  81 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 180  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||| | ||||| ||| || | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28546 actgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagtttttcaaaatctagaagtaaatcttggatc 28447  T
Q  181 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 280  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| |    
T  28446 tctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaatcgga 28347  T
Q  281 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 380  Q
    || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  28346 ataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggtatcatgtccccttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggatatgc 28247  T
Q  381 tatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 420  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  28246 tatcccatttccactctggcacatctaatggtgtcaacaa 28207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 81 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 40537 - 40198
Alignment:
Q  81 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 180  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||| | ||||| ||| || | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  40537 actgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagtttttcaaaatctagaagtaaatcttggatc 40438  T
Q  181 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 280  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| |    
T  40437 tctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaatcgga 40338  T
Q  281 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 380  Q
    || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  40337 ataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggtatcatgtccccttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggatatgc 40238  T
Q  381 tatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 420  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  40237 tatcccatttccactctggcacatctaatggtgtcaacaa 40198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 2318 - 2679
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||| |    
T  2318 tccgactgaccatctgtctacggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcgtgaagtgaacctcg 2417  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | | |||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||| ||    
T  2418 gatgtctatccgacacaatactcgatggaagtccatgtaacttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaactgagctaccggataactattattgat 2517  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || ||||| || | ||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  2518 cggaataaagtgtgttgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcgtgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 2617  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||| | ||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2618 atgttgtcccacttctactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 2679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 3315 - 3676
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  3315 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagacgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 3414  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||    
T  3415 gatctctatccgacacaatacttgacggaacaccatgtaacttcttaatattatgaatataaatctccgccaactgagctatcggataactaatattgat 3514  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| || | |||| |||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  3515 cggaataaagtgcgcggactttgtcaacctatcgacaaccacccaaatggcatcacgccctctgggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 3614  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  3615 atgttgtcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctacaggcttctgatg 3676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 77 - 410
Target Start/End: Original strand, 6896 - 7229
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  6896 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 6995  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  6996 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 7095  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||     
T  7096 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattagacaaactcgtcacaaaatccatggat 7195  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 410  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  7196 atactatcccatttccactctggcacatctaacg 7229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 77 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2657 - 2336
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||   |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  2657 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggaatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaaccttg 2558  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| | || |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2557 gatctctatccgatacaatactcgacggtacaccatgtaacttcacaatattgtgactataaatctccgcc--ctgagctaccggataattgatattaat 2460  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2459 tggaataaagtgtgccgacttcgttaacctatcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 2360  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggt 400  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||    
T  2359 atgccgtcccacttccactccggt 2336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 80 - 438
Target Start/End: Original strand, 249140 - 249498
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || |||||||| || |    
T  249140 gactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtaaacctcggat 249239  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||  | ||||  || |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |     
T  249240 ccctatctgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaatgctatgaacataaatctctaccaactgtgctaccggataactgatattaattgg 249339  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 379  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  249340 aatgaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaattgcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaaata 249439  T
Q  380 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  249440 ctgtcccacttcgactccggtacatccaacggtgtcaacaaccatgcaggcttctgatg 249498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 77 - 430
Target Start/End: Original strand, 43307 - 43660
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  || || |||||  ||||||| |||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  43307 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaaattcagcttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 43406  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || |||||||| || ||||||||||| || || || | |||||||||  | ||||  || ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  43407 gatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaatgctatgaacataaatctctgccaactgtgctaccagataactgatattaat 43506  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||   ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43507 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatgacatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 43606  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 430  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43607 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccatgcaggc 43660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 79 - 439
Target Start/End: Original strand, 19375 - 19735
Alignment:
Q  79 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 178  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||   ||||||| |||||  || | ||||| ||||| |||   ||     
T  19375 cgactgatcatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttctagaatctagaagtgaactgcgga 19474  T
Q  179 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 278  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||| | | | || || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  19475 tctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcactctcacaatgtcccggatataaatctccgccaactgagctaccggaaaacttatattgatcg 19574  T
Q  279 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 378  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19575 gaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatccaccacaacccaaatagcatcatgccctctcggagtattgggtaaactcgtcacaaaatccatagaaat 19674  T
Q  379 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    | | ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19675 gttgtcccacttccattctggcacatctaaaggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 19735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 79 - 439
Target Start/End: Original strand, 23537 - 23897
Alignment:
Q  79 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 178  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||   ||||||| |||||  || | ||||| ||||| |||   ||     
T  23537 cgactgatcatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttctagaatctagaagtgaactgcgga 23636  T
Q  179 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 278  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||| | | | || || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  23637 tctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcactctcacaatgtcccggatataaatctccgccaactgagctaccggaaaacttatattgatcg 23736  T
Q  279 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 378  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23737 gaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatccaccacaacccaaatagcatcatgccctctcggagtattgggtaaactcgtcacaaaatccatagaaat 23836  T
Q  379 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    | | ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23837 gttgtcccacttccattctggcacatctaaaggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 23897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 77 - 355
Target Start/End: Original strand, 11412 - 11690
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||| |    
T  11412 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcg 11511  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11512 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattattaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 11611  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaa 355  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| | |||||||    
T  11612 cgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctaggagtgtaaggtaaa 11690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 186 - 5
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||||||  |||||||||| || || ||||| |    
T  186 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcg 87  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctac 258  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||    
T  86 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattattaatataaatctccgccaactgagctac 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 351 - 439
Target Start/End: Original strand, 12996 - 13084
Alignment:
Q  351 gtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12996 gtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 13084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 217 - 439
Target Start/End: Original strand, 528 - 750
Alignment:
Q  217 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 316  Q
    |||||||||||| |  || || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  528 cttcacaatattatcgatataaatctccgccaactgagctaccagataactgatattaatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaacttgtcgaccaca 627  T
Q  317 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 416  Q
    |||||||| | ||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  628 acccatatagtatcatgccctctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgttatcccacttccacttcggcacatccaacggtgaca 727  T
Q  417 acaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  728 acaaccctgcaggcttctgatgt 750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 24853 - 24492
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||  |||| || || |||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  24853 tccgactgaccatctgtttacggatgataagccgaactcaacctcaacttagatcccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 24754  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| |   |||| || ||||||||||| ||||| ||   | |||| ||||| ||    
T  24753 gatctcaatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcaactacacaatttcacgaatataaatctccgccaaatgagccaccataaaactaatattgat 24654  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||| || |||| |||||||||||| || ||||| || ||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |    
T  24653 tggaataaattgcgtcgacttcgtcaatctatctacaaccacccaaatggtatcatgccctcttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccat-gga 24555  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  24554 atactatcccatttccacttcggcacatctaacggtgtcaacaacccagcaggcttctgatgt 24492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16495 - 16134
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  16495 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 16396  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||  ||||| |||||| ||||||| ||    
T  16395 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactacgctaccggataattgatattgat 16296  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| || |  | |||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  16295 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgttatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 16196  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16195 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 16134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 230 - 439
Target Start/End: Original strand, 5 - 210
Alignment:
Q  230 tgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaat 329  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  5 tgaatataaatctcagccaactgagc----ggataactgatgttaataggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaat 100  T
Q  330 catgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 429  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  101 catgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctacagg 200  T
Q  430 cctctgatgt 439  Q
    | ||||||||    
T  201 cttctgatgt 210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 189 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14867 - 14618
Alignment:
Q  189 acactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtg 288  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||| || ||    
T  14867 acacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccggcaactgagctaccggataactaagattgatcggaataaattg 14768  T
Q  289 cgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccat 388  Q
     |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||     
T  14767 tgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccac 14668  T
Q  389 ttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  14667 ttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagtcttctgatg 14618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 189 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23046 - 22797
Alignment:
Q  189 acactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtg 288  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||| || ||    
T  23046 acacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccggcaactgagctaccggataactaagattgatcggaataaattg 22947  T
Q  289 cgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccat 388  Q
     |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||     
T  22946 tgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccac 22847  T
Q  389 ttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| | |||||||    
T  22846 ttccactccggcacatccaacggtgtcaacaacccagcagtcttctgatg 22797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 17883 - 18233
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| || || |    
T  17883 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaatctcg 17982  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||  |||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  17983 gatctctatcccacacaatactcgatagaactccatgcaactttacaatattatgaatataaacctccgccgactgagctactggataactaatattgat 18082  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||           |||||||| || | ||||||| | | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  18083 cggaataaagtgtgccgacttcgtca-----------acaacccaaatggcatcatgctctcacggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 18171  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||||    
T  18172 atgatgtcccacttccactctggcacatctaacggagtcaacaaccctgaaggcttctgatg 18233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 77 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 33101 - 32739
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  33101 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaatcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 33002  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| |||   ||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||||  || |||||  ||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  33001 gatccctatccgacgaaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatgctatgaacataaatctctaccaactgtgctaccgggtaactgacattaat 32902  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| |   ||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  32901 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgatagcaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaacttgtcacgaaatccatagaa 32802  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32801 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 32739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 26785 - 27146
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| |||||      
T  26785 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctca 26884  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||  || || |||| |||||||||| | ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  26885 gatccctatccgacacaatacttgacgatacaccgtgcagcttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgat 26984  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| |  |  |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||     
T  26985 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaacagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacgaaatccatagag 27084  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    || || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27085 atactgtcccacttccactacggtacatcaaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 27146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 218 - 390
Target Start/End: Original strand, 49437 - 49609
Alignment:
Q  218 ttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaa 317  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  49437 ttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggttaactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacttgtcgaccacaa 49536  T
Q  318 cccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccattt 390  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49537 cccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgccacaaaatccatagaaatgctatcccattt 49609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 140 - 439
Target Start/End: Original strand, 12081 - 12380
Alignment:
Q  140 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 239  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   ||||||| |    
T  12081 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcgggaatgtaaa 12180  T
Q  240 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 339  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| |  ||||| ||||  |||| |||  |    
T  12181 tctccaccaactgaggtacaggaaaactgatattactcgaaatgaaatgagccgacttcgtcaatccatctacaatcacccaaatcgcgtcattcccttt 12280  T
Q  340 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  12281 cgaagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtacatctaacggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatgt 12380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9865 - 9782
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaat 160  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  9865 tccgactgaccatatgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaat 9782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 438
Target Start/End: Original strand, 1428 - 1793
Alignment:
Q  73 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 172  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  1428 tcttttcgactaaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacttcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 1527  T
Q  173 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 272  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||| || || | ||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |    
T  1528 cttggatctctatctgacacaatgttcgatggaacaccttgtagcttcacaatctcgtgaatgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatgt 1627  T
Q  273 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 372  Q
    |||||  |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  ||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  1628 taatcagaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagcgtcatgtcctcttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 1727  T
Q  373 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
      | || |||||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  1728 gtatatactatcccatttccattctagcacatctaacggtgtcaacaacccagcaggtttctgatg 1793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Original strand, 19126 - 19454
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  19126 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 19225  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||    
T  19226 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaat 19325  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  19326 cggcagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 19425  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  19426 atactatctcatttccactctggcacatc 19454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 278
Target Start/End: Original strand, 50017 - 50218
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  50017 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 50116  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  50117 gatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaatatcaagaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 50216  T
Q  277 cg 278  Q
    ||    
T  50217 cg 50218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 405
Target Start/End: Original strand, 34613 - 34878
Alignment:
Q  140 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 239  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || |    
T  34613 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaa 34712  T
Q  240 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 339  Q
    |||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| ||    
T  34713 tctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaatcggcagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctct 34812  T
Q  340 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  34813 aggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatctcatttccactctggcacatc 34878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 25505 - 25158
Alignment:
Q  73 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 172  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  25505 tctttcagactgaccatctgtctccggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 25406  T
Q  173 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 272  Q
    | |||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||| |   ||||||| ||||| |||||||||| |||  || ||||||| |    
T  25405 catggaactctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaatctcacgaatgtaaatctctgccaactgagatacaagaaaactgatgt 25306  T
Q  273 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 372  Q
    |||| | |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  25305 taattggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagcgtcatgccctcttggagtattcggcaaactcgtgacaaaatccat 25206  T
Q  373 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 420  Q
     || |  |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  25205 ggatacactatcccatttccactacggcacatctaacggtgtcaacaa 25158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 219197 - 218838
Alignment:
Q  79 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 178  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||     
T  219197 cgactgaccatctgtctgcggatgataccccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttgga 219098  T
Q  179 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 278  Q
    ||||||| ||| || || ||||| ||||| |||||  ||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  219097 tctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgtcacttcacaatatcgcgaatgtaaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaatcg 218998  T
Q  279 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 378  Q
     ||| || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| |  || || |||||||||||||| || ||    
T  218997 gaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcgacaagctcgtcacaaaatccatggatat 218898  T
Q  379 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  218897 gctatcccatttccactctggtatatctaatggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 218838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 405
Target Start/End: Original strand, 229563 - 229895
Alignment:
Q  73 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 172  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||  | || || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||| |||  |||||||     
T  229563 tctttccgactgaccatttgtctgcgaatgatacgccgaactcaaccttaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttttccaaactctataagtaaat 229662  T
Q  173 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 272  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||    
T  229663 cttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatat 229762  T
Q  273 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 372  Q
    |||||| ||| || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  229763 taatcggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 229862  T
Q  373 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
     || || ||||| || |||||||| || |||||    
T  229863 ggatatactatcacaattccactctggcacatc 229895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 4555 - 4916
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  4555 tccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 4654  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||   ||||||| || |||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  4655 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcataatatcgcgaatgtaaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaat 4754  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  |  ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  4755 cggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttatgagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggat 4854  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||  || ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  4855 atgctatcccatttccactctagaacatataaaggtgtcatcaaacctgcaggtttctgatg 4916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 78 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 19783 - 19451
Alignment:
Q  78 ccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgg 177  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||  |||||| |||| ||||| |||||||| |||||    
T  19783 ccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaacttttccataatctagaagtaaatcttgg 19684  T
Q  178 gtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatc 277  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||    
T  19683 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatc 19584  T
Q  278 gaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaa 377  Q
    | ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  | || |||  | |||||||| |  | ||| |||||||||||||| || |    
T  19583 ggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgttattccctttaggagtatttgtcatactcgtcacaaaatccatggata 19484  T
Q  378 tgctatcccatttccactccggtacatccaacg 410  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19483 tactatcccatttccactctggaacatctaacg 19451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 32534 - 32207
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  32534 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 32435  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||| ||| || || |||||  |||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  32434 gatctctatttgatac-attctcgaaagaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatgtaaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaat 32336  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || |||||| || | |||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  32335 cggaatgaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 32236  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32235 atgctatcccatttccactctggtacatc 32207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 410
Target Start/End: Original strand, 6573 - 6906
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||| | ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  6573 tccgactgactatctatttgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 6672  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  6673 gatctctatctgacacaatggtcgaaggaacaccatgcaacttcagaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 6772  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||  || |  |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  6773 cggaagaaaataagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 6872  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 410  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  6873 atactatcccatttccactcaggcacatctaacg 6906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 438
Target Start/End: Original strand, 3660 - 4025
Alignment:
Q  73 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 172  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  3660 tctttccgactgaccatttgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 3759  T
Q  173 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 272  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   | || || ||||||||||||||||  || ||| |||||||||    
T  3760 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcggatataaatctccgccaactgagacacaggaaaactgatat 3859  T
Q  273 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 372  Q
    |||||| |||||| || ||||||||   ||| || ||||| |  ||| | ||||  |||| |||  ||||||| || |  ||||| ||||||||||||||    
T  3860 taatcggaatgaaatgagccgacttgtgcaatctatctacaatcacctaaatcgcgtcattccctttcggagtgttcgaaaaactcgtcacaaaatccat 3959  T
Q  373 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
     || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||  ||||||||  |||||||    
T  3960 ggatatactatcccatttccactctggcacatctaaaggtgtcatcagccctgcaggtttctgatg 4025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 77 - 396
Target Start/End: Original strand, 1991 - 2310
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  1991 tccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 2090  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | |||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| ||||||||||||     
T  2091 ggtctctatctgatacaatgctcgacggaacacgatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaag 2190  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||  || || | |||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| |  ||||| || ||||||||||| ||     
T  2191 cggaagaaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcgacaaactcgttacaaaatccatggat 2290  T
Q  377 atgctatcccatttccactc 396  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2291 atgctatcccatttccactc 2310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 77 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 16198 - 15859
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||  | | ||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  16198 tccgactgaccatttgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctattgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 16099  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| || |||||||||| ||  |  ||| |||||||||||||    
T  16098 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatcgcgaatgtaaatttccgccaacttagacataggaaaactgatattaat 15999  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| || || | |||||||||||| || || || |  ||||| ||||  ||||  ||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  15998 cggaataaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcatttcctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 15899  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 416  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  15898 atgctatcccatttccactctggtacatctaaaggtgtca 15859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 255 - 438
Target Start/End: Original strand, 20096 - 20279
Alignment:
Q  255 ctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaa 354  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| ||   ||||||||| |||||||| || |||||    
T  20096 ctaccggataactgatattaataggaatgaagtgtgccgatttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatgtcatcatgccctctcggagtgttcggtaa 20195  T
Q  355 acttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20196 acttgtcacgaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 255 - 438
Target Start/End: Original strand, 22916 - 23099
Alignment:
Q  255 ctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaa 354  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| ||   ||||||||| |||||||| || |||||    
T  22916 ctaccggataactgatattaataggaatgaagtgtgccgatttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatgtcatcatgccctctcggagtgttcggtaa 23015  T
Q  355 acttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  23016 acttgtcacgaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 23099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 258
Target Start/End: Original strand, 1052 - 1233
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||  ||||| ||||| |||||      
T  1052 tccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttcctgaatctagaagtgaacctca 1151  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctac 258  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| || | ||| || |||||||||||||| |||||    
T  1152 gatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaatgttatcaatataaatctccgccaactgtgctac 1233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 258
Target Start/End: Original strand, 12582 - 12682
Alignment:
Q  158 aatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagcta 257  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  12582 aatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgtgcta 12681  T
Q  258 c 258  Q
    |    
T  12682 c 12682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4189 - 3872
Alignment:
Q  75 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  4189 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 4090  T
Q  175 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 274  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||    
T  4089 tggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatatta 3990  T
Q  275 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 374  Q
    ||||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  3989 atcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcattccctgtaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 3890  T
Q  375 aaatgctatcccatttcc 392  Q
    | || |||||||||||||    
T  3889 atatactatcccatttcc 3872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 392
Target Start/End: Original strand, 9118 - 9435
Alignment:
Q  75 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  9118 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 9217  T
Q  175 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 274  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||    
T  9218 tggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatatta 9317  T
Q  275 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 374  Q
    ||||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  9318 atcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcattccctgtaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 9417  T
Q  375 aaatgctatcccatttcc 392  Q
    | || |||||||||||||    
T  9418 atatactatcccatttcc 9435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 33357 - 33039
Alignment:
Q  75 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 174  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  33357 tttccggctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 33258  T
Q  175 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 274  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || ||  || |||| ||||||    
T  33257 tggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaagaaaactaatatta 33158  T
Q  275 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 374  Q
    ||||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  33157 atcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcattccctgtaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 33058  T
Q  375 aaatgctatcccatttcca 393  Q
    | || ||||||||||||||    
T  33057 atatactatcccatttcca 33039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 429
Target Start/End: Original strand, 9490 - 9846
Alignment:
Q  73 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 172  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||  | || || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  9490 tctttccgactgacaatctgtctgcggatgatatgccgaacttaacctaaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 9589  T
Q  173 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 272  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||  |||| ||||| | |||||||||||   ||||||| || ||| |||||||||  || ||| |||||||||    
T  9590 cttggatctctatctgatacaatgctcgaatgaacaccatgtagcttcacaatatcgcgaatgtaaatttcctccaactgagacacaggaaaactgatat 9689  T
Q  273 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 372  Q
    |||||| |||||| || || || ||||| || || || || |  ||||| |||  ||||| |||  ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  9690 taatcggaatgaaatgagctgatttcgttaatctatcaacaattacccaaatcacatcattccctttcgtagtattcggaaaactcgtcacaaaatccat 9789  T
Q  373 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 429  Q
     || || |||||| |||||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  9790 ggatatactatcctatttccactctggcacatctaacggtgtcatcaaccctgcagg 9846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 476 - 160
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||  || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  476 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacctcagcttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 377  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||  |||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |  ||| |||| ||||||||    
T  376 gatctctatcacacacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaataggaaaactaatattaat 277  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  276 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 177  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  176 atactatcccatttcca 160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Original strand, 14884 - 15212
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14884 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14983  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||  || || ||| |||| ||||||||    
T  14984 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaaccccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactaggcaacaggaaaactaatattaat 15083  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  | ||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  15084 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattagccaaattgcatcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 15183  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||    
T  15184 atactatcccatttccattctggtacatc 15212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 1144 - 1460
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  1144 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaattcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 1243  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  1244 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 1343  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || | |||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  1344 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcgttccctctagaagtatttggcaaacttgtcacaaaatccatggat 1443  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  1444 atactatcccatttcca 1460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 214 - 430
Target Start/End: Original strand, 28718 - 28934
Alignment:
Q  214 caacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctacc 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||| |  ||     
T  28718 caacttcacaatattatgaatgtaaatctccaccaactgagctaccggaaaactaatattgatcggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatagaca 28817  T
Q  314 acaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtg 413  Q
    |||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| || ||||| ||| |||    
T  28818 acaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgttgtcccacttccactctggcacatctaacagtg 28917  T
Q  414 tcaacaaacctgcaggc 430  Q
    | ||||| |||||||||    
T  28918 ttaacaaccctgcaggc 28934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 219
Target Start/End: Original strand, 37726 - 37868
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  37726 tccgactgaccatctgtttgcggatgataggctgaactgaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 37825  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaactt 219  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||    
T  37826 gatctctatccgacacaatgctcgatggaaccccatacaactt 37868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 405
Target Start/End: Original strand, 29578 - 29797
Alignment:
Q  187 tgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaag 286  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||  ||     
T  29578 tgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaa 29677  T
Q  287 tgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac-aaaatccatagaaatgctatcc 385  Q
    || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| |||  | ||||||| | | ||||| ||||| ||||||||| || || ||||||    
T  29678 tgagccgacttcgtcaatctttcaacaatcacccaaattgcgtcattccctttaggagtatcatgcaaactcgtcacaaaaatccatggatatactatcc 29777  T
Q  386 catttccactccggtacatc 405  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  29778 catttccactctggcacatc 29797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 251
Target Start/End: Original strand, 4399 - 4573
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  4399 tccgactgaccatctctctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 4498  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 251  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  4499 gatctctttccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaact 4573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 439
Target Start/End: Original strand, 4581 - 4662
Alignment:
Q  358 tgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4581 tgtcacaaaatccatggatatgctataccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 4662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 140 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 39730 - 39465
Alignment:
Q  140 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 239  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |    
T  39730 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaaa 39631  T
Q  240 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 339  Q
    |||| ||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  |    
T  39630 tctctgccaactgagaaacaggaaaactgatactaatcgaaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattcccttt 39531  T
Q  340 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  39530 aggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatctcatttccactctggcacatc 39465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 605 - 277
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  605 tccgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctctttcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 506  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  505 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 406  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || ||||||||| |||| || || || |  ||||| ||||  |||| | | || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||     
T  405 cggtagaaaatgagccgacttcatcaatctatcaactatcacccaaatcgcgtcattctctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaactccatggat 306  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || || |||||||||||||| || |||||    
T  305 atactgtcccatttccactctggcacatc 277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 63813 - 63485
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||   | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  63813 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccagagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 63714  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||| | ||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  63713 gatctttttctgatataatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctttatataaatctctgccaactgagcaacaggaaaactgatattaat 63614  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||| ||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||  |     
T  63613 cggtagaaaatgagccgacgtcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgcat 63514  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  63513 atactatcccatttccactctggcacatc 63485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 14861 - 14522
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  14861 tccgactgaccatctgtccgcgggtgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaacctcg 14762  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| |  ||  | |||||||| ||||| | |||||||||||   | ||||| ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  14761 gatctctatctgataaaatgtttgacggaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaatctctgccaactgagatacaggaaaactgatgttaat 14662  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || |||||| || ||||||||||| || || ||||| |  ||||| || |  |||| |||  |||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||     
T  14661 cggaatgaaatgagccgacttcgttaatctatctacaatcacccaaatagcgtcattcccattcggagtattcggcaaactcgtcacaaattccatggat 14562  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 416  Q
    || ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  14561 atactatctcatttccactctggcacatctaaaggtgtca 14522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 81 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 4232 - 3911
Alignment:
Q  81 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 180  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  ||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  4232 actgaccatctgtgtgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctataagtaaatcttggatc 4133  T
Q  181 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 280  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||||||| |    
T  4132 tctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttcgcgaatgtaaatctccgccaactaagacacgggaaaactgatattaatcgga 4033  T
Q  281 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 380  Q
    || || |  || ||||||||||| || |   | |||| ||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  4032 ataaactaagctgacttcgtcaatctat---caacaatccaaatcgtgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgc 3936  T
Q  381 tatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    |||||||||||||||| || |||||    
T  3935 tatcccatttccactctggaacatc 3911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 254
Target Start/End: Original strand, 130672 - 130849
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  130672 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 130771  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgag 254  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  130772 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgag 130849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 29161 - 28963
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  29161 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaag-aaatcttg 29063  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||| | ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| || ||||| || || ||| |||||||||||||    
T  29062 gatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgctaactgggcaacaggaaaactgatattaat 28963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 212
Target Start/End: Original strand, 59287 - 59413
Alignment:
Q  86 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 185  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||| | || || |||||   ||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  59287 ccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactctcccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 59386  T
Q  186 ctgacactatactcgacggaaccccat 212  Q
    |||| || ||||| |||||||| ||||    
T  59387 ctgatacaatacttgacggaacaccat 59413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 28890 - 28826
Alignment:
Q  341 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  28890 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 28826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 438
Target Start/End: Original strand, 15401 - 15762
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  15401 tccgactgaccatctgtctgaggatgatatgtcgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 15500  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||   | || || |||||||| |||||||  || ||| |||  || |||||    
T  15501 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaactttacaatatcacggatataaatctccgcgaactgagacacaggagaaccaatgttaat 15600  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||| || || ||||||||| |||| |  || || |  ||||| ||||  |||| ||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  15601 cggaataaaatgagccgacttcatcaatccatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctctcgtagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggat 15700  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  15701 atgctatcccatttccactatggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 15762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 113266 - 112953
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||| |||| ||||| |    
T  113266 gactgaccatctgtctgcggatgacacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggat 113167  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 279  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |   |||| || || ||  |||||||||  || ||| |||| |||||||| |     
T  113166 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctggaatataaatttcttccaactgagaaacaggaaaactaatattaattgg 113067  T
Q  280 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 379  Q
    || ||| || |||||||||||||| || || || || ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||    
T  113066 aaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatg 112967  T
Q  380 ctatcccatttcca 393  Q
    ||||||||||||||    
T  112966 ctatcccatttcca 112953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 3596 - 3268
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||    
T  3596 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctttatgtaaatcttg 3497  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| | || ||| || ||||| |||||||| |  ||  || |||||||||||||    
T  3496 gatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttaatatatatctctgccaactgggtaacaagaaaactgatattaat 3397  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||| ||||| || || || |  ||||| |||   |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  3396 cggtagaaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcccgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 3297  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  3296 atactatctcatttccactctggcacatc 3268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 277
Target Start/End: Original strand, 13011 - 13211
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  13011 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 13110  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  13111 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 13210  T
Q  277 c 277  Q
    |    
T  13211 c 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 393
Target Start/End: Original strand, 13256 - 13308
Alignment:
Q  341 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 393  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  13256 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 13308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Original strand, 220 - 548
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||    ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  220 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaggctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 319  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||    |||| || ||||| ||||||||||  || |||  ||||||||||||    
T  320 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaataccacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaagactgatattaat 419  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    |  ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |      
T  420 cagaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaattcatgggt 519  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  520 atactatcccatttccactctggcacatc 548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 7921 - 8237
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  7921 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8020  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||| |||||||||||| | ||  || || ||||| || ||| | || ||  || |||| ||||||||    
T  8021 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatacaacttcacaatctccttgatataaatctctgctaacagggcaacaagaaaactaatattaat 8120  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || ||||||||| ||||||| || || |||||||| || |  || | ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  8121 cggtagaaaatgagccgacttcatcaacctatcaacaacaacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggaaaacttgtcacaaaatccattgat 8220  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  8221 atactatcccatttcca 8237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 4881 - 4553
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  4881 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatcccaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 4782  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| |  || ||  |||| ||||||||    
T  4781 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggaaacagggaaactaatattaat 4682  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || || ||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || || || |||||||||||||| ||     
T  4681 cggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaagctcgtcacaaaatccatggat 4582  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  4581 atactatcccatttccactctggcacatc 4553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 7463 - 7779
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  7463 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 7562  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| ||||| || || || ||  |||| ||||||||    
T  7563 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaattgggcaacagggaaactaatattaat 7662  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    |   |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  7663 ctgtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatccatggat 7762  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  7763 atactatcccatttcca 7779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Original strand, 16179 - 16507
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||    
T  16179 tccgactgaccatctgtctgaggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtatatcttg 16278  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||| |||  | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  16279 gatctctatatgatgcaattctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 16378  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    |  ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||     
T  16379 cagaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcatcattcccattaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatcgatggat 16478  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  16479 atactatcgcatttccactctggcacatc 16507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18987 - 18761
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||| || ||||  ||  | ||||  |||||  |||||||||| |||||||||||      
T  18987 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacgcaacctcaacttagaacttaaagcctctttcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctca 18888  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| || ||||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  18887 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatcgcgaatgtaaatttccgccaactgagatacaagaaaactgatattaat 18788  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 303  Q
    || |||||| || ||||||||||||||    
T  18787 cggaatgaaatgagccgacttcgtcaa 18761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 410
Target Start/End: Original strand, 25498 - 25831
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  25498 tccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 25597  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | | ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  | ||| || ||||  |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  25598 gatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaatctctttaatataaatctttgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 25697  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  |||| ||| |   ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  25698 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcattccctccatgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 25797  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 410  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  25798 atactatcccatttccattctggcacatctaacg 25831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 287 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 633 - 482
Alignment:
Q  287 tgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatccc 386  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||  || |  |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  633 tgcgctgacttcgtcaacctatcgacaacaaccctaatggtgtcatgccctctcggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggaaatgctatccc 534  T
Q  387 atttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  533 acttccactcaggtacatctaacggtgtcaac-aacctgcatgcttctgatgt 482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 253
Target Start/End: Original strand, 622 - 798
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  622 tccgtctgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcg 721  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactga 253  Q
    | ||||||||   ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  722 gatctctatccaccacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaatattgtgaatataaatctccgccaactga 798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 405
Target Start/End: Original strand, 2914 - 3226
Alignment:
Q  93 tctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacac 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  2914 tctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 3013  T
Q  193 tatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgcc 292  Q
     || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||| ||||  ||  || || | |||||||||| ||  || || |||    
T  3014 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaattgagaaacaagaaaattaatattaatcggaagaaaatgagcc 3113  T
Q  293 gacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcc 392  Q
    || |||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  3114 gaattcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcc 3213  T
Q  393 actccggtacatc 405  Q
    |||| || |||||    
T  3214 actctggcacatc 3226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 350 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 7654 - 7566
Alignment:
Q  350 ggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  7654 ggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccagtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 7566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 7890 - 8206
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||| ||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  7890 tccgcctgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 7989  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    |  |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  7990 gacctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 8089  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || ||||| |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8090 cggtagaaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 8189  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  8190 atactatcccatttcca 8206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 22391 - 22707
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  22391 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 22490  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  22491 gatctctatctgatacaatgctcgaagaaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 22590  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || |  || ||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22591 cggtagaaaataagcagacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgtcccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22690  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  22691 atactatcccatttcca 22707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 153 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 8793 - 8541
Alignment:
Q  153 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 252  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || |||||  |||||||    
T  8793 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctaccaactg 8694  T
Q  253 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 352  Q
    ||  || ||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| || || || |  ||| | ||||  |||| |||  | |||||||| ||     
T  8693 agaaacaggaaaactgatattaatcggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcaccaaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggc 8594  T
Q  353 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8593 aaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggtacatc 8541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 393
Target Start/End: Original strand, 65933 - 66245
Alignment:
Q  81 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 180  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  65933 actgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 66032  T
Q  181 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 280  Q
     |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| ||||  |||||||||      
T  66033 cctatctgatacaatactcgaaggaacaccatgtaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactattattaatcggt 66132  T
Q  281 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 380  Q
    |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | |||   |||  | |||||||| || || || |||||||||||||| || || |    
T  66133 agaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgctccctttaggagtattcggcaagctcgtcacaaaatccatggatatac 66232  T
Q  381 tatcccatttcca 393  Q
    |||||||||||||    
T  66233 tatcccatttcca 66245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 39601 - 39274
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||||||  | ||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  39601 tccgactgac-atctgtctgtggatgatacgccgaactcaatcttaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttcgaaaatctagaagtaaatcttg 39503  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||  |||| | || ||| || |||||  | ||||| || |  ||| |||||||||||||    
T  39502 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaactttgcaatctccttaatataaatctctactaactgggcaataggaaaactgatattaat 39403  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||     
T  39402 tggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcagcaaactcgtcacaaaatccatggat 39303  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  39302 atactatcccatttccactctggcacatc 39274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 68373 - 68199
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||||||||||  | || || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||      
T  68373 tccgactgaccatctatttgtgggtgataagccgaagtcaatctcaactttgaacccaagttctcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctca 68274  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 251  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  68273 gatctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaact 68199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 404
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4722
Alignment:
Q  107 gccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaa 206  Q
    |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  4425 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 4524  T
Q  207 ccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacct 306  Q
    | ||||| |||||||||||||   ||||||| || ||||| ||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||    
T  4525 caccatgtaacttcacaatatctcgaatgtaaatttccgctaactgagatacaagaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatct 4624  T
Q  307 gtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacat 404  Q
     |  || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  4625 ataaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctattctatttccactctggtacat 4722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 404
Target Start/End: Original strand, 11555 - 11852
Alignment:
Q  107 gccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaa 206  Q
    |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  11555 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 11654  T
Q  207 ccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacct 306  Q
    | ||||| |||||||||||||   ||||||| || ||||| ||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||    
T  11655 caccatgtaacttcacaatatctcgaatgtaaatttccgctaactgagatacaagaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatct 11754  T
Q  307 gtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacat 404  Q
     |  || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  11755 ataaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctattctatttccactctggtacat 11852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 938 - 1254
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  938 tccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 1037  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||   ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  1038 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatccccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 1137  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || |  ||||| || |  ||   ||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  1138 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaatcacccaaattgtgtcgctccatctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 1237  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  1238 atactatcccatttcca 1254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 405
Target Start/End: Original strand, 1197 - 1528
Alignment:
Q  74 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 173  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||| |||| || ||||| ||  | || || |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  1197 ctttcggactgaccatatgtctgaggatgatacgccaaactcaatctcaacttagaacctaaagcctcctgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 1296  T
Q  174 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 273  Q
    || | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |   |||| || ||||| ||||||||||  || | | |||||||| |    
T  1297 ttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttgacgaatatatatctctgccaactgagacacagaaaaactgatact 1396  T
Q  274 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 373  Q
    ||||| ||  || || |||||||| ||||| || || || |  ||||| |||| ||||| |||  | |||||||| || ||| | ||||||||||||||     
T  1397 aatcggaagaaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcatcattccctttaggagtattcggcaaagtcgtcacaaaatccatg 1496  T
Q  374 gaaatgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  1497 gatatactatcccatttccactctggcacatc 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 116691 - 116368
Alignment:
Q  73 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 172  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  116691 tcttttcgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 116592  T
Q  173 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 272  Q
    || || ||||||||||| || || ||||||| ||| ||||| | |||||||||||   | ||||| |||||||||||||| | ||  ||  || || | |    
T  116591 ctcggatctctatctgatacaatgctcgacgaaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaatctccgccaactgggatagaggtaaattgttgt 116492  T
Q  273 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 372  Q
    ||||   |||||| || | |||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  116491 taatatgaatgaaatgagtcgacttcgtcaatctctccacaatcacccaaatagcgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 116392  T
Q  373 agaaatgctatcccatttccactc 396  Q
     || || |||||||||||||||||    
T  116391 ggatatactatcccatttccactc 116368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 197260 - 196941
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  197260 tccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 197161  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||| ||| || || ||||| ||||| |||| |||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  197160 gatctctatttgatacaatgctcgaaggaacgccatacaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 197061  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || || ||||||||||| || || || |  | ||| ||||  |||| ||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||     
T  197060 cggtagaaaatgtgctgacttcgtcaatctatcaacaatcatccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggctaactcgtcacaaaatccatggat 196961  T
Q  377 atgctatcccatttccactc 396  Q
    ||  ||||||||||| ||||    
T  196960 atattatcccatttcgactc 196941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Original strand, 6538 - 6866
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| |||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||| ||| |||||||| ||||    
T  6538 tccgactaaccatctgtctacggatgatacgccgaacacaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaattctagaagtaaatcttg 6637  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||  || || || |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  6638 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctaaaaataaatatctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 6737  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||| | |  ||||| |||||||||||||| ||     
T  6738 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctataggagtaatcgacaaactcgtcacaaaatccatggat 6837  T
Q  377 atgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  6838 atactatcccatttccactctggcacatc 6866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Original strand, 8314 - 8630
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  8314 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacatcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaaactagaagtaaatcttg 8413  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| ||| |||||||   ||  || || ||||| |||||||| || |  ||| |||| ||||||||    
T  8414 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgtaacctcacaatcaccttgatataaatctctgccaactgggcaataggaaaactaatattaat 8513  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |   |||| || | ||| | ||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8514 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattgcccaaattgcatcgttccctctctgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 8613  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||||||||||||    
T  8614 atactatcccatttcca 8630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 396
Target Start/End: Original strand, 5745 - 6064
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||| || ||| |||| | ||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  5745 tccgactaacaatctgtctacagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 5844  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||  ||||||| ||  || ||| |||||||||||||    
T  5845 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatattacgaatataaatctatgccaacttagaaacaggaaaactgatattaat 5944  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    || ||  || ||  ||||||||||||| ||  | |  |  ||||| || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| |      
T  5945 cggaagaaaatgaaccgacttcgtcaatctacccataatcacccaaattgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgggt 6044  T
Q  377 atgctatcccatttccactc 396  Q
    || |||||||||||||||||    
T  6045 atactatcccatttccactc 6064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 80276 - 80075
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||  |||||  ||||||||||| ||||||| ||||    
T  80276 tccgaatgaccatctgtccgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctctttcaaactcttccaaaatctttaagtaaatcttg 80177  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||| | ||||| ||||||||||||||||| |  | ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  80176 gatctctatctgatacaatgctctaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 80077  T
Q  277 cg 278  Q
    ||    
T  80076 cg 80075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 126985 - 126953
Alignment:
Q  73 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgata 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  126985 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgata 126953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 217 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 7533 - 7345
Alignment:
Q  217 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 316  Q
    |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| || || |      
T  7533 cttcacaatatcgcgaatgtaaatctccgccaactgagacacgggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagtcgacttcgtcaacctatcaacaatc 7434  T
Q  317 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    ||||| || |  |||| |||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  7433 acccaaatagcgtcattccctttgggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 7345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12763 - 12647
Alignment:
Q  73 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 172  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  12763 tctttccgactgaccatctatctgcggatgatacgctgaactgaacatcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 12664  T
Q  173 cttgggtctctatctga 189  Q
    ||  | |||||||||||    
T  12663 ctcagatctctatctga 12647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 362 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20938 - 20862
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20938 acaaaatccatagaaatgctgtcccatttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 27763 - 27729
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27763 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 27729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 991 - 844
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  991 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 892  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaa 224  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||    
T  891 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaa 844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 233 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 10434 - 10228
Alignment:
Q  233 atgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcat 332  Q
    ||||| ||||| ||||| || || || ||| |||| ||||||||   ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||| | | |||||    
T  10434 atgtaaatctctgccaattgtgccaccggaaaactaatattaattagaataaagtgtgctgacttcgtcaatctatcaaccaccacccatgtggcatcat 10335  T
Q  333 gccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcct 432  Q
    |||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || |||||| |    
T  10334 gccctctcgaggtatttggtaaacttgttacaaagtccatggatatgctatcccatttccattctggcacatctaatggtgtcaacaacccagcaggctt 10235  T
Q  433 ctgatgt 439  Q
    |||||||    
T  10234 ctgatgt 10228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 10522 - 10428
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaa 171  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||| || ||||||| || |||||    
T  10522 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagctgaactcaatctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttcgaaaatctagatgtaaa 10428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 8110 - 7797
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||   |||  |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8110 tccgactgaccatttttctttggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaa-cttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8012  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| |||||||||   || ||| |||| ||||||||    
T  8011 gatctctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaactga--aacaggaaaactaatattaat 7914  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 376  Q
    |  ||  || || | |||||||||||| || || || |  ||||| ||||  || | |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  7913 cagaagaaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtctttccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 7814  T
Q  377 atgctatcccatttcca 393  Q
    || ||||| ||||||||    
T  7813 atactatctcatttcca 7797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 5364 - 5031
Alignment:
Q  86 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 185  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||  |||  || ||||||||| | || || ||||   |||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  5364 ccatcggtctgcggatgatacgtcgaactcaaactcagcttagaacccaacgcctcctgcaaacccttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 5265  T
Q  186 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaa 285  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |    ||| || |||||||||| ||||| |||  || |||| || ||||||  ||| ||    
T  5264 ctgatacaatactcgacggaacaccatgtagcttcacaatctcacaaatataaatctccgccacctgagatacaagaaaactaatgttaatcagaataaa 5165  T
Q  286 gtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcc 385  Q
     || ||||| |||||||  || || |  |  ||||| |||| |||||| || ||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  5164 atgagccgaattcgtcagtctatccataattacccaaatcgcatcatgtcctctttgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat-gatatactatcc 5066  T
Q  386 catttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 420  Q
    || |||||||| || | ||| || |||||||||||    
T  5065 cacttccactctggaatatctaaaggtgtcaacaa 5031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 303
Target Start/End: Original strand, 9867 - 10093
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||  ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  9867 tccgactgatcatctgtttgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacgtaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 9966  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 276  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || |||||  |||||| ||  || ||| |||||||||||||    
T  9967 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctcccaactcagaaacaggaaaactgatattaat 10066  T
Q  277 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 303  Q
    || ||  || || | ||||||||||||    
T  10067 cggaagaaaatgagtcgacttcgtcaa 10093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5077 - 4953
Alignment:
Q  80 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  5077 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacttaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggat 4978  T
Q  180 ctctatctgacactatactcgacgg 204  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||    
T  4977 ctctatccgacacaatactcgacgg 4953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 405
Target Start/End: Original strand, 24098 - 24350
Alignment:
Q  153 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 252  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||  | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || |||| |||||||||    
T  24098 tccaaaatctagaagttaatcttggatctctatccgatccaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatcttcgccaactg 24197  T
Q  253 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 352  Q
     || || ||| |||||||||||||||  | ||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | | |||||| |      
T  24198 ggcaacaggaaaactgatattaatcggtaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctatagaagtattcgac 24297  T
Q  353 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    |||||  ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  24298 aaactcatcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 24350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 405
Target Start/End: Original strand, 1791 - 2117
Alignment:
Q  79 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 178  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| | |||||||| |||||||| |||||     
T  1791 cgacagaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttacaaaatctagaagtaaatcttgga 1890  T
Q  179 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 278  Q
    ||| ||||||| || ||  | || ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||| ||||  |  ||| |||| |||||||||     
T  1891 tctatatctgatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaattgagaaataggaaaactaatattaatct 1990  T
Q  279 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 378  Q
     ||  || || ||||||| ||||||  || | || |  ||||| ||||  |||| |||  |  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  1991 gaagaaaatgagccgactacgtcaatatgccaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaagagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatat 2090  T
Q  379 gctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
     ||||||||||||||||| || |||||    
T  2091 actatcccatttccactctggcacatc 2117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 216
Target Start/End: Original strand, 1523 - 1662
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||      
T  1523 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactaaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaactaa 1622  T
Q  177 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaa 216  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  1623 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 1662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 405
Target Start/End: Original strand, 1681 - 1745
Alignment:
Q  341 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 405  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||    
T  1681 ggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccacttccactctggcacatc 1745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 339 - 438
Target Start/End: Original strand, 17467 - 17566
Alignment:
Q  339 tcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  17467 tcggagtgttcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggaacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 17566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 439
Target Start/End: Original strand, 34015 - 34074
Alignment:
Q  380 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  34015 ctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggattctgatgt 34074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 11839 - 11618
Alignment:
Q  217 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 316  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||  | |  || |      
T  11839 cttcacaatatcgcggatgtaaatctccgcccactgagatataggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgagttcgtcaatatatgaacaatc 11740  T
Q  317 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 416  Q
    ||||  || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  11739 accccaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatattctatcccatttccactctggcacatctaaaggtgtca 11640  T
Q  417 acaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
     ||| ||||||||  |||||||    
T  11639 tcaaccctgcaggtttctgatg 11618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 18031 - 17810
Alignment:
Q  217 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 316  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||  | |  || |      
T  18031 cttcacaatatcgcggatgtaaatctccgcccactgagatataggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgagttcgtcaatatatgaacaatc 17932  T
Q  317 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 416  Q
    ||||  || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  17931 accccaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatattctatcccatttccactctggcacatctaaaggtgtca 17832  T
Q  417 acaaacctgcaggcctctgatg 438  Q
     ||| ||||||||  |||||||    
T  17831 tcaaccctgcaggtttctgatg 17810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 86213 - 85938
Alignment:
Q  156 aaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagc 255  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| ||  ||||        |||| || ||||||||||||||||     
T  86213 aaaatctagaagtaaatcttgggtctctatttgatacaatactcgacggaacaccatgtaatctcac--------gaatataaatctccgccaactgaga 86122  T
Q  256 tactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaa 355  Q
    ||  ||| || |||| ||||| | ||| || || ||||||||| |||  || || || |  ||||| |||| || ||| ||  | |||||||| ||  ||    
T  86121 tagaggaaaattgatgttaattggaataaaatgggccgacttcatcagtctatccacaattacccaaatcgcattatgtccttttggagtattcggacaa 86022  T
Q  356 cttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 439  Q
    || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||  || ||||| || ||||||||||| || |||||  ||||||||    
T  86021 ctcgtcacaaaatccatggatatattatcccacttccactttggaacatctaaaggtgtcaacaacccagcaggtttctgatgt 85938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 921 - 880
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtaca 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  921 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggtaca 880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17595 - 17524
Alignment:
Q  241 ctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctac 312  Q
    ||||||||||| || ||  ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || |||||    
T  17595 ctccgccaactaagatataggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatctac 17524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 251
Target Start/End: Original strand, 71830 - 71917
Alignment:
Q  164 gaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 251  Q
    |||||||||||| | || | ||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||| | || |||||||||||| |||||||    
T  71830 gaagtaaaccttagatcccgatccgacacaatactagacggaataccatgcaacctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 71917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33174 - 33021
Alignment:
Q  98 ggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatac 197  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| || |  |||||  || |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||| || || | ||||||||| ||||    
T  33174 ggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatac 33075  T
Q  198 tcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 251  Q
    | || ||||  ||||||||  ||||||| | || |||||||||||| |||||||    
T  33074 tagaaggaataccatgcaatctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 33021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 3372 - 3338
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3372 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 3338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 396
Target Start/End: Original strand, 3967 - 4001
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3967 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 4001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 396
Target Start/End: Original strand, 24203 - 24237
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24203 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 24237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 3441 - 3391
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  3441 acaaagtccatagaaatgctatcccacttccactccggcacaaacaacggt 3391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 396
Target Start/End: Original strand, 44347 - 44381
Alignment:
Q  362 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44347 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 44381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 251
Target Start/End: Original strand, 182 - 347
Alignment:
Q  86 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatctt-gaagtaaaccttgggtctcta 184  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||| || |  |||||   | |||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||| || || | |    
T  182 ccatcggtctggcgatgataagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagtagcttgcaaactt-tccaaaaacttagaactaaacctcggatcccga 280  T
Q  185 tctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 251  Q
    |||||||| | ||| || ||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  281 tctgacacaagactagaaggaataccatgcaacctcacaatatgctcaatgtagatctcagccaact 347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1701 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1701
Description:

Target: scaffold1701; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 70
Target Start/End: Original strand, 28 - 60
Alignment:
Q  38 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagc 70  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28 ttgatagccgtacacaccgtatgggcttccagc 60  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 117
Target Start/End: Original strand, 195 - 235
Alignment:
Q  77 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaa 117  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  195 tccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaa 235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University