View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10481A_low_289 (Length: 273)

Name: NF10481A_low_289
Description: NF10481A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10481A_low_289
NF10481A_low_289
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (8-273)||(31577474-31577739)
chr8 (13-273)||(15069456-15069716)
chr8 (8-273)||(27827874-27828136)
chr8 (52-273)||(43080491-43080712)
chr8 (52-273)||(18811597-18811818)
chr8 (8-273)||(17848415-17848680)
chr8 (13-271)||(4732426-4732684)
chr8 (16-271)||(34255650-34255906)
chr8 (13-259)||(41366135-41366383)
chr8 (78-268)||(5591656-5591846)
chr8 (13-127)||(29542940-29543054)
chr8 (64-271)||(16756505-16756712)
chr8 (64-181)||(28328727-28328844)
chr8 (64-152)||(4819484-4819572)
chr8 (64-152)||(28891612-28891700)
chr8 (65-152)||(33033488-33033575)
chr8 (202-273)||(41383542-41383613)
chr8 (52-144)||(15945514-15945606)
chr8 (52-152)||(26300515-26300615)
chr8 (220-273)||(21481385-21481438)
chr8 (51-152)||(10685074-10685175)
chr8 (52-97)||(18854028-18854073)
chr8 (51-152)||(35744566-35744667)
[»] chr3 (52 HSPs)
chr3 (8-273)||(4309690-4309955)
chr3 (8-273)||(18098351-18098616)
chr3 (8-273)||(5898222-5898487)
chr3 (8-273)||(43226890-43227155)
chr3 (52-273)||(5192463-5192684)
chr3 (8-273)||(10957506-10957768)
chr3 (52-273)||(456720-456941)
chr3 (52-273)||(6065017-6065238)
chr3 (8-273)||(7769368-7769633)
chr3 (16-273)||(11168914-11169168)
chr3 (75-273)||(23634258-23634456)
chr3 (8-273)||(27421451-27421716)
chr3 (13-271)||(7763039-7763297)
chr3 (13-271)||(29811637-29811895)
chr3 (29-255)||(9635281-9635507)
chr3 (16-271)||(23199283-23199538)
chr3 (17-256)||(5259468-5259707)
chr3 (16-271)||(37407457-37407712)
chr3 (41-268)||(15821855-15822082)
chr3 (16-258)||(6717294-6717536)
chr3 (13-259)||(32891870-32892115)
chr3 (8-256)||(15830378-15830626)
chr3 (16-271)||(10209969-10210224)
chr3 (16-258)||(4599864-4600106)
chr3 (78-268)||(22834215-22834405)
chr3 (16-271)||(10057013-10057268)
chr3 (16-271)||(10059235-10059490)
chr3 (16-271)||(10061457-10061712)
chr3 (16-271)||(10063679-10063934)
chr3 (16-271)||(10065901-10066156)
chr3 (52-152)||(5192815-5192915)
chr3 (64-181)||(6304130-6304247)
chr3 (64-152)||(10204936-10205024)
chr3 (64-152)||(22625224-22625312)
chr3 (65-152)||(10098041-10098128)
chr3 (64-183)||(54189327-54189446)
chr3 (202-273)||(28101382-28101453)
chr3 (64-145)||(10612022-10612103)
chr3 (64-152)||(10897853-10897941)
chr3 (64-152)||(29913200-29913288)
chr3 (64-152)||(47882133-47882221)
chr3 (64-152)||(16458314-16458401)
chr3 (235-273)||(1619882-1619920)
chr3 (13-58)||(23634455-23634500)
chr3 (202-257)||(3315511-3315566)
chr3 (202-273)||(43422844-43422915)
chr3 (202-273)||(53917048-53917119)
chr3 (51-152)||(8516270-8516371)
chr3 (52-97)||(9602711-9602756)
chr3 (52-97)||(16263540-16263585)
chr3 (51-152)||(32479516-32479617)
chr3 (56-152)||(28489984-28490080)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (8-273)||(72697-72962)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (8-273)||(27338313-27338578)
chr1 (8-273)||(13126917-13127180)
chr1 (8-273)||(28202880-28203144)
chr1 (52-273)||(51750871-51751092)
chr1 (52-273)||(16227002-16227223)
chr1 (8-273)||(28841256-28841518)
chr1 (52-273)||(47178196-47178417)
chr1 (8-273)||(20300965-20301227)
chr1 (8-273)||(3805311-3805583)
chr1 (16-273)||(8348259-8348510)
chr1 (13-268)||(31657975-31658230)
chr1 (13-256)||(28222563-28222806)
chr1 (13-271)||(50168492-50168750)
chr1 (107-273)||(51758368-51758534)
chr1 (57-271)||(14997764-14997978)
chr1 (202-273)||(16429782-16429853)
chr1 (208-273)||(50078174-50078239)
chr1 (64-152)||(2400469-2400557)
chr1 (64-180)||(9522545-9522661)
chr1 (202-262)||(29003345-29003405)
chr1 (125-268)||(16456489-16456632)
chr1 (202-273)||(25250655-25250726)
chr1 (14-139)||(45654851-45654975)
chr1 (13-93)||(776019-776099)
chr1 (202-273)||(6996418-6996489)
chr1 (208-262)||(28997635-28997689)
chr1 (183-255)||(33094183-33094255)
chr1 (202-257)||(31424408-31424463)
chr1 (202-273)||(31736850-31736921)
chr1 (193-259)||(45655021-45655087)
chr1 (52-97)||(19359703-19359748)
chr1 (52-97)||(47099683-47099728)
chr1 (56-152)||(41397420-41397516)
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (13-273)||(7093649-7093906)
chr7 (52-273)||(1048513-1048734)
chr7 (8-273)||(38394829-38395089)
chr7 (52-273)||(7350875-7351096)
chr7 (52-273)||(22135646-22135867)
chr7 (52-273)||(40550673-40550894)
chr7 (8-273)||(44725418-44725683)
chr7 (8-273)||(13289679-13289944)
chr7 (13-273)||(26213562-26213822)
chr7 (8-273)||(36293-36555)
chr7 (21-264)||(6047336-6047579)
chr7 (13-273)||(24816548-24816815)
chr7 (13-259)||(48490185-48490431)
chr7 (13-271)||(47675279-47675537)
chr7 (16-271)||(18391316-18391571)
chr7 (16-271)||(6593678-6593933)
chr7 (52-179)||(31157509-31157636)
chr7 (175-273)||(31159049-31159147)
chr7 (50-273)||(3890614-3890836)
chr7 (64-152)||(7070643-7070731)
chr7 (64-271)||(3324032-3324239)
chr7 (64-271)||(25406143-25406350)
chr7 (50-257)||(3903666-3903869)
chr7 (64-152)||(25352200-25352288)
chr7 (64-152)||(44015910-44015998)
chr7 (202-273)||(4294091-4294162)
chr7 (202-273)||(9679501-9679572)
chr7 (202-273)||(24749430-24749501)
chr7 (162-268)||(6570758-6570864)
chr7 (202-273)||(21678902-21678973)
chr7 (202-273)||(7471355-7471426)
chr7 (202-273)||(28486408-28486479)
chr7 (52-133)||(21988097-21988178)
chr7 (52-152)||(18412835-18412935)
chr7 (52-97)||(5818051-5818096)
chr7 (52-97)||(9186022-9186067)
chr7 (51-152)||(16884103-16884204)
chr7 (52-97)||(21645202-21645247)
chr7 (51-152)||(24262133-24262234)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (3-273)||(25462641-25462910)
chr6 (52-273)||(33309723-33309944)
chr6 (52-273)||(26067619-26067840)
chr6 (19-273)||(30444127-30444381)
chr6 (16-271)||(16567754-16568009)
chr6 (16-271)||(16651704-16651960)
chr6 (13-272)||(12158086-12158345)
chr6 (16-271)||(16553444-16553699)
chr6 (16-271)||(16630000-16630255)
chr6 (16-271)||(34165652-34165907)
chr6 (50-271)||(5408248-5408469)
chr6 (50-271)||(5412573-5412794)
chr6 (141-273)||(12910886-12911018)
chr6 (141-273)||(12936562-12936694)
chr6 (184-273)||(26931919-26932008)
chr6 (64-271)||(13879468-13879675)
chr6 (14-210)||(10456823-10457019)
chr6 (64-152)||(25942517-25942605)
chr6 (64-152)||(17694096-17694184)
chr6 (64-152)||(22350216-22350304)
chr6 (64-152)||(5165088-5165176)
chr6 (221-273)||(17012897-17012948)
chr6 (202-273)||(15533976-15534047)
chr6 (56-152)||(14738382-14738478)
chr6 (202-273)||(3631317-3631388)
chr6 (51-152)||(33331256-33331357)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (8-273)||(18467518-18467783)
chr5 (13-273)||(6745902-6746162)
chr5 (52-273)||(10750532-10750753)
chr5 (52-273)||(15356073-15356294)
chr5 (52-273)||(23665880-23666101)
chr5 (52-273)||(31543567-31543788)
chr5 (8-273)||(34478602-34478864)
chr5 (8-271)||(20505386-20505649)
chr5 (16-271)||(29721143-29721398)
chr5 (16-271)||(16408103-16408358)
chr5 (16-271)||(9788366-9788621)
chr5 (16-271)||(40380884-40381139)
chr5 (14-256)||(42427574-42427816)
chr5 (16-271)||(16545208-16545463)
chr5 (23-273)||(13694293-13694543)
chr5 (121-271)||(534527-534677)
chr5 (3-192)||(13486872-13487061)
chr5 (113-271)||(26171535-26171693)
chr5 (44-210)||(32584685-32584851)
chr5 (16-118)||(26173701-26173803)
chr5 (64-180)||(28788542-28788658)
chr5 (14-105)||(534672-534763)
chr5 (64-152)||(25446335-25446423)
chr5 (64-152)||(10628207-10628295)
chr5 (197-273)||(13294905-13294981)
chr5 (217-273)||(20043818-20043874)
chr5 (202-273)||(27911266-27911337)
chr5 (52-131)||(31781693-31781772)
chr5 (202-256)||(658869-658923)
chr5 (51-152)||(31397802-31397903)
chr5 (51-152)||(33790491-33790592)
chr5 (51-152)||(37557434-37557535)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (8-273)||(22133800-22134062)
chr4 (8-273)||(12400001-12400267)
chr4 (52-273)||(16933372-16933593)
chr4 (3-273)||(11007746-11008013)
chr4 (8-273)||(12402276-12402541)
chr4 (52-273)||(22781961-22782182)
chr4 (8-273)||(22045898-22046160)
chr4 (52-273)||(9175696-9175917)
chr4 (13-271)||(52094504-52094762)
chr4 (8-268)||(26558480-26558740)
chr4 (16-271)||(8394186-8394441)
chr4 (59-271)||(5872583-5872795)
chr4 (16-271)||(7123476-7123731)
chr4 (16-271)||(5136860-5137115)
chr4 (8-271)||(5206799-5207063)
chr4 (13-256)||(4588735-4588977)
chr4 (158-273)||(12395190-12395305)
chr4 (13-146)||(12740874-12741007)
chr4 (13-146)||(12749080-12749213)
chr4 (141-271)||(12743198-12743328)
chr4 (13-189)||(18913739-18913915)
chr4 (52-271)||(15313047-15313266)
chr4 (64-140)||(4559066-4559142)
chr4 (202-257)||(16454207-16454262)
chr4 (52-152)||(5147078-5147178)
chr4 (217-273)||(10113746-10113802)
chr4 (52-144)||(16633346-16633438)
chr4 (221-273)||(18536898-18536949)
chr4 (209-273)||(36920879-36920943)
chr4 (202-273)||(14788807-14788878)
chr4 (52-109)||(21549542-21549599)
chr4 (202-270)||(22802111-22802179)
chr4 (52-112)||(38983939-38983999)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (8-273)||(19503519-19503781)
chr2 (8-273)||(21519874-21520139)
chr2 (52-273)||(36560365-36560586)
chr2 (52-273)||(35217194-35217415)
chr2 (4-273)||(28569599-28569870)
chr2 (8-255)||(42019026-42019273)
chr2 (64-181)||(39680865-39680982)
chr2 (215-273)||(22405317-22405375)
chr2 (64-152)||(2737053-2737141)
chr2 (64-152)||(20054005-20054093)
chr2 (64-142)||(17932979-17933057)
chr2 (64-152)||(22716478-22716566)
chr2 (202-273)||(6263528-6263599)
chr2 (51-152)||(19348453-19348554)
chr2 (52-109)||(25402827-25402884)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (52-273)||(22960-23181)
[»] scaffold1899 (1 HSPs)
scaffold1899 (8-273)||(458-720)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (8-273)||(34384-34654)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (16-271)||(115371-115626)
[»] scaffold1908 (1 HSPs)
scaffold1908 (15-268)||(137-390)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (14-270)||(26559-26815)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (64-152)||(17173-17261)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (221-273)||(26284-26335)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (52-152)||(1684-1784)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (202-273)||(50852-50923)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (202-273)||(80700-80771)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (52-97)||(4059-4104)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (51-152)||(15119-15220)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (52-97)||(18804-18849)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Original strand, 31577474 - 31577739
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31577474 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcaattctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 31577573  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31577574 aaggtaatagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattcaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 31577673  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31577674 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcatggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 31577739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15069716 - 15069456
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || || |  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15069716 ctcttgagacacttaggccttcaccgtgttcatgaactctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 15069617  T
Q  113 aacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaaga 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  15069616 aacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcgatagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagt 15069517  T
Q  213 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15069516 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 15069456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27828136 - 27827874
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||| | || || ||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27828136 attccctcttgagacacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 27828040  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  || ||| |||||||    
T  27828039 aaggtaacagtgccttccttgccatatagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtataacttgatcctcatcct 27827940  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827939 caagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 27827874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 43080712 - 43080491
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  43080712 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 43080613  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43080612 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 43080513  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43080512 aactccgtaagttgctccatga 43080491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18811818 - 18811597
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  18811818 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagaccatggtatctttgaa 18811719  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18811718 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaaaagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 18811619  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18811618 aactccgtaagttgctccatga 18811597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17848680 - 17848415
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17848680 attccctcttgaaacagatatgccttcaccgttttcatcagctctcaagtccttggacttggtttgctccttggttctcaaagcagcttgaacttcttcc 17848581  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| |||||  |||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  17848580 aaggtgacagtgcctttttagccataaagcatgatatccttgaaagattcaaatgatctcggtagagcacacaagaagagtataattttatcttcatcct 17848481  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||    
T  17848480 taagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattgtattgaacttcgtaagttactccatga 17848415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4732684 - 4732426
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  |||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4732684 ctcttgaaacactaaggtcttcactgttttcatccgctctcatgtccttggacttggtcaactccttggtttttaaagccgcttgaacttcttccaaggt 4732585  T
Q  113 aacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaaga 212  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||     
T  4732584 gacagtgccttctttgctatagagcatggtatccttgaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagtcttgtcttcgtcctcaagt 4732485  T
Q  213 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  4732484 tgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctccat 4732426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 34255650 - 34255906
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  34255650 ttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccacttgaacttcttccaaggtgac 34255749  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatag-ttttatcttcatcctcaagatg 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  ||||| |||||||| ||    
T  34255750 agtgccttctttgccatagagcatgatatccttgaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgttcttcgtcctcaagttg 34255849  T
Q  215 cacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  34255850 cacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccat 34255906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 41366135 - 41366383
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41366135 ctcttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtctttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 41366234  T
Q  113 aacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaaga 212  Q
     || ||||||| ||||||||| ||||| ||||| || || |||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||      
T  41366235 gacggtgccttttttgccatagagcatggtatccttaaaggatccaaatgatctcggtaaaacacacaacaagagtatagctttatcttcgtcctcaatt 41366334  T
Q  213 tgcacctcaatattctccaagtc--atcaaggattttgttgaactccgt 259  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41366335 tgcacctcaatgttctccaaatcatatcaaggattttgttgaactccgt 41366383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 78 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5591846 - 5591656
Alignment:
Q  78 ttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcac 177  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||||| |||||    
T  5591846 ttggttctcaaagccgcttgaatttcttccaaggtgacggtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtagagcac 5591747  T
Q  178 acaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctc 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  5591746 acaacaagagtatagttttatcttcgtcctcaatttgcacctcaatgttctccaaatcatcaagaattttgttgaactccgtcaattgctc 5591656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 29543054 - 29542940
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||| | |||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  29543054 ctcttgaaacacttaggccttcactgttttcatccgctctcaagttcttggacttggtcaactccttgggtcttaaagccgcttgaacttcctccatggt 29542955  T
Q  113 aacagtgccttcttt 127  Q
     ||||||||||||||    
T  29542954 gacagtgccttcttt 29542940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 271
Target Start/End: Original strand, 16756505 - 16756712
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaaga 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   | ||| ||    
T  16756505 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaagga 16756604  T
Q  164 tctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagt 263  Q
     || |||||||||||||| | | |||  | |||||| || || || ||||  || || || ||| |||| |||||||  || || ||||||||||| |||    
T  16756605 cctaggtaaagcacacaataggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 16756704  T
Q  264 tgctccat 271  Q
    ||||||||    
T  16756705 tgctccat 16756712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 28328844 - 28328727
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaaga 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   | ||| ||    
T  28328844 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaagga 28328745  T
Q  164 tctcggtaaagcacacaa 181  Q
     || ||||||||||||||    
T  28328744 cctaggtaaagcacacaa 28328727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Original strand, 4819484 - 4819572
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4819484 acttggttaactctttggttcttaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaa 4819572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 28891700 - 28891612
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28891700 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgctctctttgccataaagcatagtatccttgaaa 28891612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 33033575 - 33033488
Alignment:
Q  65 cttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  33033575 cttggttaactctttggttctcaaaactgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccttctttgccataaagcattgtatccttgaaa 33033488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41383613 - 41383542
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  41383613 catcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatga 41383542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15945606 - 15945514
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtat 144  Q
    |||| |||||| | ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  15945606 tcaactccttgaatttggttagctttttggttctcaaagccgcttggacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcattgtat 15945514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 152
Target Start/End: Original strand, 26300515 - 26300615
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || || ||||| |||||    
T  26300515 tcaagtccttgaacttggtcaattcattggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 26300614  T
Q  152 a 152  Q
    |    
T  26300615 a 26300615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21481438 - 21481385
Alignment:
Q  220 caatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||    
T  21481438 caatatactccaagtcatcaaggattctgttgaactccgcaaggttctccatga 21481385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 10685175 - 10685074
Alignment:
Q  51 ctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttga 150  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || || ||||| ||||    
T  10685175 ctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttga 10685076  T
Q  151 aa 152  Q
    ||    
T  10685075 aa 10685074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 18854073 - 18854028
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttg 97  Q
    ||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  18854073 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttg 18854028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 152
Target Start/End: Original strand, 35744566 - 35744667
Alignment:
Q  51 ctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttga 150  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || || ||||| ||||    
T  35744566 ctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttga 35744665  T
Q  151 aa 152  Q
    ||    
T  35744666 aa 35744667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 52)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Original strand, 4309690 - 4309955
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | || || |  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4309690 attccctcttgaaacacttaggccttcaccgtgttcatgaactctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 4309789  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4309790 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcct 4309889  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4309890 caagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 4309955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Original strand, 18098351 - 18098616
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| | || || |  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18098351 attccctcttgagacacttaggccttcaccgtgttcatgatctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 18098450  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18098451 aaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcgtaagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcct 18098550  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18098551 caagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 18098616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5898487 - 5898222
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||| | || || |  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5898487 attccctcttgagacactaaggccttcaccgtgttcatgatctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 5898388  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5898387 aaggtaacagtgccttctttgccatagagaatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcct 5898288  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5898287 caagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 5898222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 43227155 - 43226890
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| | || || |  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43227155 attccctcttgagacacttaggccttcaccgtgttcatgaactctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagcctcttgaacttcttcc 43227056  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  43227055 aaggtaacagtgtcttctttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagaacacacaacaagagtatagctttatcctcatcct 43226956  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43226955 caagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaacttcgtaagttgctccatga 43226890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5192684 - 5192463
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  5192684 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 5192585  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5192584 cgatttaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 5192485  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  5192484 aactccgtaagttgctcaatga 5192463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Original strand, 10957506 - 10957768
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||| | || || |||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10957506 attccctcttgagacacttagaccttcaccgtgttcatgagt---caagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 10957602  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10957603 aaggtaacaatgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcct 10957702  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10957703 caagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaacttcgtaagttgctccatga 10957768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 456941 - 456720
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  456941 tcaagtccttggacttggtcaactcattggttctcaaagccgctcgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 456842  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  456841 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 456742  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  456741 aactccgtaagttgctccatga 456720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Original strand, 6065017 - 6065238
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  6065017 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 6065116  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6065117 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 6065216  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6065217 aactccgtaagttgctccatga 6065238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7769633 - 7769368
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||| ||||| |   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7769633 attccctcttaaaacacttaggccttcaccgttttcatcatctctcaagtccttagactttgcctactccttggttctcaaagccacttgaacttcttcc 7769534  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
     || ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7769533 tagataacattgccttctttgccatagagcatggtaactttgaaagatttaaaagatctcggtagagcacacaacaagaatatagctttatcttcatcct 7769434  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7769433 caagatgcacctcaatattctccacgtcatcaaggattttttagaactccgtaagttgctccatga 7769368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11169168 - 11168914
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||| ||||||||||||||||| | || || ||   ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11169168 ttgagacacttaggccttcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaaaccggttgaacttcttccaaggtaac 11169072  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    ||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||    
T  11169071 agtgccttccttgccacagagcatggtatctttgaatgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtataactttatcctcatcctcaagttgc 11168972  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11168971 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 11168914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 75 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23634456 - 23634258
Alignment:
Q  75 tcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaag 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  23634456 tcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagttccttcttttccatatagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtaaag 23634357  T
Q  175 cacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  23634356 cacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactctataaattgctccatga 23634258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27421716 - 27421451
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27421716 attccctcttgaaacgcttagacctttaccatttttatcagctctcaattcccttgacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttctttc 27421617  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    || || ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||      
T  27421616 aaagtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaaagatttcagtagagcacacaaaaagagtatagctttatcttcatctg 27421517  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27421516 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggatcttgttgaactccgtaagttgctccatga 27421451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7763297 - 7763039
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7763297 ctcttgaagcactaaggccttcaccgttttcatccgctctcaagtccttggacttggttaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggt 7763198  T
Q  113 aacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaaga 212  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  || ||||| ||||||||     
T  7763197 gacaatgccttctttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaatgatctcggtagagcatacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagt 7763098  T
Q  213 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  7763097 tgcacctcaatgttctcaaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctccat 7763039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 29811895 - 29811637
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29811895 ctcttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactctttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggt 29811796  T
Q  113 aacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaaga 212  Q
     |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||     
T  29811795 gacagtgtcttatttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagt 29811696  T
Q  213 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29811695 tgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctccat 29811637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 29 - 255
Target Start/End: Original strand, 9635281 - 9635507
Alignment:
Q  29 gccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttg 128  Q
    ||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9635281 gccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactcattggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttg 9635380  T
Q  129 ccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattct 228  Q
    ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  9635381 ccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtaaagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctcaatgttct 9635480  T
Q  229 ccaagtcatcaaggattttgttgaact 255  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9635481 ccaaatcatcaaggattttgttgaact 9635507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 23199283 - 23199538
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23199283 ttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 23199382  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||    
T  23199383 agtgccttctttgccatagagcatggtatctttaaaggattcaaatgatctcggtagcacacacaacaagagtataactttgtcttcgtcctcaagttgc 23199482  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  23199483 acctcaatgttctctaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccat 23199538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 5259468 - 5259707
Alignment:
Q  17 tgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaaca 116  Q
    ||||||||| ||| ||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5259468 tgaaacactaaggtcttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgaca 5259567  T
Q  117 gtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgca 216  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||    
T  5259568 atgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgca 5259667  T
Q  217 cctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactc 256  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5259668 cctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactc 5259707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 37407712 - 37407457
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||||||||| | ||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  37407712 ttgaaacactaaagccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccggttgaacttcttccaaggtgac 37407613  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  37407612 agtgccttctttgccatagagcatgatatccttgaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgc 37407513  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  37407512 acctcaatgttttccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccat 37407457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 268
Target Start/End: Original strand, 15821855 - 15822082
Alignment:
Q  41 ttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcata 140  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||  ||||     
T  15821855 ttaatcaactctcaagtccttggactcggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacggtgccttctatgccatagggcatg 15821954  T
Q  141 gtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaa 240  Q
    ||||| |||||||||| ||| | |||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  15821955 gtatcattgaaagattcaaatggtctaagtagagcacacaacaagagtatagtcttgtcttcatcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcattaa 15822054  T
Q  241 ggattttgttgaactccgtaagttgctc 268  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15822055 ggattttgttgaacttcgttagttgctc 15822082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6717536 - 6717294
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  6717536 ttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaagccacttgaacttcttccaaggtgac 6717437  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||  | || |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  6717436 agtgccttctttgccatagagcatggtatccataaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgc 6717337  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccg 258  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6717336 acctcaatgttctccaaatcatcaaggatcttgttgaactccg 6717294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 32892115 - 32891870
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32892115 ctcttgaaacactaaggccttcact-ttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccggttgaacttcttccaaggt 32892017  T
Q  113 aacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaaga 212  Q
      ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||| || |||| ||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  32892016 ggcagtgccttctttcccatagagcatggtatccttgaaggattcaaatgatctcgatagagcaaacaacaagagtatcgctttgtcttcgtcctcaaga 32891917  T
Q  213 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgt 259  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  32891916 tccacctcaatgttctccaaatcatcatggattttgttgaaccccgt 32891870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 256
Target Start/End: Original strand, 15830378 - 15830626
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15830378 attccctcttgaagcacttagaccttcaccgttttcatcagctctcaagtccttggactgtgttaactccttggttctcaaagccgcttgaactttttcc 15830477  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    |||||  |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| ||| ||||  |||| |||||||||||| |||||||   | |||| |||||    
T  15830478 aaggtggcagttccttctttgccatagaccatggtatctttgaaggattcaaatgatcgtggtatagcacacaacaaaagtatagccatgtctttatcct 15830577  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactc 256  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15830578 caagatgcgcctcaatgttctctaaatcatcaaggattttgttgaactc 15830626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10210224 - 10209969
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10210224 ttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtctttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 10210125  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| || |||||||  || ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  10210124 agtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgc 10210025  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  10210024 acctcaatgttctccaaatcgtcaaggatcttgttgaactccgccaattgctccat 10209969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 258
Target Start/End: Original strand, 4599864 - 4600106
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4599864 ttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 4599963  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| || |||||||  || ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  4599964 agtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgc 4600063  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccg 258  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  4600064 acctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccg 4600106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 78 - 268
Target Start/End: Original strand, 22834215 - 22834405
Alignment:
Q  78 ttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcac 177  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||||| |||||    
T  22834215 ttggttctcaaagccgcttgaatttcttccaaggtgacggtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtagagcac 22834314  T
Q  178 acaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctc 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  22834315 acaacaagagtatagttttatcttcgtcctcaatttgcacctcaatgttctccaaatcatcaagaattttgttgaactccgtcaattgctc 22834405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10057268 - 10057013
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10057268 ttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 10057169  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| || |||||||  || ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  10057168 agtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgc 10057069  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  10057068 acctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccat 10057013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10059490 - 10059235
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10059490 ttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 10059391  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| || |||||||  || ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  10059390 agtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgc 10059291  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  10059290 acctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccat 10059235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10061712 - 10061457
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10061712 ttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 10061613  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| || |||||||  || ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  10061612 agtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgc 10061513  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  10061512 acctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccat 10061457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10063934 - 10063679
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10063934 ttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 10063835  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| || |||||||  || ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  10063834 agtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgc 10063735  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  10063734 acctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccat 10063679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10066156 - 10065901
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10066156 ttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 10066057  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| || |||||||  || ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  10066056 agtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgc 10065957  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  10065956 acctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccat 10065901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 5192915 - 5192815
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  5192915 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 5192816  T
Q  152 a 152  Q
    |    
T  5192815 a 5192815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6304247 - 6304130
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaaga 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   | ||| ||    
T  6304247 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaagga 6304148  T
Q  164 tctcggtaaagcacacaa 181  Q
     || ||||||||||||||    
T  6304147 cctaggtaaagcacacaa 6304130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Original strand, 10204936 - 10205024
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10204936 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaa 10205024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Original strand, 22625224 - 22625312
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22625224 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaa 22625312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 152
Target Start/End: Original strand, 10098041 - 10098128
Alignment:
Q  65 cttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10098041 cttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaa 10098128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 54189446 - 54189327
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaaga 163  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   | ||| ||    
T  54189446 acttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaagga 54189347  T
Q  164 tctcggtaaagcacacaaca 183  Q
     || ||||||||||||||||    
T  54189346 cctaggtaaagcacacaaca 54189327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Original strand, 28101382 - 28101453
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  28101382 catcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagtagctccatga 28101453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 10612022 - 10612103
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatc 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10612022 acttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccgtctttgccatagagcatagtatc 10612103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 10897941 - 10897853
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10897941 acttggtcaactctttggttctcaaaactgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaa 10897853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Original strand, 29913200 - 29913288
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29913200 acttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctatttgccataaagcatagtatccttgaaa 29913288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Original strand, 47882133 - 47882221
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  47882133 acttggtcaactctttggttctcaaagttgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaa 47882221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 16458401 - 16458314
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16458401 acttggttaactt-ttggttctcaaaactgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaa 16458314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 273
Target Start/End: Original strand, 1619882 - 1619920
Alignment:
Q  235 catcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1619882 catcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 1619920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 23634500 - 23634455
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtc 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  23634500 ctcttgaaacacttaggccttcaccgttttcatcagttctcaagtc 23634455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3315566 - 3315511
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactcc 257  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||||||    
T  3315566 catcctcaagatgcacctcaatgttctctaaatcaccaatgattttgttgaactcc 3315511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Original strand, 43422844 - 43422915
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||||   |||| |||||||||    
T  43422844 catcctcaagatgcacctcaatgttcttcaaatcaccaatgattttgttgaactcgacaagtagctccatga 43422915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Original strand, 53917048 - 53917119
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  53917048 catcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatga 53917119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 152
Target Start/End: Original strand, 8516270 - 8516371
Alignment:
Q  51 ctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttga 150  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || || ||||| ||||    
T  8516270 ctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttga 8516369  T
Q  151 aa 152  Q
    ||    
T  8516370 aa 8516371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 9602756 - 9602711
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttg 97  Q
    ||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  9602756 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttg 9602711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 97
Target Start/End: Original strand, 16263540 - 16263585
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttg 97  Q
    ||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  16263540 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttg 16263585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 152
Target Start/End: Original strand, 32479516 - 32479617
Alignment:
Q  51 ctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttga 150  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || || ||||| ||||    
T  32479516 ctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttga 32479615  T
Q  151 aa 152  Q
    ||    
T  32479616 aa 32479617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 28490080 - 28489984
Alignment:
Q  56 gtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || || ||||| ||||||    
T  28490080 gtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaaa 28489984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Original strand, 72697 - 72962
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| | || || |  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  72697 attccctcttgagacacttaggccttcaccgtgttcatgaactctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 72796  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  72797 aaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcgatagagcacataacaagagtatagttttatcctcatcct 72896  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  72897 caagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactctgtaagttgctccatga 72962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Original strand, 27338313 - 27338578
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||  | | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27338313 attccctcttgagacacttaggccttcaccgtgttcttgaattctcaagtctttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 27338412  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27338413 aaggtaacagtgccttctttcccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcct 27338512  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27338513 caagttgcacctcaatattatccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 27338578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Original strand, 13126917 - 13127180
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13126917 attccctcttgaaacacttacgccttcaccattttcatcagctctcaagtccttggatttggtcaactccttggttctcaaagctgcttgaacttcttcc 13127016  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| |||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  13127017 aaggtaacagtaccttctttgccatagagcatggtatcttcgatagattcaaaatatctcggtagagcacacaaca--agtatagctttatcttcatcct 13127114  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  13127115 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttaaactccataagttgctacatga 13127180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Original strand, 28202880 - 28203144
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| | || || | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  28202880 attccctcttgagacacttaggccttcaccgtgttcatgaattctcaagttcttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaatttcatcc 28202979  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28202980 aaggta-cagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcttcatcct 28203078  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28203079 caagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtcagttgctccatga 28203144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 51751092 - 51750871
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  51751092 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 51750993  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750992 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 51750893  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  51750892 aactccgtaagttgctccatga 51750871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16227223 - 16227002
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  16227223 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 16227124  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16227123 cgattcaaaagatttcagtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 16227024  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16227023 aactccgtaagttgctccatga 16227002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28841518 - 28841256
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| | || || ||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28841518 attccctcttgagacacttaggccttcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagcctcttgaacttcttcc 28841422  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  28841421 aaggtaacagtgtcttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtataactttatcctcatcct 28841322  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28841321 caagtttcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 28841256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 47178417 - 47178196
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  47178417 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaatgtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 47178318  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47178317 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 47178218  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  47178217 aactccgtaagttgctccatga 47178196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20301227 - 20300965
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| | || || ||   ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20301227 attccctcttgagacacttaggccttcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 20301131  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| || ||| | ||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  20301130 aaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattgaaaagatttcagtagaccacacaacaggagtatagctttatcctcatcct 20301031  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20301030 caagttgcacctcaatattctccaagtcttcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 20300965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Original strand, 3805311 - 3805583
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  3805311 attccctcttgaaacactcaagccttcaccattttcatcagttctcaagtcataggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttct 3805410  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatct-------ttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatct 200  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||| |       |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  3805411 aaggtgacagtgtcttctttgccatagagcatggtatatggtatccttgaaagattcaaaagatctcggtagaatacacaacaagagtatagctttatct 3805510  T
Q  201 tcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3805511 taatcctcaagatgcacctcaatgttctccaagtcatcaagaattttgttgaactccgtaagttgctccatga 3805583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 273
Target Start/End: Original strand, 8348259 - 8348510
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | ||  | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  8348259 ttgaaacacttaggccttcactgttttcaccaactatcaagttcttggacttggttaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaagataat 8348358  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||    
T  8348359 agtgccttatttgccatagagcatgatatctttgaacgattcaaaagatctcggtagagcacacaacaagagta------tatcttcatcctcaagatgc 8348452  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8348453 acctcattattttccaagtcatcaaagattttgttgaactccgtaagttgctacatga 8348510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31658230 - 31657975
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31658230 ctcttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaattccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggt 31658131  T
Q  113 aacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaaga 212  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||     
T  31658130 gacaatgccttctttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagctttatctttgtcctcaagc 31658031  T
Q  213 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctc 268  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  31658030 ttcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctc 31657975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 256
Target Start/End: Original strand, 28222563 - 28222806
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28222563 ctcttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtctttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcctgaacttcttccaaggt 28222662  T
Q  113 aacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaaga 212  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| ||||  ||||||||     
T  28222663 gacagtgccttcttttccatatagcatggtatccttgaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaaaagtattgctttgtctttgtcctcaagt 28222762  T
Q  213 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactc 256  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28222763 ttcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactc 28222806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 271
Target Start/End: Original strand, 50168492 - 50168750
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  |||| ||  | ||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50168492 ctcttgaaacacaaaggccttcactgttttcatttgctctcaagtcattggacttgatcaactccttggttctcaaagccgtttgaacttcttccaaggt 50168591  T
Q  113 aacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaaga 212  Q
     ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||     
T  50168592 gacaatgccttcttttccatagagcatggtatccttgaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtataaaattatcttcgtcctcaagt 50168691  T
Q  213 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  50168692 tgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccattaattgctccat 50168750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 107 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 51758534 - 51758368
Alignment:
Q  107 caaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcc 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  51758534 caaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaaagattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcc 51758435  T
Q  207 tcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51758434 tcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttactccatga 51758368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14997978 - 14997764
Alignment:
Q  57 tccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagatt 156  Q
    |||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |    
T  14997978 tccttgaatttggttagctctttggttctcaaagccgcttagacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattct 14997879  T
Q  157 aaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactc 256  Q
     ||| || || |||||||||||||| | | |||  | |||||||||||| || ||||  || || || ||| |||| |||||||  || || ||||||||    
T  14997878 caaaggacctaggtaaagcacacaataggtgtaaggctttatcttcatcttccagatttacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactc 14997779  T
Q  257 cgtaagttgctccat 271  Q
    ||| |||||||||||    
T  14997778 cgtcagttgctccat 14997764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16429853 - 16429782
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16429853 catcctcaagatgcacctcaataatctccaaatcatcaagggttttgttgaactccacaagttgctccatga 16429782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 273
Target Start/End: Original strand, 50078174 - 50078239
Alignment:
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50078174 caagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccgtaagttgctccatga 50078239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Original strand, 2400469 - 2400557
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2400469 acttggttaactctttggttttcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccatctttgccataaagcatagtatccttgaaa 2400557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9522661 - 9522545
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaaga 163  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || | |||||| | ||||||||| |||||| |||| ||||||   | ||||||    
T  9522661 acttggttaactctttggttcttaaagctgcttgcacttcctccaaagtgatagtgccctttttgccataaagcataatatccttgaaattctcaaaaga 9522562  T
Q  164 tctcggtaaagcacaca 180  Q
     || |||||||||||||    
T  9522561 cctaggtaaagcacaca 9522545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 262
Target Start/End: Original strand, 29003345 - 29003405
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaag 262  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  29003345 catcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataag 29003405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16456632 - 16456489
Alignment:
Q  125 tttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaata 224  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| || ||||   |||| ||||||     
T  16456632 tttgccatagagcatggtatccttgaatgattcaaatgatcacggtaaagcacataacaagagtatatctttgtctttattctcatattgcaactcaatg 16456533  T
Q  225 ttctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctc 268  Q
    |||||||| |||| ||| |||||  | |||||||| | ||||||    
T  16456532 ttctccaaatcattaagtattttaataaactccgttaattgctc 16456489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Original strand, 25250655 - 25250726
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||||||| |||| || ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25250655 catcctcaaggtgcagcttaatgttgtccaaatcatcaatgattttgttgaactccgtaagtttctccatga 25250726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Original strand, 45654851 - 45654975
Alignment:
Q  14 tcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggta 113  Q
    |||||||||||| | || ||||||||| | ||| | ||||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |     
T  45654851 tcttgaaacactaaagctttcaccattatcatcggctctcatgtcctag-acttgattaactccttggttctcaaagccttttgaacttcttccaatttg 45654949  T
Q  114 acagtgccttctttgccatatagcat 139  Q
    ||| || ||| ||||||||| |||||    
T  45654950 acaatgtcttttttgccatagagcat 45654975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 776099 - 776019
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccg 93  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  |||| ||  | ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  776099 ctcttgaaacacaaaggccttcactgttttcattcgctctcaagtccttggacttggtcaacttcttggttctcaaagccg 776019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 6996489 - 6996418
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  6996489 catccccaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatga 6996418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 262
Target Start/End: Original strand, 28997635 - 28997689
Alignment:
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaag 262  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  28997635 caagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataag 28997689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Original strand, 33094183 - 33094255
Alignment:
Q  183 aagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaact 255  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||| || ||| | ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  33094183 aagagtataattttgtcttcatcttcaaaattcactttaatgttctccaaatcattaaggattttgttgaact 33094255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 257
Target Start/End: Original strand, 31424408 - 31424463
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactcc 257  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  31424408 catcctcaagacacacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactcc 31424463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Original strand, 31736850 - 31736921
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  31736850 catcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatga 31736921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Original strand, 45655021 - 45655087
Alignment:
Q  193 ttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgt 259  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| | |||  ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  45655021 ttttgtcttcatcctcaagatgtacctcattgttcatcaaatcatctaggattttgttgaattccgt 45655087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 19359748 - 19359703
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttg 97  Q
    ||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  19359748 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttg 19359703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 47099728 - 47099683
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttg 97  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  47099728 tcaagtccttgaacttggttaattccttggttctcaaagtcgcttg 47099683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 152
Target Start/End: Original strand, 41397420 - 41397516
Alignment:
Q  56 gtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || || ||||| ||||||    
T  41397420 gtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaaa 41397516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 273
Target Start/End: Original strand, 7093649 - 7093906
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || ||  ||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7093649 ctcttgagacacttaggccttcaccatgttcatgggt---caagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 7093745  T
Q  113 aacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaaga 212  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||     
T  7093746 aacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtataaatttatcctcatcctcaagt 7093845  T
Q  213 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7093846 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 7093906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Original strand, 1048513 - 1048734
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  1048513 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 1048612  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1048613 cgattcaaaagatttcgatagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 1048712  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  1048713 aactccgtaagttgctccatga 1048734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 38395089 - 38394829
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| | || || ||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38395089 attccctcttgagacacttaggccttcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 38394993  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  38394992 aaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcg--agagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcct 38394895  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394894 caagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 38394829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Original strand, 7350875 - 7351096
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  7350875 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 7350974  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7350975 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 7351074  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7351075 aactccgtaagttgctccatga 7351096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22135867 - 22135646
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  22135867 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 22135768  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22135767 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 22135668  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22135667 aactccgtaagttgctccatga 22135646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 40550894 - 40550673
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  40550894 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 40550795  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40550794 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 40550695  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  40550694 aactccgtaagttgctccatga 40550673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 44725683 - 44725418
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||| | || || |  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44725683 attccctcttaagacacttaggccttcaccgtgttcatgaactctcaagtccttggacttggtcaacttcttggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 44725584  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  44725583 aagataacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtatagcacaaaacaagagtatagctttatcctcatcct 44725484  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  44725483 caagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccataagttgctctatga 44725418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Original strand, 13289679 - 13289944
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||   |||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  | |||||||||||||    
T  13289679 attccctcttgaaacacatgggccttcaaagttttcatcatctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagttgtttgaacttcttcc 13289778  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    || || |||||||||||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  13289779 aatgtgacagtgccttctttgccatagaacatggtatccatgaaagattaaaaagatctcggtatagcacacaacaagagtatagctttatcttcatcgt 13289878  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13289879 caagatgcacctccatattctccaagtcatcaaggaatttgttgaactccataagttgctccatga 13289944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26213822 - 26213562
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  26213822 ctcttgaaacactaaggccttcaccattttcataagctctcaagtccttggacttggtcagctcattggttcttaaagccacttgaacttcttccatggt 26213723  T
Q  113 aacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaaga 212  Q
     |||||||||||||||||||| | ||| ||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |    
T  26213722 gacagtgccttctttgccatagatcatggtattcttgaaggattcaaaagatctcggtagagcacacaacaagagtataactttatctttatcctcaata 26213623  T
Q  213 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26213622 ggcacctcaatattctccaagtcatcaaagattttgttgaactctgtaagtttctccatga 26213562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36555 - 36293
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| | | || || |||   |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36555 attccctcttgagacacttaggccttcatcgtgttcatgagt---caagtccttggagttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaatttcttcc 36459  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  36458 aaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatttttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaataagagtatagctttatcctcatcct 36359  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36358 caagttgtacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 36293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6047579 - 6047336
Alignment:
Q  21 acacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgc 120  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  6047579 acacttaggcgttcaccgttttcatcagttctcaagttcttggacttggtaaactcgttgattctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgc 6047480  T
Q  121 cttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctc 220  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || ||||| |||    
T  6047479 cttctttgccatatagaatggtatccttgaaggattcaaaagatctcggtagagcacacaacaagagaataactttatcttcatcctaaaaatgcatctc 6047380  T
Q  221 aatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagtt 264  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6047379 aatgttctccaagtcatcaaggatattgtttaactccgtaagtt 6047336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 273
Target Start/End: Original strand, 24816548 - 24816815
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| | |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24816548 ctcttgaaacacttatgccttccccgttttcatcagctttcaagttcttggactgggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 24816647  T
Q  113 aacagtgccttctttgccatat-------agcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatc 205  Q
    ||||||||||||||| |||||        ||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24816648 aacagtgccttcttttccatagtccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaatatcttggtagagaacacaacaagagtatagctttaacttcatc 24816747  T
Q  206 ctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
     ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24816748 ttcaagatgcaccttaatcatctccaagtcatcaagaattttgttgaactccgtaagttgctccatga 24816815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 48490431 - 48490185
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48490431 ctcttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggt 48490332  T
Q  113 aacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaaga 212  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||  || ||||| ||||||||     
T  48490331 gacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaatgatctcggtagagcacacgacaagagtacagccttttcttcgtcctcaagt 48490232  T
Q  213 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgt 259  Q
    | ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  48490231 ttcacctcaatgttctccaaatcattaaggattttgttgaactccgt 48490185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 271
Target Start/End: Original strand, 47675279 - 47675537
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||  |||| | | | |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47675279 ctcttgaaacactaagaacttcactgttttcacccgctctcaagtccttagacttggtcaactccctggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggt 47675378  T
Q  113 aacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaaga 212  Q
     |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||   || ||||| | || |||     
T  47675379 gacagtgccttctttgccacagagcatggtatccttgaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtataaccttgtcttcgttcttaagt 47675478  T
Q  213 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  47675479 tgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctccat 47675537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 18391316 - 18391571
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18391316 ttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 18391415  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| || |||||||  || ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  18391416 agtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgc 18391515  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  18391516 acctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccat 18391571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 6593678 - 6593933
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6593678 ttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 6593777  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| || |||||||  || ||  ||||||||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  6593778 agtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcaatacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgc 6593877  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  6593878 acctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccat 6593933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 179
Target Start/End: Original strand, 31157509 - 31157636
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||    
T  31157509 tcaagtccttggacttggtcaactccttagttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatgatatctttgaa 31157608  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacac 179  Q
     |||| ||||||| |||||| |||||||    
T  31157609 cgattcaaaagatttcggtagagcacac 31157636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 175 - 273
Target Start/End: Original strand, 31159049 - 31159147
Alignment:
Q  175 cacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31159049 cacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 31159147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 273
Target Start/End: Original strand, 3890614 - 3890836
Alignment:
Q  50 tctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttg 149  Q
    |||||| |||||||||||  || ||||||||||| ||||||||| || |||||  || ||||| |||||| |||| |||||||| ||||| | |  ||||    
T  3890614 tctcaaatccttggacttaatttactcattggttttcaaagccgtttaaactttctctaaggtgacagtgtcttcgttgccatagagcat-ggacttttg 3890712  T
Q  150 aaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgt 249  Q
    || |||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||||| ||  ||| | || ||| | ||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||    
T  3890713 aacgattcaaacgatctaggtagagcacaaaacaagagtttaactttgtttttatctttaagatgcacctcaatgttctccatatcattaaggattttgt 3890812  T
Q  250 tgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||||  | ||||||| |||||    
T  3890813 tgaactctattagttgcttcatga 3890836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 7070731 - 7070643
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7070731 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaa 7070643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 271
Target Start/End: Original strand, 3324032 - 3324239
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaaga 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   | ||| ||    
T  3324032 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaagga 3324131  T
Q  164 tctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagt 263  Q
     || |||||||||||||| | | |||  | |||||| || || || ||||  || || || ||| |||| |||||||  || || ||||||||||| |||    
T  3324132 cctaggtaaagcacacaataggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 3324231  T
Q  264 tgctccat 271  Q
    ||||||||    
T  3324232 tgctccat 3324239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25406350 - 25406143
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaaga 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   | ||| ||    
T  25406350 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaagga 25406251  T
Q  164 tctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagt 263  Q
     || |||||||||||||| | | |||  | |||||| || || || ||||  || || || ||| |||| |||||||  || || ||||||||||| |||    
T  25406250 cctaggtaaagcacacaataggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 25406151  T
Q  264 tgctccat 271  Q
    ||||||||    
T  25406150 tgctccat 25406143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Original strand, 3903666 - 3903869
Alignment:
Q  50 tctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttg 149  Q
    |||||||| | |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||| |||||  || ||||| ||| || ||||||||||||| || || || || | |    
T  3903666 tctcaagttcctggacttaatttactcattggttttcaaagccacttaaactttctctaaggtgacaatgtcttctttgccatagagaatggtctcct-g 3903764  T
Q  150 aaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgt 249  Q
    || |||| ||| ||| | |||| |   |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||    
T  3903765 aaggattcaaacgatttaggtata---cacaacaagagtataactttgtcttcatcttcaagatgcacctcaatgttctccaaattatcaagaattttgt 3903861  T
Q  250 tgaactcc 257  Q
    ||||||||    
T  3903862 tgaactcc 3903869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 25352288 - 25352200
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25352288 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaa 25352200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Original strand, 44015910 - 44015998
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  44015910 acttagttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcataatatccttgaaa 44015998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Original strand, 4294091 - 4294162
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4294091 catccccaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagtagctccatga 4294162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9679572 - 9679501
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  9679572 catcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatga 9679501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24749501 - 24749430
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  24749501 catcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatga 24749430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6570864 - 6570758
Alignment:
Q  162 gatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaa 261  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||  ||||| | | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  6570864 gatctcggtagagcacacaataagagtatcgctttgtcttcgccctcaggtttcacctcaatgttctccaaatcatcaagtattttattgaactccgtta 6570765  T
Q  262 gttgctc 268  Q
     ||||||    
T  6570764 attgctc 6570758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21678973 - 21678902
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  21678973 catcctcaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatga 21678902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Original strand, 7471355 - 7471426
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  7471355 catccccaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatga 7471426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28486479 - 28486408
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  28486479 catccccaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatga 28486408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 133
Target Start/End: Original strand, 21988097 - 21988178
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccata 133  Q
    ||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||  |||||| ||||| |||||    
T  21988097 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacttccttcaaagtagtagtgccctctttaccata 21988178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 152
Target Start/End: Original strand, 18412835 - 18412935
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || || ||||| |||||    
T  18412835 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 18412934  T
Q  152 a 152  Q
    |    
T  18412935 a 18412935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 5818096 - 5818051
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttg 97  Q
    ||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  5818096 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttg 5818051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 9186067 - 9186022
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttg 97  Q
    ||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  9186067 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttg 9186022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 152
Target Start/End: Original strand, 16884103 - 16884204
Alignment:
Q  51 ctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttga 150  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || || ||||| ||||    
T  16884103 ctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttga 16884202  T
Q  151 aa 152  Q
    ||    
T  16884203 aa 16884204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 97
Target Start/End: Original strand, 21645202 - 21645247
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttg 97  Q
    ||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  21645202 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttg 21645247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 24262234 - 24262133
Alignment:
Q  51 ctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttga 150  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || || ||||| ||||    
T  24262234 ctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttga 24262135  T
Q  151 aa 152  Q
    ||    
T  24262134 aa 24262133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 25462641 - 25462910
Alignment:
Q  3 tcacaattcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaactt 102  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  25462641 tcaccattccctcttgaaacacttaggccttcactgttttcatcaattctcaagtccttgaactcggtcaactccttggttctcaaagtcgcttgaactt 25462740  T
Q  103 cttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||||    
T  25462741 cttccaaggtaacagtgccttctttaccataaagcatgatatctttgaaagattcaaaag-tctcggtagggtacacaacaagagtataaatttatcttc 25462839  T
Q  203 atcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25462840 atcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaagattttgttgaactccgtaagttgctccatga 25462910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 33309944 - 33309723
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  33309944 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 33309845  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33309844 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 33309745  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33309744 aactccgtaagttgctccatga 33309723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Original strand, 26067619 - 26067840
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  26067619 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 26067718  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  26067719 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggatttttttg 26067818  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  26067819 aactccgtaagttgctcaatga 26067840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 30444381 - 30444127
Alignment:
Q  19 aaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagt 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  30444381 aaacacttaggccttcaccgttttcatcggctctcaagcccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccacttgaacttcttcctaggtgacagt 30444282  T
Q  119 gccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacc 218  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | ||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||    
T  30444281 gccttctttgccatagagcatggtatcgttgacaaattcaaaagatctcggtagagcacacaagtagagtataactttatcttcatgctcaagatacacc 30444182  T
Q  219 tcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30444181 tcaatgttctccaaattataaaggattttgttgaacttcgtaagttgctccatga 30444127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16568009 - 16567754
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16568009 ttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaacttcttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 16567910  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    | |||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||    
T  16567909 aatgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagtcttgtcttcgtcctcaagttgc 16567810  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  16567809 acctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccat 16567754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16651960 - 16651704
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  16651960 ttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccacttgaacttcttccaaggtgac 16651861  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||    
T  16651860 agtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcatcctcaagttgc 16651761  T
Q  216 acctcaatat-tctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  16651760 acctcaatgtgtctccaagtcatcaaggatcttgttgaactccgccaattgctccat 16651704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12158345 - 12158086
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  12158345 ctcttgaaacacttagaccttcaccgttttcatcagctatcaaatccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgtttgaacatcttctaaggt 12158246  T
Q  113 aacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaaga 212  Q
     |||||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||  ||  |||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  12158245 gacagtgccttctttgccataaatcattgtatcctcgaaagattccaataatctcggtagcgcacagaacaagagtatatctttatcttcatccacaaga 12158146  T
Q  213 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatg 272  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  12158145 tgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggatcttgttgaactctgtaagtttctccatg 12158086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16553699 - 16553444
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||| ||| | |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16553699 ttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccctggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 16553600  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  16553599 agtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcagtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgc 16553500  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  16553499 acctcaatgttctccaagtcatcaaggatcttgttgaactccgccaattgctccat 16553444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16630255 - 16630000
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||| ||| | |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16630255 ttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccctggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 16630156  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  16630155 agtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcagtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgc 16630056  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  16630055 acctcaatgttctccaagtcatcaaggatcttgttgaactccgccaattgctccat 16630000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 34165907 - 34165652
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34165907 ttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 34165808  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| || |||||||  || ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  34165807 agtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgc 34165708  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  34165707 acctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccat 34165652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 271
Target Start/End: Original strand, 5408248 - 5408469
Alignment:
Q  50 tctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttg 149  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  5408248 tctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaatccgcttgaacttcttccaaggtgatagtgccttcttttccatagagcatggtatccttg 5408347  T
Q  150 aaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgt 249  Q
    || |||| ||| ||| ||  || || ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  5408348 aaggattcaaatgatatcaatagagtacacaacaatagtatagtcttgtcttcgtcctcaagttgcacctcaatgatctccaaatcatcaaggattttgt 5408447  T
Q  250 tgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||||  | |||||||||    
T  5408448 tgaactccgccaattgctccat 5408469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 271
Target Start/End: Original strand, 5412573 - 5412794
Alignment:
Q  50 tctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttg 149  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  5412573 tctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaatccgcttgaacttcttccaaggtgatagtgccttcttttccatagagcatggtatccttg 5412672  T
Q  150 aaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgt 249  Q
    || |||| ||| ||| ||  || || ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  5412673 aaggattcaaatgatatcaatagagtacacaacaatagtatagtcttgtcttcgtcctcaagttgcacctcaatgatctccaaatcatcaaggattttgt 5412772  T
Q  250 tgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||||  | |||||||||    
T  5412773 tgaactccgccaattgctccat 5412794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 141 - 273
Target Start/End: Original strand, 12910886 - 12911018
Alignment:
Q  141 gtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaa 240  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  12910886 gtatctttgaaagattcataagttctcggaagagcacacaacatgagtataattttacctttatcctcaatatgcacctcaatagtctttaagtcatcaa 12910985  T
Q  241 ggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12910986 ggattttgttaaactccgtaagttgctccatga 12911018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 141 - 273
Target Start/End: Original strand, 12936562 - 12936694
Alignment:
Q  141 gtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaa 240  Q
    ||||||||||| |||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  12936562 gtatctttgaatgattcataagttctcggtagagcacacaacatgagtataattttacctttatcctcaatatgcacctcaatagtctttaagtcatcaa 12936661  T
Q  241 ggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12936662 ggattttgttaaactccgtaagttgctccatga 12936694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 184 - 273
Target Start/End: Original strand, 26931919 - 26932008
Alignment:
Q  184 agagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26931919 agagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 26932008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13879675 - 13879468
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaaga 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   | ||| ||    
T  13879675 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaagga 13879576  T
Q  164 tctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagt 263  Q
     || |||||||||||||| | | |||  | |||||| || || || ||||  || || || ||| |||| |||||||  || || ||||||||||| |||    
T  13879575 cctaggtaaagcacacaataggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattgaactccgtcagt 13879476  T
Q  264 tgctccat 271  Q
    ||||||||    
T  13879475 tgctccat 13879468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Original strand, 10456823 - 10457019
Alignment:
Q  14 tcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggta 113  Q
    |||||| ||||| | |||||||||| | | ||||| ||| || || || ||||||| || ||| |||||||  || |||||||| ||||| || |||||     
T  10456823 tcttgagacactcaagccttcaccactatcatcagctctgaattctttagacttggctagctccttggttcaaaatgccgcttggacttcctctaaggtg 10456922  T
Q  114 acagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaa 210  Q
    ||| ||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||   ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  10456923 acactgccttcgttgtcataaagcatggtatcattgaaggacccaaaagatctaggtaaagtacacaacaagggtagagttttgtcttcatcctcaa 10457019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 25942605 - 25942517
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25942605 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaa 25942517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Original strand, 17694096 - 17694184
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17694096 acttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaa 17694184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Original strand, 22350216 - 22350304
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  22350216 acttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgataatgccatctttgccataaatcatagtatccttgaaa 22350304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Original strand, 5165088 - 5165176
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || | |||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  5165088 acttggttaactctttggttctcaaagatgcttgaactttctccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaaa 5165176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17012948 - 17012897
Alignment:
Q  221 aatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  17012948 aatattctccaagtcatcaaggatttt-ttgaactccgcaagtttctccatga 17012897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Original strand, 15533976 - 15534047
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  15533976 catcctcaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgtcgaactccacaagtagctccatga 15534047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 14738478 - 14738382
Alignment:
Q  56 gtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||| ||| ||||||| || || ||||| || || ||||| ||||||    
T  14738478 gtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagcagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaaa 14738382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Original strand, 3631317 - 3631388
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||   |||| |||||||||    
T  3631317 catcctcaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttattgaactctacaagtagctccatga 3631388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 33331357 - 33331256
Alignment:
Q  51 ctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttga 150  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || || ||||| ||||    
T  33331357 ctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaagaatggtatccttga 33331258  T
Q  151 aa 152  Q
    ||    
T  33331257 aa 33331256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18467783 - 18467518
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | || || |  ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18467783 attccctcttgaaacacttaggccttcaccgtgttcatgaactctcaagtccttggacttggtcaactccttgattctcaaagccgcttgaacttcttcc 18467684  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||     
T  18467683 aaggtaacagtcccttctttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatccttatcca 18467584  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18467583 caagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaaattgctccatga 18467518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 6746162 - 6745902
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | | || |  |  ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6746162 ctcttgagacacttaggccttcatcgtgttcacgaactctcaagtcattggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 6746063  T
Q  113 aacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaaga 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||     
T  6746062 aacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttttcctcatcctcaagt 6745963  T
Q  213 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745962 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 6745902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10750753 - 10750532
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  10750753 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 10750654  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10750653 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 10750554  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10750553 aactccgtaagttgctccatga 10750532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Original strand, 15356073 - 15356294
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  15356073 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 15356172  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15356173 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 15356272  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15356273 aactccgtaagttgctccatga 15356294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23666101 - 23665880
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  23666101 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 23666002  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23666001 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 23665902  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23665901 aactccgtaagttgctccatga 23665880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31543788 - 31543567
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  31543788 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 31543689  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31543688 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 31543589  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31543588 aactccgtaagttgctccatga 31543567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Original strand, 34478602 - 34478864
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||| | || || ||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34478602 attccctcttgagacacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 34478698  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  34478699 aaggtaacaatgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagattttggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcct 34478798  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34478799 caagttgcacctcaatattttccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 34478864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 271
Target Start/End: Original strand, 20505386 - 20505649
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||| ||||||| | ||||||| | || || | |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  20505386 attccctcttgagacacttaagacttcaccgtgttcatgaattctcaagtccttggacttggtcaactccttagttctcaaagccgcttgaacttcttcc 20505485  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  20505486 aaggtaacagtgccttctttcccatagagcatagtatctttgaacgattcaaaagatttcagtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatact 20505585  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20505586 caagttgcaccttaatattctccaagtcattaaggattttgttaaactccgtaagttgctccat 20505649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 29721398 - 29721143
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29721398 ttgaaacactaaggccttcactgttttcatctgctcttaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 29721299  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  29721298 agtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtagcgcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgc 29721199  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  29721198 acctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccat 29721143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16408358 - 16408103
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||||||||| |||||||||   | || ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16408358 ttgaaacactaaggccttcattgtcttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 16408259  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  16408258 agtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtagcgcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgc 16408159  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  16408158 acctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccat 16408103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 9788366 - 9788621
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||||||||| ||||| ||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  9788366 ttgaaacactaaggccgtcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttctttcaaggtgac 9788465  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  9788466 agtgcattatttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgc 9788565  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  9788566 acctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccat 9788621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 40381139 - 40380884
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40381139 ttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 40381040  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  40381039 agtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgc 40380940  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| ||||||||  | || ||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  40380939 acctcaatgttctccaaaccgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccat 40380884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 256
Target Start/End: Original strand, 42427574 - 42427816
Alignment:
Q  14 tcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggta 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  42427574 tcttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctgaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagtcgcttgaacttcttccaaggtg 42427673  T
Q  114 acagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagat 213  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  | ||||  ||||| |||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  42427674 acagtgccttttttgccatagagtgtggtatagttgaaggattcaaatgatctcggtagagcatacaacaagagtatagctttgtcttcatcctcaagtt 42427773  T
Q  214 gcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactc 256  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  42427774 gcacctcaatgttctcaaaatcatcaaggattttgttgaactc 42427816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16545463 - 16545208
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16545463 ttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 16545364  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| || |||||||  || ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  16545363 agtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgc 16545264  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  16545263 acctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccat 16545208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 273
Target Start/End: Original strand, 13694293 - 13694543
Alignment:
Q  23 acttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcct 122  Q
    |||||||||||||   |||| || || |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| || ||| || ||    
T  13694293 acttaggccttcattgttttcattagctctcaactccttgaacttggttaactcattggtcctcaaagccgcttggacttccttcaaagtgacaatgtct 13694392  T
Q  123 tctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaa 222  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||| ||| |||||| ||| || | ||||||||||||||   || |||||||| |  |||||||||||||    
T  13694393 tctttgccatagagcatggcatccttgaaggattcaaatgatctcagtagagaaaacaacaagagtataaccttgtcttcatcttagagatgcacctcaa 13694492  T
Q  223 tattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13694493 tgttttccaactcatcaaggattttgttgaactccgttagttgctccatga 13694543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 121 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 534677 - 534527
Alignment:
Q  121 cttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctc 220  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||  || |||||||||||||| ||||||||    
T  534677 cttctttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaatgatctctgtagagcacacaacaacagtatagccttgtcttcatcctcaagttgcacctc 534578  T
Q  221 aatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  534577 aatgttctccaaatcatcaagtattttgttgaactccgttaattgctccat 534527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13487061 - 13486872
Alignment:
Q  3 tcacaattcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaactt 102  Q
    |||| |||| ||||||||||||| | |||||||   |||| ||| | ||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| |    
T  13487061 tcaccattccctcttgaaacactaatgccttcattgttttcatccgctcttaagtccttagacttggtcaactccttggtttttaaagccgcttgaacat 13486962  T
Q  103 cttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatag 192  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  13486961 attccaaggtgacagtgccttctttaccatagagcatggtatccttgaatgattcaaatgatctcggtagaacacacaacaagagtatag 13486872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26171693 - 26171535
Alignment:
Q  113 aacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaaga 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||      
T  26171693 aacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtagcgcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaatt 26171594  T
Q  213 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  26171593 tgcaccttaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccat 26171535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32584851 - 32584685
Alignment:
Q  44 atcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagta 143  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| |||||||| | ||| |||    
T  32584851 atcagctctcaagtccatggacttggttaactctttggttctcaattccgcttggacttcctcaaaggtgatagttccttccttgccataaatcatggta 32584752  T
Q  144 tctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaa 210  Q
    ||  |||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||    
T  32584751 tccatgaaggactcaaaagatctaggtaaagcacacaacaagagtagagtcttgtctacatcctcaa 32584685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 26173803 - 26173701
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26173803 ttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 26173704  T
Q  116 agt 118  Q
    |||    
T  26173703 agt 26173701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28788658 - 28788542
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaaga 163  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||  || ||| ||    
T  28788658 acttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgtcttctttgccataaagcataatatccttgaaattttcaaagga 28788559  T
Q  164 tctcggtaaagcacaca 180  Q
     || |||||||||||||    
T  28788558 cctaggtaaagcacaca 28788542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 534763 - 534672
Alignment:
Q  14 tcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttctt 105  Q
    |||||||||||| |||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  534763 tcttgaaacactaaggcattcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaatccgcttgaacttctt 534672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 25446423 - 25446335
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||| | ||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25446423 acttggttaactttttggttcttaaagctgtttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaa 25446335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 10628295 - 10628207
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| || | |||| | ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  10628295 acttggttaactctttggttctcaaagttgcttgaacttcctccaaagtgatagtgtcctctttgccataaaggattgtatccttgaaa 10628207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13294981 - 13294905
Alignment:
Q  197 atcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||||| || |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  13294981 atcttcatccttaagatgcactccaatgttctccaaatcatcaaggcttctactgaactcagtaagttgctccatga 13294905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20043874 - 20043818
Alignment:
Q  217 cctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  20043874 cctcaatgttctccaagtcatcaaggattgttttgaactccacaagttgctccatga 20043818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27911337 - 27911266
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  27911337 catcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatga 27911266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 131
Target Start/End: Original strand, 31781693 - 31781772
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgcca 131  Q
    |||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| ||||| || | |||||| |||||||||    
T  31781693 tcaactccttgaatttggttaactctttggttctcaaagttgcttgaccttcctccaaagtgatagtgccctctttgcca 31781772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 658923 - 658869
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactc 256  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  658923 catccccaagacgcgcctcaatattctccaaatcaccaatgattttgttgaactc 658869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 31397903 - 31397802
Alignment:
Q  51 ctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttga 150  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || || ||||| ||||    
T  31397903 ctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttga 31397804  T
Q  151 aa 152  Q
    ||    
T  31397803 aa 31397802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 152
Target Start/End: Original strand, 33790491 - 33790592
Alignment:
Q  51 ctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttga 150  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || || ||||| ||||    
T  33790491 ctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttga 33790590  T
Q  151 aa 152  Q
    ||    
T  33790591 aa 33790592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 37557535 - 37557434
Alignment:
Q  51 ctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttga 150  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || || ||||| ||||    
T  37557535 ctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttga 37557436  T
Q  151 aa 152  Q
    ||    
T  37557435 aa 37557434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Original strand, 22133800 - 22134062
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||| | || || ||   ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133800 attccctcttgagacacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactgcttggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 22133896  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22133897 aaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcct 22133996  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133997 caagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 22134062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Original strand, 12400001 - 12400267
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12400001 attccctcttgagacatttaggccttcaccgttttcataaattctcaagtccttggacttggtcaacttcctggttctcaaagccgcttgaactttttcc 12400100  T
Q  108 aaggtaaca-gtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcc 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12400101 aaggtaacaagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcttcatcc 12400200  T
Q  207 tcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12400201 tcaagttactcctcaatattctccaagtcatcacggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 12400267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Original strand, 16933372 - 16933593
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||    
T  16933372 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatgatatctttgaa 16933471  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16933472 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 16933571  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16933572 aactccgtaagttgctccatga 16933593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 11007746 - 11008013
Alignment:
Q  3 tcacaattcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaactt 102  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| | || || ||   |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11007746 tcaccattccctcttgagacacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttagtcaactccttggttctcaaagccacttgaactt 11007842  T
Q  103 cttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttc 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  11007843 cttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctc 11007942  T
Q  203 atcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11007943 atcctcaagtcgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 11008013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Original strand, 12402276 - 12402541
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |  | | || |||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  12402276 attccctcttgagacatttaggccttcaccattttcataaaatatgaaatccttggacttggtcaacttcttggttctcaaatccgcttgaacttcttca 12402375  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12402376 aaggtaatagtgccttctttgccgtagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcttcatcct 12402475  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12402476 taagttgcacctcaatattctccaagtcatcacggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 12402541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Original strand, 22781961 - 22782182
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  22781961 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 22782060  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||  |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22782061 cgattcaaaagatttcggtagagcgcacaacaagagtatatctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 22782160  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22782161 aactccgtaagttgctccatga 22782182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Original strand, 22045898 - 22046160
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||| | || || ||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22045898 attccctcttgagacacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 22045994  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||| || |||| || |||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22045995 aaggtaacaatgccttccttgccaaagagcatggtatctttaaacgattcaatagatttcggtagagcagacaacaagagtatagctttatcctcatcct 22046094  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046095 caagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 22046160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Original strand, 9175696 - 9175917
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||    
T  9175696 tcaagtccttggacttggtcaactccttgattctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtagcagtgccttccttgccattgagcatggtatctttgaa 9175795  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9175796 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 9175895  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9175896 aactccgtaagttgctccatga 9175917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 271
Target Start/End: Original strand, 52094504 - 52094762
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52094504 ctcttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtcattggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggt 52094603  T
Q  113 aacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaaga 212  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||   || ||||  ||||||||     
T  52094604 gacaatgccttctttgccatagagcatggtatctttgaagaattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtataaccttgtctttgtcctcaagt 52094703  T
Q  213 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  52094704 tgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgtcaattgctccat 52094762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26558740 - 26558480
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26558740 attccctcttgaaacacttaggtcttcactgttttcatcaactctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagtcgtttgaacttcttcc 26558641  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
      |||  ||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26558640 tgggtggcagtgccttttttgccttagagcatggtatccttgaaagattcgaaagatctcgataaagcacacaacaagagtatagctttatcttcatcct 26558541  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctc 268  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||  || ||||||||    
T  26558540 caagatgcacctcaatattttccaaatcttcaaggaatttgttgaactatgtgagttgctc 26558480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8394441 - 8394186
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8394441 ttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 8394342  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  8394341 agtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgc 8394242  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  8394241 acctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccat 8394186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 59 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5872795 - 5872583
Alignment:
Q  59 cttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaa 158  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||| |    
T  5872795 cttggacttgttcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatgatatccttgaaggattca 5872696  T
Q  159 aaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccg 258  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  5872695 aatgatctcggtagagcacacaacaagggtatagttttgtcttcgtcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactcca 5872596  T
Q  259 taagttgctccat 271  Q
    | | |||||||||    
T  5872595 ttaattgctccat 5872583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7123731 - 7123476
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||| ||||| ||||||||||   ||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7123731 ttgacacactaaggccttcactgctttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 7123632  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  7123631 agtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgc 7123532  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  7123531 acctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccat 7123476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5137115 - 5136860
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5137115 ttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 5137016  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||| || |||||||  || ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  5137015 agtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaatgacctcggtagtgcgcacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgc 5136916  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  5136915 acctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccat 5136860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 271
Target Start/End: Original strand, 5206799 - 5207063
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccatttta-atcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttc 106  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||  | ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  5206799 attccctcttgaaacgcttaggccttcactatttttcattcgctctcaagtccttggacttggtcaacttcttggttcttaaagctgcttggacttcctc 5206898  T
Q  107 caaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcc 206  Q
    |||||| | |||| ||||||| ||||| || || ||||| | ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  5206899 caaggtgatagtgtcttcttttccatagaggatggtatcctggaaggattcaaatgatcttggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcatcc 5206998  T
Q  207 tcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    | ||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  5206999 ttaagatgcacctcaatgttctctaaatcataaaggattttgttgaacgtcgttagttgctccat 5207063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4588977 - 4588735
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||  | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  4588977 ctcttgaaacactaaggtcttcactattttcatccct-ctcaagtctttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcgttcatggt 4588879  T
Q  113 aacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaaga 212  Q
     |||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||    
T  4588878 gacagtgtcttatttgcaatagagcatggtatccttgaaggattcaaatgatctcggtagagaacagaacaagagtatagcttttccttcgtcctcaaga 4588779  T
Q  213 tgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactc 256  Q
    | ||| | ||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  4588778 ttcacttgaatgttctcctaatcatcaacgattttgttgaactc 4588735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 158 - 273
Target Start/End: Original strand, 12395190 - 12395305
Alignment:
Q  158 aaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactcc 257  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12395190 aaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcttcatcctcaagttactcctcaatattctccaagtcatcacggattttgttgaactcc 12395289  T
Q  258 gtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||    
T  12395290 gtaagttgctccatga 12395305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 146
Target Start/End: Original strand, 12740874 - 12741007
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12740874 ctcttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttcaaaggt 12740973  T
Q  113 aacagtgccttctttgccatatagcatagtatct 146  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12740974 gacagtgccttctttgccatagagcatggtatct 12741007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 146
Target Start/End: Original strand, 12749080 - 12749213
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12749080 ctcttgaaacactaaggccttcactgttttcatccactctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttcaaaggt 12749179  T
Q  113 aacagtgccttctttgccatatagcatagtatct 146  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12749180 gacagtgccttctttgccatagagcatggtatct 12749213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 141 - 271
Target Start/End: Original strand, 12743198 - 12743328
Alignment:
Q  141 gtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaa 240  Q
    ||||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12743198 gtatccttgaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagccttgtcttcgtcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaa 12743297  T
Q  241 ggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12743298 agattttgttgaactccgttaattgctccat 12743328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18913915 - 18913739
Alignment:
Q  13 ctcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| | | ||||  ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||  ||||| || ||| |    
T  18913915 ctcttgagacacttaagccttcaccactatcatcaaatcttaaatcattggacttggttaactccttagttctcaacactgcttagacttcctctaagtt 18913816  T
Q  113 aacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagta 189  Q
     ||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||  | | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18913815 gacaatgccttccttgccatatatcatggtatccttgaagaactcaaaagatctaggtaaagcacaaaacaagagta 18913739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15313266 - 15313047
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15313266 tcaagtctttgaacttggtcaactctttggttatcaaagttgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaa 15313167  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
    |   | ||| || || |||||||||||||  | | |||  | |||||| || || || ||||  || || || ||| |||| |||||||  || || |||    
T  15313166 attctcaaaggacctaggtaaagcacacagtaggtgtaaggctttatcctcgtcttccagattaacatctatgttcgccaaatcatcaataatcttattg 15313067  T
Q  252 aactccgtaagttgctccat 271  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15313066 aactccgtaagttgctccat 15313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 4559142 - 4559066
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcata 140  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  4559142 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctcttttccataaagcata 4559066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16454262 - 16454207
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactcc 257  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  16454262 catcctcaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactcc 16454207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 152
Target Start/End: Original strand, 5147078 - 5147178
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||||| || || ||||| || || ||||| |||||    
T  5147078 tcaagtccttgaacttggtcaattgtttggttctcaaagccgcttggacttcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 5147177  T
Q  152 a 152  Q
    |    
T  5147178 a 5147178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10113802 - 10113746
Alignment:
Q  217 cctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  10113802 cctcaatgttttccaaatcatcaaggattttgttgaactctgttagtcgctccatga 10113746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16633438 - 16633346
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtat 144  Q
    |||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||  ||||  ||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  16633438 tcaactccttgaatttggttaactctttggttctcaaagttgcttagacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcattgtat 16633346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 273
Target Start/End: Original strand, 18536898 - 18536949
Alignment:
Q  221 aatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18536898 aatattttccaagtcatcaag-attctgttgaactccgcaagttgctccatga 18536949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 273
Target Start/End: Original strand, 36920879 - 36920943
Alignment:
Q  209 aagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  36920879 aagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatga 36920943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Original strand, 14788807 - 14788878
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  14788807 catcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatga 14788878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 21549599 - 21549542
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaa 109  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| || |||||    
T  21549599 tcaaatccttgaacttggttaactccttggttctcaaaggtgcttgaacctcctccaa 21549542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 270
Target Start/End: Original strand, 22802111 - 22802179
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctcca 270  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  22802111 catcctcaagatgcaacttaatgttctcaaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctcca 22802179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 38983939 - 38983999
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggt 112  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||||    
T  38983939 tcaagtcattggacttgagtaactcattcgttctcaacaccgcttggacctcttccaaggt 38983999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Original strand, 19503519 - 19503781
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||| | || || ||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19503519 attccctcttgagacacttaggccctcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 19503615  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19503616 aaggtaacagtgccttacttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcatcct 19503715  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19503716 caagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 19503781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Original strand, 21519874 - 21520139
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||  | ||||| |  ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21519874 attccctcttgagacacttaggccttcactgtgttaataaactctcaagtccttggactgggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 21519973  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  21519974 aaggtaacagtgccttctttgccatagagcatgatatctttgaatgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtataactttatcctcatcct 21520073  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21520074 taagttgcaccttaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 21520139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Original strand, 36560365 - 36560586
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  36560365 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 36560464  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36560465 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 36560564  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36560565 aactccgtaagttgctccatga 36560586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Original strand, 35217194 - 35217415
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  35217194 tcaagtccttggacttggtcaaatccttggttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 35217293  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35217294 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 35217393  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  35217394 aactccgtaagttgctccatga 35217415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Original strand, 28569599 - 28569870
Alignment:
Q  4 cacaattcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  28569599 cacaattccctgttgaaacacttaggtcttcaccgttttcatcagctctcaagtccttggacttggtcatctccttggttctcaaagtcacttgaacttc 28569698  T
Q  104 ttccaaggtaaca--gtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatctt 201  Q
    ||| ||| | |||  ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28569699 ttctaagttgacaatgtgccttctttgccatagagcatgatatccttgaaggatttaaaagatctcggtagagcacacaacaagagtataactttatctt 28569798  T
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28569799 catcctcaagatgcaccttaatagtcttcatgtcttcaaggattttgttgaactccgtaagttgatccatga 28569870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 255
Target Start/End: Original strand, 42019026 - 42019273
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| | ||| |||    
T  42019026 attccctctggaaatacttatgccttcactattttcatcaactctcaagtccttggacttggttaacttcttggttctaaaagtcgattggaattcctcc 42019125  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    ||||| ||| |||||||||||  ||| ||||| ||||| |||||  ||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||    
T  42019126 aaggtgacaatgccttctttgaaatagagcatggtatccttgaagaattcaaatgatctcggtatagcatacaacaagagtataactttgtctttatcct 42019225  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaact 255  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42019226 taagatgcacctcaatgttctccaagtcatcatggattttgttgaact 42019273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 39680982 - 39680865
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaaga 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   | ||| ||    
T  39680982 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaattctcaaagga 39680883  T
Q  164 tctcggtaaagcacacaa 181  Q
     || ||||||||||||||    
T  39680882 cctaggtaaagcacacaa 39680865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 215 - 273
Target Start/End: Original strand, 22405317 - 22405375
Alignment:
Q  215 cacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22405317 caccttaatattctctaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 22405375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 2737141 - 2737053
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2737141 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttaaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaa 2737053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Original strand, 20054005 - 20054093
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20054005 acttggttaactctttggttctcaaagttgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaa 20054093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 17933057 - 17932979
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagt 142  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17933057 acttggtcaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagt 17932979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Original strand, 22716478 - 22716566
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22716478 acttggttaactttttggttctcaaaactgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaaa 22716566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Original strand, 6263528 - 6263599
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6263528 catcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaactgttttgttgaactccataagttgctccatga 6263599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 152
Target Start/End: Original strand, 19348453 - 19348554
Alignment:
Q  51 ctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttga 150  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || || ||||| ||||    
T  19348453 ctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttga 19348552  T
Q  151 aa 152  Q
    ||    
T  19348553 aa 19348554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 109
Target Start/End: Original strand, 25402827 - 25402884
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaa 109  Q
    ||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  25402827 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttcttaaagccgcttggacctcttccaa 25402884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23181 - 22960
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  23181 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 23082  T
Q  152 agattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttg 251  Q
     |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23081 cgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctcgtcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttg 22982  T
Q  252 aactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22981 aactccgtaagttgctccatga 22960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 720 - 458
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||| | || || ||   |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  720 attccctcttgtgacacttaggccttcaccgtgttcatgag---tcaagtcctttgacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 624  T
Q  108 aaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcct 207  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  623 aaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagatttcggtagagcacacaacaagagtataactttatcctcatcct 524  T
Q  208 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  523 caagtttcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34654 - 34384
Alignment:
Q  8 attcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttcc 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| | || || |  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34654 attccctcttgagacacttaggccttcaccgtgttcatgaactctcaagtccttggacttggtcaaccccttggttctcaaagccacttgaacttcttcc 34555  T
Q  108 aa-----ggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttc 202  Q
    ||     |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  34554 aatgcaaggtaacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaacaattcaaaagattttggtagagcacacaacaagagtatagctttatcctc 34455  T
Q  203 atcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  34454 atcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgtttaactccgtgagttgctccatga 34384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 115626 - 115371
Alignment:
Q  16 ttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaac 115  Q
    |||||||||| |||||||||   |||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  115626 ttgaaacactaaggccttcattgttttcatcctctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgac 115527  T
Q  116 agtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatgc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |  ||||| | || ||| | |    
T  115526 agtgccttctttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagcctgttcttcgttctaaagtttc 115427  T
Q  216 acctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccat 271  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  115426 acctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactctgtcaattgctccat 115371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1908 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1908
Description:

Target: scaffold1908; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 390 - 137
Alignment:
Q  15 cttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaa 114  Q
    ||||||||||| || |||| ||  |||| ||| | || ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||| |    
T  390 cttgaaacactaagaccttaactgtttttatccgctcccaagtccttggacctggtcaactctttggttctcaaagttgattgaacttcttccaaggtga 291  T
Q  115 cagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagatg 214  Q
    || ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||    
T  290 cactgcgttctttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaatgatctcggtagagcacacaacaagagtatagctttgtcttcgtcctcaagttg 191  T
Q  215 cacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctc 268  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  190 cacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctc 137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 26559 - 26815
Alignment:
Q  14 tcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcagttctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggta 113  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||  | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || || | ||||||     
T  26559 tcttgaaatacttagaccttcactattttcatcatctatcaagtccttggacttagttaactccttggttctcaaatccgcttggacgtccttcaaggtg 26658  T
Q  114 acagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattaaaaagatctcggtaaagcacacaacaagagtatagttttatcttcatcctcaagat 213  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| |||| ||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  26659 gcagtgccttctttaccatagagcatggtacccttgaaggattcaaatgatcacggtagagcacacaaaaagagtatagctttgccttcatcctcaagat 26758  T
Q  214 gcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctcca 270  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  26759 gcacatcaatgttctccaaatcatcaagaatttgtttgaactccattagttgctcca 26815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 17261 - 17173
Alignment:
Q  64 acttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaa 152  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17261 acttggtcaattctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtaatagtgccctctttgccatagagcatagtatccttgaaa 17173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 273
Target Start/End: Original strand, 26284 - 26335
Alignment:
Q  221 aatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  26284 aatattctccaagtcatcaaggatttt-ttgaactccgcaagtttctccatga 26335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 152
Target Start/End: Original strand, 1684 - 1784
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaa 151  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||| || || ||||| |||   ||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  1684 tcaagtccttgaacttggtcaattcattggttctctaagccgcttggacctcctccaaagtagtggtgccctctttaccataaaggatggtatccttgaa 1783  T
Q  152 a 152  Q
    |    
T  1784 a 1784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 50923 - 50852
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  50923 catcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatga 50852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 80771 - 80700
Alignment:
Q  202 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatga 273  Q
    ||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  80771 catcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatga 80700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 4104 - 4059
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttg 97  Q
    ||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  4104 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttg 4059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 15220 - 15119
Alignment:
Q  51 ctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatatagcatagtatctttga 150  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||| |||  |||||| || || ||||| || || ||||| ||||    
T  15220 ctcatgtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttga 15121  T
Q  151 aa 152  Q
    ||    
T  15120 aa 15119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 18849 - 18804
Alignment:
Q  52 tcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaagccgcttg 97  Q
    ||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  18849 tcaagtccttgaacttggtcaattcgttggttctcaaagccgcttg 18804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University