View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10481A_low_376 (Length: 250)

Name: NF10481A_low_376
Description: NF10481A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10481A_low_376
NF10481A_low_376
[»] chr5 (65 HSPs)
chr5 (4-191)||(21652690-21652877)
chr5 (1-187)||(11582564-11582750)
chr5 (1-191)||(21392874-21393064)
chr5 (1-184)||(1169946-1170129)
chr5 (1-191)||(20710823-20711012)
chr5 (1-191)||(28258286-28258477)
chr5 (1-187)||(1221136-1221319)
chr5 (4-187)||(17473177-17473360)
chr5 (1-187)||(22367889-22368072)
chr5 (1-187)||(7424367-7424551)
chr5 (1-187)||(11341326-11341510)
chr5 (1-187)||(21074894-21075077)
chr5 (1-187)||(4201370-4201554)
chr5 (1-187)||(23513486-23513672)
chr5 (2-184)||(24184499-24184681)
chr5 (1-187)||(25192401-25192586)
chr5 (1-183)||(11044-11222)
chr5 (1-184)||(9732071-9732252)
chr5 (1-184)||(16534999-16535181)
chr5 (1-187)||(22884585-22884771)
chr5 (1-183)||(29192025-29192203)
chr5 (1-187)||(110387-110572)
chr5 (1-187)||(10779584-10779767)
chr5 (1-187)||(43445157-43445342)
chr5 (1-187)||(21234810-21234994)
chr5 (1-183)||(4863961-4864143)
chr5 (1-187)||(18779398-18779583)
chr5 (1-187)||(23327643-23327825)
chr5 (1-187)||(24595191-24595373)
chr5 (1-187)||(25425312-25425493)
chr5 (11-184)||(20615305-20615476)
chr5 (1-184)||(21649523-21649705)
chr5 (2-184)||(37051677-37051857)
chr5 (15-191)||(23510676-23510849)
chr5 (8-184)||(35792544-35792719)
chr5 (13-187)||(19498490-19498659)
chr5 (1-187)||(21933567-21933748)
chr5 (1-187)||(21939737-21939918)
chr5 (1-187)||(35580944-35581125)
chr5 (1-187)||(37010571-37010752)
chr5 (1-189)||(19404268-19404457)
chr5 (1-184)||(27185118-27185301)
chr5 (1-189)||(23453638-23453827)
chr5 (1-189)||(23465143-23465332)
chr5 (4-191)||(11338154-11338341)
chr5 (1-184)||(25901730-25901911)
chr5 (1-179)||(11213007-11213183)
chr5 (20-184)||(27008705-27008867)
chr5 (27-103)||(24474367-24474443)
chr5 (86-159)||(7727296-7727369)
chr5 (89-184)||(3672685-3672780)
chr5 (1-51)||(1169798-1169848)
chr5 (1-51)||(17473025-17473075)
chr5 (86-159)||(23492722-23492794)
chr5 (86-147)||(32967547-32967608)
chr5 (87-147)||(37189501-37189561)
chr5 (4-51)||(43445013-43445060)
chr5 (130-184)||(24470996-24471049)
chr5 (86-158)||(431149-431221)
chr5 (87-147)||(28888649-28888709)
chr5 (89-184)||(5452190-5452285)
chr5 (89-158)||(21615735-21615804)
chr5 (89-158)||(24226842-24226911)
chr5 (89-147)||(19860967-19861025)
chr5 (1-51)||(35792406-35792456)
[»] chr6 (58 HSPs)
chr6 (1-191)||(18431322-18431512)
chr6 (1-191)||(18004258-18004448)
chr6 (1-191)||(25646112-25646302)
chr6 (1-187)||(35016966-35017152)
chr6 (1-191)||(15736466-15736656)
chr6 (1-187)||(18569280-18569465)
chr6 (1-187)||(27655372-27655555)
chr6 (1-184)||(31627134-31627317)
chr6 (1-184)||(32897419-32897602)
chr6 (1-187)||(16827161-16827346)
chr6 (7-187)||(18088003-18088182)
chr6 (5-183)||(11214836-11215014)
chr6 (1-184)||(16230278-16230459)
chr6 (1-187)||(23976263-23976446)
chr6 (1-187)||(33315867-33316050)
chr6 (1-184)||(16105254-16105438)
chr6 (1-187)||(4989591-4989774)
chr6 (1-183)||(25174253-25174431)
chr6 (4-191)||(13622401-13622589)
chr6 (1-187)||(16239057-16239244)
chr6 (1-187)||(1658996-1659182)
chr6 (1-187)||(10487573-10487754)
chr6 (1-187)||(16377573-16377754)
chr6 (1-187)||(16384897-16385078)
chr6 (1-184)||(23151956-23152138)
chr6 (1-187)||(14627895-14628079)
chr6 (1-184)||(18775907-18776087)
chr6 (1-184)||(19984490-19984671)
chr6 (35-184)||(18128981-18129129)
chr6 (8-187)||(17343578-17343754)
chr6 (1-191)||(13016071-13016260)
chr6 (14-184)||(15861425-15861593)
chr6 (1-187)||(16557301-16557483)
chr6 (1-187)||(16650531-16650713)
chr6 (1-187)||(29870760-29870943)
chr6 (1-184)||(26088532-26088713)
chr6 (1-183)||(18825046-18825225)
chr6 (1-183)||(18843106-18843286)
chr6 (4-184)||(18397622-18397803)
chr6 (8-184)||(23993858-23994032)
chr6 (1-187)||(1651236-1651420)
chr6 (1-184)||(22430944-22431127)
chr6 (1-146)||(25745617-25745763)
chr6 (16-184)||(1554536-1554703)
chr6 (1-187)||(22226926-22227111)
chr6 (66-187)||(19609191-19609310)
chr6 (81-184)||(16084112-16084215)
chr6 (81-189)||(28196147-28196255)
chr6 (18-184)||(22866864-22867031)
chr6 (86-184)||(25368728-25368827)
chr6 (86-184)||(15738945-15739043)
chr6 (1-78)||(16084882-16084960)
chr6 (2-51)||(1554817-1554866)
chr6 (126-184)||(18741146-18741203)
chr6 (86-147)||(16889122-16889183)
chr6 (86-159)||(33323532-33323605)
chr6 (86-159)||(35137326-35137399)
chr6 (89-145)||(22846867-22846923)
[»] chr4 (61 HSPs)
chr4 (1-235)||(821397-821646)
chr4 (1-191)||(33738948-33739138)
chr4 (1-184)||(12901057-12901240)
chr4 (1-184)||(44054612-44054795)
chr4 (1-184)||(53909055-53909238)
chr4 (5-187)||(53706079-53706261)
chr4 (1-191)||(44345510-44345701)
chr4 (1-184)||(16521479-16521661)
chr4 (1-187)||(19999215-19999398)
chr4 (1-191)||(7133734-7133924)
chr4 (4-191)||(45460244-45460432)
chr4 (1-184)||(8873779-8873961)
chr4 (1-187)||(10642874-10643060)
chr4 (1-187)||(18167481-18167663)
chr4 (1-187)||(15288295-15288479)
chr4 (1-184)||(110171-110353)
chr4 (1-184)||(15274045-15274226)
chr4 (1-184)||(21960853-21961036)
chr4 (1-187)||(9294212-9294396)
chr4 (1-187)||(10487358-10487542)
chr4 (1-187)||(22355849-22356033)
chr4 (1-187)||(26338173-26338355)
chr4 (1-187)||(13245139-13245323)
chr4 (1-187)||(15295405-15295589)
chr4 (1-187)||(16329209-16329393)
chr4 (1-183)||(18246881-18247059)
chr4 (1-187)||(47356013-47356199)
chr4 (1-187)||(14950707-14950891)
chr4 (1-186)||(8373042-8373226)
chr4 (1-183)||(14994888-14995068)
chr4 (1-184)||(25120407-25120589)
chr4 (33-187)||(54119579-54119732)
chr4 (1-184)||(34393744-34393927)
chr4 (4-170)||(30233831-30233998)
chr4 (1-184)||(5684187-5684370)
chr4 (1-184)||(15212032-15212215)
chr4 (5-189)||(18495695-18495880)
chr4 (8-184)||(13049455-13049630)
chr4 (1-187)||(26678732-26678906)
chr4 (1-135)||(23271209-23271342)
chr4 (81-189)||(13810995-13811103)
chr4 (116-191)||(13751694-13751769)
chr4 (86-184)||(43282757-43282855)
chr4 (86-184)||(52266840-52266938)
chr4 (1-134)||(18294452-18294580)
chr4 (1-111)||(8044021-8044132)
chr4 (1-51)||(5684038-5684088)
chr4 (1-51)||(18294304-18294354)
chr4 (86-159)||(15852696-15852769)
chr4 (2-51)||(19019390-19019439)
chr4 (4-51)||(8373431-8373478)
chr4 (94-184)||(15043631-15043721)
chr4 (94-184)||(15110703-15110793)
chr4 (4-50)||(47356297-47356343)
chr4 (86-147)||(27959759-27959820)
chr4 (86-147)||(34197544-34197605)
chr4 (1-51)||(34394020-34394070)
chr4 (86-139)||(37958436-37958489)
chr4 (86-147)||(41167314-41167375)
chr4 (1-51)||(18109988-18110038)
chr4 (89-158)||(41257728-41257797)
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (1-191)||(22407486-22407676)
chr1 (1-191)||(49966331-49966521)
chr1 (1-184)||(2422262-2422445)
chr1 (1-187)||(18506043-18506228)
chr1 (6-187)||(41210732-41210913)
chr1 (1-184)||(20826515-20826696)
chr1 (1-184)||(44036191-44036373)
chr1 (1-187)||(15862724-15862908)
chr1 (2-184)||(35523713-35523894)
chr1 (1-187)||(22034535-22034717)
chr1 (1-187)||(22250244-22250430)
chr1 (1-184)||(37845757-37845939)
chr1 (8-187)||(20894991-20895169)
chr1 (1-184)||(21858246-21858428)
chr1 (1-187)||(22352814-22353000)
chr1 (1-187)||(22365441-22365627)
chr1 (1-187)||(17147468-17147652)
chr1 (1-187)||(7641886-7642068)
chr1 (1-187)||(21651228-21651412)
chr1 (1-178)||(20444442-20444618)
chr1 (1-178)||(20530207-20530383)
chr1 (1-184)||(5675892-5676074)
chr1 (1-187)||(18060900-18061085)
chr1 (1-187)||(51451299-51451483)
chr1 (1-184)||(21716895-21717075)
chr1 (1-184)||(35053532-35053712)
chr1 (1-187)||(17003511-17003692)
chr1 (1-184)||(20526808-20526990)
chr1 (1-187)||(45050370-45050554)
chr1 (1-187)||(22029383-22029566)
chr1 (8-187)||(22226667-22226846)
chr1 (20-184)||(41218143-41218307)
chr1 (1-187)||(41393138-41393322)
chr1 (20-184)||(20930163-20930327)
chr1 (27-184)||(9785551-9785707)
chr1 (16-184)||(18602351-18602518)
chr1 (16-184)||(5073608-5073775)
chr1 (1-191)||(51657605-51657805)
chr1 (16-149)||(20121965-20122098)
chr1 (1-72)||(22031007-22031078)
chr1 (86-159)||(38034997-38035070)
chr1 (89-184)||(22836628-22836723)
chr1 (86-184)||(27673543-27673641)
chr1 (2-51)||(20253246-20253295)
chr1 (86-159)||(36357713-36357786)
chr1 (86-161)||(20956341-20956416)
chr1 (1-51)||(22353097-22353147)
chr1 (86-147)||(19601911-19601972)
chr1 (89-158)||(37235336-37235405)
chr1 (89-147)||(5471758-5471816)
chr1 (90-158)||(8539328-8539396)
chr1 (90-158)||(8604567-8604635)
[»] chr8 (76 HSPs)
chr8 (1-187)||(24718701-24718887)
chr8 (1-191)||(25121227-25121417)
chr8 (1-187)||(6775516-6775701)
chr8 (1-191)||(41245348-41245538)
chr8 (1-191)||(19994435-19994626)
chr8 (1-187)||(3432860-3433044)
chr8 (1-190)||(22908769-22908956)
chr8 (1-187)||(43374867-43375051)
chr8 (1-187)||(224445-224631)
chr8 (1-187)||(700858-701044)
chr8 (1-187)||(738068-738254)
chr8 (1-187)||(861963-862149)
chr8 (1-187)||(13663920-13664105)
chr8 (1-187)||(13723195-13723380)
chr8 (1-184)||(20648723-20648906)
chr8 (1-191)||(22322719-22322909)
chr8 (1-187)||(5236883-5237067)
chr8 (1-187)||(16874223-16874407)
chr8 (1-187)||(24662531-24662715)
chr8 (1-187)||(43684342-43684526)
chr8 (1-184)||(24930398-24930582)
chr8 (1-184)||(20655308-20655491)
chr8 (1-184)||(24386993-24387175)
chr8 (1-187)||(272490-272671)
chr8 (1-187)||(643178-643359)
chr8 (1-187)||(828984-829165)
chr8 (1-191)||(16416945-16417136)
chr8 (1-187)||(22089729-22089911)
chr8 (1-183)||(24107871-24108050)
chr8 (1-184)||(37610059-37610242)
chr8 (1-187)||(15320345-15320527)
chr8 (1-187)||(15500714-15500896)
chr8 (1-184)||(29758984-29759166)
chr8 (1-182)||(16195021-16195202)
chr8 (4-184)||(20568553-20568734)
chr8 (4-184)||(20574746-20574927)
chr8 (1-187)||(24547909-24548093)
chr8 (27-184)||(270429-270585)
chr8 (27-184)||(645335-645491)
chr8 (27-184)||(831070-831226)
chr8 (27-187)||(22007788-22007948)
chr8 (1-184)||(21696253-21696437)
chr8 (1-189)||(21679889-21680078)
chr8 (1-189)||(17730748-17730936)
chr8 (4-184)||(28543628-28543806)
chr8 (1-117)||(28836353-28836466)
chr8 (1-184)||(20480365-20480544)
chr8 (16-184)||(16675624-16675791)
chr8 (20-184)||(21853199-21853361)
chr8 (85-184)||(37605685-37605783)
chr8 (20-184)||(21845794-21845956)
chr8 (86-184)||(18768135-18768233)
chr8 (1-104)||(16040644-16040748)
chr8 (1-104)||(16042320-16042424)
chr8 (118-184)||(16203739-16203804)
chr8 (1-189)||(38532336-38532534)
chr8 (86-159)||(39448198-39448271)
chr8 (2-51)||(18618138-18618187)
chr8 (86-147)||(21199547-21199608)
chr8 (86-147)||(31195658-31195719)
chr8 (4-51)||(224301-224348)
chr8 (4-51)||(700714-700761)
chr8 (4-51)||(737924-737971)
chr8 (4-51)||(861819-861866)
chr8 (4-51)||(17151288-17151335)
chr8 (1-51)||(13663773-13663823)
chr8 (1-51)||(13722308-13722358)
chr8 (1-51)||(13722456-13722506)
chr8 (1-51)||(13722604-13722654)
chr8 (1-51)||(13722752-13722802)
chr8 (1-51)||(13722900-13722950)
chr8 (1-51)||(13723048-13723098)
chr8 (89-147)||(23148624-23148682)
chr8 (86-147)||(21192120-21192181)
chr8 (86-184)||(22737250-22737349)
chr8 (89-147)||(23835950-23836008)
[»] chr7 (66 HSPs)
chr7 (1-191)||(13867362-13867552)
chr7 (1-190)||(44863930-44864119)
chr7 (1-184)||(45453544-45453728)
chr7 (1-191)||(7291540-7291729)
chr7 (1-191)||(12545000-12545190)
chr7 (1-191)||(47288461-47288651)
chr7 (1-184)||(369580-369763)
chr7 (1-183)||(15952384-15952563)
chr7 (4-191)||(26071557-26071743)
chr7 (4-191)||(26095344-26095530)
chr7 (1-191)||(15823694-15823888)
chr7 (1-191)||(142313-142504)
chr7 (7-187)||(18981201-18981379)
chr7 (1-184)||(2027250-2027433)
chr7 (4-187)||(2191987-2192169)
chr7 (1-184)||(3058741-3058923)
chr7 (1-183)||(16417162-16417340)
chr7 (1-187)||(13757270-13757454)
chr7 (1-187)||(15442847-15443031)
chr7 (1-187)||(16210471-16210655)
chr7 (1-185)||(13038394-13038576)
chr7 (1-184)||(32495842-32496025)
chr7 (1-184)||(112585-112767)
chr7 (1-184)||(11582130-11582311)
chr7 (1-184)||(11285904-11286089)
chr7 (1-187)||(36051355-36051539)
chr7 (1-184)||(13912401-13912582)
chr7 (1-187)||(15525771-15525957)
chr7 (1-187)||(27102838-27103019)
chr7 (1-187)||(27110186-27110367)
chr7 (1-187)||(27175307-27175488)
chr7 (1-187)||(38784930-38785111)
chr7 (1-187)||(16480224-16480408)
chr7 (1-184)||(1938059-1938240)
chr7 (1-184)||(125520-125702)
chr7 (1-187)||(7821615-7821796)
chr7 (1-187)||(7828926-7829107)
chr7 (1-184)||(12753575-12753757)
chr7 (1-184)||(12249400-12249584)
chr7 (1-187)||(15926058-15926240)
chr7 (8-184)||(42057458-42057632)
chr7 (1-184)||(11514816-11514997)
chr7 (1-184)||(30263412-30263593)
chr7 (1-187)||(26010479-26010663)
chr7 (1-184)||(3893789-3893969)
chr7 (1-187)||(18255108-18255295)
chr7 (16-184)||(15761672-15761839)
chr7 (7-184)||(13571525-13571701)
chr7 (4-189)||(16571380-16571568)
chr7 (4-189)||(16594094-16594282)
chr7 (45-187)||(2436315-2436456)
chr7 (43-184)||(25293608-25293747)
chr7 (9-187)||(10988303-10988479)
chr7 (81-189)||(13273431-13273539)
chr7 (81-189)||(15629459-15629567)
chr7 (1-64)||(39047979-39048042)
chr7 (81-189)||(49049169-49049277)
chr7 (2-51)||(15761509-15761558)
chr7 (1-40)||(15851163-15851202)
chr7 (89-158)||(9058007-9058076)
chr7 (1-45)||(15629613-15629657)
chr7 (89-183)||(10862231-10862326)
chr7 (90-147)||(15913817-15913874)
chr7 (1-40)||(13273590-13273629)
chr7 (1-51)||(2191834-2191884)
chr7 (86-124)||(13376423-13376461)
[»] chr3 (84 HSPs)
chr3 (1-190)||(6148126-6148315)
chr3 (1-187)||(13816200-13816386)
chr3 (1-187)||(19572056-19572242)
chr3 (1-191)||(16183294-16183489)
chr3 (1-187)||(15860432-15860617)
chr3 (1-187)||(16819597-16819779)
chr3 (1-187)||(18909378-18909560)
chr3 (1-184)||(22145559-22145740)
chr3 (1-191)||(50113417-50113602)
chr3 (4-191)||(17099397-17099585)
chr3 (1-187)||(8269688-8269870)
chr3 (1-187)||(8276799-8276981)
chr3 (1-184)||(8630538-8630720)
chr3 (1-184)||(17957620-17957802)
chr3 (1-183)||(22273737-22273915)
chr3 (1-184)||(33340534-33340716)
chr3 (1-184)||(53769350-53769531)
chr3 (2-184)||(35122377-35122559)
chr3 (1-187)||(49230901-49231087)
chr3 (1-184)||(51159763-51159945)
chr3 (1-184)||(318898-319081)
chr3 (1-184)||(2048751-2048934)
chr3 (8-187)||(27839394-27839573)
chr3 (1-183)||(2450614-2450791)
chr3 (1-184)||(7852499-7852681)
chr3 (1-184)||(19230751-19230933)
chr3 (11-191)||(25057531-25057710)
chr3 (1-187)||(1468940-1469121)
chr3 (1-184)||(17913536-17913717)
chr3 (1-187)||(30152023-30152205)
chr3 (4-184)||(16259732-16259911)
chr3 (1-184)||(19945317-19945500)
chr3 (4-189)||(14294114-14294300)
chr3 (1-183)||(15469753-15469931)
chr3 (1-187)||(16745456-16745639)
chr3 (4-184)||(14522594-14522775)
chr3 (2-184)||(14297188-14297371)
chr3 (2-184)||(14302815-14302998)
chr3 (1-187)||(44228115-44228300)
chr3 (4-189)||(11198859-11199045)
chr3 (4-189)||(14299741-14299927)
chr3 (1-187)||(15574730-15574914)
chr3 (53-191)||(30205137-30205274)
chr3 (2-184)||(53899808-53899989)
chr3 (1-187)||(15613749-15613933)
chr3 (1-184)||(11062321-11062504)
chr3 (7-179)||(23491202-23491373)
chr3 (1-187)||(12265775-12265960)
chr3 (1-184)||(12351129-12351312)
chr3 (4-191)||(17523699-17523884)
chr3 (1-147)||(47786168-47786314)
chr3 (1-184)||(5227406-5227585)
chr3 (4-184)||(40938421-40938602)
chr3 (44-184)||(10737247-10737386)
chr3 (89-187)||(14846034-14846131)
chr3 (8-184)||(45859709-45859884)
chr3 (16-184)||(55315085-55315252)
chr3 (1-181)||(12562762-12562944)
chr3 (1-187)||(15939743-15939930)
chr3 (3-124)||(16935168-16935286)
chr3 (88-187)||(8305693-8305790)
chr3 (89-187)||(18905171-18905267)
chr3 (16-184)||(41268931-41269098)
chr3 (1-96)||(12031268-12031364)
chr3 (47-184)||(13976964-13977101)
chr3 (47-184)||(13956132-13956269)
chr3 (88-184)||(17138157-17138253)
chr3 (92-184)||(12951743-12951835)
chr3 (87-147)||(15874893-15874953)
chr3 (2-51)||(9303753-9303802)
chr3 (87-147)||(11330382-11330442)
chr3 (89-184)||(15516426-15516521)
chr3 (1-38)||(17937333-17937370)
chr3 (89-158)||(38812367-38812436)
chr3 (86-158)||(12490105-12490177)
chr3 (141-189)||(14287780-14287828)
chr3 (96-184)||(39654607-39654695)
chr3 (1-64)||(18897982-18898045)
chr3 (94-184)||(11883645-11883735)
chr3 (154-187)||(11813553-11813586)
chr3 (1-51)||(16260014-16260064)
chr3 (86-147)||(14060614-14060675)
chr3 (87-159)||(55442145-55442218)
chr3 (156-184)||(47786311-47786339)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (1-184)||(8125-8308)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (1-191)||(6232-6422)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (1-191)||(15151-15338)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (1-187)||(28574-28759)
scaffold0116 (1-51)||(28857-28907)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (6-181)||(686-861)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (1-191)||(256194-256384)
scaffold0011 (1-176)||(262800-262975)
scaffold0011 (1-187)||(124578-124762)
scaffold0011 (1-187)||(193303-193487)
scaffold0011 (1-187)||(75979-76163)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (1-191)||(95006-95196)
scaffold0044 (20-184)||(66745-66907)
scaffold0044 (1-51)||(95294-95344)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (1-187)||(78241-78427)
scaffold0034 (1-184)||(38903-39087)
scaffold0034 (1-161)||(44513-44674)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (1-187)||(109368-109553)
scaffold0032 (27-184)||(54330-54486)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (1-191)||(38618-38807)
scaffold0078 (1-184)||(40184-40366)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (1-191)||(2126-2317)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (1-191)||(6646-6837)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (4-191)||(26014-26200)
scaffold0037 (1-191)||(70683-70873)
scaffold0037 (1-45)||(93527-93571)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-184)||(21351-21534)
scaffold0008 (20-184)||(129504-129668)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (1-191)||(13027-13217)
scaffold0359 (1-40)||(161-200)
[»] chr2 (57 HSPs)
chr2 (3-191)||(36891998-36892185)
chr2 (1-187)||(5889582-5889765)
chr2 (1-187)||(34822886-34823070)
chr2 (1-187)||(3800398-3800581)
chr2 (1-187)||(21275812-21275995)
chr2 (1-184)||(25600652-25600835)
chr2 (1-187)||(12726741-12726925)
chr2 (4-185)||(24966987-24967168)
chr2 (1-187)||(8942334-8942520)
chr2 (2-184)||(4449517-4449698)
chr2 (1-184)||(8886832-8887014)
chr2 (1-183)||(19888065-19888243)
chr2 (1-183)||(21140569-21140747)
chr2 (2-187)||(461426-461609)
chr2 (1-184)||(12643310-12643491)
chr2 (1-184)||(22862179-22862361)
chr2 (1-187)||(14907723-14907907)
chr2 (1-187)||(20013810-20013994)
chr2 (1-187)||(23818867-23819051)
chr2 (1-183)||(43644261-43644442)
chr2 (1-187)||(12637450-12637633)
chr2 (1-184)||(22273577-22273759)
chr2 (1-165)||(25877235-25877399)
chr2 (1-187)||(11232539-11232720)
chr2 (1-187)||(22514386-22514567)
chr2 (1-187)||(23773225-23773407)
chr2 (1-187)||(24686954-24687136)
chr2 (1-183)||(24827854-24828034)
chr2 (1-187)||(28776987-28777168)
chr2 (2-184)||(15632088-15632269)
chr2 (1-187)||(20628683-20628864)
chr2 (1-184)||(22282810-22282992)
chr2 (1-189)||(7320174-7320363)
chr2 (1-184)||(6878134-6878317)
chr2 (81-191)||(22691316-22691426)
chr2 (81-191)||(22695963-22696073)
chr2 (43-184)||(27260274-27260415)
chr2 (1-184)||(22581218-22581402)
chr2 (3-189)||(24572678-24572865)
chr2 (1-189)||(28972727-28972914)
chr2 (81-184)||(269878-269981)
chr2 (27-184)||(9654140-9654296)
chr2 (16-184)||(17397894-17398061)
chr2 (89-184)||(721162-721257)
chr2 (86-159)||(23822894-23822967)
chr2 (86-159)||(23824838-23824911)
chr2 (86-159)||(23831973-23832046)
chr2 (86-184)||(22787408-22787506)
chr2 (86-147)||(19670515-19670576)
chr2 (8-101)||(22693040-22693133)
chr2 (8-101)||(22697687-22697780)
chr2 (137-187)||(22692978-22693028)
chr2 (137-187)||(22697625-22697675)
chr2 (89-147)||(24088752-24088810)
chr2 (86-159)||(4663-4735)
chr2 (86-159)||(24295958-24296031)
chr2 (86-147)||(19658678-19658739)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (1-183)||(155642-155821)
scaffold0023 (1-187)||(732-914)
scaffold0023 (45-187)||(35023-35163)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (4-191)||(87127-87311)
scaffold0021 (1-191)||(138098-138286)
scaffold0021 (1-190)||(10351-10541)
scaffold0021 (136-191)||(77069-77124)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (4-184)||(71741-71921)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (1-191)||(14364-14555)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (1-187)||(18864-19050)
scaffold0234 (1-51)||(18717-18767)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (1-191)||(32268-32458)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (1-187)||(90171-90353)
scaffold0028 (1-187)||(129075-129258)
scaffold0028 (86-147)||(78410-78471)
[»] scaffold0383 (3 HSPs)
scaffold0383 (1-184)||(1057-1239)
scaffold0383 (1-184)||(5926-6106)
scaffold0383 (1-51)||(1336-1386)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (1-184)||(8771-8954)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-187)||(4530-4716)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-187)||(2863-3045)
scaffold0124 (8-184)||(22997-23168)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (1-187)||(27799-27983)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (1-184)||(17340-17522)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (1-184)||(145223-145405)
scaffold0025 (1-184)||(147482-147665)
scaffold0025 (1-51)||(145502-145552)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (6-184)||(40291-40468)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (4-187)||(2980-3163)
[»] scaffold0195 (4 HSPs)
scaffold0195 (1-184)||(7940-8123)
scaffold0195 (1-184)||(13329-13512)
scaffold0195 (1-184)||(18000-18182)
scaffold0195 (1-184)||(20084-20266)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-183)||(5874-6052)
scaffold0003 (1-184)||(217035-217218)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (1-187)||(1873-2057)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (1-186)||(69456-69641)
scaffold0031 (7-184)||(30768-30946)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (1-177)||(2418-2593)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (1-184)||(12891-13074)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (1-187)||(244-430)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (1-184)||(32478-32660)
scaffold0184 (80-191)||(34037-34147)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (1-187)||(30041-30223)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (1-184)||(52561-52743)
scaffold0018 (1-184)||(56513-56695)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (1-187)||(6436-6620)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (1-187)||(25591-25775)
scaffold0141 (1-187)||(21336-21520)
[»] scaffold0138 (6 HSPs)
scaffold0138 (15-187)||(14565-14735)
scaffold0138 (1-111)||(28261-28373)
scaffold0138 (1-111)||(40257-40369)
scaffold0138 (86-147)||(23801-23862)
scaffold0138 (1-51)||(28472-28522)
scaffold0138 (1-51)||(40468-40518)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (1-187)||(37977-38158)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-184)||(248826-249008)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (7-176)||(5902-6069)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (4-184)||(7485-7666)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (1-184)||(41399-41582)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (1-184)||(154-336)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (5-184)||(1916-2095)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (1-184)||(11212-11394)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (1-184)||(3352-3535)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (1-184)||(3318-3498)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (1-184)||(27714-27897)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (1-184)||(46819-47001)
scaffold0068 (1-184)||(60267-60449)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (8-187)||(106689-106867)
[»] scaffold0396 (2 HSPs)
scaffold0396 (8-187)||(16132-16311)
scaffold0396 (1-181)||(13480-13660)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (1-184)||(270813-270997)
scaffold0009 (1-184)||(236874-237057)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (8-187)||(6441-6620)
scaffold0022 (86-159)||(106297-106370)
scaffold0022 (81-184)||(108343-108446)
scaffold0022 (1-40)||(113844-113883)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (1-184)||(11322-11504)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (8-187)||(51719-51897)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (1-111)||(20582-20692)
scaffold0039 (157-187)||(20686-20716)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (36-183)||(4823-4970)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (1-187)||(17377-17561)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (20-184)||(7673-7837)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (59-176)||(58899-59016)
scaffold0051 (16-63)||(59375-59422)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (8-184)||(6634-6805)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (20-184)||(4902-5067)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (8-187)||(1078-1263)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (1-189)||(6570-6768)
[»] scaffold0269 (2 HSPs)
scaffold0269 (74-184)||(771-880)
scaffold0269 (74-184)||(15027-15136)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (1-121)||(29942-30063)
scaffold0120 (115-191)||(27260-27336)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (1-171)||(5700-5867)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (80-187)||(9291-9397)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (101-187)||(14987-15073)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (57-184)||(4092-4218)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (57-184)||(48932-49058)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (70-184)||(4534-4648)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (8-189)||(145616-145794)
[»] scaffold0150 (4 HSPs)
scaffold0150 (86-184)||(20391-20489)
scaffold0150 (86-184)||(27220-27318)
scaffold0150 (1-57)||(20527-20584)
scaffold0150 (1-57)||(27356-27413)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (1-111)||(17686-17797)
scaffold0244 (1-111)||(24105-24216)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (93-184)||(197482-197572)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (43-179)||(4469-4603)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (4-111)||(34334-34442)
[»] scaffold0808 (2 HSPs)
scaffold0808 (86-189)||(2839-2942)
scaffold0808 (1-40)||(2744-2783)
[»] scaffold0092 (2 HSPs)
scaffold0092 (86-181)||(2114-2209)
scaffold0092 (1-45)||(2260-2304)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (1-51)||(23898-23948)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (86-159)||(4728-4801)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (86-159)||(7041-7114)
[»] scaffold1734 (2 HSPs)
scaffold1734 (1-51)||(164-214)
scaffold1734 (1-64)||(1-65)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (87-184)||(7290-7387)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (2-51)||(53279-53328)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (86-159)||(71655-71728)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (86-158)||(3667-3739)
[»] scaffold2147 (1 HSPs)
scaffold2147 (148-187)||(991-1030)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (89-184)||(6021-6116)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (4-46)||(3082-3124)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (86-147)||(4759-4820)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (86-158)||(117977-118049)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (86-136)||(12936-12986)
[»] scaffold1752 (1 HSPs)
scaffold1752 (1-40)||(429-468)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (87-146)||(78206-78265)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (89-147)||(34203-34261)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (8-72)||(2696-2761)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 65)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 21652690 - 21652877
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21652690 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgaacatgttttcttgataatgcaaat 21652789  T
Q  104 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21652790 gttgtggaaataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 21652877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11582750 - 11582564
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11582750 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 11582651  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582650 aatgttgtggagataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 11582564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21393064 - 21392874
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21393064 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 21392965  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21392964 aatgttgtggagataatcaatataattgggttttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatggagtccttgtac 21392874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 1169946 - 1170129
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  1169946 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatggacatgttttcttgataatgca 1170045  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1170046 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttctcctatatattgaggtgaaaattttggattgttgtcgcgttatcgagtc 1170129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20711012 - 20710823
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  20711012 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga-tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcg 20710914  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20710913 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttctcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 20710823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28258477 - 28258286
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacatt-gttgattattgataatcatg-ttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28258477 ttgatgttgaatgacatttgttgattaatgataatcatgattgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 28258378  T
Q  99 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28258377 caa-tgttgtggaggtaatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgtcgtcgcattatcgagtccttgtac 28258286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 1221136 - 1221319
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  1221136 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 1221232  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1221233 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaagttgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 1221319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 187
Target Start/End: Original strand, 17473177 - 17473360
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 103  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17473177 atgttgaatgatgttgttgattattgataatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtataagcatgttttcttgataatgcaaat 17473276  T
Q  104 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17473277 gttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 17473360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 22367889 - 22368072
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  22367889 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 22367985  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22367986 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 22368072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7424551 - 7424367
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  7424551 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc- 7424453  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7424452 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 7424367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11341510 - 11341326
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  11341510 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgc- 11341412  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  11341411 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattattgagtcctt 11341326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 21074894 - 21075077
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  21074894 ttgatgttgaacgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 21074991  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21074992 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 21075077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 4201370 - 4201554
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  4201370 ttgatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc- 4201468  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4201469 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 4201554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23513672 - 23513486
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  23513672 ttgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgattactatgatctatttgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc 23513573  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23513572 aa-tgttgtggatataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 23513486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 24184499 - 24184681
Alignment:
Q  2 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  24184499 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaattccatgatttggttgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 24184598  T
Q  102 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24184599 atgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgtattgttgtcgcattatcgagtc 24184681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 25192401 - 25192586
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25192401 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 25192500  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25192501 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gtttgttgtcgcattatcgagtcctt 25192586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11222 - 11044
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  11222 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 11126  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11125 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 11044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 9732071 - 9732252
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| ||||||     
T  9732071 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc- 9732169  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9732170 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 9732252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16535181 - 16534999
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  16535181 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttgattgtatatgggcatgttttcttgataatgca 16535082  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16535081 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcaagtc 16534999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 22884585 - 22884771
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22884585 ttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 22884684  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22884685 aa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 22884771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 29192025 - 29192203
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  29192025 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 29192121  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29192122 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 29192203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 110387 - 110572
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  110387 ttgatgttggatgacattgttgattattaataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttgattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc- 110485  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  110486 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctgtatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 110572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 10779584 - 10779767
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  10779584 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatattatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 10779680  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10779681 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttatcatatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 10779767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 43445157 - 43445342
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43445157 ttgatgttgaatatcattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatga-ttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 43445255  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43445256 aa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 43445342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 21234810 - 21234994
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  21234810 ttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc- 21234908  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21234909 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 21234994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4864143 - 4863961
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4864143 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 4864044  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4864043 aaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattattgagt 4863961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 18779398 - 18779583
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg-ttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  18779398 ttgatgttgaatgacattgttgattatcgataatcatgattgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatggacatgttttcttgataatgc 18779497  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18779498 -aatgttgtggagataatcaatataattggttgtcgtcatatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 18779583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23327825 - 23327643
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || ||  |||||||||||||||||||     
T  23327825 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtggacatgttttcttgataatgc- 23327729  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23327728 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 23327643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24595373 - 24595191
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  24595373 ttgattttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 24595277  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24595276 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 24595191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25425493 - 25425312
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||| ||||||||||||||     
T  25425493 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatg-tttcttgataatgc- 25425398  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25425397 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 25425312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20615476 - 20615305
Alignment:
Q  11 atgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtgg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20615476 atgacattgttgattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtgg 20615378  T
Q  111 aaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20615377 agataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtc 20615305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21649705 - 21649523
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||    
T  21649705 ttgatgttgaatgacatcgttgattattgataatcatgttgatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatgca 21649606  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21649605 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttatcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 21649523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 37051857 - 37051677
Alignment:
Q  2 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 101  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  37051857 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattacgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-a 37051759  T
Q  102 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37051758 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtc 37051677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23510849 - 23510676
Alignment:
Q  15 cattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| |||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  23510849 cattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgcatgtgggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagat 23510753  T
Q  115 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23510752 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtagaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 23510676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Original strand, 35792544 - 35792719
Alignment:
Q  8 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 107  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35792544 tgaatgatgttgttgattattgataatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaaatgatg 35792643  T
Q  108 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35792644 tggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 35792719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19498659 - 19498490
Alignment:
Q  13 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  19498659 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatg-tttcttgataatgc-aatgttgtggag 19498564  T
Q  113 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19498563 atgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 19498490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 21933567 - 21933748
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  21933567 ttgatgttgagtgacattgttgattattgctaat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 21933663  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21933664 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 21933748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 21939737 - 21939918
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  21939737 ttgatgttgagtgacattgttgattattgctaat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 21939833  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21939834 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 21939918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 35581125 - 35580944
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  35581125 ttgatgttgagtgacattgttgattattgctaat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 35581029  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35581028 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 35580944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 37010571 - 37010752
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  37010571 ttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgacgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 37010667  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  37010668 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 37010752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19404457 - 19404268
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  19404457 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgc 19404358  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 189  Q
    |||||| ||||| || | ||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19404357 aaatgtggtggagatgaacaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgt 19404268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 27185118 - 27185301
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||| ||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  27185118 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgaagatgaatgctatgatttaattgtgtatagacatgttttcttgataatgc 27185217  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27185218 aaatgttgtggagatgaacaatataattgggtattgtcctatatattgtggtgagaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 27185301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23453827 - 23453638
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  23453827 ttgattttgaatgacattgttggtttttgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgc 23453728  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 189  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23453727 aaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattattgagtccttgt 23453638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23465332 - 23465143
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  23465332 ttgattttgaatgacattgttggtttttgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgc 23465233  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 189  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23465232 aaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattattgagtccttgt 23465143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 11338154 - 11338341
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||| ||  ||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11338154 atgttgaatgaccttgttgattattgataatcatgttgatgtagtgatgatgaatcttatgatttgattatgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 11338253  T
Q  103 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||| || |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11338254 tgttgtggagatgatcaatatatatggaa-ttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattatcgagtctttgtac 11338341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 25901730 - 25901911
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||  ||||||     
T  25901730 ttgatgttgcttgacattgttaattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttagtaatgc- 25901828  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25901829 aatgttgaggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 25901911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 11213007 - 11213183
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  || ||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  11213007 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatctaattgtgtgcgggcatgttttcttgataatgca 11213106  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 179  Q
    |||| ||| |  || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11213107 aatgatgttgtgatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtgttgaaaattgt-gattg-tgtcgcattatc 11213183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27008867 - 27008705
Alignment:
Q  20 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatca 119  Q
    |||||| ||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||| |||  ||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||    
T  27008867 ttgattgttgataatcaaattgttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtatatgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgtggtggagataatca 27008769  T
Q  120 atataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27008768 atataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 27008705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 24474443 - 24474367
Alignment:
Q  27 ttgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24474443 ttgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaat 24474367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 7727369 - 7727296
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 159  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  7727369 tttcttgataatgcaaatgttatggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 7727296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3672780 - 3672685
Alignment:
Q  89 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || | |||||||||||||||    
T  3672780 cttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatacttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgatgtgatatcgcattatcgagtc 3672685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 1169798 - 1169848
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1169798 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 1169848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 17473025 - 17473075
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17473025 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 17473075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23492794 - 23492722
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 159  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23492794 tttcttgataatg-aaatgttgtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 23492722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Original strand, 32967547 - 32967608
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  32967547 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 32967608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 147
Target Start/End: Original strand, 37189501 - 37189561
Alignment:
Q  87 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  37189501 ttcttgatgatgcaaatgttgtggaaatgatcaatatatttggaggttgtcctttatattg 37189561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 51
Target Start/End: Original strand, 43445013 - 43445060
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43445013 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 43445060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24471049 - 24470996
Alignment:
Q  130 atgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24471049 atgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 24470996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 431221 - 431149
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| | |||||  |||||||||    
T  431221 tttcttgataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttgtattgttgtgaaaatt 431149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28888709 - 28888649
Alignment:
Q  87 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  28888709 ttcttgataatgcaaatgtagtggatatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 28888649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 184
Target Start/End: Original strand, 5452190 - 5452285
Alignment:
Q  89 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||||| |||| |||| || ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  5452190 cttggtaatgcaattgttctggagatgatcaatatgtttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 5452285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 21615804 - 21615735
Alignment:
Q  89 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 158  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  21615804 cttgataatgcaattgttgaggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 21615735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 158
Target Start/End: Original strand, 24226842 - 24226911
Alignment:
Q  89 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 158  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  24226842 cttgataatgcaattgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtcgtgaaaatt 24226911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19861025 - 19860967
Alignment:
Q  89 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  19861025 cttgataatgcaattgttgaggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 19860967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 35792406 - 35792456
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  35792406 ttgatgtggaacaacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 35792456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18431512 - 18431322
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18431512 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 18431413  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18431412 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 18431322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 18004258 - 18004448
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  18004258 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatggacatgttttcttgataatgca 18004357  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18004358 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 18004448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 25646112 - 25646302
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25646112 ttgatgttgaatgacattattgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgtttccttgataatgca 25646211  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25646212 aatgttgtggagataatcaataaaattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcattatcaagtccttgtac 25646302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 35016966 - 35017152
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35016966 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 35017065  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35017066 aaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 35017152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 15736466 - 15736656
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15736466 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 15736565  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15736566 aatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgtggtcgcattatcgagtccgtgtac 15736656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18569465 - 18569280
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18569465 ttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 18569366  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18569365 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 18569280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 27655372 - 27655555
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  27655372 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 27655469  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27655470 a-tgttgtggaaataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 27655555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 31627317 - 31627134
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  31627317 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtggtgatgaatactatgatttgtttgtgtatggacatgttttcttgataatgca 31627218  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31627217 aatgttgtggagatgatcaatataattggggattgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattggtgtcgcattatcgagtc 31627134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 32897602 - 32897419
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  32897602 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatattaatgtgtgatgatgaataccatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgta 32897503  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  32897502 aatgttgtggagatgatcaataaaattgagagttgtcctatatattgtggtgaaaattgggaattgttgtcgcattatcgagtc 32897419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 16827161 - 16827346
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  16827161 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataataca 16827260  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16827261 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 16827346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 18088003 - 18088182
Alignment:
Q  7 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18088003 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgtt 18088101  T
Q  107 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18088102 gtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgttgcattatcgagtcctt 18088182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11215014 - 11214836
Alignment:
Q  5 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||||||||||| |    
T  11215014 tgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgatctatttgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaa-t 11214916  T
Q  104 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11214915 gttgtggaaataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatagagt 11214836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16230459 - 16230278
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| ||||||     
T  16230459 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc- 16230361  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16230360 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 16230278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23976446 - 23976263
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||| |||||||||||     
T  23976446 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgctgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgtttgcttgataatgc- 23976350  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23976349 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgccgcattatcgagtcctt 23976263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 33315867 - 33316050
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  33315867 ttgatgttgcatgacatggttgattattgataatcatgtggatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 33315964  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33315965 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 33316050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16105438 - 16105254
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg-ttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16105438 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgattgatgtgtggtgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 16105339  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16105338 aaatgatgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaattgttgtcgcgttatcgagtc 16105254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4989774 - 4989591
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  4989774 ttgatgttggatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatgctatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 4989677  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4989676 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgttaattgttgtcgcattatcgagtcctt 4989591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 25174431 - 25174253
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  25174431 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 25174335  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25174334 aatgttgtggagataatcaatataattgagtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 25174253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 13622401 - 13622589
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgtttt-cttgataatgcaaa 102  Q
    |||||||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  13622401 atgttgaatgatgttgttgattagtaataatcatgataatgtgtggtgatgaatactatgatttatttgtgtatggacatgtttttcttgataatgcaaa 13622500  T
Q  103 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  13622501 tgttgtggagataatcaatataattgggagttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgtggttgcattatcgagtccgtgtac 13622589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16239244 - 16239057
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||  |||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  16239244 ttgatgttgaatgacattattgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatacgatgatctatttgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc 16239145  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgga-ttgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16239144 aa-tgttgtggagataatcaatataatttggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggatttgttgtcgcattatcgagtcctt 16239057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 1658996 - 1659182
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1658996 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgaccatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 1659095  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1659096 aa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcacattatcgagtcctt 1659182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10487754 - 10487573
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  10487754 ttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 10487658  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10487657 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 10487573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 16377573 - 16377754
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  16377573 ttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 16377669  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16377670 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 16377754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 16384897 - 16385078
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  16384897 ttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 16384993  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16384994 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 16385078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23152138 - 23151956
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23152138 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgaggatgaatactatgattcaattgtgaatgagcatgttttcttgataatgca 23152039  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | || ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23152038 aatgatgtggagatgaacagtataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattattgtcgcattatcgagtc 23151956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 14627895 - 14628079
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||  || ||| ||||| |||||||| |||| ||||||     
T  14627895 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgttatgatgtaattgtgtatgggcatgtttccttggtaatgc- 14627993  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  14627994 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtcctt 14628079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18776087 - 18775907
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  18776087 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 18775990  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18775989 aatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 18775907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 19984490 - 19984671
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  19984490 ttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgca 19984589  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  19984590 aatgatgtggaaatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggag-aaattgt-gattgttgtcgaattatctagtc 19984671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18129129 - 18128981
Alignment:
Q  35 catgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgtt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| || ||||    
T  18129129 catgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgtttccttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataatcgggtgtt 18129030  T
Q  135 gtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18129029 gtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 18128981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Original strand, 17343578 - 17343754
Alignment:
Q  8 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 107  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17343578 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgtttgcttgataatgcaa-tgttg 17343674  T
Q  108 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17343675 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgtattgttgtcgcattatcgagtcctt 17343754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 13016071 - 13016260
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacatt-gttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| |  || |||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13016071 ttgatgttgagtgacatttgttgatt-ttgagaatcatgttgacatgagatgatgaatactatgaattaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 13016169  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13016170 aa-tgttgtggaggtaatcaatataattggatatagacctatatattgaggtgaaaattatggattgtagtcgcattatcgagtccttgtac 13016260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15861593 - 15861425
Alignment:
Q  14 acattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 112  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  15861593 acattgttgattgttgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgagcatgtttccttgataatgcaa-tgttgtggag 15861495  T
Q  113 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15861494 ataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-aaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 15861425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 16557301 - 16557483
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  16557301 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 16557397  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16557398 aatgttgtggagataatcaatatacttgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgtattatcgagtcctt 16557483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 16650531 - 16650713
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  16650531 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 16650627  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16650628 aatgttgtggagataatcaatatacttgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgtattatcgagtcctt 16650713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 29870760 - 29870943
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  29870760 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgaggatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 29870856  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattg-gatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29870857 aatgttgtggagataatcaatataatggtggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 29870943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26088713 - 26088532
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||| ||||||| ||||||     
T  26088713 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgctttcttggtaatgc- 26088615  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||| |||||||||||||    
T  26088614 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgttgcattatcgagtc 26088532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 18825046 - 18825225
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||     
T  18825046 ttgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatg-tttcttgataatgc- 18825143  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    |||| |||||| || |  ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18825144 aatgatgtggagatgaataatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gtttgttgtcgcattatcgagt 18825225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 18843106 - 18843286
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  18843106 ttgatgttgaataaaattgttgatttttgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgc- 18843204  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    |||| |||||| || | || ||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  18843205 aatgatgtggagatgaacattataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gtttgtcgtcgcattatcgagt 18843286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18397803 - 18397622
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| || ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||| |||    
T  18397803 atgttgaatgacattgttgagtattgatgatcatattgatgtggtgatgatgagtattatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgaaaa 18397704  T
Q  103 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18397703 tgttgtggggataatcaatataattgggagttgccctatatattgtggtgaaaattgtagattgttgtcgcattatcgagtc 18397622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23994032 - 23993858
Alignment:
Q  8 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 107  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23994032 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-aatgttg 23993934  T
Q  108 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23993933 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 23993858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 1651236 - 1651420
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||  || ||| || ||  ||||||| |||| ||||||     
T  1651236 ttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatataattgtgtgtggacatgtttccttggtaatgc- 1651334  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1651335 aatgttgtggagatgatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 1651420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22431127 - 22430944
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  22431127 ttgatgtagaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgattaatgctatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgc 22431028  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22431027 aaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtttaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 22430944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 25745617 - 25745763
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  25745617 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgc 25745716  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatatt 146  Q
    ||||| |||| | || | |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25745717 aaatgatgtgtagatgaacaatataattgggtgttgtcctatttatt 25745763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1554703 - 1554536
Alignment:
Q  16 attgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  1554703 attgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgatgcggagat 1554604  T
Q  115 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1554603 gaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggag-aaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 1554536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 22226926 - 22227111
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||| ||| |||| ||| ||||||| || ||   |||||| |||| |||||||    
T  22226926 ttgatgttggatgacattgttgattactgataaatatgttgacgtgtgatgatgagtactttgatttatttgtgtgtggatatgtttccttggtaatgca 22227025  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22227026 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagtttgagattgtgaattgttgtcgcattttcgagtcctt 22227111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19609310 - 19609191
Alignment:
Q  66 ttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggatt 165  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||    
T  19609310 ttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaatt 19609213  T
Q  166 gttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19609212 gttgtcgcattatcgagtcctt 19609191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16084215 - 16084112
Alignment:
Q  81 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 180  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16084215 catgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaattgttttcgcattatcg 16084116  T
Q  181 agtc 184  Q
    ||||    
T  16084115 agtc 16084112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 189
Target Start/End: Original strand, 28196147 - 28196255
Alignment:
Q  81 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 180  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28196147 catgatttcttgataatgcaattggtgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggagtgttgtcgcattatcg 28196246  T
Q  181 agtccttgt 189  Q
    |||| ||||    
T  28196247 agtctttgt 28196255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22867031 - 22866864
Alignment:
Q  18 tgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataa 116  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||||  ||| | ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22867031 tgttgatttttgataatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatcatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatga 22866932  T
Q  117 tcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||    
T  22866931 tcaatttatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatttcgcattattgagtc 22866864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 184
Target Start/End: Original strand, 25368728 - 25368827
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaa-ttgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  25368728 tttcttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaatttgtggagtgatgtcgcattatcgagtc 25368827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15739043 - 15738945
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  15739043 tttcttggtaatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtaaaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtc 15738945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 16084960 - 16084882
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg-ttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatg 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||| || ||| ||| |||||    
T  16084960 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgattgatgtgtggtgatgaatactacgatttaattgtgtatg 16084882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 1554866 - 1554817
Alignment:
Q  2 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1554866 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 1554817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18741203 - 18741146
Alignment:
Q  126 ttggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18741203 ttgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 18741146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Original strand, 16889122 - 16889183
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  16889122 tttcttgataatgcaaatgatgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 16889183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33323605 - 33323532
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||| |||||||  ||||||||||    
T  33323605 tttcttgataatgcgaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagatgtcctttatattgttgtgaaaattg 33323532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Original strand, 35137326 - 35137399
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||| |||||||  ||||||||||    
T  35137326 tttcttgataatgcgaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagatgtcctttatattgttgtgaaaattg 35137399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22846923 - 22846867
Alignment:
Q  89 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatat 145  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| |||||    
T  22846923 cttgataattcaattgttgtggagataatcaatatatttggaagttatcctttatat 22846867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 821397 - 821646
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  821397 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 821496  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgg---------------attgttgtcgcattatcgagtcc 185  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||||||||    
T  821497 aatgttgtgaagataatcaatataattggatgttgtcgtatatattgaggtgaaaattgtggaggtgaaaattatgaattgttgtcgcattatcgagtcc 821596  T
Q  186 ttgtacgagtcctttattatannnnnnnggtaattcaatagccttattat 235  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||    
T  821597 ttgtacgagtcctttattatctttttttggtaattcaatagccttattat 821646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33739138 - 33738948
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  33739138 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgaaggtgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 33739039  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33739038 aatgttttggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 33738948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 12901057 - 12901240
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12901057 ttgatgtttaatgatattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatgctatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 12901156  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12901157 aatgatgtggagatgatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 12901240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 44054795 - 44054612
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  44054795 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatgatgaatactatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 44054696  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  44054695 aatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgggaattgttgtcgcattatcgagtc 44054612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 53909055 - 53909238
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||||    
T  53909055 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgca 53909154  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53909155 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctgtatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 53909238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Original strand, 53706079 - 53706261
Alignment:
Q  5 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53706079 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatg 53706178  T
Q  105 ttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  53706179 ttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattattattgcattatcgagtcctt 53706261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 44345701 - 44345510
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44345701 ttgatgttgaatgacattgttgattattaataatcatgttaatgtggtgaagatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgatttcttgataatgc 44345602  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44345601 aaatgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcccatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 44345510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16521661 - 16521479
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16521661 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatagtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 16521562  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16521561 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 16521479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19999398 - 19999215
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||| |||||||||||     
T  19999398 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgtttgcttgataatgc- 19999302  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19999301 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 19999215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 7133734 - 7133924
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  7133734 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgcgatggtgaatactatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 7133833  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  7133834 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaaatgttgtcgcattatcgagtccttgtac 7133924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 45460244 - 45460432
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||| ||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  45460244 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatcttatgatttaattgtgtacggacatgttttcttgataatgcaaa 45460343  T
Q  103 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45460344 tgttgtagagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgaattgtcgtcgcattattgagtccttgtac 45460432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 8873779 - 8873961
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8873779 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 8873878  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||| ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8873879 aattttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 8873961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10643060 - 10642874
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10643060 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 10642961  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10642960 aa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 10642874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18167663 - 18167481
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  18167663 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 18167567  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18167566 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 18167481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 15288295 - 15288479
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  15288295 ttgatgttgaatgacattgttgattattcataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc- 15288393  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15288394 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agtttgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 15288479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 110353 - 110171
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  110353 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgca 110254  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  110253 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 110171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 15274045 - 15274226
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| ||||||     
T  15274045 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc- 15274143  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15274144 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 15274226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 21960853 - 21961036
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21960853 ttgatgttaaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtggtgatgaatactatgatttatttgtgtatgagcatgttttcttgataatgca 21960952  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || |||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21960953 aatgatgtggagatgatcaatataatcaagagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgttgcattatcgagtc 21961036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 9294396 - 9294212
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  9294396 ttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgc- 9294298  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9294297 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 9294212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10487542 - 10487358
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  10487542 ttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgc- 10487444  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10487443 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 10487358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 22355849 - 22356033
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  22355849 ttgatgttgaatgacattgttgaatattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc- 22355947  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22355948 aatgttgtggagataaccaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaactgttgtcgcattatcgagtcctt 22356033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26338355 - 26338173
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  26338355 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 26338259  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26338258 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 26338173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13245323 - 13245139
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||     
T  13245323 ttgatgttgaatgtcattgttgattattgataatcatgttgatttgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc- 13245225  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13245224 aatg-tgtggagataatcaatataattgggtttcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 13245139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 15295405 - 15295589
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  15295405 ttgatgttgaatgacattgttgattattcataatcatgttgataggtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgagaatgc- 15295503  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15295504 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agtttgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 15295589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 16329209 - 16329393
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  16329209 ttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc- 16329307  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16329308 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 16329393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18247059 - 18246881
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  18247059 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 18246963  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||  || |||||||||||||||||    
T  18246962 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgattttttgtcgcattatcgagt 18246881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 47356199 - 47356013
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  47356199 ttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggaatgttttcttgataatgc 47356100  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    || |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47356099 aa-taatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 47356013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14950891 - 14950707
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||  || || ||||||||||||||||||||     
T  14950891 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattttgtgtgggcatgttttcttgataatgc- 14950793  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14950792 aatattgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 14950707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8373226 - 8373042
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8373226 ttgatgttgaatgacattgttggttattgataatcatgttgcggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttctcttgataatgca 8373127  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 186  Q
    |||| |||| | || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8373126 aatgatgtgaagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcct 8373042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14995068 - 14994888
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  14995068 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgc 14994971  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14994970 aa-tgttgtggagataatctatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 14994888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 25120407 - 25120589
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  25120407 ttgatgttgaatgacattgacgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgca 25120506  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25120507 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 25120589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 187
Target Start/End: Original strand, 54119579 - 54119732
Alignment:
Q  33 atcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatg 132  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  54119579 atcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtg 54119677  T
Q  133 ttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54119678 ttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 54119732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34393927 - 34393744
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||    
T  34393927 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataaagc 34393828  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34393827 aaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 34393744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 170
Target Start/End: Original strand, 30233831 - 30233998
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||  ||| | ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30233831 atgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgttgatgtggtgatgatgaatcttataatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 30233930  T
Q  103 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgt 170  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30233931 tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatatcgaggtgaaaattgtggattgttgt 30233998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 5684187 - 5684370
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5684187 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 5684286  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5684287 aaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggacaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 5684370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15212215 - 15212032
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  ||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||    
T  15212215 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgttatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc 15212116  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||| |||| | || | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15212115 aaatgatgtgaagatgaacaatataatcggatgttgtcctatatattgtggataaaattgt-aattgttgtcgcattatcgagtc 15212032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 189
Target Start/End: Original strand, 18495695 - 18495880
Alignment:
Q  5 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18495695 tgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatgatttgattgggtatggacatgttttcttgataatgcaaat 18495794  T
Q  104 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 189  Q
    |||||| | || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  18495795 gttgtgaagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggaaagatgtcgcattatcgagtctttgt 18495880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Original strand, 13049455 - 13049630
Alignment:
Q  8 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 106  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13049455 tgaatgatattattgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgtt 13049553  T
Q  107 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13049554 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13049630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26678906 - 26678732
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  |||| | | ||| ||||| ||||||          |||||    
T  26678906 ttgatgttgcatgacattgttgattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatatcatgattaaattgtgtatgggcatgt----------atgca 26678817  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26678816 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 26678732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 23271209 - 23271342
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| || ||||||| || || ||||||||||||| ||||||     
T  23271209 ttgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttgttgtgcgatgatgaatactacgatttatttgtgtgtgggcatgttttcttgttaatgc- 23271307  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttg 135  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||    
T  23271308 aatgttgtgaagataattaatataattgaatgttg 23271342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 189
Target Start/End: Original strand, 13810995 - 13811103
Alignment:
Q  81 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 180  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||    
T  13810995 catgatttcttgataatggaattgttgtggaaataatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtaatgtcgcattatcg 13811094  T
Q  181 agtccttgt 189  Q
    |||| ||||    
T  13811095 agtctttgt 13811103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 191
Target Start/End: Original strand, 13751694 - 13751769
Alignment:
Q  116 atcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13751694 atcaatataattgggagttgtgttatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgtac 13751769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 184
Target Start/End: Original strand, 43282757 - 43282855
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  43282757 tttcttgataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 43282855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 184
Target Start/End: Original strand, 52266840 - 52266938
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  52266840 tttcttgataatgcaattgttgtagagatgatcaatatatttggaagttatcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtc 52266938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 18294452 - 18294580
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||      |||||| |||||  ||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  18294452 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgtg-----gtgatgatgaatgttatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 18294546  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgtt 134  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||    
T  18294547 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtt 18294580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 8044132 - 8044021
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  8044132 ttgatgttgaataacattgttgattgtttatgatcatgttgaggtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgc 8044033  T
Q  100 aaatgttgtgga 111  Q
    ||||| ||||||    
T  8044032 aaatgatgtgga 8044021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 5684038 - 5684088
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5684038 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatttttatgtgtgatg 5684088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 18294304 - 18294354
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18294304 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 18294354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Original strand, 15852696 - 15852769
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  15852696 tttcttgataatgcaaatgttgtagagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 15852769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 19019439 - 19019390
Alignment:
Q  2 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  19019439 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 19019390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 8373478 - 8373431
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8373478 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 8373431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15043721 - 15043631
Alignment:
Q  94 taatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  15043721 taatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttgaaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 15043631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 184
Target Start/End: Original strand, 15110703 - 15110793
Alignment:
Q  94 taatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  15110703 taatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttgaaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 15110793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 47356343 - 47356297
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  47356343 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgat 47356297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27959820 - 27959759
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27959820 tttcttgataatgcaaacgtagtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattg 27959759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Original strand, 34197544 - 34197605
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  34197544 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgaccaatatatttggaagttgtcctttatattg 34197605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 34394070 - 34394020
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  34394070 ttgattttgaatgacattgttgattagtgataatcatgttgatgtatgatg 34394020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 139
Target Start/End: Original strand, 37958436 - 37958489
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcct 139  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||| ||||||||    
T  37958436 tttcttgataatgcaaatgttgtagagatgatcaatatatttggaagttgtcct 37958489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Original strand, 41167314 - 41167375
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| | |||||| | |||||||    
T  41167314 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttgaaagttgtcatttatattg 41167375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 18109988 - 18110038
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18109988 ttgatgtggaacaacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 18110038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 158
Target Start/End: Original strand, 41257728 - 41257797
Alignment:
Q  89 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 158  Q
    ||||||||||||| ||| || || || ||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||    
T  41257728 cttgataatgcaattgtggttgagatgatcaatataattggaagttatcctttatattgttgtgaaaatt 41257797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 22407486 - 22407676
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22407486 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtatgatgatgaatactatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 22407585  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22407586 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatccagtccttgtac 22407676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 49966521 - 49966331
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||    
T  49966521 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtttatggacatgttttcttgataatgca 49966422  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49966421 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 49966331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 2422262 - 2422445
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2422262 ttgatgttgaatgacattgtcgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatattatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 2422361  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2422362 aatgtggtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaagttgtggattgttgtcgcattatcgagtc 2422445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18506228 - 18506043
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||| |||||||||||||||     
T  18506228 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttacttgtgtgtgggcat-ttttcttgataatgct 18506130  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18506129 aatgttgcggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 18506043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41210913 - 41210732
Alignment:
Q  6 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  41210913 gttgaatgacattgttgattgttgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggccatgttttcttgataatgcaaatgt 41210814  T
Q  106 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41210813 tgtggagataatcaatataattaggtgttgtcctatatattaaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 41210732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 20826515 - 20826696
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| ||||||     
T  20826515 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc- 20826613  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20826614 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 20826696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 44036191 - 44036373
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  44036191 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgagcatgttttcttgataatgca 44036290  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44036291 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatacattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 44036373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 15862724 - 15862908
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| || || |||||||| |||||||||||     
T  15862724 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttgattgtgtgtgggcatgtttccttgataatgc- 15862822  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15862823 aatgttgtggagatattcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 15862908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 35523713 - 35523894
Alignment:
Q  2 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35523713 tgatgttgggtgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaattctatga-ttggttgcgtatggacatgttttcttgataatgcaa 35523811  T
Q  102 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35523812 atgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 35523894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22034717 - 22034535
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  22034717 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 22034621  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22034620 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 22034535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 22250244 - 22250430
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22250244 ttgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgatttaattgtgtatgaacatgttttcttgataatgc 22250343  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22250344 aaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtagtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 22250430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 37845757 - 37845939
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||    
T  37845757 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatgca 37845856  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37845857 aatgatgtggaggtaaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 37845939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Original strand, 20894991 - 20895169
Alignment:
Q  8 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||| ||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20894991 tgaatgatattgttgattattgaaaatcatgttgatgtgtgatgatgaatactattatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaa-tgttg 20895089  T
Q  108 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20895090 tggagataatcaatataattgtgtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtggcattatcgagtcctt 20895169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21858428 - 21858246
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||    
T  21858428 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatgca 21858329  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21858328 aatgatgtggaggtaaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgttgcattatcgagtc 21858246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22353000 - 22352814
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22353000 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtaatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 22352901  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22352900 aa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgttgtttgttgtcgcattatcgagtcctt 22352814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22365627 - 22365441
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22365627 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgataatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgaacatgttttcttgataatgc 22365528  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22365527 aa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgtattgttgtcgcattatcgagtcctt 22365441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17147652 - 17147468
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||||     
T  17147652 ttgatgttgaatgacattgttgattattgagaatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgc- 17147554  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17147553 aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgttgcattatcgagtcctt 17147468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 7641886 - 7642068
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || | |||||||||||||||| |     
T  7641886 ttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggtatgttttcttgataatac- 7641982  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7641983 aatgttgtggagatcatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 7642068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 21651228 - 21651412
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||     
T  21651228 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgcatgggcatgttgtcttgataatgc- 21651326  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21651327 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgtattatcgagtcctt 21651412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20444618 - 20444442
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  20444618 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgca 20444519  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattat 178  Q
    |||  |||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||    
T  20444518 aatcatgtggagatgaacaatataattgggtattgtcctatatattgtggagaaaattat-gattgttgtcgcattat 20444442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20530383 - 20530207
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  20530383 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgca 20530284  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattat 178  Q
    |||  |||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||    
T  20530283 aatcatgtggagatgaacaatataattgggtattgtcctatatattgtggagaaaattat-gattgttgtcgcattat 20530207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 5675892 - 5676074
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||  |||  |||   ||||||||||||||||||||    
T  5675892 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgaaggtggatactatgaattgattgtatatagacatgttttcttgataatgca 5675991  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5675992 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 5676074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 18060900 - 18061085
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  18060900 ttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgtttccttggtaatgc 18060999  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18061000 -aatgttgtggatataatcaatataattgggtgtagtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 18061085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 51451483 - 51451299
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||| ||| |||  |||| ||||||| ||||||||||||     
T  51451483 ttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatgctatgatttaattgtttatgggcatgttctcttgataatgc- 51451385  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  51451384 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 51451299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21717075 - 21716895
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||||||| |||||||||||    
T  21717075 ttgatgttgaatgacattgttgatt---gataatcatgttgatatgtgatgatgaattctatgatttggttgtgtatggacatgtttttttgataatgca 21716979  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21716978 aatgttgtggagatgagcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 21716895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 35053712 - 35053532
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  35053712 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 35053615  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  35053614 aatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattattgagtc 35053532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17003692 - 17003511
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  17003692 ttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgggatgatgaattctatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 17003596  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17003595 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 17003511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20526990 - 20526808
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||| |||||||||||| |    
T  20526990 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgtcttcttgataatgta 20526891  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||  |||||| || | |||||||| ||| || |||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20526890 aatcatgtggagatgaacaatataactgggtggtgtcctatatattgtggagaaagttgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 20526808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 45050554 - 45050370
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||| |||| ||||||     
T  45050554 ttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgtttccttggtaatgc- 45050456  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45050455 aatgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 45050370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22029566 - 22029383
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  22029566 ttgatgttgaatgacattgttgactattgataaatatgttgatgtgtgaggatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 22029470  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattg-gatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22029469 aatgttgtggagataatcaatataatggtggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 22029383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22226846 - 22226667
Alignment:
Q  8 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 106  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  22226846 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgtt 22226748  T
Q  107 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22226747 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 22226667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 41218307 - 41218143
Alignment:
Q  20 ttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatc 118  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |    
T  41218307 ttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaattctatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgcaaataatgtggagatgaac 41218208  T
Q  119 aatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41218207 aatataattgggtgtcgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 41218143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41393322 - 41393138
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||  ||  || || |   ||||||| ||||||||||||    
T  41393322 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatgtaactgtgtgtagacatgtttccttgataatgca 41393223  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41393222 a-tgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatactgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 41393138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20930327 - 20930163
Alignment:
Q  20 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatc 118  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |    
T  20930327 ttgattgttgataatcatgttgatgtgcggtgatgaatactatgattttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaac 20930228  T
Q  119 aatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20930227 aatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 20930163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 184
Target Start/End: Original strand, 9785551 - 9785707
Alignment:
Q  27 ttgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataat 126  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  | |||||||||    
T  9785551 ttgataatcatgttgatgtgcgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgtgcatgctttcttgataatgcaaatgatgtggagaggaacaatataat 9785650  T
Q  127 tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9785651 tgagtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 9785707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Original strand, 18602351 - 18602518
Alignment:
Q  16 attgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 114  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  18602351 attgttgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 18602449  T
Q  115 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18602450 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 18602518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Original strand, 5073608 - 5073775
Alignment:
Q  16 attgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 114  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  5073608 attgttgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 5073706  T
Q  115 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  5073707 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattggtgtcgcattatcgagtc 5073775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 51657605 - 51657805
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcatgttttct 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||         | ||||| ||  ||| |||||  |||| ||||     
T  51657605 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtagtgatgatgaatcttaattgaattatgatttgattgtgtatggacatgatttca 51657704  T
Q  91 tgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgta 190  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |||||    
T  51657705 tgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtgaagtgatgttgcattatcgagtctttgta 51657804  T
Q  191 c 191  Q
    |    
T  51657805 c 51657805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 149
Target Start/End: Original strand, 20121965 - 20122098
Alignment:
Q  16 attgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 114  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  || |||||||  ||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  20121965 attgttgattgttgataatcaagttgttggtgtgatgaggaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 20122063  T
Q  115 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgag 149  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20122064 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgag 20122098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 22031007 - 22031078
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttg 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  22031007 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgaggaatactatgatttatttg 22031078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Original strand, 38034997 - 38035070
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  38034997 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 38035070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 184
Target Start/End: Original strand, 22836628 - 22836723
Alignment:
Q  89 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||   || |||||||||||||||||    
T  22836628 cttggtaatgcaattgttgtggaaatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattatgaggtgatgtcgcattatcgagtc 22836723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27673641 - 27673543
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  27673641 tttcttgataatacaattgttttggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtggtgtcgcattatcgagtc 27673543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 20253295 - 20253246
Alignment:
Q  2 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20253295 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 20253246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Original strand, 36357713 - 36357786
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  36357713 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 36357786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 161
Target Start/End: Original strand, 20956341 - 20956416
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtg 161  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  20956341 tttcttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttgaaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtg 20956416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 22353147 - 22353097
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22353147 ttgatgttgaatgatattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 22353097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19601972 - 19601911
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  19601972 tttcttgacaatgcaaatgttgtggagatcatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 19601911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 158
Target Start/End: Original strand, 37235336 - 37235405
Alignment:
Q  89 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 158  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| || ||||  |||||||||    
T  37235336 cttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttaaattgttgtgaaaatt 37235405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 147
Target Start/End: Original strand, 5471758 - 5471816
Alignment:
Q  89 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5471758 cttgataatgcaattgtggtggaggtgatcaatataattggaagttgtcctttatattg 5471816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 158
Target Start/End: Original strand, 8539328 - 8539396
Alignment:
Q  90 ttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 158  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| ||| || | |||||||  |||||||||    
T  8539328 ttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttatcatttatattgtcgtgaaaatt 8539396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 158
Target Start/End: Original strand, 8604567 - 8604635
Alignment:
Q  90 ttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 158  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| ||| || | |||||||  |||||||||    
T  8604567 ttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttatcatttatattgtcgtgaaaatt 8604635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 76)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 24718701 - 24718887
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24718701 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 24718800  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24718801 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcacattatcgagtcctt 24718887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25121417 - 25121227
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25121417 ttgatgttgaatgaccttgttgattattgataattatgttaatgtgtgatggtgaatattatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 25121318  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25121317 aatgttgtggagataatcaatataattggaagttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattattgagtccttgtac 25121227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 6775516 - 6775701
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  6775516 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc- 6775614  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6775615 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgttgcattatcgagtcctt 6775701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41245538 - 41245348
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  41245538 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgaagaagaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 41245439  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41245438 aatgttatggagataatcaatataattgggagtagtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 41245348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 19994435 - 19994626
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  19994435 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgt 19994534  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    |||||   |||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19994535 aaatgaaatggagataatcaatatagttgtgtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattattgagtccttgtac 19994626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 3432860 - 3433044
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  3432860 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatattatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc- 3432958  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3432959 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 3433044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 22908769 - 22908956
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  22908769 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttatttg--tatgggcatgttttcttgataatgc 22908866  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgta 190  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22908867 aaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtccttgta 22908956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 43374867 - 43375051
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||     
T  43374867 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc- 43374965  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43374966 aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 43375051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 224445 - 224631
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  224445 ttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 224544  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  224545 aa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 224631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 700858 - 701044
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  700858 ttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 700957  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  700958 aa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 701044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 738068 - 738254
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  738068 ttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 738167  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  738168 aa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 738254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 861963 - 862149
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  861963 ttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 862062  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  862063 aa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 862149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 13663920 - 13664105
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13663920 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgtga-tgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 13664018  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13664019 aa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 13664105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 13723195 - 13723380
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13723195 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgtga-tgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 13723293  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13723294 aa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 13723380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 20648723 - 20648906
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  20648723 ttgatgttggatgacattgttgattgttgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattgtgtatgggtatgttttcttgataatgca 20648822  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20648823 aatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgttctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 20648906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 22322719 - 22322909
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgtt-gattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  22322719 ttgatgttgaatgacattttttgattattgataatcatgttgatgtgagatgatgaatactatgaattaattgtgtatgggcatgttttcttaataatgc 22322818  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22322819 aa-tgttgtggaggtaatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtgaaaattatggattattgtcgcattatcaagtccttgtac 22322909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5237067 - 5236883
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  5237067 ttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc- 5236969  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5236968 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 5236883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 16874223 - 16874407
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  16874223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgagaatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgca 16874322  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16874323 a-tgt-gtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 16874407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 24662531 - 24662715
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  24662531 ttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc- 24662629  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  24662630 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 24662715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 43684526 - 43684342
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  43684526 ttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc- 43684428  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  43684427 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 43684342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 24930398 - 24930582
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||| |  ||||||| |||||||||||    
T  24930398 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtagggacatgtttccttgataatgc 24930497  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24930498 aaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 24930582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 20655308 - 20655491
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  20655308 ttgatgttggatgacattgttgattgttgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 20655407  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20655408 aatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 20655491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 24386993 - 24387175
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||||||||| ||    
T  24386993 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataataca 24387092  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24387093 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 24387175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 272490 - 272671
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  272490 ttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 272586  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  272587 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 272671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 643359 - 643178
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  643359 ttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 643263  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  643262 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 643178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 829165 - 828984
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  829165 ttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 829069  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  829068 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 828984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16417136 - 16416945
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |  ||  |||||||||||||||||||    
T  16417136 ttgatgtggaataacattgttgagtattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgcgtggacatgttttcttgataatgc 16417037  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  16417036 aaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggataattgtcacattatcgagtctttgtac 16416945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 22089729 - 22089911
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  22089729 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 22089825  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22089826 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 22089911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 24107871 - 24108050
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||     
T  24107871 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtacgggcatgttttcttgataatgc- 24107969  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24107970 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgtgg--tgttgtcgcattatcgagt 24108050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 37610242 - 37610059
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||    
T  37610242 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatattttcttgataatgc 37610143  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37610142 aaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 37610059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 15320345 - 15320527
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  15320345 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 15320441  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15320442 aatgttgtggagataatcaatacaattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 15320527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 15500714 - 15500896
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  15500714 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 15500810  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15500811 aatgttgtggagataatcaatacaattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 15500896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 29759166 - 29758984
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||    
T  29759166 ttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatggacatgttttcttgataatgca 29759067  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | ||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29759066 aatgatgtggagatgaacaacataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 29758984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 16195021 - 16195202
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttat-ttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||  ||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  16195021 ttgatgttgaatgacattattgattattgataatcatattgatgtgtgatgatgaatactatgatttaaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgc 16195120  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgag 182  Q
    ||||| ||| || || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16195121 aaatgatgtagagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgag 16195202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Original strand, 20568553 - 20568734
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||| |  ||||| ||  ||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  20568553 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatatggtgatgatgagtgttatgatttgattgtgtatggacatgctttcttgataatgcaaa 20568652  T
Q  103 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20568653 tgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 20568734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Original strand, 20574746 - 20574927
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||| |  ||||| ||  ||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  20574746 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatatggtgatgatgagtgttatgatttgattgtgtatggacatgctttcttgataatgcaaa 20574845  T
Q  103 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20574846 tgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 20574927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24548093 - 24547909
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||| |||| ||||||     
T  24548093 ttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgtttccttggtaatgc- 24547995  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24547994 aatgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 24547909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 270585 - 270429
Alignment:
Q  27 ttgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataat 126  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || | |||||||||    
T  270585 ttgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtagagatgaacaatataat 270486  T
Q  127 tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  270485 tgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 270429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 184
Target Start/End: Original strand, 645335 - 645491
Alignment:
Q  27 ttgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataat 126  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || | |||||||||    
T  645335 ttgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgttgagatgaacaatataat 645434  T
Q  127 tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  645435 tgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 645491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 184
Target Start/End: Original strand, 831070 - 831226
Alignment:
Q  27 ttgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataat 126  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || | |||||||||    
T  831070 ttgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtagagatgaacaatataat 831169  T
Q  127 tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  831170 tgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 831226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 187
Target Start/End: Original strand, 22007788 - 22007948
Alignment:
Q  27 ttgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataa 125  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  22007788 ttgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaattctatgatttaattgtgtatgggaatgttttcttgataatgcaa-tgttgtgaagataatcaatataa 22007886  T
Q  126 ttggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22007887 ttgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 22007948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21696437 - 21696253
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||  |||||  ||||| || |||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  21696437 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgcgataatgaatcttatgatttgtttgtgtatgggcatattttcttgataatgc 21696338  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21696337 aaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaatactgtggattgatgttgcattatcgagtc 21696253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21680078 - 21679889
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||| ||||||||||||    
T  21680078 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgtcgatgttgtgataatgaatcttatgatttcattgtgtatggacatgttctcttgataatgc 21679979  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 189  Q
    |||||| ||||| || | ||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21679978 aaatgtggtggagatgaacaatatatttggaagttgtcatctatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgt 21679889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 17730748 - 17730936
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||| ||||||    
T  17730748 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgttaatgc 17730847  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 189  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  17730848 aaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtgg-gaaaattgtggggtgatgtcgcattatcgagtctttgt 17730936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28543806 - 28543628
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 103  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  |  |||||| ||| || ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28543806 atgttgaataacattgttgattattgatgatcatgat--ttggtgatgatgagtattatgatttgattgtgtatgaacatgttttcttgataatgcaaat 28543709  T
Q  104 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28543708 gttgtggagatgatcaatatatgtggaagttgtcctctatattgtggtgataattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 28543628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 28836466 - 28836353
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  28836466 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 28836370  T
Q  101 aatgttgtggaaataat 117  Q
    ||||||||||| |||||    
T  28836369 aatgttgtggagataat 28836353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20480544 - 20480365
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   || |||||  ||||| ||| ||| ||||   ||||||||||| ||||||||    
T  20480544 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgttatgatttaattgtgtatagacatgttttctttataatgca 20480447  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| || | |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20480446 aatgttgtggagatgaacaatataattaggtgttgtcctatatattgtggtgaaaa-tgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 20480365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Original strand, 16675624 - 16675791
Alignment:
Q  16 attgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 114  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  16675624 attgttgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 16675722  T
Q  115 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16675723 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 16675791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Original strand, 21853199 - 21853361
Alignment:
Q  20 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatca 119  Q
    |||||| ||||||||||  ||  ||||||||| || ||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  21853199 ttgattgttgataatcaatttgttgtgtgatgatggatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagataatca 21853297  T
Q  120 atataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  21853298 atataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgctgtcgcattatcgagtc 21853361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 37605783 - 37605685
Alignment:
Q  85 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37605783 ttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 37605685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Original strand, 21845794 - 21845956
Alignment:
Q  20 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatca 119  Q
    |||||| ||||||||||  ||  ||||||||| || ||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||    
T  21845794 ttgattgttgataatcaatttgttgtgtgatgatggatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtgttgataatca 21845892  T
Q  120 atataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21845893 atataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 21845956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 184
Target Start/End: Original strand, 18768135 - 18768233
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  18768135 tttcttgataatgcaattgttgtggagatgataaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtc 18768233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 16040644 - 16040748
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||    
T  16040644 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgagaatgc 16040743  T
Q  100 aaatg 104  Q
    |||||    
T  16040744 aaatg 16040748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 16042320 - 16042424
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||    
T  16042320 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgagaatgc 16042419  T
Q  100 aaatg 104  Q
    |||||    
T  16042420 aaatg 16042424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 184
Target Start/End: Original strand, 16203739 - 16203804
Alignment:
Q  118 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16203739 caatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 16203804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 38532534 - 38532336
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcatgttttct 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||         ||||| | ||  ||| |||||   ||| |||||    
T  38532534 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatttgaactataacttgattgtgtatggatatgatttct 38532435  T
Q  91 tgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 189  Q
    |||||||  || ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||  |||||||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  38532434 tgataatataattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtggtagaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtctttgt 38532336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Original strand, 39448198 - 39448271
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  39448198 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataatttgaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 39448271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 18618187 - 18618138
Alignment:
Q  2 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18618187 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 18618138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Original strand, 21199547 - 21199608
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  21199547 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 21199608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Original strand, 31195658 - 31195719
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  31195658 tttcttgataatgcaaatgttgcggagataatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 31195719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 51
Target Start/End: Original strand, 224301 - 224348
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  224301 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 224348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 51
Target Start/End: Original strand, 700714 - 700761
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  700714 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 700761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 51
Target Start/End: Original strand, 737924 - 737971
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  737924 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 737971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 51
Target Start/End: Original strand, 861819 - 861866
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  861819 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 861866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 51
Target Start/End: Original strand, 17151288 - 17151335
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17151288 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 17151335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 13663773 - 13663823
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13663773 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13663823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 13722308 - 13722358
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722308 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 13722456 - 13722506
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722456 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 13722604 - 13722654
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722604 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 13722752 - 13722802
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722752 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 13722900 - 13722950
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722900 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 13723048 - 13723098
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13723048 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13723098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23148682 - 23148624
Alignment:
Q  89 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23148682 cttgataatgcaaatgttgttgaggtgatcaatataattggaagttgtcctttatattg 23148624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Original strand, 21192120 - 21192181
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| | |||||||    
T  21192120 tttcttgataatacaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcatttatattg 21192181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 184
Target Start/End: Original strand, 22737250 - 22737349
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgga-ttgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||| |||||||  ||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||  || |||| ||||||||||||    
T  22737250 tttcttggtaatgcatttgtggtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatatggtggtgaaaattgttgaggtgatgtcacattatcgagtc 22737349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23836008 - 23835950
Alignment:
Q  89 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  23836008 cttgataatgcaattgttgaggaaatgatcaatatatttggaagttttcctttatattg 23835950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 66)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 13867362 - 13867552
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13867362 ttgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 13867461  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13867462 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgttctatatattgaagtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 13867552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 44864119 - 44863930
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  44864119 ttgatgttgaatgacattgttgatcattgataatcatgctaatgtgtgatgatgaatactatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 44864020  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgta 190  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44864019 aatgctgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgta 44863930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 45453544 - 45453728
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  45453544 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 45453643  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataatt-ggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45453644 aatgatgtggagatgaacaatataattgggaagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 45453728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7291729 - 7291540
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7291729 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 7291630  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7291629 aatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 7291540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 12545000 - 12545190
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||| |    
T  12545000 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaagatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgga 12545099  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12545100 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatatttaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 12545190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 47288651 - 47288461
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  47288651 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaagatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 47288552  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47288551 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatattttgaggtgaaaattgtggattgttgttgcattatcgagtccttgtac 47288461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 369763 - 369580
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  369763 ttgatgttaaaggacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 369664  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  369663 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 369580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 15952384 - 15952563
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  15952384 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 15952481  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15952482 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 15952563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 26071557 - 26071743
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26071557 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga-tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaat 26071655  T
Q  104 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26071656 gttgtggagataatcaatataattgggcgtggtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 26071743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 26095344 - 26095530
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26095344 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga-tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaat 26095442  T
Q  104 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26095443 gttgtggagataatcaatataattgggcgtggtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 26095530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 15823694 - 15823888
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaata----ctatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataa 96  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  15823694 ttgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatatgtgatggtgaatatatactatgatttatttgtgtatggacatgttttcttgataa 15823793  T
Q  97 tgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15823794 tgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctttatattgaggtgaagattgttaattgttgtcgcattatcgagtctttgtac 15823888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 142504 - 142313
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  142504 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgattatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgc 142405  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142404 aaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 142313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 18981201 - 18981379
Alignment:
Q  7 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18981201 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtatgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgtt 18981299  T
Q  107 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18981300 gtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 18981379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2027433 - 2027250
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  2027433 ttgatgttcaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcgtgttttcttgataatgca 2027334  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  2027333 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaatttgtgattgttgtcgcattatcgagtc 2027250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 187
Target Start/End: Original strand, 2191987 - 2192169
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 103  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2191987 atgttgaatgatgttgttgattattgataatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttatttttgtatgggcatgttttcttgataatgcaaat 2192086  T
Q  104 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2192087 gttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgctgtcgcattatcgagtcctt 2192169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3058923 - 3058741
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  3058923 ttgatgttgaatgatactgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgagcatgttttcttgataatgca 3058824  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3058823 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtattgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 3058741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16417340 - 16417162
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  16417340 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactataatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 16417244  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16417243 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 16417162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13757454 - 13757270
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  13757454 ttgatgttgaatgacattgttgattattgagaatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgca 13757355  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13757354 a-tgt-gtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 13757270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 15442847 - 15443031
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  15442847 ttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc- 15442945  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15442946 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 15443031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16210655 - 16210471
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||     
T  16210655 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataaacatgttgatgtgtgttggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc- 16210557  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16210556 aatg-tgtggagataatcaatataattaggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgttgcattatcgagtcctt 16210471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 13038394 - 13038576
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||     
T  13038394 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc- 13038492  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcc 185  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13038493 aatg-tgtggagataatcaatataatcgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattattgagtcc 13038576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 32495842 - 32496025
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  32495842 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 32495941  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32495942 aaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 32496025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 112585 - 112767
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||    
T  112585 ttgatgttgaatgacactgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataaagca 112684  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  112685 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgatgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 112767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 11582130 - 11582311
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||     
T  11582130 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtggtgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc- 11582228  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11582229 aatg-tgtggagataatcaatataattgagtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcacattatcgagtc 11582311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11286089 - 11285904
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtg--atggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  11286089 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgtgataatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatg 11285990  T
Q  99 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11285989 caaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttctcctttatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 11285904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 36051539 - 36051355
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||| ||||||||    
T  36051539 ttgatgttgaatgacattgttgattattgaaaatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgtttacttaataatgca 36051440  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36051439 a-tgt-gtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtagaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 36051355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 13912401 - 13912582
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||     
T  13912401 ttgatgttgcatgacattgttgattattgataattatgttgaaatgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttggtaatgc- 13912499  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13912500 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13912582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 15525771 - 15525957
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| || ||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  15525771 ttgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattatgtgaatgatgaatactatgatctatttgtgtgtgtgcatgttttcttgataatgc 15525870  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15525871 aa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaatcgttgtcgcattatcgagtcctt 15525957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 27102838 - 27103019
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  27102838 ttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 27102934  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27102935 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 27103019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 27110186 - 27110367
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  27110186 ttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 27110282  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27110283 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 27110367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27175488 - 27175307
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  27175488 ttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 27175392  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27175391 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 27175307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 38784930 - 38785111
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  38784930 ttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 38785026  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38785027 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 38785111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 16480224 - 16480408
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||  || |||  |||| |||||||| |||| ||||||     
T  16480224 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatgtaattgtatatgggcatgtttccttggtaatgc- 16480322  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16480323 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtcctt 16480408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 1938059 - 1938240
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  1938059 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataataatgttgatgtgtaatgatgaatattatgatttaattatgaatgagcatgttttcttgataatgca 1938158  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  1938159 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaat--tgaattgttgtcgcattatcgagtc 1938240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 125702 - 125520
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| | | | ||| |||||||||||||||||||||    
T  125702 ttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaatcgtgaatgggcatgttttcttgataatgca 125603  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    || | |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  125602 aaggatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 125520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7821796 - 7821615
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  7821796 ttgatgttgagtgacattgttgattattgatatt-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 7821700  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7821699 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 7821615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7829107 - 7828926
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  7829107 ttgatgttgagtgacattgttgattattgatatt-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 7829011  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7829010 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 7828926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 12753757 - 12753575
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||| | || |||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  12753757 ttgatgttgaatgacattattgattattgataatcatgttaatgtgtggagatgagtactataatttgtttgtgtatggacatgttttcttgataatgca 12753658  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12753657 aatgttgtggagatgatcaatatatttggaagatgtcctttatattgtggtg-aaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 12753575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 12249400 - 12249584
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  12249400 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgc 12249499  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12249500 aaatgttgtggagatgatcaatatatttggtagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 12249584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15926240 - 15926058
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||  | |||||||| |||||||||||    
T  15926240 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga-tgtgatgatgatgaatgctatgatttatttgtgt--gggcatgttt-cttgataatgc 15926145  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15926144 aa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 15926058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Original strand, 42057458 - 42057632
Alignment:
Q  8 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 107  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  42057458 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-aatgttg 42057556  T
Q  108 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  42057557 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 42057632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11514997 - 11514816
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| ||||||     
T  11514997 ttgatgttgcttgacattgttaattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc- 11514899  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11514898 aatgttgaggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 11514816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 30263412 - 30263593
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| ||||||     
T  30263412 ttgatgttgcttgacattgttaattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc- 30263510  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  30263511 aatgttgaggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 30263593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 26010479 - 26010663
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||  ||  || || ||  ||||||| ||||||||||||    
T  26010479 ttgatgttgaatgacattgtggattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctttgatgtaactgtgtgtggacatgtttccttgataatgca 26010578  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26010579 a-tgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 26010663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3893969 - 3893789
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |    
T  3893969 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgta 3893872  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3893871 aatgttgtggagatgaacaatataaatgggtgttgtcatatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 3893789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 18255108 - 18255295
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgtttt-cttgataatg 98  Q
    |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||  |||||| || |||||||||| |  ||||||  | || ||||||||| ||||||||||    
T  18255108 ttgaagttgaatgtctttgttgattgttgataatcaagttatggtgtgaatgatgaatactataatctatttgtatgtgggcatgttttgcttgataatg 18255207  T
Q  99 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
     || ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18255208 taa-tgttgtggggataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 18255295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Original strand, 15761672 - 15761839
Alignment:
Q  16 attgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  15761672 attgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgatgaggagat 15761771  T
Q  115 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15761772 gaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggag-aaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 15761839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13571701 - 13571525
Alignment:
Q  7 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 105  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| |||    
T  13571701 ttgaatgatattattgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtttgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgt 13571603  T
Q  106 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13571602 tgtggagataatcaatataattgggtgttgtcttatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13571525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Original strand, 16571380 - 16571568
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16571380 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgaggttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 16571479  T
Q  103 tgttgtggaaataatcaatata-at-tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 189  Q
    |||||| || || ||||||||| || || | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  16571480 tgttgttgagatgatcaatatatatatgaaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtctcattatcgagtctttgt 16571568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16594282 - 16594094
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16594282 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgaggttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 16594183  T
Q  103 tgttgtggaaataatcaatata-at-tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 189  Q
    |||||| || || ||||||||| || || | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  16594182 tgttgttgagatgatcaatatatatatgaaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtctcattatcgagtctttgt 16594094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2436456 - 2436315
Alignment:
Q  45 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 144  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2436456 tgtgatgatgaatactatgaattaattgtgtgtggacatttttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 2436358  T
Q  145 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2436357 ttgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 2436315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 184
Target Start/End: Original strand, 25293608 - 25293747
Alignment:
Q  43 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 142  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25293608 tgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtgaagataatcaatataattgggtgttgtcctata 25293706  T
Q  143 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25293707 tattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 25293747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10988479 - 10988303
Alignment:
Q  9 gaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| |||  || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||  |||| |||||||| |||||    
T  10988479 gaatgatattattgattgttgataatcaagttgttggtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttc-cttggtaatgcaa-tgttg 10988382  T
Q  108 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  10988381 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtcctt 10988303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13273539 - 13273431
Alignment:
Q  81 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 180  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||| | |  |||||||||||||    
T  13273539 catgatttcttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaagttgtgaagtaatgtcgcattatcg 13273440  T
Q  181 agtccttgt 189  Q
    |||| ||||    
T  13273439 agtctttgt 13273431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15629567 - 15629459
Alignment:
Q  81 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 180  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||  ||||||||||||    
T  15629567 catgatttcttgataatacaattgttgtggaaatgatcaatatatttgaaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgacgtcgcattatcg 15629468  T
Q  181 agtccttgt 189  Q
    |||| ||||    
T  15629467 agtctttgt 15629459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 39047979 - 39048042
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatga 64  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39047979 ttgatgttgaatggcattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatga 39048042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 189
Target Start/End: Original strand, 49049169 - 49049277
Alignment:
Q  81 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 180  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||| ||| | |||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||| |||||||||||||    
T  49049169 catgatttcttgataatgcaattgtggtggagatgatcaacatatttgaaagttgtcctttatattgtggtggaaattgtgagttgatgtcgcattatcg 49049268  T
Q  181 agtccttgt 189  Q
    |||| ||||    
T  49049269 agtctttgt 49049277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Original strand, 15761509 - 15761558
Alignment:
Q  2 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15761509 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 15761558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 15851202 - 15851163
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15851202 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 15851163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 158
Target Start/End: Original strand, 9058007 - 9058076
Alignment:
Q  89 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 158  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  9058007 cttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 9058076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 15629657 - 15629613
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15629657 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 15629613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 183
Target Start/End: Original strand, 10862231 - 10862326
Alignment:
Q  89 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt-gtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || |||||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||   || ||||||||||||||||    
T  10862231 cttggtaatgcaattgttgtggagatgatcaatgtatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaatttgtgaggtgatgtcgcattatcgagt 10862326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 147
Target Start/End: Original strand, 15913817 - 15913874
Alignment:
Q  90 ttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| | |||||||    
T  15913817 ttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcatttatattg 15913874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 13273629 - 13273590
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 40  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  13273629 ttgatgttgaattacattgttgattattgatgatcatgtt 13273590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 2191834 - 2191884
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2191834 ttgatgtggaacaacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 2191884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 13376461 - 13376423
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatata 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13376461 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatata 13376423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 84)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 6148126 - 6148315
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||| |    
T  6148126 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtaatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcttgttttcttgataatgta 6148225  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgta 190  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6148226 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctacatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgta 6148315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13816386 - 13816200
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| | | ||| || || |||||||||||||||||||||    
T  13816386 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatgctatgattcaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgca 13816287  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13816286 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgagaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 13816200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 19572056 - 19572242
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | | ||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  19572056 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgattcaattgtgtgtggccatgttttcttgataatgca 19572155  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19572156 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcacattatcgagtcctt 19572242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 16183294 - 16183489
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16183294 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgacaatgc 16183393  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatat----attgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16183394 aaatgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgattgaggtgtaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 16183489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 15860432 - 15860617
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  15860432 ttgatgttggatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgataaatactatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgca 15860531  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15860532 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 15860617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16819779 - 16819597
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  16819779 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 16819683  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16819682 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 16819597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18909560 - 18909378
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || | ||||||||||||||||||     
T  18909560 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgtggatgttttcttgataatgc- 18909464  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18909463 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 18909378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 22145559 - 22145740
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| | | ||| | |||||||||||||||||||||    
T  22145559 ttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattaatggtgtaggggcatgttttcttgataatgca 22145658  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22145659 aa-gttgtggagataatcaatataattgggtg-tgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttatcgcattatcgagtc 22145740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 50113417 - 50113602
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  50113417 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgagtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 50113516  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    |||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50113517 aatgttgtggaggtaatcaatataat----tgttgtcctatatattgaggtg-aaattgtggattgttgttgcattatcgagtccttgtac 50113602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17099585 - 17099397
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||| | ||  |||  ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17099585 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtagtgatgatgaatcttataatttgattgtttatggacatgttttcttgataatgcaaa 17099486  T
Q  103 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17099485 tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgctgacgcattatcgagtccttgtac 17099397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 8269688 - 8269870
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  8269688 ttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 8269784  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8269785 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 8269870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 8276799 - 8276981
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  8276799 ttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 8276895  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8276896 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 8276981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8630720 - 8630538
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  8630720 ttgacgttgaatgactttgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatgtgcatgtcttcttgataatgca 8630621  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8630620 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgttgcattatcgagtc 8630538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 17957620 - 17957802
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  17957620 ttgatgttgaatgtcattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 17957719  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17957720 aatgatgtggacatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 17957802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22273915 - 22273737
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  22273915 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 22273819  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22273818 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 22273737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33340716 - 33340534
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  33340716 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgca 33340617  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33340616 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 33340534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 53769531 - 53769350
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| ||||||     
T  53769531 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc- 53769433  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  53769432 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 53769350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 35122559 - 35122377
Alignment:
Q  2 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  35122559 tgatgttgaatgacattgttgattattgacaatcatgttgatgtgtgatgatgaattctatgatttggttgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 35122460  T
Q  102 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  35122459 atgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattatgaattgttgtcgcattatcgagtc 35122377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 49231087 - 49230901
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  49231087 ttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 49230988  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49230987 aa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagattgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 49230901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 51159763 - 51159945
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  51159763 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaggatgaatactatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 51159862  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  51159863 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattggtgtcgcattatcgagtc 51159945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 318898 - 319081
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||| | | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  318898 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgttatgatttaatcgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 318997  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  318998 aaatgatgtggaaatgaacaatataattgggtgttatcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 319081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2048934 - 2048751
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2048934 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 2048835  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2048834 aaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 2048751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27839573 - 27839394
Alignment:
Q  8 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  27839573 tgaatgataatgttgattgttgatgatcatgttaatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa-tgat 27839475  T
Q  107 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27839474 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 27839394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 2450614 - 2450791
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  2450614 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgg-gaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 2450709  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2450710 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 2450791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 7852681 - 7852499
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |    
T  7852681 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataattatgttgatgtgtgatgaggaatactatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgta 7852582  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7852581 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 7852499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19230933 - 19230751
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||    
T  19230933 ttgatgttgaatgacgttgttgattattgataattatgttgatgtgtgataatgaatactatgatttaattgtgaatggacatgttttcttgataatgca 19230834  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19230833 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 19230751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25057710 - 25057531
Alignment:
Q  11 atgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25057710 atgacattgttgattattgataatcatattgatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtag 25057611  T
Q  111 aaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    | || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25057610 agatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 25057531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 1468940 - 1469121
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  1468940 ttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 1469036  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1469037 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 1469121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 17913536 - 17913717
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  17913536 ttgatgttgaatggcattgttgattattgataagcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 17913635  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17913636 aatgttgtggagatgaacaatataattggatgtcgtcctatatattgtgttgacaattgt-gattg-tgtcgcattatctagtc 17913717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30152205 - 30152023
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  30152205 ttgatgttggatgacattgttgattattgattaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 30152109  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30152108 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 30152023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16259911 - 16259732
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 103  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  16259911 atgttgaatgatgttgttgattattgattatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaaat 16259812  T
Q  104 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    | |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16259811 gatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 16259732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19945500 - 19945317
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19945500 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgatatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgc 19945401  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19945400 aaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 19945317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14294300 - 14294114
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14294300 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 14294201  T
Q  103 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 189  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14294200 tgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctgtatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattatcgagtctttgt 14294114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 15469753 - 15469931
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||| || |||||||||||     
T  15469753 ttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatg-ttccttgataatgc- 15469850  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  15469851 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-aaattgt-gattattgtcgcattatcgagt 15469931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 16745456 - 16745639
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||     
T  16745456 ttgatgttgcatgac-ttgttgattattgttaatcatgttgaagtgtgttggtgaatactatgatttaattgtgtttgggcatgttttcttgataatgc- 16745553  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16745554 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgt-gatggttgtcgcattatcgagtcctt 16745639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Original strand, 14522594 - 14522775
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| || ||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14522594 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgagtattatgatttgattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaa 14522693  T
Q  103 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14522694 tgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 14522775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14297371 - 14297188
Alignment:
Q  2 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||| || ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  14297371 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatattgatgtggtgataatgagtattatgatttgattgagtatggacatgttttcttgataatgca 14297272  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14297271 aatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattattgagtc 14297188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14302998 - 14302815
Alignment:
Q  2 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||| || ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  14302998 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatattgatgtggtgataatgagtattatgatttgattgagtatggacatgttttcttgataatgca 14302899  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14302898 aatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattattgagtc 14302815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44228300 - 44228115
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| | | ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  44228300 ttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttaatcgtgtatgggcatgtttccttggtaatgc 44228201  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44228200 -aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 44228115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Original strand, 11198859 - 11199045
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11198859 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 11198958  T
Q  103 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 189  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  11198959 tgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattatcaagtctttgt 11199045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14299927 - 14299741
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14299927 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgaggttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 14299828  T
Q  103 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 189  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14299827 tgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctgtatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattatcgagtctttgt 14299741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15574914 - 15574730
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||| |||| ||||||     
T  15574914 ttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgtttccttggtaatgc- 15574816  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15574815 aatgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 15574730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 53 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30205274 - 30205137
Alignment:
Q  53 tgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtg 152  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  30205274 tgaatactatgaattaattgtgtatgtgcatgttttcttgataaagcaaa-gttgtggagataatcaatataattgggtgttgtccaatatattcaggtg 30205176  T
Q  153 aaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30205175 aaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 30205137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 53899808 - 53899989
Alignment:
Q  2 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  |||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  53899808 tgatgttgaatgatattgttgattattgataattatgttgatgtgtgatgatgaattctatga-ttggttgtatatggacatgttttcttgataatgcaa 53899906  T
Q  102 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  53899907 atgtggtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatataatgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattattgagtc 53899989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15613933 - 15613749
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||| |||| ||||||     
T  15613933 ttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgtttccttggtaatgc- 15613835  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15613834 aatgttgtggagatgattaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 15613749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 11062321 - 11062504
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  11062321 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgtttt-ttgataatgc 11062419  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11062420 aaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattattgagtc 11062504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23491373 - 23491202
Alignment:
Q  7 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  23491373 ttgaatgacatcgttgattattgataatcacgttgatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatgcaaatgat 23491274  T
Q  107 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 179  Q
    ||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23491273 gtggagatgaacaatataattgggtgttttcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatc 23491202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 12265775 - 12265960
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||  | ||  ||||||| |||| |||||||    
T  12265775 ttgatgttagatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgataaatactatgatttatttgtctgtggacatgtttccttggtaatgca 12265874  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12265875 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagtttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 12265960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 12351129 - 12351312
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||  |  |||||||||||||||||||    
T  12351129 ttgatgtggaataacattgttgattattgatgatcatgttgttgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtgcggacatgttttcttgataatgc 12351228  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12351229 aaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgaattatcgagtc 12351312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 17523699 - 17523884
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  |  |||||| ||| || ||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||| ||    
T  17523699 atgttgaatgacattattgattattgatgatcatgat--ttggtgatgatgagtagtatgaattaattgtgtatggacatgatttcttgataatgcacat 17523796  T
Q  104 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    |||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17523797 gttgcggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattggggtgaaaaccgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgtac 17523884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 47786168 - 47786314
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||| ||||||||||||| |    
T  47786168 ttgatgttgaatgacaatgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgctttcttgataatgaa 47786267  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  47786268 aatgtggtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattg 47786314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 5227585 - 5227406
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| ||| |||||||  |   | | |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5227585 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgaggtgtaatgatgaatacatt---tgaattgtatatgagcatgttttcttgataatgca 5227489  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5227488 aatgatgtggagattaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 5227406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 40938602 - 40938421
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40938602 atgttgaatgacattgttgattgttgatgatcaagttgatgtggtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 40938503  T
Q  103 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  40938502 tgttatggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtaaattggtgtcgcattatcgagtc 40938421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 10737386 - 10737247
Alignment:
Q  44 gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatat 143  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | || | ||||| |||||| |||||||||||||    
T  10737386 gtgtcatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtgaagatgaacaatacaattgggtgttgtcctatat 10737287  T
Q  144 attgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10737286 attgtggagaaaattgt-tattgttgtcgcattatcgagtc 10737247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 187
Target Start/End: Original strand, 14846034 - 14846131
Alignment:
Q  89 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14846034 cttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 14846131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 45859884 - 45859709
Alignment:
Q  8 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 106  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  45859884 tgaatgatattattgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgtt 45859786  T
Q  107 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  45859785 gtgaagataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 45859709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 55315252 - 55315085
Alignment:
Q  16 attgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 114  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  55315252 attgttgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 55315154  T
Q  115 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  55315153 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 55315085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 12562762 - 12562944
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| ||| |  |||||||||||||||||||    
T  12562762 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtacggacatgttttcttgataatgc 12562861  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaa-ttgtggattgttgtcgcattatcga 181  Q
    || ||||||||| || ||||||||| |||||  || |||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  12562862 aattgttgtggagatgatcaatatatttggaatttttcctctatattgtggtgaaaatttgtgaagtgttgtcgcattatcga 12562944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 15939743 - 15939930
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgtttt-cttgataatg 98  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||||||||     
T  15939743 ttgaagttgaatgactttgttgattgttgataatcaagttatggtgtgaatgatgaatactatgatctatttgtatgtgggcatgttttgcttgataatt 15939842  T
Q  99 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15939843 caa-tgttatggggataatcaatataattgggtgttgtcatatacattgaggttgaaattgtgaattgttgtcgcattattgagtcctt 15939930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 124
Target Start/End: Original strand, 16935168 - 16935286
Alignment:
Q  3 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||    
T  16935168 gatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aa 16935264  T
Q  103 tgttgtggaaataatcaatata 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  16935265 tgttgtggagataatcaatata 16935286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 88 - 187
Target Start/End: Original strand, 8305693 - 8305790
Alignment:
Q  88 tcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8305693 tcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 8305790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 187
Target Start/End: Original strand, 18905171 - 18905267
Alignment:
Q  89 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18905171 cttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgt-gattgttttcgcattattgagtcctt 18905267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 41269098 - 41268931
Alignment:
Q  16 attgttgattattgataatcatgttaa-tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 114  Q
    |||||||||| |||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||| |||  || || || | ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  41269098 attgttgattgttgataatcaagttgtctgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggtatgttctcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 41269000  T
Q  115 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | |||| | | ||||||||||||||||||||    
T  41268999 aatcaatataattgggtgttgtcctatgtattgagttg-agattgagaaatgttgtcgcattatcgagtc 41268931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 12031268 - 12031364
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgagcatgttttcttgataa 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | ||| | ||| || ||||||||||||||    
T  12031268 ttgatgttgaatgacattattgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaaattgtgaatgggcgtgttttcttgataa 12031364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Original strand, 13976964 - 13977101
Alignment:
Q  47 tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatat- 145  Q
    ||||| |||||||||||| |||  || || || |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  13976964 tgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatata 13977062  T
Q  146 -tgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
     |||| ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13977063 ttgagttgaca-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13977101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Original strand, 13956132 - 13956269
Alignment:
Q  47 tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatat- 145  Q
    ||||| |||||||||||| |||  || || || |||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  13956132 tgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaaaataattgggtgttgtcctatatata 13956230  T
Q  146 -tgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
     |||| ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13956231 ttgagttgaca-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13956269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17138253 - 17138157
Alignment:
Q  88 tcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  17138253 tcttgataattcaattgttgtggagatgatcaatatagttgggagttgtcctttatattgaggtgaaaattgtaaagtgatgtcgcattatcgagtc 17138157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 12951835 - 12951743
Alignment:
Q  92 gataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  12951835 gataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgagatgatgtcgcattatcgagtc 12951743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15874953 - 15874893
Alignment:
Q  87 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  15874953 ttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 15874893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Original strand, 9303753 - 9303802
Alignment:
Q  2 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9303753 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 9303802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 147
Target Start/End: Original strand, 11330382 - 11330442
Alignment:
Q  87 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  11330382 ttcttgataatgcaaatgtggtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattg 11330442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15516521 - 15516426
Alignment:
Q  89 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||    
T  15516521 cttggtaatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattttgagttgatgtcgcattatcaagtc 15516426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 17937370 - 17937333
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17937370 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg 17937333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 158
Target Start/End: Original strand, 38812367 - 38812436
Alignment:
Q  89 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 158  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  38812367 cttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 38812436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 158
Target Start/End: Original strand, 12490105 - 12490177
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 158  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  12490105 tttcttgataatgaaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 12490177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14287828 - 14287780
Alignment:
Q  141 tatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14287828 tatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattatcgagtctttgt 14287780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 39654695 - 39654607
Alignment:
Q  96 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  39654695 atgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgttgcattatcgagtc 39654607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 18897982 - 18898045
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatga 64  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  18897982 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatacgttgatgtgggatgatgaatactatga 18898045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 184
Target Start/End: Original strand, 11883645 - 11883735
Alignment:
Q  94 taatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||| ||| ||||   || |||||||||||||||||    
T  11883645 taatgctaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtggaaagtgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 11883735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11813586 - 11813553
Alignment:
Q  154 aaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11813586 aaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 11813553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 16260064 - 16260014
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16260064 ttgatgtggaacaacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 16260014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Original strand, 14060614 - 14060675
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||| || || |||||||| |||||||    
T  14060614 tttcttgataatgcaaatattgtggggatgatcaatatagtttgaagttgtcctttatattg 14060675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 159
Target Start/End: Original strand, 55442145 - 55442218
Alignment:
Q  87 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattgg-atgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 159  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| | | |||||| |||||||  ||||||||||    
T  55442145 ttcttaataatgcgaatgttgtggagatgatcaatataattggaaagatgtcctttatattgttgtgaaaattg 55442218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 184
Target Start/End: Original strand, 47786311 - 47786339
Alignment:
Q  156 attgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47786311 attgtggattgttgtcgcattatcgagtc 47786339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8308 - 8125
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8308 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 8209  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8208 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgttctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 8125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6422 - 6232
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  6422 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 6323  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6322 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 6232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 15151 - 15338
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  15151 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 15248  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15249 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 15338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28759 - 28574
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||||    
T  28759 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgca 28660  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28659 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 28574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 28907 - 28857
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28907 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 28857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 181
Target Start/End: Original strand, 686 - 861
Alignment:
Q  6 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  686 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgtaaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgatttcttgataatgcaaatgt 785  T
Q  106 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcga 181  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  786 tgtggaggtaatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcga 861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 256194 - 256384
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacatt-gttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  256194 ttgaagttgaatgacatttgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattaattgtgtatgagcatgttttcttgataatg- 256292  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  256293 aaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 256384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 262800 - 262975
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacatt-gttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  262800 ttgaagttgaatgacatttgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgc 262899  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 176  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  262900 -aatgttgtggaggtaatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 262975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 124578 - 124762
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||||    
T  124578 ttgatgttgaatgattttgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgatgaatactatgatttaattgggtgtgggcatgttttcttgataatgca 124677  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  124678 a-tgt-gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcacattatcgagtcctt 124762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 193487 - 193303
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||    
T  193487 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtgtgttgaagaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgttaatgca 193388  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193387 a-tgt-gtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 193303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 75979 - 76163
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  75979 ttgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgaagaatactatgatttaattgagtgtggacatgttttcttgataatgca 76078  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76079 a-tgt-gtggagataatcaatataattgggtgtcatcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 76163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 95196 - 95006
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  95196 ttgatgttaaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaactgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 95097  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  95096 aatgttgtggagataatcaatataattgagtgttgttctatatattaaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 95006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Original strand, 66745 - 66907
Alignment:
Q  20 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatca 119  Q
    |||||| ||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  66745 ttgattgttgataatcaaattgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagataatca 66843  T
Q  120 atataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  66844 atataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 66907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 95344 - 95294
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  95344 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 95294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 78427 - 78241
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  78427 ttgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatagtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 78328  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78327 aatgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 78241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 39087 - 38903
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  39087 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgc 38988  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38987 aaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaattgttgttgcattatcgagtc 38903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44674 - 44513
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  44674 ttgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatcctatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgc 44575  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtg 161  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  44574 aaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtg 44513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 109368 - 109553
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  109368 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc- 109466  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109467 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 109553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 54486 - 54330
Alignment:
Q  27 ttgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataat 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  54486 ttgataatcatgttaatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgtgcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataat 54387  T
Q  127 tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54386 tgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 54330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 38618 - 38807
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  38618 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 38717  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38718 aatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 38807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 40366 - 40184
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||    
T  40366 ttgatgttgaatgacattgctgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatggacatgttttcttgataatgca 40267  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40266 aatgatgtggagatgaacaatataattggctgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 40184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 2126 - 2317
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | ||| ||| || || ||||||||||||||||||||    
T  2126 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctataatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc 2225  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2226 aaatgatgtggagataatcaatataagtgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 6646 - 6837
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||| ||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  6646 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatggatgctatgatttaattgtgtataggcatgttttcttgataatgc 6745  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6746 aaatgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtagcattatcgagtccttgtac 6837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 26014 - 26200
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||   ||||||||||||||||||||| |    
T  26014 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgatttatctgtgtatagacatgttttcttgataatgcaa-t 26112  T
Q  104 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113 gttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatatttaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 26200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 70683 - 70873
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||| ||    
T  70683 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatggacatgatttcttgataattca 70782  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||| || || ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70783 aatgttgtggagatgattaatataaatgggtgttatcctatatattgaggagaaacttgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 70873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 93571 - 93527
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt 45  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  93571 ttgatgttgaataactttgttgattattgatgatcatgttgatgt 93527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21534 - 21351
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21534 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatgtgcatgttttcttgataatgca 21435  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21434 aatgttgtggagatgatcaatataattcggtgttgtcctatatactgaagtgaaaattgtggtttgttgtcgtattatcgagtc 21351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Original strand, 129504 - 129668
Alignment:
Q  20 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatc 118  Q
    |||||| ||||||| |||||| || || | ||  ||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| || | |    
T  129504 ttgattgttgataaccatgttgatatgcggtgacgaatactatgattttaattgtgtatgggcatgttttgttgataatgcaaatgatgtggagatgaac 129603  T
Q  119 aatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  129604 aatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 129668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 13027 - 13217
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  13027 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaagatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgacaatgca 13126  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13127 aatgttgttgagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattatggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 13217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 200 - 161
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  200 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 57)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 191
Target Start/End: Original strand, 36891998 - 36892185
Alignment:
Q  3 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||| |||    
T  36891998 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga-tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgaaaa 36892096  T
Q  103 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36892097 tgttgtggagataatcaatataattgggagttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 36892185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 5889582 - 5889765
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  5889582 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 5889678  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5889679 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 5889765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 34823070 - 34822886
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  34823070 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc- 34822972  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34822971 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 34822886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 3800398 - 3800581
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  3800398 ttgatgttgcatgacatggttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 3800495  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3800496 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 3800581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 21275812 - 21275995
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  21275812 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 21275908  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21275909 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 21275995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25600835 - 25600652
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  25600835 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 25600736  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25600735 aatgttgcggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtaaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 25600652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12726925 - 12726741
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  12726925 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactaagatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc- 12726827  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12726826 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 12726741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24967168 - 24966987
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 103  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24967168 atgttgaatgatgttgttgattattgataatcatgataacgtgtggtgatgaatactatgatttattcgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaat 24967069  T
Q  104 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24967068 gttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgtggtcgcattatcgagtcc 24966987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8942520 - 8942334
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8942520 ttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgagcatgttttcttgataatgc 8942421  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8942420 aa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 8942334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 4449517 - 4449698
Alignment:
Q  2 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  4449517 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaattctatga-ttggttgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 4449615  T
Q  102 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4449616 atgttgcgaaaatgatcaatataattggaagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 4449698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8887014 - 8886832
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  8887014 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgca 8886915  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8886914 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttatcgcattatcgagtc 8886832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 19888065 - 19888243
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  19888065 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 19888161  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19888162 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 19888243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21140747 - 21140569
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||| ||||||||||||||     
T  21140747 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatg-tttcttgataatgc- 21140652  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21140651 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 21140569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 461609 - 461426
Alignment:
Q  2 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  461609 tgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc-a 461511  T
Q  102 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  461510 atg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 461426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 12643310 - 12643491
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||  |||||||||||| ||||||     
T  12643310 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtggccatgttttcttggtaatgc- 12643408  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12643409 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 12643491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22862361 - 22862179
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22862361 ttgatattgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgagcatgttttcttgataatgca 22862262  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22862261 aatgatgtggagataaacaatataattgagtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 22862179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 14907723 - 14907907
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  14907723 ttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc- 14907821  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14907822 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 14907907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20013994 - 20013810
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  20013994 ttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc- 20013896  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20013895 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 20013810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23819051 - 23818867
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  23819051 ttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc- 23818953  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23818952 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 23818867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 43644261 - 43644442
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  43644261 ttgatgttgaatgacaatgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgca 43644360  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43644361 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagt 43644442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 12637450 - 12637633
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  12637450 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 12637546  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattg-gatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12637547 aatgttgtggagataatcaatataatggtggtgttatcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 12637633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22273759 - 22273577
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||     
T  22273759 ttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgtgcatgttttcttgataatgcg 22273660  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22273659 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 22273577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 25877235 - 25877399
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacatt-gttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  25877235 ttgatgttgaatgacattcgttgattattgataatcatgttgatgtgtgataatgaatactatgaattaattgtgtatggccatgttttcttgataatgc 25877334  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggatt 165  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25877335 aa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtgaaaattgtggatt 25877399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 11232539 - 11232720
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  11232539 ttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 11232635  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11232636 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 11232720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 22514386 - 22514567
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  22514386 ttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 22514482  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22514483 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 22514567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23773407 - 23773225
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  23773407 ttgatgttgaatgacattgttgattatttataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 23773311  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23773310 aatgttgtcgagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 23773225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 24686954 - 24687136
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||     
T  24686954 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgta--ggcatgttttcttgataatgc- 24687050  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24687051 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 24687136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 24827854 - 24828034
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  24827854 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgc 24827951  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    || ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24827952 aa-tgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtggattgttgtcgcattatcgagt 24828034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 28776987 - 28777168
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  28776987 ttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaattctatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 28777083  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28777084 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 28777168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15632269 - 15632088
Alignment:
Q  2 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 101  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  15632269 tgatgttgaatgatgtcgttgattattgataatcatgttaatgtgggatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaa 15632170  T
Q  102 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
     || |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15632169 ttgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtgttgagaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 15632088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 20628683 - 20628864
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||||    
T  20628683 ttgatgttgaatgtcattgttgattattgataatcatg---atgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgca 20628779  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20628780 a-tgt-gtggagataatcaatataattgggtatcgtcctatatattgaggttgaaatagtggattgttgtcacattatcgagtcctt 20628864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22282992 - 22282810
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||    
T  22282992 ttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataaagca 22282893  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||| | || |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22282892 aatgatgtggagatgaacaatataattaggtgctgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 22282810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7320363 - 7320174
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  7320363 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattttgtatggacatgttttcttgataatgc 7320264  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 189  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7320263 aaatgttgtggagattatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattggtgtcgcattatcgagtctttgt 7320174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6878317 - 6878134
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgt-gatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||| |||||| ||| ||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  6878317 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatattgatgtggcgatgatgaatgctatgatttaattatgtatggacatgttttcttgataatgc 6878218  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6878217 aaaggatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgtggtcgcattatcgagtc 6878134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 81 - 191
Target Start/End: Original strand, 22691316 - 22691426
Alignment:
Q  81 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22691316 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaactgtggattgttgtcgcattatcg 22691415  T
Q  181 agtccttgtac 191  Q
    |||| ||||||    
T  22691416 agtctttgtac 22691426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 81 - 191
Target Start/End: Original strand, 22695963 - 22696073
Alignment:
Q  81 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22695963 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaactgtggattgttgtcgcattatcg 22696062  T
Q  181 agtccttgtac 191  Q
    |||| ||||||    
T  22696063 agtctttgtac 22696073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27260415 - 27260274
Alignment:
Q  43 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 142  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||  |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  27260415 tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtatatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatggtcaatataattgggagttgtcctata 27260316  T
Q  143 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27260315 tattatggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 27260274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 22581218 - 22581402
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||   |||||  ||||| ||  ||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  22581218 ttgatgttgaatgacattgttgattgttgatgatcatgttgatgttgtgagaatgaatcttatgatttgattatgtatggacatgttttcttgataatgc 22581317  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||| |||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22581318 aaacgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 22581402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 24572678 - 24572865
Alignment:
Q  3 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||  | ||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  24572678 gatgtcgaatgacattgttgatttttgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttgtgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaa 24572777  T
Q  102 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 189  Q
    |||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||    
T  24572778 atgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgttatcgcattatcgagtctttgt 24572865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28972914 - 28972727
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||| |||  ||||||    
T  28972914 ttgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcatgtcgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttt-cttagtaatgc 28972816  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 189  Q
    |||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28972815 aaatgt-gtggagatgatcaatatatatggatgttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattggtgtcgcattatcgagtctttgt 28972727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 269981 - 269878
Alignment:
Q  81 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  269981 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgtggtcgcattatcg 269882  T
Q  181 agtc 184  Q
    ||||    
T  269881 agtc 269878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 184
Target Start/End: Original strand, 9654140 - 9654296
Alignment:
Q  27 ttgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataat 126  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  9654140 ttgataatcatgttgttatgtgatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgttaatgcaaatgatgtggagatgaacaatataat 9654239  T
Q  127 tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||| |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9654240 tgggtgttgctctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 9654296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Original strand, 17397894 - 17398061
Alignment:
Q  16 attgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 114  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  |  ||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| |||||| || ||    
T  17397894 attgttgattgttgataatcaagttgtttctgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgttgagat 17397992  T
Q  115 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17397993 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 17398061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 721257 - 721162
Alignment:
Q  89 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  721257 cttggtaatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgtagtgatgtcgcattatcgagtc 721162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Original strand, 23822894 - 23822967
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23822894 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 23822967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Original strand, 23824838 - 23824911
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23824838 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 23824911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Original strand, 23831973 - 23832046
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23831973 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 23832046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 184
Target Start/End: Original strand, 22787408 - 22787506
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||| | ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  22787408 tttcttggtaatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagtcgtcctctatattgtggtgaagactgtgagttgatgtcgcattatcgagtc 22787506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Original strand, 19670515 - 19670576
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  19670515 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 19670576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 22693133 - 22693040
Alignment:
Q  8 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 101  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| |||| ||||||||    
T  22693133 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa 22693040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 22697780 - 22697687
Alignment:
Q  8 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 101  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| |||| ||||||||    
T  22697780 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa 22697687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22693028 - 22692978
Alignment:
Q  137 cctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22693028 cctatatattgaggttgaaattgtggattgttgttgcattatcgagtcctt 22692978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22697675 - 22697625
Alignment:
Q  137 cctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22697675 cctatatattgaggttgaaattgtggattgttgttgcattatcgagtcctt 22697625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 147
Target Start/End: Original strand, 24088752 - 24088810
Alignment:
Q  89 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24088752 cttggtaatgcaattgttgtggagataatcaatataattggaagttgtcctttatattg 24088810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Original strand, 4663 - 4735
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 159  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  4663 tttcttgataatgcaa-tgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 4735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Original strand, 24295958 - 24296031
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 159  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  24295958 tttcttgataatgcaaatgttttggagatgatcaatatatttgaaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 24296031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19658739 - 19658678
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||  |||| |||||||| |||||||    
T  19658739 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaacatatctggaagttgtcctttatattg 19658678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 155642 - 155821
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  155642 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 155739  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155740 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 155821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 732 - 914
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  732 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 828  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  829 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 35163 - 35023
Alignment:
Q  45 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 144  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35163 tgtgatgatgaaaactatgatttaattgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 35065  T
Q  145 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35064 ttgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 35023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 87311 - 87127
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||  |||||| |    
T  87311 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactacgatttatttgtgtatggacatgttttcttga--atgcaa-t 87215  T
Q  104 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  87214 gttgtggagataatcaatataattgggtgttctcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 87127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 138098 - 138286
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||| |     
T  138098 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatac- 138196  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  138197 aatgttgtggagataatcaatataattaggtgttgtcctatatattgaagtg-aaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccctgtac 138286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10541 - 10351
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||  |||||  ||||  ||  ||| |||||   ||||||||||||||||||    
T  10541 ttgatattgaatgacattgttgattgttgataatcatgttgatatggtgataatgaatcttatgctttgattgtgtatggatatgttttcttgataatgc 10442  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgta 190  Q
    |||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10441 aaatgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtctttgta 10351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 77124 - 77069
Alignment:
Q  136 tcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77124 tcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 77069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Original strand, 71741 - 71921
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71741 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatattaatgtgcgatgatgaatactatgaattatttgtgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 71840  T
Q  104 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  71841 gttgtggagatgatcaatataattgggagttatcctatatattgtggtgaaaattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 71921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14555 - 14364
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttga-ttattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||   |||| ||||||||||||||    
T  14555 ttgatgttgaatgacattgttgaattattgataatcatgttaatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatagacatgatttcttgataatgc 14456  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14455 aaatattgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggagaaaattgtgaattgttgtcgcattgtcgagtccttgtac 14364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 18864 - 19050
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  18864 ttgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtaattgtgaatactatgatttatttgtgcatgtgcatgttttcttgataatgca 18963  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18964 aatgatgtggacatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 19050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 18717 - 18767
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18717 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 18767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32458 - 32268
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  32458 ttgatgttgaatgacattgtcgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattgtgtatgtacatgttttcttgataatgca 32359  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32358 aatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgtac 32268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 90171 - 90353
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  90171 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc- 90269  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  90270 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtgga---ttgtcgcattatcgagtcctt 90353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 129258 - 129075
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| |||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  129258 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggcatgatggtgaatgctatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 129161  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  129160 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgagattgttaattgttgtcgcattatcgagtcctt 129075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 78471 - 78410
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  78471 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 78410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1239 - 1057
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1239 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttgattgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 1140  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1139 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 1057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6106 - 5926
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  6106 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 6009  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6008 aatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattg-agattgttgtcgcattatcgagtc 5926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 1386 - 1336
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1386 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 1336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8954 - 8771
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  8954 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgaacatgatgatgtgtgatgatgaatactatgaattaattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 8855  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8854 aatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 8771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4716 - 4530
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  4716 ttgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgatctatttgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc 4617  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4616 ta-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 4530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 2863 - 3045
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  2863 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 2959  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2960 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 3045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Original strand, 22997 - 23168
Alignment:
Q  8 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22997 tgaatgacattgttgattattgatgatcatgtt-----gtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataaagcaaatgatg 23091  T
Q  108 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23092 tggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 23168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 27799 - 27983
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||     
T  27799 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc- 27897  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27898 aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcccattatcgagtcctt 27983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17522 - 17340
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17522 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgagttgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 17423  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17422 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattg-ggattgttgtcgcattatcgagtc 17340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 145405 - 145223
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  145405 ttgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttatgtatgggcatgttttcttaataatgca 145306  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
     ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  145305 tatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 145223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 147665 - 147482
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttat-ttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||| ||  || |||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||  ||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  147665 ttgatgttgaaggatcttattgattgttgataatcatgttgatgtgtggtgatgaatactatgatttaaattgtgaattggcatgttttcttgataatgc 147566  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    | ||| |||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  147565 atatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttttcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 147482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 145552 - 145502
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  145552 ttgatgttaaatgaccttgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 145502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 40468 - 40291
Alignment:
Q  6 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40468 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 40369  T
Q  106 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| | || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40368 tgtgtagatgaacaatataattgggttttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 187
Target Start/End: Original strand, 2980 - 3163
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||||||     
T  2980 atgttgaatgacattgttgattgttcataatcaagttaatgtgtgaatggtaaatactatgatctatttgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaa- 3078  T
Q  103 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3079 tgttgtggagataatcaatataattgagtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 3163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 7940 - 8123
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  7940 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgataatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 8039  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8040 aatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattattgagtc 8123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 13329 - 13512
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  13329 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgataatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 13428  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13429 aatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattattgagtc 13512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18182 - 18000
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| ||| ||| | ||| || ||||||||||||||||||    
T  18182 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatcttgatgtgtgaggatgaatactatgatttaattgtggatgtgcttgttttcttgataatgca 18083  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18082 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 18000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20266 - 20084
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| ||| ||| | ||| || ||||||||||||||||||    
T  20266 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatcttgatgtgtgaggatgaatactatgatttaattgtggatgtgcttgttttcttgataatgca 20167  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20166 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 20084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6052 - 5874
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  6052 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactataatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 5956  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5955 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagt 5874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 217035 - 217218
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  217035 ttgattttgaatgacattgttgattattgataaacatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 217134  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  217135 aaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattat-gattgttgtcgcattatcgagtc 217218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2057 - 1873
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||||    
T  2057 ttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgttgaagaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgca 1958  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1957 a-tgt-gtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 1873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 69641 - 69456
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  69641 ttgatgttgaatgacattgttgattattgattatcatgatgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 69542  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 186  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  69541 aatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggttaaaattgtgaattgttgtcgcactatcgagtcct 69456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 30946 - 30768
Alignment:
Q  7 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30946 ttgaatgacattgttgattattgatgatcttgttcatgtggtgataatgaatgttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgt 30847  T
Q  106 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  30846 tgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 30768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 2418 - 2593
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  || |||||  ||||||||||||||||||||    
T  2418 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatattgatgtgtgatggtgaatactatgatttaaatgtgtatggacatgttttcttgataatgca 2517  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 177  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2518 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatta 2593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13074 - 12891
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  13074 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgaggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgc 12975  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12974 aaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 12891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 430 - 244
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| || || | |||||||||||||||||     
T  430 ttgatgttgaatgacattattgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgatctatttgtgtgtgggtatgttttcttgataatgt 331  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  330 ta-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 32478 - 32660
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||    
T  32478 ttgatgttgaatgacattgctgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatggacatgttttcttgataatgca 32577  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32578 aatgatgtggagatgaacaatataattggctgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 32660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 80 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34147 - 34037
Alignment:
Q  80 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34147 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatc 34049  T
Q  180 gagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||||    
T  34048 gagtccttgtac 34037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30223 - 30041
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  30223 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 30127  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30126 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 30041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 52561 - 52743
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||     
T  52561 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgcg 52660  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  52661 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcacattatcgagtc 52743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 56513 - 56695
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||     
T  56513 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgcg 56612  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  56613 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcacattatcgagtc 56695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 6436 - 6620
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||     
T  6436 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcttgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc- 6534  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6535 aatg-tgtggagataatcaatataattgggcgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattattgtcgcattatcgagtcctt 6620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25775 - 25591
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  25775 ttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc- 25677  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25676 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgacatggt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 25591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21520 - 21336
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  21520 ttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc- 21422  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | || || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21421 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgacatggt-gattgttatcgcattatcgagtcctt 21336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 6)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Original strand, 14565 - 14735
Alignment:
Q  15 cattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  14565 cattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttt-cttgataatgcaa-tgttgtggagat 14662  T
Q  115 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14663 aatcaatataattaggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggatttttgtcgcattatcgagtcctt 14735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 28373 - 28261
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgt-tttcttgataatg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||| || ||||||||||    
T  28373 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgtattgcttgataatg 28274  T
Q  99 caaatgttgtgga 111  Q
    |||||| ||||||    
T  28273 caaatgatgtgga 28261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 40369 - 40257
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgt-tttcttgataatg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||| || ||||||||||    
T  40369 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgtattgcttgataatg 40270  T
Q  99 caaatgttgtgga 111  Q
    |||||| ||||||    
T  40269 caaatgatgtgga 40257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Original strand, 23801 - 23862
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  23801 tttcttgataatgcaaatgttatggagataatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 23862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 28522 - 28472
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  28522 ttgatgttgaatgacattgttgattagtgataatcatgttgatgtatgatg 28472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 40518 - 40468
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  40518 ttgattttgaatgacattgttgattagtgataatcatgttgatgtatgatg 40468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 38158 - 37977
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  38158 ttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgca 38062  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38061 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 37977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 248826 - 249008
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  248826 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgca 248925  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
     ||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  248926 gatgatgtgggaatgaacaatataattgggtgttgtcttatatattgtggagaaaattgt-gatttttgttgcattatcgagtc 249008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 5902 - 6069
Alignment:
Q  7 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||| |||| |    
T  5902 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatgataaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatg-t 5999  T
Q  107 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6000 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcatt 6069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 7666 - 7485
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||| ||  ||| | |||  ||||||||||||||||||||||    
T  7666 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtggtgatgatgaatcttatgatttgattgtgcatggacatgttttcttgataatgcaaa 7567  T
Q  103 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7566 tgttttggagatgatcaatataattgggagtggtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 7485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 41582 - 41399
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  41582 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgagtgctatgacttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgc 41483  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41482 aaatgatgtggagattaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 41399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 336 - 154
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  336 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtcgatgtgtgatggtggatactatgatttaattatgtatggacatattttcttgataatgca 237  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||| |||  |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  236 aatgatgtggagatgaacaatataactgggagttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 184
Target Start/End: Original strand, 1916 - 2095
Alignment:
Q  5 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatg 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1916 tgttgagtgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgataatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatg 2015  T
Q  105 ttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| || || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2016 ttgtcgagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatagagtc 2095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 11212 - 11394
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||    
T  11212 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcttgttgatgtgtaatgttgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatgca 11311  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11312 aatgatgtggagatgaacaatataattgggtcttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gatttttgtcgcattatcgagtc 11394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3535 - 3352
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||  ||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  3535 ttgatgctgaatgacattgttgattatcgataatcatgttgatgtgtgatgaggaatgctatgaattgattgtgtatggacatattttcttgataatgca 3436  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  3435 aatgttgtggatatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattttgtattgttgttgcattatcgagtc 3352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3498 - 3318
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  3498 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgca 3401  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3400 aatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattg-agattgttgtcgcattatcgagtc 3318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27897 - 27714
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| | ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  27897 ttgatgttgaatgacattgttgatttttgataaataagttattttgtgaatggtgaatactatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgc 27798  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27797 aaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 27714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 47001 - 46819
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||| |||||||    
T  47001 ttgatgttgaatgacattgttaattattgataatcatgttaatgtggtgatgattaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttcataatgc 46902  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||| |||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46901 aaatgatgtggagatgaacaatat-attgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 46819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 60449 - 60267
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||| |||||||    
T  60449 ttgatgttgaatgacattgttaattattgataatcatgttaatgtggtgatgattaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttcataatgc 60350  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||||| |||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  60349 aaatgatgtggagatgaacaatat-attgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 60267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 106867 - 106689
Alignment:
Q  8 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 107  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  106867 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttg 106769  T
Q  108 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  106768 tggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaactgtggatttttgtcgcattatcgagtcctt 106689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16311 - 16132
Alignment:
Q  8 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 106  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  16311 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgtt 16213  T
Q  107 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16212 gtgaagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 16132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 13480 - 13660
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| || ||  ||| |||||||||||||||    
T  13480 ttgatgtggaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgggtgtggacatattttcttgataatgc 13579  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcga 181  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13580 aaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcga 13660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 270997 - 270813
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||  || | ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  270997 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatactatggttttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatg 270898  T
Q  99 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||| | |||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  270897 caaatgatatggagatgaacaatataattgggttttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 270813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 237057 - 236874
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgt-gatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||| |||||| ||| ||  |||||  ||| |||||||||||||||    
T  237057 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatattgatgtggagatgatgaatgctatgatttaattatgtatggacatattttcttgataatgc 236958  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    ||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  236957 aaaagatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtggaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 236874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Original strand, 6441 - 6620
Alignment:
Q  8 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 106  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||| ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6441 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactttgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttgataatgcaa-tgtt 6539  T
Q  107 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6540 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgaattgttgtcgcattattgagtcctt 6620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Original strand, 106297 - 106370
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  106297 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 106370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 108446 - 108343
Alignment:
Q  81 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 180  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| |||| || ||||||||| || ||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||   || |||||||||||||    
T  108446 catgatttcttaataatgcaattgttctggagatgatcaatatatttagaaattgtcctttatattgtggtggaaattgtgaggtgatgtcgcattatcg 108347  T
Q  181 agtc 184  Q
    ||||    
T  108346 agtc 108343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 113844 - 113883
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  113844 ttgatgttgaatgacattgttgataattgataatcatgtt 113883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 11322 - 11504
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||  | || |||||||| ||||||||||||    
T  11322 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgaggtgtgatgatgaatactatgatttaattgtatgtgggcatgtttccttgataatgca 11421  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11422 aatgatgtggagattaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgttgcattatcgagtc 11504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 51897 - 51719
Alignment:
Q  8 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 107  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| || |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  51897 tgaatgatattgttgattgttgataaccaagttattatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttg 51799  T
Q  108 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  51798 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgaattgttgtcgcattattgattcctt 51719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 20582 - 20692
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20582 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactataatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 20681  T
Q  101 aatgttgtgga 111  Q
    | |||||||||    
T  20682 agtgttgtgga 20692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 187
Target Start/End: Original strand, 20686 - 20716
Alignment:
Q  157 ttgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20686 ttgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 20716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4970 - 4823
Alignment:
Q  36 atgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttg 135  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  ||||    
T  4970 atgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattgattgcgtgtgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgatcaatataattgggagttg 4871  T
Q  136 tcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 183  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  4870 tcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgtgttatcgagt 4823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 17377 - 17561
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||| || |||  ||  || || |   ||||||| ||||||||||||    
T  17377 ttgatgttgaatgacattgttgattactgataatcgtgttgatgtgtgatgatgaatgctgtgatgtaactgtgtgtagacatgtttccttgataatgca 17476  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17477 a-tgttgtggagatgatcaatatcattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 17561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 7837 - 7673
Alignment:
Q  20 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatc 118  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |    
T  7837 ttgattgttgataatcatgttgttgtgtggtgatgaatactatgattttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaac 7738  T
Q  119 aatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7737 tatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgtattatcgagtc 7673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 59016 - 58899
Alignment:
Q  59 ctatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 158  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  59016 ctatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgcggagatgatcaatataattgggtgtcgtcttatatattgaggtgaaaatt 58917  T
Q  159 gtggattgttgtcgcatt 176  Q
    ||||||||||||||||||    
T  58916 gtggattgttgtcgcatt 58899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 59422 - 59375
Alignment:
Q  16 attgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatg 63  Q
    |||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  59422 attgatgattattgatgatcatgatgatgtgtgatggtgaatactatg 59375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Original strand, 6634 - 6805
Alignment:
Q  8 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  6634 tgaatgacattgttgattattgatgatcatgtt-----gtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcatgataatgcaaattttg 6728  T
Q  108 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6729 tggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 6805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Original strand, 4902 - 5067
Alignment:
Q  20 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttat--ttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataat 117  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| || |  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |     
T  4902 ttgattgttgataatcatgttgatgtgcggtgatgaatactatgatttttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaa 5001  T
Q  118 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  5002 caatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattattgtcgcattgtcgagtc 5067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Original strand, 1078 - 1263
Alignment:
Q  8 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 106  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  1078 tgaatgataatgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgtt 1176  T
Q  107 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgag-gtga-----aaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1177 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagattgagattgaaattgtgaattgtggtcgcattatcgagtcctt 1263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6768 - 6570
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcatgttttct 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||   ||||         | ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||    
T  6768 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataaggaatcttaattgaattatgatttgattgtgtatggacatgttttct 6669  T
Q  91 tgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 189  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  6668 tgataattcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtctttgt 6570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 880 - 771
Alignment:
Q  74 gtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgc 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  880 gtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgc 782  T
Q  174 attatcgagtc 184  Q
    |||||||||||    
T  781 attatcgagtc 771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15136 - 15027
Alignment:
Q  74 gtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgc 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  15136 gtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgc 15038  T
Q  174 attatcgagtc 184  Q
    |||||||||||    
T  15037 attatcgagtc 15027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 30063 - 29942
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttga-ttattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||  |||||||||    
T  30063 ttgatgttgaatgacattgttgaattattggtaatcatgttaatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatggacatgattttatgataatgc 29964  T
Q  100 aaatgttgtggaaataatcaat 121  Q
    |||||||||||| || ||||||    
T  29963 aaatgttgtggagatgatcaat 29942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27336 - 27260
Alignment:
Q  115 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 191  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27336 aatcaatataattgggttttgtcctatatattgaggagaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 27260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 5867 - 5700
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  5867 ttgattttgtatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgaggatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 5771  T
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattg-gatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtc 171  Q
    |||||||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||    
T  5770 aatgttgttgagataatcaatataatggtggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtc 5700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 187
Target Start/End: Original strand, 9291 - 9397
Alignment:
Q  80 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 179  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9291 gcatgtttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgctgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtagcattatc 9389  T
Q  180 gagtcctt 187  Q
    ||||||||    
T  9390 gagtcctt 9397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15073 - 14987
Alignment:
Q  101 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15073 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaagttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 14987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 184
Target Start/End: Original strand, 4092 - 4218
Alignment:
Q  57 tactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaa 156  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  4092 tactatgatttaattgtgtatgcgcatgttttcttggtaatgcaaatgatgtggagatgaacaatataatcgggtgttgtcatatatattgaggagaaaa 4191  T
Q  157 ttgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4192 ttgt-gattcttgtcgcattatcgagtc 4218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 184
Target Start/End: Original strand, 48932 - 49058
Alignment:
Q  57 tactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaa 156  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  48932 tactatgatttaattgtgtatgcgcatgttttcttggtaatgcaaatgatgtggagatgaacaatataatcgggtgttgtcatatatattgaggagaaaa 49031  T
Q  157 ttgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  49032 ttgt-gattcttgtcgcattatcgagtc 49058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4648 - 4534
Alignment:
Q  70 ttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttg 169  Q
    |||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4648 ttgcgtatggacatattttattgatgatgcaaatgttgtggagatgatcaaaataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttg 4549  T
Q  170 tcgcattatcgagtc 184  Q
    || ||||||||||||    
T  4548 tcacattatcgagtc 4534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 145794 - 145616
Alignment:
Q  8 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  145794 tgaatgacattgttgattattgatgatcatgtt-----gtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgctaatgttg 145700  T
Q  108 tggaaataatcaatata-at-tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 189  Q
    |||| || ||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| ||||    
T  145699 tggagatgatcaatatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaatcgtgaattgatgtcgcattatcaagtctttgt 145616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20489 - 20391
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  20489 tttcttgataatgcaattgttgtggatatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgagttgatgtcgcattatcgagtc 20391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27318 - 27220
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  27318 tttcttgataatgcaattgttgtggatatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgagttgatgtcgcattatcgagtc 27220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 20584 - 20527
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat 57  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  20584 ttgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttgatgatgtgatagtgaat 20527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 27413 - 27356
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat 57  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  27413 ttgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttgatgatgtgatagtgaat 27356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 17686 - 17797
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  17686 ttgatgttgaataactttgttgattattgatgatcatgttgatgtagtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgc 17785  T
Q  100 aaatgttgtgga 111  Q
    ||||| ||||||    
T  17786 aaatgatgtgga 17797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 24105 - 24216
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 99  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||  ||||| ||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||    
T  24105 ttgatattgaataactttgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgttatgatttaattgtgtatggacatattttcttgataatgc 24204  T
Q  100 aaatgttgtgga 111  Q
    ||||| ||||||    
T  24205 aaatgatgtgga 24216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 184
Target Start/End: Original strand, 197482 - 197572
Alignment:
Q  93 ataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  197482 ataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 197572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4603 - 4469
Alignment:
Q  43 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 142  Q
    ||||||||| | |||||| ||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4603 tgtgtgatgataaatactgtgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctata 4505  T
Q  143 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 179  Q
    |||||| ||  | |||| | |||||||||||||||||    
T  4504 tattga-gtcgagattgagaattgttgtcgcattatc 4469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 34442 - 34334
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  34442 atgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtagtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatacaaa 34343  T
Q  103 tgttgtgga 111  Q
    || ||||||    
T  34342 tgatgtgga 34334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 189
Target Start/End: Original strand, 2839 - 2942
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcc 185  Q
    ||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||     
T  2839 tttcttgataataaaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtct 2938  T
Q  186 ttgt 189  Q
    ||||    
T  2939 ttgt 2942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 2744 - 2783
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2744 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgtt 2783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 2209 - 2114
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcga 181  Q
    |||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2209 tttcttaataataaaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcga 2114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 2304 - 2260
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  2304 ttgatgttgaatgacattgttgattatagatgatcatgttgatgt 2260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 23948 - 23898
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23948 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtatgatg 23898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Original strand, 4728 - 4801
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  4728 tttcttgataatgctaatgttgtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 4801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Original strand, 7041 - 7114
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  7041 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataatttgaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 7114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 214 - 164
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  214 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 65 - 1
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatga 64  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||    
T  65 ttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 7387 - 7290
Alignment:
Q  87 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||||| || |||||| ||  | ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  7387 ttcttgataatgtaattgttgtagaggtgatcaatatatttggatgttgtcctttatattgttgtggaaattgtggggtgatgtcgcattatcgagtc 7290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 53328 - 53279
Alignment:
Q  2 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  53328 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 53279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Original strand, 71655 - 71728
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||    
T  71655 tttcttgataatgcgaatgttgtggagatgatcaatataattggaaggtgtcctttatattgttgtgaaaattg 71728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 158
Target Start/End: Original strand, 3667 - 3739
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  3667 tttcttgataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 3739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1030 - 991
Alignment:
Q  148 aggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1030 aggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 184
Target Start/End: Original strand, 6021 - 6116
Alignment:
Q  89 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 184  Q
    |||||||||| || ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  6021 cttgataatgaaattgttgtggagattatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgttgcattatcgagtc 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Original strand, 3082 - 3124
Alignment:
Q  4 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3082 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtg 3124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4820 - 4759
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  4820 tttcttgagaatgcagatgttgtggagataatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 4759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 158
Target Start/End: Original strand, 117977 - 118049
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 158  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  117977 tttcttaataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 118049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12986 - 12936
Alignment:
Q  86 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgt 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  12986 tttcttgataatgctaatgttgtggagatgatcaatataattggaagttgt 12936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1752 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1752
Description:

Target: scaffold1752; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 468 - 429
Alignment:
Q  1 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 40  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  468 ttgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgtt 429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 146
Target Start/End: Original strand, 78206 - 78265
Alignment:
Q  87 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatatt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  78206 ttcttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaggctgtcctttatatt 78265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 34261 - 34203
Alignment:
Q  89 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 147  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  34261 cttgataatgcaattgttgaggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 34203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 2761 - 2696
Alignment:
Q  8 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttg 72  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  2761 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactatgatttatttg 2696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University