View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10481A_low_465 (Length: 242)

Name: NF10481A_low_465
Description: NF10481A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10481A_low_465
NF10481A_low_465
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (16-222)||(1018-1225)
[»] chr5 (6 HSPs)
chr5 (16-222)||(11210981-11211188)
chr5 (16-207)||(23503317-23503508)
chr5 (16-222)||(21937475-21937682)
chr5 (16-202)||(24581085-24581271)
chr5 (16-222)||(27010959-27011165)
chr5 (16-187)||(24516434-24516604)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (16-207)||(14648-14839)
scaffold0132 (16-221)||(43529-43735)
[»] chr4 (12 HSPs)
chr4 (16-222)||(13247605-13247812)
chr4 (16-207)||(16445333-16445524)
chr4 (16-222)||(15293262-15293469)
chr4 (16-222)||(14997276-14997483)
chr4 (16-222)||(55375463-55375670)
chr4 (16-222)||(9290795-9291002)
chr4 (23-222)||(12132514-12132714)
chr4 (16-127)||(37955992-37956102)
chr4 (23-187)||(16685221-16685385)
chr4 (41-103)||(12343061-12343123)
chr4 (150-222)||(12342968-12343041)
chr4 (150-190)||(9849616-9849656)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (16-222)||(12640564-12640771)
chr2 (16-222)||(22275870-22276077)
chr2 (16-222)||(24570313-24570520)
chr2 (17-222)||(24831832-24832038)
chr2 (24-222)||(23817738-23817937)
chr2 (16-222)||(28144554-28144761)
chr2 (16-222)||(22762214-22762421)
chr2 (16-222)||(25128238-25128445)
chr2 (90-207)||(21908952-21909069)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (20-222)||(8090-8293)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (16-222)||(16877643-16877850)
chr8 (16-222)||(21850885-21851092)
chr8 (16-222)||(20652881-20653088)
chr8 (23-216)||(21197056-21197250)
chr8 (18-207)||(22982464-22982653)
chr8 (48-222)||(22315249-22315424)
chr8 (16-184)||(23150974-23151142)
chr8 (15-222)||(25282155-25282364)
chr8 (45-190)||(24818197-24818342)
chr8 (58-175)||(24094210-24094327)
chr8 (150-190)||(20388259-20388299)
[»] chr3 (11 HSPs)
chr3 (16-222)||(8274743-8274950)
chr3 (16-222)||(13975389-13975596)
chr3 (16-222)||(15576339-15576546)
chr3 (16-222)||(16743047-16743254)
chr3 (16-199)||(6153207-6153390)
chr3 (17-175)||(6712792-6712950)
chr3 (23-168)||(17192690-17192835)
chr3 (15-222)||(18748258-18748461)
chr3 (17-222)||(267602-267808)
chr3 (126-222)||(21686644-21686741)
chr3 (21-91)||(21686569-21686639)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (16-222)||(20914185-20914392)
chr1 (16-222)||(20831569-20831776)
chr1 (39-222)||(46518719-46518903)
chr1 (17-199)||(22142242-22142424)
chr1 (15-187)||(21202500-21202672)
chr1 (95-179)||(20184235-20184319)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (15-223)||(23573-23782)
scaffold0037 (16-207)||(98006-98197)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (16-199)||(44578-44761)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (16-222)||(46145-46352)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (16-207)||(16233033-16233224)
chr6 (16-207)||(23996072-23996263)
chr6 (16-222)||(18838158-18838365)
chr6 (15-222)||(18571474-18571682)
chr6 (16-222)||(1649034-1649241)
chr6 (16-222)||(16382623-16382830)
chr6 (16-222)||(15078614-15078821)
chr6 (16-207)||(25743353-25743544)
chr6 (15-184)||(14129283-14129452)
chr6 (16-222)||(25655307-25655514)
chr6 (50-222)||(16097909-16098081)
chr6 (16-146)||(21413330-21413458)
chr6 (24-168)||(23124019-23124163)
chr6 (42-120)||(17813573-17813651)
chr6 (146-199)||(21413212-21413265)
chr6 (23-70)||(19968716-19968763)
chr6 (16-54)||(16087155-16087193)
chr6 (39-93)||(26276777-26276831)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (19-222)||(106681-106885)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (16-222)||(1162-1369)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (16-207)||(23385-23576)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (16-207)||(23871-24062)
scaffold0008 (16-183)||(231549-231716)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (17-222)||(122058-122264)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (16-216)||(28380-28581)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (16-222)||(40249-40456)
[»] chr7 (15 HSPs)
chr7 (16-222)||(7823849-7824056)
chr7 (16-222)||(27107888-27108095)
chr7 (16-222)||(14936296-14936503)
chr7 (16-222)||(15363889-15364096)
chr7 (16-222)||(17923629-17923837)
chr7 (16-222)||(12193505-12193712)
chr7 (16-199)||(12368714-12368896)
chr7 (24-181)||(13378655-13378812)
chr7 (16-180)||(21674690-21674854)
chr7 (16-184)||(45146505-45146673)
chr7 (15-222)||(4439876-4440084)
chr7 (16-199)||(13353100-13353283)
chr7 (23-187)||(17145408-17145572)
chr7 (23-207)||(20466738-20466922)
chr7 (17-187)||(23641469-23641637)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (15-207)||(510-702)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (16-207)||(9015-9206)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (16-222)||(14514-14721)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (16-222)||(4052-4259)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (20-199)||(10441-10620)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (39-216)||(3989-4167)
[»] scaffold0554 (2 HSPs)
scaffold0554 (39-222)||(3173-3357)
scaffold0554 (16-57)||(3107-3148)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (24-222)||(78737-78936)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (50-222)||(5766-5939)
scaffold0447 (50-222)||(10380-10553)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (50-222)||(8375-8548)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (16-222)||(7918-8126)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (16-222)||(16279-16485)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (16-222)||(22692-22892)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (16-183)||(481-648)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (16-199)||(12899-13082)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (24-222)||(33103-33301)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (53-222)||(14845-15014)
scaffold0310 (16-121)||(5370-5475)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (23-222)||(8985-9185)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (16-184)||(13242-13410)
scaffold0021 (48-199)||(6333-6484)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (16-177)||(14121-14282)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (24-187)||(10655-10818)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (39-169)||(5189-5319)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (16-183)||(13952-14118)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (16-108)||(1177-1269)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (24-207)||(370264-370446)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (15-199)||(73891-74074)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (131-190)||(7274-7333)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (15-91)||(78339-78415)
[»] scaffold1068 (1 HSPs)
scaffold1068 (17-97)||(1001-1081)


Alignment Details
Target: scaffold1710 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1225 - 1018
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1225 catcatgcacttacttcctcaactgagatacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 1126  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  1125 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 1026  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  1025 tcaccaac 1018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 6)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11211188 - 11210981
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11211188 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattgtgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgccacaaccccaacctt 11211089  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  11211088 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 11210989  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  11210988 tcaccaac 11210981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Original strand, 23503317 - 23503508
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  23503317 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacactacaaccctaacctt 23503416  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccctaaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23503417 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggattcaacttcctacacttcaaaggacgaccaacaccggtcacatgattcaccctaaaaa 23503508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21937682 - 21937475
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21937682 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggcaacgcaatccggtacgctacaaccccaacctt 21937583  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccc-taaaaatacatga 214  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  21937582 ctcaatgacatcaaacagcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttaaaaacacatga 21937483  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  21937482 tcaccaac 21937475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Original strand, 24581085 - 24581271
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24581085 catcatgcacatacttcctcaactcagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatctgatacgctacaaccccaacctt 24581184  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct 202  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24581185 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccct 24581271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 27010959 - 27011165
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27010959 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagatttgacaaagacggtggtaacgcaatctgatacgctacaaccccaacctt 27011058  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||    
T  27011059 ctcaatgacatcaaacgg-ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatga 27011157  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  27011158 tcaccaac 27011165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Original strand, 24516434 - 24516604
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| |||||||||||  || |  |||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||| | | |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||    
T  24516434 catcatacacatacttccgtaactaggacacaagaaacgcatcatgaagattcgataacgatagcgataacgcaa-ccgacacgttacaactccaacctt 24516532  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggt 187  Q
    ||||| ||  |||||||||| ||||||| | || |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  24516533 ctcaacaatctcaaacggtcaaacaaaatgtggtgtcaacttccgatacttcaaagcacgtccaacaccggt 24516604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Original strand, 14648 - 14839
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14648 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagatgatggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 14747  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccctaaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14748 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaa 14839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 221
Target Start/End: Original strand, 43529 - 43735
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43529 catcatgcacgtacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacactacaaccctaacctt 43628  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||| | ||||| ||||||    
T  43629 ctcaataacatcaaatggtccaacaaaacgaggagtcaatttcctacactttaaagcacgaccaactacggttacaggattcaccgtcaaaaacacatga 43728  T
Q  215 tcgccaa 221  Q
    || ||||    
T  43729 tcaccaa 43735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 12)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 13247605 - 13247812
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13247605 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 13247704  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  13247705 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcaagaccaacaccgatcacatgattcaccctcaaaaatacatga 13247804  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  13247805 tcaccaac 13247812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16445524 - 16445333
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445524 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 16445425  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccctaaaaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  16445424 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaa 16445333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15293469 - 15293262
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15293469 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 15293370  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  15293369 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccattcacaggattcaccctcaaaaacacatga 15293270  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  15293269 tcaccaac 15293262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 14997276 - 14997483
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997276 catcattcacatacttcctcaactgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaatgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 14997375  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||    
T  14997376 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaagattcaccctcaaaaacacatga 14997475  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  14997476 tcaccaac 14997483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 55375670 - 55375463
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55375670 catcatgcacgtacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 55375571  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  55375570 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgagaagtcaacttcatacacttcaaagctcgaccaacaccagttacaggattcaccctcaaaaacacatga 55375471  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  55375470 tcaccaac 55375463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 9290795 - 9291002
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9290795 catcatgtacatactttctcaattgagacacatgaaacacattatgaagattctacaaagatggtggtaacgcaatttgatacgctacaaccccaacctt 9290894  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  9290895 ctcaataacatcaaacggtccaacgaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacatcggtcacaggattcaccctcaaaaatacctga 9290994  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  9290995 tcaccaac 9291002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12132714 - 12132514
Alignment:
Q  23 cacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaata 122  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12132714 cacatacttccgcaactgagacacatgaaacacatcatgaggattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctccata 12132615  T
Q  123 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatgatcgccaa 221  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  12132614 atctccaacggtccaacaaaacgaggagtcaactttcgacacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 12132515  T
Q  222 c 222  Q
    |    
T  12132514 c 12132514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 37956102 - 37955992
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37956102 catcatacacatacttcctcaattgagacacataaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaa-cccaacctt 37956004  T
Q  116 ctcaataacatc 127  Q
    ||||| ||||||    
T  37956003 ctcaacaacatc 37955992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Original strand, 16685221 - 16685385
Alignment:
Q  23 cacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaata 122  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| || | || || ||||||||| || |||||  || | |  |||||||||| |||    
T  16685221 cacatacttcctcaactgagatacataaaacacatcatgaagattcaacgacgacggcggtaacgcagtctgatacaatatagcttcaaccttctctata 16685320  T
Q  123 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggt 187  Q
    |  |||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  16685321 atctcaaacggcccaacaaaacgcggtgtcaacttccaacacttcaaagcacacccaacaccggt 16685385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 12343123 - 12343061
Alignment:
Q  41 agacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctac 103  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12343123 agacacatgaaacacatcttgaagatttgacaaagacggtggtaacgcaattcgatacgctac 12343061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12343041 - 12342968
Alignment:
Q  150 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatgatcgccaac 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| || |||| ||| || |||||||||||||| |||||    
T  12343041 gtcaacttccgacacttcaaagcacgtctaacatcggttacaggatacactctaaaaaatacatgatcaccaac 12342968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9849656 - 9849616
Alignment:
Q  150 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcac 190  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9849656 gtcaacttcttggacttcaaagcacgaccaacaccggtcac 9849616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12640771 - 12640564
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12640771 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 12640672  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  12640671 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatga 12640572  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  12640571 tctccaac 12640564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 22275870 - 22276077
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275870 catcatgtacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 22275969  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  22275970 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacccttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatga 22276069  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  22276070 tcaccaac 22276077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24570520 - 24570313
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24570520 catcgtgcacgtacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccaatacgctacaaccccaacctt 24570421  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| || || |||||||||    
T  24570420 ctcaacaacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttccaacacttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatga 24570321  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  24570320 tcaccaac 24570313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24832038 - 24831832
Alignment:
Q  17 atcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttc 116  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24832038 atcatgcacatgcttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggcaacgcaatccggtacgctacaaccccaaccttc 24831939  T
Q  117 tcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatgat 215  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||||| ||||| |||||||    
T  24831938 ttaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcataggattcaccctcaaaaacacatgat 24831839  T
Q  216 cgccaac 222  Q
    | |||||    
T  24831838 caccaac 24831832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23817937 - 23817738
Alignment:
Q  24 acatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataa 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23817937 acatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcggcaaagttggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataa 23817838  T
Q  124 catcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatgatcgccaac 222  Q
    | ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  23817837 cctcaaatggtcctacaaaactaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaac 23817738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 28144554 - 28144761
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| |||||||||||  || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28144554 catcatacacatacttccgtaactgagaaacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 28144653  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||    
T  28144654 ctcaataatctcaaacggtccaacaaaacgatgagttaacttcctacacttcaaagcacgtccaacaccggttacaagattcactctcaaaaacacatga 28144753  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  28144754 tcaccaac 28144761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22762421 - 22762214
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22762421 catcatacacaaacttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattggacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 22762322  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||| || ||  ||||||| || ||||| ||||||    
T  22762321 ctcaacaacatcaaacggtccaccaaaatgaggagtcaactttcgacacttcaaaccacgactaacaccagttacatgattcactctcaaaaacacatga 22762222  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  22762221 tcaccaac 22762214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 25128238 - 25128445
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25128238 catcatacacatacttccgcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcgataaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 25128337  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||  | ||||| || ||||| ||||||    
T  25128338 ctcaataatctcaaacggtccaacaaaaagaggagtaaactttcgacaattcaaagcgcgtccaacaccagtcacatggttcactctcaaaaacacatga 25128437  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  25128438 tcaccaac 25128445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21909069 - 21908952
Alignment:
Q  90 atccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtca 189  Q
    |||| |||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| |||||||||||| | || ||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| || |    
T  21909069 atccaatacgctacaactccgactttctctataatctcaaatggtccaacaaaatgcggtgtcaacttccggcacttcaaatcacgtccaacaccagtta 21908970  T
Q  190 ccggattcaccctaaaaa 207  Q
    |  ||||||| |||||||    
T  21908969 cgtgattcactctaaaaa 21908952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 222
Target Start/End: Original strand, 8090 - 8293
Alignment:
Q  20 atgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctca 119  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8090 atgcatatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctca 8189  T
Q  120 ataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatgatcgc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |    
T  8190 ataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacatcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcac 8289  T
Q  219 caac 222  Q
    ||||    
T  8290 caac 8293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16877850 - 16877643
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16877850 catcatgcacatacttcctcaactaagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 16877751  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  16877750 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatga 16877651  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  16877650 tctccaac 16877643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21851092 - 21850885
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21851092 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatctgatacgctacaaccccaacctt 21850993  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  21850992 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaatcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 21850893  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  21850892 tcaccaac 21850885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20653088 - 20652881
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20653088 catcatacacatacttcctcaactgagatacatgaaacacatcatgaagattcgacaacgatggtggtaatgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 20652989  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  20652988 ctcaaccacatcaaacggtccaacgaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaatacatga 20652889  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  20652888 tcaccaac 20652881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21197250 - 21197056
Alignment:
Q  23 cacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaata 122  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  21197250 cacatatttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacgatggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccgtctcaaca 21197151  T
Q  123 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatgatc 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  21197150 acatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagtacgaccaactccagttacaggattcactctcaaaaacacatgatc 21197056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 207
Target Start/End: Original strand, 22982464 - 22982653
Alignment:
Q  18 tcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttct 117  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  22982464 tcatacacatacttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcggcaaagatggtggcaacgcaatccgatacgctacaaccccaatttcct 22982563  T
Q  118 caataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccctaaaaa 207  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| |||||||    
T  22982564 caacaacatcaaacggtccgacaaaacgaggagtcaacttctgacacttcaaagcacgaccaacaccaatcacatgattcactctaaaaa 22982653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 222
Target Start/End: Original strand, 22315249 - 22315424
Alignment:
Q  48 tgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgag 147  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  22315249 tgaaacacatcatgtaaattcgacaacgatggtggtaacgcaatccgatatgctacaaccccaaccttctcaataatctcaaatggtccaacaaaacgag 22315348  T
Q  148 gagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatgatcgccaac 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  22315349 gagtcaacttccgacacttcaaagcacgacctacaccggttacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaac 22315424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Original strand, 23150974 - 23151142
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23150974 catcatacacatacttccgcaattgagacacatgaaacatatcatgaagattcgacaaagacgatggtaacgcattctgatacgctacaaccccaacctt 23151073  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacacc 184  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23151074 ctcaacaacatcaaaaggaccaacaaaatgaggagtcgacttcctacactttaaagcacgcccaacacc 23151142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 25282155 - 25282364
Alignment:
Q  15 acatcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaa-gatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacc 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| || || |  ||||||||| |||| |||||| | |||||     
T  25282155 acatcatacacatacttcctcaattgagatacatgaaacacatcatgaaaattcgaaaaacgacggcgaaaacgcaatctgatatgctacatctccaaca 25282254  T
Q  114 ttctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacat 212  Q
    ||||||||||  |||||| | ||||||||||  |  |||||||||  |||| |||||| ||| ||||||| ||| ||  ||||||| || ||||| ||||    
T  25282255 ttctcaataaactcaaacagcccaacaaaacacgctgtcaacttctaacacatcaaagtacgtccaacactggttacatgattcactctcaaaaacacat 25282354  T
Q  213 gatcgccaac 222  Q
    |||| |||||    
T  25282355 gatcaccaac 25282364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24818342 - 24818197
Alignment:
Q  45 acatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaacaaaac 144  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||  | || || ||||||||||||||||||||  | || || |||||||| |  ||||| || |||| ||||     
T  24818342 acatgaaatacactatgaagattcgacaacaacggcggcaacgcaatccgatacgctactgctcccactttctcaatgatctcaaatggaccaataaaat 24818243  T
Q  145 gaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcac 190  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  24818242 atggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgttcgacaccggtcac 24818197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 175
Target Start/End: Original strand, 24094210 - 24094327
Alignment:
Q  58 tatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaactt 157  Q
    |||||||||||||||| || ||  | || | ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||  | |||| | ||||  ||||| || ||||||||    
T  24094210 tatgaagattcgacaacgacggaagcaatgaaatccgatacggtacaactccaaccttcttgataatcttaaacagaccaagtaaacgtggtgtcaactt 24094309  T
Q  158 cctacacttcaaagcacg 175  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24094310 cctacacttcaaagcacg 24094327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 190
Target Start/End: Original strand, 20388259 - 20388299
Alignment:
Q  150 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcac 190  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20388259 gtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcac 20388299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8274950 - 8274743
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8274950 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 8274851  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  8274850 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 8274751  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  8274750 tcaccaac 8274743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13975596 - 13975389
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13975596 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 13975497  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  13975496 ctcaatgacatcaaacggcccaacgaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaaacacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 13975397  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  13975396 tcaccaac 13975389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 15576339 - 15576546
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15576339 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggcaacgcaatccggtatgctacaaccccaacctt 15576438  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  15576439 ctcaatcacatcaaacagcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 15576538  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  15576539 tcaccaac 15576546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16743254 - 16743047
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16743254 catcatgcacatacttcctcaactaagacacatgaaaaacattatgaagattggacaaagacagtggtaacacaatccaatacgctacaaccccaacctt 16743155  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  16743154 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 16743055  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  16743054 tcaccaac 16743047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 6153390 - 6153207
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  6153390 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgaaaaagatggtggcaatgcaatccgatacgctacaacctcgacctt 6153291  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcac 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  6153290 ctcaataacatcaaacggtccgacaaaacgaggagtcaactttctgcacttcaaagcacgaccgacaccggtcacatgattcac 6153207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 6712950 - 6712792
Alignment:
Q  17 atcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttc 116  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6712950 atcatacacatacttccgcaactgagtcacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacacaatctgatacgctacaaccccaaccttc 6712851  T
Q  117 tcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacg 175  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6712850 tcaataatctcaaacggaccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcaaagcacg 6712792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 168
Target Start/End: Original strand, 17192690 - 17192835
Alignment:
Q  23 cacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaata 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  17192690 cacatacttcctcaattgagacacatgaaacacatcatgaagatttgacaaagacagtggtagcgcaatccggtacgctacaaccccaaccttctcaaca 17192789  T
Q  123 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttca 168  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17192790 acatcaaaaggcccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttca 17192835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 18748258 - 18748461
Alignment:
Q  15 acatcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacct 114  Q
    ||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||     ||||| |||||    
T  18748258 acatcatacacatactttcgcaactgagacacatgaaacacaccatgcagattcgacaaagacggtgctaacgcaatccgatac-----aaccctaacct 18748352  T
Q  115 tctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcac-cctaaaaatacatg 213  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| | |||||| |||||    
T  18748353 tcttaataatctcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaactttcgacacttcaaagcacgtccaacaccagttacagggttcactcttaaaaacacatg 18748452  T
Q  214 atcgccaac 222  Q
    ||| |||||    
T  18748453 atcaccaac 18748461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 267808 - 267602
Alignment:
Q  17 atcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttc 116  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||||||    | |||||||    
T  267808 atcatacacatacttcctcagcttagacacatgaaacaaataatgaagattcggcaacgacggcggtagcgcaatccgatacgctactgatctaaccttc 267709  T
Q  117 tcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatgat 215  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||| || |  |||||||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  267708 tcaataatctcaaacggtccaacaaaacacggtgttaacctcctacacttcaaatcatgttcaacaccgattactggattaaccctcaaaaacacatgat 267609  T
Q  216 cgccaac 222  Q
    | |||||    
T  267608 ctccaac 267602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Original strand, 21686644 - 21686741
Alignment:
Q  126 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatgatcgccaac 222  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  21686644 tcaaacagtccaacaaaacaaggtgtcaactttcgacacttcaaagcacgtccaacatcggttacatgattcactctaaaaaatacatgatcaccaac 21686741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Original strand, 21686569 - 21686639
Alignment:
Q  21 tgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaat 91  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| || |  |||||||||||    
T  21686569 tgcacatacttcctcaactgagatacatgaaacacatcatgaagattagacaacgacgacggtaacgcaat 21686639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 20914185 - 20914392
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20914185 catcatgcacatacttcctcaactgagacgcatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaattcgatacgctacaaccccaacctt 20914284  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20914285 cacaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatga 20914384  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  20914385 tcaccaac 20914392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20831776 - 20831569
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20831776 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggcaacgcaatccggtacgctacaaccccaacctt 20831677  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  20831676 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 20831577  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  20831576 tcaccaac 20831569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 39 - 222
Target Start/End: Original strand, 46518719 - 46518903
Alignment:
Q  39 tgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  46518719 tgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatgacatcaaacggcccaa 46518818  T
Q  139 caaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatgatcgccaac 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  46518819 caaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaac 46518903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22142424 - 22142242
Alignment:
Q  17 atcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttc 116  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22142424 atcatacacatacttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacagtggtaacacaatctgatacgctacaaccccaaccttc 22142325  T
Q  117 tcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcac 199  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  22142324 tcaataacctcaaatggtccaacaaaatgaggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcac 22142242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21202672 - 21202500
Alignment:
Q  15 acatcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacct 114  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21202672 acatcatacacatacttccgcaagtgagacacatgaaacacaacaagaagattcgacaacgatggcggtaacgcaatccgatacgctacaactccaactt 21202573  T
Q  115 tctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggt 187  Q
    |||| | ||  ||||| |||| ||||||| |    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21202572 tctcgacaatctcaaaaggtctaacaaaatgcaatgtcaacttccgacacttcaaagtacgtccaacaccggt 21202500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 179
Target Start/End: Original strand, 20184235 - 20184319
Alignment:
Q  95 atacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacca 179  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20184235 atacgttacaactctaacattctcaacaatctcaaacggtccaacaaaacgtggtgtcaacttccgacacttcaaagcacgacca 20184319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23782 - 23573
Alignment:
Q  15 acatcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacct 114  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23782 acatcatgcacaaacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaatcccaacct 23683  T
Q  115 tctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  23682 tctcaataacatcaaacggtccaataaaatggggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatg 23583  T
Q  214 atcgccaaca 223  Q
    ||| ||||||    
T  23582 atcaccaaca 23573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Original strand, 98006 - 98197
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  98006 catcatgcacataattcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcaacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 98105  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccctaaaaa 207  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  98106 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaa 98197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 44761 - 44578
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  44761 catcatgcacatacttcctcaattgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaacctcaacctg 44662  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44661 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcac 44578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 46145 - 46352
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46145 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacagccccaacctt 46244  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  46245 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatga 46344  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  46345 tcaccaac 46352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Original strand, 16233033 - 16233224
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16233033 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 16233132  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccctaaaaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16233133 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaacgcacgaccaactccggtcacaggattcaccctaaaaa 16233224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Original strand, 23996072 - 23996263
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23996072 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 23996171  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccctaaaaa 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  23996172 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaa 23996263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18838365 - 18838158
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18838365 catcatgcacatacttcctcaacttaggcacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 18838266  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccc-taaaaatacatga 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  18838265 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcacccacaaaaacacatga 18838166  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  18838165 tcaccaac 18838158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 18571474 - 18571682
Alignment:
Q  15 acatcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18571474 acatcatgcacatacttcctcaactgagacacattaaatacattatgaagattctacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacct 18571573  T
Q  115 tctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  18571574 tctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtctacttcctatacttcaaagcacgaccaacatcggtcacatgattcaccctcaaaaatacatg 18571673  T
Q  214 atcgccaac 222  Q
    ||| |||||    
T  18571674 atcaccaac 18571682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1649241 - 1649034
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1649241 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggcaacgcaatccggtacgctacaaccccaacctt 1649142  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  1649141 ctcaatcacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcccacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 1649042  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  1649041 tcaccaac 1649034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16382830 - 16382623
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16382830 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggcaacgcaatccggtacgctacaaccccaacctt 16382731  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  16382730 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 16382631  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  16382630 tcaccaac 16382623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15078821 - 15078614
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15078821 catcatacacatacttcctcaactgagatacatgaaacacatcatgaagatttgacaaagacggtggtaacgcaatctgatacgctacaaccccaacctt 15078722  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  15078721 ctcaacaacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcactggattcagtctcaaaaatacatga 15078622  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  15078621 tcaccaac 15078614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25743544 - 25743353
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25743544 catcatgtacatacttcctcaactgagacacatgaaacatatgatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatatgctacaaccccaacctt 25743445  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccctaaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  25743444 ctcaataacatcaaatggtgcaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattctccctcaaaa 25743353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 184
Target Start/End: Original strand, 14129283 - 14129452
Alignment:
Q  15 acatcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacct 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14129283 acatcatacacatacttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcaacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacct 14129382  T
Q  115 tctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacacc 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14129383 tctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaactttcgacacttcaaagcacgaccaacacc 14129452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 25655307 - 25655514
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25655307 catcatacacatacttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcaacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 25655406  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||| || ||||| ||||||    
T  25655407 ctcaataatctcaaatggtccaacaaaacggggagttaacttccgacagttcaaagcacgaccaacaccagttatcagattcactctcaaaaacacatga 25655506  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  25655507 tcaccaac 25655514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 222
Target Start/End: Original strand, 16097909 - 16098081
Alignment:
Q  50 aaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgagga 149  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16097909 aaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacacaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatcacatcaaac-gtccaacaaaacgagga 16098007  T
Q  150 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatgatcgccaac 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  16098008 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaac 16098081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21413458 - 21413330
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21413458 catcatacacatacttcctcaactgagaca--tgaaacacatcatgaagattcgacaaatatggtggcaacgcaatgcgatacgctacaaccccaacctt 21413361  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacga 146  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21413360 ctcaacaacatcaaacggtctaacaaaacga 21413330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 168
Target Start/End: Original strand, 23124019 - 23124163
Alignment:
Q  24 acatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataa 123  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || || || |||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| |  |    
T  23124019 acatacttcctcaactgagatacatgaaacacatcatggagattcgataacgacggaggtaatacaatccgatacgctacaactcccaccttctctacta 23124118  T
Q  124 catcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttca 168  Q
      |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  23124119 tctcaaacggtccaacaaaacgtggtgtcaacttcttacacttca 23124163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 120
Target Start/End: Original strand, 17813573 - 17813651
Alignment:
Q  42 gacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17813573 gacacatgaaacacatcatgaagattcgacaacgacggtagtaatgcaatccgatacgctaccactccaaccttctcaa 17813651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21413265 - 21413212
Alignment:
Q  146 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcac 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  21413265 aggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcac 21413212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 19968763 - 19968716
Alignment:
Q  23 cacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcga 70  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19968763 cacatacttcttcaactgagatacatgaaacacattatgaagattcga 19968716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 54
Target Start/End: Original strand, 16087155 - 16087193
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaaca 54  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16087155 catcatgcacatactttctcaactgagacacatgaaaca 16087193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 93
Target Start/End: Original strand, 26276777 - 26276831
Alignment:
Q  39 tgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatcc 93  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||    
T  26276777 tgagacacatgaaacacactatgtagattcgacaacaatggttgtaacacaatcc 26276831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 106885 - 106681
Alignment:
Q  19 catgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctc 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  106885 catgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcaacaaagacggtggtaacgcaatctgatacgctacaaccccaaccttctc 106786  T
Q  119 aataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatgatcg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  106785 aataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcaggaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatca 106686  T
Q  218 ccaac 222  Q
    |||||    
T  106685 ccaac 106681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1369 - 1162
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1369 catcatacacatacttcctcaactgagatacattaatcacatcatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 1270  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  1269 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcactctaaaaaatacatga 1170  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    ||||||||    
T  1169 tcgccaac 1162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Original strand, 23385 - 23576
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23385 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagaaggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 23484  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccctaaaaa 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||    
T  23485 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgagcagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaa 23576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Original strand, 23871 - 24062
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23871 catcatgaacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 23970  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccctaaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  23971 ctcaataacatcaaacggtctaacaaaacaaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaa 24062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Original strand, 231549 - 231716
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| | || | ||||||    
T  231549 catcatacacatacttccgcaactgaaacacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcattctgatacgctgccactctaacctt 231648  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacac 183  Q
     | || ||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  231649 tttaacaatctcatacggtccaacaaaacgaggtgtcaacttccgacacttcaaagcacgtccaacac 231716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 122264 - 122058
Alignment:
Q  17 atcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttc 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  122264 atcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatcctatacgctacatccccaaccttc 122165  T
Q  117 tcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatgat 215  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  122164 tcaattacattaaatggtccaacaaaatgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgat 122065  T
Q  216 cgccaac 222  Q
    | |||||    
T  122064 caccaac 122058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28581 - 28380
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28581 catcatgtacttacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatcctatacgctacaaccccaacctt 28482  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||    
T  28481 ctcaataacatcaaacggtccaacaaatcgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatga 28382  T
Q  215 tc 216  Q
    ||    
T  28381 tc 28380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 40249 - 40456
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40249 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggcaacgcaatccggtacgctacaaccccaacctt 40348  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  40349 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 40448  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  40449 tcaccaac 40456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 7823849 - 7824056
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7823849 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggcaacgcaatccggtacgctacaaccccaacctt 7823948  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  7823949 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 7824048  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  7824049 tcaccaac 7824056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27108095 - 27107888
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27108095 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggcaacgcaatccggtacgctacaaccccaacctt 27107996  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  27107995 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 27107896  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  27107895 tcaccaac 27107888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 14936296 - 14936503
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14936296 catcatacacatacttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcgataaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 14936395  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||| ||||||    
T  14936396 ctcaataacctcaaacggtcccacaaaacaaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatga 14936495  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  14936496 tcaccaac 14936503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 15363889 - 15364096
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15363889 catcatacacatacttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattctataaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 15363988  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||    
T  15363989 ctcaataacctcaaacggtcccacaaaacaaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatga 15364088  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  15364089 tcaccaac 15364096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 17923629 - 17923837
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17923629 catcatacacatacttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgtaaattcgacaaaggcggtggtaacgcaatccgatacgctgcaaccccaacctt 17923728  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct--aaaaatacatg 213  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||    
T  17923729 ctcaataatctcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaccaccggttaccggattcactcttaaaaaacacatg 17923828  T
Q  214 atcgccaac 222  Q
    ||| |||||    
T  17923829 atcaccaac 17923837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 12193505 - 12193712
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12193505 catcatacacatatttccgcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcgacaaatatcgtggtaacgtaatccgatatgctacaaccccaacctt 12193604  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  12193605 ctcaacaatctcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttccggcatttcaaagcacgtccaacaccggttacaggattcaccctcaaaaatacatga 12193704  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  12193705 tcaccaac 12193712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12368896 - 12368714
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12368896 catcatgcacatacttcctcaactaagacacatgaaacacatcatgaagatttgacaaagacggtggcaatgtaatccgatacgctacaaccccaacctt 12368797  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcac 199  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  12368796 atcaataacatcaaacggtccaac-aaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacactggtcacaagattcac 12368714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Original strand, 13378655 - 13378812
Alignment:
Q  24 acatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataa 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  13378655 acatacttcctcaattgagacacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacgaaatccgatacactacaaccccaaccgtctcaacaa 13378754  T
Q  124 catcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaac 181  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13378755 catcaaacggtccaacaaaacaaggagtcaacttccgacaattcaaagcacgaccaac 13378812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21674854 - 21674690
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21674854 catcatacacatacttccgcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctgcaaccccaacctt 21674755  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaa 180  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  21674754 ctcaataatctcaaaaggtccaacaaaacgaggagtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaa 21674690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Original strand, 45146505 - 45146673
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  45146505 catcatacacatacttccgcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaatgtaatccgatacgctaaaaccccaacctt 45146604  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacacc 184  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  45146605 ctcaataatctcaaacggtccaacaaaatgaggagtcaactttcgacacttcaaagcacgtccaacacc 45146673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 4439876 - 4440084
Alignment:
Q  15 acatcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacct 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  4439876 acatcatacacatacttcctcaactcagacacatgaaacacatcatgtaaatttgacaaagacggtggtaacgcaatctgatacgctacaactgcaacct 4439975  T
Q  115 tctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatg 213  Q
    |||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  || ||||| || ||||| |||||    
T  4439976 tctcaataatctcaaatggtccaataaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatg 4440075  T
Q  214 atcgccaac 222  Q
    ||| |||||    
T  4440076 atcaccaac 4440084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Original strand, 13353100 - 13353283
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13353100 catcatacacatacttcctcaactgagacacgtgaaacacgtcatgtaagttcaacaaagacggtggtaacgcaatccgatacactacaaccccaacctt 13353199  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcac 199  Q
    ||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  13353200 ctcaataagcttaaatggtccaacaaaacgaggagtcaactttcaacacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagtattcac 13353283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17145572 - 17145408
Alignment:
Q  23 cacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaata 122  Q
    |||||| |||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  17145572 cacatatttcctcaattggaatacatgaaacacatcatgaagatttgacaacgatggcggtaacacaatccgatacgctacaactccaacattctaaata 17145473  T
Q  123 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggt 187  Q
    |  ||||||||||||| |||||  || |||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||    
T  17145472 atctcaaacggtccaataaaacagggtgtcaacttccgacactccaaaacacgtccaacaccggt 17145408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Original strand, 20466738 - 20466922
Alignment:
Q  23 cacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaata 122  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||  | |||||  |||| |||    
T  20466738 cacatacttccgcaattgagacacatgatacacactatgaagattcgacaacgatagtggtaacgcaatctgatatgctactgctccaactctctctata 20466837  T
Q  123 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccctaaaaa 207  Q
    |  ||| | | ||||||||||| ||| || || ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||    
T  20466838 atttcatatgatccaacaaaactaggcgttaatttcatcgacttcaaagcacgaccaacaccggtcacggggttaactctaaaaa 20466922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Original strand, 23641469 - 23641637
Alignment:
Q  17 atcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttc 116  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||||| | || ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23641469 atcatacacatacttcctcaactaagata--tgaaataaatcatgaagattcgacaatgatggcggcaacgcaatccgatacgctacagctccaaccttc 23641566  T
Q  117 tcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggt 187  Q
    || ||||  ||||||||||||| ||||||  | |||||||| | |||||| |||| ||| |||||||||||    
T  23641567 tctataatctcaaacggtccaataaaacgcagtgtcaactttcgacacttaaaagaacgtccaacaccggt 23641637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 702 - 510
Alignment:
Q  15 acatcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacct 114  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  702 acatcatgaacatacttccttaactgagacacatgaaatacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacct 603  T
Q  115 tctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccctaaaaa 207  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  602 tctcaatgacatcaaacgttccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactccaaagcacggccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaa 510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9206 - 9015
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9206 catcatacacatacttcctcaattgagatacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacactacaaccccaacctt 9107  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccctaaaaa 207  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  9106 ctcaataacctcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccggtgacatgattcaccctcaaaa 9015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 14514 - 14721
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14514 catcatacatatacttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 14613  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| || ||||| ||||||    
T  14614 ctcaataacctcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatga 14713  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  14714 tccccaac 14721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4259 - 4052
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  4259 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattctacaaagacggtggcaacgcaatccgacactctacaaccctaacctt 4160  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||    
T  4159 ctcaataacatcaaatggtccaacaaaacgaggagtcaaattcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccaaattcactctcaaaaacacatga 4060  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  4059 tcaccaac 4052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10620 - 10441
Alignment:
Q  20 atgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctca 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  10620 atgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgaatattcgacaaagatggtggtaacgcaattcgatacgctacaaccccaactttctca 10521  T
Q  120 ataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcac 199  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  10520 ataacatcaaatggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcac 10441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 39 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4167 - 3989
Alignment:
Q  39 tgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4167 tgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaatgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaa 4068  T
Q  139 caaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcac-cctaaaaatacatgatc 216  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  4067 ctaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactcttaaaaacacatgatc 3989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 222
Target Start/End: Original strand, 3173 - 3357
Alignment:
Q  39 tgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaa 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3173 tgagacacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagatggtggtaatgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaacgacatcaaacggtccaa 3272  T
Q  139 caaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatgatcgccaac 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  3273 caaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaac 3357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Original strand, 3107 - 3148
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacat 57  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3107 catcatacacatacttcctcaactgagacacatgaaacacat 3148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 78936 - 78737
Alignment:
Q  24 acatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataa 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  78936 acatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagatttgacatagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctctataa 78837  T
Q  124 catcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatgatcgccaac 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  78836 catcaaaccgtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactcctgtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaac 78737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 50 - 222
Target Start/End: Original strand, 5766 - 5939
Alignment:
Q  50 aaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgagga 149  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5766 aaacacatcatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaacaaaacaagga 5865  T
Q  150 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatgatcgccaac 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  5866 gtcgacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaac 5939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 50 - 222
Target Start/End: Original strand, 10380 - 10553
Alignment:
Q  50 aaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgagga 149  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10380 aaacacatcatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaacaaaacaagga 10479  T
Q  150 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatgatcgccaac 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  10480 gtcgacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaac 10553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 50 - 222
Target Start/End: Original strand, 8375 - 8548
Alignment:
Q  50 aaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgagga 149  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8375 aaacacatcatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaacaaaacaagga 8474  T
Q  150 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatgatcgccaac 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  8475 gtcgacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaac 8548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8126 - 7918
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8126 catcatgcacatacttcctcaactaagacccatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggcaacgcaattcggtacgctacaaccccaacctt 8027  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggt-ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatg 213  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  8026 ttcaatcacatcaaacggtaccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatg 7927  T
Q  214 atcgccaac 222  Q
    ||| |||||    
T  7926 atcaccaac 7918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16485 - 16279
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  16485 catcatgcacatacttcctcaactaagacacacgaaacacatcatgaagattcaacaaagacggtggtaacacactccgatacgctacaacccca-cctt 16387  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccc-taaaaatacatga 214  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  16386 ttcaataacatcaaacggtccaataaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacaaacaccggtcacaggattcacccttaaaaacacatga 16287  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  16286 tccccaac 16279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 22692 - 22892
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||||||||||    
T  22692 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacagagatggtggtaatgcaatcc-------tacaaccccaacctt 22784  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatga 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||    
T  22785 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacaaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaacacatga 22884  T
Q  215 tcgccaac 222  Q
    || |||||    
T  22885 tcaccaac 22892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 648 - 481
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  648 catcatacacatacttcctcaactgaaacacatgaaatacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacgaccccaacctt 549  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacac 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  548 ctcaacaacatcaaacggtccaacaaaacggggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacac 481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Original strand, 12899 - 13082
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |    
T  12899 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgaaatccgatacgctacaacacaaaccat 12998  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcac 199  Q
    |||||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12999 ctcaatgacataaaaaggaccaaaaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcac 13082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33301 - 33103
Alignment:
Q  24 acatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataa 123  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  33301 acatacttcctcaactgagacacatgatacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatctgata-gctacaaccccaaccttctcagtta 33203  T
Q  124 catcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatgatcgccaac 222  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  33202 catcaaacaatccaacaaaacgaggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaac 33103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 53 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15014 - 14845
Alignment:
Q  53 cacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtc 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15014 cacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacagtccaac-aaacgaggagtc 14916  T
Q  153 aacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatgatcgccaac 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  14915 aacttcctacacttcaaagcacgaccaacactggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaac 14845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 5475 - 5370
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5475 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 5376  T
Q  116 ctcaat 121  Q
    ||||||    
T  5375 ctcaat 5370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Original strand, 8985 - 9185
Alignment:
Q  23 cacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaata 122  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  8985 cacatacttcctcaactaagacacgtgaaacacatcatgaagattcaacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctctacg 9084  T
Q  123 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccct-aaaaatacatgatcgccaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  9085 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaaattccaacacttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaa 9184  T
Q  222 c 222  Q
    |    
T  9185 c 9185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Original strand, 13242 - 13410
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  13242 catcatacacatacttcctcaactgagatacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacacaatctgatacgctacaaccccaaccct 13341  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacacc 184  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  13342 ctcaacaacatcaaacaacccaacaaaacgaggagtcaacttccgacactttaacgcacgaccaacacc 13410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 199
Target Start/End: Original strand, 6333 - 6484
Alignment:
Q  48 tgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgag 147  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  6333 tgaaacacatcatgaagattcgacaaagacagtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccctctcaacaacatcaaacggcccaacaaaacgtg 6432  T
Q  148 gagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcac 199  Q
    |||| ||||||| |||||| || |||||||||||||| || || ||||||||    
T  6433 gagttaacttccgacactttaacgcacgaccaacaccagttacaggattcac 6484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 177
Target Start/End: Original strand, 14121 - 14282
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14121 catcatacacatacttcttcaactaagacacatgaaacacatcatgaagatttgccaaagactgtggtaacgcaacccgatacgctacaaccccaacctt 14220  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgac 177  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14221 ctcgatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgac 14282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 187
Target Start/End: Original strand, 10655 - 10818
Alignment:
Q  24 acatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataa 123  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  10655 acatacttccgcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacacaatccgatacgctacaactccaaccttctcaacaa 10754  T
Q  124 catcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggt 187  Q
      |||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||    
T  10755 tctcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttctaacacttgaaagcacgtccaacaccggt 10818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 5319 - 5189
Alignment:
Q  39 tgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaa 138  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  5319 tgagaaacatgaaacacatcatgaagattctacaaagacggtggtaacgcaatccgatacactacaaccccaaccttctcaataacatcaaatggcccaa 5220  T
Q  139 caaaacgaggagtcaacttcctacacttcaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5219 caaaacgaggagtcaacttcctacacttcaa 5189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Original strand, 13952 - 14118
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 115  Q
    |||||| |||||||| || ||| |  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13952 catcatacacatactgccgcaactaggacaca-gaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatctgatacgctataaccccaacctt 14050  T
Q  116 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacac 183  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  14051 ttcaataatctcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaactttcgacacttcaaagcacgtccaacac 14118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 108
Target Start/End: Original strand, 1177 - 1269
Alignment:
Q  16 catcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccc 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1177 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccc 1269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 370446 - 370264
Alignment:
Q  24 acatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataa 123  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  370446 acatacttctgcaactgagacaaatgaaacacatcatgaagattcgacaatgacgg-ggtaacacaatccaatacgctacaactccaaccttatcaacaa 370348  T
Q  124 catcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcaccctaaaaa 207  Q
      ||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| || | |||||| |||||||    
T  370347 tctcaaatggtccaacaaaacgcggtgtcaacttccaacacttcaaagctcatccaacaccggttacagaattcactctaaaaa 370264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 199
Target Start/End: Original strand, 73891 - 74074
Alignment:
Q  15 acatcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacct 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| ||  |   ||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  73891 acatcatacacatacttcctcaactgagacacat-aaacacatcatgaagattctgcaacgacagcaataacgcaatccgatatgctacatctccaacct 73989  T
Q  115 tctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccggattcac 199  Q
    | | |   |  |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  73990 tataacctatctcaaacggtccaacaaaacgtggtgtcaacttccaacacttcaaagcacgtccaacaccggttacaggattcac 74074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 190
Target Start/End: Original strand, 7274 - 7333
Alignment:
Q  131 cggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcac 190  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7274 cggtccaacaaaacggggagtcaacttcctacgcttcagagcacgaccaacaccggtcac 7333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 91
Target Start/End: Original strand, 78339 - 78415
Alignment:
Q  15 acatcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaat 91  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  78339 acatcatacacgtacttccgcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcgacaacgacggcggtaacgcaat 78415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1068 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1068
Description:

Target: scaffold1068; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 1081 - 1001
Alignment:
Q  17 atcatgcacatacttcctcaagtgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgata 97  Q
    ||||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  1081 atcatacacatacttatgcaattgagacacatgaaacacattatgcaggttcgacaacgtcggtggtaacgcaattcgata 1001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University