View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10481A_low_555 (Length: 230)

Name: NF10481A_low_555
Description: NF10481A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10481A_low_555
NF10481A_low_555
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (1-229)||(5005638-5005866)
chr4 (1-229)||(27163592-27163820)
chr4 (1-229)||(30753510-30753738)
chr4 (1-229)||(21969469-21969697)
chr4 (1-229)||(24592586-24592814)
chr4 (1-229)||(6569621-6569849)
chr4 (1-229)||(18800897-18801125)
chr4 (1-229)||(17013768-17013996)
chr4 (1-229)||(33674085-33674313)
chr4 (1-229)||(14098309-14098537)
chr4 (1-229)||(14664786-14665014)
chr4 (1-229)||(31126793-31127021)
chr4 (1-229)||(39850391-39850619)
chr4 (1-229)||(40105913-40106141)
chr4 (23-229)||(54833158-54833364)
chr4 (56-229)||(19373029-19373202)
chr4 (37-229)||(14763615-14763807)
chr4 (37-229)||(36344823-36345015)
chr4 (37-226)||(1900031-1900220)
chr4 (37-226)||(15227644-15227833)
chr4 (37-226)||(15285236-15285425)
chr4 (37-173)||(24112489-24112625)
chr4 (37-173)||(34189268-34189404)
chr4 (11-226)||(14235810-14236025)
chr4 (37-112)||(24460913-24460988)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (1-229)||(28116273-28116501)
chr3 (1-229)||(7072926-7073154)
chr3 (1-229)||(4796969-4797197)
chr3 (1-229)||(7996276-7996504)
chr3 (1-229)||(10642784-10643012)
chr3 (1-229)||(4721345-4721573)
chr3 (1-229)||(11110677-11110905)
chr3 (1-229)||(35880480-35880708)
chr3 (1-229)||(17985272-17985500)
chr3 (1-229)||(6192030-6192258)
chr3 (1-229)||(21674407-21674635)
chr3 (1-229)||(29665301-29665529)
chr3 (1-229)||(36997405-36997633)
chr3 (1-229)||(20577178-20577406)
chr3 (1-229)||(28339016-28339244)
chr3 (1-229)||(31964789-31965017)
chr3 (1-229)||(47023167-47023395)
chr3 (1-229)||(50134387-50134615)
chr3 (1-229)||(5609638-5609866)
chr3 (1-229)||(6542790-6543018)
chr3 (1-229)||(18050976-18051204)
chr3 (1-229)||(51781725-51781953)
chr3 (1-229)||(51796814-51797042)
chr3 (1-229)||(18242441-18242669)
chr3 (1-229)||(18330388-18330611)
chr3 (1-229)||(48465629-48465857)
chr3 (6-229)||(8295689-8295912)
chr3 (23-229)||(15741420-15741626)
chr3 (1-229)||(4416630-4416858)
chr3 (1-229)||(5013426-5013654)
chr3 (1-229)||(22871190-22871418)
chr3 (1-229)||(22886249-22886477)
chr3 (1-229)||(24327873-24328101)
chr3 (1-229)||(29149071-29149299)
chr3 (37-229)||(10395850-10396042)
chr3 (1-229)||(15893022-15893250)
chr3 (1-229)||(18224905-18225133)
chr3 (1-229)||(8301580-8301808)
chr3 (37-230)||(20065759-20065952)
chr3 (37-229)||(5466699-5466891)
chr3 (37-229)||(5596718-5596910)
chr3 (37-229)||(8211455-8211647)
chr3 (37-229)||(4347036-4347228)
chr3 (37-229)||(18277404-18277596)
chr3 (37-229)||(18292705-18292897)
chr3 (37-229)||(18308006-18308198)
chr3 (37-229)||(28020992-28021184)
chr3 (1-112)||(5713058-5713169)
chr3 (1-112)||(5723968-5724079)
chr3 (1-112)||(5757398-5757509)
chr3 (1-112)||(5768289-5768400)
chr3 (37-226)||(18530114-18530303)
chr3 (37-219)||(16626855-16627037)
chr3 (37-173)||(4892983-4893119)
chr3 (37-177)||(22387927-22388067)
chr3 (37-173)||(32438927-32439063)
chr3 (37-112)||(4625778-4625853)
chr3 (37-112)||(17994133-17994208)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (1-230)||(19674190-19674419)
chr8 (1-229)||(3329753-3329981)
chr8 (1-229)||(16277307-16277535)
chr8 (1-229)||(19518377-19518605)
chr8 (1-229)||(2137493-2137721)
chr8 (1-229)||(27609139-27609367)
chr8 (1-229)||(29829066-29829294)
chr8 (1-229)||(14557380-14557608)
chr8 (1-229)||(28362189-28362417)
chr8 (1-229)||(19208594-19208822)
chr8 (1-229)||(19687851-19688079)
chr8 (1-229)||(33258476-33258704)
chr8 (1-229)||(18710339-18710567)
chr8 (1-229)||(31489984-31490212)
chr8 (1-229)||(12092967-12093195)
chr8 (1-229)||(16283202-16283430)
chr8 (37-229)||(31354277-31354469)
chr8 (23-229)||(19286218-19286424)
chr8 (37-226)||(22081142-22081331)
chr8 (37-158)||(19659306-19659427)
chr8 (37-158)||(44562928-44563049)
chr8 (37-112)||(9354495-9354570)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (1-229)||(11635453-11635681)
chr2 (1-229)||(11641642-11641870)
chr2 (1-229)||(34279198-34279426)
chr2 (1-229)||(13936808-13937036)
chr2 (1-229)||(32049547-32049775)
chr2 (1-229)||(12716869-12717097)
chr2 (1-229)||(21677446-21677674)
chr2 (1-229)||(261029-261257)
chr2 (1-229)||(23128830-23129058)
chr2 (1-229)||(28881963-28882191)
chr2 (1-229)||(40233248-40233476)
chr2 (1-229)||(16829602-16829830)
chr2 (1-229)||(16891651-16891879)
chr2 (1-229)||(22926292-22926520)
chr2 (1-229)||(37925242-37925470)
chr2 (1-229)||(12586550-12586778)
chr2 (1-229)||(27803441-27803669)
chr2 (1-229)||(34286103-34286331)
chr2 (1-229)||(34291163-34291391)
chr2 (1-229)||(39889811-39890039)
chr2 (1-229)||(27776956-27777184)
chr2 (1-229)||(27816723-27816951)
chr2 (1-229)||(9350258-9350486)
chr2 (1-229)||(12655291-12655519)
chr2 (1-229)||(31876030-31876258)
chr2 (1-229)||(34861429-34861657)
chr2 (1-229)||(37686173-37686401)
chr2 (1-229)||(37701438-37701666)
chr2 (1-229)||(19416763-19416991)
chr2 (1-229)||(20837667-20837895)
chr2 (1-229)||(39052092-39052320)
chr2 (1-229)||(27434708-27434936)
chr2 (37-229)||(37374910-37375102)
chr2 (37-226)||(21703461-21703650)
chr2 (37-226)||(19456718-19456907)
chr2 (37-158)||(31891625-31891746)
chr2 (37-112)||(3784523-3784598)
chr2 (37-112)||(27118557-27118632)
chr2 (11-226)||(27392745-27392960)
chr2 (37-112)||(34156880-34156955)
chr2 (37-112)||(34303600-34303675)
chr2 (37-112)||(16163468-16163543)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (1-229)||(16736621-16736849)
chr7 (1-229)||(16751675-16751903)
chr7 (1-229)||(17523286-17523514)
chr7 (1-229)||(17529701-17529929)
chr7 (1-229)||(5127746-5127974)
chr7 (1-229)||(11441314-11441542)
chr7 (1-229)||(45387097-45387325)
chr7 (1-229)||(2154327-2154555)
chr7 (5-229)||(5147505-5147729)
chr7 (1-229)||(11424937-11425165)
chr7 (1-229)||(31564560-31564788)
chr7 (1-229)||(26435011-26435239)
chr7 (1-229)||(26485905-26486133)
chr7 (1-229)||(26538034-26538262)
chr7 (1-229)||(31124665-31124893)
chr7 (1-229)||(3445048-3445276)
chr7 (1-229)||(10917026-10917254)
chr7 (1-229)||(24592702-24592930)
chr7 (1-229)||(26275255-26275483)
chr7 (1-229)||(26320030-26320258)
chr7 (1-229)||(26670075-26670303)
chr7 (1-229)||(9618405-9618633)
chr7 (1-229)||(16503541-16503769)
chr7 (1-229)||(16518577-16518805)
chr7 (37-229)||(4145320-4145512)
chr7 (42-226)||(16041083-16041267)
chr7 (44-226)||(16450199-16450381)
chr7 (37-177)||(5159328-5159468)
chr7 (37-112)||(31088658-31088733)
chr7 (37-112)||(45733334-45733409)
chr7 (180-215)||(22143423-22143458)
[»] chr6 (39 HSPs)
chr6 (1-229)||(26918130-26918358)
chr6 (1-229)||(26999823-27000051)
chr6 (1-229)||(3695813-3696041)
chr6 (1-229)||(16749604-16749832)
chr6 (1-229)||(26988751-26988979)
chr6 (1-229)||(30558234-30558462)
chr6 (6-229)||(15424540-15424763)
chr6 (1-229)||(4772747-4772975)
chr6 (1-229)||(27360228-27360456)
chr6 (1-229)||(27450571-27450799)
chr6 (1-229)||(34463579-34463807)
chr6 (1-229)||(4546002-4546230)
chr6 (1-229)||(4724361-4724589)
chr6 (1-229)||(13299169-13299397)
chr6 (1-229)||(27007462-27007690)
chr6 (1-229)||(27484867-27485095)
chr6 (1-229)||(28207192-28207420)
chr6 (1-229)||(4757511-4757739)
chr6 (1-229)||(16673877-16674105)
chr6 (1-229)||(17025012-17025240)
chr6 (9-229)||(24304844-24305064)
chr6 (1-229)||(24863467-24863695)
chr6 (1-229)||(29572763-29572991)
chr6 (1-229)||(16944245-16944473)
chr6 (1-229)||(26116637-26116865)
chr6 (1-229)||(26777845-26778073)
chr6 (1-229)||(22935095-22935323)
chr6 (1-229)||(23857540-23857768)
chr6 (37-229)||(27044140-27044332)
chr6 (37-229)||(29501156-29501348)
chr6 (37-230)||(29549227-29549420)
chr6 (37-229)||(4525039-4525231)
chr6 (1-183)||(22477491-22477673)
chr6 (37-112)||(13522324-13522399)
chr6 (37-112)||(20160571-20160646)
chr6 (37-112)||(22172185-22172260)
chr6 (37-112)||(28162527-28162602)
chr6 (37-112)||(33374507-33374582)
chr6 (37-112)||(8892561-8892636)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-229)||(405-633)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (1-229)||(33777249-33777477)
chr5 (1-229)||(41674471-41674699)
chr5 (5-229)||(9548719-9548943)
chr5 (1-229)||(18500920-18501148)
chr5 (1-229)||(23718160-23718388)
chr5 (1-229)||(23752622-23752850)
chr5 (1-229)||(24681199-24681427)
chr5 (1-229)||(24723726-24723954)
chr5 (1-229)||(31431190-31431418)
chr5 (1-229)||(8665647-8665875)
chr5 (1-229)||(15658932-15659160)
chr5 (1-229)||(37358827-37359055)
chr5 (1-229)||(37671664-37671892)
chr5 (1-229)||(11549116-11549344)
chr5 (1-229)||(22999286-22999514)
chr5 (1-229)||(30168231-30168459)
chr5 (1-229)||(33516118-33516346)
chr5 (1-229)||(43078011-43078239)
chr5 (1-229)||(3789288-3789516)
chr5 (1-229)||(13325016-13325244)
chr5 (1-229)||(18375584-18375812)
chr5 (1-229)||(28648988-28649216)
chr5 (1-229)||(31826591-31826819)
chr5 (1-229)||(5637672-5637900)
chr5 (1-229)||(6874064-6874292)
chr5 (1-229)||(9317213-9317441)
chr5 (1-229)||(24688329-24688557)
chr5 (1-229)||(12131917-12132145)
chr5 (1-229)||(26480154-26480382)
chr5 (1-229)||(30151780-30152008)
chr5 (1-229)||(30934398-30934626)
chr5 (1-229)||(37754730-37754958)
chr5 (1-229)||(2510813-2511041)
chr5 (1-229)||(29967238-29967466)
chr5 (1-229)||(30029177-30029405)
chr5 (1-229)||(15759029-15759257)
chr5 (1-229)||(37771171-37771399)
chr5 (1-229)||(28959970-28960198)
chr5 (1-229)||(40473724-40473952)
chr5 (37-229)||(32599677-32599869)
chr5 (37-229)||(34616283-34616475)
chr5 (37-226)||(23891971-23892160)
chr5 (1-145)||(24969870-24970014)
chr5 (46-226)||(25198797-25198977)
chr5 (150-229)||(24951872-24951951)
chr5 (37-177)||(22888287-22888427)
chr5 (37-173)||(33292346-33292482)
chr5 (37-112)||(13184853-13184928)
chr5 (37-112)||(13440699-13440774)
chr5 (37-112)||(33877129-33877204)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (1-229)||(41793583-41793811)
chr1 (1-229)||(10962422-10962650)
chr1 (1-229)||(51637970-51638198)
chr1 (1-229)||(28584733-28584961)
chr1 (37-226)||(20460863-20461052)
chr1 (37-112)||(20340643-20340718)
chr1 (162-226)||(16208461-16208525)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-229)||(9341-9569)
scaffold0159 (1-191)||(19806-19996)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-229)||(27045-27273)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-229)||(15205-15433)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-229)||(30206-30434)
scaffold0124 (37-226)||(20168-20357)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-229)||(47260-47488)
scaffold0089 (1-229)||(40344-40572)
scaffold0089 (1-229)||(29516-29744)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-229)||(7690-7918)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (1-229)||(7514-7742)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-229)||(26477-26705)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-229)||(5742-5972)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (1-197)||(8-204)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (37-229)||(7985-8177)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (11-226)||(21323-21538)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (37-112)||(2966-3041)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (150-229)||(48572-48656)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5005866 - 5005638
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  5005866 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaa 5005767  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5005766 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctcccgctgacacc 5005667  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5005666 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 5005638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 27163592 - 27163820
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  27163592 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaa 27163691  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  27163692 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacc 27163791  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27163792 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 27163820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30753738 - 30753510
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  30753738 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaa 30753639  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  30753638 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacatc 30753539  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30753538 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 30753510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21969697 - 21969469
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  21969697 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggcgggaagaa 21969598  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  21969597 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 21969498  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21969497 atccccacttccgtttcttttttcttgtg 21969469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 24592586 - 24592814
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24592586 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 24592685  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24592686 aggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 24592785  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24592786 atccctatttccgtttctttcttcttgtg 24592814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6569849 - 6569621
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  6569849 gaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaa 6569750  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  6569749 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacacc 6569650  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6569649 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 6569621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 18800897 - 18801125
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  18800897 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaa 18800996  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  18800997 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacacc 18801096  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18801097 atccccacttctgtttctttcttcttgtg 18801125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17013996 - 17013768
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17013996 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 17013897  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  17013896 aggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgaaggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggctgacacc 17013797  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17013796 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 17013768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 33674085 - 33674313
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  33674085 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaatggtgggaagaa 33674184  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  33674185 cggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacc 33674284  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33674285 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 33674313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14098537 - 14098309
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  14098537 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 14098438  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  14098437 cggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 14098338  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098337 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 14098309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14665014 - 14664786
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14665014 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 14664915  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||    
T  14664914 aggatgctgagaatacggtgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacacc 14664815  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14664814 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 14664786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 31126793 - 31127021
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  31126793 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 31126892  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  31126893 cggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacc 31126992  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31126993 atccccacttcagtttctttcttcttgtg 31127021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39850619 - 39850391
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||    
T  39850619 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaa 39850520  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  39850519 cggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 39850420  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  39850419 attcccacttccgtttctttcttcttgtg 39850391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 40105913 - 40106141
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  40105913 gaaccggcatctgctgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 40106012  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  40106013 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 40106112  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40106113 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 40106141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 54833364 - 54833158
Alignment:
Q  23 ctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcata 122  Q
    |||||| |||||  ||||||| || || |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  54833364 ctgttgagcaatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 54833265  T
Q  123 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttct 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54833264 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttct 54833165  T
Q  223 tcttgtg 229  Q
    |||||||    
T  54833164 tcttgtg 54833158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19373202 - 19373029
Alignment:
Q  56 ttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattg 155  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19373202 ttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattg 19373103  T
Q  156 atgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    || ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19373102 ataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 19373029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Original strand, 14763615 - 14763807
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14763615 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacgg 14763714  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14763715 aggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 14763807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Original strand, 36344823 - 36345015
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  36344823 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacgg 36344922  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36344923 aggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 36345015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1900220 - 1900031
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||| |||||    
T  1900220 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacgg 1900121  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 226  Q
    ||| |  || || ||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1900120 aggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 1900031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15227833 - 15227644
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||    
T  15227833 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 15227734  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 226  Q
    ||| |  || || ||||| || || ||||| |||||||||| |||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15227733 aggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 15227644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Original strand, 15285236 - 15285425
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||  ||  |||||||||  | ||    
T  15285236 cattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatatgggtacaatgg 15285335  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 226  Q
    ||| |  || || ||||| || || ||||| |||||||||| |||||| ||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15285336 aggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccatacttctgtttctttcttctt 15285425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 24112625 - 24112489
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||| ||||| |||||    
T  24112625 cattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgg 24112526  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcc 173  Q
     || |  ||||| |||||||  |||||||| ||||||    
T  24112525 gggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagcc 24112489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 173
Target Start/End: Original strand, 34189268 - 34189404
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||| ||||| |||||    
T  34189268 cattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgg 34189367  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcc 173  Q
     || |  ||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  34189368 gggaaactgagcagcattgataggagcgacagtagcc 34189404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 14235810 - 14236025
Alignment:
Q  11 ctgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctga 110  Q
    |||||||| ||| || || |||||  |||| |||||||| |  || ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  14235810 ctgttgttgcatttgctgagcaatggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagagggtactgatgatagaatggtgggaagaaaggatgctga 14235909  T
Q  111 gaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccactt 210  Q
    || ||  |||||||  |||| | | |||| |  ||||| ||||| || || | ||| || ||||||| ||||| || ||| || || |||||||| ||||    
T  14235910 gagtattgcatatactggtacggcagaggtaactgagcagcattaataggggtaacagtggccatggattgactggttccggcagataccatccctactt 14236009  T
Q  211 ccgtttctttcttctt 226  Q
    | || |||||||||||    
T  14236010 ctgtctctttcttctt 14236025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Original strand, 24460913 - 24460988
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgaga 112  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  24460913 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 24460988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 28116273 - 28116501
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  28116273 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaa 28116372  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28116373 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacacc 28116472  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28116473 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 28116501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7073154 - 7072926
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  7073154 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaa 7073055  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  7073054 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgactggctccagctgacacc 7072955  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7072954 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 7072926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 4796969 - 4797197
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4796969 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 4797068  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4797069 aggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 4797168  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4797169 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 4797197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7996504 - 7996276
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  7996504 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaa 7996405  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  7996404 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 7996305  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7996304 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 7996276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10643012 - 10642784
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  10643012 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaa 10642913  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  10642912 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 10642813  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10642812 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 10642784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4721573 - 4721345
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4721573 gaactggcaactgttgttttatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 4721474  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4721473 aagatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 4721374  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4721373 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 4721345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 11110677 - 11110905
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  11110677 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 11110776  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11110777 aggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacacc 11110876  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11110877 atccccacttccgtttccttcttcttgtg 11110905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35880708 - 35880480
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  35880708 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 35880609  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  35880608 aggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 35880509  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35880508 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 35880480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 17985272 - 17985500
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  17985272 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 17985371  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17985372 cggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacacc 17985471  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17985472 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 17985500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6192258 - 6192030
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||    
T  6192258 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactaatgataaaatggcgaaaagaa 6192159  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  6192158 aggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccaactgacacc 6192059  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6192058 atccatacttccgtttctttcttcttgtg 6192030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21674635 - 21674407
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  21674635 gaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgatgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaatggcggaaagaa 21674536  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21674535 cggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagccacggtagccatgggttgaccggctccagctgacacc 21674436  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21674435 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 21674407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 29665301 - 29665529
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  29665301 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 29665400  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  29665401 cggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacc 29665500  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29665501 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 29665529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 36997405 - 36997633
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  36997405 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggttggccgggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 36997504  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  36997505 aggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacc 36997604  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36997605 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 36997633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 20577178 - 20577406
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||    
T  20577178 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaa 20577277  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  20577278 aggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 20577377  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20577378 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 20577406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28339244 - 28339016
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  28339244 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 28339145  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28339144 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacacc 28339045  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28339044 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 28339016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 31964789 - 31965017
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  31964789 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 31964888  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31964889 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacacc 31964988  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31964989 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 31965017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 47023395 - 47023167
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  47023395 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 47023296  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  47023295 aggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 47023196  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47023195 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 47023167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 50134387 - 50134615
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  50134387 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 50134486  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50134487 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacacc 50134586  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50134587 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 50134615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 5609638 - 5609866
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  5609638 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 5609737  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5609738 cggatgctgagaatacgtcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacacc 5609837  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5609838 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 5609866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 6542790 - 6543018
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  6542790 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 6542889  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  6542890 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 6542989  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6542990 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 6543018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18051204 - 18050976
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  18051204 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaa 18051105  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18051104 aggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 18051005  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18051004 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 18050976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 51781953 - 51781725
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||    
T  51781953 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaa 51781854  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  51781853 cggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacc 51781754  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51781753 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 51781725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 51797042 - 51796814
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||    
T  51797042 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaa 51796943  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  51796942 cggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacc 51796843  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51796842 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 51796814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18242669 - 18242441
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| || ||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  18242669 gaaccggcaactgttgtttcatctgctgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagagtactgatgataaaacggtgggaagaa 18242570  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  18242569 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccggctgacacc 18242470  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18242469 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 18242441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18330611 - 18330388
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||  |||||||    
T  18330611 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg-----atgataaaatggtggaaagaa 18330517  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18330516 aggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 18330417  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18330416 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 18330388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48465857 - 48465629
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||  | |||||    
T  48465857 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcggggggtactgatggtaaaacggtgggaagaa 48465758  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  48465757 cggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacacc 48465658  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  48465657 attcccacttccgtttctttcttcttgtg 48465629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8295912 - 8295689
Alignment:
Q  6 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8295912 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 8295813  T
Q  106 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccc 205  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  8295812 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccc 8295713  T
Q  206 cacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  8295712 tacttccgtttctttcttcttgtg 8295689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Original strand, 15741420 - 15741626
Alignment:
Q  23 ctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcata 122  Q
    |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15741420 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 15741519  T
Q  123 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttct 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15741520 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 15741619  T
Q  223 tcttgtg 229  Q
    |||||||    
T  15741620 tcttgtg 15741626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4416858 - 4416630
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||  ||||||||||| ||  | |||||    
T  4416858 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtgctgatgataaaacggtgggaagaa 4416759  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||||    
T  4416758 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacc 4416659  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4416658 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 4416630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5013654 - 5013426
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  5013654 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 5013555  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  5013554 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacc 5013455  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5013454 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 5013426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 22871190 - 22871418
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  22871190 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 22871289  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  22871290 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacacc 22871389  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22871390 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 22871418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 22886249 - 22886477
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  22886249 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 22886348  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  22886349 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacacc 22886448  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22886449 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 22886477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24328101 - 24327873
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  24328101 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 24328002  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||    
T  24328001 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacc 24327902  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24327901 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 24327873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 29149071 - 29149299
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  29149071 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 29149170  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  29149171 aggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 29149270  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29149271 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 29149299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10396042 - 10395850
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10396042 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacgg 10395943  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10395942 aggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 10395850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 15893022 - 15893250
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  15893022 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaa 15893121  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  15893122 aggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacacc 15893221  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15893222 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 15893250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18225133 - 18224905
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  18225133 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 18225034  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  18225033 cggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacc 18224934  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18224933 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 18224905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 8301580 - 8301808
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  8301580 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaa 8301679  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  8301680 aggatgctgagaatacggcgcatatgagtacgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacaatagccatggattgaccggctccggcagacacc 8301779  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8301780 atccatacttccgtttctttcttcttgtg 8301808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20065952 - 20065759
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20065952 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacgg 20065853  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtga 230  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20065852 aggcatttgggctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtatctttcttcttgtga 20065759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5466891 - 5466699
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5466891 cattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 5466792  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5466791 aggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 5466699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Original strand, 5596718 - 5596910
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5596718 cattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacgg 5596817  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5596818 aggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 5596910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8211647 - 8211455
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  8211647 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacgg 8211548  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8211547 aggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 8211455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Original strand, 4347036 - 4347228
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4347036 cattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatacatgggtatgacgg 4347135  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4347136 aggcatttgggctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 4347228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Original strand, 18277404 - 18277596
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18277404 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacgg 18277503  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18277504 aggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 18277596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Original strand, 18292705 - 18292897
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18292705 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacgg 18292804  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18292805 aggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 18292897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Original strand, 18308006 - 18308198
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18308006 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacgg 18308105  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18308106 aggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 18308198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28021184 - 28020992
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28021184 cattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 28021085  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28021084 aggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtg 28020992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 5713169 - 5713058
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||    
T  5713169 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaa 5713070  T
Q  101 aggatgctgaga 112  Q
     |||||||||||    
T  5713069 gggatgctgaga 5713058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 5724079 - 5723968
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||    
T  5724079 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaa 5723980  T
Q  101 aggatgctgaga 112  Q
     |||||||||||    
T  5723979 gggatgctgaga 5723968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 5757398 - 5757509
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||    
T  5757398 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaa 5757497  T
Q  101 aggatgctgaga 112  Q
     |||||||||||    
T  5757498 gggatgctgaga 5757509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 5768289 - 5768400
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||    
T  5768289 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaa 5768388  T
Q  101 aggatgctgaga 112  Q
     |||||||||||    
T  5768389 gggatgctgaga 5768400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18530303 - 18530114
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| || ||    
T  18530303 cattaacgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgatgg 18530204  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 226  Q
    ||| |  || || ||||| || || | ||| |||||||||| |||||  | ||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18530203 aggtaactgggcagcattaataggggtaacagtagccatggattgactagttccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 18530114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Original strand, 16626855 - 16627037
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| || |||||||| || ||  ||||||| ||||||||||| ||  |   ||| ||||| |||||    
T  16626855 cattaacgggtaccggaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgtgcatacgggtacgacgg 16626954  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctt 219  Q
    ||| |  || || ||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  16626955 aggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 16627037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4893119 - 4892983
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||| ||||| |||||    
T  4893119 cattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgg 4893020  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcc 173  Q
     || |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  4893019 gggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagcc 4892983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 22387927 - 22388067
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |   | ||||| ||||||||||| || ||   ||| ||||| |||||    
T  22387927 cattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgcataagggtaggacgg 22388026  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgg 177  Q
     || |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22388027 gggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatgg 22388067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 32439063 - 32438927
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||| ||||| |||||    
T  32439063 cattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgg 32438964  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcc 173  Q
     || |  ||||| |||||||  |||||||| ||||||    
T  32438963 gggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagcc 32438927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 4625853 - 4625778
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgaga 112  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  4625853 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgaga 4625778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Original strand, 17994133 - 17994208
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgaga 112  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  17994133 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 17994208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19674419 - 19674190
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19674419 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaa 19674320  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  19674319 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgactggctccagctgacacc 19674220  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtga 230  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19674219 atccccacgtccgtttctttcttcttgtga 19674190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 3329753 - 3329981
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  3329753 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 3329852  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  3329853 tggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacgatagccatggattgaccggctccagctgacacc 3329952  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3329953 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 3329981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16277535 - 16277307
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16277535 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 16277436  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16277435 aggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 16277336  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16277335 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 16277307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 19518377 - 19518605
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  19518377 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaa 19518476  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||||    
T  19518477 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacc 19518576  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19518577 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 19518605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 2137493 - 2137721
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  2137493 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgacggaaagaa 2137592  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  2137593 aggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 2137692  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2137693 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 2137721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 27609139 - 27609367
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27609139 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 27609238  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27609239 aggatgctgagaatacgacacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 27609338  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27609339 atccctatttccgtttctttcttcttgtg 27609367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29829294 - 29829066
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  29829294 gaaccgacaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 29829195  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  29829194 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacc 29829095  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29829094 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 29829066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14557608 - 14557380
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14557608 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 14557509  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14557508 gggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 14557409  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14557408 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 14557380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 28362189 - 28362417
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  28362189 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 28362288  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  28362289 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgatacc 28362388  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28362389 atccccacttcagtttctttcttcttgtg 28362417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 19208594 - 19208822
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  19208594 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 19208693  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  19208694 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 19208793  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19208794 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 19208822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19688079 - 19687851
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  19688079 gaaccgacaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactggtgatagaatggcggaaagaa 19687980  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19687979 aggatgctgggaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacacc 19687880  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19687879 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 19687851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33258704 - 33258476
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  33258704 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 33258605  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||    
T  33258604 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacc 33258505  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33258504 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 33258476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18710567 - 18710339
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  18710567 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 18710468  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  18710467 cggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacc 18710368  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18710367 attcccacttccgtttctttcttcttgtg 18710339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 31489984 - 31490212
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  31489984 gaaccggcatctgctgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 31490083  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  31490084 cggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 31490183  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31490184 atccccacttcagtttctttcttcttgtg 31490212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 12092967 - 12093195
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  12092967 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 12093066  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| | ||| |||||| | |||||||||    
T  12093067 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcacttgagctgcattgataggagcaatagtagccatagattggccggctgcagctgacacc 12093166  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  12093167 attcccacttccgtttctttcttcttgtg 12093195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16283430 - 16283202
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||||||| ||||||| ||| || | |||||| |||||| |||||||    
T  16283430 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaa 16283331  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  16283330 aggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacacc 16283231  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16283230 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 16283202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31354469 - 31354277
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31354469 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 31354370  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31354369 aggcatttgggctgcattgataggagcaacggtggccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 31354277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19286424 - 19286218
Alignment:
Q  23 ctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcata 122  Q
    |||||| |||||  ||||||| || || |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  19286424 ctgttgagcaatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 19286325  T
Q  123 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttct 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19286324 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttct 19286225  T
Q  223 tcttgtg 229  Q
    |||||||    
T  19286224 tcttgtg 19286218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Original strand, 22081142 - 22081331
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |   | || || || |||||||||||  | ||||||||||||||||| ||  |||| ||  | || | |||    
T  22081142 cattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcgg 22081241  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 226  Q
    ||| |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| || ||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  22081242 aggtagctgagcagcattgatgggggcaacagtagccatggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctttcttctt 22081331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 158
Target Start/End: Original strand, 19659306 - 19659427
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||    
T  19659306 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 19659405  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatg 158  Q
    ||| |  ||||| |||||||||    
T  19659406 aggtagctgagcagcattgatg 19659427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 44563049 - 44562928
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||    
T  44563049 cattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 44562950  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatg 158  Q
    ||| |  ||||| |||||||||    
T  44562949 aggtagctgagcagcattgatg 44562928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 9354570 - 9354495
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgaga 112  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  9354570 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 9354495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 11635453 - 11635681
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  11635453 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaa 11635552  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11635553 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacacc 11635652  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11635653 atccccacttccgcttctttcttcttgtg 11635681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 11641642 - 11641870
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  11641642 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaa 11641741  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11641742 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacacc 11641841  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11641842 atccccacttccgcttctttcttcttgtg 11641870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34279426 - 34279198
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  34279426 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaa 34279327  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34279326 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcccgctgacacc 34279227  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279226 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 34279198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 13936808 - 13937036
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  13936808 gaaccggcagctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaa 13936907  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13936908 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 13937007  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13937008 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 13937036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32049775 - 32049547
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  32049775 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaa 32049676  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  32049675 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 32049576  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32049575 atccccacttccgtttcttttttcttgtg 32049547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 12716869 - 12717097
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  12716869 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaa 12716968  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12716969 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 12717068  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12717069 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 12717097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 21677446 - 21677674
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21677446 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 21677545  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  21677546 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacc 21677645  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21677646 atccccacttcagtttctttcttcttgtg 21677674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 261029 - 261257
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  261029 gaactggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 261128  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  261129 aggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 261228  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  261229 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 261257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 23128830 - 23129058
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23128830 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 23128929  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23128930 aggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 23129029  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23129030 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 23129058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28882191 - 28881963
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28882191 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 28882092  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28882091 aggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 28881992  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  28881991 atccctatttccgtttctttcttcttgtg 28881963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40233476 - 40233248
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||    
T  40233476 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaa 40233377  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  40233376 cggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacc 40233277  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40233276 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 40233248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16829602 - 16829830
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  16829602 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 16829701  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16829702 cggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacacc 16829801  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16829802 atccccacttcagtttctttcttcttgtg 16829830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16891879 - 16891651
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  16891879 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 16891780  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16891779 cggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacacc 16891680  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16891679 atccccacttcagtttctttcttcttgtg 16891651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 22926292 - 22926520
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  22926292 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 22926391  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22926392 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacacc 22926491  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22926492 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 22926520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37925470 - 37925242
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  37925470 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 37925371  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  37925370 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 37925271  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37925270 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 37925242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12586778 - 12586550
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||    
T  12586778 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaa 12586679  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12586678 aggatgctgagaatacggcatgtatggatatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggctccagctgacacc 12586579  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12586578 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 12586550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27803669 - 27803441
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||    
T  27803669 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaa 27803570  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||||    
T  27803569 aggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacc 27803470  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27803469 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 27803441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34286331 - 34286103
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  34286331 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaa 34286232  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  34286231 aggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacacc 34286132  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34286131 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 34286103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34291391 - 34291163
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  34291391 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaa 34291292  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  34291291 aggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacacc 34291192  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34291191 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 34291163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39890039 - 39889811
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  39890039 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 39889940  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  39889939 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacc 39889840  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39889839 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 39889811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27777184 - 27776956
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||    
T  27777184 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacctggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaa 27777085  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||||    
T  27777084 aggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacc 27776985  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27776984 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 27776956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27816951 - 27816723
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||    
T  27816951 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacctggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaa 27816852  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||||    
T  27816851 aggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacc 27816752  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27816751 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 27816723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 9350258 - 9350486
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||    
T  9350258 gaaccggcagctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtagcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaa 9350357  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||||    
T  9350358 aggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacc 9350457  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9350458 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 9350486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12655519 - 12655291
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12655519 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaa 12655420  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  12655419 aggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacacc 12655320  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    || || |||||||||||||||||||||||    
T  12655319 attcctacttccgtttctttcttcttgtg 12655291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31876258 - 31876030
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  31876258 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 31876159  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  31876158 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 31876059  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31876058 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 31876030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34861657 - 34861429
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  34861657 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 34861558  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  34861557 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 34861458  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34861457 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 34861429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 37686173 - 37686401
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  37686173 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 37686272  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  37686273 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 37686372  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37686373 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 37686401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 37701438 - 37701666
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  37701438 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 37701537  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  37701538 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 37701637  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37701638 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 37701666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 19416763 - 19416991
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  19416763 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 19416862  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||    
T  19416863 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacc 19416962  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19416963 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 19416991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20837895 - 20837667
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20837895 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaa 20837796  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  20837795 aggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggatgcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacacc 20837696  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    || || |||||||||||||||||||||||    
T  20837695 attcctacttccgtttctttcttcttgtg 20837667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 39052092 - 39052320
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||    
T  39052092 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaa 39052191  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || | |||||||||||| |||||||||    
T  39052192 cggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattggtaggagcaacggttgctattgattgaccggctccagctgacacc 39052291  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  39052292 attcccacttccgtttctttcttcttgtg 39052320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 27434708 - 27434936
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||    
T  27434708 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaa 27434807  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  27434808 aggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacacc 27434907  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27434908 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 27434936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37375102 - 37374910
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  37375102 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggcgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacgg 37375003  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37375002 aggcatttgagttgcgttgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 37374910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Original strand, 21703461 - 21703650
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||| |||||    
T  21703461 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacgg 21703560  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 226  Q
    ||| |  |  || ||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21703561 aggtaactaggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 21703650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Original strand, 19456718 - 19456907
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||| | ||  ||  ||||||||| |||||    
T  19456718 cattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgcgcatatgggtacgacgg 19456817  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 226  Q
    ||| |  || || ||||| || || ||||| |||||||||| |||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19456818 aggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 19456907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 158
Target Start/End: Original strand, 31891625 - 31891746
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||    
T  31891625 cattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 31891724  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatg 158  Q
    ||| |  ||||| |||||||||    
T  31891725 aggtagctgagcagcattgatg 31891746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 3784598 - 3784523
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgaga 112  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  3784598 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 3784523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 27118632 - 27118557
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgaga 112  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  27118632 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 27118557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27392960 - 27392745
Alignment:
Q  11 ctgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctga 110  Q
    |||||||| ||| || || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||  | || || || ||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  27392960 ctgttgttgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctga 27392861  T
Q  111 gaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccactt 210  Q
    || ||  |||| ||  |||| |  ||||| |  ||||| |||| |||||| ||||| |||||||  | ||||| || ||| || || |||||||| ||||    
T  27392860 gagtattgcatgtactggtacggtggaggtagctgagcagcatcgatgggggcaacagtagccacagattgactggttccggcagataccatccctactt 27392761  T
Q  211 ccgtttctttcttctt 226  Q
    | || |||||||||||    
T  27392760 ctgtctctttcttctt 27392745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 34156955 - 34156880
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgaga 112  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  34156955 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 34156880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Original strand, 34303600 - 34303675
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgaga 112  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  34303600 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 34303675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16163543 - 16163468
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgaga 112  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  16163543 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 16163468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16736621 - 16736849
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16736621 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaa 16736720  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  16736721 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgatacc 16736820  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16736821 atccccacttcagtttctttcttcttgtg 16736849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16751675 - 16751903
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16751675 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaa 16751774  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  16751775 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgatacc 16751874  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16751875 atccccacttcagtttctttcttcttgtg 16751903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17523514 - 17523286
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17523514 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaa 17523415  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  17523414 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgatacc 17523315  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17523314 atccccacttcagtttctttcttcttgtg 17523286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 17529701 - 17529929
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17529701 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaa 17529800  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  17529801 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgatacc 17529900  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17529901 atccccacttcagtttctttcttcttgtg 17529929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5127974 - 5127746
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  5127974 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaa 5127875  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  5127874 aggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 5127775  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5127774 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 5127746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11441542 - 11441314
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  11441542 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 11441443  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  11441442 aggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacc 11441343  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11441342 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 11441314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45387325 - 45387097
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  45387325 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaa 45387226  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  45387225 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacc 45387126  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45387125 atccccacttcagtttctttcttcttgtg 45387097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2154555 - 2154327
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2154555 gaaccagcaactgttgttttatctgttgagcaattgcattaacggatacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 2154456  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  2154455 aggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 2154356  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2154355 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 2154327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Original strand, 5147505 - 5147729
Alignment:
Q  5 cggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaagga 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||    
T  5147505 cggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacgga 5147604  T
Q  105 tgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatcc 204  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  5147605 tgctgagagtacggcatatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaatggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatcc 5147704  T
Q  205 ccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5147705 ccacttccgtttctttcttcttgtg 5147729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 11424937 - 11425165
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  11424937 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaa 11425036  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11425037 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctacattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 11425136  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11425137 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 11425165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 31564560 - 31564788
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  31564560 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 31564659  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  31564660 cggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacacc 31564759  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31564760 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 31564788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26435239 - 26435011
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  26435239 gaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 26435140  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  26435139 cggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcactgataggagcaacagtggccatggactgaccggctcctgctgacacc 26435040  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26435039 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 26435011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 26485905 - 26486133
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||    
T  26485905 gaactggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaa 26486004  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  26486005 cggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacacc 26486104  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486105 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 26486133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 26538034 - 26538262
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||    
T  26538034 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaa 26538133  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  26538134 cggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacacc 26538233  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26538234 attcccacttccgtttctttcttcttgtg 26538262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31124893 - 31124665
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||| ||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  31124893 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggttgcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 31124794  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  31124793 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacc 31124694  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31124693 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 31124665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3445276 - 3445048
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||    
T  3445276 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaa 3445177  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  3445176 cggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 3445077  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3445076 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 3445048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 10917026 - 10917254
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  10917026 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaa 10917125  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  10917126 gggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacgaaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 10917225  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10917226 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 10917254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 24592702 - 24592930
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  24592702 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 24592801  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  24592802 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 24592901  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592902 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 24592930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 26275255 - 26275483
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  26275255 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 26275354  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  26275355 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 26275454  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26275455 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 26275483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 26320030 - 26320258
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  26320030 gaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 26320129  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  26320130 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 26320229  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26320230 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 26320258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 26670075 - 26670303
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  26670075 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 26670174  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  26670175 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacacc 26670274  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26670275 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 26670303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9618633 - 9618405
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  9618633 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 9618534  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  9618533 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacc 9618434  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9618433 atccccacttcagtttctttcttcttgtg 9618405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16503541 - 16503769
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||| |||||||    
T  16503541 gaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaa 16503640  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  16503641 aggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacacc 16503740  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16503741 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 16503769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16518577 - 16518805
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||| |||||||    
T  16518577 gaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaa 16518676  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  16518677 aggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacacc 16518776  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16518777 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 16518805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Original strand, 4145320 - 4145512
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4145320 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 4145419  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4145420 aggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtg 4145512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16041267 - 16041083
Alignment:
Q  42 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 141  Q
    |||||||| ||||||||||||| || || ||| || |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||| |    
T  16041267 acgggtacctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggta 16041168  T
Q  142 tttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 226  Q
      || || ||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16041167 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 16041083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 226
Target Start/End: Original strand, 16450199 - 16450381
Alignment:
Q  44 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatt 143  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| ||   || ||||| |||||||| |      
T  16450199 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcgtacgggtacgacggaggtaac 16450298  T
Q  144 tgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 226  Q
    || || ||||| || || ||||| ||||| |||| |||||||||||| || || |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  16450299 tgggcagcattaataggggcaacagtagctatggattgaccggctccggcagataccatccctacttttgtttctttcttctt 16450381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5159468 - 5159328
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||| ||||| |||||    
T  5159468 cattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgg 5159369  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgg 177  Q
     || |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  5159368 gggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatgg 5159328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Original strand, 31088658 - 31088733
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgaga 112  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  31088658 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 31088733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 45733409 - 45733334
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgaga 112  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  45733409 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 45733334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22143458 - 22143423
Alignment:
Q  180 tgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtt 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22143458 tgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtt 22143423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26918358 - 26918130
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26918358 gaaccggcaactgttgtttcgtctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 26918259  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26918258 aggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 26918159  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26918158 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 26918130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27000051 - 26999823
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27000051 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 26999952  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26999951 aggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 26999852  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26999851 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 26999823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3696041 - 3695813
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  3696041 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaacggtgggaagaa 3695942  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  3695941 aggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacc 3695842  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3695841 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 3695813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16749832 - 16749604
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16749832 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 16749733  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16749732 aggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgagctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 16749633  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16749632 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 16749604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26988979 - 26988751
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26988979 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 26988880  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26988879 aggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 26988780  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26988779 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 26988751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 30558234 - 30558462
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  30558234 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 30558333  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  30558334 cggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacacc 30558433  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30558434 atccccacttcagtttctttcttcttgtg 30558462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 229
Target Start/End: Original strand, 15424540 - 15424763
Alignment:
Q  6 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15424540 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 15424639  T
Q  106 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccc 205  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15424640 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 15424739  T
Q  206 cacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  15424740 tacttccgtttctttcttcttgtg 15424763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4772975 - 4772747
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  4772975 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 4772876  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  4772875 cggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacacc 4772776  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4772775 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 4772747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 27360228 - 27360456
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  27360228 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 27360327  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  27360328 cggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacacc 27360427  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27360428 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 27360456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 27450571 - 27450799
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  27450571 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 27450670  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  27450671 cggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacacc 27450770  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450771 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 27450799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 34463579 - 34463807
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||    
T  34463579 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaa 34463678  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||||    
T  34463679 aggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacc 34463778  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34463779 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 34463807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 4546002 - 4546230
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  4546002 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 4546101  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  4546102 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacacc 4546201  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  4546202 attcccacttccgtttctttcttcttgtg 4546230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 4724361 - 4724589
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  4724361 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 4724460  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  4724461 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacacc 4724560  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  4724561 attcccacttccgtttctttcttcttgtg 4724589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 13299169 - 13299397
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  13299169 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 13299268  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||    
T  13299269 aggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacacc 13299368  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13299369 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 13299397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27007690 - 27007462
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  27007690 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 27007591  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  27007590 tggatgctgagaatacggcatatataggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 27007491  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007490 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 27007462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27485095 - 27484867
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  27485095 gaaccggcaactgttgtttcatctgctgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 27484996  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  27484995 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacc 27484896  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27484895 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 27484867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28207420 - 28207192
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  28207420 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 28207321  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  28207320 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacacc 28207221  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28207220 attcccacttccgtttctttcttcttgtg 28207192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4757739 - 4757511
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  4757739 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 4757640  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  4757639 cggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacagtagccattgattgaccggctccggctgacacc 4757540  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4757539 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 4757511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16674105 - 16673877
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||    
T  16674105 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaa 16674006  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  16674005 cggatgctgagagtacggcatatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacacc 16673906  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16673905 attcccacttccgtttctttcttcttgtg 16673877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17025240 - 17025012
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  17025240 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 17025141  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  17025140 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacacc 17025041  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17025040 attcccacttccgtttctttcttcttgtg 17025012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Original strand, 24304844 - 24305064
Alignment:
Q  9 aactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgct 108  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24304844 aactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgct 24304943  T
Q  109 gagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccac 208  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  24304944 gagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctac 24305043  T
Q  209 ttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24305044 ttccgtttctttcttcttgtg 24305064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24863695 - 24863467
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  24863695 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttggggttgactcggtggtagagggtactgatgatagaatggcggaaagaa 24863596  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24863595 aggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacacc 24863496  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24863495 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 24863467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29572991 - 29572763
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  29572991 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 29572892  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  29572891 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 29572792  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29572791 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 29572763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16944245 - 16944473
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  16944245 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 16944344  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||    
T  16944345 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacc 16944444  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16944445 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 16944473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 26116637 - 26116865
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  26116637 gaaccggcaactgttgttttatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 26116736  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  26116737 cgaatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgtattgataggagcaacggtagctatagattgaccggctccagctgacacc 26116836  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26116837 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 26116865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 26777845 - 26778073
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  26777845 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 26777944  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||    
T  26777945 aggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggtgcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacc 26778044  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26778045 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 26778073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 22935095 - 22935323
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||| |||||||    
T  22935095 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaa 22935194  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| || |||||||||    
T  22935195 gggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacacc 22935294  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22935295 atccctatttccgtttctttcttcttgtg 22935323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 23857540 - 23857768
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||| |||||||    
T  23857540 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaa 23857639  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| || |||||||||    
T  23857640 gggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacacc 23857739  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  23857740 atccctatttccgtttctttcttcttgtg 23857768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27044332 - 27044140
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27044332 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 27044233  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27044232 aggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 27044140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29501348 - 29501156
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29501348 cattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacgg 29501249  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29501248 aggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 29501156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29549420 - 29549227
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29549420 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacgg 29549321  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtga 230  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29549320 aggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtga 29549227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4525231 - 4525039
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4525231 cattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 4525132  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4525131 aggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 4525039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 22477491 - 22477673
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||  ||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || | |||||| |||||  |||||||    
T  22477491 gaaccggtgactgttgttgcatttgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaa 22477590  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgac 183  Q
     ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||| |||| | ||| || ||||| || || ||||| |||||||||| |||||    
T  22477591 gggatgctgagagtactgcgcatacgggtacgacagaggtaattgggcagcattaattggggcaacagtagccatggattgac 22477673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Original strand, 13522324 - 13522399
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgaga 112  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  13522324 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 13522399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20160646 - 20160571
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgaga 112  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  || |||||||||| |||||    
T  20160646 cattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgaga 20160571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Original strand, 22172185 - 22172260
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgaga 112  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  || |||||||||| |||||    
T  22172185 cattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgaga 22172260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 28162602 - 28162527
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgaga 112  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  28162602 cattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaga 28162527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Original strand, 33374507 - 33374582
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgaga 112  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  33374507 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 33374582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Original strand, 8892561 - 8892636
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgaga 112  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  8892561 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgaga 8892636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 405 - 633
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  405 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 504  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  505 aggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagttgacacc 604  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  605 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33777477 - 33777249
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33777477 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 33777378  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  33777377 aggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccagctgacacc 33777278  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33777277 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 33777249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41674699 - 41674471
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  41674699 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggtggacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaa 41674600  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  41674599 aggatgctgagcatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 41674500  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41674499 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 41674471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Original strand, 9548719 - 9548943
Alignment:
Q  5 cggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaagga 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9548719 cggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaagga 9548818  T
Q  105 tgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatcc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  9548819 tgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatcc 9548918  T
Q  205 ccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9548919 ccacttccgtttctttcttcttgtg 9548943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 18500920 - 18501148
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  18500920 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 18501019  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  18501020 aggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 18501119  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18501120 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 18501148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 23718160 - 23718388
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23718160 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 23718259  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23718260 aggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 23718359  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23718360 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 23718388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 23752622 - 23752850
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23752622 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 23752721  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23752722 aggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 23752821  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23752822 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 23752850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24681427 - 24681199
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  24681427 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaa 24681328  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24681327 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 24681228  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681227 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 24681199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24723954 - 24723726
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  24723954 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaa 24723855  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24723854 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 24723755  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24723754 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 24723726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31431418 - 31431190
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  31431418 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 31431319  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | |||||||||||| ||||| |||    
T  31431318 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgatacc 31431219  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31431218 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 31431190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 8665647 - 8665875
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  8665647 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 8665746  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  8665747 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacc 8665846  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8665847 atccccacttcagtttctttcttcttgtg 8665875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 15658932 - 15659160
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  15658932 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaacggcggaaagaa 15659031  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  15659032 aggatgctgagaatacggcacatatggatatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 15659131  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15659132 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 15659160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 37358827 - 37359055
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  37358827 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 37358926  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  37358927 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacacc 37359026  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37359027 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 37359055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 37671664 - 37671892
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  37671664 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 37671763  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  37671764 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacacc 37671863  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37671864 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 37671892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11549344 - 11549116
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  11549344 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggtggaaagaa 11549245  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11549244 aggatgctgtgaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 11549145  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11549144 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 11549116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 22999286 - 22999514
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22999286 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 22999385  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22999386 aggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 22999485  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22999486 atccctatttccgtttctttcttcttgtg 22999514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30168459 - 30168231
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  30168459 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 30168360  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  30168359 cggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgatacc 30168260  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30168259 atccccacttcagtttctttcttcttgtg 30168231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33516346 - 33516118
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  33516346 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 33516247  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33516246 cggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacacc 33516147  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33516146 atccccacttcagtttctttcttcttgtg 33516118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43078239 - 43078011
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  43078239 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 43078140  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  43078139 aggatgctgagaatacggcatgtatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagttgacacc 43078040  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43078039 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 43078011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3789516 - 3789288
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  3789516 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 3789417  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  3789416 cggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacc 3789317  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3789316 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 3789288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 13325016 - 13325244
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  13325016 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 13325115  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||    
T  13325116 cggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccagctccagctgacacc 13325215  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13325216 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 13325244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 18375584 - 18375812
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  18375584 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 18375683  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  18375684 cggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacc 18375783  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18375784 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 18375812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28649216 - 28648988
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  28649216 gaaccggaaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaa 28649117  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  28649116 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgtattgatagttgcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacacc 28649017  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649016 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 28648988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 31826591 - 31826819
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  31826591 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 31826690  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  31826691 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 31826790  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31826791 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 31826819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5637900 - 5637672
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  5637900 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 5637801  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  5637800 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 5637701  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637700 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 5637672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6874292 - 6874064
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  6874292 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 6874193  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||||    
T  6874192 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacc 6874093  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6874092 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 6874064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9317441 - 9317213
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  9317441 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 9317342  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  9317341 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 9317242  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9317241 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 9317213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 24688329 - 24688557
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  24688329 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgtattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaa 24688428  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  24688429 aggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacacc 24688528  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24688529 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 24688557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12132145 - 12131917
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  12132145 gaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 12132046  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  12132045 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 12131946  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12131945 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 12131917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26480382 - 26480154
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  26480382 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 26480283  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  26480282 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 26480183  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26480182 atccccacttcagtttctttcttcttgtg 26480154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30152008 - 30151780
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  30152008 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 30151909  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  30151908 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacc 30151809  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30151808 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 30151780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30934626 - 30934398
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  30934626 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 30934527  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||    
T  30934526 gggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattggccggctccggtagacacc 30934427  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30934426 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 30934398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37754958 - 37754730
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  37754958 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 37754859  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  37754858 cggatgctgagaatacggcatatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 37754759  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37754758 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 37754730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2511041 - 2510813
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  2511041 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacggacacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 2510942  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  2510941 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgatacc 2510842  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  2510841 attcccacttccgtttctttcttcttgtg 2510813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 29967238 - 29967466
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  29967238 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 29967337  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||    
T  29967338 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacc 29967437  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29967438 atccccacttccgtttctttctttttgtg 29967466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30029405 - 30029177
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  30029405 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 30029306  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||    
T  30029305 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacc 30029206  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30029205 atccccacttccgtttctttctttttgtg 30029177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 15759029 - 15759257
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  15759029 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 15759128  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||| ||||| |||||||||    
T  15759129 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgacctgctccagctgacacc 15759228  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15759229 atccccacttcagtttctttcttcttgtg 15759257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 37771171 - 37771399
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  37771171 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 37771270  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  37771271 cggatgctgagaatacggcatatatggatacgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacc 37771370  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37771371 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 37771399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 28959970 - 28960198
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  28959970 gaactggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 28960069  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| |||||| | | ||| |||||||| |||||||||    
T  28960070 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctacattgataggtgcaacagtagccgttgattgcccggctccagctgacacc 28960169  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28960170 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 28960198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 40473724 - 40473952
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||    
T  40473724 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaa 40473823  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  40473824 cggatgctgagagtacggcatgtgtgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 40473923  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40473924 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 40473952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Original strand, 32599677 - 32599869
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32599677 cattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 32599776  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32599777 aggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtg 32599869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34616475 - 34616283
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34616475 cattgacaggaacctgaggttagccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 34616376  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34616375 aggcatttgggctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 34616283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23892160 - 23891971
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  23892160 cattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacgg 23892061  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 226  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||| |||| ||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23892060 aggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgatcggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 23891971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24970014 - 24969870
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||| |||||||    
T  24970014 gaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaa 24969915  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttg 145  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  24969914 aggatgctgagaatacggcgcatatgggtacgacggaggcatttg 24969870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25198977 - 25198797
Alignment:
Q  46 gtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttg 145  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||| |||    
T  25198977 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcaattg 25198878  T
Q  146 agctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 226  Q
     |  ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  25198877 ggaagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcggataccatccctacttctgtttccttcttctt 25198797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24951951 - 24951872
Alignment:
Q  150 gcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24951951 gcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtg 24951872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22888427 - 22888287
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||| |||||    
T  22888427 cattaacggttacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacgg 22888328  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgg 177  Q
    ||| |  || || ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22888327 aggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatgg 22888287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 33292482 - 33292346
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||   ||| ||||| |||||    
T  33292482 cattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgg 33292383  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcc 173  Q
     || |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  33292382 gggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagcc 33292346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Original strand, 13184853 - 13184928
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgaga 112  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  13184853 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 13184928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Original strand, 13440699 - 13440774
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgaga 112  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  13440699 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 13440774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 33877204 - 33877129
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgaga 112  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  33877204 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 33877129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 41793583 - 41793811
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  41793583 gaaccggcatctgttgtttcatctgtggagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaa 41793682  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  41793683 aggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgatacc 41793782  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  41793783 attcccacttccgtttctttcttcttgtg 41793811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10962650 - 10962422
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  10962650 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 10962551  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  10962550 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 10962451  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10962450 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 10962422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 51638198 - 51637970
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  51638198 gaaccggcatctgttgttttatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 51638099  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  51638098 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 51637999  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51637998 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 51637970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28584961 - 28584733
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  28584961 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 28584862  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||    
T  28584861 cggatgctgagaatacggcatatacgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacc 28584762  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28584761 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 28584733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20461052 - 20460863
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | |||    
T  20461052 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacggcgg 20460953  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 226  Q
    ||| |  || || ||||| || || ||||  |||||||||| |||||||||||| || || |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  20460952 aggtaactgggcagcattaataggggcaatagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctatttctttcttctt 20460863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Original strand, 20340643 - 20340718
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgaga 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  20340643 cattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 20340718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 226
Target Start/End: Original strand, 16208461 - 16208525
Alignment:
Q  162 gcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 226  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| || || |||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  16208461 gcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatctctacttctgtttctttcttctt 16208525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 9341 - 9569
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  9341 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 9440  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9441 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacacc 9540  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9541 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 9569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19996 - 19806
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  19996 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 19897  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctccc 191  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19896 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctccc 19806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27273 - 27045
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27273 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggtagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 27174  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27173 aggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 27074  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27073 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 27045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 15205 - 15433
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  15205 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 15304  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  15305 cggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacc 15404  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15405 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 15433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30434 - 30206
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  30434 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaa 30335  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  30334 gggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacc 30235  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  30234 atccctatttccgtttctttcttcttgtg 30206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20357 - 20168
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||   ||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||| |||||    
T  20357 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacgg 20258  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 226  Q
    ||| |  || || ||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20257 aggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 20168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 47260 - 47488
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  47260 gaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaa 47359  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47360 aggatgctgagaatacggcacatatgggtatgatggaggcatttgggctgcattgataagagcaacagtagccatgggttgaccggctccagctgacacc 47459  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  47460 atccctatttccgtttctttcttcttgtg 47488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 40344 - 40572
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40344 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcatttacgggtacctgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaa 40443  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  40444 aggatgctgagaatacggcgcatatgggtacggcggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacacc 40543  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40544 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 40572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29744 - 29516
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  29744 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgagctattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaa 29645  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  29644 aggatgctgagaatacggcgcatacgggtacgatggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacacc 29545  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29544 atccctacttccgtttctttcttcttgtg 29516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7918 - 7690
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  7918 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 7819  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  7818 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacacc 7719  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7718 attcccacttccgtttctttcttcttgtg 7690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 7514 - 7742
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  7514 gaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 7613  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  7614 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 7713  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7714 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 7742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 26477 - 26705
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  26477 gaaccggcaactgttgtttcctctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaacgggtactgatgataaaacggtgggaagaa 26576  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacacc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  26577 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacc 26676  T
Q  201 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26677 atccccacttccgtttctttcttcttgtg 26705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5972 - 5742
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattt-cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaat-ggcagaaag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||  | |||    
T  5972 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaaacggtgggaag 5873  T
Q  99 aaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcca-tgggttgaccggctcccgctgac 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | | |||||||||||| ||||||    
T  5872 aaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccatttgattgaccggctccagctgac 5773  T
Q  198 accatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5772 accat-cccacttccgtttctttcttcttgtg 5742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 8 - 204
Alignment:
Q  1 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  8 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 107  T
Q  101 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgac 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  108 cggatgctgagaatacggcatatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgac 204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8177 - 7985
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 136  Q
    ||||||| || || |||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8177 cattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 8078  T
Q  137 aggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8077 aggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 7985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21538 - 21323
Alignment:
Q  11 ctgttgtttcatctgttgggcaatttcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctga 110  Q
    |||||||| ||| || || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||  | || || || ||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  21538 ctgttgttgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctga 21439  T
Q  111 gaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgggttgaccggctcccgctgacaccatccccactt 210  Q
    || ||  |||| ||  |||| | |||||| |  ||||  ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| || ||| || || |||||||| ||||    
T  21438 gagtattgcatgtactggtacggcggaggtagctgagaagcattgatgggggcaacagtagccacggattgactggttccggcagataccatccctactt 21339  T
Q  211 ccgtttctttcttctt 226  Q
    | || |||||||||||    
T  21338 ctgtctctttcttctt 21323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3041
Alignment:
Q  37 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcagaaagaaaggatgctgaga 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  2966 cattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 3041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 229
Target Start/End: Original strand, 48572 - 48656
Alignment:
Q  150 gcattgatgggagcaac-ggtagccatgggttga--ccggctcccgct-gacaccatcccc-acttccgtttctttcttcttgtg 229  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||   |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48572 gcattgataggagcaacaggtagccatggattggacccggctccggcaagacaccatcccctacttccgtttctttcttcttgtg 48656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University