View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10481A_low_662 (Length: 220)

Name: NF10481A_low_662
Description: NF10481A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10481A_low_662
NF10481A_low_662
[»] chr2 (89 HSPs)
chr2 (1-220)||(39682522-39682741)
chr2 (1-219)||(23706951-23707169)
chr2 (1-220)||(571606-571825)
chr2 (1-220)||(18809152-18809370)
chr2 (1-220)||(23711748-23711966)
chr2 (1-220)||(24529281-24529500)
chr2 (1-220)||(28577308-28577526)
chr2 (1-219)||(24642483-24642701)
chr2 (5-219)||(24918350-24918564)
chr2 (1-220)||(23131071-23131290)
chr2 (1-220)||(23133538-23133757)
chr2 (1-220)||(34402256-34402475)
chr2 (1-219)||(24671235-24671453)
chr2 (1-220)||(20261428-20261647)
chr2 (1-220)||(23709267-23709485)
chr2 (1-220)||(26505588-26505806)
chr2 (1-220)||(26508066-26508284)
chr2 (1-219)||(24681654-24681872)
chr2 (8-220)||(32039240-32039451)
chr2 (1-220)||(24897930-24898148)
chr2 (1-220)||(24905367-24905585)
chr2 (4-209)||(22105685-22105890)
chr2 (1-220)||(24900413-24900631)
chr2 (1-220)||(24902890-24903108)
chr2 (1-220)||(24907842-24908060)
chr2 (2-220)||(10684498-10684716)
chr2 (1-219)||(38967689-38967907)
chr2 (1-203)||(45027639-45027840)
chr2 (1-209)||(24368046-24368254)
chr2 (1-220)||(23135799-23136007)
chr2 (31-220)||(25616390-25616579)
chr2 (1-220)||(32214665-32214874)
chr2 (1-209)||(21154742-21154950)
chr2 (1-209)||(41523807-41524015)
chr2 (10-209)||(6726267-6726466)
chr2 (5-136)||(6726533-6726664)
chr2 (1-136)||(22105951-22106086)
chr2 (1-136)||(41523614-41523749)
chr2 (1-114)||(23931775-23931888)
chr2 (7-136)||(24529094-24529223)
chr2 (5-136)||(21154553-21154684)
chr2 (5-136)||(24918626-24918757)
chr2 (4-136)||(24681930-24682062)
chr2 (9-136)||(24368312-24368439)
chr2 (4-134)||(45027449-45027579)
chr2 (3-136)||(23709076-23709209)
chr2 (7-132)||(41523427-41523552)
chr2 (4-136)||(24671511-24671643)
chr2 (5-136)||(21154360-21154491)
chr2 (144-220)||(6726204-6726279)
chr2 (4-136)||(23706570-23706702)
chr2 (1-131)||(23706759-23706889)
chr2 (1-134)||(32214471-32214604)
chr2 (148-220)||(21154942-21155013)
chr2 (144-220)||(22105622-22105697)
chr2 (144-220)||(23707200-23707275)
chr2 (5-133)||(23931949-23932077)
chr2 (144-220)||(24642732-24642807)
chr2 (144-220)||(38967583-38967658)
chr2 (144-220)||(24367983-24368058)
chr2 (144-220)||(24918244-24918319)
chr2 (147-220)||(24671129-24671201)
chr2 (144-220)||(24681548-24681623)
chr2 (71-135)||(31345490-31345554)
chr2 (145-219)||(21368365-21368439)
chr2 (46-116)||(67339-67409)
chr2 (145-219)||(23799457-23799531)
chr2 (47-136)||(18809428-18809517)
chr2 (68-136)||(23711622-23711690)
chr2 (84-136)||(24642373-24642425)
chr2 (68-136)||(26505864-26505932)
chr2 (68-136)||(26508342-26508410)
chr2 (68-136)||(27920373-27920441)
chr2 (68-136)||(32039107-32039175)
chr2 (97-136)||(23131347-23131386)
chr2 (97-136)||(34402160-34402199)
chr2 (144-187)||(41524003-41524045)
chr2 (150-219)||(22686152-22686221)
chr2 (47-136)||(28577584-28577673)
chr2 (47-116)||(34823750-34823819)
chr2 (97-136)||(571883-571922)
chr2 (97-136)||(23133814-23133853)
chr2 (97-136)||(39682799-39682838)
chr2 (46-116)||(27261332-27261402)
chr2 (145-193)||(22686062-22686110)
chr2 (145-209)||(23707148-23707212)
chr2 (100-136)||(23708980-23709016)
chr2 (145-209)||(24642680-24642744)
chr2 (145-209)||(24918307-24918371)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (1-220)||(38030-38249)
scaffold0134 (47-136)||(38307-38396)
[»] chr7 (82 HSPs)
chr7 (1-220)||(456530-456749)
chr7 (1-220)||(27217069-27217288)
chr7 (1-220)||(41523126-41523345)
chr7 (1-220)||(41525588-41525807)
chr7 (1-220)||(16232729-16232948)
chr7 (1-219)||(15081576-15081794)
chr7 (1-220)||(15376448-15376666)
chr7 (1-220)||(20384858-20385076)
chr7 (2-220)||(16213893-16214111)
chr7 (1-219)||(8940489-8940711)
chr7 (31-220)||(11393051-11393240)
chr7 (1-220)||(14948857-14949075)
chr7 (1-220)||(16410268-16410486)
chr7 (1-219)||(14269691-14269909)
chr7 (1-220)||(32125700-32125918)
chr7 (4-219)||(8468945-8469160)
chr7 (1-220)||(13869557-13869776)
chr7 (1-220)||(21189330-21189548)
chr7 (3-220)||(18627775-18627991)
chr7 (3-220)||(18640481-18640697)
chr7 (1-220)||(11303456-11303675)
chr7 (1-220)||(24702447-24702656)
chr7 (1-220)||(24704894-24705103)
chr7 (1-217)||(45847389-45847605)
chr7 (1-220)||(18430921-18431139)
chr7 (1-220)||(26355716-26355934)
chr7 (1-220)||(26358168-26358386)
chr7 (2-220)||(29796819-29797037)
chr7 (2-220)||(29800638-29800856)
chr7 (4-209)||(11972768-11972973)
chr7 (1-220)||(16108423-16108642)
chr7 (1-220)||(23664687-23664906)
chr7 (37-209)||(13841274-13841446)
chr7 (4-136)||(38897772-38897904)
chr7 (1-136)||(14269305-14269440)
chr7 (2-136)||(10501129-10501263)
chr7 (4-136)||(16214170-16214302)
chr7 (2-136)||(8940769-8940902)
chr7 (1-136)||(14156620-14156755)
chr7 (1-135)||(1856964-1857097)
chr7 (1-135)||(25926864-25926998)
chr7 (31-136)||(14156839-14156944)
chr7 (139-219)||(38897995-38898075)
chr7 (7-136)||(21189143-21189272)
chr7 (4-136)||(8940962-8941094)
chr7 (144-220)||(45847638-45847714)
chr7 (1-135)||(13918137-13918272)
chr7 (7-130)||(15081389-15081512)
chr7 (1-136)||(14269498-14269633)
chr7 (1-103)||(10500962-10501064)
chr7 (144-220)||(14269940-14270015)
chr7 (144-220)||(15081825-15081900)
chr7 (144-220)||(38898106-38898181)
chr7 (54-136)||(45847249-45847331)
chr7 (144-220)||(8940383-8940458)
chr7 (144-220)||(11972705-11972780)
chr7 (1-136)||(17985119-17985254)
chr7 (49-137)||(11310239-11310327)
chr7 (144-219)||(15119918-15119993)
chr7 (178-220)||(8468849-8468891)
chr7 (145-219)||(13745569-13745643)
chr7 (170-220)||(13841221-13841270)
chr7 (47-136)||(15376301-15376390)
chr7 (47-136)||(20384711-20384800)
chr7 (145-209)||(38294567-38294631)
chr7 (97-136)||(16410544-16410583)
chr7 (97-136)||(18628051-18628090)
chr7 (97-136)||(18640757-18640796)
chr7 (97-136)||(26355619-26355658)
chr7 (97-136)||(26358071-26358110)
chr7 (47-116)||(125965-126034)
chr7 (68-136)||(27217346-27217414)
chr7 (97-136)||(13869833-13869872)
chr7 (145-195)||(9743795-9743845)
chr7 (18-104)||(16202766-16202852)
chr7 (145-209)||(8468902-8468966)
chr7 (145-209)||(8940446-8940510)
chr7 (145-209)||(14269888-14269952)
chr7 (145-209)||(15081773-15081837)
chr7 (145-193)||(25941523-25941571)
chr7 (145-209)||(38898054-38898118)
chr7 (145-209)||(43747672-43747736)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (1-220)||(13601-13820)
scaffold0444 (95-136)||(13878-13919)
[»] scaffold0230 (4 HSPs)
scaffold0230 (1-220)||(14156-14375)
scaffold0230 (5-220)||(23269-23484)
scaffold0230 (1-136)||(22912-23047)
scaffold0230 (54-136)||(23125-23207)
[»] chr3 (80 HSPs)
chr3 (1-220)||(45606641-45606860)
chr3 (1-220)||(7781081-7781300)
chr3 (1-220)||(53301238-53301457)
chr3 (7-220)||(46822470-46822683)
chr3 (1-220)||(17463387-17463605)
chr3 (1-220)||(34159535-34159753)
chr3 (1-219)||(12119388-12119606)
chr3 (1-220)||(55476700-55476918)
chr3 (1-220)||(15977742-15977960)
chr3 (1-220)||(27165461-27165680)
chr3 (1-220)||(6468869-6469087)
chr3 (1-220)||(13544234-13544451)
chr3 (1-220)||(16454015-16454234)
chr3 (1-220)||(12567769-12567987)
chr3 (1-208)||(13436520-13436727)
chr3 (1-220)||(15412640-15412859)
chr3 (1-220)||(54521031-54521250)
chr3 (1-220)||(8499729-8499948)
chr3 (1-220)||(13153990-13154208)
chr3 (1-220)||(10247458-10247676)
chr3 (7-220)||(10557117-10557330)
chr3 (2-209)||(38961573-38961781)
chr3 (1-209)||(41124159-41124367)
chr3 (1-209)||(16282492-16282701)
chr3 (1-220)||(28848356-28848564)
chr3 (4-195)||(24513910-24514101)
chr3 (2-209)||(25237063-25237270)
chr3 (3-220)||(13151527-13151743)
chr3 (1-220)||(29544576-29544795)
chr3 (1-209)||(17444498-17444706)
chr3 (53-220)||(12305354-12305521)
chr3 (1-209)||(20629926-20630138)
chr3 (2-209)||(25229476-25229683)
chr3 (1-135)||(15465448-15465582)
chr3 (2-143)||(10379613-10379754)
chr3 (5-133)||(8500009-8500137)
chr3 (1-136)||(10557394-10557529)
chr3 (1-136)||(27165738-27165873)
chr3 (5-136)||(41124425-41124556)
chr3 (1-136)||(55319038-55319173)
chr3 (5-136)||(14567430-14567561)
chr3 (5-136)||(38961383-38961514)
chr3 (1-136)||(53301045-53301180)
chr3 (4-136)||(55318848-55318980)
chr3 (1-135)||(26054999-26055133)
chr3 (2-136)||(46822747-46822881)
chr3 (4-136)||(20629736-20629868)
chr3 (5-136)||(13937518-13937649)
chr3 (1-135)||(5223677-5223811)
chr3 (144-220)||(9707484-9707560)
chr3 (15-137)||(36528447-36528569)
chr3 (144-220)||(8899303-8899378)
chr3 (144-220)||(16282689-16282764)
chr3 (144-220)||(17444694-17444769)
chr3 (5-136)||(16282303-16282434)
chr3 (31-136)||(16358239-16358344)
chr3 (144-220)||(38961769-38961844)
chr3 (144-220)||(41124096-41124171)
chr3 (31-137)||(3264325-3264431)
chr3 (144-220)||(11913928-11914003)
chr3 (1-136)||(17393201-17393336)
chr3 (4-136)||(17444308-17444440)
chr3 (144-211)||(25237009-25237075)
chr3 (72-136)||(15007988-15008052)
chr3 (145-219)||(25201323-25201397)
chr3 (47-136)||(34159811-34159900)
chr3 (68-136)||(17463663-17463731)
chr3 (48-116)||(30152450-30152518)
chr3 (97-136)||(55476976-55477015)
chr3 (145-203)||(15025934-15025992)
chr3 (144-209)||(17044330-17044395)
chr3 (47-116)||(25058298-25058367)
chr3 (47-116)||(49231768-49231837)
chr3 (97-136)||(6468772-6468811)
chr3 (97-136)||(15412916-15412955)
chr3 (189-219)||(11913867-11913897)
chr3 (145-190)||(18700200-18700245)
chr3 (146-199)||(50351664-50351717)
chr3 (145-209)||(11913876-11913940)
chr3 (145-209)||(12119585-12119649)
[»] chr1 (43 HSPs)
chr1 (1-220)||(21474821-21475040)
chr1 (1-220)||(13989075-13989293)
chr1 (1-220)||(21923026-21923244)
chr1 (1-220)||(16362127-16362346)
chr1 (1-220)||(15859743-15859961)
chr1 (1-220)||(21840976-21841194)
chr1 (1-219)||(16274990-16275209)
chr1 (1-209)||(27161321-27161529)
chr1 (1-209)||(29776960-29777168)
chr1 (7-220)||(23593474-23593687)
chr1 (1-209)||(29298461-29298669)
chr1 (1-209)||(31612585-31612793)
chr1 (4-220)||(22122752-22122968)
chr1 (4-209)||(22050574-22050779)
chr1 (1-163)||(13227129-13227291)
chr1 (1-163)||(29535317-29535479)
chr1 (1-136)||(29777226-29777361)
chr1 (5-136)||(31612851-31612982)
chr1 (1-129)||(9044739-9044867)
chr1 (4-136)||(29298727-29298859)
chr1 (1-136)||(15859537-15859672)
chr1 (4-136)||(22122558-22122691)
chr1 (7-136)||(31613044-31613173)
chr1 (4-136)||(16274800-16274932)
chr1 (144-220)||(16275240-16275316)
chr1 (4-136)||(27161131-27161263)
chr1 (1-136)||(16401407-16401542)
chr1 (4-126)||(40129387-40129509)
chr1 (144-220)||(22050767-22050842)
chr1 (144-220)||(29776897-29776972)
chr1 (144-220)||(29298345-29298420)
chr1 (144-220)||(22122945-22123020)
chr1 (144-220)||(31612522-31612597)
chr1 (145-220)||(27161518-27161592)
chr1 (66-136)||(10812612-10812682)
chr1 (144-209)||(29298408-29298473)
chr1 (47-136)||(13989351-13989440)
chr1 (1-61)||(43543269-43543329)
chr1 (47-107)||(16655942-16656002)
chr1 (145-204)||(12710152-12710211)
chr1 (97-136)||(21474724-21474763)
chr1 (145-209)||(16275188-16275252)
chr1 (145-193)||(22824136-22824184)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-220)||(20956-21175)
[»] chr6 (62 HSPs)
chr6 (1-220)||(8055238-8055457)
chr6 (1-220)||(18334327-18334545)
chr6 (1-220)||(24422756-24422974)
chr6 (1-220)||(33862003-33862221)
chr6 (1-220)||(33864487-33864705)
chr6 (5-220)||(1540650-1540864)
chr6 (5-220)||(12742526-12742741)
chr6 (1-220)||(17377582-17377801)
chr6 (1-220)||(1598266-1598484)
chr6 (1-220)||(30676444-30676663)
chr6 (1-220)||(34963582-34963801)
chr6 (1-220)||(19847706-19847921)
chr6 (1-220)||(2290915-2291133)
chr6 (1-220)||(22782436-22782654)
chr6 (1-220)||(26924375-26924593)
chr6 (1-219)||(31630275-31630493)
chr6 (1-220)||(25688711-25688930)
chr6 (1-219)||(18914142-18914360)
chr6 (1-219)||(19005361-19005579)
chr6 (1-220)||(19858657-19858872)
chr6 (5-195)||(25535641-25535831)
chr6 (4-220)||(23992632-23992847)
chr6 (1-220)||(28289071-28289288)
chr6 (54-220)||(12942410-12942576)
chr6 (1-136)||(19005637-19005772)
chr6 (4-132)||(18914615-18914743)
chr6 (96-219)||(15875621-15875734)
chr6 (1-136)||(1899-2034)
chr6 (1-136)||(8858-8993)
chr6 (1-136)||(1598542-1598677)
chr6 (1-132)||(26924182-26924313)
chr6 (1-135)||(23415258-23415392)
chr6 (144-220)||(31630524-31630600)
chr6 (1-136)||(25688988-25689123)
chr6 (4-136)||(1598735-1598867)
chr6 (1-136)||(107-242)
chr6 (1-136)||(19847513-19847648)
chr6 (1-136)||(30676251-30676386)
chr6 (1-135)||(27557016-27557150)
chr6 (4-136)||(25689181-25689313)
chr6 (1-132)||(18914422-18914553)
chr6 (144-220)||(18914036-18914111)
chr6 (144-220)||(19005255-19005330)
chr6 (17-136)||(25737128-25737247)
chr6 (9-116)||(31630090-31630197)
chr6 (1-89)||(15892143-15892231)
chr6 (46-136)||(22981326-22981416)
chr6 (46-136)||(23806992-23807082)
chr6 (144-220)||(15875515-15875590)
chr6 (161-220)||(25656838-25656897)
chr6 (145-219)||(35056707-35056781)
chr6 (1-74)||(17883232-17883305)
chr6 (47-136)||(18334180-18334269)
chr6 (47-136)||(24423032-24423121)
chr6 (68-136)||(33864763-33864831)
chr6 (145-203)||(32259078-32259136)
chr6 (68-136)||(26924056-26924124)
chr6 (97-136)||(2290818-2290857)
chr6 (145-220)||(15875567-15875642)
chr6 (97-136)||(22782712-22782751)
chr6 (181-211)||(17883303-17883333)
chr6 (145-209)||(18914099-18914163)
[»] chr4 (65 HSPs)
chr4 (1-212)||(29267570-29267781)
chr4 (1-220)||(15118087-15118305)
chr4 (1-219)||(52872807-52873025)
chr4 (1-220)||(3515216-3515435)
chr4 (1-220)||(50222074-50222292)
chr4 (5-220)||(14970445-14970660)
chr4 (1-220)||(44615497-44615716)
chr4 (1-219)||(19617801-19618019)
chr4 (1-219)||(15495908-15496126)
chr4 (2-219)||(362390-362607)
chr4 (1-220)||(15534390-15534609)
chr4 (1-219)||(14746246-14746464)
chr4 (5-220)||(44772822-44773036)
chr4 (1-218)||(7640921-7641137)
chr4 (1-220)||(19242909-19243128)
chr4 (1-220)||(36038079-36038298)
chr4 (1-220)||(49547508-49547727)
chr4 (1-209)||(11989-12197)
chr4 (1-209)||(52312782-52312989)
chr4 (1-219)||(19857798-19858006)
chr4 (1-220)||(14048786-14049005)
chr4 (1-220)||(1837254-1837462)
chr4 (90-219)||(18214992-18215121)
chr4 (119-219)||(15355071-15355171)
chr4 (2-136)||(15495716-15495850)
chr4 (1-134)||(362668-362801)
chr4 (4-136)||(18214748-18214880)
chr4 (5-136)||(362859-362990)
chr4 (1-136)||(14970248-14970383)
chr4 (97-220)||(18239250-18239372)
chr4 (1-136)||(19858064-19858199)
chr4 (31-136)||(14185621-14185726)
chr4 (4-136)||(3515493-3515625)
chr4 (4-136)||(52313047-52313179)
chr4 (5-136)||(52313240-52313371)
chr4 (1-136)||(52872614-52872749)
chr4 (1-136)||(14746053-14746188)
chr4 (1-136)||(19617608-19617743)
chr4 (144-220)||(12185-12260)
chr4 (144-220)||(18215152-18215227)
chr4 (144-211)||(19857700-19857767)
chr4 (1-155)||(30147189-30147343)
chr4 (144-220)||(15355202-15355277)
chr4 (144-220)||(52312719-52312794)
chr4 (144-220)||(14746495-14746570)
chr4 (144-220)||(15496949-15497024)
chr4 (144-220)||(19618050-19618125)
chr4 (144-220)||(52873056-52873131)
chr4 (47-136)||(22725313-22725401)
chr4 (66-132)||(14745925-14745991)
chr4 (46-116)||(14951270-14951340)
chr4 (47-136)||(15117940-15118029)
chr4 (46-114)||(55377225-55377293)
chr4 (178-220)||(362294-362336)
chr4 (47-116)||(14995644-14995713)
chr4 (99-136)||(44772723-44772760)
chr4 (97-136)||(7640824-7640863)
chr4 (145-220)||(19617998-19618073)
chr4 (1-43)||(12778417-12778459)
chr4 (144-209)||(14629428-14629493)
chr4 (145-209)||(362347-362411)
chr4 (145-209)||(14746443-14746507)
chr4 (145-209)||(15355150-15355214)
chr4 (145-209)||(19857755-19857819)
chr4 (167-219)||(26922437-26922489)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (1-220)||(2154366-2154585)
chr5 (1-220)||(17516898-17517117)
chr5 (1-219)||(20901655-20901873)
chr5 (1-220)||(264503-264721)
chr5 (1-220)||(20909221-20909439)
chr5 (1-220)||(38619645-38619864)
chr5 (2-220)||(42245101-42245318)
chr5 (1-220)||(10732675-10732893)
chr5 (1-220)||(39245345-39245563)
chr5 (1-220)||(23064722-23064941)
chr5 (1-220)||(39363593-39363812)
chr5 (1-220)||(29346189-29346407)
chr5 (1-209)||(20917581-20917789)
chr5 (1-209)||(32027665-32027873)
chr5 (1-220)||(29348662-29348880)
chr5 (1-220)||(29351135-29351353)
chr5 (1-220)||(37804637-37804856)
chr5 (1-209)||(29330203-29330410)
chr5 (6-220)||(9776567-9776781)
chr5 (1-136)||(296009-296144)
chr5 (1-136)||(17516512-17516647)
chr5 (5-136)||(29330468-29330599)
chr5 (6-136)||(295821-295951)
chr5 (5-136)||(32028124-32028256)
chr5 (1-136)||(20901462-20901597)
chr5 (144-220)||(20901904-20901980)
chr5 (3-136)||(17516707-17516840)
chr5 (7-136)||(32028511-32028640)
chr5 (1-136)||(32028318-32028453)
chr5 (7-136)||(20917394-20917523)
chr5 (4-136)||(2154176-2154308)
chr5 (144-220)||(29330140-29330215)
chr5 (144-220)||(32027602-32027677)
chr5 (1-136)||(32027931-32028066)
chr5 (144-220)||(20917830-20917905)
chr5 (148-219)||(18743965-18744036)
chr5 (61-136)||(264370-264445)
chr5 (145-219)||(1628169-1628243)
chr5 (46-116)||(27183208-27183278)
chr5 (144-209)||(20917777-20917842)
chr5 (68-136)||(20909497-20909565)
chr5 (147-219)||(21399896-21399968)
chr5 (97-136)||(39245621-39245660)
chr5 (97-136)||(39363869-39363908)
chr5 (46-116)||(23506503-23506573)
chr5 (47-116)||(1220384-1220453)
chr5 (47-116)||(10778832-10778901)
chr5 (47-107)||(28901495-28901555)
chr5 (47-107)||(28937890-28937950)
chr5 (97-136)||(23064999-23065038)
chr5 (145-186)||(24067282-24067323)
chr5 (145-219)||(18743852-18743923)
chr5 (145-209)||(20198507-20198571)
chr5 (145-209)||(20901852-20901916)
[»] chr8 (81 HSPs)
chr8 (1-220)||(1484611-1484829)
chr8 (1-220)||(14409179-14409397)
chr8 (1-220)||(24485778-24485997)
chr8 (1-220)||(5853027-5853245)
chr8 (1-220)||(27472151-27472370)
chr8 (1-220)||(16413050-16413269)
chr8 (1-220)||(32121937-32122156)
chr8 (5-219)||(38549743-38549957)
chr8 (1-220)||(4483489-4483708)
chr8 (5-220)||(14823984-14824198)
chr8 (1-220)||(20045930-20046148)
chr8 (1-220)||(22001962-22002180)
chr8 (1-218)||(18677799-18678016)
chr8 (1-220)||(4542108-4542326)
chr8 (1-220)||(15070769-15070988)
chr8 (1-208)||(16198115-16198322)
chr8 (2-217)||(16401660-16401875)
chr8 (6-208)||(25657892-25658094)
chr8 (1-219)||(1326666-1326884)
chr8 (1-209)||(15202913-15203121)
chr8 (1-199)||(24048841-24049038)
chr8 (2-209)||(20403499-20403706)
chr8 (1-219)||(19936642-19936850)
chr8 (10-209)||(45290385-45290584)
chr8 (5-209)||(19896541-19896745)
chr8 (2-136)||(20403765-20403899)
chr8 (1-137)||(15202720-15202856)
chr8 (1-136)||(19896807-19896942)
chr8 (1-135)||(14397475-14397609)
chr8 (1-136)||(38549546-38549681)
chr8 (4-136)||(15202530-15202662)
chr8 (5-136)||(15071046-15071177)
chr8 (1-136)||(27471958-27472093)
chr8 (5-136)||(32122214-32122345)
chr8 (7-136)||(19897000-19897129)
chr8 (4-136)||(16401277-16401408)
chr8 (1-108)||(45290282-45290389)
chr8 (144-219)||(13425336-13425411)
chr8 (1-136)||(16412857-16412992)
chr8 (144-219)||(20982498-20982573)
chr8 (1-136)||(38549354-38549488)
chr8 (144-218)||(20982604-20982678)
chr8 (7-136)||(16401472-16401601)
chr8 (4-128)||(24049104-24049228)
chr8 (144-220)||(38549988-38550064)
chr8 (155-219)||(13425241-13425305)
chr8 (144-220)||(20403436-20403511)
chr8 (144-220)||(45290572-45290647)
chr8 (144-220)||(19896478-19896553)
chr8 (144-220)||(32810140-32810215)
chr8 (145-220)||(19936882-19936956)
chr8 (144-218)||(1326915-1326988)
chr8 (144-220)||(15203109-15203184)
chr8 (144-220)||(16401908-16401983)
chr8 (4-136)||(19936452-19936584)
chr8 (7-114)||(11361024-11361131)
chr8 (148-219)||(21513636-21513707)
chr8 (145-219)||(18815609-18815683)
chr8 (46-116)||(24717750-24717820)
chr8 (145-219)||(36733302-36733376)
chr8 (145-219)||(38988730-38988804)
chr8 (145-219)||(39019827-39019901)
chr8 (47-136)||(1484887-1484976)
chr8 (47-136)||(20045783-20045872)
chr8 (47-116)||(29759429-29759498)
chr8 (68-136)||(5852901-5852969)
chr8 (68-136)||(14409053-14409121)
chr8 (152-219)||(5083001-5083068)
chr8 (46-116)||(39114415-39114485)
chr8 (47-116)||(13663129-13663198)
chr8 (47-116)||(22007126-22007195)
chr8 (145-209)||(19936829-19936893)
chr8 (145-209)||(38549936-38550000)
chr8 (97-136)||(4483765-4483804)
chr8 (97-136)||(14824260-14824299)
chr8 (4-62)||(32810263-32810321)
chr8 (144-220)||(1326862-1326938)
chr8 (145-209)||(13425284-13425348)
chr8 (145-209)||(13425390-13425454)
chr8 (145-209)||(20982552-20982616)
chr8 (157-209)||(32810203-32810255)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (1-220)||(6156-6374)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (1-220)||(94620-94838)
scaffold0023 (5-220)||(17178-17393)
scaffold0023 (31-136)||(17011-17116)
scaffold0023 (47-136)||(94896-94985)
[»] scaffold1792 (3 HSPs)
scaffold1792 (5-220)||(416-631)
scaffold1792 (1-136)||(853-988)
scaffold1792 (54-136)||(693-775)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (1-220)||(40609-40827)
scaffold0044 (95-136)||(40885-40926)
scaffold0044 (46-116)||(37860-37929)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (1-220)||(134420-134638)
scaffold0028 (1-220)||(136889-137107)
scaffold0028 (1-220)||(139358-139576)
scaffold0028 (1-220)||(141827-142045)
scaffold0028 (1-220)||(144296-144514)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (1-219)||(30229-30447)
scaffold0149 (1-136)||(30505-30640)
scaffold0149 (146-220)||(30122-30196)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-220)||(9451-9669)
[»] scaffold0494 (2 HSPs)
scaffold0494 (1-219)||(258-476)
scaffold0494 (144-219)||(507-582)
[»] scaffold0043 (5 HSPs)
scaffold0043 (9-219)||(10001-10211)
scaffold0043 (1-136)||(10277-10412)
scaffold0043 (7-136)||(10470-10599)
scaffold0043 (144-178)||(9936-9970)
scaffold0043 (145-209)||(9958-10022)
[»] scaffold0741 (4 HSPs)
scaffold0741 (1-220)||(4037-4256)
scaffold0741 (1-132)||(3651-3782)
scaffold0741 (1-136)||(3844-3979)
scaffold0741 (84-136)||(3541-3593)
[»] scaffold0716 (2 HSPs)
scaffold0716 (1-220)||(4903-5122)
scaffold0716 (1-136)||(5180-5315)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (1-220)||(6670-6889)
scaffold0317 (4-136)||(6480-6612)
[»] scaffold0306 (4 HSPs)
scaffold0306 (1-220)||(15131-15350)
scaffold0306 (1-178)||(11074-11251)
scaffold0306 (4-136)||(10884-11016)
scaffold0306 (4-136)||(15398-15529)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-220)||(11498-11717)
[»] scaffold0747 (4 HSPs)
scaffold0747 (1-219)||(799-1017)
scaffold0747 (1-136)||(1075-1210)
scaffold0747 (144-220)||(693-768)
scaffold0747 (4-106)||(1225-1326)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (2-220)||(3232-3450)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (7-220)||(53612-53825)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (5-220)||(38394-38609)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (31-220)||(1637-1826)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (1-208)||(6682-6879)
scaffold0574 (1-136)||(6937-7072)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (31-211)||(13391-13571)
scaffold0040 (9-166)||(43002-43159)
scaffold0040 (5-136)||(43225-43356)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (46-202)||(57708-57864)
[»] scaffold0278 (3 HSPs)
scaffold0278 (1-172)||(7996-8167)
scaffold0278 (1-136)||(8225-8360)
scaffold0278 (1-133)||(8421-8553)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (59-220)||(10982-11142)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-163)||(68227-68389)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (2-220)||(501293-501491)
scaffold0001 (5-136)||(501550-501681)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (80-209)||(28061-28190)
scaffold0114 (144-220)||(27998-28073)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (4-136)||(1740-1872)
[»] scaffold0513 (3 HSPs)
scaffold0513 (132-219)||(10647-10734)
scaffold0513 (144-220)||(10765-10840)
scaffold0513 (145-209)||(10713-10777)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (1-135)||(31497-31631)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (1-136)||(18423-18558)
[»] scaffold0711 (3 HSPs)
scaffold0711 (1-135)||(7424-7558)
scaffold0711 (12-136)||(7243-7367)
scaffold0711 (46-134)||(7084-7172)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (1-135)||(17947-18081)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (1-135)||(33465-33599)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (5-136)||(8311-8442)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (1-135)||(39626-39760)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (10-136)||(36749-36875)
scaffold0151 (31-136)||(36963-37068)
[»] scaffold0145 (2 HSPs)
scaffold0145 (144-220)||(9940-10016)
scaffold0145 (146-208)||(10005-10067)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (5-135)||(19827-19957)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (144-220)||(15150-15225)
scaffold0106 (120-219)||(15030-15119)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (30-128)||(113317-113415)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (156-220)||(35955-36019)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (146-209)||(16263-16326)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (46-116)||(6235-6305)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (145-219)||(15287-15361)
scaffold0174 (151-209)||(15350-15408)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (144-220)||(1204-1279)
scaffold0599 (189-219)||(1143-1173)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (46-116)||(8566-8636)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (48-114)||(15780-15846)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (47-116)||(6970-7039)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (49-116)||(28469-28536)
[»] scaffold1186 (1 HSPs)
scaffold1186 (144-209)||(313-378)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (144-209)||(187890-187955)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (145-201)||(66762-66818)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 89)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39682741 - 39682522
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682741 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 39682642  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39682641 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 39682542  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39682541 attgatgaagtgttatatgt 39682522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 23706951 - 23707169
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23706951 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 23707050  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23707051 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatg 23707150  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23707151 attgatgaagtgttatatg 23707169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 571825 - 571606
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  571825 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaatttgag 571726  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  571725 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 571626  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  571625 attaatgaagtgttatatgt 571606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18809370 - 18809152
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18809370 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 18809271  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18809270 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 18809172  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18809171 attgatgaagtgttatatgt 18809152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 23711748 - 23711966
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23711748 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 23711847  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23711848 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 23711946  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23711947 attgatgaagtgttatatgt 23711966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 24529281 - 24529500
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  24529281 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagcacttgag 24529380  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24529381 atatggtgaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 24529480  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24529481 attgatgaagtgttatatgt 24529500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28577526 - 28577308
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28577526 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 28577427  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  28577426 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacaatattgtccatg 28577328  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28577327 attgatgaagtgttatatgt 28577308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 24642483 - 24642701
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  24642483 gtacagaattgctcttaggtgtaaacccaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttaag 24642582  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24642583 ttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatg 24642682  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24642683 attgatgaagtgttatatg 24642701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24918564 - 24918350
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    ||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24918564 agaattggtcttaagtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 24918465  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattg 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24918464 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattg 24918365  T
Q  205 atgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||    
T  24918364 atgaagtgttatatg 24918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23131290 - 23131071
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23131290 gtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 23131191  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23131190 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatg 23131091  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23131090 attgatgaagtgttatatgt 23131071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23133757 - 23133538
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23133757 gtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 23133658  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23133657 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatg 23133558  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23133557 attgatgaagtgttatatgt 23133538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 34402256 - 34402475
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34402256 gtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 34402355  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  34402356 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatg 34402455  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34402456 attgatgaagtgttatatgt 34402475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24671453 - 24671235
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24671453 gtacagaattggtcttaggtgtaaaaacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgttgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 24671354  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24671353 ttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatg 24671254  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24671253 attgatgaagtgttatatg 24671235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20261647 - 20261428
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20261647 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 20261548  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  20261547 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatg 20261448  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20261447 attgatgaagtgttatatgt 20261428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 23709267 - 23709485
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23709267 gtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgcagttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 23709366  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23709367 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 23709465  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23709466 attgatgaagtgttatatgt 23709485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26505806 - 26505588
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  26505806 gtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaactagag 26505707  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  26505706 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatg 26505608  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26505607 attgatgaagtgttatatgt 26505588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26508284 - 26508066
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  26508284 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaagaatttatagaactagag 26508185  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  26508184 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatg 26508086  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26508085 attgatgaagtgttatatgt 26508066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24681872 - 24681654
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||    
T  24681872 gtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttgggcttccaaaggatttatagaacttgag 24681773  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24681772 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatg 24681673  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24681672 attgatgaagtgttatatg 24681654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 220
Target Start/End: Original strand, 32039240 - 32039451
Alignment:
Q  8 attggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggt 107  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32039240 attggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaattttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatggt 32039339  T
Q  108 caaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| ||||    
T  32039340 caaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatctgatattgtccatgatcgatg 32039438  T
Q  208 aagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||||    
T  32039439 aagtgttatatgt 32039451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 24897930 - 24898148
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24897930 gtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 24898029  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24898030 ttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 24898128  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24898129 attgatgaagtgttatatgt 24898148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 24905367 - 24905585
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24905367 gtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 24905466  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24905467 ttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 24905565  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24905566 attgatgaagtgttatatgt 24905585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22105890 - 22105685
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22105890 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagtta 22105791  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgatt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||    
T  22105790 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgatt 22105691  T
Q  204 gatgaa 209  Q
    ||||||    
T  22105690 gatgaa 22105685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 24900413 - 24900631
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24900413 gtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 24900512  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24900513 ttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 24900611  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24900612 attgatgaagtgttatatgt 24900631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 24902890 - 24903108
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24902890 gtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 24902989  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24902990 ttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 24903088  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24903089 attgatgaagtgttatatgt 24903108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 24907842 - 24908060
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24907842 gtacataattggtcataggtgtaaacatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 24907941  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24907942 ttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 24908040  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24908041 attgatgaagtgttatatgt 24908060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Original strand, 10684498 - 10684716
Alignment:
Q  2 tacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  10684498 tacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagc 10684597  T
Q  102 tatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  10684598 tatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatga 10684697  T
Q  202 ttgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  10684698 ttgatgaagggttatatgt 10684716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 38967907 - 38967689
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||  ||||||||| |||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  38967907 gtacataattggtcttaggtgtaaatacgaaagttgtagatatggatgttaggtttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagtatttatagaacttgag 38967808  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| || ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38967807 ttatagtgaaattactgcacgcagctcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatg 38967708  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  38967707 attgttgaagtgttatatg 38967689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 45027639 - 45027840
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  45027639 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgaa 45027738  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  45027739 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 45027837  T
Q  201 att 203  Q
    |||    
T  45027838 att 45027840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24368254 - 24368046
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24368254 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 24368155  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| |||    
T  24368154 ttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatcatgttgtttatg 24368055  T
Q  201 attgatgaa 209  Q
    |||||||||    
T  24368054 attgatgaa 24368046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23136007 - 23135799
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  23136007 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatcccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 23135908  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||| ||||    
T  23135907 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg-----------ttgtgaatacgatattgtccatg 23135819  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23135818 attgatgaagtgttatatgt 23135799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25616579 - 25616390
Alignment:
Q  31 aagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcaca 130  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  25616579 aagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattacttcacgtaggtcaca 25616480  T
Q  131 gtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25616479 atgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 25616390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 32214665 - 32214874
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32214665 gtacaaaattgttcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 32214764  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32214765 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta----------gtatatgtttgtgtatacgatattgttcatg 32214854  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  32214855 attgatgaagtgttatatgt 32214874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21154742 - 21154950
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21154742 gtacagaatttgtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 21154841  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||     
T  21154842 ttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttata 21154941  T
Q  201 attgatgaa 209  Q
    |||||||||    
T  21154942 attgatgaa 21154950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 41523807 - 41524015
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41523807 gtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaacgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 41523906  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||    
T  41523907 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatg 41524006  T
Q  201 attgatgaa 209  Q
    |||||||||    
T  41524007 attgatgaa 41524015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6726466 - 6726267
Alignment:
Q  10 tggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 109  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  6726466 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttaagttatagtca 6726367  T
Q  110 aattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  6726366 aattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 6726267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 6726664 - 6726533
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6726664 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttat 6726565  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6726564 ggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 6726533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22106086 - 22105951
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  22106086 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaatgatttatagaacttgag 22105987  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22105986 ttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 22105951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 41523614 - 41523749
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||  ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41523614 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtatggatgttatctttataatgcccttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 41523713  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41523714 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41523749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 23931888 - 23931775
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23931888 gtacataattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtattgatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 23931789  T
Q  101 ttatggtcaaatta 114  Q
    ||||||||||||||    
T  23931788 ttatggtcaaatta 23931775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 24529094 - 24529223
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24529094 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 24529193  T
Q  107 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24529194 tcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Original strand, 21154553 - 21154684
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  21154553 agaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaatttgagttac 21154652  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21154653 ggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaat 21154684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24918757 - 24918626
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24918757 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaataccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttat 24918658  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24918657 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24918626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24682062 - 24681930
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  24682062 cagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagcattctaatgccgttagtctgacatcaaaaagatttatagagcttgagtta 24681963  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24681962 tggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24681930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24368439 - 24368312
Alignment:
Q  9 ttggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtc 108  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  24368439 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttaagttatggtc 24368340  T
Q  109 aaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24368339 aaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24368312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 134
Target Start/End: Original strand, 45027449 - 45027579
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||    
T  45027449 cagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttcgaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagtta 45027548  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtga 134  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  45027549 tggtcaaattactacacgtaggtcacagtga 45027579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 136
Target Start/End: Original strand, 23709076 - 23709209
Alignment:
Q  3 acagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtt 102  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  23709076 acagaattcgtcctaggtgtaaacacgtaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagtt 23709175  T
Q  103 atggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  23709176 atggtctaattactgcacataggtcacagtgaat 23709209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 132
Target Start/End: Original strand, 41523427 - 41523552
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 106  Q
    ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  41523427 aattggtcttacgtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 41523526  T
Q  107 tcaaattactgaacgtaggtcacagt 132  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41523527 tcaaattactgcacgtaggtcacagt 41523552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24671643 - 24671511
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  24671643 cagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagctttctaatgccatttatttgacatcaaaaatatttatagaacttgagtta 24671544  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24671543 tggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 24671511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Original strand, 21154360 - 21154491
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||| || |    
T  21154360 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaatgatttatagaacttgactttt 21154459  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21154460 agtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 21154491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6726279 - 6726204
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6726279 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 6726204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 23706570 - 23706702
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||  |  ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  23706570 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatggtgttggttctatgtcaaaacaatttatagaacttgagtta 23706669  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23706670 tggtcaagttactgcacgtaggtcacagtgaat 23706702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 23706759 - 23706889
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| |||  ||||||  ||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||||| |||||    
T  23706759 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttatagttatggatgttacctttctaatgccgtaggtctgacgtcaaaacgaattatagaacttgag 23706858  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacag 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23706859 ttatggtcaaattactgcacgtaagtcacag 23706889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 32214471 - 32214604
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||  | |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||  |||||||||| || ||    
T  32214471 gtacaaaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgctctgacgtcaaaacaatttatagaacttaag 32214570  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtga 134  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32214571 ttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtga 32214604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 220
Target Start/End: Original strand, 21154942 - 21155013
Alignment:
Q  148 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21154942 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 21155013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22105697 - 22105622
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22105697 tatgattgatgaattagtatatgtatgtaaatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 22105622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 23707200 - 23707275
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23707200 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 23707275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23932077 - 23931949
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||    
T  23932077 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatttcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttat 23931978  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtg 133  Q
    |||||| |||||  || ||||||||||||    
T  23931977 ggtcaatttacttcacttaggtcacagtg 23931949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 24642732 - 24642807
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24642732 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgt 24642807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38967658 - 38967583
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38967658 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 38967583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24368058 - 24367983
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  24368058 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagtattatatgt 24367983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24918319 - 24918244
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24918319 tatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 24918244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24671201 - 24671129
Alignment:
Q  147 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  24671201 gattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgt 24671129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24681623 - 24681548
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  24681623 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattagatgt 24681548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 31345554 - 31345490
Alignment:
Q  71 ttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31345554 ttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31345490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21368439 - 21368365
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  21368439 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 21368365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 67409 - 67339
Alignment:
Q  46 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  67409 atgttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 67339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23799531 - 23799457
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| || ||||||||||||||| | |||||||    
T  23799531 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgttgaatatgatgttattcatgattgatgaattattatatg 23799457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18809517 - 18809428
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18809517 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18809428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Original strand, 23711622 - 23711690
Alignment:
Q  68 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23711622 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23711690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 136
Target Start/End: Original strand, 24642373 - 24642425
Alignment:
Q  84 gatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  24642373 gatttatagaacttgagttatggtcaaataactacacgtaggtcacagtgaat 24642425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 26505932 - 26505864
Alignment:
Q  68 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26505932 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26505864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 26508410 - 26508342
Alignment:
Q  68 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26508410 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26508342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Original strand, 27920373 - 27920441
Alignment:
Q  68 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27920373 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27920441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Original strand, 32039107 - 32039175
Alignment:
Q  68 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32039107 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32039175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23131386 - 23131347
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23131386 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23131347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 34402160 - 34402199
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34402160 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 34402199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 187
Target Start/End: Original strand, 41524003 - 41524045
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41524003 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatac 41524045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22686221 - 22686152
Alignment:
Q  150 tgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| || ||||||||||||||| | |||||||    
T  22686221 tgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaattattatatg 22686152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 28577673 - 28577584
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  28577673 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 28577584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 34823819 - 34823750
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34823819 tgttagctttctaatgacgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 34823750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 571922 - 571883
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  571922 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 571883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23133853 - 23133814
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23133853 tgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 23133814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 39682838 - 39682799
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39682838 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39682799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 27261402 - 27261332
Alignment:
Q  46 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||  |||| || || |||||||||| ||||||||||    
T  27261402 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaataatttttataacttgagttatgatcaaattact 27261332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22686110 - 22686062
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 193  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  22686110 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 22686062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 23707148 - 23707212
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  23707148 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 23707212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 136
Target Start/End: Original strand, 23708980 - 23709016
Alignment:
Q  100 gttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23708980 gttatggtcaaattactgcacttaggtcacagtgaat 23709016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 24642680 - 24642744
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  24642680 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 24642744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24918371 - 24918307
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  24918371 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 24918307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38249 - 38030
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38249 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 38150  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38149 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 38050  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  38049 attgatgaagtgttatatgt 38030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 38396 - 38307
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38396 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 82)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 456749 - 456530
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456749 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 456650  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  456649 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 456550  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  456549 attgatgaagtgttatatgt 456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27217288 - 27217069
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217288 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 27217189  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27217188 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 27217089  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27217088 attgatgaagtgttatatgt 27217069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 41523345 - 41523126
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523345 gtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 41523246  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41523245 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 41523146  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41523145 attgatgaagtgttatatgt 41523126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 41525807 - 41525588
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525807 gtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 41525708  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41525707 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 41525608  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41525607 attgatgaagtgttatatgt 41525588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16232948 - 16232729
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16232948 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgaattcaaaaggatttatagaatttgag 16232849  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16232848 ttattgtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 16232749  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16232748 attgatgaagtgttatatgt 16232729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 15081576 - 15081794
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15081576 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgag 15081675  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15081676 ttatggtcaaattactgcacgtaggtctaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatg 15081775  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15081776 attgatgaagtgttatatg 15081794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 15376448 - 15376666
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15376448 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 15376547  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15376548 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 15376646  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15376647 attgatgaagtgttatatgt 15376666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 20384858 - 20385076
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20384858 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 20384957  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20384958 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 20385056  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20385057 attgatgaagtgttatatgt 20385076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16214111 - 16213893
Alignment:
Q  2 tacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagt 101  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16214111 tacagaattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagt 16214012  T
Q  102 tatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16214011 tatggtcaaatgactgcacgtaggtcacagtgaataattgaataagattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 16213912  T
Q  202 ttgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16213911 ttgatgaagtgttatatgt 16213893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8940711 - 8940489
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccaca----gaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatt 96  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8940711 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 8940612  T
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8940611 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgtt 8940512  T
Q  197 catgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8940511 catgattgatgaagtgttatatg 8940489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 31 - 220
Target Start/End: Original strand, 11393051 - 11393240
Alignment:
Q  31 aagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcaca 130  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11393051 aagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcata 11393150  T
Q  131 gtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11393151 gtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 11393240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 14948857 - 14949075
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  14948857 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 14948956  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14948957 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 14949055  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14949056 attgatgaagtgttatatgt 14949075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16410486 - 16410268
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16410486 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 16410387  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16410386 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatcaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 16410288  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16410287 attgatgaagtgttatatgt 16410268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 14269691 - 14269909
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14269691 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggttcgacttcaaaaggatttatagaaattgag 14269790  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269791 ttatggtcaaatttttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 14269890  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14269891 attgatgaagtgttatatg 14269909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32125918 - 32125700
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  32125918 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 32125819  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  32125818 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 32125720  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  32125719 attgatgaagtgttatatgt 32125700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8469160 - 8468945
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8469160 cagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttagttttctaatgacgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 8469061  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgatt 203  Q
    || ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8469060 tgatcaaattactgcatgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttttgaatacgatattgttcatgatt 8468961  T
Q  204 gatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||| |||||||||    
T  8468960 gatgaaatgttatatg 8468945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13869776 - 13869557
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13869776 gtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 13869677  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13869676 ttatggttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 13869577  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  13869576 attgatgaagttttatatgt 13869557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 21189330 - 21189548
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21189330 gtacagagttggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagctttttaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 21189429  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21189430 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtata-gtttgtgaatacgatattgtccatg 21189528  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21189529 attgatgaagtgttatatgt 21189548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18627991 - 18627775
Alignment:
Q  3 acagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtt 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  18627991 acagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgattt 18627892  T
Q  103 atggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgat 202  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | ||||    
T  18627891 atagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccgtgat 18627793  T
Q  203 tgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18627792 tgatgaagtgttatatgt 18627775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18640697 - 18640481
Alignment:
Q  3 acagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtt 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  18640697 acagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttataatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgattt 18640598  T
Q  103 atggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgat 202  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  18640597 atagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattactatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgat 18640499  T
Q  203 tgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18640498 tgatgaagtgttatatgt 18640481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11303675 - 11303456
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303675 gtacataattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 11303576  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  11303575 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatg 11303476  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11303475 attgatgaagtgttatatgt 11303456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24702656 - 24702447
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24702656 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 24702557  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  24702556 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtat----------atgtttgtgaatacgatattgttcatg 24702467  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24702466 attgatgaagtgttatatgt 24702447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24705103 - 24704894
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24705103 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 24705004  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  24705003 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtat----------atgtttgtgaatacgatattgttcatg 24704914  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24704913 attgatgaagtgttatatgt 24704894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 45847389 - 45847605
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||  | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  45847389 gtacaaaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaactctgttagtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 45847488  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45847489 ttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtctgtgaatacgatattgttcatg 45847588  T
Q  201 attgatgaagtgttata 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  45847589 attgatgaagtgttata 45847605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18431139 - 18430921
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  18431139 gtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatcttaggtttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 18431040  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18431039 ttatagtcaaattactgcacgtagaacatagtgaataattgaatctgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 18430941  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18430940 attgatgaagtgttatatgt 18430921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 26355716 - 26355934
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26355716 gtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 26355815  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||     
T  26355816 ttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatattgtccata 26355914  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26355915 attgatgaagtgttatatgt 26355934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 26358168 - 26358386
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26358168 gtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 26358267  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||     
T  26358268 ttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatattgtccata 26358366  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26358367 attgatgaagtgttatatgt 26358386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29797037 - 29796819
Alignment:
Q  2 tacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  29797037 tacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagc 29796938  T
Q  102 tatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  29796937 tatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatga 29796838  T
Q  202 ttgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  29796837 ttgatgaagggttatatgt 29796819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29800856 - 29800638
Alignment:
Q  2 tacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  29800856 tacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagc 29800757  T
Q  102 tatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  29800756 tatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatga 29800657  T
Q  202 ttgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  29800656 ttgatgaagggttatatgt 29800638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11972973 - 11972768
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11972973 cagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatctatagaacttgagtta 11972874  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgatt 203  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| || ||| ||||| ||||||    
T  11972873 tagtcaaattactgtacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgcatatgtttatgagtatgatgttgtttatgatt 11972774  T
Q  204 gatgaa 209  Q
    ||||||    
T  11972773 gatgaa 11972768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 16108423 - 16108642
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16108423 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgctgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 16108522  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  16108523 ttatggtcaaattactacacgtacgtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacaatattgtcaatg 16108622  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16108623 attgatgaagtgttatatgt 16108642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 23664687 - 23664906
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23664687 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 23664786  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  23664787 ttatggtcaaattattgcatgtaggtcacagtgaagaattgttgatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatg 23664886  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||  |||||||||    
T  23664887 attgatgaaaggttatatgt 23664906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13841446 - 13841274
Alignment:
Q  37 taggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13841446 taggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13841347  T
Q  137 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  13841346 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 13841274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 38897772 - 38897904
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38897772 cagaattggtcttaggtgtaaactcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagtta 38897871  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38897872 tggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38897904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 14269305 - 14269440
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  14269305 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgatgtcaaaacgatttatagaacttgag 14269404  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14269405 ttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14269440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Original strand, 10501129 - 10501263
Alignment:
Q  2 tacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagt 101  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  10501129 tacagagttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaaatggatttatagaacttgagt 10501228  T
Q  102 tatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  10501229 tatggtcaaattactgcacgaaggtcatagtgaat 10501263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16214302 - 16214170
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16214302 cagaattggtcttaggtgtaaacacaaaggttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaaagatttatagaacttgagtta 16214203  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16214202 tggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 16214170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8940902 - 8940769
Alignment:
Q  2 tacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagt 101  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  8940902 tacataattggtcttaggtgtaaacaaa-aagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagt 8940804  T
Q  102 tatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8940803 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8940769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 14156620 - 14156755
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  14156620 gtacagaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgac 14156719  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  14156720 ttatgatcaaattaccgcatgtaggtcacagtgaat 14156755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 1856964 - 1857097
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||    
T  1856964 gtaccgaattggtcttaggtgtaaacac-gaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaaaacgatttatataacttgag 1857062  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1857063 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 1857097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 25926864 - 25926998
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| || |||||||| |||||    
T  25926864 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaaagagttatagaacttgag 25926963  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25926964 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 25926998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 136
Target Start/End: Original strand, 14156839 - 14156944
Alignment:
Q  31 aagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcaca 130  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14156839 aagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacgtgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcaca 14156938  T
Q  131 gtgaat 136  Q
    ||||||    
T  14156939 gtgaat 14156944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 139 - 219
Target Start/End: Original strand, 38897995 - 38898075
Alignment:
Q  139 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38897995 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 38898075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 21189143 - 21189272
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  21189143 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttttaatgccgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 21189242  T
Q  107 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21189243 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaat 21189272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8941094 - 8940962
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8941094 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgaagtcaaaatgatttatagaacttgagtta 8940995  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    || ||||| ||||| || |||||| ||||||||    
T  8940994 tgctcaaactactgcacataggtcgcagtgaat 8940962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 45847638 - 45847714
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45847638 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgt 45847714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 13918137 - 13918272
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtctt-aggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttga 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||  ||  ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  13918137 gtacagaattggtctttaggtgtaaacacgaaaactgtaggtatgaatgttagctttctaattccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttga 13918236  T
Q  100 gttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13918237 gttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 13918272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 15081389 - 15081512
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 106  Q
    ||||||||||||  |||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15081389 aattggtcttagaagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 15081488  T
Q  107 tcaaattactgaacgtaggtcaca 130  Q
    | ||||||||| ||||||||||||    
T  15081489 ttaaattactgcacgtaggtcaca 15081512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 14269498 - 14269633
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||    
T  14269498 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtatgacgtcaaaaaaatttatagaacttgag 14269597  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||  |||||||| || ||| |||||| |||||||    
T  14269598 ttatcatcaaattattgcacgcaggtcagagtgaat 14269633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 10500962 - 10501064
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||   |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10500962 gtacagaattggtcttaggtgataacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 10501061  T
Q  101 tta 103  Q
    |||    
T  10501062 tta 10501064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 14269940 - 14270015
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14269940 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 14270015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 15081825 - 15081900
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15081825 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 15081900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 38898106 - 38898181
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38898106 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 38898181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 136
Target Start/End: Original strand, 45847249 - 45847331
Alignment:
Q  54 tttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45847249 tttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 45847331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8940458 - 8940383
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8940458 tatgattgatgaattagtatatttatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 8940383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11972780 - 11972705
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  11972780 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgcccatgattgatgaagtgttacatgt 11972705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 17985119 - 17985254
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||   ||||||  |||||||||  |||||||||| | ||||| ||| | ||||| |||||    
T  17985119 gtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtaaggatgttaaatttctaatggagttggtttgattccaaaatgatatttagaacttgag 17985218  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  17985219 ttatagtcaaattactacacgtaggtcatagtgaat 17985254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11310327 - 11310239
Alignment:
Q  49 ttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaata 137  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11310327 ttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaata 11310239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 15119918 - 15119993
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  15119918 tatgatttatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 15119993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8468891 - 8468849
Alignment:
Q  178 ttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8468891 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 8468849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Original strand, 13745569 - 13745643
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||| | |||||||    
T  13745569 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattaatgaattattatatg 13745643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13841270 - 13841221
Alignment:
Q  170 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13841270 gtatatgttt-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 13841221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Original strand, 15376301 - 15376390
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15376301 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15376390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Original strand, 20384711 - 20384800
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20384711 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20384800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38294631 - 38294567
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38294631 atgattgatgaattattctatgaatgtatatgttggcgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 38294567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16410583 - 16410544
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16410583 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16410544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18628090 - 18628051
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18628090 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18628051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18640796 - 18640757
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18640796 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18640757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 26355619 - 26355658
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26355619 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26355658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 26358071 - 26358110
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26358071 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26358110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 126034 - 125965
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  126034 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgagttttagaacttgagttatgatcaaattact 125965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 27217414 - 27217346
Alignment:
Q  68 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27217414 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 27217346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13869872 - 13869833
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13869872 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 13869833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 195
Target Start/End: Original strand, 9743795 - 9743845
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 195  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||||    
T  9743795 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatattgt 9743845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 104
Target Start/End: Original strand, 16202766 - 16202852
Alignment:
Q  18 ggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    ||||||| || | ||||||||||||   ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  16202766 ggtgtaaacataaaagttgtaggtagtgatgttagatttctaatggctttggttttacttcatgatgatttctagaatttgagttat 16202852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8468966 - 8468902
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  8468966 atgattgatgaaatgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 8468902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8940510 - 8940446
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  8940510 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 8940446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 14269888 - 14269952
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  14269888 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 14269952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 15081773 - 15081837
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  15081773 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 15081837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25941571 - 25941523
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 193  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  25941571 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 25941523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 38898054 - 38898118
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  38898054 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 38898118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43747736 - 43747672
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| || |||||| | |||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  43747736 atgattgatgaagtattatatgaaagtatatgttgatgaatatgatgttgttcataattgatgaa 43747672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13820 - 13601
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13820 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttatctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 13721  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13720 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 13621  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  13620 attgatgaagtgttacatgt 13601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13919 - 13878
Alignment:
Q  95 tttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13919 tttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 13878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 4)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14375 - 14156
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14375 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 14276  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14275 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 14176  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14175 attgatgaagtgttatatgt 14156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 23269 - 23484
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23269 agaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttat 23368  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattg 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23369 ggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattg 23468  T
Q  205 atgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  23469 atgaagtgttatatgt 23484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 22912 - 23047
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||||    
T  22912 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacatgag 23011  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23012 ttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 23047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 136
Target Start/End: Original strand, 23125 - 23207
Alignment:
Q  54 tttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23125 tttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 23207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 80)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 45606641 - 45606860
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606641 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 45606740  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45606741 ttatggtcaaattactgaatgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 45606840  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  45606841 attgatgaagtgttatatgt 45606860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 7781081 - 7781300
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7781081 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaacgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 7781180  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7781181 ttatggtcaaattactgaacataggtcacagtgaataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 7781280  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7781281 attgatgaagtgttatatgt 7781300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 53301238 - 53301457
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301238 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 53301337  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53301338 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtacatg 53301437  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  53301438 attgatgaagtgttatatgt 53301457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 46822683 - 46822470
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46822683 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 46822584  T
Q  107 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46822583 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 46822484  T
Q  207 gaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||    
T  46822483 gaagtgttatatgt 46822470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17463605 - 17463387
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17463605 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 17463506  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  17463505 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 17463407  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17463406 attgatgaagtgttatatgt 17463387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34159753 - 34159535
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34159753 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 34159654  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  34159653 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 34159555  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34159554 attgatgaagtgttatatgt 34159535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 12119388 - 12119606
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12119388 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 12119487  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119488 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 12119587  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  12119588 attgatgaagtattatatg 12119606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 55476918 - 55476700
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  55476918 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 55476819  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  55476818 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 55476720  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  55476719 attgatgaagtgttatatgt 55476700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15977960 - 15977742
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15977960 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgag 15977861  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15977860 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 15977762  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  15977761 attgataaagtgttatatgt 15977742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27165680 - 27165461
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27165680 gtacagaattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatcttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 27165581  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27165580 ttatgatcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 27165481  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27165480 attgatgaagtgttatatgt 27165461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 6468869 - 6469087
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6468869 gtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttggaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgag 6468968  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6468969 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 6469067  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6469068 attgatgaagtgttatatgt 6469087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13544451 - 13544234
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13544451 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 13544352  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13544351 ttatagtcaaa-tactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 13544254  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13544253 attgatgaagtgttatatgt 13544234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 16454015 - 16454234
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaa-ggatttatagaatttga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |    
T  16454015 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatggatttatagaactata 16454114  T
Q  100 gttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcat 199  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  16454115 gttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccat 16454213  T
Q  200 gattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16454214 gattgatgaagtgttatatgt 16454234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12567987 - 12567769
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12567987 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 12567888  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12567887 ttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 12567789  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12567788 attgatgaagtgttatatgt 12567769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13436727 - 13436520
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  ||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13436727 gtacataattggtcttaggtataaatacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 13436628  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436627 ttatggtccaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 13436528  T
Q  201 attgatga 208  Q
    ||||||||    
T  13436527 attgatga 13436520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15412859 - 15412640
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  15412859 gtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgat 15412760  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15412759 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgtataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 15412660  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  15412659 attgatgaagttttatatgt 15412640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 54521250 - 54521031
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54521250 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtgggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 54521151  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  54521150 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatg 54521051  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  54521050 attgatgaagtgttatatgt 54521031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8499948 - 8499729
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8499948 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatatggaagttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 8499849  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8499848 ttatggtgaaattacggaacataggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 8499749  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  8499748 attaatgaagttttatatgt 8499729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 13153990 - 13154208
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13153990 gtacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 13154089  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13154090 ttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 13154188  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13154189 attgatgaagtgttatatgt 13154208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 10247458 - 10247676
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  10247458 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgat 10247557  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10247558 ttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 10247656  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10247657 attgatgaagtgttatatgt 10247676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10557330 - 10557117
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10557330 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagttttacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 10557231  T
Q  107 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    ||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10557230 tcagattactgcacataggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgatattgtccatgattgat 10557131  T
Q  207 gaagtgttatatgt 220  Q
    ||||| ||||||||    
T  10557130 gaagttttatatgt 10557117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Original strand, 38961573 - 38961781
Alignment:
Q  2 tacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatg-ccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38961573 tacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagccttctaatggccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 38961672  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||    
T  38961673 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatg 38961772  T
Q  201 attgatgaa 209  Q
    |||||||||    
T  38961773 attgatgaa 38961781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41124367 - 41124159
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41124367 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgatttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 41124268  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||    
T  41124267 ttatagtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaactagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatg 41124168  T
Q  201 attgatgaa 209  Q
    |||||||||    
T  41124167 attgatgaa 41124159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16282492 - 16282701
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16282492 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 16282591  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattg-ttcat 199  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||| || ||    
T  16282592 ttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgttttat 16282691  T
Q  200 gattgatgaa 209  Q
    ||||||||||    
T  16282692 gattgatgaa 16282701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 28848356 - 28848564
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28848356 gtactgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 28848455  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| | ||||    
T  28848456 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg-----------ttgtgaatacgatattttccatg 28848544  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28848545 attgatgaagtgttatatgt 28848564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24514101 - 24513910
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24514101 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagtta 24514002  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 195  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24514001 tggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgt 24513910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25237270 - 25237063
Alignment:
Q  2 tacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25237270 tacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaaaaggatttatagaacttgagt 25237171  T
Q  102 tatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||    
T  25237170 tatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatga 25237071  T
Q  202 ttgatgaa 209  Q
    ||||||||    
T  25237070 ttgatgaa 25237063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Original strand, 13151527 - 13151743
Alignment:
Q  3 acagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13151527 acagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtt 13151626  T
Q  103 atggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgat 202  Q
    || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||      
T  13151627 atagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaaggtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgcc 13151725  T
Q  203 tgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  13151726 tgatgaagtgtgatatgt 13151743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 29544576 - 29544795
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  29544576 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgatttcaaaagaatttatagaacttgag 29544675  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||  |||    
T  29544676 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatctatatatttgttaaaatgatattgtcaatg 29544775  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29544776 attgatgaagtgttatatgt 29544795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 17444498 - 17444706
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17444498 gtacagaattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttattgaacttgag 17444597  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||    
T  17444598 ttatagtcaaatttttgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatg 17444697  T
Q  201 attgatgaa 209  Q
    |||||||||    
T  17444698 attgatgaa 17444706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 53 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12305521 - 12305354
Alignment:
Q  53 ttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattga 152  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  12305521 ttttgtaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattga 12305422  T
Q  153 tgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12305421 tgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgt 12305354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 20629926 - 20630138
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20629926 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 20630025  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgat----tgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 196  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |  ||| || |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  20630026 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattgatgaagtgttatctgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 20630125  T
Q  197 catgattgatgaa 209  Q
     ||||||||||||    
T  20630126 tatgattgatgaa 20630138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25229683 - 25229476
Alignment:
Q  2 tacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25229683 tacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaaaaggatttatagaacttgagt 25229584  T
Q  102 tatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    ||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||    
T  25229583 tatagtcaaattactacacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatga 25229484  T
Q  202 ttgatgaa 209  Q
    ||||||||    
T  25229483 ttgatgaa 25229476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 15465582 - 15465448
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  15465582 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 15465483  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15465482 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 15465448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10379754 - 10379613
Alignment:
Q  2 tacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  10379754 tacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagt 10379655  T
Q  102 tatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaa 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10379654 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 10379613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 8500137 - 8500009
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8500137 agaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttat 8500038  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtg 133  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8500037 ggtcaagttactgcacgtaggtcacagtg 8500009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10557529 - 10557394
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  10557529 gtacagaattggtcttagttgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaacgatttatagaacttgag 10557430  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10557429 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10557394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 27165873 - 27165738
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  27165873 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 27165774  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27165773 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27165738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 41124556 - 41124425
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41124556 agaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttat 41124457  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41124456 gatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41124425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 55319038 - 55319173
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||     
T  55319038 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgaa 55319137  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  55319138 ttatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaat 55319173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Original strand, 14567430 - 14567561
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14567430 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctaacatcaaaaggatttatagaacttgagttat 14567529  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14567530 agtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 14567561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Original strand, 38961383 - 38961514
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38961383 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttat 38961482  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38961483 ggtcaaattgctgcacgtaggtcacagtgaat 38961514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 53301045 - 53301180
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  53301045 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 53301144  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  53301145 ttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaat 53301180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 55318848 - 55318980
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  55318848 cagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatggtagctttctaatgccgttggtatgacatcaaaacgatttatagaacttgagtta 55318947  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  55318948 tggtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaat 55318980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 26054999 - 26055133
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||   |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  26054999 gtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 26055098  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26055099 ttatggtaaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 26055133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 46822881 - 46822747
Alignment:
Q  2 tacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagt 101  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||    
T  46822881 tacataattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagt 46822782  T
Q  102 tatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  46822781 tatcgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 46822747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 20629736 - 20629868
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||  ||||||||||| ||||||||    
T  20629736 cagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacattaaagcgatttatagaacttgagtta 20629835  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20629836 tggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 20629868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Original strand, 13937518 - 13937649
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  13937518 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgtgttat 13937617  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  13937618 ggtcaaattactgcacgtaggccacggtgaat 13937649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 5223811 - 5223677
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  5223811 gtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 5223712  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5223711 ttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaa 5223677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 9707484 - 9707560
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9707484 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgt 9707560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36528569 - 36528447
Alignment:
Q  15 ttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaatta 114  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  36528569 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaatta 36528470  T
Q  115 ctgaacgtaggtcacagtgaata 137  Q
    ||| |||||||||| ||||||||    
T  36528469 ctgcacgtaggtcatagtgaata 36528447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8899378 - 8899303
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8899378 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 8899303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 16282689 - 16282764
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16282689 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 16282764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 17444694 - 17444769
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17444694 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 17444769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Original strand, 16282303 - 16282434
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||  ||| |||||  ||| || |||  |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16282303 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttatctttttaatgttgttagtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttat 16282402  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16282403 ggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 16282434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 136
Target Start/End: Original strand, 16358239 - 16358344
Alignment:
Q  31 aagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcaca 130  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  16358239 aagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaacggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcgcataggtcaca 16358338  T
Q  131 gtgaat 136  Q
     |||||    
T  16358339 ttgaat 16358344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 38961769 - 38961844
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  38961769 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgt 38961844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 41124171 - 41124096
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  41124171 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattggtgaagtgttatatgt 41124096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 137
Target Start/End: Original strand, 3264325 - 3264431
Alignment:
Q  31 aagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcaca 130  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||| || ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3264325 aagttgtaggtatggatgttagatttctaaggccgttgatttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcaca 3264424  T
Q  131 gtgaata 137  Q
    |||||||    
T  3264425 gtgaata 3264431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 11913928 - 11914003
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11913928 tatgattgatgaattagtatatgtatgtacatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 11914003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 17393336 - 17393201
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  ||||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||    
T  17393336 gtacagaattggtcttagatgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttccaatggcgttggtttgactccaaaatgatttttagaacattag 17393237  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||| |||||||    
T  17393236 ttatagtcaaattactacacataggtcatagtgaat 17393201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 17444308 - 17444440
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||  ||||||  ||||||||| ||||||| | || ||||||  ||||||| || ||||| ||    
T  17444308 cagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaagtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctaacgtcaaaacaatttatacaacttgagcta 17444407  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17444408 tggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 17444440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25237075 - 25237009
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25237075 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 25237009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15008052 - 15007988
Alignment:
Q  72 tgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15008052 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15007988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25201397 - 25201323
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  25201397 atgattgatgaattattatatgaatgtatatattgatgaatatgatattgttcatgattaatgaattattatatg 25201323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 34159900 - 34159811
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34159900 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 34159811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 17463731 - 17463663
Alignment:
Q  68 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17463731 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 17463663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 30152518 - 30152450
Alignment:
Q  48 gttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  30152518 gttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaatttgagttatgatcaaattact 30152450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 55477015 - 55476976
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55477015 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 55476976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 203
Target Start/End: Original strand, 15025934 - 15025992
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgatt 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  15025934 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgatgatgaatatgatattgttcatgatt 15025992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17044395 - 17044330
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||   ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17044395 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatattgacgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 17044330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 25058367 - 25058298
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25058367 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 25058298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 49231837 - 49231768
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  49231837 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 49231768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 6468772 - 6468811
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6468772 tgagttatggtcaaattactgcacgtatgtcacagtgaat 6468811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15412955 - 15412916
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15412955 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15412916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 219
Target Start/End: Original strand, 11913867 - 11913897
Alignment:
Q  189 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11913867 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 11913897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 190
Target Start/End: Original strand, 18700200 - 18700245
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgat 190  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  18700200 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatacgat 18700245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 199
Target Start/End: Original strand, 50351664 - 50351717
Alignment:
Q  146 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcat 199  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  50351664 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcat 50351717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 11913876 - 11913940
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  11913876 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 11913940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 12119585 - 12119649
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||| ||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  12119585 atgattgatgaagtattatatgaatgtatatatttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 12119649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 43)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 21474821 - 21475040
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474821 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 21474920  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21474921 ttatggtcaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 21475020  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21475021 attgatgaagtgttatatgt 21475040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13989293 - 13989075
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13989293 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 13989194  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13989193 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 13989095  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13989094 attgatgaagtgttatatgt 13989075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 21923026 - 21923244
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  21923026 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 21923125  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21923126 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 21923224  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21923225 attgatgaagtgttatatgt 21923244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16362346 - 16362127
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16362346 gtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaatgcggttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttaag 16362247  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16362246 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgttaatacgatattgtccatg 16362147  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16362146 attgatgaagtgttatatgt 16362127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 15859743 - 15859961
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  15859743 gtacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatacaacttgag 15859842  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||    
T  15859843 ttatggtcaaataactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-cttgcgaatacgatattgtccatg 15859941  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
     |||||||||||||||||||    
T  15859942 gttgatgaagtgttatatgt 15859961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21841194 - 21840976
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21841194 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 21841095  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  21841094 ttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatg 21840996  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21840995 attgatgaagtgttatatgt 21840976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 16274990 - 16275209
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaa-tgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttga 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16274990 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaatgtcattggtttcacttcaaaaggatttatagaacttga 16275089  T
Q  100 gttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcat 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16275090 gttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatacgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgatattgttcat 16275189  T
Q  200 gattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16275190 gattgatgaagtgttatatg 16275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 27161321 - 27161529
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27161321 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 27161420  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||    
T  27161421 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttatgaataaaatattgttaatg 27161520  T
Q  201 attgatgaa 209  Q
    |||||||||    
T  27161521 attgatgaa 27161529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29777168 - 29776960
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29777168 gtacataattggtcttaggtgtaatcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgggttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 29777069  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||    
T  29777068 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatg 29776969  T
Q  201 attgatgaa 209  Q
    |||||||||    
T  29776968 attgatgaa 29776960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 23593474 - 23593687
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 106  Q
    |||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||| ||||| |    
T  23593474 aattagtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaataatttatagaacttgcgttatag 23593573  T
Q  107 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  23593574 ttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaat 23593673  T
Q  207 gaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||    
T  23593674 gaagtgttatatgt 23593687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29298669 - 29298461
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29298669 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 29298570  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||    
T  29298569 ttatagtcaaattactgcacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatg 29298470  T
Q  201 attgatgaa 209  Q
    |||||||||    
T  29298469 attgatgaa 29298461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31612793 - 31612585
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31612793 gtaccgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttcaaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 31612694  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | || ||||||||| |||    
T  31612693 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcaaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatcagtatgatattgtttatg 31612594  T
Q  201 attgatgaa 209  Q
    |||||||||    
T  31612593 attgatgaa 31612585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 22122752 - 22122968
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  22122752 cagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgggtta 22122851  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgatt 203  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||    
T  22122852 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgatt 22122951  T
Q  204 gatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||| || |||||||    
T  22122952 gatgaattggtatatgt 22122968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Original strand, 22050574 - 22050779
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |  |||| | |  |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22050574 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcaatggtctaatgtcaaaacgatttatagaacttgagtta 22050673  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgatt 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||    
T  22050674 tggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgatt 22050773  T
Q  204 gatgaa 209  Q
    ||||||    
T  22050774 gatgaa 22050779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13227291 - 13227129
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13227291 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttttatgtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 13227192  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 163  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13227191 ttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 13227129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 29535479 - 29535317
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||  ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  29535479 gtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgtcgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgag 29535380  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 163  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29535379 ttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 29535317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29777361 - 29777226
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||    
T  29777361 gtacagaattagtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgttaaaacgatttatagaacttgag 29777262  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29777261 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacaatgaat 29777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 31612982 - 31612851
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||  || | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31612982 agaattggtcttaggtgtaaacactaaagttataggtatggatttaagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgagttat 31612883  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31612882 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 31612851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 9044739 - 9044867
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||    
T  9044739 gtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagttttctaatgccgttggtctaacgtcaaaacgatttatagaacttgag 9044838  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcac 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9044839 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 9044867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29298859 - 29298727
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  29298859 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgttctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagtta 29298760  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29298759 tggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 29298727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 15859537 - 15859672
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||    
T  15859537 gtacagaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacctcaaaactatttatagaacttgag 15859636  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15859637 ttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15859672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 22122558 - 22122691
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccac-agaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22122558 cagaattggtcttaggtgtaaacactaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttacttcaaaacgatttgtagaacttgagtt 22122657  T
Q  103 atggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  22122658 atggtcaaattactgcacatagatcacagtgaat 22122691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 31613173 - 31613044
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31613173 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaggtttctaataccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 31613074  T
Q  107 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31613073 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 31613044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 16274800 - 16274932
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||  | ||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  16274800 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcattggtctgacgtcaaaactatttatagaacttgagtta 16274899  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16274900 tggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 16274932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 16275240 - 16275316
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16275240 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 16275316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 27161131 - 27161263
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |||    
T  27161131 cagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgaatta 27161230  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27161231 tggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 27161263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16401542 - 16401407
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||||| |||||| | || ||||| | || |  |||||||||||| || |||||    
T  16401542 gtacagaattggtcttaggtgtagacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctatttccattggtctaacgtggaaaggatttatataacttgag 16401443  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16401442 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16401407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 40129509 - 40129387
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  40129509 cagaattgatcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcgttggtctggcatcaaaacgatttatagaacttgagtta 40129410  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggt 126  Q
    | |||||||||||| ||||||||    
T  40129409 tagtcaaattactgcacgtaggt 40129387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 22050767 - 22050842
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22050767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 22050842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29776972 - 29776897
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29776972 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 29776897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29298420 - 29298345
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29298420 tatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 29298345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 22122945 - 22123020
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22122945 tatgattgatgaattggtatatgtatgtttatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 22123020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31612597 - 31612522
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31612597 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtattatatgt 31612522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Original strand, 27161518 - 27161592
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27161518 atgattgatgaattagtatatatatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 27161592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 136
Target Start/End: Original strand, 10812612 - 10812682
Alignment:
Q  66 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10812612 ttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10812682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29298473 - 29298408
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  29298473 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29298408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13989440 - 13989351
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13989440 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13989351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 43543329 - 43543269
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaat 61  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  43543329 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 43543269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 16656002 - 16655942
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggt 107  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  16656002 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 16655942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12710211 - 12710152
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattg 204  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||| |||||    
T  12710211 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcacgattg 12710152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 21474724 - 21474763
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21474724 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 21474763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 16275188 - 16275252
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  16275188 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 16275252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 193
Target Start/End: Original strand, 22824136 - 22824184
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 193  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  22824136 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 22824184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21175 - 20956
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21175 gtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 21076  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21075 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 20976  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20975 attgatgaagtgttatatgt 20956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 184; Significance: 1e-100; HSPs: 62)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8055457 - 8055238
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055457 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 8055358  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8055357 ttatggtcaaattactgaatgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 8055258  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8055257 attgatgaagtgttatatgt 8055238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 18334327 - 18334545
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18334327 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 18334426  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18334427 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 18334525  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18334526 attgatgaagtgttatatgt 18334545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24422974 - 24422756
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24422974 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 24422875  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24422874 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 24422776  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24422775 attgatgaagtgttatatgt 24422756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33862221 - 33862003
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33862221 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 33862122  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33862121 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 33862023  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  33862022 attgatgaagtgttatatgt 33862003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33864705 - 33864487
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33864705 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 33864606  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33864605 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 33864507  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  33864506 attgatgaagtgttatatgt 33864487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 1540650 - 1540864
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1540650 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 1540749  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattg 204  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1540750 agtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattg 1540848  T
Q  205 atgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  1540849 atgaagtgttatatgt 1540864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12742741 - 12742526
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12742741 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 12742642  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattg 204  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  12742641 agtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgaccttgtccatgattg 12742542  T
Q  205 atgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  12742541 atgaagtgttatatgt 12742526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 17377582 - 17377801
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17377582 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaagtatttatagaacttgag 17377681  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17377682 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaaatagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatg 17377781  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17377782 attgatgaagtgttatatgt 17377801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1598484 - 1598266
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1598484 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 1598385  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1598384 tcatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 1598286  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1598285 attgatgaagtgttatatgt 1598266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 30676444 - 30676663
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  30676444 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaataatttatagaacttgag 30676543  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676544 ttatggtaaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 30676643  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30676644 attgatgaagtgttatatgt 30676663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34963801 - 34963582
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  34963801 gtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 34963702  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963701 ttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 34963602  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34963601 attgatgaagtgttatatgt 34963582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 19847706 - 19847921
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19847706 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat----gctagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 19847801  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19847802 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 19847901  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19847902 attgatgaagtgttatatgt 19847921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 2290915 - 2291133
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  2290915 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 2291014  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  2291015 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 2291113  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  2291114 actgatgaagtgttatatgt 2291133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22782654 - 22782436
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22782654 gtacagaattggtcttaggtgtaagtaggaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaatttgag 22782555  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  22782554 ttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatg 22782456  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22782455 attgatgaagtgttatatgt 22782436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 26924375 - 26924593
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26924375 gtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 26924474  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26924475 ttatggtcaaattactgcacgtacgtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 26924573  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26924574 attgatgaagtgttatatgt 26924593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 31630275 - 31630493
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31630275 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatagacgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 31630374  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630375 ttatggtcaaattattgcacgtatgtcacaatgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 31630474  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  31630475 attgataaagtgttatatg 31630493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25688930 - 25688711
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25688930 gtaccgaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaaattgag 25688831  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  25688830 ttatggtcaaattactgcacgtaggtgacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgtccatg 25688731  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  25688730 attgaggaagtgttatatgt 25688711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18914360 - 18914142
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18914360 gtacataattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgctgttggtttaacttcaaaaggatgtatagaacttgag 18914261  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18914260 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtaaatacgatattgttcatg 18914161  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18914160 attgatgaagtgttatatg 18914142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19005579 - 19005361
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19005579 gtacataattagtcttaggtgtaaacacaaaaattgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 19005480  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  19005479 ttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattactataggtatgtatatgtttgtgaatgcgatattgttcata 19005380  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  19005379 attgatgaaatgttatatg 19005361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 19858657 - 19858872
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19858657 gtacataattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgtc---tttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 19858753  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  19858754 ttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ctgtgaatacgatattgtccatg 19858852  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19858853 attgatgaagtgttatatgt 19858872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25535831 - 25535641
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25535831 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttat 25535732  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 195  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25535731 ggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 25535641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23992847 - 23992632
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||| || |||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23992847 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctaatgttgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagtta 23992748  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgatt 203  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  23992747 tggtcaatttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 23992649  T
Q  204 gatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  23992648 gatgaagtgttatatgt 23992632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 28289071 - 28289288
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28289071 gtacataattggtctcaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 28289170  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||    
T  28289171 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtga--gcgatattgtccatg 28289268  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28289269 attgatgaagtgttatatgt 28289288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 54 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12942576 - 12942410
Alignment:
Q  54 tttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgat 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  12942576 tttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcgaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgat 12942477  T
Q  154 gaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12942476 gaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgt 12942410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19005772 - 19005637
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19005772 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacttcaaaacgatttatagaacttgag 19005673  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19005672 ttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19005637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18914743 - 18914615
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  18914743 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgtcgttggtctgacatcaaaaaaatttatagaacttgagtta 18914644  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagt 132  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18914643 tggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 18914615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15875734 - 15875621
Alignment:
Q  96 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||    
T  15875734 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgtttgtgaatacgatattgt 15875645  T
Q  196 tcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15875644 tcatgattgatgaagtgttatatg 15875621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 1899 - 2034
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  1899 gtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 1998  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1999 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 8858 - 8993
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  8858 gtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 8957  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8958 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1598677 - 1598542
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||    
T  1598677 gtacataaatggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacatcaaaacaatttatagaacttgag 1598578  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1598577 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 26924182 - 26924313
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||| | ||| ||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  26924182 gtacagaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 26924281  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26924282 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 26924313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 23415392 - 23415258
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||    
T  23415392 gtacagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccattggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgag 23415293  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  23415292 ttatggtcaagttactgcacgtaggtcactgtgaa 23415258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 31630524 - 31630600
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31630524 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 31630600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25689123 - 25688988
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||||||| ||| |    
T  25689123 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaaaaatttatagaacttgcg 25689024  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  25689023 ttatggtcatattactgcacgtaggtcatagtgaat 25688988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1598867 - 1598735
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||| || |||||| ||   |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||||    
T  1598867 cagaattggtcataagtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgacgttaaaacgatttatagaacttgagtta 1598768  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1598767 tggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 107 - 242
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||    
T  107 gtacaaaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgaaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatataacttgag 206  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  207 ttatggtcaaagtactgcacgtaggtcatagtgaat 242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 19847513 - 19847648
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  19847513 gtacataattggtcctaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattagtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 19847612  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19847613 ttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19847648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 30676251 - 30676386
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||  |  ||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  30676251 gtacataattggtcttaggtgataagactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgctctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 30676350  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30676351 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30676386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 27557150 - 27557016
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||   |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| | ||||  |||||||||| |||||    
T  27557150 gtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgttaaaacaatttatagaacttgag 27557051  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27557050 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 27557016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25689313 - 25689181
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |  |||| ||  |||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  25689313 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtgtggatgtcagcattctaatgacgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagtta 25689214  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25689213 tggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 25689181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18914553 - 18914422
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| |||| |||||| |||||    
T  18914553 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaataccgttggtctgaagtcaaaacgattgatagaacttgag 18914454  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagt 132  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18914453 ttatggtcaaagtactgcacgtaggtcacagt 18914422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18914111 - 18914036
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18914111 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtta-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 18914036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19005330 - 19005255
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19005330 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgt 19005255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25737247 - 25737128
Alignment:
Q  17 aggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  25737247 aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacatgagttatggtcatattact 25737148  T
Q  117 gaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    | | ||||||||||||||||    
T  25737147 gcatgtaggtcacagtgaat 25737128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 116
Target Start/End: Original strand, 31630090 - 31630197
Alignment:
Q  9 ttggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtc 108  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31630090 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtc 31630189  T
Q  109 aaattact 116  Q
    ||||||||    
T  31630190 aaattact 31630197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 15892143 - 15892231
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattta 89  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892143 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattta 15892231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 22981326 - 22981416
Alignment:
Q  46 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22981326 atgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 22981416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23807082 - 23806992
Alignment:
Q  46 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23807082 atgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23806992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15875590 - 15875515
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  15875590 tatgattgatgaattattatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtaaatgattaatgaaatgttatatgt 15875515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25656897 - 25656838
Alignment:
Q  161 tatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  25656897 tatatgtatgtatatatttgtgactacgatattgtccaagattgatgaagtgttatatgt 25656838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 35056781 - 35056707
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  35056781 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgattatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 35056707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 17883232 - 17883305
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttga 74  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||    
T  17883232 gtacagaattggtctttggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcattctaatgtcgttggtttga 17883305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Original strand, 18334180 - 18334269
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18334180 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18334269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24423121 - 24423032
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24423121 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24423032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 33864831 - 33864763
Alignment:
Q  68 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33864831 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 33864763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 32259136 - 32259078
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgatt 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  32259136 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgatt 32259078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Original strand, 26924056 - 26924124
Alignment:
Q  68 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26924056 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 26924124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 2290818 - 2290857
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2290818 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2290857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15875642 - 15875567
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  15875642 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattattatatgt 15875567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22782751 - 22782712
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22782751 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 22782712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 211
Target Start/End: Original strand, 17883303 - 17883333
Alignment:
Q  181 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17883303 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 17883333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18914163 - 18914099
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  18914163 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 18914099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 184; Significance: 1e-100; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29267781 - 29267570
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29267781 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 29267682  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  29267681 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatg 29267582  T
Q  201 attgatgaagtg 212  Q
    ||||||||||||    
T  29267581 attgatgaagtg 29267570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 15118087 - 15118305
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15118087 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 15118186  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15118187 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 15118285  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15118286 attgatgaagtgttatatgt 15118305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 52872807 - 52873025
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52872807 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 52872906  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872907 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 52873006  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  52873007 attgatgatgtgttatatg 52873025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3515435 - 3515216
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3515435 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 3515336  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3515335 ctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgttcatg 3515236  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3515235 attgatgaagtgttatatgt 3515216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 50222074 - 50222292
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  50222074 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagatgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 50222173  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  50222174 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 50222272  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  50222273 attgatgaagtgttatatgt 50222292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 14970445 - 14970660
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14970445 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttat 14970544  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattg 204  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14970545 ggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcataattg 14970644  T
Q  205 atgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  14970645 atgaagtgttatatgt 14970660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44615716 - 44615497
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  44615716 gtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaatttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 44615617  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44615616 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 44615517  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  44615516 attgatgaagtgttatatgt 44615497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 19617801 - 19618019
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19617801 gtacagagttggtcttaggtgttaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgctgttggtgtgacttcaaaaggatttatagaagttgag 19617900  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19617901 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatg 19618000  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19618001 attgatgaagtgttatatg 19618019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 15495908 - 15496126
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||||    
T  15495908 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttaaattcgaaaggttttatagaacttgag 15496007  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15496008 ttatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttctgaatacgatattgttcatg 15496107  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15496108 attgatgaagtgttatatg 15496126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 362607 - 362390
Alignment:
Q  2 tacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagt 101  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  362607 tacaaaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttagtttgacttcaaaacgatttatagaacttgatt 362508  T
Q  102 tatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362507 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 362408  T
Q  202 ttgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  362407 ttgatgaagtgttatatg 362390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15534609 - 15534390
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15534609 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 15534510  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  15534509 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatg 15534410  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15534409 attgatgaagtgttatatgt 15534390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 14746246 - 14746464
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14746246 gtacagaattggtcttcggtgtaaggacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgactttaaaaggatttatagaacttgag 14746345  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  14746346 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtttgtgaatactattatgttcatg 14746445  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14746446 attgatgaagtgttatatg 14746464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 44772822 - 44773036
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44772822 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttat 44772921  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattg 204  Q
     |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  44772922 agtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattg 44773020  T
Q  205 atgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  44773021 atgaagtgttatatgt 44773036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 7640921 - 7641137
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7640921 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccattggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgag 7641020  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7641021 ttatagttaaattactgcctgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatatttttcatg 7641119  T
Q  201 attgatgaagtgttatat 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7641120 attgatgaagtgttatat 7641137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19243128 - 19242909
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||   |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  19243128 gtacagaattagtcttaggtataaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 19243029  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19243028 ttatggttaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 19242929  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19242928 attgatgaagtgttatatgt 19242909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36038298 - 36038079
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36038298 gtacagaattggccttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 36038199  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  36038198 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaagatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatg 36038099  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36038098 attgatgaagtgttatatgt 36038079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 49547508 - 49547727
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49547508 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 49547607  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  49547608 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaagaattatttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatg 49547707  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  49547708 attgatgaagtgttatatgt 49547727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 11989 - 12197
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11989 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatcaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 12088  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||  || ||||| |||    
T  12089 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgtgtattatgttgtttatg 12188  T
Q  201 attgatgaa 209  Q
    |||||||||    
T  12189 attgatgaa 12197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 52312989 - 52312782
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  52312989 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggttttacttcaaaaggatttatagaacttgag 52312890  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||    
T  52312889 ttatagtc-aattactgcacgcaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatg 52312791  T
Q  201 attgatgaa 209  Q
    |||||||||    
T  52312790 attgatgaa 52312782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19858006 - 19857798
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||     
T  19858006 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaataatttatagaacttgat 19857907  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  19857906 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgtttgtgaatacgatattgttcatg 19857817  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19857816 attgatgaagtgttatatg 19857798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14049005 - 14048786
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||   ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  14049005 gtacataattggttttaggtgtaaacatgaaagttgtgggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttacagaacttgtg 14048906  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  14048905 ttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgataaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtcaatg 14048806  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  14048805 attgatgaggtgttatatgt 14048786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 1837254 - 1837462
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  1837254 gtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttaaaaaggatttatagaactagag 1837353  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| |||||||||| ||||    
T  1837354 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg-----------ttgtgaaaacgatattgtccatg 1837442  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  1837443 attgatgaagttttatatgt 1837462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 219
Target Start/End: Original strand, 18214992 - 18215121
Alignment:
Q  90 tagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacga 189  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18214992 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttattaatacga 18215091  T
Q  190 tattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215092 tattgttcatgattgatgaagtgttatatg 18215121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 219
Target Start/End: Original strand, 15355071 - 15355171
Alignment:
Q  119 acgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatat 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355071 acgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatat 15355170  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  15355171 g 15355171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Original strand, 15495716 - 15495850
Alignment:
Q  2 tacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  15495716 tacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagt 15495815  T
Q  102 tatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15495816 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15495850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 362801 - 362668
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  362801 gtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacatcaaaaagatttatagaacttgag 362702  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  362701 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtga 362668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 18214748 - 18214880
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18214748 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagtta 18214847  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18214848 tggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 18214880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 362990 - 362859
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  362990 agaattggtcttaggtgtaaacccgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaatttgagttat 362891  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  362890 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 362859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 14970248 - 14970383
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||  | |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  14970248 gtacacaattggtcttaggtgataacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 14970347  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14970348 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14970383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 220
Target Start/End: Original strand, 18239250 - 18239372
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 196  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  18239250 tgagttattgtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaatttttgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtc 18239348  T
Q  197 catgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18239349 catgattgatgaagtgttatatgt 18239372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19858199 - 19858064
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  19858199 gtacagaattggtcttaggtgcaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 19858100  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19858099 ttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 19858064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14185726 - 14185621
Alignment:
Q  31 aagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcaca 130  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14185726 aagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgaacgtaggtcaca 14185627  T
Q  131 gtgaat 136  Q
    ||||||    
T  14185626 gtgaat 14185621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 3515625 - 3515493
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3515625 cagaattggtcttaggcgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctcacgtcaaaacgatttatagaacttgagtta 3515526  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3515525 tggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3515493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 52313179 - 52313047
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |||    
T  52313179 cagaattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgcctttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgattta 52313080  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52313079 tggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 52313371 - 52313240
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    ||||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  52313371 agaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttat 52313272  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52313271 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 52872614 - 52872749
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  52872614 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattctgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 52872713  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52872714 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52872749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 14746053 - 14746188
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  14746053 gtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 14746152  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  14746153 ttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 14746188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 19617608 - 19617743
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||| ||| |||||    
T  19617608 gtacataattggtcttaggtgtagacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctaacgccaaaatgatttattgaacttgag 19617707  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19617708 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19617743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 12185 - 12260
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12185 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 12260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 18215152 - 18215227
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18215152 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 18215227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19857767 - 19857700
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19857767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 19857700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30147343 - 30147189
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||  || | |  ||   |||| | ||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  30147343 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaagtatggatataaaattaaaaatgacattggtatgacaacaaaaagatttatagaacttgag 30147244  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 155  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30147243 ttatggtcaaattactacacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 30147189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 15355202 - 15355277
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15355202 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgt 15355277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 52312794 - 52312719
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  52312794 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgt 52312719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 14746495 - 14746570
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14746495 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 14746570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 15496949 - 15497024
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15496949 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 15497024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 19618050 - 19618125
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19618050 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 19618125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 52873056 - 52873131
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52873056 tatgattgatgaattaatatacgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 52873131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Original strand, 22725313 - 22725401
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22725313 tgttagctttctaat-ccgttggtttgacatcaaaatgatttataggacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacactgaat 22725401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 132
Target Start/End: Original strand, 14745925 - 14745991
Alignment:
Q  66 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagt 132  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14745925 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagcacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 14745991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 14951340 - 14951270
Alignment:
Q  46 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14951340 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 14951270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Original strand, 15117940 - 15118029
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15117940 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15118029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 114
Target Start/End: Original strand, 55377225 - 55377293
Alignment:
Q  46 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaatta 114  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  55377225 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 55377293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 178 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 362336 - 362294
Alignment:
Q  178 ttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  362336 ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 362294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 14995713 - 14995644
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14995713 tgttagctttctaatgtcgttggtttgaggtctaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 14995644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 136
Target Start/End: Original strand, 44772723 - 44772760
Alignment:
Q  99 agttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44772723 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 44772760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Original strand, 7640824 - 7640863
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7640824 tgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 7640863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Original strand, 19617998 - 19618073
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  19617998 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattggtatatgt 19618073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 12778417 - 12778459
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtat 43  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  12778417 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 12778459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14629493 - 14629428
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  14629493 tatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcgttcattattgatgaa 14629428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 362411 - 362347
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  362411 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 362347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 14746443 - 14746507
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  14746443 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 14746507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 15355150 - 15355214
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  15355150 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 15355214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19857819 - 19857755
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  19857819 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 19857755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 219
Target Start/End: Original strand, 26922437 - 26922489
Alignment:
Q  167 tatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  26922437 tatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 26922489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 2154366 - 2154585
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2154366 gtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 2154465  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2154466 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatactgtccatg 2154565  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2154566 attgatgaagtgttatatgt 2154585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 17516898 - 17517117
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17516898 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 17516997  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17516998 ttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 17517097  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17517098 attgatgaagtgttatatgt 17517117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 20901655 - 20901873
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20901655 gtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 20901754  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901755 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 20901854  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20901855 attgatgaagtgttatatg 20901873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 264503 - 264721
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  264503 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 264602  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  264603 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 264701  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  264702 attgatgaagtgttatatgt 264721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20909439 - 20909221
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20909439 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 20909340  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20909339 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 20909241  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20909240 attgatgaagtgttatatgt 20909221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38619864 - 38619645
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38619864 gtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 38619765  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38619764 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 38619665  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  38619664 attgatgaagttttatatgt 38619645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Original strand, 42245101 - 42245318
Alignment:
Q  2 tacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||    
T  42245101 tacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaatggatttatagaactatagt 42245200  T
Q  102 tatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  42245201 tatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatga 42245299  T
Q  202 ttgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||||||||||    
T  42245300 ttgatgaagtgttatatgt 42245318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 10732675 - 10732893
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  10732675 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 10732774  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  10732775 ttatagtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgattttgtccatg 10732873  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10732874 attgatgaagtgttatatgt 10732893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39245563 - 39245345
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  39245563 gtacataattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgat 39245464  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  39245463 ttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 39245365  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39245364 attgatgaagtgttatatgt 39245345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23064941 - 23064722
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||  |||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23064941 gtacagaattggtcttagatataaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctagtgccgttcgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 23064842  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23064841 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 23064742  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  23064741 attgatgaagttttatatgt 23064722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39363812 - 39363593
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  39363812 gtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgatttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 39363713  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  39363712 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatg 39363613  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39363612 attgatgaagtgttatatgt 39363593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29346407 - 29346189
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  29346407 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgat 29346308  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29346307 ttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 29346209  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29346208 attgatgaagtgttatatgt 29346189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 20917581 - 20917789
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20917581 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 20917680  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||    
T  20917681 ttatagtcaaattactgcacgtaagtcacggtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatg 20917780  T
Q  201 attgatgaa 209  Q
    |||||||||    
T  20917781 attgatgaa 20917789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32027873 - 32027665
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32027873 gtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 32027774  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||    
T  32027773 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatg 32027674  T
Q  201 attgatgaa 209  Q
    |||||||||    
T  32027673 attgatgaa 32027665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29348880 - 29348662
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  29348880 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgat 29348781  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29348780 ttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 29348682  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29348681 attgatgaagtgttatatgt 29348662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29351353 - 29351135
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  29351353 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgat 29351254  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29351253 ttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 29351155  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29351154 attgatgaagtgttatatgt 29351135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 37804637 - 37804856
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  37804637 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgag 37804736  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  37804737 ttatggtcaaattaatgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatg 37804836  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||| |||||| |||||||||    
T  37804837 attaatgaagcgttatatgt 37804856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29330410 - 29330203
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  29330410 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgctgttggtttgatttcaaaaggatttatagaacttgag 29330311  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||| ||||| |||    
T  29330310 ttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaa-aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttacgagtatgatgttgtttatg 29330212  T
Q  201 attgatgaa 209  Q
    |||||||||    
T  29330211 attgatgaa 29330203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9776781 - 9776567
Alignment:
Q  6 gaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 105  Q
    ||||||||||| ||||||| ||   ||||||||| ||   ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9776781 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatg 9776682  T
Q  106 gtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattga 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||     
T  9776681 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgg 9776582  T
Q  206 tgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||| |||||||||    
T  9776581 tgaagggttatatgt 9776567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 296009 - 296144
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||    
T  296009 gtacagaattggtcttaggtgtatacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgag 296108  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  296109 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacactgaat 296144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 17516512 - 17516647
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  17516512 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgag 17516611  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  17516612 ttatggtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 17516647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29330599 - 29330468
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29330599 agaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaggccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttat 29330500  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  29330499 ggtcaaattaatgcacgtatgtcacagtgaat 29330468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 136
Target Start/End: Original strand, 295821 - 295951
Alignment:
Q  6 gaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 105  Q
    |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| | |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  295821 gaataggtcttaggtgtaaccatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgatctgacatcaaaacgatttatagaacttgagttatg 295920  T
Q  106 gtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  295921 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 295951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32028256 - 32028124
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttgg-tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  32028256 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttgacgtcaaaacgatttatagagcttgagtta 32028157  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  32028156 tggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 20901462 - 20901597
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  | |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||    
T  20901462 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtatggatgtcagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttag 20901561  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20901562 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20901597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 20901904 - 20901980
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20901904 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 20901980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 136
Target Start/End: Original strand, 17516707 - 17516840
Alignment:
Q  3 acagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  17516707 acagaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagtt 17516806  T
Q  103 atggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    || ||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  17516807 atcgtcgaattactgcacataggtcacagtgaat 17516840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32028640 - 32028511
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  32028640 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcgttggtctgacatcaaaacgatttatagagcttgagttatgg 32028541  T
Q  107 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  32028540 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32028453 - 32028318
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||  |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||| ||||||  |||||||||  |||||    
T  32028453 gtacagaattggttttaggtgaaaacacgaaagttgtaggtatatatgttagctttctagtgctgttggtctgacgtcaaaacaatttatagagcttgag 32028354  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  32028353 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 32028318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 20917394 - 20917523
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 106  Q
    ||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||  ||||||| || |||||||||||    
T  20917394 aattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaatcatttataaaacttgagttatgg 20917493  T
Q  107 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  20917494 tcaaattactacacgtaggtcacaatgaat 20917523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 2154176 - 2154308
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||    
T  2154176 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttttaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttaagtta 2154275  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  2154276 tagtcaaattactgcacgtatgtcacggtgaat 2154308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29330215 - 29330140
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29330215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 29330140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32027677 - 32027602
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32027677 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 32027602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32028066 - 32027931
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  |||  ||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||||||||  |||||    
T  32028066 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaaattgtatttatggatgttagctttctaatgccattggtcggacgtcaaaacgatttatagagcttgag 32027967  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  32027966 ttatggtcaaattactgcacgtaagtcacaatgaat 32027931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 20917830 - 20917905
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20917830 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatcttgtccatgattgatgaagtgttatatgt 20917905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18744036 - 18743965
Alignment:
Q  148 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18744036 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 18743965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 136
Target Start/End: Original strand, 264370 - 264445
Alignment:
Q  61 tgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  264370 tgccgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 264445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Original strand, 1628169 - 1628243
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1628169 atgattgatgaactattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttaatgattgatgaagtattatatg 1628243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 116
Target Start/End: Original strand, 27183208 - 27183278
Alignment:
Q  46 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27183208 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 27183278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Original strand, 20917777 - 20917842
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  20917777 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtattatgttgtttatgattgatgaa 20917842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20909565 - 20909497
Alignment:
Q  68 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20909565 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20909497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 219
Target Start/End: Original strand, 21399896 - 21399968
Alignment:
Q  147 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||| |||||||| | |||||||    
T  21399896 gattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttgttcatggttgatgaattattatatg 21399968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 39245660 - 39245621
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39245660 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39245621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 39363908 - 39363869
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39363908 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39363869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 23506573 - 23506503
Alignment:
Q  46 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  23506573 atgttagttttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgtgttatgatcaaattact 23506503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 116
Target Start/End: Original strand, 1220384 - 1220453
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1220384 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1220453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 116
Target Start/End: Original strand, 10778832 - 10778901
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10778832 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 10778901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28901555 - 28901495
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggt 107  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  28901555 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 28901495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28937950 - 28937890
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggt 107  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  28937950 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 28937890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23065038 - 23064999
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23065038 tgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23064999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24067323 - 24067282
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaata 186  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  24067323 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtttatgaata 24067282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18743923 - 18743852
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||    
T  18743923 atgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatga---tgttcatgattgatgaattattatatg 18743852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 20198507 - 20198571
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| || |||||| | |||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  20198507 atgattgatgaagtattatatgaaggtatatgttaatgaatatgatgttgttcataattgatgaa 20198571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 20901852 - 20901916
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  20901852 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 20901916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 81)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1484829 - 1484611
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1484829 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 1484730  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1484729 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 1484631  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1484630 attgatgaagtgttatatgt 1484611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 14409179 - 14409397
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14409179 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 14409278  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14409279 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 14409377  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14409378 attgatgaagtgttatatgt 14409397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 24485778 - 24485997
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  24485778 gtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgag 24485877  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24485878 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 24485977  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24485978 attgatgaagtgttatatgt 24485997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 5853027 - 5853245
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5853027 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 5853126  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5853127 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 5853225  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5853226 attgatgaagtgttatatgt 5853245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 27472151 - 27472370
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27472151 gtacataattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 27472250  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472251 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 27472350  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  27472351 attgatgaagttttatatgt 27472370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 16413050 - 16413269
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16413050 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgacagttgtaggtatggatgttagcttgctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 16413149  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413150 ttatggtcaaattacttcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 16413249  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16413250 attgatgaagtgttatatgt 16413269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32122156 - 32121937
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||  | |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32122156 gtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaatgttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 32122057  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32122056 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 32121957  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  32121956 attgatgaagtgttatatgt 32121937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Original strand, 38549743 - 38549957
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38549743 agaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttat 38549842  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattg 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549843 ggtcaaaatactgcacgtatgtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattg 38549942  T
Q  205 atgaagtgttatatg 219  Q
    ||||| | |||||||    
T  38549943 atgaatttttatatg 38549957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4483708 - 4483489
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4483708 gtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 4483609  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4483608 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatg 4483509  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4483508 attgatgaagtgttatatgt 4483489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14824198 - 14823984
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14824198 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 14824099  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattg 204  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||    
T  14824098 agtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatattatccatgattg 14824000  T
Q  205 atgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  14823999 atgaagtgttatatgt 14823984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 20045930 - 20046148
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20045930 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgag 20046029  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  20046030 ttatagtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatg 20046128  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20046129 attgatgaagtgttatatgt 20046148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22002180 - 22001962
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22002180 gtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgag 22002081  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22002080 ttatagtcaaattactgcacgtaggtaacattgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 22001982  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22001981 attgatgaagtgttatatgt 22001962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 18677799 - 18678016
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18677799 gtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgag 18677898  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  18677899 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatgtatatgtatatgtttgtgaatacgatattatccatg 18677998  T
Q  201 attgatgaagtgttatat 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18677999 attgatgaagtgttatat 18678016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 4542108 - 4542326
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| | |||    
T  4542108 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttcgcttgacttcaaaatgatttatagaactagag 4542207  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4542208 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 4542306  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4542307 attgatgaagtgttatatgt 4542326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15070988 - 15070769
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||    
T  15070988 gtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttaaaaatgatttatacaacttgag 15070889  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15070888 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatg 15070789  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  15070788 attgatgaagttttatatgt 15070769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16198322 - 16198115
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  16198322 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgactttaaaaatatttatagaacttgag 16198223  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16198222 ttatggtccaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 16198123  T
Q  201 attgatga 208  Q
    ||||||||    
T  16198122 attgatga 16198115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Original strand, 16401660 - 16401875
Alignment:
Q  2 tacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagt 101  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16401660 tacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagt 16401759  T
Q  102 tatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    ||| |||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16401760 tatagtcagattacagcaggtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatactatattgttcatga 16401859  T
Q  202 ttgatgaagtgttata 217  Q
    ||||||||||||||||    
T  16401860 ttgatgaagtgttata 16401875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Original strand, 25657892 - 25658094
Alignment:
Q  6 gaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 105  Q
    ||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25657892 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgtttgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 25657991  T
Q  106 gtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattga 205  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25657992 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatttgatattgttcatgattga 25658091  T
Q  206 tga 208  Q
    |||    
T  25658092 tga 25658094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 1326666 - 1326884
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||    
T  1326666 gtacagaattggtcttaagtgtaaaaacgaaagttgtaggtatgaatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgag 1326765  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  1326766 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtacatgtttgtaaatacgatattgtttatg 1326865  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1326866 attgatgaagtgttatatg 1326884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 15202913 - 15203121
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15202913 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgag 15203012  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| || ||| || || |||    
T  15203013 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttatttatg 15203112  T
Q  201 attgatgaa 209  Q
    |||||||||    
T  15203113 attgatgaa 15203121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24049038 - 24048841
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  24049038 gtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaacaatttatagaacttgag 24048939  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcat 199  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24048938 ttatggtcaaattactgca-gtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtncat 24048841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20403706 - 20403499
Alignment:
Q  2 tacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20403706 tacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttgaaaaggatttatagaacttgagt 20403607  T
Q  102 tatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    ||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||    
T  20403606 tattgtcatattactgcgcgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatga 20403507  T
Q  202 ttgatgaa 209  Q
    ||||||||    
T  20403506 ttgatgaa 20403499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 19936642 - 19936850
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19936642 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 19936741  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||          |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19936742 gtatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgtttatgattgatgaatta----------gtatatgtttgtgaatattatattgttcatg 19936831  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19936832 attgatgaagtgttatatg 19936850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 45290385 - 45290584
Alignment:
Q  10 tggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 109  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45290385 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 45290484  T
Q  110 aattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  45290485 aattactgcacgtagatcatagtgaataattgaatatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 45290584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19896745 - 19896541
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||| ||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19896745 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaaattgtaggtatgaattttaactttctagcgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 19896646  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattg 204  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||    
T  19896645 agtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatgtgattgatgaattaggatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattg 19896546  T
Q  205 atgaa 209  Q
    |||||    
T  19896545 atgaa 19896541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20403899 - 20403765
Alignment:
Q  2 tacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagt 101  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20403899 tacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaggatttatagaacttgagt 20403800  T
Q  102 tatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20403799 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20403765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 15202720 - 15202856
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15202720 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgag 15202819  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaata 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15202820 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 15202856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19896942 - 19896807
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19896942 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgag 19896843  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19896842 ttatggtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaat 19896807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 14397475 - 14397609
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  14397475 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagctgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttgtagaacttgag 14397574  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14397575 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 14397609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 38549546 - 38549681
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  38549546 gtacagaattgatcttaggtataaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttttaattccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 38549645  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38549646 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38549681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 15202530 - 15202662
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15202530 cagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagtta 15202629  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15202630 tggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15202662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15071177 - 15071046
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15071177 agaattgatcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttat 15071078  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15071077 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 15071046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 27471958 - 27472093
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  27471958 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 27472057  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27472058 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27472093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32122345 - 32122214
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  32122345 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttat 32122246  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32122245 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32122214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19897129 - 19897000
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19897129 aattggtcttagctgtaaatacaaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 19897030  T
Q  107 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19897029 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19897000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 16401277 - 16401408
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16401277 cagaattggt-ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagtta 16401375  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16401376 tggtcaaattacagcacgtaggtcacagtgaat 16401408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 45290282 - 45290389
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45290282 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 45290381  T
Q  101 ttatggtc 108  Q
    ||||||||    
T  45290382 ttatggtc 45290389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 13425336 - 13425411
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13425336 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 16412857 - 16412992
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  16412857 gtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagatttatagaacttgag 16412956  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16412957 ttatggtcaaattactatacgtaggtcacagtgaat 16412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 20982498 - 20982573
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20982498 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 20982573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 38549354 - 38549488
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  38549354 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 38549453  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  38549454 ttatggtcaaattactgcacgtagg-cacagtgaat 38549488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Original strand, 20982604 - 20982678
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20982604 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatat 20982678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 16401472 - 16401601
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16401472 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaacgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 16401571  T
Q  107 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||| | ||||| | |||| |||||    
T  16401572 tcaaattacagcacgtatgccacaatgaat 16401601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24049228 - 24049104
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  24049228 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagtta 24049129  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtca 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  24049128 tggtcaaattactgcacgtaggtca 24049104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 38549988 - 38550064
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38549988 tatgattgatgaattagtatacgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 38550064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 155 - 219
Target Start/End: Original strand, 13425241 - 13425305
Alignment:
Q  155 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13425241 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20403511 - 20403436
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20403511 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 20403436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 45290572 - 45290647
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45290572 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 45290647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19896553 - 19896478
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19896553 tatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 19896478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32810215 - 32810140
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32810215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttacatgt 32810140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Original strand, 19936882 - 19936956
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19936882 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 19936956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Original strand, 1326915 - 1326988
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatat 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1326915 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatat 1326988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 15203109 - 15203184
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15203109 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaataagatattatccatgattgatgaagtgttatatgt 15203184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 16401908 - 16401983
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16401908 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgt 16401983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 19936452 - 19936584
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||  || |||| |||||||| |||||||| || | | |||| ||||||||||| ||||||||    
T  19936452 cagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtagctatggatattagctttctaattccgttggtctggcgttaaaacgatttatagaacttgagtta 19936551  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19936552 tgctcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19936584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 11361131 - 11361024
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||| |    
T  11361131 aattggtcttaggtgtaaacacaaaacttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttaagttatag 11361032  T
Q  107 tcaaatta 114  Q
    | ||||||    
T  11361031 ttaaatta 11361024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21513707 - 21513636
Alignment:
Q  148 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21513707 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 21513636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Original strand, 18815609 - 18815683
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18815609 atgattgatgaattattatgtgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 18815683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 116
Target Start/End: Original strand, 24717750 - 24717820
Alignment:
Q  46 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24717750 atgttagatttctaatgcctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 24717820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Original strand, 36733302 - 36733376
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  36733302 atgattgatgatttattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaagtattatatg 36733376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 38988804 - 38988730
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||| | |||||||    
T  38988804 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatg 38988730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39019901 - 39019827
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||| | |||||||    
T  39019901 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatg 39019827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1484976 - 1484887
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1484976 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1484887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Original strand, 20045783 - 20045872
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20045783 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20045872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 29759498 - 29759429
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29759498 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 29759429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Original strand, 5852901 - 5852969
Alignment:
Q  68 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5852901 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5852969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Original strand, 14409053 - 14409121
Alignment:
Q  68 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14409053 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14409121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 219
Target Start/End: Original strand, 5083001 - 5083068
Alignment:
Q  152 atgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  5083001 atgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 5083068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 39114485 - 39114415
Alignment:
Q  46 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  39114485 atgttagttttctaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcagattact 39114415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 116
Target Start/End: Original strand, 13663129 - 13663198
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13663129 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 13663198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 116
Target Start/End: Original strand, 22007126 - 22007195
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22007126 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 22007195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 19936829 - 19936893
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  19936829 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgttcatgattgatgaa 19936893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 38549936 - 38550000
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  38549936 atgattgatgaatttttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 38550000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 4483804 - 4483765
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4483804 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 4483765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14824299 - 14824260
Alignment:
Q  97 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14824299 tgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 14824260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 32810321 - 32810263
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatg 62  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||| |||||    
T  32810321 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatg 32810263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 1326862 - 1326938
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || | | ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  1326862 tatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgcttttgtttatgattgatgaattggtatatgt 1326938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 13425284 - 13425348
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  13425284 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 13425348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 13425390 - 13425454
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  13425390 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 13425454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 20982552 - 20982616
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  20982552 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 20982616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32810255 - 32810203
Alignment:
Q  157 ttagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  32810255 ttagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 32810203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6374 - 6156
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6374 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 6275  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6274 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 6176  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6175 attgatgaagtgttatatgt 6156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 94838 - 94620
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  94838 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 94739  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  94738 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 94640  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  94639 attgatgaagtgttatatgt 94620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 17178 - 17393
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17178 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatttttgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttat 17277  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattg 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17278 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatagttgaatatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgttcatgattg 17377  T
Q  205 atgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||| ||||||    
T  17378 atgaagtgtcatatgt 17393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 136
Target Start/End: Original strand, 17011 - 17116
Alignment:
Q  31 aagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcaca 130  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||  |||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| |    
T  17011 aagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgatatcaaaaaggtttatagaacttgagttatgatcaaattaatgcacgtaggtcata 17110  T
Q  131 gtgaat 136  Q
    ||||||    
T  17111 gtgaat 17116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 94985 - 94896
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  94985 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 94896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 631 - 416
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  631 agaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttat 532  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattg 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  531 ggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtaagtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattg 432  T
Q  205 atgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  431 atgaagtgttatatgt 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 988 - 853
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  988 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 889  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  888 ttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 775 - 693
Alignment:
Q  54 tttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  775 tttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40827 - 40609
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40827 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 40728  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  40727 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 40629  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40628 attgatgaagtgttatatgt 40609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 40926 - 40885
Alignment:
Q  95 tttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40926 tttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 40885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 37929 - 37860
Alignment:
Q  46 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    ||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  37929 atgttagctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgattt-tagaacttgagttatgatcaaattact 37860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 134638 - 134420
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  134638 gtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 134539  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  134538 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 134440  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  134439 attgatgaagtgttatatgt 134420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 137107 - 136889
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  137107 gtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 137008  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  137007 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 136909  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  136908 attgatgaagtgttatatgt 136889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 139576 - 139358
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  139576 gtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 139477  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  139476 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 139378  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  139377 attgatgaagtgttatatgt 139358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 142045 - 141827
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  142045 gtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 141946  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  141945 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 141847  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  141846 attgatgaagtgttatatgt 141827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 144514 - 144296
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  144514 gtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagag 144415  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  144414 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatg 144316  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  144315 attgatgaagtgttatatgt 144296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30447 - 30229
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  30447 gtacagaattggtcttcggtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttcacttcaaaaggatttgtagtacttgag 30348  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30347 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 30248  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30247 attgatgaagtgttatatg 30229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 30640 - 30505
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||| |||| |||||| |||||||| || || ||    
T  30640 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatgccattggtgtgacgtcaaaacgatttataaaactttag 30541  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30540 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30196 - 30122
Alignment:
Q  146 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30196 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 30122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9669 - 9451
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9669 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctctctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 9570  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  9569 ttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatg 9471  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9470 attgatgaagtgttatatgt 9451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 258 - 476
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||   ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  258 gtacataaatggtcttaggtgtaaacaagaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgag 357  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  358 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 457  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  458 attgataaagtgttatatg 476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 507 - 582
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  507 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 5)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10211 - 10001
Alignment:
Q  9 ttggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtc 108  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10211 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtc 10112  T
Q  109 aaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 208  Q
    |||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10111 aaattatttcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtgtgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 10012  T
Q  209 agtgttatatg 219  Q
    |||||||||||    
T  10011 agtgttatatg 10001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10412 - 10277
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  10412 gtacataattggtcttatgtgtcaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacatcaaaacgatttatagaacttgag 10313  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10312 ttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10599 - 10470
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  10599 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgcgttatgg 10500  T
Q  107 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  10499 tcaaattactgcatgtaggtcacaatgaat 10470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9970 - 9936
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9970 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 9936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10022 - 9958
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  10022 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 9958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 4)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 4037 - 4256
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||   ||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4037 gtacagaattggtcataggtgtaaacatgaaaggtgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 4136  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  4137 ttatggtcaaattactgcacgtgggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgtccatg 4236  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4237 attgatgaagtgttatatgt 4256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 3651 - 3782
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||  || |||||    
T  3651 gtacagaattggtcttagctgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgaggtcaaaacgatttatgtaacttgag 3750  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3751 ttatgctcaaattactgaacgtaggtcacagt 3782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 3844 - 3979
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||  || |||||    
T  3844 gtacagaattggtcttaggtggaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaacgatttatgaaacttgag 3943  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3944 ttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 136
Target Start/End: Original strand, 3541 - 3593
Alignment:
Q  84 gatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  3541 gatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtaggtcactgtgaat 3593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5122 - 4903
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5122 gtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccaatggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 5023  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5022 ttatagtcaaattacagcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 4923  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4922 attgatgaagtgttatatgt 4903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 5315 - 5180
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||   |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| |||||    
T  5315 gtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagttttcttatgccgttggtctgacgtcaaaacgatatatagaacttgag 5216  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5215 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 6670 - 6889
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  6670 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 6769  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  6770 ttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgtccatg 6869  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6870 attgatgaagtgttatatgt 6889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 6480 - 6612
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6480 cagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagtta 6579  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6580 tggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 4)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15350 - 15131
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  15350 gtacagatttggtcttaggtgtaaccacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 15251  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15250 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatttatatgtttgtgaatactatattgtccatg 15151  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15150 attgatgaagtgttatatgt 15131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 11074 - 11251
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| | |||||    
T  11074 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaaaacgatttatagtacttgag 11173  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 178  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11174 ttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 11251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Original strand, 10884 - 11016
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10884 cagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagtta 10983  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10984 tggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 11016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15529 - 15398
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  15529 cagaattggtcttag-tgtaaacacgaaagttgtaggtatggacgttagctttctaatgtcgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagtta 15431  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15430 tggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11717 - 11498
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||   | ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11717 gtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgatacttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttgggttgacttcaaaatgatttatagaacttgag 11618  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11617 ttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagttaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 11518  T
Q  201 attgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11517 attgatgaagtgttatatgt 11498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 4)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1017 - 799
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||| ||| |||||||| |||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  1017 gtacagcattcgtcttaggagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaattatttatagaacttgag 918  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  917 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatttgtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatg 818  T
Q  201 attgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  817 attgatgaagttttatatg 799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1210 - 1075
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  1210 gtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagatttatagaacttgag 1111  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||    
T  1110 ttatggtcaaattactacacgcaggtcatagtgaat 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 768 - 693
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  768 tatgattgattaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 1326 - 1225
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||||||||    
T  1326 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttct-atgccgttggtctgacgtctaaacgatttatagaacttgagtta 1228  T
Q  104 tgg 106  Q
    |||    
T  1227 tgg 1225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3450 - 3232
Alignment:
Q  2 tacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagt 101  Q
    |||| ||||| |||||| ||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3450 tacataattgttcttagttgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 3351  T
Q  102 tatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  3350 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtcaatga 3251  T
Q  202 ttgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3250 ttgatgaagtgttatatgt 3232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 53612 - 53825
Alignment:
Q  7 aattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 106  Q
    |||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  53612 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtcaaagggatttatagaacttgagatatgg 53711  T
Q  107 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  53712 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgttcatgattgat 53811  T
Q  207 gaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||    
T  53812 gaagtgttatatgt 53825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 38394 - 38609
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    ||||||| |||||||  ||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38394 agaattgatcttagggctaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaatttgagttat 38493  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattg 204  Q
    | ||||||||||| | ||  |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38494 gttcaaattactgtatgtttgtcatattgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattg 38593  T
Q  205 atgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  38594 atgaagtgttatatgt 38609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1826 - 1637
Alignment:
Q  31 aagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcaca 130  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1826 aagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 1727  T
Q  131 gtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1726 gtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatttatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgt 1637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6879 - 6682
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6879 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 6780  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  6779 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgtttgtgaatacgatattgttcatg 6690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 7072 - 6937
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  7072 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaatgatttatagaacttgag 6973  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6972 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 211
Target Start/End: Original strand, 13391 - 13571
Alignment:
Q  31 aagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcaca 130  Q
    |||||||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13391 aagttgtaggtatggatgttagcttactagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcaca 13490  T
Q  131 gtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 211  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13491 atgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 43159 - 43002
Alignment:
Q  9 ttggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtc 108  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  43159 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagggtttatagaacttgagttatagtc 43060  T
Q  109 aaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 166  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43059 aaattagtgcacgtaggtcacagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatg 43002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 43356 - 43225
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43356 agaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttat 43257  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43256 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 43225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 57864 - 57708
Alignment:
Q  46 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaata 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  57864 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatacttgaata 57765  T
Q  146 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgat 202  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57764 tgagtgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgat 57708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 8167 - 7996
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8167 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgaa 8068  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 172  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8067 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgta 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8360 - 8225
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  8360 gtacataactggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatccccttggtttgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 8261  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8260 ttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 8553 - 8421
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||  ||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||    
T  8553 gtacataattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaattccattggtatgacgtcaaaaagatttatacaacttgag 8454  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtg 133  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  8453 ttatggtgaaattactgcacgtaggtcacagtg 8421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11142 - 10982
Alignment:
Q  59 aatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 158  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11142 aatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 11043  T
Q  159 agtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11042 agtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 10982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 68389 - 68227
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  68389 gtacaaaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 68290  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 163  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68289 ttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 68227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 501491 - 501293
Alignment:
Q  2 tacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagt 101  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  501491 tacagaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtagg-atagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagt 501393  T
Q  102 tatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501392 tatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa-------------------tatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 501312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 501681 - 501550
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  501681 agaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttat 501582  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  501581 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 501550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28190 - 28061
Alignment:
Q  80 aaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 179  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28190 aaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 28091  T
Q  180 gtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
     ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  28090 atgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 28061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28073 - 27998
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28073 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 27998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1872 - 1740
Alignment:
Q  4 cagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1872 cagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 1773  T
Q  104 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1772 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 219
Target Start/End: Original strand, 10647 - 10734
Alignment:
Q  132 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10647 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 10734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 10765 - 10840
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10765 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatactgtccataattgatgaagtgttatatgt 10840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 10713 - 10777
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  10713 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 10777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 31631 - 31497
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  31631 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 31532  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31531 ttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18558 - 18423
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  18558 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgag 18459  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18458 ttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 18423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0711
Description:

Target: scaffold0711; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 7424 - 7558
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  7424 gtacagaattggtcttgggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacatcaaaatgatttatagaacttgag 7523  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7524 ttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaa 7558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Original strand, 7243 - 7367
Alignment:
Q  12 gtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  7243 gtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttatccttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttataaaacttgagttatggtcaaa 7342  T
Q  112 ttactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||| || ||||||||||||||||||    
T  7343 ttattgcacgtaggtcacagtgaat 7367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 134
Target Start/End: Original strand, 7084 - 7172
Alignment:
Q  46 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtga 134  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  7084 atgttagctttctaatgccgttgctctgccgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtga 7172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18081 - 17947
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  18081 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccattggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgag 17982  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17981 ttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaa 17947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 33599 - 33465
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||    
T  33599 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtctgacgtaaaaacgatttatagaacttgag 33500  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33499 ttatggtcaaattactgcacgtaggtcacggtgaa 33465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8442 - 8311
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    ||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8442 agaattgctcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 8343  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8342 ggtaaaattactgcacgttggtcacagtgaat 8311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 39760 - 39626
Alignment:
Q  1 gtacagaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||||||| |||||    
T  39760 gtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgccattggtctaacgtcaaaacgatttatagaacttgag 39661  T
Q  101 ttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaa 135  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  39660 ttatggtcaaattattacacgtaggtcacagtgaa 39626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 36749 - 36875
Alignment:
Q  10 tggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 109  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||  |||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36749 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgttgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 36848  T
Q  110 aattactgaacgtaggtcacagtgaat 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  36849 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 36875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 136
Target Start/End: Original strand, 36963 - 37068
Alignment:
Q  31 aagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcaca 130  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  36963 aagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcata 37062  T
Q  131 gtgaat 136  Q
    ||||||    
T  37063 gtgaat 37068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10016 - 9940
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10016 tatgattgatgagttagtatatgtatgtataagtttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgt 9940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 10005
Alignment:
Q  146 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  10067 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtacgatgttgtttatgattgatga 10005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 19827 - 19957
Alignment:
Q  5 agaattggtcttaggtgtaaccacagaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| || ||||| || |||||||||    
T  19827 agaattggtcttaggtgtaaacgcaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgaattatataacttgagttat 19926  T
Q  105 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaa 135  Q
     |||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  19927 cgtcaaattactacacgtaggtcatagtgaa 19957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 15150 - 15225
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15150 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 15225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 219
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15119
Alignment:
Q  120 cgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15030 cgtaggtcatagtgaataattgaatatgattaatgaattagtat----------atgtttgtgaatactatattgttcataattgatgaagtgttatatg 15119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 113415 - 113317
Alignment:
Q  30 gaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 128  Q
    ||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  113415 gaagttgtaggtatggatgttacatttctaatgacgttggtttgactccaaaatgagttttagaacttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtca 113317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 35955 - 36019
Alignment:
Q  156 attagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatg-aagtgttatatgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  35955 attagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaaagtgttatatgt 36019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16326 - 16263
Alignment:
Q  146 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16326 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 16263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 116
Target Start/End: Original strand, 6235 - 6305
Alignment:
Q  46 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6235 atgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 6305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15361 - 15287
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15361 atgattgatgaattattatttgaatgtatatgtcgatgaatatgatattgttcatgattgatgaattattatatg 15287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15408 - 15350
Alignment:
Q  151 gatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  15408 gatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttattcatgattgatgaa 15350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 1204 - 1279
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 220  Q
    ||||||| || |||||||||||| || || ||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1204 tatgattaataaattagtatatgaatataaatgtt-gagaataagatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 1279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 219
Target Start/End: Original strand, 1143 - 1173
Alignment:
Q  189 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1143 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 8636 - 8566
Alignment:
Q  46 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| | | ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8636 atgttagctttctaatggctttggtttgacttctagatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 8566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15846 - 15780
Alignment:
Q  48 gttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaatta 114  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  15846 gttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 15780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 116
Target Start/End: Original strand, 6970 - 7039
Alignment:
Q  47 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6970 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 28536 - 28469
Alignment:
Q  49 ttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattact 116  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || || |||||||||| ||||||||||    
T  28536 ttagttttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattact 28469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 378 - 313
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  378 tatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcgttcattattgatgaa 313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Original strand, 187890 - 187955
Alignment:
Q  144 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 209  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  187890 tatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcgttcattattgatgaa 187955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 201
Target Start/End: Original strand, 66762 - 66818
Alignment:
Q  145 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 201  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||    
T  66762 atgaatgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatga 66818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University