View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10481A_low_713 (Length: 207)

Name: NF10481A_low_713
Description: NF10481A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10481A_low_713
NF10481A_low_713
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (1-201)||(19456511-19456711)
chr2 (6-201)||(21703254-21703449)
chr2 (8-201)||(34303393-34303586)
chr2 (8-201)||(16163557-16163750)
chr2 (8-201)||(27118646-27118839)
chr2 (8-201)||(34156969-34157162)
chr2 (8-201)||(3784612-3784805)
chr2 (8-173)||(31891446-31891611)
chr2 (33-201)||(27392952-27393120)
chr2 (30-173)||(28882194-28882337)
chr2 (30-173)||(12655522-12655665)
chr2 (30-173)||(23128684-23128827)
chr2 (30-201)||(27434534-27434705)
chr2 (30-194)||(11635283-11635447)
chr2 (30-173)||(20837898-20838041)
chr2 (30-173)||(21677300-21677443)
chr2 (30-194)||(11641472-11641636)
chr2 (30-194)||(22926125-22926289)
chr2 (30-194)||(34279429-34279593)
chr2 (30-201)||(40233491-40233662)
chr2 (30-194)||(34286334-34286498)
chr2 (30-194)||(34291394-34291558)
chr2 (30-173)||(34861660-34861803)
chr2 (30-173)||(37686027-37686170)
chr2 (30-173)||(37701292-37701435)
chr2 (30-173)||(37925473-37925616)
chr2 (30-173)||(31876261-31876404)
chr2 (30-151)||(12716742-12716863)
chr2 (48-151)||(13936684-13936787)
chr2 (30-173)||(16829456-16829599)
chr2 (30-173)||(16891882-16892025)
chr2 (30-173)||(32049778-32049921)
chr2 (39-194)||(37375150-37375305)
chr2 (30-173)||(39890054-39890197)
chr2 (30-151)||(27803687-27803808)
chr2 (30-151)||(27777202-27777323)
chr2 (30-151)||(27816960-27817081)
chr2 (30-151)||(9350122-9350243)
chr2 (30-151)||(12586790-12586911)
chr2 (54-151)||(39051962-39052059)
chr2 (30-194)||(260850-261014)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (4-201)||(15227843-15228040)
chr4 (4-201)||(15285029-15285226)
chr4 (4-201)||(1900230-1900427)
chr4 (8-201)||(24460706-24460899)
chr4 (4-201)||(14235626-14235826)
chr4 (33-201)||(15391439-15391607)
chr4 (30-194)||(17013999-17014163)
chr4 (30-194)||(14763412-14763576)
chr4 (29-173)||(24592443-24592587)
chr4 (30-173)||(14098540-14098683)
chr4 (30-173)||(14665017-14665160)
chr4 (30-194)||(5005872-5006036)
chr4 (30-173)||(27163446-27163589)
chr4 (48-194)||(6569870-6570016)
chr4 (30-173)||(30753753-30753896)
chr4 (30-173)||(31126647-31126790)
chr4 (52-173)||(18800742-18800863)
chr4 (30-194)||(33673906-33674070)
chr4 (10-194)||(36344623-36344807)
chr4 (10-193)||(24112641-24112824)
chr4 (10-193)||(34189069-34189252)
chr4 (30-173)||(40105767-40105910)
chr4 (24-194)||(54833380-54833550)
chr4 (30-151)||(39850637-39850758)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (4-201)||(16449985-16450182)
chr7 (4-201)||(16041282-16041479)
chr7 (8-201)||(31088451-31088644)
chr7 (30-201)||(26484679-26484850)
chr7 (8-201)||(45733423-45733616)
chr7 (30-201)||(2108992-2109163)
chr7 (30-201)||(39211010-39211181)
chr7 (30-201)||(2775344-2775515)
chr7 (30-193)||(18540784-18540947)
chr7 (30-173)||(11424791-11424934)
chr7 (24-173)||(10916883-10917032)
chr7 (30-194)||(5127977-5128141)
chr7 (30-194)||(5147334-5147498)
chr7 (30-173)||(16503395-16503538)
chr7 (30-173)||(16518431-16518574)
chr7 (30-173)||(2154558-2154701)
chr7 (30-194)||(16736454-16736618)
chr7 (30-194)||(16751508-16751672)
chr7 (30-194)||(17523517-17523681)
chr7 (30-194)||(17529534-17529698)
chr7 (30-173)||(4145138-4145281)
chr7 (30-173)||(9618636-9618779)
chr7 (30-173)||(26275109-26275252)
chr7 (30-173)||(26319884-26320027)
chr7 (30-173)||(45387328-45387471)
chr7 (30-194)||(26435242-26435406)
chr7 (30-173)||(3445291-3445434)
chr7 (30-173)||(26669929-26670072)
chr7 (10-193)||(5159484-5159667)
chr7 (30-173)||(26537885-26538028)
chr7 (30-173)||(31124905-31125048)
chr7 (52-173)||(31564405-31564526)
chr7 (30-173)||(11441557-11441700)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (4-201)||(16626648-16626845)
chr3 (4-201)||(18530313-18530504)
chr3 (8-201)||(4625867-4626060)
chr3 (8-201)||(17993926-17994119)
chr3 (8-201)||(5652310-5652503)
chr3 (30-201)||(32292697-32292868)
chr3 (30-201)||(31034259-31034430)
chr3 (30-173)||(15892876-15893019)
chr3 (24-173)||(8301437-8301586)
chr3 (29-173)||(8295916-8296060)
chr3 (30-173)||(18330614-18330757)
chr3 (30-194)||(4721576-4721740)
chr3 (10-194)||(22387727-22387911)
chr3 (30-173)||(4796823-4796966)
chr3 (30-173)||(15741264-15741407)
chr3 (30-173)||(17985126-17985269)
chr3 (30-173)||(18051207-18051350)
chr3 (30-194)||(5609471-5609635)
chr3 (30-194)||(6192261-6192425)
chr3 (30-194)||(18277201-18277365)
chr3 (30-194)||(18292502-18292666)
chr3 (30-194)||(18307803-18307967)
chr3 (30-194)||(28339247-28339411)
chr3 (30-194)||(29148904-29149068)
chr3 (30-194)||(31964622-31964786)
chr3 (30-194)||(50134220-50134384)
chr3 (30-173)||(6542632-6542775)
chr3 (30-173)||(35880711-35880854)
chr3 (30-194)||(4416864-4417028)
chr3 (30-194)||(10396078-10396242)
chr3 (30-194)||(28116103-28116267)
chr3 (30-173)||(5713172-5713315)
chr3 (30-173)||(5724082-5724225)
chr3 (30-173)||(5757252-5757395)
chr3 (30-173)||(5768143-5768286)
chr3 (30-173)||(7996507-7996650)
chr3 (30-173)||(10643015-10643158)
chr3 (30-173)||(36997247-36997390)
chr3 (30-173)||(47023398-47023541)
chr3 (30-194)||(7073157-7073321)
chr3 (30-194)||(21674638-21674802)
chr3 (24-194)||(4346836-4347006)
chr3 (10-193)||(4893135-4893318)
chr3 (30-173)||(18242684-18242827)
chr3 (24-194)||(28021214-28021384)
chr3 (54-194)||(11110498-11110638)
chr3 (30-194)||(48465872-48466036)
chr3 (30-173)||(18225136-18225279)
chr3 (10-193)||(32439079-32439262)
chr3 (39-173)||(5466939-5467073)
chr3 (30-151)||(29665162-29665283)
chr3 (30-194)||(22871005-22871169)
chr3 (30-194)||(22886064-22886228)
chr3 (30-173)||(5013657-5013800)
chr3 (30-173)||(5596527-5596670)
chr3 (24-151)||(20065982-20066109)
chr3 (114-173)||(51782052-51782111)
chr3 (24-194)||(8211677-8211847)
chr3 (30-151)||(20577039-20577163)
chr3 (114-165)||(51797141-51797192)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (4-201)||(22888437-22888634)
chr5 (4-201)||(25198996-25199193)
chr5 (8-201)||(13184646-13184839)
chr5 (8-201)||(33877218-33877411)
chr5 (8-201)||(11325765-11325958)
chr5 (8-201)||(13440492-13440685)
chr5 (18-201)||(29889080-29889263)
chr5 (4-201)||(23892170-23892370)
chr5 (24-173)||(30934620-30934769)
chr5 (30-194)||(23752455-23752619)
chr5 (33-173)||(24970014-24970154)
chr5 (30-173)||(11549347-11549490)
chr5 (30-173)||(23718014-23718157)
chr5 (30-173)||(24688183-24688326)
chr5 (30-194)||(33777480-33777644)
chr5 (30-173)||(2511044-2511187)
chr5 (30-173)||(8665501-8665644)
chr5 (30-173)||(15758883-15759026)
chr5 (30-194)||(6874298-6874462)
chr5 (30-194)||(9548548-9548712)
chr5 (30-194)||(22999119-22999283)
chr5 (30-173)||(26480385-26480528)
chr5 (24-173)||(34616505-34616654)
chr5 (30-194)||(15658765-15658929)
chr5 (30-194)||(37671488-37671652)
chr5 (30-194)||(41674702-41674866)
chr5 (30-173)||(5637903-5638046)
chr5 (30-173)||(9317444-9317587)
chr5 (30-173)||(12132148-12132291)
chr5 (30-173)||(30152011-30152154)
chr5 (30-173)||(30168462-30168605)
chr5 (30-173)||(18375438-18375581)
chr5 (30-173)||(28959812-28959955)
chr5 (30-173)||(31431433-31431576)
chr5 (30-173)||(31826433-31826576)
chr5 (30-173)||(37358669-37358812)
chr5 (52-194)||(18500735-18500877)
chr5 (52-194)||(28649250-28649392)
chr5 (24-194)||(32599477-32599647)
chr5 (30-194)||(37770992-37771156)
chr5 (30-194)||(43078245-43078409)
chr5 (30-173)||(3789534-3789677)
chr5 (10-193)||(33292498-33292681)
chr5 (30-173)||(33516349-33516492)
chr5 (30-173)||(37754973-37755116)
chr5 (30-151)||(40473597-40473718)
chr5 (54-151)||(24681457-24681554)
chr5 (54-151)||(24723984-24724081)
chr5 (30-193)||(13324835-13324998)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (18-201)||(129-312)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (6-201)||(2759-2954)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (6-201)||(20340436-20340631)
chr1 (36-194)||(20461070-20461228)
chr1 (4-201)||(16208132-16208326)
chr1 (30-201)||(28151845-28152016)
chr1 (30-194)||(41793416-41793580)
chr1 (30-173)||(28584964-28585107)
chr1 (30-173)||(10962653-10962796)
chr1 (30-194)||(51638201-51638365)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (8-201)||(44563063-44563256)
chr8 (8-201)||(9354584-9354777)
chr8 (8-201)||(19659099-19659292)
chr8 (33-201)||(22080938-22081106)
chr8 (30-201)||(33244649-33244820)
chr8 (30-201)||(16283433-16283604)
chr8 (30-173)||(16277538-16277681)
chr8 (30-173)||(2137347-2137490)
chr8 (30-173)||(19688082-19688225)
chr8 (30-173)||(27608993-27609136)
chr8 (24-173)||(14557602-14557751)
chr8 (30-194)||(31354508-31354672)
chr8 (30-173)||(19208448-19208591)
chr8 (30-173)||(31489838-31489981)
chr8 (30-194)||(19674425-19674589)
chr8 (30-173)||(28362043-28362186)
chr8 (30-194)||(18710570-18710734)
chr8 (30-173)||(3329595-3329738)
chr8 (24-194)||(19286440-19286610)
chr8 (52-173)||(12092812-12092933)
chr8 (30-174)||(29829306-29829450)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (33-201)||(20375-20543)
scaffold0124 (30-173)||(30437-30579)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (8-201)||(8892354-8892547)
chr6 (8-201)||(8903589-8903782)
chr6 (8-201)||(13522117-13522310)
chr6 (8-201)||(28162616-28162809)
chr6 (8-201)||(33374300-33374493)
chr6 (6-201)||(22456978-22457176)
chr6 (6-201)||(22477317-22477515)
chr6 (18-201)||(27290414-27290597)
chr6 (30-201)||(14143329-14143500)
chr6 (30-201)||(26787925-26788096)
chr6 (30-201)||(27196298-27196469)
chr6 (30-201)||(27252771-27252942)
chr6 (15-199)||(20160667-20160851)
chr6 (15-199)||(22171980-22172164)
chr6 (29-201)||(22934924-22935096)
chr6 (29-201)||(23857369-23857541)
chr6 (30-201)||(27272624-27272795)
chr6 (30-194)||(26918361-26918525)
chr6 (30-173)||(13299023-13299166)
chr6 (30-173)||(24304690-24304833)
chr6 (48-173)||(26989000-26989125)
chr6 (30-194)||(16749835-16749999)
chr6 (10-194)||(29549436-29549620)
chr6 (30-173)||(15424389-15424532)
chr6 (30-173)||(24863698-24863841)
chr6 (30-173)||(27000054-27000197)
chr6 (52-173)||(4525289-4525410)
chr6 (30-173)||(3696062-3696205)
chr6 (30-173)||(29572994-29573137)
chr6 (52-173)||(4773009-4773130)
chr6 (30-194)||(16674120-16674284)
chr6 (30-194)||(34463397-34463561)
chr6 (30-173)||(4757745-4757888)
chr6 (30-173)||(27485110-27485253)
chr6 (24-194)||(27044362-27044532)
chr6 (60-173)||(4545847-4545960)
chr6 (60-173)||(4724206-4724319)
chr6 (60-173)||(28207465-28207578)
chr6 (30-194)||(27007708-27007872)
chr6 (30-173)||(26777687-26777830)
chr6 (30-173)||(27360064-27360207)
chr6 (30-173)||(27450407-27450550)
chr6 (30-173)||(30558088-30558231)
chr6 (30-173)||(29501396-29501539)
chr6 (52-173)||(26116482-26116603)
chr6 (52-151)||(17025280-17025379)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (34-201)||(21549-21716)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (116-201)||(2018-2103)
scaffold0415 (114-194)||(6080-6160)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (30-173)||(29747-29890)
scaffold0089 (30-173)||(40198-40341)
scaffold0089 (30-173)||(47114-47257)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (30-173)||(27276-27419)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (30-173)||(9195-9338)
scaffold0159 (30-173)||(19999-20142)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (30-173)||(258-402)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (30-173)||(7368-7511)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (30-166)||(26338-26474)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (30-173)||(15059-15202)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (24-194)||(9544-9714)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (60-173)||(7963-8076)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19456711 - 19456511
Alignment:
Q  1 tttagcaaatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactccc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456711 tttagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactccc 19456612  T
Q  101 gactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccat 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19456611 gactctacttctcatagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccat 19456512  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  19456511 c 19456511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21703449 - 21703254
Alignment:
Q  6 caaatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactc 105  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  21703449 caaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactc 21703350  T
Q  106 tacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21703349 tacttctcagagggcactgcacaaccagacaggacaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 21703254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34303586 - 34303393
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  34303586 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactcta 34303487  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34303486 cttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 34303393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 16163557 - 16163750
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  16163557 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactcta 16163656  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16163657 cttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 16163750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 27118646 - 27118839
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||    
T  27118646 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgaattactcccgactcta 27118745  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27118746 cttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 27118839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 34156969 - 34157162
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  34156969 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactcta 34157068  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34157069 cttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 34157162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 3784612 - 3784805
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  3784612 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagtagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactcta 3784711  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3784712 cttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 3784805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31891611 - 31891446
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  31891611 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactcta 31891512  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31891511 cttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttc 31891446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 33 - 201
Target Start/End: Original strand, 27392952 - 27393120
Alignment:
Q  33 caacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaacca 132  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  27392952 caacaacagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgataccaatgatgtatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaacca 27393051  T
Q  133 gacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27393052 ggcagggcaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgcgatttccatc 27393120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 28882194 - 28882337
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  28882194 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 28882293  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28882294 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttc 28882337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 12655522 - 12655665
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  12655522 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 12655621  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12655622 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 12655665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 23128827 - 23128684
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  23128827 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 23128728  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  23128727 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 23128684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27434705 - 27434534
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || ||| || |||| |  |||||||| || ||||    
T  27434705 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccggctttactccatagagggcattgtacaa 27434606  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   || |||||||| |||||| ||||||    
T  27434605 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaagttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatc 27434534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11635447 - 11635283
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  11635447 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 11635348  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  11635347 ctagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 11635283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 20837898 - 20838041
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  20837898 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 20837997  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20837998 ctagacagggcaagcccccacctgatctgttgcctcccaggttc 20838041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 21677443 - 21677300
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  21677443 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 21677344  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21677343 ctagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttc 21677300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11641636 - 11641472
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  11641636 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgatacagatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 11641537  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  11641536 ctagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 11641472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22926289 - 22926125
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  22926289 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 22926190  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  22926189 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 22926125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 34279429 - 34279593
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  34279429 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 34279528  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  34279529 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 34279593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 201
Target Start/End: Original strand, 40233491 - 40233662
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  40233491 caacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacga 40233590  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  40233591 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 40233662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 34286334 - 34286498
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  34286334 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 34286433  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  34286434 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 34286498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 34291394 - 34291558
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  34291394 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 34291493  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  34291494 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 34291558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 34861660 - 34861803
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  34861660 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 34861759  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  34861760 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 34861803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 37686170 - 37686027
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  37686170 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 37686071  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37686070 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 37686027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 37701435 - 37701292
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  37701435 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 37701336  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37701335 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 37701292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 37925473 - 37925616
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  37925473 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 37925572  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||||    
T  37925573 ctagacagggtaagcccccacccgacccgttgcctccaaggttc 37925616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 31876261 - 31876404
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  31876261 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaa 31876360  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31876361 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 31876404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 12716863 - 12716742
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  12716863 caacaacaacagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacga 12716764  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    | || |||||||||||||||||    
T  12716763 ctaggcagggcaagcctccacc 12716742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 48 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 13936787 - 13936684
Alignment:
Q  48 caagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 147  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  13936787 caagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctc 13936688  T
Q  148 cacc 151  Q
    ||||    
T  13936687 cacc 13936684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16829599 - 16829456
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || ||  |||| |  ||||| || || ||||    
T  16829599 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaa 16829500  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16829499 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 16829456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 16891882 - 16892025
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || ||  |||| |  ||||| || || ||||    
T  16891882 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaa 16891981  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16891982 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 16892025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 32049778 - 32049921
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  32049778 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 32049877  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| || || |||||  | ||||||||||| ||||||    
T  32049878 ctagacagggtaaacccccaccggacccgttgcctccaaggttc 32049921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 194
Target Start/End: Original strand, 37375150 - 37375305
Alignment:
Q  39 cagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagg 138  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||    
T  37375150 cagcagcaatatactagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagg 37375249  T
Q  139 gcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  37375250 gtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 37375305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 39890054 - 39890197
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || ||  |||| |  ||||| || || ||||    
T  39890054 caacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaa 39890153  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  39890154 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 39890197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 151
Target Start/End: Original strand, 27803687 - 27803808
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  27803687 caacaacancagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacga 27803786  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    | || |||||||||||||||||    
T  27803787 ctaggcagggcaagcctccacc 27803808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 151
Target Start/End: Original strand, 27777202 - 27777323
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  27777202 caacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacga 27777301  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    | || |||||||||||||||||    
T  27777302 ctaggcagggcaagcctccacc 27777323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 151
Target Start/End: Original strand, 27816960 - 27817081
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  27816960 caacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacga 27817059  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    | || |||||||||||||||||    
T  27817060 ctaggcagggcaagcctccacc 27817081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 9350243 - 9350122
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  9350243 caacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacga 9350144  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    | || || ||||||||||||||    
T  9350143 ctaggcaaggcaagcctccacc 9350122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 151
Target Start/End: Original strand, 12586790 - 12586911
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||  || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  12586790 caacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagtcgcttccaactttactccagagaggacactgcacga 12586889  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    | || |||||||||||||||||    
T  12586890 ctaggcagggcaagcctccacc 12586911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 39052059 - 39051962
Alignment:
Q  54 agacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  39052059 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 39051962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 261014 - 260850
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||| |  | | ||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  261014 caacaacagcagcagcaatataccaaaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacga 260915  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  260914 ctagacagggtaagcccccacctgatctgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 260850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 15227843 - 15228040
Alignment:
Q  4 agcaaatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgac 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227843 agcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgac 15227942  T
Q  104 tctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15227943 tctacttctcagagggcactgtacaaccagacagggtaagcctccacctgatccattgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 15228040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15285226 - 15285029
Alignment:
Q  4 agcaaatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgac 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15285226 agcaaatgcaacaacagccaccaactcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatttcgagttactcccgac 15285127  T
Q  104 tctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  15285126 tctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcaagtgtgatttccatc 15285029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 1900230 - 1900427
Alignment:
Q  4 agcaaatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgac 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1900230 agcaaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacatcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctgtatgccgagttactcccgac 1900329  T
Q  104 tctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1900330 tctacttctcagagggcactgcacaaccagacatggtaagcctccacctgatccgttgcttctcaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatc 1900427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24460899 - 24460706
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  24460899 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactcta 24460800  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24460799 cttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 24460706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14235826 - 14235626
Alignment:
Q  4 agcaaatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaa---gctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactccc 100  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| | |||||    
T  14235826 agcaaatgcaacaacagccgccggctcagcaacaacagcagcaacaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagctgctccc 14235727  T
Q  101 gactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccat 200  Q
    |||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||    
T  14235726 gactctgcttcttaaagggcactgtacaaccagacagggcaagcctccacctaaccctttgcctcccaggttccatttcgacctcaaatgtgatttccat 14235627  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  14235626 c 14235626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 33 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15391607 - 15391439
Alignment:
Q  33 caacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaacca 132  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  15391607 caacaacagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgataccaatgctgtacgccgagttgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaacca 15391508  T
Q  133 gacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15391507 ggcaggggaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatc 15391439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 17013999 - 17014163
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  17013999 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccaaagagggcattgtacaa 17014098  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||    
T  17014099 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgat 17014163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14763576 - 14763412
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  14763576 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 14763477  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  14763476 ctagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 14763412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 24592587 - 24592443
Alignment:
Q  29 tcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcaca 128  Q
    ||||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||    
T  24592587 tcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtaca 24592488  T
Q  129 accagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24592487 accagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 24592443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 14098540 - 14098683
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  14098540 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaa 14098639  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14098640 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 14098683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 14665017 - 14665160
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || ||||    
T  14665017 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaa 14665116  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14665117 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 14665160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 5005872 - 5006036
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  5005872 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 5005971  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  5005972 ctagacaaggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 5006036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 27163589 - 27163446
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  27163589 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 27163490  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27163489 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 27163446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 194
Target Start/End: Original strand, 6569870 - 6570016
Alignment:
Q  48 caagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 147  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  6569870 caagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 6569969  T
Q  148 cacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  6569970 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 6570016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 30753753 - 30753896
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  30753753 caacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaa 30753852  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30753853 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 30753896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31126790 - 31126647
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| | || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  31126790 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaa 31126691  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||    
T  31126690 ctagacagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttc 31126647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18800863 - 18800742
Alignment:
Q  52 ctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||    
T  18800863 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18800764  T
Q  152 taatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  18800763 tgatccgttgcctccaaggttc 18800742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 33674070 - 33673906
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  33674070 caacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacga 33673971  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | || |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  33673970 ctaggcagggcaagcctccaccggacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 33673906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36344807 - 36344623
Alignment:
Q  10 tgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctact 109  Q
    ||||||| || || |||| |||||| || ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| | || || ||| ||||    
T  36344807 tgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatactagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttact 36344708  T
Q  110 tctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
     |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  36344707 ccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccgaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 36344623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 24112641 - 24112824
Alignment:
Q  10 tgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctact 109  Q
    ||||||| || || |||| |||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| | || || ||| ||||    
T  24112641 tgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttact 24112740  T
Q  110 tctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtga 193  Q
     |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||| || ||||||||    
T  24112741 ccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 24112824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34189252 - 34189069
Alignment:
Q  10 tgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctact 109  Q
    ||||||| || || |||| |||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| | || || ||| ||||    
T  34189252 tgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttact 34189153  T
Q  110 tctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtga 193  Q
     |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||| || ||||||||    
T  34189152 ccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 34189069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 40105910 - 40105767
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||||| || || |    
T  40105910 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgaacttcttccaactttactccagagagggcattgtacga 40105811  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  40105810 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 40105767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Original strand, 54833380 - 54833550
Alignment:
Q  24 ccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcact 123  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| |    
T  54833380 ccagttcaacagcagcagcagcaatatactagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcatt 54833479  T
Q  124 gcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | ||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  54833480 gtacaactaggcagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 54833550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 151
Target Start/End: Original strand, 39850637 - 39850758
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  39850637 caacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacga 39850736  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    | || |||||||||||||||||    
T  39850737 ctaggcagggcaagcctccacc 39850758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16450182 - 16449985
Alignment:
Q  4 agcaaatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgac 103  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16450182 agcaagtgcaacaacagccaccagctcaacagcaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgac 16450083  T
Q  104 tctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16450082 tctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatcctttgcctcccaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatc 16449985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 16041282 - 16041479
Alignment:
Q  4 agcaaatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgac 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16041282 agcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgac 16041381  T
Q  104 tctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16041382 tctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctaaagtgtgatttccatc 16041479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31088644 - 31088451
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  31088644 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactcta 31088545  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  31088544 cttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 31088451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 201
Target Start/End: Original strand, 26484679 - 26484850
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484679 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 26484778  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  26484779 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 26484850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 45733423 - 45733616
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||   ||||||    
T  45733423 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcttaactcta 45733522  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  45733523 cttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 45733616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2109163 - 2108992
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2109163 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 2109064  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  2109063 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 2108992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39211181 - 39211010
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39211181 caacaacgaccgcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 39211082  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
     ||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  39211081 tcagacaggggaagcttccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 39211010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 201
Target Start/End: Original strand, 2775344 - 2775515
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775344 caacaacgacagtagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagtagctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 2775443  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  2775444 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 2775515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 18540784 - 18540947
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18540784 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacttttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 18540883  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtga 193  Q
     ||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||| || ||||||||    
T  18540884 tcagacaggggaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 18540947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11424934 - 11424791
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| |||||||    
T  11424934 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgcacaa 11424835  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11424834 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 11424791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 10917032 - 10916883
Alignment:
Q  24 ccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcact 123  Q
    |||| ||||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| |    
T  10917032 ccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcatt 10916933  T
Q  124 gcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10916932 gtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 10916883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 5127977 - 5128141
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  5127977 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 5128076  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  5128077 ccagacagggtaagcccccacctaatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 5128141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5147498 - 5147334
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  5147498 caacaacaacaaaatcaacaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 5147399  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  5147398 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 5147334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16503538 - 16503395
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  16503538 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 16503439  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16503438 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 16503395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16518574 - 16518431
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  16518574 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 16518475  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16518474 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 16518431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 2154558 - 2154701
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  2154558 caacaacaacaaaatcagcaagctagacatactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 2154657  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2154658 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 2154701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16736618 - 16736454
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  16736618 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 16736519  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  16736518 ctagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 16736454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16751672 - 16751508
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  16751672 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 16751573  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  16751572 ctagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 16751508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 17523517 - 17523681
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  17523517 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 17523616  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  17523617 ctagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 17523681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17529698 - 17529534
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  17529698 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 17529599  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  17529598 ctagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 17529534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4145281 - 4145138
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  4145281 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 4145182  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4145181 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 4145138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 9618636 - 9618779
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  9618636 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 9618735  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9618736 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 9618779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 26275252 - 26275109
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  26275252 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 26275153  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26275152 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 26275109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 26320027 - 26319884
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  26320027 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 26319928  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26319927 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 26319884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 45387328 - 45387471
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  45387328 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 45387427  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  45387428 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 45387471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 26435242 - 26435406
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  26435242 caacaacaacaaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaa 26435341  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  26435342 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 26435406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 3445291 - 3445434
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  3445291 caacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaa 3445390  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3445391 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 3445434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 26670072 - 26669929
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  26670072 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 26669973  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||||    
T  26669972 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcccccaaggttc 26669929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 5159484 - 5159667
Alignment:
Q  10 tgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctact 109  Q
    ||||||| || || |||| |||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| | || || ||| ||||    
T  5159484 tgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttact 5159583  T
Q  110 tctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtga 193  Q
     |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||| || ||||||||    
T  5159584 ccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 5159667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 26538028 - 26537885
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| ||  | |    
T  26538028 caacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtgcga 26537929  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26537928 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 26537885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 31124905 - 31125048
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||    
T  31124905 caacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaa 31125004  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31125005 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 31125048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31564526 - 31564405
Alignment:
Q  52 ctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  31564526 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 31564427  T
Q  152 taatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  31564426 tgatccgttgcctccaaggttc 31564405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 11441557 - 11441700
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||| |  | || || ||||||||||| ||||||||| | || || ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  11441557 caacaacagcagcagcaatataccaggccaacttttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaa 11441656  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11441657 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 11441700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16626845 - 16626648
Alignment:
Q  4 agcaaatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgac 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  16626845 agcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgatatatgtcgagttactccctac 16626746  T
Q  104 tctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16626745 tctacttcttagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 16626648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 18530313 - 18530504
Alignment:
Q  4 agcaaatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgac 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||    
T  18530313 agcaaatgcaacaacagccaccagctcaac------agcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgctgagttactcctgac 18530406  T
Q  104 tctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18530407 tctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 18530504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 4625867 - 4626060
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  4625867 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactcta 4625966  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4625967 cttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 4626060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17994119 - 17993926
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  17994119 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactcta 17994020  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  17994019 cttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatc 17993926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 5652310 - 5652503
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  5652310 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactcta 5652409  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5652410 ctcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagccttcacctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 5652503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 201
Target Start/End: Original strand, 32292697 - 32292868
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292697 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 32292796  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
     ||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  32292797 tcagacaggggaagtctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 32292868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31034430 - 31034259
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31034430 caacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 31034331  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  31034330 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 31034259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15893019 - 15892876
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  15893019 caacaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 15892920  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  15892919 ccagacagggcaagcccccacctgatcctttgcctcccaggttc 15892876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8301586 - 8301437
Alignment:
Q  24 ccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcact 123  Q
    |||| ||||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| |    
T  8301586 ccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcatt 8301487  T
Q  124 gcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8301486 gtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 8301437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 173
Target Start/End: Original strand, 8295916 - 8296060
Alignment:
Q  29 tcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcaca 128  Q
    ||||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| | ||||||||| || |||    
T  8295916 tcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccacagagggcattgtaca 8296015  T
Q  129 accagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||    
T  8296016 accagacagggcaagcccctacctgatctgttgcctcccaggttc 8296060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 18330614 - 18330757
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||  |||| |  |||||||| || ||||    
T  18330614 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgaccttactccatagagggcattgtacaa 18330713  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18330714 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 18330757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 4721576 - 4721740
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  4721576 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 4721675  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||   || |||||||| ||||||    
T  4721676 ccagacagggcaagcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgat 4721740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22387911 - 22387727
Alignment:
Q  10 tgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctact 109  Q
    ||||||| || || |||| |||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| ||||    
T  22387911 tgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcaacaatatgctagaccgacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagttgcttccaactttact 22387812  T
Q  110 tctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
     |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  22387811 ccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 22387727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4796966 - 4796823
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  4796966 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 4796867  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4796866 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 4796823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15741407 - 15741264
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  15741407 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 15741308  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||    
T  15741307 ccagacagggcaagcccccacctgattcgttgcctccaaggttc 15741264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 17985269 - 17985126
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| | || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  17985269 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaa 17985170  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17985169 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 17985126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 18051207 - 18051350
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || ||||    
T  18051207 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaa 18051306  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18051307 ccagacagggcaagcccccacctgatccgctgcctcccaggttc 18051350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5609635 - 5609471
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  5609635 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 5609536  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  5609535 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 5609471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 6192261 - 6192425
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  6192261 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 6192360  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||   || |||||||| ||||||    
T  6192361 ccagacagggcaagcccccacctgatctgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgat 6192425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18277365 - 18277201
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  18277365 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 18277266  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  18277265 ctagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 18277201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18292666 - 18292502
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  18292666 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 18292567  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  18292566 ctagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 18292502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18307967 - 18307803
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  18307967 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 18307868  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  18307867 ctagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 18307803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 28339247 - 28339411
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  28339247 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 28339346  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  28339347 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 28339411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 29149068 - 29148904
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  29149068 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 29148969  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  29148968 ctagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 29148904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31964786 - 31964622
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  31964786 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 31964687  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  31964686 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 31964622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 50134384 - 50134220
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  50134384 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 50134285  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  50134284 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 50134220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 6542775 - 6542632
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||  |  ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| ||||||||||    
T  6542775 caacaacagcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacaa 6542676  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6542675 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 6542632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 35880711 - 35880854
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  35880711 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 35880810  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  35880811 ccaaacagggcaagcccccacctgatccgctgcctccaaggttc 35880854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 4416864 - 4417028
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  4416864 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 4416963  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  4416964 ctagacagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 4417028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 10396078 - 10396242
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| ||||||||||    
T  10396078 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacaa 10396177  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  10396178 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 10396242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 28116267 - 28116103
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  28116267 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 28116168  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  28116167 ctagacagggcaagcccccacttgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 28116103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 5713172 - 5713315
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  5713172 caacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 5713271  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5713272 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 5713315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 5724082 - 5724225
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  5724082 caacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 5724181  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5724182 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 5724225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 5757395 - 5757252
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  5757395 caacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 5757296  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5757295 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 5757252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 5768286 - 5768143
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  5768286 caacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 5768187  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5768186 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 5768143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 7996507 - 7996650
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  7996507 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 7996606  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7996607 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 7996650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 10643015 - 10643158
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  10643015 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 10643114  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10643115 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 10643158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 36997390 - 36997247
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| | || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  36997390 caacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaa 36997291  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  36997290 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 36997247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 47023398 - 47023541
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  47023398 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 47023497  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47023498 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 47023541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 7073157 - 7073321
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || |    
T  7073157 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacga 7073256  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  7073257 ctagacaaggtaagcccccgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 7073321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 21674638 - 21674802
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || |    
T  21674638 caacaacaacaaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccaaagagggcattgtacga 21674737  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  21674738 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 21674802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4347006 - 4346836
Alignment:
Q  24 ccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcact 123  Q
    |||| |||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| ||||    
T  4347006 ccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacact 4346907  T
Q  124 gcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  4346906 gcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 4346836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 4893135 - 4893318
Alignment:
Q  10 tgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctact 109  Q
    ||||||| || || |||| |||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| | || || ||| ||||    
T  4893135 tgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttact 4893234  T
Q  110 tctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtga 193  Q
     |  ||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||  | || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  4893235 ccagagaggacactgcacgactaggcagggcaaacctccaccggaccctttacctccaaggttccactctgatcttaagtgtga 4893318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 18242684 - 18242827
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||    
T  18242684 caacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaa 18242783  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18242784 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 18242827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Original strand, 28021214 - 28021384
Alignment:
Q  24 ccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcact 123  Q
    |||| |||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||||| |    
T  28021214 ccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactatactccagagagggcatt 28021313  T
Q  124 gcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  28021314 gtacaactagacagggcaagccaccacctgatccattacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 28021384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11110638 - 11110498
Alignment:
Q  54 agacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 153  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  11110638 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcctccacctg 11110539  T
Q  154 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  11110538 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 11110498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 48465872 - 48466036
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  48465872 caacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccaaagaggacactgcacga 48465971  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  48465972 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 48466036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 18225136 - 18225279
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||    
T  18225136 caacaacaacaaaatcaacaagctaggcctaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaa 18225235  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18225236 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 18225279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 32439079 - 32439262
Alignment:
Q  10 tgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctact 109  Q
    ||||||| || || |||| |||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| ||||    
T  32439079 tgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttact 32439178  T
Q  110 tctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtga 193  Q
     |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||| || ||||||||    
T  32439179 ccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 32439262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 173
Target Start/End: Original strand, 5466939 - 5467073
Alignment:
Q  39 cagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagg 138  Q
    ||||||||| | | |||||| ||||||||||  ||||| ||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||    
T  5466939 cagcagcaatatgatagaccaacttttcctcttatacctatgttgtatgcagaactccttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagg 5467038  T
Q  139 gcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5467039 gcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 5467073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 29665283 - 29665162
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  29665283 caacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacga 29665184  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    | || |||||||||||||||||    
T  29665183 ctaggcagggcaagcctccacc 29665162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22871169 - 22871005
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    ||||| || ||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || |    
T  22871169 caacagcagcagcagcagtatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacga 22871070  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  22871069 ctaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 22871005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22886228 - 22886064
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    ||||| || ||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || |    
T  22886228 caacagcagcagcagcagtatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacga 22886129  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  22886128 ctaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 22886064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 5013657 - 5013800
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||| || || ||||||||||| ||||||||| | || || ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  5013657 caacaacaacaaaatcagcaagccaggccaacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaa 5013756  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5013757 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 5013800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 5596670 - 5596527
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||  |  ||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||    
T  5596670 caacaacagcagcagcagtatactagaccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaa 5596571  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5596570 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 5596527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 151
Target Start/End: Original strand, 20065982 - 20066109
Alignment:
Q  24 ccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcact 123  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| ||||    
T  20065982 ccagttcaacagcagcagcagcaatatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacact 20066081  T
Q  124 gcacaaccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    |||| || || |||||||||||||||||    
T  20066082 gcacgactaggcagggcaagcctccacc 20066109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 51782052 - 51782111
Alignment:
Q  114 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  51782052 agagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 51782111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Original strand, 8211677 - 8211847
Alignment:
Q  24 ccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcact 123  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |  ||||||  ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| |    
T  8211677 ccagttcaacagcagcagcagcaatatactagactaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcatt 8211776  T
Q  124 gcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | || || || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  8211777 gtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 8211847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 20577163 - 20577039
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaa---gctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgca 126  Q
    ||||||||||||||||| |||    | ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||    
T  20577163 caacaacaacagcagcatcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgca 20577064  T
Q  127 caaccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    | || || |||||||||||||||||    
T  20577063 cgactaggcagggcaagcctccacc 20577039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 165
Target Start/End: Original strand, 51797141 - 51797192
Alignment:
Q  114 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctc 165  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  51797141 agagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctc 51797192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 22888437 - 22888634
Alignment:
Q  4 agcaaatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgac 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  22888437 agcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgac 22888536  T
Q  104 tctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  22888537 tctatttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 22888634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 25198996 - 25199193
Alignment:
Q  4 agcaaatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgac 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25198996 agcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttttctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgac 25199095  T
Q  104 tctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  25199096 tctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccgttctgatctcaagtgtgatttccatc 25199193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13184839 - 13184646
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  13184839 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactcta 13184740  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13184739 cttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 13184646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 33877218 - 33877411
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  33877218 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactcta 33877317  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  33877318 cttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 33877411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 11325765 - 11325958
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  11325765 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactcta 11325864  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  11325865 cttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatc 11325958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13440685 - 13440492
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  13440685 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctaaattactcccgactcta 13440586  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13440585 cttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 13440492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29889263 - 29889080
Alignment:
Q  18 cagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagag 117  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  29889263 cagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgctgagctactcccaactctacttctcagag 29889164  T
Q  118 ggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  29889163 ggcactgcaccaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcatatgtgatttccatc 29889080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 23892170 - 23892370
Alignment:
Q  4 agcaaatgcaacaacagcccccagct---caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactccc 100  Q
    ||||||||||||||||||| || | |   ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||    
T  23892170 agcaaatgcaacaacagccaccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatcatgtatgccgagttgcttcc 23892269  T
Q  101 gactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||| |||||    
T  23892270 gactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtccgacctcaaatgtgatttccat 23892369  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  23892370 c 23892370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 173
Target Start/End: Original strand, 30934620 - 30934769
Alignment:
Q  24 ccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcact 123  Q
    |||| ||||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || |    
T  30934620 ccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacatt 30934719  T
Q  124 gcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30934720 gtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttc 30934769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23752619 - 23752455
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  23752619 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 23752520  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || |||||||| ||||||    
T  23752519 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgat 23752455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 173
Target Start/End: Original strand, 24970014 - 24970154
Alignment:
Q  33 caacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaacca 132  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||    
T  24970014 caacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaacca 24970113  T
Q  133 gacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24970114 gacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 24970154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 11549347 - 11549490
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  11549347 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 11549446  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11549447 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 11549490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 23718157 - 23718014
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  23718157 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 23718058  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  23718057 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 23718014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 24688326 - 24688183
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  24688326 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatattgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 24688227  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24688226 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttc 24688183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 33777480 - 33777644
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  33777480 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 33777579  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || |||||||| ||||||    
T  33777580 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgat 33777644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 2511044 - 2511187
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  2511044 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 2511143  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2511144 ctagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttc 2511187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8665644 - 8665501
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  8665644 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 8665545  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8665544 ctagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttc 8665501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15759026 - 15758883
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  15759026 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 15758927  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15758926 ctagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttc 15758883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 6874298 - 6874462
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  6874298 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagctgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 6874397  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  6874398 ctagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 6874462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9548712 - 9548548
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  9548712 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 9548613  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||    
T  9548612 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgat 9548548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22999283 - 22999119
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || ||||    
T  22999283 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaa 22999184  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || ||||||||||||    
T  22999183 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaagtgtgat 22999119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 26480385 - 26480528
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  26480385 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 26480484  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26480485 ctagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 26480528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 173
Target Start/End: Original strand, 34616505 - 34616654
Alignment:
Q  24 ccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcact 123  Q
    |||| |||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || |||||||| |  ||||| || |    
T  34616505 ccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacatt 34616604  T
Q  124 gcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  34616605 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 34616654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15658929 - 15658765
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  15658929 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 15658830  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  15658829 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 15658765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37671652 - 37671488
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||  |  ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  37671652 caacaacagcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacga 37671553  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  37671552 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 37671488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 41674702 - 41674866
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  41674702 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 41674801  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  41674802 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgat 41674866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 5637903 - 5638046
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  5637903 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 5638002  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5638003 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 5638046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 9317444 - 9317587
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  9317444 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 9317543  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9317544 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 9317587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 12132148 - 12132291
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  12132148 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 12132247  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12132248 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 12132291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 30152011 - 30152154
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  30152011 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 30152110  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30152111 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 30152154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 30168462 - 30168605
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || |    
T  30168462 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacga 30168561  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30168562 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 30168605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18375581 - 18375438
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  18375581 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 18375482  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18375481 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 18375438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 28959955 - 28959812
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||    
T  28959955 caacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaa 28959856  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28959855 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 28959812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 31431433 - 31431576
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||  |  |||| || ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||| || || |    
T  31431433 caacaacagcagcagcagtatactaggccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacga 31431532  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31431533 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 31431576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31826576 - 31826433
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  31826576 caacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaa 31826477  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31826476 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 31826433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 37358812 - 37358669
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||    
T  37358812 caacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaa 37358713  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37358712 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 37358669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18500877 - 18500735
Alignment:
Q  52 ctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||    
T  18500877 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18500778  T
Q  152 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  18500777 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 18500735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 194
Target Start/End: Original strand, 28649250 - 28649392
Alignment:
Q  52 ctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||    
T  28649250 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 28649349  T
Q  152 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  28649350 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 28649392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 32599647 - 32599477
Alignment:
Q  24 ccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcact 123  Q
    |||| |||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| ||||    
T  32599647 ccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacact 32599548  T
Q  124 gcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  32599547 gcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 32599477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37771156 - 37770992
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||  |  ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || || |    
T  37771156 caacaacagcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacga 37771057  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  37771056 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 37770992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 43078245 - 43078409
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || |    
T  43078245 caacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacga 43078344  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  43078345 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 43078409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 3789534 - 3789677
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||  |  ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  3789534 caacaacagcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacga 3789633  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3789634 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 3789677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 33292498 - 33292681
Alignment:
Q  10 tgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctact 109  Q
    ||||||| || || |||| |||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| | || || ||| ||||    
T  33292498 tgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcaacaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttact 33292597  T
Q  110 tctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtga 193  Q
     |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||| || ||||||||    
T  33292598 ccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 33292681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 33516349 - 33516492
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || ||  |||| |  ||||| || || ||||    
T  33516349 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaa 33516448  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33516449 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 33516492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 37754973 - 37755116
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||  |  ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || || |    
T  37754973 caacaacagcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacga 37755072  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37755073 ctagacaaggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 37755116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 40473718 - 40473597
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  40473718 caacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacga 40473619  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    | || |||||||||||||||||    
T  40473618 ctaggcagggcaagcctccacc 40473597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 151
Target Start/End: Original strand, 24681457 - 24681554
Alignment:
Q  54 agacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  24681457 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 24681554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 151
Target Start/End: Original strand, 24723984 - 24724081
Alignment:
Q  54 agacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  24723984 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 24724081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13324998 - 13324835
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||  |  ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  13324998 caacaacagcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacga 13324899  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtga 193  Q
    | || |||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||| ||||| |||||    
T  13324898 ctaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatctcaaatgtga 13324835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 312 - 129
Alignment:
Q  18 cagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagag 117  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  312 cagccaccagctcaacagcaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagag 213  T
Q  118 ggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  212 ggcactgctcaaccagacatggcaagcctccacctgatccgttgccttccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2954 - 2759
Alignment:
Q  6 caaatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactc 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2954 caaatgcaacaacagcctccagctcaacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactc 2855  T
Q  106 tacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2854 tacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 2759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20340631 - 20340436
Alignment:
Q  6 caaatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactc 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20340631 caaatgcaacaacagcctccagctcaacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactc 20340532  T
Q  106 tacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20340531 tacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 20340436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 36 - 194
Target Start/End: Original strand, 20461070 - 20461228
Alignment:
Q  36 caacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagac 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461070 caacaacagcaacaagctagacctacctttcctccgatactaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagac 20461169  T
Q  136 agggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20461170 agggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgat 20461228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16208326 - 16208132
Alignment:
Q  4 agcaaatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgac 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  16208326 agcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacatca---acaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtataccgagttactcccgac 16208230  T
Q  104 tctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16208229 tctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggaaaacctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 16208132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 201
Target Start/End: Original strand, 28151845 - 28152016
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28151845 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 28151944  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  28151945 tcagacaggggaagcctccacctgatctgttacctcccaggctccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 28152016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 41793580 - 41793416
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  41793580 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 41793481  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  41793480 ctagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 41793416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 28584964 - 28585107
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  28584964 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 28585063  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28585064 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 28585107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 10962653 - 10962796
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| | || |  |||||||| || ||||    
T  10962653 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttgctccagagagggcattgtacaa 10962752  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10962753 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 10962796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 51638201 - 51638365
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||| ||||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || |    
T  51638201 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttcccttcgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacga 51638300  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | || ||||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  51638301 ctaggcagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 51638365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 138; Significance: 2e-72; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 44563063 - 44563256
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  44563063 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactcta 44563162  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44563163 cttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 44563256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 9354584 - 9354777
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  9354584 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactcta 9354683  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  9354684 ctcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 9354777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19659292 - 19659099
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  19659292 aatgcaacaacaacctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactcta 19659193  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19659192 cttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaagcctccacctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 19659099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22081106 - 22080938
Alignment:
Q  33 caacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaacca 132  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  22081106 caacagcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgataccaatgctgtacgccgagctgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaacca 22081007  T
Q  133 gacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22081006 ggcagggaaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatc 22080938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 201
Target Start/End: Original strand, 33244649 - 33244820
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33244649 caacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgttgaattactcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaa 33244748  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  33244749 ccagacagggcaagcctccacctgacccgtcgcctcctaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 33244820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 201
Target Start/End: Original strand, 16283433 - 16283604
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| || |||||||| || ||||    
T  16283433 caacaacaacaacatcaacaagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccttagagggcattgtacaa 16283532  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||| |||||| ||||||    
T  16283533 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatc 16283604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 16277538 - 16277681
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  16277538 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 16277637  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16277638 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttc 16277681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 2137490 - 2137347
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  2137490 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 2137391  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2137390 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 2137347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 19688082 - 19688225
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  19688082 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 19688181  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19688182 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 19688225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 27609136 - 27608993
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  27609136 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 27609037  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27609036 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 27608993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 173
Target Start/End: Original strand, 14557602 - 14557751
Alignment:
Q  24 ccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcact 123  Q
    |||| ||||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| |    
T  14557602 ccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcatt 14557701  T
Q  124 gcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  14557702 gtacaaccagacagggcaagccctcgcctgatccgttgcctccaaggttc 14557751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 31354508 - 31354672
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  31354508 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgccgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 31354607  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  31354608 ctagacagggcaagcctccacctgatcctttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 31354672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19208591 - 19208448
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  19208591 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 19208492  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19208491 ctagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 19208448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31489981 - 31489838
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  31489981 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 31489882  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31489881 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 31489838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 19674425 - 19674589
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  19674425 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 19674524  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  19674525 ctagacagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 19674589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 28362186 - 28362043
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  28362186 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 28362087  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28362086 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 28362043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 18710570 - 18710734
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  18710570 caacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 18710669  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||    
T  18710670 ctagacagggtaagccctcacctgatccgctgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgat 18710734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3329738 - 3329595
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||  |  ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  3329738 caacaacagcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacga 3329639  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3329638 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 3329595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Original strand, 19286440 - 19286610
Alignment:
Q  24 ccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcact 123  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| |    
T  19286440 ccagttcaacagcagcagcagcaatatactagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcatt 19286539  T
Q  124 gcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | ||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  19286540 gtacaactaggcagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 19286610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 12092933 - 12092812
Alignment:
Q  52 ctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  12092933 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 12092834  T
Q  152 taatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  12092833 tgatccgttgcctccaaggttc 12092812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 174
Target Start/End: Original strand, 29829306 - 29829450
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||  |  ||||||| ||||||||||| ||||||||| | || || ||  | || || ||| |||| |  |||||||| || || |    
T  29829306 caacaacagcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttccaactttactccagagagggcattgtacca 29829405  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttcc 174  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  29829406 ccagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcc 29829450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 33 - 201
Target Start/End: Original strand, 20375 - 20543
Alignment:
Q  33 caacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaacca 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20375 caacaacagcagcaacaagctagacctacctttcccccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaacca 20474  T
Q  133 gacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20475 gacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 20543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 30437 - 30579
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || ||  |||| |  ||||| || || ||||    
T  30437 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttt-cctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaa 30535  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30536 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 30579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 130; Significance: 1e-67; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8892547 - 8892354
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  8892547 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactcta 8892448  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8892447 cttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 8892354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8903782 - 8903589
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  8903782 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactcta 8903683  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8903682 cttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 8903589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13522310 - 13522117
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  13522310 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactcta 13522211  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13522210 cttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 13522117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 28162616 - 28162809
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  28162616 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactcta 28162715  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28162716 cttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacttgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 28162809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33374493 - 33374300
Alignment:
Q  8 aatgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  33374493 aatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactcta 33374394  T
Q  108 cttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  33374393 cttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 33374300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22457176 - 22456978
Alignment:
Q  6 caaatgcaacaacagcccccagctcaacaacaac---agcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccga 102  Q
    ||||||||||||||| | || | |||||||||||   | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22457176 caaatgcaacaacagtcaccggttcaacaacaacgacaacagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccga 22457077  T
Q  103 ctctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  22457076 ctctacttctcataaggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttcttacctcaagtgtgatttccatc 22456978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22477515 - 22477317
Alignment:
Q  6 caaatgcaacaacagcccccagctcaacaacaac---agcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccga 102  Q
    ||||||||||||||| | || | |||||||||||   | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22477515 caaatgcaacaacagtcaccggttcaacaacaacgacaacagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccga 22477416  T
Q  103 ctctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  22477415 ctctacttctcatatggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctaacctcaagtgtgatttccatc 22477317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27290597 - 27290414
Alignment:
Q  18 cagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagag 117  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27290597 cagccaccggctcaacaacgacagcagcaataagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgagttgctcccgactctacttctcagag 27290498  T
Q  118 ggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  27290497 ggcactacacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcccaagttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 27290414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14143500 - 14143329
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14143500 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaa 14143401  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  14143400 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 14143329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 201
Target Start/End: Original strand, 26787925 - 26788096
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26787925 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaa 26788024  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  26788025 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 26788096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 201
Target Start/End: Original strand, 27196298 - 27196469
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27196298 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaa 27196397  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  27196398 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 27196469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27252942 - 27252771
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27252942 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaa 27252843  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  27252842 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 27252771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 199
Target Start/End: Original strand, 20160667 - 20160851
Alignment:
Q  15 caacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctca 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||    
T  20160667 caacagccaccagctcaacaacaacaacagcaacaaactagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcaca 20160766  T
Q  115 gagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtcca 199  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| || |||||||||||| ||||    
T  20160767 gagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttcca 20160851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22172164 - 22171980
Alignment:
Q  15 caacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctca 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||    
T  22172164 caacagccaccagctcaacaacaacaacagcaacaaactagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcaca 22172065  T
Q  115 gagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtcca 199  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| || |||||||||||| ||||    
T  22172064 gagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttcca 22171980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22935096 - 22934924
Alignment:
Q  29 tcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcaca 128  Q
    ||||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||    
T  22935096 tcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtaca 22934997  T
Q  129 accagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||| |||||| ||||||    
T  22934996 accagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatc 22934924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23857541 - 23857369
Alignment:
Q  29 tcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcaca 128  Q
    ||||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||    
T  23857541 tcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtaca 23857442  T
Q  129 accagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||| |||||| ||||||    
T  23857441 accagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatc 23857369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27272795 - 27272624
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| |  |||||||| || ||||    
T  27272795 caacaacaacagaatcagcaagtcagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactctactccagagagggcattgtacaa 27272696  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||   || |||||||| |||||| ||||||    
T  27272695 ccagacagggtaagcccccacctgatccgtcgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatc 27272624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 26918361 - 26918525
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  26918361 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 26918460  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  26918461 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 26918525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 13299166 - 13299023
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  13299166 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 13299067  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13299066 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 13299023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 24304833 - 24304690
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  24304833 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 24304734  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24304733 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 24304690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 173
Target Start/End: Original strand, 26989000 - 26989125
Alignment:
Q  48 caagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 147  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  26989000 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccc 26989099  T
Q  148 cacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26989100 cacctgatccgttgcctccaaggttc 26989125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 16749835 - 16749999
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  16749835 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 16749934  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  16749935 ctagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 16749999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 29549436 - 29549620
Alignment:
Q  10 tgcaacaacagcccccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctact 109  Q
    ||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| | || || ||||||||    
T  29549436 tgcaacatcaaccgccagttcaacaacagcagcagcaatacgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctact 29549535  T
Q  110 tctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
     |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  29549536 ccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 29549620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15424532 - 15424389
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  15424532 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 15424433  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15424432 ctagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 15424389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 24863698 - 24863841
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  24863698 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 24863797  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24863798 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 24863841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 27000054 - 27000197
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  27000054 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 27000153  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27000154 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 27000197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 173
Target Start/End: Original strand, 4525289 - 4525410
Alignment:
Q  52 ctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4525289 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgcacaactagacagggcaagccaccacc 4525388  T
Q  152 taatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  4525389 tgatccgttgcctccaaggttc 4525410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 3696062 - 3696205
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || |    
T  3696062 caacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacga 3696161  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3696162 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 3696205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 29572994 - 29573137
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  29572994 caacaacaacaaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacga 29573093  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29573094 ctaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 29573137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 173
Target Start/End: Original strand, 4773009 - 4773130
Alignment:
Q  52 ctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  4773009 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 4773108  T
Q  152 taatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  4773109 tgatccgttgcctccaaggttc 4773130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 16674120 - 16674284
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  16674120 caacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacga 16674219  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  16674220 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 16674284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 34463561 - 34463397
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  34463561 caacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacga 34463462  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  34463461 ctagacaaggaaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 34463397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 4757745 - 4757888
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||  |  ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || ||||    
T  4757745 caacaacagcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaa 4757844  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4757845 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 4757888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 27485110 - 27485253
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||    
T  27485110 caacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaa 27485209  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27485210 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 27485253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Original strand, 27044362 - 27044532
Alignment:
Q  24 ccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcact 123  Q
    |||| |||||| || ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| |    
T  27044362 ccagttcaacagcagcagcagcaatatactagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcatt 27044461  T
Q  124 gcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  27044462 gtacaactagacagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 27044532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4545960 - 4545847
Alignment:
Q  60 acttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgt 159  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  4545960 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 4545861  T
Q  160 tgcctcccaggttc 173  Q
    ||||||| ||||||    
T  4545860 tgcctccaaggttc 4545847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4724319 - 4724206
Alignment:
Q  60 acttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgt 159  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  4724319 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 4724220  T
Q  160 tgcctcccaggttc 173  Q
    ||||||| ||||||    
T  4724219 tgcctccaaggttc 4724206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 173
Target Start/End: Original strand, 28207465 - 28207578
Alignment:
Q  60 acttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgt 159  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  28207465 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 28207564  T
Q  160 tgcctcccaggttc 173  Q
    ||||||| ||||||    
T  28207565 tgcctccaaggttc 28207578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 27007708 - 27007872
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||  |  ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  27007708 caacaacagcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacga 27007807  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  27007808 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 27007872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 26777830 - 26777687
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||| || || ||||| ||||| ||| | ||||||||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||    
T  26777830 caacagcagcagcagcaatatgctagaccaaccttccctcctataccgatgttgtatgccgaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaa 26777731  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26777730 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 26777687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 27360207 - 27360064
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||    
T  27360207 caacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaa 27360108  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27360107 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 27360064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 27450550 - 27450407
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||    
T  27450550 caacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaa 27450451  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27450450 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 27450407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 30558231 - 30558088
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || ||  |||| |  ||||| || || ||||    
T  30558231 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaa 30558132  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30558131 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 30558088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 29501396 - 29501539
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||| ||||||||  |  ||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||    
T  29501396 caacaacagcagcagcagtatactagaccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaa 29501495  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29501496 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 29501539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 26116603 - 26116482
Alignment:
Q  52 ctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||  | || |||||| |||| |  ||||| || || || || |||||||||||||| |||||    
T  26116603 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccgactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 26116504  T
Q  152 taatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  26116503 tgatccgttgcctccaaggttc 26116482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 151
Target Start/End: Original strand, 17025280 - 17025379
Alignment:
Q  52 ctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 151  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  17025280 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 17025379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Original strand, 21549 - 21716
Alignment:
Q  34 aacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccag 133  Q
    |||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21549 aacagcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaaggacactgcacaaccag 21648  T
Q  134 acagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21649 gcagggcaagcctccacctaacctgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatc 21716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 116 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 2018
Alignment:
Q  116 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2103 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 2018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 194
Target Start/End: Original strand, 6080 - 6160
Alignment:
Q  114 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  6080 agagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 6160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 29747 - 29890
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  29747 caacaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 29846  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29847 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 29890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 40341 - 40198
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  40341 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 40242  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  40241 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgccccccaggttc 40198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 47257 - 47114
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || ||||    
T  47257 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaa 47158  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47157 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 47114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 68; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 27276 - 27419
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  27276 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 27375  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27376 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 27419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9338 - 9195
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  9338 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 9239  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9238 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 9195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 19999 - 20142
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  19999 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 20098  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20099 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 20142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 402 - 258
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccg-agttactcccgactctacttctcagagggcactgcaca 128  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   |||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||    
T  402 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctttagttgcttccgactttactccatagagggcattgtaca 303  T
Q  129 accagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  302 accagacagggcaagcccccaccggatccgttgcctcccaagttc 258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 7511 - 7368
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  7511 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 7412  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7411 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 7368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26474 - 26338
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| | || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  26474 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaa 26375  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcc 166  Q
    | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  26374 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctcc 26338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15202 - 15059
Alignment:
Q  30 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 129  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  15202 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 15103  T
Q  130 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 173  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15102 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 15059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Original strand, 9544 - 9714
Alignment:
Q  24 ccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcact 123  Q
    |||| |||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| |    
T  9544 ccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcatt 9643  T
Q  124 gcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 194  Q
    | || || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  9644 gtacgactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgat 9714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 173
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8076
Alignment:
Q  60 acttttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgt 159  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  7963 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 8062  T
Q  160 tgcctcccaggttc 173  Q
    ||||||| ||||||    
T  8063 tgcctccaaggttc 8076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University