View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10485_low_12 (Length: 249)

Name: NF10485_low_12
Description: NF10485
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10485_low_12
NF10485_low_12
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (1-245)||(17454222-17454466)
chr5 (1-245)||(24944087-24944331)
chr5 (1-245)||(23399020-23399264)
chr5 (1-245)||(20783153-20783397)
chr5 (1-245)||(19467080-19467324)
chr5 (1-245)||(20554923-20555167)
chr5 (1-245)||(21668960-21669204)
chr5 (1-245)||(14033150-14033394)
chr5 (1-245)||(14454521-14454765)
chr5 (1-245)||(14565562-14565806)
chr5 (1-245)||(15743077-15743321)
chr5 (1-245)||(22149624-22149868)
chr5 (1-245)||(23365204-23365448)
chr5 (1-245)||(24570196-24570440)
chr5 (1-245)||(24811021-24811265)
chr5 (1-245)||(27049746-27049990)
chr5 (1-245)||(27619681-27619925)
chr5 (1-245)||(31836588-31836832)
chr5 (1-245)||(35218611-35218855)
chr5 (1-245)||(36690806-36691050)
chr5 (1-245)||(37737476-37737720)
chr5 (1-245)||(5298051-5298295)
chr5 (1-245)||(6978914-6979158)
chr5 (1-245)||(9339062-9339306)
chr5 (1-245)||(17610170-17610414)
chr5 (1-245)||(17722026-17722270)
chr5 (1-245)||(22679224-22679468)
chr5 (1-245)||(23699888-23700132)
chr5 (1-245)||(27463270-27463514)
chr5 (1-245)||(30234935-30235179)
chr5 (1-245)||(31351642-31351886)
chr5 (1-245)||(34775017-34775261)
chr5 (1-245)||(36590026-36590270)
chr5 (1-245)||(39355604-39355848)
chr5 (1-245)||(39498396-39498640)
chr5 (1-245)||(42045888-42046132)
chr5 (1-230)||(1118811-1119040)
chr5 (1-245)||(13530787-13531031)
chr5 (1-245)||(16000805-16001049)
chr5 (1-245)||(23299385-23299629)
chr5 (1-245)||(24824385-24824628)
chr5 (1-245)||(23485692-23485936)
chr5 (1-245)||(40393467-40393714)
chr5 (3-230)||(31443019-31443241)
chr5 (1-162)||(34055124-34055285)
chr5 (1-230)||(21202091-21202320)
chr5 (105-230)||(26763239-26763364)
chr5 (185-245)||(34055068-34055128)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (1-245)||(9167172-9167416)
chr7 (1-245)||(18438194-18438438)
chr7 (1-245)||(15880892-15881136)
chr7 (1-245)||(9440853-9441097)
chr7 (1-245)||(174480-174724)
chr7 (1-245)||(460055-460299)
chr7 (1-245)||(1995146-1995390)
chr7 (1-245)||(6870299-6870543)
chr7 (1-245)||(8624935-8625179)
chr7 (1-245)||(17953183-17953427)
chr7 (1-245)||(20986847-20987091)
chr7 (1-245)||(22096731-22096975)
chr7 (1-245)||(26656404-26656648)
chr7 (1-245)||(2708682-2708926)
chr7 (1-245)||(4219598-4219842)
chr7 (1-245)||(8005135-8005379)
chr7 (1-245)||(9092824-9093068)
chr7 (1-245)||(11012777-11013021)
chr7 (1-245)||(24741691-24741935)
chr7 (1-245)||(26393163-26393407)
chr7 (1-245)||(40045173-40045417)
chr7 (1-245)||(42873438-42873682)
chr7 (1-245)||(4415076-4415318)
chr7 (1-230)||(13663987-13664216)
chr7 (1-228)||(14143455-14143682)
chr7 (8-230)||(16549112-16549334)
chr7 (8-230)||(16616328-16616550)
chr7 (1-230)||(16312602-16312831)
chr7 (49-230)||(33603669-33603850)
chr7 (1-227)||(13876955-13877181)
chr7 (63-209)||(13030073-13030219)
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (1-245)||(15199792-15200036)
chr4 (1-245)||(16314352-16314596)
chr4 (1-245)||(10298293-10298537)
chr4 (1-245)||(4990784-4991028)
chr4 (1-245)||(5019758-5020002)
chr4 (1-245)||(14839046-14839290)
chr4 (1-230)||(3379124-3379353)
chr4 (1-245)||(16263487-16263731)
chr4 (1-245)||(27173692-27173936)
chr4 (1-245)||(30929482-30929726)
chr4 (1-245)||(36025913-36026157)
chr4 (1-245)||(40457349-40457593)
chr4 (1-245)||(49515158-49515402)
chr4 (1-245)||(10743587-10743831)
chr4 (1-245)||(10957356-10957600)
chr4 (1-229)||(17925720-17925948)
chr4 (1-245)||(19947384-19947628)
chr4 (1-245)||(22004039-22004283)
chr4 (1-245)||(24647953-24648197)
chr4 (1-245)||(27664195-27664439)
chr4 (1-245)||(27817935-27818179)
chr4 (1-245)||(55748241-55748485)
chr4 (1-239)||(458184-458422)
chr4 (1-239)||(18755485-18755723)
chr4 (96-229)||(18133255-18133389)
chr4 (1-230)||(16851577-16851806)
chr4 (1-230)||(15867095-15867324)
chr4 (103-230)||(14907220-14907347)
chr4 (1-230)||(17244400-17244629)
chr4 (1-200)||(15406097-15406296)
chr4 (13-181)||(39042531-39042699)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (1-245)||(4430768-4431012)
chr3 (1-245)||(1061152-1061396)
chr3 (1-245)||(8998936-8999180)
chr3 (1-245)||(13264644-13264888)
chr3 (1-245)||(17899092-17899336)
chr3 (1-245)||(7797606-7797850)
chr3 (1-245)||(1786855-1787099)
chr3 (1-245)||(15654085-15654329)
chr3 (1-230)||(9383664-9383890)
chr3 (1-230)||(12240559-12240788)
chr3 (1-245)||(18004555-18004799)
chr3 (1-245)||(37874069-37874313)
chr3 (1-245)||(37882587-37882831)
chr3 (1-230)||(11209094-11209324)
chr3 (1-245)||(4751327-4751571)
chr3 (1-245)||(5582618-5582862)
chr3 (1-245)||(5868681-5868925)
chr3 (1-245)||(9984873-9985117)
chr3 (1-245)||(13375653-13375897)
chr3 (1-245)||(13386247-13386491)
chr3 (1-245)||(14473229-14473473)
chr3 (1-245)||(16394033-16394277)
chr3 (1-245)||(19786030-19786274)
chr3 (1-245)||(20676182-20676426)
chr3 (1-245)||(24386503-24386747)
chr3 (1-245)||(29464191-29464435)
chr3 (1-245)||(507155-507399)
chr3 (1-245)||(5540006-5540250)
chr3 (1-245)||(6493331-6493575)
chr3 (1-245)||(8782271-8782515)
chr3 (1-245)||(11275370-11275614)
chr3 (1-245)||(13129278-13129522)
chr3 (1-245)||(16399007-16399251)
chr3 (1-245)||(23764902-23765146)
chr3 (1-245)||(28317223-28317467)
chr3 (1-245)||(38202260-38202504)
chr3 (1-245)||(39379692-39379936)
chr3 (1-245)||(41691257-41691501)
chr3 (1-230)||(24667478-24667707)
chr3 (1-245)||(10629933-10630177)
chr3 (1-245)||(12289965-12290209)
chr3 (1-245)||(15840824-15841068)
chr3 (1-245)||(17014792-17015036)
chr3 (1-245)||(29936539-29936783)
chr3 (1-245)||(29985693-29985937)
chr3 (1-245)||(13146728-13146972)
chr3 (39-245)||(6184942-6185148)
chr3 (1-230)||(18124761-18124990)
chr3 (1-229)||(5209646-5209874)
chr3 (130-230)||(16027961-16028061)
chr3 (136-230)||(11187808-11187902)
chr3 (1-43)||(6213248-6213290)
chr3 (1-79)||(16027885-16027963)
chr3 (1-74)||(11187697-11187770)
chr3 (187-230)||(2559058-2559101)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (1-230)||(26874530-26874759)
chr2 (1-245)||(21164952-21165196)
chr2 (1-245)||(24418031-24418275)
chr2 (1-245)||(28724323-28724567)
chr2 (1-245)||(9765768-9766012)
chr2 (1-245)||(9900578-9900822)
chr2 (1-245)||(10274550-10274794)
chr2 (1-245)||(11398177-11398421)
chr2 (1-245)||(19305424-19305668)
chr2 (1-245)||(22936662-22936906)
chr2 (1-245)||(39173099-39173343)
chr2 (1-245)||(40248172-40248416)
chr2 (1-245)||(4217459-4217703)
chr2 (1-245)||(24330754-24330998)
chr2 (1-245)||(27229002-27229246)
chr2 (1-245)||(29251784-29252028)
chr2 (1-245)||(34793222-34793466)
chr2 (1-245)||(35260568-35260812)
chr2 (1-245)||(35271193-35271437)
chr2 (1-245)||(43090242-43090486)
chr2 (1-194)||(43352959-43353152)
chr2 (1-245)||(24804656-24804899)
chr2 (139-245)||(19302801-19302907)
chr2 (1-230)||(28704266-28704494)
chr2 (1-230)||(22250159-22250388)
chr2 (1-230)||(22784666-22784895)
chr2 (1-247)||(24841882-24842128)
chr2 (1-56)||(22744620-22744675)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (1-230)||(7692517-7692746)
chr1 (1-245)||(19184755-19184999)
chr1 (1-238)||(22014760-22014997)
chr1 (1-245)||(3179151-3179395)
chr1 (1-245)||(5840754-5840998)
chr1 (1-245)||(21871215-21871459)
chr1 (1-245)||(47610963-47611207)
chr1 (1-245)||(4174851-4175095)
chr1 (1-245)||(7514824-7515068)
chr1 (1-245)||(36239461-36239705)
chr1 (1-245)||(38102635-38102879)
chr1 (1-245)||(51632219-51632463)
chr1 (1-245)||(5642735-5642979)
chr1 (1-245)||(35641068-35641312)
chr1 (1-245)||(12738078-12738322)
chr1 (1-231)||(19162722-19162952)
chr1 (1-245)||(22652257-22652501)
chr1 (102-245)||(12617350-12617493)
chr1 (1-230)||(23020524-23020753)
chr1 (1-228)||(21208812-21209039)
chr1 (1-227)||(21127399-21127625)
chr1 (1-230)||(17718690-17718918)
chr1 (85-230)||(22446359-22446504)
chr1 (85-230)||(22451593-22451738)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (1-245)||(1426-1670)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (1-245)||(19232387-19232631)
chr8 (1-245)||(19425934-19426178)
chr8 (1-245)||(22149767-22150011)
chr8 (1-245)||(30317745-30317989)
chr8 (1-245)||(3351655-3351899)
chr8 (1-245)||(6158675-6158919)
chr8 (1-245)||(9348707-9348951)
chr8 (1-245)||(26117918-26118162)
chr8 (1-245)||(36085530-36085774)
chr8 (1-245)||(44488723-44488967)
chr8 (1-245)||(249417-249661)
chr8 (1-245)||(812518-812762)
chr8 (1-245)||(13691590-13691834)
chr8 (1-245)||(19136289-19136533)
chr8 (1-245)||(29084000-29084244)
chr8 (1-245)||(32080716-32080960)
chr8 (1-245)||(36300535-36300779)
chr8 (1-245)||(15783731-15783975)
chr8 (3-245)||(23790252-23790494)
chr8 (3-245)||(23802299-23802541)
chr8 (1-245)||(3840531-3840791)
chr8 (1-143)||(21295839-21295981)
chr8 (8-230)||(17291668-17291890)
chr8 (14-230)||(45563742-45563958)
chr8 (1-230)||(19938911-19939140)
chr8 (1-230)||(22670631-22670860)
chr8 (1-230)||(22464229-22464458)
chr8 (1-71)||(16744281-16744351)
chr8 (1-230)||(17012263-17012492)
chr8 (1-230)||(17544709-17544938)
chr8 (130-194)||(16744350-16744414)
chr8 (187-230)||(15975340-15975383)
chr8 (13-100)||(20261270-20261357)
chr8 (13-100)||(21047900-21047987)
[»] chr6 (37 HSPs)
chr6 (1-245)||(20032916-20033162)
chr6 (1-245)||(13920808-13921052)
chr6 (1-245)||(3669006-3669250)
chr6 (1-245)||(4638488-4638732)
chr6 (1-245)||(9115488-9115732)
chr6 (1-245)||(12719831-12720075)
chr6 (1-245)||(12862493-12862737)
chr6 (1-245)||(26032982-26033226)
chr6 (1-245)||(26041157-26041401)
chr6 (1-245)||(27349307-27349551)
chr6 (1-245)||(27410047-27410291)
chr6 (1-245)||(27501266-27501510)
chr6 (1-245)||(28254563-28254807)
chr6 (1-245)||(28333312-28333556)
chr6 (1-245)||(32304041-32304285)
chr6 (1-245)||(32964941-32965185)
chr6 (1-245)||(16956570-16956814)
chr6 (1-245)||(18827353-18827597)
chr6 (1-245)||(34810157-34810401)
chr6 (1-245)||(26872364-26872608)
chr6 (1-230)||(17055024-17055253)
chr6 (1-245)||(17780594-17780838)
chr6 (1-244)||(22383579-22383822)
chr6 (1-245)||(25675919-25676163)
chr6 (7-245)||(25724721-25724959)
chr6 (1-238)||(25680002-25680239)
chr6 (1-245)||(17611579-17611823)
chr6 (1-245)||(14056380-14056624)
chr6 (1-245)||(14062509-14062753)
chr6 (1-213)||(21126999-21127211)
chr6 (50-245)||(17061300-17061495)
chr6 (1-230)||(22812408-22812637)
chr6 (136-245)||(18551392-18551501)
chr6 (1-230)||(19446893-19447122)
chr6 (1-230)||(19071505-19071734)
chr6 (1-230)||(19954927-19955156)
chr6 (175-245)||(22305986-22306056)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (1-245)||(30095-30339)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (1-245)||(35880-36124)
scaffold0047 (1-230)||(5907-6136)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (1-245)||(39983-40227)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-245)||(45971-46215)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (1-218)||(5085-5302)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (1-245)||(11845-12089)
[»] scaffold0382 (2 HSPs)
scaffold0382 (1-245)||(12693-12937)
scaffold0382 (1-245)||(4310-4554)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (1-245)||(4534-4778)
scaffold0012 (1-245)||(135312-135556)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-245)||(46169-46413)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (1-245)||(2709-2950)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (1-245)||(3709-3965)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (1-230)||(9426-9655)
[»] scaffold0161 (3 HSPs)
scaffold0161 (1-230)||(13134-13363)
scaffold0161 (1-230)||(17807-18036)
scaffold0161 (63-230)||(20745-20912)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-228)||(27140-27367)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (1-230)||(28682-28911)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-230)||(46127-46356)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (1-230)||(11642-11871)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (1-230)||(112682-112911)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (13-230)||(13976-14192)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (1-230)||(7914-8143)
[»] scaffold1732 (1 HSPs)
scaffold1732 (1-209)||(510-718)
[»] scaffold0388 (2 HSPs)
scaffold0388 (154-245)||(637-729)
scaffold0388 (1-57)||(586-642)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (86-230)||(68436-68580)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (1-247)||(74924-75170)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (177-245)||(112754-112822)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (51-230)||(5745-5924)
[»] scaffold1684 (1 HSPs)
scaffold1684 (1-200)||(673-872)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (105-230)||(1617-1742)
[»] scaffold0453 (1 HSPs)
scaffold0453 (1-101)||(5336-5436)
[»] scaffold0758 (1 HSPs)
scaffold0758 (13-140)||(2020-2147)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (5-47)||(62944-62986)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 221; Significance: 1e-122; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 17454222 - 17454466
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17454222 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgagatggaggaattaccaatag 17454321  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17454322 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 17454421  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  17454422 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 17454466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 24944087 - 24944331
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24944087 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 24944186  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24944187 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 24944286  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  24944287 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 24944331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23399264 - 23399020
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23399264 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 23399165  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23399164 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 23399065  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  23399064 gtgcctttaacacccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 23399020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20783397 - 20783153
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20783397 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattattgattgaaatggaggaattaccaatag 20783298  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  20783297 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttatcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctccattcat 20783198  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  20783197 gtgccttgaacacccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 20783153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19467324 - 19467080
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19467324 tcatacccattgtcataaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccaaacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 19467225  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19467224 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 19467125  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  19467124 gtgccttgaacacccgctgtctaggtatcatgacctttgtttctc 19467080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20555167 - 20554923
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20555167 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaatagattatgcttcagaccatctacaagccacacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 20555068  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20555067 tacctgtaccaatgattttttcagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtgaggaacaaagctttctctccagtcat 20554968  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  20554967 gtgccttgaacacccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 20554923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21669204 - 21668960
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21669204 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagacaaacattatttattgaaatggaggaattaccaagag 21669105  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21669104 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtgaggaacaaagctttctctcctgtcat 21669005  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  21669004 atgccttgaacacctgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 21668960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14033394 - 14033150
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14033394 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 14033295  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14033294 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 14033195  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  14033194 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 14033150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 14454521 - 14454765
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14454521 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 14454620  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14454621 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 14454720  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  14454721 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 14454765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 14565562 - 14565806
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14565562 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 14565661  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14565662 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 14565761  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  14565762 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 14565806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15743321 - 15743077
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15743321 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 15743222  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15743221 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 15743122  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  15743121 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 15743077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22149868 - 22149624
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22149868 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 22149769  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22149768 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 22149669  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  22149668 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 22149624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23365448 - 23365204
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23365448 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 23365349  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23365348 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 23365249  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  23365248 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 23365204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24570440 - 24570196
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24570440 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 24570341  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24570340 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 24570241  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  24570240 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 24570196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24811265 - 24811021
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24811265 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 24811166  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24811165 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 24811066  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  24811065 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 24811021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 27049746 - 27049990
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27049746 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 27049845  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27049846 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 27049945  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  27049946 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 27049990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 27619681 - 27619925
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27619681 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 27619780  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27619781 tacatgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 27619880  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  27619881 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 27619925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31836832 - 31836588
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31836832 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 31836733  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31836732 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 31836633  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  31836632 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 31836588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35218855 - 35218611
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35218855 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 35218756  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35218755 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 35218656  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  35218655 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 35218611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36691050 - 36690806
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  36691050 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 36690951  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36690950 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 36690851  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  36690850 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 36690806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 37737476 - 37737720
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37737476 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 37737575  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37737576 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 37737675  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  37737676 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 37737720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 5298051 - 5298295
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5298051 tcatacccattgtcacaaaattgactaacgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 5298150  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5298151 tacctgtactaatgatttttccagtttggttgccaccaaatttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 5298250  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  5298251 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 5298295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6979158 - 6978914
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6979158 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaatagattatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 6979059  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6979058 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 6978959  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  6978958 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 6978914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9339306 - 9339062
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9339306 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 9339207  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9339206 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 9339107  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  9339106 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 9339062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17610414 - 17610170
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17610414 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 17610315  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17610314 tacctgtaccaatgatccttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 17610215  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  17610214 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 17610170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17722270 - 17722026
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17722270 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 17722171  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17722170 tacctgtaccaatgatccttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 17722071  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  17722070 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 17722026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22679468 - 22679224
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22679468 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccatacattattaattgagatggaggaattaccaatag 22679369  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22679368 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 22679269  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  22679268 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 22679224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23700132 - 23699888
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23700132 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 23700033  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23700032 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 23699933  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  23699932 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 23699888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27463514 - 27463270
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27463514 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 27463415  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27463414 tacctgtaccaatgatccttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 27463315  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  27463314 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 27463270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 30234935 - 30235179
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30234935 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 30235034  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30235035 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 30235134  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  30235135 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 30235179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31351886 - 31351642
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31351886 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 31351787  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31351786 tacctgtaccaatgatccttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 31351687  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  31351686 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 31351642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34775261 - 34775017
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34775261 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 34775162  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34775161 tacatgtaccaatgatttttccagtctggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 34775062  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  34775061 gtgccttgaacatccgttgtctaggtaccatgacctttgtttctc 34775017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 36590026 - 36590270
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  36590026 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 36590125  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36590126 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 36590225  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  36590226 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 36590270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39355848 - 39355604
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  39355848 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattatcaatag 39355749  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39355748 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 39355649  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  39355648 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 39355604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 39498396 - 39498640
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  39498396 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaatagattatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 39498495  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39498496 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 39498595  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  39498596 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 39498640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42046132 - 42045888
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42046132 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 42046033  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42046032 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 42045933  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  42045932 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 42045888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 1118811 - 1119040
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1118811 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgaaatggaggagttaccaatag 1118910  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1118911 tatctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtgagagtaaggaacaaagctttctctccagtcat 1119010  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1119011 gtgccttgaacatccgctgtctaggtacca 1119040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 13530787 - 13531031
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13530787 tcatacccattgtgacaaaattgacagatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccaaacattatttattgaaatggaggacttaccaatag 13530886  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13530887 tatctgtaccaatgatttttccagttaggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtgaggaacaaagctttctctcctgtcat 13530986  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13530987 atgccttgaacaccaactgtctaggtaccaggacctttgtttctc 13531031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 16000805 - 16001049
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  16000805 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaataa 16000904  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16000905 tacctgcaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 16001004  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  16001005 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 16001049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23299629 - 23299385
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23299629 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccaaacattattaattgagatggaggaattaccaatag 23299530  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23299529 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 23299430  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  23299429 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 23299385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 24824385 - 24824628
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24824385 tcatacccattgtcacaaaat-gactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 24824483  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24824484 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 24824583  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  24824584 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 24824628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 23485692 - 23485936
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23485692 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccatacattatttattgatatggaggaattaccaatag 23485791  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23485792 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttcttctccttctttcatggtaatggtgaggaaaaaagctttctctcctgtcat 23485891  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||    
T  23485892 atgccttgaacacccgctgtccaggtaccaggatctttgtttctc 23485936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40393714 - 40393467
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattattt---attgaaatggaggaattaccaa 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||    
T  40393714 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattattaattgagatggaggaattaccaa 40393615  T
Q  98 taggacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgt 197  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40393614 tagtacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagt 40393515  T
Q  198 catatgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  40393514 catgtgccttgaacatccgttgtctaggtaccatgacctttgtttctc 40393467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31443241 - 31443019
Alignment:
Q  3 atacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatagga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  31443241 atacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatagta 31443142  T
Q  103 cctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcatat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  31443141 cctgtaccaatgatttttccagtctggttgccaccaaact----ttctcctccatctttcattgtaa-ggtaaggaacaaagctttctctccagtcatgt 31443047  T
Q  203 gccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31443046 gccttgaacatccgctatctaggtacca 31443019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 34055285 - 34055124
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34055285 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataagttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgagatggaggaattaccaatag 34055186  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttc 162  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34055185 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttc 34055124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21202320 - 21202091
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  21202320 tcataaccattgtcacaaaactgacttatactcaaaaggttatgttcaagaccatctaccaaccacacattattcattgagatagaggagttaccaatag 21202221  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      ||||||| |||||| ||  |||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  21202220 ttcctgtactaatgatcttgtcagttttgttgtctccaaacttcacatttcctccatctttcattgtgagggtgaggaacatagacttctctcctgtcat 21202121  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21202120 atgccttgagcaaccgctgtctaggtacca 21202091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 230
Target Start/End: Original strand, 26763239 - 26763364
Alignment:
Q  105 tgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcatatgc 204  Q
    |||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||    
T  26763239 tgtaccaatgatcttaccaggttggctgccaccaaacttcactttgcctccttctttcattgcaagggtgaggaacatagacttctctcctgtcatgtgc 26763338  T
Q  205 cttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||||| || |||||||||||||||||    
T  26763339 cttgagcaaccgctgtctaggtacca 26763364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34055128 - 34055068
Alignment:
Q  185 ctttctctcctgtcatatgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  34055128 ctttctctcctgtcatatgccttgaacacccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 34055068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 9167172 - 9167416
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9167172 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 9167271  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9167272 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 9167371  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  9167372 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 9167416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 18438194 - 18438438
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438194 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccaaaaattatttattgaaatggaggaattaccaatag 18438293  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18438294 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtgaggagcaaagctttctctcctgtcat 18438393  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18438394 aagccttgaacacccgctgtctaggtaccaggacctttgtttctc 18438438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15881136 - 15880892
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15881136 tcatatccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 15881037  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15881036 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtgagtgtaaggaacaaagctttctctccagtcat 15880937  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  15880936 gtgccttgaacacccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 15880892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 9440853 - 9441097
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9440853 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 9440952  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9440953 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 9441052  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  9441053 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 9441097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 174480 - 174724
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  174480 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 174579  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  174580 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 174679  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  174680 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 174724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 460299 - 460055
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  460299 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 460200  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  460199 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 460100  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  460099 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 460055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 1995146 - 1995390
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1995146 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 1995245  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1995246 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 1995345  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  1995346 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 1995390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6870543 - 6870299
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6870543 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 6870444  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6870443 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 6870344  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  6870343 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 6870299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 8624935 - 8625179
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8624935 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 8625034  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8625035 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 8625134  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  8625135 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 8625179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17953427 - 17953183
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17953427 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 17953328  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17953327 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 17953228  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  17953227 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 17953183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 20986847 - 20987091
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20986847 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 20986946  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20986947 tacatgtaccaatgatttttccagtctggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 20987046  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  20987047 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 20987091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 22096731 - 22096975
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22096731 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 22096830  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22096831 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 22096930  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  22096931 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 22096975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26656648 - 26656404
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26656648 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 26656549  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26656548 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 26656449  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  26656448 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 26656404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2708926 - 2708682
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2708926 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 2708827  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2708826 tacctgcaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 2708727  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  2708726 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 2708682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 4219598 - 4219842
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  4219598 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatgg 4219697  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4219698 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 4219797  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  4219798 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 4219842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8005379 - 8005135
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8005379 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 8005280  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8005279 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 8005180  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  8005179 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 8005135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 9092824 - 9093068
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9092824 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcataccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 9092923  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9092924 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 9093023  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  9093024 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 9093068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 11012777 - 11013021
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11012777 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 11012876  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11012877 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 11012976  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  11012977 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 11013021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 24741691 - 24741935
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24741691 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 24741790  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24741791 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 24741890  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  24741891 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 24741935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26393407 - 26393163
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26393407 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 26393308  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26393307 tacctgtaccaatgatccttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 26393208  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  26393207 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 26393163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40045417 - 40045173
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40045417 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 40045318  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40045317 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 40045218  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  40045217 gtgccttaaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 40045173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 42873438 - 42873682
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42873438 tcatacccattgtcataaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 42873537  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42873538 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 42873637  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  42873638 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 42873682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4415318 - 4415076
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4415318 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcagacaatctacaagccaaacattatttattgaaatggagaaattaccaatag 4415219  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  4415218 tacccgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacatcacttctcctccttctttcatggtgatggtgaggaacaaagc--tctctcctgtcat 4415121  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||| |||||    
T  4415120 gtgccttgaacatccgctgtccaggtaccaggacttttgtttctc 4415076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 13663987 - 13664216
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  13663987 tcataaccattatcacaaaactgactgatacttaaaaggttatgttcaagaccatctaccaaccacacattattaattgagatagaggagttaccaatag 13664086  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  13664087 ttcttgtaccaatgatttttccaggttggctgcctccaaacttcacatttcctccttctttcattgtaagggtgaggaacatagacttctctcctgtcat 13664186  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    || |||||| || |||||||||||||||||    
T  13664187 attccttgagcaaccgctgtctaggtacca 13664216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 14143455 - 14143682
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  14143455 tcataaccattatcacaaaattgactaatacttagtaggttatgttaaagaccatctaccagccacacattattaattgagatagaggagttaccaatag 14143554  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      |||||||||||||| || || | |||| |||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  14143555 ttcctgtaccaatgatcttgcctggttggctgcctccaaacttcacattgcctccttctttcattgtaagggtgaggaacatagacttctctcctgtcat 14143654  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtac 228  Q
     |||||||| || |||||||||| ||||    
T  14143655 gtgccttgagcaaccgctgtctacgtac 14143682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16549334 - 16549112
Alignment:
Q  8 cattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaataggacctgt 107  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||| || || || ||||| ||||||||||  | |||    
T  16549334 cattatcacataattgactgatacttaaaaggttatgctaaagaccatctaacagccacacagtattgatagagatagaggagttaccaatagttcttgt 16549235  T
Q  108 accaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcatatgcctt 207  Q
    ||||||||| || |||| |||| |||| ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| |||||||    
T  16549234 accaatgatcttgccaggttggctgcctccaaacttcacatttcctccttctttcattgtaagggtgaggaacatagacttctctcctgtcacatgcctt 16549135  T
Q  208 gaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    || || |||||||||||||||||    
T  16549134 gagcaaccgctgtctaggtacca 16549112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 230
Target Start/End: Original strand, 16616328 - 16616550
Alignment:
Q  8 cattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaataggacctgt 107  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||| || || || ||||| ||||||||||  | |||    
T  16616328 cattatcacataattgactgatacttaaaaggttatgctaaagaccatctaacagccacacagtattgatagagatagaggagttaccaatagttcttgt 16616427  T
Q  108 accaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcatatgcctt 207  Q
    ||||||||| || |||| |||| |||| ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| |||||||    
T  16616428 accaatgatcttgccaggttggctgcctccaaacttcacatttcctccttctttcattgtaagggtgaggaacatagacttctctcctgtcacatgcctt 16616527  T
Q  208 gaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    || || |||||||||||||||||    
T  16616528 gagcaaccgctgtctaggtacca 16616550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16312831 - 16312602
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| | ||||| || |||||||| |  ||||||||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  16312831 tcataaccattatcacaaaactgattgatacttaacaggttatgttcaagaccatctacgaaccatacattattaattgagatagaggagttaccaatag 16312732  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      |||||||||||||| || |||| |||||| || ||||||||||  | |||||| |||||||| || ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  16312731 ttcctgtaccaatgatcttgccagattggtttcctccaaacttcatatttcctccttctttcattgtgagggtgaggaacatagacttctctcctgtcat 16312632  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    |||| |||| || || ||||||||||||||    
T  16312631 atgcattgagcaaccactgtctaggtacca 16312602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 230
Target Start/End: Original strand, 33603669 - 33603850
Alignment:
Q  49 agaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaataggacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcactt 148  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||  || ||||||  | |||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||      
T  33603669 agaccatctaccaaccacacattattgatggagatagaggagctatcaatagttcatgtaccaatgatcttgccagactagttgcctccaaacttcacac 33603768  T
Q  149 ctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcatatgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
     |||||| |||||||| || ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33603769 ttcctccttctttcattgtgagggtgaggaacatagacttctctcctgtcatatgccttgagcaaccgctgtctaggtacca 33603850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 13876955 - 13877181
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| | | | |||||||  |||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||    
T  13876955 tcataaccattatcacaaaactaattgatactcataaggttatgttcaagactatctactagccacacattattaatagagatagaggagttaccaatag 13877054  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      | ||||||||| || || |||  |||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||| || |||||||| ||||||| |   ||||  ||||||||    
T  13877055 ttcatgtaccaataatcttgccaagttggctgcctccaaacttcacatttcctccttcttttattgtaagggtgaggaacataaacttctgacctgtcat 13877154  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggta 227  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  13877155 atgccttgagcaaccgctgtctaggta 13877181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13030219 - 13030073
Alignment:
Q  63 ccacacattatttattgaaatggaggaattaccaataggacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttc 162  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| ||| ||||||  ||| |||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||    
T  13030219 ccacacattattaattgagatagaggagttaacaatagttcctctaccaatgatcttgtcagattggttgcctccaaacttcacatttcctccttctttc 13030120  T
Q  163 atggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcatatgccttga 209  Q
    || || ||||  ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  13030119 attgtgagggcgaggaacatagatttctctcctgtcatattccttga 13030073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15200036 - 15199792
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15200036 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 15199937  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15199936 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 15199837  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  15199836 gtgccttgaacacccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 15199792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 16314352 - 16314596
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16314352 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgagatggaggaattaccaatag 16314451  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16314452 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 16314551  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  16314552 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 16314596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 10298293 - 10298537
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10298293 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccaaacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 10298392  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10298393 tacctgtaccaatgatttttccagtttggtttccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 10298492  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||| |||||    
T  10298493 atgccttgaacacccgttgtctaggtacaacgacctttgtttctc 10298537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4991028 - 4990784
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4991028 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgagatggaggaattaccaatag 4990929  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4990928 tacctgtaccaatgatttttccaatctggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 4990829  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  4990828 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 4990784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 5019758 - 5020002
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5019758 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgagatggaggaattaccaatag 5019857  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5019858 tacctgtaccaatgatttttccaatctggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 5019957  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  5019958 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 5020002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14839290 - 14839046
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14839290 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaaaccacacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 14839191  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  14839190 tacatgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctgctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaatctttctctccagtcat 14839091  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  14839090 atgccttgaacatccgctgtctaggtaccacgacttttgcttctc 14839046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 3379124 - 3379353
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3379124 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgctttagaccatctacaagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 3379223  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3379224 tacctgtactaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacagagctttctctcctgtcat 3379323  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3379324 ataccttgaacacctgctgtctaggtacca 3379353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 16263487 - 16263731
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16263487 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 16263586  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16263587 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 16263686  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  16263687 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 16263731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 27173692 - 27173936
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27173692 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 27173791  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27173792 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 27173891  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  27173892 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 27173936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30929726 - 30929482
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30929726 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 30929627  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30929626 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 30929527  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  30929526 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 30929482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 36025913 - 36026157
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  36025913 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 36026012  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36026013 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 36026112  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  36026113 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 36026157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40457593 - 40457349
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40457593 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 40457494  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40457493 tacctgtaccaatgatttttccagtctggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagatttctctccagtcat 40457394  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  40457393 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 40457349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 49515158 - 49515402
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  49515158 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 49515257  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49515258 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 49515357  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  49515358 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 49515402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10743831 - 10743587
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10743831 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 10743732  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10743731 tacctgtaccaatgatccttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 10743632  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  10743631 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 10743587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10957600 - 10957356
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10957600 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 10957501  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10957500 tacctgtaccaatgatccttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 10957401  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  10957400 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 10957356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 17925720 - 17925948
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17925720 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 17925819  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17925820 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 17925919  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacc 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17925920 gtgccttgaacatccgctgtctaggtacc 17925948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19947628 - 19947384
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19947628 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 19947529  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19947528 tacatgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 19947429  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  19947428 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 19947384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 22004039 - 22004283
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22004039 tcatactcattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 22004138  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22004139 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 22004238  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  22004239 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 22004283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 24647953 - 24648197
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24647953 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 24648052  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24648053 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 24648152  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  24648153 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 24648197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 27664195 - 27664439
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27664195 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 27664294  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27664295 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 27664394  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  27664395 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 27664439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27818179 - 27817935
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27818179 tcatacccgttgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgtttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 27818080  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27818079 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 27817980  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  27817979 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 27817935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 55748485 - 55748241
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  55748485 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 55748386  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55748385 tacctgtaccaatgatccttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 55748286  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  55748285 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 55748241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 458184 - 458422
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  458184 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 458283  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  458284 tacatgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 458383  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttg 239  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  458384 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttg 458422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18755723 - 18755485
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  18755723 tcataccaattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattattaattgagatggaggagttaccaatag 18755624  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18755623 tacctgtaccaatgatttttccagtctggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaagaaacaaagctttctctccagtcat 18755524  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttg 239  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  18755523 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttg 18755485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18133389 - 18133255
Alignment:
Q  96 aataggacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcct 195  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18133389 aatagtacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctcca 18133290  T
Q  196 gt-catatgccttgaacacccgctgtctaggtacc 229  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18133289 gtccatgtgccttgaacatccgctgtctaggtacc 18133255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16851577 - 16851806
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| |||||  | ||||| |||||| |||    
T  16851577 tcataaccattatcacagaattgactaatgcttaacaggttatgttcaagaccatctaccagccacacattattaattgaggtagaggagttaccagtag 16851676  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      |||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  16851677 ttcctgtaccaatgatcttgccaggttggctgccaccaaacttcacgttgcctccttctttcattgtaagggtaaggaacatatacttctctcctgtcat 16851776  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
     |||||| | || ||| |||||||||||||    
T  16851777 gtgccttaagcaaccgttgtctaggtacca 16851806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15867324 - 15867095
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| | |||||| ||||| ||||  || |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| || || ||  | || ||||||||||    
T  15867324 tcataaccattattacaaaactgactgatacataaaaggttatgttcaagaccatctaccagccacacattattaatagagataaatgagttaccaatag 15867225  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      | ||||||||| || || |||| |||| |||| ||||||||||| | || ||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  15867224 ttcatgtaccaataatcttgccaggttggatgcctccaaacttcacatttcttccttctttcattgtatgggtgaggaacatagacttctctcctatcat 15867125  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15867124 atgccttgagcaaccgctgtctaggtacca 15867095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14907347 - 14907220
Alignment:
Q  103 cctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcatat 202  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  14907347 cctgtaccaatgatcttgccagattggttgcctccaaacttcacatttgctccttctttcattgtaagggtgaggaacatagacttctctcatgtcatat 14907248  T
Q  203 gccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||||| | || ||| |||||||||||||    
T  14907247 gccttaagcaaccgttgtctaggtacca 14907220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 17244400 - 17244629
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| | ||||| || |||||||| |  | ||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  17244400 tcataaccattatcacagaattgattgatacttaaaaggttatgttcaataccatctaccagacatacattattaattgagatagaggagttaccaatag 17244499  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      | |||||||||||| ||  ||| |  | | || |||||||  || | |||||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  17244500 ttcatgtaccaatgatcttgtcaggtgagcttcctccaaactaaacatttcctccttctttcattgtaaaggtgaggaacatagacttctctcctgtcat 17244599  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    || |||||| || |||||||||||||||||    
T  17244600 atcccttgagcaaccgctgtctaggtacca 17244629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 15406097 - 15406296
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||  | ||||||||||| | |||||||||| | ||  | || ||||| ||||||||||    
T  15406097 tcataaccattgtcacaaaactgactgatactaacaaggttatgtataagaccatctaccaaccacacattactaatacagatagaggagttaccaatag 15406196  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      ||| ||||||| ||||||| || ||||| ||| ||||| ||||| | |||||  |||| |||  | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  15406197 ttcctataccaattatttttctaggttggtcgcctccaaatttcacatttcctcgttcttgcattatgagggtaaggaacatagacttctctcctgtcat 15406296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Original strand, 39042531 - 39042699
Alignment:
Q  13 tcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaataggacctgtaccaa 112  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||| || || || ||||| |||| |||||  | ||||||||    
T  39042531 tcacaaaactgactaatgctaagtaggttatgtctaagaccatctaccaaccacacattattaatagagatagaggagttactaatagttcatgtaccaa 39042630  T
Q  113 tgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaaca 181  Q
    |||| || ||| | |||||||| |||||   |||   |||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  39042631 tgatcttgccattctggttgcctccaaatcccacagttcctccctctttcattgttagggttaggaaca 39042699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 4430768 - 4431012
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4430768 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgagatggaggaattaccaatag 4430867  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4430868 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctcaatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 4430967  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  4430968 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 4431012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 1061152 - 1061396
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1061152 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggctatgcttcagaccatctactaaccaaacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 1061251  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1061252 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 1061351  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  1061352 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccaggacctttgtttctc 1061396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8999180 - 8998936
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8999180 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataagttatgcttcagaccatctacaagccaaacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 8999081  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8999080 tacttgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 8998981  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8998980 atgtcttgaacacccgctgtctaggtaccaggacctttgtttctc 8998936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13264888 - 13264644
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13264888 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccacctacaagccacacattatttattgaaattgaggaattaccaatag 13264789  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13264788 tacttgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 13264689  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  13264688 atgccttgaactcccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 13264644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17899336 - 17899092
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17899336 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgctttagaccatctacaagccacacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 17899237  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17899236 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 17899137  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  17899136 atgccttgaacacccgttgtctaggtaccatgacctttgtttctc 17899092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7797850 - 7797606
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  7797850 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattactaattgaaatggaggaattaccaatag 7797751  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7797750 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 7797651  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  7797650 gtgccttgaacacccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 7797606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1787099 - 1786855
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1787099 tcatacccattgtcacaaaatttactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 1787000  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  1786999 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacagatctttctctccagtcat 1786900  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  1786899 atgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacttttgcttctc 1786855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15654329 - 15654085
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15654329 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccaaacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 15654230  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15654229 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacgtcacttctcctccatctttcatggtaagggtgaggaacaaagctttctctcttgtcat 15654130  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  15654129 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccaagacctttgtttctc 15654085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9383890 - 9383664
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9383890 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 9383791  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9383790 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcactt---ctccatctttcatggtaaggttaaggaacaaagctttctctcctgtcat 9383694  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9383693 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 9383664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12240788 - 12240559
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12240788 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgagatggaggaattaccaatag 12240689  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12240688 tacctgtaccaatgatttttccagtctggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 12240589  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12240588 gtgccttgaacatccgctgtctaggtacca 12240559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 18004555 - 18004799
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18004555 tcatacccattgtcacataattgactgatgctcaataggttatgtttcataccatctactagccaaacattatttattgagatggaggaattaccaatag 18004654  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18004655 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 18004754  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  18004755 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccacgacctttgtttctc 18004799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 37874069 - 37874313
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37874069 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 37874168  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37874169 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 37874268  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  37874269 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 37874313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 37882587 - 37882831
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37882587 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 37882686  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37882687 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 37882786  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  37882787 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 37882831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11209324 - 11209094
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11209324 tcatactcattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 11209225  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagttt-ggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtca 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  11209224 tacctgtaccaatgatttttccagtttgggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaatctttctctccagtca 11209125  T
Q  200 tatgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11209124 tatgccttgaacatccgctgtctaggtacca 11209094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 4751327 - 4751571
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4751327 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 4751426  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4751427 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 4751526  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  4751527 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 4751571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5582862 - 5582618
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5582862 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 5582763  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5582762 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 5582663  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  5582662 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 5582618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5868925 - 5868681
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5868925 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 5868826  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5868825 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 5868726  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  5868725 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 5868681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9985117 - 9984873
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9985117 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 9985018  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9985017 tacctgtaccaatgatttttccagtctggttgccaccaaacttcatttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 9984918  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  9984917 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 9984873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13375897 - 13375653
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13375897 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 13375798  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13375797 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 13375698  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  13375697 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 13375653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13386491 - 13386247
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13386491 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 13386392  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13386391 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 13386292  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  13386291 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 13386247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 14473229 - 14473473
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14473229 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 14473328  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14473329 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 14473428  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  14473429 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 14473473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16394277 - 16394033
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16394277 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 16394178  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16394177 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 16394078  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  16394077 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 16394033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 19786030 - 19786274
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19786030 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 19786129  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19786130 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 19786229  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  19786230 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 19786274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20676426 - 20676182
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20676426 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 20676327  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20676326 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 20676227  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  20676226 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 20676182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24386747 - 24386503
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24386747 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 24386648  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24386647 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 24386548  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  24386547 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 24386503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29464435 - 29464191
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29464435 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 29464336  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29464335 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttttcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 29464236  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  29464235 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 29464191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 507399 - 507155
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  507399 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 507300  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  507299 tacctgcaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 507200  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  507199 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 507155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5540250 - 5540006
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5540250 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 5540151  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5540150 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 5540051  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  5540050 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 5540006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6493575 - 6493331
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6493575 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 6493476  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6493475 tacctgtaccaatgatctttccaatttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 6493376  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  6493375 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 6493331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 8782271 - 8782515
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8782271 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 8782370  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  8782371 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacatagctttctctccagtcat 8782470  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  8782471 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 8782515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11275614 - 11275370
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11275614 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 11275515  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11275514 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 11275415  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  11275414 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 11275370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 13129278 - 13129522
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  13129278 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattaagatggaggaattaccaatag 13129377  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13129378 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 13129477  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  13129478 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 13129522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16399251 - 16399007
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16399251 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatacttcagaccatctacaagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 16399152  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16399151 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctctagtcat 16399052  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  16399051 gtgccctgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 16399007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 23764902 - 23765146
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23764902 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 23765001  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23765002 tacatgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 23765101  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  23765102 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 23765146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28317467 - 28317223
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28317467 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 28317368  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28317367 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 28317268  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  28317267 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 28317223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 38202260 - 38202504
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38202260 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 38202359  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38202360 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 38202459  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  38202460 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 38202504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 39379692 - 39379936
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  39379692 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 39379791  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39379792 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 39379891  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  39379892 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 39379936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 41691257 - 41691501
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41691257 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 41691356  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41691357 tacctgtaccaatgatcttttcagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 41691456  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  41691457 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 41691501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 24667478 - 24667707
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24667478 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 24667577  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24667578 tacctgtaccaatgatccttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 24667677  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24667678 gtgccttgaacatccgctgtctaggtacca 24667707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10630177 - 10629933
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  10630177 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggagttaccaatag 10630078  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10630077 tacatgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 10629978  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  10629977 gtgccttaaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 10629933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12290209 - 12289965
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12290209 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcggaccatctactagccatacattattaattgagatggaggaattaccaatag 12290110  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12290109 tacctgtaccaatgatctttctagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaagaaacaaagctttctctccagtcat 12290010  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  12290009 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 12289965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 15840824 - 15841068
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15840824 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccagacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 15840923  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15840924 tatccgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccttctttcatggtgatgctgaggaacaaagctttctctcctgtcat 15841023  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  15841024 atgccttgaacatccgttgtccaggtaccaggacctttgtttctc 15841068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 17014792 - 17015036
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17014792 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttaagaccatctactagccaaacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 17014891  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     || |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17014892 tacatgtatcaatgatctttctagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaatggtgaggaacaaagctttctctcttgtcat 17014991  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||    
T  17014992 atgccttgaacacccgctatccaggtaccaggacctttgtttctc 17015036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29936783 - 29936539
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29936783 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccaaacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 29936684  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  29936683 tacttgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatccttcattgtaatggtgaggaacaaagctttttctcctatcat 29936584  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29936583 atgccttgaacacccactgtctaggtaccaggacctttgtttctc 29936539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29985937 - 29985693
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29985937 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccaaacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 29985838  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  29985837 tacttgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatccttcattgtaatggtgaggaacaaagctttttctcctatcat 29985738  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29985737 atgccttgaacacccactgtctaggtaccaggacctttgtttctc 29985693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 13146728 - 13146972
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13146728 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcagactatctacaagccaaacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 13146827  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13146828 tacctgtaccaattatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccttctttcatggtgatggtgaggaacaaagctttctctcctgtcat 13146927  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| ||| |||| || ||| || ||||||| |||||    
T  13146928 gtgccttgaacatccgttgtccagatactaggacctttgtttctc 13146972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 39 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6185148 - 6184942
Alignment:
Q  39 gttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaataggacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccacca 138  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6185148 gttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatagtacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccacca 6185049  T
Q  139 aacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcatatgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaaccttt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  6185048 aacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcatgtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgaccttt 6184949  T
Q  239 gcttctc 245  Q
    | |||||    
T  6184948 gtttctc 6184942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18124990 - 18124761
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||    
T  18124990 tcataaccattatcaaaaaactgactgatacttaaaaggttatgttcaagaccatctaccagccacacattattaatagagatagaggagttaccaatag 18124891  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      ||| |||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  18124890 ttcctataccaatgatcttgccaaattggttgcctccaaacttcacatttcctccttctttcattgtaagggtgaggaacatagacttctctcctgtcat 18124791  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18124790 atgccttgagcaaccgctgtctaggtacca 18124761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 5209646 - 5209874
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||| |||||  |  |||| ||||||||||    
T  5209646 tcataaccattatcacataattgactaatacttaacaggttatgttcaagaccatctaccagctacacattattaattgaggtaaaggagttaccaatag 5209745  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      | |||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  5209746 ttcatgtaccaatgatcttgccaagttggctgccaccaaacttcacattacctccttctttcattgtaagggtgaggaacatagacttctctcctgtcat 5209845  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacc 229  Q
     |||||||| || || |||| ||||||||    
T  5209846 gtgccttgagcaaccactgtttaggtacc 5209874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 230
Target Start/End: Original strand, 16027961 - 16028061
Alignment:
Q  130 ttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcatatgccttgaacacccgctgtctaggtacc 229  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||  | ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16027961 ttgcctccaaacttcacatttcctccttctttcattatgagggtgaggaacatagacttctctcctgtcatatgccttgagcaaccgctgtctaggtacc 16028060  T
Q  230 a 230  Q
    |    
T  16028061 a 16028061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Original strand, 11187808 - 11187902
Alignment:
Q  136 ccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcatatgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||| | |||||||| ||||||||||  || ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11187808 ccaaacttcacatttcctccttctttctttgtaagggtgaggaacaaagacttttctcctgtcgtatgccttgagcaaccgctgtctaggtacca 11187902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 6213290 - 6213248
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttat 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6213290 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttat 6213248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 16027885 - 16027963
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattg 79  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  16027885 tcataaccattatcacaaaattgtctgatactcaaaaggttatgttcaagaccatctaccaaccacacattattaattg 16027963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 11187697 - 11187770
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatt 74  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11187697 tcataaccattatcacaaaactgactgatactcagaaggttatgttcaagaccatctaccagccacacattatt 11187770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 230
Target Start/End: Original strand, 2559058 - 2559101
Alignment:
Q  187 ttctctcctgtcatatgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  2559058 ttctctcctgtcatatgccttgagcagccgctgtttaggtacca 2559101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 26874530 - 26874759
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26874530 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 26874629  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26874630 tacctgtaccaatgatttttccagtttgcttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 26874729  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26874730 atgccttgaacacctgctgtctaggtacca 26874759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21165196 - 21164952
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21165196 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 21165097  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21165096 tacctgtaccaatggtttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttttctccagtcat 21164997  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  21164996 gtgccttgaacacccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 21164952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24418275 - 24418031
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24418275 tcatacccattgtcataaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 24418176  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24418175 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaatctttctctccagtcat 24418076  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  24418075 atgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacttttgcttctc 24418031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28724567 - 28724323
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28724567 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcgtcagaccatctacaagccacacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 28724468  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  28724467 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctccaatcat 28724368  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  28724367 gtgccttgaacacccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 28724323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9766012 - 9765768
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9766012 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 9765913  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9765912 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 9765813  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  9765812 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 9765768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9900822 - 9900578
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9900822 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 9900723  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9900722 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 9900623  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  9900622 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 9900578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 10274550 - 10274794
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10274550 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 10274649  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10274650 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 10274749  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  10274750 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 10274794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11398421 - 11398177
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11398421 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 11398322  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11398321 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 11398222  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  11398221 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 11398177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19305668 - 19305424
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19305668 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 19305569  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19305568 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 19305469  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  19305468 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 19305424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22936906 - 22936662
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22936906 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 22936807  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22936806 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 22936707  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  22936706 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 22936662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39173343 - 39173099
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  39173343 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaatagattatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 39173244  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39173243 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 39173144  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  39173143 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 39173099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 40248172 - 40248416
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40248172 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 40248271  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40248272 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 40248371  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  40248372 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 40248416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 4217459 - 4217703
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4217459 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 4217558  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4217559 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgctaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 4217658  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  4217659 gtgctttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 4217703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24330998 - 24330754
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24330998 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcataccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 24330899  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24330898 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 24330799  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  24330798 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 24330754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 27229002 - 27229246
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27229002 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 27229101  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27229102 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 27229201  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  27229202 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 27229246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 29251784 - 29252028
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  29251784 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatgtaggaattaccaatag 29251883  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29251884 tacttgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 29251983  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  29251984 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 29252028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34793466 - 34793222
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34793466 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 34793367  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34793366 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 34793267  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  34793266 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 34793222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 35260568 - 35260812
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35260568 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 35260667  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35260668 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 35260767  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  35260768 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 35260812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 35271193 - 35271437
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35271193 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 35271292  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35271293 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 35271392  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  35271393 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 35271437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 43090242 - 43090486
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43090242 tcatactcattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 43090341  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  43090342 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccaatcat 43090441  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  43090442 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 43090486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 43352959 - 43353152
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43352959 tcatactcattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 43353058  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcc 194  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43353059 tacctgtacaaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctcc 43353152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24804899 - 24804656
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24804899 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcagactatctacaagccaaacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 24804800  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  24804799 tacccgtaccaatgatctttcca-tttggttgccaccaaacttcacttctcctccttctttcatggtgatggtgaggaacaaagctttctctcctgtcct 24804701  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     |||||| |||| | |||||| || |||||| ||||||| |||||    
T  24804700 gtgccttaaacatctgctgtccagataccaggacctttgtttctc 24804656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19302907 - 19302801
Alignment:
Q  139 aacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcatatgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaaccttt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19302907 aacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtgaggaacaaagctttctctcctgtcatatgccttgaacacccgctgtctaggtaccaggaccttt 19302808  T
Q  239 gcttctc 245  Q
    | |||||    
T  19302807 gtttctc 19302801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28704494 - 28704266
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||    
T  28704494 tcataaccattatcacaaaactgactgatacttaaaaggttatg-ttcagaccatctatcagccacacattattaatagagatagaggaattaccaatag 28704396  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      | |||||||||||| || |||  |||| |||| |||||| |||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  28704395 ttcttgtaccaatgatcttgccaagttggctgcctccaaacatcacatttcctccttctttcattgtaagggtgaggaacatagacttctctcctgtcat 28704296  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    |||| || | || |||||||||||||||||    
T  28704295 atgcatttagcaaccgctgtctaggtacca 28704266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 22250159 - 22250388
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||||| || |  |||| |||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  22250159 tcataaccattttcaaaaaactgactgatacttaaaaggttgtgttaaagactatctaccaaccacacattattaattgagatagaggagttaccaatag 22250258  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      ||||||||||||||||| | || |||  | || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  22250259 ttcctgtaccaatgattttgctaggttgtctacctccaaacttcacacttcctccttctttcattgtaagggtgaggaacatagatttctctcctgtcat 22250358  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22250359 atgccttgagcaaccgctgtctaggtacca 22250388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22784895 - 22784666
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | |  |||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||| |||||| | || || ||||||||||    
T  22784895 tcataaccattatcacataattgactgatatttagcaggttatgttcaagaccatctaccacccacacattattaattgaagtagacgagttaccaatag 22784796  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      |||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| |||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  22784795 ttcctgtaccaatgatcttgccaggttggctgccaccaaacatcacattgcctccttctttcattgtaagggtgaggaacatagacttctctcctgtcat 22784696  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
     ||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  22784695 gtgccttgagtaaccgctgtcaaggtacca 22784666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 24841882 - 24842128
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| | |||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||| || || ||  |||| ||| ||||||    
T  24841882 tcataaccattatcacaaaactaactgatactgagtaggttatgtctaagaccatctaccaaccacacattattaatagagataaaggagttaacaatag 24841981  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      | ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||| || |||||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  24841982 ttcatgtaccaataatttttccagcttggttgcctccaaatttcacatttcctccctctttcattgttagggtaaggatcatagacttctctcctgtcat 24842081  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctcct 247  Q
     || |||||  | |||||||||||||||||  | |||||||| ||||    
T  24842082 gtgtcttgagaaaccgctgtctaggtaccatgatctttgcttttcct 24842128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 22744675 - 22744620
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatc 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22744675 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcagaccatc 22744620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7692746 - 7692517
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7692746 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 7692647  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7692646 tacctgtaccaatgatttttccaatttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 7692547  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7692546 gtgccttgaacacccgctgtctaggtacca 7692517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 19184755 - 19184999
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19184755 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 19184854  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19184855 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 19184954  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  19184955 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 19184999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 22014760 - 22014997
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22014760 tcatacccattgtcacaaaattgcctaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccaaacattatttattgaaatggaggaattacaaatag 22014859  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22014860 tacctgtaccaatgatatttccagtttggttgccaacaaacttcacttatcctccatctttcatggtaaaggtgaggaacaaagctttctctcctgtcat 22014959  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaaccttt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22014960 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccaggaccttt 22014997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 3179151 - 3179395
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3179151 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 3179250  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3179251 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 3179350  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  3179351 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 3179395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 5840754 - 5840998
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5840754 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 5840853  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5840854 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 5840953  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  5840954 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 5840998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 21871215 - 21871459
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21871215 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 21871314  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21871315 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 21871414  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  21871415 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 21871459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 47611207 - 47610963
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  47611207 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 47611108  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47611107 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 47611008  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  47611007 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 47610963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 4174851 - 4175095
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4174851 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 4174950  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4174951 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 4175050  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  4175051 gtgcattgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 4175095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 7514824 - 7515068
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7514824 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaatagattatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 7514923  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7514924 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 7515023  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  7515024 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 7515068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36239705 - 36239461
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  36239705 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 36239606  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36239605 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 36239506  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  36239505 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 36239461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 38102635 - 38102879
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38102635 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 38102734  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38102735 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 38102834  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  38102835 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 38102879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 51632463 - 51632219
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  51632463 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 51632364  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51632363 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 51632264  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  51632263 gtgccttgaacatccgttgtctaggtaccatgacctttgtttctc 51632219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5642979 - 5642735
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5642979 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 5642880  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5642879 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaataaagctttctctccagtcat 5642780  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  5642779 gtgccttgaacatccgttgtctaggtaccatgacctttgtttctc 5642735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35641312 - 35641068
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35641312 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 35641213  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35641212 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 35641113  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  35641112 gtgcctcgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 35641068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 12738078 - 12738322
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12738078 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttgtgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 12738177  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12738178 tacctgttccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 12738277  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  12738278 gtgccttgaacatccgttgtctaggtaccatgacctttgtttctc 12738322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19162952 - 19162722
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19162952 tcataaccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccaaacattattaatagaaatggaggaattaccaatag 19162853  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19162852 tacctgtaccaataatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccttctttcatggtaatggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 19162753  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccag 231  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19162752 ataccttgaacacccgctgtccaggtaccag 19162722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 22652257 - 22652501
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22652257 tcatatccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccaaacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 22652356  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22652357 tacccgtacaaatgatctttctagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccttctttcatggtgatggtgaggaacaaagctttctctcctgtaat 22652456  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||    
T  22652457 gtgccttgaacatccgctgtccagataccaggacctttgtttctc 22652501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 102 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12617493 - 12617350
Alignment:
Q  102 acctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcata 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  12617493 acctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcatg 12617394  T
Q  202 tgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  12617393 tgcctcgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 12617350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 23020524 - 23020753
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||    
T  23020524 tcataaccattatcacataattgactaatgctcaacaggttatgttcaagaccatctaccagccacacattattaattgaggttgaggagttaccaatag 23020623  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      |||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  23020624 ttcctgtaccaatgatcttgccaggttggctgccaccaaacttcacgttgcctccttctttcattgtaagggtaaggaacatagacttctctcatgtcat 23020723  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  23020724 atgccttgagcaaccgttgtctaggtacca 23020753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21209039 - 21208812
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| ||| ||||||    
T  21209039 tcataaccattatcacaaaattgactgatacttaacaggttatgttcaagaccatctaccagccacacattattaattgaagtagaggagttatcaatag 21208940  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  21208939 ttcctgtaccaatgatctttccaggttggctgccaccaaatttcacattgcctccttctttcattgtaagggtgaggaacatagacttctctcctgtcat 21208840  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtac 228  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||    
T  21208839 gtgccttgagcaaccgctttctaggtac 21208812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21127625 - 21127399
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||| ||| |  |  |||| ||||||||||    
T  21127625 tcataaccattatcacagaattgactgatacttaacaggttatgttcaagaccatctaccatccacacattattaatttatttttaggagttaccaatag 21127526  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      | |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||  ||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  21127525 ttcttgtaccaatgatctttccaggttggctgccaccaaatttcacattgcctccttctttcattataagggtgaggaacatagatttctctcctgtcat 21127426  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggta 227  Q
     |||||||| || ||||||||||||||    
T  21127425 gtgccttgagcaaccgctgtctaggta 21127399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 17718690 - 17718918
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||||||||| |  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||     
T  17718690 tcataaccattgtcacaaaactgactgatacttaaaaggttatgttcaagaccatctaccaaacacacattattaatagagatagaggagttaccaataa 17718789  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      | |||||||||||| || | ||  |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||| || ||||| ||||||| |   ||||||||||||||    
T  17718790 ttcatgtaccaatgatcttgc-agactggttgcctccaaatttcacacttcctccttctttcattgtgagggtgaggaacataaacttctctcctgtcat 17718888  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17718889 atgccttgagcaaccgctgtctaggtacca 17718918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22446504 - 22446359
Alignment:
Q  85 gaggaattaccaataggacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaag 184  Q
    ||||| ||| ||||||  |||||||||||||| || |||| |||| |||| ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  22446504 gaggagttatcaatagttcctgtaccaatgatcttgccaggttggctgcctccaaacttcacatttcctccttctttcattgtaagggtgaggaacatag 22446405  T
Q  185 ctttctctcctgtcatatgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
      ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22446404 acttctctcatgtcatatgccttgagcaaccgctgtctaggtacca 22446359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22451738 - 22451593
Alignment:
Q  85 gaggaattaccaataggacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaag 184  Q
    ||||| ||| ||||||  |||||||||||||| || |||| |||| |||| ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  22451738 gaggagttatcaatagttcctgtaccaatgatcttgccaggttggctgcctccaaacttcacatttcctccttctttcattgtaagggtgaggaacatag 22451639  T
Q  185 ctttctctcctgtcatatgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
      ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22451638 acttctctcatgtcatatgccttgagcaaccgctgtctaggtacca 22451593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1670 - 1426
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1670 tcatacccattgtcacaaaattgaatgatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccaaacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 1571  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1570 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccgtctttcatggtaagggtgaggaacaaagctttctctcctgtcat 1471  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  1470 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccaggacctttgtttctc 1426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 19232387 - 19232631
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19232387 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 19232486  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19232487 tacctgtaccaatgatttttccagtttagttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtgagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 19232586  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  19232587 gtgccttgaacacccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 19232631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 19425934 - 19426178
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19425934 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcaaaccatctacaagccacacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 19426033  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19426034 tacctgtaccaatgattttttcagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccagctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 19426133  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  19426134 gtgccttgaacacccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 19426178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22150011 - 22149767
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22150011 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccaaacattattttttgaaatggaggaattaccaatag 22149912  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22149911 tacctgtatcaatgatttttccagtttggttgccaccaagcttcacttctcctccatctttcatggtaagggtgaggaacaaagctttctctcctgtcat 22149812  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22149811 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccaggacctttgtttctc 22149767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30317989 - 30317745
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30317989 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataagttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 30317890  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30317889 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtgagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 30317790  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  30317789 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 30317745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3351899 - 3351655
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3351899 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 3351800  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3351799 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 3351700  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  3351699 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 3351655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 6158675 - 6158919
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6158675 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 6158774  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6158775 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 6158874  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  6158875 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 6158919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 9348707 - 9348951
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9348707 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 9348806  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9348807 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 9348906  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  9348907 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 9348951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 26117918 - 26118162
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26117918 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 26118017  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26118018 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 26118117  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  26118118 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 26118162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 36085530 - 36085774
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  36085530 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 36085629  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36085630 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 36085729  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  36085730 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 36085774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 44488723 - 44488967
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44488723 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 44488822  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44488823 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 44488922  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  44488923 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 44488967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 249417 - 249661
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  249417 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagacggaggaattaccaatag 249516  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  249517 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 249616  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  249617 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 249661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 812518 - 812762
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  812518 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagacggaggaattaccaatag 812617  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  812618 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 812717  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  812718 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 812762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13691834 - 13691590
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  13691834 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaataa 13691735  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13691734 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 13691635  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  13691634 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 13691590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 19136289 - 19136533
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  19136289 tcatacacattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacgagccacacattattaattgagatgtaggaattaccaatag 19136388  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19136389 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 19136488  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  19136489 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 19136533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 29084000 - 29084244
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29084000 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 29084099  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29084100 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 29084199  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  29084200 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 29084244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32080960 - 32080716
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32080960 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 32080861  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32080860 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 32080761  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  32080760 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 32080716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 36300535 - 36300779
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  36300535 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 36300634  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36300635 tacctgtaccagtgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 36300734  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  36300735 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 36300779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15783975 - 15783731
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15783975 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 15783876  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15783875 tacctgtaccaatgatctttcccgtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 15783776  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  15783775 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 15783731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 23790252 - 23790494
Alignment:
Q  3 atacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatagga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23790252 atacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgtttcagaccatctactagttaaacattatttattgaaatggaggaattaccaatagta 23790351  T
Q  103 cctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcatat 202  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23790352 cgtgtaccaataatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctctatctttcatggtaagggtgaggaacaaagctttctctccagtcatat 23790451  T
Q  203 gccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  23790452 gccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 23790494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 23802299 - 23802541
Alignment:
Q  3 atacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatagga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23802299 atacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgtttcagaccatctactagttaaacattatttattgaaatggaggaattaccaatagta 23802398  T
Q  103 cctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcatat 202  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23802399 cgtgtaccaataatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctcaatctttcatggtaagggtgaggaacaaagctttctctccagtcatat 23802498  T
Q  203 gccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  23802499 gccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 23802541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 3840531 - 3840791
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3840531 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcgtcagaccatctactagccaaacattatttattgaaatggaggaattaccgatag 3840630  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaact----------------tcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaag 184  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3840631 tacttgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctcacttctcctccatctttcatggtaagggtgaggaacaaag 3840730  T
Q  185 ctttctctcctgtcatatgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||    
T  3840731 ctttctctcctgtcatatgccttgaacacccgctatctaggtaccatgacctttgtttctc 3840791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 21295839 - 21295981
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21295839 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccaaacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 21295938  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaactt 143  Q
     | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21295939 tatccgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaactt 21295981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17291890 - 17291668
Alignment:
Q  8 cattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaataggacctgt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||  |||||    
T  17291890 cattatcacaaaattgactaataattaaaaggttatgttcaagaccatctaccagccacacattattaattaagatagaggagttaccaatagttcctgt 17291791  T
Q  108 accaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcatatgcctt 207  Q
    |||||| ||    |||| |||| |||| ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  17291790 accaataatcacgccaggttggctgcctccaaacttcacatttcctccttctttcattgtaagggtgaggaacatagacttctctcctgtcatatgcctt 17291691  T
Q  208 gaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    || || |||||||||||||||||    
T  17291690 gagcaaccgctgtctaggtacca 17291668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 45563742 - 45563958
Alignment:
Q  14 cacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaataggacctgtaccaat 113  Q
    ||||||| ||||| ||| |||  |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  45563742 cacaaaactgactgatattcagaaggttatgttcaagaccatctaccagccacacattgttaatagagatagaggagttaccaatagttcctgtaccaat 45563841  T
Q  114 gatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcatatgccttgaacac 213  Q
     || || |||| |||| |||| ||||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||     
T  45563842 aatcttgccaggttggctgcctccaaacttcacatttcctccttctttcattgtaagagtgaggaacatagacttctctcctgtcatatgccttgagcaa 45563941  T
Q  214 ccgctgtctaggtacca 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  45563942 ccgctgtctaggtacca 45563958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19938911 - 19939140
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| |||||  | ||||| |||| |||||    
T  19938911 tcataaccattatcacagaattgactaatgcttaacaggttatgttcaagaccatctaccagccacacattattaattgaggtagaggagttactaatag 19939010  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      |||||||||||||| || | || |||| |||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||    
T  19939011 ttcctgtaccaatgatcttgctaggttggctgccaccaaacttcacgttgcctccttctttcattgtaagggcaaggaacatagacttctatcctgtcat 19939110  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
     | |||||| || ||||||||||| |||||    
T  19939111 gtcccttgagcaaccgctgtctagatacca 19939140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 22670631 - 22670860
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| | ||||| || |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||    
T  22670631 tcataaccattatcacagaattgaatgatacttaacaggttatgttcaagaccatctaccagccacacattattaattgagctagaggagttaccaatag 22670730  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      | |||||||||||| || | || |||| |||||||||||||||| |  ||||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  22670731 ttcatgtaccaatgatcttgcaaggttggctgccaccaaacttcacattgcctccttctttcattgtaaaggtgaggaacatagacttctctcatgtcat 22670830  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
     |||||||| || |||||||||||||||||    
T  22670831 gtgccttgagcaaccgctgtctaggtacca 22670860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22464458 - 22464229
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||| || || ||  |||| ||||||||||    
T  22464458 tcataaccattataacaaaactgactgatacttaacaggttatgttcaagaccatctaccaaccacacattattaatagagattaaggagttaccaatag 22464359  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      | |||||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  22464358 ttcttgtaccaatgatcttgccagattggttgccttcaaacttcacatttcctccttctttcattgtgagggtgaggaacatagacttctctcctgtcat 22464259  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    |||  |||| || |||||||||||||||||    
T  22464258 atgtattgagcaaccgctgtctaggtacca 22464229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 16744281 - 16744351
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacatt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744281 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacatt 16744351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 17012263 - 17012492
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || | |||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||    
T  17012263 tcatagccattatcacaaaactgactgatacttaaaatgttatgttcaagaccatataccagccacacattattaatagagatagaggagttaccaatag 17012362  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      ||||||||||| || || |||| |||| |||| ||||| ||||| | |||||| |||||||| |||||| | || |||| ||  |||| |||||||||    
T  17012363 ttcctgtaccaataatcttgccaggttggctgcctccaaatttcacatttcctccttctttcattgtaaggttgagaaacatagacttctgtcctgtcat 17012462  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    |||||||||  | | |||||||||||||||    
T  17012463 atgccttgaggaactgctgtctaggtacca 17012492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17544938 - 17544709
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || | |||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||    
T  17544938 tcatagccattatcacaaaactgactgatacttaaaatgttatgttcaagaccatataccagccacacattattaatagagatagaggagttaccaatag 17544839  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      ||||||||||| || || |||| |||| |||| ||||| ||||| | |||||| |||||||| |||||| | || |||| ||  |||| |||||||||    
T  17544838 ttcctgtaccaataatcttgccaggttggctgcctccaaatttcacatttcctccttctttcattgtaaggttgagaaacatagacttctgtcctgtcat 17544739  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    |||||||||  | | |||||||||||||||    
T  17544738 atgccttgaggaactgctgtctaggtacca 17544709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 194
Target Start/End: Original strand, 16744350 - 16744414
Alignment:
Q  130 ttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16744350 ttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacagatctttctctcc 16744414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 230
Target Start/End: Original strand, 15975340 - 15975383
Alignment:
Q  187 ttctctcctgtcatatgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15975340 ttctctcctgtcatatgccttgagcaaccgctgtctaggtacca 15975383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 20261357 - 20261270
Alignment:
Q  13 tcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||| | ||| ||||| || |||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  20261357 tcacaaaacttactgatacttaaaaggttatgttcaagaccatctaccaaccacacattattaattgagatagaggagttaccaatag 20261270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 21047987 - 21047900
Alignment:
Q  13 tcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||| | ||| ||||| || |||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  21047987 tcacaaaacttactgatacttaaaaggttatgttcaagaccatctaccaaccacacattattaattgagatagaggagttaccaatag 21047900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20033162 - 20032916
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20033162 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 20033063  T
Q  101 g--acctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtc 198  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20033062 tgtacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcatccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtc 20032963  T
Q  199 atatgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  20032962 atgtgccttgaacacccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 20032916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 13920808 - 13921052
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13920808 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 13920907  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13920908 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 13921007  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  13921008 gtgccttgaacacccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 13921052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 3669006 - 3669250
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3669006 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 3669105  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3669106 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 3669205  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  3669206 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 3669250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 4638488 - 4638732
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4638488 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 4638587  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4638588 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 4638687  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  4638688 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 4638732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9115732 - 9115488
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9115732 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 9115633  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9115632 tacctgtaccaatgatatttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 9115533  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  9115532 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 9115488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12720075 - 12719831
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12720075 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 12719976  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12719975 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 12719876  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  12719875 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 12719831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 12862493 - 12862737
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12862493 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 12862592  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12862593 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 12862692  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  12862693 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 12862737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 26032982 - 26033226
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26032982 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 26033081  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26033082 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 26033181  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  26033182 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 26033226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 26041157 - 26041401
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26041157 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaacaggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgagatggaggaattaccaatag 26041256  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26041257 tacctgtaccaatgatttttccagtctggttgccaccaaacttcacttctcctccatttttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 26041356  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  26041357 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 26041401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 27349307 - 27349551
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27349307 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 27349406  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27349407 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 27349506  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  27349507 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 27349551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 27410047 - 27410291
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27410047 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 27410146  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27410147 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 27410246  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  27410247 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 27410291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 27501266 - 27501510
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27501266 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgctttagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 27501365  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27501366 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 27501465  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  27501466 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 27501510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28254807 - 28254563
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28254807 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 28254708  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28254707 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 28254608  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  28254607 gtgccttgagcatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 28254563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28333556 - 28333312
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28333556 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 28333457  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28333456 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 28333357  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  28333356 gtgccttgagcatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 28333312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32304285 - 32304041
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32304285 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 32304186  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32304185 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 32304086  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  32304085 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 32304041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32965185 - 32964941
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32965185 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 32965086  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32965085 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 32964986  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  32964985 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 32964941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 16956570 - 16956814
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  16956570 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagattgaggaattaccaatag 16956669  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16956670 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 16956769  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  16956770 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 16956814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18827597 - 18827353
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18827597 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcagaccatctactaaccaaacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 18827498  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18827497 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtgaggaacaaagctttctctcctgtcat 18827398  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  18827397 gtgccttgaacaaccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 18827353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34810401 - 34810157
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34810401 tcatatccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 34810302  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34810301 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 34810202  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  34810201 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 34810157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 26872364 - 26872608
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||     
T  26872364 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattatttgagatggaggaattaccaataa 26872463  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26872464 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 26872563  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  26872564 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 26872608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 17055024 - 17055253
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17055024 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcggaccatcaactagccaaacattatttattgagatggaggaattaccaatag 17055123  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17055124 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcctgataagggtaaggaacaaagctttttctcctgtcat 17055223  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17055224 atgtcttgaacacccgctgtctaggtacca 17055253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 17780594 - 17780838
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17780594 tcatatccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgctttagaccatctactagccaaacattatttattgagatggaggaattaccaatag 17780693  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  17780694 tacatgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcactcctcctccatctttcatagtaagggtgaggaacaaagttttctctcctgtcat 17780793  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  17780794 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccaagacctttgtttctc 17780838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 22383579 - 22383822
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22383579 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcgtcagaccatctacaagccaaacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 22383678  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22383679 tacccgttccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccttctttcatggtgatggtgaggaacaaagctttctctcctgtcat 22383778  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttct 244  Q
     ||||||||||| ||| |||| ||||||||| || |||| ||||    
T  22383779 gtgccttgaacatccgttgtccaggtaccaggacatttgtttct 22383822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25676163 - 25675919
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  25676163 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcagaccatctattagccaaacattatttattgaaatggaggtattactaattg 25676064  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  25676063 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatccttcattgtaatggtgaggtacaaatctttttctcctgtcat 25675964  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25675963 atgtcttgaacacccactgtctaggtaccaggacctttgtttctc 25675919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25724959 - 25724721
Alignment:
Q  7 ccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaataggacctg 106  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  25724959 ccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccaaacattattaattgaaatggaggaattaccaatggtacctg 25724860  T
Q  107 taccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcatatgcct 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||    
T  25724859 taccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatccttcattgtaatggtgaggaacaaatctttttctcctatcatatgtct 25724760  T
Q  207 tgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25724759 tgaacacccactgtctaggtaccaggacctttgtttctc 25724721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25680239 - 25680002
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  25680239 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcagaccatctataagccaaacattattaattgaaatggaggaattactaatgg 25680140  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  25680139 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatccttcattgtaatggtgaggtacaaatctttttctcctgtcat 25680040  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaaccttt 238  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25680039 atgtcttgaacacccactgtctaggtaccaggaccttt 25680002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17611823 - 17611579
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17611823 tcatacccattgtcacaaaattgattgattctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccaaacattattaatagaaatggaggaattaccaatag 17611724  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17611723 tacatgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccttctttaatggtaatgatgaggaacaaagctttctctcctgtcat 17611624  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    |||||||||| ||||  |||| ||||||||| | ||||| |||||    
T  17611623 atgccttgaaaacccattgtccaggtaccaggatctttgtttctc 17611579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14056624 - 14056380
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14056624 tcatacccattgtcacagaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccaaacattattaattgaaatggaagaattaccaatag 14056525  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||  ||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14056524 tacccataccaataatcttttcagtttggttgcctccaaacttcacttctcctccttctttcatagtaatggtgaggaacaaagctttctctcctgtcat 14056425  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||| |||||    
T  14056424 gtgccttgaacatccgctgtccaggtactaggacctttgtttctc 14056380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14062753 - 14062509
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14062753 tcatacccattgtcacagaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccaaacattattaattgaaatggaagaattaccaatag 14062654  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||  ||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14062653 tacccataccaataatcttttcagtttggttgcctccaaacttcacttctcctccttctttcatagtaatggtgaggaacaaagctttctctcctgtcat 14062554  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||| |||||    
T  14062553 gtgccttgaacatccgctgtccaggtactaggacctttgtttctc 14062509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 21126999 - 21127211
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  21126999 tcatacccattttcacaaaattgcctgatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccaaacattatttattgaaatggaggaattaacaataa 21127098  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21127099 taactgtaccaatgatatttcaagttaggttgccaccaaacttcacttctcatccatatttcatggtaagggtgaggaacaaagctttctctcctgtcat 21127198  T
Q  201 atgccttgaacac 213  Q
    |||||||||||||    
T  21127199 atgccttgaacac 21127211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 50 - 245
Target Start/End: Original strand, 17061300 - 17061495
Alignment:
Q  50 gaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaataggacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttc 149  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17061300 gaccatcaacaagccaaacattatttattgagatagaggaattaccaatagtacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttc 17061399  T
Q  150 tcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcatatgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||  ||||||| |||||    
T  17061400 tcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttttctcctgtcatatgctttgaacacctgctgtctagataccaagacctttgtttctc 17061495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 22812408 - 22812637
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  22812408 tcataaccattatcacaaaactgactgatacttaaaaggttatgttcaagaccatctaccagccacacattatttattgagatacaggagttaccaatag 22812507  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      | |||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  22812508 ttcatgtaccaatgatcttgccaggttggctgccaccaaacttcacatttcctccttctttcattgtaagggtgaggaacatagacttctctcctgtcat 22812607  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  22812608 atgccttgagaaaccgctgtctaggcacca 22812637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 245
Target Start/End: Original strand, 18551392 - 18551501
Alignment:
Q  136 ccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcatatgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacc 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  18551392 ccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtgaggaacaaagctttctctcctgtcatatgccttgaacacccgttgtctaggtaccaggacc 18551491  T
Q  236 tttgcttctc 245  Q
    |||| |||||    
T  18551492 tttgtttctc 18551501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19446893 - 19447122
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  19446893 tcataaccattgtcacaaaactgacttatactcaaaaggttatgttcaagaccatctaccaaccacacattattaattgagatagaggagttaccaatag 19446992  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      | |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||| || ||||| |||||||  |  ||||||||| ||||    
T  19446993 ttcttgtaccaatgatcttgccagattggttgcctccaaacttcacatttcctccttctttcattgtgagggtgaggaacatggacttctctcctatcat 19447092  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||    
T  19447093 atgccttgagcaaccactgtctaggtacca 19447122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19071734 - 19071505
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |  ||||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  19071734 tcataaccattatcacaaaactgactgatacttaacagattatgttcaagaccatctaccaaccacacattattaattgagatagaggagttaccaatag 19071635  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      |||||||||||||| || |||| ||||||| | ||||||||||  | |||||| |||||||| || ||||| | ||||| ||  |||||| |||||||    
T  19071634 ttcctgtaccaatgatcttgccagattggttgtctccaaacttcaaatttcctccttctttcattgtgagggtgacgaacataggcttctcttctgtcat 19071535  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19071534 atgccttgagcaaccgctgtctaggtacca 19071505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19955156 - 19954927
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||||||||     
T  19955156 tcataaccattatcacaaaactgactgatacttaaaagtttatgttcaagaccatctaccagccacacattattaattgagatagatgagttaccaatat 19955057  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      ||||||||| |||| || | || |||| |||| ||||||||||| | |||||| |||||||| ||| |||| | ||||| ||  ||||||||||||||    
T  19955056 ttcctgtaccattgatcttgctaggttggctgcctccaaacttcacatttcctccttctttcattgtatgggtgatgaacatagacttctctcctgtcat 19954957  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19954956 atgccttgagcaaccgctgtctaggtacca 19954927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 245
Target Start/End: Original strand, 22305986 - 22306056
Alignment:
Q  175 aggaacaaagctttctctcctgtcatatgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22305986 aggaacaaagctttctctcctgtcatatgccttgaaaacccgttgtctaggtaccaggacctttgtttctc 22306056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 30095 - 30339
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||     
T  30095 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccaaacatgatttattgaaattgaggaattaccaataa 30194  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30195 tacctgtaccaatgatctttccaatttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtgaggaacaaagctttctctcctgtcat 30294  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30295 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccaggacctttgtttctc 30339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36124 - 35880
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36124 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaaaccacacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 36025  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  36024 tacatgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctgctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaatctttctctccagtcat 35925  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  35924 atgccttgaacatccgctgtctaggtaccacgacttttgcttctc 35880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 5907 - 6136
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||| ||||| || || || ||||||||||    
T  5907 tcataaccattgtcacaaaactgacttatactcaaaaggttatgttcaagaccatctaccaaccacacattattaattgagatagaagagttaccaatag 6006  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      |||||||||||||| || |||| ||||||| | ||||||||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  6007 ttcctgtaccaatgatcttgccagattggttgtctccaaacttcacatttcctccttctttcattgtgagggtgaggaacatagacttctctcctgtcat 6106  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  6107 atgccttgagcgaccactgtctaggtacca 6136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40227 - 39983
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40227 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgagatggaggaattaccaatag 40128  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40127 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 40028  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  40027 gtgccttgaacatccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 39983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 46215 - 45971
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46215 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccacacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 46116  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46115 tacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctccttcatccttcatggtgagggtaaggaacaaagctttctctccagtcat 46016  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||    
T  46015 gtgccttgaacatccgctgtctaggtacgatgacctttgtttctc 45971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5302 - 5085
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5302 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgtttcagaccatctacaagccaaacattatttattgaaatggaggaattatcaatag 5203  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5202 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtgaggaacaaagctttctctcctgtcat 5103  T
Q  201 atgccttgaacacccgct 218  Q
    |||||||||||| |||||    
T  5102 atgccttgaacatccgct 5085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 11845 - 12089
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11845 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcagaccatatactagccaaacattatttattgaaatggaggaattaccaaaag 11944  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11945 tacatgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatagtaagagtgaggaacaaagctttctctcctatcat 12044  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  12045 atgccttaaacatccgctgtctaggtactaggacctttgtttctc 12089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12937 - 12693
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12937 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccatacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 12838  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12837 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccttctttcatggtgatggtgaggaacaaagctttctctcctgtcat 12738  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     || |||||||| ||| |||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  12737 gtgtcttgaacatccgttgtccaggtaccaagacctttgtttctc 12693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4554 - 4310
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4554 tcatacccattgtcacaaaattgactaatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccaaacattattaattgaaatggaggaattaccaatag 4455  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4454 tacccgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccttctttcatggtgatggtgaggaacaaagctttctctcctgtcat 4355  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     || |||||||| ||| |||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  4354 gtgtcttgaacatccgttgtccaggtaccaagacctttgtttctc 4310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4778 - 4534
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4778 tcatacccattgtcacaaaattgacttatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccaaacattattaattgtaatggaggaattaccaatag 4679  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4678 tacctgtaccaatgatcttttcagtttggttgccaccaaactttacttctcctccatctttcattgtaatggtgaggaaaaaagcattctctcctgtcat 4579  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4578 atgccttgaacacccgttgtccaggtaccagaacctttgtttctc 4534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 135312 - 135556
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  135312 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccaaacattattaattgaaatggaggaattaccaatgg 135411  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  135412 tacctgtaccaatgatctttccagtttggttaccaccaaacttcacttctcctccatctttcattgtaatggtgaggaacaaagctttttctcctgtgat 135511  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  135512 atgtcttgaacacccgctgtctaggtaccaggacttttgtttctc 135556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 46413 - 46169
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  46413 tcatacccgttgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcagaccatctactagccaaatattattttttgaaatggaggatttaccaatat 46314  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  46313 tatctgtatcaatgatttttccagtttggttgccactaatcttcacttctcctccatctttcatggtaagggtgaggaacaaagctttccctcctgtcat 46214  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  46213 atgccttgaacatccgttgtccaggtaccaggacctttgtttctc 46169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2950 - 2709
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2950 tcatacccattgtcacaaaattgactgatgctcaataggttatgcttcagaccatctacaagccaaatattttttattgaaatggattaattaccaatag 2851  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2850 tacccgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcct---tctttcatggtgatggtgaggaacaaagctttctctcctgtcat 2754  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  2753 gtgtcttgaacatccgctgtccaggtaccaggacctttgtttctc 2709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3965 - 3709
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaa-ttgactaatactcaat-aggttatgcttcagaccatctacaagcca-cacattatttattgaaatggaggaatt-acca 96  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3965 tcatacccattgtcacaaaaattgactaatgctcaattaggttatgcttcagaccatctacaagccaacacattattaattgaaatggaggaatttacca 3866  T
Q  97 a-taggacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccacc-aaacttcacttct-cctccatctttcatggtaagggtaaggaac-aaagctttctct 192  Q
    | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3865 aatagtacctgtaccaatgatctttccagtttggttgccaccaaaacctcacttctccctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaaagctttctct 3766  T
Q  193 -cctgt-catatgcc-ttgaacacccg-ctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  3765 ccctgtccatatgcctttgaacacccgcctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 3709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9655 - 9426
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  9655 tcataaccattatcacaaaactgactgatacttaaaaggttatgttcaagaccatctaccagccacacattattaattgagatagaggagttaccaatag 9556  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      |||||| ||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||| || ||||| | ||||| ||  || |||||||||||    
T  9555 ttcctgtaacaatgatcttgccagactggttgcctccaaacttcacatttcctccttctttcattgtgagggtgaagaacatagacttatctcctgtcat 9456  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9455 atgccttgagcaaccgctgtctaggtacca 9426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13363 - 13134
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  13363 tcataaccattatcacaaaactgactgatacttaaaaggttatgttcaagaccatctaccaaccacacattattaattgagatagaggagttaccaatag 13264  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      | |||||||||||| || | ||  |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  13263 ttcatgtaccaatgatcttgctagactggttgcctccaaacttcacatttcctccttctttcattgtaagggtgaggaacatagacttctctcctgtcat 13164  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||    
T  13163 atgccttgagtaaccgctgtctaggtacca 13134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18036 - 17807
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  18036 tcataaccattatcacaaaactgactgatacttaaaaggttatgttcaagaccatctaccaaccacacattattaattgagatagaggagttaccaatag 17937  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      | |||||||||||| || | ||  |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  17936 ttcatgtaccaatgatcttgctagactggttgcctccaaacttcacatttcctccttctttcattgtaagggtgaggaacatagacttctctcctgtcat 17837  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||    
T  17836 atgccttgagtaaccgctgtctaggtacca 17807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20912 - 20745
Alignment:
Q  63 ccacacattatttattgaaatggaggaattaccaataggacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttc 162  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||  | |||||||||||| || | ||  |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||    
T  20912 ccacacattattaattgagatagaggagttaccaatagttcatgtaccaatgatcttgctagactggttgcctccaaacttcacatttcctccttctttc 20813  T
Q  163 atggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcatatgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    || |||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  20812 attgtaagggtgaggaacatagacttctctcctgtcatatgccttgagtaaccgctgtctaggtacca 20745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27367 - 27140
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| | |||||| |  ||||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  27367 tcataaccattgtcacaaaactaactgatactcaaaatgttatgttcaagaccatctaccaaccacacattattaattgagatagaggagttaccaatag 27268  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      ||| |||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||  ||||||| || ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  27267 ttcctataccaatgatcttgccagactggttgcctccaaacttcacatttcctcctactttcattgtgagggtgaggaacatagacttctctcctgtcat 27168  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtac 228  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||    
T  27167 atgccttgagcaaccgctgtctaggtac 27140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28911 - 28682
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | || || |||| |||||    
T  28911 tcataaccattatcacagaattgactgatacttaacaggttatgttcaagaccatctactagctacacattattaattgaagtagaagagttactaatag 28812  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      |||||||||||||| |||| || |||| |||||||||| ||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  28811 ttcctgtaccaatgatctttctaggttggctgccaccaaatttcacattgcctccttctttcattgtaagggtaaggaacatagacttctctcctgtcat 28712  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
     |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  28711 gtgccttgagcgaccgctgtctaggtacca 28682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 46127 - 46356
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  || |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||    
T  46127 tcataaccattatcacaaaactgactgatacataaaaggttatgttcaagaccatctaccagccacacattattaatagagatagaggagttaccaatag 46226  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      ||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||||  |||||||| ||||||| |   ||||||||||||||    
T  46227 ttcctgtaccaataatcttgccaggttggttgcctccaaacttcacatttcctacttctttcactgtaagggtgaggaacataaacttctctcctgtcat 46326  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  46327 atgccttgagcaaccgctgtttaggtacca 46356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 11642 - 11871
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||  || | ||||||||||    
T  11642 tcataaccattatcacaaaattgactgatacttaaaaggttatgttcaagaccatctaccaaccatacattattaattgagataaagcagttaccaatag 11741  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      | |||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||| | ||  |||||| |||||||    
T  11742 ttcatgtaccaatgatctagccagattggttgcctccaaacttcacatttcctccttctttcattgtcagggtgaggaatatagacttctcttctgtcat 11841  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11842 atgccttgagcaaccgctgtctaggtacca 11871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 112911 - 112682
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||  |  ||||||||||  |||||||||||||| |||||  |  || | ||||||||||    
T  112911 tcataaccattttcacagaactgactgatacttaataggttatcttgaagaccatctagcagccacacattattaattgaggtaaagaagttaccaatag 112812  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      |||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  112811 ttcctgtaccaatgatcttgccaggttggctgccaccaaacttcacattgcctccttctttcattgtaagggtaaggaacatagacttctctcctctcat 112712  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
     |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  112711 gtgccttgagcaaccgttgtctaggtacca 112682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 13976 - 14192
Alignment:
Q  13 tcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaataggacctgtaccaa 112  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||  ||  |||||     
T  13976 tcacaaaagtgactgatacttaaaaggttatgttcaagaccatctaccagccacacattattgattgagatagaggagttaccaatagttcccataccat 14075  T
Q  113 tgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcatatgccttgaaca 212  Q
    |||| || | || |||| |||| ||||||| ||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||  || |||||||||||||||||||| ||    
T  14076 tgatcttgctaggttggctgcctccaaact-cacatttcctccttctttcattgtaagggtgaggaacatagacttttctcctgtcatatgccttgagca 14174  T
Q  213 cccgctgtctaggtacca 230  Q
     | |||||||||||||||    
T  14175 actgctgtctaggtacca 14192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 7914 - 8143
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||    
T  7914 tcataaccattgtcacaaaactgactgatacttaaaaggttatgttcaagaccatctaccaaccacacattattaatagagatagaggagttaccaatag 8013  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      |||||||||||||| || |||| |||| |||| ||||||||||| | | |||| ||||| ||  | ||||| ||||||| ||  |||||||||||||     
T  8014 ttcctgtaccaatgatcttgccagattggctgcctccaaacttcacattttctccttcttttattatgagggtgaggaacatagacttctctcctgtcaa 8113  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||  ||||| || ||| |||||||||||||    
T  8114 atatcttgaccaaccgttgtctaggtacca 8143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1732 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1732
Description:

Target: scaffold1732; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 718 - 510
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| | | |||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  718 tcataaccattgtcacaaaacttacttatactcaaaaggttatgttcaagaccatctgccaaccacacattattaattgagataaaggagttaccaatag 619  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      |||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||| | |  ||| |||||||| || ||||| ||||||| |   ||||||||||||||    
T  618 ttcctgtaccaatgatcttgccatattggttgcctccaaacttcacattttttccttctttcattgtgagggtgaggaacacaaacttctctcctgtcat 519  T
Q  201 atgccttga 209  Q
    |||||||||    
T  518 atgccttga 510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0388
Description:

Target: scaffold0388; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 245
Target Start/End: Original strand, 637 - 729
Alignment:
Q  154 ccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttct-ctcctgtcatatgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  637 ccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagcttttttctcctgtcatgtgccttgaacacccgctgtctaggtaccatgacctttgtttctc 729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 586 - 642
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatct 57  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  586 tcatacccattgtcacaaaattcactaatgctcaataggttatgcttcagaccatct 642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 68580 - 68436
Alignment:
Q  86 aggaattaccaataggacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagc 185  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||  |||||||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| || |||| ||     
T  68580 aggagttaccaatagttcctgtaccaatgatcttgccaggttgactgccaccaaacttcacattgcctccttctttcattgtaagggtgagaaacataga 68481  T
Q  186 tttctctcctgtcatatgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
     |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  68480 cttctctcctgtcatgtgccttgagcaaccgctgtctaggtacca 68436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 74924 - 75170
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || || ||||| |||||| |||    
T  74924 tcataaccattatcacaaaaatgactgatactaagcaggttatgttttagaccatctaccaaccacacattattaatagagatagaggagttaccagtag 75023  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      ||||||||||| || || |||| || |||||| | ||| || |  | |||||| |||||||| || ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||    
T  75024 ttcctgtaccaataatcttgccagcttagttgcctctaaattttagatttcctccttctttcattgtgagggtaaggaacatagacttctcccctgtcat 75123  T
Q  201 atgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctcct 247  Q
    ||| ||||| |  ||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||    
T  75124 atgtcttgagcgaccgctgtctagctaccatgacctgtgcttttcct 75170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 245
Target Start/End: Original strand, 112754 - 112822
Alignment:
Q  177 gaacaaagctttctctcctgtcatatgccttgaacacccgctgtctaggtaccagaacctttgcttctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  112754 gaacaaagctttctctcctgtcatatgccttgaacacccgctgtccaggtaccaggacctttgtttctc 112822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 230
Target Start/End: Original strand, 5745 - 5924
Alignment:
Q  51 accatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaataggacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttct 150  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || |||  ||||||||| | ||||||||| | |    
T  5745 accatctaccaaccacacattattaattgagatagaggagttaccaatagttcctgtgccaatgatcttgccatattggttgcctcaaaacttcacattt 5844  T
Q  151 cctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcatatgccttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||| ||   ||||| |||||||||||||| | |  ||| |||||||||||||    
T  5845 cctccttctttcattgtgagggtgaggaacatagacatctcttctgtcatatgcctttagccaccgttgtctaggtacca 5924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1684 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1684
Description:

Target: scaffold1684; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 673 - 872
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||  | ||||||||||| | |||||||||| | ||  | || ||||| ||||||||||    
T  673 tcataaccattgtcacaaaactgactgatactaacaaggttatgtataagaccatctaccaaccacacattactaatacagatagaggagttaccaatag 772  T
Q  101 gacctgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcat 200  Q
      ||| ||||||| ||||||| || ||||| ||| ||||| ||||| | |||||  |||| |||  | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  773 ttcctataccaattatttttctaggttggtcgcctccaaatttcacatttcctcgttcttgcattatgagggtaaggaacatagacttctctcctgtcat 872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1742 - 1617
Alignment:
Q  105 tgtaccaatgatttttccagtttggttgccaccaaacttcacttctcctccatctttcatggtaagggtaaggaacaaagctttctctcctgtcatatgc 204  Q
    ||||||||| || || |||| |||| |||| | ||||||||| | |||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  1742 tgtaccaataatcttgccaggttggctgcctctaaacttcacatttcctccttctttcattataagggtgaggaacatagacatctctcctgtcatatgc 1643  T
Q  205 cttgaacacccgctgtctaggtacca 230  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||    
T  1642 cttgagcaaccgctgtctatgtacca 1617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 5336 - 5436
Alignment:
Q  1 tcatacccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaatag 100  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| | ||||| || | |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||    
T  5336 tcataaccattatcacataattgaatgatacttaaaatgttatgttcaagaccatctaccagccacacattattaattgtgatagaggagttaccaatag 5435  T
Q  101 g 101  Q
    |    
T  5436 g 5436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0758
Description:

Target: scaffold0758; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 140
Target Start/End: Original strand, 2020 - 2147
Alignment:
Q  13 tcacaaaattgactaatactcaataggttatgcttcagaccatctacaagccacacattatttattgaaatggaggaattaccaataggacctgtaccaa 112  Q
    |||||||| ||||||||  | | |||||||||  | || ||||| |||| |||||||||||| || || || || || ||||||||||  | | ||||||    
T  2020 tcacaaaactgactaatgttaagtaggttatgtctaagtccatcaacaaaccacacattattaatagagatagaagagttaccaatagttcatataccaa 2119  T
Q  113 tgatttttccagtttggttgccaccaaa 140  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||    
T  2120 tgattttttcagtttggtttcctccaaa 2147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 47
Target Start/End: Original strand, 62944 - 62986
Alignment:
Q  5 acccattgtcacaaaattgactaatactcaataggttatgctt 47  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  62944 acccattgtcgcaaaattgactaatactaaagaggttatgctt 62986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University