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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF10510_2 (Length: 569)
Name: NF10510_2
Description: NF10510
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF10510_2 |
 | |
|
| [»] scaffold0516 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0045 (1 HSPs) |
| | |
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| [»] scaffold0182 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 6)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5768262 - 5767986
Alignment:
| Q |
28 |
cactttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctcca |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5768262 |
cactttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctcca |
5768163 |
T |
|
| Q |
128 |
tttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatc |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5768162 |
tttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatcaattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatc |
5768063 |
T |
|
| Q |
228 |
ctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5768062 |
ctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
5767986 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 31 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 25419769 - 25419497
Alignment:
| Q |
31 |
tttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccattt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25419769 |
tttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttctt-atatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccattt |
25419671 |
T |
|
| Q |
131 |
acttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctc |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25419670 |
acttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctc |
25419571 |
T |
|
| Q |
231 |
ttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25419570 |
ttacacacacaaatttattactataaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
25419497 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 39067067 - 39066831
Alignment:
| Q |
28 |
cactttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctcca |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39067067 |
cactttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttctt-atatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctcca |
39066969 |
T |
|
| Q |
128 |
tttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatc |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39066968 |
tttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatc |
39066869 |
T |
|
| Q |
228 |
ctcttacacacacaagtttattactataaagctcctca |
265 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
39066868 |
ctcttacacatacaagtttattactataaggctcctca |
39066831 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 84 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 47233964 - 47233744
Alignment:
| Q |
84 |
ttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47233964 |
ttactatctatctttcattttccatcagttgcaaaaacacttcatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
47233865 |
T |
|
| Q |
184 |
attgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttata |
283 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
47233864 |
attaaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcatttttttataagcttata |
47233765 |
T |
|
| Q |
284 |
tatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
47233764 |
tatatgttgcttatattatcc |
47233744 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 84 - 304
Target Start/End: Original strand, 44393667 - 44393882
Alignment:
| Q |
84 |
ttactatcta-tctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44393667 |
ttactatctaatctttcatttcccatcaattggaaaaactctctatttacttcacttcatggaagttacacaatgaatgtattataatccattttattaa |
44393766 |
T |
|
| Q |
183 |
tattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttat |
282 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
44393767 |
tagtgaggggtttcattttaaaattattcatattcttagtcaatcatcttacacacacaagt---ttactataaagctcctca---ttttctaagctcat |
44393860 |
T |
|
| Q |
283 |
atatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44393861 |
atatatgttgcttatgttatcc |
44393882 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 47933019 - 47932975
Alignment:
| Q |
126 |
catttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataat |
170 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47933019 |
catttacttcacttcatgcaagttgtacaatgaatgcattataat |
47932975 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 5)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 304
Target Start/End: Original strand, 36990987 - 36991263
Alignment:
| Q |
28 |
cactttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctcca |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36990987 |
cactttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctcca |
36991086 |
T |
|
| Q |
128 |
tttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatc |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36991087 |
tttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatctattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatc |
36991186 |
T |
|
| Q |
228 |
ctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36991187 |
ctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
36991263 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 84 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 21605209 - 21604991
Alignment:
| Q |
84 |
ttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21605209 |
ttactatctatctttcattttccattggctgcaaaaacacttcatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
21605110 |
T |
|
| Q |
184 |
attgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttata |
283 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
21605109 |
attgaggggttaaattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcatttttttctaagct--ta |
21605012 |
T |
|
| Q |
284 |
tatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21605011 |
tatatgttgcttatgttatcc |
21604991 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 89 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 37302125 - 37301929
Alignment:
| Q |
89 |
atctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattga |
188 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
37302125 |
atctatctttcatttcccatcatttgcaaaaacactccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaataatgg |
37302026 |
T |
|
| Q |
189 |
ggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatat |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37302025 |
agggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatccacttacacacacaagt---ttactataaaactcctcatttttttctaagcttatatatat |
37301929 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 441 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 8682843 - 8682744
Alignment:
| Q |
441 |
tgctcgttcactggctgtggtgctggcttcacttcctctacttttgtgccaccacctgcatttttaccaccgccttcattggccgttttgttgtcatcac |
540 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8682843 |
tgctctttcactggctgtggtgctggcttcacttcctctacttttgagccaccacctgcatttttaccaccgccttcattggccgttttgttgtcatcac |
8682744 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 84
Target Start/End: Original strand, 11381359 - 11381413
Alignment:
| Q |
29 |
actttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttcttcatatgaattttatt |
84 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11381359 |
actttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttctt-atatgaattttatt |
11381413 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 5)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 31 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13433647 - 13433375
Alignment:
| Q |
31 |
tttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccattt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13433647 |
tttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttctt-atatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccattt |
13433549 |
T |
|
| Q |
131 |
acttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctc |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13433548 |
acttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctc |
13433449 |
T |
|
| Q |
231 |
ttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13433448 |
ttacacacacaaatttattactataaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
13433375 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16712155 - 16712036
Alignment:
| Q |
180 |
taatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagct |
279 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || ||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16712155 |
taatagtgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcatcttacacacac--gt---tcaccataaaactcctcatttttttctaagct |
16712061 |
T |
|
| Q |
280 |
tatatatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16712060 |
catatatatgttgcttatgttatcc |
16712036 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 170
Target Start/End: Original strand, 16857246 - 16857290
Alignment:
| Q |
126 |
catttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataat |
170 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16857246 |
catttacttcacttcatgcaagttgtacaatgaatgcattataat |
16857290 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26615377 - 26615320
Alignment:
| Q |
115 |
caaaaactctccatttacttcacttcatgcaa--gttacacaatgaatgcattataat |
170 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26615377 |
caaaaacacttcatttacttcacttcatgcaattgttgtacaatgaatgcattataat |
26615320 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26721305 - 26721248
Alignment:
| Q |
115 |
caaaaactctccatttacttcacttcatgcaa--gttacacaatgaatgcattataat |
170 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26721305 |
caaaaacacttcatttacttcacttcatgcaattgttgtacaatgaatgcattataat |
26721248 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 31 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2505195 - 2504923
Alignment:
| Q |
31 |
tttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccattt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2505195 |
tttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttctt-atatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccattt |
2505097 |
T |
|
| Q |
131 |
acttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctc |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2505096 |
acttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctc |
2504997 |
T |
|
| Q |
231 |
ttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2504996 |
ttacacacacaaatttattactataaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
2504923 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 28 - 304
Target Start/End: Original strand, 46092247 - 46092523
Alignment:
| Q |
28 |
cactttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctcca |
127 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
46092247 |
cactttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttcttcatatgaattttatttcctatctatctttcattttccatcggttacaaaaacttgcca |
46092346 |
T |
|
| Q |
128 |
tttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatc |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46092347 |
tttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatc |
46092446 |
T |
|
| Q |
228 |
ctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46092447 |
ctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
46092523 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 28 - 304
Target Start/End: Original strand, 46134772 - 46135048
Alignment:
| Q |
28 |
cactttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctcca |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
46134772 |
cactttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttcttcatatgaattttatttcctatctatctttcattttccatcggttacaaaaacttgcca |
46134871 |
T |
|
| Q |
128 |
tttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatc |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46134872 |
tttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatc |
46134971 |
T |
|
| Q |
228 |
ctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46134972 |
ctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
46135048 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 87 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 53830644 - 53830427
Alignment:
| Q |
87 |
ctatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatatt |
186 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53830644 |
ctatctatctttcattttccatcggttgcaaaaacactctatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatatt |
53830545 |
T |
|
| Q |
187 |
gaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatatat |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
53830544 |
gaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcatttttttctaagcttatatat |
53830445 |
T |
|
| Q |
287 |
atgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53830444 |
atgttgcttatgttatcc |
53830427 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 89 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34737936 - 34737724
Alignment:
| Q |
89 |
atctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattga |
188 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
34737936 |
atctatctttcattttccatcagttgcaaaaacactccatctacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaacaatga |
34737837 |
T |
|
| Q |
189 |
ggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatat |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
34737836 |
ggggttacattttaaaattattcatattcttgatcaatcctcttacacacacaagt---ttactataaagctcctcatttttttctaagcttatatatat |
34737740 |
T |
|
| Q |
289 |
gttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
34737739 |
gttgcttatgttatcc |
34737724 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 84 - 304
Target Start/End: Original strand, 21802896 - 21803112
Alignment:
| Q |
84 |
ttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21802896 |
ttactatctatctttcatttcctatcagttgcaaaaacatttcatttacttcacttcttgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
21802995 |
T |
|
| Q |
184 |
attgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttata |
283 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21802996 |
attgaggggttacgttttaaaattgttcatattcttaatcaataatcttacacacacaagt---ttactataaagctcctcatttttttctaagcttat- |
21803091 |
T |
|
| Q |
284 |
tatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21803092 |
tatgtgttgcttatgttatcc |
21803112 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 84 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2500786 - 2500569
Alignment:
| Q |
84 |
ttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
183 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2500786 |
ttactatttatctttcatttcccatccgttgcaaaaatacaccatttacttcacttcatgcaagttgcacaatgaatgcattataatccattttattaat |
2500687 |
T |
|
| Q |
184 |
attgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttata |
283 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||| | |
|
|
| T |
2500686 |
attgtgcggttacattttaaaattatttgtattcttgatcaatcctcttacacacacaagttta---ctataaatctactcatttttttctaagcttaca |
2500590 |
T |
|
| Q |
284 |
tatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
2500589 |
tatatgttgcttatattatcc |
2500569 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 84 - 302
Target Start/End: Original strand, 5430709 - 5430927
Alignment:
| Q |
84 |
ttactatcta-tctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttat--- |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5430709 |
ttactatctaatctttcatttcccatcaattggaaaaactctccatttacttcacttcatggaagttacacaatgaatgtattataatccattttattaa |
5430808 |
T |
|
| Q |
180 |
taatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagct |
279 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
5430809 |
taatagtgaggggttacattttaaaattattcatattcttagtcaatcatcttacacacacaagt---ttactataaaactcctca-ttttttctaagct |
5430904 |
T |
|
| Q |
280 |
tatatatatgttgcttatgttat |
302 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5430905 |
catatatatgttgcttatgttat |
5430927 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 84 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21632912 - 21632733
Alignment:
| Q |
84 |
ttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaa-ctctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21632912 |
ttactatctatctttcattttctatcagttgcaaaaaacatttcatttacttcacttcttgcaagttacacgatgaatgcattatgatccattttattaa |
21632813 |
T |
|
| Q |
183 |
tattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctca |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21632812 |
tattgaggggttatgttttaaaattgttcatattcttaatcaatcttcttacacacacaagt---ttactataaagctcctca |
21632733 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 247
Target Start/End: Original strand, 20036282 - 20036446
Alignment:
| Q |
84 |
ttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaa-ctctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | || || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20036282 |
ttactatctatctttcatttcccatcagatgtaaaaaacacttcagttacttcacttcatgcaagttgcataatgaatgcattataattcattttattaa |
20036381 |
T |
|
| Q |
183 |
tattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagttta |
247 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20036382 |
tattgagcagttacattttaaaattaatcatattcttaatcaatcctcttacactcacaagttta |
20036446 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 82
Target Start/End: Original strand, 26376949 - 26377001
Alignment:
| Q |
29 |
actttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttcttcatatgaatttta |
82 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26376949 |
actttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttctt-atatgaatttta |
26377001 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 46140603 - 46140551
Alignment:
| Q |
29 |
actttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttcttcatatgaatttta |
82 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
46140603 |
actttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttctt-atatgaatttta |
46140551 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 84
Target Start/End: Original strand, 27256675 - 27256730
Alignment:
| Q |
28 |
cactttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttcttcatatgaattttatt |
84 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
27256675 |
cactttacttatgtgtcacctcaccaataattcttatttctt-atatgaattttatt |
27256730 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 170
Target Start/End: Original strand, 43943476 - 43943520
Alignment:
| Q |
126 |
catttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataat |
170 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43943476 |
catttacttcacttcatgcaagttgtacaatgaatgcattataat |
43943520 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 7)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 31 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7574285 - 7574013
Alignment:
| Q |
31 |
tttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccattt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7574285 |
tttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttctt-atatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccattt |
7574187 |
T |
|
| Q |
131 |
acttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctc |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7574186 |
acttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctc |
7574087 |
T |
|
| Q |
231 |
ttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7574086 |
ttacacacacaaatttattactataaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
7574013 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 31 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16668880 - 16668608
Alignment:
| Q |
31 |
tttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccattt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16668880 |
tttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttctt-atatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccattt |
16668782 |
T |
|
| Q |
131 |
acttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctc |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16668781 |
acttcacttcatgcaagttacataatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttgatcaatcctc |
16668682 |
T |
|
| Q |
231 |
ttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16668681 |
ttacacacacaaatttattactataaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
16668608 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 92 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41646842 - 41646633
Alignment:
| Q |
92 |
tatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggg |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41646842 |
tatctttcattttccatcggttgcaaaaacactccatttacttcatttcatgcaagttacacaatgaatgtattttaatccattttattaatattgaggg |
41646743 |
T |
|
| Q |
192 |
gttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctca-nnnnnnnctaagcttatatatatgt |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41646742 |
gttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcattttttttctaagcttatatatatgt |
41646643 |
T |
|
| Q |
291 |
tgcttatgtt |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
41646642 |
tgcttatgtt |
41646633 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 229
Target Start/End: Original strand, 43564238 - 43564304
Alignment:
| Q |
163 |
attataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcct |
229 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43564238 |
attataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcct |
43564304 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 232
Target Start/End: Original strand, 29455448 - 29455517
Alignment:
| Q |
163 |
attataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctctt |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
29455448 |
attataatccattttattaatatcgaggggttacattttaaaattattcatattcttaattaatcctctt |
29455517 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 304
Target Start/End: Original strand, 29455527 - 29455558
Alignment:
| Q |
273 |
ctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29455527 |
ctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
29455558 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 304
Target Start/End: Original strand, 43564317 - 43564348
Alignment:
| Q |
273 |
ctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43564317 |
ctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
43564348 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 31 - 304
Target Start/End: Original strand, 13786177 - 13786449
Alignment:
| Q |
31 |
tttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccattt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13786177 |
tttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttctt-atatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccattt |
13786275 |
T |
|
| Q |
131 |
acttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctc |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13786276 |
acttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctc |
13786375 |
T |
|
| Q |
231 |
ttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13786376 |
ttacacacacaaatttattactataaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
13786449 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 31 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 25807966 - 25807693
Alignment:
| Q |
31 |
tttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccattt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25807966 |
tttgcttatgtgtcatctcaccaataattcttatttctt-atatgaattttatttactatctatctttcattttccatcaattacaaaaactttccattt |
25807868 |
T |
|
| Q |
131 |
acttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctc |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25807867 |
acttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctc |
25807768 |
T |
|
| Q |
231 |
ttacacacacaagtttattactataaagctcctca-nnnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25807767 |
ttacacacacaagtttattactataaagctcctcattttttttctaagcttatatatatgtttcttatgttatcc |
25807693 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 92 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22912662 - 22912455
Alignment:
| Q |
92 |
tatctttcattttccatcag-ttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgagg |
190 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22912662 |
tatctttcatttcccatcaggttgcagaaacactccatttacttcacttcttgcatgttacaaaatgaatgcattataaaccattttattaatat-gagg |
22912564 |
T |
|
| Q |
191 |
ggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgt |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22912563 |
agttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacgaat---ttactattaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgt |
22912467 |
T |
|
| Q |
291 |
tgcttatgttat |
302 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
22912466 |
tgcttatgttat |
22912455 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23726167 - 23725991
Alignment:
| Q |
83 |
tttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23726167 |
tttactatctatctttcatttttcatctgttgcaaaaacacttcatttacttcatttcatgcaagttgcacaatgaatgaattataatccattttattaa |
23726068 |
T |
|
| Q |
183 |
tattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctca |
265 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23726067 |
tattaaacggttacatttt-aaattattcatattcttaatcaatcctctt--gcacacaagt---ttactataaagctcctca |
23725991 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 7)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 31 - 304
Target Start/End: Original strand, 52349674 - 52349946
Alignment:
| Q |
31 |
tttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttcttcatatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccattt |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52349674 |
tttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttctt-atatgaattttatttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccattt |
52349772 |
T |
|
| Q |
131 |
acttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctc |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52349773 |
acttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattatttatattcttaatcaatcctc |
52349872 |
T |
|
| Q |
231 |
ttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52349873 |
ttacacacacaaatttattactataaagctcctcatttttttctaagcttatatatatgttgcttatgttatcc |
52349946 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 84 - 304
Target Start/End: Original strand, 48266265 - 48266484
Alignment:
| Q |
84 |
ttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48266265 |
ttactatctatctttcattttccatcagttgcaaaaactctccatttactt-acttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
48266363 |
T |
|
| Q |
184 |
attgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttata |
283 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
48266364 |
attgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcatttttttctaagcttata |
48266463 |
T |
|
| Q |
284 |
tatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48266464 |
tatatgttgcttatgttatcc |
48266484 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 84 - 304
Target Start/End: Original strand, 35870343 - 35870563
Alignment:
| Q |
84 |
ttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35870343 |
ttactatctatctttcattttccatcagttgcgaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
35870442 |
T |
|
| Q |
184 |
attgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttata |
283 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
35870443 |
attgagaggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaaggtcctcatttttttctaaacttata |
35870542 |
T |
|
| Q |
284 |
tatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35870543 |
tatatgttgcttatgttatcc |
35870563 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 219
Target Start/End: Original strand, 26215284 - 26215420
Alignment:
| Q |
84 |
ttactatcta-tctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26215284 |
ttactatctaatctttcattttccatcaattggaaaaactctccatttacttcacttcatggaagttacacaatgaatgtgttataatccattttattaa |
26215383 |
T |
|
| Q |
183 |
tattgaggggttacattttaaaattattcatattctt |
219 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26215384 |
tagcgaggggttacattttaaaattattcatattctt |
26215420 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 304
Target Start/End: Original strand, 26215432 - 26215530
Alignment:
| Q |
202 |
aaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatatatatgttgcttatgtta |
301 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26215432 |
aaaattattcatattcttagtcaatcatcttacacacacaagt---ttactataaagctcctca-ttttttctaagctcatatatatgttgcttatgtta |
26215527 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5884467 - 5884423
Alignment:
| Q |
126 |
catttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataat |
170 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5884467 |
catttacttcacttcatgcaagttgtacaatgaatgcattataat |
5884423 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 54945821 - 54945777
Alignment:
| Q |
126 |
catttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataat |
170 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54945821 |
catttacttcacttcatgcaagttgtacaatgaatgcattataat |
54945777 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 84 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8150633 - 8150455
Alignment:
| Q |
84 |
ttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8150633 |
ttactatctatctttcatttcccatcagttgcaaaaacactccatttacttcactttatgcgagttacacaatgaatgcattataatcaattttattaat |
8150534 |
T |
|
| Q |
184 |
attgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctca |
265 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8150533 |
attgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcagtcctcttacacacacaagt---ttactataaagctcctca |
8150455 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 84 - 304
Target Start/End: Original strand, 10186354 - 10186570
Alignment:
| Q |
84 |
ttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10186354 |
ttactatctatctttcatttcctatcagttgcaaaaacatttcatttacctcacttcttgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaat |
10186453 |
T |
|
| Q |
184 |
attgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttata |
283 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
10186454 |
attgaggggttacattttaaaattgttcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagt---ttactataaagctcctcatttttttccaagcttat- |
10186549 |
T |
|
| Q |
284 |
tatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10186550 |
tatgtgttgcttatgttatcc |
10186570 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 84 - 304
Target Start/End: Original strand, 20171957 - 20172172
Alignment:
| Q |
84 |
ttactatcta-tctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20171957 |
ttactatctaatctttcatttcccatcaattggaaaaactctctatttacttcacttcatggaagttacacaatgaatgtattataatccattttattaa |
20172056 |
T |
|
| Q |
183 |
tattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttat |
282 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
20172057 |
tagtgaggggtttcattttaaaattattcatattcttagtcaatcatcttacacacacaagt---ttactataaagctcctca---ttttctaagctcat |
20172150 |
T |
|
| Q |
283 |
atatatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20172151 |
atatatgttgcttatgttatcc |
20172172 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 93 - 247
Target Start/End: Original strand, 4138333 - 4138487
Alignment:
| Q |
93 |
atctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaatattgagggg |
192 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| ||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4138333 |
atctttcatttcctatccgttgcaaaaacatttcatttacttcacttcttgcaagttacacaatgaatgcattataatctattttattaatattgagggg |
4138432 |
T |
|
| Q |
193 |
ttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagttta |
247 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4138433 |
ttacgttttaaaattgttcatattcttaatcaagactcttacacacacaagttta |
4138487 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 163 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 919018 - 918949
Alignment:
| Q |
163 |
attataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctctt |
232 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
919018 |
attataatccattttattaatattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctctt |
918949 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 186 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11428182 - 11428068
Alignment:
| Q |
186 |
tgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctcannnnnnnctaagcttatata |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
11428182 |
tgaggggttacattttaaaattattcatattcttagtcaatcatcttacacacagaagt---ttacgataaagctcctca-ttttttctaagctcatata |
11428087 |
T |
|
| Q |
286 |
tatgttgcttatgttatcc |
304 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11428086 |
tatgttgcttatgttatcc |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11428260 - 11428184
Alignment:
| Q |
84 |
ttactatcta-tctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaa |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11428260 |
ttactatctaatctttcattttccatcaattggaaaaactatccatttacttcacttcatggaagttacacaatgaa |
11428184 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0516 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:
Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 83 - 265
Target Start/End: Original strand, 3246 - 3425
Alignment:
| Q |
83 |
tttactatctatctttcattttccatcagttacaaaaactctccatttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataatccattttattaa |
182 |
Q |
| |
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|
|
| T |
3246 |
tttactatttatctttcatttcccatcagttgcaaaaacacttcatttacttcacttcatgcaagttgcacaatgattgaattataatccattttattaa |
3345 |
T |
|
| Q |
183 |
tattgaggggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagtttattactataaagctcctca |
265 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3346 |
tattaagcggttacattttaaaattattcatattcttaatcaatcctcttacacacacaagt---ttactataaagctcctca |
3425 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0045 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:
Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 1318 - 1266
Alignment:
| Q |
29 |
actttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttcttcatatgaatttta |
82 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1318 |
actttgcttatgtgtcacctcaccaataattcttatttctt-atatgaatttta |
1266 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0182 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:
Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10215 - 10171
Alignment:
| Q |
126 |
catttacttcacttcatgcaagttacacaatgaatgcattataat |
170 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10215 |
catttacttcacttcatgcaagttgtgcaatgaatgcattataat |
10171 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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