View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10511_low_6 (Length: 488)

Name: NF10511_low_6
Description: NF10511
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10511_low_6
NF10511_low_6
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (19-476)||(39458112-39458568)
chr5 (291-474)||(39480270-39480452)
chr5 (33-425)||(39486405-39486808)
chr5 (33-419)||(39450952-39451343)
chr5 (20-424)||(39471983-39472386)
chr5 (45-418)||(39454592-39454964)
chr5 (53-444)||(39475433-39475829)
chr5 (198-418)||(39464531-39464750)
chr5 (114-372)||(39460248-39460506)
chr5 (33-375)||(39470589-39470931)
chr5 (45-291)||(39483339-39483588)
chr5 (286-421)||(43312598-43312732)
chr5 (47-90)||(43312380-43312423)
chr5 (45-80)||(39464399-39464434)
chr5 (20-80)||(39460543-39460603)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 422; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 476
Target Start/End: Original strand, 39458112 - 39458568
Alignment:
Q  19 gagcgtagggacaaaaaattcttttacaacatcaatcatggtggtgcagaacatgtcaacaatgaatgcagctaggactccattttctggtgctttagtg 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39458112 gagcgtagggacagaaaattcttttacaacatcaatcatggtggtgcagaacatgtcaacaatgaatgcagctaggactccattttctggtgctttagtg 39458211  T
Q  119 aggttggagacggcttttttgacgtttggtttctgagctttgaggagatccaccatgccggaagttatattggagtttgggggaagagaacattctggaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39458212 aggttggagacggcttttttgacgtttggtttctgagctttgaggagatccaccatgccggaagttatattggagtttgggggaagagaacattctggaa 39458311  T
Q  219 ggtcgacaatgttaagagaatcgtcgatgggaagggatttagtgtagacatctgtttctgttgtgtgtggaaatttcatgaccaagatagttattcggag 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39458312 ggtcgacaatgttaagagaatcgtcgatggcaagggatttagtgtagacatctatttctgttgtgtgtggaaatttcatgaccaagatagttattcggag 39458411  T
Q  319 acggttatcactgttgattagaagctttgcaaattcgagggtggaaactagatgaccgacaccaggtgaaggaataatcacccacttctgctttcttcat 418  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  39458412 acggttatcacggttgattagaagctttgcaaattcgagggtggaaactagatgaccaacaccaggtgaagagataatca-ccacttctgctttcttcat 39458510  T
Q  419 cctggatatgcacttactcagtgtgagtgactgtgttctcaattgttctttgatgtcc 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39458511 cctggatatgcacttactcagtgtgagtgactgtgttctcaattgttctttgatgtcc 39458568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 291 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 39480452 - 39480270
Alignment:
Q  291 atttcatgaccaagatagttattcggagacggttatcactgttgattagaagctttgcaaattcgagggtggaaactagatgaccgacaccaggtgaagg 390  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39480452 atttcatgaccaaaacagttattcggagacggttatcacggttgattagaagcttcgcgaattcaagggtggaaactagatgaccaacaccaggtgaagg 39480353  T
Q  391 aataatcacccacttctgctttcttcatcctggatatgcacttactcagtgtgagtgactgtgttctcaattgttctttgatgt 474  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39480352 gataatca-ccacttctgctttcttcatcctggatatgcacttactcagtgtgagtgactgtgttttctattgttctttgatgt 39480270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 33 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 39486808 - 39486405
Alignment:
Q  33 aaaattcttttacaacatcaatcatggtggtgcagaacatgtcaacaatgaatgcagctaggactccattttctggtgctt------tagtgaggttgga 126  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||  ||||  |  | || |||      |||||||||||||    
T  39486808 aaaattctttggcaatatcaatcatggtggtgcagaacatgtcaacaacgaaggcggcaaggtgtccaggtggttgtccttctctagtagtgaggttgga 39486709  T
Q  127 gacggcttttttgacgtttggtttctgagctttgaggagatccaccatgccggaagttatattggagtttgggggaagagaacattctggaaggtcgaca 226  Q
     || |||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |   |||| |  ||  |   | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  39486708 tacagcttgtttgacgtttggtttctgagcttcaaggagagcgttcatgacaaaacgtggttcggtgtttgggggaagagaacattctggaaggttgatg 39486609  T
Q  227 atgttaagagaatcgtcgatgggaagggatttagtgtagacatct-----gtt-tctgttgtgtgtggaaatttcatgaccaagatagttattcggagac 320  Q
    |  |  |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||      ||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  39486608 acctggagagaatcggaaatgggaagggattttgtgtagacatcgacatcgtcatctgtggtgtgtgggaatttgatgaccaagatggttattcggagac 39486509  T
Q  321 ggttatcactgttgattagaagctttgcaaattcgagggtggaaactagatgaccgacaccaggtgaaggaataatcacccacttctgctttcttcatcc 420  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  39486508 ggttatcacggttgattagaagctttgcaaattcaagggtggaaactagatgaccaacaccaggtgaagggataatca-ccacttctgctttcttcatct 39486410  T
Q  421 tggat 425  Q
    |||||    
T  39486409 tggat 39486405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 39451343 - 39450952
Alignment:
Q  33 aaaattcttttacaacatcaatcatggtggtgcagaacatgtcaacaatgaatgcagctaggactccattttctggtgctt---tagtgaggttggagac 129  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  || |||||||||||||||  | ||    |||||||||| || ||    
T  39451343 aaaattctttggcaatatcaatcatggtggtgcagaacatgtcaacaacgatggtggcgaggactccattttctcctcctccagtagtgaggttagaaac 39451244  T
Q  130 ggcttttttgacgtttggtttctgagctttgaggagatccaccatgc---cggaagttatattggagtttgggggaagagaacattctggaaggtcgaca 226  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |   ||||    || ||  |  ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| ||      
T  39451243 ggcttgtttgacatttggtttctgagcttcgaggagagcaggcatggaagcgaaacctggattggtgtttggaggaagagaaacttctggaaggttgatg 39451144  T
Q  227 atgttaagagaatcgtcgatgggaagggatttagtgtagacatctgtttctgttgtgtgtggaaatttcatgaccaagatagttattcggagacggttat 326  Q
    ||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| | | ||||| ||||| || || || | ||||| ||||||||||||||    
T  39451143 atgttgagagaatctgagataggaagggatttagtgttgacatcattttctgatatatgtgggaatttgataactaaaacagttactcggagacggttat 39451044  T
Q  327 cactgttgattagaagctttgcaaattcgagggtggaaactagatgaccgacaccaggtgaaggaataatcacccacttctgctttcttcatc 419  Q
    |||  |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  39451043 cacgattgattagaagcttcgcgaattcaagggtggaaactagatggctcacaccaggaaaagggataaaca-ccacttctgctttcttcatc 39450952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 39472386 - 39471983
Alignment:
Q  20 agcgtagggacaaaaaattcttttacaacatcaatcatggtggtgcagaacatgtcaacaatgaatgcagctaggactccattttctggtgctttagtga 119  Q
    |||||||||||| | || |||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||| |    || |||    
T  39472386 agcgtagggacagagaactctttggcaacatcaatcatgtttgtgcagaacatgtcaacaacaaaagcggcaaggactccattttctgatctggtaatga 39472287  T
Q  120 ggttggagacggcttttttgacgtttggtttctgagctttgaggagatccaccatgccggaagttatattggagtttgggggaagagaacattctggaag 219  Q
    |||| || ||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |   |||   || |  |  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  39472286 ggttagatactacttgtttgacgtttggtttctgagcttcgaggagcgcagtcatagagggaccttgatctgtgtttggggcaagagaacattctggaag 39472187  T
Q  220 gtcgacaatgttaagagaatcgtcgatgggaagggatttagtgtagacatctgtttctgttgtgtgtggaaatttcatgaccaagatagttattcggaga 319  Q
    || ||  ||||  || ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| || || || | |||||||||||||    
T  39472186 gttgatgatgtggagtgaatcggagataggaagggatttagtgtagacatcggtttctgtgatgtgtgggaatttgataactaaaacagttattcggaga 39472087  T
Q  320 cggttatcactgttgattagaagctttgcaaattcgagggtggaaactagatgaccgacaccaggtgaaggaataatcacccacttctgctttcttcatc 419  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||| ||||||  || | ||  |||| | || || ||||||||||||||||||||    
T  39472086 cggttatcacggttgattagaagcttcgcaaactcgagagcagaaactatatgaccctcagccggaaaagggacaaaca-ccacttctgctttcttcatc 39471988  T
Q  420 ctgga 424  Q
     ||||    
T  39471987 ttgga 39471983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 39454964 - 39454592
Alignment:
Q  45 caacatcaatcatggtggtgcagaacatgtcaacaatgaatgcagctaggactccattttctggtgctttagtgaggttggagacggcttttttgacgtt 144  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| || || ||||||||| || ||    |  || ||||||| || ||||||| |||||||||    
T  39454964 caacatcaatcatggctgtgcaggacatgtcaacaacgaaagctgcgaggactccacttgcttcaccagtaatgaggttagatacggcttgtttgacgtt 39454865  T
Q  145 tggtttctgagctttgaggagatccaccatgccggaagttatattggagtttgggggaagagaacattctggaaggtcgacaatgttaagagaatcgtcg 244  Q
    ||||||||||||||  ||| || |   ||||  ||||  |  ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||   |  ||||||  |    
T  39454864 tggtttctgagcttcaaggtgagcggacatggaggaaactggattagtgtttgggggaagagagcattctggaaggttgatgatgcggattgaatcggag 39454765  T
Q  245 atgggaagggatttagtgtagacatctgtttctgttgtgtgtggaaatttcatgaccaagatagttattcggagacggttatcactgttgattagaagct 344  Q
    || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| || | |||||||||||| | ||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  39454764 attggaagagatttactgtatacatcagtttcagtggcgtgtggaaatttgaggactaaaacagttattcggagacggttatcacggttgattagaagtt 39454665  T
Q  345 ttgcaaattcgagggtggaaactagatgaccgacaccaggtgaaggaataatcacccacttctgctttcttcat 418  Q
    | || || || ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  39454664 tcgcgaactcaagggtggaaactaaatggccaacaccaggagaagggataaaca-ccacttctgctttcttcat 39454592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 39475829 - 39475433
Alignment:
Q  53 atcatggtggtgcagaacatgtcaacaatgaatgcagctaggactccattttctggtgctttagt---gaggttggagacggcttttttgacgtttggtt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||  ||||| || |  | || ||||   |||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  39475829 atcatggtggtgcagaacatgtcaacaacgaaggcggcgaggtgtccatgttgtccttctctagtagtgaggttggagacagcttgttttacgtttggtt 39475730  T
Q  150 tctgagctttgaggagatccaccatgccgga---agttatattggagtttgggggaagagaacattctggaaggtcgacaatgttaagagaatcgtcgat 246  Q
    ||||||||| ||||||| |   ||||   ||   |  |  || || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||| ||||| ||   |||    
T  39475729 tctgagcttcgaggagagctgtcatggaagagaaacctggatcggtgtttgggggaagagaaacttctggaaggttgatgatgttgagagattctgagat 39475630  T
Q  247 gggaagggatttagtgtagacatctgtttctgttgtgtgtggaaatttcatgaccaagatagttattcggagacggttatcactgttgattagaagcttt 346  Q
     |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||| || || || | ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  39475629 aggaagggatttagtgttgacatcattttctgttatgtgtgggaatttgataactaaaacagttactcggagacggttatcacgattgattagaagcttc 39475530  T
Q  347 gcaaattcgagggtggaaactagatgaccgacaccaggtgaaggaataatcacccacttctgctttcttcatcctggatatgcacttactcagtgtga 444  Q
     |||| || || ||||||| |||||| |  | ||| ||  |||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  39475529 acaaactcaagtgtggaaattagatggctcagaccgggaaaagggataaaca-ccacttctgctttcttcatcttggatatacacttgatcagtgtga 39475433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 198 - 418
Target Start/End: Original strand, 39464531 - 39464750
Alignment:
Q  198 ggggaagagaacattctggaaggtcgacaatgttaagagaatcgtcgatgggaagggatttagtgtagacatctgtttctgttgtgtgtggaaatttcat 297  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||  |  |||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||  || ||||| | ||| ||    
T  39464531 ggggaagagaaacttctggaaggttgatgacattaagagaatcagatatgggaatggatttagtgtagacatcggattctgcggtttgtgggagtttgat 39464630  T
Q  298 gaccaagatagttattcggagacggttatcactgttgattagaagctttgcaaattcgagggtggaaactagatgaccgacaccaggtgaaggaataatc 397  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||| | ||  |||| |||| |    
T  39464631 gactaagatggttattcggagacggttatcacggttgattagaagcttcgcaaactcaagggcagaaactagatgacctacagcgggaaaagggataaac 39464730  T
Q  398 acccacttctgctttcttcat 418  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  39464731 a-ctacttctgctttcttcat 39464750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 39460506 - 39460248
Alignment:
Q  114 tagtgaggttggagacggcttttttgacgtttggtttctgagctttgaggagatccaccatgccggaagttatattggagtttgggggaagagaacattc 213  Q
    ||||||| || || ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||| | |||||||   | |  ||||||||||||||||  |||    
T  39460506 tagtgagattagatacggcttgtttgacgtttgatttctgagcttcgaggaaagccatcattctggaagttggttcgatgtttgggggaagagaaacttc 39460407  T
Q  214 tggaaggtcgacaatgttaagagaatcgtcgatgggaagggatttagtgtagacatctgtttctgttgtgtgtggaaatttcatgaccaagatagttatt 313  Q
    |||||||| ||  ||||  ||||||||     ||||||| ||||||||||  ||||| | ||||| ||||| ||| | ||||||||| | || ||| |||    
T  39460406 tggaaggttgatgatgtcgagagaatcagaagtgggaagtgatttagtgttaacatcggattctgatgtgtatgggagtttcatgactaggacagtaatt 39460307  T
Q  314 cggagacggttatcactgttgattagaagctttgcaaattcgagggtggaaactagatg 372  Q
    ||||| || ||||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||| |||||||    
T  39460306 cggaggcgcttatcacggttggttagaagctttgcgaactcaagggtggaatctagatg 39460248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 375
Target Start/End: Original strand, 39470589 - 39470931
Alignment:
Q  33 aaaattcttttacaacatcaatcatggtggtgcagaacatgtcaacaatgaatgcagctaggactccattttctggtgctttagtgaggttggagacggc 132  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  || || |||  ||||| || |  | |  |||||||||||||||  ||    
T  39470589 aaaattctttggcaacatcaatcatgtttgtgcagaacatgtcaacaatgacagcggcgaggggtccatgttgttctccagtagtgaggttggagatagc 39470688  T
Q  133 ttttttgacgtttggtttctgagctttgaggagatccaccatgccggaagttatattggagtttgggggaagagaacattctggaaggtcgacaatgtta 232  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |   |||  | |||  |  ||  ||| ||||| ||| ||||  ||||||||||| ||  |  |      
T  39470689 ttgtttgacgtttgctttatgagcttcgaggagagcgttcatatccgaacctggatcagaggttgggagaacagaaacttctggaaggttgatgacatgg 39470788  T
Q  233 agagaatcgtcgatgggaagggatttagtgtagacatctgtttctgttgtgtgtggaaatttcatgaccaagatagttattcggagacggttatcactgt 332  Q
    ||||||||   |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||  ||    
T  39470789 agagaatcagagatgggaatggatttagcgtagacatcagattctgcagtgtgtgggaatttcatgactaagacagttattcagaggcggttatcatggt 39470888  T
Q  333 tgattagaagctttgcaaattcgagggtggaaactagatgacc 375  Q
    ||||||||||||| || || || | ||  ||||||||||||||    
T  39470889 tgattagaagcttggcgaactctaaggcagaaactagatgacc 39470931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 39483588 - 39483339
Alignment:
Q  45 caacatcaatcatggtggtgcagaacatgtcaacaatgaatgcagctaggactccattttctggtgctttagt---gaggttggagacggcttttttgac 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  |||  ||||| || |  | || ||||   |||||||||||| |||| | | |     
T  39483588 caacatcaatcatggtggtgcagaacatgtcaacaacgaaggcggagaggtgtccatgttgtccttctctagtagtgaggttggagacagcttgtattat 39483489  T
Q  142 gtttggtttctgagctttgaggagatccaccatgccggaagttatattggagtttgggggaagagaacattctggaaggtcgacaatgttaagagaatcg 241  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |    ||| | |||  || || | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |  |||||| ||||     
T  39483488 gtttggtttctgagcttcaaggagagcgttgatggcagaaactagatcgaagtttgggggaagataacattctggaaggttgattacattaagaaaatca 39483389  T
Q  242 tcgatgggaagggatttagtgtagacatctgtttctgttgtgtgtggaaa 291  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||    
T  39483388 aagatgggaagggatttagggtagacattggtttatgttgtgtatggaaa 39483339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 421
Target Start/End: Original strand, 43312598 - 43312732
Alignment:
Q  286 tggaaatttcatgaccaagatagttattcggagacggttatcactgttgattagaagctttgcaaattcgagggtggaaactagatgaccgacaccaggt 385  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||| ||| || ||||| ||     
T  43312598 tggaaacttgatgaccaagacggttacacggagacggttatcacggttgatgagaagcttagcaaactcaagggtggatactaaatgtcccacacctgga 43312697  T
Q  386 gaaggaataatcacccacttctgctttcttcatcct 421  Q
    ||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  43312698 gaagggataaaca-ccacttctagtttcttcatcct 43312732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 90
Target Start/End: Original strand, 43312380 - 43312423
Alignment:
Q  47 acatcaatcatggtggtgcagaacatgtcaacaatgaatgcagc 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  43312380 acatcaatcatggtggtgcagaacatgtcaacaacgaaggcagc 43312423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 80
Target Start/End: Original strand, 39464399 - 39464434
Alignment:
Q  45 caacatcaatcatggtggtgcagaacatgtcaacaa 80  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39464399 caacatcaatcatgttggtgcagaacatgtcaacaa 39464434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 39460603 - 39460543
Alignment:
Q  20 agcgtagggacaaaaaattcttttacaacatcaatcatggtggtgcagaacatgtcaacaa 80  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  39460603 agcgtagggactgaaaattctttggcaatatcaatcattttagtgcagaacatgtcaacaa 39460543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University